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The map label for this gene is nrfI [H]

Identifier: 108563439

GI number: 108563439

Start: 1068809

End: 1071619

Strand: Reverse

Name: nrfI [H]

Synonym: HPAG1_1014

Alternate gene names: 108563439

Gene position: 1071619-1068809 (Counterclockwise)

Preceding gene: 108563440

Following gene: 108563438

Centisome position: 67.13

GC content: 40.55

Gene sequence:

>2811_bases
ATGAAAAGCCTTAAGAGCTTGATTTCTTTTTTGCTGGCTTCTTTTTGGGTCGCTATCCCTTTAATCGCGCTCTATGCCTT
AGCGTGCGCGATAGCCACTTTTATAGAAAACGATTACGGCACGAGCGCGAGTAAGGCGATTGTGTATAACACCCCTTGGT
TTAATTTCTTGCATGCGTATTTGTTGGTGGTTTTAATAGGCACATTCATTAATTCTAAAGCTTTGAAGCGCAAAAGATAC
GCCAGCCTTTTTTTCCACAGCTCCTTGATTTTAATCATTTTGGGGGCAGCCATCACGCGCTTTTTTGGCGTAGAAGGGCT
TATGCATGTGCGAGAAAATAGCGCGCAAAGCTCTTTTGAGAGCGCGGACACTTACCTTAATATCACTCTTAATGACACCA
CCAAACTTTCTTTAAAAACGCCTTTAACCTTTTATCATTCCAAACGATTAAGACCCATTCATGCCACTTTAGATCACAAG
CCTTTGATTTTAGAACCCTTAGAGATTTACAAGCAAAACGCCATTAAAAAAGATGACGCTACCATTTTAGTGTTAAAAGC
GACTTATAACGGCGTGAGTCGCAAATTCAATCTCATTAAAAACAATAGGAATGAAGGCATAGAAGAAAGCGAGATGTTTA
AAGACGACAAGCTCTCTTTAAGTTTTGGATCCGCTTACATTGAATTGCCCTTTCAAATCAAATTGAAGCGTTTTGAATTA
GAGCGCTACGCCGGCTCTATGAGCCCTTCATCTTACGCTTCAGAAGTGGAAGTGTTGAAACTAGATAACACTTTAATCAA
ACCTTATAGGATTTTTATGAACCATGTTTTAGATTATGAAGGTTATCGCTTTTTCCAATCTTCCTATGATACGGATGAAA
AAGGCACGATCCTTTCTGTCAATAAAGATCCGGGTAAAATCCCCACCTATTTAGGGTATGCGATGCTTATTTTGGGGGCT
TTGTGGTTGCTTTTGGATAAAAACGGGCGCTTTTTGAAGCTTTCACGCTTTTTAAAATCCCAACAAGCCGCTAGTTTCTT
GCTCGCTTTAATTTTAATCAGCCCTTTTACTTCTTCGTTTGCCAATGAGACTCCAATTGACATGCATGGGGGAAAAAGCG
CTAAAATTGAGCGACAAAAGATAGAAAATCCCGCTAATAAAGAGGATTCTAAAAGTGCGATTTTAGAGCGTTTGAAACGT
TTAAGAGAGTATTCCAAAGACCACTTAAAAGCCTTTCAAAGGCTTCAAGTCCAGGATTTTGACGGGCGTATCAAACCTTT
AGACACCATCAGCATTGAATATATCCATAAGATTTTAAAAAAAGATGATTTTCAAGGGCTAAGTGCCATGCAGGTGCTTT
TAGGGATCATGTTTTTCCCCAATGATTGGCGTAGCGTTAAAATGATTTACACTTCTAATAAAGCCTTAAGAAAGCTTATC
GGCACGCCTTTAGACGAAAGCCGTATCGCTTTTAGAGATGCGTTTGATAGCCGTGGGTATAAATTAAAAAATTTGGTTGA
AGAAGTCAATCAAAAATCCCCTAACGCGCGCAACGAGTTGGATAAAGACGTCTTAAAAGTAGATGAACGCATCAACTTAG
TCTATACGCTTTTTAGCGCTCAATTTTTACGCATTTTCCCTAGCGATAAAACCACCGCTTGGCTCTCGCCCATTGAAGCG
ATCAACAGCCCTAATAAAGAAATTTCAAGCGTGGCAACGGCGTTTTTAAAAAATATTTTTAGCGGGTTTGATGACGCCTT
AAAAAACAATCAATGGGATAAAGTGGAAAAAACCCTAAAAGATTTAAGCATTTACCAACAAGAGCATGCCAAAAACCTCT
ATTTACCCTCTTCTAAAGTGGATTCTGAAATTTTTTTAAACCACACCAATTTTTTTAACCGCCTGACCTTGCCTTATATC
CTTCTTGGACTATTGCTTTTTATCGTTGTGATTGGCTCTCTGGTTAAAAACACGATTCCAAATATCTGGCCCACTAAAAT
CCTTTATTTTGCTATCTTGCTTTGCGCGATCGCTCATTCTGTAGGGCTAGTTTTACGCTGGTATGTGAGCGGGCATTCGC
CTTGGAGCAACGCTTATGAGTCCATGCTTTATATCGCATGGGCTTCTGTTATCGCAGGGTTTATTTTACGCTCCAAACTC
GCGCTATCGGCTTCTAGCTTTTTAGCCGGTATCGCGCTCTTTGTGGCTCATTTAGGATTTATGGACCCTCAAATTGGCCA
TTTAGTGCCGGTGTTGAAATCCTATTGGCTCAATATCCATGTCTCTGTCATCACCGCTAGTTATGGCTTTTTGGGCTTGT
GTTTTGTGCTAGGGATTTTGAGTTTGGTTTTGTTTATTTTGCGCAAACAAGGGCGTTTCAATTTGGACAAAACCATTCTC
TCCATTAGCGCCATCAATGAAATGAGCATGATTTTAGGCCTGTTCATGCTCACAGCCGGGAATTTCTTAGGCGGGGTGTG
GGCGAATGAATCTTGGGGGCGCTATTGGGGGTGGGACCCTAAAGAAACTTGGGCATTGATTTCTATTTGCGTCTATGCTT
TAATCTTGCATTTGCGTTTTTTAGGCTCTCACAATTGGCCCTTTATTTTAGCGAGCAGCAGCGTTTTAGGGTTTTATTCG
GTTTTAATGACTTATTTTGGCGTGAATTACTACCTTTCTGGCTTGCACAGCTATGCCGCAGGCGATCCCTTGCCGATCCC
TACTTTTTTATACTTTTTGGTAGCGATACCTTTTGCTCTCGTGATCTTGGCGTATTTCAAACGCCATTTGAGTTTGCCTA
AATTGGTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATCAAGACACAAAAGACGATGAGGATCTCACCAAAAAATTAAAGGCTTACATCAATATAAAACCAACCTTTCTAAAAAC
AAATCAAGCTAGGAAAATGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGGATAACCATGTTCCAGCCCCTGTTAGACGCTTATATAGACAGCACCCGTTTAGATGAAACCGATTATAAGCCCCCATT
AAATATAGCCCTAGCGAATT

Product: cytochrome c-type biogenesis protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 936; Mature: 936

Protein sequence:

>936_residues
MKSLKSLISFLLASFWVAIPLIALYALACAIATFIENDYGTSASKAIVYNTPWFNFLHAYLLVVLIGTFINSKALKRKRY
ASLFFHSSLILIILGAAITRFFGVEGLMHVRENSAQSSFESADTYLNITLNDTTKLSLKTPLTFYHSKRLRPIHATLDHK
PLILEPLEIYKQNAIKKDDATILVLKATYNGVSRKFNLIKNNRNEGIEESEMFKDDKLSLSFGSAYIELPFQIKLKRFEL
ERYAGSMSPSSYASEVEVLKLDNTLIKPYRIFMNHVLDYEGYRFFQSSYDTDEKGTILSVNKDPGKIPTYLGYAMLILGA
LWLLLDKNGRFLKLSRFLKSQQAASFLLALILISPFTSSFANETPIDMHGGKSAKIERQKIENPANKEDSKSAILERLKR
LREYSKDHLKAFQRLQVQDFDGRIKPLDTISIEYIHKILKKDDFQGLSAMQVLLGIMFFPNDWRSVKMIYTSNKALRKLI
GTPLDESRIAFRDAFDSRGYKLKNLVEEVNQKSPNARNELDKDVLKVDERINLVYTLFSAQFLRIFPSDKTTAWLSPIEA
INSPNKEISSVATAFLKNIFSGFDDALKNNQWDKVEKTLKDLSIYQQEHAKNLYLPSSKVDSEIFLNHTNFFNRLTLPYI
LLGLLLFIVVIGSLVKNTIPNIWPTKILYFAILLCAIAHSVGLVLRWYVSGHSPWSNAYESMLYIAWASVIAGFILRSKL
ALSASSFLAGIALFVAHLGFMDPQIGHLVPVLKSYWLNIHVSVITASYGFLGLCFVLGILSLVLFILRKQGRFNLDKTIL
SISAINEMSMILGLFMLTAGNFLGGVWANESWGRYWGWDPKETWALISICVYALILHLRFLGSHNWPFILASSSVLGFYS
VLMTYFGVNYYLSGLHSYAAGDPLPIPTFLYFLVAIPFALVILAYFKRHLSLPKLV

Sequences:

>Translated_936_residues
MKSLKSLISFLLASFWVAIPLIALYALACAIATFIENDYGTSASKAIVYNTPWFNFLHAYLLVVLIGTFINSKALKRKRY
ASLFFHSSLILIILGAAITRFFGVEGLMHVRENSAQSSFESADTYLNITLNDTTKLSLKTPLTFYHSKRLRPIHATLDHK
PLILEPLEIYKQNAIKKDDATILVLKATYNGVSRKFNLIKNNRNEGIEESEMFKDDKLSLSFGSAYIELPFQIKLKRFEL
ERYAGSMSPSSYASEVEVLKLDNTLIKPYRIFMNHVLDYEGYRFFQSSYDTDEKGTILSVNKDPGKIPTYLGYAMLILGA
LWLLLDKNGRFLKLSRFLKSQQAASFLLALILISPFTSSFANETPIDMHGGKSAKIERQKIENPANKEDSKSAILERLKR
LREYSKDHLKAFQRLQVQDFDGRIKPLDTISIEYIHKILKKDDFQGLSAMQVLLGIMFFPNDWRSVKMIYTSNKALRKLI
GTPLDESRIAFRDAFDSRGYKLKNLVEEVNQKSPNARNELDKDVLKVDERINLVYTLFSAQFLRIFPSDKTTAWLSPIEA
INSPNKEISSVATAFLKNIFSGFDDALKNNQWDKVEKTLKDLSIYQQEHAKNLYLPSSKVDSEIFLNHTNFFNRLTLPYI
LLGLLLFIVVIGSLVKNTIPNIWPTKILYFAILLCAIAHSVGLVLRWYVSGHSPWSNAYESMLYIAWASVIAGFILRSKL
ALSASSFLAGIALFVAHLGFMDPQIGHLVPVLKSYWLNIHVSVITASYGFLGLCFVLGILSLVLFILRKQGRFNLDKTIL
SISAINEMSMILGLFMLTAGNFLGGVWANESWGRYWGWDPKETWALISICVYALILHLRFLGSHNWPFILASSSVLGFYS
VLMTYFGVNYYLSGLHSYAAGDPLPIPTFLYFLVAIPFALVILAYFKRHLSLPKLV
>Mature_936_residues
MKSLKSLISFLLASFWVAIPLIALYALACAIATFIENDYGTSASKAIVYNTPWFNFLHAYLLVVLIGTFINSKALKRKRY
ASLFFHSSLILIILGAAITRFFGVEGLMHVRENSAQSSFESADTYLNITLNDTTKLSLKTPLTFYHSKRLRPIHATLDHK
PLILEPLEIYKQNAIKKDDATILVLKATYNGVSRKFNLIKNNRNEGIEESEMFKDDKLSLSFGSAYIELPFQIKLKRFEL
ERYAGSMSPSSYASEVEVLKLDNTLIKPYRIFMNHVLDYEGYRFFQSSYDTDEKGTILSVNKDPGKIPTYLGYAMLILGA
LWLLLDKNGRFLKLSRFLKSQQAASFLLALILISPFTSSFANETPIDMHGGKSAKIERQKIENPANKEDSKSAILERLKR
LREYSKDHLKAFQRLQVQDFDGRIKPLDTISIEYIHKILKKDDFQGLSAMQVLLGIMFFPNDWRSVKMIYTSNKALRKLI
GTPLDESRIAFRDAFDSRGYKLKNLVEEVNQKSPNARNELDKDVLKVDERINLVYTLFSAQFLRIFPSDKTTAWLSPIEA
INSPNKEISSVATAFLKNIFSGFDDALKNNQWDKVEKTLKDLSIYQQEHAKNLYLPSSKVDSEIFLNHTNFFNRLTLPYI
LLGLLLFIVVIGSLVKNTIPNIWPTKILYFAILLCAIAHSVGLVLRWYVSGHSPWSNAYESMLYIAWASVIAGFILRSKL
ALSASSFLAGIALFVAHLGFMDPQIGHLVPVLKSYWLNIHVSVITASYGFLGLCFVLGILSLVLFILRKQGRFNLDKTIL
SISAINEMSMILGLFMLTAGNFLGGVWANESWGRYWGWDPKETWALISICVYALILHLRFLGSHNWPFILASSSVLGFYS
VLMTYFGVNYYLSGLHSYAAGDPLPIPTFLYFLVAIPFALVILAYFKRHLSLPKLV

Specific function: May play a role in cytochrome c biogenesis and may be required for maturation of the NrfA protein [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: In the C-terminal section; belongs to the ccmF/cycK/ccl1/nrfE/ccsA family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002541
- InterPro:   IPR007816 [H]

Pfam domain/function: PF01578 Cytochrom_C_asm; PF05140 ResB [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 106253; Mature: 106253

Theoretical pI: Translated: 9.81; Mature: 9.81

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKSLKSLISFLLASFWVAIPLIALYALACAIATFIENDYGTSASKAIVYNTPWFNFLHAY
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHH
LLVVLIGTFINSKALKRKRYASLFFHSSLILIILGAAITRFFGVEGLMHVRENSAQSSFE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
SADTYLNITLNDTTKLSLKTPLTFYHSKRLRPIHATLDHKPLILEPLEIYKQNAIKKDDA
CCCCEEEEEECCCEEEEECCCHHHHHCCCCCCHHHCCCCCCCEECHHHHHHHHCCCCCCC
TILVLKATYNGVSRKFNLIKNNRNEGIEESEMFKDDKLSLSFGSAYIELPFQIKLKRFEL
EEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCCEEEECCEEEECCCEEEHHHHHH
ERYAGSMSPSSYASEVEVLKLDNTLIKPYRIFMNHVLDYEGYRFFQSSYDTDEKGTILSV
HHHHCCCCCCHHHCCHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCEEEEE
NKDPGKIPTYLGYAMLILGALWLLLDKNGRFLKLSRFLKSQQAASFLLALILISPFTSSF
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ANETPIDMHGGKSAKIERQKIENPANKEDSKSAILERLKRLREYSKDHLKAFQRLQVQDF
CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCC
DGRIKPLDTISIEYIHKILKKDDFQGLSAMQVLLGIMFFPNDWRSVKMIYTSNKALRKLI
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHH
GTPLDESRIAFRDAFDSRGYKLKNLVEEVNQKSPNARNELDKDVLKVDERINLVYTLFSA
CCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QFLRIFPSDKTTAWLSPIEAINSPNKEISSVATAFLKNIFSGFDDALKNNQWDKVEKTLK
HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
DLSIYQQEHAKNLYLPSSKVDSEIFLNHTNFFNRLTLPYILLGLLLFIVVIGSLVKNTIP
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NIWPTKILYFAILLCAIAHSVGLVLRWYVSGHSPWSNAYESMLYIAWASVIAGFILRSKL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALSASSFLAGIALFVAHLGFMDPQIGHLVPVLKSYWLNIHVSVITASYGFLGLCFVLGIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHH
SLVLFILRKQGRFNLDKTILSISAINEMSMILGLFMLTAGNFLGGVWANESWGRYWGWDP
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCH
KETWALISICVYALILHLRFLGSHNWPFILASSSVLGFYSVLMTYFGVNYYLSGLHSYAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
GDPLPIPTFLYFLVAIPFALVILAYFKRHLSLPKLV
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKSLKSLISFLLASFWVAIPLIALYALACAIATFIENDYGTSASKAIVYNTPWFNFLHAY
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHH
LLVVLIGTFINSKALKRKRYASLFFHSSLILIILGAAITRFFGVEGLMHVRENSAQSSFE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
SADTYLNITLNDTTKLSLKTPLTFYHSKRLRPIHATLDHKPLILEPLEIYKQNAIKKDDA
CCCCEEEEEECCCEEEEECCCHHHHHCCCCCCHHHCCCCCCCEECHHHHHHHHCCCCCCC
TILVLKATYNGVSRKFNLIKNNRNEGIEESEMFKDDKLSLSFGSAYIELPFQIKLKRFEL
EEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCCEEEECCEEEECCCEEEHHHHHH
ERYAGSMSPSSYASEVEVLKLDNTLIKPYRIFMNHVLDYEGYRFFQSSYDTDEKGTILSV
HHHHCCCCCCHHHCCHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCEEEEE
NKDPGKIPTYLGYAMLILGALWLLLDKNGRFLKLSRFLKSQQAASFLLALILISPFTSSF
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ANETPIDMHGGKSAKIERQKIENPANKEDSKSAILERLKRLREYSKDHLKAFQRLQVQDF
CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCC
DGRIKPLDTISIEYIHKILKKDDFQGLSAMQVLLGIMFFPNDWRSVKMIYTSNKALRKLI
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHH
GTPLDESRIAFRDAFDSRGYKLKNLVEEVNQKSPNARNELDKDVLKVDERINLVYTLFSA
CCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QFLRIFPSDKTTAWLSPIEAINSPNKEISSVATAFLKNIFSGFDDALKNNQWDKVEKTLK
HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
DLSIYQQEHAKNLYLPSSKVDSEIFLNHTNFFNRLTLPYILLGLLLFIVVIGSLVKNTIP
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NIWPTKILYFAILLCAIAHSVGLVLRWYVSGHSPWSNAYESMLYIAWASVIAGFILRSKL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALSASSFLAGIALFVAHLGFMDPQIGHLVPVLKSYWLNIHVSVITASYGFLGLCFVLGIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHH
SLVLFILRKQGRFNLDKTILSISAINEMSMILGLFMLTAGNFLGGVWANESWGRYWGWDP
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCH
KETWALISICVYALILHLRFLGSHNWPFILASSSVLGFYSVLMTYFGVNYYLSGLHSYAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
GDPLPIPTFLYFLVAIPFALVILAYFKRHLSLPKLV
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 10672190; 14500908 [H]