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The map label for this gene is pepF [H]

Identifier: 108562871

GI number: 108562871

Start: 458326

End: 460062

Strand: Reverse

Name: pepF [H]

Synonym: HPAG1_0446

Alternate gene names: 108562871

Gene position: 460062-458326 (Counterclockwise)

Preceding gene: 108562872

Following gene: 108562870

Centisome position: 28.82

GC content: 38.11

Gene sequence:

>1737_bases
ATGAAAGAGCAAGAATGGGATTTGAGTGCTTTATTTGAAAATAAAGAACACGCAGAAGAATTTTTAAAAACCTTACAAAC
AGAAGTGCAAGAATTTGAGAGCGCTTATCAAAATAACCTTAAGAATTTAGATGCTGCAAAATTTGCCAACGCTCTTAAAC
ATTACGAAAATTTGTCAGAAAAGACTTCTAGGGTGATGACTTACGCTCAATTACTTTTTGCTAAGAACACCAAAGAAGCG
AAGTTTTATTCGCAGTGCGAAATGGCTTGCGCGAATATCCAACAGCATCTTTTATTCTTTGAAATTGAATTTAAGAATTT
AGACGCTAAAAAACAGCTCGCTTTCATTAAAAAATGCAAAGACCATGCTTTTTATCTAAACAATCTCATAGAAAGGAAAA
AGCACACCCTAAATTTAGATGAAGAAAAGATCGCTCTAGCCCTTTCACCTGTGGGGGTGGGTGCGTTTAGCCGTCTTTTT
GATGAGCATTTTTCTTCTTTAAAAATCCCTTTTGAAGAGCAAAATTTAAGCGAGGAAGAAATTTTAGCCCTCTTGCACAA
CCCCAAACGCAAGATCCGTAAAAAATCTCAAAAAGCTTTCAGTAAAGCGTTAGAAAAATCCCGCCCTTTGCTCACTTACA
TTTTAAACATGGTGCGTAAAGATTTGCTCATTGAAACTAGGCTAAGAAAATACGATAAAAAAGAGAGTTTCCGCCACATT
GACAACCAGATCTCCCAAGAGAGCGTGGATAGCATGATAGAGATTGTGAACGCTAATTTTTCCTTAGTGCATCGTTACTA
CCATCAAAAAGCGCAAATTTTAGGGCATAAACTCAAAGACTACGATCGCTACGCCCCTTTAAGCGATAAAAATACCACCA
TGACTTACTCTCAAGCTTTAGAAGAAGTGCTTAACACCCTTAAAGCCTTTAGCCCAGAATTTCATAAAATCGCTTCTAAA
GCGATCAAAGAAGGCTGGGTGGATTCACACCCCAAAGACTTTAAGCAAGGCGGGGCTTTTAGCCATGGAGCAGTGCCTAG
CGCTCACCCTTATGTGTTGTTAAACTACACAGGAAATCGCCGAGACGCTTTCACTATCGCTCATGAATTTGGGCATATGA
TCCACCAAGAATTGTCCAAAAAACAAGGCGTATTGAACATGGATACGCCCTTAACCACCGCAGAAACCGCTTCTGTCTTT
TCTGAAATGCTGTTTTTTGAGCATTTGAAAAAAGGGTTAAAACAAGATGAGCTTCTTTTCATGCTGGCCGGCAAATTAGA
AGATATTTTTTCTACCCTTTTTAGGCAAGTGGTGATGACTAATTTTGAAAGAAGAATCCATGAGATCGATGAAGAATTAG
ACACCAAAGATTTTGATCGGATCTGGTTTGAAGAAAATCAAAGAATGTTTGAAAAGAGCGTGAAACTCACTAAAAACTAC
CATTTGTGGTGGAGCTATATCCCCCATTTTATCCATTCGCCTTTTTATTGCTACGCTTATAGTTACGGGCAACTTTTAAC
TTTGGCGCTTTATGGGCTTTATAAAAAAAGCGACGCTAAAGAGTTTGTTAAAACTTACACGGAATTTTTGAGTTTAGGAG
GGTCAAAAAGCCCTAAAGAATTAGTGTCCATGTTTGGCTTTGACATTGATAGCAAAGAATTTTGGGAAATTGGCATGCAA
GAGGTGCGTCATTTGTTAGAAGAATTTGAAAGGTTGCTCGCATGCAAAGAGAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAATGGCGTAAAAACCAAATGATAAGTTTGCTTGTATTGTCAGTGTTATGTTAAAATACAAGCGTATTTTAACTCCAAA
TTGATATAAAAAGGGATTTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGCTTTTAAACAACAAGCATTGCATGGAATACTTGCAATTTCTGTCCAAAAACCATTTGAGTTTCAACCTTTTGTGCGAA
AGAGATGCGATTGATTTTTC

Product: oligoendopeptidase F

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 578; Mature: 578

Protein sequence:

>578_residues
MKEQEWDLSALFENKEHAEEFLKTLQTEVQEFESAYQNNLKNLDAAKFANALKHYENLSEKTSRVMTYAQLLFAKNTKEA
KFYSQCEMACANIQQHLLFFEIEFKNLDAKKQLAFIKKCKDHAFYLNNLIERKKHTLNLDEEKIALALSPVGVGAFSRLF
DEHFSSLKIPFEEQNLSEEEILALLHNPKRKIRKKSQKAFSKALEKSRPLLTYILNMVRKDLLIETRLRKYDKKESFRHI
DNQISQESVDSMIEIVNANFSLVHRYYHQKAQILGHKLKDYDRYAPLSDKNTTMTYSQALEEVLNTLKAFSPEFHKIASK
AIKEGWVDSHPKDFKQGGAFSHGAVPSAHPYVLLNYTGNRRDAFTIAHEFGHMIHQELSKKQGVLNMDTPLTTAETASVF
SEMLFFEHLKKGLKQDELLFMLAGKLEDIFSTLFRQVVMTNFERRIHEIDEELDTKDFDRIWFEENQRMFEKSVKLTKNY
HLWWSYIPHFIHSPFYCYAYSYGQLLTLALYGLYKKSDAKEFVKTYTEFLSLGGSKSPKELVSMFGFDIDSKEFWEIGMQ
EVRHLLEEFERLLACKEN

Sequences:

>Translated_578_residues
MKEQEWDLSALFENKEHAEEFLKTLQTEVQEFESAYQNNLKNLDAAKFANALKHYENLSEKTSRVMTYAQLLFAKNTKEA
KFYSQCEMACANIQQHLLFFEIEFKNLDAKKQLAFIKKCKDHAFYLNNLIERKKHTLNLDEEKIALALSPVGVGAFSRLF
DEHFSSLKIPFEEQNLSEEEILALLHNPKRKIRKKSQKAFSKALEKSRPLLTYILNMVRKDLLIETRLRKYDKKESFRHI
DNQISQESVDSMIEIVNANFSLVHRYYHQKAQILGHKLKDYDRYAPLSDKNTTMTYSQALEEVLNTLKAFSPEFHKIASK
AIKEGWVDSHPKDFKQGGAFSHGAVPSAHPYVLLNYTGNRRDAFTIAHEFGHMIHQELSKKQGVLNMDTPLTTAETASVF
SEMLFFEHLKKGLKQDELLFMLAGKLEDIFSTLFRQVVMTNFERRIHEIDEELDTKDFDRIWFEENQRMFEKSVKLTKNY
HLWWSYIPHFIHSPFYCYAYSYGQLLTLALYGLYKKSDAKEFVKTYTEFLSLGGSKSPKELVSMFGFDIDSKEFWEIGMQ
EVRHLLEEFERLLACKEN
>Mature_578_residues
MKEQEWDLSALFENKEHAEEFLKTLQTEVQEFESAYQNNLKNLDAAKFANALKHYENLSEKTSRVMTYAQLLFAKNTKEA
KFYSQCEMACANIQQHLLFFEIEFKNLDAKKQLAFIKKCKDHAFYLNNLIERKKHTLNLDEEKIALALSPVGVGAFSRLF
DEHFSSLKIPFEEQNLSEEEILALLHNPKRKIRKKSQKAFSKALEKSRPLLTYILNMVRKDLLIETRLRKYDKKESFRHI
DNQISQESVDSMIEIVNANFSLVHRYYHQKAQILGHKLKDYDRYAPLSDKNTTMTYSQALEEVLNTLKAFSPEFHKIASK
AIKEGWVDSHPKDFKQGGAFSHGAVPSAHPYVLLNYTGNRRDAFTIAHEFGHMIHQELSKKQGVLNMDTPLTTAETASVF
SEMLFFEHLKKGLKQDELLFMLAGKLEDIFSTLFRQVVMTNFERRIHEIDEELDTKDFDRIWFEENQRMFEKSVKLTKNY
HLWWSYIPHFIHSPFYCYAYSYGQLLTLALYGLYKKSDAKEFVKTYTEFLSLGGSKSPKELVSMFGFDIDSKEFWEIGMQ
EVRHLLEEFERLLACKEN

Specific function: Unknown

COG id: COG1164

COG function: function code E; Oligoendopeptidase F

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the peptidase M3B family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001567
- InterPro:   IPR004438
- InterPro:   IPR013647 [H]

Pfam domain/function: PF01432 Peptidase_M3; PF08439 Peptidase_M3_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 67853; Mature: 67853

Theoretical pI: Translated: 7.29; Mature: 7.29

Prosite motif: PS00142 ZINC_PROTEASE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKEQEWDLSALFENKEHAEEFLKTLQTEVQEFESAYQNNLKNLDAAKFANALKHYENLSE
CCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KTSRVMTYAQLLFAKNTKEAKFYSQCEMACANIQQHLLFFEIEFKNLDAKKQLAFIKKCK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHH
DHAFYLNNLIERKKHTLNLDEEKIALALSPVGVGAFSRLFDEHFSSLKIPFEEQNLSEEE
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCHHH
ILALLHNPKRKIRKKSQKAFSKALEKSRPLLTYILNMVRKDLLIETRLRKYDKKESFRHI
HHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DNQISQESVDSMIEIVNANFSLVHRYYHQKAQILGHKLKDYDRYAPLSDKNTTMTYSQAL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHH
EEVLNTLKAFSPEFHKIASKAIKEGWVDSHPKDFKQGGAFSHGAVPSAHPYVLLNYTGNR
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCC
RDAFTIAHEFGHMIHQELSKKQGVLNMDTPLTTAETASVFSEMLFFEHLKKGLKQDELLF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
MLAGKLEDIFSTLFRQVVMTNFERRIHEIDEELDTKDFDRIWFEENQRMFEKSVKLTKNY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
HLWWSYIPHFIHSPFYCYAYSYGQLLTLALYGLYKKSDAKEFVKTYTEFLSLGGSKSPKE
HHHHHHHHHHHCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
LVSMFGFDIDSKEFWEIGMQEVRHLLEEFERLLACKEN
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MKEQEWDLSALFENKEHAEEFLKTLQTEVQEFESAYQNNLKNLDAAKFANALKHYENLSE
CCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KTSRVMTYAQLLFAKNTKEAKFYSQCEMACANIQQHLLFFEIEFKNLDAKKQLAFIKKCK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHH
DHAFYLNNLIERKKHTLNLDEEKIALALSPVGVGAFSRLFDEHFSSLKIPFEEQNLSEEE
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCHHH
ILALLHNPKRKIRKKSQKAFSKALEKSRPLLTYILNMVRKDLLIETRLRKYDKKESFRHI
HHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DNQISQESVDSMIEIVNANFSLVHRYYHQKAQILGHKLKDYDRYAPLSDKNTTMTYSQAL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHH
EEVLNTLKAFSPEFHKIASKAIKEGWVDSHPKDFKQGGAFSHGAVPSAHPYVLLNYTGNR
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCC
RDAFTIAHEFGHMIHQELSKKQGVLNMDTPLTTAETASVFSEMLFFEHLKKGLKQDELLF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
MLAGKLEDIFSTLFRQVVMTNFERRIHEIDEELDTKDFDRIWFEENQRMFEKSVKLTKNY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
HLWWSYIPHFIHSPFYCYAYSYGQLLTLALYGLYKKSDAKEFVKTYTEFLSLGGSKSPKE
HHHHHHHHHHHCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
LVSMFGFDIDSKEFWEIGMQEVRHLLEEFERLLACKEN
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9403685 [H]