Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is ydaO [H]

Identifier: 134301218

GI number: 134301218

Start: 74765

End: 76639

Strand: Direct

Name: ydaO [H]

Synonym: FTW_0067

Alternate gene names: 134301218

Gene position: 74765-76639 (Clockwise)

Preceding gene: 134301217

Following gene: 134301220

Centisome position: 3.94

GC content: 33.07

Gene sequence:

>1875_bases
ATGAAGATAAAAAACCTGATATTTGGTTCACCAATTCCTAATGCAAAACAGCAAGAACAAAAAATAGGTTTATTTGCCGG
TTTTGCGATACTTTCTTCAAATGCACTATCTTCTGTATCATATGCAACAGGAGAGATATTTATAGTCTTGGCAACTGCTG
GAGCAGCAGCTGTTATGCAATACTCGATCGAAGTATCAATAATGGTGATATTACTAATATTATTGATGGGTTTTTCATAT
GCACAAGTAATACGTGCTCATCCAGAAGGCGGTGGTTCTTACTCAATAGTTAAAACACATTTTAATGAAAAGCTTTTATT
GTTAACTTCGGCATCTCTTATAATTGATTATATTCTTACGGTAGCGGTTTCTGTTTCTACAGCAGCTGTAGCAATTAGTT
CAGCTTTGCCTGTTTTAGATCATTATAGTGTTAAGCTTGCTTTAGGTCTTTTGGTACTTTTAATGATTATAAATCTTCGT
GGTGTTAAATCTACTGCAAAAATTTTTATCTGGCCAACTTATATGTTTATTGTTTCAATTATTATCATGATAATTGTAGG
GATATATCAATATAATCATAACTCTTTGCATACATTTACATATACGCAAAATCAACTTGATCACATGCAAGCTTCAATGG
GTGTTTTAACTATAACTCTTTTGCTGCGTGCTTTTTCATCAGGTAGTGCTGCGTTAACAGGTATTGAATCATACGCAAAT
GGGGTTTCAGCTTACAAGTCTCCAACTTTAGCTAAATCAATAATTGGTTTGTTAACTATGACATTCTTATCAATACTAAT
GTTTGCTGGAGTTACTTTTATTGCTGCAAAAACAAGGATATTGCCAGATTTTTCAGAAAGTGTCCTATCACAAGTTGCTC
ATCAAGTTTTAGGTAATGGCTTTTTATATTATTTCTTGCAAGCATCTACTTGTTTGATTCTACTTATGGCGGCTAACACT
TGTTTTACTGGATTTCCTATTTTAGCCTCGATTATGAGTAAGGATAACTACCTTCCCGAACAGCTGCAGCGTGTCGGTGA
TAGATTTGCATTTAGAAATGGTATTATAATGTTGACTATTTTATCAGCGATCTTAGTCATAATATTTGATGCTAAAGTTA
GTCTTCTAATACCATTATATGCTTTTGGCGTTTTTATTGCATTTACGCTTTGTCAAGCAGGATTAGTTAAGTACTGGTAT
AGAAATAAACGTAAGTATAAAAGTTGGGGAATTAGAGCATTTATAAATGCTTTTGGTTGTGTTGCTACATTTGTAGTATT
AATTACAATCGTCGAGAGTAAATTTTTTGAAGGTGTTTGGATTGTCATAATTGCGATAGCGATTATCATGTATGGTTTAT
ATGCGATAAAAACTCATTATATTAGAAGAGAGCATAACCTGGCTCTAAGTGTTGATGAGGCTGTTGTAAACGCTTGTATA
CATGAAAATCTCAAACCAAAAATAGTTGTTTTAGTTTCACGTATTCACCGTGGTACAATAGAGGCACTAAGATTAGCAAG
AAATCTATCTGATGATATCACTCCAGTTTTTGTTTCGGCAAACCAAAAGAAAATTGAAAAGATTAAGTCTGAGTGGAAAA
ATTTAGCTTTCAAAGAAAAACTCTTGATAATGCGACCAGTATATAACTCGTTTATAACTCCAGTATTGCAAATTTTGCAT
AAAAATGATTTAAGAGATCCTGAGCGAGGCTATTCTGTAGTGATAATTCCAGAAGTTGTAAATACAAAATGGTGGCATTT
TTTGTTACATAATCAAAATTCGCGCATGGTTAAATTAGCTATAGCAGCAATGGATAAAAAAGATGATAAAACTGCTACTA
GAGTGGTGATTTCAGTTCCATACAAAGCAGAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCAAGGCAATTACTACACAATATCAGCAGCTATGAAAAAAGGAACAGATGAGTTGGCTAAAAAACTTAATGAGTTTTTAC
AAAAGCAACAGTAAGTATAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGAAAGATTTTTTTAGGAATTATTGGCTGGTATCAAGAGACTTTTGGAGATCTAAAGCTGGTTTAGTAGCTTTGCTGAT
CTTAGTTGTGTGCGTATTGT

Product: amino acid transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 624; Mature: 624

Protein sequence:

>624_residues
MKIKNLIFGSPIPNAKQQEQKIGLFAGFAILSSNALSSVSYATGEIFIVLATAGAAAVMQYSIEVSIMVILLILLMGFSY
AQVIRAHPEGGGSYSIVKTHFNEKLLLLTSASLIIDYILTVAVSVSTAAVAISSALPVLDHYSVKLALGLLVLLMIINLR
GVKSTAKIFIWPTYMFIVSIIIMIIVGIYQYNHNSLHTFTYTQNQLDHMQASMGVLTITLLLRAFSSGSAALTGIESYAN
GVSAYKSPTLAKSIIGLLTMTFLSILMFAGVTFIAAKTRILPDFSESVLSQVAHQVLGNGFLYYFLQASTCLILLMAANT
CFTGFPILASIMSKDNYLPEQLQRVGDRFAFRNGIIMLTILSAILVIIFDAKVSLLIPLYAFGVFIAFTLCQAGLVKYWY
RNKRKYKSWGIRAFINAFGCVATFVVLITIVESKFFEGVWIVIIAIAIIMYGLYAIKTHYIRREHNLALSVDEAVVNACI
HENLKPKIVVLVSRIHRGTIEALRLARNLSDDITPVFVSANQKKIEKIKSEWKNLAFKEKLLIMRPVYNSFITPVLQILH
KNDLRDPERGYSVVIIPEVVNTKWWHFLLHNQNSRMVKLAIAAMDKKDDKTATRVVISVPYKAE

Sequences:

>Translated_624_residues
MKIKNLIFGSPIPNAKQQEQKIGLFAGFAILSSNALSSVSYATGEIFIVLATAGAAAVMQYSIEVSIMVILLILLMGFSY
AQVIRAHPEGGGSYSIVKTHFNEKLLLLTSASLIIDYILTVAVSVSTAAVAISSALPVLDHYSVKLALGLLVLLMIINLR
GVKSTAKIFIWPTYMFIVSIIIMIIVGIYQYNHNSLHTFTYTQNQLDHMQASMGVLTITLLLRAFSSGSAALTGIESYAN
GVSAYKSPTLAKSIIGLLTMTFLSILMFAGVTFIAAKTRILPDFSESVLSQVAHQVLGNGFLYYFLQASTCLILLMAANT
CFTGFPILASIMSKDNYLPEQLQRVGDRFAFRNGIIMLTILSAILVIIFDAKVSLLIPLYAFGVFIAFTLCQAGLVKYWY
RNKRKYKSWGIRAFINAFGCVATFVVLITIVESKFFEGVWIVIIAIAIIMYGLYAIKTHYIRREHNLALSVDEAVVNACI
HENLKPKIVVLVSRIHRGTIEALRLARNLSDDITPVFVSANQKKIEKIKSEWKNLAFKEKLLIMRPVYNSFITPVLQILH
KNDLRDPERGYSVVIIPEVVNTKWWHFLLHNQNSRMVKLAIAAMDKKDDKTATRVVISVPYKAE
>Mature_624_residues
MKIKNLIFGSPIPNAKQQEQKIGLFAGFAILSSNALSSVSYATGEIFIVLATAGAAAVMQYSIEVSIMVILLILLMGFSY
AQVIRAHPEGGGSYSIVKTHFNEKLLLLTSASLIIDYILTVAVSVSTAAVAISSALPVLDHYSVKLALGLLVLLMIINLR
GVKSTAKIFIWPTYMFIVSIIIMIIVGIYQYNHNSLHTFTYTQNQLDHMQASMGVLTITLLLRAFSSGSAALTGIESYAN
GVSAYKSPTLAKSIIGLLTMTFLSILMFAGVTFIAAKTRILPDFSESVLSQVAHQVLGNGFLYYFLQASTCLILLMAANT
CFTGFPILASIMSKDNYLPEQLQRVGDRFAFRNGIIMLTILSAILVIIFDAKVSLLIPLYAFGVFIAFTLCQAGLVKYWY
RNKRKYKSWGIRAFINAFGCVATFVVLITIVESKFFEGVWIVIIAIAIIMYGLYAIKTHYIRREHNLALSVDEAVVNACI
HENLKPKIVVLVSRIHRGTIEALRLARNLSDDITPVFVSANQKKIEKIKSEWKNLAFKEKLLIMRPVYNSFITPVLQILH
KNDLRDPERGYSVVIIPEVVNTKWWHFLLHNQNSRMVKLAIAAMDKKDDKTATRVVISVPYKAE

Specific function: Probable Amino-Acid Or Metabolite Transport Protein. [C]

COG id: COG0531

COG function: function code E; Amino acid transporters

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the amino acid-polyamine-organocation (APC) superfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002293 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69311; Mature: 69311

Theoretical pI: Translated: 10.01; Mature: 10.01

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
2.9 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKIKNLIFGSPIPNAKQQEQKIGLFAGFAILSSNALSSVSYATGEIFIVLATAGAAAVMQ
CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCEEEEEEECCCHHHHHH
YSIEVSIMVILLILLMGFSYAQVIRAHPEGGGSYSIVKTHFNEKLLLLTSASLIIDYILT
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEHHHHHHHHHHHH
VAVSVSTAAVAISSALPVLDHYSVKLALGLLVLLMIINLRGVKSTAKIFIWPTYMFIVSI
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHH
IIMIIVGIYQYNHNSLHTFTYTQNQLDHMQASMGVLTITLLLRAFSSGSAALTGIESYAN
HHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHC
GVSAYKSPTLAKSIIGLLTMTFLSILMFAGVTFIAAKTRILPDFSESVLSQVAHQVLGNG
CHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
FLYYFLQASTCLILLMAANTCFTGFPILASIMSKDNYLPEQLQRVGDRFAFRNGIIMLTI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
LSAILVIIFDAKVSLLIPLYAFGVFIAFTLCQAGLVKYWYRNKRKYKSWGIRAFINAFGC
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
VATFVVLITIVESKFFEGVWIVIIAIAIIMYGLYAIKTHYIRREHNLALSVDEAVVNACI
HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHH
HENLKPKIVVLVSRIHRGTIEALRLARNLSDDITPVFVSANQKKIEKIKSEWKNLAFKEK
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLIMRPVYNSFITPVLQILHKNDLRDPERGYSVVIIPEVVNTKWWHFLLHNQNSRMVKLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCEEEEECHHHCCCEEEEEEECCCCCEEEEE
IAAMDKKDDKTATRVVISVPYKAE
EEHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKIKNLIFGSPIPNAKQQEQKIGLFAGFAILSSNALSSVSYATGEIFIVLATAGAAAVMQ
CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCEEEEEEECCCHHHHHH
YSIEVSIMVILLILLMGFSYAQVIRAHPEGGGSYSIVKTHFNEKLLLLTSASLIIDYILT
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEHHHHHHHHHHHH
VAVSVSTAAVAISSALPVLDHYSVKLALGLLVLLMIINLRGVKSTAKIFIWPTYMFIVSI
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHH
IIMIIVGIYQYNHNSLHTFTYTQNQLDHMQASMGVLTITLLLRAFSSGSAALTGIESYAN
HHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHC
GVSAYKSPTLAKSIIGLLTMTFLSILMFAGVTFIAAKTRILPDFSESVLSQVAHQVLGNG
CHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
FLYYFLQASTCLILLMAANTCFTGFPILASIMSKDNYLPEQLQRVGDRFAFRNGIIMLTI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
LSAILVIIFDAKVSLLIPLYAFGVFIAFTLCQAGLVKYWYRNKRKYKSWGIRAFINAFGC
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
VATFVVLITIVESKFFEGVWIVIIAIAIIMYGLYAIKTHYIRREHNLALSVDEAVVNACI
HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHH
HENLKPKIVVLVSRIHRGTIEALRLARNLSDDITPVFVSANQKKIEKIKSEWKNLAFKEK
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLIMRPVYNSFITPVLQILHKNDLRDPERGYSVVIIPEVVNTKWWHFLLHNQNSRMVKLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCEEEEECHHHCCCEEEEEEECCCCCEEEEE
IAAMDKKDDKTATRVVISVPYKAE
EEHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]