| Definition | Candidatus Phytoplasma australiense, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010544 |
| Length | 879,959 |
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The map label for this gene is 197294333
Identifier: 197294333
GI number: 197294333
Start: 239355
End: 242849
Strand: Direct
Name: 197294333
Synonym: PAa_0204
Alternate gene names: NA
Gene position: 239355-242849 (Clockwise)
Preceding gene: 197294332
Following gene: 197294334
Centisome position: 27.2
GC content: 28.47
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TGCAATTTTTTTGCATTACCAGATTGGATTATGATACAATGATGATAAGTTATAAAAATAAAAAAGGAAGTTAATTATAG GATGGAGTTATTTAAAGTAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1164; Mature: 1163
Protein sequence:
>1164_residues MAKKIIPIKKTKQKQPIKKTIKQVKTKLPTKKTKKIIPTPKKTVSKIKKIKKPSKTIIKKQIQPTKIIVETKKENWFVKL IKSIVKITLILLPFILIGGGIWLVISKFFPELAAKFGGVVDKCWQFIKHICHNLDDKTKKALENAGIDPEYSAIASKVLW VGGGCLLAATCCLIPGIGTFLGVSVLISTIAYVATITLTEKTNQEPPKNASPPQQVENKVDNTNKQIEPDKLTENNRDSE TLETQKKKKTTKSTELNDETLTPQPTLKQPIHKQKEINKEEYNKSLLNPDMQKQFEELGTVEKEREAQLLQERNYFEANL QAQQLEMLNIKNQKDNLEKELAEQKNLSDAEKQQLTKQIEDINTNLASRNEELNNLEKEQEVQAELRQELYDVINKDKEN LEQKTNQLEEQKNLSDAEKQQLTKQIEDINTNLTSKNEELNNLNQKLEEEAKKQTELNDVIQTQEKKLKQIQISSEEKQQ ELNNKIKDIQTTLDKQAKVTEDKNKELEQMQSQKIQLENQLASNKQDLQNLQKEIFNKEAKLEDKEKELEEQKNLSDAEK QQLTSEINNLKNDINQEKVNYQAQVSLKEEEIKQLQQTESDLKQQLTKTQAETMSLREQHVKTLEEIQRQITNYKKTVAE LENETQKLKDQIAKNSENAKQLQKELKTKQAKLDEINKKIGTLTANKDNLEKTIKDLENDQTVTNYKKIKNRTDWGVRSS SKEIQFPRFWNDKPFTYKIVPKIDFYETGFTQNARGYQAYREEIDKNTIQGESIELSPGKYYCEPSINMRNIPYSTHGAN LIFSEPTSETEPPQNLFKLDEAKENLKNISQELSNYETNLKNAQLEYNQLLENQTPDDSLQQELNNKANHIKTLKNEMQQ LEIKEQSFRSEIDTLKLENKNLKEKYTNDLTKIQQELDATKTENEQLEKEMQEIQAELIKNGNADDALVKQLNHKEAQIK ELKGKINTLEANETKLQTIIKQKDEEIKQLRQKVQEQAEQIIKLTTEIENNIEIFKQQAMKIQQLEGAIAGLEGASGSLG SDNKELLHEINKLKDQLEAEKDAHKATKERLEEKIVTLNGKNLNLTNKSTELKEKEKHWEAAVKNVGTAINIGVFTKAGV MTGAAWGSAAGPIGTIAGGVAGGVIAGAAAVASKWDVVKTWFGR
Sequences:
>Translated_1164_residues MAKKIIPIKKTKQKQPIKKTIKQVKTKLPTKKTKKIIPTPKKTVSKIKKIKKPSKTIIKKQIQPTKIIVETKKENWFVKL IKSIVKITLILLPFILIGGGIWLVISKFFPELAAKFGGVVDKCWQFIKHICHNLDDKTKKALENAGIDPEYSAIASKVLW VGGGCLLAATCCLIPGIGTFLGVSVLISTIAYVATITLTEKTNQEPPKNASPPQQVENKVDNTNKQIEPDKLTENNRDSE TLETQKKKKTTKSTELNDETLTPQPTLKQPIHKQKEINKEEYNKSLLNPDMQKQFEELGTVEKEREAQLLQERNYFEANL QAQQLEMLNIKNQKDNLEKELAEQKNLSDAEKQQLTKQIEDINTNLASRNEELNNLEKEQEVQAELRQELYDVINKDKEN LEQKTNQLEEQKNLSDAEKQQLTKQIEDINTNLTSKNEELNNLNQKLEEEAKKQTELNDVIQTQEKKLKQIQISSEEKQQ ELNNKIKDIQTTLDKQAKVTEDKNKELEQMQSQKIQLENQLASNKQDLQNLQKEIFNKEAKLEDKEKELEEQKNLSDAEK QQLTSEINNLKNDINQEKVNYQAQVSLKEEEIKQLQQTESDLKQQLTKTQAETMSLREQHVKTLEEIQRQITNYKKTVAE LENETQKLKDQIAKNSENAKQLQKELKTKQAKLDEINKKIGTLTANKDNLEKTIKDLENDQTVTNYKKIKNRTDWGVRSS SKEIQFPRFWNDKPFTYKIVPKIDFYETGFTQNARGYQAYREEIDKNTIQGESIELSPGKYYCEPSINMRNIPYSTHGAN LIFSEPTSETEPPQNLFKLDEAKENLKNISQELSNYETNLKNAQLEYNQLLENQTPDDSLQQELNNKANHIKTLKNEMQQ LEIKEQSFRSEIDTLKLENKNLKEKYTNDLTKIQQELDATKTENEQLEKEMQEIQAELIKNGNADDALVKQLNHKEAQIK ELKGKINTLEANETKLQTIIKQKDEEIKQLRQKVQEQAEQIIKLTTEIENNIEIFKQQAMKIQQLEGAIAGLEGASGSLG SDNKELLHEINKLKDQLEAEKDAHKATKERLEEKIVTLNGKNLNLTNKSTELKEKEKHWEAAVKNVGTAINIGVFTKAGV MTGAAWGSAAGPIGTIAGGVAGGVIAGAAAVASKWDVVKTWFGR >Mature_1163_residues AKKIIPIKKTKQKQPIKKTIKQVKTKLPTKKTKKIIPTPKKTVSKIKKIKKPSKTIIKKQIQPTKIIVETKKENWFVKLI KSIVKITLILLPFILIGGGIWLVISKFFPELAAKFGGVVDKCWQFIKHICHNLDDKTKKALENAGIDPEYSAIASKVLWV GGGCLLAATCCLIPGIGTFLGVSVLISTIAYVATITLTEKTNQEPPKNASPPQQVENKVDNTNKQIEPDKLTENNRDSET LETQKKKKTTKSTELNDETLTPQPTLKQPIHKQKEINKEEYNKSLLNPDMQKQFEELGTVEKEREAQLLQERNYFEANLQ AQQLEMLNIKNQKDNLEKELAEQKNLSDAEKQQLTKQIEDINTNLASRNEELNNLEKEQEVQAELRQELYDVINKDKENL EQKTNQLEEQKNLSDAEKQQLTKQIEDINTNLTSKNEELNNLNQKLEEEAKKQTELNDVIQTQEKKLKQIQISSEEKQQE LNNKIKDIQTTLDKQAKVTEDKNKELEQMQSQKIQLENQLASNKQDLQNLQKEIFNKEAKLEDKEKELEEQKNLSDAEKQ QLTSEINNLKNDINQEKVNYQAQVSLKEEEIKQLQQTESDLKQQLTKTQAETMSLREQHVKTLEEIQRQITNYKKTVAEL ENETQKLKDQIAKNSENAKQLQKELKTKQAKLDEINKKIGTLTANKDNLEKTIKDLENDQTVTNYKKIKNRTDWGVRSSS KEIQFPRFWNDKPFTYKIVPKIDFYETGFTQNARGYQAYREEIDKNTIQGESIELSPGKYYCEPSINMRNIPYSTHGANL IFSEPTSETEPPQNLFKLDEAKENLKNISQELSNYETNLKNAQLEYNQLLENQTPDDSLQQELNNKANHIKTLKNEMQQL EIKEQSFRSEIDTLKLENKNLKEKYTNDLTKIQQELDATKTENEQLEKEMQEIQAELIKNGNADDALVKQLNHKEAQIKE LKGKINTLEANETKLQTIIKQKDEEIKQLRQKVQEQAEQIIKLTTEIENNIEIFKQQAMKIQQLEGAIAGLEGASGSLGS DNKELLHEINKLKDQLEAEKDAHKATKERLEEKIVTLNGKNLNLTNKSTELKEKEKHWEAAVKNVGTAINIGVFTKAGVM TGAAWGSAAGPIGTIAGGVAGGVIAGAAAVASKWDVVKTWFGR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 133265; Mature: 133134
Theoretical pI: Translated: 7.83; Mature: 7.83
Prosite motif: PS50010 DH_2
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 0.9 %Met (Translated Protein) 1.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 0.8 %Met (Mature Protein) 1.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAKKIIPIKKTKQKQPIKKTIKQVKTKLPTKKTKKIIPTPKKTVSKIKKIKKPSKTIIKK CCCCCCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH QIQPTKIIVETKKENWFVKLIKSIVKITLILLPFILIGGGIWLVISKFFPELAAKFGGVV CCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHH DKCWQFIKHICHNLDDKTKKALENAGIDPEYSAIASKVLWVGGGCLLAATCCLIPGIGTF HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHH LGVSVLISTIAYVATITLTEKTNQEPPKNASPPQQVENKVDNTNKQIEPDKLTENNRDSE HHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHCCCCCCCHH TLETQKKKKTTKSTELNDETLTPQPTLKQPIHKQKEINKEEYNKSLLNPDMQKQFEELGT HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCC VEKEREAQLLQERNYFEANLQAQQLEMLNIKNQKDNLEKELAEQKNLSDAEKQQLTKQIE HHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH DINTNLASRNEELNNLEKEQEVQAELRQELYDVINKDKENLEQKTNQLEEQKNLSDAEKQ HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH QLTKQIEDINTNLTSKNEELNNLNQKLEEEAKKQTELNDVIQTQEKKLKQIQISSEEKQQ HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH ELNNKIKDIQTTLDKQAKVTEDKNKELEQMQSQKIQLENQLASNKQDLQNLQKEIFNKEA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHH KLEDKEKELEEQKNLSDAEKQQLTSEINNLKNDINQEKVNYQAQVSLKEEEIKQLQQTES CCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEECCCHHHHHHHHHHHH DLKQQLTKTQAETMSLREQHVKTLEEIQRQITNYKKTVAELENETQKLKDQIAKNSENAK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH QLQKELKTKQAKLDEINKKIGTLTANKDNLEKTIKDLENDQTVTNYKKIKNRTDWGVRSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCC SKEIQFPRFWNDKPFTYKIVPKIDFYETGFTQNARGYQAYREEIDKNTIQGESIELSPGK CCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCC YYCEPSINMRNIPYSTHGANLIFSEPTSETEPPQNLFKLDEAKENLKNISQELSNYETNL EEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KNAQLEYNQLLENQTPDDSLQQELNNKANHIKTLKNEMQQLEIKEQSFRSEIDTLKLENK HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC NLKEKYTNDLTKIQQELDATKTENEQLEKEMQEIQAELIKNGNADDALVKQLNHKEAQIK CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH ELKGKINTLEANETKLQTIIKQKDEEIKQLRQKVQEQAEQIIKLTTEIENNIEIFKQQAM HHHCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KIQQLEGAIAGLEGASGSLGSDNKELLHEINKLKDQLEAEKDAHKATKERLEEKIVTLNG HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECC KNLNLTNKSTELKEKEKHWEAAVKNVGTAINIGVFTKAGVMTGAAWGSAAGPIGTIAGGV CEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH AGGVIAGAAAVASKWDVVKTWFGR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure AKKIIPIKKTKQKQPIKKTIKQVKTKLPTKKTKKIIPTPKKTVSKIKKIKKPSKTIIKK CCCCCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH QIQPTKIIVETKKENWFVKLIKSIVKITLILLPFILIGGGIWLVISKFFPELAAKFGGVV CCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHH DKCWQFIKHICHNLDDKTKKALENAGIDPEYSAIASKVLWVGGGCLLAATCCLIPGIGTF HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHH LGVSVLISTIAYVATITLTEKTNQEPPKNASPPQQVENKVDNTNKQIEPDKLTENNRDSE HHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHCCCCCCCHH TLETQKKKKTTKSTELNDETLTPQPTLKQPIHKQKEINKEEYNKSLLNPDMQKQFEELGT HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCC VEKEREAQLLQERNYFEANLQAQQLEMLNIKNQKDNLEKELAEQKNLSDAEKQQLTKQIE HHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH DINTNLASRNEELNNLEKEQEVQAELRQELYDVINKDKENLEQKTNQLEEQKNLSDAEKQ HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH QLTKQIEDINTNLTSKNEELNNLNQKLEEEAKKQTELNDVIQTQEKKLKQIQISSEEKQQ HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH ELNNKIKDIQTTLDKQAKVTEDKNKELEQMQSQKIQLENQLASNKQDLQNLQKEIFNKEA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHH KLEDKEKELEEQKNLSDAEKQQLTSEINNLKNDINQEKVNYQAQVSLKEEEIKQLQQTES CCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEECCCHHHHHHHHHHHH DLKQQLTKTQAETMSLREQHVKTLEEIQRQITNYKKTVAELENETQKLKDQIAKNSENAK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH QLQKELKTKQAKLDEINKKIGTLTANKDNLEKTIKDLENDQTVTNYKKIKNRTDWGVRSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCC SKEIQFPRFWNDKPFTYKIVPKIDFYETGFTQNARGYQAYREEIDKNTIQGESIELSPGK CCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCC YYCEPSINMRNIPYSTHGANLIFSEPTSETEPPQNLFKLDEAKENLKNISQELSNYETNL EEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KNAQLEYNQLLENQTPDDSLQQELNNKANHIKTLKNEMQQLEIKEQSFRSEIDTLKLENK HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC NLKEKYTNDLTKIQQELDATKTENEQLEKEMQEIQAELIKNGNADDALVKQLNHKEAQIK CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH ELKGKINTLEANETKLQTIIKQKDEEIKQLRQKVQEQAEQIIKLTTEIENNIEIFKQQAM HHHCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KIQQLEGAIAGLEGASGSLGSDNKELLHEINKLKDQLEAEKDAHKATKERLEEKIVTLNG HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECC KNLNLTNKSTELKEKEKHWEAAVKNVGTAINIGVFTKAGVMTGAAWGSAAGPIGTIAGGV CEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH AGGVIAGAAAVASKWDVVKTWFGR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA