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The map label for this gene is 108563372

Identifier: 108563372

GI number: 108563372

Start: 988228

End: 990564

Strand: Reverse

Name: 108563372

Synonym: HPAG1_0947

Alternate gene names: NA

Gene position: 990564-988228 (Counterclockwise)

Preceding gene: 108563373

Following gene: 108563371

Centisome position: 62.05

GC content: 39.2

Gene sequence:

>2337_bases
ATGAACGCGCAAGAACTCATTAAAAAAAGCGCTTTAATTGAAAAAACGCTACAAGAACAAGGCTTGCAAGAAAGAGCGAA
GCCTTTTATGAGCGATAACGCTGTGATTAAAACCGAAGAGTTAGAGAAAACGCTAAAAGAGTTGCAAGATACAAATAGGG
ATCTTAAAGTCGGTATCATCGGGCGCGTGAAAGCGGGCAAAAGCTCGCTCTTGAACGCTTTGATTTTTGAGGGTGTAGAG
GTTTTACCCAAAGCGGCAACGCCCATGACCGCTAGCCTTACCATTTTAAAATACGCAAAAACCCTGAGCGCTCAAGTGGA
GTTTTATAGCCAAAAGGATATTTCAGAGCTTGAAAACGAACATGAAAGGTATGTAAGGGAGTTTAACAGGATTGTTGAAG
AAGAAGTCAAAAAGCAAAAAGAAAAACAGAGTTTGTCAAATAGGACTAAAGAGGGATTGAAGAATCTTGGCAACAAGTTT
AGCAGAAACAAAAACCCTGAAGCAGCGCCCAAAGAGAATATTTTAAGCGATGAAGAAATATTGGAAAAGGCTAGAAGGAT
CGCTAAAAATACATTAAATGAGGATACGAAGCTCGTTTCATCACACGATCAATACGAAAAAATGAAAAAAAGCGGATCGC
TCAACACGGAAAAATTAGATCCGCACATTCAAGCCAACAGCTTACAAGAGCTGAATCAAAAATTGCTCCAATTCGTGGGT
GCGGACGGGAAGTATATGCTCTACACTAAAGCGGTGCAGATTTCTTTGAATAACCCCAATCTTAAAGATTTGGAAGTGAT
TGACACCCCGGGAGTGAATGATCCGATCGCTTCCAGAGAAGAGTGCACCAAAGCCTTATTGAAAGATTGCGATGTGGTGT
TTATTGTAAGCCCTTCTGGTCAGTTTTTAACGGATAGCGATATGAGTTTGTTTGACAGGGTTTCTCATAAAGAAGGCCTT
CAAGAAATTTATTTTGTGGCAAGCCAAGCCGACAGCGCTGTTCTTTCTATGAGTGAGGTGGAAAAATCCAACCAACACCT
CCCTACAGCCTTTGAAAACGTGCAAAAAGCCCTTTCATCTCAATTAAATAATATCATGGGAAAGTTGATTGAAAACTACC
CCAACCAACGAGAGATTTTTGAAAAAGCAATCAAAAACGGCGTCATTTTGGCTTCAGGGGTTTGCTTTAGCATGTATAAG
GATTTCAACAACCAAGCTTCTTGGGAAAGAAACCAAAAAACAGAAGAGTATCACAATGCCTTACGGAATTTAAAAGATTT
TTACCATGACGCTTTTAATAGCGATGATAAGTCTAAAGAAAGCTTATTGTTTTTAAGCAATATGGGCGCGATTGAAGAGC
GTTTAAAAAAAGCCGCAAAAGAGAAAGAAAAAATCATGTCTCAAAAATTGCAAGATTATGCACAGAGCCAAGCAAAGAAC
CTCCATAAATTCATAGCGCAGTTGTTGCAAGATTTGGAAGAAGAAAAAAAGAGGGTTAAAAACGCTGACATTAGTGCTAT
CAAAGAGCAAATAGTGGTTTATCAAAACCTCTCTAATGAGATTGAAACAGGGTTTGATGGGGTGTATGAAGAATTTATCT
TGCATTTCATCAAAAACACTAGAGATGGCTTGAATGAAACCTTAACGAAAGCTATCCGAACGGCTAAAACGCGCTCTAGA
GAAGAAGAGGAAGAAGAGCATTATATTGAAAGAGTGAAGCAAGGCGGTCTTTCTGGAAGCTTTAAAAGAAATTTTTTGTG
GTGGGCTGATGATGATGCGGGCTATGATGAAGTAGAACGCACAAGAGTAACCATTAAAGCCGGAGCGGTGCTTGATCATT
TAACAGAGATGCATGAACGCTGCGAAAGCGCTTTGAATGACAGCGTTGAATCTTTTAAAATCGTTTTTAGAAAAGAACTC
TACGCTAAAGTCTTTTCTCAATTGCGCGAAATCATCTCTGATGATTTGATTGATGAGGTGGCTTTCAAAAGAAGCGTGGA
GGCTGTTTTAGATTCCATTGAATTTAAAGAGTTTGATTACACTGATAAGCTTCCTGGCGAGATAAGGGGGAAAACGGGTA
AGTTAAAAGGCGATGAAGCTAATGCTTTTATACAAAGCGTGGGGAATTATGTGAGGGATTTTGAAGCTGAGACTAAAAAA
GATGTGAAAGGCTATATCCAAGGTTTAAGAGAGACTTTAGAAAGGCAAAACTTTGCCAGCGATACGCTTCAAAAACTTCA
AGAAAACATGCAAAATTTGCACAATCAAGTGCAAAATAAAGTGCAATCCATCGCTCAATTAGACGCGCAAATCCAAGCTT
TAAAAGGGATTCAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGAAAAACACCTTAACGATTTAGAAAATCAAAAACAAATCTTAGAAAACAAGATCAACGCTTTAAGCGATCTAGAACAA
CAATATTTAAAGGATCAACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTGTTAATTTTTTTAAGGAAAACCACCAAAACAACCATCAAGTGGGCTTAAAAGAGTGCTACGATTTGATCGCTCGTATT
TTAAACGCTAAAATGGAAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 778; Mature: 778

Protein sequence:

>778_residues
MNAQELIKKSALIEKTLQEQGLQERAKPFMSDNAVIKTEELEKTLKELQDTNRDLKVGIIGRVKAGKSSLLNALIFEGVE
VLPKAATPMTASLTILKYAKTLSAQVEFYSQKDISELENEHERYVREFNRIVEEEVKKQKEKQSLSNRTKEGLKNLGNKF
SRNKNPEAAPKENILSDEEILEKARRIAKNTLNEDTKLVSSHDQYEKMKKSGSLNTEKLDPHIQANSLQELNQKLLQFVG
ADGKYMLYTKAVQISLNNPNLKDLEVIDTPGVNDPIASREECTKALLKDCDVVFIVSPSGQFLTDSDMSLFDRVSHKEGL
QEIYFVASQADSAVLSMSEVEKSNQHLPTAFENVQKALSSQLNNIMGKLIENYPNQREIFEKAIKNGVILASGVCFSMYK
DFNNQASWERNQKTEEYHNALRNLKDFYHDAFNSDDKSKESLLFLSNMGAIEERLKKAAKEKEKIMSQKLQDYAQSQAKN
LHKFIAQLLQDLEEEKKRVKNADISAIKEQIVVYQNLSNEIETGFDGVYEEFILHFIKNTRDGLNETLTKAIRTAKTRSR
EEEEEEHYIERVKQGGLSGSFKRNFLWWADDDAGYDEVERTRVTIKAGAVLDHLTEMHERCESALNDSVESFKIVFRKEL
YAKVFSQLREIISDDLIDEVAFKRSVEAVLDSIEFKEFDYTDKLPGEIRGKTGKLKGDEANAFIQSVGNYVRDFEAETKK
DVKGYIQGLRETLERQNFASDTLQKLQENMQNLHNQVQNKVQSIAQLDAQIQALKGIQ

Sequences:

>Translated_778_residues
MNAQELIKKSALIEKTLQEQGLQERAKPFMSDNAVIKTEELEKTLKELQDTNRDLKVGIIGRVKAGKSSLLNALIFEGVE
VLPKAATPMTASLTILKYAKTLSAQVEFYSQKDISELENEHERYVREFNRIVEEEVKKQKEKQSLSNRTKEGLKNLGNKF
SRNKNPEAAPKENILSDEEILEKARRIAKNTLNEDTKLVSSHDQYEKMKKSGSLNTEKLDPHIQANSLQELNQKLLQFVG
ADGKYMLYTKAVQISLNNPNLKDLEVIDTPGVNDPIASREECTKALLKDCDVVFIVSPSGQFLTDSDMSLFDRVSHKEGL
QEIYFVASQADSAVLSMSEVEKSNQHLPTAFENVQKALSSQLNNIMGKLIENYPNQREIFEKAIKNGVILASGVCFSMYK
DFNNQASWERNQKTEEYHNALRNLKDFYHDAFNSDDKSKESLLFLSNMGAIEERLKKAAKEKEKIMSQKLQDYAQSQAKN
LHKFIAQLLQDLEEEKKRVKNADISAIKEQIVVYQNLSNEIETGFDGVYEEFILHFIKNTRDGLNETLTKAIRTAKTRSR
EEEEEEHYIERVKQGGLSGSFKRNFLWWADDDAGYDEVERTRVTIKAGAVLDHLTEMHERCESALNDSVESFKIVFRKEL
YAKVFSQLREIISDDLIDEVAFKRSVEAVLDSIEFKEFDYTDKLPGEIRGKTGKLKGDEANAFIQSVGNYVRDFEAETKK
DVKGYIQGLRETLERQNFASDTLQKLQENMQNLHNQVQNKVQSIAQLDAQIQALKGIQ
>Mature_778_residues
MNAQELIKKSALIEKTLQEQGLQERAKPFMSDNAVIKTEELEKTLKELQDTNRDLKVGIIGRVKAGKSSLLNALIFEGVE
VLPKAATPMTASLTILKYAKTLSAQVEFYSQKDISELENEHERYVREFNRIVEEEVKKQKEKQSLSNRTKEGLKNLGNKF
SRNKNPEAAPKENILSDEEILEKARRIAKNTLNEDTKLVSSHDQYEKMKKSGSLNTEKLDPHIQANSLQELNQKLLQFVG
ADGKYMLYTKAVQISLNNPNLKDLEVIDTPGVNDPIASREECTKALLKDCDVVFIVSPSGQFLTDSDMSLFDRVSHKEGL
QEIYFVASQADSAVLSMSEVEKSNQHLPTAFENVQKALSSQLNNIMGKLIENYPNQREIFEKAIKNGVILASGVCFSMYK
DFNNQASWERNQKTEEYHNALRNLKDFYHDAFNSDDKSKESLLFLSNMGAIEERLKKAAKEKEKIMSQKLQDYAQSQAKN
LHKFIAQLLQDLEEEKKRVKNADISAIKEQIVVYQNLSNEIETGFDGVYEEFILHFIKNTRDGLNETLTKAIRTAKTRSR
EEEEEEHYIERVKQGGLSGSFKRNFLWWADDDAGYDEVERTRVTIKAGAVLDHLTEMHERCESALNDSVESFKIVFRKEL
YAKVFSQLREIISDDLIDEVAFKRSVEAVLDSIEFKEFDYTDKLPGEIRGKTGKLKGDEANAFIQSVGNYVRDFEAETKK
DVKGYIQGLRETLERQNFASDTLQKLQENMQNLHNQVQNKVQSIAQLDAQIQALKGIQ

Specific function: Unknown

COG id: COG0699

COG function: function code R; Predicted GTPases (dynamin-related)

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 88872; Mature: 88872

Theoretical pI: Translated: 5.51; Mature: 5.51

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNAQELIKKSALIEKTLQEQGLQERAKPFMSDNAVIKTEELEKTLKELQDTNRDLKVGII
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE
GRVKAGKSSLLNALIFEGVEVLPKAATPMTASLTILKYAKTLSAQVEFYSQKDISELENE
ECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HERYVREFNRIVEEEVKKQKEKQSLSNRTKEGLKNLGNKFSRNKNPEAAPKENILSDEEI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHCCCCHHHH
LEKARRIAKNTLNEDTKLVSSHDQYEKMKKSGSLNTEKLDPHIQANSLQELNQKLLQFVG
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC
ADGKYMLYTKAVQISLNNPNLKDLEVIDTPGVNDPIASREECTKALLKDCDVVFIVSPSG
CCCCEEEEEEEEEEEECCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCC
QFLTDSDMSLFDRVSHKEGLQEIYFVASQADSAVLSMSEVEKSNQHLPTAFENVQKALSS
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
QLNNIMGKLIENYPNQREIFEKAIKNGVILASGVCFSMYKDFNNQASWERNQKTEEYHNA
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCHHHHHHHH
LRNLKDFYHDAFNSDDKSKESLLFLSNMGAIEERLKKAAKEKEKIMSQKLQDYAQSQAKN
HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LHKFIAQLLQDLEEEKKRVKNADISAIKEQIVVYQNLSNEIETGFDGVYEEFILHFIKNT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RDGLNETLTKAIRTAKTRSREEEEEEHYIERVKQGGLSGSFKRNFLWWADDDAGYDEVER
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHH
TRVTIKAGAVLDHLTEMHERCESALNDSVESFKIVFRKELYAKVFSQLREIISDDLIDEV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFKRSVEAVLDSIEFKEFDYTDKLPGEIRGKTGKLKGDEANAFIQSVGNYVRDFEAETKK
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DVKGYIQGLRETLERQNFASDTLQKLQENMQNLHNQVQNKVQSIAQLDAQIQALKGIQ
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MNAQELIKKSALIEKTLQEQGLQERAKPFMSDNAVIKTEELEKTLKELQDTNRDLKVGII
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE
GRVKAGKSSLLNALIFEGVEVLPKAATPMTASLTILKYAKTLSAQVEFYSQKDISELENE
ECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HERYVREFNRIVEEEVKKQKEKQSLSNRTKEGLKNLGNKFSRNKNPEAAPKENILSDEEI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHCCCCHHHH
LEKARRIAKNTLNEDTKLVSSHDQYEKMKKSGSLNTEKLDPHIQANSLQELNQKLLQFVG
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC
ADGKYMLYTKAVQISLNNPNLKDLEVIDTPGVNDPIASREECTKALLKDCDVVFIVSPSG
CCCCEEEEEEEEEEEECCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCC
QFLTDSDMSLFDRVSHKEGLQEIYFVASQADSAVLSMSEVEKSNQHLPTAFENVQKALSS
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
QLNNIMGKLIENYPNQREIFEKAIKNGVILASGVCFSMYKDFNNQASWERNQKTEEYHNA
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCHHHHHHHH
LRNLKDFYHDAFNSDDKSKESLLFLSNMGAIEERLKKAAKEKEKIMSQKLQDYAQSQAKN
HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LHKFIAQLLQDLEEEKKRVKNADISAIKEQIVVYQNLSNEIETGFDGVYEEFILHFIKNT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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TRVTIKAGAVLDHLTEMHERCESALNDSVESFKIVFRKELYAKVFSQLREIISDDLIDEV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFKRSVEAVLDSIEFKEFDYTDKLPGEIRGKTGKLKGDEANAFIQSVGNYVRDFEAETKK
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DVKGYIQGLRETLERQNFASDTLQKLQENMQNLHNQVQNKVQSIAQLDAQIQALKGIQ
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA