>ref|NC_013316.1|:9450-9857 anti-sigma-B factor (serine-protein kinase) [Clostridium difficile R20291]
TTGGCTTGTGAGACTATAAAGATGGAAATTACTACAAATCCAGATTATGTTAGTATAATAAGATTAACAG
CATCTGGAATTGCCAATAAGATGGGTTTTCCAATAGATGATATAGAAGATATAAAGGTAGCAGTATCTGA
AGCATGTACAAATGCAATAAAACACAGTAAAGATGATGTGTTTAATATAGTATTTAATATTTTAGATAAT
GCAATTAATATAGAAATTCAAGATAATGGAAAAGGATATGATGTTAGCTCAATAAGTACACCAGATTTAG
AGAATCCAAAAGAGAGTGGTCTTGGATTGTTTATAATTAAAACTTTAATGGATGATGTAGATATTGAATC
AGAACATAATCAAGGGACAAAAATAAAAATGACTAAATATTTAGGAGTTGATATTTAA
>ref|NC_013316.1|:9857-10630 RNA polymerase sigma-B factor [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATGTAGCTAATGCTACACATTACCTAAATATGGATACAAAAGAGCTATTTAATTTATATAATA
AAAATAAAAATGTAGACATTAGAAATATTCTTATTGAAAGACATCTGTATTTAGCAAGATTGTTAGCTAA
GAAGTATATAAACAAAGGTGTTGATTTTGAAGATATATATCAAGTTGCTTCATTGGCATTAATTTATGCT
ATTGATAGATATGATGTTGAGAAAGGATTTGAGTTCTCCAGCTTTGCGACACCAACTATAGTAGGAGAAA
TAAAAAAGTATTTTAGAGATAAGGTATGGACACTTAGAGTCCCAAGAAGAATACAGGAATTAAGCAAAAA
GATAAGTGATGCGAAGATTAAATTAGAACAAGAAAATAAGAAGCATCCAAAGGTAAAAGATATAGCTGAT
TATATAGGCGTTAGTGAAGAAGATGTTTTAGAGGCTATGGAGGCTTCTTATGGATATCAACCAATGTCTT
TGGATTCATCAAGTAATGATGATTCAGAGGATAAAGATATAACTCTTATTGATAAGATTGGAAAAGAAGA
AGGTAACTTTGGAAGTATAGAGTATGAAGATTTTATTAATAAGTTTATTGAAACTTTAAATGAATTAGAA
GTTAAAATTTTTAAAGATAGATTTTTCTTTGATAAAACACAATCTAGTATAGCTAAAGAACTAGGGATAT
CACAGATGACTGTTTCTAGACTAGAGAAAAAGGTAGTAGAGAAGCTGAAAAAAGAATATGAAAAAAATTT
ATAA
>ref|NC_013316.1|:15853-16362 putative small-molecule-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTCTGATGAAAGAAGAAGCAAATTAATAGATATTTTAAAAGAATCTAAGTGCCCTGTAAAAGGTG
GAATGCTAGCTGAGATATTAAATGTAAGTAGGCAAGTAATAGTACAAGATATAGCCCTTATAAGAGCTAG
AGGATTTGAAATAATAGCTACACCTCAAGGATATATAATATATAATCAACCATATTTTACAAAGCAAATA
AAATGTAAGAATCACAGGAATTCTAAAGAAATTTATGATGAATTAAAGATTATTGTAGATTTAGGTGGAA
TTGTTAAGGATGTCATCGTAAATCATCCAACATATGGTCAGATAACTGCAGAGCTTAATATTCACTCTAA
AATGGATATAGATAATTTTATGAAGAAGGTTGAGACAAATGAATTTAAACAGTTATCAGTTCTAACTGAA
TGTAGTCATATTCATACAATTGAGACATTAAAAGAAGAGACTATAGAAGTTATAACAAAAGAATTAGAGG
ACAGAGGAATATTATCATAA
>ref|NC_013316.1|:16374-17255 putative mechanosensitive ion channel protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTTTTATCATTAGCTAAGGCTGCTTCAACAAATAGTAATATAACTAAAAGAACTTTAGAAAATA
TGCTTAATAACTTTAGTGATAATATACCAAATATTATATATGCAATAATCGTATTTGTAATAGGTATCTA
TATATCTAAGATAGTAAGAAAGATGGTTTCAAGGTTTTTAATCAAATATGGAATGAGTAAAGGTGTAAAT
AATTTCATTGTATATGGAATATACATATCTATGTTATCTATTATATCATTGATAAGCTTGGGTGTTATAG
GGATACAAACTACATCAGTTGTAGCTGTATTAGGAGCTGCTGGATTTAGTATAGGTTTAGCATTTAAAGA
AATATTATCAAATTTAGGTTCAGGTATGATTATTTTATTTTTTAAGCCATTTAATATAGGTGATTATATT
CAAGGCTCAGGTGTAGAAGGCACAGTTTCTGATATACAAATATTTAGTACTGTTCTTAAAACCCCAGATA
ATAAAACCATAATTATACCAAACTTTCAATTGACAAGTAACAATATAATTAATTACACACATCAAAATAA
AAGAAGGATAGATTTTTCATATAATATTTCATATGATAGTGATATTGATGTAGTTAAGTCCATATTGAAT
GAAATTTTTATAAATGAAAAAAGGATATTGGATGACCCAAAACCAATTATAGGTTTAAACTCTATAGGAA
ACAACACTATGCAAATAGTTGCTAGACCATGGGTTAAAACTGATGATTACTGGGATGTTTACTTTGATGT
AATGGAAAAAGTCAAAAATAAATTTGACGAAAATAATATAAAAGTTCCATTTGTTCCTTCCTCGTTATTA
TTTAATAATATGAGCAATTCAAATACAATGGATAAAAGATAG
>ref|NC_013316.1|:17713-18984 seryl-tRNA synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAGATATTAAAAGAATAAGAGAAAATCTAGATGATATCAAAAAAGCTATGGAAAGAAGAGGTGAAA
GAGAATTTGACCTTGATGCTGTAGTGGAACTAGATAATAAAAGAAGAGAAATACTTCAAGAAGTTGAAGT
TATGAAAAATGAGTTAAATGTAAATTCTAAAAAAATACCTCAATTAATAAAAGAAGGAAAAGATGTAACA
GAAGAAAAGACAAGATTGAAAGAGTTATCAGATAAGATAAAAGGTATTGATGAGAAAGTAAAAGAAGTAG
AAGCAAAAATGGAATATACATTAATGAGAATACCAAATGTTCCTCATCCAGAGGTACCACAAGGTGAAAC
AGATGAAGACAATGTTCAAATAAGAACTTGGGGAGAACCTACTAAATTTGATTTTGAGTATAAAGCGCAT
TGGGATATAGGGACAGGTCTAGGTATTTTAGATTTTGAAAGAGCAGGGAAAATAACTGGGTCAAGGTTTA
CTTTATATAGGGGATTAGGAGCTAGATTAGAAAGATCTTTAATGAATTTCTTTTTAAATACTCATACAGC
TAAGCATGGCTATACAGAAGTCTTACCTCCATTTATGGCCAATAGAAATAGTTTTATAGGGACTGGTCAA
CTTCCTAAATTTGAAGAAGATATGTTTAAAATAGAAGGATTAGAGTATTTCTTAATACCAACAGCTGAAG
TTCCTGTTACTAATATACATGCTAATGAAATATTAGATGTTGCAGAGCTTCCAATTAAATACTGTGCATA
TACTCCTTGTTTTAGATCTGAAGCAGGTTCAGCAGGAAGAGATACAAGAGGTTTAGTTAGACAACATCAA
TTTAATAAAGTTGAATTAGTTAAATTTGTTAAACCAGAAGATTCTTATAATGAATTAGAATCATTAACTC
ATGATGCTGAAACTATGTTACAAATGTTAGGTCTTCCATATAGAGTTGTAAAAATATGTACAGGAGATTT
GGGATTTACAGCTGCATTTAAATATGATTTAGAAGTTTGGATGCCAAGTTACAATAGATATGTAGAAATA
TCTTCTTGTTCAAATTTTGAAGATTTCCAAGCAAGAAGAGCAGGAATAAGATTTAAAAGAGATAAAAAAT
CAAAAGCAGAATATGTTCATACATTAAATGGTTCTGGATTAGCGATAGGAAGATGTTTGGCTGCTATATT
AGAAAATTATCAGCAGGCAGATGGTTCTGTAGTAGTTCCAGAAGAATTAAGACCTTATATGGGTGTTGAT
GTTATAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:19304-19759 putative cytosine/adenosine deaminase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAGTTCATTTTATATGAAAGAAGCATTAAAAGAAGCATATAAAGCATATAATAAAAAAGAAACAC
CAATAGGTGCTATTATAGTTAAAGATAATCAAATAATAGCTAGAGCTCATAACCTTACAGAAACGTTAAA
AGACTCTACGGCACATGCAGAAATTTTAGCGATAAAACAAGCATCAGAAAAATTAGGTGGTTGGAGGTTG
ACTGATTGTGATTTATATGTTACAATGGAACCTTGCATAATGTGTAGTGGCGCAATAGTTAATTCTAGAA
TAAAAAAGCTTATAATAGGGACAAGACATGTAAAAAATTCATATATAGAAAAACAGCATGAGTTTAAATT
AGATTATTTTAATAATAATAATGTAAAAGTAGCTTTTGATGTTTTGCAAGAAGAATGCTCGATCATATTG
CAAGAATTTTTTAAGGCATTGAGAAAAAGAGATTAA
>ref|NC_013316.1|:20230-21867 DNA polymerase III subunit gamma/tau [Clostridium difficile R20291]
ATGCATAAAGCATTATATAGAGCATATAGACCACAAAAATTTGAAGATGTTATTGGTCAAGATCATATTA
TTAAGACTTTAAAAAATCAAATATATAGTGATAATATAGGACATGCTTATTTGTTTTGTGGAACAAGAGG
TACTGGTAAAACATCTACTGCAAAGATTTTTTCAAGAGCAGTAAACTGTTTGAATAAAATAAATGAAGAA
CCGTGTAATGAGTGTGAGATATGTGAATCTGTATTAAAAGATAATACAATGGATGTTGTAGAAATAGATG
CAGCTTCAAATAATAGTGTAGATGATATAAGAGAGCTTAGAGAAAGTGTGAAATATTCTCCAGCCAATGC
TAAATATAAAGTATATATAATAGATGAAGTTCATATGTTGTCTCAAGGAGCTTTTAATGCATTATTAAAG
ACCTTAGAGGAACCTCCATCATATGTAATTTTTATATTAGCAACTACAGAGCCTCACAAAATACCTGCAA
CCATTTTATCAAGATGCCAAAGATACGATTTTAAAAGAGTTACAGTTAAAGATATGACCCTTAGAATGAA
AAAGATTTGTGAAGATGAAGGAATTGATATAGATGATAAAGCTCTTAATTTAATAGCTAGAAATTCTCAA
GGAGCTCTTAGAGATGCACTTAGTATATTAGACCAATGTATGTCTTTTGGAGAAAGTAAGATAGATTATA
AAGATGTTGTTGAATTAATGGGAAGCGTAAATATAGAACAATTATTTGAATTGTCTCAATGTATTGTAGA
GCAGGACACTAAAAAGTCTCTTGAGATATTAAATGAATTTGTCTTATGGGGCAAAGATATAAGAAATCTT
ATAAATGACTTAATTGATCATTTTAGAAATTTAATGGTATGTAAGGTTTCATCAGAATTGGATGAAATAA
TTTCATTACCAGAAGAAACTATAGAACAACTTAAAATTCAGTCTAAAAATATAGATATAAATGATTTAAT
AAGGATTTTAAATATATTATCAATAACTCAGGATGATATAAAGTCATCTTCAAATCCAAGGGTTTTAGTG
GAAATAACCATAATGAAAATTGCTCAACCAATGTTTGATGAAAGTAAAGAAGCTCTTATAAAAAGAGTTG
AGAACTTAGAAAAAATGATTGAACTGGGGAACTTTAAGTCTGAAAAAATTGGGAATAATAAAGAAAAAGA
GTATGAGGTCGATAGAGAAATAGATGTAAAACAAGAAAATGTAGTTTATGAAGATGTAAAAAATGAGGAC
GTTATACTTATAGAGTCATCTTGGAAGAATATACTTAAACAAATTAAAAAAGATAAAAAAATGCCAATAT
ACGCACTCTTAAGTGAAGTAAAAAGTTTTAATGTATATTCTAATATGTTGTATGTTATATTTGATGATAA
ATTTGATTTTGCAAAAACTAGACTGAGCTCTCAAGATACAATAAATTATTTAGAAAAAACAATAAGAGAT
GTTTTAAATAGAAGTTTTAATGTAAAAATAGTACTGACATCAGAAGTTAAAGATATAAATCTTGAAGTTA
AAGAGAAAAAGGACATTGGTGAGGAGATATTAAAGAACATAGTGAGTGAAGAGATATTAGAAATAAAATA
TAGTATTGATGAAAATGAGAGTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:21926-22276 hypothetical protein CDR20291_0006 [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTAAAAAAGGTTTTGGAGGCGGAATGATGCCTGGTGGTGGAAATATGAACAACTTGTTAAAGCAGG
CTCAAAAAATGCAAGAAAATATGCAAAAAGCTCAACAAGAGTTAGAAAGTAAAGAAGTAGAAGCTTCAGT
TGGTGGAGGAGCAGTTACTGTAAAAGTTAATGGTAAAAAAGAAGTTATAGATATAACTATCAAGCCAGAA
GTAGTTGATCCAGATGATATAGAAATGCTACAAGATTTAGTTTTAAGTGCAGTAAATCAAGCATTGAGAA
ATATTGATGATATACAAGCAAGTCAAATGAGTAAGGTAACTGGAGGTATGAATATACCTGGGTTATTCTA
G
>ref|NC_013316.1|:22289-22888 recombination protein [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAGTTTATACAGGTCCCATAACGAGACTTATAGAGGAATTTTCAAAGCTTCCTGGAGTAGGAAGAA
AGACTGCTCAAAGATTGGCTTTTCATATTATTAATATGAATACTAATGATGTGGAAGCTTTATCTAAAGC
GATTATAGATGCAAAAAGAGAAATAAGATATTGCTCAATTTGTTGTAATATAACAGATACAGACCCATGT
AGCATGTGTTCAAATAAAAGTAGAGATTCAAGTGTTATATGTGTTGTGGAAGATCCAAGAGATGTAGCAG
CTATGGAGAGAACGAGAGAGTTTAAAGGACAGTATCATGTATTAAATGGAGTAATTTCTCCAATGGATGG
AATTGGACCAGATATGTTAAAAATAAAGGAACTTATCCAAAGACTTGGCAATCAGGAAGTCAAAGAAATA
ATAATGGCAACAAATCCTACTATTGAAGGTGAAGCGACAGCCATGTATATTGCTAGGTTAGTAAAACCAA
TGGGAATCAAAGTCACTCGGATAGCTCATGGTCTTCCTGTTGGAGGCGATTTAGAGTATGCAGATGAGGT
CACAATATCAAAAGCACTAGAAGGCAGAAGAGAAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c24526-23321 putative glycosyl transferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCAAAAAAGTATTAATAATGTCTGCTTCCACTGGTGGTGGGCATAATAGGGCTGCTCTAGCTATTA
AAGAAGAACTTACTTCCAAAACACTTGATGGAGAGCCAATTGAATGTGAAATAATAGATAGTTTGAAATT
AGTTAATAATACAATGGATAAAATAATTTCAAGAGGATACGAAAAATCTGCTATATATACTCCCAAAGCC
TATGGAAGTGTATATAGATTATCTGAAACAAATCTTTTGTCAAAAAATGAATTTAAAGATAATCTACTAA
TAACATTCATGGCTAAAAAATTTAAAAAGCTTATTAGAAGCGAAAAACCAGACTTGATTATAGGAACACA
TCCTTTTCCAATGATTGCTCTAAGCACATTGAAAAAAAACTTTAATTTACATAATAATGAATCAAATGCT
TACACAGAGCATTTTTATAAACATTATACAAATACCATTAATGTTCCTCCGCTTATTTCTGTATTAACCG
ATTATACTACTCATTCTACATGGATACAAAATGAAATTGATTACTATATTGTTGGTCATGAATATGTAAA
AGAATTATTGGTGTTTGATGGAGTTGGACCGAGTAAAATTAGAACATTTGGAATCCCTGTTGAAAAATCT
TTTCTCTCTCACAGAGATAAAGATATTGTTCTTTCTGAGTTGAATTTATCTCCTGATAAATTAACTGTTT
TACTTATGGGGGGTAGCTTTGGGGCTGGAAATATAAAAGAGACACTTGATGAATTACTGGATACTGATAG
AGATTTTCAAATACTTGTAATTACTGGTAAGAATGAAAGCCTAAAAGAAAAAATCGAAAAAAAACTTATG
TCTCGTTATCATGATAAAAATGTATGTGTTCTTGGATACACTGATAAGATGAATGATATTTTAGCTTCTA
TAGATGTATTAGTAAGCAAACCTGGTGGACTTACTACAACTGAGGCTCTTTTAAAAGATGTACCTATGAT
AGTTCCTTATTATATACCAGGTCAGGAAGAAGAGAATCTTGATTTCTTATCTAATTGTGGTGCAGCACTT
AGAACTACAAAAAAATATAACTTGTCAATATTACTAAAAGTTCTAATAGATGACCCTAGCAGATTAGAAA
TGCTAAAAAGAAATGTTAAATCAATAAGAAAGTCAAATTCAGCCCAAAATATAGCTAATTTAATTTTAAA
TATAATTTCTGGTTGA
>ref|NC_013316.1|:33930-34343 hypothetical protein CDR20291_0009 [Clostridium difficile R20291]
TTGTATATAGTAATAGGAAATGAAATAGTTGATAGTGAAGAACTTAAAATAATTATAGATGAAAATAGTA
AATTTAAAGTTGAAAAAGATTTAAGTAAAAGCACAAAAAGAGAAGATGTAATAGCATATCAGTTAAGTAT
AGATTTAAATTACCTAGATTCTCTTATAAATGAGCAATGTAATTTGTCCAGTTTATCTGATGAAGAGAAA
TTTGATGAATATATGACTTTGTCTGATGAACTTGCACTGGATTTAGAAGAGTTAATGCCAAAATATACAA
TAATAAATGCTAGAGCATATAAATTAGACGAGGTAGATGGAATTGTAAAAATAATACTAGCTGTAGCGTA
TGCAGATTTAGGGCACTTAAAACTTTCTGATGTAGTAAAGAGGCTATCTAGACAAGTAGATTAG
>ref|NC_013316.1|:34652-38083 pyruvate carboxylase [Clostridium difficile R20291]
ATGCTTAAAAAGTTTAATAAAATACTAGTGGCTAATAGAGGCGAAATAGCTATAAGAATATTTAGAGCCT
GTTCAGAATTGGGGATAAAAAGTGTTGGTATATACAGTAAGGAAGATAAGTATGGATTGTTTAGAACAAA
AGCAGATGAATCATATTTGATAGGAGAAGGTAAAGGGCCAATAGATGCATATTTAGATATGGATGGAATA
ATAGACCTAGCAAAGAGAAAAAAAGTTGATGCTATACATCCAGGATATGGTTTTCTAGCGGAGAATGCAG
AATTTGCTCGTAAATGTGAAGAGAATGGAATTACTTTTATAGGACCATCATCTAAGGTAATGAATATGAT
GGGGGATAAGATTAACTCTAAAAAAATCGCAAAAGAAGTTAATGTTCAAACTATACCAGGAGTAGAAAAA
GCAATAAGAAGTACTGAAGAAGCAAAGGAAGTTGCAAACAAAATAGGATATCCTGTTATGATAAAAGCAT
CTAATGGCGGTGGCGGTAGAGGTATGAGAATTGTACATCGCGAAGAAGACTTAGAACTTGAATATGAAAC
TGCTTGTAGTGAATCAAGAAAAGCTTTTGGAGAAGATATTATATTTATAGAAAAATATATAGCTGATCCA
AAACATATAGAAGTTCAAATATTAGGTGATAATTATGGAAATATAGTTCACTTATATGAAAGAGATTGTT
CAGTTCAAAGAAGACATCAAAAAATAATAGAATATGCACCAGCTTTTTCGTTAGATGATAAAGTAAGAAA
AGAGATATGTGAAGATGCAGTTAAGTTATCAAAACATGTGGGTTATTCTAATGCGGGAACATTAGAATTT
TTAGTAGATGCAAATGGTGGGCATTATTTTATAGAGATGAACACAAGAGTACAGGTTGAACATACTGTAA
CAGAGATGGTTACAGGAATAGATATAGTTCAAAGTCAAATACTAATAGCCCAAGGTTACAGCTTAGATAG
TGAAGAAATTAATATAAAATCACAAGATGATGTGGAAATAAGAGGTTACTCTATCCAATGTAGAATAACT
ACAGAAGACCCTAAGAATAAATTCATGCCTGATACAGGTAAAATTCAAGTTTATAGAACTGGTTCAGGAT
TTGGTATAAGACTAGATGGAGGAAATGGATTTACAGGGGCAAACATAAGTCCTCATTATGATAGTTTATT
GGTTAAGACAATATCTTGGGATAGAACATTCCAAGGAGCAATAAATAAAACTATAAGATCTATAAAAGAA
CTTAGAGTTAGAGGTGTTAAAACTAATGTAGGATTCCTAGTTAATGTTTTAAATAATCCTATATTCTCAA
ATGGTAAATGTAGTACTAAGTTTATAGATGAAAATCCAGATTTATTTGAAATAACAGAAAGTAAAGACAG
AGGAACAAAATTACTTCAATTTATAGGAGATGTAATTGTAAATGATAATGCTTGTAAAGAAAAACCACTA
TTTGATGCATTACATGACCCAAGAATGGATAAGGATGGTTCAAAATCAGAAGGAAGTAAAATACTTTTCG
ATAAGTTAGGTAAATCTGCATATATAGAAAAGATAAAAAATGATAAGAAATTACTATTAACAGATACAAC
AATGAGAGATGCACATCAATCATTATTAGCAACAAGAATAAGAACATATGACTTATTAAAAGCTGCTAAG
CCAACAGAAAAATATCAAAAGGATTTATTCTCACTTGAAATGTGGGGAGGAGCTACTTATGATGTTGCAT
ATAGATTTTTAAAAGAATCTCCTTGGCGTAGATTACAAAAGCTAAGAGAAGAAATACCAAGCATAATGTT
CCAAATGTTGCTTAGAGCATCAAATGGAGTTGGATATAAAAACTATCCAGATAATGTAATAGAAGAATTT
ACAAAAGAATCTGCTAGACAAGGTATAGATGTATTTAGAATATTTGATTCATTAAACTGGGTTGAAAATA
TGAAACCATCTATTAATACAGCTTTAGAAACTGGAAAAATTGTTGAAGCAACTATGTGTTATACAGGTGA
TATACTAGATAAGACTAAAACTAAATACAATCTAGAATATTATATTAAAATGGCACAAGAATTAGAAAGC
TTGGGAGCAGATATAATAGCAATAAAAGATATGTCAGGTCTTCTTAAACCATATTCAGCTTACACACTAG
TTAAAGAGTTAAAGAAAAATGTAAAAGCACCAATACATTTACACACTCATGATACAAGTGGAAATGGTGT
AGCAACTTGTTTAATGGCGTCAGAAGCTGGAGTAGACATAATTGATGCTGCATTAGAATCTATGGCAGGA
CTTACAAGTCAGCCATCGCTTAATGCTATAGTAGAGGCACTTAAGAATACAGAGAGAGATACAGGAATAG
ATTTATTTGGATATGATGAGTTAGGAAAATATTATAAGGATTTAAGAAAAGTTTATAATAAATTTGAAAG
TGATTTAACTAATTCTTGTGCAGAAATATATAATTTTGAAATACCAGGAGGCCAATATACAAACTTAAAA
CCTCAAGCTGATAGTTTAGGATTAGTTAATAGATTTGATGAAGTTAAAGAAAAATATAAAGAAGCTAATG
AAGTTGTAGGAGATATAATAAAAGTAACTCCATCTTCAAAAGTTGTAGGAGACTTAGCTATCTTTATGAC
TAAAAATAAATTAGATAAAGACAATATAATAGAAGAAGGTAAAAATTTATCATTCCCAGATTCTGTTGTG
GATTACTGTAAAGGTATGATTGGTCAACCAGAAGGTGGAATACCAAAAGATTTACAAGAGGTAGTTCTAA
AAGGTGAAGAAGCTATAACAGTAAGACCAGGTTCATTATTACCAGCAGAAGATTTTGATGAAATAGCTAA
ATATCTAAATGAAAAGTATGATATAAATGCTAATATAAGAAATGTTATAAGTTATGCTTTATATCCAAAA
GTATATGAAGATTATATCAAACATCTACAACATTATAATGATATATCTAAACTTGAAAGTGATGTATTCT
TCTATGGATTAAATAAAAATGAAGAATGTGAAGTAGAAATAGAAGAAGGTAAGGTATTAACAATAAGATT
AGTTGAAATTGGTGAAGTTAAGGAAAATGGATTTAGAACTATAGGATTTGAGTTAAATGGAATGGTTAGA
GAAGTAGAAATAAAAGATAAGAATTTCTCTGGAAAAATTAATAATGTTGAAAAAGCTGATATGAATGACC
CTCTTCAAATTGGAGCAAGCATACCAGGAAAAGTTATAAAAATAATGGTTAAAGAAGAAGATGAAGTAAA
AGCAAATCAACCATTAATCGTTATAGAGGCTATGAAGATGGAAACTATAATAGTTGCTAAGACTGATGGA
GTAATTAAGTCAATCAAAGTAAAAGAAGATGATATGGTTGAAGATAAACAATTATTAATGATAATGAAGT
AA
>ref|NC_013316.1|:38325-40253 putative translation elongation factor [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGGTTTATGATAGTAAAATGTTGAGAAATGTAGCAGTATTAGGACATAGCGGATGTGGAAAAACAA
ATCTAATCGAAACTATAGCTTACACAGCAAACACTAATAAGATACCTAAATTAACAGACAAGGTAAATAT
GACTTATAGCATGGGATTAATACCTATAGAGTATAATGATTATAAGTTTAACTTATTGGATACCCCAGGA
TATTTTGACTTTAGCGGAGACGTTGTGTCATCTCTTAGAGCAAGTGATGCAGCAATAATAGTAATAGATG
CAACAGCGCCTATTCAAGTTGGTACAGAGAAATCATTAGAACTAACTGAGAGTATTCCTAAGATAATGTT
TATAAATAAAATAGATAATGAAAAGGCAAGATACAAAGATGCAATAGCAATGTTAAGAGAAAAATACAAT
AATAAGATAGTTCCTATGATAAGTCCTATATACAAAGATAAAAACTTTGTAAAGTTACATAATGTTTTTG
AAAACATAGATGATTTAGAAGGTGAATTTAAGGAACAAGCTATGAGTGTTAAAGAAGCATTAATGGAACT
TATAGCAGAAACTGATGACCAAATATTAGATAAATATTTTAATGGAGAAGAACTAACTACGGAAGAGATA
CAAAAAGGTATTATTATAGGTATACAAAGAGGTGATATTATACCTGTAATATGTGGTTCAACTATAAATA
ATATAGGCACAAAGGAAATATTAGATACAATATCAAGTTATTTAGAACCTATCTTTACAGAGGAAAGCAA
ACCATTTAGGGGATTAGTATTTAAAACTATGGTTGACCCATTTGTTGGAAAGATGTCATATATAAAGATT
ACTGAGGGTGTACTTTCTAAGGATAAAGATGTTTTTAATATAAATAAAAATGTAAAAGAAAAAATAGCTA
ATATATATACATTGAGAAATAGTGAATTAGTAGAAATAGAAAAAGCTAAAGCTGGTGATATAGTAGTTAT
AACTAAAGTTAATTCTCTAAAAACAGGAGACACTATATCTGCAGATAAAGATGCAGAAGCTTTAGAAAAG
ATAGATTTTCCTAAACCACAAATATATTATGCAGTAACTCCTAAGAATAAAGGTGATGAAGAAAAAGTAG
CATCTGTATTAAATAAACTAGTAGAAGAGGACCCTACATTACATTGGTATAGAAATACAGAGACAAAACA
AGCACTTTTAGGAGGTCAAGGAGAACTTCATATAAAAACAATTAAAAATAAAATGAAAGATAAGTTTGGT
GTTGATGTTGAATTGAATGACCTTAAAGTTCCTTATAGAGAAACTATAAAAGGAACAGCCGATGTACAAG
GAAAACATAAAAAGCAATCAGGTGGTCATGGTCAATATGGAGACGTAAAAATAAGATTTGAAAGATGTGA
ATCTGATTTTGAATTTACAGAAGAAATATTTGGTGGTTCTGTACCAAAACAATATATACCAGCAGTTGAA
AAAGGTCTAAAAGACTCTATGCAAAAAGGTATATTAGCAGGTTATCCTGTTACAAACATAAAAGCTACGC
TTTATGATGGTTCATACCATGATGTAGACTCTTCTGAAATGGCCTTTAAGATGGCAGCAAGTGCAGCCTT
TAAAAAAGGTATGGAAGAAGCGCACCCAATACTACTAGAACCTATAATGAAACTTAAGATAACTGTTCCA
GAAGAATATATGGGAGATGTCATGGGTGATATAAATAAGAGAAGAGGAAAAATATTTGGAATGGAACCAG
ATGACAAAGGGAAACAAATAATATTTGCAGAAGCTCCACAAGCAGAGACATTTAAATATGCAATAGATTT
AAGAGCAATGACACAAGGTAGAGGATACTTTGAAATGGAATTAGAGAGATATGGAGAGGTTCCATCACAG
TTTGCAGAAAAAATAATTGGGTTAGCTACTGCAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:40706-41170 transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAACTATGACAGATATAATTGAAAAATTTATTAAAGATTTGATGGAAGAAGATAATAGCATACAAA
TTCAAAGAAATGAACTAGCAAACTTGTTTAGTTGTGCACCATCACAAATAAATTATGTCTTAACAACAAG
ATTTACAATAGATAGAGGATATTACATTGAAAGTAAAAAAGGTGGCGGAGGATATGTTCAAATAGAAAAA
ATACGAAAAAGTAAAGATGGACATATTAGAGAACTACTAAATGAAAAAATAGGAAGTCAGATATCCTATA
AAAAAGCAAAGGAATTATTAGAAGGTTTAAAAGAGTCGGATTTGATTAACGAAAGAGAATTAAAATTAAT
ATTATATGCAATAGATGATAAATCATTGTGTATGCCAATATATGAATTAAAAGAGAAGGTAAGGTCTAAT
ATTTTAAAGAATATAATAATAGGATTATTTAGTATAGAGGAGTGA
>ref|NC_013316.1|:41177-41671 putative DNA repair protein [Clostridium difficile R20291]
ATGCTATGTCAAAAATGCAATAAGAATAAAGCATCTGTATATTATAATAAGATAGTCAATGGAGAAAAAA
CAGAGATGTATTTATGTAGTGAGTGTGCAAAAGAGAATACAGAAATGAATTTTAACTTAGATATGCCTTT
TTCAATGATGGATATATTTTCTAATTTAGGTTTTCAACCTAAAAAAGAACTTGAGGAAAAGCTAGTTTGT
CCTAAATGCAATACAACATATAGTGAGTTTAAGAATAATGGGAGATTTGGATGTAGTGAATGTTATAATG
CATTTAGTAGTCAAGTAAATCCAATGCTTCAAAATATACATGGGCATATAGAACATACAGGAAAAGCACC
TAAAAAATCTTTTTATAAGATAAGTGTAGAAAATGAGATTAAAGAACTAAAAGAAGATTTAGATAGAGCT
ATAAAAAATGAAGAGTATGAATTAGCAGCTCAATTTAGAGATAAAATTAAATATTTAAAAGGTTCTATTG
ACTAA
>ref|NC_013316.1|:41687-42712 putative ATP:guanido phosphotransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAGAACATAGTCATGAAATCAAGAGTTAGGCTAGCTAGAAATTTAAATAACTATCCATTTCCAA
ATAAATTAGATAAAGAATGTGCCATGGAAATAATAGAAAAAGTAAAAAATGCGTTTATTAATTCTAACTT
AGAACAAAAAGAAGAATTTGATTTCTATAAAATTGAAGATTTAGACCAATCTAAAAAAATGCTTATGGTT
GAAGAACATATAATAAGCCCAGATTTAGCAGAAAATGATAAAAGTGCAGTTATAGTAAAAAAAGATAAAA
CTATAAGCATAATGATAAATGAAGAAGACCATATAAGGATACAAACTATATGTGATGATTTAAACTTAGA
ATATGCATATAGTGTAGCAAATGAAATAGATGATTTGTTAGAATCAAGTTTAGAATATGCCTTTAACACA
AAGCTAGGTTATCTAACATCTTGTCCAACTAATACAGGAACAGGAATGAGAGCTTCTGTAATGATGCATT
TACCAGCATTAAGTCAACTAGGCTATATGGATGAACTTTATAAAATTTCATCACAAATAGGTATAGCAAT
TAGAGGGATATATGGAGAACGAACAGAAGCATTGGGAAATATATATCAAATATCTAATCAACTTACACTT
GGAAGAACAGAGTCTAATATTATAGAAAATGTAAGTGGACTTACAAAAGATGCAATTTCAAAAGAAATAA
AAGCTAGAGAAATATTGCAAAAAAAATTAGGTATAAAACTAGAAGATAAAATATTTAGATCGATAGGGAC
ACTTGAAAATTCAAGAGTAATGAGTAGCGCAGAGGCAATGAGCCATCTATCAAATATAAAAATGGGAATA
GAAATGAACTATATAGATAAACTAGATTTAAGGGCTATAGAACAACTTATGATAGGTATACAACCAGCGC
ATCAGTCAATAATGTATAAGAGTGATGATGTTGAGAATAGAGATATAAATAGAGCAACATATATTAGAGA
AACTTTGGAAAAATTAAGAGGAGGGATGAATTGTGAACTTCAATAG
>ref|NC_013316.1|:42897-45146 ATP-dependent Clp protease [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGGTAAGGGAGAAGAAATCTCAGAAGATATAGTATTAAGTCCAAGGAGTAAACAAATACTTGAAT
TATCAGGAATGTTTGCAAATAAATTAAAAACAAATTATATTGGGACTGAGCATATATTATTAGCAATTAT
TCAAGAAGGTGAAGGAATAGCTAATAAGATTTTAAATTATGCTGGAGTAAATGATAGGACTTTAGCCCAA
TTAACAATTGATATGATGGGTATTAGTGATAAAAATCAATACAAAGCAGAGAATAGTTACACGGGCAACC
AGAATCAAGCAGAATCTAAAGTACTTGATAAGTATGGAAGAAATCTTACACTATATGCAAAACAGAATAA
AATAGACCCTGTAATAGGTAGAGAAAAAGAAATACAAAGAGTAATACAAATATTAAGTAGAAGAACTAAA
AACAATCCAGTGTTGATAGGAGACCCAGGTGTAGGGAAAACAGCCATAGCTGAAGGTCTGGCTACAAATA
TAGCCTTAGGAAATGTTCCAGAAACACTAAAAAACAAAACTTTATACTCTTTAGAGATGGGTTCATTATT
GGCTGGGGCTAAGTATAGAGGAGAATTTGAAGAAAGAATTAAAGAAGTTGTAGATGAAGTTGTTAAAAAT
GGAAACATAATCTTATTTATAGATGAGATGCACACAATAATAGGGGCTGGGTCTACTGGAGAAGGCTCTA
TAGATGCTTCAAATATATTAAAGCCAGCCTTGGCAAGAGGAGAAATACAAGTTATAGGTGCAACTACAAT
TGATGAATATAGAAAGCATGTTGAAAAAGATTCTGCTCTAGAAAGAAGATTCCAACCAGTTATGGTAGAT
GAACCAACTAAAGAGGACTCAATAAAAATATTAGAAGGATTAAGAGATAAATATGAAGCTCATCATAAAG
TTAAAATAACTGATGATGCTATAAAGGCAGCTGTAGAATTATCAACTAGATATATATCAGACAGATATCT
GCCAGATAAAGCTATAGACTTGATTGATGAAGCTGCATCAAAAGTAAGATTAAAAGAAAATACACCTCCT
TCAGAAATAAAAAAATTAGAACTAGAAATAGAAAATATAGATAAAGAAAAAGAAGAAGCAGTAAGATGTC
AAGACTTTGAGAAAGCAGCCAAAATAAGAGATGAACAAGGTCTACTTAAAAAACAATTAGAAGATGTTAG
AGAAAGATGGAACAAGTCATCTAAACATTCAGATTTAGTTGATGGAGAAGTTATTGCTGAAGTAGTGGGC
TTATGGACAGGAATACCAGTTAATAAAATTCTTGAAGAAGAGGCTGATAGACTTTTGAGACTTGAGGAAA
TACTGCACAATAGAGTTATAGGTCAAGAACAAGCAGTAAAATCTATTTCAAAGGCAATCAGAAGGTCAAG
AGCAGGTCTTAAAGACCCTAATAGACCAATTGGTTCATTTTTATTTTTAGGTCCAACAGGAGTAGGTAAA
ACAGAATTATCTAAGGCATTAGCAGAAGTGCAATTTGGAGATGAAAATCAAATAATTAGAATAGATATGT
CTGAATATATGGAAAAACATGCTGTGTCAAGAATGATAGGTTCACCTCCAGGTTATGTAGGTCATGATGA
AGGTGGTCAATTAACTGAAAAAGTAAGAAGAAATCCATATTCAGTTATCTTATTTGATGAGATAGAAAAA
GCTCATCCAGATGTATTTAATATTCTGTTACAAATTCTAGATGATGGTAGACTAACTGATTCAAAAGGAA
GAACTGTAGATTTTAAGAATACTATTGTAATAATGACATCAAATGTTGGAGCATCTACAATTGGTAGACA
AAAAACTTTAGGATTTAGTATAGCTAAAGGAGACGAAGAAGAAAAATCTCAATATGAAAAAATGAAAGAA
AATATAATGGGTGAATTAAAACAAAGATTCAGACCAGAGTTTTTAAACAGAATAGATGATATAATTGTTT
TCCACTCACTAAATGAAAATCATATATCAAAAATAGTACTTTTAATGGCAGCGAAACTACAAGAGAGATT
AAAAGAAATGGATATAAAATTAGAAATGAGTGATGAGGCTGTTAAATTAATTTCTAAATCTGGATTTGAC
TTAGAATATGGAGCAAGACCTCTTAAAAGAGCTTTACAAAAAGAGTTGGAAGATGAGCTATCTGAAGCAA
TCTTAAAAGGTAATGTGAAAAAGGGAAGTAATGTAGTAGCAAAAGTCAAAGATGAAAAAATAGTTTTTGA
AACTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:45326-46699 DNA repair protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAAAAATAAAAACAAAATATGTATGTCAATCTTGTGGATATGAAACAGCTAAATGGCTTGGTAAAT
GTCCAGAATGTACAAAATGGAATACATTTGTAGAAGAAATAGACCAAAAAAGCACCAAAAAAGAGGTCTT
TATAATAGATAAATCTTCATCTAAACCAGTCAGTATAAACTCAATAGAAAGTAAAGAAGAAGAGAGGTTT
ACAACAGATATAAATGAATTAGATAGAGTGCTTGGAGGAGGTATAGTTAAAGGCTCTTTAGTGCTTGTTG
GTGGTGACCCTGGTATAGGTAAATCAACACTTTTAATCCAAGTATCTAGTAATGTTGCCAATTTAGGAAA
AACTGTTTTATATATAACTGGAGAAGAATCAGAATCTCAAATAAAAATGAGAGCTAAAAGATTAGGTATT
AACTCAGAAAATTTATATATATTTGCTGAAAATAATTTAAGTATAATTGAATCTTATTTAGAAAGTGTAA
ATCCAGAATTAATAATTCTAGACTCAATTCAAACTGTCTTCAGTCCAGAAATATCCTCGGCACCAGGAAC
TGTCAGCCAAATTAAAGAAGGTACTTCAAAATTCATGAAAATTTCTAAAAAAATGGGAATTTCAACGTTC
ATAGTTGGGCATGTTACAAAAGAAGGTTCACTAGCAGGACCAAAATTATTAGAGCATATGGTTGATACTG
TTCTATATTTTGAAGGAGAAAGATATAATACTTATAGATTAGTAAGAGCTGTTAAAAATCGATTTGGTTC
AACTAATGAACTTGGAGTATTTGAAATGAGGGATTTAGGATTAGTAGAACTTGATAATCCATCTAAAATT
TTAATCTCTGAAAAACCAAAAGATGTAGCAGGTTCAGTAATAATATCTACTGTAGAAGGTACGAGACCAA
TGTTACTTGAATTGCAAGCATTAGTTTCTCCTACAAGTTTTGGTATACCAAAAAGAACATCTACAGGAGT
CGATTACAATAGAGTAGGTATGTTATTAGCAGTATTAGAAAAACGTGTTGGTTTGCAAATACAAAATCAA
GATGTCTATATAAACATAGTTGGAGGAATAAAGATAAATGAACCCTCAATTGATTTAGGGATAGCCATTT
CTGTAGCATCTAGTTTTAGAAATATACCGATAGATGAAAATATAGCTGTTACAGGAGAAGTGGGACTTAC
AGGAGAAGTTAGAGCAGTAAGCTTTATAGAAAAGAGAATAGCTGAGTGTAAAAAACTTGGATTTAAAAAG
ATAGTAGTTCCTAGAAGTAATTATGATGTTGTAAAAGAGACCAAAGGCATAGAAATATGGCCAGTAGATA
ACTTAAGACAAGCTATAAATATAGTACTTGGGAGGAATCAATAA
>ref|NC_013316.1|:46702-47772 putative DNA-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGAATTTTCTAGATAATAAAAATATGCTATATGCATTAAAAATGATATCTCCTGGAACTCCACTTA
GATTAGGTCTAAACAATGTACTAAGAGCTAAGACTGGTGGATTAATTGTAATTGCAACAAACGAAGATGT
AATGAAAATAGTAGATGGAGGATTTGCTATAAATGCAGAATATTCACCATCATATCTATATGAATTAGCT
AAAATGGATGGAGCTATAGTTTTAAGTGGTGATGTAAAGAAAATATTATTTGCTAATGCACAACTTATAC
CTGACTATTTTATAGAAACATCAGAGACAGGAACAAGACATAGAACAGCAGAAAGAGTAGCAAAACAAAC
TGGTGCTATAGTCATAGGAATTTCACAAAGAAGAAATGTTATAACAGTTTATAGAGGAAATGAGAAGTAT
GTAGTCGAAGATATATCTAAGATATTTACTAAGGCAAATCAGGCTATACAAACTCTGGAAAAATATAAGA
CAGTATTGGACCAAGCTGTAACAAATTTAAATGCCTTAGAGTTTAATGATTTGGTAACTATTTATGATGT
TGCATTAGTCATGCAAAAGATGGAAATGGTAATGAGAGTTACAAGTATAATTGAAAAATATGTGATAGAA
TTGGGTGATGAAGGAACTTTAGTAAGTATGCAATTAGAAGAATTAATGGGTACAACCAGAATAGACCAGA
AATTAATATTCAAAGATTATAATAAAGAAAACACAGAAATAAAAGAACTTATGAAAAAGGTCAAAAATTT
AAATTCAGAAGAACTAATAGAATTGGTCAATATGGCAAAACTATTAGGGTATAGTGGTTTTTCAGAAAGT
ATGGATATGCCTATAAAAACAAGAGGTTATAGGATTCTTAGCAAAATACATAGACTACCAACAGCAATAA
TAGAAAACTTAGTAAATTATTTTGAAAACTTTCAACAAATTTTAGATGCATCTATTGAAGAATTAGATGA
GGTTGAAGGAATAGGTGAAATAAGAGCAACATATATAAAAAATGGACTCATAAAAATGAAACAATTAGTC
TTATTAGATAGACACATATGA
>ref|NC_013316.1|:47861-48955 hypothetical protein CDR20291_0018 [Clostridium difficile R20291]
TTGATAAGGAAAGTAACAAGAATATTGTTTATTTTACTTGGATTTACAATAGGTATAACAACCTATTTAA
CATTAATGAAAGATTTTGAAATATTAACATTTGGAAAAGAAACATATGGTTATATCGCAGCTGTAGTAGC
AGGTATAATAATAGCCATTTTAGGATATCTTATAGAACCATGGGTTGTAAATAAAGTAAAAGAAATTGCT
AAAATAGTGGATAAAGAATTGTCAAAATATCCTCAGACTGATATATTGTTAGGGTCTATGGGTCTTATAG
TAGGATTTGTTATTGCGTATTTATTAAGTGGATTAGTAAATAGAATACCAATAGTAGGTGGAATACTATC
CTTACTATTATATTTATTCCTAGGATATCTTGGAATGAAAGTTGCGCTTAAAAGTAAAAATGATTTATTT
AATATTGGAAAACTAGGAAGATTAGCAAATCCTATTAAGGATAAAGATAAGGATAAAGAAAATAAAAAAG
AAGTAAAAGCCATTCCTCCAAAAGTATTAGATACAAGTGTAATAATTGATGGAAGAATAGCTGATATTTG
TAAGACTGGGTTTATAGAAGGAAAACTTATTATTCCTGCTTTTGTTTTGGAGGAACTAAGACATATTGCA
GATTCTTCAGATGATTTAAAAAGAGTAAGAGGTAGAAGAGGTCTGGATATATTAAATATAATTCAGAAAG
AATTAAATATAGAAGTTGAAATAAGTGAGAGAGACTTTGATGATATAGCAGAAGTTGATAGTAAATTATT
AAAGCTTGCTCAGGTTTTAAATGGAAAAGTTGTTACAAATGATTATAACTTAAATAAAGTTGCTCAATTC
CAAGGTGTTGAAGTATTAAATATAAATGAGTTAGCTAATGCTATAAAACCAGTTGCTATACCAGGTGAAG
ATATGGTTGTTCAAGTGGTTAAAGAAGGAAAAGAGGCTCAACAAGGTGTTGCATATCTAGATGATGGAAC
TATGATAGTTGTTGATGGAGGAAGAAAATATATGAATGAGACTATAAAAGTACTCGTTACTTCTGTTCTT
CAAACTCCTGCAGGTAGAATGATATTTGCAAAACCTAAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:49084-51261 hypothetical protein CDR20291_0019 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAAAAAGATTATATCTTTCTTAGCAACATTTATCATAATATTAACATCAGCAAGTCAGTATAGTT
TTGCAGATGATATGTCAACACGTGGAAAAGTAATATTTATAGATATGAATAGAACTAGTATGAGTAATAT
GTTAAGAATAAAATCATTAAGAGAAGAACTAGACAATAGAGGGTATATTGGCTTGATGAATATAAGAGGC
GATAAAGGAAGTGATGATAGAAGGTCATATGCTAGTATGGGTGCTGGTGGTAGAGCTAATGTGGCTAATG
AAGAAGATATTAATTTTGAAAGCTCGAGTAAGGATAGAAATATAGTTTTTGAATCAGCTACAGGAAAAAG
TGCAAAAGGTATAAATAATTTAACTATAAATAAGTCTATAAATGAAAATTTAAACTTTGGAGAGTATGGT
TCTGTATTAGGGTCATTAGGACAAAGTTTATCTGAGAATGGATTAAAAGCATCTGTATTGGGTAATTCAG
ATATAATTGAAAATGGTCAACTTATAAAAAATAGAAACTTATGTCTAACTGCAATGGATGAATATGGAAG
AATACCTAATGGAAATGTAGATACTATAAATAAAAAAGACTTATCTATGCCTTATGGAATATCAACTGAT
TATGATAAATTGATTGTAGAGACCAAAGAAGCTTACAAAAATAATGATGTGGTTTTTGTGGAGCTTGGAG
ACACATATAGATTAGATTTATATAAACCAAATTTAAATGAAAAAACATATGAGAGTGTGAAAGATAACAT
AGAAAAAAATATAGATGTATATTTAAAAAATATATTTTCTATGGTTGAAGAAAATGACACTGTCTACATA
GCAAGTGCATTTCCAAGTGATTTAGATTATAAAAATAAAAGAAGACTTTCTCCAATAATAAAATTAAATG
GAGAAGGGAAAGGTATATTATCATCTTCAACTACTAGAAGAGAAGGTATTGTAACAAATTTAGATGTTGG
GGTTGAAATATTAGACAACTTTAATATAAAAAATCAAAATATGGTTGGAAGAAAATATGAACTTATTAAC
AGAGATGATAATAAAGAATTTTTGATGGATGAATATCAAAAGATAGTATCTATTTCAAGCATAAGGTCTA
CAATACTGAATGGTTTTGTAAGTATAGTTTTCTTGTCATGGATAGTTGCTATGATTGCAATTTTATTTAG
AAAGCATATATCAAAAAATTATAAAGAAACAACATTTTTTATATTAAAGGAACTTTTAAAAATAGGAATA
GTAATGCCACTGTCATTTATGATAACACCAATAATGAATTTCAAAACACCATTAGCAATATCTTTAGGAA
TAATTATAATAACACTTACTATATATCTTATAAGTAAAGTTTTAATAAAGAATGATTTAAAAAACATGCT
GTTTTTTACTGGATTAACCATAGTAATTATGGTTATTGATGCTGGGTTTGGCTCATATTTAATGAAAAGC
AATGTTATGAGTTATGACTGTATAATTGGAGCTAGATATTATGGAGTGGGAAATGAGTATCAAGGTGTGG
CAATCGGTAGTGCAATATTTACATTTGCAATTTTACTTACATATAAAAATATACCAAAGTGGTCTATAAT
AGTTTTTTCTTTGGTTATCTTAATTACAAGTGCATCTCCAATTATGGGAGCAAATGTTGGAAGTGCTATT
TCTGAATGTGTTGCATTTTTACTATTTATACTATTGATATATAATGTGAAGATAGACTTCAAAAAAATTG
TATTATTAGGTATAGCAGTATTATTTGTATTAGGAGTTTTTGTAGCAATAGATATGATTTTGGGAAGTAA
TTCACATTTAGGTATGTTTGTAAAAGAAATTTACTTTAATGGACCAGGAGAAATAATACAAACATTTAGT
AGAAAGATAGAGATGAATTTAAAGCTAGCTCAAACCAGTGCATGGGTAAATATACTGTTAACTGGAATAG
GTGTAATTTTAGTTCTTATGATTAATCAGATTAGATACTTTAAGCAACTGATGGATGAGTATCCAATTGT
ATTTAAAGGATTTATAGCATCAATAGCAGGATGTTTAGTAACTCTTTTAGTGAATGACTCTGGGATTGTG
TCATCAGCTACAGCCTTTATTTATGTAATTGTACCTATGATAACATTAAGTATAAATCTCACAGCATTAA
AAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c52292-51447 AraC-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAACAGAAATAATTTTTCACATGAAATAATTGAACCTATTGATAATTTAGATGTTAATTTCAAACTAT
TTGATGATAGTGGTAGTTATGTAGCAAATCATTGGCATAACTCATTAGAAATAATTTATATAACTTCTGG
TGATTTACAAATTAACATGGAGGGTTACACTTATAATTTAAAAGCTAATGAGTGTATGTTCATTAATTCT
GGAATTATTCACTCAACTAGATGTACTTATCAAGATACCTCTATATTATTGCAAGTACCATTGTCTTTTC
TAAACAAATATATCCCTGATTTTAAAAATTGCTATTTTGACTTTAAGGTTAATGCCAATGACAATAACTA
TAAAAAAAATTCAGGTAAAGTTAAACTTATATTAGAAAACATGAGAGAAATTAAACTTAGCTCTCCTCCT
GCAGCTAATCTGCTCTTTACAAGCTTATTATTTGAACTTTTATTTGAATTATATACAAACTTTAAAATAT
CTGTAGGTAATAAAAATATGAAAAAAACAGTACTTGATTTGTCAAAATTTGAACCAGTTTTAGAATATAC
AAAGATTAATTACAAAATGCCTATTTCTATTAACAAAATCGCTAAGGTAGCACACTTACAGCCAGAATAT
TTTTGTAGAAAATTTAAACAGTATATGGGACAAACTTACTTAGAGTATTTAAATGATGTGCGTATTTCTC
ATATTTATAAAGACTTAATTAACACAAATGATACCTTATGCAGTATATTAGAAGCTCATGGATTTACTAA
TACAAAATTATTTTACAGAATTTTTAAGGAAAAATTTAAATGCACTCCTAAACATATAAGAAAAAAATCT
ACCTAA
>ref|NC_013316.1|:52509-53675 putative beta-glucosidase [Clostridium difficile R20291]
GTGTATATAAAAGGTGTAAATTTAGGAGGTTGGTTAGTTTTAGAAAAATGGATGACCTCAAGTTTATTTG
AAGGCACAGAAGCTGAAGATGAATACTATTTACCAAGACAGCTTTCAAGAGAGGCATATGAATCTAGAAT
TAAGACTCATCGTAGTGAATACATCACAGAGAGAGATTTTGCAACGATTAAATCTATGGGATTTAATTCA
GTTCGTATACCAGTACCATACTTTATTTTTGGAGATTGTGAACCATTCATAGGATGTGTTAAAGAACTTG
ATAAAGCATTTGCTTGGGCAGATAAGTATGGGCTTAGTATATTGATAGACTTACATACAGTTCCAGGAAG
CCAAAATGGATTTGATAATGGAGGAATATCAGGTATATGTAGCTGGTCACAAAATCCAGAATATGTAGCG
TTTACATTAAATGTATTAGAAAGACTTGCAAAACGTTATGGGATGAGACATGAATTGTATGGAATCCAAA
TTTTAAATGAGCCTATAACAGAAAGAATGTGGAACATAATGAATGTTCCAAATCGGTTTAAGGCTGTAGA
TAAGGAGATGGCAAGGGGGAGTAAACCTAATTCATTAGAGTTTTTACGTGATTTTTATATAAAAGCATAT
AAGGTAATGCGTCCTTATATGAGAGAGGAAAACGTTATAGTGTTTCATGATGCATTTGAATTAAAAGCAT
GGAAAGACTTTATGAGAGAGGAAGAATTTAAAAATATTGTTCTAGATACACACCAATATTTGATGTTAGC
TGAATCAGATGGATGTGAACAAAGTATTGATAGCTATCTCAAATATATTAGAGAAAATTATGCTAAAGAT
ATTTTACAAATGCAAAAATATTTTCCTGTTATATGTGGGGAGTGGAGCTTATTTAATTCATATGCTTGTG
GTATAGATACAAATGGAGGTCAATCACCTCTAAATGGGATTGAATCAAATATAGATAAATTATCAAAAGA
CGATAAAAGAGAATTATATAGGAAGATAGCAAAAGCACAGCTTGATGCATGGAGAAATGGAAGTGGTCAC
TACTATTGGAATTATAAGTTATTACTAGATACAGTTAATGAAGAAGGTTGGATAGGATGGGATAGTTGGG
ACCTAGGCAAATGTGTAGCTCAAGAATGGTATCCTATAGAATATTAA
>ref|NC_013316.1|:53697-55343 putative beta-xylosidase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTAAAAACCCTATACTTCCAGGTTTTAATCCAGATCCTTGTATTTGTAGAAAGGGAGATGATTATT
ATCTTGTAGTTTCATCTTTTGAATGGTTTCCAGGTATACCTGTTTATCACTCTAAAGACTTAAAAAATTG
GGAGTTATATACTCATATTTTGACAGATGAAACAAAAATAGATTTGAAGAAGCTTCCTTCATCTAAAGGA
ATTTGGGCACCTTGTTTGACTTATTGTGAAGAAGAAGATTTATTTTACATAGTTTATGGAATTATGAACT
CTATGAATGCAAGATATTTTGATGTTGATAATTATTTAATTACATCAAAAGATATAAAGGGAGAGTGGAG
TGAACCAGTATATATACACTCATCAGGTTTTGATGCGTCTATTCTTCATGATGATGATGGTAAAAAGTGG
ATTGCATCATTAGACTGGGAGACTAGAGAAGGATATGAAAAACCTGGTGTTATATGTTTAGTGGAATACT
GTACAAAAAAGAAAGAAATAGTAGGATATCCAAAGAGAATATGGTCAGGGGGAACTGATAGAGGTTGTAT
TGAAGCACCACATATAACAAAGCGTGGAGATTACTATTATATAATGTGTGCAGAAGGTGGAACTGGATAT
GGTCATAGTGTAACTATGGGAAGGGCTAAAAATATATGGAGACCTTATGAAAAAGATTCAATGAATCCAA
TTGTAACTTCAATTCCAGGCGATTTTTATGAAAGACATGACCCTGACCATCTAAAGCCTAAATACTATAA
TCCAGAATCAAAACTTCAAAAATCTGGTCATGGAAGCTATATAGAAACAACATCAGGTGAAGTATATTTA
GTTCATCTAACATCTAGACCATTTGTACCAGAGTTAAGGTGTACTTTAGGTAGAGAAACAGCTATTCAAA
AAATGAAATGGACAAAGGATAATTGGCTTCGAATGGAAGATGAAAGTAATTTGGCAAAAGAATACGTATC
AGAAAGTAAACTAGAAGAACATTTAGTTTCATCTATACCAAGTTTTGATGACTTTGATTCAAATGTATTA
GGTTTACAGTACTATGCTCCTAGGATTTCACCATTATCATTTGCAGATGTTAAGTCTAGACCAGGATATG
TAAGGATTAGAGGTCAAGAATCAAGAACATCATTAAATAAAGTAAGCATATTGGCAAGAAAATTAACTTC
AGTATATGCAAGAATAACCACTAAGATGGAGTTTTACCCAGAGGTACATCAGCATAGTGCGGGTTTGATA
ATGTATTATGATAATATGAATTATATAAATTTAAGAAAGTATTATAGTGAAACATTGGGTCAAAGTGCAC
TATCAATAATACATCTTGAAAATGGAGAGAAGACGGAATTTTTAAATACTAGGATACCAATAAAAGATAT
ACCAATATATCTTCGTCTGTATATACAAGGTCGTAAGTCATATTTTGAATGGAGTTATGATGAAAAAAAC
TACCAAAGAATAGGAAAGGTATTTGATACAACTAAGTTTTCAGATGAGTACTGTAAATATGGAGAATTTA
CAGGTACGTTTATAGGATTAACTTGTGCAGATCGTGTAAAGCATAAACACTATGCTGATTTTGATTTTTT
TGAATATATAGCAGATGAATCAAAAGATGTCGATTAA
>ref|NC_013316.1|:55440-56813 putative xylose transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGAATACAGAAGTTAATGTTAAAGCAACTACGATTAGATATGAAAAGATTTCATTTTTTGAAAGAATTT
CTTATGGTTGTGGGGATTTGGGGTGCAATATCATATACTCAGCTATGTCAGCATTTTTGCTGTTTTATTA
TACTAATTATGCAGATGTTAGTGCAGCAGCTGTAGGTAGTATTATGCTTGTATCTAGGATACTGGATGGG
TTTAGTGACTTAACAATGGGAATTATAGTGGATAGAACTAAATCCAAATACGGTAAGGCTAGGCCTTGGA
TTTTGAGAATGGCGATTCCTTTTGCTATAGCAGCAGTATTATTATTTTCTGTTCCATCAAATCTTGGTAT
CACTTCTAAATTAATTTATATTTTTATTACATATAACTTAGTTTCTACTGTTATTTATACAGCAATCAAT
GTACCCTATGCAACTCTAAATTCACTTATAACTCAAAACCAGTATGAAAGAGGAGTATTAAGTATATTTA
GAATGATATTAGCCACTTGTGGTACCTTACTAATAAATGGACTTACACTACCTCTAGTTGAATACTTTGG
AAATAATTTATCAGCATGGACTAAAACATTCTTTGTATTTGGAATAGCATCTATAATGGTATTTTTTATA
ACATTTACTGGAACCAAGGAAAGAGTAAAAGCAGTTAAGCAAGATAGGAATGAAGTAATACCATTTAAAA
TAGGTATTAAATCTTTATTTAGAAATAAGTACTGGATACAAATAACATTATGTTTAGTTTGCATATTTAT
TGTATTTGCGATAAATGGTGGTTCATCCGTATATTATGCAAAGTTTATTTTGGGAGATGAAAAATTATTT
GGTCCTATAAATATGGTTTCAAATATATCCCAAATTATAGCTATGTTTATGGTTGCTCCTTTTATAAAAA
AATTTGGAAAAAGAAATGTATTAATAGTAGGTTCAATAATATTAATATCGTCAAATGTTATGTTTATAAT
AGTTGGACAAAACTATATAGGAGTAATATTTGCAAGTGCTATAAAGGGAATAGGAAGTGCTGGAATAGCA
TCAACAATGTTTGCTATTGTTTCAGATACTATTGAATATGGAGAATGGAAGACTGGATATAGAACTGAGG
GGCTTATAAATAGTGCATCTAGTTTTGGGTTTAAAGTGGGAAATGGATTAGGTTCAGCAATATTAGGTGC
AGTATTATCAATTGGTGGTTATGTAGGAACATCAGCTACTCAAAGTGATTTAGCTATAGTATCAATAAAA
GTATGTTTTATATACCTACCTATATTTATAACAATATTACAAATTATCATAATGTTTTTTTATAAGCTTG
ATAAAGAATATAGTACTATACTTAATGAATTAAATACTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:57258-58211 transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAATTGGAGACTTAAGATTAATGATGAAGTGTTGTTCACTTTATTACGAAGATAATTTGAATC
AACAGGAAATAGCAAATCAATTGGGAATATCAAGACCAACAATATCAAGAATATTAAAAGAAGCTTTTGA
ACAAGGAATAGTAAAAATACAGATAGTTGATGTTTTGAAAAATGATTACCAAAAAATAGAGAGAAGTTTG
GAGAGAAAATATAAATTAAAAGAAGTAATAGTAGTAGATGATAAACAAGATGCACTAACACAAAAACAAG
AACTAGCAAGAGCTGTATCTGAATATTTAACTAGAGTAGTAAAGGAAAATGATATAATAGGTGTTTCAAT
AGGAACAACACTAAAAGAAATACCAAGATATGTGGAAAAAAGTAACTGTAAAAATGTTACATTTATACCT
CTATTAGGAGGGATTGGAGACAATGAAATAGATATTCATGCAAATCAAATAGCAGTAAGTCTAGCGAGGG
CTTTTGGAGGTGATTTTAAATTATTACATGCTCCAGCTGTTATGTCTGACTTGTCTACAAAAGAGAAACT
TTGCAAAGACGAAAAAATTAAAGAAGTACTAGATTTAATAGATAAAACAACTATAGCAATTGTGGGTATA
GGAAATCCTATGAGTTTAAACTCAACAATAATGGCTTCTGGATACATGAATGAAGCAGATATAGAAGATT
TAAAAAAATACAACTCAATAGGTGCAATTTGTTTACAAGCCTTTGATAAAGAAGGAAAAACTTCTATACT
TGAATTTAATCAAAGAGTATTAGGAGTGAAACTGGAAGATTTAAAAAAGATAAAAAGAACAATAGGTGTC
GCTTCAGGAGATGAAAAAATAGAGGCAATAAAGGCATCATTAAAAGCGAAATTTATAAATAGTTTAGCAA
TTAATCACAGTTTAGCACTTAAATTATTAGAAGATTGTGACTAA
>ref|NC_013316.1|:58243-59211 acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase alpha subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGTATATGTCAATATCAAAAGAAACATTGCTTGAAATGTATAAGAGAATGAATCAGGCTAGAAAATTTG
AAGAGAAAGTTAGTTGGTTTTTTGCAAGAGGTATGGTTCATGGAACAACTCACTTATCTGTAGGTCAAGA
AGCGTCAAGTGTGGCGGCTGTAATGGCTTTAGAAAAAGGAGATTTAGTATCATTAACTCATAGAGGACAT
AGTCAATTTATAGGAATGGGAATAGACCTAAATAAAATGATGGCTGAACTTATGGGTAAAGAAACTGGAT
TTTGTAAGGGAAAAGGAGGCTCAATGCATATAGCAGATATTGAGTCAGGTAACTTAGGAGCAAATGGAGT
TGTAGGTGGAGGTCTTACAATAGCTCCAGGAGCTGCACTTACACAACAGTATAAAAAAACAGGCAAAATA
GTTTTATGTAGTTTTGGTGATGGAGCATCAAATGAAGGTACTTTTCATGAAGGAATAAATTTATCTTCAA
TATGGAAATTGCCAATAATATTTTACTGTGAGAATAATTTATACGGTATGTCAACAAGCATAAAACGTCA
TATGAATATAGAAAGTATTGCCACTAGAGCAGCTTCTTATGGAATAGAAGGAATATCAATAGATGGATAT
AACCCAATAGAAGTATACGAAACAGTACAAAAAGCTGCTGAGAAGTGTAGAAGAGGAGAAGGACCTGTAT
TAATTGAAAGTAGAACTTATAGATGGTTAGGTCATTCAAAATCAGATGCAAATGTATATAGAACAAAAGA
AGAAATAGAATCATGGAAAGCAAAAGACCCTATTGAATTTTTAAAAAATTATCTTATAGAAAATAATCTA
TCTAATGAAGATGAATTAGATAAGATTCAAGAATTTGCAAAGCAATCAATAGAAGATGCAGTAGAGTTTG
CTCAAAATAGCCCAAATCCAAAAATAGAGTCTTTATTAGAGGATGTATATGCAGACTAA
>ref|NC_013316.1|:59236-60222 acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTACAAGGGAATTAACATATGCACAAGCAATAAAGGAAGCAATGTCAGAAGAAATGAGAAGAGATG
AAAATGTAATATTTATGGGAGAAGATATAGGAATATATGGAGGGGCATTTGGTGTATCAGTTGGTATGAT
AGATGAATTTGGACCAGAAAGAGTAAGGGATACTCCTATATCAGAAGCAGCTATAGCAGGAGCGGCAGCA
GGTGCAGCAGCAACTGGTTTAAGACCTATTATGGAAGTAATGTTTATGGACTTTGTAACAATTTCTATGG
ATGCAATTGTAAATCAAGCGGCAAAAATGAGATATATGTTTGGAGGAAAAGCACAAGTTCCAATGGTTGT
TAGATGTCCAGGTGGTTCTGGAACTGGTTCAGCAGAGCAACATTCACAAAGTTTAGAAGCTTGGTTTTGT
CATGTACCAGGAGTAAAAGTAGTTGCACCTTCTACACCAGCAGATGCTAAGGGATTGTTGAAAGCAGCTA
TAAGAGATAATAATCCAGTCATATTTGTTGAGAATAAATTGTTATACAGAAAAAAAGGTTTTGTGCCAGA
AGATGATTATGTAATTGAAATTGGAAAGGCAGATATTAAAAGAGAGGGTACTGATGTTACAGTAATTACT
TATGGAAGAATGTTACAAAGTGTTGAAGAAGCAGCAGAGACTCTATCAAAAGAAAATATAAATGTTGAAA
TTATAGATTTAAGAACTTTATATCCATTAGATAAAGAGACTATAGTAAAGAGTGTATGTAAAACTGGGAG
AGTTTTAATTTGCCATGAAGCAGCTAAGACTGGTGGGCTAGGTGGAGAAATATCAGCCCTGATAACAGAA
AGTGAATCATTTGATTATTTAGATGCTCCAGTAAAAAGAATTTGTGGAAAAGATGTGCCAATACCATATA
ATCCAGAGTTAGAAAAAGCAGTTGTCCCAAGAGTTGATGAAATAGAAGAAGCAATAAAATCTTTAATTGT
TAGATAA
>ref|NC_013316.1|:60235-61281 E2 component of acetoin dehydrogenase enzyme system (dihydrolipoamide acetyltransferase) [Clostridium difficile R20291]
ATGGTGGCAAATAAAATAAAAGCCACACCAGCAGCTAGAAGTCAGGCAAGAAAAGACAATATAAAATTAG
ATAGGCTGATTGGAAGTGGAGAAAATGGAAGGATTCATTTAGTAGATGTGTTAAATTATTTAAAAGATAA
TAAAGCAAATACTACTCCTTTAGCTAGAAGAATAGCAGAAGATTTAAATATAGATTTAGAAACTATTGTA
GGTACTGGATATAGTGGAAAGATAAGAAAGTGTGATGTGGAAAAATTAACTGCAAAAGAAACTATTGTAT
CAAATAATACATCTAAATATAGTGAGAAAAAAGAGCTGAAAATTGAAAATGAAAATTCAAGCATGTTTAA
CACAGTAGAAGGAATATTTGAAAAGCCAAATCCAATGAGAGCTACTGTAGCAAAACGAATGTCAGAAAGT
TATTTTAGTGCTCCTGTATTTACATTCAATATAGAAGTAGATGCTACAGAATTGAAGGTACTTAGAGCAA
AGTTAATCGACACAGTAAAAGAATCAACTGGAGTAAAATTAACTATGACAGATTTAATAGTAATGGCAGT
ATCTAAAATACTTCCAAATCATCAAGCCTTAAATTCAGCATGGACAGATGAGGGTATATTTAGATATAAA
GATGTAAATATAGCTATTGCAGTTGGTTTAGATGAAGGCTTATATGTTCCGGTAGTAAAAAATGCAAACA
AAAAGTCTTTAAAAGAAATAGCAAAAGAAAGCAAAGAACTTGCGGAAAAAGTAAAGACAGGGAAACTTAT
GCCAGCAGACCAAGAAGGTAATACATTTACAATAAGTAATGTTGGAATGTATGGTATAACTACATTTACA
CCTATAATAAATATGCCTTCAAGTGCAATCTTAGGGGTAGGTGCTACACAAGATAAGTTTGTTCCAGTAA
ATGGAGAGGCTAAAATAAAACCTATAATGAACTTATCATTAACATCAGACCATAGAGTAATAGATGGAAC
AGTAGCTGCAAAATTCTTAAAAGATTTAAAAGAATTGTTAGAAAATCCTTTATCAATGCTTGTATAG
>ref|NC_013316.1|:61448-63178 E3 component of acetoin dehydrogenase enzyme system (dihydrolipoyl dehydrogenase) [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAGTAGAAGTAATAATGCCAAAAGCAGGAGTAGCCATGGAAGAAGGTACTATAGTATCTTGGCTAA
AGCAAGAAGGCGAAGAAGTAAAGATTGGAGAACCTATACTAGAAATAACAACAGATAAAGTTAATATGGA
GATAGAGTCAGAAGGAGAAGGTACACTTGCTGTAATCATACATAAAGAGGAAGGTGAAGTATTACCAGTA
TTTACAGTAATAGGTGTAATAGCAGAAAAAGGGGAAAATCAAGAGGAAGTAAAAGCTAAATATTTATCTG
GAAATGTTTCAAAAGAAGATATAGTTGAAGAGAATCAAAATATAGAAGTTAAAGAAGAAAAAATAAACAA
AAAAGAGTGTAATCATGATTATGATGTAGTGGTAATAGGAGGAGGACCTGGGGGATATTTATCAGCATTA
AAAGCAGCTCTTTTAGGTGGAAGAGTTGCTTTAGTTGAAGAAAATATACTAGGAGGTACTTGCTTAAATA
GAGGTTGTATCCCTACAAAGACTTATATAAAAACAGCAGAAATATTAGAAGAAATTGACCAATTATCAAA
GAGAGGTGTAAAAGTAACTGTAGATAAAGAACAGGACATTAAGAAGGCCATAAAATATAAAAATAGAGTA
GTTAAAAAACTTACAGCTGGTGTTGGCGGATTATTAAAAAGTAGAGATGTAGATGTGTTTAATCTTAAAG
CTAGTGTTAAAGAAGAGCATAAAGTAATTTTATCAGATGGAAAAGTTTTAGATACAGAAAATATAATAAT
TGCTACAGGTTCCAAAGTAAGGATATTACCTATAAAAGGAATAGAATCAAATTTAATAATAACTAGTACA
GAAGCATTAGATTTGGAAACAGTGCCAGAAGAATTAGTAATAATTGGTGGTGGAGTGATTGGTTGTGAAT
TTGCAGAGATATTCAATTCAAGAGGTTCTAAAGTAACTATAGTAGAAATGGAAGATAGAGTAATCCCAAG
AATGGATAAAGAGTTAAGCGAATCTTTAAAATATTCTCTTAGTAAAAAAGGTATAAATGTATTAACTAAA
AAGAAAGTTTCTGAATTTAAAGAAGAAGGAAATAACATATTAGTGTGCATTGAAGGTGAAGTGCCAATAA
AAGCAGATTTATGTCTATATGCTATAGGAAGAGAAGCTAATCTTTCTGGCATAGAGGACTTAGATATTAA
AATAGATAAAGGTTCAATAGTTGTAAATAGTAAAATGGAAACAAGTATACCAAGCATATATGCAGTAGGT
GATGTTACTGGAGGTGTAATGTTAGCTCATGCTGCTTTTAAAATGGGAGAGGTAGCAGCTTCAAATGCTC
TAGGTGTGAATAAAGAAGTTGACTTAGGTGCATTACCTAGTTGTGTTTATACAATTCCAGAAGTAGCATC
AGTTGGTATTACAGAAGAGGATGCTAGAAAAAAATATAATGTAAAAGTTGGTAAGTTTAATTTTGCTGGA
AATGGAAGAGCTTTAGCTTCTGGTCAAGAACAAGGATATGTGAAAGTAGTAGCAGATGCTAAATATGGAG
AAATTTTAGGTATACATATGTTTGGATGTGGTGTAGCAGAACTTATAAATCATGCAGCATCATTTAAAGC
ATTAGAGATACCTACTGATGAAGCAAGTGAGTTGATATTTGGTCATCCATGTACTTCAGAAGCTTTAATG
GAAGCTTTGGCAGATGTAAATGGAGAATGTTTACACTTACCTAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:63596-66544 putative transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGCAAAGAATAAAAAACTTAATTGAAAATGAAGATAAGAAAAATCCTTTAACAGATGAAGCGATTT
CAAGTAGGTTAAATATTCGAAGAGAAGATGTTACCTTTTTGAGAAATGAGTTAAAAATAGAAGATTCAAG
ACAAAGAAGAAAAGTTGTTTTAATTAAAGCTATAAAAGATATTTTAAAAGAAGAAAAAACTATAAATAAA
AATGATATAACAAGAAGATTAAACAGCATTGGGTTTACAGTATCAAGATTTACAGTCATACAATACTTAA
AAGAGATTCAAGATTCTGGTGACCTAAAACTTGATAAAGAGAGTGATGATAAAAAAGAAGAAATAATCAA
TAATAGAGAAAATAAAGATATAGCATTTGATAAACTCATAGGTAGTAGTGGTAGCTTAAGTACAATTATA
AAACTAGCCAAAGCAGCAATTCTTTATCCACCTCATGGTCTTCATACTATTATTATGGGGCCAACTGGTG
TTGGAAAGAGTGAGTTAGCAGAGTGTATGTATAAATTTGCAGTAGAATCATCCAGATTCCCTAAGAATGC
ACCATTTATAGTTTTTAATGCAGCAGATTATTCAGAGAATCCACAGCTTTTGCTATCACAGTTATTTGGA
CACGTTAAAGGTGCTTTTACAGGAGCTGATGAGAACAAAGAAGGATTAGTATCAAAGGCAGATGGAGGAA
TATTGTTTATAGATGAAATACATAGATTACCTCATGAAGGTCAAGAAATACTATTTCAACTGATTGATAA
AGGTATGGTCAGAAAGTTAGGAGAAACAAGACTAACACATAAAATAGATGTAATGATTATTTCAGCAACT
TCTGAGCCAATAGATTCTCATTTACTTAATACATTTAAAAGACGTATACCTGTAACAATTGAAATACCAG
AATTAGTTGCAAGACCATTAAATGAGAGGTTTGACATTATAAATAATTTCTTCTTAATAGAAGCTCAAAG
AATGGGAGCAAACATACATATAAAGTCAGATGTATTAAAAGCTCTTATGCTTTACGATTGTATAGGTAAT
GTAGGTCAACTTAGAAGTGATATTCAAGTAGCTTGTGCTAGGGGACTATTAAACCAACTTACAAACAAAC
TAAAAGAAGTAAATATAAGCATATCAGATGTACCTGGATATGTAAAACAAGGTCTTATAAAAATCAGAAA
TTGTAGAGGTAAAATAGAAAATTATGTAGATGGGGATTTAATTATAGATTCAAATCTTCAAGGTGAGATA
GAAAAGAAAAATGAAGATATATATACTTTTCCAGATGAAATATACAAACTTACTGAAAGAAGACATATTG
ATTTATTGGAACAAGGTTTAGATTTTGATGTTATAAATAGAATCATTGGAGGAGAATTAGAAAGTTGCAT
TCAAAAATACATAAAACAAGTTAAAAAAGTTTCTATTAGTAACAATCTTCCAGATATAAGTCCAATTGTT
GGAAAATATATCGTAGAGCTAACTTATGAAGTAATCAAAATAGCATCACAATACCTAAGTTCACTAGAAC
CGAATCTACATTTATGTTTAGCAGTTCACCTAAAAGCAGCTTTTGAGAGATTAAAAGAAGGAAAAGTAAT
ATCAAATGCTCATTTGAAAGAAATAATAGGAAATTATCCACTAGAATATTCTGTAGCAGAAAAGGTAGCT
CAATATTTAAAGGAAAGATATAATATAAACTTACCAAAAGAAGAAATAGGTATAATAGCAATATATTTTA
AAATGAGTAGTAGAAGAGATATGTCTGAACAAAAAAAGATAGGTGTACTTCTTATGGCTCACGGAAGAGT
AGCATCTTCTGTATGTGAGGTTACAAATAAACTATTAGGAATTAATCACGCAAGGTATTTAGATATGCCA
TTTGAGAAGAAGCCGGAAGAAATGATTGAAGAAGCTACTACAATAATAAAAGATATTGATGAAGGTAGAG
GTGTGATTATATTAGTAGATATGGGTTCACTTTCATATTTTGGAGATATTATTTCTGGAAAGACTGGAAT
TAATATAAGGACAATATCTAGATTTGATACATTGCTTTCTATAGAGGTTATACGAAGAGCAGTTTTACCA
GATTTAACAATAGACGAGATAGTTGATGAAGTTAAAGGTATAGAGCCACAAGTAAAAGAAAAGGTTAGTA
AATGTAACAATACAAAAGTAGATTTTAGAAAACCTATAATTTTAACATTATGTATTACTGGATTAGGGGG
AGCTTGTAAGATAAAAAAAATCCTAGAGGAAAATATTAAAAGTATAACTGAAAAGGTTGATATAGAACCT
ATAGGTATGATTGAATATCCAAGTCTTGATTTAGAGATAAAACAAATAAGCAATGATAAAAATGTAATCG
CCATAGTTGGAACAATTGACCCTCAGATAGCAAATATCCCTTTTTTTAGTCTAGTAGACATAAATGATAA
AGCAAAGTTAAATCAAATAAATAACCTAATTGATACAAATCAAATTGGTGAAACAAATAAAAAATATGAA
TTATCAGATTTAATACATAAAGAAGATATATTTGTGGATTTACAGGTTAAATCAAAAGAAGAAGTTCTAA
AATATATGAGTAAAAAACTTAGAGAGAAAGGTTATGTGACAAAAAATTTCTATAAAAAAGTAGTGGAAAG
AGATAACTTATTTCCAACTGAATTATCAGATGAAATAGCAATACCTCACACAGATGGAATAGATGTAATT
AGGCCAGCTATAAGTATAGCCATCTTAAAGAAGCCTATTGTGTGGAGTAAAAGTAAAGTAAAAATAATAC
TTTTATTAGCTGTAGACCAAAAGTGTTTTAATCCATTAAGCACTCTACTCTCATTTATAGAAACAGATGA
ATTTAAGAAGATAAAAAACATTAAAGATAGAGATTTTATTAGGGAGATGATATTAGATGGAGTCAATGAA
AATAATTAG
>ref|NC_013316.1|:66522-66986 PTS system, IIa component [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGTCAATGAAAATAATTAGTAGCAATTTAATTTTTAAAAATATTGAAGTGTCTAACAATGAAGATG
CATTAAAGTTTTTGGGACAACGTTTGTTTGACGAACAGTATGTAAAAGAAAGCTACATACAAGCTGTTGT
AGCAAGAGAAAAAAAGTATGCTACAGGATTACCAACAGAAATATACGGAGTGGCAATACCACATACAGAT
ATAGTACATGTAAATGAGCCAGGAATAGCAATTGGAATACTGAATAAACCAGTAAAATTTATAATGATGG
GTACAGACGATACTGAAATTGATGTAAAAGTTGTATTTATGTTAGCAGTGAAAGAGCCACAAGAACAATT
GCAACTATTAGAAAAACTTATGACTATATTTCAAGATAAGAATATACTAAATAATATTGTTGACTTAAGT
GAAGAAAGTGTGAGTGATTTATTAAACTCTAAATTGAAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:67099-67401 PTS system, IIb component [Clostridium difficile R20291]
ATGGGGGTGACTAATGTGACTAAAAAGATATTAGTTGCATGTGGAACAGGAGTATGTACTTCAACAATTG
CTATAAACAAATTAAAGAAAGCACTTCAAGACATTGGTAAATTGGATATGGTTAATATTACACAATGTAA
AGTAGTAGAAGTTGCATCAAAAGCACCTGATTATGATTTAATAATTTGTACTACACAAGTATCTAGTAGT
ATAAAAACACCAGTGATAAATGGATTACCTTTTTTAACTGGTGTCGGAATGGATAAATTAATCAATGATG
TATTAGAAGAGTTAGAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:67463-68827 PTS system, IIc component [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGGTCTTTATATGGAGATATTAAATTTCATTGTTGGTCTAGGTGCACAAGTAATGATGCCAATAA
TAATATGTATTTTTGGTTTGATATTAGGTACAAAACTAGGAAAATCTTTAAGAGCTGGTTTAACTGTGGG
AGTTGGGTTTATAGGTCTTAACACTATTATAGCTTTGCTAACAGATAATTTAGGTCCAGCTACACAACAA
ATGGTTAAGAATTTAGGGCTAAGTTTATCAATAATAGATGTAGGATGGCCAGCAGCATCAGCTATAGCTT
TTGCATCAACAGTAGGGGCTTTAATTATTCCAATAGGTCTTGTGGTAAATATAGTTATGCTAATTACTAA
TACTACTCAAACTGTTGATGTAGACATATGGGATTACTGGCATTTTGCTTTTACAGGAGCTTTAGTGGCA
GGGGCTACTCAAAGTGTAATGTGGGGAGTATTTGCAGCAGTAGCAAATATGGTAATTGTATTGGTAATGG
CAGATTTAACTGCTCCAGGTATAGAGGAATATTTAGGTATGCCAGGTATATCTCTTCCTCATGGATTTAC
ACAGGCATTTGTTCCAATTGCTATAGTAGTAAATAAATTATTAGACCTAATACCAGGTATAAATAAGATT
GAGATAAATGCTGATACATTGCAGAAAAAATTTGGATTATTTGGAGAACCTTTAATAATGGGGTCTGTAA
TAGGTGTAATAATTGGTATTGCTGCGAAATATGATATAAAAGGAATATTACAATTAGGTGTAACTATGGG
AGCTGTATTAATATTAATTCCAAAGATGGCAGCATTATTAATGGAAGGATTATTACCAGTATCAGAAGCT
GCACAGGAATTTATTGAGAAGAGATTTAAAAACAGAGGCAAGATTTATATAGGCTTAGATTCAGCAGTAG
GAATAGGTCATCCTGTTACATTATCAGTTGCACTAGTGTTGGTTCCTTTGACTATACTTATAGCAGCTAT
ATTGCCAGGAAATAAAGTTTTACCATTTGCAGATTTAGCAGTAATTCCATTTGCACTTGTATTAATCGTA
CCAATTACAAAGGGAAATGTGTTTAGAACATTAATAATAGGAATAATTATAATTACTTCTGGATTATTAA
TCGCAACTAACTTAGCTCCATTATTTACCCAAATGGCTTTAAATGCTAGCTTTAAAATGCCTGAAGGAGC
AACTATGATTTCAAGTATTTGTGATGGTGCGAATCCATTAAGTTGGGTATTTGTAAAAGTTATGAACTAT
AAAGTTATTGGAGGAGTAGTTTTTGGAGTTATAGCTTTAGGAATGGCTATTTACAATAGGAATAGAATAA
TAAATGAAAATAAAAAGCTATCTATAGAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:68862-69335 hypothetical protein CDR20291_0033 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAATATAAATATGATTCTAAAAGGTACTTACTCAGTGTTACAATACCAGGATTTTTTATGATTT
TAATATTGATTTATGCACTGTTTAATAACTATATAAATTTTAATTTGAATATATATAGTTTGTTAATAAT
TGTCTGTACTTATGGTATATTCAATACTTTTATATCATCAAGTAATCCTAAAAAAATTATTATTGACAGC
AAATGTATACATTTTACCTCATTTATGACTACACATAAGTATGAAATTAAAGATATAGAAAAGATAAGAA
TAAGAGAATTTTATAATAAAAAAATTTATCTAAAAATTAATGATGGAGACCTTTTTAAAGGTAGGTATTG
GATAAGAACAAATATGTTTAATAATAGTATAGCATTATATAGTTATTTCATTGAGTTGGAAGAGTGCTTA
TATCCAGATTCACTAAGATTTAGAAATAAAAAATTTGAGAATAAGAATATATAA
>ref|NC_013316.1|:69507-70157 putative sugar-phosphate aldolase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTATTAGAGAAATTAAGAAAAGAAGTATTACAAGCATCTTTAGACCTTTTAAACTATAATTTAGTGA
CATTAACAGGAGGGAATGTAAGTGGGAGAGATGAACAAACTGGCTATATAGCAATCACCCCAAGTGGAAT
GGATTATAGAAATCTTACACCAAGTGATATTGTTATAGTAGATGTAGATGGAAATATTATAGATGGAAAA
TGGAAAGCATCAGTGGATTTATCAGACCACTTGTATATATATAAGCATAGAGAAGACATAAATAGTATAA
TTCATACACATTCTACATACTCAAGTTGTTTTGCTATTTTAAATGAACCTATAGAATGCGCAAGTACAAC
TCTTGCAAATGAAGTAGGGGGTTCAGTACCAGTTGCAAAATTTTCACCACCAACATTTAAAAAGATGGGA
AAATGTGTTATTGAAGCAATTGGTGACAAAAGAGCATGTCTTTTAGCAAATCATGGCGTAATTGCAGTTG
GTCCATCTGTAGGACATGCTCTTACAGCCGCTGTAATGTTAGAAGATTCAGCAAAAGTATATTACTTAGC
AAAATCAATTGGCACACCAGTGCTACTGCCTGATGAAGAAATTCAAAGAGCGAGAGATGTATTTTTTAAT
GTCTATGGTCAGGATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:70331-71263 putative lipoate-protein ligase [Clostridium difficile R20291]
ATGTATTACTTATTAAACAAAAGCACAAATCCTTACTTTAATTTGGCATTAGAAGAATATCTATTTTTAA
ATGATAAATATAATGATGATATTATAATCATATGGAGAAATGAAGACTCCATTTTTATAGGTAAAAATCA
AAATCCATATCAGGAAGTACATCATGATGTTATTGAAAAGGGAGAAATTCCTATTTTAAGAAGAATATCT
GGAGGGGGCACTGTTTATCATGATTTAGGTAATATCAATATGTCATTCATACAAAAAGATAGGCAACTTC
ATGAGATAGATTTTTTGGAGCATACTAAGTTTATGCAAAAGATGCTTTCAACCTTAGGACTAGATGTATC
TATAACTGAAAGAAAAGATTTATTTTTAAATGGGAAAAAAATTTCAGGCTCTGCACAGTCTATAAAAAGA
AAAAATTCTCTTTATCATGGAACTCTTCTTTACGATTCAGATTTAAATAAATTAACTAAATATTTAAATT
CAAATAAAGCAACTGAATCAAATGCAACTAAATCTGTTTCAAGTAAAGTTACAAATATTAAGTTTTTACT
CGAAAAAGATATAAATTACTTTTTAGATTATTGTGTTGAATATTTAAAATCTAATATAAAGAATATAAAA
GAACTTGAATTGGATGAAGAAGATATTAAAAGTGTATACAATATAGGAGAAGATAAATATAGAAAGATAG
AGTGGACATATGGTAAAACGCCGAAATTTCAAGTAGTGCTACCATTTAATAATGAAAGTAAAATAAATAT
ACATGTTAACAGATGGAAAGTATCAAAATTTTTTATTTCTTATGATGATAATGTAATTAATATGGATAAG
TTGTTAGATTTGAATTTCTTTAAAGAAGAAATAAAAGAGAGTATTTTAGAAAATTATCCACATTACATAG
ATTTAATCAATTTAATATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:71504-72250 2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGATGGTTAAAAATAAAATACGAGGTGATACCATGTACAGTGTTATAATTGTTGCAGCGGGAAGCGGAA
GGAGAATGAACTTAGATATAAACAAACAGTTCATAAAATTAAGAGAAAAAGAAATTATTGCTCATACAAT
TCAAGTTTTTTATGAAAATATAAATATAGATGAAATAGTGGTATGTATAAAAAAAGAAGAAGAGGATTTT
TTTAAAGAAAATATAATAAATAAGTATAACTTTAAAAATATAAAAATAGCATATGGCGGAAAAGAAAGAC
AGGACTCAATATATAATGGTTTAAAAAAATTAGATGAAAATTGTGATATAGTACTTATCCATGATGGAGC
AAGACCATTTGTCGACCATAGAATAATCAACGAATCTATAAAGGTAGCTAAAGAAAAAAAGGCTGTGGTT
GTAGGTGTTCCAGTAAGTGATACTATAAAGATAGTGTCAGATGGAACAGTACAAGAAACTCCAGAAAGAA
ATTTGTTGTGGGCAGCACAAACCCCTCAAACCTTTGAATATAATCTCATAATAGATGCTTATGAGCAAGC
ATATAAGAACAATTATTATGGTACTGATGATTCAATGTTGGTAGAAAATATAGGTCAAAGTGTCACTATG
GTAATGGGTTCTTATGAAAACATAAAAATAACTAGTCCAGAAGATTTAAATATAGCAGAACAAATATTAA
ATATGGAAAAAAGAGATGAAGTTAACAGTAGAAGGAGAATTATATGA
>ref|NC_013316.1|:72247-72732 2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAATAGGATTAGGATATGATGTACACAAATTAACAGAGAATAGAAAACTTATAATCGGTGGTGTAG
AGATACCACACGATAAAGGTTTGTTGGGTCATTCTGATGCTGATGTATTGATACATGCAATAATGGATTC
TATTTTAGGTGCTCTAGCATTAGGAGATATTGGGAAGCATTTCCCAGATACAGATGAAGAATATAAGGGA
GCAGATAGTATGAAATTATTAGAACATGTGTATAATCTAATAACAAGTAAAGGATATAAAATTGGTAATA
TAGATAGTACTATAATTGCTCAAAGCCCTAAGATGGCTCCATATATTGAGAGTATGAGAAGTAATATATC
AAAAGTTTTAAACACAGACATTGATAATATAAACATAAAGGCAACAACAGAAGAAGGTCTTGGTTTTACA
GGAGCAAAACAGGGAATAGCTTCACAAAGTATTTGTTTATTATTGTTGACAAGTCAGAATAATTAA
>ref|NC_013316.1|:73099-74814 prolyl-tRNA synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATGTCAAAAATGTTTATGCCGACATTAAAAGAAATCCCAGCAGATGCTGAGATTACAAGCCATC
AATTAATGGTTAGGTCAGGCATGATAAAAAAAATGACTTCAGGTGTTTATAACCAATTACCAATGGGGTT
AAGAGTGTTCAAAAAAATTGAACAAATAATTAGAGAAGAATTAAATAAAAAAGATTGTCAAGAAATACTT
TGTGCAGCCTTACTTCCTTCTGAATTATGGAAAGAGTCTGGAAGGTGGACTGCTATGGGTGAAGAAATGT
TTAGACTAAAAGACAGAACAGAAAGAGAGTACTGTCTTGGGCCAACACATGAAGAAGCATTCACTGATAT
AATAAGACAAGAAATTACTTCATATAAACAATTGCCACTGAACTTGTACCAAATACAAGTAAAATATAGA
GACGAGAGAAGACCAAGATTTGGTGTTATGAGAACTAAGACTTTTACAATGAAGGATGCATATAGTTTTG
ATGTAGATGATAAAGGTTTAGATAAGTCATATCAAGATATGTTTGATGCATATGTAAGTATATTTGATAG
ATGTGGATTGGAGAATAGCCCTGTACAGGCAGATTCAGGAGCTATAGGAGGTTCTACATCAGCCGAATTT
ATGGTTAAGTCAGAAGTTGGTGAAGATGAAGTTGTATTTTGTAGTGGATGTGATTATGCAGCCAATGTAG
AAAGAGCAGAATCTTGTAATCTAGCATCACAAAAAGAAGAAATGAAAGAATTAGAAGAGGTTCATACACC
AGGAGCAGCTACAATAAAAGAGTTAGAAGAATTTTTAAAAACTTCTCCAGATAAGTTTGCTAAAACTTTA
GTATATGAGGCAGATGGAAAAACAGTTGTAGTCGTTGTAAGAGGAGATAGAGAAGTTAATGAAATCAAAG
TATCTAATGCTATAGGTTCTGTTATAGAATTTGCTCTTGCTACAGATGATGTAGTGAGAAAAGTAACTAA
TGCAGAAGTAGGATTTGCAGGTCCAATAGGTATAAATGCTGACTATGTATTTATAGATAAAGAAATTGTT
GAACAAAGAAACATAGTTGTTGGGGCTAATAAAACTGAGTACCATATAAAAAATGCTAACTATGGAAGAG
ATTTTGAAGGAATAGTTGGAGATTTTAGAAATGTTCAAGAAGGCGACCAGTGTATAGTATGTGGTAAGCC
ACTTGAAATAGCTAGAGGTGTTGAAGTAGGACATATATTTAAACTAGGAACTAAGTACTCAGAATCTATG
AATGCAAACTTCATAGACAAAGATGGAAAATCAAAGCCTATAGTAATGGGATGTTATGGAATAGGTGTTG
AAAGAACAGCAGCAGCTATAATTGAACAACATAATGATGAGAAAGGTATAATATGGCCTTTGTCAGTAGC
TCCATACCATGTTGTGATAGTTCCAGCAAATATGAAAAATGAAGAACAAATATCAATAGCTGAAAATATA
TATAATGATTTGCAAGCTATGGGTGTAGAAGTTTTATTAGATGACAGAGATGAAAGAATAGGTGTCAAAT
TCAATGATTCAGAATTAATAGGAATACCTATGAGGATTACAGTAGGTAAAAATATTAATGAAGGTAAAGT
AGAATTTAAACTTAGACATAAAGAAGATAAAGAGATAATTGACATAGAAGAAATAAATGAAAAAGTAAAG
GCAGAGTTTATCAGGAATAATGTTAGGTTAGGATAA
>ref|NC_013316.1|:74849-76381 putative dual-specificity prolyl/cysteinyl-tRNA synthetase [Clostridium difficile R20291]
TTGTACTTTATAGACACCATTTTATCTATATATAAGGATATAAAATGGTGTTTTTTTATAAAACAAATAA
ATGAGGAGGTAATTGAAATGGCAAAAAATGAAAAACAATTTGTTGAAGAAATAACAAAGATGGAAGATGA
TTTTCCACAATGGTACACAGATGTAATAACTAAGACTGACTTAGTTGATTATGCACCAGTAAAAGGTTTT
ATGGTTGTAAAGCCATATGGATATGCATTATGGGAAAAGATGCAAGAATTTATGGATAAAAAATTTAAAG
AAACTGGACATAAAAACTGTTATTTTCCATTATTAATACCAGAGAGTTTATTAAACAAAGAAGCAGAACA
CGTTGAAGGTTTTGCTCCAGAAGTTGCATGGGTAACACATGGAGGAAATAAAAAATTAGAAGAAAGATTA
TGTGTAAGACCTACTTCAGAGACTATAATATGTACAATGTATGCGAAATGGTTAAAATCATATAGAGAAT
TACCATATCTTTATAATCAATGGTGCTCAGTTGTTAGATGGGAAAAATCAACTAGACCTTTCTTAAGAAC
ATCTGAGTTTTTATGGCAAGAAGGTCATACATTACATGAAACAGCAGAAGAAGCACAAGAAGAAACAATA
CAACAATTAGAAGTATATAAAGCGTTATGTGAAGAATTACTTGCAATGCCAGTTGTAGCTGGTCAAAAAA
GTGAAAGTGAGAAATTTGCAGGTGGTGAAAGAACATATACTATAGAAGCTATGATGCATGATGGTAAAGC
ATTACAATCAGGGACAAGTCACTTCCTAGGTCAACACTTTACTAAGGCTTTTGATATTACTTTTGCAGAT
AGAGAAGGAAATTTAGCTAATCCATACCATACATCTTGGGGAGCATCTACAAGACTTATAGGTGGACTTA
TAATGACTCATAGTGATAACAGAGGTTTAGTATTACCACCAAGAGTAGCTCCAATTCAAGTTGTTATAGT
TCCTATAGCTGCTAAAAAAGGAAATGTAATGGAGACTGTTGATAAAATATATGCTGATTTAAAAACTAAG
GGAGTAGCCGTAGAAGTTGATGATAGAGATAACTATACAACTGGATGGAAATTTAATGAGTGGGAAATGA
AAGGTGCTCCAGTAAGAGTTGAAATTGGACCAAAAGATATAGAAAATAATCAAGCTATGGTATTTAGAAG
AGATACTTTAGAAAAGGATTCTATGCCTTTAGAAGGATTAGCTGATGCTATATGTGATTTATTTGATGTT
ATACACAATGATATGTTTGAAAAAGCAAGAAAACATAGAGAAGACAATACATCTATAGTTGAAAATATGG
ATGAGTTTAGAAAAGCTTTAGAAGAAAAGCCAGGATTCATAAAGACTATGTGGTGTGGAGATGCAGAATG
TGAAGCTAAGATTAAGGAAGAAACAGGAGCAACTATAAGATGCTTACCTTTTGAACAAGAAAACTTAGGT
CACAAGTGTGTGTACTGTGGAAAAGAAGCAGATAGTATGGTAGTAATGGCAAAAGCTTACTAA
>ref|NC_013316.1|:76821-78302 glutamyl-tRNA synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGTAAGAGTAAGGTTTGCACCAAGTCCAACAGGATTTGTACATATAGGTAGTTTGAGAACTGCTT
TATATAACTATTTATTTGCAAAAAAAATGGGTGGAGAATATATATTAAGAGTGGAAGATACAGACCAAAG
TAGATTAGTAGAAGGTGCTATAGAGAATATGCTTAATGCTATGAAATGGGCTGGTGTCAACCATAGTGAA
GGTGTTATATTAGATGATAGTGGAAAAGTAGTACAAAAAGGAGAATATGGTCCATATATTCAATCTCAAA
GATTAGATATATACCAAGAATATATAAAGCAACTTTTAGATAGTGGAAAAGCTTATTATTGTTTCTGTAC
AAAAGAAAGACTGGATGAAGTAAGAGATGCTCAAAGAGCAGCAGGAGAAACAGCTAAATATGATGGTCAT
TGTAAGAATCTTTCTAAAGAAGAAGTAGAAGCGAATATAAAAGCAGGAATACCATATGTTATAAGATTAA
GATTGCCAGAGAATCATACAATTAAGTTTACAGACTTAGTTAGAGGAGATATGGAATTTAATACTAATGA
CCTAGATGACCAAGTATTAATGAAAACAGATGGATTTCCAACTTATCATTTTGCAGTAGTTGTTGATGAC
TATTTGATGAAAATTACACATGTTATAAGAGGAGAAGAATGGGTATCATCTACTCCAAAACATGTTTATT
TATATGAAGCTTTTGGATGGGAAGCACCTGTATTTGTGCATTTACCAAATATACTTAATAAAGAAAAGAA
AAAATTAAGTAAAAGACAAGGTGATGTAGCTGTTGAAGACTTTAAGAAAAAAGGATATTTACCAGAGGGA
TTAGTAAACTATGTAGCATTAGTTGGTTGGTCTCCTGAAGATAATCAAGAATTGTTTACAATGGAGGAAT
TAGAAAAAGCCTTCTCTGTAGAAAGAGTATCTAAAAGTGGTGGAGTATTTGATACTGAAAAATTAAATTG
GGTTAATCAGCACTATATAAAAGATGGTGATGATGCTTATCTAACAGACTTAGCAATACCATTTTTAGTA
GAAGATGGATTTATAACAGAAGAAGAAGCTACTAATAAATATGATTTCTTAAAGAGTATGATATCAGTAC
TTAAAGAGAAATTACAATATGTAAAAGAAATTACTGAACATGCAAGTATATTTTTTGGAGATAAAATAGA
GGTAGAAACTGAAGAGGGAAGAGAGTTCTTAAGATTAGAACATATACCTACTTTAATAGATGCTTTGAGA
GAAAAAATAGAAAAAACAGAGGTATTAAATGCTGAGTTTGTTCAAGCTATGCTTAAAGAAATACAAAAAG
AGTACAAAATAAAAGGGAAAAATTTATTTATGGGCTCAAGAATAATTTTGACAGGGCAAATGCATGGTCC
AGATTTACCAAAAGTAATGGAAGTTTTAGGAAAAGAAACTTGCTTAAATAGAATAGCTTATGTAAAAAAT
AATATATTATAG
>ref|NC_013316.1|:78817-80220 cysteinyl-tRNA synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTGTGAAAGTTTATAATACATTGACTAGAACAAAAGAAGAATTTGTTCCATTAGAAGAAGGAAAGG
TAAAAATGTATGTGTGTGGTCCAACAGTTTATAACTATATACACATAGGTAATGCAAGACCATTTATAAT
ATTTGATACTCTAAGAAGGTATTTAGAGTATAGAGGATACGATGTAACTTATGTACAAAACTTTACAGAT
GTTGATGATAAGATTATAAATAGAAGTCATGAGGAGGGAATATCTCCTGAAGAAGTTGCGGCTAAGTATA
TAAAAGAATATTTTGTAGACTGTGATGGGCTAGGGATAAAAAGAGCTACTGTTCATCCTCAGGTTACAGA
TAATATACAACAGATTATAGAGTTTATAAAAGAGTTGGAAGATAAGGGATATGCATATGCAGTAAATGGT
GATGTATATTTTGATACAAATAAATTTGAAGGTTATGGAAAACTTTCAGGTCAAAAACAAGAAGATTTAG
AGGCAGGGGCTAGAATTGAGGTTAATGACCAAAAAAGACATCCTATGGACTTTGTTCTTTGGAAGGCAAA
AAAAGAAGGTGAGCCAGGATGGGATAGCCCTTGGGGAGAAGGTAGACCAGGATGGCATATAGAATGTTCT
GTTATGTCTAAGAGATATTTAGGTGAAACAATTGATATACATGCAGGTGGGCAAGATTTAACATTCCCAC
ATCATGAAAATGAAATAGCTCAAAGTGAAGCTAGAAGTGGAAAAATATTCTCAAAATACTGGATGCATAA
TGGATATATAAATATAAATGATGAAAAGATGAGTAAATCAAAAGGTAATTTCTTTACAGTAAGAGATATA
TCAAAATTATATGATTTAGAGATAGTAAGATTTTTCATGTTATCAGCACATTATAGAAATCCAGTAAACT
TTAGTGATGAGATGTTAAATCAAGCTAAAGCAGGTCTTGAAAGACTATATAATACTAAAGAAAAATTAGA
ATTTACGCTAAGTAATTTAGTAGAATCTCCTTTAACAGAAAAAGAAGTAGAGCTTGTTAAAGAATTAGAT
GACTTTAGACAAAAATTCATAGATGCTATGGATGATGATGTTAATACAGCAGACGCAGTAAGTGTAATAT
TTGAATTAGCTAAGTTAATAAATTCTAATGTAGATGAAAATTCTTCTTTGGAGTTTGCTAAAAAATGCTT
AGATGAATTTAATGAACTTACAGGAGTATTAAATATTGTAAATAAGAAAAAGGATACTGTATTAGATAAA
GACATTGAAGAATTGATACAAAAAAGAACTGATGCAAAGAAAAATAAAGAGTTTCAATTAGCTGATGATA
TTAGACAACAATTACTAGATATGGGAATTGTATTAGAAGACACAAGACAAGGTGTTAAGTGGAAAAGGAT
ATAA
>ref|NC_013316.1|:80223-80618 hypothetical protein CDR20291_0042 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAAACTGAATTAGTTACTATGTCACCATTAGTTTTAGCATACTTAGGTGATACAGTGTATGAGA
CATATATAAGAGAATATTTAATTAGACAGAATACACAAAGAAAAGTTAATGATTTGCATAAACTAGCTAT
AAAGTATGTAAAAGCTAAAGCTCAGGCAACTATAATTCATGAAATTGAAATTGAGTTAACTGAAGAAGAG
AGTAAAATTTATAAAAGGGGAAGAAATCAAAAGTCAAATACTTCTCCTAAGAATGCAGATATTATAGACT
ACAAACATGCAACTGGGTTTGAGGCATTAGTGGGATATTTGTATTTAAATAATGAAATAGAGAGACTTCA
ATATATTATCAATAAAGGAATCAAAATTATTGAAAGAGATATGTAA
>ref|NC_013316.1|:81126-81956 thymidylate synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTTAGCAGATAAAATTTTTATTGATATGTGTAATAATATTCTTGAAAATGGAGTATCATCAGATG
GAGAGGTAGTTAGAGCAAAATGGGATGATGGCCAGCCTGCTCATACAATAAAGAAGTTTTGTGTAGTAAA
TAGGTATGATCTTTCAAAAGAATTCCCAATACTTACACTAAGACCAACAAACTTAAAAGCAGCAATAGAT
GAATTACTTTGGATATGGCAAAAAAAATCTAATAATATAAATGATTTGAATAGCCGTATTTGGGATAGCT
GGGCTGATGAAACAGGTTCAATAGGGAAAGCTTATGGATACCAAATTGGACAGAAACATAAATACAAAGA
AGGAGAATTTGACCAAATAGATAGAGTGATTTATGACTTGAAATATAATCCTTATAGTAGGAGAATTATA
ACTAATATATATAATCATAATGATTTAAATGAAATGAATTTATATCCTTGTGCATATAGTATGACATTTA
ATGTAACTGGAAATAGATTGAATGCAATATTAAATCAAAGATCAAATGATATTTTGGTAGCTAATAATTG
GAATGTAACTCAGTATGCAATTTTAGTTCACATGTTAGCACAAATAAGTGATTTGGAAGTAGGCGAATTG
GTTCATGTTATAGCGGATGCACATATATATGATAGACATATTCCTCTAGTTAAAGAGCTTATTAATAGAG
AATCTTATGATGCACCAAAATTAATAATAAATCCAAACATAAAGAATTTCTATGACTTTAGAGTTGAGGA
CTTTACATTAGAAAATTATAAAAGTGGGCCACAAATCAAAAAGATTCCTGTGGCAATTTAG
>ref|NC_013316.1|:81969-82463 dihydrofolate reductase region [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTTATAGTAGCTGTAGATTTAAATTGGGGAATTGGTTATGGTGGAAAGTTACTACAGTCGATTC
CTGAAGATATGAAATTTTTTAAAGAAAAAACTGTAGGTAATGTAGTTGTAATGGGGAGAGAAACCTTTAA
ATCATTACCAGGAAAAAAAGCATTAAAAGATAGAGTGAATATAGTCTTGACTAGAAGTAAATCTTTTAAT
GATGATAGATTGATTGTTTGTAATTCTATAGATGAAACTCTTAAGGAACTACAAAAATATGAAAATGATA
AAATTTTTATAATAGGTGGAGAAACAGTATATAAACAATTTTTACCTTATTGTAATGAACTATATGTAAC
AAAAATACAGAAGACATATGAGGCGGATAGATTTTTCCCTAATATAGATATTATGTCAAACTGGGATTTG
ATTAAAGAAAGTGAAGTAAAAGAATATAACAATATAAGATATGTTTTTTCAACATATATAAATAATAGTT
TATAG
>ref|NC_013316.1|:82490-83866 hypothetical protein CDR20291_0045 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGGATATATTTGTAAATAGAGTTTCTAATGCTTTAGAAAATGATAGAGGCGCAGTTTTTGTAG
GTAGTGGTATATCGTTTAGTTCGACTGAAGTTGATTGGTTTAAATTACTGGAGCCATTAGTAAATGAACT
TGATATAACATTAGACAATAAAAGTGATGATTTACCTATGATTGCTCAGTACATAGTAAATAATTATTCA
GGAAATAGAGGGCCTTTAGTAAACGAAATATCAAAAACATTTAATAGAAAGTTTAAACTAAACAAGTATC
ATAAGTATTTAGCAACAACTAAACTTTCAACAATATGGACAACTAATTATGATATGTTGTTAGAAGATGC
ATTTTATGATTTTGATACATCGGTTAAAGTAAGTGATGATTCTATTACAAGGAATAGACTAGAATATGAT
GTGGAAATTATAAAAATGCATGGATGTATTTCTAGATCCGATTGGAATGAAATAGTTATAACTCAAGAAG
ATTATGATGATTTTTCAATAAATAAACCAGCTATATCTCAAAGATTAAGTGAAGATTTAATAAATAAGTC
TTTTCTATTTATTGGATATAGCTATAGAGATCCAAATATAAGAAATATAATGATAAATGCTAGAAGGCTA
AGTAAAAAACATACTCAACAACATTATATAATTTTAAAAAAGTTAAAAGATAGTGATAGTAATATTACGC
AAGATGATGTAGTAAGACAAGAACTTTGGTGCAATGATTTAAAACGTTTGGGAATTTCAACTTTATTTAT
AGATGAATACTCAGAGTTAGAGGAACTTTTAAGAGAGATAAGTCAAAAATCAAGAGGTAAAACAGTATAT
GTGACAGGTTCTCATAAAGAAAGCAATATGAATGCAAGAAAATTAGGAACCAAGCTAGCAAAACATAAAG
ATATTACTTTACTAAGTGGTCAATCATCTGGTATTGGCTCAGAGGTAGTTGCTGCGTTTACTGAAGAGTG
TATTAAGAGTAAAGAAGATATTATAAATAGAATGAAAATATTTCCTAATCCATATTCAGCTGATGAAAAA
TACTCTGATGATATTACTTTAATACCAGATTTAAAGAAATGTAGAACTAAAATGTTGAATTCAACACAAG
TTGTAGTTGTATTTAGTGGAGGTATAGGTACTGAAGCAGAGATAGATGTTGCTATAAAACAAAACTGTAA
TATAATTCCTGTTATAACATGTAAAGAGGATAGAGAGAATCCAGCTATAAAAAAAATCTTAAACTATAGT
GATAATATGAAAAATATAGAAATAAAAGATGCTACCTATTATAATAAAATAGTAGATGAAGATGGTGTTG
TAACAATGGAGGAAATTTATATATGCATATCAAAAATAATGAATTAA
>ref|NC_013316.1|:84193-84942 thiamine biosynthesis protein thic [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATGGAGTTGGGATGATAACGATTCATCCAACAGCAAATAAACAAATTTTTGAGGATTCTAAGA
ATAGAATGGTACCTGTCACATCTAGAGGTGGAGGTATGGTAATACAAGATTTAATCTCAAAAAATTTTTC
AGAAGATAATGTGTATTTGAAAATATTGCCAGAAATTATAAAGTATGCTCAAAAACATAATGTTTGTATC
AGTCTAGGTGCAACATTTAGATCAGGAAACATATTTGATTCTAATGATAGAGCACAGATAACAGAAATTA
AGAGTCAAATAGAATTAGCTAAGAGGATATATAAAAGTAATGTCGGGGTTATTATTGAATCACCAGGTCA
TTCAAGACCAAGTGACATAATTAAAATATCGTCAATATTAAAAAAAGAAGGTTTCCCAATTATGCCACTA
GGACCAATACCAACAGATATTGCAATAGGAATGGATCATATCGCTGCAGCTATTGGTGCTACAATTATGG
GTATAGAAGGATGTGCAAATATAATATCAACTGTCACACGAGAAGAACATACTGGAGGGAGACCTTCTAT
TGAATCCACAGTTGAATCTATAAGAACAGCAAAAATAGCTGCTCATATTATTGATATACATCAAATGAAT
GATATTAACTTAGATATGAGTGTATCTAAGTCTAGAGCTAAATCTAACACCTGTATATTTGGGAAAGATA
CAAGATATTGTGACAGATGTAGAGAACTGTGTCCTTTGTGCATTAGATAA
>ref|NC_013316.1|:85108-85410 putative thymidylate synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAATACCAAGAGGATTATGATAAATTAGTAGAGATACTATTTGAAAATCATTATAACAAACTAA
TAAAAGGTGGTAAAAACGAGAAAACATCAAAAAGACAAGTTGAGAAGAAAGCAATAGAAGATGCTAGATA
CGTATTTCCAAATGCGTGTGAAACAAAGATGGTATTTACTATAAATGCTAGAAGTTTGTTTAATTTCTTT
GAACATAGATGTTATGAAAATGGGAGTTGTCTAGAAGGAACTATGACTTGTGGAGATATAGTTCAAGTTA
GAAAAAAATTTAAGAACTTGTAG
>ref|NC_013316.1|:85414-86160 putative tRNA/rRNA methyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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ATAAAATATTAATTGCAAATTCAGCTAAAGAAGGTTCAATTAAGAAAATAATAGGAATGGCTAAAGATAA
GAATATAATTATTCAGTATGTTGATAAACATAAGCTAGATGAAGTAAGTACAAGTCATTCACATCAAGGT
GTAATAGCTTATGCAAGTGAGTATAAGTATTATGAATTAGATGAGCTAATAGATTTAGCAAAGAATAAAG
ATGAAGACCCATTTTTCATTATATTAGATGAGATAACAGACCCACATAATTTGGGTTCAATAATAAGGAC
AGCAGATGCAGTAGGAGCACATGGAGTTATCATTCCAAAAAGAAGGTCTGTACACATAACTCCTGTAGTT
GCCAAAGCATCTGCTGGAGCAGTAGAATATATGCCAGTTTGCAAGGTAACCAATATAGTTAATACAATAA
AAAGACTCAAAGAAGAAGGGCTGTGGATTGCTGCAGCTGATATGGATGGAGAAACTTTTTATAAACAAAA
TCTTACTGGTCCTCTTGGTGTAGTAATTGGAAGTGAAGGTTTTGGAATATCTAGATTGGTTAAACAAAAC
TGTGACTTTATAGTAAAAATGCCAATGATAGGTAATGTTACATCTTTAAATGCATCTGTAGCAGGTGGAA
TACTTTTATATGAGATATTCAGACAAAGACTGGATAAAAGTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:86163-86690 hypothetical protein CDR20291_0049 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAAATATAAATCATTACTTAATAATAGATGGCTACAATATTATAAATGCGTGGGACAATTTGA
AAGAACTGGCTAAAGAGGACTTAGAAGATTCTCGAGAAAAGCTTATTGATGACATTATAGAATTTTCTGA
GTTTATGGGTTATAAGACTATAATAGTTTTTGATGCTTATAATGTTAAAAATTCTCGAGAAAAAGTTGAA
AAAAGAAAACACATAACAATAGTTTATACAAGAGAACACCAAACAGCAGATAGTTATATAGAGAAATTTA
TAACTTCTTTATCAAAGTATGATGATGTAAAAGTAGCCACTAATGACTATGCAGAACAGCAAATGATTTT
AGGAAAAGGTGCTACTAGAATGTCTGCAAGAGAATTAAAGTTAGAGTTAGATCGTTCCAAGAATAAAATG
AAGGAAAAAAATATCGGTTTGAGGAAAAAAATTCAGCGAAATTGGTTGGAGGAAAGGTTAGATAAAGAAA
CATTGTCGAAACTTGAGAACATTCGTAGAAAGCGTTGA
>ref|NC_013316.1|:86740-87402 RNA polymerase sigma-H factor [Clostridium difficile R20291]
ATGGGGGAGATTTACATGTTGGTAGCAAAAGAAAAAAGTTATGAGTTAGTGGACAATTGTCAGCAGGATG
AGTATAACATTGTATTAAGAGCAAGTGAAGGGGATAAAATAGCACTAGAGTACATTATTACTAAATACAG
AAATTTTGTAAAGGCAAAAGCAAAGTCATATTTTTTAATTGGAGCAGATAAAGAAGATATAATACAAGAA
GGAATGATAGGCCTTTATAAGGCAGTTAGAGATTTTGATGGAAGTAAGACCAATTCATTTAAATGTTTTG
CGGAGATATGTATAACAAGACAAATAATAACTGCTATAAAAACTGCAACAAGACAAAAACATATACCTTT
AAATTCATATGTTTCTTTGAATAAACCAATATATGATGAAGAGTCAGACAGAACACTTTTAGATATTATA
GCTACAAGTATAGTAACAGATCCAGAAGAGCTTATAATTAGTAAAGAAGAGTTAAAAAATATAGAATCAA
AAATGAACGAATTGTTAAGTGACTTGGAATTAGAAGTACTAGAATTATATTTAAATGGAAAGTCATACCA
GTTTATAGCGGACAAGCTTAAAAGAGATGTAAAGTCAATAGATAACGCTTTACAAAGGGTTAAGAGAAAA
TTAGAAAAACATCTTGAAAACAGAAATGATTAA
>ref|NC_013316.1|:87476-88669 elongation factor TU [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTAAAGCTAAATACGAAAGAACAAAACCTCATGTTAATATAGGGACAATAGGACACGTAGACCACG
GTAAAACTACATTAACAGCAGCAATAACAAAAACATTATATGACAGATATCAATTAGGAGAAGCAGTAGA
TTTCGCAAACATAGATAAAGCTCCAGAAGAAAGAGAAAGAGGAATCACAATATCAACAGCACACGTTGAG
TATGAAACACCAAATAGACACTATGCACACGTTGACTGCCCAGGACATGCTGACTACGTTAAGAACATGA
TAACAGGAGCAGCACAAATGGACGGAGCAATATTAGTTTGTTCAGCAACAGATGGACCAATGCCACAAAC
AAGAGAGCATATACTATTATCAAGACAAGTTGGAGTACCATATATAGTAGTATTCTTAAACAAATGTGAC
ATGGTAGATGATGAAGAGTTATTAGAGTTAGTAGAGATGGAAGTAAGAGATTTATTAACAGAATATGATT
TCCCAGGAGATGACACTCCAATAGTAAGAGGTTCAGCATTAATGGCATTAGAAGATCCAAAGAGCGAGTG
GGGAGATAAGATAGTAGAATTATTCGAGCAAATAGATGAGTATATACCAGCTCCAGAGAGAGATACAGAT
AAGCCATTCTTAATGCCAGTAGAGGATGTATTCTCAATCACAGGAAGAGGAACAGTTGCAACAGGAAGAG
TGGAAAGAGGAGTACTAAAAGTACAAGACGAAGTAGAATTAGTAGGATTAACAGAAGCACCAAGAAAAGT
AGTAGTAACAGGAGTAGAGATGTTCAGAAAATTATTAGACCAAGCACAAGCAGGGGATAATATAGGAGCA
TTATTAAGAGGAGTACAAAGAAACGAGATAGAAAGAGGACAAGTACTAGCAAAGACTGGATCAGTAAAGG
CACACACAAAGTTTACAGCAGAAGTATATGTACTTAAAAAAGAAGAGGGTGGAAGACATACACCATTCTT
TGATGGATATAGACCACAATTCTATTTCAGAACAACAGACGTAACAGGAGCTTGTAAGTTACCAGAAGGA
ATAGAGATGGTAATGCCTGGAGATAACGTAACAATGGAAGTAGACTTAATAAACTCAATAGTTGTAGAAG
AGGGATTAAGATTCTCAATAAGAGAAGGTGGAAGAACAGTAGCTTCAGGAGTTGTTGCTACAATAATAGA
GTAA
>ref|NC_013316.1|:88919-89068 50S ribosomal protein L33 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAGTTAAAGTAACTTTAGCATGTACAGAGTGTAAGCAAAGAAACTACAACACTACTAAGAATAAGA
AAAATAATCCAGACAGAATAGAATTACAAAAATATTGTAGATTCTGTAAAAAGCATACAACTCATAAAGA
AACAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:89094-89315 preprotein translocase SecE subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTGCCCAAAAAAATGACGGTGCAAAAACTAAAAAAAGGTTTAGTTTATTTGGATATTTAAAAGAAA
CTAAGCAAGAATTAAAAAGAGTTACATGGCCGACAAAAAAGGAACTGTTTAAAAACACAAGTATAGTTTT
AACTGTAGTTATTTCATGCACTATATTAGTATGGGGTATAGACACTATATTATCTGGTGCACTAGCGTTA
TTACTAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:89335-89877 transcription antitermination protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAGAATTACAAGAAGCAAGTTGGTATGTAGTTCATACCTATTCGGGACATGAAAATAAAGTTAAAG
CTACAATTGAGAAAGCAGTTAAAACAAGAGGTATGGAAGACTGCATAAGACAAGTAGTTGTTCCAACAGA
AGAGGTAGTGGAAACTACTAAAACTGGAAAAGAAAAAACTAGACAACGTAAAGTTTATCCAAGTTATGTC
TTGGTTAAAATGATAATAACTGATGAATCTTGGTATGTAGTAAGAAATACTAAGGGAGTTACAGGTTTCG
TTGGACCTGGTTCAAAACCAGTACCATTAAGTGAAGATGAAGTCAAAGCTATGGGGATAGATACAACAGA
CCCTAAAGTAGTAAATAGCGATGTTGATTTTGAAATAGGAGACACAGTAAAAGTATCTCAAGGACCATTT
AGTGGACAAATAGGTAACATAGAAGAAATTGACTTAGAAAATAGAGAAGTCAAAGTATGCATAAATGCAT
TTGGTAAAAGGACTCTATTTGTAATAGAGCTTGAAGGTATAGAAAAAATCTAA
>ref|NC_013316.1|:89913-90338 50S ribosomal protein L11 [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTAAAAAAGTTATAGGTCAAATAAAATTACAAATACCTGCAGGAAAGGCTACTCCAGCGCCACCAG
TTGGACCAGCATTAGGACAACATGGTGTTAATATAATGGGATTCACAAAAGAATTTAATGCTAAAACTGC
AGATCAAGCTGGAATGATAATACCAGTTGTTATAACTGTATATCAAGATAGATCATTCAGTTTTATAACA
AAAACTCCACCAGCTGCAGTTTTAATTAAAAAAGCATTAAACTTAAAATCAGGTTCTGGAGAACCAAACA
AAAAGAAAGTTGCTAAAATGACTTCAGCTCAAGTAAGAGAAATAGCTGAGTTAAAAATGCCTGACTTAAA
TGCTGCATCAGTAGAAGCTGCTATGAGTATGATAGCTGGTACTGCTAGAAGCATGGGTGTTGTAATCGAA
GACTAA
>ref|NC_013316.1|:90408-91106 50S ribosomal protein L1 [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTAAAAAAGGTAAAAGATATGCAGGTGCATTACAAAAAGTAGATAGAACTAAATTTTATGATGCAT
CAGAAGCATTAACATTAGTTTCAGATATAGCTGGAGCTAAATTTGATGAGACAGTAGAAGCACACATTAA
ATTAGGTGTTGACTCAAGACATGCTGACCAACAAGTAAGAGGTGCAGTTGTATTACCTCATGGAACTGGT
AAAACAAAAAGAGTTTTAGTTTTTGCTAAAGGTGAAAAAGCTAAAGAAGCTGAACAAGCTGGTGCTGACT
TTGTAGGAGCTGAAGAATTAGTTCAAAAAATACAAGGTGAAAACTGGTTTGACTTTGATATAGTAGTTGC
TACTCCAGATATGATGGGTGTAGTAGGTAGATTAGGTAGAGTATTAGGACCTAAAGGTTTAATGCCAAAC
CCTAAATCAGGAACAGTTACATTTGATGTAGCTAAAGCTATAGATGAAATAAAAGCTGGTAAAGTTGAAT
ACAGATTAGACAAAACTAACATAATACACGTTCCAGTAGGAAAAGTATCATTTGGTGGAGAAAAATTAAC
TGAAAACTTTACTGCATTAATGGATGCTATAATAAAAGCTAAACCAGCTGCTGCTAAAGGACAATATTTA
AGAAGTATAACAGTAGCTTCTTCAATGGGACCTGGAGTTAAAATAAACCCAGCAAGAACAGCTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:91329-91835 50S ribosomal protein L10 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAAAGCTATAGAAATTAAATCAGAAGTTGTTTCTGAGATAGTTGAAAAGTTACAAAAATCTTCTG
CTGCTGTTGTTGTAGATTACAAAGGATTAACAGTTGAAGAAGTAACTGAGTTAAGAAAACAAATGAGAGA
AGCTGGTGTAGATTACAAAGTATACAAAAATACTTTAGTTAGAAGAGCAGCTAAAGAAGTTGGTATAGAG
CAATTTAATGATGAATTATTAGTTGGAACTAATGCCATAGCATTTGGATATGATGATCCAGTTGCTCCAG
CTAGAATATTAAAAGGATTCATGGATTCTCATCCAAAAATGAAATTAAAGATGGGTATTGTGGAAGGTGC
ATTCTATGATGAATCTAAGATTGTTGAAATGGCTAACATACCATCAAGAGAAGTTCTTATCGCTAAATTA
CTTGGTAGCTTAAAAGCTCCAGTATCAAACTTCGCATACTTAATAGATGCAATAGCGAAAAAGGCAGAAG
GTCAAGAAGAAGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:91893-92258 50S ribosomal protein L7/L12 [Clostridium difficile R20291]
ATGACAATAGAACAAATATTAGAAGCTATAGAAAATATGAAAGTTTTAGAATTAAATGAATTAGTTAAAG
CTGCTGAAGAAAAATTCGGTGTATCAGCTTCAGCTCCAGTAATGGTAGCTGGTGCAGCTGCTGGTGGACC
AGCTGCTGAAGAAAAAACTGAGTTTGATGTAGTATTAACTGACGTTGGTTCTTCAAAAGTTGGAGTTATA
AAAGCAGTTAGAGAAATAACAGGATTAGGATTAAAAGAAGCTAAAGAAGTAGTTGACAATGCTCCTAAGA
CAGTTAAAGAAGGAGCTTCTAAAGAAGAAGCTGATCAAATAAAAGAGAAATTAGAAGCTGCTGGAGCTAA
AGTAGAAGTTAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:92650-93438 NADP-dependent 7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAATTACAAGGAAAAATTGCAGTAGTTACTGCAGCAACAAAAGGTATTGGATTAGCATCAGCAG
AGATATTAGCAAAAAATGGAGCAACTGTGTACTTAGCAGCTCGTTCAGAAGAATTAGCTAATGAAGTTAT
AAATAAAATAAGTGCAGAAGGTGGTTGTGCTAAGTTTGTTTACTTTAATGCTCGTGAAGAAGAGACCTTT
ACCTCAATGATAGAAGAGGTAGTTAAAAAAGAAGGTAAGATAGATATACTTGTAAACAATTTTGGTTCAA
CAAACCCTTCTCTTGACAAAGACCTTGTAACTGGGGATACAGATAATTTCTTTGACACAGTAAATACTAA
TTTAAAAAGTGTGTATTTACCATGTAAAGCAGCAATTCCTCATATGATAAAGAATGGAAAAGGAAGTATA
GTAAATATATCAAGTATAGGTTCAGTATTACCTGATTTATCTAGAATAGCTTACTGTGTATCAAAAGCAG
CAATCAACTCATTAACTCAAAACATAGCTACACAATATGCTAAAGACAATGTTAGATGTAATGCTGTACT
TCCAGGGCTTATTGCAACTAAAGCAGCATTAGACAATATGTCTCCAGAGTTCATAAAAGAATTTTTAAAG
CATGTTCCTTTAAATCGTATAGGGGAACCAGATGATATAGCAAAAGCTGTTCTATTCTATGCTAGTGATG
ACTCATCATTTATAACAGGGGATTTACTTGAAGTTGCAGGAGGATTTGGTTTACCTACTCCACAATTTGC
AGATAATATATTAGGATAA
>ref|NC_013316.1|:93909-97625 DNA-directed RNA polymerase beta chain [Clostridium difficile R20291]
ATGCCACATCCTGTCACGATAGGTAAAAGAACTAGAATGAGCTTTTCTAAAATTAAGGAAATAGCTGATG
TGCCAAATCTTATAGAAATTCAAGTAGATTCCTATGAGTGGTTTTTAAAAGAAGGTTTAAAAGAAGTGTT
TGATGATATTTCACCAATAGAAGATTATACTGGTAATCTTATATTGGAATTTGTCGACTATTCTCTAGAT
GATAAACCAAAGTACGATATAGAAGAGTGTAAAGAGAGAGATGCTACATATTGTGCACCTCTAAAGGTTA
AGGTAAGACTTATAAATAAAGAAACAGGTGAGATAAAAGAACAAGAAGTGTTTATGGGTGACTTCCCTTT
AATGACAGAAAGAGGAACTTTCGTTATAAATGGAGCAGAAAGAGTTATAGTAAGTCAATTAGTTAGATCT
CCTGGTGTTTACTATGCGGAAGAAAGAGATAAAACAGGTAAGAGATTGATTTCATCTACTGTAATTCCTA
ATAGAGGAGCATGGTTAGAATATGAAACAGATTCTAATGATGTAATATCTGTAAGAGTTGATAGAACAAG
AAAACAACCAGTTACAGTTTTACTTAGAGCTTTAGGAATAGGAACAGATGCAGAGATAATTGACCTTTTA
GGAGAAGATGAGAGATTATCTGCTACATTAGAAAAAGATAATACTAAGACAGTAGAAGAAGGTCTTGTAG
AGATATACAAAAAATTAAGACCAGGTGAACCTCCTACTGTAGAAAGTGCATCATCTTTATTAAATGCTTT
ATTCTTTGACCCAAAAAGATATGACCTAGCAAAAGTTGGTAGATATAAATTCAATAAGAAACTTGCTTTA
TGTTATAGAATAATGAATAAAATTTCAGCAGAAGACATAATAAATCCAGAAACTGGAGAAGTATTTGTAA
AAGCTGGAGAAAAAATAAGCTATGATTTGGCTAAAGCCATACAAAATGCAGGTATAAATGTAGTAAATCT
ACTAATGGATGATGATAAAAAAGTTAGAGTTATAGGAAATAATTTTGTGGATATTAAGTCTCACATTGAT
TTTGACATAGATGATTTAAACATAAAAGAAAAAGTACATTATCCAACTTTAAAAGAAATTTTAGATGGAT
ATAGTGATGAAGAAGAAATAAAAGAGGCTATAAAATCAAGAATTAAAGAACTTATACCAAAACATATATT
ATTAGATGATATAATAGCTTCAATAAGTTATGAGTTCAATATATTCTATAATATAGGAAATATTGATGAT
ATAGATCACCTAGGAAACAGAAGAATAAGATCTGTAGGTGAATTGTTACAAAATCAAGTTAGAATTGGTC
TTTCAAGAATGGAAAGAGTTATAAAAGAAAGAATGACGGTTCAAGATATGGAAGCTATAACGCCTCAAGC
GTTAGTTAACATAAGACCAGTTTCAGCTGCAATAAAAGAATTTTTTGGTAGTTCTCAGTTATCTCAGTTC
ATGGATCAAACAAATCCTCTATCTGAGTTAACGCATAAGAGAAGATTATCAGCCCTTGGGCCTGGAGGTC
TTTCAAGAGAAAGAGCTGGATTCGAAGTGCGTGACGTTCACCATTCACACTATGGTAGAATGTGTCCAAT
AGAGACTCCAGAGGGACCAAATATCGGTCTTATAAACTCTCTAGGAACTTATGCAAAAATAAATGAATTT
GGATTTATAGAATCACCATATAGAAAATTTGATAAAGAAACATCAACAGTTACTGATGAAATACATTATT
TAACTGCTGACGAAGAAGATTTATTCGTAAGAGCTCAGGCAAATGAGCCATTAACAGAAGATGGTAAATT
CGTAAACCATAGAGTTGTTTGTAGAACTGTAAATGGTGCTGTTGAAATGGTTCCTGAAAGTAGAGTAGAT
TACATGGATATATCTCCTAAGCAGGTTGTATCTGTTGCCACTGCTATGATACCTTTCTTAGAAAATGATG
ATGCCAACCGTGCCCTTATGGGAGCGAACATGCAGCGTCAGGCAGTGCCTCTAGTTAGAAGAGAAGCACC
AATTATAGGAACTGGTATAGAATACAGAGCAGCAAAAGACTCTGGAGCAGTTGTTGTTGCTAGAAATTCT
GGTATAGCAGAAAGAGTAACAGCAGATGAAATAATTATAAAAAGAGAAGATGGAAACAGAGATAGATATA
ATCTACTTAAGTTTAAACGTTCAAACTCAGGTACTTGTATAAATCAAACACCTATAATAAATAAGGGTGA
CCAGATAATAAAAGGTGATGTTATAGCAGATGGTCCAGCAACTGATTTAGGAGAAGTTGCACTTGGAAGA
AACTGTCTTATAGCATTCATGACTTGGGAAGGTTATAACTACGAGGATGCTATATTAATAAATGAAAGAT
TAGTTAAAGAAGATAGATTATCAACAATTCATATAGAAGAATATGAATGTGAAGCTAGAGATACAAAACT
AGGGCCAGAGGAAATAACTAGAGATATACCTAATGTTGGAGATAGTGCAATCAAAAACTTAGATGATAGA
GGTATAATAAGAATAGGTGCAGAAGTAGACTCAGGTGATATATTAGTTGGTAAGGTAACTCCAAAAGGAG
AAACTGAACTTACTGCTGAGGAAAGATTACTTCGTGCGATATTCGGAGAAAAAGCCAGGGAAGTTAGAGA
TACTTCACTTAAAGTACCTCATGGTGAATCTGGTATAATAGTTGATGTAAAAGTATTTACTAGAGAAAAT
GGAGATGATTTATCTCCAGGAGTAAATGAATTAGTAAGATGTTATATAGCTAAAAAGAGAAAGATAAAAG
TTGGAGATAAGATGGCTGGTCGTCATGGTAATAAAGGGGTTATCTCGAGAGTATTACCTGAAGAAGATAT
GCCATTCATGGAAAATGGAACGCCATTAGATATAATACTTAACCCACAAGGTATACCATCACGTATGAAC
ATCGGTCAGGTTCTAGAAGTTCATTTAGGACTTGCTGCTAAGACATTAGGATGGTATGTAGCAACATCAG
TATTCGATGGTGCTAATGAGTATGACATAATGGATGCTCTTGAAGAAGCTGGATATCCTAGAGATGGTAA
ATTAACTTTATATGATGGTAGAACAGGTCAATCTTTTGACAATAGAATAACTGTTGGATATATGTATTAC
TTGAAACTACATCACTTAGTAGATGAAAAACTACATGCAAGAAGTACTGGACCATACTCATTAGTTACTC
AACAGCCACTAGGTGGTAAAGCACAATTTGGTGGACAAAGATTTGGAGAGATGGAGGTTTGGGCTCTAGA
AGCATATGGAGCGGCTCACATACTTCAAGAGATACTTACTGTTAAGTCTGATGATGTTGTAGGTCGTGTT
AGAACTTATGAAGCTATAGTTAAAGGTGAAAACATACCTGAGCCAGGAATCCCAGAATCATTTAAGGTTC
TTATAAAGGAACTTCAAAGTTTATGCTTAGATGTAAAAGTATTGACAGATGAAGACCAAGAAATAGAAGT
AAGAGAATCTGTAGATGAAGATGATACGATAGGTGAATTTGAGCTAGACGTTGTAAATCACATGGGAGAA
GTTGAAGAAAGTAATATAATAGAAGAAATTGAAGATGATTTTGTGGAAGCCACAGAAGATGAGGATATAG
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TATGTAA
>ref|NC_013316.1|:97667-101152 DNA-directed RNA polymerase beta' chain [Clostridium difficile R20291]
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CTAGAGGAGAAGTTAAAAAGCCAGAAACTATAAATTACCGTACTTTAAAGCCAGAAAAAGATGGTCTTTT
CTGTGAAAGGATATTTGGACCACAAAAAGACTGGGAGTGTCATTGTGGTAAATATAGAAGAGTTAGATAT
AAAGGTGTAGTTTGTGATAGATGTGGAGTAGAAGTAACTAAATCAAAAGTAAGAAGAGAGAGAATGGGAC
ATATAGAGCTAGCTGCTCCTATGTCTCACATCTGGTACTTCAAAGGTATACCAAGTAGAATGGGACTTTT
ACTTGATATGTCACCAAGATCGTTAGAAAAAATACTATATTTCGCCTCATATGTAGTAGTTGATCCAGGT
GAAACTGGATTGAATGAAAAACAGTTACTTACAGAAAAAGAATACAGAACTGCTCTTGAAAAGTATGGAT
ATACTTTTACTGTGGGTATGGGTGCTGAAGCTGTAAAAACATTACTACAAAATATAGATTTAGAACAACA
AAGTAAAGACTTAAGAGCGGAATTAAAAGATAGTACAGGACAAAAGAAAGTAAGAACAATTAGAAGATTA
GAAGTTGTAGAAGCATTTAAAAAATCTGGAAATAAACCAGAATGGATGATTTTAGATGCAATACCAGTAA
TACCGCCAGATTTAAGACCAATGGTACAACTTGATGGTGGAAGATTTGCAACTTCAGACCTAAATGATTT
ATACAGAAGAGTTATAAATAGAAATAATAGACTTAAAAGACTATTAGAGCTTGGAGCTCCAGATATAATT
GTAAGAAATGAAAAAAGAATGCTTCAAGAAGCTGTTGATGCATTGATAGATAATGGTAGAAGAGGTAGAC
CTGTAACAGGACCTGGAAATAGACCACTTAAATCTTTATCAGATATGTTAAAAGGTAAGCAAGGTCGTTT
CCGTCAAAACTTACTTGGTAAGCGTGTTGACTACTCAGGACGTTCTGTTATAGTTGTTGGACCAGAACTT
AAATTTTATCAATGTGGACTTCCAAAGAAGATGGCATTAGAATTATTCAAGCCATTTGTTATGGATAAAT
TAGTTAAAGAAGGTTATGCACATAATATAAAAAGTGCGAAATCTATAGTAGAAAAAGTTAAGCCAGAAGT
TTGGGATGTTTTAGAAGATGTTATAAAAAGTCATCCAGTTCTTCTTAACCGTGCACCGACTCTACATAGA
TTAGGTATACAAGCATTTGAACCAATCTTAGTTGAAGGTAAGGCTATAAAACTACATCCTCTTGTATGTA
CAGCTTATAATGCAGACTTTGATGGTGACCAAATGGCAGTCCATGTACCTTTATCAGTAGAAGCACAAGC
AGAAGCAAGATTCTTAATGCTTTCTGTAAATAATATACTTGCTCCTAAAGATGGTTCACCTATAACTACT
CCATCTCAGGATATGGTTTTAGGTTGCTATTATCTAACAATAGAAGCCCAAGATGGAGCTAAAGGAACAG
GTATGGTATTTAAAGACTTTAATGAACTATTACTTGCTTATTACAATAAATCAGTTCATCTACATGCATT
AGTGAAACTGAAGGTAACACTTGAAGATGGAAGAAGTTCATTGGTTGAAAGTACTGTTGGTAGATTTATA
TTTAATGAAAATATACCTCAAGACTTAGGTTTTGTAGATAGAAAAGAAAATCCATTTGCACTTGAAGTTG
ATTTCTTAGCAGATAAAAAATCTCTTGGTAAAATAATAGATAAATGCTTTAGAAAACACGGAAATACAGA
AACAGCTGAATTACTAGATTATATAAAAGCTCTAGGATTTAAATATTCTACATTAGGTGGTATAACAGTT
GCTGTTGATGATATGAGTGTCCCAGAAGAAAAGAAAGTATTTATAGCTGAGGCAGAAGCTAAAGTTGATA
AGTATGAAAAAGCATACAGAAGAGGTCTAATCTCTGATGAAGAAAGATATGAAAAAGTTATAGAGACATG
GACAGAAACAACTGATAAAGTTACTGATGCTCTTATGGGTGGACTAGATAGATTAAATAATATATATATA
ATGGCACATTCAGGAGCCAGAGGTTCTAAAAACCAAATTAGACAGCTGGCAGGTATGCGTGGTCTTATGG
CAAATGCATCTGGTAAAACAGTCGAGATACCAGTTAAATCTAATTTCCGTGAAGGTTTATCAGTACTAGA
ATACTTTACATCTTCACATGGTGCCAGAAAAGGTCTTGCCGATACAGCTATACGTACAGCTGAATCTGGA
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ATACTACAGAGATTTATGCTATAAAAGAAGGAAATGAAGTTATAGAAGAGATATATGATAGAATTGTAGG
AAGATATACTATAGACCCTATATTAAATCCTGAAACTGGAGAAGTTCTAGTTGAGGCTGATTCAATGATA
CAAGAAGATGAAGCAGAAACTATAGTAGCTTTAGGGATTGAAAAAATTAGGATAAGAACAGTTCTTAACT
GTAAAACTAATCATGGAGTTTGTTCTAAGTGTTATGGTAGAAACTTGGCAACAGGAAAAGAAGTTAATAT
AGGTGAAGCAGTTGGTATAATAGCAGCTCAATCTATCGGTGAGCCGGGTACTCAGCTTACAATGCGTACA
TTCCATACTGGAGGAGTTGCAGGAGCTGATATAACTCAAGGTCTACCAAGGGTTGAAGAATTATTTGAAG
CTAGAAAACCAAAAGGATTAGCTGTAATAACTGAAGTATCTGGTAGAGTTGAAATTGATGAAACAGGAAA
GAGAAAAGAAGTAAATGTAATACCAGAAGAAGGCGAGACTCAAACATATGTAATTCCATATGGTTCTAGA
TTAAAAGTTAAGCAAGGTCAAATGCTAGAGGCTGGAGACCCTCTAACACAAGGATTTATAAATCCTCATG
ATATAGTAAGAGTAAATGGTGTTAAGGGAGTTCAAGAATATATAGTTAAAGAAGTTCAAAGAGTGTATAG
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GTTGAAGACCCAGGAGATACAGATTTATTGCCAGGTGGATATGAAGATGTATTAACATTCAATGAATGTA
ATAAAGATGCTATAGATAAAGGTCTAAGACCAGCAGTTGCTAAAAGAGTTTTACTTGGTATAACTAAAGC
ATCTCTTGCAACTGATTCATTCTTATCAGCAGCTTCTTTCCAAGAAACAACAAGAGTATTAACAGAGGCA
GCAATAAAAGGTAAAGAAGACCACTTAATAGGACTTAAAGAAAATGTTATATTAGGTAAGTTAATACCAG
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TTGTACTTCAGTAAAAACAGTTACTCCTAAGAAGCCTAACTCAGCTTTAAGAAAAGTTGCCAGAGTTAGA
TTAACTAATGGTATAGAAGTTTCTGCTTATATACCAGGAGAAGGACACAACTTACAAGAGCATAGTGTTG
TTCTTATAAGAGGAGGAAGAGTAAAAGACCTTCCAGGGGTTAGATACCATATACTAAGAGGTACTCTAGA
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AAATAA
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CTAAATTAATAAATAATCTAATGGTAGACGGAAAAAAAGGAAAGTCTCAAAGAATAGTTTATGATGCTTT
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CCTGTTTTAGAAGTAAAAGCAAGAAGAGTTGGTGGGGCAAATTACCAAGTGCCAATCGAAGTTAGACCTG
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ACTCATAAAATGGCAGAAGCTAATAAAGCATTTGCTCATTACAGATGGTAG
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CTACTACTACAGAAAGAATCCTGTTTTATACTGGGCAAACTCATAAAATAGGAGAAACTCATGAAGGAGC
TTCTCAAATGGACTGGATGGAGCAAGAAAAGGAAAGAGGTATAACAATAACTTCTGCCGCTACTACTGCT
TCATGGAAAGACCATAGAATAAACATAATAGATACTCCTGGACACGTGGACTTCACAGTTGAGGTTGAAA
GATCTCTAAGAGTTCTTGATGGTTCAGTTGCTGTATTCTGTGCAAAAGGTGGGGTTGAGCCTCAATCTGA
AAATGTATGGAGACAAGCTGAAACTTATGGAGTACCTAGAATAGCTTTTATAAACAAAATGGATATATTA
GGTGCAGATTTCTACAATGTTATAAGCATGATGAAATCTAGATTAAATTCTAATGCAGTTCCTATGCAAT
TACCAATAGGTAAAGAAGATTCATTTATAGGTATAATAGACTTATTAAAAATGGATGCTGTTATATACAA
AGACGACCTAGGGGTTGAAATGGAAGAAACAGATATACCAGAAGATATGAAAGAATTAGCTGCTGAGTGG
AGAGAAAAATTAGTTGAATCAGTAGCTGAAACTGATGAAGAATTAATGATGAAATACCTTGAAGGTGAAG
AACTTACTATAGATGAATTAAAAGTTGCTATAAGAAAAGCTACTATAGCTTGTGAAATGAACCCAGTTTT
CTGTGGTACAGCTTATAGAAACAAAGGTGTTCAGTTAGTAATAGATGCAGTTTTAGATTACTTACCAGCA
CCAACTGATATACCAGCTATAAAAGGTATATTAGCAGATGGAGAAGAAGCTGAAAGACATTCTTCTGATG
AAGAGCCATTCTCTGCATTAGCATTCAAAATAATGACTGACCCATTCGTTGGAAAACTAGCGTTCTTCAG
AGTTTATTCTGGAACATTAGAATCAGGTTCTTATGTTTTAAATGCAACTAAGAATAAGAGAGAAAGAATT
GGTCGTATATTACAAATGCATGCTAATACAAGAGAAGAAATAACTAAAGTGTATGCTGGAGATATAGCAG
CAGCAGTAGGATTAAAAGATACTACTACTGGAGACACATTATGTGACCCTGCTAATCCAATAATACTTGA
ATCTATGGAATTCCCTGAGCCAGTTATATCTGTTGCTATAGAACCAAGTTCTAAAGCAGCTCAAGAAAAA
ATGGGTATAGCTCTTCAAAAATTAGCTGAAGAAGACCCAACTTTCACAGTTAAGACTGACCAAGAAACAG
GACAAACTATAATATCTGGTATGGGTGAATTACACTTAGAGATAATAGTAGATAGATTATTAAGAGAATT
TAAAGTAGAAGCTAAAGTTGGTGCACCACAAGTTGCATATAGAGAGACTATAACTCAACCAGTTGATGTT
GAATACAAGTACTCTAAGCAATCAGGTGGTAGAGGACAATACGGTCACGTTAAGATTAGAGTTGCTCCTC
AAGAGCCAGGTGAAGGATACAAGTTCACAAACAAAACTGTTGGTGGATCAGTACCAAAAGAATATGTTGG
TCCAGTTGACATGGGTATACAAGGAGCTATGCAATCTGGTATAGTTGCTGGATATCCAGTTGTAGACGTT
GCTGTTGAGTTATATGATGGTTCTTACCATGAGGTTGACTCTTCTGAGATGGCGTTTAAGATGGCTGGTT
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TGTTACTCCAGAAGATTACATGGGAGATGTTATGGGTGACTTAAACTCAAGAAGAGGATTAATCCAAGGT
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TATGAAACACCAAATAGACACTATGCACACGTTGACTGCCCAGGACATGCTGACTACGTTAAGAACATGA
TAACAGGAGCAGCACAAATGGACGGAGCAATATTAGTTTGTTCAGCAACAGATGGACCAATGCCACAAAC
AAGAGAGCATATACTATTATCAAGACAAGTTGGAGTACCATATATAGTAGTATTCTTAAACAAGTGTGAC
ATGGTAGATGATGAAGAGTTATTAGAGTTAGTAGAGATGGAAGTAAGAGATTTATTAACAGAATATGATT
TCCCAGGAGATGACACTCCAATAGTAAGAGGTTCAGCATTAATGGCATTAGAAGATCCAAAGAGCGAGTG
GGGAGATAAGATAGTAGAATTATTCGAGCAAATAGATGAGTATATACCAGCTCCAGAGAGAGATACAGAT
AAGCCATTCTTAATGCCAGTAGAGGATGTATTCTCAATCACAGGAAGAGGAACAGTTGCAACAGGAAGAG
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AGTAGTAACAGGAGTAGAGATGTTCAGAAAATTATTAGACCAAGCACAAGCAGGGGATAATATAGGAGCA
TTATTAAGAGGAGTACAAAGAAACGAGATAGAAAGAGGACAAGTACTAGCAAAGACTGGATCAGTAAAGG
CACACACAAAGTTTACAGCAGAAGTATATGTACTTAAAAAAGAAGAGGGTGGAAGACATACACCATTCTT
TGATGGATATAGACCACAATTCTATTTCAGAACAACAGACGTAACAGGAGCTTGTAAGTTACCAGAAGGA
ATAGAGATGGTAATGCCTGGAGATAACGTAACAATGGAAGTAGACTTAATAAACTCAATAGTTGTAGAAG
AGGGATTAAGATTCTCAATAAGAGAAGGTGGAAGAACAGTAGCTTCAGGAGTTGTTGCTACAATAATAGA
GTAA
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CATAAAAGACTAATCGACATAGCTAATCCAACACCTAAGACAGTTGACTCATTAATGAGATTAGACTTAC
CAGCAGGTGTAGATATAGAAATAAAATTATAA
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TAACAGCTGTTGAAGCAGGGCCTATGGTCGTTACTCAAATAAAAACAGTTGATAAAGATGGATACAATGC
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GCTAATGTTTTAAAGAAACATTTAAAAGAATTTAGAGTAGATTCTGTAGAAGGATACACAGTAGGACAAG
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ATGGATGCTCCTAAGACTAAAGAATTTGCTCAAATATTAAACAATATAAATGCTGCTAAAAAAGCTTTAG
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AAAGATGGTATACCTGCTAAGGTTGCTACTATAGAATATGATCCAAACAGAACTGCAAATATCGCATTAT
TAAACTATGCTGATGGAGAAAAAAGATATATATTAGCTCCAGTTGGAATTAACGTTGGAGATACTATATT
ATCAGGATTAGGTGCTGATATAAAACCAGGAAACTGTTTAGCATTAAAAGATATGCCAGTTGGTACTATC
ATTCATAATATAGAATTAAAGCCAGGAAAAGGAGCTCAATTAGTTAGATCTGCTGGAGTTTCTGCACAAT
TAATGGCTAAAGAAGGAAAAAATGCTTTATTAAGATTACCATCAGGTGAGATGAGATTAGTAAGCATAAA
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AAAAGACATATGGGAATAAGACCTACTGTAAGAGGTTCTGTAATGAACCCTAATGACCATCCACACGGTG
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CAAAACTAGAAAGAAAAATAAAGCTTCAAATAAACTAATAGTATCAAGAAGAACTAAGTAG
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AA
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GTTGCTAAGCCTGGTGTAGTTATAGGAAGAGCTGGTGCAGGAATCGAAGCATTAAAAGCTGAATTAGAAA
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AGCTGAAAATATAGCTTTAGCTATAGAGAGAAGGGTTGCTTTCAGAAGAGCAATGAAACAAGCTATACAA
AGAGCAATGAAATCTGGTGCTAAAGGGATAAAAGTTTCTGCTTCAGGAAGATTAGGTGGAGCTGAAATGG
CTAGAACTGAAGGTTATAGTGAAGGAAATGTGCCACTACAAACTTTAAGAGCAGATATAGATTATGGTTT
CGCTGAAGCTGATACAACTTATGGAAAAATCGGTATAAAAGTTTGGATATGTAATGGTGAAGTTTTACCA
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GAAGAAACGATAGAAGAGGAAATGACAGAAGAGGAAATGATAACAGAGGAAACTACAGAGGACAAAGACC
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AGAAGCTGCCAGAATCGCGATGACTAGATATATAAAAAGAGGGGGAAAGGTTTGGATAAAAATATTCCCT
CATAAACCAGTAACAAGAAAACCAGCAGAGACTCGTATGGGTGCAGGGAAAGGTTCTCCAGAATATTGGG
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TATGAGACTTGCTGCACATAAATTACCAATCAAATGTAAATTTGTTAAAAAAGAAGATTTAGAAGTAAAG
GGTGGTGAATAG
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GGTGGAAAAGCAGAGTTAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:115690-116958 preprotein translocase SecY subunit [Clostridium difficile R20291]
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TGATCGTGATATTCAGAATAGGTACTACTATACCAGTTCCAGGCATAGACACTAGTATTATACAAAAGAT
GGTAGGCGGCAATAGTCTACTTTCTCTGTATAATATGTTTACTGGTGGAGCATTTAGTAACTTTTCACTA
TTTGCTTTAGGTATAAGTCCATATATCACTGCATCAATCATAATACAACTTCTAACAGTAGGTTTTGAAA
GTTTAGCAGAACTTCAAAAATCTGGTGAAGAAGGAAAGAAAAAAATCAATAAGTACACTAAATATACAGC
ACTAGCTCTAGCAGTTGTACAAGCTTTGGGAATTACATTAGGAATTGTAAGAAGTGCTTTAATATCAAAT
AGTGTGTTTTTTATCACAACTGTTGTAATAACATTAGTTTCAGCAAGTATGTTAGTAATGTGGATTGGGG
ACAAAATTACTGAAAAAGGAATCGGTAATGGTAGTTCAGTAATAATATTTGCAGGTATAATATCAAGAAT
ACCTACAGATGTTATTAAAATATCGCAACAAGTTAAATCTGGCGAAGTTGCACCTTGGGTTATAGTGATT
CTAGCTGTAGTTATATTACTTACAGTAACAGGAGTTACATTTATACAAGAAGCAACTAGAAAGATACCTG
TACAATATGCTAAAAGAGTTGTTGGAAGAAAAATGTATGGAGGACAAAGTTCTCATATACCAATGAAAGT
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TGTTGGAGTTGCTTTGGAGCTTAAGAGACAGTTAGAGTCAAACTTAGTTATGAGAAGCTATCAAGGTTTC
TTAAAATAA
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GAATAGTAGAAAAATACAATATACCTCATATATCAACAGGAGATATATTCAGAAAGAATATAAAAGAGGG
AACAGAACTTGGAAAAAAAGCTAAAGAATACATGGACCAAGGTTTATTAGTACCAGATGAGTTAACTGTA
GGTTTAGTTACTGATAGAATATCTCAAGAAGATTGTAAAAATGGATTTATGTTAGATGGATTTCCAAGAA
ATGTAGCACAAGGAGAACATTTAGATATCTTCTTAAAAAATGCTGGTATATCACTAGATAAAGTTGTCAA
TATTGAAGTTGATAAGAGTATATTAGTGTCTAGAGCAGTTGGTAGAAGAATATGTAAGTCTTGTGGAGCT
ACTTACCATGTTGAGTTTAATCCTCCTAAAGTAGAAGGTGTATGTGATGTATGCCAAGGAGAATTATATC
AAAGAGCTGATGATAATGAAGAAACTGTATCTAAGAGAATACAAGTTTATCTAGATGAAACTAAGCCTTT
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GAAGATATTGTCGCAGCCTTAGGAAGTGGAAAATAA
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ATGAAGTTTTAAGAAAAGCTATTTCTCCGGGAATATCTACTTTAGAATTAGATAAAATAGCTGAAGAGAA
TATAAGAAAATACAATGCAGAGCCTTCTTTTAAAGGATATGGAGGTTTTCCAGGAAGTATATGTGCTTCT
ATCAATAGAGAGGTAGTACATGGTATTCCAGGAGAAACTATATTACAAGAAGGTGACATTGTAAGTTTGG
ATATAGGAGCCTATTATAAAGGATATCATGGTGATTCTGCGAAAACTCACGGAGTAGGCATGATATCTGA
AGAAGATAGGAAATTGATAGAAGTAACTAGAGAAAGCTTCTATGAAGGAATAAAATTTGCTAAATTAGGA
TATAGACTTTCAGATATCTCACACGCAGTACAAACACACGTTGAGAAACATGGTTTCTCGGTAGTTAGAG
ATTTAGTGGGTCATGGAGTTGGAGCAAATCTTCATGAAGACCCACAAGTACCTAATTATGGACTCCCAGG
AAAAGGACCAAGACTTAGAGAAGGAATGGTTATTGCTATAGAGCCAATGGTTAATGCAGGTCGTTATCAT
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CGATAGCAATTACTGAACATGAACCTTTGATATTGACAAAGTTGTAA
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GAAATTTATTCTTTGTAGTCAAAATAATTAATAATGAATATGTATTAATAGCTGATGGAAAAAAGAGAAA
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AAAAGAGTAGTATCTGGACAAGAGATTACAGATTCTTTTTTAAGAGCTGAACTTACTAAGTTAAATTAG
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TTAAACTAGAAAATGGACATGAGATATTATGCCACATTTCTGGAAAGCTAAGAATGAACTTCATAAGAAT
TCTTGAAGGTGACAAGGTGAATGTTGAACTTTCTCCATATGACCTTACAAGAGGAAGAATTACTTGGCGT
AAGAAGTAG
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TGGTTATCTGTGAAAATCCAAAGCATAAGCAAAAGCAAGGATAA
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GTATAGGTAAAGCAACTGCTAACGAAATATTAGCTAAGGCTGAGATAAATCCAGATACTAGAATAAAAGA
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AGAAGAGAAATTGCTTTAAACATAAAGAGATTAAGAGATATAAAATGTTATAGAGGAATAAGACACGCTA
AAGGTCTTCCATTAAGAGGACAAAGAACTAAGACTAATGCTAGAACTAGAAAAGGTCCTAGAAAAACAGT
ATCTCGTAAAAAGAAAAAATAA
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CTCATATACAATCAACTTTCAATAATACAATAATAACTTTAACTGACGTTCACGGAAATGCTATATCTTG
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TCCAATCCCACATAACGGATGCAGACCACCAAAGAGAAGAAGAGTGTAA
>ref|NC_013316.1|:120058-120681 30S ribosomal protein S4 [Clostridium difficile R20291]
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ATAGATGTTATACAGACAAATGTGCTATAGTAAAAAGAAACTATGCTCCAGGTCAACATGGCCAAGGAAG
AAAGAAAGTTTCTAACTATGGATTACAATTAAGAGAAAAACAAAAAGTTAAAAGAATATATGGAGTTTTA
GAGACTCAATTTAGAAATTTATATGAACGTGCTGAAAATATGCCTGGTAAAGCAGGTGAGAACTTATTAA
GTTTATTAGAGAGAAGATTAGATAATGTAGTTTACAGAATGGGACTAGCATCTTCTAGAAAAGAAGCTAG
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>ref|NC_013316.1|:120759-121706 DNA-directed RNA polymerase alpha chain [Clostridium difficile R20291]
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TTATAGAGCCTCTAGAAAGAGGATATGGAATAACTATAGGTAACGCATTAAGAAGAATATTATTATCATC
ATTACCAGGTGTAGCAGTGAATGCTATAAAAATCGATGGAGTTCTTCATGAATTTTCAACAATACCTGGT
GTTAAAGAAGATGTTACTGAGATAATATTAACTTTAAAAGAGCTTTCAGCAACTATAGATGGTGAAGGAA
GTAGAACACTTAAAATAGAAGCTCAAGGACCATGCTCTATCACAGGTGCAGATATAATCTGTCCTCCAGA
TGTTGAAATATTAAGTAAAGATTTAGCAATAGCTACATTAGATGATAATGCTAAACTTAATATGGAGATA
TTTGTAGATAAAGGTAGAGGTTATGTTTCTGCTGAAGAAAATAAAACAGAGAATGTTCCAATAGGTGTTT
TACCTGTGGATTCAATATATACTCCTGTTGAGAAGGTTAGTTATCATGTGGAAAACACAAGAGTTGGTCA
AAAAACAGATTATGATAAATTAGTACTAGAAGTTTGGACTAATGGTAGTATAAATCCTCAAGAGGGAATA
TCATTAGCTGCAAAGGTATTAGTTGAGCATTTAAACTTATTTATAGACTTAACTGAACATGTAAGTAGTG
TTGAAATCATGGTAGAAAAAGAAGAAGATCAAAAAGAAAAAGTTCTTGAAATGACTATAGAAGAATTAGA
TTTATCAGTTAGATCATATAACTGTTTAAAGAGAGCGGGAATTAATACAGTTGAAGAATTAGCTAATAAA
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AAGAACTTGGATTGGGATTAAAACCAAGTGAAGAATAG
>ref|NC_013316.1|:121727-122068 50S ribosomal protein L17 [Clostridium difficile R20291]
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GCTTACTAAGAAGTGGAAGAATAGAAACTACAGTGACTAGAGCGAAAGAAACTCGTAGAATGGCTGAAAA
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TAGATAATTTAAGCCTAGATGTTAAAAAAGGAGAATTTGTTGCGATAATAGGACATAATGGTTCTGGTAA
GTCTACTTTATCTAAAAACTTAAATGCTATTCTTATGCCTACTGAAGGAAATATTCTTATTGATGATATG
GATACTAAAGAAGAAGAAAGATTATGGGATATAAGACAAACTGCAGGCATGGTATTTCAAAATCCAGATA
ATCAAATAGTTGCTACTATAGTAGAAGAAGACGTTGCATTTGGACCTGAGAACTTAGGTATAGAACCAAA
AGAAATAAGACGAATTGTAGAGGAGTCTTTAAAAAGTGTAGGTATGTATGATTTAAGAGATAGACAGCCT
CATTTGTTATCAGGAGGTCAAAAGCAAAGAGTTGCAATAGCAGGAATTATTGCTATGAGGCCTAAATGTA
TAATATTTGATGAAGCAACAGCAATGTTAGATCCATCTGGAAGAAAAGAAGTTATGAAAACAATAAAAAG
ACTTAATAAGGAAGAAAATATAACTGTTATACATATAACGCACTTTATGGAAGAAGCAGTAGAAGCTGAT
AGAGTTGTAGTTATGGAAAAAGGAAAGAAAATCTTAGAGGGAACTCCTAGAGAAGTATTCAGTAAAATAA
AGATGTTAAAGGAAATCGGTTTAGATGTACCTTGTATGACAGAGTTATCTAGTTTATTAATAGAAGAAGG
TATAAATATTAGTAGTGATATATTAACTGTGGATGAGATGGTGATGGAATTATGTCAATTATAG
>ref|NC_013316.1|:123054-123875 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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TAGGTCATACAGGCTCAGGAAAATCTACATTAATACAACATTTAAATGGATTACTAAAGCCTTCCTCAGG
AGAAATATTTATAAATGATTTTAATATAACAGATAAAAACTTGAATTTAACTGAGATTAGAAAAAGAGTA
GGGGTTGTATTTCAATATCCAGAATACCAATTGTTTGAAGAAACGATTGATAAAGATATAGCTTTTGGAC
CCTCTAATTTAGGCTTAGAGGAGTCTGAGATACATAACAGGGTAAAAGCATCAATGGAAGCTGTAGGACT
TGATTATGAGGGATTTAAAGACAAATCTCCTTTTGAATTATCTGGGGGACAAAAGCGTAGAGTAGCAATT
GCTGGAGTTATAGCCATGAACCCAGAAGTTCTCATATTGGATGAACCAACTGCTGGTCTTGACCCTGGTG
GAAGAGATGAAATTTTTAACTTAATAAAAGACTTACATGAAAAAAAGAATATGACTATAATACTATCATC
ACATAGTATGGATGATATGGCAAAGTTAGCAAAAACTTTAATTGTTATGAATCATGGTAGCGTAGAATTT
ATGGGAACTCCTAGAGAAGTGTTTAAATCAAATGCTAGTAAATTAAAAGATATAGGATTAGATATTCCAC
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AGAAGCAAAACAGGAAATATTAAAAGTTGTGAGAGGACGAGGATTATGTTAA
>ref|NC_013316.1|:123965-124672 ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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TAAAATTGGCTAATATACCAGTCAAATATATTGTTAAGGGTGTTAAACCTCTTAAATGGATTATTTTGTT
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AAACAGGGTCTAAGACAAGCAATTTTTATGGCAATAAGATTAATATTTTTAGTAGTTGGTACATCATTGC
TTACTTTAACAACTTCACCAATAGAATTAACTGATGGAATAGAGAGATTGTTGAATCCATTTAAGAAAAT
TGGTTTGCCAGTTCATGAACTTGCAATGATGATGACAATTGCTTTACGTTTTATTCCTACATTGTTAGAT
GAGACAGACAAAATAATGAAGGCTCAGATGTCTAGAGGTGCAGATTTTGAAAGTAAGAATCTTATAAATA
GAGCAAAGAATTTAGTACCACTTTTGGTACCTTTATTTGTAAGTGCATTTAGAAGAGCTGATGAATTGGC
TATGGCCATGGAGGCCAGATGTTACAGAGGTGGACATAATAGGACTAAGATGAGAGAGTCTGTTATATCA
AGAAGGGATTATATGGCATGTGTATTTCAGGTTGTTTATCTGGGAGCAATTATAGCTACTAGATTTATAG
CAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:124704-125435 tRNA pseudouridine synthase 1 [Clostridium difficile R20291]
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CTTTAGGGATACAAGGTACAATTGAAAGGGCTATATATGATATAACAAAAGAAGAAACCAGTCTTATAGG
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AGTATAGAAAGTATACCAATGGCACTAAATGCCAAGTTGCCAAAAGACATATCAGTTATAGAAGCATGTG
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CAAGTTTAGAAATCCAATACTTAGTGAGATATCATATCAAGTAAAATATGAACTTGATTTTGATAAAATG
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AAGATACAGTTAGAACGATATATGATATTGATATAAGTAAAAAAGATGACTTGATTACTTTTGAGATTAG
TGGTAATGGTTTTTTATATAACATGGTGAGGATTATTGTTGGAACACTTGTTGATATGGGTCGTGGCAGA
ATTAACGAACCATTTTTAGATATAATACAATCAAAAACTAGGTCAAGATGTGGACATACAGCTCCAGCAC
AAGGATTATTTCTCAAAAAAGTTCATTATTAA
>ref|NC_013316.1|:125555-125897 50S ribosomal protein L13 (pseudogene) [Clostridium difficile R20291]
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CATTAGGTCGTTTAGCAACAGAAATTGCGACAGTATTGAGAGGTAAACATAAACCAACATTTACTCCTCA
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CAAAAATATTACAGATACCATACTGGTTATGTAGGTGGATTAAAAGAAATATCTTACAGAGATATGATGG
ATAAGAAACCAGAAGAAGTTATATCACATGCTGTAGCGGTATGTTACCTAAAAATAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:126015-126407 30S ribosomal protein S9 [Clostridium difficile R20291]
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GTGAAGGAAATATATTAGTAAATGGAAGAGCATTAGAAAATTATTTTAATTATGAGACATTAATAAGAGA
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GGATTCACTGGACAAGCTGGAGCTATAAGACATGGAATATCTAGAGCTTTATTAAAAGCTGATTTAGATT
TAAGACCTGCTTTAAAGAAAGAAGGTTTCTTAACTAGAGATGCAAGAATGAAGGAAAGAAAGAAATACGG
ATTAAAAGCAGCAAGAAGAGCTCCACAATTCTCAAAAAGATAA
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TAATTTTTAGTTTTGCAATGATATGTCTAGTAGTAGTATCCATATTTGAAATTAAAAATATTTCTGAAGA
TGTTATCAAGTATATGCCAGTAACAAACAAAACTATAATTTTAGATGCTGGTCATGGAGGCATTGATCCA
GGTGCATTAAATAAGGATAAGAGTACATCTGAAAAGGATATTAACCTAGCAATAACACTTAAGCTTAGAG
AGCTTATAGAATCAAGTGGTGGCCTTGTAATATTAACTCGAGAAGATGACAGTAGCCTTTATAAAGAAGA
AAATAATAAAACTACAAGACAAAAATATAATGAGAATTTGAAAAATAGAAAAGAAATAATATCTAATTCT
AATGCCAATATGTTTGTCTCTATACATCTTAATGCATTTGAACAATCAAAATACTATGGAGCTCAAACTT
TTTATCCTAAAGACAAACAAGACAGTAAAGAATTATCGAAGTGTATTCAAGAAGAACTTAAAAGAGTAGT
AGATAAGACAAACAACAGAGAAGTCAAACCAAGGGATGATATATATCTTTTGAAAGAAAATAATATTCCA
TCAGTACTGATAGAATGTGGTTTTTTATCAAATGAAAAAGAGTGTAAACTCTTAACTGATGAAACATATC
AAGAAAAAATAGCATGGGCAATCTACATAGGAATACAAAAATATTTAAGTTGA
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TGGAAAGTAATGGAGTTAAAGTAATAAATCTTAGTATAGGAGAACCCGATTTTAATGTACCTAATAACGC
AAAATCTTATGGTATTGATTCTTTAAATAAAGATTACACTAAATATGATTTAGTTCCAGGATTAAAAATA
CTTAGAGAGGAAATCTGTAAAAAACTTATTGAAGAAAATAACTGTAACTATTCAATAGACGAAATAGTTG
TATCAAGTGGAGCAAAAAACTCAATAACAAATACTTTACTAGCTTTAACAGACGAAGGAGATGAAGTCTT
ATTACCAAAGCCTTATTGGGTTAGTTATCCTGAAATGATTAAGTTAGTTAATGCTGTTCCAGTTTTTATT
GATACTAAAAAAGAAAATGGATTTAAGTTAACAAAAGAAGAACTTGAAAAATCTATAACAGATAAAACAA
AAATTCTTGTAATAAACAATCCTTCAAATCCTACTGGTAGTGTTTATACAAAAGATGAATTAATAGAAAT
AGTAGATGTATGCATACAAAATAAAATATATATTTTAGCAGATGAAATATATGAAAAAATATGCTACACT
GGTGAATTTACATCAATTGCATCATTAAGCGAAGAAGCTAAAGATATAACAATAACTATAAATGGTTTTT
CTAAGTCAGCTGCAATGACTGGATTAAGATTAGGATATACTGCATCTAATAAAACGATTGCTAAAGCAAT
GAGTTCTATACAAGGACATCTTATATCTCACCCAAGTCTAACAGCACAATACATAGCCTATGGAGCCTTG
AAAGATTGCTCAATTGACATAGACAATATGGTTAAAACATATAAATCAAGAAGAGATTTAATTAAATCAA
AACTAGACTCTATTGATAATGTAGGATATGTGAATCCAAATGGCGCATTCTATATATTTATAGATCTTTC
TAAAGTATCTGAGAAATTTGAATATAAAGATAGTTTTTCTATAGAATTTTGTAATCAATTTTTAGAAGAA
TATAATGTTGCAGTTGTTCCTGGCATAGCATTTGGTATGGATAAATATATTCGTATATCCTATGCTTGCA
GTGAAAATACTTTTTTATCTGGATTAGACAAATTAAAAGAATTTGTATATAAAATAATGGCATAA
>ref|NC_013316.1|:139825-142176 anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase [Clostridium difficile R20291]
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AACTCAAGAAGTAATAAAGTTTTTAAATCATAAATACTCAGAATCAGTTCCAAGTGTTGAAGATATACAA
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CTGAAAGAAGTAGAATAAGAAATTCAAAAACAAGATTGATGAAGGCAATAGAGGAAATTACCTTTGAAGA
TGCAGAAGATGCTGATATAAAAAGAGAAAATGCAAATATTAATGGTAATACAGCAATGGGAACTATGTTA
CAATATGGAAGCACTGTATCTAAAGAATTTTGTAAAACACATATATTAAAACCAGAACATTCTTTTGCTC
ATGATAATGGAGATATACACATACATGATATGGATTTTTTAAATATGGGAACATTAACTTGTTGTCAAAT
AGATGTTAAAAAACTATTCAATGGTGGATTTTCAACAGGACATGGCTTTTTAAGAGAGCCACAAGATATA
ATAAGTTATGGTGCATTAGCTGCAATTGCTATACAAAGCAATCAAAACGATCAACATGGAGGTCAAAGTA
TACCATTTTTCGATTATGGATTGGCTGAAGGTGTATATAAGACATTTAAGAAATTCTACATAGGAAATTT
AGCTAAAGCATTGAAGTTATTTAAAGGAATTGAAAATAATGATGTGATAAAGAACATAGTATATAATACA
GAGAAAGAAACAAATCAAAAAGTTGGTCTTAAGAGAGATGAATTGTATCTAAACTTAGAAAAAGAGAAAT
TAATACAGACTTTTGATATAGATGATGAACTTGTAAATAAGATGCAAAACTTTGCATTTGAAGAATCGTA
TAGAGAAACTGATAAAAAAACATATCAATCTATGGAAGCATTTATACACAATCTAAATACAATGCACTCT
AGAGCAGGTGCACAGGTACCATTTTCAAGTGTAAACTTCGGAACAGATACTTCTGAAGAAGGAAGAATGG
TAACTAAGAATCTTCTATTATCTCAAGAAAGAGGTTTAGGTAATGGAGAGACACCAATTTTTCCAATTTT
AATATTTAAGGTCAAAGAAGGCATAAATTTAAATCCTGAAGACCCTAATTATGATTTATTTAAATTATCA
TGCAGAGTATCAGCTAAAAGACTATTTCCTAATTTTAGTTTTTTAGATGCGCCTTTTAATGCAAAATATT
ATAAAAAAGGTGAACCAGATACAGAGGCTACATATATGGGTTGTAGAACAAGAGTACTTAGTAATGTGTG
TGGTTCAGAAACAGTTAGTGGTAGAGGAAACATATCTTTTACTACAGTAAATTTACCAAGATTGGGTATA
AAACATGGTATTATAAATAATGAAAAGGCTAATTTAGATGGTTTCTTTGAAGAATTAGATGAGAAGATAA
ACTTAATTATAGAACAATTATTGGAGCGCTTTGAGGTTCAAGGAAATAAAAAGATGAAGAATTTTCCATT
CTTAATGGGGCAAGGTGTATGGAAAGGTTCTGATGATTTAGTACCAGAAGATACACTAAAAGAAGTAATA
AAACAAGGAACATTGACAATTGGATTTATAGGTTTAGCAGAGTGCCTTATTGCTCTTATAGGTAAACATC
ATGGAGAAAGTAAAGAAGCTCAAGAATTAGGATTAAAAATAGTGTCACATATGAGACATAAAATGGATGA
AGCAACGGACAAATATAAATTAAATTTCTCCTTAATGGGTACTCCAGCAGAAGGTCTTTCAGGTAGGTTT
ACTAAAATAGATAAAAAAGTTTATGGAGAAATTAAAGGTATCACAGATAAAGAATATTATACTAATTCAT
TCCATGTACCAGTTTATTACAATATAAGTGCATATGATAAAATTGAGATAGAAGCTCCATACCATGAATT
GACTAATGCAGGTCATATAACATATGTAGAGTTAGATGGAGATCCATCTGATAATTTAGAGGCTTTTGAA
ACTGTTATAAAAGCTATGAAAGATTTGGGTATAGGATATGGAAGTATAAATCATCCTGTAGATAGAGACC
CAATATGCGGTTTTTCAGGTGTAATAACAAGTAATATATGCCCTGTATGTGGAAGAAATGAAGATGAAAG
TGACATCAAATTCGAAAGAATAAGAAGAATAACAGGATACTTAGTTGGTACAGTTGATAGATTTAATAAT
GCTAAAAAAGCAGAAGTAAGAGATAGAGTAAAACATAGATAG
>ref|NC_013316.1|:142198-142737 anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein [Clostridium difficile R20291]
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TATGGACTCAAGGATGTATTCATAATTGTAAAGAGTGCCATAATCCTCAGACACATGATTTATGTGGAGG
ATTTTATATGGATACAGAAGAAATTATAAATAAAGTCAAATCATTGAAATTACAAAAAGGCATTACGCTA
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TAGATGTATGGTCATATACTGGATTTACGTTTGAACAACTGTTAGATAAAAAAAATAGAGCGTATTTTAA
AAATTTAAATTTACTAAAGCAAATTGATATTTTAGTGGATGGAAAATTTATAGCTGAAAAAAAAGATATA
AGCTTAAAGTTTAGAGGGTCATCAAATCAAAGGATAATTGATGTTCAAAAAAGTTTGAAATATAAAAAAG
TGTTTTTGGTTGAGCAATATATGAAGGATGATTTATCTATAGCAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:149443-150282 hypothetical protein CDR20291_0108 [Clostridium difficile R20291]
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TTGACATATCTATAGTAGCGTATATTTTTTACAAAATATTTATGTTTATAAAAGATACAAGAGCAGAACA
AGTGTTTAAAGGTATAATATTTCTTTTATTAGCAACTCAACTTAGTAACACCTTTAAATTGCATACCGTT
TATTGGATATCTCTTAAAGCTTTAGATTATGGAGTTATAGCTGCTCTTATAATTTTTCAACCAGAATTTA
GAGCAGGACTTGAACATATAGGAAGAGCAAAGTTTAATTTATTTGGAAAGAATGTAAATACTTCTGAAGA
AACTCTCAATAGAAATATAGAAGAAATTGTAGAAGCTTTATATTCACTTTCTAGACAAAAAATAGGAGCT
CTTATCATAATGGAGAGAGAAACTAGAATAAGTGATATAATAAATACAGGAACTATTATTGATGCTGAAA
TTTCTAGGCAACTATTAATAAATATATTTATACCAAATACACCATTACACGATGGAGCTGTTGTAATTAG
AGATTCTAAGGTAAAAGCAGCTGCATGTTTTTTGCCATTGACGGAAAGTAAGGATTTAAGTAAAGATTTG
GGTACTAGACATAGAGCAGGAATAGGGGTAAGTGAGGTGTCTGACTGTATAACTCTGATTGTATCAGAGG
AAACAGGTGGCGTATCAATTGCTAAAGCAGGTAAGTTATATAGAGATATTTCTAGAGAAAGAATGATGAA
TATATTACGTAGTAATTTAAAAACAAATACAGAAACAAGAAGTTTTTTCAAAGGTGGTATATTTAAATGA
>ref|NC_013316.1|:150348-151460 hypothetical protein CDR20291_0109 [Clostridium difficile R20291]
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ATATGAGTGATTTAAAGGATAAAAATCTTGTTATATATCCAGACGAAAAATTAACAGCAGATGTATATAT
AAAAGGTAGTTTATCAAAGGTACAAAGTGTTAAGAAAGAAGATATACATGTATATGGAACCATTGAAGAC
CCAATACAAGGACAGAAGGAAGTATATTTAAAAGCAAATATTCCTCAAGGTGTTACTCTAGAATTTAAGC
ATGATGTTTTAGTAGTAAATCTTGAAAAAAACATAAAAGAAAAAAGAGATATAAAGGTAGAAGTAAGTGG
AAATTCAAAAAGAAATATAAATAAAATTGAACTTAGTAAGGAATTTGTCGATGTATCAGGTCCAAGAACT
CTAGTTAAAGAAGTCAAAAGTGTAAGAGCTAATCTAGATGTTGGTAATGAGACAGATGATTTTTCTAAAA
AATTGCAATTAATACCATTAAATAGTGATGGAACTAAGGTTGAAGGAGTAACATTAAGTTCATCCTTTGT
GACTGCAAAGATAGAACTATTGAAGGAAAAAATTGTCCCAATAAGAGTAAGTCTAAATGATAATAAAGAT
AATGATGTACTGAAAAACTATAAATTAAGTAAGGAACAAGTTACAATAAAAGGAAAGAAAGAAGATATAG
ACAAAATAAGTTATATTAAGACAAAACCTATTGACTTAGCTGATTTGGCTAATGGTGAAGAAAAAGAAGT
TAGCTTAGAAATTCCAGAGGGTATAACTCTTGAGGATAGCTCTATAACAATTAAATTAAATGATACAAAA
CAATTGAGTGCAGAATTTTTATATAATGCGGGAGATATTGAATTAAGAAATATCCCAACAAATATAGATA
ATCCAAATGTAATTTCTGATGTAGATATAAAAGTTGTTGTAGAGTCAACGGAGGATTTGAGTAAGTTAAA
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TATGAAACAACATATCAATTTAAAAAAATAAATATAGAACCTAATATTGTTGAAGTGGAATGA
>ref|NC_013316.1|:151457-151576 hypothetical protein CDR20291_0110 [Clostridium difficile R20291]
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ATTTTATGTTTTTGTTGCATCTTGTTTATTTTAGTTATATTATAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:151749-152666 phosphate butyryltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGTGGAAATGCATGAGAAGTTTTGAAGAAGTAATTAAGTTTGCAAAAGAAAGAGGACCTAAAACTA
TATCAGTAGCATGTTGCCAAGATAAAGAAGTTTTAATGGCAGTTGAAATGGCTAGAAAAGAAAAAATAGC
AAATGCCATTTTAGTAGGAGATATAGAAAAGACTAAAGAAATTGCAAAAAGCATAGACATGGATATCGAA
AATTATGAACTGATAGATATAAAAGATTTAGCAGAAGCATCTCTAAAATCTGTTGAATTAGTTTCACAAG
GAAAAGCCGACATGGTAATGAAAGGCTTAGTAGACACATCAATAATACTAAAAGCAGTTTTAAATAAAGA
AGTAGGTCTTAGAACTGGAAATGTATTAAGTCACGTAGCAGTATTTGATGTAGAGGGATATGATAGATTA
TTTTTCGTAACTGACGCAGCTATGAACTTAGCTCCTGATACAAATACTAAAAAGCAAATCATAGAAAATG
CTTGCACAGTAGCACATTCATTAGATATAAGTGAACCAAAAGTTGCTGCAATATGCGCAAAAGAAAAAGT
AAATCCAAAAATGAAAGATACAGTTGAAGCTAAAGAACTAGAAGAAATGTATGAAAGAGGAGAAATCAAA
GGTTGTATGGTTGGTGGACCTTTTGCAATTGATAATGCAGTATCTTTAGAAGCAGCTAAACATAAAGGTA
TAAATCATCCTGTAGCAGGAAGAGCTGATATATTATTAGCCCCAGATATTGAAGGTGGTAACATATTATA
TAAAGCTTTAGTATTCTTCTCAAAATCAAAAAATGCAGGAGTTATAGTTGGGGCTAAAGCACCAATAATA
TTAACTTCTAGAGCAGACAGTGAAGAAACTAAACTAAACTCAATAGCTTTAGGTGTTTTAATGGCAGCAA
AGGCATAA
>ref|NC_013316.1|:152688-153767 butyrate kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCAAAATATTTAAAATCTTAACAATAAATCCTGGTTCGACATCAACTAAAATAGCTGTATTTGATA
ATGAGGATTTAGTATTTGAAAAAACTTTAAGACATTCTTCAGAAGAAATAGGAAAATATGAGAAGGTGTC
TGACCAATTTGAATTTCGTAAACAAGTAATAGAAGAAGCTCTAAAAGAAGGTGGAGTAAAAACATCTGAA
TTAGATGCTGTAGTAGGTAGAGGAGGACTTCTTAAACCTATAAAAGGTGGTACTTATTCAGTAAGTGCTG
CTATGATTGAAGATTTAAAAGTGGGAGTTTTAGGAGAACACGCTTCAAATCTAGGTGGAATAATAGCAAA
ACAAATAGGTGAAGAAGTAAATGTTCCTTCATACATAGTAGACCCTGTTGTTGTAGATGAATTAGAAGAT
GTTGCTAGAATTTCTGGTATGCCTGAAATAAGTAGAGCAAGTGTAGTACATGCTTTAAATCAAAAGGCAA
TAGCAAGAAGATATGCTAGAGAAATAAACAAGAAATATGAAGATATAAATCTTATAGTTGCACACATGGG
TGGAGGAGTTTCTGTTGGAGCTCATAAAAATGGTAAAATAGTAGATGTTGCAAACGCATTAGATGGAGAA
GGACCTTTCTCTCCAGAAAGAAGTGGTGGACTACCAGTAGGTGCATTAGTAAAAATGTGCTTTAGTGGAA
AATATACTCAAGATGAAATTAAAAAGAAAATAAAAGGTAATGGCGGATTAGTTGCATACTTAAACACTAA
TGATGCTAGAGAAGTTGAAGAAAGAATTGAAGCTGGCGATGAAAAAGCTAAATTAGTATATGAAGCTATG
GCATATCAAATCTCTAAAGAAATAGGAGCTAGTGCTGCAGTTCTTAAGGGAGATGTAAAAGCAATATTAT
TAACTGGTGGAATCGCATATTCAAAAATGTTTACAGAAATGATTGCAGATAGAGTTAAATTTATAGCAGA
TGTAAAAGTTTATCCAGGTGAAGATGAAATGATTGCATTAGCTCAAGGTGGACTTAGAGTTTTAACTGGT
GAAGAAGAGGCTCAAGTTTATGATAACTAA
>ref|NC_013316.1|:153826-154434 putative ATP/GTP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAACTATGTTGTTAAGTTAAGAGATATGGTTTCTGGCAAAGTTGCTATAGCCGATTTAGATGTGGTAA
ATGTATACTTTAGAACTAGAGAAAAGAAAGAGTTAATGAAATCCTTAGGTATACAACCAATAGATAGCTC
AATTAATGCTCCAACATTAGATTTACCAGCAGTATCAGCAGAGGTAATGTCTCCTATGGTAGACCATTCA
TACAATTCTGTTATAGATTTAGGTGGAGATAATGTAGGTGCTAGGGTTATAGGAAGATTTAGTCATTTGT
TAAAAGAAGGCGATTATGATATGCTTTTTGTAATAAATGCAAATAGGGAGAAAACTCAAACTTCTGAAGA
AGTTATCCAATATATAAAAGAAATAGAAAAATCTTCTAAATTAAAGGTAACAGGTCTAATTAATAATACT
CATCTTATTAGGTTTACTACTATTGATGATGTTTTAAGAGGTCAGAAAGTTGCAAAAGAAGTTTCTGAAA
AATGTAATATACCGATAAGATATGTTGCATGTTTAGAAAATCTTGTTGAACAGTTACCAAAAGATTTAGA
AGGAGAAATTTTTCCTATAAAATTATATATGAGAGAAGACTGGATGTAG
>ref|NC_013316.1|:154477-154692 ferredoxin [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTAAAGGAAAAGTATCTTTTAATCAAGAACGTTGTAAAGGTTGTGGATTGTGTGTTGAAGCATGTC
CAGTAAAAATCATACAATTAGACTCAAATGTAATAAACAAAAAAGGGTATAACCCAGCAACTGTTTTTGA
AATGGAAAAATGCATAGGATGTGCAAGTTGTGCAACTATGTGTCCAGATGTAGTTATAACAGTAGAAAGA
GATTAA
>ref|NC_013316.1|:154721-155800 putative oxidoreductase, thiamine diP-binding subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTAAGATACTTATGAAAGGTAACGAAGCATTTGGAAAAGCAGCTATAGAAGCTGGTTGCAAATATT
TCTTCGGTTACCCAATAACTCCACAAAGTGAATTACCAGAATATTTATCAAGAGAGTTACCTAAAATAGG
TGGAGCGTTCGTTCAAGCTGAATCAGAAGTTTCTGCGATAAACATGGTTTATGGTGGAGCAGGTGCAGGA
GCAAGAGTTATGACTTCTTCATCTTCACCAGGAGTTGCTTTAAAGCAAGAAGGTATAACATATGCAGTAG
GAGCAGAAGTTCCTTGTGTTGTACTTAATGTAATGAGAGGTGGTCCAGGACTTGGAAGTATACAACCTTC
ACAAGCTGACTACTTTATGTCTACAAGAGGTGGAGGAAATGGAGACTACAGAACTCCAGTATTCGCACCA
GCTACAGTTCAAGAAGCTGTTGATATGATAATGGAAGCTTTTGACGTTGCAGATTATTACAGATCACCAG
TTATGGTAGTTGCAGATGGTATGATAGGTCAAATGATGGAGCCAGTTGAATTTAGAGCTCCTGAGAAGAA
AAGAGAATTGCCTCCTAAAGATTGGGCAACTGTTGGAACTAAAGGAAAAAGAAAACCTAATGTAATAAAC
TCTCTATACTTAGAACCAGAAGTACTAGAAGACCATTGTTGGCATTTACAAGAAAAATTTGATGCAATGG
AAAAGAATGAAGTACAATACGAAATGTACAAAACAGAAGATGCTGAATTTGTATTTGCAGCTTATGGAAC
TACTTCAAGAGTAGTAAAAAGCGCAATTGATATATTAAGAGAAGAAGGAATAAAAGCAGGTCTTATAAGA
CCTAAAGTATTATGGCCATTCCCATTCGAAGCATTCAACCAAATTCCTAATGCTAGAAACATATTGACTG
TTGAAATGAGTATGGGACAAATGGTGGAAGATGTTAAAATGGCAGTAGAAGGTAAATTACCAGTTTACTT
CCATGGAAGACCAGGAGGAATGACTCCAACACCAGCAGAAATAGTTGAAAAAGCTAAAAAAATTATTGCC
GGAGAATTGGTTGCAGGAGGTGCTAGATAA
>ref|NC_013316.1|:155800-156552 putative subunit of oxidoreductase [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTGTTGTATTTAAGAAAACTGAAGGATTACAAGATACTCAAACTCACTACTGTCCAGGATGTACAC
ATGGTATAATCCATAGATTAGTTGGTGAAGTATTAGAAGAACTAGGAGTATTAGGTGATGCTGTAGGTGT
TGTTCCAGTTGGATGTTCAGTTTTAGGATATAAATATTTTAACTGTGACACTCAAGAAGCTGCTCATGGT
AGAGCGCCAGCTGCTGCTACAGGAATAAAAAGAGTTCATCCTGAAAATACAGTATTCACTTATCAAGGTG
ATGGAGACTTAGCTTCAATTGGTACTGCTGAAATAGTTCATGCAGCTGCTAGAGGAGAAAAAATAACTAC
TATATTTGTAAACAATACAACTTATGGTATGACTGGTGGACAAATGGCTCCAACTACATTAGTTGGACAA
AGAGCTACTACTGCTCAATCAGGAAGAAATGCTGAAACTCAAGGTTATCCAATAAGAGTAAGTGAAATGT
TAGCTACATTAACAGGAGCTGTATTTGTAGAAAGAGTAGCAGTTGATACTCCAGCTCATGTTAGACAAGC
TAAAAAAGCTATAAAGAAAGCATTCCAAGTTCAACAAGCAGGATTAGGATTTGGAATAGTAGAAGTATTA
TCTACTTGTCCTACAAACTGGGGACTAGCTCCAAACGATGCTTTACAATGGTTAAGAGACAACATGATAC
CATACTATCCATTAGGAAATTTCAAAAATGTTGAAGTTGAGGAGGTGAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:156553-157110 putative subunit of oxidoreductase [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTACAGCTAGAGTAATATGTGCAGGCTTCGGAGGCCAAGGTGTTATGTCTATGGGACAATTACTTA
CTTATGCAGGAATGCTAGAAGGAAAAGAAGTTTCTTGGTTACCATCTTATGGACCAGAAATGCGTGGAGG
TACAGCAAACTGTGCAGTAACTGTATCTAATGAGCCAGTTGGTTCTCCACTTATAACAGATGATGCAACT
GCAGCTATATTATTAAATATACCAGCATTTGAAAAATTCAAAGATGATGTTATTCCTGGTGGAAAAATAA
TAGTAAATAGTTCTTTAATAAAAGAAAAAGTTGATAGAACAGATGTAGATGTTTATTATATACCAGCAAA
TGAATTAGCAGCTGAATTAGGAAATGATAAAGTTGCTAATATGATAATGTTAGGCGCTTACTTAAAAGTA
TCTGATACTGTAGATATAGAATCTGTACTAGAAGCATTCAAAAAAGTTTTCGGACCTAGAAAAGAAAAAT
TCGTTCCATTAAACAGAGAAGCTTTACAAAAAGGTATGGATGCTACATGTTCTAAAGCAACTAACTAA
>ref|NC_013316.1|:157220-158626 phosphoglucomutase/phosphomannomutase mutase [Clostridium difficile R20291]
ATGAACTATAAAAATATAATACAAATTACAAGCTTTTCAATTATGAAAGGAGAATCTTTAGTGAGAAAGT
ATTTTGGAACAGATGGAGTTAGAGGAGTAGCAAATACAGAACTAACATGTGATTTAGCATATAAACTTGG
TAGAGCTGGTGGATTTGTCTTAGCTCAAGGAGACCACAGAGTAAAAGTAGTAGTAGGTAAGGATACTAGA
ATATCAGGTGATATGTTGGAAGCATCTTTAATAGCAGGACTTATGTCTGTTGGATGTGATGTTATTACTG
TTGGAATAATACCAACACCTGCAGTGGCATATTTAACTAGAAAATATGGTGCTGATTGTGGTGTGGTTAT
ATCTGCATCTCACAATCCTGTTGAATATAATGGAATCAAATTCTTTAATAAGAATGGATATAAATTAGAT
GATGAAATTGAATTGAAAATAGAAGAATATATAGACGATATAGACAAAATTGATTGTCTTCCAATTGGTG
AAAATGTAGGAAGAAAATTACATGAACATTGTGCACAAAGAGACTATGTAGACTACCTAAAATCAATAAT
AAGCACTGACTTTAAGGGATTAAAAGTAGTTTTGGACTGTGCTAATGGTGCGTCATATAAAGTGGCACCA
ATAGTGTTTGATGAACTAGGAGCAAGTGTAATTTCAATAAATAGTTCACCAGATGGAAATAATATAAACT
ATAAATGTGGCTCTACACATCCAGAACAACTTCAAAGGGCTGTTTTGGAACATAATGCTGACTTAGGTCT
TGCATATGATGGAGATGCTGATAGATTAATTGCAGTAAATGAAAAGGGTCAAATTGTTGATGGAGACCAT
ATAATGATATTGAGTGCCTTAAATTTAAAGAAAAATAATAAATTGGCGCAAGATACTTTGGTAGTTACAG
TTATGAGTAATATAGGGTTGACAATAGCTGCTAAGGAAAATGGAATAAATTTATCTACTACAGCAGTTGG
AGACAGATATGTTTTAGAAGATATGGTTAAAAATGGATATAATCTTGGTGGAGAGCAATCTGGACATATG
ATATTTTTAGATTACAACACTACTGGAGATGGAGTGCTTAGTTCTCTAATACTTGCAAATATAATCTTGC
AAGAAAAGAAACCTTTATCAGAAATTGCATCAATAATGAGCCAATACCCACAAGTATTAGTAAATGCAAC
AATAAAAAATGAAAATAAGAACAAATATATGGAATATCCAGAAATAAAAACTGAGATAGAAAGAATAGAA
TCTATTTTAAACGGAAATGGTAGAGTTTTGATAAGACCATCAGGAACTGAGCCATTAGTTAGAGTTATGT
TAGAGGGTAAAGAGGAAGGTCAAATAAAAGAATTAGCAACAAACTTAGCTAATCTTATACAAGAAAAATT
ATCGTAA
>ref|NC_013316.1|:158893-160725 glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] [Clostridium difficile R20291]
ATGTGTGGAATAGTTGGATATTTAGGAAGTAGAAAGGCAGCAGAAGTTATAGTAGAAGGGCTTTCTAAGC
TAGAGTACAGAGGTTATGACTCAGCAGGAGTAGCAGTTAATAGTTCTAATGAAGAAGAACTTAATATTAG
AAAGTTTAAAGGTAGACTTTCTGTACTTGCAGAAGACTTAGAAAAGAATCCTATTGATGGAAATTTAGGT
ATAGGGCATACGAGATGGGCAACTCATGGAGAACCATCTGATGTAAACTCACATCCTCATTTTAATCAAG
CCAAAACAATAGCAGTTGTTCATAATGGGATAATAGAAAACTATATGGAAATAAAAGAAGAATTAATTTC
TGAAGGTGTTAAGTTTGAATCTCAAACAGATACAGAGGTAATAGCACATTTAGTAGATAAATACTATGAG
GGTAATTTATTAGATGCTGTATACAAAACTATATCAAAATTAAGAGGAGCTTATGCATTAGGTGTTATAT
GTAAAGAACATGGAAATGAATTAGTTGCAGTAAGAAAAGATAGTCCTCTTGTAGTTGGTGTTGGTGAAGG
TGAAAACTTTATAGCATCAGATATACCTGCATTATTAAAATATACTAGAGATGTTTATTTCTTAGAAAAT
GGAGAAGTAGTTCATCTAAAAGACGAAAATGTAACAGTTTATGACTCTAATAGAAATCTTGTTGAAAAAG
AAGTATTTCATGTAACTTGGGATGTAGAAGCTGCGTCTAAAGGTGGATATGACTACTTTATGTCAAAAGA
AATTCATGAGCAACCAACAGGAGTTAGAGAAACTTTAGAAAGAAGACTTGATGATAATGGAAATATAATT
CTAGACAGTATAAATATTTCTAAAGAAGACTTAGAAAAAATAAATAAAGTTTATATAGTGGCTTGTGGAA
CAGCATATAATGCTGGATTACTTGGTAAGTATGCCATAGAAAAATTTGTAAATATACCAGTAATAACTGA
TATAGCATCAGAATTTAGATATAGCGACCCATTTGTAGATGAAAATTCATTAGTAATATTAGTTAGCCAA
TCTGGTGAGACAGCAGATACTCTAGCAGTATTAAGAGATTCAAAGGCTAAAGGAGCAAGAATACTTTCAA
TAACTAACGTTGTAGGTTCATCTATAGCAAGAGAATCAGATGATGTATTCTATACTTGGGCAGGACCTGA
AGTAGCAGTTGCATCAACTAAGGCATATACTACTCAAATAACTTCTTTATACATGATAGCTTTAGACTTT
GCTATCAAAAAAGGAACAATAACTAGAGAATTTTATGATAGTATGATTTCTAAGATGAAAGAAATACCAT
CAAAAATACAAGAAATATTAGACAATGAAGAATATATAAAAGAAGTTGCTAAAACAGTTGTTAGTTCTGA
ACATGCATTCTATTTAGGAAGAGGTATAGACTATAGCTTAGCAATGGAAGGTTCATTGAAATTAAAAGAG
ATTTCATATATACATGCAGAAGCTTTTGCAGCAGGAGAGCTAAAGCATGGAACAATAGCTTTAATAGAAA
AAGGAACTCCTGTAATTGCCATAGCTACTCAAGAAAAGTTATTTGAAAAAATGGTTTCTAATATGGAAGA
AGTAAGAGCAAGAGGAGCTTATGTAGTAGCAATAGCTCAAAGCCATAATAAGGATGTTGAGAAAGCTGCT
GATAAAATAATCTATATACCAAATTCAGATGATATTTTATCACCAATATTAGCAGTTGTACCAATGCAAT
TACTTGCGTATCATGTCTCTGTACTAAGAGGATGCGATGTAGATAAGCCAAGAAATCTAGCTAAATCAGT
AACAGTTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:161178-162473 putative thiosulfate sulfurtransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGACAAATGATTTTAAAAAAGAAAAGAAAGAAGATTATTTTGTTAATCTTAAGGCAATATCTACTGAAG
TTTTACAAGAAAAAATGCAAGATAACGCTTGGGTTATAGTTGATACTCGCTTAAATGATGCTTATAATGG
CTGGAAGTTAGATGGAGTAAAAAGAGGTGGGCATATAAAAAGAGCAGTAGATTTTTCTGCTAATTGGTTA
AATGTATACTCAGATAGAAAAGATGAAGTGCTAGAACAAGCATTGAAAACTAAAAGAATTGATTTAGATA
AAAATATAGTATTGTATGATGCAAATGGAAAAGATGCTTTGGTTGTAGCAGATTATTTATCTAAAAAAGG
ATATAAATATCTATATAAATATGATATTAAACAATGGGCAGACGATGAAAATCTTCCAATGGAAAGATAT
AAAAATTATCAAATGATAGTTCCTGCTTTTATAATAAAAGATATATTAGATGGAAAAATTCCTGAGACAT
TTGAAGATTCAAAGAATATAAAAATGATTGAAGCGAGTTGGGGAGAAGAATCGTATACAAAAGGGCATAT
ACCTACAAGTGTTCATGTAAATACTGATATTATAGAACCTCCTCCAACATGGATGCTTGATAATGATGAT
AACTTAACTAAGTTTGCTTTAGACTATGGACTAACAAAGGATGATACTGTAATAGTTTCAAGTATTACAC
CTATGGCATCTTATAGACTAGCTGTTATATTGAGATATATAGGAGTAAAAGATGTAAGAGTTTTGAATGG
TGGAACAAACTCATGGTTATCAGCAGGATATGAATTAGAATTTATTAGTAATCCAAAACATTCATGTACT
AATTTTGGAGCAGATATACCAGTTAACTCACAATTAGTTGTTACTACATCTGAATTAAGACAAAAACTAA
AAGAAAAAAATAAGTTTATACTAGTAGATAATCGTACTTGGGATGAACATATAGGAAAAGTATCTGGATA
TACATATTATGATAAAAAAGGGCGTATACCAGGAGCTTTATATGGACATTCAGGTAGTAATAGTGTTTCA
CTAGAAGAATATCGTAATATTGATAATACAATGAGAAATAAATCTGAGATTTTAGAAATGTGGGACAAGG
AAAATATAGATGTGAATAAACAGCTTATATTTATGTGTGGAAGTGGATGGCGTGCTGCTGAAGTATTAAC
ATATGCAAATGTCATAGGAGTGGAAAATACCTCCCTTTATAGTGATGGATGGATGGGCTGGAGTCTTGAT
AATTCAAATTTAATTGAAGTGGGAGAACACAAATAA
>ref|NC_013316.1|:162957-163694 hypothetical protein CDR20291_0121 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAGTAAAATTAGCTATAAGCTTTTTTATATTAATGATTATAGGAATGACAATATCTTATGCAG
ATACAAGTATAAATACTAGATACAATAGATTAAGTAAAGCTCTTGAAATATCAGAAGCAAATTTTAAATT
TTATAATGTTAAAATTAATTCTGTTATAAATCATAATTTATCAAATAAAGAATTTCATAATATTTTTATA
GAAATAATTAACAATCTAAAGTTGGATAAAAAAGGAATAAATTGGAATCAAAAAGGGTCTGGCGATAAAA
TACAATTATGTGCTACTATAAAAGGTAGCGATAAAGAAATTTCTATAAAAGGAATAAATAAAAATAACAA
AGAAAGTTACATAGTAGTTGACATATTGGATAACAAAGTATATAAACATAAAGAGGTTATTTATAGTAAC
GTAGAAAATGTGTTAAATAAATATTCATCTCAAGTAGATGTGTCTGCTTGTATTGTTGGAGAATACACAA
AAAGGTTACAAAACAACAAATATGATGATATTTTACAAAAAATATTATATAATATGAGTGCTAAGCAAAT
AGATGAAGTTAAAGACGTAAACTTTTTATCTATAACAGCATATAGTAAAGTATTAAATGATTATGAATTA
GAATATTTAGGGGAAAAAATTAATTTAAATATAGGAATTAAATATAATGAGGATGACGGAAAAACACTCA
TATATATTGCCACACCAATTATAAAATTAGATTATTAA
>ref|NC_013316.1|:163697-164968 UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase 1 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGAGATCAAAAAATATGGCTAAGATAATAGTAAAAAAGAGTAATCCACTTAAAGGTAGTGTTAAAA
TAGATGGTGCAAAAAATGCAGTTTTACCAATAATAGCAGCGACTTTATTAGCAAACGGAAAATCAACATT
AAATGGAGTACCAAATTTAAGAGATGTTCATGTTATATCAGATTTATTAAGACATGTAGGAGCAGAAGTT
GAATATAAAGAAAATACACTTACTGTTGATGCAAGCAATATAAAAACTTGTGAAGCTCCATATGAGCTTG
TAAGAAAGATGAGAGCTTCTTTTTTGGTTATGGGACCATTGCTTGCTAGATTTAATAGTACGAAAATTTC
TATGCCAGGAGGATGTGCTATAGGAACAAGACCTATAGATTTACATTTAAAAGGATTTAAAGCCTTAGGT
GCAAAGATAGAAATGGACCATGGTTTTGTTGAAGCAGCAACAGAAAAGTTAGTAGGAAATAAATTATATT
TAGATTTCCCATCTGTTGGAGCAACTGAAAACATAATGATGGCAGCTTCTTTAGCAGAAGGGACTACAAT
AATAGAGAATGCAGCAGAAGAGCCAGAAATAGTAGATTTAGCAAACTTCTTGAACGAAATGGGAGCAGAT
GTTAAAGGTGCAGGTACTAATACTATAAAAATAAAAGGTGTTAAAGAGTTAAAAGGAGCAGAACATAATG
TAATTCCAGACAGAATAGAAGCAGCAACTTATATGGTTGCAGCAGCTATGACAAAAGGTGATATAACTGT
TGAAAATGTTTTAATGGAGCATTTAAAACCAGTTGTAGCTAAATTAAGAGAAGCTGGTTGCGAAATAACA
GAAATGGACAATTCTGTAAGAGTTGTAGGTCCAAAAGTATTAAAACCAATAGATATAAAAACTTTACCAC
ATCCAGGATTTCCTACAGATGTTCAAGCACAATTTATGGCTATGCTTACTGTAGCCAATGGAACTGGTGT
AGTTATAGAAACTGTTTTTGAAAATAGATTTATGCATGTTGCTGAATTTAATAGAATGGGTGCTAATATA
AAAATAGATGGAAGAAGTGCGGTTGTTAATGGTGTAGATGAGCTACACGGTGCAGCAGTAAACGCTACTG
ATTTAAGAGCGGGGGCAGCCCTTATTTTATGCGGTCTTATAGCAGAAGGAGAAACTCAAATAGGAGAAAT
ATACCATATCCAAAGAGGTTATGTTGATATAGATAAGAAGATAACAGCACTAGGTGGTCAAATCGAAATA
GTAGAAGATTAA
>ref|NC_013316.1|:165055-166119 stage II sporulation protein D [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAACCCATTGGTTGTTTTGTTAGGATTTGTGACTTGCTCTGTGTTAGTTCCATCACTTATAACTT
TAGTTTCTTATAAAAATGTAGAATTAACTGAAAAACCAGAGAGCCCAGTATCTATAAACAAAACTATTAA
AAAAAGTGATATTGAAGACAAAGGTAATAAAGAAGAAAAAAGTACAGTGAGCTATGAAACTGTAAATAAA
AAAGCACCAATTATCAATGTATATAATCATATAACAGGGAAAACCGAAAAGATGGACATGGAGAACTATT
TATGTGGAGTACTAGCTGGTGAGATGTCTTCAGAGTTTGATATAGAAGCTTTAAAAGCTCAATCTGTAGC
AGCTAGAACATATGTAGTATATAAACAGGAACATGGTAAATCTAGTAAACATAAAAATGCAGTAGTATGT
ACTGATTATAAACATTGTCAAGAATATAAGAGTTATGATACTCTTAAAAAATTAAATGGTGAAGAATGGA
TTAAGAATAAATATTCCAAAATCCAAGAAGCAGTTAGAGGAACTAAAGGTCAAATAATAACTTATAATGA
TAAGGCGATACTTCCTCTTTATTTTTCTACATCTTCAGGAAAAACAGAAAATAGTGAAGAAGTATTTTCT
GCAAAATATCCTTATTTAAAGTCTGTGGAAAGTCCTTATGATAAGTATTCCCCTAAATTTGCGTCAACAC
TTAAAATAAGTAACACAGATTTTGTTAAAAGTCTTAGAAGGGCATATAGCACTATTGTGATAGATGTGAA
TAATTTAAGTAAACAAGTTTCAATAACTAAAAGAAGTGATGCCGGAACTGTAGAAAAAATAAAATTAGGA
AATAAAGAATTGACTGGAAAAGACATTAGAACTGTTTTTAAATTGAACTCTGCAAACTTTGACATAAAAT
TTGGAGAAGGATACATAGATTTCGTGGTAAAAGGATATGGTCATGGTGTTGGTATGAGCCAGTGGGGAGC
AGAAGGAATGGCAGAAGAGGGCTATAAATATTATGATATATTATCACATTACTACACAGATACAAAAATA
AAAGATATATACTAA
>ref|NC_013316.1|:166185-166853 putative cell wall endopeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAAAAAGCTGTTAGAAAAAGATGGTTTTTATTTATCTTTGTTTGTATGTGTTTGTTTATTAGCAG
TAGGTGGAGTTTGGTTTACAAATAATAATGTAGATAAATTGGCTTCTAATAAAGGAATTATGGAAAATGC
TAATAAAGATAGTGAAGAGGAAATACATTTAATTGAAAAAGACAAGAAAGATGCTATCCCTACTGCAACG
GATTCAAAACAAAACTTAGAAAAAGCTAAGTCAAAAGAGGAAAATAAATCGAGTACAACAAAATTAAATT
ACATTGGAGATAAAGTAATAAGAGGATATTCAGAAAAAGAACCTAGTTATTCTAAAACTCTTGATGTTTG
GGAAACTCATAAAGGTGTAGATATTAGTTGTACTAAAGGCAAAGAAGTAAAATCTCTATTAAACGGAATA
GTAGTAGATGTATTTAATGATGAAGAATATGGGCAATCAGTCAAAATAAAAAGTGACAATAACATTGTAG
TAGTATATTCAAATCTAGATAAAAATGTTAGTGTTAAGAAAGAACAGAAGGTAACAGAAGGACAATCTCT
AGGTACTGTAGGTAGTACTTCTCAAATAGAAAGTGAAGAAGGTATACATGTTCATTTAGAGGCGTATAGT
GGAGAAAAATCTATAGACCCAATGAGTCTAATTAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:166951-167211 stage III sporulation protein D [Clostridium difficile R20291]
TTGAGATCTCATATAGAGGAAAGGGCCATAGTGGTAGCAAAATATATACTTGAAAAAAACACTACAGTAA
GACAAACCGCCAAGACATTTGGAGTAAGTAAAAGTACAATTCATAAGGATGTTACAGAAAGATTGAAGGA
AATAAATCCATCCCTTGCCAAAGAAGTTAAAAATGTGCTGGACAAAAATAAATCAGAGAGACATATTAGA
GGGGGATTAGCAACGAAATTAAAATATGAGAAGGAACATAAAAAAATGTAG
>ref|NC_013316.1|:167408-168427 rod shape-determining protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTGGAGCTGATATAGGCATAGATTTAGGTACTGCAAATGTGCTTGTTTATGTTAGTGGTAAGGGAA
TCGTTTTAGAAGAACCATCTGTTGTGGCGATAGACAAAAGAACAGATTCTGTTTTAGCTGTGGGAGAAGA
AGCTAAAAAGATGATAGGGAGAACACCAGGTAATATAGTCGCTATAAGACCTTTAAGAGATGGTGTAATT
TCAGATTATGATGTAACTGAGAAGATGTTAAAATCTTTTATAGATAAGATAGTTGATAAAAAGGGATTTG
GAAGATTTTTTATGCCAAGAATTATGGTATGTGTACCAACAGGTGTCACAGAAGTGGAAAAAAGAGCAGT
AGAAGATGCTACGAGACAAGCTGGAGCTAGAGAAGTATATATCATAGAAGAACCAATAGCAGCTGCCATA
GGAGCTGGTGTAGACATATCACAGCCTAATGGTAATATGATTATAGATATTGGTGGAGGTACTGTAGATA
TAGCTGTAATATCTCTAGGAGGAGCTGTTGTAAGTGAATCTATAAAGGTTGGTGGAGATAGATTTGATGA
TGCTATAGTTAAATATATGAAAAAACAACACAATCTTCTTATAGGAGAAAGAACAGCAGAGAAAATCAAG
TTTGAAATAGGTTCTGCATTTAAGAGAGAAGAAGAAAAATATATGAAGATAACAGGAAGAAATTTAATTA
CAGGACTTCCTAGTTCTATAACTATAAATTCAACAGAAATGTTGGAAGCACTTAGAGAATGTGTTGAGCA
AATAGTAGTTGCTACTCATGCTGTTTTGGAAAAAACGCCTCCTGAGTTAGCAGCAGATATAGGAGATGTC
GGTATAATAATGACTGGAGGAGGTTCATTATTATATGGATTAGATAAAATAATAGAACAGAGGACAGGAA
TAACTGTTACAATAGCAGATGAACCATTATCTTGTGTTGCAAAAGGTACAGGAATAGCTTTAGGTTCAAT
AGACTTACTTGAAACTGGTGGGTCTTTCAAAAGAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:168443-168871 (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl carrier protein] dehydratase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAATATAGATGAAATAAAAAAATTAATACCACATAGATATCCATTTTTATTAGTAGACAAGATTA
CAGAGCTAGAAGTTGGGAAAAGAGCTGTTGGTATAAAGAATGTAACAGTTAATGAACCATTTTTCCAAGG
TCACTTTCCAGAATATCCTTTGATGCCAGGAGTACTAATAGTAGAAGCTCTAGCACAAGTATGTGGAGTG
GCAATGATGTCTGTAGAGGAAAACAAAGGAAAACTAGGTGTATTTGCAGGTATAGATAAAGTTAGAATCA
AGAGAGAAGTAAGACCAGGAGATACATTAACTATGGAAATTGAAATGACAACTCTTAGAAAAAATATAGC
TAAGGCAGATGCTAAGGCATATGTAGGTGAAGAACTTGTCTGTAAAGGTGAATTAATGTTTGCTTTAGTA
GAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c169500-168982 hypothetical protein CDR20291_0128 [Clostridium difficile R20291]
GTGTTCCTATTGTATTTAGCTAAAGTAAACTACAGCGATGATGATGTTATACAGATGCTAAGTTCAGTTC
TAAAAACTATAATTAATGAAAATACGATTGTTGTTTGCATAGGAACAGACAGGGCTATAGGTGATACTTT
AGGCCCTTTAGTTGGAACAATACTTAAGAACAGTAACTTTAAATACCCCGTTTACGGTACACTAGATAAC
CCTATTCACGCCTTAAATATATATGAGTCTTTAGATACTATAAAAAATACACATATACAAGGTAACTTCT
TGGCTATAGATGCTTGCTTGGGGTCGCAGAGTAACATAGGTAATATACAGATTAGAGAAGGACCTATCCT
GCCCGGAAAAGGTGTTGGTAAAAAACTACCTCAAATAGGAAATTATTCTATAGTAGGAATTGTAGATAAA
ATTGATGAAAATAATAAACTTTCATTTAATAATATACGCCTTAGCTTTATATTAGATTTAGCTGAAACAA
TAGCCTTGGCTTTATTAGTATCCACCTAA
>ref|NC_013316.1|:169920-171113 S-adenosylmethionine synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAAGACATTTATTTACGTCAGAATCAGTTACAGAAGGACATCCTGATAAGATATGTGACCAAATAT
CAGATTCAATATTAGATGCATTATTAGAAAAAGACCCACAATCTAGAGTAGCTTGTGAAACTACAGTTAC
TACTGGTTTAGTTTTAGTAGCAGGAGAAATAAGTACATCTGCTTATGTAGACATTCCTAAATTAGTAAGA
GAAACAGTAAGAGAAATTGGATATACAAGAGCAAAATATGGATTTGATTGTGATACTTGCGCAGTTATAA
CTTCTATTGATGAACAATCTGGAGATATAGCTATGGGAGTTGATGAAGGTCTAGAAAGTAAGACTGGAGA
AGAGATAGAAGAAGAAATAGAAAAAGTTGGAGCTGGAGACCAAGGTATAATGTTTGGATTTGCATGTAAT
GAGACTCCAGAATTAATGCCACTTCCGATATCTTTGGCACATAAATTATCAAGAAGGCTTACAGAAGTTA
GAAAAACAGGTTTAGTTGATTATTTAAGACCAGATGGAAAAACTCAAGTTACTGTTGAATATGAAGGAAG
TAAAGCTGTAAGAGTACATACAGTTCTTATATCAGCTCAACATTGTGAAACAGTATCAAATGATAAAATA
AGAGAAGATTTAATTAATCATGTTATTAAGGAAGTTATACCAGCAGAATTACTTGATGAAGAGACTAAAA
TTTATATAAATCCAACAGGAAGATTCGTTATAGGAGGACCACAAGGAGATACAGGTCTTACAGGAAGAAA
AATAATAATAGATACTTATGGTGGATATTCTAGACATGGTGGAGGAGCTTTCTCAGGAAAAGACCCTACA
AAAGTTGATAGATCTGCTGCTTATGCAGCTAGATATGTTGCAAAAAATATTGTTGCGGCTGGTCTTGCAG
ACAAATGTGAGATAGAACTTGCATATGCTATAGGTATAGCTAGACCATTATCTATATTTATAGATACTTT
TGGGACAGGCAAGGTTTCAGAAGAAAAACTTGTTGAATTAGTAAATAAACACTTTGATTTAAGACCGGGA
GCGATAATAAGAGACTTAGATTTAAGAAAGCCTCTTTATAAAAAGGTTGCTGCTTATGGTCACTTTGGTA
GAACTGATATAGATTTACCTTGGGAAAGAACTGACAAGGTTGAGCAGTTAAGAAAAGATGCTTTAGGTGA
ATAA
>ref|NC_013316.1|:171429-172526 hypothetical protein CDR20291_0130 [Clostridium difficile R20291]
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CTGGATTTGCAACTGGTCAAGAAATACTGCAATTTTTTACGTTTTATGGATATGCGGGTATTATAGGTGG
AATAATCTCTATGGTACTATTTTCATGGTTTGGAGCAGAAGTTATAGATAAGGGAAGAGAATTGAAACTT
AAGGAGCCAATAAAAATTTATCAAGTATATTGTGGAAAATATCTTGGAACATTTTTTGAATGGTTTGGTC
CATTGTTTTTATTTGGAACATTAGTAATAATGATTGCAGGAGCAGGAGCTACACTATCAGAGTACTATGG
ATTAAATCCATATGTAGGTAGGATTGGTATGGCAATCGTTTCCCTAATAACTGTTTCATTAGGTTTGACA
AGGCTTTCTAAAATACTAGGTAATATAGGACCTATAATAATAATATTTACACTTTTAGTAGGAGCAATTA
GTTTATTTAGCAATATTGATGCTTTATCAAATGCTGGAAATATGGTTGATAGTTTAAATATTAAAACTGC
TACATCAAATGGATATTTCTCGGGAGTACTTTATACTTGTTACAATGTAATAATAGTAATAACATTCTTG
ACAGGAATGGGAGCTTCTGCAGTAAATAAGAAAGATGCTGTATGGGGTGGTATAGTAGGTGGAGTAGCAC
TTATGGCAGCAGCTATAATGATGAATTTGGCATTACTTTCAAACATAGGAAATATATACACAAAAGAGAT
ACCAGCACTTTACTTAGCTGATAAGATATCTCCAATAATAGGTATTTTATTCTCAGTAGTACTTTTACTA
GGAATATACACTACAGCTGTACCATTGTTATGGTCAGTAACTAACCGATTTGTAGAAGATGACCACCCTA
AATTTAAAATTATAACAATAGTGGTAAGTATATTAGCTTGTATAGGAGGTTTACTGCCATTTGATAAGTT
AGTAGGTACACTATATCCATATACAGGTTACATGGGAATTTTAATTTTACTATGTATGCTTTATAGAAGA
ATTACTAAAACTGAGGGGTACAAGGAGAATAAATCTGAAATAAGTTAG
>ref|NC_013316.1|:172790-175009 putative DNA-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAATTAGAAGGAATGATAAGTGAAATAGTCTTTAAAAACGAAGATAATGGTTATACAATAGCTC
ACCTGGTAAATGAAAATGATGAAATTGTGGTTGTAGGATGTATGCCTACTTTGGCAATTGGAGAAAGCAT
AGAAGTTGAAGGAAAGTGGGTAAATCATAAGATTTATGGGACTCAATTTGAAGTGAATAGTTTTATGCCA
GTAACGCCATCATCCTTAGAAGGAATTTATGTTTACTTATCTTCTGGAATGATACATGGTATTGGTGAAA
AAATGGCAAAAAGAATAATTGATAAGTTTGGTGTAGATACGTTAGAGGTGATACAAAATTCACCAGAAAA
ATTACAAGAAGTAGAAGGTATAGGGAGTAAAAAAGTAAAACAAATAGTAAAAAGTTATGAAGAAGACAGA
GAATTGAGAAATATAATAATACAGCTATCTCCTTTTGGAATAACACCAAATTACTGCCTAAAAATATATA
AAAAATATAAAAGCAGTGCAATAGAAGTTATAAATAAAAACCCATACCAACTTGCTGAAGATATAAGAGG
AATTGGATTTAAAGTAGCTGATAGTATAGCAAGTAAAATTGGTATAGATAAAAACTCTAAAGATAGAATT
TGTCAGGGAATCTTATACACTTTAAATAAATCTTTAAGTAATGGGCATACATATTTACCAGAGCATGTTC
TAATACAAGATTCGGAAAAATTATTGGAGCTAAATGGAGAAATAATAAAAGAGTGTGTAATGATGCTAGT
TTATAATCAAAAAATACATATAGAGAAAGTAAACAATGAAAATCTTATATACCTTATGCCATACTATTTA
GCTGAAAATGGAGTATGTAGTCAAATAGTAAAATTATCACAGTATGAATTTGAAGACTTAAAAATAGATA
TAGATAACGAGATTAATGTTTTAGAAGAAGATAAGAAAATTAAGTTAGCAGAAAAACAAATTTTAGCAGT
CAAAGAATCTGTTAATAGTGGAGTATTAATTATAACTGGTGGACCAGGAACTGGTAAAACAACTACCATT
AATGCTATCATAGATATATTTGAAAATAATGGTAAAAGTGTGACTTTGGCAGCTCCAACGGGAAGAGCAG
CAAAGAGAATGAGTGAAACTTCTAATAAAGAAGCAAAAACTATACATAGGTTGCTAGAAATGGGATTTTC
AACAGATGATGATTTAACTTTTTTTAAGGATGAAGAAGACCCAATAAATTCAGATGTAATAATTGTTGAT
GAGGTATCAATGGTAGACATTATCTTAATGTACAATTTACTTAGAGCTATAAAGTTAGGAACAAGAGTAA
TTTTAGTTGGAGATAGTGACCAATTACCTTCTGTAGGTGCTGGAAATGTACTTAAGGATATGATTAATTC
TAATATTATAAATGTAGTTAAATTAAATGAAATATTTAGACAAGCGCAAGAAAGTATGATAATTGTAAAT
GCCCATAAGATAAACAATGGAGAACCACTTTATCTAAATACAAAAGGTAAAGATTTCTTTTTTATAAGAA
AATCAACTAATGAAGAAATTTTAAATGAAATAATAGGATTGGTTAATGAAAGATTACCTAAATTTTATAA
AGTTGATAAATTAAAAGATATACAAGTTTTATCTTCAATGAGAAAAGGTGAATTGGGAGTTACTAATCTC
AATATAGAGTTACAGAAGTATCTTAACAAAAAAGAAAAATTTAAAGTTGAAGAAAGTTTTTCTAAAAGAT
TATTTAGAGTTGGCGATAAGGTAATGCAAGTAAAAAATAATTATACAAAAAAATGGGAAACAGAAGACCA
AAAAGAAAGTGGAGAAGGTATCTATAATGGAGATATAGGATATGTTTATCACATAGATAAAGATAAGAAA
ACTATTTATATATTATTTGACCAGACTAAAATTGTATCATACCTATATGATGAATTAGATGAAATTGACC
ATAGTTTTTGTACAACAATACATAAAAGCCAGGGAAGTGAATTTCCAGTTGTAGTATTGCCAATAGCGTG
GGCTCCTCCTATGTTACTTAGCCGTAATTTATTATATACAGCAGTAACAAGAGCAAAAAAATTAGTTGTA
TTAGTTGGAGATGTGAAATATCTTGAATATATGATAAAAAATAATAGAGTTAATCAAAGGTATTCAAATT
TAGGATATAAGCTAAATAAATTTAAACAAGAAGGGTTGTTGATAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:175012-175794 putative phosphoribosyl transferase (putative competence protein) [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATATGCAATGATAATTTTATTAAGAATTTTAAAAATATGATTAATAAATGTTTGGATTTTATAT
ATCCTGAGAATATAAGTTGCATAATTTGTGATAAATCCATAAAGAAAACAAATACTTATTCAATATGTAA
AAGTTGTTTTAAAGAAATGAATTTTATACAAGATGGTTGCATGAAGTGTGGAAAACCAATAATACGTCAT
TCAATTGAAAAAGAATTTATTGAAGAGTGTAGTTATTGTTTTAATAAAGACTTTTATTTTGATAAATCAA
TATCTTGTATTGAATATAATGATGTGACAAAAAAGATGGTGTTAGGGCTGAAGTATAACCAAAAAACCTT
TATGGCTAAGTATATAGCTCAAATAATGAAAGAAAAATTATATTTAGAAAACATAAAATTTGATTATATA
TTATTTGTTCCACTTCATAAAAAAAGGCTAAATAAAAGAGGTTTTAATCAGGCACAAAAAATAGCATTTA
ATTTAAGTAAAATAGTAAATATTCCATTATTAGATTGCATAAGTAGAAAAAAATATACAAGAATGCTATA
TAAATTGAATAAGAAAGAACGAAAAGAAGAATTAAAAAATGTATTTGTTGTTAAAGAAAATGTTAAATTA
ATAAATAATAAAAATATACTTTTAATAGATGACATATTTACTACTGGTCTAACAACAAACGAAATCTCTA
AACTTTTAAAGTTATCAGGTGCTAATAAGGTTTTTGTATTGACTCTACTTACAAAAGCAAATGATAATTA
TATTATGGAATAA
>ref|NC_013316.1|:176126-178039 putative transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
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TTAATAAGATTGCCAATGATTTTGAGTGTTCAGAAAGGACAATAAGGAATGATTGCAAATATATTGATGA
ATGGTTATCTACTTTTTGTAATGCTTATATCAAAAGAAAACCTAATATTGGAATTAAATTTAGTGGAGAT
GGAACAGACAAAATACTGGTAAATCAGAAGTTGCGAGGTGAAGTTAAAAGAGTAAATAGTGAGCTTCATA
AGCAAGTTGAGATATTAAATTTACTACTTTGTAATAATAAAAAAGTTACTTTAAATGATTTATCTAATAA
GTTGTACATAAATAAAAATATTGTCAGAGAAGAAATAAGTAAATTATCAGTAGCATTAAATAATTATAAT
TTAAATGTCTCGACTAAAAAAGGCAGTGGTATATATATTGAAGGGGATGAGAAAGACATAAGAATAATGT
TAGTATCATTCTTATTTAAATACATAGATAAATACAGATTAAACATAGATGAAATAGAGTACTTCCATAT
AGTAGATATAATAATTGTAAAAAACATAATGCTTACTATAGAGGAGGATATGGATATAAGACTTACAGAT
ATATCATTCAAGCAATTGATGCTATTTTTGCTTATAAATATAATACGAATAAGGCTGGGAAATTCTTTAA
AAGTATCAAATACTAAGAAAGAGCTTAAGCTAAAAATGCTTATATTGGATATAGAAGATGAATTGAAATC
TAATTTATCCATAGTATTAAATTATGAAGAAAAATTGTTTATAGAATCTTTAATATTGGGTATGAACAAA
CAAATAAATAGTAATAATATTAAGAAATCTTTATATCTAAATGAAGAATTAGCAAGTTATACAAAAAAAA
TTATAAATTTAGTATCAGAAGAATCAGGAATAAATTTTAATAATGATATATTACTTTATGAACAATTAAT
ATGTCATTTGAATGTTACAATGCATCAAATGAAAAGCAATGTTTACTTAGAAAATCCACTTTTAGATAAC
ATAAAAACTAAATTTTGTTTTTTATTTACAGTAATATCAAGTTCAATAGAAATTGAATTAAAAGGAAAAC
AAATAACGGAAGATGAAATTGGTTATCTTACACTTCACTTTCAAACCTCTCTAGAAAGAAAATACAGCAA
AAGGGAATCAAATAAAAAGGCAAGTATTGTATGTCCATTTAGTTTTGGAGTAAGTATGCTATTAAAAGTA
AAGATAGAAAAGAGATTTGATAACATAAAAATTATTGAAACATTAAGAGAGGAAGATTTAAAAAGAGATA
ACTTTAATAAGACTATAGATTTTATAATTGCATTTCAAGAGTATGAAAATATCCAAAAACCAATTTTTAT
AACAACACCATTATTTACTGATGAGGATGAGAATAAACTTAAAGAGTTTACAAACAAAATAAAAGAAAAA
GACACCTCATATAAACTTATGAACAGATTAATGATGTCTGATTATTTAATAAGAGAGTTAGAACATGATG
ATATTTATGAAGCTATAACATATTTAACTAATTTATTAATTGAAAAACATTATGCAGAAAAAGAGTATTT
ACAATCTATTATAACAAGAGAAAAGTCATATCCAACCAATGTTGGAAAAGGAATATTATTCCCTCATGGA
GACATGAAATATATAAAACAATCTGTTTTATGTTTTGCAAGGTTAAAAACACCAATAAAAATTAGAAATG
GAAAGGATATAAAGATTATACTTTTATTAGCATATAAAAAAGATGATGATAGAAAAGTATTTAGAGAATT
ATTTAAAGAAATATCTAATTTAACAGAGGATGAAAATATGCTAGATATTCTAAGTAAATGTGACATTGAA
AAGGTAAAAGATATTCTTATATAA
>ref|NC_013316.1|:178180-178488 PTS system, IIa component [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGAAATAGTTTTAAAGATTATAATTCATGCTGGAAATGCAAAATCTATGCTTTATGAAGCACTTG
ACTATGCAAAGGAAAACGATTTTAAAAAAGCAGATGAATTAATTGAAAATGCAAATGAAGAAATTTTAAA
AGCACATAAAGTACAAACTGAACTTATACAAAAGGAAGCTGGGGGAGATAAATCAGATATATCTATTTTA
TTGATTCACTCTCAAGACCATTTAATGACTTGTATGAGTGAGAGAAACCTTATAAAAGAAATGATTATGT
TAAGAAAAGAAATTCAAAAATTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:178513-178839 PTS system, IIb component [Clostridium difficile R20291]
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AGGTAGCAGATGAACACAATTTACCAATAGAAGTAGAGGCATTTCCGATAGCAGAAATTGACAAAATAGT
TGAAGAAAAAAATCCAGATTGTATATTATTAGGACCACAAGTTAAATACATGCTAAAGGAGTTAAAACCA
AAGTTTGAAGCTCAAGGAAAACTTATAGATATAATCAATGAAGTTGATTATGGAACTATGAATGGGGAAA
AAGTATTAAAACTTGCTATAAAGCTAATAAAATCTAAACAAGCGTAG
>ref|NC_013316.1|:178878-180212 PTS system, IIc component [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAGATTGGAAAGAATACTTATGCCATTGGCTGAAAAAATAGGTAAAAATAAATTATTAATTGCAA
TTAGAGATGGTTTTTTAATATCATCACCATTATTAATAATAGGTTCATTATTTTTATTAGTAGCAAATTT
TCCTATAAAAGGATGGAATGAATTTGTAGGTCAAATTTTTGGTCCAGATTGGGCTGTAAAATTGCAACAA
CCAACTGTAGCAACATTTGAAGTAATGACTTTACTTGCAGTTTTAGGAATTGGATATTCTTATGCAAAGC
AAATAGATGTAGATCCAATAGCATCAGCTGCAGTTGCAATAGTTGCCTTTTTTATAGTAACACCGTTTGT
AATACCATATACACCAGAAGGAACAGAATCAGTCTACATGGTAACAGGTATACCACTAGGTTGGATGGGC
TCTAAGGGAATGTTTGTAGGTATGATAACAGCAATAACCTCTGTAAAATTATTTGCTGCAGTTGTAAAAA
AAGGATGGACATTGAAAATGCCAGATGGAGTTCCTCCAACCGTATCAAAATCATTTGCAGCATTAATACC
AAGTGCAATAGTTATGGTAGTTTTCTTTTTAGTTAAGATAGCTTTTGAAGCTACACCATATGGAAGTATA
CATGAATTTATATTTAAGTTTTTACAAATGCCATTATTAAAATTAGGAAATAGTTTAGGTGCTATGGCAA
TCGCTTATATATTCTTACATTTATTCTGGTTCTTTGGAATAAATGGAAGTAGTGTTGTTGGGGCTGTGTA
TAATCCAATATTAAAAATTCTATCAGCTGAAAACTTAGCTGCTTTTCAGGCTGGTTCAAAAATACCAAAC
ATAATAACAGGTCAATTCCAAGATATGTTTGCGACATTTGGTGGAGCAGGTAGTACACTATCATTAGTCA
TAGCTATGTTATTAATATGTAAAAGTAAACGTATAAAGTCAATGGGAAAACTATCAATTTTACCAGGAAT
ATTTGGTATAAATGAGCCATTGATATTTGGTCTACCAATAATGCTTAACCCAATACTATTGATACCATTT
GCAATAGTTCCAACAATAAATATAATAATAGCTTACTTCTGTATGTCAGCAGGATTAGTGCCTCTTACAA
ATGGAGTTCAGTTACCGTGGACAACTCCAATTATATTCTCTGGTTTTTTAACAACAGGATGGCAAGGTGC
AGTCTTACAATTAGTGCTTCTTATACTAGGAATATTTATGTATATACCATTTATAAAAATGCTAGATAAG
CAATACTTGAGAGAAGAAAATGAAACTGTTGAAGAGGAAGATGATGATATATCTTTTGATGATTTAGTAT
TATAG
>ref|NC_013316.1|:180223-180741 hypothetical protein CDR20291_0137 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAAAATAGTTATGATATTGGATCAAATACAAGCTGGAGCTGGAGGAAAAGAGAAAAGTAATATAC
CTCCTGCTGGAAAATCAAGCCCATTAGGACCAGGTGTAATGATGGAGCAATTTTTAAATGAATCTAAGGT
AATAGCTACCTTATTTTGTGGGGATGAATTTTTTGTAAATAATGAAAAAGAAGTAACGAGTAAGATGATA
GCTATGGTAAAAAAATTAAACCCTGATGTAGTAATCTGTGGACCAAGCTTTAATTACGAAAACTTTTCTA
AGATGTCAGCAATACTGTCTAAAAATATAAATGATAAAACAGATATACCAGCTTTTGCAGCTATGTCAGA
AGAAAATATAGATGTGATAAACGAATATAAAAATGACATATGTATAGTTAAGACTCCCAAAAAAGGTGGA
ATTGGTCTTAATGATTCATTAAATAACATATGTAAATTGGCAAAAGCAATAGCGAATAAAGAAGATATAA
CTTTGATGAAAGAAGAATTTTGTTATTAA
>ref|NC_013316.1|:180837-181796 glycosylasparaginase [Clostridium difficile R20291]
ATGTGGGGAATGATAGCGACATGGAGAATGGCCCTAGAAGGAATAACTGAGGCATCAGAACATTTAGAAA
AAGGCATGGAAGCAGGTGATGCTGTAGAGCTTGCTGTAAGAAGAGTTGAAGACTATCCATTCTATAAATC
GGTTGGATATGGTGGACTTCCAAATGAAAATTGTGAGGTAGAACTTGACGCTGCATTTATGGATGGTAAC
ACATTAGATATTGGCGCAGTTGCTGGTATAAGAGATTATTCTAATCCTGTCAGCATAGCTAGGAAGTTAA
GTTATGAGAAGGTAAATAATTTTTTAGTTGGAATAGGTGCTGAAGATTATGCTCATAAAAATGGATTTGA
AAGAAAAAATATGTTGACTGATAGAGCGAAGTTACATTATAAAAAGAGAAAAAAAGAGACTTTAGACAAA
GGATTAAGCCCATATGCTGGTCATGATACTGTTGGTATGATATCTTTAGACAAAACTGGAAAAATGTGTG
CAGCTACATCAACAAGTGGATTGTTTATGAAGAAAAGAGGTAGAATAGGAGATTCTGCACTATCTGGTTC
AGGATTCTATGTTGATAGTAGTATAGGAGGAGCTACAGCTACTGGTTTGGGAGAAGATTTAATGAAGGGA
TGTATATCTTATGAGATAGTTAGGCTTATGAAAGAAGGAAAGCATCCACAAGAAGCATGTGATATTGCAG
TAAATGAACTTGATAAACAGCTTATCAAAAGAAGAGGAAAAGCTGGTGATTTATCATTAGTTGCCATGAA
TAATAAAGGTGAATGGGGAGTAGCTACAAATATAGTTGATTTCACTTTTTCAGTAGTAACTAAAGAAGAA
TCTCCTGCTGTATATATTTCAAATAGAGTAGATGGAAAGACTATACATAAGGTTATATCAAATGAGTGGA
TGGAAGCATATGAGGCTAGAATAAAAGCACCGATAGAAGTAAGTGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:181844-182896 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
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AAATACCTAGTGTCAAAGGGGAGTCAGAAAATGGCTTCCCTTTTGGCGAAAAAGTAGGGGAGGCACTTAA
TAAAGCATTAGAAATATCAAAAAAATTGGGATTTAAGGTTAGAAACTTGGATAATTATATTGGTTATGCA
GAGCATGGAGATAGTGATGATTATGTTTGTGTAATTGGACATGTAGATGTTGTACATGAAGGAGATGGTT
GGAAGCATCAGCCTTATAAGGGAGAAGAAACTAATGGAAGAATTTATGGACGAGGAGTACTAGACAATAA
AGGACCTATAATGTCTGCCTTATATGGATTATATGCTATTAAAGAATTAAACTTAAAATTAGATAAGAGA
GTTAGAATAATATTTGGTACAAATGAAGAAAGTGGATTTGAAGATATACCATATTATTTAGAAAAAGAAA
AAACACCTATTATGGGATTTACACCAGATTGTAAATATCCTGTTGTATATGGTGAAAAAGGCATGGCAAA
GATTAGAATAAAAAGTAAAATCAATTATGAAGAAGATGTATACCTAGGTTTTATAGAAAATATGTCTGAA
AATGTGCTTGTTACATATAAAGAGCTGAATATAGAAAATAGTAATACTATATTAGATATAAAGGTAAAAT
ACGATTTTAGTTATAAATTGAAAGATGTATTAGATGAAATAAAAGCTAGTTTTCCAAATAGTATCGATAT
AGAGGTAATTTCTAATTTTAATCCTGTATATTTTGATAAAGAGAGTAATCTTGTTAAAAAGCTTCAGCTA
GCTTATGAAAGGGTTACATCATTAGATGGAACTCCCGTGACAACTAATGGAGGTACGTATGCAAAAGTAA
TGCCAAATATAGTTCCGTTTGGACCTTCATTTCCAGGACAAAAAGGAATAGCTCATAATCCTGATGAATA
CATGGATATAGAAGATATAATATTAAATGCAAAGATATTTGCAAATGCAATATATGAATTAGCAAAGGAG
TAG
>ref|NC_013316.1|:182899-183573 putative copper homeostasis protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAGAAATAATAGGAATGTCAGTAGAAGACGCTAAAATTATAGAAGATTGTGGTGCAGATAGAATAG
AGTTAGTTAGTGCTTTAACTGAAGGTGGATTGACACCAAGTTTTGGTCTTATAGAAAGTGTTGTTAACAG
TGTAAAGATACCTGTGAACGTAATGATAAGACATCATGCGAAAAGTTTTGTATACAGTAAAGAAGATATA
AGTATAATGCAAAAAGATATAGGTGTGGTTAAAGAGATTGGTGCTAATGGAGTTGTATTTGGTGTATTGG
ATAAAAACAATAATATAGATGAGAAAAATCTAAATGTTTTATTGAAATGTTGTGATAATCTTGATGTTAC
ATTTCATAGAGCCATAGATGAATCAAATACAATAGATAGTGTTAAAATTTTGAAGGATTATGATAAAATT
ACGAATATATTAACATCAGGAGGGAAAGGAAGTATAGTTGATAACATACAAATGATAAAGAATATGATGC
TTAGTTCTAATCACATAAAAATTCTTTTAGGAGGAGGTCTTAATTTTAATAATATAGAAAAGATAAAGGA
ATTAACTAAAGCAAGTAATTTTCATTTTGGTACAGCGATTAGAATAAATAACAGTCCTTTTGAAGATATA
GATAGACAAAAGCTTAAACAACTCGTAAATATAATTTCAAGATAG
>ref|NC_013316.1|:184126-184677 putative RNA-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAACATAATTATATCTGGAAAACAAATCGAATTAACTGATGCAATAAAAAATAAAATCGAAACTAAAC
TAAGTAAGTTAGATAATTACATTCATCCAGACACTGATGTAAAAGTTACAGTAAGTGCGAGAAAAGCAAG
ACAAAAAATAGAAGTAACAATAGCTACTGTAAATGGTCCTATAATTAGAGCAGAAGATATGCAGGAAAAT
TTATACACAGCTATAGATGTTGTATATGATAAATTAAGTAAACAATTAAAAAAATATAAAAAGAGATTAC
AAGATAAACATAAAGACAACAAGAGTATAAGATTCCAAGATTCAGAGATAAATCTAGCTGATGAACAAGA
GGATTATGGGGATGAAAATCAAGAATTAGTAATTCAAAGACGTAAGAAATTTAGTGTTAAGCCAATGAGT
GAAGAAGAAGCTGTATTACAGATGGAATTAATAGGACATGATTTTTATATGTTCAAGAACATAGATTCAG
ATGAAATAGCAGTAGTTTATAAGCGTAATAATGGTGGATATGGTATAATAGAACATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:184809-187484 preprotein translocase SecA subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCTTTATGGATAATTTATTCAACATGGCAGATAAAAAAGAATTAAAAAAGTTCAATAAAACTGTTG
ATATAATAGATTCATTAGAACCTAAATTTGAATCTATGGCAGACTCGGAACTTAAAAATATGACAAATAT
ATTTAAAGAAAGATTAGCAAATGGTGAAAGTATAGATGATATACTTCCAGAAGCTTTTGCAGTAGTTAGA
GAAGTTTCTAAGAGAGTGTTAGGACTTAGACACTACAGAGTTCAAATGATTGGAGGTATAGTACTACATC
AAGGAAGAATAGCAGAAATGAAAACAGGTGAAGGTAAAACTTTGGTTGCAACTGCTCCTGTTTATTTGAA
TGCGCTTACTGGAAAAGGTGTACATGTTGTAACAGTAAATGATTACCTTGCAAAACGTGATAGAGACCAA
ATGGCAAAAATCTATGAGTTTTTAGGAATGAGTGTAGGCGTTATTATACACGGTCAAAATCCAAAAGTTA
GAAAAGAACAATATGATTGTGATATAACTTATGGTACAAATAATGAATATGGATTTGACTATCTAAAGGA
CAATATGGTAATACACAAAGAGCAAAGAGTTCAAAGAGGATTAAATTATGCTATAGTGGATGAGGTTGAC
TCTATACTAATAGATGAGGCTAGAACACCACTTATCATATCTGGACCTGGAGACAAATCAACTCACTTAT
ATTCAGATGCAAACACATTTGTTTTAACCTTAAAACCAGATGATTATGAATTAGAAGAAAAAGATAAGGC
TGTATCTCTAACAGCATCGGGTATACAAAAAGCAGAAGTGTATTTTAATGTTGATAATATAACAGATATA
TCTCATACAGAATTATACCATCATATAAATCAAGCTTTAAGAGCACATGTAATAATGAAGAAAGATGTTG
ATTATGTTGCTAAAGATGGAGAAATAGTAATAGTAGATGAGTTTACAGGTAGACTTATGTTTGGTAGAAG
ATATTCAGAAGGTTTACATCAAGCAATAGAGGCTAAAGAAGGTCTTAAAATACAAAGAGAATCTAAAACA
CTAGCTACTGTAACATTCCAAAACTACTTTAGAATGTATAAAAAACTTTCTGGTATGACTGGTACAGCAA
AAACAGAAGAAGAAGAGTTTAAAGCAATTTATAAAATGGACGTTTTCCAAGTACCTACCAATAAGCTTAT
GGTAAGAGAAGATTTACCAGATTCTGTATACAAAAGTGAAATAGGTAAATTTAATGCTGTAGCACAAGAA
ATAATTGAAAGACATAAAGTTAATCAGCCAATACTTGTAGGTACAGTATCGATAGAAAAATCAGAATTAT
TATCACAAATATTAAAGAAAAAAGGCATTAAACATGAAGTATTAAATGCTAAGCATCATGATAAAGAGGC
AGAGATAATAGCACAGGCTGGTAGATTAGGCGCTGTTACAATAGCTACAAATATGGCTGGCCGTGGTACA
GATATAGTTTTAGGTGGAAACCCAGATTTCTTAACTAAGAGAGAAATGAGAAGAAATGGATTTAAAGAGG
AAATAGTAAATAGGGTAGATACTCCAATAGAAGGTATACCTGTAAAAGGTAATGAAATTCTATTTGAAGC
TAGAGAAGAGTATGAAAAACTATTTGAAAAGTTTAAGCAACAAACACAAGAAGAACAAAAACAAGTTGTA
GAAGCAGGTGGACTTGCTATAATAGGTACAGAAAGACACGAATCTCGAAGAATAGATAACCAGTTGAGAG
GTCGTGCTGGTCGTCAAGGTGACCCAGGGAGTTCAAGATTCTATATAGGTCTTGATGATGACCTTATGAG
ATTGTTTGGTAGTGATAGAATATCTGGTATTGTAGATAAAATAGGTCTTGAAGAAGACATGCCGATAGAA
CATAGAATATTATCTAAGTCTATTGAAGGAGCACAAAAGAAAGTCGAAGGTAAAAACTTTGGAATAAGAA
AGCATGTACTTCAATATGATGATGTTATGAATAAACAAAGAGAAATAATATATGCAGAGAGAAAACGTGT
ATTAGAAGGTGAAGATTTACAAGAACAAATACAATCAATGACTCATTCTATAATAGAAGAAGCAGTTACT
CTTTATACACAAGATAAAGGATTTGATGAAGAAGGATTCAAAGAACATATGTATAATCTGTTCTTGCCAA
AAGGTAGCATAGAAATACCAGAAATAGAAAAACTTAATCCAGTTGAAATAACAGAAAAAGTTTATGAAAT
AGCTATGAAGATATATACTTCAAAAGAAGAACAAGTTGGCTATGAGAGAATGAGAGAAGTTGAGAGAGTA
ATCTTACTTCAAGCTGTTGATAACCATTGGATAGACCATATAGATGCTATGGACCAATTACGCCAAGGTA
TTGGTCTTCGTGCTGTAGGTCAGCAAGACCCAGTTATTGCTTATAAAATGGAAGGTTTTGATATGTTTGA
TGAAATGAATAAACATATCAAAGAAGACACTGTAAGATATTTATTTAATATAACAATAGAAACTCCAGTG
GAAAGAAAAGCAGTTGTAGATGTTGAAAATCTATCTTCTCCATCAGATGGAACACTTCCAACAAGTAAAA
CTGTTAAAAAAGATGAAAAGGTTGGAAGAAATGACTTATGCCCTTGTGGAAGTGGTAAAAAATATAAAAA
CTGTTGTGGAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:187590-188606 peptide chain release factor 2 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATATACAAATTAATGAAGAAAAGATGAATCAACAAGACTTTTGGAATGATAATGAAGTCGCTC
AAAGAGTACTTCAAGAAAATAAATCTTTAAAAGAGACATTAGAAGAATATGAAAGCTTAAAAAGCTTATT
AGAAGATATAGAAGTATTAATTGAAATAGGTTTAGAAGAAGATGATGATTCTGTAGAAAGAGATATAGAA
AAGTCCATAGAATCAATGGAAGAAAAATTATCTGAAATGAAAATAAAGACTCTTCTAAATGGAGAGTATG
ATAAAAATAATGCTATATTATCTATAAATGCTGGTACTGGTGGCTTAGATGCTCAAGATTGGGCTCAAAT
GCTTTTGAGAATGTATATAAGATGGTCAGAAAGTAAGGGTTATAAAGTTAAGCTTTTAGATATAATATCA
GACCCTGAAGCAGGGATAAAGACAGCTACAATTCTTGTAGAAGGAACAAATGCTTATGGGTATTTAAAGA
GTGAAAAAGGAGTTCATAGATTAGTGAGAATATCTCCATTTGACCCATCAGGGAAAAGACATACTTCATT
TGCATCTATAGATGTAACACCAGAGTTAGATGAAAATATAGAAGTAGAAATTAATCCGTCAGATTTAAAG
ATAGACACATATAGAGCTTCTGGAGCTGGAGGGCAACATGTAAATACTACTGATTCAGCAGTTAGAATAA
CACATATCCCTACTGGTGTAGTAGTTCAGTGCCAAAATGAAAGGTCTCAGCATCTAAATAAGGACAGAGC
TATGAGACTTTTAATGGCGAAATTGATAGAATTAAAAGAGTTAGAGCAAAAGGAAAAAATAGAAGATATA
CAAGGCAAATACTCACAAATAACTTGGGGTAGTCAAATTAGGTCATATGTTTTTCAACCATATAAATTGG
TTAAGGACCATAGAACAAATGCTGAGTTTGGAAATGTAGATAGTGTAATGAATGGAAATATAGACTTGTT
TATTAATGAATACTTAAAAATGAATAAAATAGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:188741-190891 putative RNA-binding protein [Clostridium difficile R20291]
GTGAATAAATTGGATATAAATCAAATCTTAAAAAAAGAGTTTAATCTTAGAGATGAACAAATAAATAATA
CATTAAAACTTATTGATGAAGGAAATACAATACCATTTATAGCTAGATATAGAAAAGAAATGACTGGCGA
AATGAGTGATGTTACACTAAGAGAATTTTATGAAAAATTAATGTATTTGAGAAATCTTCAAAGTAGAAAA
GATGATGTAGTTAGACTAATAGATGAACAAGGGAAATTAACAGATGAAATAACACAAAATATAGAAAAAG
CAAAAACATTACAAGAAGTAGAAGATATATATGCTCCATATAAACAAAAGAAAAGAACTAGAGCAACAAT
AGCAAAAGAAAAAGGATTAGAAAATTTAGCATTGTCAATACTAGAGAATAATTTAGATAATATAGAAATA
GAGGCAAAGAATTATCTTGATGAAGAGAAAGAAGTTCTTTCTATTGAAGATGCTCTAAAAGGTGCTAGAG
ATATAATTGCAGAACTAGTCTCAGATGATGCTAAGATTAGAAAGTATATAAGAGAATTAGCTTTAAGAGA
AGGTATGATAGTTAGCAAAAGTGCTACTGATGAGAAATCGGTTTATGATATGTATTATGATTATAACGAA
GCAGTAAAAAGTATGGCTCCACATAGAGTTTTGGCAATAAACAGAGGAGAAAAAGAAAGCTTCCTAAAGG
TTAAGTTAGAAATAAATAATGATAAAGTTTTAAATTACATAATAAACGAATATGTAAATGATAAAAATTT
CAAAAATAAAGAAGAAATCGTAAGTTCAATAGAAGATTCTTATAAAAGATTAATTTTCCCATCAATAGAA
AGAGAAATAAGAAATCATTTAACAGAAATAGCTCAAGAAAGAGCTATAAGTGTATTTGGAAAGAATGTTA
AAAGTTTATTGCTTCAACCACCAGTTAAAGACAAAGTAGTTATGGGATTTGACCCTGCATTTAGAACTGG
ATGTAAAATAGCTGTAGTAGATAAAAATGGTAAACTACTAGATTATACAACAGTATATCCAACAGACCCT
CAAAATGATGTAGAGGGAGCAAAGAAAGTTTTAAAAGGATTGATTGAAAAATACGATATAGATATAATTT
CAATTGGAAATGGTACTGCATCTAGAGAATCAGAAACTTTTGTATCAGAAATGATAAAAGAAATAGATAG
CGAAGTGCAGTATGTGATAGTTAGTGAAGCAGGAGCATCTGTTTATTCAGCATCTGAACTTGCAAATGAG
GAACATCCAGATATAAATGTATCAATAAGAGGAGCTATATCTATAGCTAGAAGATTACAAGACCCATTAG
CAGAGCTTGTAAAAATAGACCCTAAAAGTATTGGTGTTGGTCAATATCAGCATGATTTAAACAAAAAGAG
ATTAGAAGAAGTGCTAGATGGAGTTGTTGAAGATTCTGTAAATAGTGTTGGAGTAGATTTAAATACCGCA
TCATACTCCCTACTAGAACATGTTGCAGGAATAAGTAAAGCTATAGCAAAAAATATAATAGCATATAGAG
AAGAAAATGGAGATTTTACATCAAGAGCACAATTGAAAAAAGTAAAAAGACTAGGACCTCAAGCATTTAC
TCAATGTGCTGGATTTATGAGAATCTTAGAGGGTAAAAATCCACTAGATAATACAGGTGTGCATCCTGAA
AGTTATGATATATGTAAAAAAATGATTGAGATAATTGGATATTCTTTAGATGATGTAAAGAATAAGAATA
TAGGTGAAATAGATGAAAAAATAAAAGAAATTGGCTTGAGGGAATTAAGTGAAAAACTGGAAGTAGGACA
AGTTACGTTAAAAGATATCATAGCTGAAATCAAAAAACCAGGAAGAGACCCAAGAGAAGAAGGTATAAAA
CCTATACTTAGAACTGATGTCTTAAAAATTGAAGATATACAAGAGGGTATGACTTTAAAAGGTACAATAA
GAAATGTTGTAGACTTTGGTGCATTTGTAGATATTGGAATAAAAAATGACGGATTAGTTCATAAATCAGA
AATGAGTAATAGTTTTGTGAAAGACCCTATGAGTATTGTTACAGTAGGTGATATAGTAGATGTAAAAGTC
ATTGGAATTGACTTAAACAAAAAAAGAGTTGCCTTATCAATGAAAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:191039-192205 putative amidohydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTTTTATAAAAAATGGTAAAATAAATACCATAACAAATGGGATAATTCATGGAGATATACTTATAG
ATGAAGGAAAAATAATAGAAATTGGAGAAGATTTGATAGCTCCTTTAGATGTAGAGGTAATAGATGCTAG
TAATAAACTTGTGTTTCCTGGATTTATAGATGCTCATACTCACTTAGGTTTATGGGAAGATGGTATAGGG
TTTGAAGGAGCAGATGGAAATGAAGAGACTGACCCAATAACACCACAATTAAATCCTATAGATGGAATTA
ATCCAATGGATAGAACTTTTAAAGAAGCTTTTGAAGGTGGAATAACTTCTGTTTGTACAACCCCTGGAAG
TGCAAATGTTATGGGTGGTCAATGTATAGCTATAAAGACATGTGGAAAAAGAATTGATAAAATGGTAATA
AAAAATCCAGTTGCATCTAAAATTGCTTTTGGAGAAAATCCAAAGAGCTGTTATGGTCAGGATGATAAAT
CTCCTCAAACTAGAATGGCTATAGCTGCTTTACTTAGAGAAAACCTAAAAAAAGCAGAAGAATATTTAGA
GGATATTGATATGTATGAGAGTCATGATGATGAAGACTGTGAAAAACCTGAATATGATATAAAAATGGAA
AGTTTAATACCAGTTTTAAGAAGAGAAATTCCTTTTAAGGCACATGCTCATAGAGCAGATGATATGTTTA
CAGCAATAAGAATTGCAAAAGAATTTAATTTAAAGCTTACATTAGACCATTGTACAGAAGGTCATCTTAT
TGTAGATGAATTAGTGGAAGAAGGGTTTCCTGTAATAGTAGGGCCATCTTTGTCAGAAAGGTCTAAATTT
GAGCTTAGAAATTTGACATTTAATACAGCAGGAATACTTTCAAATGCAGGTCTTGATGTATGTATAATGA
CAGACCATCCAGTAATACCAGTTCAATATCTTCCAATATGTGCAGGTATTGCAGTAAAACATGGTATGAA
AGAAGAAAAAGCAATAGAATCAATTACGATAAATCCAGCTAAGACTTTAGGAATAGAAGATAGAGTAGGC
TCTATAGAAGTTGGTAAAGATGCAGACCTAGTAATTTGGGATAATTCTCCACTAGAGATTCAAAGTAATG
TACTTTACACTATAATAAATGGCAAAGTAGTGTATGAGAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:192507-193112 putative riboflavin transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAAACACAGCAAAAAGAGGCAATATGATTTCAACAAGAACTTTAGTAGTAATGTCAATTTTATCTG
CAATATCTTATTTATTAATGTTTATTCAAGCACCAATACCAGGTATATTTCCAGATTTCTTAAAAATTGA
CTTATCAGATATTCCAGCAATATTCGGAGGAATGTCTCTAGGACCATTAGTTGGATTTGGAATAGTTGTA
GTAAAAAATGTGTTACAAGCAATAACAGCAACAACAACTGGAGGAATAGGAGAATTTGCAAATATATTAA
TTGGTGGTTCTTATGTAATGATACTTTGTTATTCATATAAGAGAAGTGGAGATTTAAAAGGTGTACTGAT
TGGTTTTGTATTAGGAACAATATCTATGACTATAATTGGTTCATTAGTAAATTATTTTGTAATGTTGCCA
CTTTATGGTCAACTTATGGGACTAGATGCTATAATAGGTTTAGGTTCAGCTATAAATCCTCAAGTTCATG
ATTTATTCACTTTTGTAATTTGGATGATAGCTCCATTTAATGTGCTGAAGGCTGTTATAATATCTTTAGT
AACATTGCCACTTTATAAAAAAATGGGAAATATAATAAAGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:193441-194481 hypothetical protein CDR20291_0147 [Clostridium difficile R20291]
ATGCATTTATCTAAAAAAATAAAAAAATTATTTTTAGATGATAAAGGGTATTATTTTAATAGTAATTGGG
AAGATATTCATATTGGTATTTATGATACAAAATTAGGAGATTCTTTAAAGTATATCACTAATGAATATAT
TGAAAATATGGAAAGGGTAAAATACGATTATCGTGAATTAAAAAATATAGAAAATCAAACTGATGGTATG
TGTATTTTAGCAATAAGGCAGAATTACAAGGCATTAGAGTATGTAAAAAATCAAACCGAAGAATTATGTT
TAGAGGCAATAAAGTATAATTATAAAGCACTTGAATATGTAAAAGAACAAACAGAATACTTGTGTCTTGA
AGCTATAAAAAAAGATTGTAATGCACTTAAGTATGTACGAAATAAAACAGAAGGGCTTATTATAAAAGCA
ATAAGTCATTCTTCCAATATAGATGTTGTAAGTATACTAAAGGCTTTAGAGACTCAAACAAGAAGGATAT
GTTTAGAAGCAATTAAAAAAGATGGCAGGTGTCTTGCATACGTTAGAGAACAGAGTGAAGAATTATGTAT
AGAGGCCATTAAGCAAAATTATAAAGCATTAAAATATGTAAAAAATCAAACGGAAAAAATGTGTATAGAA
TCCGTAAGACAAAATGGTATGGCATTACAATATGTAAATAAACAAACTGATAAAATATGTATAGAAGCTG
TCAAACAAGATGGAAGAAGTCTACAATTTGTCAACAATAAGACAGAAGAAATATGTATAAATGCTATAAG
ATATTTAAATAAAAAATATAATATTAAAGATGTACTAAGTTACATAGATAAGTATACAGAAGATATATGT
ATAGAGATTGTAAGACAAAATGGAAAAATGCTTATGTATATAAAAAATCAAACAGAAAAAATGTGTATTG
AAGCAGTAAAAGAGAACTATAAGTCTCTTAAGTATGTAAAAGAGCAATCTGAGAGAATATGTAAAGAAGC
ATTGAAGCAAAACCATAAAGCAAAAGAGTATGTAAAAATTGCTATTGATGATTGTATATAA
>ref|NC_013316.1|:194620-195072 putative ATP/GTP hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAAAAATATATTTAGAAAATGAAAATAAAACTAGAGAAATAGGATATAAATTAGGTAAACTTTTAA
AAGAAGGCAGTGTTATCTGTTTAGTAGGAGATTTAGGAGCTGGTAAAACTACAATGACACAAAGCTTGGC
AGATTCATTAGGGATAGAAGATTATATAACAAGTCCTACTTTTACTATAATAAATGAATATGAAGGAAAA
ATACCTTTGTATCATTTTGATGTTTATAGAATAGGTAGTAGTGATGAAATGTATGATATTGGTTATGATG
AATATGTAAATTCAAATGGAATCTGTATAATAGAATGGGCTAATCTAATAGAAGATATACTTCCAAAAGA
ATATTTGAATATAGAATTGAGATATAAAGATGAAGGAAGAGAAATGATATTAACTCCAAAAGGAGAGTTT
TATAAAGAGATAGTTGAGGAGTTGATTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:195087-195788 putative glycoprotease [Clostridium difficile R20291]
ATGGATACGTCTTCTATGGCAGCAAGTGTAGCAGTTGTTGAAGATGATAACTTAATATGTGAGTTTACAG
TAAACAACAAAAAAACTCATTCACAAAAGCTTATGCCAATGATAGAAAATATGTTGAGTATGAGTGATTT
AAGTATAAAAGATATGGATTTATTAGCTGTATGTATAGGTCCAGGTTCGTTTACAGGACTTAGAATAGGT
ATGGCTACAGTAAAAGCTATGGCCCATGTAAATAATATACCAATAATAGCAGTAAATTCTTTGGAATCTC
TAGCAAATAACATAAATTTCTGTGATAGAAAGATATGTTGTATATTAGATGCGCAGAAAAATCAAGTTTA
TTCAGCTAAATACAAGTTTGAAAATGGAGAGATGATAGAATTAGATGGTGTTGATGTTGTAGAGTTTGAT
GCTTTAGTAGATGAAATTGTATCAACTAATGAAGAATTTATAATAGTTGGAGAAGCTGTATACAAATATA
AAGACAAGTTAGAGAATATAAAAAATATAAAAATACCTTCACCAGCTAATAATGTATCTAACGCAGGAAG
CTTATGCTCTTTAGCATTAAATAAATATAATAAAAATATAGATGTACATACTTGTTATACGATAAATCCT
ATGTATATCAGAAAATCTCAAGCTGAAGTACAATATGATGAAAAAATGAAGAGGCTAAATAATGGAAGAT
AA
>ref|NC_013316.1|:195826-196254 putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGACTACAGAAGATATAGATGAAGTTTTTGAAGTAGAAAAAAATTGTTTTGAAGATTATTGGTCAAAAG
AGTCTTTTAGAAAAGAGTTGTCTAATGAAGTAGCAAGGTATATAGTAGCTAAGTTAAATGGAAAAATTGT
CGGATATGTGGGAATTTGGCTTATACTTGATGAAGGGCATATAAATAATGTGGCTGTTCATAGTGACTAT
AGAGGGAAAAAAATAGGGGACAAGTTGATAAAATGCATAGTTGATTTATGTAAAGATAATAATATTGCAT
CTATGACATTAGAAGTTAGAGCATCAAATAAAATAGCACAAAATTTATATAGAAAATATGGATTTAAAAT
GGGTGGAATAAGAAAAGAATACTACAGTGATAATAAAGAAGATGCAATTATAATGTGGAACCAATTAAAA
GAGGTGTAG
>ref|NC_013316.1|:196260-197276 putative glycoprotease [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTGATATAATAACATTAGCTATAGAGAGTAGTTGTGACGAAACAGCTGCATCAGTTTTAAAAAATG
GTAGAGAAGTACTTTCAAACATAATCTCTACTCAAATCGAGACACATAAAAAATTTGGTGGTGTAGTTCC
AGAAGTGGCCTCAAGAAAACATGTGGAAAATATTGATATAGTTGTTCAAGAAGCTTTAGACAAAGCAAAT
ATAGGTTTTAATGATATAGACCATATCGCAGTTACATATGGACCTGGGCTAGTAGGTGCTTTATTGGTTG
GTCTATCTTATGCTAAAGCACTTGCATATACTTTGAATATTCCACTTGTAGGAGTAAATCATATAGAAGG
GCATCTAAGTGCAAACTATATAGAGCATAAGGATTTAAAACCTCCTTTTATAACATTAATAGTATCTGGA
GGTCATACTCACTTGGTTGAAGTAAAAGATTATGGCAAGTATGAAATTTTAGGAAAAACAAGAGATGATG
CATCTGGAGAAGCATTTGATAAGATTTCAAGAGCTATGAATTTAGGCTATCCAGGAGGTCCTATTATTGA
TAATCTGGCCAAGAATGGAAATAAACATGCTATAGAATTTCCAAGAGCCTATTTAGAAGAAGATAGCTAT
GATTTTAGTTTTAGTGGATTAAAATCTTCTGTATTAAATTATCTAAATGGAAAAAGAATGAAAAATGAAG
AAATAGTAGTTGAAGATGTAGCAGCATCTTTCCAAGAGGCTGTAGTAGAGGTTTTATCTAATAAAGCACT
AAAAGCAGTAAAAGACAAAGGATACAATATCATAACTCTTTCTGGTGGGGTTGCTTCTAATTCGGGGCTT
AGAGCTAAAATAACAGAGCTTGCTAAAGACAATGGTATTACTGTTAAGTATCCTCCTCTAATTTTATGCA
CAGATAATGCAGCTATGATAGGGTGTGCAGGATATTATAATTTTATAAATGGGAAAACGCATGATATGAG
TTTAAATGCAGTTCCAAATTTAAAGATAAATCAGTAG
>ref|NC_013316.1|:197573-200281 4-hydroxyphenylacetate decarboxylase, catalytic subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTCAAAGTAAAGAAGACAAAATAAGAAGTATTTTGGAAGCAAAAAATATTAAATCAAATTTTCAAA
ATAAAGAAAATTTAAGTGAATTTAATGAAAAAAAAGCAAGTAAAAGAGCAGAAGACTTATTAGATGTATA
TTATAATACATTATCTACTGCTGATATGGAATTTCCATATTGGTATAATAGAGAATATAGAAAATCAGAT
GGTGATATACCAGTAGTTAGAAGAGCTAAAGCTCTTAAAGCTGCTTTTTCACATATGACACCAAATATAA
TACCTGGTGAGAAAATAGTAATGCAAAAGACACGCCATTATAGAGGTTCTTTTCCAATGCCATGGGTAAG
TGAAAGTTTCTTTGTTGCTCAAGGAGAACAAATGAGAGAAGAGGCAAAGAAATTAGCCAGTAACACAGCT
GATGAACTTACAAAATTTGGGTCTGGTGGAGGAAATGTTACTGAAAGTTTTGGAAATGTCGTTTCAATAG
CTGGTAAATTCGGAATGAGAAAAGAAGAAGTACCTGTACTTGTAAAAATGGCAAAGGAATGGGTTGGAAA
GTCTGTTGAAGATTTAGGTTTTCACTATGAAAAAATGATGCCAGATTATGATTTAAAAGAAAACCTAATG
AGTACACTTATATGCATGTTTGATTCAGGGTATACACTTCCTCAAGGTAGAGAAGTTATAAATTATTTTT
ATCCTTTAAATTATGGATTAGATGGAATTATAGAAATGGCAAAAGAATGTAAAAAGGCAGTTGCAGGAAA
TGCATCTGGAGATGGGCTTATTGGTATGGACCGTCTATATTTTTATGAGGCTGTTATTCAAGTTATTGAA
GGATTACAAACTTGGATTTTAAATTATGCAAAACATGCAAAATATTTAGAAAGTATAGAGACAGATTTAG
AAGCTAAAAAAGAATACTCAGATTTAGTGGAGATATTAGAACATATTGCACATAAACAACCTCGTACATT
TAGGGAAGCTCTTCAGTTGACTTATACAATTCATATAGCATCAGTAAATGAGGATGCTATATCTGGTATG
TCTATAGGACGTTTTGGTCAAATTTTATATCCTTGGTATGAACAAGATATAGAAAAAGGACTAATTACAA
AAGAAGAGGTTATCGAATTATTAGAGCTTTATAGAATAAAAATCACTTGTATTGACTGTTTTGCTTCAGC
GGGCGTAAATGGAGGAGTACTATCAGGTAATACATTTAATACTTTATCTATAGGTGGATTAAAAGAAGAT
GGTTCTACAGGAGCTAATGAACTAGAAGAGTTATTATTAGAAGCAAGTATGAGATGTAGAACTCCTCAAC
CTAGTTTAACTATGCTATATGATGAAAAGCTTCCAGAAGATTTCTTAATGAAAGCTGCTGAATGTACAAA
GCTTGGTTCTGGTTATCCAGCCTGGGTAAACAACTCAAATGGAACAACATTTATGATGAAACAATTTGCT
GATGAAGGTATGACTGTTGAAGAAGCAAGAGCATTTGCATTAGGTGGATGTTTGGAAACGTCTCCAGGGT
GTTGGAAACAGTTAACTTTAAACGGAAAAACGTACTCTATTGCAGGTGGAGCAGGTCAATCTGCTGGCTC
TGGAGTTCACTTTATAGCTAATCCCAAAATTTTAGAACTTGTTCTTATGAATGGTAAAGACCATCGTATG
AATATACAAGTATTTGAGCCTCATAATAAGCCATTAGATACTTATGAAGAAGTCATAGAAGTATTTAAAG
ATTATTATAAACAAGCAATAAATGTTTTAGAAAGAGCAAATAACATTGAGTTAGATATATGGAGAAAATT
TGATACTTCTATAATAAATTCACTACTAAAGCCAGACTGTTTAGACAAAGGTCAACATATAGGAAATATG
GGATATCGTTATAATGCAACATTAAACGTAGAAACTTGTGGTACTGTTACTATGGTCAATTCATTTGCAG
CACTTAAGAAACTTGTATATGATGACAAAGCATTTACAATAGAGGAAATGAAGGATGCAATATTAAATAA
TTTTGGATTTAAAGATGCATTAGAAGTAGGAAATTATTCTATGGCAGACCAAGTAAAAGTAGATAAGACT
GGTAAATATGATGCTATTTACAAGGCCTGTCTTGATGCACCTAAATATGGAAATAATGATTTGTATGCAG
ATAATATTCTTAAAAACTATGAGGTATGGTTATCAAAAGTATGTGAAGAAGCACAATCTTTATATGCTAA
GAAGATGTACCCTTGCCAAATATCTGTTTCTACACATGGACCACAGGGAGCTGCTACCTTGGCTACTCCA
GATGGTAGACTAAGTGGAACAACATATTCAGATGGTTCAGTCTCTGCATATGCAGGAACAGATAAAAATG
GAGTATATGCATTATTTGAATCTGCAACTATTTGGGACCAAGCAGTAGTTCAAAATTCTCAGATGAATTT
AAAACTTCATCCAACTACTATAAAAGGACAACAAGGAACTAAAAAATTATTAGATTTAACAAGAAGTTAT
TTAAGAAAAGGTGGGTTCCATATTCAATATAATGTTGTAGATTCAGAAACATTAAAAGATGCACAAAAAA
ATCCTGACAATTATCGTCAATTAATGGTACGTGTTGCTGGGTTTACTCAATATTGGTGTGAATTAGGTAA
ACCAATACAAGATGAAGTAATTGCTAGAACAGAGTATGAAGGGGTGTAA
>ref|NC_013316.1|:200285-200542 4-hydroxyphenylacetate decarboxylase, regulatory subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAAGCATAGTGATTGTATGAATTTTTGTGCAGTAGATGCAACCAAAGGAATTTGTAGATTATCAA
AACAAATGATTAATTTAGATGATTCAGCATGTCCAGAGATAAAAGTAATGCCAAAATGTAAAAATTGTAA
AAATTTTGTTGAAGCTAATGATGAAGGTATAGGCAAATGTGTTGGCCTAGAGAAAGAAGACTGGGTATAT
TCAACATTGAATGCAATTACTTGTGAAGGACATGTGTTTAATGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:200505-201485 4-hydroxyphenylacetate decarboxylase, activating subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGCAATTACTTGTGAAGGACATGTGTTTAATGAGTAGTCAAAAGCAATTAGAAGGCATGATTTTCGATG
TACAAAGCTTTTCAGTTCATGATGGTCCAGGTTGTAGAACAACTGTATTTTTAAATGGATGTCCACTGAG
TTGTAAATGGTGTGCAAATCCAGAAAGTTGGACTGTAAGACCACATATGATGTTTAGTGAATTATCTTGT
CAATATGAAAATGGATGTACTGTATGTCATGGTAAGTGTAAAAATGGTGCATTGAGCTTTAATCTTGATA
ATAAGCCAGTTATAGATTGGAACATCTGTAAGGACTGTGAAAGTTTTGAATGCGTCAACTCATGTTATTA
TAATGCGTTTAAATTATGTGCAAAACCTTATACTGTAGATGAACTTGTGCAGGTAATTAAACGTGATTCT
AACAATTGGAGAAGTAATGGAGGAGTAACATTTAGTGGAGGTGAGCCACTACTTCAGCATGAATTTTTAC
ATGAAGTATTATTAAAGTGTCATGAGGTAAATATACACACTGCCATTGAAACAAGTGCATGTGTATCAAA
TGAAGTTTTTAATAAAATATTTAAAGATATTGATTTTGCATTTATTGATATAAAGCATATGGATAGAGAA
AAACACAAAGAACAAACAGGTGTATATAATGATTTAATATTAGAAAATATATCAAACCTTGCAAATTCTG
ACTGGAATGGAAGGTTAGTACTTAGAGTACCAGTTATCTCTGGGTTTAATGATAGTGCTGAAAATATAAG
TGATATTATATCTTTTATGCACAAAAATAATTTAATAGAGATTAACTTATTACCATTTCATAGGCTAGGA
GAATCAAAGTGGATTCAATTAGGTAAGGAGTATGAGTATTCTGATAAGGGAGATATTGATGAAGAGCATC
TTGAAGAATTACAAGATATATTTTTGGATAATGGTATAGCTTGCTATGTTGGTCATGAGACAGCTTTTTA
A
>ref|NC_013316.1|:201805-202767 putative membrane-associated CAAX amino terminal protease [Clostridium difficile R20291]
ATGAACAAATCATGGAGTAACTTGATTATTAAGAATAAAGACAAAAAAGTACGTTCAGGGTGGATTATTA
TAACTGTTATGGCTGCCTTTTACATATTTGAGTATTATTTAAGCACTATACTTATGGAAATAATAAGAAA
AATTCTGATTGCTACAGGTGACATTAATTTAAAAACAAACTATTTTTCGGAATATGCTAATTGGTTAAAT
GACGTTGGGTTACAGGTTGTATTTCAAATTCTAACAGATTCACTTATGATTATTATTCCTATAATTGTAT
GGAGATTTATTATGAAAAATCCTATTAGTGAAATGGGATTACATTCTTATAGAATTAAGAAAAAAGAAGG
ATATGTAGGAATGTTATTAGGAATATTTAATTGTACAGTAATCTTTATTATAACAATAACAATTGGTGGT
GGTCATGTTACTTCATGGGTACCAAAAATTTCACCTTTAACAGTTTCTTGGATACTTGTCTTTATTTTAG
TTGCTTTTGCAGAAGAAATTTTAAATCGTGGTTTTTTTATGGCAGTTTTACGAAGATGTAAAAATATTTA
TTTTATAATGATTGTTCCATCTGTTATTTTTGGGTTGATTCATATATGGAATCCTGATGTTACTTTTTTG
TCTGTAATTAATATTATAATTATTGGGATTCTTTTTTCATATATGTTTATAAAGTCGTCGAATATATGGA
TGTGTATAGGTTATCATTTTACATGGAATGTATTTCAGGGGATTATATATGGTATGCCTGTAAGTGGACT
TCAGGTTCCAGGGATTATAACTACACAAATCACTCATGGTAATCTATTAAATGGAGGGATGTTTGGTATT
GAAGGTGGAATTTTGACTACTTTTGTTAATCTACTTAGCTTTATATTTGTATGGTATTACTATAGAGATT
CTAAGTATGATTTTGTTAGTGATAAAGTAAATGTGACTAATATCAAGAATTAG
>ref|NC_013316.1|:c203846-202866 hypothetical protein CDR20291_0156 [Clostridium difficile R20291]
ATGAACTTAAAATTAATATGGATAAATATTCTAAACCCAGTATTTATTAAAAATGAAATAAAAAGAAAAA
AAATACAAATTATTATCTTTTTCTTTATAAACTTTGGTTTAACTTATTCATTAGGTTTACTGTTATATTA
TAATAAATTTATTGATCCAGAAAACTTTGCATCATTCATGATGATATTACCTCTATCTTCAGTTGCTATT
GCAAAGTTTTATACTGAAGGATTAAATAATGATATGTATGAATTTTATTCACTAATCATATTATTTTTTC
TTATTTATTCATTATTAATTGTTCTTAAGTTATTAAATCTAATAAATAATAATGAATTTATAATTATAAA
CCTAATATTAACTTTTATAAGTAGCTTATCAATTATAATATATTCATCAAATAAAAAAAATTTATATCCT
GTAAAAAATATTAAACTAGGTTCTTTATTAATTATTTACTTTATGATTTCTGTAATTGTTCCAACATCAT
TTATACTAATACTACAAGGGGCTCAACCTAATTATAGTGGTATCATAAAATTTATATTTACTCCAATAAC
ATCATTAACTACTATTTATATTTTTTTTAGTGAAGAATATGCCTGGAGAGGTTTTTTACAGAATATTTTT
TTTGATAAATTTGGTAAAAAATTAGGAGTCATAATATTAGGTATGTGTTGGAGCTTGTGGCACTTACCAC
TAATATTTACATTATATACACCTGAAGCGCCAATATTAGGAGTAATATTACGTTCAATACATATAGTTGG
AATTTCAATATTTTTAGGATATCTTTATATAAAAACTAAGAATATCTGGTTTTGTGCTATAATTCATGTT
TTAAATAATAGTGCTTTTCTTATCACAAATTCTAAAGAATCAACTATCACTTACCATGATATACTAATAG
TATCTATGGTTGTTTTAATTTTTTATGTTCCATTTCTATTTACAAAAGAATATAAAAATAACTTGGAGTA
A
>ref|NC_013316.1|:204974-205441 putative glyoxalase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGTTTTTAAATGTTTTAATAGTAGTTGAAGATATTGAGAAATCAAAAAAGTTTTATTATGATATTT
TGGGGTTAAAGGTAATCTGTGATTTTGGAGAAAATGTTGTATTAGAAGGTAATATATCATTACAAGAAAA
AAAGCTTTGGTTAGAATTTATTAATAAGAGTGACAGTGAAGTTAAGTTCAATGGAAATGATGCTGAGTTA
TATTTTGAGGAAGATAATTTTGATACTTTTGTTGAAAGATTGAGTACAATGAAAGGTATAGATTATGTTC
ATCTAGCTATAGAGCATAGGTGGGGTCAAAGAGCAATTAGATTTTATGATTTAGATGGGCATATTATTGA
GATTGGAGAAACTATGTCATCTGTGTGTAGACGTTTTTTAGATAGTGGTCTTTCAATAGATGAGGTAGCT
AAAAGAATGGATGTAACTGTCGAATATATTGAATCAGTTTTAGAATAG
>ref|NC_013316.1|:206612-207325 putative two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGATTAATATTATTATTTGCGAAGGTAAAAAATCAGAGAGGGTAATTCTAAATGATTATATAAATACCT
TTTTTTATAATTACAATTTTGAATACAATATCAAAGAGTTTGAAAATGGAGGCGATTTATTAAAAAAGTA
TCCTAATAATGTTGATATCATATTTATGGATATAGACTTAAATGATGAAAATGGATTTAATGTTTCAAAA
GAAATCAAAAAATTTGATGAAAGTGTAAGAATTATATTTGTATCCTCATCAAATAAATACATAAAGAAAG
GTTATGAGATAGGAGTTTATAGATATTTAGAGAAGCCCTTAAAATACTCTCTATTTAAAGAAGCAATATC
ATCATATTTAAAAGAATGCTACAAAAATGAAGCTATTTTATCTATAAAATGTAAATGCAAGATATATTTC
ATAAAGGTAGATGATATTTTATATTTAGAAGTTTTAAAAAATGATTTAACTATACATACTGAAAAAGGAA
TATATACTTTTAAGAATAGTATGAAAGAAATAGAATCAAATCTAGAAGAACATAATTTTTTTAGATGTCA
TAAAAGCTACCTTATAAATTTAATGAAGGTAAATATGCTAGATATAGAAAATAATATTGTATTTATAAAT
CAAAATTCAATAATTGTAAGTCGTTATAAGATAAAATTATTGAGAGAAAAGTTAAATAGTTGTTTGGTAG
ATGTAATAATTTGA
>ref|NC_013316.1|:207598-209370 putative lantibiotic ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
GTGGAAAATGGTAAATTTCAATTTTTTAAAGGTGTAAGAAATTGTTTTAATATGATTTATCTACATGATA
AAAGATATTTATTTATCTCTATGTTTATGGCAATTTTTCAGGGGATTGTTCCATCTATTTCTTTGTTAGT
AAGTCAAAATATCATTAATAATATGCAAACATTTTCGAAAAGTGTAAAAGAAATATTAGTTTTGTTAATT
ATGTATTTAATCATAAATATAATTCCTTCAATTTTTCAAAGTTTTTATGGATATTATAGAATAAAGTTTA
ATAAAAATTTTGAAAAACATATTGAAACAATGATGTTAGAGAAATCTTTAACTTTGAGTTTAAAAGATTT
TGAGGATGATAATACTTATGACATGATAAATAGAGCTCAATCTCAAAAAGGATTTAATATTACTATACTA
TCTGAAAACCTTATTTCAATAATAAGAGAATCAGTATCTACACTTTCTCTTATTGTTGTATTATCACAAT
TTCAACTTTGGCTAATAATAGTTGTTATTGTTATTCCTGTATTGAAATCATTATATTCCATTAAATTAGG
AAAGGAACAATATGATGTTAGTGTAAACAGAACTTGGAAAGAAAGAAAGGCCTGGTACATAGATTATTTG
TTGTCAAAAGGTTATGCTTACAAAGAGATTATGGTATTTAGAATTGGTTCTAAACTTATTAATCATTATA
AAAAATTAAAAGAGGATATTATATCTCAAGATATGAATATAGCTAAAAAGAATTTTATTGCTACGCTATT
ATGTACAGTTTTAGATTCAATTGTATCTGCAGGAATTATAGGATTTATAATAATTCAAGGTATTTTAAAG
AAGATTTTAATAGGAGATGCGACTACATATATACAAGCAGTTCAATCTATAAAGGATAATGTTGAATCAA
TATTTTCGTTATTTAGTTCAGTAATACAAGATCTTTTTTATACAGATTTACTGTTTAAATTTCTAGATTA
TAACTGTAAAGAAGACTCAATTGAACATATAAAAATATTTGAAAAAATAGGGGATATAAATAAAATAGAG
TTAATAAATATTTCATATAAATACAATCATTCATCAGAGTATTCTTTAAAAAATATTAATTTAACTTTAA
ATAAAAATGATCCTATTGCTATACTAGGAAAAAATGGTTCAGGTAAAACGACACTTTTAAAAATATTATT
AGGTTTTTATGATGATTATGAAGGTGACATCTTGATAAATGGAAAAAATTTAAAGGATATTGAAAAAGAT
GAATACATTAGAAAAGTAAGTTGTATGTTTCAAGATTATATTAAATATGAGGCTACATTAAAAGAAAATG
TCGCCATGGGAGATGTATATAAGAGTAACTTGGAAGAAAAAGTTAAAAGTAAACTTAAAGAAACTAAATT
GAAACCAAGTATTTATGAGGAAGATGGATTAGAAACTATTTTAGGAACCTGGTTTGGTAAGAAGCAACTT
TCTATGGGTGAATGGCAAAAAGTAGCAATATCTAGAACTCTTATGAAAGATGCTGATATGTACATTTTTG
ATGAACCAGATTCATCTTTAGATTCTGAAGCGGGAAATGAACTCCTTTCTTTATATAAAAAAACATTTGA
AAATAAGATTGGAATATTTATAACGCACCATATCCAACATGCAAAAAAGATAACTAACAATATTGTAGTT
CTTGAAAATGGAAAGTTGTTAGAAAGTGGAAGACATGATGAACTTATGGACAAAAAGGGTGTTTATTTTA
ATTTATTTTGTAACTGCAAATAA
>ref|NC_013316.1|:209392-210813 Radical SAM-family protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATCAAAAACCATTTATACACACATTTAAAGCTGGAAAATCATATTTTATTTATGATGTTAATACGG
ATAAGATTTTAAAGGTAAATGCTGCTGTTTATAATTATCTAAATAAAATTGAGCATAATTTAGAAAAAGA
AAGTGACTGGAACATAGAAATAGAAGACGAAATTAATACCTTGATTAATTATGGATTTCTAAAAAATAAA
AGGGTAAATAAAACAATGCACCCTGAAACTAAGTATATAAAATATCATATAGAAAATAATCTATCCTCTA
TTATTTTACAAGTAACCCAAAATTGTAATTTACGTTGTGACTATTGCATTTATTCTGGTTCATACAGCAA
CAGAGTTCATACAAATAAAAGAATGAATATAGATGTAGCAAAAAGAAGTATTGACTATTTGATTAAGAAT
TCTAGTCAATTAAATGAAGTTAGTGTTGGCTTTTATGGAGGAGAACCCTTACTTGAGTTTGATTTGATTA
AGCAGATAGTAGAATATGTAAAAGTAGTTGGAGAAGGAAAGGAAATATACTTTAATCTAACTACAAATGC
AACTTTATTTAATGAGGAAATAATAGAATTCTTTGTAAAAAATAATATAACAACTATGATTAGTTTAGAT
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TAAAAAATGTACGTTACATAAAAAATAAATATCCAGAATATTATAAAAAGAATATTACATTTAATACAGT
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TAGGTAAGAGTTATGATAGATTCTTGACTTTACTCAACAAATTAAAATTTATAAAAGATGAGAGTATGTC
ACCTTTATCAAGAATAGAAAGAGCCTTATTAGATGATTTTAGATATGAGAAAAATATTGAAGGTAGATTA
GAGTTACCAGATGTGTGGCATCATGGTGGACCATGTATACCAGGGGCTTTTAGAATATTTGTAACTACAG
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TGTTGGGCCTATAGTTATTGTGATATATGTATAGCTAAGATTGATGATACTAAATGTAATGAAAATGAAA
TAAAACCACATGATTGTGACAGAATTAGACATTCTACAGAAAATAATATGAAAGATTACTGCGTTTTGAA
ATCTCTAGGATATCAATATTAA
>ref|NC_013316.1|:210842-211912 hypothetical protein CDR20291_0161 [Clostridium difficile R20291]
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CAGATATAGAAATTAATTCACTGGTTAGTCCTTCTGGCTGGGGGTTATGCAATAAGGAGTATAATGTTAA
TAATATTATTACTAAAGTTACAAATGATTTTCAAAGTGAACTTAAAAAGAATTCTTTGGTATGGTTTGTT
GATTCAAAAGAAAATCTAGACTTAGAAAAATTTATAATTCCTAAATTAAAAGTAGCTCTAAAAGAAGGTA
AAAAGATATTATATACACGTGATGATCTTAATAAAATATCTAGGTATATATCTCATTATGAATTCAAAAA
GATTAATGAATGGAATTTAGAAAAATATGAAATAAGAGATATAGAGGGTATATCACAGATAAACACACCA
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TATACCAGAGTTTATGTTTGATGATTCGATAAGTAGTAAGACAAAGATTATTAATTTTAACCATTTTATA
AAAGATAAAGAGGTAGAGGCAAAGCCAGATTTAATAATTATAGAAGTTCCAGGAGAATTATTCCCTTTCT
CTAGAAAAATGGTTGGTAATTTTGGAATTAGAGCTTTTGAAATTTCTAATGCAGTAATAAATGATTGTGG
TATATTATGTATTCCATCAAGTATATATGATAGAGAATATTGTGAAGAACTTAAATATTTTATTAAAGGA
AGACATGGTATAAATATAGATTATTTTAGTATAGAGAAAAAAGTTATAGATACATATGAGACAGAGGTGA
AGCAAAAATTTTCATATATGTCATTAGATGAAAACTTTTTTGTTGAAGATATAGAAGATTATGAAAAAAC
ATTTTTTATACATGATAATAAACAATTACTAGAATTAGTGGACAATATAGTGAATCAATTAAAAGAGTAT
GCTAAAGTAATATCTATTTAG
>ref|NC_013316.1|:211928-212179 hypothetical protein CDR20291_0162 [Clostridium difficile R20291]
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AAAATAACAATTTAAAAAAAGAATTATTTTTTTCACCGTCTTTACATATACAGCCAAGAGAATTACTTTT
AGTATTTTGCGAGGTAATAGAAAACTTTAATATAAAAATTCCAGAGGAAAAACTTTTGAATAGGCAATTT
ACGAGTTTTGATAATGTTCTAAAAATAATCAATATGGTATAG
>ref|NC_013316.1|:212230-212433 hypothetical protein CDR20291_0163 [Clostridium difficile R20291]
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GTCCTTATACTTGTAAGATGATGGCATCTTCATCTTGTAACTGCAAGAATAATGATTATAATGCAAGAGG
AGGATCATATAATACATATTATAATAAATTGATACATGGTCAAAGAACTCCTGATGGAATGTAA
>ref|NC_013316.1|:212917-213210 hypothetical protein CDR20291_0164 [Clostridium difficile R20291]
ATGATTAGTATGATTATGATGCTTATTGGAGTATTATTTATAGTGTTTGGGATAATTTTAACTGCTGTCG
AAATAAAAGGAAAAATGCCAGGTTTTTATGGAGTTGGGCAAAATGCAGTAAGAAAAAATGCTATAGGGAT
TATAGCAGCAGGTATAGCATTAATTTTTTTTAGAAATGGGTTAGATAGTATTGATTCAATTCTTACCTAT
GGAGTATTTTTAGTGATAGAGTTAGTAGTAATAGGATTATATTTTCTTATAAGAATAAAATATGATAAAG
ATGGGAATCTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c214691-213342 putative amino acid transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAAGCTAAGAAATTAGGTCTATTTAGTATGATATTATTAGGGATTAATAGCATAATAGGTTCAG
GTATATTCTTACTACCAGGTAAAGTTTATAGTCTAGCAGGTCAAAACAGTATGTTTATATACATTTTTGC
TACACTCTTAGTTCTATCAATACTTTTATGTTTTGCAGAAGTTGGAAGCATGTTTGATAAGAATGGAGGA
GCATATCTATACTCCAAAAAAGCTTTTGGAGATTTTATAGGATTTGAAGTTGGTACAATGTCTTGGTTTA
TTAGAATTATATCATGGTCTACTCTAGCAGTAGGATTTGCAACAGCTTTAGGTTCATTTTGGCCAGAATC
TGCCACTGAATACAAAGGTTGTATAGCTGCAATACTCGTAACACTACTTTCAATAAATAGCTTATTTGGA
ATTAAAAGCACAAAGATAATGAATAATGTAATAACTATAGCTAAATTAGTACCATTAATAGTTTTTGTGA
TAGTTGGAATATTCTTTATAAAATTTGTAAATATTGTTCCTTCAGGAAATGTAGTTAACTCTAGTATGGG
TCCAGCCATTATATTAGTATTTTACGCATTTACCGGCTTTGAATCATTTATTGTGGCAAGTGGAGAAATG
GAAAATCCTAAAAAAAATCTTCCAATCGCATTAATAACCACAATATTTATATGTGCAATAATTTATATAT
TAATTCAAATTGTCTGTATGGGTATACTTGGAGATAGACTATTTGAAAACAGTATTCCAATTGCAGATGC
TTCAAGTGTATTTTTAGGCAATTATGGTAAAGTTTTCATATCTGTAGCAACATTAATATCTATATTTGGT
ATAAATATAGGTTCATCAATAGTAACTCCTAAATGTGGTTCTTCTCTAGCAGAAGAAGGTTCTCTTCCTG
CATTTATAGGAAAAACAAATAAATATGGTGCTCCATATGTAGCAATAATAATATCTTTAATTTGTTGTAT
ACCACTTGTGCTAACTGGAAGTTTTGAACAACTTGCAGTAATGAGTGTAATTGCAAGATTTGCTCAGTAC
ATACCAACTTGTTTATCAGTAATAGTTTTAAGAAAAAGAACAGATGTTAAGGCCTCTTTTAAGATTCCAT
TTGGTCCTGTTATACCAATGGTAGCTATTTTAGGTAGCTTATGGTTGTTACAACAAGCTTGGGCAGAAGA
TATTTCAAAACCTATAACTCAAAATAGAGTCTTAATAGGATTAGGGGCAATGTTGTTAATAGCTCCTCTA
TATATATTTATGAAAAAAAATAAGGAAATCGAGCATAAAAATAAATCAGAAGATTCTAAATTATATATTT
CGAGAGAAAAAATTCAATAA
>ref|NC_013316.1|:c215948-214728 putative amidohydrolase/peptidase [Clostridium difficile R20291]
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ATTCTATAAAACCATGGCTTATAAACATAAGAAGAGAATTACATAAAATTCCAGAATTAGCTCTTGAAGA
AAATCTTACTAAACAGAAGGTAATTTCTTATTTAAAAGAAATCGGAATTGATTATATGGAATTTACAAAA
CACAATGGAATTATGGCATATATTTTAAAAGAAAGTGCAGATAAAACGATTTGTATAAGAGCAGATATGG
ATGCTCTTCCTATTGAAGAAGAAAACAACATACCTTATAAATCAATACATTCTGGAAAAATGCATGCTTG
TGGTCACGATGCACATACAACCATGCTACTTGGAGCATGTAAAGTTTTACATTCAATAAAAGATAAACTT
AATGTAAATGTAAAATTCTTATTTCAACCAGCAGAAGAAGGTTTTGGAGGAGCAAAATTTTTAGTTGAGG
ATGGGTGTTTAGAAAACCCCAAGGCCGATTATATATTCGGACTTCATGTTATGCCACATATAGAAACAGG
CCTTATCGAAACAAAATATGATACATTAAATGCTAGTGTAGACACTATAAAAATAAGTATCAAAGGTAAA
AGAGCTCATGGTGCATATCCTGAAAATGGTATTGATGCAATAGTTACAGCTTCACAAATTGTTACATCAT
TACAAACTATAATAAGTAGAAACTTAGAACCAAATAATGCTGCCGTTTTGACTATAGGTAAAATATATGG
TGGTGATGCACACAATGTAATATGTGAAGATGTAAAACTAGAAGGCACTTTAAGAACCTTAAATAGCAAA
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GGACTTTACATGTAAGTGATGAAAACTATCCTGCTGTTATAAATGAAAAAGAATTAGTAGATACAGTTAT
ATCAAGTACTAAAGAATTACTTGGAGAGGAAAAATTTATATTGAGACCAAACCCGTCTTTAGGTGGTGAA
GACTTTTCTTTTTACACAGAACATTGTAAAGGAGCATTCTTCCATTTAGGATGTAAAAATGAGGAAAAGG
GCTTAATTTCACCTCTTCATACCTCTAGCTTCAATATAGATGAAGATTGTTTACCAATAGGTGTTATGAT
GCATGTAATGAATACTTTGTATTTTAATTAG
>ref|NC_013316.1|:c218329-216317 putative sigma-54-dependent transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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AATTAGTTTTTGGAGATTCTATAAATATTAATAGATACTTCATAAATGAAATAAATGATAATGATATTAT
AAATGATGATGTGATATTAGTAATGTCAGTAGAAAGATTAGACAAAATTATAAATAATATACTAGATAAG
AAAAAAGTGATTGTGGTAAGAAGAACTTTTAGGGAAGATAAAATTTATAATCTACTATCTTTACCACAGG
GTACAAATGCTCTAATCGTAAATGATTCTGATGAAACTACTCTAGAAACTATAAGTTTATTTTATAAAAT
TGGAGTGACTAATATTAGACCAATTCCATATATGAATGATAATAACTATAAAAATATAAAAATAGCTATA
ACTCCAGGAGTTCCAGAAAAAGTACCTAGCTTTATCTCAGATATATTTGATTTAGGTCACAGATATATAG
ATATTTCTACATTTATAGAAATAATAAATTTATTACAAATTGATTCAAAGGAAATACAATCTAATCTAGT
TAAATACTCAGAAGAAATAATAAGTTTAGATACTGGTATAAAAGATAAATATAAGGAATTATTTTTAAAA
ATAGAAGAATTAGATACAATATTGAATTTATCAAAAGATGGTATATTATTTACTTCAAAAGATGGTGAAA
TAAATACATATAATAGTAAAGTAAAAGATATTTTAGACATAAATGAGGATATATATGGAAAATACATTGA
TGATATATTTGTAGATAGTTTAAAAGTTTTATTGAGTGAGAAAGAGATACTAGATAAAGTTGTCGTATTC
AATAAGAAATATATAAATGTAAATAAAAAAAACATATACAATAGGGATGAAAAAATGGGCACATATTATA
GTTTACAAGAAATAACATACATAAAAAAATTAGAACAAAATCTCACTAAAAAATTAAGAGAAAAAGGACA
AATAGCAAAATATACATTTAAGGATATAAAAACAAATAGTCCTAAAATGTTTGAATGTATAGATTTAGCT
AAGAAGGTTTCTAAATCTGACTTAAGCATACTTATCAGAGGTGAAAGTGGAACTGGTAAAGAACTCATAG
CTCAGTCTATACATAACAACTCAAATAGAAAAAATCAACCTTTTATAGCAGTAAATTGTGCAGCCGTTCC
TGAAAATTTATTAGAAAGCCAGCTATTCGGATATGACAAGGGAACTTTTACTGGAGGTCTAAAAGATGGA
AAACAAGGATTATTTGAACTTGCTAATAATGGAACAATATTCTTAGATGAAATAGGCGATATGCCTTTAG
AATTACAAACAAAACTACTTAGAGTTCTTCAAGAGAAGCAGATAATGCCTGTTGGGTCTCACAATGTAAT
TAATATAGATGTTAGAATCATATCTGCTACAAATAAGAATTTAGAACAAATGATTGATAATAGCCAATTT
AGAGAGGATTTATATTATCGATTAAATACAATTCCAATAAATATACCTCCTCTAAGAGAAAGAAAAGAAG
ACATATTAATTATTATGGAAGATTTAATTAATAAGAAATTAGTAATCACACCAGAAGCAAAAAAACTTAT
ACAAAACTATATGTGGAAAGGTAATATAAGAGAACTCCAAAATGTTACATCCTATTTAAACATTATGTGT
GAAGATATTGTATTAGAGAAAGATTTACCTCCAAACTTAAGGTCTTCAGATAACAAAAATACATCATTAA
AACTAAAATATAGTAAGAATGATATATTGAATATATTAGAGATACTAATTTTAAATAAGGAATCAGATGT
TGGTATTGGTAGGGGATTAATTTTAAAAGCACTACTCGATAAGAACCTTCAAATTACAGAAGGAAAAATT
AAAAAAATATTTGAATATCTAAAAAAAGAAGAACTTATAATTTGTAGTTCAGGAAGATATGGAAGTAAAA
TAACTCAAAAAGGAGAAGATTTTTACAATAAATTAAAATATAAAGGTCTATAA
>ref|NC_013316.1|:218800-219450 putative cyclic nucleotide-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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ATAAAAAGGGTCAAAGATTTGTAGCATCAGATAAAGACTTACAAGAAGTGTTCTTTATAATAGAGGGAGT
TGCATTAGTGGAGTGTACTACTAGAGGAGGAAATAAATTTCTTGTTGACATTGTACCTGAAAATGAATTT
ATAGGCAAAATCAGTTACATATATGAACATAATTTGAAATGTGATATATTTGCAAAGACCAATATAAAAT
TATTTCGATTTGAAAAAAATGTATTTGAAGAGTTTTATCTCAAACCAGATTTTATTGCACTATTTCACAG
AAAATGTACAAGAAGAATATATGAATTATATAAAACCAGAATGGTAAGAGAACTATTTTCTTGCACAGAA
GTTATTGCCTATTGTATATCAAATAAACAAGAAAATAATGTCTGCAATATAAAAGCTATTCGTAATTTCA
GTGAAATCTATTCAATTAGTAGAAAAAGTAGATACCATTCTCTGCTAAAGTTAACTGAAAAGGAGATAGT
AAAAAAAATGGGTAATACATATGAAATTTTAAACTATGATGAATTACATAAATTGGCATTTGAAGTAAAA
GAGTTTTTGGAAGATGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c220966-219590 putative drug/sodium antiporter [Clostridium difficile R20291]
TTGCAAGAACTATTTTCTTTAAAAGACGAAAATAAAAGATTTTATAAAATACTTCTATCTTTATGTATAC
CTATTATCATACAGAACTTAATTTCTACTTCTGTAAATGTAATAGATACAATTATGATAAGTAGTTTGGG
GGAGACATCTGTAGCTTCAGTTGGAGTTGCAAACCAATTTTTCTTTCTTTTTAATATGTCCTTATCTGGT
ATCACAGGAGGTGCTGGAGTTTTTATTTCACAGTTTTATGGAAAGAAGGATGTGAGTAATATAAGAAAAG
TCACAGGTCTTACTTGTGTATTGGCAATTGTTTTAAGTTTTGTATTTGTTATTCCTGCTTTACTAACACC
AAAGCCAATTATACACATATTTTCGTATGATTCTGAGGTGGTAAAACTTTGTATAGATTACTTTAGTATT
GCAGTATTTAGTTATCCATTAATTGCTGTAAGTACTGTATTTAGTACTGGTTCAAGAGGTGTTAGAAATC
CTAAGTTAGGTATGATTTGTAGTGCATTTGCACTTGTAACAAATGTTATTTTAAATTATGGATTTATATT
TGGTAACTTCGGTCTTCCCGCATTGGGTGTAAAAGGTGCTGCTCTAGCTACTGTTATTGCTAGAATATGT
GAATTAATTTTAATGATTACTTATGTTTACCTTTATAAAAAAGACTATATATTAAAGTTTGGTCTAAAAA
ATCTAAAAGCTATTGATAAAATTTTTATAAAATCTTTTTCATCAAAAAGCTTTCCTATATTTGTAAATGA
CTCTGTATGGGCAATTGGAACTGTCCTGTATTCTGTTGCATATGCAAGAGCTGGTACTTCTGCTATAGCA
GCTAGCCAGATAGCAACCAGTACAGGTAATTTCTTCATAATGACAGCTGTATGTATTGCATCTGGTGCAT
CTATTATGCTTGGAAATGAACTTGGAGCTGACCATATTAAAAGAGCCATTGAATATGCTAAAAAGTTTTC
TATACTTGTATTTTCAGCTGGTTTAATACTTGGAATTATTTTAATTTTAAATATACCATTATTATTAAAA
ATGTTTAGTGTTTCTGATAGCTTAGCTTCTGATATAACTAAGATATTCTTTATCATGGGAATACTAATGG
CTCTTAAATCTTTTAATACATTGGTTATAATTGGTATTTTAAGAAGTGGAGGAGATACTAAATATGCTCT
ATTTCTAGAATTAGGATGTATGTGGTTAGCTTCTATTCCTCTAACTTTTATAGCTGCATTTAAAGGTGCA
CCTATATTTGTACTCGTTTTACTCACTTATAGTGAAGAAGTGGTTAAGTTTATATTTGGTGTTCCTAGAG
CATTATCTAAAAAATGGGCTATTAATATAGTAAAGGAAATTGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c222895-220982 putative ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATTGTTTTGTCATGTAATAACTTAAATAAAAGTTTTGGTATAGATTCTATATTAGAAAATATTAGTT
TTACAGTAAATGAAGGCGATAAAATTGGTATAATCGGTGTTAATGGTACTGGAAAAACTACTTTATTTAA
AATAATTTCAGGAATTTATGGATATGATAGTGGAGATATTTATACTTCTAAAGATTGTGAAATCGGATAT
TTAGAACAAAATACCAATTTTTATTCGGATAATACTATTTTGGAAGAAGTGCTAGAAGTTTTTAAAAATT
TGATAGAAATGGAATCCTATTTAAGAGAATTGGAGGTTAAAATATCTGAAGAAAGTACAAAAACAAACTC
TCCAATTATAGAAAAAATCATGGATGAATATTCACATAAACTAGAATTATTTTCAGATTTAAATGGATAT
GGATATAAATCTGAAGCCAAAGGAGTTCTAAAAGGATTAGGATTTAGTGACAATGATATGGATAAGCCAA
TAAGCATACTTTCTGGTGGTGAAAAAACTAGAGTTCTTTTAGGAAAATTACTTCTTAAGAAACCAACTCT
ATTGTTACTTGATGAACCTACTAACCACTTAGACTCTGAAGCAATAGAATGGTTAGAAGTATTTTTAAAA
CAATATAAAGGAACTGTCATGTTAATATCTCATGATAGATATTTCTTAGACCAATCCGTAAATAGAATTT
TTGAAGTTCACAACAAAAAACTTAAAGTATATAATGGTAACTACTCTAAATTTGTTGAGTTATCTAAAAT
AGAAAAAGAACTAGAGCTTAAGAAATTTGAAGACCAACAAAAAGAAATAAAAAAGCAAGAAGAATCAATT
GAAAGACTAAAAGCTTATGGTAGAGAAAAACACCTAAAGCGTGCAAGAAGTAAAGAAAAAGCATTAGACA
AGGTAGACGTTTTAGATAAACCAGAAGCTTATAGGAAAAAAGCTCGTATACAATTTACGCCTTCTGTCCA
GAGTGGTAATGATGTTCTTCAAATTAGAGATGTATCTATGGGTTATGGAGAAAGAATACTTTTTAAAGAC
TTGGATTTAGATATATATAGAGGGGAAAAAGTTGCACTTATAGGTGCAAATGGTGTTGGCAAATCTACAT
TATTTAAAATAATAACTAATGAACTACAACCTCTTAGTGGCAATATTAAATTTGGAACTAATGTACATGT
TTCCTACTTCCATCAGGAACAAAAAACTCTTAATTTAGATAACACAATAATTGATGAGATTTGGGAAAAT
AATACTCATCTTACTCAAACTACTTTGAGAAATATGTTAGGGGCATTTTTATTTGTAGATGAAGAAGTTT
TTAAGAAGATTTCTACATTGAGTGGTGGAGAAAGAGCTAGAGTTGCCATACTTAAACTTATACTATCAAA
TGCAAACTTATTGTTATTAGATGAGCCTACTAATCACCTAGATATTGATTCTAAGGAAGTCCTTGAAGAG
GCATTAACTAATTATGATGGGACTATATTTACAATATCACATGATAGATACTTTCTAAATACTGTTGTTG
ATAAAATTTTAGTTTTAGATGAAAATGGAATTACTGAATATCTGGGAAATTATGATTATTATATAGATAA
AAAAAGGCAAATCCAAGAGATGAGTATTATAGAAGAAAAAGAAGAAAAAACTAGAACTCAAATAAAAGAT
GAAAAAAGAAAAGAGAGAGAACAAAGAGAAATAGAAAAGAAAAATAGAATAAAAAGACAAAATATAGAAA
AAGAAATTGAAAAGTTAGAGATTGAAATTGAAAAATTAGATATACTTTTATGTCAAGAAGAAGTATACTC
TAATCCAGATAAAGCTAAAGAAGTTAGCCAAGAAAAAATTAATTTAGAAAATAACCTTGCCTCTCTATAT
GATGAGTGGGAAGAATTTATGTAA
>ref|NC_013316.1|:223031-223663 putative redox-sensing transcriptional repressor [Clostridium difficile R20291]
ATGTTGGGAAATAAAAATATATCAATGGCAGTTATAAGAAGGCTCCCAAAATATCATAGATATCTTGGAG
ACTTATTAGATAGGGATATACAAAGAATATCTTCTAAAGAATTGAGTGATATAATAGGGTTTACCGCTTC
TCAAATAAGACAAGATTTAAACAACTTTGGTGGATTTGGACAACAAGGATATGGTTATAATGTAGAAGCT
CTTCATACTGAGATAGGTAAAATTCTTGGGTTGGATCGACCATACAACGCAGTTCTTGTAGGAGCAGGTA
ACTTAGGACAAGCTATAGCCAATTATGCAGGATTTAGAAAAGCTGGATTCGAGATAAAAGCTTTATTTGA
TGCAAATCCTAGAATGATAGGTTTAAAGATAAGAGAGTTTGAAGTATTAGATTCAGATACTTTAGAAGAC
TTTATAAAAAACAATAATATAGATATTGCTGTATTATGTATACCTAAAAATGGAGCACAAGAAGTTATTA
ATAGAGTTGTAAAAGCTGGAATCAAAGGTGTATGGAATTTTGCACCTTTAGATTTAGAAGTTCCGAAAGG
TGTTATAGTTGAAAATGTAAACTTAACAGAAAGTTTATTTACCTTATCGTATTTAATGAAAGAAGGAAAG
TAG
>ref|NC_013316.1|:223802-224341 hypothetical protein CDR20291_0172 [Clostridium difficile R20291]
GTGGTTTTTGTGGAGGAATTATGGAAAAAGGCAATTGAATTTCATGGTCATGAATGTCCAGGGTTAGCTA
TAGGATTTAAAGCAGCACTTGCAGCAAGAAAATATTTAGGATGTAAACAGTCAGGAGATGAGGAAATTGT
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GGAAATTTACTACTTAGGATGACTGGGAAATCAGTATATCATTTCTTTAATAGGGAAAATGGAAAATCTA
TAAGAATATATGTAAAGTCAAAGCCATTTCAAATGGATAGAGAAGGATACAAAAAGTACTTATTAGAAAG
TGATTTTGAAGAAATATTTGAGATTACAGATACTAAGTTAAGACTTCCTGAAAAAGCAAGAATATTTAAA
TCTCTTAAATGTGAAGTGTGTGGTGAATTTGCATCTGAGCAATATATAAGGATTGAAGAAGGAAAGAAAG
TATGTCTTGATTGCTTTAATAAATATGAAAGATTTTATGAGGAGTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c224687-224517 ferredoxin [Clostridium difficile R20291]
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TATCAGCTGGAGACGACGCATATGTTATAGATGCTGGTTCTTGTATAGACTGTGGTTCTTGTGCAGGAGC
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>ref|NC_013316.1|:224972-226039 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
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TATTATGGCAGTTTTGACCATGAATTTAAAAGACAAGGAGAAGATTACAATTATTTTCTTAAAAATGTAA
AACCTGTATTTGAAAAAGATGACTTAACAGTGGTTAATTTAGAAGGTCCACTTACTACAGCGTCAAATGC
AAAAGAAAAAAAATTTGCATTTAAAGGAAAGCCTGGATATGTAAATATTTTAAAATCTGGAAGTATAGAG
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TGGATGAGAATAAAATAAATTATTTTGGATTAGGGAAAGATGCTGTTGTAGATGTCAAAGGAATTAAAGT
GGGTCTATTAGGGTATAATGGATTATCAACTGAATATAATGAAAAAAATTTAAAACAAATGGAAGATGAT
ATTAAGTCCTTAAAAAAGAAATCGGATGTTGTTGTAGTGTACTTTCATTGGGGGATAGAATTAGATTATT
ATCCAGATAAAAAACAAAAAGATTTTGCTCATTATGCTATAGACAAGGGAGCAGATTTAGTTATGGGGTC
TCACCCACATGTTATTCAAGGAATAGAAAAGTATAAAAATAAGTATATAGCTTATAGTCTAGGGAATTTT
TGCTTTGGAGGAAATAAGAATCCTTCTGATACAGATAGTTATATATATCAACAAACCTTTACTTTTTCAG
ATAATAAATTAACTTCAATTAAAGAGCCAAATATAATACCAACCTCAATAACATCTAGTAGCTCCAGAAA
TAATTATCAACCAAAAGTATTGGATGGAAGTGAGAAGGATAGAGTTTTAAATAAACTTGAAAAAATAAGC
AAAGATTTAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:226209-228110 putative oxidoreductase, acetyl-CoA synthase subunit [Clostridium difficile R20291]
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ATGTTGAAACAGCATTTCATAGAACAGAAGATCAGAAAGTTAAGTGTGGTTTTGGACTTCAGGGGGTTTG
TTGTAGACTCTGTTCAAATGGACCATGTAGAGTAACTCCTAAATCACCAAGAGGTATATGTGGAGCAGAT
GCAGACACTATAGTAGCAAGAAACTTTTTAAGAGCAGTAGCATCAGGAGCAGCTTGTTATTTACATGTGG
TAGAAAATACAGCTAAGAATTTAAAAAATGTTGGAATAACTAAAGGTGTTGTTAAAGGAGAAAAAACATT
AAATCAATTAGCAGAGATGTTTGGAATAGAAAGTGATGAAAAGTATGATAAATGTATAAAGGTTGCAGAC
AAAGTTATCAACGATTTGTATAAATCAAGAGATGATAAAATGGAATTAGTAGAAAAAATAGCTTATGCAC
CTAGAGTGAAAAAGTGGAAAGAGTTAGGTATAATGCCTGGTGGTGCAAAGTCAGAAGTTTTTGATGCAAT
AGTAAAATCATCAACAAATTTAAATAGTGATCCAGTAGACATGCTAGTTAATTGTTTGAACTTAGGTATA
TCAACAGGATTATATGGTCTTACACTAACTAATCTTTTAAATGATGTTATGTTGGGAGAACCAGTTATAA
GAATGGCTCCTGTAGGATTTAATGTAATAGACCCAGACTACATAAATATAATGATAACAGGCCATCAACA
TTCAACATTTGCAAATTTCCAAGATAGATTAAAAGATGAAGATGTTATAAAATTAGCTCAATCTGTTGGT
GCAAAAGGCTTTAAGCTAGTAGGATGTACATGTGTTGGTCAAGATTTACAATTAAGAGGAGAACATTATC
AAGAAGTATTTGCTGGACATGCAGGTAACAATTTTACAAGTGAGGCTGTTTTATCAACTGGAGCAATAGA
TATAGTTCTTTCAGAATTTAACTGTACTATACCAGGGCTTGAACCAATAGCAGATAAATATAAAGTAAAA
ATGGTTTGTTTAGATGATGTTGCTAAAAAAGCGAATGCAGAATACATAGGTTTAGACAGAAGTAAATTAG
ATGAACTTAGTAACACTTTAATAGAAAAAGCATTGGAGTCTTATAAGGAGAGAAGAGGAAGTATTGAGAT
AGATATACCAAAAGACCATGGATTTGAACAATCTTTAACTGGTGTAAGTGAAAAGAACCTGAAAGCGTTT
TTGGGAGATTCATGGAAACCTCTTATTAATTTAATTGCAGAAGGAAAAATTAAAGGTGTTGCAGCTGTTG
TAGGATGTTCAAATATGACAGCAGGAGGACATGATGTAAATACTGTTGAACTTACTAAAGAATTGATTAA
AAAAGATATAATAGTACTATCTGCAGGATGTTCTACTGGAGGATTAGAAAATGTTGGTCTTATGTCACCT
GGAGCAGAAGAATTAGCAGGAGAAAACTTAAAAGAAGTATGTAAGACTTTAGGAATACCACCAGTATTAA
ACTTTGGACCATGTCTAGCTATAGGAAGACTAGAAATAGTAGCAACAGAATTAGCAGCTGAACTTGGAAT
TGACCTACCACAATTACCATTAGTGCTTTCAGCTCCACAATGGTTGGAAGAACAAGCATTAGCTGATGGA
GCGTTTGGTCTTGCCCTTGGCTTACCTCTTCATTTAGCTTTACCTCCATTTATAACAGGAGGAAAATTGG
TGACAGAAGTATTAACAGAAAAATTAAAAGACTTAACAGGAGGACATGTTATAGTGAATCCAGACCCTAA
ATCTTCAGCTAATCAATTAGAAGAAATAATAATAGATAGAAGAAAAAATTTAGGGTTAAAGGATGTGGAA
TGCAATGCATAG
>ref|NC_013316.1|:228166-228576 putative oxidoreductase, electron transfer subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGCTAAAACACAATAAAGATTATGACATGTACACTCTTGATTTAGAAAATATAGATAATGATAGTAGAG
GGCATATAGAATTAGATAGTAAACATAATAATCCAGTTCCAATTCTTTGTAGACACTGTGATGAACCTGA
ATGTGTATTAGCATGTATGAGTGGTGCAATGCATAAAGATAGTGAAAGTGGAATCGTTTCATATGATGAA
GAGAAATGTGGTTCATGTTATATGTGTGTAATGTCTTGTCCATATGGATTATTAAAGCCAGATGATAGAA
GCAAGCAAAACATACTTAAATGTGATTTATGTAAAGATGAGGAGTATCCTAGATGTGTAGCTAATTGCCC
AAGTGGAGCAATTGAATTACAGAAGGAGGAAAATGATGAATTATGTAGTGTTAGGGGCTAG
>ref|NC_013316.1|:228674-229777 putative oxidoreductase, NAD/FAD binding subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGTTGCATCACGTTATATCTGAACACAGAACTTTAAAACAAATAAATTTTGTTGATGAAGATTTTATGG
AGCAAAATAATGTAAAATGGATTGCAGGTAAGACTGTTAAAGGTATAGACATAAATAAAAAGGTAGTTCA
AACAGAAGACATTACTGTAAATTATGATAAACTTTTAATAGCTACAGGTGCATCTTCTGCTATTCCTCCT
ATAAAAAATTTAAGAGATGGAAATTTTGTATATTCTGTGAGAAACATAGATGATATTTATAAAATAAAAG
AAAAAGCACAAAATTCTAAAAATGTAGTTATAATAGGTGCTGGTTTAGTTGGTATAGATGCATTAGTGGG
ATTATTTAAATATGAGCAGTTAAATATTTCTGTAGCTTTTATGGAAAAGTACATTTTAGATAGACAATTG
GATGAATATACAGCATCAGTGTATGAAAATAAGTTCAAAGAAAAAGGTGTAAAATTTTACCCAAGTGCAT
CAATACAAGAAATTGTATTGGATAACAGTAAAAATGTTACAGGTGTTGCATTTTCAAATGGTGAAGTTTT
AGATGCAGACATGGTAATTGTAGCTACAGGGGTTAAACCAAATGCTGACTTTTTAGATGGGACAGGAATA
GAATATGATAGAGGTATAATAATAGATGATATGTGCCAAACAACACAAAAAGACATATATGCAGCAGGAG
ATGTTGTAGGTAAAAATGCTATTTGGCCTCTGGCAGTAAAGCAAGGAATTGTAGCTGCCTATAATATGGT
TGGAAAAGATAAGAAGATAGAAGATGAATTTGCTTTTAAAAATAGTATGAATTTCATGGATATACCAACT
ATTTCTATAGGAATGAATACACCTGTAGATGATAGCTATAAAGTATTAACCAGACATGGAATTAATGATT
ATAAGAAGTTTGTTTTTAAAGATAATGTAATCTACGGAGCAGTTATACAAGGAGATATTTCATATGTAGG
TGTATTAACTTATTTAATAAAAAATAAAGTTGAAATATATGATTTAGAAAATAGGATATTTGATGTATGT
TATGCAGACTTTTTTAATATAAAAGAAAATGGAGAATTTTGTTATAGTGTATAG
>ref|NC_013316.1|:c231103-229916 cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase [Clostridium difficile R20291]
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TTAAAGATGAGGAAGAATTTCTAATTGGAGAGGGCTCCCCTCAGTTCAAAGTTATAGTAAATAATGATAT
TAGCAAGTCTGAACTATTAAAAAGTACATCTTTAGCACTTGGAGAAGCCTACATAAATAGAGACATTGAA
GTTGAGGGAGATTTATTCTTAACTTTAAATCTACTTTTAAAACAAATAGACAAATTCAATATTGATAATT
CAGCTGTAAAACATCTATTGCACTCATCAAATTCAATGAGACATCAGAAGAAAGAAATACATGCCCACTA
TGACATTGGCAACGATTTTTATAGCTTATGGTTAGATAAGACACTTAGTTATTCTTGTGCATACTTTAGA
AATGATAATGATACTCTTTATGATGCTCAAGTCAATAAAGTTCACCACATATTAACTAAACTAAATTTAG
AGGAAGGTATGAGCCTTCTCGATATTGGTTGTGGTTGGGGATTTTTACTAATAGAAGCTGCAAAAAAATA
TAAAATTCACGGCGTTGGAATTACACTTAGCGAAGAGCAATTTAAGGAATTTAACGCAAGAATTAAAGAA
GAGAACCTTCAAGACTATCTTGAGGTAAGACTTATGGACTATAGAGAATTAAAAAAATCAGACCTTATGT
TTGATAGAGTTGTAAGCGTTGGAATGCTTGAACATGTTGGTAGAGAAAACTATGAACTTTTCATTAAAAA
CGTAAATGCTGTTTTAAAAGATGGTGGATTGTTTTTACTTCACTATATAAGTGGATTGCAGGAATCTTAT
GGAGACCCTTGGATAAAAAAATATATTTTCCCAGGAGGAGTTATTCCTAGCCTAAGAGAAATGATACATA
TTTGTAGTGATTACAAATATCATACTATAGACGTAGAAAGTTTAAGATTACATTATGTAAAAACCTTACT
ATACTGGCAAAAAAGTTTCTCTGAGAATCTTCCAAAGATTAAAGAAATGTTTGATGATAAGTTTATAAGA
ATGTGGGATTTATACCTTTGTTCTTGTGCTGCTGCTTTCAACACTGGTATTATAGATATACATCAAATAC
TTTTCACTAAAGGTATAAAAAATGATTTACCTCTAACTAGAGAGTATATGTATAATTGTTCAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:231373-232200 putative ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATGGAAGTATATGCTTTGGTTGGGTCAAGTGGCACAGGGAAGAGCTTTAAGGCTTTAGAGTTCGCAT
ATGAAAATGATATAGAATATATAATCGATGATGGGATTTTAATATACAAAAACAAGGTTTTAGCTGGGAT
ATCGGCAAAACAAGCAAATACTACTATAGAAGCAGTTAAAAGGGCTATTTTTTATAATCTGGAGCATAGA
CAAGAAGTTAGAGAAGCAATTAAAAAAGAAAATATAAGAAAAATTCTTATTATTGGGACATCAAAAAAAA
TGGTTAATCAAATTGTAGAGAGATTGTCAATTGGAAGGGTCTGTAAGTTTATAAATATACAAGATATAAG
TACTAAATATGAAATAGAAATAGCAAAACAAGCTAGAAAAGAAGGAAATCATGTAATTCCTGTTCCAGCC
GTTGAGATAAAAAGTATGGCAAGTGGTCTCAGTATAAATTCTTTGAAGAGACTTTTTAGAAAAGGAAATA
ATAGGAATATGGTAGTTTTAGAAAAAACAATTATAAGACCAACTTTTAGTTATATAGGAAAGTTTTATAT
TAGTGCTGATGTAATTAAACAGATTATTGAATATGAAGTATACAACTTTGGAAGCATTGATAGAATAAAT
AAAATCAATATAGAGAATTGCAATAATTTTATGAATATTTTTGTAAGTATAAATATCAATGATTTAGAAA
CTATAAAAAAAATTGAAGACATACAACAGACAATAAAAAAGTCTATTGAGAAAATGACTTTAGTTAATGT
ACAAAAAATAGATATTAACATTCATAAAATTAAAAAAATAAACTTCCTCCAATGTTAA
>ref|NC_013316.1|:232329-233594 NAD-specific glutamate dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAGGAAAAGATGTAAATGTCTTCGAGATGGCGCAATCTCAAGTAAAAAATGCATGTGATAAATTAG
GTATGGAACCAGCAGTTTATGAATTATTAAAAGAACCTATGAGAGTTATAGAGGTTTCAATTCCAGTAAA
AATGGATGATGGTTCTATAAAAACTTTTAAAGGATTTAGATCACAACATAATGATGCAGTAGGGCCAACA
AAAGGTGGAATAAGATTCCATCAAAATGTTTCAAGAGACGAAGTAAAAGCTTTATCTATATGGATGACTT
TCAAGTGTTCTGTAACAGGTATACCATATGGTGGAGGTAAAGGTGGAATAATAGTAGATCCATCAACTTT
ATCTCAAGGTGAATTAGAAAGATTAAGTAGAGGATACATAGATGGAATATATAAATTAATAGGTGAAAAA
GTTGACGTTCCTGCACCAGACGTAAATACTAATGGTCAAATAATGTCTTGGATGGTTGATGAGTACAATA
AATTAACTGGACAAAGTTCTATAGGTGTTATAACTGGTAAGCCAGTTGAATTTGGTGGTTCTTTAGGAAG
AACAGCTGCTACTGGATTTGGTGTTGCTGTTACTGCAAGAGAAGCTGCTGCTAAATTAGGAATAGACATG
AAAAAAGCTAAAATAGCTGTTCAAGGTATAGGAAACGTTGGTTCTTATACAGTTCTTAACTGTGAAAAAC
TTGGTGGTACTGTTGTAGCTATGGCTGAATGGTGTAAATCAGAAGGTTCTTATGCTATATACAATGAAAA
TGGTTTAGATGGTCAAGCTATGTTAGATTATATGAAAGAACATGGTAACTTATTAAACTTCCCAGGAGCT
AAGAGAATATCTTTAGAAGAGTTCTGGGCTTCAGATGTTGATATAGTAATACCAGCTGCATTAGAAAACT
CTATAACTAAAGAAGTTGCTGAATCTATAAAAGCTAAATTAGTTTGTGAGGCTGCTAATGGACCAACTAC
TCCAGAGGCTGACGAAGTATTTGCTGAAAGAGGAATAGTTCTTACTCCAGATATATTAACTAATGCTGGT
GGAGTTACAGTTTCTTACTTCGAGTGGGTACAAAACTTATATGGATACTACTGGTCAGAAGAAGAAGTAG
AGCAAAAAGAAGAAATAGCTATGGTTAAAGCATTTGAATCTATTTGGAAAATCAAAGAAGAGTACAATGT
TACAATGAGAGAAGCTGCTTACATGCATTCAATTAAGAAAGTTGCTGAAGCTATGAAATTAAGAGGATGG
TACTAA
>ref|NC_013316.1|:233787-234443 hypothetical protein CDR20291_0181 [Clostridium difficile R20291]
ATGTATTTTTTACCACCACATGATTACAAATTAGAGGAGTTAGATTGGATTTTTGGACATGAACTTATGT
ATTTTAAAAGCAAAGACCTTCATTTAAAGTATCTAGTATTATTTTTAAAAATAGTATATTGGTTTAATCC
ATTTATATATATAATGGAAAAATATATGGATTTGGATTGTGAACTTTATTGTGATGAGAGAGTTTTAAAA
AATTGTACTGTACAACAAAAGCAAGAATATGCTCTAACTATTGTAAATTCAATGAAAAGAGGTATAAATT
TTTCAAATAAATTTGTAACTGGATTAAATAAACAATCTGATATTAGAAAAAGAGTAATGAACATGTTCAG
TGAAAAACATAAAAATGGTATCTTAATGGCTTTGATTATAAGCTTGTTTTCTTCTATTACATTTTTTAAA
TTCGATTCAACTAGTCTTATTGAAGAGAATGATTTCTTAGAGAGGTCAAGATATGCGTTTGAAGGAAGGC
AAGAAGACATGTTTGTAACAATAGATTCTACATATGCAGATGCACCTATAAAACTTAGAAAAGAGCATGA
AGAAAACTGTAGAGTCAATGGAATAGTACCAAAAGATTCAGATTCAATAGAAATTATTCCTAGATTTTAT
AAAGATTGTATGGATTTAAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:234774-235907 putative membrane-associated metalloprotease [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTAACTTTATTCTAAATGGGATTTTTAGAACAGTTATAGTAAGTAGTCTAAGCATTCTTCTGATAT
TGATTTTCAAGAAAAATGTATTTAAAAGATTTAGCAAAAAATTTAATTATTATATATGGATGATAGTTGT
TATTAAATTATTTTTACCATTTACATATTATACTTTTACAATAAATATCTTGAGAAGTAAAAAACACATT
AATATTAATAACATAAATTTAGAGGGATTTAATAATGTTTCAACTATAAGTAATAATATTATATTGTACA
CTTGGATTATAACTGTAGTAGTGTATTTAATTTACACTATATTTAAATATATAAAACTTAAAAATTTAAT
AAATGACTTATCTTATGATGTTGATGATAGAGAGATTGTAAATCTTTATAAAAATATATTAGAAGAATTT
AATATAACAAAAGATATAAAACTCAAATACTCTTATGAAGTTGAAACACCAGCATTTTTTAATTCATGTG
TACTTTTGCCACCACATGAGTATAAATTGAAAGAGTTAGACTGGATTTTTAGACATGAGCTTATGCATTT
TAAGAGTAGGGACCTTTATTTAAAATATGTAATCCTGTTTTTAAAAACAGTATATTGGTTTAATCCATTT
ATATATATAATGGATAAACATATAGATTTAGATTGTGAACTTTATTGTGATGAAAGAGTTTTAAAAAATC
GAAATTCAGAGGAAAAAAAGGATTATGCTTTAACAATTCTAAATGCAATGAGAAAAGGTTCAAATACTTC
AAATAAATTTATAGCTGGACTCCATAAGCAATCTGATATTAAAAAGAGAGTTATGAATATGTTTAATGAA
AAGTACAAGAATGGTATATTAATGGCATTAACTTTATGTTTATTATCTTCTATTACTTTTTTGAAGGTTA
ATTCAACGAGTATTGTTAATCTTAATGTATTACCTAAAGGATTTGAAGACTTACGAACTGTTAGCAGTAT
ACGTTTTTCAGTTATAGGATTTACATATGCAGATGCTCCTAAAAATATGAGGGAAGAATATAAAATAAAT
TGTGAATCATTAGGTTTGATACCTAAAGACTCTGATAAAATAGAAGTTGGTGTAGAATATTATGACAGTC
TATTGAATGATTAA
>ref|NC_013316.1|:236834-237856 putative cell wall hydrolase [Clostridium difficile R20291]
GTGAAGAAAAAGATATTAATACCAGTATTTGCATCAGTTATGGCATTATCAGTAAGTTCAATTGTAAATG
CAGATGAAGTAAATGATTCATCTCAAAATAAGGATGATAAAACAAATACTGAATTAAATTTAGGTGAATA
TAAAGAAGTAAAATATAAAGTTGCAAAAATAAAAGATGGAGTAGCTATAAAGATAAGAGAAGAAGGTCAA
GTTCAAAACATAGCTTATTCTGGAGATGAATTTACGGTTTTAGGAACTCAAGGAGAATGGGTTAAGGTTA
AAGTTGAAGATGGCGAAGGTTGGTTAGCTACTAGATATGTAGATATATCTGAAGGTGTAGGATATACTAA
CGCTGATAAAGTAAACTTAAGAAAAGATAAGAGTGAAAGTTCAGAAGTAATTGAAGAGCTGGAAAAAGGA
AGTTCTTTATTGGTTTTGGAGGATAATGGAGATTGGTTAAAAGTTAAAGATGGGGAAACAGAAGGATATG
TAAAATCATCTTATATATCTGATAAAGCTCCTGTAATAGAAGAGCCACAAGTAAACCCAAGTATTGACCA
AAATGTAGATTCTACAAATAATAATCAACAAAACAATGCAAATACTAATCAACAAAATAATAATTCAAAT
GTGCCAACAGCTAACTCTAATGCAGTTCAAGCTGTACTTAACTTGGCATATTCTAAGCAAGGTTGTCCAT
ATGTTTGGGGAGCAGAAGGACCAAACACTTTTGACTGTTCTGGATTTACACAATATGTGTATAGAAATGC
AGTAGGAAAGAATATACCAAGAACATCTAAAGCACAATCTAAATATGGACAAACTGTAAGTAAAGCAAAT
TTACAACCAGGAGACTTAGTATTCTTCACAACTAATGGTTCTGGTTCTGTTAGTCATGTTGGAATATATG
TAGGTGGGGGTAATATGATACATTCACCATCAACAGGAAAAACAGTTAGTGTAACTAGTATAAATTCATC
ATACTATACAGCAAGATTTGTTACAGCAAAAAGAATATTATAA
>ref|NC_013316.1|:238152-239072 aspartate carbamoyltransferase catalytic chain [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAAATCAAGAAATTTAATCCAACCAGAAGACTTTTCAATAGAAGAAATAGATGAAATATTAGAAT
TAGCTCAAAAAATAATTGACAATCCGTCAAAATATTCTCGTATATGTGAAGGAAAACTATTAGCTACATT
ATTTTATGAACCATCAACAAGAACAAGATTAAGCTTTGAATCTGCTATGAACAGATTAGGAGGACGTGTA
GTAGGCTTTTCAGAGCCAAATTCATCCTCTGCATCAAAAGGTGAAACTCTAGGAGATACAATGAGGATAG
TATCTGGTTATGTTGATATAATAGCTATGAGACATCCTCAATCAGGTGCAGCTTCAGAAGCAGCTAGATA
TACGGAAGTGCCATTTATAAATGCAGGAGACGGCAAAAACCAGCATCCAACTCAAACACTTACAGACTTA
CTTACTATAAAATCATTAAAAGGAACTTTAGAAAGCCATACAATAGGATTATGTGGTGATTTAAAATATG
GAAGAACTGTGCATTCTTTGGTTAAGGCTATGGCAAGATATAAAAATACAAAGTTTGTATTTATAGCGCC
TGAAGAGTTAAAAATGCCAGATTATATAAAAGAAGCTATAAAGGGACATGCATATTATGAAACTAATAAT
TTGGATGATGTTATAGGAAGCTTGGATGTTTTATATATGACTAGAGTTCAACAAGAAAGGTTTGAAGATA
AATCAGAGTATGAAAGACTTAAAAACTATTATATTTTAAATAAAGCTAAATTAGAAAAGGCATCTAAAGA
TATGTTAGTAATGCATCCATTACCAAGAGTAAATGAAATAGACATAGATGTAGATAGTGATGATAGAGCT
GTATATTTTAAACAAGCTAAATATGGAATGTATGTTAGAATGGCTTTAATAATAAAACTTTTAGGTATAA
ATGAAGACTAA
>ref|NC_013316.1|:239111-239803 dihydroorotate dehydrogenase electron transfer subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAAAATTCTGGAAAATATATATATAGGCGAAGATATGTATAGAATGAAAGTAAAAGGTAATTTTG
AAGGTAAAATGGGACAATTCTATATGTTAAGAGCATGGGATACTTATCCAGTACTTTCAAGACCTATAAG
TATACATGATATAGATGAAGAAGGGATAACTTTTCTTTATAAAGTAGTAGGAGAAGGAACTCAAATTTTG
AGTAACCTAAAGGTAAATGATAATATAAAATTAGAAGGCCCTTATGGTAATGGATATGCTAAGGTTGATG
GAAAGGTAGCTCTAGTAGGAGGAGGAATCGGTGTAGCTCCACTATATTTGGTTGCTAAAAATATAAAAAA
TTGTGATGCATATCTTGGGTTTAGAGAAGATGTTATATTAGAAGATGAATATAAGCAAGTATGTAATAAA
GTCTATACAACAGTAGGAAATACTTTTGTAACAGATATAATTGATGTTGAGAAATATGATTATATATTAA
CATGTGGTCCAACTCCAATGATGGAAAAATTAGTTAAGATGGTAGAAGGTACTAAAACGAGAATTATGGT
ATCTCTTGAAAACCATATGGCTTGTGGAGTAGGTGCCTGTTTAGTATGTACGTGTAAAACTAATGGAGGA
AACAAAAAGACTTGTAAAGATGGTCCAGTGTTCTGGGGAGAGGACGTGATTTTTAATGGGTAA
>ref|NC_013316.1|:239850-240698 dihydroorotate dehydrogenase, catalytic subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGGCGTCTGGAACTTTTGGATTTGGAAAAGAATATAATGAGATTTATGATATACAAAAACTTGGTGGTA
TAAGTAGCAAGGGTCTTACTTTAAATAAAAAACCTGGTAACAATGGTATGAGAGTTCATGAGACACCATC
CGGTATGATGAATAGTGTTGGGCTTGAAAACCCTGGAGTTCAAGGATTTATAGACTATGAATTACCTTTT
TTTAGTAAACTAGACTTAGTCAGAATAGCTAATGTTGGAGGTGGGACATTAGAAGACTACTTATTAGGGG
TTCAAATGTTAAATGACAAGCCTATAGACATTATTGAATTAAATATATCTTGCCCAAATGTCAAAGCTGG
TGGAATGGCTTTTGGTATAAAAAATGAAGTGGCAAGAGAAGTTGTTCGTGAGGTAAGAAACATAACGAAA
CTGCCTTTAGTAATAAAATTATCACCCAATGCAGAAGATATTGTAGGAATGGCAAAAGTTTGTGAAGAAG
AAGGTGCTGATGGAGTTTCATTAGTTAATACTTTTAAAGCAATGGCAATTGATATAAAAAATAGAAGACC
AGTATTTGAAAATGTATATGCTGGATTATCTGGACCAGCTATAAAACCTATAGCTTTGAGAATGGTACAT
GAAGTGTGTAAAAATGTAAATATACCTGTAATGGGAATGGGCGGAATAACTAAAGCCACAGATGCTATAG
AGTTTATAATGGCAGGAGCTACTTGTATCCAAGTTGGAACTGCAAATTTTATGAATCCTAGAATAGGTAT
TGAAATAATAGATGGGATTAATGAATTTATGGATAGAGAAGGAATAAAAAGTTTAGACGAAATAAGAGGA
ATTATATAA
>ref|NC_013316.1|:240783-241367 orotate phosphoribosyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAAGTAGATGTAGTGGATATATTAAAGAAAAGTGATGCATTGTTGGAGGGACATTTTTTATTAT
CTTCAGGAAAACACAGTAATAGATACGTACAATGTGCAAAAGTATTAAGATTTCCAGAATATGCTGCTGA
GGTATTAAGTACAGTTGTTGAACAAATAAAAGACTTAGATATAGACTTAGTAGTAGGACCAGCTATGGGT
GGAGTAATAGTTTCTTATGAGTTAGGAAGACAATTAGGAAAAGAAGCTGTATTTACTGAGAGAAAAGACA
ATACAATGGAGTTAAGAAGAGGATTTGAAGTTAAAAAAGGAGCAAAGATAATAATTGCTGAAGACGTTGT
AACTACTGGTAAATCAACTATGGAGACAAAAAGAGTATTAGAAGCCTTAGGTGGAGAAGTTGTAGGTGTT
GCATGTATAGCAGATAGAACTAATCATGATATAGGTATGCCTATATATAGTGCTATAAAACTTGATATTC
AAGTTTATGAATCTGATGAGTGTCCTTTATGTAAGGAAGGAAAATTACCAGTTGTTAAGCCTGGAAGTAG
AGAGTTCAAGGAATTAGGGATGTAA
>ref|NC_013316.1|:241582-242508 putative ketopantoate reductase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATCAATTAAATGAAAATCATAAAAAGGTTGTATTTTTTGGAGTAGGTGCTGTAGGAGCTACTT
TTGCAGAACAATTTTTTAACTCTAAATATGATTTTAAAATTCTTTGTGATAATGAAAGAAAGAAAAGATA
TTTAGAAGAAGGATTTATAATAAATGGAAAAAGGTATGATTTTAATTATGTAACTAAAGATGAGTATAAA
CAAGAGGCTGATTTTATAATTATAGGTCTAAAATATAATAATTTAAAAGAAAATATAAAAGAATTAGATG
GATTAGTTGGAAAAAATACAGTTATAATGTCTCTGCTAAATGGAGTTGATAGCGAAGAGATAATAGGAGA
AAGATTTGGAATTGGAAAAATGGTATATTCATATGTTACCAATATAGATGCAAAGAAAATCAATAATAAT
ATTATACACACTACTAATGGGATAATTGTATTTGGTAACAAAGATAATAGTGAAGATAGAAAAACTAATA
TAATAACTGAAGTCTTTGATGATGTAAATATAGAATATATTTTATCAAAAGATATTCAACGAGATATGTG
GTGGAAGTACATGGTTAATATTGGTGTAAATCAAACTTCAGCTATACTTGGTGCACCTTATGGAGTTTTT
CAGAGTTCTGAGCATTTAAGAGAATTAGCAAAATCTGCAATGAGGGAAGTTGTTGCTATAGCACAAGCAA
AAGACATATCTCTTACAGAAGATGATGTTGAAAATTCATTACATAGAATACTAGAACATTCAAAAGAAGG
AAGAACATCAATGCTTCAAGACGTGGAAGCTCATAGACCTACAGAAGTAGATATGTTTTCTAAGAATATC
TGCAAACTTGGAAAAAAATATAGCATACCTACTCCTATAAATCAGACTTTATTTTATATGATAAAAGTAA
TTGAAAGTAGATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c243450-242560 LysR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
TTGTTTGAAGAATTAAAAACATTTGTAGCTGTTGTTGAATACAAAAACTTTACTAAAGCTGGGGAATACT
TAAATCTATCACAACCAAGTGTAAGTAAACACATAAAAAATCTAGAGAATTATTTTAAAGTTGTGCTTAT
AAACAGGTCTATTAAACAAAAAACCATTTTTATAACAGAAAGTGGACAAATATTGTACAAAAGAGCTAAA
GAAATATTAAATCTTTTAAATATTACTTATCATGATGTAAGCCAAGTTTCAGATGCTATAACTGGTCACT
TAAAGATTGGTGCAAGTTTAACTATTGGAGAATATATTCTACCAAATTTTTTAGCATTATTTTCTCAAAA
GTATCCTGACATATATGTAGAAGTTTTTATAAAAAATACATCAATCGTATCTTCTCATGTTAAGGATTAT
ATTTTAGACATTGGTCTTATTGAAGGCACTTGCTCTTCCCCTTCATTTATTCAAGAATATTTTTTTGAAG
ATAAGATGGTTTTAGCACTTCCATACAATAGTCATTTATTAAAAGATTTTAGTTTTGATAAACTTCAAGA
CCAAAAATGGATAGTCAGGGAGGATGGTTCTGGAACCAGAGACTATTTAGATATGTTTTTAAGTGTTAAA
GAAATTATTCCAAAAAGTATGATGGTTTTTGGAAGTAATTATGCTGTCAAAGAATCTGTTAGAAATAATT
TAGGAATTACAATAGTTTCTAATCTAGTGACAAGCTTACCTGTTTTAAACAATGAGCTGTCTGTCATAGA
GCTTGGAAGCAGCTACAACAGACATTTCTCATATATATTTCCAAAAGATATAACTTTGTCAAAAGCAGCA
ACTATTTTCATTGAAGAGTTAAAAATATTTAGTAACTTAAATAGTATATAA
>ref|NC_013316.1|:243638-244669 hypothetical protein CDR20291_0191 [Clostridium difficile R20291]
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TGTTAGTAGGTTATATTAGTATATTTATTTCTATTTTAATTCCTAAGGTAGGGGCAGCATCAATTTCTAT
ATTTTTAGGTATGTTTGTAGGAAACCTATTTTTAAATCAAAAGGTATTTCAAAAAGGTTATAAATTTTCA
GAGACAGATTTGTTATCATATTCAATAGTACTATTAGGGGCAACACTCAGTGTATCTACCTTAATAGACT
TAAAAGTTTCAGGAATTTTATTTATAATATTGCAAATGACAATAACAATAATAGCTGCACTTTATATAGG
TAAAAAACTAGGATTTGAAGAAAACTTTAGATTTCTAATGGCAAGTGGAAATGCAGTATGTGGTTCTTCT
GCCATAGGAGCAATAGTTCCAGTGGTTAATGCGACAGATAAAGAAAAGGGAATTGCAGTAACTATTGTAA
ATGTTACTGGTATATTCCTTATGTTTTTACTTCCAATAATATCTCAATTTTTATATAGCCATGAACTTGT
AAAAACTTCAGCAATGATAGGTGGAACTTTGCAATCAATTGGTCAGGTTGTAGCAAGTGGAGCAATTGTT
GGAGAAAATGTAAAAGATTTGGCTACTATTTTTAAGATAGTAAGAGTAATATTTCTAGTTGTTGTTGTAT
TAGTATTTGGACATATGAAAAATCAGTCTAATAGGGAAATCCTTGAAGAAGAAAAGGATGAGATAAAAAA
GAAAAAAGTAACTATACCATGGTATGTAATTGGATTCTTTATAACTTGTGCACTTTTTTCAATGAACATT
ATACCAAAAGAAGTATCTGTGTTGTGCAAAGAAATAAGTAACAAACTAGAAATAATAGCTTTAGCAGCAA
TTGGATTAAAAGTTAATGTAAAAGATTTAGTGAAACAAGGGAAAGAAGTTTCTTTATATGGTTTATTTGT
AGGTACAGTACAAGTTGTATCAGCTGTAGTTTTAATAAAAATATTTATATAG
>ref|NC_013316.1|:244963-245838 putative DNA glycosylase (DNA repair protein) [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGTTTATGAAAAAGGTAATGGAGTTATACTAGAAGGAGTAACAGATTTTGACCCAGTACATATAT
TTGAGTGTGGTCAATGTTTTAGATGGCACAAACAAGAAGATGGCTCATACACTGGAGTTGCAAGGGGGAG
AATATTAAATGTCAAAAAAGAGAATGATAAAATATATTTAAATAATACGAATTTAAAGGAGTTTAACAGC
ATTTGGTATAATTACTTTGATTTAGGAACTGATTATACAGAAATAAAGAATAAGCTAAAAAATATGGATG
AATATTTGAATAAGGCTACTGAATTTGGATGGGGAATAAGAATATTAAGACAAGATGGATGGGAAATGCT
TATATCATTTATAATTTCCTCTAATAATAGAATTCCTATGATACAAAGAGCGATAGAAAATTTATCAAGA
AAGTTTGGTAAGTATATAGGTGAATATGAAGGTAATGAATACTATGCATTCCCAACACCAGAAGAACTAA
ATAAGGCCTCACAAGAGGAAATAAGAGCATGTCAAACAGGTTTTAGAGATAAGTACATAAAAAGTACTAC
ACAGGCAGTTATAGAGAATAATGATGAGGTATCTGAATATACAAATTTAAGTACAGAGGATTGTAGAAAA
GAGCTTTTAAAATTTAATGGAGTAGGACCAAAAGTATGTGATTGTATTGCATTATTTGGTATGCAAAAAT
ATGATTCTTTTCCAGTTGATGTTTGGGTTAAGAGAGTTATGCAAGAATTTTATATAGATGAAGACATGAG
TTTACCTAAAATGAGAACTTATGGAATCGATAAATTTAAAGAAATGTCTGGATTTGCTCAACAGTACTTA
TTTTACTATGCAAGAGAACTCGGTATAGGAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:245856-247346 cardiolipin synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAGTAATAGGAACAATATTTCTGTTCTATTTAATTATATCATATCTAGCTGGAGCCATAATTTCTG
TGATTATATTGCTTGAAAATAGAGACCCTGCAAAAACAATGTCTTGGCTATTGATGTTTATTATATTTCC
AGGTGTAGGTTTAATGATATATGCTATTTCAGGTAGAAATATTAGAAAAAGAAAATTATTTAAGACTCAA
AAACTAGCTAATAATATAAAAGAAAAGAAACTATTTGATACATTAGAAAAGATAACAGAAATAGTTGAAT
TAGAAAAAGAATCTATAAAACAAAATAAGCTTTTAAGAGATGAAGAGGATGGTAGTTATAGAAAAAGGGT
AATAAATATGTTGTTAAAGACTGGTATGTTTCCCTTTACTAAAAATAATAAAGTGGATGTATTTGTAGAT
GGAAATGAAAAGTTTAAAAGACTTATAGAAGATATAAGAGAAGCTAAAGACCATATTCATTTAGAGTACT
TTATCATCAAAGATAGTGAAATAGGTAGGGTGTTAAAAGAAGAACTTATAAAAAAGGCTAAAGAAGGCAT
TAAGATAAGAATTTTATATGATGATGTAGGATGCTGGAGATTTTGGTTTAATAGAAAATTTTTCCGAGAA
ATGAGGGAAGTAGGTATAGAAATTGCAGCATTTTTACCTACAAAATTTCCTATAATAGGAGGGAAATTAA
ACTATAGAAATCACAGAAAAATTGTTGTTATTGATGGAATAATTGGATATACAGGTGGAATAAATATAGG
AGATGAATATTTAGGCAAAAATGATAAGTTTGGATATTGGAGAGATACTCATATTAGGATTAAGGGTATT
TCTGTATACATGCTTCAAATGACATTTCTGATTGATTGGTATTATACGACAAAAGAAGTATTAGTGACTA
AAAATTATTTCCCAAGTGTAGGGAATGTTGGTGAAAGTATGATACAAGTTGTTGCGAGTGGTCCAGACAG
TGACTGGGAAGATATTCATTATGCTTATTTTTCTGCAATATGTCAGGCTAGAAAAAATGTTTATATAGAA
ACTCCATATTTTATTCCAGATGAAAGTCTACTAAAAGCTATAAAGAGTGCTGCTCTTAGTGGAGTTGATG
TGAGAATAATATTTCCTAAAATTGCAGACCACAAGATAGTAAATATAGCATCTTATTCATATTTTGAAGA
AATATTAAGAGCAGGTGGTAAAGTTTATTTATATAATAAAGGATTTATACATTCTAAAGTCGTAATAATA
GATGATAAAATTGCTTCTGCAGGTACAGCTAATATGGATTTAAGAAGTTTTATGCTTAACTTTGAGGTAA
ATGCATTTATCTATGATGAAGAAGTTATTAGGGTAATGACAGATGATTTCTTTGAGGATTTAAGTCACTG
TGAAGAACTTAATTTGGAGGTATTTAAGAATAGAAATATCATACAAAAAATCAAAGAATCTGTAGCAAGA
TTATTTTCACCAATATTATAA
>ref|NC_013316.1|:247539-247823 10 kDa chaperonin [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATAAGACCATTAGCTGACAGAGTAGTAATTAAAAAAGTAGAAGCAGAAGAAAAAACTGCAAGTG
GAATAGTTTTACCAGGAGCAGCTAAAGAGCAACCTCAAATAGCTGAAGTTGTAGAAGTTGGACCAGGTGG
AATAGTTGAAGGGAAAGAAATAAAAATGGAATTGACAGTGGGAGATAAGGTTATATTCCAAAAATATTCT
GGAACAGAAGTTAAGATAGAAGGACAAGAATACACAATACTAAGACAGAGTGATGTATTAGCTGTTATTG
AATAA
>ref|NC_013316.1|:247856-249484 60 kDa chaperonin [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTAAAGAAATTAAATTTTCAGAGGAAACAAGAAGAGCTTTAGAAGCTGGTGTAAATAAATTAGCAG
ATACAGTAAAAGTAACATTAGGACCTAAAGGAAGAAATGTTATATTAGATAAAAAATTTGGTTCTCCACT
TATAACTAATGATGGAGTAACTATAGCAAAAGAGATAGAACTAGAAGATAGATTTGAAAATATGGGTGCT
CAATTAGTTAAAGAAGTAGCAACTAAAACTAATGATGTAGCTGGAGATGGTACTACAACTGCTACAGTTT
TAGCACAAGCTATAATAAGAGAAGGTTTAAAGAATGTAACAGCAGGGGCTAACCCAATACTTTTAAGAAA
AGGAATACAAAAAGCAGTAATAGTAGCGGTAGAAGAATTAAAAAATCAATCAAGAATAGTAGAAACACAA
GAGGCTATATCTCAAGTTGCTTCTATATCTGCTGGTGATGAAGAAGTTGGAAAATTAATAGCAGAAGCTA
TGGAAATAGTAGGTAAAGATGGAGTTATAACTGTTGAAGAGTCTCAAACTATGAATACTGAATTAGATGC
TGTTGAAGGTATGCAGTTTGATAGAGGATTTGTTTCTGCATATATGGTTACAGATGTAGATAAAATGGAA
GCAGTTTTAAATGACCCATATATATTAATTACTGATAAGAAAATATCTAACATACAAGAATTATTACCAG
TTCTTGAACAAATAGTTCAACAAGGTAAAAAGTTATTGATAATAGCTGAAGATGTAGAAGGTGAAGCATT
ATCTACATTAGTAGTAAATAAATTAAGAGGAACATTTGATGTAGTAGCAGTTAAAGCTCCAGGCTTTGGA
GATAGAAGAAAAGAAATGCTTCAAGATATAGCAATACTTACAGGTGCTCAAGTAATATCAGAAGAATTAG
GTTATGATTTAAAAGAAGCTGATTTATCTATGCTAGGTAGAGCTTCATCTGTTAAGGTAACTAAAGAAAG
TACTACAATAGTAGATGGTTCTGGAGATAAAAAAGCTATAGAAGATAGAGTAACTCAAATTAAACATCAA
GTAGAGCAAACTACTTCAGATTTTGATAGAGAGAAATTAATGGAAAGATTAGCTAAACTTGCTGGAGGAG
TAGCTGTTGTAAAAGTTGGAGCTGCTACAGAAGTAGAGTTAAAAGAAAGAAAATTAAGAATAGAAGATGC
TCTTAATGCAACTAGAGCAGCTGTAGAAGAAGGAATAGTAGCTGGTGGAGGAACTGCTTTTGTTAGTGTT
ATACCAGCAATAGGAACACTAATTGAGAGTTTAGAAGGAGAAGTTAAACTAGGTGCTCAAATAGTTAAAA
AAGCGTTAGAAGAGCCATTAAGACAAATAGCTATAAATGCTGGTCTTGAAGGTGCTGTAATTGTGCAAAA
TGTTGTTAATTCTGAAGCAGAAACTGGATTTGACGCATTGAATGAAAAATATGTAAATATGATAGAAGCT
GGTATAGTTGACCCAACTAAAGTTAGTAGAAGTGCTTTACAAAATGCTGCATCAATAGCAAGTACTTTCT
TAACTACTGAAGCTGCTGTTGCTGACCTTCCTGAAAAAGAAGATGCAGGAATGCCAGGAATGGGTGGCGG
AATGCCTGGTATGATGTAA
>ref|NC_013316.1|:249746-250486 hypothetical protein CDR20291_0196 [Clostridium difficile R20291]
ATGGACTTAAGAAAATTACTTGAAGAAGTTAAAAATGAAAATATTGATATAGATTTTGCGTTAGAAAAGT
TAAAAGATTTACCTTATGAAGACCTTGGATATGCAAATATAGACCATCATAGAGAATTAAGAAATGGGTA
TCCGGAAGTTATTTATTGTGAAGGTAAGAGTGATGAGCATATTTTAGGGATTATTGATAAAATGAATCAA
AAAAGTTCTAACATATTGGGGACAAGGTGCAGAAAAGAAACTTTTCTGAAAATTAAAGAAATCTATAATC
ATGCTGAGTACGAAGAGGCGTCTAAAATTCTTAAGATTCAAAATCATGATATAGAGAATATAGGAAAAGG
TAAAATTGTGATTGCTACAGGGGGAACTTCTGATATACCAGTAGCAGACGAAGCTTATCATACAGCTAAG
TTTTTAGGTAATGATGTTGATAGAATATATGATGTTGGAGTGGCAGGTATACATAGGCTTTTAAATAAAA
GACATAAAATAGATAGTGCTAGAGTAATAGTAGCCGTTGCAGGTATGGAAGGTGCTCTTGCAAGTGTAAT
TGGTGGACTGGTTGATGTTCCAGTAATAGCTGTTCCAACTTCTGTTGGATATGGAGCAAATTTTGGAGGA
TTAGCAGCATTACTAGCTATGTTAAATAGCTGTGCATCTGGAATATCTGTTGTAAATATTGATAATGGAT
TTGGAGCAGGATATTTAGCATCAATGATAAATAAACTGTAA
>ref|NC_013316.1|:252135-253670 GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] [Clostridium difficile R20291]
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GAGAAAACAACGTATATTGTGAAATACTTCCATGTACTGCAAGCATAGAAAGAATAAAAGAAAAAAATCC
TAAAGGGATAATATTTACAGGCGGTCCAAATAGTGCGTATTTAGAAGATTCTCCAACAATATCAAAAGAA
ATATTTGAACTAGGAGTACCAATACTTGGAATATGCTATGGTATTCAAATAATGTCTCATGTATTGGGTG
GAGTTGTAAGAAAAGGTAATAAACAAGAAAAGGAATATGGAAAAACATCTATAACTTATGGAAAATCATC
ATTATTTGAAGGAATAACTACAAATAGTGTATGGATGAGTCATACAGATTTAATAGAAAAAGTTCCAGAA
GGATTTACTATAGTTGCAAATACTAATGATTGTCCAGTAGCAGCTATGGAAAATGTAGAACGAAACCTAT
ATGGAGTTCAATTCCATCCAGAGGTAGAACACTGTTTGGAAGGGGACAAGATACTTACAAACTTCTTATA
TAATATTTGTAAAGTAAAAGGTGACTGGACTACAGATTCATTCATAGAAGATAAAATAAAAGAATTAAAA
GAAAAAATAGGCGATAAAAAAGCTTTATGTGCTTTAAGTGGAGGAGTTGATTCTTCTGTTGCTGCAGTTC
TTATTCATAAAGCAATTGGGGACAACTTAACTTGTATATTTGTTGACCATGGTTTACTTAGAAAAAATGA
AGGAAATGATGTAGAAAGAATATTTAGAGAGAAATTTGATATAAATTTAATAAGAGTTAATGCAGAAGAT
AGATTCTTATCTAAATTAAAAGGAGTTTCCGAACCAGAAGCTAAGAGAAAAATAATAGGTGAAGAATTTA
TAAGAGTATTTGAAGAAGAATCAAATAAATTAGGAAAAATGGATTTCTTAGTACAAGGAACAATCTATCC
AGATGTTATAGAAAGTGGACATGGAAATGCTGCTACTATAAAGTCTCATCATAATGTTGGTGGAATCCCA
GAAGATGTAGACTTCCAAGAAATTGTAGAACCATTAAGAGAGTTATTTAAGGATGAAGTTAGAAAAATAG
GATTAGAGCTTGGTATAGAAGAAGGATTAATATTTAGACATCCTTTCCCAGGACCAGGTCTAGGAATAAG
AGTTATAGGTGATGTAACTAAAGAAAAATGTGATATATTAAGAGAAGCTGATGCTGTTTATATGGACGAG
CTTAGAAAAGCAGGTTTATACAGAGAAATATGGCAAGCTTTTGCAACATTACCAGATGTTAAGACTGTTG
GAGTCATGGGTGATGAAAGAACATATGCTTATTTAGTTGGTTTAAGAGCAGTTACTTCTTCTGATGGAAT
GACTTCTGACTGGTATAAGATGCCTTATGATGTATTAGAAAGAATTTCTAATAGAATAATAAATGAAGTT
GATGGAGTAAATAGAGTAGTTTATGATATAACTTCTAAACCTCCTGGAACTATTGAATGGGAATAA
>ref|NC_013316.1|:254209-255639 putative membrane-associated nucleotidase [Clostridium difficile R20291]
ATGATACTAAATCAAATATTTATAGAAGATGGAGGGATTATGAGAAATAAAATAATTATAGGAATTACTT
TTTCACTTGTATTACTAATGTCTGGATGTGCTTCAAAACAAACAGCAGAAATAAACGTATTAGCAACTAC
TGATTTACATGGAGTTATACCTTATGAGTTAACTTCTTATGTAAAAGAAGAAAGAAAAAAAGATAAAAAT
CTAACTTTAGTAGATGCAGGAGATTTTTTTGATAGTGGAGAAGTGTTTGGTTCTAGCATGGATAGTTATT
TTAGTGCTAGATATAAAGATGGTGATAATAACACTGAAAGTTATATTGAGACGCCTATTTCAAAAGATAT
GAAAGAGGTAGGTTATGATGTTGCAGTTCTTGGGAATCATGAATTTATATCCAACAATAAATTTTATCTA
GATAATATGATATCTGATTTTGAGAAACAAAAAATAAATATTTTATCGGCAAATACGTATAAAAAAAATG
GAGATAGTTATACAAAACCATACATAATAAAAAATATTAATACACCTGAAGGAAACGTAAAACTAGGAAT
TTTAGGGCTTACTATAAAAGAAGTTGGTGAGAGGAAACAGTGGAAAGATGGAAAACTTGTTGACTCTAAG
TCTTTAGAACTAAAAGACCAAGAGGGCTACAATGGTGAATTGTATATGAATGATTTAGTAGAAGATGCTA
AAAAGTGGGTTGGTATAATGGAAAAAGAGAAGCCTGACATTATAGTTGCTGTGGCACATACAGGTGAGAA
ACCTAAGAAACCTAGAAACCCAGGAAATAGAATACAAGACTTAGCTCAACAAGTTGATGGAATTGATGCT
ATAGTTGCAGGTCATAATCATGTTCAAATTGAGCAACATGATTATAAAAATAAATCAGGAGAAAATGTTA
TAGTTACTGAGCCAGGAAAGCATGGGGAATATATTTCTAAGATTAATTTTAAATTAGAAAAAAACAATGA
TAAATGGAATATAGTTGACAAATCTAGTAAATTAATTAAATTTGAAAAAAATCAAGAAAGTGATAAATTT
GGAGAATTTATTTCTTCAATTAATAAAGTAAGTAAAGATAAGAAAGAAATAAGATTATCAGAAGTAAAGA
CTCCTGAATGGGATAAAATATATGTTTTTAAATCTGGAACATCTGCAGATGATATATATAAAACAATAGG
ATATAAATGGAGAAATATATCATCTCCAAAGGGTGATGACATGGTGCAGATTGTTGTAATGAATAATAAT
AAGCCTGTTAGCTATATATATGGTGAAGCTGAAGTTATGCCAATTAATATAAAATGTGATGAATCAGAGT
ATAAAAATAATGTTGTAACTATTTATCCTAATAAAAATGATAAATTTAAAATTGAAAAAGGTAAGCAAGA
ATATAGTATTAATTTAAAACATATACAATAG
>ref|NC_013316.1|:c256662-255787 hypothetical protein CDR20291_0200 [Clostridium difficile R20291]
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AAAAATTACATATCACACAATCTGCTGTATCTCATGCTATAGCTGAACTTGAACAACAAGCTGAAACATC
ACTATTTGACAGATTACCACGAGGGGTATGTCTTACTCGCTGTGGCATTTCTCTTTTAGATGAAGCACGT
AGTATCTTAACTGCTTGTCGCAATTTAGACAAAAAAATCAGTCGTTTAGAAGAATGTACACCTATAAACA
TTGTTTCTAGCATTACAATTGCCTCTTTTTTACTTCCACCAATTTTAAGTCGACTAAAAAATTCATTTCC
ATCTCTTAAAGTGAATGTACGTGTCGAAAGTGCTAATTCAGCTATGGATATTTTAAAAAGTGGAGAAGCT
GATATATGTTTTTGGGAAGGTATAGAACCACAGGGGGCATTCCGTACAATTTTATTAGGTTCCTATAAGT
TATGTGTTGCATGTGCTCCAACTTTTCCTTTATCTGAACAAACCTTATCTCTACGACAGTTATGCACGTT
TCCGTTATTGTTACGTGAACAAGGAAGTGCTATTCGCGATACTTTGGACAGTGTATTATCTCTTTCAAAC
CAAAAAGCTTATCCTGTTTGGGAAAGTGTTAATTCTTTTGCACTTATTAAAGCTGCAGAAGCAGGGTTAG
GTATAACCATTTTGCCAGAAAATTTATTATTAGATTCACTCTTACATAAAAAATTGCGATTGATTGAATT
AGATGAGATAGATATGGAAAATAAAATGTTAGCAATATTACATAAGGATAAAAATATTACACAACCTTTG
GAAATAATATTGGATAATATAAGCAATGTACTTTAA
>ref|NC_013316.1|:256761-257345 hypothetical protein CDR20291_0201 [Clostridium difficile R20291]
GTGAAAAGAAGGAGGAATATTTTGAATCAAAGCAGAAAAATATATTTTTGGCTTTTAATTATTAACTTGT
TTATTAGCACATTCACTTTTGGCGGAGGGTATGTAGTTGTACCTATGATTAGACGTTATTTTGTAAATCA
AAAGCAATTCTTTACAGAAGATGATTTGATGAGTATGGCAGCAGTTGCACAATCAACTCCTGGAGCTATT
GCAATTAATTTATCTGCTTTGGCAGGTTATCGAGTAGCTGGTACTTTAGGGGTTGTCATTAGTTGTACAG
CAGCTATAATACCTCCACTCGTTATTCTTGGATTAGTATCAGCATTTTACACCACTTTTATATCTAATGC
CATTGTAACTGCAGTATTAAAAGGAATGCAAGCTGGTGTTGCTGCACTAATTGTGGATTTGATTATTGAC
ATGTGCTCTATGATATTAAAACAACGTTCTTTGTTTTTATCAACTATGATACCTATTGCTTTCTTTGCAA
ACTTTGTGATGAGTATAAATGTAATTTTTATATTATCTGTTTGCTGTTTTGTATGTGTAATGCAAGTTTT
CTATAAGAAGAGGGAAAATAAATGA
>ref|NC_013316.1|:257471-257908 putative chromate transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTACAGATATTATAACTATTTCACAAATGACACCAGGGCCACTGGCTGTTAATACTTCTACTTTTG
TTGGACTTCAAATTGGAGGGTTTTGGGGAGCAGTTGCAGCCACTTTAGGTTGTGTATTATGTGGTGTAGT
AATATCTCTATTTTTATATAATTTTTTTCAAAAGCATCAGAACTCTACTTATATATTTGAAATATTAAAT
GGTCTAAAATCAGCTTCATTAGGTTTAATTATCTCAGCTGCGGCTACAATTATAATCCTTGCATTATTTG
GGACGAATAAAGTGTACTTCAATTCTATATTTGAGATGCTAAACTGGACTGCACTAATAATCTTTTTTGT
TATACTACTGATAGTACGTAAGTGGAAAATTAATCCTATTGTGATTATAATAATAAGTGGTATACTAGGA
ATATTTTTTTATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c258273-258037 hypothetical protein CDR20291_0203 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAGAATGCTTTATTGCAGAAGATAGTAAGATAAAAGATGGAGTCAACATACCTACTCTTGTCTTTA
AAACACTTCATGATAGATATTTTAAAACCCAATATTTTGATAGCTATTATAATTCACTAAAATGTAAAAA
GAAACTTGTTGAAATTAATAATGTTCATAATAGTTACTATATAGATAGTGAGAAATTTTGCCAAGAAGCT
TATGATTGGTTTGTAGAAAACCAGTGA
>ref|NC_013316.1|:c262011-258583 putative DNA repair protein [Clostridium difficile R20291]
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ATTTACCAAAGACTCCAATTGAGTTATTAAAAGTGGTTCAAAGCCTAGTAATTCATGGAGACCAAGGAAA
ATTATATGGTATATCCTTTAATAAGCAACAATCTGATGAGGAATTGCTTCGTACAATTCCTCAAATGTTA
AAAAGAATATTTGAAATAAATTCTAACCCACTAACTATTCCAAGAAACCCAAAACAAAGGCTTGTTGGAA
TGTGCAGAGATTATTCTTTACTTCTTGTATCGCTCCTAAGATATCGAGGTTTTGAGGCTAGAATGAGAGC
AGGTTTTGCTAATTATTTTGAAAATGAGCTTACTTATGAAGACCACTGGCTTGTAGAATACTATGATACT
CTAACAAAGAGATGGATAAGAATAGATGCACAAATAGATGACATACAAAAAAATTATTTTCAAATTAATT
TTGACACTCATGATGTCGGAAAAACAGATGGTTTTTTAACTGGTTCAGAAGCCTGGATAAGATGTCGACA
AGGACATGCTCATCCAGATGACTTTGGATATAATAAAAATTGGAAAGGTTGGCATTCTGTAAAGGGTAAT
CTTCTACATGACTTTAATAATATGATTGGTTTAGAATTGCTTCCATGGGATTTATGGACAGAATTAAGTT
CCAAAAAATACAATCAATTAACAAGAGCAGAAAAAAATTTATTAGATGAAATGGCAGAGATATTATCAAG
CGGAAATATAAAAATAGAAGACCTTAATTTGTTAATAGAAAAATTGCCTGAAGATTATTTGAAATCAATC
TTTTCTCAGTTAAAAATATTAGGTATTTCGGAAATAAAAGAATTAGGCAATCCTCTTGAACTAGAAAAGA
AATTCAAATTTGCAAAAGCAATAAATAAATCAATTAAAAATTCACTTTGTCATAATAAAAGCTCTATCTA
TCTAAAAGGAGGAAGGCAAAACAATTTAAAGGATGTTGAGGTTACAATTCCAAAAAATCAAATAACTGTT
ATTACAGGTGTAAGTGGTAGTGGAAAATCTTCTTTAGCTTTCGATACGATTTATGAAGAAGGAAAAAGAC
GTTATTTTGAAAATCTAGGTAATGGAGCAAAACTTTCAGAACAGCTTCAAAAACCGGAATTTGATTTACT
TCAGGGATTAACCCCTACTATAGCTATCGAACAGAAAAAAGGAAGCCAAAATCCTCGTTCTACTGTTGGT
ACTCTTACAAGCATTTGGGATTACTTAAGAATGTTATTTGTATCAATCGGAAAAAGTTACTGTCCATATT
GCAAAACTCCATTAGAAAAAAAGAATAATACAAAAAATTATTGTCCACATTGCCAAACTATTTTTTCTAA
GATAAATACTTCAACCTTCAATGCTAACTCCCATACTGGAGCTTGTCACGATTGTAATGGATTGGGTTTT
ACCTATCAAGTTAATCCTCAATTAATTGTAAAAGACCCAACTATTTCAATATTAGATGGAGCTACTTACT
ATTTTGGAAAATTGAGGGGGAAAAAGCCAAATGGTAATTGGATGGTAGGTGAATTATATGCAATAGCAAA
AGATAAAAATATAGACCTAGATATACCTTGGAATGAATTGCCAAGAGATTTTATAGATGCAATCTTATAT
GGTACAGACGATAAGATATATGAATTTAGCTTTGAATCAAAGGGACGAGAATCAAAGATTAGAAGGCCTG
CTTCAGGAGCAATCAACCACATTCAAAGACTTTTTAGAGAATCTAGTTCTGAAAATAATACCTTGCATCA
ATATATGAACAAAATTCCTTGCAATACATGTGGTGGCGAATTGCTGTGCATTGAGGCTAGATTCACTACA
ATCAAAGGTTATCGCTTCCCTGAACTAACAAAAATGACGATAGAACAGTTATGGAATTGGTTGTGTGAAT
TACCAAATCAACTTCAAAAAAATGAGCTATCTTTGGTAAATGATATCTTAACAGAATTAAAAATTCGAGT
TAGTTATCTATTAAAGGTAGGTCTTAGCTATATATCAACAGATAGAACAGCTCCAACTTTATCTGGAGGA
GAACTGCAGAGAGTACGATTATCAAGTCAGCTAGGAAGTGAATTAGTAGGATTAACCTATATTTTAGACG
AACCATCTATTGGTTTACATCCAAGAGACCATAATCTAATCATCAAAATGATAGAAGAATTAAGAGACAA
GGGTAATACTGTTATAGTAGTGGAACATGATAAGGATACAATACTGTCTGCTGATTATATTATTGATGTA
GGACCAAATGCTGGTACAAAAGGGGGCTTCATCATTGCAGAAGGTACAACCCAAGAAATTATAAAAAATC
CAAATTCTATAACAGGCAAATATTTGAGTACATACAATAAGATAAGTTCACAAAATAAAATTATACCAAG
TAAATGGTTAAGCTTAAAGGGATGCCATGCAAATAACTTAAAAAATATTGATGTAGAAATTCCCTTAAAC
TGTATGTGCTCTATTACAGGTGTTAGTGGTTCTGGTAAGAGTTCTCTTGTATTTCACAGTTTACTTCCTG
CTCTAGAAGAAAAATTGAAACAAAAATCTATCCCAAATAAAAATTATACTGCACTTACTGGATTTGATGC
TATTGACGATTTTATCTTAATGGACCAAACACCTATTGGAAAATCTAGCCGTTCTACACCTGCTACATAT
ATCAATATTTTTGATGAAATTCGTTCTCTATTTACTGAAACTCCACAAGCAAAACAAAAATTATTGGATG
AAAGCTATTTTAGCTTTAATAGCAAAAAGGGGCAATGCCCAAACTGTCAAGGATTAGGTAAAACAAAAAT
TATTCTACAATATATGGCAGACCAATGGGTAACTTGTAATGAATGTCAAGGTAAGAGATATCAAAAAGAA
ATACTGTCTATACAATACAAGGGAAAAACAATTGCAGATATACTTGACATGGAAGTAGCAGAAGCAAAAA
CATTTTTTAGTGATTGCTCTGATATATATAGAAAACTCTCCTTATTAGATGAAGTGGGACTTGGATATCT
AAAGCTTGGACAAAATACATTAGGATTAAGCGGAGGAGAGTCTCAAAGGATAAAATTAGCAAAAGAATTA
GGGACAAAAACTAAAAAACGAATGCTGTACATATTGGATGAGCCTACTACTGGACTTCATTTTAAAGATA
TAGAAAATTTGTTGATTACTTTTAGAAAACTTGTAAATGAACAGCATTCACTTTTAATTATTGAACACAA
TACAGAGGTTATACGTGCTTCTGATTGGATTATCGATATAGGTCCAGACAGTGGAATAAATGGAGGGGAA
ATTGTTGCTTCTGGAACTCCTGATGAAATAAAAATAAATCCAAATAGTATTACTGGACATTTTATATAA
>ref|NC_013316.1|:262330-264564 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTATCAAGGTATAAGAAAAATAGTTTAGTTCTGTCTATAATTTTATGTTCACTTATTATTTCAA
TCCTTGTAATTACTGTTTTTAATACCGTAAAACTACACAATATATCTAATAAACAATCTAAAAACTATTT
AAACGATGTATCTACACAGATTGTAATGAATGTTGATTCTAAAATCAAATTTATTTTATCCGACTTAAGA
ATAATGGCAGATTTTATTAAGCAATATGAAGGTGATAGTCGATATGAGTATTTATCTAAAAGAAAGACTA
GTTATAAGTATTATGATGTTGGAATAATAGATTTAGAAGGTAAAGCTGAGTTTTTAAGTGGAAAAAAGTT
TGACTTAAAGAATACTGCTTCCTATAAAAAAGGAATTGAAGGTAAAGAATACTCAGAAGTAATAGAGTCA
ATGGGTTTTGTTCTTTATAGTGTACCTATATTTAACGATAATCATGAAGTGTCTAGTATTTTAATAGGTG
TATCCAATAAAGAAAGCATGGATGAGATTCTTAATATAGATAGCTTTAATGGAGAAGGAACTATTGAAAT
TATTAATAGTCAGGGAAAAACTCTTTTCATAGGAAAAAATAATGAGTTAATAAAAGACCTTAGCTATAAG
TATAAGGATTCTGCAGATGAACCTTGGGCACAAAAGATGCTTAATGATTTTAAAAATGATAAATCAGGAA
ATATTACAATAACCTCATCAAAAGGTGTACAATGCTTATTAACTTATCATCCAATTACAAGAGGTTTAAA
TGATTGGCATTTTCTTCTCATAGTACCTGAAGATGTTGTACTTGGTGAACTTAATAAGTTAAATTCTTTT
ACAATAATAATGACATTTATAACTACATGTATTATTGGAATTATAACATTAATTTTATATATTATAAGAA
GAAAATATGTAAATCAAATAGAAAATATTGCATATTTAGATAGTATAACAAATGGTATAAATTCAACTAA
GTTTAGTATGCTAGTCAAACCTTTAATTTCAGAATCACCTGATAGTACTTATATGATGATAGCAATGAAT
ATAAAAGATTTTAAGCTAATAAATGATTGTTTCGGTAGTGAAAAAGGAAATATGACACTAAAACATCTTT
ACAATATTTTGTATAAAAACATTGATGAAAATGAAGAATTTGTGTGCCGTCATGATGCAGACCTTTTCTA
TTTGCTTATTAAGAATAGACCAGTGTTAGAAGCCCTGGAGTTATTATATAAAATAGAAGCTGACACAAAT
TATTTTAATAAAAATAGGGAAAATCCATACTTTTTAAGACTATCAGTAGGTATTTACACAATTGAAAATC
ATAATGAAGATTTAATTACAATACAAGACCATGCAAATACAGCAAGAAAAAGCTTTAATAAAACTCATCA
AAGTGATTTTTCTTTTTATAGTGATATAGAAAGAAAACGATTAATATCTGAAAAAGAAATTTCAAATTTA
ATGGAAAAAGCCCTTGAAAATAAAGAATTTTTTATGTGCTTACAACCTAAAATTGATATAAAAAGTGGAA
AAATTAGTGGAGCAGAGTCTCTTGTGCGTTGGAAAAATTCAGAAAAGGGCATAATTTATCCAAGTAATTT
TATTCCTCTTTTCGAAAAAAGTGGATTTATATGTAAGTTAGATTTATATATACTAGAAGAAACATGCAAA
TTGATTTCTAAGTGGATAAAAGAAGGTAAAGAAGTGTTGAGAATTTCTGTTAATGTATCACGTCAACATT
TGAATGATAAATTGTTTTTAGAAAAATATAAGCATATATGCAATAAATACAATGTACCAACATGTCTGAT
AGATTTAGAACTTACCGAATCTATTTTCTTAGAAAATCCAGAAGCTATAGATATAATAGAGGATATTCAT
TCTAATGGATTTAAATGTTCTATAGACGATTTTGGATTTGGGTACTCATCATTAGGGATATTAAAGGATT
TTAAAGTTGATATAATTAAGTTAGACCGTTCATTCTTTGTTAGCAAAAATAATATAGACCGTGGTAAGGT
AGTTATTAAGTCTATTATTGAACTTAGCAAAAGGCTAGGTATGAAAGTAACTGCTGAAGGAATTGAAGAA
TTAGAACAAGTTGAGTTCCTAAAAAATGTAGGATGTGATTATATTCAAGGTTATGTTTTTTCTAAACCAT
TATTAATTTCTGATTTTGAAAATTTTGCATATGAAAATAATAAAATTAAAAATATCCATTATTAA
>ref|NC_013316.1|:264820-266850 putative transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAGTGGGAGAATGTTACTCATCATGAATTTTCTAAAAGGAAAAAATAAGACAAGTTACAAGGATA
TTAGCAAACAACTTAGTATAGAAGAAAGAAAAGTTAGATATGATATAAATAATTTAAATATTGTTTTGCG
TTCATTAAACAAGTCAGTAATACAAAAGATGAACAAAGGTGTGTTAATTATTCCTGATGACTTCCAAGTA
GTATGTATAAATAATAACGAATATGTATTTTCCTTAACTGAGCGAGTATCTATTATGAAAATTATATCAA
TGTTTAAAATAGATAATCTAAACTTAGAAAAATTGAGTAAAGAATTTCAGGTTTCTAGAAGTTCAATTAA
AAATGACCTTAATGTTTTGTCAAGTGAATTAGAAAGAAACCAAATAACTATTACTTATGATAAATCTTTT
AAAATAAGTGGAGAAGAAGACCTTATATATAAGCAAAGATTGAACATATTAAAATCGTATTCTTATCTTT
TTGGTAAGGAAAAATCTGATTTAAGTGTATTTGAGAAGTATTTAGTGAATGTAATTGAAAAAATATTCAA
AGGGATTTATTTGATTGATATATATAATTGGTCTATGAATTTATTATTGCAAATGGGATGGACTTTAAAT
GATGAATCTTTTACATGGTATGTGTCAAACATTTTCCTTTTTACATGGTATATACATTCAGATGAAAAAC
ATCCTTTAGAATCTGCTTCATTAAGTGAGCCATGTTTTGAAAATAAGTTTGACCAAGAATTTGAAACAAT
TATTCAAAAAAAGTTGACTAAGGAACAAATTTTTCTGTTAAAGAGTTTTGTATTTTTTACAAATAAATAT
GCAAGTTTAAACGAGGATATGGATTTGATTAGTACAGAAATTATAGTTCAAGACCTAATTTACAATATGT
CAGAAATATTAGAGATTAGCTTTAAAGAAGATATGATTCTTTATAAAGGATTACTCAATCATATTGCCCC
ATTGATAGAGAGAATCAAGCAGAATATACAGATTTATGAGGAATTACTTCATGTAATACCAGATAAATAT
CAATATGTACTTGAAGCTACTAAGGTTTCTATTCAAAAAAACAGAGTTTTAAGTCAAATAAAGAATGAAA
ATGAAATAATACTTTTGGCAATACATTTCTTAGGAAGTATACATAGAAATGAGAGGAATAACTACAAAAA
TATATTGTTAGTTTGTGGATTTGGATATGGTGTAATTGCTATGTTAAAGGATAGTTTAGTAAATGATTAC
CAGATAAATATAGTAGAGAGTATTCCATCATATAAGTTACAAGATTATAAAGAATGGGAAAGTATTGACT
TCATTATAACAACATCAAAGATAGTAATAGACTTGCCTAAAACAATTATTGAGATAAATCCATTTTTACA
AGAAGAGGATTATTTGAAGTTTGAAGAAAAAGGGATAAAAAGAAAGAACGTCTTAACTAATTATATGTCA
ATAAAAAAAAGGTTGGACTTTTTAGAAGAAGATGCTCAAAAAAGAGTATTAAGTATTATATGTCAAGAAC
TTGGATACAGTGATGAGAGAATATTATTTAGACAACTTAATTTAAGTGATTTAATAGGGATTGATACCAT
AAGGATAATTGATGAAGATATGAAATGGGAAGATGCTGTAAAAATTAGTTCAAACATACTTGCTAATTGT
GATTTTGTATCAGCACAATATGCTGAGAATATTATAGATATTTTAAAAAATGTGGGTTTTTATGCTGTAA
AAGATAACGAATTTGCTTTACTACATGGCAATGATAGTTCATTAGTCAAAGTAAGTTCGATAAGTTTATT
AATATGTAAAGAAGCAGTTAGTTTTGGAGATAAAAAGGTTAAAATCATATTTTGTCTAGCAAGCAGAGAT
AAAAAAGAGCAAATTCCTGCAATAATTAATCTAACTAAAATGGTTTATAAGACTAATTTTATTGCTATGT
TAGAAAGTGCAAAGACAAAAGAAGAAGCAGAAGTTTTAATTCATAAATATGAGAAGGAGGTCACTGTATG
A
>ref|NC_013316.1|:266847-267299 PTS system, IIa component [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAATTAGTTAATGTAAAATGTTCATTTAAAATACATGCTAATTCAAAAGAAGAAGCTATTGTAT
CGTTAGTTGATGTAGTATCAAAAGAAGGATATCTAATAGATAAAAATCAATTTTTGGAAGATGTTTTAAA
GAGAGAAGAAACATTGTCAACTTATATTGGACATGGTATAGGTCTTCCTCATAGTCAAAGTGTAGGTGTT
AAAAACTCTTGTATTACAATAGGAAAGCTTGATATTCCTATTGAATGGACAGAAGAAGGAGAAAAAGTGG
ATTTAATATTTTTAATATCAGTAACAAAAGACAATGAAAATAATCTTCATTTAAAGATTTTATCAAAATT
AGCACGTTTATTGATGCATGAAAGTTTTAGAAATCAAATTAGATGTTCAGATGAACAAACTGTTTATAAT
CTTATAAAAGAAAAAATAGAGGAGGAAGATTAA
>ref|NC_013316.1|:267301-268356 PTS system, IIc component [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAATTTTAAAGTTTTTGCAAAAACATCTTATGACAGCAACATCTTATATGATTCCATTTGTGGTTG
CAGGAGGAATATTATTTGCTTTATCAGTAACTCTAAGTGGACAAGCTGCTGTTCCTGAAACAGGCTGGTT
GGCTAAACTGAATCAAATTGGAGCTGCTGGCTTGGCTTTATTCATTCCTATATTAGGTGGATATATAGCA
TTTAGTATGGCAGATAAACCAGGATTAGCTCCAGGTATGATAGGTGCATATTTAGCAAAAGAAGTAAATG
CAGGTTTTATAGGTGGTATCATAGCAGGATTTATAGCAGGATTTGTTGTTTTACAATTAAAGAAAATTAA
ATTAGCTCCTACAATGAGAACTTTAGGTTCTATATTTATTTATCCTTTGATTGGTACATTGATTACAGGT
GGTATAATTGTATTTTTAATTGGAGAACCTATAGCTTCTTTTATGACATGGATGACAAACTGGTTAAATG
GAATGTCTGGTGTTTCTAAAATTCCTTTAGGTGGAATCTTAGGAGGAATGATAGCCTCAGATATGGGTGG
TCCTATAAATAAGGTTGCTGCTACTTTTGCCCAAACTCAAGTTGACACACTTCCATATTTAATGGGTGGA
GTTGGCGTTGCAATTTGTATACCTCCAATTGGTTTAGGATTAGCTACATTATTGTTTCCAAAAAAATTTA
GCAAGGAAGAAAGAGATTCAGGTAAAGCTTCGCTATTAATGGGATGTGTTGGAATTACAGAAGGAGCTAT
TCCATTTGCAACATCAGATCCAGTTAGAGTAATACCTTGTATTATGGCTGGGTCGATTATAGGAAATATT
ATGGCTTTTTTATTAGGATGTTTAAATCATGCACCCTGGGGAGGTCTGATAGTATTACCTGTAGTTGACA
ATAGGTTGGGGTATATTGCATCAGTATTAACTGGAGCAGTAGTTGTTGCAGTATTAATGAAATTAGTAAA
AAAAGACGTGAAAGAAGATGAAGAAATTGAAGAGGATTTAGATGAATCAATTGAATTAATATTTGAAGAA
TTATAA
>ref|NC_013316.1|:268423-268731 PTS system, IIb component [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATTGTAGCAGTAACATCTTGTCCTAGTGGAGTAGCACATACTTACATGTCGGCTGAATCACTTG
AATTATCGGCCAAAAAATTTGGTATAGAAATAAAGGTTGAAACTCAAGGAAGCTCTGGAATAGATAATGA
ATTGTCACTTAAAGATATTGATGAAGCAACTTGTGTAATATTGACTAATGATGTTGAGATTAGAAATATG
GAACGTTTTAAGGGAAAGAAGGTAGTAAGAATGAGTGTATCTGAGATAATTAAGAAATCTGATGCATTAA
TTAAGAAAATAAAAGATACTTTTCAATAA
>ref|NC_013316.1|:268835-270100 putative sugar-phosphate kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAATTACCAATAAAGACTGTCGTACAAAGATTACTAGACTTACAAGAAGAGGGGAAAAGTGCAA
CTCTTTTAGGAATTGGTCCTATGTCACCAAACTTGTTACAAGCAAGTTTTGAACTAGCAAAAGATGATGA
TTTTCCTTTAATGTTTATCGCAAGTAGAAATCAAGTAGATGCAGATGAACTAGGTGGCGGTTATGTAAAT
GGTTGGAATCAGGAAACTTTTACAAAAGATATTAAGAAGATTGCCGACAAAGTTGGATTTGATGGTTTAT
ATTATTTATGTAGAGACCATGGTGGGCCATGGCAAAGAGATAAAGAGAGAAATGACCATTTGTCTGTTGA
TGAAGCAATGGAGTTAGGAAAAAAATCTTATTTAGCGGACATTGAAGCAGGTTTTGACCTATTGATGATT
GACCCTACAAAAGACCCATTTGAAATTGGAAAAGTAATTCCACTAGATGTAGTACTAGAAAGAACTGTAG
AATTAATTGAGTATTGTGAAAACGAGAGAAAAAGACTTAATCTACCAGACATAGGTTATGAGGTTGGTAC
AGAGGAAACCAATGGAGGTCTTACTTCAACTGAGACGTATGAAACATTTATAACTAGACTAAAGGTTGAA
CTTGATAATAGGGGTTTGCCAATGCCAACATTTATAGTTGGTCAAACTGGTACTTTAACTAGAAAGACAG
AACAAGTAGGAACTTTTAATTTTAGAAATGCTTATGATTTAGCTCAAATGGCTAAGAAATATGGAGTTGG
TTTAAAAGAGCATAATGGCGATTACTTAGATGATGTAACTTTATTAGAACATATACCATCTCAAATTATT
GCTACAAATGTAGCTCCTCAATATGGTACTGAAGAAACTAGGGCATATTTAAAATTAGCAGAAGTTGAGT
GTAAATTAGAAAAAGAGGGCCTAGTTGATAAAACTTCTAATATCAGACATGTTCTTCTTGTTAATGCAAT
TGAATGTGGACGTTGGAGAAAATGGGTAGTAGGAGAACAAAAAAATCTAACTACTGAAGAGATATTTAAG
AATGAAGTTTTATCTAATGAAATACTAGATATTGCAGGACATTATACATTTAATAATGATGATGTTAAAA
AAGAAATAGAAGTGCTTTATGATAATTTAAGTAAGAATAATATTGATGGTCAAAGATTTGTTGTAGACCA
TATTAAACGTCCTTTGCGTGATTATGCAGAATGCTATAACTTAAAAGGTGTTACTACGAGGATTTTAAAT
AAATAA
>ref|NC_013316.1|:270188-270904 putative hydrolase [Clostridium difficile R20291]
TTGATTAATTTAATTTTTGATGTAGATGATACTTTATATAACCAATTAACGCCTTTTTACACTGCATATA
ATAAAGTGTTTTCTTCAATAAAGGATATTTCTATTGAAGATTTATATATGAGTAGTAGAAAGTATAGTGA
TGAGGTATTTCATATGACTGAAAATGGAGAAATGCCAATCAAAGAAATGCATATTTATAGGATAATGAAA
GCTTTTGAGGAGTTGGGAAATTCTATTACAGAAAAAGATGCACAAAGTTTTCAAGATGAGTATATATATC
AGCAATCACAAATTACACTAATACCAGAAGTTGAGAGGATTTTAAATTTTTCTAAAGAAAGAAATATTAA
TCTAGGAATTATAACTAATGGCCCATCAAACCATCAAAGAATGAAGTTAAAGCAGTTAAATATTGAAAAT
TGGGTTGATAAAAGTAATATTTTTATTTCTAGTGAGGTTGGATTTTCTAAGCCAGATACTAATATTTTTA
GAGTAGCTGAGAATGTTATGAATTTAGATAGAGAAAATACATATTATGTGGGTGATTCTTATAGAAATGA
TGTATTAGGTGCTAAAAAAGCTGGTTGGAAGAGTATATGGTTGAACCATAGAGGACATGAGGTAGAAGAG
TTGTTTTATAAACCTGATTTTGTAATTTTGGAACATAAGGATTTGATATCTTTATTTATAAAAATATGTA
GTTATAAAAATATGTAG
>ref|NC_013316.1|:c271392-271099 putative spore coat protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAATATGATAGAAAATCTAATTAAGAACAATACTTATATAGACGATAAAGTAATAATGTTAAGTA
TGCTTTCATCTGCTAAAGCATCTGCCAATATGTATCTTAATTCTGCATTAACAAGTAGTACACCTGAATT
AAGAGCTATATATTCAGCTTCACTAACTCAAATGGTAGAAGGTCACACAGCACTTACAGAATTAAGTATT
AATAAAGGATGGGTTAAACCATATGATAAGCCTATTCAACAGTTAACATGTAGTTATAAAGAATCCCAAA
ATGTTATTGACTAA
>ref|NC_013316.1|:c271613-271398 hypothetical protein CDR20291_0213 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAACACTTTCAGAAACTGAAAAAATATCTTTAGCAGCAGTTATAAAAATGGAGTCTGACGGATTAC
TTATGCAAAGAGCAATAAATATGTTAATATCAGATGAAGACCTAAAAAGACAATCAGAATCTAGTATATT
AGCAACAGAAGGAAGAATTAAAGCTATACAACAATTTATAGTTGAAAATGAAATACTAATTTCTGAGGAG
GTATAG
>ref|NC_013316.1|:c272670-272158 putative nitroreductase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAGAAGTTATAAAAAATAGACGTTCAATAAGAACATATATAGATAAAAATATAGAAGAAGATAAAA
TAACTGAAATACTAAAATCAGCTATGCAAGCACCTTCATCAAAAAATGCTCAACCTTGGGAATTTATTAT
AGTAGATGATAAGGAACTGCTGAAAGAGCTCTCAAAGTCACAGCATAGAGCAAAGCATATAGAATTTGCA
CCATTATGTATAGTAGTGCTTGGAAATAGAGATAAATTCTTAAAACCTGGTAAATGGATACAAGATTTAG
GTGCTTGCACACAAAATTTATTATTAGAAGTTACTAATCAAGGTCTAGCTGCTTGTTGGGCAGGAGTATT
TCCTAAAAATAAAGTAGTAAATAAAGTTAAACAAATTTTAGACTTACCAGTAAAATTAGTTCCTTATGCA
CTTATATCTATTGGATATAGTGAAGAAAAAAATGAATTTATAGACCGATTTGATGAAAATAAAATACATA
GAAATGTATATAAAAATAGATAA
>ref|NC_013316.1|:273120-273596 phosphoribosylaminoimidazole carboxylase catalytic subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTAGCAGTAGTTATGGGTTCAAAATCAGATTATCCAAAATTAGAAGAAGGGATAAAACTGCTTG
AAAAATATGGAATAGAGGTTGTAGCAAGAGCATTATCAGCTCATAGAACACCAGAACAACTTTCAATATT
CCTAAAAGAAATAGAAGATGATACTGATGTAATAATAGCAGCAGCAGGAAAAGCAGCACACTTACCAGGT
GTAATAGCTTCACAAACATTAATTCCTGTAATAGGATTACCTATTAAATCATCAACTATGGATGGACTAG
ACTCACTTTTATCAATAGTTCAAATGCCAAAAGGAATCCCAGTTGCAACAGTTACAATAGACTTAGGTTT
AAACGCAGCTTTATTGGCATTACAAATAATGACTTTAAAATACCCAAAATTAAAAGAGGATTTGAAATCA
TATAGAGAAGAGATGGCACAAAAGGTGTTAGAAGACGACAAGAATTTAAGGGGGTAG
>ref|NC_013316.1|:273602-274300 phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTATTATATGAAGGAAAAGCAAAACAAGTATATTCTACAGATAATGAAAATGAATATGTTGTTTATT
ATAAAGATGATGCAACAGCATTTAATGGAGAAAAAAAAGCAGAAATATCTTCAAAAGGTATACTAAATAA
TAAGATATCAACAATAATCTTTGAAATGTTAAAAGAAAATAATATAAATACTCACTTTATAAAAAGTTTA
TCAGATAGAGAAATGTTAGTTAAAAAAGTAGAGATTTTACCATTAGAAGTAATAGTAAGAAATATTGCTG
CTGGTTCTATCTGTAAAAGAGTTGGTCTTGAAGAAGGTGTAGTTTTCGATGAGCCAATTTTTGAAATAAG
TTACAAAAATGATGCTTATGGTGACCCAATGCTAAATGATGATTATGCAGTGGCAATGAAGTTAGCAACT
AGAGAAGAGTTAAAATTCTTAAGAGAAGAAACTTTAAAAATAAACGAGTTACTAAAAGCATTTTTCTTAA
AATTAAACCTAAAGTTAGTTGACTTTAAAATAGAATTTGGTAAGGATTCTGAAGGAAATATAATATTGGC
AGATGAAGTATCACCAGACACTTGTAGACTTTGGGATGTAAATACAAATGAAAAGTTAGATAAGGACAGA
TTTAGAAAAGACCTTGGAGACCTTGTAGAAGGTTATACGGAAGTACTTTCAAGAATGAATAATAAATAG
>ref|NC_013316.1|:274312-275679 amidophosphoribosyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGTGTGGAGTTTTAGGGATTTACTCTAATAAAGATGTAACTAAAGAACTATATTATTCTTTATATTCTA
TGCAACACAGGGGGCAAGAAAGCTGTGGTTTAGCTCTTTTAGATGATGGAGAAATTAAGTACAAAAAAGA
TATGGGATTAGTTGGAGATGTTTTTAAGGAAAATGAATTATCTAAGTTAAAAGGAAATATAGGGATTGGA
CATGTTAGATATTCAACAGCTGGAGGAAGTCATGTTTCTAACTGTCAACCTTTAGTTGGAAGTTGTAGAA
AAAGACAATTAGCCATAGCTCATAATGGAAATCTAGTTAATGCAAATTATTTAAAAGATATGCTAGAAGA
AGATGGATATATGTTCCAAACTAATTCAGATACAGAAGTGATTTTATATATACTTGCTAGATATTACAAA
GGGGATATAGTAGAAAGTTTAAAAGTGACAATGGATTATATAAAAGGTGCATATGCTCTTGTAATAATGA
GTCAAGAAGAATTGGTTGCAGTTAGAGACCCACATGGATTCAGACCTCTTGTACTTGGTAAAAAGGGTGA
TGAATATATATTTGCATCAGAAAATTGTGCAATAGATATACTTGGCGGAGAAGTTATAAGAGATGTAGAG
CCAGGAGAGATAATAGTAGTCAAAGATGGAGAACTAAAATCATATTTTTATTCAGAAAATTATAAACCAG
TTAAGAAAAGTTGTATATTTGAACACATATACTTTGCAAGAAATGATGCAACTATAGACAATGTAAATGC
ATATGAATTTAGAATTAAATGTGGTGAGAGATTAGCTCAGAATGAAACTGTAAAGGCAGATATGGTAGTT
CCAGTTCCAGATTCAGGTTGGCCAGGAGCTATTGGTTATGCAAATGCTAGTGGATTAAAAATAAGTGAAG
GCTTAGTTAAAAATAGATATGTAGGAAGAACATTTATAAAACCTACACAAGAAGAAAGAGAAATAGCAGT
AAAAATAAAATTAAATCCTCTTTCAACAATAATAAAAGGAAAATCTATAATTTTAGTAGACGACTCAATT
GTAAGAGGAACTACATCTAAACAATTAGTAAAATCTTTAAGAGAAGCAGGAGCAAAAGAAATTCATCTTA
GAATAACTTCTCCTCCAGTAGCTTACTCTTGTTACTATGGAATAGATACTCCAAATCGCTCTAAATTAAT
TGCATCAAGTAACAACGTAGAAGAAATGAGAGAATATATTGGATGTGATAGTTTAAAATTCCTAGATATA
GAAGGAATGTTAGATGCAACAGAACATAAGTCTACTTTCTGTAAAGCTTGTTTTGATGGAGAATACCCAG
TTAAGAAAATTGATAAGGAGGAACTACTTTCATGTTAA
>ref|NC_013316.1|:275673-276749 phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAACATATAAAGAATCAGGTGTAGATATAGATGAAGGAAATAGAGCAGTAGACCTTATAAAAGGTA
AAATAAAAGGAACTTATGATGGAAATGTAGTTGGAGATTTAGGTAACTTCAGTGGATTATACAGTTTAAA
AGATTTTGTAGGTATGAAAGAACCAGTTTTGCTTGCATCTACAGATGGTGTTGGGACTAAGTTAAAAATA
GCTCAGATGATGGACAAGCATGATACTGTTGGAATAGATTTAGTTGCAATGTGCGTGAATGATTTAATTT
GTCAAGGAGCAAAACCATTATTTTTCCTTGACTATATAGCTCTTGGGAAATTAGTGCCTGAGCATATCGA
AAAAATAGTTGGTGGAATTGCAGATGGTTGTAAAATGTCTGGTTGTGCACTAATTGGTGGAGAAACTGCT
GAAATGCCTGGAATGTATGGAGAAGATGACTATGATTTAGCAGGATTTTCTGTAGGAATAGCAGACAAAG
AAAAGATTGTTTCTGGAAACAATGTTAAATCAGGAGATGTATTGGTTGGTATATCTTCAAGTGGAGTACA
CAGCAATGGATTTTCTTTTATAAGAAAGATATTTTTAGAAACTTACAATTATAAAATGGAACAATATGTT
GAAGAACTAGGAATGACAGTTGGAGAAGCACTTTTAACACCAACTAAAATATATGTTAAATTAGCTTTAG
ATGTATTAGCTAAACATGACATAAAAGCTATAGCTCACATAACTGGTGGAGGGCTTATAGAAAATATAAC
AAGAGTTATACCTAAAGGGTTAGGACTAGATATCAATAAAAAATCTTGGGAGAAGCCTCCTATATTTAAA
ATGATAGAAGGTTTTAATGCTGTTGATGAGAGAGAACTTCATAAGAGTTTTAACATGGGTATTGGGCTAG
TTTTAATAGTAGATAAAGAAAATGCTGATGATGTTGTAAACTTTATAAATAATAGAGAAAATGACAATGC
TGCTTATGTAGATAAAAAATACAGTGAATTATTAGAAGATAAAGCGTATATAATTGGTGAAGTAGTAGAT
AGTCATGAAGGTGTAGAATTATGCTAA
>ref|NC_013316.1|:276743-277336 phosphoribosylglycinamide formyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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CTGGAGAAATAAAAGGTCAGGTTAAAGTAGTTATCTCAAGTAAGCAAGGTGCTTATGGGCTAGAGAGAGC
TAAAAATCATAACATAAAAGCAATTTGTGAAACTGATGAAGACAAGATAATAGAGATTCTTAAGGAAAAT
AAAATAGATTTAGTAGTTTTGGCTGGTTATTTAAAAATAATCAGCCCAAAGCTGGTTAATGAGTTTAGAA
ACAAAATGATAAACATACATCCATCATTAATTCCTTCATTTTGTGGAGCTGGGTTCTATGGAGAAAAAGT
TCATCAAGGTGTTATAGATTACGGAGCTAAAGTAACTGGTGCTACAGTTCATTTTGTTGATGAAGGTGCT
GATACTGGACCAATCATAATGCAAGATGTAGTTAAGGTAAATCAAGATGATGATGCAAAGACACTTGCAA
AAAGAGTGTTAGAAGTTGAACATAGGATTTTAAAAGAAAGTATAAGTCTTTTTTGTGAAAATAAATTAAA
ACTTCAAGGTAGGAGAGTGTTTATAAATGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:277329-278861 bifunctional purine biosynthesis protein [includes: phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase and IMP cyclohydrolase] [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAGAGAGCTTTAATAAGTGTAACTGACAAGACTGGTGTAGTGGAATTTGCTAAGGAGTTAAATA
AGTTAGATTATGAAATTATATCTACAGGAAATACATTTAAAACATTAAAAGAAAATGGTGTTAATGTAAT
GCAAGTTGAAGATGTTACAAATTTTCCAGAAATATTAGATGGGAGAGTAAAAACATTAAATCCATATATA
CATGGTGGTATACTTTATAAAAGAGATAAAGAATCTCATGTAGAAACTGTGAATGAGCATAAAATACATT
CAATAGATTTAGTAGCTGTAAATCTATATGATTTTGAAGGAACTTTAAAAGCTGGAAAAAGTCATGATGA
AATAATTGAAAATATAGATATTGGTGGACCATCTATGATACGTTCTGCTGCCAAAAACTATAAAGATGTA
ATAGTAGTAGTAGATATAAAAGATTATGATTCTATAATAGAAAAATTAAAAACAGATACAATGACATTAG
AAGACAGAAAAAAATTATCATATAAAGCTTTCTCAACTACAGGAAGATATGATGCGTTAATATCTAGTTA
TTTTGCTGGAGAAGTTGGAGATACATATCCTGACATATTAAATTTAACTTTCCAAAAAGAACAAACTTTA
AGATATGGAGAAAATCCACATCAAAATGGTTTCTTATATTCACAATCAAATGCAAAAAATCCAATCTTAA
ATTATGAGCAATTAGGCGGTAAAGAACTTTCTTTTAACAATTTAAATGATTTACATGGATGTTTAGAAGT
AATGAGAGAATTTAAAGATAGTGAAGAAGTAGTTTCAGTAGCTATAAAACATGCTAATTCATGTGGGGTA
GGTCTAGGAAAAGATGCTTTTGAAGCATATACAAAATGTTATGAAGCGGATAAGGTTTCAATATTTGGAG
GAATAGTAGGAATAACTTCTACTATAGATAAAGCTACAGCAGAGAAATTAAATGAAATATTCTTAGAGAT
AGTAGTAGCATATGATTTTGAGCCAGAAGCTTTAGAGGTACTTAAACAAAAGAAAAATTTAAGAATATTA
AAATTAGCTAAGATAGAAGATAGTTTACAACCATATGAAATGAAATATTTAGATGGAAAATTATTAATAC
AAGATAGAAATAATATATTAGCAGAAAAAAGTGAAAATGTAACAAAAGCAAAACCAACAGATGCACAACT
TAAGGACATGGAATTTGGTATGAGAGTAGTAAAAAATATGAAATCAAATGCAATTGCGATAGTAAAAAAT
GGTCAAACTTTAGCTTTAGGTTGTGGACAAACATCAAGAATTTGGGCATTAAAAAATGCTCTTGAAAATA
ACAAAGATAAAGATTTTACAGGAGCTGTTTTAGCGTCAGATGCATTTTTCCCATTTGATGATTGTGTAAC
ATTAGCTCATGAATATGGAATATCAGCAGTAGTTCAACCAGGTGGCTCTATAAAGGATAAAGATTCAATA
GAAGCTTGTGATAAGTATGATATGGTTATGGTATTTACAGGAATAAGACACTTCAAACACTAA
>ref|NC_013316.1|:278872-280122 phosphoribosylamine--glycine ligase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGATATTGGTTGTAGGCGGTGGCGGAAGAGAGCATGCTATATGCTGGAAACTAAGCAAAGAAAAAA
ATGTAGAAAAAGTTTATTGCGCGCCAGGTAATGCAGGAATTACAAATGTAGCAGAATGTGTAAATATAGG
TGATACTAATATAGAAGAACTTTTAAAATTTGCCAAAGAAAATGAAATAGGTCTGACAATAGTAGGACCA
GAAGTACCACTAGTTATGGGAATAGTAGATGAGTTTGAAAAAGAAGGATTAAGAGTATTTGGACCTAATA
AAAAATGTGCTCAACTTGAAGGAAGTAAAGCTTTTTCAAAAGAATTTATGATAAAACATAACATACCTAC
TGCAAAATATAAAGAATATACAAACTTAGAAGAAGCTATATCAGAAATAGATAGTTTTGGATATCCAGTA
GTAATAAAAGCGGACGGATTAGCTGCTGGAAAAGGTGTTGTAATACCTGAAAATAGAGAAGATGCTATAG
CAACTTTAAAAGAAATGATGTCAGATAAGAAGTTTGGAGCTGCTGGAGATAAAATAGTAATTGAAGAGTT
TTTAAAAGGAATAGAAACTTCAATTCTAGCATTTGTAGACAATGATACAATAGTTCCTATGGCAAGTGCA
AAAGACCATAAAAAAGTAAACAACTATGAGCAAGGTCCAAACACTGGGGGAATGGGAACTTTTTCACCTA
GTGAAATATATACAGAAGAATTAGCAAATAAAGTAAAAGAGACAGTATTAGAAAAAACTTTAGAAGGCTT
CAAAAAAGATGGACTTAATTTTAAAGGTATTTTATTTGTTGGTCTTATGATAACTGAAGATGGAGAAAAA
GTACTTGAATATAATGTAAGATTTGGAGACCCTGAGACACAATCTGTTTTATTTAGATTAGAAACAGATT
TACATGAGATAATGGAAACTATACTAGATAATAAGTTAAAAGATATAGAAATAAACTATAGTGATGATGA
AGCTGTATGTGTTATGCTTACATCAGGAGGGTATCCAGACAGTTATGAAAAAGGGAAAATTATAACTGGT
CTTGAAAACTTGGATGATGATATAGTAGTATTCCATAGTGGCACTAAGATGCTTGATGGTAATTTAGTTA
CCAATGGAGGAAGAGTAATTGGTATAACTGCAAAGTCAACTACAGTTAAGGATGCAGCAGAAAAAGTTTA
TGAAAACATAAAGAAGATAAACTTTGAAGGAATGCACTATAGAACAGACATAGGAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:280147-283953 formylglycinamidine ribonucleotide synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTGAATACTGAAAATAAAGACTCAATGGTTAGAAGAGTATTAGTTGAAAAAAGAGAAGGTTTTGACC
TTGAGGCTAAAGCTTTAAAAAAAGACTTAGTAGAAAGTTTACACATAGATAATATAGAAAATTTAAGAAT
ATTAAATAGATATGATGTAGAAGGAATATCAGAAGAAGTTTATGAAAATGCAGCAAAGACAATATTCTCT
GAACCAAATTTAGATGTAGTATATTATGAAGAAATACCAAAATTAAATGATGAAAGAGTATTTGCAATAG
AATTTCTTCCTGGTCAATACGACCAAAGAGGTGATTGGGCAGCTCAATGTGTACAAATTGTAAATCAAGG
GATAAGACCTGCTATTAATACAGCAAAAGTTTATATATTATCAGGCAAAATAACTGATGAAGAGTTTTCT
AAAATAAAAGATTACTGTATAAATCCAGTAGATAGTAGAGAAGCATCTTTAGAAAAACCAGAAACATTAA
AAATGGAAACTGAAATACCAACAACAGTTGAAGTATTAGATGGATTTATAGATTTAGATGAAAATGGATT
AAGAACATTTGTAAGTGAAAAAGGATTAGCAATGACTTTAGGAGACTTACAACACGTTCAAAAATACTTT
AAAGATACAGAAAAGAGAAATCCAACTATAACAGAAATAAAAGTATTAGATACTTATTGGTCTGATCATT
GTAGACATACTACTTTTATGACTGAAATAGAAAATGTAAAGATAGAAGATGGTAAGTTTAATGATATAGT
AAAAGAAGCGTATCAAATGTATCTTAACTCAAGAGACAATGTATATGTGAACAGACATAAAGATATATGT
TTAATGGATATAGCCACTGTTGCAGTAAAAGAATTAAAGAAGAATGGGAAATTAAATGACCTAGATGAAA
GTGAAGAAATAAATGCATGTAGTATAAACGTAGATGTTGAAGTTGATGGTAAGATGGAAAAATATCTAGT
AATGTTTAAAAATGAAACTCACAACCATCCAACTGAAATAGAACCATTTGGTGGAGCAGCTACTTGTTTA
GGTGGAGCTATAAGAGACCCATTATCAGGAAGAAGTTATGTTTATCAAGCAATGCGTGTTACAGGAAGTG
CTGACCCAAGAACGACTTTAGAAGATACTTTACCTGGAAAACTTATGCAAAGAAAAATAACTACAGAAGC
TGCTCATGGATATAGTTCATATGGTAACCAAATAGGTCTTACAACTGGACAAGTTGCAGAAGTATATGAT
GAAAACTTTGTTGCAAAGAGAATGGAAATAGGTGCAGTTATAGCAGCAGTACCAAAAGAGAATGTAGTAA
GAGAAAGACCTGAAGCAGGAGATGTAATAGTTCTTCTTGGAGGAAAAACAGGAAGAGATGGTTGTGGAGG
GGCAACTGGTTCATCTAAAGAACATAGTGAAGAGTCAATCTTAACTTGTAGTGCAGAAGTTCAAAAAGGA
GATGCTCCTAACGAAAGAAAAATACAAAGATTCTTTAGAAATAAAGAAGTTGCTCAAATGATAAAAAGAT
GTAATGATTTTGGAGCAGGTGGAGTTTGTGTTGCTATAGGAGAGATTGCTGATAGTTTAGATATAAACTT
AGACTTAGTACCTAAAAAATACGATGGACTTGATGGAACTGAGCTTGCAATTTCAGAGTCACAAGAGCGT
ATGGCAGTAGCTATAAAAAAAGAAAATAAAGATAAATTTATACAATTAGCAGTAGAAGAAAACTTAGAAG
CTACACATGTAGCTACAGTAACAGATACAGGATATTTAAGAATGTTCTGGAATGGAAAAGCAATTGTAGA
TATAAATAGAGAGTTCTTAGATACAAACGGAGTAAAACAAACTACTGATGTCCATGTTACTAAAGTAGAT
GAAGAAAATACATTCTTTAGCTCTAATGAAATAGTAAAAGATGTTAAGTGTGCAAGTATGAAAGACAAGT
TTACAAAAGTATTATCTGACCTTAATGTTTGTTCTCAAAAAGGATTAGTAGAGATGTTTGATAATACAAT
TGGTGGTAATACAGTACTTATGCCATTTGGAGGAAAGTATCAAGCGACTCCAACACAAGGTATGGTTGCT
AAGATACCAGTACTTGGAGGAGAAACTAATACTTCTACAATAATGACTTATGGATATAATCCAAAGGTAG
GAAAATGGAGTCCATTCCATGGTGCCTTGTACGCAGTAGTAGAATCTGTGTGTAAATTGGTTGCTATTGG
AGGAAATTATAGTACAACAAGACTTACATTCCAAGAGTATTTTGAAAAACTTGGTAACAATCCAGAAAAA
TGGGGTAAACCATTCTCAGCACTTTTAGGAGCATTTTATGCACAAAGTAAATTTGAGATACCTGCTATAG
GTGGAAAAGACAGTATGTCTGGTACATTTAAAGATATCGAAGTTCCACCAACATTAGTTTCATTTGCTGT
TGATACAGTAGATGCGAAGAAAGTAGTATCTCCAGAATTTAAAAAAGCAGACTCAAAAGTAGTAATGTTA
TGTGTAAACAAGGCAGAAAATGATGTTGTAGATTTTGAGGAATTAAAGAGAAACTTAGACAAAGTAAGAG
AACTTATACATGGAAATAAAGTTTTATCAACATATGCATTAGGATTTGCAGGTGTAGGTGAAGCAATAAG
TAAAATGGCTTTTGGTAATAAAATAGGATTTAAGTTTAGTGAAGAAGCTGAAAAAACATTTACAGATGAT
AAATTATTTGAGGCTAGTTATGGAAATATAGTACTTGAATTAGCAAATGATGATTTATGTATGTTAGAAG
GATACAATTATGTTGTGCTTGGAAGTACAACTAAAGAAGCTAGTATATTTATCAAAGGTGAAGAACTTGC
ATTAGATGAATTATATAAAGCACACTGTAGTACTTTAGAGCCTATATTCCCAACTAAAACAGAAGAAGTA
AAATCAAAGATAGAGACTATAAGTTATATATCACAAGGAGAAGCTAAAAAATCATCATTAAGTATAGCTA
CTCCAAGAGTATTTATACCAGCATTTCCTGGAACAAACTGTGAATATGACTCTGCAAGAGCATTTGAAAG
AGTAGGAGCTAATGCAAACATAAGAGTATTCAAGAATTTAACTTATAAAGACATAGAAGATTCTATAGAT
ACAATAGTAAACGAAATAAAATCTTCTCAAATAATAATGTTACCAGGTGGATTTAGTGCTGGTGATGAGC
CAGATGGTTCTGGTAAATTTATAGCTACTGTATTTAGAAATCCTAGAGTGCAAGAAGCTATAAATGAATT
TTTAACTCAAAAAGATGGACTAATGTTAGGTATCTGTAATGGATTCCAAGTATTAATTAAATTAGGATTA
GTTCCATATGGAGAAATAAGAGTTCCAAGTGAAAGTGCTCCAACACTTACTTACAATAATATTGGTCGTC
ATCAAGCTAAGATTGCTAGAACTAGAATTTCATCTAATAAATCTCCTTGGTTAGCTCAAACTAATGTTGG
AGATATTCATAATATAGCAATTTCTCATGGAGAAGGTAAATTTGTTGCTAGTGAAGATGTTATGAGAGAA
TTAATTGCTAATGGACAAGTAGCAACTCAATATGTTGACTTTAATAATGAAGCTACTTATGATATTGAGT
TTAATCCAAATGGTTCATTCTATGCTGTTGAAGGTATAACTAGTGCTGATGGTAGAGTGTTTGGTAAAAT
GGGACATTCTGAGAGAATTGGTGAGGAAGTATTTAAGAATATTATAGGTGAAAAAGACCAAAAGATATTT
GAATCTGGAGTTAAATATTTTAGATAA
>ref|NC_013316.1|:284159-285031 dtdp-4-dehydrorhamnose reductase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATATTAATAACAGGGTCTAATGGTCAATTAGGAAAAGAATTGGTTAGCCAATTAGAAGCAATCA
ATCAAAGTATAAATCAACCAAAATACGTTATATTAGCTACAACAAGAAATGATTTGGATATATCCAATCA
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GTTGATGCATGTGAAGATAATATCGAAATTGCGTATAAAATAAATGCCTTAGGAGTGAGAAATTTAGCAA
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ATATCCATATAGGGAAGACAATAAAACTGAACCCAATTCTGTGTATGGAAAAAGTAAACTTATGGGAGAA
AAGTTTGTTGAACAATTCTCACATAAGTACTTTATATTGAGAACAGCATGGTTATATGGTAATGGGAATA
ATTTTGTAAAGACTATGATAAAACTTTCTTTAGAAAATAAAGAGGTTAATGTGGTTAATGACCAGTTTGG
AACCCCAACAAGTACAGTAGACTTAGCAAAAATTATAATAAGAATCATGGAAACAGAACATTATGGAGTT
TATCATGCTACATGTGAAGGTGAGTGTAGTTGGTATGATTTTGCCAAAAAGATATTTGAATTAAAAAATA
TAGATATAAAAGTAAATCCAATTAAGAGTAACGAATTTAAATGTAAGGCTCAAAGACCACTATATTCTGT
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TATTTAGAAAGATATGATATAAATGAAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:285140-286021 glucose-1-phosphate thymidylyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGGAATTATTTTAGCAGGAGGGTCTGGTACAAGACTATATCCTATAACAAAATGTATATCAAAAC
AAACACTTCCAATATACGATAAACCAATGATATATTACCCTATGTCGGTTCTTATGTTGGCAGGGATACA
AGATATATTAATAATATCTACACCAAGAGATATAAAAGCATTTGAAGAATTATTTGGAGATGGAAGTTCA
CTAGGGCTTAAAATAACATATGCAATTCAGGAGAAAGCAAATGGAATTGCAGAAGCGTTTATAATAGGAG
AAGAATTTATAGGAAATGACAGAGTGTCTCTTGTATTGGGGGATAATATATTTTATGGATATGGATTTAG
TGAAAGGTTGGAGAATGCAGTTAAAAGAAAAGGAGCAACTATATTTGGGTATCATGTAAGTAATCCAAAT
TCGTTTGGAGTTGTAGAATTTGATAAGGATTTTAATGTATTATCAATAGAAGAAAAACCTACAGTTCCTA
AATCTAATTATGCTATACCAGGATTATATTTTTATGATAATGATGTTGTAGAGATAGCAAAGCTAGTTGA
ACCATCAGATAGAGGTGAATTAGAAATAACCTCTATAAACAGTGAATATCTAAAACGAGGAAAACTAAAA
GTGGAACTTCTAGGAAGAGGTATGGCTTGGCTTGATACTGGTACACATAAAGGTCTATTGGATGCTTCTA
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CTATTAAAATTGGCTAGTGAAGATATGCAATATGGTAGATAA
>ref|NC_013316.1|:286058-286615 dtdp-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAAAAATCAATGTTATAAAGACTAAAATAGAAGGATTATATATAGTCGAACCAAATGTATTTTGTG
ATGAAAGAGGATATTTTATGGAAAGCTATAATAAAAAGGATTTTATAGAGCAGGGTCTTGATATGTGTTT
TATTCAAGATAATGAGTCTAGCTCAAGAAAAGGTGTTTTAAGAGGAATGCATTTTCAGGTTAGATATCCT
CAAGGAAAATTAGTCAGAGTTACAGAGGGAGAAGTTTTCGATGTTGCAGTTGATTTAAGAAAAGATTCAC
AGACATTTGGGAAATGGGAAGGTGTAATATTGTCTGATAAGAATAAAAAACAATTTTATATTCCAGAAGG
GTTTGCACATGGATTTTTAGTTTTATCAGAAAAAGCAGTATTTAATTACAAATGTACAAACTATTATTAT
CCAGAATTTGAGCATGGGTTTATATGGAATGACAAGCAAATATCTATTGAGTGGCCTTTAAAAGGAATTG
AAGAAATATTTTTATCAGAAAAGGACAAAAAACAAAAAAGTTTTAAAGATATTTGTATAAGACGTTAA
>ref|NC_013316.1|:286653-287636 dtdp-glucose 4,6-dehydratase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAATACTGATAACTGGAGGAGCAGGATTTATTGGGAGTAACTTTGTACATTATATGCTTAACA
AGTATGTAGATTATTTTATTGTTAACCTAGACTTGTTGACTTATGCTGGTAATTTAGAGACATTAATAGA
AATACAAGACAGTTCCAATTATAAATTTGTTAAAGGAGATATTTCAAATAGGGAACAGATGTATAAGCTA
TTTGAAGAAGAAAGGTTTGATATAGTTGTTAACTTTGCCGCTGAATCTCATGTAGATAGGTCAGTTGAGA
ATCCTGATTTATTTATTAAAACAAACATTATAGGAACACAAGTACTTTTAGATGCATCTATAAAATATGG
AGTTAAAAGGTATCATCAAATATCTACAGACGAAGTGTATGGTGATTTACCAATTGATAGAAAGGATTTA
TTCTTTACAGAACAATCTCCTATCAATCCAAGTTCTCCATATTCAGCTTCTAAAGCATCAGCAGATTTGT
TGGTAAGTTCTTATTATAGAACATATGGATTGTTAACAACTATATCTAGGTGTTCCAACAATTATGGGCC
ATATCATTTTCCTGAAAAATTGATACCTCTTATGATTTTAAATGCTTTGGAAAACAAACAATTGCCAGTA
TATGGGAATGGGGAAAATGTAAGAGATTGGTTACATGTATATGACCATTGTACTGCTATAGACTTAATAA
TACATAAAGGGAATATAGGGGAGATTTACAATATAGGAGGTCATAATGAAAGAAGTAATTTAGAAGTAGT
AAAAATGATATTAAATCTTTTAGATAAATCTGAAGAGTTAATATCCTATGTAAATGATAGACCTGGTCAT
GATTTAAGATATGCTATTGATGCAACTAAAATAGAGAATGAGTTAGGTTGGAAGGCAAAATATGACTTTG
ATTTGGGTATAAAAGAAACTGTTAAGTGGTATATAGAAAATGAATCTTGGTGGAAAGCTGTTTTATCAGT
GTAA
>ref|NC_013316.1|:287612-288343 putative transglycosylase [Clostridium difficile R20291]
GTGGAAAGCTGTTTTATCAGTGTAACTTTGAAATTTATAAAATTTAGAAAGGGGCGTTTTATATTGAATG
AGATAAGTTCACTAATTAATATATTAGCATTGACTCAATTATCTGGTAGTAATACTACAAATCAATGTAA
CTGTACATATAATAGTTCATCTGGATTTGATATGATTATGATGACCTTGTTAAAAGCATTATCACAAAAT
AATCAACAGACTTCTAATGGCTACAATTTATCGTCTAATTCTGAGAATTTATTTGACGAACTCGGCAGTG
TAGTAAATAATACAGCTAGTAGATTTATAGATGTTGATACAAAAGATAAAAGTGTAAAATCAAGAATTGA
AAATGCTATAGAGCAAGCATCAAAAAAATATAATGTGGATTCGAATCTTATAAAAGCAATAATTAAAGTT
GAATCGGATTTTAATCCAAATACTGTTTCTTCTGCTGGTGCTAAGGGTCTTATGCAACTTATGCCAGAAA
ATTGCAGAGACTTGGGGGTTACAGACCCTTTTAATATAGAGCAGAATATAGATGCTGGAACTAGACATAT
TAAGGAATACATTGATATGTTTGGAGGGAGCATAGAAATGGGATTGATGGCATATAATGGTGGTCCTGGA
AGAATGAAAAGTAGAGGAGTAGAATCAATCTCTGACCTGTATAAAATGCCAAAAGAAACACAAAATTATA
TTCCTAAGGTTATGAAATATTATAGAGGGTAG
>ref|NC_013316.1|:288352-288780 hypothetical protein CDR20291_0228 [Clostridium difficile R20291]
ATGGGGATAAATATAGATAAGCTAAACATAAGTCCAAGTATAAATATGGAGGTTAAAAAACTAAAAGAGA
GTAATAAATTTTCTGACAAATTAAACTCTTTAAAACAATCTTCTTCATTGGAAGATATAAAACGAAATTT
GGAAAGTGTAAAAAAGGCAGGAGAAAGGCTTGTACTTACTCAAAACTATGGCGACATTAGTATATATAAA
AATGCAGTAAAAGAATACCTAAAATCTGTTGTAGATAATATGTATTCACTTGATAAAAATAGTAGCTTTT
GGGAGCATCAGTATTATAAGAATGTAAAGATTGTTGATAGTAAACTTGAGGATATGACTAGTAAGTTAAT
TAGTGAAGAAAAAGAAAACATAGATATTGTTTCTACTGTTGATATGATACAAGGCTTGTTGATAGATATG
TATAGATAA
>ref|NC_013316.1|:288804-289118 flagellar motor switch protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAGTAAAAAAGAGGATATATATGAATTGAATTTTGGGCAATTAATAGAAGAAAAATCTGGTGTTA
TAGAAGAAAATCAAAATGTTTTTAATGCAAAAGTAAATGTAGCTGTTTCTATAGGAAATACAACAGAAAC
AATAAAAAATATATTAGATTTAAAAGAAGGCTCTATAATAAAACTAAGTAAGAATGTGGATGAAAAATTA
GATATATATGCAAATGATAGATTGTTTGCTTATGGAGAAAGCATTATTACAAATGAGAAGTTATCTGTAA
GATTATCTAAAATAGAAGATTCAGATGTAAATTAG
>ref|NC_013316.1|:289270-289545 negative regulator of flagellin synthesis (anti-sigma-d factor) [Clostridium difficile R20291]
ATGGATATTAAAAATGTAAGTTCAAATATTGTAGTGAATAATTATTTAAAGAATACATCTGGTGTAAAAA
AAGTGGAAGAAGTTAAAAAAATTAATAAAACAGACAAGATAGAGCTATCTAAATTTGCAAAGGAAATGGC
AAGTGTGTCAAATATGAGTGATGAGAATATTAGGAATAAAAAAGTCGATGAAATAAAAAATGCATTAGAA
AATGGAACTTACAAAATAAAACCAAAAGAAATTGCGAAAAAAATGATAGAGGATATGCGAGGATAA
>ref|NC_013316.1|:289550-289966 putative flagellar biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATTACAGACTTAAAAGTTATAATATATGAAGAAAAAAATATAATTAGTAAGATGATGGAATTATTAA
AAGAACAATTTGATTATATAGTTGAAAAAGACTTAGAAAATTTAAATATGTTAAATCCTAAACTAGAAGA
TATTAGCAGGGAGCTTGCATCCATAGAAATAAAGAGAAGACAACTTTTTGGTGATGATATTTCAATGAGT
GAAGTTGTTGAAAATAGTAATGATAGATATTTAAAAGAAATATATACAGACTTGAAACACATTCTTGCTT
TAGCTAAAAATCAACAAGAATCAAATGATTCTCTAATAAAGAAAGAACTTATTTTTACGAAAAAAATGAT
TAATTTCATAAAACCAGCTGATAAGCAAACTGCAACTTATAATTCTTATGGAAATATTAGAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:289984-291294 putative flagellar hook-associated protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAGGATTATTTTCCATTTTAAATACAGCTAATTCAGGAATGAATGCGCACCAAAAAGCAATACAGA
CAATTTCTCATAATATAAGTAATCTAGATACAGACGGTTATTCTAGGCAAAGGACTGAGTTTGCTACAAA
TAGTCCAATGTATATGCCTAGTTTGAGTAATTCAATTGCAAGAGGACAATTAGGGACTGGAGTACACGTA
ACGGATGTAACAAGAGCTAGAAATAGTTTTTATGATTACCAATTTAGAGCAGAAGCTCATAAGTATGGTA
ATACAGTTTCAAAGTATGACTATTATAATACTATAGAAACTATAATAAATGAACCATCAGACTATGGAAT
ATCTGCAGGTATAGACGACTTTTTTAAAGGATGGGAATCATTAGCAAAGGATATAAATAGTGATAGTAAA
AAAAGTCTAGTGGTAGAAAATGCATCAAATCTAGCAACTTTAATAAGTGAAAGTTATAAGAAGCTTAATA
AGTTAAAGGGAGATATAGACGATAATATAAACTCTGAAATAAAACAGATAAATGACATGTTAAAAAGTCT
TGAAGATTTGAATAAATCTATTGATGTTATATCTGGTTCTGGCTCTACTCCAAATGATTTACTTGATGAA
AGAGATAGAATATTAGATGACTTAAGCTTTAAATTAGACCTTGAAAATAGCGATGTTAAAAATATGCTTT
CAGATGGTAAATTAGAACTTAATGAATTAAAAAATGCAGATGGAACTTGGAAAACAGGTGTATCAGGAAC
CTTACAAGGCTTGTTTGAAATGCATGGTAAGATTGATACATATAAAAGCGATTTAAAAGATGTATCTGAT
GGGTTAGCTAAGCAGATAAATGATGTTTATAATACATCTGCTGGAATAACAGTAACAGATTTTTTTATAA
CTTCAAATGTAGATGGTGAAGATATCATAAAGGTAAATCCAGCTATAAAGAGTAACCCAAATGAATTAAA
ACTTACTGCTGATGAGGCTTCAAAGATTGCTAAGTTAAAGGATGAAAAAATAGATATTGGGGTGGCTGGT
GGAAAAGTAAGTACAATAAGTGACCACTATAAAGCCTTTGCAGAATCAGTAGGTTTAGATTCTCAAAAAG
TGAATCAAGATGAAGTGAATCAACGTAAAATTATAAATAATATTGATAACTCACGAATGAGTGTTTCAGG
CGTATCTTTGGATGAAGAAATGACAGAGCTTATAAAAATACAACGCTCCTATCAAGCTAGTGCAAAAGTT
ATGTCAACAGCTGTGCAACTGTTGGATGTTGTAATAAATGGAATAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:291313-292245 flagellar hook-associated protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAGTTAGTACAGGTATGATGTCTAGCAACTATCTAAACTCACTACAAGATAATCTACAAAGATTAG
ATAAGGTTAATAGACAAGTTAATACAACGAAAGAAATAAACAAGCTATCAGATAATCCATATAAGGCAAT
AAAAATATTGAACTCAAAAAGTGAAATAAAAACTATGGAGACTTATGTTGAGAATTGTAAAGATACAGGG
AATTGGTTAGAAACTACTGATACTGCATTAGATCAGCTTGGAAAATTATTATCGGACATAAAGAAAACTT
TGGTGGCAAGTGGTGATGGTGCATATTCAGATGATGAGCTAAAGACTCTTAGTAATGAAACTAATGAAAA
GATGAAAGAAATTGCAAATGCCTTAAATGCAACACATGAAGGAAAGTACATATTTTCAGGTTCAAATACA
GGTGTACCACCTGTTGAATGTATAGATAATGCTGACGGTTCAGTGAGCTTAAAGTTTAATTCTAGTTTAA
ATCTTAATAAATTAAATGACTCTTTGAGTATGGATATAGCTCAAGGAATAAGTGTAGATTATAATGTTAA
ATTGAGTAGCCTTGGATTTGACCCAACAAAGACTGACCCATTTGAAGAGTTAAATAATATATCAAAGAAA
TTAGCAAATCCAGATGCTGATGCTATAAAAGAGCTGACAACAACTTGTTTAGGCGACATGGAACAATTAA
TAGAAAATACAGTAAATGTTAGGTCTATATATGGGACAAAAGCAAATACAGTAGAGGCTATGAAGGAAAA
AAATGATGATAGTTTGATACAGTTAAAGGATATTTTGTCACAAAATGAAGAAATAGATTATGGAGAAAAA
CTCGTTCAATTAAAGGCAGCAGAGTTAACTTATCAAGCTTCACTACAAACAGGAGGAAAGTTATTTAATG
TATCTATATTAGATTACATATAG
>ref|NC_013316.1|:292261-292653 hypothetical protein CDR20291_0234 [Clostridium difficile R20291]
ATGATGAAGGTTACATTAAAAAAAGGTATATTAGGTTTTGAAAATTTAAAAGAATATGAGCTTTTAGATA
TAGAAGATAATGATTCTTTAAAAGAATTTAATTCTACTGAAGAAGAAGGTATAGGATTTGTTGTTGTATC
TCCATTTGAGATTATCAATGAATATGAAATAGTTTTAAATCAGGAAACAATAGAAAAACTAGAAGTGAAA
TCTCCAAAGGATGTTGTACTATTTAATATAATTACTCTTGGTCAGACATTTGAAGAATCAACTGTGAACA
TGAAAGCTCCTATAGTGATAAATATAAAAACTAATTTTGGAATGCAAATAATTTTACAGGATGATAAATA
TTCAATAAGGCATCCATTATTGAGAGGTGATAATGGATGCTAG
>ref|NC_013316.1|:292647-292859 carbon storage regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGCTAGTAATTTCAAGAAAAAAAGATGAAGCAGTACTTATAGGAGAAAGCATAGAAGTAAAAATTGTAG
GGGTAGATGGAAACAATGTGAAACTAGCTATATCGGCGCCTAACAATATAAGTATATTAAGAAAAGAAAT
ATACGAAAAAGTAAAGAGTGAGAATATAAAAGCTACAAATAAAAATATAAAAATTTTAAAGTCATTAAAA
TAA
>ref|NC_013316.1|:292881-293276 flagellar protein FliS [Clostridium difficile R20291]
ATGTATGGAGAAAATCCTTATAATTCTTATAAACAAAATGCTGTTTTTATGGCATCAAAGGAACAATTGT
TACTTATGCTTGTTGATGGAGCAGTAAAATATACCAAAATAGCCAGAGCAGCTATCTTAGATAAAAATAC
ACAGAAAGCGCATAGAGAACTTGTAAGAGTTCAGGATATATTTACAGAACTAATGGTTACATTAGACCAA
AATGCAGGACAATGGGCAAAGGATATGTACAAAGTTTATGATTTTGTAAGATATGAACTTTCAAGAGCCA
ATATTAGAAAAGACATCCAGGTAATAGATAATGTGTTGCCTGTAATAGAACAAATTAAAGACACATGGCA
TGAAGCTGATAAAAAAAGTAAAGAAGAAAGAAGTAGGTACAAATAA
>ref|NC_013316.1|:293276-293632 flagellar protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATTAAATTTAGCTGAATTAGATAAGTTATCAAAAGAGGAATTACTATTGATGCTTGTAGATGGCA
CAGTAAAATATACCAATATATCCAAAGAAGCTCTTTTAAATAACGACTATTTGAAAGCACATAATGAACT
TATAAGAGTTCAAAATATATTTACAGAACTAATGACTACATTAGACCAAGATGCAGGTCAATGGGCAAAG
GATATGTATAAAGTTTATGAATTTATAAAATCTGAATTAGCAATAGCTGATGAAAATAAAGATATTAAAA
TAATTGATGATATATTGCCAATAGTAAAACAAATTAGAGATACATGGCATGAAGTTTACAATCAACTAAA
AATATAA
>ref|NC_013316.1|:293653-295176 flagellar cap protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAAGTATAAGTCCTATAAGAGTTACAGGTCTTTCAGGAAATTTTGATATGGAAGGCATAATCGAAG
CTAGTATGATTAGAGACAAGGAAAAAGTTGATAAAGCAAAACAAGAACAACAAATCGTTAAATGGAAGCA
AGAAATATATAGAAATGTTATACAAGAATCAAAAGATCTTTATGATAAATATCTAAGCGTAAATTCTCCT
AATAGTATAGTAAGTGAAAAAGCATACTCTTCTACAAGAATAACCAGTTCTGATGAAAGTATTATAGTAG
CAAAAGGCTCAGCTGGTGCAGAAAAAATAAATTATCAATTTGCAGTTTCTCAAATGGCTGAACCAGCAAA
ATTTACTATTAAATTAAATTCAAGTGAACCTATTGTTCGACAGTTCCCTCCAAATGCCAGTGGAGCTAGT
TCTTTAACTATAGGAGATGTAAATATACCAATATCTGAACAAGATACTACAAGTACTATTGTAAGTAAGA
TAAACTCCCTTTGCGCAGATAATGATATAAAGGCTTCTTATAGTGAGATGACAGGTGAATTGATTATTTC
GAGAAAACAAACTGGTTCGTCATCAGACATTAATTTAAAAGTAATTGGAAATGACAATTTAGCTCAGCAA
ATTGCTAATGATAATGGTATCACATTTGCAAATGATGCTAGTGGAAACAAAGTGGCAAGTGTATATGGAA
AAAATCTAGAAGCTGATGTAACTGATGAACATGGAAGAGTAACTCATATAAGTAAAGAACAAAATTCATT
TAATATAGATAATATTGACTATAATGTAAATTCAAAAGGAACTGCAAAGTTGACTTCTGTCACTGATACT
GAAGAAGCTGTTAAAAATATGCAAGCATTTGTGGATGATTATAATAAACTGATGGACAAGGTCTATGGTT
TAGTTACTACTAAAAAACCAAAAGATTATCCGCCTCTTACAGATGCCCAAAAAGAAGATATGACAACTGA
AGAAATAGAAAAATGGGAAAAGAAAGCTAAAGAAGGTATACTTAGAAATGATGATGAGTTAAGAGGTTTT
GTTGAAGATATTCAGTCTGCATTTTTTGGAGATGGAAAAAATATTATTGCATTAAGAAAACTAGGTATCA
ATGAAAGCGAAAATTACAATAAAAAAGGTCAAATATCATTTAATGCAGATACTTTTTCAAAGGCTCTTAT
AGATGATAGTGATAAGGTATACAAAACACTAGCAGGTTATTCTTCGAATTATGATGATAAGGGAATGTTT
GAAAAGCTAAAAGATATTGTATATGAATATTCTGGAAGTTCAACTTCTAAACTTCCTAAAAAAGCAGGTA
TAGAAAAAACTGCTTCTGCTAGTGAAAATGTATATTCAAAACAAATTGCAGAGCAAGAAAGAAATATAAG
CAGGTTAGTTGAAAAAATGAATGATAAAGAGAAAAGACTTTATGCTAAATATTCAGCCTTAGAATCTTTG
TTGAATCAGTATTCTTCCCAAATGAATTATTTCTCACAAGCACAGGGTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:295179-295514 hypothetical protein CDR20291_0239 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAAATTAAAAGAAAAATTAAATTTATATAAAGATATATCTTTACAAATTATAAATTTGATTGAAA
AGGAAGAATATATAAAGATAAGTAGTAAGTTAGGTGAAAGACAAGAGATTATAAATAGTGTAAGTGAAAT
TGATAGAAATGATTTTATACAGCTTTATAATAGAATGGAATTAATTGAAATTGATAGTAGGATAAGAGAT
ATTTTACAAGGACAATTATTAGAAGTAAAAAAAGAATTACATGAGTATAAGCTTACTAAACAAGTGAACA
CAATGTATTATAACTTAAATAGAGAAAAAGTAAATATTTTTAATAAAAAAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:295529-296488 flagellin subunit [Clostridium difficile R20291]
TTGTCCGATTATATAAATGAAGAATTAATAAAAAAGATTAAAAGTAGAAATGACAAGGATGTCAACTATA
CTAAGGAGGGTAAAATAATGAGAGTTAATACAAATGTAAGTGCTTTGATAGCAAATAACCAAATGGGAAG
AAACGTAAATGCACAAAGTAAGTCTATGGAGAAGTTATCTTCTGGTGTTAGAATTAAGAGAGCTGCTGAT
GATGCTGCTGGGCTTGCTATATCTGAGAAAATGAGAGCTCAAATAAAAGGTTTAGACCAAGCAGGAAGAA
ACGTTCAAGATGGTATATCTGTTGTACAAACAGCAGAAGGTGCATTAGAAGAAACTGGTAATATACTACA
AAGAATGAGAACTTTATCAGTACAATCTTCAAATGAAACTAATACTGCTGAAGAAAGACAAAAGATAGCT
GATGAGTTGTTACAATTAAAGGATGAAGTTGAAAGAATATCAAGCTCAATTGAGTTTAATGGTAAGAAAT
TACTTGATGGAAGTTCTACAGAAATAAGATTACAAGTTGGAGCTAATTTTGGAACAAATGTTGCAGGAAC
AACTAACAACAACAATGAAATAAAAGTTGCTCTAGTAAATACTTCAAGTATAATGAGTAAAGCAGGTATA
ACAAGTTCTACAATAGCAAGCTTAAATGCAGATGGAACTTCTGGAACAGATGCAGCTAAACAAATGGTGT
CTAGCTTAGATGTAGCTCTTAAAGAATTAAATACATCAAGAGCAAAATTAGGGGCACAACAAAATAGACT
AGAATCAACTCAAAACAACTTAAATAATACTATAGAAAATGTTACAGCAGCTGAATCAAGAATAAGAGAT
ACAGATGTTGCTTCAGAAATGGTTAACTTATCTAAAATGAATATATTAGTTCAAGCATCACAGTCAATGC
TTGCTCAAGCTAATCAGCAACCACAAGGAGTTTTACAATTATTAGGATAA
>ref|NC_013316.1|:296503-298722 putative glycosyltransferase [Clostridium difficile R20291]
TTGGATATAGAAGAAAGGGTAAGGCTTTGCTTTACTCCTTTCTTTTTTTACAAATATACTTTTGAAAGGA
AAATATATATGTTACTTAGTATAGTTATGATTGTTAAAAATGAAGAAAAAATACTTGAAAAAACTTTAAA
ATCATTAACCACATTAAGAAGTTCTATAGAGAGTGAACTTATAATAGTTGATACAGGTTCTACAGATGAT
ACTATAAATATATCTAGGAAATACACGGAAAATGTGTACTTTCATAATTGGAATAATGATTTTTCTAGTA
TGAGAAATATATCAATATCCTATGCTAAAGGTGAATGGTTACTTATATTAGATGCAGATGAAATACTAAT
TGATTCTTCAACTATTGTGAAATTTTTTAAAGATGGTCTTGATAAAAAATTTAATTCGGCCTCAATACAA
TTAAAAAATCTTTACTCATATGATAAAAAATTATATGGATATTGCTCAGTGCTTAGACTTTTTAAAAACA
TCGATTTTAGATACCATGGTAAAGTACATGAACAACCAATATACAAAAACCCTATATTTAATAATGTTGC
TGATTTTGAACATTATGGATATTTGTTTGAAGATGAAGAAATAAGATTAAATAAAGTAAAAAGAAATGAA
AAACTGTTATTTGAAGAATTAAAAGAGAATGATAATTCTCCATATACAAATTATCAATTAGGGAAAAATT
TTATTATATTAGGAAAATATCATGAGGCTTTATACTATCTTGAGAAATCTTATGAATTATATTCTAAACT
AGAATCGGCACCTGGTTACTTGATAACAAGTCTTGTAAAAACATATTTATATTTAGGAAAGCATAAGAAG
TGTGAAAAATTGTGTCTAAAGTATATTAAGAAAGACATGAATAATATTGATATATATTATTATATTGCAC
AAGCACAAGTAGATTTAGGGAAGTATGAAAATAGTATAGATTCGTATAAGAGATATATTTATTTGTTAGA
TAATTATGAAATAAGTACACAAGCAAATAGTTTATTTTCAGACACTGATACTGTAGGGCTTAGGGATGAA
GCTATTATTACACTGATAAAGATTTATTATAAACTTGAAAAATATGAGTCTGTAATTTCAGAGTACAATA
ACATTGAGGATATGGAAAAGAAGAAGAATGTGTACTTTAGCTTATTTATGTCCCTATACAAATTGAACAG
ATTTGAAGATATAAAAAACTATTATAAAGAAGTTTCAAATTCTAAAATTGAAAAAAATAGTTTTTATAAA
AATATAGAAGAAGTTATAAATAATATTAAAGATGATGAAAAAGAGCATGTATATAAAATCCTTTGTGACA
TTGAAGGTAATTATGGCATTTTAAATCAGATAAGGATAAATAAATGTGTATCTATAGATAAGTGTAAAGA
AATACTCAATGAAGAAAAAGAAATAATTTATGCATATATTATAAAAGTAGCTTTTGAAGATAAGATTGAT
TTACTAGATATTTTTTATGAAATGGAATATGTATGGATAGAGAAATACCTAAAATATCTTTTAGCACTAG
AAAGAAGTTTTAATTTAGTACTATATAAGTACATAATTAGTCGTCCGAATACATCAGATATAAAAAAGAT
AAGAGTATATAAAGCTATATCTAAAGTAGTTTTAGAAAGTATAAGTTTAAGTGATGAAAAATATAAGGAG
ATTTTTTATCTTTATATAATGTATTCTTATAAGTACATAAGATACATATATAGAAATTTAAGCGATTTTG
AATTAATAAAATTTGTTTGCAATGATTTAGATAAGTTTACTATAGAATTTAAGCATCTACTTGACATTAA
AAATAAAGTAAATGATGCTAATGAAAAATTAGAGTATATACATAGTATGAGGAAATTACTAAATGAGTAT
CCTTTTTATAATAAAATAATAAAAATACTTATAAGTGAATTAGAAGAAAATATAAAAGAAAGTGAAGAAT
TTAAGGATTTAAAAGATAGTTTTATTATTAGTATAGAAAATATGATTGAAACTGGCAAAATAAATGATGC
GAAATCATTGGTAGATGACTATTCAAAAACATTTATGGATGATGTAAAAATTTTAAATATAAAGGGAATT
TTATATATGTTTGAAAATAAGCTTGATAAAGCTGATTTTATGTTAAAAAAGGCATTATCATTAGATGTAG
AAAATGAAGATACTATATATAATATAGAATACTTAAAAAGTTTAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:298746-300623 glycosyl transferase family 2 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATACACCAATAGTGGTTAATGAAAAATCTAAAGATATAATAAAAGATTGGCAATATACGTATACAA
ACGAAGATATAAAATTTACAAGCATAATAATATTGACATATAATCAAATAGAATATACTAAATTATGTAT
TGAAAGTATTAGGAAGTTTACCCCAAAGAATAAATATGAAATAATAATAATTGACAATAACTCTTCTGAT
GGAACAGTTGAGTGGTTAAAGGGACAATCTGACATAAAATCTGTATATAATAACAAAAACCTAGGATTTC
CAAAAGGATGCAATCAAGGTATTGAGTTGGCTACTGGTGAAAACATATTGTTGTTAAATAATGATGTAAT
AGTTACTCCAAATTGGCTTTATAATTTGAATAAAGCTTTATGGTCTCAAGATAATATAGGTGCTGTAGGT
CCTATTACAAATGCATGTTCGTACTATCAACAAATTGATGTTGATTATAAATCAATTGAGGATATGTTTA
TGTTTGCACACAAAATAAATACATCTAATATTAACCTATGGAAATATAGATTAAAGTTAGTTGGATTTTG
CATGTTAATAAAAAAATCTGTGCTGGATAATGTAGGGGTTTTAGATGAATTATTCACACCTGGAAATTTT
GAAGATGATGATTTATCTTTTAGGATGCTAGAGTCAGGATATAAGCTATTATTATGCCAGGATACTTTTA
TACACCATTTTGGAAGTGTATCTTTTAAAGAAAATCGTAATAAATATACAGATATAATGTATATTAATAG
AAGAAAATTTGAAACTAAGTGGGGATTTAATCCAGAATATAGTGGAATGATAAGAACAGATTTGATTTCT
AAAATAGATGATAGTTTGGAGGCAAATATTAATGTTTTAGAAATAGGCTGTGGTATAGGGGCTACTCTTT
TAGAAATAAAAAATATATATAAAAATGCATCAATATATGGAATAGAAATTAGTGAGTCAGCAGGTAAACT
TGCAAAGTATAGTGCAGATGTACTTATAGCAGATATAGAAAAAGTAAAGTTGGATTATGAAAAAGATTTT
TTTGATTATATAATATTGGGAGATGTACTTGAACATTTAACTGACCCATGGAAGATAGTCAATGAACTGA
AACAATATCTAAAGAAGGATGGTTGTTTGATATCTAGTATACCAAATATTATGCATGTTTCTGTTTTAAG
AAACCTTGTGTTAGGTAATTTTACATATGAAGATTCAGGAATTTTAGACAAGACTCATTTAAGGTTTTTT
ACATTAAATGAGATAACAAAAATGTTTAATGATAGTAATTACATAATAAATAGTGTTACAGCTACTAGTA
TGCCACTTTCGGAAATTGATAATAGATTCATTGATACAATGTGTAAGGAAAGCTGTAAAGAAATGAGACA
ACAGTACGAATCTTATCAATATATAGTAAAAGCCACTAAAAGCATAGATACTAAAAGATATTCTAGTATT
AGTATGGTTAATTTAAAATACGCTTTAATGAGAATTGATAATGAATTAGATGTAGATAGTAATTTAAGTT
ATATATTTGATAATTATAATATAACTGAACCATGTTTTGTTGATGATATTGAATATTTAGTTGATACGTT
TGTGATAAATAAAGCAACTCTATTAAATAGATTAGGAGTTGAGGCATTTAACAGAGGTTTAGGAGATTTT
AGTATAAACATGTTTATGACAGTATTAGAGATGGATAGAGATGATATTGATTCAATATATAATATAACAA
GTGTATTATGTGAATTAGAAGAATTTGATACTGCTTACAACTTAATTAAAAATAGTAGCAAAAAAGTACA
GAGTGAAAGTGACATACAAGATATACTTTATTTTATTGAGGGGAAGAGATATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:300616-302730 glycosyl transferase, group 2 family [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATGATAAGATATGTTTTATAACCTGTGTAAATGATGAAAGACTTTATGAGGAATGTCTTGTAT
ATATAAATAGCCTAGACATTCCTAAAAACTTTAGCATAGAAACAGTAGCTTTAAGAGGAGCCGATTCTAT
TGCCTCTGCTTATAATAAAGCTATGAGAGAAACAGATTCTAAGTATAAGGTATACTTACATCAAGATGCT
TTTATAATTAATAAAAATTTCATATATGACATTTTAGAGATATTTAAAAAAAATACAGATGTAGGAATGA
TTGGTGTAGCTGGAGTAAAAGATATACCTGTGAATGGAATTTGGTGGGATTCTGATAAAAAAGCAGGGAA
AGTATATGATAGCCATACAGGTAAAATGGATATTTATGAATTTAGTAACTTTGAAGAATGTTTTAATGAA
GTTATGGCTATAGATGGATTAATTATGATTACTCAATATGATGTATTTTGGAGAGAGGATAAGTTTGATG
GGTGGCATTTTTATGATTTGTCACAGAGTATGGAATTTAGACAAAATAAATACAAAGTTATTGTACCAAA
ACAAAATAAGCCTTGGTGTATGCATGATTCTGGAGTAGCAAATATAAATAATGGATATGATGAATATAGG
ATAAAATTTGTAAAAGAGTACATAAATCTTGATTTATATAGAGAAAATTTTTATGAATTTGATAAGAAGA
AAGCAAGTACCATACTTAAGAGTAATAAGCATGTAATGGATTGTATGAAAGAGGAGCTTACAGAACAATT
AAGATTAAAGAATTATAAGGATGTTTTAGATATTGTTTCTAAAATTGCTCATTTTTCTGTTTTTAATCAT
ACTGGCTTGTATTCTTGTGAAAAATGTGAGAGAGCATTGCTAGAATGTGCAAATAATTTACCAGAAATAG
AAAATACGAAATTATTTACAAAAAAAGATTTAAAAAGAAGAAAAGTATTACATGTTTTAAGTGAAGGATA
TTCAACAGGAGGGCATACAAGACTAGTTAAAAATTGGATTGAGATTGACAAAGATTCTGTTCATTCAGTT
GTAACTACATGGCAATCAGATACACTGCCAGACTGGTTATTAAAAGCAATAGATGATAGTGGTGGCGAAG
TTATATCTTTGGATTTAATTTCAGATGATTATTTAAAAAGAGCTGTAGCTTTGAGGAAAATAGCTTATGA
CTGGGCTGATATAGTTATTTTATATGTTCATATGTGGGATACAATACCTGTTGTTGCTTTTGGAGTTGAT
GGGAAAATACCTATTTTACATGTTAATCACTATGATAGTACTTTTTGGTTAGGGACAAGTATTGCAGATA
TTGTCATTGATTTTAGCGAAGCTAGTCAATTAATTACATTAGATAAAAGAGGCATAGATAAATCTGAAAT
ATTACCAATGCCATTAAAAGAAAAAGAAGTATTTTCAAAATCTGAAGTTAGAAAACGATATAATTTGGAG
GATGATGTGACAATAATATTGACTATTGCTAGTGAAAGAAAATACAATAGTGTAAATGATATTAATTACT
TTAAAATTGCTAAAACATTGATTGAAAATACAGATAATACAATTATTATTGTTGTAGGAGTTGATACAGA
GAATCTCTATTGGAAAACTTTAAGTAACGTTACAGATAATAGAGTTATATGTTTTGGAACAACAGCAAAT
ATAGACGATTTTTATAAGATTTCGGATATATACCTAGAGTCTTTCATGGTAGGGAGTCATACTTCAAAAT
TAGATGCAATTTTATATGATTTAATTCCTGTTAAGTTTAAAAATGAAGTTTCACCAATTTTTACAAATAT
GTGGAATTTTATAGATAAGTTTGATTATAAGAATATAAAAGAGGTTATAGACATGATAAGAAGGTACAAT
ACTAGTGAATTTGACAGGGATAAGATAAAAGAAAAACAATCAGAAATAAAACATTTTGTTATAGATAAAC
ACTGTATTGAAATAAAAAACTATATAGACAAAATATATAAAGAGGCTAATCATCATAAAGTTAAGTATGA
TTTATATAAAAATGATGAAATCGAAGACTATCAGCTTTTTGTTGCATTATATGGTTATATGGTAAAAAAT
AAAAACATGTCATAG
>ref|NC_013316.1|:302739-303734 hypothetical protein CDR20291_0244 [Clostridium difficile R20291]
ATGAACAATATTCATATCAATAAATTTGAAAAAAGCTGTGAAAAAAACTGGGATTATTTTGTAGAAAATA
AATCTATAAATGGTACATTTCTGCAAACTAGAAATTTCCTTAATTATCATGAAGAAGGAAAATTCACTGA
CCACTCATTAATAATATATAAAGGTGAAGAAATACTAGCAGTCGTACCTGCATGTGAAACTTATGAAAAT
GGTGAAAGAGTATTTTTTTCTCATTTAGGAAGCACTTTTGGAGGTATTATAATAAGAAGTGGTTTTAATG
ATATTAGGCATGTAAATGCTATTACAAATAAGTTAGAAACATATTTACAGGAACAAAGTTTCAATAAAGT
ATATTTAAAAAATACATCAAGAATATTTTGTAAAGAGGATACTTCATTACTAGAATATTTTCTATTTAAG
AATAATTACATGTTTTATGATGAATTAAGTATGTTTTTAGAATTAAGTAAGTATAAAAAAGATATATTAG
CTAATTTTAGATATAGTAAAAGAAGATATTTTAAATATTCTTTGAAGAATAATCTTACCTTTAAAAGATT
GTATAGTGATGAGGATATAGTTTGTTTTTTTAATTTACTTTCTAATTGTTTAGATAGTAAAGGAGCTAAA
GTAATACATTCAGTAGAAGAACTTTTGGAGTTTAAAAATAATAGATTAAAAGATATTGTAGAATTTTATG
CAGTATATATTGATGACATTATGATTTGTGGGAGCATGGTATTTAACTTTCAAGAAAGAGTTTATCATAC
TCAATATCTAGCATCAAATTCGACATATAATAAATATTATCCAATGATATTTTTATACTATAATCTAATA
AAAGATGCTTTAGAGAGAAATTTTAAGTATCTTTCTTTTGGAATTAGCACTCTAAATAGAGGCAAATACT
TAGACGAGGGTTTAGCTACATTTAAAGAAGGTTTTGGTTCAAGTGCAATTTGCAACAGAACATACTATAA
AAATATAAATAAGTGA
>ref|NC_013316.1|:303826-305058 putative carbamoyl-phosphate-synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGATTAATGATTTTAGGCTCAATTAAGTATTTTGAGAATATTGTTATGTCAGCTAAAAAAGAGG
GAATATACACAATTGTTTGTGATAATAGAATTGATACTCCTGCGAAAAAGATTTGTGATGAAGCAATAGA
TGTTGATGTATTTGATTTTGATAAAATAAAAAGTATAGCTATAGATAAAAAGATAGATGGAATTTTAACT
GGATTTACAGATTCTTTAATGAAACCATATGTTTATATTGCAAATGAACTAAATTTACCATGTGTGATTT
CTTGCAATCAACTTGAATCTGTAACTAATAAGGCTATTATGAAAAAATATTTTAAAAATAATGCAATACC
TACAACTGATTATTGTATTATTGAAAGTCTAAAAGATTTAGAAAAAATACAAGGATTAAATTTTCCACTT
GTAATAAAACCTGTTGATGGTTATGGTTCAAGAGGTGTATATTTTGTATCAAATATAGAAGAATTAATAG
AAAAATTTGAATATTCTAAGGAAGCCTCACAAGATGGACAAGTAATAATTGAGGAATTTTATGAAAGTGA
GGAAATACAAGGACTAGCTTGGGTTCATAATGGAGAGTCACATGTATTTTATATTGGAGATAGAGAGCTT
GTAAATATACATACAGGAAGAGCTGGAAAACCAGATAGATTACTTTATCCATCAAAGTATTGTTTTCAAT
ATGAGGAAGAAATAAAATCTATATATCAAAATATAACACAGGCTTTTGATATAAAAAATGGACCTCTTTA
TGTACAAATGTTAGTGGGAGCATATGGAATAAAGGTATCTGAAGTAATGCCAAGATTACCTGGAGGTTGT
GACTATATGGCTATTTCTCAAATAACAGATTTAGACATAGGAAGTTTATTTGCAAACTTTAGTGTGAATA
ATGAAGTAAATTTTGATGAAATAAAGAAATATAATATGCATTTATCAAAATGTGTATATGCATTACCAAT
ATACATAAGACCTGGAACAATAAAAAAGATAAATAATATAGATAAAATAGAAAACTTAGATTATGTCACT
CAATTTCTATTATTAGTAAAAGAAGGAGATACAATAGGATTATATGAGGATGAGAGACAGGATTGTGGAA
GAGTTTATGGAATAGCAAATAATATATTTGATGCAAATATAAAGAAGAAATGTATTCATGAAATGATAGA
AATATTTGATGAAAATAATGAAAATATGATAGAAAATTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:305069-306022 putative ornithine cyclodeaminase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGATATGAAGCTAATAACTCATGAACAAATTATGTCATTAAACATTTCTCAGAAACAAGGATATG
AATGGATAAAAGAATCTTTTTTAACAAAAAAAGATTGTCAATTACCACCAAAAATAAGCATGGTAGAAGA
AGGTCATGTATTTTACAATGTAATGCCGTCCTTAAATCATAACCATATGATTGGTGGAATAAAAATGGTT
ACAAGATTGCCAGGGAGAAATCCAAGTTTAAATTCAGATATATTTCTATACAATATGAAAGATGCTAAAT
TAAAGGCTATTTTGGATGGTAATTATATTACAGCTTTTAGAACTGCTGCTGTTGCTGGTTTGGCTATTGA
TACTTTTGCTAAAAAAGATTTTAATACTATTTCTATTATGGGTTTAGGTGTAACTGCTTCTGCTATAATG
AATATGCTTTCGTATACTCTTAAAGATAAAAATATAAATATAAAGTTACTTAAATATAAAGACCAAGCAG
AGTCATTTATAAAAAAGTATGAAAAAAATGAACAATTTAGTTTTGAAATATGTGATACACATGAAGAACT
TATTGTAGATTCAGATGTAGTTATTTCTACTGTGACATATACAGATGAATATTTATCAGAATTTAAATGG
TTTAAAAAAGGTGCTTTATTATTACCTGTACATGTTATGGGATTTGGAAATGTTGATTATCTATTTGATA
AAGTATATTTAGATGATTATAATCATTTGAAACATCTAGAAAATATAGATAGATATAAATATTCTTGTGA
ATTTTATAATGTTTTAAGTAAACAAGCTAAAGGAAGAGAAAATGATGATGAGAGAATAATATCTTACAAT
ATAGGTTTGTCAATACATGATATATTATTTGCAAACAAAATTTACGAATTGTGTGAAACACTAAATTGTG
AAGAGATAGAATTAAAAGAACCAAAAGAAAAATATTGGATATAG
>ref|NC_013316.1|:306601-307701 hypothetical protein CDR20291_0247 [Clostridium difficile R20291]
GTGAATTTATTGTTGGTTAAATTTAATAATTTATTAAAACAGTTCCAAACTCATAAAGAAGAATATGAAC
AGAAGATTAAGGATGTAATGGAAAGTGGATATTATATCCTTGGAAATGAAGTAAGGCATTTTGAAGAAGA
ATTTGCTAGCTATGTAGGTAGCAAATATTGTGTTGGTTTAGCCAGTGGTTTAGATGCACTTATAATTGCT
TTTAGAGCATTAGGAATAAGTGAAGGTGATGAAGTAATCGTGCAATCAAATACATATATTGCTAGTGTTA
TGGGAATCAGCATAAATGGAGCAACACCAGTATTTGTAGAACCAAATGAATATTATAATATAGATTCATC
TAAGATAGAAGAAAAGATAAATAGCAAAACAAAAGCTATATTAGTAGTTCATTTATATGGTCAAGCAAGT
AAAATGAAAGATATACAAGAATTATGTGATAAGTATAACTTGTATTTAATTGAAGATTGTGCTCAATCTC
ATGGAGCTAAATATGATGGAAAAATGACAGGAACATTTGGTGATATAGGTTGTTTTAGTTTTTATCCAAG
TAAAAATTTGGGTGCATTTGGAGATGCAGGAGCTATAGTAACTAGTAATGAGGAAATAGCTGATAAAGTG
AAAATTCTTAGAAACTATGGTTCAGAAAAGCGATATTATAATAAATTTGTCGGATATAATTCAAGATTGG
ACGAAATTCAGGCAGGTTTATTAAGAGTAAAACTTAAATATCTAAATGAAATTGAAATTGAAAAATCAAA
AATCGTAGATAGATATCTTAATGAAATTAATAATCCCAAAGTCATACTTCCAAAGATAGAAAATAATTGT
ACTCATGTATGGCACTTATTTGTTTTACAAGTTGAAAAACGAGATACATTTATGGAATACTTAAAGAAAA
ATGGTATAGAGTCTATAATACATTATCCGATACCACCACATCTATCTGAAGCATATGCTTATTTGGGATA
TAAAAAGGGGAGTTTTAATATAGCTGAGAACTATTCAGATAAAGTTGTTAGTATACCTTTATTTGTCGGT
ATGGAAGATGAAGAAGTTAGTTATATAATTAAAATTATAAATGAATATTAA
>ref|NC_013316.1|:308507-308824 flagellar basal-body rod protein [Clostridium difficile R20291]
GTGAATACATATGACATTATAAAAATGGGATTAGATGCAACTAATTTAAGAAGTCAGACAATAGCAAATA
ATATAGCCAATATAAATACTGAAGGATATAAGAGACATTATGTAACTTTTGAAGAAACATTAAATGATGC
TATGCCAAAAATAGAAGAAAAAACAGACAATTCTAAAGGATTAAGAGTGGATGGCAATAATGTAGATATA
GAAGAAGAAAAAGTAAATCAAGCAATGGCAACATTACAATATAATGCTTTGATAAGTTTTGCAAATGGAA
AAATAGCAATGACTAAATCAATAATAAGTGGGAGGTAA
>ref|NC_013316.1|:308850-309236 flagellar basal-body rod protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAATATCTGCTAGTGGATTAACAGCAGAAAGCTTGAAAATGGATATCATATCGTCCAATGTAGCTA
ATATAAATGCCACAAGAGGTCCAAATGGAGAAGCATATAGGAGAAAAGTTGTTTCATTTGAAGAAAACTA
TGATAATAAATTAGGTATGCTAGGAGTAAAAGTTACATCTGTTGAAGATGATAAATCACCTCTTAAAGAA
GTATATGACCCATCTCATCCAGATGCAAAGCCAAATGGATATGTAGAATATCCAAATGTAAATATATTGG
TAGAAATGACAGATTTAATAACAGCTTCACGAGCATATGATTCTAACGTAGATACATTGAATGCTCAGAA
GTCTATGATATCAAAAGCTTTGGAAATAGGAAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:309246-309563 flagellar hook-basal body complex protein [Clostridium difficile R20291]
ATGCCAATTACACAAATTAACAATTTAATGCAAGGTGCAAAGTTAGATAATTTGATTGGAGAAACAAAAC
CATTAACTCTTAATAATAAAGAAGAAAAAAAGAACTTTGAAGATGTAATAATAGATACTATAGATAAAGT
TAATTTTCAACAAGTGACAGCAGATGATATGAAAGAAAAATTTATAAAAGGCGAAGATGTTTCTATGCAT
GAAGTTATGTTAATAGGTCAAGAAGCACAGCTATCTATGCAATATTTAATAGAAGTTAGAAATAAGATTC
ATGATGCATATCAAGAAATGAATAAGGTACAAATTTAG
>ref|NC_013316.1|:309588-311138 flagellar M-ring protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGCCAGTTTTAAAAATAAGATTAAAGAGCAAGTTGCTAAATCTAGGACAAAGATAAGTTCTCTAA
AAAAGGGAACTAAAATAGCATTAGGTATAGGGGTTATTGCTATATGTTTAGCGCTAGTATTTACAGCAAT
ATCTGCGAGCAAAAATAAGTATGCAGTCTTATTTTCAGAACTAGATGTTCAAGATGCTGCAGATATATCA
GCAGAATTAGAGTCTAAAAAGATAGATACTAAGGTAAAGGGAAGTACGATTTATGTACCTAGAACAGAAG
TTGATAAGTTAAGGCTGGAGCTAGCACCAAGTCTTACAGGTGGTTCTAAAGGATTTGCACTAATGGATGA
TAGTTCATCAATAGGACTTACTGATGAAGAGTTTCAGATTAAGAAGCAAAGAATGATACAAGGTGAAATA
GAAAAAACAATAAAGAGTTTTCCACAAGTGGAAGATACTAGAGTACATATAACATTTGGAGAGTCATCAG
TATTTGAGAAGGAGGCTATTCCAGGGAGTGCAGCAGTTTATTTGATGTTAAAACCAGGGACGACTTTGGA
AAAAAACCAAATAAAATCTGTTATGGCACTTATATCAGGAAGTGTTACAAATATACCAGAGAAAAATGTT
CAAGTCATTGATAACAAAATGAATTTATTATCTGAAGGTATTTTAGAGGATGAAGATGTTGATGAAAATA
ATCAACCAACAAATAGTTTGATTAATGTTGATAAAAATAAGGCATCTGAACAAGCATTGAATAAACAATT
AGAAAAGTCTATTTTAGAAATGCTAGAACCAATATTTGGTAAAGGAAAAGTAAAAGCCACAGTAAATGCT
GATTTAAGTTTTGATACAGCTGAAAAAACTGAGATAAAAATTGACCCTGATAAAGTTGCAATAAAGGAGA
CAAGGTCGAAAAATTCATCTAAATCTGCTACAAATAATGTTCAAGGTGTAGATGCTAACATGAATAACCA
AGGAAATAACAATGGTACTAATACAGAAGATAGTTTAGATGAGAGTTTTGAGTATGAAACAGGTAAGATT
GAAACTCACACTATAGTTGCGCCTGGAGAACTTAATAGATTGACAGCTTCTGTTGCAATAGATGGAAAAA
TAGCTAAAGGTGTACAAGCTGATGTAGAGGATATTGTTAATAATGCTATAGGTATGGATGGAGCGAGGGG
AGATACTCTTAGCGTTGTTTCAATGGTATTTGACCCAGAAGGGAAGGCAGAAGCTAAACAAGAGCTAGAA
GAGATTAAAAAAGAAGGATTTAAAAAGAACATAATAAAAGCAGTTATTGGAGTAGTGGCAGTGGTAGCAA
TTGGAGCTATTGGATACTTAATATATAAGAAAAGAAGTGAACGAGAAGATATGGATTATGAAGATGAAGA
TTATATTTCTAAATCTGATTCTGTTGATAGGAAGGATAATCCTCTATTAGGAGATGACCCAGAACTGACA
TTAGAGGAAGCTGTTAAAATGTATGCAGAAGAAAAGCCAGACCAAGTAACAGAGATAATAAAAACTTGGT
TAAATGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:311151-312221 flagellar motor switch protein [Clostridium difficile R20291]
GTGTCCACGGAAATTACAAATGTTAATGCGTTTGACTTAAGTGATATAAATGAAAGTGATAAGAAAGAGA
AGATAGAAGGTGAGGGTTTAAAAAAAGCTGCTGTATTATTAATGACATTAGGACCAAATGTGTCTAGTGA
TATAATAAAAAGCTTGCCTGATAAACAAGTTCAAAAAATAGGTTTAGAAATTGCAAATATTTCTTCAATA
GCTTCAAAAGAAAGAAGAGAAATCTTAAAAGAGTTTGTAGAGATAAATAGGGCAAAAGATTATGTTATAG
AAGGTGGGCTTGAATATGCAAGAGAGTTGTTAAGCAATGCTTTAGGAAATGCTAAAGCAAACAAATTACT
TGAAGGTATATCAATAAATACAAGTACAAAGCCTTTTAAACATATTATAAAACTAGATGTAAAGAAAATA
TTAGAAATACTTAGGGATGAAAGTGCACAAACTATAGCTGTTTTACTTGCACATATGGAGCCAGAAAATG
GAGCAGAAGTTTTATCATACTTAGATTTTGATTTACAAAATGAAGTAGCTATGAGAATAAGCTCAATGGG
TTCAATATCTCCAGAAGTAATAAAGGTAATTGAAAGTTCATTAGAAGATAAATTACACTCAATAAGTGGT
GATGATTTTAAGGATTATGGAGGAGTGTCTACCTTAGTTCAAATATTGATTAATTCTGATAGAAAAACAG
AAAAGAATATTTTGGGAACTATTGAAGAACAAGACCCGGCTTTAGCAGCTCAAATTAAATCTCATATATT
TGTCTTTGAAGATATTGTCAAGTTAGATGATATAAGTATACAAAAAGTATTAAAAGAAGTGACTATGAAA
GATTTAGTATATGCCTTAAAGGGTGTGGATGATGAGATTTCAGATGCTATATATAGAAATCAATCTTCTA
GAGCAGCAGATGCACTTAAAGAAGAAATGGAAATGGTTGGTGTCATAAAAGTTACACAGGTTGAGGCTGC
TCAACAAAAGATAGCAAATATAGTAAGAAAACTTGAAAGAGAAGGTGCCATAACTATTGTAAGGAATTTT
GGTGGTGACTTTGTTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:312202-312945 flagellar assembly protein [Clostridium difficile R20291]
GTGGTGACTTTGTTGAATAATAAGATTATTAAAAGTAAAAAAGCATCATATAAAGGAGTGCTAGATTTAA
CCATAATAGATAAAGTTAGAGTGGGAGAATCAAATGTAAATAAAGAAAATGATTGTAGATTTAGAGATGA
GGTAATAAAAGAAGCTATAGAATCTGCTGAGATAAAAAAGAATGAGATATTAGAAGAAGCAAAAATGAAT
GCACAAAATATAGAAAAACAAGCATATGAAAAAGGGTATAGTCAAGGTCAAAAAAATGGATATGAAGATG
GATATAAAGAGTCATATGATGAATATACCCAAAAAGCTAAAGATGAAGCAGATTTTATAAAAAATCAGGC
AGACTTAATACTATTACAAGCTAATGAGAAGATGACTGAGTACATAAAAGAAAAAAATAAAGAGATTGTA
AGACTTGCTATTAATATGGCTAGTTCTGTTCTAAAAAAGCATTTCGAAGATGAAGAATCTATGAGTGATT
TGTTAAAGCAAATTATTCAAGATTATGAAGGAAGTAGTTCATTTATAGTAAGATGTAATTCTTTCTATAA
AGATAATATAGAGAAAGAGTTTGAATTATTCAAAGAGGAAACATCACTAAAATCAAGTGTATTTGTTATT
GCAGATGATAGTATAGATAAAGGCAATGCTATCATCCAAAAGGAAAATGGAAGAATAATAGTTGGTATCG
ATTGTGCTATGGAAAAACTAAAAGAAGAATTGCTTGGTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:312949-314268 flagellum-specific ATP synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAAAACTGATATATCTATAGATTTTGACAAAATAAATAAGAAAATAGAAAATTTAGAACTCACTA
TATCAGAAGGTAGAGTAAAGAAGATAATAGGACTTACTGTAGAAGTTGAAGGAATAAAAGCTTTTGTTGG
GGAGTTATGTGTTATATACAATCAAGTCAATAAACCAGTGAATTGTGAAGTAGTGGGTTTTAAAGATAAA
GAAGTCATATTAATGGCGTTGGGAGAGCTAACATTGATAGCTCCTGGTTGTAAAGTTATTTCTAAGGGAA
TACCTTTAAGTGTTATGTGTAGCGATAATTTACTAGGTAAAGTACTTGATGGTCTTGGAAATCCTATAGA
CAACTCAGATGCTGTTTTAGGAGATAGATACAACTTGAACAATGAACCTCCTGACCCAATGAAGAGAAAA
AAGATACGAAATATAATGGAAACAGGTGTAAGAGCAATAGATGCATTTACTACTTGTGGTGAAGGACAGA
GAATAGGGATATTTGCAGGAAGTGGAGTAGGTAAGAGTACGACTCTAGGTATGATTGCTAGGAATGCAAA
AGCAGATGTAAATGTAATTGCCCTTATTGGAGAAAGAGGAAGAGAGGTACTAGATTTTATTGATAAAGAT
TTAGGTGAAGAGGGAATGAAAAAATCTGTTGTTGTATGTGCAACATCAGATAAAGCTCCTTTGGTTAGGC
TAAAAGGTGCTCTTACTGCTACTGCAATAGCAGAGTATTTTAGAGACCAGGGAAAAAAAGTAATACTTAT
GATGGATTCAGTAACTAGATTTGCTATGGCACAAAGAGAAGTTGGTATAGCAATAGGAGAACCACCAGCT
CAAAAAGGATATACACCATCTGTATTTGCTATTTTACCAAAACTTATGGAGAGAACAGGGACATCAGATA
AAGGTTCTATAACTGCATTTTATACAGTATTAGTTGATGGAGATGACTTTAATGAGCCAATAGCAGATAC
AACAAGAGGGATACTTGATGGTCATATAGTTTTATCTAGAGACTTGGCAAATAAGAATCATTATCCTTCT
ATAGATGTATTGAACAGTTTAAGCAGACTTATGAATGAGATTGCTTCAAAAGAAGACATAAAAATAGCAT
CTTTTGCGAGAGATATGCTTGCTGAGTATAGAGAAGCAGAAGATTTGATAAATATAGGTGCATATGCTTC
AGGTACAAACAAAAAAATAGATGAAGCAATCTACTATCATGAGCATATTATTAATTTTTTAAAACAAGGA
ATAAATGAAAAGAGTTCTTTTAATGAAACTATAAGTAGTTTAAGAAGAATCTTTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:314300-314746 flagellar protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATTGGATAAAAATTTTAAGTTTAGATTACAGAAAGTTTTAGACTTAAAAATAAAAGATGAAGAAG
AGATAAAAATGGAATTTGCTAAGATTCAACAAAAAAAAATAGATATAGAGAGCAATTTAGAAAACTTAGA
AAGTAATTACAGCAAATATTCTATAAGTAAAAATAATGATAGTGTTCAAAATCAAAAAATAACTATTAAC
TATTTGTTAGCTTTAAACAACTCTATAATGGATTTATCAGAAGAGCTGGATAAGTCGACAAATGAACTTG
AAAAAGCTAGAAAGCAGCTTATAAGCAAACAGATAGAGAGAAAGTCATTAGAAAAATTAAAAGAAAAAAA
ATATGGACAGTATTATAAAGAAGAACAGTTAAAAGAACAAAGCACTAATGATGAGTTTGCAAGCATGAGT
TATTTGAGAAATAGACAAGTTCTATAA
>ref|NC_013316.1|:314774-315979 putative flagellar hook-length control protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGATACAAGCAGATTCTTATAATATTATTAAAGATATTGGGAATAGAAAAAGCTCATCTAAGAATA
AAAATATAAAAAATAATAAATTTGAAGATAATCTATATAAGGCAACAGACCATAAAAAGGTTAAAGATAG
AAGAGAAACAAGTAAGCAAAATGTTAGTTCAGATAAACGGGAAAATAGTGATAATGAGTGTCATTTAGAT
GAAGATAAAAGTAATCACTTAGAAGATGAAAATACATATGAAAAAGATTGTAGTAATAATAATGAAGCTT
TACATCAATTACTGAATCTTTTAAAAGATAATTACAAAAAAGATAAAGATATAAACACTATATTGAATAA
TCTAAAAAAACTAAGTATATCAGATGAATTAAAACAAGAACTTAAGCTTAATAAAAATATATTAAATAAG
ATTGCAAATCAAAATTTAGAGTTAAATAGAGCTAGTACAAATAACCCTAATGATATAGAAAATTTAGACA
TAATGAAGTTAAGAGAACTTTTAGAAAATAATGCTAGTGAAGATATTGAAGTAATTAGTAAAACTACAGA
AAATGATACTAAAAGCATAGACTTGTACAGTTTTGACAGCAATAGAATAGATACTCTTAACTCAAATAAA
CAGAAAGATGATAGTTCTGATATTTTGGAAAAACTAGCAGGGGTAAATGGAAATAAGAGTGGAAATTTTG
GACAAGTAATAAATAAAAGCGTTGATATGAATAAAATTAAAAATGATAATGTTAATTTAAAACAGATAGA
ATCAAATGTAATGGATGATTCTATAAAAGCTATTAAGCATATGAAAACAAATGATATACAAGAATTGACA
ATTAAATTAAGACCAAAAGAATTAGGAGATATGAACATACAATTGTTAAAAGATGGTGAAAGTATGAGAG
CTGTTGTGACTGTTTTCAACAAAGATGTCTTTGACTCTATAAATAAAAACATAGCAGATTTAAAGCAACA
TCTTGAACTTACAAATGTAAATATAAAAGATGTATCAGTGCAAATGCATAGCGATAATACAAATACATCT
GATACCTTTGATAAAGCATTTGAACAACAGAATAGACAAAATAACCAAGAAAACATGAGTAAGCAAAATA
CAAATGATAAGCGTAACAATGTAGTCATAGAAGATGAGATTAAAGAAAATATTATTGATGATGATAGAGT
AGATTTACTAGCTTAG
>ref|NC_013316.1|:315997-316605 putative basal-body rod modification protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTACGGAATAGCAACGGCTTTGGCAGGAACTCAGGTAAACTATAGGTCAAATAATTTAAGCCAACTTG
AAAGAAATATTAATGATATTGCCAATAAACAAGTTAGAAGTAAAGGAAATCAGACAGTAACAGACAATGG
GACTCCAATTATAGGACAAGGCGATGATGCTGATAAAGATTTGTTTATGAAGATTCTTGTAGCACAGATG
GGTAATCAAGACCCAATGAATCCACAAGACCCAACAGAATATGTATCACAATTAGCACAGTTTGCAACTT
TAGAAAAGATGTCAGCTATGAATGATAAGCTAGATATACTTTTAGCCTTAAGCAATTCCACTCTAATAAA
TTCTGCTTTGAGTATGGCAACATCATTAATTGGTAAAGAAGTAGAAGTATCTGGGGAAGAGGAAGAAGAT
GAAAACATTGTAGGAGTAGTAAAATCCACATATATAAAAGATGGGGAAGTACACTTAGAATTAGAAGTAG
ATGGAAGTGACAAAACTGTAGGTGTTAAATATGAAAAATTACTTAAAATAGGAGAGGTAGATGCAAATTC
AGGAGAAGAAAATGACTCTTCAGAACAAGAATCTCCAGAAGAAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:316632-317615 flagellar hook protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAAAGCAATGTATTCAGGTGTAAGTGGAATGAAAGCAAATCAAACAAAACTAGATGTAATAGGTA
ACAATGTAGCCAACGCTGGAACTACTTCTTTTAAGAAAAGTTCAGCTAGAATAACAGATTCATTTTATCA
AACTGTACTATATGCAAGTGCTCCAACAGCGGCATTAGGGGGAACAAACTTAGGACAAGTAGGTGTAGGT
AGTAAGATATCAAGTATAAATAAAGATATGACACAAGGAAATGTACAACCAACTAATAGGCCATCTGATT
TAATGATAGATGGAGATGGATATCTTCCAGTAGTAAGACAAGGAACAGTTATGTATACGAGAGATGGTTC
TTTTAATTTAGATACAGGATTTAAAGCAGCTGATGGTGCTTTGAAGAATATTAAAGGTGGAAGACTTGTA
AATGGTGATGGATATATGTTACAAGGTGTGATTTATGATGGGGAATATAAAGCTGATACTGGAGAATTCA
TTAAAAAGGGTGATGCTAAAGGAAAAGAGCCTATTGTAATACCACTTCAAAGTATAAGTCCTAAGGATGG
AACAGTTCAAAATGTACTAGAGTATAATATATCAAAGGATGGAACAGTAGAATTTTTATTGAGTGATGGT
CAAAGAACTCAATTTGTCTATGATATACCTGATGGTGCTAAGGTAGGAGATACACCTGCTGGAATAGATA
AATTAAAAGGTACAATACAAAAAGTGCAAACATATGCATTCCAAAATCCAGCAGGACTAGATGCAGAAGG
AGGAAACTTATTCAAGCCATCAGCAAACTCAGGAGATCCACAAATAGCAGGAGCTACAGGAAACATAATA
CAAGGGGCAATAGAAGCTTCCAATGTAGATATAGCAGAAGAATTTACAGAAATGATAATAGCAAGTAGGT
CTTTCCAAGCAAACAGTAAAATAATATCGACATCAGACGAAATACTTCAAGAAATAATAAATCTTAAGAG
ATAG
>ref|NC_013316.1|:317628-317831 putative flagellar protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAGAGTAACGGATTTAAACGGAAGAAGATACATATTAAATTCAGACCTTATAGTGAGAATTGACT
CTGTACCAGAAAGTAGGATTCTCCTTACAACAGGAGAAAAAAATCTTGTAAAAGAGTCAGTAGATGAGAT
AGTAGATAAAGTAATAAAGTATAAAAGAAAAGTAAATGTAGGTTATATTAGGAGTGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:317831-318649 chemotaxis protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAACAGATTCACTAACATTCATTGGACTAATATTATCTACAGTATTAGTTTTATTTGGGGCAG
TAAAAGGAAGTAGTTCAGGATTGAAAAGTTTTTTCGATTTTGCATCTATATTAATCACAGTATTTGGGTC
ATTTGGAGCTTTGATGATTACATTTACTATTGATGATATAAAACTTATAAAAGATGCGCTACAATACTCA
TTCAAGACAATGAATATATCGAAATTAGACTTATTAAATCAATTTAAAACACTTTCTAAAAAAGCAAGAA
GAGAAGGACTTTTATCTATAGAAAGTGATGTAATGAAAATACAAGACCCATTTATGAAAAAAGGGTTAGA
GTTATGTATTGATGGCCTTGAAGTAAATGAAATAAGGTCTATACTAGAACTCGAAATAGATTCTGTTGAA
GAAACCAATAACAGATATTCTAAACTATTTAAAACTTGGGGGACTTTCGCACCTGCATTTGGTATGTTGG
GAACTCTAATAGGTTTAATACAAATGTTATCTGACCTTACATCTCCAGATTTAATAGCATCGGGTATGGG
AAAAGCATTAATTACGACATTTTATGGTTCTTTACTTGCTAATATCGCTTTGAACCCAATTGCATATAAT
ATAGATGAGAAGACTGAAAAAGAGATTTATGTAAAGGAAATGATGCTGGAAGGTATAATAAGCATACAAT
CTGGGGAGAGCAGCATAGTAGTTGAGGAACGTTTAGCTACATACCTTTCAAACAATGAGAAGCTAGAAAT
TATGAAATCCAATAAAAATACAGAAAGAGCAATGAGTAATGGCGCGTAA
>ref|NC_013316.1|:318639-319334 chemotaxis protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGCGCGTAAAAAAAATAAGAAAAAGGATGAGATAAATCCAGATGCATGGTTGGCTACTTATGCAGATA
CTATAACACTGATTCTTACATTTTTTGTGTTATTGTATGCTACATCAGTTGTAGATATGGAAAAATTTAA
AAACATAGCAGATGCGTTAAAAGGTCAGTTTTCTGGGATAAGTATGTTCAGTACAGGTTCAAGTACAAGT
GAGAAGTCTCCAATAGAGAGTGTTTTAGTGGATAAAAATGATAAGTCAAATTTAGAACAGGATTTAAAAG
ATAAAGTTAATAATTCTAACTTACAAAATAGTGTAACAGTCAAAGATGATAGTAGAGGGATTTTACTAGA
ACTAGATGATTCAATTTTATTTGACTCTGGGATTTCTGAATTAAAAGCAGATAGTAAAGCCACTCTTAAT
AAAGTATATGACATGATAAAGATGATGAAAAATAAGATAGTTATAGAAGGCCATACTGATAATGTACCTG
TAAAATCAAGTACACATGAATCCAATTGGGATTTATCTTCTAGTAGAGCAGTAAGTGTTGTAAGATACTT
TGTAGAAGAAAAGGGCATGGACCCTAGACTATTTTCGGCAACAGGATGTGGAGAGTATCAACCTTTGGTT
TCAAATGAAACAGCAAAGGGAAGGGCTGAGAATAGAAGAGTTAATATACTTATAACTATTGACTAG
>ref|NC_013316.1|:319346-319789 flagellar basal body-associated protein [Clostridium difficile R20291]
TTGTTCAAAAATAAAAAAATTATTATAATTATTTTGATACTGATTATTTTCTCAGCAGGAGCAGGTTTTT
TTATATTAGGAGAAGGTGGAAATAAACAAATTGACAAGATTGCAGGTTTGTTTATTCCAACAGGGAAAGG
CAAAGATGAAGTAAAGACCGAAAATCTTGACTTAGAAGAGATGGTATTAAAGCTAGCTGATGAAGGTGTA
AGATATTTAAAAGTATCAATAACTGTATCTTATGATTCTTCATATAAAGATATAGAAAAAAATACGCCTT
TAATTAGGGATAATATTATAAATTGTTTTATGGCAAAAAGGGCAGATGATTTTACTGCTGATAATTTAAA
GAACATAAAAGAAGAAATTAAAAATACATTAAATATACAACTAGGTGAAAATGTAATTCAAAATATATAT
TTCACAAATATAGTAGTGCAATAA
>ref|NC_013316.1|:319804-320178 putative flagellar protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATACTTTATTTACTAAAAATATTAATATGTATCCCAATAATTTTAATATTGATAGTCTTATCTTTAA
AAATTAGCCAAGGAACTTTATTAAAAAAATATAATGATAAATATATAAAAATACTAGATATTGTAAATAT
AAGTAAAAACAATAGCATAATAATTTTAAAAATAGGTGAAGAAGGATGCATTATGGCATCTTCTTCCTCT
AGCATGAATAAAATAAAAGATTTGACCAAAGAAGAAATATTAAGAATAGAAAACGACATTAAAGAAAGAA
ATTTTAAAATTCAAGATTTTAAAATGGAAAGAATTAAAAAGAAATATGATTTCAGTAGATATATTGGAAA
ATTTACAAAAAAGGAAGATAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:320179-320844 flagellar biosynthetic protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAACTATTATCAAAATTACCTTTGGCTGATGTACCATATACAAGTTCAATGCAATTGTTTTTATTTC
TAACTGCATTAATGTTTTTACCATTTGTAATGTTTATGATGACAAGCTTTGTCAGAATAGTTATAAGTTT
ATCATTTTTGAAATCAGCATTAGGAGCACAGCAAGCAATTCCAAGCCAAATTTTGGTAGGGCTTGCAATA
GTATTGACAATATTTATAATGAGACCAGTATTAAATGAGATAAACGAAAAGGCATTACAACCATATATGA
AAGAAGAAGTTACTATGGAAGAAGCTATGAAGGAAGCAGAGGGACCTATTAAAGAATTTTTATTAAAGCA
AACCAGACAGACAGATTTAGATTTATTTGTAGAACAGGCTGGTTTGAAAGAAAAGAAATTAACTCGTGAA
AATATACCACTATCTGTTGTAGTTCCAGCATTTGCTATAAGTGAACTAAAAACTGCTTTTCAAATAGGTT
TTTTAATATATATACCATTTTTGATAATAGACCTTGTTGTGGCAAGTGTTTTGATGTCTATGGGTATGTT
TATGTTGCCTCCAGTCATGATATCATTACCGTTTAAGTTATTATTATTTGTAATGGTGGATGGATGGAAC
TTGATAGTAAAAACATTGATATTGGGATTTGGATAG
>ref|NC_013316.1|:320857-321126 flagellar export protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTGAATTTATGATAATGAGTGTTCTTAAAAATGGCATGTTTACAGGAGCTATGATTGCAGCTCCAG
TACTCATTGTTTCTCTTGTAGTTGGGCTTTTAATAAGTGTGTTTCAAGCTACAACTCAAATCCAAGAGCA
AACTTTGACTTTTGTACCAAAACTAATAGCAATTCTTTTAGTAGTAGCTATTGGTGGAAGCTGGATGTTA
CATACTCTTATTAGCTTTACTTCGGAGATATTCAATATGATGTCTCTTATAACTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:321138-322952 flagellar export protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATTTTTGTATTTATTAGAATAGTGGCATTCTTTGGAACACTAAGGATACTATTTCCAGCTGGTACAC
CTGCTTTATTTAAGTCGCTCTTTGCAATCATTATATCAATATTGATTTCAAGTACTATGCAAATTGAATA
TGCAACAAATATAGACAACATTGTATTGTTTACCTTATATGGTATAAATGAGACCATAACTGGCATTATG
CTTGGATATATAACCAATCTATGTTTTTATAGTATCAGAATGGCAGGTTCTATGATGGATCAACAGATGG
GATTATCAATGATTAATATGTTTGACCCAAATTCAATGACTCAGACAACTTTAATTGATAATCTTATGAA
CTGGACAGCACGTATGATATTTTTTAGCATGGATGGTCATCATGTTTTAATTAGAGGCATAAGGTATAGT
TTTGAGTTAATTCCAATAGGGAAATCATTCGTAGATAATAATATAGATTATATAATAAACATATTTGTGC
AGTGCTTTTTAACTGGATTCAAAATAGCAATACCTATTGTACTTTGTCTGCTTATGGCAGATTTTATATT
AGGGCTTATATCAAGAAGTGTACCTCAACTAAATGTAATGATAATTGGTATGCCATTAAAAATACTGGTT
GGTATTGCGTTATTTATCATATCAATACCTTTAATTGTCAATCAAATAAGTCATTTATTAAGTCAAATAC
CAAAGATGTATGAGGGAACTTTCGCACTAGCTCCTATGTTTTTTATGGGTTCAACAGATAAAACAGAAGA
GGCTACTCCAAAGAAAAAGGGAGAACAAAGAAAAAAAGGTAATATAGCAAAGAGTAAAGAATTACCCGTT
GCAATGACTCTACTTGCATTCACTTTATTAGTACCTACATTATTTTCATATGTAGTGGATACACTTAAAT
CTTCTCTTAATTATTTTTTGAGTCTAGATTTTTATATGAATATAAATTATTCAAGTATAGAGAAATTAGT
TATAGCAGGATTAATGGATTTTTTTAAGATATTTTTACCAATAGCTATTCCATTCTTAGTTTTAGGTATA
GTCGCAAACCTATTTCAAGTGGGAATACTGTTTACTGGTGAAACTTTAAAACCCAATTTATCAAAATTAA
ATCCAGTTAGTGGATTTAAAAACATGTTTTCTATGAGAAGTTTGTCAACCTTAATAAAGGATACAGCGAT
TATATCTATTTTGGCTTACATAGGATATACATTCTTCCAAGATAATTATTTAGATATATTAAAGCTAGGT
AACATATACCTGCCAACTTTAATGTACACAGTTAAAGATTTAGTATATTCAATATTAAGTAAGATTTGTG
TAGCTATGATAGTTATAGCAGTTGCAGATTATGTTTATCAAAGATACAGTCATAAAAAGCAACTTAGAAT
GACAAAACAAGAAGTTAAAGATGAATATAAAAACTCAGAAGGAGACCCAGAAATAAAAGCTAAGATAAAA
CAAAAACAAAGACAAATTTCGTCTCAAAGAACCATGCAAGCAGTACCAAGTGCTACTGTAATAGTAACCA
ATCCCACCCACTTATCTATAGCAGTGAGATATGAAAAAGGGAAAGACCAAGCTCCAGTAGTGGTGGCAAA
AGGTGCAGATTATTTAGCTTTTAAAATAAGGGAAATTGCAAAGGGAAATGACATACCTATAATAGAAAAT
AAACCTATTGCTAGGTTGTTATATAAGCAAGTAGAAATAGACCAAGAAATTCCAGAGGACATGTATCAAG
CTTTTGCAGAGATATTAGTAGCAGTATATAAAATCAAAAATAGATACAAAGTCCTCAAAAGGTAG
>ref|NC_013316.1|:322961-325036 flagellar export protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAGTTTAATTTAAAGGAAAATATGGACGTAATAGTGGCATTTGGTGTTGTAGGGATTGTTCTTA
TGATGATAGTGCCGTTACCTACATTTATATTAGATATTTTACTGGCAATTAACATAAGTTTATCTGTGCT
AATTTTACTAATGACATTATTTACAACAAATGTACTTGATTTATCTATATTTCCAACAGTGTTACTTGTG
ACAACACTATTTAGATTGGGATTAAATCTTTCATCAACTAGATTGATTTTAACACAGGGATATGCAGGTG
AAGTTATAGAGGCATTTGGAAGTTTTGTTGTAGGTGGAAATTACGTAGTAGGAATAATTATATTCTTAAT
TATATTAATTGTTCAATTTGTTGTTATAACCAATGGTTCTGGAAGAGTATCTGAAGTAACAGCTAGATTT
ACGTTAGATGCCATGCCAGGTAAGCAGATGAGTATAGATGCAGATTTAAATGCAGGAGTTATAGATGACA
AAACTGCTAGAAAAAGAAGAAAAGAGCTTCAACAAGAAGCAGATTTTTATGGCTCTATGGATGGAGCAAA
TAAGTTTGTAAAGGGAGATGCCATAGCAGGTCTTATAGTAACAGCAATAAACATAATAGGTGGAATTGTA
ATAGGAGCTGTAATGCTGAATATGACTCTTATGGGTGCAGCACAGACATATGTAAGACTTACTATAGGGG
ATGGTCTTGTAAGCCAGATACCTGCTCTATTAATATCTACATCAGCGGGTATAATCGTAACAAGAGCTTC
TACTGATGAAAACTTTGGTGGATTAGTAAGTAAACAGTTAACGGCAATACCAAAAGCAGTAATGATGACT
GGTTGTGTTCTAATCGTACTTGGTATGATGCCTGGATTACCTAAACCAGCATTTTTTTCACTAGGTATAG
GTGCTATAGCAGCAGGTTACTTTTTAGGAAGAGAAAAGAAAGATACTTTAGAAGACTTGGAGTTTGAAAA
ACCTGATATGGTAAATCCAGATAAAAATGAAGTAGAAGATGTAACAAACTTAATAAATGTAGAATCAATA
GAAGTAGAAATTGGATATGGTTTAATATCTTTAGCTGATGAATCAGCAGGAGGAGATTTACTTCAGAGAA
TAGCATCAATAAGAAGACAATGTGCAATAGACATGGGTATAGTCGTGCAACCCATAAGAATAAGAGATAA
TTTACAGTTAAATCCAAACCAATACAATATAAAAATAAAGGGAAATGTAGTTGGTGGGTATGAGATAATG
CCTAATATGGTTTTATGTATGGACCCTATGAATCAAGGATTTAGTATATTTGGAATAAAGACAATTGAGC
CTACTTTTGGAATAGAGGCACTTTGGATAGAAAGTGACAAGGTAGAAGATGCAGAGATAAAGGGTTATAC
AGTTGTAGATTCATCCACAATACTTATAACTCACTTACTAGATATAATAAAATCAAATGCACACGAATTA
CTGGGAAGACAAGAAGTTAAGACTATTATAGATGCAGCAAGAGAAAATTATAGTGCTGTAGTAGATGAAT
TGATACCAGATTTAATGACACTTGGTGAAATTCAAAAAGTACTTAAAAATCTGTTAAGAGAAAAAGTAAA
TATAAAGGATAGGGTTACAATACTTGAAACGCTTGCAGACCAGTCTAGAAATACAAAAGATATAGAGCTT
CTTACTGAATATGTAAGAATAGCCTTGGCTAGAAGTATTTGTAATAATTTAGTTGATGATGATAAGACAA
TTGTAGTGGCTACATTGTCTCCAGAAACTGAAGAGTTGGTATCTAATAATTTACAAAGGTCTGTAAATGG
AACTTATCCAGCAGTTGACCCAGAAAATACAAATAAAATATTTGAGAGTATACAAGAAGTAATGAACAAT
GTATATTTCAATCATAATATACCAGTAATAGTAGTATCACCAAAGATAAGAGCTCCATTTAGAAAATTAG
TTGAAATTGTATATCCTAATTTGACTGTATTATCATTAAATGAAATACCTAACGATATTAAAATCAAAGC
AGAAGGTGTGGTGAGCATATATGATGACGAAAAAGTATACAGCTAA
>ref|NC_013316.1|:325014-326027 signal recognition particle complex, GTP-binding subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGACGAAAAAGTATACAGCTAACACAATTCAGGATGCTATGAATCTAGCCAAAATGGAATTGGGTGACA
ATATTACATTAATAGATAAAAAAGAAGTAAGAAAGTCTGGAATACAAGGTATCTTTTCAAAGAAAGATAT
TGAACTAACTATTGGATGGGAAAAGAGAGAAAACGTAGAACAAAAAGATTTAAAACGAGAGATAGAACAA
TTAAAGTTAATTATTAACAATATGGGGTTTGATAATAAGAATGATAATGATATAGATAAAATATGTAAAA
ATCTACTAAGTTTAGAATTAAATGAAGAAATTGTAGAATCTATAAGAATTGATTTGCAAGAAATGAAGTT
CAATGGAATTGATACAAGCAAAAATTTAGTAGAAATTTTAAAGAAAAAGATTAAAATAGAAAATCAAGCA
ATAAATGGTAAAATTGCTCTAGTCGGACCACCAGGAGTAGGTAAAACGACTACAATAGCAAAGTTAGCCG
CAAAATTAGTTTTTGAAGAAAATAAAAAAGTAGGAGTAATAACTATAGATACATACAGGATTGGTGCTGT
AGAACAGTTGAAGATATATACTGATATAATGAATATTCCTTTTAAAGGGGTAATAAGTCCCGATGAAATG
GAATTGGCACTTGATGAGATGAAAGATTGTGATGTTGTATTAATAGATACAACAGGTAGAGGCTATAAAA
ACTCTATGCAAATACTAGAAATCAAAAATCTTATAGATAAAGCTGAAACTGATAATATACATTTAGTTGT
GAATTGTACAACAAGAGAAAGTGATACAAAAGCAATTATAGATTCATATAGAAATGTGAATTTTAAAAGC
TTAATAATTACAAAGCTAGATGAAACAATAACATATGGCTCAATATTTAACATAATGAATTATGCACAAA
AACCAATATCATATATTACAACAGGACAAAATGTTCCTGATGATATTATAAAACCTAATGAAGATAAGAT
TATAAGGTTACTATTAGGAGTTGAAAGTATATGA
>ref|NC_013316.1|:326024-326902 flagellar number regulator [Clostridium difficile R20291]
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AGAATGAGAATGTACCTAAGATAATTACAATAGCTTCTGGTAAAGGCGGTGTTGGAAAGAGTAATCTCGC
TACAAATTTGTCTATATGCTTGACCAAACTTAATAAAAAAGTTCTTATATTAGATGCAGACATAGGAATG
TCTAATATAGATATAATAATGGGGGTAAATGTAAAAGGGACTATAATTGATGTAATTAATGGCGAAAAAA
ATATAGAAGATATAATTTCACAGACTAAGTATGGTGTAAATATAATATCTGGAGGTTCTGCCCTTAATCA
TATAGAAGACTTTACAGAAGCTCAAAGAAATAAGTTTATACATAGCATAGAACAGATTCACGATGTGGAT
TTTATAATAATTGATACAGGAGCTGGTATGAGCAAAAGCCTATTGTCATTTATATACTGTAGTACTGAAT
TTTTCTTAATAACAACTCCAGAACCGACATCATTGACTGACGCATATAGTTTATTAAAAGCTATAAGTAA
TTTTGGCATAAAGAGAAGTGCAAATATAATAATCAATAGGGTAATTGATTTAGAAGAAGCAAAATCTACA
TACAAAAGAATAAAAATGGTTGTGGACAAATTTCTAAACCTTAATCTAGAATTGTATGGATATATAATAG
ATGACAAAAAAGTAAGTTTATGTGTAAAAAAACAGATACCATTCATTTTAGAATATCCTACAAGTATTGC
ATCAAAATGTATTATAGCCATAGCAAAGAGAATGGTAAGTCAGTCAAGAGAAGATATTGTTGATAATAAA
AGTTTTCTAAGAAAGATGTTTAGTATATTTAAAAGCTAA
>ref|NC_013316.1|:326916-327617 RNA polymerase sigma factor for flagellar operon [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAGAGAAGAATTAATAAAAGAGAATATGCCTCTTGTAAAGAGTATAGCAAGAAAATTTTTTATAC
CAGGGAAAGGTTTTGAATATCAAGACTTAGTAAATAGTGGAGTCATTGGATTGATTGATGCAATAAATAA
ATTTGATGCTGAAAAGGGGGCAAAGTTTTCTAGTTACTCTTATATAAAAATAAAATCTGCTATATTAGAT
GAAATTAGAAATCAAAGTCCAATTTCTAAACATAATCTAACTAAAGTAAATAAGTATAATAGAGTGGTAG
AAAAGTTGCAATCTAAATTATTAAGAGAGCCAACTTCATATGAAATTGCAAAAGAATTAAATGTTTCAGA
AAAAGAACTTCATGATATCGAAAGTAATATAGACATGTTAAATATTGTATCATTAAACTATGTAATCTTT
GAAGATACAAATGAAACTGTACAAGATGTAATAAGTGATAGAGAAGAGGAAGCTCCAGAAAATATAATAG
AAGAAGAAGAAAAGTTAGAGATTCTATCTAAAGCAATTAGTAATTTAAATGAAAGAGAAAAATTAATACT
TTCACTGTACTATTATGAAGATTTAAATCTAAAGGAGATAGGGAAAGTGCTAGGTGTTTCAGAATCAAGA
GTTTCACAACTCCACAGAAAATCAATAAGAAACTTAAGAAACAAGATAAAAGAACTTAAATATTCTATAT
AG
>ref|NC_013316.1|:327633-328055 hypothetical protein CDR20291_0271 [Clostridium difficile R20291]
ATGATACAAATTATATTAATAGTAGTGTCTATTTTAATAATAGTAACTATAGTTATAAATTTACATAAGG
AATCAAAAAATAAAGATAACAGATACTTTGATAAAATATTTGAGCAAGAATATGAAGCAAATGATAGATT
AATAATTGCAGAAAAAAGAAGATTCTTTTTAGACAAAGTACTTGCTGAAATAAGAAGTAATAATCATATA
AAAGTTTATGAAAATTATAACCTAATAAAGGCTAATGAAGAAAGAAAGGAAAACATATTTATAGAATCAA
AAAAGGAAGTAAGACAAGAAAATGAGTTATCTCTTAAAGTGAAACATCTTATAAGTTCAGGTTATGATGA
TGTGGAAATATGTAAGATGCTAGATATTGGAAAGGGGGAACTGTCATTAATAAGGAGTTGTTACAAAATA
TAA
>ref|NC_013316.1|:328266-329039 flagellar basal-body rod protein FlgG [Clostridium difficile R20291]
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ATAACCTAGCTAATATGGATACAAATGGATATAAAAGTAAACAACTTTTGACTAAAAGTTTTGATGAATT
AAAGTTGGAGGGTTACAATAACTACGCAAATGGAACTAAACAAAAGCAGATTATAGGCGATATAAGTCCA
GGTATTTCTATGGATGAAACTATCACAAATTTTAATCAAGGACCTATAAAAACTACTGATAATAAAATGG
ATGTAGCTATTCAAGGTAAGGGATTTTTTCTAGTTAGTGATGCAGCTGGAAATCAATTTTACACTAGAAA
TGGGAACTTCAGAACAGACAATCAAGGTGACCTTATAACAAGTGAAGGGTATTATGTACTTGGGACGAAT
ACTGCTACTGGTGCTGTAGGTCATATAAATGTAGGAAATCAAAAATTTGAAGTGGCAAAAGATAATACAA
TATCACTAGATGGAAATGCTATGTATAAATTCAATATTGTAGATTTTAATGACTACAATAACTTAAAAAA
AGAAGGAGATAACTTGTATTCTGGAGGAGGAGCTATGAAAGTAAATAATGCACTTACAATACAAAGTGCG
ATAGAGTCTTCTAATGTAGATATGGTATCTGAAATTAATAATATGATGACCATATCAAGAGAATATGAGG
CAAATCAAAAGATAATTCAGGCTATGGATTCTAAATTAGCAAAAATAGCAAGTGAGATTGGTTCAGTAAG
ATAG
>ref|NC_013316.1|:329060-329821 putative flagellar basal-body rod protein [Clostridium difficile R20291]
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ACAATATAGCAAATTCTGATTCAACAGGATATAAAAAAATAAATATGGAATATTCTGATTTAGTGGATGA
AGTACTAAATAGACCATCATATCCTACAAATGGCAATGATATATCGACTGGAACAGGAGCTAAGGCAACA
GCTCCCATGAGAATTTATGAACAAGGTGCATTGGCCCCTACAGATAGTAAGAGTAATTTGGCGATAGATG
GAGAAGGATTCTTTAGAGTGATAAGAAAAGATGGTACATATGCATATACAAGAAATGGTGGATTTAATAT
AGATGGTTTAGGTAAGATTGTAGATGATAATGGAAATATATTAGATGTTCAATTTGATGCAGGATATAAC
TATAATAATACGAATATAGATAGCACAAACTTAACAGTTTCAAGAAATGGCGAGTTATTCGTAGATAATA
AAAAAATAGGAAAAATCAATTTATATCAACCTATAGGAACTCAAAATTTTATATCTGAAGGAGATAGTTT
ATTCGTCGCAACTGATGCAGCACAGATTAAACAAGTTGAGAAAGTAGATATAGTTCAAGGCTATAGAGAG
AGGTCAAATGTTTCTTTACAAGAAGAATTTGTTGACTTAATAGCCACTCAAAGAGCATTTCAAATGAACT
CAAAGGGAATAAAGACAGCAGATGAAATGTGGCAAATAGCTAATAATTTAAGAGCTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:329844-330725 putative flagellar motor switch protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGATATGAAAGAGTACGATTTTGGCAAACCTCAGAGTTATTCAAGAGAAAATTTAACTTGTTTAA
ATTTTTTATTAGCTGAATTTTGTAAAAAATATAAAAACTATATAATTTATGAACTTAAGTGTAATTCTAG
TATGATTGTTGATAGTATAGACCAAGTAAATTATCAGACTTTTTTAGATAGAGTAACTTCTTCATGTGTA
GTAGTACAAAATGCAATGGAACCTGTTATGAAAAACTTTTCTTTTAGAATAGATAGAAGTGTAGCTGATA
TGTGGATTGATATAACTTCTGGAGGAACTGGAGTTATAAAGGATAATGATAGAGAGCTTACAGAACTTGA
TAAAAAAGTGCTTTTACATCTTATGGATGATTTAGTAAGAAATATGCACTTATTTGAAGGTTTTGAAAAT
ATACAAGTATTGGATACACATACACATATTAATTTACCACAATTATGTTCTCCAACTGCACCAGTATGCG
TTGTAGATTTAAAAGTGCTAAATGATAATGAGTATATTGGAAGTGTTTCTCTTTGTTTTCCGTATAATGG
TTTAGAGGCTCTATTAGAAAGTATATCTGTTATAGAATTTTTTGATAATGATGTAGGAGATGATTCAGAG
GAATTTACCAAAAAAATCTATAATAGTGTATCTAATATAGAATTATCAGTTATTGCAGAGATAGGAAAAG
TATCAATTAATGTTGAAGACTTACTTAAACTAGAAGTTGGAGATGTAATAGTAACAAATAAAAAAATAAA
TGATTATATAGATATATTTGTAGAAAATTCAAAATCATATACAGCAACACCAGGATTTATATCAAGCAAA
AAAGGTGTAAAAATAAATGATGCTGTTGGAAAAGAGGTGTAG
>ref|NC_013316.1|:330728-331102 putative flagellar motor switch protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGACAATAGTAATCTTATTTCAGATGAAGAAGCAAAGATGTTATTAAATGATAAAGTTGAAAGTGAAG
TTGATGGGGATGATGAGTTAGCCTTAGATGTCTCTGAAGTTAATCGAAATAATATACAAAGGATACTTGA
CCTTAAGTTAGAATTATCTGTAGTTATAGGGAGAACTAAGATGACTCTAAGAGATATTTTAAATTTACAT
AAAGGTTCTCTTATTGAACTGAATACTTTAGCAGACCAAGATGTGGAAATACTAATAGATAATAAGGTTT
TGGCTTATGGAAAAGTAGTGGTGGTAGATTTAAATTTTGGTGTAAAGATAACAAGTATAGTAAGTGAAGA
AGACATGGTAAAATCTCTTGTTTAG
>ref|NC_013316.1|:331134-332537 hypothetical protein CDR20291_0276 [Clostridium difficile R20291]
GTGGTACTTATTTTAAACTTAAATGATATAAAAAAAGATATACTAAAACTCAATAAAAAAGACTCATGTT
CTCTATATAATGAATCTATTAATAATATAAATAATAATTGTATATCAACTGGATTAAAATTTTTAAAACA
AGCAAGAGATTTAAACCCAGATGATGTTGATATATTAAATCTCACAGGTCTTGTAAACTTACTAAAATGT
AATTTTGATGATGCTGTAGAAAGTTTCTATAAGAGTTCACTTTGTGAAAAAACTGCTCTGTGTGAAAAGT
ATATAAACATGCTTACATCTGAGGAGTTTTTAATTTTCTTTGAAAAGTACAATCAACTTATAAGGTTAAT
AAATAAAGGAATGTATAAAGAAGCTATACAAGGGTTTAAACTTATAACTGACCAATACTGTGATTTAATA
GAACCTTATGAGTTGCTTGCCTTACTGTATGACAAGGAAGAAGAATATATAAAATTTGATGAATGTTTAG
AAGTATTGAAGATTATTGATAAGGAAAATTATTTATTAAATCAAGAAAATAACACATTAGATATGTATAA
TAGTGCTAATATACAAACTAAAAGTAATGTAAAAGTAGATGATTATAAGAATGAGTTTTTACATAAAAGT
AGTAGTAACCATAAAATTAATGATTATAATAATGTAACTAAAGAAAAAAGTTCAAGCAAAAACCAGAAAA
GTTCAGATTCTAATAAGAAAAAAAGTATTAAAAAAAATAAGTACCTATATATAGCCATAATATTAGGAAT
ATTATTAGTAGGACAAAGTATATATAGTTCTTATAAGATGAATAATTTAACTGATAAAATATCTAAAAAT
AATGAAACTAAAAATGAAGAGTCAATAGATTCTAACTTGACTAAGAAAGAAAATAATATAGAAGAAAATG
AAGATATGAGTAAGGCTTCTAATATAAATAAGAGTAATAAAAACATTAATAAAGAGGCTGATGTAAAATC
TAAAAAAAATACTGTAGAAAATGAAGATGATAAAGATTCTGACTTATTTACAGAGGATGAATTGATGTCT
AAGGCGAATACTTTAAAATCAGAAAAAAAAACTAAATCTTCTATACAACTATATAAGAAAGTTGCAGATA
TAGGTGAAAATAAAGGGAATACATCTGAAGCAACTTATCAAGTTGCTATTCTCAGTGAAAAGTTAAAAGA
CTATAAAACTGCTGAAGAATATTATAAAATGTATGTAGAAAATTACTCAGAAAAAGATGCTTATTTTGAT
GAATCTTATTATAATTTAGGGATGATGTACTATAACAATGGTGATTTAAAAAATTCTAAATTGACATTAA
AGAAGTTAGTTAATAAGGTACCAAATAGTATGTATAATAATTCAAAAGTAAAAGAAATTTTAAAAGAAGA
ATAG
>ref|NC_013316.1|:332653-334590 chaperone protein (heat shock protein) [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATTTGAAAAAGGGAGTATTTCAATTCATACAGAAAATATTTTTCCTATAATTAAAAAATGGTTAT
ACTCTGATAAAGACATATTTATAAGAGAGCTTATAAGTAATGGATGTGATGCAGTAAGCAAACACAAAAG
ACTTGTATCACTAGGAGAAATATCAGAAAATAAGTCATCAGATTATAAAATTACAGTATCTGTAAATAAA
GGAGAAGGTACACTTAAATTTATTGACAATGGAATTGGTATGACTGAAGAAGAGATAAAAAAATACATAA
ATCAAGTTGCTTTTTCAGGTGCTGAAGATTTCTTTAATAAATATAAGGATAAGATGGAAGAGTCAAATGA
CATAATAGGTCATTTTGGATTAGGATTTTATTCTGCATTTATGGTGTCTAAAAAGGTACAAATAGATACA
CTTTCATATACAGAAGGAGCGACTCCTGTAAGATGGATATCTGAAGGTGGTACAGAATACGAAATATCTG
AATCAGATGCTAGAAATGATAGAGGAACTACTATAACACTATTTATTGATGATGATAGTAAAGAATTTTT
AGATGAATTTACTGTAAGAGGAATAATAAATAAATACTGTTCTTTCTTACCAGTAGAAATATATTTAGAA
GATGTTGAAAGATTAGAAAGAGAAGCTAAAGAAGCAGAAGAAAAAGCTAAAAAACAAAAGGAAGATGGAA
AAGAAGAGATTGTAGATGCAAAAGTAATTGAGCCTTTAAACGACACTAATCCTCTATGGTTAAAATCTCC
AAAAGACTGTACTGATGAGGAGTATAAAGAGTTTTATAGAAAGGTATTCAATGTATTTGATGAACCTTTA
TTTTGGATACATTTAAATGTAGATTATCCTTTCAATTTAAAGGGTATACTTTACTTCCCTAAATTAAAAA
ATGAGTTTGAACTGACTGAAGGAAAAGTAAAATTATACAACAATCAAGTGTTTGTGGCTGACAATATAAA
AGAAGTTATACCAGAATTTTTACTTTTATTAAAAGGTGTTATAGACTGCCCAGACTTACCATTAAATGTA
TCAAGAAGTTTCTTACAAAATGACAGGGATGTAAGCAAAATTTCTAAACATATAATTAAAAAAGTAGCTG
ATAAGTTAAAATCTCTTTGTAAAAATGAAAGAGAAGAATACAATAAGTTTTGGGATGATATACAAATATT
TATTAAATATGGTTGCTTAAAAGATGAAAGTTTCTATGAGAAGGTAAAAGAATGTATATTATTCAAAACT
ATTGATGATGAGTATATAACAATACAAGATTATTTAGAAAAATGTAAGGACAAACATGAAAATAAGGTAT
TTTATGTAAGTGATAAGGAACAGCAATCTCAATACATTAAACTATTTAAAGAATACGACTTAAGTGCTGT
TGTTTTAAACTCATCAATAGATACTCATTTTATTTCATTTATGGAATATAAAGAGAATGGAGTTAAGTTT
AATAGAATAGATGCAGACCTTTCTGATGTATTAAAAGATAAAAATGAAAATAAAGATAGTGAAGAAAACA
AAGAAGAGATAGCTAAGATAGAAGGTTTGTTTAAAGAAGCTGTTGGAGAAAGAGTGAAGAATTATTCTGT
AGAAGGATTGAAAAATGAAGACACTCCAGCTATGGTATTAGTATCAGAACAATCTATTAGAATGGCAGAA
ATGCAGTCAAGATTTGCTGGAATGGATTTAGGAATGAATTTTGAGGAAGAAAAAACTCTTGTAATAAATG
AGAACAGTCCAATAATCAAAAAATTGGTTTCTCTTAAAGATGATGAGGAAAAGAAAGATAAGATTACGCT
TATTTGTAACCAGATAGCAGATTTAGCTTTACTTTCTAATAAAGAATTAAAGCCAGATGAGTTAGATTCA
TTTGTACAAAGAAGTAATAAGCTTATGAGTCTTTTGATAGAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:334978-336108 putative 1,3-propanediol dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTTAATTATAATTTGCCAGTAAATATCTTATTTGGGAGAGGCAGAATTAATGATGTGGGAAAAG
AAGTATCTAAATATGGCAAAAAAGTATTGATAGTAACAGGTAAAAATAGTACAAAGAAAACTGGATTACT
TGATAAAACAATAGATTTACTAAAAGACTCTAAAATAGAATATGAAGTTTTTGATAGAGTAGAACAAAAT
CCTCTTATAACTACTATATATTCAGGCGTAGAAATTATAAAATCAACTGGATGTGATTGTGTTTTAGGGC
TTGGTGGTGGAAGCATTATGGATGCTGCCAAGAGTATAGCTTTTTCTTATAAAAACCCAGGAGATTTAAA
TGATTATATATTTGGAATTAGACAAGGTGAAGAAGCTTTACCTATAATCTTAGTTCCAACAACATCAGGT
ACAGGTAGTGAAGGAAATTGTTTTGCAGTACTTACAAATTCAGAAACTAAAGATAAAAAATCTATAAAGA
AGAATAGTATGTATGCAAAAGCATCAATAATTGACCCAGAACTTATGGTTACAATGCCAAAGCATATAAT
TGCATCAGTTGGATTTGATGCACTTGCCCATAATATGGAAGCATATCTTTCTAATGGAAGAAACCCTCTT
GCAGATGTACAAGCTATTTATGGGATTGAACTTATATCAGAAAACCTAATAAAGGTATATAATGATGTTA
ATGATTTAGAAGCATGGGAAAAAATAACACTTGCAAGTACTATTGGAGGAATGACGATTGGTACAGCGGG
TACAGCCTTGCCACATGGAATGGAGCATCCTGTAAGTGGTCTTAGAGATGTAATGCATGGAAAAGGACTT
GCAGCGTTGACTCCTACTATTATAGAAAGTTCATGGGATATTGATATTGAAAGATTTGGTAATATTTCAA
AGGTATTAGGAGGAACTTGTGCAGAAGATTGTTCAGATGCAATTAGAAATTTCCTTAAAAAAATAGATTT
AGATATAAAACTAAGTGATTTAGGTATTGAAAAATCAGATATAGATTGGTTAACTGATAATTGTATGAAA
ATATCAGTTGCAAATATTAAGAGACATCCAAAGTATTTTAATAAGGAACAAATAAAGGAAATGTACCATA
AGTCTTTATAA
>ref|NC_013316.1|:336335-337357 spore photoproduct lyase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAATCCCAAAAGAATAATATTCGAAAAAGGAACTTTAGACACTGATGTGGGCAAAAAAATATACA
ATAAATTTAGAGATAATAAAGATGTAGAGATAATTAATATATCATCAAATAGGATTAAAGAACACATTCC
AGGTGAAAATCTATATGAACAATATAGAAGTGGGAAGCAGACTATGGTAGTTGGGATTAGAAAAAGTCTG
AAGTTTCAAACATGTAAACCTTCTGCTAATTATCAACTACCACTTGTCAGTGGATGTATGGGAAGATGTG
AGTATTGTTATTTGAACACACAATTAGGTGATAAACCATTTATAAGGGTGTTTGTAAATGTAGATGAAAT
ACTTGAACAGACAAAAAAATATATTGAAGATAGAAAGCCACAGGTAACCATATTTGAAGGGGCAGCTACA
TCAGACCCAGTTCCAGTAGAGCCATATACTAATTCTTTGAAGAAAACAATAGAGTTTTTTGGAAGAGAGG
AAAAAGGAAGATTTAGATTTGTTACTAAATACAGTGATGTGGATAGCTTATTGGATGCTGAACATAATAA
TCATACAGAAATACGATTTAGTATCAATACTCCTAGAATTATAAATGAACATGAGCATTATACAGCCTCT
GCAAATAAAAGAATAGAGTCAGCTGTAAAACTTGCTAGGGCTGGTTATCAGATTGGTTTCATAATAGCAC
CTGTGTTTTTATATGAAGGTTGGAAAGAAGAGTATAAAAATCTGATTATAAGTATAAAAGAAGCTTTACC
AAAGGATTTTGATAAAAAAATTATATTTGAAGTTATATCTCATAGATATACAACTAAAGCAAAAAATAGA
ATACTAGAGATTTATCCAGATACACTATTGCCAATGGAAAATGAGGATAGAAAGTTTAAATACGGTCAAT
TTGGATATGGTAAGTACGTGTATGATAAAGAACAATTAGATGATATGAAAGAGTTCTTTCTTAAGGAAAT
AAATGGAGTATTTAAAAATAGTTTAATAAAATATATAATATAG
>ref|NC_013316.1|:337539-338450 AraC-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGCATGCATGGGAGTCTATTCAAATTACATTGGATTTAATAGAAGCAAATTTATCAGAAGAAATATCAA
TTAATGAATTAGCAAATAAAGCAAATTTATCACCATTTTACTATCAAAGACTATTTAAAAGATTGGTAAA
TAAGACTGTAATGGAGTATATAAAGCTTCGTCGTCTTGCAAGAGCTTCTGAATACTTAGCAGAACATAAG
AATCGTATACTTGATGTAGCTTTAAATTTTGGATTTGCTAGTCATGAGACATTTACACGTTCCTTTAAAA
AAGCATATGGATTAACTCCAGAAAAATATAGAGCAAATCCAGTAAAACTCAATCACTTTATTAAGCCAGA
ATTAATTTTAAATTATGCTATGGTTGATGAAGGTGTTCCACTGATTGCAGATGATATAGTGATTGAAGTC
AATCGTAAGACATTGAGTAATCCAAGGACATTTGTTGGAATAGAAATAGAAGTACCTATTTGCCAGTTGG
TGGGTGGTGAAACAACTGGAATTGCAATAGTAGAGGAATTATGGATGAAACTTGGAAGTCAAAGACATAA
TATACCAAATCAAATTCCAGGTGGAAATGAATTTGCTGCTCTTTATATGGGAAATGCAAAAGAAGGAAAT
TGTATGTATATGGCAGGTGTAGAGGTAGAGTCAGGTACATCAGTAGAAGGATATAATACTTTTGAGTTGC
CAGCTAAAGAATATTTAGTATGTGGATTTGAGGCAGAAAACTTTAATGAGTTAGTTAATTCAGCTGTTTT
TAAAGCAGATAAATTTATGGAAAGATGGATGAAGAAACATAATTTAACAACTACTGATTTTGCAATTGAG
ATGTATTACCCCACTACACCTGAAGCAGCATATCTGGAACATTGGATTGTTCCGGTTCCTATTGAACAAT
AG
>ref|NC_013316.1|:338465-338881 hypothetical protein CDR20291_0281 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTGGCAAGATGCGTTTTTTCAAGATACTAAACCTACATTTGAGCAAATTAATGAATTTATTAATA
ATCCATTATGGGACAAGTTAAATAAAACTTTGGTTTCTACTTATAATGTAGAACCTAAGCTTGAATACAG
TAAATGTTCAATGCAAAGAGGTTGGAATGTAAAATATAAAAAAAGAGGTAAATCACTATGTACTTTATAT
CCACAAGAAGGTTATTTTAAAGCTTTGGTTATTGTAAGTGAAAGCAATAGAGTAGAGGTTGATTTATTTA
TTAATACTTGTTGTGATTATATCAAAAAAATATATAATGAGGTAAACTTTTTTAATGGAAGTAAATGGCT
AATGATTCAAGTAGATAGTTTATTGGTATTAAACGATATGCTTGAACTAATTAAATTTAGAGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c339367-338975 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTATAAATACTGAAAAAAATATAACTAAAAACGTTGAAGAATTAACCTGTCCAATCCGTTATGCAT
TAGACATTGTCGGTGGTAAGTGGAAATTACCTATTATATGTATGTTAGCAGTTGAAAATCCAATTAGATA
TAGTAGCATAAAAAGAAAATTGGATGGCATTACAAATACTATGCTAGCTCAATCATTAAAAGATTTAGAG
TCTACTGGTATTGTTCATCGTAAACAATATAATGAAATTCCTCCAAAAGTTGAGTATACATTAACAAGTA
AAGGTAAAAGTATTGTGCCTATTTTACAACAATTTGCTAATTGGGGTGCTACTAATATGCAAGAAAAAAA
CACATGTGGACTTAGTTGCAAAGAATGTAGAAAGATAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:339508-339903 hypothetical protein CDR20291_0283 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGCATTAGAATTTTTGAACAAGGCAGGAGTTTATTATTTAGCAACAGTTGATGAGAACAATCAAG
CACATGTGCGTCCTTTAGGATTTGTTATGGAATACAATGGTAAACTTACATTTTGCACATCTAATCAAAA
GGATATGTTTAAGCAACTTATTTTTAATCCAAAGGTTGAACTTTGTTGTATAGACCAAAACCTTAATACT
CTACGTATTTTAGGTGAAGCAGTATTTGTTACATCAAAAGAAACACAAGCTAAGGCACTTGAAATAATGC
CAAGTTTAGGTCAGATGTACTCTGTGGGAGATGGTAAGTTTGAAATATTCTCTATTGATAAGGCAAAAGT
TAGTTGTTGTTCAATGAGTGGTAAAAAGATTGATGTAGAGCTTTAA
>ref|NC_013316.1|:340306-340512 hypothetical protein CDR20291_0284 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAATATAGTTCTTTATGGGAATATGTTAAGAAAAATAATAGTCAATCGTTTAAATTAACTTTTG
AAGAAATAAAAGATATTGCTGGAATAGAGATAGACCATTCGTTTTTGAAATATAAAAAAGAATTAAATGA
ATATGGATATCAAGTAGGAAAAATCTCTTTAAAAGAGAAGACTGTTATTTTCAATAAAATTGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c341656-340823 putative phosphoesterase [Clostridium difficile R20291]
TTGTCTAATTATGTAACTATTGATTTTCTTTCCTATTCGTTTTATAATATAAATTACGTTACCCTCATCT
TTTATAGAGGAGGAATTTATATGAATTTTTTATCAGATTTACACACCCACTCTATAGTCAGTGGTCATGG
CTATAGCACTTTACTAGAAAATATTAATTATTGTAAAGAAAATGGAATTAAGATACTAGGTACATCTGAA
CATGGTCCTAAGATGCCTGGTTCTCCCCACAGATGGTACTTTCACAACATTCAAAATATCCCAAGAATCA
TAAATAACATTATAATTTTAAGAGGCTGTGAAGCAAATATACTAGATATTAAAGGAAACATAGACCTAGA
GCCTTTTGTAATTCCTCGGTTAGATTATCTTATCTTGTCATTTCACGAAGCTGTTTTTTCTCCAAATACA
TTAGAGAATAATACTAAAGCTTTAATAAATGCAATAAATAAGCATGATAATATTGAAATATTAGGACACC
TTGGAAACCCAAACTACCCAATCGACTATGAATTAATCATTAAATTAGCTATAGAAAAGAATATCTTAAT
AGAAATAAATAATTGTTCTATTAAAGGCGTGTCAAGAAATGGTAGCTCGGATAACTGTAAGTATATTGCT
ACACTTTGCAAAAAATATGGTGCTAAAATCATACTAACTTCAGATGCTCACATTTGTTTTGACATAGGTA
ACTATGAGTATTCTGAGAATATCTTAAAGGAAATTAATTTTCCAGATGAATTAATAATGAATTATCCTAA
AAAACTTATTAATCATTTTCACCAAAAAGGTAAATTACTAGATGTTGATTATACAAATATCTAA
>ref|NC_013316.1|:341732-344299 putative transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
ATGACACAAAAGAAGCTATCAAGGAAAGAAAAAGTTTTAATTTGCTTGAAAAGGTTAACAGAAGAACACT
TGAACTTTAATAATGGCATTAGATTTGGATTTGATGCAGAATATATAGCTACTGAAGTAGGTATAAATAG
AAGTAATGCTAGTAAGGAATTAAATCAATTAATAAAAGAAAGTATTATTATAAAGATAAAGGGTAAGCCT
GTTCAGTACTTATATAAAGAAAGTATTGAGAGTATTTTGGGAAAGAAACTAAATAAAGGGATATTTGATA
ATATTAACTCTATAAACGAATATAGTGAAAATGATTCTATCAAAGATGAGTATATTTTAGAGAGTATAAA
AAAAGAGAACAATATTTTTAATTTAGTAGGATGTGATGGAAGTTTAAGGTCCCAAATAGAACAGGCTAAA
GCAGCAGTAATATATCCACCTAAGGGGTTGAGTACATTAATAATAGGACCTACAGGAGTTGGTAAATCTA
TATTTGCAGAATATATGTATAAGTATAGTTTAACTATAAAAGAAGATAGTGATAATGCACCATTTATCAT
ATTTAACTGTGCTGATTATTCTGATAATCAGCAATTATTATTAGCGCAGCTTTTTGGATATGTAAAAGGA
GCATTTACTGGAGCTGATAAAGATAAGTATGGTATTGTACATGAAGCTAATAATGGAGTATTGTTTTTAG
ATGAAGTTCATAGATTATCTGCAGAGGGACAAGAAATGCTATTTCTGCTTATGGATAAAGGGATATATAG
AAGGTTAGGAGAGGCTAATAAGGTACACGAGTGTAGAGTTATGATAATTGCAGCCACTACAGAAGACCCA
GAAACAGCAATGTTGGAAACGTTTTTAAGAAGAATACCTGTAACTATAAAGATTCCGTCTTTAGAGGAAA
GAGGCTTTCAAGAGAGAATGAAGCTTATATGTTATTTTTTTAAAGAAGAGAGTGTTAGGATTGGTGTTAA
GTTAAAGGTTTCAAAAGAAGTTATTAAGGCATTTATTTTATATAAGTGTAAGGGAAACATAGGCCAATTA
AAAAGCGATATACAATTAATTTGTGCAAGAGCTTTTTTAGATTATATGACCTATAAAAGGGAATGTGTAT
ATGTAAGGCTCTCTCTTCTACCAAATAATATTAGAGAATCATTATATGGAAATAATAGAAAAGAGGAGTT
TGTACAAAATTTCAGTTTTATTGGAAAAGATGATATTATTTTTTTACCAGAAGAAAAGGATTTTGAAAGT
GAAAATTTATTAATAGAAAATAAAAAATATGATTTAGATTTTTATGGAATGATAAAAGAAACTTGGAATA
AACTTCAACAAGAAGGTATTAAAGAGTCACAAATTAGAAGTGTTATAGATGGAGACATACAGAAGTATTC
CTATAATTTAATGAATACTTTTATATATAATAATAGTAATCAAACAGCTTATAACAACATTGTTAATGAT
TCAATTGCAACTACTGTAAAATATATTTTACAAAAGCATGATAAATGGAGCAAAAGAGAAGGATTAGATA
AATTAATAAAAGCTATAGCCTTACATATTCAGAATTTAATTGAAAGAATAAAGATTGGAAATATAGTAAA
GCATCCTAATAAAGATGAAATTATGAAGGAAAGAGCATATGAATATAACATAGCAAAAGAAATATTATCT
AACATGTCATTAATGTATGGAGTAGAGTTTCCAGAAGATGAAGCAATTTTTTTAGCAACATTTCTTTATT
TATCGTATGTGGGATTAAATGAGGAGAGTATAGCAATATTAGTCATAATGCATGGTGAATCTACAGCATC
TAGCATGGTGAATGTAGCCAATACTTTACTGGATTGTAACCATGCAGTGGCAATTAATATGGGATTAGAA
GATAGAGTTCAGGATATTTTAGTACAAGCTGTAGAAATAGCCAATAAAATTGATAAAGGAAAGGGAATTT
TAATTTTAACTGATATGGGGTCTATTTTAACATTTGCTAAAGTTATTCGTGATGCTACAGGAAAAGAAGT
AAAAGCAGTAGATATGGTAAGTACACCTATTGTAATAGAAGCAACTAGAAAGGCTCTAACTCCAGAAATG
ACATTAGAGAAATTATATTTTAATATTATAGAATCTATAAAGAAACATTATGGAGATATGGAAGTTACAT
ATGCTGAAAAAGATAATGGTGGTAGATATTTTGATAGACTACTAATTGATAATATTAGTAAAACTTTGAC
TTTTTTAAATGGGGAAAAGGCTTATTTTATATTAAAAGAAGTAATTAATAGAATTAGTGAACACTATTCT
TTAGTAATTCAAGATGAACTTTTAGTAAAGTTTATATTTCATTGTTCATGTATGATTGAAAGAGTAATAA
TAAAAGAGTCTTTAGTTTATAAATCATATGAAGAAAGAATTAGTAGAAATAAAGAATTATATTTAGTTAT
AAAAGAAAGTTTTAAGCTAGTAGAAGAGACATTCGATATAATTATTTCAGATATGGAATATGCAAATATA
TTAGATATATTTGAATCACAATATGATACAGATAAATTCAAAAGTTGA
>ref|NC_013316.1|:344520-344933 PTS system, IIa component [Clostridium difficile R20291]
GTGAAATTGGTGATAGGAATAATAGTTATGACTCATGGGAGTTTTAGTGAAGAAATTATAAAAAGCTGTG
AACTTATTGCAGGACCAGCAGAAAGAACAGCAGCAATTAAACTAAATAGGAATGATAATATTGAAGACTT
AAATAAAAATTTTGTAGAAAAGTTAAATGAATTAGATGAAGGTGACGGAGTTTTAGTATTAGCTGACCTA
TTAGGAGGTTCGCCAAGTAATGTTGCAAGTTTAAACCTTAAAAAAGGTGGCAAGTTTCATGCACTTACTG
GAGTAAATCTTCCAATGCTACTTGAAGCTTTAATTAATAGAGAGGGAAAAAGTTTAGAAGAGTTAGCAGA
AGCATGTATTGAAGCAGGACAAACTGGTATAAACAATATTAATAAAGTTCTTAGCTCAATGTAA
>ref|NC_013316.1|:344957-345454 PTS system, IIb component [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTTTAGTAAAATATTGCAGATGTGATGATAGATTAATACATGGTCAAGTGATATATAAATGGGTTA
AGCATCTAGGTGTAAAAAAGATAGTAGTAGTAGATGATGAAACAACCAATGATGTTATTGCTAAAGGTTT
GATAAAAATGGCAGCACCAAAGAATATTGATTTATCAATATTAACTGTAAGTGAATCAAGGAGATATTTT
TATAATAATCAAGCTGATGATAACGTTTTTGTATTAATTAAAAATTTAGATACTGCAAATAGAATGATAG
AAGAAGGGATTAATATCAAAAAACTTATTGTTGGAAGAATACCTACAGGAATAGGAAAAAAGAAAATATC
TCAAAATGTATACATTAATAAAAAAGAGTTTCTTTTAATAGATGAATTTATTAAAAAGAATATTAATGTA
TCAATTCAAATGGTACCTGATGAAGAAGAAGTAGAATTAAACCAAAATATTAATCGCTATAAAGGAGAGT
TTATTTAG
>ref|NC_013316.1|:345457-345858 putative PTS system, IIa component [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAATATAAGGTAATTATACTGTGCCATGGAACTTGGGGAAAAGTCTTAGTAGAAGAAACAAATA
AAAACTTTGGATTGTCAAATCAATATGAAGTTTTATCACTAAGTTCTGAAAAAGATGTTTCTGTATTTAT
GAAAGAGGTTGAAGAAGTAGTAGATAAAGAAGATGTGAAAATTATAATATCAGATTTATATGGAGGATCT
ACATCAAGTGTTGCAATAGCTGTTGCTATAAGAAGAGGAATAGATGCAATAAATGGACTTAGCTTACAGA
CAATTTTAATCGTAGATGAAGAATTAAGCAAAGAAGATAAATTACATACATTACCAGAAAGAATCGTCAA
AAAAAATAATAACCTTTGTGTGGATTTAATTAAAGAATTTAAAAAAATATAA
>ref|NC_013316.1|:345876-346364 PTS system, IIb component [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAAAAATAACATTAGTAAGAGTAGACCACAGATTAATTCATGGGCAAGTTATAACAAAATGGGTAA
AAATCGCTCAAGCTCAAAAAATAATAATAGTTGATGACTTCTTAGGTCAAGATGAATTTATGGCTGACAT
ATATAAAATGGCAGCACCATCAGGAGTAGAAGTAGTTATTTTAACAGCAGAAGATGCGGGACAAGCATTC
CAAAACAACACTTTAGGAGATAAAAATATATTTATTCTATTTAAAAATGTTGATATGGCAAATAAGGCTT
ATAAAGCTGGACTTAAATATGAAAAGATTCAATTAGGAGGTATTCCAAATGAAGCAGGAAAGAAAATGGT
GTTTACAGCTGTTTCATTAGGAAATGAGGATGTAGAACAACTTAATGAACTTAATGAAAATGGGGTTGAA
ATAGTCCTACAAGTTATACCAGAGGAATCATCTATGACATATGAAAATGCGTTAAAGAAATTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:346391-347146 PTS system, IIc component [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATCTGTTTTGATGTTGGCAATTGTAACAGGATTATGGTATTGGTTTGCAGCAGGTCTTGCAGGGT
ATACCCTTTTCTCAACACTAAAGTCTCCTTTATTTATAGGTTTTAGCCTTGGATTACTTTGGGGTGATGT
AACAACTGGTATGATTGTTGGTGCAAGTATAGAAATGGTTTATCTAGGAATGGTCGCAGCAGGGGGAAAT
ATTCCATCAGATAAATGTCTAGCTGCTCTTATTGCAATACCAGTAGCACTTCAAACTGGTGTTAATGCAG
AAGTTGCAGTATCTATTGCGGTACCTTTAGGTGTTATAGGAGTATTAGTTAATAACTTAAGAAGAACTGG
TAATGCTGTATTGGTTCATAAGGCAGATAAGTATGCTGAAGAAGGTAATACAAAAGGCATCTGGAGATGT
GCAACACTTTATTCTTTAATATTTGGGTTTGTTTTAAGATTTCCAATAGTTTTTGTATGTAACTTTTTTG
GAGCAGATTTAGTTCAATCATTATTAGATGTTATACCACAATGGTTAATGAATGGATTAACAGTAATGGG
CGGTATATTACCTGCATTAGGTTTTGCAACAACAATATTTACTATAGGTAAAAATAAATTCTTACCAATG
TTTATTATAGGATTTTTTATGGTTCAATATTTTGAAATATCAATTACTGCAGCTGCAATATTTGGTGTTT
GTATAGCTCTTTTAATTACCTTTATGAAAGAAGACAAAAGGGTAGGTGAAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:347146-348009 PTS system, IId component [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAGAAATAAAAAATAAAGAAGTTAAAAATGGACAAGGTCCAACTGAAGTTAATAAGACAAGAGTAC
TCACAAAGAAAGATGTAACAAAAACATACCTAAGATGGTGGTGGACAGCAGAGTTATCTAATTCTTTTGA
AAGAATGCAAGCATTAGCAGTTTGTGCAAGTTTCACTCCGGCTTTAGAAAAGTTATATAAGAAAAAAGAA
GATTTAGTAGATGCATTAAAGAGACACTTACAATTTTTTAATACTCAAGCTATATGGGGAGGATTAATTC
ATGGTACAGTTTTAGCTATGGAAGAAGAGAAAGCTACTGAAGGAAAAATCCCAGGAGAAGTTATTTCAGG
TGTTAAGAATGGTCTTATGGGACCTTTGGCTGGAATTGGAGATACTTTAGATTTTGGTACATTTCAAACA
ATATTCTTAGCTTTAGGTGCTTCATTTGGAGCAGAAGGAAGTGTTATAGGTGCATTTTTCCCAATAATGT
TTAGTATATTACTATTTTGCGAAGGTTATTACTTATTTCATTTAGGATATTCTTTAGGTAGAGATTCAAT
TAAGAAAATTCTATCAGGTGGTATTGTCAATAAGATAATTGATGGTGCTTCAATTCTAGGAATGTTTATG
ATGGGAGCATTATCTGCAACTACAGTTAAGCTTTCAACTCCGCTATCATTTGATATTGGTGGTAAAGCAA
TTGTTGTTCAAGATACATTAAATATGATTGCTCCAGGTTTATTACCACTTGGTGTTGTATTCTTCGTATA
TTGGGGAATGAAATACAAGAAGTGGACAATAACTAAGTTATTAGTAATTTTAGTTGTATTAGCATTGGTA
GGATCATTCATTGGAATATTCTAA
>ref|NC_013316.1|:348056-348535 hypothetical protein CDR20291_0293 [Clostridium difficile R20291]
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TATGGTTCTATCTTCTTATGAAAGAAGCTGAAAAATTAGGAGCTAATCCAGATGATATATGTAAAGAAGC
AATATATGGATTTGGTAAAATGAGAGGTCAAAAATATAACGTAGCAGATACTCCAGGAAAAATGGCAGAA
ATGTTATATAACAGTAAAGGACAAAAAGTGTTTGAAATGGAATTAGTAGAAAATACAGATGAGAATGGCG
TTTTAAAATTCCATCACTGTCCATTAGATGCTGCTTGGAAAGAATATGGATTAACTAAAGAAGAAAGAAA
AGAAATTTGTAGATTAGCTTGTTATGGGGATTATGGAAGAGTTGACTGTGCACAAGGTGTTAAATTAGAT
TTTGCTCAAAAATGTGCTCATGATGATGAAGTTTGTGAATTAGTATTTACAAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:348600-349907 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATATAAGCAGAAGTGTAGATAATAGTTTAAATAGAACCATAGAATTTCTAAAAGAATTGATAAAAA
TTGATTCACAACAAGGTGAACCTATTTCACAATGTCCTTTTGGTATAGGACCTAAAAAATCTTTAGATAA
AACTTTAGATTACTGTGCTAGTTTAGGTTTTAGTGTTAAAAATATTGATAATTATATTGGATATGCAGAA
ATTGGAGAGGGAGAGGAATTAATAGGGATTCCAATGCATTTAGATATAGTTCCACCAGGAGAGGGGTGGA
GTGTAGACCCATTTTCGGGAGCAGTAATTGACAATATTATTTATGGAAGAGGTGTCATAGATAATAAGGG
TGCTGTATCTATGCTTATACATGTATTGAAAAACATAGAGGATATGTATCCTACAATTAATAAAAGAATA
AGATTAATTTTTGGTACAAATGAGGAGACAGATATGAAATGTATCAAATATTACTTAGATAAAGGTGAAG
AAATTCCAAGTATGGGATTTACTCCAGATGCTATGTATCCAGTGGTTAATGGAGAAAAAGGAAGGGTTCA
TATAAGGATAGAAAAAGAAATTAAAATTGACAAAAGTAAACCTTACATAATAGTAAGGGGAGGAACTAAA
GAAAATGTTGTTCCATCTCATTGTACTGCAAAAATTATTAATGGAATTATTTCAGAGTTAACTACTAAAG
GAGTAGCTGTACATGCAAGTAATCCTGAAAAGGGAGAAAATGCTATATCTAAAATGGTAATAAAGATAGT
TGAGGATAATATGGATTTTCAGCATAGAGAAGATATAGAATTAGTTTCAAAATACCTTTGTAGTGATTAT
TATGGAGATGCATTGGGGATTAATCAATATGATGAGGTATTCAAAAACACTACCTTAAATTTAGGAATAT
TAAAAGTAAATGAGGAAAAAATCGTATGTGAGTTAGATATAAGGTATGGTAAAAATATAGTTTTAAATAA
CATAATAGATAGATTCAAAAAGGTTTTTTGTAATGGTTGGAAAATAGAGGTTATTGCTCATAAAGACTTA
CATTATGTGGATGAGAGTAATTTAGTACTTAAAAAATTATTAGAAGCCTATGAAGAAGTAACAGATGAAA
ATGGATATACAATTGCTATGGGTGGTGGCACATATGCAAGTTGGTTTAAAGATATGGTGGCGTTTGGACC
TAAGTTCTTAGCGTATAAAACTGGTGGTCATGGAGTAGATGAAAGAGTACCAATAAATCATATACGAAAG
AATATGGAGATATATACTTTGGCTTTAATAAAACTATTAGAATTGTAA
>ref|NC_013316.1|:350870-351964 DNA-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGAATTAAACATCGCAAAAACGCTGATTTTAAAGCGTAAAGAAAAAGGAATTACACAAGATGAAC
TTGCAAATTATATAGGCGTTTCTAAAGCTTCTGTATCTAAATGGGAAACTGGACAAAGCTATCCTGACAT
AACCTTTTTACCGCAACTCGCGACATATTTCAACATTACCGTTGATGAGTTAATATGTTATGAACCTCAA
ATGATGAAGGAAGATATTAATAAACTGTATAATAAACTGTGCAAAGACTTTACGGTTAAACCGTTTGATG
AAGTCATGGATGAAATAAGAGAAATCATAAAAAAATATTATTCATGTTTTCCTTTGATTTTTCGGATGGG
TCTTTTAATAGTTAATCACTATGATATTGTAGATGAAAAAAAGCGTGAACTATTAATTAGTGAAGCATTA
GAAATATTTATTCGTATACAGGAAACTTGTAATGACATAGATATTTGCCGTCAAGCAAAAAGTATGGAGG
CAACTTGTTATATATTGTTAAATCAACCCATACAAGTGATTGATTTATTGCAAAACAGCAATTTTCCCAT
GATAAATGAATCTATACTTCTTGCACAGGGGCAAATGATGAATGGTCAAATGGATGAAGCAAGAGAAACA
TTTCAACTTGGTGCATATCAGAACCTTATATCATTAGTCCAAAATCTAGTGGGTATTTTGCAAAATGCAG
ATAAATTACAAATGAAGGAAATAGAAAGACGTATTCTAGCAATTTCAGATATATTTGAGCTTGATACATT
ATCTCCTGCTATTATGCTTTCTTCATATTTAACACAGACACAAATTAATTTAATACATGGGGATAATGAA
GGAGCTATTAAATCATTACGAAAATATGTAGATTTAGCAACACGTGATATATACCCAATTATAATACATG
GGGATGACTTTTTTAATAAACTTGACAGATGGATTTCTGAAATTGGAACAGGTATTACACGTGATGATAC
AATCGTAAAAGCAGGTATTGTTGCTGCTATTAAAAATAATCCAATGTTTTCTTTATTAAGTGAAAACAAA
GAATACAAATTTCTTATAGAAAAATTATCTTTATTGGAGGAATAA
>ref|NC_013316.1|:352166-353086 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATGAATATTGTCTCAATAAATGGATTATCAAAAGGTTTTGGTAATCGAAAGATAATAGATAATCTAA
ATTTTACTGTACCAGAAGGGTCAGTCTTTGGGTTTGTAGGTAAGAATGGTGCAGGTAAGACTACAACAAT
GAAAATGGTACTTGGGTTACTTGAACCAGATAGTGGAACTATAGATGTTTGTGGTGAGAAAGTGACATAT
GGAAGAACAAGTTCTAATCGTCATGTAGGTTATCTGCCTGACGTTCCAGAGTTTTACAACTATATGAGAC
CACTTGAATATCTTTCTCTTTGTGGTGAAATTACGGGGCTTTCAAAAAAAGAAATAAAGATAAGGAGTGA
AGAGTTGTTATCACTTGTGGGGCTTGGCAATGAAAAGAGACGAATAGGTGGGTTTTCTCGTGGAATGAAG
CAACGACTTGGTATAGCTCAAGCTTTGCTTTCACGTCCCAAATTACTTATTTGTGATGAACCAACAAGTG
CACTTGACCCTGTTGGTCGAAAAGAAATATTAGATATTATGCTTAAAATCAAAGACTCAACAACTGTAAT
ATTTTCAACACATATACTATCAGATGTTGAAAGAATCTGTGACCATGTTGCTATACTAAACAAAGGAAGC
ATTGCTCTTAGCGGTACACTTTCAGAAATAAAAAGTATGCACGGAAAGGATAGACTTTTACTGGAGTTTG
CAAGTAATAATGAAATTCAAAAGTTTAAGTCTAGTGGTGGCATTAAATCCTTACTAAAAGATTCAGAAGA
AACTAATATGGAAATTGTTTTGCATGGTAAAGATATAAAAGCAATACAAAAAACAGTTATATCTACACTC
GCAGAAATGAATCTTTGTCCAGTAAAGATGGAACTAATAGAATTGTCACTTGAAAATTTGTTTTTGGAGG
TAGTAAAGTGA
>ref|NC_013316.1|:353083-353841 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
GTGAGAGAATACATAGCATTTACAAAAAAAGAGTTTAAGGAGAACATAAGAAATTATAAATTACTTAGTT
TGACTATTTTATTTTTAGTATTTGGAATAATGAGTCCTCTTTCTGCAAAATTTATGCCAGACTTGATTGC
TCATTTTGCTCCAACTTTAAAAGTTACTACTGCACCAACTGCTTTAGATTCTTGGACACAGTTTTCTGGA
AATATTTCTGGTCTTGGAACGAGTTTAACTCTAATTGTTTTTTGCAATATTTTATCAAACGAATATTCTA
AAGGAACACTCGTTATTATGTTGACTAAAGGGTTATCACGTTCATCTGTAGTATTGTCTAAATTTTCTAT
TGCAGTAATTATTATGACAATTGGTTTTTGGTTGAGCTTTTTATGTACTTATGGATATACAATGTATTTT
TGGCCAACTGCAAATCTTAATCATATTATATTTTCAGCATTTAACTTATGGTTAATTAGTATTATGTATA
TTTCCATATTAATTCTTGGGTGTGTACTATTTAGACCAGCATTTGCAAGTGTGTTACTTGTATTAGCAGC
AACTGCTATTTTGAGTTTGATTTCTATTCCTAAACAGATTGCACCTTATACGCCTAATTTCATATTATCA
AAAAATATAGATTTAGTTTCAGGTAAAGTGACACCTCCAGAATTTATTATTCCAATCATTGTAACAATTG
TTATTTCGATAGTATGTCTGTTATTAGCTGTTGTTTTGTTTAATAAAAAAGCAGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:354224-355297 putative iron-sulfur-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAGTCAAAAGTATATTTTTGTGATTTATACTCAAATTCGCAAAATAAAAACGTACCAAACAATG
TAAGAAGATTATTTGATGAAGCAGGATTCAAAGATTTAATAGAAAAGAATGACCAAGTCGCAATTAAACT
TCACTTTGGAGAAAAGGGAAATACTACATATATGAGTCCTGTGGCAGTTAGACAAGTGGTTGATAAGGTT
AAAGACTGCGAAGGAAAGCCATTTTTAACAGATACAAATACACTGTATACAGGGAGTAGAACAAATTCTG
TAGACCATCTTACAACTGCTATAGAAAATGGATTTGCTTATGCAGTTGTAAATGCACCAGTAATAATTGC
AGATGGATTATATAGTAGAAATTATGAGAATGTAAAAATAGACAAAAAACATTTTGAAAGTGTAAAAATA
GGTGGAGAAATTTATAATTCTTCTGCAATGATAGTAATGAGTCATTTTAAAGGTCATGAAGCAGCAGGTT
TTGGAGGAGCATTAAAAAACTTAGCTATGGGATGTGCAAGTGCAGCAGGAAAACAAATGCAACATTCTGA
TGTTACTCCAGTAGTAAAGGAAAAGAAGTGTGTAGGTTGTGGAAAGTGTGTTAATTCTTGTCCTACAAAA
GCTATAAGTATAGTGGATAAAAAAGCAGTTATAGATTCTGATGTATGTTATGGATGTGGAGAATGTCCAA
CTGTCTGTCCAACTAGAGCAGTAACTATACAATGGGAAAGTGACTCAGATGTGTTTGTCGAAAAGATGGC
AGAATACGCTTATGGAGCAGTATCAAATAAAAAAGACAAGGTAGGGTATATAACTTTTGTTATGAATGTA
ACTCCACTTTGTGATTGTGTACCTTGGTCAGGTAGACCAATTGCCCATGATATAGGAATATTAGCATCAA
CAGACCCTGTAGCTATTGAACAAGCATGCTATGATTTGATTTGTAAGGAAATGGGTCATGATGTTTTCAA
ACATGAACATCCTCATGTAAATGGAACTAGAATAATAGACTATGCATGTGAAATGGGTATGGGAAGTAAA
GAATATGAATTAATAAAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:355367-355630 hypothetical protein CDR20291_0299 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATTTACTATGAGAAGGAAAACAGCAAGAAGGCTAATGTAAACAATATTCCAAGTGTATTTGCGT
TTAATTTTCTAAGAAACTTTTTGACTAGCAAAGAGTATGAGGAAACTAGAAAAGAATATTTTATAAATAA
TCTAACAAAAAGTCAGGTTAATCAAGCCATGAAGGATTTAAAATGGCTATTTAGAGAATATGAAGGCTTA
GAGGTTATTACAATGGAAAGCTTGGATGGAGTTAAGACAAGGATAGTTTTATAA
>ref|NC_013316.1|:355836-356813 putative biotin synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAATACATAATAAAATTAAAAAATAAAGTATTGAGAGAAAAAGAAATAAGTTATGAAGAAGCTC
TTAATTTAATAAGCCTTGATACAAATAATAAAAACGATTTTGATATTCTATTAAAATCTGCAAATGAAAT
AAGAGAATATTTTATGGGAAGAAAAGCAGATTTATGTACGATAATGAATGCTAAATCTGGCAAATGTAGT
GAAGACTGTAAATTTTGTGCTCAATCATCTCATTATAAAACTGGTGTAGAAGAATATTCATTATTAGATT
ACAATGAAATCTTAAATAGAGCTAAAGAGATGGAGAGTAAAGGAGTGCATAGATTCTCATTGGTTACAAG
TGGTAAAGGTATGTCAGGAAAGGAGTTTAATAATATTTTAAATATCTATGAAGGATTGAGGGAAAATACT
AATTTAAAATTATGTGCATCTTTAGGTATTATAGATTATGAGCAAGCTAAAATGTTGAAGTCAGCAGGTG
TGACTACATATCACCACAATGTTGAGACGTGTAGAGATAATTTTCATAATATATGTACAACACACACATA
TAAAGATAGGATAAAAACTATAAAAGATGCTAAAAAAGCTGGGCTAGATGTATGTGTAGGCGGTATAATT
GGAATGAATGAGAGTGAAGAACAGAGACTAAAAATGGTTTTTGAAATACGAGAATTAAATGTAAAATCAT
TTCCAATAAACATTTTAAATCCTATTAAGAATACGCCAATGGAAAATTATGATGTATTAGAACCAATGGA
AATACTAAAAACAACAGCAGTATTTAGGTTTATAATTCCTAATGTGTACATAAGGTATGCTGGTGGAAGG
CTATCATTAAAGGGATATGACAAAGTTGGATTTAATGGGGGAGTAAATTCTGCAATTGTTGGTGATTATT
TGACAACTGTTGGAAGTGGGATTGAAAATGATAAAAAAATGATTATAGAGCAAGGATTTGAACTTTAA
>ref|NC_013316.1|:357032-358054 putative ribose operon repressor [Clostridium difficile R20291]
GTGAACTTCTTGAGTATAACTATAAAAGAAATTGGCGAATTGGCTGGTGTTTCTAAAACAACTGTGTCAA
AAGTCATTAATAATAAAGATGAAAATATAAGTCAGGCAACAAGAGAAAAAATTTTGAAAATAATGAAGGA
AAAAAATTATGTACCAAATAAATTAGCACAAAGTTTAGTAACTAAAAAAACTAATACTATAGGGCTTCTT
ATACCAGATATACGAAATCCATTCTTTACAGATGTATCAAGAGGTGTAGAAGACAAAGCTAATGAAGAAG
GCTACAATATAATTTTATGTAATACAGATGAAGATGCTAAAAAAGAATATGAAGGAATAAGAACACTATC
AGAGAGGATGATAGATGGAATTATATTTGCAGCATCTTCAAATACAAACTGGAAAGAAGCAAATTATAAA
GATATAAAAATACCAACTGTCTTGATTGATAAGAAGATAAGTATGAACAAAGAAACCTTAAAAGGAATTG
TTAAAATAAATAACTTTGAAGGGGCCTATATAGCTACAAAACATTTATTAGATATTGGAAATAAGAAAAT
AATATACCTAAGTGGTCCACTTCAAAATGAAATAGCAGTAGATAGATTAGAAGGATATAAAAAGGCTCTA
ATCGAGTGTAATTTAAGCTACAATTCTGCTTATGTATTTGAAGGAAAATATAAGATTGAATGGGGACAAG
AATTTATAAAAAATTTAGAAAAGATAGATTTTGATGCAATATTTTGTGCAAATGATTTGATTGCAATAGG
TGTCATAAGAGGTCTTAAAGAAAGAGGGTTAAGTATACCAAATGATGTAAGTGTCGTGGGATTTGATGAT
ATTCAAACATCAAGTCTAATAAGCCCTTCTCTTACCACAGTAAAACAGCCGTCTTATGATATAGGATATA
AAGCCAGTGAAATATTGATAAATTGTTTAAGAGGAGATAAAAAAGAATCATTTGATGAATTGATTTTCAA
ACCAGAATTAGTCATAAGAGATTCAACAAAAGAAAGTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:358096-358986 putative ribokinase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAAACATAGTTGTCATAGGAAGTGTAAACATGGACATGGTATGTTCTGTAGATAAAAGACCAGAAA
AAGGAGAAACAGTATTAGGTAATAGTTTTTTTACATCACCTGGAGGGAAAGGGGCTAATCAAGCTATCTC
AGCTTCTAAACTAGGAGCAAATGTAAAAATGATATCATGCATAGGGGAAGATGGCTTAGGAGAGGAGTTA
ATAAGAAATTTTAGAACGAATAAAGTTGATTATAGTTTAGTATCCAGAAATAATCACAAAAGTTCTGGTG
TTGCTGTTATAACATTATGTGAAAATGATAATAGTATTGTTGTTGTACCAGGGACGAATGAGCTAGTAGA
TATAGAATTAATTAAAAAGAATGAAGAAGAGATAAAGAATGCAGATATAGTATTGCTACAATTAGAGATT
CCATTAAAAACAATAAATTATGTAGTGAATTTCTGTTTTGAAAATAGGATTAAGGTTTTATTAAATCCAG
CACCAGCAGTAAAACTAAATGAAGATATAATAGAAAAAGTAACTTACTTAACACCAAATGAACATGAATA
TAAGATAGTTTTTGACACAAATGAAGGGATAGAAGAAGTATTAAAAAAATATCCAAATAAACTTGTAATA
ACAGAAGGAAAAAATGGAGCTAGATTTTATGATGGTGAGGAAATCAAGCATGTATCTTGTATAAGTGTTG
ATGTTCAAGATACCACAGGAGCAGGAGATACATTTAATGGAGCATTGGCAGTGGCTATAACAGAAGGGAA
AAAATTATATACAGCAGTAGAATATGCAGTAGTAGTATCAGGTCTTTCTGTAACTAAACTAGGTGCACAA
TCTGGTATGCCTTATAAAGAAGATGTTGAAAAATATTTAAATAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:359034-359996 D-ribose ABC transporter, substrate-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAGTGAGAAAAATTTTATCTTTAGGAATTGCTGGAATACTAGCAATAGGAATGTTAACAGGGTGTT
CAATGGAAGGACCAAGTAAATCAGATAATAAAGGTGGTTCAGACAAGAAAGATTTAACTATTGGAGTATC
TACAATAACTCTTCAACATCAATTTTTTATAGATATTGATGAGGGAATAAAAGAAAAAGCTAAGGAATTA
GGTGTGAAAGTTATAGTAAATGACCCAGACCAAGATGTAGCTAAGCAAACATCAGCAATAGAAGATTTTA
TACAACAAAATGTAGATGGAATGATAGTACTTGGAACTGATAATTCGGCTATAGTACCAGCAGTAGAAGG
AGCATTTGAAAAAATGCCAGTAGTTACAGTAGATGCTGTATTAAATACTGAAAATATTACAAGTTATGTA
GGAACAGTTAGTTATGATGCTGGTAAAAAATTAGGGGAATACACTAAAAAATACATAGATGAAAAGTTAG
GTGGAAAGTCAGAAATAGCAATAGTGACAGATTTAAAATCTCAAATACAAATGCAGAGAATAGATGGATT
TAAAGATGCGTTAAAAGGTTCAGCAAATGTTAAGATATTAAATTCACAACCAGGATATGACAGAGAAGAA
TCTCTTAATACAGTAGAAAACTTAATTCAATCTAATCCAGATGTAGATATAATATATGCAACAGCTGAAA
ATAGTGTACTAGGAGCTAAAGCTGCACTTGAATCTGCAAAAAATAAGGATGTTAAGATTGTAGGATTTGA
CTTAACTGAAGAAGCATCAAGTGGAATAACAGATGGAACTATTCTTGCTATGATTCAACAACAACCTAAA
GAGATGGGACGTTTAGCTGTAGAAGCAGTAGTAAAAGCTATAAAAGGGGAAAAGGTAGAAAAGAATATAC
CAGTACCAGCTTTACTTTATGATAAGGAAAATATAAAAGACTTTAAGAATTAG
>ref|NC_013316.1|:360050-361561 ribose ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAATATAATTCTGAAGTTAAGTAATATTGCTAAAGAATTTCCTGGTGTCAGAGCATTAGATAATG
TTAATTTTGAGTTATTTCATGGCGAAGTTCATGCACTACTGGGTGAAAATGGTGCTGGTAAATCAACAAT
GATAAAGATTTTAACTGGTGCACATTCGAAAACTTCTGGAAAATTTATTTTTGAAGGCAAAGAAATAGAG
AATATATCCCCAGATATCTCTAAAAAGATAGGTATAAATGCCATATATCAAGAACTAACAGTTTTTGACG
AATTAACAGTAGCACAAAATATTTTTATGGGAAAAGAAATAAATGGCAAAGTCTTAACCAATGACAAAAA
AATGAATGAAGAGGCTAAAAAGATTTTCGATAATATGGGAATAGATATAAATCCAAATAGTTTAGTCAAA
GAGCTTAGTATAGCTCAAAAACAAATGGTAGAAATAGCAAGAGTTTTATCATCAGAAACTAAAGTATTAA
TAATGGATGAACCTACTTCTTCAATAAGTAAAAAAGAGACTGAAATACTTTTTAGACTTATAAATGATTT
AAAAGAGAGTGGAGTTAGTATAATATATATATCCCATAGGATGGAAGAACTCTTTGAGATTTGTGACAGA
ATAACTATAATGCGAGATGGGAAAACGATTTCGACTTTGAATACCAAAGATGTATCGTCTGAGGAAGAAT
TAGTTAATTTAATGATAGATAGAAAGCTAGACCAATTTTTCCCAAAAAGAAAAGTAGAAATAAAAGAAGA
AATTATGCGAGTGGAAAATCTAACTAAGAACAATGTTTTTAATGATATTAGCTTTAATATAAGAAAAGGT
GAAATATTGGGAATAGGTGGACTAGTTGGAAGTAAGAGAAGTGAAATAGTAGAAGCTATATTTGGACTTA
GAACATATGATTCTGGGAAAATATATTTAAACAATGAAGAAGTAAAGTTTAAAACTCCATCAGATGCAAT
AGAAAATGGACTGGGATTAATAACAGAAGATAGAAAAGGTACTGGATTGTTTTTACAAATGAGTGTCAAA
GAAAACACAACTATGGCTGGGTTAAAAAAGATATCTAAGTTTAAATCAATTATAGATAGAAAAAAGGAAA
AAGAGATTTTAGAAAAATACATAGAAGCTTTAAAGATAAAAACACCACATATGAATCAAGTTATACAAAG
TTTAAGTGGTGGAAACCAACAAAAAGCTATAATAGCAAGATGGCTTTTATTACAACCAGATATATTGATT
ATGGATGAACCAACCAGAGGTATAGATGTAAATGCTAAGGCAGAGATATACAATCTAATGGGAGATTTAG
TGGAGAGTGGTGTAAGTATAATAATGATATCTTCTGAAATACCAGAATTAATATCAATGAGTGACAGAAT
AATGGTTATGAGAGAAGGTCATATAAGTGGATTTTTAGAAGGTGAAGAAATGGTTGAAAATAATGTATTA
AAATTGGCTTTCGGAGGTAAAATTAATGAGTTCAATAACTAA
>ref|NC_013316.1|:361545-362543 ribose ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTCAATAACTAAGCATAAAGAAGAAAAATCTTCTCCATTATTGACAAAATTAACAAGTGTATTTA
GAGACCAAGGGAGTGCAGCTGTAGGACTTGTAATAATTTTTATAATAATGAGTGTAGCTTCATCTAACTT
TTTAACTTTAGATAATTTAATTAATGTTGGAAGACAAATATCAATAAATGCAATACTTGCAGTAGGTATG
ACATTTGTAATAATTACAGGAGGAATAGATTTAAGTGTAGGAGCAGTAATTGCTTTAGTAGGTACATTTT
GGGCTACAACAGTAGTGAATTATAATGCACCTATATGGGTAGGTATGATACTTGCATTAGCAATAGGGAC
AATATTAGGAGTCATAAAAGGTGCAATTATTTCAACACAAAAACTACCTCCATTCATTGTAACTTTAGCC
ATGTTAACGATAATAAGTGGGGCAAGCTTTGTATTTACAGGAGGAAGACCTATATCAGTAAATACAGATG
CATTTAAGATGCTCGGTAGAGGATATATTGGACCAATACCAATACCAGTTATAATTATGATTATAGTTGT
AATAGCAGGACATTTTCTATTAAAAAGAACTAATTTTGGACGTCATGTACATGCAGTAGGTGGAAATGAA
GAGGCCGCTAGATTATGTGGAGTAAAAGTAAATAAAGTTATAGTAAAAGTATACGCACTAGCTGGACTAC
TAACAGCATTAGCTGGGATAATACTATCATCACGTTTGGCATCAGGTTCACCAACTGTTGGAGATGGAGC
AGAATTGGATGCTATAGCAGCCGTTGTGCTTGGTGGTACTAATATGATGGGTGGTTCTGGTTCTATAGTA
GGTACATGTATAGGTGTCGGAATAATAGGAATATTAGGAAATGGATTAAACTTATTAAGTGTATCTTCAT
ATAATCAAATGATTATAAAAGGTTTGGTAATGTTATTTGCTATATGGATAAATAATATAAAATTAAAAAA
ATCAGCTAAATCTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:362727-363989 putative acetylornithine deacetylase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAATTCTCTTAGATACATTAAATAGTAAAAAACAAGAATACATAGATTATTTAAAAGAACTTG
TAAGTATAAAGACTGAAGATGTTGGTCATGGAATACTAGGTGGATTTGAAAAAGAAGGACAGGAATATAT
TGAAAAACTTGCAAATTACATAGGTTTTAGTGTAGATAGACAAGAAATGAGCGAAGAATTAATTAAAAAA
GCAAAAAATATATATAAAGAAGGAAATCTAGGTCACAATTATCAAGATAGATATAATTTAATTTGTAAGT
ATAGTGATGATTTACCTGGTAAGACAATTGTATTTAATGGTCATGTAGACACTATGCCACCAGGTGATAT
AAGTAAGTGGAAATATAATCCATATCGTGCTACAGAAGATAATGGAAAACTTTATGGTCTTGGAACTGCT
GATATGAAATCTGGACTTATAGCATCAATATTAGCTGTAAAGCTTATAAAAGATAGTGGTCTAAATGTAC
CTGGTAATGTAAAAATAATGTCAGTAGTAGATGAAGAAGGTGGCGGAAATGGTACCATAAATGCAGTTAT
GAATGGTATTGGTGGAGATTGTTGCATAATTTGTGAACCATCAGAACAAAACTTAATAGTTGCACATATG
GGATTTGTATTCTTTGAAGTTGAGGTTAAAGGTGTGTCTCTTCACTGTGGTAGTAAGTGGGAGGGTGTAA
ATGCAATTGAGAAGGCTATGTTGTTGCTTCAAGATATAAAAGAGTTGGAACATAACTGGCTTATGATATA
TAAGCATCCACTATTACCTTCACCTACAATAAATTTAGGTGTAATAAATGGTGGAACAGCAGGTTCTACT
GTGCCAGATAAGTGTGTATTTAATTTATGTGTACACTTCTTGCCAAATATAATGAGTTATGAACAAGTTG
TAAATGATGTAACAAATGTCATAATGACAAGGGCTAATGGAGATTTATGGCTTAAAGATAATAAACCAAA
TATAAACATATATCAATCAGGGTTAGGTTTTCAGATGGACAAGGATTCTGATTTTGTAGTGAATGCACAT
AAAATACTAGAAGAAACTTTAGGAAAAAAATTAGAGATAAAAGGTTCAACAGCTGGCAATGATGCGAGAT
TAATGAAAAATTTAGCTGAAATACCAACACTTATATTAGGGCCAGGTTCAATAGAACAATGTCATTCAAT
TGATGAATATGTTGAAATTAAGGAGTATTTAGATAGTATACTTATGTATGCAAGTCTAATATTAAACTTA
TAA
>ref|NC_013316.1|:364009-364752 hypothetical protein CDR20291_0307 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAGTATTAATAGTAGGGGAATCTTGGGTAAAAAATATAACTCATATAAAAGGATTTGATACGT
TTGTTACAACTCATTATGAAGAAGCTGTAAAGTGGTTGAAAGAAGCAATAGAATCTGGAGGATATGAGAC
AGTTCATATGCCTGCACATGTAGCAGCAGATAGTTTTCCGTATAAATTAGAAGAGTTAAATGAGTATGAC
TGTATAATATTATCTGATATAGGTTCTAATACGTTCTTATTATCTAATAGTACTTTTATAGATTGCAATA
GTAATCCAGATAGACTTGAACTAATCAAAGAGTATGTAAATAATGGTGGGGCGTTAATCATGGTAGGTGG
ATATATGTCATTTACAGGAATAGATGCAAAAGCTAGATTTGGAGAAACTGCTATCAAAGATGTATTACCA
ATAACAATGATAGATAAAGATGATAGAGTTGAAAAACCAGCAGGAATAATTCCAGAAGTTATTGACTCTG
AACATCCAGTATTAAAAGGTATACCAACAGAATGGCCAAAGTTTTTAGGATATAACAAAACAGTAGCTAG
AGATAATTGTCCTGTTTTAGCAACTATTGGAGGAGACCCATTTGTAGCTGTTGGCGAGTTTGGAAAAGGA
AAATCTGCTATCTTTAGTTCTGACTGTGCACCTCACTGGGGTCCAAAAGAATTTACTGATTGGAAATACT
ATAATAAATTATGGGTTAATATGCTTGATTGGTTAACATGCTAA
>ref|NC_013316.1|:364925-366310 putative aminobenzoyl-glutamate utilization protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAATTTAAATAAAAAGTTTTTGATGGAATATATAGATGAGATACAGGGAGAATTAAGAGATATAT
CAGATAAGATATGGAAAAATCCAGAACTTCAGTATAAAGAATACTATGCTTCAAATTTACAAAAAGAATG
TTTAAAAAAACATGGTTTTAGTATAGAGGGATTAGAAGGTATGGATACAGCATTTGTGGCTAGTTATGGA
GAAGGTAGACCAGTTATAGCAGTTTTGGGAGAATATGATGCTTTAGATGGTTTGTCTCAAAAAGTATCCA
CTACTAAAGAACCTATTGTAGATGGTGGTGCAGGTCATGGATGTGGACATAACTTACTTGGTACAGGTTC
AATAGGAGCTGTAATTGCAGTAAAGGAATTAATCAAACTAAAAAAGCTGAAAGGGACTATAAAATACTAT
GGATGTCCAGCAGAAGAAGATTTATCTGGAAAAGTATTGATGATAAAAAAAGGTTTTTTTGATGGAATTG
ATTGTGCTTTTAGTTGGCATCCATTTGATATAAATACTCCGATAAGAATCCCAACACTTGCTAATTACTC
TGTGAAATTTAGATATAATGGGATTAGTGCTCATGCAGCACAAGCTCCTTATAACGGAAGAAGTGCACTT
GATGCAGTAGAACTTATGAATATAGGTTGTAATTATTTGAGAGAACATATATTTGATAATTGTAGAGTAC
ACTATGTAACTACTAATGGTGGAAAAATGCCAAATATAGTTCCTGATTTTGCAGAAGTGTGGTATTACAT
AAGAGGAGTTAAAATGGAGCATGTAAGAGATGTATTTGGTAGGATTGTTGATATAGCAAAAGGAGCAGCA
TTAATGACTGGTACTATTATGGAATATGACATTATAAGTGGAGTATATGACTATATTCCAAATACAATAT
TAACAGATATTCTATCACAAAATATGAAATTAGTAGGTGTGCAAAACTATAATGAAGATGACTACTATTT
TGCAGATAAATTAGCTGAGACAGTGTCTATAGATAAAAGAAGTAGTGTTTCTAGTGTATTAAGTGGAAAT
AAGGATATTACTAAGATGAATTTACATGATGAGGTTACAGATGATACATTTACTCATAATAACTGTATAT
CATTATCATTGGATATTGGAGATGTTAGCTACATAATTCCTACAGCACAATGTTCTTGTTCAGTTTGGCC
TATTGGTATTTCTGCCCATACATGGCAATCTTGTGCCAGTGCAGGTTCTGATATGGGATTTAAGGCAATG
TTATTGGCATCTAAATCTATATCATGTTCAATAAATGATGTAATGCTTGATGAATTGGTTATAAATAAAG
CAAAAAAAGAATTGAAGGATACTGTAGGTAGTTTTGAATATACTCCAATTATTTGA
>ref|NC_013316.1|:c367291-366647 hypothetical protein CDR20291_0309 [Clostridium difficile R20291]
ATGAACAATTTAGATAAAAACAATGTTAATGAAGTTTTGGATATGCTATTAAGAACTAGAAGATCCATAA
GAAGTTTTACAAAAGAAGTACCTTCAAAAGGGCTGATTGAAGAAATAATTGAAACTGGAAGACTTGCACC
TTATGCAATACTTTCAGTAGCAAAACAAACAGATTTCAGACATTTCTTTGTTATTTCAAATAACAGTTTA
CAAATGAATAAAATAAAAACCATTCTTGTTGATGTTATTAAAACTCAAATATCAGTCAATGAGAAGAAGG
CAAAGAACAACATTACCCTTCAATCCTTCATTACTTCCTTAAAAATGCAAGTTGAAAAAGGGGTTCTTGG
TATAGGAACAGCACCTTATCTTATTATTGTGGCAGAACGTCGTGGAATACCACCTATAGAACAAAAGTCA
TTATCTCATGTGATGCAGAATATGTGGCTTAAATCAACTGCTTTAGGATTAGGTTTTGAACTTGTTAGTG
TAATAGGAAGATTGAGCGATAATAAAGATTTTTGTGATATTTTAGGAGTACCAACAGGTGAATATGGATT
TGATGCCTGTGCAATTGGTTTCCCTACTACATCTGTAACTAGGGAAGGCAGAGCCATTCCTCATCCATCG
ATAAAATGGATATAA
>ref|NC_013316.1|:367555-368169 tetr (putative transcriptional regulator) [Clostridium difficile R20291]
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TAATAGATGAGAAAGGATTTAACAATATATCAGTTACTGATTTAACTCAAAGGGCAGATATAAATAGAGG
AACCTTCTATCTGCATTATGTTGATAAGTATGACTTGTTAGAGAGGATTGAAAATGAAATAATACAGGAA
ATTGAAGAGGAGACCAAACATCTTGATTCATCCAACATGATGGAGATAGATACCTCAAGTGAACCTCTTC
CATTTATGGTAAAGCTTTTTGAATATTTTAGAAAAAATTCAGTAATTATTAAATCTATCTTGGGTCCCAA
AGGTGACCCTACTTTTGAAAGAAAAATAAAAAAATTTATTGAAACCAATTTGTTTGAGAAACAAAAACTA
ATAAATTTTAACATAGATGAGGCAATAATTTCAGAAGAATATTTTATACAATATATACTTTCAGCAGACT
TAGGTGTAATTCAATATTGGCTTGAAAAAAATATGAAAGAGTCCCCTGAAGAAATGGCACTGATACTTGC
TAGAATGTCGTTACTCGGTCCGTTAAGAGCAGTGGGAATTCGTAAAGATTCATAA
>ref|NC_013316.1|:369905-370816 hypothetical protein CDR20291_0311 [Clostridium difficile R20291]
ATGCACTATAAAATAAATGAGTTAGAAAATAAATATAATTTATATAATAAAGTAGTACAAAAAGGAGTAT
TTATGTTTGGATATGTTAAAATAAACAAAATGGATTTAACATTTAGAGAATATGATTATTACAAAGCTTA
CTATTGTGGACTATGTAAATACTTAAAAAGAAATCATGGAGAAATCTCTAGGTTTTCTTTGAATTATGAT
ATAACATTTTTAATTGTTTTATTAACAGCAGTATATAACCCAGAGTCTATAAGTACAGAGGAAGTGTGTA
TAGTAAATCCATTTAAAAAGAAAAAGGTAATTACAAATGATATTACAGAATATGCAGCAAGTATGAATAT
TCTTTTAACGTATTATAAATTGGAAGATAATTTAATGGATGATAAACGCATAAAAGATAAATTGGCATAT
TATATATATAAAAACAAATTAAAATTAGCATATGAAAAGTATCCTGAAAAAGCAGAGTATATAAAACAAC
AACTAAATGAATTAAATAAGTTAGAAAAAGATAAAAATATAAATATAGATGAAGTATCTAGTATATTTGG
AAATATAATGGGTGAAGTATTTGTCTATAAAAAAGATGAAAATGAGAGAAACTTAAGAATGATAGGTTTT
AATATAGGTAAGTATATATATCTACTAGATGCCTATGAAGATTTAGATGAAGATTTTAAGAAAGGAAGAT
ATAATCCATTTATAGAGTATATTGATAAAAATGATGAGTTAAAAGAAAAAGTAAAAAAAATAATAGTAAC
ATCATTAGGATTTTTAGCTAGGGGAATTGATAATCTAAATCTAAATAAAAATGTTGGAATAATAGAAAAT
ATAATTTATTCTGGTGTTTATTTAAGATATATTAATATATTAGAAAGTAGAGGTGGAAAGAATGTACAGT
AA
>ref|NC_013316.1|:370806-371249 putative 'four-disulfide core' protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTACAGTAATACTTATAATAATGAAAATTTTATGAGAGCAAGAGCATTCATAGAAAATAGTGAATTTA
AAAAAGCATATGATTTTTTAAAAACTTTGACTGACAAATGTGCAGAGTGGTATTATTTAACTGGCTTTTC
TGCAATGAACATAGGATATTATGAAGAAGGTGAAGACTTCTTAAAAAGAGCAAAATTTATGGAGCCTGAA
AATAGTGAATATAGTGATGCACTTAGAAGTTATACACAATATAGAAATGATTATAGCAATAGGGCTGACA
ATTATAATAGAAGAAGACGTAATGATTTAGATGGATGTTGTTGCTGTTGCTGTGATGATTGCTGTTGTTG
TCTAGGTGACGATTGTTGTGAAAATTGTGCTAAGCTTTGGTGTTTAGATTCATGTTGTGAATGTTTTGGT
GGAGATTTAATAACTTGTTGTTAG
>ref|NC_013316.1|:371251-371751 hypothetical protein CDR20291_0313 [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAATATGAGTATAAAAGTTGCTTATGGAGGAGTTTTATTAGCATTAAATGTGATATTGTTGACTC
TTACAAATATTATTCCTGTAAATACATTGTTTATTATGGGGTTAGCATCACTTTTAGTATCAATTGTAAT
AATGGAATGGGGCTTTAAGAGTGGAATCGCTTTTTATATAGGTTCTATAGTTTTAGGATTTATAGTGATG
GCAAGTAAGTCTCAATGGATTGTATATTCACTTACCTTTGGAATATATGGTATTGTAAAATATCTTATAG
AAAAAGATAGGTCTATATATATTGAGTATTTTATGAAATTAGTATTTGCAAATATAATGATACTTATATT
GTATTTTTTATTAAGAACAATAGTTTATATTCCAATAAACATATTTATTATAGGTTCATTTGAGATAGCC
TTTATAGTATATGACTATGTTTACAGTTCTTTTATAGGTTATTACAATAATAGGTTAAGAAAGATGCTAT
TTAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c372681-371953 putative phosphoserine phosphatase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATATAGCAGCTTTTTTTGATATAGATGGTACTCTTTATAGAGACTCTCTTATGGTTGAACATT
TTAAAAAATTAATTAAATACGATATAATTGACCAAAAAAATTGGTATAAACATGCTAGAGACACTTTTAT
GGATTGGGATAAAAGACAAGGTAATTATGATGATTATCTATTAGAAATATGTGACCTTTATGTTGATTCA
CTAAAAGGATTAGATAAAACCTGTATCAACTTTACAAGTGACCAAGTAATTAAATTAAAAGCAGATAGAG
TTTATAAATACACACGTTCAAGGATTGAGTGGCATCTAAATCAAGGACACATAGTTATATTTATATCTGG
TAGCCCTGGATTTCTTGTTGAAAAAATGGCAAAAAAATATAATGTAACCGATTTTCTAGGAAGTGATTAT
GTCTTTGAAAATAATATATTTACAGGCACAGTTATTCCAATGTGGGATTCTATAAGTAAGAATAATGCTA
TAAATGATTTTGTTGTAAAGTATGATTTAGATTTATCAAACTCGTATGCCTATGGAGATACTAATGGTGA
TATAAATATGCTAAAAAGAGTTGGAAATCCAATAGCAATAAATCCAACAAAGGAACTTTTATCTCAAATA
TCACTTGATGAGGAAATTTCTAAAAATGTTGAGATAATAGTAGAAAGAAAAGATATTATTTATTCTCTAT
CTACAGATGTAAATATAGTGGATATTTAA
>ref|NC_013316.1|:372806-373894 hypothetical protein CDR20291_0315 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTTAATTTTGCAAAGGCTACAAATTCTAGACTTATGGGCAGTTTAGGTCTTATAATAAATTGGA
TAGATGATGAAAACAATCACTTTTGTCAATATTTTTTATTAGATGCAGAGGGATTAGGATTAGCAGATTA
TGTGAGTTTAAATAACCCAACACAAGAAGAAGCTTATATGGAAGAAGAAAGATTGATGGGAGGATTTGGT
TCAGATAGAGTTGAATTAACGAAGGATGAATCTTTATTTTTAGTATCTTATTTTGGTAATAAGAATCTTT
ATTATGATAAGCTATTGCCAGGAGATAAATGTGAGTATATTGATATTATAAAAAACTATAAAACAGATTT
AATTATAGAAAAATTATACAATAAAATATGTAAAAGAGTTGATGAGGAAGTTGAATTTATAAACTATATG
ACTATGAGATTTATAGCATGGGATAGAGAAAGTTTAAAATATTTTTCTGGAAGTGACGAGATTGCAAATA
TGCATATTACTAATATAAATGGAACATTACTTAAAAACGTGGTAAGTGATAAAGGTCAAGGCAGATATAT
AAGTGAAGCTTTATATGAAGACAATGATGGATATTATATATGTAAAATTGCTTTTTGCATAAGTAAGTGC
TATGAAACTGGTTTTAGAATTAATTCTCTATTAGTGACAGATAAAGAACTTATGTATGATTTTGAGGTAT
TTGATGAGATTTCTAAAAGTGAATTTGTAAGTGTTTACAGTGTAAATTCACCTGAAGAATTTGCAGGAGT
ATTTTATAGAGAAAATCCATTTCTGTTAAAAAGTAATATGAATGAAGGTATATTTTTTACTAGATTTAAT
TTTAATAATGACCATGTAAAAGAAAATGTATATATAATAAACAATGATATGAAAGCTATATATTACTTAA
TGGGAAATAAGTTTTTTATTGGTACTTATAACGAAAATGATTGCAATTATATCAATGAAATAAGTCAGTC
TAATTATAGTGACTATATTAAATTTGAAGAGAAATTTTTCTTTGAGCAAAATGCATTATATGACTTTGCA
GAATCAGGTTCATTAGATTTTGATGATTTTTTGGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c375180-374332 putative spore coat assembly asparagine-rich protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAACAAGAAAAAAAAGGATTTAGATACTAGTTACATGCCTTACTTAGACCCAGCGAACTATGCAG
ATTATATTACTAATGAAGAAATTCCCCAAGATGAATTGAGAAATGACCCTCAAATTTCTAATGGTTATAC
AAAAATACCTAATAACCAGAACATAAATAACCTATATCCTAATAATGTAAATCATTATCCTAAAAGTAGT
AATTCTCCAAACAACTTGCCTAACACAAATAATACATCCGGAAATATGAATTACAATACATCTGCTACAA
ATAATATGCCTAATAACATGAATAATAATACGGGTATGCCTAATAATATGTCTAACAATATGAATAGTAA
TATGGGTATGCCTAACAATATGCCTAATAACATGAATAGTAACATGGGTATGCCTAACAATATGTCTAAC
AATATGAATAGTAATATGGGTATGCCTAACAATATGCCTAATAACATGAATAGTAACATGGGTATGCCTA
ACAATATGCCTAATAATATGAATAGTAACATGGGTATGCCTAACAATATGCCTAATAATATGAATAGTAA
CATGGGTATGCCTAACAATGTGCCTAATAACATGAACAGTAATATGGGGTATAATATGAATAATACTATG
GGTATTCCTAACTTCTCATGTAATCAAAATATGCCTCCTAATGTACTTATGATGATACCAGGAGTTATAT
GTCATAATACAATGCAAGGTATGCCTGTAGTTATGCCTAGTACTATGCCTCCTAATATATATCCTACTCC
TTATGGTTCTAGTAATATGTCTATACAAGGTATACCACAGGCTACTAATATTGAAGAATTTGATGAGGAA
GAAATGTAA
>ref|NC_013316.1|:375379-375744 ArsR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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CTATGCCAGATGAAGAGATGTTATATGATTTAGCAGAATTATTTAAAGTATTTGGGGATACTACTAGAGT
AAAGATATTATATGCATTATTTGCAAATGAAATGTGTGTATGTGATATAGCGAGTTTATTAAATATGACT
CACTCTGCAATATCTCATCAACTTAGAGTACTAAAGCAGGCTAGATTAGTAAAGTTTAGAAGAGAAGGAA
AAACAGTGTATTACTCATTAGATGATAGTCATATAAGCCAGATATTTGATTGTGGATTAAATCATATTAG
AGAAACTTATAAATGA
>ref|NC_013316.1|:375767-378154 putative heavy-metal-transporting ATPase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGCAAATAATTTAATTAAAAAAGAATTTATACTAGGAGGATTAAACTGTGCACATTGTGCAGAGG
AGATTAATAATAAAGTTTCTAAACTACAAGAAGTTAAATCTTCCAACTTAAATTTTATAAATAAAAAACT
TATAGTAAATATAAAGGAAAGCTTTAATGAGGATACTACTATAGAAAAGATAATAGATATAATAGATTCA
ACAGAACCAGGTCTTGATATACAAATAAGTTCTAAAGAAAATGCATCTAGTAAAACATCAATTAAAAAAG
AGCTTATATTAGGAGGATTAAACTGTGCACATTGTGCAGAGGAGATTAATAACAAGGTTTCTAAATTAAA
AGAAGTTGAATCTTCTAATTTAAACTTTGTAAATAAAAAACTTACAGTAAATATAAGTAATAACTTTAAA
GAGGATGATGTTATAAATAAAATAAAAGAAATAATAAATTCAACAGAGCCAGGACTTGATATACAAGTAG
GGTCTACTGACAAAGTAAAAGGGAGAACTACTGAAAAATCAGGAGCTGTAAATGATACAAATAAGAAAGA
ATTAGTTCCACTTATAATTGGAGCACTTGTATATATATTTGGTATATATCAAACAGCTACAGGTTATGAA
AGTCAGTTTAGCAATATAGTATTTATAGTTGCCTATGTAATAGTAGGTGGCGATGTGCTTTTAAGAGCAA
TAAGAAATATATCAAAAGGAAGAGTATTTGATGAGAACTTTTTGATGGCTCTAGCAACAGTAGGAGCATT
AACAATAGGGGAGTCATCAGAAGCAGTAGGGGTTATGCTTTTCTATAAAGTAGGAGAGTATTTACAAGGT
GTTGCAGTTGGTAAATCCAGAAAGTCTATAACTTCACTTATGCAAATAAGACCAGATTATGCAAATCTAA
AATTTAATTCTGAAGTTAAGGTAGTGTCACCAGAAGAAGTAAATGTAGGGGATATAATAGTAGTAAAACC
TGGTGAAAAAGTACCATTAGATGGTGTAGTAGTGGATGGAGTTTCTATGCTAGATACTTCTGCACTCACA
GGAGAGTCAGTGCTGAGAGAAGTTGAAAAAGGAGATGAAATCTTATCAGGTGTTATAAATAAAAATGCTT
TATTGAGTATTGAAGTTACAAAGAGTTTTGGAGAATCAACAGTTTCTAAGATTCTTGACCTTGTTGAAAA
TTCTAGCATTAAAAAATCAAAGACAGAAAACTTTATATCTAAGTTTTCAAGATACTATACTCCAATAGTA
GTAATAGCTGCTTTATTAATAGCATTTGTGCCACCACTTGTAATCTCAGGTGAGGTATTTAGTGATTGGT
TATATAGAGGATTGATATTCTTAGTCGTTTCTTGCCCTTGTGCATTAGTTTTATCAATACCACTTAGTTT
CTTTAGTGGAATTGGGTTTGCATCTAAAAATGGTATCCTTATTAAAGGAAGTAACTATTTAGAAGCTTTA
AGAAGTGTAGATACAGTAGTATTTGATAAAACAGGAACACTTACTAAAGGTGTGTTCAATGTAACTAAGT
TAAATCCTGAAGGTATATCAGAAGAAGAATTATTAGAATATGCAGCTATTGCGGAGGTAAATTCAAATCA
TCCAATAGCAAAGTCTATATTAAGTTACTATAATAAAAAAATTGATTTAGATACAATAGACAGTTATGAG
GAAATAGCAGCTTATGGAATTAGAGTAAAGCATAATGGCAATTTTATATTAGCAGGTAATGAGAAACTTA
TGAAAAAAGAAAATATATCTTATTCATCAGCTAAAGAAGTAGGCACAGTAGTCTATATTGCTGTTGATAA
AGTATATAGAGGTTATATAGTTATATCTGATGAAGTAAAAGAAGATAGTAAAAATGCCATAAGAAGCTTA
AAAGCAATAGGGGTAAAAGAAGTTGTAATGTTAACTGGAGATAATGAGAAAGTAGCAAAAAATATTGCTC
AAGAATTAGAATTGGATACAGTTTACTCAAATTTACTTCCTAATGAAAAGGTAGATAGATTAGAAGATTT
ATATGAAGGAAGAACTGAAAAAGAGAAAATAGCATTTGTAGGTGATGGAATAAATGATGCTCCAGTATTA
GCTCGTGCTGATGTTGGTATAGCTATGGGAGGCTTAGGTTCAGATGCTGCTATTGAAGCTGCAGATGTAG
TGCTTATGACAGATGAGCCTAGCAAGATATCTAAAGCAATTGAAATAGCAAACAAGACTAATAAGATAGT
GTGGCAAAACATAATATTTGCTCTAGGAGTAAAAATTATAGTTATGATACTAGGTGCTGGAGGAGTAGCT
ACTATGTGGGAAGCTATATTTGCTGATGTAGGTGTGGCACTTATAGCAGTAGTAAATGCTATGAGAGCTA
TGAGATAA
>ref|NC_013316.1|:383783-384391 hypothetical protein CDR20291_0319 [Clostridium difficile R20291]
GTGTCTGTAATCAATAGTTTTATTTTACAATATGGATTAATCTCTGTATTTGTATTAATTATGATTGAGT
ATGCTTGTTTTCCATTACCTAGCGAAGTTGTTTTACCTTTATGTGGAGCAATTGCTGCAAGAAATCATTT
TGGATTTCTGACAATTTTAATTTTAAGTATAATTGCAGGTATACTTGGTTCGATATTTTGTTATACAGTG
GGAAATTGGGGAGGTAAATCTATCATAAATAAAATAATAGAGATATGTCCAAAGGCAAAGAAAGGAATAT
TTGCATCTCAAGATTATTTTAATAAATACTCTTCTATTTCTGTTTGTGTATGTAGATTAATCCCTTTATG
TAGAACATACATATCTTTTATAGCAGGTATAGCAGGTCAAAATATTATAACTTTTGTAATATCATCTATC
GTGGGAATAACCATATGGAATACTTCATTAATCAGTATAGGATATATTTTTTCTGAGAGTTGGGTAAGAA
TAATGTCACATTATAATGATTATAAATTCCTCGTTCTAATTATACCAATATCCATAATTTTTATTGGATT
TGTTATTAAGTCATTTATACATAAAAAACATCACAAGATAAGATTATAA
>ref|NC_013316.1|:384413-384625 hypothetical protein CDR20291_0320 [Clostridium difficile R20291]
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TAGGTTCTCGGCGTTTCTTTTATTGCTTGTGTCTGTGGTACTTTTTTCTTAAAATGTACCATGTTTTACA
CTTTGTTGAGGATAAGTTTGCTTATATAGAAGAAAAGGCGGCAGCTTTGAAAATCAAAACTACCACTTTA
TAA
>ref|NC_013316.1|:c385705-384932 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTGGAAATTACTTTGGGCTGAATGTCAAAAAATTCGTCGTTCAAAAATTGTTTGGATTACATTTTTTG
CATCCATTATGATAGCAGTCATAGTTTTTGCAGGAGGGCAGGATGTATATAATGACCCAGATTTACATTA
TGGCTTAAAGAGCGTTTATGACGGTTCACGGTATATAGACAATGCAGGTTGGTATATGGACGCGGTACAA
CCTTGGTCAACTTTTTTTGTTCTTCCTGCTGTCATTGCCCTATTAGGAAGCTATATTATTTGTCGTGAAG
AAGAGGAGGACACTATTAAATCCCTGCGTCTTATTCCCATAAATGAAACAAAATTAACCATAGCAAAAAT
GATTATTACTTTTATATTCAGTATACTTCTTTATTTGTTACTCTTTACTATAACATTTTTGACTGAATCC
GTTTTACATTTTTCCGATTTATCGACAAAACTGGTTTTAAGTTGCATGAAAGAGTATTTTCTTGATGGCA
TAGGTGTATTCTTTGCAATTTCTCCCATTATTGCCTTGGTATCGCGCATGAAAAAAGGATATTGGCTTGC
ATTAGTATTCACAGAAGTTTATTCTATTGCTGGACTATTTGCGGGTATGTCAAATGTCTTACAAACCTTT
TTTCCTATTGCAGCAATATTTAATATTTCTGGATACTATATAACTACTGGAGAAAAAATTATGGGGAGTA
TCATAAGTTTATTACTTTGTGCCTGCCTTTCTGCATTTATACTGAAAGGGCTAAAACACAATGAAAAAAA
TTGA
>ref|NC_013316.1|:c386453-385716 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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CTGCTCTCATTATGCCGTTTTTCGCACTACTATACTTCAATTATTTTGGTAAAACAGGTGTTGAGCCAAC
AAAGTTTTATAAATGGTCTGCATTTGGTTATACACTTTGGATTATTTTGCCCGTTGTTTTGGGTATATTT
TGCACCATGCTTATACACGAAGAAAACCAGTATGATATGCTCAAACAGCTTTGGATTGTACCTATTAGTA
AAATGGGATACTTTTTTAGTAAATTTTTCGTTGTTTTGATTTACTCTATTTGTTTTATGCTGATTACAGC
CGTTGCTTCTGTGTTATTTAGTGTACTTTCTGGATATGTCGTATTTAGCTGGGCAAGCATTTTATATTTG
TTGAAAAAATGTTTAGAAATTGGTGTAATCACTGCTTTTGTAATGTTGCCGATTTTGGCAATCGCTACAT
CTCAAAAAGGATACATTCTCCCAATTTGTATCACATTGGTATATGCCTTTTCCGGTTTTGTTATAATGAC
AATAAATATGTATTTACACCCATTATCCAGTATGGGAGTTATTATCATGAGAAATAAAGACATTCCAGGT
CTTATATTTTCACAGGAAATTAATGTCCCATTAGCATTTCTTTGTATTTGTATTTGGAGTATTGTATCAG
TATTGTTTGCAAGCATTGCACTAGGAAGAAGAAAGTGA
>ref|NC_013316.1|:c387435-386446 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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ATGATTTTGTGATTGAAACAAAGCAACTTACAAAAATTTATGGGAATCAAACAGTAGTTGACAAAGTCAA
TCTCCATGTAAAAAAAGGCCGAATATATGGTCTGTTAGGACGCAACGGAGCTGGGAAAACCACAATTATG
AAAATGATTTTAGGATTGACTTCAATCACGTATGGCGAGGTAGATGTATTTGGAGAGAATATTAAGGGAT
GTGAAAAACGAGTATATCCCCGTATCGGTGCAATTATCGAAACGCCAGGATTTTATCCTAATCTGACAGG
AACGGAGAACTTGGAGATTTTTGCAAAACTTCGTGGTACAGCCGCCCCTAATTCTGTAAAAAGAGCATTG
GAGATTGTAGGCTTACCTTATAAAAATAAAAAGCTGTTTAGTAAATATTCACTTGGCATGAAACAGCGAC
TTGGTATTGCCAACGCTATCCTGCATGACCCGGAACTGTTAGTTTTAGATGAGCCAACCAATGGACTTGA
CCCTATTGGTATTGCGGAGATGAGAAAGTTTATTAGGGACTTGAGCGTTGAGCATGGAAAGACAATTCTT
ATCTCCAGTCATATTCTTTCAGAAATCTCATTGTTGGCTGATGATATTGGAATTATCGACCACGGTGTTC
TTTTGGAAGAAAGTAGTATGAGTGAACTAGAAAAGAAAAACAGTAAATATATCCTGCTACAAGTTTCAGA
TATTCCAAAGACATCACTTATTTTAGAGCGTCAATTTAACACGAAGGATTATTCCGTTCAAGATGACCAC
ACTTTACGCCTTTATAACACTACTCTGGATATGGGTGAAATCAATAAAGCACTTGTAATGCAGAATGTAA
CTGTTATTAGTTCTCAACTTTGTAATGATACTTTAGAGGACTACTTTAAAAAAATCACAGGAGGAGAGGG
CATTGCTTAA
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TCCTGCTACGTGTCCGAATACAACTTACACTTATAAAAGATGCTTTAGAGGATATAAAAAATGGAAACCT
TAATCGCCGTATTTTAACAGATGAAAACGACATTACAAAACAAATTTGCTATGATATTAACGAAATAGCA
ATCAATAGCCAATTTCAACTTATTCAGCAAAAACAATCAGAACAAGCCTACAAACAGCTAATGACAAGTC
TCTCCCATGATGTAAAAACTCCACTTGCTTCTTTGGTCGGTTATTTGGAAGCAGTAGAAAGTAAAATTGT
TGTAGGAGAGGAAAAAGACGAGTATATCCATGTTGCGTCTAATAAGGCTCATTACTTAAAGAATTTTGTA
GAAAATCTATTTGAATGGGTAAAATTGGATTCTAAGGAACAAGTTTTTCATTTTGATATTTTTGACTTGA
ATGAATTATCCCGTAATATTATATCTGATTGGATACCTGTTTTAGAAAGCAGTCATTTTGAATATGAATT
TGATATACCAGAAATAGAGTACTTCTTACGTATAGACGCAAATGCATATACCCGTATCATTAATAACCTA
TTACAAAATATTATTACCCATAGTAGTGGCAACAAAATGACATTGAGAATTTTTGAAAACAAAGAGCAAG
CTCAAATTATAATAACAGATAATGGGAAAGGTATATCTTCAGACAATCTCCCACATATTTTTGAAAGGTT
GTACCAATGCGACCATTCACGAGCTTCAAAGGGAAATGGTTTAGGCTTGGCGATTGCAAAGGAACTTATT
AACGCTCATAAGGGAAATATTACCGCCAACAGCACTCCCGGTATGGGAACAGAATTTACAATATTGCTTC
CTAAAGCCCTGTAA
>ref|NC_013316.1|:c389185-388451 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
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TTTGTGCTCTTATGAAAAAATGTGTTGAGCAAGAAAATTTATCTGCTATTACTGCACATTGTGGTGCAGA
AGGTCTACATTTGCTCGATAAAAATAGACACACACTCTCTCTTGTAATTTTAGACATAATGATGCCAGAT
ATAGACGGTTTTCAAGTTCTGAAAAAAATTAGAGAAACAAGTAATATTCCAGTAATTATGCTTACTGCTA
AAAATGACGAGGATGATAAAGTTTCCGGACTACGTTTAGGTGCTGACGATTACCTAACAAAACCGTTCAG
CATAAACGAACTTATGGCTCGTGTCAATTCTCTTATTCGTCGGTATACTATGTTAAACCCTGCTTTTATA
ACAGACACAGATTGCATAATAATAAATGGCATGATTATTGACAAGACAAACCGAATTGTTTCTATCAATA
ATATTCCTGTTCAACTTACAAGCAAAGAATTTGATTTACTTGCTTTTCTGGCTTCTAATAAGGGACGGGT
ATTTACCAAAAAACAGATTTATACACAAGTATGGGAAGAAGAATATGCTTTTGACGATAGTAACATCATG
TCTTTCATCAGTAAATTGAGAAAAAAGATTGAACCAGACCCCAACCATCCATTTTATATTTTGACAGTTC
GTGGTGTCGGTTATCGTTTTAATAAGGAGGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c389333-389145 hypothetical protein CDR20291_0326 [Clostridium difficile R20291]
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>ref|NC_013316.1|:389562-390491 hypothetical protein CDR20291_0327 [Clostridium difficile R20291]
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AGATATCTTGTCTATGTGTATAGCAGCTATTTTAGAAGAAGAAAATATATTATTATCGGGACCAAAGGCA
ACGGGAAAAAATTTACTTGCTGATAATCTAGGGGAAATATTTAATAGACCTCAGTGGAATACATCATTTC
ATATAAATACAGACAGTTCAACACTTATAGGTACAGATACATTTATAGACAATGAAGTTAAACTTAGAAG
AGGCTCAGTTTATGAGTGTGCTATTAATGGAGGTTTTGGAGTATTTGATGAAATTAATATGGCAAAAAAT
GATGCTATAGTTGTGGTACATTCAGCTTTAGACTATAGAAGAATAATTGATGTACCTGGGTATGAGAGAG
TCAATCTACATCCAGCAACAAGATTTATTGGGACTATGAATTATGAATATGCAGGAACAAAAGAACTTAA
TGAAGCACTGGTATCTAGATTTATGGTAATAGATATTCCTCCTATAGAAGAAGATAAGTTAATGATGATT
TTAAAAAATGAATTTTCAGATGCTGATGAAGAAAAATTAATACACTTTGCAGGAATATTTTTAGATTTAC
AATTGAAGTCTCAAAATGGAGAGATATCTAGTAAAGCTATTGATTTACGTGGTCTTATGGCATCTCTTAA
GACTATAAGAAGAGGATTAAAACCAACTCTTGCAATTAATATGGGACTTACAGGAAAGACTTTTGATGTA
TATGAGAAAGAAATGGTTGGAGATGTAATTAAAACTAGAATACCTAATAAATGGGAGAGTATAGATGTAT
TTCCAATAAGTCATATTTAA
>ref|NC_013316.1|:390505-392277 hypothetical protein CDR20291_0328 [Clostridium difficile R20291]
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ATTACAATGAAAGTATAGATATATCAGAAAAAGATTACTCTTCAAAAGAAATAGGTCTATATTTTGCAAT
AATTGCAGGTGCTAGAAGAAAGTATGTAGATTGGGATATAGTTAAAAAATATCTTACAAATAGAATAAGA
AAAGGATACAACAAAGATATTATACTGGGTCTAATTCAAGTTATATTAAATACAATAGTTGAAGAAAAGG
TCATTAAAGATAGGCCAGGGATAGAAGACATAAGAAGAAATGCTTATAAAGATATTGTTTCACGTTTTAC
CAAAATACACAATGATAATATTATGGATAAAATTAAATACACATTTGTACTTTATAATATGGACAAGCAC
CCAGCATTAGATAGTATGACTAGAAGAATAGTTAATGATATAAGAAATATAGATACCAATCAAGATATGA
TGGAGATTTTAAAAGCATTAGATGTTATATATTTAACTTATTTCGAATACATATTAAATGGAGAAGAAAA
TAGTCTTATTGATGAAAATAATGTAGAAAGTGTAGAAGTAAATTTTGATACATTTGCTGATTTCATGTAT
GAAGAACTTTATAGTGATGAAGAAGAAAATATTATTGAAAGTGATATAGATTCAATATCTTCATCCATGC
TTGTAGAAGGTGTAGGGGATTTTGATGATTCTAAATGTAGCAATTCAGCAGACCGAGTTATATATGTTGA
TGAAGACACTGCAAATAAGATATATTCAAAAATAGAACATTATTATGGAAAAACTTATTTGAGTAAAGGT
GAAATTAAAAAAATTGAGACACAAAATTGTAGAAATGTTCATGAAGGTTGTAGAATACACTTTACAGATG
GAGTTCTTAGAAGTGAGTGTAATAATGTATTTCAACTAAAATATGTAACAAGACAAAAAGAAAATAATTT
AGGAAAATTTAGAGAACATGCTAGAATGTATAGACAGCAAATAAAGAGATTAAAAGAAAGTCTGTCAAGA
ATTTTAATAGAAGAAAATGCTAAAAGTAGAGTATATTCTGATTGTGGTACTATATTAGCAAATAGAGCTT
GGAGAGTTGGTAGAAGTAATAATAATAAAATATTTTATAAAGATATAGAAAATGAAAAAGGGAAATACGT
TATTGATATATTATTGGATGCAAGTGGCTCTCAAAGTAGAAATCAGGGAAATGTGGCAATTCAAGCTTAC
ATAATTGCAAATGCTCTAACAGAAGTTGGCATACCAAATAGAGTGATGGGATTTTCTAGTTTTTTAGACT
ATACAATATTAAAAAGATTTAAAGATTATGATGATAGTATAAAAAATAGTGAAAATATATTTGAATATTT
TTGTGCTGGTAATAATAGAGATGGTTTGGCAATAAAATCTATATGTAGTGGTCTAATAAATAGAGATGAA
GAAAATAAAATCCTGATAGTTCTCAGCGATGGAAGACCAAATGATGTAAAGATAGGAAAAAGTAGTGAGA
GAACATTAAGAGGAGAAAAGGCTTATAGGGGTATAGTTGGTTTGAGAGATACAGCCAATGAAGTGAGAAA
AGCTAGAAAGCAAAATATATTAGTACTAGGAGTATTTACAGGAAAAGAATCAGAACTTGAAGCTGAAAGA
TTAATATATGGAAATGATTTTATATATTCAAGAGATATAACTAGATTTTCTGATGTAGTTTCAATGTATT
TAAAGAAGATAATTAGAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:392790-393542 putative cobalt transport protein [Clostridium difficile R20291]
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ATGCAATGCACATAATGGAAGGATACTTACCAGTAAAATGGTCTATAGCATGGGGAGTTATATTTATACC
ATTTTTTTTAGTAGGACTAAAATCAATAGGAAAAATAGTAAAGCAAGACCCTAAAAAGAAAGTATTATTA
GCGCTGTGTGGAGCATTTGTATTTGTATTGTCAGCACTAAAGATACCTTCAGTAACAGGAAGTTGTTCAC
ATCCTACTGGAGTAGGTCTTGGAGCAATAATGTTTGGACCAAGTGTAATGTTTGTTCTTGGAACTATAGT
TCTAATATTCCAAGCATTACTATTGGCACATGGAGGAATAACTACTTTAGGAGCTAATGCTTTTTCAATG
GCTATTATAGGACCAATTATATCATTCTTAATATTTAAAGCATTAAAGAAAAAAGACGGAAATAATGCAA
TGCCAGTATTTCTTGCAGCAGCAATAGGAGATTTGGCTACATATACAGTAACTTCGATACAGTTAGCACT
GGCTTTCCCAGACCCATCAGGTGGAGTGATGGCTTCAGCAATTAAGTTTTTAGGAATTTTCTTTATGACT
CAAATACCAATAGCAATAGCAGAGGGTATTCTTACTGTAATTGTATATAATTTAATTACAGAAAATGGAG
AAAAAAGCATACTAGAAAATAATGATAAAGGAGTTAAAGCTAATGAGTGCTAA
>ref|NC_013316.1|:393532-393816 cobalt transport protein [Clostridium difficile R20291]
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CATTACTTGTTAATTCGGGAGCTGAATATGGAGGAGCAGATGGTCAAGCTGAGAGTGAAATTACTAAGAT
AAATCCAGATTATGAACCATGGTTTAGTAGCCCATATGAGCCACCAAGTGGAGAAATAGAAAGTTTATTA
TTCTCTGCACAAGCAGCGTTAGGTGCTGGTGTAATAGGGTACATATTAGGTGTTCAAAAAGGAAAGAGAA
GTTAA
>ref|NC_013316.1|:393819-394517 cobalt transport protein [Clostridium difficile R20291]
ATGCTTATAATTGATAAATATGCATATACAAATAGATTAAGTAAAGTAAATCCAAATAAAAAAGTAGCCA
TAGGAGTAATCTTTCTGATTGCTTCTATGGTAATAAAAAATATATTTGTTTTAAGTGGAATTATGATTTT
AATGAGTATTCTAGTTGTTTGTGTAGCTGGAATAGATTTAAAGAATTATTTAAAATTACTCAGAATACCA
ATGTACTTTTTATTTCTTAGTATAGGAATAACTCTTGTAAATATATCTTTTAATAAGGCAGACTTATTAT
ATAGTTTTGAAATTTTTAGTTTCAATGTAGGAATATCAAAAGCATCTATTGACATGTCTATTCATGTGTT
ATTTAGAGCTATGTCTTGTTTGACTTGTGTATACTTTTGTATACTTACAACACCTTTTAATCAATTAATA
TTCTTCTTTAAAAAAATGCATTTGCCTGATACTTTTGTTGAGCTATCAATGTTAATATATAGGTTTATAT
TCATATTTTTAGAAGAATTTTCAGAAATATATAAGTCACAAGAACTAAGATTTGGGTACATAAATTTAAA
AACTTCATATAAATCATTAGGAATTCTTGGCAGTATGCTGTACAAAAGACTTATGACAAGGTATGATGAT
ATGTGTATATCATTAGACATAAAATTGTATGATGGTAAATTTCACATAGTAGGGGATAATGATGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:394510-395328 cobalt ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAAAATAAATAATTTAACTTATCAATATGAAAAGAATACCAATGCACTATTAAATATTAATATGG
ATTTTTCAAAGGGAAATGTTATAGGTATAATAGGTTCAAATGGTTCAGGAAAATCAACATTATTTATGAA
TTTAATGGGTATATTAAAGCCTACATCTGGAGAAATTCTTTTTAAAGAAGAAAAGTTAAAATATGATAAG
AGAAGTTTATACAACCTTAGAAAAAATGTAGGTATTGTGTTCCAAGACCCAGAAAAACAAATTTTTTATT
CAAAAGTATATGATGATATAGCCTTTGCAATGAGAAATATTGGTATAGATGAAAAAATAATTAAAGAGAG
AATAAACAAAGCTCTAGTAGCTGTTAATGGAATAGATTTTATAGATAGACCAGTACATTTTTTAAGTTAT
GGTCAGAAAAAAAGGGTAGCGATAGCATCAGTTATAGCAATGGAAAATGAAATTATATTGCTTGATGAGC
CTACAGCTGGTTTAGACCCAGTAAGTACTAGGTCTATTGTAGATATAATAAAGGGATTGAATAAAGATAA
TATAAAAATAGTAATATCCAGTCATGATATGAATTTAATGTATGAAATATGCGATTATATATATGTATTG
GATAAGGGGATTTTAATTGATGAAGGAAAGGCAGAAAATGTATTTGTAAATGAAAATAACATTATACAAG
CTGGCCTAGAATCCCCATGGTTAGTAAAAGTACATAGAAATATGAATTTACCCTTATTTAAGAAAGAAGA
AGATTTGTATAAGTATTGGAAGGAAAGAGAACTTAATACAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:395559-397847 ATP-dependent DNA helicase [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTGTTAACAGGAGGAGAAATATGAATTTAGATACATTAAATCCTGCTCAAAGAGAAGCAGTAGAAA
AGACTGAAGGTCCAGTACTTATACTGGCTGGTGCTGGTTCAGGTAAAACTAAGGTATTAACAACAAGAAT
AGCATATCTTATAGAAGATAAAGGTGTACAAGCACCAAATATATTAGCTATAACATTTACAAACAAAGCT
GCAAATGAAATGAGAGAGAGAGTTGAACAAAATATAGGTCCTGAAACTAAGGATATGTGGATAAGTACAT
TCCATTCTTGCTGTGTTCGTATACTAAGAAAAGATATAAATAAGATTGGTTACAATAGAAGTTTTGTAAT
TTATGATTCAGCAGACCAAGTTACATTGGTTAAAGACTGTCTAAAAGAATTAAATTTAAGTGATAAAGTG
TTTGAACCAAAAGCAGTTATAAGTGCAATTTCAGGAGCAAAAGACAAACTTTATACTCCAAAGCAGTTTA
AAGATATCAACATGGCAGATAATAGAATGGTTAAGATTGCAGATATTTATGCGTTATATCAAGACCGTTT
AAAAAGAAATAGTGCACTTGACTTTGATGATTTAATACTTAAAACTGTAGAACTTTTCAAGGCTAATGAT
GAAGTATTAGCATATTACAGAAGTAGATTTAGATACATAATGGTAGATGAGTACCAAGATACAAGTAAAG
CTCAATATGAATTGATAAAATTATTAGCAAGAGAACATCAAAATATTTGTGTTGTTGGAGATGATGACCA
AAGTATTTATGGATGGAGAGGCGCAGATATAAGAAACATACTTGAATTTGAGAAAGATTATGACAATGTA
CATGTTGTAAAGTTAGAACAAAATTATAGGTCTACACAAGTGATATTAGATGCAGCTAATAAAGTTATAT
CTAATAATATAGAAAGAAAAAGAAAAAAGCTTTGGAGTGAAAAAAAAGAAGGAGAACTTATAAAGATACA
ATTAACTGGTAGCGAAATAGAAGAGGCTGATTTCATTGCTGATTCAATTGCACAAATAGCTAGAAAAGAA
AATAGACCTTATAAGGATTTTGCAGTACTTTATAGAGCAAATGCACAGGCAAGACCTGTAGAGGACGCTT
TAAATAGAAGTCAAATTCCATACAATATATATGGTGGTACAAAATTCTACGAGAGAAAAGAAATAAAGGA
TTTGTTGGCGTATTTAAGAGTTATTCAAAATCCACAAGATGATATATCTATAAAAAGGATTATAAATGTT
CCTAGAAGAGGTATAGGGCTTAGAACTATAGAAAAAATTGAAGATAGAGCTAACTTAAAACAGGAAAGTA
TATACTCAGTATTAATTGATATAGAAACAAATTCAGATATATCTACTAAGGCAAGGGCAAGTATAAGTGG
ATTTGTTGATATTATAGGGACTCTTAGAACTATAAAAGAAGTTTATCCTGTTAGCAAACTTATAGAAAAA
GTCTTGGATACTACAGGATATATGGACGAGCTTGTAGAGATAAGAAATAAAAATGAAAAAGATTTAACAG
GCAAAGGTGAAGAAGCTCAAGACAGAATTGATAATTTGAGAGAATTTATTTCTATAGCTTTGGAGTTTGA
AAGTAGTAATGATGATACTTATGAAAATAAAGACTTAGAGACATTCCTAACAAGTATAGCACTTACATCT
GAATCAAATGATGAAGAAGACAATGATAGGGTTTCGCTTATGACAATTCATACATCCAAAGGTTTAGAGT
TCCCTGTTGTGTTTTTAACAGGTATGGAAGAAGGGTTATTTCCTATATCAAGAGCTATAAAATCTATGAG
TGATTCACAAATAGAAGAAGAGAGAAGACTTTGTTATGTTGGTATAACTAGAGCTAAAGAAGAGCTATAT
ATGTCATTGACAGAGAAGAGAACATTATATGGTAAAACAAATGTTGCAATAGCTTCAAGATTTATGGAAG
AACTGCCAGAAGAATGTATAGAAAGATTGTACAAAGTAAAAAAAGAACTAAGCTATTCTAAAGCAAGTTA
TAATATGTTAGATAAATATACTAAAAAGTATATGAGTACTATAAGCAAATCTAAAGTTGCAGATAAAGTT
AATGCTACAATAAAAGATTCTAATAAAGAAACTAATCCAGATGATATAAAACTTGGTTCTAAGGTACATC
ATCCTAAATTTGGGGTTGGGACAGTGGTTTCTATAATTGGTACAGATGTTACTATAGCTTTTGACCAACA
GGGAATTAAAAAAATAAATAAAGAATATACAACACTAAATATTTTATAA
>ref|NC_013316.1|:397864-399162 putative aspartyl aminopeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAGTATAAACTTTGCTAAAAACTTAATAGACTTCATATATGATAGTCCGTCGTCTTTTCATGCAG
TCGAGAGTACTAAGGAAATCTTAGATAAAAATGGATTTGAAGAATTAGTTTTGAATCAAAGATGGAATCT
AAGAGTTGGTGGAAAGTATTATGTTACTAAGAATCTATCAGCTATAGTAGCTTTTGTAGTAAATTCAGAA
GATATAGAAAGAGATGGATTTAGAATAATAGGCTCTCATTCAGATTCTCCTACATTTAGTATTAAACCAA
ATGCAGAAATAGAAGCTGAAAAATCTTATTTGAAGTTAAATACAGAATGCTATGGAGGAGCAATATTAAG
TACATGGTTGGATAGACCTCTTGGGATAGCTGGTAGAGTAGTTTTAAAAGGTGATAGTATATTAAAACCA
AATGAAAGGCTTATAGACTTTAAAAAGCCAATTTGTATAATACCAAATCTAGCAATACATTTAAATAGAA
GTATAAATGATGGTCATTCATATAATAAGCAAAAAGATATGTTACCTTTAGTTGGGATGTTAAATGATAC
ATTAGAAAAAGATAATTTTCTTATAAAGCAAATAGCATCTAACTTAGATGTAAATATGGAAGATATTATA
GATTTTGATTTATTTTTATATGAATTTGAAAAAGGAAGTTTAATAGGGGCTAATGATGAATTTATATCTA
TTGGGAGACAAGATAATCTTGCAATGGTACATGCTAGTTTGAATGCTCTTGTTAATACTAAAGGTCAACA
AGGTGTAAATGTAATGGCTGTATTTGACAATGAAGAAGTTGGTAGCTCTACTAAACAAGGTGCAGATTCA
AACATGTTGTTAAATATATTGGAGAGAATTTGCATATCAATGGGTAAGGATAGAGAGGGATTCTTTGAGT
CTATTTATTCATCTTTTATGATATCATCAGATTTAGCTCATGCTATTCATCCAAACATTCCAGAAAAGCA
TGACCCAACTAATAAACCAATAATGGGAAAAGGTCCAGTTATAAAGATAAATGCTAGTCAGGCATATACT
AGTGATGGATATTCTATAGCTATTTATAAAAATATATGTAGAGAAGTTAATGTTGAGTATCAAGAATTTG
TTAATAGGTCAGATGAAAGAGGAGGAAGTACTATAGGTCCAATATCTTCTACTCATATAGATATACCATC
TGTGGATGTGGGAAGTCCAATTTTAGCAATGCACTCTATAAGAGAATTAGGAAATGTTGAGGACCACTAT
AGTATATATAAAACATTTAGTAAGTTTTTTGAAATATAA
>ref|NC_013316.1|:399193-399945 hypothetical protein CDR20291_0335 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTAGGATTATGTTTAGAAGGTGGAGGAGCAAAAGGGGCTTATCAAGCAGGAGTAGTTAAAGCCT
TGTATGATGGAGGAATAAATAAATTTTATTCGATTTCAGGGACATCAATAGGAGCAATAAATGGATATTA
TTTGTACACAGGGAATGTTGATAACTTGGAGAAAATGTGGACAAATATAAAAGATATCCAGAATGGAAAT
GTAAAAATAGTAAATAATACTGTGGATAATTCTCCTGCTATAGACAACCTAAGGGAACTAGATGATAGTA
ATATAGAAGAAATGAACTTTTATGTTAATTATGTTGAAGTTGATAATAAAGTAGTATCAGAAAAGATTGT
TGACATATCAAAAATGCCTCGTAATGAAGCCATTATCAGCATTTCATACAGTGGGTTGTTACCATCAAAT
CCAAACGCAACTCTTGGATTTAAAGAACAATTTGTGAAAGATGTGCAAGAAGGAATTTATGATGGTTTCA
AATTAGATGGAGGTTTAATTAGGAGTGCATTAATTGAACCATTAATTGGGGATAATGTGGATAAAATTAT
TTTAATATCCACAAAATATAATTATGAGTTGCCAGAGGATATTAAAAAAGTATATGATGAAGATAAAATA
ATAGTAGTTAGACCTAATACTCAATTTGCTCCTAAAGATACGCTTAACTTTGATGATGAGTTTTGTAAAA
CTATTTATCAAGAAGGATACGAAATAGGAAAAAATATACTTGATAGACTTTAA
>ref|NC_013316.1|:400010-400534 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATAAAAATCCTATAGTAACTATAGAAATGGAAAATGGAAAAGAAATCAAAATTGAGTTATATC
CAAATATAGCTCCAAATACAGTTAAAAACTTTGTATCATTAGTAAATGAAGGATATTACAATGGAATAAT
ATTTCATAGAGTAATACCAGGATTTATGATACAAGGAGGATGCCCAAATGGTACAGGAATGGGTGGCCCA
GGTCACTCAATAAAAGGTGAATTTAGTGGTAATGGATTTACTAACAATTTAAAACATGAAAGAGGAGTCA
TATCAATGGCTAGAACTATGGCACCTAATTCAGCTGGTTCTCAATTTTTCATAATGCATAAAAACTCACC
ACACTTAGATGGTCAGTATGCAGGTTTTGGTAGAGTGATAGAAGGTATGGATACAGTTGATGAAATAGCA
TCAGTTAGAACAGATTCAGCTGATAAGCCACAAACTCCACAAATTATGAAGTCTGTTACTGTAGAAACTT
TTGGAATAGATTACTCAGATGTAGAAAAAAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c404145-402547 manganese-dependent inorganic pyrophosphatase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTTATTAGTTTTCGGACATAAAAATCCAGATACAGATTCAATATGTTCTGCAATTTCATTAGCAC
ATTTAAAGAACAAACTAGGAATAAAAGCAACAGCTTATGCTTTAGGAGATATCAGAAAAGAAGCTAAATA
TGCCTTGGATTACTTTAAGGTAGATGCACCTGAAATTTTAGATAATGTTAGAATACAAGTTAGAGATTTA
AATTATGATAAAGTAGTACCTTTAACACCAACTTCATCTATATTAGAGGCTTATAACCTTATGGATGAAA
AAAATGTTAAAACACTACCTGTAACTTATGATGATGGAACTTTTGCTGGTATCATTACTATGAAAGAAAT
AGCTAAAAATCTACTTCATCAACACTTTACAACTATACACACATCACTATCAAACATTTGTAAAAACCTT
AATGGTACTATTCTTGTGGACTGTGGTGAAGATATAAAAGGTAGAGTAGTCACTTTATCATTTGGAATGG
AGACTCTAATAGAGACTTTAAAAGAAGGAGACATAGCTATTGTTGGAGATAGATATGATAGTATTGAATA
TGCTATTGATACAAAAGTTAAACTTTTAATACTTACTAATCATACAGAGATTTCAAAAGATTTGCTAGCT
CTTGCTAAGATAAATGGAGTGTCTGTTGTTTCTGTTGAAAGTGACAATTATAAAACTTCTAATGTAATAA
ATCAATGTAGTTTCTTAGACTCTATAGAAGCTACAGAAAATTTAATTACATTCAAAGAAGATGATTATAT
GGATGAAATAAAAGAGATTATGCTAGAAACAAACTTCAGATCTTATCCAATATTAGATGATGATAATAAG
TTTTTAGGTTTAGTTTCAAAAGGTCATCTATTAAACCCATCTAAAAAGAATGTTGTTTTAGTTGACCATA
ACGAATATGCTCAAAGTGCTGATGGAATTGAACAAGCAAACATAGTTGAAATAATTGACCATCATAAACT
TGGTGGTATTTCTACTGATGTTCCTATGTCATTTAGAGTTATGCCTGTTGGATGCAATAGTACTATAATT
TATCAAATGTACAAAGAAAACAATGTTGAGATACCTTATGAAATAGCTGGGCTTCTTTTATCTGCTATAT
TATCAGATACATTATTATTTAAGTCTCCAACAACAACTGATATGGATAAGAAAGCTTGTGAAGAATTAAG
TAAAATAGCAAAAGTAGACATGGAAAAATACGCTATGGATATGTTTAAATGCGGTACTTCTTTAGATGAA
TATACTATAGAAGAAATAGTAAATATGGATTTTAAAGAATTTAATATGAGTGGACATAGAGTTGGTATTG
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GACTGATTATGACAAACTAATTCTTGCGGTTACAGATATAATCAAAGAAGGTTCTTATTTAATCTATAAA
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>ref|NC_013316.1|:404993-407665 aldehyde-alcohol dehydrogenase [includes: alcohol dehydrogenase; acetaldehyde dehydrogenase [acetylating]; pyruvate-formate-lyase deactivase [Clostridium difficile R20291]
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AATCAACAAAGAATACCTCTAGCAAAAATGGCAGTGGAAGAGACTGGTATGGGTATTGTTGAAGATAAGG
TTATAAAAAACCATTTTGCCTCAGAATATATCTATAATGCTTATAAAGATACTAAAACTTGTGGTGTCAT
AGAAAAAGATGAAGCATTTGGTTTTACAAGAATTGCTGAGCCAGTAGGTGTTTTATCAGCAGTTATACCA
ACAACTAATCCTACATCAACTGCAATATTCAAATCCCTAATAGCACTAAAAACTAGAAATGGTATAATTT
TCTCTCCTCATCCAAGAGCTAAAAACTGTACTATAGAAGCAGCTAGAGTTGTACATGATGCGGCAGTTAA
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GCAGAGGCAGACCTTATATTAGCTACTGGTGGACCTGGAATGGTTAAATCTGCATACTCTTCAGGTAAAC
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AAGTTCAATCTTAGTATCAAAATCATTCGATAATGGTATGATATGTGCTTCCGAGCAAGCTGTAATAGTA
CCAGAAAAAATATATGAAGAAGTTAAAAAAGAATTTAAATACCGTGGAGCACATTTCCTAAATAAAGAAG
AAACTGAAAAAGTAGGAAAAGTAGTAATAATTGATGGTTCATTAAATGCCAGAATAGTTGGACAACCAGC
ACATGTAATAGCCAAAATGGCGGATGTAGAAGTTCCAAAAACAGCTAGAATAATAATTGGTGAAGTAGAA
TCTGTTGAATTAAATGAACCTTTTGCACATGAAAAACTTTCTCCTGTACTTGCAATGTACAAATCTAAAA
GTTTTGAAGATGCAGTTGCTAAAGCTGAAAAATTAGTTGCAGATGGTGGATATGGCCATACATCTTCGTT
ATATGCAGACTCTATAAATCATCCAGATAGAGTAGAGAAGTTTGTAAATGCTATGAAAACTTGTAGAGTA
TTAGTTAATACTCCATCGTCACAAGGTGGTATAGGTGACTTATATAACTTTAAATTAGCACCATCTCTTA
CTCTTGGTTGTGGTTCTTGGGGTGGAAACTCAGTATCTGAAAACGTGGGAGTGAAACATTTACTTAATAT
CAAGACAGTAGCTGAAAGGAGAGAGAATATGCTTTGGTTTAGAGCACCAGAAAAGGTTTATTTCAAAAAA
GGTTGTTTAGGTGTAGCAGCAAGAGAATTTAAAGATGTTATGGATAAAAAGAAAGCCTTTATAGTAACAG
ATTCTTTCCTTTACAATAATGGATACACTAAGAAGCTAACTGATTTGTTGGATGAGATGGGAATTAAGCA
TACTACATTCTTTGATGTTGCTCCAGACCCAACATTAGCTTGTGCAAGAGAAGGAGCTAAGGCTATGGCT
GATTTCCAACCAGATTTAATAATAGCTGTAGGTGGAGGTAGCGCAATGGATGCTGGTAAGATAATGTGGG
TAATGTATGAGCATCCAGAGGTAGACTTCCAAGATTTGGCTATGAGATTTATGGATATAAGAAAAAGAGT
ATATGTATTTCCTAAGATGGGTGAAAAAGCGTATTTTGCTGCTATCCCAACTTCAGCAGGAACTGGTTCA
GAAGTAACTCCATTTGCAGTTATAACTGACCAAGATTCAGGTGTAAAGTACCCATTAGCAGATTATGAAT
TAATGCCAAACATGGCTATAATTGATGCTGATATGATGATGGAGATGCCACCAAGATTAACAGCAGCATC
AGGTGTTGATGCTTTAACACATGCATTAGAAGCATATGTATCTATGTTAAGAACTGAACCAGCTGACGGT
CTAGCACTACAAGCAGGTAAAATAATATTTGAATATCTACCTCGTGCATACAAAAATGGAAAGAATGATA
AAGAAGCAAGAGAAAAAATGGCAATGGCATCTACTATGGCAGGAATGTCTTTTGCAAATGCCTTCTTAGG
AATATGTCACTCTTTAGCACATAAATTAGGTGCATTCCACCATGTTCAACACGGTGTTGCAAATGCATTA
TTAATAAATGAAGTAATTAAGTTCAATTGTGCAGAAGCTCCAAATAAGATGGGTGCATTCTCACAATACA
GATATCCTGATTGTATACAAAGATATGCTGAATTTGCTTCTTTTGCAGGAATCAAGGGAAATACAGACCA
AGAAAAAGTAGATAACCTTATAAAAGCAATAGATGAATTAAAGGCAAGAGTAGGACTTCCTAAAACTATA
AAAGAGGCTGGAGTAGAAGAATCTAAATTCTTAGAAACATTGGATGTTATGGTTGAACAAGCTTTTGATG
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ATATGTTGCCTTTCAGATAAAAAATTAGCAAAATATAGAAGACAAAAAGTAGGCTTTGTTTTTCAACAGT
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CAATTATCTGGTGGTCAACAACAAAGGGTTGCTATTGCACGCGCTTTATCTGCAAAACCAAGTATAATCC
TAGCAGATGAACCAACAGGAAATTTGGATAGTAAAACTACGGAAGAAGTCATGGATTTACTAAAAAGTTC
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ATTATATCTATAATAGATGGAGAGCTTAAATTAACACTCTAA
>ref|NC_013316.1|:c411661-409076 ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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TAAGTATAATTCTTGCTACATCACTTATTGTTGGTATTGGTACCCTCTCAAGAAGTGCTCAACAAGCAGA
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GAATACATAAAGTCTAGAAAAGATATTAAAAATTTAGGTATAACATCTCACTATGGCTATACAGATCCTA
ATGAAAGATTAGCTATAAACCTAGAATATGCAAATAAAAATTACTTGACTAATCAATCCAAACTTATAAA
AGGTCACCTTCCAAAAGCTAGTAATGAGGTGGTCGTAGAGAAATGGATTTTAAATAGTCTGGGTTTAAAA
CCAGAAATAAATCAGAACATTACTTTTAAATTATATCAAAAAGAAAAACCAGAGACATTTAAAGTTGTAG
GAATACTTGAAGATAGACCTATTGAGAAAAATAAAGGGACATGTGAAATTTTTTTAAATCTCAATGAATC
AAAATTGGATAAATTTTCTTATGCTTATATTGAATTTAATAATGGCATTGATATAAATACAAGCATAGAT
AATATAGTAAAAAATACTATGTTGGATGAGAATAGTGTTGGAAAAAACAAAATGCTTATAGAATCTACTA
GGGAAAATGGTACTTTAGATAACTCAAGTAAATACACTGCAATTACTATGAGCCTATTTTCTGGTATTGT
AATATATAGTATCTATGTTATATCGATATATCAAAGAATACAGGAATATGGTATCTTAAGAGCTATTGGA
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TAATGTAACAGTTACCCCTTTTGTTATTCCAGATAAAATAATACTTTTATCAATTGGAAGTATAATACTG
ACAATACTAATTATAAGTTTCTTTACATATTTAAAGATAAGAAGAATTTCTCCTATTGACTCTATAAGAA
AAACCTTTGGAACTGATAAAAATATAAATAAGGTCAATTCTTTGATATCAAAATTAACTTTAAATATATC
AGTAACAAAATCTATATCTGCTAAAAATATCTTTAGGAATAAAAAGGGCTTCATTATAATTATATTATCC
ATGAGTCTAGGAGGTATAATGATCATAAAGGAGAATTATAAATATTCTTTTTCAGATATACAAAATAAAA
ATGGTCAAGAAGAAACATATATGAATGCAGATTTTATTCTAACAAATTTTTTCTTAAAACTAAATCAATC
TAATAAAGCTGATTCTTTCAAGGATATAAAAGGACTTAATGATAATCAGATAGATAAAATAAAAAATATA
AATGGAATTGACAAAGTCAAAACTGCCAGCATCTTAGATACAAGAATAGAAGTAGATAAATTAAATGGAT
TAGATTACTACAATATTATTAATTCAACGCCTTATTATAAGGATTTTCCTCTATTCATAAAAAATAAGAA
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TACTTAGTGAGTGGGAGTATAAATCTGGAAAGAATGAAAAAAGAAAACCTCGCTATATTATACGTACCAC
AAGTTTCTAAAACAAATAAATACAAGCTAAGTTATACTCCTGGTACAGAAACGCCTGCTGTAGATATAAA
AGTAGGAGATACTATAAAGGTCAAATATCCAAAAGGTGAGATAGATCAAGATCTTTATATAAAACTAAAA
GATAATTATGAATATCTAGAATATGAGTTTAAAGTTGGAGCTATTGTAAGTTATCCTTTTGCAGATAATT
ACCTATATTCTGGAGATCAGGGTATAGATGTAATAACAAGTAACGACTATCTAAAAAAACTAACTGGTGT
AGATAAATATAATGTAGTTTATGTAGATATTAATAAAAATGCAAATGTAAAAAAGATAAATACACTCTTA
GGTGAAATAGGAAGTGAATCTCCTGGAACTACAACAGCTAATATGCTAATGGAAAAAGAAAACTTTGATA
AGATGACAGCTAGGGCTCTGACTTATGCTTATGGAATAGTAGCAGTAATGTTTATAATTAGTGTGTTTAA
TATAATAAATAACATAAGTTATAACTTAACTTCAAGAACTAGCGAATTTGGAATGTTAAGAGCTATTGGT
ATCTCTGAGAGAGGATTTAAAAATATGATACTCTATGAGGGAATATTATATGGAATACTCTCAAGTGTAA
TTACCATTGTGGTAGGGCTTATAATACAGTTTAGAATGTATTACACGTATAATTTTGTATCATATGGATT
GGGATTTTCAATAGATTACAAAATATATATCCTAGTTGTTTTAGCAAACATAATTGTAGGTATTCTAGCT
ACATATATTCCATTAAGGAAAATAAATAAAATTAGTATAGTTGAAGCTATAAACATTACAGAATAG
>ref|NC_013316.1|:411869-412804 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
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AATACTGGGTTAGCTGAAGATGCAAAAGAATATATAACGAATATATCAAATAGCTTTAAATCAAAAAATT
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GTGCTATTAAACATAATAGACAATGCAATAGAATCTTTGTCTGCTATACAAAAGGAAAAGAAGTATATAA
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TAATTTTAATACCAAAATATTATTAG
>ref|NC_013316.1|:412823-413560 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
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AGACCACATTAACTCTCATAAAATTGCAAAAAATAATTTTATAGAAGATACTCTTTTTGTATATAAAATA
AGGAAACAGATACATATGATTAATTTTGATGATATAGTCATGTTTGAGAAAAATTCAAGAGCTATTAATT
TATATACTAGAGATGAAGATACGATAAAATTTTATGAGAACTTTGATGATTTAAAAAAACGCCTACCTCC
TAATTTCTTTATGACTCATAGACAATACATAGTAAATTTAAGACTTATACATAAGGTTATACCTATAAAT
AAGTCTTCTTTAGAGATAAAATTTATAAATTTTCAAGAAAGTGCTACTTTAAATAAATCTTTAGAAAAAG
ATTTTCTATACAGATTTTATAGGGTTAAAAGGTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c418777-413720 hypothetical protein CDR20291_0345 [Clostridium difficile R20291]
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CTTCTTCAAAACAGTACTACGACTTAGCAAAATCTCTTTGGGACTGCATAGAAAATAGTTCATACTATTA
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AAGAACTTTGCCAATTAATTAAAAGAAAGATGGATTATACATATTCAGGAGGATATTATCGTAAAGGGTA
TCGCTCAAATAAACTTGTGGATTATTTTAGAGGTATTATAAGGTTTATTTCAAACTATGTTGATTTAATT
TATTATGATTTTTCAGTTATAGATTATCTTACTCTTCCAAATAAGGTCTTGTACTATGACTCTATAATGA
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TGGAGAAAATCAAACTGCTCTACTTACAAGACAAATGATAATTGGTATCATGAAGAGTCATAGTGATAAA
TGCTATGAAATGCTTTCTAAACTTCTTTTGGCAGCCAAACAACAAGAAGGACTTAGACAGCAAATTGTAG
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ATAATACGTAAATGTTTAGAACTTTCATATAAATCATTGACTGATGAAAAGTTCCGTATAGAATCAATTA
ATAGCAATGATAATCTTGAAATTTATTTTGCCTTATGGGCTACTGCAACTTACAACATATATGACTCTTA
CTCTCTTATTGAAAACTTACTTTCTTGTCAGGAAAAATATAAAAAACTTGTAGCTCTTTACTTTTTATCG
CATACAGAAAGTACATATTTTAAACATTCTATAGCATCTAAAAACATTAAGGGTGATGATTTAGAGATAC
TAGCATGGGTAATTACAAATTTCTATGTAGAAGGTTCTGTTGGCTACTACTATAGTTGGCAAAACAGAGA
AACTAATTTTGACTTGTCAAACACTCCTATTGACAAAGACTTTGATGCTAGAAAAGAACAATTTGAAAGT
TTAAAACATACTTTAGAAATTTTAAATTCAAAGACAAAATCATTTTCAGGAAGTGTATTTCCATGGACTT
GGATTGAAATTTCTTCTCATGAAATACTTAAATGTATGATGACTTTAACAGCATACGATATGAATGCTCA
ATTTATAGATGTGCTTATGGAAAATTGTCATCTTATGAGTTCAGATTTAAGAGCTTCACTTATAGTCAAT
TTTGTAAATGAACCAAAGACAGATAGACAACGTGAATTTTTATTGGAATGTTTAAGTGATAAGAGTGTTT
CCAATAGAGAAACGGTATTGAGTTTACTTAGAAAGCTTGAGCTAACAGATGTAGAATTAGATAAGATAAC
CAATCTATTGTCTTTAAAGACAAGCTCTATTAGACAAACAGTAATAAAAATTTTACTTGAACAAGATGAT
TCAAATTTGGAAAATATTGCTTCTTCACTGATAAAATCTTCAAATTCTCAAAAATGCCTTGGAGGTCTTG
AAATTGTAAACTTATTAAAAGACAATTCTGATAGACAAGAACTATATAATAAGCTTATTTTACTTATAGA
GGATATTGATAAATCTAAAAAGAATACATCTCAAGTTCAAATATTAATTGATAATTTGTTAGGTAAAGCA
AAAAATGATTACTGCAAAGAAAATGGTTTTGGAATATATAACCCTGAAAACAAAGTTCAAATTCCAGAAC
AATTTGATTTTAAAGATGATTCTAATAGCTCATCAAAGCTTAATAAAATTATTTCAAATATAAGTTTATC
TACTAGTGAGGATTCTGTTTCTGTAGCAACAAAAAAAGAAGCAAAAAAAATTCTCGATACGGATATAAAT
AAAATAATAAAAGTTTATGAAAAATTTGATGAGCTTATTACTGAAAATGCAGATTATGAATATGAAGTTG
AAAGATGGTCAGGTAATGTAGACAAAGTGCTTTTAGGTTATTCTACTTATAACTTGACTCCTATTAAATA
TAAAGTTTCTAATGATACTCTTGATAATTATCCATTGGCAGAACTTTGGAGAGAAACTAGTAAAAAGCTT
GACTTAGATTACAAATTAATACTTGATATCTTATTTTATAGTATAAGTACATGTGGATATAATGAAACAG
AAAAAAGTTGGTTTTCATCTATATATTCAAATGTCCTTGACTCTAAAAAACAAAATAAAATATATACAAA
ACTTGAAAAATTTAAATTTAATGGACTTACAAGAAAACTTTTAAGAGTTTTACTAAATGAGTTTGACCAT
AAAGAAATATTTAACTATTGTTTAGAAATATACTATAAACTTAGAAACTTATTGACTATAGAACAATGTA
AAAAACAAAGAGTTGAATTTACTAAAAACTATTACAGACAAAATGAATACTGCCCTGCTTTAAATGCCCC
TATTTTAAACTATTGGCTTGATAAAGCACATTCGTTTATTTATGATGATATTTCTTTTACTAAGTTTTTC
TACACTACGTTTTCAAATTATCAGTTGCTAGAATATAAGTTTCCTTTCTATACTAGCATAAATGTGTTTG
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ATCAAATATAATAAGAACATTAACAAATCCTAGATGGGCTGGTGACACATTAGAAAAGTACCCTTGGCTT
AAAGATAATTTAAAAACTGTTACAAACCGAATTATAGAAATTGAATCACGTAGAGGTGATATGCCAACAG
AAGTGTCTCATCTAGCTAATAATATACAATACTTTGAAGGTATAGATTATTTTGTAAATATTTTGGTCGC
TCTTGGTAAAGAAACTTTCCAGAGAGGATATTCATATGGTAGCAATTATTCAAAAAAAGATGTTTTAAGT
TCTCTACTTAAAAATTGCTATCCTACTAAAGAAGATGATTCAAAAAAATTAAAAAGTTTACTTAAAAATA
CCGACATTACTGAGTTAAGATTAATAGAATCTGCTATGTATGCCCCTCAATGGGTAAACATAATTGAAAA
ATATTTAAACTGGAAGGGTCTGAAAAGTACAATTTGGTACTTCCATGCACATATAAATGAAGGCTTCTCT
GCACAAAAAGAATCAGAGGTTGCTCTATTCTCCCCTATTTCACCACGTAGTTTCATTGATGGTGCATTTG
ATGTAGATTGGTTCTTAGATTCATATAAAACTATTGGGGAAGAAAGATTCAATATACTTTACAAGTCAGC
TAAATATATAACTAGTGGTGGTAACTCTCATAGACGTGCACAACTCTATGCTGATGCTACACTTGGTAAG
CTTGATAAAGACATGTTGATGAAAGAAATTGAAACAAATAGAAATCAAGATAAATTGAGAAGTTTCTCTT
TACTTCCTATGAAAAAAGGAGACCTAAAAGAAGCAACTTTCCGTTATGAATTTATTCAAAAGTTTGCTAA
AGAAAGCAAGCAATTTGGTGCACAACGTCGTGAAAGTGAATCAAAAGCTTGTACTATAGCGCTAGAAAAT
CTAGCTAGAAGTGCTGGATTTGGAGATGTAAATCGTATGATGTGGGCTCTTGAGACTGAAAAACTAAATG
AAGTTGCTCATCTATTTAAACCAAAAGATATTGATGGTACTTCAATTTGGATAGATGTTGATGAAAGCGG
AAAAGCATCTACTAAAGTTCAAAAAGGCAACAAGTCTTTAAAGAGTATACCAAAAGCTATTGCTAAACAT
CCATATGTACTTGAACTTAAATCTGTCCAAAAAGATTTAAAGAGTCAGTATTCTCGTGCAAAACAGAGTT
TAGAACAAGCTATGAAAAATGAAATAGTATTTACAGTTAAAGAAATTGCCAATATCTATAAAAATCCAGT
TATCTGCCCTTTGATTAAAAATCTAGTATGGGTATGTGATGATAATATTGGATATGTTTATAATGATAAG
TCTAAGTTCTTTATTTGCAATATAGAAGGTGAAACTTATAAGTTGACAGCAAAAAATAAATTAAAACTTG
CACATCCAGTTCATTTGTTTGAATCTGGTAAGTGGAGTGAGTTCCAACATGATTTATTTAGTAAGCAACT
TGTTCAACCATTTAAGCAAGTATTCCGTGAGTATTATAGAATAAATTCTGATGAAATATCTGAAAAAACT
ATATCTCGCAGATATGCTGGTCACCAAATTCAGCCAAAGAAAACTGTAGCACTTCTTAGAAATCAGCTTT
GGACTGTCGATTATGAAGAGGGATTACAGAAAGTATTTTATAAAGAAAATATAGTGGCAAAGATGTTTGC
ACTTGCAGATTGGTTTTCACCAGCAGATATAGAGCCTCCTACTATTGAAACAGTAGAATTTTTTGATAGA
AAAACTTATAAAAGTTTAGAATTAGCTTCTATACCTCCAATTCTATTCTCAGAAGTTATGCGTGATATAG
ACCTTGTTGTAAGTGTCGCTCATGCTGGTGGTGTTGACCCTGAAACTAGCCATTCTACTGTAGAGATGCG
TATAGCAATTGCTAAAGAACTTTTATTATTATTAAAAATTAACAATATCAATTTTGAAGGCTCTCATGTT
CTTATCACAGGTAATTTAGGTGAGTATTCTGTGCATATGGGTTCTGGTATTGTACATAAAAAAGGGATGG
GTGCTTTGAATATACTTCCTGTACATTCTCAAAGTAGAGGTAAGATATTCCTTCCATTCGCTGATGAAGA
CCCTAAGACTGCTGAGATTATGTCTAAAATCTTATTACTTGCTGAAGATAATAAGATTAAAGACCCTAGT
ATCTTAAGCAACTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c419221-418802 hypothetical protein CDR20291_0346 [Clostridium difficile R20291]
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TATCTGACAACATCAATTGCCTAAAAGAAGCTATCTCTGAAATTGTATCTAAAAATGTTCTTGAATATAA
TGAGAAAATCCCAGAAAAATCAATAATAAACTTCTTAACTAATGAAGAAATTGAATCTCAAGCTGATATT
GGAAAAGTTGGATTTGGCTCTATTTACAATGAGAATAAACAATCTGTAGAAAAGGCAATAGAAGTAGCGT
TACAGGCATTTGAAGATGGAATCTACAAAGTGCTTATAAATGAAGATGTTATTGAAAAACTCGATTCCCC
TATAAATCTGAAAAGTGGAGATATATTTACTTTTATAAGACTTACCTTGCTTGCTGGAAGAATGTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c419705-419454 hypothetical protein CDR20291_0347 [Clostridium difficile R20291]
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AGAATGTAATAAAAGTTAGAGAAGTTAAAGAAGATACAGTTAGAAAATTTTTCTTGCAAGGTGACTGTGA
AGTTCTTGTAGTATTTGAAGACACTGGGAAAGAAATACTTATTGATGACTTTTCTCCTGAAGAAGATATC
AAAAAATATTTAGGAACAAAATTTATAAATAAAAAAAGATAG
>ref|NC_013316.1|:419794-420525 hypothetical protein CDR20291_0348 [Clostridium difficile R20291]
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AACTAAATGATGTATATAAGTCCTTGCCAGTAGGAAATTGTTCTGGATGTGGAAATTGTTGTATGGAGTC
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AGCTGTATAAGTAAAATATTAGATTATTATTTTGAGGAGTATACAAGAAAGAACCCATGTCCATTTAAAG
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AGAGGATTATAATAAAAATTTAGATAATGTTATTGAGAAAAATAATAACTATAGAGAGTTAATGAAAAAG
CAATATGGATTTGAAATAAATGATGAAGTAGTAAATTACAGGATAGATTATTGTGATAGATTTATTCCAA
ATAAAGATTATTTAAGTAAATCTAAGAGATTAAGCTTTTTTGATGAGCTTATGATATTAGACTCAAATAT
TTATTCAAGTGGAAATATAGATATAGACTTTAGGGATAGAGGTATAGTTGAATATTTTATAGAGTCATTA
CTTTATAGAAATTTAGCATATAATGTGAAAATAAGGATATCTAAAGAATACAAAATAAGAAAAAGAACTA
TAGATAGAATAAAAAGAATTGTTCTTGTATAG
>ref|NC_013316.1|:420512-421495 metallo-beta-lactamase superfamily protein [Clostridium difficile R20291]
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CTTGTAATCAATTTAAAGAATATTATAAAGATGTGTGTATAATGTCATCTGAATACGACAAATTATATAT
AGAAAATCCAGAATTGTTTTCAAAGTATATTGTTGGGGGAAAGAGCAATGTATTTATGGATAATATCTTA
AAAAATAAAATGTTGGATGATATAAAGATAGATAAATCTATAGAAGTTGGAAAAATTGAATTAAACAATG
AAATGTTTGATATAATTGAGTTTCAGGGTCATACACCTGGTAGTATAGCTGTTTTGACGAAGGATAATGT
GATTTTTGTTGGCGATTTATTGATAGGAGATGAAATTCTATCAAAATACGATTTCTTGTTTCTATATGAT
ATACAAGAACAAATAAATTCATTAGAAAAATTAAAAAATATAGATTTTGAGTACTTAGTTTTAGGGCATG
GCAAGCAAGTTATATCGAAAGAAGATTCTTATAAATTAATAGAAAAACATTTGAATGCTTTAAAAAAATA
TTTATATCAAATAAGAGAGTTGCTTGTAGAACCGAAATCTTTAGAAATTTTATTAAAAAACATTATAAAT
AACAATAATTTAAGCAATAATTATAAAGAGTATCATTTTTTTAAATCTTCGTTAGTATCTGTCATAAGTT
ACTTAGTTGATTTAGAAGAAATAGGGTATATATTGGAAAATGGAGAATTGCTTTACTATACAAAAACAAA
ATAA
>ref|NC_013316.1|:421546-422358 putative guanosine 3',5'-bis-pyrophosphate (ppGpp) synthesis/degradation protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATACGAAAAATGGAATGAGATACTAGCACCTTATGAACATGCAGTAGAGGAATTGAAAATAAAAT
TTAAAAATATAAGAAAAGAATATTTAGCAAAAGGTGAATATTCTCCCATAGAGTTTGTCACAGGCAGAAC
AAAAAAAATATCTTCCATAATATCTAAGTTAAAAAGGATAAATGCAAAAGATATAGAAACTGAAATTGAT
GATATTGCTGGTATAAGAATAATGTGCCAGTTTGTTGAGGATATATATGCTATAGTTGATTTGATAAAAG
TAAGAAATGATATGACTATAATAGGAGAAAAAGATTATATTACAAATTACAAAGATAGTGGTTATAGAAG
CTATCATGTTATAATAAAATACCCTATAAACTCCATTGCGGGTTCAAAGGAAATTATATGTGAAATACAA
ATAAGAACTCTTGCAATGAATTTCTGGGCTACAATAGAACATTCATTAAAATATAAATATGACCATTACA
TACCTGAGACTCTTGCTGAAAGGCTTAGAAGAGCATCTGATGCTGCCTTTCTTTTAGACCAAGAAATGAG
TGAAATAAGAGAGGACATAATGAAAGCTCAGGCTATGTACCAAATGAAGTCTATAGCTATTAGAGATACT
CTAAATAGAATACAAGAGTTATATGACTTGGGTGATACACATAAAGCTATGCAGTACCAAAGAAAACTTG
ATAGAACTGAAACAGATAAAAATATAACTGAAATTTTGGAATTAAAACAAGAAATAGATATATTACTAGA
GCAATATAAGGATACTAAGGTAGATGATAAAGTAGTTCAGTAA
>ref|NC_013316.1|:422468-423160 putative phosphoesterase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTTGTATGCTATAGGTGATTTACATTTTTCAACATCAGTCAATAAGCCAATGAATATCTTTGGAA
GTAATTGGGATGGTCATGAAAAGAAAATTATAGATAATTGGAAAGAAGTTGTTAAGGAAGAAGATATGGT
CTTAGTACTAGGAGATACATCTTGGGGAATTAATTTATCGGAAGCTAAAAAAGATTTAGATATAATAAGC
AAACTTCCAGGTCAGAAAATACTTATAAAAGGAAATCATGATTACTGGTGGACAACCGTTACAAGTTTAA
ATAAGCTATATGAAGACATGCGTTTTATTCAGACAAATTTTTATGAATATAAAGATTATGCAATTTGTGG
AGGTAGGGGCTGGATATGTCCTAATGATGTTAAATTTGATGAGACTGATGAAAAAGTTTATAAAAGAGAA
GAGCATAGACTTAGACTATCATTAGAATCTGCTCGTAAAAGTGGTCACTCAAAAATAATTGTGATTACTC
ATTATCCTCCTACGAATGATAAATTGGAAGAATCTTTATTTACAAAGTTATTTGAAGAATATAATGTTGA
AAAGGTGATTTATGGTCACTTGCATGGTAAAGAATCTTTTAAAATGGGATTGAAGGGGATTCGAAATGGA
GTAGAATATACATTAGCATCTTGTGACTATACAGAATTTAATTTAATAAAAGTTCACGATTAA
>ref|NC_013316.1|:423247-424188 hypothetical protein CDR20291_0352 [Clostridium difficile R20291]
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ATTTTAAGAGGTCTTGTATCTACAGTAGTATTTATGTGGTATTAGCTACAACAATAATGATAAGTAATAT
TTATATGAGTGGACTTAATAAAATAAAAGAGTCTATGTATTATCACAATTATATTTCTGATGAGACATAT
GATGAAAAGTATGTATCAAATTTTAAGGAAAAAGAAAGTACCGATTTAAAACAGGATAATAAAAAGAATG
AAGAAATATCAAATAATAAAAATTTAAACAACAAACAAGATAGAAATATACAAAATAAAGAAAGTAATGA
AGAAGGAAGTAATGATATAAAAGAAAAGAATAATTCTGATAGTAATGTTTCAGTGAATAATAAATCAGAA
AAACAAGAAGATAATACAAAAGAAAATAATAAATATACAAGTAAAGAAAAAAATAGTGAAGATATAAAAA
AAATAGATATGGAAAGTATAGGAATTTTTAAGAAAGAAATTTATAATATAGAAAGAGCAGCTTTAGTTCC
AATGAGAGAATGTATACCTTACACTAAGGATATAGCAAAAAATATAACTAAATTATCTAGTATAAAAAAA
GATGTTACAAATGCCAGAAACAAGTGTAAAGAAGTTGTAAAAGAATATGAAAATATGCAGATTCCAGAAC
TTTCTAAGGAGAAGTATACAGAAACATTGAGTAATGCTAGAGATGACGTAAAGAAAGCATATGAGCTTAG
AGAAAAATCTATGGAAAGTGCTTTGAAATTAATAAATACTAAAAGCCCTAAATATATAGGGAAGATAACA
GAATATCTTGATTTATCAGATAAGCAGATAGAAAGTTTTAAAAATAGATTGAACGATTTAAAAGAAGAAA
TAAATAATTCAGAAACAAATAATATTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:424222-425382 hypothetical protein CDR20291_0353 [Clostridium difficile R20291]
ATGATGAATAAACAGAGTATAGGAAAACTAAATATGTTTTTTATGGGGATTACTCAAAGAAACCTTGATA
ATAGGCATTTTTTTATTGAGTTAGAGGTGATTTTTAAATCTGGAAGAAAAGAGTTTAAAGGAATTGCAAT
AGAGGAAGATAATAAATATAAATTTAATTTTAAAGGAAAATCAGATTTATATACGTTTAATGAGTTGCTT
AAGAATATTTCTAAAGAGGCAGAAAATTATGATGGATTAGTATTTAAATATGTTGAGCGAGGAACTATTG
TTGTAATTGAAGGAGACAATAAGAAGGTAAATGTAAAATATTTAGATAATAAAGAAGAAGTACCTAAAAT
AGATGAATTTACGGCATCTCAAATAAAAAACAGAGATTATTATGTAAAAGTAGGACAAGCAAATGCACTT
TTAAAAGAAATTGGAGTACTTACAAAAGATGGTAAGATAAAAAATGATAAAATAAGAAAATACAATCAGA
TAGACCATTTTGTTGAATTGATAGATAGTATTTTAAAAGAAATAAAGGATAAAGACTGTATAACTATCTT
GGATTGTGCTTGTGGAAAATCTTACTTAAGCTTTGTCTTAAATTTTTATATAAAAGAAGTATTGAAGAAA
AACTGTTATTTTATAGGAATAGATTATTCAGATGTAGTTATAGAAGCATCAAAAAATATGGCTAAAAACT
TGGGTTATAAAAATATGTCATTTATAAAAGAGGATTTGACTAATTATACACCTAATAGGGATGTTGACCT
TGTAATAAGTCTACATGCTTGTGATACAGCTACAGATATGGCAATAGGTCTAGGAATTAGAGCAAAATCT
GAAGCTATAGTAGTAGTACCATGTTGTCATAAGGAGTTATTAGGGCAATATAGATATGAAGCTATGGAAC
CAATATTAAAACATGGTGTATTTAAAGCTAGATTTGCAGATTTGATAACTGATGGTTTAAGAACATTGTT
ATTGGAGGGCAATGGATATGATACTTCTGTAGTAGAATACATATCTCCACTTGATACACCAAAAAATTTA
ATGATAAGAGCGATAAAAACTAAAACGAATAATGACAAAGCATTAAAAGAATATAAAGAACTGAAATCAC
AATTTGGAGTGGAACCAACCTTAGAAAAACTTATATATTAG
>ref|NC_013316.1|:425522-426094 hypothetical protein CDR20291_0354 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGTAAAAATGAACAAATTGAATATATGTATTGATATAGATGGAACAATAACAAGCCCTTATCATT
TTCTTCCATACCTAAATGATATCTTTAATAAAAATATAACTGAAGCAGAGTGTATAACACATAATTGGGA
AGAATTGTATGGTTCGGGAATAAGAGATGTGTATGCGGAGTTTAATAATAAGTATATACACTCATATGAT
GAAGCAAAGATTGTAGAGGGTGCTACAGAGGTAATTAGCACATTATCTAAAGGACATAATTTATCTTTTG
TAACGGCTAGACATGAGTGTTTAACTGATGTAACTAAAAATTGGCTATCGAGACAAGGATTTTCAGATAT
AGATGTTTACTTATTAGGAAGTGATTATAAAGTTGAAAAGGCAAGAGAACTGAGTTGTGACATATTTATA
GAAGATAATCCTTTAAACTCAGTGCAACTAGCTGATGATGGTGTTAAAGTAATACTTCTGGATACTAACT
ATAATAAAGATGTTAAACATCAAAATATAGTTAGAGTTAGTAATTGGATAGATATTGAAAAGATTATAAA
ACAAGGTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:426122-426613 hypothetical protein CDR20291_0355 [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGATTTAAAAATTGAAAATAGAAAAGGAAAAATCCATGTAAAGAGCAGTGAAATAAAAGACATTT
TAGAATTACGTCCAGACTTCGAATATGTACAAGATATATCAAATACTATAAATCAAGAAAATATATTGGT
ATTTGATTGCCAGTTGACAGGAAATTCTTTTGATATGGATGATTTAGATATAGAAGAAATATTGGAAGAG
TTAGGTGAAGAAATAGATGAGTCTTATTTCAGTGTTTTATTTGAAGATGTAAGAGCGTATTTAAAAGATG
CTACTGATGAGATAGAAGCAGACTTACAAGATAATTACTTATTTGATAATTTGAGATGTTATTTTGATAT
ATACAATATAAATCAAGAATTTACAGATTTTAAGTTTGTATTTTTAGTTTCTTTTAAAGATATAAAAATT
TCTTCATTAGCAAACCTAGCTAAGATTGTTTCTAAGAGACAGCTTATAGGTGCATCTAAGTTTTATAGTT
AA
>ref|NC_013316.1|:426842-427393 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAAGTTTAAATGAAATAATCGCTGAAAATTTAAAAAAGATAAGGAAAGAAAAACATCTTAGTTTAG
ACAAGATTGCACAACTTAGTGGTGTAAGTAAGAGTATGCTATCTCAAATTGAAAAGTGTGAGGTAAATCC
TACTATATCTACTTTGAAGAAAATAACTAATGGACTAAAAATCTCATTTACATCATTGATGGAGAGGCAG
GAAAGTGACATAGAATTGATTCAAAAAAGTGATATAGACCATTTTATTGAAGATAATGGAAAGTATATAA
GTTATCCAATATTTCCATTTGACTCCAAAAGAAGATTTGAGATATTTATGATTGAAATAGAAGAAGGTGG
AAATTTAGATTCAAATGCTGAACTTCCAGGAACACAAGAGTTTATAACTGTTTTTAGTGGCGAAGTAACC
ATTAAAATAAATGGAGAAGATTACATTGTATCTAGTGGAAATTCTATAAGATTTAAAGCTGATGTATCAC
ATATATATAGAAACTCAGGCAAAGGTATAGCTAAAATGAGTATGGTAGTATATTATATATAA
>ref|NC_013316.1|:427479-428411 hypothetical protein CDR20291_0357 [Clostridium difficile R20291]
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TAAAGTGTTGTGAAGAAATAATGGATTTAAATCAAACTGATATTGTTATTGATGATAATTTTGTATTAGA
ATTTAAGGATAAAAACAATAACTTATTTCATTTTGTAAAAACAAAAGATGTAATAAGTCATAATTATAAA
TATTATCTTCCAATTTTAAATAGACATTTCAGAGATTATGATTTTGCAGGAGTTGTAAATTGGCATGAGG
GAGAAAATGCTCCAGAACATATCCTAACAGCTCATACAATTGGAGATGTTCCAACAGGAGAATTTGGAAA
TTCAAATCCAAGATACTTTAAAAATCTAATCAATGCTATTGAGGATATAAAAAATGAAAATCTACTTGAT
GAATTTACTACATTAACAGAAGCAACTCACTGGTCTGGAACAACATATGGTGAAGAATCTAAATTAATTA
CAGAATATTCTGTACCTATGTTGGATATTGAGATAGGAAGTAGTAGTGATAGTTTTAATAATAGTATAGC
AATACAGGTATTGGCAAAATCATTAATTAGAGTATTTGATTGTGATGAACCTTTGAAGACTTTATTATGT
GTTGGAGGGGTACATTTTGAGAAATCTTTCTCAGATATTATAAAAAATAAAGAATATAACATATCAATTG
GACATGTATTGCCAAATCAATGGATTGTAAGTGGAATGTATGATGATGAATCGGGATTTGAGAAACTAGA
AAAGTGTATAAATAGTATTGAAGGTGGAATTGATTGTATAGTTTTTCATGATAAATTAAAAGGTACCTAT
AAAGAGCAATGCCGTAAACTAGGTGAAAAACTTAATGTACCTGTATTTAAACATAAAATATTAAAAAATC
CCAAAGACTTACCTATATGGTAG
>ref|NC_013316.1|:428466-429329 hypothetical protein CDR20291_0358 [Clostridium difficile R20291]
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TATTAGGTGATGAAGAAGGAGATATTTATAAAAATATAGCTTCATCATTTCTATTTTTCTTTATAGGGGG
AGTATGTTTACTTCCATTTAGCATAATGGATAGAGTTAGTGATTGGTCGTTTTTAATACCATGTTATATA
AGTAGTTTAGTCTATTCAATTGGTTCAGTAGCGTATGTAACGTCTTTAGCAACTGGGGAAGTTTCACTTG
TTACTCCAATAAATAGTTTAAATTCATTGTTTTTACTGCTTTTATCAGTTATATTTTTAGGTGAAGGTTT
AAGTTTAGCAAAAGTTGCAGGAATCATAATTATGATTGGTGGAGTGTTTATATTAAAAAAAGTAAGCTCT
TTTTTAAAGAATGTCTCTGTAATTTTTAACAATTTACCATGTAGATTAATGTTTTTATACATATTTTTGC
AGTCAGTAGGAAGAGTATTGGATAAGGCTTTTTTTGTACAAGTATCTCCTATATTATATTCAACTATACT
GTATTTTTTCGTAGGTTTAAATTTATTTATCTTTTTAGCATTTAAAAAGAAACAAAAAATAATTTGTGAG
ATTTTTAGTAATAAAAAGGGGCTTTCAATTTTAAGTGGTGCTATTAATGGATATTCTTATTTAGCATTAT
TAATTGCTTTAAATAATCTAGAACTTAGTATAGCAGAGCCATTTTCTCAAGTATCTATGATAATAACTTT
AATACTTGCTCATTTTATATTCAAAGAAAATATAAAAGAAAAAATACCAGGTTCAATTTTGATACTAATT
GGTGGGTGGCTACTGTTACTTTAA
>ref|NC_013316.1|:429576-431438 PTS system, beta-glucoside-specific IIabc component [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTATAAAAAAACTGCCATTGACATTATTGAACAAGTTGGTGGTTCAAAAAATATTTTAGCTTTAG
AACACTGTTCAACTAGACTACGCTTTAAGTTGATTGATAGAAGTAAAGTCAATCAGGATGCTTTAAAAAA
AGTACAAGGTGTTATGAGTATAGTTAATGGGGCACAATTTCAAGTTGTCATTGGAAATAGTGTTGTTGAT
GTGTATGATGAAATTTTAAAAGTTTGCCCTTTAGATACAAATGATAGTACTGTAAAAACTGAAGAAAAAA
TAAACTTAGGAACAAGATTTATAGAATTTATTATTAATATTTTTCAACCACTGATTTTTGCTATTGCAGG
AGCTGGTATTTTAAAATCACTGTTGATGTTATTAGCAATGTTTAATATTTTAAAATCAGATTCTACTATA
TATACATTATTAGTTGCTATTTCAGATGCAACATTCTATTTCCTACCTCTTATGGTAGCTGTAACTACTG
CCAATGTATTGAAATGTAATCGTTTAGTAGCTATTGCCGCTGTAGGATACTTATTGCTTCCAGCAACAAC
AACTGCTTTAAGTGAAGGTGTCGAACTATTTGGATTTACAATTCCAAACATTGCCTATAATGCACAAGTT
TTCCCGGCTATCTTATGTGTGTCTTTTTTGGCAACAATGGAGAAAATTTTTAACAAGTATTCACCAAAAC
CAATTCGAACTTTCTTTGTTCCTATGATGTCTTTGGCAATTACTGTTCCAATTACTCTAACTATTTTAGG
TCCTTTAGGATATAACGTTGGTACAATTTTTACAACCATTATTTTATTCTTATATAACAAAATGGGATTC
TTAGTTGTAGGATTACTTGCTGCTTTTCTTCCATTTATGGTTGCAACAGGAATGCACAAAGCACTAATAC
CTTATTCAATTAATACAATTGGAAAGTTGGGTTATGAAGCTTTATATATGACATCTTCATTAGCCCACAA
TATTTCTGAAAGTGGTGCTTGTTTTGCAGTAGCCTTGCGAACAAAAGATGAAACATTAAAACAAACAGCA
TTATCTGCAGGAATTTCTGCCTTGATGGGAATTACAGAGCCAGCTTTATATGGTATTACTTTACAACATA
AAAGAGCAATGTTAGGTGTTGTATTCTCAAGTGCAATTTCTGGTACATTTTTAGGATTATTTGCAGTAAA
AGGATTTGTAATTGTTGGACCAGGGCTTGCCAGTATGAGTATGTTTATTGACCCAAACAATGGAAACAAT
TTGATTTTTGCGAGTATTGGTTTTGTTATTGCAATATTAGGCTCGTTTATTATTACACTGATTATTTGGA
AGGAAGATACAAATACAGTAGAGTCATCAATTGGAGATGTTGTTGAAGAAGAGCTAGAAGAAGAAAAAGA
AGTAAATATCTTAGTAACTCCAGTAGAAGGAAAAGTAATAGATTTAAGTAAGGTTAATGATGAACTATTT
GCAAGTAAGACTTTGGGAGATGGAGTTGCAATTATACCGACCAATGGAAATTTATACGCACCTTGTGATT
CAGAAGTTGTGATGTTATTTGAAACAAAACATGCAATTGGTTTAAGAACAAAAAATGGGGCTGAGATTTT
GATTCATATTGGAATAAATACTGTAAGTATGAATGGAGATGGATTTAAAACATTTGTTAAGACAGGCGAT
AATGTAAAAGAAGGAGATTTATTAATTCAATTTGATTTAGACAAAATCTCACATGCTAATTTAGATTCAA
CTGTTATGATTGTAAACAATAATGGAGCAGATTATGCTTATAAAGTGTTAAACCAGTCTTATGGCAATGT
AAAAAAAGGAAGTATCTTGTTTGATGTAAAGGGAGGAATATAA
>ref|NC_013316.1|:431441-432907 6-phospho-beta-glucosidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAAGTTTCCAGAAGGATTTCTTTGGGGAGGAGCTACAGCTGCTAATCAATTTGAAGGTGGTTGGA
ATTTAGGTGGTAAAGGGTGGTCTGTATCAGATGTAGCAAAGGCACACTTTGATGCAGATGTGAAAGACTA
TAAATCTAATAATGAAATCACAACAAAAGATATAGAAGAAGGATTAGCACATCCTGAAGATGAAGTAAAT
TATCCAAAACGTCATGGTAGTGATTTTTATCATCACTATAAAGAAGATATTGCTCTAATGGCAGAAATGG
GATTTAAGACATATCGAATGAGTATTGCTTGGTCTCGTATTTTTCCAAATGGAGATGATAAAGAGCCAAA
TGAAGAAGGTTTACAGTTTTATGATGATGTATTTGATGAGTTGATAAGTTATGGAATTGAACCACTTGTT
ACTATGTCACATTATGAACCACCATTAAATATCGTTTTAAACTATGATGGATGGTATTCACGACAAGTTA
TCAATATGTTTGTTAGGTATGTAGAAACTATCTGTGAAAGATATAAAAACAAAGTGAAATATTGGCTTAC
ATTTAATGAAGTTGATTCTATGATTCGTCATCCGTACACTACTGGTGGTTTAGTTCGAGACCGTTTTAAG
GATAAAAACTTTGAGGAAGTTATTTTTCAAGCTATGCATCATCAATTTGTAGCTAGTGCCCTTGCAACAA
AAATTTGCCATGAGATTATTCCAAATTCAAAAGTAGGGTGTATGTTAACAAAATTAACGTATTATCCATA
TACATGTAGACCAGAAGATGTTTTGGCAACTCAACAAAAAATGAGAAGTATTTATGCATATAGTGATACG
CAGGTTTTTGGTGAGTATCCAGTATATTTACTTTCGTATTTTAAAAATAATAACATTCAAATAGCAAAAG
AAGAACATGATGATGAAATTATGAAAAAGTATCCAGTAGATTTTATTTCATTCTCTTACTATATGTCTTC
TTGTGAGGCAGCTGATACAACTGGATTAGATATTACACCTGGGAATACGTTATTAGCTGTAAAAAATCCT
TATTTAGAAATGAGTGAATGGGGTTGGCAAATTGATTCAATAGGTCTACGTATATCTTTGATTGAATTAT
ATGATAGATACAGAAAGCCTTTATTTATAGTTGAAAATGGATTGGGAGCTAAAGATATTTTAACTGAAGA
TAAAAAAGTTCATGACCAATATAGAATTAATTATTTAAAAGAACACTTTAAATGTATGTTAGATGCGATT
ATCGAAGATGGCGTTGAACTTTGGGGATACACTTCATGGGGTTGTATTGATTTGGTCAGTGAATCAACGA
AACAAATGTCAAAACGTTATGGATATATTTATGTGGATGCTGATGATTATGGAAAGGGGACATATAATCG
ATATAAGAAAGATAGTTTTTATTGGTATAAAAAAGTAATTGAAAATAATAGTATAGATTTTAAATGA
>ref|NC_013316.1|:432931-433767 beta-glucoside bgl operon transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
ATGAACTACATAATAAAGAAAGTTTTGAACTCGAGCGTTGTTTTAGTTCATGATGCAAAGTATAATGAAT
TTATTTTGCTAGGGAAAGGAATTGGATATGGTAAAAAAACAGGAGAATATATTTGTGGTTCCAATGATAA
TCAAATGTTTGTCCCTGTTGAAAATACAAAATCAAAAAAATTTTTAGAATTAATGGATGATATTCCTGTC
GACATTTTAAAGATAACACAGGAAATAATAGTAGAGGCAGAAAAGTTATTGAACTCATCTTTTAATAAAA
ACTTATACTTAATATTAGCAGACCATTTTAACTTTGCAATTGAAAGGATGCGTAAAGGAATAAAAATTAC
AAATCGAGTATTTTGGGAAATAAAAAATTATTATCCAAATGAGTTTAAGGTTGGAATGGTTGCAATTTAT
ATGGTAGAGGAGAGATTGGGCATTCAATTACCAGAGGAAGAAGCAGCTAACATTGCTTTCCATTTTGCAA
ATGCTATGGCTTCAGATGGAAATTCATATGATACGATTAAGTATGCCAAAGTAATTGGAGAAATAATTAA
TATTTTTGTTTTTTCTTTGAATAGAACCTTAGATAAAAAGAGTATGCATTATATGAGATTTATAACACAT
ATAAAATTTTTTGTGGAAAGATTTTTTTCAGATAGTATGTTAAGCAGTGGTGATGATTTATTATTTAATC
AAATGAAAAGGTCAAATCCAAAAGAAATGTTAATTGCATTAAAAGTTAGAGATTTTTTAGAAAAGAAATA
TGGAAAAAAGTTAACAAATGAGGAAATAGCTTTCTTGGTTGTCCATATCGCACGAGTTAAGCAATAG
>ref|NC_013316.1|:434333-435916 asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing] [Clostridium difficile R20291]
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GACATATTCGAAACTGGAAAGTTCTCTGTGAAGAACTTGGAATCGATTCTTCATTATGTAGAGATGAGCG
TGAACGAGCAATTTTAGTGGAAGCATATAAGACATGGGGATATGATATGGCAAATCACATGCATGGAATG
TTTGCCTTTGCATTATGGGATACTGTGGAAAAGAAACTCTTCTGCCTAAGAGACCAGTTTGGAGTAAAAC
CTTTCTATTATTATGAGACTGAAAATGGGAAGCTTCTCTATGGTTCATCTATTCGTAAGATTATGGAGCA
ACCAGGATTTGTGAAAGAGTTAAATGAAGACATGTTACAGATTTATATGTCTTTCACATATGTAGCAGGT
GAAAATACATTCTTCCGTGGAGTAAAGAAGCTTATGCCAGGACATTACCTTGTCTATCAGAATAAAACAG
TATGTATTGGTCGTTATTGGAAACCTGAATTTCATCCTGACCACAGCAAGTCTATTGAGGAATGGACGGA
TGAAATTCATACAACACTTCAGAAAATTATGCCAGAGGTAAAATCAGAGAATGAAACTGCAGAGTTATTC
TTATCAGGAGGTGTTGATTCATCTTATATATTGGCAATGTCAGATATAGAAAAAACAGGTTCATGTGGTT
ATGAGGAAGAGCGTTTTGATGAATCAAAATTAGCACAACAGACAGCTAATATTCTTGGGTGTAAAAATTC
GAGATATATAATTACACCTGAAGAGTATTTTGCGTCAGTACCTTATGTAATGTACCATATGGAGCAACCA
ACTGGAGATGCATCTGCTATCGTTTTTGCTATTGGATGCAAGGCAGCAGCTGAAAACACAAATATCTGTT
ACTCTGGAGAAGGAGCAGATGAGTTTTTTGGTGGATATAATATATACCATAAGGCAGAGTGTTATGGAGA
GAATTTGAAGACATTTTATATTGGAAATACAAACATTATGAATGAGGGTGAGAAAAGAAAAATTCTTAAG
AAATACAATCCTGATGTGCTTCCTATTGAAGTGGTAAAAGGAATTTATGAAGAAACAGAAGAACTAGATA
CACTTACTAACATGTCAAATGTAGATATTCAAATATGGTTGGAAGGAGATATTTATTTTAATATAGATAA
AATGAGTACTGCAGTTGGATTGGAAGTCAGAATGCCTCTTACAGATACAAGAATATTTGATATTGCATCC
AGAATACCATCAGAATATAAAGTGAAAGGAAAAGAGAATAAAATTGCCTTTCGTACAGCTGCATCAAAAA
CATTACCAGAAGAGATTGCTTTTAGAAATAAATTAGGATTTATTGTGCCAATTCGTATATGGATGGCTGA
TGACCAATATAATAAGGATATCCGAGATAAATTCAATAGTGAGATAGCAGATAAATTCTTTAACATAGAT
GAGATTAATGAGATTTTTAATGACTACATTAGTGGAAACTCTGATAATTGGAGAAAGATTTGGATGATTT
ACACATTCCTAGTGTGGTATGAAATCTATTTTGTAAAATGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c436577-435981 Radical SAM-superfamily protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATCTTATATACAATTGAAAATAGTATCTATGTAAATATAACTAATACATGTCCATGTAGTTGTG
TTTTTTGTATAAGAAACGAAAAAGATGAAGTTGCAAATAGTGGTAGTTTATGGTTGGAGCATGAGCCAAG
TGTAGATGAAGTAAAAGAAGCCTTCAATAAATACAATTTAGACGACTATGATGAAATCGTATTTTGTGGA
TATGGCGAACCATTAATGAGAATAAATGAATTGATAGAGGTAGCAAAGTTTATAAAAGAAAAAAGTAGCA
TAAAAATAAGAATAAATACAAATGGTCTAAGTGATTTAATACATAACAAAAAAACAGCTATTCTGTTAAA
AGATGTTATAGATACAGTATCAATAAGTCTTAATGCCCCAAATAAAGAAGCTTATAATAGAGTTACTCAA
CCAAAGTTTGGAGAAAAATCATTTGACTATATGTTAGGTTTTGCAAGAGATTGCAAAAAATATATAAAAG
AAGTAGCTTTTTCAGTAGTAGATGAAATATCTCCAGAAGAAATAGAAGAATCTAAACAACTGGCAAAAAA
ACTTGATATACCATTAAGAGTTAGACATAAGAATTAG
>ref|NC_013316.1|:c437122-436604 hypothetical protein CDR20291_0364 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAGTTACTTCTAAAAAAACTACCTATATTGTTACTTCAGCATTATTTGCATCCATAATATGCC
TGACAATAGCATATATATTACATATTCCAGTTGGTGGAAACAATGGATATGTTCATATAGGAGATGCTTT
TATTTATCTAGCTGCAACTATTTTGCCAACAAACTATGCTATAGCTGCTTCTGCAATTGGTGCTGGTCTA
GCTGATTTATCTACAGGTGCTGCTATCTGGGTAATACCAACTATAATCATAAAACCAATACTTGTATTAT
TTTTCACTTCTAAAAGTGACAAGATAATAAATAAGAGAAATATAGTTGCTTCGGTTGTAGCAGGTATAGT
AGGATTAGTTTTATACATGTTTGCTGAAGGTATAATTATTGGAAGTTTTACAAGTGCATTTGTAATGAGC
TTACTTGGCTTATTACAGCCAATAGGAAGTTTTATTGTTTTTATAATCTTAGGTATGGCACTTGATAAAC
TTGATTTTAAAAAACGTTATTTTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c438491-437493 (R)-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATACTAGTATTTGGAGCACGCGATTATGAAGAACCAGTAATAAAAAAATGGTCTGAAGAACATA
AGGATGTTCAAGTGGATATTTATCCTGAAAACATGACTGAAGAAAATGTAGTTAAAGCTAAAGGGTATGA
TGGTATATCTATACAACAAACTAACTATATAGATAATCCTTATATTTATGAAACTTTAAAAGATGCTGGG
GTTAAAGTTATAGCTTCAAGAACTGCAGGGGTTGACATGATACATTTTGATTTAGTTAATGAAAATGGAC
TTATCGTTACAAACGTTCCTTCTTATTCACCTAATGCAATAGCTGAATTAGCTGTTACTCAAGCTATGAA
CCTTTTAAGAAAGACTCCTCTAGTAAAGAAAAAAGTCTGTGAAGGTGATTACCGTTGGATAGCTGAACTT
CTTGGAACAGAAGTTAGATCTATTACAGTTGGTGTTATAGGTACAGGAAAAATAGGTGCTACTTCTGCAA
AATTATTCAAAGGCCTAGGAGCTAATGTAATTGCATTTGACCAATATCCAAATAGTGATTTAAATGATAT
ATTAACTTACAAAGATTCTTTAGAAGACCTTCTAAAAGAAGCTGACCTTATAACATTACATACTCCTTTA
CTTGAAGGAACAAAACATATGATAAATAAAGATACTCTAGCTATAATGAAGGATGGAGCTTACATAGTAA
ATACTGGCCGTGGTGGTTTAATTAATACAGGGGATTTAATAGAAGCACTAGAGTCAGGAAAAATTAGAGC
TGCTGCCCTTGATACATTTGAAACTGAAGGATTGTTCTTAAACAAAAAAATGAATCCTGGAGAATTAACT
GACCCAGAAATAAATAAACTTCTTTCTATGGAACAAGTTATATTCACTCATCACCTTGGTTTCTTCACTA
GTACAGCGATTGAAAATATAGTTTATTCTAGTTTAAGTAGTGCTGTAGAAGTTATAAAAACAGGAACTGC
TACTAATAGAGTAAATTAG
>ref|NC_013316.1|:439168-440367 isocaprenoyl-CoA:2-hydroxyisocaproate CoA-transferase [Clostridium difficile R20291]
ATGCTTTTAGAAGGAGTTAAAGTAGTAGAACTTTCAAGTTTCATCGCAGCACCATGTTGTGCAAAAATGT
TAGGTGACTGGGGTGCAGAGGTTATTAAGATTGAACCTATAGAAGGTGATGGAATAAGAGTTATGGGTGG
AACATTTAAATCTCCAGCATCAGATGATGAAAACCCTATGTTTGAATTAGAAAATGGAAATAAAAAGGGT
GTAAGTATTAATGTAAAATCAAAAGAAGGAGTAGAAATATTACATAAATTATTATCAGAAGCAGACATAT
TTGTAACTAATGTTAGAGTTCAAGCATTAGAAAAAATGGGTATAGCTTATGACCAAATAAAAGATAAGTA
TCCAGGATTAATATTCTCTCAAATATTAGGATATGGTGAAAAAGGACCTTTAAAAGATAAACCAGGATTT
GACTATACTGCATACTTCGCAAGAGGAGGAGTTAGCCAATCTGTTATGGAAAAAGGAACATCTCCAGCAA
ATACAGCAGCAGGATTTGGTGACCACTATGCAGGTCTAGCACTAGCAGCAGGAAGTTTAGCAGCATTACA
TAAAAAAGCTCAAACTGGTAAAGGTGAGAGAGTAACAGTAAGTCTTTTCCATACAGCTATATATGGAATG
GGAACAATGATAACAACAGCACAATACGGAAATGAAATGCCTTTATCAAGAGAAAATCCAAACAGCCCAT
TAATGACTACATATAAATGTAAAGATGGAAGATGGATTCAATTAGCTTTAATACAATACAACAAGTGGTT
AGGCAAATTCTGTAAGGTTATAAATAGAGAATATATATTAGAAGATGATAGATATAATAACATAGATTCA
ATGGTTAATCATGTTGAAGATTTAGTTAAGATAGTTGGAGAAGCTATGTTAGAAAAAACATTAGACGAGT
GGTCAGCTTTATTAGAAGAAGCAGACTTACCATTTGAAAAAATTCAAAGCTGTGAAGATTTATTAGATGA
CGAACAAGCTTGGGCAAATGACTTCTTATTTAAGAAAACATACGATAGCGGAAATACAGGTGTCTTAGTT
AATACTCCAGTTATGTTTAGAAATGAAGGAATTAAAGAATATACACCAGCACCAAAAGTAGGTCAACATA
CTGTAGAAGTATTAAAATCTTTAGGCTACGATGAAGAGAAAATAAATAACTTTAAAGATAGTAAAGTTGT
AAGATATTAA
>ref|NC_013316.1|:440397-441206 activator of 2-hydroxyisocaproyl-CoA dehydratase [Clostridium difficile R20291]
ATGCTAAAGATGTACACAATGGGATTAGATATAGGTTCAACTGCATCAAAGGGAGTAATCTTAAAGAATG
GGGAAGATATTGTAGCTTCTGAAACAATATCCTCTGGTACTGGGACTACTGGACCATCAAGAGTTTTAGA
AAAATTATATGGCAAGACAGGTCTTGCAAGAGAAGATATTAAAAAAGTTGTAGTTACAGGATATGGAAGA
ATGAACTATTCAGATGCTGATAAGCAAATAAGTGAATTAAGCTGTCATGCTAGAGGGGTAAATTTCATAA
TTCCAGAGACAAGAACCATTATTGACATAGGTGGTCAAGATGCAAAGGTATTAAAATTAGATAATAATGG
AAGACTATTAAACTTTCTTATGAATGACAAATGTGCTGCAGGTACAGGAAGATTTTTAGATGTAATGGCA
AAAATAATAGAGGTTGATGTATCTGAACTCGGAAGTATATCTATGAATTCTCAAAATGAAGTATCAATAA
GCAGTACATGTACAGTATTTGCAGAGTCTGAGGTTATATCACATTTATCTGAAAATGCAAAAATTGAAGA
TATAGTGGCAGGTATTCATACTTCAGTAGCAAAGAGAGTTTCTAGCCTAGTAAAAAGAATAGGAGTACAA
AGAAATGTAGTTATGGTTGGTGGAGTTGCTAGAAATAGTGGTATTGTAAGAGCTATGGCAAGAGAAATCA
ACACAGAAATTATTGTACCTGATATACCTCAATTAACTGGTGCTTTAGGAGCAGCGTTATATGCTTTTGA
TGAAGCAAAAGAATCACAAAAAGAAGTGAAAAATATATAA
>ref|NC_013316.1|:441215-442447 subunit of oxygen-sensitive 2-hydroxyisocaproyl-CoA dehydratase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATGTCTGAAAAAAAAGAAGCTAGAGTAGTAATTAATGATTTATTAGCTGAACAATATGCAAATG
CATTTAAAGCTAAAGAAGAAGGAAGACCTGTAGGTTGGTCAACATCAGTATTTCCTCAAGAGTTAGCAGA
AGTATTTGACTTAAACGTATTATATCCAGAAAACCAAGCAGCTGGAGTAGCAGCTAAAAAAGGTTCTTTA
GAATTATGTGAAATAGCTGAATCTAAAGGATATTCTATTGACCTATGTGCATATGCAAGAACAAATTTTG
GTCTTTTAGAAAATGGTGGATGTGAAGCTTTGGATATGCCAGCTCCAGATTTCCTACTTTGCTGTAACAA
TATATGTAATCAAGTTATAAAATGGTATGAAAATATTTCAAGAGAATTAGATATACCTTTAATAATGATT
GATACAACTTTCAATAATGAAGACGAAGTTACTCAATCAAGAATAGATTATATTAAAGCTCAATTTGAAG
AAGCTATAAAACAACTAGAAATTATATCAGGAAAGAAATTTGACCCTAAGAAGTTTGAAGAAGTAATGAA
AATATCAGCTGAAAACGGAAGACTATGGAAGTATTCTATGAGTTTACCAGCAGATTCTTCTCCTTCTCCA
ATGAATGGATTTGACTTATTTACTTACATGGCTGTAATAGTTTGTGCTAGAGGTAAAAAAGAAACTACAG
AAGCATTTAAGTTACTTATAGAAGAATTAGAAGACAACATGAAAACTGGTAAATCTTCTTTCAGAGGGGA
AGAAAAATACAGAATAATGATGGAAGGTATACCTTGTTGGCCATATATAGGATACAAGATGAAAACATTA
GCTAAATTTGGAGTTAACATGACAGGTAGTGTTTACCCACATGCTTGGGCATTACAATATGAAGTTAATG
ATTTAGATGGAATGGCAGTAGCATATAGTACTATGTTTAACAATGTAAACCTAGACCGTATGACAAAATA
TAGAGTTGATTCTTTAGTAGAGGGTAAATGTGATGGAGCATTCTATCATATGAACAGAAGCTGTAAACTT
ATGAGTTTAATACAATATGAAATGCAAAGAAGAGCAGCTGAAGAAACTGGATTACCATATGCTGGATTTG
ATGGTGACCAAGCAGACCCTAGAGCTTTCACTAATGCTCAATTTGAAACAAGAATTCAAGGTTTAGTTGA
AGTAATGGAAGAAAGAAAAAAACTTAATAGAGGTGAGATATAA
>ref|NC_013316.1|:442447-443574 subunit of oxygen-sensitive 2-hydroxyisocaproyl-CoA dehydratase [Clostridium difficile R20291]
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ATGAAACTGGTAAAAAAGCTATAGGTTGTTTCCCAGTTTATTGCCCAGAAGAAATTATACATGCAGCTGG
AATGCTTCCAGTTGGTATATGGGGAGGACAAACAGAATTAGATTTAGCTAAACAATATTTCCCTGCATTT
GCATGTTCAATAATGCAATCATGTTTAGAATATGGATTAAAAGGTGCTTATGATGAATTATCTGGAGTTA
TTATACCAGGTATGTGTGATACACTAATTTGTTTAGGACAAAACTGGAAATCAGCAGTACCTCATATAAA
ATATATATCATTAGTACACCCACAAAATAGAAAACTTGAAGCTGGTGTAAAATACTTAATCAGTGAGTAC
AAAGGTGTAAAAAGAGAACTTGAAGAAATTTGTGGATATGAAATAGAAGAAGCAAAAATTCATGAAAGTA
TAGAAGTTTACAATGAACATAGAAAAACTATGAGAGACTTTGTTGAAGTAGCTTATAAACATTCTAATAC
TATAAAACCATCAATAAGAAGCTTAGTAATTAAAAGTGGGTTCTTTATGAGAAAAGAAGAACATACTGAG
CTAGTGAAAGATTTAATAGCAAAATTAAATGCTATGCCAGAAGAAGTCTGTTCTGGAAAAAAAGTTTTAT
TAACAGGTATATTAGCTGATTCTAAAGATATATTAGACATTTTAGAAGACAACAATATATCAGTTGTAGC
TGACGACTTAGCACAAGAAACAAGACAATTCAGAACAGATGTACCAGCAGGTGATGATGCGTTAGAGAGA
TTAGCAAGACAATGGTCAAACATAGAAGGATGTTCATTAGCTTATGACCCTAAGAAAAAACGTGGGTCAC
TTATAGTAGATGAAGTTAAAAAGAAAGATATAGATGGTGTTATCTTCTGTATGATGAAATTCTGTGACCC
AGAAGAATACGATTATCCTTTAGTTAGAAAAGATATAGAAGATAGTGGAATACCTACTTTATATGTTGAA
ATCGACCAACAAACTCAGAATAATGAACAAGCCAGAACTCGTATTCAAACTTTTGCTGAGATGATGAGTT
TAGCGTAA
>ref|NC_013316.1|:443622-444755 acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific [Clostridium difficile R20291]
ATGTTATATAACAAAGAACAAGAACTTTTAAGAAAAGCAGTAAGAGATTTTGTTAGTAAAGAATTAGATA
CTTTACCAGCAGAAATGGATAAAACAGGTGTAATGCCTAAGGAATTAATCAAAAAATTAGCTGATGCAAA
ATTTATAAGCAGTAATATCCCAGAAGAATATGGTGGTGGGGGAGCAGGATATGTTTCTTACGCTATAGTA
ATGGAAGAAATAGCTAGAAGATGTGCTTCAACAGCTACTTTTGTTACAGCTGGTTCTTCTCTTGCTTCAT
TACCAATACTTTACAATGGTACTGAAGAGCAAAAACAAAAATACTTAAAAGGTATAGCAACAGGTGAATT
AATAGGAGCATTTGGGTTAACTGAGCCAGGAGCTGGTTCTGATGCAGGTGGACAACAAACAACAGCAGAA
TTAGTTGGAGACCACTATATATTAAATGGTAGAAAAACTTTCATAACTAATGGACCATTCTGTGATGTAG
CTATAGTAATAGCAGTTACAGATAGAAGTAAAGGACTTAGAGGAACATCAGCGTTTATAGTAGAAAGTAA
ATGGGATGGTTTCTCAACAGGAGCTCATGAAGATAAGATGGGTATAAGAGGAACTGAAACTTCTGACTTA
ATATTTGAAAACGTTAAAGTTCCAAAAGAAAACTTACTTGGAAAAGAAGGTCAAGGATTTAAGATAGCAA
TGGGTACTCTAGAAGTTGGTAGAATAGGTGTTGCTGCCTTAGCTCTAGGAATAGCTCAAGGTGCTTTAGA
TGAAGCTGTTAAATATACAAAACAAAGAGTTCAATTTGGTAAGCCTATAGCTAAATTCCAAAATACTCAA
TTTACTATAGCTGACATGGAAACAAAAGTTTGTGCAGCTAGAGGATTAGTTTATGATGCAGCACAAAAGA
GAGATGCAGGAATGAGAGTTGCTCAAGAATCTGCTATGGCTAAATACTATGCATCAGAAATTGCAAATGA
AGTTGCTTATAAAGCATTACAACTTCACGGTGGATATGGATTTATAAAAGATTATGAAATCGAAAGAATG
TACAGAGATGCTAGAATCGTATCAATATACGAAGGAACATCAGAAGTTCAAAAAATGGTAATTTCATCAA
ACGTATTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:444788-445573 electron transfer flavoprotein beta-subunit [Clostridium difficile R20291]
TTGAAAATATTAGTTTGCGTAAAACAAGTTCCAGATACTAACGAAGTAAGAATAAATAAAGAAACAGGTA
CTCTTATAAGAGATGGAGTTCCAAGTATATTAAACCCAGATGATGCAAATGCATTAGAGGAAGCTTTAAA
AATTAAAGATGAGCATGATGATGTAACTATAACAGTTATAACAATGGGACCTCCTCAAGCAGACTTTATG
CTAAGAGAGTGTTTAGCTATGGGTGCTGATGATGCAATATTATTAAGTGATAGAGCATTTGGAGGAGCTG
ATACTTGGGCTACATCAAATACTATTGCAGCGGGAATATCTAAAGTAGGTGACTATGACATAATATTTGC
AGGAAGACAAGCAATAGATGGAGATACTGCACAAGTTGGACCACAAATTGCAGAGAAATTAGACATTCCT
CAAGTTACATATGTACAAGATTTCAAAATAGAAGGAAAAGATATAATAGTTCAAAGACAATTAGAAGATG
GATACGAATTAATAAAAGTAAGTACACCTGTACTTTTAACAGCAGTAAAAGAGTTAAATACACCTAGATA
CATGTCTGTTGATAAAATAGTAAAAGCATATAAACATGATGTAAAAGTTTGGACAATTGATGATTTAGAT
GTAAATAAAGAAGAAGTTGGTTTAAAAGCATCACCAACTAAAGTATTTAGATCATTTACTCCTGAACCAA
GAGGAAAAGGAGAAATCTTAGAAGGTAAAGCTGATGAAATAGCTAGTAAAATAATAATCGGTCTAAAACA
AAAGCACATTATATAA
>ref|NC_013316.1|:445592-446629 electron transfer flavoprotein alpha-subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGATATAAAAGATTTAAGTTCTTATAAAAACGTATGGATATTTGCAGAACAAAGAGAAGGAAAAA
TAGCTCCAGTAGTTATAGAATTATTAGGAGAAGGAAGAAAATTAGCTAAAGAAGTAGATGCAGAACTTTG
TGCAATATTATTAGGAAAAGATGTTGATGGATTAGCTAAAGAATTAATCACTTTTGGAGCTGACAAAGTT
TATGTTGCAGATGATGCTCTTTTAGAAAAATATACAACTGATGCATATACAAAAGTAATAAAAGATGCAA
TAGATGAAATAAAACCAGAAATAATGCTTTTCGGAGCAACTCATATAGGTAGAGACTTAGCACCTAGAAT
AGCTTCAAGAGTTGGAACTGGATTAACAGCTGACTGTACTAAGTTAGAAATAGACCCAGAAGATAAGAAA
ATAAAACAAACTCGTCCAGCATTTGGTGGAAACATAATGGCTACAATCATTTGTCCAAACCATAGACCTC
AAATGTCTACAGTTAGACCTGGTGTTATGGATAAAGCTGAAAAAGACGAAACAAGAACTGGTGAAGTTAT
AGCATTAGACTACAAAATAACTCAAGATGATATAAGAACTACTGTTTTAGAAACAGTTAAAACTAAGAAA
GATTTAGTATCTCTTACAGATGCAAATGTTATAGTATCAGGTGGTTTAGGATTAGGTGGACCAGAAGGAT
TTGAAATGCTTAAGAAATTAGCTGACAAATTAGGTGGAGTAGTTGGTTCTTCTCGTGCGGCTGTTGATGC
TGGATGGATAGACCATTCTCACCAAGTAGGTCAAACAGGAACTACTGTTAAACCAAACCTATATATAGCT
TGTGGTATATCAGGAGCAATACAACATTTAGCAGGTATGCAATCATCAGATTTCATAATTGCTATAAACA
AAAACCCAGCAGCTCCAATTTTAGAAATCGCTGACTATGGAGTAGTTGGAGACTTACATGAAATAGTTCC
AATGCTTATAGAAAAATTAGATAGCGTTGATGATTTATTAGAAGCTATAAAAGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:447112-448743 sigma-54-dependent transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAATAATTTAATAGGGCTTATAGAACATGTAGAAAATCCAGCCATTTTATGTAAAGAATCAGGCG
AAATAATATACTGTAATCATCTAATAGATAGTATTTTTAGTTTTCTAGATATAAAAAAGCCTAGAAATAT
AAATGAATTAGATTCAAATTTTGACAAAACAGAAATACTGACAGATAGTAAAAAGAAAATAGCTTTCAGA
GAGTTAAGGATGACTGCACATATATACAATATGAAAGATAATAATAATGAAAATAATATAGTTTATTTAT
TTGAGAAGTCTCTAATATCTGATAAAGTAATTGAAGATATAATAGAGCATATAGATGAAGTTGTTGTTGT
GTTTAACAAAGATGGGGTAATTGAAAAGATGAACACTGTCAGTGATGAGATATTACCTTTTAAAAGAACT
GAGGTACTTGGTAGAAATATAACAGACCTTGTGAGACAAGGATTAGTTGAAGAACCAATAATATTAAACA
TGCTTAAAGTGAAGAAAAAGATTTATAGAAATATCGTTTACCCAGATGGGAAGCTTATTGCATATACGGC
AGTTCCAAGATGGGATTCTAAGGGAAAGCTTACAGGAGGAGTACTAACAGGGAGAGATATTTCAAGGGTT
ATTAAGCTTGAATCTCAGATAAAATATAGTGATATATCAGAAGACACAGAGTATATAAGTCAAAGTAAGA
TTATGGACAATATAAAAAAAGTTGTTAAGAGAGCTGCAGCCTCAGATTCTTCTATATTTATAAATGGAGA
ATCAGGTGTAGGAAAAGAAATAATAGCAAGAACAATATATAAGTATAGTTCAAGGAGAGACAAACCTTTT
ATAGCTATAAACTGTGGAGCTATACCAAATGAATTATTAGAGTCAGAGTTTTTTGGATATGAAGAAGGTT
CTTTTACTGGAGCTAAGAAAAAAGGTAAAAAGGGACTTTTTGAAGAGGCGAATGGTGGAACTATTTTCTT
GGATGAGATAGGTGAGTTACCAATGCAGATGCAAAAAAAATTACTTAGGGTTATACAAGAAAATACTATT
ACTAGAATAGGTGGTAGTAAGCCTATAAAAATAGATGTTAGATATATAAGTGCTACTAATATTTCTCATG
AAGACCTTAGAAATAACCTTAAATTTAGACAAGATTTGTACTATAGATTAAGTGTTATTCCAGTAAAAAT
ACCTCCTCTTAGAGAAAGAAAAGAGGATATAGTACCATTAGTAAATTATTTCTTAAAACTTTACAATGAA
AAGTACAATAGAGAAGTAGAAGTTTCACCTAAAGTTATTGAGTTATTAGAAGAATATTCTTGGCCAGGAA
ACATAAGAGAATTAAAAAACATCATTGAAAGATTTGTAGTATTATCAGCTAAAAATGTAATTGGAGAAGA
TGAATTTAACATGCTGATAAATTTAGATATGATTGATAATGAAACAGATGATTTATCACCAATAGTGGTA
AATGGAATTATGAATCTTAATGATGCATATAAAATAGTGGACCAAATAATGATAAGTAAGGCTATAAATA
AGTATGGTTCAATAACAAAGGCTGCTGAAGTTATAGGTATATATCCTTCTACCATCCATAGAAAGATAAA
GAGTGGACATATTCACGTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c449804-448878 putative fructose-bisphosphate aldolase [Clostridium difficile R20291]
ATGGCATTAATTACTACAAAAGAAATGTTTAAAAAAGCTTACGAAGGTGGATTTGCTATAGGTGCATTTA
ACATAAGTGACTTAGAACAATTACAAGGTGTTTTAAAAGCTGCTAAAGCTAAAAATTCTTATGTTATGAT
ACAAGCTTCTATGTCAGCTGTTAAATATGCTGGACCTCATACATTAGTTGAAATGGTTAAGGCTGCTTCT
GATGAAATAGGTGTAGATGTAGCTCTTCACTTAGACCATGGTCCAAATATGGATGCTATTAAAACTTGTA
TTGATGCTGGTTTCTCTTCAGTTATGATAGATGGTTCTCATTTTGACTTTGAAGAAAATGTTAGAATAAC
TAAAGAAGCTGTTGAATATGCACACTCTAAAGGTGTTGTTGTTGAAGCAGAACTTGGTGTTCTAGCTGGA
ACAGAAGATGATGTTACTTCTGATGTTCACAAGTATACTCAACCAGCTGAGGCAGTTGAGTTCGTTGAAA
GAACAGGTGTTGATTCATTAGCAATAGCTATTGGAACTTCTCATGGTGCTTTCAAATTCAAAGGAGAAGC
TAAATTAAGATTTGATATACTAGAAGAAATCCAAAGCAAATTACCAGGTTTCCCAATAGTTCTTCATGGT
GCATCTGCTGTTGACCAAAACGCTGTTGCTACATGTAATGAATTTGGTGGAAATATAGCTGGTGCTAAAG
GTGTACCTGTAGATATGTTAAGAAAAGCATCTTCTATGGCTGTTTGTAAAATAAACATGGATACTGACTT
AAGACTAGCTATGACTGCTGCTATCAGAAAATTCTTAGCTGAAAATCCAAAAGAATTTGACCCAAGAAAA
TACATTGGTGCTGGTAGAGATGCTATACAAGCTGTAGTTGAAAGCAAGATAGATGATGTTTTAGGTTCTG
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>ref|NC_013316.1|:450134-450463 hypothetical protein CDR20291_0375 [Clostridium difficile R20291]
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ATTTAGTTGAAGCTGTAAAATGTCCAAGAGACTACTTTGAAATAGAATGTATAAAGTCAGTTGCAATAAG
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GATATAGTAGCAAGAATAATAACTGATAGTATAAGAAATAATTTAGATGTAGAAAGTATGGATTTAGCAT
TTACAGTATTTGAAAAAGAAAAATATTATGAGAATGGAGAGCATTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:450463-453069 pseudouridine synthase [Clostridium difficile R20291]
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AGTATTGTAAACAAGGGTCTGTAGTAGTAAATGGAAGTGAAGTTTCAAATCCAGGAACTCAAGTAGACAC
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AATTCTGTGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGGATGAATAAACCTGATGGATATA
TATCAGCAACTACAGATAAATATGACCCAACAGTATTAGATTTAATTGATTTATCATACTTAGCTTTTGA
ACCATTTCCTGTTGGAAGGTTAGATAAAGACACAGAGGGATTATTAGTTTTAACTAATGATGGAAAGCTT
TCTCATAGAGTTTTATCTCCTAAGAAGCATGTGCCTAAGACTTATTATGCAAAAATTGATGGAGTAGTTA
CTGAAGAAGATGTAGAAGCTTTTTTAGAAGGTGTAGTGCTTGATGACGGATATAAAACTATGCCATCACA
GTTAAATATATTAAAAAGTGATGATGAATCAGAAATAGAGCTTACAATACATGAAGGTAAGTTTCACCAA
GTAAAAAGAATGTTTGAAAGCGTAGGCAAAAAAGTAGTATACTTAAAAAGATTGTCTATGGGCAATTTAA
AATTGGATGAAAGTTTAGAGTTAGGTGAGTATAGAGAGTTAACAGATGAAGAAGTAAAATTGATTGAAGA
AAGATAA
>ref|NC_013316.1|:451314-452432 transposase-like protein b [Clostridium difficile R20291]
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AAACTTTTGGATGTTGTAGATTTGTATATAATAAGTATCTTGCTAAAAGAATAGAAGTTTATAAAAACGA
TAAAGAAACTTTTACTTATAAACAGTGTAGTTCTGATTTGACTAATTTAAAAAAAGAATTAAAATGGCTT
AAGGAACCTGACAAATTTTCACTACAAAACGCCTTAAAAGATTTAGATAATGCATATAAAAAATTCTTTA
AAGAAAAAGCAGGATTTCCTAAATTTAAATCAAAGAAAATTAATAGATTTTCATATAAAACTAACTTTAC
AAATGGAAACATTATGTATTGTGGTCAACATATAAAACTACCTAAACTTGGTATGGTTAAGATAAGGGAT
AAACAAGTACCTAAAGGGAGAATACTTAATGCCACTATATCTAAAGAACCAAGTGGTAGATATTATGTAT
CATTATGCTGTACTGATGTAGATATTGAAGTATTTGAAAATACTAATAATCAGATAGGTTTAGATTTAGG
AATTAAAGAATTTTGTATCTCAAGTTGTGGAGAATTTATAGAAAATCCTAAGTATCTTAAGAAGTCATTA
AACAAGCTTGCTAAATTACAAAGAGAATTATCGAGAAAGACAATCGGTAGTTTAAATAGAAATAAAGCAA
GATTAAAAGTTGCAAGACTTCAAGAACATATAGCTAATCAAAGAAATGATTTTCTACAAAAACTATCTAC
TAAATTAATAAAAGAGAATGATATTATTTGCATAGAAGATTTACAAGTAAAGAATATGATTAGGAATTGT
AAACTATCTCGCTTAATTTCTGATGTGTCATGGTCAGAGTTTATTCGCCAATTAGAATACAAGGCTAATT
GGCATGGTAGACAAATTGTAAAGGTAGGTAAATTCTTTGCAAGTTCACAAATATGCAATAAATGTGGGTA
TAAAAACGAGGAAGTGAAAGACTTAAGTATAAGAGAATGGATTTGTCCTAGTTGTAATGAAACTCACGAT
AGAGATATAAATGCAAGTATAAATATATTAAAAGAAGGATTAAGACTAATAACAACTCAAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:453096-454457 putative tRNA (Uracil-5-)-methyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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GTCAAGTTGGAGATAGAGTTATCCATATGAAGGGTGGAATAAGTGGTCAAAAGGTGAGAGCTGGAGTTAA
AAAAGTTAGAAGTAAGAAAGCTGAAGTTAAGATGATAGAATTATTAGAGAACTCACCACTTGAAACTGAA
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AAATAAAAGAAAAACAAGTTATGGATTTATTTTTAAAGCAAGATTTATTTGGATTTCAGTTTTTAGGGAT
AGAAGGAAGTCCAGAAAACAAATATTATAGAAATAAGATGGAATATACTTTTGGAGATGAAGTAAAAAAT
GGACCTTTGACATTAGGTCTTCATAAAAAAGGAAAGCATATAGATATACAAACTGTTGAGGAGTGTATGT
TGGTTGATGAAGACTTCTCAAAGATATTAGTTTCTAGTGTAGAGTTTTTCAATGAAAAAAAGCTTCCTTA
TTATAGAACAATGAATCACAAAGGATATTTGAGACATCTTGTAGTTAGAAAAGGGATTCATACTAATGAG
ATTATGGTTAATATAGTAACTTCTTCTCAAGAAGATTTTGATATGAATGAGTTTAAAGATATGCTTTTAG
GGATTGATTTAAAGGCTGAGTTAGTAGGTGTACTTCATACTATTAATGATGGTTTAGCAGATGCAGTCCA
ATGTGATGAGTTAAGAGTATTGTATGGAAGAGATTATATACAAGAAGAAATTTTAGGTCTTAAGTTTAAG
ATTTCACCATTTTCGTTTTTCCAAACCAATACTAAGGGAGCTGAGGTTCTTTATAGTATTGCTAGGGATT
TTATTGGAGATTACAATGATAAGGTTGTATTTGACTTGTATAGTGGTACTGGGTCTATTGGACAGGTTAT
GGCTGGTGCTGCTAAGAAAGTGTATGGTATTGAGATAGTTGAGGAAGCTGTTGTTGCTGCTAATGAGAAT
GCTAAGTTGAATGGACTTACTAATTGTGAGTTTATTGCTGGGGATGTGGCTAAGGTTGTTAAGGATTTAA
AGGACAAGCCTGATTTGATTATTGTTGACCCTCCTAGACCAGGCATTCATAAGGATGCTATTAGGGATAT
TTGTGGATTTGGTGCTAAGGAGATTGTTTATATTTCTTGTAATCCTAAGTCTTTGGTTGTTGATTTGGTT
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GTGAGACTGTAGTTAAACTTATTAGAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:454980-456014 hypothetical protein CDR20291_0379 [Clostridium difficile R20291]
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ATAATCAAGGGTATGAAGATGGGTATAAAGGAAATTATAGTTCATCAAATTATAGTGGAGATTATAGTGA
TACATATGAATCAAAGTACTCAGAAGGATATGAAAAAGGTAAGGCTAAATTAGAAGAGGAAGAAAAGGTG
GCTAAAGAGACTGGATATAATTTAGGGCTTACAGGTGCTAAATCTAATAATACATATGAAAAAGAAGTTT
TAAAAAATGCTTATGATACCGGATATTCAACTGGATACAATGAATATAAGACTAAAAAGATAGAAGAATA
TAAAGCTAAAGGGATAGAGGATAGCAATAAAGATAAAGAAAAAATGACATTTGAAGAAAACATAGATTCT
GAATTTATAGATGCTTATAATAATGCTTATGACGAAATACAAGAACAATTAAAAAATGATTACACTACTC
AAGGATTTGAGAGTGCTATCAAAGGAGAAAGATTTGACACATCAACTATAGGTAATGTTAAATATGCTAA
TTGGTTTAAAGAAGGATATGATAATGGTAAGGTTAAGTTACCTAAAGCAAAAGAAAGTGTATATAATCAA
GGTTACAATGAAGAAGATTTTAGTATACCATATGAAATGAAGTCTATTGAAACTAAGTTAAAAGGTGTAT
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AGCAGCTGTAGTTGCTGGAGTAGTATATAAAAATAAAAAACGTAAAAAGATATAG
>ref|NC_013316.1|:456101-456304 hypothetical protein CDR20291_0380 [Clostridium difficile R20291]
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GAGTATACCTGGAACTGGAATATCATATACAAAAACTAGTACAAAGAAACGTAAACCTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:456475-457635 cell surface protein [Clostridium difficile R20291]
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GGATTGTCAGGAGCTAAAAATGCCCCAATATTGTTAACTAAGAAAGATACAATCCCTTCAGAAACATTAA
AAAGATTAGAAAAGGTAAAAGAAGTATATCTAATTGGAGGAAAAAATTCGATAGGAGCATCAGTTCAGAA
AATATTAAGTGATAAAAAAATAAGCATAAATAGAATAAGTGGAACTGATAGAATAGATACAAGTCATAAA
GTTGCAAAAGAAATAGGAAGAGTAAGTACGGTTAAAAAAGTAATATTAACTAATGCTTTTAAAGGCGAAC
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TACAAGTTTTGCTACAGATGGATTAGAAACTTATGCAATTGGTGGAAAAGTCAGTATGAGTGATAAGTTA
ATAAATGAAACTAAAGCAACAAGAATAGGTGGAGTAGATAGATACGATACAAATAAACAAATAATAAATA
AATTTTATAATGGCTCAAAAGAATTTTACATAGCAAGTGGGACTGATTTAGTTTATTCTTTAGTTGGTTC
TACAATTGCACAAAAAACACCTATAGTGTTAGTTGGAAATGGAAGTAATAAGAGTATATTAAAAAATGCA
AGTAAAATAACTGCTATTGGAAATATTGATGATGTTATTATAAAACAATGTTTAAATATAACTAATAATG
TTGGGGATTCAAATACAGGTATTGTAAAAGATACTAATTCAAATAATACAAACAAACCAAGTAATGAGCC
TAGCTCTAATAATCCTGGATTAACTGATAAAAGTACAGTATATGTAACTCCTAATGGAAAATCATATCAT
CTAACAAAAAATTGTTCTACACTAAAAAGAAGTAAAACAATAAATAAAGTAACATTAAAACAAGCTAAGT
CACAAGGTAAAATAGACCCTTGTAATGTTTGTGTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c459065-458166 integrase, catalytic region [Clostridium difficile R20291]
GTGGTAATTACACTATCCAAGAATGAAGATAAATATAAAGCGATTCAATCCTTATTCAATGAAAAAAAAG
CTTCGCTTATACAATTATGTGAAATCGCTAAAGTAAATCGTTCTGGATACTATAAATGGCTCAATCGAGA
TAAAAGTAATTTAGAACTTGAAAACATTAAATTAGCAACTTTGATAACTAAGATATATGAAGAAAAGAAG
GGAGTTTTTGGCTCTTTAAGGATGACCTTGCAGTTAAACAGAGAGTATAAACTTAATGTCAATCACAAGA
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ATGTACACAAGAAGTAATTGCTGAAAATGTATTAAATAGAAAATTTAGTGCAGATAAAACTTCTCAAAAA
TGGTTAACAGATGTAACTGAATTTAAATTAACCGACGGGACAAAGGCTTATTTAAGTGCAATTCTGGATT
TAGGTGATAGAAGCATAGTTTCATATGTTATTGGAAAATCAAATAACAATAACTTAGTATTCGAAACTTT
TAATAAAGCAATAGAAGTATATCCAAATGCAAAACCTATCTTTCATAGTGATAGAGGCTATCAGTATACT
AGCAGGGTGTTTAAATCAAAACTTTTAACACAAGGCATGATACAAAGTATGTCGAGAGTTGGTCATTGTA
TTGACAATGCTCCTATGGAAGGATTTTGGGGAATTTTAAAAGTGGAAATGTACTATTTAAGGAAATTTGA
TACATACGAACAATTAGTCAAAGCAATAGATGATTATATATATTACTATAATAATTTTAGATATCAAAAG
AGATTAAATTCTATGTCTCCACTTGAATTTAGGAAATATTTAAGTACAGAGATAGCATAA
>ref|NC_013316.1|:c459730-459059 hypothetical protein CDR20291_0383 [Clostridium difficile R20291]
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CAGTAATAAAAATAATGGAAGAATTAAATATTGGAAAACGTACATTCAGAGAGTGGATGCGAAATTATGA
AACTTTTGGAAATGATGGTTTAATAAAACAAAGTCACAAATCATGCTATTCTAAAGAGTTTAAATTAAAT
GCTATAGAATCTTATCTAAATGGGGAAGGATCTTATGATACTATCTCAAAAAAATATAAAATGAGATCAG
TTCATCCACTAAAAGCTTGGGTTAAAGAGTATAATCTTCATAAGGTGATAAAAGAAACCCCGAAGGGAGG
ACTCTTTATGGAGACTAGAAAAACAACATTAGATGAAAGAGCTGAAATTGTTAAAGATTGTATTGAACAT
GGTCTTAATTACAATTTAATAGCAAAAAAATACTTTGTTTCATACAGCCAAGTTAGAAGATGGACTCTTA
AATATAAAGAAAATGGGATAGATGCTTTAGAAGACCGAAGAGGTAAATCAAAAAAAGAAGATGAGTTAAC
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GAATTCTTAAAAAAGTTAAAAATCATAGAAAGAGGGTGGTAA
>ref|NC_013316.1|:460831-462204 putative arginine utilization sigma-54 dependent regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGAAATATTGGAAAATATTGATGAAGGGGTACATTTTGTTAATAAAGACGGGAAAACTATAATCT
ACAATAATTCTGTACAAAAAATGGAAAAAATGAACAGACACGATATTTTAGCCAATTCATTTTTTGATAT
AGTCAACAAAATGAAAATAAACAGGAGTACACTATTAGAAGTTTTGGAAAAAAGGGAAGTTATCAAAGAC
AATATTCAAAAATATCTGGACAAAAATGGAAAAGAGATAACAGCAATTAATACTACAATACCAATTGATA
TTAAAGGCGAGTTTGTAGGGGCACTTGAAATATCAAAGAATATGACAACGATAGAAAATTTACTAAACAG
AAATTATAAAAAAAATTTAGTCAATAAAGTTAGTAGTAGACAAAAAAAGGGTTATGAATTTGATGATATT
TTAGGGGAAAGTAATTTGATTAAAGAAGCAATAGAAAAATCTAAGAAAGCTTGCAAGTCTGATGCTTCAG
TATTTATATACGGTGAAACTGGAACGGGTAAAGAGTTATTTAGCCAGTCCATTCATTATGGAAGTAATAG
GAGAAACTATCCATTTATAGCACAAAATTGTGCGGCTTTGCCGGAATCACTATTCGAAGGTATCCTTTTT
GGAACTAGCAAGGGAGGATTTACAGGAGCAATAGATAGGCCAGGCTTATTTGAACAAGCTAACAAAGGGA
CATTGTTATTGGATGAGATAAATTCCATGCCTATTATGTTACAGGCTAAACTATTAAGGGTTTTACAAGA
AGGTTATGTAAGAAGGGTTGGAGGAACTAAGGATATACCTATAGATGTAAGAATTATTGCAACGACAAAT
GAAAGTCCAAAGGTAATTTTAAACGAGCATAAAATGCGAAAAGATTTATATTATAGGCTTAACATAATTC
ATATAAAAATTCCTCCTCTTAGAGATAGAAAAGAGGACATACTTCTATTGTGCAAAAAATTTATTTCAAA
GTATAATAAAAAGTTAAATAAAAAAGTGGTAGGAATTTCAGATGAAGCTATTAAAATTTTAAAAAATTAC
GATTGGCAAGGTAACATAAGAGAGCTAGAAAACATAATTTATTGTACTATGAGTATGATGGAAGATGAGG
TACAAATAGAAACAAGTATGATTAATCTAAACGACTATTACAATCTTAAAGAGAATAAAGAGAGTAACAA
TTATTCTTTAAACGATTTGGAGGGCAAAACACTTAGTAAGATTATCAGTGAGATAGAAGAAAAGTATATA
TATGAATCATTAGAAAAGGCATCGTACAATATAACTAAAGCTGCATCAATTTTAGGTATGAATAGGCAAA
ATTTACAGTATAAAATAAAAAAATATAATATCAAAATATTATAA
>ref|NC_013316.1|:462460-463527 putative oxidoreductase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAAAGTAAGAGTAGGAATATGGGGATTTGGAGCTATGGGAATAGGTATGGCTAATATGATTCTAA
AGAAAGAAGGTATAGAAATAGTATCTGTTTGTAGTAGAAGTACTTCAGGGAAAAGTATGTATGATGTTTT
AGGAATTGAAAGAGGAGAAAGACCAGAAGTTATTATCAATAAAAATTATGAAGAAGTTTTTAGAGAAAAA
AGTGTAGATGTTGTTTTGTTAGCAACTGATTCATTTACTAAAAAGGCTTTTGATAAAATAATTTTCTTAT
TAAATAGAAAAATAAATGTTATATCAACAGCAGAACAAATGGCATATCCACAAGCTGATGATGCAGATTT
AGCTAAAAAAATGGATGAAGTTGCAAAGGAAAATGGAGTAAGTATACTTGGAACAGGAATAAATCCAGGA
TTTGTATTAGATTTACTAGTATTGGCACTTTCAGGTACTTGTGAAGAAGTTACTAGTATAAAAGCTAAGA
GAGTAAATGATTTATCTCCATTTGGAAAATCTGTTATGGAGGAACAAGGTGTTGGAGTAACAAGGGAAGA
ATTTATAAAAGGTGTAGAAGATAAGACTATAGCAGGTCATGTAGGTTTTGTAGAATCAATAAATATGATA
GCTGATGGATTAGGTTGGAAATTAGATAAGATAGAACAAACAAAAGAGCCAATAATGACTACAGTAGATA
GAAAATCTAAATACGGAGAGGCATTGGCTGGAAATGTTGCTGGTTGTAGACAATGTGGATATGGATATGT
AAATGGAGACGTTTTAATTGAAATGGAGCATCCACAACAGATAATACCAGAAGTAGAAGGTATTAAAACA
GGAGACTATGTATCAATAAAAGGTATACCAAACATTGATTTACAAATAAATCCTGAAATACCTGGAGGAG
TAGGTACTTATGCAATGATAGTAAACTCTATTCCATTAATAATAAATGCTAGACCAGGTCTTAAAACTAT
GTTGGATATACCAGTGCCTAGAGCAATAATGGGAGACATAAGAAATCAGATAGAAGTTGAATTGGAAGAA
GAATCAAAGGCTAATTAG
>ref|NC_013316.1|:463624-463932 hypothetical protein CDR20291_0386 [Clostridium difficile R20291]
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AAGTTCCAGAGGATACTAAGAAAGTATCCTTAGAAATGTGGGTTAAAGGTTTTATACAAAGTGATGCTTC
TATAGGCGACTTAGTAGAAGTTAAAACAATTACAGGTAGACTTGTAAAAGGTAATTTACTTAAAGTAAAT
CCATATTATACTCATGATTATGGTAAATGTATACCAGAGTTACTCCAAATAGGAATCCAAGCTAAAGAAA
TATTATTTGGAGGTGTATATAATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:463925-465355 putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATTCAACATCAATAAAAGATATGAGTTATCAAGCTGTTATGGGAAGAAATAACGAAATAATGA
AAAATGCAATCGGATTGGATTATTCTTCTTTTGAACAAGAGGGAATAGGGTTTGATTATGAGAAAATGAT
GAGTGAAACAGGATATACATTACAAGATATTGAAGCAATTCAATCACAGTATGCTGTTGGAAATACTCCT
CTAATAGAGCTTAAAAATTTGACTAAATTAGCTAGAAAATGTGCTAAAGAAGGTAAAGGAGCTAAAATAT
TTGTAAAAGATGAAGCAATGAATGCATCTGGTAGTTTTAAAGCAAGAAGAGCAGCTACTGCAGTATATCA
TGCCAAACAAATGGGATATAAAGGTGTAATAGCAGCTACCAGTGGTAACTATGGTGCAGCTGTAGCATCA
CAAGCGGCAATGCAGGGATTAAAATGTATAATAGTTCAAGAATGTTATGATTCTAATGGTGTAGGTCAAC
CTGAAATTATAGAAAAAGCACGAAAATGTGAGGCATATGGAGCAGAAGTTGTTCAGTTAACTGTTGGACC
AGAGTTATTTTATACGTTCTTAGTTTTATTAGAAGAAACAGGCTATTTTAACGCATCATTATATTCACCA
TTTGGAATTGCAGGTGTAGAAACTTTAGGTTATGAGTTAGCTATCCAATTTAGAGAAAAGTATAAAAAAG
ACCCTGATATAGTTGTTTGTACAAATGCAGGTGGTGGTAATCTTACTGGAACTGCAAGAGGATTGATAAA
AGCTGGTTCCATTAATACTAAAGTAGTAGGAGCAAGTGTAGATTTAAAAGGATTACACATGGCTAGTGAT
AATCAATTTAATAAAAAATCATTTACAACAGGACATACAGGTTTTGGGATACCATACTGTACATGGCCTG
ATAGGTCAGATGTACCTAGGTCTGCAGCTAGACCACTTAGATATATGGATAGATATGTATTAGTAAAACA
AGGAGAAGTTTTTTATACAACTGAATTATTGGCACAGCTAGAAGGTATAGAAAGAGGTCCAGCAGGAAAT
ACATCTTTAGCAGCAGCATTCTCTTTAGCTCAAGAGTTAGATGAGGATAAAGTTATAGTGGTACAAGAAA
CAGAATATACAGGCGCAGGTAAACATATATGTCCACAGCTTACTTTTGCAAGAGAAAATGGAATAGATAT
AAAATTTGGAAATCCAAGAGAAGAAATTGCAGGAGTAAACTTAATATTACCAGAAAGACCAGAATTATTG
AAATGTGTTGATATTGATATGAATAAAATAAGAAAGTCATTTATAAAAAATTGCATATCTAATAATCACA
TTGATAATATTGATAAGCTAAGTAATCGAGATATAGAATTTTTAATGGAAGAAGTAAAAAGTTCAAGAGA
TTTTGTTGTTGATGTATTAAATAATTTATAG
>ref|NC_013316.1|:465433-465807 D-ornithine aminomutase S component [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAAGAGAGGATGATTTTGAAGTTAGAAGAAAACATCTTCAAGAACTGAGTGATGATGAGTTAA
AAGAAAGGTTTTGGAATTTAGCTACCCAGATAGTAGAACCAATGATAGAACTTGGTAAAAAGAATACAAC
ACCATCAATAGAAAGGTCTGTCTTGTTGAGAATGGGATTTTCTTCTCTTGAAGTAAAACCTATTTTAGAA
GGGGTTATGGAAAGAGGTCTTATAGGTAAAGGAGCAGGGCATGTAGTTTATAAATTGGCTAAATCTAAAA
ATATAACGGTTAGAGAAGCAGGTTTGTTATTAGTTAAGGGTGAATATTGGGATGAAGTTACATGTTTATT
TAGAGAAGGGGTAGAATCATGTTAA
>ref|NC_013316.1|:465801-468005 D-ornithine aminomutase E component [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAAGGAAAATAAAAAATTGGATATAGACTATATATTAAAAGATTTGGATAAATATAAACCAAAAC
GAAGAGGTTGGGTTTGGAGAGAACACTTGGAAAATCTTGAAATGGGACCTTTTAAATATAAAGACTGTAC
AAAACCTTTAAAGAAGAGTGTAGGGCTACCATCATCTAAGTATTTCAATAATATAGACCCTCAACCAAGT
CCAGTTATTACTACTGAAATAGCTTCTGGTAGATTTGAGGATGATATAAGAAGAATGAGAATGGCAGCTC
ATCATGGAGCTGACCATCTAATGGTTATCAGAACTGCTGGACAATCACATTTTGATGGGCTTATAGAAGG
AACTCCACAAGGTATAGGTGGAGTTCCAATAACAAGAAAACAAGTAAGAGCTCAAAGGAAGGCTCTTGAT
TTTATAGAAGAAGAAGTTGGTAGACCTATTAATTACCATTCATATGTAAGTGGTGTTGCTGGTCCTGAAG
TAGCAGTAATGTTTGCTGAGGAAGGAGTCAATGGAGCACATCAAGACCCACAATATAATGTTCTGTATAG
GAATATAAACATGGTAAGGTCTTTTGTAGATGCTTGTGAGGCAAAGAAAATAATGGCTTTTGCCAATATA
GCTCAAATTGATGGAGCACATAATGCTAATGCTACTGCTAGAGAAGCATGGAAGGTAATGCCTGAACTTA
TGGTTCAACACGCTTTAAACTCTATATTCTCAGAAAAAATAGGTATAGATAAAAGTAATATATGCTTATC
AACAGTTCCACCAACAGCACCTCCAGCACCATGTTTAAGAATAGACTTACCTTACGCTGTTGCACTTAGA
GAATTATTTAGTGATTATAAGATGAGAGCTCAAATGAATACTAAATATATGGAATCATCAACTAGAGAAG
CAACAGTTACTCATGTATTAAACTTATTAACATCAGTATTAACTAGAGCTGACATACAATCAACTATAAC
ACCTGATGAAGGTAGAAATGTACCTTGGCATATATACAATATAGAAGCATGTGATACAGCAAAGCAAGCT
TTAGTTGGTATGGATGGGCTTATGGATATGATAGAACTTAAAGATGTCGGTGAATTAAGAGACAAAGCAA
GAGAACTTAAAGAAAGAGCTGTATTATATATGGAAGAAATATCTGAAGTTGGTGGATATTTTGAATCTGT
GGAACAAGGATTTTTTGTTGATTCTGGAAATTATCCAGAAAGAAATGGTGATGGAATATCTAGAAAAATA
AAAGGTGGAGTTGGTGAAGGTACTGTTTATGAAAGAGAAGAAGATTATTTAGCACCTGTAACTGCTCACT
TTGGATACAATAATGTAGCTCAATATGATGAAAATGCTATAGATAATCCATCAATGTTAATAGATGGATG
TACATTTGAAAATCCAGACAAAATAATATATATTGATGAGCTTGACGATTTTGATAATGTAGAAAATAGA
CTAAAAGAATCATATGAGTACAGAAATGGAACTAAAATTAAGCCTGAAATGGAATGGTGTGCAGATGGAA
TTGTAATGATAACAATGATGCTTCCTACTGATAAAAGAACAGCAGAGTTTGCAGCTTTGGAATTTGTCAA
AAAAATGAACTTACAAGAAATTGAGGTCATAAGTAGAGAAGTTATGCATGAATCTGAAGGGACTAGAATA
GAAGTGAAAGGAAGAGTTCCGTTTGATATAGATTTAAACAATTTAGTAATACCAGAAGAACCTAAGGTAC
TAACTGATGAAGAAATAAGAGCAGATATAGAAGAAAAACCTATGAAAATAGTTTCAGCTACGGTTGGAGA
AGATGAACATTCAGTTGGTTTAAGAGAAATAATAGATATAAAACATGGAGGTATTGAAAAATATGGCATA
GAATGCCACTATCTAGGGACTTCTGTACCTGTAGAAAAATTGGTAGATGCAGCGATTGAACTGAATGCAG
ATGCAATACTTGCATCTACAATAATAAGTCATGATGATATTCACTATAAAAACATGAAAAAATTACACGA
TTATTGTGTAGAAAAAGGTATAAGAGATAAAGTAATGATTGCGTGTGGAGGAACACAAGTAACACCTGAA
ATAGCTGTTGAACAAGGCATCGATGCTGGATTTGGAAGAAACAGCAAAGGCATACATGTAGCCACTTTCT
TAGTTGAAAAAAGAAGAGAAATGAGTAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:468005-469414 putative component of D-ornithine aminomutase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATAGCAAAGTTTCTTTAAAAATAGATGTGTTGGTAGCTGAAATTGGAAGTACTACTACAGTGG
TAAACGCTTTCCACGATATTAATACTAACAATCCTATATTTTTGGGTCAAGGTCAAGCTCCAACAACAGT
GTTTGAAGGTGGCGATGTAAGAAATGGCTTATCAGGTGCTATTAAAGATTTAGCTAATAAATTATCTGTA
GATGATATAGAGTATAATGATATGTTTGCAACTTCTAGTGCAGCTGGTGGATTAAAAATGACTGTTCATG
GATTAGTCTATGATATGACAGTAAAAGCAGCTAAAGAAGCAGCTTTAGGGGCTGGAGCTGTTATTCGTCA
AATAACATCAGGTAGAATTAAAAGAACTGATTTAAATAAAATAAAAGAAATAAACCCAAACATAATTTTA
ATAGCTGGTGGAGTCGATTATGGAGAAAGAGATACAGCTATTTATAATGCAGAAATGATAGCTTCTATGA
ATCTAGGCATACCAGTTATATATGCTGGTAATGTTGAAAATCAAGAGGAAATAAGGTTAATATTTGAAGA
TACTAATTATAAGCTTTATATAACTGAAAATGTATACCCTAAAATAGATTTATTGAATATAGAACCTACA
AGAAGAATCATTCAAAGTGTATTTGAAGAACACATAACTACAGCACCAGGAATGAAATACATTAAAGAAA
TGGTTAATGAAAATATTACTCCAACCCCAGGAGCTGTAATGGAAGCTTCTAAACTTTTATATAAAAATAT
TGGAGATTTATTAACTTTGGATGTAGGTGGAGCAACTACTGATGTACATTCTGTTACAGATGGAAGTGAC
TATATTAATAAAATTTTGGTTAATCCTGAACCTACTGCAAAGAGAAGTGTTGAGGGGGATTTAGGTGTAT
ATGTAAATATGAAGAATATAGTAGAAGTTATAGGTAAAGAAAACTTACAAAGTGAACTATATATAGATAT
TGATGCAGTAATAGAGAATTATCCTCCAATACCAAAATCAAAAGAAGAAATATTATTTGTTGAGAGGTTG
ACAAAAGAAGCTGTTGTTAAAGCTATGCTAAGACATTCAGGAAAAATAAGAAATATCTATGGAACAACTG
GAAAAGTCAAAATTGCAGAAGGGAAAGATTTAACAGAAGTAAGATATATAGTTGGTACAGGGGGAGCACT
TACTAGGCTCCCTAGTAGAATTGAAATATTAGATAATATGCTCAAATACAATAAAAATAATGAATTACTA
TTTCCAAAGGAAAAAACAAAGATATTAATAGATAATGACTATATTATGGCATCTATGGGTGTTTTATCTA
AAAAATATGAAGAAGCATCTCTTAAGCTCCTGTTAAAAAGTTTGAATTTTGAGGAGGAAAGATTATGTAT
CCTAGGTTAG
>ref|NC_013316.1|:469399-470463 putative amino acid racemase [Clostridium difficile R20291]
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ATGAAAGAAGTATTAAGATATCTTTTGTTACTAAATCATTTTGTGCACAAAAAGAAATAGTAGAAGAAAT
ATGTAGTGAAGGAATAGACCATATAGCAGATTCAAGAATACAAAACTTAAAAAAATTACAAGATATAAAT
CTACCTAAGATATTGATTAGAATCCCAATGTTAAGTGAATTAGAAGAAGTTATCAATTATTGCGATATTA
GTTTTAACTCAGAATTAGAAACAATAAAGAAATTAAATGAATTATGTGAAAGTAAAAATATTATTCATAA
GATAGTTCTTATGTTTGACTTAGGCGATTTACGAGAAGGATACTTTTATGAAGAAGACTTTTTTAATAAT
GTAAGAGAGATAGTAAGATTAAAAAATATTGAAATAATTGGTATAGCTACAAACTTAACCTGTTATGGAG
CTATTATACCATCTAGGGAAAATATAGGCAGACTGGTAAGTATAGCAAAAAGAATGGAAGAAAAATTTGG
AATAAATCTAGAAATAGTATCTGGAGGTAATTCAAGTTCTATTCATCTGTTGATAAATAATAATATGCCA
GAAGGTATTACTAATTTGAGAATAGGCGAGTCCATTCTACTTGGTAGAGAAACGGCATACGGTGAAAATA
TAAATGGAACATATCAAGATGCATTTAAATTAATATGCCAAGTAGTTGAATGTAAAGAAAAACCATCAGT
TCCTATTGGAGAAATAGGAGTTGATGCCTTTAGAAATAAACCTGTTTATGAAGATAAGGGAATCTTAAAA
AGGGCAATCATAGCTATAGGTAAACAAGATATAAATATTGACTCTTTAATTCCAATAGACACTGATATAA
AAATATTAGGGGCAAGTTCAGACCACATGATACTAGATGTAAGTAACACAAAATATGATTATAAATTAGG
TGACAATTTAGAATTTTTATTAACTTATGGGGGTATCATGTCATCTAGTACAAGCAAATATGTTTCAAAA
AAAATTATAGTGTAG
>ref|NC_013316.1|:470493-471914 Na+/H+ antiporter [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAGCGAGAATGTAGAAAAGCAAGTCTGTTTGATGCAATGATACCAATTACTTGTTTGATATTAT
TTTTAAGTCTAGGAGTATTAGTGTATGGTTCATCACCTCATGTACCACTAATAGGAGCAGCAGCAGTAGC
AGGACTTGTGGCTGTATATAGACTTGGATTTAAATGGAAAGAGTTAGAATTAAGTATGTTTAATAGTATA
AAGATGGCAATGCAAGCAATCTTAATCATAATTATAATAGGCGTACTTATAGGAACTTGGATAGTAAGTG
GAGTAGTTCCATGTATGATTTACTGGGGACTAAAAATTTTATCACCAAATATTTTTTTAGTAGCATCAAC
ATTAGTCTGTGCAATAGTATCTCTTGCGACAGGTTCATCTTGGAGCACAATGGGTACAGTAGGAGTAGCT
CTTTTAGGAATTGGTCAAAGTTTAGGTATGCCAATTGGATTAATCGTAGGTTCTATAATATCTGGAGCTT
ACTTTGGAGATAAACTATCACCTTTATCTGAAACGACTAACTTAGCTCCAGCAATGGCAGGAACAGATTT
GTTTACACATATAAAATATATGTTATATTCGACTATACCATCATTATTAATTTGTTTAGTAATTTATGGT
GTAATTGGAATGAAGTATTCAGGTCAAGCACTAGATATAAAACAAATAGAATTAATTAGGTCTACATTAG
ATTCTACATTTAATACTTTATCACCAGTATTATTATTAGCTCCAGCAATAGTAATTGGATTAGTTGTATT
TAAAGTTCCTGCTATACCAGGGCTTATAGTAGGTGCTGTATTGGGAGTATTGTTTGCAGTAGTTTTTCAA
GGAGAATCTATGAATACGATATTAGATGCAGCACAAAATGGATATGTTTCGTCAACACAAATACAGGAGG
TAGATGCTTTATTATCTAAAGGTGGGATTATGAATATGATGTCCACTGTATCCTTAACAATATGCGCTTT
ATCTCTTGGAGGTATTTTAGAAAAAACAGGTATGCTTGAAGTAGTAGCATCTTCTTTACTAAGATTAGCA
AAGGGTGTATTTGGAACAGTATTATGTACTATGGTAACTTGTACAATTACCAATATAATAGCAGGTGAAC
AATATCTATCTATAGTTATACCAGGAAGAATGTATAATAAGGAATATAAAAAGAGAGGTATACATCCTAA
GATGTTGTCGAGAGCTTTAGAAGATAGCGGAACTTTAACTTCTCCATTAGTACCATGGAATACATGCGGG
GCGTATATAACAGCAACATTAGGTGTATCTGCACTAACATATGGTCCATACGCTTTATTAAATATTATAA
ATCCAATAGTATCTTTAGTATTAATTGCATGTAAGTTTAAAATAGCAAGAATAGAAGATGAACCTGAAAC
TTGTTTAAATTTTGATGTTTGA
>ref|NC_013316.1|:472343-472807 hypothetical protein CDR20291_0393 [Clostridium difficile R20291]
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TTGACTTTATGGTAGAGTTTTCAGAGTTTTCAAAACAAAGTTTTGAAAAAATTTCTAAATATCTGGAGGA
GAGAGGAATTTTATCTTCAGGAGCACCGATTGTATGTTTTCATAACATGGATTTAGCAAAATTGGATGTT
GAAGTAGGGTTTCCTGTAGCCACTTATATAGATGGGAAAAATGAGATTCTACAAAGGATTGTTCCTGCAC
AGAAAATAATAACTGCAATTGATTTAGGACCTTATGAATTACAAGACCCTACTTTAGAAGACTTATTTTC
ATGGGCAAATAGCAATGGATATAAACTTCATGGCGATATATATTACCAGTATTTAAATGATATCAATCGT
CCAGCTAGTGAATATCTTACGAAAATGATGTTACCCATTATATAG
>ref|NC_013316.1|:473105-473467 hypothetical protein CDR20291_0394 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATATATGATATATTAACACGTTTTTATATTCAAGATATAGAAAAAGCCATACCTTTTTATGAGA
ATCTTTTAAAAGAAAAATGTTCTTTGCGTTTTTCTTATAAAGAAGTTGGGTTGGAATTAGCGCAAATAGG
AAATGTTTTACTATTATCTGGTTCTGATGATGCTCTTAAACCATTTATAGAAACAAAATCTACTTTTATG
GTTGATTCTGTTGATGAATGGAGAAGTTATCTATTGGATAATGGAGCAGTTGTAGTAAGAGATAAGAAAA
AAGTTCCTACAGGATATAATATGACATTGAGACATCCAGATGGTACAATTATAGAATATGTTCAACATAC
AAAGCAGGATTAG
>ref|NC_013316.1|:474038-474922 AraC-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAAAAGGAGGGAAGCTGCAATGTCTTACAAAGTAATTAATGTCATAACTGCTATTGACTATATAG
AGGAGCATTTATCAGAAAAGCTGGATTTAGATATAATTGCTAATGCTGTTCATTACTCAAAATATCACCT
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GCAGCAAAATTATTGGTATTTTCAAAGAAACCAATTATTGAAATTGCATTGATAGCTGGATATGAAAGTC
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ATTTTATCCTTTGCAGCTAAGATTTGTTTTGAAAAAAGATAACCTATTTTCAAAGAATGTACTAGAGTTG
GAAAAAGAAATTAAACTTGCAAGTATGTCTGACATACCATTATGGATGAATTTAGTGAGATTAGTCATAG
ATGGATTTCCAAATTTGCAAGAGGAAGAATATATATATCAATTAGAACAGTATATTTTAGAAGAAAGAGC
TTTAATATTAAAACTTAATAATGTCGCTATTGCAAATATGGTGTTTAATAGAGAAACTAGAAGTATTGAT
TTTTTTGGAATACATCCACAGTATCGTAATTCAGACATTGCACAAGTGTTTTTGAAGAAAGTTATTGAAG
ATTTCTTGATAGATACAGATATCTCAATTACTACCTTTCGAGAGGGTGACAAAGCTGATACAGGACATAG
AGATATGATAAAGAAGTTGGGGTTTGCAGAAGCAGAGTTGCTTGTGGAATTTGGATATCCTACTCAAAAA
TTTATTCTTCCTTGTGTAGAAGAAAGAGATAATAGACAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:475180-477294 hypothetical protein CDR20291_0396 [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTGAAAATAAACAAGTAGTAAATTGCGATATTATTGCATCCAATTCTAAACATAATATGTGTGAAC
ATGATGTAGAGTTATTAACTTTTTTTCCAGATGAGATTGCACATCTAATAGAGATAAATAACAAGCTAGA
CAATGCTTTTAAGAAAGCTGAAAATCTTGTTGACAAGCTTGATAAGGATTATATGGACGCTAAAATGTAT
ATGGTAAAAAATCGTGGTGAAATAGACCCACATGAAATGTTTCAAAATGAACAAGGACTAAAACAAATAG
ATAACTATGGGGCTTTTATGGTAAAAGTTCGAGATAAGATTAATAAAATCAAAGATTCTCCATACTTTGC
TAGAATAGATTTTAGGCTGAAAGATATGGATGATGAATCTAAGTATTATATTGGTAGATTTGCATTTGAT
TATGAAGATGAGCTTATAATACTTGACTGGCGTTCTCCAATTGCCAGTATGTTTTATGATTATGAAATCG
GAAAAGCTGGATATGATGCTCCAATAGGATGGGTGGATGGAGAAATAACAAGAAAACGACAATTTAAAAT
TAAAAATGGAAAATTGGAATATGCACTAGAAAGTTCCATTAATATACAAGATGATATTCTTCAAAAAGAA
CTTAGTCACACTTCAGATGAAAAAATGAAGTCAATCATTTCAACAATACAAAAGGAACAAAATCAAATTA
TTAGAAATGATAAAGCTGATACACTGATTATTCAAGGGGTAGCTGGTTCTGGGAAAACATCTATAGCATT
ACACAGAATTGCTTTTCTTCTTTATCGATTTAAAGATAAAATATCAGCAAATAATGTAATTATCCTATCA
CCTAATAAAGTCTTTGGAGACTATATTTCCAATGTCCTTCCTGAGCTTGGAGAAGAACCATTATGTGAAT
TAAGTTTTGAAAATATAGCAGAGGTACAATTAGATAGAGTTATTAATTTTGAAAGTGAGAAAGACCCATT
AGAAATAAATGATGCTAAATGGTCTGAAAGAGTGCGTTTTAAATCTACACTTGATTTTGTAAAACTTATT
GATGATTATATAAAACAAATGCCAAATAAGATTTTTATTCCAAAAGACTACACTTTTGGAAGTTTTACAG
CTAAAAGTGACTGGATACAGAGTAGATTTGAGGCATATAACAGATATCCAGTTAAGAAGAGATTAGAAAA
GGTAGCTGAAGACATTCATTATAAATTTGAATCAGATAATATTATGGAAGAAGATTTACCAAAGGTAAAA
AGTATACTTAAAAGTTTGAATGGAATGTTGACAATAAAAAATACTCTTACACTATATAAGGATTTCTTTA
AACAAATGAATATATCAAACATGTTTGTGATGGCAGAAAAGAAAACACTTGAATGGTCAGATGTATACCC
ATTTATATATATTCATGCTGCATATGAAGGTATACAAGAAGATAAGATTATAAGGCATATTGTTATTGAT
GAAATGCAGGACTATACACCTATTCAATATGCTGTAATAAACTTACTTTTTAAGTGTAAAAAGACTATTC
TTGGAGATTTTGGACAATTGGTTAATCCTAATCATACTCATACATTAGATGATATGAAACAGCTATATAA
TGATGGGGAACTAGTTATGTTGAACAAGAGTTACCGTTCTACTTTTGAGATTATTAATTTCGCCAAAAAG
ATTCAAGATATATCTTCATTAGAGCCTATTGAACGACATGGTGAAGAACCGGCTTTATTAAAATGTAATA
ACGAGCAAGATGAAATAAATAAGATAAAAATAGAAATTGAAGAATTTAAAAAGAGTGATAATGCGACTCT
TGGTATTATATTAAAGACAGATAATGACGCTAAAGCTGTATATGATGCGTTAAGAGAAGAATATAGTGTT
CACTTAATATCTTCTGAAAGTTCTAGCTTTACAAAAGGAGTATCCATAACTTCTATTAAAATGTCAAAAG
GTTTAGAGTTTGATGAAGTTATTGTACCTTCAGTAAATAATAAAACATATTATAGTGATTATGACCGCAG
TTTGTTATATATTGCTTGTACACGAGCTATGCACAAACTTAAGTTAACATATGTTGGTACATTAACTCAA
CTTATAAGCATGTAG
>ref|NC_013316.1|:c479799-477556 putative antibiotic resistance ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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ATAAAATTGTTGTTTTTACTGGAGTTTCTGGTTCTGGAAAATCCAGTATCGTATTTGATACAATTGCAGC
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CCTCAGGTGGAGCTGATTGATAATTTAACTGCTTCTGTAATCGTAGACCAAACTCCTCTTGGTGGCAATG
CACGTTCTACAGTTGGCACTATAAGTGATTTGTATTCATCATTAAGATTATTATTTTCTAGAATTGGAGA
ACCCTACATAGGAACAACTTCATATTTTTCTTTTAATGACCCAAATGGTATGTGTAAAAATTGTTCTGGG
ATTGGTAGAGTTAAAGTAATCAATATTGAATCTATTATAAATCCTGAAAATTCATGGAATACAGGATGTA
TAAATGACTCTTTATTTAAACCTAATTCATGGTACTGGAAGCAGTATGCAGAGTCTGGACTTTTTGATTT
AGATAAACCTATAAAAGATTATTCTTTTGAAGAATATAATTTATTGCTTTATGGTTCAAAAAATAAAGAT
GGAAAACAAGAAAATCCAAAAATAGAGGGTATTTTTAACAAATACAATCAAACATATCTAAATCGAGATA
TTAGCAATATGAGCAAACACACAAAAGAAAAATCAGAAAGACTTATAACAGATAAGGAATGTCCTGTATG
TCATGGAAAAAGATTAAATAAAGAAACTCTTAACTGTAATATTTTAGGATATTCGATTGCAGATATGTGC
AATATGGAACTTACTGACCTTTATGATTTATTGTTACAAATAAAAGATAAAAGAACTGAAACTGTAATAA
AGACTCTTACTGATGGTTTAAAAAGAATGATTGATATTGGTCTCCCTTACCTACATCTAAATAGAGAATC
ATCATCTCTATCTGGAGGAGAAGCTCAAAGATTAAAACTTGTACGCTATATGGGGAGCAGTCTCACAGGT
ATGACTTATATTTTCGATGAACCTAGTGCTGGTATGCATCCACGAGATGTACATCGTATGAATCAGCTAT
TAAAAAAACTTAGAGATAGAGGAAATACTGTCCTTGTAGTAGAGCATGATAAAGATGTTATCTCCATAGC
AGATGAAGTTATAGATATTGGCCCAAGTGCTGGTACTCAGGGTGGACATGTTGTATTCCAAGGCTCTTAT
GATAAATTACTTTTAGCAAACACTCTTACTTCAAATGCAATGAATCTATCATTACCTATAAAAACTGACT
CTCGTCATCCAAAAGGTACCCTTCCAATTAGAGATGCTTGCATAAATAATCTAAAACATATTGATGTAGA
TTTACCAGTTGGAATTATGACTGTCGTTACTGGAGTAGCAGGTTCTGGCAAGAGTACTTTAATCTCTCGT
GTTTTTGCACAAAAATACGAAAAAGATGTTATTAAAATCGACCAAAGCCCAGTTACAGCTACAAATCGTT
CTATGCCTGCTACATTTCTTGGTTTCTTTGATGAGATAAGAAAAGTATTTGCTAAAGAAAATAATGTTGA
AGAAGGTTTATTCAGCTTTAATTCAAAGGGAGCTTGTCCTGTTTGTGATGGTAAAGGAGTACTTGTTACA
GAGCTTGTATTCATGGACCCTATTATTAATACATGTGAAGCTTGCAAAGGTACTAGATATAGTGAAGAAG
TTTTGTCAAAATTATATAAAGGTAAATGTATAGTTGATGTACTATCTATGACAGTAGATGAATCTCTTGA
ATTTTTTACAGAAAAGAAGCTATGTAAAATCTTACAAACAATGAAAGATGTTGGTTTACCTTATATGACC
TTAGGTCAACCACTTAGCACACTATCTGGAGGAGAACGTCAACGAATTAAGTTAGCTAAAAACCTCAACA
AAAAAGGTACTATATATATTTTAGATGAGCCAACTACAGGGCTTCATGGTTCTGATATTGAAAAGCTTAT
GTTGATTTTTGAGCATATAGTTGATAAAGGTAATACTGTAATTATAATTGAACATAATTTGGATGTATTG
AAACAAGCAGACTGGGTAATTGATATTGGTCCTGATGGTGGCAAAAACGGTGGTCAGGTCGTATTTGAAG
GTACACCACTAGAAATGTTTGAAAGAGGTTGCACTATAACATCAGATTTCCTTAGAAAATCAATAAATAT
ATAG
>ref|NC_013316.1|:480131-480847 hypothetical protein CDR20291_0398 [Clostridium difficile R20291]
ATGATACTAATAGTTATATTGAGTATATTCATCATAGCCTCAATCAACATAATTATATTAGGTAAAGAAA
ATATAAGAGATATAGTTATCCCTTTAACTCTATTTATTGTAAGTGATTTTTTATTTTTGTGTGGAAATAT
AATATGTAGGGGAGGAGTAATGCTACTATTTATAGGTTTATTTGCAATACCATTGATGCTAATTGCATTT
ATATGGATTTGTGTACATATGATTAAGCTTTACTATAAAAAAGATTTAAATAAAAGAAAAATGATTGGAT
GTATATTTAGTATCTTTATAAGTATAGGTACTATATTTATTCCTAGTCCAAGTGAAAGTTTTAGATTTAA
ACTTTATGAAAAAGATTATAGTGTAGTAGCTAAAGCTATTTTGAAAGTTTATGATGAAAAAAAGTTAAGC
TCTGAATCTGTCTTTTATATTCAATCTGATAAAAATGAATTGGAGAAGATATTTTCTAAAGAAGTAATAA
AAAAAATGAAAAAACTAAACAGAAATTTAGATGTAGTTAAAATTTCTGGGAATAGAAATTTAGTCTATTT
TTTCTTTGGAGCTGAATTACAATCTATTGATGGTATTGTGATTTTTAAAGATTTAAAACATGTTAAACCA
AAGTTAGATTTTATAAATAGAAGTATTCAAGCTCCTAGATTGGAGTATATTACAAATAATGTATATTATT
TTAAAGGTGAACTATAA
>ref|NC_013316.1|:480875-481813 putative beta-lactamase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGAAAAAATAATTTTATTTGGATAGTTATTCTTCTAGTTGTTGTAGCTATGGGAGTATATTATG
TAGGAAGAAAGCATAACAACACAAAACAAAAACATGATAAGAATCATATAAACTCTGAATTAAATAAATC
CAAAGTTGAAAACAATGATAAAAACAAAAAAGAAAAAATTAATATGGTTGACTATAGTGACTGTTTTGAA
GGTATTAGTGGAGGAGCTATTTTTTATAATACTAAAAATAAAGAATATAATATATATAACAAAGAATTAA
TTGAAACAAGAAGGTCACCATGTTCTACTTTTAAAATAGTTTCAACTTTAATTGGTTTAGAAAAAGGGGT
AATAAACTCAAAAGAATCAGTTATGGGATATGATGGTACAGAGTATCCAAATAAAAATTGGAATAAAAAT
CTTAGTTTAGAAGAGGCATTTAAGGAGTCTTGTGTTTGGTACTACAAAAAATTGATAGATAAAGTTGATG
CTAAATCTGTCCAAAACATTTTAGATGATTTAAAGTATGGGAATTGCGATATTAGCGAATGGGAAGGAGA
TTTAAAAAATGGAAAGGGACATTTAAATGGATTTTGGTTAGAATCTTCATTACAAATATCTCCAAAAGAA
CAAGTGCAAACAATGGCAAAAATATTTGAGGGAGATACAAACTTTAAAAAAGAGCATATTAATATTTTAA
GAGATATTATGAAAATAGATGTAAATGATAAAAACATAAATGTATATGGAAAAACTGGAACAGGATTTGA
TGAAAAAAATAAACGTGTGGATGCATGGTTTGTTGGTATGCTAGAGCGTGAAGGTGACACCTATTATTTT
GCTATTAAATCAGATGATTCCAATAAAGAAATTACAGGGCCAAAGGTAAAGGAAATTGCAATTAATATAA
TTAAGAAATATTATAGTGTAAGGGAATAA
>ref|NC_013316.1|:482157-482840 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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ATAATGTAAATTTATCAGTTCAAAAAGGTGATTTTGTATCCATTGTAGGAGCATCTGGTTCTGGCAAATC
TACATTGTTACATCTGCTTGGGGGAGTAGATAGACCTACATCTGGAAAGATTTATGTTGAAGATACAGAA
ATATCAAGTTTAAAGGAAGAAGCTCTTGCAGTTTTTAGACGTAGAAAAGTAGGTCTTATTTATCAATTTT
ATAATCTTATACCTACCCTTGATGTTAGAAAAAATATATTATTACCCATGTTACTTGATAAAAGAAAGGT
GGATGAGGATAGATTCTCTGAGATTGTATCTATATTGGGATTATCTGATAGATTAAACCATCTTCCAAGT
CAACTTTCAGGTGGACAACAACAAAGGGTATCTATAGCTAGAAGTTTAATCTATAGACCAGCTATTTTAT
TAGCAGATGAGCCAACTGGTAATCTTGATAGAAAAAATTCAGAAGAAATTGTAGACTTGTTAAACTTATC
AAATAAACGATTTAATCAGACAATACTTCTTATTACTCATGATGAGAAAATAGCACTAGAGGCAAATCGT
ATTGTAACTATGGAAGATGGAGTGATTGTCTCTGAAAAGGTGGTGAAGAAATGA
>ref|NC_013316.1|:482837-485497 ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATTCTTCAAGAATACACCTTAGACTTTGTACGACGCAATAAACGTAGTAGTATAGCTATAATGT
TAGCTATATTACTTACTACAACCATGATGTCTTCTTTGTGTGGACTGTTGTATACCATGTGGACAGATTT
TATAAGACTTTCAATTGAGAAAGAAGGTAACTGGCATGGTGAATTGTTTGACTATACTTATGGAAGTGAC
TTACCATTAATTGAAAATTTTTCTTCAGTTGATGATGTAATGGTAAAAGGACAATGGTATGTAGGCAAAA
TTAATGATGAGAAAAGAGATTATATAATTTATAGAAATGCTACATCAGAGTATTGGAATTCTATGCCAGA
AAAGGATACTATAATAGAGGGTCGTCGACCAAATAATGCTAATGAAATTGCATTATCAAAACAATATTTT
GAGAATAATCCAAGTGTAAAAATTGGGGATAAAATTACTCTTCCAATAGGAGATAGAATCCTAAATGGAA
AGCCTCTTGAACCCATAGCTCAAAAATCGAAAGGGGAAAGTTTTAAAAAAATTTCAGAGACTACATTGAC
AATAGTAGGAAAGGTAGATGTTTCCACTTCATCAGTAATACCTGCATATACAGCTCTTGGATATCTTGAT
AGAACAAGTATAAAACCTAATGATAGTATAACTGTGTACTTGCGATTTAAAAATATAAGAGACACATACA
AGGAACTTCCAAAACTTGCTAAATCATTGGGGTGGAAGACTAATGAATATGGAAAATACAATCTTAAATA
TAATAGTAATTATCTTTTAAAAATGTTAGTCTTTTCCCCAGAACAGAAAGCATCTATGAGCAGTATATCA
AAATTTTCAACTCCTATTATGTATCTTACAATAGCAATTTTTACAGTAGCTGTGTTTGTAATGGTGATTT
ACAACGCGTTTTCACTATCTGCAAATGCTAGACTTACTCAATTAGGGATATTATCTAGTGTTGGTGCATC
ACCAAAACAGATTAAAATGTCTGTAGTGTTTGAAGGTTTTTTGCTTACAATTATACCATTGCCAATAGGT
TTATTTTTAGGATGGTTATTGTGTAATAGGCTTATAGTTTATATTAATTCAGTTAATTATCATACTGATG
TTCCAGAAGTGGTATTTACTTATGGTATTCCTGCTTTTCTGCCAGCAGTTTTACTTACAATAGTAACAGT
CTGGATTTCTGCACTTATACCAGCACGAAAAGTATCAAAGATATCTCCTATAGAAGCAATACGACAAGGA
GATAGTGTTAAAATCAAAAAGTCGCATAAATATTCATTAGGAAAGATATTTGGAATAGAAGGAGAACTTG
CATCAAACGCACTACGTGCTCGTAAAAAATCTTATCGTACTGCAACAATATCTTTAACATTATCTTTTTT
ATTACTTACATGTTTTTTGCATATAATTGCAAATCAAGAAGGAGCAAAAGCTGTTTATGGAAGTGATAAT
TATAAGGACCAAAGAGATATAGCAGTTTATTTGGAAAATAGTGAACCTGTAGAGTCTGCTTTCATTGAAA
AATTAGATAATACAGAAGGTGTAAAAAGTTCACTATATTATCAAAAAATGTCTGCTTCCACTTGGCTGAC
TGAAAAAGATGCATCAAAAGAACTTGCGAAAAATGGAGGATTTAAAAGTATAGTTTCATCTAAAAAATAC
TCTCCTATAGAACGTGATGGCAAGTTTCGTATAATTTCAAATATAATTGGGCTTGATGATAAGAGTTTTA
CAGAATATTGTAGGCAAATTTCTGTAGACCCAAAGTTATTTTATGATACAAAAAATCCAACCTCAATTGT
ATATAATAAGGAGGAAGATATTAATCGTAGTACACGTAGAAATAAAGTATATATAGATTATTTAAATCTT
TCAATAGGAGATAACATTAAATTAAATGAAAAAGTATATGACGAAGATAAAGGGGATTATACTTACAACA
TGAAAGTGGGAGCTATTACAAGCACACTTCCTAAAACAGTAGATACTAGTTCAAAATATACATTAATGCA
AATAGTGCCAATGTCTATGGTGCAGGAAATATCTAAAAATTATGATGAAGTAAGTAGGTTACGTTCAAAT
AGGCTGATAGGAGTATTTAAAGTAAATAATCGTGAGGACATTCCTAGAGTAAGAGAAAAATTAGAGTCCA
TTTATAATAAAGACTATGGTTCAGGAGATTATAGTATTGAGGATGTTTTAGAAAGTGAAAAACAAAAGGC
TAGTGGAATAAAGACCATGAATTTAATAGTAGGCTTTATTACAGGTTTATTGGCTATGATTGGATTATCA
AATGTACTTGCTACAGTGTCAGGAAATACTAGAAGTAGACGACAAGAGTTTGCTATGTTGCGTTCTGTTG
GATTATCTCCAGAAGGCATAAAAAAGATGCTTGTTTTGGAAGGTTTGTTCTTAGGAATTACACCATTACT
ACTTAGTATTCCTGTGCAAATAGGAATAGTGTATGCTTTTCTACGTATAAATGAAATATATTTTATAGAG
TATTTACCATTTGCACCTATATCTACAATAATAGGTTTTACTATATTGATACTTTTTATTGTAATAGCAT
CATATATGACAGGATACAAGCAGTTGAAGAATGAAAATATAGTAGAATCTATAAAAAATGAAACAATATA
A
>ref|NC_013316.1|:c486859-485678 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
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TAAGTGTAATTCTAACAACTATAACTTCTTTTAATGAATACAATGTACTGTCTAAGGCTCTTGGTGCATC
ATATGAGTACAATCCTAAGTCTACAGAAAGTATACTAAAATCACTGAAAAATTCTAGTGATAAGGATTTT
AAAACAGGAAATGAAATTTTATCAAAACATGGATATTCTAAAAGTACATTTTGGAGTAAAAACTTTTTTT
ATTTTCTAGTGATATCGTTTGGTATAATTTCAACAATGGCTACAGTTGTATATATAATCAAACATAGAAC
AAATAAGCAAAAACTGAGTAGAATAAACAATCTTACTCAATACTTAGAAGAAGTGAATTTAGGAAAAGAG
TCTGTACTTTTACGATGTGAAGATGAATTTTCTCACCTTGAAGATGAGATATATAAAACAGTTGGGGAAC
TTCGTTGTTCAAAAGAATTTGCTTTAAAAGAAAGACAAACTCTTTCAGATAATCTTGCAGATATTGCTCA
TCAACTTAAGACTCCAATTACTTCTATGTCACTTATGGCACAATTACTTTCAGAAAATTGTCCAGATGAA
GAAATAGATTATATTAACAGACTTACAAATCAAATCTCAAGACTTGAGAGACTAGTTTCATCTTTACTTA
CATTATCAAAATTGGATGCAAGTACTTTAATATTTGAAAGCAAACTTATAGATGTACATTCTCTTCTTAC
TTATGCAATTGAGCCTATAGAAGGTTCTTTAAGAGAAAAACATCAGACATTTACTATCGAGGCTTCTCCT
TCGGTAGAATTTGAAATCGATATTAATTGGACTTTAGAAGCTCTTTTAAATATTCTTAAAAATTGTAGTG
AGCATATAGAAGATGGTGGATATATAGTTGCTTATTATAGTCAAAATCCTCTATATGTTGAGATTATCAT
AGAAGATAATGGTAAAGGGTTTGCTCAGGAAGAACTTCCATATATTTTTAATAGATTTTATCGTGGTAAA
AATGCTAGTAAGGACAGTATTGGTATAGGGCTTGCTCTATCAAAGTCTATTATAGAACGTCAAAATGGTA
CTCTACATGCAGAAAATTGCCATAATGGTGGTGCAAGATTCATAATTAAATTTTACACATAA
>ref|NC_013316.1|:c487521-486859 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTAAAATACTTCTTTTAGAAGATGATGATACAATTACATTTGGAATAAAAACTTCCCTTGAAAAGA
AAAATCACACTGTATGTTGTTATAATACGATTGCTGAAGCTAAAAAAAATTTTGATAAAACTATTGATTT
AATTCTGCTTGATTTAAATCTACCTGATGGTATTGGATACGAGTTTTGCCAATATGTTAAAAGTATAGAA
GATACTCCAGTGATATTTTTGACAGTCCGTGATGATGAAAAAGACATTATACGTGGATTAGATATGGGTG
CAGATGACTATGTGGTTAAACCATTTCTGCTCTCAGTACTTCAATCCAGAATTAATGCAGTTCTTAGAAG
AACTCATTCAAATACTAACAATACTATTACATGTGGAAATATAAGCTTGAATAAAGTTGAAGTCAAAGCA
TATTTAGATAATGTTGAAGTACTTTTGACAGCAGGAGAATATAAACTTCTTCTAAGTCTTATGGAAAATA
AAAATAGAGCTATGACCCGTACAAAGTTACTAGAAATGCTCTGGGATGTAGATGGTAATTTCGTAAATGA
TAACACTCTTACTGTTACAATAAAGCGTCTTAGAGAAAAATTAAAAAATCCACCTTGTATAAAAACATTA
AGAGGCATAGGATATAGAATGGAGGACAGCTAG
>ref|NC_013316.1|:c488199-487666 TetR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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ATTTATTCTTTGCTGTTGTCTTAAGAGGATATAAAAGACTTTGGGATAATGTTAAAATAGAAAGTGCAAA
AGGCAAAACAGGGTTTGAAAAAATAAAACTTTCATACTTTGCTTTTCATAAATTTTACTCTGTAGAACCT
TCTCTATTATGCCTTATGGGAATGATTGGTATTGTAAACTCTGAAAAATCGGATACTGATATGCTGTTTA
AAGAAAAGTTTTTTTCTTTTAATAAATTTATGTTTGATGAAATACAAGGAATGTTTGAAATTGGAAAAAA
TGATAGAAGTATTAGGCATGATATTGAAATACCTACTCTCATGTATTCATCAATATTTACACTTACAGGA
TTTTTTAATTTACTATCTGTAACAGGAAAGTCATACCTGAACAACTTTAATATAGATGAGGAAAAATTTA
TTGAAACAACTCTTGCTCTTTTAATAGATTCAATTAAAGCATAA
>ref|NC_013316.1|:c489445-488513 transposase-like protein b [Clostridium difficile R20291]
GTGGTAGTAGTGGAAAAAGCTTATAAGTTTAGAATGTATCCAAATAAAAAACAACAAGAGTTAATTAACA
AAACTTTTGGATGTTGTAGATTTGTATATAATAAGTATCTTGCTAAAAGAATAGAAGTTTATAAAAACGA
TAAAGAAACTTTTACTTATAAACAGTGTAGTTCTGATTTGACCAACTTAAAAAAAGAATTAAAGTGGCTT
AAAGAACCTGACAAATTTTCACTACAAAACGCCTTAAAAGATTTAGAAAACGCATATGAAAAATTCTTTA
AAGAAAAGGCAGGATTTCCTAAATTTAAATCAAAGAAAATTAATAGATTTTCATATAAAACTAACTTTAC
AAATGGGAACATTATGTATTGTGGTCAACATATAAAACTACCTAAACTTGGTATGGTTAAGATAAGGGAT
AAACAAGTACCTCAAGGTAGAATACTTAATGCTACTATATCTAAAGAACCAAGTGGTAGATATTATGTAT
CATTATGCTGTACTGATGTAGATATTGAAGTATTTGAAAATACTAACAATCAGACAGGTTTAGATTTAGG
AATCAAAGAATTTTGTATCTCAAGTTGTGGAGAATTTATAGAAAATCCTAAGTATCTTAAGAAGTCATTA
AACAAACTTGCTAAATTACAAAGAGAATTATCGAGAAAGACAATCGGTAGTTTAAATAGAAATAAAGCAA
GATTAAAAGTTGCAAGACTTCAAGAACATATAGCTAATCAAAGAAATGATTTTCTACAAAAATTATCTAC
TAAATTAATAAAAGAGAATGATATTATTTGCATAGAAGATTTACAAGTAAAGAATATGATTAAAAATCAT
AAACTATCTCGCTTAATTTCTGATGTATCATGGTCAGAATTTATTCGTCAATTAGAATACAAGGCTAATT
GGTATGGTAGACAAATTGTATAA
>ref|NC_013316.1|:490459-491064 putative hydrolase [Clostridium difficile R20291]
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AAGAAATTATTCTTATAGACACAGGTCTTCCTTTTATGGGGAAAAATATAATTAAAGAATTAAAAACACT
TGGCATTAAACTTACAGATATTAAGCATATTTTATTAACTCATCATGATGTTGATCATATATCTAATATT
AAATTATTGAAAGAGAAAACAGGAGCAAAGGTATGGGCTCATGTAGAGGATATACCTTTTATTATAGGAG
AGAAGGATAGACCTGGGTTTAAGAAGTTTATTGGAAAGGCAATTTCCAGAAGGCTCATTAAGGATGTTGA
ACCTTATGGAGAGAATATGAAGATTGGGAATATAAAAATTATCCATACTCCTGGTCATACTCCAGGGCAT
GTCTGCATGATTTTTGAAGATGTATTATTTGCAGGTGATTTAGTCAAAAATAAGAATGGAAATATAGTTC
CTTATCCTAATCCATGGAATTGGGATTATAAAAAGATGATGAAATCTATAAGAGAATTGGATAATTTAAA
ATATGAATGGATATGTATGTCTCATGGAACTCCTTGTATTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:491568-492317 RpiR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAGATTAGAATCGTTAGTTAACCAAAGTTATAATAGTTTAAATGAAAATGATAAAATTATTATTAAAC
AAATATTGATTTGTCAAAGAGAATACCGTAATTTTTCGTGTGAAAAAATTGCAAATGAATGTAATGTTTC
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AAAAATAATCAACTAGAATTTGTTAATAATGATAATAATTTTCATGATGTTTGCGAGAATTATCGACTAT
TAATGAATGAATTACAAAAAATATCATTTCAAGATATTTGTAAAATAATATATGATGCAGAAACAATTTA
TATTTATGGGACAGGTAATGAACAGAAAAGTTTAGCTCAAGAAATAAAGAGAATATTTCTTTCAGTAGGT
AAATGTGTTATTGACTTATTTGATATAGGTGAAATTGAATTTATGAGAGAATCATTTCAAAAAAGTGATT
TATTTATTATCATTTCTTTGTCTGGAGAAACAAAATCAGGAATTGAAATTGCAAAATTTATCAACAATCA
TATACATACGATTTCTTTAACTAGGCTTGATAATAATACAATTGCAACACTTTGTGAGTATAATCTGTAT
GTTGAAACTCAAAAACTTGATACATTACAAGCTATATCTTATGAAGTCGTAGGAGCATTTTATGCTCTAT
TAGATTTGCTTCATATGAATTACATAGAGTATAGAAGGAGAAAAGAATGA
>ref|NC_013316.1|:492314-493078 RpiR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATTGAAGGACTTTTCAATAAATATTATAATTCATTTACAGCAAATGATAAGTATATCTGTGAGT
GTATTCTTAATCATAAAGAAGATTGTATTAAACTTTCTATAGATGAATTTGCAGACAAATACCATATATC
TACAAGTGCACTTTCTCGTTTTGCTCAAAAACTACAATTACCTGGATATAGTGAATTAAGAGTTATTATA
CGCTTAAATGAAACAGAAGTAGAATATAAAAATCAAAGTAAACACCAATTAATGGATTGTTATAATAAGG
TGATAGATGATATAGAGAAGAAGGATTGTTCGATTATGTTTGAAAGAATGAAAAAGGCAAATCGTATAAT
CGTCTTTGGAGAAGGTTATTCTCAGGAAAGAGTTGTTAAAGAGATGAAAAGGATTTTCTTACCAACAGGG
AAAATTATATATGATGTTTATGGTTATGATATGATTCAGGCGCTTAATCATTTTATAAAAACAGATGATA
TGATTTTCTTTATCTCATTGAATGGAGATACATCTACAATTATTGATTTTGCTAAAGAAATGAGAATGAA
AGGAACTTATATGGTTTCTATTACAAAAATGATAAGTAATCCTTTAGCAAGATTATGTGATGAAAACCTG
TATATTCAATCTATATCTATTTCTGTAGATAAACAACTGGACTACGATGTAACAACACCTTATTTTATTT
TAATTGAACTGCTTTATATTAAATACAAGATGTATTTAGAAAGTGAACATATTCCCCGAAAGTGA
>ref|NC_013316.1|:493177-493998 putative hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTGTACAAATTATTAATACTTGATATAGATGGTACGCTTAGGGATGAGGTATATGGAATCCCAG
AATCTGCAAAGCACGCTATACGTTTATGTCAAAAGAATCATTGCAGTGTTGTTATTTGTACTGGAAGAAG
TATAGGTACAATACAAGATGATGTTTTATCATTAGGGGTTGATGGATATATTGCAGGAGGAGGTAATTAC
ATTCAATATCATGGTGAATTACTTTATAATCAATCTTTTAATCAAAGATTGATAAAGGAAGTTGTTTGTT
TGTTAAAAAAGAGAGAAGTTGCTTTTTCGATTGAGAGTCAGGAAAAAGTTTTCATGAATCAAAAAGCCAA
AGAAATATTTGAAACAATGAATCAGTTGAAAGGAACTAATTCTTGTATAAATAAACAACATATCCAAGAA
AAAATAACATATGAAAATAATATTGAAGAGTATAAGTCACAAGATGTACATAAAATTTGTTTATGGTCAA
ATGAAAAGGTATTTGACGAAGTGAAAGATATACTACAAGATAAAATGGAATTAGCACAGAGAGATATTTC
TAGTCAGTATTATGAAATTATTCAAAAAGATTTTCATAAGGGCAAAGCAATTAAGAGATTACAAGAAAGA
TTAGGGGTAACTCAAAAAGAAACCATATGTTTTGGTGATGGTCAAAATGATATTGTCATGTTTCAAGCAT
CAGACGTTACAATTGCAATGAAAAATAGTCATCAACAACTTAAAGATATAGCGACATCTATATGTGAGGA
CATATTCGATAATGGAATTTATAAAGAATTAAAAAGAAGAAATATCATATAA
>ref|NC_013316.1|:494012-495676 oligo-1,6-glucosidase [Clostridium difficile R20291]
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ATGATGGAATTGGAGATTTACAGGGAATTATTTCTCGTTTAGATTATTTAAAAGATTTAGGTATTACATC
ATTGTGGTTATGTCCAATTTTTAAATCACCTATGGACGATAATGGGTATGATATTAGTGATTATTTAGAT
ATTGCAAGTGAATTTGGAAGTATGGAAGATTTAAAAGAGTTAATTAAAGAAAGTAAAGATAGAGGAATCA
AAATTATATTAGATTTAGTTCTTAATCATACAAGTGATGAACATCCTTGGTTTCAAGAAGCATTAAAAAA
TCCAGAAAGTCCTTATCATGATTATTATATTTTTAAAAAAGGAAACGATTTACCAAATAACTGGAGGTCT
GTTTTTGGTGGAAGTGTTTGGGAAAAGGTAGAGAATAGAGACGAATATTATTTTCATTCTTTTGGTAAAA
AACAACCTGACCTTAATTGGGAAAATCCAATATTAAGAAGTGAACTTTACCAAATGATTAATACCTGGTC
TCAAATGGGAGTGGCAGGATTTAGAGTTGATGCTATTACATTTATCAAAAAGAATTTAAGTTTTCAAAGT
TTAGAAAGTGATGGTGTTGATGGTCTTGTTAAATGTACAAAAACAGTTAGAAATCAGCCTGGAATAGAAA
AAATGCTTTATGAATTAAAAGAAAATACGTTTAAAAAATATGATTGTATGACTGTTGCTGAAGCAGCAGG
TATTAGCTATGACCAACTAGGTGATTTTATTGGAGAAGATGGTTTCTTTTCAATGGTCTTTGACTTTAAA
CATGCTGACTTAGATGTTGCTTCTGGTAGTGAGTGGTTTAAAAGAATTTCATGGACAATTCCAGATTTAA
GAAAATGCATTTTAGATAGCCAAATGTATGTTCAGGAACATGGATGGGCAGCTAATTTTATTGAAAATCA
TGACCAACCAAGAGCTACAACAAAGTATCTTTTGCAATACGAAAGGAATGATGATGCAGTAAAAATGTTG
GGAGCAATGTATTTCTTTTTAAGAGGAACACCATTTATTTATCAGGGACAGGAATTAGGAATGACAAATT
TTAAAAGAGATACCATAAATGATTTTAATGATTTATCTAGCATTGACCAATACTATCGTTCAATAGATGA
AGGTTACTCAGAAGAAGAAGCGTTAGAATTTGTGAATTTAAGAAGCCGAGATAATGCAAGAACGCCATTT
CCATGGGCAGATAAAGAAAATGCAGGTTTTTCAGATGCAACACCATGGTTAAAGGTTATTGAAAATTATA
AAGATATTAATGCACAGAGTCAGATTAACAATTCAGAAAGTATTTTAGAATTTTATAAAAAGATGATAAA
GTTGAGACAAGATAGTAAGTATTCTGATTGTTTGATTTATGGTTCAATAGAACCTATTGATATAGAAAGT
GACAATGTTATTGCGTATAGAAGGCAATTAGATTTGGTAGTTATTGATTGTTATTATAATTTTTCTGATA
AACTTGTAGAAATAAAAACAGAAGAAAAATATGATATTGTATTCCAAAATTTAGATGATATAAATCTACT
AAATAAAACAGTGAGTTTGAAACCATTTCAAGCAGTATTATTGAAAGTGAGGTAG
>ref|NC_013316.1|:495681-497555 PTS system, IIabc component [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAATATAATAAAATAGCAAATGAGCTTATTGAAATTATTGGTGAAAATAATATTATTTCTATTA
CACATTGTGCCACAAGATTAAGGGTGATGGTTAAAGATAGAGAAATTATTAATGATAAGAAAGTGGAAAA
GGTTAATGAGGTTAAAGGTGTTTTCTTTACTTCTGGACAGTATCAAATTATTCTAGGAACGGGAATAGTC
AATAAAGTTTATGCAGAAGTTGAAAAAATGGGATTGAAAACTTTATCAAAAAAAGAACAAGATGAATTAG
TTAAAAATAATGAAACTGGATTTAAGAAAGTTATGAGAACTCTAGCAGATATATTTGTTCCTATTATTCC
AGTTATTGCGGCAACAGGATTATTCTTGGGATTAAAGGGTTGTTTGTTTAATGATAATGTACTTGGATTA
TTTGGAATGTCTTCTGCAAATATTCCATTGTATATTCAGACACTTGTTTCGGTTCTTACAGAAACAGCAT
TTGCTTTTTTACCAGCAATTATTGTATGGTCAGCATTTAAGGTATTTGGAGGAACACCTGTTATTGGACT
TGTTATTGGACTTATGTTAGTTTCTCCAATACTTCCTAATGCATATTCTGTTGCTGACCCATCAAATGAA
GTTGAAGCAATTATGGCATTTGGATTTATTCCTATTGTAGGCTGTCAAGGAAGTGTTTTAACAGCTATTG
TTACAGCATTTATTGGAGCTAATCTTGAAAAATGGTTCCGTAAACATATGCCTAATGTATTAGACCTTAT
TTTCACACCATTCTTTGTTATGCTAATAACAATGTTAGTTATTTTGTTAGGTGTAGGGCCTATAATGCAT
ACAATAGAATTAAAAATGGTTGATATCATCAGTTTATTGATTGGTTTACCTTTAGGAATTGGAGGATTTA
TTATTGGATTTACATATCCATTAGCTGTTATTACTGGCTTACATCATACTTATGTAATGATTGAAACATC
ACTATTAGCAAATACAGGATTTAATGCACTTATTACTCTTTGTGCAATGTATGGATTTGCGAATATTGGA
ACATGTCTAGCATTTATGAAAAAATCTAAAAATAATCAAGTTAAACAAACTGCAGTTGGAGCAATGCTAT
CTCAACTTTTTGGTATAAGTGAGCCTGTTTTATTTGGGATTCAGCTTCGATATAATTTAAAGCCTTTGAT
TATTATGTGTGCATCTTCAGGTTTAGGAGCAGCAATATTATCAATTTTACATATTCAATCTAATTCATAT
GGATTAGCAGTTTTACCTTCTTATTTAATGTATATCTATGATGGATATAATTTAATCACATACTTATTAG
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TGAAGATGAAGACGAAGAATTAGTGTTTAATGAAAATAATGAAAACTTTGTGTCTCCAGCTAAGGGGAAA
ATTGTTGCATTAGAAAATGTACCAGATGAAACATTTTCTAAAAAAATGTTAGGTGATGGTTTTGCTATTG
ATATTATAGATGGAAAAATTGTTTCTCCTATTTCAGGTAAATTAGAAACAGTATTTTCAAGTGGACATGC
ATTTGGGATTAAAGGAACTAATGGAGAAGTATTAATTCATGTTGGAATTGATACAGTTGCATTAAATGGA
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TAAAGAGAATACATGAATTAGGAAAGTCTACTTTGACAATGGTATTGTTTCCAGATGGTAAGAAGGTAAA
TATTTTGGATATAAACAAGGATGTAAAAATAGGTCAAAGAATATGTGTTGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c499709-497910 putative beta-lactamase-inducing penicillin-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTATGCCCCATTCTTTATACGATTTTTACTCAGTACATTAACCTTATCAATATTAATTGTTATAATTT
TACTTGCCAAAAAAGTATTTAAAAAACATATTTCTGCAAAGTACCAATACAATATTGGATTTATATTGCT
TATAATGTTAATAATTCCATTTGTCCCTCTTAAATATATTAATCTTGGAAATGTATTTAACTATTTATAT
ACTTTTAATCAACTTGGAAGCAGTACTAATAGGACTTCTATTATAAAAAATAGTCCAAATTCTATAATTA
ATAACTCAAATGCATTAAACGATTTTTCAGTATCCCTAAACCAAGTTAATTTTGATAGTTTAAATATTTT
ATTACTAATATCATGGATAATTGGAATTTTAATCATGATAGCTATTACTATTCATTGCAATATTAAAATA
AAAAATATGAAAAAATCAATACAAATTTTAAGAGATGAGGAGATAGTATTTATATTTGAAAAGTGTAAAA
AAGATATTGGTATAAATAAGGATTTTATACTATGCAAATCACCTATTATAAATACACCTATTACATTTGG
ATACTTTAAACCACACATTATATTACCAGATAAGTCTATATCTAAATTATCTTTAAAAGATATAAAATAT
ATCTTACTTCATGAATTACAACACTTTAAAAATAAAGATATACTGATAAATTATATAATGTGCTTCCTTC
AAATATTATATTGGTTTAATCCTCTTGTATGGTATGCATTTAAAGAAATGCGTATAGACCGTGAAATTGC
ATGTGATATTTCAGTTTTAAAAAAGCTTGATAAAGATAGTCATATAGAATATGGACAAACTCTAATAAAC
TTTGTGGATAATATTTCAAGACCATCAAATCTTACACTTACATCAGATATTGGTGGGTCAAAAAAACAAA
TAAAAAAGCGACTATTGAAGATAATGGATTTTCATAATGAATCAAATACGTTAAAATTCAAAAGCATTTT
AATTTTTACATTGATAGCTTTAATTGTATTTGGAAATATTCCCAAACTATCTATTATGGCAGATATCAAC
GAAAAATATAGACCTACAAATGAACAAACTGTGTACGAGGACTTAAGTCAGTATTTTAAAGGTTTTGATG
GAAGTTTTGTTATGTATGATTTAAAATCCAAGCAATATCATATTTACAATAAAGAAAAAAGTAAAACAAG
AATTTCTCCAAATTCTACTTATAAGATTTATAGTGCCTTATTGGGATTGGAAAATGGGATAATAACAAGA
AATAATTCACATATCCCTTGGGATGGAAAGCATCATTCTAATAGTTCTTGGAATGAAGACCAAGACTTAT
TTTCTGCTATGGAAAACTCCGTAAACTGGTACTTTCAGACTCTAGACAAAAAAACAGGGCTAAAAAACAT
ACAAACTTATCTTAAGCAAATTGGATATGGCAATTATGATGTTTCAGGTGGTATCTCAAACTTTTGGCTA
GAATCTTCATTAAAAATATCACCTATTGAACAGGTAGAATTACTTGAAAGTTTTTATACAAATAAGTTTA
AATTTGAAGATAAAAATATAGAAACAGTAAAAGATTCATTGTTAATATCAAAAAAGGATGGGGTATCACT
TTTTGGTAAAACAGGCACTGCTAATATAAATGGAAAAGATGTAAATGGTTGGTTTATAGGTTATGTGGAA
AAAAATGAAAATACTTATTTCTTTGCTACAAATATTCAAAGCAAAGATTATTCTAATGGTAGTTCAGCAT
CTAAGATAACATTATCCATATTAAATGACAAAAAAATCTATAATCCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c500098-499712 penicillinase repressor [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGTTACCACATATTTCAGAAGCAGAATATCAAGTTATGAAAATTATTTGGAAATATGCTCCTA
TCAGCACTACTGAAGTAATTGAAAAGTTGGTAGAAACAAGTACATGGAGTCCTAAAACAATTCAAACAAT
GTTATTGAGATTAGTTAAAAAAGGAGCTTTAACATATGAAAAAAATAGCAGAGTATTCGTTTATACTCCA
CTTGTTAAAGAAGAAGAATACGTAGCTACAGAAAGTAGTTCTTTTTTAAATCGTTTTTATAATGGTACTC
TTAATTCTATGGTACTAAACTTTTTAGAAAATGATAAACTATCTGAAGATGATATTGAGGAACTGAGAGA
AATCTTAAATAAAAGGACGACTAAGGGGGATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:500331-501008 putative iron-sulfur flavoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGATAATTACAGTTATAAATGGAAGCCCTAGAAAAAATGGAGCTACATCAAAAGTTTTAACTTACTTGT
ATAAAGATATAGAAAGATTAATACCAGATGTAAAAATTAATTATTTTGATTTAAGTGAGGTAAATCCATC
ATATTGTATTGGTTGTTTAAATTGTTATAAAATGGGCAAGTGTATCAATCAAAATGATAAAGTAGAGTAT
ATTCATGATATAATTACTAAGAGTGATGGTGTTATATTTGGTAGCCCAACTTATGGAAGTAGTGTAACTG
GACTTTTCAAGGTGTTTACAGATAGAGCACATATGATGCTTGAAAGATTATTGTATCGTAAGCCATGTAT
AGCAGTTACTACATATGAAAATGCACGTGGTTCAAAAGCAATTTCTTTTATAAAATCCATGGTCTTAGAT
TCGGGAGGTTATGTTTGTGGTAGTTTATCTATAAAAACTGGATTTAATCAAAATCCTATAACTGAAAAAG
TAGAATCAAAGATACAAAAGGTATCTAAAAAATTTATTTATTGCATAGAGGAAAAGAAAAATCCACCTGT
GCTTTCTCAAATCTATAATTTTATTGCTATAAATGCTGTTTTAAAGCCAATGGCTTTTAAAGATATTGAG
CAATATAAGGGAATAATTGATAGATGGGAGGAGCAGGGGATTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:501020-501445 MarR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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ATTTAAAAAAGATGTTTAAACAAAATGGATATGATATAACAACTGACCATTATGCGTTATTAAGGTTTCT
ATGGGAGCAAGATGGAATTTCTCAGATAGATTTATGTGAAAAATCATGTAAGGATAAATCTAATACAACA
AGAATTTTAGACGTTATGAAAAATAAGGGATTAATTGTCCGTAAAGTAGATGTTAAAGATAGACGTAAGT
TTCAAATATTCCTAACAGATTTAGGTAGAGAATTAGAAGAACCATTAAATGAAATTGCAAGTATATATGC
AACAGAGACATTTAAATCTATCTCTGATGAAGAATTGCCTTTGTTTACTGATATTTTGGATAGAATTGGA
AAGTAA
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CGTTAAATGGAAGTAAAGAAGTTATACCTTTAGCTATACATAGAAAAGAAAATAATATAGACATAAATGA
AGATATATTGGTAATTGTTTTTCCTGTTTATTTTGCTGATGTTCCTGATATAATAAAGTCTTTTGTAGAG
AAATTAAATTTTAATATTAATACTCATATATATGCCATTGCCACTTGTAATGGGGTAGCTGGACATAGTT
TATTTACTATAGATAAGTTACTTAAAAAAAGGGGGAAAAAATTATCTGCTGGTTTTTTAATCAATATGCC
TGGAAATGCTTTGATAACACCTTCAGATGTTGAAGAAGAAAGATTGAAAAATCAGACTAATAGGGTAGCT
GAGATTGCAAAATGTATCAATAACTTGGAGATTGGAAATATAGAAGGAAAAAACAATTTAAAGTCACATA
TAGATAGTGTTGTACTTCGTTTAGTAGGTAAGAATATGCAAATTGCAACTACTAAATTTTTTGCAGAAAA
TAAATGTAATGGATGTGGGACATGTAAAAGGGTTTGTCCTGTAGAGAATATAAGTATAGTTGATAAAAAG
CCAAAGTGGGGTAATGAGTGTGAAAGATGCCTAGCTTGTTTTCACTGGTGTCCAAAAGAGGCTATTAATG
TAAAAAAATCTTTTTTAACGAATAGGAAGAAGTATCACCATCCAGATATTACTGTAAAAGATATATTTTT
AGATAAATAG
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TAGCTTTTTATAGTAATTTAAAGCTTAAAACTAAGGAGACTCGTTATATGAAAATAAATATAAAATCAAA
GTTAAGTGAATTTATTAAACAGAACAATCTTTTTGATGACAACAGAATAATATCCTACCTTCCTAATATA
ACAATAGAAACAGACAAAATAAAAACTATAATGATTAATGAGGTTGTCCCAACTAACACCAATGACGATT
TTTATAGTGTAGATAAAGATGCTGATTATTTAAAAACTACTATTCCTTTATTTGACAGTGCAGGAATAGA
AGTATCTAACATAAATGATATCCTAGATATGGGTATCTATATAACTAATGCAGTAAAACTTCCTAAATCA
GAATATACAATAACTCGTGATACAATTAAATTACATATGCCTATTTTAGAAGAAGAAATTAAATTATTTA
AAAACCTAGAGGTAGTAATGTTAATGGGAGATGTTGCAAAAAAATCTTTTAATATGATTACTAAAAAGCA
TATAAAAAAGAATGTCATCCCTTCCATTTCAACATATAAACTTCGTAATAATGAACTTTATTATGATAAT
TTAAGAGTATTTCCATCATATATTATGACTGGTGGAAACATACTGATTGAAAAATCAAAATTTGAAATGG
CATCAGAAGATATAAAAAAAATGTTCGAGATTATAAACGGTTGA
>ref|NC_013316.1|:c503568-503311 hypothetical protein CDR20291_0418 [Clostridium difficile R20291]
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TATCAGTAAATAAAATTAAATATAAGTATAAAGTGAAAAATAATGCTTACTCTAAAAAACCTTTTTCTAA
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GACGATTATGAACAGGCAGAGTCTCTAATAAATTCTAAGTTGCGATAG
>ref|NC_013316.1|:503894-504406 hypothetical protein CDR20291_0419 [Clostridium difficile R20291]
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GGAAATCTTTATATGAAAAATATAAAAGTATTTTAAAAGTAAATTCTAAGTCTGTTTTAGAAATAATAGA
GTTTTTAAAGCGAAAATATGTAATAGTAGAAGAAACTTCAGAGGAATTTAAACATGTAGTTATCAATAAT
ATTAAGTTAAACAAGCCTTTTTCACAAAAGATTTCCAGTGATAAAGAATTAAAACCTATTGTATTTACAA
TTCCAAATGAAGGAAATGCAAAAAAATTGTACGATACTCAAGAGGAAACTTATAGTGGCTGTAAGATTAT
TGTAGGTATGGAATTTGAAACAGGTTGTGTTTTTGTAGAAGGTAGTGATGAGCTTAATGATGAAATAACT
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AGAAATATAAATTAATAGATTAG
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TGAAAGATTTAATTCTTGAAACAAAAAACTTATCAAAAAGATATGGAGAACAAATGGCAGTTAACAATGT
TTCTCTACAAATTGAACGAAATAGTATATATGGACTTTTAGGACCAAATGGAGCAGGAAAGTCCACAACA
CTTAAAATGCTTGTTGGTCTTCTTCGCCCAACAGATGGTCGTATTATTTTTGATAGAAAGCCTTGGAAAC
GAGAATCTCTTGCAAAAATAGGTTCTTTAATAGAATCCCCTGCATTGTATGGAAACCTTACAGCAGAGGA
AAATTTGTTAGTACATACAAAAATATTGGGAATACCTAAAGATAAAATTTATGAAGTGTTGGAAATAGTA
AATTTGAAAAATACAGGTAAAAAGAGAGCTTCACAATTTTCTATGGGTATGAAACAAAGGTTAGGAATAG
CTATTGCACTTTTGAGTGACCCAGAGTTGTTAATACTAGATGAACCAACCAATGGTCTTGACCCCTTTGG
CATTCAAGAATTGCGTGAATTGATTGCTTCTTTTCCAAAAAAAGGTATAACTGTAATTCTTTCTAGCCAT
ATTCTATCAGAGGTTGCTCAAGTTGTAGATAATATAGGAATTATAAATGGAGGACGACTACTATTTCAAG
GAATGCCTGACCCTAATGAAAATCTAGAAGAATTTTTTACAGATGTTATTCTTAAAGGAGGACAAAACAG
ATGA
>ref|NC_013316.1|:505362-506132 putative lantibiotic ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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CAGTGTCTTTTGCAGCATATGCATTTATAATGCAATCAACACTCATGCAAAATCCATTATCTCAAACAAC
TTCTTGGGCGTGGCAAAGTCTTTTAGCATTAATTTTTAACTGGTGGTCATTTTTATTTCTGCCTATTGGA
TTTGCATTGTTTGCTACTTTGGTAGCTTTCCAGGAAAAAAAAGCTGGAAATTATCGTGCTTTACGTACAC
ACAATGTGTCTCCTATGACACTTTGGATTAATAAAGTTATAGCTATGGCAGTCTACAGTTTTATTTCAAC
GTTAGTTTTAATAGTCGTAACAATTATAACTGGTTTAATATTGAAAGCTGGTCCAGTTCCTTTTGGACAG
ATTATAGGGGCAAGTATTGTATGCTGGGTTGTTTCTCTTGCTATACTTCCACTTCAGCTATGGCTAGCTA
CATGGAAAGGTATGTTCCTAAGTATGGGAGTTGGAGCTTTAGGTATGATATTTGGTGTCCTTGCTGCGAC
AAAACCATTTTGGATTGCAGTACCTTGGAGTTGGGCAGTTAGAATGGTATGCCCAATCATCAACATACAT
CCTAACGGTACTATATTAGAAGCTGGAGACCCACTTTTGAATACTTCAGTGATTCCTATTGGGATTGTTG
TTTCTTTGGTTGTGTTTATAGTATTAACAGCGCTTACTGCAGCTTGGTTCAATAGGAGGGATGACAAATG
A
>ref|NC_013316.1|:506129-506905 putative lantibiotic ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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TGCCTATTATTTTTTCATTATGTGTGGTTTTTTATCTCACAACTAAATCTGGAAGTACACAAGAATTTGC
TTTTGAAGGATTTTTTACAGTATGGACTGTATTCATCATTCCTATTGGAGTAGGTATTTTAGCAGGATTT
ATAGTGCAGGAGGAAGAGCTTGCTGGAAATTTTAATGGTTTTTTATGTGTAGGTATTTCTCGTGTTAGAT
TATATCTGGGAAAATTTCTTTTTCTTCTGTTTTGCCTAACTATATGCACATTTATTGCTACGTTGATACT
TTGCATAGGAATGAGTATTGCAGTGCCATCTGGAGCAACAATATGGTTATTCCTGTCAGCAGCAGGACTT
GTGGTGATTGGGACACTTCCACTATTAGCTATTCATCTTTGGGTGAGTTTTGCATGGGGTATGGGTGCAT
CTATTGGTATTAGTATCGGTGGAATTTTGATGGCAGCAATACTTGGATTAACTAGCGTTGGTGAAAAAGT
ATGGGCATTTGTTCCATGGACATGGCCAGTAAAACTAGGTATGCTTCCAGGAATTTATTTTATTAAAGAA
GCTGGAACTATTTCAACTGAGGCATTTTACTCTAAAGTGATGCAAACAGCTAGTATAGAGCTTATAGTAG
TAGCAATAGGTTTGATTATATTCTTGATAGGAGGCGTTATTTGGTTTAAAATGTGGGAGGGAAGGAAAAG
TTATTAG
>ref|NC_013316.1|:506990-507652 putative lantibiotic resistance two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
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GTCAGGCAGGTATAGAGTTATCAAAACAGGAGCCTGACCTTATTATACTGGATATTATGATGCCTAAAAT
GAATGGATTTGAGGTATGTCAGGCAATTAGAGATGATGTTTTATGCCCAATTATATTTTTAAGTGCAAAG
CAATCAGAAACCGACAAAATCAAAGGGTTGACCTTTGGAGGGGATGATTATGTAACAAAGCCATTTGGAC
TGCGTGAACTTATGGCAAGGATTGAAGCTAATCTGCGTAGGGAAAAGCGTTCACAGTATATCAATGAAGA
GAACAAGAGATCTACTTTGTATTTTGGGAAGTTATGCTTATATATGAAGGAACGTGCAATTAAAATTGAT
GGTAAGAATATTGATTTAACAAAAATAGAGTATGATATTGTTGAATTACTAGCACTCCATGCAGGACAAG
TTTTCTCAAGAGAACAAATCTATGAAAAAGTATGGGGGTGTGATTCTGAAGGTGATTCCTCAACTGTTGT
TGAACGAGTAAAAAAAATACGAGCTAAGTTTTCTGCTGTGACACCAGAAAAAGAATATATTTCCACAGTT
TGGGGTATTGGGTATAAGTGGAATAAAATGTAA
>ref|NC_013316.1|:507671-509095 putative lantibiotic resistance two-component sensor kinase [Clostridium difficile R20291]
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CCACAGTGATTACTTATGTATTTGCTCTCTATTTGTATATTCATTCCTTAAATAAGGATATCTATCCACC
AAACTATTATGAGCGACAAGTTCCTAGAATTGAAAAATACATCAATGAAAAAAACATAACTTTGTTATCA
CAATCGAATGAAGAAGGTTTAAAAAGAACGATTCGTGGGGATGATATGCCATATCAAGTTGTGGATAATA
ATGGCAATATTCTATATGGTACTAACCCCAAAAAACTATTTAAAACAAAAGAAGAATTATTTAATAATTT
TATCAATAAAACTGTTCGTAAAGGTGGTTATATCCATACTGTTCCAATCAAAGGGGATAATGGAAAGATT
GAGGGAGCTGTTATTCTATTCTATCAAGTCAAAATAACCTTTGCAAATAGTAGAGGGAGATTTGTATTTG
CAGTTATTATAATGGCTCTGTTTTCTCCATTTATATATATCGTGGGTTTTACTAGATGGCTTTCTAAGCG
CTTTGTAAAGAATATCAATCAACCATTACATCTATTGATTGATGCGTCCAAGAAGATAAAAGAAAAGGAC
CTTGATTTTGAAATCGACTATTATTCAGATAATGAACTCGGTAAACTTTGTAGTGCCTTTTCTGAAATGA
AAGACGAATTAAAAGGTTCTTTATCTGCGCAGTGGAAGATGGAGCAGGAACGTGTTGAAATGGTGGAAGC
TCTAGCACATGATTTAAAATCTCCTCTTTCTATTATTTTGGGATATACAGATGCACTTATTGGTAATAAT
ACAGATGACAATGAAAAACTTCATAGGTATCTTACAGTGATAAGAGAAAATACAGAAAAAAGTGCTGCTC
TTGTCCAAAAGATGCAATATACGTCTGACTTAGAAAAGTCAAATATACAATTAAATCTTGTTCCTATAAA
TTTACCTGAATTTTTGAGGCAAAAGGTGCAAGACTATGAATTACAGGCTCATCAAAAGGAAGTTGAACTT
ATATTGAAAATGAAGGGGAATATACAATCCCCAATTCAAATCGACGTGGATAGGTTGACACGAATTTTTG
ATAATATCATATCCAACAGTCTGCAATACACTCCATCAGGTGGTAATATTAGTATTACTGTAAAGGATGA
AAAAAATTGTATTTCTTATGAGATTTGTGATTCTGGTAGAGGGTTTAGCTCTAAAGATTTAAAAAAGGCT
CTTGATAAGTTTTATCGAGGAGATGAAGCTAGGCAGACAAAAGGTGGACATTCTGGTCTTGGGCTTTACA
TTGTCAAACAATTAGTGGAACAGCTTGGAGGTTCTGTTAAAATAGAAAATTCAAAATCAGGTGGAGCATG
TGTGAAATTTTGGCATAGCATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c511803-509335 ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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TAGCAATAGTACTATCAACTATTATGACAACTGTGGTTGGACAGTCAATTGGTATCCTACAAAATTTAAG
AATTGAACAAGCCCGTTCTTTTAATGGTGATAGACATGTATCCTTTCACCAACTTACTAAAAATCAAGTT
GATGACATAAAGAAAGATGATAGAGTTTATCAAGCTGGTACTTCAATAACTATTGGCAGTAGTAAAATAA
AGGATTCTGGTATCTCTGTACTTGTAAAAGAGTATGATAAAACAGGACTTTCTAACTACCCAAAATTAAT
GAAATTAAAATCTGGACATTTGCCTAAAGATAAAAACGAAATAGCCTTAGATGAAAACACTCTAAAGCTT
ATGGGTATAAAACCAAGACTAGGAGTGACTATACCTATGAATTTAGATATTTCACTTTTAAATGATACCA
TACCACCATATAATTACACAGCTAACTTTAAATTGAGTGGCATTTTAGAGGATGATTATACAGGATATGT
AAGTGGTATAGTAAATGGTATTGTAGGTAAAGGTACATCAGAAAATCTATTACCTAAGAGATATATTTTA
TCCTCTTTGGATTTTAAAATAAAACAGCAAGAAAAGTTTCAAGAAATAGTAAATCAATTAGCTAAAAAAA
TAAATCTTTCTCACAATTCAATTCAATATAATTGGATTTACTTAAATGCTCTTAAGATACAGTTTGAAAA
AGATGAAAATAGTTCTAATAGTGATGGTATATCTATGATTATATTGGTATCTTTATTTGTTGCCTTATTG
GTTTTACTGGCTTCTGGACTTGTAATCTATAATATTTTAAAAATCTCTGTTACAAAGAAAATTAAAGAGT
ATGGATGTTTAAGAGCAATAGGAGCTGAACCAAACCAGATATATAAGATAGTTATTTTACAAATCTTAAT
TTTATGTACTGTTGCCATACCTATTGGAGCTGTAATTGGAATTATCTCTTCTAAAGGCATAACTGGAATG
GTCACTAATATCTTAAATCCAGATATACTTCTAGCAAATGATAATAAAGAAATTACTGAGCTTATACATA
AAAATACAACAGCATATATGTTCCCATTAGTATTAAGCACTAATGTATCTTTGATTTTTTCATTTATTTC
AGCATTACCATCAGCAATATATGCTTCACGTGTCTCTCCCAAAATTGCTATGGCTGGTAGTACTACCAAA
ATCAAAAGAAAAATTAAAAGAGAAAAAGCAATAAAAAACTTTGAAAGACATCTAGCATGGCTAAACTTAA
AAAGAAATAAAGGAAGAACTATAATAACTATACTATCATTATTTATGAGTATAACAGTATTCGTTGCATT
GAGTGAGTTCTCTAATGTATTAGATGTATCTAGGTCAGTAAGCAATTTAAAAGAAGGAGATTTTTCCTTA
ACAAATGAAATATCTGGTTTTGATAAATCAACACTAGATAAAATAGATAAAATGAAAAACGTCAATCGCA
CTTCCTTTATAAAGTACTCTGAATACAAACAGGGTGAAATAGATACAGATATAAATTTTGAAAATAGTGG
TGAGATGTTAAAAATCATTGGAATTGACGAGCAGACTTTAAAAGACTTAATGCCTTCTATTACAGATTCT
ATACTAGAAGACTTTAAAAATGGTTCTATCTGTTTTATAAAAAATCCGATTGCTATTTCTACACCAGGTG
TAAAAACTAGACATACAAATTTAAAACCTAAAGATAGTATCACAATCAACAAAAAACAACTAGATATATA
TAGTACAGTAGATAAAATGTTCTTTTTACAAGGTAATGGCTGGATAAATGGTGTTGATGTTATTGTATAT
AATTCTGTTTATAACACCTTGACAAATAAAAACAAGTTCAACCAGATAAATATTTATGCTAAAGATAAAT
CAAAATTAGAACAAATAAGATTGTCTATTGAACAGATTTGTGAAAATAATCCTGGCTCTCATTGGATATC
ATATATTGAATCAGATAAGCAACTTAAAGAGAGTTTTAAACAAATAGAATTTCTAGCATGGGCAGTTATA
TTATTTGTGGGATTGATTGGTACTTTAAACATCATTAACACAACTCATACAAATATAAATACTAGGACTA
ATGAGATTGGAGTTAAAAGAGCTATTGGTATGAGTAATATTAGCTTATATAAAATGTTTTTATGGGAAGG
TGTTTATTATGGAATTTTTGCTGCTATATTTGGTTCAATTGCTGGGTATGCCAGTGCTATTATTATAAAC
ATGGCAACTATAGAAAAGCTTGATTTCACTAATATACCAATTACTTCAATTTTACAAGCTACTATTATTT
CTGTACTTGCATGTATTATAGCTACTCTTATTCCGTTAAGAAAAGTTAAAAAGATGAATATAATTGACTG
TATAGATATCAATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c512474-511806 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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ATGTAAATTTAAAAATAAACTCAGGTGAATTTGTTTCTGTAATTGGACCTTCTGGAAGTGGAAAAAGCAC
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TATAAACACACTGAAAAAGAACTATCTGCACTTAGAAGAAAATCCTTTGGATTCGTCTTTCAACAATTTA
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TAAAGACTATTTAAATGAAATTTCATCATTACTTGGAATTGCAGATAGACTCAATCATCTTCCCCATGAA
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ATTTCAATTATTGATGGTGTTCTTATGGAGGTGAAATAG
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CATCGCTTCATACTTTGATGAATAAAATCACTGGAATTTCTATCTTTGCTTTTCCATTACTCTATATTTG
CTTTGGTCTTGATGTTGCAGGAATTATGATATGTATCGTGGCTTTTCTTTCTTCTTTTGAAGAAATAGCA
ATTATGATAAAATCAAAAGAATTAAATCGTGATATAAAAAGTATATTTATGTGA
>ref|NC_013316.1|:c514646-513504 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
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TCGCATACATTTTACTTAATAATCTATATAATTCTATACAAGATAAGTATTTAAAAACACCTATAAATAC
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ATCAACATACTTCAGCTTGTACTTCCACTTATATTTTTTATAGGACTTTTATTATTAGCTGATATAATTT
TTTACAAGGTAAAATTAAAAACACCCATAGAAATCCTCAATAAAGGTGCAATGGAAATATCCAACAACAA
TTTAGATTTTTGCTTAGAATATAATAATAATGATGAATTAGGTAATCTATGTAATGCTTTTGAAAAAATG
AGGTCTGAACTAAATAAAAACAACATAAATATGTGGACTATGATTAATGATAGAAAACAACTTAATGCTG
CTTTTTCTCATGATTTAAGAAATCCCCTAACAGTTCTAAAAGGTTACTCAAACTATTTAACAAAATACAT
ACCAACAGGCAAACTTAGTGATGAGAAGATTTTATCAACCACACAACTTATGTCTGAGCATATTAACAGA
ATTGAATACTATGTAGAAAATATGAGTAATGCTCAACGATTAGAAGATTTAGTTGTTTCAAAATCTATGT
CGAATATAAACAAGTTTATAGAAAACTTAGATGAAAATATATCTATCATTGCTAAACAAGAAGGAAAATC
TTTTACACTTAAAAGTCAAATAAATAATATAAATCTATTTTTTGATGAAAATATCATTCTTAGAGTCGTC
GAAAATATAATATCGAATGCTTTTAGATATGCTAGAAATAATGTATCCATACTTATATATCTTGAACAAG
AACTCCTTACCTTTGTAATTGAAGATGATGGTATAGGATTTAGTAAGGAATCTCTAAAATTAGCTTTAAG
ACCTTTCTATAGAGATAAGACTTTAAATGACAGCAATCCACACTTTGGTATGGGTCTTCATATCTCAAAA
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CTAAATTCTCAACAAGAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c515326-514652 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
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GTATCATGCCCTATTCTATTTCTTACAGCCAGAATTGAAAATACTGACAAGATAAATGGTTTTCGTGCTG
GTGCTGATGATTATATTGTAAAACCTTTTGATTTAGACGAACTTGGAGCTAGAGTATCTGCACATTTAAG
ACGTGAACAAAGGAAGTCAAATCAAACTAAAATTAAATTTTATAATGATTTAACAATAGATTACGAAAAA
AGGTTAATTTGTATATATAATAATCAGATTTCACTTTCAAAAAAGGAATTTGATATAGTAGAGCTTCTCT
CTATGAATCCTGGACAGGTATTTGATAAAGAAAAAATATATGATAGAGTCTGGGGATACAATAGCAATGG
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TATATAGAAACAGTCTGGGGAGTTGGTTATAAATGGATAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c516974-516147 putative carbon-nitrogen hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTCTATAAAATTGCAGTATGTCAGATGATGACCACAGAAAATAAAATTGAAAATATCAATCATG
CTGTAGATATGGTAACAGAAGCTGCCATCAATGGAGCTAAAATTATAGTTTTGCCAGAAATGTTTAACTG
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AAATTAGCTGAGAAACATGGAATTTATCTAGTTTCTGGTAGTATTCCTGAGTTAGAATATGGAAAAATCT
ATAATACTTGCTATGTATTTGATAAAAATGGAGCTCTAATTGGAAAACATCGTAAAATGCACTTATTTGA
CATTGAAGTTACAGGAAAAGTTAGTTTTAAAGAATCAGATACTCTTACAGCTGGAAATGATGTCACTGTA
ATAGATACCGAATATGGAAAAGTTGGTATAGCTATTTGCTATGATATTCGTTTCCCTGAGTTATCACGTT
TAATGGCTCTTAAAGGTGTTGAAATCGTTATCTTACCTGCTGCATTTAATATGACTACTGGTCCCGCCCA
TTGGGAGTTATCTATAAGAATGCGTGCTTTAGATAATCAGATATTCTATGTTGGTGCTGCACCTGCTAGA
AATATGAATGCTTCTTATATAGCTTTTGGAAATTCAAGAATTTCAGACCCTTGGGGAAGAATAATTGCTC
AAGCTGATGAAAAAGAATGTATTATTTATGCTGACATTGATAGAGATTTAATTCCTGACATAAGACAACA
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>ref|NC_013316.1|:517356-517676 quaternary ammonium compound-resistance protein [Clostridium difficile R20291]
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ATGGATTTTCTAAATTAACTCCAAGTATACTTACTGTTGTTGGAATGATTGTAAGTTTTTATTTTTTGTC
ATTAGCACTAAAACATCTTCCACTTGGAACTTCATATGCAATATGGACTGGAATTGGTACCGTCGGTACA
GCTATTGTAGGCATGGCTATCTTAAATGAGCCTATTAGTATATCAAGAATTGCATGTATAGGCTTTATTG
TGGTGGGAATTGTAGGGTTAAAGCTATTATCTACTAATTAG
>ref|NC_013316.1|:c518489-517809 putative phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAGTGTATCAAGGAAAGACTAAAGATGTTTTTGAATTAGATAATGGAAATTACTTACTTAAAT
TTAAAGACGATGTAACTGGTAAAGATGGAGTATTTGACCCAGGCGAAAATAGTGTAGGTCTAAGTATAGA
TGGAATTGGTAGAGCTAATTTAGAGACATCTGTTAAGTTCTTTGAAATTCTAAACAATGCTGGAATTAAA
ACTCATTATGTAAGTGCTAATTTAGAAGAAGCAACTATGGAAGTTCTACCAGCAAAAGTTTTTGGTAATG
GATTAGAAGTTATTTGTCGTTATAGAGCTGTTGGTAGTTTCTTACGTCGTTATGGTTCATGTGTTGAAGA
AGGTGCTAAACTAGATTGCTATGTAGAAGCAACTTTAAAAGATGATGACCGTTGTGACCCTCTTATAACA
TCTGAAGGTTTAGAAGCTTTAAACATTATGACTCAAGCTCAATTTGATTCAATGAAAAGCATGACTCAAA
AAATTTCTAATATAGTTCGTGATACTATAGCTGAAAAAGGTCTTGAACTTTATGATATCAAATTTGAATT
TGGATTCTACAATGATGAAGTAATCTTAATAGATGAAATAGCATCTGGAAATATGCGTGTTTATAAAGAT
GGTGTAATAGTTGACCCTATGGATTTAACTGCTCTTTTATTAGATAAATAG
>ref|NC_013316.1|:518885-519937 putative sugar-phosphate dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
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AAAAAGATGATGTAATAATTAAAGTAAAAGTAGCTGGAATATGTGGTTCTGATATATCAAAATATTCAAA
GACAGGTCCACATATGGTTGGAGAAATTTTAGGGCATGAATTTTCTGGAGAAGTGGCACAGGTTGGTAAA
GAAGTAAGGAGTTTTAAAATAGGAGATAGAGTTGCTGTTTGTCCAGCTATGCCATGTTTTGAATGTGATG
AATGTAAAAAAGGATTGTATTCAAGATGTAATAATGTAGCAATAATAGGAAATAAAGAACTTGGAGGTTG
TTTTGCAGAGTATACAAAGGTGAAAGAGAGGAATTTAATAAAAATACCAGATGAGATAAGTTATGAGACT
GCCGCTGCGCTAGAACCAGTATGTATAGCAGGGCATGGTCTTTTTAGATCAGAAGCTAAAGTTGGAGATA
CTGTTGTAGTACTTGGTACAGGTACAATAGGATTATTTTCAATACAATGGGCAAAGATATTTGGCTCTAC
AAAAATAATAGCTGTAGATGTATTTGATGAGAAGTTAGACTTGGCGAAAGAGTTAGGGGCAGATATTTGT
ATAAATGCAAAAGAAAAGAATATTGTAGAAGAAATAAAAAGGTTAACTGATGGAGATGGTGCAGATATTG
TTATTGAATCGGCTGGGACTCCAATGACATGTGGGCAAGTATTGTTGTTAGCTAAAAAGGGAGGGACAGT
ATTGTATGCAGGTGTACCATATGGGGATGTAGCTTTGACTAGAGAACAATTTGAAAAGATAGTAAGAAGT
GAATTAACTGTCAAGGGAACTTGGTTTGGAAACTCTTTTCCATTCCCAGGAAAAGAATGGAGTGCTGGAT
TGTATCATATGCAAAAGGGTGATATGAATGTTGAAAAATTAGTAACACATAGAATAAATTTAGAAGAAGT
ACCAGCTTATTTTGAAAAAGTATACAAAAGGGATATTTTCTTTGGTAAGATAATGATTAATATAGATAAT
TAG
>ref|NC_013316.1|:519984-520400 PTS system, IIa component [Clostridium difficile R20291]
ATGATTCATATGACAGGGATAATTATAGCCACACATGGAAATATGGCTAAAGCAATGTTAGAAAGTGCTG
AATTAATAGTAGGCAAACAGGAAAATGTAGAAACTTTAGGATTAAACCATGGTGACAGCATAGATGAGTT
TAGTAGAAGGTTAGAAGATAGAATTGAGAAATATAAGGATGAAGGGGTTTTAGTATTGCTTGATTTTTAT
GGCGGGACTCCATTTAATACATCTGCTATTATAATAAATAAATTTGCTAAGGTATGTGAGTTAGAATGTT
TGACAGGTGTAAATTTACCTATGCTTTTAGAGCTATTTTTAAACAGAGATACTATGAAGTTAAAAGACTT
GAAGAATTTATGTGAGGAAGTTGGGATATCAGGAATCAAAGATGTTAAAACTGTTTTAAAGTTGTAA
>ref|NC_013316.1|:520429-520902 PTS system, IIb component [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAATATAGCATTAACAAGAATTGATGATAGATTAATACATGGGCAAGTTATTACTGCTTGGTGTA
AGATTACATCGGCAAAAAGGATAGTAATCGTGGATGATTTAGTAGTAAAGGACCCATTTATAGTTCAAGT
TTTACAAATGGCAGCTCCATCAACTGTTAAGGTTGAAGTACATGATGTAGAATCAGGTGCTGAAGTTTTA
AAATCACATAATGGAGATGAACATTTAATAGTATTGGTCAAATACCCTAAAACTGTCTTAGGTTTAGTAA
ATAGTGGGGTAGATTTAAAGGAATTGAATGTTGGAGGTATGGGAGCAGGGCTTGGTAGAAAAAGTTTTTA
TAAAAATATATCTGTGTCAGATGAAGAAAAAGAAATATTTAGAGAACTAATATCAAAAGATGTTAAATGC
TTTATACAAATAGTACCAGATGCAAAGAAAATTGATGTAGGAACATTATTATAA
>ref|NC_013316.1|:520949-521707 PTS system, IIc component [Clostridium difficile R20291]
ATGCACATTTCACTAATTCAAGCAGTATTAATAGCAATTTTTTATTATCTTTCTTGGAGTCCGTGGTTGA
CCTATGTTGGATTTTTTACATGGAATAGACCTCTATTGGCTGGATTTGTAACGGGAATTATATTAGGAGA
CCCTGTTCAAGGAGCAATTATAGGAGCAGGTATAAATATGATATATCTAGGTTTTATATCAGCAGGGGGA
GCTCAGATGGGGGACCCAGCTTTTGCAGGATATGTAGGTACTGCTTTAGCTATAGCATCTAAGCTAGATG
TAAGTACTGCAATGGCAATAGCTGTACCATTGGGAACTGTTGCAACTGTACTTTGGATTGGAAAAATGAC
AGTAAATTCTTTTTTTGCACATTGGGCTGATAGAGAGGTTCAAAAAGGGAATGTTGATAGAGTAGCATTT
ATAAATATAGTACCACCACAGATACTGTTATTTGCAATGAGTTTTATACCAGCATTATTAGTTGTTTATT
TTGGTCCAAATGCGATAGATGGTATGTTGGAAGTAATGAATGAGAATGTGTTACATGTATTTAATGTAAT
TGGGGCTATGTTGCCAGCACTTGGGATTGCTATGAATTTAAAATTGATTGGAAACAAGTTTACTATGCCC
TTTTTCATATTAGGAATACTAATGGCTGTTTATTTTAAAGTAGATATAATAGTAATATCTGTTATTGGAG
TAATACTTGCTCTTACAATTACTTCAATTAAGTACGGAAAAGATAGTGCTACATCTTAA
>ref|NC_013316.1|:521731-522570 PTS system, IId component [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAGATATAAAAAATGAAGTATCTAAGAAAACGTTAAGCAAAAAAGATGTAATAAAATCATGGTTAA
GATGGTTTTTCTTTGCGCAATCTAATTACAATTATGAAAGATTGCAATCAACAGCTTTCTCACATTCAAT
GTTGCCAGTACTTAAAAAATTATATCCAGATAAGGAAGAGTTAAAACAAGAAGTGGAGACTCATTTAGCA
TTTTTTAACACAGAACCTATATGTGGATGTGTTATACATGGAATAACAATAGCTATGGAAGAAGAAAAAG
CTAATGGAGCAGATGAAATAAGTGGAGATGGTATGAATGCTATCAAAACAGGCTTGATGGGTCCACTAGC
AGGAATTGGTGATACTTTAACTCAAGGAGTTATAACTCCTATAGTGTTAGCTGTTTGTATTGGTTTAACT
GAGGGAGGAGCATCAATTGCAGGTCCTATATTATTTGTAATAGCTCAATATATAATAATGACTTCAATTT
CTTTTGGAATGTGGACAAATGGATATAAGTATGGGAAAAAAGCTGTTGAAAGTATACTTCAAGGTGGAAT
AGTAAATAAGGTTATAGAAGGGGCTTCTATATTAGGTACTTTAGTCATGGGGGGACTTGTAGGTAGGTTT
ATTAATTTATCTACACCAATAAGTTATACTAGTGGTGATTTTAAATTTAGTCTTCAAACGGATTTACTTG
ATAAGATATTTCCAGGATTAATTCCTTTGGTACTTACTTTATTAGTACTCTTTGCTTTAAAAAAAGGCCT
TTCTCCAATAAAAATAATGTTTATACTGATAGTAGTGGGAGCTATTACAGGTATTTTGGGACTATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:523021-523668 dna-binding response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAACATATTAATTGCTGATGATGAAATTAGTATGCTTAAGATACTTTGTGCATATTTTAAAAAAGAAA
ACTTCAATGTGTTTACTGCAAAAAATGGGGAAGAGGCTTTAGATATTTTTTATGAAAATAAGATAGACTT
AGCTATATTAGACTGGATGATGCCAATAATTGATGGAATAGAGGTTTGTAAAGAGATAAAGGAAAATAGT
AATACAAGGGTACTTATGTTGACTGCCAAAAGTCAAAGTGAAGATGAAATAGAAGCACTCAACATTGGAG
CAGATGAATATATAAAAAAACCATTTGATCCTAGAGTTTTAATAATAAGAGCTAAGAAACTAATAAATTA
TAAAAATACAATTAATATTAAAGATTTAAAAATAGATTTTGGGTCAAGTAAAGTTTTTAAAGGTGATAAG
GAATTATTATTGACTAAGAAAGAATTAGAATTAATTCGTTGTTTAATCAATAATAAAGGAATGGTTTTAT
CTAGGGAAAAACTTTTAGATTTAGTATGGGGATTGGATTATGAGGGAGATTTTAGAACAGTAGATACTCA
TATAAGAAGATTAAGGGTAAAAATAGGAGAAGATATAATAAAAACTTATAGAGGATTAGGGTATAGTCTG
GAGGATTTTAATGACTAA
>ref|NC_013316.1|:523661-525055 sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGACTAAACTAAACAAAAAATTGTCCATAAGTATATCTATAGTAGTTGTAGTTGTTTATATAATATCTA
TAATTATAAATAGTATGTTTATTCATAGATATTATTTACATGAAAAAAGAAATATATTGGATAATGTTGA
AAATGAAATTAAAGATAAAGACATAGATAAATTAAAATCAGACATTACTTTAATTGAAGAAAAAAATAAT
ATAGATATCGTATATATAGAATTAGATAAAAATCATAAAGATAAAGGTAATATAGATAAAATAAATCAAG
ATTTATTAAATGCATTTTGGAAAAAAGGTTTAAGTTTAAATAAGTTTTGGATTGAAGAAAATAGTTTAAA
TAATATTGATAAGAAAAGTATAAATAAGATATACAATCAAGGTAAAACAAAATATAGTTTGCTTGTAAAA
TTTATCAAGAAGGATAATTATTTGTTTGCTATATCTATACCTATAGAACATTCTGAAGAAACTATTGGCA
TTGTAAATAGATTTAATATAATAATGGGAATTTTTTCAGTAGTTATAATAACTATACTTACATTTATATT
ATCAAACAGAGTTATAAAACCTATGGAAAGGTTAAAGTTTTTATCTAAAGATATATCTGAATTAAATTTT
AGGACTGAAGATATAAAAACGAACGATGAAATAGAAGAGCTAGCTTACAGCATAAACATAATGAGCGAAA
AACTTGAAAAAGCACATAATGAATTGAATAAAAGAAATGAGAATCTAAAAACTTTTATATCAGATGCATC
TCATGAAATGAAAACTCCAATAGCACTTATAAAAGCATATGCAATAGGTATGAAAGATGGTTTGGATGAT
GGGACTTATACAGATACAATAATTGAACAAGCAGAAAATATGACCAATACAATAAATTCTCTTTTATATT
GGGCAAAATATGAGAAGAAGGAGAGAAGTCTGTGTCTGGTAGATTTAAAGGAAAGGTTATATAAAAGTTT
AAAAAACTATGAGCTGTTGATAGAAAGAGGTAGTATAAGTGTTAAATGCAGTGTAGATGATAAAGAACTT
ATAATAAGTTCGGATGAAGATAGTATAGATATGGTATTTAATAATTTGATTAGTAATGCTATAAAGTATA
CTAATAATAATGAAATAGAGATTAATCTTTTTGAAGAGAATGAGAGAATTATATTATCCATAAAAAATGG
TATAGATTACAATATGGGAGATGATATAGAAAATATGTGGAAGCCTTTTTATGTTTTAGAGAAGTCGAGA
AGTAAGGAGCTTTCTGGTACTGGTCTTGGTCTTACCATAGTTAGAACTATACTTGAAGAAAATAATTTTA
GATACAGGGTTGAAATTTGCGATGGAATTATAGAATTTTATATTATCTTTATAAAAGTAATTTGA
>ref|NC_013316.1|:525456-528968 cell surface protein (putative hemagglutinin/adhesin) precursor [Clostridium difficile R20291]
ATGGACAAGGGGGAAGAAAATAAAATGAAAATACCAAAGAAGATTGCTGCAATGCTTACAGTTACAATGA
TAGCTGGAAGTTCAACAGCAGGCATAGCTAGTGCACAAACTGTGGCAACAAATTTAACAGGGCAAGAAAG
ATATGAAACTGCTGTTAAAATAAGTCAAGATGGATGGAAAAATGCTGATGAGGTAGTAATCGTAAACGAC
TCATCTATAGCAGATGCTCTATCTGCAACACCATTTGCAAAAGCAAAAAATGCTCCAATACTTTTAACAA
GTAAAGATAAATTAAATGATAAGACGAAAGCAGAAATACAAAGATTAAAAGCTAAAAAAGTATACTTAAT
AGGTGGAACTTCTGTATTAAGTACAAATATAGAAAAAGAAATAAAAGATTTAAAAATATCTTTTGAGAGA
ATCTCTGGAGCTGAGAGATATCAAACATCCTTAGAATTAGCAAAGAAATTAGATGCTATAAGTGATGTTA
AGAAAATAGCTGTAGTTAATGGTGAAAAAGGACTTGCAGATGCTGTAAGTGTAGGAGCACCAGCTGCACA
AAACAATATGCCAGTAATACTTGCTGATTCTAAAAATGGAACAGCAGTTGCAGACAAATTTATAAAAGAT
GCTGGAATAACTCAATCTTATGTAGTAGGTGGAGAGAGTTCAATTTCTGAAGCTGTTAAAAATAAACTAC
CAAATAGTACAAGACTAGGTGGAACAGATAGAAATGATACAAATGCAAAAGTAATAAAAGAATTTTATAA
AAAGACAGATTTAAAAAATGCTTATGTAACTAAAGATGGTATGAATAAACAAGACCAACTTATAGATGCA
CTAGCAGTAGGTGTATTAGGTGCTAAAAATCAATCACCAGTAGTTTTAGTTGGAAAGAACTTATCAGCTT
CACAAAAATCTCTAGTTAACTCTAAGAGTTTTGATAAGATAACTAAAGTTGGTGGGAATGGTAATGAGAC
AGCATTTAATGAAATGAAGTCATTACAAGAAGTAAAAACAGTTGAAGCTAAAACAATTTCTGAATTAAAA
TCAGCTATAGATAAAGCTACTGCTAATGATGTTATAAACTTTAAGCCAACTAGTGAGGTTAAAGAAGCAT
TTACAATACAAACTGATAAGGCGATAACAGTAAACTTAAATGGTACATATACAAAGACTGTGACTATCAA
CATGCCTAATGGTGATGTAAATAACTATGCAAAAGTGGATGATGTAGTTATAGATGATGTAAAAGATGGA
ACTTTTGTTAACTACGGAAAAATAACTAACTTAAAGGTTAATGATAAAAATGGAGCCAAGATAGAAAATA
ATTCTAAAGGTGAGATTGGTAGTTTAACAGTAGCATCTGGAGCAAGTCAAGTAAAAGTGACTAATGGTGG
TAAGATAACTACAGTTACAAATAATTCTAAAGGAACTACTATAGATAATAAAGGTACAATAAGTAGTGTT
AAGGGAGATAATTCTCCAACAATAAGTGGAAATAGTCCAAGTTCTAACTCTTCAGGAGGAAGTTCATCAA
GTGGAGGTTCTTCACATGGAGGAGGAAGTTCTTCATCAAAAGTAGATAAAGTAGTTTTGAAAAATACAAT
AACAGCAGCAAATAAATTGTATAATGAAGCAATAGAGGGAACAAATGTAGGTGAATATAAAGTAGGGTCA
AAAGCAATATATAAAACAGCAATAGACAAAGCACAGGCAATATTAGACAAATCTGGTGTAACACAAAAAG
AAGTAAATGATGCAGTAACAGCATTAAACACAGCAACAGACACATTTAAAGCAGGAAAAGTAGTAGCAGT
AGATAAAACAGCATTACAAGATGCAGTAACAGCAGCAACAGCATTACATGCTAAAGCAACAGAAGGAACA
GCAGAAGGAAACTATGCTGTAGGATCAAAAGCAACGTATAAAACAGCAATAGATGAAGCACAGGCAATAT
TAGACAAATCTGATGCAACACAGAAAGAAGTAAATGATGCATTATCAGCATTAAACACAGCAACAGAGAC
ATTTGAAGCAGGAAAAGTAGTAGCAGTAGATAAAACAGCATTACAAGATGCAGTAACAGCAGCAACAGCA
TTACATAATGGAGCAACAGAAGGAACAGCAGAAGGAAACTATGCTGTAGGATCAAAAGCAACGTATAAAA
CAGCAATAGATGAAGCACAGGCAATATTAGACAAATCTGATGCAACACAGAAAGAAGTAAATGATGCATT
ATCAGCATTAAACACAGCAACAGAGACATTTGAAGCAGGAAAAGTAGTAGCAGTAGATAAAACAGCATTA
CAAGATGCAGTAACAGCAGCAACAGCATTACATAATGGAGCAACAGAAGGAACAGCAGAGGGAGAATATG
CTGTAGGATCAAAAGCAACGTATAAAACAGCAATAGATGAAGCACAGGCAATATTAGATAAATCTGATGC
AACACAGAAAGAAGTAAATGATGCATTAACAGCATTAAACACAGCAACAGAGACATTTGAAGCAGGAAAA
GTAGTAGCAGTAGATAAAACAGCATTACAAGATGCAGTAACAGCAGCAACAGCATTACATAATGGAGCAA
CAGAAGGAACAGCAGAAGGAAACTATGCTGTAGGATCAAAAGCAACATATAAAACAGCAATAGATGAAGC
ACAGGCAATATTAGACAAAACAGGTGCAACACAAAAAGAAATAGATGATGCATTATCAGCATTAAACACA
GCAACAGACACATTTAAAGCAGGAAAAGTAGTATTAAATAAAACAGCATTACAAGATGCAGTAACAGCAG
CAACATCATTACATGCTGGAGCAACAGAAGGAACAGCAGAAGGAAACTATGCCGTAGGATCAAAAGCAAC
ATATAAAACAGCAATAGATGAAGCACAAGCAATATTAGATAAAACAGGTGCAACACAAAAAGAAATAGAT
GATGCATTATCAGCATTAAACACAGCAACAGACACATTTAAAGCAGGAAAAGTAGTATTAAATAAAACAG
CATTACAAGATGCAGTAACAGCAGCAACATCATTACATGCTGGAGCAACAGAAGGAACAGCAGAAGGAAA
CTATGCTGTAGGATCAAAAGCAACATATAAAACAGCAATAGATGAAGCACAGGCAATATTAGACAAAACA
GGTGCAACACAAAAAGAAATAGATGATGCATTATCAGCATTAAACACAGCAACAGACACATTTAAAGCAG
GAAAAGTAGTATTAAATAAAACAGCATTACAAGATGCAGTAACAGCAGCAACATCATTACATGCTGGAGC
AACAGAAGGAACAGCAGAAGGAAACTATGCTGTAGGATCAAAAGCGACATATAAAACAGCAATAGATGAA
GCACAAGCAATATTAGATAAAGCAGATGCAACACAAAAAGAAATAGATGATGCAGTAACAGCATTAAACA
CAGCAACAGCTACATTTGAAGCAGGGAAAGTACCTACTACAATTGCATTAATGTTATCAAGAATACTAGG
ATTTATGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c530653-529409 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGACGAGATTTTGAAAGGAAAAATAAAACAGTTAACAATACTTGCATTAATTTTTATATTTATAA
CTCCTGTATTTGCATTTGCAGATACTCCACCAGTACCAAATTCTTCAAGAGCAGCACTACTTATAGACCA
GGAAACTAAAAGAATATTATTTGAAAAAAACATTGATGAAAAAATGCCATTAGCGAGTTTAAGTAAAATG
ATGACCTTTTTATTGGCAATAGAAGCAGTTGATAAGAATCAAGTAAAAGAGACTGATATGGTGAAAATAG
ACAAGTCTACAGCTTCAGTAGGAGGTTCTACTTGTAAACTTAAAGATGGTGATGAAATATCTCTAGGAGA
GCTTATGCAGGGTCTAATGCTAGTATCTGGAAATGATGCTGCTATAGCCATAGCTAAACATATTGGTAAG
ACTGAAAAGAATTTTGTAAATATGATGAACAAGAAAGCAGAAGAAATAGGAATGATTGATACGTATTATT
TTAATCCAAATGGGCTTCCTATATATACTGACCCAGAACATAAAGAACCTCCTATTGAAAATATGTCAAC
TGCTCACGATATAGTTACACTTGGAAAGTATATGTATGACCATTATGAAAATCAAGTTACAAGAATAACC
ACTATGCAAGTATATAATGATACTAAAAAGGATTTTACACATTATAACACAAATCCCCTACTTGTTTCAG
TACCTGGTGTTGATGGAATAAAGACAGGCTATACAGATAATGCTGGATATTGCCTTGCATTTTCTATGAT
GGTACCTAAAGATGCTAAAAACGAAAGAAATCATAGATTGATAGGTGTTGTACTTGGTGATGGTAACAAG
AAAAATAGAATTTCTTCTTCCGCTACTTTATTGAAATATGGTAAAGATAATTTCCATTCTAAAAAGATAG
CACATAAGGGTGATATTATAGAGACTCCTTGTGTTGATGGTATTGATGATTTTAAGATAACAGTTAAGGT
TGATAAAGATTTGTATGGTGTTGTTTCAGATAACGAAAATATCAATCCTAAGGTAGTGTTTAAAAATATG
AATTATCCTATCCATAAGGGAGATATTGTTGGTGTTGCAAAGTATTATAATGACTCTGGTAAATTTGTTG
GAAGTGTTGATGTAAAAAGTGAAAGTAATATAGGATGTATTCCTTTGAAGGATAAGATTAAGATTAAGGT
TGCTAAGATAAATAAAAAACTTGAGATTAAAAATTCTGTTTGTTTTAAAGTATAG
>ref|NC_013316.1|:c533530-530696 putative transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
ATGCTAAGAAAAGATAAAGTTCTATTATCTCTACATAAATTATGTGAAAATATGACTTTAAAAGACCTTC
AATCAGATAAAACAGGATTCACTACAATAGAAATTGCTAACCATTCATCTCTTGATAGAAGTAATACCAG
TAAAGAATTAAATAACCTATATAATGAAAAAAAAGTTCTGAAAATATCTGGTAAGCCAATTTTATTTCTA
CATGTTAGTATTATAGAAAATTTAATTGGCCGTACTTTGAACAGTGATGAATTTTCTATAAATAATTGTA
ATGAGCTACTTAAATCAAGTAAAAATGACTCAGAAGATATTTTTTCAACATTACTTGGACATGATTCTAG
TCTTAAACTACCTATAGAAAAAGCTAAATCTGCTATACTCTATCCTCCAAAAGGTCTTAATACGTTACTC
ATAGGACCTACTGGTGTTGGAAAAAGTACATTTGCCGAAACAATGTACAAATATGCTGTAGAAAGTAAAA
TCTTTTCTTCTGAAAGCAAATTCGTAGTATTTAACTGTGCTGAATATGCAGAAAATGCTAACTTATTATT
AAGTAATTTATTTGGTTATGTCAAAGGTTCTTTTACTGGTGCTAATAAGGATAAATTCGGCATAGTTGCA
CAGGCTGATGGAGGCATATTATTCTTAGATGAAATACACAGATTACCACCAGAAGGTCAAGAGATGCTTT
TTCTTTTGATGGACAAAGGCATATACAGACGATTAGGAGAATCTGACATTGTGCACAAAGCTAATGTCTT
TATTGTGTGTGCCACAACAGAAGATATACATTCTTCTCTGCTTGGGACTTTTTTAAGAAGAATCCCTGTT
ACAATCAACCTACCTGCTTTACAGGATAGGTCTTTAAAAGAAAGATTATCTCTTATTAAATACTTCTTTA
TTATAGAATCAAAATACACCAATGCAACTATAAAAGTTCACAAAGATGTAATTAAATCATTACTCCTTTA
TGATTGTTTTGGTAATATAGGTCAGCTTAAATCTGACATACAACTTATGAGTGCAAGAGCCTTTTTAAAT
TACAAAACTGGACTTAAGGATAATATAGAAATAGATTTATCCCTTGTTCCTGATTACATCTATATTGGTC
TTTTAAAATTGAATGAAAATCGTAGTAATCTAAATAAATTATCAGAACTTGATTATATGCTTTTTTATGA
ATTTAATGGTAATAACTTAGAAGTTGAATATACAAAAGAACTATCTAAATACAATATAGATACATCAAAC
AATGGATTTAAATACTCTACAGAGATTCCTTATCTGGAAAATGATATAAGGAGTATGTTTATAAATTACA
TGGAAAAGTACTCTACAAAATTACTTTCGATATCTTCAGTAACTCATTCTGATTATACAAGTAATGAAAT
TTTTAAAGTAATCAATCCAAAGATTTACTATGCTGTTGAACATTCTTTAAAAGAGGCCGAAAAAATATCG
AGAAACAAATACACAAAACAAACTTATATTGCTCTTTCAATGCATATAAGTGCACTTATAGAAAATATAA
ATCAAGACACCTATAATCCTAAGTACAATTTATATAATGATAAAATTTTCTTAGATAAAGATTTAAATAT
ATCTAAAATAGTTTTAAGTATAATTGAAAATGACTTACAAACATCTTTACCTAAAGATGAAGTAAAATTT
ATATCCATGTTTCTAAATAGCATGTATCTTGAACCAAACAATCAATCTGAAAGTATAGGAGTCATAATAC
TTGCTCATGGAAATTCAACAGCAAGCAGTATGTGTGATGTAGCAAATTCATTGCTTGGTACAAACCATTG
TAATGCAATTGACATGCCTCTTGATGTAAAAGTAAGTACCATACTTGATAAAACTATAGAGTTGGTAAAA
GAATGTGACGAAGGTAAGGGTGTACTTCTTTTAACAGATATGGGCTCTCTTATAGCTTTTGGAGAACTTA
TTTCAGAAAAAACAAAAATCAAAACTCGCTCAATTGAAATGGTATCTACTCCAATAGTTTTAGAAGCAGT
AAGAAAAAGTACATTACCAGAAATGACTTTGGATGAATTAGCTAATTCCTTAAGCTCTTTAAATCCATAT
ATTGGACGAGCAGCAATCGATTCAACAGAAATAAACTATCCTGAAAAGTCAAGAGAGTATGTAATAATAA
CTACTTGTATAACAGGATATGGTTCAGCTATGAAAGTAGCAGACTTTATAAATTCTTCACTTAAAAATAT
TCGTAAATACAATATTAATTTAGTTCCTCATAATATAGAAAGTTTTAAAATGTATAAGAATAAATTTAGT
AATACTAAAATTCTGGCAGTTGTTGGAAGTGTAGATTTTAATGTAGCCAACACCCCTTTTATACACATAG
AGGAATTACTAAATGGATATGGCCTAGATATGCTAAACAAAATAATAGAAGGTACATTCAATGCCAATAG
TATTACAAATATAAAAGAAACAAATCTATCATACAACAGTTTAATAATAAACTTTATGACCCAAAACTTA
GAACTTTTGGACTCTGTTAAATTATTCAACTATGTCAATTCTTCCTTATTTACAATAATAGAATTAATAG
ATGAAAACTTAAAGAGCAAATTTAAGCTAGGATATATACTACATTGCTCTTTTATGATAGAAAGATGTTT
TAAAAATACAACTTTTCCATATAATAACATTACTGAATTAATTAGTAAAAATCATGAACTATATAGTTTA
ATACGTGAAGCCTTTAAGCCAACAGAAGCTTATTTTAATATTTTGATACCAGACGAAGAAATTGCTTATA
TAATAGACATGATTAATGAGTATCTAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:534217-535014 hypothetical protein CDR20291_0443 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATACTATAAAAGAATGGGAGATATGTTTTGTGGATATAGATAGAATTTTAAACTTTTCCTCAA
ATGCAGGTAAAGCTATGTTGCAAAGTGGAGGAGAAACCTATAGAGTTGAAGAAACGATAGCTAGAATATG
TCAATCTTTTGGAATAGACCACGTAGATGTATTTGCAACTCCAACAGCTGTAATGGCATCTGTATTTGTA
GATGGGAAATTACATTCAGCAATTAAAAGAATAAGCTCAAGAAGAGTAGACCTAAACTTGGTTCATGAAG
TTAACTCATTATCAAGAGCAATAAGTATAAATAATTTAGATATTGAATTATGTGAGAAAATTTTAGATGA
AATAAGTGAAGATAACTATTACTCGGATTTAATAACAATATTTTTTGCAGGTATTGCAGCAGCAACTTTT
TCGATATTATTTGGAGGAAATGTGGAAGAATTTATAGCTGCATTTACTGTTGGGATTCTGACTAAGTTTG
TTATTATGTATTTAAGTAAATCTTCACTTAATGACTTTTTTGTAAATGCAATTGGAGCAGTTATTATAGC
TTCTTGTTCAATTTTAATTTTAAAGCTCGGATTTATAAAGACGTTAGACCATTTAATAGCAGGAGCAATA
ATGCTCTTAGTTCCCGGGCTTGCTTTGACTAATGCATTAAGAGATTTGTTAGATGGACAGTTGATTTCTG
GTCTTGCAAAATTAGCAGAAGTATTTTTTGTAGGTGTATCTATAGCAGTAGGAATGTTCTTGGTACTTGG
ATTATACTTCAAGTTAGGGGGGATATAA
>ref|NC_013316.1|:535015-535509 hypothetical protein CDR20291_0444 [Clostridium difficile R20291]
GTGCATTTGTTTATAGAAGTAATAGCAGCTTTTTTTACTGCCTTAAGCTTTGGAGTGCTATTTAATATGA
AAGGAAAAAACTTAATACTAGCAGGAATAGGTGGAAGTATAGCTTGGTTTTCATATAAATTTCTTTTAAA
TATGGGAGTAACAGAAAACTTATGTTTTTTTATAGCTACAGTTTGTTTTGCGATATATTGTGAGTTATGT
GCAAGAATTTATATGACTCCAGCAACTACATTAAGTGTTTGTTGTTTAATAATATTAGTACCTGGTTATG
GAATATATAATACTATGTATTCTGTTTTGACCAATAATTATATAAAAGCTGTAGAATATGGGGTGAGTAC
ATTATCATGTGCAAGTTCAATTGCATTAGGATTGGTATTTATAACTACTGTATTTAGAAAAGTCAACTTA
TATGGAGTGCTTACAAAGATAAAAGAAAATGAAAAATATAAAAAGAGTATAAATAAAATTAAACAACAAA
AATAG
>ref|NC_013316.1|:535735-536913 hypothetical protein CDR20291_0445 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAGCTGTCGGATAAGAGAAGAGTCAAGGCAGTAAGTATGGAAACCTTCGTATTTATTGTACTAT
TGGCGGTAGGATTTGGATATGTAGGAAGCATCATGGGTGCAGGAATGATGTTTAAAGTAATAATGAGTAC
AGCACATGCGCTTTTATTAGACACAGTATTTTTAATAATGGCTATGGCAGTTCTTGCAGGTGCACTTAGT
GCGTTGCTTTCAGAGTTTGGAGTAATATCTTTAGTTAATAAGATATTTAAGGGTCTTATGAGACCTATAT
GGGGCTTACCTGGTGCTAGTATAGCAGGAGTAGTTGCAACATATTTATCTGATAATCCAGCTATTATACC
ATTTGCTAAAGACAAAACATTTACACAATATTTTAAGAAGTATCAAGTACCTGCTTTATGTAATTTAGGA
ACAGCCTTTGGTATGGGACTTATTGTAACAACTTTTATGATAGCTCAAGGTAAAGAATATGTACTACCAG
CTATAATAGGTAATGTTGGGGCAATAATAGGTAGTATTATTAGTGTTAGAATTATGTTGACTTTTACTAA
AAAGTATTATAATTATGACCCTAAAAATGATACTGAAAAGCAAATAAATGATAAAGGTGCAAAACTTGAA
GAGTTTAGAGAAATAAGAGATGGTAATGTATTCCAAAGAACATTGGATGCTATACTTGAAGGTGGTAAGC
TAGGTGTTGAAATGGGTATGGCTATAATACCAGGAGTTTTAGTAGTTTGTACATTAGTTATGTTATTAAC
TTTTGGACCATCTACAGACCCTGCTACAGGTCAAGCTGTTTACACAGGAGCTGCATATGAAGGTATAAAA
TTATTACCTGCTATTGGTGATAAGATTAGCTTCATAATAGAACCATTATTTGGATTCACATCACCAGAGG
CAATAGCATTCCCTGTAACTGCATTAGGAGCTGTTGGAGCAGCAATATCTTTAGTACCAGAGTTTATAAA
ATCAGGCGCTATAACTCCTAATGATATAGCAGTATTCACAGCAATGGGTATGTGTTGGAGTGGATATTTA
AGTACACACATAGGTATGATGGATGCTTTAGATGCAAGACCATTGGCTGGTAAAGCGATACTTTCGCATA
CCATAGGTGGTTTGTGTGCAGGTATATGTGCCCACTTTATATTTATGCTTGTTGGATAG
>ref|NC_013316.1|:537167-538774 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGGAACGACTACAACATGAAGACTTAAAAGAGTATGATTATGATGAAGATGGCTATCTCAGTA
AAAAGATAATTATTAAGGACTTCATAAAAACTATATTGGTTATGACAATTGCTACTGGAATATCAGTAGT
TTTTGAAAAGGTAGGTTTTAATGAATCTAATATTATACTAGTATACATATTAGGTGTACTATTTGCTACA
AGTATAACCTATGGATATTTTTTTGGAATACTTTCTTCAGTAATAGGAGTGCTATCATTTAATTTTTTCT
TTACGCATCCATTATATACTTTTTTAGCTTATAGAAAAGATTATCCTATGACTTTTTGTATTATGCTAAT
GGCAGCAATTATAACAAGTACTTTAACTTCTAGGATAAAAAGAGAAGTGAGACTTTCTCATAAGAGAGAA
AAAATGATAAGATTGCTCTATGAGAATAACAAAACGTTGCTTAAAGCAAAAAATAAAAATCAAATTATTG
AATTTTGTGGGTCTAATTTAGTAAATATATTAAATAGAACTGTAATAGTGACTATTGCAGATGAGAATAA
TAATCTAGGTAAGCCAAGTATTTATATTTGTAACAATGATGGAAGTGAGAATATATTCCATTCAGTATTA
GAAAAAGAAGCTATAAAAGAAGCTTTTAGGACAGGTAACCCAGTTGGAATTGGGACAAAATATTGCAAAA
ACAGCAGTGCATATTATTTCCCTATAAAAGGTCAAGAATCAAATGTTCTTGGTGTTATAGGTGTTGCGTG
TTTTAAGATAGATATTATTACAGAAAATGAAAAGATACTATTAGAAGCAGTTTCAACACAGGTTGCGTTG
GCAATTGATAGAGAAAATTTATTTGAGAAAAATAAAAAAGCAAATCTTGAGGCAGAGAGAGAGAGATTAA
GAGGAAATTTGCTTAGGTCAATTTCTCATGATTTAAGAACTCCACTTACAAGTATATTGGGTTCGTCTTC
AACAATACTTGAAAATGATGATGTGATAGATAAAGAAACTAGAGTAGAATTATTGAAAAATATATATGAA
GATACGAGTTGGCTAACTCATTCTGTTGAGAATATACTTAGTATGACTAGAATAGATGAAGGGAAATTGG
ATATTGAAAAACGACCAGAAGTTGTTGATGAAATAATAGCTGAATCTATATTAAGAGTCAAAAAGTTTGC
CAATAGTAGAGACATAAAAACCAATATTCCAGATGAGATAATAATCGTTCATGTGGATGTATTATTAATA
GAACAAGTGTTAGTAAATTTAATTGATAATGCTATAAGGCATACACCTAAAAATTCTAAGATAGAACTAA
CTGTAAAAAAAGAGTCAAATCAAGTGCTATTTGAAGTTGCAGATAATGGAAAAGGAATACCAAATGAAGA
TATCGGTAATATTTTTAATAGGTTTTATACTAAGAATAAGTCTAGAAATCTTGAAAGAAGAGGTATTGGT
CTTGGATTGGAGATATGTAAATCTATAGTAGAAGCTCATGGTGGAGAAATTGTCGCATTTAATAATCCTT
CTGGAGGAGCTACATTTAGATTTAGCATACCTATGTATGATGAGGAGGGGAAAGACAAGTGGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:538765-539469 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
GTGGAAATAAAGCCATTAGTTCTAATTGTAGAAGATGATAAGCCAATTTGTAAATTTATAAAAGTATCTC
TTGAAACTCAAAATTATAGGTGTGTAGAGACAGATAATGGAGGAACAGCTATATCACTTATACATTCTCT
TGACCCAGATTTGATAATTTTGGATTTAGGACTACCAGATATTGATGGGATTGAGGTAATAGGACGAGTT
AGGGCATGTGCAAAGACTAATAAAATAATTGTTGTTTCAGCGAGAGAGCATGAGAGGGATAAGGTGGAAG
CTTTAGATGGAGGAGCAGACGATTATTTAACTAAACCTTTTAGTGTAACAGAGCTTTTGGCTAGAGTACG
TGTGGCTCTTAGAAATAAAGCTCAACAGGATAATATAAATAATGATGCTCCAAAGTCTTTTGAAGTTAAA
AACCTAAAGATAGATTATGAAAATCATATTGTGTCAATTAATGGTGAAGAAATACATTTAACTCCAATCG
AATATAAGATTATTGAGTTGATGTCTAAGTATTCAGGAAGAGTCTTAACTCATAAGTTTATAATAGATAA
AGTTTGGGGAAATTACTATGAAAGTGAAAATCAGTCGCTTAGAGTTTTTATGGCAAGTATAAGAAGGAAA
ATTGAAAAGAATCCTGCTCAGCCAGAATATATTTTGACTGAGGTTGGGGTAGGTTACCGTATGGCGGATG
AATAG
>ref|NC_013316.1|:540637-543735 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGATGTAATAAATTTAATAGATGAGTTGGATGAAATTGTATATGTTTCTTCTTTAGATACATATGAAC
TTTTATATATTAATGAAATTGGGAAAAAGGCAATGGGAATTAATGATATATCCCATGTAAAATGTTATAA
AGCATTACAGGGGAAAGATTCTCCCTGCGAATTTTGTACAAACTCTATTTTAAAAGAAGATGAATATTAC
ATATGGGAAAATACGAATACTCGAACAAATAGACATTTTATATTAAAGGACAAGTTAATTAAATGGGAGG
GCAAACATGCACGATTAGAAATAGCTCTTGATATTACAGAAAAGGAAGATATAAGTAAGTCAATAGCAGA
AAAATTAGAGATAAAGGAGTTATTAGTTGGATGTATTAAACATCTTATAACAGAATCTAATTTTTCTGAT
GCTGTAAATCTTGTATTAACCAATATTGGTAAATTTCATAAAGCTGATAGAGCATATGTTTTTGAAGTAT
CAGAAGATAGAAAAAAAGTAACTAATACATATGAATGGTGCAATGAAGGTGTTGATGAACAAAAACAGGC
ACTAACAAATCTTGATATTAATGAATTAAAGAATTGGTTTTTATTATTCGAACAAAAGGGTTTTGTAATA
ATTGATGATATAGAAAATATAAAAGAAGAACAGCCAATAGAATATGAAATTTTAAAACCTCAAAAAATTG
AAAGTTTAATGACATCTTCACTAAAACAAGATGATAAAGTAGTAGGGTTTATTGGAGTTGATAATCCACA
TAAGGCTGTTGGAGATACCTCTCTTTTGACATCCCTATCTTATTTTTTATTAACTGAGATGAAAAAAAGA
AAAGTAGAAAATAAATTAAATTATATGAGCTACTATGACTTCTTGACTGGTGCATATAATAGAAACAAAT
ATATTAAGTATATAGATAATTTTCAAAAAGGAAAATTTAAATCCATAGGAGTTGTATTTGTAGATATAAA
TGGGTTAAAAGATATTAATGATAACTTTGGACATGCTAATGGCGACTCTGCTATTGTGTCAGCATGTGTA
ATAATAAAAAAATACTTTCATTCTTATAATGTTTACCGTATTGGAGGAGATGAGTTTATTGTATTATGTG
AAGATATATCAAAACAACTATTTGAAGAATTAGTGAGTTGGTTAAGTGAAGAATTTAAGGATGAGATGAT
ATATAGTGTAGCAGTGGGCAGTATTTGGAGTGACGATAATATTGATATACATAAGCTAATTAAAGTTGCT
GATGAGAGAATGTACCAAGATAAGAAGAGGTATTATAATAAGAACAAACTTAGAAATAATGAAATGGAAG
TAATTAGTGACTTAGCTGATTCGACGAATAATATTTTATTTAAACATAAAGAGTTAGTTGATAAGGTTTA
TTTTGATGATTTAATGATAAAAGGGTATTCTAAGGCTTATGAAAAATTAGCTTATAATACATATGATATA
ATTTTATCTATTTGCATCGATACTAATTTAATTACTCCAATTTATCAATCAGAGAGCAATATTTTTAGTT
TTCCTATAAAGGAAAATCTTGAAAAAACTTTTTCATACATAAAAAAACATTTAATTCATCCTGATGATAT
AATATTATTTGATGATAACCACCTTCTAAAATCTCTTGATAGTCTTAATAACAGCAAGCAAGACGATTTA
GAACTAAATTTTGAGTATAGACGTTTAGGAATAGATAAAAAGTACTATTGGGCATTAATTTATATGTTAA
AGATTAGTAGTAAAAATAAGTTAGGTGAGAAACAAACACATATTTTAGTTGCTATAAAAAATATAGATTA
TCTTATGCAACTACATAAAAACCAAAAGGATATATTAACAGGACTATACAATTATGAAAGTTTTTGTGAA
CAAACAAGTTTAATGCTTAAAAGATATCCTGACAAGAGCTATGCAATTATAATGATGGATATAGATAAGT
TCAAGGTAATTAATGACATTTATGGAGTTAGAGGAGGAGATAAGGCTTTAATATATGTTGCAGAATTGAT
TCAAAAAAACATTGGTTCTAATGGTATATGTTGTCGTATGTATGCAGATGTATTTTGTATTTTTTATGAG
AGTTACTCTGATAGAGATGTTCATAAATTAATTTATAAGATTAAAAATAGCTTAAATAGAAAAAAATTTG
AATATATGTTAGTACCATGTTTTGGGGTTTATAAAATTTTGGATAATAATATTCCAATTACAAATGCGTG
TGAAATGGCAGGATATGCTCACAAAAAAGTAAAGAAACAAAGTATCAATAACTATATATTTTATGATGAT
ACTATAAGAAATGATGCACTTGAAGAAAAACAGATGGAAAGGGAAATGGAATACGCACTTGAAAATGGGC
AATTCCATGTATATCTACAACCTAAGTATAATCTTAATGCAAATAAAATTGTTGGTGCGGAAGCATTGGT
TAGATGGGTTCATCCAGAAAAAGGTATAATACCTCCAATTAAATTTATTTCACTATTTGAGAAGAATGGG
TTTATTATCAGATTAGACATGTATGTGTGGGAACAAGTATGTTCTTTGATTAGAAAATGGATAGATTTAG
GTGAAGAGCCAGTTCCTATCTCTGTAAATGTATCAAGATTACATTTGCATAATCCACATTTTAAAGAAAT
TGTTTTAAGTTTAATAAATAAATATAGTATACCAAAATCTTTTTTAGAATTGGAGCTTACAGAAAGTTTA
TTTATTAAAAATATAAAATTATTTACTAAGATAATAGCCGACCTTAGAATGGATGGTATTGTTTTAAATA
TGGATGACTTTGGTTCAGCATATTCTTCATTAAATATGTTAAAAAATATTAATATTGATACATTGAAGAT
AGATTGTGGCTTCTTTAATGAGGAAGGAATCACAGACAGAGAAAAAATAGTTTTAAGGCACACTATAGCC
ATGGCAAAAGATTTAGATATGGATGTAGTGGCAGAAGGTGTAGAGACAAAAGAACAAGCTGAATTTTTAG
TGAGTTTAGATTGTGTGGTAATTCAAGGTTATTATTATTGTAAGCCTATTCCAAGTGCTGATTTTGAGAA
GTTACTTTATCAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:543858-545144 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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GTGATTTAAAGACTAAAATATATGTAAGAGAAAAAGTAGTAGATACAATAGAAGTTATTTCTAAATGTGA
AGATGAATGTGATGCTATTATATTTACAGGATGTGCAGTTTATGAATTTATAAAATCTAAGTATGAGATA
AGTAAGCCACATTCATTTGTACCGAGAAGTGGGACGAGTATAATGAAGGCATTTTGGGCAATAAAAAGTG
CAAATATAAAATTAGATAAATTCAGTATAGATGTAGTTGATAGATATGTTGTGGAAGATGCACTTAAAGA
ATTTGATATTAAAGCAACGAGTGTATTTTGTAATCCATTTTCTTTGGAAGTAGGAGAGTCTGAACTTGTA
GAATGGCATATAAAATTATTTGAAGAAAATAAGACGGATATAATGTTAACTGGTTTTGGTGCAGTATATA
ATGAATTAAAAGAAAGAGGCTATCCTGTATTTCGTTTACAAGCTACTATACAATTAATCAAAGAAAGTTA
TGATAAGGTAAAGAGTGAATATGCTCTAAGCAAGGCAAGATTTTCTCAAATTGCTGTCGAAATATTGAGT
CTAATAGATTATAAAGAGAAGATAGATAACTATTATTCTGACATGATAAAAAAATCAGATATGGATAAGC
TTGTAGTAAACTATGTAAGAAGCATTCAAGGTTCCTTATTTTTACTTGGAAGAAATGATTATGTTGTATT
TGTTCATAAAGGGGTAGCTGATAATGAGTATAATTATGATAAGCTATTCAATCTAAAGAGAGAGATAAAA
GACATGGGCTTTTCTCTTAGTATAGGAATTGGTACTGGAGTAACTGCGTATCAGGCTGAAAATAATGCAC
ATAAAGCATTAAGACACTCCATAGATTCAAAAGAAATTGGTATATATTTGGTAGATGAAGATGAAAATAT
AAGAGGACCTTTAGCTTCCGAAAATGAATTAAATTATTCTTTGATGCTATCTGATGAAAAGGTAATAGAA
ATATCTAAAAAGACTGGAATGAGTTGTGAGTCAGTTGCAAAAATTATTGCTATAAGTGAGAATAGAAAAA
GTAAGATTTATGATTCAAAAGAGTTAGCAGAGTATCTAAATGTAAGTGAAAGAAGTGCAAGACGTATATT
AAATAAAATAGTAAATGCAGGTTTAGGTCGAATATGTGCAAAAGAGACTAGTATTGGTGGAGGAAGACCA
AAAAATATTACTGAAATACTGTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c546836-545730 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAGATAAAAATAGACTTATAAATAATTTTATGGATATGGTTAGAATTGATAGCCCATCTAATCAAG
AATTAGAAATGTCTAAGTGGTTGGTAAACTACTTAAAAGAAAGAAATATAGATGCCATTATAGATGATGC
AGGTGAAAAATATGGTGGTAATACAGGTAATGTCATTGCCTATATAAAAGGTGAAGAAGGAAGTAGACCA
CTTTGTTTATGTGCACACATGGACCAAGTTCAACCTTGTTTAGGTGTAAAACCAATACTAGATGGTAATG
TAGTTAGAAGTGATGGAACTACTACACTTGGTGCAGATGATAAAGCTGGAATAGCTGCTATACTTGAAGC
TTTAGAACATGTTACTACAGAAAAAATACCACATAGAGATATTTATCTTTGTTTTACAATCTGTGAGGAA
GCTGGTATGCATGGTGTCAAAAACTTTAATCCTGACAACTTGCCTTGTAAAGATATGGTGATTTTAGATT
CTGGTGGAGCTATTGGTTCGATAGCATACAAAGCTCCTGCTCAACAATCTATAAAAATCTCTTTTCATGG
AAAGAAAGCACATGCTGGTATAGAACCTGAAAAAGGGTTAAATGCTATATTAGTAGCCTCTCATGCAATA
AGCAATATGCACATAGGCAGAATAGATCCATTGACTACTTCAAATATAGGTAAAATAGAAGGTGGTGGAG
CTACAAACATAGTAACTGATAAGGTTACATTGACTGCTGAAATTAGGTCTCATATACCTGAAACTTTAGA
GTATGAGCTTAATCATATGGAAAAATGTTGTAAGGATGCTGCATCTAAATTTAATACTACTTATACCTTT
GAACATAGTATGTCTTACCCTAGTTTTGAACTTAGTAGAGATAGTCACGTTTTCAAGTTAAGTGAAGAAG
CAATAAGACAAGTTGGTGTTGTTCCAAATCCAATGGTAATTGGTGGTGGAAGTGACGCAAATATATTAGC
TAATCTTGGATATAATTGTGCTATATTAAGTCTAGGTATGTATGATGTACACACAGTTAATGAATATGTA
AATATAGACGAATTATATGATACTGCCAAAATAGTTTATCATATGATTAAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c548412-546871 putative aminobenzoyl-glutamate transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGATAACGTAGTTAAGAAGAAAAACTTTTTTGACAGGACATTAAACAGAATAGAAACTGTTGGTA
ATAAACTACCAGACCCAGTTACAATATTTTTAGGGTTATGTGTACTTTTACTTATACTATCTAGTCTAGT
TGGTTCTATGGGGATATCAGTAGTTCATCCTGGTACTGGAGAAACTATAACTGCAGTAAATTTATTGACT
GTAGAACAGCTTCAAATTCTTTTAGGAAACATAGTTAGCAATTTCCAAGGGTTTGCTCCTTTGGGTCTAG
TTCTAGTAACTATGATAGGTGCTGGTGTATGTGACAAAACAGGACTTATGACAGCAACAATCAAAGCATC
AGTAAGCAAGATTCCTGAAACAAGAGTAACTCTTGTTGTAATGACTATAGGTATGCTTGCCAATATAGCT
TCAGATGCAGGTACAATATTATTTCCACCATTAGCTGCACTTGTATATCTTGGTGTTGGTAGACATCCAC
TTATAGGTTTATTTTCTGGATATGCAGCAGTCTGTCTAGGATTTGCCGCAAACATTATGATAAGTGTCAA
TGATATACTTGCTGCAAGTTTTACAGTTCCAGCAGCTCAAATGATTGATTCTGGATTTCAAGCCAATGCA
ACAATGAACTTATTTTTTATGATAGCATCAACTTTTGTTCTAATACTTTTGGCAACATGGGTAACAGAAA
AAATTGTAGCTCCTAGATTTGGTAAATATGAAGGAAATGCAGAACTAGATGTTGATGGAAGTCTTAGTGA
TGTAGAAAAGAAAGGGCTTAAAAAAGCTGGTATAAGTATATTAATATATGTAGCTATTATAGTAGCTCTT
AGTGTAATCGGTAAAAAACCATTCTTAGCTGACCCAGAAACAGGAGATTTACTATCAAACAATGCTCCTC
TTATGAAAGGTATGGTACCTATAATAGCACTAGCATTTTTCATACCTGGTGTTGTATACGGAAAAACTAT
AGGTAAAATAAAGAAGGATAAGGATGTAGTCTCTATAATGGCTAGTGCAATGAGTGATATGGGTGGATAT
ATAATACTAGCATTTGCTGCTTCACAATTTTTGCAATTATTCACAAATAGTAATTTAGGTCTGATACTAG
CTGTAAAGGGCGGAGAATTTTTAAAATCAGCAGGAATAAATGGACCTTTATTGTTGATAGGATTTATTAT
ATTATCATGTTTTATAAATTTATTTATAGGTAGTGCATCTGCAAAGTGGGCTATTCTTGCACCTATATTT
GTACCAATGTTTATGATGGTTGGATACAATCCAGCACTTACTCAGATGGCTTATCGTATAGGTGATTGTA
TAACAAATCCACTTAGCCCATTATTTCCGTACTTCCCTATTATACTAGCATTCACAAGAAAATACGATAA
AGATGCTGGTATGGGTACTGTAATTGCTAATATGATACCATACTCTATATCATTCTTAATAGTGTGGACT
ATACTATTAATATTGTTTATGGTATTTAATATTCCACTAGGACCTGGAATACTTCCTTCATATAGCATGT
AA
>ref|NC_013316.1|:c549520-548774 metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAATGCAGGAAATCGAATTATAAATACATGGTTGTACCCTATTCAAGATGGCTTTGTCTTGATTG
ATACTGGATATGAAAATGGTTTTAAACATTTCAAAAAACGAATTTCTAAATTCAACATAAAAATCAAAGA
TATTCGATACATATTTCTAACTCATGCTCATGATGACCATGTTGGTTTTCTAAATCAGATTCTAGACGAA
TCTCCTAATACAAAGATTGTTATGCATGATAAAGCTTTAGAAATTCTATATAAAGGTCAAAACTCTTTTA
TTGGTGGTTGTAACAGCCGTACTGCCTTTCTCTTTTGCCAAATTATGAAACTATTTGGAAAAGGTGAGCA
TAGTTTTTCTCCACTTAAACAAGAATTTGAAAAAAGGTGTATTCTTGTGTCTGACAAGAATCGTAAAGAA
ATTGAAAAAGAACTAAATGGAAAAATTATAGATACACCAGGACATACTGCTGATTCAATTTCACTACTAA
TTGATGATGGTGTTTTATTTTGTGGAGATTCTGCAATGAATGGATTTCCAAGTACTCACAAAATTACCAT
ATTTGCAGAAAGCAAACTAGAATTTATTCAATCTTGGAAAACAATCATCAATACAAAACCTAAAATGATT
TATCCTGGACATGGAAAACCATTTGAATACAGTAAATTAGAACAAAATCTAATCTATGTAAATAAAATAA
ATTTATATCCTCTACATAATTCAAAAGATATTCACAGATTTTTGTAG
>ref|NC_013316.1|:c551042-549732 putative amidohydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAGAACAATTAAAATCTCTAGTAATAAAAACTATAGATGAAAATAGAGAAAAAATATTAAAAA
TAGGTCAAGGAATATACAAAAATCCAGAATATGGATATAAAGAATTTAAAACTACAGAAGCTGTTTCAAA
CTTTTTTGAGCAAGAATTAAATTTATCTGTAGAAAAAAATATAGCAGTTACAGGATGCAAAGCAGATGCA
AATTCTAGCAAGAAAGGTCCTCATATATCTATACTTGGAGAATTGGATGGTATATCATGTAAAGAACATA
AAGATGCTAATGAAATAGGTGCTTCTCATACTTGTGGACATAATATTCAAATAGCTGGAATGTTAGGTGC
TGCTGTTGGTTTAGTAAAAAGTGGCGTTTTAGAACATTTAGATGGTAAAGTATCTTTTATGGCTACTCCT
GCTGAAGAGTTTATTGAGTTGGAATACAGAGAGCAATTAAAAAAAGAAGGAAAAATAACTTATTTTGGTG
GAAAACAAGAATTAATAAAAAGAGGTTATTTTGATGATATAGACATATCTATGATGTTTCATGCTTCTGA
TTTAGGAGAAGATAAGGCTCTAGTTGGTCCTGAGAGTAATGGATTTGTTGGAAAAAAGGTTAAATTTATA
GGTAAAGAATCTCATGCTGGTTCTGCTCCACATGATGGAATAAATGCTTTAAATGCAGCAATGCTTGCTA
TAAACAACGTGAATGCACTTAGAGAAACTTTTAAAGAGTCTGAAAGAGTTAGATTCCACCCTATCATCAC
AAAAGGTGGAGATATAGTAAATGTTGTTCCTGCTGATGTTCATATGGAATCATATGTTAGAGCTAGAACT
ATAAATGGTATGATTGATGCTAATGAAAGAATAAATAAGGCTTTGATGGCTGGTGGAATGGCAGTTGGAG
CTGATGTTGAGATAACTGAAATTCCTGGATATCTTCCAATATTACGATACAAAAGTCTTGATAATTTATT
TAAAAACAATCTTGAAGATTTAGGTCTAAAAGGAAAAGTTATTGATGGTGGAGATTTTACAGGCTCTTTT
GATTTTGGAGATGTGTCTCATATAATGCCTACTCTTCACCCTATGATTGGTGGTGTAAAAGGAGCTCTTC
ATACAAGAGATTTTGAAATAGTTGATGAAGATTTAGCTTACATAATTCCTGCTAAAGCAATGGCACTTAC
AGTTGTAGACCTTCTTTTTGATAATGCTAAGGATGCTAAAGATATATTAGATACCTTTACTCCAGTTATG
ACTAAAGAAGAATATCTAACATTCCTAGAAAAACACGATAAAACTTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c551525-551055 hypothetical protein CDR20291_0454 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTGCTAATTTAAATTTAAAGAAAAGTTCATATCAATTATTGGTTATGTCTGTTATTGGAGTTATAA
TTCTTATAGGACAAAGAATTAGCGTTGGTACATCTATAGTTACAGCTCTTCCTGGTATGGTGATGCTAAT
ATTAGCTGCTATGGCAGCTATGATTATAAAAGATTTATTTCCTAAATCAATCTTTCCAGCTTTTGGATTT
GCAACTATAATCGGCCTTTTACTTAGTATGCCATATAGTCCAACATCTGAAGTATTCTTAACTAACACTA
ATAATATTAACTTTATGGCTATAACTACTCCACTACTAGCTTTTGCAGGAATTTCTGTTGGAAACAAAAT
AGAAGCTTTAAAAGAAATGTCATGGAAAATAGTTATAATTTCACTTATTGTATTTACAACTATATTCTTT
GCATGTGCGAGTATAGCTCATATAGTTTTAAGTATTCAAGGTAAAATATAG
>ref|NC_013316.1|:c552380-551529 hypothetical protein CDR20291_0455 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAATTAATAAAAAACATTTTATTCAAGTATTTTTAACTTGCTTAATCTTGGTAGTAATATGTGAAT
TTATAGGGCAAAGAACTATAGCTATTGGAAAAGCCTCTATAGTACTGTTCCCTATGCTTTATGCAGTTAT
AATTGGACTTATAATAACACCAGATTTATTAGGTAAAAAAATTAAAGCACTTAAAAAAGTGGTTGGAGAA
AAAGAAATAAATATTGCTGGTGAAGTTGTTGGAATTGCACTAGTAATGCTTGGTATAAAATATGGTACTA
CAGTTGGACCAAACATTGACAAAATAATTCAAGCTGGACCAGCATTTATCGCTCAAGAATTTGGTCATAT
ACTTGCACCAATCGTTGCATTACCTCTTGCATTAATGTTTGGAATGAAAAGAGAAGCTGTTGGAGCTACT
GCAAGTATAAGTCGTGAACCTTCTTTAGGAGTTATATCAGAAAAATATGGGATAAACTCACCAGAAGGTA
GTGGTGTACTTGGTACATATTTAATGGGAACAGTTCTTGGTACTATATACTTTAGTGTACTAGGTTCAAT
ATCTATTTATAGTGGTCTTCACCCATATGCTTTGGGAATGGCCTGTGGTGTTGGTAGTGGAAGTATGATG
ACAGCAGCTGCTGGTTCATTATCTACCATGGTACCACCTGAAATGGCAGATACAATACTTGCCTATGCTG
CAACAAGCAATATGATGTCTAGTATAACAGGAATTATATTCTTAGTTTTTGTATCCTTACCATTTACTAA
TTTTATGTATAAGATTTTAGAACCTAAATTTTCGAGAAATAAAAAAACTAAAGAAATTAAATCTACAGAA
GGAGAGTGCTAA
>ref|NC_013316.1|:553305-554216 DeoR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATAAATAGATTAACAGAAATAATAGTAATTCTATTAAATAAAAAATTAGTAACAGCTAAAGAGT
TGGCAGATAGGTTTGAAGTTTCTACAAGAACCATATATAGAGATATAGAAACTCTGTCTATGTCGGGAGT
ACCAGTATATATGACGAAAGGCAAAGGAGGAGGGATATCTTTAATAGAAGAATATTCTATAGACAAGGCC
ATACTGTCAAAAAAAGATAAAGAGAGTTTAATAGTTGCACTGAAAACATTACAGGCGACTAAGTATCCAG
AAATAAATTCAGTAGTAAATAAAATTGGCTCAATATTTGGAGAGCAGAATTTTTCAAACTGGATTGAAAT
AGACTTTACTGAATGGGGAAGTAATTTTAATGAAGATGATAAATTTACAAAAATAAAAGAAGCTATTTTA
AGACGTAATACTATAAATTTTAATTATGTAAATAGTTTGTCAAGCCAGACAAACAGAACTGTCGAACCAC
TGAAGCTTATGTATAAGAGTAAGACTTGGTACTTGTATGGATTTTGTAAACTAAAAGATGATTTTAGGAT
ATTTAGAATTAGTAGGATAAGGAATTTATCTATAAAGGATGAAGTATTTTCAAGAAAGATAATAGAAGAA
GTATGTTTGAATGATTCTAAAGTAATTAAGGAAAATACTATAACGTTGAAATTGAGGTTTAAAGAAAAGA
TGCTTTTTAGAGTATTTGATGATTTTAATAAGGATTTAATAACTAAAAATGAAGATGATACATATGATGT
AATTACAGAATTTCCTATTGGTGAATGGATTTATGGATATATTTTATCGTTTGGTGACAATGTTGAAGTA
CTTGAACCTAAAGATGTTAGGGATAATGTAATAACTAGACTAAGGGAGTTGTCTAAAATTTATTCATTAT
AA
>ref|NC_013316.1|:554391-554888 hypothetical protein CDR20291_0457 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTATGAAATAGTAGAGATAAATGAGAAAATAGTTATAGGAATATCGAAGGAGACTACAAATAAAG
ATGGACAAGCGGTAAATGCTATAGGTGAATTGTGGAAAAAATTTATGGGCAAAGGGATATATAATGCTAT
AAAGGGTAAAAAGAATGACAAGACAATAGGTCTATATACAGATTACCAGGGTGATTTTACAAGTCCGTAT
AGCTTTGTTGCATGTTGTGAAGTAAATAGTAATTCTGATAAAGAGAAGAATTTAGAAGAATTAAACACTA
ATAATACTGTTGGAGAAAGTATTATTAGTAAAGTTATACTAGCAGGTAAGTATGCAAAGTTTGTTATAGT
AGGAGGTCAAAAAGAAGTAGGAGATTTTTGGTTTAAGTTTTGGCAAATGGATTTTGATAGGACTTATATA
AGTGATTTTGAAGAGTATCAATGTAATACTTTTGATACAAAGAAACAAGAAATTCATATTTACATAGGAA
TAAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:555632-555994 chemotaxis protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATAAAATTTTGATAGTAGATGATGCTATTTTTATGAGAATGATAATTAAAGAAGCTCTGAGTA
AAAGTGGCTATAATAATTTAATAGAAGCAAATGATGGAGAAGAAGCGTGTAATATATTTAAATATGAAAA
GCCTGATTTGATGTTGCTTGATATTACAATGCCAAAAAAAGATGGTTTAGAGGTGCTAAGAGAAATAAAA
AAGTTGGATTCAAGTGCTAAGGTTGTAATGTGCTCTGCAATAGGACAAGAGAATATGATTGTAGAAGCCA
TAAAACTTGGAGCGTTAGATTTTATAGTGAAGCCCTTCAAAACAGAAACATTAGTTAAAGTTGTAAATAA
TGTTTTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:556156-556677 chemotaxis protein CheC [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAATAGCAATGTAGAAGTATTAATACCTATGGTCAAGATACTTGAATATAATGAAGCGACAAATT
TGCTTGGTGGTCCAGAAAACAAAGTAGTATGTATTTTACTCGATATGAAAGGTGATATCAATGGAATGTT
TATGTTTTTGTTGGATGAATCAATAACTCAACTTATGCTAAGTTCTCTTTTTAATAAAGAAGAAGCTTTT
TTAGATGAGATTGAGGCAATTGAAATTTCAGCAATTAAGGAAATAGGAAATATTATGGCAAGTTCATATG
TAAATGCTATTGCATCTATGTTAAACATGACTATAAGTGTTTCAATTCCAGATATATGTATTGATATGGT
TGGAGCTGTTCTAAATGTGCCTATGATAAGATTTTCAGATGTTGGTGACAAAGTCTTATTTATAGAAAAT
AAATTTAAAATGAGTGATAATTATTTTACTAGCCACATTTTGATGATTCCAGAAATGAGCTCACTTAGAG
AAATACTCGTGAGGTTGGGATTAGAAGTATGA
>ref|NC_013316.1|:556674-557159 chemotaxis protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAGAGAGATAGTAGTGAACATTGCAGATATGAAGATAGCCTATAGACCAAATGTTTTAGTTACTT
ATGCACTTGGCTCTTGTGTAGGAGTATGTTTGATAGATAAAGTAGCTGGAATTGGTGGAATGTTACACGT
TATGTTGCCATATAGTAAAGATGCTATTAACATTGAAAATAAGTGTAAATTTGCTGACACAGGAATAAAT
GAGCTCATTAAATCTATGGAGAATATAGGTGCAAATAGAATATATATAAAAGCAAAAATTGCTGGAGGTG
CTCAGATGTTTTTAGGAAGCAGCAATTCAGTAATTGCAAGTATAGGACATAGGAATGTTGAGGCAGTAAA
AAAAACTCTTTTAGGATTAAATATTCCAATATTAGCTGAGGACACAGGTATGAATTATGGTAGAACAATA
CGTTTTTACACTGAGACGGGTGAATTACTTGTAGATTCAATAAATAAAGGTAAGAAGAAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:557202-557720 chemotaxis protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGATTTCCAGATGACCCATATTTAGATTATGGACTAATTGATGAAGGAATTAAGTATCTAAAGTTTA
AAGTAGATGAGCAAGATTTTGGGGTTGAACTTGAAAAGGTAATAGAAATTACTGGAAATCAAGAAATTAT
ATTTATTCCAGAACTACCTACATATTCTAAAGGCATAATAAATCTAAGAGGAAAAATCATTCCAATAATA
GATATGCGTTTGAGACTTAAAAAAGATGAATTAATGACTACAAATTGCATGTATATAGTAGTAACTGAAA
TAAAGGACTTGGTAGTTGGATTTGTGGTTGATAGAGTTGATGATATAGTAAGCTTAGAAAAAAGTAAAAT
ATCACCTCCACCAAGAGTTACTATAGAATATTCGGATTATTTTGTAAGTGGCGTTGGAGAATTAGAAGGT
AAAATAATTACTTTACTAGATTTAGAGAAACTTTTGACAGATAAAGATGAAGTTTTAATAGATGAATTAA
TCAATGGGTTTGATTGCACTATCATGTAA
>ref|NC_013316.1|:557835-558815 putative chemosensory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAAGAGAGGTTTGTATATGAAAAATAAGCAACAGGGAACAATTTTAGTCGTTGATGATAGTGTTC
TGATGTGTGACTTAATAGATAAAACACTTACAAAAGATAATTTTAAGGTTAAAAAAGCATTTAATGCAAT
AGAGGCAAAAGAATTTATTGAAGAATTTATACCAGACATTATTTTGCTTGATATAATTTTACCAGATAAC
TCTGGTTTTGAGTTTTGTAAGGAAGTAAAATCTAATACTCGTACAGCAGATATACCTATAATTTTTATAA
CTTCAAAAAATACAGATACAGACATAGTAAAAGGATTTGGTGTAGGAGCAATTGACTATATGGTGAAACC
TTTTAGTATGACAGAATTAAAAGCTCGTGTTATAGCTCATCTTGAAGTAAAGAAATCTCAAGATAAATTA
AAAAAGATAAATAATGAACTGGAATCTTCTCTTGAAAAATTGAATAGACTCGTTGTAAGAGATTATCTTA
CAGGTCTTTACAATAGGCGACATATAATTAATCAGCTTATGGAGCAAAGAAGAATTAATAAATATAGTGA
AACATCAATATCCCTTATCCTTGGTGATATTGATGACTTTAAGGTTATCAATGATACTTATGGGCATGAA
GCAGGGGATTTCGTGTTAACAGTAATATCAAGTATAATAAAAAAGAATTGTAGACAAATTGATACTGTAT
CAAGATGGGGTGGAGAAGAGTTTTTGATAATGCTCACAAATACTCCAATAGAAGGTGCTAAGATACTTTC
AGAAAGAATCCGTAAAGAGATAAAGGAGTTTGATTTCAACTATAAAGAACATAAAATAAAGTGCACTATT
ACATTAGGAGTAGTAGAAGTAAACTCAAATATATCATTAGAAGAAAACATATCCTTAGCAGATAAAGCAA
TGTATGAGGGTAAAAACTTAGGAAAAGATTGTAGCGTAGTGAGTACAATGAAAGGATTAAAAAAGATATA
A
>ref|NC_013316.1|:558841-560544 putative methyl accpeting chemotaxis protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGAGAAGTAAAGCTTTCTAAATTAGCAATTGTATTGCTGATTATTATAGTATTGGCTGTTCTAG
CAGGGATTTTTTCTTCTATTTCATCTTATAAAGCATTTGAAAAAGTAGAAAAAAGTATTAATGATATGAA
TAATTTGAGGACTCAAAGTCAGTATATAAAAGATACAACTAGAGAGATAAGTGATGTATTAAGAAGATAT
GTATTTACAGGAGAAAAAAAGAATAAAGATATTTATGAAAAAGAATTATACGGAAAAACAAGAGAATCAG
CTTTAAACAAATTAGAAAAAATTGGTCTTACAAAGAGCGAGTCAAATAAAATCTTAGAAGCAAAAGAAAT
ATCAGATTCTTTAGTACCAACAGAACAAAGTGCAATAAAGGCAGTCGAAAGTAATGATAAGAGTAAAGCT
CAAAGTATAATTTTTGGTAGTGACTATATAAACTCCCAAGAGAAAATGGATTCTTTAATAAATGAATTTC
AAGAGGATATAGTTACCCGTTCAAATTCCAAAATTGTAGAAGTAAAAAAAGAATTACAAAGTCTAATATT
AAGAACAATATTTATACTTTCCCTTTTAATAATATTGACAATAATAGAATATACAGTAATAAAATTAAAG
ATAGTGATTCCTATTAATAGAGTAGAAAAACACTTTTCAAGAATTGCATCTGGGGACTTAAGAACAAGTA
TAGACGTTGAAGAAAGTAAATCTGAAATAGGACTATTAGTGAGTTCTGTCAAAAAGATGCAAAGTATGCT
TTTAAATTACATAGACCTTATAGACAGTACATTAACTAGTATTGCAAAAGGAGATTTAAGAGTAGAGATA
GACCAAGAATTTATAGGTGATTTTAAATCAATTAAAATATCTTTAGAAAGTATAATAAACTCTTTTAATG
GTGATTTTTCTGAAATAAATTTATCAGCAGAACAAGTTGCAAGTGCTTCAGAACAAGTTGCAGCAGGTGC
ACAAGCTCTTTCACAGGGTGCTACTGAACAAGCTAGTTCAGTAGAAGAATTAGCTTCCACGATTAATGAG
ATATCAGATGGAATTAAGAAGTGTGCAGATAGTGCTAGTCTTGCATGTGAGGTATCTGACCAATCTGCAT
CACAAGTTGGTTTTGGAAGTAGATGTATGGATGATATGATGACATCAATGGGTGAAATAAGTGAAAAATC
GAGTGAAATATCAAAAATAATCAAAACAATAGATGAGATAGCATTCCAAACTAATATTCTCGCATTAAAT
GCAGCTGTTGAAGCAGCAAGAGCAGGTCAATATGGTAGAGGATTTGCAGTTGTAGCAGATGAAGTTAGGT
CTTTGGCTGGTAAAAGTGCAAAAGCAGCTCAAAATACAGCTATTCTCATAGAAGAAGCTATTAAAACAGT
AGAAAATGGTGTCAGAATTGCTAAAGAGACTGCAAATGCATTGGACTTGGTAGTAAATGGTGTAGAAAAA
ACTACTAATTATATTAATGGTATTTCTTCGGCTGTACATAGTCAAGAAGTAGCAATTACACAGATTTTAT
CTGGAATAGAGCAAATTTCCATAGTAGTCCAAATGAACTCAGCAACAGCAGAGGAAAGTGCAGCAGCCTC
AGAAGAGATGTCTGCTCAAGCTCAAATTTTAAAAGAATTAGTAGAAAAATTTCATCTAAAGGAAAGTGAA
GTAAGAGAATCATCATGGGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:560771-562903 chemotaxis protein [Clostridium difficile R20291]
GTGATAAATGTGAATTATATTGAACCGAGTATGAGACAAATGTTAGATATGTTTATATTTGAGACAAGTT
TATTACTCGAACAATTAGATGAAATTATGATTCAAATAGAAAAAGAGAAAGTATTTACTCATAACAACAT
TAATGAAACTTTTAGAATAATGCATACGATAAAAGGTTCAGCATCTATGATGGGGTTAGACAATATATCT
GCTTTAGCACATAGTGTAGAAGACTTGTTTTATGCTATACGTGAAGGTAAAATAGAAGTTTTAGACAATG
ACCTATTATTTGATTTAGTCTTTCAATCATTAGATTTTATAAGAAGAGATATAGATGAGCTACAATCAAG
AGGTTGTATATCTTCTGATTACTCTAATTTTATTGAAGGAATTGAAGAGTATGTGAGTACTTTGGAATTA
TCAAGTTCTATGAAATCAAAGGATAATGCAAATTTAGAAAGTACAGACGAAAAAGAAGCAATCGATTCAA
ATTTTGAATACAAAGAAGACTCTGATGTAGTAAAAATAATCTTTGAACAAGGTTGCATGATGGAAAATGT
GAGAGCGTTCATGCTTGTATTTGAACTTAGAGATTACTGTGAATTTATAGATTTTTATCCAAAAGATGTA
GAAACAAATGCAGAGTCTACAGAATATATTAAAAGTTATGGGTTTTATATACAATTTGTAGCTAAAGAGG
ATAAGGCAATAGTTTATAAAACTATAGAAGATAATCTCTATGTAAAAGAATACATAAATATTAGTAAAAA
AGAAATAGAAATGAAAAATACATCAAATAATGATGCAGTAGAAAATAAATTAAAAGATAATAATAAAGTA
AGTAAAAGTTATCAAAATAACTATACAGAAGATGAGATACAAGAAGATGTTTTAAATGAAAAAACTGATA
TGGAAAAAGATAGTCTAAGTGAAGAAAATGAACATTTACCAATAAGTAAGCAGAGTATTATGAGTGTAAA
TTTAGAAAAATTGGATTTACTTCAAAATATAGTTGGAGAAATTGTAATTATGGAATCAATGGTTGTAAAT
AGCGTAAATTCTACAGGTGTTGATATAGATAATTTCAATAAGGCAACAAGACAATTACACAAGCTTACAG
ATGAATTGCAAGATATAGTAATGTCTATGCGTATGATTCAAATTGCTGGTGTATTTCAAAAAATGCATAG
AATTGTACGAGATATGAATAAAAAATTAGATAAAAATGTAGAGTTAATAACTATAGGAGCAGAGACAGAG
GTAGATAAGAATGTAATTGATAATTTAGCAGAACCTTTTATGCACCTTATAAGAAATGCTATGGACCATG
CAATAGAGCCTATTGAGGAGCGTATAGCGAAAGGTAAAGAAGAAGTGGGAAAGATAGTTTTATCTGCTGA
GAATCTAGGCGGAGAAGCTGTGATAAGTATTTCAGATGATGGTAGAGGCATTATGAGAGATAAGATTTTG
GCAAAAGCTAAGGAACAAGGTCTTCTTAAACATCAAATTAATGAGTATACTGATGACGAGGTCAATTCTT
TGATTATGACTCCAGGTTTTTCTACAAAAGAATCTATAACTGAATTTTCTGGAAGAGGAGTAGGCATGGA
CATTGTTCGTAAAAGTATTGAAAAAGTTGGAGGTTCAATTGAAGTAAAAAGTAAACAGGATGAAGGGACA
ACCTTTACTATAAAAATACCATTAACTCTTTCTATAGTAGAGGGTATGAAGTTTAAAGTTGGAGATTCAC
TATTTACTTTACCAATATCATCCATAAGAAGAACATTTAAACTTACAGACTTAAATCAAATAATTACAGA
AGGAAATAAGACAGAGTTAATTACAATATATGGAGCATGTATTCCCATTATAAGGTTACATAAAATATAT
AATATTCAAACAAAAGTAACCAATCTGATGCATGGTAATATGATAATTATTGAAAATGAGCATAAAGCAG
TATGCATTTTTGTTGATGAAATAATAGGTAATCAGCAAGTTGTTGTGAAACCATTTCCAGTTTATTTCAA
CCGATTTAATATAAAAAATAAGGGTTTATCGGGATGTACAATACTTGGGGATGGAAGTATAAGTTTAATT
ATAGATGCAGATAGCATTATAGAAATATATTAG
>ref|NC_013316.1|:562916-563356 chemotaxis protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTAAAGATGAAATTATTAAACAAGTATTAACATTTTATGTAAATGATGTTATTTATGGAATAGAAT
TAGAAAATGTGATTGAAACCATAAGATTTCAATCAATAACGTATGTACCATGTCTTCCAACATATATAAG
TGGAGTTATTAATTTGAGAGGAAGAATAATACCAGTTATTAATATGCATATAAAGTACAATCTTCCTAAA
GCTGATTATAATGAGAGAACTTGTATAATAATTACAAAGGTTGATGAGTATCAAGTTGGAATTATTGTAG
ATAAAGTTGTTGATGTTATTCATATAGAAAATCTAAATTTACTAGAGACGACTAATTCTAACAACACTAA
TATTAATAAAGATATAAAAGAGATTGCGAAAGTTGAAGATAATTCTATATTAATTTTAGATATTCGAAAG
TTTTTGATTAATAGCATATAG
>ref|NC_013316.1|:563392-564195 chemotaxis protein methyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAAACTCACAGATGAAGAATTTATAGTTCTTGTAAACCATGTAAAAAAAGAATATGGTATTGATT
TAAGTAAAAAAAGAGCGTTAATTGAAGGTCGCTTATACAATACAATGATAGAGAAAAAACTTAGTTCTTT
TAGTCAATATATGAATCTATTATTTAAAGATAAGACAGGAAATGAAGCTATAAACCTAATAAATAGATTG
AGTACTAACCACACATTTTTTATGAGAGAACCTCAACATTTTGAGTTTATACAGAATAGTATACTTCCTT
TTTGGGAAGAAAATAATAAAATAAGAAACATAAATATATGGAGTGCAGGATGTTCTAGTGGAGAAGAAGC
GTATTCAATAGCTATGACTTTGGATGATTATTTTGGATATAATAAAGAGTTGTGGAACATTAAAATCATA
GCCACAGATATTTCAACTAACTCACTTGAAAAAGCTAAAAGAGGTATATACATAGAATCAAATGTTAACA
ATGTTCCTGAGTTATGGAAGAAGAAGTATTTTATAGACAACAAGGATGGTACATTTAAAATTTGTGATAA
GATTAGAAAAAGTGTAATTTTTAAGTCATTTAATTTAATGAATGATTTCTCATATCAACATTTTGATTTG
ATTTTTTGTAGAAATGTTATGATTTATTTTGATTTAAAAACAAGAGAAGAACTTATAAATAAATTTTATA
ATGCTACCAAAAAAGATAGTTTTTTGTTTGTAGGACATGCAGAAGTAATCAACAGAAGTAGTACTAAATA
CAAATATGTAAAACCTGCTATATATAAACGATAA
>ref|NC_013316.1|:564253-564831 putative chemotaxis-related protein-glutamate methylesterase [Clostridium difficile R20291]
ATGGTTATTGCTATAGGCGCATCTGTAGGTGGTACAGAAGCAATACTTGAAATTATAAAAGACCTACCAA
AATCAACACCAGGGATTGTTGTAGTTCAACATATGCCAGCTATATTTACTTATATGTATGCACAACGGCT
TGACAAGCAGTGTATTATGAATGTAAGAGAAGCTAAGAATAATGATAGAGTCGAACAAGGAAATGTGTTA
ATTGCACCTGGGGGTTACCAGATGAAATTGTGTACGGATAAACAAGGATATTATGTAACTTGTGAAAAAG
GAGAAAGAATAAGTGGTCACTGTCCATCAGTAGACGTTTTGTTTGATTCAGTAGCAGAAGTAGCAGGTAA
AAATTCAATAGGAATAATACTTACAGGTATGGGTTATGATGGAGCAAATGGACTTTTAAAAATGAAAGAA
AATGGTTTATTTACAATTGGACAGGATGAAAATTCTTGTATAGTATATGGAATGCCAATGGTAGCTTTTG
ATAGAGGTTCTGTTATGTTACAATTACCTCTTGGTGAAATTTCAAACTGTTTGATAAGACATATTAATAT
TTTAAAACAAAAAGATTAA
>ref|NC_013316.1|:564937-565800 hypothetical protein CDR20291_0468 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTTTTTAAAGTCGATACAAAAGCTAAAGTTTTAAGATATGTATTTGTTTTAACATTGACTATAA
TGGCTGTTTTGGCAATTAAACATGACTATAAATATAATAATTTAAGGAAAGATGCTTCAATTAATTTAAA
TAGTAATAAGGAAGCAGTGACTGTTATGAGTAACCAGTCATTACCAAAGGGTAATACAAATAGTAAACAA
ACTTTATCAGTAAGTACAATAGGAAGTAAAACAATAGTGAAAAATGATGAGTATTTAGAAAGTACTATAA
ACATGCCTGTAATAACAAATTCAAATAAAATTGTTGAAAGGTCTACAAATGATAAGATAAAAAATGACAT
ATTTGAATTTTATAATAAATCATATAAAGAAGCAAAGCAGTATCTTAAGGATAATCCTGACGAGAAAAAT
AAGTTTGTTGCAAATGTAGACTTTGAACTTAAAAAGAATACTGATTCTGCTCTTAGTATAAAAGTGAGAT
ATTATACTTATAGTGGTGGAGCACATGGATTTTATCAAGATATAGCATATAATGTGGATATGAGAACTGG
AAAATTTTTAGAATTAATGGACTTATTTAAGGATAATACTAAATATAAAGAAGTTATAGATGAAGAAATT
AAAAGACAAATAGCTGAACTTGAAAAAAAGGATGAAGAAAATATCGGAATATATAATTTTAAAGGTATAA
AAGAGAATCAAAACTTTTACTTGCAAGATGAGAATCTAGTTGTATATTTTGATTTATATGATATAACTCC
ATATGCAGCGGGAATACCAGAATTTTCAATAAATAAAGCGTTGATAAGTTCTATGCTAAAACCAGAGTAT
GTAGATTTATTTGATTTGAAATAG
>ref|NC_013316.1|:565867-566856 putative ornithine cyclodeaminase [Clostridium difficile R20291]
ATGCTACTTTTAAAAAAAGACGACATAAAAAAAGTATTTACAATGAGAGATGCAATTGAAGCTGATAAGG
AAGCTTTTAGAATTTATTGTGAAGGAAAGAGTGTAAATCCTTTGAGAACCAATATATCTGTTCCAAGTCA
AGATGCTAGTATGTTATTTATGCCAGGATACGTAGAAGAATTAGGCTGTGGGGGAATAAAAATTGTATCT
GTATTTCCTAAAAATGCTCAAAAAGGCAAACCAGTAATTCCAGCAACAGTACTATTATTAGATGGAGAAA
CTGGAGAAGTTAGTGCAGTATTGGATGGTACTTATGTAACTCAGATTCGTACTGGAGCAGCCTCTGGAGC
AGCTATAGATGTATTGGCTAAAAAAGATTCTAAGATTGGAGCTTTGATAGGTCTAGGAGGACAAGGTGAG
CCACAACTTGAAGCCATGATAGAAGCTAGAAATTTGGATGAGGTAAGAGTTTTTAGTAGAAACAGGGAAA
GTAGAGAAAAATTTGCAGAAGAAATGAACTTAAAATTAAGTAAATATAATACTAAAATAGTTGCAGTTGA
ATCATCTGATGAAGCCATAGATAACGCAGATGTGATAGTTTTAGCTACTCCATCAAAACAACCAGTACTT
AATGGAAACTTAGTGAAAAAAGGAGCTTTAATAAGTGCAGTAGGTTCATATATGCCAGATATGCAAGAGT
TGTGCCCAAACTGTTTAACTAGAGCGTCTAAGATATTTTTTGAATCAACAGATGCAGTTTTATCTGAGTC
AGGAGATATATTAATTCCATTAAAAGAAGGTAAGATAAGTAAAGATGATTTTAGTGGTGATTTAGGAAAC
GTTATAAATGGAACTATTCCTGGAAGAGAAGATGATGATGAGATAATTGTATTTAAAACTGTTGGGATAG
GTGTACAAGATGTCGTAACAGCAAAAAGAATATACGATAAAGCAAAAGAAAACGGTATTGGAATAGACTG
GAAGTGGTAA
>ref|NC_013316.1|:566948-567559 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATGGTAAAAAAGTTAATATTGTCTACGATTATGGCTCTAGTTTTAGTTCTAACTATAGGGTGTT
CTAATGCAGAAGAAAAAGTAAAGTCGAATTTTGAAGCTAATTTAGCTGCATTAGAAATGTATAAGTATGA
TGAAAAAGGAATTTCTGATGCATTAACAGAAGCTGAATATAAACAGATTCAAACTTATAACAGCAAGGAC
AAGGTTTCAATGATTGCTCAATTGACACCTCTTTATGGTAAAGAAAATGCTGAAAAGATATACGAAACAA
TTGTTAAATTAATTCAAGGTGTTGAAAAGACAGTAACAGTGGAATCTTCTAGTAAGGATAAGATAACTTT
GAAAGTTGTAAGTAAAGCTTTAGATACTAGTAAAGTAATGAGTGAAGCGAACACTTTAGTAAAATCTTAT
GTAACTGATGAAAAGAATTACGATAAAAAAGAAAAAGAAGTTCAAGATGATATGACAAAAATGATTATAG
ACCTTTACAATAAGAAACCAACTAAGGAAGTTACAACTATGATTACATATACTAAAAAAGATGGTAAATG
GCAACCACCTAGTAATATACAAAAGTTATGTGAAGGAATATATACAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:568002-568799 hypothetical protein CDR20291_0471 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGGGGTGTTTTTTATGGTATCAAGGCAAGAATTAAAACGAGTATCTAAAGCTCAGTTATCTGGAA
ACTGGGGAATATGTGCAATTTCTATGGCAGTATATATTGCATTGATAGTATTAATATCAATTGTAGGATT
ACCTTTTGAACCATTGACTACTATTGTAGTGGCTGTAATAGCTTTTTGCGTTTCAGCAGGATTTACATGT
ATGTTCTTGAAAATTACTAAAGATGAAAAAGTCAAGATAGGAGATATCTTTGTAAGTGGGAGAATTTATT
TAAGAAGTTTTGGTTTTTATTTATTTGAATCAATTATTGTTTATATTTATTCTTTTATAATCACAATTAT
AGGAGCGTTTTTATCATTTGGAGTTTTACTTACTAGTGGAGCAATTGAATATTTATCAAGTGATAATGTT
GGAATAGGGACTATTATTTCTACTGGAATAACTCTAGTTCTTATAATACTTGTTCTTATGTTACCGGTTT
ATATATTGCTATTATATGTTTCTCAAGCTACTTTCTTAATTTGTGAAGACAAGGATAATATGGGTGTATT
TAAATCAATGGGTGCTAGTTTAGATATGATGAAAGGAAATGTACTTAAATTATTTGTACTAAACTTTAGT
TTTATAGGATGGTATATACTTTCAATAGCTACTCTTGGAATAGGTCTACTATGGCTAATTCCATATGTAG
GTGTTACTAATTGTAATTTTTATAGACAATTAGTAAAAGAAAACCCAGATGTAGAGGATATACTATTAGA
TAAAGAAAAATCTTATACTATGTACTAA
>ref|NC_013316.1|:569004-569363 putative penicillin-binding protein repressor [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGATAAAATTATTTGATTCAGAACTTAAAGTAATGGAAGTTCTATGGGAGAGAGGAGAAAGCAAGG
CTGGAGAGTTAGTAAAAATTTTAAAAGAAGAAACAGGATGGAATAGAAACACTACGTATACCGTTATAAA
AAAATTAGTGTCAAAAGGTGCAATAGAGAGAATTGAGCCAAATTTTGTTTGTAAAGCTTTAATAAGCAAA
GAGGAAGTACAAAAACAGGAAACAGAAACTTTAATTAATAAAATGTTTGGAGGGTCTTCAGAAAAATTTC
TTTCAGCTTTTATTAATAAAGAAAATCTTTCAAGTGATGAGATTACAAAACTCAAACAAATTGTTGAAAA
ATTAAAGTGA
>ref|NC_013316.1|:569374-570756 putative penicillin-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTCATTAAATTGTTAGAAATGAGTTTTACTTCTGGAGTATTACTTTTAATAGTTATTTTTATAAGAG
CATGTTTATTTAAAAAATTACCTAAAAAGGTATTTGTATTATTGTGGTTGATTGTTTTATTTAAACTTCT
AATACCAGTAAGTTTAAATTCTGGTTTTAGTATTTATAGTATAATTGAATCGACTTTTGATGTAGAATTG
GGTAATACATCAACAGAAAATTATACTCTTAAGAAAGCTAGTGACTCTACAGGTAAAAACAATTCTGACG
AATTTGAAATAATGTCTAATATTGAAAATATTATGATGTTGGAAATGTTGGGCATTTTGTCTTTTATAGT
TACTATTATGTTTAGCATACTTTTATGCTTTAGATATTTTAAAATAATTAATCTTTTTAAAACTTCAATT
CATATAAAAAATCATGAGTTCATTAAAAAATGGATGTGTAAGAATAGCCGTTTTAGAAGATTTATTGTTT
GCATATCTGAATTTACTAGGACACCACTTACATCTGGTATTTTAAAACCACGAATTATTTTGCCAAAGCA
AATGAATTATGCTAATAATCAAACTTTAGACTTTGTTTTAACTCATGAAATGGTTCATATTAATAGCTTT
GATAATCTGTTAAAGTTATTTATGCTTGTAGCTCTTGTTGTCCATTGGTTTAATCCCTTAGTTTGGGTGA
TGTTTTTTTTACTAAATAAAGACATAGAATTTAGTTGTGATGAAAAGGTTATGAGTATACTTGGTGAAGA
ATATAGGGCTGATTATGCAACCACACTAATAAGTCTAGCAGAGGAGAATAATCCATTTTCAATGACAATA
TGTAGTGGATTTGGAAAGACAAAAATAGAAAAGAGAATAGTTAATATTATGAAATTTAAAAAATCAACTT
ATGTTACTTTTTTAGTTTCAACTGTATTAGTTTGTGGGACAGGTCTTGTTTTTGCAACAGAAAATAAAGA
GATTAATGAGGTTGAATCTTTTGGTTTAACAAAAAATGAACAAAGTGATAAAAGTGGATTTTCAATAAGT
AGTAAATCAACTGATTTATATTCTCCCAAAGTAGAATCTGATATTCTTGTTAGTAAAGCTAAAAGTGATG
GAGAGACTCATTTTAGTACGGCAAAAGTATCTGTAATTGAATTTAGAGAGCATGAAGAATCATCTATGAG
CAAAGTAACTAATTCTGAGAATAGTGAAGAAACGTATGTAAATAAATCTAGTAATAGTAAGGATGTACTT
TATACTGATTCAGGAGAAGTTTCAATTGAGCAAAGTAACTATAATGATAATCGCTTTGTCATATCAAGAA
AAGGGAATTTGTTAGCAGTTAATAAAGAACAATATAGAACATGGATAGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:570972-571382 hypothetical protein CDR20291_0474 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATAAAAAAATCCCTTATAAGTGCAATGATGGTATCTGCAATGGTACTAGGAGGAACTGGAGCAG
TATTTGCAAATGGAAATGATTCATCTAATATTGCTTTACCTAAACTTGAATCTCTAATAAAATCAGGAAT
AACTGACCCTACTGAATTGGAAAAGTATGGTGTTGAGCATTATACTTATGAAGAGTATGCTAAACATATT
CAAGAATTAAAAGACTATGCTAAAGACCCTAATGCAGTCAAAGATGTAAGTCAAAAAGACCTTGAGGAAA
CAATTAAGAAAATGGAACAAGAATTAGAAAAGATAAAAACTGAAGGATTAAAAATTATGAAGCCTATCAC
TATAGAAAATGAAGATGGGTCTCAAATTTCAATTGCTTACAATTATGCAGCAATTGACTAA
>ref|NC_013316.1|:572575-573231 hypothetical protein CDR20291_0475 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAGGCGATTTTATATGGAGTGGAGTTCTTATTTGTATTATTGCTGTCTTAGCAATACCAAGTA
GTAGAGAAGTATTTATGGAAGCAACAGGTGCACATCCATATATTGGGGGTTTTTTAAAGTTTGCTGTATT
AGCTACAATGGGAGATTTACTTGGTGCTAGAATTTTGTATAAGGATTGGAAAATACCAGTAGGAGTATTT
TATAGAGCAATAGTTTGGGGAATAATAGGTGTAGTTACCACATATGGAATGTCAATCTACTCATCAGGTG
TAGGTCAAGCACAAGTGGATGGTATGCTTCCATTTGAGGGAATAGCTTTTGCAAATGCTCTATTTAAGAG
TGCAACTATGAATATACTAATGTCACCAACTGTATTTTTATTCCATAAGGTTATGGACTGTTTTATAGAT
AAAAAATATGAGGTTGGAAAGGGGATTAAGGTAAAACTTAAAGATGTGGTAAATATTGTGGACTGGAATG
CTTACCTTGGTTTTAGTGTTTTAAAAACTATACCATTTTTCTGGATACCATGTCATACAATTGTATTCTT
ATTCCCTGCTGAGTATAGAGTAATTGCTTCTGCATTTGCATCTATAGCTTTAGGTCTAATATTGGCTTTA
GCTAATAAGTCTAAAGTTGCAGTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c574972-573701 putative spore cortex-lytic enzyme pre-pro-form (putative spore peptidoglycan hydrolase) [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAGATGGTTTCTTAACAGTAAGCATAATTGATGCTACTAACAATAGACCTATTCAAAATGCAGTAG
TAAACATATATTCAATGTCTAATGGTAGCCAAAGCTCATCAACTTTATACCAAAACCTAAGAAGTAATGA
ATCTGGTCAAGTGACTGGTTTAGTATTACCAGCACCAGATGTAGATTACTCTCTACAGCCATCTGATGTT
AGACCTTATAGCCAGTATATAGTGGAAGCCATAGCAGATGGATATGAGACAGTTGTCATAGAAGGAACGC
AGTTGTTAGCTACAATTGTAGCAAGACAAGGAGTTCCCATGTCTCCTAGAACAAGAAGTAAGCGTTCTTT
CTCAAGACAAAGTGAGTTGATTTTTGACATAGGAGAACATACTCTATATGGTACTTATCCTCCTAAGATT
CCAGAAAGTAACTTAAAACCATTACCACCTCCTACTGGTTTCGTTGTATTAGATAACCCTGTAGTGCCTG
AATTTATAGTAGTTCATGATGGTTTGCCAGAAGATTCATCAGCTCCAAACTATTGGATTCCATTTAAAGA
GTACATTAAAAACATAGCGTCATCTGAAATATATTCAACTTGGCCTGAACAGACAATCTATGCAAATGTA
ATAGCTATAATATCATTTACTTTAAATAGAGTCTTTACTGAATGGTATAGAAATAAAGGATATAACTTTA
CAATAACTTCAACAACAGCATACGACCATAAGTTTATAAATAATAGAAACTTATTTGAACCAATTAACGT
AGTTGTAGATGCTATTTTTAATACTTTTATAAAAAGACCTCCTACATCAAGACAGCCACTATTAGCACAA
TATTGTGATGGACAAAAATCTCAATGTCCTGACCAAATGACTCAATGGGGCAGTAAAGACTTAGGTGACC
AAGGATATGACTATGAGAGTATCCTAAGATATTTCTATGGAGATGAGATAGTATTTGAAAGAGCACCTAT
AGTAAGTGGTGTACCAGTGTCATTCCCTGGTACTACACTACAAGTTGGTTCTTCTGGGCAGTATGTTAGA
ACCATACAAAATCAGTTAAATGCTATATCTAATTCTTATCCAGCTGTACCAAAAGTTATAGAAGATGGTA
TCTATGGAGCAGATACAGAAAACGCTGTTAAGATATTCCAAGGAATCTTTGGTTTACCTCAAAGCGGAGT
AGTAGATTTTAAAACATGGTATGAAATATCCAGAGTTTATGTAGCTACAACTAGAATAGCTTCTTTAAAT
CCTTTAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:575217-575933 putative spore-cortex-lytic protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGCTAGATTTATTTTTATTAGCAATAGTTCCTATATTGATAGGGATGTTTTGGATAAGGTCTAAAG
ATAGATATTGTAGAGAACCCCTAATCCATCTAATTAAATTTTTTTTAATAGGTGCTTTTCTAAGTGTTAT
AATTATACTTTTAGAAAATTTACTGATGAAGTTTAATGTATTTGAAGGGTATTCAGAACTAATATATGTA
TCATTTGTAGTTGCAGGACTTGTGGAAGAAGGTGTAAAAGCTCTGATACTGATTCCTGCCCTAATTAAAG
AAAAACACTTTACTGAAAAGTTAGATGGTATTATTTACTCTGTATTTTTAGCTTTAGGATTTGCAACAAT
TGAAAATATGGTTTATATTTTTTCTGAAAGTAGAAATCTAGCACTGCAAGTTGGTATTAATAGGGCAGTT
ATCTCTATACCAGCTCATGTAATGTTTGCAATTACTATGGGCTACTATATTTCTAAGTATAAATTTGAGG
GAAATAAAAATAAAAGACGTGAGTATTTGTTTATGGCAGTGTTAATTCCAATTTTATTACATGGAGTTTT
TGATTTCATATTGATGATAGAATATAGATGGGCTATTATATTACTTATAGTTTATGTAATAATTTTGTGG
AAGATAAATCTTGATAAACTTGAGAAATATATGAATCACTCTAAAAAAGTGTTTTTCGGTAATCTTAGGA
AAAAGAAGAAGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:576012-577322 putative methylase [Clostridium difficile R20291]
TTGACAGAATTACCAAAGGAATTTTTAGAAGATATTGAAGAAATACTAAAAGATGAATATGATGATTTTA
TAAAAAGTTATGAGGAAAGTAAGACTACTGGGCTTAGAATAAATACTTTAAAAATTGACAAGAAAAAATT
ATTTGATTTGGAGTTGTTTGATTTGAATCAAATACCATGGGCAGAAGAAGGTTTTTATTATGATGATAAA
ATTGACAGACCTGGTAGAAATCCACTGCATGAGGCTGGAGCATACTATTTGCAAGAGCCTTCTGCAATGA
GTGTAATACCAAAGGCAGATATTAAAGAGGGTGAAAAAGTTCTCGATATGTGTGCTGCTCCTGGTGGAAA
ATCTACATATATACTATCTAAGCTAAACGATACAGGTTTATTGGTTTCTAATGAAATTAATGCTAGTAGA
ATTAAGGCTCTAGGGGAAAATTTAGAGCGATTTGGAGCGAGAAATTGTATTATAACAAACACCGATTCTA
ATAGCTTAAGAAAGACGTTTAATGGGTATTTTGATAAGGTTATTATAGATGCACCTTGTTCTGGGCAAGG
TATGTTTAGGAAGGATGAGGTTGCCATATCAGATTGGAGTTATGCAAAGGTAGTAGAATGTCAATCCATC
CAAAAAGAGATTATCAGAGATGGATATAAAATGTTAAAGAAGGATGGCATTTTAATTTACTCAACTTGTA
CTTTTTCAAGGGAGGAAAATGAGCATGTTATAAATGAGTTTATCAGTGAATATCCACATGCAGAACTTAT
TGAAATGGAAAGATTATGGCCTCATAAGATAAAGGGAGAAGGTCATTTTGTTGCCAAAATAAAAAAATTA
GAAGAAGAAGAATGTAATGTCAAAGAATTAAAAATAAAAAATTTAGATAAAGAAATAAAGGATTATAGGG
AGTTTGAAAAGAAATTTTTAAAGGTTGATTTTTATAGTAATAAAAAAAATAAATTTTATTTAAGAGGAGA
AAATTTGTACCTACTTCCTGAAATATATCCAGATACGAAAAAACTAAAAGTATTGAGATACGGTTTGCAT
TTAGGGGTTTTAAAGAAGAATAGATTTGAGCCTTCTCATGCACTATCTCATTACTTAAAAGTTGAAGATG
TAAAAAATGTTGAAAACTTCAGTGTACAGAGTGAATCAATTCTTAAATATTTAAAAGGGGATGTTGTGAA
TTCTAATGATAGTAGAGGATGGGTTTTGGTTTCGGTTGAAGGAATACCTTTAGGTTGGGGAAAAGAATCT
TCTGGTGTAATTAAGAATCATTATCCTAAAGGTCTTAGAAAAGTATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:577422-577958 signal peptidase I [Clostridium difficile R20291]
GTGGGTGAAGCAGTTAAAAAAGAAGTTGTAGAATGGATAAAAGTGATTGTCATAGCTCTTGTTTTGGCAT
TTGCAATAACTCGTTTTATAGTGCCAACAATAGTCAAAGGAGAATCAATGTATCCTACATTAGTTGAACG
TGATTATTTGATAGTTAACAGAATTGCGTACAAGGTAGGAGAGCCAAAATACAAAGATATAATAGTATTT
AAAACCGACTTAACAGAGGAAAATGGAAAGAAAAAAGATTTAGTAAAAAGAGTTATCGGGGTTCCTGGTG
ACCATGTAAAAATACAAGACTCCAAGGTATATGTAAATGATAAGTTGTTAGATGAGACTTCCTATATACA
TAATAATCGTACTGATGGAGATATTGATATCGTAGTTCCAGAAGGAAAATTATTTGCAATGGGAGATAAT
AGAGAAAAAAGTTTAGATAGTAGATACGATGAGGTTGGATTGGTCGACGAGCATACCATTTTAGGAAAGG
TTCTAGTCAGATTGTATCCATTTTCTAAGATAGGAACTATTGACTAA
>ref|NC_013316.1|:578124-578660 singal peptidase I [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGAAACTATTAAAGAAGAGATTGTAGAGTGGATAAAAATAATTATTACTGCACTTTTTTTTGCAT
TTATTATAACTCGTTTTATAAAACCAACACTAGTAAATGGAGAATCAATGTACCCGACACTTAAATCACA
TGATTATTTGGTAGCAAATAGGATGACATATAAGTTATCAGAACCAAAATGTGGAGATATAATGATATTT
AAGACTGATTTATTACAAGAGAATGGAAGGAAAAAAGAGCTTGTAAAAAGGGTTATAGGTGTTCCTGGTG
ACCATCTAAAAATTAAGGATTCTAAGGTTTATATAAATGGTAAGTTATTAAATGAAGTTTCATATATACA
TGATAATTATACTGAAGGCGATATTGATATGGTGATTCCTAAGGGAAAAGTATTTGCGATGGGAGACAAT
AGAGAAGTTAGTTTAGACAGTAGATATAAAGAAGTGGGATTGGTAGATGAAGAAAATATTAAAGGAAAAG
TTATTTTAAGAGTATTTCCTTTTACAGATATAGGTATTTTTGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:578670-579425 putative endonuclease [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAGTTGGTATAGCGTCCTTATTGTTTAATATTGAGGAGGCTTTAAACATTTGTGAGAGTATAAAGC
AAATAACTCATTTAGAGATTGGAATTGACAATATATCTGAATGTAGCGAGTTATGTAAATATAAAGAGAG
AATTTCTAAGTTAGGATTATCTATAGGGATACACTTGCCTATGGAATTAAATACTTGCGAAAACATAGAG
TATATACGAAATTCATGGATAAATTTTATTGAGAAGATAGAATTTGAACTAAAAGGATTTGATATAAGGT
ATTTTAACCTTCATTTGGGATATGTTATGACAAATAGAGTTAGAAAGAATAGAGACAAATATTTAGGAAA
TAGTGTGGATTTTTTAGATAAATTAAATACAAATTCATATGTATGTATAGAGAATACTTATTCAAAAGGT
GGGGATTTTTCAAATATTGGAAATATATCTTATGATTTTGAATATATATTTAAGAGGATTAAAAATTCTA
AGATTTGTTTTTGTTACGATACTGGACACTGTTTAATTGATGAGGATGCTTATGTAAAGAACTTAAAGGA
TAAAATAAGACTGATACACTTAAGTGATAATGATGGTATCAATGATACACATGTTGGTATAGGAAGAGGA
ATTTTATCTGAAGAGGGGATTAAAGAGGTCTTAACATTAGATGCAGAATATTTAGTATTAGAAATAAATT
ACGAAGACATTGAAGATACTATAAGTAAATTGAATAATATTGTAAGAGAGGGTTAA
>ref|NC_013316.1|:579499-581166 putative phosphoribulokinase/uridine kinase [Clostridium difficile R20291]
GTGAAAAAAATAAACTTAAAAATAGAAGGAAAAGATAAGGAATATTCATTAGAAGAAAATTCCCCTGGAA
TCAGATTGGGAGATATAGCGAAAGAATTTTGTGATGAGCATAAGGGTTATATAACACTTGCAGTTGTAGA
CAATAAACTAAAAGAGCTAAATTGTAGAGTTAAGAAGGATTGTGAGATAAATTTTTTAGACACTACTAAT
GAAGATGGAGAGAGAGTTTACTTTAGAGTCATGTCATTTATATTTGTAATGGCTTGTAGAGAAATCTTTT
GGGATAGCAGAGTTACAATAGAACATTCACTATCAGATGGGCTATATTGTGAAGTTCATATAGATAGAAA
GCTTAAAGAAGCAGATGTTGAAAATATAAAAAACAAGATGAAAGAGATAGTAAACAACGATTATGTTATA
GAAAAAATTGAAGTTACAAGAAATGAAGCTATTTCTATATTTGAAAATAATGAAATGTATGAAAAGGCAG
AGCTTTTGAAATACAAAGAGTATGATAGTGCTAAAGTATATAAGTGTAGAAACTATATAGACCATTTTTA
TGGTTATATGTTGCCATCAACTGGTTATATAAAATCATTTGATATTAAGCTTTATAATGGAGGCGTTATA
ATTTTAGGGCCTAGTGAAGAAGATAAGACTCTTCCTATGAAGTTTGTACCTCAACCTAAGCTATCAAGTG
TATATTATGAAGCAGAAGAATGGTCAAGACTTATGGGAATTGACAAGGTAGTATCTCTTAACAAAATAAT
AGAAAACAATGAATATGGAGATATAATAAGGACATTCGAAGCATTGCATGAAAAGAAGTTATCCCAAATA
GCGGATATGATAAAGGATGGCAATAAGAGAGTAATTTTAATAGCAGCTCCATCTTCATCTGGAAAAACAA
GTTTTGCTCACAGATTATCAATACATCTTAGAGTAAATAATTTAAATCCTATTTCAATTTCTTTAGATGA
TTATTTTATAGATAGAAAACATACTCCTTTAGATGAATATGGAAATTATGATTTTGAATCAATTTATGCA
ATAGATTTAGAGAAGTTTAACTTAGACTTAAAGAAACTTTTAGCTGGTGAAGAAATTGATGATATAAGAT
TCAATTTTAAAGAAGGTAAGAGAGAATACACTGGTAAAAAAATAAAGATAGATTCAAATCAGCCAATTAT
ATTAGAAGGTATACATGGGCTAAATCCTATTTTAACATCATCTATACCAGATGAAGATAAATTTAAGATA
TACATAAGTGCCCTTACTCAAATAAATTTGGATGACCATAATCGAATCCCTACTGCTGATTTGAGAATGA
TAAGAAGAATTGTTAGAGACTATAATTTTAGAGGATATAGTGCTGATAATACTATTTTACAATGGGCATC
AGTTAGAAGAGGAGAAAAGAAGAATATATTCCCGTACCAAGAGGAGGCAGATGCTATATTTAACTCTGCT
TGTGTATATGAATTAGCAGTTTTAAAACGATTTGCGAAACCTTTGTTGGAAGAGATAAAGGAAGATAATC
CTGCACATATTGAAGCTACTAGATTACTAAAGTTTTTGCAGTATTTTGTTGAATTGGACGATACTTCTGA
CATACCAGGTATTTCAATTCTTAGGGAATTTATTGGAGGAAGTAAAATAGTTGATTAA
>ref|NC_013316.1|:581744-582673 putative glutaminase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATACGTTAGATGAGACATTATTAAAAGAAATTATAAGTTCTAATAAGAAGTATACTAATTATGGGC
AAGTCGCTAGTTACATACCAGAATTAAAAAACGCTAGAAGAAATGATTTAGGAATTTGTATCATAGATAG
CGAAAATAATCTTTATAGTGCTGGAAACTGTAGCACAAAGTTTACTATACAAAGTATTTCAAAACCAATT
GTGCTTGCTATGGCACTTATGGATAATGATTGGGAAGACGTTTTTTCAAACGTTGGAATGGAGCCAAGTG
GGGACCCATTTAATTCAATAATGAAACTTGAAATTAATGACACAAAAAAACCCTGTAATCCAATGATAAA
TGCAGGGGCTATAGTAACTACTTCCCTTATAAATGGGAGTTGTTTAGAAGAAAAAGAAGAAAGAATGCTT
AGTTTCTTTAGAAAGTTAGCAAAAAATGATAATATAGGAATAAACTATGATGTCTATAAGTCTGAAAAAA
TGACTGGAGATAGAAACAGAGCTATGGCTTACTTATTGAAAAGTGATGGATTTATCAGAGGGAATGTAGA
AGATGTTCTAGACCTTTATTTTAAACAATGCTCAATTGAGATAGATTCTGTAGATTTAGCGAGAATTGGA
ATAAATCTTGCAAATTATGGAGTAGATATAGAAAATGGTGAGCATTTAATGAGTGAAATGGTTTCTAGGA
TTGTCAAGACATTTATGATGACTTGTGGAATGTATGATGCTTCTGGGGAATTTGCTATTAAAGTTGGCAT
TCCTGCAAAATCTGGAGTTGGGGGTGGTATAATGGCTTCTGTGCCGGGACGCATGGGGATTGGTGTTTAT
GGACCTGCGCTTGACAAAAAAGGTAACAGCGTCGCAGGAGTTAAAGTTTTAGAGGAGTTGTCAAATAAAC
TCAAATTAAATATTTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:582771-583334 hypothetical protein CDR20291_0484 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAGGTATTGGTATTACGAGATTTGGAGTGCATAAAGGCTATTGCGCATCCACGTAGAATAGATA
TTCTAAAAGCATTTGACAAATCGCCATTGTCAGCAAAACAATTATCTCAATTATTGGAAGAACCTCATGC
AAAAATAAACTACCATATAAAAATGTTATACAAAGTTGGTATTTTAGAATTAGTTGAGGAAAAAATAAAG
TCGGGGATTGTGGAAAAGTACTATTATCCAAGTGCAAAAAATGTGGTTATAGGGAATAGGATACTTAATT
TTTCTTTAGACAATGGGGAAGAAAAAGAAGAATTGTACATATCAAAATTTGAAAATATGAGTGAAGTTTT
TTATAAGGCAGCAGAGGAAGATGTTTTAGAAAATGAAAATATAGTTGATTATCATGATATTTCTCTTACT
CATGATGAATTAGTTGAACTTAGTGACACTATGAAGTCAAAGATAGATGAAATTTTAAATAAAAGACAAC
ACAATGTTGAAGGTTCTAAGTATGATATAGCTATGGTTATAGTTCCTACTCTTGAGGAGGAATGTCCTAG
TTAG
>ref|NC_013316.1|:583822-584658 endonuclease IV [Clostridium difficile R20291]
ATGATTAAATTAGGAACACATCTTTCAATAGCAAAAGGATTTGCTAATGCGGCTGAGACAGCTGTATATA
TTGGTGCAAATACATTTCAATTTTTTAGTAGAAATCCAAGAGGAGGAAATGCTAAAGAATTTGATGAAAA
AGATATAATTAAATTTCAAGAAATTAGAAAAGAAAATAATTTTGCACCACTGCTTGCACATGCACCATAT
ACTATGAATCTGGGTGGTACAAAGGATGATGTATACGAATTTGCAACAAGGGTGATAGATGAGGATATAA
GAAGGATGGACTCATTAGGAATTGAATACATGTGTTTTCATCCTGGAAGTCATATAGGTGGTGGTGTAGA
TTTTGGTATAGATAGAATAGTAAAAGGATTGAACAATGCCATAAAGGGTGATGAAAATATAACTATACTT
CTTGAAACTATGTCGGGAAAGGGAACTGAAATAGGTTTTAAATTTGAGCAATTAAAAAGTATAATAGACA
AAATTGAGCATAAAGAAAAAATAGGTGTGTGTCTTGATACATGTCATATTTTTTCAGCCGGTTATGATAT
AGTGAATGATTTAGATGGGGTTTTGGAAGAATTTGATAAGGTTATAGGCATAGAAAGATTGAAAACTGTC
CATCTAAATGATAGTATGATGCCATTTGGAGACAAAAAAGACAGACATGCTCCTATAGGGGAAGGAAAGA
TAGGATTAAAAGCATTAATTGATTTTATGGAACATCCTAGTCTAAAACATTTACCATTTTTCTTAGAAAC
TCCTTTTGATGATGAAGGTCACAAGAGAGAGCTTAAAATGATAAAAGAAATACTATCTAGTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:584910-585905 putative aldo/keto reductase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAATTTAGGCAATACTAACATGAAAATAAAGAGAGTTGGCTTTGGGGGCATTCCAATACAAAGAA
TTACTCAAGATGATACTAACTTAGTTATAAATGAGTTAGAAAAACAAGGAATAAACTTTATTGACAGTGC
AAGAGGGTATACAATAAGTGAGGAAGCAATCGGAATTGCCATTGAAGGAAAAAGAAATAAATTTTTCTTA
GCTACTAAAAGTATGTCCAGAGATTATGATTCAATGAAGAGAGATGTTGAAATAAGTTTAAATAATTTTA
AAACTGATTTTATAGATTTATATCAATTCCATAATGTTAAAGAAGAGGAGTATGATAATCTTTTTAAAGA
TAAAATGGCTTATAGTGCCCTTTTAGAGGCAAAGGAGCAAGGTAAGATAAAACATATTGGTATAACTAGT
CACAATTTAAATACTATAGAAAAAGCTATAGAAGATGGAAAATTTGACACTATACAATTCCCTTACAATA
TAGTTGAAGGACAAGCAGATGAAGTGTTTAAAAAAGCTCATGAAAAAGGAATTGGGATAATAGTAATGAA
ACCTTTAGCTGGAGGTGCTTTAGACAATGCAACACTGGCTATTAAATATATACTATCTAAAGATTACATA
GATGTAGTTATACCAGGTATGGAGAGTGTTGAACAGGTTAGACAAAATGTCGCTGTACTTGAAAATCTTG
TTCTAGATGAAAAAGATAATAAGGAAATTGAAGAAATAAGAAATTCTTTAGGTAAAAAATTCTGTAGAAG
ATGTGAATATTGTATGCCTTGTGCTGTAGGAATAAATATACCATTGAGTTTTTTATGTGAAGGTTATTAT
ACTAGATATGGATTAAAAGAGTGGGCTAAAGAAAAATATGAGGTTATGGATGTTAAACCTACTGAGTGTA
TTGACTGTGGGCTTTGCGAGAGTAGATGTCCATATGAACTTCCTATAAGAGAAATGCTTAAGACTGTTGT
TGAAAAGCTAGGATAG
>ref|NC_013316.1|:c586578-586162 putative endonuclease [Clostridium difficile R20291]
ATGGTGAAAAATTTGATTAAAATAACAATTCCAGGTAGACCTATTAGTAAATCTAATTTTAAGCTTCATA
ACATAAATGGTCAAGCATGGATGCCTTCAAAGGGAAAATATTCTAAGTATCTTGCATACGAAAACATGAT
TGCAGGTTTTATAAACCAACAGTATCAAGGGGAAACTGTTGAAGAAAATCTAATAACAGTCTTGAAATTA
TTCTTTCCAAATAAGAGAATGGGGGATTTACATAATTATCCAAAAAGTATTTGTGATGGTATTGAAAAAA
GTGGAATAATAAAAAATGATAAACAACTTAAGCCAGTATTTTTATTTGATTTTATAGATAAAGATAACCC
TAGGGTTGAAATTGAACTTTATCCAGTATCTAAATACGATATATCCTATAATATTTTTGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:587566-588480 putative iron-sulfur cluster protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAATAAGGAATTAAAAGCATTTTGTAATTTAATAGGATTAAACTGTGTAGGAGTAGCAGGGGTAG
ATAAGTATGATAATTTAGAAAAGATACTTAAGGACAGACAACAAAAAGGTTATTTAACTGGTATGGAAGA
ACCAATAATTGAGAACAGAATTAACCCAAGACATATAATGAAGGATGCTAACTCTATAATAGTCTGTGCA
TTTCCATATCATATAAATAGACAAGAAAAGAATAAAAATTCAAATTTATCAAAATATTGTCATGGAAAGG
ATTATCACATTGTAGTAAAGGACTTTTTACAACAAATTTGTGATTATATTTCTAAAACAGTAACAGATTT
TAAATACAAGTTATTTGTTGATAATGGACCATTAGTTGACAGGTATTTAGCTTATTTATCAGGAATAGGA
TATTTTGGAATAAATAATAATATCATAACTGATGAATATGGTTCTTACGTATTTATAGGGTATATAGTAA
ATAATTATAAATTTGAAGAAGATAAACCACTAGAAAAAAGTTGTTTTAAATGTGGTAAGTGTGTAAAATA
TTGTCCGGGAAATGCTATATTGGGAAATTATGATATGAACCCCAAAAAATGTTTATCATATATAACTCAA
AAAAAAGGAGATTTGTCAGAGAAAGAAAAAGTTGTTTTAAAGAATGGCAAAAAGGTATTTGGATGCGATA
TTTGTCAAGAAGTATGTCCACATAATGTTGAAATGCCAACAACTCATATTTTGGAATTTAAAGAAAATAT
AATAGATTATTTGGATTATGATGAGATACAAAATATTTCAAATAAAGAATTTAAAAGGAGATATGGAGAT
AGAGCTTTTAGCTGGAGAGGGAGAAATATAATAAAGAGAAATATGGAAATAATTTTAGATAAGTATGATG
ACTAA
>ref|NC_013316.1|:588586-590823 putative ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
TTGAAATATAATAATACATCTGAAATAAATCCACTAGATTATATATTGGGTCAAGAAAGAGCTGTAGAAG
CTATGGAATTAGGGTTGAAAATAAATAATCCAGCGTACAACATATATATAGCTGGTGAACCTGGAACTGG
TAAAAGTACTTATGCCTTAAAGGTTTTAAATGAATATGCATCCAAAAAAAATACACATAAAGATTGGTGT
TATATATATAATTTTGAAAACCCTAGAGAGCCTATTATAGTTGAATTAGAAAAGGGGTTTGGAAGAGAAC
TTAAGAAAGATATGGAGAAATTAATTGAAAGTCTTTTAGAAGATTTTAAAAATGCGTTTGAAAGTGAAAA
TTTTGAAATAGAAAAAAATAGACTTCTAGATGAATATGAAATAGAAAAAGATATGCTTTTGAAGCAAATT
AAGAAATATGGGGAAGAAAAAGGATTTAAATTAAAACAGAGTAAAATGGGAATAGTTTTTATCCCTTTGA
AAGAAGAGGAAGATGAAAGTGATAAGTCTGATGAAGAGTTTTACAAAGCTAAAAGAGAACTAGAAAATAT
GGCGATACAGGTCGTATATAAAATTAGAAACTTAGAAGAAATAGCTGAAAAAGCAGTGTTAGAGCTTGAA
GAAGAGATAGCTAAACTTGTAGTAGAACCTCATATCAAGAGATTGTGTGAAAAATATGAAAATTATGATA
AGATTCAAACTTATCTGGAAAATATAAAGAAAGATATAATAGAATATATGTATTTGTTCTATTTAGATGA
AGAGGAGTTAAAAGATAAGTATGATAAAGAGCATTTTATTAAATACAAAATTAACCTATTTGTAGACAAT
GAAAGCTCAAAGAATAAAGAATCAGCACCTGTTGTAGTAGAGATAAACCCAAGTCCAGCAAATCTATTTG
GAAAGGCAGAGTATGATTATGCAAATGGAAATATAAAGACTGATTTCACAAAACTATTATCAGGAGCATT
TCATAGGGCTAATGGTGGTTATTTAGTACTTTATGCAGACCAATTACTAAAATATACAATGTCTTGGGAA
ATTCTTAAAAAGACTTTGCAGACTAAAAAAGTAATATTGGAAACACAAACAGCAATTAAACCAGAAAATA
TGCCATTGGATGTTAAATTAGTACTGATTGGAAGCCACTATATATATGATATTTTATATAGATATGATGA
AGATTTTGAAAAATATTTTAAAGTATTTGTAGACTTTGATAGTGAAATGGATAAAAATGAAGATAATGAA
GAAGGAATAGCAAGATTTATAGCATACCAATGTGATAAGAATAATTTAAGGCATTTTACTAAATCAGCAG
TTGAAGAGGTTATTAAATTTAGCACTAGATTATCTGGTGATTTAGAAAAACTATCAACTAAGTTTAATAA
AATAATGGAAGTTGTAATAGAAGGAAGTGCTTATGCAGAGTTTAGAAATTCGGAGTATACAGAGCAGTGT
GATGTTAAAAAAGCAATAAGTGAAAAGAGAAAAAGAATCAATAGAGTGGAAACACATATGGATGAATCAA
TTGAAAATGGATTTACTCTAATAGAAACAGAGGGAAGAAAAGTAGGAGTGATAAATGGTCTGTCAGTCTT
AAGTACAGGAGAATACTCTTTTGGTAGAGCTTCAAGGATTACAGCGACCACTAGCCCAGGAAGTAAAGGC
ATAGTAAATATAGAAAGAGAAGTAAATATGAGTGGCTCTATACATAACAAAGGAGTGCTTATATTAGGTG
GCTATCTTTCTGAGAATTTTGCACAGGATTTACTATTGTCACTAAACGCATATGTTTGTTTTGAACAAAA
TTATGGTGGAATAGATGGAGATAGTGCATCTTCTGCAGAATTATATGTACTATTATCATCTCTTAGTGGA
GTATCAATTAAACAAAATATTGCTGTTACAGGTTCTATAAATCAAAAGGGTGATATACAAGTAGTTGGTG
GTATAAGTGAAAAGATAGAAGGATTTTATTCTATATGTAAAACTAAAGGGTTAAATGGTGAGCAAGGCGT
CATAATTCCTAGAAAAAATCAAAGAAATCTCGTTTTATCAGATGAAGTTAATGATGCAGTGCGAGATGGA
AAATTTAAGATATATACTGTTGAAAGAGTAGAAGAGGCTATAGAGATATTGACAGATGTTAAATTTGAAG
AAATAAAGAAATTGGTAAAAGAAAAATTAATATCTTTCAGCAAGATACAAACTGTGTCAAAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:591467-592072 endonuclease iii [Clostridium difficile R20291]
TTGGAAAAATTGTACCCAGATGCTAAATGTGAGTTAAATTATGGGACAGCCTTTGAACTTTTAATAGCAA
CTATTTTATCAGCACAATGTACTGATGTAAGAGTGAATAAAGTTACTTCAGAGTTGTTTAAAAAGTACAA
CACAGCTAGAGACTTTGCTAATTTGAGCATTGAAGAAATTAGTAAAGAGATAAAGAGTTGTGGTCTTTAC
AAAAGCAAGTCTCAAAAAATAAAGGATACATCTGAACAGCTATGTGAATTATATGATGGTGAAGTACCTG
ATAGCTTAGAAAAGCTTATAAAATTACCTGGTGTTGGAAGAAAAACGGCAGGGGTTGTACTTAGTAACGC
TTTTAATCATCCAGCAATAGCTGTAGATACTCATGTATTTAGAGTTAGCAATAGAATAGGAATAGTGGAC
GAGCCAAATCCTCAAAAAACAGAATTTGCACTTATGGAAGCTATACCAAAAGAAAGATGGTCACACTCAC
ATCATGTATTAATTTTTCATGGAAGAAGAATGTGTAAAGCTAGAAATCCAGAATGTGCAAGTTGCCCAAT
AAAAGAAGATTGTAATTATTATAAAGAACTTAATGAAACGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:592266-592736 putative RNA methylase [Clostridium difficile R20291]
ATGTCATTAAATATAGTATTAGTAGAACCAGAAATACCTCAAAATACAGGAAATATAATAAGAACCTGTG
CAGCAACAGGTTCAACTTTACATTTAGTAAAACCACTGGGTTTTTCATTGGATGATAAACACCTAAAAAG
ATGTGGGCTTGACTATTGGGATATAGCTGATATACAATATTACGATAGCTTTGAAGAATTACAAGAAAAG
TATCCAAATAGTAAATACTTTTTTTCTACAACAAAGGCTAAACAGTCACATTCAGATGTGAAATATGAAG
AAAATTGTTTTATAGTATTTGGGAAAGAAACAAAGGGATTACCAGAACCTTTGTTGAAAGCAAATATGGA
TACTTGTATTAGAGTGCCTATGTTGGATGTTGAAAAGGCTAGGTCATTAAATTTATCAAATTCAGTTGCT
ATTGTAGTGTACGAGGCTTTAAGACAAATAGGATACCCAAATATGAGGTAG
>ref|NC_013316.1|:592772-593620 hypothetical protein CDR20291_0492 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATCTAAAGATAATCTGTGACAGTTTATCGGACGTGCCAAAAGATTTGTTAGATAAATATGATA
TAGATATAGTTTCATTAACAGTTATACTGGAGGAAAGAGAATACAAGGATAGAATTGATATATCTGGAGA
TGAATTTTATAAAAGGCTTAGAGAAGAAAATGTATATCCAAAAACTTCTCAAGCTACTTATGCCCAATTT
AAGGAAATTTTTGAGAAATATACAAATGAGGATAGAGAGATACTTTATATAGCAGGGTCTGCCACAGCTA
CAGGGACGTATCAAAGTGCTGTAATGGCAAAGAATGATGTGGATGGTAAAATATATACATATGACTCTAA
CTTGCTTTGTATGGGAACTGGTTTACTTGTAATAAAAGCAGGAGAACTTGCAAGTGAAGGAAAGTCTGTT
GATGAAATATTACCTGTTTTGGATGAATTAAAAGAGAAGGCTTTTGTTATATTTTCAGTAGATACATTGG
AATATTTACAAAAGGGAGGTAGAATATCATCTACTAAGGCAGCAATAGGAAGTATATTAAATATAAAACC
GATTCTTGAAATAAGAGATGGACTAGTTTCGCAAATATCTCAAGTAAGAGGAAAGAAGAATGTAATTTCT
AAGATGATGGAATTGATAAAATCAAATTGTGGGGATGATTTATCAGACCAAATTGTGTATATAGGATATA
GTGATGATTTTAAGGAAAAAGAACAATTATCTAAGGTTATGCAAGATGAATTAAGACCTAAAGAAATTAG
ATTTTTCCAAATTGGTGTGTGTATAGGTGCGCATGCTGGTCCTGGTGTCACTGGTATCATATGCTTAAAA
AATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:593976-594980 putative outer membrane lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGCGTTTCAAAAGAATATTGATATTGATGTTAACTGTAGCAATGATAGCTGGAATGTTGGTTGGGTGTG
CTAATAACCCAAGCAATAATCCTAGCTCTAGCAAAGATAATAAAAGTGATATAAGCGATAAAAGTAATTC
AAAAAAATCTGTATCAATGATACTAGATATTGAAGGAACAAATAATGAAGCTATGAATAATGCAGCTTTA
TTAGCATTAAACAATGCTCAAAAGAAACTTAATATAGATACAAACAAAGTGGAATCAGATGATTCCTCAA
CTTTTTCTAATAGTATAGATATTTTATGTAATGACAATTACGATTTAATTATAGCTGTAGGAGCTAGATT
TGCAAAACCATTGGAGATGGTAGCCAAGAAATATCCAAAGCAACAATTTGCAATTATAGACTATGAGTAT
GACAAGCAACCTTCTAATATAACTTCAATTTCTTATGAAGATAATAAATCTGGATACCTAGCTGGATTAA
TTGCTGGAAAAATGACTGAAAGCGATAAGGTTGGTTTTATAGGAGGAATAAAGAGTTCTAGTAGGGATAA
ATTTGAATCAGGTTTTAGAGAGGGTGTTAAATTTTCTAATAGTAGTATAAAGGATATTTCAGTTGAGTAT
GCAGATGTTTTTAAAGATAGCAAATCAGTAGAATCTATAGCTAAAAAAATGATGGATAATGGAGTGGATA
TTATTTTTTCTACTACTGAAGATGATTCAAAAGCTGTAATAGATGCAGTAAGGGCAAAAAATAAAAAAGT
TATAGCAACGAATAAAGACCAACATGAGTTAGCTCCAGAAAATGTTATAAGTTCTATTGTAAAAGATTTT
GAGAATCCTACTTATAATCTGATACAAAGTTTTGTAAAAGGAAATTATAAAGGCGGAAAAGTTATAGAAA
ACACAGTTAAGTCTGGAAGTACTGGGCTTGCCCAAAATAGTTCTCAAAATATTCCTCCAGATGTGTTAGA
ATATGTTAATAAGAACAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:595096-596217 putative outer membrane lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
GTGAATTTTGTGAAAATAAAAAGGATATTGATGGCTTGCTTTGTAGTAGTTTTTACAATTTTTATATTAG
CTATATGTAACTTTGATTTTGGATTTGATAAAGTAAATAAGAATAATTCTAATATAGATAGTGCTAAATC
GAAACAGAGTGAGTCTAAAAGTGTACCAACTTCAGCAGAAAAGGATAAATTAAATAGTAAAAGTAAGAAT
GAAGAAGATGACACAGAAGATGATTCATATGTAAGAAAAACTATTGGAGTATTGTTAGATACCGAAAACT
TAAATAACGAATCATATAATAATAATGTACTATCAGCCTTAAAAAGGGCTGATGAAGATTTTGATGTTAG
GATAAAACTTGAAAAACCAAAGACTTCTAAAAGTTTTAAAGAGAGTATAGAAAAACTACATAAGTATGAA
CCAGATTTGATAATAGCAGTTGGAGCTAGATTTGCAGAGCCAATTAAAGAAGCTGCTACTAAATATCCCA
AACAGCAATTTGCAATAGTTGACTATACTTATAAAGTTCAGCCAGCTAATGTAATTTCTGTATCATTTCA
AGATAATGTTACTGGATATTTAGCAGGGCTTATTGCAGGTAAAATGACTGATACTGGGAAAGTCGGTTTT
ATAGGCGGAGTTGAGGGTTCTAGTAGAGATAAGTATGAATCTGGATTTAGAAAGGGGCTTAAAACTTCAA
ATAAAGATGCTGAGTTACTAGTTAAGTATTCAAATATATTTGAAAACCCTGAATCAGCTAGAACTATTGC
AAAGGAAATGAGAGATTCTGATAGAGATGTTGTATTTTCAGCTACAGAAGATGATAGTAAAAGAGCTATT
CAGGTAGCAAGAGAAAATGGTGGTAAAGTTATAGCTATTAATAAAGACCAATACGATATGGCTCCAGATA
ATGTAATAAGTTCAATTATAAAAGATGTAGAACAACCTGTCTATGAACTGATAAAGAACGTTGCAAAAGA
TGGTTTTAAGGGAAGTAAAGTAATGGAATTTAAAATAAAAGATGGAGAACTTGGCTTGACTTCAAAGAGC
AGTAGAAATATACCACCAGATGTTTTGGAATACATAAAAAAAGAGTATAACAAAGTGAAAGATACATATT
AA
>ref|NC_013316.1|:596640-597401 hypothetical protein CDR20291_0495 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATTTACAAGAGAACCATTTATACTAGATGACGATTTGTGTCTAGCTTTGGTGGACAAAAGAATTA
GTTATCTAATGGAAAATGAATTAAAATTAAGAAATATAGAGATAATAAAAACAATAGAATGTAAAGAATT
ATATGAAAGCATAAAATATCACCCGGATATATGTATTTGTAATTTAGGAAAAGGAGATATAATTGTTGCG
CCGAATGTATATAATCAATACAAAGAGTTATTAAGTAGATATAAATTTAATATAATTAAGGGAGAAGCTA
ATTTATTAAATAGATACCCTTATGATATACCTTACAATATTGCGATAGTTGGTGACTATGCTATACACAA
TTTTAAGTATACTGACAAAGCAATATTAGATTATATTGAAAATAATAAACTTAAAAAGATAAATATAGAG
CAGGGCTATTCTAAATGCTCAATCTGTATAGTAGATAGAACGTCTATAATAACATCAGATAAAGGTATTT
GGAAAAGTATGAAGAATACAGAAATAGAGTGTTTATTGATAGAAAAAGGTCACATAAATTTATTTGAGAT
GAATTATGGATTTATAGGTGGATGTACAGGGTTGATTTCTAAGGATAAACTAGCTTTTTGTGGAGATGTT
AAAAAACATCCTGACTATGAACGTATAAAAAGTTTTGTAGAAAGTAAAAACAAGGAGATAGTTACACTTA
GCTGTGAAAATTTACTAGATATAGGTTCTATAGTTCCTCTCATGACAAGAAAGGAGCGATAA
>ref|NC_013316.1|:597431-598222 hypothetical protein CDR20291_0496 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTTTTGAGGAATAATAATGTAAACGATAGATTAATATATACGAATGACATTGTAGAAGTAGTGA
TAGATTCTGCAAAGCAAGAAGTGTTAAATAAAAAAATACTTAATGGTACTAAAGCTGAACAAAGAGCTTT
AAATATTGATGAGATATCAACGGAAATAACTAGTATGATAATAAGTATAATGAAAGAGAAACTTTTGAAA
GAATACATTCTAAAATGCTATGGGCGTACATATCCTGAAGATAAAAATAATATATACATATATTCACTGA
ACATATTTGCTAAAAAAGAGATTTTTATGAGAGAAACAGTATTTACTAGGGTGAGAAATTATATAGAAGA
AAATGATTTTATAAATGTAGAAGGTTTTATTAGATTTAGAATGAGAGAATTTATGAAATATATTTCTGCT
ATAGGTGATATTGCAGTTGAGGAGTATTTAATAAAGAAAGACCAAGATGAATTTATAAGAGTTTTAAAAT
ACTTTATAGATACTCAAGAAGAAAAGATTGATTTGCTTAAAGTTCATATAATGGAAGATAATACATTTGT
TTTATACGATAAAAATGGAAATAAGATAGACAGTATAGATGATGAAGAAATTATAAATATGGTAATAAGA
GAAAATTTAAATTATGAGGACTTTTTAATAAGTACCTTATTAACTCTATGTCCCAAAAAAATAGAAATAT
TGGATTTGTTAAATAATAATTGCTCAAAGGAAATTATAGATACTGTAGAAGCAATTTTTGAAAATAAAGT
TAGTATAATTATGGAAAACTAG
>ref|NC_013316.1|:598402-599004 putative membrane protin [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAATTTAATTAGGATACTGATATTAGCTGTTATTGGTGGATTTATAGGTTATGTTACGAATGTAG
TTGCTATAAGACTGATATTTAGACCAATAGAGCCTATTAAAATACCTATTTTAAATATAGAAATAGTAGG
TCTTATACCAAAGAGAAGAGCAGAAATAGCAGCAAATGTAGGAGAAATAATTCAAGAAGAATTTCTTTCT
ATGGACGAAATACTTGCAAATATCATTACTGACGAAGATAAGGAAGAAGTTGTAAGATACATAAAAGCAA
GGGTAAAAATTATAATACATGAGAAAGTTTCATTTATCCCGAGTGGTATAAAAAACATGATACAAGATTA
TCTAGGAGAGATAATTGAGTCTGAAGTTAAGCAAAGTATAGATGAATTGAGTAAAAATATAATAAATAAA
GCAAATGAACGTATAGATATACAAAAAATGGTCGAAGATAAGATTAATGAACTAGATTTATATGAATTGG
AAGAGATAATAATAAGAATAGCTAAGAAAGAATTAAAACATATAGAGTTTTTGGGGCTTGTCTTAGGGTT
TTTAATAGGTATAGCTCAAGGGTTAATTACTATGTTTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:599774-601786 threonyl-tRNA synthetase [Clostridium difficile R20291]
GTGGAACCGCGAATTAATATCGTCCCAAACATATTTGGGGCGATTTTTTATTACAAAAAATCTAAAAATT
ATTTCAATAAGGAGGAAAAAACAATGATTAAAGTTGCTTTAAAAGATGGCTCAATAAAAGAATTTGAAAA
TGCTATTTCTGTTATGGATGTAGCTAAATCCATTAGTGAAGGATTAGCTAGAAATGTGGTAGCAGCGTCT
GTGAACGGAGAGGTTGTAGGTCTGGACCACATTATAGATACTGATTGTGACTTGAATTTATTTAAGTTTG
AAGATAAAGAAGGTAAGGAAGTTTTTAGACATACATCAGCACATATATTAGCTCAAGCTATAAAAAGACT
TTACCCAGAAGCAAAGCTTGCTATAGGACCAAGTATAGAAAATGGATTCTACTATGATATAGATTTAGAC
CATAGATTAGTTCCAGAGGACCTAGAGAAAATAGAAGCTGAAATGAAAAAAATAGCTAAAGAAGATTTAA
AAATAGAAAGATTTGAACTTCCTAGAAATGAAGCTTTAGAGCTTATGAAAGAACAAGGAGAAGACTATAA
GGTAGAACTTATATCTGATTTACCTGAAAGTGAAATAATATCTTTCTACAAGCAAGGTGATTTTACTGAT
TTATGTAGAGGACCACATTTACCATCTACTAAAAAGGTAAAAGCTGTTAAATTACAAAGTGTAGCAGGTG
CATATTGGCGTGGTGACGAAAATAATAAGATGCTTCAAAGAATATATGGAACTTCTTTTGAGAAAAACAA
AGACTTAGAAGAGTACTTACATTTACTAGAAGAAGCTAAAAAGAGAGACCACAGAAAATTAGGTAAAGAA
TTAGGATTATTTATGATACCTGAAGAAGGTCCAGGATTCCCTATGTTTTTACCAAAAGGTATGGAACTTA
AAAATGAATTATTAAAATTCTGGAGAGAAATACACAGAAAAGCTGGATATATTGAGATAGAATCTCCAAT
CATATTAAATAGAAAATTATGGGAGACTTCAGGACACTGGTATCATTACAAAGAAAATATGTATACAGTT
AAAATAGATGATGAGGATTATGCTATAAAACCTATGAACTGTCCTGGTGGATTAATTTACTATAACTCTC
AACTACATTCATATAGAGATTTCCCAATGAGAGTTGCAGAGCTTGGTAGAGTTCATAGACATGAGTTATC
TGGTGCATTACAAGGATTAATGAGAGTTAGAGCATTTACTCAAGACGATTCACATATATTCATGTTACCA
GAGCAAATTAAGGACGAAATAAAAGGAGTAGCTAACTTAATAGATGGTATCTACAAAACTTTTGGATTTG
AATATAATTTAGAATTATCTACAAGACCAGAGAACTCTATGGGAAGCGACGAAGAGTGGGAAGCAGCAGA
AAATGGATTAAGAGAAGCTTTAGAAGAGTTAGGTCTACCATATACTATTAATGAGGGTGATGGAGCATTC
TATGGTCCTAAGATAGACTTCCATCTAAAAGATTGTTTAGGAAGAACTTGGCAATGTGGTACTATCCAAT
TAGATATGCAACTTCCAAGACAATTTGATAATACTTATATTGGTCAAGATGGTGAAAAGCATAGACCAGT
TATGATTCATAGGGTTGCTTTTGGTAGTATAGAAAGATTTATAGGTATATTAATAGAGCATTATGCTGGT
AAATTCCCAGTTTGGTTATCTCCAACTCAAGTTAAGATACTTCCTATATCTGATAAATTTATGGATTATG
CAAATGAAGTTAAGAAAGAGTTATTTGATAAGGGTATAAGAGTTGAATTAGATGATAGAGCTGAAAAAAT
TGGATTTAAGATAAGAGAAGCTCAGCTTGAAAAAGTGCCATACATGTTAATAGTAGGTGAAAAAGAAGTA
GCTGATAATAATGTTTCTGTTAGATCAAGAGATAAAGGTGAAATAGGTAGTATTAAATTAGATGAATTTA
TAGCTAGTATTTCAAAAGAAATTGAATCAAGAGAAAGTATTATTCAAGACTAA
>ref|NC_013316.1|:603722-604840 transposase-like protein b [Clostridium difficile R20291]
GTGGTAGTAGTGGAAAAAGCTTATAAGTTTAGAATGTATCCAAATAAAAAACAGCAAGAGTTAATTAACA
AAACTTTTGGATGTTGTAGATTTGTATATAATAAGTATCTTGCTAAAAGAATAGAAGTTTATAAAAATGC
TAAAGAAACTTTTACTTATAAACAGTGTAGTTCTGATTTAACCAATTTAAAAAAAGAATTAAAATGGCTT
AAGGAACCTGACAAATTTTCACTACAAAACGCCTTAAGAGATTTAGATAATGCATATAAAAAATTCTTTA
AAGAAAAAGCAGGATTTCCTAAATTTAAATCAAAGAAAATTAATAGATTTTCATATAAAACTAACTTTAC
AAATGGAAACATTATGTATTGTGGTCAACATATAAAACTACCTAAACTTGGTATGGTTAAGATAAGGGAT
AAACAAGTACCTAAAGGGAGAATACTTAATGCTACTATATCTAAAGAACCAAGTGGTAGATATTATGTAT
CATTATGCTGTACTGATGTAGATATTGAAGCATTTGAAAATACTAATAATCATATAGGTTTAGATTTAGG
AATTAAAGAATTTTGTATCTCAAGTTGTGGAGACTTTATAGAAAATCCTAAGTATCTTAAGAAGTCATTA
AACAAACTTGCTAAATTACAAAGAGAATTATCGAGAAAAACAATCGGTAGTTTAAACAGAAATAAAGCAA
GATTAAAAGTTGCAAGACTTCAAGAACATATAGCCAATCAAAGAAATGATTTTCTACAAAAACTATCTAC
TAAATTAATAAAAGAGAACGATATTATTTGCATAGAAGATTTACAAGTAAAGAATATGATTAGAAATCGT
AAACTATCTCGTTTAATTTCAGATGTATCATGGTCAGAGTTTATTCGTCAATTAGAATACAAGGCTAATT
GGTATGGTAGACAAATTGTAAAGGTAGGTAAATTCTTTGCAAGTTCACAAATATGCAATAAATGTGGGTA
TAAAAACGAGGAAGTGAAGAACTTAAATATAAGAGAATGGATTTGTCCTAGTTGTAATGAAACTCACGAT
AGAGATATAAATGCAAGTATAAATATATTAAAAGAAGGATTAAGATTAATAACAATTCAAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c606875-605838 hypothetical protein CDR20291_0501 [Clostridium difficile R20291]
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TTATCTCACTCCTTATAGGAACTATAATTTCACATTCTTTTAATTTCCCTTTTAATACTCTTAATCCTAA
ATACAATTATGATAACTATATAGTGGCTAAAAATGAAAGTTTTTCAGATAAAATAAATGACATTAATGTT
GATTGGATTTCAGGTGAAGTTAGAATTAAGAGAAGTGATTCTAATAAAATCAAATTAATTCAAAAAATCC
CTAGTAATTTCTCAAAGAAAAAACTAGCAAAAATAATGGTTGACGGAAATTCTCTTTCTATATATGATAA
TTCAACTAAAAAATTCTTCATTGGAATTAATCTTCCAAAACCAACAATACTTGAACTATATTTGCCCAAT
AAGCTTTATGATAAAATAACCTTATATACTACTTCAGCAGATATATATAGCACTTACATAAGAAGTAATA
CAGTTGAAGCTAACACAATTTCAGGTGCAATAGGTCTCTCTGGTAATATTAATAAAATAAATTTAGACAC
AACTAGTGGTCACATTGATATAACAAAACTAAATAGTAAAAATGCTACACTCAAATCAACATCTGGTGAA
ATACAGCTTTCTGGGAAAATTGATGTTTTAAACTTAGAAACAACTAATGGCAATATAAATTTAAAAGATA
TATACAATAAAAATCTTACTTGTAGTTCAGTTTCTGGAAAAATGAACTTATCTGGAGTTTTTTCTGACAT
TAAAGCTGAGTCAACTAGCAGTAATATAAAAATCAATTCTAGCAAAATGTTGTCTTCTCTGTACTGTGAA
ACTACTTCTGCCAATGTCGATTTGTCTATTCCTGATAATCCAGGTTTCACTTTAAATTTTGATAAGGTTT
CTGGTGTTTTGGACAGTGACTTTGAGTTGAATCGTCATAGTGATTTATACACTTATAAAAATGGTATTAC
AAATTTATATTTAAGCACTACAAATGGAAATTTAACTATTATAAAAAACAATCATTAG
>ref|NC_013316.1|:c607554-606868 hypothetical protein CDR20291_0502 [Clostridium difficile R20291]
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AACTTAAAGATGAATTATTTGAAAATCTAAAAGAAAAGTATAACGACCAAATACAAGATGGTAAAACAGA
ACAAGAAGCATATAACTCAGTAATCTCAGGAATTGGTGATTTATCTGAGTTAATTGAAAGTGTTAAGGAA
CCATATTCTCTACCTTCTGAATTAATTGAAGAAAAAAAGAAAAGAGCCTTAAGAGCATCAATAGCAGTTG
CTCTTTTTATAATAAGCCCTTTCCTATTTGTAGTCTCAGTTGTAAGTTTTGGCATAGAACCAACTATAGC
TATTCTTTTAATGCTCATATTAATAGCACTTGGAGTAGGTTTATTAGTCTATAATCAAATGACAAGGACA
AACTATGCTCTATACAATGATAATTTATCAAATAAATTCAAAGAATTTGAGGATTTTGAGGAAAATTATA
ATCATATAAATCCAGTTTATAAATCATTTATGAATGCATATTGGATTATAGTAGTTTCTATATATCTAAT
CACAAGCATACTATTTAATATTTGGTCCTTTTCGTGGATACTATTTATAATAGGTGCTGCTGGTGTCAAC
ATTGTCAAAGGAATTATACAACTAAAAGGCTACAAGGAGGAGGATAAATATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:608247-609587 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAAGTCAAGCTTATTTTGGAATATTTTCATTGCGATATCCTTTATGATAGAATGGTTTCTTTGTA
AGAAAATGCTAGATTATACAAGTGAGAAAAGGATTTCTAACAAAAAAATAAACTTTTGTATGGTAGGTAT
TATTGTTTTTGCTGACATAATATATTTTTTTGATGTACCTCCAAATATAAGAGTAATTATATCTATGATA
ATTACTATTGCATTTTATAAAATCTCATATGATGTGGGATTTATAAAGTCTGTATTAATATCCTTAATTT
ATTGGATGTTACTAATCGCCACAGATGCTTTGAGTATATCTTTAACAGTTTGGCTTAATTCTATAAATGA
CATGAGTAGTATGGGGACGGGAGATATATACAGAATTGAGTCTATAATATTGGGAAAGATACTTTTGATT
GTGTCTTTGTTTTTATATAGAGCCTTAAAGATAAAACTTAATATAGAAATAAATAAAAGGACATTATTTT
ATATAGTTATTCCTATAGTCGCTAATATAGCATCTTTTTTTGTAATTTTTGAATACATATTTAATCCAGG
GTCTGGTAGCTTAATACATAATTTCCAATTCGTTATGATTTCTGTTGTATTGCTTATATCAAGTATCACT
TTAGTTTTAATTGCTAAAAAATTACAGCAATATAATACTTTAGTTGTAGAAAACAATATGATTAAAAATA
CTTTGAAGTATGAAAATGAGTATTATGAAGATATAGAAAAGAAATATTTAAAAACTAGATTACTAAGTCA
TGATATGAAAAATCACATACTGTGTATAAATGCTATGATTAAAAAAGGTATTGATGTTACTTCTTATTTA
AATAATTTGCAGGTAGAAATTCAGAGTAATGACTTGTTATTTAATACTGGTAATTTTATATTAGATGCTA
TATTAAGTGAAAAGAAAGAAGTTTGTGATAAGAATGATATAGAACTAAAAATAGGAATAAATTTTAGTTG
TTGTGAAGCTGTTGAATTAGTAGATATATGTCATATATTTTCAAATATTTTAGACAATGCAATTGAGGCA
TGTAATAAAATTGATAGTGGAAATAGAGTTATTTGTGTTAAAGGTGATGTTATGCAAAATTTTTATTTAA
TAAGAGTTGAAAATACTAAGATGAATAAGATTATTACTAAAAATGGAGATATTTTGACAGACAAAAAAGG
TTCTCTTCATGGACTTGGAATAAAAAGTGTAAAAAACTCTGTAAATAAGTATGGTGGTAATGTTGTAATT
GAATATGATGATAAAAAATTTGTAGTTAAAATTGCTATTCCACTTAGAAATGTGAAGAAAGCAGTTAATC
ATGTGATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c610888-610265 hypothetical protein CDR20291_0504 [Clostridium difficile R20291]
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CTTTAGAACAAGCATGGGAAATATTAAGAAAATACAATAAGGAAGAATTTCATATAAGACATGCTCAAAT
TGTATCTGGAGTTATGAGATACTATGCAAAGGAGTACGACCCTGAGAGAGTAGACTTTTGGGAAATAGTT
GGACTTTTACATGATTTAGATTTTGAAATGTATCCTGATGAACATTGTGTTAAACAAAGAGAATTAATGA
CAGAGCTTGATTTAGATAAATCAATAATCGATTCTACAATAAGTCATGGATATGGATTAACTGGTTCAGA
TGTTAAACCAGAGCAATTTATGGAGAAAGTATTATTTGCTGTGGATGAACTTACTGGTTTAATTGGTGCT
GTTGCAATAATGCGTCCTTCAAAGAGCGTTTCTGATTTAGAATTAAAATCTGTTAAGAAGAAATTTAAAG
ATAAATCATTTGCTGCTGGCTGTTCTCGAGACGTTATAAGAAGTGGTGCAGAAATGCTTGGATGGGAACT
TGATAAGCTTATCCAAACAACTATAGAAGCTATGAGAAGCTTGATTCCAGAGATGGCAATATAG
>ref|NC_013316.1|:c612245-610995 putative efflux protein [Clostridium difficile R20291]
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TTGGTGCATCAATACTTAAATTTGCTTTATCTTTATACATACTTGATATAACTGGTAAAGCAGAAATATT
TGCTACTATACTAGCAGTATCTTCAATCCCAATTATAGTATTCTCCCCTATTGGTGGAGCTATTGCGGAT
ATATTCAACAGAAGAAACTTAATGGTTATTTTTGATTTTTCAAGCAGTCTTACAGTACTAATCTTAGCAG
TATTCTTATTCAACAATAATGGTTCAATATTACTTGTAGGAATTATTATGACCATATTATCAGTTATAAG
CACAATGTATCAACCAACTGTTCAGTCAAGTACACCCCTTTTAGTTGATAATGAGCATTTAATGAATGCA
AATGGTATTGTAGCTGGAGTTGCATCTCTTACAAATATTGCAGGACCTGTATTAGGAGGTGTCTTGTATG
GTGTGATTGGAATTAATGCAATTATAGTTATAAGTTGTGTAAGTTTCTTTCTATCTGCAATTATGGAGAT
ATTTATACAGATTCCTTTTATCAAACAAGAGCAAAACAGCAACATTATAAAAACTATATTTACTGATATA
AAGGATGGTATTGTTCATATATGTAAAGAAAATAGATTTATACTAAAAATACTTTTTTTAGCTATAGCAA
TAAACTTATTTTTAAGCTCTATGTTAATAGTTGGTATCCCCTATATAGTAAAAATCACTATGGGAGCTAG
TAACTTCTTATATGGTCTAGCAGAAGGAGCAATTTCTTTTAGTTCACTGGTAGCTGCTGTTAGTATTGGT
ATTTTCTCAAAACATCTAAAAATCACTAATTTGCACATTTCCTTTATTATATGTGCAGTTATGTTCATAC
CAATGGCGGTTTCAGTATATCCATTTATATTAAACACAGGATTTCCAGTTCCATTTTTAATCTTTATAGT
ATCATCTATGCTAATATTTTTTACAACGACTCTTATCTCAATATATGTTATAACAGTCACACAATTAAAA
ACTCCAAATGAACTCTTAGGAAAAGTAATGTCAATTCTTTTTGCAGGAACAGCAATTGCAATGCCTCTTG
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ATTTATTACACTACTTATAGCATTTGTATCAAAGATAACATTGAGGAACGAAAATCTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c613115-612537 TetR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTAAAAGTTTTACAGAAATAGAAAAAGACAATATAAGAAAAAGACTAATTTCAGAATGTGAAATCA
ACTGGTCTAAATATGGATACAAAAAAACTAACATTGATGAACTTTGTTCAAAATCAGGAATCGCAAAGGG
TTCTTTCTATACATTTTTTGATTCAAAAGAAAAGTTATTTTTTGAAGTACTAAATGGAATCCAAAACAGA
CTTATATCATCAGTAGATGAAATTTTAAGTAACATGCCTCCAAAAGAAGGCTTTGCAAAATCCTTAAAAA
TGTTATATCGATTATATGATAAAAATCCATTTTTATATTCACCAAATAATCCTGATTTCATCAGCCTAAT
AAATAAACTACCTCAAGATATGTTTTTACAACTTGAGTCCAATAACATACAAAGTTTTTACGACTTAATT
AAGAGACACAATCTCAAGTTGAAGATAGAAAAAGAAAAAGCCTTTGGTGTTTGTAATTCTCTACTATCAA
GTCTATTGGTAAAAGAAAATATTGAATATAACTATATTGAAGTATTTGATTTTATGGTAGATAATCTTGT
AGAACACATACTTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:613454-614914 NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
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ATTCGAGAAAGCCAATAGAAATTTACTCACCAATAGATAATTCTCTTGTTGGGAAAGTACAATCTATGAC
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TACAAGAGAGCCAATATATTTCATAAGGCTGCTGATTTATTGTTAGAAAATATAGATGAGATAGCTAATA
TACTGGTACTTGAAATAGCCAAAGACATAAAATCTGCAAGGGCAGAAGTTGAGAGAACAGCAGATTTTTT
AAGATACACAGCTGATGTGGGAAAAAATATGGAGGGTGAAGCCATTAGTGGAGATAATTTCCCTGGTGGA
ACAAGAAATAAGATGTCTTATGTTTCAAGGGTTCCATTAGGTACTGTTTTAGCTATATCTCCTTTTAATT
ATCCTGTAAATTTATCAATGTCAAAGATTGCTCCAGCGCTTATTGGTGGAAATGCAGTTGTATTAAAACC
TGCTACACAAGGGGCTATTAGCGCACTTCATGTGGTAGAAATCATGAGAAAAGCTGGGATACCAGATGGA
GTACTTAATACTATTACAGGTAGGGGTAGTGAGATAGGGGATTATGTTGTAACGCATAAAGGAATTAATT
TTATTAACTTTACTGGTAGTACTGAAGTTGGTCAGCATATATCTAAAATATCTGGAATGGTACCACTATT
ATTGGAGCTTGGTGGAAAAGATGCGGCTATAGTATTAGAAGATGCAGACTTAGATTTTGCAGCTAAGAAT
ATAGTATCTGGAGCGTATTCATATTCAGGACAAAGATGTACGGCAGTAAAGAGAATTTTAGTACAAGAGA
GTGTGGCGGATAAATTAGTCGGAAAAATAAAGCCATTGGTAGAGAAGTTGACAATTGGAAATCCAATGGA
TGAAGTAGTTATCACTCCTCTTATAGATAATAAAGCAACTGATTTTGTTCAAGGGTTGGTTGATGATGCA
TTACATAAAGGAGCAAAGTTAATAACAGGTAATGTTAGAAAAAATAATTTATTCTATCCAACATTGTTAG
ATAATGTAAATGTTGATATGAAAATTGCTTGGGAAGAACCATTTGGTCCAGTACTTCCAATTATAAGAGT
TAAAGATATAAATCAAGCAATTGAAATTGCTAATCAATCAGAGTATGGGCTTCAATCATCAGTATTTACA
AGTGATATTGATAGGGCATTTTATATAGCTGATAAACTTGAAGTTGGTACTGTTCAAATAAATAATAAGA
CTGAAAGAGGTCCAGACCACTTCCCATTTTTAGGTGTAAAGGCATCTGGTATGGGAACTCAAGGTGTTAA
GTATTCAATCGAGGCTATGACTAGACCTAAGGCAGTAGTGGTAAATGTTAGGGAGTTGTAA
>ref|NC_013316.1|:615288-615893 TetR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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TGAGTCTCATGGCTGAAAATGGATTCCAAAAAACATCAATGAGAGAAATTGCAGTTTTAGCCAACATGGG
AAAGTCAAGTCTATACGATTTTTTCAAAACGAAAGACGAGATTGTTGTATATGCAGTTGAGAAAGAAATA
GAAAAAACTATCCAACAAGTTCATAGGATTATTGATGGTGAACCTTCACCACAACAGTGCCTTAGAAAAA
TCATGCTTAATCATCTTAGATTTCCAGAGCAGTATAGAACTGTACTGATGTGGTTAAATACAGAATCTGA
TTATTTAGAAGAAGAGTATCGAAAGAGACTTAAAGATGCTCGTTATGCATATCAAGATATTATAAAATCG
GTAATTGATAATGGTGTGACCACAGGCATCTTTCGCAAAACGGATACCGCTCTTGTGACACGTTTGTTAA
TTAACTCCATGTTATCAATCAGCTACACGTCACGACCATCGGATAGTTCGGAAAAAATGTTGGATGAAAC
AATGAATATATTTCTGCACGGAATTATGAATGATGGAGGTGAATGA
>ref|NC_013316.1|:615890-618463 putative PEP-utilising kinase [Clostridium difficile R20291]
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GGATGTCTTTATCAAAACTATTGACAGCAGGCATCCCTGTGCCAGACGGTTTTCATGTTACGACTGCTTC
ATACCAGATTTTTGTTGAGACGAACCATATTCAGTCTCGAATTAATAAACTGCTAGATGGTATTGATTCC
AATAATACCAACCAACTTGAAGATGTATCTAAGAAAATAGGGGAGCTTTTCCATAATGGAGAAATGCCAC
AGGAAGTGTCGGACGCAATTAAAACAGCTTATGCCGGATTAGGGAACATATCGGTGGCTGTTCGTTCGTC
TGCGACTGCTGAAGATTTACCTGACGCTTCTTTTGCAGGTCAGCAGGAAACTTATCTTAACATACAAGGT
GAAGATAAAGTTATTGACGCTGTAAAGAGATGCTGGGCTTCCTTATGGACAGCTCGTGCTATTGCTTATC
GTGTGAAGAATAATATAAAGCACGAGATTGTCGCACTTGCTGTTGTAGTACAAAAGCTTGCATTTTCCGA
TTCATCTGGTATTATGTTTACGTTAAACCCAATCAATGGTAGACGTAGCGAAATGATTATTAACGCTGCA
TGGGGGCTTGGTGAAGCGGTGGTTTCTAGCTTAGTTACACCCGATACAATCGTAGTGGATAAGGACTCCG
AACGAATTATATCGTATGAAGTGGCAAATAAAGAGATTATGACGGTTCGTACTTCAGAAGGAACAGAAGA
AACCATGGTTCCTGAAAGGTTGAGAAAAAAATATGCTCTTACTCGTAATCAGGTAATGCAACTGATACAG
CTTGGAAAGAAAATTGAGAAGTATTATCAAATGCCTATGGATGTAGAGTGGGCACTGGAAAAAGATAAAT
TGTACATTGTTCAAGCTCGTCCAATTACTGTTCTGCCACCGGAATGGGTATTGCCAGAACAGGATGTTGT
ATACACAAAGGGAAGTTTGGCAGAACACTTGCCAAATCCTGTTACACCTTTGTTCGCCACGCTTGGTCTT
GAAATCGTAAACCGTGCATCGGAGCTTTTATGGATAGATATGTTTGGTAAAAGTGCGAAAAAATTATTAC
CAAAAAACGGCGCATATACGGTTATTAATGGATATGTTTATCTTTCTGCTAAATCAAAGCCACTTTTGAT
TGCTATCAAATCCCTTTCCCCACGCTCTTTACGTAGGACACTTATGAACAGCGTTGCACGCTGGGAAACG
GCACGAAAAGGATATGAGGATGCTATTAAACAATGGGAAGAAAAGCCCCTGCATACGATGAACGCCCATC
AAATTATGGATGGTATTCAGACAATATTTTATGCCGCATGTATTTATTTCACAAGGATTCAGCTTACATT
GCCTGCTGCTTCTATCAGTGAAACATTATTTACAAAATTATTTCAAGGAGCAGTTCGACGTGCTGGTATA
ACGGATACTTCCGTTTTCCTGCTTGGGTTTGATACGATTGCTCTGCAATCGGAAAAGGAGTTGTGGGGTC
TTTCAGAATGGGTAAAGCAAAATAACAGCATCAACCTTTATCTGCAAAACAGTCCTGCAATAAAGATAGC
AGAAGATTTCATGTCTTCAGTTATGCCTGTTGGAGTTTCACAGGAAGTATGGATAGAATGGAAAAATCGA
ATCAATAAGTACTTTAAAGAGTTTGGTCGTACCGCTTATGAGTTTGATTTTGCGTATTCCACACCGCAGG
AAACACTTACACCAACTTTTGAATCCGTAAAAACATTTGTGGAAGGAAAAGGGGAAAGTCCTTTTTTACG
CCAGACCACGTTTGAAAAGCGTAGAAAACATGCAGAAGAAGAGATTTTACAACACATAGGTGGATTGCGT
AAAAAACTATTTTTTAAGTTGCTCCATTGGGCACAGGAAACCTCTCCTATGCGTGAAAATGCTATTTATT
TGATGGGAATGGGACATCCTCTGATTCGTTGTATGTTTCAGGAAATCTCAGAACGATTCATACGAGGAGG
AGCTATTTCACATTTAGATGATATTTATTGGCTCACAAAATCGGAATTGGAGGTACTTATAGAGCAGTTG
GATAAAAACAAGTCTCTATCTGATATGAACGGGATAATACCTGTTCGAAAAGCTGAACTTAAAAAATACA
TGGGTTATGTGTCACCGTCCAAGTTGCCAGAGAAAAACAAAAAAACTATATCACAAGCACCACAGAAGCA
GAAAGATGGGAAAATTGTGTTGACGGGCATTGGTACCAGTACTGGTGTTGTGACGGCTCCAGCTTGTGTA
CTGAATAGTCCAGCAGATTTTGAAAGCTTTCAACCTGGAAGTGTTTTGGTTGCAGTTACCACAACTCCAG
CATGGACACCATTATTTTCATCTGCAAGTGCGATTGTAACGGACATTGGTGGTCCTCTTAGCCATTCAAG
CATTGTCGCACGTGAATATGGCATCCCAGCCGTTATGGCTACACACATTGCCACACGAACTATTAAGAGC
GGACAAATGATAACGGTGGACGGGTTGGCAGGTACGGTGACGTTTGATGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c619213-618722 putative signaling protein precursor [Clostridium difficile R20291]
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TTCCTTCTCACCTTATAGAAATTGAGATTACAGAAACAATTGTATTTGAAGATGTCAAAGTATTTAGTGA
AATAATAAATGAAATTCATAAAAATGACTTTAAATGCTCTATTGATGATTTTGGAAGTGGCTATTCTTCA
ATCAATATGCTTAAGGGTATTTATGTTGATACATTAAAATTAGATAGAGCATTTTTTCAATCAGAAGATT
TAGATTCTCAACGTGAAAGAAATATAATTGTATCTATAATCGAACTAGCTAAAAAGTTAAAAATGACCAC
TGTAGCTGAGAGAATAGAGACCAGTTTTCAAAAAGATTTCTTGCAAGAAATAAACTGTGATATGTTACAA
GGATACGTGTTCTCTAGACCTTTGCAAATAAAAGACTTTGAAAAACTTATGTTTCAAAACTCCTCCAATT
AA
>ref|NC_013316.1|:619729-620004 hypothetical protein CDR20291_0511 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTCTTTTTGTTGGTGGATGGTCAAAATTTAGGGCTGTCGAAGAAGAAGATTTAAAAGTATTTAATG
AAGCTATAGGAATGCTAAAAGGGGTTGATTATGAACCACTTATTGTTGCTACTCAAGTTGTAGCAGGAAC
AAATTTTAAATTTATTTGCAATGCTACTTCAGTTACAAATCCTCCACATGATTATTTAGCAGAGATAATT
GTTTTTAAACCTCTTCCTTGTGATGAACATAATGCAACAATTACAAGTATTAATATAATTAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:620024-620311 hypothetical protein CDR20291_0512 [Clostridium difficile R20291]
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TAATAGTTGATAATGTTTTTTTTGAACGTCAAGGTGATGTATTTAATAGTATCACGAATAATAATTTAAA
TAATTATGATGTAAAAATATTACCAACTGATAATGTTTTTTTAGAATTAAAAATAACATCTACTAAAGAT
TTAGAACCTGTTTTTATTGTAGTTGAAGATAGACAATACAATCATGGTAGTATAATGTTTAAGCCAGTAT
TGGTATAG
>ref|NC_013316.1|:620784-625162 hypothetical protein CDR20291_0513 [Clostridium difficile R20291]
ATGCCAGAAAATAACAATCAACTTTTAGAAGAAATAACACTCTTATTAAATGAAGGAAAAGTAGCAATAA
ATAAGGCTGAAAATCAAAATTTAATTCTAATTCTTGGTGGGACAGGATGTGGCAAAAGTACTGCAATTAA
CTATCTTGCAGGATGTGTAATGATGGAAGTAGAAGATGAAGATACTGGTATATCATATATTGATTGCTTA
GACCCTGTGGCAGAGATTGGTTCAGGAGCTGTTTCTCAAACTTTATACCCAAACATTGTAAATATGAGAA
AACCAATAGAAGGAATGGATGCAAAATTATGTGATACTGCAGGTTTTAGCGACAATAGGGGAGTAGCCCA
TGATATTAGTGCAGCAGTTTCATTAGGTGAAGTATTTAAAAATTCTGCATCTATATGTGCAGTAATTGTA
TTGATTAAAAAAATGCAAAATTCTGTGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATGGGAGGTTCAGACCAG
AAGCAGATATATTAGATTCTAGACTTACAAAAGTACTAGACCTGTTTCAACAGTTAAATATGTGTCTTCA
TAAAGACAATTTTAGGGGCAGTATAACTTTTTTCATTTCAAAAAGTTTCTTAGGAAGAACAGAAAAACAA
ATATATAATGTTATAAAAAGAAAATATGAACAATTATGTGAAAATTTAGATAGTAATATAGAGGAAAAAG
CTTGGTTATTTGAAGAATTGCTAAAAGATAATGGTAAAAATATTCATCTTTGTAAGCCACTTGAATCAGA
CGAGAGGGAAGGCTTATTAAAGCAAGTACTAGAATTAGATGAAGTTAAAGATAAGACATCAGCATTCCAA
TATCCAATTAGTGCAGATGCAAGATTAGTTTTAGATACGTTGATAAAAGAAATTCAAAACAATATCGTAT
CTAGCCTAGAAGATTATGTTAAGGCGTATACAGAAGATTTTATCAGTATTATTGGAAGTATAACAATGAT
TCAAGAAATAGCAAAATATGATGAGGTTGTAAAAGTATTTAAAAACTGGTTGGAAAGTACAACAACTCTT
ACTATAGAGAGATTTATCAACGTATTAGCCAAACAAAGTGGCTTATTCTTACAAGATAGTTGCATGGAAT
TACAAAATAAGATAAAAGGAAACTTAGATATAATTGATGCTTTAAGTAAATATACAGAACATGGAACTGG
GGAAATTTTATTACCTTCTGTACATATGGAATTTATTATAGAAAAGGCAAGTAAGAAGATAATGGAACAA
AACTTCATTATAATAAGAAAGAATTTAGAAAAAGTTTTAGTTTCTTATGAAGTACAAAAACAGGTATTTA
CATTACCAAATAGAGAAAAATTAATGGAAGTTGCAAATAAAAAGGATTATGTATATAGTGTAAGTGATTT
TAATTCAATTTTGACAAATGTTACAGTTACACAAAATGAAGAGTTAGAAGACAGTATAACAAGATTAAGT
GCATATGGAGAAGAAGGTAATGAGATAATTAGAGAATTTATTGGTAAATACATTTTAAATCCATTTATAG
TAAAAACAATTAATATTAATGATAAGAAAGGTATTGAAATAAGAGCATTAATTCCAAACTTAGTAATTAG
TAGTGTATTGGAATATTTCAAAAATAGAAAAGTAGATGACAATGTTTCTACATTTATGTTCTTTGCCAAA
GATACTATTTATATGGATGATAACCTTGGAATGGACTTTGCATCAGAGAAAAATATTATTCTTGCTTGTA
ACAATCTTGATGTAGGTAGTAATGTAAAAATTAATGTAAGTGGAAAGAGCGGAGAACTTGTAGATAGTTC
TATGTATGGGAAAAATGGTGAAGATGGTAGAGATGCAGGTAATATTTACTTATATATTAAAGAAGAAATT
AGAAATTATCGTTTAACACTGATTGCAAATGGAGGAAATGGTTCTAAAGGAATAGATGGTAAAAATGGTG
AAACAGGAGATTCTGGAAGTAATGGAGCTGATGCAGGATATACAAGTAGTTTCCATGGACAGATGTTTAA
AGGGTATTTTGCAAAAGGTACAAGTGGTAAAAAAGGTGACAAAGGTGGAGCTGGTGGAAATGCCGGAAGA
GGTGGAAATGCTGGTAATAAAGGTAATATTTACTTCATTTCAGACTCAGAGGAACAAAAAAATAGAATAA
TTAATCATTGTGATATAACAGTGAAAGATGGAGAAGCAGGTCCAAATGGTAGACCAGGTTCAGGTGGATA
TGGAGGAAGTGGTGGCTATCACGGATATAATACACTTTCATTTTCTCCAAGTGGTATAGATAAGACTGTT
TACTATACAGGATATTTTACAAGTTGGGATTATAAGTTAGATAGTATAATTAAATATCATATAGAATTTA
GTGGCGGAAGTTGGAATGAAGGCAAAACAGGACCAGCAAGAGAATACGCTGAATATGGAGATAGAGGAGA
CGACGGAGGATTTAATGCTCCAAATACTAAGTTATCAACAGCTGTTTCAAAGGTAGAAGAGAATCTTATT
AAAGAAAAATATCAAGGCTATTGTTCCGAAATATAG
>ref|NC_013316.1|:625177-630387 hypothetical protein CDR20291_0515 [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAAATAAACTTTATAGTGAAATCGTAAACCTTTTGGAAGAAGGAAGAGACGAGCTTAGAAAATATG
ACTTAAAAGAAAAGTCAATTTTGTTATTCTTAGGTGCTTCAGGCGTTGGAAAGAGTACTTGTATAAATTA
TTTAAAAGGTTGCGTGATGGAAGAAAAAACGGATGAAGAGACTGGACAAATATATATAACTGCAAAAGAT
TCAGCTGTCGAAATTGGAAATGGTGTATATTCTAAGACTTTATGTCCAGAAGTTGTAGATATTGCAAATA
GAAATTTTTCATTATGTGATTGCCCAGGTTTTTTTGATAACCGTGGAGCAGAGTATATGATTGCTGGTGC
TATGCTTGTAAGGGAAACTATTTCTACATCTTCAAAGGTGAAAGGGATGGTAGTTATTTTAGACTATCAA
TCCTTACTGGACTCTAGACATACATTATTGATAGAAACAGGCAAAAATTTGAAAGATATGCTTGGTGATT
ATGCAAAGTATAAAGAAAATTTCTTCTTTCTTATCAATAAAATACCTAAAACACTAATCGGTAATGTAAC
AGAAGAAAAAATAAGGAATATATTGGAAAAAGCAAAAGAAGACCTAGATAGTCAAGAGAAAGATTACGAC
GGTTGTAAGGAATTAGTGTACTTATTAAATGTAGCATTATCAGATGGTGTATCTATTAAATTATGTAATC
CACTAGATAGACAGCCAGAAAAGTTGTTGGATGAAATGAAAAATCTACCTGAAACATTTGAAAAAACAGA
TTTGGGATTGATGCTTACTGCTTCTTGTAAAATAGAAATACAAAAAGCCGTTGATGTAACCTATAAAGAC
CTAGAAAAACTTTTAGTTCCTTATATAGAAAGTGTCAAAAAAGGTATGGAAGATTCTATTTCCATTCTAT
CTTCTATAAATAGTCTAAAGGATAAAAAGACTCAATTAGATAAGATGTATACAGATTTATGTAGTAGGAC
TAATAATATGAAAGAGCTTATGGAGTTTGTACAAGAACTTTCATATGGTGATGGCGTACAGAAAGTGAAT
ATATTAGAAGAAACACGTCTTCTTTTAGAGTTAAATAGCTACTGTAGTGAGACTCATATTGTTGGTCTAA
GTGAGTTGTTAAAATCATTGCTAAAAAATACTTTAGAAGATACATTAAAAGATATCAAATATTGGATAGC
AGAAGAAGAATATAGGGAAGAAGAAGCCAAAAAGCTTGAAGATGCAGAGTATAGGATAGAGAAGATTCAA
AGTTGTACATATATAAAATCATATGAGAAAGAAAATGTACTTTCTATATATATTCCTATACCTAAAGTGA
ATTTATCGGATTTGACTAAAATAATATCTGGTTATCAACTTAATATTTTGTCATCTATATATATGTATGG
AGATTGTGAGTTGAAAATTGACTGTAATATGGAGAAAGAAGTCTTCTCAGGTAAGAATATTGTACTACTT
ACAGAAAAATTATGTATACCAGAAGGGATTTATTCAATCAACGTATCTGGTAAGGATGCAGAAAAATTGG
TTGGAGAAGGTTCTATTTACGACGGAATGAATGGAAGAAATGGCAATAATGCAGGTACTTCAGGTGATAT
TTTATTATCTTTTAAAGAAATAGAAAAAAGAGGAGAACTTAAACTTTACGTAGATGGTGGACGTGGTGGA
AATGGACAAGATGGAAAAAGAGGAGATACAGGGATAACTGGAGAAGCTGGGGAAAATGCTAAAATAGGTT
CTAAAAAAGAGTCAAAAGAATTTGCTAAGGTTAAAGGTACAAAATACTATGTGGTAAAAGCAGAAAAAGG
AAAACAAGGTGGAACTGGAGGCACAGGAGGTAATGGTGGAAATGCAGGTCTTGGGAGCAAGTCTGGACAG
GTTTATCTCCTTGGAAAAGCTTCTTTATTAAAAGGTGCTATAAGTAAAAAAGATGGAAATCATGGTCTAG
CAGGAAAAGGAGGCTCTGGAGGAGCTGGTGGTGCAGGAGGTCTTGGTGGAATTAGAGGTATATATGAAGA
AACAATAAGATATATAGGTACCTCTGCTCCAATAGATGACAGTGATAGAAATTACTATTATTTTGATAGA
TATGTGTTTAATCATGCTTCAAATGAGAACCAAGTAGCAGATGATGGAGAGAAATTAAATGCTCTTTATG
AAAAACATAAGGACTGGACAATTAGCAAACGTGAAGATTCAGGTTTAGTCGGAGCAGAGGGAAAAGACGG
TCGCTCTGGAGATGCATTAAAAGAAAAGGAATTGTTAAAGCAGGAGTATTCTTTGTCAATAGATACCTTC
TTCTATGAATTTTTCGAGAGATTTGGTTTTTCTGGAATTAAAGGTTATAGAAATCTTAGACTGTTGTGTG
CAGTGGGAATTTTAGAAGCTGATATTTTAGAACTTTCACATATTTATGAAATTTTTCATGCAGTTGAGAA
AATAGAGATGCAATTAAATAGAGAAATACTTCAGAAGTACTATAGTTTTGAGAAGAAAAATAAAGCAGTG
CTTTCTCTGGATGATATGAATATAAAGAAAGAATTTTATAAGGAGGCAAAGGAAATCTATGAATACCTTA
TAAATAAATTGATGCAGTCTGATAGAATAGAATCTTTTATAGGAGAAAAGAAGAATTTTAGCGAATGGAG
TATGATTTTATTTGCACTTGAACAAAAAACAGCATTCTATGTGCAGATGATTGAAGAAAGTGAAATTGGA
GGAAATCGTGTTACAGATATTCGTTCTTTGACAGATTATCTGGACAAGACCTTAAGAGAATTGGAACAAG
GAAAGAAAGATGAGTTAAAAGAAGGATATTTCAATACTTATAAGGAAAGTATCCTAACTCAAATTGAATC
TGGAAATCAACAAATAGAAGTTTTAAAAGATGAACTTGAGAATAAAATGCTTTCTGTTAATGCAAAGATG
AACCTGTTGATTCAAGAAATTATAAAGATGAAAGAAGAGGAGCAAGAAGACATAGAGGAACTAAAAAAGA
AACAGGCAAAACTTGAGGAACAAATGAAAACACAGTTAATTCTTTCTGGAATACAAAGCGCATTGAGTTT
ACTGACTGCATTTAGTGGTGTTGGTCAAGCTTGTCTAGGGGCATTTGACAGTGCAAAATCTTTGAAGGAA
AATCTTTCAGCTAAAGAAGAGGAATACCAATGGACTAACAGGATGGTTGATTTTTCAGATTTTAAATTGG
ATTCTGATGGTATGAGATTTGTACTTGGAGAACAGCTAAGTGAAGATAGAAAAAATGCTTTAGATAAAAT
GACTTATAATTTGGCAGGTGTTGATGAAGAAAGAAGAACTAAATTTGACCAAATTAAGGAGATTATAGTT
AAGTCTATAGATGATGATAACTATGCAGAAAAAGCTGACGATATTCAAAGAGCAAAAGAGGGGTTAAGTG
AAAGCGAGTATAAGGAAATTTACACAAAAATCCAGAAAAAAGAAATAGGTATGTTGGAGGCAAATTACAA
TAATAAACAGCAAAAAGATAAGTTAGCTGCACTAGAGAAAAGTAAACAAGCTATTGAAAGACAGCAAAAG
ACATCTAAAATTAAAAATGCATTGAGTATTGGAAGTTCTGCTTGTTCTCTTATAAATACTGCGATTAGTG
GTGTTAATAATTGTCTTAATGTAAAATCTAGTTTTGAGAGTAAAATAGAGGTAGTTAAAGAGGCAATTAA
AGATAAAGAAAATAATATTAAGAAATTAGATGAATTGAATACTCAAATGGTGGAATTTAAAGATAAAACT
TTGAAAGAATCTGTTATACCATTTGTAGAAAAATTCGATAGTACAGTTAAAAATCAAGATATTTTTGAAA
ATGAGATAAGTAAATTAAAGATGAAGGAAGTTTTAACTGAATTAAGCACAAAGTTTGGAAGCTTAAAAAT
GGAAAATTCAGAGGAGATTTCTATAATATTTAAAAAAGTACAGGATATGATGGAAACTCAAATTATCATT
ACTGATAAGATTGATAAGAAAAAAGATAATCTTGCAATGGGAGAATTGATTTATCAAATGTCAGGTAGTG
GTAATCAGATGAATGAATATCAGAAAAAACTTATCCATCAAATTGAATTAAATCAGGTTAGATATTTGTG
TCAGGTTGAGGCAGCAGCTTTTCAACTATGGACGTTTCCATTTGGAAGCAATATAGTAAATATCTTAAAT
AGATGCCATGTAGGTATTACAGAAGATGAAAACGAGGTTATAAATCAGGCGAAAGAGCAAAATAGACAGA
TTAGAGAGTTTCTTGACCAAGATGCTTACCAATGGCAAAAAACGGATAACCATATTTTGAAGGTAGCATT
AACAGGCAGTTTAGATGGGAAATCACGTGTGGGATTTGAAAATACATATTCTCTATATGATTGTAATGAA
GAAGAAGTGAAAAAGCTTTTGACAGGAGATGAAATTAGTTTTGAAGTTCCATTAAATAAAAACTTTGATG
CCATAAAATATGTAACCATGTATGCAAATATCCCGAACCTTAGACGAAATATTTTAGAGGATAGTTTAAA
AGTAAAGGTGCATATTCATTTATATGATAGTGGATACTTCTCCCTATATGATGATAAAAAAGATGTCTAT
TATCAATATGTATTTCCACAAAACTATATAGATATTACACATGGTCTTGATGTTAAATACAATGATTCAG
ATTCAATAAACTCAATATGGTCTTCAGTAGAAGATAAAGGAATTGAAAAGTTCAAAAATGCAGGATTAAA
CTCTGGTAGAAGTCCATATTCTATGGCTAAGATTTCTTTGAAGGCACATTTTAATAAGAAGCTTTCTTAT
GATTCACTTACAAATGAGCAGAAGAAGAAACTAGAATCATACTTTGATAAACCTAGTAAGTATGCATGGA
GCGAGAGTATAGATATATTGAAGAGTCTAGGGTATATTGATTTGAAGGGAATTTTGTCAAAGAGTTGGTA
TGAAATCAAGAAAGATATAGATAGTGATGGGGAGATTATGAAGCATTTTTCTATATTACAAGTTGATTTA
TTGGAAAGAATTATTTATGAGCAGACTAGTATACTAAAGGAAAATATACCTAATTTGACAATTGAATTGG
TAGGCTGTGGTATTTATGTAGAGTCTGAATTTAATTATCTAAAGCAAAATGATTTAAAATGCTATGAAGA
AAGATTGGTTGAAAATACAATTATTTGTTGA
>ref|NC_013316.1|:c632711-630612 putative cation transporting ATPase [Clostridium difficile R20291]
TTGAATTTTTATATAAAACACGAAATAAGAGGTCGTATACGCTTTGACTTACAACTTGGCAAATTAAACA
ACAAGCAGTCCGATACTCTCTTATATTATTTAACTTCTATAAATGGTATTACCAAAGCAAAAGTTTACGA
TAGAACTGGTGATGCAGTCATTTATTACACTGGTGAAAGAGAATACATAATAAGAGAAATCACTAAATTC
AGTTTTAACAATAGCAAAATAGAAAACCTAGTTCCTGAACATACCAGCAGGGAATTAAACAATTATTATA
GAGACAAATTAGCAAATAAACTGCTAGTCAAAAGTATCTCCAAAATATTTTTTCCAAAGTCCTTAAGATT
TTTTTTAATTGGACTTCATTCTATAAAATATTTTAAAAAAGGTCTCTCTTCCCTACTAAATAAAAAAATA
GAAATTTCTGTTTTAGATGCCACTGCTATAGGTATTTCTATTTTTAGAAAAGATATCAATACGGCTGGTT
CAGTTATGTTTCTTCTTGGTATCGGTGAGTTATTAGAAGAATGGACTAGAAAAAAATCTATAGACGACTT
GGCTCAAAGTATGTCACTAAACATTGAAAAAGTATGGTTAAAAAAAGATGCCACTGAAATACTAGTTCCA
ATTTCAGAGATAAAGGAAGGAGATTTAGTCAGTGTAACTATGGGAAATATGATTCCATTGGATGGAGTTA
TAGTATCAGGAGAAGCAATGGTCAATCAGGCATCACTTACAGGTGAATCCCTTGCAGTTAACAAAAAAGA
AGGCTCTTACATATATGCTGGAACTGGAATAGAGCAAGGCAATATTGTTATGTGCGTCAAGGAAAAAGCT
GGTACTACTAGATTCCAGAAAATAGTAACTATGATTGAAGAATCTGAAAAACTAAAATCTTCTGTAGAGA
GTAAATTTGAACATCTAGCAGATACATTAGTTCCATACAGCTTTTTAGGAAGTATATTAACCTATGCAAT
TACTAGAAACCCTATAAAATCACTCTCTATATTGATGGTAGATTTCTCTTGTGCATTAAAACTCTCTATC
CCTATTTCAGTACTATCAGCCATGAGAGAATGTAACAATCACAGCATTGCTGTAAAAGGTGGAAAATTCC
TTGAAGGTGTTGCATGTGCAGATACTATTGTATTTGATAAGACAGGCACATTAACAAAAGCTCAACCAAC
TGTTTCAGATATAATTACATTCCAAAATTATAATAAGAAGGATATGTTAAGACTTGCAGCTTGCTTAGAA
GAACACTTCCCACACTCCATAGCAAATGCAGTAGTTTATGAAGCTGAAAAACAAGGGCTTAGTCACAAAG
AAATGCATACAGAGGTAGAATATATTATTGCTCATGGCATTTCAACAAAGGTCGATGATAAAAAGGTTGT
AATAGGTAGCAAACATTTTGTATTTGAAGATGAGAAGTGTACTATCCCAGACGGTGAGGAGGATAAGTAC
AACAATCTATCAGATGAGTATTCTCACCTATTTATGGCAATATCGGGTAAATTATCAGCAGTTATTTGCA
TAAATGACCCTTTACGAAAAGAAGCAAAATATGTAATTTCAAATTTAAGAGAATATGGAATAAAAAAGAT
TGTGATGATGACTGGAGATAGCGAAAAAACAGCTAAATCTATAGCAAGTAAAGTTGGTGTTGATGAATAT
TATTCAGAAGTCTTACCAGAAGACAAAGCCAATTTTGTTAAAAGTGAAAAACTAAAAGGTCGCAAAGTAA
TTATGATTGGTGATGGAATCAATGATTCTCCTGCTATTTCAGAATCAGATGTCGGAATTGCAATGAGTGA
AGGTGCTGAAATAGCAAGAGAGATTTCAGATATTACCATATCAGCAGATAATTTGAATAATTTAATCGTT
TTAAAGCAGATTAGTAATAAGCTTATGAAAAGAGTTGATTTAAGTTCTAAGTTTATTATCGGCTTTAATT
TAGGTCTGATTTTACTTGGCGTAAGTGGATTTGTTAGACCAAGTACATCTGCCTTTTTACACAACGCATC
TACTGTTGGAATAAGTTTAAACAGTATGACAAATTTATTGGAAAACACCAATACTTATAACTACTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c633149-632754 hypothetical protein CDR20291_0517 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATTTTAAAAATGAAAAAAACAGGAATATTTTTAGGAGGAGTACTTTTTGGTACTGTAGGTGTTA
AGATACTTTCAAGTGACTGTGTAAAAAAAACTTGCACTCGTGCAACAGCAGGAGCATTGAAAGTTAAAGA
TTCTGTTCTTGAAACAACTACGAAAATTCAAGAAAATGTAGAAGATATTTTAGCTGAAGCAAAAGAAATC
AACGAGCAAGAAGACTTATCTACATCTAAGGTAAACGTTGTACAAGATACTCTTAAATGCGAACAAGAAG
TTCTTAAAACTGAAACTATAAAAACTGTAGAAGATACTAATTCTAATAACATTAAATGTGAAGAAATCAA
AGATAACGTAATTGAAGAAAAAAATAATACTTGTACAACAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c635023-634583 hypothetical protein CDR20291_0518 [Clostridium difficile R20291]
ATGTATGAACGTATGCTTGATAAAAGCAATAAACCCTGTTTGTCTCAAATAATAGAATATATAGGTAAAG
ATGGATATGCACGATTGTGTAAGTTGGAAACTTACTTGGAAACTCAATATAATTTATCAAGAGAACTTCG
ATTTCCTTTTGGAAACAATTATGGTTGGGGTTACAAATATAGCCATAAATCTTTTCATTTATTTTATGCT
TTTTTTGAAAAAGGTGCATTTACTGTTCTGATTCAGATAGGTGACAAGCAAGTTCCAGCAGTAGAAAAAA
CGTTGGTATCTTTGACACCAAAAGCTAAAGAACTCTGGGTCACTCGTTATACTTGTGGCAATAATGGAGG
TTGGATTAAGTATCGTATTTTAGAAGATGCAGACTTACTTGATATTATTCAATATATAAGAGCAAAAAAA
TCTCCACCTAAACAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:635359-636672 hypothetical protein CDR20291_0519 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAAGAGATATTTAGAATCCGATGTATTTGAAGCTTTTCAAGAAAGACTTTCTTATCTTTTTAATG
AATTTGATTATATCTATGTATCTTTTAGTGGAGGAAAAGATAGTGGCTTACTGCTAAATTTAGTTTTGGA
TTATAAGAGAAAGAATAATATAAGTTCCAAAATAGGAGTATTTCATCAAGATTTTGAGGCTCAATATAGT
TTGACTACTGAATATGTTGAAAAAGTATTTGAAGAGAATATTGAAGATATTGAACCATATTGGGTGTGTT
TACCAATGGCTACAAGAACTGCTGTAGGAAATTATGAAATGTATTGGTATCCATGGGATGATGAGAAAGA
AGAATTATGGGTAAGAGAAATGCCAGTCAAAGAATACATAATAAATCAAAAAAATAATCCTTTTACTTAT
TATAAGTATAAAATGAGACAAGAAAGTTTGGCAAAGCAATTTGGTAGATGGATTAGAGATATACATGAAG
GTGCAAAAGTTGTTTGCTTATTAGGAACACGAGCAGCAGAATCTCTACAACGTTATTGTTCTATTGTGAA
TAAACAGCATGGATATAAAGGAAAGTGCTGGATAACTAAGGAATTTAAAAATGTCTGGACGGCATCTCCT
ATATATGATTGGGAAATAGAAGATATATGGTTAGCCCACTATAAATTTGATTATGACTATAATAAAATTT
ATGACTTATTCTATAAAGCTGGAGTAGCTCCAAGAAAAATGAGAGTGGCATCACCTTTTAATGATTCAGC
AAAAGAGAGTTTAAATTTATACAGAATATTGGACCCAGATGTATGGGTGAAATTGGTTGCTAGAGTACAA
GGAGTTAATTTTACTTCTATTTATGGAAAAACAAAAGCTATGGGATATCGTAGTGTTAAATTGCCATATG
GACACACATGGAAAAGTTTCACATATTTTTTGCTTGATACCTTACCTGAAAATATAAGGAATAGCTATAT
TAAAAAATTTTCAACATCTATTGAGTTTTGGCAGAATACAGGTGGTGGTTTGTCAGAAATAGTTATACGT
GAATTGTTGAGAAAAGGTTATAAAATAGAATTAAATGGAGTTTCAAATCATACAAAAGATAAAAAGAGTA
GAGTCATATTTTTGGATGATATACCTGATGATACGGATGATATTAAATTTACCAAAGATATACCAAGTTG
GAAAAGAATGTGTTATTGTATTTTAAAAAATGACCATATGTGTAGATTTATGGGATTTGGTCCTACAAAA
GAACAGAGAATTAGAACGGAATATATTAAGAAGAAATATGAAAAAATTCATTAG
>ref|NC_013316.1|:636690-637226 hypothetical protein CDR20291_0520 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATATAAAAGTCCTGTATATGGAATCATCGCAGTGCCAATCGAAAAGATAGAATCTAACGACTATA
ATCCAAATGCAGTAGCCCCACCAGAAATGCAGTTGTTGTATAAAAGTATAAAAGAAGATGGGTATACAAT
GCCAATTGTCTGTTATTATAATGAGGAAAAGGATAAGTATATTATTGTAGATGGTTTTCATAGATATAGA
GTAATGCTTGAAAATAAGGATATATATGATAGAGAAAACGGACTTCTTCCTGTTTCAGTAATTGATAAAT
CTCTTGATGAAAGAATGGCAAGTACTATTCGACACAATCGTGCAAGAGGTTCTCATAATGTGGATTTAAT
GAGTAAAATTATAACTGAACTTTGTGAAATTGGAAAATCTGATGAATGGATATCAAAGCACCTGGGTATG
GAAGTTGATGAAATTCTTAGATTGAAGCAAATAACTGGATTAGCTTATTTATTTAAAGATAAAGAGTTTG
GTAATGCATGGATTCCCTTTGGCTCTGATATAGAAGAAGAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:637745-637966 hypothetical protein CDR20291_0521 [Clostridium difficile R20291]
ATGGGATATTTAAAAGAGGATAAACAAGACTATTGTTGTGAATTTGCTAGACCATACATCAATCGTCAAA
TTTATGATGACACATACAATCCAAAAACAGCATTAAAAAGAGGTACTTTATTTCCTGAATTAGATTTAAT
AGAGTCAAATAACTATAATGATTGGCTATATTCAAATCCTAAAAATAGAGTTAGAGCTAAAAAAGGGGGT
AACATGTACTAA
>ref|NC_013316.1|:637966-638229 putative spore-coat protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTCATTAAATAGAAGAGAACTTTTAGAGAGAATTTCAGAATATCAATTTGCCTGTATAGAATTAAATT
TATATTTAGATAACAATCCAAGGGATAAGAAAGCTCTTGATTTATACAATAGATACTGCGATAAATTTAC
ACAAGCTGTGTGTGATTATGAATCTAAATATGGAGCATTAACTAATTTTGGATATGAATCAAGTGAATAT
CCTTGGTCATGGATATCTGAACCTTGGCCATGGGACAAATCATTTTATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:638291-638863 putative spore-coat protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTGGATTTATCAAAAAACACTGGAACATCCAGTTAACATAAGACAAGCAGACCCTAGAATGGCAAAAT
ATATCATGACTCAGTTGGGAGGACCTAATGGTGAGTTGGCAGCTGCAACTAGATATCTTCAACAAAGATA
TACTATGCCAACTGGAAAATCTCGCGCACTTTTAACTGATATAGGTACAGAGGAAATGGCCCATGTTGAG
ATAATTTCTTCAGTGTTATATCAATTAATAGGCAGTTGTACTCCGGAAGAGCTTAAGGCTGCTGGACTTG
GTAGTAATTATGCTAATTTTGGACATGGTCTTCAACCAGTAGATTCTAATGGAGTAAACTTTACTACAAG
TTATATTAATGTCTTTGGCGATTCGGTAACTGATTTACATGAGGATATGGCTGCTGAACAAAAAGCATTG
GCTACGTACTATCAATTAATAAATTTAACTGATGACCCTGATTTGAAAGATATATTGAGATTTTTGGGTG
AGAGGGAAGTAGTTCACTATCAAAGATTTGGTGAAGCATTAATGGATGTTTATGAGTTTACAGAGTGTAA
GCATCAGTTCTAA
>ref|NC_013316.1|:639681-640214 methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase 1 [Clostridium difficile R20291]
ATGCAATATATTAGCTATTACCATAGTCCAATTGGAAATATTCTTTTAGCATCAGATAATGTTGGGTTAA
CTGGTCTTTGGTTTGAGAATCAAAAGTATTATGCTTATAATCTTGACCAAGAACATCAAGAAAAAGAATT
GCCAATTTTCGAGCAGACAAAGAAATGGCTAGATATTTATTTTTCGGGAGAAGAGCCCAATTTTACACCA
TCACTCCATATGGTAGGTACTCCTTTCCAGACTACAGTGTGGAAAATTTTACAACAAATACCATATGGTA
AAACAATCACTTATGGAGAAATTGCACATAAAGTTGCTCAACAAAAAGGAATATCTAAAATGTCAGCACA
AGCAATCGGTGGTGCAGTAGGGCATAATGGAATCTCTATTATTGTTCCATGTCATCGTGTTGTAGGAACA
AATGGGAGTTTGACAGGGTATGCTGGTGGAATTGATAGAAAAATAAAATTGTTATCTTTAGAAAAAGTAT
CTGTGCAACATTATTTTATCCCAAAGAAAGGGAGTGCATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c641473-641225 putative plasmid-related protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAACCTGATATTAAAGACTTAAAAACTGGACAAGTTGAAACTAGTAGTAGACTTGATACAATTCAGA
GTGATGTTACAGAAATTAAGTCAGATGTAAAAATTAACAGAAATACATTAGATACAGTGATTAAACATAC
CTCTTCATTAGTAGAAGATACATCAGATATTAAAAATGATTTAAACAATATAGAGATAGTCACATCTAAG
AATTGGAATGATATTGCTAAATTAAAATCAGTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:641547-641750 hypothetical protein CDR20291_0526 [Clostridium difficile R20291]
GTGCCATCCATACTACTGATACTGCCTTGCATATCGCTAATAGTACCTTCGATATCATTGATATTGCTTT
GCATATCGCTAATAGTGCCTTCGATACCATTGATACTGCCTTGCATATCGCTAATAGTGCCTTCGATACC
ATTGATACTGCCTTGCATATCGCTAATAGTACCTTGCATATCGCTAATAGTACCTTGCATATAG
>ref|NC_013316.1|:642321-642734 hypothetical protein CDR20291_0527 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATGCCAAAAGAGAGTATTGATACGATTATGTTTGCTCCTTGTGGAATGAATTGTATGGTTTGCT
ATAAGCATTGTTATCACAAAAAGCCATGTGCTGGTTGTTTGAACAGCGATACAGGAAAGCCAGAACACTG
CCGTAAGTGTAAAATAAAGGATTGTGTCTGTCAAAAAGGGTTGTTTTATTGTTTTGAATGTTTCAATTTT
CCTTGTAAACTCATAAAAAATCTTGAAAAAAGTTATAACAAGAGATATCAAGCAAGCCTTATGGAAAATA
GTAAATTTGTTCAGCAGTACGGTTTAGAGAAGTTTATGCAAAAGCAGAAGGAGAGATATACTTGTTCTAA
ATGTGGAGGAATTATATCTATTCATGATAGGGAATGTAGCGAGTGTCAAGAAAAAGTGAAATAG
>ref|NC_013316.1|:642830-643318 hypothetical protein CDR20291_0528 [Clostridium difficile R20291]
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GTATATGGGATAAGACTGCCATTGATATTCAACACATTGGAAGCACTTCTATTCCCAGTATTAGCGCAAA
GCCTATTATTGATATTGTTGTAGGTGTTGCTTCTTTAGAGGAAGCTAAATTATACCTCGAAAGGTTAGAG
CAATGTGGAATCGTTTTTCGAGGTCAGGATGTACCAAAACAATTACTTTTTGCTATGGGAGATTTTGAGA
AAAATACTCGTACTCACCATATTCATGTTGTTGAATGGAATAGTGTCGCATGGAATAATTATATCAATTT
TCGAGATTATCTAAATACTTTTACAGACAAAGCAAAACTCTATGATAGTCATAAACAAAAATTAGCATTA
CAGTTTGAGGACAATCGTAAAATCTATACACAGAGAAAGCAAGAACTAATAAATATTTTGCTGGAATAA
>ref|NC_013316.1|:644825-645934 transposase-like protein b [Clostridium difficile R20291]
GTGGAAAAAGCTTATAAGTTTAGAATGTATCCAAATAAAAAACAGCAAGAGTTAATTAACAAAACTTTTG
GATGTTGTAGATTTGTATATAATAAGTATCTTGCTAAAAGAATAGAAGTTTATAAAAACGATAAAGAAAC
TTTTACTTATAAACAGTGTAGTTCTGATTTGACCAATTTAAAAAAAGAATTAAAGTGGCTTAAAGAACCT
GACAAATTTTCACTACAAAACGCCTTAAAAGATTTAGATAATGCATATAAAAAATTCTTTAAAGAAAAAG
CAGGATTTCCTAAATTTAAATCAAAGAAAATTAATAGATTTTCATATAAAACTAACTTTACAAATGGAAA
TATCGTGTATTGTGGTCAACATATAAAACTACCTAAACTTGGTATGGTTAAGATAAGGGATAAACAAGTA
CCTCAAGGTAGAATACTTAATGCTACTATATCTAAAGAACCAAGTGGTAGATATTATGTATCATTATGTT
GTACTGATGTAGATATTGAAGCATTTGAAAATACTAATAATCAGATAGGTTTAGATTTAGGAATTAAAGA
ATTTTGTATCTCAAGTTGTGGAGAATTTATAGAAAATCCTAAGTATCTTAAGAAGTCATTAAACAAACTT
GCTAAATTACAAAGAGAATTATCGAGAAAGACAATCGGTAGTTTAAATAGAAATAAAGCAAGATTAAAAG
CTGCAAGACTTCAAGAACATATAGCTAATCAAAGAAATGATTTTCTACAAAAACTATCTACTAAATTAAT
AAAAGAGAATGATATTATTTGCATAGAAGATTTACAAGTAAAGAATATGATTAAAAATCGTAAACTATCT
CGCTCAATTTCAGATGTATCATGGTCAGAGTTTATTCGTCAATTAGAATACAAGGCTAATTGGTATGGTA
GACAAATTGTAAAGGTAGGTAAATTCTTTGCAAGTTCACAAATATGCAATAAATGTGGGTATAAAAACGA
GGAAGTGAAGAACTTAAATATAAGAGAATGGATTTGTCCTAGTTGTAATGAAACTCACGATAGAGATATA
AATGCAAGTATAAATATATTAAAAGAAGGATTAAGACTAATAACAATTCAAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:647572-648585 putative membrane-associated metalloprotease precursor [Clostridium difficile R20291]
GTGGTTAGTTCATTTTTAAATGATATCTTTAGAACAATTTTAGTAAGTTGTATTTTTATAGTTATTTTAT
TAGTCTTTAGAATAACTTTATTTAAGACTTTCAGTAAAAAATTTAATTACTATATATGGCTTATTGTGAT
TATTAAGCTATCATTACCATTTATGAATTATACTTTTATATTTAATGAGTCAAAATATAATGGTAATATT
AATAAGATAAGTTTAGGCAATTTTAATAGTATTTCTATTGTATATAGTACTGTTTTAGTCTCTGTTTGGA
TTGCTATTACGATATTTTATTTAGTTTATACTTTATTGAAATATATTAAGCTTAAAAATATGATAAATGA
TTTGTCTTATGATGTTGAGGATGATAAGATAAAAAATCTTTATGAAAATTTATTAAAAGAGCTTAAGATA
AATAAAAAAATACGGCTTAAATATTCATATGAAGTTGAAAGTCCAGTATTTTTTAATTCGTGTGTCATTT
TACCACCATGTGATTATACATTAAAAGAGTTAAACTGGATATTTAGGCATGAGTTGATGCATTTTAAGAG
TAAAGACCTTTACATTAAGTATTTGGTGATATTTTTAAAATGTGTTTATTGGTTTAATCCTTTTGTGTAT
ATAATGGAGAAGTTTATAGATTTGGATTGTGAATTTTATTGTGATGAAAGAGTTTTGAAGAATTGTACGA
TAGAAGAGAAGCAGGATTATGCATTGACAATAATTAGTGCAATGAGAAAAGGTTCAAATAGTTCAAATAA
ATTTGTGGCTGGATTACATAAGGAGTCAGATATTAAAAAAAGAGTGTTTAGTATGTTTAATGAAAAGTAC
AGAAATGGTATTTTGATAGCAGTTATTTTATGTTTATTATCTTCTATTACATATTTTGAAATTGATTTAA
TTACTACTAAATCAATATTTTATCCACTTTCAAAACAAACACCTATTGAAAATAGAACTAATTCAAAACC
TACATATCAGATTAATGTTTATATAGATAATTAA
>ref|NC_013316.1|:648941-649510 hypothetical protein CDR20291_0532 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGAAGTTGGAAGATATGACTTTAGAGGAGTTATGGAACTTGTTTCCTATATTTTTGACTACTC
ACAAAGAATGTTGGAAAAATTGGTTTAAAGAAGAACAATATAGACTAACTGGAATATTGCCAATGCAAAA
AATTGTTAGAATAAGTCATATTGGAAGTACTTCTGTGAGTACGATTTATGCCAAGTCCATTGTTGACATA
CTGATTGAGATAATTCCTGATTATAATATGAAAGATATTAAAGATTTGATTGAGTCGAATGGATATATTT
GTATGTCTGAGAGCAGTAGTAGGCTTTCACTTAATAAAGGGTATACAGTAGATGGGTTTGAAGAACGCGT
TTTTCATTTGCATATAAGGTATGTAGGTGATAATGATGAGTTGTTTTTTAGAGATTACTTAATTGACCAC
CCAGATGTTGCAAAGGAGTATGAAAAACTTAAGTTGGACCTTTGGAAGAAGTATGAGCATAATCGTGATG
CTTATACAGATAGTAAACTAGATTTTGTTAGGGAGTTTACTGAAAAGGCAAAGGTGTTGTATTCTAATAG
ATATAATTAG
>ref|NC_013316.1|:c651184-649847 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGGACACTTATTCTTTAATCTCTACAAGCATAAATTTTATTCTAATATTAATCAATATTTTCATAGCCT
TTTTTCTTTATAAGTTGACTTCCTATTTTATAGACTTTAGGAATCATTGGATTTTCAAAATCATATTGAT
TTTGGGCTACTCTATTATTAGTCAAATGATAATATGGCTTTCCGACCCCGTAAATATTTTGTTTACACTA
TTCGGATATTTTATACTACTTATAATATGTAGCAAAAGCAAATTAATTCCTATAATATCAGTTGTCATGA
TACTTTATCCTATTATAATTGGGCTTAATTTTCTTTTTATAAACAACCCTATATATGAGGAACTTATACA
CTCAAAAGAATATATTTTAATACTTTCAATAGTCCAGATAATTTCTGCTCTAATTAAATTATTATTTTGG
TTTTTAATACATATTTTCCTAAAGAATAGATTGGTCAATATAAAACAATACTTATCAAATAAAATATGGA
TTTTTATTGATATGGTATGTATATCTTCATTTTTATCAATATTAATTGCTATTATTCTGCCACCTACTAA
TTTAATCCCTATGGGTAGTAATAAGAATATTATCTTAGGCAACTTACCTTATGGCACTTATCTAATCATC
TTGTCAGCAATTCTGGCAAATATCGGTGTGATACTTCTTTTACAGCCATTGATTGAAAATGTAAAGATGA
AGATAGAAAAACAAGCAAATCACCTAAAAGAAAAATACTATAACTTACTAGAAAATCAACAAATTCAAAT
ACGCAAAATGCGACATGATATGAATAATCACTTTCAAATGATTGAATCGTATTTAGAAATTGAAGATATT
GCTGGAGCTAAAAAGTATTTTAATCAGTTAAAAATAGGTATAGGTACTCTTAGTGGCAAACAATTTTGCA
AAAACCAAGCTCTTAACTCAATTTTAAATCTTCGTCATACAAGTTTGGAAGAAAATGGTGTTGATGTGCA
CTTTAATATAGATATAGACAATCACTTGGGTATAGAACCTATAGATTTATGTACTATTTTTTCAAATTCT
TTAGATAACGCTATAGAAGCATCTTTGAAAATTCCTGATTTGTCAAATAGAAAAGTGGTATTAAAGGCAC
GTTGTGAGAAGGAGTATTTTAGCTATTTATTGACAAACAACAAGGTAAATCCTATCAATAGAAAACAAGA
ACTATTTATTTCAGATAAAAAAGATAGTAATTCTCACGGATATGGTATTGAGAATATTAGAGAAATTGTT
AATAAGTACAATGGAAAATTGGATATCTCTTATACTGAGAATGAATTTTCTCTATTTCTTTATATTAGAT
TATTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c652352-651624 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
TTGAAAGGAGATAAAAAATTGACTTCGATTTGTATTTGTGATGATGAAAAACAACAAAGAAACATGCTGA
ATAAAATCATTACAAGAGAAATGGATTTGTGGGGCTACCCCTACCAAATAAAAGAATATTCAAATGGAGA
AAGTCTAGTATACAATCTAGAACACGAAAATTATTACATAGATATTATTTTTTTAGATATTGAACTTGAA
AAAAGTAATGGCGTTGACATAGCAAAAACTATACGAAAACATTCAAAAGATACTATAATCATCTTTGTCA
CAGGTTTTTCTGACTATGTATTTCATGGGTATGATGTAGGAGCTTTGAACTACATCTTAAAACCTTATAA
AACTGAAAAAATATGTAAAGTATTAAAAGAAGCACTAAAAAAATTAGAACAATGGAAAGAAAACTTTATT
ACAGTTCATATTGGAACTAATCTTTGTAAAATTAATACAAAAGATATCCTCTACTTTAAAAGCGAGCTAA
GAAAATTAACTGTAGTTACCTTTGATAAAACATTAGAATACTACGGAAAATTAAATGATATGGAAACTGT
TCTTCCCTCTAATTTTATACGTACGCATCAAAGGTATATTGTCAATCTAAACCATGTAGATAGTATAACT
CAAACTTATGCCAAAGTTCAGAATGAAAAAATTCCTATAAGCCGTAAAAAATATCAAGAGGTTGTAGGAA
AATTTACAAGGTATATGTTAGAACCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c655059-652948 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGACAATTAATAAATTATACAGCAAACTTCGAGCCTATAATTGGAAGAACTATACAACTTTATTCTTTT
GTATAATACTTTCTGTGGTATTAGTAACTTCATATGCTCTAATTTATTTTAGCCCAACAATACAAAACAT
ACTTCCAACTGGTGGAGATAGCAGAAAACAGGCTACAATGATATTCTCAGTTGCTATATTAGGATGCGCT
GTCTTTACTACATACGCTTCTTCCCTCTTTTTAAAATTTAAAAGCAAGGAAATTGGTATTTTCATGGCTC
TAGGAACAGATAAGAAGAAATTAAAAAAACTTCTATTTTCAGAGATATTGTTAATTTCAATAGTATGCTG
TTTTTTAGGTCTTATATTAAGTATTCCTGTATCTTTTGGTATATGGAAAATATTTCAATTAGTGATTATT
GATACCAGAGAAATGACATATCATTTTGGAACTCAAGGATTCATATATGGATTTATATTTAGTGTATTTG
TGACATTATGCATATTTATACTTTCTGTAAAATTTATTAATCGTACAAATATAATTGATATATTAAATGA
CCAGAGAATATCTGAACCAATACAGGATGTAAAGGACTGGTATGGTATATTAGGTATAATTTTTATTATA
CTAGGTATTTTTCTAGGATATATCGTACCTTCACTAACTATAAACAAATTAAATTATAGACTACCATCTG
TATGGAGCTTTACTTATCTACTCTCTCTTATTGGAATATATATGATTATGACATACATAGTTGTACATGC
TAAAAGAGGAAAACATCCAGAAAAATACTATAAAAACATCATATCAACTAGCATGATGAGATTTATGGGA
AGACAAACAGTAAAAAACATGTGTGTTATTTCATTTTTGATTGCAGGAGCATTATTTGCTGTATTCTATG
TTCCTAATATGGTTGCAGGTATCTATGATACTCTTAAAAATAACCCTATAGATTATACTTTTACCTACAA
TCAAAGAGATAAACAGGTATCAAAAAAAGATATTGAACAATTAGCAGATAAACACAATATAAAAATTCAA
AACTATATGGAAATTCCTTCTATAGAATTAATTGTTGATGGTGTAGAATCAATATATCATAAAGATGGAA
CTATCGAAAGGGTATATATGAAAAAAAGCTCCTATGATATGTTCTTTAATTCTAAAGATTTTTCCAAGCT
AATTGACAAACCAATAACTATAAAAAATGGTGAATATCTTGCTGTTGTAAATAAAGGAAATGAAAATCAA
GATTATAAATATACCAAATTTATATCAAGCCCAGTCACAGAAAAAGAAATCCCCTTTAGATATGCTGGAA
AAATAATATTTAATGGTTCTTTTTTTCAAAATAGAAGTATGAACGCCTATGTCCTTAATGATGAGGATTA
TAAATCATTTACTAAAGATTTATCCATAAAAAATTACAATAATTCTATACTATTTAATGTAGATAAAGAT
ACCTATGCTTTTGCCAATGACTTAAAGAAAGAAATTATAAAAAGAACATCTAAGGAAATGGGCATGTTCA
GTGGTTATGATGAATACGTAAAAAAACGTTATGAATCAACTGGAAGAAAATATTTTATGGATGAAGAATA
TCCAAGTGGTGAAGGTCATTTAAAACTAGACCCAAACAACAATCAGTTGTATCTTAATTGGAAATACTAT
CCTAACTTTAAAATTTTACAAAGCCAAGATATGATAAAAAACATGGCAGTCTTCTTAATGTTATTCATAT
ATGTGGCAATCATATGTTTTACAGCAGTAGGAATCATTGCATATACAAGGGGTGTTACTATAGCTATAAA
TCACAAGCAGGTCTTTATGGATTTAAATCGATTAGGAGCAAACAATGATTATATAAAGTTCTGTATTAGA
AATCAATTAAAGAAAGTATTTTCATACCCTCTTATTGCAGGAAGTTTTTTAATTTATCTGTTTAATTTTA
TGATTATGTTAAATAATGATGGTAGAATCGTCAATAGTGAGGTCAATGCTCTTTTGATAAACTTAGGTTT
TATAGGGATTTGTGGAGTTTATATGTACCTTATATATCTATTAACTTATAAGAAATTCAAAAAAATTATT
GGTATTTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c655822-655049 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTGAGGATGATATATATGCTTAAAGTAAACCAATTATGTAAATCATATAAAACAGGCAATAAAA
CATATCCTGTATTAAAAAATATTTCTTTTGAAATCAACAAAGGAGAGTTTGTCGCAATCATGGGTTCATC
AGGAAGTGGAAAAACTACTCTTTTAAATTGTATTTCATGTTTTATCCCAATTGATAATGGGGAAATAATT
CTTGGAAATAATAATATAAGAAATTTAAAAGAAAAGGAACTTTCAGAAGTTAGAAACCAACAACTAGGAT
TTGTATTCCAAGATTTCATGCTATTTGATGGTCTTAGTGTCTTTGAAAATATATGTGTTCCACAAATTAT
CAAAGGTAGTCAAGTCTTACAAATGGAAAACCGTGCAATTAATCTATGCGAGCTATTTGGTATTGAACAT
ATCAGAAAAAAATACCCTGCCGAAATATCTGGTGGAGAAAAACAGCGTACAGCAGTAGCAAGAGCACTCA
TGAACAACCCAGATTTAATATTAGCAGATGAACCAACTGGTAACCTTGATAGTAAGTCTTGTCGTACAGT
CATTGAATCATTTTTAAAAGCAAAGCAAGAATTAGATGCTACTATACTCATGGTTACACACGATAGCTTT
GCAGCAAGCTTCTGCGACCGAGTTATTGTGCTTAAAGATGGAATAATTTATAAAGAAGTTGTAAAATCAA
ATTCAAGACATAAATTCCTAGATGAATTACTAGAAGTTTTAAAAGAAATGGGAGGCGCTCAAGATGACAA
TTAA
>ref|NC_013316.1|:c657273-657097 hypothetical protein CDR20291_0537 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTTTTACATTTATAGGAGTAATATCAGCAATTTTATTGTTGTGTACAATTATATGTGGTTTATGGA
TAAAACTTAATAATCGTAATAATGACTCTAATTCTCACTTTACTTTTTCAATACTTTCAATTGCTTTTTC
ACTGTTAATTGTGGTGGCCTTTTTAGTAAGAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c658027-657377 TetR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGTATCTAAACGTGTATTAAACATGTTTAATTTTTTTATGGAGAAACTTTTAAGGGGAAAAATTA
TGAAAGCAGATTCAACAAAGGAACAATTAATTAATGCCACAATCCAGTTACTATCTTCACATAGAGATGT
TTCAAGCATTACGGCTAGAGAAATTGTAGCTAAAGCAAATGTCAATTTAGCTATGATTAATTATTATTTT
AAATCTAAAGAGGAGTTAATTAATATTTCTATTAAAAAATTTTTAAAGCGTCATATGGATGAATATAAGG
CTACACATGATACTAAAAATTTAGCACCTAAACAGCAATTAAGGGAAATACTAATTGCATTTTTTGATTT
TATAGGTGAACATAGCCAATTTATAAAGATTTCTGTACCCTATATATTGATACAAGAAGAAATTGTTTAT
CCATTTGAGATACTACCTTTAATTAAGGCTCACTATGAAAATCAGAATAACAAAAAAACTGAAGCTGAAT
ACAGAACTATTGCGTATCAAATAACTTCATTTATTCAGTTGCTTTTTCTTCGTTCTAATGCTTTTTTCAA
GTATAGTGGTATTGATATTCTTAATGTTGAACAGAGAAATGGTTTAATAGATTTTCAATTAGATTTATTA
TTGGTAGATATTACAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c658908-658084 MerR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAAAATAGGAGAGGTTTCAAAACTAACACAAATTTCTATTCGTATGTTGCGTTATTATGATGAAC
TTGGTATTTTAAAGCCTGCAGAAATAGACAAATATACAGGTCATAGATTATACTCAGTTGAACAGATTTC
AATATTACAAAGAATTGTATTATTGAGAGATTCAAAATTTAGCGTTGCAGAAATAGCAAATATCGTACAT
AATTGGAATGATGAATTTGTAATTAAAGAATTGAATAGAAAAAAGAATGAAATACAAAAGGAAATAAAGC
ACGAACAACAAAGAATAAATAAAATTGATAAATTTATAGAAGCTATAAACTGTGATAAAGATGAAATTCA
TTACAATGTTGTCTTTAAAAAGATTCCAAGTTATAAAATCATATCACTTAGAGAGGTAGTCCCAGACTAC
CAATCTGAAGGTATACTCTGGGAAAAGTTATCTAAATTTATTAAAGAAGAACATATAGAAGTATCACGTC
AACCCAACAATAATATAGCTTTTTACCATGATGAAGAAGTCAAAGATAATGGTGTAGATATTGAAGTTGG
AATGGTTGTAAAGAAGATTGGAAAGAACAAATCTGGATTTATATATCGTGAGACAGAAGAAATTGATATG
ATGGCATGTACTATGGTTTATGGTCCATATGAAAATATAGCTGGTGCATATGAATCGTTCTGTTATTGGT
TAGATAAAAATAGTGATTATCAAATATCAGGTATAAATAGACAAATCGGTCATAAGGGTGAGCATAATGA
AATAAATCCTGAAAATTATCTTACAGAAATTCAAATCCCCCTTATAAAAGTCTAA
>ref|NC_013316.1|:c659979-659086 hypothetical protein CDR20291_0540 [Clostridium difficile R20291]
ATGCAACTATATAACACCCCCTTTAATACAAACAAACACTTAATCTATTTCTTTACATCTACGCTAGTAT
TGAACTGGATATTCAGTCTTACACCTGCGTTGCTCGGAATTACAAATACAATACTTGGAGAAATCATTTT
TTATCTTGCATATACATCACCAGCTATTGTAGGTCTATTTTTTATTTCTACAATCTATCCACAAAGTGCA
AAACAAGATTTTATTTATAGATACCTAAGCTTTAAAGAAATTAGAATAAAATGGATACTATTAACAATAT
TATTTTTTGCTTTAACTTTTATTACTTCGTTAATAATCGGAAATTACTTTAATGTAAAAACTTCTGATAT
AGATTGGATACACATAGCAGTGTTTAGACCTTCTAAAATAGCTTATATGCTATTAGCAAGTTTTATATTG
AGTATACTTAGTCAAGAAGCTGGATGGAGAGGATACGCCATTGACAAATTATTAGTTAGATTTGGATTTA
TAGGCTCTTCAATTATTTTAGGGCTTGTTTGTGGAATCTGGTATCTAGGGTCGTATTTTACACCTAATCA
AATACCATATAATTTGGCACAATACTCCCTATTTGATGCTTTTTTATTTATACCAAACATTGTACTTTTA
AACTTTATAATTAATTTTGTATATATCAATACAAGTAGAAGCATTTTATCAGCTGGGTTAGTTCATATGA
TGTACTATTTTTTCAACATTCAATTACTTCTACACTACCCTATTAAATTATGTGTAATAGCTCAATATGT
ACAAATAATATTTGGTTTAATATTTCTTGTATATATGATTTCTTCTAATAAATTTAAACAGAAGGTAAAT
TCTGAAATTGAACAGATAAAGTCGGATGATTTTGAATTTGAGTTAGACTGGTAA
>ref|NC_013316.1|:c660673-660236 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATACATGTCGAACAAGGTATTAATTGTGATGATATTGAAATAACCATAAAATGTTCTGCTCTAG
ATAATAACATTGAAAAAATAATTTCATTATTGAGTACACCATTACTTGATATAAAAGGTAAAAAATCAGG
AGAGATTTATAAACTCAATGTCTGTGATATTTTATACTTTGAAACAGTTGGAAATAAAACATTTGCTTAT
TATGAAGATGATGTATTTGAAATTGATTTAAAAATATATAAATTATCAAAATTATTAGCTAATACATCCT
TCTCACGAATATCTAAATCCATGATTTTAAATATGGACTACATAAAAAGTATAAAAGTAATATCACATAA
TCGCATGCAAGCTACTTTAAAAAACAACGAAAAAGTTATTATAAATCGTCGTTATATAAAAAATATTAAA
GAAAAGCTAAACATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c661322-661092 hypothetical protein CDR20291_0542 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAATTAAGAAAAAATTAGTCATGAGCTTTAAAAATGTAAAGGATAAACAAGTTTCTTTTTCTATAG
AAAATCCAAAGGATGATTTAACTGAAGAAAATATAAAATCTGTCATGGATTTGATAGTATCTAAAAATAT
TTTTTCGGTTGGAGGATTTGACCTAGCTTCTGTTGTTGAAGCCAAGGTTGTGGAAACAAATACCACTCCT
TATGACTTAGTTATAGAATAG
>ref|NC_013316.1|:c662235-662014 hypothetical protein CDR20291_0543 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGTTGTTTCAACAAAAAATTTATCTAGTATAAAACTAAAATTGGATGCTGGTTTTGATGATAAGG
GTAAGGCAGTTGTTAAAAGTAAATCATTTGCAAATGTAAAAGCAGAGGCATTAAATGAAGATGTTTATGC
TGTTGCAGAAGCAATAGCAAGTCTTCAAGAGAACCCTATTGTAGATATTTTAAAATTAGATAGTACATCA
TTATCTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:662660-662800 hypothetical protein CDR20291_0544 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAATTTTATTAAAGTTAATACAAAAATTAATTTTAAAGCTAAGAAATTTTTTATTAGATTCAATA
AAACTAATAAATATAGTTTAGTCAATAATGTATTAAATAAAAACTTTGTTAAGTCTATAAAAATATCTTA
A
>ref|NC_013316.1|:662815-663072 putative phage-related regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGATAAAAGTGGAGGATATACCAGTTCAATTTCATGCAATGGTAGAAATAATCGGAATTGATAAGT
TCATAGAGGTTGCCAAGTTGTATGGAGGAACAAATACTTATATACCTACGTATAAGGGGCTTTTTAGATA
TGCTAGAAATAGGGATATAGTAAAACAATTTAATGGAGTCAACCATAATGAATTGGCTATTAGATATAAT
ATGTGTGTAAGCAATATTAAGCGAATACTCAATGAAAATAATGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:663506-664759 putative phage-related regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGGGGAAATAGAGATGAATAAGGGATTTTACAAATTAAATTCAGTGGTATTGAACTTTGATATTAAGA
ATGATGTTAACAAGATAAGATTTAATCATTATATAATGAGAAAAGAAAACATACAAAGACTTCAAGGAAC
TCTGCCAAACGGACAATTTTATATGACAGTGAGAAGAGCTGCTACAGATTTACAACTTTCTATTTCTACT
ATAAGTAGGCTTGTAAAAGAGTTTTTGGATTTAGGGATAATAAGATTAGTGTCTAAGGGTGTAAAAGGTA
ATCGTTCTGTATATAGTTACGTAAGTATAGAGTTTAATGGAAGTTTATTTGATGATAGCAAATATATGGA
ACTTGACTGTGTATGTAATGATGAATTTATTGATAATAGTGGCATAGAGTTTGATTGTGATAGCAAAGAT
AATTCTTTTAATGGAGATATAAATGTAGAAACTGTGCATTGCATTAATGAGTATTTCTCTGATGATGATG
TAGAGCATAATTATAACAATTTCCATAATAAAGATACTATAAAGGATAAAGCCATTTCTAATATTAGCAC
TATCAAAAAATATATTGATGAATCTTTTGATACAAATAAATCAGAAAATTCTAACTTACAACAGGAGTCA
ATAAATTTCAACTTTAATGATACATGCAATGAAATAGATAAAAGAACGAATAATAGTATAGAAAATAATC
AAAATAAAAGGCCTATGAGATTGAGTGACATCAGTGTTTTAAGTGATAAAGGTATGACAAATAAAAAGAA
TTACTTTAATCATAATCATGGTATACAAAAAAGGAATAAATCTGCAACAAAGAAAAAAGAATCCTTAAAT
AAATTTAATAAAAAAAATATACAGCAAAGCATTATAAATATGCTAAATAAAAAATCAGGTAAGAATTTTA
AAATCGATTCTCCAATAAGCATAAAACTTATCAATGAAAGGCTAAAGGAGGGCTATGTCTTAGAAGATTT
CTATAAAGTTATTGAGGTAAAAGTGGCTAAGTGGAAAAATACCATAATGGAAATGTATATAAGACCAGAA
ACCTTGTTTAGCTATAAGTTTGAATCCTATGTAAATGAAAACATATCTATGAAAAGTCAAAGTAATGTTC
ATCCATGTAAAGAAGGCAATAGTAATGATAGCAGTAATTATATACATTCTGATTATACAACATATGATGG
CAGTGTGCGTGAGAGAAAAAAATATGAGAATGTAAGATACTGGAATCCTATATGTGAAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:665465-666766 putative phage-related replicative helicase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGTAAATCAAAAGATGTTGAAATAGAGAAGTCTATTTTAGGCACAATTCTTTTAGACAATAAATTAA
GCTATAAGCTAGATGAATTAAATGAAAACATGTTTATGAATGATATATGTCTTGAGATATTTAAAATTAT
GAAAGAACTTAAAAAAGAAAACATAGTGATTGATGTGGCCACTGTGAAATCAAAGATAGATAGAAAATCT
CTAGCAATAAAAACGAGTGATGTGACTAATCTAATTACTTGGGGTCAGAATTTTGGTCTTGATGGTCATA
TTAAAATTTTAAAAGAAAATTTAGCTAGAAGAAGCATAAATCAAAACTGCCAAAACCTTTTACACAGCCT
AAACCTTGGAGAAAATATCGATACTTGTATTTACAAATTTGAAAGTAATATAAAGGAGATTTTGGACAAG
GATACTTATGAAAATGATGATGTAAATAGTATAGCAGGGAAGGTGCTTGATTTTTTAGAAAACAAAAAAG
ATATTGGATTTAAATTTGGTATAAAATTACTTGATACTACTATAGGAGGTCTTTTTAAAGGAGAGCTAAC
CACAATAGCAGCTAAATCGGGGGTTGGGAAAACTGCTTTGGCACTTCAAATAATGTTAAATTCATTTAAG
CAAGGTAAAAAAACTTTATTTATAAGTAGAGAAATGACCAGTGAGCAAGTATTTATGAGAAATATATGCA
GAGTAACTGGTGTAAGTACAAGGAATATGAAATCTAAAGAAATAGATGAAAATGATTGGAAACTTATTGT
AAATGCTATAGGTGATTTAAGCGAAAATAACTTAATTTATATTAATGATAAGATAGATACAATTAGTGCA
ATTAGAAAGAGGATAAGGCAGGTAAAGCCAGATTTATTAATAGTGGATTATGTGCAACTCCTTACATCTC
AGAAAAGCATGGATAAGAGAGAAAGGGAGGTAGCTACTTTTTCGAGAGAACTTAAAAATATGACTTTAGA
TTTTAATATACCTGTAATCCAATTAAGTCAGTTAAATGATGAAATGAAAGATTCAAGACCTTATGGAGAT
AGACCTATGAGGGATAGCAAAGCCATCTACCACGATAGCAACAATGTGGTTTATATACATCAATTAAAGG
GGAGTGATTATGAAGAAGCAGTGAGAGATATTGGAGAAAGTGAGGAGGCAGTTAGAGCATCAGAATACAG
GGGAATTAAGATGGTTGATTTAATAGTTGCGAAGTGTAGAGATGGACAGACTAGGCATAAGCATTTTTGT
TACTTTGGGGATAAGTTACATTTTCAAGAACTAAATTATTAG
>ref|NC_013316.1|:666842-667117 putative phage positive regulator of late transcription [Clostridium difficile R20291]
ATGTTGGAATTAACGAAAATTATAGAATTACTTGAAGAACACAAGATAGAAGTAAGTATTCCAAAGGAGT
TACATAAGTATAGTTTATTGGAATACCTTGAATTGTGTCAACAAAGTGGGGGAACATATTTTTATATTAA
AACACTGGAAGGGGCATTAAAAGAGGCTAGAAATGAGCTTATGATTAAATTGTTTAATGGGAAAAATTAT
ATGGAATTAGCGAGGATGTTTGAAATGAGTGTTATTAATGTCAGGCATATTGTTAGAAAAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:668442-668672 putative ferredoxin [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTAATAAAAAAAAGAAGTATGCAAATATTTTAGCAAATGAGTGCGTTGCTTGTGGTAGCTGTATAA
AAGCATGTCCAAGAAGTGCTATCTCAGTTCCATGTGGCATTAGTGCAAAAATTAATAGAGATTTATGTGT
TGGATGTGGGATTTGTGAAAAGATATGTCCAGCATCTGTAATTGAGATTATAACAATATTAAAAGAGGAA
GAAGGTAAGTGTCATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:668665-669246 hypothetical protein CDR20291_0550 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATAAAAAACATTGGTATGACTATTTATGGATTTTTTCTTCAATATATTTGGTATTGGGATTTG
TAAATATTATTTTCGCTTGGATTGGGCTAATTTGTTTCTTTGTTCCACTAGCTATTTCTATTGTTAAGGG
AAATAAAGCTTACTGTAATAAGTATTGTGGAAGAGGGCAACTGTTTAATTTGCTTGGAAATAAATTGAAG
CTGTCAAGAAATAGAGATATTCCTAAATTTATTAGAAGTAAGTGGTTTAGATATGGGTTTTTGACATTTT
TTATGGTAATGTTTGCCAATATGCTTTTTTCAACTTATTTAGTGTTTGAAGGAAGTAGAAATTTTAAAGA
AGTAGTGACTTTGTTGTGGACTATAAAAATGCCTTGGCAATGGGCGTATCATGGAACTTTAGTTTCACCT
TGGGTGGTACAGTTTGCATTTGGTTTTTATAGTGTTATGCTTACATCAACTGTTCTTGGTTTGATTACTA
TGATATTGTTTAAACCTCGTTCATGGTGTGTTTATTGCCCTATGGGTACTATGACTCAGATGATATGTAA
GGCAAAGAGTAAGTCTGTATAG
>ref|NC_013316.1|:670169-671854 abc transporter, atp-binding/permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATATTTAATAGAAATAGCAAAAAAAGAGAGGTTATTAGTTTTTATATATTTAGCACTAGGTATAG
GAATAGAACTTTTAAATAGTTTTAGTGCTAATTATTATCAGAGCCTAATAGATAGATTTAATAACAGTAC
TATAAATTTTCACATAATTTTTATCTATGGAACTGTATTAGTTACTTTATGTCTTTTAAGATATATTGAT
GAATATCCAGGTAGAAGACTAGAACATAGTTTTTTTTTAGATTTGAAATTAAAGGCTTTAGAAAAAATGA
GTAAAATAGATTACTTAGAATATCAGATGTTAGGCACTGGAAAATTAATTCAAAAAATTGAAAATGGAGC
TAATGCTGGCAGAAATATATTTTTTAATTTTTTATTAGCCGTTGTTAGAAAAATAATTCCATCAATTTTA
TTTAGTATGGTTTTTATTTATAGAATTGATAAAAAAGTTATGTTTACCATATTAATTGGATATTTTATAG
TTTTTATTATTACTAATTTACTAATAAAAGCTCTATATCAAATCAAAGAGCATATATTAATTAATGAAGA
GAAGATGAATCATTTTTTAGTTCGTGGATTTGTAGAAATGGTTGTATTTCGGGTAAACAAAAGATTTGAG
TATGAAATTTGTCAGTCAAAATTTGCGAAAAAAGAAATTATTGATTCTAGGGTTAAAATGACACTGATTC
ATGAAGCTTTCTTCACGATTTTTTCATTAATAGTGACGTTCATAAAAATGTTAATAATAGTTTATAGTTG
GAAAACTAAAACAATAAGTATAGGTTCTATAATTGCATTGATAACTTTACTAGATAATGCATATACTCCT
ATAGCTATTTTTAATGTATTGTATATTCAATTTAAACTAGATAAAGCAGCATATAAACGCTATACAGATA
TTTTGGAACTTAATAATGATGGTCAACTGTTAGCAGGTAAAGAAGTTAATTTAATGTATGGAAATATTGA
ATTTAATGAGATTAGCTTCTTGTATAATAATAAGCGAGAGATATTTAATAAACTTAGTTTAAGTATTAAA
AGTGGAGAAAAAGTAGCTATTGTTGGAGAGAGTGGTTCTGGTAAATCAACTTTAATTAAACTATTAATTG
GATTATTAAAGCCCAGCGAAGGAACTATATTTATAGATGATTATAATCTACTTGAGATGAATCTAAATAG
TTACTATAATTATGTTACATATGTGTCACAGGATTCACCTATATTTGATGGAACTTTACGTGAGAATATT
GTATTTGGAAAAACTATAAAAAGTAATGATATTATTGAAGTCTTAGAAAAAGTAGGTTTAAAAAATTTAT
ACTTAAAATTAGAAGCTGGTTTAGATACTAAATTAGGTGAAAAAGGAACTACATTATCAGGTGGAGAAAA
GCAGAGGCTAGCATTAGCAAGGCTTTGGTTTTCAGATGCTAAGATAATTATATTAGATGAAGCTACATCA
GCTTTAGACAATATTACAGAGGAAAAAGTTATGCTAAATGTTATGGAATTTTTGAAAGATAAAACAACTA
TTATGATTGCTCACAGATTTAACTCAATTAAGAATGTTGAAAATATAATTGTTCTTAAAGAGGGGAGTAT
AATAGGTAGTGGTAGCTTTAAAAAACTATTAGATGGTAATTTATATTTTAGAGAATTATACTATACAATG
TCATAA
>ref|NC_013316.1|:c673011-672334 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGATTTCACAAAATGAAATTGATATACTTACACATAGCTTGCCTTTTTGGGATAAACTTACTGACTTAC
AAAAAGAATTATTAATTTCTTCAGCAAATACCTCGGATTACAAAAAAGGGAATCCAGTACATTGTGGTGA
TAGTGACTGTATTGGTATTTTGATTATAAAGTCTGGAACAATACGTACATACATACTTTCAGATGAAGGT
CGAGAGGTTACACTGTTCCGACTTGATGATGGAGATGTATGTATTTTATCAGCTTCCTGTATTCTAAAAA
CAATAACTTTTGATGTCTATGTAGATGCTGAAACGGACTGCGATATTATACAGATTAATTCCTCTGTTTT
TGCAAAATTATCTACAGAAAATATTCATGCAGAGTTATTTTCATATAAATTAGCTACCGAACGTTTTTCT
GATGTTATGTGGGCTATGCAACAAATTCTTTTTATGAGTTTTGATAAGCGTTTGGCATCTTTTTTAATTG
ATGAGATAGCTAAAAATGGCAGTAGCACTATAAATATGACTCATGAGCAAATTGCTAAGTATATGGGTAG
TGCCAGAGAAGTTGTATCGAGAATGTTGAAATATTTTGCTAGAGAAGGTATTGTGTCTTTATCTCGTGGT
GGTATAAAAGTATTGGATAAGGATAAACTTCGTTCTTTGACACTGTAA
>ref|NC_013316.1|:c674564-673200 putative drug/sodium antiporter [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAAAGTAACAAAAAAATTGAATTATTAGGGTCTGCCCCAATCTCAAAAGCATTGTTATCTATGG
GATTACCTACCATGATAGGTATGATGATAACTGCATTATACAATTTGGTTGATGCATACTTTGTGGGTGG
ACTTGGAACAAGTCAAATGGGAGCTATATCCGTTGCATTTCCATTAGGTCAGCTTGTTGTGGGATTAGGA
TTATTGTTTGGAAATGGAGCTGCTTCATATATTGCCAGACTTTTAGGCCATGGTGATAATGAAAAAGCAG
GAAAAGTGGTAAGTACATCTATTTACAGTAGTATTATAGTGGGTACATTAGTTATTATTGTGATTATGAT
TTTTCTCAATCCAATTTTAAAATTGTTAGGAGCTACAAAAAGTATTATGCCTTATGCAATATCTTATGCT
AGCATTTATGTCGTGTCATCTATTTTTAATATATTCAATGTCACTATGACTAATATTGTCACAAGTGAAG
GAGCTGCTAAAACAACTATGTGTGCTATGTTATTAGGTGCTTTGCTTAATATGATTTTAGACCCGATATT
CATTTATACTTTTGGTCTGGGGGTAAGGGGTGCTTCTATTGCAACAGCTATCTCACAGATTGCTTCAACA
CTTGTTTATGTAGGATATATTTTAAGCAAGAAAAGTATATTTAGTTTTAGAATTAACGAATGCTGTTTTT
CAAAAGAAATTTTTTCAGAAATCCTAAAAATTGGCATACCTACATTAATATTTCAATTATTGACTAGTCT
TGCCATTACATTAACTAATATGGAGGCTACAAAGTATGGTGATTCTGTGATAGCTGGAATGGGTGCTGTA
ACACGAATAACATCTTTAGGTAGTCTTGTTGTATTTGGTTTTATAAAAGGTTTCCAACCAATTGCTGGTT
ATAATTTTGGTTCGAAGAACTACGATAAATTACATATAGCAATAAAAACTTCCATATTATGGACTACAAT
ATTTTGTGTAGTGCTTGGTCTTATATTGGTGCTTTTCCCAAAATCTATAATTTCACAATTTACAAGTGGT
GACATTCTATTAATAGAAAATGGTAGTAAAGCTCTTAGGGCAAATGGGTTTTCATTTATGCTATTTGGAT
TCTATACAGTGTATTCTACATTATTCCTAGCACTAGGAAAAGCAAAGGAAGGTGGATTTTTAGGTATGTG
TAGACAAGGCGTCTGTTTTATCCCTATAATTTTGATTATTCCTGTATTCTATGGGTTAAATGGTATCTTA
TATGCACAACCAATAGCTGATTTGATGGCTGCTATAATTGCTGGTTTTATGTCTATAAGGTTACATAAGG
AACTTAATCTTTTAAAAATAAACGGTATGCATTAG
>ref|NC_013316.1|:674683-675213 hypothetical protein CDR20291_0554 [Clostridium difficile R20291]
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ATATTCAAAAGGCAGTGGAATACAGGAATATATCACGTTGGGTTAAAATAAGTACACCATCAATTTATAA
AAAAGTAATTCAATTAGAACAAAAGGGATATATTGAAAGTAAAACTGTGAAGAATGGAAAAATGCCAGAA
AAAGCAGTTTATTCATTAACTGAATTAGGTGAGACACATTTTTTAGATTTAATGTTTGATACATCTAGCA
AACCAATAAATATTCTTTTAGATTTTAATGCTGTTATAGTAAATTTAAATAGCCTTACACCAGAAAAACA
GAAATTATGTCTCAATAATATTGAAGAGAATGTTCAAGAGTTAAAGAAAACTATTGAGGAAAATATAATT
ATAAAGACAGAAGTACCAGAGACAGCAAAAGCAGTGTTGGAGCAACAGTTGGTGCTAGCACAAGCATTGG
AAACCTGGATAAATTCTTTAAAAGATAATATGGGGAATTAG
>ref|NC_013316.1|:675802-676881 hypothetical protein CDR20291_0555 [Clostridium difficile R20291]
ATGCCAGAATTACTAAAAAATATGTATAATCGTGAGTCACTTTATGAAGTTGCAGTAGCTATCCAATCAG
TTTACAACTCATTTAAGGTAGACGAGTTCATAAAATCTACAATGGATGAGACATGGAATAACTTAGAATT
AAAAGCCAGATGTCGAAAGATAAGTATGAGTTTAGGAATGTATTTACCAGAAGACTATAAGGAAGCTCTT
TCCATTCTTGAAAAATCAGTTACAGGTTTTTATTTTGCTTTTTTCTTTCCAGATTTTGTTGAAGTTTATG
GGCAGGACGAAATAAATTGGGATTTATCTATAAGTGCATTAGAAAGAAATACTGAGTATTGGTCTTCAGA
ATTTGCTGTAAGAGCATTTATCATCAAGGATGAAGAGCGTATGATGGCACAGATGCGTAAATGGTCTAAG
CATAAGAGCGAACATGTACGAAGACTTGCAAGTGAAGGTTGTCGTCCCCAGTTGCCTTGGGGACAAGCAA
TATCCAAATTTAAAAAAGACCCTACACCTGTACTGCCTATATTGGAGCAACTTAAAACAGATACATCAAC
GTATGTACAAAAGAGTGTTGCTAATAATCTAAATGATATCTCAAAAACACATCCAGATTTAGTCATAAGC
ATTGCAAAGGATTGGTACGGTAAAAATAAATCTACTAACTGGATTGTAAAGCATGGTTGTAGAACTCTAC
TAAAAAAAGGCAATCGTGATGTATTAGCCCTTTTTGGATATGATGATACTACTTCTATAAATCTTCAGGA
CTTTACTTTAGAAACAACGTCTATTTCTATTGGAGAGGATTTAACTTTTTCATTTAATATTTTAGCAAAA
AAAGCGACAAAAACAAGGCTCGAGTACGGAATTGATTATATGAAATCTAATGGAAAAAGGAATAGGAAGA
TATTTAAAATATCGGAGGTTTCATTAAAAGAAAATGAGAAAAAGTCATATATGAAAAAACATTCATTTGC
AGATGTAAGTGTAAGGAGACATTATCCAGGTATCCACTCGATTACTATTATTATTAATGGGGTAGAAAAA
GGCAAACTTGATTTTGAATTAGGTGTATAA
>ref|NC_013316.1|:677205-677573 hypothetical protein CDR20291_0556 [Clostridium difficile R20291]
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AAGATGCTTATATTAATTGGCATGATACAAATGAGCATTTTACTTTAGAAGAATTTATTATTGCAAATTG
TGAGTATCCTGATAAATGGAATGGTAAAGTAGAAAGGGTGCTAGAATTTGGAAATTTAGTAATTACAGTG
ACACATGTTTATGCAATAAATAAACCACTATCATTTCATGTCGTTTCATTTATCAGCCTTAAAGATGATA
AGATTATTTCTATTGATGAATATTGGGGAGAGGATGATGATGTGCCACAGTGGAGATTAGATAAACATAT
TGGAAAGCCAATAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:677690-678493 hypothetical protein CDR20291_0557 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGAAAAATACATCTTATCTGACCGAGGTAAAGTATATTATTGGATAAAAGAAAGTAATAGTGTGT
TTGCAAAGAACTTAATTTTTTTGCCAGGACTAACAGCAAATCATCATCTTTTTGATTTCCAGATACAGTA
CTTTTCAAAAAATCATAATGTATTGGTATGGGACGCTCCTGCTCATGGAAAATCAAGACCTTACTTAGAT
TTCTCATATTCTAACTTGGTAGAAGAATTGAAAGTAATTTTAGATAAACAAAATATGAAAAAGGTTGTAC
TTATAGGGCAATCGGCAGGGGGATTTGTGGCACAGTCCTTTATTGTAAAATATCCAAATATGGTAGAAGG
ATTAATGATGATTGGAACTTGTCCATATGGAACTGACTATTATAGTAAGTCAGATATTTTCTGGTTAAAA
CAGACTGAATGGATGTTAAAGTTATTCCCAGATAAATTGTTGCGAAACATAATATCTAAGATGTGTGGAG
CTACGTCTGAAGGCAGAAGGAGTATGATGAAAATGTTAGAAGGCTACGAAAAAAAAGAACTGTGTCATCT
CATGTATCTGGGATTTGCTGGGTTCATGCCAGAAATTCAAGACTTAAATATACATTGTCCAGTTTGTTTG
GTGGTTGGAGATAAAGACAAGACGGGTAAAGTGAGAAAATATAATGAGCAGTGGCACAATAAGACTGGGT
ATCCATTGCACATTATAAAAAATGCTTCACATAATGTAAATGTCGATAAACCTAGTGAACTAAATCAGAT
TATGGATATATTTATTAAGCAATTAAATATATAA
>ref|NC_013316.1|:678878-679768 putative radical SAM superfamily protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATTGAGAGTATACCAGCAAAACAAATTTTACAAAAAGTGAAATTTGACAATACAAGATGGTTTGGAA
TTGACTATAATATGAATCTCTATCGTGGTTGTTCTCATGGATGTATATATTGTGATAGCCGTAGCACAAT
ATACAACATAGAGAATTTTGACAAAGTTAGATATAAAGAAAATGTGATAGAGATTTTAAGTAAAGAATTG
CGTTCAAAAAGAAAAAAAGGGGTAGTAGGCATTGGAGCTATGTCTGACACATATAATCCTTTTGAAAAGC
AACTTTGTATTACAAAGCAAGCACTAGATTTGATTTCGGAAAATCATTTTGGAGTGTCTATTGATACTAA
AAGTAGTTTGGTGGTTAGAGATATACCGATTTTGCAGAAAATTAAAAAAAATAATTCTGCTATTGTAAAG
TTGACTATAACCACTGCAAATGATGAATTATCAAAGAAAATAGAACCTTATGTAAATCCAAGTTCTGCAC
GATTTGACGCAGTGAAAGAACTTAATGATTCTGGAATTTTTTGTGGCATATTATTGACTCCTATGCTTCC
ATTTTTGACTGATAATAAAGATGAAATACGAGCAATTGTAGAAAAAGCACACAAGGCTAATGCAAAGTTT
ATTTATTGCATGTATGGTGTAACAATGCGTAGTGGTCAGAGAGAGTTTTTTTATGAGCATTTAAGAGATA
TATCACCAAAATTAGTACTTAAATATCAGAAAACATATGGTTTAAACTATGTATGTACTATACAAAATAA
AGATTCTTGTGAGAAGTTGTTAAGAGAAGAATGTGCACGTTATGGTATTTTGACAGATATGAAAGAGATT
ATAAAAGCGTACAAGAGGTCGGAGTCATATATTCAAATAAAATTTTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:680231-680674 putative acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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GTGAAGAAATGATTGATAAATATCTCAATAAAGGAACTATGTACGCATTGTATGATAATAAAGAACTTAC
TTGTATAGCAGTTGTAAATGAAATTTCCAAAGAAATATGTGAATTAAAAAACATTGCTACATATGAGCAT
TTTCAAAATATGGGTTATGCCTCAAAGATGATTTATCATCTTTTAGATGTTTATAGTAAAAAATATTCAT
CAATGGTTGTTGGTACATCTGAAAGCGGAGTTCCTTTTTATGAGAAGTTTGGATTTGTTTATTCACATAA
AATTAAAAACTTTTTTGTAGATAATTATCCAGAACCAATCTTTGAAGGAGAATTACAATGTGTTGACATG
TTGTATCTATCATATAACTTTTAG
>ref|NC_013316.1|:680816-681016 hypothetical protein CDR20291_0560 [Clostridium difficile R20291]
TTGTTTATTTTGAATTTTGGAGGATTAATTATGGATTCAAATAATAATACTATAAAATCAACTGTTAAAA
AGGGTATTTCTTTTGGTTCTTGTTTAGCAATGATTATTTCTTATACTGCATGGAAATCTATTCCATGGGC
TATTTTTCATGGCTTAATGAGTTGGATATATGTACTTTATTATTGGGTTAAGTATGCATAG
>ref|NC_013316.1|:681567-682475 hypothetical protein CDR20291_0561 [Clostridium difficile R20291]
TTGACTAGTGAAAATGTTGGAGAAGTTGTAACTGAAGATGGGTATGCTAAGCCTGAGTATGATGAGGTAT
TTAAATCATTGTTTACTTTAAATAATGATTACGATTTACTTGCAAATTTTATAAATGATATCCTCAAAGA
TGCTCCATATGCCAATAGGAATATCAAACCGTTCACTCATATAAAAAGAATAATTAAGGCTGAAACCGAC
CCAACAATTAATTACATTGGTGAGAAAAGACCTAGACTTTATATTTTGGCTGAAGATGAAGAAAGTAATC
ATATAAATATTGAGATGCAAAGAGCTCTTGAAGATGATTATTTGGAAAGAGCTGAATATTATCTTAGTCG
TGTACATGGTAGAAAGTTAGAAGAAGGTAAAGAGTATAAAGAAATTGGAAAAACTGTTGGAATACATATA
CTAAATCATGTAAAATATAATCACATAGAAGATTATGTAAATTGCCTGAGATTAACAATGGACGGGCATC
CAAATATTTATTCTAGTAAAACTGCATTATATTTTATAGAACTTCCAAAAATTCGTAAATCCAGTTGTAT
AGCAAACAGAGTTCTAATATGGGGTAAACTTATTGATAATCCTTCTCATATTGATATTAGAATACTATCT
AAAACAGATTATGTTATTAAAAGAGCACTTGATAGATTAAAAGAATTAGGCAGTAATGAGGACTATTTAT
TAAATTTAAAGAGAGGTGCGTATATTATGAATAAAAGTAGAAATTTTAAAGAAGAAATTTTTCAAGAAGG
TGTTGAAAAAGGGAAAAGAGAAGAGAAATTTAATATCATCATAAAATTAAAAAATAAAGGATATAATTTG
AGTGAAATATGTGATATTATAGATGATTTGAATAAATCAGAGGTTGAAAAAATCTATAATCAAAACTAA
>ref|NC_013316.1|:682655-683143 hypothetical protein CDR20291_0562 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTTTATACTATACAGACTTTAGAATTTTGGAACAACAATAAAAACAATAAATATCTATCAAATG
ATTATTCTTTTATATTAGAAGACTTTGATATTCCATACAAATGGATGTATAGTCAAATGACAAATAGAAT
ATATGAATTTGATGATAGTATGATATGGGTTTGGACGAAGAGACCTGATTTAAGATGTAGTGGTTATTTA
GAAAAAGGAAAAAAAGGTGTTTTACTTGAAATAGAAATAAGTGAAGACAATGTGTTATTATCAGAATTTG
ATTTATGGCATTTACCTTTAATGGATATTACTGTAGAGCTTTATGAAGATGAACAAATTGAAAAGAAGGT
AAGTTGGGAAAGAATATTTGACTTAGAACTGTGTTCAAAATTAAATGAAGTTAATATAGAAGATTTGACA
TTGCAAGGAGTGACATCTAAAGTGCCTCTATCTAATGTAAAATTAATAAAAGAATTTGTTGCAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:683229-683636 hypothetical protein CDR20291_0563 [Clostridium difficile R20291]
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GAGCTACATTAGTAAATAAGTATTTTTTTAAAGGAAGTAGTATTGAATATCTTCCTATAATTATTTGGGT
ATTAGCTATGGGAGCTCAGTGGGTCTATAATAAAAAGTATGATGATTTAATTGATGAGGCATCAAAATGT
ATACTATCAAGAGTTAATGATATTGCAATAAAAGTATTGTTTTTTTCTGTAGCTATAGTATCTATATTTC
TTGTAACTTTGGACATAAATGTGTCAAATTTAAATATAGGAATGTCTTTATTAGTCATTTTGTTTATTCA
ATCCTTGTTGAAGTTAATTCTATTTATATATTTTGACAGAAAGGGGATATACAATTAG
>ref|NC_013316.1|:683637-683855 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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CAAAGTCAGTAGGAGTAAGACGTGAAACTATTGTACATTTAGAAAATGGTCGCTACAATCCTTCTTTAAA
ACTGGCAATGGATATTGCTAAGGTATTTGATACAACTGTAGAAGAGTTGTTTGAATTTATTGAAGAAAAT
AATATTTAA
>ref|NC_013316.1|:685290-685979 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGACATCTTATTGGTTGAAGATGATAAGAATATTCGAGAAATGGTATACGATTTTCTGATTAGTGAGA
ATTATTTTGTTAAAACTGCCGTTGACGGAAATACAGCTATTGAAATATTTAAAAATTATTCATTTGATAT
TATTTTACTGGACTTGATGTTACCAAAGTCTAGTGGTTTTGAAGTATTAAAATATATACGAAGTGTGAGT
GTTGTTCCTGTTATTATTACTACTGCGAAAGATAGTGACACAGATAAAATGCTAGGGCTTAATCTTGGTG
CAGATGATTATATTACAAAGCCTTTTTCAATCGTAGAATTGCTTGCAAGAATTAAAGCTAATATTAGACG
TGCAACGGTGTATAGCAGTTCAAGAAACTCTGAAGATATGGTTATTCAGTATAAAGATTTGATTATAAAC
ATATCAAAATATGTAGTTTCAAAGAATGGAATTGACTTAAACTTAACACATACAGAATTTGAAATTGTTA
AATTACTAGCGACTAATCAAGGACGTGCTTTTTCAAAGGAACAATTATACAACACTATTTGGAAAGAACC
TTATTATGGAAATGAAAATGTGCTAAATACTCATATTAACAGGTTAAGAAATAAATTGTCTGATGGTATA
GAAAAAAATAATTATATTAAAACTCTTTGGGGAATTGGCTACAAAATGGAGGAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:685979-686896 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGTTATTTTTAGTTGTAATTTCGATTGTACTATTTGCTTTCTACTTAAAAGAACGAAATAAGTCAA
AGAAAATGGAAAGTGATTATAAGTATATCAATTCAAGACTTCGTGATATAACAAATGATGATGAAATTAA
TTATATTTTAGTACCATCTGATATTTCGATTGTAAAAGAAACAGCAGTAGATATAAATAAACTTCTTGAA
AAGTTTTACAGTAGGCAAATTAATTATAATAGAAGTGAAAAAGCGATATTGCAAATATTTACAAACATAT
CACACGATTTACGAACTCCCATCACAGTATTAAAGGGTTATATTGAAATGCTATATCTTCAAAGTCAAAA
AGAAGAATTATCTTCTTCAATGAGAGCAACTTTGGAAAAAATGCAAACAAATTCAAATGAGCTTGTTAAT
TCAATAAATAACCTGTTTAATATGGCAAAAATCCAATCTGGAGATATGATATTAAATCTTCAAAAATCCA
ATCTAACACAATTATGTCATGAGATTATTTTAGAGTTTTATGATTTACTAGATAAAGAAAACTTTAATGT
TGAAGTTAATATTGAAGATAGACCTATATATGCAAATGTTGACACAGAAGCATTACAACGTATACTCAAA
AATTTAATTGATAATGCTATAAAATATGGTTCAGATGGTAGATTTTTAGGGATTTCACTATATGAAAAGG
AAAAACATGTTTTTATAGATATTGAGGATAAAGGTTCAGGTATTTCTGAAACTGAAAAAGAGCATATTTT
CACAAGAGCTTATACTGCTGACAGAAAAAAAGGCAATGGTTTAGGTTTGGCTATTTCTCAAGGGCTTGCA
AACTCTATGGGAGGTTCAATTTATGTAAATAGTAGACCTAATGTAAAAACAGTTTTTACGGTAAAATTGA
AAAGTTAG
>ref|NC_013316.1|:686966-687895 putative lantibiotic ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATGAACTATATCATAGAGACCCATCAATTAAAGAAAATATATAAAGATAAAGCTGTTGTTAATGATG
TTAATATTCATGTGAAAAAGGGAGAAATTTATGGATTTGTTGGACCAAATGGAGCAGGTAAAAGTACAGT
AATGAAAATGTTGCTAAATCTCGTTAAGCCAAATTCTGGAGAAATAGTTATGTTCAGTAAGAAAGTGGCA
GAAACTGATTTTGAAATATTAAAAAAGATTGGTACTATTATTGAAAATCCTTATTTCTATGAGAATTTGA
CTGCTAAACAGAATCTTGATTTACACTGTGAATATATGGGTTATTATAACAAAGAACATATATCAGAGGT
ATTGGAATGTGTCGGATTGTCAAAGCAATCAAACAAGAAAGTTTCAAAATATTCTTTAGGGATGAAACAA
CGTCTTGCAATAGCTAGAGCAATTCTTACTAAACCAGAATTATTGATTCTTGATGAACCTATAAATGCAC
TCGACCCAGAGGGGATAAGAGAAATGCGAGAATTATTCCGTAAGTTAAATACAGATTATGGAATAACTAT
ATTTATTTCTAGTCATATTCTTTCAGAGGTAGAACAAATTGCGGACACTATTGGAATTATTCAAGATGGT
AAACTTATTAAAGAAATTTCTATGTCAGATATACACAAATATCAAACAGATTATGTTGAAGTAGATGTAG
ATAATGTGGAACTTGCTGGATACTTGTTAGAAAAAGAATTTGGAATAAAAGACTTTAAAATTACTTCGGA
AAGTTGTATTGAAATATATGATTTACGAAAAGATGTAAAAGAAATATCCAAAATATTTATCAAAAATCAA
ATTGGTATAAATAGCATTGGACGTAAACAAAGTTCTTTAGAAGATTACTTCTTCCAAACTACAGGTACAG
GAGGTATAGAAACACTATGA
>ref|NC_013316.1|:687892-688572 putative lantibiotic ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATACATTTAATGAAACTAGAATTAAAAAAAGTTGGGCTAAAAAGATATTTTTTATTTTCAATACTGG
GGATTTTGTTATGTATGTTTTTTGTCTTTACTGGATTGAATGATAAATCTACTTCAATATATGATTATGA
TGTTACATTTAGGACAATCAGTTTAGTTTTCTGTTTTTACTATATTATATTATTTGCTGTGTTGAATGTG
GCATATATAATAAATGAATATACAAATAAAACAATCTTGATTTTATTCTCTTATCCACTTGACCGTAAAA
AACTTATTTTATCAAAGTTACTTTTGATTACGACTCTTATGATATCATCAATGATAGTTGGATATATCTG
TTGTTTTACATTCGTTGTTGTGTTGGATAAGTATTTTAATTTAGTTATTGGAGATTTTCATATTTCAATT
TTATCTTATTGGATACCAGGAGCAATTAAAAGTATTATTGTATTTTGCTCATTAGGTATATGGACATTCG
TTGTTGGAATGATAAGAAAATCAATACCTGTTACCCTTGTCAGTTCAATTATTTTTATCAATTTAAGACA
ATTTATTTTAGCTGGTACAAATACAACTCAAGACAGTCTGATTTCTGTTTTTATTATAGTTGGAATAACT
GTGATTGGTATATATTATATACTAAATCATAAAGTTACTGAAATTGACTAG
>ref|NC_013316.1|:689017-689718 fic family protein; putative filamentation induced by cAMP protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAACAATTCCTTTTTAGATAAATTGATTGAGACAAAAGAACTTAAAAATTCACTTTATAATGTGTTAA
AACACAATTTTCTTTATCATTCTAATAAGATAGAGGGCAGTACTTTTACTACTGAAGCATTAGCACTTTT
ACTCGATAAGAATGTTGTTACAGGAAGACATACTTTAGATGATGTACAAGAAACTGTTAATTCTAGTTAT
GTATTTGATACAGTAATTGACTCACTGAAAGAGAAAATAACACATAATTTCTTAAGGAATCTACATTCAA
GTTTAATCTTCAATACAACCCTACATTCCAGAGGGATGGCTGGTATATATAAAACTATACCCAATATGAT
ACTAGGAACTGATGTAAGCATAGCACAACCATTTGAAGTTGAGCCAAAGCTTGATGAATTAATTGAATGG
TACTATAGTCAGAGTGAAGTGTCTATTAAAGTTATAGCTGAATTTCATTATAGATTTGAATTGATACATC
CATTTCAAGATGGTAATGGTCGCATAGGTAGATTTGTTATGCTAAAACAGATGTTAGAAAATAATCTTCC
TATAAAAATTGTATCTTGGGATAGTGAGGACTTGTATAGAAACTCCTTAAATTCTTGTAGTTTAGGTAAT
TATGTCCCTTTAATTGAATATTTATCAAGTTTAGAAGATTTTAGAGAAGTATATAAAATGTTATGGAAAT
AA
>ref|NC_013316.1|:690613-691272 GntR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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GTGGTGAATACTCTGTAGGTCAAAAAATATTACTAAATGACCTTTGTGAAAAATTTGAAGTAAGCAGAAC
ACCAGTTGTACAAGCAGTAAAAATGCTAAATAAAGATGGAGTGCTTACTATTATGACAAATGGTAAAGTG
TACGTACCAGAGTATGAATATGATATGGTAAAACAAGTTTGTGAAACGAGAACACTGATTGAAACATATG
CTTTAGAAAAAATGATGCAAGAAGAGGAAGAGGTTTTTCAACAAAAGCTAGATGTAATAAAAAGATACTC
TGATAAATGCGAGGAGTACTATCGTCAAGAAAAATCTGTAGAACTTGCACTAGCAGATTTGGAATTACAT
AAAGCCATTGTAGAAGGGGCAAATAATGAGATTTTAAATGATGTATATGTTGGTATACAAGGAAGATTTA
TAGTAGTGAACTATTTAATTCGACCATTAAAAAATCGTAATTATGAAGGAACAGTACAAGACCATTTTGA
AATATTAAAATTCATTGAAGACAGAGATACAAAAAAAGCAGTAGATAAACTAAGAAATCATATTCAAGGA
ACTATTAAAAGATTCTGTGAAGATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:691550-693616 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAGGTGGTAGAGAGTTTGAAAAAAATTACTAAAGAAAGGATAGAAAATACTATGAAAAAGCTAT
TTACGAGCGAAACATTTTTGGAATATCAATTTATAAGTGATTGCCAAATATCACCAGATGGAGGATATAC
AGCATTTATTGTAAAAAAAGCTGATATCAAAGAGAATGGTTACACAAGCCAAGTTTATATATTAAACAAT
AAAACTGGCGAATTAAAACAAATAACGTCTATAAACTCTGTTGGAGCATATGTCTGGGAAGATGAAAATA
CTATCTTGTTCCCTGCTTTGCGAAATGAAAAAGTAAAAGAAGCTGTCAAAAACGGTAAGCAATGCATGAG
TTACTATGCTTTATCTTTAAATGGTGGAGAAGCAGAAGAACTTTTTAGACTCCCTATCAAAGGTGGTAAA
TTGAATCCTATAGGAAAAGGTTTGTATGCAGTTATTGATTCTTATGACAATGACCGACCTATTGTAGAGG
GATTGCCAGAAGAAGAACAACAGAAAAAAATAAATGCTTATAACAAAAGACATTATGAACATTTCAAAGA
AATTCCTTATGCTGTCAATGGGGAGGGATATATTAGCAGAAAAAGAAAACGCCTATATATATACGACAGT
AATATAAATAAGTTGAAGGCAATTACAGCACCTATGTTTAATGTTGTAGGTATGAAAATAAGTGATGGAA
AAATCTTATATATAGGGCAAGAGTTTAAAGATGTAAAAGGTTTGAAAAATGGGGTCTATGTATTTGATAC
AAACACAAACACAAATATCTGTATATTAGAAAAAGATAAGTATATTATAAAAGGTTTTGAATTATATCAA
AATCAAGTGATACTAAACCTAACTGATGCTTTATCTTATGGAAATGGAGAAAATGGAGATTTTTATACTA
TTGATATTGATACGAAAGAAATGAAACTTCTTTCAGGGCATCAACATCATTGTATTGGAAATACAGTAAC
ATCTGATGTTAAAATGGGTGCTGGTCAGACAACAAAGGTAGATGGAGAATATATTTATTACACTTCTACA
GTAGATATGGACTGCATTATTGAAAGAATACATATTCCAACAGGAAAACAGGAAAAAGTAACACAGACAG
GTTCAGTTGATTTTATAGATGTAAAAGATGGCAATATTGTATGTGTGGGTTGTTTAGGAAATGGATTACC
AGAAGTTTATACAGTAGAGAATGGAACATTGTGTAAGAAAACACATTTAAATGACCATATTTTAGAGGAA
TATAAAATTTCTGTGCCAGAATACATAGAGTCAAAAGGAAGTTCTAAATGGGAAATACAAGGATACGTAT
ATAAACCAGTAGATTATGAGGTGGGGAAAAAATATCCAGCTGTATTGGCGATTCATGGAGGACCAAGATT
GACATATGGACCATATTTTATGCATGAGATACAGGTATTTACAAGTGCAGGTTACTTTGTATTCTTCTGT
AACCCAAGGGGGTCTGAAGGTCGTGGCAATGCTTTTGCAGATATTAGGAAACAGTTTGGAGATATTGATT
ATATAGATTTTATGGAATTTACAGATACTGTACTTGAAAAATATACAGACATTGATAAAACAAAATTGGC
TGTTGAAGGTGGAAGTTATGGTGGATTTATGACGAATTGGATAATTGGTCATACAAACCGTTTTGCTGTT
GCTTGTGCTCAGCGTTCTATTGCAAACTGGAGTAGCATGGAGGGTACAACAGACATTGGTTATTATTTCT
GCAAAGGACAAACAGGTGCTTCTCATATGGAAAACCACGAGCTTCAATGGAAACAGTCACCTCTTGCTTA
TGCTGATAAATGTGTTACACCGACTTTATTTTTACATGGTGAAAAAGACTATAGATGCTATATGCAAGAA
GCATTCCAGATGTTTTCAGCATTGAAAATTCATGGGTGTCCTACAAAACTTTGTCTATTTGAAGGGGAAA
ACCATGAACTGTCTCGTTCTGGTAGACCAAAACAAAAGCTACAAAGATTAGTTGAAATGCTAGATTGGTT
TTCTGTGTACATAAAAAAAGATAACATAGGACAGTAG
>ref|NC_013316.1|:693633-695588 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAAATAAAGATTGAAAGTTCAGATATTTTTGAATATATATTCCCTCATGATATTTCTTGTTCAC
CTGATGGAAAGCATATTGCTTATATTATATCAAATATCAACGAGGAAAAAGACTGCTATGAACATGACTT
ATATGTGATGGACATCAAAACAGAAAAACAAATACATATGACTCAAACAAAAGATGTAACATCATTTAGT
TGGATTTCTAATACAGAACTACTTTTTACATCTAAAAGAAATAAGCCAAAAGCAGGTACAACAGATTTTT
ACACTATTTCTATAGAAGGAGGAGAAGCAAAAGAAGCATTTTCTATTCCAAAAGCTTGTAGCGTACCTGT
ATCACTTGGAAATAAATTGTGGTTATTGACAACAAAAAATCCAACGGATTCTAAAAAATCAGAACCAGAT
AGGGCAGTAGAGGGTGTAGATTATTGGACATTTACAGATAAACCTTTTATAAGAGATAGAGAAAATTTTT
CTCAAAGAAGACGTGTAACATTAGAATTATATCAAGAAGGTGAAAATATAACAAAAGCCATTACACCAAA
ATTTTGTGAAGTAGCAGGTATAGACGTTTCTTCTGATAAAAACAGAATTTTATATACTGGTCAGATTTAT
GAAGATTGTGCAACTCCTTTTTCTGGACTTTGGGAGTATCATATAGACAGTGGTGAAACCAAAGAACTTG
TACCACAAGGAAAGTACCAAATAAGTTTGGCAAAATATATTGGCAAAGATAAAGTAATGTTGCAAGCTTC
AACATTAGAACGTTCTATCACACAGAATCATGATATTTTTATACTTGATTTGAGTACTAGTGAAATAAAT
ATGATTGCTAGTCCAGATGGTATGTATGCTACATTACTGGATGTAGATGCAGTATATGGTGGTGGACGTA
GTAATAAAGTTATAGGAGATAAATTTATTGGTGCAAGAATTTGCAGAACTATGACAGAATTTAATGAGTT
TGATACAAAGACAGGTAATATACGTATCATCACAAAAGTAGATGCTTTTACATCTTTTGATATTTACGAC
AACACCATGTACACAGTAATGTTGAAAGATTATGAGTTAGCAGAAATATATAGCATTGATATGACTACAG
GTACAATGAAAAAAATGACTGCTTTTTCTAAACCATATTTAGATACTCATAAGGTTTCATTACCTGAAAA
ATTGACGTTTGTAGCAAAAAATAAAGAAGAAGTTGATGGTTTTGTTATACCACCTATAGATGCTAAAGAA
GGCGAAAAATATCCTGCTGTATTGTTCATTCATGGTGGACCTAAATGGGCATATGGCTATATGTTTACAC
ACTTGAAGCAGTGTGTAACATCAAAGGGAATGTATGTGATTTATTGTAACCCTCATGGTGGTGACGGTTA
TGGTGAAAAATTCTTAGAAATGGTAGAAAGATGGGGGTATGTTGACTATGAGCATCTTATGGAATTTGTA
GATACTTGTATTGAAAAATATCCTGGGATTGATGCAGACCGCTTAGGGGTTGCAGGGGGAAGTTACGGTG
GTTATATGACAAACTGGATAATTGGCCATACAGACCGTTTCAAAGCAGCAGTTTCTCAAAGAGGTATTAG
TAACTTGATTACAGCTTCTTTAATTATTGACTTTGGGGATAGAATTATGAAGCAGACTTGTGGAGATAAG
ACGCCTTGGAATCATGAGGAGGTTCTTTGGAATCATTCACCTATTAAATATGTGAAAAATGTTAAGACAC
CAACATTGTTCTTACATAGTGATAGGGATTATAGATGTTTTATGGGGGATACTTTCCAAATGTTTACAGC
ATTAAAACAGCTTGGTGTAGATACAGAAATGTATTTGTTCCATGGAGATACACATGGATTGTCTAGAAAT
GGAAGACCATCTAATAGAATTGCACGAGCAAATGCTATTGTAGATTGGTTTGAAAGATATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:695604-696794 hypothetical protein CDR20291_0573 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTGATATGTTATTATGGTTTAGTGTCGTATTAGTTTTATTTGCTATTGGGGATTTAATTGCAAGCA
AAACAAAAGCAAAAGTATCAGCTGTATTTGTTACACTACTTTTATTTTTGATTCTATTTGTCACAAAAGC
AATACCAGCTGATATTATTGAAAAAGCAGGTATGACCGCAGCAGCTAGTTGGAGTGTTCCAATGATTATG
TTTAGTATGGGAACAATGTTGAATGTTAAACAATTTATAGACGAATGGAGAACAGTATTGACAGCATGGC
TTGGAATTGTAGCAGTTATAGTCTGTGTCTCATTATGTATTCCTTTGTTTGGAAAATCAACAGTATTGAC
AAGCATACCAGTTATAAATGGAGCTTTACCTGCTACTACTATTATGACACAAGCAGCACTAGAAAAAGGA
CTGACACTTGCAGCAGCTACAGCAACAGTTGTATTTGCAATTCAGAAGTTTATTGGTACACCAATAGCTT
CAAGAGCAGCGTTACAAGAGGCAAACCGTCTTTTAGTAGAATATCATGAAGCAAAATCAAAAGGCATTGA
TTTAGCAAATGTTGATACTGATAAGAAAGAAGCAGAGAATACAGGCACAAAAGTAAAACAAGCTTTCTGT
GAAAAATACGATAAATATTATTCTACAAATGTTTGTATATTTTTTATAGCACTATTCTCTTATCTAGGGT
ATGAACTTTCAGAGATTATTCATGTAAATTATTCTATTGTATGTCTTGTTGTTGGTGTTATTGTAACACG
TATTGGTATTGTACCAAAAGACATTTTGGAAAAAGGAAAAATCAAGGGATTTATTAACATGGTTGTGTTT
GCAGCTGTTATTCCTTCTTTAGCAAAAGTTTCTTTGACAGATTTAATTAGTCTTTTTGTACCAATTGTGG
GTATGTTTGCAGCTTCTATCATTGGTATATTCCTTATGATGAAGGTGTTACCAGGTTGGAAAATTATCGG
TTCTAAACCTCTTGCTTTTGGAGTAGGGTTTTGTCAGATGTTGGGATTCCCAACTACATATTTAATTTCA
AATGAAGTGTGTAATGCTGTTGGAGAAACGGAAGAAGAAAGAGCATATTTGATGTCTAAGATTATGCCTA
AGCTGGTAGTTGGTGGTATGGCTTGTATGATTTCTATTGTAGTAGCTGGTCTTATGGTACCAATGTTGTA
G
>ref|NC_013316.1|:697928-698302 GntR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTGCTCATTTCTAACACATCAGATAAGCCATTATACCAACAAATTAAAGAGCAAATTAAAGAAG
CAATATTTACTGAAGAACTGAAAGAAGGGGATGCAATGCCCTCAATAAGAAATTTTGCTAATGATTTAAA
AGTTAGTATTTTGACTATTAGACGAGTGTATGAAGAACTTGAAAATGAAGGTTTTCTTACACGCCAAGTT
GGAATAGGAACATTTGTTTCAACTGGAAATTTAGAAATACTAAGAGACTCAAAGAGGCGTATAGTTGAAC
AAAAAATGGCAGATATGATTAAGGATGCAAAAGCACTAGGAATTACACAGATAGAGTTACAAGAAATGAT
GGGTATTCTATATGAGGAGGATTAA
>ref|NC_013316.1|:698289-699161 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGAGGATTAATATGGAAAATATTTTAGAAGTTTATAACTTAAATAAGACTTATACCAATTTTTCAT
TATCTAATATAAGCTTTGTATTACCAGAAGATTGTATAACTGGATTTATAGGTGTTAATGGAGCAGGAAA
AACAACAACAATTCGTTCGATATTGGATGTCGTAAAGCGTGATAGTGGAAAAATAAAAATCTTTGGTAAA
GATTTCGATGGAAATGAGAAGGAATTAAAAAATCGAATTGGAGTTGTATTTGATGATTCATATTTCTATG
AGGAGTTGTCAATGTCAGAAATGAAAAGTATTATTGCACCTTCATATGATAATTGGTGTGAAGAAGATTA
TCAACAAAATATGAAGCGTTTTAATCTTAATCCAAAACAAAAGATTGATACACTTTCAAAAGGAATGAAA
ATGAAATTTGCTTTAGCATTAGCATTATCGCATAAAGCTGAGTTTTTAATTATGGATGAGCCTACAAGTG
GTTTAGACCCACTAATCCGTAGTCAGATACTTGACATACTAACAGAATATATGAAGAAATGTGGTCGTGG
TGTTTTCTTTTCTACTCATATAACATCTGATTTAGACAAAATAGCAGATATGATTGTTATGATTGACAAT
GGACGTATTATATTAGAGCGTGAAAAAGATACTCTATTGGATGAACATAGAAAAGTAAAAGGGGATATTC
AATTTCTAAATGATGAAATCAAAAAATTATTTTTAAATTTAGAAATTACAGGTTATGGTTTTATAGGGAT
TACCTCAAAAATTAATGAAGTGCAAAAAAATATGCCAGATATTTTAATAGAGCGTCCTACAATTGAAGAT
ATTATGCTTGCATATATTGAAAGGAGAGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:699164-699802 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTGATTCATTTAGTTAAAAAAGATATTCTGATTGTAAAAAAATATGTATTGTTGATATTGTTTATTG
CAATAGGAATCCCATTATTTATATTATGGCGTTTACCTCCATTTGCACAAATATTGGGATTTGTACTATC
AATTATATTTTCAGAATTTATGCTGTGCCAGTATCTATTATTAAAGGAGAGTCAATATTCAAAAGCATCT
GTATTACTTTGTTCAACTCCTTATCCTAGACGTGGCTTAGTTCAATCTAAGTATGTTTTATTTGCAATGG
TATTTATCTATTGTACATTAGTTTACTGGATTGAAAATTTACTTATTCCACAAATAGGAACTTTTGACTT
AACATATATTTTGATTGTTTTATTAATAAGTTCTATTATTTATGGAGTTTATATGCCTATTCAATACAAA
TTAGGATATGAAACAACAAAATTCTTTTTCGTGATGATAATCATGGCTTCATCATTTGTATTACCATTAA
CTATAGCTCACAGCAATTTTGAAATTCCATTTATATATCAGTATCCATCCATGATAGTGAATATTGTATT
GTTCCTTTTAAGTTTAATTATACTGTTAGCTTCAATGTTTATTTCTATTAAAATTTTTAGTAATAAGGAG
CTTGTATAA
>ref|NC_013316.1|:700776-701510 metallo-beta-lactamase superfamily protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTAGCAAAGGGATTAGATGTTTTAAAAATTTCATCAAATGTATTCGGTGAAGATAAAGTTATGT
ATATTCCTGTAATCTACACAGAAGATGATGCAACACTTATTGACACAGGTCTTCCGGGTCAAGGTGATTT
AATAATTGATGCTCTTAATAAAAGTAACACGAGCTTTGATAGGTTAAAAAATATAATAATTACTCATCAT
GATATAGACCATATAGGAAACATAAATTATCTAAGAGAAAAATCTAAGAATAATATCAAAGTATATGCAT
ACAAAAGTGAAGTCAGTTATATAACAGGAGAAGAAACTCCTTTTAAACTTTATATGTTGGAACAAATGGT
AGATAAAATTGATGATAAGATGCTTAGTATGCTAAATGTTATGGTACTTGGATTTAAATCATCATATACT
AAAGTAGATGTGTCATTAGATAACCATGAAAAATTGAATCTAGGTGAGGAAATAGAAGTTATACATACAG
GAGGTCACACTAGAGGTCACATATGTCTTTATTTAAAAGAGTCTAAAGTACTTATTGCTGGAGATTTGTT
ACAGGTAGAAAATGGAGAACTTACGCCTGTTGATGTAATGCACAGCAACAAACAAGAGTTAAAAGATGCT
ATTAAAAATATAAGTAATTATGATATAGAAACGATAGTTTTTAGTCATGGTGGATTATATCAAAGAGACA
TAATTGGAACATTGAAAAACCTAATTATTGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:702652-703908 putative chloride ion channel protein [Clostridium difficile R20291]
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ATGGTGGACTATTTTTGTTAGGACTCATAGGTATACCAGTTGGTGCAATTATAGGTCTTATAGACACCAT
ATTTGGAACGGTTCTTCTAAAAGTTACAGATATTCGAGAAACATATCCAATGTATCTGATACCATTTTTA
GCAGTAGTAGGAGTTGTTATTGCTTATTGCTATTTTAAATTTGGAGGAAAAAGTAGTAAAGGAATGAATC
TAATATTTGAGGTAGGGCATGGAGAAGAAGAAATTATTCCTTTAAGATTGGTTCCATTTATAATATCAGG
TACATGGTTAACCCATTTATTTGGTGGTAGTGCAGGACGAGAAGGAGTTGCTGTTCAGATTGGTGCAACT
TTTTCACATTGGGTAGGTAAAAGGTTGCCTATAAAAAATGCTTCTAGTATTTTTCTAGTAACTGGTATAG
CAGCTGGTTTTGCAGGATTATTTGAGACACCAATAGCAGCAATACTATTTGCTATGGAGGTTTTGGTAGC
TGGTTCACTGGAGTATCAATCGCTTTTTCCTGCGTTTACTGCTTCTTTTACAGCAAGTGCAGTATCAAAA
ACTTTAGGGTTAGAGAAATTTTCTTTTGCACTTTCTTCTAAAGTTGTATTTGACTTACCAATATTTTGGA
AGCTTATTGTTTTAGGAATTATTTTTGGAATGGTTGGTGGAGCATTTGCATGGTGCCTGAAATTGTCAAA
AAGAAAAATAGGTAATAGATTAAAAAATCCTATGATAAGGATTGCTATTATTGGAGTATGTCTTAGTGTA
TTATTCCTTTTATTTTATAAAGGAAGATATTCAGGTTTAGGGACAAATTTAATTCAAAATAGTTTTTATG
GTGGAGAAATTTATTCATTTGACTGGCTGTTAAAGTTTATACTTACAATACTGACTTTGTCAGCAGGTTT
TCAAGGAGGAGAGGTTACACCTTTGTTTTCCATTGGAGCTAGTCTTGGTGTATTGTTAGCAGGATTTTTT
AATTTGCCAATTGAATTAGTTGCAGCGCTTGGCTATGCTAGCGTCTTTGGCAGTGCTACAAATACTTTTT
TTGCTCCTGTATTTATAGGGGCAGAAGTTTTTGGATACAGCTATTTACCTTATTTCTTTGTAGTATGCGC
TATTTCATATATATTTAATATGGATAAATCTATTTATTCACTACAAAAAATTTCAACGAAACAATAA
>ref|NC_013316.1|:703971-705164 putative Na(+)/H(+) antiporter [Clostridium difficile R20291]
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TACCTAGCTTATTGGGAATGTTACTTACAGGAATCATATTGGGTTCATATGTTTTAAATTTGATTGATAA
TTCAATACTAGATATTTCTTCTGACCTTAGAAAGATTGCATTGATTATTATATTAACAAGGGCTGGATTA
TCTTTAGATATAAACGATTTGAAGAAAGTGGGAAGACCTGCTGTACTTATGTGCTTTATTCCAGCTACTT
TTGAAATTATCGGAATGATAGTTTTAGCACCAAAATTACTAGGCGTTTCTATATTGGAAGCAGCAGTCAT
GGGTGCAGTAGTAGGAGCAGTTTCTCCCGCAATTATTGTACCTAAAATGCTTAAATTAATGGAAGAAGGT
TATGGTACAGAAAAAAGTATTCCACAGATGCTTTTAGCAGGAACTTCTATAGACGATATTTTCGTAATTG
TGATGTTTACAGTATTCACAGGATTGGCACAAGGAAATAGTATATCAGCTATTAGTTTTTTACAAATTCC
AGTATCAATTATATTAGGTGTAATAGTTGGAGCAGTGATTGGAATCTGTTTAGCAGTATTTTTTAAGAAG
GTTCATATGAGAGATTCTGCTAAAGGGGTGTTGCTTTTAAGTATCTCATTTTTAATGATAAGTTTGGAGA
CTGCTTTAGAGGGTATTGTGCCATTTTCTGGATTATTAGCAGTTATGAATATTGGGATTTTCCTTCAGAT
AAAATATCGTGTAGTTGCAAGAAGATTGTCTGTAAAGTATTCAAAACTATGGGTTGGTGCTGAAATTCTC
TTGTTTGTTTTGGTAGGGGCAACAGTAGATATAAGTTATGCATTTAAAGCAGGAATTGGAGCTGTAATTT
TAATATTTGGAGTTCTTTTATTCCGTATGGTAGGAGTATTCTTCTGCCTTATTAAGACAAATTTGACAAT
AAAAGAAAGATTGTTCTGTATGATTGGCTATATTCCAAAGGCTACAGTACAGGCAGCAATAGGAGGTGTA
CCACTTGCAATGGGGATAGCATCTGGACAACTTATTTTGACATTAGCGGTTCTCGCTATACTTATAACTG
CACCTCTTGGAGCTTTTGGAATTGATGTAACTTATAAAAAATTATTAACTTCTGTAGAAGGTAAGAGTAA
GTAA
>ref|NC_013316.1|:705371-705751 putative regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
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CCAATTCATATGAGATTATTGATTATATGAAAGAAGAGCATAATTTACCAGAAAAAGTGGCTTTAAAAAT
TTTATCAAAATTATCAAAGAAAAGATTCTTATATGTTCAAGAAACAGGCAAGTGTATGTATTATACAGTT
GCAATAAAAGAAAAGACATATTTAGAGTTTATATCAAGAAATGTGCAAAATCTTTTGAAGAATAATTTTA
TAAGGAATTTATTAGTATCATTTCACGAAGAGGAGCTAACAGAGGAAAAGATAAAGTCGTTAGAAAACTG
GGTAGTAAATTGGGAAGAAGCTTATATATAA
>ref|NC_013316.1|:706660-707214 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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TATTTATGTTTAAGCCATTAGTAAAAAAACTTAGTAGAGTTTTACATTATGAAGAGGGAGAAACAGATTT
AATAATATTTTTTATTGAATTAATAAAAAATATTAAATTAAGTAGCTTTTCAGAAAAAAGCGATGCTATT
ATAGTCAAATATATTCATAAATCATTACTGAATAAGACTTTTGAGTTGTCTAGAAGATATTCTAAAATGA
AGTTTAATTTTGTAGAATTTGATGAAAATATCTTAAATATGAAAAATAATTATCAAAGTAAGTCTGTTTT
TGAGGAAGATATTTGTTTTTTCGAATATATTTTGAAAGAATTATCTGGTATTCAAAGAAAAGTTATTTTT
TATAAATATTTAAAAGGATATTCTGATAGAGAAATATCAGTGAAATTAAAAATATCTAGACAAGCTGTTA
ATAAGGCTAAAAATAGAGCATTTAAAAAAATAAAAAAAGACTATGAAAATTATTTTAACTTGTAA
>ref|NC_013316.1|:707545-714645 toxin B [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTTAGTTAATAGAAAACAGTTAGAAAAAATGGCAAATGTAAGATTTCGTGTTCAGGAAGATGAAT
ATGTAGCAATATTGGATGCTTTAGAAGAATATCATAATATGTCAGAGAATACTGTAGTCGAAAAATATTT
AAAATTAAAAGATATAAATAGTTTAACAGATATTTATATAGATACATATAAAAAGTCTGGTAGAAATAAA
GCCTTAAAAAAATTTAAGGAATACCTAGTTACAGAAGTATTAGAGCTAAAGAATAATAATTTAACTCCAG
TTGAGAAAAATTTACATTTTGTTTGGATTGGAGGTCAAATAAATGACACTGCTATTAATTATATAAATCA
ATGGAAAGATGTAAATAGTGATTATAATGTTAATGTTTTTTATGATAGTAATGCATTTTTGATAAACACA
TTGAAAAAAACTATAGTAGAATCAGCAACAAATGATACACTTGAATCATTTAGAGAAAACTTAAATGACC
CTAGATTTGACTATAATAAATTTTACAGAAAACGTATGGAGATAATCTATGATAAGCAGAAAAATTTCAT
AAATTACTATAAAACTCAAAGAGAAGAAAATCCTGACCTTATAATTGATGATATTGTAAAGATATATCTT
TCAAACGAGTATTCAAAGGATATAGATGAACTTAATTCCTATATTGAAGAGTCATTAAATAAAGTTACAG
AAAATAGTGGGAATGATGTTAGAAACTTTGAAGAATTTAAAGGTGGAGAGTCATTCAAATTATATGAACA
AGAGTTGGTAGAAAGATGGAATTTGGCAGCTGCTTCTGACATATTAAGAATATCTGCCTTAAAAGAAGTT
GGTGGTGTATATTTAGATGTTGATATGTTACCAGGAATACAACCAGACCTATTTGAGTCTATAGAGAAAC
CTAGTTCAGTAACAGTGGATTTTTGGGAAATGGTAAAATTAGAAGCTATAATGAAATACAAAGAATACAT
ACCAGGATATACTTCAGAGCATTTTGATATGTTGGATGAAGAAGTTCAAAGTAGTTTTGAATCTGTTCTA
GCTTCTAAGTCAGATAAGTCAGAAATATTCTCATCACTTGGCGATATGGAGGCATCACCACTAGAAGTTA
AAATTGCATTTAATAGTAAAGGTATTATAAATCAAGGACTAATTTCTGTGAAAGACTCATATTGTAGCAA
TTTAATAGTAAAACAAATCGAGAACAGATATAAGATATTGAATAATAGTTTAAATCCAGCTATTAGCGAG
GATAACGATTTCAATACTACAACGAATGCTTTTATTGATAGTATAATGGCTGAAGCTAATGCAGATAATG
GTAGATTTATGATGGAACTAGGAAAGTATTTAAGAGTTGGTTTCTTCCCAGATGTTAAAACTACTATTAA
CTTAAGTGGCCCTGAAGCATATGCGGCAGCTTATCAAGATTTATTAATGTTTAAAGAAGGTAGTATGAAT
ATCCATTTGATAGAAGCTGACTTAAGAAACTTTGAAATCTCTAAAACTAATATTTCTCAATCAACTGAAC
AAGAAATGGCTAGCTTATGGTCATTTGACGATGCAAGAGCTAAAGCTCAATTTGAAGAATACAAAAAAAA
TTACTTTGAAGGTTCTCTTGGAGAAGATGACAATCTTGACTTTTCTCAAAATACAGTAGTTGACAAGGAG
TATCTTTTAGAAAAAATATCTTCATTAGCAAGAAGTTCAGAGAGAGGATATATACACTATATTGTTCAGT
TACAAGGAGATAAAATTAGTTATGAAGCAGCATGTAACTTATTTGCAAAGACTCCTTATGATAGTGTACT
GTTTCAGAAAAATATAGAAGATTCAGAAATTGCATATTATTATAATCCTGGAGATGGTGAAATACAAGAA
ATAGACAAGTATAAAATTCCAAGTATAATTTCTGATAGACCTAAGATTAAATTAACATTTATTGGTCATG
GTAAAGATGAATTTAATACTGATATATTTGCAGGTCTTGATGTAGATTCATTATCCACAGAAATAGAAAC
AGCAATAGATTTAGCTAAAGAGGATATTTCTCCTAAGTCAATAGAAATAAACTTACTGGGATGTAACATG
TTTAGCTATTCTGTAAATGTAGAGGAGACTTATCCTGGGAAATTATTACTTAGAGTTAAAGATAAAGTAT
CAGAATTAATGCCATCTATAAGTCAAGACTCTATTATAGTAAGTGCAAATCAATATGAAGTTAGAATAAA
TAGTGAAGGAAGAAGAGAATTATTGGATCATTCTGGTGAATGGATAAATAAAGAAGAAAGTATTATAAAG
GATATTTCATCAAAAGAATATATATCATTTAATCCTAAAGAAAATAAAATTATAGTAAAATCTAAAAATT
TACCTGAATTATCTACATTATTACAAGAAATTAGAAACAATTCTAATTCAAGTGATATTGAACTAGAAGA
AAAAGTAATGTTAGCAGAATGTGAGATAAATGTTATTTCAAATATAGATACACAAGTGGTAGAAGGAAGG
ATTGAAGAAGCTAAAAGCTTAACTTCTGACTCTATTAATTATATAAAGAATGAATTTAAACTAATAGAAT
CTATTTCTGATGCACTATACGATTTAAAACAACAGAATGAATTAGAAGAGTCTCATTTTATATCTTTTGA
GGATATATTGGAGACTGATGAAGGCTTTAGTATAAGATTTATTGATAAAGAAACTGGAGAATCTATATTT
GTAGAAACTGAAAAGGCAATATTCTCTGAATATGCTAATCATATAACTGAAGAGATTTCTAAGATAAAAG
GTACTATATTTGATACTGTAAATGGTAAGTTAGTAAAAAAAGTAAATTTAGATGCTACACATGAAGTGAA
TACTTTAAATGCTGCATTTTTTATACAATCATTAATAGAATATAATAGTTCTAAAGAATCTCTTAGTAAT
TTAAGTGTAGCAATGAAAGTTCAAGTTTATGCTCAATTATTTAGTACTGGTTTAAATACTATTACAGATG
CAGCCAAAGTTGTTGAATTAGTATCAACTGCATTAGATGAAACTATAGATTTACTTCCTACATTATCTGA
AGGATTACCTGTAATTGCAACTATCATAGATGGTGTAAGTTTAGGTGCAGCAATCAAAGAGCTAAGTGAA
ACAAGTGACCCATTATTAAGACAAGAAATAGAAGCTAAGATAGGTATAATGGCAGTAAATTTAACAGCAG
CTACAACTGCAATCATTACTTCATCTTTAGGAATAGCTAGTGGATTTAGTATACTTTTAGTTCCTTTAGC
AGGAATTTCAGCAGGTATACCAAGTTTAGTAAACAATGAGCTTATCCTAAGAGATAAAGCAACAAAAGTT
GTAGATTATTTTAGTCATATATCATTAGCTGAGTCTGAAGGAGCATTTACTTCATTAGATGATAAAATAA
TGATGCCACAAGATGATTTAGTAATATCTGAGATAGACTTTAATAACAATTCAATAACTTTAGGTAAATG
TGAAATCTGGAGAATGGAAGGTGGCTCAGGTCATACTGTAACTGATGATATAGATCACTTCTTTTCAGCA
CCATCAATAACATATAGAGAGCCACACTTATCTATATATGACGTATTGGAAGTACAAAAAGAAGAACTTG
ATTTGTCAAAAGATTTAATGGTATTACCTAATGCTCCAAATAGAGTATTTGCTTGGGAAACAGGATGGAC
ACCAGGTTTAAGAAGCTTAGAAAATGATGGCACAAAACTGTTAGACCGTATAAGAGATAACTATGAAGGT
GAGTTTTATTGGAGATATTTTGCTTTTATAGCTGATGCTTTAATAACAACATTAAAACCAAGATATGAAG
ATACTAATATAAGAATAAATTTAGATAGTAATACTAGAAGCTTTATAGTCCCAGTGATAACTACAGAATA
TATAAGAGAGAAATTATCATATTCTTTTTATGGTTCTGGAGGAACTTATGCATTATCTCTTTCTCAATAC
AATATGAATATAAACATAGAATTAAATGAAAATGATACTTGGGTTATAGATGTCGACAATGTCGTAAGAG
ATGTCACTATAGAATCTGATAAAATTAAAAAAGGAGATTTAATAGAGAATATTTTATCTAAATTAAGTAT
TGAAGACAATAAAATTATTTTAGATAATCATGAAATTAATTTCTCTGGAACATTAAATGGAGGTAATGGA
TTTGTATCTTTAACATTCTCAATCTTAGAAGGAATAAATGCAGTTATAGAAGTTGATTTATTATCTAAAT
CATATAAAGTTCTTATTTCTGGTGAACTAAAAACATTGATGGCAAATTCAAATTCTGTTCAACAGAAAAT
AGATTATATAGGATTGAACAGCGAATTACAAAAAAATATACCTTATAGTTTTATGGATGATAAAGGAAAA
GAAAATGGATTTATTAATTGTTCTACAAAAGAAGGTTTATTTGTATCTGAATTATCTGATGTAGTTCTTA
TAAGTAAAGTTTATATGGACAATAGTAAACCTCTATTTGGATATTGTAGTAATGATTTGAAAGATGTTAA
AGTCATAACTAAAGATGACGTTATTATATTAACAGGATATTATTTAAAAGATGATATAAAAATCTCTCTT
TCTTTTACTATACAAGATGAAAATACTATAAAATTAAATGGAGTATATTTAGATGAAAATGGAGTAGCTG
AAATATTGAAATTTATGAATAAAAAAGGTAGTACAAATACTTCAGATTCTTTAATGAGCTTTTTAGAAAG
TATGAATATAAAAAGTATTTTCATAAATTCCTTACAATCTAATACTAAGCTTATATTAGATACTAATTTT
ATAATAAGTGGTACTACTTCTATTGGTCAATTTGAGTTTATTTGTGATAAAGATAATAATATACAACCAT
ATTTCATTAAGTTTAATACACTAGAAACTAAATATACTCTATATGTAGGTAATAGACAAAATATGATAGT
AGAACCAAATTATGATTTAGATGATTCTGGAGATATATCTTCAACTGTCATTAATTTTTCTCAGAAATAC
CTTTATGGAATAGACAGTTGTGTTAATAAAGTTATAATTTCGCCAAATATATATACAGATGAAATAAACA
TAACACCTATATATGAAGCAAATAATACTTATCCAGAAGTGATTGTATTAGATACAAATTATATAAGTGA
AAAAATCAATATTAATATCAATGATTTATCTATACGATATGTATGGAGTAATGATGGAAGTGATTTTATT
CTTATGTCAACTGATGAAGAGAACAAGGTATCACAAGTTAAAATAAGATTTACTAATGTTTTTAAAGGTA
ATACTATATCAGATAAGATATCTTTTAATTTTAGTGATAAGCAAGATGTATCTATAAATAAAGTTATTTC
AACATTTACACCTTCATATTATGTGGAAGGATTACTTAATTATGATTTAGGTCTGATTTCTTTATACAAT
GAGAAATTTTATATTAATAACTTTGGAATGATGGTGTCTGGATTAGTATATATTAATGATTCATTATATT
ATTTCAAGCCACCAATAAAGAACTTGATAACTGGATTTACAACTATAGGTGATGATAAATACTACTTTAA
TCCAGATAATGGTGGAGCTGCTTCAGTCGGAGAAACAATAATTGATGGCAAAAACTACTACTTCAGCCAA
AATGGAGTGTTACAAACAGGTGTATTTAGTACAGAAGATGGATTTAAATATTTTGCTCCAGCAGATACAC
TTGATGAAAATCTAGAGGGGGAAGCAATTGATTTTACTGGCAAACTAACTATTGATGAAAATGTTTATTA
TTTTGGAGATAATTATAGAGCAGCTATAGAATGGCAAACATTAGATGATGAAGTGTACTATTTTAGTACA
GATACAGGTAGAGCTTTTAAAGGGCTAAATCAAATAGGTGATGATAAATTCTATTTCAACTCTGATGGTA
TTATGCAAAAAGGATTTGTTAATATAAATGATAAGACATTCTATTTTGATGATTCTGGTGTGATGAAGTC
AGGATATACTGAAATAGATGGAAAATATTTTTACTTTGCTGAGAATGGAGAAATGCAAATAGGAGTATTT
AATACAGCAGATGGATTTAAATATTTTGCTCATCATGATGAAGATTTAGGAAATGAAGAAGGTGAAGCAC
TTTCATATTCTGGTATACTTAATTTTAACAATAAGATTTATTATTTTGATGATTCATTTACAGCAGTAGT
TGGATGGAAGGATTTAGAAGATGGTTCAAAATATTACTTTGATGAAGATACAGCAGAAGCATATATAGGT
ATCTCAATAATTAATGATGGTAAATATTATTTTAATGATTCTGGAATCATGCAAATTGGATTTGTCACAA
TAAATAATGAAGTATTTTATTTCTCTGATTCTGGAATAGTAGAATCTGGAATGCAAAATATAGATGATAA
TTATTTCTATATAGACGAAAATGGTCTAGTTCAAATTGGTGTATTTGACACTTCAGATGGATATAAATAC
TTTGCACCAGCTAATACTGTAAATGATAATATCTATGGACAAGCAGTTGAATATAGTGGTTTAGTTAGAG
TTGGTGAAGATGTATATTATTTTGGAGAAACATATACAATTGAGACTGGTTGGATATATGATATGGAAAA
TGAAAGTGATAAATATTATTTCGATCCAGAAACTAAAAAAGCATATAAAGGTATTAATGTAATTGATGAT
ATAAAATACTATTTTGATGAGAATGGAATAATGAGAACAGGTCTTATAACATTTGAAGATAATCATTACT
ATTTTAATGAAGATGGTATTATGCAATATGGTTATCTAAATATAGAAGATAAGACGTTCTACTTTAGTGA
AGATGGTATTATGCAGATTGGAGTATTTAATACACCAGATGGATTTAAATATTTTGCACATCAAAATACT
TTAGATGAGAATTTTGAGGGAGAATCAATAAACTATACTGGTTGGTTAGATTTAGATGAAAAGAGATATT
ATTTTACAGATGAATATATTGCAGCAACTGGTTCAGTTATTATTGATGGTGAGGAGTATTATTTTGATCC
TGATACAGCTCAATTAGTGATTAGTGAATAG
>ref|NC_013316.1|:714767-715267 putative cell wall hydrolase protein [Clostridium difficile R20291]
ATGCACAGTAGTTCACCTTTTTATATTTCTAATGGTAACAAAATATTTTTTTATATAAACCTAGGAGGCG
TTATGAATATGACAATATCTTTTTTATCAGAGCATATATTTATAAAGTTAGTAATTTTAACTATATCATT
TGATACATTATTAGGATGTTTAAGTGCAATAAAAAGTCGTAAATTTAATTCTAGTTTTGGAATAGATGGA
GGAATCAGAAAAGTAGCAATGATAGCATGTATATTTTTTTTATCAGTAGTTGACATTCTTACAAAGTTTA
ACTTTTTATTTATGTTACCACAAGATTGTATCAATTTTTTAAGACTAAAACATCTTGGAATATCTGAATT
TTTCTCTATTTTATTTATTTTATATGAAAGTGTAAGCATATTAAAAAATATGTGCTTATGTGGATTACCA
GTACCTAAGAGATTAAAGGAAAAAATAGCAGTTTTACTAGATGCAATGACAGATGAAATGAATGCTAAGG
ATGAAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:715995-724127 toxin A [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTTTAATATCTAAAGAAGAGTTAATAAAACTCGCATATAGCATTAGACCAAGAGAAAATGAGTATA
AAACTATACTAACTAATTTAGACGAATATAATAAGTTAACTACAAACAATAATGAAAATAAATATTTACA
ATTAAAAAAACTAAATGAATCAATTGATGTTTTTATGAATAAATATAAAAATTCAAGCAGAAATAGAGCA
CTCTCTAATCTAAAAAAAGATATATTAAAAGAAGTAATTCTTATTAAAAATTCCAATACAAGTCCTGTAG
AAAAAAATTTACATTTTGTATGGATAGGTGGAGAAGTCAGTGATATTGCTCTTGAATACATAAAACAATG
GGCTGATATTAATGCAGAATATAATATTAAACTGTGGTATGATAGTGAAGCATTCTTAGTCAATACACTA
AAAAAGGCTATAGTTGAATCTTCTACCACTGAAGCATTACAGCTACTAGAGGAAGAGATTCAAAATCCTC
AATTTGATAATATGAAATTTTACAAAAAAAGGATGGAATTTATATATGATAGACAAAAAAGGTTTATAAA
TTATTATAAATCTCAAATCAATAAACCTACAGTACCTACAATAGATGATATTATAAAGTCTCATCTAGTA
TCTGAATATAATAGAGATGAAACTTTATTAGAATCATATAGAACAAATTCTTTGAGAAAAATAAATAGTA
ATCATGGGATAGATATCAGGGCTAATAGTTTGTTTACAGAACAAGAGTTATTAAATATTTATAGTCAGGA
GTTGTTAAATCGTGGGAATTTAGCTGCAGCATCTGACATAGTAAGATTATTAGCCCTAAAAAATTTTGGC
GGAGTATATTTAGATGTTGATATGCTTCCAGGTATTCACTCTGATTTATTTAAAACAATACCTAGACCTA
GCTCTATTGGACTAGACCGTTGGGAAATGATAAAATTAGAGGCTATTATGAAGTATAAAAAATATATAAA
TAATTATACATCAGAAAACTTTGATAAACTTGATCAACAATTAAAAGATAATTTTAAACTCATTATAGAA
AGTAAAAGTGAAAAATCTGAGATATTTTCTAAATTAGAAAATTTAAATGTATCTGATCTTGAAATTAAAA
TAGCTTTCGCTTTAGGCAGTGTTATAAATCAAGCCTTGATATCAAAACAAGGTTCATATCTTACTAACCT
AGTAATAGAACAAGTAAAAAATAGATATCAATTTTTAAACCAACACCTTAACCCAGCCATAGAGTCTGAC
AATAACTTCACAGATACTACTAAGATTTTTCATGATTCACTATTTAATTCAGCTACCGCAGAAAACTCTA
TGTTTTTAACAAAAATAGCACCATACTTACAAGTAGGTTTTATGCCAGAAGCTCGCTCCACAATAAGTTT
AAGTGGTCCAGGAGCTTATGCATCAGCTTACTATGATTTCATAAATTTACAAGAAAATACTATAGAAAAA
ACTTTAAAAGCATCAGATTTAATAGAATTTAAATTCCCAGAAAATAATCTATCTCAATTGACAGAACAAG
AAATAAATAGTCTATGGAGCTTTGATCAAGCAAGTGCAAAATATCAATTTGAGAAATATGTAAGAGATTA
TACTGGTGGATCTCTTTCTGAAGACAATGGGGTAGACTTTAATAAAAATACTGCCCTCGACAAAAACTAT
TTATTAAATAATAAAATTCCATCAAACAATGTAGAAGAAGCTGGAAGTAAAAATTATGTTCATTATATCA
TACAGTTACAAGGAGATGATATAAGTTATGAAGCAACATGCAATTTATTTTCTAAAAATCCTAAAAATAG
TATTATTATACAACGAAATATGAATGAAAGTGCAAAAAGTTACTTTTTAAGTGATGATGGAGAATCTATT
TTAGAATTAAATAAATATAGGATACCTGAAAGATTAAAAAATAAGGAAAAAGTAAAAGTAACCTTTATTG
GACATGGTAAAGATGAATTCAACACAAGCGAATTTGCTAGATTAAGTGTAGATTCACTTTCCAATGAGAT
AAGTTCATTTTTAGATACCATAAAATTAGATATATCACCTAAAAATGTAGAAGTAAACTTGCTTGGATGT
AATATGTTTAGTTATGATTTTAATGTTGAAGAAACTTATCCTGGTAAGTTACTATTAAGTATTATGGACA
AAATTACTTCCACTTTACCTGATGTAAATAAAGATTCTATTACTATAGGAGCAAATCAATATGAAGTAAG
AATTAATAGTGAGGGAAGAAAAGAACTTCTAGCTCACTCAGGTAAATGGATAAATAAAGAGGAAGCTATT
ATGAGCGATTTATCTAGTAAAGAATACATTTTTTTTGATTCCATAGATAATAAGCTAAAAGCAAAGTCCA
AGAATATTCCAGGTTTAGCGTCAATATCAGAAGATATAAAAACATTATTACTTGATGCAAGTGTTAGTCC
TGATACAAAATTTATTTTAAATAATCTTAAGCTTAATATTGAATCTTCTATTGGTGATTACATTTATTAT
GAAAAATTAGAACCTGTTAAAAATATAATCCACAATTCTATAGATGATTTAATAGATGAGTTCAATCTAC
TTGAAAATGTATCTGATGAATTATATGAATTAAAAAAATTAAATAATCTAGATGAGAAGTATTTAATATC
TTTTGAAGATATCTCAAAAAATAATTCAACTTATTCTGTAAGATTTATTAACAAAAGTAATGGTGAATCA
GTTTATGTAGAGACAGAAAAAGAAATTTTTTCAAAATATAGCGAACATATTACAAAAGAAATAAGTACTA
TAAAGAATAGTATAATTACAGATGTTAATGGTAATTTATTGGATAATATACAGTTAGATCATACTTCTCA
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CTAGACGAACATGACCCATTACTAAAAAAAGAACTAGAAGCTAAGGTGGGTGTTTTAGCAATAAATATGT
CATTATCTATAGCTGCAACGGTAGCTTCAATTGTTGGAATAGGTGCTGAAGTTACTATTTTCTTATTACC
TATAGCTGGTATATCTGCGGGAATACCTTCATTAGTTAATAATGAATTAATATTGCATGATAAGGCAACT
TCAGTGGTAAACTATTTTAATCATTTGTCTGAATCTAAAGAATATGGCCCTCTTAAAACAGAAGATGATA
AAATTTTAGTTCCTATTGATGATTTAGTAATATCAGAAATAGATTTTAATAATAATTCGATAAAACTAGG
AACATGTAATATATTAGCAATGGAGGGGGGATCAGGACACACAGTGACTGGTAATATAGATCACTTTTTC
TCATCTCCATATATAAGCTCTCATATTCCTTCATTATCAGTTTATTCTGCAATAGGTATAAAAACAGAAA
ATCTAGATTTTTCAAAAAAAATAATGATGTTACCAAATGCTCCTTCAAGAGTGTTTTGGTGGGAAACTGG
AGCAGTTCCAGGTTTAAGATCATTGGAAAATAATGGGACTAAATTGCTTGATTCAATAAGAGATTTATAC
CCAGGCAAATTTTACTGGAGATTCTATGCCTTTTTCGATTATGCAATAACTACATTAAAACCAGTGTATG
AAGACACTAATACTAAAATTAAACTAGATAAAGATACTAGAAACTTTATAATGCCAACTATAACTACTGA
CGAAATTAGAAACAAATTATCTTATTCATTTGATGGAGCAGGAGGAACTTACTCTTTATTATTATCTTCA
TATCCAATATCAATGAATATAAATTTATCTAAAGATGATTTATGGATATTTAATATTGATAATGAAGTAA
GAGAAATATCTATAGAAAATGGTACTATTAAAAAAGGAAATTTAATAGAAGATGTTTTAAGTAAAATTGA
TATAAATAAAAATAAACTTATTATAGGCAATCAAACAATAGATTTTTCAGGTGATATAGATAACAAAGAT
AGATATATATTCTTGACTTGTGAGTTAGATGATAAAATTAGTTTAATAATAGAAATAAATCTTGTTGCAA
AATCTTATAGTTTGTTATTGTCTGGGGATAAAAATTATTTGATATCCAATTTATCTAATACTATTGAGAA
AATCAATACTTTAGGCCTAGATAGTAAAAATATAGCTTACAATTACACTGATGAATCTAATAATAAATAT
TTTGGAGCTATATCTAAAACAAGTCAAAAAAGCATAATACATTATAAAAAAGACAGTAAAAATATATTAG
AATTTTATAATGGCAGTACATTAGAATTTAACAGTAAAGACTTTATTGCTGAAGATATAAATGTATTTAT
GAAAGATGATATTAATACTATAACAGGAAAATACTATGTTGATAATAATACTGATAAAAGTATAGATTTC
TCTATTTCTTTAGTTAGTAAAAATCAAGTAAAAGTAAATGGATTATATTTAAATGAATCCGTATACTCAT
CTTACCTTGATTTTGTGAAAAATTCAGATGGACACCATAATACTTCTAATTTTATGAATTTATTTTTGAA
CAATATAAGTTTCTGGAAATTGTTTGGGTTTGAAAATATAAATTTTGTAATCGATAAATACTTTACCCTT
GTTGGTAAAACTAATCTTGGATATGTAGAATTTATTTGTGACAATAATAAAAATATAGATATATATTTTG
GTGAATGGAAAACATCGTCATCTAAAAGCACTATATTTAGCGGAAATGGTAGAAATGTTGTAGTAGAGCC
TATATATAATCCTGATACGGGTGAAGATATATCTACTTCACTAGATTTTTCCTATGAACCTCTCTATGGA
ATAGATAGATATATCAATAAAGTATTGATAGCACCTGATTTATATACAAGTTTAATAAATATTAATACCA
ATTATTATTCAAATGAGTACTACCCTGAGATTATAGTTCTTAACCCAAATACATTCCACAAAAAAGTAAA
TATAAATTTAGATAGTTCTTCTTTTGAGTATAAATGGTCTACAGAAGGAAGTGACTTTATTTTAGTTAGA
TACTTAGAAGAAAGTAATAAAAAAATATTACAAAAAATAAGAATCAAAGGTATCTTATCTAATACTCAAT
CATTTAATAAAATGAGTATAGATTTTAAAGATATTAAAAAACTATCATTAGGATATATAATGAGTAATTT
TAAATCATTTAATTCTGAAAATGAATTAGATAGAGATCATTTAGGATTTAAAATAATAGATAATAAAACT
TATTACTATGATGAAGATAGTAAATTAGTTAAAGGATTAATCAATATAAATAATTCATTATTCTATTTTG
ATCCTATAGAATCTAACTTAGTAACTGGATGGCAAACTATCAATGGTAAAAAATATTATTTTGATATAAA
TACTGGAGCAGCTTCAACTAGTTATAAAATTATTAATGGTAAACACTTTTATTTTAATAATAATGGTGTG
ATGCAGTTAGGAGTATTTAAAGGACCTGATGGATTTGAGTATTTTGCACCTGCCAATACTCAGAATAATA
ACATAGAAGGTCAGGCTATAGTTTATCAAAGTAAATTCTTAACTTTGAATGGCAAAAAATATTATTTTGA
TAATGACTCAAAAGCAGTCACTGGATGGAGGATTATTAACAATGAGAAATATTACTTTAATCCTAATAAT
GCTATTGCTGCAGTCGGATTGCAAGTAATTGACAATAATAAGTATTATTTCAATCCTGACACTGCTATCA
TCTCAAAAGGTTGGCAGACTGTTAATGGTAGTAGATACTACTTTGATACTGATACCGCTATTGCCTTTAA
TGGTTATAAAACTATTGATGGTAAACACTTTTATTTTGATAGTGATTGTGTAGTGAAAATAGGTGTGTTT
AGTGGCTCTAATGGATTTGAATATTTCGCACCTGCTAATACTTATAATAATAACATAGAAGGTCAGGCTA
TAGTTTATCAAAGTAAATTCTTAACTTTGAATGGTAAAAAATATTACTTTGATAATAACTCAAAAGCAGT
TACCGGATGGCAAACTATTGATAGTAAAAAATATTACTTTAATACTAACACTGCTGAAGCAGCTACTGGA
TGGCAAACTATTGATGGTAAAAAGTATTACTTTAATACTAACACTGCTGAAGCAGCTACTGGATGGCAAA
CTATTGATGGTAAAAAATATTACTTTAATACTAACACTTCTATAGCTTCAACTGGTTATACAATTATTAA
TGGTAAATATTTTTATTTTAATACTGATGGTATTATGCAGATAGGAGTGTTTAAAGTACCTAATGGATTT
GAATACTTTGCACCTGCTAATACTCATAATAATAACATAGAAGGTCAAGCTATACTTTACCAAAATAAAT
TCTTAACTTTGAATGGTAAAAAATATTACTTTGGTAGTGACTCAAAAGCAATTACTGGATGGCAAACCAT
TGATGGTAAAAAATATTACTTTAATCCTAATAATGCTATTGCTGCGACTCATCTATGCACTATAAATAAC
GACAAGTATTACTTTAGTTATGATGGAATTCTTCAAAATGGATATATTACTATTGAAAGAAATAATTTCT
ATTTTGATGCTAATAATGAATCTAAAATGGTAACAGGAGTATTTAAAGGACCTAATGGATTTGAGTATTT
TGCACCTGCTAATACTCATAATAATAACATAGAAGGTCAGGCTATAGTTTACCAGAATAAATTCTTAACT
TTGAATGGCAAAAAATATTATTTTGATAATGACTCAAAAGCAGTTACTGGATGGCAAACTATTGATAGTA
AAAAATATTACTTTAATCTTAACACTGCTGTTGCAGTTACTGGATGGCAAACTATTGATGGTGAAAAATA
TTACTTTAATCTTAACACTGCTGAAGCAGCTACTGGATGGCAAACTATTGATGGTAAAAGATACTACTTT
AATACTAACACTTATATAGCTTCAACTGGTTATACGATTATTAATGGTAAACATTTTTATTTTAATACTG
ATGGTATTATGCAGATAGGAGTGTTTAAAGGACCTGATGGATTTGAATACTTTGCACCTGCTAATACTCA
TAATAATAACATAGAAGGTCAAGCTATACTTTACCAAAATAAATTCTTAACTTTGAATGGTAAAAAATAT
TACTTTGGTAGTGACTCAAAAGCAGTTACCGGATTGCGAACTATTGATGGTAAAAAATATTACTTTAATA
CTAACACTGCTGTTGCAGTTACTGGATGGCAAACTATTAATGGTAAAAAATACTACTTTAATACTAACAC
TTATATAGCTTCAACTGGTTATACAATTATTAGTGGTAAACATTTTTATTTTAATACTGATGGTATTATG
CAGATAGGAGTGTTTAAAGGACCTGATGGATTTGAATACTTTGCACCTGCTAATACGGATGCTAACAACA
TAGAAGGTCAAGCTATACGTTATCAAAATAGATTCCTATATTTACATGACAATATATATTACTTTGGCAA
TGATTCAAAAGCGGCTACTGGTTGGGCAACTATTGATGGTAATAGATATTACTTCGAGCCTAATACAGCT
ATGGGTGCGAATGGTTATAAAACTATTGATAATAAAAATTTTTACTTTAGAAATGGTTTACCTCAGATAG
GAGTGTTTAAAGGACCTAATGGATTTGAATACTTTGCACCTGCTAATACGGATGCTAACAATATAGATGG
TCAAGCTATACGTTATCAAAATAGATTCCTACATTTACTTGGAAAAATATATTACTTTGGTAATAACTCA
AAAGCAGTTACTGGATGGCAAACTATTAATAGTAAAGTATATTACTTTATGCCTGATACTGCTATGGCTG
CAGCTGGTGGACTTTTCGAGATTGATGGTGTTATATATTTCTTTGGTGTTGATGGAGTAAAAGCCCCTGG
GATATATGGCTAA
>ref|NC_013316.1|:c725022-724462 hypothetical protein CDR20291_0585 [Clostridium difficile R20291]
GTGTTTTTTGGCAATATATCCTCACCAGCTTGTTCTGAAGACCATGAGGAGGTCATTTCTAATCAAACAT
CAGTTATAGATTCTCAAAAAACAGAAATAGAAACTTTAAATAGCAAATTGTCTGATGCTGAACCATGGTT
CAAAATGAAAGACGACGAAAAGAAAGCTATTGAAGCTGAAAATCAACGTAAAGCTGAAGAAGCTAAAAAG
GCTGAAGAACAACGTAAAAAAGAAGAAGAAGAGAAGAAAGGATATGATACTGGTATTACTTATGACCAAT
TAGCTAGAACACCTGATGATTATAAGTACAAAAAGGTAAAATTTGAAGGTAAGGTTATTCAAGTTATTGA
AGATGGTGATGAGGTGCAAATAAGATTAGCTGTGTCTGGAAATTATGATAAGGTCGTACTATGTAGTTAT
AAAAAATCAATAACTCCTTCAAGAGTGTTAGAGGATGATTACATAACTATAAGAGGTATAAGTGCTGGAA
CTATAACTTATGAATCAACTATGGGTGGAAAAATAACCATACCAGGGATAGCTGTAGAGAAAATTAATTA
A
>ref|NC_013316.1|:725559-725804 hypothetical protein CDR20291_0586 [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAGAACTACAAAAAATTCCAGGGGTAGGGAAAGCAACAGAAAAATCTTTAATCATGTTAGGATATA
CAACTATTAAATCACTTAAAGATGCAAACCCAGCACAAATGTATGAAAAGGAATGTTTAATGCGTGGACA
GCACATAGACAGATGTCAGTTATATGTATACAGATGTGCAGTATATTTTGCATCAACTGAAAATCCAGAA
CCAGAAAAATTAAAGTGGTGGTATTGGAAAGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c726290-726021 hypothetical protein CDR20291_0587 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTGAATCAAGATGTGGTGTCTGTTGTGACAGTTGTACAAAAAAAGAACAAGTAAATTGCACTGGTT
GCCCAACTATGGAAAAACCATTTTGGGGTGGAGAATGTAAGGTTAAAACTTGCTGTGAAAGTAAGGAACT
TAATCATTGTGGTGAATGTGATACTTTCCCTTGTGATATGCTTTTAAATAAGGGAAAAGACCAAGGCTTT
GACCCTATGGTAAATATTGGGCAATGTAGAAAATGGCTTGAAGAAACAGTTTCTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c728061-727324 putative lantibiotic ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAGGAAGTCAGTTTTGGGAGAAATTCTAAAGTTAAAAAATTCTTTTATATGGTATGTATTATTAG
CTTTGCCACTTATAAGTGTGTTGATTGGTTCTGGTAATTTTTATCTAAATCAAGGCATACTCAAAAAAGA
ATGGTACAGCTTATGGACTCAAGTTAGTCTTTTTTATGGGGAATTTTTCTTTCCTATCTTAATCGCAATC
TTTTGTGCATATATTTGTAGGCTTGAACATATGAATCATAATTGGAATAATGTAATGACACTGCCAGTTA
ATTTAAAAAATATCTTTTTATCTAAACTTACAGTAGTTTCAATACTTACAGCTATTACACAAGTTTTCTT
TGTTATCTTTTATATAGTTGCAGGAAATATGTTTGGTTTTTCTGGTAGTGTACCTAAAGAATTGACTGGT
TGGATTGCTAAAGGTTGGATTATTTCTATTTCAATAGCTTCTATACAATTATACATGTCTATAAAGATTA
GAAGTTTTGCAACTCCTATTGGTATTAGTCTTTGCCTTTCTCTATTTGGTATGGGATTAATAGTAGCAAA
ACCTGCTGTTGGTATATTTTTCCCTTATTCTATGTTAGGTAGTGCTATGGGGGTTATAAAGCAATCTGCT
TTAAATGTTAATGACACTATAGTTACAATATGTGTTGCATTTATTACTACTATAGTATTTTCTGAAATTG
CCAATAGAAATTTTAGAAAGAATGATGTTATTTCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c728834-728073 putative lantibiotic ABC transporter, peremase protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATACCTTGGTCTAGAATTTTATAAACTTAAAAGAAAGAAGATTATTCTGATGACCTTTTTATTTG
TAGCTGTTGAAATAATGTGGTGTATCGTAAATTCAAATAGGGCTATTACACGTAATCCAGATATGTTAGG
TGGATTTGAATATTCCTATATGCTTATGAGTTTTGCAAGTTTAAATGGTCTATTCTTTCCTATCTTAATA
TCAATAATTACATCACGCATAAGCGATATAGAACATAAAGGAGATACATGGAAGCTTTTAAAATCTTCTG
TGACATCTTTAAATAGTATTTATTTATCCAAATTTTTATGTTCTGCTATTTTGGTATCTATACCTATATT
GATGCAAGTGTTATCTATTGTGTTGTTTGGACATTTTAGAGGGGTTATTGAGTCAATTTCTGTATCTTTA
CTTTTAAAATACACATTAGGAACAATTCTTGTAAGTATTGCTATCATTGCACTACACCTATGGATTGCAA
CTGTAATTCCAAATCAAATGATTGCAATTACATTTGGCATGATTGGTAGTTTTATAGGTTTGACATCAGG
TTTGTTTTATCAAGGTATTCGTAGATTGTTTATATGGTCTTATTACCTAGAGTTATCACCTTTAAGTTAT
GCTTATGATAATGTTTTAGGTTCATCTGTCTATAGAATTGATATGAATTTTTCTATTACGATTTTAGTTT
TCTTAATTGGAATGCTAATTTATTATATTGGAAGAAATCATTTATTAAAAAAAGAAGTATAG
>ref|NC_013316.1|:c729757-728834 putative lantibiotic ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACATATGGAAATGATAATTAGAACACAAAGACTTTCAAAGGAATACAATAAAATATTTAGAGTAA
AGGATATAGACCTAAGAGTTCCACAAGGAGCTGTATATGGTTTTTTGGGTCCTAATGGAGCTGGAAAATC
TACCACTCTTAAAATGCTTCTTGGACTTGCTAAACCCACACAAGGAAATATTAATATTTTAGGTAAAGAG
TTAAATGAAAAAAATAGAATATCAATTTTAAAAGATATAGGTTCTTTGATAGAATCTCCATCATACTATG
GTCATCTTACAGGGCTTGAAAACATGACCATAATGCAAAGACTCTTAGATTTACCTAAAAAAAATGTAAA
TGAAGCATTAAAAATTGTAAGGTTAGAAAATCAAAAAAATAAAAAAGTTAATCAATATTCTTTAGGTATG
AAGCAACGTCTTGGCATTGCTATGGCAATAATGAAGTTTCCCAAATTATTAATACTTGATGAACCTACAA
ATGGACTCGACCCAGCAGGGATTGAGGAAATTAGAGAATTAATAAAATCTCTACCAGAAAAATACGGCAT
GACTGTTCTAATCTCTAGCCATCTTTTAAGTGAAATTGACCAAATTGCCACATCAATAGGAATAATAAAT
CATGGCGAACTGGTTTTTCAAGATAGCATAAAAGAACTTCATAATAGAGGTCAAAGTCAGATTGCTATCA
AAGCTAAGAATGTTGTATCTGCACAAAAGCTATTAAATACTAAAGGATATATGTCACTTATACAAAATGG
GTACTTGACTATTGAAAATTTAAAAGACTCAGATGTGGCTAAAATAAATGGTATGCTTGTCCATTCAAAT
ATAGATGTATTTAGAATAGAAGAACATAAAAAAAGCTTGGAAGATATATTCCTAGAACTTACTGGTAAGG
CGGTGACTTTATAA
>ref|NC_013316.1|:729913-730626 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGATTATGGAGTCAATAAAAGATAAAAAAATACTTGTGGTTGATGACCACAAGGAATTATTAAAAATGA
TAGATGAAATCCTAAGAAAAGAGGGATTTAGTAGAGTATTTTTAGCATCAAGTTATGAAGAAGCTGTTAG
GGTATTTAGAAATGTAAAGCCAGATTGTGCAATTTTAGATGTTGTATTGCCAGATGGAGATGGTTTCTCT
ATTATGAGAAAAATTAGAGAGACATCTAAGATACCAGTTATTTTTCTCTCTGCAAGAGGTGAAGATGAAG
ATAGATTGATTGGTTTGGGATTAGGGGCTGACGATTATATAGTAAAGCCATTTTTACCAAAGGAACTTAC
TTTAAGGCTTGTGGGTATATTAAATCGTGTATATGTGCCTATAGAAGAAGAGGAGTTGCCAGTATTTAAA
CTGGGAGATTCTGTTGTTGTGAATTTAAATAGTGCATGTGTTGAGAAAGATGGGCAAGAGATTTCTTTAA
CAGCTAAAGAGCATTCGTTGCTTTTAAAGTTGTATGAAAATAAAGGGAGAATTGTTACTAATGATTCACT
ATGTCAAGCCATTTGGGGAGATGATATGTATGGATATGAAAATACCCTTATGGTTCATGTTAGAAGGGTT
AGAGAGAAGATAGAAAAAACTCCATCTACACCTAAACATCTTATTACAGTAAGAGGTCTTGGATATAAGT
TGATGATTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:730671-732077 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
TTGGATAGTGTAAAGTACATATTGAGGCGATTTATAGGTTCAAGTATCTTGATTTCATTACTTTTTATTG
TATTAAATATAGCAGGTTTTCTTCTGTTTTCATATATGCTATTTGTATCTAAATACTCTGATAATTTAGA
TACAAGTGATAGCAGAGAAATAAAATCAAACTTGATTATGATTGAAGATAATTTGATTTTAAAAGATGGA
AAGTTTATTTTAGATGATTCTAGTAAGGAAGTACTACATAAAAATAAAGTTTGGGCAATGTTAATTGATA
ACAATGGAGATAGAATATGGGGATTTGATTTACCAAAAGAAATTCCAAGTCATTATACTTTGACAGATGT
AGCAAAGTTTTCAAGGTTCTTTTTAAAGGACTATCCTGTGTATGTATGGGAACATCCAAATGGAATATTA
GTAACAGGTTATCCAAAGGACAAATACACTAAATTTAACCTTACTTATACGATTAAGGAAATAGAACAAT
TTCCTATGTTAATAATAGGTATGTTTCTGGTTAATGCAATAGTTACTTTTTTAATAGCTCTATTCATAGG
TTTAAAAATGGTGAAATCTATAAAACCAATTATTACTGGCATAAAGCTTATGTCAAAAGGAGAACCAGTA
CTTTTACAAGAAAAAGGAATACTAAGTGATATTTCAAAATCTATTAATACTGTATCTAAAGAGTTGCAAA
TGAAAGATGAAAAACTTAGGAAGAAAGAGGAAGCTAGGTCTAACTGGATTGCAGGAATATCTCATGATAT
AAGAACTCCACTTTCAATGATAATTGGATATGCTGGAGAACTTGAAGAAAGCAGTAGCCTTTCAAATAGA
GAACAAGAGCAAGTGTCTATTATATGCAATCAAGGGGTTAAAATCAGAGAATTAGTAAATGACCTAAATT
TAGTATCTAAACTTGAATATAATATGCAAGCATTGAATTGTGATAAGATTAGAGTTTCTGCGTTTTTGAG
AGAGCTTATTTCTGAGTTTATAAATAATAATTTGGATAATGACTTTTATGTTGAACTTGATATACTAAAT
GAAGATATTATTATAGATGCAGATAAAAAATTATTAAAAAGGGCTATTAGTAATTTAATACAAAATAGTA
TAACTCATAACCAACAAGGATGTAATATAAGGGTTACCTCTAAGTCTGATTTAGATTTTTGCTATATAAT
TGTTGAAGATGATGGAAAAGGTATGAGTCAAGAAAGAATTAATAGTTTATTAAAGAGCCAAAATGGACTA
AGTGAGGCATATGCCAAAGGTCAAAATCATGGTCTAGGTATTTTGATAGTAGCTGGAATTATTAATGCAC
ATAGAGGTAAATTAGATATTATGAGTATTGATAGTCAGGGACTAAAAACAATACTAAAATTACCTCTAAT
TAAGTGA
>ref|NC_013316.1|:733666-734055 putative regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGACTATAAAAAAGTTGCCACAATCAGAATTAAAGATAATGAAATTTATATGGAAATCAGATTCCAAAG
TAACATCTAGAGATATTGTTTTAGGAATGGAGCAAAAATATCAATGGAAACAAACGACAACTTTGACTCT
TTTATCTAGATTAGTAGTAAAAAGATTTCTAAATTCTCAAAAGATAGATAAATATACACATTATGAAGTT
TTAATTAAAGAAAAGGAATACATAGGAGTTGAGACAAGAGATTTTTTTAGAAATATTCATGATTCTTCTA
TAAAAAGTTTATTGTTGTCATTACATGAAAATATTAATTTGAGCAAAGATGATATCTTACTTATTGAAGA
GTGGATAAAAAATCTAAAAGAAGAGGAGAAAGACGTATAA
>ref|NC_013316.1|:734800-735270 putative glyoxalase [Clostridium difficile R20291]
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TTGAGCAAGAAATTGAATTGGACTTAGGCAAAAATGTAACATTTAAAGGAGGATTTGCTATACAAGAAGA
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GAGGTTGATGATTTTGACGAATTTATTGAAAAACTCAATTATTATAAAGATGTAGAGTTTGTCCATAAGC
CACTAAAACATGAATGGCAACAAAGAGTAGTGCGTATTTATGACCCAGATAAGCATATTATTGAGATAGG
AGAGTCTATGGAAGTTATAGCTAGAAGATATTTATCTGAGGGATACTCTGTAGAAGAAACTTCTAAAATA
ATTCAACATCCAATTGAATTTGTAAAGCAGTGTGAAAATAGTAAGGAATGA
>ref|NC_013316.1|:737338-738045 hypothetical protein CDR20291_0596 [Clostridium difficile R20291]
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TAAAAATATTGGAAGAATTAACAAGTAAGATAAAACTAGAAAAGGGAATGCGTATTTTAGACTTAGGTTG
TGGTAAGGGTATATCTTCGATATTTTTAGCAAAGGAATTTGATGCTACTGTATTTGCAACAGATTTATGG
ATAGAACCAACTGAAAACTATAAAAGATTTAAAGAGTTTAAATTGGATGATAAAATATTTCCAATACAGG
CAGAGGCACATGAACTACCTTATGCAGAAGGTTTCTTTGATGCGGTGATAAGTATCGATTCTTATCACTA
TTTTGGAAACAAAGAAGGATTTTTAGACAATCATATATCACCTCTTGTAAAAGAGGGGGGAATACTTGCT
ATGGCAATGCCTGGATTAAAAGAAGATTTTGTGGATTGTATACCAGATGAACTCATTCCATTTTGGCAAG
ATAATATGAACTTCCATTCAATTACATGGTGGAATAAACTTTGGTCTGAATCGGAGTCTGTGATTGTAGA
GAAATGTGAAGCTTTAAATTGTCATGATGAAGCTTGGAAGGATTGGATAAATTGTGATAATTCATATGCT
ATAAATGACAAAAAAATGATGGAAGTAGAGAATGGAAAGTATTTTAATACAATTTCTTTGATAGCGAGAA
CTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:738225-738440 hypothetical protein CDR20291_0597 [Clostridium difficile R20291]
TTGGGTATTTTTATTTTTTTAAAGTTAAATTGCAAATACTATTGTGTGATATATATTTTAATACTAAATG
TTTGTTTTATAAGAAATAAACTAATAGAAAAAATAGTTTTAACAATGAAAGCAAAAAAGGTATTGATGAA
GATTAAAAATTTTATAGTACCATTTTATATATTTTTTTATATATTTTATTATACTTTAAATCAAATTTCA
AAATGA
>ref|NC_013316.1|:738657-739157 putative acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
TTGATAGAAGGAATAAAATTTATAAAGGCAGAAGAAAAGTATATTTATTCGTATTGGCAAACTTTTGATA
AAATAGCAAAAGAGAGGAAATATCTAGCTATGGATGAAGCCTTTCCTTTTGAAGAAACAGTTGAATTTAT
AAAAAATACTATAAATAAAAACTTACCACAACTGTTTATAATTGATTTAGAATCAGATAACTGTATTGGT
TGGTGTGACGTTTTACCTAAAACTGAAAAAGTTGGTTATTTAGGCATGGGTATTCTTAAAGAGTATAGGG
AAAAAGGTATCGGAAGTAGTCTTTTAAAACAAATTATTGATTTATCAAAAGAATATGGGTATGAAAAAAT
TGAGCTTGATGTATTTAAAAGTAATAGTAGAGCTATTCATGTTTATAAATCTTTAGGGTTTGTAGAGGTA
AATACAATATCTAGTGGTTTTACATGGAATGATAGACCTGTAAAAGAAGAAGTAATTCAAATGGAGCTTA
CACTTATATAA
>ref|NC_013316.1|:c740186-739407 hypothetical protein CDR20291_0599 [Clostridium difficile R20291]
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CACTAAATAGTTTACCAGAAAGAGAGGAAAATTATAAAATGATTAATAATAAAACACACAAATTACCATT
TAGAAAAGGCTTAGTTGCAACTTTAGCCATTACTTTGATATTGAGCACAACAGCCCTTGCAGTAGGACAT
ATATATAGTTTAGTTGGAAAATCAAGTACTAAGGCTACCTATACATCTATCCCAACTACAGAACAAGTAA
AAAAAGACTTTAACTTTACCCCTAATATAGTTTCTGAATTTAGTAATGGATATAAATTTAAAGGAGCATA
TACTGTAAATAAAAAAGCACTTGACAAAGAAAATAATGTTTTAGGAAAATCAAAAGCACTTAGTTTTGAA
TATAAAAATGGCAATGATGAAATATCTCTTGACACAGCAAATAATGTACTTGAGAAGAGTTCTGACAATC
TAAAAGTTGTAGATACTTACAAAGATATTAATATTTCTTATGAAGCATTCGCACAAAAGTTTGTACCAGA
AGGTTATAAAATGACAGAACAGGATAAAATTGATGAAAAATCAGGCAAATACACATTTAGTGTAGGGCCA
AATAATGAATCAGACAAAGTTGAAGTTAATGAATTTAAGTTTTTGACATGGAAACAAGATGGAGTTTACT
ATTCTTTTACAGTTCAAGACTCAAATTTATCTATGAATGACTTAGTTAAAATGGCTCATGAAGTAATAGA
TGCAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c740686-740183 putative RNA polymerase sigma factor [Clostridium difficile R20291]
TTGCATAGAAGGGAAGGAACTCAGTTGGATAAAACTACATTTACAAACAATATACTTGAATCAGAACAGA
CTTTGTATCGAGTATCTAAGTCTATTCTAGGAAACGACCAAGACTGTGAAGATGCCGTCAACAATGCTAT
TTTAAAAGCATATGAAAAGTTGGATTCTCTTAAGGAAGAACAATACTTTAAAACATGGCTGATTAGAATA
GTCATAAATGAATGTAATTCATTAAGACGCAAACGATTAAAATCTCTATCATTTGAAGATGTCTTCAAAA
ACAAAAAAATTGATGAAAAAGATGACTATAGCGATTTGTATACTGCTATTCAAAGTCTACCTAAAAAAAT
TAAAATTCCAATAGTCCTTTACTATATTGAAGGTTATTCAGTAGATGAGGTTAAGGAAATATTAGATATA
CCTCAAGGAACTGTAAAAAGTAGATTATCAAGAGGAAGAACATTATTAAAAACTAAATTAGAAAACACGG
AGGTAATCATATGA
>ref|NC_013316.1|:741468-742169 hypothetical protein CDR20291_0601 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGTTTCAAGAAATGATTAATAGCCCAGGTCTTTGGATTGTTTCTAGTTTTTTAGTAATTATTTCAG
TTGTTCAAGCAATCGTATTTATGAAATCAGCACTTAAAGAGGCTTCAAATCTTGGTATTGAAAGAAAAGG
AATTAAAGCAGCAATTCGCTCAGCTAGTGTTACAGCAATTGGACCCTCTCTATCTCCTGTTATTACATTA
TTATCACTGGTAGCTGTGATTGGTGCTCCTACGACTTGGATGAGGCTTTGTGATGTAGGAGCTGCCAGAA
CAGAACTTGGAGTAATATCTCTTACATCAAATTTATCTGGAGTAGAAGTAGGTAGTGCTGCATTTGGAGC
AGAAGCTTTTTCGTATGCACTATGGGGAATGGCTTTAAATAACTTAGGTTGGTTGCTTGTTGTATTTATT
TTGGGTCATAGAATGCGTGGAATTGTTGAAAAAATGAATGTGAAATATAATCCTACTTGGGTTAAAAAAC
TACTTGCAGGGGCTACAGTTGGATTATTTGCTTACCTTCTTTCAAATCAAATAAAAACATTCGAAATACC
AAAACTTACACCAGCAGTTATTTCAGCTATAGTTATGCTAGTATTGACGACTTTATTTAAAAAGAATCAA
CGATTACAAGAATTATCCTTAGGTATTGCCATGTTGATTGGTATGTTTGGCACACAGATTGTACTATCAT
GA
>ref|NC_013316.1|:742195-742851 putative membrane protein precursor [Clostridium difficile R20291]
ATGTATGATAAAAAGATGATAAAAATAGGGAGAATTTCTATAGGTCTTGCAATTATTGCAAATTTTATTC
CTGCAATCTATGTAGGTCTTCGCTTTGGTCAGATGCCAATGCTTTCTGTTATATTCCAAATTTGGGGATT
AGTTGCTACAACTTATGGAGTGAGTTGGATTGTTCAACCTATAGCTTATTATCCAACACTAGGAGCTCCA
GGTTCTTATATAGGTTGGCTTGCAGGTTCTGTTGGAGATATACGTATGCCTGCAGCATCAATGGCACAGA
AAATTGCAGGTGTAGAAGCAGGAACTCATGAGGGTGAAGTTGTAGGAACAATTGGTACATGTTGTTCAAT
CTTTGTATCAGCTTCTATGATTACTATTTTTACCATTGTAGGCTATAAAGTAATTCCTTTGTTACCTGAA
TTTATTACTGATTCATTTAATTATATACTTCCAGCATTGTTTGGGGCAATTTACGTTGATATTGCGCGTA
AAGATATTCGAGCTGGTGGATGTACGATTGCTGTAGCATTAGCTATTATGTACTTTGGTGAAAAAATTGG
TATACCAGGTGGATTGTTGACATTGTTTATTGTGTTAGGTGGGATACTTATTACAAGGGTTTTCTTTGTA
ATTGATAGCAATAAAACGAAAGAATAG
>ref|NC_013316.1|:743058-744698 amidohydrolase 3 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTGATGTTAAAATTGCCAATGGAATAATCATTGATGGTACAGGAAATTCAAGATATAAAGGTGATG
TAGGGATTGTAGGAGACAAAATCATGGCTATTGGAGATCTAAGTCAAAAAGAGGCTAAAGAGACTATAGA
CGCAACTGGAAAATTTGTATCACCTGGTTTTATAGATTTCCACACTCATTCTGATTTATCTCTTGTGTAT
GACAAATACACAAGAAGCCGTATCCATACAGGTGTAACAACAGACGTTATTGCAAACTGTGGTATAGGAG
TTGCTCCGATAAGAGAAGAGAAGAAGCAGGAGTTAATTGACTATCTTGGAACGAGGATAATTGGTACAAT
TCCAATAAAATTGAACCTTCACTGGAATACAATGCAGGAATACTTTGATTACTTAACTGAAAATTCTCCA
GCAGTAAATGTTGTAGCTTATGTAGCACAAGGACCTGTACGTATCAATGAAATGGGATTTTCAAAGGAGC
CAGCTACTTTAGAGCAACTTAAAAATATGAAGTTGGAAGTTAGAAAGGCTATGGAAGCTGGATGTGTAGC
TCTTTCGTCAGGATTAGTTTATTTACCAGGAGCATATACAAAGAAAGAAGAAATGGCTGAATTATGTAAG
GAATTGATACCATACAATGGATACTATATATCTCATATTAGAGATGAGGGTGATGAAGAAATGGAAGCTC
TTGATGAAGCAATTTATATAGCTAAGACGGCAGGAGTTCCTCTACATATTTCTCATTTAAAAGTCATGGG
TCATAAGAATTTTGGAACTATTGATAAGGTATTTAAAAAGCTAGATGAAGCTGAGGCAGATGGCTTGGAA
GTTACTTTTGATTGTTACCCATATACAGCTGGAATGACATCTTTGGGTGCACTTTTACCTCCTTGGGCTT
TTGAAGGTGGTGTAGAAAACATGGTAAAACGATTAGAAGTGCAAGAAAATAGGGACAGAATTATAAAAGA
GCTAGAGGAAGGGATTCCTGGATGGCAATGTTTCTACCAGTTAGCAGGTGGTTGGGACGGTGTTGTACTA
GCCTCTGTAATGACTGAAGCAAATAAATATGTAGAGGGTAAAACTTTAATGGAGGTAGCTAAAATCAATG
GTGAAAATCCATTTGATACGTTCTTTAGGCTTTTGATTGAAGAAAAAAGTAAAATTCAAGTAGTTGTTCA
TACACAAGGTCAAGAGGATACAGATAAGGTCGTTTGCCATCCAAAGTCATGTATAGGTTCTGATAGTATG
GACCTTTCTACAGAAGGCTTACTTTCTCTTGGAAAGCCTCATCCCCGTGCATTTGGTACTTTTGGACGAA
TTTTCTCTTACTATGTTAGAGAAAAAGGTATGTTGACTTTTGAGGAAGCAGTTAAAAAGATAACTTATCT
TTCAGCAAAACGCTTAGGAATTTATAAAGAAAGGGGTCTACTTAAGGAAAATTATTTTGCTGACATTGTG
GTATTTGACCCAGATACAATAGAAGATAAAGCGACTTATAGTAATCCTAAACAGTATACAGTGGGAGTGG
AATATGTATTGGTAAATGGTAAAATTGCATTGGCAGGAGGAAAGCAAACTGATGTATGTGCTGGACGTGT
AATTAAAAATCCTCTTAGCATAGCAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:745057-746379 hypothetical protein CDR20291_0604 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATACTTTATGTAGGACCAGGCATGGTAATCGACAAAATACTAGCAGTAAGTAAAAAGAATTTTC
CCAATATTGAAGCAGATTTTCTTAGATATGATAGATATATTGAAGTACCTGATTTATTGGAAAAATATAG
AGGTAGAGTAGATGCAGTTCTTTTTACAGGTAAATCGCCATTTAAATTTTTTGAAAAAAGACAAAAAGAT
TTTGTGTTGTCTGATTATATTCCTAGACATGAAACAACATTATACAGAGTATTGCTTGAAATTACATATT
TGCTTAAATTCGATATTAGTAGACTTAGTATAGATACTTATGATAAAGCTATGCTGAAGAGATTGTATAA
AGAAATTGGAGTTGAATTTAAGGATGAACATATGTTTTTTGCAGAGCAAAAGTATTTAGAAGAGGACTAC
ATAAAGTTTGTGCTTGAATTTCATAAATATAATTATCAAAATAATGACATATGTTGTTGTATTACAGGTC
TTGAAGAAGCATATCATGCAATGAAAAAAGAGAATATTCCAGTAGTTTTAGCCTTGCCTTCTGAGGATGT
AATGGTACAAAGTATAAAAAACATTCAGATGCGTTATATTGCAAAGAAAAACAATGAGAATCAGATTGTT
GTTCTTGCTATCAAACTTAATATGCCTTCAGAATATTCACTGATGAAGGAAGATGAGTACGCTTATCTTT
CACAAAGGATTAAGATTCTTGATAAACTATACCATTTCAATAGCCGTATAGATGGTGTTTTGGTAGAGCA
GAGTAGAAGCGAATTTATGATTTTTACAACTAAAAAAATACTTGAGTTAGAAACAAAGAAGTACAGAGAT
ATTTATTTGTTGGATATGATTCGTGAAGTTTCAGTTATAAACACTTATATAGGAATTGGTTATGGAAAAA
CAGCAAATGAAGCTAAATTTAACGCTTATGAGAGTATTAAGATGGCTCAAAGTCAAAAAAATGATGCAGC
ATATGTAGTTTTTGAAAATGGAGAAATTATGGGACCACTAAAGCCAAATCCTGCTGTCAAAGAGAAAAAT
AGCTTTGATGAACGATTTTATCAAATTGCTACAGAGACAGGGCTAAGTGCTAATACTGTATATAAAGTGT
TCAATAAAATAATAAATAGTGGAAAAACTGAATTTACATCAAAGGAATTAGCTATTATATGTGGTGTAAG
TATTAGAACTATGGACAGGATTATACTTAGATTGTGTGATTCTGGTTATTGTGAGGTAGTGAGTGAACAG
CTTATGAGCAAGTATGGTAGACCCAGTAGAATATTACGTTTTAAACCTTTTCTGTTGTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:746576-747583 hypothetical protein CDR20291_0605 [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAAAATATCAGGATTCAAAAAAAGTTGTAAGAAATTATTTTGAAGCATTAGAAAATGCTACTGGGG
ATGAGGTTGAAAATGTCTTAAAGCAACATATGAAATCAGATTATAACTGGAAAGGTGTGTATCCATTTCG
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CAAAGACGACAAGATATTTTCATTGCAGGAACAAATGAGATTGACAATAGTGAATGGGTAATGAGTATGG
GGCATTTTATGGGACTTTTTGATAAGGATTGGCTTGGCATTAAACATACTCGTAAAATGATTAGTTTAAG
ATATGCAGAATTTAACTGTGTTCAAGATGGTAAAATTGCTAAAACTGGATTATTTGTAGATATAATTGGG
TTTATGATTCAAGCAGGAGTTAATCCATTGCCACCACAAACAGGTTCATATTTTGTATATCCAGGGCCAA
TTGACCATAATGGATTACTTTTTGAAGATGCAGATGAAGTTGAAGGAGTAAAAACTTTAGCATTAGTAAA
TAAAATGGTAGATGATTTATCTGAATTAAATGAAAGTGGTACTATGGGATGCCCACCAGAAATACTTAAA
AAATCTTGGGCTAAAGATATGATTTGGTATGGTCCAGGTGGAATTGGTGCTTCTTATACTATACCTAGAT
ATCAAGAGCAACACCAGCTACCATTTAGAAATAATTTAAAAGGAAAGACTTTCAATGGGCATGTATGTAG
ATTTGCAGAAGGTAATTTTGCTTGTTTCTTTGGATGGCCTAATCTGACTAATGTACCATGTGGAGGTTTT
TTAGGATTACCAGGTGGAGAGGTTAAAGCAGATATGCAAGTTGTTGATGTTTATTATCGTAAGGGCGATA
AACTTCAAGAAAACTGGGTGTTAATTGATATTCCTTATTGGTTGAAACAACAAGGGCTTGATATTCTTGA
GAGAACTAAAAGTATTTTTAATGCTTAG
>ref|NC_013316.1|:747621-749018 hypothetical protein CDR20291_0606 [Clostridium difficile R20291]
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AATCATGTACGGTTAAAGAAAACAAAGCTAAAATGAATCAAACTAATTTTAGTAATATAAATGAAAATCA
AACAAATGAGAATAAAACGAACACATATAAAGGAAATATAGATAAAATAAACACAAATAAATCCGACATA
AATAAAGTTAACATAGATACAGTGGATACAGATAAATTAAATACAAATACTCTTACTGAAAAAAATAAAA
AAGTTATATTTAAGGGGGAAGATAATATGTCATCTACAAAAATTTACTATGGAGATTCATTAGAAGTAAC
GCCTGTTGGAGTAATGGATTACAATGATTTTTCAAAACAGACAAAAAGGGAACAGGAAATACCTGGATTT
GATTCTAAGTATAGAGATTTTGTAGATTATATTATGAAGATTACACATAATATCTGGGAAGAAAAAGGTA
TAGGTGTTATTTATGATACATATCACAATAATGTTACAATGCATTGTGGCTCTTCAAATTTAGTTGGTAT
TAAAGATGTTATTTCCAATACTCTTCAAACATTACATGCGTTTCCTGATAGAAGATTAATTGGTCAAAAT
GTAATATGGTCTAACTTTGGTGCTGATGGTTTTTTATCTTCTCACCGTGTTTTGTCTACAGCAACTAACT
TAGGTGATAGTAATTTTGGACCAGCAACAGGTAGAAAAATAAACTTTAGAACTGTAATTGATTGTGCCAC
AACTAACAATAGAATCCACGAAGAATGGTTGGTTAGAGATAATTTATGGATTGTTACTCAATTAGGATTA
AACCCTCAGGAAGTAGCAAAGAGTATGGCAAAGGCAAGTGAATCTAAAGTGCTTAGCTTACAATCAACTT
ATGGTATCTGTGAATCTATGGATGGTCAATTTATGCCAACTAAGTATCAAGCAAAAGATGATTCTGTTGG
CGAAATGATGCTTGAAATGACAAGCCGTATTTATAATTATAAATATATAAATGAAGTTAAAAAATACTAT
CATGATAATGCAGTAGTACATTTTATATGTGATAAAGATTTAAATGGTTATGATGAGATTCAAGGAATGA
TTGTAAGTTTACTTGCATCAATTCCAAATGGAAGTTATGAAGTGGAAAGAGTAACTTGTAATCAAAGAGA
AAAAAATGAAGGTTATGATGTATCTATAAGATGGAGATTACGTGGAATAAATGAAGGTATAGGATTTTTT
GGACAGCCTTCTGGAAAGCATATAGAAGTAATGGGAATCAATCATTATCATATACTTCAAGGTAAAGTAA
AGGAAGAGTGGATAACTTTTGATGGTATGGATGTATTAAAACAAATGTATATGGGAGTAGAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:749106-750428 putative transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAAACTTTTAGCAAAAATTATGACTAAATTTAAAAGGGGGAATTATAAAAATATGAAAACAACGG
TTGAAATAGAAAATGATATCATATTAGGAAAAGACTATTCAAACCTAAAAAGAGGAATTGCATTTTTTTC
AATTGCTTTAATATACTTTTTTTATTGCTACAATTTTATGGTGGGTACTTTTATTAAACCAACAATGATT
TATGCTTTAGCAGATGGGGGATTTGGCTTTTCATTAAAACAAACAGAAGAAATATTTGCAGTTATGTCTT
TTGGTACAATTCCAGGTACATTTATTTTTGGGGTGATTTCTACAAAAATTGGGAAGAAGAGGACTTTAAT
TAGCGTTGCTTTACTGATTGGATTGACAACATTTATACCAATGTTATCTCCTACAGATATTATGTTATGG
AAAATAGCACGTTTGTGTACAGGAGTAGTGTTGGGAGGCGTATTTGGAACAGCTATGCCTTTAGTTGCAG
ATATGTTTCCAAGTAAATATCGTGGTAAGTTAGCTGCTATATTAACTGCTTTATTTTCATTAGCAATGAT
TTTTGGTGGGAAAGTATATGGCGTTTTAGGTGATGCAAATTGGCAAATATTGATGTATACTGCGATTATA
CCACCTATAGTTGGAGCTATCTTAGCAATCTTCTTTGTGCCAGATGATTTGGAGTATACAAAGGAATTAG
TTAAAAAGGGAAAAGAAACTGGTGAAAAGATTAGCTATATAAGTATGTATAAGGGAAAATACTTATGGAT
TGGATTGGGAACGATTCTTTTATCAGGTGCAAATTTTACAGCATATTCAGCATTTTCAAATAATGCAACT
ACATACCTAGTGACAGGAATAGGAATGTCAGCAGCAGTGGCTGGGTCTATATATAGTTTACAAGGAATTG
GTCAATTAGTAGGATATTTATTCTGGGGTTCAATTGCAGATAAATTTGGAAGAAAAATACCTTTTATAGG
TATGGCATTAGCAGCAGTATTTGTTTTTATATATACAAAATTAGGTGGAGATAATACAACAACATTCTAT
ATGATATCAGTATTACTAGGTGTTGCTGTTGGATATTCTGGAGCATGGGGAGCATACTACACAGAGTTGT
TTCCAAGTAAATATCGTTCGTTGTCATCTGGTATGTCATTTAATGGAGGAAGGATTATATCTACGTTTGC
AATACCTGCTATAGCTGGTACAGCTTCTGGTACTTTAGGTATGATGACTATCTTTTACATATCAATCGCA
GTCTTTGTAGCAGGTGCTATTGTATGGTTATTCTTACCAGAGACGTTAAATAATAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:750470-751509 putative sodium:solute symporter [Clostridium difficile R20291]
ATGATTTCATCAATTGATGTATGTATTATAATAGGATATTTGCTATTAATGTTAGTTATTGGTTATTATT
CAGGAAAAGATAATAAAAATCAAGAAGATTATTTCTTGGCAGGTAGGTCAATGCCATGGATTCCAATTGC
TTTATCAGTTGCAGCTACTATGATTAGTGCAAATGGCTTTATAGGTGGTCCTGGATGGGCATATGTAGAT
GGAATGTATCCAGTAATGGTAAAATGTGCAAAAAATTCTTTTGTAGTTAGTGCATTTGTTATGAATTTAG
TTTACTACTTTATGCTATTGGTAGGAGTAATTTTATTTGTTTTTTATGGGGGAAGGACATTTGAAACTTC
AAATGAAATAATGATTACTTTTATTTTAAATGAACTTCCAGTAGGAGCCATTGGAATTATTATTGCAGGT
GTGTTTGCAGCAGCAATGTCTAGTATCGACTCTATATTAAACAGTATGACAACTGTTTTTACGAAGGATA
TTTATGAGTTTTATTTCAAAAAAGACAACAAAGAATCATCATTAAAAGTTACAATGATTATAACTGTAGT
TATAGGAGTTGTTATGACAGGTTTTATTATTATGGGATTTGGAGGAAGCATCAAATCAATTCTTGACCTT
GTTGGTAACTATATCTCATACTTTGCTGGACCAGCTACAGGTGCATTTGTACTAGCAATGTTTACATATA
AAGCTAATGATAAAGGAGTATCTATTGGTTTTATTGTAGGGTTAGTTTTAGGATTTTTTATTTCTAATAA
ATATAATGTGAGTTGGTTGTGGAATCCAGCAATAGGTGCTACAATAACATTGATATTTGGATATATTTTT
AGTGTCATTTTAAAGAAAAATCATAAAGTAGATGATATTAAAAAATACACTGCATTTGGTATGAGAAATC
ACCTTATTTCTCAAGGAATGGATAAAGTAGATGGAGTATCTATAGTGCCATTTTCTTTAGGTAAACAAGA
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>ref|NC_013316.1|:751544-752566 LacI-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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CTCAATCATCTGTTTCAAGAGCATTTGGTAGTGCAAATGGAAAGGGCGTAAAACCTGAAGTAAGAGAAAG
AATTTTTCGTGTAGCAAACGAAATAGGGTATGTTCCTAATTTGGTAGCACGGGGAATGATTAGTGGAAAA
ACTAATGTTATAGGTTTGATAGTTGGTGATAGTCTAGGTCCATTTTACAATAGAATTATCAATTTATTTG
TAGAAAAAATTCAAGAGATAGGTAAACAGTGTCTCGTTTTTAAAGTTCCTAGACAACAAAGTATAGATAG
TATAATTTCAAAAGTAATTCAGTTTCAAGTAGAAGCTGTGATTATTACAGCTTCGGCCATGAATAAGGTG
ATGGCTGAGACTTGTGAAGAAAACAATATTCCTGTGATTCTTTTTAATCGTTTTATACCTGGTATAAAAA
TAAGTACAGTCTATGTAGACCCAATTGAAGGTGGGGGCATGGTTGCTGAATATCTGCTTAAGAAAGGTCA
TAAGAATATAGGATATATTCAATTTACGAGAGAAACAAGTGAAGAAATGGAAAAGAAAATTGGATTTTAT
TCTAAGTTAAGACAAAGTGGGATTCATAACCTTAAAGAAGAATCTGCAAACTATGATTATGATTCTGGAT
ATGAAGCAGGTAAGAGAATGTTAGCATTATCAAATCCTCCAACAGCAATTTTTTGCACAAGTGACTTGAT
AGCTATTGGTGTAATGGATGCTGCAAGGTTTGAGTACAAGTTGAGGGTGCCAGAGGATTTATCAGTGATA
GGATATGATGATATTCAAATGGCTTCATGGAAGAGTTATAATTTAACGACGATTAGACAACCACTAGATT
TGTTGATTGAAAAAACAATTAACATACTTAAGTCCTTATTAAATGAAGAAAATCCAGAGTCAGTCGTTGA
AATGTTAAAACCTGAATTGATTGAAAGAGGTTCTACACTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c754579-753176 putative ATP-dependent peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATGCTAAACAACTTTTTTAAGAAAATCAACAATCCAGCTCCTGTCTTTGCACAGACAAAAATGG
AAAGAGATAATCAAACAGATGATTCACTTTCTACAAAACCAAAGACTACATTTAGAGACGTTGCTGGATT
AGACGAAGTAAAAGAAGAACTATTTGAAATAGTCGATTTTATGAAGTCACCACAAAAATATCAAAAAATG
GGTGCAAAAATACCTAAAGGAGTATTATTTTATGGTCCTCCAGGAACAGGTAAAACCCTACTTGCATCTG
CTGTAGCTGGTGAAACAAACTCATCATTTTTCAATGTTACTGGTTCAGAGTTCGTTGAAAAATATGTAGG
TGTGGGAGCAAAAAGAGTTAGAACTCTATTTGAAAAAGCTAGAAAAGAAGCTCCAAGTATAATATTTATA
GACGAAATAGATGCTGTAGGAGCAAAGAGACATCTTGAAAGTAACAACGAAAAAGACCAAACACTAAACC
AACTTTTAGTTGAAATGGATGGATTTAATAAAGATTCCAATGTATTAATAATAGGTGCTACCAATAGACT
TGACTTATTAGATGAAGCTTTACTTAGACCAGGAAGATTTGACAGACACATTCATATAGGTGCACCAAAC
TATCACACTAGATTTGAAATTCTAAAGGTACATACAGATGACAAACCTATAGACAAATCTGTAAATCTAG
AACTTTTAGCTAAAAAAACTCATGGTTTCAATGGGGCTCATCTTTCAAATATAGCAAATGAAGCAGCTAT
ATTTGCAGTTAGAGATGACAGTGAGTGTATTACATCAGAACATTTTGACAAGGCACTTGAAAGAGTTATT
GCAGGGCTAGAATCTAAAAACTCTGCATTGGTTGAAAAAGAGAAAAAAATAGTAGCATATCATGAAGCTG
GACATGCTCTTGTAAGTGATATAGTAGGAATTTGTCCTATACAAAAAATATCTATAGTTCCTAGAGGACA
AGCATTAGGTTATGTTCTTCAATTACCTGATGAAGATAGATATATTTATACTAAGGATGAGTTGATTGGA
AAAATAAAAATATTACTTGCTGGAAAGGCTTCAGAAGAATTAATATTTAATCATAAATCTACTGGTGCAA
AGGACGACTTAAAGAAAGTCACTGAAATAGCTAACCAAATGGTTTGTGAATATGGTATGAGTAACTTAGG
ATTTATGACTATTGATGGAAATGATAAGACTTTCTTATGTGATAAGGTTCAAAAGGAAGCAAATCGTATA
GTTGAAATTTGTTATAAAGAGACTTTAGAGATGTTAAAGGATAATCTTGAAGATTTACATTCTGTTTCTA
AATTCTTATTTGAAAAAGAAACTATGACTCATGAAGAGTTAAAAGATTTGATAGGAAAAGAAGCTGTAAA
CTAA
>ref|NC_013316.1|:755540-755965 translation initiation factor IF-3 [Clostridium difficile R20291]
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CGAATCCACCAGTATGTAAGATAATGGATTATGGAAAGTTTAGATATGAGCAAGCGAGAAAAGAGAAAGA
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TTAAATACGAAAGCTAATAATGCTATAAAGTTCCTTAAAAAAGGGGATAAAGTCAAAGTTGAACTTAGAT
TTAGAGGAAGAGAATTAGGACATAAAGACATAGGTAAAGAAGTTATGCTTAAGTTTTTAGATATAATAAA
AGAGTTTGGAGAACCAACAAAAGCCCCTGCATTTGAGGGTAATAATATGGTTGTAATTATAGATCCAAAA
AAATAG
>ref|NC_013316.1|:755993-756187 50S ribosomal protein L35 [Clostridium difficile R20291]
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GAGCTAAAGCTTTTAAAAAACATATATTAACTAAAAAATCTGCAAAAACTAAAATGAACTTAAGAAAATC
AACTTTAGTAAGTGATGGAGATGCCAAGAGAATAGCACAATTATTACCATACTAA
>ref|NC_013316.1|:756243-756599 50S ribosomal protein L20 [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAAGAGTTAAAAAAGCTATGAACGCTCGTAAAAAGCATAAGAAAATATTAAAACTTGCAAAAGGAT
TCAGAGGATCTAGAAGCAAATTATATAGACCAGCAAATACATTCGTAATGAAAGCATTAAAAAATGCTTA
TATAGGAAGAAAGTTAAAGAAGAGAGACTTCAGAAAACTTTGGATACAAAGAATAAATGCAGCTGCTAGA
ATGAATGGAATATCTTATTCAAGATTAATGAATGGATTAAAATTATCTGGTATTGAAGTTAACAGAAAAA
TGTTATCTGAAATGGCTATACAAGACCCAGAAGGATTTGCAAAATTAGCAGAAGTTGCTAAAGCAAAATT
AGCTTAG
>ref|NC_013316.1|:756909-757454 hypothetical protein CDR20291_0614 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGAGAAACTAATGGATTGTTTTGTAAACCCAATTAAATGCAAGTTATTGCTTGAAGTTTTTTCAA
ATAATCGAACTACAGCTAAACAATTAGGAGAAAAATTTCAAGATATATCAAAGGCAACACTTTATCGTTA
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AAAGTATATGCTATGAAGTTAGATATAGCTGATGATGTGAACAAAATTATAGATGAGAACTCTGGAGAAG
AATATGCTCAACTGTTTACTCAATATATGATGGGATTTTTAAGAGAATTTTATGAATACGCTGAAAGAAA
GGAAAAGGATATCCTAAAAGAGGGTTCAGGATTTTCTGTCTGTCCAGTATATGCTAGTATTGATGAAATA
GTTGAAGTGAGTAAAAAAATTGCTAGTATACTAGAACCTCTAAGAAATAACTCGCACGAAGAAGGCAGAA
GAATGCATTCTATAGGAGTGATAATCACTCCACCTAAAGAGGATGAAGGGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:757890-759815 putative nucleotide phosphodiesterase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATAAAATTTGTTATTATGCCATTGGTGATATTTTTAATAGTATTATTTGTGGGGTGTCAAAGTA
CAAAAGATACAGAAGTTAAAGCAAAAGATACAGAAATTAAAATATTAGGTACAGGTGATTTGCATTCAAT
TTTGACAGACTCTATGGTTTCATATGTAAATGAGGAAAGGGAAAAGAATAAAAATCTGCTTATGGTAGAT
GCGGGAGATTTCTATGGTACACAAAGTAGAGAAATGTGGGAATGGTCTTCTGGAAAAAAGTTAATTAATA
TTAAAAGAAATGGTAGAGCAGAGTATGATGACATAATTAAAAGTAGTAAAGATGAAGTACCTATAGTTAA
AGATATGGCAAAGTTGAAATATGATGCTGTAGTTTTGGGAGATAATGAATTTATTTCAAATGATAAGCAA
AGTCTTGATAAACTAGTTTCTGATTTTAAAAATAATAATATGCCATTGGTATCAGCAAATATATATGAAC
AATCTGGAGAAAATTATGTACAACCATATGTAATGAAAAATATTAAGACAGATGAGGGCAATGTAAAAGT
TGGAATACTAGGTCTTACTATAAAAGAAGTAGGGGAAACCCTTGGTCTTGAGGATTTTGAAAAGGATAAA
AAAGCTAGAGAGCTTGGAGAACAAGCTGATTACAAAGGAAAATTATATGCAAATGATTTAGTAGAAGATG
CAAAGAAATGGATAAAAGTTATGGAAAAAGAAAGTCCAGACATAATAGTTGCAGTTGTACACTCAGGGGA
AGAACCTAAAACAGATAGAAATCCAGGAAATAGAATAAAAGAGTTAGCAACTACAGTGGATGGAATAGAT
GCAATTGTAGCTGGTCATACTCATGAAAAAATAGATGAACACAAATATAAAAATAAATCTGGAGATGAAG
TAATTGTTACACAACCAGGTTGGCATGGAGATAGAGTATCAGAGATTAATTTCAAATTAAATAAAGAGAA
TGGAAAGTGGGACATAAAGGAAAAGTCTAGTAAATTAAAAATAATTGATAAAGAAGTAAGTATAGTTGCT
ACTGCAGATTTACATTCACATTTCTCTGATAAATTAACAGTTGACCTTGTTAATGAACGTAGTAACCCAA
TTGAACCTGTTGTAGTAGATGCAGGCGACTTCTTAGACCCTCAAACAGATGAAATGACTCAATGGTATAA
AGAGTGGAAAAGTATAAGAGATAATAATAGTGATAAAACGATTAGTAGATGCCCAATGGTCATGGATATG
AATCAGGGAATGTATGATGCAGTAGTACTTGGAAATCATGAATTTGTATCTGAAAAAGATGAATTTTGGT
CAGATGAACGCCTTTTAGATGCTGTTATAGAGGATTTTGAACAGGTGGCAATTTCTGTGTTATCAGCAAA
TATATATAGGCAATCTGGTAAAAATTATGTTAAACCATATATTATAAAAGATGTGGAGACGAGTGAAGGT
AATGTAAAAGTAGGAATATTGGGACTTACTATAAAAGAAGTAGGTAAAGGTCTTAAAAATGTAAACTTAC
AAGAGCAATTTCAATATAAGGATAAATTGTATGCAAATGATTTAGTGGAAGATGCAAAGAAATGGGTAAA
AGTTATGAAAAAGAAAAAACCAGATATAATAGTTGCAGTTGTACATTCAGGAGAAGAACCAAAAAATCCA
AAACACCCAGGAAATAGAATAAAAGAGCTAGCAACTACAGTAGATGGTATTGATGCAATTGTTGCTAGTC
ATACTCATGAAAAAATAGATGAGCATGAATATAAAAATAAGTCTGGAGAAAAAGTTATAGTGACACAACC
AGGTGAGCATGGTAAATATTATTCTAAAATTACCTTTAAAGTAAATAAAGAAAAGGGTTCGTGGATTATT
AATGATAAATTCAGTAAAACAATTGAGGTTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:760153-762120 putative nucleotide phosphodiesterase [Clostridium difficile R20291]
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TAAAATTTATTATAGTAGCATCAATAATATTTTTAATAGTATTACTTGTGGGGTGTCAAAGTACTAAAGA
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GAAGAGGAGAGAAAATATGATGAGAATCTACTTATGGTAGATGCAGGAGATTTTTTTGACATGCAAAGTG
GTGAGATGAATAAGTGGTTTACTGGTCAAAAATTAGTAAGATTTAAAGATGGGATACCAGAGTACAAAAA
AATAGCTGAACCACGTGAAGGAGAAGTTCCATTGGCTAAAAAAATGGCAAAGCTGAAGTATGATGCAGTT
ACATTTGGGAATCATGAATTTGTATCTAATGACAAGCAGAGCCTTGATAAATTGGTTTCTGATTTTAAAA
ATAACAATATACCATTAGTATCAGCAAACGTATATGAACAATCTGGAGAAAACTACGTAAAGCCATATGT
AATGAAAAATATAAATACTGACAAGGGAACTGTAAAGGTTGGTATACTTGGTCTGACTATAAAAGAAGTA
GGGGAACGTTCAAGGTTTAAAAGTTTTAAACAAGATAAAAAGGCTAGAGAACTTGGGGAACAACCTCAAT
ACAAAGGGAAATTATATGCAAATGATTTAGTAGAAGATGCAAATAAGTGGGTAAAGGTTATGGAAAAAAA
AGAAAAGCCAGATATAATAGTTGCCATTGTACATTCAGGTGAAGAGCCAAAAAATCCTAAAAATCCAGGA
AATAGAATAAAAGAACTAGCAACAACTGTAGAGGGAATAGATGCTATTGTAGCAGGTCATACACATGAAA
AAATAGAACAGCATACATATAAAAATAATTCTGGTGAAGAAGTAATAGTAACACAGCCTGGAGCTCATGG
TAATAGTATATCAAAGATTAATTTTAAGTTGGATAAGAAGAATGATAAGTGGTTTATAAAAGACAAATAT
AGTGAATTAAAGGTTTTTGGAAAGGAAGTAAATATAATTACAACTTCTGGTCTGAATCCAAAATTTTCAG
ATGAAATGGCAGTTAATTTGTTTAATGAAAGAGATAGAGATGTTCAACCTATCTTTATAGATACTGGAGA
TTTTTTAAATACTAATACAAAAGAAATGACTAAGTGGGCTAAAGAGTGGCAATACAATGAAAATAAAGGC
ATCTATAAAAAAATAAATGAATGGCCAATTGTATATCTTGGTTATGATGCTGTAGTACTTGGTAGCCATG
AATTTACAGAGGATAAAGAGACTTTTGAGGGAAAAAAATCTACATTGGATTATATTATAGAAAACTTTGA
AGAAATGAAGATACCAGTATTATCAGCTAATATATATGATGAATCTGGAGAAAATTATGTAAAACCTTAT
ATAATTCATAATGTAGAAACTAGGGAAGGAAATATAAAGGTTGGAGTATTAGGTCTTACTACTACTGATA
AGGATGAAGAAGACTTAAGTAGCTCAAGCTTAAGCAAAGACTCAAAGACTTCGAAAATTCCTGAAGAAAC
AGGAAAGTTATATACTAATAATCTAGTAAAAGATGCAAGCGAATGGGTAAAAGTTATGCAAAAGGAAAGT
CCTGATGTGATTGTTGCAGTTGTACATTCAGATAATAATAGTACTCTAAAAAATCCAAGTAGTGAAGTCA
AAAAACTTGCAATGTCAGTAGATGGAATAGATGCTATTGTTGTAGGTCATACGAAAAATAAGGTAGAAGA
ACATATTTACAAAAATAAGTCTGGAGATGAGGTTATAGTAACACAATCTGGAGAAGATTGTTATTCAAAA
ATAAGTCTTGAACTAAGAAAAGAAAATGGCAAGTGGAATATCATAAACAAATATAGTAAAGCAATAAAAA
TGAAGTGA
>ref|NC_013316.1|:762508-763287 putative short chain dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTATAAGAAGATTGCAATTATAACGGGTGCTAATAGTGGTTTTGGTAAAGAGTTTCTAAAGTTAT
TAATAAATGAAGAAGAAATAACAGAAATATGGGCAGTTGCAAGAAACAAGGCGAGATTAAATCAATTAGT
AGATGAATTTGGAAGTAAGGTAAAAGTTTTTTCAAAAGATTTATCAAAAATAGAAGAAGTAAAAGAAATT
GGTACATTTTTAAGTAAAGAAAATGTATGTATAAAATACCTTATAAACAATGCTGGTTTTGCAAAATTCT
GTTCATACAATGATTTAAGTATAGATGAATCTATTAATATGATTGATTTAAATATTAGTGCTGTTGTAGT
ATTGGGACTTATATGTATTCCATATATGCAAAAGGGAAGCCATATTATGAATATTTCTTCACAAGCATCA
TTCCAGCCATTGCCATATCAAAATATTTATAGTTCAACTAAAGCGTTTATAAGAAATTATACAAGAGCAT
TAAATGTTGAACTTAAGAGTAAAGGGATAAATGCAATTGCTGTATGTCCAGGTTGGATGAGTACAAATCT
ATTTAAGAGAGGTATAGTTGTAGCTGAAAAAGGGACAAAAAATTTCCCAGGCATAGTGTCTCCAGACGTT
GTTGCCAAAAAAGCATTGAAGGATGCAAAGAAAAATAAGGATATTTCTGTGTATGGTATAAATACAAAAT
CCAGTCATTTATTAGCAAAACTATTGCCACAAAAAATGATGATGAAGGTTTGGTTAATGCAACAACATAT
TAAGGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c764472-763597 hypothetical protein CDR20291_0618 [Clostridium difficile R20291]
GTGATTGTAGATTATTTATATAATCTAATATTTTTAGAAGGTGGTGTAATAACTTTGAAATTAAAAATTG
TTGGTAGTGGCGGTATGTCAATTATTCCAAGTTCATTTTGTAAATGCAAAATATGTGAAGAAGCCAGGCA
AAAAGGCGGAAGATATGAACGATTAGGACCAAGTTTATATATTGATGATATAAAAATGCTGATAGACACA
CCTGAAGATATTACAGTAGCTTGTAACAGACAAAAAATATCGGAAGTAAAACATATTTCAATTTCTCACC
ATGACCCAGACCATGTTAAGGGTATTAGAATTGTCGAAAAAATAGGATGTGACTTTATCACAGGAGAAAA
TAATCCAATTGGCTTTTATGCTCTTCCTGAAGTAATTGAAGATATAAACCGAACGAATCTCGATTGTCTT
AAATATTATGGTGATGTTATAAATTGCATTTCTATTAATGAAACTTCGCATGTAAAGATAAATAATTTTG
ATATTGATTTGATTAACAATAACCCAGACAGGAATATAACCTTCTATGTTATCAAAGAGAATGAAAAAAA
AGTCATATATGCCTGCTGTAATCCCAAGCCATTTACTCATAGTGATATGTACTTTGATGCTGATGTTTTA
ATAATAAGTCTAGTTTCTGATGATGGTATATTAAATGATGGTACAAAACTTGAAGACACACCATTTAAAG
ATGAAATATTTACTTTAGATGAGATTGTTGAAATTAAAAACTATTATAGAATTAAAAAGATTATCATTAC
ACATATTGACGAAATGTGGGGAAAATCATATGGTTATTACAGTGAATTAGAAAAGAAACTTGATAACATT
TATTTTGCATATGATGGTATGGAAATTATAGTCTAA
>ref|NC_013316.1|:c765961-765143 MerR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAAGATAGGCGATTTTTCAAAGCTAAGTAAAATTAGTATTCGTATGTTACGTCATTATGATGAAA
TAGGACTTTTAACTCCTTCTCATACGAATAACACTAATGGATATAGATACTATAGTGCAGACCAACTTTC
TACTACAAATAGAATCCATGCACTAAAAGATATGGGCTTTGGCTTGTATTCTATAAAAGAAATTTTGACA
GAATATAACGATAAAGAAAGTCTTATAAAATATCTAAATATCCACCATTCTCAAGTAAAAGAACAATTAG
AAGATACACAGAAAAAACTATTAAAAATAGAAACCACTATTAAAAGAATTGGAGGAAATGATATTATGAA
AAATTATGATGTAACTATAAAGAATTTTGCACCAAAATATATGATGACACTTAGAAGGGTTATACCAACT
TATCAAGACGAAGGAATGTTATGGCATCAAGCATTTTTAGAGACAAAAGACCAGAATGTTCAAATTGAAC
CCCCAAAGTATTCTAAAGCAGTCTTTTATGATACTGGATATAAAGAAGATTCTGTAGATGTTGAAGTACA
AGTTGCTGTATCTGGAAAGTATAAAGATACTGAACATGTTAAATTTAAGACTGTTCCAAGTGTGACTGCT
GCAACTGCAATTGTTAATGGAAATTTCAATCAAGTTGCAGACGCTTGTGAGGCTATTGGTAATTGGATAT
CAGATAATAACTATGATGTGGATGGTCCTATGTTTAATATTTATCATGTAAGTCCTGGCAACGATAGTAA
TCCTGATAATTGGGTAACAGAGGTATGCTTCCCAGTTAAAAAGAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:766129-766710 TetR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGTAATGATAAAGATGCTAGAGAACGTATAATTGAAGTTACATTGAATCTTTTAAATGAAGTAG
ATGATATTGAGGAGATTACAGTTAGAAAAATTGCTGAGCGTGCAAATGTTGGAGTTGGTTTAATAAATTA
TCATTTTAAAACAAAGGATAATTTGTTGAGTACTGCCATAGGAGATGTGATGTCAAATATAATAGCAGAG
CTATATGACGATAGTGTATATACTCTAAGACCTATTGAAGATTTGAAAAATTTATTAAAAAAATTGTGTG
ATACTGGATTACATTATGAAAAAGTGCTTCCTTTTGTGTTGAATCAATGTATAACCAATGGAGATATGCA
AGCAGAACTTGATATTGTCCCTATGCTTCGTAAAATTTTTGGAAATAAAAAAGATGAAATGAGTCTAAGA
ATCATTGCCCTGCAAATTATTTTACCAATACAGATTTCTGCTTTATCTACAGAATCATTTCAGTTATACA
GTGGTATAAATATAAAGAATAAATATGAGCGAGATAAATTCATTGATATTTTAATAGAAAATATTATTGG
AGAGGATGTTGATGTAAGATGA
>ref|NC_013316.1|:c768807-767065 putative exported peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGGTTAAATCCAAGAAGAAAATATTTGTTTTTCTAATTTTAATTGCAGTTTTTATTATATTTGCATCAT
ACATAAGAAATTATACTAATGATACAAAAAAAGATTCTGTTAGAGGAACTATTCCTTTTGAAAAAATGGA
ATATAAGCGTCCTAATATACAGTCAATTTGCGAAAACATTAACAAGTGTAACGACAAACTTTTAACAGCT
AAAACAGCTAAGGAACAATTAAATTTATTTAATGAAGTTGATAAAATTTATCAGGATTTTTACAGTACAC
TTACTATAGCAAAAATTAGAAATAACATAGATTCATCAGACGAATTTTACTCTAAGGAATATAAGTATCT
TATGAGTAAATCAGTAGATGTTGACATGTCATACAAAGACTTTCAAGATAGATTTGTAACTTCTAAATTC
TCTAAAGAATTAGAAAAAGAACTTGGAAAGGATACATTTAATTATCTAAAGAACATTGGAAAACTTAATT
CTAAAGAAGTTGAAGATTTACTTAAAAAAGAGCAAGACCTAGTTGTAAAATATGAAGACTTATTAGCTAA
ATCTACAGTATCAATAGATGGTATAGAGGTAGACTTTGAAGAAGCCTTGTCAAGACCAAATCTTAGCCCT
GAAGAATATGTGAAAATTTATTCAGATTACTTAAAAAAATACAATCCTATATTTGGTAACATATTCTTAG
AACTTATACAGACAAGAACTGAAATAGCAAGTAAGCAAGGATTTAAGAATTATATAGATTATGCCTATAT
GAACCTAAACAAAGACTATTCTCAAGAAGAAGCTAAAAAATTTAGACAAGATGTAAAAGATTACATAGTT
CCATTATATAGAGAGATTTCATCTAAACCATCTGATTCTTCTATTTATATTAAAGTATATAAAAATCGCT
CATTTAGGAAGTTTGATAAAGTACTTGAAGATATATCTCCAAAACTAAAAGAGAGCTTCGACTATATGAA
AAAATATGACTTGTACGATTATTCTTCTGGAAAAAACAAATCGCCTGGAGGATATACTACTTATATAAAT
AAATATAAAGCACCTTTCTTGTTTAATACATGGGACAATTCTTTTTTAGGTGTTACTAGTTTTGCTCATG
AGTTTGGTCATTTTTATAATTACTACAACAGTATTAACTTAAATAATAAGATGCAACCAAGTATAGATGT
ATGTGAAGTTCATTCAACATCTTTAGAAATTCTATTTTATAAATATTTTGATGATTTTTTTGGTAAACAA
TCTGAAGCTATAAAAAAAGAACACTTATCGATTGTTTTAAATACTATTATTGATGCTTGTCTTTATGATG
AATTTCAAGAAATTATATACAAGAATCCATATATGAGTCTAAATGATATCAATAAATTGTTTTTTGATTT
AGAGGAAGAATATGGAGTTTCCAATAATATACTTAGAGAAAAAAATGCTCCTTTTTGGATACTTGTATCT
CATAACTTCCAAGTTCCTTTTTATTACTTGAGTTATGGTCTTGCATCTGATGTATCACTTCAGATATGGC
AATTATCACAAGAAGATTACAGAAAAGCTGTTGATGTATATATGGATTTTTTAAATCAAAATACTGATGC
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AGCTCTACTTTATATGATTATTTTGGTATAGATAATCCACTTGAACTAAAAAATGCTTCTTAA
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TCCCGATAGCGTCGCAGAGTGGAGAGAGTATAGGCTTATTAAATGCTCTATTTACGGCTACTTCAGCGGT
TTGTGTTACTGGTCTAGTTATGGTAGATACAGCAACTTATTGGAGTTTATTTGGACAGATAGTTATAATA
ACATTGATACAAATTGGTGGTCTTGGATTTATGACCGTAGCCACAATGTTTTCACTTATGGCACGAAAAA
AAATACAACTAAGAGAAAGATTATTAATACAAGAGTCATTAAATCAAGCTGATTTATCGGGACTTGTAAG
ACTTACAAGATTTGTATTAATAATAACCATAACAATAGAGGGAATAGGTGCACTGGTTTTATCAACTGTC
TTTATTCCACAATTTGGTTTGTCTAAAGGGATATGGTATAGTGTATTTCACGCAATATCAGCGTTTTGTA
ATGCCGGATTTGACTTGATGGGCAGTGTAAGTGGCCCATTTACATCGTTAAATTCTTATGTAAACAACTT
TACAGTATCAATGACTGTTTGCGCACTTATAGTGCTTGGAGGGCTAGGATTCCCTGTTGTACTTGATATT
GTAAGAAAAAGAAGATTTTCAAAATTAAATGTGCATTCTAAGGTTGTATTGTTTTCAACTGCTACACTTA
TTTTTGTGGGTGCATTATTTATTTTTCTTATAGAATTTAATCAAAAAGCTACTATGGCGGACTTGCCTTT
AAAGGGAAAAGTACTATCAGCAATATTTCAATCAGTAACAGCAAGAACTGCTGGTTTTAATACACTTGAT
TTAGCTACTTTACGAGAAAGTAGTGTATTTGTAATGATAATTTTGATGTTTATTGGAGCATCACCTGCAT
CAACTGGTGGGGGTATAAAAACAACAACACTAGCTGTTTTAATCATTACAGTTAGAAGTTTTCTATCAGG
AAAATCAGATATAGAAGCTTTTGAAAGAAGATTAGCTCCATCAACTATAAAAAAATCTCTTGGTATATTT
GTAATCAGTATATCAGCAGTTATTTTTGGAACATTGATTATTTCAATAACTCAGCCTAATTTTACATTAG
TTCAATCAGCTTTTGAGGTTACATCAGCACTTGCTACAGTTGGTTCAAGTTTAGCTGGAACTCCAAATTT
AAATGCTTTAGGTAAGATTATAATAATAATCTTTATGTTTATGGGTAGAGTTGGTTCTCTTACTTTATTT
ATGGCTATACTTTCTGGTGGTAGAAGAAAGAGTCAACCAATCAGATATGCAGAAGGTAAAATTATGGTTG
GTTAA
>ref|NC_013316.1|:770923-771594 putative cation transport protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGCAATATATAGTCATTGGGTGTGGGAGATTTGGAAGTTCAGTTGCGTCTACTATGCATCTTTTAG
GACATCAAGTAATGGCAATAGACAAAAATGAAGATTCAGTTCAAAGTATATCTGACAAGGTAACCCATTC
ACTTATAGTGGATGTTACTGATGAGCAAGCGTTAAGGTCATTAGGTTTAGGTAACTTTGATGTAGCAGTA
GTTGCAATAGGTTCTGATATAAGGGCATCTATAATGGCGACTCTTATAGCCAAAGAAATGGGTGTAGAGT
TGATAATATGTAAGGCAAAGGATGAATTACAAGCTAAAGTGCTTTATAAAATTGGCGCAGATAGAGTTGT
ATTTCCAGAAAGAGATATGGGAGTAAGAGTTGCACACAATTTAGTTTCGGATAATATATTAGACCATATT
GAACTTGACCCAGAGTATTCAATTGTTGAAATCGTAACTCCAAATAGTTGGGTTGGCAAGACACTTATAG
AGCTTGAATTAAGAGCTAGATATGAGATAACTGTACTTGCTATAAAAACAGGTAAAAATATAAATGTTAC
ACCTTCTCCAGATGAGGAACTTACAGCCGGAAGTATCCTAGTTATAATCGGTCAAAATACTAGTATAACA
GCGATAACATCTGGAAATAAGGGGATAATTAGAAGAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:771785-772582 putative RNA methylase [Clostridium difficile R20291]
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ATAGGAATAAAGAGTCAAAGTTCATAATAGAAGGATACAGAATAGTAATGCTTGCACTTGAATGTATGGC
AAACCTTGATTATGTATTTATCAATGAAGAATTTGAAAATAAGAAAGAACATGTAAAACTATTAGAAGAT
TTGGATAAAAAAAACACAAAGATATACAAGACTACTAATAAAAACTTTAAAGAATTAGTGGATACAGAAA
ATACTCAAGGAATAATAGGTGTAGTTTCATTTAAGAAAAAAAAATTAAGTGAAAGTATAAATAAAAAAGA
TAAATTTGTATTGATTTTAGATAGAATACAAGACCCAGGAAATATGGGGACTATAATAAGGACTGCTGAT
TCTGCTGGAGTAGATGCCATAATAGCACTAAAGGGATGTGTCGATATATACAACCCAAAAGTAATTAGGT
CTACTATGGGTTCTATTTTTGATATGAATATAATTGATGCTTCACAAGATGAAACTGTGGACATGCTTAA
ATCATTGGATTTTAATATAGTTTCAAGTTACTTAAATACAGAAAATTTTTATGACAAAATAGATTATGGT
TCAAAAGTAGCATTGGTGATAGGAAACGAAGCAAATGGAATAAATGAAGAACTTGTATCAAAGTCTGATA
TTTTGGTTAAGATACCTATATATGGTAAAGCCGAGTCGTTAAATGCTGCGATAAGCTCTGCTATACTGAT
GTATGAAATAAAAAAATACTTAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:773201-774229 phenylalanyl-tRNA synthetase alpha chain [Clostridium difficile R20291]
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GCATAGAAAGTGTAGAAAGTTTAAGAGTTAAGTACTTAGGAAAAAAAGGTGAGATAACTGCCATACTTAA
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ATTGAACTTAGCATAAATTCTAAAAAAGAAGAAATAAATGCTATTGAAAAAGAAAGAAAATTAAAAGAGG
AAGTGATAGATGTTACTCAACCAGGAAAAGTTTTAAAGGTTGGGAAGAAGCATCCAATAACTCAAATTAT
AGATGAAGTAACAGATATATTTATCGGAATGGGATTCTCTATAGCAGAAGGGCCAGAAGTTGAGACTGTT
GAAAACAACTTTGACGCATTAAACGCTCCTAAAGACCATCCATCAAGAGATATGAGCGATACATTCTATA
TCAATGATGGGGTATTACTTAGAACTCAAACATCTCCAGTTCAAGTAAGAACTATGAGAAGTCAAGAGTT
ACCAATAAAAGTAATTGCACCAGGTAGATGTTTTAGGTCAGACTCGCCAGATGCTACACACTCACCAATG
TTCCATCAGATAGAAGGGCTTGTTGTTGGAAAAGATGTTACTATGGCAGAATTTAAAGGAACTATGGATA
TCTTCGTTGAAAAATTGTTTGGTTCTGATATCAAAACTAAGTTTAGACCTCACAACTTCCCATTTACAGA
ACCAAGTGCAGAGGTTGATGTTACTTGTTTCAAATGTGGTGGTAAAGGTTGCCCAATGTGTAAATATGAA
GGTTGGATAGAAATATTAGGTTCAGGTATGGTTCATCCAAATGTGCTTAGAAATTGTGGAATAGACCCAG
AAGTTTACAGTGGATTTGCATTTGGAGTTGGGGTTGAAAGACTTGCAATGCTTAAATACGAAATAGATGA
TATTAGATTATTATTCGAAAATGATATGAGATTCTTAAATCAATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:774246-776639 phenylalanyl-tRNA synthetase beta chain [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAGTATCTTTAAAATGGCTTAGAGACTATGTTGATATAGACATGGATGTAAAAGAGTTCGCTGATA
AAATGACAATGACAGGAACTAAAGTTGAAACAATAGATTATTATGGTGAAGAAATAGAAAATATATTGGT
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ATGGTTCTAAGTTACCTGGAGGAGTTGAAATCAAACAGACTGATTTCAGAGGTGAATTATCAGATGGTAT
GATGTGTTCAGCAGCTGAACTAGGTATAGATGAACATTACATTGAGGAGTATAAAAGAGGTGGTATATAT
ATTTTAGACCACGAAGATTCTTATGAATTAGGAAAAGATATAAAAGATGTTTTAGGATTAAAAGATGCTT
TAATAGATTTTGAATTAACTTCAAACAGACCTGATTGTAAATGCATGATGGGTATAGCTAGAGAAGCAGC
TGCAACTATAGGAACAAAAGTAAAATATCCTGAAATCGAAGTAAAAGAAAGTGACGAAGAGATAGATTTC
AAAGTTGAGATAGATAATCCAGATTTATGTAGAAGATATGTTGCTAGAATGGTTACAGATGTAAAAATAG
AACCTTCTCCATATTGGATGCAAAGAAGACTTACAGAAGCAGGAGTAAGACCTATAAGTAACATAGTCGA
TATAACAAACTTCGTAATGTTAGAGCTTGGTCAACCACTTCATGCTTTTGATATAAATCAAGTAGAGACT
GGAAGAATAGTAGTAAGAAATGCTAAAGATGGAGAGAAACTTGTAACATTAGATGATGTTGAGAGAACAT
TAGATAAAGATATGCTAGTTATAACAAATGGAGAAAAATCACTTGGTTTAGCTGGTGTAATGGGTGGTGC
TAACTCAGAAATAACTTCTAATACGAAGACTGTACTTTTTGAAAGTGCCAATTTCAAACCAGAAAACATA
AGAATGACAGCTAAAAAAGTTGGTATTAGGTCAGAAGCATCTTCAAGAAATGAAAAAGACTTAGACCCTA
ATCTTGCAGAGATAGCAGCAAATAGAGCTGCACAACTTGTTGAAATGTTAGGAGCAGGAAAAGTTTTAAA
AGGTGTTGTAGATGTATATCCAAATAAACCAGAACCTAAAAAATTGGTAGTAAATCCTCAAAGAATTAAC
CACCTATTAGGTGTAGATGTACCAATGGAGCAGTTTGTAGGAATTTTAGAATCATTAGAGTTTAAATGTA
ATTTGGTAGCTAATGATAAATTAGAAATAGATGTACCAAGCTTTAGAACAGATATGGAACAAGAAGCTGA
TGTATGGGAAGAAATAGCTAGAATTTATGGATTTGAGAATATACCTTCTGTACAATTAGAAGGAAATACG
ACAGCAGGAATTAAAACTTCAAAACAAAAATTCATGGATGCTTTAAAAGATAATTCAACTGCTGTAGGAT
TAAATGAAATATTAACATATTCATTTGTAAGCCCTAAGGGAGTCGATAAGATAAGAGTACCAGAAGGTAA
TGCTAAGAGAAACTTTGTTAAATTACTTAACCCATTAGGAGAAGAAACTTCTGTAATGAGAACTACTTTA
ATACCAAATATGTTAGATGTTTTATCAACTAATGTATCTCATAAAATAGAAGAAGTATCTGCATTTGAGT
GTGGACATATATTCATCCCACAAGATTCAGAATTACCTAAAGAAGAAAATAGAATGTGTGTAGGTATGTA
TGGTAAAGATGTTGACTTCTTTGCACTAAAAGGAACTATAGAAACTATACTTGTAAATGTCGGATTTAAA
GGTTATGAAATTGAACCTCAAGATAATAATACTACCTTCCACCCTGGTAGATGTGCTAAAATAGTGTATA
ATAATAAATATGTAGGTACATTAGGTGAATTGCATCCAGATGTTATAGAAAACTACAATCTAGGTCAAAG
AGTTTATGTCGCTGAAATAGATATTGACTTTGTATTTGATAATTCTGATAGAACAAAGAATTATGTGCCA
TTACCAAAATATCCATCTACATCAAGAGATATAGCTCTTATTGTTAAAGATGATGTATTTGTAAAACAAA
TAGAAGATATAATAAAGGAAAATGGTCAAGGATTAGTAGAAAGCTACAAGTTATTTGATGTTTACAAAGG
TTCTCAAATAGAAGCTGGATACAAGTCAATTGCGTATTCAATAACTTATAGAAGTAAAGATAAAACTCTA
ACAGATGAAGATGTAGCTAAGGTGCATGATAAGATATTAAGTGAATTAAGCGAAAAATTAAATGCTAACT
TAAGATCAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:776646-777254 hypothetical protein CDR20291_0627 [Clostridium difficile R20291]
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AAACCCGAAATTGAGCTTATCAGTTGCTGCGATACTAACTGCATTAAATATATCAGACCTTTTATTTGAA
TGTTCAGATGAGAATGAGAAGTTGATTAAAGCTAATGAAGAATTGAGTAAGAAGGTTGGAGCATCTAATG
AAGAGCTTCAATTAGAAATCAAGTCTTTAAAGCTTACGATAGCAGAAAAAGAAGCAGAAAATCGTGAAGC
TGAGACTAAGATGAAAGAGTTAATTGAGATTATAGAAAATAAAAAGCAAGAAATATTCGAACTTAGTAAT
ACGACAGAAGGTTCTAGAGCAGAGTTAGATGTTTATAAAAACAAGATTGAGGAGTTAAGTACTCAACTTG
AAGAAGCAAATGAAAGAGCTACTATAGCTGAAAACTTAGCTTCTGAGTTTCAAAACAAAGCTTATGATTT
ACAGTTAAAATGTACAGGGTTAAATAATGATGCAAAAAATGTGGAATAA
>ref|NC_013316.1|:777596-778279 hypothetical protein CDR20291_0628 [Clostridium difficile R20291]
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TGGATATTTATACTTATGTGGTAAGAGGTAAAGTCTTTGCTAATGCACAAACTGGAAATATAGTTTTATT
TGGGCTTAATATAGCAGAAGGTAATGTAAAGGAATCATTTTATTATTTGATTCCTATTTTGGCATTTATG
TTAGGTGTATTTATAGCCGAGAAGATAAGAAAGTATTTTACAAATAATAAGACAAAGATTCATTGGCGTC
AGGTTATCATTATAATTGAAATGATTACAATACTTATTGTTTCATTTATTCCTAGAGGAAGATTTAATAT
GTTTGTAAATGTTGCTATTTCTTTTATTTGTTCAATGCAAGTAGAGAGTTTTAGAAAAGTAAATGGGAAT
AGTTTTGCAACGACAATGTGTACTGGAAATTTAAGAAGTGCTACAGAAACTTTATTTCATTATATACATA
CTAAGAATATTTTTATGATAAAAAAGAGTTTACAGTATTATGCTATTATTATATTCTTTATATCTGGAGC
TATTTTAGGAACTTTTTTTACAAAAATTTTCGTGGAAAAATCAATACTAATATGTTTTTTTATTTTGGCA
GTGGTCTTTGGAATTATGTTTATCAATAAAGATGATTCATTTAATGAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:778771-781389 protease [Clostridium difficile R20291]
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GCTGATTGAGGCTGTTAAATACTCTCATATAAGGGGAGTGCAAGTCTTTGTTACTGTAAATACATTGATA
AAACAGTATGAAATAGAAGATTTTGTAGAGTATGTAAAATTTTTATACGATATAGATATTGATGCTTTAA
TAGTACAGGATATAGGAATGGCAAGACTTATAAAAAAACTATTACCTGACTTTGAACTACATGCAAGCAC
TCAAATGGTAGCACATTCCTTAGAAGATGTAAAATACCTTCAGAGTGTAGGGTTTGATAGAGTTGTTTTA
GCAAGAGAATTAAATGTTGATGAGATAAAATGGATTTGTGAAAATACAACTGTAGATATAGAAGTTTTTG
TACATGGAGCTTTATGTGTATGTTACTCGGGTCAATGCCTTATGAGTAGTATGATAGGCAATAGGTCTGG
AAATAGAGGTAGGTGTGCACAGCCATGTAGACAAAAGTATGAGTTGATAGATATAAATACAGGAGAAGTA
GTAAAAAGTAATGGAGATTATTTGTTGAGTCCTAGAGATTTAAGTACTATAGAAGATTTGGATAAAATAA
TTGAAACAGGTGTATTATCTTTAAAAATTGAAGGGAGAATGAAAAAACCAGAGTATGTAGCTACTGTGGT
TTCAGGATATAGAGAAGCGATTAATGAATTTGTAGATAAGAAAAAAATAAGTATTTCTGAGGAAATAATA
AATAATTTGTATACCATATTTAATAGAAAGTTTACAAAAGGATATATATTAGGTGAAGTTGGTAAGGATA
TAATGAACTCTAATAGACCTAATAATCAAGGGCTATATATTGGAAAAGTTTTAGATTATAATAGAAAGAA
CAAAAGACTTAGAGTAATGCTAGAAAATACGCTTAAGAAAGGTGATGGAATTAACTTAGGTGGAGGTACT
ATTGGAAGAATAATAAAGGATGGAGAGATAACTACAATAGCACATAAAGGGGATTTGATAGAATTAGATT
TTGTTGGAGAAGCAAAGAGAAATCAGCTTATATATAAGACTTCTGACAGCGAATTAATGAATAGAGTACA
AGCTACATTTCAGCAAGATAAAGAGTTCATAAAAACTAATATACGTGCAAAAGTGAGTATTAAACTAGGT
AAAAAGCCAGAGCTTTTTATAAGTGATTTTTGTGGAAATAAATCGGTGGTAGAAGGAGACAAAATAGTTG
AAAAAGCTATAAAGGTGGCTTTAAGTAAAGAAAAAATAGAAACACAAATTCAAAAGCTTGGAAATACACC
ATATAAGTTAAAAGAGATAGAAATTGACCTGGATGAAGGTGTAAGTATGCCTATAAGTGTGTTAAATCAA
ATGAGAAGGGATTGTATTGAGCTTTTAGATGAAGAAAGAATAAAGATAAAAGATAGAAAATTTAAGAAGA
ATAGATTAAAATACCAACCAAATAGAGTAAATAAACAGAAAAAACTTGATACAGTTCCTAAGATTAGAGT
TAAAGTTAAGAACTTGGAGCAATTAGAAGCAGTATTAAATTATAATGTAGATTTAATCTATTATGAAGAT
ATAAATACATTATCAAAAGCTTTACAAATGGCCTCAAGTATTTCTATAGATTCAAGTATTTCTATAGATT
CAAGTATTTCTATAGATTCAAGTATTTCTATGGATTTAGATACTTCTTCGTCTTTAGGTATTCCTAAAGA
ACTAATGGGTTCAAATACAAATAACATAGATACTTTGTCAAATACAAGTAAAATAGATACTTTGAATAAG
AACCACTATAATACAGCAGTCACTGACAAAAAATTAATCTATTCAGCACCAAGGATTGTTAGAAATAAAG
AGTACAAGCAATTTGAGATATTGGATAATATAAAAGGAATTAATAAGGTTCAAATTGGTAACTGGGGCTC
TATGGAATACTTTAAGAAAAAAGACTTAAATATAGATTGCTACTTAAATGCATTCAATAGTGAAAGTATA
AACCACTTCAAAGAAGAGGGAGCAAGTACAGTTTGTTTGTCACAAGAACTAAACTTAAATGAAATTAAAC
AAACTTTAAAATATACAGATGTAGAAATTGAAGCAGTAATATATGGATATGCTCCTATGATGGTTACAGA
ATACTGTCCTATGGGAGTAGTTGTTAGAGATTGTAAAAAGGACAAGAGAGTTGCTAAATGTAAGGAAAGT
AGTTATGCTTTAAGAGACTTTACGGATGCAAGTTATAGGATAACACAAGATATATTCTGTAGAAGTACAA
TTTACAATTCGAAGGTTACTTGTATGTTGGACAATCTATATGAGTTAGAGGAAATTGGAATAGATGTATT
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CAGGACACTACTATAAAGGTGTAGAATAG
>ref|NC_013316.1|:781493-782071 putative phosphohydrolase [Clostridium difficile R20291]
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CTGTTGAAGCTGTTATGAGAGAATTAGCCAAAAGACTAGAGCCAGAAAAAGAAGAAGAGTGGGCAGTGGC
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ACAACAACAGTAGAACTGCTTAAAAAAGAAAACTTCGGTGACGAAGAAATGTATAGAGCAATACTTGGTC
ATCATGATGGAATGGGAGTTACAAGAACTAGCTTAATGGAAAAAGCAATATATGCAGCAGACCCTATAAC
TGGGTTTATAACTGCTATAGCTTTAGTTTATCCAGATAAAAAACTTACTAGTGTAAAGACTAAGTCTGTT
ATTAAAAGAATGAAAGAAACGAGATTTGCTTCAAATGTAAATAGAGATGCAATGAGAAGTATAGAAGATA
TAGGGATTCCATTTGATGAATTTGCAGAACTTTCTCTTAATGCAATGAAGAATATAAGTGATGTGCTTGA
AAGTGCTGAAAATAATTAA
>ref|NC_013316.1|:782105-782581 putative DNA repair protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACTTACAACTATTTGTTATATAGAAAAAGATGACAAGACTTTGATGTTGTACAGAAATAAAAAGA
AAGATGATATACATGAAGGTAAGTATGTAGGAGTTGGAGGAAAGTTTGAGCAAGGAGAGACTCCAGAAGA
ATGTGTAATTAGGGAAGTAAAGGAAGAGACTGGTCTTACTCTTAAATCATTGTCATATAAAGGGTTGATA
ACTTTTCCAAAATTTAAAGATGAAGAAGATTGGTATATGTTTTTGTATTTCTCAGATGAGTTTGAAGGTG
AATTGTCTGAAAAAGATTTAAATGATTGTAAAGAAGGAAATTTAATTTGGGTTGGTAATGATAAAATATT
CGATTTAAATATGTGGGAAGGTGACAGGTTGTTCTTAAATTGGGCTAAGACTGGAAATATCTTTAGTGCA
AAGATTGTATATGATAATGGGAAACTAAAAGATTATAATGTAAGTTTCTTAGATTAA
>ref|NC_013316.1|:783100-783921 putative reductase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGACATAAATTTAGAAAAATGTGTAGGCTGTGGGATGTGTGAATCAGACTGTCTTGTAAATGCAA
TAAAAGTTAAGGATGATAAAGCAAAGGTTAAAAATATTCTCTGTATTAACTGTGGTCACTGTATGGCAAT
TTGCCCAACAGATGCAATAGAAATGCAAGGATTTGATAAAAATGAAGTAATAGAATACAATCGTGAAAGT
TTTGAATTAGAACCCGAAAAGTTATTGAATTTTATTAAATTTAGAAGAAGTATAAGACAATATAAAGATA
TAGAGGTAGAAGAAGAAAAAATAAAAAACATAGTGGAAGCTGGTAGATACACACCAACAGGTGGTAATAG
ACAGCCTATAAGATACATATTAGTAAAAGAAAAGCTAAAAGAAGTGAAAGAACTGGCAATACAAGGTCTT
TATAATTTGGCATTAGATACTGATGACAATGACCCTGTACGTTCTATCTATAAAAATACATTTAAGAAAA
TGTACAAAAGATATAAAGAGAACGGAAATGATTCTTTATTTTATGATGCCCCACTACTTATGATAGTTGT
AGGTGATATGTCTCTAGGTGGAAGTGCTTATGTAGATGGAGGATTGGCTGCATCTAATATGGAACTTATG
GCCTATTCTCAAGGATTAGGAATTTGTTATAATGGATTTTTTGTTATGGCATCAAATGTAGAGCCAAAGA
TAAAAGAACTGTTAGGAATGAGCGAGAACGAAGCAGTTATCACTTCATTTATATTGGGTTATCCAGATGT
GAAATATAAAAGAACTGTAAATAGAAACACTGCTAAATTTGAAATGAGATAG
>ref|NC_013316.1|:784144-786657 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGATTGTGTAGTGAATTTAAAAAAATTACTTTTATTAATTATTGTAATTACATCTATATTCACTT
CTTGCATATTTTCTTTTGGTATCAATGCTATAGGTAATGATAATCGTACCATTCGTGTTGCTTATCCTAT
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ATTGCACAGTATACTGGATGGAATTATGAATTTGTTCAAGTTCCTGGAGAGATAAATGAATCTATTACAA
AATTAATGAAGATGTTAGAAAATGGTGAAATTGATATAATGGGAGGTATGTTATACAATGAGCCAATGCA
AAAAATATATAATTATGCGGGAAACAGTTATGGAGTAGCAAATACAGTACTACAAGCATTATATGAAAAT
ACAGATATTGATAACATAATGAGTTCGCAAGATGTGAAAAAAATTCGTATTGCTGTAATAGAAAATTCTG
ATACTAGGCTTAAAGAATTAGATGAGTATTGTAAAATGAATCTTATGTCACCTGAATTGGTATATTGTAA
AACAAGTGACGAGCAATTAGAAGTACTAAAGAGTGGTAAAGCAGATGTACTTCTTAATGTTAGTATGAAC
CCAATAGAAGGTGTGCGTACTGTAGCAAAATTCTCATCAAAGCCATTTTATTTCATTACTCCAAAAGGCA
GTACAGACTTAACTCAAAAGCTTAATTCAGCAATTAATAATATTGAACAGAAGGACCCATATTTTTCAAC
TACTTTATATGAGAAATACTTTACGCCAGAGAATAATCAAATGTTTTTATCTGATGAAGAAACTAATTAC
ATTAAAGATACAGAAAAATTAAAAGTAGGAGTACTTTTAAACAAACCACCGTTTCAAAATGCAGATAAAG
ATACAGGAGAATTAAGAGGTATATCAATTGATTTGTTAAATCATATATGTGATAAAACAGGTTTGGAATT
TGAACTTGTGCCTGTAAAATCTCAAGAAGATTTGGAAGATATGGCTAAAAAACATGAAATTGATATTGTA
GCAGGAATGATTTATGATTATGAGTACTCTCGTGAACATAATATAGCTATGTCTCGGCCTTTTCTTTCTA
CTCAATATACTATGATGATTAATAATAAATTAAATGAGAATAGTCTAAATGGAAAGCGTATAGCTCTAGC
CAAAGGTATTGATTATTATGGTCAGTTTGAAGAAAATATAGTTTGGTATGATAATTTAGAAGAGTGTATA
GAAGCTGTTAATAAAGGCTATGCAGATTACACTTATGGAGAAGGTTATTCTATGCAGTACTATATGAATC
AACCTAAGTATAAAAATGTGCGCCTAGTTCCTCAAACTTATGAAGCAAAGAGTATTTGTTTTGGCATAAT
TAAAAAAGATAAACAAGAATTATTGAATATATTTAATAAAGCTATTATAAGTATTTCATCAGAAAAAATG
CAATCAATTGTCTACCAAAATACTACATATAGACAAGATTTCTCGTTGCTTTATATTATGCAACAGAATC
CAATTGAGACTATTTTTATTGTAGCAAGTTTATTAATTTGTATTATTGGATTTATGGCATTTGGTTTACA
TACTCGTACAAGTATGAACGAAAAGATATCTTTGGAACTCAAAAAACATACTCAGTTGTATGAAATGACA
AGTGAATACTTTTTTGAGTATGATTATAAGCAAGATAAATTGATAATTTCTATGCCAGAAAAGGGTATTG
AGACTTATTATGGTTTGGATAAAAGTGATAAGGAAAGTGAAAATGGCAATATAGAAAATGAAAGAGATAA
AATAAGAAGAGAATATAATAAAAAGTTTTTTGATGTAATAAAATCACAAGAAAATGGGACTACTGAAATG
TATTCTATCATGCTTGATGATACTTTTCATTGGATTAGAATTACTTCAAAAATAATTTATAATGATAGAA
AAATACCAATGTATGTAATTGGTAAAATAGCTAATATTGATTCTGAAAAAGAGGAAAAGAATAGATTGTT
GGATAAAGTTCAAAGGGATAGTTTAACAAATATTTATAATGCAGCATATATTAGAAAATTAACTACACAA
AATTTATTAAATTTATCAACTGAAAAAAATGGAGCTTTATTGATTATAGATATTGATTATTTTAAGTCAA
TTAATGATACTTATGGTCACCTGGTAGGAGATAAAGTACTGATTGATGTTGCAAAGGTACTTGATGAAAG
TTTTGCAAAAGATGATATAGTAGGTCGTTTAGGTGGAGATGAATTTAGTGTTTATATAAATGATATAATA
AATAAGGAAGAACTTATCAATAAATGTAATGATGTATACAATCATATTCATCTCATTAAGTTGCCAAATG
GAGAAAGTTTATCTATTAGTATGGGGGTAGTTATAACAAAGCGTGGTCAAGAGTATGATGAACTGTATCA
AATAGCAGATAATGCTCTTTATGATTCTAAGAGACAAGGAAGAAATAGATTTAAAATAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c788312-786861 putative aminoacyl-histidine dipeptidase [Clostridium difficile R20291]
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CTAGAGGTTCTGGAAATGAAAAAGGCATAAGTGATTTTTTACTTAGCTTTGGTAAAAATTTAGGTCTTGA
AACTATTCAGGATGAAAGCTTAAACATAATAATAAGAAAGCCTGCTACAAAAGGATATGAAAATTGTCCA
GGTGTAGTTCTTCAAGGACATATGGATATGGTTTGCGAAAAAGAAAAGAATGTTGAACATGATTTTCTTA
AAGACCCTATAAAATTAAGAATTGATGGTGACATGATATATGCTACTGGAACTACTCTAGGAGCTGACAA
TGGTATAGCTGTTGCTATGGGTATGGCTATATTAGAAGATAATACTTTAGAGCATCCTGCACTAGAAGTT
TTAGTTACTGTTAATGAAGAAGATGGTATGAATGGTGCAGATGCACTAGACCCTAGCTTAATTAAAGGTC
AATATATCCTAAATATGGACTCCGAGGAGGAAGGATACTTATTAGTTAGCTGTGCTGGTGGTAAAACTTG
TGTTGTTAGTTTACCTGTTGAATACAAGGAAGTTAAAGGTGACAAACAAGGATTATTAGTTGAGGTTACT
GGACTATTAGGTGGACACTCTGGTATGGAAATTGTTTTACAAAGAGCAAATGCTAACAAAGCAATAGCTA
GAGTATTAAGTGTATTGAATGTTGATTATGAATTAGCTTCTGTTGATGGTGGTACTAAGCACAATGCTAT
ACCTCGTGAAGCTAAATGTGTAATAGCTGTTAATAAAGCTGATGTTGAATCTGCTAAAAAACAAATAAAT
GACATTTTAACTGCATTTAAACATGAGTTTACTACTTCTGACCCTGGCATGACTTACTCAGTAGCTGAAA
CTTCTGTAGACAAAGTTCTTACTAAAGATTGTAAAGAAAAAGTTGTTCAAATGTCTTGCTTAACTCCTCA
TGGAGTTCAATCAGTAAGTCTTGATATAGAAGGATTAGTTGAAAGTTCTACTAACTTCGCTATAATTGAA
ACTAAAGAATCTACTATTGAATTTTTAACTTCTGTTAGAAGTTCTGTTATGTCTATTAGAGATGAAATCG
CTGATAGAATAAGACTTTTGGCTCAAGCTTTAGGTGCTAATTACGACCTTATAGCTCAATACCCAGCTTG
GGAATTTAAAAAAGGCTCAAAATTAGAAAAAATATGCAGTGAAACTTATGAGAAATTAACTGGTAAAGTT
CCTACTGTTATGGCTCTACATGCTGGTCTTGAGTGTGGATTATTACTTGATAAACTTCCTCATGCTGAAG
CTATCTCTATAGGACCAGATATGTTTGATGTTCATACTCCAAATGAACATGTTAGTATCCCTTCTGTAGC
TAATGTTTGGGATTATGTTATTGAAATATTAAAATCTATGAACCAATATTAA
>ref|NC_013316.1|:788629-791007 putative DNA mismatch repair protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGAGAAATCGTTAAGAGTTCTAGAATACAATAAAATAATAGATTTGTTAAAGAAGAAAGCCTCAT
CTTCTTTAGGTCTAAAATATATAGAAAATTTAGTACCAAATACTGATTTTGTAGAAGTGAAATCTATGCT
AGAAGAAACTAGTGAAGCTCAATCAATTATTATAAAGAGAGGTTCAGTAGGGTTGGAAGGTATTCATGAT
ATAGAAGATAAGGTAAAGAGAGCTTATATAGGTGCTTCTCTTGACCCAGGAAGTCTGATTATGATAGCAG
ATACCTTAAGAGTGGCTAGAAGATTAAGAAATAGCTTATCTAGTAGTGATGAAGAAGATTTTAATTATCC
AATAATACAATCTCTATCAAATTCTCTATATGTGTACAAGGACATAGAAGACCAGATATACAATGCTATA
ATTAGTGAAGTAGAAATATCTGACAATGCTTCAAGTACACTTAGAGATATCAGAAGAAGAATAGCCCAAA
AAAATCAATCCATTAGGTCAAAATTAAATTCAATAATAAGTTCAACTACTTATCAAAAGTACTTACAAGA
TGCAATAATTTCTCTAAGAGGTGATAGATTTGTAGTACCTGTAAAATCTGAATATAGGTCGCAAGTAGCT
GGTATAGTGCATGACCAGTCATCTTCTGGTGCGACACTTTTTATAGAGCCAATGACTATAGTAGAGATGA
ACAATGAATTGAGGCAGTTGAAACTAGGAGAGCAAGAGGAAATAGAAAGAATTTTATCAGAGATTTCAGC
TATGGTTGGAGAAGTGAGCGAAGATTTAATCTCTAATCAAGAGATACTTGGAAGATTGGACTTTGCATTT
TCAAAGGGAAAACTTTCTATACAGATGAGAGGAATAGAACCAACTTTAAATGAGGATAAATATTTAAACA
TAAAAAATGGAAGACATCCACTGCTGGATAAAAAGAAGGTAGTAGCAAATACAATTTATTTAGGAAGAGA
CTTCCATACATTGGTGATAACAGGTCCAAACACAGGTGGTAAGACTGTTACAATAAAAACTGTAGGTCTA
TTTGCACTTATGACACAAAGTGGACTTCATATACCTGCTGATTATGGAAGTAGTATGTGTGTATATGATA
ATGTATTTGCAGATATAGGAGATGAACAGAGTATTGAACAGAGTCTATCAACATTTTCATCTCATATGAC
GAATATAGTATCTATATTACAAAACGTAACAGCAGACTCTTTAGTTATATTTGACGAGTTAGGAGCAGGA
ACAGACCCTGTTGAAGGAGCTGCCCTTGCAATAGCAGTATTAGAAGATATAAATTCTGTAGGAGCTAAAT
GTATAGCTACCACTCACTATAGTGAGCTTAAAAATTATGCTCTTACTAAACCAGGTGTAGAAAATGCAGC
AGTTGAATTTGATATAGAAACTTTAAGCCCAACATATAAGTTACTTATAGGTGTTCCCGGAAAATCAAAT
GCGTTTGAGATTTCTAGAAAACTTGGGCTAAGTGATTATGTGATTTCACGTGCTAAAGAATATATAAATA
CAGAAAACATAGCTTTAGAAGATGTGTTACAGAATGTTGAAAAGAATAGAATCAAAGCAGTAGAAGATAG
AGAAGAAGCTGAAAGATTAAAAGAAGAGATTGAAAAACTGAAAGTAGAGTATGACGAAAAACTTGAAAAA
TTGGTCAGTCAAAGAGATAAGATGATTGAAAAAGCTAAATCAGAAGCATTTTCAATTATAAGACAAGCTA
AAGAAGAAGTAGATATTATAATAAAAGAACTTAGAAATCTTGAACAAGAAAGAGCTTCAAAAGAAAAGAA
TCGTAAGATAGAAGAACTTAGAAAAGAATTGACCAGCTCTATGGGAAGTCTTCAGCCAACAGTAAAAAGT
ATGATAGTTCCAAAGGTATCAAATAAGGAGATAAAAGACTTAAAGCCAGGTGAAGAAGTTAAGGTAATAA
CTTTAAATCAAAATGGTAGTGTAGTTTCAGTAGATAAAAAGAGAAAAGAAGCAGTAGTGCAAATTGGTAT
AATGAAGATGACTCTACCTTTTAAATCTTTACAAAAAACACGCAAAGATGTTTCAACAAATGTAACTAAA
TCAACGAGAAACATTATAAGGTCAAAATCTGGTAGTGTAAAAAATGAAGTTGACCTTAGAGGGTTAAACC
TAGAAGAAGCTATAATGGAAGTAGAAAAGTATCTTGATGATGCATATGTGGCAGGTTTAGAGTCTGTAAC
AGTAATACATGGAATAGGCACAGGAGTATTAAAAGCAGGGCTACAAGACATTTTAAGAAGAAATAGACAT
GTAAAATCACAACGAGGTGGTCAATATGGAGAAGGTGGAGCAGGAGTAACAATTGTTAAATTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c791607-791047 hypothetical protein CDR20291_0636 [Clostridium difficile R20291]
TTGCTCTTTTATCTATTTTTATACATCAATATTAGCTTTATATACTTTTTTTACTCTTTTATCTATTTTT
ATACATCAATATTAGCTTTATATACTTTTTTTACTCTTTTATCTATTTTCTATAAATCTTTTTCACTCTT
AATTTTTATTCCTTCTTCTTCTAACAGCCTTGCTGTTATACCTTTCCCTGGTATCTTTTTACCTGAAAAA
CTACCATCATATATTAGATTACATCCACAAGAGGGGCTACCCTCTTTTAGTATTGCTTCGCTACATACAT
ATAAATTTGCTATTTTTAGAGTTTCATTAGCCCCTCTTACAAAGTTTTCTGTTACATCCTTATTATCTTT
AGTAATTACTTTTCCATCAACTATCTCAGCAGGTGGTCTTGGTGTAGATAGACCACCTAACTGCTCTGGG
CATACAAGTGTAAATTCTTTGCCTTTTAAATATTCCTTGACTTTTTCATTTTCATTATTATCGCCACTAT
ATTTACAATTTATTCCTATTAAACATGCAGATACCAATATCATAAAAATGTGCTCCTATACAAATTCTTA
A
>ref|NC_013316.1|:791899-793599 arginyl-tRNA synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAGATTTTAAGGTGGCAATATCAAATTGCCTTAAAGAAAAAATAGAAGATTTATCGAAAGAAGAGA
TAGAGGCACTTATAGAAGTTCCACCAAATAAGGATATGGGGGACTATGCTTTTCCATGCTTTAAATTAGC
CAAAGTGTTTAGAAAAGCTCCAAACATGATAGCAAGTGAATTGGCGGAAAGTATAGAACCAAGTGGAGAG
ATAACAAAAGTAATACAATTAGGCGGATATGTAAATTTCTTTGTAAATAAATCTCAATTAGCAGAAACTG
TAATTAAAAAAGTTTTAGATGAAAAAGAAAATTACGGACATAGTGATTTTGGAAAAGATAAAACTGTAAT
AGTTGAATATTCTTCTCCAAATATAGCAAAACCTTTCCATATAGGGCACATAAGAACTACAGTTATAGGT
AATGCTTTATATAAGATATATGATTCGCAAGGATACAAGACTATAAGAATAAATCATTTAGGTGACTATG
GAACTCAGTTTGGTAAGTTAATAGTGGCCTTTAAAAAGTGGGGAGAAAAAGAAGTAGTAGAGTCTAATCC
AATTCCAGAATTACTAAAATTATACGTAAGATTCCATGATGAAGCTGAACAACACCCAGAAATGGAAGAT
GAAGCAAGAGCATGGTTTAATAAATTAGAAAATGGTGACGAAGAAGCACAAGAATTATGGCAATGGTTTA
GAAATGAGAGTTTAAAAGAGTTTAACAGAGTGTATAAACTTTTAGATATAGAATTTGATTCTTTAGCAGG
AGAGAGTTTTTATTCTGATAAAATGAACAGAGTTATCGAACTATTAGAAGAGAAAAATCTTTTAAAAGAG
TCTAAAGGAGCAAGAATTGTTGATTTAGAAGAGTATAAAATGCCACCAGCACTTATTACTAAGAATGATG
GTTCAACGTTATATATGACAAGAGATTTAGCTGCTGCAATATATAGAAAAGAGACTTATGATTTTGACAA
GTGTATATATGTAGTTGGTTCTCAACAAAACTTACATTTCCAACAATGGTTTAAGGTAATTGAGCTTATG
GGATATGATTGGGCAAAAGATTTAATTCATGTTGGATTTGGTATGGTTGCACTTGAAGAAGGTACTATGT
CGACTAGAAAAGGAAGAGTAGTATTTTTAGAAGATGCTTTAAATCAAGCTATAGATAAAACTAAGGAAAT
TATACTAGCTAAAAATCCAAATGCTAAAAATGTGGATGAAATATCTAAGCAAGTAGGTGTTGGGGCAGTA
GTATTCCAAGAGTTATCTAACAGTAGAATTAAAGACTATACCTTCTCTTGGGAAAGAACGCTTAGTTTTG
ATGGTGAGACTGGACCATATGTTCAGTATACACATGCTAGATGCTGTGCAGTTTTAAGAAAAGCAGAAGT
AGAAGTGACTTCTGATATAGATTATAGTCTATTAGCTGATGAAGATAGTGCAGAAGTTCTTAGAGTTATA
GAATCATTCAATAAGAATATTTTACTTGCTCTAAAGAAAAATGAGCCACATATAGTGACTAGATTTATGT
TAGATTTAGCTCAAGCGTTTAATAAATTTTATCATGACAATCCAATTTTAGTAGAAAATTTGGAAATAAG
AAAAGCAAGACTTGCATTAGTTTTAGCAACAAAACAAACTTTAGAAAATTCTCTGAAATTGTTGGGAATG
CACGCTCCGGAAAGAATGTAG
>ref|NC_013316.1|:793853-794776 hypothetical protein CDR20291_0638 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGACGAATTACTAAAAAAAGTCTACACATCTTCTTTTAGTAGTGCAAGTAGGGCTCTTAAAGATT
TAACTATAATAAATACAAAATCCTTAATAGATGATAAAACGCAAAGATGTGTGTATATAGACGAAAATAG
ACTGAGAGATGAACTTATTTACTATAGATTTTATGGAGAAAAAATAGGAAATATCAATTTTTTAAATATT
TTACTACCACTAATTTTATCAAATACTAATATTCAAAAAAGCGAAGATGAGGTTATTAAACTAATAAAAA
AGTATGTTATTTATTTTAAAAAAGAAGAACTTTTATTTGATTATTTATTAGGTTCTGTAGTGTATAATTC
CATTATGCACAATCTTATAAATAATAGTAAAATAGAGTATGTCGAATTACTACAGAGTATTAAAGACAAG
ATAATAGGATTTTCTATAGAATTAGACAAATCAGATGTTGTAAAGTTTCAGATGGCAAGGATTAAAGCAA
TACAATTAATTGATAAGTACATTGATTTGAAATCTGAAGATTATGATGAAGAAAGTATTTTATTAAATGT
TTTAAATGTTCTATATGATGTATATATGGAAGATAGAACTGTAGAAAATGAAGGAATTAATAGCATAAAA
AAATCTATATTATCCATTTTGGGTGAAGATAGTAAATTAAATGAAGATAATATAGATTTTATTTTTTCTA
TGTCCGAATATGTTGTTAAATTGAGAAAATATAAAATTGGAGTTAAGGCATATAATAAAAGCATAGACCC
AAGAAGTCTTATAAGACTTGAAGAAGGTAATACTATAATAGACCCTATATTTAATCAAATAACAGTTATG
TCGAAAACCTTTAATGATAATATATTAAGCATAAAAATAAATTCTAAATCAGGTATTTATATATTAAAGT
TTAAAAAGGTTTAG
>ref|NC_013316.1|:795123-796877 putative adenosylcobamide-dependent radical SAM superfamily protein [Clostridium difficile R20291]
TTGAAAATTTTATTAACAACATTAAATTCCAAGTTTATTCATACAAATTTGGCTATAAGATATCTAAAAG
AATTTGTAAGAGATTTGATAGAAGTTAATATGAAAGAATACACGATAAACAACGATTTGGACTATATTTT
AAAGGATATATATAAAAATGAATATGATATAATATTATTCTCAACATATATCTGGAATGTGGGAGATATA
GTTAAACTTTGTGATAATCTAAAAAAAATTAGACCTAATACTAAAATAGCTTTGGGCGGACCGGAAGTGA
GTTATGATAGTTATGAGGCAATGAAAAAGTATGATTTTGTGGATTATATACTTTATGGAGAGGGAGAATT
AATTTTTAGAGACTTAGTACTTCACTTGCAAGGAAAGATGAAAATAAATGATGTAAATGGACTTGTATAT
AGACAAGGCAATGAGATAATAGTGAATAAGCCTATGGAATTACTTCAAGATTTGGATGAGATTCCTAGTC
CTTATGAAAACTTGAATCCAAAAGAATATGAAAATAGAATAGTGTATTATGAATCATCAAGAGGTTGTCC
TTTTAACTGCCAGTACTGTTTATCATCTACTATTCCAGGTCTAAGGTATTTTAGTTTAGACAGGATAAAG
AGTGATTTAAAAGCTTTAATAGATGCAAGAGTATCACAGATAAAGTTTATAGATAGGACATTCAATGCAA
ATAGAAAAGTGGCTATGGAAATCATGGATTTCCTTATGAAAAATGATAATGGATATACAACTTATCATTT
TGAAGTTACAGCGTATTTGATAGATGATAAGATGCTTGAGTTTTTGGCTGATTGTAAAGAAGGTCTTTTT
CAATTTGAAATAGGGGTTCAGTCAACGAATGAAAAAACACTTGATGCAGTAGGTAGAAGGGATGATTTTA
AAAAGTTGTCTCATGTTGTACAAACTGTAGCATCTTATAGAAATATACATCAGCACTTAGACTTAATTGC
AGGACTGCCTTATGAAGATTATAAGAGCTTTGAAAATTCTTTTAATGATGTATTTAATCTAGGTATAGAG
CATCTGCAATTAGGCTTTTTAAAGATGATTAAAGGGACAGGTATGAGAAAAGTTGCAGATGAGCATGGTT
TTAAATATAAGGATTATGCTCCATATGAGTTTTTATACAATAATTATATAAGCTATGAAGAAACTTTGAA
GCTAAAGGATATAGAAGATATACTGGAGAGATACTACAATTCTAAAAACTTTGTGTTATCTATGAGATAT
ATTATAGGCAGATTTTATAAACAAAGTCCTTTTAAATTCTTTGAGGTTTTTGCCAAGTATTTTGATGAAA
ATGGCTACTTTGATTTGGCACAAGGAAAGAATCAGTTATATAAAATATTGATGGATTTCTATAATGAAAA
AATCAACATAGATAATGATGTATTCAATGATATATTAAAATATGACTATATATCACTGGGTAAAACATCA
AATATACCACAGTTTTTTAATAAGCTAGATGTGGATGATTTTAAGAATAGATGCCATGTATTTTTACAAG
ATAATGATAACTTATCAACATATTTACCTAGTTTTGTTGATAAACCAGCTAAACATATAATAAAATATGT
TCATTTTGAGCCATTTAGATTTAATGTTGTGGATTTAAAAAATGATATAAATACAGAAATAAGAGAAGTA
GAAAATGTAGTCTTATTTGAGTATGATGATAAAAAAATATTTGAGAAATCTAAAACTCATAAAGTAGAGA
TTTAA
>ref|NC_013316.1|:796895-798037 hypothetical protein CDR20291_0640 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATTTTAAGATAGAAAAATATTTGCTAAAAAAAGCAGAAGAATTAGCTTTTATAACTATAAAACATG
GTGGAGAGTTTAAATTAAAAAGCTATAAAGTGCCAAAAGGCGGATTAGATGTACCTATAAAAAATGAGGT
ATTAGTAAAAGGGATAAAAGAAAAGACTGCTCAAGATAAGTTAAATTCAATGTCTATAGCAGATGCAATG
ATATATATAATTGGAATAGATAGTAAGTTTAAAAACAATGCAGAGTATGAGAAGTTTTTAAATGCTTTAT
CAAAAGATATTGATTTGGATTTGAAATCGTATATGGGATATATGTCGAGAAAATACTTTGAGATTGGTGA
ACATACAGATTCTTTAATATATATAAAAGCATTTATAACAATGTATCCAGATGATTTAGATGCAATGTAT
AACTATGCGATTGTTTGCCAAGAGATAGCTAAACAGTATCAAAAAGATATGGATGATAAGGCAATGAATG
CATTCTTACTTGAAGCCATGGCTAAGCTTGAAAAGGTAATTGATGTTGATGAGAATTTTGCATTAGGTTA
TTATCACTTAGGCTACCATTATTATAATCAAGGTCAATATTTAAAGACTAAGCTGACTTGGGAAGAAGCA
TTAAGGCTAGGGTTAGATGCTGATTTAGTAGCTGAGGTACAAGAGAATCTAGGCAAGATGGACTTTAAAG
TTCAATATGAAGAAGGATATACACTTGTATTCCAAGGTAAGTTTAAGGAAGGATTAGAGAAGTTACTTCC
ATTAGAAGAAGAACATATGGATTGGTGGAACTTGCTGTTTATGATAGCACTTGGATATAAGGGTATGGGC
GAAATAGAGCAGGCTAAGATGTATCTTGAGAAGATATTGATAATAAAGCCTAATCAGGTGGATACTATAG
TGGAATTGGGGCTTTGTGAGGCTTATAAGAATAATTTAGATAAAGCAATAGAGTATTTTGAACAAGCGGC
TAAGATAAAGGAAGACCCAGAAATACTTTGCAATTTAGGAATGGCTTATTTAAATAATGGTGATATTGAT
GATGCAACTTACTATATAGAAAGAGCTTATGAATTAAATCCACAAGATGAAATTACTATTGCTTGTCTAA
GAGAACTTGGAATAAATAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:798358-799269 putative phosphate butyryltransferase [Clostridium difficile R20291]
TTGATAAAAAAATTAGATGATATTTTAGAACAACTTAAGGGAGGAGAGAAAATTGTACTCTCTGTAGCAG
CAGCTCATGATAAAGAAGTTTTAATGGCAATAAAGGATGCTGTAGAAAGAAATATAATTACTCCTATATT
GGTTGGAAATGAAGGCAAAATAAGAGAAATATCAAAAGAAATAGGATTTGATTTAAGTGGTATCAAAATA
GTGGATAAGGATGATATCAAAGAGTGTGCAGAAATAGCAGTTAAATTAGTATCAAGTAAAGAAGCCGACT
TTGTAATGAAAGGATTATTAGATACATCTGTCATATTAAAAGAAGTGTTAAATAAAGACTATGGTCTTAG
AACTGATAGTTTATTAAGTCATGTTATGGTATATGAGTTAGAAAAATACCATAAATTACTTATAACTACA
GATGGAGGTATGAATATAGCTCCTGATTATGAACAAAAGGCAAAGATATTAAAAAATTCTATAAAAGCTG
CAAAAGCTTTAGGAATGGAAACTGTAAAAGTTGCATGTTTGGCAGCTAAAGAGAAAGTAAATCCTAAGAT
GCAAGCAACTGTAGATGCAGATATGTTAGCAAAAGCTTGTAAAGAAGGAGAATTTGGTGAAAATGTAATT
GTAGAAGGTCCTCTGGCTTTTGATTTAGCTGTTTCAAAAGAAGCTAGTGAGATAAAAGGGTTTAAAAGTG
AAGTATCTGGAGATGTAGATATCATATTGGTTCCAACAATAGAGGTTGGCAATGGAATAGGGAAAGCCTT
TACATATATGGCAGACTCTAAATCAGCAGGTATAATTATGGGTGCAAAAGCTCCTATAGTTTTAGTGTCA
AGAGCTGATTCACATGAATCTAAATTATATTCTATTGCATATGGGGCTATTGTAGCTAAAAATATGAAAT
AG
>ref|NC_013316.1|:799876-801795 putative bifunctional carbon monoxide dehydrogenase/acetyl-CoA synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATGAAAAAATGTTAACAATTGATTTAAACAGCCAGAAGATGATAGCTAAAGCTAGAGAAGAAGGCG
TAGAAACAATGTATGATAGAAAAGAAGGCTTTAAGGCACAATGTGGTTTTGGTCTTCAAGGTGTTTGCTG
TAGAATATGTGGAATGGGACCATGTAGAATAAGCCCTAAGACTCCAAGGGGGTTATGTGGAGCAGATGAG
CATACTATAGTAGGTAGAAACTTTGCAAGAATGGTTGCTGGTGGGACAGCTGCCCATTCAGACCATGCTA
GAGATATAGCACATACATTAGCATTAGCTGATCCAAATGGAAACTATAAAATAAGAGACGAAGCTAAGTT
AATTACTTTAGCTAAAGAATGGGATGTAGAGACAGAAGGTAGAGATATCTATGATGTAGCACATGAAGTG
GCAGAAATTGCATTAATGGAATTTGGAAAACCTTTTGGGACATTAAGATTTATAAAAAATGCACCAGAAC
CAAGACAAAAAATATGGAAAGAATACGCTATAGAGCCAAGAGCTATAGATAGAGAAATTGCAACAATAAT
GCACTCTACTCATATAGGATGTACTGGTGATATAGATAGTTTAATACACATGAGTCTTAGAACTTCTATG
GCTGATGGTTGGGGTGGTTCTATGATAGGTACTCGTCTAAGCGATATCTTATTTGGAACTCCAGTGCCAA
GAAGAACAGAGGCTAATTTAGCAGTATTAGAAGAAAATAAAGTTAACATAATATTACATGGACATGAGCC
AGCATTATCAGAAATGATAGTTTTAGCATCAGAAGAGCCAGACTTAGTAGCTTTAGCTAAAGAAGTTGGT
GCTGATGGAATAAACTTAGCAGGTATGTGTTGTACAGGTAATGAGATTACAATGAGACATGGTGTAAAAA
TAGCAGGAGACTTCCATCAACAAGAACTTGCAATAATAACTGGAGCAGTTGAAGCTGTAATAGTTGACGT
TCAATGTATATTCCCTGCATTAGCTAGAGTTGCAGATTGTTACCATACTAAATTTGTAACAACTTCTCCA
AAAGCTAAGATAACAGGTTCAACTTATATTGAATTTAGAGAAGAACAAGCACTTGATGATGCTAAAGCAA
TAGTTAAAGAAGCTATTTTAAACTTTAAAAATAGAGATAAATCAAAAGTACTTATACCTGAATTAAAATC
AGGCGCAACAGTTGGGTATAGTGTAGAAGCAGTAGTAAATCAATTAGACAGAGTTGTAAACTCTCATATA
GACCCAGCAGGAACAGTTAAGCCATTAACAGACTGTCTAAAAGCTGGAGTATTAAGAGGAGCAGCTGGTG
TAGTTGGATGTAACAATGCTAAAGGAGTTTCAAATGAGGCTCACGTAACAATAATGAAAGAATTAATCAA
AAACGACATAATAGTAGTTACTACAGGTTGTGGAGCTTCAGCAGCAGCTAAGTTTGGTTTAATGGAATCT
GATGCGGCTGAAAAATATGCAGGTAAAGGTCTTGCAACTGTCTGTAAATTAGTAGGAATCCCACCAGTAC
TACATATGGGTTCTTGTGTTGATATAAGTCGTATACTAGATTTAGTTGGAGCAGCAGCTAATTACTTAGA
TATGGATATGTGTGACCTTCCAGTTGTAGGTATAGCTCCAGAATGGATGTCAGAAAAAGCAGTTGCTATA
GGATGCTATGTTGTAGCTTCTGGTATAGACACTTATTTAGGAATAATGCCTCCAATAGCTGGTTCTTCAA
GAGCAGTGGATATATTAACTAGTGAGTTAAAAGATAAAGTTGGAGCTACATTTACTGTAAATACAAATCC
AAAAGAGTTAGCAGCTACAATAATAGAAGATATAGAGAAAAAACGTGTTCACTTTGAAGCATTAGTTGAA
GAAAAAATGGCAGAAAAGGCTGAAGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:802105-802884 putative carbon monoxide dehydrogenase accessory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGATAGCAATAACAGGTAAAGGTGGAGTAGGTAAAACGACTTTTTCTTCAATGCTCTCTAGGATGT
TTGCTGAAGACGGATACAGAGTTGTTGCTGTTGATGCCGACCCTGATGCTAATTTAGCTTTAGCACTAGG
TTTTCCAAAAGAAGTATATGAATCAATAGTACCTATATCAGAAATGAAAAAATTAGTTTCAGATAGAACA
GCTGCTTCTGTAGGTTCATTTGGAAAAATGTTTAAGATGAATCCTAAAGTAGACGATATCCCTGAAAATT
TCTGTAAAGAATACAATGGAGTAAGATTACTTACATTGGGAACCGTAGATTCTGGTGGTACTGGATGTGT
ATGTCCAGAGCATGTTCTTTTGAAGAGACTCTGCTCACATTTAATACTACAAAATAAAGATGTAGTGGTT
ATGGATATGGAAGCGGGAATTGAACACTTAGGAAGAGGAACAGCCCAAGGTGTAGATGCTTTTATAGTAG
TTGTAGAACCAGGAGAGAGAAGTCTACAGACTTATAGAAAAGTTAAGAAACTTGGACATGATATAGGTGT
AAATAAAGTATTTGTAGTAGGAAATAAAATTAGAAATAAGGAAGATGAAGAATTTATAATCCAAAACTTA
GAAGATGGAGAATCTTTAGGATTTATTTACTATAACCAAGATGTTATTGATTCTGATAGAGCTAATCAAT
CTCCATATGATTCTAGTGAAACAACGAAAGAACAGATTAAAGCAATAAAAGATAAATTAATGTCACTTAA
GGATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:803133-804809 formate--tetrahydrofolate ligase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGATTTAAATCTGACATTGAAATAGCTCAAGAAGCTAAGCCTCAAGATATTAGAGAGGTTGCAAAAA
AATTAGGACTAGGTGAAGATGATGTAGAACTTTATGGTAAATACAAAGCAAAAGTTGACTACAATCTACT
AAAAAGAGAGACTGGTAAAAAAGCTAAGTTAATACTAACTACAGCTATAAATCCAACTCCAGCAGGTGAA
GGAAAAACTACTACTACTATAGGTGTTGCTGATGCATTTGCTAAACTAGACAAAAATGTATTAGTTGCTT
TAAGAGAACCATCTCTAGGACCAGTATTTGGTGTTAAAGGTGGAGCAGCTGGTGGAGGATATGCACAAGT
TGTTCCTATGGAAGATATAAACTTACACTTCACAGGAGATTTTCACGCTATAGGAGCTGCTAACAATCTT
TTAGCTGCTATGCTTGATAACCATATTCACCAAGGAAATGCACTTAGAATAGACCCTAAGAAAATAACTT
GGAGAAGATGTGTGGACATGAACGATAGACAACTTAGAAATATCGTTGATGGTATGGGTAAAAAAGGTGA
TGGAGCAGTTAGACAAGATGGATTCGATATAACTGTTGCTTCTGAAATAATGGCAGCGTTCTGTTTGGCA
AGTGATATATCTGATTTAAAAGAAAGATTAGGAAACATAATAGTTGGATACAGCTATGAAGGTGAACCTG
TAACAGCTAGACAATTAAAAGCTAATGGTGCTATGGCTGCATTATTAAAAGATGCTTTAAAACCAAACCT
AGTTCAAACTCTTGAAGGAACACCATCATTTGTACACGGTGGACCATTCGCAAATATAGCTCATGGATGT
AACTCTGTTATAGCTACAAGAATGGCTATGCACTTTGCAGACTATGTAATAACTGAGGCTGGTTTCGGTG
CTGACCTTGGAGCAGAAAAATTCTTAGATATAAAATGTAGAATGGCAAACTTAAAACCAGATGCTGTTAT
AATAGTTGCTACTGTAAGAGCATTAAAATACAATGGTGGAGTTGCTAAAGCAGACTTAAATAACGAAAAC
CTAGAAGCTCTTGAAAAAGGACTTCCAAACTTATTAAAACATGTTGAAAACATAACTCAAGTATATGGAT
TACCAGCAGTTGTTGCAATCAATAGATTCCCACTTGATACTGAAGCTGAACTTAAACTTGTTGAAGACAA
GTGTAAGGAATTAGGTGTTAATGTTGCTCTTTCTGAAGTATGGGCAAAAGGTGGAGAAGGTGGAATTGCA
GTAGCTAAAGAAGTTTTAAGATTATTGGATGAAGAAGAAAATAACTTTAGATTCTGCTATGAAGATGATT
TATCTATAAAAGACAAGATAAATGCTATAGCTACTAAGATTTATGGAGCAGATGGTGTAGATTATACTCC
TGAAGCTGATAAGGAAATAGCTAACTTAGAAAAACTTGGATTTACTAAAGTTCCAGTATGTATGGCTAAG
ACTCAATATTCTTTAACTGATGACCAAACTAAATTAGGTAGACCAACAGGATTTAGAATAACTGTAAGAC
AAGCAACAATTTCAGCAGGAGCTGGATTTATAGTTGCACTTACTGGAGAAATAATGAAGATGCCAGGATT
ACCAAAAGTTCCAGCAGCAGAAAAAATAGATGTTGATGAAAATGGAGTAATAGCTGGATTATTCTAA
>ref|NC_013316.1|:804914-805546 methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase [Clostridium difficile R20291]
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GTGGGGGAGCTGCTGCACTAGTAGGTGCAATAGGTATGGCTTTAGGTAGTATGGTATGTAACCTTACAAT
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AAAGATTTATTAAAAATGATAGATGATGATGCAGAATGTTTCTTACCATTATCAAAAGCTTACGGGCTTC
CTAAAGAAACAGAAGAAGAAAAAAGAATAAAAGCAGAAACAATGGAAAAGGCATTAAAAGTTGCTTGTGA
AGTACCATTAAACATAGTAAGAGTTTGCTATGAAGCTATTAAGTTACATGAAGATTTAGTTGATAAAGGT
TCAAGACTTGCTATAAGTGATGTTGGTGTAGGAGTTCAGTGTTTAAGAGCTGCTATACTTGGTGGACAAT
TAAATGTAGTTATAAATATAAATTCTATACAAGATAAAGAATATGTTAATAAGGTAAAAATAGAAGTAGA
TAAGTTAGTTGAAGATGGTGTAAAAATTTGTGATGAAGTTTATGCCAAAGTTGAAAAAGCTCTTGGAAAA
TAA
>ref|NC_013316.1|:805638-806510 putative FolD bifunctional protein [includes: methylenetetrahydrofolate dehydrogenase; methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase] [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGGAATGTCAACTAAAGGACAAATTATAAAAGGAAAACCTGTAGCTGATAAAATTAGTGAAGAAT
TAATAAAAGAAGTCGATTTACTAGTTAAAGAAGGTATAAATCCTAAACTAACAATAGTTAGAGTTGGGGC
AAGAAGTGATGATTTATCTTATGAAAGAGGAGCACTAAAGAGATGTCAAAACATAGGTATAACAACAGAA
GTGTTAGAGTTAGCTGAGGATATAACACAAGAGGAATATATTGATGTATTAAAGAGAGTTAATGATGACA
AAAATGTTAATGGTATATTATGTTTTAGACCTCTTCCAAAACACTTAAATGAAGAAGTTATAAAATATGT
TATTGCACCGGAAAAAGACGTAGATTGTTTTAGTCCAATAAACTCTGCTAAGGTAATGGAAGGGGATAAA
AGTGGATTTCCACCATGTACACCTACAGCAGTAGTTGAGATATTAAAACACTATAATGTTGATTTAAAAG
GAAGTAAGGTAACAGTTCTTGGAAGATCAATGGTAGTTGGAAAGCCAGTATCAATGCTTTTATTAAGTGA
ACATGCAACTGTTACAATATGTCATTCAAAAACTAAAAATCTATCAGGTGTAGCAGCAGAGGCAGACGTG
CTAATAGCAGCTATTGGTAGAGCTAAGATGGTTGATGAAAGTTTTGTTAAAGATGGAGCGGTAGTTATAG
ACGTTGGTATAAATGTTGATGAAGAAGGAAATTTATGTGGAGATGTTGATACAAATGCAGTTTTAGACAA
AGTATCAATGATAACTCCAGTTCCAGCGGGGGTTGGTTCAGTTACAACATCTATACTTGCAAAACATGTA
GTTAAGGCTTGTAAATTACAAAACAATAAATAG
>ref|NC_013316.1|:806547-807221 hypothetical protein CDR20291_0648 [Clostridium difficile R20291]
ATGATAATTTCTGAAAATAAACCATTAGAAGAAGTGCTAGGGTACTTAAAGGATTTTGACAAGCTGGTTT
TAGTTGGTTGTAATCAATGTGCAGCAACTTGTAAAAGTGGTGGGGAAGAAGAAGTTTTAAAAATGAAGGA
AACTCTTGAAGGTGAAGGCAAAAAAATCTTAGGATATGTAATGCTTGACCCTGCTTGTAACCTTTTAAAG
TCTAAAAAGGATTTAAAGGCTCTAAAAGAAGAGACTAAGGAAGCTGATGCAGTTTTATCTTTAGCATGTG
GAGATGGTACACAGACAATAGTTAAGAATTTAAAAGATAAGCCAGTTTATCCAGCCAACAATACTTTGTT
TATAGGGGAAGTACAAAGAGTTGGAGAATATGAAGAAGCCTGTAAGGCTTGTGGAGACTGTGAACTTGGT
TGGACAGGTGGGATATGTCCAGTAACTATGTGTGCTAAAGGTCTTATGAATGGGGCTTGTGGTGGAGCTA
AAAATGGTAAGTGTGAAGTAAACTCAGAGAATGATTGTGCTTGGATAAAGATATATGAAAGACTAGAAGC
TATAGGACAATTAGATAACTTAGCAGAAATAAGACCACCAAAAGACTATTCTAAGCAAAATAATCCAAGA
AGTTTAAGTGCAAAGAAAAAGAAAGAAGCAGCAGCAAATTCATAA
>ref|NC_013316.1|:807257-808138 putative methylenetetrahydrofolate reductase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCTTATTAAGAGAAACATTAGAAAGTGGAAAATTTGCAGTTACTACTGAAATGGCTCCTCCAAAAG
GGACTGACCTTTCACATTTAATAGAATGTGCAAAGCCGTTAGTTGGAAGAGTTCATGCAGCAAATGTAAC
AGACTTTCAATCGGCAGTTATGAGAGCAACTTCTCTTGCTACATGTAAATTATTAAAAGATGCTGGATTA
GAGCCAGTTATTCAAATAACAGGGAGAGATAGAAATAGAATAGCTATACAAGGAGAAATGTTGTCAGCAG
GTGTATTTGGGATAAACAATTTGTTGGCACTAACAGGAGACCATACTAGCGTAGGAGACCATCCACAGGC
TAAGGGAGTGTTTGATTTAGATTCTGTGGGGATACTTCAAACTGCTGAGACTTTAATGGCAGGTACGGAC
ATGGCTGGTAATAAGTTAAAAGGTTCTCCAGATTTTTATCTGGGAGCATCAGTAACTCCAGAATATTCTC
CAATAGAAGTTCAATTATTAAAAATGCAAAAGAAGATAAAAGCAGGGGCTAAATTTTTCCAAACACAAGC
ACTTTATGACATAAATACAATGAGAAAGTTTAGAGAATTAACAAGGGATATGGATTGCAAGGTATTAGCA
GGAATAGTACCTTTAAAATCACCAGGAATGGCTAAATTTATGACTGCAAATGTACCAGGAATATTCGTTC
CAGATGAACAAATCGAAAGATTAAGAGCAGCTGGAAAAGAAAACTGGGTAAGTGAAGGAATAAAAATGGC
AGGGGAACTTATCAAACAATTAAAAGAAGAAGATTTATGTGATGGTGTTCATATAATGGCAATTGGGGCA
GAAGAGAATATACCTGCTATACTGGATGCCGCAGGTTTATAG
>ref|NC_013316.1|:808182-809567 putative carbon monoxide dehydrogenase/acetyl-CoA synthase complex, dihydrolipoyl dehydrogenase subunit [Clostridium difficile R20291]
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CAGATGTAACGGTTATTGAAAAAAGAAGAGTTGGAGGAACTTGCTTAAATGCAGGATGTATACCAACTAA
AGCACTTCTTGCTTCTTCAGGAGTATTGAATACTGTAAAAGAAGCAAAGGATTTTGGTATAGAAATAGAT
GGTACAGTTAAGCCAAACTTCACTGCCATAATGGAAAGAAAAAATAAAGTTGTAAACCAATTAATAAGTG
GTATAGAGTTCTTATTTGAAAAAAGAGGAGTAAACTTAGTTAATGGTTTTGGAAAATTAATTGATAAAAA
CACTATAGAAGTAACTAAAGATGATGGAACAGTAGAAACTATAAAAGCAGATAAGATAATACTAGCAAAT
GGTTCTGTTCCAGTTGTACCAAGAATGTTCCCATATGATGGAAAAGTTGTAATAACTAGTGATGAAGTTC
TTGGACTTGAAGAGATACCTGAGTCTATGTTAATAGTAGGTGGTGGAGTTATAGGATGTGAGATAGGGCA
GTTCTTTAGAGCCTTAGGAACAGAAGTAACTATAGTTGAGATGGTTGACCAAATACTATTAAATGAAGAC
AAAGATGTAGCTAAACAACTACTTAGACAATTTAAGAAAGATAAAATTAAGGTTATTACAGGTATTGGAG
TACAAACTTGTGAAGTAGTTGATGGTAAGGCGGTTGCAACTCTTTCTAATGGAAAGGTTATAGAAGCACA
ATATGCATTAGTATGTGTTGGTAGAAGACCTAACCTTGACAATTCTGGAGTAGAAGATATAGGAATTGAA
ATGGAAAGAGGAAAAGTAGTAGTTAATGAACATCTTGAAACTAATGTAGAAGGTATATACGCAATAGGCG
ATATAATAGATACTCCTTTCCTAGCACATGTTGCTTCTAAAGAAGGTATCGTAGCAGTTGAAAATGCTTT
AGGTAAGACTAAGGTAGTAGATTATAGAGCAATTCCAAGATGTGTTTATACTGAACCTGAAGTTGCTGGT
GTTGGTAAGACTGAAAAGCAACTTGAAGCTGAAGGTGTAGAATACAATGTAGGTCAATTTGATTTTAGAG
GTCTTGGAAAAGCACAAGCTATAGGACATTTCCAAGGATTTGTAAAAGTTATAGCTGACAAAGAAACTGA
TAAGATAATAGGTGCAGCAGTAGTAGGACCTCATGCTACAGATTTATTGACAGAGTTGTCACTTGCTGTT
CATCTAGGATTAACAGTAGAACAAGTAGGGGATGCAATACATCCACATCCAAGTTTATCTGAAGGGCTAA
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>ref|NC_013316.1|:809623-810393 putative carbon monoxide dehydrogenase/acetyl-CoA synthase complex, nickel-inserting subunit [Clostridium difficile R20291]
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ATTATTTGGTTAAGGACAAAAAGGGACCAGTATTAGTTGTAGATGCTGATGCCAATGCTAACATAAATGA
AGTGTTAGGTATCGAAGTTGAAGCAACAATAGGAGAAATAAGAGAAGAAGTAAATCAAAGAGAAAAGTTA
GGCAATGCATTCCCTGGTGGTATGACAAAGGCACAATATCTTCAATTTAGATTAAATTCTATAATCGAAG
AAGGCGAAGGATATGACTTATTAGTAATGGGTAGGTCAGAAGGTGAAGGATGTTACTGTTTTGTAAATGG
GATACTTAGAGAACAAGTAAACAAAATATCTGGTCATTACAAATACTTAGTCATGGACAACGAAGCTGGT
ATGGAACATCTAAGTAGAAAAGTCACTAGACATGTTGATACACTTTTATTGGTTAGTGATTGCTCAAGAC
GTAGCATACAAGCTGTTGCTAGAATAAGAGATTTAGCTGAGGAACTAAAGTTAAGTGTTGGAAGAATACT
TTTGATTGTAAATAAAGTTCCAAATGGGGTTATGAATGATGGTGTTAAAGAAGAAATTGAAAAGCATAAC
CTAGAGCTAATCGGTGTTGTACCTATGGATGAATTGATATATGAATATGATTCTACAGGTATTCCTTTAG
TTAATTTACCTGAAGATTCAAAATCTAAAGTGGCTATGAAAGAAATTTTTGCTAAATTAGAATTAAAATA
G
>ref|NC_013316.1|:810413-811357 putative carbon monoxide dehydrogenase/acetyl-CoA synthase complex, small subunit [Clostridium difficile R20291]
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AAGCAATTAAATTAGGTGGGGAAAATGTATTACCTTTTTATAGTTTTGATGGAGAAGTAGGTAATTCTCC
AAAAATAGGTATACAAATATCAGACGTTTATCCTGAAAGCTGGACTGATTCATATAAGGAATTATACAAA
GATGTAGCTAATTGTCCAGTAGAGTGGGCTAAATATGTTGAAGCTAATACACAAGCAGATTTTATTTGTT
TAAAATTTGATGGTTCTGACCCAAATGGATTAGATAAGTCAGTTGATGAATGTGCTGATGTAGCTAAGGC
AGTAATTGAAGCAATAAAATTACCTTTAGTTGTAGCTGGTTCAGGAAATCATGAAAAAGATGGTAAATTA
TTTGAAAAATTAGCTCAAACATTGGATGGACATAACTGCTTATTTATGTCAGCAGTAGAAGATAACTACA
AAGGAGTAGGAGCATCAGCTGGTATGGCTTATGCACATAAAGTAGGAGCTGAATCTTCTGTTGATATAAA
CCTAGCTAAACAATTAAACGTATTGTTAACTCAACTAGGCGTTAAAGGTGAAAATATAGTTATGAATGTT
GGATGTTCAGCAGTTGGTTATGGATATGAGTACGTTGCATCTACTATGGATAGAATTAGACTTGCAGCAT
TTGGTCAAAATGATAAGACATTACAAATGCCTATCATAACACCAGTAGCTTTTGAAGTAGGTCATGTTAA
AGAAGCTATAGCTCCAATAGAAGATGAGCCAGATTGGGGTTGTCCAGAAGAAAGAACTATAGCAATGGAA
GTTTCAACTGCAGCAAGTGTTTTAGTAGGTGGTTCAAACGCAGTTATACTTCGTCATCCAAAATCAATAG
AAACTATAAAAGAATTGGTTAACGCATTAGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:811388-812755 putative carbon monoxide dehydrogenase/acetyl-CoA synthase complex, alpha subunit [Clostridium difficile R20291]
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CTTGTATGGCTTTCTCTATGAAGGTTGCTTCAGGAGCTGTAGAAGTAGGTAAATGCCCACATATGTCTGA
TGACGCTATAGCAAAATTATCAGAGGCTACTGCACCTTTAATGAAAGCTTTAAAAGTTGGTGCTGGTGCA
TCTGAGTATGAACTAGGTGGAGAAACAGTATTATTTAGACATGAAAAAACATTAGTAAGTAGAAATAGAT
ATGCAGTTTCATTCTGTACTTGTATGAGTGATGAAGCAGTAGATGCTAAAATAGCTAACATGAAAAAAGT
TGACTATGTAAGAATTGGTGAACAAATGAAAGTTGAAATGGCTGTTTTAGAGTATTGTGGAGATAAAGAT
GCGTATTTAAAATTAATAGATAAAATAAAAGGCAGTGGATTAGAAGTAGCTTATATTTTAGCTTGTGATG
ATGCACAAGTAGTTAAAGAAGCTGTTGAAGTATTAAAAGATGCTAGACCAATGGTATATGGAGCAACTAA
AGAGAACTACAAAGATATGATAGAAGTAGTTAAAGGAGCAAGTTTACCATTAGGTGTAAAAGCTGGTAGC
TTAGAAGAATTATATGAAACAGTTGAATTAATTCAAGCCGCTGGATATAAAGAATTAGTATTAGATGTAA
CAGGAGAAAACATAAAAGATACTTACACTAATGCTATACAAGTTAGAAGAACAGCTTTAAAAGAGCAAGA
TAGAACATTTGGATATCCTTCAATAGTATTTGCAAATAGATTATCTAATTCAAACCCTATGATGGAAGTT
GCTTTATCATCAATATTCACTATAAAATACGGTTCTATAATAGTAATAGATGATATTAGTTATGCTAAGG
CATTACCATTATTTGCACTAAGACAAAACATATACACTGACCCACAAAGACCAATGAGAGTTGAACCAAA
GATTTATCCAATCAACAACCCAGATGAAAATTCTCCAGTATTAGTTACTGTTGACTTTGCATTAACTTAC
TTCATAGTTGCTGGTGATATAGAAAGATCAAAAGTTCCAGTATGGTTAGTAATACCAGATGCAGGTGGAT
ATTCAGTTCTTACATCTTGGGCTGCTGGTAAATTTGGTGGAAACTCAATCTCTGCTTTCATTAAAGAAAG
TAAGGTAGAAGAAGTAACTAATTGTAAAGACCTTATCATTCCAGGAAAAGTTGCAGTACTTAAAGGTGAT
ATAGAAGATAACTTACCAGGATGGAATGTAGTTATAGGACCAGAGGAATCTATGGAATTACCTAAGTTCT
TAAAAGGATACCAAGAAAAAGCATGCCAAACAAACTAA
>ref|NC_013316.1|:812805-813611 putative carbon monoxide dehydrogenase/acetyl-CoA synthase complex, methyltransferase subunit [Clostridium difficile R20291]
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AAAGAGACCCAGCTCCAATCTTAAAAAGAGCAAAAGAGCAATTAGAAGCAGGAGCACACTATATAGATTT
TAATATAGGACCTGCCGAAAGAGATGGCGAAGAAATAATGACATGGGGAATCAAATTACTTCAATCTGAG
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ATAGAACTAATGCAAAACCAATAATAAACTCTGCTGATGCTGGCTCAAGATTTGATTTAATAGATATAGC
AGCTGAATACGAAGCAATGGTTATAGGTTTATGTGCAAAAGAAGGTATCCCAAGAGATAATGATGAGCGT
ATGGCTTACTGCCAAGAAATATTAGAAAAAGGCTTAATGTTAGGAATGGAGCCAACTGATATACTATTTG
ACCCATTATGCTTAGTTATAAAAGGTATGCAAGAAAAACAAGTAGAAGTTTTAGAAGCTATAAAAATGAT
GACTGAGATGGGACTTTTAACTACAGGAGGATTATCTAACGTATCTAATGGATGTCCTAAGCATGTTAGA
CCTGTTTTAGATAGTGCATTCTTAGCAATGGCAATGGCTAATGGATTTAGTTCAGCTATAATGAATCCAT
GTGACCCAGAATTAATGAAAACTGTAAAATCTTGTGACATAATCAACGGGGCATCTTTATATGCAGACTC
TTTCTTAGAGTTAAATGAAGGTGGATTTGCTTTCTAG
>ref|NC_013316.1|:813668-815794 putative carbon monoxide dehydrogenase/acetyl-CoA synthase complex, beta subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGAATCTATATAATATAATCTTTACAGGGTCAGAACAAGCTTTAGGTGCGGCTCAAGCTATGTTAGCTG
AAGCTATAGAAAAGAATGGAAAAGAGCATAAAGTTGCTTTCCCTGATACAGCATATTCATTACCTTGTAT
ATATGCTGCAACAGGACAAAAGATGAACACTTTAGGGGACTTAGAAGGTGCTTTAGAAGTAGTAAAATCT
TTAATAAATAGAACTCATTTACTAGAACATGCTTTTAATGCTGGTTTAGCTACGGCTTTAGCTGCAGAAG
TAATTGAAGCATTAAAATATTCAACTATGGATGCTCCATATAGTGAGCCATGTGCAGGTCATATAACTGA
CCCTATAATCAGATCACTTGGTGTACCATTAGTTACAGGAGATATACCTGGTGTTGCAGTTGTTCTTGGT
GAGTGTCCAGATGCAGAATCAGCAGCAAAAGTTATAAAAGATTACCAATCTAAAGGTTTACTAACTTTCT
TAGTTGGTAAAGTTATAGACCAAGCTATAGAAGCTGGAGTAAAAATGGGTCTTGAGCTAAGAGTTATACC
TCTAGGATATGATGTAACTTCTGTTATACACGTTGTATCTGTTGCAGTAAGAGCAGCATTAATATTCGGT
GGATTAACTCCTGGTGATTTAAACGGATTATTAGAGTACACAGCTAATAGAGTTCCTGCATTTGTTAATG
CATTTGGACCATTAAGTGAATTAGTTGTATCTGCAGGTGCTGGAGCAATAGCTTTAGGATTCCCAGTTAT
AACTGACCAAACAGTTCTTGAAGTTCCAATGAACCTATTAACTCAAAAAGATTACGATAAGATAGTAGCT
ACTTCATTAGAAGCTAGAGGAATAAAAATAAAAGTTACTGAAATACCTATCCCAGTTTCATTTGCAGCAG
CATTTGAAGGTGAGAGAATTAGAAAGAGCGATATGTTTGCTGAGTTTGGTGGAAACAGAACTGAAGCTTG
GGAGCTTGTTGTTAAGAAAGAAGCAACAGAAGTTGAAGACCATAAGATAGAAATAATAGGACCAAATATA
GATGAAGTTGATGCAGATGGTGTATTAAGATTACCGCTTGCTGTAATAGTTAAAATAGCTGGTAAAAATA
TGCAAGAAGATTTCGAGCCAGTTCTTGAAAGACGTTTCCACTACTTCTTGAACTATATAGAAGGTGTAAT
GCACGTTGGACAAAGAGATATGGCTTGGGTAAGAATCTCTAAAGATGCATTTGATAAAGGATTTAGACTT
GAGCATATAGGAGAAGTTTTATATGCTAAGATGTTAGATGAATTTGAATCAGTAGTTGATAAGTGTGAAA
TAACTATAATTACAGATGCTGAAAAAGTGTCTGAATTAAAAGGAGAAGCAATAGCTAAGTACAATGCTAG
AGATGAAAGATTAGCTTCATTAGTTGATGAAAGTGTTGATACTTTCTATTCTTGTAACTTATGTCAATCA
TTTGCACCAGCTCACGTTTGTGTTGTTACTCCTGAAAGACTTGGTCTTTGTGGAGCAGTTAGCTGGTTAG
ATGCTAAGGCTACTAAAGAATTAGACCCAACAGGTCCTTGTCAACCAATAGAAAAAGGCGAGTGCTTAGA
TGATAGAACAGGTGTATGGAATTCAGTAAATGAAACTGTAAACCAAATATCTCAAGGTGCAGTTGAATCT
GTTACATTATATTCTATACTAGAAGACCCAATGACTTCTTGTGGATGCTTCGAATGTATCTGTGGTATAA
TGCCAGAAGCAAACGGATTTGTTGTAGTTAACAGAGAATTTGCAAGTGTTACTCCAGTTGGTATGACTTT
CGGAGAACTTGCTTCTATGACAGGTGGAGGAGTTCAAACTCCAGGATTTATGGGACACGGAAGACATTTC
ATATCTTCTAAAAAATTCGCTTATGCAGAAGGTGGACCAGAAAGAATAGTTTGGATGCCAAAAGAATTAA
AAGATTATGTAGCTGATAAATTAAATGCTACAGTTAAAGAAATGACTGGAATAGAAAACTTCTGTGATAT
GGTTTGTGATGAAACTATAGCTGACGATTCTGAAGGAGTATTAGCTTTCTTAGAAGAAAAAGGTCATCCA
GCATTAGCTATGGAAAGTGTAATGTAA
>ref|NC_013316.1|:815881-816258 putative glycine cleavage system H protein [Clostridium difficile R20291]
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TATATATAGGTATAACAGACTATGCTCAAGATCAATTAGGAGAAATATTGTTTGTTGAAACACCAGAAGT
AGAAGATACTGTAACTAAGGGAGTAGATTTTGGAGTAGTTGAGTCTTCTAAAGTAGCTTCTGATTTAATA
TCTCCTGTTAATGGTGAGGTATTGGAAGTTAATGAAAAATTAGAAGATGAGCCAGAATGTATAAATGAAG
ACCCATATGAAAACTGGATATTAAAAGTAAAACTAGCTGATGTGGCTGAACTTGATACGTTATTAAGTGA
TAAAGAATACGAGGCTGGATTAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:816304-818298 putative iron-sulfur protein [Clostridium difficile R20291]
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TAAAAGTGAGTTTTACACCAAACAATAAAGAGGTTTATTGTAATGAGGGTGATATATTACTAGAGGTTGC
AAGAAATGCAGATATATTCATAGATGCTCCTTGTAATGGAAACGTGTCTTGTGGGAAGTGTAAAGTAAAA
TTATTGAATGGAAAAGTTGATACAGAAAAAACAAGACATATAACAGATGATGAGTGGGAGCAAGGTTATA
TACTAGCTTGTTGTACAAAGGTAATATCAGATATAGAAATTGAAGTTCCTTCTAAAGTATCATCTTCTAT
GCATGGTATGAAGATAGAAGGTAGTAATAAAAAAGAGGATAGGGAAATTTTTGAAAGAGCTAAAAAAATA
ATTGAAGAACATAACCTTCAATTTAAAACAAATATAAAAAAGAAATACATAGAAATGGAAGAACCAAATT
TAGATGATAATATAAGTGATGTAGATAGATTGGAAAGATATGTTAGAAATAGCCTAGGATATAATGAAAT
AGATTTTAGATTGGATATACTTAGAAAAATGCCAACTGTATTTAGAAAGAGTGATTTTAAGGTTACAATA
ACATATGTTCAAAAACAAAAGAAACTTACAATCATAAATATAGAACAAGGTAATAAAGAAAATTCCTTAT
ACGGAGTTGCAATAGATATTGGTACAACTTCAGTAGTTGTTTGTTTAGTAGACCTATATTCAAAAGAGGT
AGTAGATAAAGCATCTTCTGGAAATGCACAGATAAAATATGGAGCAGATGTTATAAATAGAATTATATAT
TCAACTAAGAAAAATGGATTAGAGACACTTCATAAAGCTATAGTTGAGGAAACTATAAATCCACTATTAA
AAACAATATATGAAAGAAATGGAATAGATAAGGAAGATGTAGTTACATTAGTGGCTGCCGGGAATACAAC
TATGACAAGTTTATTCTTGGGTGTGTATACAGACTTCTTAAGACAAGAACCTTACATACCACCATTTTTA
AAATCTCCAAAACTTATGGGTGAAAATGTTGGTCTTTTTGTAAATGACAGTGCATATGTGTACTTAGCTC
CATCTGTTGCAAGTTATGTAGGAGGAGATATAACAGCAGGTGTATTATCAGCAGGGATATGGTCAAGTGA
AGAAAATGTTTTATTTATAGATTTAGGAACTAATGGAGAGATTGTATTTGGAAATAAAGATTATATGATG
AGCTGTGCATGTTCAGCAGGACCTGCTTTTGAAGGTGGAGGGATAAGCTGTGGAATGAGGGCATCAGCAG
GAGCAATAGAGAAAGTAATTATTGATAAAGAAACTTTAGAGCCAACATTAAAGATTATTGATGAATGTGC
ACCAGTTGGTATATGTGGTTCTGGTATAATTGATTTAATCTGTCAAATGATTACTAAAGGTGTAATAGAT
AGAAGAGGTAAAATATACAGGGATTTAGATAATAAGAGAGTTAGATTTAATGAGCATGAGATAGGAGAGT
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TAGGGTTACTTCCTGACATTGATAGAGAAAAATTTACTTATATAGGGAATAGTTCACTTGTTGGTTCTTA
CTTAGCTCTCATAAGTAAAGATGCAAAAAATAAACTTGAAGAAATAGGTAATCAAATAACTTATGTTGAA
CTTAGTGTATATCCAAGTTATATGGATGAATTTATTTCTGCATGTTTCTTACCACATACGAATATAGAGC
AGTTCCCAACAGCAAAGAAATTACTAGAAGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:818323-819195 putative radical SAM superfamily protein [Clostridium difficile R20291]
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TAGAGTTTGCTTATCCTAACCAGACACTAGCTCTTAGTACTACAAGCAATCAATGTAGTTTGAAATGTGC
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CATTGTAGAGTTGTGTAAGTATTTAGATATAGTTTCTTTTGATTTAGTGTTTGATGATGAGACAATAAGA
GAAGTTTATAAGATGAAAAAGAGTAAAGAAGATTATATTGAAGTTTATAATACAATACAAGAACATACAG
AAGTAGCACCACATATATGTATTGGTTTAAAAGGAGGACAAATAAAGGGTGAATATGAAATTATAGAATA
CCTACAGAAAAATCCTCCTAATAAGCTTACATTTATAGTCCTTATTCCAACAAAAGGGACTGAGTATGAA
AATGTAGAACCTCCTGAGTTAGAAGGGGTAGCAGATATTTTATGTGAAGCTAGAATTAATTTACCAGATA
CTGAAATTAATCTAGGTTGTATGAGACCAAGAGGAGTGTATAGAAAAGAGCTAGACCAATTATCTATAAT
GTGTGGAGTCAATAGAATAGTATTACCATCAAGGTCTGCAAAGAATAAGGCTATAGAAATGAATATGACA
ATAAATGAGTGTAAGGAGTGTTGCGTTTTATGA
>ref|NC_013316.1|:819180-820130 putative radical SAM superfamily protein [Clostridium difficile R20291]
GTGTTGCGTTTTATGATTAGACTATCAGTTGGGACAGCAATAGAGCTTGGGATATTAAACAAAAAAAGCG
ATATACCTCCTACCACAGCATATATAATGATTGGAGAAAAATGTATAAATAAATGCAGTTTTTGTTCTCA
ATCAATAGAAAGTAGTACTAGAAAAGATAAATTATCAAGAGTAATTTGGCCAGAGTTTTCAAAAGAAGAA
ATATTAGATGCTTTAAAAGCTTATAAAGGAAAAAATATAAAGAGAATATGTATTCAATCAATGGCAAGTG
AAGAAGCACATAACTCTGTTTTAGACTTTATAAACTATATAAGTGGTAAGATAGACATGCCAATTTCACT
ATCTGCAAAATTAGAAAATGATGAACAGATAAAGAAGTTTTTTTCAGTAGGAGTTGATAAAATAGGAATA
GCAATAGATGCATCAAATAAAGAACTATATGAAAAAATAAAAGGAAATAACTATGATGAAAAGTTAAAAT
TTATAACTGAAATGTCAAAATCATATCCCAATAAAATAAGTACACATATAATAGTTGGTATGGGTGAAAG
TCATGAAGATATATACAATTTATATATTTATTTAAAGGAAAATGATGTAACGATTAGTTTATTTGCATTT
ACTCCAGTTAGAGGAACTAAAATGGAAAAGATAAATCAACCAAGCATAGAAAGTTATAGAAGGGTACAGT
TAATGTCTTATATGATAAATAAAGGTTATCCAAAAGAGTATTTTAAGTTTAAAAATGGATACTTAAATAG
TATAAAGCTTGACAATGATATTTTAAAAGACATAAACAAAGGCTATCCTTTTGAAATAAGAGGTTGTAAG
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AAAGTGAGATAGATTTAGCAATAAGAGAAATAAATCTATAG
>ref|NC_013316.1|:820177-820992 putative biotin/lipoate-protein ligase [Clostridium difficile R20291]
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TATTTACTGCATATAAGAAAGGACATAATAAGCCAACTCTTAGATTTTATACATGGGAACCAGCTTGTTT
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TATACTAGAAGAATTACAGGTGGAAGAGCTGTATTACATGATAATGAGCTAACTTATAGTATAATTATAG
GAGAAGATAATCCTTTAATCGATAAGAGCATCAACCTATCTTATAGATATATAAGTGAAGGTCTAGTTAA
AGGATTGAATCTAAGTGGTATAGAAACAGATAATTTAAATAGAGGCGAGAGAATAAGTAGGGAAAATTTA
TCAGCTGCATGTTTTAATGCACATGCATCATATGAAGTTACTATTAATAATAAGAAGGTAATTGGAAGTG
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GTTTAAATTAATAAAAACTAAGACACCAGAATTGAAAGAAAGAGCTATGAAATTTACAGCTAAAAAAGCA
AGTGGAATAGAAAATGAAATTGGCAGAAAAATAGACATAGATATTCTACAGAAAAACATAGTAAAGGGAT
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>ref|NC_013316.1|:821143-821334 hypothetical protein CDR20291_0661 [Clostridium difficile R20291]
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ATATAGACCCTTGTGATGGAAAGATTTATTTAACGGATTTATTAGGAGAGCAAAAGATAATAGATGGGAT
AATTAAAGAAATAAGATTGATGGACCATAAGATAATAATACAAGAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:821353-821769 hypothetical protein CDR20291_0662 [Clostridium difficile R20291]
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AGTTACCTACATATGTAGAAATTTATGCACTAGGGACTAATTCTATAGCAACTAGTTCTATGATGAAAGC
TCATGCTAATAAAGGAGCTACAGGGGAAAATGCTATAGTAGTATCAGCTAAAAAAGCAAATATAATAGTT
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>ref|NC_013316.1|:821785-822135 hypothetical protein CDR20291_0663 [Clostridium difficile R20291]
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CTCATGGAGATATATGTCATGAACATCCACATGACCATGCTCACGACCACGACCATGAACATAGTCATGA
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GTATTGAAAAGGCTATAGAGTATATGGAAGAAGCTAATAAAATGTTGTTAGAGGCTAAAAAACATATGTA
A
>ref|NC_013316.1|:822675-823454 putative histidinol phosphatase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGATGGTCATATACATTCACCTTATTGTCCTCATGGAAGTAAGGATGATTTTGAAAAATATGTAC
AAAGAGCAATGGATGTTGGAATAACAGAAATGACATTTACAGAACATTTTCCGTATGCAAATGGATTTAG
AGACCCTGCTCCTGAAAATGATAGTTGTATGAGTATTGAAGATTTACCAAAGTATTTTAATGATGTCAAG
AAGTTGAAAGAAAAGTATGAGGGTAAAATCAAGATAAATGTTGGGTCGGAAGTGGATTTTATAGAAGGAT
ACGAAGAAGGGATAAAGGAGAATTTAAATAAATATGGAAAGGAATTAGAAGACTCTCTTTTATCAGTACA
TATAATTAAAATTGATGATGATTATTATTGTGTAGATTACAGTGTAGAGGAGTTTCAAAATTTAATCGAC
AAATTAGGAAGTATTGAAGCTGTTTATAATAAGTATTATGAAACATTGATAAAAGCTGTAAATTCAGATT
TAGGTATACATAAACCAAAAAGAATAGGTCATTTAAATTTAGTTAGAAAGTTTAATCAGGTATTTCCATA
CGATTATAAAGGAAATACAATTCTTGAAGACTTAATAAAGTTAATTAAAGAAAAAGGTTATGAACTTGAT
TATAATGTTTCTGGAAATAGAAAAGAGTATTGCAAAGAGCCTTATATAGATGGATACTTATTAGAGTTGG
TAAAAAAATACGATATTCCATTAGTTTTAGGTTCTGATTCTCACTGTGCAGAGGAAATAAATAAATACGA
TATTATTTAG
>ref|NC_013316.1|:c824648-823767 hypothetical protein CDR20291_0665 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAAGATTAATAATAATGATATTGTCTGTTGTCTTAGTACTATCAAGTATACTTACGATATTTG
CATATTCAAATATTAAATATAATAATAATAAATTGATATATTCTAATATGATAGATAAAAAAACTCAAAA
TAGTGTAAAGGAAATCCTAAAAGAAAATAAAATTAATGAAAAAGACATAGATACATTTATTAAAGCAGTC
AACAATTATAATAAATTGCAAGTTAAAATACTTCAAAATAATATAAATATATCTAAATCTGGATATTCTT
CAATCAATGCAAAACAAGTTCCATATAACCTAGAAAAATTGCAAGATAATTGGGTGAAAAAATTCCCTGA
TTATATGGATGTAAATTGTAGAATAACTGCTTTTAGACTTTTTAAAGATTTTATAAATTCAAATAAGAAA
TTTACTGGAGACTCTATTGATTTGAATGTCGACTTAGACACTATAATGAATAATAAAGATGCTAAATTTA
GCACCAAAGATGTAGAAAAATTTATCAACTTCTTTTCTGCAATACCAGCTAAAGATACAGATGATACAAT
CAAAATTGCAGAACAAATAAAAAATGAATGGAAAAAAAGAAAAATATCTTTTAAAAATAATAAAAATATA
TCTATTATAAATGGATTTCTTCGTTATCCAGAAACTAAAAACGTATTTATAGGTCATACAGGCATATGTA
TTAAAACTAAAAATGGCATTCTATTTTTAGAAAAATATGGTGTTACATCACCTTATCAAGTTACTAAATT
TAAAAATAAAAAAGGTGTAAAAAATTATATGTTTAATAGATTGAAGATGTCAGAAGGTGAAATTGAATTG
CCTGACCCTATAATAATGGAAAACGATAAACTTATGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:825201-825713 hypothetical protein CDR20291_0666 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTAAAAAAATTTAAAAGTGGTATAGTAATGGCATTAACAGTAATGGCAATTGGAGCATCATTGA
CAAATGTATCAGCTATGGAATTAAACAAGAGTAAAGAGTTTGAAACTAAATACAATGAAATGAAGAGGGA
TTTTCAAGAGGATTATGGAAAAGAAGACAAATTTAATATAACATTGGATGATGAATTTACAAAAGAAGAA
GTAAATGGAGCTAAAGGGATTATAAAGACAACTAATAAAATGAATAATGAGGTTGTAGTATTAAATTATT
TTGATGAAATGAAATCTGGGATTGAATTTGAGTTGAAGGCAAAAGCAGAAAAAAATGCAATTTTGAGAGA
TGAATTTCAACAAGGTTATGGAAAGGAAGATAAATTCAAAGTTGTGTTAGATGATGAATTTACAAAAGAA
GAGGTAAATGGAGCTAAGGGCATTATAAAGACTACAGATAAAGAGACAGGTGAGGTTATCGTATATAATT
ACTTTGATGAGCTTGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c827489-826392 putative aminotransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAACATATCTATTCAGTCCTGGACCAGTAATGGTTACAGATAAAGTCAGAAATTCACTTCTTC
ACTATGATATATGCCATAGAGGAAACGAGTTTATGGATTTATTCAAAGATACACAACAAAAAATCAATAA
ACTATATAATGCAACTTCTAATTACTACTCATTAATTGTATCTGGCTCTGGAACATCTGTAAATGAATGT
GTACTATCTTCTATCTTTGACAAAGAAGATGCAGTTCTGCTAGTTAGTAATGGTGTTTTTGGAGAAAGGC
TAGAAGAAATATTATTTACTTATAATGTAAAAACATATAAGCCTAATTTTGAATGGGCAGAATACCCAGA
CCTGGACATTTTAGAAAAATATATAATTGAAAATTCTGATATAAAAGTAATTGCTATGGTGTTCCATGAA
ACTAGTTCAGGAATGATAAATCCAGTCCCTGAACTAGGAAAACTTGCTAAGAAGTATAACAAAATATTTT
TTGTAGATGCAATAAGTGCCTCAGCAGGTGAATATATTGATGTAGAAGAGTTTAATATAGATATAATAAC
AGGTGTTGGTGGTAAAGCTCTTGGAGCATTTCCAGGTTCTGCATACCTTTGTGCTAAAGAGAGTATTTTA
CAAAATATTAAAGAAAATCAATGTAAGAATGTATATCTTAATCTTTATAAACACTATAAAGTTGCTAAAT
CATCTTCTCAAACACCAAATACACCTAATGTTACTTTAATATTTGCCCTTAATGAAGCTTTAACTGAGTT
TTTGGAAGATGACAGTAAAATAGAAAGATACAAAGAATGTTCTGCTATTTTAAGGAATGGCATGGAAGAA
TTGGGGCTAACATTTTTACTTCCAGATAAGTATATGTCTAATACAGTAACATCTGTATTTCTACCTAAAG
AAATCAATGTAAATGAGTTTATATTAGGCCTAGAAAGGGAAAGTGGCTATGTTGTCTATCCAGGAAAAGG
CAAATTCCTAGATGCTAACATATTCCAAGTTGCAAATATGGGAGAAATATATCCAGAAGATTGTTATAAA
TTCTTAGATATCTTAAAATCAAAATTGGAGATAAAAAAAGTTATATAA
>ref|NC_013316.1|:827782-829308 glycerol kinase [Clostridium difficile R20291]
GTGAAATATGTATTAGCAATTGACCAAGGAACAACAGGAACAAGAGCAGTATTGATAAACGAAAAATCAG
AGTTTGTTTTTAGCGATTATATGGAACATACTCAAATATATCCACAATCTGGATATGTTGAACATGACCC
TATAGAAATTTGGAATAATACAAAAACTGTGAGTAATAATGTATTACAACAGGCTTTTGAAAGTGGAATC
AATGAAAGTGATATAAAAGGAATTGGTATAGATAATCAAGGTGAAACAGTAATGTTATGGGATAAAAATA
CAGGTAAACCACTTTACAATGCTATCGTATGGCAGTGTAGGAGAACTTATGATTATGTGGAAAATTTAAA
GAATATACCAGGTTTAGAAAATAAGATAATAGATAAGACTGGGTTAATTATAGACCCATATTTCTCAGGT
ACAAAAATTAAATGGGTAATAGATAATGTAAAAGGTGTAAAAGAAAAAATTAAAAATGGAGAAGTACTTG
CAGGAACATTGGATAGTTGGTTAATATGGAAAATGACAGGAGGAAAATCTTTTTTAACTGATGTATCTAC
AGCAGCAAGAACAATGCTTTTTAATATAAGAGATATGGATTGGGATAGAGAGTTGCTTGACATTATAGGA
GTGCCTAGAAGTATTTTAGCAGATATAATGCCTACTAGTGGTGATTTTGGAACTACAGATAAGGAGGCAT
TTTGTGGGGTTTCTATAAAAATTACTGCTTCAATGGTAGACCAACCAGCAGCTTTATTTGGCAATGGATG
TTTTGAACCAGGAATGGTTAAAAATACTTATGGTACAGGATGTTTCTTATATATGAATATAGGTGAGGAG
TTAAATATAGCAGGTAATGGTATTTTGACAACAGTTGCTTGGAAGATAGGAGATAAAGTTACATATGCTT
ATGATGGTGGAGTGTATATAGCAGGTGCTGCAATACAATGGCTTAGAGATGGAATTGGAGTTATAAAAAA
TTATTCAGAAACTGATGACATGGCAAATTCCATATCAAGTACTGGAGGGGTATATTTTGTACCAGCATTT
GCAGGTATAGCAGCACCTTATTGGGACCAATATGCTAGAGGCACAATGGTTGGGATAACAGGAAGTACTA
AAAAAGAACATATAGTAAGGGCTACTCTTGAGTCTGTTGCACTTCAAGTCAAGGATGTTGTTGATTCCAT
GAATTTGGCTTCAGGGAAAGAAATAAAAATGTTGAGAGTAGATGGTGGAATTACTAAAAATAACTTTACA
ATGCAATTTCAATCTGACATATTAGATATACCAATTGAAATTGCAGAAAATCCTGAAACGACAGTACTTG
GTGTAGGGTATATGGCAGGGCTTTCCTGTGGTGTTTGGAACAGTATTGATGAAATTAGAAGTGAATTTAC
AATAAGCAAAAAATATATTCCAAATATGACTAAGCAAAAAAGAGAAGAAATATTACTTGGATGGAATCAA
GCAGTAAAAAGAGCTATGAATTGGGAAAACGATACCAAAAAGGTGTGTGCTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:829349-830464 putative ethanolamine transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGCCCTTTGATAAAATTATATTATACATAATGGCTGTGGGAGTGCTTTTAGGAGCGTTAGATAGAATAA
TTGGAAATAAATTTGGACTTGGAGAGCAGTTTGAAGAAGGGTTTAATTCAATGGGTCCATTGGCTTTAGG
AATGGTTGGTATAGTTTGTTTAGCTCCAGTAATTTCAGATGTACTAGGTCCTATAATAATACCAATATTC
AATCTCTGTGGAGCTGACCCATCTATGTTTGCAACTATTTTAGCGAATGATATGGGAGGGTATCCATTGG
CTATGGAACTTGCACACAATAAAGAGGCAGGAATGCTTGCAGGATTAGTCGTGTCATCCATGCTTGGATG
TACATTAGTATTTTCAATTCCAGTAGGACTAGGTCTTATAGAATATGAAGACAGACCATTCTTTGCAAAA
GGGTTACTGATAGGCTTGATAACAATACCTTTTGGAGGTATTATAGGAGGATTAATAGCAGGATTTAACT
TATCAATGGTAATTATAAATATGATACCAGTGATAATATTGGCAGTAATATTGGCAGTAGGTTTAAAATT
TAATTCTACACTTATGATAAATGGGTCATTAGTTTTTGGAAAATTTATATCTATATTGATAACGATAGGT
TTGGGAGCAGCAGCATTTCAAGAAATAACAGGTATAGTACTTATAAAAGGCATGACACCTATAAGAGAAG
GTATTCAAGTAATTGGAAGTATTGCAATAGTGTTATTAGGTACTTTTCCAATATTACATTTATTAGTTAA
AGTTCTTAATAAACCACTTACAATAGTGGGTGGAAAATTAGGTATGGATGCCACTAGTGCAGCAGGATTA
GTTTTTACTTTAGCCAATAGTATTCCAGTATATAAAATGATGAAAGATATGAGTCCAAAGGGGAAAGTAG
TAAATACTGCTTGGCTGGTTTGTGCTACAGCAGCTTTGGGGGACCATTTAGGATTTACAGCAGGAGTAGT
TCCAGAGATGATTACACCTGTTGTAATTGGAAAATTGGTTGGAGGAGTATTGGCAATTGCACTTGCTATA
CTTATGACAAAAGATTTAACTTTGGAAGAAGAACAAAGTATTAAAATGAAGAAAGATGCAGTGTAG
>ref|NC_013316.1|:c831509-830745 DeoR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGTTACCACAGGAAAGATACGAGAAGATTTTAAGTATTCTCAAATCAGATAATATAATTAAAATAAATG
ACATAGTTCAAATGTTTGATATATCAATAGAAACTGCACGAAGAGATTTAGCCCATATGGAAAGTATCGG
TCTTTTAAAAAGAGTTTATGGTGGTGCTATACCAGTTATAGCAAGTAGCGTAGAACTTAACTATGTTAAA
AGAAAAAAAATAAACTCAAACGATAAAAAACAGATTGCTATTAAATGTAGTGAGTTTATAAATACAAATG
ATACTATTTTTATGGATACTGGAACTACTGTACTTGAAGTTTCAAAAAATTTGAAAGATAAAAAGAATCT
AACTGTAATAACCAACTCAATTTTAGTTGCAAATGAACTTATGAATACTAATATAAAAGTATATGTGCTT
GGTGGCTATCTTAGAGAAACTGAAGGTTCTTTTTCTGGTCCACTTACACTCTCAGCTATTGAACAATTTA
ATGTTGATAAAGCTATTTTAGGTGCTGGAGGTATCACTCTTGAAAATGGAATCTCTGACTATCACTTAGA
AGAAGCACTGGTTAGAAAAAAAATGATTGAAAGGTCTAGAAAATCTATAGTAGTTGTCGAACCTCCTAAG
TTTGGTATAAATTCATTTGCATCAGTAGCTCCTATAGAACACATAGATACTATTATTACCTCTGCTAGTA
TAGACCATAATATAATAATAGAGTTTTCTCAAAAAGGAATACCTTTAGTCATAGCTGATAATTAG
>ref|NC_013316.1|:831946-832734 putative chemotaxis protein [Clostridium difficile R20291]
ATGACAACTTTAATTTTTTTCATAGTGGGGATAGCATCTTTGGTAGTTGCTTTTGTTATTGATGGGGGAC
ATATTGGAGTATTATTTGTATTTTCATCAGCACTTGTTGTGTTTGGTGGAACTATAGGCGCTGTTGGAGC
TTCGACTCCATTCCCTGTGTTTAAAAAGTCTATAAAGATAATGTTATTAGCTTTTAAAAATAAAAAGCCT
AATAACATAGAAAATATAATCTATTTCAAAGAAATTGCAACAAAGGCTAGGAAAGAGGGGCTTCTTAGTG
TTGACAAAGAAATAAGTGAGAATGATGAATTAGACCCTTTTATTAGAAAAGGGCTTGAACTTATGGTAGA
TGGGGTGGATGCAGTTACTATAAGAAATATATTGGAATCACAGATACAGATAACATCAAAACGACATAAA
GAAGGAATAGCAATTTTTGATTCAGCAGGTGGATATGCACCTACACTGGGGATAATAGGTACAGTTATGG
GATTAGTACATATTTTAGGTAATCTTTCAAGTAATCCAGATGCATTAGGACCTCAAATTTCTGTTGCATT
TTTGGCTACTTTGTATGGTGTTGGTTCTGCCAATTTAATATGGTTACCAATAGCATCAAAACTTAAGGCT
ATAAATCAACAGGAAATAAGTGAAAGACTTTTGGTGATAGAAGCAATATTATCCATACTTGAGGGTGATA
ATTCTAATTTAATGACAGAAAAATTAAAAATATTTTTAAATTCAAAAGAACTAATTGAACTTGAAGAAAT
TGGTGGTAGAGCTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:832749-833495 putative chemotaxis protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTATGTTGTATGATGAAGATGAAAAAGAAGAAAACAATGAGCGATGGCTTTTAACTTATTCAGACC
TCATAACATTACTTATGATTTTCTTTGTAATAATGTATTCTATGAGTAATGTTGATGCGGAGAAATATAA
ACAATTATCTCAATCTCTAAATTCTGCTTTTGGTGGTTCTTCTGGAGTTATTGAAGGTGGTAATAGCAAA
ATAGAACCAGTAGTTGAACCAGGAAGTAATGATTTAGATAGTTTACAAAATGCTAAGTTTAAAAAAGTTG
GTGAAGAAATCCAGAAGTATTTAAATGAAAATGGTATGGCTAATTCAGTATCATTAAGAGTTCAAGATAG
AGGATTAGTAATAAGCCTTAAAGATACAATACTATTTGATACAGGAAAAGCAGTTGTAAAGGATAATTCT
AGAGATAAGATTATTCAAATAGGTAAGATGTTAAATGAAATGAATAGTTACATGAGAGTAGAAGGTCATA
CAGACAATATGTCTATAAAAAATTCAGAGTTTAAGTCAAATTGGGATTTATCAGTTATGAGAGCAACCAA
TGTTGTTCAACTTCTTATTGACAATGCAGGTATAGCACCAGATAAATTATCTGCTGTAGGATATGGTGAG
TTTAGACCAATAGCAGAAAATTCATCTGAAGAAGGTAGGTCAAAAAATAGAAGAGTTGATATAGTTTTAG
TTGATAGTAAATATGATAATGTAGAAAATGTTTCAAAGGATAAATAG
>ref|NC_013316.1|:833673-834047 hypothetical protein CDR20291_0674 [Clostridium difficile R20291]
ATGGGGAATAAAAATAAAAATACGAAATATAAAGATAAAACAAGAGAAAGATATAATAAAAAAGTTGAGA
ATTTAAATAAAGAAAAATTAAATAAAGATAATAAACAGTCTAAGAAGGTAGATAAGATTGATGATATTAT
TAATAAATCTAGTATTGTATTATGTGTACTTCTAGTGGTGTTTTCATTACTTTACTTATTTAAATTGGTT
CAACTTAATATAATAATGATACTTTTAGTAATTACAGTAGCTATTCAACAAGGATTGGTGTCATTTGGTG
CATTTAGAAATAAAAATTATGTAAAAGCTTTATTTTCTATATTTGTAATAGTATGTTTCTTAATTGCTTT
TAAATATGTTGTAAATCCTGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:834139-835599 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAGGTGTAAGTTTGCAAAATTAATTATCACATCAATGATTGTTTTATTACTTACAGGATGTAGTT
TAAAAAAGGAAGATAATTATAAGTTAGACCCAGAAAATCCGACATCAATACAAATTTGGCATTATTATAA
TGGACAGCAAAAAATGGCTTTTGATAAGCTTGTTAAGGAATTTAATGACACTATAGGTGCTGAAAAAGGA
ATTATTGTTGAAGCGTTTAGTCAAGGTAATGTAGTTGATTTATCAGAGAAAGTTTTAGATTCTGCAAATA
AAAAAGTTGGCTCTGAAGATGTGCCAAATATATTTGCAGCATACTCAGATACTGCATATGAAATGGATAA
ATTAGGGTTACTAGTAGATATGGATAAGTACATAAGTAAAGAAGAATTAAATGAATACATAGACGAATAT
GTAGAAGAAGGCAGAATAAATTCTAAGGATGAGTTTAAACTTTTCCCAATTGCAAAATCAACTGAAATTT
TGATGTTAAATAAAACTGATTGGGATAAATTTGCAAAAGCTACAAATTCAAATATAAATGATATAAAAAC
AATTGAAGGATTAGTAGAGACATCAAAAAAATATTATGAATGGACAGATAGTTTAACGAAAGAGCCTAAT
GATGGTAAAGCATTTTTTGGGAGAGATGCTTTAGCAAATTATATTATTATAGGAAGTAAACAACTAGGAG
TAGAAATTTTTTCTGTTAAAGATGGTAAAGTTACACTAAATATTGAAGAAAAAGTTATGAAAAAGCTATG
GGATAATTTCTATGTACCATATATAAATGGATATTTTGCTTCTTATGGTAAGTTTCGTTCTGATGATGCA
AAAACAGGTGATATATTAGCTCTTGTAGGCTCTAGTTCAGGAGCAGCATACTTTCCAGATAGAGTAATGC
TAAATGATAATGAGAGTTATAATATTGAAACATCTGTTTTTCAAGCACCACGTTTTAAAGGAGAAGGAAA
ATATGCTGTACAACAAGGTGCAGGAATGGCTGTAACAAAATCTACTAAAGAAGAAGAATATGCATCAGTA
GAATTTTTAAAATGGTTTACAGATAAAGAGCCTAATATAAAATTCTCTATTGCTTCTGGATATTTACCAG
TAAAGAAAAAAACGAATGATTTGAATGTTATAAAAGAAGTTATGAAGAAAGATAATTTGAGTTTATCTGA
TAAAGTTGAAGGTTCAATAGCCTCATCTATTGAACAAATTAACAGTTGTAATTTATACACTAATAAAGCA
TTTGATGGTGGAACTAAAGCTAGACAAATACTTGAATATTCAATGCTTGATAAAGCTAAAGAAGATTCAA
ATAAAATAAATGAATTGGTAAAAAGTGGAACTTCTAAGAAGGATGCGGTAGCACAATTTAATAATGATAA
GAATTTTGAAACTTGGTTTGAAAGTTTTAAGGCTGAGCTTGAAAATGCTATAAAAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:835652-838528 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAACAATCTAAGAAAAAACAATTCAATAATGAAAAAGATGATATTTCCCCTAATTATTGTTATGC
TAATTCAAACAAGTTTATTTTGTGCCACAATTTTATGGGGAGGAACTATTAAGAAATTAAATGATAATTC
GTTTGACATCTTAAATGAAAGAGTAATTAATCGTAAAAATTATATACAAAATGAAATGTTACAAAGATGG
TCAAATACAAGTGAAACGGAAGCTACAATTAATTCCTCTGTAAAAAAAATATTAAATGAAAAAAATGCCT
TAATTGAGGATGTAGGCAACAATGAAGAAATTAACAAAGATATTATAAAAAGCATATCAAATGATTTAAT
ATATCTTTTGAGAAAAAACTCTGTTACAGGAGCTTTTATAATTCTAAATGACAAAAATATTAACGATAAG
CCAATAGATAGTAAAGGTGAAATAAGTAGGACTGGATTGTATATAAGGGATTTAGACCCTAAGTTTAATC
CAAATGATAATTCTGATTTGTTAATTGAGAGAGGTTCATCAGATATAGCAAGAAGTTTTGGAATATCTAT
GGACAGTTATTGGGAACCTAAATTTTCATTTAAAAGTGAAAATGAGCAAGAGGGAGATGATTTTTTTTAT
AAACCATTTAGAGCTGCAATTGATAATCCAAACGTATCAAGTTCTAATTTGGGATACTGGGGAAGTAAGT
TTTTATTGACAAATGCAGGTGATAGGCTTATGACATATACAGTTCCCCTTATTTATGAAGATGGAACTGT
ATATGGAGTACTTGGAATAGATTTAAGTGTAAATTATTTAAGAGAATTACTTCCATACTCAGAGATAAAT
GGAAATAAAAAAGGTAATTATATTTTAGGTGTAGATAGAAATAATGATATGGCCTTTGAAAATGTAATTT
CAAATGGATACTCATTAAAAGAAAAATTTTGGGATGGTTTACATTCTAATTTAGAGCAGAAGGAATCGTA
TAAAAATATATATAAGATTAAAAATAAAGATAATGAATGTGGTAATGGCAACATTTATGCTAGTGTACAA
TACTTAGATTTATATAACTCCAATACTCCATTTGAAAATGAACGTTGGGCTCTTTTGGGTATTATTGAAG
AAAAAAGTCTTTTGTCATTTTCAAAAAGGATAGAGAAATTAGTTATAATATCTATAGCAATTTCTTTATT
AATAGGTCTAATAGGTATTTACATTGCATCAAGATTATTTACAAAACCAATTGTTCTTTTAGCCAACAAA
GTTAGAAACAGTAATCCATCAAAACCAGTAAATCTTGATAAGATAAATATATCTGAAATAGATGAATTAT
CTTCAGCTATAGAGTTACTCAGTGCAAATGTTGCAGATTCTTCATCAAAATTATCACAGATTATTGAAAT
GGTAGATATGCCAATCGGGGCTTTTGAGTTATACAAAAACGCAGAGAATGTTTTTTGTACAAAAGATAAA
AAACTTAAGTGGATAAGAATGAATATCTTTGAAGATGAGCTAAAGGTTCTTGGTGTTGTTGTTGATGTCA
CAAAAGAATTTATTGAGAAAAGGAAGATAGAATATGAAAGAGATTTTGATATTTTAACGAATCTTTTAAA
TAGGAGAGCTTTTCATTCACAGATACAAGAAAAATTTAAGAATAAAGATGAACTTAAGATAGCAGCATTT
ATTATGTGGGATTTAGATAATCTAAAATATATTAATGATACATATGGACATGATGCTGGTGATGAATATA
TTAGGTGTGCTGCAGACATACTTAAGAAGTTTATATCATGGAATGGTATAGTATCTAGACTTTCAGGTGA
TGAGTTTTATGTATTTATATATGGATATGAAAGTAAAGATAGTATAAGAGATATTATTAATTCTGTTAAG
AAACAGATGAATAATACCTTATTAAAACTTCATGATGGAACAGAATTTAAAATAAGGGCATCAGCAGGAA
TTTCCTGGTACCCTGATGATTCAACCAACTATGATGAATTAATGAGATACGCAGATTTTGCTATGTATCA
AATTAAAAATACAATCAAGGGGGAAGTTAGTGAATTTGATATTAATATATATAATAAGGATTCATTCTTA
TTGAGTAATAGAGAAGAATTAAACAAGTTAATTGATGGTCAATTAGTTGAGTATGCATTTCAGCCTATTG
TAGATTGTAAAGGTAAAGTATTTGCATATGAGGCACTTATGAGACCTAAAATAAAAACTTTTAGTTCACC
AATAGATGTAATTAGATTAGCTCGTTCACAGTCTAAATTATATCAAATTGAGCGTATTACATGGTTTAAA
GCACTTAAATCATTTAAAAAATACAAAGAAAAATTTGGCGATTGCAAACTGTTCTTAAATTCTATTCCTA
ATAATAATTTATCAAAAGTAGATTTTGAGGAAATTGAAGATTTATATGGTGAATATTTAAATAGAGTAGT
ATTAGAAATAACAGAGAATGATAAGATTAATGAAGATTTTATTGAGAAAAAGAAAGCATATATAGACCAT
TGGAATATAGAAATTGCTTTAGATGACTTTGGGACAGGTTACAACGGAGATGCTGTACTATTATATATAA
TGCCAGACTATGTAAAGATTGATATGTCTATTGTAAGAGGTATTGATAAAGATGAAAACAGACAGAAAAT
ATTAAAAAATCTTATCTCATATTCTAACGAAAGAAATATTAAAGTGATATCAGAAGGTGTAGAAACAAAA
GGTGAAATGGAAACACTGATTAATCTTGGAGTAGATTATATGCAGGGTTACTATATTAGTAAACCATCAT
TTATACCTGAAGATATAAGTGACAAAATTAAAAAAGAGCTCAAGATATGTCATGAAAATAGGAATGATGT
GGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:838605-840671 putative ATP-dependent DNA helicase [Clostridium difficile R20291]
GTGGTGGAGCTAATAATCACAACAAACATAGATATAAGAAAGTTAAATGAAAATCAATTAGAAGCAGTTG
AACATATAGATGGGCCTTGCATGATACTTGCAGGGCCTGGTTCAGGTAAGACCAGAGTAATTACATATAG
AATAGCCAATATGGTTGTAAACAAAAATATAGCACCAACAAGAATCTTGGCAATAAGTTTTACCAAGGCA
TCTTCAATAGAAATGAAAAATAGAGCTTTGAATTTAAGTGATGATATAAGACTTAATAAGGTAACCTATG
GTACTTTTCACTCTGTATTTTTTAAAATTCTAAGATACTTTGAAAGATACAATTTAGACAGTATATTTGA
TGAAAAGTCAAAGCGAATGACAATCAAGGCAATCCTAAAAAGTTTAAATATAGAGAATGCTGATGATGAT
GAGAATATAGGACAAGTTATAAATGAAATCTCCTATGTAAAAAATGAACTTATGGATAAAAATGAATTTA
ATTCAGAAGTATTAACAAAAGATGAGTTTTTAAAAGTATACAACTTATACGAAGAACAAAAATCTAAAGT
TAACAAAATAGATTTTGATGATATGCTTATAAGAACTTATTATTTACTTTTGAACAATAAGTCTGCACTA
GAAATGGTTAGAAATGTGTATAAATATATATTGATAGATGAATTTCAAGATATAAATAAAGTACAGTTTG
AAGTTTTAAAGTTAATTTGTAGCCCATTAAACAATATATTTGCAGTTGGAGATGAAGACCAAAGTATATA
TGGATTTAGAGGTGCTAGACCAGATTTTTTGCTTGAATTTGAACAATACTTTAATAATACTAAAAAAATA
ATATTAGATATAAATTATAGGTCTAAAAGTGAGATAGTGTATACTGCAAATAGACTTATCGACAAAAATA
AAAATAGATATGAAAAAGTCATTAAGTGTAGTCAGGGGGATGGAGGAAGTGTTACCTACATTTCTCCACA
TGATTCAGAGGAAGAAGCCTTATATATTGCCAAGGAAATAATTGACGAAATACAAAAAGATTATGTAGAG
TATTCAGATTTTGCAGTAATTTATAGAACAAATATACAGTCAAGAGCATTAGTAGATGTATTTATGGATA
TGAGGATTCCATTTGTAGTAAAAGACTCAGTAATTACAATATATGACCATTGGGCAAGTCAAGATATACT
AGCTTATTTAAGAATAGGTATTAATCCAAAATCAAATAAAGATTGGTTGAGAATTATAAACAAGCCTTTT
AGATATATATCCAAAGACAGTATAAATATGGTTAAGGATGAAAAAGACTTTATAACAGCATTAATAAATA
AGTGTAATCTTCATCCTAAACAAGTTAAAACAATAAATGATTTGGAAATAGATTTAAGTTATTTAAATAC
TTTAAATCCTAAAAATGCAATATCTTATATTAGAACTAGTCTTGATTATGATAGATACGTTTTAGATTAT
TGTAGCAACAGAAAGATAAAAACTAATGGACTTGTAGAGATATTAAATGAACTTGAGAGTTCAGCAACTA
ATTTTAATACTGTTACAGAGTTTTTAGAGCATATTGATAGAGTAAAGACTGAGTTAACGGAAAATAACAA
GAATAAGCAGACTGAGGGTGTCATATTTACAACTATGCATAGTGCAAAAGGATTAGAATTTAGAAATGTT
TATATTATAGGTGTAAATGAAGGAACAATACCTCATGAAAAATCATATGATATTTGTAAGGAAGAGAAAA
AAGAAGAACAATTAGAAGAAGAAAGAAGACTTATGTATGTTGCTATTACAAGAGCTGAAGAAAAGTTATG
TATAAGCTCTACTTTAAATAAGTATGGTAAGAAAGTTGATAAATCATTATTTATTAATGATATAAAATCT
CCAACGAAAAAAGAAATTGACAGTATTGGTGTAGGGGATAAGGTATACCATAAAAAATTTCATGAAGGAG
AAATAATTAAAAAAGATGGAATTATGTTTACAATAAAGTTTAAAGATAGAGAGCGAATCTTGGATTTGAA
AACTTGTTTATTGAAGAATATAATTTATACTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:841699-842514 amino acid ABC transporter, substrate-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTATTTAAAAAATTATTAAGTTTAGGATTAGTATTAGGATTGACATTATCGCTAGTAGGATGTA
GTGGTGGAGGAGAAAAAACAAAGTTAGAACAAATAAAAGACAATGGAAAATTAGTTGTTGGTACTAGTGC
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TTGGCTGAAGAATTTGCAAAAGAGCTTGGTGTAAAGGTTGAAATTAAGGATATGTCATTTGATGGATTAA
TAGGTGCTTTAAATGCAGACCAAGTTGATATTGTTCTTGCAGGTATGTCTCCAACACCAGAGAGAGAAAA
GAGTGTTGATTTTTCAGAATTATATTATTTAAGTAGAAATGCAGTTATAGTTAAAGATGCAGATATAGAC
AAAGTAAAAACTGAAGATGATTTAAAGAAACTTAGAGTTGGAGTTCAAGCAGGAAGTATCCAAGAAGAAT
ATGTAGTTAACACTTTAAAAATGACAACTACAAAATCTTTAAAAGCAATACCTGATTTAATTACAGAATT
AAAAAATGGAAACATAGATGCAGTTGTTACTAATGAAGCAGTTTCTTTAATAAATGTTAAAAAATATGAT
GGAATAAAAATGGCAAATACTGAAGTTGGTAAAGATGTAACAGAAGGTATGGCAGCAGCAATCAAAAAAT
CTGACAATAACAAAGATTTTATAGAATTATTAAACAAAAAGATAAAAGAATTACAAGATGGTAAGAAGAT
AGAAGAATTTTTAAATGAAGCATCTACTGAAGCTGCTTCAAATTAG
>ref|NC_013316.1|:842542-843219 amino acid ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTTAGATTTTAGTTTTTTAAGTAGATTTGGGACTTCTTTTTTGGAAGGAACAGGTGTGACAGTAT
CAATTTCTCTTGTGGCATTATGCTTTGGATTTATAATAGGTATAATTATCTGTATGGCAAAAATATCAAA
GAGCAAAGTATTAAGAGCAATATCATCAATCTATATTGAGGTTTTAAGAGGGACACCATTATTAGTACAG
ATATATATAGTATGGTTTGGTTTACCTCAATTAGGAATAAGATTCCCTATGTTGTTTGGTATACCAAGTG
AATTTATAGCTAGTGCATTTGCATTATCAGTAAACTCTGGTGCATACGTGGCAGAGATACTTAGATCAGG
TATACAATCAGTTGATAATGGACAAATGGAAGCAAGTAGATCATTAGGATTAAATTATTGGTCAACTATG
AGATATATAATAATACCTCAAGCTATAAAAAATATATTACCTTCATTAGCAAATGAGTTTATTACACTTG
TAAAAGAATCTTCAATAATATCTGTAATAGGAGTTGTTGAGATAATGCGTACTGCTGATATAGTAAAAAA
TGCAGCATTTAGAGCATTAGAGCCATTAATAGTAGCAGCAGCAATTTACTTTGTTATAACATTTACTCTA
TCAAGATTAGTTGGATTATTAGAAAAGAAACTATCTGTGTCTAACTAG
>ref|NC_013316.1|:843278-844000 amino acid ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATTACAATAAAAAATTTAAGTAAATCTTTTGGAGATTTAAATGTATTAAAAAATATAGACTTAGAAA
TCGCTAAAGGCGAAATAATGGTTATAGTAGGTCCAAGTGGTTCTGGTAAAAGTACACTTCTTAGATGTAT
GAATTTACTAGAAATACCTACAGGTGGAGAAATAATATTTGAAGGAAAAAATTTGGTCGATAAAAAAACT
AATATTGATGAGGTTAGACAAAATATAGGTATGGTGTTTCAAAACTTTAATTTATTCCCACATAAGACTA
TTTTAGATAATATAACATTAGCACCAATTAAATTAAAAAAGATGACTAAGGAAGAAGCAGAAAAAAAAGC
AGAAATTTTGTTGAGTAGAGTTGGTCTTTTAGATAAAAAAGATTCATATCCATCACAATTATCTGGAGGA
CAAAAGCAAAGAATAGCAATAGCTAGAGCACTTGCTATGGAACCAGATATGATGTTGTTTGATGAGCCAA
CATCTGCTCTTGACCCAGAAATGGTAAACGAAGTTTTGGATGTTATAAAAGAACTTGCTAAAGAAGGTAT
GACAATGGCAATTGTAACTCATGAGATGGGATTTGCTAAGGAAGTTGCAGATAGAGTTATTTTTATAGAT
GGAGGAAGTATACTTGAAGATAATACTCCAGAAGAAGTTTTCGGAAATCCAAAACATGAAAGAACAAAAG
CATTTTTAGCAAAAGTGCTATAA
>ref|NC_013316.1|:844648-845799 putative cysteine desulfurase [Clostridium difficile R20291]
TTGGAAATATACTTAGACAATAGCGCAACTACAAAACCTTATCAAGAAGTTATAGATAAAATGGTTTATG
CACTTAATACGGAATATGGAAATCCTTCTTCTGTCCATAGAAAAGGTGTAGAAGTTGAAAAAGCTATAAA
AGAAGTAAGACAAGATATAGCTAAATCTCTAGGAGCGAAAGAAAAGGAGATTTATTTTACATCAGGTGGT
ACAGAGTGTAATAATACTATAATAAGAGGTATTACTAGTTTAAATAAAAAAAGAAAAAATCACATAATAT
CTACTAACATAGAACATCCTTCTGTTTTAAATACATTAAAAGATTTAGAAGAAGATGGTTTTGAAGTAAC
TTATTTAGAGGTCGGAAAAGATGGGAAAATAAATATAGAGGATTTAAAAAATGCGATAAAGTCAACTACA
TGCTTAGTAAGCATGATGCATGTTAACAATGAAATAGGAACTATACAGCCAATAGGTGAAGTTGGAAAGT
ATTTGAAGGGTTTAAAAGAAAAAATTTATTTCCATGTTGATGCTATTCAGTCATATGGAAAAATTAATTT
TAGACCATCTAAATACAATATAGATTTTATGAGTGTAAGTGCACATAAATTTCATGGTCCAAAGGGAATT
GGATTTATGTATATAAAAGAAAATAATCGCCTTAAGCCTATGTTAACAGGTGGTGGTCAGGAAATTGGAA
TTAGGTCGGGAACAGAAAATGTACCTGGAATATATGGTCTTGGAGAAGCTGTTAGAATACTAAACAAAGA
TTTAGATGTTGTTATTTCGAAAGTAAATAACTTAAAAAATATATTAAAAAATGAAATAATTGATAATATA
GAAGATATAAAAATCAATTCTCCAGAAGATGGAGTATGTCATATATTAAATGTATCATTTAGAGGGACAA
AAGGAGAAGTTTTACTTCATTACCTAGAGCAAAAAGGTATTTATGTATCAACTGGCTCTGCATGTTCTTC
TAAAAAGAAAGGTAGTTACGTATTAAATGCTATAGGTCTTACAAATGAAGAAATAAATGGAACAATAAGA
TTTAGTTTATCTGATATGAATACAGAAGAAGAAATGTTAGAAGCTGTGAAAGTTTTGAAAGAATCAATTT
GTGACTTAAGGTCAATAATGAAAAGAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:845845-847020 putative thiamine biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGTGTATAATATATTAATAGTAAAGTATGGAGAAATTGGAGTAAAAGGAAAGAATAGATATATATTTG
AGAATAGGCTTATAAGAAATATAAGAAATATGTTAAAACCAATTGGAAGATTTAATGTATATAAAGAGTA
TGGAAGAATATATGTTGATTTAGAAGACTATGATTATGAAGAAGTAATTGAAGAAGTTAGAAAAGTATTT
GGGATAGTGGGTGTGTGCCCTGGAGTAAGAGCTAAAAAAGATTATGATACATTAAAAGAAATAGCTTTAA
AAATGTTAGAAGAAAAAATAGAGGCTGGATATAAAACTTTTAAGGTAGAGTCAAGAAGAGGAGATAAGTC
TTTCGGGTTGACTTCTCAAGAAATGAGTATGGATATAGGTGGATACTTATTATCAAAGGTAGGAGATAGG
ATTAATGTTGATGTAAGAAATCCAGAAGTTAAAATAAAGTGCGAATACAGAGAATTTCATACTATGGTCT
ATAGTGATACTATACCTGGATATGGTGGATTGCCACTTGGAACGAATGGTAGAGCTATGTCTCTTTTATC
AGGAGGTATAGATAGTCCAGTAGCTACATGGATGGTTGCAAAAAGAGGTATGGAGGTAGAGGCAGTTCAC
TTCCATAGTTATCCATTTACAAGTGAAAGGTCACAGGAAAAAGTTAAGGATTTAGCTAAAATACTGGCAA
AATACTGTGGTAGAGTAAGACTTCATAAAGTTAACATATTAGAAATACAAAAAGCAATTGGTGAGAATTG
TAATGAAGAAGAAGCTACTATTCTTTCAAGAAGATTTATGATGAGGATAGCACAGAGACTTTCTGAAAAA
AGACATTGTGATGCTTTAATTACAGGTGAAAGTATTGGGCAGGTTGCATCTCAAACTATACAAGGGCTTA
CTTGTACTAATGCCGTTGTAGACTTACCAGTGTTTAGACCACTTATAGCAATGGATAAATCAGATATAGT
TGATATAGCCAAAAAAATAGGGACTTTTGAAACATCTATAGTGCCTGAAGAAGATTGTTGTAGTGTATTT
TCTCCTAGAAAGCCTGTCACTAAACCTAGATTAGAGAAAATAGAAAAATCTGAAACAGCACTTGATATTG
AAAAATTAGTACAGGATGCTATTGACAAAATAGAGGTAGAGGATATTGAGTTTTAG
>ref|NC_013316.1|:847161-847979 fimbrial protein (pilin) [Clostridium difficile R20291]
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GAATTTTAGTTATAGTAGCTGTTCCAGCGTTATTTAGAAATATAGAAAAAAGTAAGGCAGTTACATGTCT
TTCTAATAGAGAAAATATAAAGACTCAAATTGTTATTGCAATGGCTGAGGAATCAAGTAAAGACAAGAAT
GAAGTCATAAAAGAGGTATTAGAAAACAAAGATGGTAAGTACTTTGAAACAGAACCAAAGTGTAAGTCAG
GTGGAATATATTCAGCAACGTTTGATGATGGTTATGATGGAATAACTGGAATAGAAAGCATTGCAAAAGT
GTATGTTACTTGTACAAAACATCCAGATGGTATTGAAATGGCTAGGGATATACATCAAAGTATGAAAGAT
TTGATTGCATCATTTGCACAAGACCCTTCTATAATACCAGGAGCTTCAAAGGGCAATGATGATTTTAGAA
AATATTTATTAGACAATAAATATAAAAATGGGTGGCCTACAATTCCAGATGAATTTAAGGCAAAATATGG
ATTAAGTAAGGATACACTATATATACAACCATATGCATATAATCCTACTAAATCTGATGCTACTGTAGTT
GTATTTGCAAATAATAAGACTGGAGGTAATTGGTATACTTCCCTAGTTTACGATTATGATGAAGGTAGAT
GGTATAAAGGTAAAAATGGTATTTCTGTTGCAGGTAGGTCATGGGATGTTGACACAGATAGTGTTAAGTC
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>ref|NC_013316.1|:848222-848863 putative reductase [Clostridium difficile R20291]
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CAACAGAGCAAATTAGTGATGAGCAAGTAAACACATTATTACACTGTGCATTTGCAGCACCTTCAGGATG
TAATAAACAGCCTTGGCACATAACTGTTGTGCAAGACCAGAAACTTTTAAAAGAGATTAGTGATGATACT
TTATCTAGGATTCATGAAGTGAGTAATGTTGAGATAAATAAAAACTTTAAGTTATTTTATGGTGCTCCAA
CCGTTTTATTTATTTCTTATGATGAAAGTAGTTCATGGGCTCCATATGATATAGGAATACTTACAGGGAA
TATAACAACAGCTGCACAAGCACTAGGGCTTGGAAGTTGTATAATAGGAATGGTTAGAGGTTTATTTACA
CCTGTTGAACAAGGGGATATTGAAGGTCTTGTGAGTGTATTGGATAAAGAAGATGTAAAGGAATCAGAGT
CAATAAAGATGAAGTTTGATACAAATAAAAAATACAGAGAACTACTTGATATACCAGAAGGGTATTCTGT
ACCATTTGGTATTGCTGTAGGTATTCCAGATGGAAATTTACCAAATGCTAGAGAGGTAGTTTACAAAGTT
TCCAGAGTTTAG
>ref|NC_013316.1|:850276-851946 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAGAAGAATCGAACTCTTTAAGTTTAGACCATATAGAAATTTTCTTTGAACTTTTATCTCAAAGTA
CAGAAGATTATATATTTTTTTGGGATATAAATAGGAATAAATTTAAAATTTCTTCAGCAATTTTTGATGA
ATTTAACTTAAGTAAAGAGATAGAATCTGATTTAGTCAATTGTTGGAGTAAAATTGTTTATCCGGATGAT
GTTCAAATATGGAAAGATGATATACAAGAATTACTACATGGAAAAAAAGGTGAGCACAATTTAGAATATA
GGTTGATTAATAAATATGAAGAAATAGTATGGATTTCTTGTAGAGGTAAAGTTTATGTGTCGGATGACCC
AAAAACTATATTTCTAGTCGGGAGAATAAAGAATATTGGTGAAAAAAATAAATTTGATTCTATCACAGGA
ACGTGGAATAGAGAACAATTTGAACATAGAATGAATTATCTTATAAAAGAGAAAATTTATAAAAATGGTG
CTATGTTTATCATGGATATTGATAATTTTAAAAATATAAATGAAAAATATGGACATTCTTATGGTGACAA
AGTATTGCGTGCAATTGCTACTGAAGTATTAGAATATCTTCCAAAAGATGTAAGATTGTATAGGTTAGAT
GGAGATGAATTTGCATTTTTTTACCCTATGTGTACTAAAGAAACTATAGAGAAAATATATGAAAAGATAC
AGATGTATACAAATACTCAGCATGAAATTGAATCAAATAAGTACTATTGCACAGTGACTGCAGGAGTTGC
TATGTATCCAGAAGATGGAGATAATTATTTAGATTTATTTAAACATGCTGATATTGCATTGGATATAGCA
AAAATTAGTGGTAAAAATAGAATTAAGTTTTTTTCACAAGAGCTCTATGAAAATAAACTAAAGGTAATTT
CAATGCAACAAAAACTAAGAGAGTGCGTTGAAAATAATTTTAATGACTTTGAGCTGTTTTTTCAACCCCA
GGTAAATGCTGTTACAAAAGAGGTAATAGGGGCAGAGGTACTTTTAAGATGGCATTCGAGTACTTATGGA
GAAGTATCTCCTGTTGAATTTATACCAATACTAGAACAGAGTAATTTAATTATACCAGTTGGGAAGTGGA
TTATAAAAGAAGCTGTAAAACAGTGTAAAGAATGGCATAAAATAAATCCAGACTTTAAAATATCTGTAAA
TGTATCGTATATTCAGTTAAAAGAAGATTTTTTTAGAGATTTTATAGTAGAATGTTTAGTAGAGTATCAA
TTAAGACCTGAATTTTTAATTTTGGAATTAACAGAGAATTGTTGGATACCAGATATAAATTTACTAAATG
ATAAATTTATTAGTTTAAAGGGTATAGGAGTATATATTGCAATAGATGACTTTGGTACAGGGTATTCATC
TTTAAATTACCTTAAAGAACTGTCTGTTAATATAATAAAAATTGAAAGAAGTTTTGTTAAGAATATTACA
TATAATAGTTATGAATATACTTTTCTTGAATATATTATTAAATTAGCTCATATTATAAATTTAAAAGTTT
GTGTTGAGGGAATAGAGTCTTATGAAGAGTATGATATAGTAAAAAGCTTAGGTGTAGATATTATTCAGGG
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>ref|NC_013316.1|:c852802-852068 pyruvate formate-lyase activating enzyme [Clostridium difficile R20291]
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TATTTTTTCAGGGGTGTCCTCTTAGATGCAAATACTGTCATAACAGGGATACATGGGATATTAAATCAGG
AAAAGAATACACAGTTGATGAAATAATAACGGATGCTCTTAAGTATACTTCTTTTATGAAGTTTTCTGGT
GGAGGTATAACTGCCTCTGGTGGTGAATCCACTCTTCAACCAGAATTTTTAAGTGAATTATTTAAAAAAG
CAAAAGAAAATGATATACACACTTGCTTGGATACATCTGGATTCGTAGATATAGAAACTATAGACCCAGT
TTTAGATAATACTGATTTGGTTTTACTTGATTTAAAACATATGGTTGAGGAAAAATCTATTGATTTGACT
GGTGTTGGTATGGATAAGGCATTAAAACTTGCTAGACACTTAGAATCAAGAAATATTCCTGTATGGATAA
GACATGTTTTAGTTCCTGGCATTACTGATGATATAGATAATTTAGAAAAACTAGGTCAATTTGTAGCTAC
ATTGAAAAATGTAGAAAGATTTGAATTGCTACCATACCATTCTATGGGAATACACAAATGGGAAAGTTTA
GGTATCGATTATGAACTAAAAGATGTTCCTGATGCCACTAAGGAAGATGTCCAAAAAGCTAGTGAAATAA
TCTCTAAATTTGGAGTGAAAGTATATAATAGTTAG
>ref|NC_013316.1|:c855193-852962 formate acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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TAAACTATTCTCCATATGAGGGAAATGACTCTTTCTTAGCTGGTGCCACTGAAAATACTAAAAAATTATG
GGACGAAGCAATGGTCCTATTTAAAAAAGAAAGAGAAAATGGTGGTACTTTAGATGTTGATACAAAAACT
GTTTCTGGAATAGCTGCATATGCTCCAGGATATTTAGATAAAGAATTAGAAACAATAGTTGGGTTACAAA
CGGATGCCCCTTTAAAAAGAGCTGTCATGCCATATGGTGGTATAAAGATGGTTGAAAATTCATGCGAAGC
TTTTGGATATGAATTAGACCCAGAAATAAAAGATATATTTACTAAATACAGAAAAACACACAACCAAGGA
GTTTTTGATGTTTATACTCCAGAAATGAGAGCTGCTAGAAAATCTGGTATAATAACAGGTCTTCCAGATG
CTTATGGTAGAGGTAGAATAATTGGTGACTACAGAAGAGTTGCTCTATACGGTGTTGATGCTTTAATAGA
AGATAAAAATGAGCAAAAGAAATCATTAGAAGTTTCTTGCATGGATGAGGAAGTTATCAGATTAAGAGAA
GAAATAACTGAGCAAATATCAGCTTTAAATGAACTTAAAAAAATGGCTGAATCTTATGGATTTGATATAT
CAAAACCAGCAACTAACTCAAAAGAAGCTGTACAATGGTTATACTTTGGTTATTTAGGTGCTGTTAAAGA
CCAAAATGGTGCTGCAATGTCTTTAGGTAGAACATCTACTTTCTTAGATATATACTTTGAAAGAGATTTA
AAAGCTGGAATCGTAACAGAAGAAGAATTACAAGAGTATATGGACCATTTTGTTATGAAATTAAGAATGG
TTAAGTTCCTAAGAACTCCTGATTACAATAACCTATTCTCTGGAGACCCAACTTGGGTAACTGAGTGTAT
AGGAGGTATGGGAATAGATGGTAGAACATTAGTTACTAAAAACTCATTTAGAATGTTAAATACTCTATAT
ACATTAGGACCTTCTCCAGAGCCAAACTTAACAGTTCTATGGTCAACTAAATTACCTCAAGGATTCAAAG
ATTTCTGTTCTAAAGTATCTATAGATACAAGTTCAGTACAGTATGAAAATGATGATTTAATGAGAGCATA
CTGGGGAGATGACTATGGTATAGCTTGTTGTGTATCTGCAATGAGAATTGGTAAACAAATGCAGTTCTTT
GGAGCTAGAGTTAACTTAGCTAAAACTTTATTATACGCTATAAATGGTGGTGTAGATGAGAAATCTGGTG
TTCAAGTTGGACCAAGATTTGAACCTATAACTTCTGAGTACTTAGATTATGATGAAGTTATGAGTAAATT
TGAACCATTCACTGATTGGTTAGCAACATTATATGTAAATACTTTAAATGTAATACATTATATGCATGAT
AAATATTCTTATGAAGCATTAGAAATGGCATTACATGATAGAGATATATTTAGAACTATGGCTTGTGGTA
TGGCTGGGTTATCAGTTTGTGCAGACTCATTATCTGCTATAAAACATGCTAAGGTTAAAACTATTAGAAA
TGAACAAGGAATAGCTGTTGATTTTGAAATAGAAGGAGATTATCCAAAATACGGAAACAATGATGATAGA
GTTGATAGTATAGCTGTAGAGTTAGTTGAAAGCTTTATGAATAAAATAAGAAAAAATAAAACTTATAGAA
ATTCTTATCCAACTCAATCTATACTTACAATAACTTCAAATGTTGTTTATGGTAAGAAAACTGGTAATAC
ACCAGATGGTAGAAGAGCTGGTGCTCCATTTGCTCCTGGTGCTAACCCAATGCATGGTAGAGATACTAAT
GGTGCTTTAGCTTCATTATCTTCAGTTGCTAAATTACCATATGAACATGCTCAAGATGGTATATCTAATA
CTTTCTCTATAGTACCTGCTGCTTTAGGAAAAGATATGACTGAAAGAATAAACAATCTTTCTGCAATGAT
GGATGGATACTTCTCTCAAAATGCTCATCACTTAAATGTAAATGTATTTGATAGAGCTACTTTAGAAGAT
GCTATGGAACATCCAGAAGAATATCCACAATTAACTATAAGAGTATCTGGATATGCAGTTAACTTCATAA
AATTAACTAAAGAGCAACAATTAGATGTTATAAACAGAACATTCCACGGTAAAATGGCTTAG
>ref|NC_013316.1|:855486-856547 Ca2+/Na+ antiporter [Clostridium difficile R20291]
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TTATCACAGTGGTATTATTTTTAGTAGGTTTCCTATTAATTACTAAAGGCGCAGATATCTTTATAAATTG
CACTGTAGAGATAGGTAGAAAAACGAATATATCAGAAATTATACTTGGAGCTACTATAGTTAGTTTTGCA
ACAACATTACCTGAATTTACAGTGTCTCTACTTGCTTCTATTGATGGTCATACTACTATGAGTTTAGGAA
ATGCAGTTGGTTCTATAATATGTAATACAGGATTAGCATTAGGGTTGGTTGTTTTTATAAGTCCATTTAA
TGTAGATAAAAAAATGTTTTTTTCTAAGTCTTTACTATTAATAGTATCCGTTATAGTTTTAATTTTATTG
AGTTTAGATGGAGTTATAACAAGAGGTGATTCATTATTACTTATAATAATATTAATCTTTTATATGGTTA
ATAATTATAGAAGTGTCGTTGGAAAATCTGATACTAAAAATAGAAATATTAAAAATAACACTATTAAAGA
CATATCTACTAAAAAAGGGAAAAATTATAGAGGTTTTTCCGTATTAGAAATTGTAAAAATACTATTACTT
TTTGCTACAGGATTGATAATGATGATAATAGGTTCACAAATCCTTATAGAGAGTGGAGTAATAATAGCTA
GTTTTTTAAATATACCTCAGGGTATAGTAAGTTTAACTATAATAGCACTTGGAACTTCTCTGCCAGAGAT
AGTTTCGTCGATTACTGCTATAAGAAAAAATCATCATGAAATATCAGTAGGAAATATTTTGGGTGCAAAC
ATATTGAATATAGTATCAGTAATAGCTGTATCAGCAATACCAAATAACATACCAATACTATCTCAAAATA
GACAATTGGATATACCATTCATGATATTATTATTATTAATAGTAATAATACCAACACTTAAATCTAATAG
ACTTAGTAGAATACAAGGTATATTGATGTTATTCACATATTTTCTGTACATATCAATTTTGTATTTCATG
TATATTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:856638-858251 putative ATP-dependent RNA helicase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATAACAAAGTTTGAAGATTTACCAATAAGTGAGGGAATAAAAAAAGCTATAGCTGAAATGGGGT
TTGAAGAACCATCTCCTATACAAGCACAGTCTATACCTGCGATTTTGTCAGGTAAAGACGTTATAGGACA
AGCTCAAACTGGTACGGGAAAAACAGCTGCTTTTAGTATCCCTATACTAGAAACAATAGACCCAAATAAT
AGAAGTTTACAAGCTGTAGTGCTTTGTCCAACAAGAGAACTGGCAATACAAGTATCAACAGAAATAAGAA
AGTTAGCTAAGTATTCGCACGGAATAAAGACATTACCTATATATGGTGGCCAGCCAATAGATAGACAAAT
AAAATCTCTAAAGAGTGGTGTGCAAGTTGTAATAGGTACACCAGGACGTACAATAGACCATATCAATCGT
AAAACATTAAAGATGGATAATGTAAAAATGATTATATTAGATGAAGCAGATGAAATGCTAGATATGGGAT
TTAGAGAAGATATAGAAATGATTTTAAGTAAGATTCCAGAAGAAAGACAAACAACTTTCTTTTCAGCTAC
TATGCCAAGAGGAATTTTGGAATTAACTAAGAGATATCAAAAAGACCCAGAGCATATAAAAGTTGTTAGA
AAAGAACTTACAGTTTCAAATACAAAGCAATACTATATAGAAACTAGGTCATCAAATAAATTAGAAGTAT
TATGTAGATTAGTAGATGTATATGACCCTAAACTATCTGTTGTTTTCTGTAATACTAAGAGAAAAGCAGA
TGAATTGGTAGGAGATTTACAAGCAAGAGGATATTTTGCAGATGCATTACATGGTGACTTAAAACAGACT
CAAAGAGATATAGTAATGGATAAGTTTAGAAATGGTACAATAGATATACTTGTTGCTACTGATGTTGCAG
CTAGAGGTATAGATGTTGATGATGTTGAATGTGTATTCAACTATGACTTACCACAAGATGAAGAGTATTA
CGTTCATAGAATTGGTAGAACTGGTCGTGCTGGTAGAGAAGGTATGTCATTTACTTTTGTATTTGGAAAA
GAAATGAGAAAGATGAAAGATATAGAAAGATATACTAAATCTAAACTAATAAAGCATAATATACCAACAA
TAACTGATGTTGAAGAGAAAAAAGTAGGTACTTTCTTTGCACAAGTTAAACAAACTATAGAAGAAGGTCA
CTTAACTAAACAATTACAATGGTTAGAAGGTTTCTGTAATGATGAAGATTATGCAATGGTTGATATAGCT
GCTGCACTTGTAAAACTATCTCTAGGTGAAGAAATGAAAGAAGAAATAATAGAAGAAAAACCTAGAAGAG
AGCGTGGAGATAGAAAAGGTGGTACTGGAGCTAAAGATGGTATGATTAGATTATTTATCAATATTGGTAG
AAATCAAAGAGTACAAGCAAAAGATATAGTTGGTGCTATAGCTGGAGAAGTTGGAATACCAGGTAAAGTA
GTAGGTACTATAGATATATATGATAAGTATACTTTTGTTGAAATACCTAAAAAAGATGCAAAAACAGTAA
TTGAAAAGATGAAAGATATTAAGATAAAAGGTAATAAGATTAATATAGAAAAAGCAAATAAGAAGAAAAA
ATAA
>ref|NC_013316.1|:858526-860511 putative transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAATGACTTATATGGACCCTAGGGTTTTTTTGATTTTAGAAATGGTGTTAGAAGAAGACACAAATA
CTCTAGAACAATTTTCAAATGTTTTGGGTGTTAGTACTAGGACTATCAGAAACTATATAAACCAGATTAA
TCGAGAATTAAAAGGTGGTATTGCTAAAATAGTTAAAAATGAAAAAGGTACATATAGTATAAGAATTGAG
GATGAAAGTAAATTAATTGAGATTGTAAATTTTAATAGAGGAAAGCTATCAAATTTTATAAATTTAAATT
CACCTGATGAAAGAATAAATTATGTTCTTGATATTTTAACTATGACCAACAATCCAATTACCATAGATGA
TTTGGCTGAAGAGATATGTATAGGAAGAACAACATTAATAAAGGATTTAAAAAAAGCAGACAGAATTTTA
GCTGAATATGATTTAGAATTAAAAAGGAAGCCAAATATAGGTATGATTTTAGTTGGTGAAGAAATGGATA
TAAGATTATTAATCCTTGATAGATTGTATGAAAATTATATTGATGTCTTGGAAAACGTTAATCAGATAAA
TTTAGTTAAAGATTATGATATTGAATGTCTTAGAGATGAATTAAAAAAGTTGTTTAAAAAAGAAGAACTC
TACATAACAGAACAGGTCTTGAGAGATGTTGAAAGATATATAATCATGTCTGTCTTAAGAAATCTAAATG
GGTACAAATTTGAAAAGATAGATAAGAGATTTGAAGTGATAAGATGTTCAGATGAATATACTTTAGGATT
AAAGCTCAAAGCTTTATTGGAAAAGATATTTAATATAGTTTTAAATGAAAAAGAAACCATATTTTTGACA
ATGCCATTAATAGGTAGAAAAGCTCCTAGTACAAAATTAGCACTTAGCAGTATAAAGATAAATGATAGCG
TAAAGGAAGTTGTAGATGAAGTAACTAGTTTTTTATTAGAGACCTCAGGGATTGATTTTAAAGAAGATAA
AAAGCTTATAGAAAATTTGGAATATCACTTGTATTTTGCACTTAATAGAATGAGATTCAACATAAGGGTA
AAAAATCCTCTTTTACAAGAAATAAAGGAAAGATATACATTTCCATATAGTGTTGCAAAGATAGCTGCAA
TGATAATTGAGGAAAAGTTTGACTTGAAAATATGTGACCACGAAATAGGATATATAGCATTACATTTTGG
AAGTTATTTTGAAAAAAATTCAAGAAAAGTTCTAAATGTAAATAGGGTAGCTGTTGTTTGTGGAACAGGT
CTTGGGACTGCACAACTTATTAGAATAAAGATAGGAAAAATACTTGGAGAAAGTGTAGAAGTAAATACTT
TTTCTGATATAGAAGCTAAAGCTAATTTAGATTTATTAAAGTATTATGATTTAGTATTTACAACAGTAGA
TTTCAAAACAGACTTAGATGTTCCAATTTTTAGAGTAAATGCGTTATTTAATGAAGAAAGTATAAAGAAA
GAGATAGAAAATGCAATACTTTTGAAAAATAGTATAAATCTTAAGTCTATAAAAAAGATTGAAAAAAATA
TCCCTTTTATAGGTAAATTAATTGAAGAGGATAAGTTCTTTATATTGAATAAGAGTACGTTTATGGAAAA
TTTAGAAGATATGTTAGAAAAATTAGTTCATAAAGGAATTATTGATATAGAGTTCAAAAAAAAGGTATTA
AAAAGAGAAAAGAAATCTTCAACAGCATTAGATAATTATATAGCATTGCCTCACTCAGTTAATACTAATG
GGGAAAATCTTTATCTGTCATTTGGAATATTAGAAAAACCAGTGGTTTGGGATACAAAGGAAATTAGAAT
AATAATATTGATGATAATTCCAGATAAGAATGTAGATAGTACAGACCTGATAATAAAAAGTTATGAAGAA
GTACTTGAAGTAGGGAGAGATAAAAAAATGATAGAAGAACTTGCTAAAGTAAAATCATTTGATGAATTTT
ATAAAATAATTACCAAGAGGAGGTAA
>ref|NC_013316.1|:860516-860950 glucitol operon activator protein [Clostridium difficile R20291]
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AGAAAAATGCAAGGTGTTACAGTATTGGCAAGAGTAAAGTCATTTGAAGGTTTGGTAGGAAAGAGCTTAG
AGTACATAGAAAAATCAGATTTAACTGTTTACAATAAACTACTTAAAAAAGCAATACTAGATGCAGTCAA
ACAGTACATAACATTTGAGAAAAATAAATGTGAAGATACAAATAATCTGAGTACTGATGAAGAGTGTAGG
ATGGAAGTAGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:860979-861539 PTS system, glucitol/sorbitol-specific IIc2 component [Clostridium difficile R20291]
ATGACGCAATTTTTTCAAGTATTAGCAAGTGGTGCAGATAGTTTTATGAATTTATTTAGGGCAGGTGGGC
AACAATTTGTAGGTTTTGTAACAGATATAGTACCACTTTTAGTAGCATTATTAGTTACAATGAATGCAAT
TATCAACTTTATTGGTACAGATAGAGTCGAGAGACTTGCAAAAAAATGTTCTGCAAATATATTTACTAGA
TATTTGATATTACCAGTCCTTGGTACATTTGTATTTGCAAACCCAATGACACTATCACTAGGAAGATTCT
TGCCAGAAAAGTTTAAACCTAGTTACTTTGCAGCAGCAAGCTTTTCATGCCATACAATGAATGGATTATT
CCCACATATCAATCCAGGTGAACTATTTATATATCTAGGAATTGCAAATGGTATAACAACTTTGGGATTC
TCAACAGCAGATTTAGCAGTTAGATATTTGTTAGTGGGTATAGTTGCAAACTTTATTAAAGGTGTAGTTA
CTGACTATACAACAAAATTTGTAGAGAAACAACAAGGAATAGCATTAAATTCAGATATAAAGATTGGATA
A
>ref|NC_013316.1|:861603-861971 PTS system, glucitol/sorbitol-specific IIb component [Clostridium difficile R20291]
ATGGCATTTAACAAAGTTAAAATAGTAAAAGGTTCTGGAGGATGGGGTGGACCATTGATAATAGAACCAA
CAGAAAAGAAGAATAAGGTAGTATATGTGACTGGGGGAGCAAAGCCAGAAACTGCAGTAAAAATAGCTGA
ACTTACAGGATGTGAGTTAATAGATGGATTTTCACAGGGTGTTAAAGATGATGAAATCGCATGTGTAATA
ATAAATTGTGGTGGAACATTGAGATGTGGTATATATCCTCAAAAGAAAATACCGACTATAAATATAATGA
AAACAGGAAAAAGTGGACCATTAGCAATGTTTATAAAAGAAGATATATATGTTTCAGGGGTAAAACCAAC
AAATGTAGAGCAGTTATAA
>ref|NC_013316.1|:861996-862562 PTS system, glucitol/sorbitol-specific IIc component [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTTATGATACTAAAAAGAAGATAAGTGAGCAGAGTCAAGGAATTGTTGCAAAAATAGGTATAGCAC
TAGGAAATGTGACAAGTACTCTTTTTCAAGCTGGTAGGGATACTATAGATACATTAATACATACTATACT
GCCTTTTATGGCTTTCGTTGCAGTCCTAATAGGTATAATAAATCAATCAGGTATAGGAAATTGGGTAGCC
AATTTACTTACTCCATTAATCGGAAATGTTGGAGGTTTAGTTGTCTTATCAATAATATGTTCATTTCCGT
TGTTGTCTCCGTTTCTTGGACCAGGAGCTGTTATAGCTCAGATAGTGGGGGTATTGGTTGGTACAGAAAT
AGGAAAAGGAAATATTCCACCAAGTTTAGCATTACCAGCATTGTTTGCAATAAACTCACAAGCAGCTTGT
GACTTTATACCAGTAGGTCTTGGTCTTGCAGAAGCTGAACCTGATACAGTTCAAGTAGGAGTTCCGTCAG
TTTTATATTCTAGATTTTTAACAGGTGCACCAACTGTTCTATTAGCATGGTTAGCAAGCTTTGGGTTATA
TAAATAG
>ref|NC_013316.1|:862603-862968 PTS system, glucitol/sorbitol-specific IIa component [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATTAATATACAGTACTCAAATAAATAAAATAGGAGATAATGCAAATGAATTTTTACAACATAATA
TGTTTGTAACTTTCAAAGATAATGCTCCTCAAGAGTTAGAAAATTACTGTTATATACATTCTGAAAATAA
TTTAGTAAAAGAAATACTTACGAATGATGTGTTATCAATAAATAATGTTGATTACAAAATTACTTCTGTT
GGTGAGTTAGTAAACCAAAATCTTTCAGAATTAGGTCATATAACATTTAAGTTTACAGGTGAAAAAGATG
GAGCAATTGGAGGGACCTTATATCTTGAAGAAAAAGAAATAGCACCTATTGGCGTAGGTACTATACTAAA
AATAATTAGAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:863063-863842 sorbitol-6-phosphate 2-dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATGAGAAAAGTGGCTTTAGTTGTTGGAGGAGGAAGAAGTTTAGGTGAATATTTATCTAAACATT
TAGCTAAAGTAGGTTATGATGTTGCTATTGCAGATTTAAATGAAGACAACGCAAAAAAAGTAGCTGAAGA
AATAGAAACTGAATTTGGTTGTAAATCTGTAGGATATGGTTGTAATGCCATAGATGAAAGACAGGTTATA
AGCACTGTTAAAGCTATTGAAAATGATTTTGATAGAATAGATTTATTAGTGTACAATGCAGGAGTGGCTG
TAAGTAAAAAAATAACTGATTTTGGATACAAAGATTTTAAATTTATTGTAGACGTAAATTTAAATGGGTA
CTTTCTATTTGCAAGAGAAGTATCTAAAGTCATGATAGCAAAAGGTATTGAGGGTAGAATCATACAGATA
AATTCAAAATCAGGTAGAGTGGGAAGCAAGCATAATTCAGGATATTCAGCAGGTAAATTTGCTGGAGTAG
GACTTACTCAAAGTTTAGCGCTAGATTTGGCAGAACATAAGATAACTGTAAATGCACTGATGCTCGGTAA
TTTACTTGATTCTGATATGTTTGAAAGTTTAATTCCTCAATATGCAGTAAAATTGGGAATACCTGAATCA
GAAGTCAAGCAAGTTTATATAGATAAAGTACCTTTAAAAAGAGGGTGTAGATTTATAGATGTTGCAAATA
TGCTTACATTTTATGCTTCAAAGGAAGCTGAATACTGTACTGGTCAATCTATAAATATTACTGGTGGACA
AGTTATGTAA
>ref|NC_013316.1|:864835-865953 transposase-like protein b [Clostridium difficile R20291]
GTGATAGTAGTGGAAAAAGCTTATAAGTTTAGAATGTATCCAAATAAAAAACAGCAAGAGTTAATTAACA
AAACTTTTGGATGTTGTAGATTTGTATATAATAAGTATCTTGCTAAAAGAATAGAAGTTTATAAAAATGC
TAAAGAAACTTTTACTTATAAACAGTGTAGTTCTGATTTGACCAATTTAAAAAAAGAATTAAATTGGCTT
AAAGAACCTGACAAATTTTCACTACAAAACGCCTTAAAAGATTTAGATAATGCATATAAAAAATTCTTTA
AAGAAAAAGCAGGATTTCCTAAATTTAAATCAAAGAAAATTAATAGATTTTCATATAAAACTAACTTCAC
AAATGGAAACATTATGTATTGTGGTCAACATATAAAACTACCTAAACTTGATATGGTTAAGATAAGGGAT
AAACAAGTACCTAAAGGGAGAATACTTAATGCTACTATATCTAAAGAACCAAGTGGTAGATATTATGTAT
CATTATGTTGTACTGATGTAGATATTGAAGCATTTGAAAATACTAATAATCAGATAGGTTTAGATTTAGG
AATTAAAGAATTTTGTATCTCAAGTTGTGGAGAATTTATAGAAAATCCTAAGTATCTTAAGAAGTCATTA
AACAAACTTGCTAAATTACAAAGAGAATTATCGAGAAAAACAATCGGTAGTTTAAATAGAAATAAAGCAA
GATTAAAAGTTGCAAGACTTCAAGAACATATAGCTAATCAAAGAAATGATTTTCTACAAAAACTATCTAC
TAAACTAATAAAAGATAACGATATTATTTGCATAGAAGATTTACAAGTAAAGAATATGATTAGAAATCGT
AAACTATCTCGCTTAATTTCTGATGTGTCATGGTCAGAATTTATTCGTCAATTAGAATACAAGGCTAATT
GGTATGGTAGACAAATTGTAAAGGTAGGTAAATTCTTTGCAAGTTCACAAATATGCAATAAATGTGGGTA
TAAAAACGAGGAAGTTAAGGATTTAAATATAAGAGAATGGATTTGTCCTAGTTGTAATGAAACTCACGAT
AGAGATATAAATGCAAGTATAAATATATTAAAAGAAGGATTAAGATTAATAACAATTCAAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:866179-868491 putative formate dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATATAATAAAAAAATTAAGTCATGGATGTACATTAGATTGTCATGATTGTTGTAAATTCAATGTTT
ATACTAAAGAAAATAATGTAGTAAAAATTGAAGGAGATAAAAATCATCCTTATACAAAAGGTTTTATATG
CAAAAAAGGGATGGCTCATTTAGATAGATTAAATCATAAAGATAGAATAAAGACTCCTATGCTTAAAGTT
GATGGAGTATGGAAAGAGATTTCTTTTGATAAGGCTATAGAAATAATGGCAGAAAAGCTTACATACTATA
AAGAAAAGTATACATCAAAGTCTGTCATGCATTATGACCAATATGGAAGTGGGTCTGTGCTAAAATACAT
AGGAGATATATTTTTTAATTTTTATGGAGGTGTTAGCAGACATAAGGGTGGTCCCTGTTGGAGTGCAGGG
ATGCATGCTCAAAAATATGATTTTGGAGTAGCTAAGAGTCATGCTATAGAAGATATGTTAAATAGTAAAA
GTATATTTGTGTGGGGAAAAAATCCAGCATATACTACAATTCATACTATGCAAATAATTAAAAAAGCTAA
AGAAAAAGGGATAAAGATAGTAGTGATTGACCCCATATATACAAAAACAGCTCAAATAGCAGATAAGTAT
GTACAGGTAAATCCTGGAACAGATGGAGCTTTAGCTATAGCTATGGCAAAAATTATAGTAGAAGATAAAT
TATATGATGAAGAATATATAAACTCGTATGTTATTGGTTTTGAAGAATATAAAAAATATTTATCTTCATT
GGAATTAAGTTTTTTAATTGATGAATGTGGTGTTAAAGAGAATGATATAAGAGAGTTAGTGGATTTATAT
ACTAACAAATATTCAAGTATAAATGTTGGATATGGGCTTCAAAAATATAAAAATGGTGGAAACACAATAA
GAGCGATAGATGCTTTAGGTGCTATAACTGGTCAAATAGGATTTAGTGGTGGAGGGGTAAACTATGCTAA
TAAAGTTTATCCAAGTGTTATAAATTCTGACCCTTACAATAGCCAATCATATGGTGAAGATAGGGAGTTT
TATGTAAGTAATATCAGTAAATTTATAGAAGAATCTTTAAAAAATACATCAAATAAAGTAAATTATGCAT
CAGATGAACTTGATACAACATCAAATAAAGTAAATTACATATCAGATGAACTTGATACAACATCAAATAA
AGTAAATTATGTATCAGATGAACTTGATACAACATCAAATAAAGTAAACTATGTATCAGATGAACTTGGT
ATGGCATTACATAAAGTAAATTGTGTATCAGATGAACTTGATATGACATCAAATAAAGTAAATTATGTAT
TAGATGAACTTGATATAACATCAAATAAAACAGATTATATATCAAATGAATTGTATAATTTATCTAATAA
GTCAATCAAAGATAATATTCCTATAAAGATGGCTGTGATAACTAAAAGTAATATGCTGAATCAACTGCCA
GATTTAGTAGAATTGGAGAGGGTGTTTTCAAAAATTAAATTTAAAGTATGTTTTGATATGTTTATGACTG
ATACAGCTACTTTATGTGACATGTTTATACCGTGTACAAATACACTAGAGAGTGAAGATATAATTTATAG
CTCAATGACCAATCCATATATAACCTATAATGAAAGAGCTGTAAAGCCAGCACATAAATTGATGGATGAA
TATTATTTCTTTATGGAGCTAGCTAAAAAAATGGGATTAAATGATTATCCTTTTGTAGAAAAGAGAACTT
ATTTAGAAAAAGTGATTGAACCACTTAAGCGTTTTGACAAAAATCTGGATATAGAAAAACTTAAAAACAA
TTACTTTACTATACATAACCTTGTTGCTTGGGAAGATAAGAAGTTTGAGACTCCATCTGGAAAATACGAG
CTTTATTCAGAAAGTATAAAAAACTTGGGAATAAGTCCAACACCTGTATATATAAGCAATAAATATAAAG
AAATAGAAGATAAAAATATTTCTTTTAGATTATTAACTAATCATCATGCAGATACTTTATTTAGTCAGCA
TTTTATGGACAAAAAATCTATAGCTCAAGCATATATAAATCAGAGAATGGCTAAAAAAGTAGGTATTGAG
GACAAAGATATTGTGATATTGAGGTCAAAAAAGGCAAAAATAAATGTACAAATAAATATAGATGATGGAG
TAGGTAATTATATAGTAAAAATGTATGTTGGTTGGTGGAAGAAACATGGAAATCCTAATAGTTTAACAGA
CACTGGTATATCAGATTTTGGAGGTCAGGTAACATATAATGAAAGTATGGTAGAAATAATACGACAAAAC
TAG
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TAGCCAATGAAATAAGGGAAGAAATAGATAACTTATTAAGTGTAAATCAAGTAAAAAATGTTGTATTTAA
TTTTGAAAATATTAATTTTATGGATTCTTCAGGTATAGGCGTCATCATAGGTAGATATAAAAAGATTTCT
AATGAAGGGGGACGAGTTTCAGTAATTAATATAAGTTCACGAGTTAAGAAGATTTTTGATTTATCTGGGT
TAAATAAAATTATTGGCATTTATGATACGTATGAAGAAGCTCTAAGTTCTTTGTAG
>ref|NC_013316.1|:868928-869356 anti-sigma F factor [Clostridium difficile R20291]
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CATCCTTTGCAGCTAAGTTAGACCCAACAGTAGATGAGTTAGTAGATATAAAAACTGCTGTCTCTGAGGC
TGTTACGAATGCTATAATACATGGATATGAAGAAGACAGTTCTAAGTTTGTTTTCTTAAGATGTGAGATA
GAAGGAAATACTATAAAGATTATAGTTGAAGATGAAGGGTATGGAATAGAAAATGTGGAGAAGGCAATGG
AACCACTTTATACATCAAAACCAGAACTTGATAGATCAGGAATGGGATTCACAGTAATGAAAAGCTTTAT
GGACGATGTAGAGGTAAGTTCTGTAAAAGATAATGGGACTAGAATTGAAATGACTAAAAAAATAAATGTG
CCTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:869379-870143 RNA polymerase sigma-F factor [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGTAACTGTTGCCAGAGAAGAAAAAAAACCTCTTCTTAGTCATGAAGAGACTCTAGAACTTATTG
AAAAAGTTCAAAATGGAGATGAAGAGGCAAAAGAAATATTAATATCAAGCAATTTAGGTCTAGTTAGGAG
CGTTGTATCTAGATTTTTAAATATAGGATATGATAGAGAAGATTTATTTCAGTTAGGTTCTATAGGCTTA
ATAAAATCAATATATAAATTTGACCCAAAATTTAATGTAAAATTCTCTACTTATGCAGTACCAATGATTT
TAGGTGAAATAAAGAGATACTTAAGAGATGATGGTATGATAAAAGTATCAAGGTCGTTAAAGCAAATAGC
TGTAAAGGCAAAGATGGAAAGTGAAGCTTTAACTAAAAAATTAGGTAGAGAGCCAAGTATAGAAGAATTA
GCTAAAGCAATAGATGTAGAAAAAGAAGATTTAGTAATGGCTATGGAAGCTAATTTCAATGTTGAGTATT
TGCAAGGAGTTATTCATGAAGAGGAAGGTTCTCCAATATGCCTTATTGATAAAATAAGCATGAAAGGAGA
AAGTGAAGAAGAAAAAGTAGTGGATAACATATTGTTAAAAGACATACTTGGAAGACTGGATAAGAGAGAG
CGTCAAATAATAGTTCTCAGATACTTTGAAGACATGACTCAAAGTGAAATAGGAGAGATGCTCAATATAT
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TTGCATTTATTGTAGGTGGAATTATTTGTATGATAGGGCAAGCAATAAATGATTTGTATATGAAAGTTGG
AGGTCTTGATAAACTAGGTGCTAGTTCTGCAACATCAATAACATTAATATTTATAGGGGCATTTTTAACT
GGATTAGGAGTTTACGACCTAATAGGAAAAAGAGCTGGAGCTGGTTCTATAATTCCAATAACAGGTTTTG
CTAACTCAATAGTATCTCCAGCAATGGAGTATAAAAGAGAAGGCTATGTATTAGGTGTAGGTGCAAACTT
ATTTAAAATTGCAGGACCAGTTTTAGTTTATGGTATAGGTTCTTCTATTTTATGTGGAATTATTTATTAT
ATTTTTAAGATGTTTTAG
>ref|NC_013316.1|:871014-872027 stage V sporulation protein AD [Clostridium difficile R20291]
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CTATAGTGGGTCCTAAGGAAGGTGAAGGACCACTAAAGGACTATTTTGATATGATTATGACTGACGATTT
ATATGGTGAAAAGACTTGGGAATTAGCTGAAAGTAAAATGGTAGAGACTGCATCCCAACAAGCTATCCAA
AAGGCAGGTAAAAAATTGTCAGATGTAAATTATATGCTAGGTGGCGATTTAATAAATCAAATAGTGCCAG
CATCATTTGCAGCAAGAGAACTGGCTATTCCATTTTTAGGTATATATGGAGCTTGTTCTACAATGGCAGA
AGGTCTTTGTATAGGTTCTATGCTTATAGATGGTGGTTTTGCTGATTTAGTACTGTCAGGTACATCAAGT
CACTATTGTACAGCAGAAAGACAATTTAGATTCCCACTTGAACTTGGAAATCAAAAACCAATGACAGCTC
AGTGGACAGTTACAGGAGCAGGAAGTGTATTATTAGCTCCTAATGGAGACGGTCCAAAAGTAAAGTATGT
TACTGTTGGTAAAGTAATAGATGAGGGTATTGATGATGGTAATAATATGGGACCAGCTATGGCTCCAGCA
GCAATAGATACTATCTACTCTTACTTTGAAGATACTAATGATGACCCAAATAGCTTTGATATAATTGCTA
CTGGAGATTTAGGTACTCTTGGAAAACAGATAGCAGAAGACTTTCTAAAAGAAAAAGGTGTAGATATATC
AAAAGTTTATACTGACTGTGGTATAGAGATGTTTAACCTTAAAGAACAAGATGTCCACTGTGGTGGAAGT
GGATGTGGGTGTTCAGCTACAGTGTTTGCAGGATATATATATGATAAGTTGAGAAAAAAAGAATTTAACA
AAGTAATGCTTGTATCAACAGGAGCACTACTTTCACCGACAAGTACACTACAAAAGCAGACAATACCATG
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>ref|NC_013316.1|:872041-872403 stage V sporulation protein AE [Clostridium difficile R20291]
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ATTATTTCAAAATGCAAACTCCATATGTTATGGTAACGTATGTAACAACTGGTGTAGTTTTAACTTTTCT
AGGACTTTATGAGCCATTAGTTAAGTTTGCAGCAGCAGGTGCAACAGTTCCTATAATAGGATTTGGATAT
TCACTTGCTACAGGAGTAATAAAATCAATTCAAAGTGATGGTTTTTTAGGTATTTTTTTAGGAGGTACAA
CTGCTACAGCTGGTGGAATAGCAGCAGCTATATTCTTTGGATATATTATGTCAGTAGTATTTACTCCAAA
AGCAAAACCATAA
>ref|NC_013316.1|:872586-873602 LacI-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGTAACTATTAAAGATATTGCAAGGAATCTAGGTATCAGTTATTCAACTGTTTCTAGGTGCTTAAACA
ATAATCCTAATGTATCTGAAAAAACAAAAAAGAAAGTAGTAGAAGAGGCAAATAGACTAGGGTTCCATTT
TAATGTAAATGCAAGAAATTTAGCAAAAAAAGAAACTAACAGGATAGGGGTAATCTTTTCAAATAATTTT
AATCATCAAGATACTAGAAAGTTTTTTAGTGATATAATGGATAGTTCTATAAATTCTATTGAGACTAATA
AATACGATTTTATAATACAGCCTAATAATAACATTAGTGGTGATAGTAATGTATATAAAATGGTAAATGG
ACAAATGGTTGATGGATTAGTAATTGTGTCTCAATCAATAAAAAAAGAAGAGTATGATTTTTTAAAAGAC
AATAATTTTCCACATGTATTTATATATTTTAAACCATCTTTTGTAGGAGAAGTAGACAATTTCTTTTGGG
ACGATAACGTGTATGGAGGTTATATAGCTACCAAGCATTTAATTGACCATGGTCATAAAGACATAATAAC
AGTAACTTCAGATGATAGGAGTTCAAAAATGCATGAAGATAGAACTAAGGGATATTTAAATGCTATGGAA
GAGGCAAATTTAAAGACCGAAGTCATTAAATCTAAAATGGATTTTGAATCTCAAGTTGAATTTTTAGAAA
AATATATTGATAAAATAAAAAAAGCTTCAGCTATATTTGTACAACAAGATGTACCTGCGATTTCTATAAT
ACAAGAGTTAAAAACTACTTATGGTATAAATGTACCAGAAGATATTTCCATAATAGGGTATAATAATATT
GAATTAATATCATATTTTAGGTCGCATTTATCAACAATAGATGACCCAAGAGAGCAAGTTATAAAAAATG
GAGTAGATAGTTTAGTAAATATAATAAATAAAAAGAGTACAGAACACATTCCAAGAAAATTATATCCAAG
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>ref|NC_013316.1|:873977-874819 hypothetical protein CDR20291_0706 [Clostridium difficile R20291]
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TTGGACCTATTTCATTTAAAGTTATGGGAATAAATGTAACTTTACTTAGTATACTATGGGCTATATTCAT
AGGAATGGCTGTTTCTCCTCATTTATTAGGGAGAGTTATACCAGCCTTAAAAAAGTTTATAGGGGATAAT
GAAATAAATGTATCTCCATATTTATTATCTTTGACACTATATCCATTAGGAATAATGTTTGGAATTAATG
CAGGGCCTAAAGTTGGTATATTACTTCAAGCAGGACCAGCACTTTTATTACAAGAATTTGGTCATATGGG
TACAATGTTGATAGCATTACCTGTTGGAGTAGCATTAGGTCTTGGAAGAAGTGCATTAGGTGGTACTTTT
TCATTATGTCGTGACACAGCACTAGGCATTATTGGAGATAAGTATGGATTAAACTCACCAGAAGGTATAG
GAACACTAGGAACTTACATAAGTGGTAGTATATTTGGAACATTATTATTTTCATTTTTAGCACCAGTGGG
TGTACTTTTAGGATTTCATCCATATGCTTTAGCAATGGCATCAGGAATGGGTAGTGGTTCAATGATGGGA
GCTGCAACAGCATCATTAATGAATACGGTTCCACAAATGTCAGAGCAGATTTTAGCATATTCAGCTACTA
GTGGATTGATTACAGCTGTTACTGGAATATATATAGAATTATTCTTATCTTTACCAGTAGCCAACTACTA
TTATAGCAAAGTAGCTCCAGTTATTGAAAGATTTAGAGGAAGAAAAACAAGAAGAACAAGTAATAAATTG
TAA
>ref|NC_013316.1|:874834-875298 hypothetical protein CDR20291_0707 [Clostridium difficile R20291]
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TTGGACAAATGATAGCACTTAAGACTCAGGCTCAAGATTTGTTGATTGGAAGTATATCTGGATTTTTGTT
GGTGATAATTGCTATTATAATAAAGAATTTTGTTAAAAAACCTAATTTACCAGGTTTTGCATGGGCTACA
TTAGTTGCATTCGTTTTATCGCTTCCAATATCTCCAGTGGGGGATATCATAGCAACAAATGTAGGGAAAA
TCAATTTTATGTCTACAGTAACACCATTATTAGCTTTTGCAGGAATCTCTGTAGGTAACCAATTAGATAT
ATTAAAGACTTTGAGTTGGAAGTTAGTAGTTATATCATTTATAGTTATGACATCTACTTACTTTGGTTCT
GCTTTTATATCTCAAACAGTTTTAAGATTAAATGGAATGCTTTAA
>ref|NC_013316.1|:875285-876457 putative amidohydrolase [Clostridium difficile R20291]
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TATCTGAAGAGAAAAAGACATCATTTGAAAAAGTTTCTGACTATTTATTTTCAAATCCAGAATTAGCATT
TGAGGAGTATAAGTCACAAAAAGCATTATGTGATTTGTTAGAAGAAAATGAATTTAATGTAACTAAAGGT
GTAGGAGGATTAGAAACATCTTTTGAAGCTGTGTATTCAAATGGAACTAATGGGAAAACAGTTGCTTTTC
TAGCTGAATATGATGCACTTCCAGGAATGGGACATGCATGTGGGCACAATATCATAGGGACAAGTTCTGT
TGGTGCAGGTATCATATTAAAAGAAATCATGAAAAAACATAATATAGAAGGGACTGTAAAGGTTTTTGGA
ACACCTGCAGAAGAAAGAGTAGGTGGAAAAATAACTATGATTAAAGAAGGTGTATTTAATAATGTAGATG
CTGCATTAATCTTACATCCAAGTGATGCTTCAATGCCTGATGATATATCATTTGCTCAAGTTAATTTAAA
ATTTGATTTTACTGGTAAGGCATCACATGCTGCTGCTTTTCCTTGGGAAGGGAAAAGTGCCTTAAGTGGA
GTAATAGCACTATTTAACAGTGTAAATAGCATGAGATTACATCTTAAAGATTATGCAAGAGTACATGGAA
TTATAACTGATGGAGGTAGCATACATAATATAATTCCTGAAAAATCTACAGCTATATTTAATGTAAGAGC
CTTAAGCATAGAATATTTAAATGAGATTTGTGAAATGCTTAAAAATTGTGCTAAAGGAGCTGCAATTTCT
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TGAATATAGTTAGACAAAATTTTGAAGTTTTGGGTGAAGACTATGTTGAAAGAGATTTAAGTCAAGGTAT
AGGTTCAACTGATACAGGAAATTTAACTCATGAGATACCTGCAATACAAGCATATATAAAATTAAAAGAA
AATACTGCAACTCATACAGATGAATTTGCTGTTGCAGCTGGTGGTGAAGAAGGCAAAGTAGCACTTATAA
AAGCAATTAAGGTGCTAGCAATGTGTGGAGTAGATATTTTGTATAGTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:876501-877436 hypothetical protein CDR20291_0709 [Clostridium difficile R20291]
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AAACTTACTTACAAGGTTATGGTGAAGTAGATGTAACTGTAAAAGAATTGTCTTCAAGTAAAGGTTCAAC
AGATTTAGTAAAGCTTACAATTCCTGGGAAAAATGGAAAATTAAAAGGTGGAGATGCTCCTACTCTTGGT
ATTTTAGGTAGATTAGGAGGGATTGGAGCAAGACCAGAAGTTATAGGTTTTGTCTCAGATGGTGATGGAG
CATTGGTAGCAATTGCAGTGGCTGCTAAACTTTTGGATATGCAACGAAAAGGGGACATATTAGATGGTGA
TGTTGTAATTTCAACTCATATTTGCCCAGATGCTCCAACTAAAGAACACTATCCTACTCCTTTTATGGAT
TCTCCAATTGATATGATGACTATGAATGAAAATGAAGTTGATAGTAGTTGTGATGCAATACTTTCTATAG
ATACTACTAAAGGAAATAGAGTAATCAATACTAGAGGATTTGCAATATCGCCAACTGTTAAAGAAGGCTA
CATATTAAAAACTAGTGATAACCTTTTAGATATTATGCAGACTGTAACAGGGAAATCTCCATTTGTATTC
CCTTTGTCTATTCAAGATATAACACCATATGGAAACAATCTGTATCACTTAAATAGTATTTTACAACCAG
CAGTAGCTACAGATGCACCAATAGTAGGAGTAGCAATTACAACAGAGATGCCTGTTGCTGGATGTGCTAC
AGGTGCAACTAATTTTAGTGATTTAGATTCAGCTGGGAGATTTGCAATTGAAGTTGCCAAGCTATTTGGT
AGAAATAAGTGTGATTTCTATGATAAAGAAGAGTGGGAAATGCTTATTAAGAGATATGGCAAATTAAATA
GATTTCAAACATTTGGTATACAGTAA
>ref|NC_013316.1|:877775-878176 hypothetical protein CDR20291_0710 [Clostridium difficile R20291]
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TCCCAAAAACCGCAAGCACTATGGGAGGCTATAAGGCGGCGACCATTCAGGGGCGATCCCCTCGAAACCG
GGATAGGGTTCCCATGTGGGACATAATAAAGAGCGCCCCGGAGGTATCAACTACCATCCGGGGCGCTCTT
TATTATGTCCCGTGGGAACCATGCCCACGAAGCAGGGCGTACAACGGACAGATAGGTCCTACCCTCCTGA
CAGACTGGAATCTCAATCCCATCGAAAACAATCATAACAATCATGGCAAGATTATATACACTCCTGTAAA
ATATTTTTGTGTGTACCATGAAGTACTGCTTGCCACTATTGAGAACGGATAA
>ref|NC_013316.1|:c878699-878235 cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein [Clostridium difficile R20291]
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AATGGAAGGAACTTTATAATAATGCTAGGGGAAAATTAAATCCACGCACAATTTCACCTTTTATCGATGC
TGGTGGGGTTGCCGCAGCAATCCTTACCGACAGCGGAAATGTTTATACTGGCGTGTGTATTGATACAGCC
TGTACATTGGGAATGTGTGCAGAAAGAAATGCTATCGCCAATATGATAACAAATGGCGAAAGTAAAATTA
CTAAATTAGTTTGTGTGATGAGCAATGGGAGTGTTGGCTCACCATGTGGTGCTTGTCGTGAATATTTAAT
GCAACTTGATAAGGATAGTGCTTGTATTGAGATTTTAGTTAATGTCGAAACAGAAAAAACTGTTAAATTG
AGTGAGCTCTTGCCGGATTGGTGGGGTTCCGACAGGTTTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c881625-878932 penicillin-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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ATAAACCAATTAATAGAACTTCAGCTAACAAGACTCGTTCAACAAAAAACAAGAAAAAATCTAAAAAAAG
CGATAAATTTAAAAAACTAAGAGTATTTGGGATAGTATTTTTAGTTTTACTAGTTGTTGGTACAGCAGGT
ACTGCTGGTCTAGTATTTGCGTCACTAAGAGATGTAACTCCAGTTACAGAAGCTGTTTTAGATAAACAGA
CGAACCAAACAACTACTATTAAATACGCTAATGGAAAAACATTGTCTACAGCTCCAAGTGTAAATAAAAA
GACACCCGTTCCATTAGATAAGATTTCCCCTTATCTTCAACATGCTGTAATTGCAATAGAAGATGAGCGT
TTTTATGAGCATAAGGGTGTCGATATTAAAGGTTTATTTAGGTCAGTATTAAAGACCCTTACAGGTACTA
AGCAAGGTGGTAGTACTATTCCTATGCAGGTATCCAAAATGCTGTTAACAACTGAACAGCAAACTATACC
TCGTAAAATAAAGGATATTTACTATGCACATGAGATGAGTAAAACAGTAAGTAAAGATAAAATACTAGAA
ACTTATTTAAATAACTTCTTCGTTGGTAGAGGTCTAGCAGGTGCTGAGGCTGGTGCACGTGGTTATTTTG
ATAAGTCTGCAGCTGACCTCACTCTAGCAGAGTCAGCACTTCTTGCTGGTTCAACTAAAAATCCATCAAG
ATTTTCAGCCTATAAAACTTCTAAGTTAGAGGGAAATGAAACTAAGGAGGATTTAGAAAATAAATTATTA
TTTTTTGTTAACACAACTGATGATGATTTAGATGACCCTACTCAAGTGGACTTTGATATGATTGAAAAAA
TAAAATCTTGGGAGCTTATATCTAATGATACTTATAGACAATTAAAAGCAGGTACATTAGTTGTTAGAAA
GGCTGTAAGTAACCCTGAAGCTAAAAAAAGACAAGAAATTGTTTTAAAGAAAATGTTAGAATTGAAATAT
ATAAAACAAAGTGAATATGATGAAGCAATCAAAGCTAAAATAGAAATAAAATTGCCTCAATCATCAGATA
AAGTTTCTTCATCTGTAGAAGACCTTATCGAAAGTGAAGTTATAAATGCTTTAATGGAACAAGGACATAC
AAATGATGAAGCTCAAAACTTATTCTACAATGGTGGTCTAATTGTAAACACAACTATAGACCCTAAAATG
CAAGATGCTTTAGAAGAAGAATTTGATAGAAATAGCAATTTCCCAGGACATATGGTCGGCCCTGATGGAG
TTAGCCAACCACAAGCTGCAATGGTAATCTTAGATTATAAAAATGGTGAAATAAGAGCACTAGCTGGAGG
AAGAAATATAAGTGGTAGAAAAACTTTGAATCGTGCTACTAACCCTCATCAGCCAGGTTCTTCTATAAAA
CCTTTAGCAATATATACACCTGCTATTGATACCCTAAAAATAACACAATCAACTGCTCTAAGTGATTCTC
GAGGAGGATATAAGTTTGAAGAAAATAATAAATGGAATCCAAGAACTACTACTGCTGGTCATGGTTCTAT
GAGTTTACGTAAAGCACTTGCTAAATCTTCAAACACGATAGCTGTCAAAACTGCTGAAATGCTTGGAGAC
TCTTATGATGAATGTGTAGATATAATGATGGATTACTTAAAGAACTTTGGTATAACAACTTTAAAGAATA
ATCACTCAGGTTCATCTGAAGCAAGTGATAGAAAATTCCCATCATTGACACTAGGTGGTATGGCGAATGG
TATTACTCCACTTCAAATGGCTGCTGCTTATGGTACATTGGCAAATCAAGGTGTTTATGTAGAACCTTCT
ATTTTTACTACTATAACTACCTTTGATGGTCAATTATTAGTTAAAAATGCTCCTGAAGAACATAAAGTTG
TAGACCCTGAAGTAGCTTATGTTGTTACAGATATGTTAGAAAGCGTAATTACTGAAGGTACTGGTGGTGT
TGCTACACTTCCAAAGGGAATGCCTGTAGCAGGTAAAACAGGTACTACAAATAGTGCATATGATGCTTGG
TTTGTCGGTTACACTCCTTATTATGTTGGTGCAACTTATATTGGAGATGATGCTGGTAGAAAAGATGATT
CTGGTAACACTATAAAACGTAGAGAAGTACCACATGGAAGTACTAGTACTGCAAAACTATGGGAAAAAAT
TATGGAAAAAATACATGCTAATTTAACGGTTACTGAATTTGAAGTTCCTAAAAATGTATATTTTACAAAA
ATTAATTTAGAGGATGGAGGAAAGCAATCTTCTGGCTCTAAAGCAGCATTTATTGAAGGTACTGCTCCTA
CTAAAGTAAGTTCTCAACCATCATCTGAAGATACAAAAAAACCAGACAATAACCAACCAGAAGAAAATAA
TAATAACAATAATAACACAGGTGATAATGGTGGCGGTTCTACTCCTCCTGATAATGGCGGAAACAATGGT
GGTGGCTCTACTACTCCTCCTGATAATGGCGGAAACAATGGTGGTGGCTCTACTACTCCTCCTGATAATG
GCGGAAACAATGGTGGTGGCTCTACTACTCCTCCTGATAATGGTGGAAATAATGGTGGTGGCTCTACTAC
TCCTCCTGATGGTGGTGGAACTCCAGCAACTTAA
>ref|NC_013316.1|:881839-882537 hypothetical protein CDR20291_0713 [Clostridium difficile R20291]
TTGAATAGAATAGTAGATAGAAAAACAAAAAATGAATTTAGAAAAATCATAGCTATTTTTTTAGTAATTC
TTTTCTTGTCTGTATTTATAGGCAGTTTTATATATATAGATAAAACTTTAAGACCGACAATAACAGTTTT
AGCAGAGACTAAAGCTCTTGAACTAGCAAATAGGTCGATAAATAAAGCTGTTGCTGAGATGGTAGAAGGA
AAAATAAATTATGAAGATTTAATGGATATACAACTTGATAATAATGGTAAAATAACTATGATACAAGCAA
ACACTATAATGATGAATGAAATTGCATCTGCAATAGCTTTAGAAATACAAGATGAATTAAAAAAGGATAA
GACAGCAAGTTCTTACATACCTATAGGAACAGCATTAGGAAGTCCTATATTAGCTAAATACGGTCCTAAA
CTTGAAGTGTCTATTGAACCTATAGGAACAGTATCAGTAAACTTTAAAACGGAATTTGAGTCTTCAGGTA
TAAATCAAACTAGACATAGAATATATTTAGAAGCTCAAACACAAGTTAAAGTAGTAATACCACTTATAAC
TTCAACAAAACAAATTAAAGCTCAAATACCTATTTGTGAAACTATAATAGTAGGTGATGTTCCAGAAAGT
TATGTAAATATTCCAGAAAAAAATCTAGGAAATGTTTTACCTAACACTGGAAAGAATACCAACAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c883756-882749 putative stage IV sporulation protein [Clostridium difficile R20291]
ATGCAACTTAAAAATTTTCATTTTAAAAATAATACTTTAAGTAAAAAAACCAACTTAGCTAAGTCAAAAT
TTACAATTGTTTTAACATTTTTATTTTTATTATATTTTTTCTCAAATAATTTAATTTATGCACAAAATTT
ACAAAAAAATGAACCTGAATATTTAATACCAATTGGAAACGTACTTCAAATTGACGCAGAATTAAAAAAT
ATCATAGTTAGAAATCCTGGAGAAGCATCTCCATTTAGATTGGGTGATGCTATAGTAAAGGTAAATAATT
CTGAAGTTGATGGATATAGTGACTTTGCCAATACCTTAAATGCTTTACCAGAAGAAAAACAAGTATCTAT
TTTATTAAATAGAGGTGGACAACTTATAACAATGAAAACTACCAAACACATATTAGAAAAAATTAGTTTT
AACAATTTACTTTCTGGATTTGCTACTTTAACGTATATCAATCCAGATACATCAGAGTTTGGAGCTGTAG
GTCATCCAATAAGTGTTGGTAATGCAAGAAAAATACCTATTAAAACAGGTTCAATTTCTACAACTAAGCA
CCTTAATATAGAAAAATCTTATAAAGGTAGTGTTGGATGTATAAATGCAAAACGAGAAAATATTATTGGT
AGCTTTACAGAAAATACTGATTTTGGAATAAGAGGTCAAATTAATAACTTTGATATTTCCAATTTAAAAA
AATATAAAGTAGCATCTTTAGATGAAGTTAAATTAGGAAAAGCTCAAATAATTTTACAAGATAACTTTAA
TAAGTGTAAAAAATATAATATTGAAATTATAGATATAGAAAACCAAAAACATCCAGAAAGTAAAAGTTTT
AAAATTAAAATTACAGATAAAAAGCTTTTAGCTCAAACTGGTGGTATTGTACAAGGTATGAGTGGTACTC
CAATAGTTCAAGATAATAAAATAATCGGAGCAGTGTCACATGCAATTGAAAATGACCCAGCTGTAGGTTA
TGGTGTATTTATTAAATGGATGTTGTAA
>ref|NC_013316.1|:883984-884868 putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAATATAGATTGTTAGTTACTTGTATAATTGCCATGGGAATCATAATTATAGGAACATCAAATC
CAGTTAGCAATTTTTACAAGACTACAAATTTGATTAGTTCAGGAAATATCACAAATGAAAAAGCAGATAA
AGATGAAAATTCAAACAAAAATAATAAAGATAAAAATGAAGACAAATCTAATTCTAAAAGTAATAAAGAT
AAGTCATCAGAGGACAAATCGTCAGATAAAAAAAATAAAATTCAAAAAAATAAAAAACTTTTAATTTGTA
TAGACCCAGGGCATCAAGGAAAAGGAGATAGCAATTTAGAACCAGTAGCTCCAGGTTCTTCCTCTAAAAA
AGCGAGAGTATCTTCAGGAACAGAGGGTATTGCTACAAAAAAACCAGAATATGTTCTAAACTTAGAAGCA
TCTCTTGTTTTAAAGAGTATATTAGAATCTAAAGGTTATAATGTAATAATGACTAGAGAGACACATGATG
TAAATATAAGTAATTCAGAGAGAGCAATACTTGCTAATGATAAAAAAGCAGATATGGTTGTAAGAATACA
TGCAGATAGTTTAAATAATTCTTCAAAAACTGGAGCATCTATATTGATTCCTGAAAAAGATGGAAAATAT
ACAGCTCCTATATATGAAGAGAGTAATAAATGTGCTGAATTTATCAAACAGAATATGGAACAATCAGGTA
TACAAATCAATGGAATCGTTCAAAGAGGTGATTTGACTGGATTTAACTGGTCAAAAGTACCAGCCGTATT
AGTAGAAATGGGATTTATGAGTAACTATAATGAAGACCAAATGATGTCAAATCCAGACTACCAAAGAAAA
ATGATGCAGTGTATAGCTGATGGATTGGATGCGTATTTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:885040-886620 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTGTAAAATTTTTTTGAGAGGTGTTGAAATGCTAGTAGTAGAAAATGTGAGTCATGGATTTGGTGCGA
GAACAATATTAGAAAATGTATCCTTTAGACTTAGAAAAGGTGAACATATTGCACTAGTTGGTGCTAATGG
AGAAGGAAAATCGAGTTTTTTAAATATAATAACAAAGAAGCTTATGCCAGATGCTGGAAATATAAAATGG
TCTTCAAGAGCTACAGTAGGTTACTTAGACCAACATACGGTATTAAGCAAGGAAAAAACTATAAGAGAAG
TGCTTAGAGAGGCTTTTAAGCATATGTTTGACTTAGAGCAAGAAATGATTGCTATGTATGACAAAATGGG
AGAAGCTAGTGATGATGAAATGAGTAAGCTTCTTGAAGAAACAGCAGAGATACAAACTATACTTGAAAAT
AGTGGTTTTTATATGATAGATGCAAAGATACAAGAAGTTGCAAATGGTCTTGGTCTTGGAGAAATTGGTC
TTGATAAAGATGTAACTGACTTAAGTGGAGGGCAAAGAACAAAAGTACTTCTTACTAAACTTCTACTTGA
AAATCCAACTATTCTTATATTGGATGAGCCTACAAACTATTTAGACGAAGAGCATATAACATGGCTTACT
AAGTACCTTCAAGAGTATGAGAATAGTTTTGTCTTAGTTTCTCATGATATTGAATTTATAAATAATACAT
GTAATGTAATATATCATATGGAAAATGGAGAGTTAAATAGATATAAAGGAAATTATGATGAATTTGTAAG
ACTTAATGATATAAAGAAACGTCAAGAAGAACAAGCTTATGATAAACAAGTTGAAGAAAGAAAAAGACTA
GAGGATTTTGTAGCTAGAAATAAAGCTAGAGTAGCAACTAGAGGAATGGCTAACAGTAGACAAAAGCAAC
TTGATAAGATGGAAATATTAGAAAGACCAAAAGAAAAAATAAAACCTACTTTTGCTTTTAAAGATGCTAG
AGCAGCTAGTAAAATAATTTTTGAAACAGAGAATTTAGTTTTAGGGTATGATGAAGCATTGACAAAACCA
CTTAATTTCCATTTAGAAAGAGGAAAAAAGATTGCCTTAAAAGGAATGAATGGTATTGGGAAATCTACTC
TATTAAAAACTTTACTTGGAATAATAAAACCATTTGAAGGAAATGTTAAATTAGGTGACTATTTGGAAGT
TGGATATTTTGAACAAGAGAGTTCAAGGGAAAATAGTAATACACCTATGGATGAAGTTTGGAGTGAATTT
CCAGGGCTTACAAACTTTGAAGTTAGACAGGCTCTTGCAAAATGTGGACTTACAAATGAACATATAACGA
GTCAAATGAGAGTATTAAGTGGTGGAGAAGCTGCTAAGGTTAGACTTTGCAAAGTAATGTTAAAAAATAT
AAATTTCTTAGTATTAGATGAGCCTACAAATCATTTAGATGTTGAGGCAAAAGATGAATTGAAGAAGGCT
ATCAAAGAGTTTAAGGGAACAGTTCTTTTAGTATGCCATGAGCCAGAATTTTATTCAGAAATTGTTGATG
ATGTATGGAATATAGAAGATTTTACCACTAAAATCGTGTAG
>ref|NC_013316.1|:886649-887284 hypothetical protein CDR20291_0717 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGTTTCTAAATGTACTTTTTTCAGTTTGTATTAGTATTGTTATAATAGTAGGTGTTATTAATT
TTACTGTTGGATTTAAACAACTTTATTATTTTGACATTGATTACTTAAATATATCAGAGTTATCTGGTTT
ATCTGAAGATGATATAAAATTGAACTACGATTATCTAATTGATTATAACTTAAATAAGAATGTGTCTGAG
TTCAAGTTACCAACATTAAAATCTTCTCCACAAGGGAAGATACATTTTGAAGAAGTCAGGAATATATTTC
AAAATATAAATAAATTAGCTAAATTATTATTGGTAGTTTTTTTAGTAGGAATTATATTGAGTGTAAAAAA
TAAAAATATAAAAATCTTGAAAACTACATCAATAACACTTATAATTATGCCATTATTATTAACAGTTCCA
ATTTTATTAAATTTTGAAAAATCATTTATTATTTTTCATAAATTATTATTTAGAAATGATTATTGGATAT
TTAATCCAAATTTAGACCCAGTTATAAATATATTGCCAGAGGAATTTTTTTTTCACTCAGGAATGATGAT
TTTAATATTAATTTTGTTAGCAAGTATCTTACTATTTGTAATGTATAGATTATATAAATCTTTCAAAATA
AAATAA
>ref|NC_013316.1|:c887655-887395 putative metal-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGGCGAAAATTATAAGTTTTTTAATCACAAAGATTGCGAATTTTTCCCTTGTCATAAAACTAATAAAC
CAGAAGAGTTTAACTGTCTATTTTGCTATTGTCCTTTGTATGCTTTAGGAGAAAACTGTGGTGGAAACTT
TAAGTATACAGATAAAGGTATCAAAGATTGCAGTAGTTGCATGTTACCTCACAAAAAAGATAATTACAAT
TACATTATGGGCAAATTTCAAGATTTAGTTAAAATCACTAGTAAAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:887872-889155 putative ATP/GTP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
GTGAAAGAAATTCAAGAAAAAGCACTTCTTGTAGGTCTGAATTTGACTACAATAGTGAAAAAAAATGATG
ATATAGACACTAGTGAATCTATGGAAGAATTAAAAGAGCTAACAAAAGCTGCTGGGGCAGAAGTTGTAGG
TAGCTTAATTCAAAATAAACATTCTGTAGATGCAGCTTATTATATAGGAAAAGGTAAAGTAGAAGAAATA
AGAGCCTATAGTGACTCTTTAGATGCTACTTTAGTAATTTTTAATGATGAATTATCTGGTGCTCAAATCA
GAAATATAGAGAATGTTGTTGGAAGAAAAGTAATAGATAGAACTACTTTAATTTTAGATATATTTGCTCA
AAGAGCACTTAGTAAAGAAGGTAAATTACAAGTTGAATTAGCACAATTAAAATATAGATTGCCACGACTT
TATGGAATGGGTGGTGAGATGAGTAGAACAGGTGCAGGGATTGGTACTAGAGGTCCTGGAGAACAAAAAC
TAGAAATAGATAAGAGACATATACTTAATAAAGCAGCAGACATAAGGCGTGAACTTAAAGAAGTAAAAAA
GAATAGGGAGACACAGAGAGTTAAGCGTTTAAAGTCAAATATACCGATTGTAGCACTTGTTGGGTATACA
AATGCAGGAAAATCTACTCTTTTGAACGAATTAATAAAGACACACAAGGATTATGAACAAGAAAAAGAAG
TTTTTGTAAAAGATATGCTTTTTGCAACTTTGGATGTAACTCTAAGAAAGGCTCTTTTGCCGAATAAAAA
AGAATTTTTAGTAGTAGATACTGTTGGATTTGTAAGTAAACTTCCCCATGATTTAGTAGAGGCGTTTAAA
GCAACATTGGAAGAAGTACAGTATGCAGATTTAATTTTACATGTAATTGATGCGACAAATACTAGTTATG
AATTGCAAAAAAGTACGACTGAAGGTGTATTAAAAGAACTTGGTGTAAATGATAAAAAACATATACTTGT
ATATAATAAAGTGGATAAGCTAGAATTGGATATATATCCTAAAAGTCAAGAAGATATTGTGTATATTTCT
GCAAAACAAGGCATAAATATGGATAAGCTATTAAATATGATAGAAATTGCTTTAATGGAAAATACTTATT
CAGTAAGCTTGATGTTACCTTATGAGAGAGGTGATATATTTAGTAGAATAAAAGATAAATATAATGTGGA
GAATTTTGAGTATGGGGAAAATGGCATAACGCTAGATGTAAACTTCGATGAAGAAGATTTTAATATCTAT
AGAGAGTACATACTAGAAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:889163-889840 hypothetical protein CDR20291_0720 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATATAAATTGGGAAAATATAGATAATCTTGAAGATTATTTTATAACCTATCTTCTTTATAAAGAAT
CTAAAACAGTATCTCAAATTAGTAAAATTAGAAATATTTCAAGTACTGAAGCAGGTGAGCAACTTATACA
AGCAAAATTAAAAATAAAGGAAATGCAAAAAGATGATTTTGAGGCATCTAAGGATATTTTAGATAAATTT
TTAGAACTAGATAAAATTAAGAGACTTGATTTTATGGATAGCTTAGATGACGAAAAAATGGTATACTTTA
AGAGAAAGGTTTTCAAAAGAATCCTTGTGGAAAAAAATGCTGAAGATTTAATTGTTTTAATTTGGGCGAC
AGGTGAGCTAAAAGATGATAGATTCTTAAAGTTGCTTCATCAGCTCACAAACCACAGACACTCAGATATT
AGAAGAATAACTTATTCAGCAATCAGAAAGATTGAATCACCAAGTAGTAGAGAAGTACTGCAAAAAGGTC
TCTACGATAAAAATGCACAAACTAGACAGTATTGTGCAAAGGCTCTTTCAAAACTAGGGGATGAAAACAG
TTTAAAGATTTTACAGCAGTTGAAAGACAAGAATAAGAATTTTGAAAAAGAATATGTGCTTAGAGCTTAT
GACGAAGCCATTAAGTCATTGGAAAATGCAAAAAATTTGAAAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:889926-890369 putative NUDIX-family hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGTAAGACGTTGTGCAGGTGGAGTAGTGTTTTATGCTAATAAAGTACTTATTGTAAAAAATGATA
GGGGAGAATGGACACTTCCAAAAGGAAAGATACTTGGAGGAGGACTTCCATATGAGAGTGCTGTTCAAAG
AGTTAAAGTAGAAACTGGCATAGATGCTAAAATGATAGATGTGGCTGGCGATACTATGTATGAATTTTTC
TCAAGAAGTAGACAACAAGAAGTTTGTAATGCAATAATGTGGTATGTTATGGAAGCTTGTAACACTAATT
GTGTACTTGCTCCTGAATTTCAAGAAGGTGGATTTTATAAAGTAAAGGATGCTTTAGATATGTTATCACA
TCATAAAGAGCAAGCTTTAGTAGAAGTATCTTATAAAAAGTTTAAGGAATTAAAGAAATTAGTTTCAGAG
GGCGATGATGTTCCAGCAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:890651-891319 hypothetical protein CDR20291_0722 [Clostridium difficile R20291]
ATGATTAAAATAGGAGGAAATACAATGAGCAATTACAGGACATTACATGAATTTGGAACAGATGAAATAA
CTATTGAAAAGTCTGTTTTTATTGGATATGCTAAGCCTATAAAGAGTGAAGAAGAAGCATTAGAGTTTAT
AAATGAAATAAAGAAAAAGCATAAAGATGCAACTCACAATGTGTGGGCTTATACTGTAGGTAAAAATATG
AATATACAAAGATATAGTGATGATGGAGAACCACAAGGAACAGCTGGAATACCTACATTAGAGGTTATAA
AAAAAGAAGATTTGAGAGATGTAGTGGTTGTTGTTACTAGGTATTTTGGAGGAACAAAATTAGGTGCAGG
CGGTCTAGTTAGAGCTTATACAAAAGGTGCTAAATTGGGACTTGAAGCAGGTAAGATAATTTATAAGGTA
ATGTATCAAGAAGTTAAGGTTAAGATAGACTATACTCAACTTGGAAAAGTGCAAAATGAGTTAATGAATT
TGGGGTATTTTATAAAAGATACTGTATATGAGGATAATGTTGAGATAGTAGTGTATTCAAGATTAGAAGA
TGTAGAGAAATTATCAGAAAAAATGATTGATATAACAAATGGAACAGGAAAAATAATTTTAGGAGAGGAA
TTTTATTTGTCTGAACAAAATGGAGAAATTTTAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c891782-891405 hypothetical protein CDR20291_0723 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTATTTGCTCTAATTGGATTTTTTGCAGGAATTATTGGAGGAATGGGAATGGGTGGAGGAACAATCC
TTATACCTGCACTCGTTTTACTTGCTGGCATAGACACTAAAATAGCACAAAGCGTAAATTTACTTTCATC
TATCCCTATGACACTTATAGCACTTGCTATACATATAAAAAATAAAAATGTAATTTTTAAATTGGTTATA
CCTATAGCTGTGTTTGGGGTTTTAGGAGCTGTATTTGGTTCACTATTAGCTAATTATCTGTCTTCAGATA
TATTAAAAAAAATATTTGGGATATTTTTACTTTTAGTCGGTTTATTTGAAGTAAAAAAAGGATTCTGTGC
AAAATCCGATAAAAAGCCATTAAATTGA
>ref|NC_013316.1|:c892168-891782 hypothetical protein CDR20291_0724 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAACTGATGATTTAAAGAAAAAATACTTTGATTTTAACTTAAAAAATACGATAATTGGAGTTT
TTACAGGATTTATAAATGGAGTTTTTGGTTCTGGAGGAGGTACTCTTTTAGTTCCAATATTAAATGACAT
CGTTAAGGTAGAAGAACATAAATCTCATGCAACTGCTCTTTCTATAATAATATTCTTAACGACAGCAAGT
TCTGTTTTATATGTATCTAAAGGTACTTATGATGTTAACTTAACAATTAAAGTTGCAGTTGGAAGTATTC
TTGGTGGTATTATAGGAGCTAAATTACTAAATAAGGTTACTGGAAAGTTTCTTAGAATTTCTTTTGGAAT
AATTATGATAATTGCAGCATTAAGGATGGTGTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:892347-893102 NH3-dependent NAD(+) synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAAATATAAAAATACAAATAGACAAAACTGTAGAATGGCTTATAAATAAGGTTAATGAGGCAAATG
CAAAAGGATTAATTGTTGGTGTATCTGGAGGAATTGATTCGGCAGTAGTTGCTAATTTAATTAAAAAGGC
ATTTCCAGAAAACTCTATGGGAGTTATAATGAGCATAAAAAGTAATCCTCAAGATAGAGAAGATGCACTT
AAGGTTATAGAGGGATGTGATATAGAATACCTTGATTTAGACCTTATAGAACCACAAAGTGCTATATTAG
ACATGGTAGTAGGAAATTTAAAAGATAAACATTTATATAGAGCAGAATATTTAAAGATGACAGATGCGAA
CTTAAGAGCAAGAGTAAGAATGAGTACAATTTATACAATTGCTAACAATCTAGGATATTTAGTTGTTGGT
ACAGACAATGCTGCAGAAATACACACAGGATATTTTACTAAATTTGGTGATGGTGGAGTTGATATTTTAC
CTATTGCAAATTTAACTAAAGGAGAAGTATATGAATGGGCAAAAGAGCTTGGTGTTCATGAAGATTTAAT
AAACAAAGCTCCTTCAGCAGGTCTTTGGGAAGGTCAAACAGATGAAGATGAAATGGGAACTACTTACAAT
ATGATAGATGCTGTGTTAGAAGGTAGATTGGATGAAGTTCCTAAAAGAGACCAAGAGATAATAGAAAGAC
TTCATAGATTAAGTGAACACAAGAGAAAAACGCCTGCACAACCTCCTAAGTTCTAA
>ref|NC_013316.1|:893185-893904 hypothetical protein CDR20291_0726 [Clostridium difficile R20291]
ATGGGACGTATAGGTAATATAATTAATAGAAAAGGTAAACAAGATGCTCAAAGAGCAAAGATATTTACTA
AACATGCTAGAGCAATAGCAGTTGCAGCTAAAGAAGGTGGAGCAGACCCAGAGTACAATGCAGCGTTAAA
AACAGCTATAGAAAAAGCTAAGGCAGATAATATGCCAAATGATAATATAGATAGAGCTATCGCTAAAGGT
GCTGGAGCAGGCGCTGGAGAAGACTATGAAACTATAGTTTATGAAGGATATGGACCTGGTGGAGTTGCTG
TTATAGTAGAAACTTTAACTGACAACAAAAACAGAACTGCTGGTAACGTAAGATACTATTTTGACAAAAA
CGGAGGAAACTTAGGAACTAGTGGATGTGTGTCTTTTATGTTTGATAAAAAAGGACAAATATTAGTTGGT
TTAGGAGATGGAGTTTCAGAAGAAGAATTGATGGATGTTGCATTAGAAGCAGGAGCTGAAGATTTCATAA
CAGAAGAAGATGGTTATGAAATAATAACTACACCAGAAGATTTTTCTAGTGTTCGTGATGAGTTAAAAGC
TAAAGGATATGAGTTTATATCTGCTGATGTGAAGATGATACCTCAAACTACGACTGTATTGACTGAAGAA
TCTCATTTAAAAATGATGAATAAATTAGTTGATATGCTTGAAGAAGATGATGATGTTCAAGATATATATC
ATAACTGGGAAGTAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c895076-894072 LacI-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAACAATCAAAGATATTGCAAAAGACTGTGGTCTTTCTTCAGCAACTGTCTCGTACGTCTTAAGTG
GTAAAGGAAATGAACGCAGGATTCCGCTACATACACAAGAGCTTATATTAAATTCAGCTGATAAGCTTGG
ATATAAACGCTCTACTCCTATTAAACATAATAATATTAAAATAGCTTTTTATTGGCAGGATGAGGGATTT
GAGTTGGCATCAACCAATATACTTCAAGCAATAAACCACATAATTTCTTTAGAACATTTAAACATAAATA
TCATCATACGACCTTACAAAGTTGGTCATCTATGTGATGATGAATACTTTTTTGCAAATAATTATTATGA
TGGAATTGTTTTAACAGGTATCAATGCTGATGATATAGAATATCTAGTAAAAAATAAACCTAAAATTCCT
GTAGTTGTTGTAAATCGTGAAATACCTGGTTTTTCAAGTGTATCTATTGATAATGAGGAAACTGGTCGTA
TAGCAGCTTTACATGCTATTCAAAATGGTAAAAATGATATTGCTGTTGTATTCAACCCAACTTCCTTTAC
ATGTATGACTTTAAGGGGTAAATCTTTTTTAAAAACATGTAAAGAACATGGAATACATCTATCAGATTCT
ATATATTATTGTTCTAATAAAATAGATAGTGGATATGATATTGCTCAAAAAATGCTTGCAAAAAATTCAC
TAAAAAAAGTAATTTTTTGTAATCATGATGTTGTAGCTCTTGGTATGATGAATGCATTTCATGAATCTGG
AATTGTAATTGGAGAGGATATTCAAATATTTGCAGCAAGTAATGGACCTTCACGACTAATGGCAAGAAGT
ATTCCTCCTTTGACAGTTATAGATTTAAAAATGGAAGAGACAGCAGAACGTAGTCTTAGGATGATTATTG
ATACAGTAACTGGGCGTATAAATGGTATTCAGCAACAAGTTATATACCCATCAATTATTTATAGACAATC
AAGTCCAGCTCAAAATTTACTTTAA
>ref|NC_013316.1|:895342-896238 putative hydroxymethylglutaryl-CoA lyase [Clostridium difficile R20291]
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CTGATAAAAAGCTTAAGATTATTGATGGTCTTATTGCTTCAGGGATTAAACAACTTGAAATTAGTTCATT
TGTAAGCCCAAAAGCAATACCTCAGATGAAAGATGCAAAAGAAGTAGCAACTTATTGTGTAGAAAAATAT
CCTGATGTGAAACTTTATGCATTAGTTCCAAATTTATATGGTGCTAAAGTTGCATGGGAGTGTGGTATAA
GAGATATATCCTATGTTATATCTTTGAGTGAAACTCATAATAAAAAAAATATAAATCGTACCCATGAAGA
GTCTATTGATGAGCTTAAAAAAATAATGAATACTTATCCAGACATGAATATATGTATTGGAATGGCTACT
GTATTTGGGTGTCCTTTTGAAGGTTTACCAAAAATTGAAGATGCCATAAGATTTGCTAAACGCCTTTGGG
AAAACGGTATCAGGGAGATAAATCTAGCAGATACAATAGGGATTGCTGACCCTAAGCAAGTAAGAGAAAC
TATTAGTGCATTAGTTGAAGCTTTACCAGAGTGCAGATGGCAGGTACATATTCATGATACTAGAAATATG
GGAATGGTTAATACTCTTGTGGCTATTGAATCTGGAATTACTACTGTTCAGTCTACACTTGGAGGATTAG
GAGGATGCCCATTTGCTCCTGGAGCATCTGGCAATACTGCAACTGAAGATTTAGTATATATGCTTGAACG
TATGGGGTATGATACAGGAGTTGATTTTGTTAAACTTCTTGAATTATCAAAGTATCAGAAGAGTTTTGTA
AATGGAGTATATAGTGGTCATCATGTAAATATAAAGTCTGATAGTTGTAATTGTTAG
>ref|NC_013316.1|:896283-897638 hypothetical protein CDR20291_0729 [Clostridium difficile R20291]
ATGCTGATTGGTAAAATAGATTTATTGATAAAAAAGATAAATTATAAAATACATTATCTAATAAAACAAA
TAAAAAAATTGAGGGGGATTAGTATGGATATTATAGCTTTACTTTTATTTTTAGGAGTTATTATTATTGC
ATTTGTACGTAAGAATAATGCAGGTATTTTGGCTCTAGCTATTGGTGTCATAGCTGTTAGAATTTTTGGA
ATGGATGATAAAGAACTTTATGGAGCTATAAGCAACTCAATGTTTACTACACTTGTTGGTATAACACTAC
TCTTTGCAATAGTGAACTCAACAGGAGCATTAAAGCTTGTTGCAGAAAAAATTGTAGCTGCTTCTGGTAA
ACGTGTTTGGCTTATACCTATAGCAGTTTTTATAGCAGGATTTGTTGTTGCTGGTGTTGGACCTGGGGCA
ATTCCAGCACTTGCAATTATCCCAGCAATGGCTGTTCCTGTAGCCATAACGGTTGGTTATAATCCTGTAA
TGCTTGCACTTATAGGTGAATGTGGATTAATGGCAGGTCGTATGACTCCTATTACTCCAGAAGGTCAAAT
TATAACAACCGTTGCAGAAGGGGTTGGAATTGAAAATGTTATGCCTACTATCTTAGCCTGTCAAACTCTT
TCTACAATTGTATTTTCAATAGTATTGTTTATAATTTTCAAAGGATATAAACTTAAAAAACCTATAAATG
TTATAGATAGTAAGCAAATAGAAAAATTTAATATAAAGCAGATAATTTCTCTAATAAGCATAGTAGTTAT
GATTGCTTTTATCATAATTTTTGATATGAATGTTGGGCTTGCAGCTTTTGCAGTTTCAGCTGTACTTATT
TTTTTCAATATTGCTGATGAAGGAGAATGTATCAAATCAATTCCATGGAGCACGATAGTAATGGTTCTTG
GAGTAGGTGCAATGATGACAATCGTAGATGCAGCAGGAGGTATTGACTTGATGAGTAATGCATTATCATC
ACTGATGAATAGTAAAACAGCTACTCCAATTATGAGTATTTCAGCAGGACTTATGTCTATGGTTAGTTCT
GCTTTAGCAGTAGTTTATCCAACTATGATGCCTATGTGTGTTGATATAGCTAAGGCAGTTGGAGGAGTAG
ACCCACTAGCACTTATTGCTGCAGTCGGTGTTGGAGGTTCTCTTGCTGGTGTAAGCCCACTTTCTACTGG
TGGGGCATTGATTTTAGCAGCTATGGGTTCAAGTAAGAAAGACTTTAATAAGGAAGAACAAAATAAGGTT
TTTGTACAGCTTTTCATTATGAGTGCAGTTGGCTTATTGGTTATTGCAGTAGTATCAATATTATCATTTA
ATGCAATAACACATTTAATGAACTAA
>ref|NC_013316.1|:897714-898907 putative beta-alanine CoA-transferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAGGAGCATTAAGCAATATAAAGGTACTTGACCTTACAAGAGTTCTTGCAGGTCCATATTGTA
CAATGATGTTGGCGGATTTTGGAGCTGATGTTATAAAAATAGAGATGCCAAGAAAAGGTGATGATACAAG
AGGTTTTGGACCTTTTGTAAATGGAGAGAGTTTATACTATGCAAATATAAATAGAAATAAAAAAGGTATC
ACTCTAAACCTTAAATCAGAAGAAGGAAAAAATATATTTTTAGAAATGGTAAAACATGCTGATGTTGTAG
TAGAAAATTACAGACCAGGTGTAATGGAAAAGTTAGGTCTGGGTTATGATGAGTTGGCTAAAGTTAACAA
TCAAATAATTTATGGAGCTGTATCAGGATTTGGATGTTATGGACCATATTCAGAACGTCCAGGTTATGAT
ATTATTGCACAGGCAATGGGTGGTCTTATGAGTATAACAGGGCAAGAAGGAGGAGAACCAACGAGAGTTG
GTAATGCTATGGGTGATGTACTAGGTGGAATGAATTTAACTATTGGTATACTCACAGCACTCAACGCTAG
AAAAATAATAGGAAAAGGACAAAGAGTAGATGTTTCCCTCGTTGATTCTGTTGTATCGTCTCTCGAAACT
GGTATACAGAGATACTTTGATTCAGGACAACCTGAACTTATGGGTAATAGATATGCTTCAGCCTATCCTT
ATGACTCTTTTAAGGCAAGTGATGGAAGTTTTGTAATAGGCTGTGGTAATGACAAACTTTTTGAAAAGTT
ATGTAAAAAAGTTCTTTTTAGAGAAGACCTTTTAATAGATGAGAGATTTAAAACAAATCTTAAGCGTTGT
GAACATTACAAGGCTCTTAAACCAGAAATAGAAAAATGGTCTGTTAAGCATACAATAAAAGAAGCAGTTG
ACTTAATATCAGAGGCTGGAGTTCCTGCTGCTCCTATCTATAATCTTGATTGTGTTACAACAGATGAACA
TATAGCAAAAGCAAGAGAAATGATTGTAGATATTAGTCATCCTATTATAGGAAATATGAAAGTCAATGGA
AATCCAGTTAAGTTGATGACAACAAAAGCTAAAATTGATATGCCAGCACCATCTCTAGGGGAAAGTAACG
AGGAGATTTATAATGGTTGGCTTGGTTTTGATAGTGATAAAATAAAAGATTTAAAAGAAAATGGAGTTAT
TTGA
>ref|NC_013316.1|:899515-900330 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase (crotonase) [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAATGGGGGGAATATGATGGAATCTGTAATGGAAAATTTGAACAATCTTAAGGTGGAGGTTAAGG
ACAAAGTCTGTGTTATTACTATAAATAGACCTAAAGCTTTAAATGCTCTTAATAGTGACACTCTTAGGGA
ACTATCACAAGTTATTGATGTAGTATCAGAAAATGAGGCAATATTAGGAGTTATTATTACTGGAGAAGGT
AAAGTTTTTGTAGCCGGTGCTGATATACGCCAGATGCAAAACTATAAAAGTGAGGAAGGCAGAAAATATG
CAGGTTATGCTCAGGGAATTTTTGATAAAATTGAAGCTCTTGAGAAAACAGTAATAGCAGCAGTTAATGG
ATATGCATTAGGTGGTGGATGTGAACTTGCTATGAGTTGTGATATTAGAATTGCATCAGAAAAGGCTATA
TTTGGACAACCTGAAGTTAATTTAGGAGTTATTCCATGTTTTGGTGGAACTCAAAGATTATCAAGACTTG
TTGGAACTGGAATAGCTAAAGAGTTAATTTTTACGGGGAGACAAGTAAATGCAGAAGAAGCTAAATCTAT
TGGGCTTATTAATAAAGTGGTTCCAAGTGATTTACTTTTAGAAGAGTCTATGAAGATGATGAACCAAATA
GTTGAAAAAGCGCCAATAGCAATAAGATATGCAAAAGTTGTTATTAACAAAGGGATAGATATGGATTTAA
AGAATGCTCTTGAACTAGAGAAAGATATTGCAGGTTTAACTTTTGCTACAAGAGATAAGCAAGAAGGAAT
GAATGCATTTATAGAAAAGAGAAAGCCAGTTTTTGAAAATAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:900424-901764 putative permease [Clostridium difficile R20291]
ATGAATACGGGAGTAATTATAAGTTTAGTAGGGATTATCATAGCTCTATCTCTTCTAGTTGTAATGGTTA
TGAAGGGAATAAATATTTTTATTATAGCAATTGTATGTTCATCATTAGTTGCTATAACAGGAAGCCTAAA
TGTGTATGATGCACTTAAAGTGGATTATATGACAGGATTTGTTGGATTTCTTCAGGCAAATTTCTTTATT
TTCCTAACAGGGACATTAATGGGAAAAATAATGGAGATTACTGGTGGAGCAAAATCTATTGCTAAGATGA
TTGTAAGATGGATTGGTAAGGATAAAGCACTACTTTCTATTCCAATAGCTTGTGGAATATTAGCCTATGG
TGGAGTAAGTGTTTTCGTTGTAAGTTTTGCAGTGTTTCCGATAGCTTTAGAAATTTTTAAAGAAGCTGAT
TTGCCACGAAGATTTATACCAGCAGCTTTGACTTTTGGATGCTCAACTTTTGCTATGGTTGCACCAGGGG
CACCACAAATTCAGAATATTGTTCCAGCATCAACATTAGGGACAGATATTATGGCCGGAGCAGTAAATGG
TTTTATATCATGTGCAGTAATGTTTATAGTTGGAAGTACCATTTTGTACAAAATGGTTTCAAAAGAAAAA
GCCAATGGTGGTCATTTTATAGCACATGAATCAGATATATTTGATGAAGCAGAAGCAACTAATTCTAAGA
GAGAAAATGGTCCTAATGGTGTAATTGCCTTAATTCCATTGATAGTGTCAATTTTAATAATTAATGTAAA
AGTTAATGGAAAAGCGATAGTACCAATTGAGGTGGGAGTATTTATTGGAGCTTTATTAGTATATTTATTG
TTAAATAAATATCAAGATAATACTAAAATAGTTGGACATGTTGGTGATGCATGTAAAACTACAGTAGTAG
CAATATGTAATACTTGTGCTGTAGTTGCATTTGGTTCAGTAGTAAAATCAGCAGTTGGTTTTGACTTCAT
AGTTAATGCCATGACTAATATTCCTGGTCCTCCTATTGCAGGGGCTGCAGTTGGAACTACAGTTATTGCA
GGTATTTGTGGGTCAGCTTCAGGTGGACTAGGAATTGCAGCTCCACTTCTTGGACCAGTATTTTTAGCCA
AGGGTGTTTCCGCTGCAGCATTAACTAGGACTATGGCAATTTCATCAGCAGCATTAGATTCACTTCCACA
CAATGGATATATTGTTACTGTAACAAATGGTCTGTGTAAAGAAACACATAAGGATGCCTATATGCCAATA
TTCTGGGTAACTGTTTTAACTCCGTTTATTGGAACCATAGTAGCAGTCCTACTGTTTACAATGTTCCCGG
GATTGCCATAA
>ref|NC_013316.1|:901901-903133 putative CoA-transferase [Clostridium difficile R20291]
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CTAAAATATTAGCTGATTGGGGTGCTGACGTTATTAAGGTAGAGCCAAGCTTTGGAGACCCAGGAAGAAA
GACAGGGGCAACAATGACAATGCCAATAGATGATTATAATAATCCTTTTTACAGCACATATAATTCAAAT
AAAAGAGGTTTGTCTATAAATCTTAAGAGTGAAACTGGAATTGAAATTATGGATAAGCTTTTAAGTGAAG
CAAACGTATTTGTTTCAAGTTATAGAACAGGAGCATTAAAAAGACTAGGTCTTGATTATGAATCATTAAG
TAAAAAGCATCCACACCTTATCTGGGGTCAGATAAATGGTTTTGGCGATTTTGGACCTGCTAAGGATAAT
GCAGGATTTGATACAGTTGCCTTTTGGGCAAGAAGTGGGGCTATGCTTGATATAGCAGAAAAAGATACAA
GTCCAATAAATCCACCTATAGCCTTTGGAGATGCAACAACTTCTTGTAGTTTATCTGGAGGAATATGTGC
AGCTTTGTACCAGCAAGCTAAGACTGGAAAAGGACAAAAAGTAATGGCATCTTTATTTGGGCAAGCAATA
TGGAATGCATCATCTTTATTAGCATCTACACAGTTTAGTGATGAGTATCCAAAAACTAGAAAAAATGCTA
TTTCACCAGTAATAAATTCTTATCGTTGTAAGGATGGAAAGTGGATATTCTTAAGTATTTTAGAGCATGA
AAGATATTTTGAGGCACTTTGTAGATTATTTGGAAGAGAAGACTTAATAAAAGAAGAGAAATTTGCATCT
TCAGTAGAAAGTAAGAAAAATGCTACAGAACTTATTAATATTTTGGATGGTGAATTTGCAAAGTTTACTC
AAAATGAGATGGTTGAAAAACTTACTGCTGCTGATATAGCTCATGAAAAAATTCAACATGTTAATGATGT
AGTGACTGATGAACAGGCTATTGCTAATAACTATATATATGAGCATACAAGTAAAAATGGAAATAAGACA
ATGCTTGCATCCACTCCAGTTAAATTTGGAAATATTGAAGTTAACATGACTTGTGATGCTCCACTTATAG
GAGAACATTCAGATGAGATATTGAGAGAACTTGGATACAGTGATTCTGATATAGAAGCTCTAATTGAATC
TGGAATTGTAACAATGAATAAAGAAGCATGTGAAATATGTTAA
>ref|NC_013316.1|:903173-904315 putative acyl-CoA dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATTTTAGATTAACAGAAGCACAATTAATGCTTCAAAGAGTAGCAAAAGAATTTGCAGAGAATGAAA
TAGCACCAATAGCTGCTGAAACAGATAAAACAGGTATTTTTCCAAGGGAGCTTTTTAGCAAAATGGCTAA
AATAGGATTTAATGGCATTGGAACACCTGTAGAGTATAGTGGTTCTGGAGGGACAGATATAGAAAAGGTA
ATTGTTGTTACTGAGATTGCCAAAAAATGTGCAGCATCTGCAGCAATATTATCAATACACACAATATATG
CTCAAGCTATTTTGAAATTTGGTACTGAGGAACAAAAGAAAAAATACCTTCCAATGATGGCTGAAGGTGG
GTGTGTAGGTGCTTTCGCCTTAACTGAACCTAATGCTGGTTCAGATGCTGCAAGAGCTGCAACAACTGCA
ATTATTGATGAAGAAACGGATGAATATGTTTTAAATGGAACTAAGTGTTTTATTTCTGGTGGAGGTCAAG
CAGAATCATTAATAATATTTGCACTGACAGACCCATCAAAGGGAATAAAGGGAATGTCTGCTATCATTGT
CGACAAAGGTACTCCAGGTTTTTCAATAGGAAAAATTGAAGAAAAAATGGGTATTCATGGTTCAGAAACT
GCAGAGTTAATATTTGATAACTGTAGAGTTCCAAAGTCTAACTTATTAGGAAAAGAAGGCAAAGGATTTA
ATATAGCTATGACTTGTTTAGATGGAGCAAGAATTGGAATTGGAGCTCAAGCTGTAGGAATTGCTGAAGG
GGCTTTAGAAGAAAGTATCAAATATTCTAAAGAAAGAGTCCAGTTTGGCAAGCCAATTTCAGCGTTGCAA
GGTATTCAATGGTATATAGCAGATATGGCGACAATGGTGGAATCAGCAAAATTATTAGTATATTATGCTG
CAGATTTGAAAGCTAGAGGAGAAAAACACACTAAAGAAGCTGCTATGGCAAAATACAATGCGTCAAGTAC
TGCAAGAGAGGTTACAAATCTAGCCCTTCAAATCCATGGTGGATATGGATATATGAAGGATTATCCATTA
GAGAGAATGTACAGAGATGCCAAAATAACAGAAATTTACGAAGGTACTTCAGAAATACACAAAGTTGTTA
TTTCAAGAGCAGTACTAGGATAG
>ref|NC_013316.1|:904326-905120 electron transfer flavoprotein beta-subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATAGTTGTTTGCTTAAAGCAAGTTTCAGATACTAATGAAGTTAAAATAAATAAAGAGACAGGTA
CTCTAATAAGAGATGGTGTACCAAGTATAATCAATCCAGATGATAGAAATGCTTTAGAAGAAGCTCTAAA
AATGAAAGATGAACTAGGAGCAGTGATTAAGGTTATAAGCATGGGACCTCCTCAAGCTAAAAGTGCTTTA
AAAGAAGCTTTGGCAATGGGAGCTGATGAAGCTTATTTAATCTCAGATAGAGCTTTTGGTGGTTCAGATA
CTTGGGCTACATCTACAATTATTGCTGCTGCTATAGAAAAGGTTGGAAAGTATGATGTAATATTCTGCGG
AAGACAAGCTATAGATGGAGATACAGCTCAGGTTGGACCAGAGGTTGCAGAATTTTTAGGGATACCACAA
GTTACTTATGCAAAAGAAGTAAAGGTTCAAGATGACAAATTACTAGTAACTCGTTATACAGAGACAGGGG
ATTATTTAATAGAAGCAAAGATGCCAGTTTTATTAACTGCTATAAAAGAGTTAAACAATCCAAGATATCC
AAGTGTAAAAGGAATCTTAGAAGCTTATAATAATGGAGATGCGAAGATTACTGTATTAACACTTGCAGAT
TTAGATGTTGATACAACTCAAATTGGATTAAAGGGTTCACCTACAAATGTTTATAAGTCTTTTGCACCAG
TTAAAGACAAGCATAATGAAATAATAGAAGGTATAAATAAAAAAGAAAAAGCTGAGAAACTAATAGAAAT
ACTATTCGATTTGAAACTAGTATAG
>ref|NC_013316.1|:905131-906153 electron transfer flavoprotein alpha-subunit [Clostridium difficile R20291]
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AAAGGGAAGGCAAAATTAATCCTGTTACGATAGAACTTATTGGTGAAGGAAGAAAGCTTGCTGACCAATT
AGGAAAAGAGCTTGAAGTTGTGATAGCTGGATATGAAGTAGAGAAAGAAGTGAAGGAATTACTTCACTAT
AGTGTTGATAAAGTATATTACATCAATGACCCTCTTCTTAAAGATTTCACTACTGATGGATATGCAATTT
CAATTGCAAATTTAATCGAAAGAAAAAAGCCAGAGGTTGTATTGGTTGGTGCTACTTCTATAGGAAGAGA
TATAGCGCCTAGAATTGCAGGTAAGGTTGGAACAGGTCTAACTGCTGACTGTACAAAACTTGAAATAGAT
TCAACAGATAATAAGTTATTACAAACAAGACCAGCATTTGGTGGAAATTTAATGGCCACTATTGTTTGTC
CAAAAAATAGACCACAGATGTCAACAGTTCGTCCAGGAGTTATGGCAAAAGCTGTAAGAAACGAATCAGA
GACTGGAATTTTAGAAGTTGTTACTCCAGAACTTACTGAAAAAATGATTAGAACTAGATTAGTAGAGGTA
CTTCCACAAGAAAAGAAATCTGTAAATCTAACTGATGCTAGAATAATAGTATCAGGAGGAAGAGGATTAA
AAAGAGCAGAAGGATTTGAGCTTATAAAAGAATTGGCTGATAAATTGGGGGCAGAGATTGGTGCTTCAAG
AGCAGCAGTAGATTCAGGGTGGATAGAACATTCTCATCAAGTGGGACAAACAGGAACTACTGTTAGACCA
GAACTATACATTGCATGTGGAATATCTGGAGCAATACAACACTTAGCAGGTATGAGTGATTCTAAATATA
TAGTTGCTATAAATAAAGATGCAAAAGCCCCTATTTTTAGTATATGTGACTATGGAATAGTAGGAGATTT
ATATGAAATTATACCTGAAATGATAGAATCATTAAATAGGTAA
>ref|NC_013316.1|:906252-907628 putative sigma-54-dependent transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAGCAGTGGTATAAGGATATATTTGCAAGAATATTATCTATGACTGATGATGGTTTTATTGTTG
TAAATACAAGTGGAGTAATAATAGATATTAATGATAAATATTGTGACTTTTTAGGAAAAGAAAGAAAAGA
TATAATAGGACAAAATATACAAAGTATTATACCAAATACAAAAATGCTAGATGTTATGAAAGATAAGTAC
TGTGAAGAAGGAGCTATACATCATTATTCAGGTGGAAATACAAAAGAAAAAAGTGTAATAGTAAGTAGGT
CTTATGTAGAAAATGACAATGGAGAAGTAGTTGCAGGAGTAGCTCAAGTTAAATTTAGATTGCAATCATT
TGATGTAGCTAAAAAATTAATGTCAGAATATATGGAGCTCCAATATTATAAAGAGCAGTTTAAGGATAAC
TGCGGTTTTGACAAGCTCATAGGTGAAAATAGAGACTTCATAGAACTTAAGAAAACAGGTGTGAAAGCTT
CTAAAACAAACTTTCCAGTACTTTTAACGGGTGAAACAGGCACAGGTAAAGAAGTCTTTGCTAGAGCAAT
TCACAATAATAGCAGTAGGTCAGATAAACCTATGGTTAGTATAAACTGCGCTGCAATACCAGAAGAATTA
TTAGAGTCAGAGCTATTTGGTTATGACGAAGGAGCTTTTACAGGAGCAAAAAAGGGTGGTAAAAAAGGTA
AGTTTTTAGTTGCAAATAATGGTACAATCTTTTTAGACGAGATAGGTGACATGCCTTTGACCATGCAAGC
AAAACTTTTAAGGGTTCTTCAGGAAAGTGAGATAGAACCAGTGGGAGGTCTTAAAACTATAAAGATAGAT
GTAAGAGTAATCTCTGCCACAAGAAAGAATTTAAGTAAAATGGTTGAAGAGGGATTATTTAGAGAAGACC
TATACTATAGATTAAATGTAATAAACATTCATATGATGGAATTGAAGGACAGGCAAGATGATATTTTATT
GCTAGCAAATTATATATTAAACAAATTAAATGTTGAATACAAGGAATTGAAGGTTTTAAGTGATAAGGTT
AAAAATTGTTTTATTAACTATACTTGGCCGGGAAATATAAGAGAACTACAAAATGTAATAAAAAGTGCCT
ATGCTGTAAGTGATGATATGGTCATTATGATGTGTGACCTTCCATCTAAGATGGATAATATCAGCAGAGT
AGCTCAATGTAATGTGGATAGCAATTGTTCAATTCATGAAATGGTTGAGAATTATGAAAAAAGCTTAATT
ATTGATGTGTTAAGGAAGTATAATTGGAAATGTTCTAAGGCAGCAGAGGTTATGGGAATACACAAGAGTC
TTTTATATAAGAAAATAAAAAAGTATGAAATTGAATTAAATAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c908304-907960 hypothetical protein CDR20291_0738 [Clostridium difficile R20291]
ATGGACCAAATTAAGCGTTTACATGAATTGCAACAAAAATCATATTTAACTAAAGAAGAATTTGAGGAAT
TAAAAAATAACACATATATTGAAAGATTTGAATTAAGAGATGAGTGCGATAACTCTTATATTTATACATT
TTACACTAACGATAAATGTAATGATATAAAATTTATAAAATCACAATTTATCGTTACACTTATAAAAATT
GGTTTCCTATGTGAGTGTGGTGGTGTATTTAGACAAAAGAAAATAGTTGATGAATATGATTATGGATACA
ATGCTATATATAAGTGTGATTCTTGTGGCAAAGAACTTGATAAAGAAGTAGAAAATTATGACTAA
>ref|NC_013316.1|:c908709-908473 hypothetical protein CDR20291_0739 [Clostridium difficile R20291]
TTGAGTCTTGTTTTTTTTCATAAAATCATTTGTATGTTAAAAAATAAATTAATTACTCTAATTCCAGTAT
ACAATGCCCAAAATATGTGGTATATTTTAACTATAATATATTTATATATATTATTGTCAGAATATTTAAA
GTTAAATTTATATAAAACATCTTTATTTATATATCACTTATATTTGGATATATTTTCTTTTTTTAGTTTT
CGGGTTAGTAAGGGGTTAGTAGTTTAG
>ref|NC_013316.1|:908792-909802 hypothetical protein CDR20291_0740 [Clostridium difficile R20291]
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AATGTTTAGAGCTAGTAAGAAAAAATGGATTGAATTTAATATACATAAAAAATCAAACAGAAGAGATATG
TCTAGAGGCTGTTAGACAAAATTGTAATGCAATAAAATGTGTTCAGAATCAGACAGAAAAAATATGTATA
GAAGCAGTTAAACAAGATTGGAGAATGTTAGAATTTGTGGAAGAGTCAACAGAAGAAATTTGCATGTTGG
CTATTAACCAAGATGGAACAGCATTAAAATATATAGAAAATCAGACAGAGGAGTTATGCTTAAGAGCCGT
TGAAAAAAATGGTGCGGCTTTGGAGTATGTAAAAGAACAAACAGAAGAAATATGTATAGAAGCAGTTAGA
AACAGCGAATTTGGATTGGCAAGAGTGAAAAATCAAACAGAAAAAATATGTATGGAAGCAGTTAAGCATT
GTAGCTATAATCTAAAATGGGTAGAAAATCAAACAGAAGAAATATGTATGGAAGCAGTGAGACAAAATGG
GCTTGATTTGAAATTTGTAAAAAATCAAACAGAAACAATCTGTTTAAGAGCAGTAAGACAAAATGGAATG
GCATTAGAATTTGTAAAGGAACAGACTGTTGGTATATGCTTAAAGGCAGTAAGACAATATGGAATGGCAT
TAAAATTTGTAAAAGAACAAACAGAAGAAATTTGTACAGAAGCTATAAAACAAGATAAAAGAGCACTTAG
TTTTGTAAAAGGAGATAAGGAAAAATACAAGGCTCTATATGATAATAATGAACCATTTGCAAAGAGATAT
GTTAGAAATGTAATAGAAAAAGAAAACAGAGCATTGATTAAAAAAGGAGAAGAAAATGCAAAAATCAAAA
TTGCAGGAAAACTTTATGATAGAGGCATGTCTTTTGAAGATATATCAGATATAGTTGAGATTGAAATAAG
CAAGTTAAAAGTGAGTTTAGGTGTTTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:909896-910426 putative flavodoxin [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAATAAATTATTTTTATTAGATAAGGGGGAATTAAAGTTGAAGATTACAGTATTATACCAAACAA
GAAGTGGAAACACAGAAAGGGTCGCTAAGCTGATAGAAGATGGAGCTAAAAAGGTGGATGGAGTAGATGT
AAAGCTTATGAGACTTGATAATATTGATTTAGATTATTTAAATGAAAGTAAAGCAGTAATATTTGGAACA
CCTACTTATTTAGCAAATACAACTTGGGAAGTAAAAAAATGGTTTGATGAAGATTCAAAAAAAGTTAATT
TAGCTGGAAAATTAGGAGCTGTTTTTGCTACATGTGATTATATATGTGGAGGTCCAGATGTTGCGATACT
TACTATAGTAGGACATTTGATGGTTAAAGGGATGCTTGTGTATTCTGGAGGTGGTTCTTTAGGAAAGCCA
TTTATACATTTAGGACATGTACATTCAATTGAAGGTCCAGAGTTACAAGATGAGAAGGCTATAATATTTG
GTGAAAGAATTGCTACTAAGGCAAAAGAACTATTTGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:910602-912530 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGTATGGCATATAGAATATGAGATTTTTTCTGCAATTATAGTTATTTTTTTAATGGTATACTTTTTTA
GAAGTAAATTTATACCTACTTTACAAAACAAAATATATTGTGCACTTTTAATATTCTCATTTTTATTTAT
ACTTTCAAATATTTTAGGTTCATTTTGTCTAAATAATATAGACAAAATTCCAATTTTTATTACTTTTTTA
TTGAATCAGATATACTTATTGTTATTGCCAATACCAGCAGCTCTTGTATCATTTTATGTTATGGCTATTA
TTTATCAAGATATAAGGTATATGAAAAAAAGATTATTATTTTTATCTATACCACTTATAATTTGTATAAT
CTTATCTATTACAAATCCTTTTACGCATATTCTATTTGGATTGTCAAAAGAAACAGGTTATATACGGGGT
TGTGGATATGTTGCAACTTTTGCATCTTTTTTCTTTTATGCAATATATTCAGCATTTTTATCTTTTAAAT
ATAGAAAAGCAATGCATGAATCAAAAATATGGGCTATTAGAGGTTTTCTTATAGTTTCAATTGTGGCAAT
TATCTTACAGGCAATTTTTTTACAGTATCTTCTTACAGGAACTGCATGTGCATGTAGTTTACTTTTGACA
TATCTTTCTATGCAGAATCGAGGTCTTATTATTGATGACCTTACTGGTGTACTCAATAGACAATCTTTTA
TTCAAGAGCTAGATTTGAATATCAATACTGAACAATCAGGATTTATTATTACAATTGCGCTTGATGATTT
TAAGTTTATGAATGAAACTTTTGGAACAAAAAATGGAGATATTGCACTAAAAGAAGTTGGAAAATATTTG
ATTCAGATACATGATGTAAACCATGTATATAGAATAGGGGGAGATATATTTTCTATTGTTGTCAATAGTC
AATTAGGTATAGAACCAGATGATATTATCAGAAAGATAGAAGAAAGATTTAAAAAGCCTTGGCTAGTAGA
AGAGATAAGTTTTAATTTAGCAACTAGTATTGCTGTTGTTTATTACCCAGAAAATGCAGAAACGACAGAA
GATGTAATTGTTGCTATAGATTTCTCTATACATGAAGCAAAACGTTCTGAGTCAAGGCGAGTTGTTTATG
CAGATGCGTCTATAAGTGAAAAGATAAAGAAGAAACATGTTATTAAAAATTGTTTAAAAGAAGCATTAAA
AAATGATGGGTTTGAAGTGTACTACCAACCTATATTTTCTAATAGCAGGGGCAGGTTTACTTCAGCAGAG
GCATTACTTAGGCTAGAACACAAAGAGTTAGGTTTTATACCTCCTGATGAATTTATTCCAATTGCAGAAC
AAACAGGATTGATTAACTCAATTGGATTAGTAGTCTTTGAGAAGGTATGTAGATTTATAGCTAGTGATGA
GTTTGAAAATTTAAAATTGGATAATATAGCTGTGAATCTTTCTGTAGTACAATGTATGCAAAAAAACTTA
GCTGATGATTTACTTTATCTTATGAATAAATATAATGTATCACCAACTAAATTTAAACTTGAAATTACTG
AGACTGTGGCTATGGGCTCTTTTAATATAATTAAAGAAACAATGGAAAGATTAATTGATTTAGGTGTTAA
GTTTGCACTTGATGATTTTGGAATTGCTTATTCTGGAGTTACTAATATGCTTTCTTTACCATTTTCAGTA
ATTAAGTTAGATAAGAGTTTGATTTGGTCTATGAATGAAGATAGTAGGCATAAGCTTACAGTTGAGACGA
TTATAGCTCTTATAAATAAATTGAATATGAAGGCTGTAGCAGAAGGTGTTGAAACCATTAAGTGTGCTGA
AGATTTAATAGCTATGGAGTGTGAATATTTGCAAGGGTATTATTTTTCTAAACCAGTTCCAGAAGATGTT
TTTAAAAATTTGTTGAAAGAAAATACTTTTACAAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:912705-913115 putative universal stress protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAAAGAAAATATTAGTGCCAATTGATGGGACAGAAAGAAGTATGCATTCTTTGGAATTTATAA
AAGGAATATTTAAAAAAGATGAAGTTGAAGTAGAAATAATGAATGTAAAAGAACTAGTATTTATTGATGG
CATATCCCTGGCTGAAGAGATAAAAAATTCTGAAAATTTAGGAAGAAGAATCTTGGATAAAGCAGCAGAG
ATAATGGGAGAGTATGATGTTAAAGTACATTTTACTTTTGGATATCCAGGAGATGAGATAATTAGAAAAG
CAAAAGAAGATAATGTAGATTTTATAGTTATGACAAAATCTACTAAAAAAGGTCTTACAAGAATGATAGG
TTCAGTAACAGCAAGTGTAGTTAAACAAGCAAAATGTATAGTGATGATTGTACCGGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:913137-913439 putative PTS system, IIb component [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAAAGATAGTAGCAGTTTGTGAAAGTGAAAGAAGTTTAAATTCTCTTAAGACAGCTGCAAATG
ATTTAGGATTTGATTTAGTTTATGAAATTCAAGAAAATGATAATATAAAAAATGAACTTTCTATTTATGA
TATAGAAGATGCATCTATAGTGTTATTTGTTACAAGTGATTCTATAGAAAGCATAGAGAAGATTGATAGA
TTTATAGATAGAGAATTTTATGAAGTTGATCCAAAGTATATAATAGAGGATGCAAAATCTATAGTAAGTG
AAATTTTAATAGACTTAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c914347-913655 GntR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGCTTAAATGCCACTGAAAAAATTATTGATTATATTAAATTAAACATTCTAAATGGAACTTTTA
AAATTAATAGTAAATTACCAAGTGAGAGAAAGATTGCTGACCTATTTAACATAAGTAGAATACCTGTAAG
AAATGCCATAAATATACTCTGTAAGGAAGGAATACTTAGAGCTGTGCCTTACTCAAGTCCTATAGTTGAA
GGATTTAAAAAAGTTGACCTATTTGATGATGGTGAAATCTATAAAAATCATAACATACAAGAATTTTATG
TAGAATCTTTAAGAGCAAGACAACTTATCGAAAGTGAAGCTACTAAACTAGCAATTTTAAATGCTACATC
TAAAGAACTTCAAAAAATAAAATATACTTACCTAAAGTCAATAGAGGAATTGGATAAGGTTTCTCATGGT
TTGATAGAAGAATGTTATGATGCTGACTTACAATTTCACAAAGAGATAATTTTAGCTTCTCATAATCCAA
TTTTTATAAAATATTATGAGTTAATACCTAAAACAGTTTCTTCTAACCAATACTTCGGTTTTAAATATAG
AAATTCTCTTAAGGATATGATTAGCCACCATAACAAGATAATGATGGCATTTGATAGTAAAGACTCTTAC
TTAGGTTATACATCAATGTACAATCATTTAGAAGATGTAATTCAGTTATTTCAACATGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c915572-914373 putative transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGATAATATGAAAAAAATATCTAATCAAAAATTACTTTTACTTTCTATTGTTACATTTTTCTGGT
TTTCACAATATGTATATATACCTTTCCAAAATCCATATTTAAGTGCATGTAATGTATCTACAAATATGAT
TGGTATAATAATAGGTGCATATGGAATCTCACAATGTTTATTAAGGATTCCTGTTGGAGTATTTGCTGAT
TCTATAAATAAACATAAAATATTTATACTGTCTGGAATTTTCTTTGCTGGTTTAGCATCTCTTATAAGAG
TCTTTTCTCCTGGAGGCAATGGTTTTCTTATAGCTAACATTTTATCTGGAATATCATCATCAACTTGGAT
TTCTTACATGGTTCACTATACCAACTTTTTTTCTACAGAACATCAACAAAAAGCTACGAGTACGATAATA
TTGGTAAACAATCTAGGAATGTTGATTGGATTTGTTATGAGTACTTTATTTTATGAAAAATTAGGAATGA
CAGCCTTATGTATCATGAGTGTATTGTCTTCAGTTATTGGAACGATTCTAGCCTTAAATATAAAAAATCA
TAATTCAAAAAAAATACCTGAAAAAATATCAATTAAAAAATATTTATCTATCTGCAAAGATAAAAGACTT
GTATTTTTTTCCTTTATGGCATTAATTCAACAGGGTATTCAAATGTCTACAACAATGTCATTTACTACTC
AAATTCTTAAAAACTTAGGTTCTAGTTCTACCCTCATAGGTCTATCTTCTATATCTTACATGGTGTGTGC
TGTTGCTTCTTCTGGCTTTGCTTCTACTAAATTTTGTACTAAGTATGGGCCAAAATTTTGGATTCCTTTA
GTTTTTATTTTAGTTTCAGCCTATTGCTTTTTAGTTCCAACAATAAAAAATATTAATATAATATTTGTAC
TACAAGTGCTACCAGGTATATCTACAGGTATACTCCTTTCTTACCTTACTAGCGAGTCTATGAAAAATGT
ACCAAAACATCAGAAATCTACTGCAATGGGTTTTTTTCAAGCAATTTATGCTATAGGAATGTCTGTATTT
CCAATGATAGTTGGTAAAATATCGGAATATACTTCAATACAATATGGATACTTTATCTTGGCTATTATAG
CTATTTTGGCCTCTATCCTGTCTTATACATATTATAAAAAAGTAGATTTAACTCTTAACTATGATATAAT
ACAATCATAA
>ref|NC_013316.1|:915896-917773 PTS system, IIabc component [Clostridium difficile R20291]
ATGGATTATAAAAATATAGCTCAAGAAATTCTACTAAATGTAGGAGGAAAAGAGAATGTAAATGAAGTGA
CTCATTGTATGACAAGACTTAGATTTAAAGTCAAAAGCGCTTCTAAAGTGAATAAGGATAAATTATCTAA
AACTGAAGGAGTAATAACTGTTGTTGAGAGTATGGGTCAAATACAAGTTGTAATTGGAAATAAAGTAAAA
ACAGTATATGATGAGGTTATAAAAATTGTACCTCAATCAAATGACGTAGGTAAAAAGAATGAAAGTCAAG
AAAAGCAAAGTATAATTAATTCTATATTATCAGCAGTAGCTGGTATATTTACACCTACAATACCTGCTAT
AGCAGGGGTTGGTATGATTAAAGGTATTTTATCAGTTCTTGCTATGTATTATATGAATAAAAATGGAGTA
GATATAAAAGAAACGCAAAGTTATATTATCTTAAATGCCATGGCCGATTCTATATTCTATTTTATGCCTA
TTATACTAGGATATACTGCGGCTAAAGTATTTAATGCAAATAAAATAATATCTATGGTATTAGGAGCTAC
ACTTTGTTATCCAACTTTTACTGCTTTGATGGCAGGTGAAGAATCTGTTAGATTTTTAGGATTGGCAGTA
ACAAAAGCTACGTATACATCATCTGTTATTCCAATAATTATTGCTATATGGGCTCTTTCATACGTTGAAA
AAGTATTAGAAAAGTATATACCTGAGGTAATTAAAATAATAATGGTTCCAACTTTATCATTGGTTGTAAT
GTTACCTGCAACATTATTTTTATTTGGACCAATCGGAATTTATATAGGAAATGTCATAAACTTTTCTTAT
AAGTATATTTATGAATTAAGCCCAGCGTTGTGTGGAGCATTTGTAGGTGGGTTATGGTGTGTGTTGGTTA
TATTTGGTGCTCATAGAGCATTATTACCAATAGGTATAAGTGATGTTGCTCAAACAGGAAGACAGAATTT
ATTGGCATTTGCAGGAGCTGCAAACTTTTCACAAGCAGGGGCTGCTCTAGGAGTATTCTTTAAAACTAAA
AATCAAGGACTAAAAACAATTTCTATGTCTGCAACTATAACAGCTTTATTTGGTATAACTGAACCTGCAA
TATACGGTGCCAATCTTAGATTAAAAAAACCTATGGTATGTGCCGTAATATGTGGTGCATTTGGAGGTGC
GATAATGGGAATGGGTGGAGCTTATGGTAATGCATTTGCAAACCAAGGTGTTTTAACTATACCTGTATAT
GCTGAAGCAGGTGCATTAGGTTTCTTAAGTTATCTAGGTGGTTGTGCTATAGCATTTTTTGGTTCAGCTA
TTTCAACTTATCTAGTTGGATTTGAAGATTTGGAAGAGTCTTCTAATAAGGAAAATTCATTTATAAAAGT
AGAAACGAAGGATGGTGTTATTGATATAACTTCACCTGTAGAGGGCGAATGTATAGAATTGTCAGAAGTA
AAGGATGATGTATTTGCTTCAAAAGCTATGGGAGAAGGTATAGCTGTGTTACCTACAAAAGGAGTAATAA
CAGCCCCTACTGATTGTGAAGTAGCTTCTTTATTTCCAACATTACATGCAATAGGATTAAAATTAGATAA
TGGAGCAGAAATGTTAATACATGTTGGAATCAATACAGTAGAGTTAAATGGTAAATACTTTACAAAACAT
GTTAATCAAGGAGATTTAGTGAAAAAAGGTGATAAACTTATATCGTTTGATATAGATAAAATAAAAAAGG
CTGGTTATGATGTAACTACGCCAGTTATAGTAAACAATACATTTGATTTTGGGCAAGTAGTTTCTTGTAA
ATCTAGTTATGTTTCAACCAATGATAATATAATTTCATTAGTATTAGCTGGTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:918085-919491 putative 6-phospho-beta-glucosidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATACAGGATTTCCAAAAGACTTTTTATGGGGAGCATCATCTTCTGCATTTCAAGTGGAAGGAGCTT
GGGATAAAGACAATAAAGGAAAAACCGTAGCCGACTATAATTCTTTTAAAAAGTCTCATTTACAGGCAGA
TACTAAAGTTGCATCAGACTTTTACCATAATTATGAAGAAGATATTGAATTAATGAAAGAATTAGGGATG
AAAACATATCGTTTTTCAATTTCATGGGCAAGGATAATACCAGATGGTGAAGGAGAGATAAACCAGAAAG
GTTTAGACTTTTATAATAAGATAATAGACAAACTAATAGAGTGTGATATTGAGCCATTCGTAACTTTATA
CCATTTTGACCTTCCATTTAAATTAGTAGAGAAATATAATGGTTGGGAAAGTAGAGAAACTGTCTATGCT
TTTGAAAGATTTGCTAAAATATGCTTTAAGCATTTTGGAGATAGGGTAAAGTATTGGCAACCTCATAATG
AACAGAATTTAATTGTTAGAGTGGAGGAGAGAATTAATATATATGATGAAACAGATTCATGGAAGATAGA
TAAAATGCGTGCTCAGATGGATTATAATCTTTGCTTAGCACATGCATTAGCAGTCAATGCATGTCATGAG
ATGATAAAAGAAAGTAAAATTGGAGCAGCAGTATCATCATCTGTAACATATCCTCTTACTTCTAAGCCAG
AAGATGTATATGCAGCTAGAATGAATGATAATTTTAAAGTGTACTATATGCTTGATATGCATCATTATGG
AGAATATCCAGGGTATTATATGAAGTATCTTGAAAAAAGAAATACAGTTCCTCACATGGAAGATGGGGAT
AAAGAGATACTTAAAAAAGCTAAAATGGATTTTATAGCTGTAAATTATTATAGGACAAATTGTGCAGAAG
CTTTACCTGAAGATTCACAACATCCATTTGGATTAAGAGAAGGAACTGTTGATTTTAGTATGTATGGACT
ATTTAAAATGTCAATGAATCCTAACTTAGAGGCTTCTGAGTATGGAGCAGCAATAGACCCATCAGGTCTT
AGAGTTGCCTTAAATGAATATTGGCAAAGATATCACTTACCTGTTATAATAACAGAAAATGGTCTAGGAG
CTAAAGATATATTAGAAGATGGAAAAATTCATGATGACTATCGTATAGACTATTTAAGAAGTCATATAAA
TGCATGTAAACTAGCTATTGAAGATGGTGTAGAGATGATTGGATATTGTCCATGGTCATTTACAGACCTT
TTAAGTTCTTCTCAAGGTTTTAATAAGCGTTATGGACTTGTTTATATAAATAGAACTGACCATGAAGTTT
TAGATTTAAAAAGAATCAAGAAAGATAGTTTTTACTGGTATAAAGAAGTTATAGAGAACAATGGAATAGT
AAAATAA
>ref|NC_013316.1|:919519-920367 putative transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
ATGTACATTACAAAGGTATTAAATAATTCGTTGCTACTTGCAAAGGATGATAATGATGAAGAAATAATAT
TGATGGGGAAAGGCATTGGCCATAATTATAAGGCCGGGTCTGAGTTAAATAAAAAAGATATAGAAAAGAT
TTTTGTTCTTCATGATGAAAATATAAAAAAGAGTATTATACAATTGGCAACAGAAATAGATGCAGAATAT
TTTGGTATAGCTCAAATGATAATTGCATATGGAATAGAAAAATATAACTTAAAACTTATGAACCATATAT
ATTTGGCCTTAACTGACCACATTGCCTTTGCAGTGAGACGCTTTAAAGAAGGTATAATGATTGAAAATCA
CTATTTGTTCGAAATCAAGGAATTTAATCCAAAAGAGTATGATATAGGAAAATATGCTATTACTGTTTTT
AAGGAGGTTCTTGGTTTAGACCTACCAGAAGAAGAGATTGGTAATATAGCAGGCCATTTTATAAATGCAC
AACAAGATAATCCTTATAGTGATAGAAATAAGAGAAGTGCTAAAATTGTAAATGCTATTTTGCAAATAGT
TCATTATCACTTTTCTATTGTATATAATAAAGAGTCATTTTATTATAGGAGATTTGTAATGCATCTAAAG
GCCTTTTCACAAAGATTTCTGGCTAATGAACCATCAAGAGAAAAAATAGATTTTATATATGAGCAAGTTC
AAAAAAATTGTAAGGAAGAGTATGAATGTGTGAAAAAGGTAGGAGCTTATATGTATAAGGAATACTCCAG
AGAATTACCAAGACAAGAGGAGTTATATTTGATGATTCATATTCATAAGATTTTAGGAGAATTATGCGAA
AATAGTTAG
>ref|NC_013316.1|:921004-921720 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTGTAGAAAGGGGAACTAAGATGAATAAAGTTTTAATTATAGATGATGATAAAGATCTTTGTATTT
TGTTAAAAAAGAGTATTTCAATTGAACAGATTGAAGCAAACTATTGCCATTCTGGGAGAGATGGACTGGT
TGAACTTTCAAAACAAGATTATCAGTTAGTAGTTCTAGACGTGATGATGCCAGGTATGGATGGTTTTGAA
ACTATGGAACAAATACGAAAATATAGCAGTATTCCCATCTTAATGCTGACATCAAAAAGCGATAATTACA
GCAAAGTGCATGGATTGCGAGCTGGTGCAGATGACTATCTAACCAAACCATTTGAAATTACAGAATTTAC
TGCTCGTGTACTGTCTTTAATCCGACGTTACACCCGTTTTAATCCAAAAAATGAGGAACCACAGCAACTT
TCTTTCAAAGGTTTGTTGATTGACCTTGACCAGCATACAGTGACTACCAATGGCGAACCTATGTTGCTTC
CACCCAAGGAATTTGGTGTGCTTCTTTACTGTGCAAGGCATCAGGGTAAGATTTTGACAAAACAGCAGAT
TTATGAAGCTGTGTGGGGTGAGCCATATGTATATGATGACAGCAATATCATGGCTATTATCAGTCGCCTA
AGAAAAAAAATTGAACTAGACCCATCATCTCCCATCTATTTGCAAACAATAAAAGGAATTGGGTATCAAT
TCAACACGGAGGTATGA
>ref|NC_013316.1|:921717-922652 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATGGATGAACAAACGATAATTCTTTTCTTATTCTTGCTGTCGATTGGTCTACTTTTTCTTTCCA
TATTTGCTTTTTCCAAGCTTGGGCATATTCACAAACGCCTAAAAGATATAGAGGAGATACTGGCTGATGT
ACAAATTGGAAACGAAAATCGCAAAATACTAATTAAGCCATGTGATGTTATGGCTCCATTGGTTTATCAG
CTTAATGAGATTGTCTACGATTATGAAAATAAGTTACTTTCTCTGAAAAAGTCGGATAAAGCTAGCAAAC
AACTTATGACAAGTCTATCTCATGATGTTCGTACACCATTAACAACTCTGATTGGTTATCTGGATGCTGT
ACACAGTGGTATAGTTATCGGACAAGAACGGGAGGAATACCTTGAAATCGCTAGGCGTAGAGCCTACGAC
CTCAAGGATTACATTGATGTTCTTTTTGACTGGTTTCGGTTGAACTCTGATGAATTTACGCTGTCAATAG
AATCTGTGGAAATTGCAGAGTTGTCACGCAATATTTTGAAAGACTGGATTCCTATATTCCATGAAAAGAA
ACTGAATTTTGAAATTGATATTCCAGAAAATCGACTAATGGTAAATCTCGACCCAGATGGATATTCCCGT
GTGGTTAATAATCTGGTTCAAAATGTTCTTGCTCACAGTAAGGCTCGGCAAATCAAGATTACCATGAGTG
AGGATTCCAGAATGGTATTACTCCGTGTTGATGATGATGGTGTTGGGATTGCCAGAGAAAATTTACCACA
TATTTTTGAGCGACTGTATAAGTGTGATAAAGGACGTTCAGAAAAAGGAAGTGGTCTTGGTCTATCTATT
GTCAGTCAAATGGTGGAGCGAATGGGTGGTCAGATTTCCGTAGAAAGTGAGATTGGAAAGTATACCGTAT
TTACAGTGAGCTTACCATTAATATAA
>ref|NC_013316.1|:922800-923723 putative lantibiotic ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATTTAATTATTGAAACAAAAAATCTCACTAAGCAATATGGTGCTCAAAAGAGCGTTTCTAATT
TGAATATTCACGTTCAGAAAGGTCGCATTTACGGATTGCTAGGAAGAAACGGTGCGGGTAAGACGACAAC
TATGAAAATGTTATTGGGTCTAACAAAACCAACTACTGGAGAAATTAAAATATTTGGTCAGGACATTCAC
AATAACGAGAAGAAGCTTCTTCCTCGAATTGGATGTTTGATTGAATCACCAGGGTTTTATCCTAATCTGA
CAGGAACAGAAAATCTCAAAATCTTTGCAAGGCTTAGAGGAATACCAAAAAAAAATGCAGTAGAATCAGC
ACTGGATGTAGTCGGTTTGCCAAACAATGACAAAAAGTTATTTTCTCAATACTCTCTTGGTATGAAACAG
AGGTTGGCGATTGCTCTTGCCATTATGCATGACCCACAACTGTTGATTTTGGACGAGCCTATCAATGGAC
TTGATCCTATTGGTATTGCAGAAGTAAGAAAGTTTATTCGTGATCTCTGCACAGAACGAGGTAAAACTAT
TTTGATTTCCAGTCACATTCTTTCTGAAATTGCCTTGTTGGCAGATGACATTGGTATTATTGACCATGGT
ATTTTGTTGGAGGAAGAAAGTCTTGCCCAATTAGAAGAAAAAAACAGTAAATACATACATTTTGCTGTAT
CTGATGCAGCACATGCAGCAAGGCTTCTGGAAACCCAACTTAACCTGAAAAATTTCAAAGTAGCAGATAA
TTACAATATTATGCTATATGATACAGATGTTTCTGTTGCAGAAATAAATCGTGCTTTCATTCTAAACAAC
ATTGAGGTATCAGAATCTCATTTATGCGAAGATACTCTTGAAGATTACTTCAAGAAAGTAACAGGGGGTG
AAGGAATTGCTTGA
>ref|NC_013316.1|:923707-924477 putative lantibiotic ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
GTGAAGGAATTGCTTGATATAATTTCATGTGAATTTTCAAAACTCAAGCGGTTAAAATTTATACTGATTT
CTATTTTAGGTGCTTGCTTATTTCCAATTCCCGCAACAATTTTGATTGCAAAGGACAACTTGCCCTTTGA
GCAATTGTTCAAATTAGTTGTCAATTTTGGATATTTTTTGCTATTACCAATTGTATTAAGTATTGTTGCT
AGCCAACTATTTTTTATAGAAAGAGATAACGATGTATTAAAAAATCTTGCAACAGTGCCAGTGCCAAAAG
GAAAACTGGCTCTGGCAAAATTGGCTGTGTTGCTGTTTATATCATTGTTCTACTCCGTTGCAGGGTTAGG
AGCTACTATCATTGGAGGTTTCATTGTTGGAATAGTAGAGGGGGTTACTGTAAAATTAGGAATGAGCATT
GCTTTTGGAATTATGTTTTTTGTTACTGTACTTCCTGTTGTGGTACTCATTGTATATTTCAATCGCAGCT
ATATTTTTTCTATTATACTTTCTTTTGTATATGCTATTTTCAATTTTAGTATATCCTTAAATATTATCAA
TTTTGAACCAAATAACCCACTATTAAGCGTATTACCTGCTCCTGTTATAATGCGTTGGTGGATGGCATTT
TGGGGAGATCCCACTGGCGAATACACGGCACTTAGACAGCCATATTTGCTCTCAACTCCTGCTTGTGTAG
GTATTTTATGTTTGATAACCATTATAGCAGTCCTGCTGATTTGTATGATATACAAAAAGCAGGAGAATTA
G
>ref|NC_013316.1|:924487-925269 putative lantibiotic ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGCTTGATATAATTACTACAGAATTTCAAAAAATAAAAAGATATAATATTCTATGGATTGGTGTTGTTG
CTGTTCTGTTTTCAGCACTATTGGCAGTTTTTCAGGTTGTAAGTTCACACGGCAGTGACCCTCTAACGTA
TGAGAGCTTTGCAAACGGAGTTATCTGGAATAATTTCAGTCTTAGTTTTCCATTTGGGATTACACTTATT
GGAGGATATCTTATTAACCGTGAATATACAGACCAAACCTTAAAAAACATCCTAACTGTTCCTATTTCAT
TACGCAAATTGCTAGTGGGAAAATTAATTGCGGTTGGAGGAATTGCTGTATTGTTAAGTCTTTTCAGCTT
CTTATGCACATTTATTTTGGGGTTGTTATTTTGCAATATCAATATATCTGTTACACTCATTGTAAAATCC
TTAGTTCAGATTTTGTCTGTTAATCTGTATTGTTATGTTGCTGTTTTGCCGATTATTGCTTATTTTGGTC
GTAAACAAAATGCATTTCTGACGGGTGTAGGGATTGCATTTGTATACGGGTTTTGTGGTGTGTTTGTTGC
TGGAAGAAATCTGACAGACTTTTATCCAATCACAGCAGGTCTTGGTCTAGTTGGATACAACAATGGTGCT
GGTACTGTTTATCAGCCACTTATCGGTGCTATGACTTTGATTGTAATTCTAATCTTGACAACTATTCTAC
TTGTATTTACACCTAATTATGATAAAGTTATGACCATATCTAAGAAAAAAGGGATAAAGCATAAAAAGTA
TTCTCATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:925646-926182 rubrerythrin [Clostridium difficile R20291]
ATGAACTTAAAAGGAACTAAAACAGAAAAGAATTTAATGGCAGGATTTGCAGGAGAGTCAGAAGCAAGAA
ATAAATATACATACTACGCTTCAAAAGCAAGAAAAGAAGGTTATAATCAAATAGCTGCTATATTTGAAGA
AACTGCTAACAATGAAAAGGAACATGCTAAATTATGGTTTAAACTTTTACATGATGGTATGCCTTCAACA
GAGGAAAATTTAAAGGATGCAGCAGCAGGTGAAAACTATGAATGGACTGATATGTATGCAAAATTTGCTA
AAGAAGCTAGAGAAGAAGGATTTGACAAGATAGCTTATTTATTTGAAGCTGTTGGAAAAATAGAGAAAGA
GCATGAAGAAAGATACTTAAAGCTTTTAGAAAACTTAAATGAAGGAAAAATATTTAAAAGAGATGAAGAA
GTTGTTTGGCAATGTCAAAACTGTGGTCATGTGTATGTAGGTACTGAAGCACCAGAAAAATGCCCAGTAT
GTGACCATCCAAAAGCGTATTTCAATATAAAAGCTGAAAATTATTAA
>ref|NC_013316.1|:926214-926603 putative oxidative stress regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTTTCTAAACAACGAGAACTGATTTTAAATGAAATATTAAATAATCCGGTTCATCCTACTGCGG
ATTACCTATATGAAAACTTAAAAAAAGATAATCCAAATTTAAGCTTAGGAACTGTTTATAGAAATTTAGC
TCAGCTAACGGAACATGGCTTTATAAGAAAGGTTAGTATTCCAGGGTATCCAGATAGATTTGATGGTCGA
ATAGATAATCACTATCATATCATATGTGAAGTATGTGGAGAGGTATACGATTTAGAATCCGAAGTTCTTA
ATAATTTACAAGAATTAATATCTGAGGAGACAGACATAAAAATAACATCTTATAACATAAGTTTTAAAGG
GATTTGTAATAATTGTAAAAGGTGTAGCCAAGTAGGTTAG
>ref|NC_013316.1|:926640-927026 rubredoxin oxidoreductase (desulfoferrodoxin) [Clostridium difficile R20291]
ATGTGTAGTGAACAAAAATTTTTTATATGTGAGACTTGTGGAAACCTTGTAGGAATGATACAAAGTGGTG
GTGTACCTATTTTCTGTTGTGGAAAACCTATGAAGGAACTTGTTCCTAATACAACAGATGCAGCAGTTGA
AAAACATGTACCTGTAATTGAAGTGGATGGAAATAATGTTACTGTTAAAGTAAGTAGCACAACTCATCCA
ATGACTAAAGAACATCATATAGCATGGGTGTATCTTATGACTGAACAAGGTAGTCAACGCAAATGTCTAG
CAGTAGATGGAGAACCTGTAGTTAAATTTGCTTTGAATGATGATGATAAAGTGATTTCTGCCTATGCTTA
CTGTAATTTACATGGATTATGGAAGGCTGAACTGTAA
>ref|NC_013316.1|:927153-928595 putative oxidative stress protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAATTTATAAATGTAGTGTTTGTGGATATATTTATGATGAATCTAAGAATGATAAAACATGGGATG
AATTAAGTGAAGATTGGGAATGCCCTGTATGTACAAAAGGTCGTAGTTATTTTGGAAAGATAAGCACTGT
TTACTATGAAGAAGATGAAAAGATAGCAGAAGACATAGTTGAAAATGAATCTAAATTAAATACTGAAAAA
GAGGGAGATTTAAATTACTTAAGTACATATTTAAGAAGAGATGATGAAGTTGAGAAACATATGGATATAA
TTCACGAAATGGCTGTTACAGGAAAATCTATAATAGAACCTATGAGAACTAAACTACCAGTAATTTCTTG
GGATGATATTTTAATTATGGGTGCTCAATTAAATCCATTACCTTTAAATGAGCATGATGAAGTAAATACA
ACAACAATAATAGGAAAAAAAGCAAAGAAACCTATGATTATAGAAAATCCAGTTTATATTTCCCACATGT
CATTTGGAGCTTTGTCTAAAGAACTAAAAATAGCTTTAGCAAAGGGTGCAGCCCAAAATAAGACAGCTAT
GTGTAGTGGTGAAGGAGGTATATTACCAGAAGAGAAGGAAGCTTCATACAAGTATATTTTTGAGTATGTA
CCAAATAAATATAGTGTAACTGAAGAAAATCTTAAAAATTCTGATGCTATAGAGATAAAAATTGGTCAAG
GAACAAAACCTGGTATGGGAGGTCATCTTCCTGGCGAAAAAGTAACTGAAGAAATAGCAAAAGTAAGAAA
TAAGCCTGTAGGTCAAGATGTAATAAGTCCATCTTGTTTTGAGGAAATACAATCCAAAGAGGATTTAAAG
AAACTTATAGATGAACTTAGAGAAGTTTCAGAAGGGCGTCCAATAGGTGTTAAAATTTCAGCAGGTCATA
TTGAAAAAGATATGGAATTTATAGCTTATGCTAAACCTGATTTTGTAACTATTGATGGTCGTGGTGGAGC
TACTGGAGCAAGTCCAAAGTTGCTTAAAGATGCAACTTCAATTCCAACAATATTTGCTCTTTATCGTGCT
AGAAAATACATAGATACACATGGATTAGATATAGATTTGGTTATAACAGGTGGGCTTCGTATATCTACTG
ATTTTGCTAAGGCAATTGCTATGGGGGCTGATGCAGTTGCTATTGCAAGTTCTGCTCTTATGGCAGCGGC
GTGTCAACAATATCGTATATGTGGTTCTGGTAAGTGTCCTGTAGGAGTAGCTACTCAGGATGAGGAATTG
AGAAAAAGATTACATATAGAAAATAGTGCTAATAGAGTGGCAAACTTTTTAAATGTAAGTTTAGAAGAAC
TTAAGACTTTTGCTAGAATTTCTGGTCATAAAGATATACATGATTTAAGTGTTGATGATTTATATACTGT
TAACTCTGAAATATCAAATTATACAAACATACAGCATGTATAG
>ref|NC_013316.1|:928892-929707 metallo-beta-lactamase superfamily protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAGATTGAAGATACAAGTTTTAGTTGACAATAATACTTATATTGATAGATACTTTGTTGGAGAAC
CAGCAGTAAGCTATTATATTGAGATTGATGGAAATAGGATTTTGTTTGATTCGGGATATTCAGATGTATT
CATATCAAACGCTGAAAAATTAAATATAGATTTAGGAAATTTAACTCATGTTGTTTTTTCTCATGGACAT
AATGACCATACAAGAGGTATCCAGTTTTTAGAAAATAGGTATGATTTATCTACAGTTGAACTTATTTCAC
ATCCTAACTGTTTTATACCTAGAAAACATGGAGAGAAAAGCATAGGAGCTCCATTTTCTGCTGAGGAAAT
TAAAAATATTTTTATGTATAATCCTAAGGATAAGCCATTTAATCTAAGTAAGAATTGTGTGTTTTTAGGT
GAAATACCTTCTATAAATAATTTTGAAAAAAGAGCTAAAATTGGTAAATGTAAAATAGGAGATTTGTGGG
AAGATGATTATGTTTTAGATGATTCTGCTATAGTTTGTAAAACTGATAAAGGTATTTTTATTGTTACAGG
ATGTTCTCATAGTGGAATTTGTAATATAGTAGAGTATGCTAAAAGGGTATGTGGAGATGATAGAGTTATT
GGTATACTAGGTGGTTTTCATCTTTTTGAATTGAATAATAGGTTAGATAGTACAATACAATATTTGGATA
AAGAAGAAATAAGAATGTTGTACCCTTGTCACTGTGTTTCTTTTAAGGTAAAAGCTAAGATGAATGAAAT
ATTGAATATAAATGAAGTTGGAGTAGGGCTGACCATAAGTATATAG
>ref|NC_013316.1|:930308-931492 hypothetical protein CDR20291_0760 [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAAAAAGTGTAAAGAAAGCAAAAGTAACGGGATCTATGTTAGCCATTTTTGGTGTTGCAAGCGTTC
TTTTTAGTTCACATGCAGGAGGAGGATTTGCTACAGGGAATCAAGAAACTCAGTACTATGTGCAGTATGG
ATGGACAGCACCACTTATGGCAATTTTAGCAATGATTATACTTACTGCTACCATGAGAGAAGTTATCATA
ATGTATAATAATAACAATTGTAGGAATTATAAGGATTTATTTTGTGAGCTTTGGAGACCATATCCAAAAC
TTGAAATAATATGGGAGATATATTACTATCTAATGGTTTTAATAGCTGTAAGTGCTGTTATAGCAGGTGC
AGCAGCAGTATTTCAAAGTATAGGAGTAAATTATTTTGTAGCTGTATTTATTATTGGAGTTGTACTTCTT
GTCTTTACTATATTTGGTGCTATGCTTGTATCTAAAGCAGCTACAGCAATGACAATAGCTATTCTAGTAT
GTACTCTTACTATTTTTATTGTTGGTATAAAAGCTAAAGTACCAGAAATAACTGAAATATTATCAAATAG
AACGAGTTTCACACCTGGCTATATCAAGCCAATACTTAATACTTTTATTTATGCAGGTTTTCAATCGGTT
GTTATACCTACACTTGCAGGATGTTCAAGACCACTTCTTAAGAACTCAAAAGAAGCTACTAAGGCAATGA
TAATTTCATTTGTTATGAATGCAATTGCATTAGGACTTGCTGTAACTATGCTAATGGGATGGTATAGAGA
AATTATTGCTGCTGGGCAAACAACACTCCCTACTCTTTATGTTGCAGGTCAATCTGGAAATCATACTATA
TACATAATTTATAATGTTGCATTATTCCTTTGTTTAATGTCTACAGGAGTAACTACTATATTTGGTCTTG
TAAATAGATTTGAAGACCATAAAGCACTTTCTTTCCTTTCTTCAAGAATGAAAAGAAGGGTATTTACAGC
TTGTGCAATAATGGTAGTGTCAATGCTTATATCACTTACAGGATTAAGTAATATTGTTAAATATGGATAT
GGATATTGTGGTTATCTTGGTCTATTCACTATAGTAATTCCATTCCTTACACTAGGACATTATAAGAATA
AGAAGTTTGCAAAGGAAAATCCAGAAGCTAAATGGCCAGCGGAATTAAATGAAAATGTAAATTAG
>ref|NC_013316.1|:c932996-931869 putative ATP-dependent RNA helicase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGGTAAGATAACAATGGATTTCAAAAGCTTAGGGATTAGTGAAAATACAATAAATATTCTAAAAA
AATCAGGAATAACAACACCTACACCTATACAAAAAGAAAGTATTAAACTAATAAAAGAAGGAAAAGATGT
AATAGCAGAAGCTCAAACTGGAACAGGAAAAACACTAGCTTTTTTACTTCCGATATTTGAAAATATATCA
TTAGATATAAATGATATACAAGTACTTATACTTTCTCCTACAAGAGAACTAGCTATTCAAATAACAGAAG
AAGCTATGAAACTTAAAGAATCTAAAGATGTAAGTATTCTTGCAGCATATGGAGGAAAAGATATTGGTTC
TCAAATAAAGAAACTAAAAGGAAATATTCATATGATTATAGCTACACCAGGTAGGCTTTTAGACCATCTA
AATAGAAAAACAATAGACCTTAGTAAGTTAAAGACTTTTGTTTTAGATGAAGCAGACCAAATGTTGCTTA
TGGGATTTAAAAACGAAGTGGAAGCTATTTTAAAAGAGACTTCAAACAAAAAGCAAACACTATGCTTTTC
TGCAACTATAAATTCTCAAGTAAAAAAATTAGCTTATAGATACACAAAAAATCCTGTTGTAGTTTCTATT
CAAAAAGAAGAAATCACTCTTAATAATATAAAACAAGAAGTAGTAGAAACTACAGATAGAAAAAAATTAG
ATGCCTTATGTAAGGTACTAGATGAAGATAATCCTTTTATGGCAATAATATTTTGTAGGACTAAGAGAAG
GGTTGACAATCTTGAAGAAGCTCTTGCTATAAGAGGATATAATTGTCAAAAACTTCATAGTGATATTGCT
CAATCAAAACGAGAAAGAATAATGAAATCATTTAGAAATTTAGATATACAATACTTAATAGCTACAGATG
TAGCTTCTCGTGGCCTTGATATATCTGGAGTAAGTCATATATATAATTACGATTTACCAGAAACACCAGA
AGACTACATCCACCGTATTGGTAGAACTGGTAGAGCTGGTGAAGAAGGCTATACATGTGCTTTTATTGAC
CCTAAAAATGAACGAATGTTAAGTGAAATAGAGACGGCTATAGAATCTAAAATTAGTAGAAGAATTATAG
AATTATAA
>ref|NC_013316.1|:933441-934634 putative homocitrate/2-isopropylmalate synthase [Clostridium difficile R20291]
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AAACAGCTGGGGTTGTATTTGCAAATAGAGAAAAAATAATGATTGCTGAAATGTTAAGTGACCTAGGTGT
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AGAAATTTAAAATCAGATATAATGGCTTGGAATAGAGCAGTAATAAAAGATGTTGAAGAATCTATTTCTT
GTGGTGTTGATGCAGTAGCTATATCAATATCAGTATCTGACATTCATATAGAAAATAAATTGAGAACTTC
TAGAGGCTGGGTTTTAGAAAATATGGCTAAAACAGTTGAATTTGCAAAGAAAAATGGATTATATGTTTCA
GTAAATGGAGAAGATGCTTCAAGAGCAGATATAGACTTCTTAACTGAATTTATAAATGTTGGAAAACAAG
CAGGGGCAGATAGATTTAGATACTGTGATACAGTAGGAGTTATGAATCCTTTTTCTATAAAGAATGCAAT
AGAAACTCTTTATGAAAGAACTAATTTTGATATAGAAATGCATACACATAATGACTTTGGGATGGCAACT
GCAAATGCACTTGCAGGAATAGCAGCAGGAGCAAATTATGTTGGTGTTACAGTAAATGGATTAGGTGAAA
GAGCAGGAAATGCAGCATTAGAAGAAGTTTTAATGGCACTTAAGTGTGTTTATAAATGTGATTTAAATAA
TATAGATACTAGAAAATTTAGAGGAATATGTGAGTATGTAGCACAGGCATCAGGAAGAATACTTCCTACA
TGGAAACCAGTAGTTGGGGATAATATGTTTATACATGAATCTGGTATACATGCAGATGGAGCTTTAAAAG
ACCCGCATAACTATGAACCATTTGACCCAAGTGAAGTAAATCTTGAAAGAAAAATAGTAATAGGTAAACA
TTCAGGAAGAGCTGCAGTTATAAATAAGTTGAGTGAATATGAAATGTATATTTCTCCAGAAAACGCTACC
AAGCTATTAAATGCTATAAGAGCTACATCTATAAGATTAAAAAGAAGTTTAATGGATAAAGAAATTCTTC
AATTATATTGTGATATACTAGCACATGAGAAAGGCACAACAGAAGAAGAAGCAGTTAGAGGTTCATATAT
TTAA
>ref|NC_013316.1|:934659-936584 putative aconitase/3-isopropylmalate dehydratase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAGATAATATAGTTTATAAAATAATTAAAAAACATATAGTAGATGGAGAAGCTGTTGCTGGAAGTT
CAATTGGTATAAAAATAGACCAAACTTTAACACAAGATTCTACTGGAACAATGACATATCTTCAACTAGA
AGCTATGGGAATAGATAAAGTAAAGACTAAAAGAAGTGTGGCATTTGTAGACCATAATATGTTACAACAA
GGATTTGAAAATGCAGACGACCATAAGTATATACAAACAGTGGCAGATAAATATGGAGTTTATTTCTCTA
AGCCAGGAAATGGTATTTGTCATCAAGTATTTTTAGAAAGATTTTCAACACCAGGAGATACACTTTTAGG
TTCTGATAGCCACACACCTACTGCTGGAGGTGTGGGCATGATGGCTATTGGAGCTGGTGGATTAGATGTT
GCTTTAGCCATGGCAGGAGGAGCATACTATATAAAAGCACCAAAAGTCTGTAAGGTGAATCTAGTTGGAA
AATTAAATAATATGGTATCATCAAAAGATATAATATTAGAAGTGTTAAGAAAACAAACTGTAAAAGGTGG
AGTAGGTAAAGTTTATGAATATGGTGGAGAAGGTGTCAAAAGCCTATCTGTTCCACAAAGAGCTACAATA
ACAAATATGGGGGCTGAACTTGGAGCAACTACTTCAATCTTCCCAAGTGATGAAAAAACACTAGAATTTT
TTAAGAGTCAAGGAAGAGAAGACGCATGGATAGAGTTAAAACCAGATGCAGATGCAGTTTATGATGAAGA
GATTACTATAAACTTGGATGAATTAAAACCATTAGCTGCAAAACCTCATAGCCCAGACAATGTAGATGAA
GTTGAAAATATAGGCAAGATTAAAATAGACCAAGTGGCAATAGGAAGTTGTACAAATTCTTCTTATGAAG
ACTTAATGAAAGTAGCACAAATCCTGAAAGGAAATAAAGTACATAAGGATGTGAGTTTGGTAATAGCACC
AGGTTCAAGACAAGTTATGGAGATGATTGCTAGAAATGGGGCTTTGGCAGATATAATAAGTGCTGGAGCT
AGAATACTAGAAAATTCTTGTGGTCCATGTATTGGTATGGGTCAATCTCCAGGTACTGACTCTGTGTCTT
TAAGAACTTTCAATAGAAATTTCTATGGTAGAAGTGGGACTTTGTCAGCACAAGTATATTTAGTAAGTCC
AGAAGTGGCAGCAGTAAGTGCAATCAAGGGAGTGCTTACAGACCCAAGAGAATTTGATATTAAATTTACA
AATTTAGATGTAAATGAATTTTTGATAGATGATAGCATGATAATTAAACCTGCTGATGTAGGAAGTAATG
TAGAAGTAGTTAGAGGACCTAATATAAAACCTTTCCCTCTTAATACAGAGCTAAGTCAGTCTATAGGTGG
AAAAGTTATATTAAAGACAGAAGATAATATAACTACTGACCATATAATGCCATCAAATGCTAAGTTACTT
CCTTTTAGAAGTAATATACCGTATCTTGCAAACTATTGTTTCAATACTGTAGATACAGAATTTCCTCAGA
GAGCAAAAGACAATAATGGTGGATTTATAGTTGGTGGAGATAATTATGGTCAAGGTTCAAGTAGAGAACA
TGCAGCTTTAGCACCATTATATCTAGGTGTTAAAGGGGTAATAGTTAAGAGCTTTGCAAGAATCCACAAG
GCTAACTTGATAAATAGTGGTATAATTCCAATGGAGTTTTGTGATGAGAAAGATTATGAAAATATATCTC
TTTTAGATAATCTGGAGATACCAAATATTTTAGACAATCTAGGTAGTGGAATTTTAGAAGTTAAGAATAC
AACTAAAGGAACTTCTTTTAAGGTCAAAGTAGAATTGTCAGCAAAAGAAGTTGACGTATTAAAAGCTGGT
GGAAAATTAAACTACACTAAAAATCAAGCTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:936606-937601 putative isocitrate/3-isopropylmalate dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAAAGTGACACTTATACCAGGAGATGGAATAGGACCAGAAGTTGCGAAAGCTATGAAAAAGGTAG
TAGAAGCTACTGGAGCAGAAATAGAATGGGAAGAAGTTAATGCAGGAGAGGCAGTTATTGAAGAGTATGG
TACTCCACTTCCTGAATATATTATAGATAGTATAAAAAAGAACAAAATAGCTATAAAAGGCCCAATTACT
ACTCCTGTAGGTAAAGGATTTAGGAGTGTAAATGTAACTTTAAGACAGGCATTAGATTTGTATGTCAATT
TAAGACCTATTAAAAGTTTTAAGGGGATAAAATCAAGATATGAAGATGTTGATTTAGTGGTTGTAAGAGA
AAATACAGAAGATTTATATGCTGGAATAGAACATAAAATAGGTGATTATGCAGCTGAAAGTATAAAGATA
ATAACAAGAAGTGCAAGTGAAAGAATCGTTGATTTTGCATGTAACTATGTTAAAGATAATAAGAGAAAAA
AAGTTACAGCTATACATAAGGCAAATATAATGAAAATGTCTGATGGATTGTTTTTAGATGTGTTTAGAGA
AGTTGCATCAAAACATGGTGTAGAATATGATGATTTGATTGTAGATGCAGCAGCTATGAACTTAGTTTTA
AATCCAGAAAATTATGATGTAATGGTAATGCCAAATCTTTATGGAGATATACTATCAGATTTAGGTGCTG
GGCTTGTTGGAGGTTTAGGTATAATTCCAAGCGCAAATATTGGTAAAGATTGTGCGATATTTGAAGCTGT
TCATGGAAGTGCTCCACAAATAGCAGGTCAAAATAAGGCTAATCCAACAGCACTTATTCAATCATCAGTA
ATGATGCTTAGATACTTAGGTGAATATGAAAATGCACAAAAAATAGAAACAGCTTTAGAAAAAGTATTTC
TTGAAGGAAGTAAATTGACTGTAGATTTAGGTGGCTCAGCTTCTACTACAGAGTTTGCGGATGAGGTGTG
TAAGTATATTGTATAG
>ref|NC_013316.1|:937928-938401 MarR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGTAGGTTCAGTGGAGGTGTGTTTGATTAAGACTTTAGATAGTAATATATTAAGAGAAGTAGGTACTT
TATCTAGAGCAGTAAATTCAATAAATGATATTAAGTACAAGGAATTAAAGTTACAAAAAGGACAATTTAC
ATTTTTGACAAGAATCTGTGAAAATCCTGGTATAAATCTTGTGGAATTATCAAATATGTTAAAGGTAGAC
AAGGCTACAACAACCAAGGCTATACAAAAACTAATAAAGGCAGGATATGTAGATAAAAAGCAGGATGAGT
TTGATAAAAGAGGATATAATTTAACTCCAACTGATAAATCTTTGGAAGTTTATGAGTTGATAATTGAAGA
AGAGAATAGAAGTATAGAGATATGTTTTGATAATTTTACAGATGAAGAAAAACAAGTGGTAACTAAGTTA
TTAGAAAAAATGAGCAAAAACGTAGAAAATGAATGGTTTAAAGTAAAGAGATAG
>ref|NC_013316.1|:938435-938929 putative acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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TGAAGACTTATAATAATACACAATGGGATGAAAACTATCCATTAGAAAAAGACTTTGTTTCAGATATTAA
GAAACAAGATTTATATATTTATGAAGTGGATGGAGAAGTAGCAGGATTTATATGTCTTAATTATGAAGAG
CCAGAAGAATATTTAGGCTTAAATTGGTCATCTAATAAAAAAGCAATGGTAATACATAGAATGGCTGTAA
ATCCAAACTTTAGAAAGACAGGAATAGCATCTAAGTTAGTTGATTTTGCTGAAAAATTAGCTGTAGAAAA
CAATGTATCATACTTAAAGAGCGATACATATTCAATAAACTCAAAAATGAATTTATTACTTACAAAGTGT
GGTTTTATAAAAATCGGAGAAATGAGTTTTTTAGGAAAGGAGAAATCTTTCTACTGTTATGATAAAATAT
TATAA
>ref|NC_013316.1|:939008-939547 putative reductase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGGGATGATTTATATGATTGGATTTCTAAAGAAAAGAAGAAGTATTAGAAAATACAAGGATGTTG
AAGTAGAAAAAGAAAAATTAGATAAAATATTAAAAGCTGCTCTTTTAGCTCCATCATCAAAGGGGCTTAG
AACATGGGAATTTATAGTGGTAGATGATAAAGAAAAGCTAATTAATTTATCTCAATGTAGAACTAAGGGT
GGTGGATTTTTCTTAAAAAATGCACCTTTAGCTATTGTAATTATTGCAGATAAAGAAAAAAATGATGTTT
GGATAGAGGATGCAAGTATAGCTGCTTCATACATACAACTTCAAGCTCATGAACTAGGTTTAGGTTCTTG
TTGGATACAAGTAAGAAATAGAATGTATGATGATAATATAGAAGCTGATAAGTACATTAGAGAAGAATTA
AAAGTACCTAGCAAGTACAGTGTAGAATGTATAATTTCTATAGGATATTCTGATGAAGAAAAGAAAGCAT
ACAATGACTCTGATTTAGACTATAAAAAGGTTCATTTTAACAACTTTTAG
>ref|NC_013316.1|:939736-940047 putative DNA-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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GAGATTCTTATGAGAGTAAACTTCAAAAAAAACAGTTTGAGGTAGATAGTTTGAAATCAGAATTGGATAG
ACTAAGAAGCTATAAAAATAGCCTTAAGCCAAAAGAAAAACAAATTACTGATGATGATATAAATAATATA
AAGAGTTTAAGAAGAGATGGCTTAAGCTATAAAGAAATTTCAAATCAAACAAGTTGGAGCAAAGCAACTG
TAAGTAGGGTATTAAATGGACTTTACGATTAG
>ref|NC_013316.1|:940075-940761 putative membrane-associated CAAX amino terminal protease [Clostridium difficile R20291]
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TGATTTTGAATTATGTACTTCTAAGTCAATTTGAATTTACTCTTGAAAATTTTAATATTATAAACTTAAT
TTCTTTTACATTAGTTGGTTTATCGTTAATTTTATTTTTAAAAGATAATTCTTTGTATAACAAGGTTAGA
AATAGAAAAATCACAGAAGCTTTTGAAGAAAATAAAAACAATATACTTATTGAAAAGTGTAAGCTTATAC
TTTTTGTTGTGGTTTTATCTTTAGCAATAATTGTAACTTATTGTACTAAGGGATATGTACTTTTTAATGT
AACTATGATGACTTTGTCTGTATTGATAGTTCCAATATTTGAAGAGTTATTTTTTAGAGAATATATATGG
AACTATCTAAGTAATTTTATAAAGTCAAAGAGTAAAATTATCTGTATAACATCTATACTATCTGGAATTT
ATAATATAGGATACATAGATGTTATAAGAAATTATGTAATATTGTATAACAATTCAAGCTACACCTTTGA
AGTTATTATTTCAAAAATTATGATAGGTACTGTTTTTGGTATTGTACTTGGATTAGTTAAGTATAGGTTT
AGAGATGTAGGGTTTTGTATATTATTGAGGAGCTTATTTGCTATATTTATTAGGTAG
>ref|NC_013316.1|:940993-941877 putative hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTTGTGACTTTTTGTAGTAGCAATGAAGAAAAAATAGGTGTATTTAATTCAGAAACAAATAGTA
TATATGAAATTAATAGTTTAGGATTAAGTAAATTATATACTGATATGAATGATTTTATTGAAAACGTATC
TACAGGAGATTTAGAAAAAATAAAAAACAATTCATTTGAAAACGCAAAGTGTTATAAGTTAGAAGAAGTT
AAATTATGTTCCCCAATTGTAAGACCTAAAAAAGATATTATATGTTTAGGTCTAAACTATAAAGACCATG
TCAATGAAATCCCAGATGGAGTTATAAAAAACGTAGTTATGCCAGATTATCCAATTTATTTTTCTAAGAG
AGCAGACAAAATAATTGGAGTGGATGATAAGATAAGCTTACATGGAGATTTGGTAGAGAAGTTGGACTAT
GAATCAGAACTTGCAGTAATCATAGGTAAAGAAGGTATAAATATATCAAAAGAAGATGCTTATGAATATA
TATTTGGATATACAATAGTAAATGATATAAGTGAAAGAGCACTTCAAGATAAACATGTTCAATGGTTTAG
AGGAAAAAGCTTAGACACACATACATCTATGGGACCTTGTATAGTACATAAAGAAGAATTTGAACATCCT
TTAAAATTAGATATAAGTAGTGTAGTAAATGGAGAAGTAAGACAAAATTCTAATACAGAGTACTTTATAT
TTGATATACCTACTATAATAAATGATTTATCAAGAGGAATGACTCTAAAGCCAGGAGATATAATTTCAAC
TGGAACTCCAGCAGGGGTTGCTATGGGGATGAATCCTCAAGTATATTTAAAGCATGGCGATATAGTTGAA
TGTAAAGTCGAAGGAATAGGAGTTTTAAAAAATATAGTTGATTAA
>ref|NC_013316.1|:941976-943151 putative formyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAAGAGAACTAGAATTAAAGTATGGCTGTAATCCAAATCAAAAACCATCAAAGATTTATATGAAGA
ATGGAGAACTTCCTATAGAAGTATTAAATGGAAAACCTGGATATATAAATTTTTTAGATGCATTTAATAG
TTGGCAACTTGTGAAGGAATTAAAAGAAGCTACAGGTCTTCCAGCAGCAACTTCATTTAAACATGTAAGT
CCAGCAGGAGCAGCAGTAGGGGTACCTTTATCAGATACTTTAAAGCAAATATATTTTGTTGATGATTTAG
AGCTTTCTCCATTAGCTTGTGCTTATGCAATGGCAAGAGGAGCAGATAGAATGTCTTCTTATGGTGATTT
TATAGCACTTTCAGATGTATGTGATAAGGAGACTGCAACTATTATAGCAAGAGAGGTTTCTGATGGTATA
ATAGCTCCAGGATATACAGATGAAGCCCTTGAAATATTAAAAGGAAAACGTAAAGGCAACTATAATATTG
TAAAAATAGATGAAAATTATACTCCTGAGCCTATTGAAACAAAGGATGTTTATGGAATTACTTTTGAACA
AGGTAGAAATGAAATATTAATAAATGAAGAACTATTAAAAGATATTCCAACTGCGAATAAAATTTTTACA
GATAGTGCAAAACGTGATTTAATTATAGCTCTTATTACATTAAAATATACACAATCAAATTCTGTTTGTT
ATGCTAAAGATGGACAAGTAATAGGGGTAGGTGCAGGTCAACAATCACGTATTCATTGTACTAGACTTGC
AGGTAACAAAGCTGATACTTGGTATCTTCGTCAACATCCTAAAGTATTAAACTTAAAATTTAAAAAGGAT
ATAGGTCGTCCAGATAGAGATAACACTATTGATGTATATCTTTCTGATGATTATATGGATGTGCTTGCTG
ATGGCATATGGCAAAACTTTTTTGAAGAAAAACCAGAGCCTCTAACTGGAGAAGGAAAAAGAGCATGGCT
TAAAACTTTAACAGGAGTAGCACTTGGTTCAGATGCATTTTTCCCATTTGGAGATAATATAGAACGTGCA
AAAAGAAGTGGGGTAAGTTTTATAGCACAACCAGGTGGTTCTATTCGTGATGATAATGTTATATTAACTT
GTAATAAGTATAACATAGTCATGGCATTTACTAAAAATAGATTATTCCATCATTAA
>ref|NC_013316.1|:943279-944133 hypothetical protein CDR20291_0772 [Clostridium difficile R20291]
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AAATGAAAGTGACGCAAGGTGGTATGTTCAGTGGTGGAATAGGTATTTATATAAAAATATAAATAAAGAA
GAATCATTAAAGAGTATTATTAATACTGGAATAATAGAAGTAAAAAAAGAGTATGAACTAAGATTAAATG
GGTTTAAGGTTGAAAAATTAGATTTACCATCTAGTTCTATAGTTGTTGTAAAATTTCATGAAAATAAAGT
AGAGTATTTTTTATTAGGAGATTGTGCTTTGTTTATTAAAAATGGAGATTCCAAAGTTATAAAAGATAGG
AGTATTTGTAAATTTGATAATACTGTATTTGATGAAATGAGTAAACTTTCTAACTTGGAAGAGATGGCAT
TTGATGAGATTAGAACTAGTGTTATGGATACAATAGTAAGCAATAGATTGAAGAAAAATACGAAAGAGGG
CTATTGGATATTGGATTTTGATGAGGAAGCTGTGGAAAATTCTATATATGGATACATTGAAATAAAAAAA
GATTTTCAATTGATGCTAACGAGTGATGGTTTTACAAGTGCATGTGATAGATATAATCTAATAAAAGAAG
AAGAATTGATACGTATAGCAGAAAAATTTGGTATAGGATATATACATAATAAAGTAAGGGATTTTGAAGA
TAATGACTATAAAGCGGTTAAAGTGCCAAGATTTAAAATAAAAGATGATTCATCTTGTTTATATTTAGAT
ATATATAATGATTAG
>ref|NC_013316.1|:944177-945412 putative glycosyl transferase [Clostridium difficile R20291]
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TAAAAGGGTTCGAAAAAATCGGTCATAAGCAAGCTGTAATTGCAGGTATAGATGTAAATGATGATGTAAA
TTGTTTTCCAAGTGAAGTAAGTTTTTATCCAGTAAAGTATAATTGTGGGGAGTTAAATTTTCCTGTTGTA
GGTATGAGTGATTCTATGCCATATGAAAGTACAAGATATAAAGATTTAAATATAGACATGATAAATAGAT
TGAAATATCAATTTAAAGTAAATATAGATAAGGCTATGAATGATTTTAAACCAGAACTTATAATATGTCA
TCATTTGTACCTCTTAACTGCATTTGTTAGGGAAATAGTAAAAGATATAAAGGTTATGTCTATTTGTCAT
GGAACTTGTTTAAGACAGTTAAATACCATTGATTTAGAGAAAGAATACATAATAGCAAATATAAGGAAAT
TAGATTTAATATTTGCTCTTCATGAAAATCAGAAATATGATATTATAAAGACTTTTGGAGTAAGTGAAAG
TAAAGTAGTTGTAATTGGTAGTGGTTATAATGATGATATATTTTATAATAAAAATTATAAAATAAAGGAT
GATAAAATAAAAATAGTATTTGCAGGTAAGATATGTAAATCAAAGGGATTGATTCCATTTATAAAATCTA
TATCTAAATTAAAATATAGTAAAGATTTAATAGAAGTCAATTTTGCAGGTACTGGAAGCGATATCGAATC
ATATAATGAGATAGTTAAACTGGCAAGTAAGTCTCCATTTAAAATGAATTTCCTAGGAAAGTTAGAACAG
AGAGATTTAGCTGAGCTATTCAACAGGTCACAAATATTTGTGTTACCATCATTTTATGAGGGATTACCAG
TTGTAGTTTTAGAAGCTTTATCTTGTGGCACAGATGTAATCACTACTGATATTCTTGGTGTTAAAGAGTG
GATTGGTAGTGAGATTAATAATTCTGGAAAGATAGAATATATTTCTCTACCTTTTATGGAGAAAGAAGGT
ATTCCAAAAGATGAAGAGTTATATGATTTTGAAAATAATTTGTATAATGCAATAGATTCTAAGATACAAT
CTTTATTGAATAACTCAAATGAGAAAACATCTGTAGATATGTCAAAAAAAACGTGGGATGGCTTAGCATA
TAGAATAAATGAAGTTATTTTAATGGATGAATTGTGTTTAGTCTAA
>ref|NC_013316.1|:945513-946454 cell surface protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGATTAGTAAAAAGGTATTGGCGTTAGGTATTTCAGCATTACTGTTAAGTGTTAGTTTTCCAACAT
CAATAAACGCACTAGATAAGATTGAAAATATTCAAGGAGTAGATAAATATGAAACAGCTGGGCTTATTTC
AGATAAGCAAGATTTTACAACAGCAGTTCTTATCAATGCAGATTCTACAATGGTAGATGGGATTGCTGCA
AGTGGTCTTGCAGGAGTAAATAATGCAGCTATTTTATTAACTAATAAGGATGATATACCAGAAGCAACAC
TTCAAAGACTGAATAGAGTTACTAAGATATATGTAATAGGTGGAGAAAATTCTATAAGTAAAGATGTAGA
AAAAATGTTACTTATGAGAAGAATGCAAGTTATAAGAATTGATGGTGTAGATAGAGTAGATACAAGTTAT
AAAATTGCAGGTGAAATAGAAAAAATTAAAAACAGTGATAAGATGTTTTTAGTAAATGGATTTAAGGATG
AAGCTGATGCAGTAAGTGTTGCATCTGTTGCTTATAGAGATGGAGCTCCTATAATATTGACAAAAGATAT
ACCTTCAGCAGAAGAAGACACAGACTTAGACCCATGGTTTGGAGTTTCTCCTGTTCCAGTATATGCTATT
GGAGGAGAGTCTACATTAAGTGATTACATAGTGAGCAGATATAGAGCAACTAGAATTGGCGGTGTTGATA
GATATCAAACTAATAAAAATGTTATTGAAAAGTTCTATAATGGAGCAAAAGAGTTCTATATAACAAGTGG
AGACGATTTAGTTTATGCTTTAGTTGCATCACCACTTGCAAAAAATGCTCCTGTTGTTTTAGTTTCAAAT
AAAAGTGATAAGAGTATATTAAGTGGAGCTAGTAAAGTAACAGCAATAGGTATAAGTGATAAGAGTATTA
TAGAGCAATGTTTGGATGCTGTAAAGAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c947036-946683 putative nuclease [Clostridium difficile R20291]
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AAAATGATATTACTAAAAAGATTTACCTTGGAAAAAGTAATGACATAAAAAGCAAATTTAACTCTCTCAA
ATTTCAGCTTGGTGCTGGCTCATGTATGATAAAAGAATTAAATAATGAATGGAAAAAATATGGTGAAAAA
GCATTTACATTTGAAGTTTTAGAACTTATAAAACATGATGATAACAAAACAGAGAAAGACTATTTAGAAG
AACTAGATATTTTAGAGATGATTTGGTTAGAAAAATTAAAGGAAGATAATACTTATGAAATTTATTCCAT
ATAA
>ref|NC_013316.1|:947323-948243 hypothetical protein CDR20291_0776 [Clostridium difficile R20291]
ATGATTATTATGAATAAAAAAATAGAATTAATAGGGAATTTTGCAAGTGATTGGATTAGGTATAGTGATT
ATGAATATAAAATTACTGAAGAAGATGAATTATATATAGTTCCAACAGAAGATGCTGTGTTTACCATGTA
TAACCCATTTGATGTAGCAGATGATATAATAGTAGATATAATTCGCATAGGACAAGAGGCATTACAAGAT
ATATCAAAAGAGACAAAAGAAATGAAACTAAAGAAAGAAGTACTTGAATTTGTAAAAAAGTATGGATTAT
TGGGTTTAATATATTCAAGTGTATATAATAGAGATATAGTTGGAGAAGAAAGAGTACTGATGATTGAAAA
GAATTATATTACAAAAGAGAATATATTGAGTACAGATGAATATGTAAACATGTTTATACCATTTGCAAGT
GATGAAGATGTGTATTTTAAAAAATATAGAAGGGGTATAGATGTATCAAAGAGAGAAGAATCTCCAAAGT
TTTTTGGAAAGAGACCATTGATTTTAGATTTAGTATTTTCAAAGTTCTACACTGAACAACTAGATTGGAT
TGTAAGTTTTGCTAAAGATATGTGTAAGCATTTTAATCAAATTTGTGTATATAAAAATACATCTAATCTA
TTAACTGAAAGTGTTACTATTATGTCTGGAGGGTTTAATCCTCAAAAGATAGGATTTTCTATAAGCCAAT
TAGATAAACCAATTATTGCATGGGAGTTTGATTCTTTGAAAACAGCTATTGAGACTATCTATGCCTTTGC
AATTACAAGTGAACCTTCTTCTTTAAATAAATGCAAGTACTGTGGTAAAATTTATATTCCTACAAATTCT
AAATCTCAATACTGTTCACCTTCTTGTAGAAATTGCTCAAATGTAAAGAAAAGTAGAAGTAGAGCCAAAA
AAGATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:948473-948937 hypothetical protein CDR20291_0777 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAATAAAAAAGGAGAATTTAAAAATGATATCACCTATTATTTTGAGTTCTATAAATCAGAATT
TAAAGGAAATAGAAAGAAATGAACTGCTTGAAACTAATATAGAATCTGGAGATTATGGTCTAGCTCTTTC
TGAATCTGATGTAAAAGATATAATAAATTCGAGAGATAATACTTTAAAGGGGTATGGAAGAATAGAATTA
GATATAAAAGTTACAAAACAGTTAATAGAAAATATATATACATCACAATATACAAATGTGGACAATTATT
TAGAGGCTATTAATGATATGCAAGAAATTTTTTATTATTTAAAAAATGAAACTGATGACAAGATATGTGA
TGATGAGATTATAGAAATACTGGGTGAATTTTATGAAAAATTTTCAGGCAATATGGACAATGTAAGAGGA
GAAGCAGACGAATTTGCAAAGAAATTTAAATTTGGAGAAGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:948960-950495 hypothetical protein CDR20291_0778 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAATAATTTAAGTAATATTAATATAAACGAAAATAATTTAATAAAGAACCAATATTCCATATCTC
TACTTAAGGAATGTCTAAATTGTAAAGTGATAGATGAAAGAGAAGTATATAATATACAACAAGAAATATC
TCTAATACTTATGGATTTGATTAAAAAATATACAAATGGTCAAAGCACATCAGTAAAAACAGAAGTTGCC
GAAAAACTGTTGATTTCAATATGGTATGCTATTGATGCATATATAAATAAGCTTGGAGATATAGAAAAAA
GAGTTGTGGAGTTGACTGCTAAGAATGTTAAAAAAGTGTACCTTGGAGGCATTGAAATATTAGAGGAAGA
GTTAGTTAGGCTGAAAGATTTTTATAAACTAATGATGAGTAGAAAATTGGATACTAATTCAATAGCATAT
AATGATACCTTGATGGAGTTATCAAGTTTCTTTAAAAGTTATATTGTAAAATTTGAAGCTCAGGACGTTC
CAGTAAGTATAGATTATCCATTGGCACTAGATGATATGGATGTTAAGGGTATTTATTATGTGAAGAATTA
TATTGAGAGTATAGATATAGAAAATAGATTTTGTAACCTATTTAAGAAAAAAGATAGAGAAAAATTATTT
TATGACTATGGGGTGATTTATAAAATAGATTGTGATGTTATACTTGTAAATTTATTTGAACTTATTATAA
ATAATTGTATTTTTTCTACTATTTTAGGAAATGAAGTGATTAATTTAGAAATTTCAAAATATGAGTATGA
ATTTTTAGAAAAACAATTTAAAAATATGTACAATAATATTACTGAAGATAAAGTTATAGGCTCTGAAGAA
AGTAATATAATTGAATTGATTGAAGTAGATGATAGTTTTAACACTGAAGTAGATAGTAATTTGGATTATA
ATGATTTTGAAGAAATTAACAGAGAAATTAGAATAAATAAAAAAATAACTTTACTACTTATGGAAGCAAT
TGAAGTATTAATAAAAAGATTAAGCATAGAAGATGAAGATGTAATAAGATATATTAAAAAATATGAAAAG
ATATTTATTGAATCTGTGCTAAGCTCAATAAAAAGTAACACTTTTAAAAGTATGGTAACTGTGAGTAAAA
ATAAAAATGAACACTTAGAAGACTATATTGTTGATGATGAAAGTAAATTGGATGATGAATCGTTTAGAGA
GATATTCAATGAGATATTAGATAGTACATCTATAATTGAAAAAATAAGAATAATAAAGGAAAATATCAAT
GCTAAAAAAGACTTTATCGATATTCTTGAATCTGAATGTTTATTTGGAGAAGAGTATTTAATGTTGTTTG
CATCATTAAGTGAATTAGAATTGGCAATATTGGGTAGTGTAGTATTTTATGAAGATATTAGAATGAGAGA
AATTAATATATTAGAATTTATGTTAAATGAGAAAACTGAAACTACTTTATGGAAGACAGAGTACATTAAA
TTTATGAAGAGGCAAAGTGAAGATAAGATATACTCCATAGAAGAGCATATGAATAAAATTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:950579-951946 putative aminobenzoyl-glutamate utilization protein [Clostridium difficile R20291]
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GGGAAAATCCAGAATTAGCCTTTGAAGAAAAGTATGCAAGTAGCATTCAAAAAGAATACCTAAAGTCAAA
AGGATTTAAAATTGAAGAAGTAGAAAATTTACCTACTGGATTTATAGCAAGTTTTGGAGAGGGTAAACCT
GTGATTGGCATACTTGGAGAATATGATGCTTTACCAGAGCTATCACAATGTGTGAGTGCAGAAAGAAAGC
CATTGGTAGAAGGAAAAGCTGGACATGGATGTGGGCATAACCTGTTGGGTGTAGCAGGTGTAGGAGCAGT
TGTTTCTATAAAAAAATTAATAGAAGAAAATAAATTTAATGGAACAATAAAATATTTTGGTTGTCCTGCT
GAAGAAGAAGGTGGAGGAAAGACAGTTATGTGTATAAATGGCTGTTTTGATGATGTAGATTGTGCATTTA
CATGGCATCCTTTTGATATAAATGCACCTTGGAGAGGTGGAAGTCTGGCAAACTTATCTGTAAAATTTAA
ATTTAAAGGGATAACAGCCCATGCAGCTCAAGCTCCTCATAATGGTAGAAGCGCACTTGATGCTGTTGAA
ATTATGAATGTTGGAGCTAATTATTTGAGAGAACATGTTATTGACTCTATAAGAATGCACTATGTTATAA
CTAATGGTGGTGGAAGACCTAATGTAGTTCCTGGATTTGCTGAAAGTTGGTACTTTATTAGAGGTAAAAA
AGCAAGGGATGCAGAACATGTTCTTGATAGATTAATAAAAGTAGCTCAAGGAGCAGCAATGATGACAGAA
ACTGAAATGGAGTATAAGGTTACAGATGGAATATATGACTATATACCAAACCAATGTTTGACTGATTTAG
TTTATGACAATATGGTTTTTGTTGGTTGCCCTAAAAATACTCCTGAAGAAGAAGAATTTGCAAAAAAATT
GTGTGATACTCTTACTAGAGAAGAAAGATTAGGTGTAGCAACATCATTACAAAATGATAAATCTATTGTA
GAAAGTTATATACACAAGGAAATAGTTGACGGTGACAAAGATAAAGGACTAGCTGGTTCTACTGATGTTG
GAGATGTAAGTTATGTAATACCAGTGGCTCAATTTGCAATGGCAGCTTGGCCTGTTGGAATTGCAAGTCA
TACATGGCAGTCATGTTCATCAGCAGGTTCAAATATAGGATTTTCTGCTATGATAAATTCAGCTAAAGTA
CTGGCTTGTAGTGCTTATGATGTATTTATGAATACTAAAATTATTGATGAAGCAAAAATTGAATTTGATA
AATCATTAGATGGACAAAAATTTAAACCATTGGTATAA
>ref|NC_013316.1|:951981-952205 hypothetical protein CDR20291_0780 [Clostridium difficile R20291]
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TAGAGCTTATAGATGTAAATGAAAATGGTGTGGTTTTAGTTAGACTACAAGGGGCATGTAGTGGGTGTCC
AGGAGCGACTATGACAATCAAAGCTATTATTGAAAATGTTTTGGTGAGTGAAGTTCCAGGAGTAACTCAA
GTATTAGGTGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c953053-952655 hypothetical protein CDR20291_0781 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTATAAATTAATACTTGCAATAGTATTTATAACATCAGCTTTAATTTTCTACACTATAGGTGTAT
TTGGAGAAAGAAAGGCAAAAATTTTAAAAAAGAAACATGTAATTATATTTTGGCTTGGGTTTATATTTGA
TACTTTAGGAACATTTACAATGAGTAACATAGCCAACAGCCATACTTTTGAAGTAAAATCTGCTTTATCA
CAAAACCTTCATAGTATTACAGGTCTTCTTGCAATTGTGCTTATGCTTTTTCATGCAAGTTGGGCTACTT
TTGTCCTATACAAAGATGATGAGGAAAAGAAAAAATTCTTTCATAAGTTTAGTATAGTTGTATGGACTAT
ATGGTTAGTTCCATACTTTATAGGTATGTTTATTGGTATGGTTGGATAG
>ref|NC_013316.1|:c953499-953056 MarR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
GTGATTTTATTGAAAAGTAATTATGACTGTTTTAGAATAGCCATGCTCTTAAAAGAACTTTATTCTAAAA
CTATGTACACAGTAGAAGAAAATTTTAAAGAAAATGGATTAACACACCAACAGATTATAGTTATAAAACT
GGTAGCTCATAATCAAGAACTTACAATATCACAACTATGTGATGAAATGTCTTTAGCTAAAGGTACGGTT
TCAGGCATAATCAGCAGATTAGAACAGATTGGATATATAGAAAAATTCAAGAAATCTAATGATAAAAGAA
ATACATACGTTAAGTTTACAACAACAGGATTTGAATTTGCCACAAATTTTAAAATTAAAATGCAAGAAAG
TTTTGATGATATTTTTAAAAATTGTGATGAAAACGAATTGAGTGACTTAGTAAAAAATCTTAGAAATATA
TTGGCAAAAGTAAAGGAGAGATAA
>ref|NC_013316.1|:953771-954802 oligopeptide ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
TTGCTTTTATGTGGTTTTTTTATTGCAACAAAGGGGGGTTGGGGTTTGTTAAAGGATATACTGAAAAAGT
TGTTGCAGTTTATTTTAGTAATGTTTTTATTATCTTTTATTGTTTTTTACATGGCAAGACTTGCTCCAGG
AGACCCATTAATCTCTTACTATGGGGATGGAGTAGAAAGAATGAGTACACAAGAAAAAGAAAATGCTATG
AAAAAACTTGGTTTGAATGAACCAATATACAGTCAATATATAAAATGGATTTCAAATGCATCAAAAGGGG
AATTTGGAATTTCATTTAAATATAAACAAAATGTTACTTCTGTTATAAATGATGTCTATATAAACACTAT
AATATTAGGTGGTTCAGGGTATATACTTACCTTTGTGCTAGCCTTATTGTTAGGAATATTTTGTACATTA
CATGAAGATAAGCTCATTGATAGAATCATATGCAAATTAGGAACAATAACCAACTGTATTCCATCATTTT
GGGTTGCCTTAGTACTCATACTTATATTTAGTATAAACTTAAGTATACTTCCAAGTAGTGGTGCTTATTC
AATGGGAGAAGAGTCCAGTATATTAAGTAGGATATCACATCTAATCTTACCTCTTACAGTACTTATATTA
AGCCATCTATGGTATTACACATATATGATAAGAAATAAATTACTAGAGGAAATAAGAGAAGATTATGTGC
TTTTATGTAAAGCAAAAGGTTTAAATAATAGAACTATTGTTTTTAAGCATTGCCTGAGAAATATAATGCC
ATCATATATTAGTATAATGGCCATTTCGATACCTCATATACTAGGAGGAACTTATGTAGTTGAAAAAGTT
TTTTCTTATCCTGGGTTAGGAACACTTTGTTTTGAAAGTGCAAAGTATCATGATTATAATATGTTATTAG
TTTTATGCTTAATAACAGGGGCTTTAGTAGTATTTGGGAATATGTTAGCTCAAATTATAAACAATAAAAT
AGACCCTAGAATGAAATATGATAGAGGTGATACTAATGAAGCCACAATATAG
>ref|NC_013316.1|:954777-955697 oligopeptide ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
GTGATACTAATGAAGCCACAATATAGTGATTTTGAAATTGTAGGAGAAAATTATATTTTAGTAGCAGAAG
ATGAACATATAGAAACAAAGAAAACCTTATCTAAAAAAATTAAAGAATTACCATATATATCAATTATTAT
TTTATCAATCATAGTCATTGGAAGTGTATTCTCATCTTTTATAATGACACATGAACCAACATACATGGAT
TTAGCAAGTTCTAATTTAGCTCCAAATAAAACTTTTTTATTTGGAACAGACTCAATGGGTAGAGATATAT
ATTCTATGATATGGTATGGAGGAAAAATATCTTTATTTATAGGACTATTTTCCACTGTAATATCAACTGT
TATAGGAATTGTTTATGGTAGTATAAGTGGTTCAGCATCTGAACTCGTAGATGATGCAATGATGAGGTTT
ACAGAAATCATACTTAGTATACCTTCAATATTAATTATAATATTTGTACAAGCTATACTTGGAAATTCAA
ATCCAGTATCTATGTCCATAGTAATAGGGATAACAAGTTGGATGAATATATCTAAGATAGTGAGAACAGA
AGTTAGACAAATAAGAAATAGCGAATACATACTAGCAGCTAAGAGCATGGGAGGAGGATTCTTCTATGTA
TTAAAGCAACATTTACTTCCAAATTTTGTGGCATCAATAATGTTCATGGTTGTAACAAACATAGGCGCAG
CTATTGGTACTGAATCGACACTTAGCTTTTTAGGAATTGGTTTACCAATAGAAATTGTTTCTTGGGGAAG
TATGTTATCTTTGTCAGAGGAAGCATTACTTTCAAATAGATGGTGGATTATACTGATTCCGGGTATATTT
TTGGTTACCACATTGGTGTGTATAACAAATATAGGTAATTATATAAGAAAGAATAATAATAAAAAATCTA
GTAATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:955810-957378 oligopeptide ABC transporter, substrate-binding lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTAAAGAAGTTAAAAGTTTTAAGTTTAGTAATGATACTTAGTCTAATGGCAGGTTGTTCTAGTG
GAGGAGACAAAGATAAGAAGGCAGATACGCCTAAAGATGGAAAGGTACTTGTTTATGGAAGTAATGACTA
TACAAGTATAAATCCTGCACTATATGAACATGGAGAAATAAATTCATTAATATTTAATGGATTAACAGCT
CATGATGAAAATAATAAGGTGGTTCCTTGTCTAGCAAAGGACTGGAAATTTGATGAGGCAACAAATACAT
ATACTTTTAATTTAAGAGATGATGTTAAGTGGCATGATGGAGAGAAATTTACGGCAAATGATGTTAAGTT
TACAATAGAAACTATAATGAATCCAGATAATGCTTCTGAGATAGCATCAAATTATGAAGATATAACAAAA
ATTGATGTGGTTAATGATAATACTATAAAAATTACTTTAAAAGCTCCAAATACAGCAATGCTTGATTATT
TAACAGTAGGAGTATTACCAAAACATGTTTTGGAAGGTAAGGATATAGCTACTGATGAATTTAATCAAAA
ACCAATAGGTACTGGACCATTTAAACTTGAAAAATGGGACAAAGGTCAAAGTATAACACTTGTTAAGAAT
AGTGATTATTTTGTAAAAGAACCAGGATTAGATAAAGTAGTCTTTAAGATTGTTCCAGATGATAAGGCTA
AGGCAATGCAATTAAAATCAGGAGAATTAGACTTAGCTCAAATAACTCCTAAAGATATGTCTAACTTTGA
AAAAGACGAAAAGAATTTTAAAGTAAATATAATGAAAACAGCCGACTATAGAGGTATATTATACAATTTT
AATTCTAAATTCTTTAAAGATAAAAAAGCTAAAGGATTACCAAATGCTTTAAGCTATGCAATAGATAGAA
AAGCAATAGTTGACAGTGTATTATTAGGACATGGTGTACCAGCATATTCACCTTTACAAATGGGACCATA
TAATAATCCTGATATAGAAAAGTTTGAATATAATCCAGAAAAAGCTAAACAAGAAATTGAAAAGCTAGGT
TGGAAATTAGGTTCTGATGGAATCTATGAAAAAGAAGGTACTAAGTTAGCTTTCGAGATAACAGCAGGTG
AGAGTGACCAAGTTAGAGTTGATATGGCTAAAATATGTGCACAACAGTTAAAAGAAATTGGTGTTGATGC
TAAAGCTGTTGTTGTAACTGAAACAGATTGGGCTAATCAAGATGCTCATTTAATAGGTTGGGGAAGTCCA
TTTGACCCAGATGACCATACATATAAAGTATTTGGAACAGATAAAGGTGCAAATTACAGTGCTTACTCTA
ATCCTACTATAGATAAAATACTTCAAAAAGCAAGAGAAACAGAAGATAAAGATGAAAAATTAAAGTTATA
TAAACAATTCCAAGTAGAAATGACTAAGGATATGCCTTATACATTTATTGCTTATATAGATGCAATATAT
GTTGGAAAACCAAACATAAAAGGATTAACACCTGATACAGTTTTAGGTCATCATGGTGTAGGTATATTCT
GGAACATAGCTGACTGGACAATTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:957453-958478 oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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ATCTGTACTGTGTAAGAGTTTGATGAGGATACTCCCATACAATGGATATATTAAAAATGGAGAGGTTTTA
CTTAAATCAAGTGATTTGGTTAAGAAGTCTGAAAAAGAGATGGAAGATATAAGAGGAAAGAATATATCAA
TGATATTTCAAGACCCTATGACATCTCTCAATCCAACTATATCAATAGGAAAGCAAATTGCAGAAGCTGT
AATCATTCATCAAGGTATAAGTAAAAGTGAAGCAAAAAAGAGAGCCATAGAGCTTATTGAATTGGTTGGA
ATTGATAATCCTGAGAAAAGATTTAAACAATTTCCACATCATTTTTCAGGTGGAATGAGACAACGTATAG
TAATAGCTATAGCACTTGCCTGTAATCCAGATGTATTGATTGCTGATGAACCTACAACTGCTTTAGATGT
AACTATACAAGCTCAAATAATTGATTTAATAAAGGATTTACAACATAAAATAGGTTTGTCAATAATATTT
ATAACTCATGATTTAGGAGTAGTTGCAACTATAGCTGATAGAATAGCAGTTATGTATGCAGGAAAGATTG
TAGAAATAGGAACTGTAGAGGATATATTTTATGACCCTAGACATCCATATACTTGGGGGTTGTTGGGTTC
ATTACCTACTTTAGATTCACAGGATGAATATTTATATAATATACCTGGAATGCCTCCAAATTTATTGAAC
CCACCAAAAGGAGATGCTTTTGCAATAAGAAATAAAAATGCACTTAAGATAGATTATGAAAAAGAGCCAC
CAATGTTTAAAATTAATGATACACATAGTGCAGCAACTTGGTTATTGCACCCAGATGCACCTGAAGTAGA
TGTACCAGTTAGAGTAAATTGTGGAAGGGTGATTTCTAATGAATAG
>ref|NC_013316.1|:958471-959415 oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAGAGAAAAAATACTGGAAATAAAAAACTTAAAGCAATATTTTCATTTGGACAAAAGTACTACTG
TAAAAGCAGTTGATGATATAAGTTTTGATATATATAAGGGTGAGATATTTGGATTGGTAGGAGAGTCGGG
TTCAGGAAAATCTACAACTGGTAAAACTATAATAAGACTACATGAATCTACTGGTGGAGAAGTAATTTAC
AAAGGAAATTGCATATCAGATAAAAAAACGTACAAATTTATAAAAAAAGATGTAAACAAAAGTATGCAGA
TTATTTTTCAAGATTCTACTTCATCATTAAATCCACGTATGACAATTGCAGATATAATTTCAGAGCCACT
AAAAATTCAAGGTATCTGTAAAAATAAAACAGATAGAATGAATAAAGTATATGAGATGCTAAAGCTAGTA
GGACTTGATAGAAGTTATGCAAATAAGTATCCATCTGATTTTTCAGGTGGACAAAGACAGCGTATTGGCA
TAGCACGAGCTCTTTCAGTAGACCCAGAATTTATAATAGCTGATGAGCCTATAGCTTCTTTGGATGTGTC
TATACAAGCACAAATAGTAAATTTATTTAAAAAATTGCAACAAGAAAAGAATTTAACTTGTTTATTTATA
GCTCATGATTTATCTATGGTGAGACATATTAGTGACCGTATAGGAGTTATGTATAATGGAAAATTAGTAG
AATTGGCAGATTCAAATGAATTGTATAATAATCCTATTCATCCATATACAAAATCACTACTTTCTGCAAT
TCCTGTTCCTGACCCTAGATATGCTAAGTCAAGAAATAGAATAGAGTATAATTCTAATGGATATGATTGT
TCAAATGAAAAGTCATTAAGTTGGATTGAGGTTTCAGATGGACATTTTGTATATTCTTCTAAATCAGAAA
TAAATAAATATCAACAAAATTTAAAAGTTGTTTAG
>ref|NC_013316.1|:959774-962429 sigma-54 factor, interaction domain-containing protein,transcriptional regulatory protein levr [Clostridium difficile R20291]
ATGATATATAAAAAAGATAAAGTAATGAAAGTTTTAGAATCATCATATAGGGAAAATGAAAAAGGGATTA
CAGCTAACCAATTATCAGAAAAGACAGGAATTGCAAGAAACAATATAAGTACATATTTAAACCAATTATT
CAATGAGGGTATGGTTACGAAGATAAAAGGAAGACCTGTGTATTATATCCCTGCAAATCTTAACCTTAAC
AAGAATGAATTGCTTGATACACAAAGTGAGTTGCTTGGCATAAAAAAAGGAACAAAAGTAGAAAACAAAA
TAAAAAAAGATAGTTTTGAAACACTAATAGGTAAAGAACATAGTTTAAGACCTATAATAGAAAAATGCAA
GGTCGCAATGCTCTATCCTACAAATGGACTTCATACTATTATCTATGGAGAAACAGGAGTAGGAAAGAGT
ATGATTGCTAGATATATGTACGATTATTCTATAGATAGTGGAATTAGAAAAAATAAAGCTCCTTTTGTAA
CATTTAATTGTGCTGATTATGCTAATAATGCACAATTACTTATGGGACATATTTTTGGAGTAGAACAAGG
AGCTTATACAGGTGCAGAATCTTCCAGAAAAGGTCTTTTGGAAATTGCAAATGGAGGGATACTATTTTTA
GATGAAATTCATAGACTACCAGCAGAAGGTCAAGAAATGTTGTTTACTTTTATAGATAAGGGAACATTTA
AAAGACTAGGAGATGCAACGAAAGAAAGAGATTCTAAGGTATTAATAATATGTGCTACTACAGAAAATCC
GACATCAACACTATTAGATACATTCAATAGAAGAATACCAATGAAAATAGAAATACCATCACTGAGAGAT
AGGACAATGATTGAAAGAATGGAATTAGTCAAAAATTTTTTCAAGGAAGAATCAAAAAGTATTTCTATTT
CAATAAAAGTACATAAAGAAATAATTAAATCACTATTACTTTATGATTGTAAAAATAATGTAGGTCAACT
TCAAAATGATATAAAATTAGCTGTTGCAAATGGATACCTAAGATATAAAAGAGATAATAAAGAACCAGTT
TATATAGAGAAAAAATATTTTGATAAATCTATAAATGAAGTGAGTGATGATTATAGAGAGAAGTCTATTA
AAGCAGATGAAGTTATAACACATGGAATAGAATATTTTGTATTTACGTCATTAGGAGAAGAAGAAGTTAT
TAACTACAATGATATAAATATTATTAATGCAGTAAATACTAATCTTAATAAATCTGTAGAAATGAATATA
GCAGATGCTTCTCTATTTAATAATGTTAAGTTTAAAAGCATGTGTGAATCAATAAGACAAATTATTAAAG
AAGATGAAGAAATAGATATAAGTGAATCAATATTTAAGTCAATGGCAATTTATATAAAAAGCGTATTGGA
TAAAAGTAGCTCTACAAACAACATAGATTTGAATCAAATTAGAAGAAATAACAGAAGTGAATTTAAAACA
GCACTAAAAATAGTTGGAATAATTGAAAATGAATTTGATTTATTTTTATCTATAGAAACTGTAGCATATA
TTACATTATTCATAGTACAAGCTAAACAAGATGAACAAAATAAAATAGTGAATAACATTAATATTATAGT
TGCTATGCATGGAGAAACTACAGCAAGTATGGTAAAAGCAGTTGGTGATATTATTGGAAAGTGCAGTGCT
ATTTCTTTCGATATGAAGTTAGATAAAAGCTATGATGAAGTTATTGTAGATTTTAAAAATTTAATTAATA
ATATAGACAATAAAGATGTATTACTATTTACAGATATGGGTTCATTAAACTCCTTTGATGAAATTATAAA
GAAAGAAAAAAAGTGTGAAGTAAGAGTAATTCCTATGGTGACGACATTAACTGTGTTAGAAGCAGTTCAG
AAGGCCAATATGGGATTACCTTTAAATGACGTATACAACTCTATCACTAACACGAGAAAGTATTATTTTG
GAACTAATGAAATTCAAAATAAAGAAAATCTGTCTAAAACAATTATTATAGCATCACATGTTTCAGAAGG
TGTAGATAATAAAACAAGAAAAATATTAGAAGAAAAGATGAGTAGGTACTTAGATGGAATAGATATTATA
TCTGTCCCATATAAAACAGAAAAAGATTTAAGTTTAAATATTACAAAACTTAAAGAAAGTAGTAATATTG
TTGCAGTAATCAATGAACAAAGAATTAATATTAGAGGAATTGACTATATTAGCAAAAAAGATATAGATAA
GGATGAAAATATCAATAAATTAAAAAATATTATAAAGATAAGTATAGGTTATGATGATGTAGTTGAAGGT
TTAAAGACATCCTTAAAAAGCTCTAATTATAATAGGATATTTAAAGATATAAAATATGTGTCTGATGAAT
TGTTTTTAGTATTTAATATAGAAAAGAAATACGATAAAGTAATTGGACTTATGATGCATTTAGCTTTCAT
GGTAGATGGGTTGATTGGAAATACTAGAGAAATTGAAAAGCTTGATAAAGAAAAAACACTTGATTATCAC
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AAGAGTGCTATCAAATATTATTAATATTAGAATATGCAGAAATAATCGAAAAAGATTACCAATGA
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TTAGTGCAGACGAAATAATATCGTCATTTCAAAAAGCTATAAGAAGAAATATGGTGGAAGAAGCTTGTGA
ATTTGCTTATGAACTATATATATCATCACCAGAATTAGAAGATAAGCTATGGAGAAGGATACTTACAATA
TCAGTTGAAGATATAGGAATGGGGGACCCATCAGCTGTAATAATCATAAATAATTTAAATCAAGTAAGAA
AGGAATATTCATATGCAGATGGAGACAGACCTTTATTTTTCATACATGCAATAAGATATCTTTGTGCATG
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GAAGTTATGGACGTGGCACTTGACAAGCATACATATAGAGGATTAGAAATGGGAAGGGATTCATTCCACT
TTTTAAATGAAGCTAGTATAGTAATACCAGAAAAAGAAGTAGATAATGATTATAAAGAAAGATACTTAAA
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GTAGTGAGCATGAAAAGTTAAAAACTAAAACTATAAATATAGAGGCAACATCATTCGAAAATTTAAAATC
ATACATTGAAGCTAATGATACAGATGTAGTACTTGTAGCACCACAAATTAGGTTCAAGGAAGATGATGTA
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CTCCTTCTGTTATGAAGTCGGCAATCGAATTATATAAAAATAGATAA
>ref|NC_013316.1|:963750-965039 PTS system, IIc component [Clostridium difficile R20291]
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ATCTTCAAGCTATAAAAGAAGGTATGATAAGCATTACCCCAATAATAATTGTTGGTTCTTTAAGTATGTT
ATTTATGGCATTAAACAATATGTTACCTGAAGGAAGTGCAAAAACATTATTATCTGAAAATATGGATACA
TTACTTATCCCTAATAAATTTACTATGAGTTTATTATCTATATATTCAGCATTTTTTATAGCTCAGGCAC
TAGCTAAAAAATATAATCTTAATCATGTAGAAATAGGTATGACAGCAGTTGTTGCACAACTTGTTGTATG
TGGACAAGTAGTAGATGGTGTATTAGATACAAGTTATTTAGATGCACAAGGTTTATTTGTAAGTATATTA
GTAGCACTTTTAGTAGTTGATATTACTAAGTTTATGAATGATAAAAATCTCGTAATTAGATTTCCAAAAG
AAGTACCTAGTGTAGTAAATAAAAGTTTTAGAAATTTAACTCCAATGATAGTATGTATAATGTTATTTAC
AGCAATAGCAGCAATAACTAAAAATGTCTCAGGTCAACCATTACCAGCTATTATAATGAATTTCTTAGCA
CCAGCTATAAGCAGTGTAGATAATGTTTTTGCAGTAACTATAATACTATTTATAACTCAATTATTATGGT
TCTTTGGCCTTCATGGAGCAGCAATAACTTCAAGTATATGGATGCCAATAGCAGCTACATATATGGCAGA
AAATGCAACACTGATAGCAGCAGGAGGAGACCCAAAATATGTGTTTACAATAGGATTTTACTATGGTTTC
TTGCAAGTAACTGGTTCAGGGATAACTTTGGGATTAGTGTACCTTATGTCAAGAAGTAAGTGTAAGAGTT
TTAATAGTATGGGAAAAGTTGTGATTTTACCATCACTATTTGGAATAAATGAGCCAGTAATATTTGGAAC
ACCAATAGTTATGAACCCATATATGTTTGTACCATTTGTATTTGGACCTGTATTGGTTGGAGCACTTAAT
TTTATGGCATTAAAAGTAGGATTAGTAGGATTACCTATTGCAGAACCACCAGGCTTTTTACCTCCAGGGG
TTGCAGCATTTTTGATGACATTAGATTGGAAGGCAATCGTATTAGTATTTGCAAGTATAATACTTATGAC
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ACATTAGATGATGATAGCTTTGATTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:965063-965392 PTS system, IIa component [Clostridium difficile R20291]
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AACTTGTAGATATATTTGAGATGATGGACCCAAGAATTAATAAGAATTAA
>ref|NC_013316.1|:965540-966868 6-phospho-alpha-glucosidase [Clostridium difficile R20291]
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AACTAGATGAAAAGATACCTCTAAAACATGGAGTAGTTGGTCAAGAAACTTGTGGACCAGGTGGAATAGC
TTATGGAATGAGGTCTATAGAAGGTGTTCTTGAAAACATAGATTATATGGAAAAGTATTCTCCAAATTGT
TGGATGTTAAATTATTCTAATCCAGCATCAATAATAGCGGAAGCTGTTAGAAGGTTGAGACCTAATTCTA
GGGTAATAAATATTTGTGATATGCCAATAGGTATGGAACATAATATAGCAAGGATTGCAGGACTCAAATC
TCGTAAACATATGGATATAAGATACTTTGGATTAAATCACTTTGGTTGGTATACTTCAATTAAAGATAAA
AAAGGAAATGAACTTTTACCAAAATTAGTAGAACATATAAAAGAATATGGTTTTATAAATGGTGAAGAAG
GAATGAAAAATGACAAGAAAGATAGTTGGTTTGAAACTAATTTATTTACTAAAGAAATAGTAAAAACAGA
TTTAACTACAATACCAAGTAGTTACTTAAAGTACTATCTATTTCCAGATTATGTTGTAAATCATTCTGAT
GTAAATTATACTCGTGCCAATGAAGTTATTGATGGAAGAGAAAAAGAAGTTTTTGGTTCATGTGCATTGA
TAGAAAAGCAAGGACATTCTAAGGGCAGTGGGCTTAAGATAGGAATACATGCAGAGTTTATAGTGGATTT
AGCTACAGCTCTAGCTTTTAATACACAGGAGCGTATGTTATTGATAGTTCAAAATAATGGAGCTATAGAA
AATATACAAGATGATGCTATGGTTGAAATTCCATGTATAGTTGGAAAAGACGGGTATGAACCATTATCAA
TAGGGAAAATACCAACATTCCAAAAAGGTTTAATAGAACAACAATTAGCAGTTGAAAAATTAGTAGTTGA
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CTATGCGTGGATAATGAGATACATTCATGCGCAGGTCCTAGACTTAGAGAAGATTGTGACAAAATAATAA
AAAAACAAGGGCATTTAGAATATACTGGAGATGCTAAGATAACTAGAGGCTATTGTTTACCTGCAAAATT
TGTAGTACATACTGTTGGACCTATTGTATCTGGTGGTCAGCCAAGTAAAGAGCAAGAAAAGCAACTGCTT
CATTGTTATAAATCATGTTTAAATACAATAAAAGAAATTGATGAAATAAAAAATATTGTTTTTTGTGGAA
TTTCTACAGGTGTATTTGGTTATCCAAAAAAAGAGGCAGCTAATCTTGCTGTAAGTAGAGTTAGACTATG
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TATAGAAGAATATTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:968250-969230 hypothetical protein CDR20291_0795 [Clostridium difficile R20291]
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TAATCCTATTAATTGTATCTTATATATTTGGCAAATTAGTGTATAATAGTTCGGTTGGTTTAGAGCAGTT
AATAAAAAACGAAGATATAGTAAAAATATTTTCTGAGAGAAAAGATAAACCACTGGAGAAATTAAAAAAC
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ATATAAAGACAAGAGATACTATGATACTTGTTCATGGAATTGGAAGTAGTTACTATGAAATGTTAAAGGT
AGCATATAGATATTTAGATAAAGGTTATAATGTATTAGTTTATAATCAAAGAAATACTGGTAATAGTGGT
GGAGATAATTACACATTTGGTCTTTATGAAAGGTATGATTTAGATAGTCTAGTTAAATTTGTAAAAAATA
AATTTCCTGAAGGAAGATTAGGAGTGCATGGATTTTCCATGGGAGCAGGGACAGCTGCTATGCATTCAGA
GATAAATTCAAAAGATGATAAGGTCGATTTTTATATACTGGATTCTCCTTATTCTGAAATGAAAGATGCA
ATTAGAATGGGAGTACTAGAAAAACGAATACCAGATATATTAATCAATTATGTGGTGATTTGTGGAGATT
TATATAATAAGTTTAAATCTGGATTTTGGTACAGTGATGTAAAACCATATGAGTCAGTTGAGAAATCTAA
TGTACCCATACTGTTTATACATGGAACAAAAGATACTGTTTGTAATTATCAAAATAGCAAGAAAATGTAT
GATTTAGTTAAACATGATAAAAAAGACCTATGGCTTATAGAAGGTATTGGTCATGTTGATGGATTTGAAC
ATGATAGTACAGTATACTTCAATAAAATATTTAAATTTATAGATAGTAATGTTTTAAGTGATAAAAGTTA
A
>ref|NC_013316.1|:969433-969882 hypothetical protein CDR20291_0796 [Clostridium difficile R20291]
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TAATTTATATAAGACAACAGGTACTGACTGTATTGTATTTTTATTATTTATTGTAGAGTGTGTATACCTA
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TAAATAACTTGTTGGTTGAAAAAATACAAGAAGAAAGCAACATTGTATATAATTTATTAAACTCATATGT
GTTGCCACATATATATAAGAAAGCAAGGGTGTTGATGTTTAAAACATATCATATGTTAATCTACATTAAA
GAAAAATACTATTATGTAAATATATATTAA
>ref|NC_013316.1|:c970972-970043 hypothetical protein CDR20291_0797 [Clostridium difficile R20291]
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ATGAATTAATCAAAAGAGGTGAACTTCCTTCTTATAAAGTAGGGAAAAAAATAAGAGTTGATACTAAAGA
TGTTGAAGAATATATCAACAGCCAAAAAACTGGTAAAGTAAAGGATACACATTTCAACAATAAAAATATA
GATATAAATAATAATTTCAAAATTATTATTTCTGGTCAAGATGTAATATTAGACATTTTAGCTAGGTCTG
TTGAAAAAAAATTGGATGGAATAAGTACATTTCGCTCTTATATAGGTAGTTATAATGCTTTGTATGAGTT
ATATAATGGCAGAGTTTCTATAGCATCATCCCATCTATGGGATTTCGAAACGGATGAATATAATAGCACT
TTTGTTAAAAAGCTATTGCCAGGAATACCATGTGTACTTATAAATCTAGCTTATAGAATGCAAGGTTTCT
ATGTTGCTAAAGGAAATCCTAAAGAGATAACAACCTGGGAGGATTTAACAAAACCAAGTATAACCATTGT
AAATAGGGAAAAAGGTTCTGGAACTAGGGTTTTACTAGATGGTAAACTTAGACTTCTAAACTTTAATGGT
AAACATATAAAAGGTTATGATAATGAAGAATTATCACATCTTGGAGTTGCAAGTACTGTTTCTCGTGGAA
TAGCTGATGTTGGTTTGGGAAATGAAAAAGCTGCTTTACAAGTAAATAATATCGACTTTATTCCTCTTCA
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AAACTATAGCAAAAGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:971132-971977 putative molybdenum ABC transporter, substrate-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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TACAACAACAAATAGAACAAGGAGCACCTTGTGATTTATTTATTTCAGCAGGTCAAAAACAAATGAAAGC
TTTGGATGAAGAGAAGTTATTAGTTTCTGATACTATGAAAGATTTAGTAAAAAATGATTTAGTTCTTATT
TCTTCTGCTGACAGTAGTGTATCAGGTATGAAAGATTTGACTACAGATAAAGTGAAGAAAATTGCTGTTG
GTGAAGTTGAAAGTGTTCCAGCTGGTAAGTATGCAGATGAGGTGTTAACTAATTTAAATTTAAAAGATAA
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GATGTTGGATTCGTTTACTTCAGTGATACTGTCAATAATGATAAGATAAAAGTAGTTGAAAAAACAGACG
AAAAAACTCATTCACCTATTACATATCCAGTTTCAGTAATTAAAGCTAGTAAAAACGTAGATGCTGCTAA
GAAATTTGAAGAATTTTTATTAAGTGAGTCAGGACAAAAGATTTTTGAAGAATTTGGATATAAAAAAGTA
GAATAA
>ref|NC_013316.1|:972060-972809 putative molybdenum ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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GAACAGATTGGTCACCCTTATGGATATCACTTAAGACATCTATTTTGTCAACAATAATAACTTTTGTAAT
AGGAATATTTGTGTCATATATTATGGCTAACTATAGAGGTAAGTGGAAGGGTCTTATAGATGGACTATTT
ACACTTCCACTAATTTTGCCACCAACAGTTGTAGGTTTCTTTTTATTATTACTATGTGGGAAGAATGGAT
TTATAGGAAAGTTTTTATTAAATTTCGATAGGACTTTAATATTTAGTTGGACAGCAACTGTAATTTCAGC
AGTAGTGGTGTCTTTTCCTATGATGTATAGAACTTCAAGGTCAGCTTTTGAACAGATTGATAATAATATG
CTGTCAGCTGCTAGAACATTAGGTCTTAATGAATGGAAAGTATTTTTTAAGATTGCAGTTCCATTAGCAT
GGCCTGGAATAATTGGTGGATTGGTGCTGTCGTTTGCCAGAGCTCTTGGCGAATTTGGTGCTACACTTAT
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GATATGAATAAAGCTATGATGTGGGTTATGATTATTGTAGCAATATCTATAGCAATGATTTTATTACTAA
ATTATTGGTCGGAATTTCAGCAAAAAATTATAGGAAAGAGGTGTGGATAG
>ref|NC_013316.1|:972822-973886 putative molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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AACTTGGGCTTTTAAAACTAAGTAAGAGTGAAAAAAAGGAAATAGTAGCAAGGTACTTAGATATACTTAA
ATTAAATGGGTTTGAAGGGAGATATCCTTGGCAATTATCTGGTGGTCAACAACAAAGGGTAGCACTAGCT
AGAGCATTGGCAACATCTCCAGATATATTACTTTTAGATGAACCTTTCTCAGCACTGGACCATCATTTAA
GAAGTAATATGGAAAAAGAACTTATGAATATGTTAAAAGATTACAAGGGAGATATACTATTTGTTACTCA
TGATATTGAAGAAGCTTACCGAGTTTGTGATGATATTATAGTGTACAACAAAGGAGAAGGTCTTCCAAAG
AGACCTAAAAAAGAGCTCTTTGAATCTCCAAAGTACCTTATAGAAGCTAAGATAACAGGGTGTAAAAATA
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GAAGATTTAAATGAAAAGTTATGTTTCGAATTGATTAACATTGTAGAAAATCCTTTTACATATACTATAT
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AACAAAAAGGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:973892-974449 maltose O-acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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GGATATAACATACATGTAGGCGAAAATTTCTTTGCAAATTATGATTGTATTTTTTTAGATGTATGTAAAA
TTGAAATAGGTGACAATGTAATGTTAGCTCCAAACGTTCAAATCTATACAGCCTATCATCCAATTGATGC
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GGAGTAATCATAACACCAGGAATTACTATAGGTGATAATGTAGTAATAGGTGCAGGAAGTGTAGTCACAA
AAGATATACCACCAAATACTGTAGCTGTTGGAAATCCATGTAGAGTAATAAAGAAAATAGAAGAATAA
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AGTAAATTCCAAAGTTCAAGTTGATGCTTTAAAAGAATATGCATCTAAAAATGGATTTAAAGTTGTTGAA
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TTCTAATGAAAATATTTCTTATGTAAAGACTAAACAAGAATAG
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TTATTCCTAAAAACAGGTCTTGGATACACTTTAAAAGGTGTTGGTGATAACTCTCAAATGATTAAATCTC
TGGGTATAAATATAGGTTCTATAAAAATACTAGGACTTATGATTTCAAACGGACTTATAGCTTTATCTGG
TAGTCTTATGGCTCAGTTCTTGGGATTCTCAGATGTAAATATGGGTATAGGAACTTTAGTTCTTGGAATT
GCCTCTATCATAATTGGTATTACACTATTTAAGAAATTTACTTTTATCAAAGATACTACTGCAATAATTG
TTGGCTCTTTTATATACCAATTCACTATATACTTTGCAATGAGTTTAGGAATGTTATCAACTGACTTAAA
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AAACATTAGAATTGGTTAAAACATTGACTCCAAAAGCAAAGAAAATAGGGGTTATATACAATACTAGTGA
AGTTAATTCAAAAATCCAGGTTGATTCTCTACATGATTATGCTAAGAAAAATAATTATGAAGTAGTTGAA
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ATGTCCCTACTGACAATTTAATAGTTTCTTCTATGCCAATAGTTTCTAAAGTTGCTAATGAAAACAAGAT
TCCTATAATAGCCTCTGAAGAAGGTTCTGTATCTTCTGGTGCTTTAGCTTGTTGTGGAATAGATTATGAA
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>ref|NC_013316.1|:c980107-979352 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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GTCCTTCTATGACGGTTAGAGAAAATTTATCTCTAGCACTTAATAAAGGGAAATTATTGAACTTAAAAAA
ATGTCTTCGTCATAAAACGAATAATTTGGAACACTTACTTGAAGGAATTTCTTTGGACTTAAAAAAATAT
TTAGATATTAAAGTACAATATCTTTCAGGAGGTCAAAGACAATCACTATCACTAATTATGTCTAGCTTAG
CAAGTCCTAAGGTCTTATTACTAGACGAACATACAGCAGCACTTGACCCAAAAACATCAAATGAAGTAAT
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ATTTTCTCTTACTAATGGTATTTCTCCTGTAGTAGCAACTTTAATGGCTATCTTATGTGGTTGTACTGCT
GGTCTTGTTACAGGGATTCTTCACATTAAGTTTAAGATATCTAACTTACTTTCTGGTATTTTAGTTATGG
GAATGCTATACTCTATCAATTTAAGAATAATGGGAAAATCAAATATTCCTCTATTTAGCTTTAAACACTT
ATTCAATGGGGAAATATCTCCTATAGTTTTAGCCTTAGCTTTTGTATTCATCTGTAAAATCCTTTTAGAT
TTATTCCTAAAAACAGGTCTTGGATACACTTTAAAAGGTGTTGGTGATAACTCTCAAATGATTAAATCTC
TGGGTATAAATATCGGTTCTATAAAAATACTAGGACTTATGATTTCAAACGGACTTATAGCTTTATCTGG
TAGTCTTATGGCTCAGTTCTTGGGATTCTCAGATGTAAATATGGGTATAGGAACTTTAGTTCTTGGAATT
GCCTCTATCATAATTGGTATTACACTATTTAAGAAATTTACTTTTATCAAAGATACTACTGCAATAATTG
TTGGCTCTTTTATATACCAATTCACTATATACTTTGCAATGAGTTTAGGAATGTTATCAACTGACTTAAA
ACTAATAACTGCCATAGTTATAATAGCTTTCCTAGCTACTGGTAACTTAAATATTTCACTAAAAAAAACA
AATGCAAAGCTAGTACCAAAAATAAATCAGAAAAAAGAGGTGTTGTAG
>ref|NC_013316.1|:981793-983373 putative carbohydrate kinase [Clostridium difficile R20291]
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TGATTGTATTGATGGAAAATGCGGTTATATCTGCAATGAAAAATATGGATATAGACATGTATAATAGTTA
TACAGTTGTATGTGGTGTTGGAAATAATGGAGGAGATGGTCTTGGAATAGCAAGACATCTAAATACATAT
GGAAAAGAAGTAAACGTATTTTTAGTAGGTAATCTTGAAAAACTAAGTGAATGCTCTAAAATAAATTACA
ATGTACTTTTAAATATGGGAATTAATATTATAAATATTAATAAAAATGATTTAAGTGAAAAAAATTATGG
AGATGAAAATGAAGTAGATAAAATTATTAAAGTTGAGAAACAAAATATTATAAAAAATAAAAATTTAACA
ATTTTTAAAGATAGAGTATCTAAAAGTGATGTTGTAGTAGATGCTATATTTGGGACTGGATTAAAACGTG
ATATAACTGGTATTTTTAAAGAAGTTATTGACATAGTAAACGATAATAGCAAAAATACATATTCTATAGA
TATTCCTTCAGGTATAGATAGCGATAATGGAAATGTATTAGGAACTTGTATTAGAGCAAACAAAACGATT
AGCTTTGAGTTTTATAAAAGAGGTTTTCTAAACTATGACACTAGCACACTTATAGGTGATGTAGTTGTAG
AAAAGATAGGTGTTCCAGATTTTATTACAAGAAAATACCATGATGAAGAGTTCATAACTGATAAGACTTT
TGTAAAAAATAATATTAGAAGAAGAGATAAGCATGGTTTTAAAAGTGATTTTGGAAAAGTATCTATAGTT
GCAGGTTCAAAAGGATTTTATGGTGCAAGTTTCATAGCAACTGAATCTGCTGTTAAGAGTGGGAGTGGAC
TTGTAACATTAATTAGTAGTGAAGATGTGCAAGAAAAGGTATCTATTAGACTTACAGAAGCAATGACTTT
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GGAGATAATAGTCAAACATTTGATAAATTACTTAAGATAGTAGAAAATTCTAATTGCCCAATAGTATTAG
ATGCAGATGGATTGAACGTTATGAAGGACAGATGTTATAAGTTTTTAGAATGGAAAAATAGATTTGTAAT
TACACCTCATTTGGGAGAAATGGCCAGGTTGACAGGAGATTCAATTGGGTATATAAGAGAACATAGAGTA
GATGTTGCAAAAGAATTTGCTCAAAAATATAATCTGGTGGTGCTTTTAAAAGGTTATCAAACTGTCATAA
CAGATGGTAAAAAAACATATATAAATCCTACAGGAAATAGCTGTATGGCAACTGGTGGAATGGGTGATTG
TTTGCTTGGAATGATTACTTCATTTATAGGTCAAGGTATGGATATATTGGAAGCTACAGTTAGTGGAGCA
TATATACATGGCTATATAGGAGATAAATTGAGCAAAGCAATGTATACGGTAAATGCTACGGATTTAATAA
GTAACATTTCATTAACAATGAAAGAGTTGTTGGATATATAA
>ref|NC_013316.1|:984119-985237 transposase-like protein B [Clostridium difficile R20291]
GTGGCAGTAGTGGAAAAAGCTTATAAGTTTAGAATGTATCCAAATAAAAAACAGCAAGAGTTAATTAACA
AAACTTTTGGATGTTGTAGATTTGTATATAATAAGTATCTTGCTAAAAGAATAGAAGTTTATAAAAACGA
TAAAGAAACTTTTACTTATAAACAGTGTAGTTCTGATTTGACCAATTTAAAAAAAGAATTAAAGTGGCTT
AAAGAACCTGACAAATTTTCACTACAAAACGCCTTAAAAGATTTAGATAATGCATATAAAAAATTTTTTA
AAGAAAAAGCAGGATTTCCTAAATTTAAATCAAAGAAAATTAATAGATTTTCATATAAAACTAATTTTAC
AAATGGAAACATTATGTATTGTGGTCAACATATAAAACTACCTAAACTTGGTATGGTTAAGGTAAGGGAT
AAACAAATACCTCAAGGGAGAATACTTAATGCTACTATATCTAAAGAGCCAAGTGGTAGATATTATGTAT
CATTATGCTGTACTGATGTAGATATTGAAGTATTTGAAAATACTAACAATCAGATAGGTTTAGATTTAGG
AATTAAAGAATTTTGTATCTCAAGTTGTGGAGAATTTATAGAAAATCCTAAGTATCTTAAGAAGTCATTA
AACAAACTTGCTAAATTACAAAGAGAATTATCGAGAAAAACAATCGGTAGTTTAAATAGAAATAAAGCAA
GATTAAAAGTTGCAAGACTTCAAGAACATATAGCTAATCAAAGAAATGATTTTCTACAAAAACTATCTAC
TAAATTAATAAAAGAGAACGATATTATTTGCATAGAAGATTTACAAGTAAAGAATATGATTAGAAATCGT
AAACTATCTCGCTTAATTTCTGATGTGTCATGGTCAGAATTTGTTCGTCAATTAGAATACAAGGCTAATT
GGCATGGTAGACAAATTGTAAAGGTAGGTAAATTCTTTGCAAGTTCACAAATATGCAATAAATGTGGGTA
TAAAAACGAGGAAGTGAAGGACTTAAATATAAGAGAATGGATTTGTCCTAGTTGTAATGAAATTCACGAT
AGAGATATAAATGCAAGTATAAATATATTAAAAGAAGGATTAAGACTAATAACGATTCAAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:985428-985967 hypothetical protein CDR20291_0810 [Clostridium difficile R20291]
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CATATGAAAAGAGGGTAGATAGTATGAAGTTAATATGGTTGATAGTAGCAGTCTTATTTGGAATAGCAGA
AATGTTAACACCAAGCTTAACATTGATATGGTTTAGTGTAGGAGCTGTAATACTTATATTTTTAAGTAGC
TTTATAGAGAGTATTTTCTTACAAATTTTAATATTTGCAGTAATTTCTATAGCAATGTTAGTCGTAGCTA
CTAAAAAAATAGTAAAAAAAGATAAAGGCTATAAATCTAACACTAATTTACAAGCAATGATGTCTAAAAA
AGGTATTGTTACAGAAGAGATTTCTCCAAATAACACAGGTCTAGTTGTAGTTGAACATGAAACATGGACG
GCTATTTCTATAGATGGTGAAAAGATAGAAAAAGGTTCTACAGTAGAAGTATTAAAAATTGAAGGGGTAA
AATTAGTTGTTAAAAAAGTAGACGCCACAGTTAATGTGACAAACCAATAG
>ref|NC_013316.1|:985988-987031 hypothetical protein CDR20291_0811 [Clostridium difficile R20291]
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GAGTTATAAAACAATCTAAAGTAGGTATAATAATGAGACTTGGTAAGTTTCAAAAAGTGGCTGAAACAGG
TGTACATTTCTTAATACCATTTTTAGATAAAATGGCATATGTAATTGACCTTAGAGAAATTGTAATAGAT
TTTCCACCTCAACCAGTTATAACTAAAGATAATGTAACTATGCAGATTGATACAGTTGTATATTATAAAG
TTACAGATCCAGTTAGATATGTGTTTGAGATAGCTAATCCAATAGCTGCTATTGAAAATTTAACAGCTAC
AACACTAAGAAATATAATTGGTGAACTTGATTTAGATGAAACATTAACATCAAGAGATATAATAAATGTA
AAAATGAGAACTATCCTTGATGAAGCAACAGATAAATGGGGTATAAAAGTAAATAGAGTAGAGTTAAAAA
ATATAATGCCTCCTCAGGATATTCAAGTTGCGATGGAAAAACAAATGAGAGCAGAAAGAGAAAGAAGAGA
GGCAATACTTCAAGCAGAAGGTAATAAGTCAGCTGCAATACTTCAAGCAGAAGGTGAAAAACAATCTGCG
ATATTAACAGCAGAAGCCAAAAAAGAAGCTATGGTACGTGTAGCAGAAGGTGAAAAAGAATCTGCTATAT
TAGTGGCAGAAGGTGAAGCTGAAGCTATAAGACAGACCGCTATTGCTAAGGCACAAGGTGAGGCTGAAAT
GATAAAAAGAACTCAAATGGCAACAGCAGAAGGTTTAAAATTAGTTTTTTCAGCAATGAAAGAGGCTGAT
ATAGACAATAATATTCTAGCATTAAAATCTATGGAAGCTCTTGAAAAAATGGCTGAAGGTAAGTCAACAA
AACTGGTTTTACCTTCAGAAGCAGTTAATTTCCTAGGAACATTCAAAGGAATAAAGGAAGTTATGAGTGA
TGATAACAAAGAAGTACTTGATATAAAAGAAGTTTTAAATGATAATGAATCATTAAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:987802-988962 glucose-1-phosphate adenylyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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GAATTGCCAAACCAGCTGTATCATTTGGAGGTAAGTATAGAATTATAGATTTTGTGTTAAGTAATTGTTC
AAACTCTGGTATTGATACTGTAGGTGTTTTAACTCAATATAGACCGTTGATATTAAATTCACATATAGGC
ATGGGAAGTCATTGGGATTTGGACAGAATAAATGGTGGTGTCTATGTTTTACAACCATTTATGAATGAAA
AAGAAGGAAATTGGTATAATGGTACAGCACATGCGATATATCAAAATATGGACTTTGTAGATACCTATAA
TCCAGAATATGTATTGATATTATCTGGTGACCATATATACAAGATGGATTATAGCAAAATGTTAAAATTT
CATAAGGAAAAACGCTCTAAAGCTACAATAGCAGTGATTGAAGTTCCTTGGGATGAAGCTTCAAGATTTG
GGATAATGAATACAAATGAAGATTCAAGTATCTATGAATTTGAAGAAAAACCAAGTGAACCTAAGAGCAA
TTTGGCATCTATGGGAGTATACATATTTGATTGGAAAATGTTGAGAAATTATTTTAAGGAAGCAGAAAAA
AATCCAGAAATAAATTATGATGATTTTGGAAAAAATTTAATACCTAAAATGTTAGAAGATAATGTTGGAA
TGTATGCTTATCCATTTAAAGGATACTGGAGAGATGTAGGAACTATACAAAGTCTATGGGATGCTAATAT
GGATATAATAAAATCTCCAGAAACACTTGATTTAGCAGACCCTAAATGGAAGATATATACAAATACTATG
GCAATGCCTCCACAATATATAGGTAAAAATGCAAATGTTCATAGATCAATGATAGCTGATGGTTGTAGAA
TTTTAGGTGAAGTAGGCAACTCTGTATTATCACATGGAGTTGTTGTTGGTAAAGGAAGTAAAGTAATTGA
TTCAGTAATAATGCCAAATGTTGTAATAGGTGAAAATGTAACTATAGAAAAAGCTATGATAGGTGAGTGT
GCAACTATAAATGATAATGTTCAGATAAAGAATGTAAATAATGAAATAAATGTAGTTTCTGAGTATGAAA
ATATCGAACCTAGATGCGTATTAATAGAAGGAGGTCTTTAA
>ref|NC_013316.1|:988964-990094 glycogen biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
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ATGGAAGACCAATAGCATCTACACCAATAGCTGGAAGATATAGAATAATAGACTTTGCTTTATCTAATAT
GATAAATTCAGGAATCACTAAAGTTGGAATATTCGCAAAAGAAAAATACAGATCATTGACAGACCATATA
GGTAGTGGTAAAGATTGGGATTTAAGTAGAAAAAAAGGTGGCCTATCAATTTTTAGTCCAGAAAACACTA
AGTATAGAAATACTTACTCACATAGAGAAGGTGATATATATACTATCTTAGCTAATCTAGATTATATAGA
AAAGAGTGAAGAAGAATATATTTTAATAGCTCCAAGCTATATGCTATGCAATTTAAATTATTCTCAAGCA
TTGGAATACCATAAAAAATCTCATAATGATATAACTATAATATATAAAAATGTAAATAATGCAAATAAAG
ATTTTGCTGGTAACTTAACACTAAATTTAGATAGTAACAATAGGGTAATAAATGTAGGAAATAATTTAGG
CAAATTCCCTAGAGCAAACATATGTATGGAGACATATATTATGAAGCGTGAAGATTTTGTTGAATGTATA
TATAACATTGTAAATAAAGGCAGTTATTGTTATTTAGAAGAATTTATTATTGAAGAAGCAGAAAATATGA
AAATAGGAGCTTATGAATATACAGGATATCTAAAATGTGTAAATTCTGTTGAATCATATTTTGAAATGAG
CAAAGATTTATTAAATTTAGAAGTTGCAGATGAATTATTATACTCTGAAAGAAAGATATTTACAAAAGAA
AAGAATGAATCACCTACAATTTATACAGATAGTGCTAAAGTAGAAAATAGCTTTATAGCATCTGGTTGTT
TAATAGAAGGTACTGTAAAAGATAGTATCATATTTAGAAAGGTAAATGTTGAAAAAGGAACAGTTATAGA
GAACTCAATAGTAATGCAAAATTGTGTAATAAAGTCAAATGCAAAACTATATAATGCAATATTAGATAAA
AATACGAGTGTATCAAATGGGAAAGAATTAAGAGGAGATGAAAAATATCCTCTTGTAGTGGAAAAGAATA
CAAATATATAA
>ref|NC_013316.1|:990123-991565 glycogen synthase [Clostridium difficile R20291]
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ATGCATTGCCTAAAGAATTAAAAAAAGAAGGTGTAGATGTAAGGGTAATAATGCCCAAATATTCAACTAT
ACCAAGTTATTTAAAAGATCAACTAAAAGAAATAGCTGTGTTTAGTGTACGTGTTGGATGGAGAAATCAA
TACTGTGGTCTTTTAGAAATGGAATTGGATGGTGTAAAATTTTACTTTATAGATAATGAATTTTATTTTA
GAAGAGAAGATGAAAGAAAGAGTATCTATGGATATGGAGATGATGCAGAAAGATATACTTTCTTTACAGA
TGCAGTTTTAGAAGCTATAAGTAGAATTGATTTTTATCCAGATGTAATACATATAAATGATTGGCATACA
GGGATGTTACCATTAATTCTAAAAGAAAGATATGCAACCCTTGAGGGGTATAAAAATATAAAAACTATGT
ATACTATACATAATCTCCAATATCAAGGTGTATTTGATAAGCATGTTTTATATGATATATTGGACTTACC
ACAAAAATACTTTGATAATAGAGATATAGAGTATTATGGCTCAATAAATTTTATGAAAGCTGGTATAAAT
TTTGCAGATAAAATTATAACTGTTAGTCCTACTTATGCAAATGAAATACAAACATCTTTTTATGGTGAAC
AATTAGATGGATTACTTAGAAAAGAGTCAGGAAAATTAAAAGGTATATTAAATGGTATAGATTATGATTT
AAACGACCCTGCAAAAGATAAAGATATATTTGTTCATTATGATGTAGACTCAATTGACAAAAAAGTAGAA
AATAAATTGAGATTACAAGATATATTGGGACTTAAAAAAGATTCATCTATTCCGTTGATAGGTATAGTTT
CGAGATTAGTTTCTCAAAAAGGATTTGATTTAATAGCATACATGATGCCAGAACTTATGAGAGAAGATTT
ACAGATTGTCGTTTTAGGAACTGGAGAACATCAATATCAATCAATGTTCAACTATTACGATTCTAATTTT
TCAGATAAAGTATCAGCTAGAATTACTTTTAATGCATCATTGGCTCAACAGATATATGCTGCAAGTGATA
TGTTCTTAATGCCATCATTATTTGAGCCTTGTGGTATAGGTCAAATGTTAGCTATGAGATATGGTTCTTT
ACCAATAGTTAGAGAGACTGGAGGGCTTAGAGATACAGTAACACCTTATAATAAATTTACTGGAGAAGGC
AATGGATTTAGTTTTAAAAATTACAATGCTCATGAGATGTTTTTCTGTTTGAAAAATGCAATCAAAGTAT
TTAAGGACAAAGAAAAATGGATTAAATTAGTTGAAAATGCAATGAAAACAGATAATAGTTGGAAAAAATC
AGCTAAGGAGTATATAGAAACATATAGAGACATATGTGATTAA
>ref|NC_013316.1|:991558-993999 glycogen phosphorylase [Clostridium difficile R20291]
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TGTATAGCTTATATGCACAATCTATCAAGGAAGCTACTGATGAACAATTGTTAAATGTATTATGTAGTCT
ATTGAAAGATGAGATAGCAAAAAAATGGGTTGCTACAAAGTTAGATAAGAAAAAAGAAGTTTATTATTTT
AGTTTAGAATTTTTAATAGGGAGACAGTTAAAATCTAATTTATTAAATTTAAATATTGAAGAAGAAGTTA
GAGAAGGTTTATCTGAATTAGGAATCAACTTGGATGATTTAATTGAAGCTGAAGTAGACCCAGCCTTAGG
AAATGGTGGACTTGGTAGATTAGCAGCTTGCTTTTTAGATTCTATGGCATCTTTGAACATAAGTGGTCAA
GGATATGGAATAAGGTATAAATATGGTCTGTTTGAACAAAAATTTGTAAATGGTTATCAGGTAGAAGTGC
CTGATAACTGGCTTACAGAAGGACGATATGCATGGGAAACTGTAAGACCAAATGAAGCAACAATGGTGAA
GTTTGGTGGTGAGGTAGAATTAATCAAGGAAGGTAGTCATTTAAAAGTAATTCATAAAAACTACCTTCCT
GTAATGGCAATGCCTTATGATATACCAATAATCGGATACCAAAACCAATGTATAAATACTTTAAGATTGT
TTAAGAGTGAAATACCAAAGAGAGATTTTGGTGAACTTACCTCAAATGCTCTAAATTATTCTGGTAGCTA
TGAAGAGGCTTTAAAACATAAGTATTATACTGAGGAAATATCACAGGTATTATATCCTGATGATTCAAAC
TATGCAGGTAAGTTGTTGAGGTTGAAACAAGAATACTTTTTTGTAAGTGCAGGGATACAAGATATAATAA
GAAAATATAAAAAGAACAAATTAAATATTGATAATTTATTCGATAAGGTAGCAATTCATATAAATGATAC
ACATCCTACCTTATGCATACCAGAACTTATGAGAATTTTGCTTGATGAAGAAAATTTATCTTGGGATGAA
GCATGGGAAATAACTAAAAAAACAGTGTCCTATACTAATCATACTATAATGTCAGAAGCAATGGAAAAAT
GGCCTGTAAGTATGATGAAAGAACTATTACCAAGAATTTATATGATAATAGAAGAAATAAATAGAAGATA
TGTAGAGGAATTAAATAATAAAGGATATGAGCAGGATAGAATAAAAAGAATGAGTATAATAGACTGTGAC
AATATCAATATGGCAAACTTATGTATTGTCACAAGTCATAGTGTAAATGGAGTTGCTAAGCTTCATACTC
ATATTCTTGAAACAGAGGTATTAAAAGATTTCTATCAAGATGAACCAAATAAATTTAATAATAAGACTAA
TGGAATTGCACATAGGCGATGGCTTATAAGTTCAAATCCTCAACTTAGCAATTTAATTACAGATTTAATT
GGTGATTCATGGAAGAAGGATACCTTACAATTAAAAAATATTGAAAAATTTAAAAATGATTCCTCTGTTT
TACAAAGACTTGATGATATAAAATACAATAATAAAGCAAATCTAGCAAAGTTTATAAAAGATAAATACGA
TTTAAATGTAGACCCAAGTTCGATATTTGATGTTCAAGTTAAGAGATTGCATGCGTATAAAAGACAGTTA
CTGAATATATTTAATGTACTTCATATGTATCATGAATTACTTGATAATCCTAATTTGAATCTTGACCCAA
GAACTTTTATATTTGGTGCAAAAGCAGCACCAGGATATTATTTGGCTAAATGTATAATTAAATTTATAAA
TTCTGTTGCAAGTACTATAAATAATGATGTTAGAGTAAAGGACAAGTTAAAAGTAGTATTTTTAGAGAAT
TATGGAGTATCATTAGCAGAAATAATAATACCAGCAGCAAATGTTAGTGAGCAAATTTCAACTACAACTA
AGGAAGCATCTGGAACAAGTAATATGAAGTTTATGATGAATGGTGCTATAACTTTGGCTACACTTGACGG
CGCAAATGTAGAGATATGTGAACAGGTTGGTAAAGAAAATATGTTTTTATTTGGACTTAGTGCAGAACAA
GTACTAAATTATAATAAATATGGTGGATATTCTTCACTTGACTTATATCATTCTAATATGGATATAAAAA
GGGTGGTAGATGATTTAATAAATGGATTTATTCCTAATCTTGGCGAAGAAGGAAGAAGTATTTATAATTC
ACTCACTACTTACAATGATGAGTATTTTGTATTGAGAGATTTTGAAAATTATGGTCAAGCTCAAGCAGAT
ATAAACAGGTTATATAGAGATAAAGAAAAATGGAATAAAATGTCTTTAGTTAATATAGCTAACTCTGGAT
TTTTTTCTTCTGATAGAACAATTTCTGAGTATGCAAAAGACATTTGGTTTAAAAGGGTGTGA
>ref|NC_013316.1|:994004-995869 putative alpha-amylase [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAAGTGTAATAGAATATAACTCTTGGGATAAAAATTTTAAGGCTCCGTTTGGAGCTTTAAAATTTG
ATGAGGAATTGACCATTTGTGTTAAAGTAAATGAGGGATACAATATCAAGTCTATTTCCCTAGAAATAAA
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TGTGGTAAGATTGAAAAGTTTGATGGTACAGGTGTTTATTTTTATTACTTTAAAGTTGATGTTGAAATGG
ATGGTCAGATAAAGACTTTATTTTATGGAAAAAACAGAGATAATGGATATTCTTGTGAATATAATTATAG
TGATATTAATAAATATCAAATCACTGTTTACAAAGATTTTAAAGTACCAACATGGTACAAAGAAGGAATA
CTTTATCATATATTTGTAGATAGATTCAATAATGGAAATCGTAGTGGTAAGGTTGATAATCCTAAAAAAA
ATAGTTTCATATATGGAAATTGGGAAGATATACCTATGTACATAAAGGATAGTCAAGGGGATGTTATAAG
ATGGGATTTCCATGGTGGAAATTTAAGAGGGATAATCAATAAACTTGGATATTTAAAAAAATTAGGTGTA
AGTATACTATATCTAAGCCCTATATTTGAAGCTTCTAGTAATCATAAATATGACACAGGTGACTATAAAA
AAATTGACCCAATGTTTGGGGATGAAGATACATTTAAAGAACTTATTGATAAAGCAAAAGAAAAAGGTAT
ATCAATAGTATTAGATGGAGTTTTTAGTCATACTGGAGCAGATAGTAAATATTTTAATATGTATGGAAAC
TATAATAGTTTAGGGGCATATCAATCTAAAGAATCTCCATATTATTCATGGTATATGTTTGAAGAATTTC
CTCAAAAGTATAAAAGTTGGTGGGATGTTAAGACATTGCCAAATATAAATGAATTAGAACATAGCTATAT
GGATTATATAATATATGACAATGATAGCGTTATAAATAAATGGGTAAATATGGGTATTAAGGGCTGGAGA
CTAGATGTTGCAGACGAATTACCAACTAAGTTTATAAGAGAGTTAAAAAAGGAATTAAAAAAGGCAGATG
ATGACTCAATTCTTATAGGTGAAGTATGGGAAGATGCATCAAATAAGATTAGCTATGGTCAGAGAAGAAG
TTATTTATTAGGTGAAGAATTAGATTCTGTTATGGGTTATCCTTTTAGAAATAACATGTTTTCTTTCTTA
AAAGGAGAAATTAATTCATATGAACTTTGTAATAGATATATGCAGATTAAAGAAAATTATCCAAAAGAAT
CATTTAGGTCTAATTTAAATTTAATTGGAACACATGATGTTACAAGAGCTAAAACGGAATTAAATGATGA
TGTAGATTTAGTGAAGCTTGCTGTAGCTATACAGATGACATTTGAAGGAGTACCATATATATATTATGGA
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AAGATATGCTTAATTTTTATAGAGATGTTATAAAAATTAGAAATAAGAATAAACTTTTAAGTTCTGGAAA
TACAGAATTTATATATACTAATAATGATTCTGTATTTTCTTTTATTAGAGTTGATGAAAATAATGATAGA
ATGTTAATTTTAGTAAATAGAAGTGAAAATGTGGAAAGTATATCATTATGTATAGAGAGTAGTTTTATTG
AGGAAATACCTATAAAGTATAGTCTTAAAAATGCAAATAGTACTATACAAATTGAAAATAATGAGTTGAA
AGTAGATTTAGACTCTAAATCATTTAGAATTTTTAGAGTAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:996099-996767 GntR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGAACGTCTTATGAAGGTAGATCCACTTACAACTCAAGTATATGACTATATATCAAAGAAAATCC
AAAATGGAGAGTATGAAGCTAATCAGAGAATTACTGAATCTGAGATTTGTAAATCTATCGGAGTTAGTAG
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TTTGTAGTAAAAGAATTTCAGGAAAAGGAGAAATTAGACACCTATTCCGTAATTGGAGTATTGGATGCGT
TAGCCGGTTCTTCAGCATTACAAAATTTAACTGAATCAGACCTAGTAAAAATGGAAGAATTAACAGAAAT
GATGGCGGTCTCTATAAAGTATAAAAATTACAATAGCTATTTAAAATTAAGTAATGAATTTCACGATATA
TACATAACTAAATCAGATAATCAGGTGTTAGTAAATCTATTGAACTCTTTAAGATATAATTTTATGTCAA
AGTCATATACTAGTGATAATGAAGATGAGTTATATAAAATGTTGACATACAGCAATAATCAACATATTGA
AGTAGTAAAATTTATGAGGGAGAATGATTTAGAAAATGTTGAAAGAGTTTTGAGAGAACATTGGAAAACG
ATACCTATAGCAGAGATGAAAAAAGAGAAGCTTTTATAA
>ref|NC_013316.1|:997405-998880 arginine decarboxylase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAGCGAGTTTGCAAATGCAGTTGAATTAAGCTATGAGTGTGCTCCATTATTAGAGTCGTTAAAGG
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TTATAACGAATGGCACAACTCAAGCAATACATGCAATGATTTTGAGTGTTATAAAACCAGGTGAAAAAGT
ATTACTTCCAAGAAATATACATAAATCAGTAATAAATGCGTTAATACTTTGTGGAGGAATACCAATATTT
ATACAACCAGAATTTGATGAAAAACTAGGTATAAGTTTAAATATTACTCTTGAAAAAGTTAGAACAGAGA
TAGAAAAAGATTGTAATATAAAAGCATTATTTTTCCTTAATCCAACTTACTATGGAGTTTGTGCAGACCT
TGAGAGTATTATAGAACTATGCCATAAAAATAATGTTTTAGTGTTAGTTGATGAAGCTCATGGTGCACAT
TTTCCATTTCATTTAGATTTACCTCCTTCTGCAATAAGTTTAGGAGCTGACATGGTAGCTGTAAGTATAC
ATAAAACTGGAGGAGCATTGACACAATCTTCAGCACTCTTATTGAATAGAGATAATGTAAGTTTTGAAAA
GGTTCTTCAATCAATCAATATGCTACAATCAACATCAGCATCTTATTTGCTTATGGCAAGTATAGATGGT
GCTAGAGTTAATCTAGTTGAGAATGGTGAAAAGCAACTGTCAAAAGCATTAAATCTATCTAGGTATGCAA
AATCTAAATTGAACAAAATTGATGGAATAAAAGTTTTATCTACAGAAATATTGAAACAAAAAGGTGTTAA
ATTTATAGATGAAACAAAATTGTGTATAAATGTAAAAGAATTAAATTTGACTGGATTTGAAGTATACGAT
TTATTATATAAAAATTTTTCAATTCAAGTAGAATTGGGAGATTCATATAATATACTGGCACTTGTGTCCA
TTGGAACAAATAAATCAGATATAGATAGATTAGTAAAAGCACTTTCTATAATTGCAAAGATTTATAGAAA
AGAATCAACATTAAATGAATTTAATATGGTTCAAATAAATCCAATTATTAAACTTAATCCAAGAGAAGCT
TTTTATGCACCAAAGGAAAGTGTAGAAATCAATTCATGTATAGATAGAATTTGTGGAGAATCAATAATGG
CATATCCACCAGGTATACCGATTATTGCTCCAGGAGAATTGATAACAGAAGAAATTATGGAGTATATTAT
TTTCTTAAAAAATAGCAATGCGTATCTTACAGATGTACAAGATAAAAACTTAGATAGAATACTAGTAATA
AAATAA
>ref|NC_013316.1|:998967-999380 S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTTGAAACACTAGGAAGACATATACTAGTAGAATACTATAATTGTGATGAAAACGTACTTAAAG
ACCCACGTCTTATAGAAAATTTTATGAATGATTCAGCATTAAATGCAAAAGCGACAATTGTGGATTCTGT
ATTCCACCATTTTAATCCTTGGGGGGTTTCAGGAGCTGTTATAATTGCTGAATCTCATTTGACAATACAT
ACATGGCCTGAATATGGTTATGCAGCAGCAGATTTTTTTACTTGTGGTGATATAGACCCATGGAAAAGTT
TTGAATTATTAGAGCAACTTTTAAAGTCTGAAAGAAGCGAGTCTACAGAAATTCCAAGAGGCTTAACTAC
AAAAATTAAAAAATATTCAAAAAAAGATTTAGGTAAGATTACTCATAAACCAGAAGCAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:999410-1000261 spermidine synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAACTTTGGTATACAGAAGAATGGACAGAAAATGTAAGATTTTCTATAAAAGTAAATAAACATCTAT
TTGAAGGAAAGTCTCAATTTCAAAGGATAGATGTATTTGATAGTGATGAATTTGGAAAATTTCTAACAAT
AGATGGATTAATGATGGTAACATATAAAGATGAATTTATATACCATGAGATGATAACTCATGTTCCTATG
GCTACAAATTTAAACATAAAGAAAGTATTAGTCATAGGTGGAGGTGATGGAGGTACAGTAAGAGAATTAA
GCCGTTATCCTCAAATAGAAAAGATTGACATGGTTGAAATAGATAAAATGGTTGTAGATGTATCTAAGGA
GTATATGGATATATGCTCATGTAAATTAGATGATAAAAGAGTGAGTTTATATTTTGAAGATGGTGTTAAT
TTTGTTAAGTGTGCACATGATAAATCATATGACCTGATAATAGTAGATTCAACTGACCCAATAGGACCAG
GCGAAGGGCTTTTCTCAACTGATTTTTATAAGGATTGTTATAGAATACTGACTGATGATGGAATTTTAGT
AAATCAAAGTGAAAGTCCGTATTTTGACTTTAATGCTAAAGAGATGAAAAGAGCTAATAAAAAATTAAAA
CAGATATTTCCAATATCAGAAGTTTATCAAGCACATATACCAACATATCCATCTGGTCACTGGTTGTTTG
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GATGAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1000272-1001129 putative agmatinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAACACTTTTATGAGTATGGACAAAAATTATGAAGAATCTAATCTTATAGTATTTGGTGTTGGATTTG
ATGGAACTACTTCTAACAGACCTGGGGCTAGATTTGCAAGTAGCTCTATGAGAAAAGAATTTTACGGTCT
TGAGACATATAGTCCTTTTTTAGATTTGGACTTAGAGGATTATAATATATGTGATTATGGAGATTTAGAA
ATTAGTGTTGGAAGTACAGAACAAGTCTTAAAAGAAATCTATCAAGAGACATATAAGATTGTTAGAGATT
CAAAGGTACCCTTTATGATTGGAGGAGAGCATTTAGTTACATTACCAGCCTTTAAAGCAGTACATGAAAA
GTACAATGATATATATGTAATTCATTTTGATGCCCATACTGATTTGAGGGAAGAATATAATAATAGTAAA
AATTCTCATGCAACAGTAATTAAAAGAATATGGGATATTGTAGGTGATAATAAAATATTTCAATTTGGTA
TAAGGTCTGGGACAAAAGAAGAATTTAAATTTGCTACAGAAGAAAAACACACATACATGGAAATAGGAGG
AATAGATACGTTTGAAAATATAGTTAATATGCTAAATGGAAAGAATATTTATCTAACTATAGATTTAGAT
GTATTGGATGCATCTGTGTTTCCGGGAACAGGTACACCAGAACCTGGTGGTGTAAATTATAGAGAGTTTC
AAGAGATTTTTAAGATTATAAAAAACTCTAATATAAATATAGTTGGTTGTGATATTGTAGAGTTAAGCCC
TGATTACGATACAACAGGTGTATCGACAGTTATAGCTTGTAAAATCTTAAGAGAGTTATGCTTAATAATA
TCTGATAAAATTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c1001509-1001309 cold shock protein [Clostridium difficile R20291]
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ATGATGTTTTCGTACATTTCTCAGCTATACAAAATGATGGATACAAAACTTTAGAAGAAGGCGAAAAGGT
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>ref|NC_013316.1|:1001937-1003466 iron-dependent hydrogenase [Clostridium difficile R20291]
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TAAGACATGATGTTTTAACTGCAATAGCTAGACTTGGAAAAGAAGATAACCTTACCAGAGAAGCAATGGA
TAATATTCAGTATGAAATAATAAAAGGTGAGAAACCTACATACAGATGTTGTGTTTATAAAGAAAGAGCT
ATAATATCTGAGAGAGTAAATGTAAGTATGGGGTTACAACCAGGTCAAGATAAGATAGATTTAGATACAA
TGGATATAGAAGAAGATGAACAAATTATATATATTTTGGAAGCTGCATGTGACAGTTGTCCAATAAATGA
ATTTACAGTAACAGATATTTGTAGAGGATGTCTAGCACATAGATGTAAAGAAGCTTGTAAATTTGGAGCT
ATAACACATGTCGGAGGAATGGCCTATATAAATCATGAATTATGTAAGGCTTGTGGAATGTGTAAAAAAG
CTTGTCAATATGATGCCATCTCAGAGGTTGTTAGACCATGTAAGAGTGTTTGTCCAACTAATGCCTTAGG
ATTTGATAGAGAAAATATGAAAGCTATGATACATGAGGATAAATGTTTAAACTGTGGAGCATGTATGTCA
GCATGTCCATTTGGAGCAATATCTGATAAGAGTTTGATAGCTCCTGTAGCTAGAAAGTTGGTTCAAAAAG
AGAAAATGTATGCGGTAGTAGCTCCAGCTATAACAGGTCAAGTTGAAGCAAATGTTACATATGGTCAAAT
AAAAAATGCTATAAAATCACTAGGATTTGTTGATGTATTAGAAGCAGCTTGTGGAGCAGATGCAGTTACA
GTTCATGAAAGCTTAGAATTTGCTGAAAGAATGGAAAAGGGAGAGGCTTTTATGACAAATTCTTGTTGTC
CAGGATTTGTTGGTTATATAGAAAAAACATACCCAAATCATGTAGGAAAAATATCTTCTACAGTGTCTCC
TATGATAGCTAGTGGTAGATTTATAAAAAGTCATGAACCAGATGCTAAAGTTGTATTCATAGGACCATGT
ACAGCCAAAAAGAGTGAGGCAGCTAAGAAAGAATTAAAAGGAGCTGTTGATTATGTACTTACTTTTGAAG
AAATAATGGCATTATTTGAGGCATTTGATATAGACTTGGCTAAGTGTTCAAATGAAGATATAGATGATGC
ATCAATTTTTGGAAGAGGTTTTGGAGCTGCTGGTGGTCTTACAAAAGCTATAGAAAATTATCTTGCTGAA
AAAGGTATTGGTGTTAATTTTGAACCTGTAAAGATTTCTGGTTCAAGAGAAATCAAGAAAACTATGACTA
TGGCTAATTTAGGAAAGCTAGAAGGTAATTTTATAGAAGGAATGATGTGTGAAGGTGGTTGTATAAATGG
TTCTGGTAAATTCTTATCAGGTGCAAAGGTTAAAGCCACTTTTGATAGAAAAAATTCTCAATCAACTAAG
AAAAGTGTCTTAGCAAATACAAAGATAAAAGATTTTAGTAATATAAATTTAGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1003724-1005220 iron-dependent hydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTGAATTTGAAACGCAACTAAAAAGGTTGAAACATGAAGTTTTAACAGCAGTAGCAAGACTATCTA
TTGAAGAAAATTTAACAAAAGAAAATATAGAAAAAATTCCATATGAAATAATTAAAGGAGAAAAGGCGAG
ATATAGATGTTGTGTTTATAAAGAGAGAGAAGTAGTTCTTGAAAGGGCGCAACTTGCATTAAGTTTAACT
CCAAATAGTAAATATGGAGATATAAATCCAGATTCAGTTAGTTTGGACACAGATGAGCAAATTATATATA
TAGTTGAAGCAGCATGTGATAGATGTCCAATAAATGAATTTACAGTTACAGAGCTTTGTAGAGGGTGTTT
GGCTCATAGATGTAAGGAAGCATGTAAATTTGGGGCAATTTCTTATATAAATGGGAGAGCATATATAAAT
CATGATTTATGTAAGGCTTGTGGAATGTGCAAAAGTTCATGTCAATATGATGCTATATCAGAAGTTGTAA
GACCTTGTAAAAGCGTTTGTCCAACAGGAGCTTTGGATTTTAATAGAAACACTATGAAAGCAATGATACA
TGAAGATAATTGTATAAATTGTGGAGCATGTATATCAGCATGTCCTTTTGGAGCAATATCTGATAAGAGT
TTGATAGCACCTGTTGCAAAAAAACTTGCAAAGAAAGAAAATATGTATGCAATAGTAGCTCCAGCTATAA
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TATGATAGAAGCTTCTTGTGGAGCAGATGCAGTTACAGTTCATGAAAGCAATGAGCTTATTGAAAGAATA
AAATCAGGAGATAATTACATGACAAATTCATGTTGTCCGGGATTTTTTAAGTATATAGAGAAGATGTTCC
CAGATGAAAAAGATAGAATATCATCTACAGTGTCTCCTATGGTAGCAACAGGAAGATTAGTAAAAAAAAT
AGATTCTGATGCTAAAGTTGTATTTATAGGGCCATGTACAGCTAAAAAGAGTGAGGCAACAGAGAAAAGT
TTAAAAGATTCAGTAGATTATGTACTTACTTTTGAAGAACTAATGGCATTATTTGAAGCATTTAATATAG
ATTTATCAAAATGTTCAAATGAAGATATAAATGATGGTTCGATTTTTGGAAGGGGATTTGGAGCGTCTGG
TGGACTTGCCAAATCAGTACAGAACTATATTGCTGAAAAGGGACTTAGTTTTGAGTTTGAACCTATAAAA
GTATCTGGTCCAAGACAAATTAAAAAGACAATGACAATGGCTAAATTGGGAAGATTAGAAGGTAATTTTA
TAGAAGGAATGATGTGTGAAGAAGGTTGTATTAATGGAGCAGGTAAGTTTTTATCAGGTGTAAAAGCTAA
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>ref|NC_013316.1|:1005354-1008152 metallo-beta-lactamase superfamily exported protein [Clostridium difficile R20291]
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TTGTAACAAATATAACTACTAATAGTAAGATAAAATCAACAAGTGAATCTTATTTAAAAAGTGACAAAAA
TAGTGTGAGGCAAAATGGTATCCAGAGGAGCACAAAAAATACTGCATTTAAGACTACTATATTAAGTACT
GGAAAGTCTGACTGTATATTAATCGAGATAGGTGATAAATTCATAATGATTGATACAGGAGAAGATAAAA
ATGGAGAACAAATAGTTGATAAATTAAAAGAAAAAGAAATAAATGCACTTGACTATTTGATTAAAAAAAT
GCAAAATTCTATGAAGCAGGAACCCTGTGACTTTAGTCATAGGAGGTTCAGTTTAACCCATTTAGATAAG
GACCATATAGGTGGAGTAGATAGTGTGTTATCTAGTGTTAAAGTAAAGAATATTATACAAGCAAATTATA
AGAAAGATAGTAAGCAATATGATGAATATATTGACTCACTTAAAAAAGCTGATATAGAACCAGTGCTACT
AAAAGATAATATGAATATTGTAATCAATAGTGCAGAAATAAACATACATCCGGCTTCAAAAAGCAAGTAC
GAGAGTTCAAATGATTATTCAATAATCACTAATATAAGCTATGGAGCACATAAGTTTTTATTTGCAGGAG
ATGCAGAGGAAGAAAGATTGTCAGAGTTTATAAATGGAAATACTTTAAAATATGATTTTGTTAAAATGCC
TCATCATGGAAGATATGACAAATTAACTGAAACATTTTTAGAGTCTACTTCACCCCAATATGCTGTTATT
ACATGTTCAGAGAAAAAAGAACCAGAGGAAGGTGTTTTAAAAATATTGGAAAGATTGAATATAAAAACAT
TTTTGACTTCTAGTGGAGAGGTAGTTATCAATAGTGATGGTAAGACATTGAGTGTGAATCAATAA
>ref|NC_013316.1|:1006343-1007461 putative transposase-like protein B [Clostridium difficile R20291]
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AAACTTTTGGATGTTGTAGATTTGTATATAATAAATATCTTGCTAAAAGAATAGATGTTTATAAAAGCGA
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AAGGAACCTGACAAATTTTCACTACAAAACGCCTTAAAAGATTTAGATAATGCATATAAAAAATTTTTTA
AAGAAAAAGCAGGATTTCCTAAATTTAAATCAAAGAAAATTAATAGATTTTCATATAAAACTAATTTTAC
AAATGGAAACATTATGTATTGTGGTCAACATATAAAACTACCTAAACTTGGTATGGTTAAGGTAAGGGAT
AAACAAATACCTCAAGGGAGAATACTTAATGCTACTATATCTAAAGAGCCAAGTGGTAGATATTATGTAT
CATTATGCTGTACTGATGTAGATATTGAAGTATTTGAAAATACTAACAATCAGATAGGTTTAGATTTAGG
AATTAAAGAATTTTGTATCTCAAGTTGTGGAGAATTTATAGAAAATCCTAAGTATCTTAAGAGGTCATTA
AACAAACTTGCTAAATTACAAAGAGAATTATCGAGAAAGACAATCGGTAGTTTAAATAGGAATAAAGCAA
GATTAAAAGTTGCAGGACTTCAAGAACATATAGCCAATCAAAGAAATGATTTTCTACAAAAACTATCTAC
TAAATTAATAAAAGAGAATGATATTATTTGCATAGAAGATTTACAAGTAAAGAATATGATTAAAAATCGT
AAACTATCTCGCTTAATTTCTGATGTGTCATGGTCAGAATTTGTTCGTCAATTAGAATACAAGGCTAATT
GGCATGGTAGACAAATTGTAAAAGTAGGCAAATTCTTTGCAAGTTCACAAATATGCAATAAATGTGGGTA
TAAAAATGAGGAAGTTAAGAACTTAAATATAAGAGAATGGATTTGTCCTAGTTGTAATGAAACTCACGAT
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>ref|NC_013316.1|:1008685-1009035 hypothetical protein CDR20291_0827 [Clostridium difficile R20291]
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ACAGTGAATATGAAGAAAAAGATTTAGTGTATAATACAGAAGAAGAAGTTATACTTATAACTTTAAAAAG
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GAAAATATGCAGTATATAGCAATAGAATTTTATACTATGCTTATGGAAAAGACTGATGAAGAATTAGAAG
CTATGAATTTTTCTAAACAAGAAGTTTATCAAGGTATAGAAGATATTAGAAAAGTATTGAATTTAGAATA
A
>ref|NC_013316.1|:1009297-1010802 hypothetical protein CDR20291_0828 [Clostridium difficile R20291]
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ATTTTGACAAACTTTATTTAGAGTTTGGAGGAAAATTGATGGGAGACCTTCATGCAAAAAGAGTACTTCC
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GTCTATGCAGGAGATATAGAAAGAAACAAAATAAGAGGAGACTTTGGTATCACTTATGATATGGAAGTTT
TAAGATTAATAGATGATTTAAGAGGTTATGAACTAGATGTAAATAGTGTAGTAATTACTAGATTTGAAGG
ACAACCTGCTACAACTGTATTTATAAATAAATTAGAACGTAGAGGAATTAAAGTTTATAAGCATTATCCA
ACAAAGGGATATCCGTCAGATGTTGAGACTATAGTTAGTGATGAGGGATATGGAGCAAATGAATATATAG
AAACTACAAAGCCAATAGTAGTAGTCACAGCACCAGGACCTAATAGTGGAAAACTTGGTACTTGTCTAAG
TCAGTTGTATCATGAAAATAAAAGAGGTAATGTAGTTGGATATTCTAAGTTTGAGACATTCCCAGTTTGG
AATGTACCTGTAAAACATCCTTTGAATATAGCTTATGAAGCAGCTACAGTTGATTTAAAAGATGTGAATA
TGATAGATTCATTCCACCTTGAAACGTATGGTGAAATGTCAGTAAACTACAATAGAGATTTGGAATTATT
TCCAGTGCTTAAAAAAATAATAGAAAAGATAACTGGAAAAGAATCAATTTTCCAATCTCCAACTGATATG
GGTGTTAATAGAGTTGGCTTTGGAATAATAGATGATGAAGTAATAAGAAAAGCTTCTATAGAAGAAATAA
TAAGAAGATACTTTAAAACTGCCTGTGAGTATAAAAAGGGACAAGTTGATAAAGGCGCTTATGATAGAAT
GAAAATGATTATGGAAGAGCTTAACTTAAAGCCAGAAGATAGAAATGTTGTATTACCTGCTAGAAATTAC
AGTAATAAATTAAAAGAAAGTGCCGACAAGAATGATACTTGTCCTGTAGTTGCATTAGAATTAGAAGATG
GTACAATATTAACTGGTAAGGGTTCTGATTTAATGAATGGAACAGCAGCAGTAGTATTAAATGCCATTAA
ACATTTAGCCAATATATCTGATGATATGCACTTAATATCACCTGTAATATTAGAACCTATCATAAACTTA
AAAACAAAGACTTTAGCTAGTAGAAATGTTTCACTTAGTTGCCAAGAGGTGTTAACTGCACTTAGTATTT
GTGCTGTAACTAATCCAACTGCACAGTTTGCTATGGAAAAGTTAGCATTATTAAAAGGGTGTCAAGCTCA
TTCTACTACTATATTAAATAGAGATGATGAACAAACATTTAGAAAGCTTGGTATAGATGTAACTTGTGAC
CCAGAATATCCTTCACAAAATCTTTACTATAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:1011192-1012289 DNA polymerase IV [Clostridium difficile R20291]
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ATAAAAAATTAAAAGGAAAACCTGTTATTGTCGGTGGAAATCCACAAAGCCGAGGTGTGGTTGCAACGTG
TTCTTATGAAGCTAGAAAATTTGGTATCCATTCAGCTATGCCATCAGCTGTAGCTTACAATAGGTGTCCA
TATGCAGTTTTTGTAAGACCTAGATTTGATGTTTATAAGAGTGTGTCAGAGCAAATAAGAGATATATTTT
ATAGATACACGGATTTAGTTGAACCATTATCTTTAGATGAAGCTTACTTAGATGTAACAAAAAATAAAAA
AAATATTGATTCATCAATTGAGATAGCAAAGCAAATAAAAAAAGATATATTTAGAGAAGTTGGTCTTACT
TCTTCAGCTGGTGTGTCATACAATAAGTTTCTTGCTAAGATTGCATCAGACTTAAGAAAGCCAAATGGGT
TAACTGTAATAACCGAAGAAAATGCCCAGGACTTTTTAGATAAATTACCTGTGAATAAATTTTTTGGTGT
TGGAAAAGTTACTTCAAATACTCTTAAAAATTTAGGTATAAAAACTGGATATGATTTAAGGTGTTTAAAT
TTATTTGAACTTGAAAATATATTCAAAAAAAGAGGTTATGAATTATATAAATTTGCTAGAGGAATAGACG
ATAGACCAGTGGAACCAAATAGGGTTAGAAAATCTGTTGGGGCTGAGACTACATTAAGTCATAATTTGGA
TATTGATGAAGAAGAAACACGCAACATTCTTGATGAACTTTGTGAAGAAGTATGTCATAGATTAAAAAGC
TCTGAGAAGTTTGGAAAAACATTAACATTAAAAATTAAATATGAGGACTTTACAAAGATAACTAGAAGCC
TTAGTTTAGAACACTATATTGACGAATATAATGATATAAGAAGTGGTGTAGATAATTTGTTGAGAAATGT
TGAGGTTAATGGAAAACAAATTAGGCTATTGGGAGTTACAATATCAAACTTAAGTGATAAAAAAGAAACT
TATAAAGATATTACATTATTTGAATACATGGATAGTATTCAAATGTGA
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ATAGAGCTTAGAAGAAAAATAGGATATGTTATACAGAACACAGGCCTATTCCCTCATCTTACAATAAAAG
AAAATATAGAGCTAATTCCACGCCTAAAAAAGGAAAAATCCGTTGAAGAAATTGAAAAAAGAACGTTGCA
ACTACTTGAGATGGTAGGACTTGATAGTGATGAATTTTTGAATAAGTATCCTTCAGAACTTAGTGGTGGA
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TTAGTGCTTTAGACCCAATAACGAGAACATCTTTACAAGAACAATTATTTTCTCTTCAAGATGAATTGAA
AAAAACTATAATATTTGTAACGCATGATATGGATGAGGCTTTAAAGATAGCTGATAAAATTTGTATTATG
AAGGATGGAAGAATAGCACAATATGATACTCCCGAAAATATACTTAGAAAGCCTGCAAATGACTTTGTAA
AAGATTTTATCGGAGAAGATAGAGTTTGGGATAATCCAGAATATATAAAAGCAAGAGATATTATGATAAA
AAATCCTATTGCTGTTAATTCCACTAGAACTGTAACTCAAGGAATAGAAATTATGAGAACGAGTAAGGTT
GATAGCTTACTAATTATAGATAGAGCAAAAACATTAAAAGGTATTGTTACTGTAAAAGATATGAAAGATA
TTGATGATAAGTCAATATTACTTGCTGATATTATGTCGAGTGAGCCTTTGCATGTAAATGAAGGTGATAA
TTTAGTAGAAATACTAAATGTAATGAATCGTAATTCGGTTGGATATATTCCGGTTATTTCTGATGAAAAT
AAACTGGTAGGGCTTATTACTAGAAGTAGTTTACTTTCTGTTTTAAGTGAACAATTCTTAGAAATGGAGG
TGAGTGTTCTTGGCTAA
>ref|NC_013316.1|:1013668-1015221 glycine betaine/carnitine/choline ABC transporter, substrate-binding protein [Clostridium difficile R20291]
GTGTTCTTGGCTAATTTTTTTAACTTTATACTATTACAAAAAGATAAGATTATAGAGCTTTTAATACAAC
ATATGAGTCTAACTGTTACATCTATTTTAATAGCTATAATAGTTGGTGTTCCTCTTGGAATAATTATTTC
AAGAATCTCATCTCTTAGAAAGTTTGTACTTGGATTTGTAAACTTAGTCCAAGCAGTTCCGTCTATGGCA
CTTTTGGGTCTTCTTGTACCTATACTTGGCATAGGAAGTAAACCAGCCATATTTATGGTAGTGGTTTATT
CATTACTACCAATTGTAAAAAATACGTATATAGGTATAACAAGTATTGACCCAGTAGTATTAGAATCAGC
TAAAGGTATTGGTCTTACAAGAAATCAGACATTATTTAAAATACAATTCCCTTTAGCACTTCCTATAATA
ATGGGTGGAGTTAGAATATCTGCAGTTACAGCTGTTGGTTTGATGACTCTTGCAGCATTTATAGGTGCTG
GTGGTTTAGGATATTTAGTATTTTCAGGGGTTCAAACTGTAAATAATAATATGATTTTAGCAGGGGCAAT
CCCATCATGTATAATTGCACTGTTAGTTGATTATTTATTTAGTAAAATTGAAGTTGCAGTTACTCCAAAA
GGATTAAATCCAAAAGCACCTAAGAAAAATTATATAGCACTTAAAGTAATATCTGTAGTGGTTGTTGTTT
CAATGTTGTTCGTTGTTTTTAGTTCTAGTTTTTCAAGTAAAAAAGATACAATAACTATTGGTTCTAAAGA
TTATACAGAACAACTTATACTTGGTAATGTTTATGCTGAATTAGTAGAAAAAAATACGAATCTTAAAGTT
AAGAAGAATTTAAATCTAGGTGGTTCATCTGTTGCGTTTAATGCAATTAAATCTGGTGAGTTAGACATGT
ATGTTGACTATACAGGTACACTTTTGGTAAATGTAATGAAACATGCTCCGATTAAAGATGCTGATGAAGC
ATATAATGTTGTAAAAGATACTATGGAAAAAGAAAATCAGTTAACTTTACTTGACCCTCTTGGATTTAAT
AATACTTACACATTAGCTATGATGCCTGAAACTGCTGAAAAGTATGGAATAAATACTATTTCTGATTTGA
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GCTTTCTAGAGATTATGGTTTAAAATTCAAAGATGTAAAAGCAATGAATGGAAGTTTAAGATATACAGCT
TTAGATAATAATGAATCTCAGGTTATAGATGCATTTTTAACTGATGGTCTTATTAAAAAGTTTAATCTTA
AGATATTAGAGGACGATAAAAATTTCTTTGTACCATATTATGCAGCACCATTAGTAAGAGAAGATACTTT
GAAGAAATATCCTGAGTTAGAAAAAGTTATGAATATGCTTTCAGGAAAAATAAATGAAGAAACTATGAGA
GAACTTAACTATCAAGTGGATGAACTTGGTAAATCACCAGAAGAAGTTGCTCATTCATTCTTAGTTAAAG
AAGGCTTAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:1015555-1016421 putative cation efflux rotein [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAACTATAAGAAAGTGAAGCAAGTATTGTGGATAATTTTATTTGCTAATTTTGCAGTAGCATTAT
TAAAAATCATTATTGGTAATCAAATAAAAAGCTATAGTATGACAGCAGACGGATTTCATTCTTTGTCAGA
TGGAGCATCTAATATAGTGGGGCTTATAGGTATTTTCTTTGCATCTAAACCAAAAGATAAAAATCATCCT
TATGGACATAAAAAGTTTGAAATTATAACCAGTTTATTTATAAGTGGTATGTTGTTTGTTATAGCAATTA
AGATAATTCTTAGTGCAGTGCTAAGAATAGCTAATCCAGTTGTACCTGCTATAACTATAGAAAGTTTAAT
TGCTTTAATTATTACACTTTTTATAAATATTTTTGTATGCATGTATGAATATAGAATTGGGACTAAACTA
AATAGTTATGTTTTAATTTCGGATTCATTGCATACAAGAAGTGATATATTTGTGTCTCTAGGTGTATTGG
TTACTTTAGTTGGTGTTAAGTTAGGATTTCCAGTAATAATAGAATCTATAGTTCCTATTATTATTTCTGC
ATTCATAATTTATTCGGCTTATGGAATATTTAGGCCATCTATTGGAATTTTGGTCGATAGAGTGGCTGTA
GATGAGGATTATATAAAAGAAATTGTGTTTGAATTTAATGAGGTAAGGGATGTTCACAATATCAGAAGTA
GAGGTAGCAAAAGTTCTATTTATATTGACATGCATGTAATGGTAGACCCATTTATAAGCGTAGAGCAATC
TCATGATTTAACACATAAAATTGAGAAACAAATACAAGAAGAAATTAATGAAAATGCTCAAGTAATAGTC
CATATTGAACCTTTTTATAGTTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1016562-1017704 aldo/keto reductase [Clostridium difficile R20291]
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ATTTAGAAAAAAGTAATCAAGAAAATGCTGATTTAGTCAAATATGCGTATGAAAAAGGTATTAATTACTT
TGATACAGCGCCAGGGTATTGTGATGACAGAAGTGAAGATATATTTGGACTAGCCTTTAGACAAATGATA
AAGGAAGGTAAGACCGATTTTTATGTATCAACTAAAGAAAAGCCAAAAGCATGTGATACATCAGAAAAAG
CTATAGAGGCTGTAAAAAAATCAATAGAACGATTAGGCGTATCTAAAATAAATTTTTATCATGTTTGGAA
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AAAGAAGAAGGATTGATAGACCATATAGTATTTTCATCTCATCAACCAGGAGATGAGGTTATAGATATTC
TAAGTGAAAATAAGTTTGAAGGTGTAACTATGGGAATAAATATATTAAACTTTCCATATAGGCTAAAAGG
TGCCAAATATGCTGTTGATAATGGATATGGTGTTGTGGCAATGAATCCATTAAGTGGTGGAACTATTCCA
AAGTATAATAAAGAACTTTCTTTTCTATCAAAAGATGGCGAAAGTACTATAGAATCAGCTTTAAGATTCA
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TAAAATTGCAGACGAAAATAGAATTTATTCAGATGAGGATATACATGATATTGAGACTAGATTAAATAAG
AATATGAACGAAATATGTACAGGTTGTGGTTATTGTAAAGTATGTCCAAAAGGTATTAATACCCCAGCCT
ATATGCTTTTTTATAATGAAAAGCAGATGTTTAAAAAGAGTGATGAAGAAATGACAAAGTTAGTTTATGG
TTTAGGACATTGGAATTACACAATGAATAGTAAGGCAAAAGCTAAAGAATGTATATCTTGTGGAAAATGT
GAAGTTGAATGTACTCAGCATTTACCTATAATAGATAGATTAAAAGAAATTAAAAAATGGGAAGAAGATG
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>ref|NC_013316.1|:1018088-1019326 hypothetical protein CDR20291_0834 [Clostridium difficile R20291]
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TAATAACTTACTTAATAATAACTAAGATATTTTTTTCTAAGACTACTATATTTTATAATTTAAACAATAC
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CAATAGCAAATCCTGGGACAACAGATTTTAATAGTGCCTATGGGTTTGGACTAATTTGTCTACAAATAAT
AACTAGTGCTATGTCAATAACTTTAGTCTTTAATCATATTAAAAAGATAAAAATGCAGAGATTAACTTTA
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TATATAGCCAATTTTCATTAATATTTTTCATAGTTATTGCAAATAAGATGAAAGGAAAAAATTCTTATTT
AGTAGAATTAGCAGCTATTCCTCTATTTGGAATAACTATTAGTAATATATATTTGTATTTTTTTAATATG
ATATTTGAGTTTAAATTAAAAATAGGAAAAATGTTAAAACATTTAATTACATTTATCCTAATGGCATATA
TTTGTGTAGTTTCAACGAAGTCTTATGAGAGTTTTATGAACCTTGGAAATGTAATACAGTATGATACGAA
ATTTATAAGTGGAGAACCAATTTTGGAAAAGATTGCAATGATTATAGAGAGATTATTGTATTCGGTTTTT
TATTTTCCTGGAGCAAGTATTAAAAAAGGGTTATTTTTGCAAAATGGAGAAGTTGCTACAATACCAGTAA
TTCTTACATTATTAGCTTTATGTTTTTGTGTTTTATCAGTTATTGAAAATTCAGAAAAAAGAGTTCCTAA
GCTATGTATGGGAATAATTATATTCAATCTAACTTTACATGGTATAGTAGGATATAATCTAGTCAATTCA
AGTATTATGGCTATAAATTTTAGTTTTGCAGTTATAATTTTATTGGCTTACTTTACGAAAGCGCTTAGAA
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TGGATTTATAGAAATTTTAAACATAGGGATAAAATCATATCCTGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1019355-1020242 UbiA prenyltransferase family membrane protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACAGACCAATACAAGTATAAGGCTTCTTACTAAAATTTCAGATTATATAAAGTTAATGAGAATAA
AGCAATATATAAAGAATTTCTTTGTATTTTCAGCTATAATTTTTTCAAACAACATACTAAATATAAATTT
ATTTTTAAATACGTTTATTGCGTTTGTGTGTTTTTGCCTAATGTCATCATCAGTATATGCACTGAATGAT
GCTATAGACATGGATAAAGATAAAAAACATCCTAAAAAATGTAATAGACCAGTGGCAAGTGGAAGAATAA
GCAAAAAAAGTGCTAATATACTATTTGTAGTATTAGCTTTAATTTCAGTCTGTTTATCAACAGTTGTTAG
TTTTAATCTTTCTATAATTCTTAGTCTCTATTTGATAAACAATATATTATATTCTCTTAAACTAAAGAAT
ATAATACTATTAGATGTGTTTTCAATATCTCTTGGTTTTATACTTAGGGTTTATGCAGGATGTGTAGCCA
TAAGTGTTAGTTTATCAAATTGGATAATTTTATGTACATTTTTCTTATCTCTGTACTTAGCTCTTGGAAA
ACGTAAAAAAGAAATAGAAACTCTAAGAGATGATGCAGTTGAACATAGAAAAATATTGGAAGATTATGAC
ATAGAAAATCTAAATCAAATGATGATAGTTATATTAAGTTCTACAATTGTATGTTATTCATTGTATTCTA
CAAGTAATCCAGAAAAGCCACATATGATATTTACAACAATATTTGTAGTTTATGGTGTACTTAGATATAA
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AACGTAATCTTATGGATAATTACATGTTTAATAATATTGATTTTTTAG
>ref|NC_013316.1|:1020276-1020905 putative hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAAGTGTATTATTACTTGATGTAGATTATACTGTTATAAATACTGATAGCATGATAGATTTTT
TTATTTACTCTTTAAAAAATAAAACCTTTAAAACTATTATAAAGTTGCCATACATTATTTTTATTCTATT
TATGTATTTAATTAGAATGATACCCTTGAAGAAGGCAAAAGAGGCAATCTTTTATCCAATAGTAGATTTT
AGTGAAGAAGATTTAAAAAAGTTTTTTGATGATTGCATAATGAAAAAAATTAACGAATCTATGAAAAAGG
TCATTTACAAAAATAAAGAAGAAGATAATGTTATAATTATGATAACTGCATCTCCATATGCATATATGAA
ATATTTTAAGTATTATGGTCTTGCAGACAAGGTTATAGGCACGGAGTTTTTTTATGAAAATTCAAGATAT
AAAAATCAATTCATTGGAGAAAACTGTAAGGGAATTGAAAAAGTAAAAAGAATAAAGGCTGTATTAGGTA
AACTTGGGATAGAGATTGATTATGAAAATTCATATGCATATTCAGACTCTAAGAGTGATTTACCAATGCT
TTCATTGACTAAAAATGCATTTTTAGTTAGTAAAAAGGATGGTGAGGTTATAGAGCAAATAAATTCATAA
>ref|NC_013316.1|:1020910-1021374 hypothetical protein CDR20291_0837 [Clostridium difficile R20291]
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CAGAATTGAGGGGAGCCATTCCTATAGGTATTGCAATGGGCTTAAATCCTATATGGGTTTATGTATTTAG
TGTAATAGGTTCTACATTGGTATCGATTCCCTTGATATTGACATTCAGACATGTATTACAATTTTTAAGA
GGGAAGAAACTATTTAAAGGGATTGCTGATGTAATTGATAGAAAAATAAACTCAAGAATGAAGAAATTAA
AAAGTGTTTCGATAATTGGTATAATACTATTTGTAGGTATACCACTGCCAACTACAGGAACATGGACTGC
ATCTGCTATAGCTTCCATATTAAAAATGAGAATAAAAGATGCTTTTATGGGAGTATTTCTTGGCAATTTG
TTATCAGGGGTTATAGTTTCAGCTCTTTCTTTACATATAATATAA
>ref|NC_013316.1|:1021624-1022991 putative drug/sodium antiporter [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATTCAAACACTAACTTAGGCAGTGAAAGTGTGGGTAAATTATTATTTAAACTTGCTACACCTG
CTATTATTGCACAAATTGTAAATGTTTTATACAACATAGTCGATAGGATTTTTATTGGTAGAATGGAAAA
TGGAGAAGTTGCTATGGCTGGTGTTGGAGTGGCCTTTCCAATAATAATTATAATAACTGCATGTAGTTAT
TTAATCGGTATGGGAGGAGGTCCATTAGCTGCTATAAAAATGGGTGAGCAAAACAATGATGAGGCAGAGA
AAATAATGAGTAACAGTTTTTCTGTACTGGTGATTTTAGCAATACTTTTGACTATAGGTTTTAAGATTGG
AAAAGAGCCTTTACTTTGGATGTTTGGAGCAAGTGAATCTACAATTAGATATTCAATGGACTATTTAAAT
ATTTATTTAATAGGTACAGTGTTTGTTCAGATTTCAATGGGTATGAATACTTTTATAAATACCCAAGGGT
TTGCTACAACTGGAATGATGACAGTTGCTATAGGTGCTTTAATAAACATAATACTTGACCCGATTTTTAT
ATTTGGCTTTAATATGGGTGTAAAAGGAGCTGCATTAGCTACTATAATTGCACAAGGCGTTTCTGCTATT
TGGGTACTTATGTTTCTCTTTGGAAAGAAAAGTATACTTAAAATAAAAAAGAAGTATATGATACCAAAAG
CAAGTATCATCTTACCAGTGCTTGGCTTGGGAATCTCTCCATTTATAATGCAATCTACAGAAAGTTTAGT
ACTTATAGCCTTAAATAGTAAATTACAAATGTATGGAGGAGATTTAGCAGTAGGTTCAATGGCCATAATG
AGCAGTATAATGCAAATTCTTATGCTTCCTAATATGGGGGTTACACAAGGAGCACAACCAATAATAAGTT
ATAATTATGGTTCAGGTCAACTTGATAGAGTAAAAAAGACATTTAAGTTGTGTTTATTGTCATGTTTTAC
ATATTCTACTATTTTATGGCTTTTATTAATGATATTTCCTGCATTTTTTGTTAGTATATTTAATAAGAAT
CCGCAGTTACTTAGTATGACTAGTTGGAGTATAAAAATATATTTTGCTGGTGCTTTTATGTTTGGGATTC
AAATAGCTTGTCAACAGACATTTTTAGCACTTGGAAAAGCAACAATATCTTTGGTTTTAGCTCTACTTAG
AAAGATTGTACTTTTAATACCTTTAATATTTATACTCCCAACATTCTTTAATGAAAAACTTTTTGCAGTA
ATTTTAGCAGAGCCAGTTGCAGATATAACAGCTGCTACTATAACAGCAATTTCTTTCTTTATATTTTATA
AATGTTTTCTATCAAAACCTAAAGCAATAAAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1023191-1024465 putative 30S ribosomal protein S1 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTATAATGGAAAATGATTTAACAATGCAAGAATTACTTGACCAGCAAGAACAAGTATTCAGCAAAG
TGAAAGTTGGAGAATTGACAACTGGAAAAATAACTGCAGTGAGAAATGATGAAGTACAATTAGGATTAGA
CTATGGGTTTGATGGAATAATACCTATAAGTGAATTGAACATAGAAAAAAATCAATATATAGAAGATATA
TACCACATAGGTGATGAAATAACTGCTGTAATAACAAAAGTATCTCAAAAAGATGGTACAATAACTTTAT
CTAAATTACAACTTGACAAAAGAAATGATTTTGCCGAGTTACAAAAGGCTTATGATGAACATAGAATAAT
AACTGTAAATGTTGAAAAGAATATAGATAAAGGTGTATTTGCTAATTACAATACATATACATTTTTTATA
CCAATTTCTCAACTTGATACAAAATTTATTACAGATACATCTAAATTTGTTGGTCTTAACTTAGAAGTTT
ATATAAAAGAATTGGATGTTAGAAAAAATAGACTTGTAGCATCTCATAGAGATGTATTACAAGAGCGTAT
AAATAAAGAGAGAGAAGAAAGAAGAGCTCAAATTAAGGCAGAAAAAGAAGCTGAAAGAGCAAGAATTAAG
CAAGAAAGAGAAGAAGAAAAAGCTCGTATCAAAGCAGCTAAAGAAGACTTATTTAATTCTCTTGAAGTTG
GACAAAAAAGAGATGGTAAGGTGACAAAGATAATGCCTTATGGTGCATTTGTGGATATTGGTGGGATTGA
AGGATTAGCACATATAAATAATTTAGCTTGGACAAGAGTTGAAAGTGTTGAAGATGTTGTTTCAGAGGGA
CAAGAAGTAGAAGTTTATGTGTTGGATGTAAATAAAGAGACTAAAAAAATTGCCTTGGCATTAAAAGACA
TAAATAATGACCCTTGGGATTTAATAGCAAAAGAAGTACAAATTGATGATGTTGTCAATGCTAAAGTTCT
TAGAATAATAGAAAAAGGGGCTTTTGTTCAAATTAAAGAAGGTGTAGATGCGTATTTACCAATATCTGAA
TTGAGTGATACTAGAGTGGCTAAAGTTACTAATGTTGTTAATATTGGAGATGAGGTTAAAGTTAAGATTC
TTGATTTTAAACCAAAGACTAAAAGAATGTTGGTTTCAATAAAAGAAGCAACTAGAGAGCCAGAAGAGGA
TATAACAGAATACCTAGAAGTAGAGGAATCTTTAGGAAGTATTGGAGAATTATTTAAAGATAAATTTAAA
GATTTAGAAGTGTAA
>ref|NC_013316.1|:1024583-1025302 putative phosphoesterase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGTCTATTATGGATGTACATTGTCACACTCTAATAAGTGGACATGCACATAGTACTTTCAAGG
AAAATGTCGAAGAGGCGAGTAAGAAGAATATAAAATACTTAGGAATATCAGACCACGGACCTAATATGCC
AGGAGGACCACATCCATTCTATTTTTATAATTTGCATTTGCTTCCACGTGAAGTGCAAGGTGTAAAGATT
CTTAGGGGAATAGAAGGAAATATAATGGATTATAGTGGTAATTTAGATGTTCAAGAAGATATGTTGCAAC
ATTTGGATTATATAATCGCAAGTTTGCATAGACCTTGTATAGCTTCTGGTACAAAAGAAGAAAATACAAA
TGCTATTTTAAAAGTTATGGATAAACCTAAGGTAAAAATAATTGGACATCCAGATGACAGTAGGTATCCT
TTAGATTATGAACCTATAGTAAAAAAAGCTAAAGATAAAAATATCCTTTTAGAAATAAATAATTCATCAT
TAAGTTCAAACTCTCATAGAACGGGTACTTGGGAAAATGTAAGTCATATGTTGACATTGTGTAAAACATA
TGGTACAAGAGTAATTCTTGGTACTGACTCTCATATATGTTATTCTATAGGAGAATTTGAAAATGCAGAA
AAAGTTTTAGAAGCAGTAGATTTTCCAGATGAATTAGTCATAAATTATCATGAAGATGAAATTATAGAAT
TTTTTGATATAAATTTTTAG
>ref|NC_013316.1|:1025347-1025769 hypothetical protein CDR20291_0841 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTATTATGACAATGGTTATTTTAAAAAAGGAATGACTATATATATGGTTTTAGCACTTATAATTT
TAGCTACAATTTTTATATATTCAACGACAATATTATATATTTTATGTATAATAACAGCAGTTTTTCTATT
TAAACAAGGTCGTGATTTTTCAAATAAATATGAGGGAAAAGTATATATTACTCTCGATAATCATTCAATA
TTAATAAATAATCAATGTATATTCAGTATAAAATCTAAACAAAGTCAAAAGTTTAATTATAAGATAATAG
AAAAAATAGAAGTAGTAAAAAATATATTAAATATATACACTGACGAATCTAATTATAAAATTAGATTAAG
GGCATTGAGTTTGGAAGATGAAAAAAAATTATTGAATATCATAGATGAAAAGATGAAAAAGTTTAAGGCA
TAA
>ref|NC_013316.1|:1026287-1028029 2-isopropylmalate synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGTGTGGAAAGTATAAAAAATATGATAAAATGCAAATAGTAAATCGTAAATGGCCAGATAATGAAA
TATTTAAGGCTCCAATTTGGTGTAGTGTCGATTTAAGAGACGGAAATCAGTCACTGCCAACGCCTATGAG
TGTAAATGAAAAAGTCAGAATGTTCAAAATGCTTATTGATACAGGATTTAAAGAAATAGAGGTAGGATTT
CCATCAGCATCAAATACAGAGTATACATTTTTAAGAAAATTAATAGATGAGAATATGATTCCAGATGATG
TAACTATACAAGTACTTACACAATCTAGGGCTCATCTTATAGAAAAAACATTTGAATCAATAAAGGGATG
TAAAAAAGCAATTATACATTTATATAACTCTACATCTGTTCTTCAAAGAGATGTGGTTTTTAATATGAGT
AAACAAGAAATAATAGATATAGCAGTTGAAGGAGCAAAATTATTTAATGAAGAAGTAAAAAAATATCCAG
AAACAGAATTTACTTTTGAATATTCACCAGAGAGTTTTACAGGAACAGAGATGGATTATGCACTTGAAAT
ATGTGAGGCAGTGATAGATGTTTGGAAACCAACTCCTCAAAAAAAAGTAATAATAAATCTTCCATCAACA
GTGGAAATGGCAACACCAAACGTATATGCAGACCAAATAGAATGGTTTTGTAAAAATATAAGTTGTAGGG
ATTCTATTATACTAAGTTTGCATACTCACAATGATAGAGGAACTTGTACGGCTGCAAGTGAACTTGGATT
ATTGGCTGGTGCCGATAGACTTGAAGGAACACTATTTGGAAATGGTGAAAGAACTGGAAATATGGATATA
GTAAATGTGGGACTTAATCTTTATACACAAGGAATAGACCCAGAGCTAGATTTTAGCAATATAGATAAGA
TAATTGGTATATATGAAGACTGTACAAAACTTATGGTACATGATAGACATCCATATGCAGGTAATCTTGT
ACATTGTGCTTTTTCAGGTTCACATCAAGATGCTATTAGAAAAGGCATGATAGCAATGAAAAACAGAGAT
AATGATTACTGGGAAGTTCCATATTTACCAATAGACCCTCATGATATTGGAAGAGAATACAAAGAAATTA
TAAGGATAAATAGCCAATCTGGAAAAGGAGGAGCTGTTTATATAATGGAAACAGATTATGGATTTATGAT
ACCTAAGAATATGCATTCTGATTTTGGAAATGTAGTCAAAATGGAATCTGATAGAATTGGGGAAGAACTT
AGTAGTGAAGCAATATTTAATTTATTTAAGAAAGAATATATTGAAGTTGAGAGCCCTTATAAAGTTAAGA
AGTATAAAATAAAATCAATGGATGAATTAAACTATGAAAATGATGATTCTAATGATACTAACATGATTGA
GATGACTGCAAGAATAAGTTATATGGGAAATGAACAAAGGATTGTTGGTATAGGAAATGGACCTGTAGAT
TCATTTAATAATGCACTAAAGCAATGTGGCATGAAAGATTATAAATTTAGATATTACTGGGAACATGCAT
TAGAGGAAGGGTCACATTCAAGAGGGGTAGCTTATGTAGGAATAGAGCACAATAATGAAGTCTATTTTGG
TGTAAGTATATCGGAAAACATAAATACAGCAGCTATTAATGCACTTATGAATGCAATAAATAAAAGTTAT
ATTGAGGAGGAAATAAAAAATGGGGATGACTATGACGCAGAAAATATTAGCCAAACATGCTAA
>ref|NC_013316.1|:1028169-1029263 3-isopropylmalate dehydratase large subunit [Clostridium difficile R20291]
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TCGCAAAATCAAAAGGAGTTGTAAATTTTTTTGATGTAGGAGATATGGGAATAGAGCATGTTCTTCTTCC
TGAAAAAGGTATAGTAACTGCTGGAGATGTAATTATAGGTGCTGACTCTCATACTTGCACATATGGAGCA
TTAGGAGCATTTTCTACTGGTGTAGGTTCAACTGATATGGGAGCAGGTATGGCTACAGGAAAATGTTGGT
TTAAGGTTCCTGGAGCAATAAAATTTGTTTTGAAGAATAAACCAAATAAATGGATAAGTGGTAAAGATAT
AATACTTCATATAATAGGGGAGATAGGTGTTGATGGAGCACTTTACAAGTCGATGGAATTTTGTGGAGAT
GGAGTAGAATACTTATCTATGGATGATAGATTTACTATTTGTAATATGGCAATAGAAGCAGGAGCAAAAA
ATGGAATCTTTCCAGTAGACGATAAGACTATGGAATATATAAATTCACATAAGTGTTCAACTATAACAAA
AGATGTAAATATATATGAAGCAGATGAAGATGCAGTCTATGATGAAGTATACGAAATAGATTTAGCCGAA
CTAAAAGAAACAGTAGCCTTTCCTCATCTTCCTGAAAATACTAGAACAGTAGATGAGATAGATAAGGATA
TAAAGATAGACCAAGTTGTAATAGGTTCTTGTACAAATGGAAGAATATCAGACCTTGAAGTAGTAGCTGA
GATAATGAAAGGCAAAAAAGTAGCAGATGGAGTTAGAGTTATGATATTTCCTGGAACTCAAAAAGTATAT
CTTGAAGCTATAGAAAAAGGGTATATTACCACTTTTATAGAGGCAGGAGCAGCAGTTTCTACACCAACTT
GTGGTCCATGTCTAGGGGGACATATGGGTATACTTGCAGCAGGAGAAAAATCCATTTCAACAACAAATAG
GAATTTCGTAGGAAGAATGGGGCATGTTGATTCAGAGGTGTATCTTGCAAGCCCAGCTGTAGCAGCAGCA
TCAGCTATAACTGGAAAAATATCAAAACCATCAGAAATAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:1029278-1029769 3-isopropylmalate dehydratase small subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGATTGCCAATGGAAGTGTTTTTAAATTCGGTGACAATATAGATACAGATGTAATAATACCAGCTAGAT
ATTTAAATATAGCTGATTATAAAGAACTAGCAACGCATTGTATGGAGGATATTGATGATAAATTTATTTC
TAAGGTAAAAAAAGGAGATATTATAGTTGCAACTAAAAACTTTGGTTGTGGTTCATCAAGAGAACATGCA
CCAATTGTAATAAAAGAAAGTGGAGTATCCTGTGTGATTGCTTCTACTTTTGCTAGAATATTTTTTAGAA
ACTCTATAAATATAGGGCTTCCTATACTTGAATGTGAAGAAGCTGCCAATAACATAGATGAAGGGGATAA
TATAGAAGTAGATTTTTCTACAGGTGTGATAAAAAATATAACAAAAGAAAAAGAATATAAAGCAGAACCA
TTTCCTGAGTTTATGCAAAATATTATATTAAATGAAGGCTTAATTAACTCAATAAAAGCAAATAGGGGGT
AG
>ref|NC_013316.1|:1029776-1030846 3-isopropylmalate dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTGTAATATAGCAGTCATAAAAGGTGATGGTGTTGGACCGGAAATTATAGATGAAGGTATAAAGG
TTCTAAATAAAATTTGTTGTAAATTTAATCATAGATTCGATTGTGAATATGTATTAGCTGGAGGATGCGC
GATTGATGAAATTGGAGAACCTCTACCTAATAAAACTGTTGAAACTTGTCGAAAAAACGAAGCTGTATTG
CTTGGTGCTGTTGGAGGACCAAAGTGGGATAAATGTAAGGGAGATAAAAGACCAGAGTCTGGTCTTTTAA
AATTAAGAGAGTCATTGGGTTTATTTGCAAATTTAAGACCAGCTACAATGTATGAAAGTATAAAAGAAGC
TTCACCACTTAGAACGGATATAGTTGAGAAAGGCATTGATTTTGTTGTTGTAAGAGAATTAACAGGGGGC
ATTTATTTTGGAGAACGTGGAAGAAAAATCATTGATGGTATCGAAAATGCTTATGATGTAGAAATATATA
ACGAAAATGAAATAAGAAGAATTGGTAAGAGAGCTTTTGAAATAGCCAGAAATAGAAATAAAAAACTTAT
AAGTGTAGATAAGGCAAATGTGCTTGAGAGTTCAAGACTTTGGAGAAGTATAATGGAAGACTTAGCTAAA
GAGTTTGAGGATGTAGAACTGTCACATATGTATGTTGATAATGCTGCTATGCAAGTTGTAAAAGACCCTA
GCCAATTTGATGTAATAGTGACTAATAATATATTTGGAGATATAATATCTGATGAAGCATCTATGATTAC
GGGTTCTATAGGTATGTTACCATCAGCATCACTTAGAGAAGATAGTTTTGGTATGTATGAACCAATACAT
GGAAGTGCGCCTGATATAGCTGGAAAAGATATTGTAAATCCAATTGCAACTATTCTATCTGTAAGCATGA
TGTTAAGACATAGTTTTAACTTAGAAGAAGAAGCTAAGTGTATTGAAGATGCTGTACAAAGTGTACTCAA
TAAAGGTTATAGAACTATTGATATCTATAATGGTGTGGGAAATGTTGTAGGAACAAGAGCAATGGGCGAA
TTAATAGTAAATGAAATTTAG
>ref|NC_013316.1|:1031209-1031724 putative thioesterase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATTTTTTGGCAAAGTATAAAGTTTTGAAGAAGCAAAATAGTAGTAAATCTTGTTTAGTTTGTGGAA
CACAAAATGAGCTAGGACTTAAAGCAGATTTTTATGAACTTGAAAATGGAGAGCTTGTATCAATTTGTAA
TACAAAGGATTGGCATCAAAGTTATCCTGGGAGAGTTCATGGAGGTATGTCTGCTGCAATATTAGATGAG
ACTATTGGAAGAGCTGTAAGTATAAATGATGACCAAATATGGGGAGTAACAGTATCTTTAGAGTTGAAAT
ATAAGAAACCAGTACCAACAGATGCTACTATAAAAGTTGTTGGAAGAATAACTAAAGAAAACAGAAAATT
ATTTGAAGGTACAGGAGAAATAATTCTACCAAATGGAGATATAGCAGTGACAGCAACTGGAAAGTATATG
AAAATGCCTATTGGACAAATTGCAGAAGGTGATTTTTCTAATGAAGAATGGTTTTTTGAAGAATCGAAAG
AAAAAGTGGAATATATTGAACTTTGA
>ref|NC_013316.1|:1032097-1033173 putative aminotransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAGAAATTATTTATTCCTGGTCCTATTGATGTTAAAGAAGAAGTCTTGCAAAAGATGGCTACAC
CAATGATAGGACATAGAGGAAAAGATGCATCTATGCTCCAAAAGAGTATAAGTGAAAAGATGCAAAAACT
ATTCTATACAAACAACACGATACTTTTATCCACGTCATCCGGAACTGGTTTAATGGAAGGCTCCATTCGT
TCCTGTACATCCAAAAAGGCAGCAGTATTTTCCTGTGGATCCTTTGGTGATAGATGGTACAAAATGGCAG
TGGCTAATAATGTCCCAGCGGATATATTTAAAGTTGAATTAGGAGAGGCAACAACGCCAGAAATGGTTGA
TAAGGTGCTTTCTACCGGAGAATACGATTTAATAACTGTAACTCACAATGAAACTTCAACTGGAATAAGA
AATCCAATAGAAGAAATTGGAGAAGTTGTTAAAAAGTATGAAGATGTAATCTACTGTGTAGATACTGTAA
GTTCAGCCGGTGGAATAAAAGTCGAGGTTGATAAGATTGGAATAGATATTTGTATAACATCAGTACAAAA
AGCACTGGGATTACCACCAGGAATGTCTATTTGCACATTTTCTCAAAAAGCAATCGATAGAGCTAAGCAA
GTACCTTTTAGAGGAGTATATCTTGATTTGTTAGCAATGTATGAATACTTAATCAAGAAAAACTACCAAT
ACCCTTCAACACCATCTCTTTCTCACATGTTCGCTTTAGATTTCCAATTAGATAATATATTAGATGAAGG
CCTAGATAACAGATTCAACAGACATGAAGACATGGCAAACTTAGTTAGAAACTGGGCTAAAAAACACTTC
CAAATTTTTACCAATGAAAATCACTTATCCAATACACTTACTGTTATAGAAAATACTCAAGGTATTAGTG
TATCAAATTTAAATTCAAAATTACAAGAACGAGGATTCCAAATAGCAAATGGCTATGGAGATTTAAAAGA
AAAAACTTTTAGAATTTCACATATGGGTGACTATACTGTCGAAGATGTACAAGAATTATTAGATAATATT
GATGATATATTAGGTTTTAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1033413-1034354 putative D-3-phosphoglycerate dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAATATATTAGTTACTGATGGAATAGAGAAAGAAGCAGCGAGAAAATTGAGAGAGTTAGATTTTA
ATGTGATAGAGCAGTTTTATGAAAAAGATGTTTTAGGAGATAAACTTAAAGATGTTGATGTACTTGTAGT
ACGTTCAGCTACTAAAGTTACTAAAGATGTAATAGATAAAGCATTAGAGGGTAAAAAGTTGAAGTTGATA
GTAAGAGGTGGAGTAGGTCTGGATAATATAGATGTTAAATATGCTCAAGCTAATGGCATAAAAGTTATGA
ATACTCCAAATGCAAGCAGTATATCTGTTGCAGAGCTTACAATAGGTCAATTATTTGTTCTTGCAAGATT
CATAAATACTGCAAATGTAACTATGAGAGATGGAAAATGGGAGAAGAAGAAGTATAAAGGTACAGAAATT
AATGGAAAGACACTTGGACTTATAGGTTTTGGAAGAATTGCAAAAGAAGTTGCAAAGAGAGCAGAATTAT
TAGGTATGAATGTTATATATACTGACATAATGGGTGAGGCGCAAGGTTTTAACAATTATAAATTCTGTGA
TATGGAAGAAGTTTTAGAAAATGCAGATTTCTTATCTTTACACATACCATTTGATAAGAATAAGGGGGCA
GTAATAACTGAAAAAGAAATAAATAAGATGAAGAAAGGGGCTTATTTAATAAACTGTGCAAGAGGCGGTT
TAGTTGATGAAAAAGATTTACTAAAAGCATTAGATGAAGGTAAATTATCAGCAGCTGCTATAGATGTTTA
TGAACAAGAACCTACATTAAATTTAGACTTAGTAAATCATCCAAGAGTTTCTCCTACACCTCATATTGGG
GCATCTACAGTAGAAGCTCAAGAAAGAATAGGAGACGAAATAGTAAATGTGATTCAAGATTTCTTTCTTG
ACTTCAACAATCTAATAGGGGTAGCATTATAA
>ref|NC_013316.1|:1034386-1035636 hypothetical protein CDR20291_0849 [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAACGATTAAACCATTTAAGGCGATTAGACCAAATAAATATATAGTAGATAAAGTAGCAGCACTTC
CTTACGATGTTATGAATAGTAAAGAAGCTAGAAGAATTGCAGAAGGGAATCCATATTCATTTTTGCATAT
AGATAAATCAGAAATTGATTTAGATGAAAATATAGATTTATATGATGAAAAAGTTTATTTAAAAGCGCGA
GAAAATTTATATGAGTTTCGAAAACAAGAAATTCTAGTAAAAGATGACAAAGAGTGTATATATATATATA
AACAAATCATGGATGGTAGAGCTCAAGTTGGTATAGTAGCATGTATATCAGTTGATGAAAGCTTGAATGG
AACAATAAAAAAACATGAGTACACTCGACCAGAAAAGGAAATTGATAGAACTAAACACATAAAATACTGT
GATGCTAATACGGGAACTATACTTGTAACTTACAAACATCAAAGGGTGATAGATGATATAATCAATGATT
TTATGGATAATAATGAACCTTTATATGATTTCATAACAGATGACAAGATAGAGCATACAGTATGGAAGAT
TGATAGTGATGATATAATAGATAACCTAGTAGATAAATTTGAAAAATTAGATTATCTATACATTGCAGAT
GGTCATCATAGGACAGCTTCAGCAGAAAATGTAGCCAAAGAAATGAGAGCTAAAAATCCAAATTATACTG
GCAAAGAAGAATTTAATTACTTCATAGCAATGATTGCACCAGATGAGAATTTAATGGTTTTGGATTATAA
TAGGGTTATCAAAGACTTAAATGGTTTAAGCGAGGAAGAATTTATAAATAAAATAAAAGAAAATTTTGAA
CTAGAAGAAATAGAAGGAAAAGAAAAATATAAACCTGACAAAAAAGGAACTTTCGGAATGTACCTAGGTG
ATAAGTGGTATAAAATGAAAGCAAATAAAAATTTATTAGAAATAGAAGACCCTGTTGACTCATTAGACAT
TTCTATATTACAAGACTATGTTATTGATGCTATTTTAGGAATTGACAATCCTAGAGTAGATAAAAGAATT
GATTTTATCGGTGGAATTAGAGGTCTTGAAGAATTAGAAAAAAGAGTTAATGAAGATATGAAAGTAGCAT
TTGCAATGTATCCTACTAGTATTGAAGATTTAATAAGAGTAGCAGATGCAAATAAGATAATGCCAGCTAA
GTCAACATGGTTTGAACCTAAAGTAAGATGTGGGCTATTCTTACATGAAATAAATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1036454-1040002 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATGAACAGACTAAAGCCAAGAATTTTAGGTATTAGTATCTTGTTTATTATTATAATTATTTTAACAT
GTGGAGCTGTTTTCAAGTTTAAATTTAAATTAGATAATAAATTAAAAGAAACCACACATACATATTTGTC
TGAGTTTACAGAACACAATATAATTAATCTCAAGACAAGACTTAGTGGTCAATTTGACATGCTTGAATCT
ATTGCTAACTTCATAGGAAACTTGAATAATATAAATAATGAAATGGTGATTGCTTTAATGGATTCTGATG
TAAAGCGAAGTTCTTTAATTAGAATGACTATCTCTACATTAGATGGGGAATGTTATTCTAATGATGGAAT
CACCCATAATGTTCAAGATAGAGATTATTTTAAAAAAGCTAAAAATGGAGAAAAGAATATTTCAGAGCCT
TTAAAATCTATTGTTAATAATAAAGAAATAATAGTTTTATCTACCCCAGTTTATAAAAGTGGGAAAATAG
TTGGTGTTTTAAGTGGAATTTATGATTCAAAAAAGTTAAATGAGTTATTAGGATTATCTGCATTTGATGA
AAAAGCAGATGTTTTTGTTGCAAAGAAAAATGGAGATATAGTTGCTCAAAAAACAAATAAAAATAGAAAG
ACGATATCATGTATATTTCAGCTTTTTGACAAAGATAATTGTGATGAAGATGATTGTCTAAAAACTATAA
AAGAAAATATGAAAAATGATAAGTCTGGATATTTTAATTATAACTTAGATAATGAAAAATTTATGTTAAA
CTATCAGCCACTTGGAGTTAATGATTGGTATGTTTTTTCTGTTGTGCCAAATAAAATAGTGTCTATTCAG
TCAGAGAATATATCTTATGATGTATATATTTTTGCATTAGAAATACTACTAGTTATATTGATTTTTATAA
TATATATAGCATGTATTATAAATAATAACACCAAAATTATTATAAATGAAAAAGAAAAATTTAAAGTACT
CACTGATAATATATTAGGAGGGGTTAAAACCTGTTTAAAAGATGAATATATGACTATGACATATGTAAGT
CAGGGGTTTTTAGAGCTTACAGGTTACTCTTGTGAAGATTTAAATAAAATATTTAAAAATAGATTTAAAG
ACATGATTTATAAAGATGATTTAGACAAGTTTAATTGTATTATTCTAAATCAATTAGAAAAACAAGATAA
AATTGAAGTTGAATATAGAATTGTAAGAAAAGATGGAAGTATAATTTGGATTTTGGAGAGAAGTAAGTCT
ATAAATGATAATAAAGGAAGTGAGTGTATTCAGGGAGTTTTAACTGATATAACAGAACTTAAGAAAATAC
AAGAAGAGTTAGATTCAAAAAGATTTGAAATACAGGCTATCAATGATAGTATTGTTGGTGGAATAGTGAT
AACTGAGATAAATGATGATTTTGATAGTATATATTTAAATGAAGGTTATTTAAATATGATTGGATATACA
CGCAAACAACTGGAAGATGAGCTAAATAATAAATTAATCAAACTTATTTTTAAAGATGATAGAACAGAAT
TAATTAATAGTATAAACAAACAACTCAAATTAAGTGATACATTTGCATCTGAACAAAGAGTTGAAAAAAG
GGATGGTACTATTATATGGATTTTATTAAAAGGAAGAAAGATAATTTATGATAATGGAAAATCTGTACTT
TGTTGTGTTATTGTAGATATCACTTCTGCTAAATTATTAGAGCAAGAACTTAAAAAGAGTGAAGAACGTC
ATGAAATCATTCTAAAGCAGACGCAAAATATCATAATAGAATGGGATATAGAAAAAGATAAAATGAATAT
ATCACCTAATTGGTATAATAAGTTTAAATATGACCCTATAACTGAAAACGCAACAAAAAATATAATTAAA
TCAGTAGATATATATCATGATGATATGGATAAGTTTATTTCATTAATTAAACTTACTTCACAAGGTAGTG
AGTATGAAGAGTGTGAAATTAGACTTAGAACTAGAGATACTATTTACGCTTGGTTTAGTATAAAGGCAAC
AACTTTATTTGATAATAATGGTAAACCTTATAAAGTAGTAGGAAGTTTGACTGATATTGATGAATCAAAA
CGAGAAGCTGAAAAGTTGAAAGAAAGGGCAGAAAAAGACCCTCTTACAGATTTGTATAATAAAAAAGCAT
CACAATCACTTATAGAAGAGTACATAACATTGGATAAAAAAAGAAAAGGTGCTTTAATGATTATTGATAT
TGATAACTTTAAAGGAATAAATGATAATTTAGGACATTTATATGGGGATGCTGTATTAAGTGAAATTGCA
AATGACCTAATAAATCTATTTAGAGCAACCGATATAGTAGGCAGAATTGGTGGAGATGAGTTTATTGTAT
TTATAAAAGATATTTCTGAAACAAGAGATATTATAAATAAAGCAGAAGAATTGGTAAAAACATTTGAAAG
GTCTTTTTTAGGTAAAGGACGAAATTATAAAATATCATTAAGTGTAGGAATTGCTAAGTTTCCACAAGAT
GGTATGGACTATATGACACTATTTAGAAATGCGGATATGGCTCTTTACTCAGCCAAAGGGAAGGGTAAGA
ATTGTTATACATTGTATGATAAAAAAATTGATAAAGTCCAATATATAACTAATACAAGAAATGCAGGAGA
TAGTGATAATGTAGAGATGTCTTTTAAAGAACATATCACAAATTATATATTTGATATACTATATGAATCA
AGTGATATAGAAGTGGCAGTAAATTTAATTCTAAGTATTGTAGGTAAACACTTTAATGTGAGTCGCATGT
ATATATTTGAAAATTCAGATGATAATCGAGTATGTAAAAATACATTTGAATGGTGTAACGAAGGTGTAAC
CTCGGAAATTAATAATCTTAAAAATATTTGTTACAAGGATTTAGGCAACTATCTTTTAAATTTTAATGCA
GATGGGTTATTTTATTGTAATGATATTGAAAATTTAGGTAGTGATGTGAAAAAAGTACTTAAGCCACAAG
GCATACGTTCAATATTACAATGTAAAATTTTAGAGGGCAATGAATTTAGAGGGTTCATAGGATTTGATGA
ATGTTCATATAATCGTATGTGGACTAATGATGAAGTGAACACTTTGACATTTATATCTAAAACGCTCAGT
ATGTTTTTATTAAAAATGCGTATTCAGAGTAAGCTAGAAGAGTCTTTAACAATTCAAAAATCTGTGATGG
ATAATATGGATATATGGGCATATGTTGTTGACAGGAATACCTATGAATTATTATTTATCAATAAAAAAAT
GCTTGAGTCAGCATCAAACACTCATGTAGGTGATTTATGTTATAAAGCGATATGGAATAATCAAGATAAA
CCTTGTAAAAAATGCCCTATGATATATTTAAAAGATGGTGATGATACTTATAAATCATTTATGCGCAATA
AAAAGTTTGAGGTACAGGCAAATATAACTACAACTACTTTGAAATGGTTTGATGGGAAAGATGCATGTTT
AATATTTGGAAGTGAAGTAACTAGTATTGAAGCTGAAGAAAATACTTAA
>ref|NC_013316.1|:1040187-1042121 putative radical SAM protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATAAGTTTTTACCAATAAGCAAACAAGATATGATAGATAGAGGATGGGAAGAATTAGATTTTG
TTCTAGTTACAGGAGATGCTTATGTGGACCATCATAGTTTTGGAACAGCAATAATATCTAGAGTTTTAGA
AAATGCTGGGTATAAAGTTGGAATAATAGCTCAACCAGACTGGAGAACTACAGATGATTTTATGAAGCTA
GGAAAACCGAGACTTGCATTTCTAGTTAATGCAGGAAATATGGATTCAATGGTCAATCATTATTCTGTAA
GTAAAAAGCATAGAGAAAAGGATATGTATTCTCCAGGTGGGAAAATGGGTTATAGACCAGATAGAGCTAC
TATAGTATATTGCAATAAAATAAGAGAAGCATACAGTGATGTTGCAATAGTAATAGGTGGAATTGAAGCG
AGTTTAAGAAGATTTGCACACTATGATTATTGGAGTGATAAGGTTAGAAAGTCTATGTTAATAGATAGTG
GAGCAGATTTATTAGTTTATGGTATGAGTGAAAAGCAGATTGTAGAAGTAGCCAATGCACTTAATGATGG
ATATGACCCAAAATATATTAGACATATTGATGGGACATGCTATATTTCAGATACATTGGAAGAAATATAT
GATAAATATATATTAATTCCATCATATAAAGAAATTTGTGAAGATAAAATGAAGTATGTAGAAGCTTTTA
AAATTCAATATGATGAGCAAGACCCATTTAGAGGTAATATAATTGTTCAACCTCATGGAAGTAAGTATCT
GGTTCAAAATAAGCCAGAAAAACCACTTAGTAGAGAAGAACTAGATGAAGTATATGGATTACCATATCAG
AAGACATACCATCCTGTGTATGAAAAATTTGGAGGAATACCAGCTATAGAAGAAGTAAAATTTAGTATAG
TAAGTTCAAGAGGCTGTTTTGGTAGTTGTTCATTTTGTGCAATAACATTTCATCAAGGTAGAGCAGTGCA
AAGTAGAAGTGAAAAATCAATTATTGATGAAGCAATAGGAATAACAAATTTAGATGATTTTAAAGGGTAT
ATACATGATGTTGGAGGTCCAACAGCTAATTTTAGAAGACCAGCATGTAAAAAACAAATTACTAAAGGTG
CTTGTAAAAATAGACAATGCTTATCTCCATCACCATGTAAAAATTTAGATGCAGACCACAGTGAATACTT
ACATTTACTTAGAGCTGTAAGAAAATTACCTAAAATAAAAAAGGTGTTTGTGCGTTCTGGAATTAGATAC
GATTATGTAATGGCAGATAAGAACAATAAATTTCTTAGAGAGTTGATAGAGCATCATGTAAGTGGTCAGT
TAAAGGTAGCCCCAGAACATATATCAGAAGAAGTTTTAAAGTATATGCAAAAACCAGCAGGAAAAACTTA
TGATAAATTTAGACAGAAGTTTTTTGCTATAAATGAAGAATTAGGTAAAAAGCAATATTTGATACCCTAT
TTAATGTCTAGTCACCCTGGTTCTACCTTAAATAGCGCTATAGAGTTAGCAGAGTATTTAAGAGATACTC
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AGGTATTGACCCGCTTACAATGAAGCCAGTTTATGTTCCTAAATCAAAACGTGACAAGGCAATGCAAAGG
GCTTTATTACAATATAGAGCACCTAGAAATTATGATTTGGTATACTCTGCGTTAGTTGAAGCAGGAAGAG
AAGACTTAATTGGTTTTGGACATAGATGTCTTATAAAGCCAAAAAATGAAAAGCCTTATTTTAATAGAAA
TAATTCTAAAAAAAATGTATCTAAAGGAACAAATAAAAACAAAAAAACTAATACAAATAACAGAAGTAAT
AAAAATCAACAAAAAAGTTCAACTAAAAAAAAGAAAAAACATTAA
>ref|NC_013316.1|:1042227-1043222 ABC transporter, substrate-binding lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
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GAAAAGATAACCCTAAAAATAAGGAGCTATCAGTTGTCAAACAAGTAAAAGTAGCTGTTCCAGATGGACT
ACCAGCAGTGGCAATAGCTAAACTTGCAAATGAAAATCCAGAGATTAAAGAAGGATATGAAACAGTGTAT
AGCATTGAAAAGACACCTGAGGCGATTTCCACTAGAGTGATGAAAAAAGATGCAGATATAGCTATAGTTC
CTTCAAACATGGCTGCAATAGCGTATAATAAAACTTCATCATATAATATTGTTGGAACTGTAGGAATGGG
TTCACTTTATTTGGTGTCAACAGAAAATATAAAAGATTATTCTGATTTAGTTGGTAAAGAAGTTGGATGT
ACTGGAAAAGGACTTACTCCAGACATAACTATAAAAAGTCTTTTGTTACAAAAGGATATAAATTATTCAA
ATATAAAATTTAATTATGTAAATTCAGCAAGTGAACTGGTACCATTATTGGCTACTGGTAAAGTTAAGAC
AGGTATTGTTCCAGAACCTGCACTTAGTGCTTTGATGTCTAAAAATCCAGACATAAAAATTATAAAAAGT
TTAAATGACTCATGGAAGGAAGTAAGTGGTTCAAAAGACGGTTATCCTCAATCTACTTTAATTGTAAAGT
CTGAATTTTTAAGAGATAATAAAGATTTTGTTGATTCTTTTGTAGGTCAATTATCAAATAGTATAGATTG
GGCAAACAAAAATCCTGAAGAATTAGGTGCATATTCTGAAAAAATAAAAATATCTACTGAATCAAAGATA
ATAGGAAAATCTCTTGAAAGAGCTAATTTAAAATATATTCCAGTTAAGGACATGATTAAAGATTATAAAA
ATTACTATGAGAAATTAGCTAATTTTGATGATAAGACATTAGGAGGCAAAGTACCAGATGAAGCAATATA
CTTTGTTGAGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1043194-1043979 ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGCAATATACTTTGTTGAGAAATAAAAAAAATAAAGAACAATTTATAGATAAAATGGAGGTAACAC
TTTCTTGTGTTATCCTCTTATTTTTATGGCAAATTATTGCTTTAAAAATTGATAATGATATTTTTTTACC
AACAGTAGGTCAAGTATTTAATAGTATAAAAGAGATTATGCTAAATTCTAGTTTCTATATAGATATACTT
TACTCTATGGGGAGATGTTTTTTTAGTTTTTTACTGGCTATGATTTTTGCCATTATACTTTCAATAGTAT
CTTATTTAAATAGATTTTTTAGAAACTTATTAAAGCCAATCAATGCTTTGACACGTTCAATACCAACTAT
GATATTGGTAGTACTTGCACTTATTTGGTTTGAAAAGGATAGTACCCCTTTTATAGTTGGATTTACTATA
GTTTTTCCTATATTGTATGATAACGTTTTGGGCGCTATATTGAATATAGACAAGAACTTATTAGAAATGG
CTAATGTGTATAAAATAAGGTTTATAGATAAGGTGTTAAAAATTTATTTACCAGCCATAAAATTTCAAAT
TATATCTATACTAGTATCAACATTCTCTTTAAGTTTGAAAGTTGCTATAGCAGGAGAGGTATATAGTCAA
CCTACATATGGTATTGGAACTATGATACAGACTGAAAAAATTAACTTTAATACATCTGGAATATTTGCAT
GGATAATTATTGTTCTTTTAATATCTGCTATTTTACAAATAGCCCAAAAGTTTTTAGCAAGGAGAGCTTT
TTTATGGAAAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:1043967-1044665 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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TTAATATTGATTTTTATGTAAATGAGGTAAATTGTATCCTTGGAAAATCTGGTTGTGGAAAAACTACACT
CTTGAACATAATAAGTGGGATTATTAAAAATGACACCAACAATCTAAATATCAAAGAAAATTTAAATAGA
GTAGGAAATAAGCTTGAAGCTAGTTACATATTTCAAGATGATAGACTTATAGACTGGTTAACAGTAGAAG
AAAATATAAAGATAGTTGTAAATAAATACTATAATAAAACTCAATTAAATAAAATTTGTGATGAATACTT
GGAATTGGTTGGAATTAGTGATTATAAAAAATTCTATCCTCAGATGCTTAGTGGAGGTATTAGACAAAGA
GTAAATATTGCTAGAGCTTTTATATATCCATCAAAAAACATTATAATGGATGAACCTTTTAAATCTATTG
ATGCAAAGAATACACAGCTTATAATGGATAATTTCAGAAATATATTAAGAAAAGAAAAGAGAACTGTATT
ATTTGTAACTCATAATATTGAGGAAGCATTGTTTTTAGCAGATAGGATATTTATTTTAGGAGACTCTCCA
ATTAGAATAAAAAAAATATTAAAAAATTCTAAGGAATTGGAAAAAAATGAAGTTTTGAAGTTGATATAG
>ref|NC_013316.1|:1044788-1045261 putative regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
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TGAAAAGTGAACATGTGGATGGTGTTGAGGTGGCACATGATATAGGAAGAGATGTAAATGAAGTGTATAA
GACATTAGTAACTCAAGGAGTTAGTAAGAATATATATGTATATGTAATACCAGTACATGAAAACTTAGAC
TTAAAAAAGGCTGCAAAAGTAGCTAAAGAGAAAAGTGTAGAGATGATTCATGTAAAAGATATAAATAAGC
TTACAGGTTATATTAGAGGCGGATGTTCTCCTATAGGTATGAAAAAGCTTTATAAAACTTTTGTAAATGA
AAGTGCAAAGAATTTAGATACAATTATTGTGAGTGCAGGAAAAATAGGATATCAAATAGAACTATCTCCA
TTTGATTTACAAAGACTTATAAAAGTAGAATTTGTAGATGTAATAAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1045458-1046297 fumarate hydratase, subunit A [Clostridium difficile R20291]
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TAGGAGAAGATGTTTTAAGTTGTATAAAAGAAAAAGCGAAAAGCGAAAAGAGTGAAGTTGGAAAAAATAT
ATTGAATATATTAGTTGAAAATGCTGAAATAGCTAAAGAAAAAAATATACCAATATGCCAAGATACTGGT
ATGGCTGTATTTTTTGTTGAAATAGGACAAGAAGTTTTAATTGAAGGAGACACACTTACTGATGCTATAA
ATGAGGGAGTAAGACAAGGGTATGAAGAAGGCTACTTAAGAAAATCTGTTGTAAGTCCAATTAACAGAGT
AAATACAAAAGATAATACACCTGCTGTTATTCATTATGATATGGTAAAAGGTGATAAAATTAAAATAGAA
TTTGCAGCTAAGGGATTTGGAAGCGAAAATATGAGTAAGATGAAAATGTTAAAGCCATCAGATGGATTGG
AAGGAATTAAAAAATTCATAATAGATACAGTTTCAGAAGCTGGACCTAACCCATGCCCTCCTATGGTAAT
TGGAGTTGGTATAGGTGGGACTGTGGACAAATGTGCTCAAATAGCTAAAAAGGCACTTTTTAGAGAACTA
GGTGAATTTAATAAGGACGAAAATATAGCAAAACTTGAAAGTGAACTATTAACAGCTATTAATAAACTTG
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CATAGCAGGTCTACCTGTTGTTGTAAATATAAACTGCCATGCATCAAGACATAAGAAGGTAGTAATTTAG
>ref|NC_013316.1|:1046310-1046858 putative fumarate hydratase, subunit B [Clostridium difficile R20291]
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TGAGTGGTATACTTTATACAGCAAGAGATGCTGCTCATAAAAGATTGATAGATTGTATAAATAAAGGTGA
AGAATTACCATTTGACGTATATGGTCAAGGAATATATTATGTAGGACCTACTCCTACAAAGCCAGGAGAA
GTTATAGGTGCTGCAGGTCCAACGACGAGTTATAGAATGGATGATTTGACTATACCTCTTTTAGAAAGAG
GTCTTAGATTGATGATAGGCAAGGGAAAAAGAAGTGATGAAGTTATAGAAGGTATGCAAAAATACGGAGC
AGTTTATCTTGCTGCAATAGGAGGAGCTGGAGCGTATATTTCAAATTCAATAAAATCATGTGAAATTATT
GCATATGAAGATTTAGGAGCTGAAGCTATAAGAAAGATTGTAGTAGAAGACCTTAAACTTACAGTAGCAA
TAGATAGCTATGGAAATAATATATATGAGCAAGGTCGAGCAATTTATGAATGTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1046924-1048105 NAD-dependent malic enzyme [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTAAGGATTATGCAAAATTGGCATTAGAAATGCATGAAATCAACAAAGGGAAAGTAAGTGTAGAAA
GCAAGGTAGAAGTTAAAACTAAGGATGATTTATCAACAGCATATACACCAGGGGTTGCTGAACCTTGTTT
AAAAATACATGAAAATCAAGATGATGTTTATATATACACTTCTAAAGGGAATCTAGTAGCAGTAGTTAGT
GATGGAAGTGCTGTACTTGGATTAGGTAACATTGGTGCTGAAGCATCTATACCTGTTATGGAAGGTAAAG
CTATATTATTTAAACAATTTGCAGATGTAGACGCTTTTCCAATATGTTTAAAGACTAATGATGTAGATGA
GATAGTTAAATCTGTAGAGTTGATGGAGCCTGTATTTGGAGGTATAAATTTGGAAGACATATCTTCTCCA
AGATGTTTTGAGATAGAAGAGAGATTAAAAAAATCTTTAAGTATACCTGTTTTTCATGATGACCAACATG
GGACAGCAATAATAGTTGCAGCAGCCATAATAAACTCAATAAAGTTAATTGAAAATAAAAAAATAGAAGA
TTTAGAAATAGTTATAAACGGAGCAGGAGCTGCTGGTATAGCCATAGCAAAGATACTACTTAATATGAAT
GTTAAAAATATAATCTTATGTGATAGAAGTGGAGCATTGGAAGCTAGTATAGAAAATCTAAACTATGTTC
AAAAAGAAATGTTAAAAGTAACAAATATAAGAAATGAAAAAGGACCTTTAAAAGATATTATAAAAGGAAA
AGATGTATTTATTGGTGTTTCAGGTCCAGGAGCTGTTACAAAGGAAATGGTTGAAAGTATGTCTGAGAAG
CCAATAATATTGGCAATGGCAAATCCTACTCCAGAGATAATGCCAGAAGAAGCAAAATTAGGTGGAGCAT
TTATAATGGGAACAGGTCGTTCAGACTTCCCTAATCAAGTCAATAATGTACTGGCTTTTCCTGGAATATT
TAGAGGAGCATTAGATGTTAAGGCTAAAGAGATAAATGAAGAAATGAAGATAGCTGCTGCATATGCAATT
GCTAATACAATAAGTGATGAAGAAATATGCCCAGAGTATATATTACCAGATGTATTTAATAAGAATGTAG
TAAAAAATGTTGCTAAGGCAGTTAAAGAAGCAGCGATAAAAACTAAAGTAAATAGAATATAA
>ref|NC_013316.1|:1048278-1048541 hypothetical protein CDR20291_0859 [Clostridium difficile R20291]
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ATAAAGATGGAAGTAAAAGTACTGATTATTGTAGTTATTGTTTTAAAGATGGTGAGTTTACAGCTGATAT
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>ref|NC_013316.1|:1049067-1049750 hypothetical protein CDR20291_0860 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCAGTATATTGTTAGTTGAAGATGATTTAAGCTTGATATATGGATTAGAGTTCTCTATACAAAAAA
GTGGATTTAGTATAGACATAGCAAGGACAGTAAAAGAAGCTATGCAAATGTATGAGGAAAAAAATTATGA
CTTATTGCTTTTAGATGTATCCCTACCTGATGGTAATGGATTTCAGATTTGCGAAAAAGTACGAGAGGTT
TCTAATATACCCATTATATTTTTGACTGCTTCAGATGAAGAGGTAAATGTAGTGATGGGTCTTGATATGG
GTGGCGACGATTATATAACAAAACCTTTTAAATTAAATGAATTAATTTCAAGAATAAAAGCATTACTTAG
ACGTTATAATGTTGCAAGTAATGTGAATGAATTAAGTTCAAATAATATTACTATTAAATTACTTGAAAAT
CGTGTTTTTAAAGGTGAATTTGAGGTGGAACTTACTACAGCAGAATATAAATTATTGTGCTTATTTATGA
AAAATAAAAATATTGTACTTACTAGAAAAAACATATTGGACAAGTTATGGGATGGAAATGGTAGCTTTAT
AGATGACAATACATTATCAGTATATGTAAGACGATTGAGAAATAAAATTGAAGATAATCCTGAAAATCCT
AAGTTTCTATTGACCGTTAGAAGAATGGGTTATAAGTGGAATGTAATTAAGTGA
>ref|NC_013316.1|:1049761-1051002 sensor protein [Clostridium difficile R20291]
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TTATAGTAGGGCAAATAGTGGTTATAAGTATAACTAACAATTATAAAAAAACGTTGATAGAACATGATTA
TAATATAGCTGGATACTTATATAGTATAGGTGTTGATAAATCTAAAATACCATCAGCATTTGTTGCACAT
GAAGATAAATATATTTTAAAAGGAAAAGAAATACTAGATACAGCTGGATATGGATTTGATATAGATGTTA
GCTTTACACCAAGTGTAAAATTGTTTCAAAGTAAATATATAAAAACTATGTCTATCTATTTATTAGTATT
TTTTACTATGATTATTTTCATACTATATATGTATTTTTTTAGGCAACAAAGTAAGATAGAAGAGGCTAGT
TATAAAATTGATTTATTTATGAATGGAAATATAAATGAAAGACTAAATACATATGAAGAAGGTAGCTTAT
CAAAATTATTTAGTTCAATAGATGTTATGTCGACATCTTTAAATACACATATATTAAAAGAAAAACAGAG
CAGAGAATTTCTTAAAAATACAATTTCGGATATATCGCATCAATTAAAAACTCCACTTACAGCTTTAATA
ATGTACAATCAGATACTACAAGAAGAAAGTCATAATAGTGATGTCGTTGAAGCTTTTGTACAAAAAAGTC
AAAGTGAACTAGAACGCATTGAAACATTGATTAAGAATTTACTAAAGATTACAAAGATAGATTCAAAAAC
AATAGTTCTCAATAAAAATAATGTTAATCTTAAAAATTTAATTGTCAAAATTTTGTATAGCTTTGAAACT
AGGGCAGAAAAAGAAGGAAAGGTTATTTCTATAAATGGTTCAGAAAATACATTGTTGTTCTGCGATTATG
AATGGATGTCAGAGGCTTTAAGTAATCTTATAAAGAATGCATTAGATAATACAAAAGAGAATGATAAAAT
AACGATAGAGTGGTTTGAGACGACTATAACCACCATTGTTTCAGTTAAAGACACTGGAAATGGAATCCAT
GTTGAGGATATTCATCATATATTTAAAAGGTTTTATAGAAGTAAGTTTTCAAAAGATAATCAAGGTTTAG
GACTGGGATTACCACTAGTTAAATCTATTGTGGAACAACATAATGGTACTATTTCTGTAGAAAGTAAACT
ATCACAAGGAAGTACATTCACCATAAGTTTTTTAAAGCTTACTAATATGTAA
>ref|NC_013316.1|:1051074-1051757 predicted abc transporter, atpase component [Clostridium difficile R20291]
ATGGATATTCTTGTGGTTAATAATTTATGTAAAACATATGGAAATGGATATACAAAAGTAGAGGCATTGA
AAGATGTATCCTTTACAGTTTCAAAAGGAGAGTTTGTGACTGTAGTTGGAGAATCTGGTTCAGGAAAGAG
TACACTATTAAATCTCTTAGGAGGTCTTGATACTCCAACATCAGGGAGAATATTTATTGATGGTAAAGAA
ATATGTTCAATGAAAGAGGAAAAACAGACTATTTTTAGACGTCGTAACATAGGGTTTATATTTCAGGCAT
ATAACCTTATACCAGAACTAACTGTGGAGCAAAATATAATATTCCCATTGTTATTAGATTATAAAAAACC
AGATACTATTTACTTAGATGAAGTATTGACTATTTTAGGTCTTAAAGATAGGAAAAATCATCTTCCAAAT
CAATTATCTGGTGGTCAACAACAGAGAGTTGCAATTGGAAGGGCTTTGATTACAAAGCCAAGTATTATAC
TGGCAGATGAGCCAACGGGAAATCTTGACAGTAAAAATAGTAATGATGTAATTTCACTTTTAAAAGTGAC
TGCAGAAAAGTATAATCAAACCATTATTATGATAACTCATAATACGAATATAGCTTCTACAGCAGATAGA
ATACTACAGGTTTCTGATGGTGTGCTTACAGACCTGGGGGTGAATAGAGAATGA
>ref|NC_013316.1|:1051754-1054084 hypothetical protein CDR20291_0863 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAGCTACTTAGAATTAGTACCACAATATGCAAAAGTACATAAGAAAAAAAATAGAACTACAATTT
TATGTATTATTATTGCAGTATGCTTAGTTACTGCTATCTTTGGACTTGCAGATATGGCTATACAATGTCA
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TCAGAAATAAATAGTAGAGTAGATATAGCTCACCATGGTAGGGGGCAAGTCGTTGACAGTGGAGAGTTTA
AATCAAAGGAGATTTTGATACAAGGTTTAGATGAAGAAGTAGCAAAACAATTTAACTTAGAAATAATAAG
GGGTCGTTATCCTATTGGGGAGAATGAGACTTTAATAGATGAGGATGCAGTTAAAAGCTTTAATCTAAAA
ATAGGAGATTTTATCAAAATAAAATTAGCAGATGGTAGAAATAAAAATTATAAGATAGTAGGTGAATATT
CATCAATATCAAGCTTAAGAGCTACAGATAAACATGGATTAATACTTTCAATATTGGGTACACAAGCTAT
TAAAAAATCAGAAACGTACGATTATTATTATATTACATTTAAAGAAAAGGTTAATATTAGAAAAGCCACT
TCTGATATTAAAAATACCTTCAATTTAAGTGATAAACAAATCGGTAAAAATGAAAGATTACTTTCTATTA
TAGGTCAAGGCGACTCTGACTTTTCTAAACCACTGTATTTAACAGCAGGATTACTTTTTGTACTTGTTTT
AGTAGCAAGTATTATCATGATATATAATAGTTTTAACATGAGTGTAATTGAGAGAGTTAAATTTTTTGGT
CTGTTACGTTGTCTAGGGTCATCAAAACATCAAGTTAAAAAATTTGTTGTTTTAGAAAGTTTAATTTTAA
GTATAAAAGCTATTCCAATAGGCTTAGTATTAGGAAGTCTTGTAACTATTATATCTTCTATATTTCTTAA
GTATGTTAATGAGTTATTCAGCTCAATGCCAATTTTAAAAGTTAGTTTTATTGGTATTGCATTTGGAATA
ATTGTAGGGTTTTTAACTGTAATATTATCAGCTATTATTCCAGCAAAAAAAGCTTCCCGTGTATCTCCAC
TTAGCGCTGTACGTGGGAATCTAATGTCCAAAGAAATTTTAAATAACGGGAAGACAAGTAAAGTTGCAAA
TACAGGAAGTTTTAAAATTGAGACTTCTATGGGATTAAATCATGCTTTTTCAAGAAAGAAATCTTTTGTA
CTTATGACTTCTTCATTTGCCATTAGTATTATACTATTTTTAGGTTTTAGTGTGCTTATAGACCTTATGT
ATCAAGGACTTAAGCCTATGAAGCCAGAAGCTCCTCATATATCTATTGTTGACCCTAATTTTAAGTCTGT
TTTAACTAAGGAAGATATTAATGAAATAAGCAATATCAAAGGAGTAAAGAAAGTATACAGTAGAATGATG
ACGGATATAGAAGCTACATATAATGGGAAGAAGACAAAATCACAATTAATTTCTTATGAAAAGTATCAAT
TTAATTGGGCAAAAAAATATCTATTAAAAGGAGAAGTTAATGAAAATAAACTACAGTCAGAAAACCTTGC
ATTAGTAGAAGAGGGGCATGGATTTGATATAGGAGATAAGATATATATTAAAAATAGAAATGCTGAAAAA
GAGTTAGAGGTAGGAGGTATACTTTCCTCAATTCCATTTGAGGCTAAAGATAAATATATTGGAAATATTA
TAACATCTGAAAATACTTTTACGAATATAACAGGTATAAAGGGTTATATAATAATGGATATTCAGGTTGA
TAAAGATACTCCTGGAGATTTAATTGAAAATATAAGACGTGTAGTAGATGATAACTTAGAGGTCAGAGAT
AAAAGACAAAGTAACTTAGAGGTTAAAAATTCGTTTTATACTATGGCAACATTTGTATATGGATTTGTGT
TTATTATTGCGATTATAAGCATGTTTAATATCATAAATAGCATGAATATAAGTGTTACAAGTAGAAAGAA
TTACTATGGTGTTATGCGTGCAGTAGGCATATCCAACAGACAATTAAGAAGAATGGTAATAGTAGAGGCA
GGTTCATATGCAATGAGTGGTTGTTTATTAGGTAGTATACTAGGATTAATGTTACATAGGTATATGTTTA
TATCGTTAGTAAGTTCAATGTTTCATTTAGAGTGGCAAGTACCTTTTAATTTACTACTTATCACTGTACT
AACTATGATAATAATAACTTTATTATCAGTAAGAAAACCAGTCAAAAAGATTTGTGAATTAGATATAATA
GACTCAATAAATGCACAATAA
>ref|NC_013316.1|:c1055107-1054265 hypothetical protein CDR20291_0864 [Clostridium difficile R20291]
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AGGTGATGAAGTAAATGCTTTCATATTTAAAGATTCTGATGACAGAACTGCTGCAACTTTAATACCGCCT
TTAGCTAAGGTTGGGGATGTAGCACATTTAAAAGTAGTTGATAATACGGACATTGGTACTTTTATAGATA
TGGGACTTCCTAAAGACATACTAGTTCCTTTTAAAGCTAAGACTTATCCACTATTTAGAGACGAAAAATA
TTTATTTTATATATATTTAGACAAAAGCAAAAGAATTGCTGCTACTACAGATATAGATTCATATTTATTA
ACAGACCATACTTACAATGTAGGAGATATTGTAACTGGAGTTGTATATGGATTTCAAACTAATAATTCTG
CAATGATATGTGTAGACAATAAATATGCTGGTGTAATACTTCATAATGAGTACTTTACTGAACTAAAAGC
TGGTGATGTTCTTGAAAATTTACATGTCATAAAAATATATGAAGATGGAAAACTTGGTCTTTCTCCTAGA
GGAAATAGAAAGGATGAACTTGATACTTTAGAAAATAAGATTTTAAGTTATTTAGAGGGTTCTGATGGAT
ATATGAGATTTAATGATAAATCTGACCCTAAAGATATTTCTATATTATTTAATTCAAGTAAGAAAAATTT
TAAACGAGCTCTTGGAGTGCTTATGAAAAAAGGATTAATTTATCAAGATGAAGAAGGAACTTATCTAAAA
TAG
>ref|NC_013316.1|:1055402-1056136 GntR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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TAGAAACTGGTGAGCTTAAAGAGGGTGATGCAATAATGCCAGAAAGAGAACTTTGCAACATACAAAATGT
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AAAGGGACATTCGTTGCAAAGCAAAAAAAGAAGTATCAGTTTTCAAATGTAAAAGGTTTTACTGATGTTA
TGAAAGAAAAGGGAGTAAACATAAAAACGGATATATTATCCTTTGAGATGGAACTACCAGATGATTTAGT
TAAAAGAAAGCTTGGAATAAGTGATAATACTACAAATATATATAAGATTGTCAGACTTAGATATACTGAT
GGAGAGCCATTTGGATTAGAAATAGTATATCTATCAGAAGAAATGTGTAAAGGTCTAACAAAAGGGATAT
TGGATAATTCTTCATTATATAGGGTTTTAAATGAAAAATATGGCTATAAGATACAAAAAGCTGAACAAGT
AATGGAGCCAGTAATACTTTCAGATGAAGAAAGTAAGCTTCTTGAAACAGATGAAGGTGCTTTAGCTCTT
AAACTTCATAGAAATTCCTATAATAGAGAAGGTAGCCCTATAGAATATACCATATCAATATTTAGAACAG
ATAAATATCAATATGAAATAGTATTGAGTGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:1056146-1057279 N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase [Clostridium difficile R20291]
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ATGAAAAAATAATTGATATAGCTGATAGTGTACCAAAAGATTGTGAAGTTATAGATGCTGATGGAAAATA
TATATCTCCAGGGCTTATTGATATTCATATACATGGAAATATGGGAAAAGATACAATGGATTCGACTGAT
GAATCTATTGAAACAATTTCAAAATCAATTATGAGACATGGAGTAACATCTTTTCTTCCAACTACAATGA
CTATGGATAAAGAACATGTTTATGATGCACTTGAAGTTATTAAAAAAGCCCAAAATAGAAAGCTTGAAGG
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AAATTTATAATAAATTCAAAATACGAATTTATAAAAGAATATAAAGATGTTATAAAAGTTATAACTTATG
CTCCAGAAAAAGATATTGATTTTGATTTTACTAGAGAAATAAAAAGATGTACAGATATAGTTTTATCTAT
TGGTCATAGTAATGCAAATTATGACCAAGCTAAAGAAGCTATAAATTTAGGAGTAACTAATATAACTCAC
ATGTTCAATGCAATGACTGGTTTAAACCATAGAGACCCAGGCGTTGTTGGTGCAGCACTTACAACTAATG
TGTACAGTGAGCTAATAGCAGATACAATCCATATAAATAAAGATTTATTTCAATTTATACTAAATAATAA
AGGGAAAGAAAGACTGATTTTAATAACAGATTCTATAGAAGCTGGTGGTCTTGAAGATGGCAATTATTCT
CTTGGAGGTCAGAAAGTCATAGTTAAGGGTAATGAAGCTAGACTTGAAAATGGAGCATTAGCTGGAAGTG
TGTTGTCTTTAAATAAAATGGTATTTAACTTCTTAGATAATACAAACCTTAAAGTGAATGAAGCAATTAA
TTTAGCTTCTTTAAATCCAGCAACATCTTTGGGAATAAATGACAAAAAAGGAAGCTTAGAAATAGGTAAG
GATGCAGATATAGCTGTATTTGATGAGAATTTAGATTGTAAAATGACACTTTGCTTGGGGGACGTAGTAT
ATAAAAATATATAG
>ref|NC_013316.1|:1057378-1058127 glucosamine-6-phosphate deaminase [Clostridium difficile R20291]
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TAGTTTTAAAACCAAATTCAATACTGGGACTAGCTACAGGAAGTACACCAGTAGGTATGTATAGAGATTT
AGTAAAAAAATACAATGATAATATAGTAGATTTTTCAGATGTGATGAGCTTTAATTTAGATGAATATTAT
AAGTTACCAATATCTAATGACCAAAGCTATGATTATTTTATGAAAGAGAATCTATTTAATCATGTAAACA
TAAAGCTAGAAAATACTCATCTACCAAATGGAATGGCTGATGATATTGAAAAAGAGTGTCTGAACTATGA
AGCTTCTATAGATGCAGCTGGTGGTATAGATGTACAAGTACTTGGAATAGGTCGTAATGCTCATATAGGT
TTTAATGAACCTGATACTAAATTTGCAAAAAGAACTCATGTAGTTGAACTTACAGAGTCTACAATAGAAG
CTAATGCAAGATTCTTTAAATCAAGAGAAGATGTTCCTAAAAAAGCTGTAAGTATGGGAATAGGTTCAAT
ATTGAAGTCTAAGAAAATATTGCTTTTAGCTTCAGGAGAAGAAAAAGCTGATGCAGTATATAATACTGTT
TACGGAGATATAACTCCAGAAGTTCCTGGTTCTATACTTCAACTTCATAAAGACACTATAGTTATAGTAG
ATGAAGCAGCAGCAAGTAAACTGAATCCAAAAGATTATAAATTAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c1058741-1058259 hypothetical protein CDR20291_0868 [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAAATCAGATTCCAACAAAATAAAACTGAATAAAGTATTTCTGAAGGGAGAATTTAAAATGAAAA
AAGCTCTTAGATATCTTTTATTTTTAATCATTCTATTGCTTATATATTTTTTAGCCGTTAAATTAAATTA
TGATTTCTATACTCAATTTCACACTGGTTATATGCAAGACTTTAAAAGATACATTTTTATTAATTTAATT
TCCTCTGGTGGTATTGGTTTGTTACTAGGAACTGAATTATTGATTAGAGAATACAAAAAGGATGGTAGTT
GGTATATTGATATTCCAAGATTACTTCTTCTTTGTTTTCCATCTTTTTTACTATCACTGATGCCTGTATT
CTTCTTTATGTTTCCAATTGGTAATATCCCAATTATAGGTAATTTTATTATGCTTGATAGAATCCCACTA
AACATAATAATTTTTAACATCTTATTCGGATACTTCTTGATAACGAGTTTTCGTAAAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1059234-1059938 two-component system response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAGTTAATTTATATAGCAGATGATGAAGATAATATAAGAAATTTGGTAAAGACATTCTTAAAAA
ATGAAGGTCATGATGTTATGGATTTTAAAACGGGTGATGAACTTTTAGAACAATTTAATATAAAGGAGTG
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AAAAGTACAGTCCCAATAATCATGCTTACTGCAAGAGATACAGATATAGATTATATTACAGGGATAACCT
TAGGTAGTGATGATTATTTTACAAAACCATTTAGCCCAATGTCTTTGGTTATGAGAGTAAAATCTATATT
TAGAAGGATAGAGTTTGAAAAGAAACAAAATTATGATAAATATAGTAACTCGATAGATATGGAATTAAAA
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CAAATGAATATAATCTATTGACTTATTTGTTTGAAAATATAGATAGAGCAGTTTCCAGAGATGAATTATT
AAACAAAATATGGGGATACGATATAGAAGTTGAGACAAGGGCTGCTGATGATACAGTGAAGAGATTACGT
AAAAAAATTTTAGATACAAATATTTTAATAGAAACTGTATGGGGGTTTGGATTTAGGTTGAAGGAGAAAA
GTTAA
>ref|NC_013316.1|:1059940-1061427 two-component system sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
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AAAATATAAGCATAAAAACTAGGATTTTGTTGAGCATACTTTGTTTGATAATTATAGTATTTATGATAAT
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GTATTAATATCTGTAATGTGTTTTGCTGGAATATTAGCAATATTTACAGCTGTGATTTTATCTGAGAAAA
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CTTTGACTTTTCAGATAAAGAATTAGTAGAGCTCTCAACTGTTATGAATAAGAGTGCTGAGTATCTGGAT
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CTATAAATAAGGGGATAAAATTTATTTATGAATTTGATGAAGAAATGGTTTTATTTGAATGTGATGAAAA
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GTGTGTAAGTATAATCAAAAAAATATAGTTGTGATAATAGAAGATGATGGAATTGGAATCAAGAAAGAAG
ATTTACCTCATGTTTTTGAAAGATTCTATAAGGGAGTAGGGGGAAATCATGGAATTGGATTATCAATAGT
TAAATCTATTGTAAATAAGCATGGTGGGCGTATATACGTAGAAAATGGCAAAAAAGGAGCTAAGTTTACT
ATATTATTTAAATTGTAA
>ref|NC_013316.1|:1061632-1063245 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAACAGCTGATTTTTAATATTACAAATTTAGTAACGGTTGTATTTGAAGCTTTTGTCATCCATA
TGTTTTTATCAGACTTTTTAGGTCAGAAAGAAGGGTATATAAAAGTTGTAAGATATGCTAAACTGGGTTT
TATAATATGTTTAGGATTCTGTAATTTAATAACTTTAAACCCTAAAATCACAATGCCTTTAATTTTTATC
CTTATTTTTTCAACATCATTTTTATATAAAGGAAATTTAAAGACACGATTGTTTACTACTGTTTTATTAA
GTATATTCTTTATACTGTCAGAAATTGTAGTTACAAGTATTTTTGTTTTATTTGTAAAAGAAGGCTTTGA
AATAATGCTTGAAAATAATAGTATAAGAGTATTGGCGACAATTTTATCTAAAATTGTCTTTTTGTTGACT
TGTAAAATTATTTGTCTATTTAAAAAAGATGTACATTTAGATATGCCCATAAAGTATTGGCTCCCTTTAT
TTTTAATACCTATATTTAGTTTATTTCTGTCTGTTTCTATCTTTGATGTAAGTAAATTTTTTAGTCTTGA
AAGTTTAAAATTTCTAAGTTTAATATCTAGTGTTGGCATTTTATATATTAATTTTATTGTATTTTATTTA
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AGGAAGAATTAAGACTTAGTAATGAGTGTTATAAAATTATTGTTGAACAGACTGATTCTGTCGTTTTCGA
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TGTAAGAATATTTTTAAAGAAATTAAAGATAAAGACTTAGTTCATTCTGAAGATAAAGCTATATTTGAAG
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GGAGTAATTGTAGACGTAGATAGTGATATAAAAAAATATGAAGAGTTAAGAACTAGAGCAGAAAGTGACT
CATTGACCAATATATACAATAAAGGTACATTTGAAAAATTAGTGGAAGAAACTATAGTTATGAATACAGG
TGATAAAAAAGATGCATTATTCATTATTGATTTAGATGATTTTAAAGAAATAAATGATAATTTTGGTCAT
CCATTTGGTGATTTTGTACTAAAAACATTTGCTGATAAGATACAAGCTAGTTTTGGTAATAAAGACTTAG
TCGGAAGAATTGGTGGAGATGAATTTGTTGTATATATGCAAGATTATGTTACAGAAGTAAATTTGCATAA
AAAAGCTAAAGAATTAAATAGAGTACTTTCGGATAATTACACTGATTTGAGTTTTAGTTTTGATTCTTCT
GTCAGTATAGGTATTGCAAGGTATCCTCAAGATGGAACTTCATTTTTTGAATTGTTTAAAAATGCAGATA
GAGCACTTTATAGCATAAAAGCATCAGGTAAAAATTCATATTGTTTATTTGAAGAAGAACTATATGTACA
GTGA
>ref|NC_013316.1|:c1064765-1063935 MerR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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CACTTTTCCATTATGATGATATAGGTCTTTTCTCACCAGAATTAAAGAAAGAAAATGGATATAGATACTA
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ATTAAAGCTTATATAGACAAAAGAACACCTAATTTACTAATTGAGCTTTTAGAAAAGAAAACCATTGATA
TTAAAAATGAAATTGAAAAACTAAATAATATTCAAGCTCTAATGGAATCTACTATTTCATTCACTAAAAA
TGCCTGTAATATAGATGCGAATACTATTACTTTAAAAGAACATGAGGAAGAGTACTTGGTCAAAACACCT
ATTACATATAAAGAACAGTTTTTAGGAGATGAGGAAGAAAATTTTTTATATGAATGTATTAACTTTATGG
ACAACTATGAATTGAGTGACTATGGTACGATTGGCTCAATCATTAAAGGTGAAGATATAATTAATAAAGA
CTTTGAATCATATTCATATTTATTTACAAAAGTTAATAAAGAGTACAAGAAATATCCTGTATCAATCAAA
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TATTAAATTTTTTTAATCAGAATAATTTACGTATTGGGGATTTTGTTTATGAAGAATATCTTCTATATGA
TATAAGTGTGCGAGATTCTAACGAATATCTAACTCAAATCTCAGCAGAAGTTAAAATATAA
>ref|NC_013316.1|:1064838-1066565 putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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TACAAACACTTGGAACTTTGTATATACCAACACTTACAGCAAATATAGTAAACAATGGTGTAGTAAAGGG
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TAAAATCACAAGATTTATCAATAAATGATTTTAATAATATAGGTACAGCATCAATGATTACTAGGAGTAC
TAGTGATATTACTTTAATAGGTCAGTCTGTGTTTATGTTTATTCAATTGGTATTACCAGCACCAATTATA
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TTTTATTCATGCTTTCAGCATTTTTAGTTGGTAAAAAGCTTATAAAGTTGTTTAAAATGATGCAAATAAA
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GAGCATTTTGAAAAAAAGAGATTTGATAGAACTGCAATAGATTATTCTGAAACAGCAATTTCAATAAATA
AAGTATTTGCAGTACTTATGCCTATTGTAATGTTAATAATGAATTTAGGTATAGTAAGTATTATTTGGTT
TGGTGGGATGAGAGTCAGTAATGGAAATATGGAGATAGGTCATATAATGGCACTTATTGAATATTGTATC
TTAATTTTATTCTATTTAATCATGGGAGTAATGGTATTTATGTACATACCTAGAGCAGGTGCATGTGCAG
ATAGAGTAAATCAGATATTAGATATAGAACCTGAAATTGTAGATGGAAATGGTCGTAAAGATACTGTCTC
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AATATAACATTTGAAGCAAAATCTGGAGAAGTAACTGCAATTATAGGAAGCACTGGCTCAGGCAAATCTA
CTATTGCAAATATAATACCACGTTTTTTTGAAATTCAATCTGGAGAAATATCTATAAATGGTCAGGATGT
TAAGAAGATTCCTCAAAAAGAACTTAGAGATAAGATTGGATTTGTGCCACAAAAAGCTTTTTTATTTAGT
GGAACAATAGAAGAAAATATAAGGTATGGAAAAGAAGATGCAAGTATTGAAGAAATAAAGCATGCTGCAA
GTATAGCTCAAGCTGATGAATTTATTTCTGATATGGAAGACAAGTATGACTCATTTGTAGCACAAGGTGG
AAATAATTTGTCAGGTGGTCAAAAACAGAGAATATCCATTGCAAGAGCGTTAGTTAGAAAGCCTGAAGTA
TATGTCTTTGATGATAGTTTTTCTGCATTAGATTTTAAAACAGATAAAAGACTTAGAAAAGCGTTGAAAA
ATGAAATCAAAGATTCATCAGCTATAATTATAGCACAACGTATAAGTACAATCATGGATGCTAATCAGAT
TATAGTTTTAAATGATGGAAAAATTGTAGGTATTGGAAAACATAAAGATTTACTTGAAAATTGTGAAGTT
TATAAGCAAATTGCGGATTCACAACTTAGTAAAGAAGAACTTGCATAA
>ref|NC_013316.1|:1066602-1068464 putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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AAGTTAAGGATGCAAAAAAAACTACTAAGAGATTATTAAAATATATGGCAAAACAAAAGTTTAAAATATT
AATTATTTTTATTTCAGTATTGATAAGTTCAGCGCTTACAGTTTTAGCACCTATGGTTATGGGAAAAGCT
ATTGACCAACTATTTAATGGAATAAAAACTGCAGTCCAAACAGGTACAAAATTCAGTGTGAATTTTAGTA
CTATGGGGGGGATAGTATCAATACTTCTAGGGTTGTACTTAATTAGTGCAGTATTTATATATATTCAACA
GTATATTATGTCAGGAGTTGCACAAAATCTAGTTCTTAGCATGAGAAAAGATTTAAGTGATAAACTCAAT
AAACTTCCTCTTAAGTACTATGATTCTCATAAAAAGGGGGAAACACTTAGTATAGTAACAAATGATTTAG
AAAAAGTAGCAGATAGTTTACAAGAAGGATTAATGCAACTTATTACAGCAGTAGTTACAGTAGTTGGTTC
TATTGTAATGATGATAAGTATAAGTGTACCACTTACAATAGTATCAGCTATAACATTACTTGTTTCATTG
GGTATTACTGTTGTAATTGCAAGAAAATCACAAGAAAGATTCTCTGAAAATCAAAAGGCACTAGGAGAGT
TAAATAGCAATATAGAAGAGATATTTACTGGTCAAATAGTGGTTAAAGCATTTAGTAAAGAAAAGGATAC
TATAAGAAACTTTAAAATATTAAATCAAAATCTTTATAATGCAAGTAGAAGAGCACAGTTTTCGTCATAT
GCAATATCTCCAATTATTAGATTTATAAACCTAATTGGCTATGTTATTATAGCAGTTGTAGGTGGGATAT
TTGCATCAACTGGAGCAATGACTCTTGGTAGTATACAAGCGTTTATTCAATATGTAAATCAAGCATCAGA
GCCTACTACAGAAATATCTTATATTGTAAATATGCTTCAAGCAGCAATAGCATCTGCAGAGAGAGTTTTT
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AAGTACAATTTGAGCATGTTAAATTTGGATATAGTGATGATTTTATTCTTATGAAAGATATTAATATCAA
TCTAAATGCAGGAGACAAGATTGCAATTGTTGGACCTACAGGAGCTGGAAAGACAACTCTTGTAAATTTA
CTTATGAGATTTTATGAGATACAAGGTGGAAGAATTACTATTGATGGTGTTAATATAAAAGACTTAAAGC
GTGGAGAACTTAGAACTATGTTTGGTATGGTTCTTCAAGATACATGGCTGTTTAATGGAAGTATAAAAGA
AAATATTGCATATAGTAAGTCAGATGCCACAATGGATGAAATTGTAAGAGCAGCAAAATCAGCAAGAGTA
GACCATTTTATAAGGACTTTACCACAAGGGTATGACACTATATTGACTGAGGATGCTTCTAATCTATCTC
AAGGTCAAAAGCAACTTCTAACAATTGCCAGGGCAATACTTTCAGACCCATCAGTATTGATTCTTGATGA
AGCAACATCTAGTGTAGATACTAGAACAGAGGTAGAAATTCAAAAGGCAATGAATAACTTGATGAAGGGA
AGAACTAGTTTTGTTATTGCACATAGATTATCAACTATTCGAGATGCTGATTTAATATTAGTAATGAAAG
AAGGCACTATTATTGAACAAGGAAGCCATAAGGAACTTATTGAAAAGAAAGGATTCTATGAAGAACTTTA
TAATAGTCAATTTTCAAGTGAATATGATGAAGAAGTTGTATGA
>ref|NC_013316.1|:1068797-1069486 hypothetical protein CDR20291_0875 [Clostridium difficile R20291]
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AATCAAGACTCTATCCAATAATGAAGAAAGATGAAAATGCATCTAAAGATGGAAAATATCTTATTAGGAG
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TTTAGGATAAGATTTTATAATAATAACTGCTCTTATATAAGGTTAGAGAAAAAAATCAAACATTACAACA
TGACATCAAAGCTATCAACTAATTTAACCAAAAAAGAAGTAATAAATATACTAAACAATGATATTGAATT
TCTAAAAGAGTCGACAAATTGTTTATTAAGAGAATTTTATTTGAAATTAAAATGTGAAAGATTAGAGGCA
AAAAGCATAGTTGATTACAATAGAGAAGCTTTTATTTATCCAGTTGGAAATGTAAGAGTTACAATCGATA
GTGATATTAAAACTTCTGTAAATTCGATAGATTTATTTAATAAAGATTTGCCGACTGTTTCGGTAATTGA
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ATTAATAAGACTACTTCTACAGCAGTTTCAAAGTATGCTTCAAGTAGATTATATATTTAA
>ref|NC_013316.1|:1069591-1070277 hypothetical protein CDR20291_0876 [Clostridium difficile R20291]
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TTGTGGACAGTGCTTTAGCACTAGGTTCAGCTTTTTTAGTAGGTTTGTTTATATATATGGTCTATAAAAA
GACTTATATGGGAATTATGTATTCTCGACCATTCAATGTGTCGCTTGTAGCACTTACAATGCTTACAACT
TTTGTAATATTGGCGGTTACTTCAAATGTAGTTTTATCCTTAGGTATGGTTGGTGCTTTATCTATAGTAA
GATTTAGAACAGCAATTAAAGACCCAATGGATTTAGTATTTCTATTTTGGTCATTGGGTTCAGGTATAGT
TTTAGGAGCAGGTTTGATTCCCTTAGCTGTCATGGGTTCAATAATTATGGGATTGATTCTAATATTCTTT
TCAAATAAAACAATATCTGAAACTCCATATATATTGATGGTAAATTGTAATAATGAAGATTCAGAAGATA
TAGCAACTGATAAAATTAAAAAAGTATTTACTAAATATCAAATAAAATCAAAAAGTGTTACACCAGAAAA
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GTAGATGGAGTTACTAATGCAGTTCTTGTAAGCTATAATGGTGACTATGTAGCATAG
>ref|NC_013316.1|:1070294-1072201 hypothetical protein CDR20291_0877 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGATAAAAAATTTACCCTTCTTATCTCTATTATGATTATATTTTTATGTGCTGTAGTTGGAGTTT
ATAGTACATCTAGCAACAAAAGTGTTGATTTATATAGTGATGTATATATTGAAAAATATTTTAACAGAGA
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GAAGAATTTAAGGTTGCAAAAGTAACTGTAGATGGAGATACATATGGAAACGTAGGTATAAGAACTAAAG
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GTATAATACTAGTCAAAGTATGGAAGGGCTTACTCAATTAAATCTTAATAACTGTTACTCTGACCCATCT
TATATGAGAGAGTTTTTAACATATAGTATTTGCGAGGAAATGGGATTAGCGACTCCAGAATTTGCATATG
CTAAAGTCTCTATAAATGGCGAATATCATGGTTTGTATTTGGCAGTAGAAGGATTAAAAGAGTCTTATCT
TGAAAATAATTTTGGTAATGTAACTGGAGACTTATATAAGTCAGATGAAGGAAGCTCGTTGCAATATAAA
GGAGATGACCCAGAAAGTTACTCAAACTTAATCGTTGAAAGTGATAAAAAGACAGCTGATTGGTCTAAAA
TTACAAAACTATTAAAATCTTTGGATACAGGTGAAGATATTGAAAAATATCTTGATGTAGATTCTGTCCT
TAAAAATATAGCAATAAATACAGCTTTATTAAACCTTGATAGCTATCAAGGCAGTTTTGCCCATAACTAT
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GTGGTTTTGGTGGAGGTAGTCAATCTATAGCAATTGATGAACCTACGACAGGTAATTTAGAAGACAGACC
TCTCATATCCTCGTTATTAAAAAATGAGACACACAAAACAAAATACCATAAATATCTGGAAGAGATAGTA
ACAAAATACCTAGATTCAGACTATTTAGAGAATATGACAACAAAATTGCATGACATGATAGCATCATATG
TAAAAGAAGACCCAACAGCATTTTATACTTATGAAGAATTTGAAAAAAATATAACATCTTCAATTGAAGA
TTCTAGTGATAATAAGGGATTTGGTAATAAAGGGTTTGACAACAATAACTCTAATAACAGTGATTCTAAT
AATAATTCTAATAGTGAAAATAAGCGCTCTGGAAATCAAAGTGATAAAAAAGAAGTTAATGCTGAATTAA
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GGTAAGTCAATACCAGGGGTTTTGGAAGTTGCAGAAGATATGAGTAAAACTATAAAATCTCAATTAAGTG
GAGAAACTTCTTCGACAAAGCAAAACTCTGGTGATGAAAGTTCAAGTGGAATTAAAGGTAGTGAAAAGTT
TGATGAGGATATGAGTGGTATGCCAGAACCACCTGAGGGAATGGATGGTAAAATGCCACCAGGAATGGGT
AATATGGATAAGGGAGATATGAATGGTAAAAATGGCAATATGAATATGGATAGAAATCAAGATAATCCAA
GAGAAGCTGGAGGTTTTGGCAATAGAGGAGGAGGCTCTGTGAGTAAAACAACAACATACTTCAAATTAAT
TTTAGGTGGAGCTTCAATGATAATAATGTCGATTATGTTAGTAGGTGTATCAAGGGTAAAGAGAAGAAGA
TTTATAAAGTCAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1072654-1073343 hypothetical protein CDR20291_0878 [Clostridium difficile R20291]
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AGGAATAACTATAGGAACTGCTTCTATAATTGTAGGCTCTATAGTAGTTATTGCTGATGTCGTTCTTGGA
GAAAATGTAGGATGGGGAACTGTTTTTAACATGCTACTAATTGGATTCTTTATGGATTTACTTTTATATA
GTAATTTAATTCCAGAGGCTGATAGTTTATTTGTAGGAATAATTATGTTGATATTAGGATTGGTTCTTTT
GTCTGTTGGAATGGTATTTTATATGGGAAGTGGTTTAGGAAGTGGACCTAGAGATGGTTTGATGGTTGCA
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TTTATCAAAGTGTATATGAGTGGTGAGAAAAAAGCTGCTGTTCAAAATATAGTTAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1073779-1074318 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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AAAGCCACATGAAGGTGAAGAATTTGGATATGTATTAGCAGGTTCAATATATGTCCATATAGGCGAAAAG
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AACTTGCCACCATATGAAAGACAAGTAAACACAGTATTTCAAAAATATGCTTTATTTCCACACATGGATG
TTTATGAAAATGTAGCTTTTGGATTAAAAATTAAAAAGACTCCAAAAGATGTAATAGATGCTAAAGTAAA
AGAGGTTTTGAAACTTGTTGCACTAGAAGGTTTTGAAAGACGACAAGTTGAATCATTGAGTGGAGGACAA
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GAGCACTTGATTTAAAGTTAAGACAAGAGATGCAAATAGAATTAAAGAGAATCCAAAAAAAATTAGGAAT
AACATTTGTTTTTGTAACTCATGACCAAGAAGAGGCTCTTACTATGTCAGATACTATTGTTGTAATGTAT
AAGGGCAAAATTCAACAAATGGGAACACCACAAGATATATACAATGAACCTAAAAATTCATTTGTAGCTA
AATTTATAGGTGAAAGTAACATATTTGATGGAATTATGATAGAAGATTATAAAGTTAATTTCTGTAATAG
AGATTTTGAGTGTGTTGATAAAGGATTCGAAAAAAATGAAAATATAGAAGTAGTAATAAGACCAGAAGAT
ATAAAAATGGTAAAGCCAGAAGAAGGAATGTTAAAGGGGAAAGTTACATCTACAGTGTTTAAAGGAGTGC
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>ref|NC_013316.1|:1075382-1076218 spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGAAAATCTTTTTTAGCATATCCATATGTAGTTTGGAGTGCGATATTTGTAATAATTCCTTTAA
TATTAGTGGTATTTTTTAGTTTTACAAAAGAATCAGGTGGAGGTTATGCCTTTACACTTGAGAATTATAA
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ATATGCCTTATAGTTGGTTATCCAGTGGCATATATAATTTCAAAGGCTCGTGTAAGTAGAAGAGGTTCAT
TAATATTATTGTTTATTCTTCCTATGTGGATGAACTTTCTTTTAAGAACATATGCATGGGTTGCTATATT
AGGAAAAAATGGACTTTTAAATACATTTTTAGGTTGGTTTGGAATACAACCATTAGCAATTTTGTATACT
AATTTTGCTATACTTTTAGGTATGGTGTATAACTTTTTACCATTTATGGTTCTTCCAATATATACAGCAC
TATCAAAGATGGATAATGATTTGATAAACGCTGCTCATGACTTGGGTGCAAATAATATGACAGTTTTTAG
AAAAATTATATTTCCTTTGAGTTTGCCAGGTGTAATGTCTGGAATAACTATGGTATTTATGCCAGCAGTC
ACTACTTTTGCAATATCAAGACTGTTAGGTGGAGGTAAAATAATGCTGGTTGGAGATTTGATTGAACAAC
AGTTTACAGTTGTTGGAGATTGGAACTTTGGTTCAGCTATATCGATATTTATGATGATAGTAATATTAAT
ATCTATGTCTATAATGTCAAAATTTGGAGATGAATCTGACAAAGAAGGCGGTGGGTTACTATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1076323-1076997 putative spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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CTTTATATTATACTATTGTAATAGCTATATTAGCGTCTGTAATATCTACAATAGTAGGAACTATAAGTGC
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AATACAGAGATAGTTACAGCAGTAGCTCTTATGAGCCTGTTTGTATTTGTAAAAATGGAATTTGGATTTA
CAACAATGCTATTGGCACATATAATGTTTTGTTTGCCATACGTTATACTTTCAGTTTTGCCAAAAATGAA
GCAATTACCTGATAATATAGAAGATGCAGCTATGGACTTGGGAGCAACACCTATATACGCTCTTAGAAAA
GTAATTTTACCACAAATAAAACCAGGTATAGTTTCTGGATTTTTAATTGCATTTACTATGTCAATAGATG
ACTTTATAATAAGTTTCTTTAATGCTGGAAATGGTGTAAGCAATCTTTCTATAGAAATCTATGGAATGGC
TAGAAGAGGTATAAAACCTGAAATAAATGCATTATCAACAATAATGTTTGCAGTGGTTCTAGGTTTACTT
TTACTAGCTAATAAAAAAGAATCTATAGTAAGGGGGATTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1076997-1078049 spermidine/putrescine ABC transporter, substrate-binding lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
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GTAATAAAGCAACTGATTCTACAAAAGTTTTAAATGTATATAATGTTGGAGATTATATAGATGAGTCTCT
TATAGATAAGTTTGAAAAAGAAACAGGAATAGATGTTCAATATTCAACTTATGATACTAATGAAATGATG
TATCAAAAAGTAAAGAGTGGTAGTACACACTATGATTTAGTATTTCCTTCAGACTATATGGTAGAGAAAA
TGAAAAATGAAGGTCTTTTGGAAAAATTAGATTTTAAGAATATACCTAATATGAAATATTTAGATAAGAG
TTTTTTAAATCCTGTATACGACAAAACTAATGAATATAGTGTTGCATATATGTGGGGAACTCTTGGAATA
TTGTACAATAAGAAAGAAGTTAAAGACCCTATGGATAGCTGGAATATACTTTGGAATCCAAAGTATAAGG
GAAATATAATGATGTTTGACTCTGTTAGAGATACTATAGGGATAACTCTTAAAAAATTAGGATATAGCAT
GAATAGTGTAAATCCAAAAGAAATAAATGAAGCTAAAAATCTTTTAATGAAACAAAAGGATTTAGTATTG
GCTTATGTAAATGATGAAGGTAAGGATAGATTGCTTGGTGGAGAAGTGGCAATGGGTATGCTGTATTCTG
GAGATGCAGTTACGCTAATGGAGCAAAATCCTGACCTTGATTATGCTATACCTAAAGAGGGAACTAATAA
ATGGGTAGATGCTATGTGTGTACCTACAACAGCACAAAATAAGAAAGAAGCTGAGCTGTTTATAAACTTT
TTATTAGACCCAGAGAATGCAAAAGTAAATGCTGAGTACATTGGGTATTCAACACCTAATACAGGAGCAC
TAAAATTATTAGACCCAGAAATAACTCAGAATCCTGTTGCATATCCATCTAAAGAAGTACTTGATAAATG
TGAAACTTTTGAAGATATTGGTGAAAATATAAAATTATATGACAAGGCTTGGATAGAGTTAAAATCAAAA
TAG
>ref|NC_013316.1|:1078493-1079341 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAGGATAAATAAAAAAATAGATTTATTAATATTGGCTTTGCTCGTTTTTATATTTTTAATTGTTG
GAATAGTAATACTATCGATTAGGACAGAAAATAAATTGAATGTGTTCATAATGTTAGCAATAATTTTTTT
TATAATAATGTTAACTTATTTATCAAATTCAGTAGTGGGGTTGATAACAAGTTCAATAATTATATTTATG
TATACATCCTATATTTTATATAACAATATTACTCACAATATGGATGTTGAATTTATATCATATATGTGGA
TAATAGCAACACCAGTATCTTCAATTATAATGGGTAATCTGAACAAAAGCATAAATGAATTGCAAAATAC
AAATAAAAAACTATCTGAACAGTATAAGGAATTAGTGACTATTGATAGTGAAACTGGACTTAGAAATTTA
AAGATTTTTTATAATGATGTAAATATGGAGATAAGTAAATCTATTAGACATAATACTGATTTTTCTCTTA
TGATAGTAAAATTACCATACTACGGAAACCTACAGACTATATTTGGTGAAAACAAAACTAATAAAATAGT
AAAATATATTGGTTCAAATATTATAGAATGTACAAGAAATGAAGATATAATTTATAGTTTACAAAAAGAT
ATGATAGGGATACTAATGCCAAATACATCTTTGGAAGGTTCGAAAGTTGTTAAAGACAGAATAAAGAAAA
GGATAAAAGAATTAAATTTAGATTTAAACAATAGGGGAAAATATGTAAATATAGATGTCAAAATTGCATT
TTTACAATATAAGAGTAGTTTTGGAGATAGTATAAATTTTAAGAATATAGTTGAAGAGGAACTTCAATAT
GATGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1079334-1080995 putative cell wall anchored protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAAAATATTTAATAAAAGTTTATTAAAATTAGTAATTGTATTATCAATAGTACTGACAATATCAA
ATTTTAGCTTATTTTCATATGCATCAGAAATTACTTCCAGCACAGATAAGGTATTAATCATATATGATTC
TAAGAAAGAAACAGCTTATAATAGAGATATTTTAAATATTATGAGAACTCTATTGGGAAGATTTAGTTCA
GATATAGAGCTATTAAAATTGAGTAACTATGATGGTGAGATAAATGAAAATTATTACAGTCATATATTTA
TTTTAGGAATCAATGAAAACTCATATAATAATGATAAAAACACTAAAAACTTGATTAGTTCCTTAAATTC
ATATAAAGTAACTATATGTTGGTTAGGATATGGTATAGAAAATCTTTTGGAACATAAAAAATACAATTTA
GACTATGTAGGAAAAACAAACAATATAGTTAGTGTAAATTATAGAGGTAAATCATATAACTTGGATGAAC
ATTATGTTTTTAACATTGTAGAATCAAAAGATACAAGTAATAAAGTAATAGGAAGTATTAATGATACCTT
AAATAAGTATCCATATATAATAAATGATAAAAATCTTTTTTATGTATCAAAATTAGATTTAGATGGAGTT
TTATTTTATATATTTTGCGATTCACTTAATGATATTTTTAATATTAAGACGTTTGATAAAGGACGTATAT
TTGTAAGAATAGAAGATGTACATGCTTTTAGAGAACCAAAAAATCTTGTAGAGATAGCGGATTATTTAAG
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TGCATGGATATACTCATCAATACAAGAAAGAAGAAGTTTCTGGAGAAGGGTATGAATTTTGGGATGGTAA
AAAAGATGAACCCTTAAAAGAAAATATGAAGATATTTGTCAAAGATAGAGTTTTGAATGGTCTTAGAGTA
TGTATAGAGAATGGAATTTATCCTCTTGCATTTGAAGCGCCACATTATGCAATGGAATCAGAGGGATATA
AAGAATTAAAAAAATATTTTTCTACTTATATGGGGCAACATCAAAATAATGATAAAAAATTTAGCACAAA
TACATATCCTTATATTATTAGGGATACAGAGGAGTTTAATATATTTATACCCGAAAATTTAGGATATATA
GACCCAGAAGACAAGTTTACTTTTCAAAATATAAAAGAAAATTTAGATAAATTATCTATTGTAAGAGGTT
TTAGTGGAGGGTTCTTCTTTCATTCATATTTAAACATAGAGTATCTAAAAAACACAATAGAATATTTAGA
AAAACAGAATATAGAATTTATGAATTTAAGAGATTTTAATAATTGGGTAAAAGTTGATGAAATACAAATA
AGAAATAATGGAGATGAAATTATAGTCAACTATGATAAGGACTTAGATGAAATAACTAAAAGTGATACTA
GATTTAAATACATATCCAATATTAGTAAAATTTTAATATTCATAGTATCTATAAGTGTTTTAATATTTGT
GATTATATTTATATATTTTAAGAGAATAGATAAAAAGAAATTTTTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1081044-1082300 putative glycosyl transferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAGATTTAAATGTATCAGAGTATTTGTTCGTATTTAGTCTGTTTAGTATATGGTCTTTATTGCTTA
TAAATATTATTTTAGCTATGGGTGGATATATATTTTATTTTAAAAACTTTGATAAAGAAATAAAAGAAAT
TGATGAATATCCTATGATATCAATACTTGTTCCTGCTCATAATGAAGCTAAAGTGATAGGTAGAACTGTG
GAGTCTTTGTTATTACTCAATTATCCTAAGAGTAAGATGGAACTTATTGTTATAAATGACAATTCTTCTG
ATAATAGTAAAGAAATTTTAGAAAATATAAAGGATAGGTACAACAATTATAATTTCACTATAATAAATAC
AGATAGTTTAACAGGTGGAAAAGGAAAGTCTAATGCATTAAATATTGGATATAAGGTTTCAAAAGGAGAT
TTTATAGCTGTTTATGATGCAGATAACACACCAGATAAAAATGCACTTAGATATCTAGTACAAACTATAG
TAATGAATGATGAATTAGGTGCTGTTATTGGGAAATTTAGGACTCGAAATAAAAATAAAAACCTATTAAC
CAAATTTATAAACATAGAAACATTAAGCTTTCAATGGATGTCACAAGCTGGTAGATGGCAACTTTTTAAT
CTATGTACAATACCAGGAACTAACTTTATATTGAGGAGAAGTATCATAGAAGAAATTGAAGGATGGGATA
GTAAAGCAATTGCAGAAGATACAGAAATAAGTTTTAGGATATATAAATTGGGATACAAGATAAAGCTTGT
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GCAAAAGGGAATATATATGTATTAATGAAATATATAAAAAATATATTTAAACAGGGAAGAAATAAGATTG
TGTTTGATATAGCTTACTTTTTTTCTGTATATTTTCTATTTTTAACAACTGTAATTATATCCGATATTTT
ATGTGTTTTAAGTATATCTAAACTAGTAGAAATTTCTATTCCAATTAACTTTTTTCTAATATGGATACTA
TCTTATCTTTTATTTATTATAGAAGTGAGTATAAGCCTTACTATAGAAAAAGGTGAAGCAACAATTGAAA
ATATATTCATAGTTGCAATAATGTATTTTACATACTCTCAACTATGGCTGTTTGTAGCTATAAAAGGGAT
GATAGAGTATCTAAAAGATATAATTTTTAAAAGAGAGGTTAAATGGTATAAAACAGAAAGATTTTGA
>ref|NC_013316.1|:1082323-1084404 putative cell wall anchored protein [Clostridium difficile R20291]
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TAAATGCTGATGAGACTAAAGTTAAAAATTATAAGTTTGAAAGAGATATAACTATTGATGGTGTTATAGG
AAGTAATAGTACTTTTTTTGAAGTAAATAAAAATTGGGATATTGAAGAAGTTTTATTGCATCTTAATTTT
AGTAAGAGCCAAATATTAAATGGAGATGTTTCAAGTTTAACTGTATTGATAAATAATGTACCAATAAAAT
CTATTAAATTAAATGCTAAGACAAATTATAAAAATACATTAGAAGTATTAGTTCCAAAAGATTATATAAT
TCAAGGATATAATGAAATAAAAATAAAAACATACAAAACAATATCTGATAAAATTTGCCAAGATGATTCC
AATACTGGGAACTGGATGGTTATTCACAAAGAATCATATATATCAATTAGATATAAGCAGAAAAAGGTGG
AAAACTCAATAAATGAATATCCGTATCCATATGCAGAAATTGAAAATAATCATAAATTAGATACAACTAT
AGTAGTACCAGATAATATGACTAGAGGAGAGACTACAGCAGTGTTTAATTTGGCATCATCATTTGGAAAA
ATAACAAAAAATGATGATTTAAAGTTAGATGTTAAATTATATTCAGAAATGAAAAATTGGTCAGATGATA
ATATTATATATATTGGTAAACCTGAAAATACAGCAGAAGAAATTTTGGATATTTTAAGTATAAAGGAACA
AACCCTATTATCTTCAAACTGTATAATCAAGCAAGTAGATTCACCATACAATAAGAATAAGAAGATGATG
GTGGTAATTGGTAGTAATGAAGATGATTTAATAAAGGCATCAAATTTATTAATAGAAAATAGACTTTCTA
ACCAAGTTTTATCATCATCAGTGCTTGTAAACAAAGAGACTAATATAAAAATTAATAGGGAACAAAAATT
AAATTTAGGTCATTTAACATTAAAAGACTTAGGATATTCTGACTTTTTGTTGGAAGGAGCATTTAATCAA
CAAGCTTTGTTTGATGTCAAAATACCAACGGGTAAGGTATTAGATGATGGTTCAAAGATTATCTTAAATT
TAAGATATTCTGACAATTTAGATTTTGAAAAATCTTTAGTTACAGTGTCTATAAATGATGTTATTGTGGG
AAGTAAAAAATTGGATAGGTCACATTCTAATAATGATAAGTTAGAATTAAAAATACCTAAAGATATAGAT
AATAAAAACTATTATCAAGTTAAATTGACATTTAATTTGAGTATAAAAAATTCGAATTGTGTTACTAGAG
AGAGTAATAATCCTTGGGCATATGTATCAAATAATTCTTATTTGGCGTTATCTACGAAAGAAAATGAAAC
CTTATCTTTTGAAAATTATCCGTATCCATTTGTTAGAGATGATGAGTTTAATGATTTAACTGTGATAATG
CCAGATTATTCAGGGTCACAAGCTATGACCTGGATGTTTAGATTAGGTGTTACTTTAGGTACGAATATAA
ATTCACATAATGGAAATATAAATGTAATTAGAGGAAAAGAATTTAGTGACAAGTATAAGGATACTAATAT
TGTAGTTTTTGGAGTGCCACATAATAATTCTGTTATAAAGATGTTAAATAATAATTTAAATATAAAGTTC
GATAAAAATTACTCCAATTTTATATCAAATGATAAGATAAGCTTTATTGATGATTATGGAAAAAATATTT
CTACCATTCAATTAATAAAATCACCATATAATAATCAAAAAAATATCATGGTAATTAGTTCAATGAATGA
AAAAAACTTATATTTAGGAATGGATTATTTGTTGAATAAAAGTAAAGTTAATGATTTAAAAGGAGATACA
TTGATAATTGATGAATACGGAGAGGTAGAAGATTTAGCTTATAATTTAAAACCTAAGAAAGAAGTAAAAG
ATTCAAGCTGGAATATGAGTATAAATAAGACAACTAAAGTATTTTTAATGATTTCTTTTATTACTATAAT
TGTAGTCATGATATTATCAATGCTATATATAAAAAAATATAAAAGAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:1085580-1086704 UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGACATCAAGGTTATGACTGTATTTGGAACTAGACCTGAAGCTATCAAAGTAGCACCTTTAATAA
AGGAACTTGAAAAAAGAGAGAATATAAAAAGTATTGTTTGCGTTACAGCTCAACATAGAGAAATGCTTGA
CCAAGTTATAGAAACCTTCAATATAAATGTAGACTATGATTTGGATATAATGGAAAAAGGACAAAGCCTG
AATGATATAACATGTAAGATTTTAAATAAACTTCCCTTGATTTTAAACAAGGAAAATCCAAATATAATAT
TGGTACATGGAGATACAACCACAACTCTAGCTACAAGTTTGACTGCATTTTATAATAAAGCTCTTGTTGG
TCATATAGAAGCTGGGCTTAGAACCTATGATAAATATTCTCCTTTTCCAGAGGAGTTAAATAGACAACTT
ACAGGTATTATTGCTGATATGCACTTTGCTCCTACTAATTTGGCTAGAAAAAACTTGATTTCTGAAGGAA
AACCTAATAATAATATATTTGTAACTGGTAATACTGCTATTGATGCTTTAAAGATGACAATAAAAGAAAA
CTATAATCATCCTATAATTGATGAGATTGGTAACGATAGGATGATTTTGTTAACCTCTCACAGAAGAGAA
AATTTGGGTAAACCTATGAAAAATATATTCAGAGCTATAAAGCGAATAGTAGATGATTTTGAAGATGTAC
AGATAGTATATCCCATACATTTAAATCCTAAAATACGAACTATAGCTGATGAGATATTTGGAAAATTTCC
TGAAAAAATTCATATTATAGAGCCTTTAGATGTAGCTGATTTTCATAACTTTTTAAATAAATCTTATATG
ATAATGACTGATAGTGGAGGAATACAGGAAGAAGCTCCATCATTAGGTAAGCCAGTCCTTGTGTTGCGTG
ATAAAACAGAAAGAACAGAAGGAATTGAAGCAAAGACACTTAAATTAGTAGGTACTAATGAAGATAGAAT
ATATAATTCAGTGAGCGATTTATTAATAAATAAAGATAGCTATGTTCAGATGAGTAAAGCATCTAATCCA
TATGGAGATGGAAATGCAAGCAAATATATAGTGGATATAATAATTAAAAAATTTAATTGCAAATATTTAA
ATTAG
>ref|NC_013316.1|:1086782-1087756 putative mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTAGAAAATTAATAAAAAATTTAGGTAAAAGTAAAAGTGTAAAGAGAGTGAAACTTTTATTTAAGA
AGATTTTTATTACTGTATTCATAGTAGCAAGTATAGTTGCTATTTTTAATATAACGAAATATTTTGAGGA
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GATGGAAAGGTCCAATTAAGTTGGAAGGCCTTACTTGCTATAGACATGGTAATACATGATGAAGATTTAA
GTAATATAAAAAAGAAAGACACATTGGATATAGGGGAAAAGTTTATAGTAGAAGATAAAAATGATAAAGG
CGAAAAGGTGTATAAGGTAAAAAAGTTTAATAAGGTATTAAGCGAATTGAAATTTGACTCTTCTCAAAAA
AGTAGAGCAAGAAAATACATGAAAGATTTGGAATACACATACCTTGGAAATAAACAATTAGATAGTAGTG
ATGAAAAAATTAAATTTATAAAGAAGTTAGAAGACTCAGCTATAAGAGAATATATTGATTATGGAATATT
GCCCTCTGTAACAATTGGACAAGCTATATTAGAATCTGGCTGGGGAAATTCTAAACTTACAAAACAGAGT
AATAATTTATTTGGTATAAAAGCAGATAAAGCATGGAAAGGAAAAAGTGTAGAAATTTCAACTTCAGAGC
ATTATAATGAAAAAATTGTAGCTAGTTTTAGGTCGTATAATTCATTACAAGATTCTGTCAAAGACCACAG
TTTATTTTTAATTAATAATAAAAGATATAGAAAACATGGGTTGTTTGAGGCAAAAGATTATATTAGTCAA
GCTCAAGCATTAGAAAATGCAGGATATAGTACAGCAGAAGATAAAAAAGGAAATCGTATATATGCAGAGC
TATTAATAGATATTATTAGGAGTTATAATTTGCAATTGATAGACAATAAAGTTGAGACAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1093266-1095305 cell surface protein (putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase) [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAATAAGGAGATTAATATGAGAAGAAATACAAAATTATTAACAACAGGGATTCTTTCAATGGCAA
TCGTCGCACCTACAATGGCATTTGCTACTGAATCTAATGCTATGGAAAATAACGCTGATTTAAATATAAA
CTTAGAGAAAAAAAGTATCGTTTTAGGTAGCAAATCAAAAGTCAGTGTCAAGTTTAAAGAAAAACCAGAT
GCAGATAGCATTACATTAAAGTATAAATGCTATGATATGCCATTGGATACAACTCTAAATTATAATCAAT
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AGGGATAACAATAAACAGCAAAAATAATCCTAAAACTTTAAACAAACAAGAACTAGAAAAGATGGGATTA
AATTTAAAAGACTATAATGTAACGCAGGAATGTATAATTGAAGATATAACTTCTAGAAAAGATGTAAATA
AATATTTAAGAAAAACTTCTGCACCTATTACAGAACTTACAGGAAGTGATAGATACGAAACAGCAGTTAA
AATAAGTAAAGAAGGCTGGAAAAATGGTTCAGATAAGGTAGTTATAATAAATGGGGATGTAAGTATAGAT
GGCATTATATCAACTCCACTAGCAACTACATATAATGCTCCAATACTTTTGGTTGAAAAAAATAATGTAC
CTAATAGTGTAAAATCAGAATTAAAGCGTTTAAATCCTAGAGATGTAATTATAATTGGAGATGAGAATGC
TATTTCTAAAACTACTGCTAATCAAATTAAATCGACTGTAAATGCTAGTCAAACACGTCTAAAGGGCTCT
AATAGATATGAGACATCTTTATTGATAGCAAAGGAAATAGATAAAAATCATGATGTGGAAAAAGTATACA
TAACAAATGCTAATGGCGGAGAAGTGGATGCACTTACTATAGCAGCAAAAGCAGGTCAAGACAAGCAACC
AATTATATTAACTGATAAAAATAGTATTACAGACAACACATATAAATGGTTAAAGAGTGAGGATTTACAA
AATGCTTATTTTATAGGTGGACCTCAAATGATATCAACAAATGTTATAAATAAGGTAAATGATATAACTA
AAGATAATGTTACTAATAATAGAGTATATGGAGCAGATAGACACGAAACAAATGCAAACGTAATAAAAAA
ATTCTATACAGATGATGAGTTAGAGGCTGTTTTAGTAGCTAAATCAGATGTACTTGTTGATGCTTTAGCA
GCAGGTCCATTGGCTGCGAACTTAAAATCTCCAATACTTATAACACCAAAGACGTATGTATCTGCATACC
ATAAAGATAATTTAGAAGCTAAATCAGCTAATAAAGTATATAAAATAGGAGGAGGATTGACTTCTAAGGT
AATGAACTCTATAGCATCATCATTATCTAAACACAATACAACTCCAACAGAACCAGGAAATAGTGGGGGT
AAGACAGTTATGATTGACCCAGGACATGGTGGTTCGGACACTGGAACAACAGGTAAACCATTAGGGGGTA
TTAAAGAAAAAGACTATACATTAAATACTTCACTTGCGACAACTGAATATTTACGTTCAAAGGGATTCAA
TGTAATAATGACAAGAGACACAGATAAGACTTTATCTCTTGGAAATAGAACTGCTTTATCTAACTCTTTG
AGACCAGATTTATTTACGAGTATACACTATAATGCATCTGATACAACTGGGAATGGTGTAGAAGTATTTT
ATAAGCTTAAAGATAAAGATGGAGGGACTACTAAAACTGTAGCTACAAATATATTAAATAGAATCTTAGA
GAAATTTAATCTAAAAAATAGAGGTGCAAAAACAAGAACACTATCAACTGACCCTACAAAAGATTATTTA
TATGTTTTAAGAAATAATGATATGCCAGCTGTACTTGTAGAATGTGCATTTTTGGATAATGAGAAAGATA
TGAGTTTACTTAATACATCAAATAAAGTAAAAGAAATGGGTACACAAATAGGTAAAGGCATAGAAGATTC
ATTAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1095797-1097830 cell surface protein (putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase) [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAGTAAGGAGATTAATATGAGAAGAAATACAAAATTATTAACAACAGGGATTCTTTCAATGGCAA
TCGTCGCACCTACAATGGCATTTGCTACTGAATCTAATGCTATGGAAAATAACGCTGATTTAAATATAAA
CTTAGAGAAAAAAAGTATCGTTTTAGGTAGCAAATCAAAAGTTAGTGTCAAATTTAAAGAAAAACCAGAT
GCAGATAGCATTACATTAAAGTATAAATGCTATGACATGCCATTGGATACAACTCTAAATTACAATCAAT
CAACTGGGGCATATGAAGGAACTATCAATTATAACCAAGACCCAGAATATCTAAATGTTTGGGAACTACA
AGGGATAACAATAAACAGCAAAAATAATCCTAAAACTTTAAACGGACAAGACCTAGAAAAGATGGGATTA
AATTTAAAAGACTATAATGTAACACAGGAATGTATAATTGAAGACATAACTTCTAGAAAAGATGTAAATA
AATATTTGAGAAAAACTTCTGCACCTATTACAGAACTTACAGGAAGTGATAGATATGAAACAGCAGTTAA
AATAAGTAAAGAGGGCTGGAAAAATGGTTCAGATAAAGTAGTTATAATAAATGGAGATGTAAGTATAGAT
GGCATTATATCAACTCCGCTGGCAACCACATATAATGCTCCAATACTTTTGGTTGAAAAAAACAATGTGC
CTAATAGTGTAAAATCAGAATTAAAGCGCCTAAACCCTAAAGATATAATTATAATTGGAGATGAGAATGC
TATTTCTAAAACTACTGCTAATCAAATTAAATCGACTGTAAATGCTAGTCAAACACGTTTAAATGGTTCT
AATAGATATGAGACATCTTTATTGATAGCAAAGGAAATAGATAAAAATCATGATGTGGAAAAAGTATACA
TAACAAATGCTAATGGCGGAGAAGTGGATGCACTTACTATAGCAGCAAAAGCAGGTCAAGACAAGCAACC
AATTATATTAACTGATAAAGATAGTATTACAGACAATACATATAAATGGTTAAAGAGTGAGGATTTACAA
AATGCTTATTTTATAGGTGGTCCTCAAATGATATCAACAAATGTTATAAATAAGGTAAATGGAATAACTA
AGGATAGTGTTACTAATAATAGAGTATACGGAGCAGATAGACACGAAACAAATGCAAATGTAATAAAAAA
ATTCTATACAGAGGATGAGATAGAGGCTGTTTTAGTAGCTAAATCAGATGTACTTGTTGATGCTTTAGCA
GCAGGTCCATTGGCTGCGAACTTAAAATCTCCAATACTTATAACACCAAAGACGTATGTATCTGCATACC
ATAAAGATAATTTAGAAGCTAAATCAGCTAATAAAGTATACAAAATAGGTGGAGGATTGACTTCTAAGGT
AATGAGCTCTATAGCATCATCATTATCTAAACACAATACGACTCCAACAGAACCAGGAAATAGTGGGGGC
AAGACAGTTATGATTGACCCAGGGCATGGTGGTTCAGCACCTGGAAATTCATCTGGAGGAATGATTGAAA
AAGATTACAATTTAAATACTTCACTTGCAACAACTGAATATTTACGTTCAAAGGGATTCAATGTAATAAT
GACAAGAGACACAGATAAGACTTTATCTCTTGGAAATAGAACTGCTCTATCTAATTCATTGAAACCAGAT
TTATTTACAAGTATACATTATAATGGCTCAACTAATAAACAAGGTCATGGTGTAGAAGTATTTTATAAGC
TTAAAGATAAAAATGGGGGGACTACTAAAACTGTAGCTACCAATATATTAAATAGAATTTTAGAGAAATT
TAAACTTACAAATAGAGGTATAAAAACAAGAGTACTTCCTAGTGATTCTACAAAAGATTATTTATACGTT
TTAAGAAGTAATGATATGCCAGCTGTACTTGTAGAATGTGCATTTTTGGATAATGAAAATGATATGAGTT
TAATAAACTCATCTGCAAAAGTAAAAGAAATGGGTACACAAATAGGTAAAGGAATAGAAGATTCATTAAA
ATAA
>ref|NC_013316.1|:1098058-1099971 hypothetical protein CDR20291_0893 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATATTTATTTGAAAAAAGTAGTTTAAAAGAATATGGAAATGAAGCTTTAGATAAATATAGAGAAT
TATTAGATAAAACTGATAATAATTCAAGGTGTATTCTTTTATTAGTACCAAACAATAACACAAAGATACG
ATATGAAAGGGCTCTAAGATTAAATTATAGTGAAGAACTGAAAATAACAACATATATAAGTTTTGTGAAG
AAAGAATTAGTTAAATACTGGCCACTAATAATAGAAAAATGTGATGAAATAAATACAAAGGTTGTATCTC
CAACATTTATATCAAATAGTTTAAGTGAATATTTAATAGTGCAAAAAGTTAAGGAAAAAAGGATACAAGA
AGGATATTTTGAAGATATTACAGGAACCAATAAATCCATAGCAAATAGTATAATGACTAACATAAATAAA
TCTGCATTTAATTTAATTGATTTTGATTTTATTGGAGAAAAAATATATTCATCAAAGAAAAATAAAGATA
GTATATATAGATTTTCATACACTCAGATGGATGAAATTATATCATATTATATAAATTCGTTACTATCAAA
TTCAATTTTAGATAATGCATTAAGCATATATTTATACAATCAATACCTACTTAATGATGATTTTTATTTA
AAAAACTTATTTACAGAAGTGAGATATATAATTGTGGATAGTCTTGAAAGCTCAAGTAATGCAGAAGTTG
ATTTTATAACAGAAGCATTGGATAATACATTACAAAGTTATATATATTTTGATTATAGTAGGGATTATTC
TGTATTTAATAATGTGGATATAGACTATATAAATGAGAAAATAATATCAAAAATTAAGCCTAAAGAAGAA
AATATTAAAAAGAAGGAGATTAGAATAGAAGATTTATACTTATTACCTGCAAATATAGAATTAAATCAAT
CAAGTCAATTATACAATGAAATGTTAGATTTAATAAGTGAAAAAGTTATATCTCTTATAGAAGAAAATGT
ATCTCCAAGAGATATAGCAATTATATCTCCTATAAACAATAGTATATTGGAGCATCAAATTAGAGATTCT
TTGATAGAAAAAAATATAGATGTTTTTAGTACTAAGAAGGATAAAAAAGCTGTAGATTATCCATATGGGA
ATGCATTGGTAGTGGCTACATGTATATTTTATGGATATTTAGATTTTATAAAAGATGATGAATACTTAAG
CTTTTTAGAAACTCTTTTAGAAATAAATAGGATAAAAGCATTTAAGATTTTTAATGAAACAAGACATTTA
AGTATTGATAATATAGATGAACATAGTCAGTATCGTGATATTTTACAGTATATTGAAGAAAAAAAGAAGA
GTGATATAAAAATACATGAATTTTTAACTCAATTTTACATAGATAAAATGTTAAATTTAAAAGAAGGTAA
AAAGAATGTTGGGTTATGTAAAAAGATAATAGCTGAAAGTGAGTCTTTTAGTGAAAGTTTAAGTCTACTT
AGGATGAAAAAAGAAAAGATATTTATAGAAGCTTTAAAAAGTACAATAAACGATTATTACTCTGTTGTCG
ATATAGAAGAGTTGAAATCCAAAGACAAAATAGTAATAACTACTCCTTATTCATATATATCATCAAATAT
AGATAGAAGTATACAAATATGGGTAGATATAGGAAGTAATGCTTGGAATATGAAAATAGAAAAAGATATA
AGTAATTTAATTGTACTTAGAAAATCTTTTGAAGAAAAAAAGATTTATACAAATGAAATGGAAGAATATT
ATAAAAAATATTATCTATACAATACAGTATATAATTTGTTATTAAATGCAAAGAAAATCTATGCATTTAA
AAGTGAATATGCGATTAATGGTTATATCCAAGAGAGTATATTATATAGTATACTTTTAAAAATCTCACAT
AAAGGAGATAAAAATTATGATTAA
>ref|NC_013316.1|:1099964-1102183 putative helicase [Clostridium difficile R20291]
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AGAAAGATTCTTGAAGAGAATAAAATAGATGATACTAATTCGTATGAAGTAATGACTATACACAGTTTGG
CTGTAAAAATAATAAAGGAAAAGCCAGAAGTTGTAATGTTAAGTGAGGATTTTAACATAGCTGACGATTT
GCAAAAAAGTATTATATTAAATGAATGTATAAGTAGATTTAGATTTGAAGGTGGAGAAAGAGCTTTTAGA
TGGTTTTTAAAGGAGCAAAAAGATGAACGCTGGAAAGAAATAGCTCTTGAAGCCTGGGAAAGAGGTTTTT
TTGAATTTGCAGGAAATGCAATAAGTGAACTTAAGTATAAGGGAATTTCTCCAGATAAACTTGAAGAAAT
ATTGTCAAGAGGACACAAAGGAATGCTTAAAATTATTTTACCAATATATAAATTGTATGATAGAAAATTA
AAGCAAAATGGATTGCTAGATTATGATGATATATTAATTTTAGCAGAAAAAACTTTAAGCTTAGACGAAG
GGCTTAGAAAGAAGTTTCAAACTAGATACAAATATATATTTGAAGATGAGTGTCAGGACTCAAATGAAAT
TCAAGGTAATATAATAAAAATTATATCTAGTGAAAATAAAAACCTAGTTAGAGTTGGAGATATAAATCAG
AGTATAACAGGAACATTTTCATCATCAGACCCTAAATTTTTTAAAGAATTTATAAATAGTGCAGATTTCT
GTTATAGGATGGATATGTCAAATCGAAGTTCAAAAGATATACTTGATTTAGCAAACACTCTTGTCAAGTA
TGTTACAAAGGAATTTAGACAAGAAGAATGTAGACATGCTCTTGAAGATATGCAAATAAAAACTGTGCCA
AATGGAATGGGATATAAAGAAAATCCTAATCCAGAACATTATAATATAAATGTAAAGTGGTATGAGAGTT
GGAAAATTGAAATAGAGCAAACTGCTAGATACGTTAAGGGTATAAAAAATAAATATCCAGATAAAAGTAT
AGGTATATTGGTTCCATTTAATGAACAAGTGACACAAGTTGCTAAAGAACTTAGAGAGAATAATCTAACC
TTTGAAGAATTAGGACCAAATTCTTTGAATAAAAGGAAGGTTATAAACAACATAGCATATATTATTGATT
TTATGTTACATTGTGATGATGTAGAAAAGTTAATAGTTGTACTTAATAAAGTTTTTATAGATACTGATAA
TGAAGAAGAAATAAAGTATTTTTTAGAAGAATTAAAAAACTATTCTACCGAAGAAATTATTTATAATTTT
GAATTTAGTAAGTTAGATAATGATTTAATAGAATTTAAAGAAGAAAGTGACATATATTTAAGTTTTAAAA
GAGGAATAGATATTATAAAACAGATATTAGAATATCCAATAATAAGGTTAGACCTCTTAGTTTTGTTTAT
TGGGAAAAAACTTAATTTAGAAAAAGAAGATAAAGCTGTACTGGATTATATATCTTTTTATATAAAGTAT
CTAATATCAGAAAATATAAATATGGATTTAGAAGATGTATATAATTTATTGTTTGATGTAAAGAATAGGG
TGTTTAATCATATAATAGATGTGGTATATGAGATAAATGGATATGAACCAGAGCCCGGTAGTATAACACT
ATGTAACTATCATAAGTCAAAGGGGATGGAATGGGATTGTGTGTTTTTACTAGGTCTTGTTGAATATAAT
TTCCCTGACAATATTAATCAAAAGTTTCAGAGTGATAAATGGTATCTAAAAGAAAAATATAAAAACCCTA
TGGCAATTATTAAATCAGAAGTTGAAGCTATATTAAAAGGAAGTATTTCAACAGATTATGCTCATAAAAC
GAAGATTGATTCTATAAATGAAAAGATTAGACTTTTATATGTAGGGATTACTAGAGCAAAGGAAATGTTA
GTACTTTCAGGAAGTGCTTATAGAGATGAAAGTGATATAGGGAATAAGAGAAAAGAGCAAAAACCATGTA
TATATTTAAGCAGACTTAATCAACATATTATTGAAAAAAGGTCAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1102292-1103122 hypothetical protein CDR20291_0895 [Clostridium difficile R20291]
GTGAACGATAAATTAAAATATTTTTCTTATAGTCAAAATTCAATCAACACATATAAATCATGTCCATTGA
AATTTAAATATAAATATATTGATAGAATAAATTGGAAAAATGATGATGTTGGTAGTAGAGAGTATTATGA
AACTTTAAAAACAGGAAGAGATTTTCATTTGATTTGTGAAAGATATTTTAGCAATATACCTCTTGGAATC
TATTTTAATGAGGATGATAAAAATAGTAAAAAGTTTTTAAAGTGGATGGAAAATATAAAAAAAGTTGTTC
CTATTGAAAAAGGAAAAACGTATTTGCCAGAATATGAAGTAAGGATGACCTTAAATGGGGATATAATACA
GGCAAAGTATGATTTAGTTGTAATTGGAAATAACAATATAGAAATATGGGATTGGAAAACCGAGTCTAAA
AAGATTGACTATAAACACGTAGAAAATAGAATACAAACTATTGTTTATATGTTTTTAGCAAAAGAAGTAA
TACCTAAAGTTTTAAAAATGGACATAAATGTTAAAGATATAAATATGAGATATTATCAACCTGAATTTGA
TGACTTACCAATTACCATTTTATATGATGAAGAAAAACATGAAGCAAATAGAAATAAAATTCAAAATTAT
ATAAGTATGATAAAAAACACTAATTATGAAGAACATACATACGAAGACAATCTATACAATGATATAGAAA
AGGTATATAATAAAGAAGAACGTATGTGCTATAGAAATAAAAAGCATTGCAAGTATTGTGAATTTAATAA
GTTATGTAATGGCAAAGAAATAGATTATAGTATTTTGGAGGCGGAAATTTATGGGACTTAG
>ref|NC_013316.1|:1103112-1106579 ATP-dependent nuclease subunit B [Clostridium difficile R20291]
ATGGGACTTAGGTTTGTATTAGGTAGAAGTGGAAGTGGAAAATCCACCTATATACTAGATGAGATTAAAA
AAGAAGCTCAAAAAAATGAAACGACATCAATTATACTTTTAGTTCCAGAACAGTACACATTTGAGGCTGA
AAATAGAGTAAGTAAGCTATTCTTAGGAAAAGAAAAAGATAAGTATCTAAGAGTTAGGGTACTTAGCTTT
AAGACACTAAGTAATATAGTTTTTTCTCAAGTAGGAGGATTGACAGATGTAAATATAAATTCTAGTGGAA
AAGCAATGATGGTATATAGAGCTATTGAAGATGTAAGTGAAGAATTAAATGTGTTTTCAAAATCAAAATC
GCAGTCTGGTTTTGTAAGCTCAATTACAGATATGATATCAGAAATGAAACAATACAATATAAGCCCTGAA
ATGTTAGAAAATATATCTGGAGAATTGGATAATGAAACTTTAAGTTTAAAATTAAAAGATATAAGTAAAA
TATATAATTCTTTTGAAGGGAAATTGCATGAAAATTATGTAGATGCTCAAGATATGTTAACTTCATTGGC
AAGTAAAATTGAATTAAGCAGTTATTTAGATGGAGCTTGTGTTTATATAGATGAATTTACAGGTTTTACA
CCAAATCAGTACAATGTCATAAAGAGTATATTAAATAAGTCTAAAAGTGTTAATATCTCTTTGACTGTAG
ATGATATCAACTATATTGGGTACAGTAAATCTGATATGTTTTCTAGAACGAAATTTACTTATTCAAAATT
GACTCAATTGTGCAACGAAGAAGGCATAAAAATATTGCCACAAGTAAATTTAAACACAGGTGTTATAAAA
AGATTTGAAAAAGTTAAGGAATTACAGCACCTAGAAAGATTTTATAATGCTTATCCATATAAAATATATT
CAAATCCAACTGAAAATATAAAGATAAAAGAGTTTAACAATTTATATTCAGAGGTGGAAGAGATAGCCAG
AGAAATTGTACATTTAGTTAGAGATAAGAATGTAAGATATAGAGATATAACCATTGCTACAAGAGATTTA
AATAGATATGATTTTTTAGTACACTCTATATTTAATGAATATAATATACCAAACTTTATAGATAAGAAGA
GAGAGGCAAAAAGTAATCCAATAGTTATTTTAATTATTTCAGCTTTAGAAATGAAGAATAGACGATATGG
GTATGAAACTATGTTTAGGTATTTAAAAAGTGGACTTATAGGAATTGATAATGATGATATAAATTTACTA
GAAAATTATGTGTTGGCTAATGGGATTAAAGGTAAAAAATGGTTTGATGAAAAATGGGATTATAGAATAA
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TAGAGTATTAGAGCCTATAGTAATTTTACAAGAAAAATTAAGAGGAAAAAATAGAGTAAAAGAAATCTGT
AGATATATATATGAATTTTTATTAGATATAAATATGCCAGAAACTATAGAAAATTTAATAGTAAATTTTA
AGGATAAAGGGGAACTTGATGTTGCAAATCAATACTCACAAGTTTGGGACATAGTAGTGGACATATTAGA
CCAAATGGTGGAACTTATGGGTGATGAAATAATTTCTTTAGAAAAATTTATAAAATTAATAACCTTAGGC
TTTGATGAATATGAATTAGGACTGGTTCCTCCTAGTATAGACCAGGTACTTGTAAGTAGTGTGGATAGAA
TGAAAAATCCAGACACGAAATATTTATACCTAGTTGGAACTACTGATGGTGTGTTTCCACTGATTACAAA
GGATAGTGGAATATTGAGTGATAATGATAGGGAAAGTCTTGGAAACAAAGGAATCGAAGTTGATATTGAT
AGTAAGACTAGGAGTTTTGAAGAACAGTTTCTTGTATATAAAGCTCTTACTTCGACATCTAAGAATTTAA
CCATAACATATCCAATATCAGACCATGAAGGTAAAACGCTTAGACCATCAATAATTATATCAAGACTTAA
GAAGATATTTCCAAATATAGAAAATAAAAGTTATTTAGTGGAAGAAAATAAAAGCACTGATAAAGATATA
CTTAAAAAAATAACGGTTAAATCCCCTACATTTAATGAACTTATAAACGTAATAAAAAATTATGACAGTG
ATGATTACAATACAGAAGAGATTAATAGTATTTGGTTAGATATATATAGGTACTATTTAAAAGATGAAAT
CTATAGTTCTATAACAAAAAAAGTTATAAAAGGTCTTAGTTATACTAATCAAGTTCATAAGATTGAAGAG
AAAAAAATAAGGTCATTGTATAAAAGTAATTCTCTTAGCATATCTAGGCTTGAAAAATATGCTGAATGTC
CATTTGCTTATTTTATACAATATGGTCTAAAAGCAAAAAAGCGTAAAGAGTATTCATTTACACCACCAGA
TTTAGGAACTTTTATTCATAATATTTTAGATAGGTTTTCAAAAGAACTTTTACAAGATAATTTAACTTGG
AGAGATATTGATGAAAAATATATAGAATTAAAGATAGGTATAATAGTTGATGAAATAATTTTAAAGATAC
CAGGATATATATTAAATAGTTCTGAGAGGTATAAATACCTTGCATATAGATTAAAGAATATGTTGACAAC
TGCTATAACTATAATTAGTCAGCAAATAAAACAAGGTTCATTTGAACCAATAGATTATGAAGTTAAATTT
GGCGACAATGGAAAATATCCACCTATAAAAATGGTGTTAGAAAATGGACAAGAAGTAAGTTTAATTGGAC
AAATAGATAGAGTTGATGAATTTGAAGAAGGAGAAAATAAATATATAAGAATAATAGATTATAAGTCAGG
CAATAAGTCCATAAGTCTAACAGAAATATATTATGGTCTACAATTACAATTACTTGTGTATTTAGATGCA
ATCCTTGAAAGTGCAAAGGATGAAGATATAAATATAAATCCAGCTGCAATACTATATTGTAGAATAAATA
ATCCAATAGCAAAATTTAATGAAGATAAAGATGATGAAGAAATACAAGAAGCAATATTAAAAGAACTTAG
AATGAAGGGGCTTGTAGTAAAAGACTCTCACATAGTTAAAGAGATGGATAAATCATTAATAGATGGAGAA
AGGAAAAACTCTTTAGTAATACCAGTAGGTCTTACTAAGGATGGAAATGTAGGTAAAAGTACTTCAGCAA
TAAGCTATGAGGATTTCAAACTGCTTAGAAAATATGTAAGGCATGCTATAAAGGATTTATGTGAAGAAAT
GTTAAGTGGAGAAATACGTATAGCTCCATATAAACATAAAGATGGAACATCATGTGACTTTTGTGATTAC
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AAGAGATAATAAAAATGATGAAAGGAGATGTTAATTAG
>ref|NC_013316.1|:1106579-1110406 ATP-dependent nuclease subunit A [Clostridium difficile R20291]
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CTGCTGCTGCTGGTTCAGGAAAAACAGCCGTTCTAGTTGAGCGTATAATTCAAATGATAACAAGTAGAGA
AAATCCAATTGATATAGATAAGTTATTAGTTGTTACATTTACTAATGCTGCTGCGTCAGAAATGAGAGAG
AGGATAGGGGATGCTATAGGAAAAGCCTTAGATGAAAACCCAGAAAATAAACATTTACAAAACCAACTTG
TTTTATTAAATAAATCTAGTATTACAACAATACACTCATTCTGTTTGGATGTTATAAAATCAAACTTTCA
TAGAATAAACTTAGACCCTAATTTCAGAATAGGAGACCAAACTGAATGTGCTATTTTGAAACAAGAAGCA
ATAGAGGAAGTATTTGAAGATTTATATGAAGAAAGAGATGAGGGGTTTTTAAATTTAGTTGAAAGTTATG
CAGAAAGAGGAGGAGATAAAGAAGTACAAGATATTATCTTGGGAATATATTCATTTGCAATGGCTTCTCC
TGAACCTAAAAAATGGTTGATTGACTCAGCAGAACGATTTAATATTGATGAAAATTTTGATTTTTCACAG
TCTATTTGGGCTAGAGCTATATTAGACACTGTAAAAATAGAAATTAATGGTCTTTGTCTAAATATGGAAA
GGGCATTAAAAGAAGTGGAATCAATAGAAGAATTAGAAACTTTTGCAGAAAAGTTATCCGTTGAATATAA
AAAAATTGCTAACATTTCACAAGCATGTAATAAATCTTGGGATGAGGCATATAAAAAGATGGCAAGTATG
TCCTTTGAAAATTATGTAAAAGGAGTAAAAAGAATTTCAAAAGATGCTCCTTCGTATATAAAAGAATCAA
AAGAAAAGGCAAAAACTATAAGAGATAAGACTAAGAAGTCTTTAGAAAGTATAGTAAGTGCTACATTCAA
TAAAGATAATGATTCTATTAGAGAAGAAATAAAATATCTTTATAACATAGTTAAACCAATATCTAGTGTT
GTACTGAGATTTGAAGAGGAATATAGCAATAAGAAAAGAGAAAAAGGAATAATAGATTTTAACGATATAG
AGCATTTTGCATTAAATATACTTACAGATATAGATGAAAAAGGTAATATTGTACCTTCTGATATAGCCGT
TGGATATAGAAACAAGTTTTATGAAATATTTATAGATGAATATCAGGATAGTAATCTAGTGCAGGAAGTA
CTGCTTAAAGCTGTTGCAAATACAGAAACTCCAAATAGATTTATGGTTGGTGATGTAAAACAGAGTATAT
ATAGATTTAGACAAGCAAAGCCAGAATTATTTTTGCAAAAATATAATAACTATAATGATAAAAAGGGAAG
TTCCCATAGAAAAATAATGCTTTACAAAAATTTTAGAAGTAGAGAAGAAGTTGTAGATGCTGTAAATTAT
ATATTTGAAAATATAATGAATGAGAATATAGGAGAAATTGAATATACAGAAAAAGAAAGACTAAATTTAG
GTGCGAATTTTAATGTGGATACAGACGAGAAATCTATTATTGGTGGAGCAACGGAGATACACCTAATACA
AAAAGATAATAAACTTGATGATGATATTATAAATGATAAAGACGATAGAATTAATAACAAAGAAAATGAA
ATAGAGGAAGAAGAAAAATTAGATAATATACAACTTGAGGCTAGAATGGTTGGAAACATTATCAAAGATT
TAATGAAAGTCAATGAAGATGGAAAAATTCAAAAGGTCTATGATAAGGGAATAGATGGATATAGACCTGT
GGAATTTAGAGATATAGTTATTCTTTTAAGAGCTACATCTGCATGGGCTCCAGTGTTTGCAGATGAATTG
ATGAATATGGATATACCAACATATGCTGATGTTGGAGTGGGGTATTTTGATACGATTGAAATAAAAACAA
TATTGTCATTACTTCAAATAATAGATAATCCAATGCAAGATATACCTCTTATATCTGTATTAAAATCACC
TATATTTGGATTTACACCAGAGGATTTGATTGATATTAGAGTTCAGAGTAAAGATAAAATTTTTTATGAG
GTTTTAAAAAGTACAGCAGAGTATGATGGATTTACAGATTCTCAAAATGAAACTGAGTCTGAGTTTATAC
CAAGTGAAGAGTGCATAAACAAAAGTAAAGATTTTTTAATTAAGCTAAAGGAATTTAAAGAAAAGTCAAT
GTACATGAGTACAGATGAATTTATATGGTACTTGTACACAAGGACTGGATACTATGCTTATGTTGGAGCA
TTGCCAGGTGGAAGTCAAAGACAAGCTAATTTAAAAGTATTGTTTGAGAGAGCAAAACAATTTGAAGAAA
CCAGTCTTAAAGGAATATTCAACTTTGTAAATTTTATAGAGAAATTAAAAAAATCTAGTTCTGATATGGG
AAGTGCAAAAACACTTGGTGAGAATGCAAATGTTGTTAGAATAATGAGTATTCATAAAAGTAAAGGTCTA
GAATTTCCAGTAGTCATATGCTCTGCAATGGGTAAAAATTTCAATACTCAAGATTTTAAAAAGAGTATTT
TATATCATCATAATTTAGGGTATGGACCTCAATTTGTAGACTATGAGAGAAGGATTTCTTTTCCAAGTAT
AGCCAAAGAAGCATTAAAAAGCAAAATAAATATAGAAAATTTATCAGAAGAGATGAGAGTTTTATATGTT
GCATTTACAAGAGCTAAAGAAAAATTGATTATAACTGGTTCTACTAGAAATATACAAGATAGTATAAAGA
GATGGTCAAATGGAATTGAAAGTTTAGATACAATATCACAATACGAGATATTAAAAGGTAAAAATTTTTT
AGATTGGATAATGCCTTGTGTATTAAGACATAGGGATTTATCTAATCTACTAGAAGAAGTAGGATTAGAC
GCAGTTTTTAATGTTGAACATAATTCAAAATGGTATGGAAAGTTGTGGAATAAGAATGATATTTTAGTGG
AAAAGAAGAGTGATGAAGAAAAAGAAAGTATTGAAGAAATTCTTGAAAAAATAGATGTAGATAGTCCGGA
CAGTGATTATTACAGTGAAATAGAAAAAAAATTAAACTATATATATCCATATGAATTTAGTACAAGAAAA
CCTGCTACTATATCTGTTACAGAAATAAAAAAGATACAAAATAATTATGAAGAAGAGTTAATAAATACTA
TATTTGAACAAAAAGTAATATTAAAAAAGCCTCTATTTATTCAAAATGAAGAAGAAAGAGAAAAAATAAG
TGGAACAGAAAGAGGTACAATAGTCCATTTGGTTATGGAGGTTTTAGACTTAAAAAATGTAAGTAGTGTA
AATGATATAAAATCACAAATAAGAGGTTTTGTTTCAAAAGGTATAATAACAGAAAAACAAGCTAGTATAG
TAAATCCATATAAAATATATAAATTTTTTGCCTCTAACATAGGAAAAAGAATGTTGAATGCTGAAATTAT
AAATAGAGAAAAATCAATTTATGCACAAGTAAATATGAAAGACATATATATTTATGAAAAGCTTATAAAC
AATGATGATAAAAAACTTTATGATAATGAAAGTGTCATGTTAAGAGGTATAGTTGATGCTTATTTTGAAG
AAGATAATCAAATAGTTTTGGTGGATTATAAAACAGATTTTGTAAATGAGGAAAATATAAATCAAATAAT
AGAGAAATATAAAAAACAGTTGGATTTATATGCAGATATTATTGAAACTTTAACTGGTAAGTCAGTAAAA
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>ref|NC_013316.1|:1110452-1111663 nuclease subunit D [Clostridium difficile R20291]
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AAGCAAAGTTTTGTGAGGAATTTATAAAAATAGTAGAATCAAATGAAATAGATATGGTTATAATTGCTGG
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GCCAATAATGGTCAGAGGTGTGTATTAATAATTTCAGGAAATCATGATAATCCAGAGAGACTTTCTGCAA
TAACACCTCTAGCACATGAACAGGGGATACTTATATATGGTTATCCATTAAGTGCTACGATAGAAGCTAA
GTATAAAGGGTTTGAAATAACATATGCAACTCAGGGATGTACAAAACTGAATATAAATGGAGAAAATATT
GTGATTGCTACATTACCTTATCCAAGTGAAAAAAGATTAAATGAAGTTTTTTCAAGTGAAGATGAGTTTG
AGAAACAAAAAAATTATTCTGAAAAGGTAGGAGATATATTTAGAAGTTTAGAAGAAAATTTTAGAAGTGA
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CAATTAGGTGGAAGTTTTTTAGTTGAAAGAAAAGATTTGCCAGAAAAGGCTCAATATACTGCACTAGGTC
ATTTACATAAACAACAAAAAGCTTCCGAACGTTTAAATGCATACTATTCTGGTTCTCCACTTCAATATAG
CAAGGATGAAAGAGCGTATACCAAAGGGGCATACATAGTGGATATAAAAGCTGGAGAAAAACCAATAATT
GAAGATGTATATTTTAATAATTACAAACCTATAGAAGTATTTAAATGTAATGGAATAGAAGAAGCACTAG
ATATATGTGAGCAAAATCAAGATAGAGAGATTTGGTCATATTTTGAAATAAATACTGATGAGATAATATC
ACAGAATGAAATTAAAAAAATGAAGGAACTATTAAAAGACATAATAGAAATAAAACCAATAATAACATCT
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>ref|NC_013316.1|:1111638-1115177 exonuclease subunit C [Clostridium difficile R20291]
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GTGTGCGATAAGGCAATTATATCATACGAGTTTGAGATAGGAAGCAAAAACACTAGAAGAAGATACATTG
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GATGGAATTACAGAGGAAGTATACAACAATATAAACCAAGAATTAATAGAGTTAAAAAATTTGGAAAAAG
ATAAGAATAATGCTTTAGACCTAGCTCAAAAATCTTATGAAGAAAGTAAAACAGTATATGAAGAACAATT
AAAGTTAGAAAAAAATGAACTTAGAAAAAATGAGCTTGATTTAAAAAATAGTGAGATAAAAGAAAAGATT
GCTCTTGTAGAAAATGATAGTAACGCTAAAAAGGTAGACCCATACATAAGTTCAGTTCAAAATCTAGAAA
AAAAGATAGATGAAGATAGCTTTGTAGTAAGTAATTTAGAAAAGAAATTAGCAATATTAAATCAGGAGCT
TGAAGTTACAAAAAATAGATATGAAAAAATAAACAAAATTAAGAATGAAGAAGTCCCTAAATTGAGTGAA
GAAAAAATAAGATTGCAACAAGCAATAAAATTAGAAGAAGAGTTAGTTTTATTAGATAGAGAGTTAAAAG
ATCTAAAAGAAAGTGGAATTAATTTAAATAAGACTAAAGTTGAATTAGAAAAAGTAAAGCAGGTGTCAGA
GTCCAGAAAAGATGCAGTTACTAAATCTATAAAAGAAGTTGAAGGAAAGATTGATAAAGTAAATATAAGT
GCAGAATTAAAACAAAAAATATTTCTAGCATATGAATACGAGAAAGATTACAACAACGTATTGGAAGAAA
AAAATCAAAAGCTAAATAAACTAGAAGAAATACTCAAAGAGACAGAAAATATAAATTTAAAAGTTAGATA
TATTGATAAAGATAAGAATGATGTAAATCGTAATTTAGAAAATTTATCACTTCACTTGGATGTTCTTCTT
AAAAAATGTCCTGGTAAGAGTGCTGATTTACTTTTAAAATCTGAATATGTTACTGAATTAAGAAGTAAAG
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TAAGTTTAATACTGAAAGGGAAGTAAATTTACTAAATGAAAAACTTGAAAATAATAGAAAGAATAGAGAT
GACCTAGAAAAAGAATTAGAAGAACTAAAGTATTTAAATTTAGCCTCTGAACTTAGACGTGAATTAAAAG
AAAATATGCCTTGTCCAGTTTGTGGGTCAAAACATCATGAAAATCATAATATAACTAAGTATGATGAAAA
TATATCTTTTGTCAAAGAAAAACTGGAGAAATTAGAAAAAGAAAAAATAAGTATAAGAAACAATATAGAG
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GAATTAGAATTACTAAGTACTGGGCATTCAAATTTATTAAAAAATAGAGACTCACTAGATATTAAAATAA
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GGAACAATATAAAGACCAAAAATCAACACTAAATAAACTATTAGCAGAAAATAAATTTGAAAGTATATAT
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ATTGGAGCTAATCAAAATCAGTTAATAACACTAAAAGACTCTTTAGATAAGATAAATGATTTTAATAAAC
AACTTAAGGTAGTTGAACACAATGTGGACTTATTGGAAGAATTAGATAAATGTGTGCAAGGAAATAAATT
TGTAGAATATGTTTCTACAAACCAATTAAAATATATAGCATTGGAAGCATCAAAACGATTGGATGGAATA
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GGCTGGAATAGGTTCAAAAGTAAAAATTGAATATAGTTAG
>ref|NC_013316.1|:1115308-1116561 putative modulator of ions transport [Clostridium difficile R20291]
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TCTCAGCATCTGAAACGGCCTTAATGTCGTTGAGTAAAATCAGAATCAGATATATGCAAGATGAAGGAGT
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AATAACGTCGTAAATATAGCAGCAACATCCATATCAACATCTTTGTTTATAGGATTAATGGGAGAAAAAG
GAGTGGCACTTGCTACAGCTGTTATGACAGTATTAGTATTAATATTTGGTGAGATTACTCCAAAAACAAT
AGCAGCAAATAATTCAGAAAAGGTTTCTCTATTAGTATCTAAACCTATAAAAGCAATTATATTTATATTA
AGACCAATAGTATGGATATTTAATATAATTACAAATATTATATTTAAATTATTTGGTATAACAAATAAAG
GAGCTAAATCATTCATAACTGAAGAAGAGCTAAAAACTATGGTAAATGTAAGTCATGAAGAAGGCGTCCT
TGAAATGGAAGAGAGAGAAATCATAAATAATGTTTTTGAATTTGGAGATATGCAAGCTAAAAATGCAATG
GTACAAAGAATAGATATGGTAGCTATAGATATGGAAGATAGTTATGATGAGATAATACAGGTATTTAAAA
CTGAAAAATTAAGTAGAATGCCTGTGTATGAAGAAACTATAGATGATATTGTAGGAATACTTAATATAAA
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TTCACGTATGAGTTCAAAAAGATAACACAACTTCTTGAAGAGATGAAACTTGAAAAAAGTCAGATGGCTA
TAGTTGTAGATGAGTATGGTGGAACATCTGGACTTTTAACTATAGAAGATTTAGTAGAAGTCATTGTTGG
AGATATAGAGGATGAATATGATGAAGAAGAGGATGAAATACAAGTTATAAAAGAAGATGAGTATATTGTA
GATGGAAGTACTAAAATTGGTGATGTTAATGAACTTATTGGTGTAAACTTGGAATCTGAGGAGTTTGATT
CCATAGGAGGTTTTATAATTGGACACCTAAGCAGATTGCCAGAAGAAAATGAAGTAATTGAAGTTGATAA
TATAAGATTTTGTATAGAAAGTATAGAAAAAAATAGAATTAAAAAAATAAGAATATATACATAA
>ref|NC_013316.1|:1117852-1119078 peptidase T [Clostridium difficile R20291]
GTGAAACAAAAAGTAGTGGAAAGATTTTTAAAATATGTATCATTTGATACAACATCTAATTCTCAGTGTG
AGAACTGTCCATCTTCAGAAGGTCAAAGAGTTTTAGCTAAGTATATAGTTGAAGAGCTAAAAACAATGGG
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TTCTCCAGAGTTGGAAGAATTTAAAGGTGACGATTTAATAGTCACTGATGGAACAACTCTACTTGGCTCT
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AAAATTTGGAGCAAAATATGCATATACTTTAGATGGAGGAATAGTTGGAGAACTTGAATGTGAAAATTTT
AATGCTGCAAATGCAACTATTACTATACATGGTAGAAATGTTCATCCAGGTTCAGCTAAAAATAAAATGG
TAAATGCTATACATATAGCTGCTGAAATATCAGAAATGTTCCCAGCAGATGAAAGACCAGAAACAACAGA
AGGATATGAAGGATTTTGGCATTTAAATTCTATAGGTGGAAATGTCGAGAATGTAAGTATGGCTTATATT
ATTAGAGACCATTGTAGAGAAAAATTTGAAAATAGAAAATCTATTATGATAGAGAATATAGAAAAAATAA
ATAAGAAATACGATAATAGAGTGGAATTGGATTTAAAAGATTCTTATTACAATATGAAAGAAAAGATTGA
GCCAGTTATGTTTATAGTTGATATAGCTAAAGAAGCTATGGAGGAATTAGGTATAAAACCACGTTTAGTT
CCTGTAAGAGGTGGTACTGATGGAGCAAGATTATCTTTTAATGGATTACCTTGTCCAAATATATTTACTG
GTGGATTAAACTTCCATGGGAAAAATGAGTGTATACCAGTTAGTTCTATGGAGAAAGCTACTAAACTAAT
TGTAAGAATAGCTGAAAAATATGCTGAAAGAGTTTAG
>ref|NC_013316.1|:1119336-1120337 cell surface protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTGCCAAGTTGTGTATATGCAGACACTATTAGTAAAAATCAAAATGCACAGGTAGATATGAACAATT
ATCTTCAAGGTAGAAAATCTCCAAAGGAGGAAAAACTTATTGGTGAAGATAGATTTGATACAGCGATAAA
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GCATTGGCTTCAACTCCTTTGGCAAGTAAATTGGATGCACCAATACTGCTTACAAATAAAAATAGTATAC
CATATAATGTAACAGAGGAAATAAAAAGGCTTAATCCAGCAGAAGTTATTTTAATTGGAAGTGAAGGAGC
TATTTCATCAAGTGTAAAAGAATCTCTTGAAGATATGGAAGTATTAGTCAGTAGAATCGGTGGAGCAGAT
AGAGAAGAAACATCTTTACTTCTTACTAGACAGCTAGATGATACTGGTGATTTAGGTGTCTCAAAAGTGG
CAGTGGTTAATGGGTATAATGGACTGGCAGATGCAACTTCAATATCAAGCCCAGCTGCAAGTGATAATAC
AGCTATAATATATACAGGTAAGGATAGCATAAGAAGTGAGGCAAAGAATTTTATTACACAAAACTCAACT
AAGACATACATAGTAGGTGGGGAGTACAGTATAAGTAAAAAACTTGAAGGACAGTTAGTAAACTCAGAAA
GACTAGCAGGAACAGATAGAAAAGATACTAATGCGAAAGTTTTAGAAAAGTTTTATGGAAAATCAAGTAA
GGTTAATAATATGTATTTTGCAAAAGATGGAAGTGGTAGAGAAGCTGATTTAGTTGATGGGCTTGCTGCT
GGAGTATTAGCATCAAAAACAAAGTCACCTGTAGTACTTGCAAGTGGAAGTTTAAGTAGTGCACAGAAAA
GTTTTATAAAAAAAGTAAAGGCTGATAAATTTGTACAAGTTGGTGGAGGTAAAAATAGTAAACCATATGC
AGAAGCATTAGCCTTACAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c1121324-1120755 putative phosphoesterase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATAGGAATAATGAGTGATACTCATGGTAGCTTACTTTACTTTGAAAAAGCGTTAAATGTATTAT
CTGATTGTGATGTTTTATTACATGGTGGAGATGTCTTATATCATGGACCTAGAAATGATATTCCAGAAGG
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AAATTAGAATTATATTGAATCATGGTTATATAGAATCAGAAGAAGAAATTATTGACAAAGCAAAGAAAAT
GGGTGGTGACATATTAGTTTTAGGACATACTCATGTAAAAAAACTATACATGGATGATAATTTAATAGTA
ATAAATCCAGGAAGTACTTCTATCCCAAAAGATGGAAGCCATTCTGTCGCAATTATAGATATCATAAAAA
CTGATGATGAGGATGAGCTTGAACTTGATATAAACTTAATTGACATCAATACTGGAAATATAATAAATAT
CAATGATTAG
>ref|NC_013316.1|:c1122149-1121349 putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase [Clostridium difficile R20291]
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GAAAACTTATCAATGCTGGCTTTGAAGTGTATTCAGATATTTATCCAGACACAGAGCTTATTATATCAAT
TGGTGGTGATGGCTCTTTTTTAAGAACAGTTAGAGATTTCGATTTTCCTGAGATTCCCATAATGGGAATA
AATACAGGTCATCTGGGGTTTTTTCCTGATATTTTACCAGATAAGATTGATAGCTTTATTGAAGCTTATA
CAAAAAAAGATTATATTATTCAAGAAATGTCACTTCTTAATGCGGAAGTATATACAACTACTAGTGGTTC
TAATATGCTTGCTGTAAATGAGGTTGTTATAAGAGGAGACAAGTCTAGGACTATACACCTAAATTTAAGC
CTTGATAATAAACATATACAAAATTTTAGTGGAGATGGTATGATTATTTCTACTTCCACAGGTTCAACAG
CCTATAACTATTCTGCTGGAGGTAGTATTGTTGATATAAATCTTGAACTTATGCAGATTACACCTTTACA
TCCGATAAATACCAATGCATATAGGTGCTTTACATCAAGTATAATATGTTCAAATGAATCTGTTATAAAG
ATTGCACCAGAATATAGATTTGAAGATTCTGTATTGATTGTCGTTGATGGAGTTGAGCACAGATTTAGAC
AAATCGAAAATATAAAAGTTAGTATATCTGATGCAAAAATAAAATTACTTAGAATGTCAAACTATGAGTT
TTGGCATAGAGTATCTGAAAAATTTTTATAG
>ref|NC_013316.1|:1122251-1123156 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
GTGGGTATAAAAAAATGCATAAGAGGTGAAGATGTGTTTAGCATAAGGAATATCACAAAAAAATTAGGAA
AATTCAAGTTAAATAATATAAACTTAGAGTTAAAGGAAGGGGATATTGTTGGGATTATAGGACCAAATGG
TTCGGGAAAAACGACTTTAATAAAAATTATAATGGGGATTATTGATGCAGATGAAGGTGAAATTGAACTT
TGTAATGAAACTATTGAAAATTCTCCAATAAGCTTTAAAAACAATATTGGTTTTGTATATGATTCTTTAC
AATTTTATCCACATTTAAAGGTTAAGGAATTTAGAAAAATAGTTTCTTTATTTTATAAGAATTTTGATAG
AGAAAAATTTGATGAATACCTTAATAAGTTTGACATAGAAGAAAATATGCATATTGAAAATTTATCTAAA
GGTCAATCTGAGAAGCTTATGTTATCAAGCGCACTTAGTCATAATGCTAAGTTATTGATTTTGGATGAAC
CAACTGCTGGTATAGACCCGATTGTAAGAACTGAAATAATGCAGTACTTACAAGATTTTGTGAAAAATGG
AAGTAGTAGTGTAATAATTTCTACTCATAATACTGATAATTTAATTAAAATTGCTGATTATCTTGTTTTT
ATAAATAGAGGAAATCAGATTTTTACTGTTAAGAAAGAATTAATAGAACAAGAATATAAGATAATTAGGG
CAAATAAAGCAGAGTTAGAAGCAATTAAAGAAAGTATAGTTGGTGTTAAAGAGTATAAATATTATAATGA
GGCACTTGTTAAAGTTGGAGATAGCTTGAAAGTAAAAAGCCTATTGATAGAAATTGATAAGCATAAGGTC
AAAAATCCTACTATAGAAGAACTAATGTATTATTATGTAAATGAGGTGAGAGGATGTTCAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:1123144-1123830 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTCAATTTAATAAGAAAAGATTTAATAATAGGAATTAGTTCAGATGGTATCCGTAATTTAAAGTACA
TATTGCTATTTTTTGTGTTTTATTTTTTCCTTAATTCAATTTCATATTATACAGTAAGTATTGTTGTTAG
TTATTTGATATTTATAAATACATTTGAGTGTGATTATGAAAATGATTCAAGGATTTTTATAAGGAGTATG
CCAGTTAGTATAGAAGATATAGTTTACTCAAAATATTTATTAGGTGTAGGACTAATAATTTCTGTAACAA
TAATTGTGTCCTTACTAAGTAAATTGACATCACTAGTGTTCTTTAGAAATATGGTTTTAAATGATGTATT
TTTTTCTGTAAATATATTTTTAGCAATTTTGACGATTTTACTGCCTTTAATTTTTAAGTTTGGATATGGA
AAAATGAAAGTTTGTGGTTTTATAGTAAGTATTTTAATTTACTTTGTATATGGAAGTCTTTTGAAGATGA
TTAGTATGATTGTATATCAAGTAAAGCATTTTAATTATAGTAAAGTTGGAGGAGTATATCTTTCAAATTA
TGTAACTGATATAGCTAATACTAAGTATATAAATTTATATAGTATGACATTTTTAACAATAATAATTTTT
ATAATATCAATGTATTTTTCTATTAAGATTTCAAAAAAGAATAAGTTTAATTATTAA
>ref|NC_013316.1|:1123882-1124424 hypothetical protein CDR20291_0908 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAAGTTTATAAAAGTTTCATTTTTTATTTTGGGGATTTTTACACTATTCATAGCTATAAATAAAT
TAGTATATAGAGATATGGTAAGTGTCAAAGATTATGAAATAAATCATTTAGAGGAAATTGTTTTTGATTT
TGATAGCAGGAGAAGTAGAGATATCGGTACTATTGTAAGATTTAAAATAAGCAATAATAGTAAATATAGT
TATAAATTAAACAGTGCTAAAATGAAGTTTGAAAATTGTGTGGAAAATAAAAAGGGAATGAATAAGTGTT
CTGCATATGTAAATGTAGATTTATTTAATGAAAAAAATTCTATAACTGAAAGTACTCTGAAATATGGAAT
AAAACCAAATAATCAAGGTTATGTTGATTTTGTAATTCCAAAAGGACTAAATTTTGATTATAGGTACTTT
AATGAATCTGGTATGAGTGTAGAATATAAAGGAGAATATATTGTCAATATTCCAATGGCAAAAGGACTTT
ATCTAGTAGTTGGAAAAAATAATGATACATGGAATGCTAATATTATGGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1124503-1124970 putative regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAATAAGTAATGTAAGAGAGTATTTTAAACAATTTGGCAAGGAAGACAGTATATTAGAATTTGAAC
AATCTAGTGCTACTGTGGAACTTGCAGCTGAAGCAGCTGGGGTTATTCCAGCAAGAATAGCTAAGACACT
CTCATTTAAAATAGGAGATGATGCAATTTTAATTGTGACAGCTGGTGATGCTAAGATTGATAATAAGAAG
TATAAGGCTGAATTTAATTGTAAGGCTAAAATGTTGACACCAGAAGAAGTCTTGGAGTTTACTGGACATG
CTATTGGTGGAGTCTGTCCATTTGGTTTAAAAAATTCTATAAAAGTCTATTTAGATGATTCAATGAAGAG
ATTTGATACAGTATTTCCTGCATGTGGCAGTAGTAACTCTGCAATAGAACTTACATGTGAAGAAATGGAG
AAGTTTTCTAAGAGTGAAAAATGGGTAGATGTTTGTAAGAATTGGTAA
>ref|NC_013316.1|:1125678-1126814 butyryl-CoA dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATTTAAATTCTAAAAAATATCAGATGCTTAAAGAGCTATATGTAAGCTTCGCTGAAAATGAAGTTA
AACCTTTAGCAACAGAACTTGATGAAGAAGAAAGATTTCCTTATGAAACAGTGGAAAAAATGGCAAAAGC
AGGAATGATGGGTATACCATATCCAAAAGAATATGGTGGAGAAGGTGGAGACACTGTAGGATATATAATG
GCAGTTGAAGAATTGTCTAGAGTTTGTGGTACTACAGGAGTTATATTATCAGCTCATACATCTCTTGGCT
CATGGCCTATATATCAATATGGTAATGAAGAACAAAAACAAAAATTCTTAAAACCACTAGCAAGTGGAGA
TAAATTAGGAGCATTTGGTCTTACTGAGCCTAATGCTGGTACAGATGCGTCTGGCCAACAAACAACTGCT
GTTTTAGACGGGGATGAATACATACTTAATGGCTCAAAAATATTTATAACAAATGCAATAGCTGGTGACA
TATATGTAGTAATGGCAATGACTGATAAATCTAAGGGGAACAAAGGAATATCAGCATTTATAGTTGAAAA
AGGAACTCCTGGGTTTAGCTTTGGAGTTAAAGAAAAGAAAATGGGTATAAGAGGTTCAGCTACTAGTGAA
TTAATATTTGAGGATTGCAGAATACCTAAAGAAAATTTACTTGGAAAAGAAGGTCAAGGATTTAAGATAG
CAATGTCTACTCTTGATGGTGGTAGAATTGGTATAGCAGCACAAGCTTTAGGTTTAGCACAAGGTGCTCT
TGATGAAACTGTTAAATATGTAAAAGAAAGAGTACAATTTGGTAGACCATTATCAAAATTCCAAAATACC
CAATTCCAATTAGCTGATATGGAAGTTAAAGTACAAGCGGCTAGACACCTTGTATATCAAGCAGCTATAA
ATAAAGACTTAGGAAAACCTTATGGAGTAGAAGCAGCAATGGCAAAATTATTTGCAGCTGAAACAGCTAT
GGAAGTTACTACGAAAGCTGTACAACTTCATGGAGGATATGGATACACTCGTGACTATCCAGTAGAAAGA
ATGATGAGAGATGCTAAGATAACTGAAATATATGAAGGAACTAGTGAAGTTCAAAGAATGGTTATTTCAG
GAAAATTATTAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1126858-1127655 electron transfer flavoprotein beta-subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGAAGGATTTATGAATATAGTCGTTTGTATAAAACAAGTTCCAGATACAACAGAAGTTAAACTAG
ATCCTAATACAGGTACTTTAATTAGAGATGGAGTACCAAGTATAATAAACCCTGATGATAAAGCAGGTTT
AGAAGAAGCTATAAAATTAAAAGAAGAAATGGGTGCTCATGTAACTGTTATAACAATGGGACCTCCTCAA
GCAGATATGGCTTTAAAAGAAGCTTTAGCAATGGGTGCAGATAGAGGTATATTATTAACAGATAGAGCAT
TTGCAGGTGCTGATACTTGGGCAACTTCATCAGCATTAGCAGGAGCATTAAAAAATATAGATTTTGATAT
TATAATAGCTGGAAGACAGGCGATAGATGGAGATACTGCACAAGTTGGACCTCAAATAGCTGAACATTTA
AATCTTCCATCAATAACATATGCTGAAGAAATAAAAACTGAAGGTGAATATGTATTAGTAAAAAGACAAT
TTGAAGATTGTTGCCATGACTTAAAAGTTAAAATGCCATGCCTTATAACAACTCTTAAAGATATGAACAC
ACCAAGATACATGAAAGTTGGAAGAATATATGATGCTTTCGAAAATGATGTAGTAGAAACATGGACTGTA
AAAGATATAGAAGTTGACCCTTCTAATTTAGGTCTTAAAGGTTCTCCAACTAGTGTATTTAAATCATTTA
CAAAATCAGTTAAACCAGCTGGTACAATATACAATGAAGATGCGAAAACATCAGCTGGAATTATCATAGA
TAAATTAAAAGAGAAGTATATCATATAA
>ref|NC_013316.1|:1127674-1128684 electron transfer flavoprotein alpha-subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGGGTAACGTTTTAGTAGTAATAGAACAAAGAGAAAATGTAATTCAAACTGTTTCTTTAGAATTACTAG
GAAAGGCTACAGAAATAGCAAAAGATTATGATACAAAAGTTTCTGCATTACTTTTAGGTAGTAAGGTAGA
AGGTTTAATAGATACATTAGCACACTATGGTGCAGATGAGGTAATAGTAGTAGATGATGAAGCTTTAGCA
GTGTATACAACTGAACCATATACAAAAGCAGCTTATGAAGCAATAAAAGCAGCTGACCCTATAGTTGTAT
TATTTGGTGCAACTTCAATAGGTAGAGATTTAGCGCCTAGAGTTTCTGCTAGAATACATACAGGTCTTAC
TGCTGACTGTACAGGTCTTGCAGTAGCTGAAGATACAAAATTATTATTAATGACAAGACCTGCCTTTGGT
GGAAATATAATGGCAACAATAGTTTGTAAAGATTTCAGACCTCAAATGTCTACAGTTAGACCAGGGGTTA
TGAAGAAAAATGAACCTGATGAAACTAAAGAAGCTGTAATTAACCGTTTCAAGGTAGAATTTAATGATGC
TGATAAATTAGTTCAAGTTGTACAAGTAATAAAAGAAGCTAAAAAACAAGTTAAAATAGAAGATGCTAAG
ATATTAGTTTCTGCTGGACGTGGAATGGGTGGAAAAGAAAACTTAGACATACTTTATGAATTAGCTGAAA
TTATAGGTGGAGAAGTTTCTGGTTCTCGTGCCACTATAGATGCAGGTTGGTTAGATAAAGCAAGACAAGT
TGGTCAAACTGGTAAAACTGTAAGACCAGACCTTTATATAGCATGTGGTATATCTGGAGCAATACAACAT
ATAGCTGGTATGGAAGATGCTGAGTTTATAGTTGCTATAAATAAAAATCCAGAAGCTCCAATATTTAAAT
ATGCTGATGTTGGTATAGTTGGAGATGTTCATAAAGTGCTTCCAGAACTTATCAGTCAGTTAAGTGTTGC
AAAAGAAAAAGGTGAAGTTTTAGCTAACTAA
>ref|NC_013316.1|:1128703-1129500 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase [Clostridium difficile R20291]
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AAATGAATAGACCTAAAGCCCTTAATGCAATAAATTCAAAGACTTTAGAAGAACTTTATGAAGTATTTGT
AGATATTAATAATGATGAAACTATTGATGTTGTAATATTGACAGGGGAAGGAAAGGCATTTGTAGCTGGA
GCAGATATTGCATACATGAAAGATTTAGATGCTGTAGCTGCTAAAGATTTTAGTATCTTAGGAGCAAAAG
CTTTTGGAGAAATAGAAAATAGTAAAAAAGTAGTGATAGCTGCTGTAAACGGATTTGCTTTAGGTGGAGG
ATGTGAACTTGCAATGGCATGTGATATAAGAATTGCATCTGCTAAAGCTAAATTTGGTCAGCCAGAAGTA
ACTCTTGGAATAACTCCAGGATATGGAGGAACTCAAAGACTTACAAGATTGGTTGGAATGGCAAAAGCAA
AAGAATTAATCTTTACAGGTCAAGTTATAAAAGCTGATGAAGCTGAAAAAATAGGGCTAGTAAATAGAGT
CGTTGAGCCAGACATTTTAATAGAAGAAGTTGAGAAATTAGCTAAGATAATAGCTAAAAATGCTCAGCTT
GCAGTTAGATACTCTAAAGAAGCAATACAACTTGGTGCTCAAACTGATATAAATACTGGAATAGATATAG
AATCTAATTTATTTGGTCTTTGTTTTTCAACTAAAGACCAAAAAGAAGGAATGTCAGCTTTCGTTGAAAA
GAGAGAAGCTAACTTTATAAAAGGGTAA
>ref|NC_013316.1|:1129598-1130443 3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTAGCTGTAATAGGTAGTGGAACTATGGGAAGTGGTATTGTACAAACTTTTGCAAGTTGTGGAC
ATGATGTATGTTTAAAGAGTAGAACTCAAGGTGCTATAGATAAATGTTTAGCTTTATTAGATAAAAATTT
AACTAAGTTAGTTACTAAGGGAAAAATGGATGAAGCTACAAAAGCAGAAATATTAAGTCATGTTAGTTCA
ACTACTAATTATGAAGATTTAAAAGATATGGATTTAATAATAGAAGCATCTGTAGAAGACATGAATATAA
AGAAAGATGTTTTCAAGTTACTAGATGAATTATGTAAAGAAGATACTATCTTGGCAACAAATACTTCATC
ATTATCTATAACAGAAATAGCTTCTTCTACTAAGAGACCAGATAAAGTTATAGGAATGCATTTCTTTAAT
CCAGTTCCTATGATGAAATTAGTTGAAGTTATAAGTGGTCAGTTAACATCAAAAGTTACTTTTGATACAG
TATTTGAATTATCTAAGAGTATCAATAAAGTACCAGTAGATGTATCTGAATCTCCTGGATTTGTAGTAAA
TAGAATACTTATACCTATGATAAATGAAGCTGTTGGTATATATGCAGATGGTGTTGCAAGTAAAGAAGAA
ATAGATGAAGCTATGAAATTAGGAGCAAACCATCCAATGGGACCACTAGCATTAGGTGATTTAATCGGAT
TAGATGTTGTTTTAGCTATAATGAACGTTTTATATACTGAATTTGGAGATACTAAATATAGACCTCATCC
ACTTTTAGCTAAAATGGTTAGAGCTAATCAATTAGGAAGAAAAACTAAGATAGGATTCTATGATTATAAT
AAATAA
>ref|NC_013316.1|:1130515-1131705 acetyl-CoA acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGGGTAATGAATATGAGAGAAGTAGTAATTGCCAGTGCAGCTAGAACAGCAGTAGGAAGTTTTGGAG
GAGCATTTAAATCAGTTTCAGCGGTAGAGTTAGGGGTAACAGCAGCTAAAGAAGCTATAAAAAGAGCTAA
CATAACTCCAGATATGATAGATGAATCTCTTTTAGGGGGAGTACTTACAGCAGGTCTTGGACAAAATATA
GCAAGACAAATAGCATTAGGAGCAGGAATACCAGTAGAAAAACCAGCTATGACTATAAATATAGTTTGTG
GTTCTGGATTAAGATCTGTTTCAATGGCATCTCAACTTATAGCATTAGGTGATGCTGATATAATGTTAGT
TGGTGGAGCTGAAAATATGAGTATGTCTCCTTATTTAGTACCAAGTGCGAGATATGGTGCAAGAATGGGT
GATGCTGCTTTTGTTGATTCAATGATAAAAGATGGATTATCAGACATATTTAATAACTATCACATGGGTA
TTACTGCTGAAAACATAGCAGAGCAATGGAATATAACTAGAGAAGAACAAGATGAATTAGCTCTTGCAAG
TCAAAATAAAGCTGAAAAAGCTCAAGCTGAAGGAAAATTTGATGAAGAAATAGTTCCTGTTGTTATAAAA
GGAAGAAAAGGTGACACTGTAGTAGATAAAGATGAATATATTAAGCCTGGCACTACAATGGAAAAACTTG
CTAAGTTAAGACCTGCATTTAAAAAAGATGGAACAGTTACTGCTGGTAATGCATCAGGAATAAATGATGG
TGCTGCTATGCTAGTAGTAATGGCTAAAGAAAAAGCTGAAGAACTAGGAATAGAGCCTCTTGCAACTATA
GTTTCTTATGGAACAGCTGGTGTTGACCCTAAAATAATGGGATATGGACCAGTTCCAGCAACTAAAAAAG
CTTTAGAAGCTGCTAATATGACTATTGAAGATATAGATTTAGTTGAAGCTAATGAGGCATTTGCTGCCCA
ATCTGTAGCTGTAATAAGAGACTTAAATATAGATATGAATAAAGTTAATGTTAATGGTGGAGCAATAGCT
ATAGGACATCCAATAGGATGCTCAGGAGCAAGAATACTTACTACACTTTTATATGAAATGAAGAGAAGAG
ATGCTAAAACTGGTCTTGCTACACTTTGTATAGGTGGTGGAATGGGAACTACTTTAATAGTTAAGAGATA
G
>ref|NC_013316.1|:1131957-1132802 putative pseudouridylate synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGACTTTAAAAGAAGTTTTATTGGACAAGCTAAATTTCTCAGTTAGGTCATTATCAAAAATGAAGAAGG
AAAAGAGTGTTTTAGTAAATGGAGTATATAAAAAACCAAGTTTAAAGGTGTATAGTGGTGATTTAATAGA
AGTAAAAATAGACGAGGAAAAAGCAAATTTTGAACCTCAAGATTTAAATTTACAGATAATTTATGATGAT
TTTGATATAATTATGGTGAATAAACCTCCATTTATGGTAGTTCACCCAACAAAAAGCCACTATGATAAAA
CAATAGCAAATGGTATTAGTTACTATATAGATAATCAAAAAGAAAACGTAAAAATAAGATTTGTAAATAG
GTTAGATATGAATACTTCAGGGTTAGTTATAGTAGCAAAAAATGCTTATGCACATCATACTTTATCTACA
GCAATGAGTGAAAATAAAGTTGAAAAAAAGTATATAACAGTAGTTGATGGAATTATAAAAGAAAATGAGG
GAACTATAGATGAGCCAATTTATAGACCTACAGAAGATTCAATAAAGAGGATAATAGATGAAAGAGGACA
GTCATCTGTTACTCACTATAAAGTAATAGAAAGACTAGAAAATGCAACTGTATTAGAAGTAAGCTTAGAA
ACTGGTAGAACACATCAAATAAGAGTACATATGGCTCATATAGGTCATGGAATAATAGGTGATGAGTTGT
ATGGTTATGTAGATGAAGAGCTAATAAATAGGCAAGCACTTCATGCATACAAGCTAGAGTTTGAACAACC
AAGAACAAAAGAAAAATTGAAATTTAAAGCAGATATACCAGAGGATATGAAAGAGTTAATATCGAAATTA
AGATAA
>ref|NC_013316.1|:1132816-1133820 hypothetical protein CDR20291_0917 [Clostridium difficile R20291]
ATGATAATACATAAATTTATAATACATGTTTTGGACAAAAATAGTGATGTTCCAATATTAAATGACTTTG
AAGGCAAAGTTAATCAAGAAGTAGATGGTTTTTTCCAGAAAGCTATAAAAAGAATTGCAAAAGATGAGGA
TTTAAGAAAAGGTGTTTTTAAAGATTATAATGACAATTTAATTAAAAACTGTTGTGAACAAATAATATAT
GATGAAAGTACTTTTTTGAAAAATTCTAAAGAAATTGCATCTTACTTGTTTGACGTTATGAAAATTAATG
CTGCACTAGAATCTTGTGATTTGGCAATTTGCTTATACACTATTAAAGATGAAAAGAGTGTAGCAATACT
GAAATTAGATTATAAAAAGTTGTACACTCATTCAATTGAATTTGTGGATGATAAATTTAATATTCAAATG
GTTTCAAATGAAATTGGTATCCCAGAGACTTTAAGACAAAAGCAAGGAGCTTTGATTAGTTTAAGTGGTA
TAAATGATGAGTTTCATCTAAGGCTTTTAGATAAGGATGCTGAAAAAGAAGGGTCAGAATCTAAGTTTGT
AACAGAATTTTTAAATGCTAAAAAAATAGATGATGATAAGTACAAGACCAAGGTATTTAAAAATACAGCT
GAAAATTGGATAACTAATGCTCTTAGTAATGATATAAAGCAAGCTGAAGATGTAAGAAGTATATTAAATT
ATACACTGAAGGAAAAACATGAAGTTGATATAAATGACTTTGTTGATAATTCAATTAAAGATGATGAGTT
AAAGGATAGCTTTAAAGAGCATATGGAAGAAAAAGGTCTTGATGAAAGTTTTAGTATAGATAAAAAATGG
GTTGAGAAAAAGCTTAAAAAAAGAAGTATAAAAACGGATAATGGTTTTGACATAAAAGGGAATCTAACTG
ATTTTGAAGACCCAATGAAGTATACTGTAAAGCAAAATCAAGATGGAACTATAGATATAATAATAAAGAA
TGTTACATTTTATGAAGAAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c1134191-1133964 acyl carrier protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTGAGAAAATAAAAGAAATAATAGCAGAACAATTAGGGGTAGACAATTTAGATGAGATAACTATGG
AAGCATCTTTAATGGACGACTTAGAAGCTGATTCATTAGATGCTGTTGAAATTATAATGGCCCTTGAAGA
TGAATTTGGAATAGAAATACCAGACGAGGAAGCTGAGAACTTTAAATGTATTGGTGATATATGTAAATAT
ATCGAAGAAAACAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1134363-1134788 hypothetical protein CDR20291_0919 [Clostridium difficile R20291]
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ATTCAATAACTTTAGATATGCAACGTATAGAGGATTATGTAATGGAGACCAATTTAATCCTTGAAGATGT
AGCTGAAAAGGAGAGTTATGTATCTAATGAAAAAGAAGACTACATATCAAGGTTAATGCATGTAAAGAAA
GGAATAGAAAATTCAAAAACATCCTTCTTGATAGAAAGATATAAGGAGTACAAAATAAAATCAATAGAAA
GTTTAATCTACACTATATCAGAGGAGAAAAAAGATTATCTGGATGAAGTTGATAGATACAATAAACTTGG
TGAAAAAGAAATAAATAAACTAATCAATAAAAACTTTTTAGAAGTAACTTATCTGTCTATTACTACATAT
ATTTAA
>ref|NC_013316.1|:1134836-1135042 hypothetical protein CDR20291_0920 [Clostridium difficile R20291]
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TGATAATAATAGTTATAGTATTCTTACTATTATGCACAGACATTTTAGAAGACTTATTATGCGATGACAA
TATATGGATATGGGTTATATTAATAGTATTGTTATTATTTAACTTCGATGATGGTTGTTGTTGCTAA
>ref|NC_013316.1|:1135224-1135403 hypothetical protein CDR20291_0921 [Clostridium difficile R20291]
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TCCTATTCTTAGCTTTTGGAGATAGCTGGGCAGAATTTGACATAATGGCATGGATACCATTCCTAATAGT
TTTATTAATACTTTGCTGCTGTGGTGGATGCTTAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1135437-1135637 hypothetical protein CDR20291_0922 [Clostridium difficile R20291]
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TCCTATTCTTAGCTTTTGAAGATTGCTGGAGAGACATTGACATAATGTCATGGATACCTTTCTTAATATT
ATTGCTAATAACTTGTTCATGTGGTGGATTCTTTGATGGTGAAGTAGGTTGCGGCTGCTAA
>ref|NC_013316.1|:1135884-1136906 LacI-family transcriptional regulator (catabolite control protein) [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGATGAAAGGCAATATAACGATAAAAGATGTTGCTAAACAAGCAGGAGTGTCAATATCTACTGTAT
CTAGAGTTATAAATGATTCAAAACCTGTAACTGATGAAGTCAAACAAAAAGTTTTAGAGGTTATAAAAGA
GACTGGATATATACCAAATCCACTTGCTAGAAGCTTAGTAACAAAGAAGAGTCAATTAATAGGGGTAATA
GTTCCAGAAGTTTCAGATTCTTTTGTTAATGAGGTGTTAAATGGGATAGAAGAAGTTGCTAAAATGTATG
ACTATGATATTCTTTTAGCGAATACATACTCTGATAAGGAACAAGAACTTAAGAGTATAAATCTATTGAG
AGCAAAACAAGTGGAAGGTATAGTTATGATTTCATGGATAGTTGAACAAGAACATATCAACTATATACAA
AATTGTGGAATACCAGCGACATATATAAGTAAAACTGCTAGAAATTATGATATATATACAGTAAGTACTA
GCAACGAAGAAGCTACTTTTGATATGACAGAGCATCTTATAAAGAAAGGTCATGAAAAGATAGCTTTTAT
AATGACGAGTAAAGATGATACTGTTTTAGAAATGGAAAGACTTGCTGGTTATGAGAAAGCACTTTCAAAT
AACAATATAGAATTAGACAAGAGTTTGATTAAGTATGGTGGAACTGATTATGAGAGTGGATACAATAGTA
TGAAAGAACTATTAGATGATGGAATAATACCTCATGCGGCTTTTGTAACAGGTGATGAGGCTGCCATAGG
TGCTATAAATGCTATATGTGATGCTGGATATAAGGTTCCAGAAGACATATCTGTTGCAGGATTTAATGAT
GTTAAGATAGCTAGAATGTATAGACCTAAACTTACTACAGTATATCAACCTCTATACGATATGGGAGCAG
TAGCAATAAGAATGGTTATAAAATTAATAAATAAGGAATTAATTGAAAATAAGAAAATAGAATTACCTTA
TAGAATTGTTGATAGAGAAAGTGTTACAGAAAGAAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c1137469-1137029 hypothetical protein; hypothetical protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATAATTCAATATATATTTATAGAAAGGGGTTTTTTTATGAAAAAATTAGATACAGAGTCATTAG
AAAAAATGGCTAAACAAAAAAATATTGACAAGGATAAAATAGAAAAGATGGCTGATAGTTACAAAGGAAA
ATCAGAAAATGAACTTATGGAGGAACTTATAAAAATAGGTAAGAACTTAGATGGAAGAGATGAAGTAGTA
TCAAAATTCAAAGCATTTTTAGATGAAAATCAACGCAAAAAACTAGATAATATAATGGAAAAAATCTCAG
ATGCAGAAAATCAAAGAGATACTAAACCAGCTAAAACTAAGAAGGCTAAACCTACTAAAGGTAAATCAAA
TTCACCTGCACCAAAAAATACACCAGGTGGTCAACAAAAAAAATCTAAAGGTTTATTTAAGAAAACTAAA
AAGTCTAACCCTCATGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:1137639-1138544 hypothetical protein CDR20291_0925 [Clostridium difficile R20291]
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AAAATAAATCAAAAGGAAATAATAGAGTTAGAAAAAACAAAAAAAATGCAAATGATAAACTTTCACAGTC
TACACATGGCAATTTAAGGTTTGATGCAAATGATATAAAAAGAGGTTTAAGGCTCATGGATTTAAGTGAA
GAAGATTTAGAAATGGGAATGGAAATAATAACAAGAACTAAAAAATACATGTCAAGAGATGAAAGAAAAA
TACTAATAAAAATAGAAAGTGTTTTAGATTTAGTTAGAGGAATAAAAAAATTAAATAATATAGATATGGT
AGATACAGAAGATGAAACGGATTTTTTCAGAAAAATGGATAGTGATGATAAAAAGAATATGATGATAAAG
GAAATTATAGATGTATTCCCAGAAAAAAGAAAAAATTCAGTTGAAAAAGCTATAGGAATGAAAAAGAAGA
TAGATTTATTTGCAGAATTATTTTTACCAGATGACTTTGGTGAAGGTGGATTTAGTTTGAGCTCTTTGGC
AAATATAAACAATCTTGGTAGTATGAATAATCTCAAATTGTTAGGAAGTCTTTTAAGAGGTGATGATAGT
AATAATGATGATGAAGACAATAATGATGAGTTAAATTATGAAGACGAAGAATTAGATTGTGAAGACAAAG
AATTGGATGATGATGAGTTAACAGATGAAGGTGAAATGGAGGATAATGAAGATGAATTAGTAGAAGATAA
GAACACAGGCTATGAAAATATAGAAAATGATGAAGATATAGTATACGATGAGGAACTATACAACATTAAT
GAGCAAGAATCCGAATACAATTATAATGAAAAAAATACTAAAACTAGAGCTAAGAAAAAACGATAA
>ref|NC_013316.1|:1139022-1140239 hypothetical protein CDR20291_0926 [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAGATTATAAAAAAAATAAAAGAAGAATGATGAATCAGCCAATGTCTACAATGAATGAAGAAGAAG
TGTATACAGATGAAATAAATTCAGAAGACATGAGAGGGTTTAAAAAATCACACCATCATAATGGATGTAA
TACTGATAATAAGTGTGAGTGCCATGATGAGTGTAATCCATGTAACCCATGTAATCCATGTAAACCTAAC
CCATGCAATCCATGCAAACCTAATCCATGTGATGACAAATGTGAATGCCATGACAAGTGTAAATGTGATT
GTGAACCATGTGAAATGGATTCAGATGAATGTTTTGAAAACAAATGTGGACCAGAATGTTGTAATCCGAT
ATCTCCAAGAAACTTCTCTGTATCAAATGCAGTGCCATTTGCAATAGAGGCTAATAGAATATTTGATACT
ATGCAATTCCAAACATTTACAGATGCAACAGGTCCAAATGGAGAACCATTAACTTTTGAAACAGAAGTAG
TAGAAGTATTTGGTTCAATTCCAAGTGCAGGTCAAGCAAGTGTAACTATAGAAAAAATATGCTTAAGTAA
TGATGGAATAGTTATAGACACAGGAATGACAACTTTAGAAGATTTCGATTTAGACCCATTAGGAGATATA
GTAGGAAGAAACTGTGAAACAACTTTTGAATTTGCAGTTTGTGGAGAAAGAAACGCTGAGTGCTGTAGAC
AAGGAAAAGGCAAATCAGTAGCTTATAAACAAAGAGGATTAACTGTAGCAGTTCGTAATTTAGTACTAGA
GCTAAGAGGTAGATGTGGATGTACAGAGTTCGTTGCATTAGCTTTCCCAGCAGTTAGAGCAGGAGGTGGA
TGTAAGAGAAGAGTTGATTATGTAGAATTTACTTTTAACACACTTTCAGCACCAATATGCTTGCCAGCTG
ACGGAAGAGCTGTTACTTTAAGACAAGAATATCAAACTAACTTAACTGTAGATTGTATAGGAAAATCTAT
ATTAAAATTAGAATGCAACGAATGTTGTGAACCTTTCTATGAATTAATTATACCAAATGATATAGATTTA
GTACTTTGCTTACAAGAAACAGTTAGCACATTAATAAGTGAACAAATAGTAGTTTTAGCATCACCAAATC
CAATCCAACCAAGACTTGTTGATACTTTCTCTAAAGTATGTGATTTTTCGCAATGTGGACCTAATCATGG
AAGTGGAAAGCCAAGTTGCCACAGATAG
>ref|NC_013316.1|:c1141671-1140340 putative polysaccharide biosynthesis/sporulation protein [Clostridium difficile R20291]
GTGATTTTTTTGAAAGTACCTTATTTAGTACTATCAACAGTTATTTTATTTATATCCAATTTTATTGTAA
GAATATTTGGTTTTTTATATAAAATATTCTTATCAAGAGCACTAGGTGAAACAGGTTTAGGTATCTATCA
TATGATTTTTAACTTTTTGATGATTTGCTTAGCTGTTACAACAACAGGTATACCTACTGCACTTAGTTGT
CTAGTTGCAAAGAGAAAAGCTTTAAACGATAGACACAATACTAATGCTCTATTTATATCAACTTTATATA
TATCATTTTTCGTAGCACTAATTATATCTATAGTTGCATCTTTCAATAGTTCTTTTTTATCACTTAAATT
TTTAAAAGATGCTAAATTAAATCTATTTATACTAGCTGTTTGTCCTGCTATAGTTATAATAACTCTTTCA
AACGTACTAAGAGGATATTACTATGGCATAAAGAATGTAAAAATCCCTGCTATTGGACAAATCATTGAAC
AAATTGGTAAAATATTATTTGTTTTTTTACTTGTTATGTACATAAATAATAAATCTATGAATTGTTATAT
AGCTCTATTAGGTATATCTATTGGTGAGTTGAGCAATATTATATTTATGCTTATTTGCTTATGGCGAGAT
TCATCATTTGACAATAGGTATATTATAAGCATAAAAGATTTTTATAATTCTTCTATGGAAACATTAAAAA
TGTCTATTCCCATAACTTGTAATAGAATGTCAAACATACTTTTGCAATCTATAAGTTCTATGATGATACC
ATCAAGATTAGCATTATCAGGAATGACTTATCAACAATCTTTAAGTATGTATGGTATTGTCAGTGGGATG
GTAATGCCCTTTATATTTTTACCTTTTACTGTTGGTTCAGCGCTTATTGTAAATTTAATACCAACTATTT
CACAGGAAATGGCTCTAAGAAAGCGTAAGAGTGTAATTAAAAAAATCAAATACTCCATACTTCTTACTTT
ATTTGTAGGCATACTATCATCAATATTTTTTTATTTCTTTGGAAAAGATTTATGTATATTAGTATTTAAA
AATACACTTGCAGGAGAATATCTAAAAGCTATGTTTTTAGTTCCACTATTTATGTCCCTAAATCAAACTC
TATCTGGCATTTTACATTCAATAAGAAAAGAATTAGCTTCAAGTATAAATACTATTACTGGCATGTTAAT
TCAACTAATAGCTTTATATGTATTTCTTCCAATTCCAGGACTTAATATTTATGCATACATATACACAATG
ACGATAGTATCAATCTTTACTTGTCTATTACATACTATAGTGCTTTTTAAATCACTAAAATCTATACGCT
AG
>ref|NC_013316.1|:c1142507-1141713 putative phosphatase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTTACGACTATCACATGCACTCAAGTTTCTCTACAGACGGAAAATCTACAATGGAAGAAATGGTAA
AAAAATCTATTGAACTCGGTTTGGAGGAAATTTGTTTCACAGACCATGTTGACTATGATGTATATGCTGA
TGATTCTTTTTCAATTGTCTACGAAGATTATTTTAAGAGTTTAGAGACTCTTCAAAGCAAATACAAAGAT
AAAATATCAATAAAAAAAGGAATTGAATTTGGAGTTCAAACTCAATTAATGGATACATACAAAAAGGAAG
CACATCAATATCCATTGGACTTTATAATATGTTCTATCCATGCTATAGATACAATGGACTTATACCTTGG
TAATTATTTTAAAGATAAAACTCAATATGAAGTTTATGAAAATTACTATCTTTATTTATATAATATTGTT
AAGAATTATAAAGATTACTCTGTCTTAGGTCATTTAGATTTGATTAAAAGGTATGCACCTTATGACACTA
TTTTAGATGATAGACTATTTTCTGATATAATTGAAGAAACTCTTAAACAAGCTATTTATGATGGCAAAGG
TATCGAGATAAATACCTCTTGTTATAGATATAATCTTCCAGACCTAACCCCATCTAAGTATATACTTCAA
ATGTACAAAGACTTGGGAGGGGAAATCATAACCACAGGTTCAGATTCACATCATATAAGTCAAGTTGCAT
GTGAGTTTGACTACATATATTCATTACTAAAAAATATGGGATTTAAATATGTATCTAAATTTAATAAATT
GAAACCAGAATTTATAAAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:1142608-1144062 putative aminotransferase [Clostridium difficile R20291]
GTGATAAATTTGGAAAAATACAGAATAGATTTAAATGAGAAAAAATCAACTAAATATATACAGATATTTA
ATCATATAAAAGAATTGATAATAAATAAAGAGTTAGTAGAACATGAAAAATTGCCTCCAATAAGAAAACT
ATCAAATTTTTTACAAGTAAATAACACTACTATAGTTAAGGTATACGAGCTTTTAGAAAATGAAGGATAT
GTATATAAAATTATAGGGAGTGGTACTTTTGTATCAAGTTCAAATTCTTATAAAAGCGGTATAGATAACA
GGAAAAATAAGATTATTGTGCAAAGAGAAGATTTAATTCATTTTGACAATGGGAATCCATCTAATGATAT
GTTTCCTATCGATTCATTTAAAAATGCTGTAAATATGGCATTATCTAAAGATGGTAGTTCAATATTTGAA
TATGATGAAGGTCTTGGCTCTGAAGAATTAAGAGAAAAAATGGTAGAGTATCTAAGTGATGGAAATATAA
AAACTACTAAGGAAAATATTCAAATAATATCAGGTGCTCAACAAGGTATAGATATAGTTTGTAAAGGACT
TATAAGTTATTCAGATGTTGTTTTTATGGAAGAACCTTCTTACAATGGAGCAATTGAAGTGTTTAAAAGT
AGAGGTGCAAAAATAATATCTATACCTATGTTAGATGATGGAATTGATATAGGTATTTTAAAATTAAAGT
TGGAAAAAATAAAACCAAGACTTATATACATTATGCCTAATTTTCAAAATCCAACTGGAATATCTTACTC
AACATATAAAAAAAAGAAATTGATAGAATTGGCAGAAGAACATGATTTTTATATAATAGAAGATGATTTT
ATAAGTGATTTTGTTTTTGAATCAAAGGACAATAGAACAATTAGAAGTTATGATGATAAAAATAGAGTAG
TATATATAAAAAGCTTTTCAAAAATACTTATGCCAGGTCTTAGGATAGGAATTGTAGAAATGCCAAATGA
GTTGTTAAAAAAAGTTTTATGGGCTAAATATTCATCAGATATATCAACACCAGGTTTAATTCAAAAATCA
ATGTATTACTATATGAATAATTTTGATTGGAAGAATTATTTGAGTCATATAGAGAAGATATATACTAATA
AGTATAAATTGTCAAAAAACTTGATTAATGACAAATTGAGTGGTAAATTAAAAGTTAGAAAATCTTGTGG
AGGAATAAACTTTTTTTTAGAATTACCAAGAGGATATACATCTCAAGCATTTACAAATTTTATGTTAAAC
AAAGGAGTGTCAATGCTTCCAGGAACTTATTTTTTTGACAATCTAGTGGATGATAGATTCTTTAGGATAA
ATATAGCTCGCCCAAGCATGGAAGAACTAGAAAAGGGAATATCTGTAATAAGTGATAATATAGATGAGTT
TTTTTGTGAATATAAAAACAAGTTAGATATAAAAAGCAATAAATTATTTTATTAA
>ref|NC_013316.1|:1144091-1144300 hypothetical protein CDR20291_0930 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTGACAAGAAGAAATTAGATAGGATTAATGAATTAGCAAAGAAAAATAAAGAGGGAATCCTTTCTG
CTGATGAAATCAAAGAAAGAGAAATTTTAAGGAAAGAATATTTAGAAAACTTTAGAGCTCACTTTAGATC
AAGACTAGATAGTGTCAAAGTAGTTTCACCAGAAGAATATGAGCAATACATGAAAAACAATAAAAATTAG
>ref|NC_013316.1|:1144320-1145714 putative aminopeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAACTTAAAGTACGAATTTAAGAATGCTTGGGATTTTGAAAGAAAAGAAAATACTATTGAACAAATTA
TGCAATATTCTCGCAATTATATGGAGTTTTTAAGTAAGTCAAAGACTGAAAGACTTTCAGTAAAAGAAAT
TATAAAATTGGCTAAAGAAAATAACTATATTTCAATAGATGAAGCTATGGAAAAAGGAAGCATAAGTTGT
GGTGATAAGATTTATGTTATAAATAAAGAGAAGGCAGTAGCACTTTTTGTAATAGGTAAAAATTATATAG
AAAAAGGTATGAAGATTATAGGAAGCCATATAGATTCACCAAGATTAGATTTAAAACCAAATCCACTGTA
TCAAGAGAGTAATCTAGGTTTTTTTAAGACTCATTATTATGGTGGAATAAAAAAATACCAGTGGACAGCT
CTTCCACTTGCTTTACATGGTATAGTTATATTAAATGATGGAACAAAAGTGGACATATCTATTGGGGAAG
AAGATAGTGACCCAGTATTTTGTGTAACTGATTTATTGATTCATTTGGCTGGAGACCAAATGCAAAAGAA
ACTATCAGAAGGAATTAGTGGAGAAGCTTTAAATATATTAATTGGGAATATTCCTTTAGAAGATGAAGAA
AAAGAACCTATAACAGCAAATATATTAAAGATTTTAAATGAGAAATACAATATAGTTGAAGAAGACTTAT
TAAGTGCTGAAATTGAAGTAGTTCCAGCTGGTAAGGCTAGAGATTTAGGGTTTGATAGGTCTATGGTGTT
GGGATATGGGCATGATGATAGGGTATGTTCATATGCTGCTGTAAAAGCTATACTAGAAACTGAACAACCA
GAATTTACTTCAGTTGCATTATGTGTAGATAAAGAAGAAATTGGTTCTAAAGGGAATACAGGTATGCACT
CAAAGTTTTTTGAAAATACTGTGGCTGAACTGATTGCTTTAGAAGGAGATTATTGTGATATTAAAGTAAG
AAGAGCTTTAGCAAATAGTAAGGTATTATCAGCTGATGTTTCTGCTGGATATGACCCAAATTTTGGAGAA
GCATATGAAAAGAGAAATTCAGCATATATGGGAAATGGAGTAGTTTTAACTAAGTATACAGGTTCAAGAG
GAAAGAGTGGATGTAATGATGCTAATGCTGAATTTATGTCAGAAGTAAAGAGAATTTTTAATAAAGGAAA
TGTAGTATGGCAAACTGCTGAACTTGGAAAAGTAGACCAAGGAGGAGGCGGAACTATAGCCCATATATTG
GCAAATCAAGGTGCAGAGGTTATAGACTGTGGTGTTGGAGTTTTAAATATGCATGCACCACATGAGATTG
TCTCTAAAGTAGACATATATGAAATGTATAAGGGATATAAGGCATTTTTTAATATAAATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:1145930-1146706 GntR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGTTACATAGGGAGGTGAGCAAAATGGATGAAAAGAGACAAAAAAAAGAAATGGATTTAGAAGTAAATT
CCTTTGTTCCTTTATATCAACAACTATATGACAACATAAAAAAACAAATAGCATCTGGCATATATAAACC
AGGAGATAAACTTCCATCTGAAGGAGACTTATGTAAAGAATTTAATATAAGTCGTATAACTGTGAGAAAT
GCACTTAATGAACTTGTAAAAGAAGATATATTATGTAAAAAACGTGGTAAAGGGACTTATGTAACAATAC
CAGAGAGAATAGAAGCAACATGTGCAGGAAATAGTTTTACTAATTCTTGTCATCGTATTAATGCAAAACC
AAGTACCAAAATAATCTCTGTTTTAATAAAAAAAGCAGATAAGCAAGTAGCTGAAGCTTTAAGTATTGAA
CTAGAAGAGAAGGTAATATGTATTAAAAGACTTAGATTAATAGATGAAGTACCTGTTATTTTTGAAGTTG
ACTATTTTAGAATAGATTACATGTTTTTATTAAAAGAAGAATTAGAAGATAAATCTTTAATGGAGGTTAT
ATCTAATAATATAAGCACATTACCTAAACGAGTAGAAAATATATTTGAAGTAAAACATTCAAACAAAGAA
TATTCTGACTATCTTAAATGTGCAAGTAATATGCCACTATTGAAAGTAAGACAATCGGTGTATACAGAAA
ATAATGATGTCTTATATTACAATGAGCAATTTATAAGAAGTGATAAGTACAAATATGCAGTATCAGCAGA
AATATAA
>ref|NC_013316.1|:1146732-1147145 PTS system, IIa component [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGATAATATTAGCATCTCATGGAGATTTTTCAAAAGGGCTTTTAAATGCAGTAAAAATGATAG
TAGGAGATTTAGCAGATTGTGTTAGTTCGTATGGTTTGTACCCTGGACAAAGTGCTTCAGATTTTGCTTT
AGAATTAGAAAAAACAATATCAGAAGATATAGAATGTGAATATATAATTTTATCTGACTTATATGGAGCA
AGTGTATGTACAGCAATGTTAAGATTAACTAATCTACATAATGTTAAGTTATTTTCTGGAATGAATTTGA
ATATGGTATTAGAACTTCTTACAAGGTTTTCTGATGAATTAACAGTTGAAGATATAGAACAATTAGTGGA
AGAATCTAGAAGAGGAATACAAAGCGTGACATTACAAATTAAAGAAGAAGAAGAGGTATTTTAG
>ref|NC_013316.1|:1147149-1147892 hypothetical protein CDR20291_0934 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAAAGGGAATATTATCAGTATTTAAAAGTAAAAAACCAATTATAGCAATGATACACTTAAAAG
GAGATACTCCAGAAGATATCTTTGAAAGAGCTAAAAAAGAGATTACAATCTTTGAAGAAAATGGTGTAGA
TGGAATAATGTTAGAAAATTACTATGGTAATTATTATGATTTAGAAAGAATACTTGAATATGTATCAAAA
GCTAATTTGTCAATACCATATGGAGTAAATTGTTTAAATGTTGATACTATGGGATTTGAACTGGCAACAA
AATATAATGCTAGTTATATACAGGTTGATTCTGTAGTAGGTCATGTTAAACCTAGAGACGAAGCTACTTT
AGAAGAATTTTTTAAATTACAACGTTCAAAATGCCCAGCGTATTTAATTGGAGGCGTACGTTTTAAATAT
CAGCCAGTATTATCAGAAAATGACGTTGAAGAAGATTTAAAAATAGGAATGACAAGATGTGATGCTATAG
CAGTTACAGAAAATGCTACAGGTCAAGAAACATCAATGGAAAAAATAGAACTGTTTCGTAAAAATTTAGG
AGACTTTCCATTGGTTATAGCTGCTGGAGTTACATTAGAAAATGCAAAAAAACAGCTTGAATTAGGAGAT
ATGGCAATAATAGGAAGTTACTTTAAAGATAATTACAAAGATTTTGGGAATGTTAGTGTAGAACACGTAA
AAACATTCATGGATGAAATCAAAAAAATTAGGGAGGAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:1147892-1148362 PTS system, IIb component [Clostridium difficile R20291]
ATGATTAAATTAGTAAGAGTAGACCACAGACTTATACATGGACAAGTAGCATTTACATGGACAAAGTTTT
TAAGCACAGACTGTATATTGATAGCAAGTGATGAATTATTAAAAGATGAATTAAGAATGGCAGGGCTTAA
AATGGCTAAACCATCTAATGTTAAGTTAGTAATGAAAAGCATAGCAGATTCTATAAAAGCACTTAACTCA
GGTGTTACTGATAAATATAACTTATTGATACTTTGTGAATCTGTAGAAGATGTTTATAGACTTGCTAAAG
AGGTAAAAGCTATTAAATCTATAAACCTTGGTGGAACAAAATCAGATGATAATCGTGAAAATATATCTAA
AGCAGTGCATGTATCAAAAGATGATATAAAGATGATTAAAGAGTTAGATTCAGAAGGCGTAAATGTATTT
GTACAATTAGTTCCTGATGATGATGCTACAAATGTAATGAAATTAATATAA
>ref|NC_013316.1|:1148373-1149137 PTS system, IIc component [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATGGAATTTACACAAGTTATTTTGATAACTCTAATTGCATTCTTTGCATATATGCATAGTTTTG
TAGGTTCTACAATGCATAATAGACCTATAGTTGTTGCACCACTTGTTGGTTTAGCACTAGGTAATCTTCA
TACAGGTATAGTAATAGGTTCAACATTAGAATTAGTATTTATGGGTGCATTTCCTGTTGGGGCAAGTAAT
CCTCCTGATTTTGTGTCTGGTTCTATTATTGCCACAGCGTTTGTAATATTAACGGGTCAAGATGTATCAG
CAGCAGTTGTACTTGCAGTTCCTATAGCAACTCTAGTATTGCTTATAGATAACTTCTTAATGACAGTAGT
ACTTACATGGGGAGCTCATATTGCTGACCGTTATGCAGAAGAGGGGAATATTGAAGGCGTAGAACGTGTG
CAATTATTATTTGGTATAGGAAATAAATTAATATTAGCAATAATAGTAGGTATAGGATTTTCATTAGGTG
TTCCAGTAATAGAAAAAATACTTTCATTTATACCATCATATGTAACTCATGGAATGGATGTTGCAGCAGG
CGTGATTCCAGCAATAGGTTTTGCCATGTTAGCTAGGATGATGCTTAATAAGAAAACAGTAGCATTTTTA
TTATTAGGATTTATATTGGTTGCTTACCTAAACATAACAGTAACAGGAGTTGCATTGTTTGGATTAGCAA
TAGCTTTAATATATGTTAACTTTGTAGGAGAGAAGGAGGTAATAGTAGATGACAACGAGTTCTAA
>ref|NC_013316.1|:1149121-1149963 PTS system, IId component [Clostridium difficile R20291]
ATGACAACGAGTTCTAAGAAGTTAGATACAATTTCACCCGATAGTAAAATAACGAGGAAAGACTTTTGGA
AATGCTTTAGAAGGTCATTGACATTAGATTCATCTTGGAACTACGAACGTATGCAAAATATAGCATATGC
ATACATGATGGCACCAATAATCCGTAGATTGTATAAAGATGATAAGGAAAAGAAATCTAAGGCTTTAAAA
AGACATTTAGAATTTATGTCAGTTACTCCTCATATAAGTACTCTTTTGGTAGGTATATCTGGAGCTATGG
AAGAAGAAAATGCAAAGAATAAAGAATTTGATGCTAATAGTATAAATGCTGTTAAATCAAGTTTAATGGG
TCCAGTTTCTGGGATAGGAGATTCATTTTTCTGGGGAACATTAAAGCTTATAGCAGCTGGAGTTGGTATA
GCTTTAGCTTCTCAGGGTAACATAATGGGACCGATTTTATTCCTTTTAATAATAAATGTTCCTCATTTTA
TTATACGCTATATATGTCTAGATAAAGGATTTAAGTATGGAACTCAATTCTTTAAAGATGTGAGTAGTTC
AAGTATAGTTTCAAAAGTTATGGAAGCAGCTTCAATGTTAGGGCTTATGGTAATTGGAGGTATGACTGCA
TCTAATGTAATGTTAAAACTTAGTGTTAATGTAGGTAGTGGAGAATGGGCAGAGCCTATTCAAACTTACT
TAGACCAAATAATGCCATGTATGCTTCCAGCTATGATATTCGGTATTATGTATTGGTTATTAGGAAAAAA
GGTAAAGACAACTACGATATTAATTTCAGTTATGATTATTTGTATAGTATTAGCTGCTATTGGAATAGTA
TAA
>ref|NC_013316.1|:c1151028-1150123 LysR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGATTTTAAACAACTTGAAGTATTTGTTGCTGTTGCAAAACATCAGAGTTTTTCAAAGGCCGCAAGAG
AACTTTTTTTAACTCAACCTACTGTAAGTGCACACATACAGAATTTAGAGAGAGAGTTGGAAACTGTTCT
TATAAATAGAAGCAACAAAGTTATTACACTCACAAAATCTGGTGAAATTCTTTATGAACATGCTATATAT
ATATTGAATAATTGCAAACGTGCAATTTATGATATAAAAGAATATTCAGGAAAAATAGAAGGTATTATAG
ATATAGCATGTAGTTCCATACCTGAAACTTATATTTTACCTGATTTTATGAAGAGTTTTTCTATGAGTTA
TCCAGATGTAAAATTTTCCATAAGCCATTATGATTCTCAATATGCTATATCAGAAATTTTAAATGAACGA
ATAAGCTTTGGATTAGTTGGTTCTAAAATCAATAATCCTCAAATAGAGTACCTAGACTTATTAGATGATG
AACTTGTTCTTATCACTCCTTCAGATTTTAAAATTGATAATAAAAATAATTGTATCGATATAGGAGAATT
GGCTTATCTAAATTTTATTATGAGAAAAGAAGGGTCAGGTACAAGAAACTTAATACTAAACACACTTAGT
AAAAATAACTTTCCAGTAAGTAAATTAAATGTAATAGCTCATGTAGAATCAAATGAGGCTATTAAGGAAA
TGGTTAGATTAGGTCTTGGAGTCTCCTTTATATCGTACATTTCAGCTATTGATTATCTCAATGCAGGTAA
AATAAAATGTTATAAAATAAAGGGTGTTGATTTTACTAGAAAATTTTTCTTTATTTACTCTAAAAAGAAA
ACTTTTTCCCCATTAGAAGATAAATTTCTAAACAGATTATGTGAGTATTTCGAAATTATAATATAA
>ref|NC_013316.1|:1151390-1152124 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGTTAAAAAGGTCATTAGTTTGTGTAACTATTTTAGGTATTATACTTGTTGGATGTCATAAAGAAA
ATACTAAAGAGAAAAATCAAGTAGCAAGTAAAGCAACACAGCAAAAAACTATGACAAAAGTTCAAAATGA
TGTTAATGAAATTATGAATAAAGATTATAAGTACATTATAAAGAATATGGGTATACCTTATAATACATTT
TATTATATAAAACCTAAAGTTTTAAAAGAATCGAATACAATGCAAGATATAAATACATCAAGTTATATGA
CATTAGTTTATCCAAAATATACTGGAAATGATGAACTAGATGGAAGTGCTTTATATGTTGATATTAACGA
AAATAAAGTTGTCAATGTTGAAACCAATTCTTTCTCATCACAAGGTATATCAGTCATTGATGCTGAATCT
AGTGTTGTGATTGAAAAAAGTGACCATGAAAAATCGGCTGTATCACTAGAAAATTTTAGACGTATTGACC
TGGGAGAGTATGTTGGTGTTGAAGAGTCTAGAATAAATGAAATTGTAGGAGATGCGAATTATGATTTAAC
AGCATATAATCATGAAGGTAGTAAAGTAGTTAAGAGTTATAGATTGAAAGAAGATAACAAAATATTAAAA
AAAGAGGTACTTACAATAAGTATTGTGGATAACAAAATAAAATCTATAAAAACTATTGAAAGTGATAAAA
TTGTAAAAATAATAAAAGGAACTTTATTAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1152335-1153516 molybdopterin biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGAATTAGAAGATGCCATAAAAATTATTGAAAAAAATGTTTTACCAATAAACAGGGTCAAGATAG
TAAATCTTATAGATGCAGTAAATAAAGTAGTTGCAGAAGATATATATTCAACAATTGATAGTCCTCCATT
TGATAGGTCACCCTATGATGGTTATGCATATAATGCAAATTCTGAAAATAGAAATTTAAAGGTTATAGGG
ACTTTGTATGCAGGAGAAGTATTTAATAAGGTATTAAATAAAAATGAAGCAGTGAAGATAATGACTGGTG
GAAAGATACCACAGGGTGCAAACTGTGTAATAAAAAAAGAAGATGTAACGGTTATAGGTGATATGATAAT
TTTAAATGTAAAATTAAAGGAATACGATAATTACATATTTAAGGGTGAGGATATAAAAAAGGGGCAATTG
ATTATTAATAAAAATCAGAATATAGGATATGATGGTATTGGAGTATTAGCAAGTCTTGGAATATCCAAAG
TAACTGTTTATGATGATTTAAAAGTTGGAATTTTGAATACAGGTACAGAACTACAAGATATAAATGAGAC
TTTAGAGAATGGTAAAATATACGATAGTAATAGATATACCTTATATTCAAGATTATTAAAACTTGGAATA
CAGGCAGATACAATATGCAATTGTTCTGATGATATATTGGAGTTAGAAAAAAAGGTAAAGAATATGTTAC
AGAGTGTAGATTTTTTAATTACAACAGGTGGTGTTTCTGTTGGAGATAAAGATTTAATTCCAGATGTATT
CAAAAAAATAGGGGCAACAGAATTATTTTGGAAGATAAACATTAAACCTGGTGGAGCTTGTTATGTAGGT
ATATTGGGAGAAAAGCTATTATTTGGTCTTTCTGGTAATCCACATGCAGCAATAGTGGTATTTGATAATG
TGATAGTTCCTGTTATTGAGTATTTAACATATAAGAAGGGAATACATCATATAAAAGCTATATTTAAAGG
AGAATTTAATAAACTTTCAAATAAAGATAGATTTGTAAGTGGAAAACTATATACAAGTGAAGGTAAATTG
TATGTAGAGCTAAATGATAAGAAAGATGCAAAAGCTAGATTATCTGCAACTCTAAGAAGTAATTGTATGA
TTAAGATTAAAAAGAATGAGACAATAAAAGAAAATCAATTAGTGGAGATTGTTATTAGATAG
>ref|NC_013316.1|:1153521-1154072 molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein B [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGGACACAATTTTATGTATAATATATTGTCAGTTGTCTCATATTCAGGAGTAGGTAAAACTACGT
TGATTGAAGGCATAATAAAAGAATTAAATAAAAAAGGGTATCGTGTTGGAGTTATTAAACATACCTGCCA
TGATTTTGATATGGATGAGGAAGGAAAAGATACTTATAAACATAGAAAATCTGGGGCGAGAAAAGTCTGT
ATAATATCAGATAAACGAGTAGCATATATTGAAGAACTAAAAGAGAAGAATCCATTATATAAAATGATTC
AATTATATGAAGATATGGACTTGATTATCATAGAAGGATATAAAAATTATAGATTTAAAAGATTGGAAGT
AACTAGAAAAGGTAAGTATGAGGATATTTTATCTAATAAGTCTGATTTGATAGGTATTGTCAGTGATATA
GAATATAAATTGAATATTGAACAGTTTAATTTAAATGATTATAAAAATATATCAAAGTACATAGAGTCTT
GTATAAAAAATGAAATTTTAAGTATAAGCAATGTTGAAATAAAAAACATATTAAAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1154191-1154466 PTS system, IIb component [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAATATTAGTAGCATGTGGAGCAGGAATCGCAACATCAACAATAGTTTGTGACAGAGTAGAAA
GATTGGTTAAAGAAAATAATATACACGCAGAAGTTGAGCAATGTAAAATTGCTGAATGTTCAACAAAACA
AGAAGGTGCTGATTTAATCGTATCTACTACTATACTACCAACAACTTATGATATACCTACAATAAAGGCA
ACAGGATATATAACAGGTATAAATACAACAGCATTAGATAAAAAGATATTAAATGCATTGAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:1154722-1156422 ABC transporter, ATP-binding/permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAAACAATTTGTCAAATATTATAAGCCATATAAGAAAATTTTTACACTAGACCTTATAGCAGCTT
TTCTATTTTCCTTATGTGATTTAGTTTATCCTATGATAACTAGAAATATAATGGATGACGTTGTTCCAAA
TAAAAACTTAAGAATGTTAGTAGTTTTTGCAGTAGCACTTATACTTATATTTATAGCAAAAGCAGGGCTT
AACTATTTTATGCAGTATTGGGGACATGTTATTGGTGTAGATATGCAAGCTGATATGAGAAATGAGGTAT
TTACACACTTACAAAGACTTCCAAATACGTATTTTGATAATAACAAATCTGGAGTAACTATGTCTAGAAT
AGTAAATGATTTAATGGATATAACAGAACTTGCACATCATGGTCCTGAAGATTTATTCATTTCTATAGTA
ATGTTGGTTGGTTCATTCTTTATACTTATAGATATAAATATTCCTCTTACGCTTATAATATTTGCTATAT
TACCGTTTATAATTTGGTTTGCAATAGCTAAAAAAGATAAGATGAATATTGCTTTTATGAAGAGTAGAGT
TACTATAGGTGATGTAAATGCTACTTTAGAAAATAGTATAGCAGGTATGAAAGTAACTAAGTCTTTTTGT
ACTGAGAAAGAAGAGTTAAATAAGTTTGTAAGAAGCAATAAATTATTTAGAAGAGCAAGACAAGATTCTT
ATAAGGTAATGGCAGAATATTACTCTGGTATGAATTTATACATGGATATCTTAGAGTGGGTAGTTGTAAT
AGCTGGTGGTTATTTTACTTATATAGGAAAAATTACTTTGGGTGATTTTGCTGCTTATATACTATATGTA
AAAATGTTTATACAACCTATGAAAAAATTAATAAATTTTACAGAGCAATATCAAAATGGTATGACAGGTT
TTAAAAGATTCATAGAGATAATGGAACAAGACCATCAAAAAGAAGCTAAAAATCCTATTGAACTTGAAAA
TGTAAAAGGTGACATTGAGATAGAAAATATATCTTTCACATATGAAGATAAGACTCAAGTTTTGGATAAT
TTAAGTTTATCTATAAAAGCTGGTAAGACTATAGCATTAGTTGGACCTTCTGGAGGAGGAAAGACTACAT
TATGTAATCTATTGCCAAGATTTTATGAATTTGATAAGGGTGATATAAAAATTGATGGAAAGAGTATAAA
AGATGTTAGTTTAAAATCATTGAGAAAAAATATAGGTATAGTTCAACAAGATGTATTTTTATTTACAGGA
ACTATAAGAGATAATATTCTTTGTGGGAACCCTAATGCTACAGATGAAGAAATGATAGCTGCTGCTAAAA
AAGCTAGAATACATGACTTTGTAGAGACTTTGCCAGATGGATATGATACTTATATAGGAGAAAGAGGCGT
AAAATTATCAGGTGGGCAAAAACAAAGAATTTCAATTTCAAGAATCTTTTTAAAGAATCCTCCAATAATA
ATATTGGATGAGGCTACATCTGCTTTAGACAATGTAACAGAAAGAGAAATTCAAGAGTCTTTAGAGGAAT
TAAGTAAAGATAGAACAAATTTAGTTGTTGCACATAGATTGACTACTATAAAAAATGCTGATGAAATCAT
AGTATTGACGGATAAAGGAATTGAAGAAAGAGGTACTCATGAAGAGTTAGTAAACAAAAATGGAGTATAT
AGTAGGTTACACAATAACTAG
>ref|NC_013316.1|:1156785-1157972 hypothetical protein CDR20291_0944 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGCAATAACAGCTTTTTGTCTAGTTTTAATATCACTGACGATAGGAGATATAGTTTCAGCAAAAA
CTAAAGCTTTTGTTCCGTCGGTTTTTGTATCAGCAATTATATTTATAGTAGGATTCTGGACTTTTTTCCC
AGAAAATATTGTGGACTTAGCCGCTTTAGGAACACCATTAGCTCAATTAGGTATGCTTTTGTTAATAACT
CATATGGGAACTATGATGAGTATTAAGGAATTAGCAGGTCAATGGAAAACAATAGTAATAGCCTTGGCAG
GAATAGTAGGAATATGTGTAGGTGCTTTGGCATTAGGGACAATAGTATTTGGATGGGATACAGCAGTAAT
AGCTACACCTCCTCTTACTGGAGGGCTAGTTGCATCTATAATGATGGCAGATGCTGCTACAGCAAAAGGT
CTTGCAAGTTTATCAGTACTTGCAATTTTGATGTATGTTGCACAAGGATTTGCGGGTTATCCTATTACAG
CATTAATGCTTAAAAAAGAAGGAAAAAGACTTTTATCAGACTTTAGAAGTGGAAAAGTAACTGTAAATAC
AGATGAAGAAAAAGTTAAGGATTTACCTGAACAAAAAAGCAGATTTAAGATAATTCCAGACTTACCAGAA
AAATATGATACGACATATATGATAATACTTAGATTAGGATTTGTAGCATGGTTAGCAGTACAATTTACAA
ATCTTACAAATGAAGTTGTATCAAGATATGTTATATGTTTAATATTTGGTGTAATAGCATCAGAACTTGG
AATAGTTGATAGAAAACCACTTAATAAATCTGGTTCATTTGGATGGTTAATGACATCATTGATGGCTTTT
ATATTTGCAGGATTAGCAAAAGCTACACCAGCAATGCTTGTTGAAATGGCAGTTCCTCTTGTAGGAATCA
TAATATTTGGTGTAATAGGTATGGGAATATTCTCTATTATAGTAGGTAAGCTTTTAGGTGAAAGTAAAGA
AATGGCTTTTTCAGTTTCGCTTACATCACTTTATGGTTTTCCACCAAACTATATATTAACTGAAGAGGCA
GTAAAGGCTTTGGCTGAAACACCAGAAGAAAAAGAATTTTTAATGGATAAGATGCTTCCAAAGATGCTTG
TTGGAGGATTTACTACAGTTACAATAGCTTCTGTAGTAATAGCAGGTATCTTTGTAAATCTAATATAG
>ref|NC_013316.1|:1158008-1159195 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGTGTACTACTTGGAGGTATGGAATGGATATTAAAGAAATAACAAAGAGTTATAAAGACTATGTAATTA
AGCTTAGAAGGGAATTTCATGAAAATCCTGAGAAAAGTATGGAAGAAGTTAGAACATCAAAGAGAGTTAA
AGAAGAACTTGATAAAATAGAGATACCATATGTATCAGCTGGAGGTACAGGTGTAATTGCAACTATAAAA
GGAGCTAATCCAGGAAAGACTGTAGCACTTAGGGGTGATATGGATGCTCTACAAGTTGTTGAATGCACTG
ATGTAGAATACAAATCTAAAAATGAAGGACTTATGCATGCTTGTGGTCATGATGGTCACACATCAATGCT
TCTAGGGGCAGCAAAAGTGTTAAATGATATTAAGGATAGTATCAATGGAACTGTAAAATTATTTTTTCAG
CCAGGAGAAGAAGTTGGTAAAGGTGCAAGAGCTATGATTCAAGATGGTGCTATGGAAGGTGTAGATAGTG
TGTTTGGAATACATCTTTGGACTGATGTAGAATCTGGGACTATATCGGTAGAAGAAGGACCAAGAATGGC
TTCTGCCGATTTCTTTAAAATTACTGTAAAAGGTAGAGGTGGTCATGGTTCACTTCCTCATCAAGGTGTT
GATGCAGTGCTTGCAAGTTCAGCAATAGTTATGAATCTACAATCTATGGTTAGTAGAGAAGTAAGTCCTC
TGGAACCATTAGTTGTGAGTGTTGGAGTTTTAAATTCTGGAACTAGATTTAACGTAATTGCGAGTGAAGC
TGTCTTAGAAGGTACAATAAGGCTATTTAATCCAGAGCTTAGAAAGCAAATTCCTGGAATTTTAGAACGT
ATAGCAAAATCTACAGCAGAAGCATATAGAGCAGATGCTGAATTAGAGTATGGGTACTTAACACCAGCAG
TTATAAATGACAAAGAATGTTCAAAGATAGCTACAGATGCAGCAATTAAGCTATTTGGAGAAGACTGTAT
AACACTATTTGAAAAAGTAACAGGAGCAGAAGATTTAGCTGAGTTTATGAATATAGCACCTGGTGCACTA
GCATTTGTAGGAGCTAGAAATGAGTCAAAAGGTGCTTGCTATCCTCATCATCATGGATGCTTTAATATAG
ACGAAGATGCTCTAGAAATTGGAACTGCTTTATATGTGCAATATGCAGTGGATTTCTTAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1159337-1160149 zinc transporter [Clostridium difficile R20291]
GTGATTTATTTGAATAATGTAATATTTGCATTTTTGATAACATTATTGGCTGGTTTATCTACTGGTATAG
GAAGTTGTATAGCATTTTTTGCTAAAAAAACAAATACTAAGTTTCTTTCTATAAGCTTAGGATTTTCTGC
TGGTGTTATGATTTATGTTTCTATGATAGAAATTTTTCCTAAAGCACAAGATGCTTTGACAAAATCTATG
GGAGAGAAATTAGGAAGTTGGTCAACTGTAATAGCTTTTTTTATAGGTATGGCTATCATTGCTGTTATTG
ATAAGTTAATTCCACAAGAAGAAAATCCACATGAAATAAAGAAAATGGAGAATATAGAAGAAAAGAATAT
CAAAAAAAATAAGTCTCTTTTGAGAACAGGTATATTTACAGCAATGGCTATAGCAATTCACAATTTTCCT
GAAGGATTAGCTACATTTATATCAGCTCTTGATGATGTTACAATAGCTATCCCGATAGCAATTGCAATTG
CAATACACAATATACCAGAAGGTATATCTGTATCTGTACCAGTTTATTATGCCACAGGAGATAAAAAGAA
AGCTTTTTATTATTCCTTTTTATCTGGTATGTCTGAGCCTTTAGGAGCGATTATTGGATATGTACTTCTT
AGAAATTTTTTAAATGATATAACTCTTGGAATTGTATTTGCAATTGTAGGAGGAATTATGGTATTCATAT
CACTAGATGAATTATTGCCATCAGCTAGAGAGTACGGGGAACATCATTTATCTATTTATGGATTGATTGC
AGGAATGGGTGTTATGGCTATTAGTTTATTACTATTTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1160245-1160805 hypothetical protein CDR20291_0947 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTGCTATGGAAAAGAAAATAAAATTCAAATTTGACTGGTATAGTTCACCTGATAAGATAGAGAAAT
GGTTAGAAGATATTGAAGCTAAAGGATATAATTTATATAAGATAAATAAATTTGGAGGAATATTTTATTT
TCATAAGGGAAGTCCAAGAAAAATAAAATACACTGTTGATTACTACTATGATGTAGAGAATAATTATTTT
GATGAACATAAATCAAATGGCTGGAATCTTGTATTTAGGAGTATTGGTAGTTTTATGGGTACATCTGCAT
GGTATATATGGTCGAAAGAATACAAAGACATACCTCCTAAATTATATAGTGATTCTGATAAAAAAAACAA
AGTAAAGTCAATTTTATTTATGAATATGTTTATATTCTTTATGTTAGTAGTAATATTTATATATTTATTG
AATATTGAAATAAGAAATTTATATAGTGGTTATGGAGCATCTGTAACTGCTATTGTACTACAGATTATAT
TGTTGATTTTATATGCAGTACAATTATATAGGAGATTAATGTATTATTTAAGGCTTAAAAAGTTTAAATA
A
>ref|NC_013316.1|:1161056-1161769 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGATTAAGATAGCAGTTTGTGAAGATGAAAAAGAAACACAACTTTTAATAGAAGATTACCTTGAGAATA
TATTAAAAGATATAAGTATAGAATATGAGATACAAAAGTATATATCTGGAGAAGAGTTACTGGAAAGTAA
TTTAAAAGATATAGATATATTACTTCTTGATATAAAAATGGAAAAATTAAATGGAATGGATACTGCAAGA
AAGATTAGAGAAGTAGACGATGAAATGGAAATAATATTTGTAACTTCATTAATAGATTATGTGCAAGAAG
GTTATGAGGTAAGAGCTTATAGGTATTTACTAAAGCCAATAGAGTTGGAAGAACTAAAAAAACATGTGCT
AACTTGTATCAAAGATATTGAAATAAATAAGGAAAGTCATATTACAATAAAAAATAAGTCTAATACATAT
AAGATTTATTTAAATGAAATAAAATATATAGAAGTTCAAAAAAAAGATATGCTAATACACACAATAAACA
AGAATTTTGATATAAAATATAGTTTAGGTAAAATAGAAAAAGAATTAAATCCATATAAATTTATAAGATG
CCATAAAAGTTTTATAGTAAATTTAAGATATGTTGAAAATATAAAGCCTAATGCTGCAATACTGGAAAGT
GGAGAAGAGGTACCTATTAGTAGATATAGATATAAAGAAGTTAAGGAGAAATTTTTAAAATTTCTTGGTG
ATACAATATGCTAA
>ref|NC_013316.1|:1161763-1163142 sensor histidine kinase virs [Clostridium difficile R20291]
ATGCTAAATTTTATGAATGAGCTATTAGTAGTTTTATCTATATTTATACAGTTTTCTATAATGAACGGAA
TTTTAATTTATAAAAAGGATAGTAAAAAAAATGAAAAAATAGTATTCTATATTGTCTTGTTTCTTATTTA
TATTATAATTCAGATAAGTAGATTATTTAATGGAGGAAGTTACTTTAGTAATATAAACTATTTATTTTAT
ATATTAGCATTTATTGCTTGGGGAGGATACTATAATTATTTTTATAAGATGGATTATATTAAGTATTCCA
TTTTCTTTTATCTATTTAGTGTATATTATAAATGTTTGGATGCTGTTATATATAGAATACTATTTTTTGC
AATTACAGGTAATGTTATTTCATCTAAAGAATCCTTATTAGTACCTCACTTAGAATCTATAAAAATTCAG
ATATATAGTAATTTAATAATTATTCTTATATATCTTGTATTTAGCTTTTTTAGGAAGTCTATAAAATTAA
TTAGCCAAGATAAGAGAAATTATGTATATTTATTATTTGCCTTATTAGCTAATACAATGAATATGCTTGT
AAATTATGTATTAAAAAAATTAGAACGGTTTGGGTCATTACATTCAGAAGGATACTATTTTGATAATTTT
GTTAATCCAAAGTTGGTAGGAGCTAGTAGTATATTTCTTATATTATTGTTTAAAGAAATAATAAAAGAGA
ATAGATTAAAATCTCAAGCTGAATTAATAAAAAATAAGTTAGATATGCAATATGCGCATTATTTAAGTAT
TCAAGAATCTCATATGCGAGTTAAGAAACTATATCACGATATAAATAACCACATTTATTGTATAGACAAC
CTTAGAAACAATAGCAAAGAAATTAATGAATATGTTAACAATTTAAAAGATGAAATAAAAACATTTAAAT
ATATCTATAATACAGGAAATATGATATTAGACATTATAATCAACGAAAAGAGTGAAATATGTTTAAAAAA
AGGAATTAAATTTACTTGCTCTATAAATTTTTCAAAAGTAAATTTTGTAAAACCTATAGATGTGTCAAGC
ATATTTTCTAATATTTTGGATAATGCAATAGAAGCATGTGATAAAATAGTGGATGAAAATATTAATAAAT
ATATTAGAATTAAAGGAACTATAACAAAGTCATTTTTTGTACTTAAATGTGAAAATAGTAAACTAAATCA
GCTTACTTTTAATAAAAATATATTGTTAACAAACAAAATGGATAAGTTCGTACATGGAATAGGTATTCAG
AGTATTAAATCTTCTTTACAAAAATATAATGGAGAATTATTATTTGAAAATAGTATCGATAAATTTATAC
TAAATATATATATACCATTGGAGCAAGATACTGACAGTTGGGGCGATTAA
>ref|NC_013316.1|:1163368-1164072 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAGGATTGTGTATGAAAGTAAAAAGGAATATAAATAGAGTGGCAATAATTGTGGCTTTAAATCTTA
GCTTAGCATTGATGGCAGGATGTATGTCTCCTGTATCTGATAAGAACTTAAGTAGCTCAGAACAAATTAG
TAAAGATTCATTGAAAGAACAAGTTGAAGATAAAAAAGATGAATCTATCGAGCTATTTAATAATTACTCA
CAAAAGATTAATGATGCGAAAGGTAGAGAAGAAGTAAAAAAAGATTTATCTCAAAGATTTTCGAAAGCTA
TAATAGACAGTGGTTATAGTATTACTGACTCAAAATCAGATGGTAGCTTTGTAGTATCTATAAATGGTGC
TGAAAAACCACCTGAAAAAAATATTCGAAGTTTATTCTATTCTATGTCTGAAGACGATAAAGAAGGAAAA
GTAACAATAGATATTCTCTGTGCTAAAGAGTATCCAGAAGATGATAAGTTATCTGAGAGTGATAAATATA
TTAAATTTATATACAATTTATTTAAATCATTGACTAATACGAACTTAACTGAGAAAGAAATTTTTTCTAT
GGTTGAAGAAGAATTTAATAAGGGAGTAGGTGTTGTGGAGCTTCCTTATATGAAGGATATACATGTTGAA
GTTAACAAAGTTAAACAATCAACTAAGGTTTTAAAACTAAGTCTAGTATACAAATTTGATATTTCAAATC
ATTAG
>ref|NC_013316.1|:1164291-1166663 glycerol dehydratase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTCAAACTAATAGAATAGAAGCATTTAGACAAGAATATATTAATTCTAAACCTATGATATGTTGTG
AAAGGGCTAGAATTTTTACAGAATCACATAAAAAAACTGAGGGAGAAGCTATCTGTATAAGAAGAGCTAA
AGCTTTTTTGGAGACATGTAAAGAACTTCCTATAAAAATCTTTGAAAATGAATTAATAGTAGGTACAGCA
GGAAAATTTAGAAGAACAGGGATATTGACACCAGAGTTTTCTTGGCAATGGGTAGACAAAGAAATGGATA
CTTTTGATAAAAGAACTCAAGACCCATATGTAATATCAAAAGAACAAATAGAATTTATAAGAAAAGAAAT
ATTTCCATATTGGAAGGGAAAATCTTTGGAAGAAGTTTTCTTAGCAAGAATCCCAGAAGATACAGCTAAG
ATATTAGTAGATACAGGAATAATAGATAATGATTCTAAGTGGAGACAGGCAGTTGGTGAAGTAACACCAG
ATTATCAAGATATATTGTTTGTAAAAGGATATAAAGGGATTAAGGAAGATGCAGATAAAAAAATTAAAGA
ATTAGATATATCAGTTTCAGAAAATATTGAAAAGATAGATTTTTACAAATCTGTTTCTATAGTTGCAGAG
GGTATTATGACATTGGCACAAAGATATTCAAATCTTGCAAAAGAGATGAGTAAGCAAGAAACAGATGAAA
AGAGAAAGTTAGAACTTATAAAAATTTCAGAGATATGTATGAATGTACCAGCAAACCCTCCAACTAATTT
TTATGAAGCAATACAATTTGTATGGTTTGTTCAATTAGGTGGTATTCTATCAGAAAATCCATTGGCATTA
AATTTAGGTAGATTTGACCAATATATGTATCCATATTATGAAAATGATGCTAGAGAAGGTAAAATAACTG
AATCAGAAGCTCAAGAATTGATAGAAGCACTTTGGATTAAGTTATCAGAATGGGTATGGACTATATCAGC
AAATACAGCAAATTACTTTGCAGGATATAATCAATTCCAAAATCTTACTGTTGGTGGTAAAAAGAGAAAT
GGTACTGATGGAACGAATGATATCTCATATATGTGTTTAAAGGCTACAGAAAGTGTAAAAACTCACCAGC
CAGGATTAAGTGTTAGAGTGAGTCAAGGAGCACCAGATAATTTCGTAATGGCAGTTGCTAAATTGGTAAA
ACAAGGAACTGGTTTCCCTGCTATACACAGCGATAGTGCAGGGGCACAAATGTTATTACAAGATGGATAT
GATGCAGAAGATGCTAGAGATTGGAGTAACTGTGGTTGTGTAGTTCCTCATTTTAGAAAAACAGGACAGT
GGACTTCAGCCGTAAATATCAATTTTGCAGCAGCTTTAGAATATGCTATGAATGAAGGTAAGAGTAGATT
AACTGGAGAAAAAATGGGGTTAGATACAAAAAATATCACAGAATTTACTTCTTTTGAAGAACTTAAGGAT
GAGTTTTTAAAGCAATTAGCATATCTTGTAAAAAGTTCTGTTATAGGAACTACTGTTGCTCAACAAATTC
ATAAAGAAATGGTACCAAGACCATTTTTATCTACTTGTGTAGATGGATGTTTGGATAAGGGAGTTGATTT
AAGTAAAGGAGGAGCAAAATATAATATAGGTCCTGTATTAACTGGTATAGGGTTAGGTGTAGTTTCAAAT
TCATTGGCAGCTATAAAAAAATTAGTATTTGAGGATAAGGTGACTACGCTAGAAGAATTAACAAAAGCAC
TAAATAATGATTGGGAAGGTTATGAAGAATTAAGAAAACTTGCGTTGGATGTTCCTAAGTATGGAAATGA
TAATGATTATGTAGATTCATTAGCAATTGAAGTTTCTGATTTTTATTATACTGAAACTAGAAAATACAAG
GATATTTTTGGCTCTAAATTTAATAGTGCATTTATGGGTATATCAAACTATGTACCAACTGGAAAAATCG
TAGGTGCAACTCCTTGTGGAAGAAAAGCGACAAAACCTTTGACAGAGGGAGTTTCTCCGTTTGTTGGTAC
TGATACAACAAGTCCACTAGCAGCCATGAAATCTGCATCAAAAATAAATCATGATGTTCATACTGGTGGA
ACACTTCTAAATTTAAGACTGAATCAAGATTTGGTGGAAACTGAAAGAGGACTTAGAAATCTAACATCTA
TGATTAAATCATATTTTGCTTTAGGAGGATTCCATGTACAATTTAATACGATATCAAATGATACTCTATT
AAAAGCTCAAGAAAATCCAGAAGAATATAAAGATTTATTAGTGAGAGTTGCTGGATATAGTACTCAATTT
GTTAATTTATCAAGAGAAATGCAAGATGCTATAATAGCTAGAAATTCACATAGCAATTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1166678-1167580 glycerol dehydratase activator [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAAAAAGGTAGAGTTGTAAAAGTACAACATTTTTCAGTAAATGATGGAGATGGAATAAGGACTA
CTATATTTTTAGAAGGATGTAAATTAAAATGTAAGTGGTGTTCTAATCCAGATTCCTGGAGTAACATAGT
AAAATTAGGTGTTATGAAAGATAAATGTGTATCCTGTAATAGATGTATAGATGTTTGTCCTCAAAATATA
AGTTCACTATTTGATAGAACGCAAATAAATAATAAATGTGATTTATGTGGAGAGTGTATCAAGGTATGTC
TTAAAGATGCCATTTGTATAATGACCGAAAAAATGAGTGTTGAAGAAATAGTAGAGGAAGTTGAAAAGGA
TTTTATATTTTTCTTTGAATCTAATGGAGGGATAACTTTTTCTGGAGGTGAACCTACACTTCAGATTGAT
TTTTTAAGAGAATTAGTTGATATTTTTTATGATAAAGGCATAAATATTGCAATTGAAACTTGTGGATATT
TTGATTGGAATAAGGTAAATGATGTATTTGAGAAAATAGACCACATATTTGTAGATATAAAATCTATGGA
TGATAATATTCATAAAGAATATACAGGAGTAAGTAATAAAATTATATTAGATAATATATGTAGGCTTTCA
AAGTTGAATAAATCTATGGTTATAAGAGTGCCAATTATTTATGGAGTAAATGATAGTGAAGAAAATATAA
GAAATACTGCATTATTTGTCAAACAAAATGTTCCAGGAGGCAAGATGGAGTTACTTCCATATCATAAATT
TGGAATCGATAAATATAAGGCATTAGGGCTTGAAGATTATATATATGAATTTGATGAAATTTGTAACAAT
CATATGTTAAAATTAAAAGAGATAGTAGAACTTACAGGAGTAAAAATCATAGAATACAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1167600-1168151 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAATAAATTTCCTAATGTGGGAGAAAATTTAAGGTTATTGAGACAAGAAATGGGCATAAGTTTAG
ACAAAGCTTCAAAGATGACAGGTGTCAGTAAAGCAATGCTTGGACAGATTGAGAGAGGTGAATCAAGTCC
GACAGTATCTACTTTATGGAAAATTTCATCTGGATTTAAAATAAATTTTACTACACTATTAAATGAAAAT
ACAAATACCTATGAGGTTATAAAGAAAGAAGAAGTAGAGCCTATTGTTGAGCAAAAAGGGAACATGAAGT
TATATCCAATATACCCTTTTAGCCCTCAAAGAAGGTTTGAACTTTTTATAATTGAGCTTGAGGAAAACTG
TACTCATGTTTCATCTACACATAGTTATGTTTTAGAAGAGTATGTACTCGTAATAGAAGGTAAACTTGAC
CTTAATGTGGATGGGAAAACTTATATTTTAGAGTCTGGACATTCTATTAGGTTTGATGGAACTTTAGAGC
ATATATATAAAAATTTAAATAAAGGAAAAACTATATTTCACAATATAGAGGTTTATAGATAA
>ref|NC_013316.1|:1168315-1169187 putative phosphoesterase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTATAAAGGTTTCAATGACAGTATTAGTATTAATATTATTGTATATTCTGTATAAGTATGAAACTC
AGCATATAGAAACGACAGAATATACTATTTTCAACAAAAAAATTCCAAAGGAATTTGATAACTTTAAAAT
AGTTCAAGTGAGTGATTTACATAATAAGGTGTTTGATAAAAATAATAAGGTATTGATAGATAAAATTGAA
TCATTAAACCCAGATGTTATATTTATAACAGGAGATTTAGTAGATGGAGAAAATAAAAATTTTCAAGTTG
CATTAGATTTAATAGATAATTTGGTTGAAAAATATGAAGTATATCATATAATTGGAAATCATGAACAAAA
ATCTTTAATAAAAAAGTATAAACATCTATATAAGGATTATTTTAAGGAACTATATTCAAAGAAAATAATA
AATATGGAAAATGAATCTGTAAGAATATATAGAGGTAATAGCCATCTTAATTTATATGGTTTAATTATAC
CATTGGAATGCTATCCATATTTATTTGCTAATAACAAAAAATTAGAACTAAGTGACAATTTTGTAGAAGA
CAATCTAGGTAAAGTTAATGAAAATGAATATAACATTCTTTTAGCACATACACCATTTTTCTTTGAAAAA
TATGCAAAATGGGGAGCAGATTTGGTTTTAGCAGGACATGTTCATGGAGGTATAATAAGAATACCTTTTG
TTGGAGGTGTATTATCTCCAAATAGAGAGTTCTTTCCTAAGTATGACTGGGGAAAATATGAAAAAGATAA
TAGCACTATGATTTTAAATAAAGGCTTAGGAGGCTCAAAAGTTTTAATTAGGCTTAATTGTAAACCAGAG
ATAGTTAAGATTACATTGAAGTATGAGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1169351-1170331 hypothetical protein CDR20291_0955 [Clostridium difficile R20291]
ATGGGTGATACAAGTAGATTTTATGAGTCTGTAAAAAATAAATATCCGAAATTAAAAGATGGAACTAGGG
TTCATCTGTGGCCAAAAGAAAACATTATAATTGGTCCTATTTATGATGAAGAAGATGGATATAAAAAAAG
TATCGGAAATGTGGATAGCTTAAGTTGGAAGCAAATTGTTATACTGGCTGAATGTGATGGGAAAAATACT
ACTGACGATATAATAAATATATTATCCAATAGATATAGAAATATCCATAATATGAAAGAAAAAGTTATGG
AATTTTTTATGTTTTATGAGAATGTATACTTAACGTTTGAAGATGATATACAGACACTATCAAGTGTATT
TGAGATAACAGGAAATAAATCATACATTACTCCTTTGTACTTTACTATAGAAATAGATGGAGATAATAAT
ACAAATGATTATTTTTCTGAAATCACAAGTTTATTGAACTGCATGTATGAGAAAGGCTGTAGATTTATAG
AGGTTATTGGTGAGGATATTTTAAAAAATAAAAGTATGAGAGAAATATTTCAATATATGTTAGACCATTT
TGATTTAATTGTGGTAACTAAAGATAGCTTTACTATTGATAGAAGCTTAATAAAAGAATTAGATAATTAT
CGTCATAAAGTGATATGGAAAGTATATTCAAAAAATGATGATACACGTATTAAATTAAAAGAAGATATAA
AAATAACCAGTTTAATAAAAAGGGGTCACACTGTAGTAAGAGGAGACAGAGAAAAAGCAATAAAAATAGA
AGATATGAGGTTTAAAGATACAAAGGAGAGGTTTTCAAAATATGGAGCAGAGTGGAGTCATTTATATATT
TCTTCTGATGGTAGTGTAAAATCTTATTCATTTCAAAAAGATAAAAGAGTCTATTTAGGCAATATATTTA
ACAATTCTGTTGAAGAAATTTTCTTAGAGATGCAAAATAAAATTGACAAACTAGAAATTGTGTATCAATA
A
>ref|NC_013316.1|:1170832-1171053 hypothetical protein CDR20291_0956 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGTAAATAATCACAAGTGCCCAGAGTGTGGTGAACATAGTAAAAAGTTTGAAATAGTAGAGGAAA
ATGAGGATTGTGTAATATTTGAATGTTACACTTGTGGAACTATATCTATATTAAAGTATTGTGAGAACTG
TAAAGAATTTGTATTTGTAAATATTCCAAATAATGTGGAGACATATGAGTATTGTTGTGGAAAATGTAAT
AATAAAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:1171559-1172428 nitroreductase-family protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGATTATAAAACAATCATATTAAATAGAAAGTCTGTTAGAGAATATAAGAACATAGATATTAAAGAAG
AATATCTTAGTGAAATTAAGAAATACTCAGAATCTTGTAAGAAACTAGTTCCAGAAATAGATGTTGATGT
AAGAATTATGAATAAAAGTGAAGTTTTTAATAATTTAGATAAAGTAGCAGGGTACAAAGGAAATATGATA
GATTCTCCAAGTTATATTATAATATTATCTGACATAAAAGATAATTACATTGAAAATTCAGGGTACATAG
GAGAAAGTATAATCTTTAAAGTAACAGAACTTGGAATTGGTTCTTGTTGGGTTACTTTTGAAGATGGAAA
AAAGGTAAAAGAAAAACTTGGAATTAATTCAGATAAAGAGGTAACAGGAATTATAGCTATTGGATATGGA
GAAAATGTAAGTAATGCTAAAGTATTAAATGCTACAAAAACTGGGCAAAATTATTCAAAATCTGATATGC
AAGTTGTAACAGATAAGGGGTCTACTAGACTAGGTGTAGAAGATGTTGTTTATATGAACGAATGGGGAAA
TGTTGCAAGTATAGAAATCTTAGAAGAAAGAGCACTTCTTGATGCATTTCACTATGCAAGATTAGCTCCA
TCTACATTAAATAGACAACCATGGAGATTTATAGTTGATGGAGGCACTGTAGTTTTAGCTGTTAGAAAAG
ATGGTCATACTAATTTATATGAAGAAAAAATAGACATTGGTATAGTTATGCTTTATTTTGCAACAATAAT
AAGTGCAACTATGTTTGATTTAAAATGGAATTTAGGTACTCCAGACAAAGATTATAAAGTGCCAGAAGAC
TATAAGATAGTAGGATATTGTAATATATAA
>ref|NC_013316.1|:1172654-1173520 AraC-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATGGATAAATAAATTAAATCAAGCTATTACTTATATTGAAGAAAATCTCGAAAGTGGAGTGGATT
ATGCAGAAGCAGCAAAAATTGCATGTTGTTCAACCTTTCATTTTCAAAGAATGTTTTCATATATTGCAGA
AGTACCATTATCTGAATATATTAGACGAAGACGTATGACTAAGGCTGCATTTGAACTTCAGAACAGTAAC
ATCAAAATTTTAGAACTATCTGAGAAGTATGGTTACGATTCACCAACATCTTTTAATAGAGCTTTTCAAA
ATATACATAACATTTCTCCATCTGCAGCTAGAGCAAAGGGTGTTGTTTTAAAAGCATATCCTAAGATGAC
ATTAAGCATTTATGTAAAAGGAAATGTAGAAATGCAATATCGTATTGTAGAAAAGAAAGGGTTTCGTATT
GTTGGTATAAAAGAAAGTATGAACATGATTGTAGAAGAGTGCTTTGAGAAAGTTCCTAAGTTATGGGCTA
AATGCATAAAAAATGGAACAATTGATAAACTTTCAGAGTTAATAAATAACGAACCTTGTGGATTGCTTGG
AGTTAGTGTGTGTACAAATAGTAAGGGTTTAGATTATTATATTGCTGCACCAACAGATAAGCCTGTATTA
GAAGATACTCGTGAATACTTAATACCATCAGGTACATGGGCAGTATTTGAATGTGTTTCTCCAATGCCAA
ATGCTCTGGCAATACAGGAATTGCAAAAAAGAATTATTACTGAGTGGTTACCAAGTTCTGGGTATGTGTA
TGCTAACTTACCAGATATTGAACTTTATCCCAATGGCGATATCAATGCTCCTGATTATACTACAGAAGTT
TGGATTCCAATTCAGAAACCAAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:1174593-1175711 transposase-like protein b [Clostridium difficile R20291]
GTGGCAGTAGTGGAAAAAGCTTATAAGTTTAGAATGTATCCAAATAAAAAACAACAAGAGTTAATTAACA
AAACTTTTGGATGTTGTAGATTTGTATATAATAAGTATCTTGCTAAAAGAATAGAAGTTTATAAAAACGA
TAAAGAAACTTTTACTTATAAACAGTGTAGTTCTGATTTGACCAATTTAAAAAAAGAATTAAAATGGCTT
AAGGAACCTGACAAATTTTCACTACAAAACGCCTTAAAAGATTTAGATAATGCATATAAAAAATTCTTTA
AAGAAAAAGCAGGATTTCCTAAATTTAAATCAAAGAAAATTAATAGATTTTCATATAAAACTAACTTTAC
AAATGGAAACATTATGTATTGTGGTCAATATATAAAACTACCTAAACTTGATATGGTTAAGATAAGGGAT
AAACAAGTACCTAAAGGGAGAATACTTAATGCTACTATATCTAAAGAACCAAGTGGTAGATATTATGTAT
CATTATGCTGTACTGATGTAGACATTGAAGCATTTGAAAATACTAACAATCAAATAGGTTTAGATTTGGG
AATTAAAGAATTTTGTATCTCAAGTTGTGGAGAATTTATAGAAAATCCTAAGTATTTTAAGAAGTCATTA
AACAAACTTGCTAAATTACAAAGAGAATTATCGAGAAAAACAATCGGTAGTTTAAATAGAAATAAAGCAA
GATTAAAAGTTGCAGGACTTCAAGAACATATAGCTAATCAAAGAAATGATTTTCTACAAAAACTATCTAC
TAAATTAATAAAAGAGAATGATATTATTTGCATAGAAGATTTACAAGTAAAGAATATGATTAAAAATCGT
AAACTATCTCGCTTAATTTCTGATGTATCATGGTCAGAATTTATTCATCAATTAAAATACAAGGCTAATT
GGTATGGTAGACAAATTGTAAAAGTAGGCAAATTCTTTGCAAGTTCACAAATATGCAATAAATGTGGGTA
TAAAAACGAGGAAGTTAAGGACTTAAATATAAGAGAATGGATTTGTCCTAGTTGTAATGAAACTCATGAT
AGAGATATAAATGCAAGTATAAATATATTAAAAGAAGGATTAAGATTAATAACAATTCAAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1175870-1176313 hypothetical protein CDR20291_0960 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGAATATGTTATATCTTGGAATAGTATATTTTATTTGTGGAATTTTACTTGTTTTATTGGCTA
CGTTTACTGAGTTTTCATTTGAGGCTTTTATTTGGGGATTATCTGGAGCTGCTTTAGGTCCAGGTATATG
TATGATTTTTCAATATATGTATTGGAGTAAGCCTGAAAGAGCAGTAGATTATGAAGAAAAGATAAAAAAC
CAAAGGATAGAGATGAATGATGAAAGAAGAGTTATGTTACGTGATAAAGCTGGACGTATCACTAATCAAA
TCATGTCCTATGTTCTTGTAATTCTTATATTTATTGTTTCTATATTGAGTGTATTTTCTGTAATGGTAAT
AAGCAAGTGGGTTTTAGTTGTTCTTGGATTGCTTATTTTATTTCAATTTATTTGTAGTGTTGTTGTATAC
AATAAATTAGATAAAAAGTTGTAA
>ref|NC_013316.1|:c1177899-1176763 hypothetical protein CDR20291_0961 [Clostridium difficile R20291]
TTGTTTATTTTTTATTGCTTTGGTAAAAATAAACTAATCAAAATAAAAGTAAGGAGATGTAGCATATTGA
ACAAAAGACATAGTCTACCTATAGTATCAGTGATATTATTGATGGTCTTAATTATCTTTAATAATAACCA
AAATTATATTACAATGAAAGAAGTTTTTAATGTCCATATTATGCAGAGTCAAAATAAAAAGATTAAACAA
AAGTATTATCTAACTAAAGATGGATGGCTATTAGGCAACTTTGCTAAATTATTATCTGATTATCATATAA
AATCTTACTCCAAAGCCATTAATAACTTGAGTAAGTTAAATAGAAAAAAAGATTTTTACTTTGTTTCACT
TCCTCATAAGACAAATATGCTTAAGCACTTGTATCCAAGTGGTATAGAAGGTAAAAATAATATAGATATT
AACAAAGAAAACTTAGAAAAGCAGTTAACAGACATAAATTTCTTAGATATAGATGATTACTTTTATAGAA
GTTTTACCGAAAAAGAGAGAGAAAAATTCTTTTTAAAAACAGACCATCACGGAAATTCATTAGGAGCATT
TGAAGAATATAAGTTTATTCTTGATAAATTAGACCTTGGCTTATCTAAATCAGAAATAGATAGTCATTTA
AAAAGATACAGTACTCGATATGTAAATGACAAGGTCTTTATAGGTAGTTATAATAAAAAGATGGGATATC
CACTTAAGAAAAAAGAGTCTATAAGCTATGTTGAAATAAGTGATGCAAATTACAAATATTTTATTAGTAA
TGGTACTAAAAATACTGAGATTAATGAAAATATCATAAAAGCAAAATTAAAAGATAAAAGAGAATGGGAC
TATGGTGGAGCTTATATGAGAGGTTGTGATTGTCACATACTTAAGATTAGAAATTCAAGCTCTTTAACTA
ATAAAAAGGCCCTTATATTTAGAGATTCGTACCAAGCACCTATGACTTGGATGTTGGCTGATACTTTTAA
GGAACTCGAAATACTAGATCCTAGATATATAAAAAATATAGATATGACCTATGATGAGATAATTAAAAAC
AGTAATGCGAATGTAGTTTTATTTATGTATAATAGCTTTGGATTTGCTGGAATGATACAAGAAATGATTG
ACAAGGGAATAGCATAA
>ref|NC_013316.1|:c1179149-1177947 hypothetical protein CDR20291_0962 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAAAAAAAACCAAGGATTGTTGCCATTTCATTTTTAATTATAGTATTTGGATTTTTCATACTAA
ACTTCACACTTCCAAAGAAAAAATTAAGTATAACTGAAAATAGAAATCTTGCAAAATTTCCGACTGTAGA
AAATTTAAAAAAATGTGACTTTATAGCCAAGTTTGAAGAATATTTTAATGACCATTTTGCATTTAGAGAT
GAAATGATATCAATAAATACAAGGACTCAGGCTAATTTAAATAAAACTAAGGTAGGTAACTATTATCTAG
GAAAAGATAACTGGATATTAGGTATGTTTCCAGAAATTTTAGACCAAAAACAATTAAGTCGATACGAAAA
ATCCATTAATTATTTATCTAATCTAAGTAAAGATATGGGAAAAAATGTGTATTTTACAATGATGCCACAT
AAAACTAATATGTTAAAACATTTGTATCCTAAATATGTTGATAATATGGATAATATAGACATAAATTTAA
AGAATTTTAAAAATAGATTAAATCCAGATTTAATTAAATATATAGATATGGATGAGTATTTTTTAAGTAA
CTATTCAGATAAAGAAAGAGAAAATTTATATTTTAAAACTGACCATCATTGGACTGGATATGGAGCATTT
GAAGGCTTTAAAATGATGGCATCAAATATGGACTTAGGTCTATCTAAGCAAGATTTAGACAAGCATTTTA
GTAGCTATAAAAAGTCTATAATTACTGATAAGAAATTTATAGGAAGTTATAATCAAAATATAGATATGCT
AATTAAAGAAAATGAATATGTAGTTTATATGACAAAAGATAACCAAGATTATAGCTTTGATATAAATGGA
GAAGAAAAAGAAGAAAAAGAAGAAAAAGAAGTTTATGCAACTGAAAGAGATAATAAAGAGTGGGATTATG
GTGGTGCATACATTAGAGGAGCTAAAACTAATATATTAACTATAAAAAACCCTAAAGCATTAGTAGATAA
AAAAATACTAATATTTAGAGATTCATATCAGGCTCCTACAACACTTTTATTTGCTGATATGTTTAAAGAA
GTAGAGATAGCAGACCCTAGAAATATAAACTCAATATATAAAACATACAAAGAGATAATCGAGGAAAGTA
ATGCAGATATTGTAATGTTTATGTATAATAGTTCTGGGTTTGATTCAATGATAGATTCAATGATAGATAA
AGGAATAAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c1180574-1179165 hypothetical protein CDR20291_0963 [Clostridium difficile R20291]
ATGATATTCAGTAGTTTAATATTTTTATTTTTATTCTTTCCAGTCACACTCATTTGCTATTACTTGGCAA
ATCCTAAGTATAAAAATGTTATGTTACTTCTAGCAAGTATTGCATTCTACGCATGGGGAGAACCAAAATA
TATTTTTTTGATGATACTATCAATAATAGTAAACTATATATTTGGTATTAAAGTTTCTGGCAGTAAAAAT
AAAAAAATGTGGGTTGTGCTTTCTGTTATTTACAATATATCTATTCTTGCTGTATTTAAGTATAGCAATT
TTTTTATAGATAATATTAATTTTTTATTCAATACAGATATAACTATACCTGAGGTTAAATTACCTTTAGG
TATCTCATTTTTCACATTCCAAATAATGAGCTATGTAATAGATGTATATAGAAATGATGCTAAAGTTCAA
AGAAAATTAGCTAATTTAGCATTATACATAAGTTTATTCCCTCAGCTTGTAGCAGGTCCTATTGTTAGAT
ATCAGACTGTTGCAGATAGCATTGAGTATAGAGAACACAATTGGGACAAATTTACTCAAGGTGTAAACAG
ATTTGTTGTTGGTCTTGGAAAAAAAGTAATTCTAGCAAATCAATTAGGTGTAATCGCAGATGGTGTATTT
AATAAGTCAGCTGGAGATTTATCAAGACTTGAGGTATGGCTAGGTATAGTTTGCTATACACTTCAAATAT
TCTATGACTTTAGTGGCTATAGTGATATGGCCATTGGTTTAGGTAAGATGTTTGGATTTGAGTTTTTAGA
AAATTTCAACTATCCATATATCTCTCAAACAGTATCTGAGTTTTGGAGAAGATGGCATATATCTTTAGGT
ACTTGGTTTAAAGACTATGTGTACTTCCCATTAGGTGGAAGTAGAGTCTCTAAGGCAAAACTATATAGAA
ATCTATTTGTAGTATGGTTTTTAACCGGGATGTGGCATGGAGCTAGTTGGACTTTTATTATATGGGGTCT
ATATTATGGAATATTAATATCAGTAGAAAAAGCATTCTTAGAAAAATTTCTATATAAGATGCCAAGAATT
GTAAGACACATATATCTACTTCTTATAGTCATGATTGGATGGGTATTTTTTAGAGTTGATGATTTACCAG
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ATTTATAATTGAATATTGGTATATAATTGTTGGGGCAATCCTTCTATCAACTCCTATTGTAAAAGTTGTA
AAATCATTATTAATTAAGAAAAATAAAAATACATTAAATAGCACATTATATCAAGTTACTAATGTGGTTT
TCATTGTTTCTTGTATGTTTATTGTAATAATAATGTTAAGTAGCTCAACCTATAATCCATTCTTATATTT
TAGATTCTAA
>ref|NC_013316.1|:1182350-1184998 DNA polymerase I [Clostridium difficile R20291]
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AAAGAGTATAAGGCTGGAAGAAAGGGAATGCCAGATGAACTGGCAGAACAATTACAGCCATTAAAAGACC
TTTTAGATAAATTCAAAATAAATAGATTGGAAATAGATGGGTATGAGGCAGACGACATTATAGGAACTGT
TTCTAAAAAAGCAGAAAATAATGGGTATAAGGTATACATAGTAACTGGAGACAAAGATGCTATTCAACTT
GCTTCAGATAATACAACTACTCTTATAACAAAAAAAGGAGTTGGAGAAGTTGAAGAATACAACTTTAATT
CTGTAATTGAAAAATACGAGATGACTCCAGCACAATTTATTGATTTAAAAGGTCTTATGGGAGATAAGTC
AGATAATATACCTGGAGTACCTGGAATCGGTGAAAAAACAGGTATAAAGCTTATAAAAGAGTTTTCTAGT
ATAGAGAATTTAATAGAGAATACAGATAAGCTTAAAGGTAGTGTAAAAAAGAAAATAGAGGAAAATAAAG
AAATAGCTATTCAAAGTAAAAGACTTGCAACAATTATAAGAGATGTGCCAATAGAAGTGGATTTAGATAG
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TTATCAAGATTAGTTGATTTGGTCGATTCAGATGACACAGAACACGTAGAAGAAAAAATAGAAATATTAA
AATTAAAAGATACAGAAAAATTTATAGATGAAGTAAACAAAAAAGGACAAGTTATTTTAAAAACTGTTAG
AGGACAAGGTAATATACTTGAAAAAAATATAATATATATTTTTATAAGTGTAGATGGAGAAAAAATATAT
TATGTAGATTCAAATGAAGTGTCAAAGTTAGATAGTATATTTTCAAATAATGAAATTAAAAAGTATGGAT
ATAATTTAAAAGATGATTATATATCTTTAAAACCATATAATATAAACTTAGAAAATATGTATTTTGATAT
AACAATAGCTGAGTACTTAATAGATTCAACTTCATCTACCTCATATGATTGTAGTGCAATAGCTATGAAG
TATTTATCAAAAAAGGTTAAATCAAAAGAAGAATTATTAGGAAAGGGTGTTAAATCTAAAAACTATGAGG
ATTTAGAATTTGAGGATTTAGCAGAGTATATGGGTCAAATAATATGCACAGTTAAAGAAACAATTCCTAT
GATGGAAAGAAGTCTAATGGATATGAGTATGGATGGTCTTTTTTATCATGTAGAGATGCCTTTAGTAGAA
GTCTTAGGTCATATGGAGTATGAAGGTATAAAAGTAGACAAAAGTATATTGGATGAATTGAGTGTAGAGT
TTAAAGAAATAATAGCTACACTAGAAAAGGAAATTTATGAATTATCAGGAGAGCCATTCAATATAAATTC
ACCAAAACAATTGGGTGTTATATTATTTGAAAAATTAGAGCTTCCAATAATTAAAAAAACTAAAACTGGA
TATTCAACTAATGCAGATGTTTTAGAAAAATTAAGAGATAAGCATCCAATAATAGATAAGATAACTGAGT
ATAGACAAATAGTAAAGTTAAATTCTACTTACGTTGAAGGACTTTTAAATATAATAAATCCAGAAAGTAA
TAGAATACATTCATCATTTAATCAAACTATAACGACTACAGGAAGAATTTCATCTACAGAACCAAATCTT
CAAAATATACCTATAAAAATGGAAATGGGTAGAAAAATAAGAAAAGTGTTTATTGCAGATGATAACTGTA
AGTTGGTTGATGCCGATTACTCACAAGTAGAGCTAAGAGTTCTTGCACATATGAGTCAGGATGAAAATAT
GATAGAAGCATTTAAACATCATGAAGATATTCATACCAAAACAGCTTCACAAGTTTTTAATGTTCCTATG
GAAGATGTTACTAGTGAATTGAGAGGTGCAGCTAAAGCTGTAAACTTTGGTATTATATATGGTAAAAGTG
ACTTTGGTCTAGCTGATGATTTAAATATACCTGTTCCAAAGGCGAAAGAATATATCGAAAGTTATTTTGC
TAAATACCATAAAATAAAAGAGTTTATGGACACAACAGTAGAAAAGGCTAGTGAGGATGGATATGCTGTA
ACAATTTTAAACAGAAGAAGATATATACCAGAAATAAAGTCAAGCAATTTTATGGAAAGAAATAGAGGAA
AGAGATTTGCAATGAATGCACCAATACAAGGAAGTGCAGCAGATATAATAAAAATTGCTATGATAAATGT
TCATAAAAAATTGGAAGAGAACAATTTGAAATCAAAACTTATACTACAAGTTCACGACGAGTTGATAGTT
GAAGCAATTGATGATGAAATAGATATAGTTAAGAAAATAGTAAAAGAAGAAATGGAAAATGCTGTAAATA
TGGATGTTCACTTAGATGTAGATTTAAATGTAGGTAGTTCTTGGTATGAGACAAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:1185007-1185609 putative dephospho-CoA kinase [Clostridium difficile R20291]
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TTAATATTTCTATAGTGGATGCTGATATTATATCCAGGAAGATATTTGAGGATAAGTTGTTATTGGAAAA
AGTATTTGTCCATTTTGGGCAAAGTATAAAAAATGATGATGGAACTCTAAATAGAAAAGCTCTTGGGAAA
ATAGTTTTTAGCGATGAAGAAAAACTTAAGGAATTAAATAGCTTGACTCATCCGCGAATAAGAGAAAAAA
TAATAAGTGAAATAGAAGAATTGAGAAAAAAAGGCGAAAATATAGTAGTATTAGATGCAGCAATATTGGT
AGAAAGTGGTTTTTTAGATATGGTTGACAAGCTATTAGTAGTTACTTGCAAACAAGAAGTACAAATTAGT
AGAATACAAAAGAGAGATAATTGTAGTAAGCAGGAAGCACTTAGTAGGATAAATTCACAGATGAGTCAGG
AAGAAAAATCCAAATATGGTGATTATATAATAGATAATTCGGGAACAATAACTGAATTAGAAAGTAAAGC
ACATAAATTTATTGAGTACATGAAGGAGAATTGGCGTGAATAG
>ref|NC_013316.1|:1185602-1186156 putative transglycosylase [Clostridium difficile R20291]
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AAGTAATACATAAATTTTTATATCCTAAAAAATATTCAGAGTATGTAGAAAAGTATTCAAAAGAATTTAA
TTTAGATGAAAATATAGTTTACAGTGTTATTAAAGCCGAAAGTAAGTTTAATAGTTCTGCTGTTTCAAAA
AAGGAAGCAAAAGGATTAATGCAAATATTAGATATAACTAGAGATTGGGGAGCAGAGGAACTAAATTTAA
AAAATGTGGATATTTTCGACCCAGAGACTAATATAAGACTTGGCTGTTGGTATTTAAGTAAGTTATACAA
AGAATTTGGTAAATTAGATTTAGTGATAGCTGCATATAATGGTGGTTCAGGTAATGTGAAAAAATGGTTA
GAAAATAATGAATATAGTAAAGATGGCGAAAATCTACATGATATACCTTTTAAGCAAACTTCAAAATATG
TAGAAAAAGTAAAAAATAATTACGAACATTATAATAAGATATATGGCAAGAAAGGAAAAAACTAA
>ref|NC_013316.1|:1186156-1187871 putative solute-binding lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
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AAACAAAACAAAGTAGTAGTGATTCAAGTTTACAAAGTCAAAGTTCTATAGATGCTAAGTATATAAACTT
AACAATGGTAACTCCAAAAACTATAAATCCTATAACTAATACTGATAAGTCTGTTGGTTATATAATGAAT
TTAGTTTATGATAGTTTATTTACTATAGATGAGAACTACAATGTAATTCCTCAATTAGTTAAGGAGTATA
ATATAGCTCAGGATGGAATGAGTATAGATATAAAGCTAAAAGATGCAAAGTGGCATGATGGAAAAAATGT
TACTTCAAATGATGTAAACTATACTATTGGTTTAATTCAAAAAAGTGCAGATAGTCCATATAATGAATTT
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CTTTTTCAATTGATAGTTTAATTTTTCCAATCGTATCTCAAAATCATTTAGATTCAAAGGATGTAAATGA
CAAGAATAATAATATGATAGGAAATGGGAAATATAAAATAGAATCATATACAGAAAGAGAAGGAATGGTT
TTATCTGTAAACAAAGATTACTATGAAGAAGTTCCAAAGACCATGAAGAACATAAAAGTAGGTATGGTGC
CTAATGAAGAGGCAAGGACATCTATGGTTATGGCTCTTGATAGTGATATAACCAATGTTACATTAAATGA
TTTAAGCAAGTTTCAAGAAAAAGAGTTTAATATAACAAAATATCAAGGAAGAGATTATGAGTGTGTATTA
TTTAATTATAATAATCCATTTTTTAAAGATGTTAATTTTAGAAAAGCAATTGCTCACTCTATAGATAAAG
ATAGAATTATTAGTGAAGGTTATATGGATGATGCTACTCCAGTTAATTTTCCACTTAATTCAAAATCAAA
ATACTATAATAGTGAAATGAAGGATTTAGAGTTTAATAAAGATAAGGCGATAGAGTGTCTTGCTAAGGTA
GAATATGCAAATATAAACTCAGTAAATCAAAATGACAATAAAGTAAAAAATCAGAAAAAATCAGCTAAAA
AGAACTCAAAGAAGCTTACGCCAGAAGAAGAAGCAAAAGCTAAAAAAGCAGAAGAAGATAGAATCAAAAA
AGAAGCTGAAAAGAAAAAAAATAGAGAAAAAGAGGAAGTAAAGAAAAGTCTTTCTGAAATGAACTTAAAG
ATAATAGTAAACAGAGATAATAGTGAGAGAATAAAAACTGCAAACATAATAAATGAAAACTTAAAAGCTA
TAGGAATAAATAGTACAGTAAATCAGCTGTCAGATAAGGATATGGAAAATGCTCTTAATTCTAAAAATTA
TGATTTAGCATTAGTTGGATGGAAACTATCAATTATACCAGATGCAAGTAGTATTATAGCAAGTAGTGGA
TATACTGATGATAAGCTAAATGGATATATGTCTGCACTTACAAGTTCTACGTCTGAAATTGAAACAAAAA
AAGCATACAAAGATGTACAGACATATATAAAAGATAATGCAACATTTATAAGTTTAGCTGTGAGAAACAA
CTATATTGTAAGTAATAGTAGATTAAAAGGTAAAATTACTCCAAATGATTTTGATGTATATGAGGGAATA
TCTAATTTAGATATAAAATCGAATGAATCAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1187944-1188156 putative heavy-metal binding protein [Clostridium difficile R20291]
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TAG
>ref|NC_013316.1|:1188357-1188956 hypothetical protein CDR20291_0969 [Clostridium difficile R20291]
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GTTATGTATCACAAAAAGGAGCAAAAAAATACTTTGAAGGTAACTTGGATAAGATTATTAATAATAATAT
AAAAAAATTCAATCAAAGTATTGGTCTTAATAGAGTATATTTAAAAATGTTAAAAAAGTGTGCATATCAA
GAAAGTGTAACTTCAATATCAAGGACTATAAAGAAAGAAGCATTATTTAAATCAAAAAAAGAGCTATTTG
CTTTTTCAGAGTACTTAAAACTTGATATTAACAAGCGACTTTCATATAATCAAATTTTAAGAAAAATATC
AAGATATATATACTATAATAGAAGTTCATATGCTCAAAAATACGTTGTTTTCAAAAGAGGAGATGAAGAA
TATCTTTTAGAACCAGAGAAAATAAAAGATGAATTAATATCAAGCTATAGGTCAAAGACTAGAGAAGATA
TGAGGTCAATAGCAAAACTTTTGGATATAGAAGTAGAAGATGATTATAATGCTGAAGATATTAGAAAAAA
AGTAATAAATTATATTATCAAAGAAAAACTTAAAAGTTAG
>ref|NC_013316.1|:1189184-1189555 lactoylglutathione lyase [Clostridium difficile R20291]
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AAGCTTTAGGGCTTAAAGAGGTAAAGCGTAAGGAAGCAGAAGATGGAAGTTTTATATTAGTTTATTTAGG
AGATGGTATTACTAGTCATACATTAGAATTAACTTGGCTTAGAGATTGGGACAGACCATATAATTTAGGA
GACAATGAATTTCATCTGGCTTTAGAAGTTGAGGAGTTTGATGAGGCAAAAAAACTTCATAAAGATTTAG
ATTGCATATGTTTTGAAAATGAAAGTATGGGAATTTATTTTATAGCGGACCCAGATAATTATTGGATTGA
AATACTTCCTAAAAATCATTAA
>ref|NC_013316.1|:1189678-1190961 putative cell wall hydrolase [Clostridium difficile R20291]
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ATGCAAGTGCTCTTGAAAAGGGAACAGTAACAGCAAGTGCCTTGAATATAAGAAGTGGACCAAGTTCTGA
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AAAGTAAGGGTATCGAGTTCTGTTGTTGGATGGGGAAGCGCAAAATACATATCAACAAGTGGTTCATCTG
AAGGTACATCAAATCAAAATAATCCAACTTCAAGTGGGACAACTATTAGTGGAAATGGTAAAGTAAATGT
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GCTGTGAGTTTAAATGTAAGAAGTGGTCCTGGGACAAGCTATTCTATAATAGGAAAATTAAATGGTGGAG
ATGTTGTTGAATTAAAATCCAAAAATAATGGTTGGTATAAGGTAAAGTTATCGAGTGGAACAATTGGATG
GGTGAGTGCCAGTTATATTTCTGAGACTAATGAAGGTACAAAAGAAAAACCAAATTCATCATCTAACCAA
AATTCTCAATCTAATAGTAACTCAAAGCCATCATTTACTGGAAATTCAGATAAATCTACAGCAAAAGGTT
CAACAATCGTAGATTTTGCATATACTCTTATTGGAATACCATATCAATGGGGAGCTTCAGGACCTGATAA
ATTTGACTGTTCTGGATTTACACAGTATGTTTTTAAACATTCTGTAGGCGTTTCTATTCCTAGAGTTTCT
AGAGAACAGGCTAATTTTGGAAGTGCAATTTCTATGGGGAATTATGCACCAGGAGATTTAGTTTATTTTG
ACACTGATGGTGATGGAACAACTAATCATGTAGGTATATATGTAGGAAATAGTAAATTTATCCATTGTAG
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CTTGGTGCAAGAAGATTTGTTTAG
>ref|NC_013316.1|:1191072-1192016 hypothetical protein CDR20291_0972 [Clostridium difficile R20291]
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TTATAACGATTGCTTGCTTGTGTCTAATTGGCTATTATTCTTATACAAAAATAAAAGATAGCAAGATATT
GGAGTATGTATCGGCTAAAATACCATTTCTAAATAATTCATCAGATATAACTTATAAAGATATATCTGAT
GAATTAAATTCAATAAAAAAAGGGAAAAAATCTAAATCACAAACCAATTCAGATGATAAACAAGAAACTA
ATCCAGAAAAAGCGGTAAATAACACTAAAGAGCCAGAAGAAGTCAAATTAGCTACTATAGAAGGCTGGGA
TATGTACACTATTCAAGTTGCTGCAATAGATAATAATGATGATTTGAAAAAAATACAGACATCATTAGTT
AATAATGACATACCTTTTTCAGTTATGGAGAAGGATGGAGTAAAAAAAATACAGACCTATTCCTCTTTTG
ATGAAAATGATGTTAGAAAGCAGATAAGCAGTGTAAGAAAGGTGTTTCCAGATGCATTTTTATCACACTT
AGATGCACCTATGTTGTCTTTAGAGTATACAAGTAACTACGCTTATATAGAGAGTATATCTAAAGAATTA
AATAAATTAATAACAAACTTTAAAGAAGAATCAAGTTTTTGGTCGAATGCTGAAAATAATGTAGATATGG
AAAAATATAATACTATTTTGACAAATAGAAAGGCAATATCACAAAATATATCAAAAGAAGCTGAAAAGAT
TGACTATTCTGAAATGCGTTTATTTAAAGATAATTTAATAGAGTATGTAAAGAATGTGAATGAAAAAATT
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AGGAGTACTCTATGTTTATAAATTCTATAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1192232-1193569 electron transport complex protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACTCTTAACTTTTAAGGGAGGGATACATCCTCCATATAGAAAAGAGTACTCTAACACAAAGGCAC
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TATTGTTGAAGTTGGTGATGAAGTAAAGTTTGGGCAAAAAATAGGTGAACAACAAGGTTTTGTTTCATGT
AACGTTCATTCTTCAGTATCAGGTAAAGTTATTGCTATTGAACAACATGAAGTACCAGGAGGTTCAGCTC
AATGTGTAGTTATCGAAAATGACTTTAAGGAAGAATTACATGAGAGTGTTCAACCAAAAGGTCAGTTAGA
GGATTTGAGCAAAGAAGATATAGTAGGTATCATAAAAGAGGCAGGAATAGTAGGTATGGGTGGAGCTACA
TTCCCTAACCATGTAAAAGTATCTCCTCCACCAGATAGCAAGGCAGAAGTAGTTATATTAAATGGTGCAG
AATGTGAACCATACTTAACTGCAGACCACAGATTAATGGTTGAAAATCCAGAAGATGTTGTGTTTGGTTT
AAGAGCATTAATGAAGGTATTAGATGTCAAAAAAGGATTTATAGGAATTGAAACGAATAAACCAGATGCT
ATAGAAGCAATTCAAAATGTAGCTAAAGACTATAGTGAAATCGAAGTTGTTGGCCTTCAAGTGAAATATC
CACAAGGAGCAGAGAAACAACTTATTTATGCGTGTACAGGCAAAGAAGTTCCATCTGGTGGATTACCAAT
AGCAGCAGGTGCAGTTGTTGACAATGTTGCCACAGCAGCACAAATAGCTAAGTCTATTAAAACAGGTATG
CCTTTGGTTGAAAGAATCACTACAATAACAGGTAGTTGCATCAAAGAGCCAAAGAACCTAATAACAAAAG
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TATAATGGGTGGACCTATGATGGGAATAGCTCAATATACTACTGAAATAGCGACTAACAAAGGTTCTTCA
GGAATTTTATGCTTGGATGAGGAAGAATCACGTACTCCAGATATTCAAAACTGTTTAAGATGTGGAAGAT
GTACAGATGTATGTCCATCATTCTTACAACCACTTTTCATAAGTGCATATTCTTTAAAAGATGACTATGA
CACAGCTGAATATCATAGAGCAATGGATTGTATAGAATGTGGGTCTTGTTCATTTATTTGTCCAGCAAGA
AGACCATTACTTCAATCTATAAGATCAGCAAAGAGAGAAATAGGAGCAAAGAGAAGAAAGCAAGCTGCTC
AGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1193592-1194569 electron transport complex protein [Clostridium difficile R20291]
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AGTACTATAGGAGATTTTTCAGCTGTTGTAACAGGATTATTATTAGCATTTAACGTACCAGCATCACTTC
CTTGGTGGATGTGTCTAGTAGGAGGAATATTTGCAATATTAGTAGTTAAAATGGTATTTGGTGGAATTGG
ATGTAACTTTGTCAATCCAGCACTTGCTGCAAGAGCATTTTTATTAGCATCATTCCCAGTAGCAATGACT
GCTTGGACTCAACCAGGTGTTAACTGGATAGGTAAAAATTTAGATGCAGTTACTACAGCAACTCCATTAA
GCTTTTTGAAAAATGGAGCAGCAGGACTGGCAGACCTTTCTAGCAATGGAATTAGTCTTGCTGACATGAT
GATAGGGAATATTGGTGGATGTATAGGTGAGACATCAGCAATATTATTATTATTAGGTGGAGTATACCTA
ATGTATAAAGGCATAATAAATTATGTTATACCAGTATTTTACATAGCAACTGTATTTATATTAACATTCC
TTTTAGGTGGATTTAATATAACTTTCGCAATATATCAACTGTTTGCTGGAGGACTTATGTTAGGTGGATT
CTTCATGCTTACGGATTATACAACTTCGCCTATGACTAAAAAAGGTCAAATAATATACGCTGTATTAGCT
GGTCTTATAACAACTGTTATAAGAATGTATGGTGGATATCCAGAAGGTGTATCTTACTCAATACTATTAG
TGAACTGTCTTGCTCCACTTATAGATAAGTTTGTTAGAAATAGAGTATTTGGGGAGGTGGCTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1194569-1195138 electron transport complex protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAACAGTATGGTGAGATTAGGTGGTACTTTACTTGCTATAAGTGCAATAGCTGCATTAGCTCTTGGAG
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ATAGCTGAAGTGTATGAAGGTTTAGATGGTTCTGAAGTGGTTGGATATACTTTAAAAGCTAAACCAAGTG
GATATGGTGGAGAAATTGAAGTTATGGTAGGTATATCATCTGAAGGTCAAGTTACAGGTGTTGACATTGG
TAATATGTCAGAAACAGCAGGTCTTGGAGCAAAAGCTAAGGATGATGCATTTAAGGGTCAATACAAAGGA
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TAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1195151-1195744 electron transport complex protein [Clostridium difficile R20291]
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TTTATAGTAGTTATAGCTACATTTGTTACAATAGTAGGTATGCTTTTAAAAGCATATGTTCCTGCTCTTG
ATAAGGCTCTTGGTATATATATACCATTAATAGTTGTTAACTGTTTAATATTAGCTCGTGCAGAAAGTTT
TGCTTTCAAAACAGGAGCTATGCCTTCAATAGTTGATGGTGTAGGTCAAGGTCTTGGATTTACTGTTGCA
CTTACAATAATAGGTGCAGTAAGAGAATTACTTGGAAATGGTAGTTTATTTGGAATGACATTATTTGGAG
CATCTTTCCAACCAGTATTAATATTTATATTACCACCAGGTGCATTCTTAACATTAGGATTCTTATTTGC
AGGATTTAATAAATTAAGAAGTAAAAAAGCATAG
>ref|NC_013316.1|:1195759-1196334 electron transport complex protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTAATACTTTTATTTTTAAGTATCGTTCTTGTTAATAACGTTATAACATCTCAATTCTTGGGTA
TATGTCCTTTCTTGGGAGTTTCTAAGAAGGTTGATACAGCAGTAGGGATGGGAGTTGCGGTTACGTTCGT
TTTAACTCTAGCTTCAATTATAACTTATTTTATACAGATTTTATTAGTAAAAACTGGAACTGGATTCTTA
CAAACAATAGCTTTTATATTGGTTATAGCTTCTATAGTTCAGTTCGTTGAAATGGTAATTCAAAAGATGA
GTCCATCTTTATATCAAGCATTAGGAGTTTATTTACCTCTTATAACTACAAACTGTGCAGTTCTTGGTAT
AGCTCTAGTTAATGTTCAAAAAAGTTATAATTTAGTAGAAACAATAATAAATGGATTTGGAGCCGGAGCT
GGATTTACTTTAGCAATAGTAATATTCGCAGGTATAAGAGAAAGACTAGAGTTAGCTGATATACCAGAAG
CATTTAAAGGTTTCCCTATAACGCTTATATCAGCAGGTTTAATGTCAATAGCTTTCTTAGGATTTACAGG
ACTTATAAAGCTATAA
>ref|NC_013316.1|:1196350-1197321 electron transport complex protein [Clostridium difficile R20291]
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CATCTAAAAAGTTTGCTGTAGAAGTAGACGAGAGAGTGGAAGCTATACTAGGAGTACTTCCAGGAGCCAA
CTGTGGAGGTTGTGGATTTCCAGGTTGTGGAGGTCTTGCAAATGCGATAGTTGAAGGCAATGCACCAGTT
AATGGTTGCCCTGTAGGTGGAGCAGATGTTGGTGCAAAAGTTGGAGAAATAATGGGAATAAGTGCTGAAG
CAGGTGAGAAACAAGTAGCAAAAGTTATTTGTAAAGGAACTTGTTCAAGTGCAAAAGATAAATATGAGTA
TGAAGGAATATCAGATTGTAGAGCAGCAAATGTTTTAAACTCAGGTGCTAAGATGTGTAAATTTGGATGT
TTAGGTCTTGGAACATGTAAGGATGCTTGTAAATTTGATGCTATTTCTATAGTTGATGGAATAGCAGTAA
TAGATGAAGAAAAGTGTGTAAATTGTGGAAAATGTAAAGAAGTTTGTCCTAAGGGTATAATAATCACAAA
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ACTGCTGGATGTATTGGCTGTGGAATGTGTGTAAAAGCTTGTAAATTTGATGCAATAATATTTGAAGACA
AAATAGCTAAGATAGACCCTAATAAGTGTGTAGGGTGTATGCAATGTGTAGCAAAATGCCCTACAAAAGT
AATATCAGGTGACATAACTAAGAAAAAGAAAGTTACTATTGACCAAGAACTTTGTGTTGGATGTACAGTG
TGCAAAAAACAATGTAAGTTTGATGCAATAGAGGGAGAATTAAAAGAAAAACATAAGGTAGATGCAGATA
AATGTGTAGGATGCCATTTATGTATGGAAAAATGTCCAAAGAAAGCTATTAAAATTTTGTAA
>ref|NC_013316.1|:c1197527-1197360 hypothetical protein CDR20291_0979 [Clostridium difficile R20291]
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TTTGTTACACTATTGTTATATTTATTACCATTAGAATAAATATACATAAAATAGAGGTATGGAAATTATT
CCATACCTCTGTTTTATGTACTCATTAG
>ref|NC_013316.1|:1197541-1198125 septum formation protein [Clostridium difficile R20291]
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GTTGTTTTAGACAATGCTATTTTAGGAAAACCAAAAGATGAGTCTTGTGCAAGAGATATGTTAAAAAGAC
TATCTGGAAGAGAGCATCAAGTCATAACAGGTATTAGCTTAATAAACTTGTGCGAAGATAAAAAGGTAAT
TGACTATGTAATCAGCAATGTGAAATTTAAAACGTTATCAGAGCAGGATATTGAGGATTATCTGAAAACT
AATGAGTCATTTGACAAAGCAGGAGCCTATGGTATACAGGGTTATGGAGCTTTGTTAGTTGAAGAAATTA
GAGGAGATTATTTTAATATAGTTGGTCTTCCAATTTCAAGGTTAGGCGACCTATTAAAAAAATATTTTAG
TATAAATCTTTTTTATGGAGTGTGA
>ref|NC_013316.1|:1198170-1198829 DNA repair protein [Clostridium difficile R20291]
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TGTTGGCTATACTTTTAAGAACTGGCAACAAGAATAAAAATGCTATTGAATTAGCCAACTATATAATAAA
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GGGTTATCAAAATCAACCCAAATTAAAGCAGCTTTAGAACTAGGCTCTAGAGTAGCTAGTTTTAAACCTA
TAAAGTATAAAATAAGGAATCCTTGGGATATACAGAGGTATTATATGGATAGCCTAAGGTATTTAAAAAA
AGAGGTTTTTAAAGCAGTTCTTTTAAACACAAAAAATGAGATAATATCTGATGTAGATGTATCTATAGGG
ACTTTAAGCTCGTCATTAGTCCATCCAAGAGAGGTTTTTAAAGAAGCTATAAGAAGAAGTGCAAGTAAGA
TAATAGTGATGCATAATCACCCCTCAGGAAGTGTAGAACCATCAAGAGAAGATAAAAATATCACATCAAG
ACTTATTAAATGTGGAGAAATAATTGGAATAGAAATAATAGACCATATAATTATTGGAGATGGATTATAC
TTTAGCTTTAAAGAAAATATGATAATTTGA
>ref|NC_013316.1|:1198899-1199960 rod shape-determining protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTAAGGAAAAAAAGAAAGAAAAAAAAGGTTTTTTTAGTTTTAATAAGATGACAAAGGATATGGGAA
TAGATTTAGGGACTGCAAATACATTAGTTTACATAAAAGGACAAGGTATTGTTGTTAGAGAACCATCAGT
TGTCGCAATAAGAGATGATAGTAAAGAGGTATTAGCAGTAGGTGAAGAAGCCAAAAAAATGATAGGTAGA
ACACCAGGAAATATAGTAGCTATAAGACCTATGAAAGATGGAGTAATAGCTGATTTTGACATAACTCAAT
CAATGATTAGCTATTTTATACAAAAAGCGGCTGATAAAAAAGGTGTTGTAAGTCCAAGAATAGCTATATG
TGTTCCTTTTGGAGTTACAGAAGTAGAAAAGAGAGCTATAGAAGAGGCTGCAAGACAAGCTGGAGCTAAA
GATGCATTCCTTATAGAAGAGCCAATGGCAGCGGCTATAGGGGCTGGATTAAAAGTTGAAGAACCAGAAG
GTAATATGGTAGTTGATATTGGTGGAGGTACTTCAGAAATAGCTGTAATATCCTTAGGAGGAATCGTTAC
TGCTAAATCTATAAGAATAGGTGGAGACGAATTTGACGAGTCTATAGTGGCTTATGTAAAAAAAGAATAT
AATCTTATGATAGGTGAAAGAACTGCTGAAAATGTAAAAATTAACATAGGTTCTACATTTAAAGATGATG
AAGAAATAAATATGCAAATAAGAGGTAGAGATTTAATCTCAGGATTACCTAAAACAATAGAAATATGCTC
TACAGAAGTTAGAGAAGCATTAAAAGAACCTGTAAGTTCAATAGTAGATGCAATAAAATCTACACTAGAA
AGAACTCCACCAGAATTAGCCTCAGATATAATGGAAAACGGAATAATGCTAACAGGAGGAGGCGCTTTGC
TTAGAGGTCTTGATAAGCTTATTACACAGGAAACTGGTATGTCTGTACAAATAGCAGAAACACCTCTTGA
TTGTGTTGCACTTGGAACAGGTAAATCTGTTGAAGACCAAGAAATCTTTGAAAAAGTATTAATGATGAAT
ACTAAGAATTAG
>ref|NC_013316.1|:1199970-1200863 putative rod shape-determining protein precursor [Clostridium difficile R20291]
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TAGTTGCTATCACTTTAATTGGAATTGTGGGTATATCAATTGGTAAATTTTCTAGTGGTAGTCCAGTAAA
TTTAGGAGTAGCTTCAGATGCTATTACAAGTGTAGGTAAGGGAATAAATGATGGATTTTCTTTTATCAAA
AATGGTTTTAAAGATGTAGCAAATTTTAAAGATAATTCTAAAAAGGTAAAAAAATTGGAAGAAGAAAATG
AAAAACTTAAAAAAGATATGATAGCTTTAAATGCCAAACTAGATAAAACAGAATCGCTAGAAGAGTTAAA
AAAGACACTGAACTTTGTACAAGAAGAGTATAAGGCGACAAGTATTTCAGCAAGTGTTGTTGGTAAAAAT
GATGGAAACTGGTATGAGAGTTTTGTCATAGGTGCAGGAAAAAATTCAGGTGTAAAAAAAGAAAGTATAG
TTATGAATGGTAGTGGGTTAGTTGGCATAGTTTATGAAGTTTCCAACAATTATAGTAAGGCAATTTCACT
ATTGGATTCTAAGGCATCTGTAAGCTTTAAACTAGCAAAGGATGCCAATGCTAAAGGTACAATTACTCAA
AATACTACTTTAGATAATAAAGATAGTTATAATAGTAAAGGATATTTGCAAGGATATATGTTTGACTCAT
CATATAATGTAATTCAAGGAGATATAATAACAACATCAGGTCTTGGATTCTTCCCAGATGGTATACCAAT
TGGCGAAGTTGAAAAGGTGGTTGATGATAAAGATAAGTCATTAAAATATGTAGTTGTAAAACCTTATGTT
GATTTTAAGAATATAAATGACGTTGTAGTCATAGAACCAAGAAATATAGGATAA
>ref|NC_013316.1|:1200878-1201366 hypothetical protein CDR20291_0984 [Clostridium difficile R20291]
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TAGATATTTTTGGCATAAGCTTTAATTTAGTTCTTATATATGTAACCATAATCTCTCTTTATTTAGATGA
ATTAGAAGGTGGGATTATAGCAGCAATAATAGGGCTTATTAAAGACATAACCGTTGGTGGAATTTTTGGT
GTAAATGCATTAATTTTGTTTATTATTGCATATGCAATTGGATACATGAGAGATCAGCTATATAAAGGTA
GTTATATTATTACTTTCGTTTTAATTTTTATAGGCAGTTTAATTGATTCAATTGTCAATATAGGTACATC
TAGTATAATTTATCAAAGCTACAACATATCAACACTTTTTGTAAAAGGTCTACTAGTAGCACCAATAGTG
AATAGTTTAATTGGTTTAGTAATATATCGCTTATCTAAAAGAGCAGTTTTAAAACTTAAAGAAGATTAG
>ref|NC_013316.1|:1201378-1204356 putative penicillin-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGAAAATAAACAAGTTGATAGACTAAAAATAATTAAGATAGTCATGAGCGTGATATTTTTAGCTA
TTTTAGTAAAAATAATCTATATGACTACATTTAAATATGAATATTACAATGAGTTAGCTGAGAATAAAAC
ATATAAAAAGTTGGCAATAGAAGCTCCAAGAGGAGAAATAAAAGATAGATATGGAAGACTGTTGGCAGGA
AATAAAAACTTATTTACTGTTCAAGTTTCAGGTAACGATATTAATAAGAAAGATGCAAATAAGCATTCAA
GAGCAAATGAAATATCATTAAAACTTATAAATTTGCTGGAGAGAAATGGTGAAGAATATGTAGATGAGTT
TCCTATATATGTAGAAAATGGAAAGTACTATTATACATATGACAGAGATATTAGGGAATATAAATCAGAA
AATGGTATTCCAAATGATTATAATGCTAAGGAAAGTTTTTATTACTTAGTAGACAAACTTATATCAGCTG
GAATATTATCTCAAGAAGATAAAAGATTGGATGCGACAAGATTACAGGCAAAACTAAATGAAAATGGATA
TTATCCACCTATTTTAGTTAGTAAATGGATGTTCACAGCAGAAAGAGATAAGAGAGATTGGTTGGCTAGT
TATAAGATAAAAGAAACTAAACTGAGTGCCAAAGAAGCGTTTGAAAAAGTAAGAAATAGTGATGCATTAG
AAATTGATAAAAGTTTGAGTGATGAAGATGCAAGAAAAATAATGGTCGTAAGGGATTTGATAAAATCAAA
AGGATATTCTCAATATAATCCAGTAACTATTGCTAAGGATGTAGGAGAAACTACGATTGCTCAAATTGAA
GAAAGTGCTATGGACCTTGTTGGTGTTTCAATAGCAGTAGAACCAGTAAGATATTATCCTAATGGGTCAT
TAGCTTCTCATATGTTAGGATATGTAGGAAAAATGCCATCCACTCAAATAGAATCATACCTTCAAAAAGG
TTATGAAACTGGAGATATGGTAGGTCTTGCAGGAGTAGAAAAGAGTAATGAAAGTAGATTAAGAGGAACT
GATGGTTATAAAATGGTTAAAGTTGATGCATTGGGTAGAATCAGTAAAGAAATTGAATCTAAAAAACCTA
AATCAGGAGATACTGTGTATCTTACACTAGATAAAGATTTACAAGAAGTTTCAGATAATGCATTAAAACA
GATAATCGAAGTTGCTTCTAAAGGAGGTACTTTTAAAAGTAAATTTGGGGACAAACCAATTAGTGCATAT
GCAGGAAAAGCACAGTCAGCAGCTCTTATAGCTATTGATGTTAAAAATGGAGAAGTATTAGCTTCATCAA
GTTATCCTAATTATGACCCAAATAAATTTGCAAAAGGTATTTCTACAGAGGATTATAAAGCACTTCAACC
AAAAAATCCAAATGACTTACTAGCAGGAAGTCCACTTTTAAACTTGGTTACACAAGGGGAATTTCAGCCA
GGTTCTTCATTTAAGATGCTAACTTCAATGGCAGCATTAGAAAATGGTTTGGATCCAAACTTTACTATAA
ATGACCCTGGGGTTATAATGTTAGGTAAAAAATCTTTTGGTGACTATGTATGGAACCATGGTAGAGGAAA
CCATGGTATGACAAACTTATATAAAGCGATACAAGAGTCTTGTAATATATATATGGCAACAATTGGTACA
GGTAAAACATGGCCAGATGGAAAAAGCATTGGTATAGATATGAATGCAAATAAAATACTTGAGTATGCAA
AATTATTTGGGCTTGACCAAAATACAGGGCTTCAAGATGAAGTAGAAGAAAGAGCAGGTAAAGTTCCTAG
CACAGAAGATAAATTGAAATCAACACAAGCTCTTCTAAAGTCAAATTTAGAAAGAGAAATGGCAAATGAT
TTTGTTGATATAACTAGAGAAAAAAATCCTAAAGAATATGAGAAAAGAATCAATGAGATTGTAAGCTGGG
CAGCAGAAAAGAAAACTCCTGGTAGAGTCGAAACAATGAATAGGCTAAAGAAAATGAATGTTAAAGAAGA
TAGAATAGAAGAAGTAGCAGATTTAGCAGTATTCAGTTATTTTAACTTTGCAAAATGGAGTACTGCAGAT
ACATTTAACTTAGCTATAGGTCAAGGTGAAAATGCTTATACACCAGCTCAAATATCAAGATATGTAGCTG
CTATAGCAAATGGAGGTAATTTAGTAGAATTATCTGTAGTTGATAGAGCTGTTTCAAGTGATTATTCATC
AGTTAAAATTAATGACCAGAAGAAAGTCGAAAAAATACCTTTTAAAAATCCAGATAACTTAAAAGAATTA
ACAAAAGGTATGAAATTGGTTGCAAGACAAGGTACAGCGAAGAGTGCTTTTGCTGATTTTCCAATAGATG
TAGCAGCAAAAACTGGTACAGCTGAGAAAAGTGGGAAAATACCTACAGATAACGAGTATGAATATTTAAA
AAGTCATATGTCATCTTATAATGTCAACCTAAATGATGCGATTAAACTAGCTGATAAGATGAAAGCAGAA
AAAGAAAAAGAGCTTTCATTAGCTAAGGAAAAGGAAATAAAAAAGAAATTAGAAAATAAAGATTTGAAAG
ACGAAGAAAGAAAGAAATTAGAGGAAGAATTAGAAGATGGAGTAAAAGTTAGATTAGAGGACACTGATAA
GGTGAATTCTTCATATCTAAGAAAAGCTATAAAAGAATTAAATCCAAAAATAACAGATGACCAAATAGAT
AGATTTAAACAAGATTATGGTTCTTTTACATGGACTGTTGCTTTTGCTCCAGCAGATGACCCAGAAATAG
CTGTTGTATGTGTAATTCCTCAAGGTGATTCAAGTGTATTCTCACTTTTACCAACTAGAGAAGTTATTGG
AACTTATATGGGATTAGAGCCAACTAATAGTAAAAATGACAACAAGACGAATGATGTTAACAATTCTTCT
GACGAAAATATAAATTTCGAGTCACAAATTAATAGATAG
>ref|NC_013316.1|:1204454-1205137 septum site-determining protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTTTAAGAGAAATTTGTAGTCAAGAACTAGTAGAGTTCAAGGGTAATAAAAGAGGGATAATAGTAA
ATATAAAAAGAGAAGCTCCATTTGAGGAAATACAGGAAAAAATAATAAACAAATTGGAAGCATATGTTGG
CTTTTTTAATGGGGCTAAAATTAGTAAAATTAATAGTGATTGTTTAACTGACATGGAGATTCTAGAACTT
AAAGAAGGAATTACTTCTAGATTTGATGTGGAATTTGTTGAAGATCAAAAAATTGAAGAAAATAGTAATT
TTCCAACAAAATATGTCAATACCCTAAGATCTGGTGAAAATATTGAATTTGAAGGTGATGTAGTTATATT
GAATGATATGAAACCTGGTTCAAAAGTCCTTTCAAAATCAAATACAGTTGTTATGGGAGATATAAATGCT
GGTGCTAAGGTTGTAGCAGGAGGTAATGTTTTTGTAATGGGTAAAATAGAAGGTTTTGTACATGCAGGTG
CAGAAGGCAATGAATTTGCATATGTTGTTGCTGGAAATCTTAATCCTAAAATATTACAAATAGCAGATAA
TATTGCAGAAGCTCCAGATGATGAAGAAAATTATGAAAATGAATCAGAAATTAGCCCAGAAATAGCCTTT
GTAAGTAATGGAAGAATTGTAATCGAAAGCTATTTGTCAAAGTTAGACAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1205161-1205958 septum site-determining protein (cell division inhibitor) [Clostridium difficile R20291]
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GAACTGCGCTAAGCCTAGAAAATAAAAAAACAGTAGTTGTGGATGCAGATATTGGACTTAGAAACTTAGA
TGTAGTAATGGGTCTTGAAAATCGAATAGTTTATGACATAGTAGATGTAGTTGAAGGAACTTGTAGGCTT
AAGCAAGCTCTAATAAAAGACAAAAGATTTGATAATCTATATTTATTACCAGCAGCACAAACTAGAGATA
AAAATGCTGTCTCAGTTGAGCAGATGATTGATCTGTGTGAGAAACTAAAAGAATCTTTCGAGTATATAAT
AATAGACTGTCCAGCAGGTATTGAGCAAGGCTTTAAAAATGCAGTAGCTGGGGCAGATAGAGCTATTGTA
GTTACTAATCCAGAAATATCAGCAGTAAGAGATGCTGATAGAATAATAGGTCTATTAGAAGCAAATGAAA
TAAAAGAGATAAGATTAGTTATAAATAGAATTAGAAATGATATGGTTAAGCGTGGAGACATGATGGATAA
ACAAGATATAATAGAAATATTAGCAATAGATTTGTTAGGTCTTGTTCCTGATGATGAAAGCATAATTATA
TCAACAAATAAAGGAGAGCCAGCTATACTTGATTCTAAGTCACTTGCTGGTCAAGCATACAAAAATATCG
CAAAAAGGATACTAAATGAAGAAGTTCCTCTACTTGATCTTGAAGTTGAAGATGGATTCTTTGGTAGACT
TAAAAAAATGTTTAGCATGGCTAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:1205976-1206260 cell division topological specificity factor [Clostridium difficile R20291]
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AGCTAGTTTTAGTTCATGATAGAGTAGATTGTTCACCACAACTTTTAGAGATGATAAAAACAGACATTTT
AAAAGTAATAGCTAATTATGCAGAAATAGAAGATGATGGTCTTGAAATAAAAATGTCTAAATGCAGAGGT
GAGCATGATGACAAACCTGTATCTGCATTAGTTGCTAATATACCACTAAAGAATATAAAAGATAGATGTA
TGTAA
>ref|NC_013316.1|:1206345-1207475 rod shape-determining protein [Clostridium difficile R20291]
TTGAAAAAAATCAATATTAATTATAAGTCGACAATTAAGTTGATAAAACAGTTAGACTGGAAACTTATAG
TTACAGTATTAGCTATCTTTATTTTTGGGCTTGTTATACTTAGTAGTGCAACACATGCTAATTCAACAGG
TTCATATAATCAATTGATTAAACAAGGATTAGCTTTTGTACTTGGTATAGGAATGATTATAGTCATATTA
TTTTTTGACTATAATCTTCTAGGCAGGTATTATAAAGCGCTTTATATAATAAGTCTTATTTTGTTAGCCA
TAGTTTTATTACCTGGAATTGGGACAGTAAAAGGTGGAGCTAGGTCGTGGATTAACTTAGGACCACTTGA
CTTGCAGACATCTGAAATAGTCAAATTAACATTTGTACTAAGTTATGCAAAGATACTTGAATCCAAAAAG
GATAAATTAAATACGTTAAAGGAAGTTATGCCTGTTGTAGTTTATTCTCTTCCATTTATCGGATTATTGA
TTGCACAACCAGACTTGGGAACAGGAATTGTATTTTGTTGTATGATATTTGCAATGCTGTTCACAGCAGG
TCTTAGCTCAAAGTTGATAAAAAGAGGAATAATCATACTATTAGTGTCAATGCCACTGATGTATTTAATG
ATGGCAGACCATCAAAAGGTAAGAATAGAAGCTTTTCTAAATCCAGAAGATGTAACTCTAAAAGGAAACT
ATCAAGTTATGCAATCTCTGATTGCAATTGGTTCTGGGGGCGTAACTGGTAAAGGACTTTACAATGGAAG
TCAAAATCAAGAAGATTTTTTACCTGTACAAGATAGTGATTTTATATTTGCTGTTGTAGGTGAAGAACTT
GGTGTAATAGGAATGGCAGTGTTGATAATCTTATTTATGATATTCCTATTAAGGCTTTTAGCAATTGCAA
GAGATGCAAAAGATTTTTATGGAACCCTCATAGTGGTTGGTGTTATGGGAATGTTTGGTTACCAGATAAT
CCAAAATATAGGTATGACGGTTGCGTTAATACCAGTAACTGGAGTAACATTACCTTTTGTAAGTTATGGA
GGAAGTTCGTTATTGACATCTTTAGCAAACTTAGGATTAGTACTAAATGTGTGTATGAGAAGAAAGAAAA
TAAATTTCTAA
>ref|NC_013316.1|:1207516-1207929 methylglyoxal synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATAGCATTAGTAGCACATGACCAAATGAAAAACACTATGGTCGGATTTTGTATAGGTTATGAAT
CAATTTTAAAAAAGTATGGACTATATGCAACTGGAACTACAGGAAAAAGAATAATGGATGAAACTGAATT
AAATATAAATAGATTAGCATCTGGTCCTTTAGGTGGAGACCAACAAATAGGTTCTTTAATAGTAACACAA
GAAATAGATTTAGTTATTTTTTTAAGAGACCCATTGACATCTCAGGCTCATGAAACAGATATACAAGCGT
TAATAAGACTTTGTGATGTTTATCATGTTCCAATAGCTACAAATCTAGCTTCAGCAGAAATATTTATAAA
AGCTCTTGATAGAGGAGAACTATCATGGAGAGAAGTTAGAAAAAGCAAAAGTCAACGTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:1208414-1208743 PadR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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ATTGTTATGGATATGAAATTGCAAAGCAAGTAAGAGAAAGAAGTGAGTTTGAATTAAAAGAAGGAACAAT
GTATCTTGCACTTAAAAGAATGGAATCTAAAAATTTAATTAAATCTTATTATAGCAATGAACAAAGTTCA
GGTGGAAGAAGAAAATATTATAATTTAACTAATGAAGGTAAAGATTTTTTAGAAATAAAGAAACAAGAAT
GGAGATTTATTAAAAAGGTTATGAATCAATTTTTGGGAGAGGTGGATTAA
>ref|NC_013316.1|:1208747-1209538 hypothetical protein CDR20291_0992 [Clostridium difficile R20291]
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AACAGGAAATGAGATGCCATCTTATAGAATCTGCAAATGAATTTAAATTAGAAGGATTAGATGAAGAAGA
AGCATGTAAAAAAGCAATTGAAAGATTTGATGATGGTGATGAAATGCAGTATGAATTATGTAATATAATA
AAAGAACTATCTTTATCATTGGATAGGCATAAATCAATTGTAATGGGGTTTAAAAAAGTATTAGGTTACA
TAAGTATAATTGCATTTTTAATTTCTGGATTTATGTGGTATTACAATAATAGTTTACAACATAATATGTA
TAATTTAGGAAAAGAACTTGATGGAGAAATAAAGCAATTGGCAGAAAGACATGATATGACAAATATTGGT
GAATATAAGTTAGAACTTGAAAAAATACTTGATAAAGATAAGTATAGTAAAGTCAAAGCTCTTAGACTAT
ATGTAATAGATATGAAAGATGGAAACACTAATTTAAGTTCTTCTGGATTGAATGCTAATATGGTATATGA
GAGGGAAGCAGATTATAATAACATAAGTAATTTTATACAGCATTTAGGATATAATGGAAAAGATTTTTTA
GACAAGAATGGGAATATAGTAAATCCAGATATTTTCTTAGAATATTTCTTTTATTTTGAATCGGAGATGT
TAATTCCAGTAGCATTTGCATTTGGATTATTATGTATAATAGCGTATTTTATATTAAGATTTAAAATTTC
TTTAATAAAAAATAATAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1210042-1211184 hypothetical protein CDR20291_0993 [Clostridium difficile R20291]
ATGAACTTAATTAATGGTAGGGAATTGAAAGTAAAATATATTATAAAGGAGAATGCTAATATGAAAAAAA
TCAGGAAATTAGCTACTAAACTATTGATTGCAACGATGGTTTTAACCTCATGTATGAGTGTAACAGTTTA
TGGTATGACAGCTAAAGATGTTACTGCAAAGACACCGAAAAGCTATGTAGCTGGAACCAACAGTATATAT
GGTCCAAAGTTATCACAAGCTCAACTTAATTCGGTAGCACAAGCAACAGCAGACTTTATGAACAAGAAAA
TTACAAAGAACATGACCACAGATGCTAAGATTAGGGTTGCTTATAATCACATTAAAAACAACACAACATA
TGTTAACTGGAACGCAGCAGAGGGAGCCAATACTGCTTATACATTGGTTACTAAAAAAGGTGCTTGTTCT
GGAATGTGTAGGAGCTTGAAAGCTTTATGTGATGCTATGGGAATTGAATGTTATTATGTACATAGTACAA
CAAATGACCATCAGTGGAATCTTATTCGTTTTGAGGATGGACGTTTGTATCATGTAGATATTGATGCCAA
CAAATCAGCAGGAGCAGACATCATATACAAGAGTCTTACTCACCCATTACCATTTGACAAGAAAGCCTAT
CCAGCTGTTGGTGAATCAGTAAAGACACAGAATCCAACGCCAACTGTTAAGAAACCTACGCCAGCTAAGC
CTTCTGCGCCAGTTGGACCTGGGAATCACACTATGATAGCAGATCAAGAAGAAGCAATACTTGATGAAGT
TTATGGAAATAATCTACGTCCCAAAATTGAAAGGTATGAGGGAGTTCCGTGTAGTTTAATCAACTCATCA
ATAAATACAATTAAGTTTACAAGCAAAAATTCAAATTTAGACCCATCAAGGCATACAGTTTCTGTAATAG
GGTTTATGAATACACCATATGGTATGGTTGCATTAGCTCCAGATGGTGTACCTGTTGAGTATCCTTTTGA
ATATGATAAGCCATTTTCTTTAGATTTTACTGGTAAAAACCTTTCTGCAGCAGAATTATCAAAAAAGTGT
AAAAACAATAATGTAATTATTAAAATAGAAATTGGTGAAATAGAACCTAATTCTGGAAGAGGGCAAGTAA
GATATGCTAGATATGTGAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c1212589-1211396 putative anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAAGTTTTTGAAGTAAAAAAAGATATCTACTTTACTGGCGTAGTAGATGAAGGTTTAAAAGTAT
TCGACATAATAATGGAAACTGAGTTTGGGACAACTTACAACTCTTATTTAATCAAGGACGAAAAAACGGT
TTTATTTGACACTGTAAAGGCAAATTTTAAAGATGAGTTTTTAAGTAATTTATCAGAGGTTACTGATATA
GCTAAAATTGACTATGTTGTAATTCATCACACAGAACCAGACCATGCAGGTAGTTTAAAATACTTATTAG
ATATAAATCCTAATATAGAAGTTTATTGTACTAAAGCTGCTAAACTATACTTAGATGGTCAAATAAATAG
ACCTTTTAACTGTCATGTAATAAAAGATGGTGAAATTTTAAATATCGGTAAAAGAAATCTTAGATTTATA
ACTGCTCCATTCTTACATTGGGTTGATACAATGTTTACTTACATTGAGGAGGACAAGACTCTTTTAACTT
GTGATGCATTTGGTTGTCACTTTGCAAGTGTTGATGCAGAGGTAGTGAATAGTGAAGATTATCTAAAATC
AGCTAAACACTACTATGATTGTATAGTTAAGCCATTTGCTAAACATGTTTTAAGTGCTGTAGATAAGGTG
GTAGGACTAAACATAGAATTTGATACTATATTGACTTCTCATGGTCCAATGCTTACTAAAGACCCAATGG
CTGCTGTTAAAAGATATGTTGAGTGGTCTACAGAAGCTGTTAATACAACTAATCAAAATCAAGTTTCTAT
ATTCTACTTATCAGCTTATAGTAATACTTTAGAGATGGCTAAAAAGATAAAAGAAGGACTTGATAAAGAA
GGTGCAAAGGCTGAATTATATGATTTAGAAGATATGACATTAACAGAAATGCACGATACATTAGTAGTGT
CAAAAGTAATATTACTAGGTTCTCCAACTATAAACAAAACTATGGTTAAACCTATGTGGGATTTATTCTC
TGTTATAGACCCAATGGCTAACCAAGGCAAGATAGCAGGAGTATTTGGTTCATTTGGTTGGAGTGGTGAA
GGTATAACTATGGCTGAGACTTTACTTAAATCTATGTCATTCAAAATGCCTGTAGAATCTCTTAAGAAAA
AATTCTTCCCTAGTGAAGAGACATTAAAAGAGTGTATGGCATTTGGTGCAGAATTTGCAAAATTAGTTAA
ATAG
>ref|NC_013316.1|:1212908-1214752 radical SAM-superfamily protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAGTAGACTTGAAAAAAATCTTAAAAAAAGTAGAAAAGCCTGCTAGATATCTTGGAAATGAAA
TAAATTCAATTCATAAAGATACTAGTAATAGTGAATTGATAAGATATGCACATTGCTTTCCAGATTTATA
TGAAGTTGGTATGAGTCACTTAGGGAGTCATATATTATATGATGTAATAAATAAGGATGAAGATGTATTT
TGTGAGAGAGTGTATTCTCCTGCAGTTGATATGGAAAATATAATGAGAGAAAAAAGTATACCATTATTTG
CATTAGAGTCAAGAGAGCCTATAACAAACTTTGATTTTGTCACTTTTACACTTCAATATGAACTTTCATA
CACTAATATCTTAAATATATTAGATTTAGCCAATATACCAATATTAAAAGAAGAAAGAACTTTGGAAGAC
CCATTTATAATGGTTGGTGGTCCTTGTGCTTATAATTCCGAACCATTAGCAGATTTTATAGATGTAGTAA
TATTAGGTGAAGGTGAAGAGGTTAATTTAGAAGTAGTAAATGAGTATAAAGAATGGAAGAAAAATAAAAC
GACTAGAGAAGATTTTTTATATAAAATATCTAGCATAGAAGGAGTATACATACCAAGTTTTTATGATGTC
AAGTACAATGAAGATGGTACAGTTCAAAGTGTAACTCCTAATAGAGAAGGGATTACTAAAAATCCTACTA
AAAGGATAATAAAAGATGTTGAGACTGTAGATTATCCAGAAAAACTAATAGTACCTTATATAGATACTGT
TCATGATAGAATAGTACTAGAATTATTTAGAGGATGTACTAGAGGATGTAGATTCTGTCAAGCAGGTATG
ATATACAGGCCAATAAGAGAAAAGAGTGTTAAAAGACTTAAAGAAATATTAGATAAATTAGTTAAGAATA
CTGGATATGATGAAATATCATTATCATCACTTAGTACGAGTGATTATAGTAAGTTATCAGAGTTGACTGA
TTATTTGGTAGATGAATATGCATCTAATAATATTGGGATTTCGCTTCCATCCCTTAGATTAGATAATTTT
TCAATGGAAATTGCTGATAAAATACAACAAGTAAGAAAATCTGGACTTACTTTTGCTCCAGAAGCAGGAA
CTCAAAGACTTAGAGATGTTATAAATAAAGGTGTTACAGAAGAAGATTTGGAAAATGCAACAGAAAGAGC
TTTTGAGATGGGGTGGAATAGTGTTAAGTTGTATTTTATGATTGGTTTACCAACTGAGACTTATGAAGAT
TTAGATGGTATAGCTAAATTAGCTTATAAAGTTATTGATATTTATAGAAAAGTAAATGGAGGAAAGCTAA
AGAGAAGTTTTAGTGTTACAGTGAGTACTTCTACATTTGTACCAAAGCCATTTACACCTTTCCAATGGCA
TGGTCAAGATACTACAGAAGAAGTTATTAATAAGCAGAGACATTTAGTAAATAAATTAAGAAATAACAAT
ATAAAATACAATTATCATGATTCAAAGACTAGTTTGATGGAAGCAGTAGTAGCTAGAGGCGATAGAAGAA
TAGGAAAAGTTATATATGATGCATTTAGACTAGGTGCTAAATTTGATGGATGGGCAGAACATTTTAATTT
AGATATATGGAAAGAAGCTATGGAAAAGAATAATCTTTCTATAGATTTTTATGCACATAGAAATAGAAAC
TATGAAGAGGTATTTCCTTGGGACCATATAGATGTAGGTATTAGTAAAAAATTCTTAATTAGAGAAGACG
AAAATGCTAAAAAAGAAAAAATCACTTCTGATTGTAGACATAACTGCAATGGTTGTGGAATAAATATACA
TGATATAGGAAGGGGGCTTTGCTAA
>ref|NC_013316.1|:1214754-1215455 hypothetical protein CDR20291_0996 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAGATAATAAGAGTAAAATTTAAAAAGGAAGGCGACATGATATATATATCACATCTTGACCTTC
AGAGATTGTTACAAAGAGCGTTTAGAAGAGCTGAAATAAACTTATCACATTCTCAAGGATTTAATCCTCA
CCCTAAAATGAGTTATGGCAATGCTTTGGCTTTAGGGACAGAAAGTCAAGGTGAGTATGTAGATATTGAA
ATAGAAGAAGATGATTTATCAGTAGAGGAATTTTTAAATAAAGTATCAATTCAACTTCCAGATGGGATAG
ATTTTATCAAAGCAAAAGAAATTGATAGACAAACACCTTCTCTTTCTTCTGTGATAGACTATGGAGAATA
TTTGTTTAATATAGATTTGAAAAGACCTATGACGAAAGAGTTTGTAAAAAGAAAAGTAATTGACTTTATG
AATAATAAAGAAATAATCATAACAAAAAAGAATAAAAAAGGTAAGATGGTTGAAGTAGATATAAGACCTA
TGATAAGAACCTTTGATGTTTTAAATTTAGAAGATGAACATATTACTCTTACTGCTACTATAGCTACAGG
CTCAAAAACTAATTTAAATACTAATATACTTATACCAAAGATATTAGAGATGTTTGAACTTGATATTGAC
CCATTAGATGTTGATATATTGAGAAGAGATTTATATGTATTAGAAGATGGGGAATTAGTGACTCCTATGT
AA
>ref|NC_013316.1|:1215473-1216894 ribonuclease g [Clostridium difficile R20291]
GTGAAAAAGATAGTTATTGAGTCCCTAATAGGGTCCCAGAAAACAGCAGTACTTGAAGATGAAAGATTAA
CAGAACTTTTTGTTGAAGACAATTTAAATAAGAAGACTGTATCCAATATATATCGTGGAATCGTAAAAAA
AGTTATACCAGGAATAGAAGCTTGTTTTGTAGATATTGGATTTAAGAAACTTGCTTATTTACAATTAAAA
AAGGGAAGTACTATAAAATCTGGTCAGGATATTTTGGTTCAGATAAATAAAGAAGAAATAGGAACTAAAG
GCGCAAAATTAAACACTGAGATTAGTATTTCTGGAAGGTATATTGTCTATATACCTTCCAATGATAGAAC
TACAATATCAAATAAAATTACTGATGAAAAAGAACGATTTAGATTAAAAAAAATTACTAAGGCAGTAAAT
AAGGAAAATCTAGGATTAATAATAAGGACTGAGGCTCAAGGTTGCACTCATGATGAAATAAAGAAAGATA
TAGAAGAGTTGAAATTAAAGTATGAAAATATTTTAAAAGAATATAAACTTGGTATAGGTCCGAAATTATT
ATATAAGTCTTTAGATTTTGCAACTAAATATGTAAAAGATAATGTGAATGATGATATTGAATCTATAATT
ACCAATAGTTATGATAAGTACTCTGAACTTAAGTCTATTTTAAGAGGTATAGATAAGACTTATGTTGATA
AACTGTGTCTTGAGGAAAATAGAGATGTATTTGATTTATACAGAATAGAATCTAAAATAGAAAAATTATT
AAATAAAAAAGTATGGTTAAAGAGTGGAGGTTATTTAATAATTGAAAAAACAGAAGCTCTTACGGTTATA
GATGTAAATACGGGTAAGTTTATTGGAACTGGTAAACTTGATGAAACCGTTTATAAAACTAATCTTGAAG
CTGCAAAAGAAATTGTAAGACAGCTTATAATTAGAGACATAGCTGGGATAATAATAATCGATTTTATTGA
TATGCATAAAAAGAAGCATCAAAAGGAGATTTTACACATCCTAGAAGAAGAATTTAATAAAGATAAAAGA
AAAGCTGAAGTATTAGGTATGACAAAACTTGGTTTAGTAGAAGTTGCTAGGCGTAGAGAAAAAGAATCCA
TTGATAAGTATTATTTAATGTCTTGTCCATGTTGTGATGGTGAACAAACAATAAAATCTGTACATTATAT
ACTAGATAGTATTGAAAAAGAAATTATGAGAATAAGTGAACATACTGTTTACAAAAACATAATGGTAGAA
TTTAATGATTTTATTTTTGAACAAATAAAAGAATATTATATGGATATAATTGATAAAATTGGTGAAAAAT
ATAATATAAAGATTTCTTTAAACGCAAATAGTACATTAAAGCACAATAAAACCAATGTTATTTTCGATAA
AATAGTTGACAATAAAATGTAA
>ref|NC_013316.1|:1216995-1217306 50S ribosomal protein L21 [Clostridium difficile R20291]
ATGTACGCTATAGTAAAGACTGGTGGAAAGCAATATAAAGTTTCTGAAGGTGATGTATTATTCGTTGAAA
AATTAGAAGCTAACGCAGGTGATGTTGTTACTTTAAACGAAGTATTAGCTTGCTCTAAAGATGGAGAATT
AAAATTAGGTTCTCCAGTAGTAGAAGGAGCATCTGTTCAAGCTAAAGTTGTTGAACAAGGTAAAGCTAAG
AAAGTTATAGTTTTCAAGTATAAAGCAAAAAAAGATTACAGAAGAAAACAAGGACATCGTCAATCATACA
CTAAGATAGTTGTAGAAAAAATAAACGCTTAG
>ref|NC_013316.1|:1217321-1217638 hypothetical protein CDR20291_0999 [Clostridium difficile R20291]
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ATTTTGCTGAAATAGGCTATGATATAGTATGTGCTGCAGTTACATCTAATGCTATTGCAGTTATAAATTC
TTTAGACAAATTACAAAAGATTGAATTTGAAAAAGTAGTAGGAGAAGAAGGTCATATAGAGTGTATAGTC
AAAGATACGCATGTAAAAGACGCACAATTATTACTAAATCACTTTCAATTAGCGGTTAAAGAAATTAAAC
GGGAATACCCAAAAAATATAAAAATTTTAAAAAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:1217652-1217942 50S ribosomal protein L27 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAACATGAATTTACAATTATTAGCATCTAAAAAAGGGGTAGGTTCTTCTAAAAATGGTAGAGATT
CTATATCTAAAAGATTAGGTGTTAAGAGATTCGATGGTCAATTAGTAACTGCTGGAAGTATAATAGTTAG
ACAAAGAGGAACTAAAATACATCCAGGAACTAATGTTGGAAAAGGTAGTGATGATACTTTATTTGCATTA
GTTGATGGTACTGTTAAATTCGAAAGAAAAGACAAGAAGAGAAAAAAAGTTAGTATATATCCAGTAGCAA
TAGCTGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1218044-1219330 Spo0B-associated GTP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
GTGAAGAATTTGTTTATAGATAAGGCAAGAATATTTGTTAAGGCTGGAAATGGTGGAAATGGTTCGGTAG
CATTTAGAAGAGAAAAATACGTTCCAGCTGGTGGTCCAGACGGTGGAGATGGTGGTCGTGGAGCAAGCAT
CATATTTGAAGTTGATTTGGGGCTTAGAACTCTAATGGACTTTAAGTACCAGAAAAAATATCAAGCTCAA
AATGGTGGCGACGGAAGCAAAGGAAAAAGAGCTGGTAAAAATGGAGAAAATTTAGTATTAAAAGTACCAG
CAGGTACAGTAATAAGAGATGAGGCTACAGGTCTTGTATTAGCAGATTTAAAAAAAGAAGGAGATACAGC
TATAGTTGCAAAAGGTGGTATAGGTGGTAAAGGTAACCAACACTTTGCAAATGCAGTAAGACAAGCTCCA
GCTTTTGCAAAATCTGGTACAGATGGAGAAGAAAGATGGATAACTCTTGAACTTAAAATGATAGCAGATG
TTGGTCTTTTAGGATTTCCAAATGTAGGTAAATCAACATTTCTATCAGTTGTAACTAAAGCTAAACCCAA
AATTGCAAACTATCATTTTACAACACTTACACCAAATCTAGGTGTTGTTCAAACTAAGTTTGGAGATAGT
TTTGTACTTGCAGATATACCTGGAATTATAGAGGGTGCTTCTGAAGGCATAGGATTAGGTCATGAGTTCT
TAAGACATGTTGAGAGAACAAAGGTATTGATACATATTGTAGATATATCTGGATTAGAGGGAAGAGACCC
TATTGAAGATTTTGACAAGATAAATGATGAGCTTAAATTGTACAATGAAAAGCTTTCAAAGAGGCCACAA
GTTGTAGTTGCAAATAAATTTGATATATTAGAAGATGAGAGTAAGTTTGAGAAGTTTAAGAGTGAATTAG
AAGGCAGAGGATATACAGTATTTAAAATGTCAGCAGCAACTCGTCAAGGCATAGATGAAGTAATAGCCTA
TGTTTCTAAAATGCTAAAAGAAGTAGAAGATGTGGAGCTAGTTTCAGAAGAAGAAATGTATAGACCAGAA
CTTGATATTGGTACTGAAGAAGAGTTAAGTATAGATATTGAAGATGGTGTGTATGTAGTTACAGGTAAAG
CACTTAGAAGAATAATGTATTCTGTAAATTTTGATGATATGGAATCCCTTCAATATTTCCAAAAAGCTAT
GGAGAGTCAAGGTGTTTTTGATAGGCTTAGAGAAATGGGAATAGAAGATGGAGATGTGGTTAAAATTTAT
GAATTAGAATTTGAGTTTTACAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1219382-1219750 hypothetical protein CDR20291_1002 [Clostridium difficile R20291]
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GTAAAGAAGGTGTTACAGAGAGTTTCTTAGAGCAATTAGATGGTATGTTAAGAACTAGAGAATTAGTAAA
AGTTACTATATTAGAAAATGCAGGTCTTGATACTAAAGAAACTGCTAATGCAGTATGTGAAGCTTTAAGA
GCTGAATTTGTGCAGGCTATTGGTTTTAAATTTACTATTTACAAGAGGAATATTGAAGAGCCTAAAATAC
TTTTTCCAGGACATGAACAGGCGAAAGCAAAGACTAAAAATAATAATGTTACAAAAAAGGGTAAACCAAC
TAAAAGAGCTGTTAGATAA
>ref|NC_013316.1|:1220051-1221256 homoserine dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
GTGAAGATAGCAATATTAGGGTATGGAACAGTAGGAAGTGGATTAATTGATTTAATAGAAAATAATACTT
CAAAAAGAGATATAGAAGTTGTTGGAATTTTAGTTAAAAATAAAGAAAAACACAAGTATAAGAAGTATTT
TGATAAGATAACTACTGATATAGAAGATATATTTGACAAGGATATTGATATACTAGTTGAAGTAATTGGA
GGATTAAATCCAGCTTTTGATTATGTAACAAGAGCGTTAAATAAAAAAATACATGTAGTGACAGCTAATA
AAGATTTACTGGCTGAAAAAGGTAGTGACCTTATAGAATTAGCTAACTTAAATAATGTTAGCATCAAGTT
TGAAGCATCTGTGGCAGGTGGTATTCCAGTTTTAAAACCATTGATAGAATCACTGGAAGGCAACAATATA
AAGAGCATAAACGCTATTTTAAATGGGACTTGTAATTTTATATTATCAAAGATGTATGATGAAAATTTAC
CATATGATGTTGCTTTAAAACAGGCACAAGAGTTGGGATTTGCAGAAGTTAATCCAGATGCAGATGTTTT
AGGATATGATAGTGCTAGAAAGTTATCTATATTGTCTACTTTATCTTATGGAAAAATAGTATATTGGAAA
GATTTATTATTAGAAGGAATAACTTCAATAGATGAAAAAGATATAGAATATGCAAAAAAATTAAATTGTA
AGATAAAATTGGTTGCTAGAAGTAAGTATGAATCAGGAGAAGTAAGTGGATTTGTTAGACCAGCATTAGT
GGACAATAATAATATGCTTTCAAAGATAGATAATGAGTTCAACGTAGTTATTTTAGTAGGTGATTCAGTA
GGTGAACTTTCTTTTGTAGGTAAGGGAGCTGGAAGAGGTGCAACAGGAAGTGCTGTTTATGCAGATATTA
TAGATATAATAGATAATAGAAGTTCAAATATAAAGTCTTTTTCAAAAGGGAAATTGGATTTAAGTGGACT
TATAGAAGATGAGTGTAGTGCAGTAGTTAGATTTGGTGGGTATAATAATAAAGATGGAATTTTAGAATGT
TTAGATAAATATGTAGATAGTTATGATATTATAGATGATGAAGAATTGGCGATTTTTGTAAGTGCAAAGT
CAGAACATGAGATTGATAGAGTTTTGGAAATTGTAAAAAGAAATAATTACAGTGAATCAGCTAAAAAATT
ATTGAAGATAGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c1222023-1221457 putative integrase/recombinase [Clostridium difficile R20291]
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ATAGTGAAAATGGCGTTGAAAAAAGATTTAGAAAAAATCCTAAAGTTGCATTGGCACTAATGTTAGAAGC
TAATTTAGGTCTAAGAATATCAGATATTTTAAGATTAAAGATAGGTAATTTTAAAGGTAATATGTTGGAA
ATAAATGAAAAAAAGACGGGCAAATTACAGTATAGACCAGTTAATAAAAATATAATTGAGTCCATAAATG
AACATGCAAGAAAGTATAATCTTAAATCAAATGACTACTTAGTAAATATAAAGACAAAGGCTATTCAAAA
ACAGTTGAGGATAATTTGTAAACACTTAAATCTGTATAATATAAGTACACATAGCTTTAGAAAGCTCTAT
GCTACTACTCAATTTGAAAAGAGTAACAATAATTTAGAGTTGGTTAAAGAACTTTTAAATCACAGTTCTG
TAGCCACTACACAGCGATATATAAGAGTAACTCAGCAAGCTATTAATGAAGCTAGTGAAAATTTCTTTAT
TGGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1223550-1222291 hypothetical protein CDR20291_1005 [Clostridium difficile R20291]
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TCCTATACCCAAATGAAGCTATAAAATCTGCAAGAGAAGGCTTCTCTATATGGTCTAATGTTTTAGTTCC
ATCACTACTACCATTTATAATTGGAGCAAACTTAATTGTTGATTTAAAAATAGTGGATATTATAGGGTTT
ATCATCAATCCCATAACTAGATTTGTATTTAATGTTTCAGGAAAGAGCGCTTTAGCTTTTGCTATATCTA
CAGTATCTGGTTATCCAGTAGGAGTAAGTTTAGCTTCTGAATTTAGGAGTAATGGGCAAATTTCTAAGCA
TGAAGCACAAAGACTTGTGTCTTTTTGTTCTACATCAGGACCTTTATTCATAATAGGTTCGGTTGGTACA
GGTATGTTCCAAAATTCAAACTTAGGTTATTTAATGATTCTCTGCCATTATCTAGGAACTATATTGGTTG
GTCTTTTCTTTAGAAATTATGGTAATGAAAATCTTCCAAAGACAAAATTGGATTTAAAAACAAATATAAA
AAATGTAATCAACATTAGAAATTCAAGTGGGAATGGTTTTTTTGTTTTATTTGGAAATGCTGTATTTAAT
GGAGTAAATACATTACTTACAGTTGGTGGATTTGTAATTGTTTTTTCAGTAGTATTTAAAATACTATCTC
TTTTTAATGTAATCTCATTAATAGCATCAGTTATATATTTGCCTCTTTCATTTTTAGGTGTTAGTAAAGA
ACTCTGTCAAGCATTTGTAAGTGGTCTATTTGAAATTACTATAGGATGCAATAAAGTATCTAGTATAACA
AGTTCTCCAGAAATTTTAAGAGCATCTTTAGCTAGCTTTTTGATAGGATTTAGTGGATTATCCATCCTAG
CTCAATGTTGTACATTTCTATCAAAAACGGACATAGATTTAAAATTATACATACTAAGTAAATTTGCGCA
TGGAGTTTTAGCTGCTATCTTTATATTTATACTTTATCCAATTGCAAACTCTGCTGTGTTGGTTTCTAGC
TTTGCTGATACATACAACGTTATATATAATAATTTAATCTGGTTTTATTATCTTAGCTATTATGATACAA
TTCTTCAAATTGTAGTAATAATTTATCTAATCTCAGCAGTATTTATTGCAAAAAAACATATGAAAACTTT
ATCTACAAATGGGAAACTAATGCGATATAAAAATACTTTTTTTATTAAGAAATTTTCACGAAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1223675-1224388 GntR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAATAGTATAGCTAGTAAAAAAGTTTATGAACAAGTAATTGAGCAAATACAATATAAAATACTAA
ATGGAGAGTTAAAAAAGGGGGATAAATTACTATCAGAAAGAGAATTGTCTGAACAAATGAATGTGAGTAG
AACTTCCATAAGGGAAGCTATTAGGGTATTAGAGACTATGGGAGTGATAGAAAGCAGACAGGGTGAAGGA
AATTTTATATGTACAAATATAGAAAAAACTTTAATAGAACCTTTATCTATGATTTTTAAACTTAATAATG
GCACACTTGAAGATATATTAGAGCTTAGAATAATCCTAGAAATTGAGATTGCAAAACTTGCTTCAAAGAG
AATAACTTCTTCTGAAGTTATAGAATTGAAACATATAATAGATGAAATGAGAGTAGAAACTAATAAAAAA
GATAATAATCGAGTACTGGTGTTATTAGACCAAAAATTTCACAGTAAACTAGCAACATTAAGTAAAAATT
ATTTAATTCAAAGTCTTTTTATGACAGCATCAAAATTATTTGATGGATTTATAGAAGATGCAAGAGAAAA
AATAATCGCAGAACCTTTTAATGAAAATATATTGCTTAAACAGCATGAAGCTATATACAATGCAGTTGTA
GAAAATGATGTAGAACTTGCATGTGAGAAAGCAAAGGAACATATGGATTTTATAAGTAAAAATTATAGAA
AAAATGAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1224506-1225780 hypothetical protein CDR20291_1007 [Clostridium difficile R20291]
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GTGTTTTGGAGTCAAAATCGGATAATTATATAGAACATAAGACTCAAGAAGAGATAGTTGAAGAATCTAT
GAATAATCCTATAGGCTCTAATTCTCTGGAAGAACTGGTTAAGGGGAAAAAGAATGTAGTCATAATTACA
AGTGACCATACAAGACCTGTACCAAGTAGAATAACTATGCCAATTATATTAAGAAGGATTAGGAATGTTA
ATCCAGAAATTGATGTGAAGATTATAGTGGCAACTGGATTTCATAGGCCAAGTACAAGGGAAGAGCTAAT
TTATAAAATGGGAGAAGAAATAGTAGATAATGAAGATATAGTTATGCATATATCTACTGATGATAAATCT
ATGTGTAAAGTAGGGATATTGCCTTCAGGTGGAGATTTATATATAAACAAACTAGCATATGAGGCAGAAC
TTTTGATAGCAGAAGGTTTTATAGAACCTCATTTCTTTGCAGGTTTTTCAGGTGGCAGAAAAAGCGTACT
TCCAGGAATCGCATCTGCAAAGACTATAATGTACAATCACTGTAGTGACTTTATAGATAGTGATAATTCA
AGAACTGGGAAATTGAATAATAATCCTATTCATGAGGATATGGTATATGCAGCTAAAGTTGCAAAGTTAG
CATTCATATTGAATGTTGTAATAGATAAAGATAAAAAAATAATTGCTTCCTTTGCTGGTGATGTCGAAAA
AGCACATACTAAAGGATGTAGATTTGTAACAGAGTTATCAAAAGTAAATTCTATAAAATCTGATATTGTT
GTAACTACAAATGGTGGATATCCACTAGACCAAAATATTTATCAATCTGTTAAAGGAATGACAGCAGCTG
AAGCTACTTGTAAAGACGGTGGAGTAATAATAATGATTTCAGCATGTAATGATGGTCATGGAGGTCAATC
TTTTTATGAAAATGTAGCAAATGCAGATTCTCCAAAACAACTTTTAGATAAAATTAGAAGTGTCGATAGA
GTAGATACGATTCCAGACCAATGGGAATTTCAGATACTAGCGAGAATATTATCTAAATATACTGTGATAA
TGGTAACAGATAAGTGTAATCCTGAAATGATAAAAAAAATGCATATGAAACATGCATTTAACTTTAAAGA
AGCTTTAGAAATGGCGAATAGTATAGTTGGTAAGGAGAGCAAAGTAGTAGTTATACCTGATGGAGTATCA
GTTATAGTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1225797-1226585 electron transfer flavoprotein beta-subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAATTTTGACATGTATTAAACAAGTTCCTGGAACGACTTCAGTAGAAGTTGATGAAACTACAGGAG
TACTAAAAAGAGATGGAGTAGATTCAAAAATGAATCCCTATGACCTATATGCTTTAGAAACAGCTCTTAG
AATAAAGGAAGATAAGAAAGCGAATCTAAAAGTACTTAGCATGGGTCCTCCTCAGGCAAAGAAGGTAATT
GAAGAAAGTTTTATGATGGGAGCTGATGAAGGAGCATTAATAAGTGATAGGAGATTTGGAGGAGCAGATG
TATTGGCTACTTCCTATACCATATCACAAGGTATTAAGAAGATGGGAAAGGTAGACCTAATAATTTGTGG
AAAACAAACTACTGATGGTGATACAGCACAGGTGGGACCTGAAGTAGCTGAATTTTTAGATATACCTCAT
GTTACTAACGTTACAAAATTAATTGAAGTTAAAGATGAAAGTATAGTTGTTGAAATAGATATGCCAAATG
ATTTACAAGTATGTGAGATTGAATATCCATGTTTAATAACTGTAGAAAAAGACATTTTTCAACCAAGACT
ACCTTCATTTAAATTAAAACTTAATACTAAAGATAGAGAAATACCTGTATATAGCTTAGATGACTTTGAA
GATAAAGATGAAAATAACTATGGACTTAACGGTTCTCCTACTCAAGTTGTAAGAATATTTCCTCCAAAGC
CAAATACAGATAAAAATATTGTAAGAGGAAATGCAGATGAACTAAGTTTTGCACTTGTAAATAAATTAGA
GGAATTAAAGTTGGTGTAA
>ref|NC_013316.1|:1226599-1227819 electron transfer flavoprotein alpha-subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAAAGATAGTTGTAAATCAAGATAAAATAACTGACTTAAAGAGAATTTTAGAAATATGTCCTTTTG
GGGCTATAGAAGAAAAGTCAGGTATAGTAGAAATAAGTGCTGGCTGTAAGATGTGCAAGTTGTGTGTCAA
AAGTGGACCAAAAGGCGCATTTGAATTTATAGAGAGTAGTAAAGTACAAATTAATAAAGATGAATGGAGG
GGAATTGCAGTATATGTTGAACATCATAATGGAAATATACATCCTGTAACGTACGAGCTTATAGGTAAAG
CTCGTGAGATGGCATCAAAAATAAAACAACCTGTGTATTGTGTATTTGTAGGAAAAGACATAAAAGATAA
GTGCAGTAATTTGATTTCTTATGGGGTGGATGAAGTATTTGTATATGATGAAGATGAATTTAAAGATTTT
AGGATAGAACCATATTCAAAAGCAATAGAAAACTTTATAGATAAAATAAAACCAACGATAGTATTAGTTG
GTGGAACTACATTAGGTAGGTCATTAGCTCCAAGACTTGCCGCTAGATTTAGAACAGGTCTTACAGCAGA
TTGTACAATACTTGATATTCAATCAAATACTGATTTAGACCAAATAAGACCAGCATTTGGTGGAAATATA
ATGGCTCATATAAACACACCTAATAATAGACCACAATTTGCCACTGTAAGATATAAAATATTTTCAGCAC
CAGAAAAAATAGAGAATACTACAGGAAAGATAACTTTATGTAAAGTAGAAAAAAAAGAACTAAAATCTAA
AATTAAGGTACTGAGTGTAAAAGAAAAAAATAAAGAAGTTGGTCTGGAAGAAGCTGAAGTGATAGTTGTG
GCAAGCAGAGCAATAAAAAAACAAGAAGATATGGAGATGATATATAAATTAGCTGATAAGCTAAACGCTC
AAGTGGCAGGAACAAGACCTGTAATAGAAGCAGGTTGGATAGATGCTAAAAAACAAATAGGTCTTAGTGG
TAGAACTGTAAAACCTAAATTGATAATAACTTGTGGTGTATCTGGAGCAGTTCAATTTGTTGCAGGGATG
CAGGGTGCTGACTATATAGTAGCAATAAATAAAGATGATAAAGCGCCTATACTTGATGTAGCACATTTAG
CTTTAATAGGTGATATTTATGATATTATTCCTAAATTGATTGAAAAAATAGAAAATAACAAAGATAATAA
TCAAAAATATATGGCATCAGCAGCTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1227830-1229221 putative FAD/FMN-containing dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAAATTAATCGATAAAAAAGATATAGATTTTTTAATAGATACTTGTGGAGAAGAAAATGTATTAG
TTGGAAGTGATATAAATGAAGATTTTTCACATGATGAACTTGGAGGGATTGAGAAGTACCCTGAAGTTTT
AGTAAATGTACTTGAAACTGAACAAGTATCTAAAATAATGAAATACGCATATAAAAATAATATACCAGTC
ACACCAAGAGGTCAAGGTACTGGTCTTGTAGGTGCTGCTGTTGCCATAAATGGTGGAATAATGATTAATC
TATGTAAAATGAATAAAATACTTGAAGTTGATTATGAAAATTTAACATTGACAGTAGAACCAGGTGTTTT
ATTGATGACAATAGGTCAATATGTTCAAGATAGAGATTTATTTTACCCACCTGACCCAGGTGAAAAAAGT
GCTACAATTGCAGGTAATATAAACACTAATGCAGGTGGTATGAGAGCAGTAAAATATGGCGTTACAAGGG
ATTATGTAAGAGGACTTGAAGTTGTACTACCAAATGGAGAAATTATAAATGTAGGTGGAAAGGTGGTTAA
AAATAGTTCTGGATATAGTATAAAGGATTTATTAGTAGGTTCAGAAGGTACTTTAGGAATAGTTACTAAA
GCTATATTAAAATTGCTTCCTTTACCAAAGAAAAGTATAAGTTTGCTTATACCATTTCCAGATTTATCAA
TGGCAATAGAAACTGTTCCTAAAATAATAAAATCAAAATCAATACCAACGGCTATAGAATTTATGGAAAG
AGATGTAATATTGGCAGCAGAAGAATTTTTAGGTAAAAAGTTTCCAGATAATACATCAGATGCTTATCTT
TTACTTACATTTGATGGAAATAGCACTGAAGATATAGAAAAGGAATATGAAAAAGTAGCTAATTTATGTT
TAGAAAATGGTGCATTAGATGTATTTATATCAGATACACAAGAAAGAAACGATTCTATATGGTCAGCCAG
AGGTGCATTTTTAGAAGCTATAAAGGCATCTACGACACAAATGGATGAATGTGATGTCGTTGTTCCAAGA
GATAAGATAGCAGAGTTTATAAGATACACTCACGAGCTTCAAGACAAATTAAAAATAAGAATAAAAAGTT
TTGGTCATGCAGGAGATGGAAATCTACACATATATATTTTAAAAGATGGTATGGATGATAATACATGGAA
AATAAGATTAAAAGAAACTTTTGACTATATGTATAAAAAATCTAGAGAACTTAGTGGTCAAGTTTCTGGT
GAACATGGCATAGGATATGCTAAAAAAGAGTACTTACATGAATCAAATTCAGATGCTTATATGATGTTAA
TTAAAAATATAAAGTTAGCTTTTGACCCTAAAAATATTTTAAATCCAGGGAAAATATATTAG
>ref|NC_013316.1|:c1230764-1229484 hypothetical protein CDR20291_1011 [Clostridium difficile R20291]
ATGAACATACTTGGATTAATAGTTGAATATAACCCATTTCATAATGGACACATATATCATTTATCTAAAT
CTATAGAAAAAACAAATGCAACACATACTGTAGCAATAATGAGTGGAAATTTTCTACAAAGAGGCGAACC
AGCTTTATTTGATAAATATACTAGAGCAAAAATTGCTGTCGAAAATGGTGTAGACTTAGTTATAGAATTA
CCAACTTTATTTGCTTGTCAAAGTGCTGAAATTTTTTCTCATGGTGCTATAACAATTTTAAATTCACTAA
ACTGCATAAATTCTATATGTTTTGGTAGTGAAGAAGGAAATACAGAAATTCTTTATAATATAGCTGAAAT
TTTAGCAAATGAACCAAATGAATTTAAGTTACTTTTAAAAAAATATTTAGATGATGGCCTGTTATTTCCA
ACAGCTAGAGCTAATGCACTTTTTGATTATATACATCAAGACAAAAAAAATAATTTTATACAAAATTATT
CAAAGGAACAATTATCAAAAACATTAAATTCATCAAACAACATACTGGGTATAGAATACATAAAAAACCT
CATCCATTTAAACAGTAGTATAAAACCATTTACTATCTCCAGGGTCCAATCAGAATATAATTCCGAAGAA
ATTGAGAGTGATATTTGTTCTGCTACTGCTATAAGGACTTCACTTAAAGAAAATACAGACCTTTTTCATT
TAAAAAATGTTATTCCAGAAAAAACTTATAACATCCTAAATGAAAAAGTAGATAATGGTTTTTTACCTAT
GTTTGATGACTTCTTCTTTGATATTTTAAAAACAATTATACTTAGAGATATGGACACTTTAAAAGAGTAT
TTTGAAGTAAATGAAGGCATAGAAAACAGAATCTATAAAGATATCTTTACATCTGAATTTCTACATGAGC
TACAATTAGCAATTAAATCCAAGCGATACACTTTAACCAAAATCAAACGAACTCTAAACAATATATTGTT
AGGTATTAAAAAAAGCGACATGCAACTTATAAAAAACATAGATACTATACCTTATATAAGAATACTTGCT
TTTAATGATAAAGGTAGAGAAATTCTAAAAGAGATAAAAAATAAATCTGAAATAAAAATAATAAACAAGT
TTTCAAATATATCATTTTCATTAGATGATACGATTTTTAAAACACTCATAAGTTATGATATAAAAGCTAC
AAATATATATAATTCAATATATTATAAAAACAATAAAGATTTAGTAAAAGGCCCTATGGATTTTTATACT
CATCCAATATATGTAAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:1231227-1232423 acetate kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATATTAGTATTAAACTGTGGGAGTTCTTCATTAAAATATCAATTAATAGATATGAATAATGAAG
AAGTTTTATGTATAGGATTGGTTGAAAGAATAGGAATAGAAGGTTCTATATTAAAACATGAAAAAGCAGG
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TACATGCTGGAGAAAAATTTGCAACTTCAGTAGTAATAACTCCAGAAGTAGAAGAAGCTTTAAAAGAATG
TATAGATTTAGCTCCACTTCATAATCCAGCAAACATAATGGGAATAGATGCTTGTAAAGCTATACTTCCA
GATGTACCAATGGTAGGTGTATTTGATACTGCTTTCCATCAAACAATGCCTAAATCTTCATACTTATATG
GTTTACCTCATGAGCTATATACTAAATATGGGGTAAGAAGATATGGATTCCACGGAACTTCTCATAATTA
TGTATCTCAGAGAGCAGCAGAGATATTAGGAAAAGATATAAAAGATTTAAAAATAGTAACTTGTCACTTA
GGAAATGGTGCTTCTATAGCTGCTGTTGATGGTGGAAAATGTGTAGATACATCTATGGGATTCACTCCAT
TAGAAGGATTAATAATGGGAACTAGATGTGGAGATATAGACCCAGCTATATTACCATTCTTAATGAGAAA
AGAAGGTTTAGATGCTGATGGATTGGATAAATTAATGAATAAAGAATCTGGAGTATATGGAATGACTGGA
ATTTCTAGTGACTTCAGAGATATAGAAGATGCAGCTAAAAATGGAGACGAAAGAGCTCAGGCTACATTAG
AAGCGTATGTTAAAAAAGTACAAAAATATATAGGCGCTTATGCTGCTGAAATGAATGGATTGGATGTTGT
AGTATTTACTGCAGGCGTTGGTGAAAATGGAAAGGCTATAAGAGCAGATATTGCTTCTAACATGGAGTTT
TTAGGAATGAAATTAGATAAAGAAGCTAATGATGTTAGAGGAAAAGAAACAGTAATATCTACTGCTGATT
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AAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1232516-1233040 hypothetical protein CDR20291_1013 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTTAGCATAGAAAAAATAAATAGAAAAGAAACTGACAAAATAGACTTGAATTTTTGTGAAAAAA
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AAAGACTAATAAAGGTTTGTATCTAGATATAGATGTCAATTTTACAATTGTTGACACTTGTTCAAGATGT
CTTAAAGAAGTAGAAATACCACTAGAGTATTCTATACAAGGTTTTTTAGTAAAAGAAGAAGATTATGATG
AAGATGAGTTTGAGGAATTTGATCCTTTTATATTCGATGGTGAAGAAATCGACCTTATTGATATAATAGA
ACAGACATTAGATTTTAATGTACCTCATAAAGTTCTTTGTAGTGAAAACTGTAAAGGTCTTTGTCAAGTA
TGCGGGGCAAACTTAAATGAAGAAGAGTGTTCTTGCAGTGAAATTACAAACGATGAGGAATACATAGATC
CTCGTTTTGCTAAATTAAAAGATTTATTTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1233065-1233241 50S ribosomal protein L32 [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAGTACCAAAGCGTAAAACGTCTAAATCAAACACAAAAATGAGAAGAGCAGCTAACTCAAAGATGG
AAGCAACAGGATTTGTAAGTTGCCCACAATGTCATGAGCCAAAATTACCACATAGAGTGTGTCCAGACTG
TGGATATTATAAAGGTAAAGAAGTTGTGTCTAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1233448-1234005 DeoR-family transcriptional regulator (fatty acid and phospholipid biosynthesis regulator) [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGAAAAGTAAAGCCCAAAGACAAAAAGAGCTTATAGATATGCTAAAGACAGATCCTTTTTATA
CTGATGAAGAATTATCAAGTCTGTTTGATGTAAGTATACAGACCATAAGATTAGATAGAATGAGTCTAAA
CATACCAGAGCTAAGAGAAAGAGTCAAATCAATAGCAGAAACTCAGAGTTCAAAAGTAAAGACTTTAGGA
GTAAAGGAAATTACAGGAGAAATCATTGATTTATCTGTAGGGCGATTAGGTATATCTATGTTAGAAGTTA
CACAGGACATGATTTACTCTAAGACTAATACTTTAAAAGATACGTATATTTTTTCTCTAGCAGATTCATT
GGCAATGGCTATAATAGATGCACCTAAGGTTATTATGAGAGTTGCAAATGTAAAAAGTTTTAAGTTGATA
GAACAACAAGATAGACTTATAGCAAAAGCAGAAGTGTATAGAAATATAGATAAAAAGCATTATGTAAAAG
TTGTTATCAACAATAAAGCCCAAGAGCAAATATTTAGAGGAAAGTTTATCTTTGAAGAATTAGATTAG
>ref|NC_013316.1|:1234016-1235038 fatty acid/phospholipid synthesis protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATAGTAATTGATGGAATGGGTGGAGATAATGCACCTAAATCTAATGTAGAAGGCGCAGTAAATG
CTATAAAAGAATATCAGGTTGATTTAATAATCACAGGAGATAAAGATTTACTTGAAAAGGAATTTTCAAA
TTATGAATTTGATAGAAATAAATTAGAGATAGTTCATACTACTGAGATTATAGAAAACGAAGATAAACCA
GTAAAGGCTATAAGAAGTAAAAAAGATTCATCTATGGTAGTAGCATTAAATCTTGTAAAAGAAGGAAAGG
CAGATGCTATAATATCAGCTGGAAATACAGGAGCCTTACTTGCTGGTGGATTATTTGTTGTTGGTAGAAT
AAAAGGAATCGATAGACCTTGCTTATGTTCAGCAATACCAAATGTAAAGCGAGGAATGACACTTATAGCA
GACTGTGGCGCAAATGCAGATTGTAAACCTAAGAATCTAGTTGAATTTGCAGCTATGAGTAATATTTATT
CAAGAAAAGTTTTAGGTCTTGAAAATCCTAAGGTAGCATTAGCAAATGTTGGACTAGAAGAAGGCAAAGG
CAATGATTTAGTCAAAAGGTCATATGAAGAAATTAAAAAATTAGATTTAAATTTTATAGGGAATGTAGAA
GCTAGAGAAGTTATAAATGCATACACAGATATAATCATATGTGATGGATTTACAGGTAATATATTACTTA
AATCTGCTGAAGGTGTAGCACTTTCAGTTATGAGTCTTATAAAGGAAACTTTTATGGCCAGTACAAAAAG
TAAAATAGGAGCATTACTTATAAAGGATGATTTAAGAAAATTAAAAAGTTTTATAGATTATTCTGAGTAT
GGGGGAGCTCCACTTTTAGGTCTAAATGGAGGAGTTATAAAAGCTCATGGTAGTTCTGATGCTAAAGCTA
TAAAAAATGCTATAAATCAAGGAATAAAATTTTCAAAGGGAAAAGTCGTTGAAGATATTAACCAATTTAT
AAGCAAATACAATGAAGAAAATAAAAATAACGAAGATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1235064-1236050 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III [Clostridium difficile R20291]
ATGAATACAAAGGCTGGAATATTAGGAGTAGGAAGTTATCTACCTGAGCAATCATATGATAATTTTCACT
TCGAAAAAATAATGGATACATCAGATGAGTGGATAAGTACTAGAACTGGTATTAAGGAAAGAAGATTTGC
CAAAGAGTCTGAAGCAACTTCTGACTTAGCATCTAAAGCTGCCTTAAAAGCTATAGAATGTGCAAAGTTA
AACGTAGAGGATATAGAGCTGATTATATTAGCTACAATTACTCCTGATATGTCTTTGCCTTCAACTGCAT
GTATAGTACAAGATGCAATAGGAGCAGTGAATGCTACTGCATTTGATATATCAGCAGCTTGTTCTGGATT
TGTATATGGAGTAACTATTGCAAAGCAATTTGTGGAAACAGGTTGCTATAAAAATGTGCTTGTAATAGGA
GCAGAAACTTGTTCTAAGTTTTTAAATTATGATGATAGAACAACAGCAGTATTGTTTGGAGATGGAGCTG
GAGCAGCTGTTATTGGTCCTGTAAATGAGGGTGGAATACTGTCTACACATATGGGCTCTGATGGTAAAGG
AAAAGATTGTTTAAAAGTACCTGCTGGAGGTTCAAGACTTAAGGCAAGTAAAGAGACTGTAGAAGCTAAT
CTACATACAATAGAAATGGCAGGTAGTGATGTGTTTAAATTTGCAGTTAGAAAGATGGCAGAAACTTCTT
TAAGAGCTCTTGAAAAAGCAAACCTAAATACAACTGATATAGACTACTTAGTGCCACATCAAGCTAATAT
AAGAATCATACAAGCTTCTTCTAAGAGATTAGAGCTTGATATGAAAAAAGTTTATGTAAATATAGACAAA
TATGGAAATATGTCTGCTGCATCTATACCAGTAGCATTAGATGAAGCTTATAGAGAAGGTAAAATTAAAA
AGGGTGATAATGTAGTTTTAGTTGGCTTTGGTGGAGGTCTAACTTGGGGGGCTTCAGTTGTCAAGTGGAC
TTTATAG
>ref|NC_013316.1|:1236159-1237088 trans-2-enoyl-ACP reductase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAATTTGCAAAATATTAAATATAAAATACCCAGTTATCCAAGGGGGAATGGCATGGGTAGCTA
CTGCATCATTAGCAAGTGCTGTATCTAATGCAGGAGGACTTGGCATAATAGCAGCAGGAAACGCACCAAA
AGAAGCTATAAAGAAAGAAATTGTTGAGTGTAAAAAATTAACAGATAAACCTTTTGGAGTAAATGTAATG
CTTATGTCGCCATTTGTTGATGATATAATTGATTTGATTATAGAAGAAAAAGTTCAAGTTATTACTACTG
GTGCTGGAAATCCTGCAAAATATATGGATAGATTAAAGGAAGCTGGAACAAAGGTTATTCCTGTAGTACC
TACAATAGCTTTGGCACAAAGAATGGAAAAGTTAGGAGCTACAGCAGTAATAGCAGAAGGTACTGAAGGT
GGAGGACATATAGGAGAACTTACTACTATGGTCTTAGTTCCACAAGTTGCTGATGCTGTAAACATACCTG
TAATAGCTGCTGGAGGAATTGTAGATGGTAGAGGAATTGCAGCATCATTTGCATTAGGTGCCAGTGCAGT
TCAAGTAGGAACTAGATTTATTTGCAGTGAAGAGTGTTCTGTGCATTCAAACTATAAAAACTTAGTACTA
AAAGCAAAAGATAGAGATGCAATTGTAACAGGAAGAAGTACTGGTCATCCAGTAAGAACATTAAAAAATA
AACTATCAAAAGAATTTTTAAAGATGGAACAAAATGGAGCTACTCCTGAAGAATTGGATAAAAAAGGTAC
AGGAGCTTTAAGATTTGCAACAGTAGATGGAGACATAGAAAAAGGTTCATTTATGGCAGGTCAAAGTGCT
GCTATGGTAAAAGAAATAACACCTTGTAAGGAAATTATAGAGGCTATGGTAAATCAAGCAAGAGAGATTA
TGCCAGCAATAGAACTGTAA
>ref|NC_013316.1|:1237104-1238054 malonyl coa-acyl carrier protein transacylase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAAAAGTTGCACTAGTATTCCCTGGTCAAGGAGCTCAATATGTAGGTATGGCCAAGGATTTATATG
AAAATAATGCTGTTGCTAAAAGTGTAATAGATGAGGCTAGTGATGCCTTAAATATGGATTTAAAAAACCT
TATGTTTAATGGAAATGAAGAAGAACTTTCTAAAACTGAAAACACTCAACCTGCTATGGTTACACATAGT
GTAGCAGTATTAAAAGCGGTACAAGCTCAAATAGATTTAAAATATAATGCATGCTTAGGATTATCCTTAG
GAGAGTATAGTGCGTTGGTTGCAGCAGATGCAATTGACTTTAAAGATGCTGTATGTTTAGTTAAAAAAAG
AGGTAAGTTTATGCAGGAAACAGTTCCAGCAGGTGTTGGAGCTATGGCAGCAATTTTAGGTTTAGATAGA
AATGTACTTGAAAATGTGGTTAAAGATATACAAGGAGGTATTGTAGAAGTAGCAAATTACAATTCTCCTG
GACAAATAGTTATATCTGGTGAAAATGAAAAGATAGAAGAAGCAATGGTAAAATGCAAAGAAGCAGGAGC
AAAAAGGGCAGTTAAATTAAATGTAAGTGGACCTTTTCACTCATCAATGTTAAAAGAAGCTGGTGTAAAA
TTGGCCAGTGAATTAGAAAAAGTTAACATAACTAAACCTAAAGTTGATGTGGTGGCAAATGTAAATGCAG
ATTACTATAAAAACGAAGGTAAAGACCTGCTTATAAAACAAGTAAGTTCATCTGTTCTTTGGGAAGATTC
TATAGAAATACTTTTAAATGATGGATATGATACTTTTATAGAAATGGGACCTGGAAAAACTTTAAAAGCA
TTTATTAAGAAGATAGCTTCCAATAAAAAAGCAAATGTCAATATTTATAATATAGATGGTATAGATTCTC
TTAATGAATTTGTACAAAATTATAGAAATGGAGAGATATAA
>ref|NC_013316.1|:1238054-1238803 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAATCTTACAGGACAAGTAGCAGTTGTTACTGGTGGCTCTAGGGGTATAGGAAAAGAAATAGCAA
AAAAACTAGCATCTTTTGGAGCTGATGTAGTAATCAATTATACTTCTAAAGAAGATGAAGCACTAAAAAC
TAAAAATGAAATAGAAAGTATGGGGGTAAAGTGTACCTCTATAAAATGTGATGTGTCTAAATTTGATGAA
GTGAATCAAATGATAGATTCTGTTGTAAGCGAATTTGGAAAAATTGATATATTGGTTAATAATGCAGGCA
TAACTAAAGATGGTCTGCTTATGAGAATGAAAGAAGAAGATTTTGATAGAGTTATAGATATAAACTTAAA
AGGTGTCTTTAATTGTACAAAAGCAGTTACTAAACCTATGATGAAAAAGAAGTATGGAAGAATAATAAAT
ATGACTTCAGTAGTTGGAATTATGGGTAATGCAGGGCAAACTAATTATTGTGCATCAAAAGCAGGTGTAA
TTGGATTTACAAAAGCTTCTGCAAGAGAGTTAGCATCAAGAAACATAAATATAAATGCAGTAGCACCTGG
ATTTATAGAAACAGATATGACTAGAGTACTAAGTGATGATGTAAAAGAATCAACACTAGCAAACATACCA
AAGAAATCTTATGGTAAACCAGAAGATGTAGCCAATGCCGTAGCATTTTTAGTTAGTGACATGTCAAGTT
ATATAACAGGACAAGTAATAAATGTAGATGGTGGAATGGTAATGCAATAA
>ref|NC_013316.1|:1238857-1239081 acyl carrier protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAATAAAGTTGTAGAAATAATAATAGAGCAATTAGGAGTAGAAGATAAAGAAATAACTATGGAGA
CATCATTAATGAAGGATTTAGAAGCAGATTCATTAGATGCAGTAGAAATAATAATGGCACTTGAAGATGA
ATTTGGTATAGAAATACCAGATACAGAAGCAGAAAACTTCAAATCTATAGGAGATATAGTTAAGTATATA
GAAGCTAATAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1239110-1240348 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAAGAGTAGTAATAACAGGACTTGGATGTGTTACGCCGTTGGGAACGGGAAAAGAAGAGTTCT
GGAGTAATATAAAATCTGGAGTATCTGGTATAGATAAAATAACTAATTTTGATGCTAGCACATATCAAAC
TCAGATAGCAGGAGAAGTTAAGAATTTTCATCCAGAAGAATATATAAGTAAAAAAGAATTGAAGAGATTA
GATAAATTTGCTCAATTTGCAATAGTATCTGCTAAATTAGCAGTTGAAGATGCAAATCTTGATTTAGATA
AAGTTGATAGAGAACGTTTTGGTGTTATAATAGGTTCTGGAATAGGTGGAGTTGAAGCTATAGAAACTCA
ACATAAAATTCTTTTGGAAAAAGGAAATAAAAGAGTAAGTTCACTTTTTGTACCTATGATGATAGGAAAT
ATGGCAGCTGGTCAAGTTTCAATATTTTTAGGAGCAAAAGGGCCTAACACTAATGTATGTACAGCTTGTG
CATCAGGAACTCATTCAATAGGTGATGCTTTTAAGGTAATTCAAAGAGGTGATGCAGACATCATGGTAGC
AGGGGGCTCTGAAGCTGCTGTAACAGGTCTTGCTTTTGCTGGATTCTGTAACATGAAGGCTATGTCAACT
AGAAATGATGACCCTAAAACTGCATCAAGACCGTTTGATAAAGACAGAGATGGTTTTGTAATGGGAGAAG
GAGCAGGTATTGTTATCTTAGAAGACTTAGAACATGCTTTAGCAAGAGGGGCTAAAATATATGCAGAAGT
AGTTGGATATGGTTTAACTGCTGATGCATACCATATGACAACTCCAGCTGAAAATGGAGAGGGAGCAGCT
AGGTCTATGAATATGGCTTTGAAAGATGGAAATGTTCCATTAGAAGAAGTAGATTATATAAATGCTCATG
GAACTTCAACTTATTACAATGATTTATATGAAACTATGGCTATAAAAACTGTATTTGGAGAAAAGGCATA
TGACTTATGTGTGTCATCAACAAAATCTATGACTGGTCACTTATTAGGAGCATCAGGTGCTATAGAGGCT
GTTGTTTGTGCTATGAGTATAGAAGATAGTTTTGTGCCTCCAACTATAAACATACAAGAAGTTGGTGAAG
ATTTGGATTTAGATTATGTTCCAAATCAAGGTAAAGAAAAAAATATTAGATATGCACTATCAAATTCTTT
AGGATTTGGTGGGCATAATGCTACAATAGTACTAAAAAAATATGTATAA
>ref|NC_013316.1|:1240574-1242292 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
TTGAATTTTAGACTACCAAAGAAAAGGTTACCCAAAAAGATAATTTTTATATGTATAATACTTATTAGTA
TTATTTTGTTTATAAAGTATGACCAAAATGGATTGAAAGAAAGAGAAATTATAAATAAGGGAAAATATAT
GTCTGAAAGCCTTGTGGCAGATAAGGAGTATGATGAAGCAAAAAAAGTGGTTAAGACTTCTTTCGAATCT
ATTCCAGAAAAAAAATACAATAAAGTATATAATGAAGTTTGGGATATGTTAAAGACTATTTCATATGTTC
CAGATGGAACGAAGATAGTCATTGATTCTTTAGAAAAGATGAGAGAATCAGATGTGAAATTATCTGATGA
ATGTAGATTTAATATAGAAAAAAGATTAGCATCAGTGTATATAATGGATAATAATTATTCTAAGGCAGTA
GATTTAACTGTAAAGTCTATAAAATTGGCTGAGAAATTGGGGAATAATTATGAAAAAGCAAGACTAGATG
TTGATTTGGCGAGCATATTTTTAAATATAGGTAGCTATGAAACAGGAGAGAAATTAATAAAGGATTCTTT
TAAAATAGATATTGATGAAGGTGAAAAAAATGGAATGGTTAGATTATATGCTATTATAAATCTAGCAGAA
ATATATGTAGAAGAGGGAGAATATGATAAAGCTATTGAAATAAGTAGCAGGATAAAAGATTATAAAAAGT
TTGTAAATACGGATAATTACAATGATTTTGATATAATGGCCTCTATAATGAAGTCAAATGCGTATGTGGG
CAAAAATAATATACAAAAGGCAAAGACTTTTTTAGAAAAAGCTGATTATCTTATAAAATCAGATAGAACA
GTTTATATATTAGATAAAGATATGTACTATTATATGGCAATGGGAAACTTAGAATATAAAAGCGAAAATT
ATAATTCTGCAATAGATAATTATAAAAAAAGTTTAGAGATATCTACCAAAAGAAAGTTAACTCAGGAGAA
AATAAAAAATTTAAATAAGATATTAAATATATATGAAAAACAAGGAAATATAGAATCTTTAAATGAGTAT
CAAAAGATGTTAATAAATGAATATAAAGAGAACAAAAGTATAAGAGATTCAGAGACTAGTTTCTATATAA
TTGATAAAGTATCAAACGAAAGTAAGCTATTTGAAAAAACTAAAAAAGAAATAAAATATTATAAAATATT
ATTTACAGTAATTTTAATTGCTATATTAGGGTCTACTTTTTTATACAACCGATTGAAGTATTTTAAAGCA
CAAAATTTACATGATGGTCTTACAAATGTTTATAATAGAAAAAGTTTTGATATTATGTATGAAAAGTACA
GAGAGAAAGATGATAATTTTGCACTTGTGATGATAGATATTGATAATTTCAAGCTCATAAATGATAATTA
TGGACATAAATTTGGTGACACTGTTATAAAGGGAATAACAAATACCATTTGTGTTATGTTAGAACAAGAT
GATAAAGTCTTTAGGTACGGAGGAGAAGAATTTTCTGTATTAATAAGAAATAAATCTGGTGAGGAAGTAG
CAGATATAATTGACAATATAAGGGTTGCAATTGCAAATAAAAAGTGGAATGATGATGTGACTGTGACTAT
AAGTGCAGGTGTAGCTCATATTTCAGATAGCAAAGATGTACTAGAAGAAGCTGATAAAAATTTATATAAA
GCAAAACAACTTGGTAGAAATAAAGTAGTATATAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1242323-1244323 putative sigma-54 dependent transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACAATCAATAGCTATAGTAACTGATAAAATAACTAAACTATCATCTTTCTTAGAAGAAAATATAC
GTTTGGTTTTAGGTAATTATATTGATATAAACCACTATTATCTGGAAGTTTTAAAAGAGAATGATAAAAT
ACAAGGTGATTTTGTACTAGTAATGAATGATGATAGATTAAACAGTATGAGAAAGCATTTAGTACAAGAT
AGTAAGATTATAGTGATAAGGAGAACACTTAAAGAAAATGAAATATATGGATTATTTTCAATACCAAATG
GAACTGAAGTATTGGTTGTAAATGATACAAAAGAAACTACCTTAGAAACGATAAGCTTATTTTACAAAAT
AGGAGTAAAAAATTTAAAGTTTACTCCATATATTGAAGGAAAAATTTATAAAAATATAGACATAGCTATA
ACGCCTGGAGTAAAGGAAAAAGTACCAAGTTATATAAATAAAGTAATCGACCTTGGTAATAGATATATTG
ATATATCTACTTTTATAGAAATAATAAATGGTCTTAGAATTGATGTTAAAGAAATACGTAAAAATTTAAT
GGCATATTCTGAGAGTTTAATAAGTTTAGATAATGGAGTTAAAGATAATTATAGGCAACTGTTTTTAAAA
ATAGAAGAACAAGATGTTATATTGAATCTATCAAAAGATGGAATAATATTTACTTCAGCAGATGGTATAA
TAAACACATTTAATAAAGAAGCTTTAAAAATTTTAGGTATAAATGAAAATCCACAAGGCAAAAACATAGA
AGATATCATTTCTGAAGATTTAAATATTTTACTTGAAGACAAAGAAATAATTGATGAAGTGGTATTTACA
AATAAAAAATATATAAATGTAAATAAAAAAAGTATTTTTTCTATGGGGAATAAAGCTGGGATATATTATA
ACTTACAAGAAATAACGTATATAAAAAAATTAGAACAAAATCTTACTAATAAATTAAGAGAACAAGGTCA
GATAGCAAGATATACATTTAAAGATATAAAAACTAAAAATAAAAATATGGTAAAGTGTGTAGAATTGGCT
AAAAAAATATCTAAATCAGACCTTTCTGTATTAATAATAGGAGAAAGTGGTACTGGTAAAGAATTATTAT
CACAATCAATTCATAATGCTTCCAATAGAAGTAATCAACCATTTATAGCGGTTAATTGTGCAGCAGTTCC
AGATAGTCTATTAGAAAGTCAACTGTTTGGATATGAAAAAGGCTCTTTTACAGGAGCTTTAAGAGAAGGA
AAAAAGGGTCTATTTGAACTTGCTAATAATGGAACTATATTTCTGGATGAAATTGGAGATATGCCTCCAT
TGCTACAGACAAAGTTACTAAGGGTATTACAAGAAAAGCAGGTTATGCCTATAGGTTCCCATAATGTTAT
AAACATAGATGTTAGGGTCATAGCAGCAACAAACAAAAACTTACTAAAGATGATTAGAGAAGGAAAATTT
AGAGAGGACCTGTATTATAGACTAAATGTATTGCCAATAGATGTACCATCATTGAGGAATAGAAAAGAAG
ATATAATAACACTTATGAATTTCTTTTTGAAAAACAATGTAAGACTTTCGCCAGAAGTTATAACTATTTT
AGAAAAATATAATTGGCCAGGAAATATAAGAGAGTTACAAAATGTTGCTTCTTATGTAAGTCTAATGTGT
GATAGTATGGTTTTTAGAGATGACTTACCACCATATATAAGGGTAGAATGTGCTAACAATTATGAAGATG
GATTTGGTTATACAAAAAAAGAATTTGAGGAAATACTGAGGATTCTATATGAAAGAAGAGAGTCATCCTC
TGGAGTTGGAAGAGGGTTTATAATCGAAAAGCTTATACAGGAAGGGATTGAGATTTCTGAAAGCAAAGTT
AGAAAGGTGCTATCTTATTTAAGTGAATGTGGATATATATCATCTAAATCTGGTAGAGGAGGAAGTCAAA
TAACCTCAGAGGGGATAAAACTTTATAATAATATAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1244668-1244916 hypothetical protein CDR20291_1025 [Clostridium difficile R20291]
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CAAATGTAAACTTTATAGGTGGATGTGATGGAAATTTAAAAGGGCTAAAAGTATTAGTTGAAGGCATGAA
TATAGAAGATGTAATACAAAAGTTAAAAGGAATAGAGTGTAAAACAAAGCCAACATCTTGCCCAGACCAA
CTGTCTCTAGCATTGGAAAATTATATGAATATAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1244951-1245676 putative glutamine amidotransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACCAATAATAGGGATTTTAGGAAATTTAATAATAATGGAAAATGGTATGTTTCCAGGTCTTGAAA
GGTCATATGTAAATAATGATTATATAAATGCAGTGCTAAAAGGTGGCGGTAGTCCAGTAATAATTCCTGT
AAATACAGATAAAGAAGTTATAAAAAAACAGATTGAAATGGTTGATGGAGTCTTAATATCTGGGGGATGG
GATATCAATCCTCAACTGTATGGAGAAGAAACAAGAGAAGAAACGACATTTATATATCCAGAAGTGGATG
AATTTGATTTAATTGCAATAAGTATAGCATTAGAACTTAAAAAGCCTATATTAGGTGTATGTAGGGGACT
ACAAATTTTAAATGTAAGTTTAGGAGGAACTTTATATCAAGATAATAATCTTATAGAAGGAAGTTATATA
AAACATACACAATCTTCTAAAAGACATGTAGCTACTCATAAAGTCGATGTTAAAGAAGGAAGTATTTTAG
AGGGAATTTTAGGAAAACAATTACTTACAAATAGTTATCATCATCAAAGTGTCAATCAGCTTGGAAAAGG
ATTAAAAGCCATAGCATACTCAAAAGATGGTATAATAGAAGCTATTGAGAAAGAGGAGGAAAATTTTGTA
GTAGGAGTACAGTGGCATCCAGAAATGATGGTAGATTACTGTGATAAAATGGAAAAACTATTTAAATATT
TTATAAATATTTGTTCAAATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:1245698-1247011 putative amino acid permease [Clostridium difficile R20291]
ATGAACGAAAAGAACAAAATGGGATTAATAAGTATTATACTTTTAGGTATTAATGCAGTAGTAGGAGCTG
GAGTTTTTCTATTACCAGGAGATGCAATGAAATCATTTGGTGTAGCAAGTATATTTGTATATATATTTGA
TATGTTGTTAGTTTTATCTATGGCATTCTGTTTTGCTGAGGTTGCAGGTAAATTCAATAAAAATGGCGCT
GCCTATGTATATACCAAAGAAGCTTTTGGAGATTTTTGTGGTTTTGAAGTAGGTCTTATGAAATGGGTAA
TAGGATGTATTTCTTGGGGAGCTTTAATAGTAGGTTTTCCTACATCATTATCAGCAGTATGGGCTCCAGC
AGGTGAACCACATATACAAAAAATTATAATTGTAGCCATGATAGTTGGGCTTACAATTATAAACTTATTA
GGTGTATCTCTATCAAAAATTGTACAAAATGTTATAACTGTAGGTAAACTAATTCCATTAATACTATTTA
TAGGAATAGGTATATTTTTTATAAAAGGAGTTAATTTTACTTCTTCAACAATGGTACCTCCAGGAGCTGG
AGCAACAGAGTTTGGAGCAGCAGCACTTTTAATGTTTTATTCATTTACAGGATTTGAATCTATAGCAGTT
GCAGCAGAAGATATGGAAAATCCACAAAAAAATATACCAATAGCAATTATAAGTGTAATAGTAATTGCAT
CAATAATATATATATTAAATCAAGTTGTATGTGTTGGTATACTAGGAGATTCGTTATCTAGTACATCTAC
ACCAGTGGCAGATGCTGCAAGAATATGCTTTGGAAATATGGGAGCTGGATTGGTTACCTTTGGAACATTG
GTTTCTGTTGGTGGAATTTGTATGTGTGGTGCTTTTGTAAATCCAAGAAGTTGTGTAGCTTTAGCTGATG
ATAAAATGTTACCAAGAATATTTGCAAGAAAAGATAAAAAAGGTACACCATATGTAGCGATAATAGCTAC
TATGTTAATCACTATACCAATAGCTCTATCTGGAAGTTTTGCTGAATTAGCAGCAATAAGTGCAGTTGCT
AGATTCATACAATACATACCAACATCTTTATCCGTATTAGTGTTTAGAAAGAAAAGACCAGAATTAGTAG
GTACTTTTAAAACTCCTTTTGGAGCAGTGATTCCTCTAATTGCTGTATGTGTTGGAACATGGTTGTTATT
CCAAGCATCTATGCATCAATTAATTATGGGATTAGGAGCTTTGGCAATTGGAGTACCATTATACTTTATA
ATGAAGTCTTATAATAGAAAAGTCTGTGGTGAAAATTTAAAGAAAATAGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1247310-1247756 putative acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
GTGGGTGGAGAAACTCATTTTCTGTCATTTGGAAAGGATGAATATAAAATATCTTTGGAGGAACAAGAAA
ATGCTATAGAATCAGCAAAAGCATCTGATAATTCTGTTAAACTGATTGCATTTATAGATGATGAAATAGT
TGGGATTGCAACGATTGATTCTAATCAAAAAGCAAAAGGAAAGCATGTTGGAGTATTAGGAATTGTTGTA
AAAGAAAAATATTGGGGAATTGGATTGGGTAAAAGGCTTATGTTAGACCTTATAGAATGGTGTAAATCAA
ATGGAATAACCAAGAAGATAACTCTTGTCACTAATGAAGAAAATTATAATGCTATAGGATTATACAAAAA
AGTTGGATTTGAAGTAGAAAGCATACTAAAAAAAGAATGTTATTATAATGGTGTTTATACTGATTTAATA
GGAATGTCACTTTTATTGGGAATATAA
>ref|NC_013316.1|:1247845-1249830 putative fructose-1,6-bisphosphatase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATCTGTGTAAAATATCAGATGATTATTTAAACAGCAAGCTTAAGTATTTAAAGTTATTATCAA
AACAATATCCAAGTATATCAAAAGCAAGTACAGAAATAATAAATTTAGAGGCTATATTAAATCTTCCAAA
GGGAACAGAGCATTTTATAACAGATGTACATGGTGAATATGAACCATTTGTACATGTATTAAAAAATGGT
TCTGGTGTAATAAAGAGAAAAATAGAAGAATTGTTTTCAAATACAATAAGAGACAGCGAAAAAAAAATGT
TAGCAACTCTTGTATATTATCCTGAACAAAAGTTAGACCTAATAATTAAGCAAGAGGAAAATATAGATGA
TTTTTATAGAATAAATATTTATAGACTTATAGAACTTTGTAAATATGCTTCTAGCAAATATACTAGGTCT
AAAGTTAGAAAACTGTTACCAGAAAATTTTAAATACATAATAGAAGAACTTTTGCATGAGCATGTTAAAA
GTGAACATAAAGAAGAGTATTATAAAAGTATAGTTGAAACAATAGTTGACATAGGAATAGCTAAGGAGTT
TATAATTGCTATTTCTACAGTTATACAAAAATTGGTTGTAGATAGACTTCATGTAATAGGAGATATTTAT
GATAGAGGTCCAAGACCAGATATAATTGTCGATAAGCTTATTGAACATCATTGTGTGGATATTCAATGGG
GAAATCATGATATATTGTGGATGGGTGCAGCCTCAGGTGAAAAAACTTGTATAGCAAATGCACTGAGGAT
ATCAGCTAGATATGCGAATTTAGACATTGTAGAAGACATATATGGAATAAATCTGTTGCCTTTAGCCACT
TTTGCTATAGAAATGTATAAAGATGACCCTTGTAAAGAATTTATTCCAAAGGTTAATGACCAAAGTGTAA
CAACAACAGAAAAGTCTTTAATGGCAAAAATGCACAAAGCAATAAGTATAATTCAATTTAAGCTTGAAGG
TGAGGTTATAAGACGAAGACCTGAATTTGAAATGGAACATAGACTTTTGCTTAATATGATAAACTATGAT
GAAGGTACGATTACTTTAAAAGGTAAAACATATAAATTAAAAGATACTTATTTACCTACAATAGACAAAA
AAGACCCATATAAATTAACTATGGAAGAAAGAAATGTTATTGATAAATTAGTATCTTCATTTAGAGGTAG
TGAAAAATTACAAAAACATGTTTCATTTTTGTTTTCTAAAGGAAGTATATATTTAAAGGCTAACTCAAAT
TTACTGATTCATGGATGTGTACCATTAAATGAAGATGGAAGCTTTATGTCTATGAATATAATGGGAAAAG
AGTATAAAGGTAAGGCTCTTATGGATAAGATGGAGTCTCTAGCAAGAGAAGGATTTTTCTTTAAAGATAA
GGCAGAAGAAAAACTATATGGTATGGATATTATGTGGTATTTATGGACTGGGAAATGTTCATCATTATTT
GGTAAAGATGATATGACTACATTTGAAAGATACTTTATAGAAGAAAAAGAGACTCATAAAGAAAATAAGA
ATCCATATTTTAAACTTAGAGAAAATGAGATGGCTTGTAAAAGATTATTTGAAGAATTTGATTTAGAGCT
TGATGAATCCCATATAATAAATGGTCATGTTCCTGTGGAGAGTAAAAATGGAGAGAGCCCAATAAAAGCT
AATGGTAAAATTCTCGTTATAGATGGTGGTTTTTCTAGGGCTTACCAAAAAACTACTGGTATAGCTGGAT
ACACTTTGATATACAATTCTAGAACTTTGCAATTAGTATCGCATGAACCATTTAATTCTGCTGAAGAAGC
CATTGCAAATGAAAGTGATATCTTATCGACAACTGTTGTAGTAGAGCATAAGGCAAAGAGAAAAATGGTG
AGAGATACTGATGAAGGAGTAAAAATACAAGAGGAAATAGAAGATTTAAAACTACTTTTAATGGCTTATA
AGAAAGGGCTAATAAAAGAAATGTAG
>ref|NC_013316.1|:1250054-1251022 stage III sporulation protein AA [Clostridium difficile R20291]
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CAAACAATAATCTGAACATAGAAGAAATTAGGTTACGCTCACAAAAACCATTGATACTAAATGCAAACTC
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AGAGAAGATGTAGAGCAAACTTTTCAAATAATATGTAAATATTCAATACATTCATTTATGGATGACATAA
AAAAAGGATTCATAACTTTGAGAGGAGGTCATAGAGTAGGGTTAGTTGGAAAAGCAATAGTAGAAGATGG
ACAAGTCAAAAATATAAAGCATATATCATCTTTAAATATAAGGGTATCAAGGGAAATTATTGGATGCTCG
GATAAGATTTTAAGTCATATTATAAAGGGAAAAAATCAGATTAATAATACTTTGATAATATCACCACCTC
AATGTGGAAAAACAACTTTAATAAGAGATATAGTAAGAAATTTAAGTAATGGTAATGAAGATTATGGATT
TAAAGGTTTAAAAGTAGCTTTGGTAGATGAGCGTAATGAGATAGCAGGAGCTTATCTAGGTGTTCCACAA
ATGGATGTGGGAATAAGAACTGATATAATAGAAACTTGCCCAAAAGATTTGGGTATTACGATGCTTTTAA
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AGCATTAAATGGAGGTATAGGATTAATAACTACTGTGCATGGAGATTCAATAGATGATATACAAAATAGA
AAAGAATTAAATAGACTTCTGGATAAAGAGTTATTTAAAAAGGTTATAATTCTTTCTGCAAAAAGAGGAG
CAGGAACGATTGAAAAAATTTATGATTTAGAAGAAAAGAGATGGTATTTTGCAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1251012-1251533 stage III sporulation protein AB [Clostridium difficile R20291]
TTGCAAATTAAAATAATTATTATAGCTCTCTTGGTAGGAAGTAGTTATTTGATAGGTGAACAAATATACA
AAACTTATACTCGTAGACATAAACAATTAAACGATTTAATAAGAGTTTTAGAAATTTTGAGGATGGATTT
ATCTTTCGGACTTTATACATTAGAAGAAATCTTTAATAGGATAGGTGGAAATAAAGAGTTTTGTTTTTGG
AAATTTTTCTATCAAATATCAGAAGGACTTCACAATGAACAAAGTAAAACTTTGGAAATAATAATATCAG
AAAATATTGATGTCTTAAGTAAAGAAACTTATCTAGGCAATAAAGAAATTGAGGAACTGAAAAATCTAAT
ACTTACTTTAGGGAAAAGCGATATAGAGTCACAACAAAGAATGATAGATTTATCTATAGAAAATTTGAAA
AAACAAACCTATGAGACAAAGGAAGATATAAACAAAAAAGGCGTATTGTATAAAAAATTAGTGACATTCA
TAGGTATAGGTATATGTATTATATTGATTTAA
>ref|NC_013316.1|:1251535-1251747 stage III sporulation protein AC [Clostridium difficile R20291]
ATGGGGAGGTTTATTATGGAAATATCATTGATATTAAAGGTTGCAGGTGTCGGTATTCTAATATCAGTAT
TGAATATGATATTGGAAAAAACAGATAGAAAAGATTGGGCAGGTCTTACTACATTAGCAGGTGTAATAAT
CGTATTGGGTATGGTAATAACAGAAATAAGTGACTTGTTTAATACTGTAAGAACAATGTTTCAACTTTAC
TAA
>ref|NC_013316.1|:1251763-1252149 stage III sporulation protein AD [Clostridium difficile R20291]
TTGGAAATAATGCAATTAATAGGAATTGCAATCATTTCAACTACACTCTGTTTAGTAATTAAAAAAGATA
GACCAGAGATAGCAAATTTCATAGCAATAATAACTGGAGTAATAATACTATTGTCAGTTATGTTTAAGCT
AAATTTTATAGTAGATAGTATACAAGATTTGGCTAACAAGGCTAACATACCGACTATGTATATATCATTA
ATAATAAAATTAATTGGGATAGCATACTTAATGGAATTTGCGATACAACTTTGTAAAGATTGTGGGGAAG
GAAACATTGCTTCAAAACTAGAATTTGGAGGTAAAATAATAGTTATGTCAATGTCTTTCCCTATACTTTT
GTCCATTGTAGAAATGGTGGTGAATATAATTCCATAG
>ref|NC_013316.1|:1252234-1253439 stage III sporulation-related protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAAGATTTTTACCAATGATTATAGGTTTTTTATTTACTTTCTTTTTTGTAAATATCTTTGCTA
TTATGATATTTGCTAATGAAGTACCAAGTAGTGAAGATAAAGAATATGGTGAAACAAAAAATAGCATAGA
TAAATATATAGATGGTCAATTAGACAAGCTAGATATAAATGAGATTCAAGACTATATAAATAAAGAAATA
GTTATTAATGATGTTAATTTAAAATCATTTGTAAAAGATTTAATTAGTGGAGAAAAAAATATCTTAGATT
TATTCAATAAAGATGGATTGAAGATATTGATGTTTGATGAATTTAAAGCAAGTTTAAAGGTAGTAGCAGT
AATTTTGGTACTGGCTCTGTTATCATCTATTTTAAAGAGTCTGGAAAACTCTTTTTCATCAGGTGCAGTA
AGTCAAATAGCAACATATATAATATTTATCACAATGGTATCACTTACACTTATTGGTTTTAAAGATGTAT
TACAGATTTGTTATGATGCAATAGACCATACTGTAGGTCTTATGCAAGTTATAATGCCAATATTAATAAC
ATTTTTACTTTTAATTGGGTTCCCAATAACGTCGACTACTTTGAATCCTATCTTCATAGGAGGAGTAACA
TTTATAAATGTATTTTTTAAAAATTTTCTATTTGTATCTATTACTGTTGCATTTGGAATTTTAATAATAA
ACAATTTATCAAAAAATATAAGGCTAAAGAGATTTTTCTCCTTTGTAAAACAAATAAATTATGTTTCTAT
TGGAGCTATGTTTACTGTTTACTTAGGTCTTGTATCCATACAAGGATTGTATGTAACCAGTTTTGATAAA
TTCAGTGTAAAGACTGCTAAATTTGCTATAGGTAATTTTATTCCTGTTGTAGGTGGATTTGTATCTGACT
CTGTGGATATTTTATTATCTTCATCTCAGCTTATAAAAAATATATTTGGAGGAATAGGGCTTATCTTACT
TGTTGGAATTTGTTTACTTCCAGTAATAAAAATTTTATCAGTAATAGTAGTGTACAAATTAGCAGCAATA
ATTGTAGAGCCTGTTGGAGAGGATGGAATATCTAATTTTTTAAATGAAGTGGCAAATTTAATGATAATAA
TGCTAGCATCAGTAATTGCTATAACAGTAATGTTCTTTGTAACTGTAGCTATCTTGACCTCGATAAGTGT
CGTAAGTCAAGGGTAA
>ref|NC_013316.1|:1253499-1254116 putative stage III sporulation protein AF [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAGAGGGCATAAAGGCATGGATAGTTAGTGTTTTGATAGGAGCATTTATAGTAAATATAGTAGATA
TGATTTTACCAAGTTCTAAGATAAAACCTTATGTCAACCTAGTTTTAAACTTTATGTTTGTATTTATTGT
AATAACTCCAGTAGTAGGATTTTTTTCAAAAGATATGAGTTTAGAAGATAGAATATTAAAATCTATGGGA
AACTACAACAAGCAGTATGTAGATAGTACAAATGCTTTGGCAAAAGAGACTGGAAATAATAGTCTATCCA
AGGGATATGAGGATGGGTTAAAAGAAGTACTTAAATTAAAACTTGATGAATATGGTTATGATTTAGAAGA
TATAGAGCTTAATGGGGCAAATATAAATAATATAAAAATAAAAGAAAAGAATAATAGTGCAAAAAGTAAT
AACAGTTCCAATGAAGAAAATAAAAATAATAGTACTAAAAGAGAGGAAGAAAACATAAACTCTAATGACA
AAGAAAATTCTAAACAAGTCTTCAAAAAAGGTACAGAGTATGGGTTGAACCTAAATGAAGAAAAATTAAA
AAACGACTTAATAAAGGTGCTGGATGTTTCTATAGAAGATATACAAATTGATAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1254128-1254682 stage iii sporulation protein ag; flags: precursor [Clostridium difficile R20291]
ATGTTGAAAAACTTAAATGACAAAGATAAGAGAAAGGTATATTCACTAATAACTATAGCAGGAATATGTG
TGGTTTCATTAGTATTATTATCTTGTTTTCCTAGTAGCAAAAGTGATAAACAAGTTGGAAAAACAGAGAC
TAATAAAAATGCTGAAAAGCAAGTCACTAAAAAACAAGAAAAAGATGATTTAGAGTCAAAATTAACAGCA
ATACTATCTAAAATTGATGGTGCAGGAGACGTTGATGTAATGGTTACATTTGAATCAAGTGAAGAAATAC
AACCTGCTTTTAATTCAAATAATACAACAGAAACAACAGAGGAAAAAGATGCACAAGGTGGAGAAAGAAC
AGTTACGACTTCTAGTGAAAATAAAACAATGATAACTTCAAATTCAAGTGACCCTGTAGTTATAAAAACT
ACAGAGCCAAAGATAAAGGGAGTGATAGTGGTAGCAAGTGGAGCAAGTGACCCAAGTGTTAAAGAGACAC
TTTATAGTGCAGTACAAACATCATTACAAGTAGCTGGTCATCAAGTAGAAATATATTCTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1254709-1255398 putative stage III sporulation protein AH [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGTTTAATTATAAGGGAAGAGGATTTGTAATAATAACTTTAACTGCAATGTTAGTGGTAGTAGGAA
CAGTGAATTATCAACTAAGTAAGAAATCTTTATTAGAAACATCAAAAGAGTTTAAGGCATATGAAGAAGC
ACAGTTGCAAAAAAATACTGATGATAGTGATAGTAGTAAGACAGAGGATTCTAGTAATGTAGATAAACAA
GGTGGTAAGGAAAGTGCTGATATTGATATAGTCGATAGCAAAGCTAGTAAAGTAAAAGAAAAGGCAACTG
AGACAAGTAAGGAAATAAAAGCTCAATTATCATCAGAGAAAAATATGAAAAAGGCATCTTATATTTTAGA
TATGAAAATGAATAGAGAAAAACAAAGAAATGAGTTAGTTCAAGATTTAAATGAAATGATAAATAATCCA
TCTACAACAGAAGAATCTAGAAAAGAAGCTTCTAATATGAAATTAAATATAGTTAAAATTCAAGAAAAAG
AACTTCAAATAGAAAACCTTTTGAGTACAAAAGGATATGAAGAAGCGTTAGTTTATATAAGCGATAACAA
AGTTAATGTAGTTGTAAATGAAGCTAAATTAGAAAAGAAAGATGCAGCAAAAATATTTGATTTAGTTGCA
GAACAAGCCAATGTGAAGTATGAAAATATTAAACTTACAAATAATAATAGTAATAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1255508-1255870 hypothetical protein CDR20291_1038 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGATAATAAATTTGGACAAGTAAAAATATCTAATGATGTAATAGCTACAATAGCTGGTTTAGCAG
CATTAGAAGTTGAAGGCATAGAAACTACAGCAACATTAACAGATAAGTTGTTAAAAAATAATGGAGTAAA
AATACAAATCGAAGAAGAGGATGTTAATTTAGATGTAATGGTTACGATAAAGTATGGAATGTCAATACCA
GATACAGCTTTTAAAGTTCAAGAAAATGTAAAAAATACTGTTGAGACAATGACAGGACTGAAGGTTTCTC
AAGTAAATATACACATTCAAGGAATCAGCTTTAAGAAGGATAAAGTTGATAAAGAAGAAGCAAAAGCAAC
TAAGAAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1255955-1256461 N utilization substance protein B [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAGATAGGGCACAAAAGAGTACAACAAGAGAATATATAATGAAACTTATATACCAAATAAATA
TTAATAAAGAAGATTTTGAAACTTTAGAAGATAAAGTAGATAATTTTTTAAAAGATAATTCAGAACATAT
TATAAATAGATATAAAGAACTTGCACTTCAATACTCAAAAAATACAAATTTAAAGTTAGAAGATACTGAA
ATTGAAGATGTTATAGACAAGAAATATATAAATACAGTATGCAAAGCATTAAAAGAAAATCATGACAAAA
TAGATGAGTTAATAAATAAGCATGCTAAAAACTGGACAGTAGATAGAATGCCAAAGGTAGATGTTTCTAT
ACTTAGATTGTCTGTGTGTGAAATACTTTATTTAGACACTCCTAATAAAGTATCAATAAATGAAGCGGTA
GAACTTGCAAAAATATATTGTGATGATAAGTCTCCTAAATTTATAAATGGTATATTGGGAAGTGTTGTTG
ATGAAATTGGGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1256445-1257515 putative O-sialoglycoprotein endopeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTGGGAAATAATATAATAATTGGAATTGATACTAGCTGCTATACTACTTCTATAGCAGCTATCT
CTTTAGATAAGAAAGTTATATTCAATGAAAAAATAATGTTAGAAGTAAGGGATAATTCAAAAGGTTTAAG
GCAAAGTGAAGCTGTATTTCAACATATCAATAATTTAGGGATTCTTAGTGATAGGATAAAATCTTTTAAA
GATAAGTTTAATGTAGAAGGAGTTTGCTCATCAAAAAAACCGAGACCTGTTGAAAACTCATATATGCCTG
TATTCAATGTAGGTCATAATTTTGGAAAATTATTGTCTAGTATATATGGTTGTAGGTTTTATGAGACTAC
TCATCAAGAGAATCATATTGAAGCAAGTTTATTAAATAGTAAATTAAAAAATAATAATAAATTTATTTCT
GTTCATATGTCTGGTGGTACTACAGAGATACTTTTAACAAGCAAACAAGATAGTCATCACAATGTATGTG
ATACTAATTTAGGTAAAATTGCCAAAATAAGTATTAAAAAAGATGATAAAAGTAAGTTATACAATAATTT
TGGATATAATATAGATATAATTGGAGGAAGTAAAGATATTAGCTTTGGTCAACTCATAGATAGAGTAGGA
ATTAAGCTTGGATATAAATTTCCTTCAGGAAAGTATTTGGATGAAAATGCTTTAAATTGTAATCTTAAAA
TAGAAAGTGGTCTGAAAACTTCTGTAAGAGATGGGTATATGAATTTATCTGGATTAGAAAATCAGGTAAA
TAAGATTATAAATGATAATGGAGATAATACTAATCAAAAAGAATACATATCTAAATTAGTATTAGATTCA
GTAGTTAGAAATATGTTTAAATCTTTAGTATATTTATGTGAAACTTATAATGTAAATGAAGTAGTATTTG
CTGGTGGAGTTTCTGCAAGTAAGTATATTCTTAGAGAATTAAGCATGAAGTTAAGAAAAAAGCATATAGA
AGCTTATTTTACAGAACCACAATATTCAACTGATAATGCTGTCGGGTGTGCTATAATAGGATTGAATAAC
TTTTTAGGAGAAAGAGTATGA
>ref|NC_013316.1|:1257512-1258717 exodeoxyribonuclease VII large subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACTAAGAGCTTTAGATATAAGTGAAGCAAACTCATATATTAAAAGAATTTTAATAAACGACCCAA
TACTTTCTAATCTTAAAGTTAAAGGAGAAATTTCTAATTTTAAGGTTCATAGTAGTGGGAATGTATATTT
ATCACTTAAAGATGAAACATCAAAGTTAAACTGTGTAATTTTTAAAAGTAATTTTAATCGCAATTTAAAA
TTAGATAATGGTGTAAAAATTATAGCTAATGGATATATATCAGTCTATGAAAGAGATGGTGCGTATCAAT
TATACATTAATGAAATTGAAATAGAGGGAATAGGAAATTTACACATAGAGTTTAATAGATTAAAGGAAAA
ACTTAATAAAGAAGGATTATTTGACCCTAAATACAAGATACCTATACCTAAAATGCCAAACTCAATTGGC
GTTATAACATCTCCAACAGGTGCTGTTATAAGGGATATAATAAATGTAATAAAAAGAAGATATCCGAAAG
TTAATATAAAGCTTTATCCAGTAATGGTTCAAGGAGATAAATCAGCTGAAGAAATCTGTGAAGCAATTAG
ATTTTTCAATCATATGAAGAATGTTGATACACTTATAGTTGGTAGAGGTGGGGGTTCAATAGAAGAACTT
TGGTCTTTTAATGATGAAATGGTAGCAAGAGAGGTTTTTAATTCTCAAATTCCGATAATATCAGCAGTTG
GGCATGAAACGGATTTTACTATTTGTGACTTTGTGTCTGATATGAGAGCCCCAACGCCATCAGCAGCAGC
TGAGATTGCTACTCCATCATTGGATGATATAAACTATAAACTTGGAAACATAAAAAGTAGGATGAGTAAG
TCTCTTACAAATCAAATAGAGCTAGACCAATATAGGTTAGAAACAGTATTTAATAAGATAAATAACTATT
TAGATTCGTACACAATAAAAGATAAAGTTATACAATTAGACAAAATATATGATAAAATAATTTTTGGAAT
AGAAAATAATTTAAAATTAGAAGATGAAAAATTAGTAAAAATTGGAGCATTACTCCATAATTTAAGTCCA
TTAGCTACTATGGATAGAGGTTATAGTATAACTCAAAAAAATGGAAAAGTAATAAATAGTATAAAAGGAT
TAAAAATAAAGGATAGTATAGATATAGTATTAAAAGATGGAAATTTAGAATGTATGATAGATAAAATTGA
AAATAAAGAGGGATAG
>ref|NC_013316.1|:1258719-1258934 exodeoxyribonuclease VII small subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTAACCTACGAAGAAGCTTATAAAAGATTAGAAAGTATTTTAAGTGAATTAGAATCTAAAAATG
CTAGCTTGGATGAATCTTTAAGCCTATATGAAGAAGGTATAAGCCTTTATAAACATTGTAATAAGCTTTT
AGATGATGCTAAATTGAAAATAAGTAAATTTAATCAATTAGGAATAGAAGAAGACTTTAAAATAGAGGAG
GAATAA
>ref|NC_013316.1|:1258937-1259824 geranyltranstransferase [Clostridium difficile R20291]
TTGGAATTTAAACAATGTCTAAAAGAAAAAGCAAGTTTTGTAGAAAAAGTACTTAAAGAATATATGCCTA
AAGAAGAAGGGTATCAAAAAACTGTTATTGAAGCTATGAACTATAGTTTAAGTGCTGGAGGTAAAAGATT
AAGACCAATACTTACATTGGAGGCTTGTAAAATAGTTGGAGGAAATGAAGATGAAGCTATTCCTTTTGCT
ATTGCAATTGAAATGATACATACATATTCACTAATACATGATGATTTGCCAGCTCTTGACAATGATGATT
TAAGAAGAGGAAGACCAACAAATCATAAAGTATATGGAGAAGCTATGGGGATTTTAGCAGGAGATGCTTT
GTTAAACTATGCTTTTGAAGTAATGCTTGCAGGCTCAATCAATAAAGAAAATCCAGAAAAGTATCTAAAA
GCTATAAATGAAATTGCCAAAGGTGCTGGTATATATGGAATGATAGGTGGTCAAGTAGTAGATGTAGAAA
GCGAAAATAAACAAATTGAAAAAGAAAAATTAGATTATATACATATGAATAAAACTGCTGCAATGATGGT
AGGCTGTATGAGAGCAGGAGCTACTATAGGTGGAGCAAATTCTGAACAAATGGAAGAAATAACTAAATAT
GCAAAAAATATCGGATTATCATTCCAGATAGTAGATGATATACTAGACATAGTAGGAGATGAAGCTAAGT
TAGGTAAAAAGGTTGGAAGTGATATAGAAAATCATAAGTCAACATACCCATCTCTTTTAGGTTTAGATAA
ATCTAAAGAAATTGCACATAATTTGATTGATGAAGCAAAGAAAAGTATAGAAAAATTATCTGATGATGTA
GATTTTTTAAAGGGATTGGCTGAATATATAATAGATAGAGAATACTAA
>ref|NC_013316.1|:1259854-1260291 hypothetical protein CDR20291_1044 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATTTTTTTTCGGAGATTTTTAACAATGGGGCTTTGGGAATAAGTCTGATTGCTTGTTTCTTAGCAC
AATTTATAAAAATATTTACTGGTAAGGAAAAAAGAATTGAGTTATCAAGAATACTTATTTCAGGAGGTAT
GCCTAGTTCCCATAGTTCTTTTGTTACAAGTTTAGCTACAGTGGTAGGTATTGAAAAAGGGTTTAATTCT
ACTGATTTTGCTATAATTACCGTACTTGCCTTAATTATAATGTATGATGCAGCAGGTGTTAGACGAGCTG
TTGGTAAACAAGCTACTATATTAAATCAAATGGTGGCAGATATACAGCATGGAAAGCATATAGAGCAGAA
GAAATTAAAAGAATTAATAGGTCATACACCACTAGAAGTTTGGTTTGGAGCTTTACTTGGAATAGTAACA
GCTTTAATATTGATGTAA
>ref|NC_013316.1|:1260325-1262190 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAAATATTTAGATAAAGTAAATTCTCCAAAGGATATAAAAAATATGAGTATAGAAGAAATGGATT
TACTTGCAAAGGATATAAGAAAGTTCTTAGTAAAATCTGTTTCAAAGACAGGAGGACACTTAGCTTCTAA
TCTAGGAGTGGTTGAGTTAACATTAGCACTTCATAAAGTATTTGATAGCCCTAAAGATAAGATTGTATGG
GATGTAGGGCATCAATCTTATGTTCATAAAATAGTTACTGGAAGAAAAGATTGTTTTGTATCTTTGAGAC
AGTTTAATGGACTAAGTGGTTTTCCAAAGGAGAATGAAAGTCCTCATGATATTTTTGATACAGGACATAG
CAGTACATCTATTTCTATAGCTACAGGTATTGCCTGCGCTAGGGATATAAAAAAAGAAAACTATAGTGTT
ATATCTGTGATAGGAGATGGTTCTATAACAGGAGGTATGGCACTTGAAGCTTTAAATCAATTAGGATATA
TAGATACCAATATGATAGTAATCCTTAATGATAATGAGATGTCCATAGATAAAAATGTTGGAGGAATGTC
TAAATATCTGTCAAGTATTATAAGAAACTCAACAGTTGAGAAAATGACAGATGAAGTTGATAAAATTTTA
AATGTTACACAAACAGGTGAAATTTTATCTAAGACTGCACATAGATTTAAAGATAAACTAATGTATAGCT
TTTCTCCTCAGGACTGTTCATTTTTTGATTCATTAGGTATAAGATATTATGGACCTATAGATGGCCATAA
TACTAAAGAACTAATAGATATATTGAGAAAAGCTAAACACAAAAAAGGGCCTGTTCTTTTACATGTAATT
ACGAAAAAAGGAAAAGGGTACAGATTTGCAGAAGAACAACCTGATAAATATCATGGAGTATCAAAGTTTG
ATATAAAGACAGGTGTTACATCTGCAAAAGTTAAGTCTATGTCAATTAGTGTTGGAGAAAAACTTGTTGA
TATGGCTAATAATAATGAAGATATAGTAGCAATAACAGCTGCAATGCCATCTGGTACAGGGTTAAACCTG
TTTGAAAGTGCATATCCAAAAAGATATTATGATGTTGGTATAGCTGAACAACATGCCACAGGATTTGCAG
CAGGTCTTGCAAAAAATGGTATGAAACCTTACTTTGCTGTGTACTCATCATTTTTGCAAAGGGCATATGA
CCAAGTTATTCATGATGTATGCATAACAAAAAAGCCAGTTACTTTTCTTATAGATAGAGCTGGATTAGTT
GGAAATGATGGAGAAACTCATCATGGTATGTTTGATTTAAGTTACTTAAATTCTATTCCAAATATTGTAG
TAATGGCTCCAAAAGACACAAGAGAGATGGAGCTTATGATGGATTTGTCATTAAAATTAGATTGTCCACT
AGCAATTAGATACCCAAGAGGAAGTAGTTATTACCTAGATAAGGGAGAATATGGAGAGATTGTACTGGGT
AAATATGAGGTATTAGATGACGGTCAAGATACAGTCATACTTTGTATTGGAAGTATGGTAAAACATGCTT
TAGAGGCTAAAGAAATATTATCAAGAGAAGGAATAAATCCGACAATAGTTAATGCTAGATTCTTAAAGCC
AATTGATGAAGGTATGTTAAAAGCATTATTAAAAAATCATAAAAATGTAGTTACTATAGAGGATAATATT
GTAACTGGAGGATTTGGAAGTAGAATAAACAAGTTTATTATAGATAATGAATATAACGTAAATATACTTA
ATATAGCAATACCAGAAGAATTTGTAAAACATGGCAATATAGATGAATTATATGATTTTGTAGGATTATC
GCCAAAAAGTATTGCTGATAAAATAAGGAAATTAGTTATTGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1262323-1263135 putative RNA methyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAAGAATAGATTTATTATTAGTAGAACAAGGGTACTTTGAAAGTAGAGAAAGAGCCAAAAAAG
CAATAATGGCTGGATTGGTTTTTGTTGATAATCAAAGGTGTGATAAGGCTGGTACAGAAGTAAAAGAAGA
TTGTAGTATAGAAGTAAAAGGAAATCCAATACCATATGTCAGTAGAGGTGGTTTAAAGCTTGAAAAAGCA
ATGAAAAACTTTGATTTGACTATTGATGGAAAGGTATGTATGGATATAGGGGCATCCACAGGTGGTTTTA
CAGATTGTATGCTCAAAAATGGAGCAATAAAAGTATTTTCTATAGATGTTGGTTATGGTCAACTTGCATG
GAAATTGAGACAAGATGATAGGGTTGTGTGTATGGAAAGAACTAATATAAGAAATGTTACAATAGAATAT
ACAAAGCAGTTTGCTGATTTTGCGTCAATTGATGTGTCTTTTATATCGTTAAAGTTAGTACTTCCAAAGG
CAAAGGAGTTAGTACGTCATGATGGGGAAGTTGTCGCTTTAATTAAACCTCAATTTGAAGCAGGAAGAGA
AAAAGTAGGTAAAAAAGGAGTAGTTAGAGAAAAATCTACACATATAGAAGTTATAAAAATGATTTCTGAT
TTCTCAGTCGAAAATGGATTTGAGATTTTAGGGTTAGATTTTTCTCCTATTAAAGGTCCTGAAGGTAATA
TAGAATATCTAATTCATTTGAGAAATGGAAATGAAGGATATGAATTTGATGGTGAGACATACAATAACAA
AATAGTAGAAGTTGTTGAAGCTTCTCATAATTTAGACAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1263173-1264834 DNA repair protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATTGTGCCTTAGTTGAAGAACTAAGGTTGAATATTGATAAAAACTTAAATATACTTACAGGTG
AAACTGGTTCAGGAAAATCTATAATAATAGATGCACTTGGACTTTGTTTAGGTGATAAATATGATAGGTC
TTTTTTAAGAAAAGGAACAGATAAGGGACTTGTTGAGGCTGTATTTTTTTCAGACAATAGATATCTTAAA
AAAATATTAGAAGAAAATGATATAAGTATGGAAGATGATAATTTATTGGTAATAACTAGGTTGATATACT
CAGATGGTAAGAGTACTGCTAGAGTAAATGGAAGGACTGTTAAAGTGTCTCTTCTTAAAGAAATTGCATC
TACACTTATAGATATACATGGTCAACATCAAAATCAAGCTTTGTTCAATAAAGATACTCATTTAAAATTT
CTAGACCTTTTTGGAGAAAATGAATTGGAAGAGTTTAAAATTGCTTATAAAAATGTGTACCATAAGTATA
GTGAAGTAAAAAAAGCTTTAAATTGCTTGACAGAAAATAAAGATGAGATGCAAATTCAACGAGAAATAGA
TTTATTAAGATTTCAAATAAATGAAATTGAAGCTGCAAATCTAAATAAGAATGAATATGAAGATTTATTA
AAACAAAGAGAAGTTTATAGAAATAGTGAAAAGATATATAATAATCTAAATTCGAGTTATAGCAAGTTAC
ATAATGGTGAGTATAATGTTATTGACCTAATAGGTCTTGCATCTAAGGAACTTAATGACATATCTAAATA
TGACAGTGTTTTAAGTGAATATAGTGATACTGTAGAAAGAATTATGTATGAGTTACAAGACATATCTGGT
GAGATAAGAAATTACAAAGATAATATAGACTTTGAACCTTATGAGCTAGAGCAGATTGAGCTTAGAATCG
ACGAAATTAATAATTTAAGAAGAAAATATGGAGACAGTATAGATGATATATTTGAGTATTATGGAAAAAT
TAAAGATAGATTAGATGAAATATTAAATAGAGATGAAAGAGTTGAACAGTTAAAAAGCAAACTGATGAAT
ATAGAAGAAGATTTAAAAATAAAAGCCAGTAAATTGACTAAAGCAAGAATAGAAGTAGCAACTACTTTAG
AAAAAATACTTCTTGATGAATTAAAAAGCTTAAATATGAAAAATGTAATGTTCAAGGTTAATTTTGAAAA
AGGTTCATTTACTTTAGATGGAGTAGATGATATTGAATTTATGATATCTTTTAACTTAGGAGAAGATATT
AAGCCTATATATAAAGTTGCATCAGGTGGTGAGATGTCCAGATTTATGTTAGCGTTTAAAACCATATTGG
CTGATATAGATGATATTGATACATTAGTGTTTGATGAGATAGATACTGGAATAAGTGGGATAGCAGCACA
GATAGTTGGTGAGAAATTGAGTGATATAGCAAAGAAAAAACAGATAATATGTATAACTCATTTACCTCAA
ATTGCTGCAAATGCAGACACTCATTATTGTATAGAGAAAGATACTTCAAATAATAGGACGTTTACCAATG
TTAGTAAGTTAAATGAATCTCAACGAAAAAATGAAATTGCCAGACTTATAGCAGGTAACAATATAACAGA
AAAAACTATTGAACATGCAAGTGAAATCATTGAATTGGCTAAAAAATGTTAG
>ref|NC_013316.1|:1265049-1265915 hypothetical protein CDR20291_1048 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAAAAGATACTATGCACTTAATTTTTATAATTGTAATTTTTATTTTATTATGGTATATTGTGG
TAGCAGTAAGTGAGATTAATAAAAATATTGAAAGTTGTAGTAACAAATTAGATTATTTGTCACAAGAGCT
TATGAGTACTAAGTCGGATATTAGTAATACTATAAATGAAGAAATGTCAAAAAGTTATATAACAAAAAGT
ATTGACTTAAAAGTAAAAAAAATCGAGAAAAAAGAATGTACTATTGATGTAGATGTTCAATTAAGTAAAC
TTGGAAAAAATGGAAAAGTATTTTTTATGTATAAAGAAGATAGTGATAAATGGAATGAAACTGAGATGAC
AAAACATGGGGAATTATCATATGCATGTGAAATAAAGATAAATACAGGAAGTGAATATGATTATAAAGTA
GTTACAAGTGGAGATATATCTGAAAGTTCTGATGTACAAAAACTGACTAAATCTGATTATATGCCTGAAC
AACCTATATTTAATTCTGGGATAAGAGATAATAGAGAATACTTTATTGAAATAGTAGAAAATAGTAATCT
TTTTAATCATGAGAGTGAAAAGTCAAAAAATAAAGCTTACGATAATATCAGGTTAGAAAAAGTAGATATT
ATTGTAAATGAAGGAAAAAAAGACACTATATACAAAGCCCAATTAGCTGAAGGCTTAGATGATGGCAAAA
CTAATAATTCAAATAGAAATCAAGTGAATTATGAAGTAAGTTTTCCTAAAAGGGATATTGATGACATAAT
TTATATTAAAGCTAAACTTACATACAATAATGGAGTAGAATATACAAAGGATATAACTGAAGATATAACT
ATGGGATTACAAGATTTAGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c1266527-1266006 putative acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
GTGAAGTCATTATATAAACATGTTTATATAATGGCGGATAAAATGGCTCAAAATATAACTTTACAATTTG
TTGAAGAAAAAGATTTAGAAAATCTTGAAAACGTAAAACTTCTATTTACTGAATATTCAAATTCTCTAAA
TATAGACTTATGTTTTCAAGACTTTAATAATGAATTAAAAACACTTCCAGGAAAATATAAAAAACCTTCA
GGCTCATTGATATTGGCATTTGTTGATGAAAATTTGGCAGGTTGTGTTGCTTTAAAAAAACTTGAAGGTA
AAATATGTGAATTAAAAAGATTATATGTAAGAAATCAATTTAGAGGATTAAAAATAGGAAAAATACTATT
GGAAGAAATCATTGTAGAAGCTAAAAAAATTGGATATACACACATGAGATTAGATACTCTTCCAAGCATG
AAAAGTGCACAAGGATTATATGAAAAGTTTGGTTTTTATGATATAGAACTTTATACTTATAATCCAATTG
AAGGGGCTAGATATATGGAATTAAAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c1267016-1266558 spermine/spermidine acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
TTGAAGGACGGTAATATCTTGAAATTAAATGTAAGAATTGCAGACATAAATAATTGGCACGATTTAGTTA
GTTTGTCTGTAGATAAAAGTCAGTTAGATTACATAGAAAGCAATGCACTTTCTATTGCTGAATCTAAATT
TATAACAGCTTGGGTACCTGTTGGAATATATGATGAAAATTCTTTAATAGGATTTGCTATGTATGGTCGT
TTAGAAGATGATAGAGTTTGGCTTGATAGATTTATGATTGATTCAAAATATCAAGGTAAAGGATGTGGAA
AAGCATCATTAGATTTTCTTGTAAATCATCTTAAAAATGAATATAACTGTGATGAACTATATCTTAGTAT
ATTCGAAGACAATAAAATGGCTATTAAGCTTTATAAAGATTTTGGATTTAAGTTTAATGGAGAGCTTGAC
TATGGTGGTGAAAAAGTAATGGTATTAAAATCTAATTGA
>ref|NC_013316.1|:1267159-1268217 stage IV sporulation protein B [Clostridium difficile R20291]
ATGAACAAAATAAATAAAAATTTCAAAAATATTTGGATAATATTAGGAGCTGTATCGATTTTTACCATGG
TTATAATTTTTAATAAAAATTGTAATGTTAATAAAGAGACTCAAATAGAAGCTTTTACAATTAAGAATCA
TGATAAAAAATTTGTATATCCTATGGGAAATATAATTGGAGTAAAAGCAAATACAGATGGTGTATTGGTC
TTAGGATATGAGGAAGAGGATGTAGGCTATATTGGAGGCATACAAATAGGTGATAATATAGTAAAAATAG
ATAATAAAAGGATAAAAAATAGTCAAGATGTATCAGAGATTTTGAATAAGATTAAAAAAAGTAAAGTTGA
AGTGACTTTTGAGAGAAAAAATAAGTATAAAACAGAAGTAATAGAGACTAAAAAAGAAAATGGCAAGTAT
AAACTTGGATTATGGGTAAGAGATAAAATATCTGGAATTGGAACTATGACTTTTTACGACCCTAGTATGG
AAAAGTTCAAAGCAATCGGTCATGCCATAAAAGATTCGGATACTAATGAACTATTAAAGATAAAGCAAGG
CTATATATATAAGCCAGAACAATTAAAAATAGTAAAAGCTAGTAATGAAAAAGTAGGTAAAATAAAAGGA
GATTTTAATGACAGCAATTTAATGGGTAATTTCTCAAATAATTCAGAGCTAGGTATAAGTGGTAATATTA
CAGAAAACCATAATAAAGAGTTTAATGTAGCAAATAAAGAAAAGCAATTAATAGAAGTTGGAAGACCGCA
AGATGTAAAAATAGGAGATGCAGTAATTCTTTTTGAGGATAAAAACAAAAATATAACAAGCTATGATATA
AAAATAGAAAGTATAGTATATGATAAAGGAAATTATAGAGATATGGTAATAAAAGTAGTAGATGACAAGT
TATTGGAATACACAGGAGGTATCGTACAGGGGATGAGTGGAGCTCCAATAATACAAAATAATAAAATTAT
TGGTGCAATAACTCATGTTTTTAGAGATAATCCGAAAAAAGGATATGGTATTTTTATAGATGAAATGATA
AAATTGTAG
>ref|NC_013316.1|:1268359-1269183 stage 0 sporulation protein A [Clostridium difficile R20291]
ATGGGGGGATTTTTAGTGGAAAAAATCAAAATAGTTTTAGCAGATGACAATAAGGATTTTTGTCAGGTAT
TAAAAGAGTATTTGTCTAATGAAGATGATATCGATATATTAGGCATAGCTAAGGATGGAATTGAAGCATT
AGACTTAGTAAAAAAGACACAACCGGACTTATTAATACTAGATGTAATAATGCCACATCTAGATGGATTA
GGTGTAATTGAAAAATTGAATACTATGGATATACCTAAAATGCCAAAAATAATAGTACTATCAGCAGTAG
GTCAAGATAAGATAACTCAAAGCGCAATAAATCTAGGAGCAGATTACTACATAGTAAAGCCATTTGATTT
TGTTGTGTTTATAAACAGAATTAGAGAGCTAGTTTCTAATAGAGTTACACAAGTTGAGCCAAAACCTAGA
CCAGTTCAAGAGACTCAAATGACTAGAAGTGATTTTGTTAAGAATGTAGGAAATATAGAGACAGAAATCA
CAAATATAATACATGAAATAGGAGTACCAGCTCATATAAAAGGATATTTATATTTAAGAGAAGCAATAAA
AATGGTTATTGATAATGTTGAGCTTTTAGGTGCAGTAACAAAAGAGTTATATCCAAGTATAGCTAAAAAA
TTCAATACAACACCAAGTAGAGTTGAAAGAGCAATAAGACATGCAATAGAGGTTGCATGGAGTAGAGGAA
AAGTTGACACAATAAATCAATTATTTGGATATACGGTACACAATACTAAAGGAAAACCAACTAATTCAGA
ATTTATAGCAATGATTGCTGATAAATTAAGACTAGAACATAGTATGGTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1269596-1270717 putative pyrophosphokinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAGTCGAGGCCCCTATAAAAGTAGATCGAAAAACCAAAAAACTTGCTAAAAGAGTTGAAAGTGGGG
AAATAGCAGTTATAAATCATATAGACATAGATGAAGTTGCTGCAAACTCTTTAGTAGAAGCTAAAATAAA
ACTTGTCATAAATGCGGCTCCTTCTATAAGTGGTAGGTATCCCAATAAAGGTCCAGGGATATTAACTGAA
AATAATATACTAATAATTGATAATGTTGGAGAAGAGTTATTTGAAGAATTAAAAGAAGGAGAAACTATAG
AAGTTGTAGATGGAAAGATATATAGAAAAGGAAAATTTTTAGGTGCAGGAGAAGTTTTAGACAAGTATGA
GGTTTCACACCAAATAAAGGCTGCCTATGAGAATTTAGCTGTAGAATTGGATAGATTTATAGATAATACT
ATAGATTATGCTAAAAAAGAAAAAGGATTTATACTTGGAGAAGTAGAAATTCCAAAAGTGAAAACTAATT
ATGCTAATAAACATGTATTGATAGTTGTAAGAGGTCAGGACTACAAAGAAGATTTAAGTACTATGCTTTC
TTATATAGAAGAGGTAAAGCCAGTATTGGTTGGTGTTGATGGAGGAGCAGACGCTTTAATTGAGTTTGGA
TATACTCCAGATGTGATTGTAGGTGATATGGATAGTGTAAGTGATGAAGCTTTAAAAAAGGCTAGTGAAA
TAGTAGTACATGCTTATACAGATGGAAGAGCACCAGGTCTTAAGAGGGTTGAGGAATTAGGCTTAGATGC
AGTTGTATTTCCTGCGCCAGGAACTAGTGAAGATATAGCTATGCTTATCGCCTATGAGTATAAGGCTGAG
TTAATAGTAGCAGTTGGTACACATTCAAATATGATTGATTTTCTTGAAAAAGGAAGAAAAGGTATGGCAA
GTACTTTTTTAGTTAGACTAAAAATAGGTTCAAAGCTTATAGATGCTAAAGGCGTTAATTTGTTATACAG
AAGTAAATTAAAAATAAAGTACATATGGGCATTAATAGCAACAGCATTATTTCCTGTGTTGGTAGTTGCA
TCATTGTCACCAGGAGTTCAACAGTTCATACAACTAATGCAATTAAAGTTTAGAGTATTATTACAGATGT
AA
>ref|NC_013316.1|:1270735-1271610 hypothetical protein CDR20291_1054 [Clostridium difficile R20291]
ATGCATATTAATATGAAATATTATATAGTCACTATAGGGGCTATATTTATAGCTTTGGGTATAGGCATGT
TAGTAGGATTTAATTTAAATAATAATCAACAATTAAGTGAACAACAAGCAAACATAATAAATGATTTGGA
TGATAAGTTTAATATCTTAAAAGAAAAAAATGATAAACTTGACAGTGACTTAGCAAGTGTAAATAGAGAT
TATGAAGAGGCAGTTAATTTTATAAATAAAAATGTAGATAAGATTTTAGCTGGTTCGCTGAATGGTAAAA
GTATAGGAATAATATCGGCTAATGAAAATGACGATTATACAAAAAATATAGAAGACATAATAAATAAATC
TAATGGAAGTATTGCATTTAATATAGTATTAAAAGAAAATATAACAAATCCAGAAAAGTTAAAGGAAATG
TCAACTAAACTAGGTACAGATGTAAAAAATGCAAATGATGCAGTTAATTATATAATTGACACCCTTAAAA
AGGAAGATGCAAGTGACATTTTAACATATCTTCAAGAACTAGATGTAATAAAGTTTAACTCTCTTGGAAA
TACATATCTAAAATATGATTCTGTTGTAATAGCTGGTGGAAATGATGCAAAAGACAGTACAAAACAGTTT
GAAAAAATAGAAAAATTTGTAGTTTCAAAACTTAAATCAGAGAATAAATATTTAGTAGAAGTTCAAAATA
CAGGAGTTAAAACTTCTTATGTAGAACTATATTCTAAAAACAAAGTTGCAACTATAGACAATATTGATGA
AGGTATAGGAAGTATATCTCTAGCTATTCTTCTACAACAAGGTAATATAGTTGGTAATTTTGGTAGATTG
GATACTGCAACTTCATTGTTGCCATCTATTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1271634-1272326 putative glycosyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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GCATATTGGACATTAAGCAAATAAATGAAATAATAGTTGTGGATGATGGTTCAATTGACAATACTGCTAA
GGTTGTATCTGAGCTAGAAAATGAAAAGATTAAATTTTTTAAGTTAGATAAAAATAGAGGTAAAGGATAT
GCTTTAAATTATGGTATCAAATTAGCAATGAAAAATGCAGATATTATAGGTTTTCTGGATGGAGATTTAG
GAAGCTCTGCTAAAGAAGTTGAAAAATTAATAGTACCTATATTAAATGGTGAGGCGGATGTTACAATAGC
CAAGTTTCCTCCTGCAAAGAGAAAAGGAGGTTTGGGATTTGTAAAAGGTTTAGCTAAAAATTCTGTGTTT
GAGATGACTGGTGTTGAGTTAGATGCAACTTTATCAGGTCAAAGAATATTTAAAAGAGAAGTTTTAGAAA
AGTTTGATGAAATACCTTTTGGATATGGAGTAGAAGTTGGAATGACCATTGATATATTAAAGTATGGATT
TAAAATTAAAGAAGTATTAGTAAATATGACTCATAATGAAACAGGAAGAAATTTAAAAGGTTTTATTCAT
AGAGGGAAACAGTATTATCACATAAAAAAGGTTTTAGGACAAAAAAAGAAAGAATGGAGGTAA
>ref|NC_013316.1|:1272334-1273158 putative glycosyltransferase [Clostridium difficile R20291]
GTGAAAGATTATATACTTTATACCATTTTATTATTAACTGGATTATTTGGAACCTATGCTGTAATTCCAC
TATTTAAAAATTTATTGATAAATGGAAATGTACTTAGACCAAACTATAAAAAAGATATGATACCAGTAAG
TATGGGAATTGTATTTTTGCCTATGATTGTAATCAATGGAATAATACTTGCTTTCTTTACTACAGAATTT
AAGGATTTAGCGTATATATTTATGTTTATGTTTGGTATGATATCCATGTTTTTTGCAGGGATACTAGATG
ATGTCATTGGAAATAGAGATGTAAGTGGTTTAAAGGGGCATTTTAAAAGTTTATTTAAAGGAAGTCTTAC
AACAGGAGGTTTTAAAGCTTTATTTGGTGGATTTGTAGGGCTTATAGTTTCTGTTGCTATATCAAAAGAC
ATAATTGATATAATAGTAAATACACTAATAATAGCTCTATCAACTAATTTAATGAATCTTTTGGATTTAA
GACCAGGAAGGGCAATAAAAGCATATTTATTCATAATGGTAATTATATTTTTAACATTGACAGGATTTGT
TCAAGTTCTTCCATTACTTATAGTACCAAATGTACTTGCATACTTTAATTATGATTTAAAAGCAAGGGCT
ATGATGGGAGATACTGGTTCAAACGTCCTTGGAATATCTATTGGAATGCTCATTTCTTTTGGGTATCCAT
TTAACATTAGATTAGGATGGTTAATATTTGTAGTTATTATGCATATATTCACTGAGAAATACTCATTAAC
TAAGATAATAGAAAAAAATAAACTATTAAATTTTATAGATAAATTGGGAAGGTAG
>ref|NC_013316.1|:1273163-1274230 hypothetical protein CDR20291_1057 [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAGCAAAAGAGTGGGGATTGTTGAATCAATAGTAAGTCAAACTGAAACTCTAGATGATATAAGAG
TAAATATAAATGGAAAAATACAAAGGGCATATAATTATCCCAAAATATCTGGAACTATAAATATAGGTGA
TGAAGTGGTTTTAAATACAACAGCAGTAGAACTGAGCTTAGGTACAGGTGGATACCATTTTGTAATAACT
AATTTAAATAATATAGAATCTACTTTAACTGAAGGTGGGCATATAATGAAACTTAGATATACACCTCTTC
AAATAAAAGTGGATTCTGTTGAGGAACAAGAAAGTATTTATCATGATAAATTTGCGAATTTTAAAGGATT
AGAAGGTCTTTCTGTTGTAGTAGGGACTCTTCATAGTATGTTAACTCCATTTGCAGCTTCATTTAAAAGA
AATAATCCAAATAAAAAATTAGTATATATAATGACTGATGGAGCATCTCTTCCAATTTATTTAAGTAAAA
ATGTGGACACTTTAAAAGAAAAAAAATTAATAGATAGTACGATAACTATAGGAAATGCGTTTGGTGGAGA
TTATGAATGTATAAATATATATACTGCATTAATTACAGCAAAAGAAATACTAAAAGCGGATGCAGTATTT
GTCAGTATGGGACCTGGAATTGCTGGGACAGGAACAAAATATGGATTTACAGGGATTGAACAAGGCTCTA
TTCTTGATGCCGTAAAAAAACTTGAAGGAAGAGCAATTGCAATTCCAAGAATTAGTTTTGCTGACAAACG
AGAAAGACATCAAGGTATTTCACATCATAGTATGACTGTATTTAAAGAAATTGTAAATGTAAATGTAGAC
ATACCAATAACTATATATGATGATGAAAAATTGAACTTTATAAAAGAGCAAATCAATTTAAATGGTTTAG
ACAAAAAGCATAATATAATTTATATAGATAATAATAAAACGAAAGAGGATTTAGACTATTTTAATCTAAA
AGTAAAGAGTATGGGAAGAAATTATGAACAAGATGAGGCATTTTTCAAAGCTGCAAGCACAGCAGCATAT
TACTTAATGGAGGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1274232-1274768 ADP-ribose pyrophosphatase [Clostridium difficile R20291]
ATGGTATTAGAAGAAAAAACTATTAGTAGTGATAGGGTTTATACAGGTAAAGTAATTACTTTAAAGGTTG
ATACTGTTGAAATTCCAGGGCAAGGATATCAAAAAAGGGAGTTAGTAGAAGTTGGTGGAGCAGTAGGAAT
AGTTGCAATCACAGATGATAATAAAGTTGTACTAGTTAAGCAATTTAGAAAACCTATAGAAAAGCCAATC
TTTGAAATTCCAGCTGGTAAACTAGAAAAAAATGAAAGTCCAAAAGAATGTGCTGAAAGAGAATTAAAAG
AAGAAACTGGGTATAGTGCAAAAAATATTAAGCTAATACATAAATTTTTCACTTCAGCAGGTTTTTCTAA
TGAGATAATGTTTGTATATTTAGCAACAGGTCTTACTCCAGGAGAGAATAATTTAGATGCAGATGAGTTT
TTAGATGTCTATGAAATTGAGCTTGAAGAAGCATATAACATGGTATTAAAAAATGACGTTGAAGATGCAA
AAACATCTATTGGATTATTATTAGTAAAAGATATGTTTAAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1274836-1275441 hypothetical protein CDR20291_1059 [Clostridium difficile R20291]
TTGAGAAGAACATATAGAAAAAATGATTTTAGAGAATTAAATAGACAAATAATTATTATAGGATTGTTGT
TTATGATGTCTATTGTTGTTGGGTCTTACATAAATAAAATATTGCCAGGTTCTAGTAACAATATATTAAA
CAATATAAATCCTGCTGTAGAGTATTATAATCTAAATATAAGCATAAAAGATACAGTGATACAAAATTTA
AAATCAGATGCAATCTTTATGGGCTCAATAGCTCTATTAAGTCTATTTGTAGTAACAATTCCAGCAGTGT
TGGTAGCTTTTGTATTAAAAGGGATGTCAATTGGTTATACAATAAATAGTTGTATATTGGCATTAAAATT
TAAAAGTATAAAAATGATTTTAATAATATTATTTAAAAATTTGATTATTATTCCATGTGCAATCATATTA
GCATTAATTAGTTTAAGTTATTTTAAAGAAATGGTTTATGAATTTAAAAAGAAAAATAGAAAAAATATGC
AATTTTTAATTAAGAGGTATATACTAAATATTATAATTATAATAGCACTATCATTGGGGTTGCAATTAAT
ATTAAATACTGTAAGTATTGGTATTATTAAGTTCCTAGCTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1275453-1276367 putative tyrosine recombinase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATATTATAGAGGGATATATAGATTACATAAAAGATAAAAAAAAATTATCAGAGAACACAGTGGCAT
CATACTTTATGGATATAAAAAAATATATGGAATATATAAATCAAAAAAGCATTAAACTAGTAGATATAGT
AGAAAATGATATTATAAGTTACTTAATAAAGTTGGAAAAAGATAATGTATCAATAGCTACAATAGCGAGG
ATGATATCCTCTATAAAATCTTTTCATGATTATTTATTTTTAAATCATATATGTACAAATAATCCTGCAA
AGGATATAAAAAAACCTAAAATAAAAAAAGAAAATATAAATATACTTACAGAAGAAGAAATTGAAAGACT
ATTAAATTTTCCAAAGTTAACAACACCTAAATTGATTAGGGACAAGGCTATTTTTGAAGTATTATATGGT
ACTGGTATAAAAGTATCTGAATTAGTAGAGATGAATATAGAGGATATTGACCTAGATATTGATTATATAT
ATTGTAATTCATGTTGTAAAAATCAAAGAGTGATACCACTTTGTGATATTACAAAACTTTACTTAGAAAA
GTATCTAAAAGAAGCAAGACCTAAAATGGCTGTAGAAGGTGAAAAATCATTATTCGTAAGTTCATTAGGT
CAAAGGTTTACACGACAAGGTCTTTGGAAAGTCATAAAAAAATATTCTAATCTAGCCAATATAGATAAAA
ATATAAATCCTACAATGCTTAGACATTCATTTGCTATTCATTTGTTAAATGAAGGTGCTAACATTGCTGT
TGTAAGTAAAATTTTAGGAAATGTTAATTTATCTAGTTTGCAAGTATATTTAAATCATATAGATAAAAAC
GTGAGAAGAGAAATAAAGGAAAAACATCCTAGAAATGATGTTGATGTAGAATTACAAAAAGCAGAAGCTA
AATAG
>ref|NC_013316.1|:1276409-1277581 phosphopentomutase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCAGAGTAATTTGGATTGTAATTGATAGTGTTGGGATAGGAGCATTACCTGATGCTGAAAAATTTG
GTGATAGTAAGGATGTAAGTACCCTTGGAAATATATTTAAGGAATATCCAGATATTCAGATTCCTAATAT
GAGAAATTTAGGTATAGGAAACATAGATGGTATAGATTTTTTTGAAAGTATAAAAGAACCAATAGGTTGT
TTTGGAAAGTGTAAGGAAATGTCTCAGGGAAAAGATACTACTACAGGTCATTGGGAAATGACTGGTATAA
TAGTTGACAAACCATTTAAGACATTTGAACATGGATTCTCTAAGGAGATAATAGAAGAGTTTGAGAAAAA
AACTGGAAGAAAAGTAGTAGGAAATAAACCAGCTTCAGGAACTGTAATAATAGATGAGTATGGAGAGCAT
CAAATAAAAACTGGAGATGTAATAGTATATACATCAGCTGATAGTGTATTTCAGATTGCTGCTAATGAAG
AAGTAATTCCCCTAGAAGAACTCTATAATATGTGCAAAATCGCTAGGGAAATAATGATGGGGGATAATGC
AGTAGCTAGAGTAATTGCTAGACCATTCATAGGTAAGAAAAAAGGTGAGTTTGTGAGGACTTCAAATAGA
AGAGATTATTCACTAGACCCATTTGAACCAACAGTTCTTGATAATATAAAAGAATCAGGACTTGATGTTT
TAGCAGTTGGAAAAATAGAAGATATTTTTAATGGAAAAGGAATTACAGATGCTATCCACACTAAAAGCAA
TATGGATGGAGTGGATGAAACTTTAAATTATATGAAACAAGATAATAAAGGTCTAATATATTCAAATCTC
GTTGATTTTGATTCTAAATATGGTCATAGAAGAGACCCAGAAGGATATAAGAAAGCTCTTGAAGAGTTTG
ATAGTAGACTTCCTGAAATAATGGCTAATATGAGAGAAGATGATATTTTAATAATCAATGCAGACCATGG
AAATGACCCAACATATAAAGGTACAGACCATACAAGAGAATATATACCTGTTATGATTTATGGCAATAAG
ATTAAAAAAGGTTTTAATTTAGGAGTAAAAGATACTTTTGCTGATATTGGAGCAACTGTTGCAGATATAC
TAAATGTAAAGTTGCCTAAACATGGGTCAAGCTTTAAAGAAGATTTATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1277628-1278440 purine nucleoside phosphorylase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTGAAAAGATAGCACAAAGTAGTAAATTTATAAATTCTAAAAGTAATATAAAACCTAAGATTGGTT
TGATATTAGGTTCTGGACTAGGTGATTTAGCAAATGATATAGAAGACCCTGTCACAATTAAATATAGTGA
AATTCCAAACTTCCCTGTATCAACAGTAGCAGGACATGCTGGACAACTTGTAATTGGAAAACTTGAAGGA
AAAGAAGTTATTGCTATGCAAGGTAGATTTCATTACTATGAAGGATATTCTCAGAAAGAAGCTACTTTTC
CAGTAAGGGTTATGAAAGAATTAGGAGTCGAGATTCTTATAGTAACTAACGCTGCTGGAGGCGTAAATAA
AGAATTTAAAGCAGGAGATTTGATGCTTATAAGAGACCATATAAACTTTAGTGGAAGTAATCCATTAGTA
GGAAAAAATGATGACAGATTTGGTGCTAGATTTCCAGATATGTCAGATGCATATTCTTCTAAATATGTAG
ATGTAGTTAAAAACTGCGCTAAAGAATGTAATATAGATGTCAAAGAAGGCGTTTATATGTTTTTTAGTGG
TCCAAACTATGAAACACCAGCAGAAGTGAGAATGGCACAAATTTTGGGAGCTGATGCTGTAGGTATGTCT
ACTGTTCCAGAAGTCATAGTAGCTTCTCACTCCAATATAGGAGTTATTGGTATATCTTGTATAACAAATA
TGGCTGCTGGCATCTTAAATCAACCACTAAGTCATGAGGAAGTAATAGAAACTACTCAAAAAGTTAAATC
AGAATTTATGAATTTAGTTAAAACAACGGTTAAAAATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:1278629-1279969 pyrimidine-nucleoside phosphorylase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGATTTCAATTATGAGAATGTATGATATTATAAAAAAAAAGAGAGATAACTTAGAGCTTAGTAAAA
AAGAGATAAACTACTTTATAGAAAACTATTCAAAGGGAGATATACCTGACTATCAAGCTTCTGCACTATT
AATGTCGATTTATTTAAATAAGATGAATAAACAGGAAACTGTACATCTTACAGAAGCAATGATGAACTCT
GGAGACATGATAAACCTGTCTGAGGTAGATGGAATAAAGGTAGATAAGCATAGTACTGGTGGTGTTGGAG
ATAAGACTACCATAGCTCTTATACCTTTGGTTGCTTCATGTGGAGCACCAGTTGCAAAGATGTCAGGTAG
AGGTCTTGGTCATACTGGTGGTACTATTGATAAATTGGAGTCTATACCAGGTTTTTCGACAGAAATGGAG
ATAAGTAAATTTATTGATTCTGTAAATAAGTCTAAAATAGCAGTTTGTGGTCAAAGTGCAAAGGTAGCAA
TTGCAGATAAGAAAATATATGCTCTTAGAGATGTTACAGCAACTGTTGATAATATATCATTGATATCATC
AAGTGTAATGTCTAAAAAGTTAGCTTCAGGAGCTGATGCAATTGTGTTAGATGTAAAAACTGGTGATGGA
GCATTTATGAAGACATTAGAAGAGTCTTTTGAGTTAGCTAAATCTATGGTTGATATAGGTACTGGTATGA
ATAGAGATACAATAGGGATTGTAACAGATATGGATGAACCTTTAGGTTTTGCAGTGGGAAACTCTTTAGA
AGTTATAGAAGCAATTGAGACATTAAAAGGAAATGGCCCTAAAGACCTTGTTGAGCTATGTGAAGTATTA
GGAGCATATATGTTGGTTTTATCAAAGGTAGCACATGATTTTGAAGATGGTGTTGAAAAGATAAGAGAAT
CAATAAAATCTGGTACTGCTATACAAAAACTCAAAGAGTTTATAGAGAATCAAGGTGGTAATAAAGATGT
AGTAGATGATTATTCTTTATTCAAAAAATCAAAGTATAAATATCCAGTTAAATCAATTAAATCAGGTTAT
ATAAGTAAAATTAAAGCTGAAGATGTTGGTGTATCAGCTATGATTCTTGGAGCAGGTAGAGAAACTAAAG
ATGATATTTTAGATTTATCAGCAGGGATAATTTTAGAAAAGAAAGTAGGAGATTATGTAAATGAAGGTGA
AGTTTTAGCTTACATGTATTATAATGATGAACAAAAGCTTTCATTGGCAAAGGGAAGATTTATTGATTCC
TACTCTATTGTAGATTCAAAAATAGAAAAAAATAAATTAATATATGGTATTGTAACTAAAGAAGAGATTA
AAAAGTTTTAG
>ref|NC_013316.1|:1280182-1281261 putative exported aminodeoxychorismate lyase [Clostridium difficile R20291]
ATGAACTTTAAAGAAAATAGATTGAAAATAGCAGTATTAATAATTGTTATTTTGATTATCTTAGCAGGTA
TATTTGTGTTTATACAAATAGGTCCTTATGATAAAAATAACAAAAAAGATGTAATTATTGACGTTCCAAG
TGGAGCATCTGTTGGAAAAATATCTGACATATTATATGAAAATAAATTAATAAAGAATGAACTATTATTT
AAACTTTTGGTAAAGGTTAGCAATAAAGCTCCGTCTATAAAATCAGGAACATACTTACTTAATCAATCGT
ATTCAAACAATGATATAATAAGTCTTTTAGTTTCAGGTAAAATATATCAGGATGGTATAAAAGTGACTAT
TCCAGAGGGAGCTACATCTAAAGAAATTATAGCAATGTTAGTAAGTAAAAATTTAGGAGATAAAGCTACT
TTTGAAAATTTAATAAAAAAACCTCAAGAATTTTATGATAAATTTCCATATTTGAAGGAAGATGGAATAA
CCTCTTTAGAAGGGTTCTTGTATCCAGAAACTTATTATTTTAATTCAAAGAAACAATCAGAAGAAGATAT
TTTAAGCGAAATGTTAAAAGTATTTGACAGTAAATACACGGACAAGTTTAAAAAGAAACAAAAAGAATTA
AATATGACTCTTCAAGAAGTAATGGAAATGGCATCAATAATTGAGAAAGAAGCTGTTCTTGACAAAGACA
GACCTATAATAGCAAGTGTGTTTTATAATAGACTTAAGGTAGGTATGCCTCTTCAATCAGATGCTACAAT
ACAATATATATTTGAAGAGAGAAAGAAAATTGTAACATATGATGATTTAAAAATTGATTCACCATATAAT
AGTTATAAAAATAAGGGATTACCTCCTACACCAATATCAAATCCTGGTATAAAATCTATTGAAGCAGCAT
TATATCCAGAGAAAACAGACTATTTATATTTTGTAGCTAAGATTGATGGTGGAAATAATTATAGTACAAA
CTATCAAGACCATTTAAAATACGTTAAAGAATATAAAGAAGCAAGGGATAAACAATCAAAAGATACAAAA
GCAACAAATAAAGAAAATACAAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1281433-1282107 putative O-methyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAATATAGTTAATGATTTGGTTGAAGATTATATAAGAGTGACATTAAAAGAAAAAGAAGGATTTT
TAAAAGATTTAGAAATTTATGCAGAGGAAAATAGTGTTCCTATAATACATAAAGAAGTTTCAGATTTATT
AAAAGTCTTGTTAAAGGTTCAAAAACCAAAGAGAATTTTAGAAGTAGGATGTGCAATTGGTTATTCTTCT
ATTTTTTTTGCAAGTATTATAGGAAAAGATGCAGATATAATAACTGTTGAGAGAAATGAAAAAATGATAG
AAAAAGCAAAAGAAAACATAAAATTAGCTGGATTTGACAATAACATAACTATACTAGAAGGAGATGCAGA
AGAAAAACTTAGTCAAGTCCAAGGTGAATTTGACCTTATATTTATAGATGCAGCCAAAGGTCAATATAAG
CTATTTTTTGATTTAGTTATAGATAAATTAAAAGATGGGGGACTTTTAGTATCTGATAATATTTTGTATA
AAGGTATGGTTGCTCATGATGATTTTGTTGTAAGAAGAAAAAAGACTATAGTTAAAAGAATGAGAAATTA
TTTAGATTATATATGTAATTGTGACTATTTAAGCACATCATTGGTACCAATAGGTGATGGTGTAGCACTA
AGTTATAAAGAAAGTAAAAGAGGTGATGTAGATGGAATTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1282094-1283341 putative protease [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATTAAATAAAGTAGAACTTTTAGCTCCAGCAGGTGATTTGGAGAGATTGAAAATAGCTATAACAT
ATGGAGCAGATGCCGTTTATATAGGTGGAGAAATTTTTGGAATGAGGTCTGCAGCGAAGAATTTTAGTAA
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ATACCTCATAATGAAGATTTTCTACAATTAGAAGACTATTTGTTGGAACTAGAAGAGATAGGAATAGATG
CAGTTATAATAGCTGACCCAGGAGTGCTTAGTGTCATTAAAAAAGTAATTCCGAATATGGAAATACATTT
AAGTACACAAGCAAATACAACCAATTATCTAAGTGCAAACTTCTGGTACGAGCATGGAATAAAAAGAGTT
GTAGTGGCAAGAGAATTATCTTTTGATGAAATATCTGAGATAAGAGCAAAAACACCTTTAGATATGGATA
TAGAAGCGTTTATGCATGGTGCTATGTGTATTTCTTATTCTGGTAGATGTTTAATAAGCAACTATATGAC
TGGAAGAGATGCAAACAAAGGTTCTTGTGCTCAATCTTGTAGATGGCAATATCATTTGGTGGAAGAAAAA
AGACCTGGTGAGTATTTTCCAATATACGAAGATGAAAGGGGTACATTCTTCTTTAACTCAAAAGATTTAT
GTATGATAGAGTATATACCAGAGTTAATCAAATCTGGTATAACAAGTTTAAAAATAGAAGGTAGAATGAA
GACTGCATACTATGTAGCTACTGTTGTAAGAGCATACAGAATGGCAATAGATGAATTTTACAGAGCCCCA
GAAAACTGGAAGTTCAATCCAATGTGGATGGAAGAACTAAAAAAAGGTAGTCATAGACATTTTACATCAG
GTTTTTACTTGAATAAACCAACAACAGAAGACCAAAATTATCAATCAGCATCATATGTTAGAAACTATGA
TTTTATAGGTATAGTTAGAGAAACAGAAGATGAAGATGGTCTTATTGTTGTTGAGCAAAGAAATAAAATG
TGTGTTGGTGATGAAATAGAAGTTATGGGACCATATAAAGAAACTATGTTTACTAAAATTGAAGAAATGT
ACAATGAAGAAGGAGAAGCTATAGAATCAGCTCCTCATCCTAGACAAATAGTGAAGTTAAAGCTATCAGT
AAAAGTTGGTAAAGATTATATGCTTAGAAAAGTTATAGAAGAAAAGGTTGAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1283413-1285077 putative penicillin-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAAAAAAGAAGACTCCATTTTTGAAAAAAGTGGGAAAGAGAAGCTGGTGTATATTTACTATAATTT
TAATAATTTATAGTGTTTTAATTTATAGGCTAGTTGATATACAAGTATTAAAAGGTGATAAATACAAACA
AAGTGTTGAATCACAAAGCGTTGAGAAAGTCGAGTTAAATAGTGGAAGAGGAATAATCTATGATAGAAAC
AACAAGAAGCTTACAGATACAAGTAAATCTCAGGTATTAATTGTTGAAAAAGAAAAATTAAATAATAACT
ATAAAATTTTGGAACTTATTAAGAAAGCTACTAAGATGAATGATTTAGATATATATAAAGCTGTACAAGA
GCAATTGACACGCCCTATAATACAGATTCAGACTAAAAATATCGATAAGAGTATGAAAAAAGAACTTGAG
AAAAATGGAATAATGGTAGAAGAAAAAACTATGAGGTACGCAAAAGATGGTTTATTATCACATACAATAG
GATATATAAAAGAAGATGATAAATCAGGTCAATCAGGAATTGAAAAGAGTATGGATAGTGTACTTAGAAA
TTCAAATGAAAAGTATATAAGTGCTTTTAAAGCTGGAGATGCAGGAAATGAAAAATCTCTAAACATACTA
AAGGGAAGTGTAAAAACTGTTGATAATAAGGATAAAGATAGACATCTAAAAACTACTATTGATTATAACA
TTCAAAAAAAATTAGAACAAATACTAAATAAAGAAGAAAATCCTACAGCAGCAATAATCTCGGAAGCATC
TACAGGTGAAATTCTTGCAATGTGCTCTAGACCTAATTTTGACCAAAATGACATATCAAAAAGTTTAAAA
GGAAAAAATGGGGAATTTGAAAATAGAGTTATAAAAGCGACATATCCACCAGGGTCTGTATTTAAGATGG
TAGTTTTATTTTCTGCACTTGAAAATGGTGTTATAGATGAGAACTATACTTACAACTGTACAGGTAAGAC
TAAAGTTGGGAATACTAATGAAATACTGCGATGTAATAAAAGAGATGGTCATGGTTTCCAAAACTTAAGA
CAAGCTTTTTCTAATTCATGCAATCCTGCATTTTTAGATATAGCTATGAAACTTGGAAAAGAAAAGATAC
TCAAATCTGCTGAAAAATTACATTTATTTGAAAAGGTTGATATTGGTCTTGATGAAGAAAAAATTAGAGA
AGCTCCAAAAAACATATCAATAAGAAATTTAGCTATAGGTCAAGAAAATATAGAATTTACACCACTTCAA
ATAAATCAAATGACTCAAATAATAGCTAATAATGGAACATTCAAACCACTATACTTATATAAAAGTCTTG
TGGACAATAATATGAATACAATAAAAACTTATAAGTCTTCAAAAAAAGAAGAACTTATTTCTCCTTATGT
GTGTACACAAGTTAAAGAATATATGAAGTCTGTATCTAGGATTGGTACAGCTAAAGACCTAAAAGATATT
GAAGGTGGTTGTGGAGTTAAAACTGGTACAGCTCAAAGTAGTTTAAATAAAAAAGCTATAGACCACGGAT
GGATAACAGGATTTTATCCTGAAGAAAGACCTAAGTATGTAATAACTGTGTTAGTAGAAGGAACTCAAAA
AGGAAATAAATCTGCAACACCTATATTTAAGGAAATATGTGAAAGTATAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c1286731-1285481 site-specific recombinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGACCAAGGTATCATATTAGAAACATTCAAAGAAAGTAAAACCAAAATCATCACACCTAGAAAAA
CATACGACCTAACAGATGAATTTGATGAGGAGTATTCAGAATTTGAAGCATTTATGGCAAGAAAAGAATT
AAAACTTATATCAAGAAGAATGCAAAGAGGTAGAATAAAATCAGTTGAAGAAGGGAATTTCATAGGAACT
TCTGCTCCATTTGGATATGATGCTGTAACAACAGGTAGAAAAGAAAGAATACTTGTACCAAATAAGGATG
CTGATGTAGTTAGGACTATCTTTGACTTATATATTAATGAAGATATGGGTTGTAGTAAAATATCAAAATA
CCTAAATAACTTAGGCATTAAAACTGCTACAGGTGCTAATTGGTACAATTCTGCAATTACAAATATAATA
AAAAATAAGGTATATTGTGGCTACATTCAGTGGCAAAAAAAGGACTATAAAAAATCTAAAAATCCAAATA
AAATAAAAACTGTTAAGCTAAGACCTAAAGATGAATGGATTGAAGCAAAAGGAAAGCATGAACCTTTAAT
AAGTGAAATAACATGGAAAAAAGCTCAAAATATACTTAAAAAAAACGGTCATGTCAGCTATGGTAATCAA
ATAAAAAATCCACTTGCAGGAATAGTGATTTGCAAAAATTGTGGTAGACCATTAGTATATAGACCATATG
CAGACCACGACTATATAATTTGTTACCATCCTGGTTGCAATAAAAGTTCTCGATTTGAATTTATTGAAGC
TGCCATTTTAAAATCTTTGGAAGACACGGTAAAAAAATATCAATTAAAAGCATGTGATTTAGACTTAGAT
AAAAATAATAAAGATAGTAATATAGAATTTCAAAAACGAGTCTTAAAGGGCTTAGAAACTGAATTAAAAG
AATTAGGTAAACAAAAAAATAAGTTATATGATTTATTAGAACGTGGAATATATGATGAAGATACATTTAT
TGAAAGGTCCAACAATATAAGTTCAAGAACTGAAGAAATTAAAGATTCAATTAAGACAGTAAAAAATAGA
TTGAGTACTGTTAAAAAAGACAATTCTAAAATAATAGAAGATATTAAAACTGTGTTATCACTTTATCATG
ATTCAGATTCCCTTGGAAAAAATAAACTCCTAAAATCTGTAATTGATAAAGCAATTTATTATAAGTCTAA
AGAACAAAAACTAGATTCTTTTGAATTAATGGTTCATTTGAAATTACATGAAGACCAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c1287944-1287123 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGATAATCAGTAAAAAAATAACAGCAATATTAGTATCATTTTTAATTATGATATCAATGGTTGGATGTG
CTCCAAAAGAAAGTGCTACAGAAGTAGCTAAAAAGTACCTTGATAGTATAGAAATCAAAGACTACGAAGT
AGCATATAATTTATTAAGTAAAGACAGTAAGGAAAGTGTCAGTCTAGAAAAATTTGAAGAATATCAAGAT
ACTTTATTTAAACTTCAAACCCTAAAAGATTATAAACTTGGTGAAGAAAATAAAGTAGAGAAATACAAAT
ATTCTAATAAAGAGTACACAAATCTTGTTAAAATAAAAGAAACTGATACTATAAAGTATATCACTGAAAA
TAAAGAAGATACTGCAAATTTTGATAGATATTTTATAATCGAAGATAATGAATATAAATTATTATGGCAT
AAAGACTTTAAAAGAGCTCTTAGCTCTAATTATGTCAAAATCGCTAGGTCAGAAACAAAAAAAGATGAAG
ATAAGGATTATAATAAAGCTGCTATTGATATCAAAAAAGCTATAGAAATTGATGATAAAAATCCACTTGC
ATATTATACACAATCATATATTTATATAGAGTTACAACGATATGATGAGGCTTTAAAGTCAATTGATAAA
TCCTTAGAATATCTAGATAAAAATAATGAAGCTTATAAAATAGACGCTAGTGATGCTTACAATTTAAGAG
GTGTTATTTTTATGAGTAAATCAGAATTTAATAAAGCTAGAGAATCTTACAATAAGGCGCTTGAACTTAA
CCCGGATAATGAATATGCAAAAACTAATCTAAATGATATTAAAGGATTATAA
>ref|NC_013316.1|:1288135-1289562 cell surface protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATTAAAAAATTATTAACAATAGGGTTATCTTTATCTATATTTATTGCTAGTTGCCCTATATCTG
CAAATGCTCTTGATAAAATTGAATCAATTAAAGGTGCAGATAAATACGAAACTGCTGGTATAATTGCAGA
CAAACAAAACTATACTACAGCTATATTAATTAATGCAGACAGTACAATGGCTGATGGATTAAGTGCAAGT
GGACTTGCAGGAGCTATAAACGCTCCAATTCTTTTGACTAAGAAAAATAACATACCAAATGCTACACTTA
AAAGATTAGAAAAGGCAAAAAAAGTATATATAATTGGAGGAGAAAACTCTATTAATAAATATACTGAAAC
TGTTCTAAAAGGCAAAGGAATAGAGATTAAAAGACTTCAAGGTAGTGATAGAATTAAGACAAGCTATAAT
GTTGCAAAAGAAATAAATTCAATTAACAAAGTAAATAAAGTCATATTGACTAATGCTTTTAAAGGAGAGC
CTGATGCAATGAGTGCTGCACCTGTAGCAGTTAGAGATAAAGCAGCTATAGTATTAACTGATGGAAAAAG
TGTTCCATTTAATACAACTGGTGTAGAAAGTTATGTAATAGGTGGTACTTCATCAATGAATGACAAACTA
GTTAAGGATACTAATTCAACTAGATTAGGTGGGACAGATAGATATGATACTAACAAAAAGATAATAAATA
AATTTTATAGTGGAGTAAAAGAATTTTATATAGCAAGTGGTACTGATTTAGTGTATGCTCTTGTTGGTTC
TACCATTGCTAAAAATAATGCTATTGTGTTAGTTGGTAATGATAGTAATAAAAGTGTATTGAAAAGTACA
ATTAAATTAACTGCTATAGGAAATTTGAGTGATAGTATATTACAGCAGTGTTTAAATGTAACAAAAAATA
TAGGCGATTCTAATACTGGAAGAGAATATACAGTAGAAGATGCTGCTAATGCAGTGAAAAAACTATTAGG
TGTGAAGAAATTTTATTACGAACCTAATTATTCAGAAGATGAAGATTTAATATTTCTACTAGATAAAAAT
TTTGATTTTTCAGGAAAAGAGTACTATGTATTTGCTTACATTAAACAGGGTGCAGAGGGTGATGTTAGAT
ACTGTGTAGCTAAAAATGATATGAGCAAAGTTTATACATATGATGTTAATGGTAATATGAAAGTATGTAA
TCCAGATGATTATAAAAATAAAGGAAGTATAACAGAGGAACAAGCAAAACAGATAGCATTAAAAGAATGT
GCTAAGAGACATAAAGTCAGTATCAATAACTTAGTAGTTGATATGATAGATTTTAGAGATGATATATATA
GTGGTAATGTCTATGCTGTTAAAATCAATTCAAAAAATAGTAATGGTACTTTTGGTTGGTTTTTTATAGA
TATAGAAACTGGGAAAATTTATAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1289872-1290543 hypothetical protein CDR20291_1071 [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTAAAACTAAAGTATCATCAGAGCAAAAAATCGAAGCAATTGAATCATATTTAAAGGGTGAAAATT
CAGTAATAAAAATAATGGAAGAATTAAATATTGGAAAACGTACATTCAGAGAGTGGATGCGAAATTATGA
AACTTTTGGAAATGATGGTTTAATAAAACAAAGTCACAAATCATGCTATTCTAAAGAGTTTAAATTAAAT
GCTATAGAATCTTATCTAAATGGGGAAGGATCTTATGATACTATCTCAAAAAAATATAAAATGAGATCAG
TTCATCCACTAAAAGCTTGGGTTAAAGAGTATAATCTTCATAAGGTGATAAAAGAAACCCCGAAGGGAGG
ACTCTTTATGGAGACTAGAAAAACAACATTAGATGAAAGAGCTGAAATTGTTAAAGATTGTATTGAACAT
GATCTTAATTACAATTTAATAGCAAAAAAATACTTTGTTTCATACAGCCAAGTTAGAAGATGGACTCTTA
AATATAAAGAAAATGGGATAGATGCTTTAGAAGACCGAAGAGGTAAAGCAAAAAAAGAAGATGAGTTAAC
TCAATTAGATGAAATAAAGTTGGAATTGAAAATTGTAAAAGCAGAAAAACACAAATTACAACTGGAGAAT
GAATTCTTAAAAAAGTTAAAAATCATAGAAAGAGGGTGGTAA
>ref|NC_013316.1|:1290537-1291436 integrase, catalytic region [Clostridium difficile R20291]
GTGGTAATTACACTATCCAAGAATGAAGATAAATATAAAGCGATTCAATCCTTATTCAATGAAAAAAAAG
CTTCGCTTATACAATTATGTGAAATCGCTAAAGTAAATCGTTCTGGATACTATAAATGGCTCAATCGAGA
TAAAAGTAATTTAGAACTTGAAAACATTAAATTAGCAACTTTGATAACTAAGATATATGAAGAAAAGAAG
GGAGTTTTTGGCTCTTTAAGGATGACCTTGCAGTTAAACAGAGAGTATAAACTTAATGTCAATCACAAGA
GAGTGTACAGACTAATGAGAGCCGTAGGCTTAAGGTCTATTTGTAGAAAAAAGAAATTTAGTTATGTTAA
ATGTACACCAGAAGTAATTGCTGAAAATGTATTAAATAGAAAATTTAGTGCAGATAAAACTTCTCAAAAA
TGGTTAACAGATGTAACTGAATTTAAATTAACCAACGGGACAAAGGCTTATTTAAGTGCAATTCTGGATT
TAGGTGATAGAAGCATAGTTTCATATGTTATTGGAAAATCAAATAACAATAACTTAGTATTCGAAACTTT
TAATAAAGCAATAGAAGTATATCCAAATGCAAAACCTATCTTTCATAGTGATAGAGGCTATCAGTATACT
AGCAGGGTGTTTAAATCAAAACTTTTAACACAAGGCATGATACAAAGTATGTCGAGAGTTGGTCATTGTA
TTGACAATGCTCCTATGGAAGGATTTTGGGGAATTTTAAAAGTGGAAATGTACTATTTAAGGAAATTTGA
TACATACGAACAATTAGTCAAAGCAATAGATGATTATATATATTACTATAATAATTTTAGATATCAAAAG
AGATTAAATTCTATGTCTCCACTTGAATTTAGGAAATATTTAAGTACAGAGATAGCATAA
>ref|NC_013316.1|:1294919-1295170 hypothetical protein CDR20291_1073 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTCATATTTTATAACAAGGGGTGATGTTATGAAAATACTACAACAATTTAAACCATACAAATATG
ATAAAGAAAAAAATATAGAATATGATGAAAAAATTATAGCTAATCAAAACACAGAAGTTTATATAGTATA
TCCACGTATATCTGATGAAGAAAATAGGAGAAGATGGGAAGAGTTCAATGAAGTAGCTAAAGAAGTAGCT
ATTAATATAGCTATGAAGAAAGTTGAGACAGTAGAAAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1296762-1296379 hypothetical protein CDR20291_1074 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGAAAAAATTTTTTATAGGTATTCTTATAGTTTTAATAATCTCTGTGATAGCTATACTTAATATAA
AAAATGATAAAAATGTCTTTATTGGAGAATCAGAAAATTGGAAAGCTAAATTTGTAACTACTGAAGGACA
CTCAAAATTAGAAATAAAATATAAAAATAGTAAAGATGTAGTTGAACAAAAATTTAATTATTCCTATCAA
TTTATAGATGGTGAAGATGCAGTTGTAGTTGTAAAAAATGAAATTTTAGAAGCAGGTCAAGAAAAAGCAA
TAAAAATACAAAGACCAGGTCTTTATTCAAATAGAGAATCTAGTTACAAGCTAATTATATCTTGGAATGG
AAATGAGGAAACTATAAACTTGAAAAAGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1296889-1297233 hypothetical protein CDR20291_1075 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTATAGGTTAAAAAAATCTGTAACAACTATTTTATCTTTACTCATAATGACAATACTATTACCAA
CAAATGCAAGTGCTAGTAAGGTAGAAGATTCATCTATGAAAGTAATGTATTCAGAGAAACAAGTAACAGA
CATGGACAAATTATACGATATGGCTAAAAATGGAATTACTGATGTTAAAAGTTCCAATGAAAAAGGTATA
ATCAAAAATGCAAGAACAGGAGAGTCCATATACGTTGATTCTATATCAACAACTCAATTATTAGAAGTTA
AACAATCTAAAAATTTAACATCAAAGATATATTCTAAGACAGTTTTTTTGATACTAATACAATAA
>ref|NC_013316.1|:c1298934-1298617 hypothetical protein CDR20291_1077 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATTTTGGAAATATCAATCTTATACTTATTGGAATAATAGTTATAATAGGAACTACAATAATATATT
TAATTAAACCTAAAACTGCTTTTTGTAGTAAAAAATATTTTAATAAATTAGAATCAATATATGGAAATAT
AGATAAGAAAAAAACTGTTAAACTAGAAGTACTTTATCGCTATGTAACAGGTCTTGAGTATATATCAATA
GGCTTATTTACAAGAAGATTAGATATTACAATAATAGCAATAATATTAGTAGCTACTATAACAGTAATAT
TATATTACTTAGTTAGAAAGAGATATATAACTATATAA
>ref|NC_013316.1|:c1299795-1299226 hypothetical protein CDR20291_1078 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACTAAGAAATCCAAAGATTAAGAAATTGTTATCAGTAGCATTATTAGCAGCTCTTATAGGTATAC
CTATTGGACAAACAGCCAATGCAATGGAAATTTCAAATAACGTCCCAAGTTATATAGAAAACAATCCAAC
AACAATAGAAGACTTGGAAATCAATGACTCTCAATTACCTAAACCAGGTACAGTTACATACATAGATATT
AATAAGCTAATTAAAAACCTTAAGGAAAATGGTATCGACACTACTCTTATTGAAAATGAATTATATTATA
GAAAAGCTGGAACAAATAAAATAGTTTGGACTAAGACAGGCTTTGATTTATATCTTTCTAAAGGAGTTGC
ATTAACTTTAGCTGGTGCTGGTACAGGGGTTGCAGGGCTTTTGGCTGGTGCCATTCCTGGTATAGGACAG
TATCTTGCAGCTGCTATAGTTGGAGCAATTACAATGCATCTTGGTTCAAATATAACATCTGGAAAAATCT
TTAAATTTAAAAAAATGCGTTATAATAAAGGTGGGGCTTATGTAACCAAATATTACTTACAATCTGTAAG
AAATCAATAG
>ref|NC_013316.1|:1300949-1301458 putative teicoplanin resistance protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATCTAGAAAACATAATATTACAAAAGGATTATTTATAGTTTACATAATTATTTTAACATGGATAA
TACTATTTAAGTTGCAATTTGATATCTCATCTCTTGAAACCATGAATCTTAGAAGCATAAACTTAGTACC
TTTTGCTGGGTCACTTATAATTAATAATAGAGTAGATATATCAGAGATTATATTAAATGTGGCTATATTT
GTACCATTTGGGATATATGTGTGTATGCTAAAAGAAGAATGGAGCTTTATAAAAAAAGTTATACCTATTT
TTATAACTAGTTTAGCATTTGAAACACTTCAGTATATATTTGCACTAGGTGCAAGTGATATAACCGATTT
GATAGGAAACACACTAGGAGGAATCATAGGAATAGCTGTTTTTATGCTATTATCGAAAATATTTAAGAAT
AATACCATAAAAATTATCAATGTATTGGCATTGATTGTGACAATTATTGTTGTATTATTTTTAGGATTAG
TTATTTTTGCAAACTTATAG
>ref|NC_013316.1|:c1301754-1301560 putative phage-related DNA-directed RNA polymerase 7 kDa polypeptide [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCGTAATTGTAATGTGTAGTCGTTGTGGAAAAGAAATAGATAAATATAGAAATAAATATATAACTT
ATTATGAGAAAAATACCAATGCAGAAATTAAAGTTTGTATAAATTGTGCATTAGATTTATTAGAAAAAAC
AAGAGAAAATCAAGAATTGAACATACGAGAGTTTCAAGATACAATAATTCTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1303217-1303591 hypothetical protein CDR20291_1081 [Clostridium difficile R20291]
TTGTTTTTATTATTGAAAATAAGAAAGAGTGGTTTTATATCAATCGAATGTATAATAAGTATTGCTATAT
TATATGTGGCTGTTTATTTAGTTTCTACATCATTGTATAATTGTTATAGTTTTATCAGTAGAAATATATC
TGACAGAGAAATGTTAAGTACAGCAAAAAAATATATAGAAGATGAGAAGTATAGAATACAAAATAGTAAG
TATGAGTTAATTGAAGATAAGATAGAAAAAAATTACATAAATGGATATGAAATTAACAGTAGAATAGAGC
AAATTTTAGATTATTATCAATGCTATGAAATAAATATAGAGATAAAAAATGAATTTAAAAAACTGAGGTT
TAATAGCTATGTTACTAGAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1303575-1304291 hypothetical protein CDR20291_1082 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTACTAGAAAATAAAGGCTCTATATTAATAATAACATTGATAATATTTTCTATTATAAGTACTGTGT
GCATTATGTGTATAGGTTTAATTTATACACATAATAATATGTTTGAGTTAGGATACAAGGACATTCAACT
AAAAGAAATTTCTTTAAGTGGAATAGAAATATCAGTAAGTAATGTACTTTCTTGTGTTGAGGAAGCTATT
GATGTATCTAATAATGAAGACGAATTTAGAGAATATTTCTTAGGAAATAATATGATTGAATGTATAAAAA
AAATAAAAGATACATCTTATAGTAGTTTAGAAGAACTTTCTTTAAAAGTAGAAAATAATACTATTTATGA
CAGAGGAGATTTTTTTGAATTTGATATAGAAAGTAATGTTAGAGAAAAAGAATTTTTAAAAGCAATAAAA
GTAAGAGTGAAAATCAAAAATCCATGGATAGGAATTGACATTGAAGATTATATGGATAAATCTAATAACA
ATAAAATTGATGACAAAACATTCAATAATTATAAAGCATCTGAAAATAATGAAATTCTAAATCAATTTAA
AAATGAAAGTGAAAATATAAGGAATCAAGAGGTTGTTGAATTTACAGAAGAAGATGAAGAATATGAAGAA
GAACTTAAACAAAACATAATTGAAAATATAAAGAAGAATTTTGATGAAAAAAAACTAGTACAGGTATATA
AGTATAGGGGTGTATAA
>ref|NC_013316.1|:1304284-1304730 hypothetical protein CDR20291_1083 [Clostridium difficile R20291]
GTGTATAACTTTGAAAAAAGAAGGAATGTGACTGTAATAGAATTAATAGTATCTATCAGTATAATACTCT
TGATAGTTACATTATCTTTTCCAAAAGATAATCTTGAAAATCATAAAATAAATTTATTTGCACGTCAACT
TTGTTCAGATATAAGGTATGTTAGGCGAATTAATATGTTTAGCAACTACAATACATATATATATTATATA
AATCAAGGTAAACACGAAGGTTATGTATTGAGAAAAGATGGTAAAAACATTAAATCAATAATGCTACCTA
AAAATGCAAAAATAGCTAGAAGTATTGAAATAATAAAGTTTAAATCTGATGGGTCGCCTCAAAAGGCGTC
TACAATAGAGATATATAATAATAGATTAAGAAAAACTATAACAATAACACCTGTAAGTGGAAGAGTACTT
CTGAAAGAGGGAAAATATGAAACATAA
>ref|NC_013316.1|:1304720-1305244 hypothetical protein CDR20291_1084 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACATAAATATGGTTACTTGCTTTTGGAAAGTGTAGTATCATTGTCTTCAATGGTGATAATTATAC
TAGTTTTATATTCTATATTTTTGTCTACAATAAACTTAAAGTTAAAAGTAGAAGATAAGATAGAACTACA
ACAACAAAGTCTTGAAATCATAAAATCTATGGAAGGAATTATTAGCAATTCTATGGGAATAATGAATGTA
TCTAATTATGAAGAAACATTTAAAAAGACAACGTCTATAAAATGTAGATATGTAGATGAAAATAATAATG
AAGAAAGCATAAGTAATAAAGAAATTATATTGAATGAAAGACGAAATAAGTTATTTGTAAATTCTTTAAA
TGGCGAAAGTAGTCAAGCAGGTGGTTATGAAATTGGAGATTATGTAGATGAGATGTATGTATTAATTACT
AATAATGGTCAATATGTTAATATTAAATTGAAATTATCAAAACGTAGTCAAAAATATGAGACTGATTTCA
AAATAAAAGTATGGAATTTTAGTGAAAGTATATAA
>ref|NC_013316.1|:1305541-1306113 elongation factor P [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGAACAAAAAATGGTATCAGCAGGTGATTTTAGAAAAGGTGTTACATTTGAAAAAGATGGACAAC
CATGTTTAGTAGTTGATTTTCAACACGTTAAGCCAGGTAAAGGAGCTGCTTTCGTTAGAACTAAATACAA
AAACTTAAAAACAGGAGCTATAAGAGAAGAAAGTTTCAATCCAAGTGAAAAATTCCCTAAGGCTGTTATA
GATACAAGACAAATGCAATATCTATACAATGATGGTGAGTTATATTATTTTATGGATCAAGAAAATTTTG
AACAAATACCATTAAACTATGAGCAAGTTGAAGATGCAATTAAGTTCTTAAAAGAAAATGAAGTTGCTAC
AATAAGATTTTACCAAGGACAACCATTCCAAGTGGAAGCGCCAAACTTTGCAGAGCTAGAAGTTACAGAT
ACAGAGCCAGGTATAAAAGGTGATACAGCAAGTAATGTAACTAAAGCAGCTACAGTTGAAACTGGAGCAG
TTGTTCAAGTTCCATTATTTATAAATACTGGAGATAAAGTAAAGATAGATACTAGAACAGGTGAATATTT
ATCAAGAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:1306205-1306660 hypothetical protein CDR20291_1086 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACATTTATATGAAGAAGTTGCATACTTAAAAGGCCTAGCAGAAGGACTAGAAATAAGTGCTGAAA
GTAAAGAAGGGAAAATGATACATAAAATAGTTGATGCATTAGAAGTATTTGCAGATGCTATTGTAACATT
GGATGAAGAACAAGAAGAACTTCAAGATTTTGTTGAATCTATAGATGAAGATTTAGCAGATTTAGAAGAA
GATATTGCTGACATGGAAGAAGATCTTTATGAAGAAGATGACGATGAGGATGATGAGGACTTCAGCTATA
TAGAAATGGAATGCCCAAATTGTGGAGAGTTAGTAGAAATAGACGAAGATTTGTTATATGATGATGAAGT
AGATGTTGTTTGTCCTGATTGTAAGGCTGTGATATTATCATCAGAAGATGATTGTGATGATGATTGTACA
TGTGGTGGTTGTCCAAGTTGTGATGATAGAGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1306823-1307533 putative ribonuclease III [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATAAGTAAAAAATTACTAGATAATATACAAAGATTTGAAAATGTTATAAATTATAAATTTAAAA
ATAAAGAATATATACTAGAAGCTCTTACTCATAGTTCATATTCTAATGAAAATAAAAAATATAATTTTAA
CGAAAGGTTGGAATTTTTAGGGGATTCGGTTTTAGGCATAGTGATAAGTGATTATTTATTTAATGAAGAA
GCTAATCTGCCCGAAGGGGAACTAACTAAACTTAGAGCAAATATAGTTTGTGAAGATTCGTTAAGTGAAG
TAGCTAATGATATAAATTTAGGTATTCATATGTTATTAGGTAGAGGAGAAGAAGCAACAGGAGGAAGACA
TAGGACTTCAATATTAGCAGACGCATTTGAAGCTGTAATAGCTGCTATATATCTTGATGGAGGTTTTGAA
AGTGCAAGACAGTTTATACTTCATCATATGGAAAATATAATTTATGATTCAAGAAAAGGAAATATATTTA
GAGACTACAAAACGCATCTTCAAGAAGTGTTACAAGGGAATGGAGAAAATAATATCTGGTACAGGCTTAT
AGAAGAAAAAGGACCAGACCATAATAAAAGATTTGTAATGGAAGTTGGAATTAATGACGATGTATTGGGT
ATAGGAGAAGGAAAGAGTAAAAAAGAAGCTGAACAGTTAGCTGCTAAAATAGCTTTAAAGAAAAAATTAT
GGGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1307587-1308657 radical SAM-superfamily protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGAGAATTATACCTATATTTGTTCCTCACAAAGGATGTCCTCATGATTGCATATTTTGTAATC
AAAAAAAAATAACAGGTGTGAGTACTGATGTTACTAGTGAAGATGCAAGAAATATAATTGAGGAATGTTT
AGAGACTATAGATAAAGATGCAGATGTAGAAATAGCATTTTTTGGTGGTAGCTTTACTGCTATAGATATT
GATATACAAAAAAGTTTATTATCAGTTGCTAAAGAATATGTAGAAAAAGGTCTTGTAAAAGATATTAGAA
TGTCTACAAGACCAGATTGTATTGATGAAGATATATTAAGTATGCTAAAAGAATATAAGACAAGTATAAT
TGAACTAGGAGTACAATCCTTAGATGAAAAAGTATTATTAGATAGTATAAGAGGTCATCAATCTGAAATT
GTATACAAGAGTTCAAAGATGATAAAAAATAGTGGAATCAAACTTGGATTACAGATGATGATTGGTCTTC
CAGCTGACACAGAAGAAAAGTGTATATTTACAGCAAAAAAATTTGTAGAGCTAAAACCAGATTGTGTTAG
AGTCTATCCAACTTTGGTAGTAAAAGATACAGGTCTTGAAAAGTTAATGGAACAAAATAAATATAATCCA
TTTACTCTTGAAGAGAGTGTAAATATAGTAAAAAAAGTTCTTGTACTGTTTTATGTTAATAATATCAATG
TAATAAGAGTTGGGCTTCAAGCTACTGATGATATACAAATTGGAAAAGCTGTTTTAGCAGGACCATATCA
TCCTGCATTTAGAGAGTTGGTAGAAGCAGATATGATAAAAGATTATTTAGAATTTGTTATTTTGCAAAAT
AAAAATATAAAGCAAATGTTGGTCAAATCTAATAAAAAGAATATTTCTAAAATCATAGGAAATAAAAAAA
CAAATGTTAAATATATGGAAGAAAAATTTGGTGTGCTTTTAAAAACACAAGAATCCGATTTAGATATAAA
TCAATTAGAAATTGTGTTAGATGGGAAAAGTTTAATTAGTGCTAATATGAGAGACATTCATAGAAAATTG
TATGACATTTATGACCTTTAG
>ref|NC_013316.1|:1308685-1312239 chromosome partition protein [Clostridium difficile R20291]
TTGTATTTAAAAAGACTAGAGTTAAAGGGATTTAAATCCTTTCCAGTAAAAACAGATATTATTTTTAAAG
AAGGAATAACAGCCATAGTAGGACCAAATGGGAGTGGAAAAAGTAATATATCTGATGCTGTAAGATGGGT
ATTAGGAGAACAGAGTATTAAGAGTCTTAGAGGTGATAAACTCGAAGATGTAATATTTGCAGGTACAGAT
ACAAAAAAACCTATGAATTATTGTGAAGTGGCTCTTACTATTGATAATTCTGAAAATCAATTGGAATTAG
ATTTTACAGAAGTAACTATAAGAAGAAGGGCTTATAGAAATGGTGAAAGTGAATTTTTTCTAAATAATAA
AAGTTGTAGATTAAAAGATATAAAAGAAGTCTTTTTAGATACTGGTATTGGAAAAGATGGTTATTCAATC
ATAGAACAAGGAAAAGTAGATGAAATATTAAGTAATAATCCTTTAAGCAGAAGAAAAGTTTTTGATGAAG
CTTGTGGCATATCAAAATATAGATATAAAAAACAGGAAGCAGAAAGGAATTTAAGTAATACAAAGGAAAA
TTTAGAAAGAATAGATGATGTATATATAGAAATTGAAAATCAATTAAAGCCTCTTTTTAATCAACAGACA
AAGGCAAAAAAGTACTTGGAAATAAGTGAAAAATTAAAGATACTTGAAGTAAATAGCTTTATAAGAGAAA
TTGAAGGAATAGAAAAAGAATTAAGTGAGGTTAATGAACATCGTAAGGTTATTGAAAAGGAGCTCAATGA
AAAAGAAGAACAAAAAAATGTTGTAGAGAAAAAGCAAGAAGATATTAATAAAGAGGTAGAGGTATTACAA
GATGTAATTGAAAAATCTGTAGATTATATAAATTCAATTAAAGGAGTTATATCAAAAAAAGAGTCCCAAA
TAAATTTAATTAAGGAAAGAATAAGAAATTTTACGAATGAAATTAGTAGAAAAAATTTAGAAATAAATGA
TATAAAAGAGAAGCTAAATGAAAATAAGCAATACATAAAAGAATTAGAAAGTAATAAATTATCAGGTAGT
GAAGAACTATCTACCTTGCAGGAAAATATAAAAGTATTGGAGGCAAGTAAAGATAAACAAAAAATTAAGT
TAGAATCCCTAAATAATGAGATAGAATTATTGAAAGAAAGTATAATTGATATATTAAATAAGAAACAAGA
GTTTAGTAATAAGCTGTCCACTTTAAACGCAAATAAAGAAAATATGAATATCAGAGATGAAAATATAAAT
TCAGAGATAACAGAGTTAAACAAAAATATTGAAATAAAATCATCTGAATTAGATACTATAAATAAAGAAT
TTAATATGCAAAATGAAAATTTAAAGAATGTAAATAATAGACATAAAGAATTATCAATTAATTTGCAGGA
TTCAATTAGTGAACACAATAAACTAGAAGATGAAATACAGAAAAGTAAATATAATTTAAATGGATATAAT
TCAAAGTTAAATGTCTATATAGATATGGAAAATCATTATGAAGGATTTAATAGAGGAGTAAAAGAAGTAC
TAAAAAATAAAAATTTAAAAGGAGTTCATGGAGCATTAGGACAAATTATAAATGTACCTGAAAAATATGA
GAAATCTATAGAAGCAGCTCTTGGTGCTTATATGCAAAATATAATAACTGATAATGAGTTTAGTGCTAAG
TCTGCAATAAACTATCTAAAACAGAATAATTTAGGTAGAGTAACATTTCTTCCATTAAATATAATTAAAT
CAAATAAAGTAAGTCTAGGAAATTTAAAAGCAAATACTAAGTTCATAGGAATAGCAAGTGATTTAATTAC
ATTTGATGAAAAGTATAGAAATATAATTGAAAATATACTTGGAAGAACAATACTTATAAATAATATAGAT
GAGGGCATAAAATTTGCAAAAGAAACTGGTCATAGGTTTAAAATAGTAACTTTAGATGGTGAAATCTTAA
ATCCAGGAGGTTCTTTGACTGGGGGAAGTCTAAAAACTAATGGGAATATACTATCGAGAAAAAGATACAT
TAATGAATATACAGAAAAGATAAGTAATATCAAGAATGAAATTTCACATCTAGAATTAAAAAGAGAATCT
TTAGACAAAGATGTGAAAAATATCAAAAATGAAATTGATTCACATGAAAGTAAAATAAAAGATTTAGAAA
AAAGTATAATAATAAAAAGTACAAGTATAAAGAATGTTGAATCTGAAATTGAATCGTTAAAAGGTAGTAT
TACTAAATTAGAAAATGAGAAGAATGATTTAAATTCTAATCTAAATTATACACTTGAAAAAAGCGATGAT
GTTAGAAAAGATATGGAAGAGTTAGATGATTTATACAATAAAAATAAAGAAAAAATTGATGCATTGAATG
AGGAAATAAAAAGATACAATGATTTATATGATAAAGAAAAATCTGAATTTGATGAATTGAACTTAAGTTT
AGTGAAGAAAACAGAAGCTTATAATAGTATAGTTAGAGATATAAAAAGAATATCTGGTGAAAATTGTGAG
CTAGAAGAAAAGAATAAACAATTAGAAGAGTCATTAAATTATGAAGAACATGAAATAATTAAATTACAAG
ATTCTATAGCCACTGAAGAAAAAGAAAAAGAAAATTTAACAAAACAACTAGGGGATAGTAATAGAAATCT
TGAAACTAGAAAAATAGCAAAAGATGATTTAAAAAATAGTTTTGATGAAATTAATAAAGAATTAAAAACT
ATAGATAGACAGCATATAGAGCTTAAAGAAAGTTTATTTAAAGTTGGTGGAAGATTAGAAAGATTAAAAA
CTAGTCAAGACACATATATAAATAAGTTGTTTGAGCAATATGATATGACTTTAGTACAAGCATTGGAAAT
TAAAGATGAAGATTTGGATATAGATAGAAAATTCTTAGAAAGTCTAAAGAGAGAAATAAGAAGTCTTGGA
AATATAAATATAGGCTCTATAAAGGAATATGAGGAAATAAAAGAAAGATACGATTTTTATAGCGAACAAA
AGCAAGATTTAGAAGAGTCTATGGAAGAGATAGAAAAACTTATACACACTTTAGAAGAAAATATGAAATC
TGAATTTGAAATTAAGTTTGAAGAAATAAGTAAAAATTTTAAATATGTATATAAGAGATTATTTGGTGGA
GGTTGTGGAGAATTAACTATTTTAGATAAAGAAAATTTATTAGAAAGTGATATACTAATAACAGCTCAAC
CTCCAGGGAAAAAAATGAAAAATTTAAATCTATTATCTGGTGGAGAGAAAGCTTTAACAGCAATAAGTAT
ATTATTTGCTATATTGATTACAAAGCCAACACCATTTTGTATATTAGATGAGATTGAAGCGCCACTTGAT
GATGCAAATATATTTAGATTTGGAGAATTTTTGAAGGATTTATCTAAAGAGACTCAATTTATATCAGTAA
CTCATAGGAGAGGAACTATGGAAGCTGCTGATTATATCTATGGAGTTACAATGCAAGAAAAAGCCATTTC
AAAAGTTATTAGCTTAAAATTAAAAGAAGCTCAGGAAATAACAGATATTATATAA
>ref|NC_013316.1|:1312266-1313546 putative signal recognition particle [Clostridium difficile R20291]
GTGTTAAAAAAATTATTTGGTTTTGGAAAAGACAAGGAAAAAGAAATAGAAAAAAAAGATGCTGAAGAAG
AAATAGAAGTTGAAGACAGTGTTGATAGTTTAGAAAACTTGGAAGAAACCATTTTTTCAGGACTTGAAGA
AGAAGTGATAGATAAAGTGGAAGATATTGAAGAAAAAACTGAGGAAAGTGTCAATAATGAAGGCACTGAA
GAAATCGAAAATTTTGAAAAAATAGAAGTTGAGATGGATAGTAATGCAAAAGAAGTAGAAAATATTTCAA
ATAATGATTCTCAAGAAGAGATAATCGAAGAATTAGAAAATTATGATGAAATTGAGTCTAAAGAGATAGA
AGATAAAGAAGATAAGAAAGTTAACTTGTTTGAAAGACTAAAACAAGGATTGACAAAAGCAAAGCAAGGA
ATAACTGATAGAATAGATGAAGTTTTAAAATCATATACAAAAATAGATGAAGAATTACTTGAAGATTTAG
AGGAAATTTTAATAACAGCAGATGTTGGTGTAAATACAACTATGGATATAATTGAAAGACTAAGAGATAA
AATAAAGCAAAAAGGTATTACTGAACCAATAAAGGTAAGAGAAGAACTTAAATCTATAGTTGAAGATATT
CTTACAAATGAAAACTCTACACTAGATATAGAACCAGCACCATGTATAATATTAATGGTGGGTGTAAATG
GGGTCGGTAAGACTACTACAATAGGTAAACTAGCAAATAGATACAAAAAAGATGGTAAAAAAGTTTTATT
AGCAGCAGCAGATACATTTAGAGCAGCAGCAACAGAGCAATTAGAAATTTGGGCAAATAGAACCAATGTA
GACATAATAAAACATCAAGAGGGAGCAGACCCTGGAGCTGTAGTATTTGATGCTATAAAAGCTGCAAAAG
CTAGAAAAACAGATGTATTAATATGTGATACAGCAGGAAGATTACACAATAAGGCTAATCTTATGAATGA
ACTTGGAAAAGTATTTAAAATAGTAGATAGAGAATTTCCAGAAGCAAAACGTGAAGTACTTCTTGTGGTG
GATGCTACAACAGGTCAAAATGCAGTTGTTCAAGCAAAGACATTTAAAGAAGTTGCAGATATAACAGGTA
TAGTACTTACAAAACTTGATGGAACTGCAAAAGGTGGAGTAGTCCTTGCAGTAAAATCAGAAGTAGATGT
ACCTGTAAAACTTATTGGAGTTGGAGAAAGTGTAGAAGACCTACAAGATTTCAATGCAAAATCATTTTCA
GATGCATTATTTGGTAACTAA
>ref|NC_013316.1|:1313649-1314017 hypothetical protein CDR20291_1091 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATAGAAAAAATGGTCGAAATTGGATTGTTATTTGAACAGTATAAAGAATTATTAACTGACAAGC
AGAAAGAAATAGTTGCTCTATACTATGAAGAAGATTATTCTTTAGGTGAAATTAGTGAAAATCTGAATGT
ATCAAGACAAGGTGTTTATGATACCTTAAAGCGTTCAGAAAAAATACTAAGAGATTATGAAGAAAAGTTA
CACTTAGTATCAAAGATTCAAGAGCAGGAAAAAAATATTAAGATTATAAAAGATAAAATTATTGACATTA
AAGAAGATTTATTGCACAATAGAGATTGTGCTAATTTAATCCCTAAGCTAGAAAATATAGAAGATGTATG
TAGGGAGATGATAAAATGA
>ref|NC_013316.1|:1314014-1315366 signal recognition particle protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATATTTGAAGGATTGTCTGATAAACTACAAGGGGCATTTAGTAAGTTAAAATCTAAAGGAAAACTTA
CAGAAGTAGATGTAAAAAATGCTATGAGAGAAGTTAAACTTGCTCTTCTTGAGGCAGATGTTAACTTTAA
AGTAGTTAAAGATTTCATAAAAAAAGTTCAAGAGAGATGTGTTGGACAAGAAGTTATGCAAAGCTTAACT
CCAGCTCAGCATGTAATCAAAATTGTAAATGAAGAGCTTACAAGTTTAATGGGAGATGTACAAAGTAAAG
TAATGATTTCCTCAAAGCCTCCTACAATTTTAATGATGGTTGGATTGCAAGGTGCAGGTAAGACTACTAC
AGCAGGAAAACTTGGAGGATATTTTAAAAAGCAAGGTAAAAAACCTCTATTAGTAGCTTGTGATATTTAT
AGACCGGCAGCTATAAAGCAACTTCAAGTTGTTGGAGAAAAATTGGATATACCTGTATTCAATATGGGAG
ATAAAGAAAATCCAGTAAATATTGCGAAAGCAGGTTTAAGCCATGCGATTAAAAATGCTAATGATTTAGT
TATTATAGATACAGCTGGTAGACTTCATATAGATGAAGTACTTATGGCTGAGTTAAAGTCTATTAAATCA
GAAGTTAAGCCACATGAGATACTTTTGGTTGTAGATTCTATGACAGGTCAAGATGCTGTAAATGTTGCAG
AAAGCTTCAATGAGGCACTTGGTGTTGATGGAGTAGTATTAACTAAATTGGATGGAGATACTAGAGGTGG
TGCTGCACTTTCAATAAGAGCAGTTACACAAAAGCCTATAAAATTTATGGGGATGGGAGAAAAGCTAGAT
GATATAGAACCTTTCCACCCAGATAGAATGGCATCAAGAATATTAGGTATGGGAGATGTCTTAAGTTTAA
TAGAAAAAGCACAAGAAAATATAGACTTAGAGAAAGCTAAAGAATTAGAGCAAAAAATTAAAAAACAAGA
GCTTGATTTTGAAGATTTCTTACAACAAATGGAACAAATACAAAATATGGGACCTCTTGACAAGATACTT
GGTATGATACCTGGTATGGGAAATGTAAAAGACCAACTTGGAGATGTAGATTTGAATGGCAAAGAAATGA
AGAGAACAAAAGCCATAATTCAGTCAATGACTACATATGAGAGAAGAAACCCAGGAGTATTAAATGCTTC
AAGAAAGAAAAGAATAGCTAAGGGCAGTGGAACTAGTGTACAAGATGTAAATAGACTTATAAAACAACTT
AATGAAATGAAAAAAATGATGAAGATGTTTGCTGGTTCACAAAAGAGTATGAAGAAAAGGGGCGGCTTAG
GCGGTTTACCTTTTTTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1315404-1315676 30S ribosomal protein S16 [Clostridium difficile R20291]
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ATTCAAGAGCTCCAAGAGATGGAAAATTTATAGAAGAAATAGGATACTATAATCCAATTTCTGAACCTAA
ACAAGTAAGAATAAATGATGAAAAAGCTATAAAATGGTTAGCTACTGGTGCTCAGCCAACAGAAGTAGTT
AAAAAATTACTTGTAAAAAACGGAGTAATAGAAAAATTCGAAGCTTCTAAACAAGCAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1315741-1315968 hypothetical protein CDR20291_1094 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAGCTAGTTGTAGATATAGCTAAGGCTCTAGTTGATAATCCTGACTCAGTTGTTGTTGAGGAAT
TTGAAGATAATGATGGTATCGTCTTAAAGCTTACAGTTGCTCAAGAGGATATGGGTAAGGTTATTGGGAA
GCAGGGAAGAATAGCTAAAGCTATAAGAACTGTCGTAAGATCTGTTGCAAATAGAGAAAATATAAAAGTT
TCTCTTGAGATAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:1316076-1316591 putative 16S rRNA processing protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAAAAATTAACTCATTTTAAGGTAGGTCAAATAGTAAATACACAAGGTTTAAAAGGTGAAGTAA
GAGTTTATCCACTTACTGATGATATAGAGAGGTTTGATGAATTAAAAGATTTCTATCTGGGAAAAGATTT
AAATAATAAATTGGCTGTTGAAAAAGTAAGATACAAAGGTTCTATGGTTATAATGAAGATAAAAGGCATA
GACAGCATAGAGAAAGCAGAAAAACTAAAAAATAAATTTATGTATGTATCTAGAGAAGATAGCAGAGAGC
TTGAAGAAGGCGAATTTTTTATAGCAGATATGATTGGAATGGAAGTTTTAACTGTAGATGGAAAATATGT
AGGAATACTAGAAGATGTTCTTCAATACTCAGCAAATGATGTTTATGTAGTAAAAGGTGAAGAAGATAAA
GAATTTATGATACCAGCTATAAAAAAATTTGTACCTACAATAGATATTGATGAAAGAAAAATGATTATAG
ACCCTATTAAGGGAATGATAGATTAG
>ref|NC_013316.1|:1316600-1317295 tRNA (Guanine-n(1)-)-methyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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GAGCAGTTGAAAAAGGTATAATTGAGGTTTATATATATAATATAAGGGATTTTTCTAATAATAAACATAA
AAAAGTAGATGATTATCCATTTGGAGGAGGAGTGGGGATGGTAATGACTCCTCAACCTATATATGACACA
TATAAGCATATAATAACAACTCACAATATAAGTAATCCAAGTGTAATTTATCTTACTCCAAAAGGTAAGG
TATACAATCAATCTATAGCAAAGCAGATGTCTTTAAAAGAAGATATAATACTATTATGTGGCCATTATGA
AGGAGTAGATGAGAGAATCATTGATTTAATAGTTACTGATGAAATTTCAATTGGAGATTATGTATTAACT
GGGGGAGAGCTCCCAGCACTTATAATGATAGATTCTATATCAAGATTAATACCAGGTGTATTAAACCAAG
AAGAATCATTTGAAGAAGAATCATTTAAAGATAACTTATTGGAATATCCTCATTACACTAGACCTAGAGA
TTTTGAAGGATTAAAAGTACCAGAAGTGCTTTTATCAGGGAATCATAAAAAGATAGATGAGTGGAGAAGA
GAAGAATCTATAAGGATAACCAAAGAAAGACGATTTGATTTATATAAAAAGTCTAATGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1317480-1317830 50S ribosomal protein L19 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGAAATGCTAAGAGCAATTGAGCAAGAACAATTAAAAAATGAAGTTCCTAATTTTGGACCTGGGG
ACACAGTTAAAGTACACGTTAGAATTATAGAAGGAAAAAGAGAAAGAATACAAGTATTCGAAGGTGTAGT
ATTAAAGAGACAAGGTGGAGGAGCAAGAGAAACTTTCACAGTTAGAAAAATGTCTTTCAATGTTGGTGTA
GAAAGAACTTTCCCAGTTCACTCTCCAAAAATAGAAAAAATAGAAGTTACTAGAAAAGGTAAAGTAAGAA
GAGCTAAACTAAACTACTTAAGAGGTAGAGTAGGTAAAGCTGCTAAGATAAAAGAAGCTAGAAATAAATA
A
>ref|NC_013316.1|:1318142-1319047 putative GTPase [Clostridium difficile R20291]
GTGATACATGTGTCAAATGAATACGAAGAGTATCTTATGGATGACAATCTACATATAAACTGGTATCCAG
GTCATATGAAAAAAACTAAGGAGTTAGTAAAAAATAACTTAAAATTGATTGATGTAGTAATTGAACTTTT
GGATGCTAGAATCCCGTTTAGTAGTAAAAATCCAGACATAGACAGGCTTGTAGGAGATAAGCCAAGAGTT
GTCGTACTTAATAAGAGTGATATGGCAGATAGGGATAAATTGAATCAATGGATTGAATACTATAAGAAAA
TTAATATCAAAGCTATACCAGTAGATACAATAAAAGGTGTTGGTATAAATAATATAATCGAAGAATGTAA
AAATGTAACTAGAGAAAAAATGAGTTCTTTAAAAGACAAAGGGAGAAAAGAAAGAGCTATACGAATAATG
ATAGTTGGAGTTCCAAACGTTGGTAAATCGTCTCTTATAAACAAATTAACAGGTAGAAAAAGCACTCAAA
CTGGAGATAAGCCAGGAGTAACGAAAGGGAAACAATGGGTTAGATTAAAGGGAAATCTTGAACTTTTAGA
TACACCTGGAATACTTTGGCCTAAGTTTGAAGACCAAGAAGTTGCATTAAATTTAGCATTTAGTAGAGCT
ATAAAGGATGAGATTTTAGATACTGAGACTTTGGCTTTAAGACTTATAGAAAAACTTATGAAAATAGAAC
CTGAGAAGTTGAAAGCCAGATATAAGTTAGATTGTCTAGGAGAAACTCCAATTGAAACTATGGATATGAT
TGGCCATAAAAGAGGGTTTATAACAGGTAAAAAAGAACTAGATTATACACGCATAGCCGCAACTGTATTA
AATGAATTTAGAGATGGAAAAATAGGAAATATAACATTGGAAGTTCCAGAAAACGTTAAAAGATAG
>ref|NC_013316.1|:1319436-1320728 branched-chain amino acid transport system carrier protein [Clostridium difficile R20291]
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TAATATTTCCACCTTACTTGGGAATAATTACAGGTCCAGAATGGTTAATTGCCTTCTTAGGATTTACGTT
TGCTGATGCTGGATTGGCACTTCTAGCAGTAATGGCTACAGCTAAATTCGATGGAAACGTAGTTGAAATG
TTTAAAAGATGTGGTATGAAGTTAGGGATTCTTATAGGTTGTGCAGACATTTTATGTATAGGTCCATTCT
TAGCTATACCAAGAACAGGTGCAACAACTTATGAAATGGGTATAATGCCTTTATTTGGAACTTCAATTCC
AGTGTTATTATTCTGTATACTTTTTTTTGCGCTTTCATATGTACTAACAATAAGACCTTCTAAGGTCGTA
GATATAGTTGGACAGTTTTTAACTCCAGCTCTTTTAATAGCTCTAGCATTTATAATTATAAAAGGTATTA
TATCACCTCTTGGAGATATAGTAGATAAACCTATGATACCTAATGTATTTGCAGAAGGTATAGGTCAAGG
ATATCAGACAATGGATGCTTTTGCAGCAATAGCACTTGCATCAGTGTTAATAGTATCTTTAAATGATAAA
GGATATTCTACTATTAGTGACAAGTTAAAAATGATTGGTAAGGCGGGGGTTCTTGCTTGTGGAGGATTAG
CTCTAGTTTATGGAGGATTATGTTTCCTTGGAGCAACTGTATCAACAATGTATGGAACAGATGCAGTACA
ATCACAAGTAATAGTAAATATAACTGAAGGATTACTTGGAAATGTTGGGAAAGCGATTTTAGCAGTAGTA
GTATCATTAGCATGTTTAACTACATCTATAGGTCTTACATCTGCCACAGGTCAATATTTCTCTAGACTTA
CAAAAGGTAAATTGAGTTATGAAAAAATAGTATTAGCTGTATCTGTATTCAGTGCAGTAGTAGCATCTTT
TGGTGTTGGAACTATAATAAAGATAGCATCTCCTATACTAAGTATAGTTTATCCACCATCAATTGTTTTA
ATAATTTTAGCTTTCTTCAATGAAAAAATTAAGAATGATAATGTGTACAAAGGAGCAGTATATATGTCAT
TGCTTGTAAGTATACTAACAGTTATATCTAGTTATGGAGTAGATGTTCCAGTAGTAAAATCTTTACCTCT
TCATTCATTAGGATTTAACTGGGTGGTACCAGTTATAATAGCTGGAATAATTGGTAATTTTATACCATCA
AAGAGTCAATCTAATACACTTGGAACAAACTAA
>ref|NC_013316.1|:1321846-1323138 branched chain amino acid transport system carrier protein [Clostridium difficile R20291]
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GTGCAGGGAACTTAATCTTCCCTCCATATCTAGGAGTTTTATCTGGAAGTAGTTGGCTAATAGCTTTCAT
AGGATTCCTTTTTGCAGATGGTGGTTTGGCATTATTAGCAGTTATAGCAGCAACTAAGTTCAATGGAGAC
ACATCGAAGATGTTCTCAAGAGCAGGCAAAGGATTAAGTATTGCATTAGGATGTGCAATGGTAATCTGTA
TAGGGCCACTTTTAGCAATACCTAGAACAGCAGCAACAACTTATGAAATGGGTATATTGCCTACAATAGG
TTCTGGAATAAGTCCAGTAATATTCTCTATAGTATTCTTTGCTCTAGTATTGGTTTTAACAATAAGACCA
TCAAAAGTTGTAGATATAGTTGGGTCAATATTAACTCCAGCTTTACTTATAGCTTTAGCAGTATTAATAG
TTAAAGGTATCGTATCTCCATTAGGAGAAATAAGAGACAGTTCTTTAATTCAAAATGTATTTGCAGAAGG
TATAACTCAAGGTTATCAAACAATGGATGCATTGGCAGCTAGTGTATTTGCATCAATTATAATCATGTCA
GTAATAGCTAAAGGTTATACAGGTGAGAAAGAAAAGATGAAAGCCACAATAAGTGCAGGTGTAATTGCAG
TAATAGGAATGGCATTAGTTTATGGTGGATTATGTTATCTTGGAGCAACTGTGTCTCAACAATATGGACA
AGATGTTCAACAAACAGCTTTAATAGTTGCAATAACAGCAGCTTTACTTGGAACTACAGGTAAAATTTTA
TTGGCTATTATAGTTGCATTAGCATGTTTAACAACAGCTATAGGTCTTTCTTCAGCAGCTGGTCAATATT
TCTCAACACTTACAGATGGAAAATTAAAGTATGAGCATATAGTTATAGTAGTTTGTGTATTTAGTGCAAT
CATATCAAACTTTGGAGTAAGTACAATAATAAAATTCTCTTCTCCTATACTAAGTATGGTATATCCAGCA
ACTATAACTCTAGTTATACTAGCATTATTTAGTAATAAAATTAAAAATGACAACGTGTTCAAATGTGCTG
CATACATGGCATTATTAGTAAGTGTATTAACAGTTGCAACAAGTTTTGGTGTAAAAATTCCTCTAGTTAA
TAGCTTACCATTTGCTTCATTAGGATTTAACTGGATAGTTCCAGTTGTAATAGCAGGAATAATAGGAAAC
TTTATTCCATCTAAAAGCAGTAAAACTGCATAA
>ref|NC_013316.1|:1323703-1325892 putative ribonucleotide-diphosphate reductase [Clostridium difficile R20291]
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ATAAAGCTAGTATAAATAGTGAAGGTGGAGTAGATAGAGAGTTGGCATATGATATATCAAGAAAAATAGC
TAATGACTATAATTCTATGGAAAAATGCTTATCCGTAGAAGAAATACAAGATATAGTTGAAGTACTACTT
ATGGAATCAAATAGAAAAGATATAGCAAAACACTACATATTATATAGAGAAAGACGCTCTGAAATAAGGA
CTAAAGCTTGGGAGTTTGATGAATTACAAAAATCAATATGGAAGAACAAGTATAGACATAATGGTGAGAG
TTTTGATGAATGGATAAAGAGAATTTCAAATAATAGTTCAAGAATATCAAAACTAATAAGACAAAAAAGA
TTTCTATTTGCTGGAAGAATTTTAGCAAATAGAGGATTACAGAAAGAAGGAAAAAAAGTAACATATTCTA
ATTGTTATGTAATAGAACCACCAAAAGATAGCATAGAAGATATATTTGATACTGCAAAAAAACTTGCTAG
AACTTTTAGTTATGGTGGAGGAGTTGGAATTGATATTTCAAAGCTAAGACCAAAAGGAGCGAAAGTTAAC
AATGCTGCAAAACATACGACTGGAGCAGTCTCTTTTATGGAACTTTACAGTATGACAACTGGCTTAATTG
GTCAAAGAGGGAGAAGAGGAGCTCTTATGATTTCTATGGATGTAAATCATCCGGAGATAGAAGAGTTTAT
AGATATAAAAACAGATTTGGAGAAGGTTACTAAAGCAAATATTTCCATAAGGGTAACAGATGAATTTATG
CAAGCTGTAAGGGAAAAAAAGTTATATAATTGTACTTTTGAAGTTGAAACTACTGGAGAAAAAATAGTTA
AGATAGTAAATGCTTATGATTTATTTAATAAATTTGTGAAAAATAACTGGGATTATGCAGAACCAGGTAT
ATTGTTTTGGGATAAAATAAAAACATATAATTTTATGAGTGAAGATAAGAACTTTTGCTTTTCAGGAGTA
AATCCTTGTGCAGAAGAACCACTTCCAAGTGGAGGAAGTTGTCTACTTGGCTCAATAAACTTGTCAGAGT
TTATAATACAACCATTTGGTGAACATGCTACTTTTGATATTAATAAATTAAAATCTTGCGTTAGAGAAGC
TGTAGTAGCTTTAAATGATGTCTTAGATGAGGGGTTGAACTTGCATCCATTACAAGAACAAAGAGATAGT
GTACATAAGTATAGACAGATAGGTTTAGGTGTAATGGGTATAGCTGATATGCTTATAAAAATGGGAATAA
GATATGGTTCTGATGAATCTTTAGAACTATGTGATTTAATTGGTAAGACTATGTTAAATGAAGCTGTGAA
GCAATCAGCATTAATTGCTAAAGAATATGGAACATTTAGTGAGTATAAATATGAAAATATTTCTAAATCT
AAGTTTTTTATAGAAAATCTAAATGAAGACACTAAAGAAATGGTTAAAAAGTATGGGCTTAGAAATTCAC
AACTTTTAACCATACCTCCTACAGGTTCTATATCTACAATGATAGGTATCAGTGGTGGAATAGAACCTAT
ATTTAATCTTTCATATATAAGAAAAACTGAAAGCTTGCATGATGAGGATGTGTATTATAAAGTATATACT
CCAATTGTTAAAGAGTATATGGACAAGAAAGGTATTACAGATGAAGAATGTTTACCAGATTTTTTTGTTA
CTGCTATGAATATAGGATATGAAGAAAGAATAAACATGCAAAAAGTATGGCAAAAGTATATTGATGCTTC
TATATCATCTACAATAAATATACCTTTTGAAACTACAGTTGAAGATGTTTTCAATATATATATTAAGGCA
TGGGAGGCTGGTCTTAAAGGAGTAACAATATTTAGAGATGGATGTAAAAGGAGTGGAATTTTAATAAATG
AAAAAAAGGAAGAAAATAATAAAGAAGATAAAAAAGAAAATAGTAAAAAAGAATATTATAAAAATAATAA
AAAAGAAAAAGATAATAAAGATGAAAAAGCCAAAGAAATAATAAATAAAAATTTTGAAGAAGATGAAAAA
TTTGTGTGCCCTGAATGTGGAAGTGAAGGAATTGCACATACAGGTGGATGTAGTATATGTTTAAAATGTG
GCTATAGTGGATGCAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1325960-1326727 ribonuclease HII [Clostridium difficile R20291]
ATGCAGGATAAAAGTGTGAGGGAGATTAAAGAAATAATAGAGACTTTAGAAGTAGAAAAATATATGGAAT
ATATAGAACTGTTAAGAGTTGATGAAAGAAAATCTGTACAAGGTCTAGCTATAAAACTAGCAAAAAAGCT
GGATAATATTAGAAAAGAAGAAGAAAGATTGGAAACTATAAATATATTTGAGAACGAAGGCTATGATAAA
GGTTATTTGTATATTGGAGGAATTGATGAGGCGGGAAGAGGGCCACTTGCTGGACCTGTTGTAGCTTCTG
TTGTAGTATTTAAAAAAGATACAAAAATAGAAGGTGTAAATGACTCTAAGAAACTGAGTGAGGCAAAAAG
AGATGAACTTTTTGAAGTAATAAAAGAAGAAGCACTAGATTATGGAATAGGTATAGTAAATAATGAAGAA
ATAGATGAATTTAATATATTAAATGCTACATATATGGCAATGAAAAAGGCTATAAATTGTTTAAAAAAAG
CACCGGATTATTTATTAGTTGATGCAGCAACAATACCAGGTATTGACATATCTCAAAATCCAATTGTGAA
AGGAGATTCAAAATCTATATCAATAGCAGCAGCAAGTATACTTGCTAAAGTTACTAGGGATAGTATAATG
TACCAATATGATAGAGTATACCCAGAATATGGGTTTAAATCTCACAAAGGATATGGAACTAAAGAACACT
ATGAAGCTATTGAAAAATATGGCATAACTCCTATCCACAGAAAAAGTTTTTTGAAAAATATACTGTAA
>ref|NC_013316.1|:1326785-1327801 putative FMN-dependent dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATATAATGAATTATTAAAAAGTGCTAGAGAAAATTTAAATGGAAGTTGTAAAGTTTGTAAGGTTT
GTAATGGGGTTGCTTGTGCAGGTGAAGTGCCTGGCATGGGAGGTAAAGGAAGTGGTTCTTCTTTTATAGA
AAATAGCAAGAGTTTAGAAAAAGTAAAAGTAAATATGAGAGTAATACATGATGTATCAAATCCTGATACA
TCTATAGAGATGTTTGGAAAGAAAATGAGTGCACCTATATTTGCAGCTCCAGTAACAGGAACTACTTTAA
ATATGGGTGGAAAAATTAATGAAAGAGATTACATAGAACCAGTAGTTGCAGGATGTGCTAATAGTGGTAT
TTATGCAATGGTTGGTGATACGGCAGTAGATGCTTTTTTAATGGAAAATTTAGATGTAGTCAAAAAGTAT
AATGGAGCTGGAATTGTATTTATTAAACCTTGGGATAATGAAAATATTATAAAAAAGATAAGATTAGCTG
AAGAAGCTGGTGCATTTGCAGTTGGAGTTGATATAGATGCCTGTGGTCTAGTAACTTTATCATTACATGG
AAAACCAGTACTTCCTAAAAATGTTAAACAAATAAAGGAGTTAGTAAAGTCTACTAAACTACCATTTATA
TTGAAAGGTATAATGACTGTTGAAGATGCTTTAATGGCAGTAGAAGCAGGTGTGTATGCAATAGTTGTAT
CAAATCATGGAGGAAGAGTGCTTGACTGTACACCAGGAGCATGTGAAGTTTTACCAAAAATTGCTGATGC
TGTTAAAGGTAAAGTTACAATACTTGCAGATGGTGGAGTGAGAACTGGTTTAGACGTACTAAAAATGATA
GGTTTAGGTGCAGATGCAGTATTAATAGGAAGACCTTTTGTGACTGCTTCATTTGGTGGTGCAACTGATG
GTGTAGAAACTTATGTAAATAAACTTCAATCAGAGCTAAGTAGTTCTATGATATTAACTGGATGTCAAAC
TATAAAAGATATTGATGGAAAAGTTATATACAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1327867-1328115 hypothetical protein CDR20291_1104 [Clostridium difficile R20291]
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GTTTTACTGGAAGAGAAAAAAGAACTTGAGGAAGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c1328789-1328292 putative regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAAAATCGGTGAAAGTGTAATGTATCCAAAAGAAGGAGCCTGTTATATAAGTGGTCTTGTAACAA
AGGATATAAATCATCATATACAGAAATACTATGAATTGACTGTTATTTACAATAGTAATCTTAAAATTTC
GATTCCAGTTTTAAATGCTGATAAGATTGGTGTACGTCCAATTATGGATGAAAATGAAGTTGAAAACTTT
ATCCAATCCCTTGATAAGGTTGATTGTTTATGGGTTTTTGATAGAAAAAAACGACTTAAACTATACCATG
ATAAATTTCATTCAGGAGATGTTTTTGAGATTGTAAAATTAATTAAGATGCTTATGATACAAGATAATTC
AAAACAACTATGTAGCACAGATAAGGACTTTCTAAATAAGGCTCAAAGGTTTGCTTTGTCAGAATTGGCT
GCAGCACAATGCAAATCCTACACAATTGTATTAGAAGAAATGAAAAACCATATACTAAATTCAAAAAATA
ACAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c1330094-1329030 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATTAGGTTGACTATTGCAAACATAAAAAGATATATAAAAAATCATGCTCTTTTAGTTAATATGGTTT
TGTTTCCTGTTATATTAATGTTTTATCTTAACTTTTTTACTGGCAACTCAGAAAATCAATCAATGTACTT
TTCTCCAGTAGCGATTGTATCCAATTCTTCTGGAAAATACGAACATAAGTTAATAGATAGTTCTAAATTA
AAAGAAAACTCATTTGGATTAAACGAACAAGACAAGGCTATGGATCTATTAAAAAATAATAAAGTTTCTG
CTGTCTTCATTTTAGATAAAAACTTTTCAAGCAATATAGATAACTTAAAACGACCTGAGGTTAAATGTTT
TAAAACTGAAAATGGTGGAGGTAGTCTTTGGGCAGAATCACAAATAGAATCTTTTATTACTAATTCATTA
AAATTAAAAATAGATAGAAATATAGATGATAAATTGACCAAGACAAATATAATTGATAACAGTTCAGGTA
AGAATAAAAATTCATTTTTAATAGTTTTCTTGATATGTTATTTCATGTACATTAATGCAGCACATCTAGC
TTCTGATTTATTTTCATTAAAGAAATCTAATACCTTAAAAAGACTTGTTTCTACAAAGCATAATGATATA
AAAATAATTTTCAGCATATTTTTAGGGTTATTTTTTACTCAAGCAATTGTATACACCTTAACTTTAGTAT
GTTTCACATCTATAAGTAATTTTAAATTGACTCTAAATACATTGATGATTGTACTAGCAAATAGTTTTGT
TGCTACTGGATTTGTATTTTGGATAGCTAGGGTGTTTAAAAACGAAGGTTCTATAAGTCTTATGTCTACG
TTTTATTCTTTAATAGGTTTAGCTATATCCATATCTAATATGATACCATCACTTGATAAATTATCCTTTA
TGGCTAATCTTTCAAAGCTTACACCATTTTATTGGACTATAGATGCTATTAATAATAATGGTAATATATT
AATAAATATAATTGTTTTAATTCTTATTGGAATGGTATTTGTAACAGCCGGAAGTCTTAACTTAAGAGAT
TTTGCTAGAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c1331194-1330097 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTGTACATTAGTGTAAAAACTATGCTAAAAGTTTTAAAAAGCTCCTTTATGCTTAATTTAATAT
ATTTCTTAGCCTTACCTCTAGTTTTAGCTGGATTTCTTGGGATGGTGACAGAAAGTATATTTCAAAATCC
TATAAAAACAGATTTGACATCAATTGTTATATATGATAAAGATAATACAAAGCTATCAAGTAATTTGACA
GGATATCTAAAAAACGATTTATCTTCTATATTAACAGTTCAAAAAGATGATTCTAAGGCAGACTTAAAAC
TTACTATACCTAAAGGATATGAGAATAATTTATTAAATGAAAAATCAAATAATCTAAGTATAGAAAAACT
TAAATCTAATGATAATATTGCAATATTACTTCAAGATATATTAGATACTTATCATGAAAAATTATATCTG
AATAATTCTCAAAAATTAAGTTCAGAAGATTTCTCAAAATTATTTAATAAGAATTCTATTGATACCTCTA
TAATAAAAAATAATGTTAAACAAAACTCTTATGAGTACTTTGCTTTAGTTTCCCTTGGATTCTTCGCAAT
AATTTTTATAATGAATAGCATTTTATCAAATTATGTAAGTGAATCAAAAGGACTTTCAAAAAGACTCTAC
TCTATACCTGTAACTAGAGTACAATTTTTAATTTATGATTTTATAGGTTTCTGGATTTACTCATTTATAT
TTTTATCATTATACGTTTTATTTTTTAGAACACTCGGTGTAACATTCAAAGGTAACTTTGTTATATTAGC
TTTACTTTGTGCTTTAGCTTCTTATTTTATGACTTCAATATCTACTTTTATAACTACCTTTTTTAGCAAG
AAATATGGTACAGTTATAGTTTATGCATTACTCTTCTTGCAAACAGTTTTTGGAGGTATTTTCAGCATAG
TAAATGATGTGTTTACTAAGTTTACAAGTTTATCTCCTACTTATTTAATAGGAACATTGTTCAGTAATTA
TGAGACGTTTAAAACTATAGATTCAATAGAAAGTTTAATTTTTACATGCCTAATTGCATCTACAGTATTG
ATTGCACTTTCTATTGTAAAAGAAAAATATAAATGGAGGGAGGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1332143-1331208 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGATATAGTAAGAGTAAATAATATAACAAAAAGATTTAATGATAAATTAGCACTTGATAATATCAGCT
TTTCTGTTAAAGAAGGAGAGATATTTGGACTTATTGGACCGAATGGTGCTGGTAAATCTACACTTATAAA
TATAATTACAAATCTTATGTTACCAAATAGTGGCGACATCCAAATCAATGGTTTAGATTTGTCAAAAGAT
TGTATAAAAGCAAAGTCTATAATAGGATTAGTTCCACAAGAATTAGCACTTATAGAGACTCTTACTCCTT
TTGATAACTTAGAGTACTTTGGCACTTACTATGGACTAAAGGGAAAATTGCTTCAAGAGAGAATAACTGA
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AGGAGATTGAACATTGGAATAGCACTTTTAAATCATCCTAAAATATTAATATTGGATGAACCAACTGTAG
GTGTTGACCCGCAATCAAGAAACCATATTTTCAATTTTATAAAAAATATATCTAAAAAGCAAAAAACCAC
AGTAATATATACTTCTCATTATATGGAAGAAGTTGAGCATCTTTGTTCTAAGATTTTTATTATGGATGAA
GGTAAAGAGATTGCTTTTGGAGATAATGATTATTTAAAATCATTAGTATCTACAAATACAAAATTAATTA
TGGAAATAAAAAATATAAATGCTCAACTTATATTTGATTTAAAAAATACTAAAGGTGTTGTATCTATTTT
AGAAAATAATTCATTATTAGAATTAGGTGTAGACAAAAAATTACAACTTACAGATGTATTATCTGTTGTT
GACAAAAATAATTCAAAAATAACACGAATATCTTATGAAGAACCTAGTTTAGAAGACGTATTTTTAAATC
TAACAGGTAAAAATTTAAGGGACTAA
>ref|NC_013316.1|:c1332984-1332331 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
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TTATTTTATCATCTTATGACGATTTAGAAATTGTAGGAGATGCTTCCAATGGATATGAAGCATTAGAATT
TTGTAAAACAAATGATGTAGACATAGTTCTTATGGATATTCGGATGAAAGTTTGTGATGGAGTTCTAGGC
ACAAGACTTATAAAAGAATATGATAGCTCTATAGCATTATTAATTTTGACAACCTTTAATGATGATGAGT
ACATAGAAGATGCTATGAAATTTGGGGCTTCAGGATATCTTTTAAAGGATAGTTCGGATGAAGTATTACA
TGAAGGGATTCGTTCCTCGTTTTTTGGAAATATTGTACTTGATAAAAGTGTGGCTGAAAAAATTATGTAC
CCTCAAAAAACTATAGAACAAAAACATATTTCTGATATGTATAATTTAACAGAAAAAGAAATATCCATAA
TTAGATTAATCGCAAATGGACTTAACAACAAAGAAATCAGCCAAGAATTATTCTTATCTGAAGGTACAAT
AAAGAATAATATCACCAATATCTTAGGGAAACTAGAGCTTCGTGATAGGACACAACTAGTTATATTTGCC
TTCAAAAATAAAATTGTAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c1334176-1332968 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGCTAGTTTTTATAATGAAAGTTTATTTTTATGGAGGAATGTCTTTAATGAACAGAAAAAAAACATTTA
TTTTTATACGATATTTATCTCTATTTATATTACTTATAAGTTATTTAAACCATACTGAAAATACATTGTA
TCCAGCTATAACAATGATTATATTATTTCTAATAATAAATAATCAAGTTAGATTTTTTTCTTTATCAAGT
GAGAATAAATTTATACTTATTTCTTATTTTTTAGAGCTTATTCTAATTTTTATATTTTGTAAGTATATAA
AGACTTTTAATCCACTTTACTATGTTTCTTTAATTTTGGATGCCTCATTTTTAATAAAGGAAAAATATAA
ATATATATTATTCTCTTTAGTTATAATATTTTCTTTTATTATTGGTTTAGATAAAAATTTATATTTAGCA
CTAGAATCAAGTTCTACATTACTAATTATAACCCTCTTTTCTGTGTATCTAGAAAACGAGAATTTATCTA
AATTATACAATCAAAGTCTTTATGACAAACTCAGGGTTTCTAAAGATGAATTAAAAAAAGCTAATGCCGA
TTTAGAGATTTATGCAAATTCTATAGAAGAGTTAGCAATTTTGAAAGAAAGAAACCGTATATCGAGGGAA
ATACACGATAGTGTGGGACATTCTCTTTCTACGACGATAATCCAATTAAATGCTATAGAAAAACTCTTAA
AAGACAAACCTCTCATTTCTGATTTAGTTCATGAACTTAGAGAGTTTGTAACTGAAAGTTTTCAAGATGT
GAGAAGAGCTATATCTGAACTAAAACCCATTGAATATGAAAATTACCAAAATTTACTTAAAATCAGAGAA
CTGGTTAATAGCTTTATTAAACTTACAAATATCAACGTTAGATTAACTATATCAAAAAATACCTGGAACC
TATCTACAAATCAATCTATCGCTTTATATAGACTTGTTCAGGAATCTCTTTCCAACGCATCAAGACATGG
AAAAGCAACTGAAATCAGAATTTTTATAACATTTAATCCTTCAAATCTTATAATTACTATCAGCGATAAT
GGTATAGGGTGTAACAATATAAAAAGAGGAAATGGACTTAGCAGTATTAGCGAAAGAATATATGAATTAA
ATGGTAAAGTTGAATTCGATAATTCTAATACTGGATTCACAATTAGAGCGTCTTTTCCTAAATTTTCAGG
AGGTGATTTTTTTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1334313-1334657 hypothetical protein CDR20291_1111 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATAAAGAAAAAGGTGATTTTGGAGAAGAAATAGCAGTTAATTATCTGCTATCAAAAGGTGCAA
AGATACTAGAAAAAAATTATAGATTAAGGATAGGGGAGGTAGATATAATAGCAAATATAGGAGATGAAGT
TGTATTTGTGGAGGTGAAATCAAGGTCTAACATAAAGTATGGCTACCCTTGTGAATCTGTAGATTTTAAA
AAAAGAAAAAAGATAATTGGTGTCGCAAAATACTATATTATAAAAAATAACTTAAATAATACTCCCATAA
GATTTGACATCATAGAGGTCTATTTGTTAGAAAAAAGAATAAATCACATAATGAATGCTTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1334688-1336289 putative competence protein (putative magnesium chelatase) [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAGTATTATTAATTCAAGCAACTTAGTAGGAATCGACAGCTTTTTAGTTAAGGTTGAAGTAGATG
TAAGCAATGGAATACCTAGTTTTAATATTGTTGGTCTTCCAGGCAAAGAAATTAAAGAAGCAAGAGAAAG
AGTAAAGTCAGCAATTCTTAATAGTGGATATAAATTTCCAAGCACGAGAATAGTTGTAAATTTATCACCA
GCAGATATAAAAAAAGAAGGAGCTTTTTTAGATTTATCTATAAGTATAGGCCTTTTAAGAGAGTTAATAA
AAAAAGATGAAAATTACATAAGAGAAAGTATGTTTATAGGAGAATTATCATTAGATGGAAAAATAAGAAA
AGTAAGAGGGATATTGCCCATAATTATGGGTGCAAAAACTCAGAACATAAAACGTATTTTTATACCAATT
GAGAACATAAAAGAAAGTCTATTAGTAGATGAAATTGATATAATTCCTATTAAAAGTTTAAAAGAATGTG
TCGATTTTTTAAACGAAGAGATAAAAGTCGATAAAGTAAGTATAATGTCTTTTTTGGATGATAAGTCAAG
AAAAGAGAACGGAGAATTAGAAAAAGATAATAGTTATATAGATTGCAAATATACTAAGATTAATAATGAA
GAAAGTAAATATGATGAAGACTTTAAAGATGTAAAAGGAAATTATTTTGTAAAGAGGAGTGCAGAAATTG
CAGCAGCTGGAAATCATAATATGTTTATGATTGGACCTCCAGGCTCAGGAAAAACTATGATTGCAAAAAG
AGTAAGGACAATTTTACCAGATATAAGTATAGAAGAAATGATAGAAGTAAGTAAGGTTTATAGTATATTG
GGTATGATAAATGAAAGTAAAGGAATAATTGATAAAAGACCTTTTAGAGCACCTCATCATACAACTACAA
AGCAATCTTTAATTGGAGGAGGAATGGATGCAAGACCTGGAGAAATTGCTTTAGCACATAGAGGTATCTT
ATTTTTAGATGAGATAGCCGAATTTGATAGAAAAATACTTGAGACTTTAAGACAACCTATAGAAGATGGA
TATGTAAATATATCCAGAGTAAAGTACAGTGCAAAATATCCTTGTAGAGTACTGTTAGTTGCAGCTATGA
ATCCATGTCCATGTGGTTATTATATGTCAGAGACAGAGTGTAGATGTAGAAGTAACGAAATTGATAGATA
CATAAATAAAATATCAGGTCCATTGTTAGATAGGTTTGATATTTTTGTAGAAGTTAATTCTATAAAATAT
TCAGATTTTAATTCTTTAAAACAAGAAGAAAGCTCTCAAAAAATAAAGAGAAGAGTAGAAAATGCTAGAA
AAATACAGATAAATAGATTTAAGAAAGATAATATAAAAAATAATAGTGAAATTAAAGCTTACAATTTATT
TAAATATTGTAAACTGGAAAAAGAAGCTTCAAAAACGGCTGAGATGATATTTAATAAATACAACCTAAGC
AGTAGAAGTTATACAAAACTTTTAAAAATGGCAAGAACAATAGCAGATTTAGAAGAAAGAGACTTGATAA
ATTCACAGTGTATTATAGAAGCTTTTTCATTTAGAAAGGCTTATTATAGTTATTTTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1336308-1337408 putative competence protein [Clostridium difficile R20291]
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TAGAAAATGAAATAGTAAATATTGAAGATATATTTGATTTTTCTGAAAAAGAAATATATAATTTAAAAAA
TATAAGCTTGAATATTAGAAAAAATATAGTAAAATATAGAGGTTACGCTTATTTAGAAAATATAAAAGAA
CTACTTTACAAAAAAGCGATTAAATATATTTGTAAATATGATAAAGAATATCCTGAAAATTTAAAGAATA
TATACAACGCTCCAAAGTTATTATTCTACAAAGGTGACATAGGTTTAGTTAATAATAATTTTAATATAGC
TATAGTAGGTTCAAGAAAACCTACAGCCTATGGAATTAATTGTGCAAAAACAATAAGTTGTCAACTATCC
CAATATGGAGTTAATATAGTAAGTGGATTAGCTATAGGAATAGATGCATACTCGCACATAGGTTGTATGA
GTGGAAAATCTAAAACTATAGCAGTACTTGGTTCAGGAGTAGACAATCCTCTTCCAAAACAAAATTTACA
TTTATCAAATAAAATATTAGAAAATGGGGGATTATTATTATCAGAGTATAATATTAACTCGACAGTAGCC
CCGTACCATTTTTCTAATAGAAATAGAATTATCAGTGGTTTAAGTGATGGAGTAGTTGTTGTAGAAGCAG
CAATAAAAAGTGGTGCACTAATCACAGTAGATTTTGCTCTTGAACATGGAAAAAATGTTTTTGCAATACC
TGGTAATATAAATTCTCAAATGAGTAGAGGTTGTCATAAAATTATAAAAGAAGGTGCAAAATTAATTGAA
AATATAGATGATATTTTAAATGAATATAACATATTTAATATTATTGATAAAAAAATAAATCAAAAATATG
ATAATATAAGTCTAAATGCCAAGTCTAAGCAAATAATTGAAGCTATAAAAAGAGAAGGAAACTTGCATAT
AGATAGTATTTGTGATTATACTGGTATAGAAATAAAGTATGTAAATTCAATAATCAATGAATTAGTACTA
AATGAGTTAGTAGTAGAAATGAATAATAAAACGTACAGTTTAAATGTATAA
>ref|NC_013316.1|:1337441-1339528 DNA topoisomerase I [Clostridium difficile R20291]
ATGGCCAAAACATTAGTCATCGTAGAATCGCCTGCAAAAGCTAAAACTATAGAAAAATTTTTAGGGAAAA
GTCATTACACAGTTAAAGCATCAGTTGGTCATGTCAGAGATTTACCTAAAAGTAAATTAGGTGTAGATAT
AGAAAATAATTTTGAACCTCAATATATAAATATAAGAGGAAAAGGCGATGTAATAAAAGAATTAAAAAAA
GAAGCTAAAAAATCTAAACAAGTATATCTAGCAACTGACCCTGATAGAGAAGGTGAAGCTATATCATGGC
ATTTAGCTCATATACTAAATTTAGATGAATCTGAGGATTGTAGAATAGAGTTTAATGAGATAACTAAGGA
TGCAATTAAAAAAGCAATTAAACATCCTAGAAATATTGATATAAATTTGGTTGATGCACAACAGGCAAGA
AGAGTGCTAGACAGACTTTTAGGTTATCAAATAAGTCCTATATTATGGCAAAAGGTTAGAAAAGGTCTTA
GTGCAGGTAGAGTGCAATCTGTTACAACAAAGTTAATTTGTGATAGAGAAAAAGAAATAAAGGCATTTAT
TCCAAAAGAATACTGGACAATAGATGTTGAGGCTAAGACAGTAAAAGACAAAGATATAACTTTGAAATTT
TATGGTAAAAATGATGAAAAGATTGAATTAGAAAATGAAGAAGCTGTAAATGAAATACTAAAAGAAATGG
AAGGTAAAGATTTAAAGGTTGAGAAGATAGAATCTAAATCAAGACGTAAATCAGCTCCAAAACCATTTAC
AACAAGTATGCTTCAACAAGAAGGAGCAAATAAGTTATTTTTTACTACTAAAAAAACAATGATGATAGCA
CAAGAATTATATGAAGGTATCGACATAGAAGGTGAAGGTACTGTTGGTCTTATATCATATATAAGAACTG
ACTCTAAAAGAATATCTGATGAAGCAAAAGAAAAAGCTAAGGGTTATATCGTAAACAATTTAGGAGAAAA
CTACTATAAAAACACTGGTGATAAAAAAGAAAAAAAGGATACTAAAAAGGTTCAAGATGCCCATGAGGCA
ATAAGACCAACCTCAGTTGATAGAACTCCAGAGAGTATAAAAGCCTCATTGAGCAAAGACCAGTACAAGT
TATACAATTTAATTTGGAGAAGATTTGTAGCTAGTCAAATGGAAGATTCAGTGTTTGATATACTAAATGT
AGAATGTAAAATAGGCGATATTGTATTTAAGGCAACTGGTTCAAAAATGAAATTTGATGGTTATACCAAG
GTATATAATTTTTCAGAAAGAGAAGACAAAATTTTACCAAGTATAGAAAAAGGAGATATATTAAATATAG
AAAATATATTGCCAGACCAACATTTTACACAACCACCAGCAAGATATACAGAAGCTAGTTTAGTAAAAAC
ACTAGAAGAACTAGGTATAGGTAGACCAAGTACGTATGCTCCAACAATAGCTACTATACTGAATAGAGAG
TATGTTGAAAAGCAAGGAACAAGTCTATGTCCAACAGAACTTGGAATAATAGTTACTGATATTTTGGAAA
ATAATTTCCATAAATTTATAGATGTAGATTTTACTGCTGATATGGAAAGTAAACTTGATGTTATAGAAGA
AGGCAATACAGATTGGAAAAAGATTGTATCAGAATCATATGCACCACTTAAAGAGGCTATTGAAGAAGCT
CTTGAAAATATAGAAAAAGTAAATATGGATGAAGAAACTGATGAGATTTGCGAGAACTGTGGGTCTAATA
TGGTTATCAAATATGGTAGATTTGGAAAGTTTATGGCTTGTAAAAACTATCCCGATTGTAAAACAACTAG
ACCAATTATGAATAAAATTGGTGTTAAATGTCCAAAATGTGAAGAAGGAGATATTATACTTAGAAAATCT
AAAAGAGGTAAAGCTTTTTATGGGTGTTCTAATTATCCAAACTGTGACTTTGTAGCTTGGAATAAGCCAA
CAGGAGAGTTTTGTGAGAAGTGTGGTTCATATATGGTTGAAAAAGTGACTAAATCTGAAACAAAAACAGT
GTGTTCTAATAAAGAATGTAATAAAGAGACAAAAGAGCATAATGACGGAAAAGAGTGA
>ref|NC_013316.1|:1339693-1340478 GTP-sensing transcriptional pleiotropic repressor [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAAGTGAAGTGTTACAAAAAACAAGGAAAATAAATAAAACATTACAAACAAGTGGTGGAAGCAGTG
TCTCTTTTGATTTACTGGCCGGAGCATTGGGCGACGTTTTAAGTTCTAATGTTTATGTAGTAAGTGCAAA
AGGTAAAGTACTAGGTCTTCATTTAAATGATGTTCAAGACAGTTCAGTTATAGAAGATGAGTATACTAAG
CAAAAGAAATTTTCAGATGAATATACTCAAAATGTGTTAAAAATTGATGAAACATTAGAAAATTTAAATG
GTGAGAAGATATTAGAAATCTTTCCTGAAGAACATGGAAGATTACAAAAATATACTACAGTAGTTCCAAT
ATTAGGAAGCGGTCAAAGATTAGGAACATTGGTACTTTCAAGATATTCAAATTCATTCAATGATGATGAT
TTAGTAATAGCTGAATACAGTGCAACTGTTGTTGGTCTTGAAATATTAAGAGCAATAGGTGAAGAATTAG
AAGAAGAAATGAGAAAGAAAGCTGTAGTTCAAATGGCAATAGGCACTCTGTCCTACTCCGAGCTTGAAGC
AGTTGAACATATTTTTGCTGAATTGGATGGAAAAGAAGGTCTACTTGTAGCAAGTAAGATAGCTGATAGA
GTTGGTATAACTAGGTCTGTAATAGTAAATGCACTTAGAAAATTTGAGAGTGCAGGTGTGATAGAATCAA
GATCATTAGGTATGAAAGGTACTCATATAAGAATACTTAATGACAAACTTACAGATGAATTAAAAAAATT
AAAAAACAATCAATAA
>ref|NC_013316.1|:1340555-1341850 putative ATPase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAGTATATTAAAAAGGAGTGAGAAAATGCCTTTAGCAGATAAAATAAGACCAAAAACAATGAATG
ATGTAATAGGTCAAAGTCATATAATAGGTAATGGAAAAATATTGTCTAAGATATTACAATCTAATTTTTT
ACCAAATATGATATTTTTTGGTCCTCCTGGTGTTGGTAAAACTACAGTAGCGGAAATAATAGCAGAAAGA
AGCAATAAAAGCTTCTATAAAATAAATGCTACTAATTCATCTTTAGAAGATATAAAAAAGGTGATATCAG
AGCTTGGAAGTATAAATAATGTAAATGGAGTCCTATTATATATAGATGAAATACAAAGTTTTAATAAAAA
ACAGCAACAATCAATATTAGAATTTATGGAAAATGGGAGTATAACTTTGATTGCTAGCACTACAGAAAAT
CCATATCATTATGTATATAAAGCTCTTTTAAGTAGGTCTACTGTATTTGAATTTAAACCTTTAGAAAAAC
TTGATATAGAAAAAGGACTGAAAAGAGCTGTTGAAGTATTAAATGAAGATAGCTATATGGATATTGAGTG
CAATAATAATGCTATTGAAGATATAGCAATTCTTTCTGATGGAGATATGAGAAGAGCCTTAAATATTTTG
GAAGTGGTAGTCTATTCAACTAAACCAAATAAGGATAATATAACTTATATAGATTCAGATGTAATAAGGG
CATCTACATTTAATAAAATTATAAACTATGACAAAAATGGTGATAGTCATTATGATATTTTAAGTGCATT
TCAAAAATCTATAAGAGGAAGTGACCCACAGGCATCTATACACTATCTAGCAAGACTTATAAAAGGTGGG
GATTTGATAAGTATATGTAGGAGACTTTTAGTAATAGCTAGTGAAGATATAGGTTTAGCTTATCCAAATG
CTATTGTAATTGTAAAGGCATGTGTAGACTCAGCTATGCAACTTGGATTTCCAGAAGCGAAAATACCATT
AGCAGAAGCTACTATTCTTTTGGCTACATCTCCAAAGTCTAATTCTGCATGTATAGCAATAATGAAAGCT
ATGGATGAACTGGATAAAGAGTTTGTTAAGGATATACCAAATAGTATAAAGGATGCTCACTATTCTGGTT
CTAAAGAAATAGGTAGGGGTTGTGGATACAAATATCCTCATAATTTTAAAAATCATTATGTAAAGCAACA
GTATTTACCAGATAGCATAAAAGATAGTATTTATTACATACCACAAGAAAATAAAACTGAGAAAAATATA
AAAAAATATTTAGAATATCTAAATAGTGATTTTTAG
>ref|NC_013316.1|:1341881-1342651 putative acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTATAAAACTTAACTCAACTTATCACAGTAGAGTTATGAAATACTTAAAAAAAGAACCTGAGTACA
ATTTGTTTATAATAGGGGATATTGAAAGATATGGATATGGAAATAATTTTTTAAATATATGGGCAGACGT
GGGTGAACATGGTGAAATAAAGGCAATATTACTTAAATATTTTGAATTTATGATGTTTTATTCTGATGGA
GAGTATGATGTTGAAGGTTTTTATAATCTACTTCGTAATACTAATTACGAAGAAATATCTGGGAAAATAT
GTGCTGTAGATACTTTAGCAAAGAGATTAGGACTTAATAATTTAAAGGTAGTTGATTTTTGCAAACTTCA
AACTAAAAAGTTTTTGATAGATAATAATTGTAATGCAAAGGTTAAGAGAATTAGGCTTGGAAATCTAAAA
AAGACAGTGAAACTTTATGACTTAATAGATGAATTTCACAGTACAACTTTAGAGAATTTAAAAAATGGAC
TAAGGACAGGTAGAGGATATTGTATAGAGATTAACAAACAGGTGGTGTCAATGGCAAAGAGTACTTCAGA
AAATAGGACTCATGCAATGATAATTGGAGTAGGAACACATCCTAAATATAGAGCTAAAGGACTTGCTACA
AAATGCCTAATTAAACTATGTTCAGAGTTACTGAGAGAAAACAAAATTCCTTGTTTGTTTTATGATAATG
AAGAGGCTGGAAAGATATATAAAAAACTAGGATTTGAAAACATTGGAAAATGGGGAATTTATTCAAAATA
A
>ref|NC_013316.1|:1342760-1343206 RRF2-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGTTGTCTACTAAAGGTAGATATGGACTAAAAGCAATGTTTGAATTAGCATTAAATCAAGACAATG
GACCAGTATCATTAAAATTTATTGCTAAGAAGCAAAAAATATCAGATCAGTACTTAGAACAAATATTTTC
ATCTTTAAAAAAATCGGGTCTAGTAAAAAGTGTGAGAGGTGCTCAAGGAGGTTATTTGCTTTCAAAGAAT
GCTGAAGACATAACAGTAGGAGATATACTTGTAGTATTAGAAGGACCAGTTGCATTATCTGACTGTGTAC
TAGATGAAGATGTATGTGAAAACTCAAACATGTGTGTAACAAAAATAGTTTGGGAAAAGATGAAAAAGGG
TATAGAAGATGTTATAGATTCAATTACTCTTAAAGATATGATAAATGACTATAACAAAAATAAATTAGAA
AATGATATAACAAATATTAAAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1343215-1344417 cysteine desulfurase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGTAATGGAAAAAAGAAGATTGTATATGGATTATTCTGCAACAACACCTATTAAAAAAGAAGTAT
TGGATGCAATGATGCCATACCTAACAGATTATTTTGGTAATGCATCTAGTTTTCACACATTCGGAAGAGA
AGCAAAAGATGCTTTGGATAAAGCAAGAGAACAAGTAGCAGCCCTTATAAATGCTGAACCTAGTGAAATA
TATTTTACAGCAGGTGGTTCAGAAAGTGATAACTGGACACTAGAGGGTGTAGCTTATGCTAATAAAAACA
AAGGTAATCATATAATAACTTCAAAAATAGAGCACCATGCAATACTTCATACATGTGAATACTTAGCAAA
ACATCATGGATTTGAAATAACTTATTTAGATGTTGATAGCGAAGGAAGAGTAGACTTAAGACAACTAGAA
GATTCAATAAAAGATACTACTATACTTATAAGCATAATGTTTGCAAATAATGAAATAGGAACTATACAGC
CTATTAAAGAAATATCCGAAATAGCTAAAAAACATAAGATATTATTCCACACTGATGCAGTACAAGCTAC
AGGTAATATTCCAGTAGATGTTAAAGAATTAGGAATAGATTTGATGAGTATGTCTTCACATAAAATATAT
GGACCAAAGGGTGTAGGAGCTTTATACATAAGAAAAGGTGTAAGACTTCATAACTTTGTCCATGGTGGAG
CACAAGAAAAAAGCAAAAGAGCTGGTACAGAAAATATACCTGCAATAGTTGGATATGGAAAAGCAGCAGA
ATTAGCTAAGGAAAATATGCAAAATCATGTAGAAACTTTAACTCGTCTTAGAAATAAGTTAATAGATGGT
GTGTTAGAAAGAATACCTTACACAAGAGTAAATGGTAGCTTAGAAAATAGATTGCCAGGAAATGCAAACT
TTGCATTCCAATTTATAGAAGGTGAAGGAATACTTTTATTATTAGATATGTTAGGAATTGCTGGTTCAAG
TGGTTCTGCATGTACTTCTGGTTCATTAGACCCTTCACATGTACTTCTTGCAATAGGTTTACCACATGAA
ATAGCACATGGTTCATTAAGACTTACAGTTGGAGATTTTACAACAGATGATGATATAGATTATATACTAG
AGAACTTACCAAAAGTAATAGAAAGACTTAGAAGCATGTCACCACTTTATGATGATGCGAAGAAACAAGG
TTTAGTAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1344471-1344911 NifU-like protein [Clostridium difficile R20291]
ATGCAATATAGTGATAAAGTTATGGAACATTTTATGAATCCAAGAAATATGGGAGAAATTGATAATGCAA
GTGGTGTAGGTGAAGTTGGAAACCCTACATGTGGAGATATAATGAAGATATTTTTAGACATAGATGGAGA
TGTAATAAAGGATGTTAAGTTTAAAACATTTGGCTGTGGTTCAGCTATAGCAAGTTCTTCTATGGCAACT
GAAATGATAAAAGGAAAAACTATAAAAGATGCATTAGAACTTACAAATAAAGCTGTTGCAGAAGCTTTGG
ATGGTTTACCACCAGTAAAGATGCATTGTTCAGTTTTAGCTGAACAAGCTGTAAAAGCAGCTCTTATAGA
TTATGCTCAAAAGAACAATATCCATATACCAGAATTGGATGGATATGTTATAGATGATGCTCATGACCAT
GATGTTGAAGAAGAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1345200-1346279 putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAAAAGTAATGATAGGTATGAGTGGAGGAGTTGATAGCTCTGTAGCTGCATATCTTTTAAAAC
AACAAGGATATGATGTCATTGGTGTTACTATGAAGTTGTGGCAAGATGATGATGTTGTTGAAATTGAAGG
TGGTTGTTGCTCTTTATCTGCTGTTGAAGATGCTAGAAGGGTAGCAAATAAAATAGGTATACCATTTTAT
GTTTTAAATTTTAGAGAAGTGTTTAAAGAAAAAGTAATAGATTATTTTATAGATGAATATTTGGAAGGAA
AAACTCCTAATCCCTGTATAGCTTGTAATAAACATATAAAATTTGATGATTTTTATAAGAAGGCTAGACA
AATAGGTTGTGATTATGTAGCTACAGGTCACTATGCAAAGATAGAAAAGGATGAAAGTACAGGAAGATAT
TTGCTAAAAAAATCTGTTACAGATAAAAAAGACCAAACTTATGCACTTTATAATCTTACACAAGAGCAAC
TAGAGCATACTTTATTGCCAATAGGTGACTATGAAAAAGATAGAGTAAGAGAAATTGCTAAGGAAATGGG
GATGGCAGTACACAATAAGCCTGATAGTCAAGAAATTTGTTTTGTTAAAGATAATGACTATGCAAATTAT
GTAAAAAAACATTCTAAAAAGCGTATTGAAGAAGGTTTTTTTGTAGATACTAAAGGCAATATACTTGGAA
AACATAAGGGTATATTATATTATACTATAGGCCAAAGAAAAGGGCTTGGAATTACTTTTGGAAAACCAAT
GTTTGTAATAGACATAAATCCAATAAATAATACCATAGTTCTTGGAGACAATGAAGATTTATTTAAAAAG
GAACTTATTGCTAAAGATGTTAACTTTATATCAATAGATACGTTAGAAGAACCCTTAAGAGTTCAAGCCA
AAATAAGATATTCAGCAAAACCATCACCAGCTACTATTCATAGAGTAGGAGAAGATACTATTAAAATAGT
TTTTGATGAAGCTCAAAGAGCTATTACTAAAGGTCAATCTGTAGTAATGTATGATGGAGATATTGTAGTA
GGTGGAGGTATAATCGAGAAAAGTTTATAA
>ref|NC_013316.1|:1346728-1349367 putative alanyl-tRNA synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAGATGGGATTAAATGAAATAAGAAGTAAGTTTTTAGAATTTTTTGAGTCAAAAGGTCATTATG
TAGCAAATAGTTATTCTTTAGTACCAAACAATGATAAGAGTTTGTTACTTATAAACTCAGGTATGGCACC
TTTGAAAAACTACTTTTCAGGTGTAGAAGTACCTCCAAGTGTGAGAATGTGTACATCTCAAAAATGTATA
AGAACAGGAGATATAGAAAATGTAGGTATAACTGCAAGACATGCTACATTCTTTGAAATGATGGGTAACT
TCTCATTTGGAGATTACTTTAAAAGAGAGTCAATCAAATGGGGATGGGAATTTGTTACAGAATGGCTAAA
TATACCAGAAGATAAGATATGGGTGACTGTATATGAAGAAGATGATGATTCTTATGATATATGGGCAAAA
GAAATGAATTTCCCAGAAGAAAGAATGGTTAGACTTGGAAAAGATGATAATTTCTGGGAAATAGGTACAG
GTCCTTGTGGTCCTTGTTCAGAAATATATTTTGATAGAGGAGAAGAATATGGATGTGACAATCCAGACTG
TAAACCAGGCTGTGATTGTGATAGGTATTTAGAATTTTGGAACCATGTATTTACTCAATTTGATAGAGAT
GAAGAAGGAAATTATAGTCTATTAGAAAACAAGAATATAGATACAGGTATGGGTCTTGAAAGAATGGGAT
GTATTATGCAAGGCGTAGACACTATCTTTGAAGTTGATACAATTAAATCTATACTAGAAGCAGTTGAGAA
GTTAACAGGAGTAAAATATGGAGAGAATCCAAAAAATGATATATCAATAAGAATAATAACTGACCACATA
AGAGCTGTAACATTCTTAGTTAGTGATGGAGTGCTTCCATCAAATGAAGGAAGAGGATATGTTCTTAGAA
GACTCCTTAGACGTGCTGCTCGTCATGGTAAGTTATTAGGAGTAAAAGAATTATTTTTACAGAAACTAAT
AGATGAAGTTATAAAGGTAAATGATAAAGCATATCCAGTTTTAGTTGAAAAAGAAAGTTATATTAAAAAA
GTAGTTGGAATAGAAGAAGAAAAATTCAATGAAACTATAGACCAAGGAACAGAAATATTGAACTCTTATA
TAGAAGTATTAAAAAATGAAGGAAAGACTGTCCTAAGTGGTCAAGAAGCTTTTAAACTATATGATACTTA
TGGCTTCCCTATAGACTTAACTAAAGAAATATTAGAAGAAGAACATCTATCTGTAGATGAAGAAGCTTTT
AATGAAGAAATGGAAAAGCAAAAAGAAAGAGCTAGAAATGCTAGAGGAAATATGGATGGAGAAAGTTGGA
AGGAAGACCCTCTATCAAAATTAGAATCTACAGTTGACAGTACATTTAATGGGTATAGTGAAATTTATGG
TGAAGGAACTATTGAAGCTATAGTTAAAGATGATGAGCTAGTTCAAAGTGCAGAAGAAGGCGATAAGGTA
TCTATAGTACTAGATAACACTACTTTCTATCCTGAAGGTGGAGGACAAGTTGGAGATTGTGGATTGATAA
CTAATGAAAACTTAGTTTTAGAAGTATTAAATACTAAAAAAGGTGCTAATAATAGTATAAAACATATAGG
TATAATAAAATCAGGAAGAATAAGTAATGGGGACAAAGTAAAGACACTCGTAGATAGAGAAACTAGAATG
TCAGCTGCAAGAAATCACAGTGCTACACATTTACTTCATAAGGCATTAAGAGAAGTATTAGGAGAACATG
TTAATCAAGCTGGTTCTTTAGTAACTCCAGAAAGACTTAGATTTGATATTACTCACTTTGAAGCGATATC
AAATGAAGAATTAAAAGTAATAGAAGAAAAAGTAAATAATGTTATTTTATCATCTTTAGACATAAAATGT
GATATTATGAATATAAAGGAAGCTAAAGAAAAAGGAGCTACAGCACTATTTGGTGAAAAATATGGTGATG
AGGTAAGAGTAGTTTCTATGGGAGATTATTCTACAGAACTTTGTGGAGGAACTCACTTGACAAATACTTC
TCAAGTAGGAATGTTCAAAATATTATCTGAAGGTGGAGTAGCAGCAGGTGTAAGAAGAATAGAAGCAATA
ACAGGAAAAGCTGTTTATGAATACCTAAAAGAAAGAGATGGAATTATCTCTGAAGTTTGTGTAAACTTAA
AATCTAAAGAAGATAATTTAATTCAAAGAATAAGTTCTTTATTAGAAGAAAATAAAAACTTATCTAAAGA
ATTGCATGATATGAAAGCTAAGATGAGTTTACAATCAGTTGATTCTATTTTTGATTCTAAAGTTGAAGTA
AATGGAGTTAATTTGATAACTAATAAATTTGAAGGTATGGATATGGATACACTAAGAGAAACAGCAGATA
ATCTAAGAGATAAGCTTGGTTCTGGTGTAGTAGTACTTGCAAATGTAGTAGATGATAAAGTTAACTTTGT
AGTTACTGCCACTAAAGATGTATTAGATAAGGGAATACATTCAGGTAATATTGTTAGAGAAGTTGCAAAA
ATAGCTGGAGGAAAAGGTGGAGGAAGACCTAATATGGCACAAGCAGGAGCTAGTGATGTATCTAAGGTTG
ACCAAGCTTTAAGCTATGCAAGTGAGGTTATTAAGACACAAGTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1349392-1349649 hypothetical protein CDR20291_1123 [Clostridium difficile R20291]
TTGGAAAAAGATTTAGACTACACTATGAAATTTGAAGGAATACCAGAAGATAGGATGAGTGTAGGAGATA
CTATTGATTTTGTATATAAAGCATTAGTTGAAAAAGGATATAACCCTATAAATCAAATTATAGGGTATCT
CCTTTCTGGTGATTCTAGCTATATAACTAGTCATAAAAATGCAAGAGCTATAATTAAAAAATTTGAAAGA
GATGAGATACTTGAAGAAGTAATCACGCACTATCTGAATAGAAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:1349659-1351830 hypothetical protein CDR20291_1124 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAAAAAGATTATGTCGTTGTTTGCAATAGTCATTATGATTTTTGTATCAACTGCTAGCTATGGTT
TTGCTGAAGAAAAAGGCAAGGTCATATTTATTGATATGAATAGGACCAATCTTGGAAGTATGATGAATAT
TCCAATCTTGAAAAATGAGATAGAAAAGAGAGGCTATGTAGCTCTCATGAATATAAGAGGGGATCAAGGT
ACTGATGATAGAAGGTCTTATGCAAGTATGGGTGCAGGAACAAGAGCTAGTGTAACTACTGAAGACTATA
TCAATTTTCAAAAAGTAGACCAAGATACTGCTAAAGCTTTTGAAGTCGCAACAGGTCAAAAAGCTAAAGA
AATAAATGATTTAGGCATTAATAGATCTATAAATGAAAATCTTGAGTATGGAGAATATGGAGCAAATTTA
GGGTCATTAGGAAAAACTTTATCAGAAAATGGTTTAAAGACATCTGTAATTGGAAATGCTGATATAATTG
AAAATAATCAATTAGTTAAAAATAGAAACTTATGTTTAGTAGCTATGGACCAATATGGAAGGATTGATTC
AGGTAATATTGATAATATTAATAAGAAAGATTCTAAAATGCCATTTGGAATATCTACAGACTACGATAAA
TTACTAGATGAAACTAAAAAATCCTATAAAAATAGTGATGCTATATTTGTAGAACTTGGAGATACATATA
GATTAGATATGTATAGATTAAATCTAAATGATAATACTTATGGTACAATGAAGAAAAATATTGTAAAAAA
TATAAATAAATATCTTGAACAAGTATTTTCTATGGTTGGAGAAAATGACACTGTTTATATAGCAAGTGCA
TTTCCAAGTGACCTAGATTATAAGAATAAGAGAAGACTTTCTCCAATAATAAAATTTAGTGGAGAAGGGA
AAGGTCTACTGGAATCTGCCACAACAAGAAAGGCTGGAATTGTTGCCAATTTAGATGTTGGAGTAGATAT
ACTAGGTACATTTGGTCTTGAAAATAAAGAGATGGTAGGTAGAAGTTATACTTTAGTAAATAAAGAGGAC
AATGTTGGCTATCTAAAATCACTTTATGAAAGGATAGTGTCTATATCTTCAATAAGGTCAACTATTATAA
ATGGCTTTGTAGGCGTAATATCTGCTTCTTGGGTAATTGCCATGTTTGCGATTTTCTTTAGAAATTATAT
GCCACATAAAGAGCGTGTATTCAAAGTACTTAAGGAGTTTATAAAATTAGGCATAATAATGCCACTATCA
TTTATGTTAGCTCCTTTGATGAATTTTAAAACTCCAATTTCAATATCTTTGGGAATATTTGCGACTACGC
TAATATTATACTTGTTAGGTAGAAAATTATTTAAGGACAATGATATAAAGCACATGGGATTTTTTGCAAC
ACTTACTATTTTAGTCATAGTTATAGATTCTGTATTTGGAACATACTTAATGCAAAATAACATAATGAGT
TATGATGCTGTCATAGGAGCTAGGTACTATGGTGTAGGAAATGAATATGAAGGTGTAACTATAGCAAGTG
CAGTATTTGGCTTAGCAGTATTATTACATTATAAGAAGGTATCTAAATTACTTGTTGTAATTTTTTCGTT
AATAATACTTATAACTAGTGCATATCCTTCAATGGGTGCAAATGTTGGTGGAGCTATATCAGAATGTGTA
GCATATTTGTTGTTTATAATGCTTATATATGACATTAAAATAGATTTTAAGAAAGCTGTATTATTAGCTG
TTTCAGCTGTAGTTGTCGTTTTTGCATTTGCAGCTTTAGATATACTTTCAGGTAGTGAATCTCATTTAGG
TATGTTTGTACAGAGAATTTTCCTAAATGGACCAGGAGAGATATTACAAACATTTGGAAGAAAAATTCAA
ATGAATATGCAACTAGCACAGACAAGTGTATGGGTAAATATTTTACTTGTAGGAATTGGAGTAATTGCAG
TACTTATATTTAAACCATCTAGACACTTTAGAAAGATAATGAATAATTTTCCAATCTTGTTTAAAGGGTT
TATTGCATCTATGGTTGGTTGTATAATTACTCTTTTAGTTAATGATTCTGGAATAGTTGCTGCATCTACA
GCATCTATATATATACTTATACCACTAATAATAATAAATATAAATATGATAATATTTGAAAAAAACAACT
AA
>ref|NC_013316.1|:1352036-1352461 putative holliday junction resolvase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAGATGGAAGAATAATGGGTCTTGATGTTGGTGATAAAACTATTGGAGTTGCTGTGAGTGATTTGA
TGGGATTAACTGCACAAGGTGTAAAAACAATAAAAAGAGTTGGCAAGAAAAAAGATATTGAAGAGTTAAA
AGCAATAATAAAAGAAAAACAAGTAAATAAAATTGTATCAGGATTACCAAAAAATATGAATGGAACTTTA
GGTCCACAAGGAGAAAAAGTAATCAAGTTTTGTGAATTGGTAAAAGCAGAAACAGGTATTGATGTAGAGT
TTTGGGATGAGAGGCTTTCTACAGTAGCGGCAGAGAGGTCTTTATTAGAAGCAGATGTTAGTAGACAAAA
AAGAAAAAAGGTTATAGATATGTTGGCAGCAGTAATAATTTTGCAAGGATATTTAGATTTTAAAATAAAT
TCATAA
>ref|NC_013316.1|:1352539-1352826 hypothetical protein CDR20291_1126 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGAAAATATAATAAATTTAATAGACGAAAATGGCGTTGAAAGCCAATTTGAAATAATATTAACAT
TAGAAGCAGAAGGAAAAGAGTATGCAATATTAATGCCTTTAGATGATGAAGAAGCTGAAGAAGCTTTAAT
CTTTAGAATTGATGAGGATGAAGAAGGTGAAATATTAATACCTTTGGAAAGTGATGAAGAGTATGAAACT
GTTGTAGCTGTGTATACTGCTATAATGGAAGAAGAAGGTTTAAATTACGACGAAGATGAATCAAATGGAC
TTAACTAG
>ref|NC_013316.1|:1353108-1353566 ferric uptake regulation protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAAATACAATGGATTTATTAAAAGACAAGTTAAAAGAAACTGGTTTTAAGATTACGCCACAAAGAA
GAGCAATAGTTGAAATATTGCTTAAACATGACCATTCACATCTAAGTAGTGAGGAAATCTATGATTTAGT
TAGGGTTGACTGTCCTGAAATAGGCTTAGCTACTGTATATAGAACAATGCAGCTATTGGATGAAATAGGA
TTAATATCAAAACTAAACTTAGACGATGGATGTATAAGATATGAGATTAGTCTACATAAAGAAGACTGTC
ATAATCATCATCATCTTATTTGTAAAAATTGTGGAAAGATAATGGAAGCTAAAGAAGACCTTTTAGACAA
TATAGAAAAAGAGATACAATCATTGTACAAATTTAAAATACTTGATCATGATGTTAAATTTTATGGATTA
TGTGACGAGTGTAATGGAGTAAGCGATTCAGAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c1354420-1353683 putative membrane-bound metal-dependent hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGCGTGGTAAAACTCATTGTGCAATAGGAATCTTAACAGCTATCCAAACATCTTTAATATTTAAAATTC
CTATATCTTTAGTTGATATTTTAGTTTCAGCTACTTTTGCTGTACTACCCGATTTGGATAAATCTAATTC
TATGGTCTCAAATTTCATTCTAAAAAACAATGTATCCAAATACATATATAGAATTTTTATATATGCTGTT
AATATTATTATTTTCTTTATTTCAATAAATATAAATGATAATTTTTATTTAAGCGCAATAATTACATTTG
TTGCAATTATAATTATTGAAGCAAAACTAACCCACACATTTCTAAGAAAAGTTTTTCTATCATTAATATT
TATACTATTAGCTATATGCTTATACATCATAGAAGTTGAAATATATTTTACAATTTTTTGTCTAATGTTG
TCAATTTTTCCCTGGTTAAAGCACAGAAGTTTTTCTCATAGCATATTTGCAACTATAATAGTATATTTTT
TACTAAAACAGATAGAATTAATCACTAATATTAATAATTTATCTTTTTATGGTACGATTGGTTATGCAAG
TCATATGTTTTTAGGAGATTTATTTACAAAGCAAGGAATACCAATTTTTTATCCGCTAAGCGAAAAGAAA
ATTTCTTTAGGTTTTTTAACTGTTGGAGGACCATTTAGTAATTTCATAGAAAAATCATTCATTTTTGTAC
TTATAGGATTAATTATATTTTCAATATTAAAACTATAA
>ref|NC_013316.1|:1354592-1356313 metallo beta-lactamase superfamily protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATTGTAGAACGTGTTAAAAAATTAAATAGACAGAAGGAGATGATGCAATTGTTCAAAAAGAACACCA
ACAAGATAAAGGTAATGGCCTTGGGTGGACTTAACGAAGTTGGAAAAAATATGACTGTTGTTGAGTATAA
AGATGAAATAATTGTTATAGATGCTGGACTTAGTTTTCCAGAGGATGAAATGTTAGGAGTAGATATAGTT
ATACCAGATATAACTTATTTAGTAAAAAATAGGGATAAAATAAAGGGTATATTTATTACACATGGACATG
AAGACCATATAGGAGCTCTTCCATATATATTAAAGAAAATAAATGTACCTGTATATGGGGCAAGACTTAG
TATAGGTCTTATACAAGTAAAACTTAAAGAACATAAAATGAATAATGTTAAGTTAAATGTTATAGGTCCT
AGACAAGTTATAAAGCTTGATAATATGGAAGTAGAGTTTTTGAAAAATAACCATAGTATACCAGATGCTT
ACTCTATTGCAATACACACAGACCAAGGTATAATATACCACACAGGAGATTTTAAGATTGACTTGACTCC
TATTGATGGAGATGTTATGGATATGCATAGAATCTGTGAGTTGAGCAAAAAAGGAGTTCTTTTAATGCTG
GCAGATAGTACTAATGCAGAAAAACCAGGATTTACTATGTCTGAAAAGACTGTTGGGGTAGGTCTTGACG
AATTATTTGCAAAAGGAAATGGCAGAAGAATTATAGTTGCTACCTTTGCATCCAACATACACAGATTACA
ACAAATAATAAATACTGCTGAAAAGTTTAATAGAAAAGTTGCTATATCAGGTCGCTCAATGGTCAATGTA
GTCGGAGTTGCAAAAGAATTAGGATACCTAGATATTTCTGATGACATGCTTATAGATTTAAATGATATAT
GTAAGTATGAAGATAGTGAATTAGTGATAATAACAACTGGTTCACAAGGTGAACCTATGTCAGCTCTTGC
TAGAATGGCTTTTTCAGAGCACAAAAAAGTAGAAATAAAGAGTGGCGATTTAGTTATAATATCTGCTCAT
CCAATACCAGGAAATGAAAAATTAATATCAAGAGTAATCAATTTCTTATTTGAAAAAGGAGCAGAAGTAG
TATACAGTGATATAGCTGATATACACGTTTCTGGACATGCCTGTCAAGAAGAATTAAAACTTATACATGC
ATTAGTTAGACCAAAGTTTTTTATGCCAGCTCATGGTGAATATAGAATGTTAAAAAGACATGCTGAAATA
GCTGAACAGCTTGGTATGGATAAAGAAAATATTTTTGTCATGCAAACAGGAGATGTTTTAGAATTAGATA
AAAACTCTGCTAAGGTAGCAAACCGTATACAAACAGGAAACATATTAGTTGATGGTCTAGGAGTAGGCGA
TGTAGGTAATATAGTTTTAAGGGATAGAAAGCATTTATCAGAAGATGGTCTTATGATAGTTGTAGTTACT
ATTTCCAAGGATGAGGGTAAGGTCTTAGCAGGTCCAGATATAATTTCCAGAGGATTCGTATATGTAAGAG
AGTCAGAAGATTTAATGGATGGAGCAAAGGATATAATTAAGAATGTTCTAAATGAATGTGAAGAGAAAAA
TATTAAAGAATGGGCTTATTTAAAGAATAATATTAAAGAAAACCTAAAAGAATATTTATATCAAAAAACT
AAACGAAATCCAATGATACTTCCTATCATAATGGAAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:1356519-1356719 putative small acid-soluble spore protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGATGATGTTTCAAGACAAAATGCTATAAAAGCTTTAAAACAAACAAAAATGGAAATAGCAGGAGAGT
ATGGAATGAATTATGAAGATGCTTTTGAAATAATAGAAAATGCGTCTAATAAAGGTGTTTTAGAAGGTTA
CTTTAAAAAGCTTGAAAAGAAAAAAAATTTAGGTCAAGGTATATCTAGGCATTTAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1356773-1357936 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein) [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAATTAGCTAGTACTGCTTTGGCTATATTAATTGCGCTTACTCCTTTAAGCTTTTCTTTTGCAA
ATAATAAGGAAAATGCTGATGCCAACCAACTAAATATATCTTCAAAATCAGCAATTTTGATGGATGTTGG
TAGTGGACAAATTTTATATGAAAAGGATGCTCATAAAAAGCTTCCTCCTGCTAGTGTAACTAAGGTAATG
ACTATGCTACTTATAGTAGAAGCTTTGGATTCAGGCAAGATTAAGCTTGATGATGAAGTTCAAGTAAGTG
AAACTGCATCTAGTATGGGTGGTAGTCAAATATTCCTAGAGCCAGGAGAAACTCAAAAGGTTGATACATT
ATTAAAAGGTATAGCTGTTGCTTCTGCAAATGATGCTTGTGTTGCTATGGCTGAACACTTAGCTGGAAGT
GTTGAAGGATTTGTTGATAGAATGAATGCTAAAGCAAAAGAGTTAAATATGAATGATACTCATTTTGCAA
ATACAAATGGACTTCCAGTTGCAAACCACTATACATCTGCTCATGATATAGCTTTAATGTCTAGAGAACT
ATTAAAACACGAAATGATAAGTAAATACTTAACTACATGGATGGATAAGGTTGTAGTAGGGAAGAAACAA
GTTACAGTAGGTCTTGCAAATACTAATAAACTTATAAAGCATTATCAAGGAGCAACTGGTGTTAAAACTG
GTTTTACTCAAGAAGCAAAATACTGTTTATCAGCATCTGCAAAGAGAGGTAATACTCATCTAGTTGCTGC
AACTTTAGGAGCAGAGACTTCTCCAGAAAGATTTAATGATGCCTCTAGCCTTTTAAACTATGGATTTGCT
AATTATGAAAGTGTTAAGTTATGTAGTAAAGGTGATAATATAGCAACACTTACATTGGATAAGGCTGATG
AAAACAAAGTTAAATTGGTTGCTAAAGAAGATTTAAATGCTCTTATTAAAAAAGGAAGCTCTAAAGAATT
TGAGAAGAAAATTGAAATAGTAAAAAATCCTAAGATGCCAATTAAAAAGGGAACTGTTTTAGGAAAAATA
AAGATATGTAAAGATAAAAAAGTAATAGGCGAAGTGGAATTGATAAATACTAAGGATATAAATAAGGCAA
GCTATCTACAAATGCTTCAAAGAATAATTGATAATATGATATAA
>ref|NC_013316.1|:c1358569-1358147 hypothetical protein CDR20291_1132 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATAAAAATTCAAAATGTGTCATGGTAATAGACGAAAATTTACCAATGGGAATTATATCCAATA
CAGCAGCTATAATGGGAATTACACTAGGAAAACATGCCCCAGAAACTGTTGGGCCAGATGTAATTGACAA
AACAGGTAATAGCCACTTAGGAATTATTGACATTCCTGTACCTATTTTAAAAGGAAACAAAGAAATAATA
AAAGATTTACGTAAAAAATTATATACTTTGGAATTTAACGATTTAACTGTTGTAGATTTTTCAGATGTAG
CACAAAGTTGCAATCTTTATGAAGAATTTACACAAAAGATTGCTAGTGTTCCAGAAGATGAGTTACAGTA
TTTTGGGATAGCAATTTATGGGAATAAAAAGAAAGTGAATAAACTTACTGGTAGTATGCCTTTACTTAGA
TAA
>ref|NC_013316.1|:c1359426-1358590 AraC-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
GTGAGACAAGAAGAACGCACAGTATGCTTTGATAGGGAATTAAAAATTGAAGCATATAGATTTAAAGGCA
TAATGCAAAAATTCCCAAACCATTTTCATGAACATTATGTAATTGGTTTTATAGAAAAAGGTCAAAGATA
TTTATCTTGTAAAAATAAAGAGTATACCACAAGTACTGGAGATTTGCTACTTTTTAACCCTTTTGACAGT
CATACTTGTGAACAAATAGATGATAAAGTACTTGATTACAGATGTATCAATATTAAGCCAGAAATAATGA
AAAAAACCGTCTTTGAAATTACAGGTAAAAATTATTTACCAAAATTTAATCAACCTGTTATATTTCGCAG
TGAGCTAGTACCTCTACTACAAGAATTACACTATATAATCATGGAAGAAGAATTGGATTTTAAAAAGGAA
GAGCTTTTTTTCTTCCTAATTGAGCAATTAATTGAAGAACATACAGAGCCAAATTTGCAATCTAACTTGG
AAAATACAAATATAGAAATTCAAGCAGTATGTGATTATCTAGAAAATAATTATGCTGAACATATAGTACT
TGACGAATTAAGCACTATAGCAGGTATGAATAAGTACTCTCTACTTCGTAATTTTACGAAATTAAAAGGT
ATTACACCATATAGATACCTAGAAAATATACGGGTAAACAAAGCTAAAAAGCTTTTAGAAAAAGGCGTAG
AACCTATAGATGCTGCGATACAAACAGGATTTGTAGACCAAAGTCACTTTACAAACTTTTTTAAGAATTT
TATTGGTCTTACACCAAAGCAGTATCAAAATATATTTATAAATGATGATTCAAACAACTTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1359724-1360320 putative membrane-associated peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAGTATGAATATAGGAGAAATAGTAGCAAGTTTAGTTGGTATAGCTATGGCAATATCAATACATG
AGTTTGGCCATGCTTATTCAGCTCACTTATTGGGAGATGATACAGCTAAAGCTTATGGTAGAATGACATT
AAATCCTGTAAGACATGTTGATCCAATAGGTCTTTTGGCTATGTTTATCCTTAAGATAGGGTGGGCAAAG
CCAGTACCAGTAAATCCAAATAATTTTAAAAACTATAAGATAGGAAACCTGATAGTTTCACTTGCAGGCG
TTTTTTGTAATGTTTTGACTGCTATACTGTGTGTAATTATCAATAAGTATGTGCATATGTATGCTATAAA
TACAATAGCTGGATATGTGCTTATATATAGTATGGGATTTGCAGCTTTTAACTTACTTCCGATACCTCCA
CTTGATGGATGGGGAGTTATATCTACATTTGTACCATATAAATGGAATGAATATTTGTATAAATTTGAAA
GTATGAGTTATATAATTTTATTAATTGCTTTATTTACTGGTATATATCAAATAATACTATCACCAATATA
TACAGTGTTGCTAAAAATAGTATATTTATTTGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1360350-1361069 segregation and condensation protein A [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGTATAATATACAATTACAAGTCTATGAGGGACCATTAGATTTACTTTATGATTTAATAACAAAGC
ATAAAATAGATATAAAGGATATATCTATAATAGATATAACTAAGCAGTATCTAAATTATTTGAAAATGCT
AGATAAAATGGATTTAGAGATAACTAGTGAATTTATAACTATGGCATCAAAACTTTTAGAGATAAAGTCT
AAATATCTGCTTTATAAGCAAAAAGATGAAGAAGAAGACCCAAGAATAGAACTTATGGAAAAGTTAGAAG
AATATAGAAAGTTTAAGGTAGCATCACAAGATATAAAAGAAAATATAACTTATGTTAATGAGAGATTTTA
TAGAAATAAAGAAGAGATAATTATTGATGACAATGTGGATTTAGAAGATATATCAATTGAAGCAATAAAA
AATATACTTCCATACATATTTAAAGTTAAAACATCACAGATAGAAAATGCTAATGATGAGAAACTAGACA
AAATAGTAAGGAAGAAGATAATATCTGTGGAAGAAAAGATATTGTATATAAGAGATATTATAAAAGATAA
GATTGAAGTTACTTTTACAAATATTATAAAATCATATGAAAATGATGAAATAATAGCTACTTTTTTATCT
ATATTAGAGCTTATAAAAGAAAAAGAAATAGTAGTAGTACAAGACATATTTTTTGATGATATTCTAATAA
GAAAAAGTTCGGAGTGTTAA
>ref|NC_013316.1|:1361071-1361610 segregation and condensation protein B [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGAGAAGATATAAAGTATATTATAGAATCTGTTATGTTTGCATATGGGGAACCAATAAGTATAA
AAGAATTAAACTATATAATAAATAAAGAACTTTCATCAAAAGAAATAGAGATTATGTTAAATTTACTTAT
TGAGGAGTACAGAGAACAAAATAGAGGTATTCAAATAATCAAGCTAGAGAATAAGTACCAAATGTGTACA
AATAAAGACTATGCAGAATATATAAAGAAGATTATTGAACCAAAGAAAAAGAAAAGTTTGAGCCAAGCTA
CATTAGAAACTCTTACTATAATTGCCTACAAACAACCAATAACAAAGGTAGAAATAGAGGATATAAGAGG
AGTAAAATGTGATAAGGTATTACAAACTTTGTTTGAAAATGAACTTATAAGAGAAGCTGGTAGATTGAAT
AAGATAGGGAAACCAATAATTTATAAAACAACAGATGAATTTTTAAAGTTGTTGAATATAGAAAGTCTTG
AAGAATTGCCGCCTATAGAAAATTATCAAGAAGTGGCAACAAATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1361772-1362401 hypothetical protein CDR20291_1137 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGCTTAATGAATTATTTAATTTTAAGTATTTAATAATAGCTGTAATTTTTATTATAAGTGTAACTA
TGTTGATTTTAATATCTCATATAAACATCTTAATAATAGCTGATATAAACAACAAAGATATTTGTTTAAA
GCTTAATATAAAATACATGTTTAATTTAATAAATATAAATAGACAACTTTATCCAGCTGAAAATAGTAAA
AATAATGATAAAAAAGAGGGGATGAAGAATAATATAGATTCAAGTATATTATTAGCTGATGACCTTTTGA
GCATTTATAGATTATTAAAAAAGATAAAAATACATGAACTTTATTCAAATATTAATTTTGGAACTGGAAA
TATTGGCTTAACATCTTCTGTATATGTATTGATAAATACTTTGTATGGAAATTTATTTAATATGATTGAT
GCAGAAAAAATGTATTTAAATGTAAATCCAGATTTTACAAAAGATTATGTTTTAGGAAATATAAGGATAC
ATATAAGGCCAAGAATAAAAGCTTTATTTAATATTATAATAATGATTAATAAAATTATGAATAAAAATAA
AGGAAATAAGGAAGGTGATAGTAATGAGAGCAACAGGTTCGATACAAAGTCTTATGGAAACAACTCTTGA
>ref|NC_013316.1|:1362385-1362783 hypothetical protein CDR20291_1138 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAACAACTCTTGAAACAATTAAAGGTTCTATAGATGCAAATACTATTATAGGAGACCCTATAAAAA
CAGATACTACAGTGGTTGTACCTATATCAAAGGTTACAATTGGCTTTGGTATAGGAGGAGGAGAATACTC
AAAAGGATATGATGATAAAGATAGGGAAATTGAATTAAAAAATGAAAAATCAGATACGAATTTTGCTGGA
GGTAGCGCAGGGGCTATATCTGTACAACCAGTAGCATTTGTAGTAGTTGAAAGTGGAGAGACTAGAATAA
TGAGTTTAGACAGTAATATCAATCTAGTGGATAATATATTATCTATAACTCCTAGAGTATTGGAGAAAAT
TCAAAATATATCACAAAGTAATAAGAATCAAGATAAAAACAATATGTAA
>ref|NC_013316.1|:1363031-1363471 MarR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCGATAAAGAATTATCTATTTTGTTGTTAGAAAGTATGAATAATTTTCATAATTTAATAAAGATTA
TTAATAACGAAAGATATAAAAAAGATAAGGTTCTTACAGAAAGACAGTTCTTTGCCTTAGTAAAAATAAG
AAAACATGATAAAATAGAGCTTAAAAATCTAAGTAGAGATTTACATGTATCTACTTCTAGTCTGTGTATA
CTACTTAATAAATTGGTTGAGCAAGAGTATGTATATAGGGAAGAAGATAGTAGAGATAGACGAAATACTT
TTTATGGAATAACTAAAAATGGAGAAAAGATATTGGATAATGAAATACTAAAGTTTGTATCTATAATAAG
TGATAAAATGGATTGCTTAGATATAGATAATAAAGATAAATTATTTACTTCTTTGGAAGAGTCTAAAAAT
ATAATAGAACAATTATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1363487-1364938 putative cytosol aminopeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATAAAGTATTCTAAAGAGATATTAAAAAGTTTAGAAAATGCTATAACAGTAGTAGCTCTATTTG
AGGGAGAAGATGTTTCTACGACATTTGATAAAATAAATATGATAAGCAGAAATTTTAATTCTAAAGAAAA
TAGTATAGATACTGTAACATTGGTTGAAAATAACAACTTGGTAAATGTTTGTCTTGTTGGTTTTGGTAAG
AGAGAGTTATTGAATAGAGAAAAAATTAGAATCATAGGTGGTAATTTGTGTAAAAAATTAAAAAATATAT
TGAAAAATGAAGCATATAAGAGTAGTGATGTTAATGTACTTAATCTTAATTTAAATAGTGATGAAATAGG
TTCTTTTGTAGAAGGGATATTACTTGGAAATTATAAGTTTGATAAGTATAAGACAAAAAGTAAGGATTTT
GAAAGAAAAGAAGTTGATACTATAACTATATTTACTGAAAAAGAAGTTGAGTGTCAAATAGAAAAGGCTA
AAATATTAGCTAATTCAACTATAATAGCTAGAAATCTAGTTAATGAACCATCAAACGTAATATATCCAAA
AACATTAGCAATAGAAACAGTTAAACTTGGTGCAGAGTTCGGGTTTAATGTTGATGTTTATGAAGAAGAA
AAAATAAAGGCATTGGGAATGGATGCTTTTTTCGCCGTTTCAAGAGGTTCAATCAATAAACCAAGATTCA
TAGTAATGAGATACTTTGGAGATAAAGAAAGTACAGATATATTAGGTCTAGTAGGTAAAGGATTGACTTA
TGATACTGGTGGATATTCTTTAAAATCAAATGCTTCTATGCTAGATATGAAGACAGATATGGCTGGTGCT
GCGAGTGTTATAGGTGCTATGTGTGCTATATCTCAAAGTAAATTAAAGAAAAATGTTATAGCAGTAGTGG
CTGCATGTGAGAATGCTTTATCAGGAGGTTCATACAAACCTGGAGATATAATTAGTTCTATGGCAAAGAA
AACTATTGAAGTTTTAAATACGGATGCCGAAGGTAGACTTACATTAGCTGATGCAATATACTACATTATA
AACAATGAAAAAGTAACAAAGGTAGTTGATGTAGCTACATTAACTGGTGCTGCTTTAACATTGTTAGGAA
ATGTTGCAACTCCTATAGTAACAAATAATGATGATTTTTATTGTGAATTAGAAAAAGCTGCCACTTTATC
AGGAGAAAGGGTATGGAAGATGCCAATTTATGATGAATTTAAAGATATGATAAAAGGAGAAGAAGCAGAC
CTTAAAAACACTGGTGGTAAAAATGCTGGATGTATAACAGCAGGAGCTTTTATTGGTGAATTTGTTGGGA
ATACTCCTTGGATACATATGGATATAGCGGGGACAAGTACATCATCAAAATCAATTGGATACAAAGCAAA
GGGGGCTACAGGAGAACCTGTTAGAACATTATACTATTTGGCAGAAATCTAA
>ref|NC_013316.1|:c1365697-1365029 hypothetical protein CDR20291_1141 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAAAATTTTTCTTTTTTCTAGTGAACAATTTGTAAGTCTCTTTATATTTGGATTATTTTTATACT
ATTGTCCAAAACTAACCAAAAATATTTTACCTTATAGCTATACAGTTGAGAAGATAATTTGTACATTACT
TGTAATAATTATGGCTCTAGAGCAATTATTACTTATTTCTTCAGGTAATTATAGTACTCTAAACTCTTTA
CCAATTGGAATCAATTATATCTGTATATATCTGTGTATAGCCATACTAATTTTTAAGCAGTATCATCTTT
TTAATATATTTTTTTCTTGGAGTTTAGTTTGTTCAGTTGGAGAACTCATTTTTTCTAAAAACTTGGGCTA
TGAATTTCCTAGCTTAATATATTTTATATTTATCTTCTCTAAGTGCTTGATAATTTATGCAGATATATAT
ATGGTTGATGTTAGAAAATTTAGAGTTAACAGATATGCACTTAGAGATAACTTAGCTATATGTTTTATTT
ATTTTTCATTCATATTTTTACTAAACACATTTACCAACTCACAATACTATTATGGTTTTTTAAGTCATAG
CACAACTGCTATTTTTACGTTTATTTTTGTTACTAGTATTATGTACATACCTGCTCTTTTATTTAATAGA
GATACTTTTATACTTGAGAAAAAGAAAAAGAGTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1365966-1366106 hypothetical protein CDR20291_1142 [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAATAATAGAGTCAGCATCAAAATTGGCTGAGATGGTTCATTTATTGGCTGTTGAAAAGGGGATAA
CTGATATAGAAGCATGGGATGAAGCTGTGAAAGAATACAGCAAAATTTATGAAGAAAGAAGAAATGAATA
G
>ref|NC_013316.1|:c1366601-1366281 putative pyrophosphohydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACTAAAAACTATATCTTTACCAGAGCTTAATAATTTAGACCCAACACTAGAATCTACATTTATCA
AAATGGGTGAAGAACAAGGTGAATTAGCTGAATGTATAGGTAAATTCAGAAATCTAAGTGGAGAAAATAA
TGATTTAGATGAAGTTGATATTATAAAGAAAACTGCTAAGGAACTAATGGATGTAGCTCAGACATGTGTT
ACTATGATGTTTAAGCTAGAAGAACAATATGGTATTAATCTTGATGAAATACGTAAGGAGCATATAAAAA
AGCTAGAAAAAAGAGGTTACATAAAAAATATGGATAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c1367458-1366721 putative NAD-dependent deacetylase (Sir2-family regulatory) [Clostridium difficile R20291]
ATGGATGCAAATAGCTTAAAAGACTTAATAGCTAATCACAATAATATTGTATTTTTTGGTGGAGCAGGTG
TTTCAACTGAATCTAATATTCCAGACTTTAGAAGTTCTACTGGATTATTTAGCCAAAAACTCAATAAACA
ATTTACTGCTGAACAATTAGTTTCACATACTTTTTTTGTTAGATATCCAGAAGAATTTTTTGAATTTTAT
AAGGATAAATTAATATATCCTAATGCAAAACCCAACAATGCTCATATAGCTTTAGCAAAACTCGAGGAAA
TGGGTAAGCTTAAAGCTGTCATAACTCAAAATATTGATGGACTTCATCAAATGGCTGGAAGTAAAAATGT
GCTAGAACTTCATGGTTCTGTACATAGAAATTATTGTACTAAATGTGGTAAGTTTTTTGACTTAGAATCT
ATGTTAAATCTGGGAGGTAATATTCCTTATTGTGACAACTGTGGTTCTATAGTAAAACCAGATGTAGTAC
TTTATGAGGAAGCTCTTGACAGTGATGTCATTACTAAAACAATTTCTGCTATAAGTAATGCTGATTTATT
GATTATAGGAGGTACATCATTAGCTGTGTACCCAGCAGCAAGTTTTATAGATTATTACAAAGGTGATTAT
ATTGCTCTTATTAATAAAGCAAATACAGTCTATGATAAGTCAGCTTCTCTTGTAATAAATAAACCTATTG
GAGAAGTTTTATATGAGGCTGTATTAAGACAAATATAG
>ref|NC_013316.1|:1367673-1369496 putative mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase [Clostridium difficile R20291]
GTGAAGAAAAAAGCAGCTTTAGCAACATTGGCTATGTTACCCTTAGGTGTGGTAAATGCACATGCTGATG
GAGATATAGGTATAGTGACTATAAATTATTTAAATGTAAGAAATGAGCCAACTGCCGAAAGTAGCATAGC
CTTTGTTGCTAAAAAAGATGATAAAGTTTTGATTAAAGACTCTTCTAATGGATGGTATAAAATAAAAGCT
GAATCTGGACAAGAAGGTTGGGCTTCATCAAAATATATAGCAAAATCAAATAGTGACTCTTTAAGAACGT
CTACAAATAAAGAAAAACAAGTTATTTCAAATAGTTTAAATATGAGAAATGGAGCAGGTACAAGTTACAG
AGTAATAACTGTACTAAAAAAAGGTCAAAAAGTAGAAGTAATATCAGAGAGTAATGGATGGTCTAAAATC
AAATATGATGGAAGACTAGGATATGTATCTAGCTCTTATTTAGGAGACGTTTCAAATTCAACTAATAAAT
CAAAAACTAAACAAGTGAATACAACTTCACTAAATGTAAGGAGTGGACCAAATACAAGTTATGGTTTGTT
AGGCAAGTTGCCAAAAGGAAGTAAAGTAGAAGTAATATCAGAAAGTAATGGATGGTCCAAAATAAAGTAT
AATGGAAAAGATGCCTATATATCTAGTATGTACTTATCGGATGTAAGTCAAAGTAATTCAGACAATTCTA
GTCAAAGCAATGATAAAAAGAATACTGATAAGGTTGTAAATACAGCTTCTTTAAATGTAAGAAGTGGACC
AGGTTCTACATATAGTAAGTTGGGAAAAGTTTATAAAGGAAGTAAAGTAACTGTACTATCAGAAAGTAGT
GGATGGGCTAAGATTAATTTTAACAATAAAGAAGCATTTGTAGTAGGCAATTATTTATCTACTTCAGCAG
ATACTTCAAATAATAACTCAAATAGTAACTCTGATAACAGTTCTAATAGTAATGGCAATAATTCTTCATC
ATCAGGTCAAGTAAATGGTATGTCAGGTATAAGTGGGGCTAAAATTGATTATAAATCTTTGAGTTATACT
TTAGAATCTCATATAAGTAAACAAGTTGAGAAAGCAGCATCAGGAGGAAATGTGATAGCTCCAAGTAATA
GGAAAAGCACTCCAAGTCCTGAATTTAGTACTTTTTCAGCTCAAAGAACAAGCTCATTTGTAAATGCAAG
TTCAAGTGATATAGAATATTATTTAAATCCTAAAAATTTTACAAATACTACTAAAGGTATGATGCAGTTT
TTAAAGATTAACAGTTATAGAGATGGTATTTCAGAATCAAGTCTTAACTCGTATCTTAATGGTTTATCTT
CTAGTGTATTTAAAAACCAGGGAGCAGCCTTTATAAATGCTGCCAAGAAGTATAATATAGATGTTGTATA
TCTAGTATCTCATGCTATGTGGGAAACTGCTTATGGTAAGTCTACACTTGCCCAAGGTCAAACATTAACA
TCTTATAAGGGACAACCTCTTAGTAAGCCAGTTAAAGTATACAATTTTTTTGGTATAGGAGCAATAGATA
AAAGTGCTAATGTTTCAGGTGCAGAAGCAGCGTATTCCAATGGCTGGACTAGTGTAGAAGCTACAATAGA
TGGCTCTGCAAAGTGGATATCACAAAATTACGTAAATAGTTCTAAGTACAATCAGAATACTATCTACAAG
ATGAAGTGGAATTATGATTATACATGGCATCAGTATGCAACTGATGTAAACTGGGCTAATGGAATTTCTG
GAATTATGGAAAATTTAATTGGTCTTTATGGAGGAGGAAGTAGTTTGGTTTTTGAAGTTCCTCAATATAA
GTAA
>ref|NC_013316.1|:1369711-1374009 DNA polymerase III PolC-type [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAGTATTAAGGAATATTTGGATAAGTTAGAAATTAATAATAGTGGTCTTGGAAAGCAACTTAAAG
AAGTTTATATAAATAGAGTAGTTTATTTTAAGGAAGATAAGATAGTTTATTTTTATCTAACTTCTAAAGA
TATTGTTTCTCATGAACTTTTAGATAAATTTAAAGAAGAATTGATGTATAAACTCGATTATTTTAAAGAT
ATGAGGATGAAGATAAGATTTACTGGTCTTGAAAGAAAATCCAATAAAGATGTTATAAAAAAATATTGGA
ATAATATATTGTATATATTAAAGTATCTTTGTCCATCTATTGCAGGGTGGTATAAACAAGTAGAATTTCT
TTGTTTAGAAGAAGAATTAAAAATAAAACTTCCAAAAGGTATATTTTATGAGCGATTAATGAAAAAAAAT
GTAACTTATGTACTTAAAACCGTGCTTAGCGAAGAGTTGGGATTAGATTTAAATATAACAATAGAAAAAG
CTGTTGATGAAAAGGTAAATAAAGAAAGACTCATAAGAATCAATGATAGAGAAATGGAAGAAAAAATTAG
GGCTTTAGAAATTGGAAAAGTTAATAACTGTGAAGAAAATGAAGAGGAAAGCTATGTCATTAAGTCTGAT
GTAGATGAAAATTTAATCTATGGAGATAATGCAAATGCTATGATTGAAAATATAGTTGAATTAAATGCAT
CTTCTGGAACAGTTGCAGTTGTTGGAGATATATTTGATGTTGACACTAAAGAACTTAAAAACGGAAAAAT
ACTTATGATAGCTTCAATTACAGATTATACTAGCTCAATAAGCTGTAAACTTTTTTTAACAGATACAAAT
AAGGATGGAGTACTTGAAAATGTTAAAAAGGGAGCATACTTAAAAATCAAGGGTGACATAGTTTATGATA
CATATCAAAGAGAAATTAGTATGATGATTAGTGGGATAAGAAAAGAAACTAGAATAGAGAGAGAAGATAA
ATCAGAGGAAAAAAGGGTAGAACTCCATGCACATACACAAATGTCTTCTATGGATGCTATTTGTTCTGTT
AAAAAGCTTGTAGAGCGTGCAGCCAAATGGGGTCATTCTGCTATTGCTATAACAGACCATGGTGTTGTAC
AAGGATTTCCAGATGCTATGAATGCAGGTAAGTCAAATAATATAAAAATACTTTATGGAGTAGAAGGGTA
CTTGGTTGAAGATGATTCTCTCATTATAGAGGATGCAAATGATAAAGAACTTTCGCAGACATTTGTTGTA
TTTGACATAGAGACAACTGGTTTTTCTAATACAAATGATAAAATAACTGAGATTGGTGCTGTAAAAATAG
AAAACTTTAAGATTGTAGATAGATTTAGTGAGTTAATAAATCCTGAAAAAGATATTTCCTATAAGATACA
GGAATTGACAGGAATAACTAATGAATTAATTAAAGACAAGCCAACCATTGAAGAAATTCTTCCTAAGTTT
ATGGAATTTGTTGGAGATAGTGTATTAGTAGCACATAATGCAGAGTTTGATACCGGATTTATATCGCAAA
AATGTAGGGAACAAGGCTTGTTATATAATAACAAAAAAGTAGATACACTTATGTTAGCAAGAGTAATGTT
GCCAAACTTAAAAAGACATAGATTAAATGTCGTTGCAAAAGAACTTGGTATTCCTCTTTTAAATCACCAT
AGAGCAGTGGATGATGCTGAGGCTACAGCACTTATATTTAATAAGTTTTTGCAGATGCTTACAGAAAAAG
GTGCAAAAACTCTAAGTGATGTAAACAATATACTTGGAAAGATTGATTACACAAAGCTTAGCACAAATCA
TATAACCTTGATAGCAAAAAATTCTATAGGTATAAAAAATTTATATAAAATAATTTCAGATGCACATGTA
AATCATTTTTTTAGAGCACCAAGAATCCTTAGAAGTGTATTAAATGAATATAAAGAAGGATTAATAATTG
GTTCGGCTTGTGAAGCTGGGGTGGTTTTTCAAGCTGTAAAGAAAAACGTGTCTGATGAGGAAATGAAAAA
AATAATAGATTTATACGATTATATTGAAGTAATGCCTATAGATAATAATAGATTTATGATTGATAAAGGA
GAAGTAAAGGATGAAGAAGAGTTAAGGGAGTTGAATAGGAAATTAATTGATACAGCCAAAAAATTTGACA
AAATTCCAGTAGCTACTGGGGATGTTCATTTTTTAGACAAACATGAAGCTGTCTTAAGAAAAGTTCTTAA
ATATTCTCAAGGTTTTAAAGTAGATGAAGAAGAAACTTATTTACATTTTAGAACAACAGATGAAATGTTG
GAAGAGTTTAGTTATCTTGGAGAAGAATTGGCATATGAAGTTGTAGTTGAAAATAGTAATCTGATTGCCG
ATATGGTTGAAGATATAAAACCTATACCAGATGATACTTATCCTCCAATTATAGAGGGCTCAGATGTGGA
GTTAAGAGAAATGTGTTACAAAAAAGCCAAACGAATCTATGGAGACCCAATACCAGAAATAGTTCAAAAA
AGACTGGATAGAGAATTAAATTCAATAATAAGCAATGGGTATGCAGTTATGTATATTATAGCTCAAAAAC
TGGTTGCAAAATCTCTTTCAGATGGATATTTAGTTGGTTCAAGAGGCTCAGTTGGCTCATCTTTTGCAGC
TACTATGAGTGATATAACAGAAGTTAATCCTCTTCCAGCACATTATATTTGTGAAAACGAAGACTGTAAA
TATTCATTCTTTTATGAAATAGGTGAATGGGGCTCAGGTGTTGATTTACCAGACAAGGATTGTCCAAAGT
GTGGAAGAAAACTTGCTAAAAACGGTCATGATATTCCATTTGAGGTTTTCTTAGGTTTTGAAGGTGATAA
GGAACCAGATATAGACTTAAATTTCTCAGGAAATTATCAGCCAACAATTCATAAATACACAGAAGAACTA
TTTGGAGAGGGGTATGTATATAGGGCTGGGACTATAGGTACTGTAGCAGAAAAAACAGCTTTTGGATACG
CAAGAAAATATGTGGAAGAAAATAATATAAGTGTACCAAATGCAGAAGTACTTAGGCTTTCAAATGGATG
TACTGGAGTAAAAAGAACCTCAGGACAACATCCTGGTGGAGTTATGGTTATACCAGACTATAAAGATGTA
TACGATTTTACACCTATACAGTATCCAGCAAATGATACTTCTTGTGGTGTTATAACTACTCACTTTGATT
ATCATTCAATAAGTGGTAGAATACTTAAACTTGATATACTTGGACACGACGGTCCTACCATTATAAGGAT
GCTTGAAGATATGACTGGAATAAATATAACAGAAATTCCTTTAGATGATAAAGAGACTATGTCTCTATTT
ACATCTACAGAAGCATTAGGTGTTACACCAGAAGAAATAAACTGTCCTATAGGTTGCCTTGCTGTACCAG
AGTTTGGAACTAAGTTTGTACGACAGATGTTACTTGACACCAAACCCACTACATTTGCAGAACTTGTGCG
TATATCTGGTCTCTCTCATGGGACAGATGTTTGGGTAAATAATGCACAAGACTTAGTTAGAGAAGATATA
GTTGGATTAAAAGATGTTATATCTACACGAGATGACATAATGAACTATTTAATATTTAAAGGATTACCTC
CCAAAATGAGTTTTACAATAATGGAGAGCGTAAGAAAAGGTAAAGGTCTAAAACCAGAACACATTGAAGA
AATGAAAAAAAATAATGTTCCAGAATGGTATATAGGCTCATGTAAAAAGATTAAGTACATGTTCCCAAAA
GCACATGCTGTTGCTTATGTAATGACATCATTTAGAATTGCATATTGTAAAGTTCACTATCCAGAAGCAT
TTTATGCGACTTATTTTACGACAAAAGTTGAGGATTTTGATGCAGATTTAATTGTTAAAGGATTAGATGC
TATAAAATCAAAAATAAATGAAATTGAGTCACTGGGAAATGATGCAACCACAAAAGAAAAAGGTATGTTG
ACCGTTTTAGAAGTTGCTCTTGAAATGTATGCTAGAGGAATAAAATTATTACCAGTTGATATATATAAAT
CAGATGCAACTGAGTTTATAGTTGTAGGAGAAAAAACATTACTTCCACCAATGGCAGCAATACAAGGGCT
TGGAGGAAATGCGGCTATAAACATCCAAAATGAAAGAAAAAATGGTGAATTTATATCAAAAGAAGATTTG
AGAAAGAGAACAAAAATATCAAAAACGGTAATAGAAACTCTTACTAATCATGGTTCACTTGAGAATATGA
GTGAGAGAAATCAATTGTCATTGTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1374213-1374674 hypothetical protein CDR20291_1147 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAAATTTAGAAGCTACAATTGAGGAGATTGTAACTAAAATAACGGATGAACATGGATTTGAAA
TGGTTGATGTTGAATATGTAAAAGAAGCAGGAGAATACTACTTAAGAGTATACATAGATAAAGAAGAAGG
AATATCTTTAAATGAATGTGAATTAGTTAGTAGAGAATTAAGTCCAATACTAGATGAAAAAGACCCTATA
AAAGAAAATTACTTTTTAGAGGTATCTTCTCCAGGACTTGATAGAGCATTAAAAAAAGACAGAGATTTTG
TTAGATATCAAGGTAGAGATGTAGATTTAAAATTATATAAACCATTAAATGGATGTAAGCAATTTGAAGG
TGAACTTGTAGGATTAACAGAAGATAATAATATAAAAATCATTGCAAATGGTAAGGAAATGGAATTTAAT
AGAAAAGATGTTGCTATTGTCAGATTAGCAATAAAGTTTTAG
>ref|NC_013316.1|:1374704-1375858 transcription elongation protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATCATGAATTTATGGAAGCATTAGATGAATTAGTAGTTGACAGAGGTATAGATAAAGAAATACTTA
TAGATACTATAGAACAAGCTCTTTTAACTGCATACAAGAAAAACTTTGGTTCAGCACAAAATGTTAGAGT
TGAATTTGATAGAGACAAGGGAGATATAAAAGTATTTTCTCAAAGAGTTGTTGTTGATGAATCAGATTTA
TATGATACTTTCTTAGAAATAGAGTTAGCGGATGCTAGAGAGATAAACCCTAATTATGAATTAGGTGATA
TTATAGAACATGAAGTTACACCTAAAAACTTTGGAAGAATTGCAGCTCAAACAGCAAAGCAAGTAGTTGT
TCAAAGAATAAGGGAAGCTGAGAGAGAAATAGTGTATAATGAATTTATAGAAAAAGAAAATGAAATAGTT
ACAGGAGAGGTTGCTAGAGCAAATAAAAATGTTGTTTATGTAAATCTTGGAAGAATAGAAGGTATAATGA
CTCAAAGTGAACAAATACCATTTGAGAATTATAAAGCAGGTCAAAAAATAAAATTCTATATACTTGAAGT
TAAAAAGACTAACAAAGGACCTCAAATAGTTGTATCAAGAAGTCATCCGGGTCTAGTAAAGAGATTGTTT
GAAGAAGAAGTTCCTGAAATATATGAAGGAATAGTTCAAATAAAATCTGTAGCAAGAGAAGCAGGGTCAA
GAACTAAAATGGCAGTAAAATCTATAGATGAAAAAATAGACCCAATTGGAGCTTGTGTTGGACCAAAAGG
ACTTAGAGTAAAAAATATAGTGGATGAACTTGGCGATGAGAAAATAGATATAATAAAATATAGTGAAGAC
CCAGCAGAGTTTATATCAGCAGCACTTAGCCCATCAAAAGTTGTTAGAGTAGATATAGATGAAGATGAAA
AGTCTGCCTTAGTAATCGTTCCAGATTATCAGTTATCGCTTGCTATAGGTAAAGAAGGTCAAAATGCAAG
ACTAGCAGCAAAATTGACTAACTGGAAAATAGATATTAAGAGCGAATCTCAAGCAGAACAAGAAATGTTA
AATCTTGAAAATTCCAAAGAAATAGAAGCTGAGGATGTTGAAGCTGAATTTATCGACCAAGAAGAGTTAG
GTACTTCAGAGGATAATTTTAGTGAAGAAGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1375865-1376146 hypothetical protein CDR20291_1149 [Clostridium difficile R20291]
ATGATTTTGAAAAAAGTAAAAAAAGTGCCTCAAAGAAAATGCATAGCATGTCAAGATAGAGACTCTAAAA
AAGAGCTTATAAGAATAGTTAAAAATAAAGAAGGAAAAATATTTTTAGACCCAACAGGAAGAGCCAATGG
AAGAGGAGCATATGTATGTAAAAGCTCTGAATGTCTAAAAAAAGCTATAAAGAGTAAAGCATTAAATAAA
GCTTTTAAAATAGATGTTCCAGATGAAGTCTATGATAATCTACTTATGGAGTTAGAAGAATATGAAAAAT
AA
>ref|NC_013316.1|:1376136-1376447 putative ribosomal protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATAATAAAGAAAAAGTACTTTCGTTCTTAGGGCTCGCAACTCGTGCAGGGAAAATAGTGTCTG
GTGATGATTCAACTTTGCTTGACCTTAAAAAAGGAAAAGTAAATTTGATTTTAATCGCAGAAGATGCATC
AAATAATACTAAAAAACTTTTTAAAGATAAATCAACTTTTAGAAATATTCCATATCTATTTTTTTCAACA
AAAGAGGAAATAGGATTTGCAATAGGAAAATCTCCAAGAGCAGTTGTAGGAATAAAAGATGAAAATTTTT
CTAAAAAGATAATTGAACTAATAGAAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:1376469-1378409 translation initiation factor IF-2 [Clostridium difficile R20291]
GTGTCAAAAACAAGAGTATACCAAATAGCAGAAGAATTAAATATATCAAATGAAGAGCTTATAAATAAGT
TAGCTGAATTAGATATAAATGTAACTGACAAAGATTCAGTATTAGAAGGTGAAGAGTTAGAATTAGCACT
TGAAATGTTAGGTGAAGATTTATCTCAAGAAAATGGAAATGTTATAGAAATAGATGGAAAGTTGACAGTA
CAAGTATTAGCAACGAAATTAGATAAATCTCCATCAGAAATAATTATGAAGCTTATGAAAATGGGAACTA
TGGCAACAATAAATCAAGAGATAAGTTTTGAGATTGCTGCTTTGGCTGCCAAAGACTATGGATTTGAATT
AACAGTAGCTGAAAGTGATGATACAGAAGCTTTAGAAATAGAAGCTTTAATGGAAATTGAAGAAGATAAA
GAAGAGGATTTAAAACCTAGACCACCAGTTGTTACAGTTATGGGACATGTTGACCATGGTAAGACATCTT
TACTAGATGCAATAAGAAAAACTGATGTGATTTCAGGTGAAGCTGGAGGAATAACTCAGCATATAGGTGC
TTCAGAAGTTAAAATCAATGGACACAAAATAGTATTTTTAGATACTCCAGGACATGAGGCTTTCACATCA
ATGAGAGCAAGAGGAGCACAAGTTACAGATATAGCAATATTAGTAGTTGCAGCAGATGATGGTATAATGC
CTCAAACAGTTGAAGCTATAAACCATGCTAAAGCAGCAGGTGTACCTTTAATAGTTGCTATTAATAAAAT
AGATAAACCAGGTGCAAACCCAGATAAGGTTAAACAGGAATTAGCAGACCAAGGATTATTAGTTGAAGAC
TGGGGTGGAGAAGTAATAGCAGTTCCAGTATCAGCTAAGAAAAAAGAAGGAATAGATACACTTTTAGAAA
TGGTATTATTGGTTGCTGAAATGGAAGAGTTAAGAGCTAATCCAAATAAAAGAGCAGTAGGAACTGTTAT
AGAAGCTGAGCTTGATAAAGGAAGAGGGCCAGTTGCAACAGTACTTGTTCAAGGTGGTACTTTAACAGTA
GGTGACCCAATCGTTGCAGGTGTTGCATGTGGTAAAGTTAGAGCAATGATAAATGCAAAAGGTAAGAGAG
TAAAAACAGCAGGACCATCTACAGCAGTTGAGATATTAGGTCTATCAGAAGTTCCACAAGGAGGAGACCA
ATTTGTCGAAGTTCCAACTGATAAGATTGCTAGAAGTGTAGCAGCAAGAAGACAACAAATAGTTAGAGAT
GAAATGTTAAAATCAACTCAAAGATTATCACTAGATGCTCTATTTAGTCAAATGAGTGAAGGTTCTATAA
AAGACCTTAATATAGTTATAAAAGCAGATGTACAAGGTTCAGTACAGGCAGTTAAACAATCTTTAGAAAA
ATTATCAAATGAAGAAGTTCAAGTTAAAGTAATACATGGTGGTGTTGGAGCTGTAACAGAATCAGACATA
TTACTTGCAGCAGCTTCTAACGCAATAATAATAGGATTCAATGTAAGACCAGTTCCAGGTGCAGAATCTC
TAGGAGAAAAAGAAAATGTTGATATAAGAACATATACTATAATATACAAGGCAATAGAAGATATACAAGC
GGCTATGACTGGTATGTTAGACCCTGAATATGTTGATGAAGAAACAGGAAAAGCTGAAATAAGAGAAATA
TATAAAATATCTGGTGTTGGAACAGTAGCTGGATGTTATGTGACTAATGGTAAGATATTTAGAAATTGTA
AAGTAAGATTAGTTAGAGATAGCATAATAATACATGAAGGTGAGCTTGCAGCACTTAAGAGATTTAAAGA
TGATGTAAAAGAAGTTAATTCTGGATACGAATGTGGTATGAGTTTTGTAAATTATAACGACATAAAAGAA
GGCGATATAGTAGAAGCTTATATAACTAAAGAAGTAGAAAGAAAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:1378452-1378832 ribosome-binding factor A [Clostridium difficile R20291]
ATGGCATCATATAATAGAACAAGAAGGATAGCAGAAGAAATAAGAAAAGTCGTAAGTACTATGCTTATAA
ATGGAGTAAAAGACCCTAGAATAACATCTATGGTGAGTGTAACTGATGTAGAAGTTACAAATGACCTAAG
ATATGCTTATGTATATGTAAGTATTCTAGGTGGAGATGAAGAATCCACACTAACAGGTCTTAAAAGTGCT
GGAGGATATATAAGAAGAGAAGTAGGAAAAAATATAAAACTTAGATATATTCCTGAGATAGTATTTAAAC
TTGATGATTCAATAGAAAAAGGAATGTATATGGATAACCTTATAAAAAGAGTTAATGAAAAAAATGCTCA
ACAAAATGAGGATGAAAATTATGATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1378786-1379796 putative RNA-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAATGCTCAACAAAATGAGGATGAAAATTATGATGAATAATATGGATAGTATTATAAACTATA
TTTATGAGGGTGACTATTTTATAGTTACCTCTCATATCAGTCCAGATGGAGACAATGTTGGTTCTACACT
TTCAATGTATTATACATTGAAGAATTTAGGAAAAAATGTATATTATGTACTTGATGATGAAGCTCCATTA
AATTTAAGGTTTTTGGTTGAAGGTGTAAAAATCTATAAGTCTAATGAATTTAATATGAAGAACTATTCTT
TAATTGCACTTGATTGTGGGGATAAGATGAGAATATGTGTGAGTGATGAAATCAAAAATAATGCATCAAA
ATTAATCTGTATTGACCATCATGCTAGTAATGATTCATATGGAGATTTAAATTATGTAGATATTGATGCA
TCTTCTACATGTGAACTAGTTTATAATTTATTGGTTAGATTTCAGCAAACAAAAGATATTAATATTATAA
ATGAAGATATAGCAACATGTTTATATACAGGTCTTGTAACTGATACTGGAAACTTTTCGTATTCAAATGT
ACATGCAAGTAGTTTTGAAATGGCAAAAAATTTACTTGTTTTAGGTGCACAAAAAAATACTATAATACAA
AATATATATCAAAGCAATTCTTCTGATTATTATAAATTATTAGGAGAAGCTCTAAAAGGTTTGGAGATAT
TTGATTCAAAGGTATCTAGTATAGTTTTAACTCAAGACATGATGAATAGAAATAATATTAGCTTTAATGA
TGTTGATGGAATAACAACATATACAAGAGATATAAAAGGTATAGAAGTTGGAATTTTATTTAAAGAGAAA
AAACAAAATGAAATTAAAGTGAGTTTTAGGTCAAAAAATTATGTTGATGTAAGTGAAATAGCCAAGTTAT
TTGGCGGTGGTGGTCATGTAAGGGCTGCTGGATGTACTATTAGAGATAGTATTGATAATGCAAAGAAAAT
GGTACTAGAGGCAGTGTTAAAATCAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:1379809-1380714 tRNA pseudouridine synthase B [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAGATTATAAGTATATTGAAACCCACAGGTATGACATCTCATGATGTTGTAAGTAGAGTGAGAA
AGATTTTAAATATAAAAAAAGTTGGTCATACAGGTACTCTTGACCCAGATGCTTCAGGTGTTTTACCAAT
CTGTATAGGGAAAGCTACAAAAGTATGTGAAGTTATTTTAAACAAAGATAAATCGTATATATGTGAGCTT
ACTTTAGGTATAAGTACAGATACTTATGATGCTTCAGGTGAAATTTTAAAAAAAGTTGATGATTTTAAAT
TTAGTAATGAAGACATAGAAAGAGCTTTTGATACACAAAGAGGAGAGATAAATCAACTTCCTCCAATTTA
TTCAGCTTTAAAGGTAAATGGAAAGAGAATGTGTGATTTAGTAAGAAGTGGTAGACAATCTGAAATTACT
TTAAAAACAAGAAGAGTAAATATAAAAGACATAAAAATACTAAGTATAAAAGGTAATAAAGTAATGTTTT
ATGTTGAGTGTTCTAAAGGGACTTATGTGAGAAGTATTTGCCATGATATAGGAGAATATCTGGGTTGTGG
AGCTCATATGTCGTTTTTGAATAGAACATCTTCTGGTAAATTTGACTTAGATAATTCAATAACATTAGAA
GAATTAGAATTATTTTATGAAAATAAAACTTTAGACAAATACTTATATGATATAGATTATGTCCTTGATT
CGTTTAATTATGTTGTATTAAACCCTAATGCTATAAAATATTATAGTAATGGTGGCTCAATAGATGATAA
AAGGTTTTTAAAAAATAATTTCGATAAAGATGATGAAGTTGTAAGAGTATACAGTACAGATAATTTCTTA
GGATTAGGAAAGTTATCAAAACACAATAATACAATAAGTGTTAAAAGTGATAAGATGTTCATATAA
>ref|NC_013316.1|:1380845-1381774 riboflavin biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGTGATTATAAAATCTATAAAAGAAATAGCAAACATAAAAGAAAGTGTCATTACCATAGGAAATTTTG
ATGGTGTACACAAAGGACATCAAGTTCTTATAGGAAAAACAGTTGAATATGCAAAAAAAGAAAATATACA
GAGTATTGTATTTACATTTGCAAATCATCCTGTAAATTACTTTAGACCAAACTCAACAAAAAATATTATA
AGCAATGATGATAAAATAAAATTATTAGAAGATTTGGGAATAGATATAGTTGTAATCATACCATTTGATG
AGTATATGACTAAAATACCTGCAAAGGATTTCGTAGATGAGATACTAGTAAAAAAATTAAAAGCTAAAAA
GATAGTAATTGGACATGACTTTACATTTGCAAGGGCAAAAGAAGGCAATGTTAATCTATTAAAAAGCTTA
GAACATGAATTTGGTTTTGAGGTAGAAGTAATAAAACCCATCAAAATCAATGATGTAAGAGTGAGTAGTA
CTTATATTAGAAGTTTAGTATCCCAGGGTGATATGGCTAATGTCAAGGAATATTTGGGTAGAAATTACAA
GTTAGAAGGTTGTGTTATACATTCTAAACACCTTGGAAGAACTATAGGATTCCCAACGGCAAATATTGAC
CTTAAGAATAATATGCTCGTTCCAAAGAGAGGTATTTATGCTTCTATTGTACATATTGGAGATGAGACTT
ATTTTGGTGCTACAAATGTAGGCTATAACCCAACAGTTAATGGAAAAACTTTGTCTATTGAAACAAATAT
TTTAGAGTTTGATAGAGATATTTATGGGGAAAATATAATTGTTGAATTTTTGGAAAGAATAAGAGATGAA
AGAAAGTTTAATTCAATAGATGACTTAAAAAATCAATTGTATAATGATACAAATTATGTGTATGAAAACT
ATGTTTGCAAAAACAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1381774-1381872 hypothetical protein CDR20291_1156 [Clostridium difficile R20291]
ATGTATGATAAAATGATTAAGGAAAATAACCATTACTCGGCATTTGAATACTCCAATCAATGCTTAGTAA
TAGGCGTTTCTAAAAAAATACGGAGGTAA
>ref|NC_013316.1|:1381878-1382135 30S ribosomal protein S15 [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAACAAATCAGAAATAATAAAAGAATATGGAAGAGCTGAAGGGGATACTGGTTCTCCAGAAGTAC
AAATAGCTTTATTAACAGCTAGAATAAACGAGTTAAATGGACATTTAAAAACTCATAAGAAAGACCACCA
TTCAAGAAGAGGACTATTAAAAATGGTTGGTAGAAGAAGAAACTTATTAGCTTACTTAAAGGAAAAAGAT
CTTGAAGGATATAGAGCATTAATAGCTAAATTAGGATTAAGAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1382375-1383220 hypothetical protein CDR20291_1158 [Clostridium difficile R20291]
TTGAAAATAAAGTTAGTATGCGATAGTTTGTGCGATATTCCAGATGAAATATCAGAAAAAGATTATATAG
AGATAGTTCCACTTACAGTTATTTTTAATGATAGGGAATATATAGAAGGAGTAGATATAAAGAAAGAAGA
GTTTTATAAAAAAGTAAAAGAAATCAAGCAAATACCTAAAACTTCACAAGCTACATATATGGAGTTTAAA
GAAGTGTTTGATAAGTTCATAACAGAAGGTTATCATATAATCTGTATGACAGGGGCTGCAAACGCATCAG
GAACTTTTCAAAGTGCTATGATAGCTAAAAATGATGTAAATGAAAATGAAAAAATACATATATTTGATAC
TAGAAATTTATCTCTAGGTAGTGGACAATATGTTATAAAGGCATGTGAACTTCTTGAAGAAGGACTGGGA
TTTGAAGAAATTATAGATGAATTAGAAAATACTCGCAGTAGTGTAAGATTACTTTTTGCACCATATACAC
TTGATTTTTTAAAGCAGAGTGGAAGAGTTCCAGTTGCAACTGCTTTGATAGGAAATATGTTAAATATAAA
GCCTATATTTTTCTTTGATAATGGGGAAGCTAAGTTGGTAAATAAGGTTAGAGGAATAAAGAATATAGCA
AGTAAACTGGTCGATATAATTTTAGAAATGAATGAAGGGTCTTTAGAAGGAAAAATCGTCACAATAGGTT
GTGGAGATAATTTACACGATTGTGAAATATTAAAAGATGAAGTAAATAAAAGAATAAAAGCAAGAAGAGT
ATTATTTACTCGAGGAGGAGTTTCTATTTGCTCTCATACAGGGCCAGATATATTGGCTATAAGTTGTTCT
AATTAG
>ref|NC_013316.1|:1383345-1385456 polyribonucleotide nucleotidyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTGAACATAAAATATTTAAAATGGATTTTGCAGGAAGAGAACTTTCTGTAGAAATAGGAAAGATTT
GTGAAATGGCTAGTGGTAGTTGTATAGTTCGATACAGTGACAGTATGGTAATGGTAAATACAACTAAATC
AGCCAAACCTAGAGACGGAATAGACTTTTTTCCTTTAAGTGTGGATTATGAAGAAAAATTATACTCTGTA
GGTAAGATACCTGGAGGTTTTTTAAAGAGAGAAGGGAAGCCTTCAGAAAAAGCTATACTTACATCAAGAT
TGATAGATAGACCAATAAGACCTTTATTCCCAAAAGGATTTAGAAATGATGTTCAGGTAGTTGCAACAGT
TCTATCAGTAGACCAAGATTGTACACCAGATATAGTAGCAATGATAGGTTCTTCAATAGCCCTTTCTATA
TCAGACATACCATTTAATGGACCAACAGGTTCAGTATGTGTTGGCCTTGTAGATGGTGCATTTGTTGTAA
ATCCAAACGCAGAGCAAAGAGAAAAAAGTTCAATGCATCTAGTTGTTTCAGGTACAAAGGAAGCAATAAT
GATGGTTGAAGCCGGAGCTGATGAAGTTCCAGATGAGGTAATGCTTGATGCTATTTTATTTGCTCACCAA
GAAATAAAAAAAATAGTTGAGTTTATAGAAGGTATAGTTGCAGAAGTTGGAAAAGAAAAAATGCCTGTTG
AATTATACCATGCAGGAGAAGAAATAACTCAATTGGTTCGCGAATTTGCAACTGATAAGATGAAAAAAGC
AGTTCAGACTTTTGAAAAGTTAGAGAGAATGGAAAATATGGATAGAGTTAAAGAAGAAACTTTAGCTCAC
TTTGAAGAAACTTTAGAAGATTTTGAAGATTTTGTTGGAGATATAGAAGAAGTATTACAAGATATAATAA
AAGAAGAAGTAAGAAAACTTATAGTACATGAAAATGTAAGACCAGATAATAGAAAACTTGAAGAAATAAG
ACCTATATGGTGTGAAACTGGCATGATACCTAGAGCTCATGGTTCAGCCATATTTACTAGAGGACAAACT
CAAGTACTTAATGTTGCTACTTTAGGTGCTTTAGGAGATGTTCAAAAATTAGATGGGTTAGATGAAGAAG
AAAACAAGAGATATATGCATCATTATAATTTCCCCGCATATAGTGTTGGAGAAGCTAGACCATCAAGAGG
ACCAGGAAGAAGAGAAATAGGACATGGTGCTTTAGCAGAAAGAGCTTTATTACCAGTAATACCATCTCAA
GAAGAATTTCCTTATGCTATTAGATTAGTTTCTGAAGTATTAAGTTCAAATGGTTCTACATCTCAAGCAA
GTGTATGTGGCTCAACATTATCTTTACTTGATGCAGGTGTACCTATAAAAGATATGGTTGCAGGTATAGC
AATGGGACTTATAAAGCATGATGGTAAGGTTGCAGTGCTTTCAGATATACAAGGTATGGAAGACCATTTA
GGCGATATGGACTTTAAAGTAGCTGGAACAGAGTATGGTATAACAGCAATACAAATGGATATAAAAATTG
ATGGTATAGATAAAGAAATTCTACAACGTGCTTTAAAACAAGCTAAAGAGGGTAGAATCCATATACTAGG
AGAGATGAGAAAAACTATATCTCAGCCAAAACCAGAACTTTCACCATATGCACCTAAGATTGTTAAAATG
CAAATAAATCCTGACAAGATAAAAGATGTAATAGGGCCTGGTGGAAAGATAATAACTAAGATAATAGACG
AAACTGGAGTTAAGATAGATATTGAACAAACTGGGGAAGTATTTATATCAGGTATTGAGATTGATATGAT
TAAGAAAGCTCAAGAACTTATAAATAATATAGTAGTTGAACCAGAAGTAGGAAAAACTTATAAAGGTAAG
GTAAGTAGAATAATGAACTTTGGAGCATTTGTTGAAATACTTCCAGGAAAAGAAGGATTACTTCATATAT
CTCATATAGCTCATGAAAGAGTTGCCAAAGTTGAAGATGTATTGAATATAGGGGATGAAGTTGAAGTTAA
AGTTACAGAGATTGATGAAAAAGGAAGAGTTAATTTATCAAGAAAAGTTCTTTTACCAAAACCAGAACAT
AAAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1385722-1386465 putative polysaccharide deacetylase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAATGATGGTACTTAATAAGAGTAAGCTCAAAAAAATCATAATACTAATTTTAGTAGTGTTATTAG
TATTATCAGGAGGGGTAATGGTATTAAAGTTATTTAACAACAAGCCAGTATTTAATTTATTTAATGGTGT
AGATTTACCATATGAAAGAGGTACAAAGGATAAAAGTGGATATGTTGCATTAACCTGTAATATAGACCTT
GGATGGGAAACAGAGTACGTAGAATCCATTTTAGAAACACTTAAAAAAGAAAATGTAAAGATTACATTTA
ATGTAACTGGAAAATGGGCAGAAAAGAATAAGGATGAATTATTAAAGATAAAAAAACAAGGACATGAAAT
AGGTAATCATGGATATAAACATTTAGATTATTCTACATTATCATATGAAGACAATTATGAGCAAATAGAG
ACCTCTAAAAAGATAATTGAAGAAATTATAGGTGAAAAAACTAAATTTTTTCAAGCACCAGCAGGTTCCT
TTGGTCCAGAAACAGTAAAGGCTGCTAAAGCATTAGGGTATACTTCTATCAAATGGGATGCCGATACTAT
AGATTGGAAATACAAAGACCAACCAGAGGTAATCATTGATAGAATGAAGAAAAAAGACATTAAAGATAGT
AGTATAATCTTAATGCATCCAACCAACGCAACGACAAAATGTATAGATGATATTATAGCTATTGTAAGAG
AAAAAGGACTAAAACCAGGGAAACTTAGTGATGTATTTAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:1386623-1387870 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAAGACAAAAATACTGGAAAATGGGCTTACAATAATTGGTGAAGAAATACCATATCTAAAGTCAA
TAACATTAGGTATTTGGATAAATGCAGGCTCTAGGATAGAAGAAGCACAGGTGAGTGGAACTTCTCATTT
TATAGAGCATATGATGTTTAAAGGAACCAAAAACAGAACATCAAAAGAGATTGCTAGTTCAATAGATAAT
TTGGGTGGTCAAATAAATGCATTTACAAGTAAAGAATGTACATGTTATTATGTAAAACTAATAGATGAGC
ATATAGATACGGGAATTGATGTATTGAGTGATATGATACTAAATTCTAAATTTGATAAAAATGATATAGA
TAAGGAAAGACTTATAATATTGGAAGAACTTAAGATGTATGAAGACTCTCCAGATGACTTATCTTATGAT
TTATTAGTGGAAAATATATATGCTAATGATGGATTAGGAATGAATATAATTGGGACAAAAGAATCTCTAT
ACAATATAACTAGAGAATCCATGTTAGAATACTTAAATAAGTATTATATTCCAAATAACGCTGTTATTTC
TATAGCTGGAAACTTTAACTTTGATGATATGGTGGAGAAAATCAAATCAAAATTTGGACACTGGGAAAAG
AAAAATTTGAGTATAGACATAAGTGAGGCTAAGTTTAATCCTTGCTTTATATCAAAAAATAAAGATACTG
AACAGGTGAACTTAGCTATCTGCCTAAAAGGTATTCCTTTTGAAAATGATGAAGAAGTCTACTCAATGGC
AGTGGTAAATAATATTTTCGGTGGAAGTATAAGCTCAAGGCTTTTTCAGAAAATAAGGGAAGAAAAAGGT
TTAGTATATTCAATATACTCATCACAGACATTATATAGGAAATGTGGTGAATTAGGCATATTTGCAAGTA
TGAGTACAGAAAATTTACAAGATGTATATAATTTAATAAAGAAAGAAATTGAAAATATAAGAGAAAACTA
TCTTACAGAAAAAGAAATATCTGAAAGCAAGGAACAGTTAAAAGGAAATTATATATTGGATTTAGAAAGT
ACTAGCAGTAGAATGATGTCTACTGGTAAATCTATGTTACTTAGCAAAAAAGTAAAAACTACAGATGAAA
TACTTGAATGTATAAATAATGTTAATATTAATTCAATAAAGAAGGTTGTTGATAAGGTATTCAATATCGA
AAATATTGGTACATGTATAGTTGGAAGAGATGTAGAAAAGATTCTACACTTGGATTAA
>ref|NC_013316.1|:1387905-1388150 hypothetical protein CDR20291_1162 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTATCTGAAATAGCAGGTAAGGAAATAGTTAACTTGGTCACAGGAGAAAGATTGGGGGTCATTG
GAGAATGTGACCTTATACTAGATGAAACTACAGGCGGTATATTAGCGCTTCTAATTCCAAAGGAAAAAGG
ATTTTTTGCCAGAAGAAAAGATAAGTCATTTTTAGAAGTACCATGGAGAAATGTAAAAAAAATAGGTAAT
GACATGATAATTATAGAATATGAGGGATATATTTAG
>ref|NC_013316.1|:1388160-1389383 aspartokinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTATTTTAGTGCAAAAGTTTGGTGGGACATCAGTAGAATCATATGAAAAAATGAATGAAGTATGTA
AGATAGTAAAAGCATACAAAAAAAATGATGAAGAATTACAATTAGTATTAGTAGTTTCAGCAATGGGAAG
AAAAGGAGCTCCATATGCTACAGATACACTTATAAATTTGTGTAGTGCAGTAAATGATGAGCCAAGTAAA
AGAGAACTTGATTTAATAATGTCTTGTGGAGAAATAATATCAGGAACAATTCTTGCTAATTTATTGAATG
CACAGGGGATAGATTCTGTTTTCTTTACTGGTCAGCAAGCAGGTATAATTACAAGTGATGAATATTCTAA
TGCAAAGATAAAGTATATAAATCCTAAAAAGGTAAAAAGAGCTTTAGATGATGGTAAGGTTGTAGTTATA
GCTGGATTCCAGGGTGTAACAGATGATGGAGAAATAACTACTCTTGGAAGAGGAGGAAGCGATACATCAG
CAGTTGCTATTGGTAAAGCTTTAGAATGTGAAACAGTTGAAATTTACACTGATGTGGATGGTATAATGAC
TGCAGACCCTAGAGTAGAACCAAACGCTAAAGTATTGAGTTTTATAGATTATGAGGAAGTATTCCAAATG
GCTGACAAAGGTGCAAAAGTAATACATCCAAGAGCAGTACAGTTGGCTAAAAGTGGAAATATAACTTTAG
CCATAAAGAATACAATGAATCCAACTTTTGAAGGTACAAAAATAGGTTCTTTATGTAGACACTTAGAAGA
GAATATAGAATATGAACAAGAAAGAGATTTTAAGGTTGCTGTTGCAAATAAAGATAGTGTAGCACAAGTT
AAGATTAAATCAGCAGAAGAAGTGTTTACAGAAGTATTAAATGAGATAGAAAAGAAACTTATAACTATAG
ATATGATAAATTTCTTTATATCAGAAAAAGCATTTGTTGTAGAAGATGCTGATATAAAATCATTAAAGGA
AATACTAGATAAATTTGAATTAGATTATGAAGTAAATAGAGACTGTGCTAAGGTAACATTGATATGTTCA
AGAATTGCTGATGAAATGTCTGGTATCATGTCAAAGGTAGTTAGAGGATTATCAAAAGCAGGGGTATCTC
TTTTACAAACATCAGACTCAAATATGACTATATCTTGTTTAGTTAGTGAAGAAGATATGCATACAGCAGT
ACATGCTATACACCAACAATTTTATTTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1389496-1390230 translocation-enhancing protein TepA [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGATTATAGAGAAGATAATGAAAGATTTGATAAAGATAATTGTAGTGAAGAATCTAGTTGCGAAG
AGAGAGAATGTATAAAGCAATTTGGTACCAATGAAATGCCACCTCAACCTCCTAAAGATATTCAATGTAT
AACTATAATTGGAGAAATTGAGGGACATTTTATAGGAAATCCTCAAAAAAAAGCTACAAAGTACGAGCAT
ATAATTCCAATGCTATACTCAATTGAGGAAAGCAATGATGTTAAAGGAGTGTTAGTTGTTTTAAACACTG
TTGGAGGAGATATTGAAGCAGGTTTAGCTATTGCAGAACTTTTAAACAGTACATCTAAAAAAGTAGTTAC
TCTTGTTCTAGGAGGAAGTCATAGTATAGGTGTTCCTCTTGCTACAGCAGGAGATTACTCATTTATAGCA
CCAACAGCAACCATGATTATACATCCAGTGCGAACTACTGGTCTTGTGATTGGTATAAATGAGACTTTTG
AATATTTTAAAAAGATGCAAGATAGAATAATTCAATTTATAATAAGAACATCAAATATCAAAAAAGATGT
ACTTGAAAAACTTATGCATGAAAAAGATGAACTTGTAAGTGATGTTGGTAGTGTATTAATAGGAAAAGAA
GCTGTGGATTATGGTCTTATAGATGAAGTTGGAGGACTAAAAGAAGCACTTAAAAAATTAAGAGAGCTTA
TAAAAGAATCTGAGGAAGAAAAAAATAATGATTAA
>ref|NC_013316.1|:1390353-1392764 putative DNA translocase [Clostridium difficile R20291]
ATGGCCACGAAAAAGAAGAAAAAAAAGAAGGTAAATACCTTAAGTTTTAATGCAGAATATCATAATTTAA
TAACAATATTTATAGGTGTATTTTTATTATATAGTTTAAATTCTAATTCTATGGGATGGATACCTGTGTT
AATGCAAAATCTTTTTAAGGGACTATTTGGAGGGCTTTCAATAGCAATACCATTTATAGTAATTATAACA
GGACTTTTAGGATTTTTTGATGGAAATGAATATATATATAGGCTAAGAAAGACTAAACTATACTACATAA
TTATTTTATTTATATTTGTATTTTATGGATTATTAAATGCAGGAACTCTTCCTGTAGATAGCCCACTAAA
AGGTAACATGTTTGATGATGTTATGAAATTGGGTGTAAGTGGACAAGGTAGTGGTTTGATAGCAACAACT
ATTGCGTATTATATGAGTAAAATATTTGGTATAGCAGGTGGATGGTTAATAAGTATCTTCGCACTTATAC
TTTCTGTAATGTTTATATTTAATATTTCTATAAAAGATTTGGTGTCAAATGCAAAATCAAAATCTAAAGC
ATCTAAAGACAGCAATTTAACGTTTAAAGATAAAATTGCAAATATGAAAAAATCTGCAATAGATATGATG
ACTGATGAAGTAGATGATACTACTATAAATAAAAAACCAGGTTTCTTTAAAGGGTTAATGTCAAAAGGTC
TTAATAATGATGATGAAGAAGATGAATATTTTGAAGAAGAAAATAGTGATGGTGTAGATGATAAAACTAT
AAAAATAGTTGGATTTAATAAGGCAGAAGATGAGTATTTAGAAATATTAGAAGGAACTCAAAGTATGCCA
GAGTTAGATGTTTTAAAAGAATTACAAAAAGCTACCAATGAAAATCCAGTTGTAGATACTAAACCAGAAA
AAAAAGTTGATATAGCTAAATCTAATTTAAATATAGAAAAAACTCAACCTATGAGTATTGTAGCAGAGCC
AGTTAATGAGGATTATTCAAACTATAAAAAGCCTAGCATTGAGCTTTTAAATAAAGTAAATAAGAAGTCT
GATGAAAATGGTAAAAAGAAAGTGTTGAAAAATGCTTCTCTTTTAGAAAAGACACTATCAGATTTTGGAG
TGGAAGCAAAAATTAATCAAGTTACAGTTGGACCTACTATAACAAGATATGAAATACAACCAAGTCCAGG
AGTCAAGGTAAGTAAAATTGTAAATTTAACTGATGATATAGCTTTAAGTTTAGCAGCTAAAAGTATAAGA
ATTGAAGCCCCAATTCCTGGTAAAAGTGCAATTGGAATAGAAGTTCCAAATGAAGAAGCTCAAATGGTTG
GTGTGAGAGAAGTTCTAGAAAGTGAAGAATTTAATAATTTTAACTCTCCTCTTGCAATGGGACTTGGAAA
AGACGTAGCAGGAAAAATTATAATTGGAGATATAGGTAAGATGCCACACTTACTAATAGCTGGTTCTACA
GGTTCAGGAAAGAGTGTGTGTGTAAATACATTAATAAGTAGTATTTTATATAAGGCAAATCCTGATGAAG
TAAAATTACTATTAATAGACCCAAAAGTAGTTGAACTTGCAAATTATAATGGAATACCACATCTATTGAT
ACCAGTAGTTACTGACCCTAAAAAAGCTGCAAATGCTTTAAATTGGGCAGTTACAGAGATGAATAGAAGG
TATAAATTATTTGCAGATGCTCAAGTAAAAGATGTAACAAGTTATAATGAGAAAGCGGAAGAAAAACTTC
CTAAAATAGTAATAATAATAGATGAGTTAGCAGATTTAATGATGGCAAGTGCAAATGATGTAGAAGATTA
TATTTGTAGATTAGCTCAAATGGCAAGAGCTGCTGGAATGCACTTGATTGTAGCAACTCAAAGACCATCT
GTTGACGTTATAACAGGGGTAATAAAGGCTAATATACCATCTAGAATAGCATTTGCAGTATCATCTCAAA
CTGATTCAAGAACAATCCTTGATATGGGTGGTGCAGAGAAGCTTCTAGGTAAAGGTGATATGTTATTCTA
TCCACTTGGTGCAGCAAAACCAGTTAGACTTCAAGGGGCATTCATATCAGAGAGTGAGTCGGAAAAAGTA
ATTGATTTTGTAAAAAGTCAGGTTAAAGATGGAATAAAATATGAAGAAGATATAATTGAAACTATATCTA
AGGTTAATACTTCAAAGAGTAGTGATGAGGATGAGTTTTTGAGTGAAGCGATAGAATTTGTCGTGGAAAG
TGGTCAAGCATCTGCCTCTATGCTACAGAGAAGATTTAAAATAGGATTCAATAGAGCAGCTAGACTTATA
GATTCTATGGAAGAAAGAGGCATAATTGGAGCAAGTGAGGGAAGTAAACCTAGAAAGGTATTAATAAGCA
AACAGGATTTGCAGAATTTAGAAGGTGAATAG
>ref|NC_013316.1|:1392767-1393825 putative ATP/GTP binding protein [Clostridium difficile R20291]
TTGTCAGTTATAAAAATAGAAAAAGCACTTAAGCTAGATAAAGTAATATTTGTAGATGTGAGAACTGAAG
GAGAATATGAAGAAGACCATATATTGAATGCAATCAATATGCCTCTTTTTAAAAATAATGAACATAATGA
AGTTGGAACAATTTATAAGATGCAGGGAAAACATGAAGCAATACAAAAAGGGTTTGACTATGTATCGTAT
AAATTAAAGGATATATATTTACAAGCAGCAGAACTTGCATTAAATTATGATAATATTGTCATATATTGTG
CAAGAGGCGGAATGAGAAGTGGAAGTATAGTAAATTTATTATCATCATTAGGTGTAAATGTATATCAACT
TGAAGGTGGATATAAGGCTTATAGAAATTTTGTATTAGAGTATCTAAGGCATGTAATGGATACAAAAAAC
TTTGTATCTGTTCATGGATTGACTGGTACAGGAAAGACTGATTTGTTACATTTATTAGATGAAAAAGGAA
TAGATGTACTGGATTTAGAAGGCATAGCTAAAAACAGTGGTTCTACCTTTGGTTTTATAACTTTTGATAA
AAAGCCACCATCTCAAAAGAACTTTGAAACAAAACTATTTGAAAGTGTATTTTTTTCGAAAGAGAATTAT
ATATTTGTCGAGAGTGAAAGCAAACGAGTTGGAAGTGTTACAGTTCCAAATGAAATTTTCGAGGCAATGA
CACGAGAAGGACATCATATATTATTAGAATGTGATATTGAAAATAGAGTTGATAGACTTTGTAGAGATTA
TATTTATGATAAAGATGAAGGTAATATATTGATTTTAAAAGAATGTATAAACAAGTTTAGAAAAAGATTG
GGTAATAAAGTAGTAGATGATTATATTGATTTATTAGAATCAGGTGAATATAAAGAACTTGTAAAAAGAT
ATCTTTTAGAATACTACGACCCACTTTATATGCATTCAGTAGAGAAATATAAGTATAGTAAGATTATAAA
TTTTAATGATACACAAAAAGCTTTAGAAGATGTTATAGACTTATATGAGAGTATATTGGAAGGAGAAAGT
GAATGTTAA
>ref|NC_013316.1|:1393819-1395153 radical SAM-superfamily protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAAAATAGCATTGGAATCATTAGGATGCTCAAAAAATTTAGTAGATGCAGAAATAATGATGGGAA
TTTTAAATAACAAAGGCTATAAATTAATTGGAGATTTTGAAGAAGCTGATGTAATTATAGTAAATACATG
TGGGTTTATAGAGTCAGCTAAACAAGAATCTATAGATACGATAATAAACTTTTCAGAGTTAAAAAAAACT
GGCAATTTAAAGTTGTTGATAGTAACAGGGTGTCTAGCCCAAAGATATTCTGAAGAATTAAAAACTGAAA
TTCCTGAAATAGATGCTATAGTAGGAACAGGAAGCTATCAAAATATAGATAAAATACTTAAAGAATTAAG
TGAAATGCATCAAATTGTAAGCCTTAATGATATAGAGTTTGTATTTAATGAAGATTTACCAAGATATATA
TCTACACCTAGCTATATGGCCTATTTAAAAATTGGAGAAGGATGCTCCAATAATTGTACTTATTGTATAA
TACCAAAACTAAGAGGTAAATATAGAAGTAGAAAATTTGAAGATATAATTAAAGAAGCTAAGAAATTAGC
TGAATCTGGAGTAAAAGAACTTGTGGTTATAGCACAAGATACGACAAAGTATGGTTTTGATTTATATGGA
AAAGAAAGATTATCAGAACTTTTAGAAGAACTTGCAAAAATAGATGGATTTAAGTGGATAAGGGTTATGT
ATTCATATCCAGAATCTATAACAGAGGAATTGATACAAGTTATAAAGAAATATGATAATATATGTAGTTA
CTTTGATATGCCAATACAGCATGCAAGTAACAATATTTTAAAATTAATGAATAGAAAAACTACTAAAGAA
GATATATTAAATAAAATCAATCTGATAAGAAGTAATATACCAGATGCTATACTTAGAACTACGATAATAG
TAGGGTTTCCTGGTGAAACAGAAGATGACTTCAAACAACTTGTGGACTTTGTTGAAGAGGTTAAATTTGA
TAGACTTGGTGCATTTGCATATTCAAGAGAAGAAGATACACCAGCAGATAGATTGCCAAACCATATAGAT
GAAGAAGTAAAAATACAAAGAAGAGATACTTTAATGATGATTCAACAAAAAATATCTGAAGAACTTAATG
ACAAAAAGATAGGAAAAACTTATGAGGTGTTAATAGAAGAACAGATAGAAGATAATGTATATACAGGAAG
AACACAAGGTGATGCGGAAGAAATTGACAGTATAGTGTATGTAAAAAGTGTAGACAATCTTGAAGTAGGA
GAATTTGTAAGTGTTCAAATAAATGATGCAATGGAATACGATTTAATGGGAGATGTTTTATATGAACTTG
CCTAA
>ref|NC_013316.1|:1395131-1395682 CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTTATATGAACTTGCCTAACAAGTTAACTTTGTTTAGAATATTTTTAATACCAGTATTTGTTTTAA
TTATGTTGCTCAATGTACCAAATAAATTTTTAATAGCTTGTATTATTTTTATAATAGCTTCAATTACTGA
TGCTTTAGATGGAAAAATAGCTAGAAAATACAATCTAGTCACTGACTTTGGAAAATTTATGGACCCATTA
GCAGATAAGTTATTGGTTATTTCAGCACTTACATGTATGATAGAAGACCATCTTGTAAGTAGTTGGATGG
TAATTATAATAGTGGCTAGAGAGCTTACAGTTAGCATATTAAGAGCTATAGCTGCTGCTGATGGAAAAGT
AATTGCTGCTGGAAACAGTGGAAAACTTAAAACGATAACTCAAATGGTATCTATAGTGTTTTTATTGTTA
GGCGCTCAGTTTGAAAATGTATTGATATTAAATATTGGTGAAATTCTCATTCTTATAGCTACACTACTTA
CATTATATTCTGGATGGGAATATCTATATAAAAATAAAGAGCTTTTTATGTCTTCTAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1395970-1397016 RecA protein (recombinase A) [Clostridium difficile R20291]
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AAGGTTCAGTAATGAAATTGGGAGAAGCAACATCTATGTCTATAGATGTTATATCAACAGGAGCGATTGG
TTTAGACATAGCTATTGGTATAGGAGGTCTACCTAGAGGGAGAATAGTTGAAGTATATGGTCCAGAATCT
TCTGGTAAGACTACTGTTGCGCTTAGTTGTGTAGCATCAGCTCAAAAAGATGGAGGAATAGCTGCATTTA
TAGATGCAGAACATGCACTTGACCCAGTATATGCAAAAGCTTTGGGTGTGGATGTTGATAACCTAATAAT
ATCTCAACCAGATACAGGTGAACAGGCTTTAGAGATAGCAGAGGCATTGATAAGAAGTGGAGCGATAGAT
ATAATAGTAATAGACTCAGTAGCAGCATTAGTTCCAAAGGCTGAAATAGATGGAGATATGGGTGATTCTC
ATGTAGGTTTACAAGCTAGACTTATGTCACAAGCACTTAGAAAGTTAACTGGTTCAATTAAAAAATCAAA
TTGTGTTGCTATATTTATAAACCAGTTAAGAGAGAAAGTAGGAATAATGTTTGGAAACCCAGAAACTACT
ACTGGAGGACGTGCACTAAAATTCTATTCATCAGTTAGATTGGATGTTAGAAAAATAGATACAATAAAAC
AAGGTGATAAAGTTATAGGTAGTAGAACTAGAGTTAAAGTTGTTAAAAACAAAGTAGCACCACCATTTAA
GCAAGCTGAATTTGATATAATGTATGGAGAAGGGATTTCAAAAATTGGAGACCTTTTAGATATAGCTGCT
GATGTAGATATAGTTAAAAAATCAGGTTCATGGTATAGTTACAATGATACTAAACTTGGACAAGGAAGAG
AAAATGTTAAAAAATTCTTGGAAGATAATTTAGATTTAACTACTGAAATAGATGAGAAAGTTAGAGCATT
TTACAATTTAAATGAAGAACATGAAGAATCAGGTACTTCAGTATCAAAAGAAATTGTAGAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1397192-1398733 putative nucleic acid-binding protein [Clostridium difficile R20291]
GTGGATGTCATAGATAGTGTAGTAATGATTGTAATAGGTGCAGCTGTTGGTATTATAGCTGGATATTTTG
TTAGAAAAAATATATCTGAAGCAAAAATTGGACAAGCTGAAAACTTGGCCAAAGAAATAATAGATAAAGC
ACACCACGACTCAGAAACAGTACAAAAAGAAAAATTACTAGAAGCTAAAGAAGAGATCCATAAGTGGAGA
ACAGAAGCTGAAAGAGAAAACAGAGAAAGAAGAACAGAAGTACAAAAGTATGAAAAAAGAGTAGTACAAA
AAGAAGAAGTCTTAGATAGAAAATTACAAAATTTAGAATCTAAAGAAGTAAACCTAAGTGAAAAATTAAA
GGTAGTGGAAAAGAAAGAAGAAGAAGTCGAAGTAATAAAAACTCAACAGTTAGAAAAATTAGAAAGTATA
TCAGGAATTACTTCTGATAAGGCCAAAGAAATCATCTTAACCAATGCGGAGAGAGATGTAAGACGTGAAA
TGTCTATAATGATAAAAGAGATAGAAAGTCAAGCTAAAGAAGAAGCTGATAAGAAATCAAGAGAAATTAT
AGGATATGCAATTCAAAAATGTGCAGCAGATCACGTAGCCGAAACTACTGTAACAGTAGTAAGCTTGCCT
AATGATGAAATGAAAGGTAGAATAATAGGTAGGGAAGGTAGAAATATAAGGACTTTAGAAACCTTAACAG
GTATAGACCTTATAATAGATGACACTCCAGAAGCCGTAATTTTATCAGGATTTGATCCAATAAGAAGAGA
AATTGCAAGAATTGCTCTAGAAAAATTAATAGCAGATGGAAGAATACATCCAGCTAGAATTGAAGAAATG
GTTGAAAAGGCGAGAAAAGAAGTTGACAATATTATAAAAGAATATGGTGAACAAGCTGCATTTGAAACTA
GTGTACATGGGATTCATCCGGAATTAATAAGATTATTAGGTAGACTTAACTATAGAACTAGTTATGGACA
AAATGTACTTAAACATTCTATAGAAGTTGCTCATATAGCTGGTATAATGGCTGCTGAAATAGGAGCAGAT
ATTAGATTGGCTAAGAGGGCAGGTTTATTACATGATATAGGTAAGGCTGTAGACCATGAAATGGAAGGTA
CACATGTTGAAATAGGTATGGATTTACTTAGACGTTATAAAGAGTCTAAAGAAGTTATACATGCCATGAG
TACTCATCATGGAGATTACGAACCTCAAACAGTAGAGGCTGTATTAGTTACAGCAGCAGATGCAATATCA
GCTGCTAGACCTGGTGCGAGAAGAGAAACTTTAGAAGCATATATAAAGAGACTTGAAAAATTAGAAGAAA
TAGCTAATTCATATGAAGGTGTAGAAAAATCATTTGCTATACAAGCTGGTAGAGAAATAAGAATAATGGT
AAAACCAGAAGCTATAAATGATGAAGAAATACATCTATTGGCTAGAGATATGACTAAGAAAATAGAGGAT
GAACTTGAATATCCTGGACAAATAAAAGTAAGCATAATAAGAGAAACAAGAGCTATAGAGTATGCGAAGT
AA
>ref|NC_013316.1|:1399368-1401149 hypothetical protein CDR20291_1171 [Clostridium difficile R20291]
GTGAGCCAATACATAAATATAAATTCTCAGTTAGACGCCCTAAAATTGAAGGAGTTCGAGAAAATATTTT
ACGAAAATATCAATGAGGACGTTAAAGTAGTGCCAAAAGTTACTCCTTTTAAAGGAATAAATACCGATTT
GTTGTATGTTAAAGATGGAAGAATTTTATTTATAAAATTTATGGATACAACAGAAGATATATTTTTTATT
TTAGAAGAAGAGTTACTTGAAGTTATGAATGAGGAATATGAACTTTTGAAACTAAAAATGGGACAAAAGA
ATAGAAATATAAGTTATAACTACGTTTACATTATGCCATACGTTGAAGTTGAGGAAACATATGAATTTGA
AGAATTTGTTAATAATAATATAATAGATAAAAATAAGCTTCAAGATATAATGAATAAGGGTTCGCTGGAG
GAGTATCTTAATGATGAGAATGATGAAATAAACTTAAATTTATTTTTACTAGACATATGTTCAGAATACT
ATATAATAAATGATAAACTTCATCTAAATGAAAAATTTAAAAAAATTTCATTCTACAATGATGACTATAA
GTATACAGCAACTATGATGGAAGACGTTCAAATTAAAGATGTTGTTTCTATTAAATATGGGAATACACTT
ATTGAAGGTGGTTCTGGTATAGGCAAAACAGCAATTATGCTTTCTAGGGCTATAAAATTAGCAAAAGTAT
ATCCACATCATAAATTAGTCATATTTACACATACAAAACAATTGTGCAATGAGCTTCGAGAGAGGATAGA
GTTATTATACAAAGATAATAACAATTTAGAAGTTCACACATTTAGTTCTTTTATATTTAAACTAGCTAAA
AAATTCAATTTAATTGTAGATTATAACATGTTAAAAAATGATTACGAAAAGACCTTTAATAATCTTGTAA
AACAAGCACAGAACATTATAAAAAATAAAAATATGTTCAAGGCTATTTTTATTGATGAAGCAGAAAGCTT
TTTAGAGTATGAAATAGATTTTATAAGGGAGTTTTTATATAAAACAAAATTCATATTTAATGTGTGTTCT
TGTAACTCCTTGAATATCTCTAATAGATTGAATATATTTAAAAAATTATATAATGGTATAGAATTTGATG
ATAAGATTATCTTAAGTAAAAATTATAGACAAGCTAAAGAGATTGTAGATTTTACAAATAAATTTTCAAA
TAATTCTAACTCATATATCAACGAATTAAGACCAAATACAGAATTTAGTACTTTCTTTTATACTAAAGCA
CTTAGAGGTGGAAATAAGTCTGTTGATATAATAAAAGTAAGTGACCTTGATGACCAAATAAGTTCTGTAA
TCTGGGAAATTGAGTATTTAATAAGTAAAAAAGGTCTTGATTATTCTGAAGTTGCTATCGTTTATCCTTA
TAATAAGAAGAAATTAAAAAGTGGAAAAACCATTTACTTTCAATATATGTTAAAAAAAGCATTGGAAGAG
GCAAAAATTCCTTATATATGTGCAGAAGATAATTTGACAAATATAAGTAAGAAGGTAGGAACTACAATAG
CAAATATATATGCAATAAAGAATTTAGAGTATAAAGCGGTAATAGTATGTGAATTAGAGATGTTATACAA
TCAAACTATAAATGATATTGAACAAGATTATCAAGTAAATGACTTTGTAGGAGATTTAAATAAGGTTTAT
TTAGCTATGAGTAGAGCAACAGACTACCTAAGTATAGTAACAACTTTTAATGAAGAAGCAAGTGATATAA
TAAGACTTATTACAGAATCAAAAGATATTTAG
>ref|NC_013316.1|:c1401779-1401231 signal peptidase I [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAGGAGAAAAGTTATGAGTGTTAAAAAAGAAATATTTGATTGGATTAAGTCAATAGCTATGGCTA
TTGTACTTGCATTTGTAATTCTACAATTTATAAGACCTTCTGTTGTAAGTGGAGAATCAATGTATCCTAC
TTTAGATGATAAAGATTATCTGATTTTAAATAGGATATCATACAAGGTTGGTAAACCTGAAAAAGGCGAT
ATTGTAGTTTTTAAAACCAATTTAGTTGATGGAGAAACAGGAAAGAAAAAAGACTTAATAAAAAGAGTTA
TAGCTACTGAAGGTGACAGAATAAAAATATCAAATTCTAAAGTGTATGTAAATGGAAAATTATTAAATGA
ACCATATATACACAATAACTATACTTCTGGAGATATAGATACTGTTGTTCCAAAAGGTAAACTATTTGCA
ATGGGAGATAATAGAGAAAATAGTAATGATAGTAGATTCCCTGATGTAGGTATGGTTGATGAAGATGAAA
TTCTTGGTAAGGTTATGGTGAGACTATTACCTCTTGATAATATTGGGAAAGTGGACTAA
>ref|NC_013316.1|:c1402646-1401801 undecaprenyl-diphosphatase [Clostridium difficile R20291]
TTGTATTGGAGGTATTTTGATTTGGAAACATTTAGTTTGCTTGAAATTTTTAAGGCAGTCATTTTGGGCA
TAGTTCAGGGAATAACAGAATGGCTACCAGTAAGTAGTACAGGGCATATGATATTAATTAATGAGTTTAT
AAAATTGAATTTTTCAAATACATTTATAAATACATTTTTAGTTGTAATTCAATTTGGTTCAATACTAGCT
GTACTTGTTATATTTTTTAGAAAGTTAAATCCTTTTGATAGTGCAAAGAATATTAAACAGAAAAAAGAAA
CAGTTCGTTTATGGCTTAAGGTTATAATTGCAGTTATACCATCTGGAGTTATTGGAATACTGTTTGAAGA
TGACATAGACAGAGTATTCTTTAATTCAACAGTAGTTGCTATTGCTCTTATTGTCTATGGTATAATAATG
ATAGGGCTTGAAAAGAGAAATAAAAGACCTAAGTATAAAGATTTTTCTCAAGTTACATATAAATTAGCTC
TTTGTATAGGATTATTCCAGTGTCTAGCTCTCATACCAGGTACATCTAGGTCTGGTTCTACTATAATAGG
TGCAGTATTACTTGGTACTTCTAGATATGTAGCAGCAGAGTTTTCATTCTTCTTAGCCATTCCTACAATG
CTTGGAGCTAGTGCATTAAAACTTCTAAAAGCTGGATTTGGATTTACTGGATTTGAATGGCTTATTTTAG
GTGTTGGTTCTGTAGTAGCATTTGTTGTTTCAATTGTAGTTATTAAATTTTTTATGGACTATATCAAAAA
ACATGACTTCAAAGTATTTGGTTATTATAGAATAGTCTTGGGTATAGTGGTTCTTGCTTATTTCTTTCTA
TTATAA
>ref|NC_013316.1|:1402861-1403790 putative tyrosine recombinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGGAAAGGAGTTATTATGTATAGTACAAAAATACTAGATGATTATGAGTATGAAACTTTTAATG
TTTTTTCTACAAAATTAAATCCAAACACGAAACACGATTATTTATCAAAGGTTATACTGTTTAAAGAATT
TTTAAAAGGGAAAGAATTGATTTATGCTACAAAAGAAGATTGTAAAAATTTTGTAGACTATATACAGACT
AAATATGCGAAATCAACTTGTGAAAAGATATATAGTTATTTACATAGTTTTTATAACTTCTTAAAAAAAG
AAGGATACATAGATATAAATCCATTTAGATATGTAGAAAAACCCACAGTAACAAGAATAAAAACAAAAGA
TGATGTTCTAAGTATACAAGAAATAAATAAACTTATAGGTATCCTACCAAAATTAAATATAAGAGATAGA
GTAATAATAGTCTGTCTAGTTACTACTGGGTGTTTATTAAATGAATTAGTTAGCTTAAAGTGGAAAGACC
TTATGGTAGATGAAAACGATAACTCATATGTAAGGTTAGGTAAGGGAAGAAAAGAAAGAGTAGTTAAATT
ACATCCATACTTTTTTAAACTTTTAGAAGATTACAGGAATTATTCTGGGCTTCCAGAGGTAATAATACCT
AGTGATGATTTTATTTTTACAACTCAAAAGAGTAATTCTATAACAGATAGAAATGTCAGACTTATAGTCA
AAAAAGCATTAGATTTAGCTGGACTTTCTCAATATTCAGCAAGAGATTTTAGACATTCATTTGCAGCAAT
AAGTTTAAGGCTTGGGGCAGATGAAAGTGATGTAAAAAATCAGCTTGGATGGAGTGATAAATACTATGCA
ATTAGATATAAGTATGTATTAAATTTTGTTGATAGTGAAATAGTGGATTACTTAATTGAAAAAGATAATT
TGGATATAAATAAAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1403934-1405379 adenylosuccinate lyase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGATAATAAATATACTACTTACTCAAACCCACTTACAGACAGATATTGTAGCAAGGACATGAGTT
ATATATTTTCTCCACAATTTAAATTCTCTACATGGAGAAGGTTATGGGTTGCACTTGCAGAAGGTGAACA
TGAGTTAGGAATCAATATAACTGAAGAACAATTAGATGAGCTAAGAGCTAATATAGATAATATAAATTTT
GATGAAGCTAGAAAAATAGAAAAAGAAGTAAGACATGATGTAATGTCTCACGTAAAAGCTTATGGTTTAC
AATGTGAAAAAGCCAAAGGAATAATACATTTAGGAGCAACATCTGCATATGTTGGAGATAATACAGATGT
TATACAAATGAATGAAGCTTTAAAACTTCTAAGAGTAAAGCTTGTAAATTTAATAAACAATTTAAAAGAA
TTTGCACTTAAGTACAAAGATATGCCAGCTCTTGGATTTACACACTTCCAAGCTGCTCAACTTACAACAG
TAGGAAAAAGAGCTTGTTTATGGGCTCAAGATTTAATTCTTGATTTGGAAGATTTAAACTATAGAATAGA
TAACATGAAGTTAAGAGGAGTTAAAGGTACTACTGGTACTCAAGCAAGTTTTTTAAGCTTATTTGAAGGA
GACCACGAAAAAGTAAAAGAGTTAGATAAGAAAATTTGTAAAAAGATGGGATACCATTCTTCCTATGCAG
TAAGTGGACAGACATATACTAGAAAGTTAGATTATCAAGTAATAAGCATACTATCAGGGATAGCTCAAAG
TATGCATAAGATGACTAACGATATAAGACTTTTACAAAGTTTAAAAGAATTAGAAGAGCCATTTGAAAAA
AATCAAATAGGTTCATCAGCAATGGCTTATAAGAGAAACCCAATGAGAAGTGAGAGAATAGCATCTTTAT
CTAAGTATATAATCTCTGAATCTATAAGCCCTGCAATGGTACAAGCCACTCAATGGTTAGAGAGAACATT
AGATGACTCAGCCAATAAGAGATTGGCAATACCTCAAGCATTTATGGCAGCAGATGCTATACTTGAAATA
GGGATAAATGTAACTGATGGTTTAGTAGTATATGAAAATATGATAAATAAACGTGTAAATGAAGAACTTC
CTTTTATGGCTACAGAAACAATACTTATGGAAGCTGTAAAAAGAGGTGGAGATAGACAGGAATTACATGA
AATAATAAGAGAATATTCTATGAAAGCTGCCTATAGAGTAAAGCACGAAGGTAAGGATAATAACTTAATT
GAACTTATAATGAATGATGATTCATTTAAAATGAGCAAGGAAGAAATACTATCTATAATGGACCCAAAAA
ACTTTATAGGTAGAGCTCCAGAACAAGTTGTAGAATTTGTAAATGAAGTTGTAGAACCTGCTATAAAAGA
TTATAAGGAAGACTTAGGAAAAGTAGATGTGGACCTAAGAGTATAG
>ref|NC_013316.1|:1405690-1406142 MarR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAACTATATAGTAAAAGATACCATAAGTTTTTTAGTAAAAACATTTCCTAAGATTTATTCTAGTCTGT
ACTTAGAAGACCTAAAAAAATTTGCACCAGATTATAATGTAAATAAAACACAATTAAGAGCATTAGTTTT
CATAAAAAATTATGGAGTAATAAGTATGACTGATTTATGCTCTAAGTTAAATATAGAAAAAGGCAGTTTA
ACTAGTATGGTTGATGATTTAACTGATAAGAAGTATGTAACAAGGAAAAGAGATTTAGTTGATAGAAGAA
AATATCTAATTGACATTACTGAAGAGGGAGATAAGATAGCAACTGATTTTATGGATAAATTAAGTGATGG
TTTAGGAGAAAAACTTTCTAAATTAACTGAAGAAGACAGAAAAAAATATTTAGAAGCAATAAATACTCTT
CAATATATATTAAACAAAGAAGAATTTAGATAG
>ref|NC_013316.1|:1406555-1408132 PTS system, maltose and glucose-specific IIbc component [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACAAAAAATGAAAGAGTTTTTTTTACAGTTAGGAAAATCATTTTTATTGCCAATAGCATTAATAT
CTGCTGCAGGTATATTTTTAGGAATAAGTTCAGCATTTTCAAATCCTAATATAGTTAGTGATATACCTTT
TTTAGAAAATAATTTTATTCAAGGAATATTGGGTTTTACAAAAGCTATAACAGGAGTACTTTTTGGAAAC
TTAGCAATATTCTTTGCTATATCAATATCTGTTGGTCTTGCTAAAGAAGAAAAAGCAGTTTCTGCATTTT
CTGGTTTTGTTGGTTATTTAGTATTACACACTAGTGTAAATTATATGTTAGGGTGTAGAGGTATTCTTGC
TGAACCTGACATGATGAGAGAAATGGGTCAAGCTGTAACTTTAGGCATACAAACATTAGAGTTAGGAGTA
TTTGGTGGAATTGTAGTTGGTATAATAACAGCATCATTACATAATAAATACTATAATATAAAACTGCCAG
ATTATTTAGGGTTCTTTGGTGGAACTAGGTTTGTTCCAATAATAACAACAGTAGTATTCTCTATTTTGGG
GATAATAATACCATATATATGGCCATATGTAAATACAATTATTCAGAGTGTAGGTATTGGTATAGCTAGT
TTAGGATATTTAGGAACCTTTGTATTTGGATTTCTTGAAAGGCTTTTAATACCATTTGGATTACATCATA
TATTAAATGCTATGTTTAGATTTACTGAAGTAGGAGGTTCTTTAGTTGTAGGAGGACAAGAAGTATTTGG
AGCATTGAACATATTTTTAGCTCAACTAAGTGACCCTGAAACAATCAGTTTTTCAACAGAAGCAACTAGA
TTTTTAGCTCAAGGGAAAATACCTATAATGGTATTTGGTCTTCCTGCTGCAGCATATGCCATGTATAAAA
CTGCAAAGCCTGAAAATAGGTCGAAGGTTAAAGGTATATTACTAGCTGGTGCTTTAGCAACATTTGTAAC
AGGAATTACGGAACCATTGGAATTTTCATTCTTATTTGTATCACCAATATTATTTGTTATACATGCATTT
TTATCAGGTATATCATTTATGATGATGCATATATTTGGAGTAGCAATAGGAAATACTCAAGGTGGCATAA
TAGATTTAGTAGTATTTGGAGTTATGCAACCAAATACAAAGTGGATTTATTCTATAATACTTGGTTTAGT
GTATGCACTGGTTTATTATAATGTATTTAAGGTTTTGATACTTAGATTTAACTTACAAACTCCAGGACGA
GAAGAAATAACAGATATAAATTTTGATTTAGAACCTTTATCAAATAAAGTAGAAATAGCTCAAAGTGGAG
AAACTACTAAGAGAGCATTATCCATAATTAAATATTTAGGTGGTAAGGAGAATATAGAAGATATAACAAA
CTGTATAACTCGCTTAAGAGTAGTAGTTAAAGATATGAGTAAAGTAGATGAAAATGCTTTTAAAAAATAT
ACAGGTGCAATGGGCGTTATAAAAGTATCTGATAAAGATATCCAAATAATTTATGGGCCATCTGTATCTC
AAGTAAGAGACGAAGTTTCTTTTGCAATGTCTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:1408291-1409043 RpiR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAACCTAATAGACAAATTAGATATAAATCAAAAAAAATTATCTACAAATGAAATATCTCTTTTAAACT
ATTTTCTAAAAAATTCTGAAAAAATAAATCAAAAAAAGATTAAAGATATAGCAAATGAAACTTTTAATTC
GACTGCATACATAGTAAGGTTTTGTCAGAAGCTCGGCTTTTCTGGATATAGTGAATTTAAAAACTTTTTA
GTTTTTTCATATTCAAATAGAAATGAAAGAAATAAGGAGTTTACTAAAAGTCAAAGTGATATTTTTACTG
ATGTTATGGATACACAAAATTTAATAAATGTAGAGAATATAGATATGTGTTTAAATGAAATACATAATTC
TAAGCATATATATTTTTTTGGTGTTGGGTCTTCTAGATTAGTATGTACTGAAATGTCTCAACGTTTTTCA
GCTATAGGTGTAAATGTAAAATACTATGATGATTCAACTCTCATGTATTTGGCTGCATCAAATATTACTA
AAGATGACCTTGTAATTGCTGTATCTATGTCTGGAGAGACTGCTCAAGTTATTAAGGCATGTAATATAGC
AAAAACAAATCAAGTTAAAGTAATTTCTCTGACAAATATAAGTGTCAATTCATTATCAAATATAGCTGAT
ATAAAATTATTTGTATCTTCTCCACAATATAATTTTAATAGTGTTAACTATACGTCTAGAGTGCCAGCAC
TTTCTCTTATGGAATATATGTTTCATAAATACATTGAAAAATACAATAGATGA
>ref|NC_013316.1|:1409176-1410522 maltose-6'-phosphate glucosidase [Clostridium difficile R20291]
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AGTCTTTATGTAAAATGAGTGATAGATTTCCTCTAAATAAAGTAACTATGTTAGATGTAGTAGAAGAACG
TCAAAGATTAATAGGGGAATTTGGAAAAATATTATTTAAAGAAGAATATCCTAAAGCAACACTTGAATAT
ACTACAAACCCAGATGAAGCATTTATAGATGTAGATTTTGTATTTGTTCAAATGAGAACTGGTGGTCTTA
AGATGCGAGAATTAGATGAAAAGATTCCTCTACAATTTGGACTGGTTGGTCAAGAAACTTGTGGAGCTGG
TGGATTTGCTTATGGGTTAAGGTCTATAGGTGATATGATAGAAATGGTTAAGACTGTAAGAAAATACTCT
CCTAAAGCATGGATATTAAATTATACAAATCCTGCTGCTATTGTTGCAGAAGCATTAAAAAGAGTATTTC
CAGATGATAAAAGATTACTTAATATGTGTGACCAACCAGTTAACTTGTTAAGGTCTTATGGAAGATTGTT
AGACATGGATTCAAGAACATTTGAGCCTGTATACTTTGGATTAAATCACTTTGGATGGTTTACACATTTG
TATGATAAAAATGGTGAAGATTTGGTACCTAAGATAAAAGATTTAGTAGCAAACTCTGGATTCCAACCTG
TTGATGCAGAACAAAGAGATAAATCTTGGTTAGACACTTATGGAATGGTTAAAGATATGTTGGAAGATGT
ACCAGATTACTTACCTAATACATATGTACAGTATTATCTATATCCTGATAAAAAAGTAGCTAAATCAAAT
ATAAATTGTACTAGAGCAAGAGAAGTTATGAATGGAAGAGAAAAGCGTGTATTTGAAGAATGTAAATCTG
TTATAGAAAAAGGAACATCTATAGGTTCTAATTTAGTGCATAATGATGCTCATGGGGAATTTATAGTTGA
AGTTGCAGAAGCAATAGCTCATAACAAACACCAAATAGCCATAGTTATAACAGAAAATAATGGGGCTATT
AACAACTTACCTGATGATGCAATGGTAGAAGTAGCTGCGATTCTTACAAAGAATGGACCGAGACCTTTAC
ATGTAGGTAATATACCAACATTTTATAAGGGACTGTTAGAAGGTCAACTAGCTTATGAAAAGTTAGCAGT
TGATGCATACTTTGAACAATCTTATGAAAAAGCTATTTTATCTTTAACATTAAATAGAACTATAATCTCT
CCAACTAAGGCAAGACAAGTTTTAGATGCTTTAATTAAAGTGAATAAAGATTACTGGCCAACACTATATA
AAGAAAATGAAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c1411830-1410634 aspartate aminotransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTATTCAAACAGAGTTAGTGCAATGCAAGCCTCTCCAATCAGAAAACTTGTTCCATTTGCACAAG
CAGCAAAAGATAAAGGAATCAAAGTATATCACTTAAACATAGGACAACCAGACATAAAAACTCCTAAAGG
ATTTTTTGATGCTGTTAAAAACTTTGATAGCGAAGTCTTAGAATATGCTACATCAGAAGGTATTCCAGAA
TTATTAGAAGCACTTCAAAATTACTATAAAACTTACGATATGAATTTTGAAAAAGATGAATTATTAGTAA
CTAATGGTGGTAGTGAAGCTTTACTTTTCACTATGATGGCAGTTTGTGACCCAGGAGATAATCTATTAGT
TCCAGAACCATTCTATACAAACTACAATGGATTTGGTCAATCTGTAAATGTAGAAGTTAATGCTGTTACA
ACAAAGGCAGAAAACGGTTTCCACCTTCCATCTAAAGAAGAAATATTGTCTAAAGTAGATGATAAAACTA
AGGCTATAATTCTTTCTAACCCAGGAAATCCAACTGGTGCAATTTATACAAAAGAAGAACTTAATATCCT
AGCTGAAATAGCTAAAGAAAAAGATTTATGGATAATAGCAGACGAAGTTTATAGAGAATTTGTTTATGAT
GGGCTTGAGTATACAAGCTGTGGTAACTTAGAGGGTGTACAGGATAGAGTTATAATAATAGACAGTGTTT
CTAAGAGATACAGTGCTTGTGGTGCTAGAATTGGTTCTATCGCTTGCAAAAATAAAGGTCTTATCGCTCA
AATACTTAAATTATGTCAAGGAAGACTTTGTGTTCCTACATTAGAGCAAATAGGAGCTGTTGAGTTATAC
AAAACTCCTGTTTCTTACTTCAAAGAAGTTAATGAAGAGTACAAAAAAAGAAGAGATGTATTATACAATG
AATTAATGAAGGTTGAAGGTGTTATATGTAAAAAACCAACTGGTGCTTTCTATATAGTTGCTAAATTACC
AGTTGAAAATGCAGAAGATTTCACAATTTGGATGTTAAAAGAATTTAACAAAGATAATGAAACAGTTATG
GTTTGCCCTGCTGAAGGATTCTATGCTACTCCAGGTTTAGGACGTGATGAAATAAGATTAGCTTACATCT
TAAATGAAAAAGACCTTCATAGAGCTGCTACATTATTAAAAGAAGGTTTAGAGCAATATGTAGCTTTACA
AAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1412215-1413165 putative galactose-1-phosphate uridylyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAATTAAGAATAGATCCAATTACTAATGATGTTGTTATATTTGCTACAGATAGGTTAAAAAGAC
CTTTAGATACAGCAGATATCCCAAATGAAGATGAAGAAACTAATGAATATGATGAAGAATGCCCATTTTG
CAAAGGAAATGAAGCTCATGCAACTGATGCATTATTTGAAATAGAAAGTGAAGAAGGATGGCTTGTAAAA
TCTGTCTACAATAAATTTCCTATAATTGATGATATGGCAAGAGATGTATATGGTGTTCATGAAGTAATGA
TAGAGAGCGATAAACATAATCGTAGTTTTTATAACATGAGTCAAAAAGAATTTGAAGATGTTTTTTTTAT
GTATAGAAATAGATTTAGAGATTTGTCGAAAGATGATAAAGTAGAGTATGTTAGTATCTTCAAAAACTTC
TTGAGAAAGGCAGGAGCATCTTTGATGCATCCACATGCTCAAATATTGTCTATGTCTTTTATTCCACCTG
AAATTACGAATGAACTGTTAGTTTCAAAGGAGTATTATGACAGCAATAAAAGCTCTTTGTATGATGATTT
AATAGAAAATGAAATAAGTTTAGATAGAAGAGTTGTTTATAATGGAGAAGCTTTTTTGGTACTTATACCA
TATGCAACCAAGTATAGTGGAGAAGTAAGAATAATATTTAAAGATAAAATAGAGTTTGGTGAGTTAAATG
ATAATAATATACAGGAGCTTTCTACAATATTTGAAAAGTTGTTTAAGAAGTTATACAATATCAATGGATA
TATGCCATTTAACTTATGTATTCACACTCATCCAACAAAGATTGAAACAAAATCGTATTTTAATGTTCAT
ATGCACATAATCCCAAGAAAATATAATTTTGGAGGATTTGAACTTGGAACAAATATGTATGTTTCTTCAA
TGAGCCCTGAAGATTTAACAAAAAAGTTAAAAATTGATTAA
>ref|NC_013316.1|:1413311-1414078 putative exodeoxyribonuclease [Clostridium difficile R20291]
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TTTTAGACTTTTTCAAAGAAGTAGATGCAGATATATTTTGTTTACAAGAAACTAAATTGCAAGAAGGGCA
AATAGAGTTAGATTTACCAGGATATTTTCAATATTGGAATTATGCTGAGAGAAAGGGTTATTCAGGTACT
GCTATATTTACAAAAAAAGAGCCTTTAAAAGTAATGTATGGAATAAATATAGAAGAACATGACAAAGAGG
GTAGAGTGATAACTCTAGAGTTTGAAGATTTTTACTTTGTTACAGTATATACGCCAAATTCTCAATCTGA
ATTAAAGAGACTAGAATATAGAACTAGATGGGAAGACGACTTTATAGATTATTTAACCAAACTAGATAAT
CATAAGCCTGTAATTGTGTGTGGAGATATGAACGTTGCACATAAAGAAATAGATTTAAAAAATCCTAAAA
ATAATATGAAAAATGCAGGTTTTACTAAAGAAGAAAGAGAGAAGTTTTCTAAATTATTAGACAGTGGGTT
TATAGACACATATAGATATTTTAATCCTGATAAAGAAGGCGTTTATAGTTGGTGGTCATATAGATTTAAT
GCAAGAAAAAATAATGCAGGGTGGAGAATAGATTATTTTTGTGCATCCAAAAAATTAGAAGATAGATTAG
TAAGTGCGGATATACACACTGAAATATTAGGTTCAGACCATTGTCCAGTTGAATTAGAGATAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c1414745-1414170 putative exonuclease [Clostridium difficile R20291]
ATGACTAATATTAAAAATTCTGATTTTAATGATTCGCCTACTTTCCCTGAGGTCTACAACAATTTTATAA
AATTTATATCATCACAAGACCCTATATTATGTGTTTGGGGAGTTGGAGATTTAAAGGAATTATACAGGAA
TATCAACTATCACAAGCTACCATCAAGTTCCTTACCTAAATCTTATATTAATATACAACAACATGCATCT
AAATATTTCAATAATCCAGCAGGAAAAAGCATTGGCCTACAAAATGCTATTTCTATATTGGAACTTGATG
AAAAAATGTCTTATCACAATGCTTTAAATGATGCATATTATACTGCTAAAGTTTTTATTAAGATATACAA
TCCAAGTATAGTCCCAGATATATATCTTTATACGAGTATAAAACCTAAAACTATAAGATATTCTAATAAA
AAAAGAGTTGATTATGATAAGTTATTTGATGAATTTAGGAAAATTTTAAATCGTGAATTAACTAAAGACG
AGAAAAAAATCATTAACTTAGCTTATAATATGGGGAAAACAAATCAATTTACATTAGAAAATGTTAAGCA
AAGAAAAAACAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1414761-1415132 hypothetical protein CDR20291_1184 [Clostridium difficile R20291]
ATGTATGTCTTTATAAATTGTAGGTTTTACATAGCTATTAAACGTATCTATTATATTGAATTTAGAATCC
AATTTAATTGCTCCTATTTGTATAATTTCAAAAGGACACTTTTCATTGGATACAGTTTTATTGAGTTTTT
TATCAAATCCTTGGTTAAATTCCAAATCGAAAATTATGTATTCCATAAAGTTTATCTCCTAAATTTTTTT
ATTATTTCTTTTACTATAGATTATATTATAAATAAAATTAAATTTTCAAATAAAAATACTTTTATTTTAG
TATACCCCATATTTGTAAAAATGTTAAACTATTGTATGTATAATATTTTTTCCAATAAAAAATATTGCGA
ACTTTTTATACTTGATATATAA
>ref|NC_013316.1|:1415261-1417159 glutamine synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAGTCTATTATACGTAATAGAGAAAGATAAACACACTAATGAAGAATTAAGAGAAATCCTAAAAA
GCAATAAAAATATAAGATTTGTTTCCTTAATGGGGGTTGATTTAGGAGGAAATGCAACAGATGAAAAGAT
TCCTGTAGAATTATTTTTGGAGGATATAGATAAATTTTTGGAATCAGCTATACAGACTGATGGTTCAAGT
GTTGAGCTTTATAATATAGCTACATTAAATAATGCGAAAGTAGATTTAATGCCAGATAAAAGTTGTCATT
GGTATGTAGATTACAATATGGAATATATAGACGAAGAAGTAGGTCTACCTGTTGGAACATTAAAGATACC
TGCATTTTTAATACATGATAATAAAAAAGTATGTTCTAGAGGAGTACTTCAAAAAGCAGATAAGTACTTT
AAAAAGTCAATGTATGAAATATTTAGAGAATATCCACATGTAATAAATAACATAGGAATAGATTCAGTAG
ATGATATAGAGGAAATAATGTTAACAGCAGCTACAGAACTTGAGTTCTGGGTTAATACTCCTGAGGATAA
AGCTGACTTAGAGAAATTATATGTATCACAAAGCCTAAAAGAGCAATACTGGAAAAGAACTCATGGTATT
ATAAGAACTTGTTTAGAGAAAAGTTTAATTATACTTCAAAAGCTAGGTGTAAACCCTGAAATGGCTCACA
AAGAGGTCGGAGGAATACAAAGTTCTATTAGTATAGATGGAAGAACAAACCATGCTATGGAGCAATTAGA
GGTTTCTTGGAAGTTTTCTACACCATTACAAGCAGCAGACAATGAATTATTAGTAAGAGATGTTATAGAG
GATGTATTTACATCACATGGACTAGAAGTTACATTTAAAGCAAAGCCAATTCATGGAGTAGCAGGAAGTG
GTGGACATACACATGTAGGAGTAAGTGCGAAGTTAAAGGATGGAAGTATAAAAAATCTATTTGCTCCAAA
AGATTTAAAAGAAGATTATCTAAGTGAACTAGGATATGGGGCTCTTATGGGACTTCTTTACAATTATGAA
GTATTAAACCCAATTGTAACAGCTTCTAATGATGGATTTAATAGATTAGTTCCTGGATTTGAAGCTCCTG
TATGCATAGTTACATCTTTAGGGCATAGTTATGAGATTCCATCAAGAAATAGGTCAGTGCTTGTTGGATT
AATAAGAGATATGAAAAATCCAAAGACTGTAAGATTTGAGTTAAGGTCACCAAGCCCTCTATCTAACACG
TATTTAGTAATAGCAGGATGTTATCAAACAATGTTGGATGGTATAAAAGCAGCAGCTAAGAGTGGTCTTA
GTACAAAAGAACTTGAAAAAGAGTTATCTAAAAATGTAGGTGAAGAAAGTTTCTATTTAGAAAAAGATAG
AGCATATAGAGATGAAAATGATGTATTTGAACATTATAGTTTGGAAGAAAGAAATGCAAGATTTGGAATA
CCACCGGCTACAGTTTATGAAAATATGAAAAACTTAGAAATATATGCTTCAAAATTAAAATCTTTAAAAC
AAGGTGATGTATTTACTGATAGTATAATAGAATCATTTAAGATTGGAGCTATAGATAAGTGGCAAAAAAA
ATTAAAAACTAGAATAATAGAGGCTGGGATTCAAAAAATAAGAAGTATTGTCAAGATACACACAAAAGAA
AATATGGATGCGCTTGATGAGGTAGTTTGGAACTCAATATCGGATTTAAAGTTCAATATTATGAAGGATA
CTTTAACTAGAGAATCACTATTCACTAGAGTGAGAGAAGCTATAGAAAATAAGGATTACCAGACTGCTTC
AGATTTACAAATAGAATTAAAGAGAAGTATGGAAGAAATACAACAACTGTATATGCAGTACAAGAAAAAT
ATATACTAA
>ref|NC_013316.1|:c1418408-1417287 putative cell wall biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGATGATAAAACAATATTAATCTTAACTGCTCAATTTGGTGCTGGACATATAAGTGCTGCAAAAG
CAGTCAAAGAATGTATTATTGAAAAATATAGTAACTATAATGTTGTTATACAAAACTTTATAAATGCAAG
TATTCCCATGATGAATAAACCTATGGTAAAACTTTATGAAAACAATACAAAATATACTCCTGGATTATAT
AATTACTATTATTACTTTAAGAAATCGTTTGATTCAAGACATGATTTATCTCATAAATTATATACACCTA
AACTTTCTGAGTATATTGCTGATATAAATCCAGATTTGATTATCTCTACATTTCCACTAGCGGCTGCTTG
TGTAAATAACTTTAAGATAAAAAATCCTGATATAAATATACCTACACTTACAGTTATAACAGATGTTGTA
GATAGTATGGAATGGGTTTTTGAAAATACAGATTTGTATTTTGTTCCTTCTCCTGAAATAAAAAATAGAT
TTTTTCAGAAAGGAATAAATCCAGACTCCATAAAGGTTACTGGAGTTCCTGTTGATAAGAGATTTCAAAT
TGAAAGTAAAGAACTATGTTGTGATAAATATAGACTATTACTTCTAGGTGGAGGAAGAGGCCTATTTGAT
ATAGATGAGGATTTTATGCATTGGATAGATGAATTTATTGAAGAACATAGTAATTCTATAGAAATTACAA
TAGTTACTGGTAAAAACAAAAAATTATATGACAATCTAACTCATAAAAAACCTCTAAAAAATATTAAAGT
ACTTGGATTTGTAAACGACATGTATAATCTAATAAGAGAATGTGACCTAATGCTAACTAAGCCTGGAGGA
GCAACTATATTTGAAGCTATTCAATCACAAACTCCAGTACTCGTGAAAATGCCAAAAGTTGGACAAGAAA
TTGAAAACGCTAAATTTATAATAGATAAGGGTCTTGGCATGATTTATAGTGATGACCTAGACCTTAAAAA
CATATTTTATAAATTAGTATCAAATGAATTTGATTCTATAATAAACTTTATGAAAAAAAATTTAGAAGAA
TTTAAAACAGTTATTCATCCAGAGAAAATTGCTGATTATATATCAGAATTAATAGATAATCATTACAGTT
AA
>ref|NC_013316.1|:1418607-1418939 padr-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAACACACAATTTAGAAAGGGTGTTTTAGAAATTTGTGTACTTGCTCTCATATCTAAGAAAGATATGT
ATGGATATGAGATAGTACATAACATCTCTAAAGTAATAGATGTAAATGAAGGAACAATATATCCTATTCT
AAGAAGACTTACAAAAGATTTGTATTTCGAAACATATATACTAGAATCTAATGAAGGTCCTGCTAGAAAA
TACTATAGAATAACTTCACTAGGAAAAGAGAATTTATCCAATCTGATGGAAGAGTGGAGAGAATTTGTAA
AGGCTGTTGAGATTTTAATAAGTGAAGATGAGGGAGGTAATGAACTTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1418926-1419984 hypothetical protein CDR20291_1188 [Clostridium difficile R20291]
ATGAACTTGAATAAAACTGAGTTTCTTGAAATTTTAAAGGATTATCTAAAAAAAGATTTTTCTGAGAGCG
AAGTTAATGATATATTGAGAGATTATGAAGAGTATTTCGTAGATGGTCTTATAGAGGGAAAGAGTGATAT
GGAGATAATAGCATCACTTGGTTCACCAAAATCTATAGCCAAAGAACTTATCTTGCAGACTAAAGAAAAA
AATATTGAAGAGGAAAAAATAATAAATACAGATGTTTTGAATGATAAGTTTAGTAAATTTAAATCAGATA
TGAAAAAAGGTTACTCTATCTTAAAAGATGAAGCAAAAGAAAAGTATAGTAAATCAAAAGAAAATATAGA
TGGAAAAATAATGAATACAGATATATTAAATGGTAAATTTAGTAGGTTTAAATCAAATATAAAAAAGGAT
TACTCTATCTTGAAAGATGAAGCTAAGGAAAAGTACAATAAATCAAAAGAAAATATAAATGATAAACTTA
CACCAAGTATAGAAGAAGGTGTAGGGGGATTATCTAGACAAGTTATAAAGGGATTATTAGTAGTGTTATC
TTTATTTCTAATTGTTCCAGCATTTGCGTTTGTATGTGCTATTGTATCTGTTACTATTGCATTAGTATGT
TCATTAATTGCTTTTGTTATATTAATTCCATTTGTGATTAAATTTATAGCAATGGTTCCAGATGTTATGA
TGTTTTGTATTTTCGCAACCATAGCATTTGTAGGGCTTGAGATACTTGCATGGCAAATTTTATTATTTGC
TATAAAACTAGGTAAACAATTACTAAATAATTATATACATTGGATAAAGAGAAAAAATATTTATATAAAG
GCAAATGAAAAGATGGAAAAAAGAAAAAAAGCTACTTTAAATGATGAAGATTTGAATAAAGACATTAATG
AAGATTCATATAATAATGATTACTACAATAGAGAAGAAGAAAGCATAAAAGAAACTGATGAATATAATGA
TGATAGTATAAATTTTGAGGCGATATATAAGGACCTTGAAGATATAGAAAATAAGAAAGGAGAAGATAAA
CATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1419977-1421047 hypothetical protein CDR20291_1189 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAAAACTTGCTATATTTGCTGCAGTTTTATTGGTAATAGGTATAATAGGGACAACATGGTCAG
GGATTTTAGTTATGCCAAGCCTAATAAACTTTGGTTTAGAAAAGGAAGCTGAATTTAAAAAAGAAAATAA
ACTTTATCAAGAAAAAGTAAATATTGACAAGTTAGATATATCTGTTGACAATATAAACGTTACAATAAAG
AAAAGTTCAAGTGAAGATGTGCGTGTAACAACAAGAGGAAATAATGAGTTTTACAAATACAATGTAACTT
TAAAAGATAAGACTTTAGTTGTAAAAGGTGAAAGAAAATATGAAAATAAAATTAAAAAGATTAAAAATTT
CGACCAATTATTAAATACATCTATAAATAGTATGTTTTCACATGATTATAGAGAAATTATAATATATGTA
CCAAATAATGTAGACATAAATGCATCAAGTACAAGTTCATACTTATTTGTATATGATAATGTAGCTTCAA
ATACTATAACATATAAAACTTCTTATGGAGGTTTTAGTAGAGCTATAACAGAGAACAAAGTAAATAGATT
AGAAAACCTAAACTTAATATCTAATAGCAATCTTCACTTGTCAACAAAATCAATTTTAGGCGTTAAAAAT
GTAAACATAGAATCAGAGTCATTGGATATATCTTCAGAGAATGAAGATGTATTTATCAATAATATAGAAG
AGTATATACCTGAAAATGTAAATATAAAAGAGAAAATAGGTAGAAATTCAAATTATGAAAGTGAATTTTA
CTTGTACTCTAATATGCCAATTGCTAAGTTCCTGGACATAGAAGTTCCAAATTCTAAGGTAAGACTTGAT
ATACCAGTAAATAAGTATAAATTTAATTGTGATATAAAGTCAAAAGAAGCAATTGAAGAATTTAATAATG
ATGAAGAATATGACAATGATTCATATGATTATGAACATAGTGAAGAACATAGCAACAAGTATAGAAATAC
GAGGGAAATAAAAGGGCTTTTGAATAAAAATCTGTCGAATTTAGAGAAAGAATATACTATAAAAATAAAT
TCAAATAGCTTAGAATTGTAA
>ref|NC_013316.1|:1421149-1421685 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAATAGCAGTAAGTTTTTTAATAATTGCTACTACTTTATTGAGTACAGCATGTATGGATTATA
GCATCAGTGCAGTTGAGCTAGTTGATTCTAAAGAATCAGCAGTTGTAAAGAAGGATGAAGATGCAAAAGA
AGAAACAACTAGTAAAATGATTAATTCTAAAAAAACTACTAAAATACCTATAGAGATAATTTCAAAGGAT
GAGAAAATAGTAAAGTACTTACAGATTGATGAAGAAAGTTCACTTAAGGATAAACTGCGATTAATCTTAG
ATACATTATCAAATGAGTATTTTAATGGTTTAGACATGGAAGTAGAAGTTAAGGAAAAAGATAATCTTGT
TAAAATAAACTTGATAGAACCAGATAAAAAAAGTAGAGTTTCTTGGAAAGATGATTATTTGAATGAACAA
AATATAATATATACTATAAATAATATTATTAAAAATGTCATCCAAGAAGAAGATAATAGCATTTGGATTG
AAGAAGTAGAGATATACTACAATGGAAAATTAATAGAATTAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:1421793-1422509 putative lantibiotic ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATTATGAATAATTATATTTTGCAGGTAAAAGGAGTTTCTAAAAAATTTAAGGAGCAGATGGCAG
TTGATAATATTTCACTAGCAATTAAATCTAATTCTATATATGGATTATTAGGACCAAATGGAGCTGGGAA
ATCTACTTTATTAAAAATGATAACTGGGATTTTAAATCCAACTTCAGGAAAAATAATGTTTGAGGGACAT
AGATGGACTAGAAAGGATTTATCAAATATTGGTTCTCTTATTGAGTCTCCTGCTATATATGAGAATTTAA
CAGCACGAGAAAATTTAAAAGTCCATACTACTTTACTTGGTCTTCCTGACTCTCGAATTGAAGAAGTTTT
AGAGACTGTCGACTTAAGAGATACTTTTAAAAAGCGTTCAGGTCAATTCTCTCTAGGTATGAAGCAACGT
CTTGGTATTGCTATTGCATTATTAAATCACCCAAAACTTTTAATCTTAGACGAGCCTACAAATGGTCTTG
ACCCTATTGGTATTGAAGAACTTAGAAAATTGATTCGTTCTTTTCCAAAACAAGGAATTACAGTTATTTT
ATCAAGCCATATCTTGTCTGAAGTTGAACAAGTCGTAGATGAAATCGGAATAATTTCTAATGGAGTAATT
GGTTATCAAGGAGAAGTATCAAAAGAACAAAACTTAGAAAAACTTTTTATGAAAGTTGTAGCTGAAAATA
GAAAGAGAGGGGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1422511-1423227 putative lantibiotic ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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TTCCAGTGTTTTGTATACTTTTGTGTGGACTAGGTGGAGGGCAAAATGCTGCTTTCAACTGGTGGTATAC
GACATTTCTTCCAGGAGCATTAACATTAATATCTTCTTTAATAGTATTAAAAGATGAAAAAAGTAAATAT
CGTGGTATTTTACCATTGCCAATTGAAATGAAAGACGTTTGGGCTGGAAAAATGATTTACTGTATTATTT
GTTGTTCTATAGCATCGATTATTTCTGCAATAGGTGTAGTTTTTGTTGGGATAATCTATAAAGAAACTAT
TTCAATAGGTCAAAATATCATTGCAACTATATTAATTATTTTACTATTTATGTGGCAGATTCCTCTTTGT
ATGTTTTTAGCTTCAAAATTTGGTATATTTGTTACAGTTCTAACAAATATGTTCTTTACTATTGTTGGAG
TTGCTGTTTTCTCAACTACAGAAATGTGGTATGTATTTCCATATTCGATTCCTTCAAGATTAATGGTTGT
TGTATTGCATATTCTACCAAATGGGCTTCCTGTACCAGAGGGGAGTGAACTTTTAAATAATGCTGTTATT
TTACCAGGAGTATTAATATCTGTTATTTTATTTGTATTATTTGCTTTAGTTACAAGAGCTTGGTTCAATA
ATAGAGAGGTGAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1423229-1423987 putative lantibiotic ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGACAACTAATAAGAATATTTTGTTCTGATTTAATAAAATTAAAGAGAAATTTTATAATACTAATGC
ACATTTGCATTGCTTTAATGGGGATGGGATTGTTTTTATGGTATTATAAGGTTTCAGGAGCTGATAATAT
ATTAAAGATAGTAGCATATTTACAAGTTATAGCAATAGCTTTTCCTTTATTGTCAGGTGTTGTGTGTTCA
ATGTTTGTTGAACAAGAATATTATGCAGGGAATTATAAACATATGTTAACAACATCTAATCCAAAATATC
TTACTCTTATAAGTAAATATATAATCTTAGTATGTCTTGGTTTTGTAGCAACATTAGTGTCTGTATTAGG
TTTTAAATTTGGTATATCTAAGGCTTACTTTACATCAAGCTTTTATATGATTTCAATTCTAATTTTAATT
GGGTGTAATTTATTTGAATACATATTACATTTATTCTTAAGTTTAAGGTTCGGAAAAGGAACATCAATTG
GAGTAGGTATAGTTGAAATGTTACTTTCAGCATTATTATTAACTGGATTGGGTTCTGGCATTTGGCAGTA
TTTTCCTTGTGCATGGGGTGTTAGATTTATAACTATTTGGTCGTCTTTTTCAAGTTCTAAAACGGTTGAA
TATATAAAGGTTGAATCAATAAAAGCATATCAATCAACAGGTTTAATGTGTGGTTTTGTAACAATTTTAG
CATTTGTAATTTTATGTATTTGGTTTTCTAAATGGGAAGGTAAAAAGTCAGAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1424122-1425519 lantibiotic two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGGCACAAATGCTTAGAAGTAAAAAATCTAACAACAAAAAAGTTGAAAAGTTAAGAACTATTTTTATAA
AATATTTATCTTTATTCTTTGTTATGACAATTTCATTTGCACTTCTTTTAATGTTATCATTTTCTGTATT
ATTATCATCAGGTGTAATATTACCAGCTAATTATTCAGAAAAACAATTTGATAAATATAAAGAAAAGATT
ATTTCAAGTGAAAAAGCAATTGAAGATATAATTCCAAATTTATACGAGTATGGTGTTTATACTTTAGATG
GGAATTTGATCTCAGGCACTTTTAATAAAAAAGAATCAAAACAAGTATGGAATTTAATGAGAGATATTGA
AGAAAGGCATGCATATTCAGAAAGTTATATAAAGTTTTTTAAGAAAGATGAAGTTTTTATAATAAAATAC
AAACTAGTATCAGAGTATAGTTCTCCAGTTTTAAGAGCATATTTACCAAAACCAGAGATGTTAGGTATGA
TTATTTTTAGTATAATATTTTTTATTGAAATTGTTATATTATCAAAAGTATTTGGCAAGAAATTTAATAT
TGAAATGGAGCTTTTAAAAAATACTACAGAAAAAATAGAACAACAGGATTTAGATTTTGTTGTAGAATCT
AGTAAAATTTATGAAATTAACAATATCCTTTTTTCTATGGATAAAATGAAGTTGGCGTTAAAGAATTCTT
TAGAAAAACAATGGATGCTAGAAGAAAATAGAAAGGAACAGATATCTGCACTGGCACATGATATAAAAAC
ACCATTAACAATTATACATGGAAATACTGACTTATTAATTGAAATAAATGAAAATCCTGAGTTATTAGAA
TACATGGAATATATCTCAAAGGGTGTCACTCAAATAGAAAAATATATTAATACTTTAATAGATATATCAA
AAACAGAGAATGGCTATATATTAAATAAAGAAGCAATTAATATGAGTGAGTTTATAAAAGATGTCTTACT
GCAAATAGAAGCATTAGCTAGTACTAAAAACTTAGATGTGGAGTTTTATAAACAAGATAATTTGCCTAAA
AATATAACTATAGATAGAGAACTGTTATTCAGAGCTATTATGAATATAATTTCAAATGCTATAGATTATT
CACCAAGCCAGAGTAAACTATACATAAGTGTATCAGTAAGTAATAAATACTTAAAATTTGTAGTTACAGA
TTGTGGAAGTGGTTTTTCTAAAGCAGATTTGTCAAAAGCTACAGAACAGTTTTATACAGGAGATTTGAGT
AGAAATTCTAAATCTCATTACGGAATGGGACTTTATATTGTAAATAATATTGTACAAAAACATAATGGAA
TTTTATATATTGAAAATTCTGTGAAAACTGGTGGTGCTATGGTAACAATTGAAATACCAATAGTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c1426416-1425595 putative pyridoxine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAAAAAAAGTCGCAGCAATTAATGACTTATCTGGAATAGGAAAATGCTCATTATCGGTTGCTATAC
CTATACTTTCAGCATTAAAGGTTCAATGTTGTCCATTTCCAACGGCCATACTTTCAAGTCAAACTGGTTA
TCCTGAATTTACTTTCTTAGACTTTACTGATGAAATGGTAAAATATTCAAATGTTTGGAAAAATTTAAAA
GTCAATTTTGATAGTATATATAGTGGTTTTTTGGGTTCAAAGCATCAAATTGAGATAGTGGCTAATTTTA
TAAATGATTATCCCAATGCTTTTATCGTAGTTGACCCTGTGATGGGTGATAATGGAGTTATGTATCCAAT
ATTCACAGAAGAAATGAGACAGGAAATTAAAGAATTAGTTAAACATTCAGATTTAACTACTCCTAATTTA
ACAGAAGCTTGTTTCTTAACTGGAAATGATTATACTAAAAGCGATTATAATAGAGATGAGCTTATATATA
TTGCAAAATCTGTATCTGATTTGGGACCTAGCAAAGTCGTTATTACTGGTATATTAGAAGATGATAATAT
ATTAAATTTGGCTTATGATAGAGATAATGACCATGTATTCTTTACATCAGTCAAATACAATAATTGTTCT
TACAGTGGAACTGGAGATATATTCACATCTATACTTTGTGGTATGTTAGTAAATAAACATGATTTGGGAG
TAGCGGTTAATACTGCAACAGATTTTATATATAAAACTATAAATTACACATCTCAATTTGATACTGATAG
AAATGATGGAGTTATGTTTGAAAACTTTTTATCAGATTTAACTAATATATAA
>ref|NC_013316.1|:1426643-1427821 hypothetical protein CDR20291_1196 [Clostridium difficile R20291]
GTGTACTATTTGGGAGGTGTAGCTTTGAAAATACTGAAAAATAAGAATAAGTACATCAAAGGTATAATGG
CATTTGTATTTTTGTCTTTAGCTACTACAGCAGGTGTATTTTTAATCAATGATTTAAGTATGAAAAATAT
GGAAGAAAAAGTCATGGAATCTGCAAATGTTGAAGGTGATGATGTAAAAGACCAATATAAACTATTGCTT
GAAAACTTATTTGACTACAGAAATAAGGCAATATTAGAGAAAAATGAAAACATTTTAAAAGGTCTTTATG
AGACGGATAAAAAATTTGGTCTGTGGGCTTATGAAAATGAAGTAAAAAAGATGAAGTATTTAGAAAACTG
GTCTAGTAAGCAAGGTGTAAAATTTAAAGACATAAAGACAAGGGTTAAGATTAAAAAAATAAAAGAAAAA
GAAAAAGACCTCTATGGTATAATCTGTTCAGTATCGACTGAATATAAGTATTCATATGAAAATCAAAAGG
ACAAAGAAAATGCCTTTAGAATAGGTACATATCATTATCTAAATGTAAAAATTATAGATAATCAATATGT
CATAACTAAAGAGTGGTACACAGACCCTTTTGCAGACTCTTTAAATTTAGAAAATATAAAATCTGAGGAT
ATAAGAAACTATATTGGGCAACAAGATGGTGTAGAGTTACAGCTTACAGATGAACAAAAAAAGGCTATAG
ATTATGCACATAAATACTGTGGAGCCGCAGCTGATGAAGAACATGGTATGAAATTTAATCCAAACTATAG
GGATTATAATCCAGAAGGTGGAGATTGTGCAAACTTTGCATCACAGATAATGTTTGAAAGTGGAAGGTTC
AAAAAGAACTCAATTTGGAATTATAGCGAGAGAGCAGGTACAAAAGCATGGGTAAATGCACAAGCTTTTA
AAAATTATGCACTGTATAGTGGAAGAGGTTCATTAATTGCTAAAGGTTCCTATGAAGAAGTATACAAAGA
AGCTTATAATTTACGTCCGGGGGATTTTGTTGGTTATGAGAAGAAAGGCAGAATAACACATGTTTCGACA
GTGACAGGATTAGACTCAAGAGGATATCCTTTGGTAACTTGCCATAATACTGATAGAATGTTGGTGCCAT
GGGATTTAGGCTGGAGTGATAAGTCCATAAGATTCCATATAATAAAAATAAATTATTAA
>ref|NC_013316.1|:1428004-1428204 putative cold shock protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAACTGGTGTAGTTAAATGGTTTAACAACGAAAAAGGATTTGGATTCATATCTGTAGAAGGTGAAG
GAGATGTTTTCGTACATTTCTCAGCTATAACTGGAGATGGATACAAAACATTAGAAGAAGGACAAAGCGT
TGAGTTCGAAGTAGTAGATGGAGCTAAAGGTCCTCAAGCTGCTAACGTAGTTAGATTATAA
>ref|NC_013316.1|:1428625-1429053 putative regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAACATATTATTCTTTCTAACACCAAAAAGTGAAGTAGCATATATATATGAAGACTACACTATAAGGC
AAGCACTAGAAAAAATGGAATATCACAAATACTCTGCAATTCCAATAATAAGTAAGGATGGTAAATATGT
TGGAACTATAACAGAAGGTGATTTTTTATGGACATTAAAAAACGATTTAAATCTGGACTTAAAGGGATTG
GAAGATGTTCCAGTGACAGATATAAATAGAAAAATGGATAATTCTCCTGTTTCCATCAACGCAGATATTG
AAGATTTAGTTATAAAATCTTTAAATCAAAATTTCATTCCTGTTATAGATGACCAAGACACATTTATTGG
GATAATAAAAAGAAGAGATGTAATAGGTTACTGTTATGAGATAATACGTGGATATAAAAATTTAGCTAAT
GATAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c1429981-1429196 putative peptidyl-prolyl isomerase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATACACTATGAAGGAGTTAACTATTATGGAAAAAAAAGTTTTAGCAACAGTTGGAGAAAAAGAGA
TAACTAATATTGATATTGAAAATGCATTAAAATCATTAGACCCTTATCAAGCTATGCAATTTAAAACTGA
AGAAGGAAAAAAACACTTATTAAATGATTTAGTGAATCAAGAATTATTCTTCTTAGATGCTAAAGAAGAA
AAATTAGATGAAGAAGAAATATTTAAATTAGAAATGAAAAAGATAGAAGAAAATGTATTAAAGCAATTTG
CTATAAATAAAGTTTTATCTAGTGTTAATGTAACAGAAGATGAAAAAGTAAAATTCTTTGAAGCTAATAA
GAGCTCTTTCTCTAAACCAGAAAGTGCAACTGCTAAACATATATTAGTAGATAGTGATGAAAAAGCTAAA
GAAATACTTGCTCAAATAAAATCAGAAGAAATATCTTTTGAAGATGCAGCTCTTAAACATTCTTCTTGCC
CATCTAAAGATATGGGTGGTGATTTAGGAACATTCGGTAGAGGACAAATGGTTCCTGAATTTGAAGAAGC
TGTGTTCTCTATGGCTAAAGGTGAAGTAAGTGAACCAGTTAAAACTCAATTTGGATACCATATAATAAAA
TTAGAAGACCTTCAAGAAAGTACAGAGTCTACATTTGATGAAGTTAAGGCTGAAGTTGAAAAAAGTTTAT
TATATCAAAAACAAAATGAAGTTTATGGAAATAAGATAAATGCTCTTAATGCTAAGTACGGAAACCTTGT
AAAATACAACGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c1430488-1430072 hypothetical protein CDR20291_1200 [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAAAGAAAAGTTGTTTGATAATTATTTTAAGTTCTTAGCACTATTATTTTGGCCAATTATGTGGT
ATAAGTGGATAGTAATTTCAAATGGTACTCTTGAAAATATGTTATTTACCATATATGCAATCGTCGCAAT
TATTTTCATCATTTTATATTCGGTGTTTATGATAAAATATAAAGACATTACACAAATAGATTTCTTTTAC
AGGATAAGTACTCTACTTGCTTTTATATTTACACTTTTTAGCTTTTTAATATACCCAAAGAGTTTATTTT
TCTTGTATTTAAAGATTATTTTTACTGGAATATACCTTTATTATTCAATAGTAAAAACTCTTAAATTTAA
AGATGATGAAGGTGTAGTGGGTATTATGAGCTCACTTTTATTAATTGTAATAACTTTGTTCTACTAA
>ref|NC_013316.1|:c1431158-1430652 putative phage-related protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATTTGGATAAGCTTTTTGAATTAGCTTCTCAAGAAGAGATAATAATTCATTATACCACTTATA
TTGCAGGTGATTTAGAAGGGCTATATATAAACAAACATGGTATTAAAATTATATCATTACTCAGTAATTT
AAAACAAAACTCAAAAAAATTGACATCCATCTTAGCTGAAGAACTTGGACATCATTTCACTAGCCTTGGA
TACTATGTATCCTCTTATAACGATTATTATACAAAAATTATTATAGATAAGTGCGAAAATAAAGCCTTAA
AATGGGCTTGTGAGTTCTTAATTACTGAAGAAGATATAATAAACATAATTAATTCTGGCATCACTTGCGT
TTATGAAATGGCAGACATACTTAATGTGGATATTACTTTCTTTCAAAAAAGATTAGAATTTTTATCATTA
AAAAAACAGTCTTTACAACTTGGAAATAATAAATATTTAATATTAACTAATTTGCCGTATTTCTACATAT
TTGATCCAATTTCATAA
>ref|NC_013316.1|:c1431560-1431240 putative phage repressor [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTGCCAAAAGATTAAGAGAACTTAGAAAGGAATTTGGATTGACTCAAAGAGAACTTGGAGAAAAAG
TAGGCGTTTCCCAAAGAGTCTTAGGGTACTATGAAACAGAAAACAGATTTCCTGATGAACACATTTTAAA
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GATACAGTAGCTGCACATAGAAAAAATCCACATGAAGAGTTACCTGAAGAAGCACAAGAACAACTTAATG
ATTATATAGAATTTTTACTAAATAAATATAAAAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1431729-1431926 putative phage regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAAAAATAACTTGAAATATTATAGAAAATGCAAAGGTATGACACAAATTCAACTTGCCAGAAAGG
CTGGAATTACAAATGACTATATATCTCAAATAGAAAGAGGTATAAAAAATCCTGGTCTTCTTATGGCTAA
GAAGATTTCTAGTATTTTAGAACAAAATATAGAAGAAGTTTTTTTTATACAGTTATAG
>ref|NC_013316.1|:1432031-1432471 hypothetical protein CDR20291_1204 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAACAAAAAAGATATATTATTTAAAGAAACAGATGAAAGATTACATAATTATAAGTATTTGGATA
TAAAGATAAAGAATATTAATTTGGACATAAAAAGATGTGAGAATGAATACTCTGGATGTGGAGCAATGGT
ATATACAGAAAAGACTAGTAACACATATAACATAAGTTCTTCTGTGGAAAATGAGGTGTTAAAAAGAGAG
GAAAGATTAAGAAAATTAAAAATGGAAAAAGAAGATATAGAAATAGAAAAAGAGAAGATAGAAAATGCTC
TAACATGTCTAAATGATATAGAAATGGAATTTTTTAATCTTTTTTATAATAGTAAGACAAAAAACAATAT
GACATATATTTCTATGAAACTACACTTAGATAGAACATCTTGCTACAATTTAAAGAAAAAAATGATATTT
AAATTGAGTGAGATATTATAA
>ref|NC_013316.1|:1432720-1433163 hypothetical protein CDR20291_1205 [Clostridium difficile R20291]
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TTATTGATGATGAAAGTGTGCAAGGCTCTGAAGGGTCTTGTTTTTTTGTAAGTATACTATCAGTTATTTG
TACACCTATAATGTTAAATACGAATAATAAAGATATTGTTATCTCTATAAAATACTTACCAAAACCACAG
TCAAAGAGTATTAGAATGTATGAAATTTCAGATGAATTAAATAAGTTATTCAACAGAAATATAAAGGTAA
CAGACAGAAAATTAAATATAACAAAGCTAGAACAAAGTATTAAAAAAGAAGAGTCAATTTATGTATTGAA
CTTTACAATTACACTAAATTATCTGGATAGTGTATATGAAGAAGATGTAGTATATGAAAATATGGAAGAA
ATCAATTTAAATTTAGGAGAGTGA
>ref|NC_013316.1|:1433168-1434232 hypothetical protein CDR20291_1206 [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTATAGGATTACCAAGTATCAACATATCATTTAAGGAGCTAGCTACAACTGTTAAAGAACGTTCAG
CTAGAGGAATAATTGCAATGGTGCTTAAAGATGCTAAGGCACTAGGTCTTAATGAAATACATGAAAAAGA
GGATATACCAGTTGATTTATCTGCTGAAAATAAAGAGTATATAAATTTAGCTTTGATGGGAAATGTTAAC
ACTCCAAATAAATTATTAGTTTATGTAATAGAAGGAGAAGCAGATATTCAAACTGCATTAGATTTTTTAG
AGACTAAGGAATTTAATTATCTATGTATGCCAAAAGCAGTAGAAGCTGATAAGACTGCTATAAAAAATTG
GATAATTAAACTTAGAGATATAGATAAGGTTAAGGTTAAAGCTGTATTAGGAAAAGTTGTAGGAAATCAT
GAAGGGATAATTAATTTTACTACAGAAGATGTGTTAGTTGGAGAAAAGAAATACAGTGTTGATGAGTTTA
CAAGTAGGGTGGCTGGACTTATAGCAGGAACACCTTTAAGTCAATCAGTAACTTATACTAAGCTTAGTGA
TGTAGTTGATATACCTAAGATGACGAAAGTTGATGCAGAATCAAGGGTTAATAAAGGAGAGCTTATACTT
ATTAAGGAAGCAGGGGCTATAAGAATTGCAAGAGGAGTAAATTCTTTAACTGAGTTAACAGAAGAAAAAG
GAGAAATGTTCCAGAAAATAAAAATAGTTGACACTTTAGATATTATACATAGTGACATAAGAAAGGTGAT
AATAGATGACTATATAGGAAAGGTTACTAACAGTTATGACAACAAATGTTTATTGATAGTAGCTATAAAA
AGTTATTTAGAAGAATTAGAAAAGTCAGCACTTATAGAATCTGATTCTACTGTTGAAATAGATTTTGAAG
CACAAAAATCGTATTTAAAATCAAAAGGAGTAGATTTATCTTATATGACATTACAAGAAATAAAAGAAGC
TAACACAGGTTCTAAAGTATTTTTAAAAGCAAAAATAAAAGTACTTGATGCTATGGAAGATATAGATTTA
TCAATAGAAATATAG
>ref|NC_013316.1|:1434246-1434674 hypothetical protein CDR20291_1207 [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAAATATGGAAGCTAGAAATGTAATGAGTGGTACTTGGGGAGAACTTTGGCTTGATGGAAACAAAG
TAGCAGAAGTAAAGAAGTTTCAAGCAAAGATGGAATTTACAAAAGAGGATATTATAATAGCAGGTCAAAT
GGGTACTGATACAAAGTATATGGGATATAAAGGAAAAGGTTCAATAACTCTATACCATGTTAGTTCAAGA
ATGCACAAGTTAATTGGAGAAAAGATAAAGAGAGGTTCTGAACCTAGATTTGTTGCTATATCTAAATTAA
ATGACCCAGATTCTTATGGAGCAGAAAGAATAGCAGTAAAAAATATAGCATTTGATGATTTAACTTTAGC
TGATTGGGAGGTTGGAGTAAAAGGAGAGATAGAAGCACCTTTCACATTTACTGAGTATGATTTTCTTGAT
ATAATTTAG
>ref|NC_013316.1|:1434788-1435234 hypothetical protein CDR20291_1208 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGAAAATGGATTATCAAAAAATATAAACATAGTAGATTTACTTTTAAATGCAGATACAGAAAACT
TAGAAAGACCAAGTACTATAGTTGAACTTAAGAGATTATCAACTATATTTGGGCAGGAATTTAAAGTAAT
GTGTAGAGCTTTAACAATAAGTAAAGATGAAGAGATACAAAATACTTGTCTTAAAATTGATGAAAATATG
AAAACGGATATAGACTTACCGGAGATGCAGATGCTTACAATTATAGAAGGTGTTTGTGATTTGGATGGAA
AGCTTTTATTTAAAAATAAGGAACTAATGGATAAATTTAAGGCTCCAACACCAAAAGAATTGGCAAGAAA
ACTATTATTACCAGGTGAAATTACCAACCTATATAGAATACTTCAAGATGTTATGGGTTATGGTAAAAAT
GCAGTGATAGAAGAGGTAAAAAACTAA
>ref|NC_013316.1|:1435261-1435428 hypothetical protein CDR20291_1209 [Clostridium difficile R20291]
ATGTACTATTATTGGAAGAAAAAAGGTATAAGACCGTCCCTTTTTTATGCAATGGATAAAGGCGAATTAA
AGCTTATTGAAGCTTTTTTCGCCTTAGAAATTGAGGAAGAAGTTGAAAAAATGAAACATGGATATGGAGT
GTGTCCTTTGACAGGAGGTGGTATGTAA
>ref|NC_013316.1|:1435401-1437881 hypothetical protein CDR20291_1210 [Clostridium difficile R20291]
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ATAATTACACACCAAAAATGAACCAAATTATATCAGTAACTGATAATTTTAGGAGAGCAACTGTGGCTGT
TTCACTTTCCACTAATGTAATGGCTAGTAGCATAAAAAATTCTATTGGAAGTGCAAGTAGTAGAGTAAAC
AGTTTAAATTCCTCGTTAAGAAAAGTTCAAACTACTGCTAGTAGTGTAAGTTCAACTATGGCAAAATTAA
GTTCTAGCATAAATGCTGTTTCAGGAGTTATTGGAAGTTTAAATGGAAGTATTATGAGACTAGCAATAAC
TATAGCTATGATTATTGATTATTTTAATAAGTTGATTCAAAAGAAAAATGAGTTTAATTCAAATATTATG
ATTATATTAATATTTAAAGCTAAAAGTGATGAAGTAGAAAAAACTAAAAATAAATTACTTGGAAATTTAA
AAAAGATTGGTGGCAAGATTTGGAATATCGTAATAAAAGCAAAAGATATGACTAAGAGAGTGATAAGTAG
TATCTTGGGAAAATTAAAACGAGTAGAGAAACGTCCTTATCAAGGAAGTATTAATCTTAAAGATATGGTA
AGTAGTGCTATGGCTAGAATTTTGCCTAAGTTAATGTTGTTTAAAAATACTTTTTGGAGTGGTGTAATAG
CTATAAAAGATATGGCAAGTAGCATTATAAGTAAAGTATTTCCCAAATTGAGATTGTTTGCAGGTAAGGT
ATGGAGTGGTGCAATAGCTGTAAAGGATATGGCAAGTGGAATACTTGGTTCGATAAAAGGGAAGATATCT
GATTTGACAAATGGTGCTACTATAGGTGTCGCTGTGAAAAAGGGTGTTGACTTACTTGGTCAGGAACAAA
ATCAGAAAGTTGTTCTAGAAAGTGTAATGAAAAGAAATACTGGAAAAACTAGCCAAAAAGATGTTGATAA
GTATTATGACAGTTTAGTAAATATGGCAAATGATACGCCTTTTGACCCTGAAGATGTTGTTGCAATGGGA
ACTAAAGCTAAAATGATTAGTAATATTACTGGTGGCAAAAAAGAAAAAGATATAACTCAAGCTATGGTAG
ATGTTAGAGCTTTAAATATGAATACAAGTAGTGAACAAGATGTATCAGCAGCTTTCTTAAGTGCAGCAAA
AGGAAATATGGAATCTCTTAATACTCTGGTAGGAGAAAATTATAAAACTTTTGATGAAGCATTGGAAGGC
ATAAGTGTAAAGCAGATGGGGTTAGCTAAAGAAATGAGTAATACAATACCAGGTATAATATCAGGAGCTC
AAACAAGCATTAACAATGGTTTGAAGAGTATTGTTAAACCTTTTGATGATATTTTAGGTCAAGGACTAAA
GAAAATAAAAACTTTTATAGAAAGTGGATTAGGGAATTTAGCTGGCTTATCTGAAAAAATGGCTGGTAAA
ATAGGCAATGTAATGAATGGTAAGATAATTATTGGCAACAAATATGACCAGATGCAATCTAGAAGTGTAA
AAAATGGAAAAGAGTTTTCTGATTCTACTCAATATCGAATTTCTAATGAGGCTGAAAAGCGTAAAATGAT
GGTTGAAAATAAGCAAGAACGTTTTGAAAATCATGCAGCAACAATGATAGGGAATGCACCAAAAGCAATT
GTTAACGCAGGAAGTACACTATTACAAAATATTGATTTTACAGCATTAATAGATTCACTACTTCCAGTAG
TAAACTTAGTAAATAATTTACTAGATAGTATAAACAATAAATCACCAATTGCACAAGGATTAATAAGTAT
ATTTGGTACAATAGTAACTACAGCATTCCAACTAATCGGACCTGTAGTTGAAGCTGTTAGTCCTATTATC
ACAAGAATTTTTACTTTTTTAGGTGAATATGCACCTCAAATAAACAATTTTATAGAGACACTGGGTGTTA
TTTGGAAAACTGTATGGGAGACCTTAGGACCTCTGTTGGAAACTGGATGGAAAATTATAGAGCCAATATT
GGGAGCTTTTTTTAACATATTAGATAAAGTATGTAAAATAGTTAAAGATATATGCAAATGGTGGCAAACT
ATGATTAATAAGATAAAAAATGGAAGCATCACAGGAACAGTTTTAAATCTAGTGGAAAAGAGTAAAAAAA
ATTACAAAGATAATCCATATGCTGGAACAAAGGCTGGTGATTCTGGTAAAGCTTATTCAAGTAAGAAAGG
TAATAATGCATTTGGATTGAACTATGTTCCTTATAATGACTATCAAACCAGACTCCATGAAGGTGAAATG
GTTTTAACTAAACAAGAAGCAAATCAATATAGAAGCAGAAAAAATGGTGGAAATATAAACATAGCTAAGT
TAGCTGATACAATAGTGATTAGAGAAGAAGCTGATATAGAAAAGATAACATCAAAATTAGTTGCAAGTAT
CCAATTGGCACAGTTAGGGGGTGTCTTATAA
>ref|NC_013316.1|:1437881-1438303 hypothetical protein CDR20291_1211 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAATGTGGCTTAGACAAGCAGAAGATAGATTTAGATTTCCAGTATTTCCATCTTCCTTTAGTATTA
ATGGAAAAGCTGCTGTAAACTCTTCTAGTATACTCAAAATAGGTGAAGTAGCAACTTTTGGTGGTGTAGC
TCTTAAAAGCATTTCAATATCAAGTTTTTTTCCAAATAAAGACTACACTTTCTGTGACTATACAGGTTTT
CCATCACCATATGATTGTGTAAATAAGATAGAAAAATGGATGAAGGAAGGTTTTATATTAAGATTTACAA
TTACGGAAACAAATATAAATATGGAAGTCATAATTGAAGGGTTTAGTTATGAAGAAAGAGATGGGACTCG
AGATGTATATTTTACATTAGATTTAAAAGAGTATAAAAGAATAAAGATACCAAAAGTAACTCCAAAACAA
TAA
>ref|NC_013316.1|:1438585-1440114 putative phage cell wall hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAATTAATAGGTCTAAAGATTCAAGCAGTAATGAAATTAGTTTTGTATCTAAAGATATGGGATTTT
TACTTACACAAAGTGAAGTGTCATACAATTTTAAAGATAAGTTAGTTGAAGACATAGCAAAGCAAGTATT
TGCTGAAAATAGGCTTTCAGTTGGAACAATAGCAAAGACCAATGTCAAGTATACAAAGATGTTTATAGGA
GTAAATGGTTATGACACAATAATGAGTGCATATACAGAGGCAAGTAAAAAGACAAAGAAAAAGTATATGA
TAGAGGCTAATTTAGATAAGTTTAATGTTATTGAAAAAGGAACTGTTACATTAAGTGTTATGTTTGAAGA
GGGATTTAATATTATAAATACCACCTTTTCGGAGAGCATGGAAAATGTAAAAAATAAAGTAATAGTGGTA
GACCAGTATGGAAGCAAGATTAGCGAAAAAATAGATAATGAAATTTTTAAGGAAGTAAATGTAATAATGC
AAAAAGTAATTCAGCAACAAGAAAATCAAGATGTAGATATTGATAGCGAGTTTAATGGGATAGAAAAAAG
CTGTTCTCTTAAAGGTTATGGAGATGTAAGTTGTATAACTGGTAGAGGAGTAAAAGTTAAAGATTCTTAT
ACAAAGCTTGTAGGACTATTTTATATAGATACAGACAAACATACTTGGCAAAATGGAGAATATCAAATTG
AGCTTGAACTTAATTTTCAAAATCTTATGGATGAAAAGTCAGCAGGACAGGATGAACCTAAGGAAGAAAG
TAATTTAGGGGGAGAAGATTATGCAGGAGGAAAAGAGTTTACAGCAGAATTTACAGCTTACTGTCCTAGA
AAAGAAGAAGGTGGAGATACAGATTGTAGAAAGAAAAAACTTGACCCATCTAAAAAAACTTGCGCTGCTC
CTATGGTTGGTAAATATGAGCAAACTTATTATACAAAAGAGTTTTTAAATAAACATCCTTTATTGAACTA
TGGAGATGAAATACAGGTAATTACAGGAGTTTCTGGTCGTGATGGAGTCTATAAAGTAAATGACGTAGGA
CCTGCAATAACTATAGAAAAAAATGGAACATACCATATAGATATTTTATTTGGAAATGTTGAAGAAGCTA
GTAAATTTGGAAGAAGAAAAGGAAAAATTATTATTGGTGGTTATTCTGGTAATGTATCTGATAAAGCTAA
AATAGTAATATCAGAGGCAAAAAAACATCTAGGTAAACCTTATAAATGGGGTGGAAATGGACCAAGTAGT
TTTGACTGTTCTGGTTTAATGGTCTACTGTTTTAAAAAAGTTAATGTTAGTTTGCCAAGAACGTCAAATC
AACAATCTAAAAAAGGCAAGAAAGTAGAACAAAAAAATCTTCAAGCAGGAGATTTAGTATTTTTTCATAA
TCCAGTCAGCCATGTTGGATTATATATAGGTAATGGAGAATTTTTACATGCTCCACAAAAAGGTGATGTA
GTTAAAATAAGTAAGTTAAGTAGTAGAAGAGATTTTAATACAGCTAGGAGAGTATTATAA
>ref|NC_013316.1|:1440130-1440456 hypothetical protein CDR20291_1213 [Clostridium difficile R20291]
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TTTTTATTGGAAAAATTAAAAGTAAATTACCAGATTTAAAAATAGAGACAAATAACATCATATTAGAAAA
AGAAGATATTTTGATAGATAGTTGGATGATTGATAGACAGCTAGAAACATTTGACACAGAAACAAATCAA
GAACACCAGCATGAAGTAAAAAATCCTTTTATAGATAACTTTGAATCTGGGGATATGGTAATAATGTTTA
GAATAGGCGAAAAATTTGCTGTTGTAAGTAAGTTGGTGAGCTTATAA
>ref|NC_013316.1|:1440456-1440884 phage protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTACAATATTTCCTTTTATAGGTGTCCCAGAGGATTATATCTTACCTAAAACAGAAGAATTGCCAA
TCTTTCGTGAAGTGGCATGGGATTTTGAAAAAGATGAACCTATTTTAGAAAAAGGTGACTTTAAAATAAT
TGAAAAAAAAGAAGCCTTAAAAGTTTGGATATACAAGTGTATAAAGACAAATAGATATGAACATGAGATA
TACTCTTTAGAATATGGGACAGAGCTTTCAGAACTAATAGGACAAAAATATACAAAAGGTCTTACAGAAA
GTGAAGCTAGTAGATTCATAAAAGAGGCCCTTCTAATAAATCCATATATATTAGAAGTAAACGTAAAAAG
TGCTAACTTTAACAGAGACGTATTGAGTGCAAATGTAAAAGTATCCACTATCTATGGGGAGGTGGAAATA
AATGTATAG
>ref|NC_013316.1|:1440877-1441929 phage protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAGTGACCAGACATATGAAGTAATAAAAAATAGAACTCTTGAAAATATTAATCTTGATATTTATA
AAGGAGAAGGTTCTTTTCTAAACAACATGGTATCTGGAAATAATCTAGAACTTTCGAAGATATATCTAGA
ACTTTCAAAGATACATAAAATGGCTTTTATACAAGACACATATAACCAGTTTCTTGATAAAAGAGTCAAT
GAATTTGGTGTATATAGAAAGTTAGGTACAGAGTCAAATGGAGAAGTTGAATTTATTGGAGAGAAAGGAA
CTGTAATAAATAATGGCACAATAATATCATATAGAGATTTACTATTTGTAGTAATAAAAGATGTAACTAT
TGGTAGTGAAGAAGGTGACAATAGCCCAGTTCAAGCTCTGGAAGTTGGTAAGAAATATAATTTACCTACA
AATTGTGAATTTAAACTAGTTGATAATATATCTGGAGTAACAAAGATTACTAACACAAGAAGTTTTGAAG
GTGGTACAGATATAGAGACAGATGAAGAACTAAAAGAAAGATTTTATAAAATCCAAAGAAATCAAGCTAC
AAGTGGAAATAAAGCTCACTATGAAGAATGGGCTTTGGAAGTAGATGGAGTCTATAATGTTAAGGTTTAT
CCAAGATGGGATGGTCCAGGAACAGTTAAGGTCTTGATATTTGGGGAAAATAATCAAGCTGTTGATACAG
AAACGATTGAAAGGTGTCAGCAACATATAGATGAAGAGAAGCCTATTGGACCAACTATAACAGTTGTGAC
ACCATTACCAATAGAAATAAGTATAAGTGCAGTAATGAAACTAGAAGATGGATATACATTAGACAATGTA
AAAGAATCTTTCCTAGAAAGTATAAATACATACTTTAGAGATATTAGAGGAGAGATAATCTATACAAAAG
TCATGGGAATACTTATAAATACTACTGGTGTACACGATTTAAGTAATCTACTTATAAATGGAAGTACAGA
TAATATAACTATTAATGAAGATAAAATACCTAGTGTAACAACTGTTAATTTTAGTGAGGTGGAAAATCAA
TGA
>ref|NC_013316.1|:1441926-1442624 phage protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGCTAATTGATAAACTACCATCATTTGATAGAAATTACATTGTAGAGGAGATACAAGGTGCATACG
ATACAGAATTAAATATTCTTAAAGAAGATATTGATGATACCTTTAACCAATTATTTGTTGATACAGCGAC
ATGGGGATTAGATATGTGGGAAGACATACTCTGCATTGAAAAAAAAGAACTTGATTTTGACACAAGACGT
AGCAATATAAAAGCTAAAATGAGAAGCAGAGGTACTAGTACTATTGAAGTTATAAAAAGTATATGTGAGG
CATATACAAAATCAGAAACAGATATAAAAGTTTATAGTGATGAATTTACATTCGTATTGAGTTTTATAGC
AAATAACTGTGACTATAAAACTCTTTTAGATTGTAGCGAGATGATTGAAAGAGTAAAACCTGCTCACTTA
TTACACTATTTAGAACCAATAATACTAGATAAAAGTATGGTCTATTGTGGTGGAGGTATGGTATGTAGTG
AAGAGGTAAAAGTTCATCCATACTTTGAACCAATTATAAAATGTAGTGCTGTTGTAAACTGTGGAGCTGG
AATGTTAAGTAGAGAAGAAATAAAGGTTTATCCTTTAAGCATTAAATGCATTGAAAATAATTGTAAGATT
AATATAGCTATTGCAAATGATACAGGCGTAGAAAATGTAGTAGTTTATCCTAAATCGGAGGTGGTATAA
>ref|NC_013316.1|:1442625-1443611 putative phage tail fiber protein [Clostridium difficile R20291]
TTGGAAGAAAAATTTTATATAATATTAACCAAAATTGGTAGAGAAAAAATAGCAAATGCAACTGCACTAG
GAGAGCTTGTTGGATTAACCAAGTTTCAAGTTGGAGATAGTAATGGAGAATATTATGAGCCAACAGAGGA
ACAAACTGCTTTAAAGAATGTAGTTTGGGAAGGAAATATAAATTCTCTAAGAATTGATGAAAAAAATCCT
AATTGGATAGTTATAGAGACTATTTTACCAGGAACAGTTGGTGGATTTATGATAAGAGAAGCTGCTGTTC
TGGATAATGAGAATAATATAATAGCTATAGGTAAGTATCCAGAGACGTATAAGCCACGTGCTGAAGATGG
CAGTATTAAAGATTTGGTTGTAAAAATGATTTTACAATTGTCCAATACTTCAAATGTTACATTAGAAGTA
GACCCGACGTTGGTTTTTGTAACTCAAAAGGATATTCAAGATTTAGATGATAAGTTTGATAAAAATATAA
AAGAAATAAAAGTAAAAATTGGAGATACAGATATATTAACTACAGATTCTAAAGATTTATCAGGAGCTAT
AAATGAGGTAGTTAAAAAAATAGAAAATATATCTTTTGATGATGTTATAAGTGGTCAAATACAAACTGAT
ATATCAGTATTAAAAAATAGCTATAACAAATTATCTGAAAAAGTGCTAGATATATTAATATACCTAGAAT
TAGAGTCAGAAGTAACTGTAGATGAGGCTGGTTATTGGTATGATACATTAGCAAATGGAAATAACATAGT
AGCTATAGAAGGGCTTAAGTTAGATTTAAATAGAAAATGTATAACAGGTGAAATTGGTAATGTGATTTTT
AGAGATGTAGTATTACCATTTAGTGCAAATAGAGTTAGATATATACATGATATGGATAATAACTTTGTTG
AGACAAAATCTAGTAACACTTATTTAAAAGAACAAAAAGATATAACTCTAAGTAAATATTCATATGAAAT
AAGATAA
>ref|NC_013316.1|:1443633-1448810 hypothetical protein CDR20291_1218 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGCAAAATAAACTTTTACAGCGTGGTGCTTATTTTAATGATAAGAACATATTGATTGATGATTTTG
ATAAAAGATATAATGATTATGATTTTGTAGAATTTTTTACTGGTATAAGTAATAGTACCTTTGGTTTAAA
ATCAGATGGTAATTTATATGCTTGTGGCGATAATACAGGTTTTCAACTAGGACTTGGAAAAGATTCGTCA
GAGAGAAGGATGTTTAGTAAAGTAAAAATTGATAATGTAAAATATGTATCTTGTGGTTCAAAACACAGTG
TAGCAGTAACTAAAGATGGATTTGCATATGGAGCAGGAACAAGTAATGTAGGTCAATTAGGTGTAATTGA
GTCTACAGTATATTATGAATTTACTAAGCTACCAATAGATGATGTAAAAACTGTTGCATGTGGTTATGAC
TTTACATTTGTGCTTAAAAATGATGGAACATTATATTCAGCAGGTTTAAACTCAAGTGGTCAACTTGGAC
TAGGTGATACTAACAATAGAGCTACTTTTACTAAAGTAAATATAGATAGTGTGAAAGATGTAGTGACTTA
TAATCAATCTGTATTTATCATAAAAATGGATGGGACAGCACATGCATGTGGATTAAATTCAAATGGGCAG
TTGGGAATTAATAGTACTTTAAATAAAAGTGTATTTAATAAAATAGAAGGTATGGATAATGTAAAACAGA
TAGCGTGTGGTAGTAGTCATACAATTCTTATTAAGAATGATGGAACTATGTATACTACAGGCTATAATGG
AGTTGGTCAGCTTGGTACAGGAAATAATAATAATTCAATTGTATTTACTCTTTCTAGTATAAATAATGTT
AAGTATGCTTCTTGTGGAAATAATCATACTATGATATTAAAATACGATAATACACTGTTTAGTACAGGAC
AAAACAATTATGGTCAACTAGCCAATGCCAATAAAGATGTAGCATCAAGAAATACTTTTGCTAAGGTTAA
TGTAGAAAATATAAAAGATATTAAATGTGGTTCTCAATTTAATTTTTTAATAAATGGTTCAAAAGAGATA
TTTGTATCTGGCTGTAATTTAGCAGGTCAACTTGGTTCATTTTTTCATACAACTTTTCTGTATGAGTTTT
CAAATGTGCAATCTTCAAATTTAGATAATTATTCAGGTTTATTGGTTAATGATGATTATTTATATGTTAC
AAAGGACAATAGTGAATTTTTAAATGTAAAGTTAAGTGATAATTTTCAAGATTATAAGAAGATAGAGTTA
ACAGATAGCAATATGTTTATTGTTATGAATGATGGTACATTGTATGCTTGTGGTTTAAATAATTATGGAC
AGTTAGGATTGGGAGATACTGTTAACAGGTCAGTTATGACTAAGGTGGATATAGATAATGTTTTGGATAT
AAAAGGAAACGGAAACTCAACTTTTGTGCTTAAGAATAATGGAACATTATATTCATGTGGTTTAAATAGT
AATGGACAATTGGGTTTAAGAGATGAAGTTAATAGAAATATATTTACAAAAATAGAAATAGAGAATGTAA
AGGATTTTTGTGTAGGAAGCAATTATGTCATAGCTTTAAATCACTCAAAAGAAGTATATGGATGGGGAAA
TAATCCTTATAATAATATAGAAAAAACTTCTAATTATCCATATAAGCAGGGAATAAGTAATATTGAAAAG
ATAGCAGCATATGATTATTCTGTATATATGATAAACAGTGAAGGGAAACTATATGTTTCTGGATACAATT
ATAATTATCAATTAGGTAAAGGAAATAATAGTAACCAAAGCAAAGCATTAGTATCTCAATGTAGAACAAA
TTCAACATCTTCTACATCAAATGGACTTAGAACGTTACCTAAAATAACTAATGTTTTTCCTTTTTATGAT
GGTTGTGCAATAATTGACGAAGGAGGTTATGTTTATTTAACAGGATATCATGGATATTTAAGAACATTAA
ATAGCAGTCCAAGTATATCTGATTATTCAAGATATGGAACTTTTATTGAGGCTACAAATTCAAATCATAA
TACTTATTTTATACAAGAGACTGATTTTAGTGGAATTGAAAAAGTAATAGGGATGTCAAATAATATATTA
TTTTTTAAGAAAGGAAGTTCATATATTACTGGATATCCAAAAACATTTGGCTCAACCATTACTGGACATA
GAAGTTATACTAGTATTAATTCTGAGAGTTCTAATTTAGGAAGTAATTTTATAATATATCATAGTAATTC
CAAGTTATATGGAAAAGGGATTGCTAATAGTGGGCAATTTGGGAATTCAACAAATATAGATGGCACAAGT
AACTATGATACAGGATTAAAAGACATAAAAGATATAATTGTAAAAGGAAATACTGTAGTAGTAGTAGATA
AAAATAACAATATATATGTAACAGGAATGAATCAGAATAACAAACTTGGGATAGGGGAATATAACAACGA
ACCAGTAAAAAAATTCACAAATATAACTGAACAATCAAACTCATTTATATTTATGGATGATATAAAAGAA
ATTACAACATCAAGAAATACAATGTTTATAGTAAAAAATGATGGAACAGCCTATGCCACAGGAAATAATA
GTTCTGGACAATTAGGATTAGGTGACACAATAAATAGAAATAAGTTCACTCAGATAAACCTTGATAATAT
AAAGAAAATATCAACAAGTATAGATGGTAACACAACATTTGCAATTAGAAATGATGGAACACTATACTCC
ACAGGATTAAATACCAAAGGACAACTGGGATTAGGTGATATAGTAAATAGAAATACATTTACCAAAGTAA
ACATCCAAAATGTAAGAGATGTTGTTTTAGGGACTACTCACTCGCATGCAATCAAAGATGATAACACATT
ATATTCATGTGGAGAAAACACTCATGGGCAACTGGGCTTAGGAAGCGAAAGCAACCATCCAGACGTATTG
ACATTTACTGTAAACAATATAACTAATGTAAGAGATGTGTACTGCTCAGATACAACAACATTTATTGTAA
AGGACACAAACATTGCATATTGTTGTGGATACAATAATAATTCACAACTAGGTATGGGAAATACTACTGA
CCAGTATAGTTTTATAAAGTGTATGGAAAATGTAAAAGAAGTTATACCAAATGAAATAAATACCTATATA
ATAACAATCTATAATACTGCATATAGTACAGGTTTAAATACTGATTATTGCTTAGGTCTAAATAGTAATA
GCAATCAAAGTTCATTTTCTGAAATTCCAATTTCAAATGTAGTAAAAGTAGCTCCAAACAGAAATAATGC
AGTACTTTTACTTACAAGTGAAGGGGATGTATATACTGCAGGCAAATGTAGTAATGGTTCAGGTACAGGA
AGTGAGACTCCAGAGAAGATTAAAAAAATAGCATCAAAGGCAAAGGATATTGGAATGAATTATAGATGTG
GACATTATGTAAGTGATAATGGAGACCTATATGGTACAGGTTTTAATAATAATGGACAATTAGGTGTTGG
TGATGTAACAAAAAGAGATACATTTATAAAAACCAATACAAGAGTAAAGAAAATACTTCCTTTAGAATAT
GCAAATATAGCAATAAAAGATACTAATGATATATATATTTGTGGATTAAATAACTATGGACAATTAGGTG
TTGGAAATAGATACGATAGTAGAAATAATGATAATAGAATATTTAATTATAAGCATATGAATTTTGTAAT
GGGTGATTTGACATCTATTAAAAACAGACATAACTTTATACTTCTAAACAATAAGATAGTGATACCTACC
ACAAAAGACATAGATTATGGTTTAGTATTAGGAAATTTATACAAAGGAGACCTTTATACTGAGCTTCCAT
ATGAAGATATAAAAGAAGTATCTATTTCTAAGACTCATATTATTATATTACTTAATGATGGAACAATGTA
TGGATGTGGTACAAACTACCATGGAGAATTATTGCAAGACTTGTCTATAAATCAAGTGGATGAATTTGTG
CAGATTAATGTATCAGATGTAAAGCATGTTTCATGTGGAGATAACTTTACTTATTTTATAAAATCTGATG
ATAGTCTTTGGTCTATTGGTAAAAATTCCGAATATCAATTAGGTATAGGTCACAATAATCCAGTTACTGA
ATTACAAAGAATTACAACTATATCTAGCTGTAAAGAAGTACATTGTGGTAAAAACTATACATTAGTAGTA
ACTACAGGTAATGAATTATTTGTACAAGGATATAATGATAAGGGAGCTTTAGGATTAGGAAGCGATAGTG
AAAATACTATAATTAAGTTCTTTACAAAAGCACTAACAGACATAAGAGAAATAAAATCTTATGGAAGTGA
CCATATATTAGTACTTAAAAATGATAATTCAGTATGGGTTACTGGAAAAAATAGGGATGTATATAAAATT
GAACAACCAGTAGAATTTTTAAAAGAATTTACTATAGTACCTATTTCTGAAGATGTAAATACAGTAAAGG
ATGTACTTGCAACAGACAATACATTATATATTATATCAGAAGTAGGAACGACAAATGCTGCTATAGAAAT
TACTGAAAAATCAATTTCATCAATTAAGATAAAAATACAAGACCCTAATAAAGATATAAGTAGAATAGAA
ATGCTTATAAATGGTGAAAGTGTAAAATCTGTAAGTGATTTAACTACTGAAAAAATATCCTTTGAAGTAC
CACCAGATAAAATTAAAATAGGAGAGAATAAGATACTATTTAGAGCTTATTGTAAAGGTGATGATTTATA
TGCATCTTTATTTATTTTTAAAGAGAGTACTGGAAATTCTATAATTAAAGATTCTTATGTTATGATAGGT
AATAGAATGTACAAGGTAGTTAATACAACATCTAATGAACAAGATATTACAATTACACTAGATAGAGGAC
TTGAAGAAGATTTAAATCTTGGAGACCCTATATATCAATTAATAAATAAAACTAAAGTTCAAGTAAAAAT
AAATAAATCTGACTTATTCAAAGACATGAAACTAGTTGAAATCAAAAAATCAGACTCAAGTTATCAAGAA
ATCTATGAATTAGAAGAAGCCAACATAAAAAGTGCTCAGCCTAAAATCATAGTAGAAAAAGGAGATAAAT
GGACAGCTATAAAACGTCCATCTATGATTTTTAGATATGATGCTGAAAACAACGAGCCACAAGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:1449061-1449180 putative phage-related protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGTAGAAGTATATGTAGCTTTAATTTTAAGAGGCAGAAAAACAATAGAAGAAGTACCAGCAGTAATTA
GAGAGCAAGTTAGAATTAGATGTAAAGAATTAGAAATACCAGTTGAATAG
>ref|NC_013316.1|:1449443-1449703 hypothetical protein CDR20291_1220 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAAATTAATAACCGAATTGAGTAGTCTGGGGGCAATAGGTATACTATGTGCTCTATTATTTAAAA
ATACTATGCAGGAGAAAAAAGAAGATAGAGACATGTATAAAAAAACTGTAGAAAATTTTATAGAATTATC
TACACAACAACAAGAAATAAACAAAAATATACTTGTTCAAATGGGAATAATGAAAACAGATGTAGAGGAA
ATTAAGGAAGATGTTACTGATATAAAAGGTATGTTACAAAACGGTGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c1450383-1449928 hypothetical protein CDR20291_1221 [Clostridium difficile R20291]
ATGGGCTTAAGAGACAAATTCGCGCAATCATTTGCTAGATCAAAAACTATGAGTGGCCCTGAGAAAAAGG
CTAATGAAATAATGGGTAAATTGCTTCTTAAGAAAGCTATATTACCTATCGTTTTAATGTTCGTGATAAT
AATCGCTGGAGCTATGCTTAAAATCAATTCTTGGGTTACACTTGGCATAAATTTAGTTATTGCTGTTGGT
GCTTTCTTCTACATAAGAAATTCTAGTAAAAAGTATCAGAACTTTAAACCTTATGTTGGCAATTTGATTA
GTTTAGAGAAAAAAGGTAAAAAAGAGTACGTTGCTATTATAAAACAAGGTAAGTTACCAGTTAAGTTACA
AATAGCTTATGGTGGTGAAGACCTTGAACATGTTAAGAAAAATCAAATGGTTCAGATAAGTTATAATCCA
GATGCTAAAATAGCTATTTTGGTTAATAGACAATAA
>ref|NC_013316.1|:c1451030-1450611 putative phage regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGATACTTTAGGAGAAAGAATTGTTTATTTGAGAAAAGCAAAAAACCTTAAACAATATGAACTAGAAG
AAATGTTAGGCTGTGACAACTTAAGTAAATTTGAGAGAAACATTAGAAAACCAAATTATGAAATATTAAA
ATCTATAGCTGAGATATTTAATGTTTCAGTAGACTGGCTATTAAATGGAGATAATCTATCACATAAATCA
GATTTAATTTGCGATTCCTCCTCAAACTATCCACTTAATAGCATAAACTCTAATGAAATAAAGCTTTTAA
ACAACTTTAGAAAGTTAAATGATTATGATAAAGCCAAAATAGAAGGTATGATTGAATTAAAACTTCATGA
ATATGAAAAAGAGAAGGATTTAGGAAAAATTGAGTATAACAAAAATAAAGATGAGAAAATAGATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1451329-1451538 putative phage regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGATGCTCGAAAAAAATGGATACCTTTTTTGGGAGTGCAAGTCAAGCAAAGACTTATTGAATTAAATA
TGACTCAAAGGGAATTAGCGAAGAAAATAGGTGTTAATGAAAACTATTTGTCAGCTATTTTAAATGGAAG
AAGAACAGGTAAAAAATATAAATCATCAATTTATCAATTACTTAATATAGAATATTCAGAAGATGATTAA
>ref|NC_013316.1|:1451558-1451779 hypothetical protein CDR20291_1224 [Clostridium difficile R20291]
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TTACAGCACTTAGTAATATAAAAAGCTTAAATATGGAAAGATTAAATACTTTAACTAAATATTCTAGTAC
ATGTTCAATCCTTCTTAAAGAGGGGAATTATGAAGGATGTACAATTGTGTATAGAAAGATGTTGGAAGAA
TTAAAAACATGA
>ref|NC_013316.1|:c1452403-1451996 putative phage regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
GTGTATTTTGTGGATACTTTAGGAAAAAGAATTGCTTATTTGAGAAACTCCAAAAAACTTACTCAGCGCA
AACTTATGGATATTTTAAAATTTGAAAACTTAGGCAAGTATGAAACAGGAGATAGAAAACCTAATTGTGA
TATACTAATGTCAATAGCTGATTATTTTAATGTTACGACTGACTGGCTTCTCTATGGTAAAGAGAAGGTA
AATGTCAATAGTAGTGTAAAAGAAGATAAAGAAGATTACTTACATGTTACTAATGATGAAATGATGATAT
TAAATCTATACAGACAACTAAACGAACGTGATAAAATAAAAATAGAAGGAATACTTGAACTTAAGATATC
TGAATATAAAGACTTAAAAAAGCATTCCTCTAATAATAATGAAGATAAAATGGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1455319-1452815 putative transporter [Clostridium difficile R20291]
GTGGTGTTTACCTTGAATCATAATACTAGTATTAAGAACAAGGACAGTAATCCAAAAATATTTTTAGTAC
TTACACTTTATCTATTAGGTATATTTATGGGAGCTATTGATACTGGAATAGTATCACCAGCAAGAACGAT
TATACAAAATAGCCTTGGAGTAAATGAAAAAACGGGAATTTGGATGATTACCATATACACATTAACATAC
GCTTCTGTAATTCCTATCTCTGGAAAATTAGCAGATAAAATAGGAAGAAAATATGTGTATCTAGTTAGTA
TATTTCTATTTGGTAGTGGTTCATTAATATGTGGATTATCATCACTATTTTCCAATTTCTATATTTTATT
AATTGGTCGTGTTATTCAAGCAATTGGTGGTGGTGGAATCATGCCAATTGCTACAGCAGAATTTGGAACT
ACCTTCCCAGAAAATAAAAGAGGCATGGCTTTAGGTTTAGTTGGGGCAACATATGGTATTGCCAATATTT
TAGGTTCAAGCATTGGTAGCACAATTCTAAGTATCTTTGGAACTCAAAATTGGAAGTGGCTATTTTTTGT
AAACCTTCCAATTTGTTTAATCATACTTATTGGTGGAGTTTTCTGTATTAAAAACAATAAGTCTGAATCT
AAAGAAAAAATAGATAAGCTTGGTACATTGATGTTGATATGTATAATCGTATCACTATTATATGGTCTTA
TGAATATAGACTTTTTTAATTTTAAAAATTCTATACAAGATATATCAGTTTATCCATACTTATTGACATT
TATTGTACTTATACCTATTTTCATATTTATTGAAAATAGAGCTAAAGACCCTATTTTAAGCTTTGAATAT
TTTTTAAATCCGAGAATATTGATAGTACTTATTTTATCTTTAATTGTTGGTATTGGAATGATGGGTATGG
TATTCGTTCCACAGTATGCTGAAAATGCATTAAAGATAAATGCTGGTTCTGGTGGATATTTTGTAGCTAT
ATTGGGATTATTTGCAGGTATTGCTGCTCCTTTAAGCGGAAGACTTATTGACAAGTTTGGGGCAAAGAAA
ATACTATTACTAGGATTTTCTGTATCTATGATAGGCTCTCTTTACCTAGTTTTAATTGCTCTAAAAACCA
ATACTGTATTTAGTGTATGTGTAAGTTTAATATTTATGGGATTAGGAATGGGCTTTACTATGGGAACTCC
TCTAAACTATATGATGTTATCAAATACAAGATTAGAAGAATCTAATTCAGCACTTGCAACATTATCCTTG
ATACGCTCAATTGGTACTTCAATTTCTCCAGCTATAATGATTGGATTTATAGCACATGCAGGATTATCTG
TGCAAGATAATATTATGGACTTAGTTGGAAAGCCCTCAACTCCTAAAATAGTTCAACTTGAAGAACTTGA
AAACATGATAGATGACTTAAAATCAGACCCTGAAATGGCAAAAAATTTAAAAAATGTCTCTATCCCAAAT
ATGAATGATACTTCAAATATAAATATGGACATGACAGGTGGCAAACTTCCAAAATCCTTACTTAATAAAG
TTCAGTCAGCAGATACAACCAACATTACCAATATAACAAAAGAAATATCAACAACAATGTTTGATGAAAA
AGTTCCATCTATAATTACTAAAATACAGAAAAATGTACAAAAAGGAATAGATGGAACACAAAGTGGAATA
AACGGTATTGAAGATGGTGAAAATAAACTAAATAGTGGTATTAAAGGAGTTCAAACTGGTATTGACAATA
TGGTAAAAGCTAGAGCTGGTATTAATCAAGGAATAGATGGTGTAAAAAAAGGTATTGCTGGTGTTGACAA
AGGTATAAAAGGTATGGAACAAGGTCTTGAAAAACAAGATGAGGCCATCAAGGAACTTACAACTGCTTAT
AATAAAATACCTACTACAGAAAAGACTCCTACTGATAACGAAAATAACTCAAATGAACAAAACCAGAGTA
ATACCAGTAATTCTGAATCAGACGACACTAAGAATGATTCTACAGAAAATAAGAATAACAATTCCAGCGA
GAATAAACCAAATGTAAATGAACAAAAAGAAAGTTTAAATGCTCAAATACAGCAACTAAAAAAGACAAGA
GATGACTTAAATACAAAGTTACAAAAAAATAAAACTCAAAAGAACGAATTAAGTAAAAAACTAAGATCAA
TGGAATCTCAAAAGAAAGAGCTACAAAGCAAGTTAAATAATTCTATAAACCAAAAGAAAGACATGGAAAA
AAGCCTTGATACAATGCAACAGCAAAAAAAATCACTCCAAGCAGTTTTAGCAAAGACACAAGAGGTAAAA
ACTGAAATACCAAAGGCTTTTGATAAATCAAAATTGGATTATATAAATTCCATAGAAAATAATAGAACAA
AAATAGAAAATACACTACAATCTACTCTAAACTCAGGATTCAAACAGATGTATATAACAGTATTCTGTGT
AAATCTACTAGCATTTATAATATTATTGTTCTATAAAGAAAATAAAACTAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c1455863-1455321 TetR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGCCAAAGATTTTAGAAAATGTAAAAGAAGATATATTAAAAGTATCTCGGGATATGATTTTAGAAGAAG
ATTACTCGAATATTAGCATAAGGAAAATAGCTCAAAGGTGTGGTATAAGTGCAGGTACAGTATATAATTA
CTTTAATTCAAAACAAGAAATAATAGAATATATCACAAAATCTGAATGGGATTTATTGATAAGGCGAATT
GAATACTCCAATAAAAACACTGAAGATTACATAAAAAAACTAAACATTATTTTTACTGAAATAAGAAATT
TTATAAACAAAGTTCATAATATCCAATACAATGACTTTTTAAACACTTTTGAAACAGAGAGATTTTTTGA
AATGAAAAAACACAAAGACGACTTTCATGAACAGCTTTCAAATAAAGTATATGAAGCTTTAGAAAAAGAA
AGTTTTTTTAATAATGACAAATTAGTATGCAATATCATAATAAAAATGTTTTTTTCATATTCAACATATC
TTCATATAGAATTTGAAGATTTAAAACCCTATATTGAAAAATTAATACATTAA
>ref|NC_013316.1|:1456100-1457620 glycerol kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGGTGATGGAAAAGAAGTATGTAATGGCATTAGACCAAGGAACAACCAGTTCAAGAGCTATACTATTTA
ATAAAAAAGGCGAAATAGTGAAAATTGCACAAAAAGAGTTCAATCAAATTTATCCAAAAGCTGGATGGGT
AGAGCATGACCCTATGGAAATATGGGGGTCACAAAGTGGTGTAATGAGAGAAGTTATAGAAACAGCAGGT
ATAAGACCAGAAGAAATTGCTTCAATAGGGATAACTAATCAAAGAGAGACTACGGTTGTTTGGAGTAGGT
ATACTGGTAAACCTATTTATAACGCAATAGTATGGCAGTGTAGGAGAACATCAGAAATATGTGATGAACT
TAAAAATAAAGGATTGGAAGAATCAATAAAAGAAAAAACAGGTCTTTTAATAGATGCATACTTTTCAGCA
ACAAAAGTAAAATGGATATTAGATAATGTAGAAGGAGCTAGGGAAAAAGCAGAACAAGGAGAGTTATTAT
TTGGAACTATAGATACATGGTTAATATGGAATTTAACTCGTGGGAAAGTACATGTAACAGATTACTCAAA
TGCATCTAGAACAATGATGTACAATATAAATGATTTAGAATGGGATGAGGATATATTACGAGAATTGGAC
ATACCAATAAGCATGTTGCCATTAGTAAAACCTTCTAGCTATGTTTATGGTCATACAGATGAGCGCATGT
TATCAGGAGCTAAAATACCTATTGCAGGATGTGCTGGAGACCAACAAGCAGCATTATTTGGTCAAAATTG
TGTTGAAGAAGGTACTGCAAAAAATACTTATGGAACGGGTTGTTTCTTACTTATGAATACAGGCAGTAAC
ATAGTTAAATCTAAGCATGGGTTACTTACAACAATTGCTTGGGGAGTTGATGGAAAAGTAACATATGCAT
TAGAAGGAAGTATATTTATTGGAGGAGCATCTGTTCAATGGCTTAGAGATGAATTAAAGATAATTGAATC
TGCAAAAGATAGTGAAATGTATGCAAATAGGGTAGAGGATACTAATGGTGTATATGTAGTGCCAGCATTT
ACAGGTCTTGGAGCTCCATATTGGGATATGTATGCTAGGGGTTCAATTTTAGGACTTACAAGAGGAGCAA
AAAAAGAACATATAGTAAGAGCCACATTGGAATCAATTGCTTATCAGACAAAGGATGTTTTAGAAGCAAT
GCAAAACGATTCAAAATTAAAACTAAAATCATTAAAAGTTGATGGTGGAGCAAGTAATAATAATTTTTTA
ATGCAATTTCAATCAGATATATTAAATGTAGATATAGATAGACCCAAAATAGTAGAAACTACAGCTTTAG
GAGCTGCTTATTTAGCAGGGTTGTCTGTTGGATTCTATATTGGAAGAAATGAAATTACTTCAAAGTGGTC
AGTAGAAAAAGAGTTTAATCCAAATATGAGTGAAGAGAAGAGATGTAAATTATATAAAGGATGGAAAAAA
GCTGTATCGAGAGCTTTAAGCTGGGAAAAAGAAGATGAATTGGATATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1458363-1457734 GntR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAAAAACTATACGATGCCAATATACCAAAAAATAGCGTTGGATATTGCAAATAAAATATACACGG
GTGAAATACAAGAGGATTCAGTACTATTTGGACGCTCTGTTTTGGCTGGTAAATACAATGTATCTCCAGA
AACGATAAGAAGAGCTGTCAAAATTTTAGAGGACATTGGCGTTGTTAAAAGCATAAAGGGTAAAGGTGTT
ATTGTACTATCTCCAGACAAAGCTTCTTCTTTTATAAAAAAATATAGAGATATTACAAATATATCATCAT
ATAAATCAACACTTTATAATTTAATAGATACTAAATCTAATTTAGAAAATGAAATATTAGATACTATAAA
TAAAATTTTAGACTATTCCAACAGACTTGAAATAATCAATCCTTTAGTGCCCGTTCAGTTCACCATAAAT
TCTAATTGCAAATATATTGGTCAAACAGCTGCACAAACTAAATTTTGGCAAAATACAGGTGCTACAATAG
TTGCAATTAAAAGAGGTGAAGAACTTATAATATCTCCTGGACCATATATTGAATTTTTAGAAGGAGACAT
TCTCTTAGTAGTTGGTGACCAACACATTTACAATTCTATACCAATGTTTTTATATGAAAACGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1458952-1459743 hypothetical protein CDR20291_1230 [Clostridium difficile R20291]
TTGTATAAAGTAGATTTAAATAGTGATTTAGGAGAAAGTTTTGGAACGTATAAGATTGGTTTAGATGAAG
AAGTTTTAAAATATATTTCATCAGCTAATATAGCTTGTGGGTTTCATGCAGGTGACCCTAGTCATATGGA
AAAAACAGTACAGCTAGCTAAAAAAAATGGAGTGAAAATAGGCGCACATCCAGGTTTCCTAGATTTAATA
GGATTTGGAAGACGTGAGATGAAAATAACAAAGCAGGAAGCTAAAGATTATACAAAATATCAATTGGGTG
CTTTAATGGCATTTGCAAGTTCAAATGGATGTAATATACAACATGTAAAACCACATGGAGCATTATACAA
TATGGCAGCTAAAGATAAAGAGTTAGCTATGGGGATTTGTGAAGCTATATATGAAGTCGATAAAGATATT
ATACTGTTGGGGCTATATAATAGTGAAATGATAAATTCTGCTAAAGAAATTGGACTTAGGTTTGCAAATG
AAGTATTTGCAGATAGAGCTTATGATAATAATGGTTTTTTGGTTCCAAGAAGTGTAGAAGGAGCAGTTAT
ACATGATACAAAACATGCAATAGATAGGGTTGTTAGGATGGTAAAAGAAGGAACTGTAGAAACTTTAACA
GGTGAAGTTATACATATCAAAGCAGATTCTATATGTGTACATGGGGACAATCCAAAAGCAATAGAGTTTG
TCAAAGAAATAAGAAAGCGTTTTGAATTAGAAGGTATAGAAGTTTGTCCATTAGAAAACATAGAAGTTTG
TTCGTCAGAGAACATAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:1459772-1460992 putative transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTACAAAAAATATTACAGATAAAACTAAAAATAAAAAAGATGTCGGAGCACTTATAGGGGCTGCAT
TTATAATGGCAACATCAGCAATTGGACCAGGGTTTTTAACTCAGACTGCACAATTTACCCAAGATTTTGG
ACCAAATTTTTCATTTGTAATTTTAATTACAACAATCCTTTTTATAGGGGCTCAAGTAAATGTATGGAGA
GTAATTGGTGTATCAGGACTTAGAGGTCAGGATATAGCAAATAAAATAATACCGGGATTAGGTTATTTAG
TAGCTTTTTTAGTAGCTCTTGGAGGATTAGCTTTTAATATAGGAAATGTTGGTGGAGCTGCACTTGGTAT
GAATGTAATGTTTAATATGAATATGACATTAGGAACTGTATTAAGTGGATTAATAGCTATATTTGTATTT
ATGTCAAAAAATTCAAATTCTCTAGTCGATAAGATAACTAAATTTTTAGCATTAGGAATGATAATTATAG
TTGGATATGTAGCAATATCAAATCATCCTCCTGTTGGAGAGGCAGTATCAAGAATGGTAAAACCAGAAAA
TCCAAAAGGATTGATATTCCCAATAATAACTCTACTTGGAGGAAGTGTTGGAGGTTATATAACTTTTGCT
GGAGGACATAGATTAATAGACGGTGGAATAACAGGAGAAGAAAATATAAAAGAAATAACTAAATCTTCTC
TTTTGGGTATATTAGTTGACACAATGATGAGAGTTCTTTTATTTTTAGCAATACTGGCAGTGGTTTCAAA
AGGTCTTCAACTTGACCCAGAAAATCCAGCTGCTTCAGCTTTTAAATTTAGTGCAGGAGCAATAGGATAT
AAATTCTTTGGACTTGTATTATGGTCTGCTGCAATTACATCAGTTATAGGAGCTGCTTATACATCAGTTT
CTTTCTTAAAGACACTAAATCCTTTTATAGATAAATATGAAAAATATTTTATAATAGCATTTATAGCAAT
ATCAACACTTATAATGGCATTTATAGGAAAACCAGCTACTTTATTAATTTTAGCAGGAGCTTTAAATGGA
TTGATACTTCCAATCACATTAGGAATTATGCTTATAGCATCTAAAAGAAAAGATATTGTTGGAGATTACA
AGCATCCTACATGGCTTTTAATATTTGGATTAATAGTAGTTTTAATATCTGCATATACAGGAATAACTTC
TCTTAGCAGCCTAGGTGCTTTATTTGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:1460976-1461707 putative allophanate hydrolase subunit 1 [Clostridium difficile R20291]
GTGCTTTATTTGCTTAATTTAGAAGAGGTGACATTTATGGAAACTAGATACTTGATATCAGGGGATAAGG
CAGTGGTTGCTGAATTTGGAAATGAGATATCAGAAGATATAAACAAAAAAGTAATTTCATTTATGAGAGC
AATAGAAATATCGAATCTTAAAGGTATTGTAACAGAAATGGTACCAACATATAGGTCACTTATGATAAGT
TATAATCCATTAGAAATAGATTTTGATAGTTTGATTGAGAATTTAAAAAAAATAGAAGATAATTTGGAAA
GTATAGTATTACCAAAACCTAAAATACATGAGATTCCAGTATGTTATGATGAGGTTTTTGGTATAGATAT
TAAAAACGTTGCAAGCTACAATAATCTCACTGTAGATGAAGTTATAAAAATACACACAAGCAGAGAGTAC
TTGATATATATGCTAGGGTTTACTCCTGGATTTCCATATCTAGGTGGTATGGATGAAAGAATAGCTACAC
CTAGATTAGAAGTGCCAAGGACTAAAATTTATGGTGGGAGTGTTGGAATAGCAGGTTCCCAGACTGGTGT
ATATCCTATTGATAGTCCTGGTGGATGGCAAATAATTGGTAGGACACCTTTAAAATTATATGATGAAAAT
AGAGAAGAACAGATTTTGCTTAGAGCTGGAGACTTTATAAAATTTGTTCCAATAACATTAGATGAATTTA
TAGAAATCGAAAAAAATAACTTAAGTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:1461737-1462723 putative allophanate hydrolase subunit 2 [Clostridium difficile R20291]
ATGGGATTCAAAGTTGAATTAGGAGGTTTCCAAACATTAATACAAGACAGAGGTAGAGTTGGCTATGGTC
AATATGGTGTATCTGGATGTGGAGCAATGGATGAGTATGCACATAGAGTAGGAAATATATTAGTAGGAAA
TTCTGAAGATGAGGCTTCTTTAGAAGTTTTAATGTTAGGTCCTACAATTACCTTTGATGAATATACGCAA
ATAGCAGTAACTGGGGGAGATTTAGGGGCTAAAATAAATGGAAAAGAAATTCAAAACTGGAGGTCATATC
AAATAAATCCAGGTGATGTATTATCATTTAGAGGTGTGAAATCAGGTGCTAGAGCCTATGTGTCAATAGC
TGGTGGAATAGATGTTCCACTTGCAATGGGAAGTAAGTCAACTTATACAAGATCTAAAATTGGCGGATTT
GAAGGTAGAGCACTTAAAAAAGGAGATTATATAAATACTTTTATTCAGGAAAAAGATTTTACAATAAATA
AAAAATTAAATTCAAAATATATTCCAACTTATAGTTCAGAAATCGTACTAAGAATTGTAAAAGGTCCTCA
ATTTGATGCTTTTTCTAACGGTGAAGTAGAGAAATTTTTATCAAATAAATACAAAGTTACGAATGAAATA
GATAGAATGGGTTGTAGACTAGATGGAGAGAGTATAAAGCACCTTAATGGAGCAGATATTATATCTGATG
GTATTTCTTATGGAGCTATACAAGTACCTGGTCATGGAAAACCGATTATAATGTTATCAGATAGACAGAC
TAGTGGTGGCTATACTAAGATAGGGAACGTTATAAGTGTAGATTTGTATAAGTTAGCACAAGCAAAGCCA
AATGATGTAGTAAAATTTGAACTTGTAGATATATATGAAGCACATAGACTATTGAGAGAGCAAGAAGATA
AGATTCAAGATATCTACAAGAGTATGAAAAATATAAGAGTTGTAAAGGCAAAAGTATTAAATGATATAGC
AGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1463508-1462942 hypothetical protein CDR20291_1234 [Clostridium difficile R20291]
ATGCTAGGTGAAAAGATGAGAAATATAAGAAAAAGCAAGAAAAAAACATTAAGTGATGTTTCCAAATTGA
CAGATTTATCTATAAGTTATATCTCTCAAATAGAAAGAGATGCTATTGAACCATCCTTGTCTTCATTGAG
AAAAATCGCTGAAGTTTTAGACACTCCTTTATATATGTTTATGGATGACAATAATACTGATGATTTAGTA
ATTAGAAAAGAAGATAGAGTTATGATGAAATTTCCAAAGAGTGAAATGTTTTACGAGATAGTATCTCCAA
TGCCTACAACTGAATTTACACCTTCAATTTTATTTGTAGAGTTTGAACTTAAACCAGAAAGTGAGGATGC
TAAAGATTATATCTATCATGCATCAGAAGAAATTATGGTGGTAACGAGTGGTGTGGTTGATATTTGTATG
GGTGAAAAGGTAGTTAGATTAAATCCAGGTGACTCAACATTTATAAAAGCTAATGTACCACATAAAATCA
TCAATCCAAGTAAAGATACAATAGCTCGTGGATATGGAGTTATATCACCTCCAATTTGGCCAATAAAATC
TAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1463860-1464927 putative chloromuconate cycloisomerase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGATAACAGATATCAAATTTGAAAAGCTTAGAATTAAATTAAAAAAACCTGTAGTAGTTTCATTTG
GAGTAATTGAATATGGAGAAAGTGTAATTTTAAAAATTGAAACTGATGAAGGGTATTGTGGATTTGGCGA
AGCAGCACCTCTTGCAGCAGTTACAGGTGAAGTTTTGGATAATGTTCTTTCAGTATTGCTTATGTTTAAA
AAAGAGTTAATAGGCAAAGACCCACTAGATATTGAAACCATACATACAATCATGGATGGAATTATTATAG
GTAATACTTCTGCAAAAGCAGCTATTGACATAGCTTTATATGATATTAAAGGAAAAATTATGAATGCACC
TCTTTATAAAGTTCTTGGAGGATTTGATAGTAAAGTCCAAACGGATATTACTATAAGTATAGATAAGCCA
GAAAAAATGGCAGTAGAAGCTTTAGAAAGAGTAAAAGAAGGTTTTAGGATATTGAAGCTTAAAGCAGGTA
TAAATCCTGAAGACGATATTGAAGCTGTAAAATTAATTAGAGAAGCCGTTGGAGAGAGTATAAGAATTAG
AATTGATGCAAATCAAGGATGGAACGTAAATAGCAGTATAAATACTATCAAAAAATTAGAAGAATTTAAT
GTTGATGCAATTGAACAAGCACTTCCACATTGGGATTTAGATGGTACTGCTTACATAAGAAATAAAAGTA
ATACAAAAATTATGATAGATGAATCGTTACATTCACCAATAGATGCAATTAAGGCTATAAAAAAGAATGC
AGTTGATACATTTAATATTAAGCTGATGAAATCAAGTGGAATATATCCTGCTATAAAAATCAACAACATA
GCTGAGGCAAGTGGAGTAAATTGTATGTTAGGATGTATGCTGGAAACGAGAATTGGTATAACAGCAGCAG
CAAATTTAATAGCATCTAAAAAGAACATAACAGAAGCTGACCTTGATAGTTTTATGTTTTGTGAAGAATC
AAAAGATATATCTGGAGGATTTGTAATGGATGGAGATATTATGAATCTTGTCAATAAACCAGGTTTAGGA
ATAGAAGTAAACTTATGA
>ref|NC_013316.1|:1464946-1466106 hypothetical protein CDR20291_1236 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATACACTTTTTTCAAATCCAGGTAGTATACTTGCTGTAATGACATCAATGATTGCATTGGGTTTTT
ACTTACAAAGATACAAAGCCATTAAAAGCTTAGGACCAGCACTTACAATAATCATAATGGGAATAATACT
TTCAAACTTAAAAGTAGTTCCAGTAAGTACTGAGTTATATGGAACTATTTCAACATATGCTATCCCAGTT
TCTATGACTATAATGTTGATGAGTGTTGACTTAAAAGAAATGACAAAATTATCAAGAGAACCTTTAATTG
CAATTTTTGTAGCTGTATTAACTGTAAGTATCATGGCATTTTTATTTGGATTAGTATTTGCAGAAAAAAT
ATCAGAAGGTTGGAAGGTTGCTGGAATGTTTGTAGGTACATACACTGGTGGAAGTGCTAATCTTACAGCT
ATTGGAACAGGCCTTAATGTAAGTAGACAAACTCTTGCTGCAGCAAATGCAGCAGACTATGTAATTGGAG
TACCAACATTGATATTTATGTTTGCTCTACCAGCAATATTAAAAAATTCAAAGAAGTTTAAAAAACTTTG
GCCATATCATGTAGAAGAAACAGAATTAGAAGATTGTCAAAATGAAGAATTTATGGAGTCAAAAGAATGG
AGTATTAAAGATATAGCTTGGATGTTGGCTATAGGTTTTGTTGTTACAGAAGTTTCAACAATACTTGCTG
GATATTTCAATTCAAGTTTTAGTAGTGCAGCAAGAATACTTTTAGTTACAACAATTTCAATTATAATTGC
TCAATTAAAGCCAGTAAAGAAACTAAAGGGAAATTTAGATTTAGGATTATTTGTTGCATTATTCTTTTTA
TGTACAATAGGTTTTTCAGTAGATATAAAAGAGTTTTTAGGTTCAACTTTTACTATAACACTTTACTGTT
TTAGCATAATTTTTGCTTCATTTGTTTTTCATTTAGGCATAACTAGACTTTTAAAGATAAAGTATCAATA
TGTAATACTTTCTATAGTAGGAGCAATTGCTGATGGTCCTACTTCAGCTTTAGTAGCTGCTTCTGCAAAG
TGGAATTCGCTTGTAAGTGTAGCAGTCGTAATGGGAGTAATTGGTGGAGTATTAGGAAATTATGCAGGTA
TATCAGTGGCATATGCAATAAAGATGTCTCTAGGATTATAG
>ref|NC_013316.1|:1466119-1468215 putative esterase [Clostridium difficile R20291]
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TTGAAAAGTTGAATCCTTTTACAAATAAAATAGAAAGTTTAAAACCAATAAGCAAAGAAGAAAATACATA
CTATTTAAATCTTACAAAAATAGATTTAAAGTCTTTATTTAATAACTTTGATGTATATACTAAAAGCTTA
GTAAACACAGATAAAGACACAGTTATAAATAACTTAGGAGAAACGCATTCTAAACTTAATGAATATATAT
GGGTTCAAAGAAACAAAAAGTTCCCACTAGATATAATTATTGTAGATAATAAAATAGTAGGTTTTATCTG
TTTATCCAGAGAAACTTGTACTATATTAATTATGGATGGATATGAAGAGTATACTGTATTAAAAGAATGG
GAAAAAACCCATAAAAATGAAGAGATATATTCTATAAGATTTGGTGGAAATTATATGATTGATATGAAAG
ATGGTATAAAACTTTCTACAGATGTATATCTCCCTGATTTTGTAGATTCTACCAAAAAAGCACCAACAAT
TCTTATGAGAACTCCATATGGAAAAGAAAATGATAAAGAAATATATTATAAATATGTACAAAGAGGATAT
GCTGTTGTAATACAAGATGTTAGGGGAAGAAATGAATCAGAAGGTAAGTGGGAACCTATGATTCATGAGA
GGGAAGATGGAGATAGTACCATAAATTGGATAGTATCACAGGAATGGTCAAGTGGAATAGTTGGAATGCT
TGGAGCATCATATCTTGGTTATGTCCAATGGGCAGCTGCATCTTCAGGCAATAAGCATCTTAAAGCTTTA
GTTAGTATAGTAACATCAGGAAGCCCTTTTATTGATATACCAAGAAAAGGAGGAGCTTTTGTATCTGGTA
TGCTTGCATGGGCATTTATGGTATCAAGAAATAAAGTTGATAGAAGTAAAATGGTAAGAGATGATTGGGA
TGATGTTTTAAACATACGACCAATAGAAAATATACCTGTTGAAGCTCTTGGATATAGAATTGAATTTCTG
GAAGAATGGTTAAAGAGAGTAGAAAAAGATGAGTATTGGGATTTGATGGATTGGCATTTACAAAAAGATA
AAATAAATGTACCTGCATTGGTTGTATCTGGGTGGTATGATGATAATAGTATGGGAACTACAGAGGCCTT
AGATGTTATAAAGGACTATGAAAAAGGAAAGAGAAAGGCTATTCTAGGTCCATGGATGCATAATTCAAAT
ACTTTAAGAGATATAAATGGTATTTCTTTAGGAAATAGTTCATTAAGATATGATTTGGATTATAATTATC
TATTATGGTTTGATAAATACTTAAAAGGTATAGAAAATAACATAGATACGACTGCTCCAGTAGAGTATTA
CTCTGTAGGTTTTAATAAGTGGAAGACAGAAGAAAATTGGCCAATAATAAATAAGATAGATAAAAGTATG
TATCTAATAAGTGATGGAAATGCTAACACATCTTTAGGAAATGGTAGATTAGTATTTGATAATGATTTAG
AAGAAAAGTATGATAGTTATATATATAATCCAAAAGACCCATCAGTACAACTAATTGATATGTCAGAGAA
TGAAGTTGGAGTTCCAAATAACTACAAAGATTTAGAAAAAAGAAGTGATATGTTGTGTTATACATCAGAT
GCTTTTAGTGAAGAATTTACTGTAACAGGTGATATAAAGTTAGAGTTTTTTGCATCAAGTTCTGCCAAAG
ATACTGACTGGGTTATAAAAATTATGGACGTGGATTTAGATGGAAATTCAATTAAATTAGCTGATGGTAT
ACTTAGTGCTAGATTTAGAAATAGTTTTTATAAGTCAGAGTTTATGGAAGAAGGAGAGATTTATAAGTTT
ACGATTATAACTTCAAAAATATCAAACACGTTTAAAGTTGGTCATAAAATTAGACTAGATATAACGTCTA
GTGCTAAAAACTTTATTTTCCAAAATAGCAACACGAAAGAGGGATATAATAGTATTGAATATATAGAAGC
AAAGAATACGATTTACCATGGAGGTAAATATCCATCTAAATTGATATTGCCAATAGAAAATAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c1468718-1468374 putative endoribonuclease [Clostridium difficile R20291]
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TATGTGGACAAACTCATGCTGAAGGAGGAGTAATTGAACAAACAACTGAAGTTTTAGCTAAAATAGAAGA
TTTATTAAACAAATATGGTTCAGATAAGCAACATTTGCTATCTGTTACTATTTATTTAAGAGATATGAAA
GACTTTGAAGCTATGAACTCTGTTTGGGATGCTTGGGTTGAAAAAGGATTTGAACCTGCTAGAGCTTGTG
TTGAAGCTAGACTTGCTAGAGAGCATTTGTTAGTTGAAATGAGCGTTGTTGCAGCTACAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1469010-1469900 hypothetical protein CDR20291_1239 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAGCACAATCAAATCAAATCGAATAAAAGGTATAATGTTTATAATAGCATCAGCGCTTGGCTTTG
CAATGATGTCTGCATTCGTAAAGCTAGCTGGAGATTTACCAAGTTTTCAAAAAGTGTTCTTTAGAAATCT
GGTATCAGCTATAATAGCTTTTTGGCTTATCATAAAACATAAAGGAAGTCTAACTGGTAAAAAAGAAAAT
TTAAAAGTACTTTTATATAGGTCAATATTTGGAACTCTAGGAGTTATATTTAACTACTATGCAATTGACA
AGTTGATGCTTTCAGATGCTAATATGCTAAATAAAATGAGTCCCTTCCTTGTAGTAATATTTTGTGCAAT
TGCTCTAAAAGAAAAAATAAATGTAAAGCAGATAGGAGCTATTATAATTGCATTTATAGGAGCTTTATTC
ATAATAAAACCAACATTTAGTGTAGAAGTAATTCCATATCTTGGGGGAATTGCAGGAGCTGTATTTGCAG
CAATGGCATATACTTGTTTAAGAGTTCTTGGAGATAGAGAAGATTACTATACAATTGTATTTTTCTTTTC
AGTTTTTTCATTAGTTACTGTAGGGCCAATTGCTTTTGCAGTATATGAACCAATGACCCTTATGCAACTT
ATATATCTATTACTAGGTGGAGTATTTGCAAGTCTAGGTCAATTTGGAATAACTTTAGCATATAAATATG
CACCTGCTAAGGAAATCTCTATATTTGACTATAGTAATATAATCTTTTCAGCAATTTTAAGTATATTCTT
ATTCAATGTCTATCCAGATATGTTAAGTGTTGTTGGATATTTAATAGTATTTTCGGCAGCATTTTATATG
TTTTTATACAATAAGAAGTTAGATAAATTAGACAAAGAAAAGAAGAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1470118-1471404 putative oxidoreductase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAAGTGAAAGTTGCTGTGATTGGAGCAGGTAATAGAGGAACGTATGCATATGCTCCATATATTT
ATGAAAATTCTGATATATGTGAAATAGTTGCTGTAGCAGAACCTAAAAAAGGAAGACGAGAACTATTTAC
ACAAAAATATAACCTAGATAGTAAAAATGTATTTGAAACTTTAGAAGACTTTTTTAAACATGACAAGATG
GCAGATGCAGTAATAATAGCTACAAATGATGATAGACATTATGATGTAGCAAAACTAGCTCTTGAAAAAG
GTTATCATGTACTATTAGAAAAGCCAATGTCTAATAGTTTAGATGGTTTGGTACATATAGATGACTTGTG
TGATAAGTATAAAGATAAGATTTTTATGATTTGCCATGTACTGAGATATTCTCCATTTTATAATAAATTA
AAAGAAATTGTAGAAAGCAAAAAATTAGGAGAGCTAGTTAGTATACAATATAATGAAAATATAGGATATT
GGCATTTTGCACATAGCTTTACTAGAGGGAATTGGAGAAATAGCAATGAAACCAGCCCTTTAATTTTAGC
AAAGAGTTGTCATGACATGGATATTTTGTTATATTTAGTAGGAAGTAGATGCAAAAAAATATCTGCATTT
GGAAGCTTAAAGCATCTTAATAACCAAAATGCTAGTGGAGAGATGGCACAAAATTGTCTTCAGTGTTTAG
TTGAAAAAAAATGTCCATATTCAGCAAAGAGAATTTATTTAGAAAAAGATAGAAGTATAAATAGAGCTGT
TCACATAAATCCAACTGAAGAGAATCTATTAAATATACTTAAGACAAGTCCATATGGAAGATGTGTTTAC
AGATGTGATAATAATGTTGTAGACAATATGGTAAATATATTACAGTTTGAAAATGGAGTGACGGCTACTT
TTAATTTATGTGCATTTACTAAAGAAAATGGAAGAACTATAAAGTTAATGTTTAGTCATGGTGAAGTTGG
TGGGGATTTAAATAAAAATGAGATAAGAATTAAAAAATTTGGAAAAAACGAAGAAATAGTTATGAATCCA
TCAAATCAACAGAATATGGTAGAGGAATATGATAGAAATCTTATAGCTGAATTTATTAAATTAGTTTCAA
ATAAAGAACTAGAAAAGGGTAGAGTAGCAGCAAAAGAAGCTATACAAAGTCATGTAATGGCATTTGCAGC
AGAATATTCTAGGGTCAGTGATGAAGTAGTGTATATAGAAGAATTTTTTGATAGTGCTAAGCAAATGACT
AAGGAGATAGAAGAAACTATATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1471936-1471493 hypothetical protein CDR20291_1241 [Clostridium difficile R20291]
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TTTTTTTTGGTATAACTTTTTGTATTTTCACGGTTATAGGAATTGGCTTCTTATCATTCTTAGGATTTGA
ATATAAATCTCTTGGAGCTGTATTAATTTTCTTTTTAATATATTTTTGTATAACCACTCCAATTGATTTT
CTATGCACTACTATTTTAGATATATTCAGATATGTAAACAAATTACCATACTCAATATATAAACTTTGCG
AATTTATAATTGATTTTATACTAACTTTTCTAGCTATGAACATAATTGATACCTTTATGGATTCAGTAAC
GATTCCTTTAAGTACAGAAATCTTATTCGCTTTACTTTCTTATCTTTTATCAGAATGTATGGATTTTTTT
GATAGGGATAAGAAAAAACCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1472811-1471960 putative amino acid amidase [Clostridium difficile R20291]
ATGTATTTTCTGTTATCTGTTATTATCATCAATAATAAACATAAGGGGGTATATATTATGAAATTGTATT
TAAGTGCTGATATAGAAGGTACTTGTGGTATTGTAAATTGGGATGAAACAAAACTTGAATGTGAATTTTC
ACAACACTATAGAACACAAATGAGTAAAGAGATAACAGCAGCATGTGATGGAGCTACTCAATCTGGTGTA
CATGAAATACTTGTTAAAGATGCACATGACAGTGGTAGAAATATTAATCCAAATATTTTACCTGAAAACG
TCAAAATACTTAGAGGATGGACCAAAGACCCACTAGTTATGATGGCTGGAATTGATGAAAGCTTTGATGC
ATGTATATTCACCGGCTATCACTCTGGAGCTACTTGTAATGGTAATCCACTTTCTCATACTATGGATATT
GATTATGACTATTTTAAAATAAATGATGAAATAGCATCTGAATTTACTATAAATGCTTATATTGCTGCAT
ATTATAATGTTCCTGTAGCATTTTTAAGTGGAGATGAAATGCTTTGTGAGAGTGCAAAAAAACTAAATCC
AAATATAGTCACTGTTCCTGTGTCAAAAGGAATTGGAAATGGTTCAATTTCAATCCATCCAAACCTTGCA
CTAAAAAAAATTGAAAAAGGTGTCAAAAAAGCTTTATCTGGAGATTTATCTAGGCACTTAATAAAATTGC
CAGATAAATTTAAGATAGAAATAAAATTTAGAGAACATTATAAAGCTTTTAAGGCCTCTTTTTATCCAAA
TATGAAAAAAATAGATTCTCAAACAGTACTATTTGAAACAGAGGACTATTATGAATTTTTAAGAATGTTA
TTATTTATATAA
>ref|NC_013316.1|:c1473796-1473320 hypothetical protein CDR20291_1243 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAAATATTAATAAATCCTATAGGTAAAATATGTATTCAAGGCGAAGAGGTCTTTATTAAATTAG
ACAAAAAGTATGTACCTGCATTAAATGAACTCGACGATTTCAGTCATTTAAATGTATTTTGGTGGGCTGA
TGGGTTTGATAATCCTGAACTAAGAAGTATTTTAGAAACCCCAAAACCTTATAAAAGTGGACCAAACGTT
ATAGGAATATTTGCAACAAGGTCACCTATAAGACCCAATCCAATAGCATTGACTGCTGTACAAATTATCA
ATATCGACCATGAAAATGGTATAATAAAAATACCATATATTGATGCTAATGATAATAGTCCTGTTATAGA
CTTAAAGCCATATACTCCAAGCGTTGATAGGGTTGAAAATCCGTCCGTTCCTAAATGGTGTAGTCACTGG
CCTAAGAGTGTAGAAAAATCAGGAGAATTTAATTGGGAAGATGAAATTGAATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1475075-1473897 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGTGTTTTATGCTTAATATAAGAACTCTTTGTCATGAGATAAATGATTGGATTATAAATATAAGAAGAG
ATTTACATAAGACTCCAGAACTTGGATTAGAAGAATTTCAAACTAAGAAAAAAATTATTAAATACTTAAA
TGAAATAGGTATAAATTATATTGAATATAAGAATCATACAGGGATAACTGCATACATTAACGTGAGTCCA
AACTTTGAAACAGTTGCTATAAGAGCTGATATAGATGCCTTACCTATAACAGAAGAACTTAATTATTCTT
ATAAATCTATTAATATTGGTAAAATGCATGCATGTGGTCATGATGCACACACTGCTATTTTACTGGGTAC
TTGTAATATACTATTTAAATTAAAGAATTACTTAAATGTAAATGTAAAATTCTTTTTTCAACCTGCCGAG
GAAACTATTGGTGGGGCTCAACTTATGATAGAAGATGGATGTCTTGAAAACCCAAATGTAAAATATATAT
TTGGACTCCATGTAAATCCCAATATCAACAAAAATCTAATTGAATTAAAATACAACACTCTAAATGCTTC
CACCGATACACTTCAATTAACTGTACATGGTTCAAAATGTCATGGAGCTTATCCACATCAAGGTATTGAT
GCTATTGTTATATCTGCTCATATTATTACAGCTCTACAGACAATCGTTAGTCGAAACACAAATCCAACTG
ATTCTGTGGTTATTTCTCTAGGAAAGATTGAAGGTGGAATCAAGGAAAATATAGTTTGTGACAAAGTGGT
TATAAGGGGTACTTTGAGAACCTTGACTCCTGAAACTAGAGAGTTTTCAAAAAAACGAATTAGAGAAATT
TGCGATTTTACTTGTAAAACATTTGGAGGAAGTATTTCTGTTGAAATTGAGGAAGGTTATCCAGCTCTTA
TCAATTCAAACCATCTAGTAGATTACGTCAAGCAAAATGCTGTAGAATTGTTTGGAGAAGAAAATATTAT
CCTTAAAGACTCGCCCACTCTTGGGGCTGAAGACTTTTCGTATTTTCTAAGACACTGTGAAGGAGCTTTT
TACCACCTTGGTTGTGCAAATCGTGAAAAAAACATTACTTCCCCTTTGCATACCTCTACTTTTGATATTG
ACGAAGATTGCCTTATTACTGGTGTCATGCTCCATGTAAAAAATGTATTATCATTCTAA
>ref|NC_013316.1|:1475229-1476092 putative muramoyltetrapeptide carboxypeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAGGAATAATTGCGCCATCTGGGCCATTAAGAAATACAAGTTTGGAGGAAATAAAGTTTAATTTAG
AAAGTTATGGTTACGAAGTTAAGTTTTCTGAAAGTTGTAGTTTAAATTATAAAGGTTATTTAGCTGGTAA
TGATGATATTAGAGCAAGGGATATAGAAGATATGTTTTTAGATAAAGATGTAGATATAATTATGTGCTTA
AGAGGAGGTTATGGAACAACAAGAATATTGGATAAAATAAATTATGATATAATAAAGCAAAATCCAAAAC
CATTTATAGGTTTTTCTGATATAACAGGTTTAAATTTAGCTTTTTATAAAAATTGTGGACTTTTACCATA
TCATGGAATAATGGCAGCAAATGTAGGTAAATGGGATAAATTTACCTATAAATCATTGGTAAATGCTTTA
GAATTTAAAGATGACTTATATTTAGAAAATCCAAAAGAAGAAAAGATTTATACTGTATGTGAAGGTAAAG
CAGAGGGAATAATAATGGGAGGAAATTTATCCTTAATAATTGCCACAATGGGAACAAAATATGAAATAGA
TGCAAAAGATAAAATTTTGTTTATTGAGGAAATTGGAGAACCTCAATATAAACTGGATAGAATGTTAACA
CAACTATATTCTTCAGGAAAACTTGAGGAATGTAATGGTATAATTTTTGGAGATTTTAAGGATTGTATTG
AAGAAAATGATTTGATGGAATTACTAATAGAATTTGCAAATAAGGTCAATAAACCTTCTATATATAATCT
TCAGTCAGGACATTGTATCCCAATGATAACTATTCCTTTGGGCAGAATGTGCGAATTAGATGCTACAGAA
AAAATCGTTAAATTAAAAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1476163-1476756 hypothetical protein CDR20291_1246 [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTGATGATAGAATAATAGACTTTAACGAACTAAAGAACAAAGTTAAAGATTCTGATGTAGATAAAT
TTGAGCAATACATATATAACTTATATTTTTCTGTTATGGATGGAAAGATGTCCATGGCTGAGTTTTCAAG
AAAAATATTCGATTATATGAGAGATAACAACATATCTCAAGAAAAATTTATGAAAATACAAAAGCAATTT
ATGGAGAGATATGGTATGGACACTGAAGAAGTAGAAAAACAACTTAGAAACTTTGGAATCGACCCTTCTA
CAGCAGGTTTTATGAGTAATAATACTTCCAGCAAAGTATCTACAGAAGATTTAGAGTCATTTAAGAAGAG
TGCAGGATTTTATGAGAAATATGGAGAAAAAATCCAACCAAAGAGTTGTATAACAACATTTATAAAAAAT
GACTTAAATGATATTAATGTAATAATCGACCAAGAAAAGATAATGCTTTGTAGTGATAGAAAAATAAATC
TTATGGATTCAGAACTAAATGAGTTTTTATTAGAATATAAGAATATGTTTAATAAAAAAATAAAGGTAGT
AATGTGCGAAACTACGAATAAGTATGATTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c1477642-1477007 hypothetical protein CDR20291_1247 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAACTTATTAAATGAACTTGAAGCTTTAAAGAGTAATTTAGATAATCTACCAATAGAAAAAATAG
AAAATTATGATTTGAGTAAAACTGCTTTATTTATAATTGATGTTAATAATGGCTTTGCAAGACAAGGTGC
ATTATACTCTCCTAGAGTAGAGTCTTTAATAAAACCAATTGAAATGTTTACAAAAAAAATATCAAACAAA
TTAAATAGAGTAATAGCATTTACTGATTCTCATACTCCTAAATCAATAGAACTTTTGAGTTATCCTGTTC
ACTGTTTGGAAAATGATGTAGAAAGTGAATTGGTTGATGAACTTAAGTCGATAGAAAACCTACAAATTCT
TCCTAAAAATTCTACTAATGGATTTTTTGCATTAGAAAATTTGGATTTTGATAATATAGATAATATAATT
ATAGTTGGCGATTGCACAGATATATGCATATATCAATTTGCAATAACTCTAAAATCATATTTTAATCAAC
ATAATATTGAAAAAAATATAGTTGTACCTATGAATTTAGTAGATACTTATGATATTCCTAACATTCACCC
TGCTGAGATTTTAAACTTAGTATTTTTCAACAGTATGATTCAAAATGGAGTTAATGTATTAAAAGAGATT
CGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1478453-1477722 glycerophosphoryl diester phosphodiesterase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATTTATGCTCATAGGGGGTTTAGTGGAAAGTATCCAGAAAATACTATTCTAGCTTTTAAAAAAT
GTTTGTATATGGATATATATGGAATAGAACTTGATGTCCACAGAACTAAGGATGGAAAAATTGTAGTTAT
TCATGATGAAAAGGTTGATAGAACTTTTAATGGACATGGTTTTGTAAAAGACTTTACTTTAAGAAAATTA
AAAACTCTAAACTCATCTTTTGAAGGATATCAAAACAATAAAGAATGTAAAATTCCAACTTTAGAAGAAG
TATTAATTCTAATTTCACCTACAGACCTTATTTTAAATATAGAACTAAAAACTGACAAAATAAACTATCC
CAATATAGAAAAAGACGTTTTAGAGCTTATTTTAAAGTATAATATGAAAAATAGAGTTCTTATATCTAGT
TTCAACAGCAATAGCTTAAAAAACTTTCATAAATTAGACCCTAGTGTAAAAACAGGATTATTGTGTTATT
TACCTATAAACAATGTAGTCAATTTTGCTAAATTTCTGGGTAATAGTTACCTTCATCCACCTCTAGTTTT
AGTAAATGAATCTCTAATTGAACTTTGTCACAAAAATCTACTTGGTGTCAATGTATATACTGTAAATGAA
GAGGATGATATACTACACTGTCTAAAACTCAATGTAGATGGTATTTTTACTAACTATCCAGATATTGCTT
CAAATCTTTTACACTCAAAACAATACAGCTAA
>ref|NC_013316.1|:1478784-1480973 putative nonribosomal peptide synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGTATGAAGTTAATTTAGAACGAGCTATGAATTATTGGATGGATTTGTTAGATGATTATACGAATATAG
CAAAAATTCCAAATGATTTTTTTTATAAAGATTGTTCTGATGAAGTAGTAGATGAGGTTTTTAAGATGAA
TATTGAGAAACATGAAAGGTTAATTCAATATTCTAAAGTGAACAATATTAGCATAGACTCTATCATAGAA
ACTATATATGGCCTTATACTTCAAAAGTATATATATGAAGATGATGTAGTTTTTGGTAAAACAATGAATA
TAATTCCAATAAGAGTAAGAGTTAGACAAAGTGAAAAATTTATAGATGTTGTAAGGAAGCTAAAAAGGCA
GTGGAGCAGGTCTTTAGAGTATGGATACTATTTGTTATCAGATATAGAGAATAAAAATCATCTAAATACT
AAGCTTATAAACACAATATTTATAGCTAAAAGTTTTGATTTATCATATGATTATGACATAGAAAAAAAAG
GATATGATTTATCTGTAATAGTATATACTAAGAGGGCACTTAAAATAAAAATAAAGTATAAACCATCTAT
ATATAAAAGAGAAACTATTAGAAGAATTTTAAATCAATTTGATTATATAATAGAGCAAATAATAGAAGAT
AATGATATTTTAATAGAAGATTTAGAATTTGTATGTAAGGAAGAAGAAAAAGTATTATTGGAAGACTTTA
ATAATAATCAATATGAAGTACCCTATGATAAAAGTTATGTTGATTTATTTAGGGAGCAAGTTAAGGTAAC
ACCTAGTAATATAGCTGCTAGGGATGAAAATAGAAAGTTAACATATAAAGAATTGGATGAGGTAACTGAT
AAACTTGCAGGTTATTTAAATCATATAGGAGTGGAAAGTGAAGACATAGTAGCTGTAATGTTACCAAGAG
ATATTAACATAATTATTACAGCAATAGGGATTATGAAATCAGGGGGAGCATTTTTTCCAATAGACACGAG
TAATCCAGAAGAAAGATTGAATTACCTTCTTGAAGATAGTAATGCAAAAGTAGTGATAACTACAGATGAA
CTCAAAAGTAAGGTTGTAAATGAGAATACCATAGTACTCGATATAAATGATGAAGAAATGTTTAAGCTTG
GATATGAATTAACTGAAAAAATAACATCATCAAATTGTGCATATACGATATCTACTTCAGGGTCAACTGG
TAGGCCAAAGACCATAGCTATAGAACATAAGAGTTTAGTAAATATGTGTTATTATAGCGTAAAATCTATA
AGCGCTACAGAAAATGATATATGTGGTATATACTTAAGTTTCAGTTTTGATGCTGTAATGAAACAACTAT
TCCCTTATTTGCTTGTAGGTGCATCAATAGATATTATGCCTGAAGAAGCTAAATTTGATGAATATACAGT
AAATGAATACTGTGAGGAAAATGACATAACTATACTAGCATTGCCAACAGCATTTGCAAGGTTATTTATA
CAAAATTGCAATAATAATTCACTTAGAGTTGTACAGACTGGAGGAGAAAGATTAAAAGGATATAGAAAGC
GTAATTATGAACTATATAATGAGTATGGACCAACCGAATTTACTGTTGTATCGACTTCTTTTCATGTGGA
CAGAGAATATGGAAAAATACCAATAGGAAAACCTATATTTAATACTTATGCATATGTATTAGATAAAAAG
AACAAACTATGTCCAATTGGAGCACCAGGAGAGCTATGTCTATCAGGCATTCAAATATCAAGAGGATATT
TAAATAAAAAAGGGCTAACAGAGCAAGTATTTGTAGAGAATCCTTACAAAACTTGTGAATATAATAAGTT
AATGTATAGAACTGGTGATTTAGTAAGATGGTTAGATGATGGAAATTTAGATTATATTGGAAGGATGGAC
AATCAAGTAAAAATTGATGAGTTTAGGATAGAGCTATATGAGATTGAAAATATAATAAATAATATTACAG
AAATTAAAAGTGTTGTTTGTATATCGAGAACAAATGATGACGGGGATATGTATATATGTGCATATTATGT
AATTGATGAGGAAGATAGTGGTAAGATAAATGAAAGAACCATTAGAGAATATTTAAATGAGCATCTACCT
CCATATATGATTCCAACAATAATAATGAGGATAGATAAAATACCAGTTACACCAATAGGAAAAGTAAATA
AAAAAGCACTACCAGAGTGA
>ref|NC_013316.1|:1481336-1483312 putative oligopeptide transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGTATATATGTTATAATATATACAAATTGAAAAGGGGTGAAAATTTTATGAACAAAAAATTACCTAAGG
GTGCTTATGGTGAGGTTAGTGGAAAAGATTACGTTCCATATATCACAGATAAGTCCAGAACCGGTGGAAA
TGTAGCTGTACTGATTATCGGTATTATTTTAGCTGCCATTTTTGCCGCATCTACAACTTACTCTGGAATG
AAAGCCGGTCTTACAGTTGCTGCAGGTATTCCAGGAGCTATAATAGGTTCTGCTTTTGTTGGAGCATTTG
CTCGTTCAAAGGGTATTCTTGGTAAAAACTTAATCCAAGGGATGTCAAGTGGTGGAGAATCTGTTGCAAG
TGGATTTATTTTCGTATTACCAGCAGTTATATTAATTGGAAGCCAAATTACATTCTTTGAAGGCCTAGCT
GTTGGAGTTGGTGGAGTTTTATTTGGTATAGGAATTGCTGCTATAGTTCACAACTATCTAATAGTTGAAG
AACATGGTAAACTTATGTATCCAGAATCAATGGCTATATCTGAGACACTTGTTGCTTCAGAGGCTGGTGG
AGATTCAATTAAGTACATGGGAATTGGATTTGTAATAAGTGGATTTATTACTGTATTAACTGGTTCATTC
TTAAATGTAGCAAACAATGTAATGAGTCTTGTAGGAAGCAAATTCTACAAATGGAAATTTGATATTGAAG
TAAATCCTCTACTTTTAGGAATTGGATTTATAGTAGGGCTTGAAGTTTCTTTAACAATGTTTGCAGGAAG
TATTTTATCAAACTTTGGTATAGCACCTTTAATAGGATACTTTACAGATATGGCTAAAGATGGAGCTATG
GTATGGAATAATCCTGCAATGCCTCTTAACCAAATGGATGTCGGAGCAATATCTAGTAGTTATGTAAAAT
ATATAGGTGCTGGTATGATGCTTTGTGGAGGTATTATTGGTGCAATAAAACTTATACCAACTATAATCGC
TTCTATAAAAGAAACACTTAAAGCTAAATCAAGTGCTGGAGAAGGAGAAGAAGGTTCATCTATACAAATG
ATACTTTTATTAGGTGGAGTAGTTATTGGATTTTTAGCAGCATTCTTAATTTCTGGTAACATTGTTATGG
CAATTATTGGAGCTATCATATCTCTTTTATTATCTTTATTATTTGTCATAGTAGCTGGTCGTTTAACAGG
AACAATTGGAACATCAAATCTTCCAGTTTCTGGTATGACTATAGCTTCTCTAGTTATTGTAACATTAGTG
TTTGTTATAATGGGATGGACTGATTTAGAAGCTAATAAATCATTACTTTTATTTGGTTCATTTATAGTTG
TTGCTATTGCTATAGCTGGAGGTTATACTCAATCTCAAAAAGTAACTTATATTATTGGTGGTAGCAAAAA
CGAAATGCAACGTTACTTTACAATTGCAAGTATAGTTGGTGTTATAGTTGTTGTAGGAGTAATTTTATTA
CTTTCTGACCAACTTAGAGCAACTGGTGATAATGTACAATTTGCATTACCACAAGCAAACTTAATGTCAA
CATTAACTTCTGGTATTATGTCAGGTAGTTTACCTTGGGTTATGATTATTGTTGGAGTATTTATGGCAAT
AGTTCTATATGCATTAAATTTACCAATAATGACTATAGCTATAGGATTCTATTTACCAATTGCAACAACT
TCTATAATATTAGTTGGAGCATTAATTCGTTTATTTGTTGAATTAGTATCTAAAACTGAAAAAGAAAAAG
AAGTTAAAGTTTCTAATGGTATAAGTTTATCTTCTGGTCTTGTTGCTGGTGGTTCTATCATTGGTTTAAT
AGGTATAATATTACAAGTAACTGGAGTTGTAACTCCAAAGGTACCAAGTGGATTTGCTGCAACAAATTCA
ATGGCAATTGCTTTATTAGTAGTTTTAGTTGTGCTTACAACATTACCTATTGTTTTATCTAAAGTAAAAA
ATAATGAGCAAGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1483299-1483646 hypothetical protein CDR20291_1251 [Clostridium difficile R20291]
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AAAATAGTGTTGTTACTATACTTGAAAAACAGGACCATAAAATTCAAAAGTTTTTTAGAAAGTTAAAAGC
TAGAATACCTAAATACAAAAAAATAGAACTAGATGAATATTCCAGTTTTGTTTTTTTACAAATTGATGGT
CAAAGGACTGTTAGAGAAATAGGCAAGAACCTAGAAGCTAAATATGGAGAAGAATCTCATCCACTTTATG
AAAGGTTGTTAGTATTTTTAAATCATATTGAAGTTAATTGTCACTATATTGAAAGACTGGATATATAG
>ref|NC_013316.1|:c1485807-1483888 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTAATGACATTGGAAAATATAAGTAAAAGCTATTCTGAAAAAAAATTACTAGAAAATATATCTC
TTGGAATAAATGAGGGGGAAAAAATAGGACTTATTGGTGTAAATGGTACTGGTAAATCTACCTTACTCAA
AATTATTGCAGGAGTTGAAGAAAGTGAGACTGGTAATATAACAAAAACTAATGGTATTAGGATAGAATAT
CTACCTCAAAATCCAACTTACAATGAAAATTCAACTGTACTTGAACAAGTATTTAATGGAACTTCTGAAG
AATTAAAGCTACTTGGTGAATATCAAGAAATCCTAGAAAAACTTAATTCAAACTTTACAGAGGAATTAAA
TAAAAAATTATTATCAGTACACGAAAAAATAGATGCCTTAAATCTTTGGGATTTAGAAAGTGAAGCTAAG
TCAGTACTTACAAAGCTTGGTATAAATGACTTTAATCAAAAAATAGCAGAACTTTCTGGTGGGCAAAGAA
AGAGAGTCTCTCTGGCATCAGCCCTTATTACACCTTGTGAGTTTTTGATACTAGATGAGCCTACAAACCA
TCTAGACAATGATACTATAGATTGGCTTGAGGAATATCTTAATTCAAGAAAAGGCTCATTGCTTATGATA
ACTCATGATAGATACTTTTTAGACCGTGTTACAAATAGAATTATTGAACTGGACAAGGGTAGATTATTCA
GTTATGATGGGAATTATTCAATATTTTTGGAAAAGAAAATGGAAAGACTTTCGCTAGAAGCAAGTATTGA
AGATAAAAGACAAAATTTAATAAGAACAGAGCTTGCGTGGGTAAAACGAGGAGCTCAGGCTCGTAGCACT
AAACAAAAAGCTCGTTTACAAAGATTTGATGAACTTATGAATAGAGATTCTTTTAAACCTGATGAAAATC
TCGATATATCTGTTGCATCAAGTAGACTTGGAAATAAAATAATAGAAATACACAATATATCTAAATCATT
TGAAGAAAATACTGTTATAGATAATTTAGAATACACTTTAACTCGTACAGATAGAATTGGTATAATAGGC
AAAAATGGTATGGGTAAATCTACCCTTATAAATATACTTAATGGAGAAATAGAGCCTGATAGTGGATATA
TTTCAATTGGAGAAACAGTTAAAATAGGTTGTTTTTCTCAAGACGACTCTCATATGAATATTGATATGAG
GGCTATAGACTATGTAAAAGAAGCTAGTGACTATATAGAAACTTCAGATGGTACTAGGATTACAGCTTCT
CAAATGTGTGAAAGATTCCTTTTTAATGGTACTATGCAATATACTTTGATAGGTAAATTATCTGGTGGTG
AAAGAAGAAGACTACATCTTCTTAAAATCCTTATGACAGCTCCTAATGTGCTTCTTTTAGATGAACCTAC
AAATGATTTAGATATTGAAACGCTTAAAATATTAGAAGAATACCTAGACGAATTTAAAGGTGTAGTAGTT
ACAGTATCACATGATAGATATTTCTTAGATAGAATTTGTAATAAAATATTTGCATATGAAGGTAATGGAA
AAATTCATATCTATACAGGTAATTACAGTGATTATCTTATTTATAGAGAGATTCAAGGAATTGAATTTGA
AGAATCTAAAAGGGAATCAGTTAAAAAAGATGACTCTACTACCCTAAAAAAAGAAAAACCTAAAAATGAT
AAAAAGCTTAAGTTCTCATATAATGAACAAAGGGAGTTTGAAAATATTGACTCTGATATAGAAAAACTCG
AATCTAAAATTGCAACACTTGATGAAAGTACTGCAAAATTTTCAACTGATTTTACTAAACTTCAAGAAAT
TTTAGATGAGAAATCTAAACTAGAAAAGGAACTTGAATACAAATATGAAAGATGGGAATATTTAAATAAT
CTAGCTGATGAAATAGCTAATAATAAGTGA
>ref|NC_013316.1|:c1486639-1485833 hypothetical protein CDR20291_1253 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATCTAATACTGGGGGATAATATGAGTAAAAAGTCAAAACGAAGAAAAATTAATAAATTAAAATTAA
CGATTGTAATAACTGTATTATTTCTTGCTTTATTATCTATATATGAGATACTGTTCTCTAATCCCAACAA
AAAAGGTAATATAAAGAGTCAAGAAACTATGCAGAATAAAAATAATACAACAGATGATTCTAAAAATAAT
CAAAGCTCTACCAAAAAGCAGGAAGATAATAATATCAAGCCTACTTTTTCATATTCTTCAATACCAGATA
ATATAAAAAATAAAATGATTGGTAAATCTATGCCTACTGATGAACCTATAAGCTTTGATAGTCTATCTTA
TTTAAAACTTACATATTATGGATTTGATGAAAAAACTCATCAAGGAGAAATGATAGTAAACAGTGAACTA
GCTCCAGAAGTAGTGGATATTTTTAAGGAATTATACGAAAAAAAATATCCAATTGAAAAAATTAAATTAA
TAGATGACTATGATGCTGTAGATGAAAAATCTATGTCTGATAATAATACCTCATCATTTTGTTATAGAAC
TATAGCTGGTACAAATGTAGTTTCAAATCATGGTAAAGGACGTGCTATAGATATAAACCCATTACAGAAT
CCTCAAGTTTCTGGAAATGATGTTACACCTAAAATAAGTACAGTTTATGCTGATAGGTCTAGCACAAAAT
TTGGAATGATAAAAAAAGGTGATGATTGTTATAATGCTTTTGTAAGCAGAGGTTGGAGTTGGGGTGGCTA
TTGGAAAAACCCAGATTATCAACATTTTGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c1488146-1486698 GntR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
TTGATATTTTCAAATCTAAAACTAAATGATAATGAACCAATTTATATACAACTTAAAAATTATATAAGTG
ATATGATATCAAAAGGACTAATTCCAGACAATAGTAAGCTCCCTTCTACAAGGGAGCTTAGTCAGCTTTT
ACAAGTTAGCCGAAATTCTGTAGTTTTAACTTATGAAGAATTAAAATCAGAAGGATTAATCTACTCTATT
TCAGGAAAAGGTACATTTGTTAAATCAAAGAATAAGTCTTCAAATACTACATGGTCATTAAACTGGGATT
GTTTAGAGAATACATACTCTAAAAAAGCCAATGAATTGGACATTATAAAAAGTGAAATTCCTTGGAGCTC
TGACCTGATTTCCTTTAAAAGTATTTCTCCAGATGGAGATTTATTCGACATGGAAGAATTAAAAAAATCC
TTTTTAAATAGAATTTCACTAGAAGGACATAAATTACTCAACTATGGATATGCACAAGGTTATAAGCCCC
TTATTGACTATTTACTAGAATATATGACAAACAAGGGTGCTGATATAAGTAATAAAGATATACTAATAAC
AAATGGATTCACAGAAGGCTTTGATATTATTATGTCATCTTTTACCCAAGAAAAAGACTACATAATATGT
GAAAATCCTACTCATAATACTGCTATAAAAATTATGAAATCTCATAACCTCAATATCTTAGGTGTAGATA
TAAATGAAGATGGTTTGGACTTCAATATGCTAGAAGACAATTTAGTTAAGTATAAAAATAAAATAAAGTT
TGCATACATTACACCCTCTTATCACAATCCTACAGGAATTGTAATGACTCCTGAAAATAGGTACAAATTC
TATAATCTTATGAAAAAATACAATATAGCAATTATAGAAGATGGATTTAATGAAGAATTACTCTACAATA
GTTCTCATATATTTCCTATCTGTTCCCTAGATAATATGAATAATGGGGTCGTATATATTGGTAGTTTTTC
AAAAATTTTATTTCCTGGAATGAGAATTGGATGGATATTTGCAGATAAAAAAGTAATCAATAAACTAGAA
AGTGTAAAAAGGTGCAGAAACATACATGTATCCTTTTTAGACCAAGGAATTTTATTTGATTATTTAAGTA
ATGGAGGTTTTGAAAAATACATTAAAAAAATACGTAAATTCTATGGGGACAAATTTAACTTTGCATATAA
ATGTATAAAAAAATATATAAAAACAGAATATATCTTGGGTGATGGAGGTTTGCATATATTTATAAAACTA
AAAAATATAGATACTAGAGTTTTATTAGAAAAATGTTATGAAAAAAATGTTATATTTATGCCTGGAGATT
TATTTTTTACAGATAACTCTGGTTTTGATACTTTAAGACTCGGATTTTCTAGGTTGTCTTTTGAAGACAT
TGAAATTGGAATAAAAATAATTGGAGAAACTATAAATGAAATGTTCTAG
>ref|NC_013316.1|:c1489069-1488170 D-alanine--D-alanine ligase B [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATAGCAGTTATAATGGGTGGAATATCATCAGAGAGAGAAGTTTCTTTAAATTCAGGAAAAGAGA
TATATAATAACCTTGATAAAAATAAATATGAAGTTGTAAAAGTAATAATAGATGATAAAAAAGATATATT
TACAAAGATACCAGAAGATATAGATTTTGCAATACTTGCTTTACATGGAAAATTTGGTGAAGATGGATGT
ATTCAATCAATACTTGAGACTATGGATATACCATACTCTGGATGTGGACCTCTTTGCAGTGGGATGTGTA
TGGATAAAAATATAACTAAAAAAATGCTTAGAGATTCAAACCTACCTACTGCTCCATGGGTTTTAGTAAA
ATCAGTTGATGAAATCGACTATGATGAAATAGATAATATAGGTTATCCAGTATTTATAAAACCAAACTCA
GGAGGTTCAAGTGTAGCCACATTCTTTATTCATTCTAAGGATGAAGTTGAAGAAGCAGTTAGAAAAGGTC
TGGAAGTTGACGAATTTGTAATGATTGAAAAATATATACCAGGTGGAGAATATACTTCATTCATATTAAA
TGGAGAAGTGTTCCCTACAATATCTATAAAATCTGATTCAGGATTCTTTGATTATGAAGCTAAATACTCA
GTTGAAAAAGGTGCAAAGGAAGAAGTTGTTTACTTAGATGAAGAACTTCAAAAAAGAGTAAACGAAATTT
CTGAGACTTGTTGGAAAATTTTTAATTGCAAAGCATATGTAAGAGTTGATATGATTATAAGTGAAGGTAT
TCCATATGTTCTTGAACTAAATACTCTTCCTGGAATGACTCAAACTAGTTTAATTCCTAGAAGTGCTGCT
GCTAGAGGTATTAAGTACAGTGAACTATTAGATAAACTTATAGAATACTCTTTAAATTAG
>ref|NC_013316.1|:1489327-1490583 putative competence protein [Clostridium difficile R20291]
TTGAAAGCTGAAATAATAAGTGTAGGAACAGAAATATTATTGGGAGATATAGTAAATACAAATTCTCAAT
TTTTAGCTAAAGAACTTGCATCATTGGGAATAGAAGTATACCATCAGAGTACTGTTGGAGATAACAAACA
AAGACTTTTAGAATGTTTTGATGAAAGCTTAAAGAGAAGTGATTTTGTAATTACTACAGGTGGTCTTGGG
CCAACTGGTGATGATATGACAAAAGAAACTGCTGCAGAATACTTTGGTCAGAAATTAGAACTACATAAAC
CTTCACTAGAGGTTTTGGAATCTTTCTTTGTTAAAACAGGAAAAAAAATGGCCGAAAATAATATGAAACA
AGTGTACTTTCCAAAAGATGCTATAGTACTAAAAAATAATAATGGTACAGCTCCAGGGGCAATTTTAAAA
AAAGATGGTAAATTTATAATAGTATTGCCTGGACCTCCAAGAGAAATGAAAGCTATGTTTAATGAGAGTG
TCAAACCTTACTTACAACAATTCACAAATGAAATGCTAGTATCTAAGACTTTAAGATTATATGGAATAGG
TGAGTCAAATCTAGAATTAGAAATTCTCGATATAATTAATGAGCAGACTAATCCAACAGTTGCTTTATAT
GCAAAAGAATTAGAAGTTACAATAAGAATAACTGCAAAGGCTGAAAATGAAAGAGAAGCTTTTAAATTAA
TAAAACCAGTAGAAGAAAAAATAAAAAGTAGAGTTGGTAAATATGTATATACTGAAGGAGATATTTCCAT
ATCTGAAGGGGAGACTGCTTTAGAAGATGCTGTTTCTAAGTTACTTGTAGAAAAAAATCTAACAATAGCA
GTGGCTGAATCTTGTACTGGAGGTTTGGTTTCTTCATCTCTTATAAACTATCCAGGAATATCTTCTGTAT
TTCTTGAAGGATGTGTAACATATTCTAATGATTCTAAAATGAAAAGATTAGGAGTAAAAAGAGAAACTTT
GGAAGAGTTTGGAGCAGTAAGTGAGCAAACAGCTATAGAAATGGCTGAGGGCGTTGCTAAAGGACTTAAA
GCTAATATAGGTATATCCACAACTGGAGTAGCTGGACCTGGTGGAGGAACCAAAGAGAAGCCTGTGGGAC
TAGTTTATACTGCAATATATATAAATGGAAAAACAATAGTAAAGAAAAATATATTTAATGGGGATAGAAG
AAAGATAAGATTAAGAGCTACTAGAGATTTACTTAATGAATTGAGAATACAATTAGAAAAGCTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1490653-1491432 putative hydrolase [Clostridium difficile R20291]
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TAGTAGCAATTGAAGAAATAGAAAAAAAGGGAGTACAGTTTAATGTTGCTACAGGTAGAATTTTTAAACA
AGCACATAATATTATCAAAGATAGTTTAGATATGAATGGATATTATGTATGTGAAAATGGTTCATTTATA
TATGATAAAGATTATAATGTAATTTTTAAAAGAACGATAGATGATAATTTAGTAAAAAAAGTCATTGATA
GATTTGAATCAAGTGATGCACAACTTTATTTTAAATATAAGGGTGATGTAATTGTGGGTAGTGATACCAC
TGCTTTTAGACATTATTCTAGTGACTTTATAGTTGACCCAGATTTTGAAAAAAGAAGTAGTTTTGATAAT
CTTATAGGAAATATAGGCGTATGTTCTGAAAATTTGGAAGAGTTATCCAGAATAGAACTTTATCTAAAAA
GTGAGTTTAGTGAAGTATTAGAAATATATTTTTCTGGAACATATACTTTAAATATAGTTCCTAAAAGTGT
GTCAAAAAGAGGAAGTATAGAGCATGTAATAAAAACGTTAAATGTAAGTCCAGATGAAGTTGCTACTATT
GGGGATTCTCCAAATGATATTTGCATGTTAGAAGGATTTAAATATAGTTTTGCAATGTCTAAGGCAAGGG
AAGATGTAAAGCAAAGTGCAAATTATGTAGTAGATAGTGTAAAAAGTGCCATAGATGTTATAATGGAGAT
AAATAGTTAG
>ref|NC_013316.1|:c1492120-1491536 hypothetical protein CDR20291_1258 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAATGAATACCCATTTTATTATGGCAAAATCAATACTTGATAATATAGATGAAAATAAAACATTCT
TTATAAGCGAAAAAAATTTTATATATGGCAATATAAAGCCTGATGCTTTTTCTAAATATAAATTAAAAAA
ACATTATTTAGATGAGTCATTTAATATGATTGTTTCTAAAATAAACTATCTATGCAGTCTTAATATAGAT
AGTCTTTCTAAATACTTTTCAGTAAGTAGACTTAGTCAGGAACTAGGAGTCATATGTCATTTTTTATGTG
ATTTTTTCTGTGTAGCTCACAGTGAACGTTGGGAATTTAAGCATAGCTTAAATAAACATGTTACTTATGA
AAGAGAACTTGGAGCATTTGCAAAAGATGTTGATTTATCTAAAATTAAATGTGGTACTATAAATAGTAGT
TTTGAGAAGTTTTTTACTAAACTTTATAGTGATTACAAAAAGAAAACTGATTATATGAATGATTTAAAAT
TTTCAGCTTATACTTGTAATAGTGTCATAAATTATATACTTGACTCTATTTTATCTAATACAATAAAATC
ATATCATATAGCAAATTGCGGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1493750-1492320 sigma-54 dependent regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTAGATTTGGAATTTTATCAAAAAATATTAGAAGCTTCCCATGATGAAATATGTGTTTCTGATG
ATAAAGGAATAATAATATATTGTAATAAAGCATTTGAAGAAAATTATGGTCTAAAAAAAGAAGATATTTT
AGGAAAAAATGTTTCTTTTTTAGAAGACTCTGGATATTCAACAAAAAGCCCCATACCAATTGTATTAAAA
ACAAAGACTAAATTTTCACTGGAACAAGATACTCAAACAGGGAAAAAGCTTATCATAACTGCTACCCCTA
TATTTGATGAAAATGGAAACTTAGAATTTACTGTTGAAAATTGTAGAGATATAACTGAACTTAATAATAT
AAAAAATAAACTTGAAGACACAAAAAAGCAAGTAAAAAAATATAAATCTGAGGTAGAAACACTATACAGA
ACTGCACTTAGAATTGAAGATACTGTAATTATGGACGGAATAGTGATGAGACCAATCATAAACACAGTAA
ATCATGTTTCTAAAACGGATGTAAGTGTACTTTTATTGGGTGAATCTGGAACAGGAAAAAGCTCACTTGC
TAGATATATACACCACAACAGCAATAGATCTAATGGCCCATTTATAACAATAAATTGTGCAACTATATCT
CCACAACTTCTTGAATCTGAACTTTTTGGATATACTTCAGGTGCTTTTACAGGTGCAAGTACTAAAGGTA
AAGTTGGGCTCGTAGAATTAGCTAATGGAGGAACTCTTTTTTTAGATGAAATAGGAGATATACCACAAAA
TCTACAGGCAAAATTTTTGCAATTAATACAGGATAGAACTTTTACTCCAGTTGGGAGCTTAAAAAATAAA
AAGGTTGATATAAGAATTATATCTGCTACAAATGCTGATTTAGTTTCAAAAGTAAAAGAAAAAAAGTTTA
GAGAAGATTTATACTATAGATTAAATGTTATAGAAATAAAATTGCCTCCTCTTAGAGAAAGAAGGGATAA
TCTAGTGGAAATTATAAAATATTATTTTAATAGGTACTCAAGTGACTTCAACCTAAATAAAACTATTTCT
AAAGAAGCTATGGATGCTATTGCAAATTATAGATTCCCAGGCAATATAAGAGAATTACAAAATATAATTC
AAAAAATCTTGCTTACTTGTACAGATAATCATATAACAATAGATGACTTACCAAACATTCTTACAAAAAA
TATACATATTACCAATAATGGAAATAAAACACATATATCCCAAATTAATAAGGTTATTATATCTGACTCA
AAATCTACTAATTATAAAAATAAAAATTTTGACACCTTAATTAAAGAGTATGAAAAAAATATAATTTTGG
ATGCTTATGAAAAATTTGGTAGTTCTTATAAAGTAGCCAAACACCTTGAAATCTCACAGTCTAAAGCCAA
TAGGTTAATTAGAAAGTATACTAATACTTAA
>ref|NC_013316.1|:1494066-1495010 hypothetical protein CDR20291_1260 [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAGAAAAAAGTAAAGGGTATGTATTTATAGCAATAGCAGGGTTATTATGGGCTACACTTGGATTAT
TTGGAAAGTTTTTAATGGGAAATGGACTGACATCAGAACAAGTAGCATTTACAAGATTGTTTTTTGGATT
TATAGTTTTAGGCGTATATTCATCTATAAGGACACCACAAATCTTAAAGATAAGCAAAAAAGGAATTATA
TATTCAGTAATAATAGGAATTATATGTCAGGCAATGTTTAATTTATGTTATTTTAAAGCAATTGACATTG
CAGGTGTATCAATTGCAGCAGTTTTACTATATACATCACCACTGTTTTTAGCAATATTTTCAAAAGTATG
TTATAAAGAAAATATTACTAGAAGCAAATTATTTTCACTTATTCTTTGTTTTATTGGTGCAATTATGGCA
GTGACTGGTGGACGTTTGGATTTTCAAGGTTTAAACGCTTTTGGACTTTTACTTGGGGTATTATCAGCAA
TAGCATATGCACTTATGCCAACTATTAGTAAAAATGCTTTAAAGGAATTTTCAAGTTCAACAATATTAGT
ATACAGTTTCTTATTTGGAGCTATATTTATGATTCCTTCTTCGAGACCTTGGGAAATCTTAAATTATGCT
AAGGATTTAGATGTTTTATCTTGTATGCTAATGTTAGGCATTGTTCCAGCTGCACTTGCATATATTTTTT
ATGCAGCAGGTATATCTAAAGGTGTAGAGTTGTCAGTTGCAGGTGTTGTGGCATCAGTAGAGTTAGTTGG
TTCAGTAATAATTGGTTGCACTATATTAGGAGAAAGTTTTTCCTTAGGGAAGTTATTTGGAGTGATGTTG
ATGTTAATATCTGCAGTAGTAGCACTTAATCTTTCTTATGATGAAATAAGAATATTTTATAAATCCAACA
AGTTAAAGCAGATTGAAAAAACTGAAAGTATTTAG
>ref|NC_013316.1|:c1496225-1495281 putative radical SAM-superfamily protein [Clostridium difficile R20291]
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GAAATACTTTTGGAGAAAAAGTTTTTAAGGTATCTATAAATGCAGGATTTACCTGCCCAAACATTGATGG
AAGTCTTGGTTATGGCGGATGTACCTACTGTAGCAAAGAAGGCTCAGGTGATTTTGCTGGAAACCCTAAA
GATAATCTTATCAGTCAATTTTATAATATAAAAGAAATGATGTTAAAAAAATGGCCTCATGCAAAGTATA
TTGGCTACTTTCAAGCCTATACAAATACGTATGCTCCTCTTGAAGTTTTAAAAGAAAAATATGAGACTAT
ATTAGAACTTGAAGATGTCATAGGTCTTTCAATATCCACAAGACCTGACTGTTTGCCAGATGATGTTGTA
GAATACTTATCTGAACTAAATAAAAGAACCAATTTATGGGTTGAACTTGGACTTCAAACAATTCATGATT
CTACATCTAAAATTATAAATAGAGGTCATGATTATAAAACATTTGTTGAAGGTGTTGAAAAATTAAAGTC
TAAAAATATAAAGGTTGTCGTACACATTATAAATGGTCTTCCTGGTGAAGATTATAATATGATGATGGAA
ACAGCAAAGGCAGTTGGTAAAATGGGTGTAGACGGTATAAAAATCCATCTATTGCATGTTATAAAAGATA
CTCCTATGGAAAAGATGTTACAAAATGGTATGTTAACTCTTATGGAACAAGATGAATATATCAATCTTGT
CTGTGACCAATTAGAAATACTTCCTGAAACTATGATAATCCATAGACTCACTGGTGATGGTAAGAGGGAT
GAACTAGTAGGTCCTATATGGAGCCTAAAAAAATGGGAAATTTTAAATCAAATTGATGATACTTTAAAGG
CTAGAAATTCTTATCAGGGCTGTAAGTTTGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1496929-1496336 hypothetical protein CDR20291_1262 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTCTGTTATAATTGTTCTATCGATTTTGGAGGTGATTTTATGTACACAAATTTTAATATCGATT
TTAATAACTTTAATAAAAAAGAAAATGCTACTAAATTTATGTTAATGGGAGTATTGCTCATTATCTTAGG
ATTATTATGCCTTACATTTAAGACATTAGGTATAAAATTAATTTCTTGGACTTTTGGTATTGCACTTTTA
TTCTTTGCATATTTAAATTTAAAAAATATTAATGAACTAAAAAGATATGCTACTAAAGAAGAAATTAAAC
CCTCTATTAATATCCAATGGGTTCTAATAATTGCATGTATATTACTTTTTGTATTTCCTCAAAAAATACA
AAGCATATTTTCATTATTTTTAGGGTTTTATTTAATCTTTAATCAACTAGTAGCACTTGTAAATAGTAAG
AATAATCCTTATTCTAAATTTACAACTTGGAATATAGTTAAGATTCTATTTGGTATATGCCTTATATTAT
CTCCACTTTTTTTATCTAGATTTATAGTATCGATAATGTCTTTTTTCATAATATTATTTGGACTAGTTCT
ATTTTTCTCTGGAAATACAGCGAGAAAATATTAA
>ref|NC_013316.1|:1497036-1497464 hypothetical protein CDR20291_1263 [Clostridium difficile R20291]
ATGACAAAATTATGGGCAATAATATTTGCATTATTAGCAGGTGGTTCTACAGCTCTTGAAGCTTTTATAA
ATGGAGAACTAGGAAAAAGTACAACAGCATTAGTGGCCACCTTTATAAGTTTAACTGTAGGAGCAATATT
TTTTTTGGCAAGTATAATAGTTACAGGTGACTTAAAGTGTCTAGTATCTATAAATGGTTTTAATTATAAG
TTGTTATTAGGAGGAGTATTTGGAGGTTTAATAATATATTTTACAGTAAAGGCAATTCCAAATTTAGGAG
TATCAAATACACTTATATTAACACTTGTATCCCAAGTTTTAGTTGGATTTTTTATTGATAGCGTAATTTT
GGGACAAGAAACAATGCATTTATACAAATACATAGGGGTTATACTTTTAATATTAGGGACATTCTTTATA
GTGAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1497531-1498199 putative ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAGGTGTTAAAATTGGCTGATGAAAAATTTGTAATGTCATTTAGTGGTGGTAAGGATAGTATAT
TAGCATTAAATCGAATGTTGAAAAAAGGATATAAGCCTGTGGCACTCTTGACAACTATAAGTGAAGAACA
TGGAAAGTCATGGACACATAATTTAGAATATAATATGCTTAAGCAAGTAAGTAGCAATATAGGATTACCT
TTATTAGTTGCTGAGTGTGGTGTAGAAGGATATGAAGAGAGCTTTGAGAGGGCTTTAATAAAAGCTAAAA
ACATGGGAGCAACGATATGTGCATATGGAGATATAGATATAGAAAGTCATAGAAAATGGGATACTGATAG
ATGTGAAGCAGTTGGTATGAAAGTAGATTTACCATTATGGCAAGAGAGTAGAGAGGATTTAGTATATGAA
TTTATAGACAGTGGATTTTGTAGTGTTGTAACAAAAGTAAACTTAAAGCACTTAGGAGAGGAATTTTTAG
GAAAAAAATTAACTAGAGAACTTGTGGAGAAGATAAAAAATGCTGGTGCAGACCCATGTGGAGAACATGG
AGAGTATCATACATTTGTCGTAGATGGTCCAATATTTAAAAAACCTGTAGAATATGAAGTAAAAGGAACT
TTAATAAAAGATGGCTATGGATATTTAGAAATAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c1499672-1498317 putative drug/sodium antiporter [Clostridium difficile R20291]
ATGGATACAAAAATATCTATAAACGAAAACATGAGTCTAGGTAAAAGATTTTTTAAATACCTAGCACCAT
CTGTAGTTGCAATGTGGGTTTTCTCACTATATACAATGGTTGATGGAATATTTGTAAGTAAAGGAGTTGG
AGAATTGGCTTTAGCTGCTGTCAATATATCAATGCCTTTTATTAATTTTATATTTGCAGTTTCTCTATTA
TTTTCAACTGGTGCATCTACCATAATTGCAATCTATCTGGGGAAAAAAGATATTAAATCTGCTAACGAAG
TCTTTTCATTTAACTTAGTATCAATAATTATATTATCAATAATTATATTAGCTATAACTTTTTTTAATTT
AGATAGATTAGCACTATTTTTAGGAGCTACAGAATCTACAATTGGTATGGTTAAAGATTATTTAGGAATA
ATAATATTTTTTAACGGATTCTTTATAGTGTCTTATTCTTTAGAAGTTATAATAAAAACTGATGGCTTTC
CAATATTAGCTACTGTTGGTGTAATAATATCTGCTCTTACAAACATCATACTTGATTACTTGTTTGTAAT
TGAATTTGGATGGGGTGTAAAAGGTGCTGGTATTGCAACTGTTTTGTCTCAAGTCTTTTCTACTATTTTC
TTCTTAATACATTTTTTAAGAAAAAACTCTACTTTGAATTTTTCAAAATTTAGAATTGATTTTAAGACAC
TTAGAAAAATTGTATTTATAGGTTTTCCTGATTCAACTACTGAATTAAGTTGTGGTATAGTTGTTTTACT
TTTTAACTTAAGTCTTACTAAATATATTGGAGAAAATGCTCTTATTTATTATAGTGTCATAAATTATATA
AATACATTAGTACTTATGACTATGATGGGTATAACTCAAGGTATGCAACCACTTACTAGCTTTTATTATG
GTGCAGGAAATATAGATAATGTAAAAAAATTATTAAAAATGGGGATAAAAGCCACAATAATAGCATCAGT
TGCTGTATTTGCAATTTGTATGGCTTTTTCAGGACCAATAGTCTCTTTATTTATACACCCAGAAGAAACA
ATGCTATTCAATGAAGGAGTTCGTGTATTTAAAATATTCTCTATATCTTTCTTATTGGTAGGAATTAATG
TAATAATTTCTGGATTCTTTGTATCAGTAGAAAAACCATCAATTTCTACTGTTATATCTCTTGGTAGAGG
GCTTGTAATAGTTGTTTTAAGTCTAATTTCAATGATACTAATATTTGGTGGACAAGGAATATGGATGACT
ACTATTGTTTCTGAGTTTATATGTCTTATTTTATCATTAGTTTTTCTAAAAAAGAATTTTTCTACATTAG
ACTCTAATCTAAATAAGGTTGCTTAG
>ref|NC_013316.1|:c1504501-1502768 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCATACTCCTAAAAAAAGCACCCAAATTAGCAAAACATATTATAACAAGTTTTTATATAAATCGAG
ATATCAATGAAGTATTAAAATACCTTTGTGAAAATGTTACATGGATTGGACCAGGAGAACAGGAATTTCT
CACTTCTTTTAATGAAATAAAAAATTATTTTTATGCAGGTCAAGATGAAATTCCTTCTTGTGATATAAAT
AATGATGTATTTGAAACTGTAAGTGAAGATGAGAATAGATGTATGGTATTAGGAAGATATACTGTTCGAA
CTAAAGAAAATGCTCAAATGATTTTAGAGGTAAATCAACGTTGTACATTTGAGATAATTGAGGATAGAGG
AAAATTATTAGTAAAGCACATGCACATATCAAACCCTTATGGTGAAATGCAACTTGATGAATACTTTCCC
ACTAAAATTGGAACTCAAAGTTATGATTATTTGCAAAGATTACTAAAGGAAAAAACAGAAGTTATTGAAA
TGATTACAAATAATATCAATGGTGGCTTAAAAGGTAGCAATGATGATAGTACATACTCATTTTTCTATGT
CAATGAGGGATTGCCCAAAATATTAGGATACACATATGATGAGTTCATGGAAATGAGTGGTGGTTCAGCA
GTGGGTGCTGTATATCCACCAGACTTACCTAAAGCACTAGAAGATTGTGAACGATGTTTTGCAAAAGGAC
CTACATATTCATCTGAATATAGAATCCGAAAAAAAGATGGAACATTAATGTGGGTATTAGATTCTGGAAT
GAAATCGTTAAATAGTGATGGCATAGTAAAAATTAATAGTATTATTACTGACATAACCCAACTAAAAAAC
ATAGAATCTGAACTAAAATTAGAAAGAGAGCGATATCGTATTGCTTTGCAAAATATTACAGATATCATGT
TTGAGTATGATATTGAAAACGATACCCTTATAAAATATCAACGTGTAGAAATTGACAAAAAAATTGAATT
AGAAAATTTTGAAACAAAAAATTACTCCAAACTATTAGAATCTGGTAAAATTATTCACCTTGATGATATT
GGAAAACTACTAGAAGTACTTCATGGAAATCTTCGTGAAACAATTGAGATAAGACAAGTAAATTCATTAA
CTAAAAATGAATGGAGATGGATTCGTGTTCAATGTTCAGTTATATATGATAGTGACCATAACCCTATCAA
AACAATAGGCGTTTTAAAAGACATAACTGAAGATAAATCTAAATTAGAAAGCTTAATTAATCAGGCTCAA
CGTGACCCACTAACACAATTATATAATCAAAGAGTATCACAAAATCTTATTGAAGAGTATCTATGTAGTT
CTGATTCCAAAAATAATGATGCTCTATTAGTTATTGATATTGATGATTTTAAAACTGTAAATGATACTTT
TGGGCATTTAGAGGGAAATGAAGTTTTAGTTGCTGTATCAAAAATACTATTACATAACACACATGATAAA
GACATAGTTGCTCGAATTGGTGGAGATGAATTTACAATATTTATAAAATCATTAACAAAGGATTTAATAA
TAAAAATTACTAATGATATTTTAAATGATGCAAGTAAAATAAAAGTAAAGGACAATCATAAAATAACATT
AAGTATTGGTATTGCCTTCACTGATGATTCAACTAAATTATATAAAGATTTATTTTCTAAAGCTGATAAA
GCTCTTTATCTATCAAAAGCAGATGGCAAAAATTGTTATAGTACATACGAATGA
>ref|NC_013316.1|:c1505586-1504741 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAAAGAAATTTTTTTAAGAACTTTTCCAGGATTTCTAATTATAAGAGATTCTAACTACAGAATTA
TATTTATAAATGATAATTTAAAAAATTTAATTAAAAGTTATATGCAAGATAATCCACTTGGAATGACTAA
TATAGAAATAGCTAAGAAACTCCCTGATAATATTGCTAAATTTTTTACGGATTCTCACAATATTCAATTA
GATTGGGAAAAAAATTATCCTTATGATAAAATTTCAAATTGGATTTTAGAGTTTAAAAAAGATACTACAA
GCTATTGGAATGTTTTAGAATACAAAGTAGATGTTGATGAAAAAACCTACATAATTACTATGGCCAATGA
TATAACAAAACTCTATGAAGAAAATAAGAGAAATCTTCACTACTCAATTACTGACCCATTAACTGGAGCA
TATAATAGAAAATATTTAAATGATAGATTTGACATATTTATAGGAGATTATATTGTACTAATTGACTTAG
ATAATTTCAAAATGATAAATGACTATGAAGGTCATAATGTAGGAGACAAGATTTTATGTGATTTTGTTTC
ACTTTTAAATAAAGAATTAATAAATTCTACTTCTATTATAAGATTAGGAGGAGATGAATTTATTGTTATA
TTCTCTAGTGATGTTGACAAAAATTATGTTTATTCACAACTAGAAGCCTTAAGAGAAAATTTTTTAAAAG
TATTCTCTAAATATAAGTATCTTTCATTTAGTTATGGTGTTGATACAGTAAAAAGAAATTTAAAATTGAC
AATAGTTGAATTGGATAAAAAAATGTATAAAAACAAGGAGAAAAACAAGAAAAAATTTGATAAAAATGAT
TATTAA
>ref|NC_013316.1|:c1507851-1505617 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAAATCATAATTATATAAAAATGTTAAATAAAAAGGTAGAAGTATTATCTAAGGAATTAGATAGTA
GAAATTTTAAATTAAAAACCTTAAATGAAATAGATTTTTTTTCTAAAATACCAAACAGAGAATTTATGTA
CCAATATATTGATGACTGTATTTCGAAAAATATACATATAGGAATCATGTTATTAAATATCGATAACTTT
AAATTATTTAATGATATATATGGATATCTAGTCGGAGAAAATTTATTAATTACTCTAACTCAAAACCTAT
TGCACTTTATTCCAGAATCAAAGGGAATAGTCGCTTATTTAAAAGGAGAAGGTTTTTTAATTGTACTTCC
AAATGTATCAAATAAAGAGTTAAATAATATGGGTGCAACTATTATAGAGAGCTCCCGAGAATTAAAAATA
AGACTTCCTAATGAAAAAGAAATATACTCCAATGTTACATTTAGTATCGGCAGCACTATCTGGAATGGTG
AACCAAACATGACTACTTTGATACTTTTCAACCAAGTATATAGTGCTTTAAAAAAGGCTAAAAGTGAAGG
CAAAAATAGATACATTCTATTTGATTTTAAAGATAATAGTTTTTACAATAAATTAGAAAATGATAAGGAG
TTCTTATCAGAAATATCACATGTTCTACAAACTAAACAAATTGAAGTATTTTACCAACCACTTTATAATA
TAAAAAATAATACTATAGTTGGATGTGAGGCACTTGCAAGATGGAGACACCCTATTAAAGGACTTCTTAC
TCCAGATAAATTTATTCCTTTATTTGAACAGTTTGGTCTGATAACGGAATTAGATTTGCATTTATTTGAA
GAGAACTGTAAAAATATAAGAAGATGGATTGATAACAATGATGTTTTTGTTCCAATTTGTTGTAACTTTT
CTCGTCTTCATTTTTTTAACCCTAATTTTCCAAGTATGCTAAAAGGTATTACTGAAAAGTACAGCGTCTC
TACATCAAATTTTAGCATTGAAATAACAGAAAATATATTAATAGAAAATACAAATACAATTATTCAACAA
CTAGCTGAACTTCGTTCTTATGGTTTTTCTGTATCAATGGACGATTTTGGTTCTGGATATTCATCTTTTG
GTATGTTGCAAAATCTACCTTTTGATATAATCAAAATTGATAGGATATTTTTATCTCATAATTTAAATGA
TTTTAAAAATACAACCATTTTGTACTCTATAATAAACATTGCAAGAGCTCTTGGGATGCTTACAGTATGT
GAAGGTGTTGAAACAGAACAACATGTAGAATTTATTAAAAGTATAAATTGTGATATCGCCCAAGGTTATT
ATTATGCAAAACCCATGGAGTGCAAAGAATTTGAAAAATTACTATCTAAAGAGAATAATTCAGAGAAAAT
GTTTATAAAATATTCTGATATAGGAAAATCTTTAATAGAGAAGATATTTGATGGATTTTTTATTATGCAA
GATATGAAAAAACTAAGAGCTAATGTCACTGAAGACATTCAATGGTTTGATTTTTACAACAAAACTGAAA
TTACATCTTTTCCTAAAGTAATAGAACATTTTGAAAAACATATTAAAGGTAAAAAATTTTCTATTCTTTA
CAAAAGTATAACCCCACATAATACTGAATCAGATTCATTATTAATTAGTGGAGAAGCCGTTTTATCAGAT
GAAGCTTCTGAACATCAAAAATATAGCAATTTCTACTTTAGTGCAAATTGTATAATTTCAGAAAATAAAT
TACTCTTAGCAAAATTACATTTGGATTTAATTAAAACTGCTGGCTATATAAATGAATTTGAATCATATTC
AATACCTAAAATGACAAATACACATCTTGATGAAAGTAATATTTTATCACAATTTTATTCAATGTTGCCT
GTAGGTATAATTCGCTACGATTTATTTGGTGATATGATTATTACTTATATGAATGAAGAAATGTTTGACA
TTATAGGTTATACAAAAGAACAGTTTTTTGGTGAGATGGGCGGAAATTTAAGAGCAATTGTTCATCCAGA
TGATTTAGACTTTGTTTATAAAAAAAGTTTGGATATGATTGACACAAATAAAATTGAACCATTTTTATAT
AGATTCATAAAACGAGATGGTCAAATTGTCACAGTTATGTATACACAATGTAACCTTTCTGCAATTGATG
GAAGGTCGATTGCCCAAGGTATGTATGTAGATGTAAATAAAATAAAAAATTTAACAAAAATCTAG
>ref|NC_013316.1|:1508621-1509430 MerR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGATTACTATAAAATAGGAGAGATATCTAAAATATATGGAATAGGTAGAGATTCATTAATGTATT
ATGAAGAAATAGGCATTCTAAGACCAGTTAGAGATATAAATGGATATAGAATGTATAATATATCAGATAT
ATGGAAATTAAATTTAATAAAAGAATTTAGAAGCTTGAACTTTCCAATGAAGAAAATAAAAGAATACCTA
GATGACAGAAGTATAGAGTCTACGAAAAATATTTTAAATGAAGAACTCGATTTAATTGATAAAAAAATAG
CTGAATTTATAAGCCATAAGGAAAATATTATAAAAAGATTGAGTTCGATTGAAAGTGTAATTCAAAATAC
AAAAATAGATGAGATAGAGGTTGTATATATAGAAAAAAGAAAAGCTTTAGAATTAAATGCTGATATAAAG
AGGGATGAAGACTTCGATTTTTTAATTCAGAAACTTCAGAAAGAATATGAAGATAGATTTAATATACTTG
GAAACAACAATATTGGTTCTGCCTTTTCTACTGAAGCAATTAATAAAGGTATATTTAATGAGTTTAAATC
TGTATTTTGTTTTCTGGAAAGTAATGAGAAAGTATATAATATAGTTTTTGATGAAGGATATTATGTAACT
TTAAATTATACTGGGAGTAATTCTAATAATAAGATGTATATGGAGAAGGTGTTTAAATTTATAGAAGAAA
ATAATTATAAGATAATTGCTGACCCTATAGAAATCTATAAGATAGATATACATGAGACTGGAATTGTAGA
AGAGTTTGTAACGGAAATTCAAGTTCCTATAACTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1509575-1509814 hypothetical protein CDR20291_1270 [Clostridium difficile R20291]
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AAACTATTGGATTAAAATATAGAGGAGATGGAAAATTAGATAAAGTTATAAATAAAACTTTTCCAGTACA
ATCTACTATATATTCAGATTTATGTTTAGATTGTGGCGAAATAGTTAGAACCTATATAAAGGATAATACT
GATAGGAATTGGTGTAAAGATAAGAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c1510178-1510002 hypothetical protein CDR20291_1271 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAGAGATGAAATGGATAAATGTACACACATGTTAACTGCTTATATTAGTAGTTTATATGATTATT
GTGATTTTATAGATACACAGCTAGATGATTTTATACTAGAGTACGGAGAAAATGTAGTAGAATCTTGTTT
ACATCAAGTGATGGTATTGGTAAGTAAGTATAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c1511357-1510683 hypothetical protein CDR20291_1272 [Clostridium difficile R20291]
ATGAACCATCATATATTGATTCAATTTGAATATATAGCAAGAATCATTACTGCTGGTTTCTGTGGGGCTT
TAATTGGATATGAGAGAAAGAATAGACTAAAAGAAGCTGGAATACGCACTCATTTTATAGTGGCATTAGC
TTCAGCACTTATAATCATTGTTTCCAAGTATGGATTTAATGATATAGTGGGTACTCCAGGTATTGGTCTA
GACCCAGCCCGCGTTGCAGCACAAGTTGTCAGTGGTATAGGTTTTTTAGGTGCTGGATTAATATTTATTA
GAAATCAATCAGTAAGTGGTCTTACTACAGCTGCTGGTATATGGGCAACAGCCGGTACAGGTCTTGCCAT
TGGCTCTGGATTATACTTAGTTGGTATTGTTTCAAGTATCATTATTGTTATTGTACAGATAACACTTCAT
AGAGATAGGAAGTGGATGAAACTCCCTACAGCAGAGCAAGTTTCTCTTAAAATTTCTAACAGCACTGATT
CCATAGAATATATTGAAGGTAAATTTAAAAAATCTAATATTGAAATTATAAACATGAATATTAAACGCCT
TGATGGGGATTGGTTAGAAGTAGTTATATATACTAAGTTACCTAAAGGATATAAAAAAACAAATTTATTA
AAATTATTTAGCGATAATCCTCTTATAGAAACTTTAGAAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c1512131-1511577 hypothetical protein CDR20291_1273 [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTATAGCTTTAATATTGATTGATATTCAAAATGATTATTTTAAAAATGGAAAATGTGAATTATTTC
AATCAGAAGAAACTGCTGAAAATGCTAAAAAAATACTACTGTTTTTTAGAAAAAACAATTTACCAGTTAT
TCATATACAGCATATATCAACAGATAAAACAGCTTCTTTTTTTCTTCCTAATACTCATGGTTCAGAAATA
AATAAAATTGTTTTTCCACTAGATAATGAAGAAATTATAATTAAACACACACCAGATAGTTTCTTTGAAA
CAGATTTGCAAAGTATCCTTGAGAAAAAAAATATTACTAATCTAGTAATCTGTGGAATGATGAGCCATAT
GTGTATTGATACAAGTGTAAGAACAGCAAAGAAACTTCGATACGACATAACTCTAATAAGCGATGCATGT
ACAACGAAGAATTTATCTTGGAATAATATAGAAATTAATGCAAATACTGTACATCAAGTATTCATGGCAT
CACTACAGAACAGTTTTGCAGATGTAAAAAACACAGATAAATTTTTATCTAACTATCACAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c1512574-1512209 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATAAGAGCTGAATATACATGTCCTCTTGAAATTGTACATGACATAATCAAAGGAAAATGGAAAA
CTATCCTTATATTTGAATTAAGACAATCTAATAAAACATTTTCTGAATTGCAACATAATATTTATGGAAT
AAATCAAAAAATGTTGATTCAACAATTAAAAGAGTTACGTGATTTTGGGATTATTGATAAAATAAGTTCT
GCTGGATATCCATTACATGTTGAATATTTTCTTACTAATCGTGGTAAAAAAATGTTAAAAGCAGTGGAAA
TAATGCAAGAAATAGGAATCGAATATATGCTTGAACATGGTCAACAAGAAATTCTAGATAATAAAGGAAT
TTGCTACAATAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1512805-1512939 hypothetical protein CDR20291_1275 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATATCAAGAAAAGCTATGAAAATAATAGAATTAGCACAAAAAATTGCAAATAAGAGAGGTATTT
CAGTAGAAGAAGCTTGGAGTGAAGCAGTAACAGAATATAAAAATAAATACGAACATATTGCATAG
>ref|NC_013316.1|:1513039-1513824 hypothetical protein CDR20291_1276 [Clostridium difficile R20291]
TTGATTGTAAAAATAGATAATACTTTAGAAAAAGAATTTTGGCAATATGTATCACATGAAGAAAGTTTAA
ATTTATTCATAATTGGATACGTTGAGAATTATGGATTTAGCTCTCAATATCAAGATATATGGTCTCAGGT
AGAAGATGGAAATATAACCTCTATAATATTAAAAAATAAGTCAACACTTATAATTTATAGTTTTAAAAAT
AATTTTGATATAGGAGAAATGAAGAATCATATAAAAGATTTAGATGTAGAAAGCATAAGTGGAAAAAAAT
GTGTAATAGATAGACTAATAAGTAAATACAAAGATTTTTATGAAAAACTAGATAATAAATTTTGTGTATT
AAAAGAAATAAAAGAAATAGATTTTTCCAACATGAAGGAGTATAAAATAGAAAATGCTCAGGAAAAAGAT
ATTGATGAAATAGGAAAACTTTTAAATAGGTCAGACTATAAAGTAAGTAAAAATTACATAGAAGAAAGGA
AAGAACATTTAAAAGAGGGAAATGTAAGAGCATATTTTATTAGAAATGATGATACTATGATTAGCACTGT
GTCAACTGGTATGGAAACTAGTTTTTTGGCAATGGTGGTCTCTGTAAGTACAGATAAAAGATATAGGGGA
AAAGGACTTGCAAGTTATATGGTTTACAATTTGAGTAAAGAATTATTGTTGGAAGGAAAAGTTCCATGTC
TTTTTTATAATAATGATGTAGCAGGTAAAATATATCATAATATAGGATACAAAGAGATAAATGAATGGAC
AATTCTTTTTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c1515433-1514195 hypothetical protein CDR20291_1277 [Clostridium difficile R20291]
ATGCATAGCATTAAAGATTACTCTTTATTGCTATGCATTATCTTTTTAGGAGTGATGACATTGAAAACAA
ATAAAATTTCTTTTAATAAAGGTCTATATTACCTTAATACAAATGCCAATTTTAATTTTCAGTTAAACAG
GATTATTATGTGGGATGGGGGGCGCTTGGAAGATATACAAAAAGTTTCCTCTAAAATTGTCGATAGCGAA
AGTTGGAAAACAGAACTTATGTATCTGGCACAAGAAGCTGAACAAGATGGACGCACAGAAAATGCAATTG
CTTACTATCGTATGAGTGAATTTTTTATGTATGATGGTGACCCTGATAAAATATCAGTCTACAAAAAAGC
AACTACTCTATTCTACAACTACTACTCTGAATATTTCTCAAATGGAACTGTACAAATTTTTCATGTACCA
TATGAAAATATCACCCTACCTGTAATGTATGCAAAAGCGCAAGGCGAGGTAAAAGATGTTATATTGCTCC
ACGGTGGAAATGATTCTTACTTTGAAGAATTCTTTTTCCCAATGCTTTATCTTGCGTCACAGGGATTTGA
TATTTATCTTTTTGAGGGACCTGGTCAAGGTGGAGTGATGCGTTTGCAGGGAAAACACTTTACTTATCAA
TGGGAACGTCCCGTTAAGACAATTTTAGATTATTTTCATTTAGAGAATATAACTATTGTAGGTGCTTCCT
TGGGAGGTTTTCTTGCTCCACGAGCAGCAGCCTTCGAAAAACGAATTGAACGCGTGGTAGCTTGGTCTGT
ATTCCCCAATTTCTTAGACATAATAGTTGGTTCACAACCAATAAAAATGCAAAATCTACTTAGACTACTG
CTAAAACTCAAAACAAAATGGCTAGTCAATTTTATAATAAAGCAAAAAATGAAAAGTGGCGATAGTATGG
TGGTATGGGGTTTAAAACATGGAATGTACGCATATGAAGCGTCTACACCCTATGAATATTTTCAGAAAAT
CAAGTATTATCAAATAGATTCTATTGCAAAAAATATAAACCAAGACATTTTGATTTTAGGTGCAACACAA
GATCATTTTATTGATTATAGAACTGTTGGTAAAGAGATTGATTTACTCAACAATGTCCGATCCCTTACAT
TTAGGCTTATGACAGAAGCAGAACAAGCTAGTAACCACTGTAACTGTGGAAATAGCAAACTGGTTTTAGA
TACAATTTCAAATTGGATTATGATGATGAAAATACATGATAGAGTCTAA
>ref|NC_013316.1|:c1516261-1515476 transcriptional regulator, arac family protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAACAAGGAGTTGACAGCTATGACTACCATTTGTGTAATGATTGACCATATATTTTTAGATACAGAGT
ATAGACAACCAACTATCCATAAACATCTTGCAAAACATATTATTATATCACAGTCTGGTAACTTATCTGT
GACGTTTGATAAGGGCGAATCATTACAATGTAAAGGAATTATTATTGATTCCAATGTATCGCATACGGTG
TCAAGTAAAGATAATAAAATGTTGGTTTTCTTGATAGATGATACAAGCATACTCGCCCAAAATATTAGTC
AACACCAATTACTAAATCACTCTTTTTTCGTTATAGATAATCTTATAGTTGAACGAATACAAAATATTTA
TACAGCTTGTCAGGTAAAAGGATTGTCCCAAAGCTATATTGATTTTTCAAAACAAGCTTTCCGTCTATTG
AATTTAAATTATCATATTTCGTCTATTACAGACAGTAGAATACAATGGGCATTGAATCATATTCTAAAGT
CCACACACATTCACAATGAAATCTTTTTTGAGATATGTGCCGAAGTAAAATTGTCCAAAAGCCGGTTTTC
TCATCTTTTCAAAGAACAAATGGGAGTATCACTAAACAGCTATTTGGCTTTATCAAAACTTCGCAAGGCT
TATGAGTTATTGTTAAAAAGTGGAGATATTACCTCAGCTGCTATGGACGCAGGGTTTAGTTCACCGTCTC
ATTTCTCAGCTTCCAGCAAAAAATATCTTGGCATTACTGCAAGTGAGCTTATAGGAAAATGTAAAATATA
TTTTATCCGCCAATAG
>ref|NC_013316.1|:c1517253-1516429 putative exported polysaccharide deacetylase [Clostridium difficile R20291]
GTGAAAAAAGATAGCCTAAAAAAATACATTATGATAGGAGCATTTGCTCTAATACTTTTTGGAATTGCTA
GTATAAATTTTAAATCATTAGATAAAACAAAAACTCAAATTTCTAGTCCAACACTCGACACACATGAATA
TGATTGGTATTTTAACCCTAGGGAGGATGGTAAACAGCCATCACCTATAAAAGAAGCTGATTTTTTTAAA
AAATACGGAGCTTATTATGTAGGAAATCCCAATGAAAAAGTTATATATCTATCATTTGATGCTGGATATG
AAAGTGGAAACACTCCAAAATTATTAGATACGCTTAAAAAACACAATGCTAAAGCTCAATTTTTCGTAGT
TGAAAGTTATATAAAAAGCAATCCAGAGTTAATAAAGCGTATGGAAAAAGAAGGACATTTAGTTTGTAAT
CATTCAAAAAGCCATCCATCAATGGCAGGTATTACAGATTTTGAAAAATTCAAAGAAGAAATTACAAGTG
TAGAAAAAGCATACAAAGATGTTACTGGAAAAGAAATGCCTAAGTATTTTAGACCTCCAATGGGTAAATT
TAGCGAACAATCTTTAAAATATACACAAGATTTAGGATATAAATCAATATTTTGGAGTTTTGCTTATGTA
GATTGGTATGAAAAGAAACAACCTACTCATGAATTTGCCAAAAACAAAATTTATTCAAGAACTCATCCTG
GTGCAATAGTTTTACTGCATCCAAATTCATCAACAAATACTGAGATATTAGATGAGGTTCTTACACATTG
GGAAAAAGAAGGTTATAAACTTAAAACACTTGATTATTTAAATAATAAAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1517474-1520593 putative exonuclease [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAATATAATAAGTGTATTGAATGATGTTGTTTTTTTAGATATAGAAGTTAGTGGATTAGATTGTT
TAAATTCAGAAATTTTAGAAGTTGGAGCTGTCAAGGTTAAAGACTGGAAAATATATACCTATGAATCATT
AATAAAAAACAAATTTGAGGTACCTATAGAAGTATTCTCAGTATGTAAAAATTTAGATAAAAATGATTTA
GAAATAGCTAATGAAATAGAACTGGTGGAAGATAGACTTGTAAATTTTGTAGAAGATAGTTTCATTATAT
GTCATGATTTAAGTCTGAAAAAAAAGTTTTTTGAGTATCATATGCCAAAGTTAAAAAACAAATTTATTGA
TTTAATTGAATTAGCAGTTATTTTAGAACCATATCATAAAGATTATAGCTTAGAATACTTAAAAAATACT
TTAACAAATTGTAATTCTAAAGTGGAAAATAGAGCTTTATCAGATGCTATTGATATAATAAATATTGTAA
ATTGCCTTTTAGTAAAATTTAATAACTATGAAAAAACTACTTTGGAGCCATTGAGTTTTAAAATAAATTC
ATATCTTAAAAAATTTAATCTTCCAACATGGGAATGGAGCAAATTTTTAGAAGAGGCAAATTATGATTTA
TCAAATAATATAAATATAAAAAAAGAATATAATATATTTGACTCAAAAGAAGAAAAGAAGAAGGAAAGAG
AAACCTTAAAAATTTTAAATGAAGAAGAAAAAAATTATGAAGAATTATTAAAATACAAAACTATTTGGGA
GAATAAAGAAGGATTTACATATGAATATAGACCTGGTCAATATGAGCTTACTAAAACAATAAGAGAGTTG
TTTAGAAATAGCGAAGATGAAGAAAAAATTGCATGTATAGAGGCACCAACTGGTATAGGTAAAAGTGTAG
GATATTTATTGCCTGCAATATTAGAGGCTAGAATTAATAAAAAAAGATTATTAATTTCTACTGACACAAA
GGAATTGCAGATACAATTAATAAATAAAGATATTCCAAATGTGTTAGATTCTTTGGGTCTAAATGGAAAA
GTAAGTTACGGATATATAAAGGGAAAAAATAACTATATTTGTATAGATAGACTGGAAGCATATATAGATG
ATTATGAGTCTCAAAACCCTACTAAAGGAGAAATTTTATCTTTAATATTTTTGAAGAGATTAGTTGAAGG
TGGCAAGTATGGAGATATAGAAGAAATAAATTATTTAGTGTTTGACAACTTCAAGGAAATAAGTACCCAC
TTAAGAAATGTAAGTTGTGACCCAAATATGTGCAGACCTAAAAAATGCAAAAAAGATTGTTTATATAAAA
ACAGAATAGAAGAATTAAAAGAAGAACATATAACAGTAGTAAATCATTCACTATTAGCTAAATGGCCGTA
TAAGGATGAAAAACCTTTAGAAAATATAATAGTAGATGAAGCACATAATTTGACTGAAAAAGGATATGAT
TTCTTTTCAAGCATTATAAATTCAAAGTCTTTAAGGTATTTATTACAAGAAATTTATCCTTACGAGTTTA
TTCAAAATAGTAGCTTTATATATAAAAAATATAGTAGAAATATGAGAAAAATAAAGGCTTTTGATAAATT
TTATAATGTATTAAAAATTGGAAGAGAAGATAAACAAAAAATTGCTAGAAGTATAAATCTCATTATTGAA
GAGATAGATTCAATATTAAAGTTTGGTAATTGTAATGAATATAATAATGTAAGTAATTATAATTTAAGAT
GGGAACTGAATTTGCAAATAGATGAAATTGTGGGAAAACTAAAAAAGGATGGTATAGATACTGAAATAAG
TTATAGAGCCTATAGTGAAAAGATAAAGTTGAGTTGTGAGAAAATAATAAAAAATTTAGTTTCAATAATA
ATAATAATTTATAGGAATATTGATGATGATAGTATAGATAAAGAAGCAGATATATATAAATTTGGAAAGG
CAAAGACAAGAGATTTAGAGGATATAAAGATTATATTTGAAATCTTTTTAGAGTATGATGAAAAGGATGA
TTATGCAAGGATAGTTGAAATTGATAAGAATTATAATGACTTTGAATTTCGAGTAGTACCATTAAAAATA
GCAGATTTATTTGAAGAAAATATTTTATCTCAATTAGAAAAAGGAATATTTTTATCAGCAACTTTGAGTT
TATCTGAAAGTATGTCTTATTTTAAAAATACATTAGGAATAGACAGAGTTAAGAATGTGGAAAAGATTAT
AGAACCAATTTTTGATTATAAAAATAGAGTCTCTGTAGTTGGATTTTCTGATATTTGTGAGTACAGAAAT
TCTGAATTTCCAAATGAGATGAGTAAAATTATATCTAATATATCAAAGATTACAGAAGGTCATACATTAG
CTCTTTTTAATAGTAAAGATAGACAAGAAAAAACTTATGAAATATTGAAAAAATACTTACATAGTTTTAA
CTTAGAAATTTATGCTGATAAAAAGGGGATTAGACACCTTAACGATTTAAATAGAAAATGTGTAGTACTT
GGCTCAAAAGGATGTTTTGAAGGCGTAGACATTCCAGGGGATGGTTTGGTTTGTGTAACTTTAGACAAGC
TTCCGAATCTAAATCCAAAAGACCCTTTGTATTTTACTATAATGAAGAAGTATGGTATAGACTACTATAC
TATAAATTATCCTCAAATGACCATAAAGGTAAAGCAAGCTATGGGGAGAATTTTAAGAAGCAAATATGAC
TATGGATGTTTTGTGATTTTTGATGTAGGAACTAATATAAGTGTTTTAAAGAGATTAGAGAAAGATTTAC
ACGATTGTAAAATTTCAAAGGTTAATAGCAATGAGTTTTATACTTATATAAGGCGACATTTAAATAAATC
TAGAAGTTTAATACTAAAATCTGTTATATTTGATACTATAAAAGCGTTGAATGTTGATGCTAAAATGGAT
AACAATGATGTTGATAAAGATATTATAAAAAAAGATATAAATGAAAATATAAGACAAAGAGCTGTAAAAG
GAGAAGTGTACCATATTGATATTATAAAAAAAGATATGAAAGTAAAATATTTTGATAGAAACTATCTTAT
AAATTTAGATATATTTATGAGAGAAGAAGATAAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1520596-1521210 putative ribonuclease [Clostridium difficile R20291]
GTGGGAGTGAGATATTTGGCAAAACAAAAGTTTTATGCTGTGAAAAAAGGTAAAAATATAGGTGTATATA
ATACATGGGATGAGTGCAAAAAACAAGTAAATGGATTCTCAGGAGCTGAATATAAGAGTTTTTCTACTTT
TCAAGAAGCTAAAGAATATATTGATGGGTCAGAAAAATTGAGTTTTCAAGAAGATAAGGAGTTTATAGAA
GCATATGTAGATGGAAGTTATGAACATTCAGTAAAAATGTATGGTTCGGGTGTTGTGATTTTAAAAAATA
ATGAAGTTATAAAAACTTATAGTGAAAAAGGAAAAGAGAAAACTTTAGTAAGTATGAGAAATGTAGCTGG
AGAGATAGAGGCTTCTAAAATTGCAATGCAGTACTGTATTGACAATAATGTTCAAAACTTGATTTTATAC
TTTGACTATGAAGGGATTGAAAAGTGGTGTACTGGAGTTTGGAAAACAAATAAAGAAGGAACTATAGCAT
ATAAAAATTTCTATGACAGTATTAAGAATAAGCTTAATGTAAAATTTACAAAGGTTAAAGCTCATTCTGG
AAATAAGTATAATGAGGAAGCTGATAAATTAGCTAAAAAAGCTATTGGTGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c1523596-1521467 putative bifunctional protein: peroxiredoxin/chitinase [Clostridium difficile R20291]
ATGCCAAATTTGCCAAGTTTAGGGTCAAAGGCTCCTGATTTTAAAGCCAATACAACAAATGGTCCTATTA
GACTCTCTGACTATAAGGGTAATTGGATTGTTTTATTTTCACATCCTGGTGATTTTACACCAGTTTGTAC
TACAGAATTTTTATGTTTTGCTAAATATTATGACGAATTTAAAAAAAGAAATACAGAACTAATTGGTCTA
AGTGTTGATAGTAACAGTTCACATTTAGCTTGGATGTATAATATTTCTTTACTTACAGGTGTAGAAATTC
CATTTCCTATTATAGAAGATAGAGATATGAGAATTGCCAAGTTATACGGCATGATATCAAAACCAATGAG
TGATACATCAACTGTTCGCTCTGTATTTATTATAGATAATAATCAAATTCTAAGAACGATTCTTTATTAT
CCACTAACTACAGGAAGAAATATTCCAGAAATACTTAGAATAGTAGATGCACTTCAGACTAGTGATAGAG
ATAATATAGTTACTCCTGCAAACTGGTTTCCTGGAATGCCAGTGATTTTACCTTATCCTAAAAACTATAA
GGAATTAAAAAATAGAGTTAACAGTTGTAATAAGAAATATTCATGTATGGACTGGTACTTATGTTTTGTA
CCAGATAATTATAATGATGAAGAAGTGAGCAAGAAAATTGATAATACTTGTAGCTGGAAAAAAGAACATA
CTAAAAACATTGAAAATGAATGTAACTGTGAACATGAACATCATGACTACCTGAACAAAGCTCTTGACTG
TAAACAAGAACACAAGACTGATATTAAAGATGATTGCAACCATGAGAAAAAACATACTAAAAATACTAAC
AAAGTTCACAACTCCAAACAAGATAAGTTTAAAGATAAGTCTTGTGATGAAATGAATTTTAACTATGATA
AAGATGAATCTTGCGACAAAATAAATTCTAGCTATAACAAAGAAGATAGTAGTTATGAAGATTTCTATAA
ACATAATTATAAAAACTACGATTATACTAGCGAAAAAAATACTAAAAAAATAGCTATGAAAACTTTAAAA
GATTCAAAAAAATTAGTTAGACCACAAATAACAGACCCATACAATCCAATAGTTGAAAATGCAAACTGTC
CAGATATAAATCCAATTGTAGCAGAATATGTTCTTGGAAATCCAACTAATGTAGATGCTCAACTATTAGA
TGCAGTTATATTTGCTTTTGCTGAGATAGACCAGTCTGGAAATTTGTTTATTCCTTATCCTAGATTTTTA
AATCAATTACTTGCTCTTAAAGGTGAAAAACCTAGCTTAAAAGTAATTGTAGCTATTGGAGGTTGGGGAG
CTGAAGGATTCTCTGATGCAGCATTAACACCTACATCTAGATATAATTTTGCAAGACAGGTCAATCAGAT
GATAAATGAATATGCTTTAGATGGAATAGATATAGACTGGGAATATCCTGGAAGTAGTGCATCTGGAATA
ACATCAAGACCTCAAGATAGAGAAAACTTTACACTCTTACTAACTGCCATAAGAGATGTTATAGGAGATG
ATAAATGGCTTAGTGTAGCTGGAACAGGAGATAGAGGATATATAAATTCAAGTGCTGAAATAGATAAAAT
AGCTCCTATAATAGATTATTTTAATCTTATGAGTTATGATTTTACAGCAGGTGAAACAGGCCCAAATGGT
AGAAAACATCAAGCAAATCTTTTTGATTCAGACTTATCTTTGCCAGGATATAGTGTTGATGCAATGGTGA
GAAATCTTGAGAATGCTGGAATGCCTTCTGAAAAAATCCTTCTCGGTATACCATTTTATGGAAGATTAGG
TGCCACTATAACAAGAACTTATGATGAGCTTAGAAGGGATTATATAAATAAAAATGGATATGAATATAGA
TTTGATAATACTGCTCAAGTTCCGTATTTAGTTAAGGATGGAGATTTTGCAATGTCATATGATGATGCTT
TATCAATATTCTTAAAAACTCAATATGTTCTTAGAAATTGTCTAGGTGGTGTATTCTCATGGACATCAAC
TTATGACCAAGCAAATATACTGGCTAGAACCATGTCTATTGGTATAAATGACCCTGAAGTATTAAAAGAA
GAACTTGAAGGTATTTATGGGCAATTCTAA
>ref|NC_013316.1|:1523820-1524110 hypothetical protein CDR20291_1283 [Clostridium difficile R20291]
GTGATTGGATTGAAAAAAATTCTAAGAATTTTAGTTATCTCCATGATGATATGTTTTGCAATGACTTTTG
CATTAGTGTTAATAAATTCAGTTATGGGAGTACATATAGGATTGGATTATTACTTTTTGATGGGAAGTGT
GCTTACAGTTTGTTTAACAATTGGAATTGTTTTATGCAATGCTAGAAAAATATTTGATAGCAAAGCTATA
CACAAGACAAGAACGAAAACTGTCAGTACTAATAAAAAACAAAAGAGTCATTCTAGGGATATAAAAAGAA
AGATATCATAA
>ref|NC_013316.1|:1524276-1525667 hypothetical protein CDR20291_1284 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTTAGAGATTTATTTGAGAAGGCTGTAGATTTTATTGATGAAAAAAGGAAATCTATAGTTGCGA
TTTCATTATCAACATTAGGTGTAATTGCTTTGATAATAGTATTTTTCTTAAGTAGTAACGAGTTTAGTGT
AGGAAATGAAGCTAATGAGTTGTTAAAGATTATAGAGAAAAGACAGTATTCTATAGCTGTTGATTACTAC
ACAAGTATAGAAAAAAAGTTTTCTGATTCAAAAATGGAAAGGTTTAATAAGTCTGTTTCTAAAAAAATAA
ATAAATTGCTATTAAATAGTGGTGATAAATATTTAGATGGAGACATAAGTCAAGAAAGTTTTATTGGATT
AATAAATACTGTGAAAGAATTAAACAAAATAAGTATAGATGTGGATGACTTATTAGCTCAAGCTGATAGA
GTTAGAGAAATGTATAAAGAAGAAAATACTACTTATGATATTGCCATTAACTACATAAGTACTGTTTCAA
TATTAAATGGTATGGGTAGTAACCTAGATGTATACAAACAGAATATAGAAACAATCAAAGAGTCTAGAGA
TGTTTATGACTCAGCAGTAAAAGACCAAAAAGCATATAAGTATTATGAAGCTATTGAAAAGTATAATAAA
GTATTAAAAGAAGATGAAAAGTATTACAGTATGGCTCAAAATGGGAAAGAACAATGTATTGAAGAAATGT
ATGATTACTATATAAGTAGAGCTGAAGAGGCAAATACTTCTGGAGATTATGAAAGAGCATTACAATATAT
TGAGTATTTAAAAGAAGATTATTCAGATGATGAAAAGGTACAGAGTTTAGAAAAAAAATATAAAAAGAAT
TTATCATTGTATACCTTAACATCTGATGACATTATAAATGTAATAGCTAAAAAAAGTGGCAAAGACAAGG
CAAATCTATCTATAAATTCACTTCCACAAATGATAAAAAATAATAAATACTATTATGCTGAAGTATATGA
GTATGATAAATTAATAAATGAAGTTTTGGTAAGTGCAAAAACTAAAGATTTATATTCGTATAAAGATGGT
AAAAAAGATTACAAAGTAGATTATGGTGATGGATACTTTAGAATATTAGAAGATGGAAGTTATCAATTTG
GTATTACAAAAGATAAAGCTAAGTTTGTGTTAACTAATACTCTTGATGAAAAAGAAAATAAGTATAAAAA
GATTGAGATATTAGATATAGAGAAAGCAGATAGATATGTAAAAAGTAAAAAGAGTTTAGAAGAATTGTTT
GGAAAATATAAAAATATTTATTATTATGCTGTAGTAAATAAAGGCTTATTTAGAGGCAAAGAAGTTTATG
CTATTAATATTTACAATGAAAAAATATATGCCATATCAGAAAATGGACTAAATGAATATTAA
>ref|NC_013316.1|:1525782-1527251 hypothetical protein CDR20291_1285 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAATGTGAACAAAAAGCTAGTTATAGCTATTGGAGCTGTAGCATTAGTAGCAATAATTTTTATAG
GCATAATGTGCATGCAATTTAAAGGGGAGAAAATAGCAAAAAACACATATGTTAATGGAGTAGATATTGG
AAAATTAACTAAATCGCAAGCAAAACAGGAATTAGCTAAAAAATACAAATTAGAGAATGTTGAGTTTAAT
TACAATGATAAAAGTTGGAAAGTAAAGAGCAAAGATTTAAATTTATCTACTGATCTGGATAAAACAGTAG
AAAACGCATATAATTTAAATAGAAAGAGTAGTTTCTTTGGCAATCTATCAAAAACTATTTCAACAAATTT
TGGCAAAAAAAGCAACTTAGTAGTTGTGATAAATTATGATAAAAATAAATTAAAAGCAGAAATGGAAAAA
ATAGCTAAAGAAATAGATGTAGATGTAAAAGATGCTACACTTGATATAAGTGGTGAAAAAGTCAAGGTTA
TACCAGATTCTGATGGTCTTAAAATGGATATTTCTAAGAGTATGGAGAATTTTGATAATCAAACTAAAAA
AGGTAACTATAAAAATGAGTTAGTAGTAAAAGCTACTCCAGCAAAAGTAAAAAAAGAGCAACTTACTAAT
ATAGATACAAATTTAGGTACGTATTCAACAATATTTAAAACTTCTCAAATAAATAGAAGTATAAACATAA
AATTAGCAACAGATAATATAAGTAATGTATTACTTATGCCAGGAGAAACTTTCTCATTTAATAAACATAC
AGGGAAAAGAAGTAAGGAAAATGGATATAAAAGTGCACCTGTAATAATGGAAGGTGAGATGGAAGAAGAT
TATGGTGGAGGAGTTTGTCAAGTTTCATCTACGTTATACAATTCTGTGTTATACGCAGGTTTAGAAATTG
TTAATGTAAAAAATCATACTATACCATCAAGTTATGTTCCAAAAGGAAGAGATGCAACTGTTGCAGATAG
TGGAATAGATTTCTTATTTAAAAATAATCTAAAGCATCCAGTTTACATAAAAAATTACGTTTCAGGAAAT
CAAATTGTTTGCAATATATATGGAAGTGCAGAAGATAAACAAAATATAACGATATCAACAAAATTAGATG
GCGTTTCACAAACTACAATGAAAAGAGTTAATGACCCTACAATGCCTAAAGGTAAAGAAAAAGTAGACAA
AAGTGGAAGAAATGCATATTCTGTATCAACATATAGAACATTTAATGATGCAAATGGTAAAAAAATTAAA
ACTGAAAAAATAGCTAATTCATATTATCCTAAGAAGGAAGGTATTATATTAGTTGGGACTATGGAACCAA
AACCAGAGGAAAAACCAAATACAGACGAAAATAAGAATAATCAAAATACAAACAATCAAAATCCAAATAA
TCAACAAAAACCAGAAACACCACCAACTGATAATAAGCCTAATGAGACACAACCACAACCGCAAGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:1527316-1527909 putative sigma-54-dependent transcriptional regulator () [Clostridium difficile R20291]
TTGAATTTAAATAATATAACGAATTACGTTCAAAGTATTTGCGAGAATATTTCTAATGTATTGGATGTAG
ATGTTACTTTAGTTACAAAAGATTTAACTAGGATAGCAGGTACAGGAATATTCAGAGGTAAAATAGGAGA
GACAATATCAGAGAAGTCAGTGTACTCTCTTGTTTTAAAAGATGGAAAATCCTATGTTATAAATAAGGAA
ATAGAAGAGAACTGTAATAAATGTGCAAATAGAGAAAATTGTAAAGAATTAGCTGATATATGTACTCCTG
TTAAAATGGGAGAACATATACTTGGAATCTTGGGTATAGCTGCGTTTAATGAAGAGCAAAAAGAAAAGAT
ACTTTCAAAAGATAAGGAGTTAACTGCTTTTGTAAGGAGTATGTCTGATTTAATATCTTTTAAACTAGAT
GAACTTTATAAACAAGAAGTTAAGACTATAGATGACCTTGAGAGGGAAGCTATAGAAAATGCCATAAAGA
AATATGGAAGTAATACAGAAGGTATGAAAAAAGTAGCTGAGGCATTAAATATAGGTATAGCTACACTCTA
TAGAAAAGTAAAAAAATTCAACATTAAAAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:1528040-1529437 putative multiprotein complex assembly protein [Clostridium difficile R20291]
GTGGAGGTGAGTATTATTTTAGTTAAAGATATAAAACAAGACATAGAAAGCATGCCTAGAAAAATTTTAG
ATATATCTTTGATAGAAGATAATAAAAGTGATTTGACTTTTTTTAATATAGAAGAAGAAGACGGTGATGA
AACATTAAAAGCATTAAAACAGAGTTATGTGACTACAAATTATAAAGAAGAAACTCTATTAAACTTGCAA
GGAGCTTTAAATTCAAAGTCAGACACAACGTCTAAGGAGTTAAAATTAGAATCATATAAAAGATATAACA
ATGCATTGGATTTAGCATATAAAAATTATATAACTAGTGCCATTAATATGGTTAATAAAGCTCTGGAGAT
AAATCCTAAAGATATTGATATACTAAATCTTAGAGGTCTTTTAAAGTTATTAAAATGTGATTTTGCTAAA
TCATTTGAGAGTTTTTATACTGCTTTATGTTATGAGAATAATCATATATCTAGAAAATATGTAAATCTAA
TTTCATCTGAAGATTTTAAAACTTTTTTAGGAAGATACAATCATTCTATAAGATTTATAAATGAAGAATT
AAATTATGAGTCAATACATATTTTAGAGAACATAATTGAAGAAGAGCCTGAGCTAATAGAGCCATATGTA
ATCTTATCTTTGTTATATGATAAACTAGGTAATGTAAAAAAGAGAGAAGGATATTTAGACAAACTTAAAG
AGCTAGATAAAGATAATCCTGTATTTGAAAAAAATGAAGAAGAAAAAGAAGATACAAGTAAAAAGGAAGA
AATAAGAAAAGTAAAAAGAAAGAAAAGTATTTTACCATATATTATAGTTGGCTGTGTTTTAATAGGTATG
GGGATATATTTGATTCAAAGCAAAAAGAGAATAGAAAACTTGAATAACCAAATAAGTAGTAAAGAGGAAA
AGTTAAGTGAAACTGATAAAAAGTTAGGAGAAACGAGTAAAAAATTAGAAAAAACGAATAAGGAATTAAA
TGAGGTTAAAAATAAAGAACCAGAAAGAGAGATAACTGTAGCTGATGAGGAAGATTTATATTATCAAGCT
CTAAATTTAAAGAAAAACAAAGAATATGAAAAAGCCATAGATAATTTTAAAAGTGTAGTTTCTTCTGGTA
AAACTAAAAAATATATTTCTGAGTCAATATATCAATTAGCAATAACAAATAAATTATTAGGAAATAAGGA
TGAAGCTATAAAATATTACAAAAAATATATAAATACTTATACTAAAAATGACCAGTATTATGATGATTCA
TATTACGAGTTGGGTATGCTTTATTATGATAATGGCGATTTAAAAAATGCACAACAGACTTTTTATAGTT
TGAGAAGTGAAGTTCCAGACAGTATGTATAACAATTCAAAAATAAAAGAAATCTTAAGTGAAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1529619-1529990 hypothetical protein CDR20291_1288 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTTTTCAATCAATTAGTAATAATTTTATCTATCTGGGTAATAGGAGAGTATATAAGTTCCTTTA
TACAAGGAATTATACTTATTCCTGGGAGTATAGTTGGTATGCTATTATTATTTCTACTACTACAATTTAA
AGTTTTAGACTTGAGTAGTATAGAAAATGTAAGTGGATTTTTCCTCGATAATATGGCTATATTTTTTATT
CCAGCAGGTGTATCACTTATAAAGTCATTAGACCTAATAAGGGAAAATGTATTAGTGCTTTTATTAGTCA
TATGTTTAAGTACACTAATAGTAATGTATACTACTGGAATTATTGTGGAGAAAATGATAAAAAAGAAGGA
AGAAGGACAAAAAAATGTATAA
>ref|NC_013316.1|:1529983-1530672 hypothetical protein CDR20291_1289 [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAATGTATTACAGACACCAGTATTTGGTATAATAGTAACAATAGTTTTTTTCAATTTAGGAAGAT
ACATTCAACGAAAAACAAGTAATCCTATATGTAACCCTTTATTAATTGCAATCGTAGGAATAATATTGTT
TTTAAGCATATCTAAAATCCCTTATGAGAATTACAAGATAGGAGCTGATAGTCTAAATTTCTTTTTAGGT
CCTGTCACAGTAGTACTTGCAGTTCCACTTTATAAACAATTTGAATTATTTAAAAAGCATATGTTTGAGA
TTATTGTAGGAATAGGTTGTGGTATAGTGATTTCTTTTGTATCTGTATTGATAATTGGCAAAATAGCTAA
TTCAGATGTAAGTATAATAAATTCACTAATTCCAAAATCTATAACAACACCAATGGGAATATCTTTAGCA
AATTCTTTAAATGGTATAGAATCAATAACAGTTGTAGCCATAATTTTTACAGGTATTTTTGGTGGTATGG
TTGCTTCTACAGTATTCAAACTGGGGAATATAAATCATCCAGTTGCTAAAGGAATTGCTCTTGGAACATC
TGCACATGCTTTAGGAACTACAAAAGCTTTTGAACTTGGAGAAATAGAAGGAGCTATGAGTGGTGTTTCT
ATTGGAGTTTCTGGTACAATTACAGTAATACTAATTCCAATTATAATGAATTTTATATAA
>ref|NC_013316.1|:1531192-1532058 hypothetical protein CDR20291_1290 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTGAAGTTAAGAATACCCTACAAAAACATCCAGTTTTAAGATATTCAACAATGCTATTTGGGATGT
TGATGACATCTATAGGAATAAATGGGTTCTTAAGACCAGCACATCTGCTTAGTGGAGGTGCTACAGGTAT
AGCAACATCTATAAACTATTTGACAAATATAAATGTAGGTTTATTAACATTTTTAATCAATATTCCAATA
TTTATCTTAGGGTTCATATACCTTGAAAAAGAGTTTTGTATTTCAAGTTTGGTAAATATGATTGTATTTT
CATTATTATTAGGAGCAACTCAGGAAATAAGTAATATTATACCTATACATGATATATTGCTTCAAAGTGT
ATATGGTGGTATATTATCTGGTTTAGGAGTCGGAGTTGTATTTAGAACTAGGTCTTCTCAAGGTGGTACA
GATATAATAGCTGCAATACTAAAAATTAAGAAGAATATAGAAATGAAAGACACTGCTTTAGCAATAAATG
GCTTGATAGTACTTACAGGAAGTTTTTTATTTGGGTTGGATTTAGCATTATACACTCTTATAGGTCTATT
TCTAAATGCGTATTCAATGAGTTTTATTAAAGATGCAATGAATTACCAAAAATCTGTTATGGTAATGTCA
AATGAAGTCGATTTAATAGCAGAAGATATAATGAAGAGTTTAGTTAGAGGTGTAACTTTTTTAGATGCAG
AAGGTGCATACACTCATCAAAAAAAGAAGATTATATATACAATAGTTTCATCAAATGAGATACCAAAGAT
AAAAGATATAGCTTTGAAGTATGATAAAAAGGCCTTTATATCTGTAAATGATGTTACAGAAGTAAAAGGA
AGAGGGTTTAAAGCAAAAGATTTATAG
>ref|NC_013316.1|:1532300-1533109 hypothetical protein CDR20291_1291 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTATCTAAAGAATATGTTAATTTGTATGATAATTATTTGAAATATATAAATGAAGTAAACAAAG
AGATTAGAAGTATAAAGAACATGAAGAAACGTGTTTTAAAAAAGGGCGATTTTGCTCCAGAAAATGAAGT
ATTAGAATTGGAAGGAAAAACAATACGCGATATAGATGATGTCGATACAAAAAAACCAAAAAATAAAATA
TATAAATTTTCAAATGGGGATGTGTATGTAGGAAAATTTTTAGAAGGAAAGATGGAAGGGCAAGGATCAT
ATACTTTTTTTGTTGATGAAGGAACGGCTATGGAGTACATAGGAGAGTTTAAAGAAGACAAAAAAAACGG
AAAAGGAAACTTTGTATTTTCAAATGGAAATGAATATATAGGCCATTTTGAGGAAGATATGATGAACGGT
ATTGGAAATATGTTATATAATAGCAAAGATGAATATATTGGAACTTGGAAAAATGGAAAAAAAGATGGAA
AAGGTATTTATAAGTGGAGTGATGGATGTATATATGCAGGTGAATTTAAAGGTGGAAAGATGGAAGGGTA
TGGTATTTGCTATAATAGTAAAGGGGAAGTACTTTATGAAGGAGAATGGAAGAATAATTTGATTCATGGT
AAAGGAACTTATATATGGGAAAAAGGTAAAAAGTATATAGGTGAATTTATGCATGGTAAAAAACATGGAC
AAGGAACTTTTTATCTAAATAATGAATTGGTTTATGAAGGGACTTGGAAATTTGATAAGCCATCCATCTT
CGACAGAACATTAGATGAAATATTTTCATTAAGACTATAG
>ref|NC_013316.1|:1533228-1534316 hypothetical protein CDR20291_1292 [Clostridium difficile R20291]
TTGATTTTAAGAAGGAGGGATATATTGAAGAGATTAATTGCTTTAGTGTTAGTAATACTTATTGTTTTAT
TTTATAGCCCTGAATTGATAGAAGAAGGATATGATTTAAAAGAAAAATTTTTTCAAAGTGAAATATGGAA
TGAATTTTTAGACAAAATAAATATAAATAATAATTCTAAGAAAGATAAAAAAGAACAAAATCAAAATTTA
CAATCAAATAATACTGAAGGGGAGAACTTAGGAGAGTCAGATATAAAGAATTTTGAAAAAATAAGCTTAG
GAGATAATTTAAGCTATGTTTTATCAAGTATTGGTAAACCTGGTAGAATTGATATTAGTGAATATGGTTT
TGATTGGTATGTATATAATCAATATGGAAAAGAATTTGCAATGGTCGGACTTGAAAATGATGAAGTAGTA
GCACTTTATAGTAATTCTATTAATTCATGTGAAAATCAAGATATAAAACTAAATCAAGATAGACAAACAG
TGAGAACTAAGATTACACCATTAAAATATAAGAGAAAAGGAAATACCAGATATATAATAAACTCAGAAAA
TCAATATGATATAATAAGTAAAGAAGGTAAGTATATTACAATTTTCTACGATATTCATGAAGAAAATAGA
GTTTGCTCATATTTAATAATTGATAAAAGTACTGAAGATGAGTTTAAAAAATTATATCCAGATGATAGAG
AAGAACTTAAAAAATGTTTTGAACTTGAAGTTATAGACCTTGTAAATAGTGTTAGAAATCAAAGAGGATT
AAACTCATTGAGATACAGTGAACAGGCAACTTTGAGTTCAAGAAAACATAGTGAAGATATGAGAGATAAT
AATTTTTTTGACCATATAAATAAGAAGAATGAAACTCCATTTGACAGAATGAAAAGAGAAGGTATAGTAT
ATACTTCAGCTGGAGAAAACATAGCAGCAGGACAGATTAATGCAATATATGCGCATGAAGCTTGGATGAA
CTCTGAAGGACATAGAAAAAATATTTTGGGGAACTATAATAATATTGGAGTTGGAGTAATATTTGGAGGA
AGCTATAAAACATATTACACTCAAAATTTTTATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1534344-1535063 putative exported polysaccharide deacetylase [Clostridium difficile R20291]
ATGACATCATGGAAAAAAAAGACAGTATATAAGTGCTTAATAGCAGTAGTCTTGTTTTGTGGAATAGTGT
TAATATCTAATTTTAGTAAAGTTTCTGCTTTGATGATGGATACTAATGGAAATGTTTTGATTAAACATGG
TTCAAGGGAAAAAAAGCTAATAGCAATTACCTTTGATGATGGTCCTCATCCTAAAGAAACTAGTCAAGTT
TTAGATGTATTAAAGAAATACAATGTAAAAGCTACTTTTTTTATAGCTGGAAAACATGCAAAATGGTATA
AAGAACCATTAGTAAGAGCAAGTAAAGAAGGTCACGAGATAGGAAATCATACTTTCAATCATCCTGATAT
AAGTAATTTAAGTTCTAGTCAGATAGAAGAGGAGATTGTTAAGTGTGAAGACATTTTGAAAGAAGTAACT
GGAAAAAAACCTACATTATTTAGACCACCATTTGGAAGTTATAGAGAAAAAGACTTAATAGAAATTGCAA
AAAAGCATGACTATAAAGTTGTTTTATGGACAGGTGTAGATGTGAAAGATTGGAAAAATCCAGGAGCTAA
TAGCATTGCAGATAAAATAATTAATAAAGTAAAAAATGGAGATATAATACTTTTGCATGATTATGCAACT
AATGATACAGTTGAAGCTTTAGATATGTTTATTCCAAAAATGATTGAAAAAGGTTTTAAATTTGTAACAG
TTTCTGAGTTGATAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1535087-1535671 para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase component II [Clostridium difficile R20291]
ATGATTCTTATGATAGACAATTATGATTCTTTTGTATACAACCTAGTCCAATATATAGAAGAATTAGGGG
AAGCAGTTGTAGTAAAAAGAAATAATGAAATCAAAATAAGTGACATTGAAGAACTAAATCCAGAGGTAAT
TGTGTTATCTCCAGGACCGTGTTCTCCAAAAGAAGCTGGTATTTGCATAGATATTGTTGAGCATTTTAAG
GGGAAAAAACCTATACTAGGAATTTGTTTAGGTCACCAAACTATTGGATATGTTTTTGGAGGAGATATTA
TAAAAGCACAACAGCCTGTGCATGGAAAAGTATATAGTATCAACCATACTAATAAAGGAGTTTTTAGGGG
ACTTAAAAATCCTTTAAATGTCACTAGGTATCATTCACTAATAATTGATTCCAATACAGTTCCAAAAGAA
TTAGAAATTACAGCAATTACTGATAAAGGGGAAATAATGGGGATTAGGCATAAGAAATATTTAATAGAAG
GAGTACAGTTTCATCCAGAAGCTATTTTGTCAGAGTATGGTCATGAAATGCTTGAAAATTTTATAACAGA
AGCTAGAGAAAGGGTACATATGTAA
>ref|NC_013316.1|:1535673-1537022 para-aminobenzoate synthase component I [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAGAGAGATAAATACTAAATTAAATTCTTTTGAGATATTTACTATTTTTAGAAATGAACATGACA
GTTTTATATTAGACAGTGCTATGGATAAAGAAAAATTGGGAAGATATTCTTTTATAAGTAGCCAACCATT
TAAGGTATTAAAGTATAAGGATACTGATGAAAATCCTTTAGAAGTTTTAAAAGAAGAACTACATAAGTAT
AGGGTTGTAAATGATACTAATCTTCCATTTGTAGGAGGTGCTGTGGGATATTTATCTTATGATTTAGGTA
ATTACATAGAAAATTTACCTAGAACTGCTGTAGATGATATTGAGATGCCTGATATGTATTTTGGATTTTA
TAATCATGTAATAGTTATAGACCATCTTGTGCAAAAAACTTATATAGCTACTCCAAACATAGATATCGAA
TTAGAAGAAAAGATAATAGATGATATAGAACAAAGAATATTAAAAGAAGAGAAAAAAGGTATAGATAGCA
TATGTTATGAAGAAAAAGAAGTAACACCTATAAGACTTAAATCTAATTTTACAAAGGAAGAATTTAAAAA
TGCAGTTCAAAGTGTTAGAGAGTACATAAGACAAGGAGATATATATCAAGCTAATTTAACACAAAGGTTC
AGTGGAGAAACAGAACTTACAAGCTTTGAATTGTATAGGGACTTAAGAAGATTTAGCCCAGCACCATTTG
GGGCATTCTTAAACTTTGAAGATACACATATATTATCAAATTCTCCAGAAAGATTTATAAGATGTGTTAA
TAAGAGAATAGAAACTAGACCAATAAAAGGTACTCGTCCAAGAGGGAAAGATAAAGAAGAAGATTTAAGA
CTTCAACAAGAACTTAGAAATAGTGAAAAAGATAGAGCTGAACTACTTATGATAGTAGATTTAGAAAGAA
ATGATATTGGCAGAATATCTAAAACTGGAAGTGTTAAAGTTCCAGAGCTATTTGTAATTGAACCATATGC
AAATGTAAATCACTTAGTTTCCACAGTTGTAGGTGAGTTAAAAGATGATAAAGATGCTACTGATGTAATA
AAAGCAACTTTTCCAGGGGGGTCTATAACAGGAGCACCTAAGATTAGAGCAATGGAAATTATAGACGAAT
TAGAGCCAACGCAAAGAAATGTATATACTGGTTCAATAGGTTATATAGGTTTTAATGGTGATATGGATTT
TAATATAGCAATTAGAACAATAATCAAAAATGACAAAAAAGTCTATTTTCAAGTTGGAGGAGGAATGACT
TGGGATTCTGACCCAGATGAAGAATATCAAGAAACACTTGATAAAGCTAAATCCATAATGAAGGCTTTGA
GGGGATATTATGAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1537012-1537755 putative aminodeoxychorismate lyase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAATAATGTAGGTTTTGATAGTAGTTTAAGTAAATTTGGAATTGGTTTGTTTGAAACTATTAGAG
TTAAAAATGGAATAGCAGTAGATTTAGATATCCATATAGAAAGAATGCTAAGTTCAATAAATTGTTTGGA
TTTAGATATAAACTATAAAAAAGATTTCTTGATAAATGAAATTGTTACATATATAAAAAAAGAAAATGTC
ATTAATAAAGCACTTAGAATTACTGTTTTTGATGAAGGTTATAATATATCTATTAGGGATATTCCATATA
ATCAAGAGACGTATGAGAAGGGGTTTAAATTAGCTATATCGCCAATAGTTAGGGGGAATAGTTTAATTCA
TAGACATAAGACTACTAATTATTTTGAAAACATATATACCAAAAATATCGCAAATAAGACTGGTTATAAT
GATGGTATATTTTTAAATTCAGAAGGTGTAATATTAGAATGTTCTATGAGCAATATTTTCTTTATAAAAG
GAGAAAGAGTGTACACTCCTAGTGATAGATTACCGATATTAAATGGAATAATAAAAAAAAGGATTATAGA
GATTTGTGACGAATTACATATAGAGTTGATAGAAAATGAAATTAATATATCAGAAATTAGTAGTTTTGAT
TTTGTTTTTGTCACAAATAGTCTTATGGGCGCTATAAAGGTTACAGAAATTGACAAAATAAAATTTAATA
AAGAAAATGTTGTTTTTGATAAAATAGTGAAGTTATTAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1537789-1538490 hypothetical protein CDR20291_1297 [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGGTTGTATTTATGAAGTATACAATGAAGAGATGACTAAAATAATAGAAAACCAAAACACTTTGG
CTGTATATTTAGTAGGTTCTAGTAAAGACGTAGATTTTACTCTTTATGATGTAGAGATAAACGATATTGA
TGTGTTCGTTTTTGTAAAAGAAGGGGAAAAACAAGAGAGAATACTGTTTAAAAAAAAGGGAATAGAATTT
GATGTAAATTACTTTTCAAAAGATGGTGTAAAAAAATTATTATCAAATAGGGAATATTTCTTTGTGAAAG
AAATGAAAGATGCTAAAGTACTGTTTGATAGGGAGAATATATCAAATATTATAAAAGATATAAGTAGAGA
TATTTACTTAGAAGGACCCAGTAAAATGTCATTAGAGGAAAAGTCTTTTATAAAGCAAGATATTGGAGCA
AAAATATCGAATTTAAAAAATAAAGAAAAATTTGATGTTTTTGAATATCATTTTTTGACGAATTTATATT
TAAAAGATATAATAATTGGGTACTTTAATATAAATGATAAATGGGTACCAAAAGACAAAAAATTGCTAAA
AGTTTTAAAAAAAGAAAATAATGAGCTTTTTGAACTAGCGTCAAAAGTAAGTGAAAATTATGACTATCAA
AGACTTTTAGATGTTTATAATTATATTTTTAAAGAAATTGAGACAAAAGAGGTTATAAAACTAATCTTCT
AG
>ref|NC_013316.1|:1538516-1539088 putative GTP cyclohydrolase I [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAGTTGATAAAGAAAAGATACAACATGCAGTAAGAGAAATACTAGAGGCAATTGGAGAAGACC
CAGATAGAGAAGGTCTAATCGAGACTCCAAATAGAGTTGCTAGGATGTATGAAGAGATATTCTCTGGTCT
TAGTGAAGAACCAAGAGACCATTTAAAAGTTCTTTTTGCAGATGAAAAACATGAAGAATTAGTATTGGTA
AAAGATATTCCATTTTATTCATGTTGTGAGCATCATCTAGTTCCTTTCTTTGGAAAAGCTCATATTGCTT
ATTTACCAAAAGGAGGAAGACTTACAGGGCTTTCTAAACTTGCTAGAGTAATAGATACATTGGCAAAAAG
ACCACAATTACAAGAAAGAATCACTAAAAATGCTGCAGATATAATAATGGAAGAATTACAACCTTATGGT
GTCTTAGTAGTAGTAGAAGCTGAACATATGTGTATGACAATGAGAGGTGTAAAAAAACCAGGTTCAAAAA
CTGTTACATCAGCAGTGAGAGGAATATTTGAAAAGGACATTGCGTCTAGAGCCGAGGCTATGAGTTTGAT
TACTATGAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:1539142-1539945 dihydropteroate synthase [Clostridium difficile R20291]
GTGTCATTAATTGTGTTTGATTATGGTAAAAGAACTTATATAATGGGAATATTAAATGTAACTCCAGATA
GTTTTTCTGATGGAGGAGATTTTAATAACTTGGACATAGCAATACAACATGCAAAAGATATGGTTGACCA
AGGTGCAGATATAATAGACTTAGGAGGAGAGTCTACACGCCCAGGTCATAGCTATGTAGACTCAGACGAA
GAGCTAAGAAGAGTAATCCCTGTAATAAAAAAACTTAAACAGGAATTGGAGATACCAATATCAATAGACA
CTTATAAGGCAGATGTTGCAGAAGAAGCATTAAAATTAGGTGTCACTATGGTAAATGATGTTTGGGGTCT
TAGAAAAGATAAAAATATGGCTTCTGTAATAGGAAAATATGATGCAGAAGTGTGTATAATGCATAATCAA
GATGGGACAAACTATGACAAAGATATAATGGAGTCAATAAAAGACTTTTTTAAGGTAAGTATAGAAATGG
CAATGAGTTGTGGTGTAAAAAAAGAAAAAATAGTACTTGACCCAGGCGTAGGATTTGGCAAGGATTTTGA
ACAAAATATTGAAGTATTGAGAAGATTAAATGAATTAAAAGATTTAGGGTATCCTATTTTGCTTGGGACA
TCCAGAAAATCAGTAATAGGAAAAGTACTTCCAGTTGAGCCTAAAAAAAGATTAGAAGGTACAATAGCTA
CTACTGTTCTTGGTATAAGAGATGGCGTAGATATAGTTAGAGTACATGATGTTTATGAAAATTTAATGGC
AGCTAGAATGACTGATGCAATATATAGAAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:1539956-1540321 dihydroneopterin aldolase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAAAATATTACTTAGTAATCTAGGATTCTATGGATATCATGGTGTTCTTAAAGAAGAAAATTTTC
TAGGTCAGAAATTCTTTGTCGACATGGAACTTTATATTGATTCAAGAGAAGCAGGTCTTAGTGACGATAT
AAATAAATCTGTAAGCTATGCCGAGGTTTACAATGTTGTTAAAGATATTACTGAAAATAAACAATTTAAT
CTTTTGGAGGCTTTAGCGGAAAATATTGCTGAAGAAGTCTTGAATAAATTTATACTTATAAATGGAGTTA
TGGTCAGAGTTAGAAAGCCTGAGGCTCCTGTAAATGGTATTTATGACTATTTTGGTGTTGAGATAAGGAG
AACAAGAGATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1540314-1540820 2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridi ne pyrophosphokinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAGGCTTATTTGGGAATAGGTACTAACATGGGTGATAGATTTGATAATTTATCAAGAGCATGTG
AACTTTTGAAAAATAGTGATTCTATATATAAAGTAAAGGAATCAAGTTTATATGAAACAAAACCATGGGG
ATATACAGAACAAGCAGATTTTCTAAATATGTGTGTAGAAATAGAAACAGAATTTGAACCTTATGAGTTG
TTAGAATATTGTCAAGAAATAGAGAGAGAACTACACAGAGAGAGAATAGTTCATTGGGGACCAAGAACTA
TAGATGTAGACATACTATTTTTTAATGATGTAGCTTCCACTGATGAAAGACTAACAATACCTCATCCGAG
GATTCAAGATAGAGCTTTCGTTTTGATACCACTTATGGATTTAAATGAAGAACTTATAATAAATGAAAAA
ACAGTAAAAGAACATTTAAACCTCCTATCTGCTGAAGAAAGAGAAGAAGTAAAGGAGCTTGTAGGTTATG
AAAGAAAACCTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:1540801-1541586 putative chorismate biosynthesis-related protein [includes: phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase and chorismate mutase] [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAAAACCTATTTAATAATAATTCAAAGATAGAGATAAATACAAATAACAAAAAGATAACTGTAA
AAAAAGATAAACTTATAATAGCTGGACCATGTGCAATAGAGAGTTATGAGCAACTTTTGGAGACTGCTAA
ATTTGTAAAAAGTCAGGGAGCAAATATTTTAAGAGGAGGAGCGTACAAGCCAAGAACATCGCCAAATTCA
TTTCAAGGATTAAAAAAAGAAGGTCTTAAAATATTAAAAGCAGTTAAAGACGAAGTTGGTATGGCTGTTA
TTACAGAACTTATGGATGTAAGAGATATCGACGAACTGTATAGTATAAGTGATATAATTCAAATTGGTTC
AAGAAATATGCAAAACTTTACTCTTTTAAGTGAAGTGGGAAAACAAAATAAACCTGTTATGTTAAAAAGA
GGAATAGCATCCACAATTACTGAATGGATAGGTGCTTCTGAATATATAGCAATAGAAGGAAATAGTAACA
TTATAATGTGTGAGAGAGGTATAAGAACGTACAATGATTATACTAGAAATACATTAGATTTAGCTGCGGT
ACCCATTATTCAAAAGGAAACAGGTCTTCCTGTTGTGGTAGACCCAAGTCATGCCACTGGAGTTAGATAT
TTGGTAAAACCTATGTCACTGGCATCTTTTGCATGTGGAGCAGATGGAATAATGGTAGAAGTACATCCTG
ACCCAGAAAATGCTTTGTCAGATGGTGCTCAATCTCTTTGTTTTAATGAATTTGAAGATTTAATGAAATC
AATTAATAATTATTAA
>ref|NC_013316.1|:1541805-1543631 DNA primase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAACACAAAAAATTACACCAGAAGGTGATAATATGAATGATATAAAAGACATTATTGAAGAAATAA
AAGCTAGATGCGATATAGCAAGTATAATATCTGAATATATGAATATAAAACAATCTGGAGCTAATTACAA
AGGGTTATGTCCATTTCATGGTGAAAAGACACCTTCTTTTTATATAAATACATCAAAACAGATTTATAAG
TGTTTTGGTTGTGGTGAAGGTGGAGACGTAATAAATTTTGTCATGAAAATGGAAAATTTGGATTTTATGG
ATGCTGTAAAAATTTTAGCAAATAAATGCGGTATAGAAATTAACACTAACATGAATGAAGAAACTAGGAT
TAAAATAGAAAAATCTAAGAAATTTCAAGATATCCATACGGAAGCAGCTAGATTTTATCTTTCAAACTTA
TTGGGAAGCAAAAATCTTGGGTATGAATATTTAAGAATAAGAGGACTAGATGATAAAATTATTAAGAAAT
TTGGTTTAGGATTTTCTTTGGATTCATGGAATTCACTTATGAATACTCTAATAAGTAAAGGATACAAAAA
ACAAGACTTATTGGATTGCGGTCTAATTGCAAAAAATAGAGATGGAACTAATTGCTATGATAAATTTAGA
AATAGAGTTATGTTTCCTATATTTGACTATAGAGGAAACATAATAGGATTTGGGGGAAGAGTATTAGATG
ATTCTTTGCCAAAATACTTAAATTCTCCAGACACATTAATTTTTAATAAAAAACAGAACTTATACGGATT
AAATTTTGCTAGAAAAAATTTAGAAAGTAAAACTATAGTCTTAGTTGAAGGATATATGGATTTAATTTCG
CTTTATCAGTATGGTATAAAAAATGTAGTAGCAACCCTTGGAACAGCCTTGACTGAACAACAAGGCATTT
TAATAAAGAGATATGCGGACACTGCTATTATATCTTATGATTCTGATGAAGCAGGAATAAAAGCGACTTT
AAGAGCTATAGATATACTTACTAAATTAGGTATCAATGTAAAAGTGTTAGACTTAAAAGATGCTAAAGAC
CCAGATGAATTTGTAAGAAAATACGGACTTAGTGATTATAAAAAAGCTATGGATGTTTCTACTCACTACA
TAAAATATAAAATAGATCATCTTAAAAAAGAATTTAACATTCAAAAAGATGAAGAACGAGTGAAGTTCGC
AAAAGAAGCTTCTAAAATTATAAAACAATTGACAAGTCCTGTTGAAATTGATTTTTATACAAAGTATTTA
AGCAATCAAATAGATATTAATGTCGAGTCTATAAAGAGAGAAGTTTATGGCAAAAATTACAATAAGCCAT
ATAATAACAAAAATCAAAAGAAAATAGAAGAAAAAGTAATTGAAAAAGTCGAAGTCAGACAAGACGGAAA
ACAATTAGTTGAAGAAACTCTAATAAAAATAATGTTAGAAGACAAAAAAATTAGAGAAATAGCGTTACTT
AAAGTAGAAGAAAGTGATTTTTTATTGAAAGAAAGTAAAGAAATTTTAAATTACATGATTAAAAATCAAG
AATTGGACAAAATAACTATTGACAAATTGAAAAGTTTAAACATATCCGAAGAATACTTAAAAGAATTAAA
TTCAATTTCTTTGAATAGTATAAACTTAGAGAACACAAAAGAAATAGAAGGAATAATAACAAATATCAGA
AAAAACTCATTAGAAGAGCAAATTAATAGCTTGTTGAGAGAACAACAAGAATTAGAAAATAATAATGATA
TGAAAGAGGTAGATGGTAGAGTTATGGAAATTGCTTTAAAAATAGTTGAGATAAATAAAATTTTAAAGAG
CTTGTAG
>ref|NC_013316.1|:1543649-1544815 RNA polymerase sigma factor (sigma-43) [Clostridium difficile R20291]
GTGGAAAATAAATCGAATAAAAAAGAGTTAAAAAAGGTTACTGCTAAGACATTAATAGAAAAAGGAAAAA
AGCAAGGTTCTCTGACACTTGCAGAGATAATGGAAGCTTTTTCGGAGACTGAACTTGATAAGGATCAAGT
AGAAAATCTTTATGAGACTTTAGGAAATTTGGGAATAGAAATAACAGAAACAAAAAATTATAAAGCTGAT
ATAGATTTTTCGGTTGCTGATGACGATTTAAGTATAGGCCACTTAGATGAAGATGCAGAGGCAATTTCAC
ATGATGACTCTTCTGCAATAGAAATAGAAACTGTGGATTTATCTTTACCAAAAGGGATAAGTATAGATGA
CCCTGTAAGAATGTACTTAAAAGAAATAGGAAAAATTCCTCTACTTAAACCACATGAAGAAGTAGAATTT
GCTAGAAGGATGCACGAAGGTGATGAGATAGCAAAACAAAGGTTAGTTGAAGCAAACTTAAGACTAGTTG
TAAGTATAGCAAAAAGATATGTAGGAAGAGGTATGCTTTTCTTGGATTTAATACAAGAGGGAAATTTAGG
TCTTATAAAAGCAGTCGAAAAATTTGACTATACAAAAGGATATAAGTTTAGTACTTATGCAACATGGTGG
ATAAGACAAGCTATAACACGTGCTATTGCAGACCAAGCTAGAACTATAAGAATACCAGTTCATATGGTAG
AGACTATAAATAAGCTAATAAGAGTATCAAGACAACTACTTCAAGAACTTGGAAGAGATCCAAAACCAGA
AGAAATTGCAAAAGAAATGGAAATGACAGAAGATAAAGTAAGAGAAATAATGAAAATAGCTCAAGACCCT
GTGTCTTTAGAAACACCAATAGGAGAAGAAGAAGATAGCCATTTAGGTGATTTTATTCCAGATGATGATG
CTCCAGCCCCAGCAGAGGCAGCAGCATATTCTTTATTAAAAGAACAAATAGAAGATGTACTTGGTTCGTT
AAATGATAGAGAACAAAAAGTATTAAAGCTTAGATTTGGTCTTGAGGATGGTAGAGCCAGAACTCTTGAG
GAAGTTGGAAAAGAGTTTGATGTAACTAGAGAGAGAATAAGACAGATAGAAGCAAAAGCACTAAGAAAAC
TAAGACATCCAAGTAGATCAAAAAAACTTAGAGATTATTTAGACTAA
>ref|NC_013316.1|:1544962-1545669 hypothetical protein CDR20291_1305 [Clostridium difficile R20291]
TTGAAAGGAGAATTATATTTGAAATTAACAGATAGATTATTGAAAATAGCATCATTAGTGTCAGATGGTA
AAAAAATAGCTGATATAGGGACGGACCACGGATACATACCAGTATATTTGTTAAAAGAGGGAAAAGTACC
ATTTGCAGTGCTAGCAGATGTTAATAAAGGACCTCTTGACAATGCACATAAAGAAGTCATACAGAACAAT
CTTTTAGATAAAGTTGATTTACGATTGGGTTCTGGTATAGAGATACTTGAAATAGGGGAAGTAGAAGAAG
TGATAATTGCTGGTATGGGTGGAATCTTGATAAGTGAGCTTCTCGAGGCTAAAAAAGAAGTAGCACATAA
TGTAGAAAAATTAATATTACAGCCAATGCAAGCACAAGAAGAACTTAGATATTACCTTTTAAACAACGGA
TATGAAATTTTAGAAGAAGTTTTAGTGAGAGAAGATTTTAGAATATATGAGATAATTGTTGCCAAATATA
CAGGTAAAAATACTATAATAGAAGATGAGATATATTATGAGGTTGGAATAAAGCTTTTAGAAAACAAAGA
TTCTCTTTTTAATGATTTTATAGAAAAAAAGATAAAGACATATAGTTCTATAGTTAATAAATTAGAAGGG
AAAAATGGGGAAGCTATAGATAAGAAGAGAAAGGAAAGCGAAGTTGCAATAAAAAAACTTGAAAATTTAA
TAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1545683-1546780 hypothetical protein CDR20291_1306 [Clostridium difficile R20291]
ATGCTATTAAAGAGTCTAACTAGAAAAATTGAAAAAAAGTATCCTCTAAACTTAGCAGAGGATTGGGATA
ATGTAGGTCTTATAGTTGGAGATTTTGATATGGATGTAAAAAAGGTATTGGTATCTTTAGAAGCTAATGA
AGATGTTATTGATGAAGCTATATCCAAAAATATAGATTTAATTGTGACACATCATCCTTTTATATTTGGG
AAAATTAATAAAATTAATAGTGGAGATTTAAAAGGCAGACTTATCCAAAAACTTATTAAAAATGATATAT
CACTTTATTCTATGCATACGAATTTTGATATAGCATTTGATGGTCTAAATGACTATTTTATGGAAATTAT
GGAATTTGGTAATTCAAAGGTTTTAGATATAACTAAAAGCGAAAATTTGTATAAATTAGCAGTATACGTT
CCACATAACTATTCAGATGAACTTAGAAAGGTTTTAAGTAATTCAGGAGCAGGTCATATAGGGAATTATA
GTGATTGTACGTTTTCAATAGAAGGTGAAGGACAATTTAAGCCATTAGAAGGCTCTAATCCGTTTCTTGG
AAGTGTAAATGATATAGAAACTGTAAATGAAGTTAAAATTGAAACTGTAGTACCACAGAAGCTTTTAGGT
GGGGTAATAAGTTCTATGTTAGATGCACATCCTTATGAAGAAGTTGCATATGATTTGTACAAGTTAGAAA
ATAAAGGTGAGATATTTGGACTAGGTAGAATAAGTAAACTTGATAAAAGTATGACATTAGAAAGTCTTTC
AAGGAAAATAAAAGAGAAATTAAATATGAAACACATAAGAGTAGTTGGAAACCTTAGTACAGACATAACG
AAAGTAGCCGTTGTAACAGGAGCTGGTTCAGAATTTGTAAAAAAAGCTAAGAGACAAGGTGCAGAAGTAC
TAATTACGGGTGATGTAAAGTATCATGAGGCACAAGATGCACTTGATATTGGAATGTGTATAGTGGATTG
TGGTCATTTTGATACAGAAGATATATTCAAAAATGTTATGAAGAGATTTTTAGATGAATTTAGTGAAATT
GAAGTAATAAAGAGTAATGTATATTTGAATCCATTTAGTACTATTTAG
>ref|NC_013316.1|:1546839-1547414 putative flavoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGATGAAAGTAGCAGTAATTTTTCATAGTGTTTGTGGGAGTACATATTTATTAGCTAGAGAATATAAAG
AAGTGCTTGAAGAAATGAATATCGAGGTAGATATATTTAGAGTAAGTGACGAAGTTGCAAAAACACTTCC
TCAATATTATTTGATAAATTACAAAGAATACAAAGACGAATTTGAAAGTATAAATGTAATTAAATCTGGA
AAAGAAATATTAGATTATGATGCTATATTTATGGGTTCACCAACATATTATGGAAATGTATCTGGACCAA
TGAAGATGTTTATGGATAGTTTTTCTGATATTTGGGTAGGTGCTCCTTTGAGTGGTAAAATATTTGGTTG
TTTTGCTACAGCAGGTTCACAACATGGAGGAGGAGAATTAGCTTTGCAAGCTATGAATATATTTGCTCAA
CATATGGGAATGACTCTTTTGTCAGTTCCATGTTCAGTAAGAGGAGGTTATCCAGCGTATGGAATACTTC
ATATAGCAGGAGATAATTCTGATATAAGACCAAATGATGATGCCAAGATAGGTATAAGAGATTACCTAAA
AAGACTTAACATATAA
>ref|NC_013316.1|:c1547941-1547474 putative 5-nitroimidazole reductase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAAAGAAATGAGATTGAAAAAAAGAGAAATGACAAAAGAAGATACTGTTGAAGTATTAAAAAATG
GTGAATTTGGTACTTTTTCCACTATATCTGAAAATGGTTATCCTTATGGAGTTGCTGTAAATTATGTATA
CTTTAATGATTCTATTTACTTTCATTGTGCAAGAAATGGACATAAGTTAGATAATATATCGAAAAACAAC
AAAGTTTCTTTTTTAGTAGTTGCTAATGAAAGTGTTATTCCAGATAAATTTAGTACTACTTATTCTAGTG
CTATAGTTTTTGGAAAAGCTTGCACTGTAGAAAATGAAGAAAAGAAAAATGCTCTTGTAGAAATAATAAA
AAAATATTCTAAAGGATTCTTTGAAGAAGGCATGAAGTACATAGAGAAGGATATGAACTTAACAACTGTT
GTTAAAATAGAAATTGACCATATTTCTGGTAAAGCTTCACGTATATAA
>ref|NC_013316.1|:c1548818-1548327 putative phosphohydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGATTTTCATAATGTTGTCAAAAGCTGAAATCAAATATTTTAATGAATGTGCTTCTGAGATACTTT
CTTCTGAAAAAGTTCAACTTATGAGAACATTTCCTCATCATGGCAATGTTTCATGTCTTGAACATAGTTT
GTCAGTAGCATATTATAGTTATCTATTATGTAAAAAATTGCACTTACGTGTTGATATTCAAAGTGTTATT
AGAGGAGCTTTACTACACGACTTTTTTCTTTATGATTGGCATTACAAAGGTGATAGAAAAGGATTACATG
GATTTACTCACCCTAGAGAAGCATTAAAAAATGCAACTTTATTTTTTCAAATAAATGAAAAAGAAACGGA
CATAATTTTAAAACACATGTGGCCACTTACTGTTAAGCCACCTAGATACAAAGAAGCATTTATTGTATGT
TTGTTGGATAAATTTTGCTGTTTAGTTGAGACTTTAAAGATACATTCTTTATTATCTCCTTACCATGTAT
AG
>ref|NC_013316.1|:c1550014-1548923 hypothetical protein CDR20291_1310 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAGATTGAATGTCTATTTACAATATTTCCAGTTCTAATTTTGATGTATGCTACATTTTATTTTA
TGCCCTATTTTGTAGGTAAAAAACACATCTATGGAGTTTCTATAGACCAAGAGCATAAAAATTATAATTA
CTTTATAAAATTAGATAAAGAATTTAAAAAACTATTATCTTTAGGTTTTATTATAGACTTTATATTAGTT
TTTATTCTGGTTTTTACATTTAATAAATTGGAACTTTCATATTTTATTGGTATTATAGGTTTTTTATTAT
ATGAGAGTATACTATATATTCATACACATAAAAAAGCTAAGAAGCTTAAATCAGAAATTTATTCTAAATT
AGGTCATATAGATGTAGATTCAAAATTAATAGTAGATATGGATTTTATAAATAAGAAAAATAAAATAATA
AAAAAATTTAAAATAATCTATTTAATACCGATACTATTTACTTTGGGGATGAGTATTTTTATAGCATTTA
ATTATAATAAATTGCCAGACTCAATTGCCACTCATTGGAACATAAATGGGTCTCCTGATGTTTTTATAGA
TAAATCATTTCTTAATGTATTTAAATTAATCGGTACTGACTTTTGTTTAATGGTTTTATTATATATAACT
TCCATTGGATCCATAAAGTCAAGGATTAAGATAGATACAAATAGAATTGAAGAAAGTAGAGTTGAAAACA
TTAAATATTTAAATAAAATTGGTTATTTGTTTTTAATATTGATGATTATAATGACAACACAGTTTTTTAC
TACTCTTTTATCAATAAAAACAAAACTATCAACTGCTATGAATATTACAACGCTTTTAGTTATAATTTAT
TTAATAGCAACATATATTAATTCCCCAAATTTAAAATTCAACTCATCTTATTCTCCAGAAGAAGATGAGA
AGTATTGGATAGCAGGCATCATGTATAATAATCCAAATGACCCATCATTAATGGTTAATAAAAGGTTTGG
TATTGGATGGACTATAAATTTTGGCAATCCTCTTGGAAAAATACTATATATTGCTATAGCTTTACTTTTA
ATTTTTTCATTGTTTAGCCTAATAAAATCTCTCTTACTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1550396-1550007 GntR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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CTATAGCTTCAGGAGAATTGAAAATAAATGAATCACTTCCATCTGTAAGAAGTATGGCAGAAAATATTGG
TGTAAATTTACATACAGTGAACAAATCCTACAATGAGTTAAAAGAAGAGGGATTCTTAAATATTGATAGA
AGAAAAGGTGCTATTGTAGCTCAACTACCAATGAAAATAGATAATACAACTCGTCAAAAAAATAAACTTG
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AAGTTTATTTGACAAGTATGAGGTGAAATATTATGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1550588-1551034 hypothetical protein CDR20291_1312 [Clostridium difficile R20291]
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CAGGAGCTGTAATTACAGGTGTAGGAGCATATGCTGTATACAAAATGGTAAAAAGCCATAAATCTAATTC
TCAAATGGTCAATACAAATTATTATGGAAATAGCGATTATGATGATTATAAATATGACGAATTTGATTAT
GACTGTGATTGTAGAGACACAAAACAAGATTATGAATATGAAGAATTAAAAAAAAAAGTAAAAGAATTTA
ATTCAAGAAGAATAAATTGTGAAAATTGTCCACATGTTTCTCAAGAAGAAATGATGCAATATGTAAATAG
TGTTAAAGATGTAAAGGAAGATATTGATTTACATGAAGATGCTAAAAAAGATAATATTTACAAAGAAGAT
GAATACAAAAAATATGAAGAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1551298-1552023 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
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TAAAGTATGCTTTAGAACAAGAAGGATTTAGTATAGATATATCAAAGGATTTATCTAGTGGAAAAGAAAT
GATTTCTTCTAATGAATATAGCATGATACTGTTGGATGTTACATTGCCAGATGGAACTGGTTATGAGCTT
TGTAAATATATAAGAGGATTCTCTCAGGTTCCTATAATATTCTTGACTGCTTGTGATGAAGAAGTAAATA
TTGTAATGGGTCTCGATATAGGTGGAGATGATTATATAACAAAACCTTTTAGAATTAGAGAATTAATATC
CAGAATAAAAGCTGTTTTAAGAAGAAAAGGTAATACTTCAGAAGAAAATAAGAAAATACTTAAATTTGGA
GATTTAAGTATATATACATTAGAAGCTAGAGTATATAAAAATGATAAAGAAATATTTCTGACATCAGTTG
AATATAAACTTCTTTTAATTCTTATACAGAATAAAAATACTGTTTTAAGTAGAACTCAAATATTGGAAAA
ACTTTGGGATGTAACTTATGATTTTGTAAACGACAATACTCTAACTGTTTATATAAAAAGGCTTAGAGAA
AAAATAGGTGATGATTTATGTGAACCAATCTACATAGAAACTGTAAGGGGGATTGGTTATAAATGGATAG
GAAGTGAAAATAGTGTTTCTATATAA
>ref|NC_013316.1|:1552001-1553254 two-component sensor kinase [Clostridium difficile R20291]
GTGAAAATAGTGTTTCTATATAATCCAGAAGTGAAGAAGTTTTTAAGTAAGTATGTTACTTTGATGTTTA
TTGTTATCATAATATCTATTGGATTTAGCATAATCAACGTGTCTTTAACTAAAGAGATGGTTGTAAGAAA
TAATCAAGCTATAATAGGGACTTTATCGAGTAAGTATCCAAACTTAGAAAGTCAGATAGTAGACATAATA
ACTCAAGGGAAGTCTATGAAGAACATAGATTATGGTCAGAAAATATTAAGTAAGTATAATTATGATAAAT
CTATTAAGATAAACTCTGAGCCTATTATTTCTAAATTAGTTTTAGAGACTATCAAAATAAATATAATATT
AGTATGTATAATATTTATTTTGATATTTGTGTTGGTTGTTAGATATTTTACGTCAATTTACAATGATTTA
TCAGATATGACTAAGTATGTTTACTATAGTTCAGAGGGTAAGCCATTTGATATGAAAAACAAGAATCAAG
AAGGGCAGATAGGTCTTCTAAAAACTGAACTCTTAAAGATGACGACAATTCTTAATGAAAAGGTTGAACT
TTTAAAAAGAGAAAAGATATTTTTAAACAATACAATTTCCGATATATCACATCAATTAAAAACTCCTATG
ACTTCTTTAATAATGTTGAATGATTTATTATATAATGATGTACCATACGAAGTAAAAATCGATTTTTTAA
ATAAGATAAAAAATCAATTAAATAGAATGGATTGGTTGATTAAAAGCATGCTTAAATTATCAAAGGTAGA
AGCAAAAGTGATAAATTTTAAAAAAGATAAGGTAAAATTTAGTGAACTCATACATAGAGCAATGCTATCT
ATGAAAATACCTATGGAGATTAAAAATCAAAAACTGACTATAGAGGGAAATGATAATGTATCTTATATTG
GTGATATTGATTGGTCTGTGGAAGCACTAGTGAATATAATCAAAAATTGTGTAGAACATACTCCTGAATT
TGGAAATATAATTATAACCTATAAAGAAAATCCATTATTTTCTGAACTAATAATAAAAGATGAGGGTGAA
GGTATAGATAAAAAAGATATACCACATGTATTTAAACGATTCTATAGAGGAAGAAGTAGTTCAAAAGAAG
ATAGTGTAGGAATAGGTCTTGCAATGTCAAAATCTATAATAGAAAGCCAAAATGGCGATATATATGTAAA
CAGCGAAAAAGGTAAGGGTACAGAATTTCATATAATATTTCATAAAATGTATGATAGTGACTAA
>ref|NC_013316.1|:1553334-1554011 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAATTTTAAGAGTAGAAAATCTAACTAAAAGTTATGGTAAAAATGAAACAAAAGTTGATGCTATAA
AAAATGTAAGTTTATCAGTTGAAAAAGGAACGTTTATAGCAATAACAGGTCCAAGTGGAAGTGGTAAAAG
TACCTTATTACATTTATTAGGAGGAGTTGACAGACCAACTAGTGGTAAGGTTTATATAAATGATGTTGAT
ATATATAATTTAAAAACTAAGGATTTGGCGATATTTAGAAGAAGAAATATAGGTCTTATATATCAATTTT
ACAACTTAATTCCAGTCTTAAATGTGAAGGAAAACATATTGCTTCCAGCAGAGCTTGACAATAGAGATAT
TGATAGAGAATATTTTGATGATTTAATGAAAACATTAGGTCTAATTGATAGAGAAAAGCACCTTCCAAAC
CAATTATCAGGAGGTCAACAACAGAGAACCTCTATAGGACGTGCATTAATTAATAGACCTTCTATAATAT
TAGCAGATGAGCCAACAGGTAATTTAGATAGTAAAAATTCAAAGGAAATATTAGAATTGTTAAAATTGTC
AGTAAAAAAATACAATCAGACACTAATAATGATAACTCATGACAAAAATATGGCACTTCAAGCTGATAGA
ATTATAAGCATAGAAGATGGAATCATAAAAAGTGATGAGGTGATGTAG
>ref|NC_013316.1|:1554012-1556573 ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTATATACATCACTAACCATTAGATACTTAAAACAAAATAAAAGAAGAACCATTGTAACCATAA
TCGGTATAATACTTTCAACAGCTTTAATTTGTGGTATAGGAAATATATTTGAAAGTTTTATGGATTATCA
AATGAGAGAAACTATAAAGAATGATGGAAGTTTCCATGTTACATTTTATGATGTAAATAGAAAAAATGTG
GAATATGTAACGAAATCAGCTGAAATAGAAAAACATGCATTTACCAAACAACTTGGATATTCTAAATTAG
AAAATAGTGAAAATGCTATATTAAGTATAAAGCAATATGATCAAAATGCAATAAACGGATATAAAGTTTC
TATAAAAGAAGGTAGATTTCCAGCTAAGGAAGGAGAAATTGTTTTAAGTGAAAGTATTATTAATCTTATA
GATGATAAGTTAAAAATAGGAGATAAGATAACTTTAAAAGTAGGGGATATGTTTGACTCAAGCAAGAAAA
AGATTGATAGTATGACATTTCATGAAGGTGATTATATAGCAAATGAAAAAGATAGAACTTTTAAAGTTGT
TGGTATAATTAAAAAACCTGGGTTTGAACGTTATAATGGAATTGCAACAGCTATAGCCTACTTTAATCCT
ATGAATAATTACAATGATACAATTAATGTATCAGTAGCAGTAAGAAATCCTAAAGATGTGTATAAGATAA
GTAATAAAATAAGTAAAAATATATATTCAAATAAAGATAAAGAAGCAGTTTCTGATATGATAAAATACAA
TGAACATTTATTGAGGTTACAAGGTGCTAGTAAGTATTCAAATATAAATAGCTCTATAAAGTCTATAATT
ATAGCAGTAACTATTTTAGTAATCATATGTACAATTGCTACAGTGTACAATTCCTTTAGTATTTCTATAA
ATGAACGAAAAAAACAGTTTGGGATATTAAATTCTATAGGTGCTACATCTAGTCAAATTAAAAGATTAGT
TTTTATAGAAGGTATTATAATTAGTTTAATTGGTATACCAATAGGACTAATATCTGGAACAGTAGCTATA
GACCTATTGTTTAAAATTATAAATAAGTATTTTACTGAATCGGTTGTTACTAAGATGAGTTTGCAGATAG
TGTATAATCCAATAATAATTATTGTTAGTATAATAATAGTTTTGCTTACAATCTTTATATCAATTCTACT
ACCTGCAATATCGGCTTCTAATATTTCTCCCCTTAATGTGATTAAAAATACTGGAGAGTATAAAGTGGGC
AAAATCAAAAGCTCAAGACTTATTAAAATGATTTTTAAAACTGAAGGAGTACTTGCATATAAAAATATTA
GGAGAAATAGAAAAAAATTTATAATAACTCTTTTTTCTTTAATGGTAAGTATAATAATATTTATATCTTT
TAGTGGCTTTACATTACTTTTACTAAGAGGTGAAGAAATTAGAAATTCTCAAAGAAAATATGATTTGTAT
TTAACTGCAAAGAACACAGCTAGGTCTGTAGAGGATACTATAAGTGAACTAGAAGATATTGATGGGATAA
AAAACTTTGAATTGGCAACAGGACAATATGTGTCTATAAGAGTAAGTGAAAATAAAATAAATAAATCCAA
GGAAGATTTAATCAGGAAATATTATCAAAAATATAAGATTGGAGAAAGTTATGAATATGATTTCAGTAAT
AATGAATTGATTTTTCCGGGAGATTTTGCAGTAAAAAACAAAATAAATAACTTAGTACAGGGCTCTTTTA
ATAAAGAGAGAGCAATTGAAGAAAATGGTGTTATATTAGTTAGAAAAAGTGCAATTGAAGAAAATGGGAA
GAAAGGTGTAGTAGAACTTACCAACTATAAAGTAGGAGATACAGTAAATTGTGAATATCTTGATGAAAAT
GCCTTAAGTAAAAAAGTAAAGGTCAAGATTCTTGCTATAACTGATGAAGAACGTCTAGGTTTTGGTTATC
AAAATATGGGGTTACAATTTATAACTTATGATGAAGTTGCTAAAAATTTAAATTTAAAATTAAGTAAAAG
CCTTATATTTATTGATTCAGGAGGAAGCATTAAGACTAAGAAGGAAATAGAAGCTTTGGCAAATAAAAAT
GATTTTAACTTTTATGATGAAATTTCAAGCAGTGAAAGTGAAAAACAAGATTTAAAGGTTATTAAAATAT
TTGTATATGGTTTTATAGTAGTGATATCTTTAGTGAGTGTTACAAATATTCTAAATACAGTAAGTACAAG
TATAAATCTAAGAAAAAGAGAACTTGCAGTAATACAATCTATAGGGGTTACTCCTAAAGGATTTAGGAAA
ATGATATATTTAGAAAGTTTTATATATGGTATACTGTCATTGTTGTTTGGAATACCAATTAGTATTGGTA
TAATTCTAATTATGAATAAACTTATTTCAGGTGTAATTGAATTTTCTCCGATTATACCGTGGACAGCCAT
AGTTATCTGTATAGTAAGTGTTTTTATAATAACTTTTATAGCAGGGTATATACCAATGAGTAAATTAAAT
AAAGAAAATATAATAGATAATATAAGAAGAGAAAGTATATAG
>ref|NC_013316.1|:1556794-1558068 putative iron-sulfur protein [Clostridium difficile R20291]
GTGATTACTATTTCTCATATAACTGCGAAGAATATGTATAAAAGTTTAGAGGAAAGAATAAACAAGTTTC
CACAAGGTGCTCCACCATCTGATACATTATACAAAATACTAAATGTACTATATACAGAACAAGAGGCGAA
GTTAGTTGCTCAGCTTCCAATAAAGCCTTTCAGAGTAAAAACAGCAGCTAAAATTTGGAGTGTAAGTGAA
AGTGAAGCATATAGAGTATTGGATAAACTTGCTAGTAAGGCTCTGATACTAGATATAGAAGATAATAAAG
GGAAGAAATATATAATGCCTCCTCCAATGGCTGGTTTTTTTGAGTTTGCCATGATGAGAACGAGACACGA
TATAGACCAAAAACTTTTGGCAGAACTTTACTATCAATATATGAATGTAGAAGAAGATTTTATCAAAGAT
TTATTTTATTCAACAGAAACGAAGCTTGGAAGAGTATACGTTCAAGAGGAAGTTTTAACTAATGATAATG
AGGTTAGTATTTTAGATTATGAAAGGGCTACTCATATAATTGATGAATCAACTCATATAGGTATAAGTAT
GTGTTACTGTAGACATAGAATGCAACATGTTGGAAAAGCTTGTGATGCTCCCATGGATATATGTATGACG
TTTGACAATGTAGCAAATTCTTTAATAAATAATAAATTTGCAAGACGTGTGGATAAAATAGAATGTAAAG
AACTACTTCATCAAGCATATGAACATAACTTAGTTCAATGTGGAGAAAATGTTAGGAAAGGGGTTACGTT
TATATGTAATTGCTGTGGATGTTGCTGTGAAGCAATGGTAGCAGCTAAAAGATTTGGAAATCTTCATCCA
GTACAGACAACAAGTTTTATACCAAATATAAACCATGAAAATTGTGTAAAGTGTGGTAAATGTATAACTG
CATGTCCAATAGATGCGATAAGCAAGGTTAAGGAAGATGGTAAAGAATATATAAAAATTGATGAGGATAG
ATGTTTAGGTTGTGGAGTTTGTGTTAGAAATTGCCATAAAAATAGCATTATGTTATTAAAGAGAGATGAA
AAAATAATAACTCCAGCAAATTCAGTACATAGAGCAGTTCTCATGGCAATTGAAAAAGGGCAGTTACAAA
ATTTAATTTTTGATAATAATGCTCTGGCTAGTCATAGAGCTATGGGAGCTATACTGTCAGCTATATTAAA
GCTTGAACCAGCTAAAAAGATTTTAGCCAGTAAACAATTAAAGTCAGTATATTTAGATAAATTGTTAAGT
ATGAATGATAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c1561270-1558229 cell surface protein (putative penicillin-binding protein) [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAAGCAAAGGATCTCTAAATTATTATCTAGTACATTAGTATTGAGTATGTTATTTACTGCTGCTC
CAAATATTACTTTTGCTGATAATACAAAAGATAATTCCGAAAAATATCAAAGTTCTGATATAGAATTACA
TGATTATAGTAAAAACGCGGAATCTTACACAAAAACTAAAGCTCTTGCTAAAGAGAAAATCCAAACTTTG
CTATCAAAGTATGGTGCTGTAAGTGCTCAATATGCTTTGATTGATAATGGCAAAATTGAGATTTCTGGTA
ATGGTGGAGTTTACAGCAAACAGGATAACAAAAACTTAAATAAGGATAATATGTATAGTATCGCATCTAT
CAGTAAAATGTTTACTACAACAGCTGTTATGAAGTTGGTTGATGATGGAAAATTAAATTTAGATACTCCT
GTTGTAAAGTATATACCTGAATTTAAAATGGCTGATGATAGATACAAGGAAATCACTCCAAGAATGTTAT
TAAATCATTCATCAGGGTTGATGGGAAGTAGTTTTAAAAACACTATTTTATTAGCAGACAATGATTCTTA
TGGTCATGATAATTTCTTAAAAGAATTACAAAAACAAAGATTAAAAGCTAAACCAGGAGCTTTTTCCGTT
TATTGTAATGATGGATTTACTTTAGCTGAAATTTTAGTAGAAAGAGTATCTGGTATGTCATTTACTAATT
TTCTTGATAAATACATAAATAATCCACTTAACTTACAAAATACAAAAACTACAGAAAATAGTTTTGATAG
TTCAAAACTAGCAAAAGCATATGTACCTTATTGGGAAGATGCAGTTCCACAAGATAACCTTAATGCTATA
GGTGCAGGTGGTTTATATTCAAGTGCAGAAAATCTATGTACATTTGCACAAACATTTATGAAAAATTCAA
ATGGTATTCTTTCTCCTGCTTCAGTAAAAGCTATGGAAAACAAAGAATATTTAAATGGTCTATGGCCTGA
AGGAGAAGATTCTATACTTGGATATGGTTTAGGGTGGGATTGTGTCAACACTTATCCATTTAATCAGTAT
AATTTAAAAGCTCTTACAAAAGGTGGAGACTCTTTATTATTCCACAGTAATCTTATAGTTCTTCCAGATG
AAAATATGGCAGTTGCAGTTCTTTCTTCTGGTGGAAGTAGTCAACTTAACGAAATAATTGGACAAGAAAT
CTTACTATCTGCATTAAAAGAAAAAGGTAAAATTAAAGAAATAAAACCTGATAAAACATTTAGTAAGCCA
CAACAAGTTAAAATGCCTAGCTCTCTAAAAGAAAATAGTGGTCTTTATGCTTCTTCAAATATGATAAAAG
TAGATGTTAATGATAATGGTACTTTAACAGTATCTTCTCCTTATATAGAAAATGGACCTGAAGATAAATA
CGTATACATAGGTCAAGATAGATTTGTATCTGAAAAGGGTAACAGTTGTTTAAAATTTGTAAAAGAAAAA
AATAATATCACATATTTAAATATGAGCTCTTATGATGATGTCCCTGGATTAGGTCAGACAGCAAGTTTAT
ACTATGTAGCTCAAAAAGTAGATGACAACAATATATCAAATAGTGTCAAAGAAGTGTGGAAAAAAAGAAG
TGGCAAAGGTTACTATCTAGTGGATGAAAAATATACTTCTCAAAGCTATATGTTTGGCTCTGTAAAAGCA
AGTTTTAGTCTTTCTGATGAAACTCCAGGTTATATAGTTAACACTAAAATAATGGATGAGAATAACTCAA
ATGCTTTTATAGAAATACCTGGTGTAATAGGTCGTGATTTATCCGACATTAAACTTCATAAAGAAAATGG
TACAGAGTATTTATCTTTTGGAACACTAACGTATGTTAGTGAAGATTCTATAACTAATTTGCCAGCAGAA
AAATCTTTTACTTGTGAACTAGAATCCAATGGTTATGCAAAATGGTATAAGATTGGTGACGATATCGCAA
ATAAAAAAATAGAAGTTAATCTTCCTCAAAATTCAGCTTTTGCTGTTTATGATGATAAAGGTGTTCCTGT
AAACTATTCTTTAGTTACAAAGAACAATAGAGTTAGATTGCCAAAAGGAGGCGTAATTGTTTTCTTAGGA
AGTCCAAATGCTAGATTTGAGGTTACATATCAAGATGAAGTAAATGCAAGTGCACTTACAGGAACTGATA
GATATGAAACTTCTATTAAGATAAGTCAAGCAGGTTGGGAAAATGCTGAAAATGCAGTTTTAATAAACGA
TTCAGCAATTGCAGATGCTTTGGCCGCAACACCATTTGCATACAAGAAAAACGCTCCTATATTATTGACT
GGAAGCTCTCAAATAAATGAAAAAACTTTGGCTGAATTAAAGAGATTAAAAGTTAAAAATGTATATGTAG
TTGGTGGAGAGGCTTCTATAAATGAAAAATCTTTAGATACTATAAAATCAAACAATATCTCTGTATCTAG
AATTTCAGGAAGTGATAGATATCAAACTTCTATGAACATTGCTAAAGAATTGAACAATATTAGCAATATA
TCAAAGATTTCAGTAGTTAATGGCGAAAAAGGATTAGCCGATGCAGTAAGCATTGGAGCTGTATCAGCTC
AAAATGATATGCCTATAATACTTACTAATGAAAATAGTAATATAACTGAAATAAATAACTTATTTAAAAA
CAAAAAGATTGATAAATCTTATGTAATCGGTGGAGAATATACAGTTTCTAAAAATATAGAAAGTAAACTT
CAAAATCCACAGAGAATATCAGGTAACACTAGAAATGAAACTAATGCAAAAGTAATAAAAGAATTTTACA
AGGATTCTAAGATAGACAATTTATATGTTGCTAAAAATGGAATGAATAAACAAGATGATTTAATAGACGG
ATTATCTGTTGGAGTTTTGGCTGGAAAAACTAAATCTCCTGTAATGCTAGTAGGAAACTCACTAGATTAT
AATCAAAAAGAACTATTTAAAACTATGAGATTTAAATCTGTAACACAAATTGGTGGAAATGGAAATGAAA
ACTCATTTAAGCAAATAAAAGAAATAGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:1561477-1561776 putative phage shock protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAAGAATATAAATAAGAAGCAACTTAAAGAAATGATGAAAAATGAAAAGGATGTTTTATTATTAG
ATGTAAGAACTAAAGATGAATTTAAGGAATATAAAATAGAAAATGCTATAAATATATCTTTACAAGATTT
AATCAATAATATAGATGAAATTTACGATTATAAAGATAAGAAAGTAGTAGTTTATTGCAGAAGTGGTCAT
AGAAGTGTTACTGCATGTAATTTGTTAGCTGAAGAAGGTTTTGAGCATTTATATAATTTAAATTCAGGAA
TAATTGATTATATGAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1564242-1562014 putative membrane protein (putative phage infection protein) [Clostridium difficile R20291]
GTGAGACATTTGAAAAAAACTAATAGTTTAAAAGAAATTTTAAACTGGAATAATATCAAGAATTTAAGAC
CTTCAAAGGGTTTAAAAAATATATTAGAAATTTTTAAAAGTGACCTAAAAGATATACGTGGCAATTATGC
CGTACTTGTAATAGTTTTAGGTCTTGCTTTTTTACCATCTCTGTATGCTTGGTTCAATATAAAGGCATCT
TGGGACCCTTATGGAAGCACTGCTAATATGCTTGTAGCAGTAACAAATGAAGATAAAGGAAATGAAATAG
CAGGACAAAAGATTAATGTAGGAGACCAATTAATTGAACAACTCAAAGATAACAAGAGTTTAGGTTGGCA
GTTTGTAGATGAAAAAACTGCTCTTGAAGGTGTTAAAAAAGGTACTTATTATGCATCACTTAAGATTCCA
AAAAATTTTACAAAAGATTTGACATCTTTAATTACAGATGATGTTAAAAAAGGCGAAATTATCTATACTG
TTAATGAAAAAATAAATGCAGTTGCACCAAAGATTACAGATAAAGGTGCTTCTACAATACAACTACAGGT
TAATCAGACTATAGTAAAAACAGTTAGTGAAATCGTTCTTGGTATATCAAACGGAGTTGGTGCAGGAATT
GAACACAGTCTTCCAAAATTGACAAAAGTTGAAAATTCCCTTATTGACCTTCAAAAGAGATTTGACCATA
TAAATAAGACTGTGGATTTAGCTTCTGATGCTACTTCAAAATTATCTGATACAGTTAAAGATATTAAATC
TGATTTACCTACAATTAAAAAGACTCTGAATGATACAAAACTATTATCAAGTGACTTAAAAAAATTCTTA
GAGGATACAAATGATAATTTAGACGAACTTTCTCCTCTTATTAAGTCTGACTTAAATTTAATGGTTGACC
TTTCATCTTCTGCTTCTTCTCTTACATTAAATTTAATTGATGCAGTAAATAGTGGCAGTGAAGATGTACC
TAAGTTGATAGATAATTTATCAGAAAAACTTTCTAATTTGCAATCTTTAAACGATACTTTGGTGGACTTT
TTAACTAAATTAAACCAACTTACATCAAATAATAGATTGGATGATGTAATAGATAATCTTGAAGACTCTA
GCAATAAAATAGATTCATCTATATCAACATTAAATGATATTAAAAACAAAGTTATATCTGGACAACAACC
ATCTATAAGTGCTTTGAATAATGTTTTAAGTCTATCAAATGGTATTGGAAGAATTAATTTAAATATTTTA
AATAATTTTGACTCAAAAATATCAAAACCTATAAATAGTATATTTGCAAACAGTATAAAAGTAGCAAATG
ATATAATTACTGTTTTAGATAAGGCAGAAGCAAAACTTCCAAAGGTTGAAGAAATACTTACTACTTCTCT
AAAACTTTCAGGAAATGCACAGGAAAGTATATCATTGATAAGAGAAAGACTTCCTTTAGCAAAAGGAATG
TTGGATGATTTGATTGATACTTTAAGCAAAATTAGTAATGGTGAAGATATGAAAAAATTAGTCAGCTTGC
TTGAAAGTGATATATTGACAAAGTCTAATTTCTTAAAAGAACCTGTTGAGGTGAAAACAGAGAAATTATA
TCCAATTGAAAATTATGGTTCTGCAATGACACCATTTTATAGTGTTCTTTCTACATGGGTTGGTATATTA
CTTATTTCAGCACTATTGTCTACATCTGTACATGGAAACTATAAACCTTATGAAATTTACTTTGGAAGAG
GTCTTACTTTTTTAAGTATAGCTCTTGTCCAAGGTTTTATAATAGGAACTGGAGATATATTATTGTTAGG
AGTAACAGCAAAACATCCAATTTTATTGATAGTTCTGCTTATGTTTACTAGTATGGTATTTAACTTTATA
GTGTATTCTTTAGTTTCTGTATTTGGAAATGTAGGAAAAGCAATTGCAATAGTACTATTAGTCGTTCAGA
TTGGTTCTTCTGGTGGTACATTCCCTATACAAGTTACACCTACATTCTTCCAAAGAATAAACCCTATAAT
GCCATTTACCTATGCAATAGGTGCTACAAGGGAAGCAGTTGGTGGTATATATGCTCCAAATCTAACTAAA
GATATACTAGTTCTATTACTATTTATGATTCTGTCTATTTGTTTAAACGTACTTCTAAAAGGACCTATAA
ATAGAGTTATAAAACCATTTAATGATAAATTTGGCGATAGTAATTTAACTGGTCATTAA
>ref|NC_013316.1|:1564536-1566311 ABC transporter, ATP-binding/permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGTATTTTAAAAAATACATAAAAAAATATATAGTATTATTTCTAACAGCAGTATTTTTTTTAACAT
TGGAAGCTTTTTGTGATTTAGCTCAACCAACTATAATGGCAAAAATAATAGATATAGGGGTTTCAAATAA
GAACCTAGACTACATACTATCAACAGGAGCTATAATGATAGGTATAACTTTTTTAGGTGCAATATTTGCA
ATAATAAGAAGTGTAATCTCGGCAAGAGTTTCTCAGCATTTTTCTTATGATTTAAGACAGGATGTATTTG
AAAAGATAAATACATACTCATTAAAACAAATAGATAAATTTGGTAGAGCTTCGTTAATAACAAGAATTAC
TAATGATATCAATCAAATGCAACAATTCGTTAATGGAATGATGAGAGTTTTTATAAAGTCACCAATAATG
TGTATAGGAAGTTTAATTATAGCTATAAAATTAAATTTAAAGATGTCAATAATTATTCTAATTGCAGTTT
TAATTATATTTATTATAATATTGCTTAATATGAAGATAGGGTATAGATTATTTAAAAATGTACAAGAAAG
TACAGATAAAGTAAATTCAAAATTAAGACAGTTTTTAAGTGGAATAAAAGTAGTTAAACTATTTTGTAGA
TACGATTATGAGAACCAAAGCTTTGAAGAGTTAAATGATGAACTTTTTAAAAATAGTAGAAAAGCTACAA
CTATGATGTCATTTTTTAGACCGACAATTACAATAATCATTAATGTTTCCATAATAATAATATTACTGAT
TGGAAGGCATTTAATTTATTCAGGAGAAATTAAAATTGGGATTATAGTTGCTTATGTAAACTATATGACT
AGAATATTAACATCTCTTATAATGATTTCACATGTTTTTAATGTTTTTGTTAGGGCAAAAGCATCTTATG
AGAGAATAAGTGAGGTTTTGGTTGATGAGAATGAAGAAGTAATTGAGAGAGAAGAAAGTTTAGATGTTGG
AGAAAAAGATTTAAAGTTTGTAAATTGTGATATAATTTTTGAAAATGTAGATTTTTCGTATAACAAAAAT
ACAGATGAAAAAATATTAAAAAACGTATCCTTTAAAATAGAAGAAGGTCAAAATATTGGTGTGATTGGTC
AAACTGGTTCAGGAAAGACTTCTTTAGTAAATTTAATTCAAAAATTATATATAATTGATAAAGGTGATAT
TAAGATTGGAGGACGTAGTATATACAGTATTTCTGAAGAAAGTTTAAGGGAAAAAATAGGTGTAGTATTT
CAAAATAGCAGTGTGTTTGGAAAAAGTATACTAGAAAATATAGTTATGGGAAATGAGGGTATAAGTAGAG
AAGATGTTATAAAATCATGTGAGATAGCAAATGCAAATCAATTTATAACTAAACTCGAAAATTCTTATGA
TGAGGTTTTATTTCAAAGGGGTAAAAATTTATCAGGAGGACAGAGACAAAGAATTACTATAGCTAGAGCT
ATAGCCAAAAAACCACAAATATTAATTCTTGATGATTGTTTTAGTGCAATGGATATTAATACAGAGACAA
TTATAAGAAAGAATATAAAAGAGTATATAAGTAATTTAAGAGAAAAGGAAAGTAAGAAATGTACTGTAAT
AACTATTTCACAAAAGATTAGTTCTATAATTGACTGTGATAAGATTTTAGTCTTGGATGAGGGTGAGGTG
GTTGGATTTGCTACACATGAAGATTTACTGGTTAGTTCTCCAATTTATAAAAAAATTTTTGCGTTGCAGA
ATTTAGTAAGTGAAGATGTAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1566324-1568147 ABC transporter, ATP-binding/permease protein [Clostridium difficile R20291]
TTGAACTTAAGTACTGGAAATCAAAAGGTCAGTAGATTAAAGAAAAAAGAAAAGCCTAAAGATTTTAAAA
AAACGTTTAAAAGAATTTTTATGTACTTTAAAAAAGATAAGAAGATTACTAGATTTATTTTTTTGCTAGT
AATAATTGATTCAATTATATCAACTGTAATACCATATACTATTGGAAAGGTAGTTGACATAATAGATATC
GATACTTATTCAAAATCCATTTTCTTAAAAGGAATAATTATTTTACTTTCATTTTATATAATTGAGTTTT
CAGTTAAACTGTCTAAGGGGATATGTACAGCTAGATTATCTCAAAGTATAGTTAAAGAAATGAGAAGTAA
TTTATTTTTAAAATTTAAAAATCTACCAATAACCTTTTTTGATAAAAGTTCTACTGGAGATATTATGAGT
AGAGTGACAAATGATGTTGATAATATCAGTACAGGAATATCAAATTCATTAGTACAGTTAATTACAGGAA
TCTTAAACATATTGATGACTTTTATTATGATGTTTGTATTAAGCCCAATTTTAACATTTTGCAGTGTAAT
ATTAATACCGATAGTAATGTTTGTGAGTAATTTTATTGCAAAGAGAACTAGAGTTTTTTTTAAGCAACAA
CAAGTTGAGTTGGGAAAACTAAATGCACATATTGAAGAAATGATATCAAACATAAATGTAGTAAAATCTT
TTAATTATGAAAGAAAATCTGTAAATGATTTTAAAGAAGTCAATGATAGACTTCTAAATATTTCCCTTAA
ATCGCAAATTTACACTTCTCTTTTAATGCCTATTATGAATGTGATTAGTAATATAGGATTTGCAACTATA
TGTATTATAGGAGGTGTTCTTGCATCTAAAGATATTATAACCATAGGGGTTATAGCTAGTTTTTTAAGTT
ATGTAAGACAATTCACAAGACCTTTAAATGAATTAGCAAATCTATTTAATACATTACTTTCAGCCATAGC
TGGATGTGAAAGAGTTTTTGAAATTATAGATGAACAAGAAGAGCAAGAAGTGCATAACATGTTTAAAAGT
GAGATTAACGATAATAAAGATGGTAATTTAAACTCTCATTTTGTAAAGGGAGAAATTGAGCTTAAAGATG
TAAGTTTTTCTTATGATTCAAAAAAGAAAATTTTAGATAATATAAACCTAAAAATCAAAGCTGGCACATC
AAATGCCATCATAGGAGAGACAGGAAGTGGAAAAACAACGATTATAAATCTAATTACAAATTTTTATCAT
ATAGATGAAGGAAGTATATTTTTAGATGGTAAGGATATATACTCTATTAACAGAAACTATTTGAGAACTT
GTTTTGGAGTAGTTCCACAAGAAGGTTATATATTCAATGATACAGTTATGGAAAATATAAGGTATGGAAA
TCTGGAGGCTACTGATGAAGAAGTTATATATGCTAGTAAAATAGCAAATGCACATAAATTTATAGTTAAA
ATGCGTGAAGGATATAGTACTGTATTATCGGATAGGGGTGAAGATTTAAGTGAAGGTCAAAAACAATTAA
TAAGTATTGCTAGAGCAGTATTAAAAAATGCTCCAATACTTATTTTGGATGAGGCTACAAGTAACATAGA
TATAGCAACAGAAGCTAAAATTCAAGAAGCAATAAATAATTTAACTTATGGAAAGACAAGTATAATTATA
GCTCATAGATTAAGTACCATATCAAATTGTGATAATATAATAGTTTTAGAAAATGGTAGAATTGTGGAAT
CAGGAAATCATAAAGAATTGATAAAATTAAAGGGACATTATTATAGAAACATATTATTGACACAGGGAAA
ATAA
>ref|NC_013316.1|:1568265-1568810 putative ruberythrin [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAAATTTGTTTGTACAGTATGTGGATATATACATGAAGGAGATGCTGCACCAGCACAATGTCCAG
TATGTAAAGTTGGAGCTGATAAATTTGAAGAAATGAAAGGCGAAAAAAATTGGGCTGATGAGCACAGAAT
AGGAGTAGCTCAAGGTGTAGATGAAGAAATAATCGAAGGATTAAGAGCTAACTTTGTTGGTGAGTGTACA
GAAGTAGGAATGTATTTAGCAATGAGTAGACAAGCTGATAGAGAAGGTTATCCAGAAGTAGGAGAAGCTT
ATAAGAGAATAGCTCTTGAAGAAGCTGAACATGCTGCTAAATTTGCAGAACTTCTTGGAGAAGTTGTAGT
TGCAGATACAAAAGAAAACTTAAGAGTTAGAGTTGATGCTGAGTATGGTGCAACTGATGGACAATTAAAA
TTAGCTAAAAAAGCTAAAGAATTAGGACTAGATGCTATACACGATACAGTACATGAAATGTGTAAAGATG
AAGCTAGACATGGTAAAGCATTCTTAGGATTATTAAATAGATATTTTGGAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1569363-1569791 hypothetical protein CDR20291_1324 [Clostridium difficile R20291]
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AAAAAGTTGATTTTCAATTACCTACTGTTTTTATGATTGTTACATTTATTGTTTCTGCTATTTCAGAAGA
AATTGTTTTTAGAGGGTATATTCAAACAAGGTTAACTGGATTAATAAAAAATAGTGTACTTTCATCTTGT
ATTAATGCTTTTCTTTTTCTATCTACACATTACCCTGTAAAATGGATTTCAAGTGGAGATTTTTCATTTG
CAATTCTATCTGGATTTTATGTGATATGCCTTATATTACTTAACTTTTCATGTGATTTAGTATATCGAAA
AACTAACTGTCTGTGGGGGGCATGGCTACTGCATATCTTGTATAACATTGGCACAGGAGTGCTGATTTTT
ACTACTTAG
>ref|NC_013316.1|:1569911-1570519 putative hydrolase [Clostridium difficile R20291]
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GAGTTAATAATTTTATAAAAGATGTTTGTCAAAAGTATTATAAAGGTGGGTATGATGTGTTTTGTCCAGA
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GTTAAGTTTGATATTTATAAAAAAGTAGAAAAACTTATAAATGGTTTAAAATCGGAGTATAAACATGTAT
TTGTAGTTGGGTATAGTATAGGTGCAACTATTGCATGGAGATGTAGTGAAAACTCTTTGTGTGATGGTAT
AATTTGTTGTTATGGCTCCCGAATTAGAGATTATATGGATGTAATTCCAACATGTCCTATTTTGCTAGTG
TTTGCAAAATACGATTCATTCGATGTTGATTATGTTTCTTCTCAACTTTCTAGAAGGCAAAATATTCAAA
TTGAAATTTTAGACGCAAATCATGGTTTTATTGATACATACTCAAAAAACTATTCTAATGCTCAAACAGA
AGTTTTTAATATTAAAGAAAAAAACTTTCTATCTAAATGTTTAGGCTAA
>ref|NC_013316.1|:1571043-1571255 putative ferrous iron transport protein [Clostridium difficile R20291]
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TAACTTAATAATAGACGTAAAAGATACTAGAGTTGCATTAGATAAAAAAATGGCAAGTAGAATAATAATA
TAG
>ref|NC_013316.1|:1571268-1571489 putative ferrous iron transport protein A [Clostridium difficile R20291]
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TGGTGATCCAATTGAGGTAACAGTCAGAGATTATGAACTATCAATTCGTAAGTCAGATGCAGAAAAAATT
ATTGTGGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1571574-1573745 ferrous iron transport protein B [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGGAATGGAAATGTCAATAAAAATAGGTCTCATAGGAAATCCTAACTGTGGTAAGACAACAATGT
TCAATGGGCTTACAGGCTCGTCGCAATATGTTGGTAACTGGCCAGGAGTAACAGTTGAAAAAAAAGGTGG
AAAATTAAAAGGAAATAAAGATGTGGAAATAGTAGATTTACCAGGTATTTATTCTTTATCTCCATATACA
TTAGAAGAAGTAGTTACACGTAATTTTATGCTAGATGATAAGCCGGATGCAGTAATAAATATTGTAGACG
CATCAAATATAGAGAGAAATTTATATCTTACAACTCAAGTTTTAGAGCTAGGTATACCGACCATTATAGC
TCTTAATATGATGGATATTGTAAATAAGAATGGTGATAAGATAAATATTAAAGAACTATCTGAAGTTATA
GGTTGCCCAGTGGTAGAAGTAACAGCAGTTAAAGGTCAAGGAATTATGGAGGCTGCTGAAAAGGCAGTTG
AACTTGCAAGTAGTAACAATAAATTAAATTTCAAATTACCTTTTGTTGATGAAAGTAAGGACGCAATAGA
AAAAATTGAAAAAATAATAGAAGAAAAGACTCCATATATAGATGTAGAAACACGCTGGTTAGCTATAAAG
CTATTTGAGAGAGATGAAAATGTTATACAAAAACTTGATATTTCTAAAACAATATTGAATAGTATTGAAG
AAATAACTAGAAATTGTGAAGATGAATTGGATGATGATAGTGAAAGTATAATAACAGCCAATCGTTATGA
ATTTATTAGTTCAATAATTTCAAGTATAATAAAGAAGAATCGAAAAGGTAAGGAAACTGTATCAGATAAG
ATAGATAAGATTGTAACAAATCGTATACTAGCATTACCTATTTTTGCACTTATAATGTGGGGAGTTTACT
ATATAGCAGTAAGTTCATTGGGTACTATAGCAACTGATTGGACAAATGATGTACTGTTTGGAGAAATTAT
TCAAGGCAATGTAAGTAATTTTCTAGCTTCTTTAAATGTAGCAGAGTGGTTACAAGGACTTGTAGTTGAT
GGTCTAATTGGTGGAGTTGGAGCAGTACTAGGATTTGTACCACAAATCATGCTTTTATTCTTATTATTGT
CAATATTAGAAGATTGTGGGTATATGTCACGTGTAGCTTTTATAATGGATAGAATTTTCCGTAAGTTTGG
TCTTTCAGGAAAATCATTTATACCAATGCTTATAAGTTCAGGTTGTGGAGTTCCAGGAGTTATGTCAACT
CGTACTATAGAGAATGATAGAGATAGAAAAATGACTATTATGTTAACTACATTCATTCCATGTGGAGCTA
AGATTCCAATAATAGCATTATTTGCAGGGGCATTATTTGGAGGTGCTTCATGGGTAGCTCCATCAATGTA
TTTCTTAGGTATTGCAATGATAATCATTTGTGGAATTATATTAAAGAAAACTAGTTTATTTGCAGGAGAA
CCATCTCCATTTGTTATGGAATTACCTCAATATCATGTTCCAAGTGCAAAAGGTGTTTTAATACATATGT
GGGATAGAGGAAAAGCATTTATAATCAAAGCAGGAACAATTATATTTGTTGCTTGTGGAGTAATCTGGTT
CTTACAATCATTTAATTGGTCATTACAAATGGTAGATGCTGGAGATAGTATATTAGCTAGCTTAGGAAAT
ATAGTTGCACCAATATTTGCTCCTCTTGGATTTGGAAATTGGCAATCATCAGTAGCAACAGTTACAGGTC
TAGTAGCTAAGGAAAATGTAGTTGGAACATTTGGAGTTTTATTTGGTATATCAGATGCAACAGAGCAAGA
CCCAACACTTCTTGCTTCAGTTGCAAGTATGTTTACAGTAGCTAGTGCGTTTGCATTTATGGCATTTAAT
ATGCTTTGTGCACCTTGTTTTGCAGCTATTGGAGCCATAAAAAGAGAAATGGGTTCATGGAAATGGACAT
GGATTACATTAGGATTCCAAACTTTAACAGCGTATATAATTGCTCTTCTTATAAATCAAGTTGGAAGTTT
AGTTTTAGGTACTGGAGGAAGTATTGCTGGGGCAATAATATCTATATTTATAGCAGTAGCAGTAGTCTTT
GTAGTTTTAACTTATTCAAATAAAAATATGAAAAAAGAAAAAATGGGTAAATTAAGTTATATGAAAAATT
AA
>ref|NC_013316.1|:1573765-1573923 hypothetical protein CDR20291_1329 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATGGCTACATTTATTATAGCAGCTATTGTAGTAGTATTAATGGCACTAGCTGTAATGTATATGG
TTAAAAATTCAAAAAAGAATGGTAGCAGTTGTGGATGTGGTTGTTCTGGATGCTCAAGTAGTAAGAGTTG
TCATAGCGCTAAGAGATAA
>ref|NC_013316.1|:1574103-1574813 hypothetical protein CDR20291_1330 [Clostridium difficile R20291]
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AAGGTGCTATGGTAGCCTTTAAAGGAAATTTTAATTTTGAAAAATTGCTGTTAGGTCCAAGTAATGGCGG
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GTTGAAGGTGAAGGTGAAATTTACCTAGCTCAAAATGCTTACCATGTAGATGTAATATCAATTGACCCAG
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CAAGATGTTGCTATAATAACAGATGGTAATCCTCTAATTCTTGAAGGACCTTGTTGTGTTGACCCAGATG
CATTAGTAGCTTGGACTGGAAGAGAACCATATCCTAAAGTATCAAAACTATCATGGAAGACTTTTATTGG
TCAGACTTCAGGAGAATCTTATCATATGGAATTTGTTGAACCTGGACAAATAGTCATTATACAACCATCT
GAAAGATTGTCTGGCTTAAAAACAGATTCTACACCTTCTGATAGAATGAGTTCAGGTGGATTAAGACTTG
GCATAGATTAA
>ref|NC_013316.1|:1574898-1575668 putative aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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TAGTATGTGTTTTGGGTATATGGAGTAGCTATATTCTGCCTCCTCCTGAAATAGTCTTAGATACTTTTAT
AAAAATGATATATGACGGTTCTATTTTCTTAAATGTTTATGCCAGTGTAAGAAGGATATTAATAGGTTTT
TTAATAAGTTCATTGATGGCTATACCACTTGGAGTTGTATTTGGAGTAAATAAAAAAATGTATGAATATT
TCAAACCACTATTTGAATTTATGCGAAGTACACCTCCACTAGCTTTGGTGCCAATGCTTATTTTATGGTT
TGGTATAGGTGAAGAATCTAAAATTATAATTATTATTTTGGCATCCTTTTTTCCAATATTTTTAAATACA
TTGAAAGGTATAAAAAATTGTGACAATAAATTAATAGAAGTAGGTAAATCTTTTAATTTATCTAAAAAGA
GAATTTTTTATAAAATAATAATCCCTAATTCTATGCTGGATATTGTTGTTGGACTTAGTTTAGGGCTTGG
GTATAGTTTTAGGGCTATAATTGGAGCAGAGCTTATTGCAGCTTCTTCAGGACTAGGATATTTGATTTCT
GATGGAAAAGATATGTCTAGAACTGATGTTGTATTGGTAGGAATTTTTGTTATTGGATTTTTAGGTATAC
TTTCAGATTATCTATTTTCAAAGATAATAACAAAATTTAGCAAAGGGAAGCAGGTTGATTTAAATGGTTA
G
>ref|NC_013316.1|:1575661-1576392 putative aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGTTAGAAGTGGATTTTTGCTAGAGAATATATATAAGAAATATTTAGTTGATAATAAAGAGCATTTAG
TTCTTGATAATATATCTTTAAATATATCTAGTGAAGAGATAACTGTTATATTAGGTGAAAGTGGATGTGG
GAAAACAACGCTACTTAGAATTTTAGCAGGGCTTGAAAATGCTACTAGTGGAAACATATATTTTTTTAAT
AATGATAAAAAGTGTACTCCAAAAGTAGGAATGGTATTTCAAGAAAGTAGACTTATGCCATGGCTGAATG
TAAGTGAAAATATACTTTTACATACTGAAAAAGATAATAGAAATAAAGTTGATTTAGACAAGTATTTAAA
AATGATGAAGCTTGAAAAGTTTAAAAACTCATATCCAAATGAATTATCAGGAGGAATGGCTCACAGAGTA
AGTATAGCAAGAGCACTTTCCTTCAATCCCGATATTTTGCTGATGGACGAACCATTTGCAGCGCTAGATT
ACTTCACAAGAAGAAAAATGCAAAAAGAAGTTGTAAATATCCATAAAAATACTAAAAAAGGTGTAGTATT
TGTAACTCACAATATTGAAGAAGCTATGGAAATAGCAAAGAAAATAATTGTTTTTAGTAAAAATAAAAGG
ATTAAACAATTTAGTGTCGAAGATGAATATAATAGAGATTTAACTAAAAACTATTATATAAACTTGAAAA
AAGAAATATTAAGGGAATTGGGGGAGTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1576426-1577385 putative aliphatic sulfonates ABC transporter, substrate-binding lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGACATCTTTAATAATGGTGTTGGTTGGGACTGTAGGATGTTCAACAACAAATGATAAGAAAGATGAAC
CTGCAAAAAAAGAGGCTAGTTTACCTAAGGAAATAAATTTAACTTATGTAAAATCACCACTTAATGTTCC
TAGTATATTAGAAAAAAAGGATGATTTATTTGGAAAGGAATTTAAAAAGGACAATATAAAAGTCAACTTC
CATGAATTGACAACAGGACCAGAGCAAACTCAAGCATTAGCAGCAGGTGAGCTAGACTTTTTACATGCAT
TAGGAGGAACGTCTGCAATAATAGCTGCATCAAATGGTGTTGGTCTTAAAATTACGAATATTTATAGCCG
TTCACCAAAAGGATATATGCTTATAACTAATAATGATAATATTAAATCTATAAAAGACTTAAAAGGTAAA
AAAATTGTAGGTCCAAAAGGGACTATACTTCATCAACTGTTGATTGCTGCACTTGCTAAAGAAGGCTATA
CTATAGATGATGTTGAATATGTAAATATGGATATTCCTAGTGCTGCTTCTGCATTAGAAAGTAAAAGTGC
TGATGTAGCAATGCTTGCAGGTCCAGTGGCATTGAAAACGATAAATTCAGGTGCCAAAATGATTGTAAAT
GGAGAAGGATTAGTAAGTGGAATAATAGTTACTGCTGTAAGTGATGACTTTGCTGAAAAATATCCTGAAT
TAGTAAAAAGATTTATGAAGGTTCATGAAGAAACTTTAAAATATATGAATGAAAACAAGGATGAAGTGAT
GGATGTTGTATCTAAAGAAGTTGGTTTATCTTTAGATGAAACAAAAGAAATGTATTCTTGGTATGACTTT
AGTTCTAAAATAACGGACAAGGATATAAAAGAATTAGAAGATACACAGGAATTTTTGATGTCTAATGGAA
TGCAACAAAAGAAAATAAATATTAAAGATATGTTGTACAATCAAAATTAG
>ref|NC_013316.1|:c1578079-1577483 hypothetical protein CDR20291_1334 [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTTGTTGTAATTCACAATTTTGTTGTAAAAATAAAATTGAATCATCATATATAAAATGGCTTTTAG
AGGTTTTAGGTCCAGTCTTTTTAGGCTCTAAACCTGCTGAAATAATAAATATTTCGTTTACTGATGTAAA
TAGAGAGGAAAAAATTAATGATATTTATAAATATCTATATAAATGTAAGAAAATAGATTTTATAGTTATT
GATAAAGAAAAAAAGGGATTAAAAATCTTATTTGTAAATAAAAAAGCATTATCAGAAAAATTAAAATGTA
AAAAAACAGTAAACTTTTTAAAGTTTTTAGGATACAAACAAAATACGAATGTTAATGCTTATTTAGAGCA
TTTAGTAAATAAACTTAAGAGTGATGTTTTTCCTGATGAAATAGGTATTTTTTTAGGATATCCTCTTAAA
GATGTGATTGGATTTATGGGATATAGTAATTATGAAGTTTCTATGATTAAATATTGGAAAGTTTATGGTG
ACACAAAACAATCCGAGGACACATATTCAAAGTTTTTACTTCACCGTAAGAAAATGAGAAAATTACTAGA
CTACATAAGTGTAGATAAAATAGTAAGTTGTTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1578325-1578924 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTAAAAAGAACTTTATTTGTAGGATTAGCATTAGTATTAGCTATAGGAATAACTGCATGTGCTA
GGGATAATGAAAAACCAAATGAAAATGCAGGAAAAAATCCTAATGAATCTGTAAATAATAATGAAGGATA
TATGAATTATTATTCAACAAGTTATAATGATTATATAGCAGGTCTAAATAGATATTCTATTTATGATACT
CCAGAAAGTATAAACAATCAGTTTAAAGATAAAGAATATCCAGGAAATGAAAAATATCTAAGTGATGTAA
AGGCTGCATATAAAGATAGTAGAGATAAAATACAATCATTTGTAACATCTCTTAAAAAAGACGGTAAAAC
AGAAGATACAGAGTTAAAGAGAATGAATGATGACCTAATAGCTGAAGGGGAAAGATTAGTAAAAGATATA
GATGAGAGAATAGAAAAATTAGATAAGGTATCTGATGAAGATATGAAAAAAGGTCAAAATGATTTTATGA
AACTAGTTCATGGAACTGAAGATGTTGGAAACGATATTGGTAGTGGTTTTAGAAAAATGATAAAAGATAT
GAATGATAGATTGGGAATAACAGGAAATAATAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c1579559-1579092 hypothetical protein CDR20291_1336 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATGATACTATTAAGGCTGATGATATTCTCAATTATTGTCTATCAAACTTAGATGATGTTGTAC
TAATGGATAGTTGGGGGGAACGAGCAATTTACTACAATCCTAATGGTGTTTTAAAGCGAGGGGTATATGT
TCTTACCATTAAAGAAAAAGACAGTAATCATGATAAAGGTTCGTTGGTTAGTCGTCCAAATGTATACCGT
GTGAATATAGGATTAAAAAAAGAAACTTTTATTGAAATGTTTGGATATATTCCAAAGCGTCCAGGTGTAG
GGCAAATAGTTGATATGGATTTTGATTTTACAAAATTGGACACAATCATGCCACATCCTATCTACTCATG
GATGGGATGGATATGCGTCCTAAGCCCTACTGAAAAGACATTTGAGAACTTTAAAACTTTAATAGAAGAA
TCTTACAATTTTGCAAAACAAAAATTTAAAAAGAGAAAAAACAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1579664-1580581 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATGTCAAGAGCTGAGCGTTTAATTGAACTGATGATAACAATAAATGCAAAAAGAAGTTTTACAG
CGGGAGAGCTAGCAGAAGAATTTTCTGTATCAAAACGTACTATACTAAGAGATTTACAGGTATTGGAAAG
TGTTGGATTTCCACTATATTCAAAAGTTGGAGCGGCTGGAGGATATCATGTACTTAAAGAACGTATACTT
CCACCAATTACATTTTCAGAGAGTGAGGTAAAATCTATATTCTTTGCATATCAGTCACTAGAGTATTATA
ATGATTTACCATTTGAGCAAGAAACTATTTCTGTTTTAAAGAAATTTTTAAATTGTATACCAAATGATAT
TCAATATAATATTGAGAATATGAGACGTAAACTTGTTTTTTGGACACCAGATAGGCATTGCTCAACACCA
TTATTGAAGGAATTGTTTAATATAGTAATGAATGAATTTACAATTAAAATTGAATATTCATCAAAGCAAA
AAAATAGTATACGTACCATTGTTCCTATTGGTTTGTATGCTATGAATGGACTTTGGTATTGTCCAGCTTA
CTGTATAAAATCAGAATCTGTTAAGGAATTTCGTGCAGACAGAATTGTGAAGATTTTGAGTATAGAAAAC
TTATCAAATAAGAAATATAAGGTTTTATCTTCTATACATGATTATCTTAAGAATATGGAAGTAGGTACAG
ATTATCATATTAAAATTAATCTGACAGATGAGGGAGTAAAACGTTGTGAAACAGAATTTTTGTTGGCAAG
AGGATTGAAAATTTTGTCTAAGGGTGGATACATAGATATGTATATACCAAAATCTACACTTAATTGGGTG
GCTGAATATTTTTTAACTTTTGGAAAAAATGCTACAATAATAGAACCTATAGAACTTAAACATTTGATTA
AAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1582985-1583965 D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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ATGTAAGTATTGAAATAGAATCTGGAGAAATTTTTGGAATAATAGGTCATAGTGGTGCAGGGAAATCAAC
ACTACTGAGATGTATAAACGGATTAGAAGAATACCAAGAAGGCAGTGTACTTGTTTCTGATAAAGAAGTA
AAGTCATTGAATGAAAAGCAAATGAGAGATTTAAGAAAAGAGTTAGGAATGATTTTTCAACACTTTTCAT
TGCTTGAAAGAAAAACTGTATTTGATAATGTAGCATTGCCATTAGAATGTTTTGGATACTCAAAGGCAGA
AATTAAAAAAAGAGTTTTAGAGTTATTAGAAGTAGTTGGAATATCTGAAAAGAAAAATGATAAACCCAGA
AATCTAAGTGGCGGACAAAAACAAAGGGTTGCAATTGCTAGAGCTTTAGCACTAAACCCACAAGTACTTC
TTTGTGATGAAGCAACTTCAGCATTAGACCCAAATACTACAAAGTCAATTCTTTCATTGCTTGAAGATAT
AAATAAAAAATTGGGAATAACAATAATAGTTGTAACTCATCAAATGGAAGTTATAAAGCAGATTTGTGGA
AGAGTAGCAATAATGGAAAATGGAGAAGTATTAGAGGTAGGAGATACAGAAGAAATATTCTTAAGAAATA
CTAAAGGACTTAGAAAATTAATAGGTGAAGAAAGTATAATATTGCCAAAAGGAACAAATATAAAGATACT
ATTCCCTAAAGATATTTCTAATGAAGCTATTATTACGACTATGGCAAGAGAACTAAATATAGATGTGTCT
ATAATATTTGGGAAATTAGAACAATTTAAAGATGATATTTTAGGTTCACTTATTATAAACATTTCAGATA
AAAGTGGAGAGCACGTAAAACAATATCTAACTAGTAAGGGCATAAGATGGGAGGAAATGATAAATGAATA
G
>ref|NC_013316.1|:1583958-1584614 putative D-methionine ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAGTTTAATTGACTTTTTAACAACACTATTTCCAAATGCATTGTTACAAACTTTGTATATGGTTA
TAGTACCAACTATAGTGGCAACAATATTAGGATTTATATTAGCAATCATATTAGTAGTTACAAAACCAGA
TGGATTAAAACCAAATAGCACAATAAATAGTGCATTAGGATTTATAGTAAATATATTTAGAAGTTTCCCA
TTTATGATACTTATAGTTGCAATGATTCCAATAACTAGATTAATCGTTGGAACAAGTATAGGGGAAACTG
CTGCAATAGTGCCAATAACTATTGGGGCAGCACCGTTTATCGCTAGAATTATAGAAAGCTCATTAAATGA
AGTTGATAAAGGATTGATAGAAGCAGCAAAATCTTTTGGAGCTACAAAAAGACAAATAGTATTTAAAGTT
ATGATAAAGGAAGCTATGCCTTCAATAGTATCTGGAATTACATTATCAATAATATCTATACTTGGTTATA
CAGCTATGGCAGGTGCAGTAGGAGCTGGAGGATTAGGTAATATAGCACTTATTTATGGATATCAAAGATT
TGATACAGCAGTAATGGTATATACTGTAATAGCACTTATAATATTAGTTCAGATAATCCAGGGAGTAGGA
AATCTGGCTTATAAGAAACTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1584650-1585441 putative D-methionine ABC transporter, substrate-binding lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTAAAGAAATTATTATCAGTAGCATTGGTGTCAGCAATAGCAATATCAGCAGTAGGTTGTTCAA
ACAAAGAGGATAAAAAAATACTAGTAGGAGCTTCATCAAATCCACATGCAAAGATATTGGAAGTTGCAAA
ACCTTTGTTAAAAGAAAAAGGATATGATTTAGAAGTAAAAATATTTGATGATTATGTACTTCCAAATACA
GCTTTAGATGAAGGGTCTTTGGATGCTAACTTCTTTCAACATATTCCATTTTTAGAGGAAACTGTGAAGG
AGAAAGGATATAAACTTACTTATACATCTAAAGTTCATATAGAGCCAATGGGATTCTATTCAGAAAAAGT
TAAGTCATTAGATGAATTAAAAGATGGAGCTGTTATAGCTGTGCCAAATGATGCAACTAATGGAGCTAGA
GCACTTAAATTATTAGCAAAAAATAAATTGATAGAAGTAAAAGATGGAGAGCTTATAACTAAAAAAGATA
TAACTAAAAATCCTAAAAATATAGTAATAAAAGAAATGAATGCAGAGCAATTACCAACAGTATTAAAAGA
TGTTGACGGAGCAGTAATAAATTCTAATTATGCTTTAACAGCTAACTTAAATCCTACTAAGGATGCAATA
GTAATAGAATCAAGTGATTCTCCATATGTAAATATAATAGCTTGTAGAGAAAATAATAAAGATAGTGATA
AGATTAAGGCTTTATCAGAGGCTATGAATAGTAAAGAAGTTAAAAAATTTATACAAGATGAATATAAAGG
AAGTATAGTTCCAGCTTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1585589-1588327 putative two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATCTAAAGGAACTTTAAGTAAGAATAAGGTCTATATACTAGCTAATGGGTTATTTTTGGTTATTG
CACTTTTAAATATAAATTTGTATACAGTTTCTATAAATATGTATAGAATAATTTTACTTTGGATATTTGG
ATATTCTATAGTTTATATAAGTAGCTTTAAAACAGATGAATTTATAAATATATTGAAAGTAGGGTGTCTT
GTATTAGTTTTTGTAAGTATTTTAGGAGTAGTAAATTTAAAAATTCAAAAATTCCAAATTGTATTGCTTA
ACTTAAGCATAATTAATATGTCTACTTTTATATACTTAACCATTTCTAAAGTAAAAAAACTAAGAATAAG
CCCAATACTAATTTTTTATAGTGCTTTTGTGATATTAGATTACTTTATAAGAAATATTTTTAGTGATATT
AACTGGAATATGATTATTATATTAATTAATATTTGTATATCTATGTTTAATTTACTATATTTGTTGAATA
AACTTGATAGTAACATTGAGCACTATAAGTTAATAAAAGATTTAACATATTTTGTTTTTTTTACAACTAT
TATATGTTTTGTAGCAATTTCTAAGATTAATATAGTAGATTCAGATAGATTAATAGGAGTAATATATTTA
CTATTATGTAACCATACTTATTATGTATATGTATACAGTCTTAATAATAGAGTAGTGTATCCATATTATG
AACTTGATTCAATCAATAAAAAATTAAGTAAAAAGTCAGAGCAATTAGGAAAGATAAATTTAGCAATAGA
AAAGGATATGATTATACAAAGAACATTAAAAAACTACATAGACCAGAGAAAAGAATTACTTAGACAAGCT
CTGGATACAATACCAAATGTATGGATAGTAACAGACTATGATTTTAATATAAGTTACACAAATAATAAAT
TTAAAGATGAATTTTCAAAGGATATGAATAATTATTATAAAATATTAACTTTTATAAAGGAAGATGAAAA
AGTTGCTGAAAAATTGAAGAAATTTGATAACGATATAAGTATAATTGATAAACTGGTAGAGTTAAATGAT
AAAATTTATTTGTTAAGTTTAAGTAATAATAAAGATGAAAGCAATTACTTAATAAGTTTAAATGATATTA
CAAATGAAATCAAAATAGATGAAGAAATAAGAAATATAAATAAAGACTATGAAAACATTATACTAAATAT
TCCATCTCCTATACTTGTAAGAAGTGCTGAAGGTGGCATAAAGAAGAATAAGGTAATAAGTATAAATAAA
AAATATGAAAAGAGTTTTAAATGTGTTTCAAGTGATTTAGTCGATATGACATTAGAACAATATTTTGAAA
CTTTTAACATAGATTTCTTTGACAATAGGAAATTTAAAAGATTAAATCTAACACAAGAAAAGAAAGCTGA
AATAGTAAGTTACAATGACACAGCAAACTGTATAGTTAATTTTGTGATGTCTGACTCAGAAGGTGAAGAA
CATGTTGAAGAAGTTAGAGTTGGAGACTATTGGTCAGATAATAAACTCTTTAAATTGCTTACATTTAGAG
ATATAACTAAAGAGATAAATATTCTTAGAACAGTAAATGAACAAAAAATAATATATGAAAAATTACTTGA
TGTTATACCAGAGGCTATTTTTCTTGAGGATTTAAGTACATCAAGAGTACTATATACAAATAGAGCCTTT
AGAGAGTTGTTCGGAATTTCTAGTGATGTATTAGGAGTTACAACACAAAAATATAGAAATATATTAGTAA
AAAAATACATAAACAATTTAAATATAGGAGAAAGAGAGAAGAGTATCCATATAGTAAATGAAAATAATCA
CATTAAAGAAGTAAAAATGATATCAAGAACATTATACTTTGGACAGAAAAGAAGTAGAGTGAGAATTATT
AAAGATTTAAGTGTGCAAAGAGAGTCTGAAAGACTTAAAAAAGCATTAATAAAACAAAGACAGTATGACC
AAATGAAGATGGAGTTTTATGCTAATATATCTCATGAACTTAAGACACCTTTAAATAATATATATAGTTC
AGTTCAACTTATTGAAAACCTTTATAAAAAAGGAAAAATAATTGATTTTCAGGATATACTAAAAGAACAT
ATAAAAATAACTAAACAAAATATGTTTAGATTATTGAGATTAATAGATAATATAATAAATATTTCTCAAG
TTAAGTCAGACATATATAAGATTAAAGCAGTTAATTTTGATATTATTGACATAACAGAAAGAATAGTTAC
ATCTATTAGTAGTTATGCTAAGTCTAAAGGAATAGATTTAATTTTTGATACGGATGAAGAAACTGTTATG
GTAGGGCTTGACCCAGAATCTATAGAAAGAATAATACTAAATATATTATCAAATGCTATAAAATTTACTT
TAGAAGGAGGAGAAATCCTTGTAGGTATATATAAAAAAGACGAAACAGTAGAGATAATTATAAAAGATAC
TGGAGTGGGCATAGACAAAGAAAAATTAAATGATATATTTAATCGATTTAAACAAATTGAAAACAGTGGT
ATATCAAATGAATTTGGAAGTGGTATAGGTTTATGCCTTACAAAATCATTGATTGAAATTCAAAATGGGA
AGATTTACATAGATAGTAAGGTAGGAGAAGGAACTAATGTAAAAGTTATATTCCCAATTAAAGAGGTTGT
TGAAGAAGTATATGATAATTCAAATTACAATGATAATATTGAAAAGTTTGAGATAGAATTTTTTGATATA
TATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1588436-1589044 putative 3-methyladenine DNA glycosylase [Clostridium difficile R20291]
TTGGAAAAGGATTTTTTTAGAAAAAATGGAATTGATTTAGCCAAATCAATATTAGGTAAATATCTAATAA
GGAAATATGAAAATAAAGTAATTGTTACCAAAATCATAGAGACAGAAGCATACATGGGTGTAAATGATAA
AGGAGCACATGTATATGGCAATAAAAAGACAGATAGAACTAAGCCATTATATTTAGATGGTGGACATATA
TATGTTTATTTAATTTATGGTATGTATAATTGCTTAAATTTATCTGCAAATATAGAAAATGTGCCAGAGT
GTGTATTAATAAGAGGGGTAGAGCCTATAACTTCTTTAGATGAGATATCTATGAATAGATACAACAAAGC
TTACACTGAGTTGAGTAAATATCAAGTAAAAAATATTACTAACGGACCAGGAAAACTTTGCAAAGCTTTA
AAAATAGATAGAAGTCTAAATAGTAAGAGTATAATGGGTGAAGAATTATATATAAGTGATTTTTATTATG
ATGATAAAGGAAAAAAAGTATTTAGTAAAGATGAGTTAGATATAAAAACTAGTAAACGTATAAATATAGA
TTATGCAGAAGAAGCAAAAGATTTTTTATGGCGTTTTTATATAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1589924-1590514 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGTTTTGAATAAGGACATAGGAGCAAAAATAAAGCAACTCAGAACTCAAAAGCAAATGACGCTGAAGG
ATATGAGTGAAAAAACAAACTTGTCAATTGGTTTTTTATCACAACTTGAAAGAGGATTAACAAGTGTGGC
AACAGATTCCTTAGGAAAAATAGCAAGTGTACTAGATGTAGAATTAACTTACTTTTTTATGAAGCCAAAA
GAGCATAAAAGAGCTGTATTAAGAAGTTATGAAAAAGAAGTATTTGATGTAGAAAACTCAACATTTATAC
ATTATCATTTATCATCTAGTTTAAAGGAAAAAACAATGCTACCAAGATTAATTGAAATTCTTCCAAGTAA
GAGTAGTGAGGAAATTTGTTGTTACGTACATGAAGGTGAGGAATTTGTGTATGTATTAGAGGGTACTCTT
ACAGTGTTTTTGGGAGATGAACAAATAGAAATGTATCCAGGAGACACAATACACTATAATAGTGAAAAGA
ACAATCATAATTGGGTCAACTATACTAATAAGGTAGTGAAAATTTTGGTAGTAAGTATACCAAATCCATT
TGAAAAGTCTGATGCAGTTAAAGAAGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:1590554-1591357 pyrroline-5-carboxylate reductase [Clostridium difficile R20291]
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AATTAGTTGAACCTAATATGGTTATAGCATCAGCATATAGTCAAGGAACTCTCGATAGAATAGATGCAAA
TTTTGGAATAAATACTACAAAAGACTCGAAGGAAGTAACTAGAACCTCTGATATAGTAATTGTAGCTGTT
AAACCAGATATATATGATGATATTTTGGAAGAGATAAAAGACTTTATAGATGACAATAAAATTATAGTTA
CAATAGCAGCAGGAAAATCTATAAAGGATATAGAGTCAATTATAGGAGAAGATAAAAAAATAGTTAGAAC
TATGCCAAATACTCCAGCTCTTGTAAATGAAGCCATGTCTTCTCTTTCTATAAATAAAAATATAAACAAT
GAAGACTTAGAAGCAGTTACAGAAGTATTTAATTCTTTTGGAAATACTGAGGTAGTACCAGAGTATCTTA
TAGAAGCTGTAATTGGTGCAAGTGGTTCTGCACCAGCATATGTATTTTTATTTATAGAAGCTATAGCAGA
TGCAGCAGTAATTGCAGGAATGCCAAGACCACAAGCATATAAGTTTGCATCACAGGCTGTTATGGGTTCT
GCAAAAATGGTACTTGAGACAGGAAAACATCCTGGTGAATTAAAAGATATGGTATGTTCACCTGGTGGAA
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ATGTATAGAAAAATCTAAAAAAATGAGTGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c1592640-1591438 hypothetical protein CDR20291_1346 [Clostridium difficile R20291]
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TGCTTGTACTTGGGAGTATGAACCTTTCTTATGCAGATGGTACAAATGTAGTTACACTTGGAGCTAACTT
ATCAGAGTCTCAAAAGCAGCAAATGCTTAATTACTTTGGAGTAAAAAAAGACCAAGTCTTAGTTTTAGAT
GTAACAAATGCAGAAGAAAGACAGTATTTACAAGGTGTTGCAACAGAGGGTCAACTTGGAAAAGTTACTA
TCTCTTGCTCATACGTTGAACCTACTAAAAAAGGAAATGGAATTAATGTTAAAACAGCAAACTTAACTTG
GGTAACTAGTTCAATGATTGCTTCAACCCTTACAACAGCTGGTCTTGAAGATGCAAATGTTATTGCTGCT
GCTCCATATCCTGTAAGTGGTACTGGAGCATTGACAGGAATCATGAAAGCATTTGAGGATGCTTCAGGAA
AGAAACTTGATGAAACTAAGAAAGAAATTGCTTCTGAAGAATTGGTAGTTACAGGTGACTTAGGAGATGA
TATAGGGCAAGAAAAAGCAACAGGTGTAATGAATGATATAAAAACAGAAATTGTAAAGAATGGTACAAAA
GATACCAATCAAATAGCAAATACAATAAATAATGTTGTAAATAATTACAATATTACTATTACACCAGAAC
AAAAAGAACAAATTAAAGGTGTAATGAAAAAAATAGCTGACCAAAATTATGATTACAATAGCATGAAAAA
TACACTAGATAATGTATCAGATAATGTAAATGAACAATTAAAGAAATTAGGTGAAAGTGTTAAGGGTTCT
GGTATACTAGATACTATTGGTGGATGGTTTAGTGGAATAGGAGACTGGTTCTCTGGTTTATTCTCAGGCG
GAGATAAAAAAGATTTGGGAATCTTAAATAACACTAATGATGAGTCTCTTGGCTCTGATGCTGTAATAAA
TTCTACAGAAGGTGTTCAAATAAATCCACAAAATAATACTAATTCTAACAATGATAGTGATACAAATAGC
TCAAAAAATGATACTTCAAGTAATAATGAAAATAACGATAGTTCTCAAACAAATGAAAACAACACAACAA
ATAATTCAGAAAATCAATCAAATAATAATGACTCAGTTGGTTTCTTTGAAAAAATAAAAAATTGGCTTTC
AGGCTTATTTTAG
>ref|NC_013316.1|:1592880-1593356 hypothetical protein CDR20291_1347 [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAAAAGAATTAGTAAAAGATAGAGTAATAAAATATTTAATAGAAGATTTATTAGTCCCTCAAGATA
TGATTGATACAAATGTTGAGTTGGCAGAATTTGAAGAAGGTGCAGAAGGAGTTTTAGATATTGTTGTAAA
TGTTAAAGATGAAGAAGATTATTATGCACCTGTAATGATAGTGCAATGTTTAGATGAAGATGTAGAGTTA
GAAGGAGAAGTTTTACAAAAACAAATAGAATTTTTAGAAGAAGTGGATAATATAACTATGTCAGGTAGAT
TGGTTTTAACTAATGGGGATGCTATGATGTACGCTGATTGGAGAGGGGAAGAATACGATACTGAGGCAGC
TCTTCCAACTTATGATATAATGGTAAAAGAGTTTCATGAAATGGAACAACAGGCAAAAGATTTAGAAGAA
CATCATCACCATGATAAAAATTGTGGATGTGGATGTAATCATCATCATGAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1593626-1594531 RNA polymerase sigma factor rpoD [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAGAAGGGGTTTGATTATGGATACTAAAAAAGAAAATAATTATGAAAATTATATTTGTGTGGGTT
CATCAAATGTATCAAATGCGATGAAAATGTATTTAAAGGAAATAGAGGAATACAAAATGTTGTCAGCAGG
AGAAGAGGTAGAGCTGGCTAAGGAAATAATCAACTCATCTTCAGTAGCAAAAGAAAAATTTATAAATTCA
AATTATAGGTTGGTAGTGAGCATAGCAAAGAGATATAAAAGAGATAGTATTGATATGTTGGATTTAATTC
AAGCAGGAAATATAGGACTTATAAAAGCTGTAGAAAAGTACGATTATAAAAAAGGATACAAATTTAGCAC
TTATGCAACTTGGTGGATAAAACAAAGTATAACAAGATATATCGACGATTGCGAAAATACTATTAGGATA
CCTATACATCTTCATCAGAGAATAAATTTTGTAAAGAAAAAGAAACAAGAACTTTTAAATGTATTATTAA
GAGAGCCAACTATAGATGAGATTGCAGATGCATGTGGCTTAGAAGTTGACAAAGTGTTGGAATTATTAAG
AAGAGATAAAAATGTTGTATCTTTGGATACTCCATTAAAAGAAGATGAGGATAGTAGTTTAGTTGAATTT
ATACCATCAGATGCTGATTTTAAAGATGTTGTAATACACGAAGTTGAACAGCATAATTTAAAAGAAAAGA
TAGAAGAACTACTTACAGGTCTTGGTGAGCAAGAACAGCAAGTTTTAAGAATGAGATTTGGAATTGATGA
TGATGACCCTAAAACACTAGAACAGATTGGAAAGGTATTTGGAGTTACCAGAGAACGAATAAGACAGATA
GAAGCTAAAGCAATAAGAAAATTAAGACATCCAAGTAAGTTAAAACAATTAAAGCATTTTTATTAA
>ref|NC_013316.1|:1595005-1596549 putative membrane protein (virulence factor (MviN) homologue) [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCAAGGTAGCTAAAGCAACTTTTTATTTGATGATAGTTACTATAATCTCTAAGATTCTTGGAATGG
GTAGAGAATTAGTATTATCATCAATTTATGGTACAGGCTTATATACAGAGAGTTATTTAACAGCTATGAA
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ATAAGTAGTAAACAAGGTGAAAAGCAAGCACTAAAGTTTTTAAACAATGTTTTAAATATAATAGTTGGTA
TATGCATAGTTGTAGCTATATTAGGAGTTATTTTCTCAAAGCAACTTGTAAGTATATTTGCTATAGGATT
TGAAGGAGAGAGGTTTTTACTTACCGTAAAATTTACTAAAATATTGATAACAGGAATAATATTCATAGGT
ATTACGAGTGTTATGTCAGCATTTCTGCAAATTAAAGAGAACTTTATTGTAGTTGGATTTGGGAGTATAC
CCTATAATATAGTAATAATTATTTCAATAATGTTAAGTACCGTATTTGGACCATACATACTTCCAATTGG
TGCTGTGGTTGCTATGGTAGTTCAACTGCTCTTTTACATGTTTTTTGTTAAAAAAACGAACTACAAATAC
TTATACTACTTAAACTTTAAAGATGATAGCCTTATTAAATTACTAGCATTACTTTCACCAGTATTTATAG
GTGTTGCTGTTAATCAAGTGAACTCATTGGTAGATACAACTTTAGCCTCAACATTAGTTAAAGGAAGCAT
TCCAGCACTTACTTATTCAGATAGATTAAATGGTTTTGTTACAGGGACATTTACAGCTTCAATAGTATCT
GTTATGTATCCTATGTTATCTAAGTTAAGTGCAGAAAATAATCAAAAGAAGTTTACTAGTTCAGTTAAAT
CTAGTATAAATATGATAATAATTTCTATGATTCCTATTTCAGTTGCTTCTATTTTTTTTGCAACTCCTGT
TGTTAGAATCATTTTTGAAAGAGGTGCTTTTGATGCGAGGGCAACCCAAATGACAGCAACTGCCTTAATT
TTTTATGCAGTTGGTATGACTGCATTTGGATTAAGAGATATTTTGGGAAAGGTTTTTTATTCATTACAAG
ACACAAAAACACCTATGGTAAATGGGATTATATCTGTAGGGGTAAATATAGTATTGGACTTAGTTTTAAT
AAAACCAATGGCTCATGGTGGTCTTGCTCTTGCAACTAGTTCATCATCAATTGCATGTATATTGTTACTC
TTCTTGAACCTAAAGAGAAAAGTTGGATATTTTGGACAAGATAAAATAATAAAAGCAACTTTGAAATCGG
TAGTTGCATCTTTAATTATGGGTGTTTTATCATACTTTACGTATAAATTTATATTTGGAATTTTGGGAGT
AGGAACATTTAATGAGTTTGTATCACTAGCTATTTCAGTTATAGTTGGAGGTGGAATTTATACACTACTA
ATGACTATTTTTAAAGTTGAAGAGGTTGATATGATACTGAATATTGCAAAGAGAAAATTGCATTTAAAAA
AGTAA
>ref|NC_013316.1|:1596585-1597244 putative deoxyribose-phosphate aldolase [Clostridium difficile R20291]
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TTTCAGATATAAAAAATAAAGATTATGATAATATAGGAAAAGAAATAAAAGAAATAAAAAAAGCTATAGG
AGATAAAGTATTAAAAGTCATTATAGAGACATGTTATTTAGATGAAGATGAAAAAATAAAAATGTGTGAA
ATAGTAACAATGTCAGGTTCAGATTTTATAAAAACATCTACTGGAATGGGAACAGGTGGAGCTACTTTAG
AAGACATAAAGCTTATGAAAGAGCATGTTGGAAAAAATGTAAAAATAAAAGCTGCAGGGGGAGTTAAATC
AATTTCTGATGCAGAAAAATTTATAGAGGCAGGAGCAGAAAGGTTAGGAACTAGCTCAATATGTAAAATA
TTAAAAAATGAAGATACAACAGATTATTAA
>ref|NC_013316.1|:1597427-1597795 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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TAATTTCAAGGAGGATTAA
>ref|NC_013316.1|:1597799-1598674 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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GTCAGATATTTGAATTTTCTTCTAGTTTTTATAAAAGTTATGATAAAGGCTTAGAAGAAGAATTATGCAA
ATATTTTGATTTAAATACTAAAAAAAAGTATAAACAACTGTCAAGAGGTATGAAAACTATACTTTCAAAT
ATAATAGGTATTTGTTCTAATTCAGCTATCACCATATTTGATGAGCCAACAATTGGTTTGGATGCAGTAA
ATAGACAAGAGTTTTATAACATAATTTTAGATAGTTATATAAAAAATCCAAGGACAATAATAATATCAAC
TCATTTGATTGATGAAATAGATGATTTACTGGAGCATGTAATAATATTAAATGAGGGAAAAATTATTATA
GATGAAGAAATTGATGTCATAAAACAAAAAGCTCATTATATTACTGGAAATAAAGAAGAGTTAGAAAAAT
TAGAATGTATAAAAAATATAAAACCTAAAAAGGCATTTGGAAATGCAGTTGCTTATTTTTACTATGGTGA
TTTTAGTGAAAATGATGAAAAAATACTTAAAAATTCAAATATTGATGTAGGATACATAGGGCTACAAGAT
ATGTTTGTTAACATGACTAAGAAGGAGGAATTGTAA
>ref|NC_013316.1|:1598675-1599469 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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TTGTGGGAATTGTTATGAATATTTTGCCAGTGTTTATCCTCAAGATTTTTGGAGAAGCATCTAAAACTAA
TTTATCCACGATTGTGAATCCTATTTTAACATATATAACTATACTGCTATTTGTGTATGGAGTAAATATA
GCAAATAAAGACTTTTCAGGAGCTTTAAGTATAAGAGCAGATCGAAAAAGTTGTATAAAAGCTATTGTCA
TAGATTTAATTATTTTAAGCTTTGTGATTTCTATTTTAGGTATAGTTTTGATTTTTTTATCGAAGTTATT
TATAGAAATTATAACAGGTTACAGTATAGAACTATCAGTTTTACTAAAGAGAGATATGATTTGGACATCT
ATATCAGCACTGATAGATCCTTCAACATCAAGTATGCCACTAACTTATTTAAATTATTTTGTACAAATAT
GTATAAATGAAATATGTATAGGTTTTATAGGAGTATTACTTGGAGCTTTTACATATAGAGTTAGAAAAGT
TACTAGTATTACTATATTGATAGGATTACCGATATTAATGGTAATTTATATAGTTAATTTTGCAACTAAA
AATATGCATAAAATGCTATTGTATTTAGAAAAAATTATTTATTCATTTCAGAATCCTTTTATTTTATTTG
GAACAAAGGTAGGAATTATAGTTATTTGCATAATATTTATAATTTTATTACTTAGAAAAGCACCAATTAA
AGAGTATGCAAATGACTTATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c1600889-1599564 putative drug/sodium antiporters [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATTTATTTACAAGAAAATTCACTACTTTTGAATTTCTAAAATTTGTTTCTCCTGCAATTATAT
CCATGATATTTATATCTTTGTACACAATAATAGATGGCATCTTTGTATCAACATTAGTTGGTTCCGATGC
TCTTGCTAGTATAAATATTGTACTACCTATAATTAACCTTGTTTGTGGATTTGGAATAATGATGGCAACG
GGTGGAGGTGCTATCGTTTCTATACGTATGGGTGAAAATAGACAGGATGAAGCCAACTCTACATTTTCTT
TTATAGTTTTGTTTTCATTGATTGTTGGGATTTCATTCACAGTAATCTCATATTTCTTTATCAAAGAAAT
ATCTATTTTGCTTGGTGCAACAGATAAGTTATTACCATATTGTATAACTTATGGTAAAGTTATGATTTTA
TGTACACCATTTTATATTTTAAAATTTATATTTAACTACTTTGCAAGAACTGATGGAAATTCTAAATTTA
GTTTATTTCTATCAGTCATTGGTGGTGTAACAAATATAATATTGGATTATGTATTTATTAAATATTTTGG
AATGGGTCTTTTAGGAGCTGCAGTTGCAACTGCTATAGGTATTATTTTAACTTGTGTTTTAGGTATTATT
TACTTCTTATCTAATAAATCTACACTCAAATTAAGAAAACCAAAAACCGATTTTAGACTTATAAGAGATA
CTATGATAAACGGTTCTTCTGAAATGGTTACAGAATTATCTACAGGAATTACAACATTCTTATTTAATGT
AGTAGCTTTAAAATTAGCAGGAGAAAATGGACTTGCTGCTCTTACTATAGTATTGTATGCTCATTTTTTA
ATGACATCAGTCTATCTAGGATTCGCTGCTGGAGTGTCTCCATTAATAAGCTATAATTTTGGTGCTGAAA
ACAGTGATAAATTAAAAGAAACATTTAAACATTCTCTAAAATTTATATTTGTTTCTTCTCTTTTAGTGTT
TATTATTGCTTTAGTATTTGCACCATTTATTGTTAGGGTTTTTGTAAGTCCAGATAACACAGTATTTAAA
CTAGCCTTACAAGGATTAAAAATATTTGCATTTGCTTTTTTGTTTGTTGGTATAAATATATTTGCATCAG
GATTTTTTACAGCATTTCACAATGGAAAAATTTCAGCTATTATATCTTTTAGTCGTGCCTTTGTTTTTAT
AATCATAGGAATCATAATTCTTCCTCCTATGTTAAACATGACTGGATTATGGCTTACAGTTCCATTTGCT
GAGGTTATAACCATATTTATATCTATTCTATTTATAAAAAAATATAAAGGTAGATATAAGTATTAA
>ref|NC_013316.1|:1601310-1601894 putative thioredoxin [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGTTTTTTATGGTAGTTTTAGGATGTATTTTTGTTTTAGGTGTGATTTCTGGATGTAGCAAAA
AAGAATCTAAGCCAGTAGAAAAAAACAAGAGTAATAGTGAATGGTTTAGTAATTTAGATACGGAGGATGT
TGATGGAAATAAGGTAACAAAAGAGATATTTTCAAATAAAGAACTTACTCTTATTAATGTCTGGACTACT
TGGTGTGGACCATGTGTGGGTGAAATGCCAGAGCTTGAAGCATTATCAAAAGAATATGAGAGTAATAATT
CCAATGTAGCTATAAAGGGATTAGTTGTAGAAGTTGATAAAACTGATATGAGAACTGGTCTTTCAAATGA
AGAGAAAAATTTAGTTAAAAACATTATGAAAAAGTCAGATGCAACTTACCAACAATTGACTGTATCTGAA
GAACTTAAAAAAACTGATTTTAAAAGAGTTATGGAGTTTCCAACAACTTATTTTGTAGACAAGAAAGGAA
ACTTTGTGGGTGAGAAGGTTGTAGGTGCAAATAGTAAGGAAGAGTGGAAAAAAATTATAGATGAAAGACT
AAAAATGGTAAAAGCCAATGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1601887-1602036 hypothetical protein CDR20291_1356 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAACTTTATTAAAGATAATAAAAAAGGCATTTCTATTATTGCAATTAGTATTATATTTATTGCAT
TAGGTACATATCGTGGAGAAACAAATACAGTATTAACTAAAGCAATTATGATTTGTCTTGAGTGTATTGG
TATTGGTTAG
>ref|NC_013316.1|:1602047-1602946 putative iron-sulfur cluster-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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ATGGATATGTAAATGGATTTTTAGAAGGAACTATATATGGAGGAGAAAGTAAAAAATTATGTGTACCTGG
ATTGAATTGTTATTCATGTCCAGGTGCACTTGGAGCATGTCCAATAGGTTCATTACAAGCAGTTTTATCA
AGCAGAGAGTATAAATTCTCATTTTATGTTGTTGGTTTTTTAATGGCATTTGGTGCTTTTTTTGGCAGAT
TTGTTTGTGGTTGGCTTTGTCCCTTTGGACTTGTACAAGATTTACTACATAAAGTACCCTTTCCAGTAAA
GATAAAAAAAGTTTATGGTGATAAATATCTAAAATATCTAAAGTATATAGTCTTAATAATGTTTGTAATT
ATTTTGCCAGTTGCTATTGTAAATGTAGCAGGGGGTGGAAATCCTTGGTTTTGTAAATGGATTTGCCCTT
CAGGAACACTTTTGGGAGGAATACCACTTATTTTAGGAAATGAGAATTTAAGAGAATCAATAGGATTTTT
ATTTAGCTGGAAGTTAAGTATTTTGCTATTGATATTATTGATGTCAATCATTACTTATAGGCCATTTTGC
AAGTATATATGCCCTTTAGGAGCAATCTATGGTTTTTTTAATCCTATTTCAATATATAGATTTAAAATTG
ATAAAGATAAATGTACAAATTGTACAGCATGTCAAACAAAATGTAAGCTTGATATACCAATATATAAAGA
TGTAAATAGTCCAGACTGTATTAGGTGTGGTGAATGTATAAAAGTTTGTCCACAAAATGCAATTACTACA
ACTTTTTCAAAAGATAAAAAAGAGAATAATATTTGTGCAAAAAAGTATAGGGGGATATAA
>ref|NC_013316.1|:1602951-1603520 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
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ATAATAAGATAAAAAATGAAGTGGATAGTATGTTTAATTCAATAAAAACACAAGATGCAGATACTGTTGA
TAAGTATTTCCCAAAATCAGGGTTAGGTAATCTTATATACGAAGATAAAGAAGGATTTAAAATGTATTCT
AAAAATATGACTTGGGAAATTTCAGATATAAAGAATAATAAGGATAAAGTGACTGTAGATTTAAAAATTA
ACAATACTGATATGGTTTCTATTTTAAAAAAGAATCCTCCTAAACTAGGAGAAATGATGCCAAATCCAAC
TATGAAAGATATTGATTCTGCAAAGAAAAAAGAATTTAATATTACATTAGAGCTTGTTAAATCTGGTGAT
AATTATGTTTGTAAAGTTAATCAAGAATCTGCAATGAAATTATTAAATGTGATTACAGGAGGTGGTATAG
ATTATCTAGCTGACTATAATAAAGATTATTATAAACAGCTTGATGAAGAACAAAAAAATTATGAAAATAA
AAATAGTTAG
>ref|NC_013316.1|:c1604334-1603687 hypothetical protein CDR20291_1359 [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAGACAAACACCATTAGAGAAACGATATGACAAGCTAGGTCCTCATATTGTAACAGCATTCAAAA
AACGTTATTTTGATGCTTATTACTGTAAAACTAGAAATGAAGCTTTGCAACAAATTTTAGATTTAATTCC
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GAGAAAGGATTTAAAGTTATTGATAGAGATTTAGCAAAAACTCCAGAAGAAAGAACTGAAATTATGCGTC
AAGCACTTCTATGCGATACTTTTTTGATGAGTAGCAATGCAATTAGTGAAGATGGACAACTCTTTAATAT
TGATGGAAATGGCAATCGTGTAGCTGCAATGATATTTGGTCCAAAAAATGTTATAGTTGTAGCTGGTATG
AATAAAATTGTAAAAAACATTGATGATGCAATACAAAGAACTAGAACAATTGCATCTCCAGCAGTTGTTC
AGCGTTTTCAAGATGTCAATACACCATGCTATATTAATGGAAGTTGTATAGATTGCACAAGTCCTGAAAG
CATTTGTGCATACATGGTTACTACAAGAATCAGTCGTCCAGCAAAAAAAATAAAGGTAATATTGGTAGGA
GAAAATCTTGGTCTATAA
>ref|NC_013316.1|:c1605638-1604724 hypothetical protein CDR20291_1360 [Clostridium difficile R20291]
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AGCATGCTCTTTTTTTAGAAGCAGGATTCACAAATAAAAATTATAATCTTGCTATGGAAGCTGACCACTA
TAAAAAGCAATTTGAAGATTTATTATCATACACTGTTAGTGCTAGTAATGGTATAATTAGACCTGATATA
TTATATTCAGAAGAGCTTGTAACTACTCTCACATCAGTTGCAGAACAAAAAACAGAAGAGTTTACAGGGA
TAGAAATAAACAAAGACATCACTACAAGAGAATTAAATCTACAAAGTGGTGTAAACCCACAAGTTGGTCA
AGACTTAGTGAACTATGTAGCTCAACTTAACTCTGATGCAATAAGATTACTTGATGGGCTTATTAATTTT
AAAGAAAGAGTCTTAGATGGTGTACTATCATGTACTATATTTACATCAAACTACCCTCTACTTCTTGAAC
ATATAATACATGAAGCAAATTTATATCGTTCTTATGTAGTTGACCTTGAAAATAAAATAGATATTGAGTC
AAAAAACGCTAAAGAAATAGAATTATTCTGGGACCATATTATGATGGAACATGCTCTGTTTATGAGAGGA
TTACTAGACCCCTCAGAAGGTGAACTAATAAATACTTCAAATGATTTTGCTATAAAATTTAATGAATTAA
TTGAAAAAACAAACGAAATGACTGATTCTAATATCAAGAACATTACAGAAGAAACTCTAAATGAAACTGT
TGAGTTTAAAGATTTTAAAGAAGCAGGAGCATCAGGAATAGAACAGTGTAAGATAAAATCTATAATATTA
CCACTTTTAGCAGACCATGTTTTAAGAGAGGCAAATCATTATATTAGAATATTGGAGAGTTATAAAAACA
TGTAA
>ref|NC_013316.1|:c1607911-1607063 putative pantoate--beta-alanine ligase [Clostridium difficile R20291]
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GGCTTGTTACAACAATGGGATTTTTACATGAAGGACACCAAAGTCTTATAAAAAAAGCTGTAAAAGAAAA
TGATAAAGTAGTAGTGAGTGTATTTGTAAATCCAACTCAATTTGGACCAAATGAAGATTTTAATAGCTAT
CCAAGAGATATAGATAAAGATTTTAAATATTGTATGGATAGTGGAGCAACAGTAGTCTTTAACCCATCAC
CAGAAGAAATGTATTTAAAAGGTAATTGTACTACCATTAATGTTTCTGGACTTACAGATTTTCTTTGTGG
AGCTAAAAGACCTGTTCATTTTGGAGGTGTCTGCCTAGTTGTTTCAAAGTTTCTAAATATAGTAACACCT
GATAAAGCTTATTTTGGAGAGAAGGATGCCCAACAATTGGCTGTAATTAAAAGAATGGTCAAGGATTTAA
ACATAAATACAGAAATAATAGGCTGTCCTATAATTCGTGAAAATGATGGATTAGCAAAAAGTTCGAGAAA
TACATATCTCTCTGAGGAAGAACGAAAATCTGCTCTAATATTAAATAAGAGCTTAAGTTTAGCAAAAGAA
GAATTAGTAAAAGGCAATCTAAATCCAAAGAATATAAAAGAATTAATAACAGCTAAAATAAATTCTGAAC
ACTTAGCAAAAATAGACTATGTTGAAATTGTAGATAGTGAGACATTACAACCTGTTAAGCAAATAGAACA
TTCTATCCTTGTGGCAATTGCTGTGTTTATAGGAAAAACCAGACTAATTGATAATTTTACATTTGAGTTA
AATATATAG
>ref|NC_013316.1|:c1608757-1607930 3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATACCATACAGACTTTTAAGAACGCTAAATATGAAGGAAAAAAACTATCTATGCTTACTGCTT
ATGACTACTCAATTGCAAAAATAATGGATGAATGTGATATAAATGGTATTTTAATAGGCGATTCATTAGG
AATGGTCATAAAAGGTGAAGAAAACACTCTATCTGTTACTATAGACGAAATTATATATCATACAAAAGCT
GTAAAAAATGGTGCAAAAAATGCCTTAATCGTAAGTGATATGCCTTTTCTATCTTACCATGTTTCTATAG
AAGATGCAGTTAAAAACGCTGGTAGACTTATAAAAGAAGGAGGAGCTCATGCTGTAAAGTTAGAAGGTGG
CTCAAACGTTATAAAGCAAATAGAAAGCATTGTAAATGCTCAGATACCTGTAATGGGGCATTTAGGATTA
ACTCCTCAATCAGTAAATTCATTTGGTGGGTTTAAGGTTCAAGGAAATACCAGTGAAACAGCAAGACAAC
TTATTGAAGATGCTAAATTAATAGAAAAAGCAGGTGCATTCTCTATTGTCCTTGAAGGAGTTCCTACGAA
AATAGCTGATATGGTAACTAATTCTATTTCAATTCCTACAATAGGTATAGGGGCAGGAATTAACTGCGAT
GGACAAATTTTAGTTTATCAAGATATGTTGGGAGTGTTTGGAGATTTTGTTCCTAAGTTTGTAAAGCAGT
ATGCAAATATAGGAGATATAATGAAAGATTCAATTAAAAATTACATCCTAGAAGTTAATACAGGTGCATT
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>ref|NC_013316.1|:c1609628-1608732 hypothetical protein CDR20291_1363 [Clostridium difficile R20291]
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TAGAATCAATAAATTTAACAAAAACAAAGATTTACAGCAATTTGAGAGATATAATTTATGAAAACGATAT
ATTATTTATTACAACATCAGATGATTCTATTGAAATTATAGACAAAAAACTTTCCAAATTTAATTTAAAA
CATAAATACATTTGCCACACAAGTGGCTCTTTAAAATCTAGTATATTGTTCTGTTCAAAAAAAGCAGGTG
CATTAATTTATTCTATCCATCCTATATTTGCATTTTCCAATAAAAATACCAACATAAAAAAAATGAAAGA
CATTTGTTTTTCCATAGAAGGTGATAATGAACAAGATGATTTAGTTATTCAAAATTTCATAGATGGTTTG
GGAAACCAATTTTTTATAAGAGATAAGGATACTTCATCCACTTATCATCTAGCTAATGTTTTAGTTTCAA
ATTTAGTATTATCTTTACTAGATATAGGAGTAAGTTACTTTATTAAATTAGGTTTATCTGAAGAGGAATC
TTTAAAAGCTATCAGTCCTTTAGTAAAAAAAAATATAGAAAATATACTTGATAATGGCTTTACTAAAGCT
CTTACTGGTCCTGTTTCTCGTGGAGATATAACACCAATAAGGAAACATCTATCTGTATTGAATAAAAAAG
ATGAGGATATCTACAAAATACTATCCTTAAACCTACTAAAAATAATTGCCTTAGGAAATGACAATTCATT
AAAAGGTACAAAAAATATTACTATAGAAAATGCAATCGAAAATTTAATAAGTAAATCTGAAAAATACAAA
GAAATTTACAAACTTTTAGGAGGAAAAAACGATGAAAAATACCATACAGACTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1610308-1612401 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
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CTAATGAAATTATTTTTATGAACAAGAAAATGAAAGAAGAATATAATATTTTAGATCCAGAAGGAAAAGT
TTGCTGGCAAGTATTATATCCTGAGCAAAATTCTACTTGTAGTTTTTGTAAAGTTTTAGAACTATTAAAG
AATGATAAAAAAGGAGTATTAATAAAGTGGTATGAAAAATGTAATAAGTTAAATCGTGTTTTTGAAAATT
ATGATAGTTTAATTACATGGCAAGATGGCACAGTTGTTCATATGCATCAATCAATAGATATTGCAAACTC
AACAATCTTAAATAAACCAATTAAGATTAATGAATTTAATGAAATATCAAATACTAAAGAAGGAAAAGGA
GTTTTTAATTTTTCAAGAGACAATTTTGATTATAATTCTACATTGCTTTATGATGCTTTGATTAGAGGTA
CAGATGAATATATATACATTTGTAATATGAAAACAGGCGTATTTCGATATTCACCATCACAAGTTGAATT
ATTTGACTTACCAGGAGAAATTGTTGAAAATCCGCTTATTTACTGGAAAAAAATTGTACATCCAGAAGAC
TGGAATCGTTTTTATAAGTCAAACACTGAAATAGGTAAAAACCAGATGGATTATCATACAGTGGAATTTA
GGGCTAAAAATCGTAGTGGAGAATATATATGGTTAAGATGTAGAGGACAACTAATGCGTGATGAATTTGG
AGAACCAAGTATTTTTGCAGGAATAATGACGCAATTAGGTAAACAAAATAAGATTGATTCATTGACACAG
TTACTGAATTATCATGAATTTATGAGTGTATTTGAAGATAAAATTTCAAATCCTATGATTGAAAAATTAT
GCATAGTATTATTAAATATTGACGATTTTAAAAATGTTAATGAGATGTATGATAGGGATTTTGGAGATAA
TATAATAAAAACACTAGCACAGTCTATACAATCTATTTTACCAGATAATGCTGAACTTTATAAACTTGAT
GGGGACGAAATGGGTATTCTTGTTGATAATGTTGAAGAAAATGAAATTCTAACTCTATATAATCAAATAC
AGAATATGATTATACACCTTCAACTATGGAGAAAATATGGATTAAATATAACAATTTCTGCTGGTTGTGT
AATATATCCAAAACATGGAGATACAGTAAAAGAACTTTATAAATGCGCTAGTTACTCTTTACAATATGCG
AAAGAGCATGGTAAAAACAGGCTTGTTTTTTTCTCCCAAGAAATATTAAAAAATAAAATGTATTCATTAG
AAATGATGCGGGATTTAAAGGCATCAATTAATGATGATTTTAGGGGATTTAGTCTTCGATTCCAGCCACA
AGTAGATACACAAAGTCATAAAATAATAGGTGTAGAAGTTCTTTTAAGGTGGACTAATGACAAATGCAAA
GCAATTTCTCCTTTGGAATTTATTCCAATATTAGAAGAAAATGATATGATAAATATTGTAGGGGCTTGGG
TGCTTCGAATGGCATTACGTACTTTTAGGAAATGGATTGATTACTATCCTTTTTTTAAAGTGAGTGTAAA
CGTTTCAGCTGTTCAAATATTAGAAGACACATTTATTGAAGATATAGTAAAAATTATAGATGATGAAAAT
TTTCCTTATCAAAATCTTGTTTTAGAATTGACAGAAAGTCATACAGTACAAAATATGAGTATTTTACAGT
TTAAATTTAAGGCTTTACAAGATTTAGGAATTTATATTGCTATGGATGATTTTGGTACTGGATACTCGTC
TCTAGAAGTTTTAAAATTTTCTCCAATAGATATAGTGAAAATTGATAGAGTATTTGTTAAAGATATATTA
AAGAGTAAGTTTGATGCTACATTTATACATTTTATTGTTGCAATTTGTCATGATGTAGGAATAAAAGTAT
GTTTAGAAGGTGTAGAAACACAAGAAGAGTATGATTTAGTTAAACAAATAAAGCCAGATTACATACAAGG
ATATTTATTTGGAAAACCGCAGACAGCAACAGAAATCTTTGACCTTTTAAAGCTAGATAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1614014-1614832 MerR-family transcriptional activator [Clostridium difficile R20291]
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TCTATGACAAAATAGGTATTTTTTCTCCTGAATATAAAGATAAAAATAATTATAGATATTACTCAGTTTA
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TATATACAAAATAGAACTCCCCAGCTTTGTGTGAAAATGCTTAAAGAAGAAGAAAAAAAGATAAGAGAAA
AAATAAAAAAACTAAGAAAGATAAGCTCTAAGATGCAAAATAGAATAAATATAACAGTTGAAGGAATTTC
TAAAATGAATAGTGAAGAAATTTATATATCCAAAAAGTTTGAAGAATATTTAGTTCTATCAAGCGATTTG
AGTAATATGAGTAATAGTGATTTTATGATGGAATTAATAGATTTCACCAATTATTGTAAATCGAAAAATT
TGTATCAAGGATATGAGTTGGGAGTAATAGTAAGTAATGAAAATATAAAAAATGGGGACTATTTAAGTAT
ATCAAGTTTTTATTTGAAGATAGATAAAAAAATAAAGGATAAAAAGCTATATGTAAAGCCAGAAGGAATG
TATGCTTGCATAAAACATATTGGAAAATATGAGGATTCATATAAATCTTACGAAAAATTGAAAAAATATA
TATATGAAAATGAATATAAAATTATTGGAAATTCGTATGAGGAGAGTATACTTGACTTTTTTTGTGAAAG
TAATGAAGATAATTATATGACTGAAATTTCAATTCAAGTATCCAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c1617085-1614965 putative ferrous ion transport protein [Clostridium difficile R20291]
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ACCAGTTTGTAATTGCATTGGCTGGCAATCCAAATACAGGTAAAAGTACTGTATTTAATCATCTTACAGG
GCTTAGACAGCATACTGGAAACTGGCCAGGAAAAACTGTAGCTACAGCTCGTGGTAATTTTAAATATAAA
AATACCGAATATGCATTAATAGATTTACCAGGAACATATTCTTTATTTGCCTTATCACAAGAAGAAATTG
TAGCTCGTGATTTTATATGTTTTGGTAATCCAGATGCAGTAATAGTAGTATGTGATGCTACATGTCTTGA
AAGAAATTTAAATTTAGTATTTCAAGTGATGGAACTTACAGATAAAGTTATTTTGTGTATTAATTTAATA
GATGAAGCTAGAAAAAAAGGCATTACTATTGATAAAAAACTTTTAGAGGATTCTCTTGGTATTCCAGTTA
TTTTAACTGCTGCAAGAAATGGCTCTGGTATGGATGAACTATTGGATACTTTAAATGATGTATCTTTTGA
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CCAGAATTGGATAATATTATACCAGGTATAAATTCTAGATGGTTGGGACTTAGACTTATTGATGGCGATG
AAAGTATATTTGAATCTATGAGTAATTATATAGACAAAGATTCTATAGATGCTATTAATGAAGTAAAGAA
AAAGATTCCAGACAATATAAATAAACAGAAAATAAGAGATGAGTTTACTAAAATCAACTATGATTATGCT
AAAAAACTGAGTGATGAGTGTTGTTCTAATGTTGCTAAAAAATCAACTGATAGAGAAGAAAAAGTAGATA
AAATATTAACATCTAAAATATTTGGGCTTCCAATAATGCTCTTATTATTAGGTACTATATTGTGGATTAC
TATAGAAGGGGCTAACTATCCATCCACTTTATTATCTAATTTATTACTCGGATTTGAGCCAAGTATTTCG
GGTATATTAAATAGTATTAATTGTCCATCATGGTTAAATGATATGTTGGTTTTAGGATTATACAGAACAT
TAGCATGGGTAATCTCTGTAATGCTACCTCCTATGGCAATATTTTTTCCATTATTTACCCTACTTGAGGA
TTTTGGATATTTGCCAAGAGTTGCATTTAACTTAGACCACCTATTTAAAAAAGCTTGTGCACATGGAAAA
CAGTGTTTGACTATGTGTATGGGATTTGGATGTAATGCAGCTGGAGTTATTGGTTGTAGGATAATTGACT
CTCCAAGGGAAAGACTTATAGCTATACTTACAAACAACTTTGTTCCTTGTAATGGTCGTTTTCCTACTTT
GATAGCTATATCTACAATATTTTTTAGCTCAGTTATAACCAACTCTTTCGTATCAAGCGTAGCAACTGCA
CTTTGCATAACTTTACTGATAATTCTAGGTGTTATAATAACATTGTTGGTTTCTTATACTCTTTCTAAGA
CGCTATTAAAAGGAGTTCCGTCTACATTTACATTAGAACTTCCTCCTTATAGAGTTCCTCAAATAGGAAG
AACTTTATATACCTCTATAATAGATAGAACAATATTTGTTTTAGGAAGGGCTGTAATGGTAGCCATACCT
GCTGGTGTCATAACTTGGATATTTGCAAATATATATATAGGAGATTTAAGCATATTATCACATGTTGCAA
ACTTTTTAGACCCTTTAGCTAAATTAATTGGTCTTGATGGTTTTATATTACTTGCTTTTATTCTTGGATT
CCCAGCAAATGAGATAGTTGTACCTATACTTTTAATGGCTTACCTAGCAACTGGTTCTATGATAGAATTA
GATAGCTTTAGTGCTTTAGGTCAAGTTCTTAGAGAACATGGATGGACTTATTTGACAGCTTTAAATGTTA
TGCTGTTCAGTTTACTGCATTGGCCTTGTGCAACAACACTTTTAACAATAAAAAAAGAAACTGGTAGTTT
AAAATGGACTGCCTTAGGATTCTTAATGCCTACTATACTTGCTTTTGTTGTTTGTTTTTTAACAACTACA
GTTTACAATTTATTTATATAA
>ref|NC_013316.1|:c1617338-1617111 putative ferrous ion transport protein [Clostridium difficile R20291]
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TAAGAGAAAGAATGTTAGCGCTTGGTCTTACTAGAGGAGCTGTTATAGATGTAGTTAGAAAAGGTCCAAA
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TTAGTTTCTGACATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1618105-1617665 putative acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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AGGTATTTGCTTGTGAACAGAAGATATTTTCATTAAACGATTATGATGATATAGATAAAAGCTCTTATCA
CATATTTTTAAAAGAAAATGGATTGATTTGTGCTTATGCTAGAATAATTCCTAAAGAATACAGCTCTTAT
AATGATGTTTCCATTGGTAGAGTTTTAGTTCTTTCTAGTCATAGAAGAAAAGGATTAGCAAAACAAATGA
TGGATTGTGCTATAGATTTTATAAAAATTAACTTACACGAAAATAATATAACCTTATCAGCACAAACTTA
TATAAAGAACCTTTACTTATCTTGTGGTTTTAAAGAAATCTCAGAAGTATACGACGAAGCAGGTATTGAA
CATATTAAAATGAGATTATAG
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CTACTAAAAAATTAACTGAAGCAGCTTTATTGTCATCTTTATTCATAGTAGTAACAATTATAGCTGTGAG
TACTGGATTTGGATATGCTATTTACTTAGATTTTATAGTGCCAGTATTTTTTTGTATAATCTGCTTGAAA
TGTGATTTAAAGTATACCATTTTATCTGGAATTACTTCACTTTTAATAATTTCTCTGGTACTTGGAAATC
TAGGAACTGCTATTTGGGCAAGTCAGAGTGTATTACTTGGTATAATGTGTGGCTATCTAATAAATAAGCC
TACAATGGTTATGGATGATTTAGTATATGGTTCAGTATTTGGGGTTATTGTAATGGTTTTCATTGATATA
TATGCTTCAACATTAATAGGTTATAGTTTTATGAAAGAATTTCAAGGATATAGCAAATGGATTTATTTTA
ATGGGTATACAAATTTTATTTATTATTTAATGATAGCATTGTTTCCTTTTGGTATGGTGTTTTGCATATA
TTTATTAAGTTTAATTTTAGGGAATAAATTGCATATTTTAGATTCTAATTCTTTAAAAAAATTTTTAATA
TTTAAGAATTTTAGAAGTTTAAACCAATTTTTATGTTGCTCAAAAAAAGCTTTTTACATATGTGTTTCTT
ATCTAGCCATTTTTGAAGTTCTAAAACTGTTGAATGTTAAAGTTGATTCTGTTTATTTAAAAACAATCTT
TATATCAATAACCTATATAAGTGTCTATTTTATCATTAGAGACTCATGTATGTCACTACAAAACTTTATA
ATAGCTAAGTTTAGAAAATTATTATATGCTAGAATTTTATTTTTGATAATAATTTTATTGCTGTTTTTTA
TATTTGATGTAACAGTTATTAGTTTAATAATTATAAACGCATTTTTAAATAAGAAAATAAATATAAGATT
GAGTCAGAGTAATATAGTCAATAAACAAATAAATCTTTTGATTGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1619722-1620930 tyrosyl-tRNA synthetase [Clostridium difficile R20291]
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TAAGGGAAAAGCTTATTAAATCAGAAAAAGAAGGAAAGCCTATGATAGTAAAATTGGGTCTAGACCCAAG
TGCTCCAGATATACATTTAGGGCATACAGTAGTTCTTAGAAAGATGAAACAATTACAAGATTTAGGTCAT
CAAATAGTAATAATAATTGGAGATTTTACAGGAAAAATTGGAGACCCAACTGGAAAATCTAAAGCTAGAA
AAGCTTTAACAACAGAGCAAGTTCTTGCAAATGCAAAAACTTATGAAGAACAAATTTTCAAAGTTTTAGA
TAAAGAAAAAACTATTGTAAGATTTAATAGCGAGTGGTTAGCCAAGTTAAATTTTGAAGATGTAATAAAA
TTAGCAGCAACTATTACTGTTGCGAGAATGTTAGAAAGAGAAGATTTTAAAAAGAGATATGAAGGACAAA
TGCCAATATCAGTACATGAGTTCTTCTACCCATTAATGCAAGCATATGACTCTATAGCATTAGAAGCTGA
TATAGAACTTGGTGGAACTGACCAAAGATTCAATTTACTAATGGGAAGATCATTACAAAGAGAATTTGGT
ATGGAGTCTCAAATAGTAATAATGATGCCTTTAATAGAAGGATTAGATGGTAAAGAAAAAATGAGTAAGA
GTTTAGGTAACTATATTGGAATAGATGAAGAAGCGGGAATAATGTACCAAAAATCTATGGAAATTCCTGA
TGAACTTATAATTAAATACTACAATTTAGTGACAGATGTTCATCCTGATGAAGTTAATAAAATAGAATCT
CAGTTGAAAGAGGGTTCAGTAAATCCAAGAGATATAAAGATGAACTTAGCAAGAGAAATAGTAACATTAT
ACCATGGAGAAGAATCTGCTAAAGAAGCTGAAGAAAGATTTAAATCTGTATTCCAAAAAGGTCAAATACC
TGAAGATATACAAACAATTCAAGTTAAGGAAGATGGATTTGACTTAATCGAAGTACTAGTTTCTAATGAG
ATTGTTAAGAGTAAGAGTGAAGTTAGAAGATTAGCTTCTCAAGGTGGAGTAAAGGTAAATGGTGAAAAAG
TAGAGGATTTAAGCACTATTGTAAAAGAGAGTGAATTAGTTGTTCAAATAGGAAAGAAAAAATTTGTAAA
AATCGAGCTAGTAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c1621956-1620991 putative polysaccharide deacetylase [Clostridium difficile R20291]
TTGTCGGTTTACTTTTTCTACTTTCTTCGATATAATTATAATATATTTTTGATACAATTCGACAAAAGGG
GGAATGCTGTAATTATGGTAAAAAAAAGAAAAAAGAAAACTGTTACACTTACTATACTTGTTGTAATAGT
TATTGGTATTTTTTCTATGGCATGGGCGGACATGTCTAGAAAAAAAGAAATGAAAGAAACTCAAGAAAGA
CTTAAAGCTGAAAGATTAGAAAAAGAAAGAATTGAAAAAGAAAAAAATGAACCTATTATTGGTGCAAAAA
AAGAAGCTGTAAAAGAATATGGATATGACGCAAAAATAGTTTGGGACAAACTTAACAAATACGACTATTC
AAACAATGGAGAAAAGATAGTCTTTCTTACATTTGATGATGGACCATCTACTACTAATACTCCACAAGTT
CTAGATATCTTGAAAAGACATGGTGTTAGAGGAACTTTCTTTATTAAGGGTGATTCTCTTGAAAGAAAAG
GAGCTAATGAAATTTTAAAAAGAACATTTGACGAAGGAAATGCAATAGCCCATCACTCTTATACCCATGA
CTATAAAAAACTATATCCTGGCAGAAGCCTAAATCTCGATACATTCGTAAATGAACTTAACAAAACTGAT
GAAGCTATGAAAAAAGTCTTAGGAAAGAATTTTTCCTCAAATGTAGTTAGATGCCCAGGCGGGTATATGT
CATGGAAAAATATGGAACCTCTAGGAAACTACTTAAAAGAGAAAAACATGGCATCAATTGATTGGAACGC
TTTAAATGCTGATGCAGAAGGTAAAAAGAAAAATGCACAAGAATTATTTGAACATGCAAAGAAATCTTCT
GAAGGCAAAGAAATGGTTGTTCTTTTAATGCATGATACTTATGGAAAACAAGAAACAGTAAATGCATTGG
ACCAAATTATAACATATTTTAAAGACAATGGTTATCAATTTAAAATTTTAATATAA
>ref|NC_013316.1|:1622234-1623202 hypothetical protein CDR20291_1372 [Clostridium difficile R20291]
TTGCTGTTTAGGGGGTTTATAATTTTGCAAAAAAATAAAAAGGAGGGGGCTTTATTGAAAAAATACTTTG
GAGAAATAGGACTAATATTTATAGCAATTATATGGGGAAGTGGCTTTGTAGCAACCCAATTTGCATTAGA
CGGTGGGCTTACACCTCTACAAATCATAACTTTAAGATTTTTCTTGGCAGCTATAATTATGAATTTACTG
TTTTTTAAACAGATTCGTGCCAATATGGGTAAAAAATTATTAAAAGCAGGAGGGATTTTAGGAATATTTT
TATTTCTAGCATTCACAGTACAAACTATTGGACTTATGTACACTACACCATCTAAAAATGCATTTATAAC
AGCAGCTAATGTTGTAATAGTTCCGTTCATAGGATTTATACTTTATAGAAGAAAACTTGATAAAATAGGA
ATAATAAGTAGTTTGGTAGCTCTTATAGGAATTGGGATACTTTCTTTAGAAGCTGATTTCTCTATTAATT
TTGGAGATTTTCTAACACTTATATGTTCATTCGGATTTGCATTTCATATATTCTTTACAAGTGAGTTTGC
AAAAGATAACAACCCAATGGCATTGACAGCTATTCAATTTACAGTAGCGTTTTTAATGTCTGTTGTAGTT
CAAACATTTGCAGGTCAATTAAAGATGGAAGCTGAATTATCTGGTTATATGGGAACTATGTATCTAGCTG
TATTTAGTACTACAATTGGATTTTTATTTCAGACTATATGTCAAAAAAGAGTTGATGGAACTAGAACAGC
TATAATATTATCCACAGAGGCTGTATTTGGTACAATATTTTCTATAATAATTCTAAAGGAACTTATTACA
GCAAAATTGATTATTGGTAGTATCTTGATATTTGTTGCAATCATAACTGCAGAAACTAAATTATCTTTTT
TAAAGAGCAAAAAAGTGAAACTTAAAGATTCAGAGGAGTCTTCATTAGAAAGTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:1623425-1623970 putative rubrerythrin [Clostridium difficile R20291]
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GAAGTAGGAATGTATTTAGCAATGAGTAGACAAGCTGATAGAGAAGGTTATCCAGAAGTAGCTGAAGCAT
ATAAGAGAATAGCTTTTGAAGAGGCTGAACATGCTGCTAAATTTGCAGAACTTCTTGGAGAAGTTGTAGT
TGCAGATACAAAAGAAAACTTAAGAGTTAGAGTTGATGCTGAGTATGGTGCAACTGATGGAAAATTAAAA
TTAGCTAAGAGAGCTAAAGAATTAGGATTAGATGCTATACATGATACAGTACATGAAATGTGTAAAGACG
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ATTTAGAGGATATTGGTGGTATAGATAAGTTTGTTAAAAAAGGAAGCAAAGTACTTATAAAACCAAATTT
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AGAGCATTTATAAGGCATCTGGAATTGAAGAAGTAGCAAATGAACTGGGCATTAAGTTAAATTATGATGT
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CAAAATTTTTAAATGAACCTATTTCAAAGCTTATAACACCAAAGCCTGTGGTAAGATTTCAAGATTGCAT
AAAATGTGGAAAATGCAAGGAAGCTTGTCCTGCATCCACTATAGAGATAGGGACTAAAGGTGCTATTATA
GACTTAAGTAAATGTATAAGATGTTACTGTTGCCATGAACTTTGTCCTAAAAAGGCTATTGATGTCAAAC
GTAATTTTGTATTTAAGTATGTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1625262-1626527 dihydroorotase [Clostridium difficile R20291]
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TAAAAGAAAATAAAATTTATAAAATAGGCAAGTTTGATGAAAGTGATGAATATGAAAAAATAATAGATGC
TAGTGGTAATGTAGTTGCTCCAGGTTTAGTGGATGTACATGTACACTTTAGAGACCCTGGGTTTACATAT
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ATACTAATCCTATTGTAGATAATGAAGATACTTTTAATTATGTTAAAGAAAAGTCAAAAAATGCATGTAT
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AAAAAAGCTGGTGTACCAGGGTTTACTGATGATGGATTACCTTTAATGGATAGCAATCTAATTATGGAGG
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GAAAAAATGTCTATAAATCCTGCAAAGTTGTACAATTTAAATATTGGATTTATAGAAGAAGGGGCTGTAG
CAGACATTGTTATATTCAATCCAGAAGAAGAATGGACAGTTGAAAGCTTTGTTTCTAAAGCTGATAATTC
ACCGTTTAAAGGTAAATCTTTATATGGAAAGGTTAATTATACAATATGTAATGGGGAGATTGTATATAAC
GCCTAA
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GGATTATAATAGGAATAACTTCAGTAATACTTGTTAGTTCTATAGGTAATGGATTTCAAAAAGAAATTAA
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GAGTAGAAAGAATAGCTCCTTCAAGAGATGGGTTTAACCTTGATTCAGTTTACTCTTCACAAGCATCTTT
TGATAAAAAAACTACGTATGTTGATGTTGGACCAGTAAAAAAAGATTCTAAAATAAATTTAATTTGTGGT
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TCCCTAGTACCTAAAAAGGCTTTTGACACTTTAATGAGTCAAAATTCTTATTCAAATGAAATTTACCAGT
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GATGCACCCTGGTATCAATGGTTCTTATACTACACCAGACCCAACTGAACAGACAGCTTATCTTGAAAGC
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AAAACCTAGGTCTATATTATTTCAATTTTTAGTTGAAGCTGTTTTTATAACAGTATGTGGTGGAATTTTA
GGAACTATAGTTGGATTTGCTGCTACTAACTATGTTTCTAAATATATAGGTTTTGAAGCTATACCTAGCT
TAAATAGCTTATTTTATGCAATTGTAGCTACTATATTGACTGGAGTTGTATTTGGTCTGATTCCAGCCTT
TAAAGCTTCTAAACTAGACCCTATAAAGGCAATTTATAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c1628722-1628048 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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CCTTAAATTTAGAAATTGAATCTGGAGAATTTGTCATGATAATGGGTAAGTCTGGTAGTGGTAAAACTAC
TTTACTTAATATCTTAGGTTTTCTAGATGTATTTGATGAAGGAAGATATATATTTGATGGAACAGATGTA
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TAATCTTTGCTGATGAACCGACTGGGGCATTAGATAGTGAAACTAGCAGAGAAATTATGGAGCTTTTAAC
AAGGCTCAACAAACAAGGTAAGACTATAATAATGGTTACACATGATCAAGATTTAACTAAGTATGCAACT
AAGGTTATACGACTTAAAGATGGTGTGTTTACTTCGGAGGTGTAA
>ref|NC_013316.1|:c1629959-1628730 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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ATAGCAGTTTTGGAAGTAGTGGCTTCAAGTCTAAAAATAAAGGTTTTAAAAACAATCCCTTTAAAAATAA
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TCGAAAAACACTGAATTACAAGCTAATGAAAATTTTATCGAAACATATACTATTCCTGAAAATGAAAAAA
TATTTATAAATGGGATGGTTGTTCCTAAGCAAACTAAGGACTTCAATATATCTGGAGATTATGAGTTAAG
TGATGTTAATGTTACAAATGGTCAAAAAGTAAATCAAGGAGACCTTCTTTTTACTGCTAAAAATCCAACT
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AAAGCTTACTGGTAGAATAAGTTTTATATCTGATAAACCATCTACTCCAAATACTGAAATGGGAGCTCAG
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ATCTTCAAGCATCACTTGAAGTAGCTAATTCAAGCTTTAAAATACCAGCATCTTGTGTACTTAAAGACAA
CAAACACTCATATGTATTTAAGGATTTAGATGGTATATTGAAAAAGCAAATTGTAGATGTAGCAAGTCAA
AATGATGATTTTGCTGTAGTTAGAGGCGGTCTTGAACAAGGCGATATAATAATAAAACACCCTACTAAAG
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AAACAAAAAAGTAGAAGAAGTTACTATGGATGTGAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c1631075-1630071 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
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CAGTATCAGTTATTATATTTTCTCCTGTAGATGTTTTTCTGACTGATACTATTTTATATATATTAGTTGT
AAATGTTGTGTTTTTATTTTTATATCTATTTATTAGCTACATCAAGAAGAACAAATTTTTAGATAAGATA
AAAAATGATACATTCAAAATTAATATGAATGATATAGAATTAGCTAGATGTAAAAATGAAGAAAAAATAT
ACTTGAACATTATTAAAAATCATCAATATCAATGTAATAACATAATAAATAATAATATCGAGAAATTTGA
AGAAAACAAAGAGATTTTAAATATGTGGGTACACGATGTAAAGATACCTATAGCTATAATAAAACTCATT
CTTGAACAAAATGAAAATTTAATTAATGAAAAAATTTCAGATGACATAGATAGTGAAATATTTAGAATTG
AAAACTCCGTTGAAAAAATTTTATATTTATCAAGACTCGAAGATTTTCATAAGGATTTTTTAATTCAAGA
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ATTTTAGACTTAAATAATTTGAATTTTAAGGTTTTATCTGATGAAAAATGGCTATACTTCATATTCGAGC
AATTATTGAGTAATTCCCTAAAATACTCCTCATTAGGAGATAATATATCTATCTATTGCAAAAGAACCAA
AAATTATTTACAATTAAGAGTGGAAGATACTGGTTGTGGTATAAAAAAGGAAGATTTAAATCGAATATTC
AATAAGGGATTTACAGGTAATAATGGAAGAAACAATTCTAAATCTACAGGTCTTGGGCTTTATTTAGTAA
AAGAACTTTGTGATAAGCTTGGTCATAAAATTGATGTAGATTCAGAGTACAACCAATATACAAAATTTAC
TATTACATTCAAATGTGATTTATAG
>ref|NC_013316.1|:c1631773-1631099 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
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GGGGACATGATGTTCATCAAATAGAAAATCTTGAAAATATAATAGAAGAGTTCAAAAACTATAACCCAGA
ATTAGTTTTATTGGACATAAACCTTCCATTTTATGATGGTTTTCATTGGTGTAATGAAATAAGAAAAATT
TCAAAAGTTCCTATAATTTTTATTTCTTCAAGAAATTCTAATATGGATGTAATAATGGGTGTAAATTTAG
GTGCAGATGATTATATACAAAAACCTTTTTCTGTAGATGTCTTAGTAGCTAAAGTTAATGCCCTTTTAAG
AAGAACTTATAATTTTGTTGATAATAACTCAAATCAGATTATTCACAATGGTGTTACTTTAGATTTATCA
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TTATGAAATATAAGGGGCAGATAGTAAGTAGGAATAAACTCATGAAAAAATTATGGGATAATGATTGGTT
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GATTTTATAGAAACAAAAAGAGGATTGGGTTATATAATCAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:1632061-1632828 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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TAAAAGGAATAACTTTCAAGGTTTATAAAGGAGAATTTGTTGGTATTATGGGGTCTTCCGGTGCTGGTAA
ATCAACACTTTTAAATATTATTTCTACAATGGATTTACCTTCATCAGGAGATATTTATATAAATGGAAAG
AATACTATTAAAATGAAGCAAAATGAATTGGCAGATTTTAGACGTGATAATCTAGGCTTTGTATTTCAAG
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ATTAAAATTAAACAAAGACAGCAATAAAACAATATTGATGGTAACTCATGATGCTATAAGTGCGAGTTTT
TGCAATAGAATACTCTTTATAAAGGATGGAATAATATTCACAGAAATTGTAAAGGGAGAAAGTAACAGAG
AGTTCTATAATAAAATAGTAAATACAGTTTCCTTAATTGGAGGAGTTAATAAAAATGACTTTATTTAG
>ref|NC_013316.1|:1632815-1634752 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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TATTATTCAAACTCATTTTTTTTCAATAGACGTAGGCGAGAAGTAGGAACTTATAGTTTACTTGGAATGA
GGAAAAATCAGATAGGAAAAATATTTTTATATGAAACTTTTTTGATGGGTATAGTTGCAATACTAATAGG
TATATTTTTAGGACTGTTATTTTCAAAGCTTATGACTATGATGCTTGTAAAATTAATGAATGAAATGATA
GTAGTAAATATGAACTTAAGTATAAAGGCCTTAGTTAAGACACTAGCGGTATTTTTAATAATATTTATAG
TTATTGGAATAAGAAATACTATAGTTATCAGAAATAAGAGAATTATAGAGTTATTTAATAAATATCCAGA
AAAGTATAAGTTTAAAAAATTTATAAAGTTAAAATGTGTACTTGGTGTTTTATTAATAGCTATTTCTTAT
TTAATGTCAATTAGTTATTTTATTGCTGAAAATATTATGCTTTCAGTTTTTATATTAGTTACAATAATAC
CTGGAACTTTTTTATTTTTTTCATCAACTATGTATATGATTATTGATGCTGTTAAGAAGAGAAAAAGTTT
TTATTATAAGGGACAGAATTTAATTGCATTTTCTGAACTTGGATTTAAATTAAAGAGCAATAGTAGTGTA
TTGGCTGTAATAGCAATATTAATAGCTACGAGTGTAACTATGCTAGGGTTTACCATATCACTTTATTACG
ATATAGATAGGAACATAAGTGAAAATTATAAATACAGTTATACCATAAATTTAGGAAATTCTTATGTAAA
TAACGAAATTGACAAATTATTATATAAATATAAAAAAGATAATAAGATAATCTTTGATAAAACAATAGAA
CTTATAGACAAAGATATAAATATTGAAATGTATTATAAAAATGGAAATAGTTATATAGAAGATAGAACTT
CTGTAGATATTATTAGAGAAAGTGATTTTAAAAAATTAAGACAATATCAGAATAACAATTATGAAGAATT
AACTTCAAAGGAATCTGTGTACTATGTTTCTGATTCATACAAAAAAATGTTTTTTAAAGACTTTGAGATT
GAAAAAATAAACTTGTATATTAAAGATACAAATGAGTATGATATAAATCTGTTTAAGGTACAAAAAAGCA
TCTTGGAGCCAGAAATAAATTCACAAGCTACGTTTGATTTAATTGTAGTAAAAGATGACGTATTTAATCA
GTTAAAATTACATGGAAATTCTAGATTAATAAGATTAATTGATATAAAAAATGAAAAAAAAGAACTGGAT
TTGACTTTAAAATTTAAAAATATAGTAAGTGAAAATATGAAATTTACTTATCCTTTTAATTTTACATCAA
GTATTGAAAGTTATAATAACTTGATAAAATTAAGTGGTCTAATGCTGTTTATAGGCATATTTTTGTCTGT
AGTATTTCTTTTATGTACAGGTAGTATAATCTTATTTAAACAATTATCAAATATATATGATGATAAGGAA
AGATATATTATGTTAATAAAACTTGGAGCAAATAATAAAGATATTGAGAAAATAATATCAAAACAGTTAA
AAATTATATTTTTAATGCCATTAGTTGTAGGTACAGTTCATAATTTATTTGCTATGTCTATAGCACAAAA
GTTTATACCAAGGTCATTACTTGTACCAATTATCATAACTCTAGTCATTTATTTTATAGGATATTTTATA
TATTATTTTTTAACTTTAAAATATGCTCTAAACATGATAAAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1634977-1636590 putative gamma-glutamyltranspeptidase [Clostridium difficile R20291]
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TATGCCCTTGTTTGGATAGAGGAAGAAAAACGATTGTATGGTTTAAATTCTAGTGGCTTTGCTCCAGAAA
ATATGGAATTAAAAAATTATAATAATATGAAAGAAATGCCAAAATATGGGTTTGGAGCAGTAACTGTACC
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ATGAACTCTATGAAAAAGAACTTATTGGAGAAGAGTTCAAACCATGGTTTGATACATTTTCTAAAGATGG
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GGGCTATAAGAAAGAGTGACTTAGAGTGTTTTTATCCAACATGGGTAGAACCTATAAGTACAGAATATAA
GGGATATAAAATATTTGAAATCCCACCAAATGGTCATGGAATAACAGTTTTAATGGCACTTAACATATTA
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TAGCTTTTGCAGATTCTAAAACATATGTAACTGATATAGAGCATATGAAGGTAAAGATTCAGGAATTACT
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GAGCCATATTGTGGTGGTACAGTATACCTTTGTACTGCAGATAAGGATGGAAATATGGTTTCATATATAC
AGAGCAATTACATAAATTTTGGTTCAGGAATTGTGATACCAAGAACTGGGATTGCTTTACATAGTAGAGG
AAATAATTTTAATTTAGACCCTAAACACCACAATGTAGTAAAACCATTTAAAAAACCTTATCATACTATA
ATACCTGGATTTTTAGGTAAAGAAGATAAAGCAATAGGTCCATTTGGTGTAATGGGAGCTTTTATGCAAC
CACAAGGACATATTCAAGTGTTAACAAATATGATTGATTTTGGATTAAATCCACAAGAGGCGCTAGATGC
TCCAAGATGGCAGTGGATAAAAGGAAAGGAAATAGAAGTTGAACCAGAGATGCCAAAGCATATAATAGAT
TCATTAATTGAAAAGGGTCATGAAATAAAAGTAATTCATGATACTGTCGACATGGGACGAGGTCAAATAA
TATTTAAAACAGAACAGGAAAGTTATATTTGTGGGACGGAATCAAGATGTGATGGTCATATTGCAGTTTA
TTAA
>ref|NC_013316.1|:c1637574-1636723 putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase [Clostridium difficile R20291]
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GACCCTTTAATACTAAAAGAAAAATTAGAAAAAATGGGTGTTGATAATGACACTACGATTGTAACTTATG
ATGATGGAGATTTAAATGGAGCTTGCAGATTATTTTTCCAATTAAAACATTTGGGGCTTAAAAATGTCTA
TGTACTAGATGGGGGAATAACATCTTTCGTAAAGGAAGGTGGAGAATTGGAAGAGAAAGTGAATATACCA
AGTTGTACAGGTAAGGAAATTAGACCAAATATAAACAATGATTTAGTTGTTCCAATGGAATATGTTAAGT
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ACCTGCTTACTCAAAAGCTGGTCATATACCAAGTGCAAAAAATTATTTTTGTAAGGATTTAATAAAAAGT
GACTTTGAAAATGGCTCACTTAAAGATATAGAATTTTTAAAAAAATTCTTTAAAGATTTAAATAATTATG
ATGAAGTAATTTTATCTTGTGGTTCAGGGATATCTGCTTGTGTTAACAGTCTTGCTCTTAGAGAACTGGA
TATACCTCACAAGATTTATATTGGTAGCTTTAGTGACTGGATTAGTTATGATGACAATGAAATCAAAACT
GGTCAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1638185-1639093 putative dehydrogenase, electron transfer subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGAATAGCGAGATGAGTAATAAAATAGTTAGTAAGAGACAATTAACAGATAGTATTTATTTAATGG
AAATAGAGGCACCTAGAGTTGCAAAATCTTCTCAACCAGGTCAATTTATAATAATTAAAAATGATGAAAA
GGGAGAGAGGATTCCTCTTACAATAGCTGACTATGATAGAGAAAAAGGAACAGTAACTATTGTATTCCAA
ACAGTTGGTGCTTCAACTAAAAAGTTAGCAATGTTTGAAGAAAACGATTTTGTAATGGATTTTGTAGGGC
CATTAGGACAAGCAAGTGAATTTATACATGAAGATATAGAAGAATTAAGAAATAAAAAGATATTATTTGT
AGCTGGTGGAGTTGGTTCTGCTCCAGTTTATCCACAAGTTAAATGGTTTAAAGAGCATGGATTAGATGTA
GATGTAATAATTGGTGCAAGAACTAAAGAATTAATTATATTAGAAGATGATATGAAAAAAGTAGCTAAAA
ATGTATATGTATCAACAGATGATGGTACATATGGATTTAATGGAAGAGTTACAGACCTATTAAAAGATTT
AGTTGATAATCAAGGTAAAAAATATGACCAAGCAATAGTAATTGGACCAATGATAATGATGAAATTTATG
TGCCAATTAACTAAAGAACTAAATATACCTACTATAGTAAGTTTAAATACAATAATGATAGATGGAACAG
GTATGTGTGGTGGTTGTAGAGTTAGTGTTGGAAATGAAACTAAGTTTGCATGTGTAGATGGTCCTGAATT
TGATGGTCATTTAGTTGATTTTGATCAAGCAATGAGAAGACAGTCTATGTACAAGACTCAAGAGGGAAGA
GCTATTCTAAAACTTGAAGAAGGCGATAGTCATCATCATAGTAATTGTGGATGTGGAGGTAACAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1639093-1640487 putative glutamate synthase [NADPH] small chain [Clostridium difficile R20291]
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AAGTATGCTTAGGGTATAATAAAGAAGAAGCTATGGCAGAAGCTAATAGATGTTTAGCTTGTAAAAAACC
AAAATGTGTGGGTGGATGTCCAGTAGGAATCGACATACCAGGGTTTATAACAAAAATTAAAGAAGATGAT
ATAGAAGGTGCTGCTAAAGTAATAGCTAAGAGCAGTTCATTACCAGCTGTTTGTGGTAGAGTATGCCCAC
AAGAAAGTCAATGTGAAGGTGTATGTATACTTGGAATAAAATCAGATGCTGTATCAATAGGTAAATTAGA
AAGATTTGTAGCAGATTGGTCAAAAGAAAATGACATAAATTTATCTGATACAGAGCCTAAGAAAAATCAA
AAAGTAGCAGTAATAGGAAGTGGTCCAGCAGGTCTAGCTTGTGCTGGTGATTTAGCTAAAAAAGGCTATG
ATGTAACAATCTTTGAAGCAATGCATGAGCCAGGTGGAGTTTTAACTTACGGAATACCTGAGTTTAGACT
TCCAAAACAAGCTGTTGTTCAACCTGAAATAGACAATATAAGAAAATTAGGTGTAAAAATAGAAACTAAT
GTAATTGTTGGTAAAACAATTACAGTAGATGAACTTATAGAAGATGAAGGATTTGAAGCTATATTCATAG
GTTCAGGAGCTGGTCTTCCAATGTTTATGAATATACCAGGGGAAAATGCAAATGGAGTGTTTTCTGCAAA
TGAGTTTTTAACTAGAGTAAACTTAATGAAGGCTTATAGAGATGACTATGATACACCTATTAGTTCTGGT
AAAAAAGTTGCTGTAGTAGGTGGTGGAAATGTTGCTATGGACGCTGCTAGAACTGCATTAAGATTAGGTT
CAGAATCATATATAGTTTATAGAAGAAGTGAAAAAGAGCTTCCAGCAAGAGCTGAAGAAGTTCATCATGC
AAAAGAAGAAGGCATTATATTTAATACATTAACAAATCCTAAGGAAATTTTAGTAGATGAAAATGGATAT
GTTAAAGGTATGGTTTGTATAAGAATGGAATTAGGAGAGCCAGATGATTCTGGAAGAAGAAGACCTATAG
AAATAGAAGGTTCTGAATTTGTACTTGATGTAGACACAGTTATAATGTCACTTGGAACAAGCCCAAATCC
ACTAATATCTTCTACAACAAAGAGTCTTAATATAAATAAGAAGAGATGCTTAATAACAGATGAAAATGGT
CAGACTTCTAAAGAGGGTGTATTTGCAGGTGGAGATGCTGTTACTGGAGCAGCAACAGTAATATCTGCAA
TGGGTGCTGGTAAAACAGCAGCAGCATCAATAGATGAATATTTAAAAACAAAAGTTAATGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:1640853-1643072 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAAGAGAAAAAGTATTTGATGGGCTAGTTTTTAAGCATATATTAATCTTATTAATACTATTAG
TTTTGATTGATTTAACAAGTACCATCATATATGCAAGTAACTCTATGGAAATTACTTCTAGAAATATGAT
TGAGGCATCAAAAAGAGAACTTGAAAACTATTTAGAAGTAAACATATCTTTATTAAAAGCTCTTAGTCAA
GATGATAGATTTTCTAATGGTGAAACATCACTAATTGAAAAGGGAAAATTATTAAGGCCATATCAAAAGG
AATATAATCTTTTTATGATTGGTATAACAGATACAAAAGGAAATGCTTCAAGTACATATAGGGAAAATGT
TAACTCAATAAAAGATAAGCCTAGTTTTGAGAAAGCAATTAAAACAAAGCAAGTAGTAGTTTCAGATATT
GAAGTCAGTAATGTAACAGGTGACAAAGTATTTATCATATATGTACCAATTGTAAAAAATAATGAGATGA
TTGGGACCATTTTTGCTTCTTTTTATTTTCAAGATGTAAATAATTTAATAAGTAGAAGCAATTTTGATGA
TTCTATTAAATTTCTAATGATAGATAAAGATTATACTATTATTTCTCATCCAAACAAAAAATATGTAAAT
GATAAAAGTAAGATGCTTGATTTAGAAGGGAATATTATAGGAACCACTAAAAGTGAAATCTTAAAAAATA
TAAATAAAAAATGTCAAGGTGATTTTTTATCTTGGGATAATTGGAGATTATATAATGTAAAATATACGAA
CATAAAGTGGACTAATTGGACTTTAGTATCAAAATGTAATATATTTAAGAACTTTAAAAATCTAATAGTT
AATTTTATGATAAAGTTGTATTTTTATATAGTAATATTTATGATATTGTGGAAATTAAGTAATGCTAAAT
TAATAGAACAACTTAAAAAATTGGCTTATTATGATTCTTTAAGTGGAATAAAAAATAAAGAAAAGTTTAG
AAAAGATTCTATGTATATTTTAAAGAATTATTATCAAGATAATTTTTACTTAGTACAATTGGATGTCAAT
AAATTTAAATATATAAATGAGATGTTTGGATATGCTGAAGGGAATAAGATATTAATTCATATATCACAGG
TTTTAAATAATAATACAAATAAATATGAAATTTGTGCTAGGATGGATAATGACCATTTTATATTGTTGAT
TGCTTGTAATACTGAAGATGAACTTTTAAATAGATTATCTAAAATAAATAAAGAAATTTGTAACTTAAAT
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TGTACCTTTATTTGAAAAGAATGGTTTTATTGTAAATATTGATATGTTCGTGTTTGAAGAAGTATGCAAA
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ACCTTTCTTTTGATATTTTAAAATTAGATAGAGGATTTTTAATCGAAACAACAGATACAAAACGTGGAAA
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ACTTATGAACAAGTAGAGTTCTTGAAAGAGATAGGTTGTGATAAGGTTCAAGGATACTTATTTGCTAAAC
CTATGGTATTAGATGAATTTGAAAAACACTTAAACTTTAAATTTGATTAA
>ref|NC_013316.1|:1643150-1643965 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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TGAACATATTGAGTATTAGAAATATATCAAAAACATATTGCGGAAATATTCCATTTAAAGCATTAGATAA
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TTCTGATATACTAGCTGTTTTGTCTCAAATAGGAGGTGTAAGATAG
>ref|NC_013316.1|:1643965-1645845 ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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GTTCTGTTTTTTCTATAATGATATTTTTTGTTTTTGCAGTGTCTATGTTCCATCCGATTATAACAAAATC
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TATTTTTGATAACAGGACCAATGAGCTTAAAATTATTGAGAAAAAAGAGTATTTTAGAGCTTTTAGTAGG
TACAAAAAAGCCTAAAAAAGAGATAAAATCTTCAAGGCTATTTGGAATAATTGGTGTAATATGTCTTATA
TTAGGATATGCTATGATACTATTTGGCAATAAGTTAAAAATAAATGGAGGTATGTATACAACAGCACTAT
TAATTACTTTGGGGATATTTTTATTTTTTTCTCAATTTACTATTTTGATATTAAAGTATTTAAAAAATAA
AGAAAAATTTTATAAGAACAAAGTAAATATGTTACTTATAAGTAATTTGATATATAAATTAAAGGATAAT
ACACGATTGTTATTTTTAATAACAATACTTTTATCGGCTACTTTAGTAGCATTTACAACAACTTCAACAC
TTGTAAGTTCTCAAGGAGAAGCTTCTAAAAATAATTTCCCAATGGTTTACTCATATTTTTCAGAGCATAA
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TGCAAAGATAACTGAAAATTTAAAAGAAAAACATTTTAATTTGGATAGAGAATATAACAGGTCATATTTT
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GAGATAGGTACATTGTTTTTTATACCGTATTTTATAGCAATTATAAATAGCATAATTTCTTTACTGTTTT
TAAATCAAGTATTAAATAATAGTTTTAGGTTAGAAAATTTGGGTATATTACTACTGATATCATCTATATA
TTCACTTTATTTTTACTTATTAAAAAAAATTTATACTAGAAAAGTTTGGTTTTTTGATTAA
>ref|NC_013316.1|:1645964-1647355 putative drug/sodium antiporter [Clostridium difficile R20291]
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TAATAGGTATGTTGGTAAATAGTTTATATAATGTAGTAGATAGAATTTTTATTGGAAATATACCAGGGGT
TGGACCACTTGCAATAACAGGTCTTGGTGTAACAATGCCAATAATGACAATAATACTTGCATTTGGGATG
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AACTTATAGGAAATGCAATGACGTTATCTGTAATAACAGGAATTATCATAATGATACTTGGAATATTATT
TGCAAATAAAATACTTACATTGTTTGGAGCAAGTGAAAATACTTTAATATATGCAAAATCATATATAAAT
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GTCCTAAAATTTCAGCAGGAATAATGATAGTAGGATGTTTAACTAATATAGTTTTAGACTGGATATTAAT
ATTTGGATTCAATTTGGGAATACAAGGAGCTGCAATTGCTACAGTAACTTCTCAGGCTCTTACAGCTATT
TTAACTATAGGGTATTATATAAGTGGAAAATCAAACTTACGATTCAGTAAATCTAATCTAAAATTAGATA
AAAAGCTAATAAAAGCAGTGTTTGCAATAGGTATGTCGCCATTTGCGATGCAACTTGCAGCAAGTTTAGT
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TCTTCCATTGCAATGGTATTTTTGATGCCTATCTTTGGAATAAATCAAGGAGCGCAACCTATTATAGGTT
TCAATTATGGAGCTGAAAAATATGATAGGGTTAAAAAAGCATATTTAGGTTCATTAGTAGTAGCTACTAT
AATTTTATGTATGGGTATGGTAGTAGTTATGCTTTTCCCAGAAGCTATTATAGGTATATTTAATAAAGAC
CCTGAACTTATGAATATATCTGTTAATGGATTAAGAATATACTTACTTATGTTGCCAATTGTAGGCTTAT
CAGTTACAGGAACAAACTTTATACAATCTATAGGAAAAGCAAAAATGGCTATGTTATTGAGCCTTTTAAG
ACAAGTAATTTTATTGATACCAGCAGTATTAATTCTTCCTACATTCTTAGGTTTACAGGGTGTATGGACA
GCTCAACCAGTGTCTGATTTTATAGCTACAGTAATTACAGGTATAGTTGTATTTAGAGAATTAAAAAGAT
ATACTCCTAAAACTGAAAAATTAAATGAAAATGAAAGACTAAATGAGATAACTACTGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1647462-1648502 hypothetical protein CDR20291_1391 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATTTACAAAGAAAAGCAAATTAAAAAATATGTATGTAAACATGAATGTAGCTAGAATGTTGTCTA
AGATAAATGAGTATAAGGGTAGGCAACTGCTTTACAAAAAACAACCAAAAGAAATTTTAGAAAACCTAGA
AAAAAAATCTTTAGTAGATTGTTCTGAATCTACATACATTGGAAATCAAAGAGATAGTAGTAATTTTAAT
CTAGAAAAGTTGATAAGTAATGAAGTTACACCTAGAAGTAGAGAGGAATTGAGTATTGTTGAATACAGAG
ATGTGGTAAAAACTATTAACAGTGCTTATGAGAGTATTCCCATCAGTTCACAAACGATTCTTGAGCTTCA
TGGGTACTTATATAAATTTTCATCTACTAGAGGAGGAAGTTATAAGTCAGATAATGATTTTATTGAACAC
AATTTAAAACCTAGCGAATTTATAAGTATTGATTCAAGTGTCAATAAAGTTGAAAAAGCTGTAGAAGAAA
TATGTGAAGCTTATAATACATTGATAGAGGAAGATGAAATTGATATATTAATATTAATTTCTGCATTTGT
GTTAGATTTCATATTGATACATCCATTCAAAGAAGGTAATATAAAAATGGCGAGAGTACTTATCCTATTG
TTACTAAATAAAAATGGGTATGAAGTTGGAAGATATATAAGTTTAGGAAAGATATTTGATGATAGTTCAT
ATGAATATTATAGTAATTTAAATTATTTGAAAGCCTCAATAGGTAGTGAAAAAGCAGATATGAATGCATG
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AAGAAAAGACAAACAAAAACTAGTAGAATAGAAAAAATAATAAATTCTACCCTTGGATATTTTACAAAAG
AAGATATAAGAGATTTATGTCCTGACATTCCAGAACCTACTATAAATAGAGTTTTTAATAATCTAAGAAA
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>ref|NC_013316.1|:1648991-1649644 putative acyl carrier protein phosphodiesterase [Clostridium difficile R20291]
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CAAGAAAATTTATAAATAAATTTATGGAAAAAAACAAAGATTTTGAGGTTGAAGAGATAGACCTTTATAA
AGAACATATACCGAGACTTGAGTATCAGTACTTTGAAAAAAGAAATAGCATAGTTAGTGAAGAAAATGCT
AAAAATTTAGACGATAAGGATAGAAAAGAGCTTACAAAGATTAGAAATCTTTGTGACCAATTTGTGAGTG
CAAGTGTTTATGTAATAGCAGCACCTATGTGGAGTTTATCTTTTCCAGCACCACTTAAAGAGTATATAGA
TTGTATAATTCAAGATGGAAAAACTATATCTTTTGAAGGCAATGATAAACCACAAGGAATTTTAAATGAT
ATTGATAGAAGTATGGTATATATACAATCTTCTGGTGGACACATACCATGGGTCTTGAAGCCAGTTATGA
ATAAAGGGTTAAATTATGTGGAAAGTATTATGAAATTTATAGGAATTAAAAAATTTGATGAATTGTTAGT
AGATGGAACTGGAACTAGTGAAGAAGAAAGACAAGCTGCAATAGAAAAAGCATCTGAAAAAATACATGGT
ATAATAGATGGTATGAAATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1649720-1649929 hypothetical protein CDR20291_1393 [Clostridium difficile R20291]
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AAATAAAAGATAATATAGTAATGATAGATGATGGCACTGGTACGTTAAAACAAGCCGTTTTCATAGGGTA
TAAACAAATCCAAATTAATTTAAATTGTTCACATTGTCAAAACTTAAATAGAATAAAATTAAATTTGTAG
>ref|NC_013316.1|:c1650635-1650069 hypothetical protein CDR20291_1394 [Clostridium difficile R20291]
ATGATGAATAATGAACTTAATACTATAATACTAGAAACACTAAATAATGCAGATATAACTTCAAACGATA
TTCCCTCTATTGACTTATATATGGATCAAATTATTTCTCTAATTGACAATAAACTTTCTCCTAATAAAAG
ATTTGAAAGTGATAAAATTCTTACTAAAACCATGATAAATAATTACAGCAAAGAGGGATTAATCAAACCA
GTTAAGGGAAAAAAGTATACTAAAGAACAAATTTTACAGATGATAATTATTTATTCTATGAAAAATACAC
TTACAATACAAGAAATTAAAAGAATCTTACATGGTGTGTATGAAAAGGATAATTTCAGTGAAAAAGATTT
AGTTTCATGTTACGAAAAATTCATGTTAATAAAAGAAAATCAAAGAAAGAATATACCGGACTTTATAGAG
TCTAATTTTGAAAATATTAGTATAAATCCAGAAAATAAAGATGATTTATTGATAGCCTTATTAAGTCTGA
CTTCAATGGCTGACCAATTAAAAAATATTTCAGAAAAATTAGTAGACAGATATTTTCCAGACATAACCAA
AAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1650796-1651449 putative hemolysin-like membrane protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTATCAATTTTTTTTAAAGGGTAGAGACCCAATAAGCAGTTTAACTCATTTTATAGGTGCTTGTTTAT
CTCTTTTAGCAACTATAATTTTAGTTTTTCAATCTGTTACATTACAGGAAACTTCTCTCTTGATGATAGT
ATCTGTATCGGTATTTGGACTTTCACTAATTGCTTTATATAGTGCAAGTTCGTATTATCATTTTTTAAAG
GGGACACCAGAACAAGAATTGTTTTTTAGAAAAGTAGACCATGCAATGATTTATGTATTGATTGCTGGCT
CTTATACACCAATATGTCTGAATTTTATGGAAAAAAAAGAAGGCATAATATTTGTTACAGCAATATGGAT
AGTTGCATTTATTGGCATAATAATAAAAATATTTTGGATGGATGCACCTAGATGGTTATCTACCAGTATA
TATTTACTTATGGGGTGGGCAATTGTTTTTGATATAAATGCATTCAATTCAATTCCTAAGGATTGCCTTA
GACTATTAATTATGGAAGGTGTATCTTACTCTATAGGTGCAATTATTTATATAATTAAAAAGCCTAATAT
AAGTCCTGAGTTTGGATTTCATGAAATATTTCATATTTTTATTATGATAGGTTCTTTATTTCACTTTTTA
GCAGTTTTATTGTATGTTTTATAG
>ref|NC_013316.1|:1652311-1653255 putative ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit [Clostridium difficile R20291]
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ATAAACTTTTTTTGGATGAAGAATATTTTCAAATAGAACCACAATTATTTGAAGAATATGATGAATTTAC
AACTATAAATAATAAAATTCCAGAAGAATCTATGGTAAAGGTTGTAAATGGAAAAGTAATGGTACTTAGA
GCTGATATAACTACAAGTATAATAAAAAGCCTTGTACCAAGATGGGAAGATGGTTTAAAGCTTAAGCTTT
TTTATAATTCATCAATATATAAAAATAAAAATACAGTTGGAATAAAAGAGATAAGACAAATAGGTTGCGA
GTATCTAGGAGAAGCCTCTGTAGAAGCAGATAGAGAAGTAGTGAAATTAGCTCTTAAGATACTTGAAAAA
TACAATAATAATTTTATTTTAGAGGTTGGGAGTAGCAAGTATATTCATGGTTTGTTAGAAGAATTAAATT
TAAATAAGAATTGTGAAAATCAAATTAAAAATTTACTATATACGAAGAACACTCATGAATTAAAAGTATA
TATTGAAGAACTGAAAATTAAGCGTGAAGTAAAAGAGCTATTATCAAATATTTTAAGCTTGCAAGGGAAT
TTATACAACGTTATTGAAAAATCAAACAAGTTCTATTGTAATAATAAGATGAAGCAAGCTCTTGAAGAAT
TAAAGCAAGTAAATAATTTAATTGAGGAATGTAATTTTTTAGATAAGGCTAGATTTGATTTATCAATGAT
TACTATGCTTGACTATTATGAAGGAATTATGTTTAGAGGATACTACCCAAACTCATATAAAGAAATTCTT
AGTGGTGGAAGATATGATTCTTTAACTAAAGAGTATGGAAAAGAAATTCCAGCCATTGGATTTACACTAA
GTGTTGATGAGTTAATGAAGTATGTATATAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1653277-1653903 putative ATP phosphoribosyltransferase [Clostridium difficile R20291]
TTGGATTATTTGACTATAGCACTAGCAAAAGGACGAATTGAAGGGGAATCATTTAAAAAATTTAAAAAAA
TGGGTCTAGGAGATAGTATAGACACAGATACGAGAAAACTAATTTTTAAAGATGAAGAAAATAAAATTAT
ATATATACATGTAAAGCCATCAGATGTAGTTACATATGTTGAAAAAGGAGTCGCTGACCTTGGTATAGCA
GGTAAAGATACTATTTTAGAGAATGAGACAGATGTATATGAAATATATGATTTAGGTTTTGGAAAATGTA
AATTTGCTGTAGCAGGATTAAAGGGAGATAGCATATATAGAGAAGATGAATATCTAAAAGTGGCAACAAA
GTATCCCAATATAGCAAAAAAGTATTTTAAAGAGAAAGGTCAAAAAATTGAAATAATAAAATTAAATGGT
TCTGTAGAACTAGCTCCAATAGTAGGGTTGTCAGATGTAATTGTAGATATAGTTGAGACTGGCAATACAC
TTAAAGCAAATGGTCTTGAAATATTAGAAGACATATGTAATATAAGTGCTAGAATTATATCAAATAGAGC
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>ref|NC_013316.1|:1653937-1654986 putative histidinol-phosphate aminotransferase [Clostridium difficile R20291]
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TTGATGCAAATGAAGGAAGTAAGAGGTTGTTTAAATACCTTATTAAAGAAATTTCAGATAGTGATATAGA
TTTAAATTTATATCCTGAAGATTCTTATAGTGATTTGAAAGAATCTATAATAGATTACATAAATATTTCT
GGAGTAAATAAGAAAAATCTTCTAGTAGGAAACGGTTCAAGTGAAATAATTGATTTAATAATACATACTT
TTGTAGATAAAGATGAAGTAATATTGAGTTTCTCTCCAAGTTTTAGTATGTATTCTATATATAGTCAGAT
AAATGGGTCTAAATTTATAGGTGTTGAAAGTGATGAAAATTTAGTTATAAATATAGATAATGTGATTGAA
AAAGTAAAGGAGAATAATCCTAAAATAGTAATTGTATGTAATCCTAATAATCCAACTGGAACAATATTAA
AGAGGGAAGAGATAATAAAGCTTTTAGATTCAACTAATAGTCTAGTGGTTTTAGATGAAGCATATATGGA
TTTTGGAGAAGAAAGCATGTTAAGTGATGTTTTTAAGTATGATAATCTAATAGTTCTTAGAACTTTATCA
AAGGCATTTGGATTGGCTGGAATAAGAACAGGATATATGTTATCTAATAGTAGTTTAATAAATTCTGTTG
AGAAAGTAAGACCTCCATATAATTTAAATTCATTATCAGACTTTATTGCTACAAGAGCACTTAGAAATAA
AGATGTGGTAAAGGCTTATATAAAGGAAGTAAAAGAGGAAAGAGAAGTTTTATATGAAGAAATGATTGGT
ATGGGAATTAAAGCATACAAATCACAAGCAAATTTTATATTATTTTATTCTGAAATCGAAAATTTATCAC
AAAAACTTATTGATAGAGGAGTTTTAATAAGAAAATTTGGTGGAAAGTTAGAAAATTATTACAGAGTTAC
AATTGGTGATAAAGAAGAAAATTCTATGTTTGTTGGAGCTATAAGAGATATTTTGAAAAAGGAGAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1654989-1655567 imidazoleglycerol-phosphate dehydratase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAATTTGGAAGGTAGAAAGAAATACTTTTGAAACACAGATTTTAGTAGAATTAAATATTGATGGTT
CTGGTAAAGCTGAAATAGATACTGGAATAGGATTTTTAGACCATATGCTTACCTTAATGTCATTTCATGG
CAAGTTCGATTTAAAAGTGATTTGTAAGGGTGATACATATGTAGATGACCACCATAGTGTAGAAGATATA
GGTATAGCTATAGGTGAAGCATTTAAAAATGCACTAGGTGACAAAAAAGGAATACGAAGATATTCTAATA
TCTATATACCTATGGATGAATCTCTATCAATGGTAGCAATAGATATAAGTAATAGACCTTATCTTGTATT
TAATGCTAAATTTGATACCCAAATGATTGGTAGTATGAGTACTCAATGCTTTAAAGAATTTTTTAGAGCT
TTTGTAAATGAATCGAGAGTAACATTACATATCAATCTCTTATATGGGGAAAATGACCATCATAAGATAG
AAAGTATTTTTAAAGCATTTGCAAGAGCTTTAAAAGAGGGTAGTGAAATAGTTTCTAATGAGATAGCATC
TTCAAAGGGGGTTTTGTAG
>ref|NC_013316.1|:1655569-1656174 putative imidazole glycerol phosphate synthase subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATAATAGTAGACTATGGTCTTGGAAATATAGATTCTGTGTCTAGGGGTTTTAGAAAAGCTGGAA
TAGAAACTAAAATTTCTAGTGATATAGATGAAATAAAACAGGCAGATTCACTTATACTTCCAGGTGTTGG
AGCTTTTAGAGATTCTATAAGTGCCTTAGATAAACTAGGATTGATACCAATAATAAAGGAGCATGTTTCT
AAGGGTAAATTTATGATAGGTATATGTCTAGGAATGCAATTACTTTATGAAAAAAGTTATGAGTATGGAG
AATATGAAGGATTAGGACTTATAAAAGGAAGTATTGATAAACTGGATATAACTTTAAAAGTGCCACATAT
GGGATGGAATAATCTAAAATTTAATAAGGCAAATGATGATATACTTAAATATATAAACGAAGATGATTAT
GTATACTTCGTTCACTCATATTATGCAAATTCATCAAATGAAGAACTAGTTGCATTTTCAGAATATGAAA
AGAAAATCCCTGCTATTGTTAGAAAAGGCAATGTATATGGTATACAATTTCATCCTGAAAAAAGTGGAGA
AGTAGGGTTAAATATATTAAGAGCATATGGGGAGATGATAAAATGA
>ref|NC_013316.1|:1656171-1656893 putative 1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5-phosphoribosylamino)methyliden eamino] imidazole-4-carboxamide isomerase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAATATTTCCAGCAATAGATATAAAAGATAATAAGTGTGTAAGACTCACACAAGGAGAATTTGACA
AAGTAAATGTATATTATGATAATCCATTAGAAGTAGCATATAAATGGAAAAATGAAGGAGCAGAATATAT
ACATATAGTAGATTTAAATGGTGCTAGAAGTGAATTTGGTATAAATACAAAAATAATTGAGGATATAGCA
AACAATATAGATATACCTATTCAAGTTGGTGGTGGAGTTAGAGATAAGGGAAAAGTCAAAAGTTTAATAA
ATGCTGGTGTTACTAGAGTAATATTAGGTAGTATAGCGATTGAAAATTTGAATTTGGTTGAAGAATTGGT
CAATGAATATAAAGAGAAAATTGTAGTTTCTATAGACGCTAAAGATGGAAAAGTAGCAGTTAGGGGATGG
GAAGTTGTAAGCGATGTAGACTCATTAACATTATGTAAACAACTTGAAAAGATAGGTGTACAAACTATTG
TTTATACAGATATATCAAAAGATGGGATGTTGCAAGGGCCAAATTTTGACATATATGAAAGAATAGCAAA
GGAAACGTCATTAAATGTTATTGCTTCTGGAGGCGTAACTTCTATAGAAGACGTAAAAAGACTAAAAGCT
ATGAACTTATATGGTGCAATAATAGGTAAAGCGCTTTATGATAAAAAGATAGACTTTAAGGAGGCACAAC
AATTATGCTTACTAGGAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1656875-1657633 putative imidazole glycerol phosphate synthase subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGCTTACTAGGAGAATAATACCTTGTCTAGATGTGAGAAATGGAAGAGTTGTAAAGGGAAAAAAATTTA
AAGATATAGTAGATGTTGATAGTCCAGAAGTACTTGGAAAATTTTATAGTGATTGTGGTGCAGATGAACT
TGTATTCTATGATATAACTGCATCAAATGAAGAGAGAAAGACATCTTTAGAATTTGTGACAAAAGTTGCA
GAAAATATAAATATACCATTTTGTGTTGGTGGAGGAGTAAATAAATTAGAAGATTTCACTGATATTTTAA
GAAAAGGTGCTGATAAGGTTTCTATAAATTCATCAGCAGTCAAAAATCCTGAATTAATAAGGGAAGCTTC
ATTAAAATTTGGAGCACAATGTGTTGTTTTATCGATAGATGCAAAGAAAAATGAAGAGGGTTCATGGAGC
GTATACGTAAAAGGTGGAAGAGAAAAAACTAATCTGGATGCAATTGAATGGGCTGTTAAAGGTGTAGAAC
TTGGAGCAGGAGAAATTGTTGTAAATAGTATGGACGAAGATGGAATGAAAAATGGATATGATATAGAATT
ATTATCAAAGATAACTTCTTTAGTAAATGTACCTGTCATAGCATCTGGAGGCGCTGGAAAAAAGGAAGAT
TTTTATGAGGCAGTTAATAAATCTAATGTAGATGGAATTTTAGCAGCATCTGTTTTTCATTTTGGCGAGA
TAAAAATAAACGATTTAAAGAAATATTTAAAAAACATGGGTGTAGAAGTAAGATTATAA
>ref|NC_013316.1|:1657661-1658329 histidine biosynthesis bifunctional protein [includes: phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase and phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase] [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAATAAGTGTAACAATGTATACAGTGATGAAGTAGAGGAATTTATAAGAAGTATAAAGTTTGATG
ATAAAGGGTTAGTCCCTGTTGTTGTTCAAGAGGTAGTTAGTAAAGATGTACTGATGTTAGCATATATGAA
TAAAGATGCTATAAAGAAAACCTTAAAAGATAAAGTAGCTTGCTATTTTAGTAGAAGTAGACAAAAACTT
TGGGTTAAAGGTGAGACATCTGGTAATACTCAAAAAGTAGTTAAGATGTCTTATGATTGTGATGTAGATA
CTATACTACTTTTTGTTGAACAAACTGGTGTAGCTTGTCATACAGGCAATTATTCTTGTTTTTACAGAGA
CTTGTTTGATGATAGTTCAAAAATGGAGCCTGAAGTACAAACAAATATATTGAAAGAATTATATGATTTA
ATCAATGAAAGAAAAAATAATCCAGTTGAAGGTTCTTATACTAATTATCTTTTTGAAAAAGGAATAGATA
AGATTCTTAAAAAAGTAGGTGAAGAGAGTAGTGAGGTAATTATAGCATCAAAAAATACCGATAAAAGTGA
ACTTATTTACGAAATTAGCGATTTAGTGTATCATACATTGGTTTTAATGATAGAAAAAGGTGTTGAAATT
GATGAAATAAAAAAAGAATTACTTAAAAGAAGAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1659115-1660458 putative amino acid permease [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGAGGAAAAGAATGGGAAGTAATGAACTGAAAAAGACTCTTGGCGTATCAGCAGCATTATCAACTG
TTGTTGGTTCTGTTATAGGAGCGGGCGTATTTTTTAAACCACAAGCAGTCTATACATTAACTGGAGGAGC
TCCAGGTCTTGGTATATTGGCATGGTTAATAGCTGGAATCATAACTATAACAGCTGGTCTTACAGCTGCA
GAAGTATCAGTTGCGATACCAAAAACTGGTGGAATGATGGTATATATAAAAGAAATTTATGGAGACAAAT
TAGGTTTTTTAACTGGATGGATGCAAATTGTATTATTTTATCCAGGGATGATGGCAGCATTAGGTGTTAT
ATTTGGAGAACAAGCATCAGCACTAATTGGTAGCCCATCACTTTTACTTCCAATAGCAATTGGAATTATA
GTAATAGTTGCAGGGCTTAATATGTTAGGTTCAAAAACTGGAGGAGTCATACAAACTGTCTCTACAATTT
GTAAGTTAATACCACTTATTTTAATAATGGTTGTTGGATTTATTAAAGGTGGTGGAAATAATCCAATACT
TACACCTATGGTTGGTGAAGGATTAAGCCTGGGTAGTGTACTAGGTCAAGTTTTAATTGCTATATTATTT
GCTTTTGATGGATGGATGAATGTTGGTACTTTAGCTGGAGAAATGAAGAATCCTGGAAAAGACCTTCCAA
AAGCTATAATAGGTGGATTGTCAGTTGTTATGGCTGTTTATTTTATAATAAATTTAGCGTATCTTTGGGT
ATTACCAGCTAATGAATTAGCAAATTATGCTTCTCCTGCATCAGCAGTTGCTGAAGTTATATTTGGTTCA
ATGGGTGGAAAAATAATATCTGTAGGTATATTAATTTCAGTGTTTGGAGCATTAAATGGATTTTTACTAA
CTGGTTCAAGGGTGGCATATACTTTAGCTACAGATAAGACTTTACCAAAGTATGGTATATTTTCTAAATT
AAATTCTGCTCAAGTTCCAGCAAATGCAATAGCATTAGTATCTGTTATTGCATCTATATATGCTTTGTCA
GGTCAATTTAATTTATTAACTGACTTAGCTGTATTTGCTACTTGGATATTCTATGTATTAACTTTTATAG
GGGTTATGAAACTTAGAAAGACTCATCCAAATATACCAAGAGAGTATAAAGTTCCATTATATCCTATTGT
TCCTATAATAGCTATAGCAAGTGGTATATTTGTTGTAGTTAATCAATTGTGTTTTGCAGGGATGAAAACT
ACTATGATATCTATAGGAGGTCTTGTAATAACAGCTATAGGCTTACCAGTGTATGCTTATATGACTAGAG
GAATAAAAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:1661213-1662046 putative polysaccharide deacetylase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAATAAAAAGAAAAAAATAAATAGAAAGAAGTTGTATTTGCTTTTAAGTGCTATTGTAGTGTGTC
TGGCTTTTATAGTAGTTGGTGTTCGCGTCAGCTCTTTAAATATGAAGGAAAATGAAATTAGTAGAAATGC
AAAACTGTCAAGTTCTACTATTACAGATATAGTATCTAATACATCAATAGAAGTTAGTAAAGGGCCAAGT
AAAAGTTCTGGAAAAATAGCATACATAACTATAGATGATGGCCCATCTAAATTTACTGACGAGATGATAA
AAACTTTAAATAAATACAATGTTAAAGCAACTTTTTTTATGATAGATGGGAATATGAAGGAATATCCACA
GCAAGTTAAAAATATAATTAAAAATGGGAACACAGCAGGTTTTCATAGTGTATCACATGATATTCACAAG
CTTTATGTTACTAGTACATCAGCAAAAGAGGAATTTGATACAAATGATCAAACTTTTTATAAGATAACTG
GTAAACATTCAAAAGTAATAAGAATACCTTATGGAAGCAAACCATATACACCACAAGCCTCTTATCAGGC
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CAAATTGTACAAAATGTAAAAAATCATATTAAGAATAGAAAAGGTGAAGATAAAGACCAACTTGTAGTTT
TAATGCATGAGAAAAAACAGAGTGCAGAAGCTTTAGATTCAGTTTTAAAATTCTTATCAGATGAAGGTTA
TGAATTTGCGCCAGTAGATCAAAACCAAATACCAAAAAATTATTGGTTACGTAATTTAGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:1662139-1663071 putative peptidyl-prolyl isomerase [Clostridium difficile R20291]
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TCACAAAAGAACAGTACAAAAAAACAAAAGCAGTTTTATCTGCTACTAATAATTATATAAATGGGCAGTC
TTTAGATGAATTAGAAAAAACTTTGGATAAAAAAGGTAGAAATAAATTAGAAAATGTTATAATATCGTTT
ATGGTGGATAATGAACTTTTATATCAAGAGGCTAAGGATAAAGGACTAACTCCAAGTAAAAGTGAAGTAG
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AGGTGTTGATAAAGAATATTTAAAACAAGAAATATCTAGAGATTTAGCAATAGATAAAAATAAAAAGGCC
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ATGTAGAAGAAGTAAGTGCTTCTCAGATACTTATATCGACTTTAGATAAAAATAAAAAAGAAGTAAGCAA
AGATAAAAAAGAAGCTTTGAAGAAGAAGGCAGATAATATATTGACTAAAATCAAAAATGGAGAAAGTTTT
GAAAGTTTAGCTAAAAAATATTCGGATGATAAAGCAACTGGAAAAAATGGAGGACAGCTAGGATATTTTA
CAAAGGATGATAAAAATGCTGAGTTTACAAAGGAAGTGTTCAAATTAAAGAAAAATGAAGTTTCAAATGT
GTTTGAAACTAGTTATGGATATCATATAGTCAAAGTTACTGATAAAAGAGAAAGACAAAAAAGTTTTAAT
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AAGATGCTAAAATAGACAGATAG
>ref|NC_013316.1|:1663123-1663605 RNA polymerase sigma factor [Clostridium difficile R20291]
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TAGCATATAGTTATACGAAGAATGAAGAAGATGCCTTAGATGTGGTTCAAGAAGCCATGTATAAGGCACT
ATACTCAGTGGAAAATATTAAAGAAGTAAATTATATAAAGACATGGTTTTATAAAATTTTAGTTAGAACG
AGTATAGATTTTATTAGAAAAAACCGTAAATATAATAATATGACAGATATTGACCTTATAGATGAGACTG
GAGAGTATGATAAATATACTGATTTGGATTTAAGAAGAGCTTTGGAAGAATTACCTATTGAATACAAATC
TATTATAATATTAAGATTTTTTGAAGATTTAAAGATTGAAGAAGTAGCAATAATATTGGATGAAAATGTG
AATACTGTTAAAACTAGGTTATATACTGCTTTAAAAAAACTAAAATTAAAAATTGAAGAGTAG
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ATTTAAAGTTGCAATAGCCTTTGCATGTATATTTACAGTATTAGTAAATATAAGTCCTGTATTTGCAGAC
AATTTTTCTAAGATACCTGTAATTGGAGTAATAGTAGAAGTAATAACTATAAAAAATTATAGTTTAAAAA
GTGAAAATTATGAAGCTGAGATTGATATTCCTAAAATACGAGGTTTAAAAGATAAAAACTTAGAACAAAG
ATTAAACAGTAGTTTTATGGAAGATGGAAAAAGGCTTTATCATCAATTCCAAGAGAGAATGGAGAAGATA
CAATCATCAAAGAATAAAGGATATAAATCTTTAAGTTTGAGTTATAGTGTAAAAAATAATTCTAAAAAAT
TTCTATCAATAGAGATGACAAAAAATGAGATAGAGGCTTCATCATATGTGAGTAAGGCACATTATACTAT
TGATAAAAAAAGACAAATAGTTTTGACTTTGCCAATGCTTTTTAAAGATGATAAGTATATAAAAGTTATA
AGTGATAATATAAAAGAACAAATGAGAGAACAAATGAAAAAGGATAGTACAAAATCCTATTTTATAGATC
AAAAAAAAGACTTGCCTGTTGAAGATTTTAAAACAATTAATAAGTATCAGGATTTTTATTTTAATAAAAA
TGAAGACCTTGTAATTTGTTTTGATGAATATGAAGTAGCACCTGGTTATATGGGTGCAGTTGAGTTTGTA
ATACCATATAAAGTAATAAAAGATTTGTAA
>ref|NC_013316.1|:1664529-1665284 hypothetical protein CDR20291_1409 [Clostridium difficile R20291]
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CATTAGTAGATATAAACCCTATATTTGCAGGTAGTTCCTCTAATGAGACTTCAAATAGTGATACGATAAA
GGTGTTAAATGCTAAGAGTCTCAACTTTAAACAAGGCAATTATGAAGTGAATGTGAGTATTCCTAAAATA
AAAGGTTTAAAAGATAAAACTTTAGAGAATAAATTAAACAATGAGTTTTTGCAAGATGGGAAAAAAATTT
ACAGTGAATTTCAAAATAAAATGAAAAAGGAAAATAATAAGGGTCATAGATACCTAAATGTAATCCATAA
TGTCAAAAATAATTCTAAGGACTTTTTATCAATAGAAATGACAAAAGAAGAGATAGAAGATTCCTCGTCT
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ATAGTAGATATATTAGAGCTATAAGTGATAATATAAAAGAGCAGATGAGAAATCAAATTAAGAAAGATGA
TACAAAATCTTATTTTATAGACCAAGATAAAGACTTCCCAGTGAAAGATTTTGAATCTATAAATAAGTAT
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ATATGGGAGCAGTAGAATTTGTGATACCAAATAAAGTAATAAAAAGACTAAGATAG
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CTCATTCAGGTTCAACACCACGTGAAACTGGAGCAATGATGATTGTGAAAAATGATTCTACTATATTTGG
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TCAATGTTGTATAAATTTACTCTAAACAAATCTGATGTGGCAAAACTAGGAATGATATGTGGAGGTACTG
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GGAAAATACAAGTAAAGCATATATATTTGGTGCAGGTCATATTTCAAGAGATGTTGCTGTGATACTATCT
CTTTTAGAATTTAGAACAGTAGTAATAGATGATAGAGAAGAATTTGCTAATTATGAAAGGTTCCCAGAAT
CAGAAGTAGTAGTTTTAGATTCTTTTGAAAATATACCAGATTTTCCAACTGACGAAAATAGCTATATAAT
TATTTTAACAAGAGGTCATCTATATGATTCAAGTGCTTTAGAATGGGCTCTTAAAAGAGAAACTGGTTAT
ATAGGTATGATTGGAAGTAGAACAAAAATTGGATTGACGTACGAAAAACTCATGAAAAAAGGTTTTAAGA
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TGTATGTATAGCTGCTGAACTTATAAATTGTAGAGCTAATAAGGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1666152-1666913 hypothetical protein CDR20291_1411 [Clostridium difficile R20291]
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TAGTATATAAAAATAGAAAAAATATTTCTATAAAAATAGATCCATTTGGCAAAATAATTGTAATGAGTCC
TCCTAAAATATCCAAAAAAATAATAAAAGATATAATTATTGAAAAAGGAGACTGGATACTTAAAAAGTCA
GAAAAATATAAAGGAAGAGAAGAAGTATACAAACAAAGAATGTTTATAACTGGCGAAAAATTTCTTTATT
TAGGTGAAGAGTACCATCTAGTTATAAAAGAACTGTTGAAAGATTCTGTCAAAAAAAGTAACTGTAGAAT
AACTATTAACGAATATCAAATAGTTGTTCAGACAAATGATACAAGTACAGATTTTATTAAAAAATCTTTA
AAATCTTGGTATAAGATGGAAAGTGAAAGAACAGTATTAGAGAGAATAGATTTTCTTAAATTAAATTGTG
AAATAATGAAGCAATTAGTTCCAGCAAGTGTTAAGGTAAAAGAACAAAATAAGAGATGGGGAAGTTGTAC
AGCTCAAAAAAATATTTATATAAACTCAAAAATATCTATGGCAAGATTAGATGTAATTGATTATGTAATA
ATACATGAGTTTAGCCATTTAGTACATATGAATCACTCTAAAAAATTCTATGATTTAGTAAAATCCATTA
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>ref|NC_013316.1|:1667444-1667683 hypothetical protein CDR20291_1412 [Clostridium difficile R20291]
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GAAGAAGAGAGGTTGATATACAATCAATAAGTATGACTGTAGATAATATGAATAATTCAGGTATAAAATT
AATAGTAAATGAAGAAAAGACATCTTTAGATTCTGTCTTAAACCATATGAAAAAACTACATGATATAAGA
GAGATAACTGTTGAAAGAATGAGACATTAA
>ref|NC_013316.1|:1667953-1668948 ketol-acid reductoisomerase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATGGCAAGAATGTATTATGAAAAAGATGTGGATTTAGAGGTTTTAAAAAATAAAAAGGTTGCAG
TTTTAGGTTATGGAAGTCAAGGACATGCACATGCACAAAATCTTAGAGATAACGGTGTACATGTAGTGAT
AGGTCTTTATGACGGAAGTAAATCAGCACAAAAAGCAAAAGAAGATGGATTTGAAGTTAAGAGTGTAGCA
GAAGCTACAAAAGAAAGTGATTTGACAATGATGTTAATGCCTGATGAAAAACAAAAGAAAGTTTATGAAG
AGAGTGTAAAGGATAACTTAAAAGAAGGTCAGACATTAGCTTTTGCTCATGGATTCAATATACATTATAA
TCAAGTACAACCACCAGAATTTGTTGATGTTGTAATGGTAGCTCCTAAAGGACCTGGTCACTTAGTTAGA
AATGTATTTACAAAGGGAAGTGGAGTTCCTGCACTATTTGCAGTATATCAAGACTACACTAAAAAAGCTA
CAGAGACAGTTTTAGCATATGCAAAAGGGATAGGAGCAACAAGAGCAGGTGTTTTAGAAACTACTTTTAA
AGAAGAAACAGAAACAGATTTATTTGGAGAACAATCAGTACTTTGTGGTGGAATAAGTGAACTTATAAAA
TTGGGATATAAAACGCTTGTAGATGCAGGTTATCAAAAAGAAGTAGCATACTTTGAATGTTTACATGAAA
TGAAACTAATAGTCGACCTTATATATGAAGGTGGATTTGAAAGAATGAGATATAGTATAAGTGACACAGC
AGAATATGGAGATTATGTATCTGGTAAAAGGGTAATAACTGATGCTGCAAAACAAGGTATGCAAAATGTT
TTAGAGGATATACAAAATGGAAAATTTGCAAAAGCGTGGATTAAAGAAAATGAAGAAGGACGTGAAAACT
TCCTAAAAACTAGAGAAGAAGAATATAATACAGAAATTGCCGAAGTTGGTAGAAATCTAAGAAGTATGAT
GTCATTCTTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1669001-1670689 putative acetolactate synthase large subunit [Clostridium difficile R20291]
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GTGGAGCCGTGATACCTCTTTATGATGCTCTATACGATTATTCAGATGATTTTAAACATATAAGGACATC
CCATGAACAAGGTTTAGTTCATGCTGCAGATGGGTACGCAAGAAGTACTAATACAGTAGGAGTTTGTTTT
ACAACATCTGGTCCAGGAGCAACAAATGCCATAACTGGAATAGCAACAGCTTTTATGGATTCTTCACCTA
TGGTTGTAATTTCAGGGCAGGTGCCAACTAGTTTATTAGGAAAAGATTCTTTTCAAGAAATTGACATAAC
TGGAGCAACATTATCTATGACAAAACATAATTATTTAGTTAGAAACACTAAAGAATTAGTTCCTACAATA
AAAGAAGCTTTTAGAGTTGCAAATTCAGGTAGAAAAGGACCTGTACTTGTAGATGTTCCAAAAGATTTAT
TTTTAGCAGAAATGGATTTTAGTGGTGAGGACTATGATTTATGTCAAATAGATGATTATATGGATTATAA
GAGTGATTTTGATCTAGATGATGAAACTAATATTAAGCTTTTAAATGAAGCAATAGATATCATAAAAGAA
TCTAAAAAGCCTGTAATATATGCAGGTGGAGGTGTTAAATCTTCAGACAGTGAGGAAATTCTTGAAAAAT
TTGCAACTAAGATAGATACACCCGTACTAAATACACTTATGGGGCTTGGAAATATAGATAGAAAGAATGA
ACTATCTCTTGGAATGGTTGGAATGCATGGAAGTAGAGAAAGTAATTTAGCACTTTCTAATTCAGATTTA
GTAATAGCGATAGGTGCGAGATTTAGTGATAGAGTGATAAGTAAAAGTTCTGAATTTGCTAAAAATGCAA
AAATAATACACATAGACATAGACCCATCTGAAATAAGTAAAAATATAGAATCTAATGTATCTTTGGTTGG
AGATGTAAAGCTAGTCCTTAGTTTATTAATTGAAAGGGTTGAAAGTAAGAATAATAGCAATTGGAAAGAA
GAGATAAAGACATTTAGAAAGAGTGAGGGTGTACAAACATATGAATTTCATCCACAAAATATACTTAAAA
AAATAAATGAAAAATATGAAACATTAAAGAAACCCACTGTGGTAGTAACTGATGTCGGTCAACATCAAAT
GTGGTCTGCTAAATACTGGAATTTTAAAGGTAATAAAAGTTTTATAACATCAGCAGGGTTAGGAACTATG
GGATTTGGTTTAGGTGCAGCTATTGGAACTAAAGCTGGTAATGTAGATAAAAATGTGGTTTTAGTAACTG
GTGATGGAAGTTTTAGAATGAACTGTAATGAACTAGCTACAGTTGCAAATTATAATGTACCTATGCTTAT
TTTACTACTCAATAATAGAACATTAGGAATGGTAAGACAATGGCAGAAGTTATTTTCCAATCAAAGATAC
TCTCAAACTGATATTAATGAAAATGTGGATTATGTTAAACTCGTAAATGCATATAATATTGATGGATATA
AGGTATCCAATATGGAAGAATTAGGAAAGGTTCTAGATGTGATAGATTTTAATAAACCTGTATTTTTACA
ATGTGATATAGATAAGGATTATGATGTTTATCCTATTGTAGCACCTAATGATGCATTGGAAAATTTGATA
TGTAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c1672177-1671047 prophage lambdaba04, site-specific recombinase, phage integrase family [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGGTGGAGTAAGAAAAAGAAGCAACAAATGGTATTACTACTTTGACCTAGGCATAGTAGAAGGAA
AAAGAAAAAAAGTAGAAAGAGTTGGTGGCAATACAAAAAAAGAAGCAGAAAAAGCACTAAGAGAAGCACT
AAATGAATATGAAAACTCTGGCATAGTCTTTGAAGAAAGTAACATCAGCTTATCAGACTACCTAGACTTT
TGGTACAAAGAATATGTTTTACTCAACTGTAAATACAACACTCAAGAAAGCTACCGAATAAACATAGAAA
AACATATAAAGCCAAAACTAGGAGCTTACAAAGTAAAAGCTTTAACTCCTGCAATACTACAAAACTTCAT
AAATAAAAAGTACAAAGAGGATTATTCTCAAAATACATTACAAGTATTAAAAGCCATATTACATAGGTCA
TTAAAATCAGCAGTCCATCCTTACAAACACATACGAGAAAACCCTATGCAATATGTAAGCATACCAAAAA
CTAAATCTAAAACAGAAACTAATAAAGTTAAAACTATTACATTAGAAGAATTTAATCAAATACTAAATAT
ATTTCCTCAAGATTCATTTCAACGTATAGTTTTACTAATTGGATTTCATACTGGTATGCGAAGAGGTGAA
ATTATTGCACTAAAATGGGATAATATAGACCTTGATAATAAAACTATCACAGTAAAGCATACTTTGATTA
AAAAACCAAATGGAATGTTTGAATTAGGGCAACCAAAAACAGAAAGCTCTTGCAGAACTATATTTACAGG
TGACACTTTAATAAAGGCATTAAAAGAACATAAATTATATCAAAAGAAAATGAAATTAAAATACGGAGAA
TTTTACTTTGATAGTGATTGGGTATGTACCAAAGAAAATGGTCAACAAGTGAATACTCACACTTTAGACA
CTATAGTAAGACAAATTCGAGTAGCTTTAAACAATGACTTCCATTTTCATTCTTTAAGACATGCACATGC
TACTCTATTATTAGAAAATGGTGCTAACATTAAAGACATACAAAACCGTTTGGGTCATAGCCAATTATCA
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TTACAAATTAG
>ref|NC_013316.1|:c1672963-1672256 hypothetical protein CDR20291_1416 [Clostridium difficile R20291]
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TAATTGGAAAGTTAGCTAAAAATGGATTGTATGAATTTTCTTATGAATATGAAATTGATGAAGCTATTAA
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CCATTTGCAAGTAGATTACCTGATAAAAAAAGAAAGGACATCAATAAAATTTTGGATAAGTATGATATGT
CTGAGTATGATACATATGAACTTTTAAAAAGAAGTGGTGCAAGATTACCTATAGATACACTAGAATTTGT
AGATCCAATTCCTTTGGACATTGATAAAAATATAATTAGATATTTTTATATTGCAGGAGTAAGACATTAT
GCTGGGTGTGAAGGACATGAATGTGATAATTCAATAGAATTAGAATCAAATGAAGCTCTAGTTCTAGAGT
TAGAACCAGAAAATAAATTTGATCCTCATGCAATCAAGGTATTTGATAAAAAAGAGAATCATATAGGTTA
CATTCCTAGATATTATAGTGGAGAATTAACAAGTATAATAAATAGAGGATTAAAGTATAATTGCATTATT
AAATTTGTTAACAAAGAAAATAATTGTGATGAATGTATAAAAGTTAAATTAGAAATATTATTTGACGAAT
ATAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c1673845-1672976 hipa-like [Clostridium difficile R20291]
GTGATTAAAAATTTTGATGAATGGAAAGAGTATGATGGTTTTTCTTATGGTAGTGGAAGAAGCGAGAAAA
TCTGGCTAATTAATGAAAAAACTAAAGATATAGGCTTGTTTAAATTCCCTAAAACAAAAGAAACTGGAGA
ATATTGGGCAGAAAAATTAGCCTGTGAAATAGCTAGTTTGTTAAAGATTCCTTGTGCTAATGTTGAGATA
GGTACATATAATAAAAGAATTGGTTCAATGAGTTATTTAATCAATAAAAATGATGAGAAATTGATTGAAG
GCGTGTGGTTAATAAACAAATATTATCCTTGTTATAATACAGATAAGTTATATGATTATAAAAATAATGA
ATACTATTCATTGAAAATGATTTTTAAATCTATAGAAGAATATAACATAAAAAATGATTTTCTAAAAATG
TTAATTTTTGATTACTTGATTGGAAATAGAGATAGGCATCAAAATAATTGGGCTCTACTAGAAAGTCAAA
ATAAAATTACTCTTAGTCCTCTATATGATAACGGATCATCATTATGTTGTTATGTTAATATTGAGAACAT
AGATTCTTTCTTCACTGATCATCAAAGATTTGAAGCTCTTATAAATACACGTTCAAGATCAAGAATAAGG
ATAGATGGAAAAAATAAAAAAGAACCAACACACTTAGAAGTGCTAAAATATTTAAATTCAAATTATTATG
AACAAACTATAGATTTTGTAGAAAAGATAATAAATCTTATGAATGAAGTAAACATAAATACATTAATAGA
TAACTATTCAGAAAATATTATAAGCCCAAAGTTAAAAAAATTGCTAAAAATATATCTAAAAGAAAAAGTG
TTAAGAATAAAAAATATATATAATTTGTGA
>ref|NC_013316.1|:c1674971-1674465 putative phage-related protein [Clostridium difficile R20291]
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AAAACAAAACAATGCTAAACTAATAGAAATCTTAGCAGAAGAATTAGGACATCATTTTACCAGTGTTGGA
AACTATGTATCTTCAAAAAACAGTTACAAAAATAAAATCTTGATAGACAAAACTGAAAACAAAGCACTAA
AATGGGCATGTGAATTTCTTATAACAGAAGAAGAAATAATACATGTTATTAATTCACACGCTACAAGTGT
ATACGAAATAGCTGAAGAATTACAAGTTAGCATCAACTTCTTACTAAAAAGATTAGAATTTCTATCAAAA
AAGAAAAGCATGTTGGACTTAGGAAATAATAGATTTTTAGTATTAACTAATTTGCCAAATTTCTACATAT
ATGAGGATATTTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1676376-1677185 hypothetical protein CDR20291_1419 [Clostridium difficile R20291]
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TTTGGTTTGTTGGAAAAGATATTGCAGAACAATTAGGATATAAAGATACATCTGATGCTTTGAAAAGACA
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AATGAAAGTGGTCTTTATTCTTTAATATTAAGTTCTAAGTTGCCAAGTGCAAAATTATTTAAACGTTGGG
TAACTAATGAGATATTACCAAGTATACGTAGTACTGGGACATATAATATGATAGATTTGCAAACTAAACT
ACCAACTACATATAAAGAAGCGTTACAACATCTTATAGAGCAAGTAGAAGTAAATGAGCAGTTACAACTA
GAAAGTAAAATGAAAGACCAAGTAATAAAAGAACTAAAACCAAAGGCAGATTATACAGATATGATATTAA
AAAATAAAGGACTTGTCACAATAACTCAAATAGCAAAAGACTATGGAATGAGTGGAAAAGAAATGAATAA
AATACTTCATGAAAGAGGGATTCAATATAAACAAAGTGGACAATGGCTTTTATATAAACAACATCAAGGG
AAGGGATACACTCATTCAGAAACAATAGACATAACTAGAAGTAATGGAATGCCTGATGTAAAAATGACAA
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AGAAAAAGGATATAGTTATCAAACTTCAATATTAGGTTAG
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ATGGTTGAAGTTAATGTAAATGTAAAAGTTAAAGTAGAAGCACCAGAATTTACAAATGCACTATTAGTAG
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GAAAGAAGAGAAGAAAGTTGAAGTTAAAAAAGCTGAAAAGATTAAAAAGGTAGAAGTAAAAGAAGACGTT
AAAGAAGAAATAGCAGAAGCAAAGGAAGAAATAGAAAAGAATAATGAAAATACAACTAGTGAAGTTAAAT
ACACAAAAGAAGAGGTAAGAACTAAGGCAGCACAAGTAAGTAAGGCAGGTAAGAAGGATAAGCTTAAGGA
GTTATTTGGTGAATTTGGAGCTAGTAAGTTAAGTGAAGTAAAAGAAGAAGATTATTCAGCTTTTATGAAC
AAATTAGAAAGTTTATAG
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AGAAGTTAAATTAATGCTAGAGTATGAAAAAATAAGTAAAAAGGCATATAATGCAAGAATTAAAAAGATA
CAGAAAAGTGAGTATTATAACTCTGAAATGGAGGACTATATACAATCTTATGTTGAGAATGTAGTTGAAT
TAGTAAATGATAGTAAAGCTATATGTGATGATGTAATAGTGATGTTAGAAGAAAGACTCGATTTTAGTGA
GTGGGTTCCAGAAGGATTTGGAACAGGAGACGTTGTTGTAATATCTGATGGTATACTTCAAGTTATAGAC
CTAAAGTATGGAAAAGGTTTAGAAGTTTCAGCTATAGAGAATCCTCAACTTAGACTATATGGTTTAGGGG
CATATAATCAGTTTGAAATGCTATACGATATTGATTTAATTAAAACAACAATAATTCAACCTAGACTTGA
TAACATATCAAGTGAAGAAATAGAAGTTACTAAATTACTTACATGGGCAGATAATGTTAAGAAGAAGGCT
CAAATGGCTTTTAATGGTGAAGGAGAGTTTGTAAGTGGCAGTCATTGTGGATTTTGTAGAGCTAAAAATG
ATTGCAGAAAAAGAGCTGAGGATAACCTTAAACTAGCTAGAAAATATGATTTTGCTGACACATTTGCTCT
TAATAAATATGAGATAGCAGATATTTTAGGTTTTGCTAAGAATATACAAGATTGGTTAAAGGATGTTCAA
AGTTATGCACTAGAACAAGCTGAAAAGCATGGTGTTAAATATCCAGGATATAAGCTTGTAGAAGGCAGAA
GTAATAGAAAGTATGTAGATGAGCAAGAAGTTGCTAAGGTTTTATTAAATTCAGATTATGATGAAGAAAA
AATTTATAAGCCAAGGACCTTAAAAGGAATTAGTGATATGGAGAAAGCTATAGGTAAAAAGAGTTTTGCT
AAACTACTAAGTGATTTAATTATAAAACCAGTTGGAAAAGCTACTTTAGTAGTAGAAAGTGATAAAAGGT
CAGAAATTAATAGTATAGATTCAGCGAAAAAAGATTTTGAAATATAA
>ref|NC_013316.1|:1680740-1681312 hypothetical protein CDR20291_1422 [Clostridium difficile R20291]
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TTTTTAAGTCTTATGTAGAGCAACATCCATACTTATATGAAGAGTTTTATCAAGAAGGATGTATTGGGTT
ATATAAAGCAGCATTAAATTATGATAGTAACAGAGGCAAGTTTTCTACAGTGGCTGTTTCTTACATAAGA
ATAGAAATGTTTAAAGCTTTGCGTTATGGCGAAAAACATTATAGAAACTCTATAGAAGGTTTAGATGTAA
GTGTATTTGAAGATAGTAAAAGACCATTAAAAGATATACATGGATTTTATGAAATTCAATTTAACTATGA
TGTTGATTATATAAGAAAAATTGCAAGAAAGTCATATTTAAAAGATATTGATAAAATAGTAGATTGGATT
TTACAAGATAAAAAGATATCTGATATAGGAGAGTTATTAAATGTTTCTTCAACAGTTATTTGTGGAAGAA
TTAAATTGTTTAGTAAGCAAGTTAGAGATTTAGATAAATTTGGAGAAATAACTTCAAATATAAAATCAAT
ATACCAAATATAA
>ref|NC_013316.1|:1681335-1681907 hypothetical protein; hypothetical protein [Clostridium difficile R20291]
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AAAGCAGAGCAATGGTAGAAGGTGCAGAGCCCAAGTATTCAGTTTGTATTTTAATACCAAAATCAGATAA
GGTGACTTTAGGAAGAATAAAGAAGGCTATTGATGCAGCTAAAGAACAAGGTAAAACTTCTAAATGGGGT
GGAAAATTACCAGGTAATTTAAAAACACCTCTTCGTGATGGAGATGCAGAAAGAGCTGATGAAGCAGAGG
AATATGTAGGAATGTATTTTTTAAATGCAAATAGTACACAAAAGCCAGGAATAGTTGATAAAGACTTAAA
TGAAATATTAGATAATACAGAGGTATATAGTGGTTGTTATGGAAGAGTTAGTATAAACTTTTTCCCATAT
AATAGTGCAGGAAATAAAGGAATAGGTTGTGGCTTACAAAATGTTCAAAAGTTAGCAGATGGAGAAGTAC
TTGGAGGAGCTAGAGCTAGTGCAGAAGCAGATTTCTCAGATGACTTTGAATATGAAGATGAAGAAGAGGA
CTTCTTAAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:1681907-1683865 dna-directed dna polymerase i [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGACCTTATCAATTGATATAGAAACATATAGTGATTTAGATATAAAAAAAGTTGGAGTCTACAGAT
ATGTAGACTCTGCTAATTTTGAGATACTGTTATTTGCCTATGCTTTTGATAATGAAGAGGTAAAAGTTAT
TGATTTAGTAAATGATGAAGAGTTACCAAAAGAAGTAATAGAAGCTTTAAATGATAATAAAGTTATAAAA
TCAGCATTTAATGCTAATTTTGAAAGAACAGCAATAAGTAAATTTTTAAATATTAATTTAAAACCAAATG
AGTGGTCATGTACAATGATAAAGGCGTTAACACTAGGACTTCCAGGAAGTTTAGATAGTGTGTCTAAGGC
TTTAAAGTTTAATGAAGATAAACAGAAAATGAAAGAAGGTAAAGCATTAATACAATATTTCTGTAAACCT
TGTAAGGCTACAAAAGTTAACAAGGGAAGAACTAGAAATTTACCAATACATGATATGGAAAAATGGAATA
AATTTAAAGAATATTGTAAACAAGATGTTGTAGTTGAAAGAGAAATAAGAAACAAACTTAGTAAGTATAA
GACTACCGAAAGAGAAATTAAATTATGGTATTTAGACCAGAGAATTAATGATACTGGTATTAAAGTTGAT
ACAGAGTTAATAGAGAATGCAATAGAATGTGATAAAAGATATACTGAAAAACTTACAAAAGAAGCAATTA
AAATAACTGGTCTAAATAATCCAAATAGTCCAGCTCAATTAAAAAAATGGTTAAGTGATAAAGTTGGCTT
TGAGATTACAAGCCTAACAAAAGAAAGTATTCCAGAAATATTAAAACAAGTTGATGATGAAAATGTAGTT
AGAATTTTAGAACTTAGAAAATTAATGTCCAAAACTTCTATAAAGAAATATGAGGCTATGAAATTAGCTA
AAGGTAATGACAATAGAGTAAGAGGTCTACTACAGTTTTATGGGGCTAATAGGACTGGTAGATGGGCAGG
AAGATTAGTACAAGTACAGAATTTACCACAAAATCATATAGAGGATTTAGACCTAGCTAGAAACCTATTA
AAAGAAGGAGATTTTGATTTAATAGAGCTTTTATATGATAGTGTACCAGATGTCTTAAGTCAATTGATAA
GGACAGCTTTTATACCAAGTGAAGGTCATAGATTTATAGTATCAGATTTTAGTGCAATAGAAGCTAGGGT
TATAGCTTGGTTCGCTGGTGAGAAGTGGAGATTAGATGTATTTAATTCTCACGGGAAAATATATGAAGCT
AGTGCTAGTCATATGTTTAAAGTTCCAATAGAAAGTATTAAAAAAGGTGACCCACTTAGACAAAAAGGTA
AGATTTCAGAGCTAGCTCTTGGATATGGGGGAAGCATAGGAGCTTTAACATCAATGGGGGCTATAAAAAT
GGGTCTTGATGAAGAGGAGCTTCAACCTCTTGTAACAACATGGAGAAATGCTAATCCAAATATAACTAAA
TTTTGGTGGGATGTAGATAAGGCAGCTAAAAAAGCCATAAAAGATAGGACTATAGTAAAACTCCAACATG
GGATTAAATTTATTTATAATCCAGGAGTTTTATTTATAGAACTACCAAGTGGTAGAAGATTATCATATCT
AAGACCTAAGATAGAGCCTCATACTACATTTAGTGGGGATAAGATAACATATGAAGGTATGGAACAGACA
AGTAAACAATGGAAAAGAATAGATACTTATGGACCTAAGTTAGTTGAGAATATTGTTCAAGCTACAGCTA
GAGATTGCTTAAGAGAGGCTATGTTTAATGTGACAGATGCAGGTTATAGCATTGTAATGCATGTACATGA
TGAGCTTGTAATTGATGTAGATAAAAAAGGAGGTTCTTTAGAAGAAGTTAACAGTATTATGGGAAAAGAA
ATATCTTGGGCTAAAGGTCTTCCTCTTAAAGCAGATGGATATGAATGTGATTATTATAAGAAAGACTAG
>ref|NC_013316.1|:1683877-1686294 putative virulence-associated protein e; putative virulence-associated protein e [Clostridium difficile R20291]
ATGGATATAAAGGCCAGTGAAATTGAACACATAAATGTAAGACATGATGGCCAACTCATGCTGGCCATAG
GAAAAAATAAATTAGAAACACATTGGAAAAATAAAAGTATTTTATGGTCCGAACTTGTAAATAGATTAAG
TAAAACATTAAGAACTCAAGAAACATATACAGAATATAGGAAGATGTCAAAGACTGAAAAAGATAGAGTT
AAAGATGTTGGTGGATTTGTAGGTGGAAGCTTAAAAAATGGAAGACGAAAAGCAGAGAATATTGCAAATA
GAAGTATTATAACTTTAGATATAGATTATGCGAATAAAGATATATGGGAGGATATAACATTATTAAATGA
TTATGCTTGTCTTATGTATTCTACGCACTCACATACTGAGAATAATCCCAGATATAGACTTGTAATACCT
TTAACTAGACCAGTACTACCAGAAGAATATCAAGCAATTTCCAGGATGATAGCAGATACTATAGGAATAG
ATATGTTTGATGATACTACATATCAACCTCATAGACTTATGTATTTTCCAAGTACTTCAATTGATGGAGA
CTATATATTTAAATTTCAAGATGGAGAGTTTTTAAACCCAAATGAAATACTAGATTTATATTTAGACTGG
ACAGATGTAAGCTATTGGCCAGAAAGTTCGAGGGAGAGGCAAAAGTTTAATACACAATTAAAAAAACAAC
AAGACCCTATTGAAAAGGCTGGAATTATAGGTGCATTTTGCAGGTCCTATAGTATAAAAGAAACTATAGA
AAATTTCTTAAATGAAGTATATATTCCTGGTATTGATGAAACCAGGTATACATATTCAGAAGGTAGTACA
AGTGGTGGAGTAGTTATTTATGATGACAAGTTTTCATATAGTCATCATGGTACAGACCCAGCAAGCGGAA
TTTTATGCAATGCTTTTGATTTAGTTAGGATACATAAATTTGGTGAACTTGATGAAGATGCTAAACCCGA
AACGCCTGTAAATAGATTACCTTCATTTACTCGAATGAGCGAATTTGCAAGCAGTGACACTAAAGTACGA
AAGACTATAGGAAGAGAAAACCTTGATAAAGCTAAGGATGATTTTGGTGATATAGATTTTGAAGATGATG
AATGGTTAACTAGGTTAGATTATGACAATAAGGGAAGTTATAAGAAAACAACAAACAATATCTTAATGTT
TATAGAAAATGACCCATATTTGAAAGGAAAAATAGCTTATAATGAATTTTCAAATAGAGCTGTCGTTTTA
GGTAAGTTACCTTGGAGAAAAGATGATAAATTAAATGATTGGAATGATAGTGATGATTCTGGGCTTAGAC
ATCATATAGAAACAATTTACAATATCTCATCACCATCAAAAGTAAATGATGCTCTAATAATTGCTTTTGA
AAATAATACTTTTCATCCTATAAAAGATTATTTAAATTCTTTAAAGTGGGATGGCATTAAGAGAGTGGAT
ACACTTTTAATTGACTATTTAGGTGCAGAAGATAACCACTATACAAGGACTATAATAAGAAAAGTTTTAG
TAGCAGCAGTAGCAAGAGTATTTAATCCAGGAATAAAGTTTGATAATATGATGGTTTTATCTGGTCCTCA
AGGAATGGGAAAAAGTACTTTTATTAAAAAACTTGGTGGAGACTGGTATTCTGATAGTTTAACTACTGTA
CAAGGTAAAGAAGCGTATGAACAATTACAAGGAGTATGGTTGCTGGAAATGGGTGAAATGATGGCTACTA
AAAAAGCAGATATTGAGGCAGTTAAGCATTTTCTAAGCAAATCAGAGGATATATATAGGGTCGCATATGG
GAAGAGAACATCAAGGTTTTTACGTCAATGTGTAGTTATAGGAACAACTAATGATAAAGAATTTTTAAGA
GATAAGACCGGGAATAGAAGGTTTTGGCCAATAGATACAGGAGTAAAGAAGGTTAACAAGAGTATATTTA
ATGGTCAACTTGATAATGAAAGAAATCAAATTTGGGCAGAAGCAGTAGAATTATGTAAAGCCAATGAACA
GCTATATCTATCAGATGAGGAGAAAAAAGAAGCTGAAAGACAACAAAGAACTCACTCAGAAGAAAATGCT
AAATCTGGAATTATCGAAGAGTATCTAAATAAACCTATTACTGAGAATTGGTATGATTTAAGTATTTCAG
AAAAGAGAGAATATATTCATGGTTCAGATTTTGGTGATTTAAAAGAAGGAACAATATTAAGAGAAAAAAC
GTGTGTTATGGAGATATGGGTTGAGCTATTTAATGGAGAACCTAAACAACTCACGCCTATCTTATCAAGA
GAAATTAATGATATATTAAAAGGATTAGATGATTGGATATCATATAATGGAAATTTAAGGTTTGGGAAAA
TATATGGTAGGCAGAGAGCTTATGTACGTAAAAGTTAG
>ref|NC_013316.1|:1686851-1688221 snf2-related protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATTTAAACCACATCCATACCAAGAATACACAATTAGAAAAACTATAGATAATAATAATATAGGTT
TACTATTAGATATGGGATTAGGTAAAACAGTCTGTACTCTAACAGCTATAAGTGAATTAATGTATGATTA
CTTTGATATATCAAAAGTTTTAGTTATAGCACCTTTAAGAGTTGCAAGAGATACCTGGAGTAGTGAAGTA
AAAAAATGGGAACATCTAAAGCATCTAAAAGTATCTAAAGTTCTTGGTAGTAAATTAGATAGAGTGAGAG
CTTTAAGTACAGACTCAGATATTTATATAATAAATAGAGAAATGGTACCCTGGATAGTGGATTTTTATAA
AAGAAAATGGCCATTTGATATGGTTGTGATAGATGAACTTAGTTCTTTTAAATCAAATAAAGCACAACGA
TTTAAAAGTTTAAAGAAAGTATTGCCTTTAACTAAAAGAGTAGTTGGGCTTACTGGTACACCAACACCAA
ATAGTTTAATAGACTTATGGGCACAGATGTACTTACTTGATAGAGGTGAAAGACTAGGTAAAACTATTAC
AGGATATAAAGAACGATACTTTGAGCCAGGACAAAAAAATTATCAAACAGGAGCTATATATAATTGGCAA
CCTAAAAATGGAGCAGAAAATGCAATACATAATAAAATAAAAGATATTTGTATAAGCTTAAAAGCAGAAG
ATTATTTGAATATGCCTAGAAAAATAGATAATAAAATTGAAATACACCTTGATAGTAAAATACTTAAATA
TTACAAAGAATTAGAAAAAGAGAAGATATTAGAATTAGATAGAGATATAATAACAGCTTCATCAGCAGCT
GTAGCAGCAAATAAACTTTTACAATTAGCTAATGGAGCAATTTATGATAATGATAAAAATGTAAAGGAAC
TCCATAGAGAAAAATTAGAAGCTTTAAAAGAAATTATAGATGTTTCAAATGGTAAGCCTATTATAGTTTT
TTATAACTATAAACATGATTATAATCGTTTAATGAAAGAGTTTAAGAGTTTGAAACCAAGAACAATAGAA
AACTCAAAAGATATATATGATTGGAATAATGGAAGAATACAATTATTACTTTGTCATCCAGCAAGTACAG
GACATGGACTTAATTTACAATCAGGTGGAAGTATAATTGTTTGGTTTGGATTAACTTGGAGCTTAGAACT
GTATCAACAAGCTAATGCAAGGCTTTATAGACAGGGTCAAAGGGAAACTGTTATTATCCATCATCTAATC
TGTAAAGGTACAATAGATGAACAAGTAATGGAAGCTATAGAGAATAAGGATAAAGGGCAAAGTGCATTAC
TTGAAGCAGTAAAAGCAAAATTAAAAGAATATAGGGAGTGA
>ref|NC_013316.1|:1688375-1688854 hypothetical protein CDR20291_1427 [Clostridium difficile R20291]
GTGGATAAAGAAAGTATAAAAGAAATTGTAAGAGAGTTAAGAAAAGAAGAAAGAGAAGATAGGAAAAAAG
GCGTTTTATATAATACTAGATTATTGATGAAGCATTATAATGATTTTAAGAGACATATAGACTCAGCGGT
AAGTGAAGCTAAAGATGTAGATTACTTAGAGGATGATTTAGGTAAGCTTGATAATGAAGAGTTGTATATT
TTAAGTATAAAGAAAAGTAAAGCAAGAACTATTATTATGATAGCACATATAGATTCAGCAATGAAAACTT
TGAAATTAAGACAAGAGCGTTTACATTCTTATGAAAAGTATAGAGCTTTAGAGCTTTACTATTGTGATGA
AAAAACATATGAAGAAATAGCAGAGATATTAAATTGTGGAGTAGTTACATCAAGACGTTGGATTAATGAA
ATGGTAAAAGAACTTGGAGTGTATTTATTTGGTATAGATGGCTTGAAATTAACTGTTTGA
>ref|NC_013316.1|:1689137-1689589 bro family, n-terminal [Clostridium difficile R20291]
ATGTTGAAAATTTTACAAGAGAAAAATGTAAGGATGATATGGTCAAAAAATGGAGAAGAAGTTTGGTTTA
ATGCAAATGACGTAGGAGAGGAACTAGGCATAGTAAATATTCGTGATACATTAAGAAATATAGATAGAGA
ATATAAAAAGAAATTTAATGAGTCTACTGTCGGAGATTCCTACACTAGAAACTTTAAAGATAAATTGCCT
AACTTTGGTACTACTTTTGTTACAGAAGAAGCTGTGTACAATATGTCATTTAGAAGTAATAAAGCAGAAG
CAAAACTATTTACGAAGTGGGTTACAAAAGCACTTAAACAAATTAGAATACATGGTTACTATATTGCCAC
AGAAAAAGATCAAGAATGGCTGGATATAAGAACAGAAGGTAAAAGGTCAGAAAAGATTTTACAGATGAAA
TACAAGAGTTTTTTTATTAATACAAGTACTTGA
>ref|NC_013316.1|:1689881-1690855 hypothetical protein CDR20291_1429 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAATTTTAAAAAAAGATATATTGATGTTTATAGAATAGATATTATAAATAAAATTAATGGGAGTG
TCTATTCAGATGAAGAAATTTTAAAAGAGGTAATAAAGACCTTCTTTAAGGATAAAGAATATTGTAAAGA
AAACAAAAATGGAATTAATATTACTAAAGATAAAAAGTTTTGGATTACAGAAGTAAAATGTAGCGAGGAT
GATTTAATAATCAAGGTGAAACTTGAATATACTAAATACAATCAGAATACAAATATTATAAATGCTCATA
CTAAAGAAGTAGAGGGTAATAAAAAAATGGATCAAGGAGATAGCAATAAGCAGCACCTATTTATTAAATT
TATGAAGGAAAATAATATAGCAGTAGTATTATTTGAAAGAGTTTTTGTGGGGGTTCCCATGATTGAACTA
AGTAAAAACTTACATCTATATTATGAGGATATGATTGAAAATAATAAATTTGATAATAATATGTCAAAAA
CATCAATTAATATTACACAAATAGCAAGTAAAGATTTTATAGAACAAATATTAGATTTAGATGGTGTTTC
AAAAATAACTTTAAATGTTGATAGAGAGAAGTTTGGAACTGATGAAGATAATTTGTTTTCTAATTTAAAT
AATTCAAGACGACATAACGATTTGATATATAAGCCCACATTTAGAACTAGATATTTACCTAGTGAAGTTA
AAAGATGTTGCGAAAAATATATTAAAGGAGAGGAATTTAGAAATAAAAAAATAAATAGGATAATAATTGA
GGGAGAGAAAAATAAGAGAAAATTAAAGTTGGATACTGAGGGTATAAAGTTGTGTAGAGAAATAGAGGTT
TCTCTTGATATAGATAATCATATAGATAGTGAAGACATTTTTGAGAAGATGAATAATTTGATAGATGATT
TAATTGAGAATAATTCAGTTTTTTTTAATTTAATGTATCAAGAAGTTGCTATGAGTGAAGCATAG
>ref|NC_013316.1|:1690876-1691385 hypothetical protein CDR20291_1430 [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAAAAAGGTATTAAATATCTTACTCAATTATTACAAGGCTATAAATTCTAAAGAAGTAGTAGAGT
TAGTTTTAACACCAGTATTAATATGTATTATTTCATACATGTTTTTTAATTCGTCAATTAATAAAGAAGT
TGTAATTTCTTTAAACAAAGATGTACTAACTTTGTCAGGACTATTAGTAGCTTTTGGAGTTTGCATTATT
ACATTATTGTTTACTACATATAACAAATCAATATCAGAAGCAAAAGATATAAAAACAGAAAGAAAGGTAA
ATGGATTTAATATATCATACTTTCAATTCATACAGTTAAAAGCATATTATACTGTAATAATGGAGATTTT
GGTTGTTGTAATATGTTTTATCAATACAATAATGCTTACTCGATATTATTCTAATATAATTTTCTATGTT
TTAATATTTTTTACAGTTCATATAATTTTATCTCTAACTACATTAATAATAAGTATGTTTCATTTATCCT
GGAAGGATAGAGGAGACTAG
>ref|NC_013316.1|:1691455-1692147 putative phage DNA-binding protein [Clostridium difficile R20291]
GTGCAAGATGTCAAAGAAAAGGTAAAACAAGATTACTTAAAAGGAATGAAACAAAAGGAAATATCAGCAA
AGTATGACATTAGTTTAAATACTTTAAAGTCATGGATAAAAAGATACAATTGGTCTAGTGAAAAAAAGAA
GGGTGCACCTATAAATAAAAGGGGTGCACCCTTTTCTAATAAAAATTCAGTTGGTTATGGTGCTCCAAAA
GAGAATAAAAATGCTGAAAAGTTTGGTTTCTTCTCAAAATACTTACCTGAAGAAACTAGGGAATTAATAC
AAGAAATATCTATAAAAGATAAATTTGATATTCTTTGGGAACAGATAACAATTCAATACGCAGCAATAAT
AAGAGCACAGAAGATAATGTATGTTAAAGATAAAGAGGAAATGATTAAGGAATTAAAGAAACATGAAATC
ACAGAAAATAGTGAGAAGATAGAGTATGAATTTCAATTTGCATGGGATAGGCAAGCATCTTTTCTTAATG
CACAGAGTAGAGCTATGAGTGAGTTAAGGAGTTTAATTAAGCAGTATGATGAAATGATTCATAAGGATTG
GAATTTGGCTACAGAGGAGCAGAAAACAAGAGTTGAGAAGTTGAAATGTGAGGTTGCTAACCTAAATAAA
GATGATATTGGAGATGATGAGTTGAAAATAAGTGTAGATTATGGTGATAGAAATGATAGTTAG
>ref|NC_013316.1|:1692125-1693378 phage terminase large subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGGTGATAGAAATGATAGTTAGAATAAATTTTAATCCAGATTTCAAGGAAGCTAATTTTACTAAAAAAA
GATACAGAGCAATGAAAGGTTCAGCAGGGAGTGGAAAATCTGTTAATGTAGCACAAGACTATATACTAAA
GTTAGGAGATAAGAAGTATCAAGGAGCTAATCTATTAGTAGTTAGAAAGTCAGAAGCTACACATAAGTAT
TCAACGTATGCAGAGCTTACAGGAGCTATAAATCGTATTTATGGTAAACAAGCTGATAAGTATTGGAAAA
CTACTTTAAATCCTTTAGAAATTAAGAGTAAAGTTACTGGTAACTCTATAATTTTCAGAGGAGTTAATGA
TGCAAAACAAAGAGAAAAATTAAAATCAATTAACTTCTCGAAAGGAAAATTAACATGGGTTTGGTGTGAA
GAAGCTACAGAACTTATGGAAAGTGACATAGATATACTAGATGACCGTTTAAGAGGTATTTTAACTAATC
CTAACTTGTATTATCAAATGACATTTACATTTAATCCAGTCTCAGCTACTCATTGGATAAAAAGAAAGTA
TTTTGACTATAAAAATGATGATATATTTACTCATCATAGTACTTATCTACAAAATAGATTCATAGATGAA
GCTTACTACAGAAGAATGCAAATGAGAAAAGAGCAAGACCCAGAAGGGTACAAAGTATATGGTCTTGGAG
AATGGGGAGAAACTGGTGGAGCAATACTTAAAAATTATGTTATACATGAATTTCCCACAGAATTTGAATA
CTTTGACAATATGAGACTGTCACAAGACTTTGGCTTTAATCATGCAAATGCAATACTTAGAATTGGCTTT
AAGGATGGAGAGTTATATATATGTAATGAAATATATGTACATGAAATGGATACCTCAGAAATCATAAAAA
TTGCAAATAGTAGAGGTTTAGAAAAGACTCTATTTATGTACTGTGATAGTGCTGAACCAGATAGAATTAA
GATGTGGAAGAGTGCAGGATATAAAGCTAAAGGAGTTAAAAAAGGACCAGGAAGTGTTAAAGCTCAAATA
GATTATTTGAAACAATTAAGAATACATGTACATCCTAGTTGCACTAATACCATAAAAGAAATACAACAAT
GGAAATGGAAACAAGACGAAAGAACTGGATTATATCTTGATGAACCAGTTGAGTTTATGGATGATGCAAT
GGCTGCTCTTAGATATTCTATAGATAATAAGCTTAAAAATAATGGAATAAGCTTCTTAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1693384-1694826 phage portal protein [Clostridium difficile R20291]
GTGTTAAATATTTATATAAGTGAAACAGATTTAATAAAAGTTCAGTTAAAAAAAGAGAGCACCTTTAACC
TAGTAAAAGTCATAGAACACTACATCTTAAAGCATAGGCCAGAAAAATATAAACAAGGAGAAGAATACTA
TTATGGTAATACTGATGTAAACAATAAGAGAAGATATTATCTCTTAGATGGAGCTAAGGTTGATGATTTT
ACTAAAGTTAATAATAAAGCAATTAACAACTACCATAAGCTTTTAGTTGACCAAAAGGTAGGCTATAGTG
TCGGAAATCCCATAGTATTTAATGCAGATGATGATAATCTCACTAAGCTTTTAAATGACTTACTAGGAGA
AGAGTTTGACGATACAATAACAGAACTATATCTCAATGCTAGTAATAAAGGGGTTGAATGGTTACATCCA
TATATTAATAGAAAAGGTGAGTTTAAATATGTAATAATTCCAGCTGAAGAAGCAATTCCTATTTGGGATA
GTAAAAGACAGAGGGAATTAGTTGCATTTATTAGGTTTTATTATATTGAAGATATAGATGGAAATAAAAT
AAAAAGAGTTGAGTACTACACAGAAAATGACGTAACTTACTTTATTGAAAGAGGTAATAGTTTTATTCAA
GAATTTTTATATGATGAATATGGAAAAATGACTGATATACAAGAAGGTCATTTTAGAATAAATAACAAAG
AACAGGGATGGGGTAAAGTTCCATTTATACCTTTTAAAAATAATGAAAAGTGTGTCTCAGATTTAACTTT
CTATAAGTCTTTAATTGATATATATGATAATAACATTTCTACACTTGCAGACAATTTAGATGAAATGCAA
GAGGTCATTTATGTATTAAAAGAGTATCCAGGAACAAGTCTACAAGAGTTTATAGATAATATAAGATACT
ATAAATCAATTAAAGTAGATGGTGGAGGTGGAGTTGATAAACTAGAGATAAATATACCAGTTGAAGCCAA
AAAGGAGCTTCTTGATAGATTAGAAAAGAATATAATTATTTTTGGTCAAGGAGTTAATCCCGAATCTCAA
AACACAGGTGACAAATCGGGTGTAGCTCTTAAATTTTTATATTCACTACTTGATTTAAAATGTTCCAAGA
CTGAAAAGAAGTTTAAAAAAGCAATTAGAGAGCTTTTATGGTTTGTGTGTGAGTATTTAAAGATAAGTGG
TAGTAAGAGCTATGATTATAAGTCAGTTCAAATAACATTTAATCATTCTATGATAATAAATGAGTCTGAA
AAAATAGATATGGCTTCTAAATCAATTGGAATTATATCAGATGAAACTATTGTTAGTAATCATCCTTGGG
TTGAAGATGTTAATGACGAACTTGAAAGACTTAAAAAACAGGAAGAAACCCAAAAAGAATATGATGATTT
AATTCCTACTAATAATCAAGAGGGTGTTATAGATGAAACATAA
>ref|NC_013316.1|:1694816-1696351 phage protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACATAAAGATTATTGGAGGAAAAGATTTGAACAATTAGAAGAAGTTCAAAACAATAAAAGTGTAA
AATATTATCTTGAATTGGAAAAGAAATACAAATTAGCTATGAATAGTATAGAAAAAGATATATTATCATG
GTATAACAGATTTGCTGAAAATGAAGGAATATCTTTATTAGAAGCTAAGAAACTGTTAAATACAAGAGAA
TTAGAAGAATTTAAGTGGAATGTAGAAGAGTATATTAAATATGGCAAAGAAAATGCTATAAATCAAAAGT
GGATGAAGGAGTTAGAAAATGCTAGTGCAAGACTTCATATAACAAGGCTTGAAGCTTTAAAGTTACAAAT
ACAGCAACACGTAGAAGTTTTATATGGAAATGAACTTGATGGTATTGATAAACTAATGAGAGATATTTAT
ACAAGTGGATACTATCATACAGCTTTTAATGTTCAACAAGGAGTAAACGTTGGTTGGAGTTTAATGAGTC
TTGATACTAATAGAATAAATAAAATTATCTCTAAACCATGGGCAACAGATGGATTAAACTTTAGTGAAAG
AATTTGGGGTAAGCATAGACCTACTTTAATAAATGAACTACATACTAAGCTAACTCAATCAATTATTAGA
GGTGAAAATCCAAAAAATCTAGTAAATGACTTTGCTAAGAGATTTAATGTATCTAAATCACAAGCTAAGA
ATTTGATAATGACTGAATCAGCTTTCTTTGCATCAGCAAGTAGAAAAGATTGTTTTAGTGATTTAGATGT
AGAGAAATATGAGATTATTGCTACATTAGATTTAAGAACTTCAAATATATGCAGAGAGTTAGATGGAAAA
ATATTTGATATGAAAGATTATCAAGTTGGAATAACAGCTCCACCATTTCATTGTCGTTGTAGGACAACAA
CAGCTCCTTGGTTCGAGGATGAAGAAGGCTATAGAGCAGCAAGAGGAGAAGATGGAAAAACATATTATGT
ACCATCTAGTATGAAGTATAATGAGTGGTATGAGAAACATATAGAGGGTAGACTTGGAAAAGAAAAAGCT
GACACCCTTAGAAAAATGCAACTAAATGAGAGTAAAGATAGAAAACAATTTGAAGAATATAAAAAGGTAT
TAGGAAATGAAATACCTTCTAAATTTGATGAATATCAACATATGAAGTATAATGATACTATAAGGTATGA
GGAAGCTAAAAAGCTTTATAAGGATGTAAATTGGCAAGTTAAGAATCAGAGAAATTTAACTAGTGGAAGT
GTTCATTCAGTGCCATTTGAATCAAAACCAAATAGTGTATTTGATAATTACAAAGATGGTAAATTAATTC
AAAGAAGATACTATGGTAATACAGGAAAACCTAGATTAGATTTAGACTTAACTGACCATAGAAACCCAAA
GCAACATAAAATTGTACCTCATAAACATGATTGGTTAGCTGATGAAAATAACCATGATAAGGTAAAAAGA
GAGAAGGATATGGAGCTTACAAAAGCTCATAAAATAGCTAACAAAGATATTTTGAATGGAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1696669-1697232 scaffold protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGATTGGTTAAAAGAATTGCTAGAAGGAATAAAAGTAGAGGATAACAAAATTGATGTAGCTTCTCTTC
AAAAATCTATAGAAAAGAAAATAAAGGAGACTACAGTTACTCAAGAAGATTATGTAAATCTTGAAACACA
ACTTAATACAGCTAATGAAACTATTAAAAAGTTTGAAGGAGGTATGACAAAAGAAGATGTAGAGAATCTA
AAAACAACTTATGAAACTGATAAGAAAACTTTGGAAGAAACCTACAAAAAAGAAATTGAAGAAAAAGATT
TTAATTACTGGTTAGGTGATGCTTTTAAATCTGTTAAATGTAGAGATGAAATAGCGTTAAAAGCTCATTT
AGACATGGAAGCCCTAAGAAATAGTAAAGATAGACAAAAAGCTTTTGAAGAGCAAATAAACCCTTTGAAA
CAGGATAAAGATTATTTGTTTAATGCAACACTAGAAGGTGAAGAACCTAAAATAGATACTATAACACCAG
GGCAAGAGCCTAAGATAAATGATTTTGGTTTTAATTTTACTGGGGTAAGACCTCATGAAAATAATAATAA
ATAG
>ref|NC_013316.1|:1697244-1698134 putative phage major capsid protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAGCACTAAATTATGCAAAAGAATATTCAAATGTTTTAGCACAAGCATATCCTTATACTTTAAACT
TCGGGGATTTGTATGCAACAGAAAATAATGGAAGATATAGATGGACGGGTTCTAAAACAATAGAAATACC
AACTATATCTACAACTGGAAGGGTAGATTCAAACAGAGATACAATAGCAGTAGCTCAAAGAAACTATGAT
AATGCTTGGGAACCTAAGGTATTAACTAATCAAAGGAAATGGTCAACATTGGTTCATCCAGCAGATATAA
ACCAAACTAATTATGTGGCTTCAATAGGTAATATAACAAAAGTATATAATGAGGAACAAAAGTTTCCAGA
GATGGATGCTTACTGTATATCTAAAATATATGCTGATTGGACCGCATTAGGTAACACAGCAGATACAACT
GTTCTTACAACAGCAAACGTATTAGAAGTATTTGATAAGTTAATGGAAAAAATGACAGAAGCTAGAGTAC
CTGAAAATGGAAGAATATTGTATGTTACTCCAGTAGTAAATACACTTATCAAAAATGCAAAAGAGATACA
AAGAACAGTAAACATAAAAGATGGTGGAACTTCTTTAAATAGACAAACCACAGATATTGACACAGTTAAA
ATAATTAAAGTACCATCTAATCTAATGAAAACTGCATATGATTTTACAACTGGATGGAAAGTAGGAGCAG
GAGCTAAACAAATCTTTATGTCCTTAGTTCACCCAAGTGCAATAATTACACCTGTTTCTTATCAGTTCTC
TAAGTTAGACGAACCAACAGCAGTTACAGAGGGAAAATACTTCTACTTTGAAGAAAGTTTTGAGGATGTA
TTTATATTAAATAAAAAAGCTGATGCAATACAATTTGTTGTTGAAGCATAG
>ref|NC_013316.1|:1698387-1698797 hypothetical protein CDR20291_1437 [Clostridium difficile R20291]
GTGAAAATTATGGAAAATAATATAATTGATGAAATAGAAAAAAGACTTGAAAGTTTTGGATATATATTAA
AAGATGGAGATAAGTGGTTAATAGGTTTTGTAAGAGAAAAAATAGAAAATATTATTAAACTAGATTGTAA
TATAAAAACTATGCCAATTGAATTGAAAGAAATTGAAGTTGATATGATAGTTGGAGAGTTCTTATTTACC
AAGAAAAATATGGGTCAATTAGATATAGAAAGCATTAACTTTGAAGCTGTAGAAAAGTCTATATCAGAAG
GTGATACAAAGGTAGATTTTGCTATAGGAAGTGGTTCTCAAACACCAGAACAACGCTTTGATAGCTTAAT
AGCTTATCTTACTACTTATGGTAAGAATAAGATATTAACCTTTAGGTGCTTAAGATGGTAA
>ref|NC_013316.1|:1698791-1699138 phage protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGTAAGTAAAACTAGAAAAGCAATAGAAATGTTATATAGAGATAAATGTACTATAGTTGAGTATCAGC
CAATTAAAGACCCTGTAACAAAACGAACTAACAATAAAGAAGTGATTGTATTAGAAAATCAACCATGTAA
ACTTTCATATAAAAATATAGTTTCTGCTACAGAAGGGAAATTAGCTAAGCTAGAGCAAACTATTAAACTC
TTTATATCTCCAGATATAGAAATTAAAGCAGGTTCAAAACTTATTATAAATGATAAAGAGTATGTAAGAA
GTGGAGAATCAGCTATATATCCAAATCATCAAGAAATAATACTTGAGTTATTTAAGGATAAAGCATAA
>ref|NC_013316.1|:1699517-1700344 hypothetical protein CDR20291_1439 [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAAAAGAGGTGATTTTATGGCAAAATTTTTAGATATTACAGGAAAAAAATTTGGAAGGCTAAGAG
TCATTAAATTTTCTAAAGAGATAAAAAGCGGTAAAAGAAATAGGAAATATTGGTTATGTAAGTGTGATTG
TGGAAATTTCAAAGAAATAAGAACTGACTCTTTAACTAGTGGCTTAGTGCAATCTTGTGGATGTTTAAAA
AAAGAACAAGATAAATTAAATTTAACAGACAAATACCAATTTAAAAAGAAATATAAGGTTCAAAATAAAA
GACTTTACAGTATATGGAAGGGTATAATATCTAGATGTACAGATAAAAATAATAAAAGATACAATAGATA
TGGTGAAAGGAATATAATTGTGTGTGATGAATGGTTTTGCTATGATAATTTTGCAAATTGGGCATTGAGT
AATGGATATTCAGAGAAACTTACAATTGATAGAATAAATAATGAAGGAAATTATGAATCAAGCAATTGTA
GATGGGTGGATATAAAGACACAATGTAGAAATAGGTCAACAAATATATTAGTAAAACATGAAGAAAAAGA
AATTACATTGATAGAGCTTTCTGAAAAAACAGGTATTTCATACTCTTGCTTAAGAAGTAGATATTCTAAG
GGATTAGTAGGAAATAAGCTTATAGAAAAAGTTAAGATTATTGAAGAAAGCAGAGCTAAGTTATCTATTG
AGGATGTAAAAGAAATTAGAAAAAAGTATTCTGATGGATATACAATAAAACAACTAAGTGAAATATATCC
TGTAACATATTCATCTATATCAAATATAGTCCATAGAAGAACATGGAAAAATATTTAA
>ref|NC_013316.1|:1700693-1701130 phage protein [Clostridium difficile R20291]
ATGCTTAATAATATTATAGATGGAATATCAGTAAAGTTAGATAAATCGTTTGGAGAAAAATATACAATTT
ATAGCGAAGATGTGGAGCAAGGTATTAATGAACCTTGTTTTTTTATTGTTCCTTTAAATCCAAGCAAGAC
ACCATATCCAAGCGGGAGAGAATTAAAGAAAAATTCTTTTGATGTACATTATTTCCCTCGTTCAGAAGAT
AAGAATTTTGAAATAAATGAGATAGCTGAGATGCTACTGGAGGAATTAGAGTATATAGAAATTGATGGAG
ATTTAGTAAGAGGTACAAATATGAATTTTGAAATTATAGACAATGTTCTTCACTTCTTTGTTGATTATAA
CTATTTTACTATAAAAAATAATGATACCAATAAGATGGATACAGTAGAGTTATTCGGTGGTTTGAAGAGA
GGTGATAATTTTGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1701300-1702610 phage protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTTTAGGTGGAGGAACATTCGTAACGCAAAATAAAATACTTCCTGGTGCATATATAAATTTTATCT
CAGCTAAGAGGGCAACCAGTTCATTATCAGATAGAGGTATTGTTGCAATGCCTTTAGAGTTAGATTGGGG
CATAGATGAAGAAGCATTCCAAGTAACCAGTGATGATTTTGAGAAGTATTCAGTGAAGTATTTTGGATAT
GATTATACTCATGAGAAGCTGAAAGGTTTGAGAGATTTATTCAAAAATATAAGGTTGGGATATTTTTATA
AATTAAATAAAGGCGTTAAAGCCAGTTGTACTATAGCCACAGCAAAATATAGTGGTATAAGAGGAAATGA
CTTAAAAGTAACAGTTACAACAAATATAGATGATAATGCTAAGTTTGATGTTGTAATACTTTTAGATAAT
AAGAAGGTAGATACTCAAATAGCAAAGGTTATTACAGACTTACAAGACAATGACTATATCACTTGGAAGA
AGGATGCAACACTAGAAGCAAGTGCAGGACTTGTATTTACTGGTGGAACCAATGGCGAAGCTGTGACAGG
AGCAGAGTACCAAGCTTTCTTGGATAAAATAGAAAGTTATTCATTTAATGCACTAGGGTGTTTGGCTACA
ACAACAGAAATTAAAAGTTTATTTGTAGAATTTACAAAGAGAATGAGAGATAAGGTAGGAGCTAAGTTTC
AAACAGTACTATATAAGAAAAGTGATGCAGATTATGAAGGTGTAGTGTCTATAGAAAATAAGATTAAAGA
TAAAGATTTAGTTGAATCTAGCTTGATTTATTGGGCTACTGGAGCTATAGCAGGATGCGATATAAATAAA
TCTAATACTAATAAAAAGTATGATGGTGAGTTTGATGTTGATGTTAATTATACACAAATACAACTTGAAG
AAGCTTTAAAAACTGGTAAATTTATATTCCACAAGGTGGGAGATGAAGTTCATGTGTTAGAGGATATAAA
TACTTTTGTATCATTTACAGATGATAAAAATGACGATTTTTCAAGTAACCAAAGTGTTAGAGTACTTGAC
CAAATTGCTAATGATATTGCAACTTTATTTAATGAAAAGTATTTAGGTAAAGTTCCGAATGATAAGGCAG
GAAGAATAAGTTTCTGGAATGATGTTGTTAAACACCATAAAGAATTAGAGAATATAAGGGCAATAGAAGA
TTTTAAAACTGATGATGTTAGTGTAGAGCTTGGAAATGATAAGAAAACTGTCATAGTATCTGATGCTATT
AAGGTAATAAATGCTATGAGTAAGCTTTATATGACTGTTTCAGTTAATTAG
>ref|NC_013316.1|:1702627-1703097 phage protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTCAAACAATAAATGCTAAAGATACAGTTAGTGCAAAGAAAGCTGAATGTTTTATAACTATAGAAG
GTAAAAGATATAATTTTATGCAAGCTATAGATTTAGAGGCTAAAATGGAAAAAAATAAAAGTGAAGTTCC
AATTCTAGGAAGAACAACAAAGGGAAATAAAACAACTGGGAGTACAAATACTGGAAGTGCAACATTTCAT
TATAATACTTCTATTTTTAGAGAATTACTTTACAGATATAAAGAAACTGGTGAGGATATTTATTTTGACA
TACAAGTTACAAATGAAGACCCTACATCTGCTGTAGGAAGACAGACAGTAGTACTTAAAGATTGTAATAT
GGACAGTGGAATAATTACTAAATTTGATGCTGATGGTGAGTATTTAGATGAAGATATGGATTTCACTTTT
GAGGATTGGGAATTAGTTGAATCCTTTGCATTACTTAATGGAATGTTATAA
>ref|NC_013316.1|:1703156-1703983 hypothetical protein CDR20291_1443 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATTTGAAAGTGGAATTAAATTAGGCAAACTTACTTTAATTAAATATTTAGGGAGAAATAAACATA
GTAAAAAAGTCTGGCTATGTCAATGTGAGTGTGGGAATAAAGTTGAGAGAGTAGAAAATAATTTAAAGCA
ATCAATTAAAAATGAGAAGCCTCCACATTGTGGTTGTTCTCCAAACTGGAAAGGACAAAATAAGAGATTT
AAAGATATAACTGGGAAAACTTTTGGGAAGCTTACAGTATTGAAAATGTCTGGGAAAGATAAATATAGTC
ACAATTTATGGTTATGTCAATGTGAATGTGGAAATAGAACAATAACTAGTACAAGTGCATTAGAACAAGG
AAAAGCACAAAGTTGTGGCTGTATAAGAAAGGAAATATTACTAGAGCGCTCTACAACGCATAATAAATCT
AATGATAGCTTATATAGAGTTTATCACCGTATGATTAAAAGGTGCACAAATAAGAGTAATAAAGATTATA
ATTATTATGGAGGTAGAGGCATAGAAGTATGCAATGAATGGCTAGAGGATTTTATAAATTTTTATAACTG
GTCTATAGAAAATGGATATAGAAAAGGTTTAACAATAGATAGAATTAATGTGAATGGAAATTACGAACCA
TCAAATTGTAGATGGGTTACTTGGGAAGTTCAACGAAATAATAAAAGAAATAGTATTAGAGTTAATTATA
AAGGTGAAATGATTACTTTAAAACAATGTGCAGAAAATTTGAATGTTAAGTATCTATTTCTTTATAATCA
ATTAGTTACTAAAAAAATTCCATTGGAAGAAGTAATAAAAAATATAGGTATGGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1704055-1704495 phage protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAATTTAAGTGCTTTTTTAAGTCAAAATGCAATAAAGGTTGATAATGTAAAATATGTAGCGAGTA
ACAGATTTTTAGATAAAGAAGGGAAACCAGTTGAATGGGAATTAAAAGTTTTATCATCTGAAGAAGACGA
AGCACTAAGAAGAAAGTGTACTAAAAGAGTAAAAGTGATTGGTAACAATGGTAAGCATACTGGACAATAT
ACAAGTGAAATTGACTACAATAGTTATGTAGCTGAATTATGTGTAGCATCTACAGTATTTCCAGATTTAA
AGGATGCCGAACTCCAAAATAGTTATGGAGTAATGGGAGAAGCTCAGTTATTAAAGACAATGCTTACAGC
AGGTGAGTATGTCAATTATACAGTAAAAGTGAATGAAGTCAATGGATTTGATACATCTTTTGAGGATAAA
GTAGAAGAAGCAAAAAACTAA
>ref|NC_013316.1|:1704836-1704997 hypothetical protein CDR20291_1445 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAACTTTTTACTTAATGTAATAGCTGGCGTTATTGCTAGTTTAATATTTTGCTTAATTTGTAAAG
TATTTCTAAAAGTAAAAAGCCACTCAACTCGTGGCAAGAGTAAAAGTGGCTGGGAATTTGATTTTAAAAT
CAAGTTCCACAAATTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1706641-1707507 prophage antirepressor-related protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATTTAATAGTAAAAGAGTTCAATGGAAGTCAAATTTATACTTTTATGTGGAAAGAAAAATCTT
GTTGGATAGCTAATCAAATAGTTGGATTATTCGATTATGCTGATGTATCTAAAACAATACAGGATTGCAT
AAAAGCAGAAGACTTTGAGATTGAACAAGAGTATGATGTATTGAAAGGAAATGAATTTAATGATTTTGTA
ACTACTTTAAATGTAGTCGCAAATAATATAATTAGTAATAAAGCTAGAAGTATAACTATTTTTTATGAAG
ATGGTTTATATGGATTTTTACAATACACAGACAAACCTATTGGTGTACAGTTTAGGAAATGGCTTAGACG
AGAAGTTTTACCAAGCATAAGACAAACTGGTGCATACATAACTAACAATGCTAATCCCGAAAAACTAAGA
GAAAAAGCAAGTGAGATTGAGAAATTACAGTTAGCTTACAATAGTACATCTATGTTAAAAGAACTATTAG
ATGGTGCAGGCTTTGACAATAAATCCAAACTATTAACAGCTAAAACATTATATAAGAAAGCAGGAATTGA
TTTACCAATAGAGATAAACGAAGAAGAACATTATTTTGATACAAAGCAAATAGCATCTAAACTGAAAATA
TATTCTAAGAGTAATAAACCAGCACAGTTGGCTGTTTGTGAAATTATTAAAAAGATTGATTTAGAAGAAA
ACGAAGTCAAAGGCGTTTGGGAAACTAATGGTTCTTGGACTGGTACTGTAAATAAATATACAAAGAGTGT
AATAGATAAGGTTAGAAATTGGATAGAGGAAAATAATAGACCTACTAAGATTGCAGGTGAAAAGAAGAAT
TATCATGTGGTTTATAAGATTGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1708372-1708899 hypothetical protein CDR20291_1447 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAGAAGGAAAGAGAAGAAGAGGATGTCTATTTTGGTTTATTCTTATTATTTTATTTTCTGGAGTTG
TTGGAGCAATAGCAGGGAACAGTACTAATAATGAAAGCACTGAAAAACAGAAAGAGGATTTAACTAAATA
TATTGGTGAAGAAGGTAGTATAGGAGATTTAAAATTAACTGTTAATAGCATTTCAAAAGCTAGTGAAATA
TCAGTAGCATCTGGTTATTTAGCATACACTCCAGATAGTGGCAAATATGGTATTATAAATTTAACAATAA
AAAATCAAACTAAGGAAAGCCAATCTTTTATGCTAAATTCATTCACATTAATAGGACCAGATGATTCAAA
ATATGTTCCATCTTTATTGATTGATGTAGGAAATAAATATATAACTATGGATACTGTAAATCCTAATTTA
GATGTAACAGGTAATATTGCATTTGAAATTCCTAAGGATTTACTAGTTTCTGATTGTAAACTAAAATATA
GTGGTTCAGAGCAAGAATTTATATTAAAAGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1709037-1709804 hypothetical protein CDR20291_1448 [Clostridium difficile R20291]
ATGGGGTTATTTGGAAAGAAAAAAGCAGATATATGTTGTATTTGTAATACTGAGATAGGAGTACTGAATA
TTGAAGATGGTTGGATATGCAATTCTTGTTTTAAAGAATATTGTGATGCACTTTCTATGACTAAAGCACC
TAAAATTTTAAGAAAATTAGATATTGAAAAGACTATATCATCAACTAAAAAAAATAATGAACTTCAAAAA
ATATTTAATACAACTAATAATATAGAAAACTATATAGAATTTGATGAAGATAATAAAAAATGGCTTGTGT
CTAAAAAAAGTATAAACGATAAAAAAACTCCTATCATTCATTCTTATGAAGATATCGTGAAATTTGAACT
TCTTGAAAATGGTGAAACTGTAACTAAAGGAGGAATAGGAAGAGCTTTAGCGGGAGGAATTTTATTTGGA
GAAGCAGGAGCTATAGTTGGAGGGATAACAGGTAAAAAAACAACAAGAAAAGTTGTTGATACATTTAAAA
TTAAAATAACAATTAATAATATTGATAATCCTATTGAGTATATCGAATTAATTAATAAAAAAACAAAAAC
TAATTCTAGTGCTTATGAGAAAGCTTACAAAGATGCCCATAAAATTTTATCAACATTATCTGCTATTACA
CAAAGCATTAAAGAGACAGACAATATAAATACTAAATCTGTAGCAGATGAGATATTAAAATATAAGAATC
TTTTGGATATGGAAGCTATTACACAAGATGAATTTAATACTAAGAAAAAAGAATTATTGAATTTGTAA
>ref|NC_013316.1|:1709870-1712242 putative phage tail tape measure protein [Clostridium difficile R20291]
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CTATTAATACGACAATTAATAGCCTTGAAAGGTTACAACAAAGATTGCATAATCCGCTTAACACAGGTGG
GATACAAGCATCTCAACAAAGTTTAAACAATATTGAAAACATATTAACCAGGATAGAACAGAAAATTGGA
AGAAATACAAATGAACAAGAAAACTTTAATAATAAGATAAAGCAAGGAAGTGAAGCAGGTTCTCTATTAG
TATCTAAACTCAAAAGTTTGGCTGGCATATATATTGGAATAAGAGGTATAGAAAGTATTACAAAAGCAGC
AGATACAATTGCAAGTACAAAAGCACGTTTAAATTTAATGAATGATGGATTACAGACAACAGAACAACTT
AATAAGATGATTTATTTATCTGCTCAAAGTGCAAGAGCTAGTTATGCAGATACGGCAGCACAAGTCGCTA
AACTTGGAATATTAGCAGGAGATGCTTTTGGAAGTTCGGCAGAGGTGATAAAGTTTACAGAACTTATGAA
TAAAGCTTTTGTAATTGGAGGAACATCAGCAAATGAAGCTAGTGCGGCTATGTATCAGCTTACTCAAGCT
ATGGGTGCAGGGAAACTTCAAGGTGATGAATTTCGCTCTATAATGGAAAATGCACCTTTATTAGCCACTA
AAATAGCTGATGCAATGGGAAAAACTAAAGACCAATTAAAGGAATTGTCAAGTAGTGGAGCAATAACAGC
AGATGTTATAAGAAATGCACTATTTAAAGCTTCTGATGAGATAGAAAAGAAATTCGCAAGTATGCCAGTC
ACTTTTAGTCAAGCACTTACTATGATGAAAAATGACGCCTACATGATTTTTGGGCAAACCCTCGGAAAGA
TAAGTGGAGCATTGCAAAGCGTTAGATTTAGTGAAATTGTTGTATCTATAAGAAATGTTATGATTGCAAT
ATCTTCAAACATTTACGATACATTAAATATTATAAAAAATATTTTAAATAGTGAATTCTTTTCAAACTTA
GTGCAAGGATTTACATTTTGTGCGGTAGTAATAACTAAAAGCTTAGGTTCTATTGTAAATACTGCATTAA
ATATAGTTAATATATTTGCACAAAATTGGAGTATAATAAAACCTATTGTATTTGGTGTAGCTTCTGTTTT
TATATTGTTTAGAGGGGTTTTGCTAGCGACTAAAATAGCTACAATAGGTAACGTAATTGCGAATGTTGCT
CACGCTGCTTCCTCTTCACTATCAGCACTTATGACTAATATACAAGCAGCAGCACTGATGCGTTCGAATG
GAGCTACTTTATCAGCAACAATAGCCACTTGGGGTTTAAATGCAGCTTTATTAGCTTGTCCAATCACATG
GGTAGTATTAGGTATTCTAGCATTTGTAGTAGTAGTTTTTGTTGCAGTAGCAGCAGTAAACAAATTCGCA
GGTACAAGTTTAACTGCCTTAGGAGTAATTGTGGGTGCTGTATTTGCAGCAGTGGCAGCAATACAAAATG
TTATGATTTGGTTATTAAATGGCTGTATAGCTGTAAATGAAGGCATTACAAATGGTTGGAATCAATGTGT
ATATCTAATGAAACAAGCTATTGCAAAAGGTGTAATCTTTATAATCGAGAAAATGGCATCTCTAAATAAT
TCTGTAAATAATGCTGGAAATGCACTTGGGAAAGCTTTCATAGATGGGGCAAATATCGCAATACGAGGTG
TAAACAAATTAATTGACCTAATAAATAAAATACCAGGGATAAATATTGGTAAAGTAGGAGAGGCAACGTT
TACGCCAGTTAAGGCAGATAATAGTTACATCAAACAACAGATTGATAGCTTAAACAGATGGGTAGGAGAC
GCACCAGAGAAAGTAAAATTGGAGCGAATGGGATACAAAGATATTGGAGCAGCATTTCAAAAAGGAAATG
CACTTGGAACTAAATGGCAAAATGCTATAACTGATAAATTTAAAGATACTTTTGACATTAATAAGATGCT
AGAAGATGCAAAGAAAAAATTAGGATTAGACGATTTGTGGAATAAACAAAATCCTTTAAACAACCTTGGT
GGATTTGGTGGAGATTTAGGAAAAAATGTAAAGGACACGGCAGGCAATACTGCAAAGATGGCAAAGACTA
TGGATAAAAGTCAAGAGGACTTAAAATACTTAAGAGATATAGCAGAGCAAGAAACAATCAATCGATTCAC
AGGAGTAAACATTAAAATAGATATGAACAATACAAACAACATAAGTAAAGATACAGATGTTGATGGAATA
GTTAATGTCTTAACTGAAAAACTGAACGATGCTATGGTTGTATCAGCGGAAGGAATAGTTTAG
>ref|NC_013316.1|:1712259-1712948 putative phage cell wall hydrolase [Clostridium difficile R20291]
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CAAACAAGAACAAGACAGTTGATTTGATAAATACTGGAGAAGTAAACATATTAAAAAAAGAAGGATTATC
TGAAATAAGTTTTGAAGCAGAATTTACACATAATAAACTACCTTTTTGTAGAGGTCAATTTAGAGATGTT
CAATTCTTTTTAAGTAAGCTAGAATTACTAAAAACTGATTGTAAGCCATTTCAATTTATTGTATCTCGTG
AGTTAGGTAACAAGGTCTTATTTAACACTAATATAAAAGTATCTCTTGAAGAGTATGCTATTTCAGAAGA
TGCAGATAATGGCTCAGATACAAAAGTTGCAATAAAATTAAAGCAATATAGAGATTACTCAACTAAAAAG
TTAGTTCTTGCCCCTCCTAAAAATGAGACTGGTAGACCTAATGTAAAGATAGAGCCAAAACGAGTTGATT
CAGTCAATGCCACAAACACTAAAACATATACAGTAAAAGCAGGGGATAGCCTTTGGTCAATTTGTCAGAA
ACAACTTGGTAATGGTTCATTATATAAGAAAGTATACGAACTAAATAAATCTATGATGGATAAGGCAAAT
AAGGGCAAAAACTTAAGTAAATACACTATTTATAAAGGGCAGGTGTTAAAACTTGGTTGA
>ref|NC_013316.1|:1712956-1714833 putative phage cell wall hydrolase [Clostridium difficile R20291]
GTGTTAGCAAATGATAGAGATGTAAGATTAGTAATAGCTCATTGGGAAGATTTCTACGAACCTGCTGTCA
TTGATGGTATCACATGGGAGATAGAAAGACGAGGTACACCTTCTAAGTTAGAGTTTACAATAGTCATGGA
TGATATACTAGAGTTTTGCGAAGGAAATTCTGTAAGGCTGTATTATAAAGGAATAGGCATATTTTATGGA
TATATATTTCAAAAGAAAAGAGATAAAGAAAATCACATTAAAATTGTTGCTTACGACCAGTTGAGATATT
TTAAGAATAAAGATACTTATGTATATAGTAATAAAACTGCAAGTGAACTTGTAAAAATCTTGGCTAAAGA
TTTTAATTTAAAATACAATGTCATAGAAGATACTAAGTATAAAATATCTAGAGTCGAAGAAAATAAAACA
CTCTTTGACATGATACTAACAGCACTAGATGATACTTTAAGAGAGAAAAAAGAAATGTATACCTTGTATG
ATGATTTTGGAAGAATAACATTAAAGAATGTTGCATCAATGAAACTAGATACTGTCATGAACAATGATGT
AATTGAGGATTTTGACTATAATTCATCAATAGATAGTGATACTTACACAAAGATTAAACTTGTAAGAGAC
AACGAGGAGTCAGGAAAAAGGGATGTATATATTGCTCAAGACTCAGCTCACATGAGAAGTTGGGGAATAC
TTCAAATGTTTGATACAGTAGACAAAAACATGAGTGAAGCAGAGATAAAACAAAAGTGTGATATACTTCT
AAAACTATATAATAAGAAAACTAAGTCATTAAGTTTAAAAAATGCACTTGGAGATATTAGAGTGAGAGCA
GGTTGTTTAGTACCTGTTTTTTTAAATCTAGGAGATATTGAATTGCAAAATTATATGTTAGTTGAGAAAG
TAAAACATACATTTGAAAATAATTCACATTTCATGGATTTGACCTTGGTTGATGGAGACGAATTTGCTTC
ATATTCTTCAAGCTCATATAGTAGTGGAAATACTAATAATAAAGATGAAAAGAAAAATGGTCCTGCACAA
AGTATTATGAAAAAAAATACAGGTAAAAAAGTTCCTGCTATATTTACTGCATATTATCCAGGAAACAATG
CAATGGAAGGTGGAAAAACAGATTGCAATGGAAAGCCACTTGATGTAAAATCAAGAACTGTTGCTGGTCC
AATGAATCGAGAAGGAGTTAAGAAAACTTGGTATACTGATGATTTTCTAAATAAACATCCAGTTTTTGAA
TATGGAGATAAAGTAAAAATTATACTTCCTGGTACTGCCTATGACAACAAAGTATATACAGTTAAAGATA
ATGGAGGAAGAATATATGTTGAAACAAACGGAACATATCATATAGATATACTATTAGCTAATGCTAGTGA
ATGTAAAAAATTTGGTAGAAAGAATGGCTATATAATTATAGGTGGAGATGAAGAACAAACATATCAAGTT
GAAGGTAATAACCAAAGTAATACAAATAACAATTCTAAAGAAGATAAATTAATTAGTATAGCAAAAAGTA
AACTGGGTTGTAATTATGTGTATGGAGCAGAAGGTCCTAATAATTTTGATTGCAGTGGGTTTACTCAATG
GTGTTATAAACAAATAGGTATAAAAATTCCTCGTACTGCTTCTGCACAAAGTAAAGCAGGAAAAGCAGTA
GATTTAAAAGATAGAAGCAAGTGGAAAGCAGGAGACTTATTATGTAGAATTGGTGGAGGAAGTAGTAATC
ATGTTGTAATGTACATTGGAAACAATCAAATAATTCATTCACCACAAACAGGAGATGTGGTAAAAATAGA
GTCTGTTAATTCTTATAGAAAAGGAAAAGCATACACACATGTGAGAAGATTTATATAA
>ref|NC_013316.1|:1714847-1715107 phage protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCCAAGATTTATTACAGATAATAAAAAAAGCTGCAATGGATGCAGTAGAAACAAGCAACCCAATGA
GGGTTGTATTTGGAACAATAGAAAGTATTAGTCCTCTAAGAGTTAAGATAGAACAAAAACTATCTATTGG
TGAAATTTTTCTAATACAAACAGATACATTTAAAAGATATACAGATAAAAAAATGGGAGATAAATTAGTC
TTAATTCGTATGCAAGGAGGGCAACAATACTTGATTTTAGATAGGATGTGA
>ref|NC_013316.1|:1715112-1715531 phage protein [Clostridium difficile R20291]
GTGTTACCAAGTGATAATTTAGATTATGATATTGAAGATGTATCAATAATTAATTTTGATGTAAGACAAG
AGCCAAGTAAGACATTTAAACTTCATATAGAAAAGTCTAAGATTGATGGTATTTGTGATGATGTAGAAGC
ATTAAAACAAACCATTTTTTTAATTTTAAATACTGAAAGGTATGAGCATCTTATTTATTCTAGAAATTAT
GGTGTTGAATTAAATGATTTAATTGGAGAACCTATTTCATATGTAATACCCGAACTTGAAAGAAGGATAA
CAGAAGCACTAATTCAAGATGATAGGATTGAAAATATAGATAATTTTGAGTTTCAAAATATAAAGGGTAA
AGTACAATGTAGATTTTCAGTTCATACAAAATATGGAAATATAAAAGCAGAGAAGGTGGTGAGTGTATAA
>ref|NC_013316.1|:1715544-1716581 putative phage tail protein [Clostridium difficile R20291]
ATGACATTTGAAAATATAATTAAAAGAATGTTAGATAGTGTACCAGATACTTTTGATAAAAGGGAAGGTT
CTATAATATATAATGCTCTTGCTCCTGTTGCTATAGAACTTACAGAAACATACATTGCTATGGATGAATT
ACTAGACCAAACATTCGTAGATACTGCTAGTTATTATTATTTAGAGAAGAGATGTAAAGAAAGGGGAATA
ACACCACTTGAAGCCACTCATACGATTGCTAAAGGAGTTTTTAACATAGATATTCCACTTGATTCTAGGT
TTAATCTAGGAGAATATAACTATGTAGCAATTGAGAGAATATCTGAAAAAACATATAAAATGAAATGTGA
AACTACTGGACCTGTATTTGAGTTAGGAAAACTAATACCTATTGAATATATAGATGGTCTTGAAACTGCT
GAACTAACTGAAATCTTGATAAATGGAGAGGATGAAGAGTCAGAAGATAGTTTAAGACAAAGATATTATG
ATAGCCTAAATTCACAGAGTTTTGGCGGGAATATACAAAACTATAGGGATGAAGTTAACAAAATACAAGA
TGTTGGAGGAGTTAAAGTTTATCCAACTTGGGATGGAGGTGGGACTGTTAAGTTAGTAATAATTAACTCT
AATTTTAAAGTGCCAAGTGAAGAATTAGTAAACTTAGTTCAAGAAGAAATTGACCCAATTGGACACCAAG
GAGAAGGCTTAGGATTAGCACCGATTGGACACCGAGTCACAGTTGAAGGAGTTACAAGTACAACTATAAA
CATATCAGCAGAAATAACATACAAAAATGGCTACACTTGGGAGAATATAAAATCAATTGCAGAAGAAGCA
ATAGACGACTATTTAAATGAACTTAACATGAGTTGGGAAGATGAAGAAAACTTAATAGTCCGTATATCTC
AAATTGAAACTAGATTACTTAGTATTGATGGAGTATTAGACATTGCAAATACAATGATAAATGATGTTAA
ATCTAATCTAACAATAGATAGTAACAGCATAGTAGTGAGAGGTGAGGTAGTTGGATAA
>ref|NC_013316.1|:1716574-1717191 phage protein [Clostridium difficile R20291]
TTGGATAAAGAGATTAATCTAATAAATTACTTGCCACAAATTCTACAAGATAAAGAAGAATATATAAAAG
TATTTAATGTAGAAAATAAAGAAATAAAAACACTACATGATAAATTAAAGGACCTATCAAATGACCAGTT
TTTAGAGGACCTAACTATAAGTGGTATAAAAAGATGGGAAAAGATAATGTCTATAACTCCTAAAAGTAAT
GAGAGTTTAGAAGATAGAAGGTTTAGGATTTTTAGTAAATATATAAGTAAATTACCTTACTCAGAGAGAT
TTTTAAGGAACTGGCTAGATAATGTAGTTGGAGAAGGCAATTATGAATTAACTATTAATAATGCTACTTA
TAACATACACCTTGAGAGTGATGCTAGAAATCAAGATTGGTTTGAGGAAGTTCATTCTTTTGTAAGTAAT
ATTAAGCCATGTAATATGACTTTAGATTACACTAGAGTGCTTATAAGCAAAGACAATTATATGAATTTTG
GTATAACAACCCTAATGGGTCAAGAAATAACTATATACCCTTGGAGTCCACCAGATATAGAAACTTATGG
AGAAATTGATGTATTAACTGGCAATGGAGTTGGATACCAAGAGATAACAATATTTTAG
>ref|NC_013316.1|:1717203-1718228 putative phage tail fiber protein [Clostridium difficile R20291]
TTGGCTATAGATAAAAGTTATTACACTATAATTACAGATGTAGGAAAAGCAAAGATAGCAAATGCAAGTG
TCACAGGTAATAAAGTAGGGTTTGTAAAAATTCAACTTGGTGATGGTGGAGGAAGTGAGTATACTCCTAC
TGAAAGTCAGACAGAACTTAAAAATGTGGTATGGGAAGGCAACATCGGAAATACAACCACAGATGAAACT
GCGCCAAACTGCATAATATTAGAGAGTTTAATACCATCAAGTGTAGGTGGATTTATGATAAGAGAAATAG
GATATTTAGATGATGAAAATAATCTAATTGCAATCTCTAAATATAAAGAATGTTATAAACCTTCTATAGA
ACAAGGAGCAGTTGTTGATATGAAGGTTAAAACTGTGCTTATTGTATCTAATATAAATAATATAGAACTT
AAAATTGACCCTACAATAATTTTTGCTACGCTCAAAGATATACAGGATTTAGATGCTAAAATAAGCAATG
TAAACACTAAAATTGATACAACTAAAACAGAGTTAACAAGCAACATAGAAACTGCTAAGACAGAGTTAAA
CACTAGAATTGACACAGAAAATGAGAAACAAAATATTAAAATTGACCAGCTAATAGCAGGTGGTTCAAAT
GTTGCATCTACTCAAACAATAACAATTGATGATTGGATAGATAATCAAGAAGGTGGATTCAAAGCAACTG
TAACACATGGTTTATTAACACAGAGAATAACTGTAAGTATTATAGATGCTACTACAAAAGATAATGTAGT
ACCCGATTTCACAATTATAGACGATAATTCTATTGAGGTTAGAAGTGGAGTAAAAGTTGAGTTAAATGTT
TATGTGATTAATGGGAATGCAGAGACTCATTTTATTAATGCGACTGTAGATGATAATAGAGTGTCTGAAA
TGACTACTTATTCATCAAAAAAGATACATGAAGAAATTGGTAAGGTAGCAGAGCAACTGACAGGAATTAA
TAGTAATATTATATCGACTGTAAATAACGACATACTACCTATATAG
>ref|NC_013316.1|:1718245-1719771 hypotheticalphage protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGCGTTATCAATGAGTTATTTTAATTTACCTGACAAAAGAAAATATACTAAAAATCTTGCATTTAATC
CATTTGCAGGTGGAAGGCAAAATTTTGAGTGGACTGGTGGTGACCATGGACTAAATGGTGAGTTTAAAGA
AACTTGCTTAAGTTGCACTTACAATGGTTCAACATTAAATTGGGGTTCAGGAAATGTTTGGGTCTTGGGG
GAATATGGTCAATATACATTTACTTATAATTGTGAATCAATGCATGTGGATACACAACAAAAATTTCCGT
ATACTTCTAATAGAATAATAACTATAAAAGGTAGACCTGTAATATCTGGTTCAGATACTTCACTTGGGAA
TAAAAGAAAAGGATTTAGTGTAGATTTTACTGTAAGTGATGATACTCCAAATGTTAATTTAATAGTACGT
GCTTATCTTGATGATAAATTAATACAAAACATTACTCCTGTTGTACAAAATTCAACTTTAACAGCAACAG
TAACAGATAGTCAACTAAACTCTTTATCCGTAGATGGAAATCACAAACTAAAAATACAATTAAATGATGG
ATATGATAATTTTGATAGAATTTTTACTTTTAAAAAAATAGAAAAGGGAATTGATATATCAACATCATTA
GTAACTGATAGCCAAGCTAAGTTTACTGTAACAAAAATATACAGTGAATTGACAAAAATAGAGTGTTATT
TAGATGAAACATTAAAAGAGACTTTTACTACAGACTTGTATTCAGAAAAGACTATAAACTATGAACTTAT
AGACAATGCAATACACACATTAAAAATAGTTGTAACTGATGCAGAAAATGTTGTAGAAGAAAAAGTTATA
AGTATAAGTAAGAATATAATGCCATTGCAACCTGATGCAACATTACAAGATATATCAACTAAGTTAACAG
AGATTGGGCAAGGCGTTAGAAATGGTAAAACAAGCATTATAAATACTTTAGCATTAAAGAATATAGATGC
AAGTTTAAATAATACACTCGTTGAGTTATCAGAGAAAATTAAGGGAGGTTTTGATAGTGGAGACGCTAGT
TTACAAGATTTGATGAATCAATTAACACAAGCTAATAATACTATATCGCAGTTAAATACTAAGTATAAAG
TTGCTAGTGGTACAGTTACTTCTTTTGCGGATAGTACTAAAATTGCTTATCCATATCTAACCGACAATGT
TACTAAACCTGGTTCTTGGATTAAAGTTAGTAATTTAGGCTTTAAACCTAATATTTTCTTTGCTGATTTT
GATTACTATGATGCTGAATATAAAAATAATTATAAACTTTTCCTTTTCGCTTGTAATGGTGTTGCCACAC
AAAGAGGTGTTGATTTTTCAAGTGTTACATCTTTTATCAGAAAAAGTGGTGATGAGTATTTTCATGCTAA
TGGATGGCTATATAGTAACTCAGAGGGGGATGTCTATTTTAATAATACTGGCGTTCAGATTCCAGCTTAT
AACTTTGATTCAACTCAAAAACATACTTATAAATGGTATGCTATTAAATTTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:1719786-1720079 hypothetical protein CDR20291_1458 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGTTCCAAACCGAATAATATATGACCAAACAGGTAGAACAATCTTTGAAACAGGCGAATCCTGTG
GAGATGTATTGCCACATTATACAATAACGGAATTGCATTATATAGATATTGAATATGGAAGTATAGATTA
TACAAGGAATAGAGTTATAGGTATAAATATAGAAACAAAAGAACCGATTTTAGAAGAAATACCAGTATAT
ATAACAGATGAGGAAAAGAGAATACAAGAGTTAGAAAATCAATTATTAATTGCAGAAAATGAGAAAGTAG
GAGGATTATTATAA
>ref|NC_013316.1|:1720079-1720261 hypothetical protein CDR20291_1459 [Clostridium difficile R20291]
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AAAATAGAGAATTTCAGTTAGATGACGTGACTAACACAGAGTACAGAAAAGCTGTAGAGGATTATATTAT
AAAAAATAGTGGAGTAGTAGAAGGAGCAGAACCAACTATATAG
>ref|NC_013316.1|:1720295-1720861 hypothetical protein CDR20291_1460 [Clostridium difficile R20291]
ATGACTTTTAAAGAGTTGGTTAATAAAGTTAGAAATCTTGTATTAGAAGCAAAGAATGTAACTATAGAAG
ATACAGAAAGTAAATTTACAAGTGAAAATGTAGAAGGAGCATTGAAAGAATGTATAGATAGAGCAGATGA
GGCTTTTCAAGAAGCCGATAGTGGAAAAACACTTTTATCAACTGCTATCGGCTCTCCTACTACATCAGAA
CAAACATTTCAAGATTATGCGAACTATATTACAGGATTTAAGAGCAATATAAGCAATTTAGAAACTCAAT
TGAAAAGCAAATATTCTATTAGATATGGTCCTATTGATGGATATGATGGTAATCCTTTTTCTGCTAATTT
TGGCAAGAGTGCAAGTTACCTTATTGTCTATGTTTACTTTAGAAGAAGTGTATATTATTATAATCCCAGT
GGTAGTTCTTTAGGAAGTAATACAGGAGGTTCTGAACGTGCATGGATTACTATAAACAGCAATAAAACTG
GTTTTTCAGTTCATTCATATGATACTAGTTATGAGTCATATCCTTTTACAGGTTATTATATTGCTTGTTT
CGCATAA
>ref|NC_013316.1|:1721186-1721443 holin [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAATTTAATAAGTTTTATACCAGAGCAGTTGCTAATTTTAGTAGCTGCTCTCTCTATTATAGGTA
AAGGTTGTAAAAAATATAAACAATTAGATAATAAATACATTCCAGTAGTGTTACTGATACTTGGAATAGG
TTTCTCAATATGGATGCTAGGATTAAATCCTGTTGCAGTCTTACAAGGTGTAATTTGTTGGGGAGTTGCA
ATAGGTATAAATCAAACTTACAAACAGTTGAAGGATGGTGAAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1721704-1722567 hypothetical protein; hypothetical protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGTTGAAGTAAAAGAAGAAAAAACATTTGATGAACAAATAGATATTTTAAAAAGTAGAGGATTAATAA
TAAATGATAAAGAAGATGCTAAATTTGTATTAAGTAATGTCAATTATTATAGGTTTACAGCATATCTTCT
AAGTTTTAAGAATGATGATGGCTCATATAAAGAAGGAACTACGTTTGAAGAAGTTTATGATATATATAGG
TTTAATAAGGAATTTAGGATATTATTAACAGATTTGTTAGGGAGCATAGAAATAGCATTTAGGACATACA
TTGCATATACATTAGCAATTAAACATGGTGCTTGTGGATATCTAGAAAGGGAGAGTTTCAAAGATGAAAA
ATTCTATATTAATTTTTTGACAGCATTAGAGAGAGAAAAAAGTAATAATTCAGATAAGCTTTTTATTATA
CACCATAAAGAAAAATATGAAGGAAAACTTCCCATTTGGGTTGCAACGGAAATAATGACTTTTGGTATGT
TGTCAAAATTATATTCAAACATGTTGCCAGAAGATACTAGATACATAAAAAATAATTTGTGTAGAGTGAA
TACTTTATTAGTTAAATCTTGGTTACAATCATTAACACAGGTCAGAAATCAATGCGCTCATTATGGTAGA
ATATATAATAATAATTTCCGTATTATAACAATAAAAAACGAATATAAAAAGTATAACTTGGATAATAAAA
AGATATTTTCTTATATACTTGCTATGAAGCATTTGACTATGGATAAATTAATTTGGAATAGTTTTTTTAT
AAAACTTCAAAAGTTAATTAATGATTATAATAATTCTATAGACTTAAAGCTTATTGGTTTTCCTAATAAT
TGGATAGAGATATTGGCTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1722646-1723458 n-acetylmuramoyl-l-alanine amidase (cell wall hydrolase) region relative to most database matches fragment [Clostridium difficile R20291]
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TTAACGAATACCAATACAATAAATCTCTTGCACCAGTATTAGCAGATACATTTAGAAAAGAGGGTCATAA
GGCAGATGTAATAATATGTCCTGAAAAGCAGTTTAAAACTAAAGCAGAAGAAAAGACTTATAAAATACCT
AGAGTTAATAGTGGAGGATATGATTTACTTATAGAACTACATCTAAATGCAAGTGATGGTCAAGGAAAAG
GTTCAGAAGTTCTATATTATAGTAATAAAGGTTTAGAGTATGCAACTAGAATATGTAATAAGCTAGGTAC
AGTATTTAGAAATAGAAGAGCTAAATTAGATAAAGGATTATATATCTTAAATAGTTCAAATCCTACAGCA
GTATTAATTGAAAGTTTCTTCTGTGATAATAAAGAAGATTATGAGAAAGCTAAGAAACTAGGTCATGAAG
GTATTGCTAAGTTAATTGTAGAAGGTGTATTAAATAAAAATATAAATAATGAGGGAGTTAAACAGATGTA
CAAACATACAATTGTTTATGATGGAGAAGTTGACAAAATCTCTGCAACTGTAGTTGGTTGGGGTTATAAT
GATGGGAAAATACTGATATGTGATATAAAAGATTACGTGCCAGGTCAGACGCAAAATCTTTATGTCATTG
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ATTTGATACACTTTATAAGGCATTAGATTTTATTAATAGATAG
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TATTATTTGTAAATGCATTAGATTTAGAGAGTAACAATAACATAAAATCTTATAAAAGAAAGAATGTAAA
GGAAATTGATATAAGCAATAAATTTGTTGATGAATCCTTTAGAAGAGATATTGTTGAAAAGGTATTAGAT
AATAGGGATGATCCATTAACAAATGAAGTTGCATCAAAAGATAACTATAAAATATATGAAAGTGATTTAA
ATAAAATTGAGAGTTGCTTAGAGTTAGATTTACATAAAAATCCAGATGTTTCTAATCCAAACAAAATAGA
TAATTTAGATGGGATAGAAAATTTTAGAAATCTAGAAAAGCTTGATTGTAGTTCAAATAATCTAGAAAGT
GTAGATTTAAGTAAAAATATAAAATTAAAATATCTAGATATTAGTGGAAATAAAATATTAAACATTGATT
TAAAAAACAATAATCTTATTAATGAATTACATTGTGATGCAAATAAATTATCAAATTTAGACCTTAAAAA
TAATAAAAATTTGGTAAGTTTATTTTTTACTAGTAATGAATTAACAGAGATAGATTTAAGTAATAATGTG
AACTTAGAAAATTTACAATTTCTTAATAATAATTTAAAAAGTATAGATTTAAGTCATAATAAAAAGTTGA
AATCTCTAAATTGTACTAACAATAAACTTAAATCCCTTGATTTAAGTAATAATGTTTTTTTGAAAAATTT
AAGTTGTTCAGGTAATAACCTGAGTAAATTAAATATAAAAGGACTTACAAGTCTTGAGTATTTGGGATGT
GCTAAGAATAAATTACAAGATTTAGATGTATCTACAAATATAAAATTAGATTCTTTACTTTGTGGGAAAA
ATAGTTTAACAAAAATAGATATAAGTAAAAATAAAGAATTAAATTCACTGGAATGTAGTGGTCAATATAT
AGAAAAAAGCATTATAAAAAATGGTGAAAATATAGTTGTAGATATAGGAATTGAAAATTCGAAATTAAAG
GAATTATATCCACAAAATTATAATATTTCAACAGGTTTTCTAACATGGGAAAATCTTTCTGACTTTCCAA
ATAGCATAAGTTATAGTTTGGAATATGAATATGGTCCAGTAAATGATACAGAGACTATGGATGTAAATAT
ATCAATAGATAAATTAGTGAAATGTAGAATCAGATATATAGATTATGATGGAAGTATAATTAATGAAAAA
GAAATATCAGATAATTCTAGTATAAATGAAATTCAAATTAATCCTCAAAGAGAAAACTATGAGTTTAGTG
GTTGGAGGAACAATAAAGATGAAAAAATATATACATCAGAGCAGGTAAGTAAATTAGTTTTTGATGATAG
TACTGATTTTATAGCAACTTATAAAAGAAAATCAACAGGATCAAGTGGTTCTTCTGGTGGAACTTCAAGT
AAAGAAGATTTTAATATAGCACCATCTAAGGAAAAAATAACAGGTGCAGACAGAAATGAAACATCAGTGA
AAATAAGTCAAAAAGGATGGAATAAAGCTGATAATATAGTGTTAATAAATGACTCTAGCATATCGGATGC
TTTATCAGCAACACCATTTGCTAAGTCTAAAGATGCACCAATATTACTTACTAAAAATAATAATTTAAAT
AAATTAACAGAAAAAGAAATAAATAGATTAGAAGCAAAAAATGTGTACATAGTGGGTGGATTAAAGTCTG
TTGATGAAAAAGTAGTGTCTGATTTAAAGAAAAAAGGATTAAATGTAATTAGAATATCTGGAAATGATAG
ATATGAAACATCAATAAAACTTGCAAAAGAATTAGACAAAAATTCTAACCTGTCAAAAGTAGTAGTGGTA
AATGGAGAAAAGGGACTAGCTGATGCAGTAAGTATGGGAGCTATATCAGCAAAAGAGGAAATGCCAATTC
TTCTTACTAATCAAAATGATGATATGAAAGATATAAAAGACTTAATAGCTAATAAAAACATATCAAAATC
ATATGTAATAGGTGGAGAATCTTTATTTAATAATAAAGAAGTGAATAATACATTACCATCTGTAACTAAA
ATAGCAGGTTCTGATAGAACAGAAACTAACTCAAAAGTAATAAGTCATTTCTATAGCAAAGATACACTTA
ATGACTTATATGTAGCTAAGAATGGAATGAATAAACAAGACGATTTAGTAGATGCCTTATCAGTAGGAGT
GCTTGCAGGTAAAACTGAATCTCCAGTAGTATTAGTTGGAAATGGATTAGATGATAGCCAAAAAGAGTTA
ATCAAGAATAAAAAGTTTAAAAATATAACTCAAATTGGTGGAAATGGAAATGAAAAAGCATTTAATGAAG
TAGAAAACTTAGTTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1726872-1727549 putative manganese-containing catalase [Clostridium difficile R20291]
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TAATGCAAGAACAGTTGGGTGGTGCAAATGGAGAGTTAAAAGCAGCTATGCAATACTTGTCCCAAAGTTT
TAGAATAAAAGACCCTCAAATAAAAGATTTATTTCTTGATATAGCAGCAGAAGAGCTTAGCCATATGGAA
ATGGTAGCACAAACTATAAATTTATTAAATGGACATGATGTTGATTATAATGCAGTTAATACAGGCGAAA
TAGAAACACATGTATTAACTGGTCTATCACCAGTCTTAATAAACTCATCAGGAGCTCCTTGGACTGCTAA
TTATGTTACAGTTACAGGGGATTTAGTAGCTGACTTACTTTCAAATATAGCTTCTGAACAAAGAGCTAAG
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ACAGAGAAGAAGCACATAATGCTCTATTTAGAGATGCTTTAAATAAAGTTAAAGATACAGGTTCAAATAG
AGATTTTGGAGTTACAGAAGATTCTAGATTATATTTCGATTTGTCTACTCCAGGGCCAAATCACAATACT
AAGATAGATATTAATCCTCCTTCTTTTGAAAAACCTTTAAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1727723-1729759 hypothetical protein CDR20291_1466 [Clostridium difficile R20291]
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TTTAAGTGTAGGATATTCAACATGTCATTGGTGTCATGTTATGGAAAAAGAATCTTTTGAAGATGAAGAA
GTTGCTGAAATAATGAATAGAAACTTTGTGGCAATAAAAGTAGATAAAGAGGAAAGACCTGATGTAGATA
GCGTGTATATGACAGTTTGCCAAGCTATGACAGGTAGTGGTGGATGGCCAATGACCATAATAATGACACC
AGATAAAAAACCTTTTTTTGCGGGAACATATTTCCCAAAATATTCAAGGTATAATAGACCTGGAGTTATA
GATTTATTAAAGAATGTATCTGAAAAATGGAATACAAGTAGGGATATATTAATAAAATCTGGAGATGAAA
TAATAGAAGCTCTTAAGGATGATTTTGGTGTAAAAAATACTGAGGGTGATTTATCAAAAGAGATGTTGAG
TTCATCAGTTAGAGTATTTAAGGCCATTTATGATGAAAAGTATGGTGGTTTTGGTAATGCTCCTAAATTT
CCAAGTCCTCAGAATCTTATGTTTTTAATGAAATATTATAGCATAGAAAAAGATAAAGATGTGTTAAAAA
TGGTGGAAAAAACTTTAGATGGAATGTATAGAGGAGGCTTGTTTGATCATATTGGATTTGGGTTTTCAAG
ATACTCTACTGATAAAAAGTGGTTGGCTCCTCATTTTGAAAAAATGCTATATGATAATGCTATGCTTACT
ATAGCTTTTTTAGATGCATATAAAATAACAAAGAAAGAGTTATATAAAGAAATTGCTATAAAAACTATAG
ATTATGTAGTTAGAGAGATGAAGGATAAAGAAGGTGGGTTTTATTCAGCACAGGATGCTGATAGTGAAGG
TGAAGAAGGTAAATTTTATACATTTAATCCTCTTGAGATAATTGAAGTTTTGGGTGAAGAAGATGGAACT
TTCTTTAATAATTATTTTGATATAACTAGTAGTGGAAATTTTGAAGGTAAAAGTATTCCTAATCTTATAA
AAAATAAAGAATATGAAAGACATAATGAAAAGATAGCTGACCTTAGTAAAAAGGTATTTGAATATAGAAA
AGAAAGAACATCTTTGCATAAAGATGACAAGATACTTACATCATGGAATGCATTGATGATAGTTGCTTTA
ACAAAGGCATATAGTACTTTAAAAAATGACATATATTTAGAGTATTCAAATAAGTGTCTTAACTTTATAA
ATAATAATCTTGTAAATGAGTCAGGTAGATTATTAGCTAGATATAGAGATGGAAGTTCCGACTATTTAGC
ATATTTAGATGATTATGCTTTTTTAATCTGGGCGTATATAGAGCTTTATGAGTCAACATTTAATATGAAA
TATTTAGAAAAGGCTTTAAATTTGAATGAAAGCTGTATCAACCTTTTTTGGGATTATGAAAAAAGTGGAT
TTTATATATATGGTAAAGATAGTGAAAATTTAATAGCAAGACCAAAAGATTTGTATGATGGAGCTATTCC
ATCAGGAAATTCTGTTCAATTATACAATCTTATAAGACTTGCGAAAATTACTGGAGATAATAGACTTGAA
GAAATGTCATATAAACAATTAAAACTGTATGTGGATAATGTAAAGAGTTCTCCAACTGGCTACAGCTTTT
ATATGCTTTCATTGATGTTTGAACTTTATTCTACTAAGGAAATTATATGTATTTTTAAGGAAGATTCTGA
TTTAATTGCATTTAAAGAATTGATAAGTGAAAATTTTATACCAAATGCAACTTTTTTAGCAAAGAAATAC
AATGAAGAAAACACTATTATAGGTTTTTTAAATAACTATAGATTGAAGGATGATAAGACTAGTTATTACG
TGTGTCAAAGTAATAGTTGTAGTCAACCAATTAATGATTTACAAAAATTAAAAGATATGATTTTAGGAGT
AGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c1730588-1729950 MarR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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TCATGGATTATTCAAATGAACTAAAAGAGCTCTTTTTAATGAATCAAACATATGCAACTCTTTTTACCCT
TACAAACAAAATACAAATAGAAGGAGATAAATATTTTGGTATACTTACTTCAAGACAGTATATGACTATT
TTATCAATTCTTCATTTACCAGAGGAAGAAACAACATTAAATAATATTGCAAGAAAAATGGGTACAAGTA
AACAAAATATAAATAGACTAGTTGCTAATCTTGAAAAAAATGGATATGTTGATGTAATTCCAAGTCCTCA
TGATAAGAGAGCAATTAATGTTAAAGTTACAGACTTAGGAAAAAAGGTTATGGTAACATGTAGTAGGACT
GGAATAAACTTTATGGCAGATGTATTTCACGAATTTACCAAAGATGAATTAGAGACCTTATGGAGTTTAC
TAAAAAAAATGTATCGTTTTAATGGTGAAGAACAAGATGGCTTTGAAGAAGATGCTAATTTTATGGAATA
TGAAGAAATAGATAAAATTAAATCTGAAGCACTTGAAGAATTTGCAAAAAGAAGAAATAGGGTAAATAAA
AACGATTAA
>ref|NC_013316.1|:1732430-1733185 transposase-like protein b [Clostridium difficile R20291]
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AAGGGAGAATACTTAATGCTACTATATCTAAAGAACCAAGTGGTAGATATTATGTATCATTATGCTGTAC
TGATGTAGATATTGAAGCATTTGAAAATACTAATAATCATATAGGTTTAGATTTAGGAATTAAAGAATTT
TGTATCTCAAGTTGTGGAGAATTTATAGAAAATCCTAAGTATCTTAAGAAGTCATTGAACAAACTTGCTA
AATTACAAAGAGAATTATCGAGAAAAACAATCGGTAGTTTAAATAGAAATAAAGCAAGATTAAAAGTTGC
AAGACTTCAAGAACATATAGCTAATCAAAGAAATGATTTTCTACAAAAACTATCTACTAAATTAATAAAA
GAGAACGATATTATTTGCATAGAAGATTTACAAGTAAAGAATATGATTAGAAATCGTAAACTATCTCGCT
TAATTTCTGATGTGTCATGGTCAGAGTTTATTCGTCAATTAGAATACAAGGCTAATTGGCATGGTAGACA
AATTGTAAAGGTAGGTAAATTCTTTGCAAGTTCACAAATATGCAATAAATGTGGGTATAAAAACGAGGAA
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CAAGTATAAATATATTAAAAGAGGGATTAAGACTAATAACAATTCAAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1734176-1735390 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAATTAAAATAGGTAAAGTCATACAGCGTCTTAGAAAAGAACGAAATTTAACTCAAGAACAATTAG
CAAAGTTTATAGGTGTGTCAACACCAGCAGTATCTAAGTGGGAGAGTGGAAATTCTTACCCAGATATAGA
ATTATTGCCTTTATTAGCAGACTTTTTTAATGTGTCTATTGATAAGCTTTTAAATTACAAGATTGATTTA
AGTGAAGAAAAAGTAATGAAAATTTATAAAGAATTAGAATCAGGCTTTGCTAGAATTGAAATTGATTTAT
CAACAGAAGAACCAAAAGAAGAATTTAGACAAGACTTAGAATCTGTAAAAAAGCTTTCTAATATGTATAT
AGAGAAGTATCCTAAAAGCTATTTATTGAAGCTAAGGATATGTTCGCTGTATCAGATGTATTCATATAAA
TTTGGTAAGAGTGAACTTAATGACAGAGTAAAAGAAACAACGAATATTCTTGAAGATATAGTGAGAAATA
CAGATGATATCCAAATAAAAGAAACAGCTCTTATTATATTATCAAACGCATATTGTATGTTGGAAGATTA
TGAAAAGGCAGAGTTGTATTTAAATATGATACATAAGTCAATAGGGGATACAAGTGTTAATTTAGCTATG
ATATATTTAAAGCAAAATAGACTTGAAGAAGCAGAAATATTGCTTCAAAATAAATTGTTTAGTAATATAT
TTAATATAAGCATGGATTGTAAGGGAATAATTAATGTATACAAAAATCAATACAAGGAATTAAAGAAAAA
ATTGGAGAATAGAAATTTTAATAAAAATGCAATTGAGAGAGAAATGGAGTATATAAAAAATAAGTTGCTG
TGGTATGCAAATCTTTCTTTAGAAATAAAAAAAATGCTCAGTGAAGATAAAGGTGCATTTTTTAGTATGT
ATGTGGATTATATGGAATTATCTCTAATTTTTTTATTTTTTAACATGAAAGAAGAAGCAAAAAAAGCCTT
ATATAGTCTAAAAGAAATATTAGAAAAATATCCTATACATGAAAGTTTGGATGTAAGTCAAATGAGATTT
TTTGATAAGGTAGAGTCTAAAAATTTATATACTTTTAATATATATACAAACTTGTTAATTGTACTTAATG
ATGACAGTTATAATGAGCTTAGAGAAGAACCAATTTTTAAGGATGTAATTGAAAAGATTTTAGATATGGA
AAAAATGTTGAAAAATAAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c1736349-1735810 hypothetical protein CDR20291_1471 [Clostridium difficile R20291]
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TGGAATTATATAAAATTAGTTTCCCATTTCATGAACAAAGAAAATCTTATTTGCAAACAGAAATTTTGAA
AAATAAAGAATATCAATTCAATTTAATTTATGATAAAAACCAGTTTGTCGGCATAATTTTATGTTGGGAA
ACAGATAACTTTATCTATGTAGAACATTTCTGCATTTTTCCAGAAATGCGCAATAATAGATATGGACAAA
GAGCGTTAGAGCTTTTAAATAAGAAAGGAAAAACTATTATTTTAGAAATTGACCTTCCAATTGATGAGAT
TTCAATTTATCGCAAGGCGTTCTATGAAAGAGTAAAATATAAGACAAATAATTATGAACACATTCATCCA
CCATACCATGAAAAATTCAATGGGCATAACCTGATTGTAATGTCTTACCCAGAAAAGTTATCTAAAATGG
AATATGATAAATTTAATCACTATCTAAGAAATAATGTCATGAGTTTCTAA
>ref|NC_013316.1|:1736687-1737484 hypothetical protein CDR20291_1472 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGAAAAGAGAAAAGAGGATAATAATATCATCTTTATTAAGTGTATCAATTTTAATGGGTTTGGTAA
GTATATATTCTATATTAAATAAAGAAGACATAATTTTAACTGTTAAGGGTCAAGAGCAAAAAGTATCTTC
CTTTAAGAAAACAGTTGAGGAACTTTTGGATGAACAGGGTGTAAAGTATAATTCTGAAGATAAGATTAAT
CCAAGTTTAGATACAGAACTAAAAGATGATATGAAAATAAAAGTTGTTAAGGTAACTAAAAGTAAAAAAG
AAGAGATTGAAAAAATTCCATTTGATACAAAGCATGTAAATGATAGTAATTTGTTAAAAGGAAAATCTAA
AGTTTATCAAGAAGGTCAAGAAGGAGAAAAAAAACTAGTCTATAATTTAACTTACCATGATGGAAAATTA
GTCAAAAAAGTCTTATCAAAAGAAGTAATATCTAAGGAGCCAACTACAAAAATTATAAAATATGGAACTA
AAGAAAAAGTACTAATAGCATCAAGAGGAGCAAATATAAGAGGAGGCAAACATATGAAAGTGGTTGCCAC
TGCATATGCAGGAGATACAATAACATCTACTGGTACAACTCCAAGATGGGGTGTTATTGCAGTTGACCCA
CGTGTAATACCATATGGAACAAAAGTATATATACCTAAACTGGGTATGACTTTTGTAGCAGAAGATTGTG
GAGGTGCAATTAAAGGTAATAGAATAGACATTTTTATGAACAGTGAAGGAAAAGCTTCAAATTGGGGAAG
GAAAAGTATAGATATATATCTACATTAA
>ref|NC_013316.1|:1737594-1738184 putative arylesterase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATAGTCTGCTTAGGAGACAGTTTAACGTATGGATTTGGAGTATCACGAAGTAATTCATGGACAA
ACATTGTAAATGAAGAGACTCGATTAGAAATAGTAAATAAGGGTATAAATGGTGATACAACAAGTGGTAT
GTTAGCTAGGTTTAATGAAGATGTTGTAAAAAACTCTCCTGATATAGTTTTTATAATGGGTGGCACTAAT
GATTTTATTGCTGGTGCGGGAAATGAAATTATTAATTCTAATATAATGGCTATGGTGCATCAGTCATATT
CAAAAAATATTATACCTATAATAGGTATACCATTAAAACCAGATATTCCAAATGTTAGGGAAGATTGGAG
TTGTTTTACTGATTTTAATATAGTATCTCAAAACTTAGAATCATATAGTTATTGGATAAAAAAATTTTGT
ATGACATTTAATACTAATTTCGCAGATTTTTATTCAGAATATAATAAAAATATGGAACTAGAAGGATATA
AAAAATTATATTTTGATGGGTTACATCCAACCAAAGAGGGTCATAGAATAATGGCAGACATTTTTATTAA
TTCAATTAATAAGTATATAGAAGAGTTATAG
>ref|NC_013316.1|:1738196-1739947 putative phosphoglucomutase [Clostridium difficile R20291]
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CTTATGAAGAGTGGATAAAGGGTTCATATTTTGATGAAGATACAAAGCTAGAGTTGGAGAATATAAAAAA
TAATGAAAAAGAAATAGAGGATAGATTCTATAAGGATTTAGAATTTGGGACTGCGGGTCTTAGAGGAATA
ATTGAAGCAGGAACGAATAGAATAAATAAGTACACAGTTAGAAGAGCTACTTTTGGATTGGCAAACTATA
TATTAGAAAACACAACAAAAGAAGAAACAAGTAGAGGAGTAGTAATAGCTCATGATAATAGACACAAGTC
TAGACAATTCTGTATAGAATCTGCAAATACTTTGGCAGCATGTGGTATAAAAGCATATATATTTGATAGT
TTGAGAACTACTCCAGAATTATCTTTTGCTGTTAGAAGCTTAAATGCAATCGCTGGTATAGTCATAACAG
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GATTGCAAATGCAATAACAGAGAAAGTAAATAGTATACATGATTATAGTACAATACCAACCTTAACGGAA
GCTAATAAAAATTTGGTAGTTTTGTTGGACGAATCACAAGATACTAAATTTATAGAAGCAGTAAAAAGCC
AAATTATAAGAAAAGATTTAGTTAAAAATGTAGGTAAAAGCTTTAAGATAGTTTATACACCTCTTTGTGG
AACAGGGAATGTTCCAATAAGAAGAGCATTGAAAGAAGTTGGTTTTGAAAATATAATTGTAGTTCCAGAA
GAAGAAAATCCAGACCCAAATTTTGCAGGGCTTGATTATCCAAATCCAGAAGAGAAAAAAGCTTTAAATA
GAGGTATATTACTCGCAAAAGAAAAAGGAGCAGACCTTGTAATAGCAACTGACCCAGATTGTGATAGAGT
AGGTGTAGCAGTAAAAACTACTACAGGTGAGTATGCTTTACTTACAGGAAATCAAATTGGTGGTATGCTG
ACACATTATATAATAGAAGGATTAAAAGAAAATAACAAATTAAAAGAAAATCCTACAATAATAAAAACCA
TAGTTACATCAGAATTTGGAGCAGATATAGCTAAAGCAAATAATGTTGATGTATTAAATGTTCTTACAGG
TTTTAAATTTATTGGTGAAAAAATAAAATTATTTGAACAAAATAAAAATAGAAGTTATGTATTTGGATAT
GAAGAAAGTTATGGTTACTTAGTTGGGACTCATGCTAGAGATAAAGATGGTGTAGTTTCTTCATTGTTAA
TATCTGAAATGGCAGCATTTTACTATTCAAAAGGTATAAGTTTATATGATGGTTTAATAGAACTTTATAA
AAAGTATGGATTTTTCAAAGAACAGACTATATCTTTGACTTTAAAAGGTATAGAAGGTGTAGAAAAGATA
AAAGAAATAATATCTTATTTTAGAGAAAATCAAATTGATTATATAAATAGTATTAAAGTAGTTGATAAAA
AAGATTATAAAAATGGTATAGATAATCTTCCTAAATCTAATGTTTTAAAATACTTTTTGGAAGATGAATC
TTGGGTAGCTATAAGACCATCTGGAACAGAACCAAAACTTAAATTTTACATAGCTGTAAAAGGAGCTAGT
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AA
>ref|NC_013316.1|:1740161-1741000 putative membrane-associated ribonuclease [Clostridium difficile R20291]
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AGTCAGCAGAAGTATCTTTCTTCTTAATGTTGTCCATATTTCCTTTTTTAATATTTACAATAAGTTCTAT
AGCTTATATACCGATTCTTCATTTAAATAAGTATATAGCTTTGTTTAGAAATATGATGCCAGAAGGTGCT
TTTGCTGTGTTATCTTCAATCATAGTTTCTGCAATAGACAATAGAAACCTGAAATTTTTAGCAGTCAGTT
TTGTACTTACTATGTGGACATTTTCAAGAGCAGTAAAAGCTCTTATTAAAGGAATGAATAGAGCCTATAA
AGTTAAAGAAACTAGGTCTTTTTTTAAAATTTTATCTATATCATTTTTATTTACAATAATGCTTTTGGTC
CTTATTTTTTTATCTATGATATTTTTAGTTTACGGGGAAAAAATAGGTTATTTTATTTTTAATCTTGTAG
GATTGGATGAGATATTTATAAAAATATGGGATATTCTAAGATACACTGTAGGTATAATAACAATAATAGT
GATATTTACACTTTTATATAAATACACTCCAAATAAAAAGTTAACTATTAAAGAATCTGCGCCAGGTGCT
ATTTTTGCTACTTTTGCTTGGTTTTTAGTATCATTTTTATATTCTTATTATACAAATTACTATGCTAACT
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TATCGTTATTGGCTATGAGGTAAATTCAAGATTGTATTTTAGAAAGATAAGACATGAAATGTTAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1741517-1743373 putative two-component histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
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AATCGATTCCTTTGATAAAAAGGAAAAAGTAGCTTATATTAAAGACGAAGAAGGCATATATATAGATTGC
AGTGAAAATTTAATACCAATATTAAATAACAACATTAAAACAACGAAAGATATCTTTGGTAAAAATGATA
TAGAAGTATGGGGAGAGAATACAGGAAAATTATTTAGAGATGATTATAGAGGAGGAGTATCTAGTAAAAA
AAGATTTTTACAAAATCTTTTTGAATATGAAGAAACATTTTTTATGGTTGAAAAATATTTTTTGTATGAT
GAAGACGAACTTTTAGGTACTATAGGGATAATAGATAATATAATATATAGTGGTTACAGTAATAGAAATT
ATAACTCAAAAGATTTAATGAAGATGATAGAACACTCAATTCCAGAGAATATGTTTTATAAAGATGTGTA
TGGAAATTATATTGGATTTAATTCAGGTTTTTTGAATTTAGCTTGTATGAATAAAGAAGAATTATTAGGG
AAGAATAGTTATAAAATATCAGAAGAAGAAGCTTTAATAAATAAGATATTTGAAAGTGATAAGGGTGTAG
TTGAAAATAAAAAAGTAGTTACATTTGAGTTAAATGTAAGTATAAATGATGAAAATAAGTGTATTGAGAT
TACAAAAAGGCCGTTTTTTGATAGCTATGGAAGTGTTATTGGAATAATTGGAACAGCAAGGGATATAAGT
AGAAGAAAAAGATTAGAAGAGGAAATGGATAAAACTAGGATGGAATTTTTTGCAAATTTATCCCATGAAC
TTAGAACGCCTATAAATTTAATATCATCTTCATTACAAGTGATAGAAAAAAAAGAAGCAGATTTAATAGA
ATCAAATGATACTTTAAAAAGAAATTTAGGTATAATAAAACAAAATGGAAATAGAATACTGAGGTTAGTA
AATAATGTTATAGACTTTACAAAAATGCAATCAGGATATTTAGATTTTAAACCAGAAGAATCTGATATAA
TTGCATTTATAGAGGAGATATGTATGTCTGTAGCTGATTTTGCAAGCCAAAATAATATACAACTTACATT
TGATACAGAAATAGAAGAATTTTCAATGTTATTTGATTCAGAAAAATTGGAAAGAATAATATTAAATTTA
CTTTCTAATGGAATTAAGTACAATAAGAAAGATGGAAAAATAAATATATTTTTATATGTGAAAGATAATG
TATTTAATATGAAAATATCTGATAGTGGAATAGGTATACCAAAAGAAAAAATAGATAAAATATTTAATAG
ATTTGAACAGATTGACAATGAACTTTCCTACAGAGTTAAAGGAAGTGGTATTGGACTTTCATTAGTGAAA
TCTTTGGTTGAATTGCATGAGGGAAGTATATCTTTAAAAAGTCAACTTGGTATTGGAAGTGAATTTATAG
TTTCATTACCTGTTAGAAGTGAAAATAATATTGAAAAATATAATCATAAAAGAGAAATCAGCAATGAACT
AAGTAAAAAATTAGAAATAGAGTTTTCGGATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:1744082-1745299 homoserine dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATAAAGTGAAAATTGGAGTACTAGGATATGGAGTTGTAGGAAGTGGACTTATAGATATAATAG
ATAATAATAAAGAAAAAAGAAGTATAGAAATAGTTGGAATTTTAGTTAATAATTTGGAAAAACATAAGGA
TAAAAAATATTCTAATATAATAACTAATAATATAGATGATATATTTAATAAAGATATAGATATACTTGTT
GAAGTCATGGGTGGTTTAGAACCATCATTATCTTATATAAAAAAAGCATTAAACAATAAAATTCATGTTG
TTACAGCAAATAAAGATTTGTTAGCTGAATGTGGAGATGAGCTTGCAAAATTAGCAAGTGAAAATAAAGT
AAGTATTAAATTTGAAGCTTCAGTCGCAGGAGGTATTCCAGTATTAAAACCAATAATAGAATCACTAGAA
GGAAATAATATAGATAGTATAAATGCAATTTTAAATGGAACTACTAATTTTATATTATCTAAAATGTATG
ATGAGAATCTATCTTATGATATGGCATTAAGACAAGCTCAAGAATTAGGTTTTGCTGAAGCAAATCCAGA
GTCAGATGTATTAGGGTATGATGCTGCTAGAAAACTATCAATATTATCAACTCTAGCTTATGACAATAGA
GTATATTGGAAGGATGTGTATTTAGAAGGAATTACAGATATAGATGAAAAAGATATTGAATATGCAAAAA
AATTAAATTGTAAAATAAAATTGATTGGTCAAAGTAAGTATGAAAATGATAAAGTAAGTGCTTTTGTTAG
ACCTGTTTTAGTAGAAAAAGATAATATCCTTGCTAGAATAGACAATGAGTTCAATGCTGTCATAGTGAAT
GGAGATTCAGTAGGAGAAGTTTCTTTTGTAGGTAAAGGAGCTGGAAGTTTAGCAACAGGAAGTGCGGTTT
ATTCAGATGTTATAGATATAATAGATAATAGAGTTTCAAGTATAGATTCTTTTACTAAAGATAAAATACA
AGTTAATAAAATAGTTAGAGAAAAGTGTGGAGCACTTCTTAGATTTAAAAAATGTAATAAAGATGAAATT
CTAAATATAGTTGAGAATTGTTTAGTAAAATTCGATATTTTAAATGATGATGATGAACTTGCTATTATGG
TTTATGCTGATTCTGAATATGAAATAAACAACAGTTTATGTCTAATAAAAGATAAAGGATATTGCGAAAA
AATGAATAAAATGTTGAAAATAAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:1745413-1745907 hypothetical protein CDR20291_1478 [Clostridium difficile R20291]
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AATGGTTCCAGAATGATAGAGAAGAATATGAAAGAGCAGCATACGATGAAGATAGAGAAAGAAGAGGCTC
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AATGTGAAGCTAGAAAATTATGGGAAGAAGCAGAAAAATACTGGGATGAATATTCAAAATACAACTATAA
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GGAAATAATGGAGGAAACAATAATAATTGTTGCCATAAATGCCATAAATGTAATTGTAACTGCTGTAGAA
AATAA
>ref|NC_013316.1|:1746172-1747437 histidinol dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGTATTAAAACATCAAGTATGAAAGAAAAGGTAGATGAAAAGATATTAAGAGAGCAAGTAAGTT
CTATAATAGAAGATATAAGAAATAATAAGGATGTTGCACTTAAAAAATATAATGAGAAGTTTGATAGAAA
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AAAGATTTGCCAACAAAGGACATAGCATATAGTTCATGGGAAAATAATGGAGAGATAATATTGGTTGATG
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GGTGACTATGTTTCAGGTACCAATCATACATTACCAACACTTAAAGCATCAAGATATACTGGTGGTGTTT
GGGTTGGAACTTTTATCAAAACTTGTACAAAGCAGATATTTAATGAAAAAGCTATACAATCATTAGCACC
TGTAGCTGAAAAGCTGGCAAAAGAAGAGGGATTATATGCACATGCAAAGGCTGCTGAGGTTAGGTTTAAA
AAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c1748392-1747640 hypothetical protein CDR20291_1480 [Clostridium difficile R20291]
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TCCTGCATGGTAATACTGGTTCTTCTAATATGTTTAAAGCACTTGTGCCATTATATGTAGAAAATTTTAG
ATGTATCTTAATTGATTTTTTAGGTAATGGACAGTCTGATAGAGTTTCTCAATTTTCTCCTGACATATGG
CATGATGAAGCCTTACAGACAATAGCACTGATTGAACATTTGAATTGTGGTAAAGTTGGCTTAATTGGAA
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AGATAGCTTTGATGGACGTACTCTTAATGATAACTTCATAGATAATCTAATCACTGGAAGGGAAAAATCA
AAGCAAGATATTCAAGCACGAAAATTCTATGAATGGTGTCATGGAAAAGATTGGGAGAATGTTGTTAATC
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AAGCAAATGGCAACTTTTATTTCAAAAGCAAGTATTCACATTTTTAGTCAGGGAGGACACCCTGCTATAT
TGACAAATGCAGATGAATTTGCACAGTTAGCAAAAGTTTTTTTCAAGTATTAA
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GTAAAGTGATTTATATTCCCAAAAAGCAAGAGCACAAAAAGCATTGGGGTGAAAACACAAACACCAAACA
AGTCTTAGCTTCTCGTAATTCTCAAATCTGTATAAATTTCCAAAATGGAATGAGTATCAAGCAGTTATCA
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AAAATGAAGGTCCTATAACAAAACCAGAAATTTCAAGCATTACTGAATTGAGTTTAGCTACAGTTAATAA
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AGAGCTCAATTATTTGAAATAAATGCAAACTTAGAACACATAATAGCTTTATATTATTATAGAAATTGTT
GTATAGGGGTAGTTGCCAATTTATTAGGTGAAATAATTTATCAAGAAGAATTTAATATAAGAATGGATAC
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ATAAGGGCTATTGGAATTGGTGTCCCAGGAGTTGTAAAAAAAGGTGTAGTTAAAAATATACCAACTATAA
AAAGTTGGGAAGGTATAAATTTAGAAAATTTAATAAAGAGTAAGTACAATACTAAAGTGTTTATAGAAAA
TGATACAAATATTACTACTATTGGGATTTATCAAAAACAGTATAAAGACAAATATAAAAATATGGCTCTT
ATGTATTTAGAAGATGGTATTGGTTCAGGTATAGTTATAAATGGTGAATTGTATTTAGGTTCTACAAATT
TTGCTGGAGAATTAAGTTATCTAAATATAGAATTTGGTAAGTATAACTCTAACAACTTAAATCTTGAAGA
TTATATTATGAGTTTAAGAAAAAGATATTTAGAAAGTAAAGATAATAAATTTAAGAAAGAAATTTTATCT
ATAATATCAAACTTTATAAGGACTCTTGTATGTGTCCTAAATCCACAAGCTATGATTATACAGTGTAGTA
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TAAATTAATAAAAGTAGAGTCATTGAGAGAAAGAAGTATAAATGGAGTAATTAGTATGTGTTTAAAAGAA
ACTGACTATCAATATTCCTTATCTAATAAAAAAGGAGGATATTAA
>ref|NC_013316.1|:1750350-1751300 putative N-acetylglucosamine kinase [Clostridium difficile R20291]
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ACATACTTAAAGAACATACCACTGGTTCAACTAATTATAAGTCAGTTGGAATTAAAAAAACATATGAAAA
TATTAATAATGGACTTAAAAAAATATTAAAAGATTTATATATCGATTATGACGATATTGAGTACACTGTA
TTTGGTATATCTGGTTGTGATTCTCCTAATGATTATAAGATTATAATGGATGAAATATTAAAAATTGGGA
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TTTAGTAATTGTGGCTGGGACAGGTTCAATTATACTGGGAATTAAAGAAGATGGAGAAATATATAGAGTT
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TATTGCTTTATTGTGATGAATGTCATGAGTATAGTGATTTATTTAGTTGTGTCTTGGATTTCTTTGGAGC
AAATAGTTTTGAACAACTTGCATATATGATTACTGATATAAACAATAATGTTGAAATAGCAAACCTAGCT
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AACTATCTAAATTAGCTCAAGTAATATTGAGAAAAATATCTAATCCAATGAAAATAGATAAAAGCGAAAT
AAATATAGTTTTGTCTGGTGGTACATTAAATAAAACTGTATATGCTCAAATGTTAATGAATAATTTAAAA
ACAGAAAATACAGATAAAAATTTAAAATTTATATCTCAAGAAAATCAGCCAGTATATGGGGGGATAAGAC
TTGCTATGGCATTAGCTAATAGGAGAGTTAAGCATGGATAG
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ATATAAAATGTAAACTACTAGAATTATTGGACTGTATTGATATAGAAAAGGTTATCATGGGATGGAGTGT
AGATGAAGAATTATATGTAGAAACTAAAAAACTATTAAATAAATATAATGTTGAACTATATCTTTGGTTG
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AGGGCTATGCTTTACAAGAGGATGAAAATTTTGAATTTTATTGCCCAAATAATAAGGAAAATATAAAAAA
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TATGGTTCTTTTTCGAATAAACTAAATGGTGTTTTTAATTGTTTTTGTAAAGATTGTTTAAATATATATG
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AGGGATTGAAAATAGGTATAGATACTTTTTCTCCTTTTATTTCTTACTTTACAGGTCAAGATTTAAAAAA
ATTACAAGAAGTAGCAGATTTTATAAAACCAATGATGTATAGAACTACAAAAGCTCCAGCTGGTTTACCA
TTTGAATTTGAAAGGTTTATTGATGAATCCATACATAAGAATAAAGAGATTGGAAAAAGAAATTTCTTAG
ATATTTTAGGAATTAAAGAGTATGAAGGAGATGTATATCCTATAGAATTTGTACTAGAGGAAATCGATTT
TATGACAAGGAATCTTAATAAAGATATATATGTAGGAGTTGAAATAAATAAAAAGGAAATTATAGCTCCT
GTTACACCTAAGTACATAAGTGAAAATATTTCAAATATAAATAAGACAACAGTAAAAGGATATGTTTTAT
CTTGGGATTTGTTATCAGCACCAAAAGAAAATATTGATGAAATTATAAAATGGTTTCGGAATTAG
>ref|NC_013316.1|:1752508-1753986 putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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GAGAAGTAAGAGCTCTTTTGGGAGCTAATGGAGCAGGAAAATCTACACTTATTAAAATTTTAGGAGGAGT
TCATTCTCAAACTAAAGGTAAAGTAATTTTGACTGGTAATGAAATAATGTTTAAAAATTCACATCATTCT
AAAGAAAATGGTATTAGTATAATTTATCAAGAATTAAGCTTGATACCAACGCTTACAGTACTTGAAAATA
TTTTTCTTGGTAGAGAAATTTTAAAAGGAAGTGTGTTTTTAAACAAGAAAGACATGCTTGAGGAATATAT
GAAAATTTGTGAGGATTTTGATTTTAATATAGACCCACATACAGTAGTTTCTAATTTAAGTGTAGCAAAC
CAACAAATGGTTGAGATAATGAAAGCTGTTTCATGTAATTCTGAAATTATCATAATGGATGAACCTACAA
CATCACTTACTAATAATGAAAAAGATGGGCTATTTAAAATAATAAGTAGACTAAAGTCTAAAGGTAAAAC
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GGAATTATGATTGGAACTTATGATGTAGAGGATTTAACTAAATTAAAGATAACTCAACTTATGACAGGAA
ATGATAATCACAAACTTATTGAGAAGAAGGATTATACATTTGCAAAGTATGAAGAGCCACCAGTACTAGA
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GGTCTTGCTGGTCTTGTAGGTTCAAGAAGAACTGAAATTATAAATTTGATATTTGGTATAGATAATAAAG
ATAGTGGAGACATTTTTATCAATGGTAAAAAAGTAGACATAACTTCTCCTAAGGTTGCTATAAAAAACAA
AATAGGATTGATTCCTGAAGATAGAAAAAATCTAGGATTAATTTTAGAACAAGCTATATACACAAACTCA
TCATCAGTACAAATTGATAAATTCAAGAAATTTTTGTTTATAGATAGAAATAAAGAAATTGAGTTTTCTA
AAAAAGGTGTTAAGGAATTAGGAATAAAAGTTAGTGATGTAAAGCAAGAAGTAAAAGAGCTTAGTGGTGG
AAATCAACAAAAAGTAGTAGTTTCTAAGTGGTTAGAGAAAGATTTAGATTTAATAATATATGATGAGCCG
ACAAAGGGAATAGATATTGCTGCAAAAGAAGATATTTTCAATACAATCAAAGAATTTTCAAGTGAAGGAA
TAGGAGTAATATTTATATCTTCTGATTTAGAAGAAGTAATAAGAGTAAGTGATAGAATTTTAGTAACTAG
AGAAGGTTCTATTGTAGATGATTTAAAAAATGAGAATATACAGGTTCAAGATATAATGAACAGTATATTT
AATGTATAA
>ref|NC_013316.1|:1754009-1754959 putative ribose ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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TAGCTATAAGTATTGCAACTCCATCATTTTTAGGTAAACAAAATATACTTAATCTTTTACGACAATCTTC
TATAATTGGAATAATTTCAGCAGGTATGACTTTTGTTATAATATCTGGAAACTTTGATATATCAGTTGGA
GCAGTAGCAGCTCTTGCAGGTGCTATAACAATGAAATTTGCGACTGGTGGAACTAATTTGTTTGCATCCA
TGCTCTTAGGTGTAGCGATTTGTGCAGTAATAGGATTAATCAATGGTATAGTAGTTGCAAAGATAAATGT
ACCATCATTAATAGCAACTATGGCTATGGTCACTATTGTAAGAGGATTGCTGTTGATGCTTACAGGAGGA
TATCCAATTACTGAAAATATACCAATACTTGATTACATTGGAAATGGATATTTGTTTAATATACCAATAC
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TGTTTATTCTGTAGGAGGGAATCAAGAAGCAAGTAAACTTAATGGTATAAATGTAGATTCTCACAAAGTG
AAAGTGTTTATTATTAATGCTGTACTTGCAGGAATAGCTGGAATCGTACTAACAGGAAGACTTGGGACTG
CAACTGCTATTGCAGGTGAAGGATATGATATGGATGCAATTGCATCTGTAGTAATAGGAGGTACATCAGT
GGCAGGAGGTTCTGGTTCTGTACTTAAAACTGTTATAGGAGTATTACTTATGAGTGTTATAAACAACAGT
TTTAATCTTCTTGGAATAGATGTATATTTCCAGTACATATTTAAAGGATTAATAATTTTAGCAGCAGTTG
GATTTGATTCTTATAGCAAGAAAAAACTTGCTTCAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:1754980-1755942 putative ribose ABC transporter, substrate-binding lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAATTAATGAAACATTTAGCATTGTTGTTATCACTTGTTATGATATTTGGTTTAGTTGGTTGTT
CAAATGGTGGTGACAAAGAAAAAAATGGAGAAAAGAAAATAGCAGTATTACTACCAGGTTCAACAGGTTA
CTTTGTAGCAACTAAACAAGGTATAGATGCAAAATCTAAAGAATTAGGTGTAAGCGTGGAATATGCAGAT
GCTCAATGGGATGCTAGTAAACAATTATCACAAGCTGAAGATTTTATGGCTAAAGGGGTAGACATGATTG
CATTATGTGGAGTTGATTCTGCTGTAAGTGAGAGAATAGTTAAAGCTGCTAATGATTCAGACGTCCCTAT
AGTAGCATTTACAAATTCTATAGGAAGTAACCCAACTGGAGAATTTAAAGGTTTAGTTACATATATAGGA
CAAAATGAGGAGGAAACAGGAGCACTAACTGGAAAAATTGCTAAAAACTTATTAGGAGAAACTGGTGGGA
AAGCTGTATTAATAGAAGGAGTACCAGGAACTACTCCACAAGTATTAAGAAAAAAAGGTCTTGAAAAAGA
ATTAAAAGATAGTAATATAGAAATAGTTTATAATCAAACTTCAAATTGGGAGAAAGAGCAAGCTTTAAAA
GTAACAGAAGATTTAATTCAAAAGAAAACTGATTTTAATGTTATAATATGTCAAGATGATAATTCTGCTA
CAGGTGCAGGTCAAGCTTTAAAAGATGCTGGTCTTAAGGATAAAGTTAAAGTCATAGGTTTGGGTGGAAG
TAAAGATGGATTAAAAGCTATAACTGATGGGTTAATAGATGGTACAACTTATATGTCTGCTGTAGAAGAA
GGTGGATTAGTCATAGAAAAGGCATCTAAATTCCTTAAAGGTGAAAAAATAGAACCTGTTACACAAATTA
AACAAGTTGAAGTTAACAAAGATAATATTTCAGAGTTCAAGGGTGAATGGTAA
>ref|NC_013316.1|:1756314-1756946 hypothetical protein CDR20291_1488 [Clostridium difficile R20291]
ATGGCCAGGCGGTTATTTTTAGAAAGGATTGGACTTATATTTTTAGGTTCAGCAATATTAGCATTTGGAG
TTTATAATTTTTATTATTTAAACAACATAACAGAAGGTGGAGTGTTAGGTATTTTACTACTGTTAAAAAA
TTTATTCAATATACAACCAGCAATAGCAAATGTTGTAATAGATGGTTTACTACTTTTAGTAGGATATAAA
TTTTTCGGTAAAAAATTCCTTATATATTCAATAGTAGCTTCTATAACTTTTTCAGTGTTATATGACTTAT
TTGAAGCTATAGGACCTCTAGTACCACAATCACAAAATATGCTTTTATCAACTATTTTGGCAGGTGTAAC
TGTTGGAACTGGTGTAGGTATAGTAGTAAAAGCAGGTTGTGCATCAGGAGGAGACGATGCTTTAGCATTA
GTAATTTCTAAGACTACATCTTTGAACATAGGGCAAGTTTATTTAGCAACAGATGTTATTGTATTGTTGT
TATCATTATTTTATCTATCAGCGTTTGATATCTTTTATTCTTTGATTGCTGTTACAATTAGTGGCAAGGT
AATTGATTTTATTTATTATCATGGTAAAAGTTTGGATATGGATATAAGTAATGATATAGTTCCAGAATGT
TAA
>ref|NC_013316.1|:1757496-1759172 potassium-transporting ATPase A chain [Clostridium difficile R20291]
ATGGTGCAGATAGTAATAGTGTTAGCGATTTTTATGATTTTAGTAATACCTATGGGCAAGTATTTATATC
ATATAGCTACTAATCAAAAAACATTTGGAGATAGACTATTTGATAAAGTGGACAATTTTATATATAAGGT
ATGTAGTATAGATAAGAAAAAAGAAATGAACTGGAAACAGTATGCATTAGCTTTATTATTTACAAATGCA
GTTATGGTATTTATAGGATATATCATACTTAGAACTCAAAGTATGCATATTTTTAATCCAAGTGGAATTA
AAAGTATGGAACAAGGACTATCATTTAATACAATAATAAGTTTTATGACAAATACAAATCTTCAACATTA
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GCAACAGGATATGCGGCTGCTATGGCATTTGTAAGAGGTCTAGTCGGTAAAAAGAAAACATTGGGAAATT
TTTATGTAGATTTAATTAGGATAACAACAAGAGTACTTTTACCAGGAGCTTTAATTATTGGGCTTATATT
AGTTACACAAGGAGTACCACAAACTTTTGCTGGGACAGAAACAGTGACTACTATAGAAGGAAAGCTTCAA
GATATAGCTAGAGGTCCTGTGGCAGCTCTTGAATCAATAAAACATTTAGGAACAAATGGTGGTGGATTCT
TTGGTTCAAATTCATCACACCCATTTGAAAATCCAACAATAATATCAAATATAGTAGAAATATTATCTAT
GATGATATTACCAGGAGCTTGTGTTGTTGCATTCGGTCACATGATAAAGAATAAAAAACAAGGTTGGGTT
GTGTTTGGCGCAATGTCAATCATATTTTTAATAGGTCTAGTAGTGTGCTTTAAAGCAGAAAGTGCAGGAA
ACCCTATTTTATCACAATTAGGGCTTAATCAAAGTATGGGAAGTATGGAAGGTAAGGAAGTTAGATTTGG
TATAGCACAATCATCATTATTCACAACAGTGACTACTTCCTTTACGACAGGTACAGTTAATAATATGCAT
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AAGGCGTAGGTCTGATGAATATGTTGATGTACGCTATAATAGCAGTATTCTTATGTGGATTAATGGTAGG
AAGAACACCAGAGTTTTTAACTAAGAAAATCGAAGGAAAAGAAATGAAGCTTATTGCTTTACTTATTATA
TTACATCCACTTTTAATACTAATGTTCTCTGGTCTTTCAGTAGCAATACCAGCAGGGCTTGAAGGAATTT
CAAATCCTGGATTCCATGGATTATCACAGGTATTGTATGAGTTTGCATCTTCAGCAGCCAATAATGGTTC
AGGATTTGAAGGTCTAGGAGATAACACTATGTTTTGGAATATAACAACAGGTATAGTTATGTTCTTTGGA
AGATATGTGTCTATTATAGTACTACTAGCAATATCAAGTTTGTTAGCATCTAAAAAAGCTGTAAATGAAA
GTATAGGAACACTTAGAACGGATAATTTTACATTTACAATAGTTTTAGTACTTGTTGTTTTAATTGTTGG
TGCTTTAACATTTTTCCCAGCCTTAGCGCTTGGACCTATTTCGGAGCATCTAGTGTTGTGGCACTAA
>ref|NC_013316.1|:1759197-1761254 potassium-transporting ATPase B chain [Clostridium difficile R20291]
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AATTAAATCCTAAATATATGATGAAAAATCCAGTTATGTTTGTTGTAGAAATTGGATTTATAGTAACATT
GATACTTACAATAGTACCTAGTTTGTTTGGTGATGAAGGCAATAATTTAAGAGCTTATAATGGGATTGTA
ACAATAATCTTATTTATAACAGTCCTTTTTGCAAATTTTGCTGAAGCTGTAGCTGAGGGAAGAGGTAAAG
CTCAAGCAGATACACTTAAGAAAACTAGAAAAGATACAGTAGCAAGGGTTATAGATACGTTAGGAAATGA
AAAAATGATAAGTGCAAGTGAGCTAAAACTTGGTGATATTGTTTTAGTAAATGTTGGAGAAGTTATCCCA
AATGATGGAGAAGTTATAGAGGGCATAGCTTCTGTGGATGAGTCAGCAATAACTGGAGAATCTGCACCTG
TCATGAGAGAATCAGGTGGAGATTTCGCATCTGTTACAGGTGGTACTACAGTTGTAAGTGACTGGTTAAA
GATAAGAATAACAACAAAACCAGGAGAATCGTTCTTAGATAAAATGATAGCTCTTGTAGAAGGTGCTTCA
AGACAAAAAACGCCAAATGAGATTGCTTTAAATACTTTGTTAGTAGGGTTAACACTTATATTTATGGTTG
TTTTAATATCTCTTTATCCAATGGCAAACTATGCAGGTGTAAAGATTCCAATTTCTACTATGATAGCTCT
TTTGGTATGTTTAATACCAACTACTATAGGTGGATTGTTGTCAGCTATTGGTATTGCAGGTATGGATAGA
GTAACTAGATTTAATGTAATTGCAATGTCAGGAAAAGCAGTAGAAGCTTGTGGAGACGTTGATACTATGA
TTTTGGATAAGACAGGTACGATTACTTATGGGAATAGACTTGCATCAGAATTTATAGCAGTTGGAAATGC
AGATTCAAAAGATTTAATAAATTATTCTGTTATGTGTTCATTAAAAGATGATACACCAGAAGGAAAATCT
ATAGTTGATTTAGGTATGAAATTAGGTTCAACAGGTAAGACAAAAGAGGCAGAGGAAGCTGAGTTTGTAG
AATTTTCTGCACAAACTAGAATGAGTGGTATTAACTTAGCTGATGGTAGAGCTATAAGAAAAGGTGCTTA
TGATAGCATAATAAAAAGAGTAAAAGAATCTGGTGGTACAGTGCCAGAAGATTTAGAAGAAAATGTAAAT
CGAGTAGCTAAACTAGGAGGAACACCTTTAGTAGTGTGTGTAGATAATGAGATATATGGAATTATCTACT
TAAAAGATACAGTAAAATCAGGGCTTGTAGAAAGATTTGCTAGACTTCGAGAGATAGGAATAAAGACAAT
AATGTGTACAGGGGATAATCCCTTGACAGCAGCTACAATTGCAAGAGAAGCTGGAGTAGATGGATTTATT
GCAGAATGTAAACCAGAAGATAAAATAGATGCTATAAAAAAAGAACAATTAGAGGGTAAAATAGTTGCAA
TGACAGGTGATGGAACAAATGATGCTCCTGCACTTGCTCAGGCAGATGTAGGTCTTGCAATGAATAGTGG
TACAACATCTGCAAAAGAAGCAGCAAATATGGTGGATTTAGATTCAGACCCAACTAAGATATTGGAAGTT
GTTGAAATAGGAAAACAGCTTTTAATAACTCGTGGGGCTTTGACAACATTTAGTATAGCAAATGATGTTG
CAAAATATTTTGCGATTATACCGGCTATATTTACTCTTGCAATACCTCAAATGGAGATATTAAATGTAAT
GAAACTTTCTACATCATTTAGTGCGATATTATCAGCTTTAATATTTAATGCTATAATTATCCCATGTTTA
ATACCTCTTGCAATGAAGGGAGTAAAATATAGACCTATGAAATCACAAGCTATGTTAATGAGAAATATGC
TTATATTTGGTCTTGGTGGAGTTATAGTACCATTTTTAGGAATAAAATTAATTGATTTATTGATTACACC
TTTAGTAATGATTCTTAATTTAGGTTAA
>ref|NC_013316.1|:1761258-1761899 potassium-transporting ATPase C chain [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGATATAAAAATGAAAACATTAAAGCCAGCATTACTTGTAAGTATTGTATTGTTAGTTGTTTGTG
GACTTGTATATCCACTTGTTTTGACAGGTGTAAGCCAAGTTGCATTTAAAGATAAAGCCAATGGAAGTAT
GATAGAAGTAAATGGTGTAAAAGTAGGTTCAGAACTTATTGGTCAAAGCTTTACAGATGCGAGATTCTTT
AAGGGAAGAGTATCATCAGTAAACTATAATACTTATACAAAAGAAGATTTAGTACCAGATAAAGATGGAA
ATGCATCTTATGGAGGTGTATCATCAGGGTCTTTTAATTATGGAGCTACAAATCCAGAACTTCATGATAG
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CTATAGCAAAAGCGTCTGGAATATCAGAAAGTAAATTACAAAAAATTGTAGATGATAATACTTCCAAAAA
ACTTTTTGGAGTTTTAGGTGAAGATAGAGTTAATGTACTAAAGGTTAATATAGAGGTCGCAAAAATATTA
GGTCTTATATAG
>ref|NC_013316.1|:1762136-1763044 putative O-acetylserine sulfhydrylase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTATATAATAACGCATTAGAGTTGATAGGAAACACACCTGTAGTAAGGCTGAATAATTTAGGCTGTA
CTAATGGGTGTTCTAACATATATGTAAAATTAGAAAAAGTAAATCCAGCAGGAAGTATAAAAGATAGAGC
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ACTAGTGGAAATACTGGTATTGCATTATCTATGATAGGAAAATTAAAAGGATATGAAGTAGTAATCGTAA
TGCCCGAAACAATGAGCGTTGAGAGAAGAGATTTAATGAAGGCTTATGGAGCAAATTTGGTGCTTACAGA
TGGTAAAGCTGGAATGGCAGGTTCCATAGAAAAAGCAAATGAACTTTTAAAAGAAAATCCAAACTATAAA
AGCTTAAAACAATTTGAAAATAAAGATAATCCAAATGCACATTATAAAACAACAGCAGTTGAAATTATGA
ATGATGTCAAAGATTTAGATATATTCGTATGTGGAGTTGGAACAGGTGGTACTTTAATAGGAACTGCAAG
ATATTTAAAAGAACAAAATCCAAACATAAGAGTAATTGCACTTGAACCAAAAAAATCTCCAGCTATATCA
GAAAACAAGACTGGACCTCATAAAATACAAGGAATAGGTGCTAACTTTGTTCCTGAAAATTATGATTCTA
GTGTAGTTGATGAAGTAATATTAGTAGATGATGAAGATGCATTTGATACAGTTAAATTACTTGCAGCAAA
AGAGGGAATTTTAGTAGGGATATCTTCTGGAGCAAATATATTTGGTGCTATAGAGATGGCAAAAAAGTAT
CCAGATAAAAAGATAGTTACAGTAGCTCCAGATGGAGTTGATAAGTATATGTCTATGGGAATATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1763062-1763661 serine acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
GTGAATACTTTGTTTAAGAAAATAAATAAAGATATTGAATATATAATGAAGAATGATCCAGCAGCTAGGT
CTAAGATAGAAGTTTTTTTACTTTATCCATCAGTTCATGCAATGATAATGCATAGGATGGCTCATGCTCT
TTATAAGAAGAAGAAGCTTTTTACAGCAAGATTAATATCCCAGATATCCAGATTTATGACTGGCATAGAA
ATTCATCCTGGTGCTAAAATGGGGGAAGGTATATTGATAGACCATGGAATGGGTGTTGTAATTGGAGAGA
CAGCTGAAGTAGGTAATAGGGTGACAATATATCAAGGAGCTACTTTAGGAGCTACAGGAAAAGATACTGG
AAAGAGACATCCAACTGTTGGTGATGATGTATTAATTGGTGCTGGAACAAAAATACTAGGACCTTTAAAT
ATAGGTTCAAATTCAAAAATTGGTGCAAATTCTGTTGTCGTTAAGGATGTACCTAATGGTGCAACAGTTG
TTGGTATACCAGCAAAAATAGTAAAAATAAGAAACCTAGAACCTGTAAAAAAGAATAAAAAAGAAGTGTC
CTATGAGTATGATGAATTAGATAATGTATATTATATATAG
>ref|NC_013316.1|:c1764932-1764063 methionine aminopeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGTTAAATAGAAATGATAGCTGTTGGTGTGGAAGTACTAAAAAATATAAAAAATGTCATATGGATA
TGGATAATAAAATAGATTCATTTGCTAAGTTAGGTCATATTGTACCAACTCATGATATTATAAAAAATGA
AAGTCAAATTGAGGAAATAAAAAAAAGTGCTGTAATAAACACAAAAATTTTGGATTATATTTCAGATAAA
ATCGAAATTGGAATGTCTACAGAAGATATGAATAAGTTGGTTCATGACTTTACACTACAAAATGGAGCTA
TCCCTGCTCCACTAGACTATAATGGATTTCCTAAAAGTGTATGTACATCAGTAAATAATGAAGTTTGTCA
TGGTATTCCAAGCAAGGACATTATCTTAAAAGATGGAGATATTATAAATGTAGATGTTTCTACTATTTTT
AATGGATACTATTCAGATGCTTCAAGAATGTTTATGATAGGTAATGTTAATGAAAATGCAAAAAAATTAG
TTCAAGTTACAAAGGAATGTGTCCAAAAAGGTCTTGAAGTTGCCAAACCATGGGGATTTTTAGGAGATAT
AGGTGATGCTATCAACTCTTATGCAAAGAAAAATGGATACTCTGTTGTTAGAGAAATAGGTGGTCATGGA
GTTGGATTAAGCTTTCATGAAGACCCTTTTGTAAGTTATGTATCTAAAAAAGGGACTGAGATGCTATTGG
TTCCTGGGATGATATTCACAATAGAACCTATGGTAAATGAAGGAACTCACGAAATTTTTGTTGATGAAGA
AAATAATTGGACTATTTATACAAAAGATGGTAAATTATCTGCTCAATGGGAATGTATGGTTTTAGTTACA
GAAACAGGGGTTGAAATACTAACTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c1766379-1765129 hypothetical protein CDR20291_1495 [Clostridium difficile R20291]
ATGATTATGGAAAACAATTTAAATATAGCTAAAAAAAATAATACTGAATTATTACAAAATGACTCACTTA
AGGTCAACTTACAGATAGGTGTAGACTTTACACTTTTATCAAAATCACTTAAAGCCTTTTATAAAAAAGA
AAAAGATTTTTATTGCATTGCTCTTGCGCCATGCAATGTATCTAGTGAAAAAGCAAATAGAAAAATAAGT
ATTTACGATATGATAAAAGAAATTAATATTTTAATTGAAAGTATAACTGATAAAAATGAACTTTTAAGTG
AAGAACTCTTTACTAATAATTTATCAGAATTTTATGATGAATCTTTAGATGAGATTTATATAGACTTAAA
ACAAGCATATTTATATATTAAAAAGAATACAGATAGTCTTAACATAGAAGACTCAATTGAATATGTATTT
GATGTAGATATAAGCAATGATATAAAAGCAAAGGAAAATCCACTAATTAATTTTAATTCACTTTCTTTAG
TAGTATGGAGTGGCGAAACAAAACATATTTTACAACAAATGAATATTTTAGACTTAGAGGATATTCACTC
TTATTATATGGAAAATAATACAAATATAACTATCTATGAAAATAATACTCTTCAATATAAATTTGATGAA
GAATCTGAAGATATAAAAGACAGTAGCATAGATATAATTGAACAAATGCTTATACTTCCTGATGACTTGA
ATTATGATAAAGATGAAGTTGAAAATATGAAAAGCAGACTTGCAAAAATAAATATTAAATATTTACAGAC
ACTTAAAGAAAAGGATATAAAAATAAAATTAATAAATTCAAATCTAACTGATGAACCAGAATTTAGTGAT
TTAAAATATCAATTACCTCCATGTTGGGTAAGATCAGGCAAGACTTGGAAAGATGTACCTGGTATATATA
GAAATAATTCTATAGTAGCTAAAATAGGTTATAGTAACCCTAGCTATGCAAATGTACATTCATCAAAAAA
TTTAGAATTACATGAAACTGCACATGCTATAGATAAAAATGTTTTAAATAAAAAATCAAATTCTGAAGAA
TTTATGGAAGTATTTGCTCAGGAAAGATATAAGCTTTATGACCCTAAACAAGTTGCACATGCATATATAA
GCAAGTTTATAGAAGAATTTTTTGCAGAATCATTTGTGCATTATTATCTTGATGAAGATTCAAAAAATAC
TTTAAAGGAAAATTGTCCTCTAACATATGATTTTCTTGAAAAACTTGAACTAAACTATTAA
>ref|NC_013316.1|:1766664-1766975 putative endonuclease [Clostridium difficile R20291]
GTGTATTTTACATATATTATAAGATGTAAAGATGATTCTCTATACACTGGATATACCAGTAATATAGTTA
GAAGAATGAATGAACATAAGTTAGGAATTAATTCAAAATACACAAGAGCAAAGGGATTTGAAAAACTAGA
AGTTTATTTTGTGACCAACACAAAAAGCAATGCTATGAAGTTAGAATACTATATAAAAAAATTAACTAGA
AATAAAAAATTGTCTATAATAAAAAACCCAAGTATACTTATAAATTTAATTGATAATAAAGAAGATTATA
TTATTGGTAAGGAAATAGAACAATTAACATAA
>ref|NC_013316.1|:1767260-1768054 putative phosphomethylpyrimidine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAATTATAAAATACCAACACTTACAATAGCTGGCTCTGATTCATCTGGAGGAGCTGGGATTCAGG
CTGATTTGAAAACGTTTAGTGCAATTGGTACTTATGGTATGAGTGTAATAACAGCTATAACAGCACAGAA
TACTAAAGGAGTTTTTGCTGTAGAGGATTTAAATAAGAAAATAATAAAAAAACAAATAGAGGCAGTCTTT
GAAGATATACCTCCAAGAGCTGTAAAAATAGGAATGGTTTCAAGTCCTGAGATTATACTTGAAATAGTTG
AGAATCTAAAGAAATACAATCCAAAATATTTGGTTGTGGACCCAGTAATGATATCTAAAAGTGGATATTA
TCTATTAAAGCCAGAGGCAAAAGAAAACTTAATTAAGTATTTGATACCACTTGCATACATAATTACACCA
AATATACCAGAGGCAGAAGAAATAACAGGAATAAAAATACATAATGTAGATGATATGAAGAGAGTAGGAG
AAGAAATACTACAACTTGGACCTAAATTTGTACTTATGAAAGGAGGTCATTTAGATGGAGAAGCAGTGGA
TATTTTAGTTGGTAAAAATATATTTAAAGTTTATAAAAGTGAAAGAATTGATAAAAAAAATACACATGGA
ACAGGGTGCACATTATCTTCTGCAATAACATCTTATCTAGCATTAGGATATGAAATAACAGAAGCAGTAA
ATCTAAGTAAAATCTATATAACAGAAGCAATAAAAAGAAGTTTTGATATAGGTCATGGAGTAGGACCAGT
ACATCATTTTTATAAATTTGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1768078-1768866 hydroxyethylthiazole kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAATTTAATTAAAGATGTAAAAAAATTAAATCCATTGGTAATTCATTATACTAATAATGTAACTA
TAAATGATTGTGCTAATGTGACTTTAGCTGTAGGAGCAAGTCCTCTTATGAGTTTTTCATATGAGGAAGT
AGAAGAAATGGTAAGTGTAGCAAATTCTGTAGTAATAAATATAGGAACTATGAACTCAAATATGTTGGAT
TTATTTCTATTAGCTGGAAAAGCAGCAAATAAGTACAATAAACCTGTTGTTTTGGACCCAGTTGGAGTAT
TTGCAAGCAAAGCGAGAGCAGAACTTACAAGTAGACTTTTAAATGAAGTCAAATTTAGTGTTGTTAAAGG
GAATGTATCAGAAATAAAGTTTATAGGTGGCTTTAATGTAAGGGGTAAAGGTGTAGATTCATTTGATGAA
GAAGAAGATTCTACTGAGATAATAAGAAAGATTGCTGAAAAGCTTGAATGTGTAGTTGTAGCAACTGGAA
AAATAGATATAATAACTAATGGTAAAGGTATATATAAAATAAACAATGGAACTGATAAATTAAAAGGAAT
TACAGGAACTGGATGTATGACTGCTAGTTTGATTGCAAGTTTTATGGCTGTTACTGAGAATATATTAGAA
GCAGCAACAATGGGTGTTCTTACAATGTCTTTAAGTGGGGAATTAGCTAATTTAAATAATCCACCAATAG
GTACATTTAAAGAAAATCTTATGAATGCTATTTATCAAATGGATATAGATACTTTAAGTAAAAATTCTAA
TATTGAATTTTTAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1768889-1769521 thiamine-phosphate pyrophosphorylase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTGATAAAGAATCTTTAAAAAAATGCTTAAAGTTGTATTTGGTAACTGACTCTGAAATGCTTAAAG
GTAGAGACTTTTATAAATGTCTTGAAGATGCAATATCTTCTGGAATAACAACTGTACAACTTAGAGAAAA
AAATGCTTCTGGAAGAGAGTTTTTAAGAAAAGCTATGAAACTTAGAGAAATAACTGAAAGATATGGTGTT
AAGTTTATAATAAATGATAGAGTGGATATAGCACTTATTTGTGATGCAGATGGAGTACATGTAGGACAGA
GTGACATTGATGTGAGAGAGGTTAGAAAGCTTATAGGAAACAATAAAATTCTAGGAGTATCAGCAAGAAC
TTTAGAAGAAGCTACTTGTGCAAAAAATGATGGCGCAGACTATTTAGGTGTAGGGTCTATATTCACAACA
TCTACTAAATTAGATGCAAAATCAGCTTCGTTTGAAACTGTTAAAGAAATTAAAGAAAAAGTAGACATGC
CATTTGTGCTAATTGGAGGTATAAATTTAGACAATATAGATAAACTTAAATGTTTAGAAAGTGACGGGTA
TGCTATAATATCAGCTATATTAAAAGCTGAAGATATCTCTAAAGAAGTGGAAAAGTGGACATTAAAAATA
TAA
>ref|NC_013316.1|:1769660-1769962 PTS system, IIb component [Clostridium difficile R20291]
ATGATTAAGATATTGTTAGTGTGTGTTGGAGGCATGTCTTCTACCCTATTGGTAAATAAAATGGAGAAGG
ATGCAAAAAAAAGAAATATAGACTGTAAAATATGGGCAGTTGGAGAAGGAGATATAAAATCGGAGCTTGA
TAACTTTGATATTTTACTTCTTGGACCACAACTTAGATTTATGCTTGATGACGTAAAGTCTATAGTTGGA
GATAGAGTTCCAGTATCTATAATAGATATGGTAAACTATGGTACTTGTAATGGTCATGCTGTGTTAAATT
CGGTTTTAGAAATATTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c1770783-1770028 ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAATGTTAAATATCTTATGGCGTAGTATGAAGTGGCGTTTTAAAAATCCAATCTCATTTGTAGTTA
CTATATTACAACCTTTTCTTTGGCTTGTGCTTTATAGTTCTATTGCAAACCAAACTATGAATAATATAAA
TATCAATAATTATACTGCTTTTATACTACCAGGTATCATTGTACTGGTTGTGTTTTCTTCTTGTAGTAGT
GGTGGTATTATAAACTTTATAATGAAGAACAGTGGAAGTTTCTATAGAGTCTTAATTGCACCTATCAGTA
GGTATTCAATCGTCCTTGGTCAATTATTAGAAGCTATCTTAGTTTCCTTCATAGAAGTAACTATTTTGTG
TATAGTAAGTATATTCTTCTCAGTAAGGATAGAATCTGGCATTGGTGGAATCCTACTTATGATAGTACTG
ATATTTATGACAGCCTTCTTTTTATCAAGTCTAGCTTATTCTATAAGTTTATTATTGCCAAATGAAATAG
TTTATGAAACAATTATGACTGCAATTGTACTTCCTATTTTCTTTTTAAGTTCAGCTCTTTTCCCTATAGA
AAGTTTATCTGGAGGATTAAAAGTAGCAGTGATGCTCAATCCATTTACCCATGTTATTAACGCTTTACGT
AGCTTAATATTTGGTGAGACTATTCTTATTGGAGATATACTGCCTGTTATCCTACTATTTTTAATATTGT
GCTGTTCAAGTTTTTCACTTGCTATGTGGAGATTAAAAAAAGAAATGGTAAGCTAA
>ref|NC_013316.1|:c1771733-1770771 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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GCTTTAATGTAAATGCTGGAGAAATTTTTTCTTTACTTGGTCCTAATGGTGCTGGTAAATCTTCTCTTAT
AAATATTTTGACTACCTTTTACAAACCTACATCTGGAAATGTAAAAATGTTTGGAAAAGATTTAGTAGAT
AATCCTTCTTGGATACGTACTCAAATTGCTTGTGTAGCACAGCAAATCTCTATTGATGAACATTTATCCC
TTATGGAAAATATGGTATTTCAAAGTAAAATGTATAAAGTAGAACCACAGATTGCAAAACAAAGAATAGA
CTCTTTAATTGATAAGTTTGACTTATCTAGTTACTTAAAATATCCTACTTCATCATATTCAGGGGGTGTA
AAACGTAGATTGGACATAGCTATGAATATGGTATCATCTCCTAAAATCCTATTTTTAGATGAACCAACTG
TTGGTATGGATGTCGATTCAAGAAAATCTATGTGGGATATGTTATTAAAAATTAGAGATGAGTACGGCAC
AACTATATTTCTAACTACTCATTATCTTGAAGAAGCTGAACAATTGAGTGATAATATTTGTATTATGAAG
AATGGAAAGGATTTAGCACAAGGAACACCATCAAGTTTACGTAGTTACATTAGACAAAATATACTACGTA
TAACTTTCCATAATACTGAAGATATAAAAAAATATAAAGATTCAATTAAAAGTACTGGTTTAGTAAAGTT
TATGAGCGTACGAGAAAATTCAATTTTTATAAGTGTAAACGATAGTAGAACTGCTTTTACTTTAATAAAT
AAATGGCTTTTAGAACATGATATAGAATTTGATGCAATAGAAATTGTAGAGCCAAGTCTCGAAGATGTAT
TTTTAGCACTTACAAGTTCTAAAAAAAGCTTAAAGGAGGAATGGGAATGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1772144-1771737 hypothetical protein CDR20291_1503 [Clostridium difficile R20291]
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AGTCTAACGGTGCACCATTCTTTTGCTACTATGATGTTGACCAAAAAACTGGTGTTGCAGAAATGGAATT
ATGTGTTCCAACTGCTGAAACTCCAAATCGTATGGGTATAACTACAAAAGAATTTCCTAAAACAAAAGCT
TTATTTTTTACTCACACAGGCTCTTATAGTAATTTGCCAAAAACGTATGAAATGATATTTAAATATATTC
ATGAAAATAATATAAAAATACAAACTCCTTGGAGAGAAGTATTTATTAAAGGACCAGGTATGTTGATAAA
AGGAAACCCAGATAACTATATTACAGAGATAATATTTCCACTTAAAGAGGAGGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1772551-1772907 GntR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTTGAATTAGATAATACAACTCCCATTTATTTGCAAATAGTAAAGTATATAAAGAGACAAATAG
TAACAGGAGAGTTGAAACCAGGAGAGACAATACCATCAAGAAGAGAAATGGCACTTAATCTAAAAGTAAA
CTTAAATACAGTTCAAAGAGCATATAAGGAGATGGGTGATATGAATATAATAAATACTTTTAAAAATTAT
CAAAGCAGTGTAACAGTTGATGAAAATATATTAAAAAATTTAAAATTAGAGCTTATAAATGAATCACTAT
CTGTTTTTATAGAAGATATGAAAGCAATAAATGTTAGCAAAGAAGAAGTTTTAAAAATAATAGAAGATAA
GTATTAG
>ref|NC_013316.1|:1772961-1773695 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTGGAGGATAGTAAATATGATAGAAATAAAGAATGTCAGCAAAACATATAAAAGGATGCAAGGGCTTA
AAATAAGAAAGATAGAAGCTTTAAAAAATGTAAGTTTTAATATAGAAAAGGGAAAAATAACTGCATTACT
TGGTATAAATGGTGTTGGTAAATCAACTATGTTAAAAGCAATAGCAGGACTTATAAACATTGATAGTGGA
GAAATTCGTATAGATGGAGAAAAAATAAATGAAAAGGTATACAATAAATTGGCTTTTGTTCCAGATGTAC
AATCTCACTTTAGCAATACAACAATAAAAGAAACATTTGAATTTATGGAAATTTTTTATTCAAAGTGGAA
TAAAGAAAAATCAAAAGAAATGATGGACATATTTAAATTGGATGAAGATGAAATAATTGATAACTTGTCA
AAAGGAAACATTGCAAGAGTAAAATTAATACTTGGATTTTGCCAAGACCCAGAGTACATACTTCTTGATG
AACCATTTACAGGAATTGATTTGTTTAAGAGGGAAGAGTTTATAGGAGTAATAGCGCAATATATGGAGGA
AAATCAAGCCATTATCATAACTACTCATGAGATAGTAGAGATAGAAAGTTTAGTTGATGAGGTTGTAATT
CTTGATGAAGGGCAGATTATAACTTCATTTAATGCAGAAGAATTAAGAGAAAGAGAAGGTAAATCTATAT
TAGATAAGATGAGGGAGGTATATAAGAATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1773688-1774512 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAACTTCTATATCTAATAAATGTAGATTTGAGAAGAAGCAATAAGTTTTATATAGCTTATATAT
CATTTTTTTCATTAATTACACTTAGTTTAAATTTATTCGAAATTAATAAATTTAAAAATTCTAAATTTAT
TATGAACTTAGCAATAGAAGATTTTGGAGGTATATTTTATGGACTAGGGATACTTAGTAATCTTGGTTTT
ATCCAAAATATATTGTTCTTTGGAATGTTGGGACTTTTTATATACTATATTTTTATGTGGAAAAGAGAGT
TCTTTTCAAATAATCAAAGTATTTATACACTTATGATGTTACCTCAAAATAAGTTTAAGATTTGTATATC
TAAATCAATAGTTTTGATAACAATGATATATGGTTTTTTGATAAGTCAGACAGCAACATTATTTATATGT
AAATATATATTTAATTTCATTTTTAGAAATATTCCTATAATCAATATGAACTTTGCCAAAGATTTATATT
ATTTAAACTTGAAGAGTATACCAATTGATTTTATCTCTTTTATGGCTATTTATGTATTTTTACTACTTAT
AGCTATTTCTATTGTAAATTGCTGTATATTATTTATCTTTTCCTATATAAATAAATTTTATGTAATTTTA
ATCACTTTGCTGATTATAGCAGGCTTATATTTTTCAACAATATATATAAATATAATCAATTTATTTAGAA
AATATTATAATCTTATAGGATTTCAATTTAACAATTTAGTAGCAGGGTTATTAAGTTTTTTAATTATAAT
GTTTATTCTAAATGGAATATCTTATTTGCTAATTAAAAAGAAAGTATCTCTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1774524-1775723 hypothetical protein CDR20291_1507 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTAAAATCTAAAATATCTATACTTATTATATTTTTGACTTTAGCAATATATTTTAGTATAGGTT
TATTAAATAATGAAGATAATTTAAAGATAAAAACTATAAAAGGTGACTCTAATGAATTAGACCATATAAA
CATAAATTTTGGATATGCTTTGAATGGATATATAAATTCATATTATACAATAAATGGAAGTAACAAAACT
AAAAAGACTGAATTAATAAAACTACAAAAGGATAGTAAGAACACAAATAATTTAATTGATGTATCTAGTG
GTTCAGATTTAATTGCTCATGTTGGATTTGAAATGAATGAGGAGTCAAAAGATATAAACTTTGTGATAGA
TGAGAAAAAAGAAGATTTAGAAAAAGGTGTATTTCCATCAGAAGGTAGTGATAAAGAAATTGAATATGAA
AAATTAGATATGAATAATTTTACAAGGACAAGATATAAAGTAGATAAAAGTACAGATGATTATTATGCAA
ATATACTAGCATCAAAAAGATATAAAAAATACTTATATGTATCTGTACTTTATGCTACAAGTGATTCATC
AGAAAATAACAAAGAATATTCAAGTACTATAGATATAATAAAAATTAATCCAGAAAATAAAAAAATCAAG
ACTATAAAAAGTATAAATTTAAGTAATTATTTTTCCGAGAAATACCAAGACATAGAGAACATAGGTGTAA
GTTATGCTAGCAAATATGAGGATAAGATGTATATTTTAGTAAATGTACTAAATACAAACATAGGTGATAA
TAGTAATTCTAAATTTCATTTACTTGAGTATAATCTTGAAGAAAATAAGGAAAGCATAATGGAATTAAAA
ACTGATAGCAAAATGGCTTTAGCAAAAGCAAAGTTAGAAGCTAATAAATTATATATGGTAATGTCGAATG
ATTATGATAATAGTTCAATTACAGAGTTAAATTTACTTACCTATAATATATTAGATAAAAGCTTAGATGA
AGATAAATATGTTTTAGATAATAGAGAAAAAAGAGGAATTAGAAGTATTGAAATTGATTCAAATAAAATC
GTTGCATATACATCAAGGCTAAACTCTATATTATCTTGGGATAATAAATTTATGCTATATATAATAAATA
AAAATTCTAAGGAAATTGTATATGAAGGAGAATTACAATTTAACAGTTCAAATAGTATGTTAGAATTTGA
AATAAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:1775732-1776544 hypothetical protein CDR20291_1508 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGATTTAATAAGATTATTCGAATTTGAATTAAAAAGAAATATAAAGAATTATATATTTATAATAA
TTTGTTGTTGTTCTTTTGTAATTTTAAACATAGTAAAAAATTTAAATGACTATAATTACATAATAGAAAA
TGCAGTTAAAAGTGAACAGTTAACAAAAATCGGAAATACGATAGAAACGGTAAATGTTACAGGTTTCTCA
AGCTTTAGAAATATAATGGGTTCTACAGAATCGTGGTTTATATTTGGTATAATTGCATGTATTTGCTATG
CTTTTTTTATTTGGTATAGAGACTTTAATGGTAGGAGTAAATCTATATATACACTTATAATGCTACCTAA
AAATAGAATCAATATTTATATATCTAAATTATTAAATATATTATTTCTAGTGTATAGCTATACAGTAGTA
CTTACAATATCTTTGTTTATTGCAAGTAAGTTGTTGCCTAGACATATGCTTGGTAATGTCACAAACTATG
GTTTTGTACAAGAAACAATATATGAGTTAAAAATGTTACTTCCATATAGCTTTGAAATACTATTTGTAGA
GTATATATTTTTATTGATAGGATTTGTATCTGTAGTATTTACATCAATTCTTATAAATAAATCTATTTAT
AAAGTAAGCACTTTAATAAGTTTTCTATTTTTAGTTTTGGAAATTTTAGTGTTTATAATTTCTATAGAAT
TTATTATACCTTATGAATACAGTGATGTATTTACTGTTCTATATTCAAGTATAAACATATTTGTATGTAG
TCTTATATCTAATAAACTTTTGAAGCAAAAGATTGACTTTTAG
>ref|NC_013316.1|:1776555-1777823 hypothetical protein CDR20291_1509 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGCAAAAAATATAGGAAAATATACAATATGTTTTATAATAGTATGTTTTTTAATGATTACTATGA
CCTTAATATTGAGTTATTTTAATAAGGATAAACTATCTGTAAAAACTTTAAAAGGCAATGTAAAAGATAT
AGGGAGAGTAAGTGTAGTATATACACCTAATATAAGCAAATTTTCTTATGAGGAGGTAATTATAAGTAAA
AATGGAGTAAGAAATAATAAAAACCCCAAATCAAGAATTAGAAATGATTATTTAAATATTGACAAAAAAT
ACAGTGATTTTGTTAATGATAAAGGAAAAGAACTTATATATAAAGATGATTTGAATATAGGAGAAGCGTA
TACCTCTGTTAAGTCTGATTTAGTACAAGGAATGAATGCTTTAAATGATTGTATAAAGGTTTCAAATAAA
AATTTAAAAAGTGGGGTAGAAGAAAATTTTGATATTAATTTAAATAAGTCTGATTTTAAAGAAAACAGTT
GGAAAACCTTGTTTAATAAAATATATAAAGGCAATTTATATATGGTAATTAGTGAAACTAATATTTCAGG
TTCTAAGGTCAATAATATTTGTATATTAAAGATAGATATAAAAAATAAGTCTTATAAATTATTAAATAGA
TTTAATTTAGGATTACAGAATGGATATCAACAAAATATCAATGAAATTAAATTTTCTATTGGAAGTAAAT
TATACTTAGAAATAGTAAATAATAAAAGTAAAAATGGAGATATTGAAGGACATGATAGTTACTCTAACCT
TATTATATATGATATAGAAGATAACACTTTTAATATAAGTAATAAATTTATGGATAATCTAAACAAAGAA
AAGAATGCAAATCCAAAGGAGATTGGCTTATTAAGTAAAACTAAGCTAGATTATATGATAAAAAATAATA
AATTGAATCTTATAGTTACGGATATGAGTAATTCCATAATCAATCTTGTTTATGATATTAATTCTAATGA
GATTAAATTAGAAGATTATGAGATACTTGATTTAAAAGTAGATTATAATGAAGCATCATCTGGAGTTAGG
AAAGTTAAGTTACTGGATGATAAGATTTATTCTATTTCAGGTATGAAGAACAGTATATCAGGAGAATTAA
AAGGATTTAAAGGGATTGTTGATGTAGTCGGAACTAAGCCAGTAAAATTTCAAGTATTTGATATGAAACT
TAAAAAGAATATTTATGAAGCTGAGCTAATAAATGGAGATATAAGTTTACAAGAAAAGTTATTTTTTGTT
GCAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1778189-1779370 putative amidohydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAACAAAAAATATATTAAAGCAGGGAATTTAATTGATGGAACAGGAAATAGTATTATGCAAAATAAGG
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GTTGGAAATCCAAAGATATATTATGATAATGTATCAGATGTAGAGCTTGTAGTAAATACGATAAAACAAG
TTGATGCTTATTTGGATTCAGGAGTAACATATATTAGAAGCTTAGGTTGTCCCAAATATGTGGATGTACA
ACTTAAAAATCTTATAGACAAAGGGTCTATAGATGGTCCTGGTATAGTTACTTCAGGTCCAGTTATATGT
ATGACAGGAGGGCATGGATATTATTTTGGTATTGAAAGTGATGGAGTGGATGAATGTAGAAAATCAGCCA
GAACAGTTTTAAAAAATGGAGTAGATTGTGTAAAGATAATGGCAACTGGAGGTGTAACAACTGATGGAGT
TGAGCCAGGGTCACCACAATTAACTTTGGAGGAAATGAAGGCTGCTGTAGATGAAGCTATAAAAGCAGGT
AAAATAACTGCCACACATGCACAAGGAAGAACTGGTATAAAAAATGCAGTTCTTGCAGGAATTACTTCTA
TAGAACATGGTGTTTATTTAGATGATGAAATAATTGATTTGATGCTTGAAAGAGGAACTTACTTAGTTCC
AACTGTGGCTGCACCATATTTTATTCTAAATGCAGGAAAAGAAAGTGGAATAACTGAAGCTACTCTTAGA
AAGTGTGAGATTGTTGCCATTCCACATAAAGAATCATTCCTAAAAGCATATAAAAAAGGAATTAAAATTG
CAGTTGGTTCTGATGCAGGAACTTCTTATAATGAACATGGAAAAACATATTATGAAATGAAGCTAATGTC
AGATTATGGTATGGATAATATGGATATAATAGTTGCTGCTACAAAAACAGCATCTGAACTTTTAAGAATT
GATAAAAATTATGGAACTCTAGAAAAAGGAAAGAAAGCAGATGTTATAGTTGTAAATGGAAATCCAGTAG
AGAATATAGACGTACTTGCAGATGTGTTAGCAGTATTTAAACTTGGTAAAAAAGTTAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c1780438-1779512 hypothetical protein CDR20291_1511 [Clostridium difficile R20291]
GTGTATTTAGTGGAAAATAATAAATGTAGAGAGGACTTTAGATTTACACAAGAATATGAGGAAGATTATC
CAAATACAAATGAAAGATACTATGAAAATTATCAAGTAGCTGATAGATACTATAATTATCCAAATAAATA
TAAAGAACCTAAAATAAAACAATGTTGTTGTAAAAAAAGTATGAGAGAGGCCTTAGAACTTCTAAGATAT
GATGCTCTAAGACCTTTTGTAAACTTTAATCAATTTGCTTTTATCTCAGATTTCTTTATAGTAGGTGCTA
ATTTGGTAGGTATAGATCTTTCAGCTCCTCCAAAAGATAATTTATCTGGACTTGATGGTACTTTTGAAAG
ATTTTCTGCTTGTAACTGTGATTTAATAGATATAGCTGGTAGAGTATCTTATCCTATTCCAGTCCCTTTA
ACTCTTGAGGGATTAATTAATACTATAGGAACTATACCAGGAGTAGCTGAATTAATTGCACTTATTGATG
CAGTTATTCCTCCTACGATAGACCTTGGGGCTATATTAGATGCAATACTTGCTGCTATAATTGATTTTAT
ACTTGCTGCATCTACTCCATTAGCAAACGTAGATTTAGCATCATTGTGTAATCTTAAAGCTGTTGCATTT
GATATTACACCTGCAGATTATGAAGATTTCATAGCATCTTTAGGTTACTATCTTGATAAAAAACATTACA
AAGAATGTAATTGTAACTGCGATTGTGATGATTGCTGTTGTAATAAAGGTATCCTAGATAATCTTTATAT
GTCAAATATAAATAATCAAGTTACTGTAGTAGCTGGTAGTTTGGTTCTAACTGGTGTTGAAGTTCTAGGT
AAGAAAAATGATGTTATAGTACTTGGAAATTCTAATGATTCAAGAATATACTTTGTATGTGTAGATTCTA
TAGATTATATTGCATAA
>ref|NC_013316.1|:1780682-1781476 putative sodium extrusion ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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TAAGAAAGCTAAAGAAAGTAAAAACTAAAAAAGAAGAATTTTTTGCTGTAAATAATGTTTCATTTAAAGT
TATGGAAGGTGAAATTGTTGGAATATTAGGTCCAAATGGTGCAGGAAAGACTACATTACTTAGAATGTTA
GGTGGCATATTAACACCAACATCAGGAAGTATAAATATTTCTGGATATGATTATTCAATAGATAGAAATT
CAGCAAAAAAAGAAATAGGTTATCTCTCTGGAAATACAAAACTATATGGAAGGCTTTCTCCGAGAGAACT
TCTAACAACTTTTGCAAGTCTATATGAGATGTCAAAAGAAGATATAGAAGAATCAATTGAAAATATTGTA
AAAATAATGGATATGAGTGAATTTATAGATAATAGAATTGAAAATCTATCAACTGGTCAGACTCAAAGAA
CATCTATAGCCCGTTGTTTAATACATTCTCCAAAAGTATATATTTTTGATGAGCCAACACTAGGTCTGGA
TGTTTTAAGTAGTGCATCTATTATAGATTTTATGAAGAATGAAAAACTAAGAGGAAAAACTGTTCTTTAC
TCAACTCATTATATGGAAGAAGCAGAAACTTTATGTGACAAGATTTTTATGATTCACAATGGGAAAATAA
TTGCATCAGGAACACCACAGAGTTTAAAAGAGGAATCTGGAGTAAATAATTTGAGAGATGTATTCATAAA
ACTTGCCAGAAAGGAGGACATTTAA
>ref|NC_013316.1|:1781477-1783537 putative sodium extrusion ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAGTAAGATTGTAAAATACATATTTAAAAAAGAAATGTTAGACATATTGAGAGATAAAAAGACTT
TATTTATGATGATTGTTGTGCCACTTCTTTTATATCCTTTACTTATGTTATTAATGATTCAAGTAATGAA
TATGTCTGCAAGTAGTATGAATAGTAAGGACATTAATATAGCTTTTAATAATAAACCTAATAAGGTGTTA
GTATCCATGATTGAAGATGATAATTTAGAAAAAGATACTAAAAATACTTCAAATGATAAAGGCAAAATAA
GAGTGTTAGATGTAGATAACTATAAAAAGTCATTAGAAGAAAATAAAATTGATGCTTATATAAAGATGGA
AGAAAAAAAATCATCTATAAATTATCAAATATATATAAATTCTTCTCAAGAAAATTCTTCTAATGCACTA
AAAAGAATTGAAACTGTTTTGGATAAATATAAAAGATTTACCATAGAAAAAACTTTATCTGAAAAAGGAT
TAGATGTACAAGCTACTTTAGAACCAATAACATATAGCACTGTAGATGTTGCAAAGACGGAAGAAGTGGC
AGGATACTTTTTAGGTCAGATACTTCCATTTATATTAATAATAGGAGTTTTACTAGGTTCAATATATCCA
GCAATAGATGTTATGGCTGGAGAAAAGGAAAGAGGTACATTAGAAACATTATTTACACTCCCAATATCAA
ACTTAGAACTGGTTATGGGAAAATATATGGCAGTTTCTCTTAGTGCAATAGTAACAGCAATTTTAAACAT
TTTATCTATGGGACTGACTATGGCATTTATTTTAGTTAGTGGAGGTATTAGTAGCCAATTTGGCTTTGGA
AACTTTAATTATGGAGACTTAGTCTTACCAATTATAACTACTTTAATTTGCATATGTCTTTTTTCAATGG
TAGTTTCAGCAATAAGTATGTGTGTATGTTCATTAGCAAAAAGTTTTAAAGATGCTCAAAACTACATAAC
ACCTCTTATGTTAATTATTATGATACCATCATATGTTTCTATGATACCAAATATAGTATTGGATAGAGTG
ACAGCTGTAATACCTGTAGTAAATATATCTTTACTTATAAAAAGTGTATTATCTTTTAAAAGCGATTTAA
ATTTAATAGCCTTAGTTTTAGCATCAAATGTAGCCTTTGTTATATTGGCAATCATACTACTGTCTAAGAT
GTTCAATTCTGAGGAAATACTTTTTGGTAATAGTAAGAGTTTTTCTTTCTTAGAGAAAAGAAGTAATATA
AAAAAAGGGTCTATACCAACTGTAAGTGATGGTGTTATTTTATATGCAGTAGGATTAGTTCTATTGATTT
ATGTTGGTTCTTTAGTTCAAATTAAATTTGGTATGGCAGGTATTATAATGACACAATTCATGATAATTTC
TTTACCATTATTATTTGCATGCTATATTAAAGCTGATTTTAAAGAGGTATTTAGCTTGACAGTTCCTAAA
TTAAAGCATGTGTTTGGGAGCATTGTTCTTTGGATTGGTGGATACATACTTATTATGATTATAACACAGC
TAATTTTATTCTTATTTCCTCAAAATATGGAAGTTGCTGAAAGTTTAAATAAGGCTCTTTTTATCAAAGA
TAGTGTTTTACTGAATTTACTAGCAATAGCTTTATTACCAGCTATATGTGAAGAACTGTTTTTTAGGGGA
TTTATATTTTCTTCATTTAGTAAATCAAAAGATAAAAATAAGTCTATCAAACTCGCTATAATATGTAGTG
GGGTACTATTTGGTATTATGCATATGGATTTTATTAGAATAATTCCAACATCAATATTAGGTATTATATT
TGCATACAGTGTGTATAAATCTGGTTCAATATTTGTATCAATGTTATTGCATTTTTTAAATAATAGTGTA
GCAGTTGTGTTAAATCATTATACAACTGGAAATATAACCAACTTATATAAATTTGTTGAAGTTGATTTTT
CGAACTTAAATGTACTTAAATTTGCCTTAATTCTTCTAATAAGTCTTATATTAATTATGTTAGGATTAAG
AGTTTTAGATAGAAAGTCTTTAAGAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1784219-1785763 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGAATTTACAAAAAAAATTGATGTTTTTTTTATTTATTTGTATAATTTTACAAATTACATACACAA
CACCAGTCTATTCTTTATGCAAACTCTATAAAAACAACTCCATAAATAACTTTGAGTCTATTGTGTCTAA
TAATCAGTTTATTAGCAAATATGCAATACAAATAATACTTATTATGGCTATAATATGTATGATGCTTATA
TTCTATATAATATATGACAAATTAAATTTTAAAATTAAATTGCAAAAGATAGCATATACAGATAATCTTA
CAGGAGCAAATACTATAGATAAATTTGTAATTGATGCTAACAAAATACTATGTAAAAATACTCAAGTAAA
GTATGCTTTATTATATATAGATATTGATAAATTTAAATATATAAATGATTTATTTGGATATGAAGTTGGG
AATGAAATTTTGCGTAATTTAACAAAAATTATTAAGAGTAATATATTTGAAGAGGAAATGTTTGCAAGAA
TATCTGCGGATAATTTTATTATAATTATGAAATATATAGAAGAAGAAGATATAACAAAGAGGTTAAAAAC
TATATTTGAGGAATTAGACTTGTTTAATAATAATCAAGAAGAAAAGTATAAGTTAGTTTTAAGTTGTGGA
ATCTATTTTATACTTCCAGAAGATAGAGATATCAACTCAATCATAGATAGGGCTAATATACCTCATAAAA
TGGCAAAGGGAGGACATAAAAGTTCATATGCATTTTATGATAATAAGATTCATGACCAAGAGATAAAAGA
AAAAGAGATGGAAAATACAATGTTTTCAAGTTTAGAAAATAAAGAGTTTATTATATACTTACAACCTAAG
ATAGATCTTAATACAGGAGAGATACAAGGTTCAGAAGCACTTGTTAGGTGGAAACGTCCTGATAAAGGGC
TAATACCTCCAAATGAATTTATCCCATTTTTTGAAAGAAACGGTTTTGTTATAAATTTAGATTTATATGT
GCTTGAAGAAGTATGTATATACCTTAGAAAATGGATTGATGCAGGAATAAATCCAGTTACTGTTTCAGTT
AATGTTTCAAGAATACATTTATATTGCAATAATTTTATAGAAACATACAAAAATATAATTGATAAATACA
ATATACCTGCAAAGTATATAGAACTTGAATTAACGGAGAGTATCATATTTGATAATTTTGATATTTTAAT
TGATATAATGAATAATTTAAAAAAAATAGGATTTTTAATATCTATGGATGATTTTGGTTCAGGGTACTCA
TCATTAAATATGTTAAAAGAAATTCCTATGGATATCTTAAAACTTGACCAAAAATTTATTATGGAAACTT
ATAATAGTAAAAGAAGCAAAATAATTGTTACTAAAGTAATAGAAATGGCAAAAGAGTTGGGTATGAAAGT
CATATCAGAAGGAGTTGAGACAGAAGAACAGTTTAAACTTTTAAAAGAAGTAAAGTGTGATATGGCACAA
GGATATTTGTTTGGAAAGCCAATGCCAATTGAAGAATTTGAACATTTAATTGTATCCAACTTGGTAAGAG
GGTAA
>ref|NC_013316.1|:1785939-1786307 GntR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATGGGAACTTGATAATAACAAACCTATATATATACAATTAGTAGAACATTTAAAGTTAAAAATAA
TTTCAGGGGAAATTAAAATAGGATCTAAATTAGAAACAGTGAGAGCACTAGCAGAAGATGCGGAAGTTAA
TCCAAATACAATGCAAAAGGCTCTAACAGAACTTGAAAGACAAGGTTTAGTTTATAGTCAGAGAACTAAA
GGAAGATTTGTAACAGATGATAAGGAAAAAATAAAAGCTATGAAAGAGGAAATAGCTAATGTGGAGATAA
ATACATTAAAAGTAACCTTAGAAAAGCTTGGATATGATAGAGATGAAATGCTAAAACTTATTACAGAAAA
TCTGAAAGGAGAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:1786309-1787034 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAAAAATATAAGCAATGTTTCTCAAGATGGAATAGTTGAATTTAAAGGTGTAAACAAGAGTTATG
GAACTAAGAATGTTTTAAAAAATATTGATTTAAATATACCAAAGGGAAAAATAGTCGGGCTGTTAGGGCC
TAATGGAAGTGGTAAAAGTACAATGATTAAGCTAATGAATGGATTATTACAGCCTGATAATGGTGAAATT
ATGATAAATGGAATGAAACCATCCATAGATACTAAAAAAATAGTTTCATATTTACCAGAAAGAACTTATT
TAAATGATTGGATGAAGGTATCAGATTTACTTAAGTTTTTCTATGATTTTTATAGTGATTTTGATGTTAG
AAGAGCAAATGAGATGATTAAAAGCTTAGATATTGATGTAAATGAAAAGCTAAAGACAATGTCTAAAGGA
ACTAAAGAAAAAGTTCAACTTATTTTAGTAATGTCAAGAAATGCGAGCATATATATATTGGATGAACCTA
TAGGTGGTGTTGACCCAGCTGCAAGGTCATATATACTTAAGACTATATTAAAAAATTATTCTGAAGATAG
TACTTTACTGATTGCTACCCACTTAATAAGTGAAATAGAAAACATATGTGATGAGATAATATTCATATCA
AAAGGAGAAATAGTGTTACAAGGAGACGTTGAAGCAATAAGAGAAGAAAAAGGAAAATCTATAGATGCAT
TATTTAGGGAGGAATTTAAATGTTAG
>ref|NC_013316.1|:1787028-1787792 putative ABC transporter, peremase protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAGGTAAATTATTAAAATATGAGTTAAAAGCAAGTGGAAGAATATTTATACCGTTATATATAGCCA
TATTGATAGTAGCTGTATTTAATGGAATATTTATGAATACAAATATACTTCAGGTACAGGGAATAGGAAT
ACTAGTATTAACAAGTCTTTTTATGGCATTAGGAGTTTTAACTATTGTAGTTACAATTCAAAGGTTTAGA
AAAAATCTTTTGGGGGATGAAGGTTATTTAATGTTTACTCTTCCTGTTAGCACTAGTTCACTTATATTAT
CTAAATGTATAACAGCACTTATATACGCTGTACTTAGTTTTATAGTTGCAGTATTCACTTTTGGAGTTCT
TATGCTTTTTGGTACTTCTGGAATTTTACTACCTGAAATTTTAGATTTGTTTAACACTAGTTTTAAATGG
ATTTCTGAAAACTTTTTAGATATTTTATTATTAGTAGTAGTAATGTTTATTTCATATTCATCATTTATTT
TGTTATTATATACATCAATCTCAATGGGACAATTACCAAAATTCAATAAACATAGAAACATAGTGGCATT
TGCTTCTTTTATAGCTATAAATATAGTAATATCAATTGTTGGAGATGCAGTTGGAAGCATCTTACCAAAT
GAAGATACAAATATGGTATATCATCTTTATCAGAGTCCTAGTTTTATGCTTGCAATACTTGGTAGTCTTG
TAGTTGCAATAGCGTTATTTTTCGCTACAAAATTTATATTAGATAAAAAATTAAATTTAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1788014-1789264 putative permease [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGTTATACAAAGGCTAAGTGGAGTGTTTGGGGTATAATTACATTTTCATTTGTTTTAGTATTAT
TTTTAAGGATGTCAACTGCTGTTGTTTCAGACAATTTAGCAAATGAGTTAGGTTTTAATTCTATACAAAT
TTCAAATATAGCATCCTTTTGCCTATATGCATATGCATTTATGCAAATACCTGCAGGAATTTTGATTGAT
AAATATGGAGCAAGAAAAATTAGCAGTCTTGGAATAATAATGGCAAGTTTAGGGTCAATTTTATTTGGTT
TGATTCAAAGTATAGAATTAGCATATATTTCTCGTGTAATTGTAGGGGCAGGAACATCAGTAATATTACT
TTGTATTTTAAAAATTCAAGGGAGATGGTTTAATAAGTCAGAATTTGCTTCTGCAACAGCTAAATTTTCA
TTTGTAGGAAATTTAGGTGGAGTTCTTGCTACTTTTCCACTTGTGTTTTTGTCTGAACTTGTTGGTTGGA
GAAATTCATTTTTATTAATCGGTATAATTGGTGTTGTAATTGGATGTTTTATATATATTATTGTTAGAGA
TACACCAAAAGAGTATGGATTCAATGTAGATACTGAACCCTATGAAAAGTCAGAGAAGGTTAATATTGTT
GATGGTATTAAGTCTGTTATAAAGAACAAATCAACATGGTATAATTCAATGATAATGTTCTCTTTTGTTG
GTCTTACAAGTGCATTTATAAGCTTGTGGGGAGTAAGATACATAATGGACGTTTATGGTGTGAGTAAGAG
TTTTTCTGCGTTTATAGTATCATTTTTTACATATGGATTTATATTTGGTTCAATAATTATGGATTTTGTA
TTTGCTAAAATAAGGTCTAGCAAATTTAATATAATAAAATTTGGAGCAATGATAGATTTGTTTATATGGA
TTGTAATTGTAGTTGTATACCAGGTAAAACCACCAATTATAGTTTTACCAATATCATTCTTTATTATGGG
ATGTATAGTTATGTCACATCTACAGGTTTTTAATGATGCCAAGTATAAAAATAAAGAAATTTATTCTGGA
CTGGCAACTAGTGTTATTAATACTTTTGAATTTATAGGAAGTGGAATTATTAATTTGATTATAGCTATCT
CTTTACAAGTAAATTCATATAATATAGTTGATGGATATAAAAAAGGTTTTGTAGTATTTATAGTACTAAG
TATTATAACTATAGTATCATCTCATATAGGGGTAAAAAATGATGATTGTAAGGCTATATAG
>ref|NC_013316.1|:1789455-1790339 putative mechanosensitive ion channel protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGATACGACGAAAATAGATGATATAAGCAAGTTAGATTTAAATAATTTAGACATTAATAAGATGGATA
TGGGAGGTATAATGGAAAGTCTGCTAGAATGGGCTACTACAAGCGGAGTAAAACTTATAATAGGTATACT
TATACTTTCTATTGGATTTAAAATAATAAAAAAATTTGTAAACCATGTTATGTTAGTACTTAGTAAAAGA
GATATTGATTTAACTTTAAGAAGGTTTTTGAAGTCTCTTCTTTTGAGTGTACTTAAAGTTGCCGTTATAA
TCATTGTTCTGGAATATTGGGGAATGAGTTTGTCCAGTTTTGCTGCTGTGATAGCATCAGCAGGGGTAGC
AATAGGTTTGGCTTTACAAGGTAGTCTATCAAATTTTGCTGGAGGATTTATTATACTATTGATTAGACCT
TTTAAAGTAGGAGATTACGTAGAAGCAGCAGGCCATGGAGGAACGGTTGAACAAATAGGACTTTTTTATA
CACAATTGGTTACTCCAGATAATAAACAGATACTTATACCTAATGGTTCTGTATCAAATGATAGTCTAAT
AAACTATTCAGCAAAGAATACTAGACGAGTTGATTTGACTTTTAGTGTAGGGTATGAAGATGATATACTA
CATGTTAGAAGAGTACTTAAAGATATTGTTAATAATCATAAATTAATAATAAATGAGCCAGAACCATTTA
TAGGAGTAGTAGAACATGGAGATAATGCTGTTAAATTTGCAACTAGAGTTTGGTGCAAGACAGAAGATTA
TTGGACAATTTATCTTGATTTACTAGAAGAGGTTAAAGTTAGGTTTGACGAAGAAGGAATTACGATTCCA
TATCCTAAAATGGATTTAACAGTAAAAGAATTAAACAAAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:1790701-1791318 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGTGTAAAAAAACGTATTTATTAGTGGTAAGTATACTTATAGCAGGTTTATTAACTGCATGTAGTGGGA
GCCCAACTAAGGATTCAGGACAAGCACAAGATAATACAAAAAAGGAGGCAAATGCTTCAAATAATGCTTT
AAAAGATGAAAAAAATAATGAAAATTTAATGGAACAAGATTTTAAAGTGCCATACACAGATGCAATAAAC
ATATTTAAAGATAAATACAAGGATGCTGATATAGTAGATTTAAGTCTTGAGAGAGATTTAAATAAATTTG
TTTATACTGTGGAAGGTGTAGATGATAATAATGAATATAAGATGAAAATTGATGCTAATACAAAAGATGT
ATTAGAAGATAAAACAGAAAAGTTAGATTCAGAAGATTTAAATGGAGTTGCTAGAAAAGAAAAATTAGAT
TTAAATGACATAATTACACCTCAACAAGCTATGGAAATTGCATTAAAAGAACAAAATGGAATGGTTAAAG
AATGGAGTTTAGACAAAGATTTAGATGTTACTTTTTATAAAATAAGAATAGATAAAGATAAAAATGAATA
TGACATAAAAGTAGATTCTAAAAAGGGAACTGTATTGAAGGTAGAAAAAGAAGATTAG
>ref|NC_013316.1|:1791426-1793957 putative nitric oxide reductase flavoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGTCATTGAAATCACTAAAAATAAAAGAAAATTTATATTGGGTAGGTTCACTTGACCCTGATTTAAGAG
TATTTGACATAATTATGTATACACCTTATGGAACTACTTATAATTCATATGTATTAAAAGGAACAGAAAA
AACAGTTTTGTTTGAGACAGTTAAAGATAAGCATTTTGACAATTATATTGAAAGATTAAATGATTTAAAT
ATAGATTTTGAAAAAATAGACTATATTGTTGTAAGTCATACTGAACCAGACCATGCAGGAAGCGTTGAAA
AGCTTTTGGATTTAGCTAAAAATGCAAAAGTAGTAGCTTCAGAAACAGCAATTAAATATCTTAAGGAAAT
CGTAAACAAAGACTTTGAATATGTTGCAGTTACAGATGGAGATACATTATCAATTGGGGACAAAACTTTA
GAATTTTTCTCTGTACCTATGCTTCATTGGCCAGATACTATATACACATATATAAAAGAGGATAAAACTC
TTGTAACATGTGATTCATTTGGTAGTCACTATAGTAATGATAAGATAGTAAATACACTTGATGAAAATGA
AGAAAAGGATTACTTGGATGCTTTAAGATACTATTATGATTGTATAATGGGTCCATTTAAACCATCTATG
GTAACTGCTATAGAAAAGATAAAAGATTTAGATATAGATACTGTATGTCCAGGTCATGGTCCAGTATTAA
CTGAAAATCCTAGAAAAATTATAGACCTTTATTATAACTGGAGTGTAAAGGAACAAATAAAGTTAGAAAA
AGAAGTTACAATTTGTTATGTTTCTGCACATGGATATACAAAGATTATGGCAGAAGCTATAAAAGCATAT
ATTGAAAAAAATAGCAACTATAAAGTAAATTTATTTGATGTAATAGAGCATAAGCAAGAAGATATTTTGG
CAAAAATAGCAGTATCACAAGGTGTATTATTTGGAACACCAACAATATTAGGAGATGCGTTAAAGCCTAT
ATGGGATATATTAATATCGTTAAACCCAGTTCTTCATGGTGGAAAAGTTGCTTCAGTATTTGGTTCATAT
GGATGGAGTGGAGAAGGTATAGAAAATGCTATGGAGAGAATAAGTCAGCTTAGAATGACAGCAGTAAAAC
CTTTTGCTGTTAACTTTAAACCATCAAATGAAGAGATTGATAAATTACATTCTTATACAGGTAAATTCCT
AGATAAGTTAAATTCTACTTTTGGAAGTAAAAAGAAAACTAAGAAATTTAAATGTGTAATTTGTAATGAA
GTTTTTGAAGGTGATAGTGCTCCTAGTGTATGCCCTGTATGTGGAGCTAAGGAAGACCAATTTATAGAAG
TTGAAGAAGATGAAGTTACTTTTAGAAAAGATACTGATGAATATTTCGTAATAGTAGGAAATGGAGCAGC
TGGTTTTTATGCAGCAGATGCTATAAGAAAAAGAAATAAAACTTGTAAGATAACTATGATTTCTAATGAA
GATGAGTTGACTTACTATAGACCTGCACTTTCTGATGGTATAAATGAAGAACTTGGTTCAGATTTCTACA
TGGAAGATAAAGATTGGTATGATAAAAATAATATAGTAGTAATATTAGGAACGAATGTAGATAAATTAGA
TGAAGTGAATAAAACTATTATAGTGAATGATGGAGCTATTAAATTTGATAAGCTTGTAATAGCTACAGGA
AGTAGAAACTTTATACCACCGATTAAGGGCCATGATTTAGAAAATGTGTTTACTCTTAGAAATATAAAAG
ATTTATATAGTGTAAAAGAAGCACTAGAAAAATCTAAGAAAGTTGTAGTGATTGGTGGCGGTTTATTGGG
ACTTGAAGCTGCATGGGAATTTAGACTAAAAGGATTAGAAGTAGTAGTAGTTGAAGCCATGGATAGCATA
CTATCAAAACAACTTGATAAAGAGGGTAGTAAAATATTAGAACAATGTGTAAGAGATACAGGAATAGATG
TAAGATTGGGTGTAGCAGTTGATGGTATTGAAGGTGATGGAAAAGCTCAAAAAGTTGTATTTAAAGATGG
AGATAGTGTTGACTGTGATATGGTAGTATTTTCAATTGGTGTAAGAGCAAACACTCAAATGGTTCAGGAT
ACATCTGTAAAAATTGATAGAGGTATTGTTGTAGATAAGACATTACAGACAAATGTTAAAGATATATATG
CTTGTGGAGATGTTGCACAAGTGGGAAATATTAGTTTAGCAATATGGCCATCTTCAGTAGAAATGGGAAA
AATAGCAGGAGCAAATGCAAGTGGAGATAATTTGACATTTGAAAGTGAAGTATATCCAGTTTCATTAGAT
GCAATGAATGTAAAAGTATTTAGTATTGGTAATATACAAAATTTTGATAAAGAAATTTCATCAAAAGATG
AAGGTCAAAGAATATATAAAAAATTATTTATGAAAGATGGTTCATTAGTTGGAGCTATACTTATAAATGA
TTTAAGCTGTACTGTTAAATTGATAAGATTAATATCTGAAAAAGGTGATTTTGAGGATATTATGAAGGCT
GATATACTATAA
>ref|NC_013316.1|:1794391-1795092 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAACGAAAATATTTTGATTGTGGATGATGAAAAAGAAATAGCAGATTTAATTGAAGTATATTTAAAAA
ATGAAGGTTTTACAGTATACAAGTTTTATACAGGTAAGGAAGCTCTAGAATGTATTGAATCTAAAGATTT
GGATATGGCTATTTTAGATATTATGCTTCCTGATATTGATGGATTTCATATTTGCCAGAAAATTCGAGAA
AAATACTATTATCCTATCATTATGTTAACAGCTAAAATTGAAGATATAGACAAGATAATGGGTTTAACCA
TAGGTGCTGATGATTATATAACAAAGCCATTTAACCCTTTGGAAGTTGTTGCAAGAGTAAAGACACAATT
AAGAAGATATATGCGATATAATAATTCTTATGAACAACAGTCGATAATTGTTAATGAGTATGATATTAAA
GGATTGATTATCAATAAAGAAACACATAAATGTAGTTTATTTGGGAAAGAAGTAGCATTAACACCGATTG
AATTTTCTATTCTTTGGTATTTATGTGAACATCAAGGAAAAGTGGTTCCTTCTGAAGAATTGTTTGAAGC
TGTATGGGGAGAAAAATATCTTGATAATAATAACACAGTTATGGCTCATATAGGGCGATTACGTGAAAAA
ATTCATGAACCTTCTAAAAACCCGAAATTTATAAAAACTGTATGGGGAGTAGGTTATACAATTGAAAAGT
AA
>ref|NC_013316.1|:1795142-1796224 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAACAGCTTTAATGGCATTTATAGCCATTATTTTCATATGGATTTTATATTCTTTTATATTGTATG
GTAAGTTTTCTATCTGGATAGTATCATTCTTTGAAAATGCTTTTCGTATGGAATATAAAGCTGCATTGAA
TTTATATCAGCAGATTTTCCGTAATAGCATGGAGCTCTTCATGATACTAGCTATGGTGATTGTGTTTTTT
ATAATATTCCGTGTTTATTTAAATTGGTTTACAAAATATTTTAGTGAAATAAATCAAGGTATTGACTCTC
TTATCAAAGAAGATGTTGGAGAAGTGGCTTTATCTCCAGAGTTATTGGCAATAGAAAAGAAAATAAACTC
AATTAAACATATACTTGAACAACGTAAATTTGAGACACAAATGGCAGAACAACGTAAGAATGAACTTATT
GTTTATCTTGCACATGATTTAAAAACACCACTTACATCAGTTATAGGGTATCTGACACTACTTCGAGATG
AAAGTCAGATTTCTGAAGAACTGCGAAAAAAATATTTATCTATTTCGTTGGATAAGGCAGAGCGTCTTGA
AGATTTAATTAATGAATTCTTTGAAATTACAAGGTTTAATTTATCAAATATATCACTTGAATACAGTACA
GTAAGCTTAACTCGTATGCTTGAACAACTAACATATGAGTTTAAACCTACTTTGATGAGTAAGAATTTAA
AATATACACTGAATGTTACACCAAATATGATGATAAGGTGTGATGTTAATAAAATGCAACGTGTATTTGA
TAACTTATTACGAAATGCTGTTTATTATAGTTTTGAAGATACTACTATTGAAATAACAGCTGTACAGGAG
GATGATTATATAAAGCTTAAATTTATAAATCATAGCAATACGATTCCAGAGGAAAAACTTGAGCGTATTT
TTGAACAATTTTACAGGTTGGATACATCTCGTAATTCAAACAGTGGTAGAGCTGGGTTGGGACTTGCTAT
AGCTAAAGAAATAGTGGAGCTTCATAACGGGACAATAACAGCTCATAGCGAGAACAATATAATTACCTTT
AAGGTTATTATTCCGATTGTAGGAAATTTGTAA
>ref|NC_013316.1|:1796485-1797585 putative D-alanine:D-alanine ligase (putative vancomycin/teicoplanin A-type resistance protein) [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATAAAAAAATTGCAGTTATATTTGGTGGAAACTCAACAGAATATGATGTATCATTACAATCAG
CTTTTGCAGTACTTGAGAATTTGAATACGGAAAAATATGATATTATACCAATTGGAATTACAAGGGAGGG
TAATTGGTATCATTATATTGGAGATTATAATAATATCCAGAATAACACTTGGTTTGAAAGGGATACTGAT
ATAATTCCAGTTATTGTTTCGCAGAACCGTGTCAAAAATGGTATTATTGAATTTTTAATTCCTGATGCTG
TTTCTCAGAATCATATTCCAAATAGTGCTATTGAATCATGTGAAAATGATATTAAATACACTAAACTTGA
TTTTGTATTTCCTGTATTGCATGGAAAAAATGGAGAAGATGGAACAGTGCAGGGGTTATTTGAATTGGCA
GGTATACAGGTTATTGGATGTGGTACTCTTTCTTCAGCATTATGTATGGACAAAGACAAATCACATAAAC
TTGTTCATTCAGAAGGTATTAAAGTACCAAAATCAATATTACTAAAATACTCAGATAAATTTAATGTGGC
TGAACTGTCAAAAGACTTAACTTATCCATTATTTATAAAACCTGTGCGTGCAGGTTCATCATTTGGTATT
AGTAAAATTTATAAAAAAGAAGAGTTACAAGTAGCAGTAGACTTGGCTTTTGAACATGATAATGAAGTAA
TAATTGAGGAAAATATTGATGGTTTTGAGGTAGGGTGTGCAGTTTTAGGAAACGATGACTTACTTGTTGG
AAGAGTAGATGAAATAGAATTGTCAAAAGGATTTTTTGATTATACAGAAAAATATACATTGAAAAGTTCA
AAAATTCATATGCCAGCTAGAATTGATTTGGATTGTGAGAAAAGAATACAAGAGACAGCAAAAATTATTT
ATAGAACTCTTGGATGTTCTGGATTTGCTAGAGTAGATATGTTTTTAACTCCATCTGGTGAAATTATTTT
TAATGAAGTCAATACAATTCCTGGCTTTACTTCTCATAGTCGTTATCCGAATATGATGAAAGGTATTGGA
CTGTCTTTTGAAGAAATATTGGATAAGATAATTGAGGTGTACATAAAATGA
>ref|NC_013316.1|:1797585-1798388 putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATATTTTATTAGATAAAAATAAAGAAGATAAAATGACAAATACTATCTTATTGACTAAAGATA
AAGTTTATGATGGGAATCTAATTCTAGTAAATGCTTTTTTACCAGTTAAAACATCTGAAGATATAGATTT
AATTCCTGTAGATACAAGGTTTCCAAGTATTCTTATGAAACGTGAAGCTACAAATATTTTACAAAATATT
TTAAAAAGTATATGTGGAATAAATGAAATAGTACCTGTAAGTGGATATCGTACTGCAGAGGAACAACAAG
ATATATATTCAAGCTCTCTGCGTGACAATGGAAAAGACTTTACTAAAAAGTTTGTAGCACTTCCAAATCA
CAGTGAACATCAGACAGGGCTTGCTATTGATTTAGGGTTGAAGAAAGAGGTTATAGATTTTATCTGCCCT
GAATTTCCTTATAATGGTATTTGTAATGAGTTCCGTAAGGCAGCACTACATTATGGTTTTATAGAGCGTT
ATCAGTGTAAAAAAGAAGAAATAACAGGAATATCTCAAGAACCATGGCATTTTCGTTATGTCGGATATCC
ACATTCTGAGATTATCAATAAAATGAATCTCGCCCTTGAAGAATATATAGAATATATTAAGAGATTTTCG
TATACAAATTGTTTAAAAATAGAAGATAAAGAAAAAATTATAGAAATCTTTTATGTGCCTATTCATACTA
AAGAAGAAGTGAGAATCTCTATACCTGAACAATGTGTATATCAAATATCGGGTAACAATAAGGATGGTTT
TATTGTGACATTTTGGAGAAATAGAAAGGACTAA
>ref|NC_013316.1|:1798406-1800544 serine/alanine racemase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTAGGAATAAATCTTATGCAGGGCTTGATTATTTTAGGATTATAGCTGCATTACTTATAATTGCAA
TTCATACATCTCCATTATTATCATATAGTAAAATGGCTGACTTTGTGTTAACTAGTATAATTGCTCGTAT
TGCTGTGCCATTCTTTTTTATGCTATCAGGCTTTTTTCTAATTTCAACATATAATTATAATTGTAATAAA
CTGAAATCTTTTCTAAAAAATGTATTATTTATTTACGGGATAGCTATTGTAATTTATATTCCCTTAAATA
TTTACACTGGATATTTTTCCATGAATAATTTAGTGCCCAATATTATTAAGGACATTGTATTTGATGGGAC
TTTATATCATTTATGGTATCTACCTGCATCAATTATTGGTGCAAGTATTGCATACTTTCTTGTAAAAAAA
CTAGGTTTAAAGTACTCATTAGTAATCACTATTGTTATTTATGTAATTGGTATGTTTGGTGATAGTTATT
ATGGTTTTTTAGAAAAAATACCACTATTAAAGAATTTATATGGGTATATTTTTGAAGTATCAGATTATAC
ACGAAATGGTATATTTTTTGCACCTGTATTTTTCATACTTGGTGGAATAATATCTAATAAATCTAATTAT
ATGTCAACTAAAAATAGCTTGATTGGATTTCTTATATCATTCTTACTTATGTTATGTGAGGGAATGTTTT
TACATAAACTAGGGGTACAGCGTCATGATAGCATGTATATTATGTTATTGCCATGTATGTATTTCTTATT
TACAGCCTTAACATTTTTAAAAGGTTCTCGAGCTAGGTTATTGCGAACATCATCATTAATTATTTATATT
ATACATCCTATGATGATTGTTGTTATTCGTATGTTTTCTAAAATATTCGGAATACAAACTGTCTTGGTTG
ACAATAGCCTTATTCATTATATAGTGGTAAGTATAGCATCTTTTATAGCTTCTATAATTATTATATTGAT
TCTTAAACCTCTAAAAAAAGACTTGAAAGGAGAACATAAGGTAAATACCAATAGAGCTTGGATTGAAATT
GATTTAAATAATTTGGAACATAATGTAAAGATGATACAAAAAGCTATGCCAGAAGATTGTGAATTGATGG
CAGTTGTAAAAGCTAATGCCTATGGTCATAGTGCTTTTGAAGTAGCGACTTGTGCAAACCAAATAGGTGT
AAAAGCATTTGCAGTAGCAACAATAGATGAGGGGATTGATTTACGTCGATATGGAATACTAGGAGAAATA
TTGATTCTTGGATATACTAACCCAATAAGGGCAAAGGAACTTCATAAATACAATCTTACACAGAGTGTTA
TTGACCTTAATCATGCTATCTCTTTAAACAAACAGAAATACAACATAAAATCACACATTAAAATTGATAC
AGGTATGCACAGACTGGGTTTTGATGTTAATGATGTGAGGTCAATTTTAAAGGCATTTAAATTAAAATAC
TTAGATATATGTGGCATATTTACACACTTGTGTGTTTCAGATAGTCTGAAAGATGAAGATGTAGACTTTA
CAAATAAACAAATTGAATGTTTTTATAAGTTAATTGATTTTCTGTTAAAAAAAGGTATAAAAATTCCTAA
AGTACATATTCAAAGTAGTTATGGTTTTTTTAATTATCCCAATCTTAAGTGTAATTATGTAAGAATTGGA
ATTGCATTATACGGGATATTAAGTTCTCCAAATGATACGACTAAATTGCAACTTGATTTACGACCTGTTT
TATCCTTAAAATCACAAGTAATTCTTATTAGAAAAATACAAAAAGATGATAGTTTTGGATATGGAAGAGT
CTTTATTGCAAGCAGAGATAGCGTAATTGCTATATTATCTATTGGCTATGCCGATGGTATACCTAGAAAT
TTATCCTGTGGAAAAAGTTACGTAATAATAAATGGTTGTAGAGCAGCAATAGTGGGTCGAATTTGCATGG
ACCAACTTGCTGTTGATATTACAGATATACCTAATGTAGAAGTTGGTAATACGGCAATAATAATAGGAAG
AGATAATTTATCTGAATTATCTGCTTCTGAAGTTGCAAATAACTCATGTAGTATATCGAATGAATTATTG
AGCAGAGTAGGAAGAAGGTTAAATGTTATAAAGAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1800858-1801478 hypothetical protein CDR20291_1527 [Clostridium difficile R20291]
ATGCAGTATATACAAGAATTACTTGATTTGACTCAAAATTATTGGGTGTTAGCCACAATAATCGGCTTAT
TAAGTGCATTTATAGAAAGCTTTATACCAGCCTTACCACTTGTTGCTATAGTTACAGCAAATGCTGCAAT
ACAAGGATTATTTATTGGATGTTTGTTATCATGGATTGGCTCAGGACTTGGGACAACTTCATTATTCTTA
TTAATAAGCAGATTTAATGATAGTAAGCTTTTTAATAAGTTGAGAAATAGTAAAACTGAAAAAGCAATAA
GTTGGATGGATAAACAGGGATTTAAGTTATTATTTATAGCGTATGCCTGTCCATTTATGCCTGGTTGTTT
AGTTACTATCGCATCAGCTTTTGGTAAAAAAGATTTAAAAGATTTTGTGCCAGCAATGTTGGCAGGAAAA
TTTGTAATGTTTATAGTTATAAGTTACGTGGCAAGTGATATAGAAGGTTTTATAACAAGTCCTTTAAAGA
TAGCATCATTTATATTATTGGTGTTTTTGTCATGGAAGATTGGAAATAGAGTAAATAAAAATCTTGAAAA
TCATAATTATGATTTCCATCATAAAAAACATCACAATGATAAAGATGATAAAATGATTTAG
>ref|NC_013316.1|:c1802213-1801644 putative membrane-associated metal-dependent hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTATAGTGACGATTCAGGAGGATTTTTATATGATAAAAGAAACACATGAAAGGGGAGGTTATATAT
TCGCACTTTTGATACTCCCCTTTATAAACAATCTGTACCTAGTTAAATACGATATTGCATATAAAATAGT
ATTAATTATAATTTATATTTATTTTGCATATTTAGGTTCTTTATTTCCAGATATAGATATGAGAGGTTCT
TACATAAGTAAAAAATTTATGTTAATATACAAATTATTTGGAAGTAGGTTTAGACATAGAGGGTTTACTC
ACAGTCTAATTGCCTTATTACTTATTTATAGTTTTTTTAAATCTCTGACAATCTTCACTAACAATAATAT
AGTTTTCTCATGTTTGTCCAGTGGGTTTATAATAGGATATCTATCTCACTTGTGTCTTGACCTTATTACT
AAAGAAGGTATTGAATTGTTTTATCCCATTACCATAAACATTTCTTTACTACCTATAAAAACTAACTCAA
AAACAGAAAAATTCATATCTAAGCTATTAAATTTCATAGTTATTTTTTTGATTGGATATCAATTTTATAT
TTTATTATAG
>ref|NC_013316.1|:c1802997-1802293 putative superoxide dismutase [Mn] [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAAAAAAATATTAATACCAGTTATTATGTCTTTATTTATAATCTCACAGTGCATAACTTCATTTG
CTTTTACACCTGAAAATAACAAATTTAAGGTTAAACCATTACCTTATGCATATGATGCACTTGAACCTTA
TATAGATAAAGAAACAATGAAACTGCATCATGATAAGCATTATCAAGCTTATGTTGATAAATTAAATGCT
GCTCTTGAAAAATATCCTGAGCTTTATAATTATTCTTTATGTGAATTATTGCAAAATTTAGATTCTTTAC
CTAAAGATATTGCTACAACTGTAAGAAATAATGCAGGTGGAGCTTATAATCATAAATTCTTTTTTGATAT
AATGACGCCAGAAAAAACCATACCTTCTGAATCTTTAAAAGAAGCTATTGATAGAGACTTTGGTTCTTTT
GAAAAATTTAAGCAAGAGTTCCAAAAATCTGCTTTAGATGTCTTTGGTTCTGGTTGGGCTTGGCTTGTAG
CTACTAAAGATGGGAAATTATCTATTATGACTACTCCAAATCAGGATAGCCCTGTAAGTAAAAACCTAAC
TCCTATAATAGGACTTGATGTTTGGGAGCATGCTTACTATTTAAAATATCAAAATAGAAGAAATGAATAC
ATTGACAACTGGTTTAATGTAGTAAATTGGAATGGTGCTTTAGAAAATTACAAAAATTTAAAATCTCAAG
ATTAA
>ref|NC_013316.1|:1803170-1805044 asparagine synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGGACGGCAATATTTCAATTTATTATAAAGGTGATATATCTAAAAAAGAAGATATTAAATTTAAAATAA
AAGAATCTGTAAATAATACAAGACTTTCTAGTAGAATAGAGTATAAGGATGAGGAAAAAACTTTTGATTT
TGAAAGATTTAATGTAATTGATGCTATTTATGGAAATAAACCATTTGAAAAAGATGGAAAAGTTATTGTT
TTTAATGGAAATATATATAACTATCATGAAATAAAAGAAGAATTAATTAAAAAAGGACACAATTTTACTA
CAAATGATGATATTGAAGTCTTATTGGCATCTTATATAGAATTTGGTAAGAATTGTGTACATAAGATTAA
AGGAATGTTCAACTTTATAATCTATGATAGAGAAAATGAAAGTATATTTGGAGCAAGAGATTTATTTGGG
ATAAAACCACTTTATTATATAAATAAGGAAAATGCAATAATTTTTTCCTCAGAGTATAAGTTTTTACTTG
AATATATGAAAAATTTAAATATAAATGAAAGAAGCTTACAAAGTTATTTTTCATTTCAATATGTACTTCC
TGAAGATACTATGATACAAGGAATAAGGCTGATACCAGCAGGTCACTATTTTAGGGTAGAAAATGGTATA
CTATCTTTAAAGAGATATAATAAACTTGAGTTTAGAAGTAGTACAAAATTTTTTTATACTAAAAATCACT
TAGGCAATAGAGATGTGAATGAGGATGATATAAGAAATATAGTAGTAGATTCAATAGTAACTCATATGGA
AGAGGAGAAAGAAATTGGAACATTTTTGTCTGGTGGAATAGATTCATCTATTATAACTACTGTGGCTTCA
CAAATTAATCCAAATATAAAATCTTTTTCTGCAGGCTTTAGTGTCAAAGGATATAGTGAATTAGAAGTAG
CAAAGAAAACAGCTGATAAGTTAGGTATAGAAAATATCCAGATTAATATAACACAAGATGAATATATAAA
ATCATTACCGAATGTAATTTATTCTTTGGATGACCCTATAGCAGACCCTTCAGAAGTAGGTCTTTATTTC
TTAATTAAAGAGGCAGGTAAACATGTTAAAGTAGCATTGTCTGGAGAAGGAGCAGATGAATTATTTGGAG
GATATAATATATATAAAGAGTATAGTACTATGAAATCAGTTGTCAATTCACCTACTTATATTAAAAGTAT
ATTAGGAAGAGTTTCAGAACTTATGCCAAACATAAAAGGAAGAAATTATCTTTATAGAGCTACAACACCA
TTAGAAAAAAGATATATAGGAAATGCAAAAGTTTTTGAAAACAGCGAAGTAAAAAGATTCTTTTTTAAGT
ATAAGGAAAAGAATATATATGAATACCTGTTGTCTAATTTGTATAGAGATGCACAAAAAAATAATTACGA
TTATATAAGTAAAATGCAACATATAGATGTGAATACATGGCTTCAAGGCGATATACTTCAAAAAATTAGC
AAACTTTCTACAGCTGAGCAGGTTGAACTTAGAGTACCATTTTTATATAAAGATGTATTTGATGTAGCAA
AAAATTTAAGAATGGAGCAAAAAATAAATAAGAATAATACAAAAGTTTTACTTAGAGAGGCGTTTAGAGA
AATAGTCCCAGAATATGTTGTTCAAAGGAAAAAATTAGGATTTCCAACTCCAATAAGAGTTTGGTTAAAA
GATTCTCTAGGGGATATTGTAAAGGAAACTATTTATAATTCAAATGTAGATGAATTTATAGATAAAAAAT
ATGCAATAAAACTTTTAGATACGCATCTTAAAGGTCATAGAGATAATTCGAGAAAAATATGGACTATATT
TACATTTTGTCTATGGCATCAATTATTTATTGAGCATAAAAATGTCGAGTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c1806572-1805136 putative serine protease [Clostridium difficile R20291]
ATGATTTGTACTATTAAACCATTAAAGATTTCAATAAAAAAGTCAACTGAACCTCTAATTGAATTTATAT
CTGATACTACCTATAAAAATAAGAGTTCTTCATATATTAAAGAAGTCCACTTTACAAGATATATAGGTGT
TGATGATTCAATTGATAAATACATAGAAAAAGTTAAAAATATAGATACTTATTTTTTTAATAATCCTACA
ATTCCCTATATTAGATTAAACAATCTAAAAATAAATTTTGACAAAGAACAAACAGATAAGATGCTTAAAA
TTTTTAATATTTATGATAGTTCTAAGTTTAACAGTTGGGATTTATATAATATCGACTTTCCATGTAAAAT
AGAAAATGACACTTTAAATTGGACTAAAAAGATTGCATTTAAAAATACTTTAGATTTATTTTCCACAAGT
ATGCCAAATTGTACATCCTCTATCATCAAAAACTTTGCAGTTAAACTTTTGTGTTGGATGGACTATTTTC
TACCTAAATTATTTTATAACAAGGTGAAGACTACTATTTCACCAAAGATAGTATACTTTGGAAATATTAA
AAGGCAAGAACTTTTTTTCTTATATTTTTTATCACAACTTGGGTGTGATATTTTATATATAAATCCAAAT
AAAGATATTCTTGATTTATATCCTGAATGTTCAAAATTTTCTACTCTATTTGAACTTTCTAGGAAAACTC
CAAATATATTAGAAATACCTTTTGAAAGGCATATTACAAATATAAATTACAGTGAAAATACCAATAAGAC
TTCTCCTACTACGAATAAACCTAACTCTAAAAATACACTTAATAACACAAATCTAACATCTAAAAAAATT
GCACAAGATGAGGAAGTAGAACTTTCTTATGAAGACCTTGCAAAGTTATCAGCTTCTGTTGTTATGATTG
TTGTGTGCAATAACGAAAATAAACCGTTTAAGAGTGGTTCTGGAGTAGTAATAAATAATGAAGGTTATAT
ACTTACGAATCTTCATGTAGTCAATGATGGGTATTCATTTTTAGTTAGATTTGAAAATGATGATAAAGTT
TATACATCTTACCAAATTATAAAATACCATTCAGATTATGATTTAGCTGTGATAAAGGTTGATAGAAAAT
GCAAACCAATACCTGTTAAAGTCAGTAAAAAACCTGTGAGAGGTCAAAAAATAGTTGCAATTGGAAGCCC
TTTAGGTCTTTTTAATACAGTTTCAGATGGAATTATCTCAGCTTTTCGTGATTTTGAAACGGTTCAAATG
ATACAATTTACAGCTCCAATCTCTAGTGGTAGTTCAGGAGGAGCTCTTTTAGATATGTTTGGAAACTTAC
TAGGATTGATTTCCGCTGGATATGATGATGGACAAAACTTAAATTTAGCTGTTGAAAGTAATCTTGTCAA
AATATTTGCCAATAATTTTATTGAGATAGTAAACTAA
>ref|NC_013316.1|:1806901-1807479 tellurium resistance protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGGTATAACATTATCAAAAGGCCAAAAGGTTGATTTAACTAAAGGAAATCCAGGTCTTAAAAATATTT
TAGTAGGTTTAGGATGGGATACTAACAAGTATGATGGTGGATTTGACTTTGATTTAGATACAGCAGCATT
TTTAACAGGAGCAAGTGGAAGTGTTACTAATGATGGAGATTTTGTATTTTACAACAATTTAAAACATACA
TCTGGAGCAGTTGAGCATCTAGGAGATAACAGAACTGGCGAAGGTGATGGAGATGATGAACAAATAGTTG
TTGATTTATCTAAGATTCCTGGAGAAATAAGCAAGATTTCTTTTACTGTTACAATTCATGATGCGACAGA
AAGAAGACAAAATTTTGGACAAGTAAGTAATTCTTATATAAGAATAGTAGATAAAGACACAAATGAAGAG
TTAATAAAGTATGAATTAGGAGAAGATTTTAGTATAGAAACAGCTATAGTAGTAGCTGAAATATATAAGC
ACAATGGAGAATGGAAGTTTAATGCACTAGGTTCTGGTTTTGAAGGTGGTCTTGCTGCATTATGTGGAAA
CTTTGGAATAAACTTATAA
>ref|NC_013316.1|:1807518-1808096 tellurium resistance protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTATAGTATTAAAAAAAGGACAAAAAATCGATTTAACTAAGGGAAATCCAGGTCTTAAAAATATAA
AACTTGGACTAGGATGGGATACAAATTCATTTGATAGTGGCTATGATTATGATTTAGATGTAAGTGTTTT
CATGGTTGGAGAATCTCAAAGAGTTGAAAAAGATGAAGATTTTATATTCTACAATAACTTAAGACATCCA
TCTGGAGCAGTTGAACACTTAGGTGATAATAGAACTGGTGAAGGTGATGGAGATGATGAGGAAATATTAG
TGAATTTAGAGACAATGCCAAAGCATATACAAAAGATAGCTGTAACAGTTACAATATATGAGGCTGCTGA
AAGAAGACAAAATTTTGGACAAGTAAGCAACTCATATATAAGAGTATTAAATTCTGAAAATGATGAAGAA
ATATTAAGATATGACTTAGGTGAAGAATTTAGTATAGAAACTGCAATTACAGTATGTGAGATATATAAGT
ATAATGGAGAATGGAAGTTTAGTGCAGTTGGAGCAGGATTTGAAGGTGGCTTAGAAGCACTTTGTAGAAA
CTATGGCTTAAATGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1808182-1808811 tellurium resistance protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTCGATTAATTTATCAAAAGGTGATAAAATAGATTTAAAAAAATCTAACCCAGGACTGAGTAACATAC
TTGTAGGTCTAGGATGGGACCCTGTGCAACAATCTGGAGGAGGTTTTTTTAAATCGTTATTTGGTGGAGG
ACAAGCTGATATAGATTGTGATGCATCTGTATTTATGCTTAATCAAGAAGGTAAATTAAGTGGAATAAAA
GATTTAATTTATTTTGGAAATCTAAAAAGTGCCTGTAAATCAGTTTTGCATACAGGAGACAATCTAACTG
GTGAGGGTACAGGTGATGATGAACAAATCCTAGTTAATTTGGATAAAGTTCCATCAAATATTCATAAATT
ATTGTTTGTAGTAAATATATACAATTGTGTAGATAGAAAACAACACTTTGGAATGATAGAAAATGCCTAT
ATAAGAGTTGAAGACCAAGGTAATAAGAAAGAGATAGCAAAATACAATCTATCTGATAATTATTCTGAAA
AAACTACTCTTATAGTAGGAGCTATATATAGAAAAGATGGAAGTTGGCAATTTAAAGCAATTGGTGAAGG
AACAAAAGATGCGGGTCTTAAAGAAGTAATGCAAAATTTAGACAGGATTGAGTGTGCATATGGAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:1808795-1811560 putative calcium-transporting ATPase [Clostridium difficile R20291]
GTGCATATGGAATTTAATAATGATATCAAATATTATAATGTAGATAAAGAAGAAGTTACAAAAGACTTAT
CTGTTAATCCTGAAAAAGGTTTATCAGAATCAGAAGTCAAGACTAGAAGAGAAAAATATGGTTTGAATGA
ATTTACTCCAAAAGAAGAGGGTAGTTTTTGGGATGATTTAAAAGAAAGTTTAAGTGAACCAATGATAGTT
ATCTTGATTATTGCAGCAGTAGTAAGTGCAGTAATTGGGGAAACTCATGATGCAATAGGGATTGTAGGTG
CTATAGCAATAGGTATAGCAATAGGTATGATTACAGAAGGTCGTTCTAAGAAAGCAGCAGAGGCTCTTTC
TAAGTTGACTGAAAACATAGAAGTAAAAGTATTGAGAGATGGGGAAGTACATCAAATTTCTAAGAGTGAA
TTGGTACCAGGTGATATAGTATATATTGAAACTGGTGACATGGTACCTGCTGATGGTAGACTTATAGAAA
GTATAAACCTTAAAATTAGAGAAGATATGTTAACAGGAGAATCTGATGACGTATCTAAAAAGTGTGATGT
AGTAGTTTCTATGGAAGAGATAGAATCTAAAGGAGCAGTAGTAGTACAGGAGCCAATACCTGCAAAACAG
ATAAATATGGTGTTTGGTGGTACACTTGTAGCTTATGGTAGAGGAGCTCTAGTTGTAACTTCAATTGGAG
ATAATAGTGAAATGGGTAAAATTGCTCAAAACTTATCAGAAACAGATGAGCAAACTCCACTTCAGATAAA
ACTTGGAAATTTAGGTGGTTTGATAGCCAAAGTTTCTAGTGCAGTAGCAGGATTACTATTTATATTTATG
GTTTTCCAAATGATAAGTAAGAATGTATTAAATGTAGATATGTCTGGAATATTACCGTTTTTAGAATCAA
TAGACCCAGTTAAAACAGCATTTACAGTATGTGTTGCGTTGATAGTTGCAGCAGTGCCAGAAGGTCTTCC
AACTATGATAAATATGACACTTGCAATAACAATGCAAAAAATGGCTAAAATAAATGCATTGGTTACCAAA
AAAGAAGCTTGTGAAACGATAGGTTCTGTTTCTGTAATATGTTCAGATAAAACTGGTACATTAACTGAAA
ATAGAATGACTGTAGAAGTTGCATATGTTGATGGCAGATATATTGAAAGTTCAGAAGAGGAAATAAATAG
TTATTTTGAAGAAAACTGTATGATAAACTCTACAGCTGATGTAGAGCACAATGATGGTGATATTAAGTAT
TTAGGAAGTGCTACTGAATGTGCATTGCTTTTATATTACAAAAACGTAGATTATAGACAAGTTAGAAAAA
ATTCTAATATAGTAGCTCAAAATCCTTTTACTTCAGATTCAAAGAGAATGACTTCTGTTATAGGTCAAGA
TAATCATCATGTACTATTATCAAAAGGAGCACCAGAAGTCTTACTTGAATTATGTTCACATATTCAAAGA
GGAAAAGACATAGTTCCATTAACTGAAAATATAAAACATGAGATTTTAGAAGAAATAAAGAAATTGCAAA
TAAAATCAATGAGAACTTTAGGGTTTGCATATAAAGAAATCTCACAAGCTGAAGAAGAAGCAGCAGTAAC
TGCTGAAAGTGATGCTATGAATGTAAGTGCAATGGAAAATAATTTAGTATTTAGTGGTTTTGTTGGTATA
AGAGACCCACTTAGAAAAGATGTTATAGAGTCTGTAAATACAGCAAATAAAGCTGGTGTTTCTGTAAAAA
TGCTTACAGGAGATAATATAAATACGGCAAGAGCTATAGGTGAAGAGTTAGGCCTATTAAAAAATAATAT
GAGAGTGGTTGAAGCTTCATATATAGATACTTTAGATGATGAAGAATTAAAACAAGAGATACAAAGTATT
TCAATCGTGGCAAGAAGTAAACCAGATAGTAAAATGAGAATAGTTTCAGCTCTGCAAAAGAGCGGGGATG
TTGTTGCAGTAACAGGTGATGGTATAAATGATGCTCCAGCACTTTCAAAAGCAGATGTTGGTATAGCAAT
GGGTATATCTGGTACAGAGGTATCTAAAAACGCAGCAGACATAATTTTAACTGATGATAGTTTTAGTACC
ATTGTAAAAGGTATTAAATGGGGTAGAGGAATTTATGATAACTTCCAAAGATTCGTTCAATTCCAATTAA
CTGTAAATGTAATTGCATTTTTAGTGGCTATAATATCTCAAGTTATGGGACAAGAGATGCCATTTACTAC
AATACAATTATTATGGGTAAACATAATTATGGATGGACCACCAGCACTAGCATTAGGTTTAGAGCCAGTT
AGAGACCATGTGTTAAATAGAAAACCTGTTGATAGAAAAGCCAATATAATTTCTAAGTCAATGGTGTATA
CAATAGTATTAAATGCATTTTATATAACAGCAATACTAATGTTACAATCTACATTTAATTTCTTAGGAGT
TGATGAAGCTCATAAGGGAACAGTAATGTTTGCGTTATTTGCTTTTAGCGCACTGTTTAATGCATTTAAC
TGTAGAGAGTTTAATGCAGATAGTATCTTCCCTAATTTTACACATAACAAATTAGCACTACAAATAATAG
TGTTGACAGGAATTGCACAAGTAATATTTACTCAGCTATTCCAAGATTTCTTTAACTCTGTAGCAATGGA
TTTTATGACATGGGTAAAAGTTTTATGTGTAGCAGCAAGTGTAATTGTGGTTAATGAAGTTGTAAAATGT
ATAATAAGACTGGTAAAACCAAAAAAGACTGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:1811647-1813209 hypothetical protein CDR20291_1536 [Clostridium difficile R20291]
ATGGGTGACTCAAAGGTATTTGAAAAAATATTCTCCAGCCAATCAGATAGAGGAAATTACACTCCTTCAA
AGGGATATCTAAGTTATTTTATTTCGTATATTGGTTTAGAAGATGAAGTTTTGTACAATCTCGAGATATT
TAAGACAAAACAAAATATTGATAGCAAAAAAGATATTGCTTTATTTACTGATGTTATAGCAAATCCTAGT
GATTTTGATATTATAAATTATTTTAAAAGTGGACTTCAAAAATATAGAACTAGCATGGAAGATGTAGATA
TAAATATTTTGGGATTTGAAGAGATTGATTATAAAATAAAGCAAGCAATGGATAGAGTGTTAAAAGAAGA
GGAAAAAGAATTTACTAATGATAGAGTTAAACAAAATTTTATAGTGAAAATAATGGCATGGATAAAAATT
TATATCGGTGCTTTAGATATAAATAAAAATGAAGCTCCAAAAGTAATATTTTATGGAGATATAAAAAAAC
ATGAAGTTTATTTACTCTTAATATTATACTTGGCAGGTTTTGATGTTTTATATCTTAATCCAAATTCAAA
GAGTAATATAGATATTTTAAAATCAGAAAGATACAATATAGAGTTTGAAGAAGCCAACATAATAGAAGAA
AAAATTTCTTTTGAAGAAAGGGTTATTTTAGGGGAAAAAATAGATAAAAGTTCTGTAAAAAAAGCTTTTA
CTGTTGGGGCAGAAGCATCAAAGCGTATAAGTGAGGAATTGTTAAATGATGCAGGATTTATAAAACCTTG
GCAACTCCAAGATAGAAAAATAAAAAATCTACTTCTAAGTTCAACTGTTGATGAAATATCAATATACTGG
AATCAACCACTTAAATTAAGACCAGGATTTAAGTTTAATGATGCTATTGTAGAAGCTCCAAATTTTCTTT
CTAAGATTAATGGAATATATAATGATAAGAATGAATATATTAAGTTTTTAGATTTATTAAGAGATTCGGA
AAGTTCAACATTTATTGAATTTAATGGAGATGTAGATAGATTTTCAAAAGCTTTTACGAGAGAAGCTTTT
AGTTTATCCTTTTTATTGGATTCAAAAGGTGTAATAGATAAAAACTCTGTTTTAAATAATAAAGATTATT
CCATATCAACACTAGCACTTAATCAACAAATTATGATTTTAGAGAAAGTGGAAGAGTTGTTAGAAGGAAG
TATGTTTTTGAATGGTTTAAGTGGAGAAGACAAGATAAAAGGTCTATTTACAGTACTTCACATGGATAAG
AAATTTGTTCATATGATGAACAATTTCGATTACTCACTTATAAACCCAAAATTGATTATATACATGTACA
AGAGTATTGTATTTGATAAAGAAATAGTTTTTCTTATGCTTTTACTTAGTAAGATTGGATTTGATATTAT
CATATTATGTCCAGGAGGAGAAAACAATATAGAGAATGTTATAAATAACCAATTGATTGATATACACAGA
TTGGATAAAATGGTATATGACCTTAAATTAAATTCGCTTGAAAATGATATACCTTTACTTAAAAAAATTT
TTGGAAAGAGGAGACGATTTTAG
>ref|NC_013316.1|:1813210-1814346 putative tellurite resistance protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGGGATAAATATAAATAGTTTTTCAAAAGATAAGAACTCTGTAGAGGTTACTGAGAATTTGCCTACAG
CAGTTCAAGAAGAAAACTTCGATATAATGGAATATACAAATAATAAAAAAAATGAACTGAGAAAGTCTAA
GGAAGTTGAGGCATTGACATCCCTTATAGAAGTAGAAAATCCAGATACGATTTTACAGTTTGGTAGGAAA
GCATCTGAAGGAGTAGCAAGAGTTTCTGATAGCCTTTTAAATACAATAAAATTAAATAGAAATGAAGAAA
ATTCTAAAATGCTGGTTCATTTAACTAAAATAATGGATAAGTTTGATTTAGACGATTTTCAAGAAACTAA
GGAACCAAATTTCGTTCAAAAACTTTTCAAAAAAGCTAATAATGCCATTGAAATGATGTTTCAAAAGTAT
GAAACATTGGGAGGAGAAGTTGAGAAAATTCAAATTGAGCTTGAGCAATACGAAAGAGATATAGCACTTT
CTAATAAGCAAATAGGTGCTATGTTAAATGAAAACTTTGAGTTTTATAATGAACTTCAAAAATATATTGT
TGCTGGAGAAATGGCAATAGAAGAAATGGATAATGAAATACTACCTTTCTTTAAACAAAAATCAGAGACT
AGTGGAGACCAAATGGATGTTGTCAATTATCAAGAACTATTAAAAGTTTATGATATGTTAAATCAAAGAG
TCTATGATTTAAGAATAGCAGAAAATATAGCTATCCAAACAATACCTATGCTTAGAGGTATGCAACATAA
TAATTATGGTTTAATTAGAAAAATAAATAGTGCATTTGTCGTAACTTTACCAGTATTTAAACAATGTTTA
TCTCAAGCTATATTACTTAAAAAGCAAGAATTACAAGCAAAATCTCTAAAAGCACTTGATGACAAAACTA
ATGAATTATTGCTTAGAAATGCACAAAATGTAAGTACTCAAAGTGCACAAATAGCTAGAATGGCTGGAAC
AAGTTCTGTTCAAATAGAAACATTGGAAAAAATGTACAATACTATCAAGTCTGGTATAGATGAAACTATG
AGAATAGAAGAAAACAATAGAGCTTTAATTAAGGATAATACAAAGAGATTGGAAGAATTAAATACGACTA
TAATTTATAATAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:1814410-1815486 hypothetical protein CDR20291_1538 [Clostridium difficile R20291]
TTGAAATATTTCGATTATATCTGCAAAGATGATTTGGAGAGAATTTTTTTGAAGGAGCCAGAAGACTTTA
GTGCTAAGACTGAAAAAGATGTGTTGAAATATGCACTGGGCGCTTTTTTATACGTTCCAGCTACTCAATA
TAATATGATTTATAAGAGTATTATAGGGGATGTTAAGGGAGTTAGACCATTAGCTATTTGTTTAGAAGAT
GCTGTTGGAGTAAATGGAGAGTTAGAGGCTATAGAAAATCTTAGATTAATTTTAAAAAATATTAGCAATG
AAAGTATAACTAATAAAGATGGAATACCACTAATTTTTGTAAGAATAAAAGATGTGGAGCAACTGTTGAG
AATTAAAGAGATTATAATTAAAAATAGTCATTCTATAACAGGAATATTAATTCCTAAAGCAAATTCGGAG
TTGATTGAAAATTGTATAGAAGCTTTATATTCTATGAATCTTCAAGATATGTATGTTATTCCAATAATAG
AGACAAGAGAATTTATATATAATGAAAAAAAAGAACTTAGTTTTACTAATTTGTACAATGCTATTTTAAG
ACATAAGTCAAGAATATTAAGCATTAGAGTAGGCATAACTGATATATTAGGGATGTATGGTATAAGGAGA
GATAAAAACTTCTCTATATATAATAATTTGATTTGTTCTTCATTTATATTAGATATAATCACATATCTTC
AAAGACCAGAGTTAGATATACCTATAAGTGGTGGAGTATCAGAATTTTTTGATATGACAAATAAGGATAT
AAGAAATAAGTATATAGAAGAAATATTATTGGATAAATATCATGGATTAATTGGAAAGACCGTAATTCAT
CCAATGCAAATTCAAATTGTACAAGCGCTATCTACAGTATCATATGAAGATTTTACTGATGCTTTGGATA
TACTGGATAGTACAGACAGTAAGTATGGTGTGAGCAAGGGTGTATTAGGAGAGAGAATGAATGAAACAAA
TCCACATTTTTTATGGGCTAAAAAAACATTGATTCTATCTAAAATATATGGTGTATTAAATAAAGGAGTA
GACTATGAAGAATTGCTTAAATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1815464-1816702 hypothetical protein CDR20291_1539 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAATTGCTTAAATTTTAATTGTGAGATTGACATTATTGATAATCCATTGAATTTAGAACTAAATG
ATTTTTTAGACGTAGGAGTAAGAAATAATAGCAAAAGACGTTTTTTGTTTATCTCAAAGAAACTCGGTAA
ACATTTAGCATGTAAGCCAAGTGAGATGGATAATTTGGGAAAATTAATGGCTACAATTTATAATGAAAAA
AATAAGGAAGAATCAAATGGTACTGTTATAGCTTTTGCTGAAACTGGTACAGCTGTTGGGCATAGTTTTT
TTGATTACTTATGTGGAGATTATGAATTTATTCATACTACTAGAGAGCAGTTTGACGAGTTAGAAAATCT
GGAATTTTTAGAGGAACATTCCCATGCAACAGACCAGAATTTATACTTTGGTATGCTTAACAACTTTAAA
TTTGGAGATGAGATAATATTGGTTGATGATGAGATTACCACAGCCAATACATGCATGAATATAATTAGGA
AAATTCAAAGCATTTATCCTAAAAAGAAATACACTATATGCTCAATACTCAATTGGGTAAGTGATGAAAA
TTTAAGTAAAGTTACTCGTTTAGAAAGAGAGCTAAATTGTAAGATAGATTTTGTATACTTATTTAAAGGA
AACTTTAAATTTTATATAGATGAAGATATTATTTCAAATTACAACGATAATTATAGTATTACTAAATTAG
AGACTATTTCAAGTGATAAAGTAAATTTAGTAGTAAATCATATTTATGTTGATTTAGAAGATTATATTGG
AAATAAGAAATATGTAAAATATACAGGAAGATTTGGAATTAATAGAAGAGAACAATTTAGATTAAAAGAA
ATCGTTAAGAGAGAAAGTAAAAAAATAACTATGGCCAGTAAAGAATCTTTAAAAAATGAAAAAGAAAAGA
TTCTATTTTTAGGTACTGAAGAATTTATGTATATACCTATGCTGTTTGCAAAAGAAAAAGAAAATCAATA
TGATATATACTATCATTCAACAACAAGAAGTCCAATTATTAATATTGATAAGAAGCATTATCCTATTAAA
AGTAAATTTATGCTAAAGAGTTTTTATAATATAGATATTCAAAATTATATTTACAATATAGATAAACATA
ATTTTTCTAAGTGTTATTTATTTGTAGAGCTGAATAAAAGTGAAAATTCTTATCTAGAATTTATTGATAT
AATTAAAAAAACAAGTATAAAAGAATTAACTATAGTATGTTGTAGCTAA
>ref|NC_013316.1|:1816756-1817844 hypothetical protein CDR20291_1540 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAGATTTTAGCACGTATTCTAAAGATGATGTTATTTTTTTATTAAAAGATATATCAAATTTAATTG
AAGAAGAAGGAAATAAAGAAAGAGAATTAAAAATACAAAATGGTAGACATTATTCAGAAATGATACCAAT
AGAGTATGAAGTTAGTGAAGATTATCTGAATTTATATCATGAGAAACTAAGAGAAAATAAAGATAAGCTT
GCATTTTCTATAGGAGTTATGTGTGAAAAAATAATTAAAAAAAATGGAAATGATGTAGTACTAGTTTCAC
TTGCTAGAGCAGGAACACCTATTGGTATTTTGGCAAAAAGATATATAAGAAGCAAGTATAATGTAAGTTT
ACCTCACTATACAATCTCTATAATAAGAGATAAGGGAATAGATATGAATGCAATTGAATATATAGTAAAG
AATCATCCGAGCTCAAAAATTCAATTTTTAGATGGATGGACTGGTAAGGGAACTATATCAAAAGAACTTG
AAAAAGCATGTGATGAACTTAATGTTAAATTTAAAAAACATTTTGACTCAACACTTGCTGTATTAGCTGA
CCCTGCTGGATATTCAGGACTTTATGGAATTAGAGAAGATTTCTTAATACCAAGTGCATGTTTAAATTCA
ACCGTTTCTGGTTTAGTAAGTAGAACTGTACTAAGAGAGGATTTAATTGGTAAAAATGACTTTCATGGAG
CTAAGTTTTATAGACATTTAAAAGATAAAGATGAATCTATGAACTATATCGAAACTATAGAAGAATGTTT
TAAAAATCAATTTAAGAATATATCTGATGAAGTTGAAAACTGGGAAAGTGACATTATAACAAGAGATGGA
TACTTTGATGTTTTAAATATAAAAGAAAAGTATAACATAACAGATATTAACTTTATCAAACCAGGTGTAG
GGGAAACGACAAGGGTTTTACTTAGAAGAGTTCCGTATAAGATTCTTGTTAAAGACTTAAATGATAAATC
TTTAGACCATATATTCATATTAGCTAAGGAGAAAAATGTTGAAGTTGAACAAATGGATTTAAAAGCCTAT
AAATGTTGTGGAATAATAAAAAATATGAAAGATATTTAG
>ref|NC_013316.1|:1817872-1818663 hypothetical protein CDR20291_1541 [Clostridium difficile R20291]
ATGATTGTTTTTTCAGATTTAGACAGGAGTATCATTTACTCCAATAAATTTTTAAATGCTGATAGTAAAT
ATGCTAATATAGAAATTTATAGGGAAAAAGAAATATCTTATATATCTTTAGATACTATAAATTTAATAAA
GCAAATACAATATTATGGTATGTTTATACCTACAACTACTAGAACAGTGGAGCAATTTAAGCGTATAGAA
TTTAATAAATATGGGATTTATTTTCCTTGGAGTATAACTTCAAATGGAGGAGTTATACTTAAAGATAATG
AAATATTGAAATCATGGAGTGAAAAAATAGATAAACTAAAACCTGATTATGAGCCCATTGAAAGTATGAT
TCATAAATTTAAAGACTATTTGAATGTAGATGGAATAACTAATTTTAAAGTTGCAGAAGATACATTTTTT
TATATAGTTGTTGATTTCTCAAGATTTAATTTGGATTCAATCAAAGAATATACAAATATATTGGAATCAA
AAAATTGGAAGTTTTATGTGAGTGGCAGAAAAATATATTTTATACCAAAAGAAATTTCAAAAGAAAATGC
TATAAAATACTTGACTAAAGAATTAGGAATAGAATATTTTTATGCAGTTGGAGATTCTATTATGGACTAT
GGTATGCTTAATATCTCAAATAAATCCTATGTATTGAAGCATGGTGATATAAATAAAAATGAAATAGAAA
ATTCATTTATATCAAGTTCTTTCAAAGGAATGAGTGGAACTGAAGAGATATTATCTAACATTTTAGACGA
GAACTGCCTACTTAATATATAA
>ref|NC_013316.1|:c1819332-1818778 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATAGATGTCGGAAGCAAAATTAGATCTCTTAGAAAATCTAAAAATATAAGTATCTCTACTTTAG
CAAAAAATTCAGATTTAAGTACAGGCTTAATAAGTCAAATTGAGCGTAATATGGTTGTTCCATCTATTGT
AGCAATGTGGAAAATATCAAAAGCTCTTGATATAAATATAGGTTATTTTTTTGAAGAGATTGGAAGAGAG
GACTCTGATATAGTAGTAAAGAAAAATAATCGAAAAAAAATAGTAACTAATGATTCTACAAAATTTTATG
AACTTCTTGTTCCTAATTTATCTGGGAAAAAAATAGAATTTATACTTGTTACGCTAGATGGTCATACACA
AAAAAACAGTGAATTTGTGACACACGAAGGAGAAGAATGTGGCTATATAATAAAAGGTAAAATGAAGATA
ACACTTGGAAATAAGGAATATCTATTGGAGGAAGGAGATAGTTTTTATTTTAACAGTACTATACCACATG
TGTATGAAAATTATGATGATGAGGTATGTATCTCAGTCTGGGCAATGACTCCACCTTCATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1819512-1820729 hypothetical protein CDR20291_1543 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGTAATTAAGATGAAGAGTTTTGTAAGTCCTGATAATATTTGGGTATTATGGGCAGTTGTAACTG
GATGGGCAGCATTTAGTATTTACTTGGAACAAAAGTACAATTGGGCATCAAAAGTGTCGGGAGCAATAAT
AGCTCTTGTAGGAGCAATGTTATTATCAAATCTAAATATTATACCAGTAGAGTCTGTTGTATATGACCAA
GTATGGGGATATGTTGTTCCTTTAGCCATAGCTTTATTGTTATATCAATGTAATATTAAAAAGATATGGA
AAGAAAGTGGAAGATTGCTCATTATATTTCTTGTAGGTTCTGTAGGAACTGTACTTGGAGCTATGATTGG
ATTTTTAGCATTAAAAAATGTAGTACCAGATTTAAATATTGTTGCAGCTATGATGACAGGTTCTTATATA
GGTGGAAATGTAAACTTTGCTGCTATGTCAGGGGCGTTTGATGCGCCAGGAGAATTAGTATCAGCAACAG
TTGTAGCAGATAATCTTTTAATGGCATTATATTTCTTTGTCTTAATAGCTATACCATCAATTGGATTTTT
TAGAAAACATTTTAAACATCCACATGTAGATGAAATGGAAAGTATAGGTATAACTGAAGGAGAAACAGTA
GCAGCAAATTATTGGGGAAGAAAAGAAATATCTTTAAAAGATATAGCAATAGCCATTGGTAGCGCCTTTA
TAATTGTCGCAGTATCTGTAGAACTATCAACTTGGTTTAAAGCTATAATACCATTATCAAATCCTTTTTT
AGCAATGTTAAATACTTTATTTGGAAATCAATATCTAATAATAACTACTTTGACTATGTTGTTTGCCACA
TTTATGCCTAATTTCTTTGGTGATATAAAAGGAGCACAGGAATTGGGTACATTTTTAATATATATATTCT
TTGTTGTAGTAGGTGTTCCTGCTTCAATAACATTAATAATTCAAAAATCACCATTACTACTTTTATACTG
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GAAGCTATTCTTGCATCTAATGCAAATATTGGTGGTCCTACAACAGCAGCAGCTATGGCAATATCAAAAG
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TCTTTTAGTAGGAAATATTTTGATATAA
>ref|NC_013316.1|:1820786-1821766 putative dipeptidase [Clostridium difficile R20291]
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TATTTAGAAGAATCCATCTTGATAATTTTAAAAGAGCAAATATAGAAGGAGCTATTTTTGTAATATGGAT
AGACCCACCATATGATAAAGAGCCTGAAAAAAGAGTTAAACAAATTATAAGCTCTATAAAAGATGAAATT
GAAGATATGAAAGATGTTGTAAACATAGTAAAAAAATATTCAGATATAGATAAAGGTATAAGTGAAAACA
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TTATAAAGAAGTTGGTGCAAGACATGCATCATTAACTTGGAATGAACAGAATGAACTTGCTACAGGATGT
TTAGGGGATGAAAATCGTGGTTTAACTGAAATAGGTAAAAAAGCAGTCAATAAAATGGAAAAATTGGGCA
TGATAGTAGATGTGTCACATTTAAATGAAAAATCATTTTGGGATTTAATGTCTGTTGCAAGTAAGCCAGT
TATAGCTTCTCATTCTAATGCTAGGAGTTTATGTGATGCTAAAAGAAATCTTACAGATAATCAATTAAAA
GAAATTTCAAATACAGGTGGATTAGTTGGAATAAATAGTTTTAGAGGATTTACTAATAGTAATCCTAAGA
AGCAAGATTTAATACATTTGGTTGACCATATAGACTATATGGTAAATCTTATAGGTATAGAACATGTATC
TTTTGGTTTTGATTTTAGTGATTACTTAGGGAAAGAGACTATAGGTTCTTTTACTGGAAATGCTAGTGTG
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ATAAAAAGAAAGATATAGAGTTAATCTCTAGTGGTAATTTTTATAGGCTCTTTAAAGATATACTAAAATA
A
>ref|NC_013316.1|:1822013-1822966 putative iron compound ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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ATATAAATATAATGCATATATTTGCAAAAAATCAGCATAAGCTTATGATATTTATCATGAGTAGGGTACC
AAGATTAATAAGTATATTGATTGCTGGTGTAGGAATGAGCATAGCAGGTCTTATAATGCAACAGATAAGT
AAGAATAAATTTGTATCACCTACAACAGGTGCTACAATAGATGCAGCTCAATTTGGGATAGTAATATGTA
TGCTTTTAGTACCAACTGCCTCTATTTTTACAAAGACAATAATAGCATTTGTATTTTCTCTTGTAGGGAC
TTTTACGTTTATGAAAATAATAGGGAAGTTACAATTTAAAAATATAATCTTTGTACCATTAGTAGGTATA
ATGTTTGGAAATATAATAGGTTCTATGACGGATTTTATCGCGTATAAATACGATTTGAGTCAAAATGTTA
GTTCTTGGATGCAAGGTGACTTTTCTATGATACTTAAAGGAAATTATGAGATATTATATATCACAATACC
CCTTATAATATTAGCATATATTTATGCAAATAAATTTACTGTTGTTGGTATGGGTATGGATTTTGCGACA
AACTTAGGTCTTAGTTACAAAAGAATTGTCAATATAGGTCTGATAATAGTAGCACTTGTTACAGTATGTG
TAGTCGTTACAGCTGGTAATATCCCTTTTATAGGTCTAATAGTTCCCAATATCGTATCCTTGTATATGGG
TGATAATATAAGAGCAAGCATATGGTATACTGGTTTACTTGGAGCGGTATTTGTACTTATATGTGATATT
TTTGGAAGAATTATTATTTATCCATATGAAATATCTATAGGACTTACAGTTGGAGTTATAGGAAGTATAC
TATTCCTTTATTTAATATTAAGGAGGAATGTGAATGAAGCTTAG
>ref|NC_013316.1|:1822956-1823912 putative iron compound ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGCTTAGTCTCAATCAAAAAATTTACTTTGTAAGTATATTACTATTCATATCAATAGCACTTTTTA
TAATTTATGGAATAGACATGAATCATTTAGAATATGCATTATCACAAAGAATACCAAAAATATTTGCTAT
GGTATTAGGTGGAGGATGTATAGCATTTACTACTGTAGTGTTTCAAACAATTACAAACAATCAAATATTA
ACACCAAGTGTACTAGGTTTAGATTCATTGTATGTAATGATTCAAACTATAATAGTATTCATATTTGGTT
CAAGCAGTAGTCTGATTATAAATGAAAATTATAATTTTATTATTAATGTAGCTATGATGATTGGAGCTTC
ATTGTTATTATATAAGATGTTATTTGAAAAAAATAAAAATAATATTTTCTTTTTAATCCTAGTAGGTATG
ATATTTGGAACCTTATTTAAAAGTGCAACAACATTTATTCAAGTAATGATAGACCCGAATGAATTTTTAG
CTTTACAAACTAGTATAATGGCAAGTTTAAACAATATAAACACTAATGTATTGTTAATAGCATTTATAAT
AATTATTGCCATAATACCTTTTATATATGATGAAATAAAGTATTTAGATGTATTGTCGTTAGGTAAAGAA
CAAGCAATTAATTTAGGTGTAGATTTTGATAAGGCAGTTAAAAAAATGATAATATTAATAGCAATTTTAG
TCTCAATATCAACAGCACTTATTGGACCTATGACATTTTTAGGACTTTTACTTGCTAATATAACAAGAGA
AATTTTTAAAACATATAAGCATACATACTTGATTTCGGGTTCTATGTTGATAGGGATGATTACATTGATA
ATAGGTCAATTTTTTATACAACATGTATTTAAGTTTGATACGACTTTAAGTGTAGTAATAAATTTTATAG
GAGGAATTTACTTTATTCAATTACTATTAAAGGGGGCAAATAGATGA
>ref|NC_013316.1|:1823909-1824664 putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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TAGAAAAGGGAAAGATAACATCTTTTATAGGACCAAATGGAGCTGGAAAAAGTACAGTACTATCAATAGT
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AAAGAATTAGCAAAAAAAATAGCTATTCTTAAACAATCTAACAATATAACTTTAAAGCTTACAATAAGAG
AATTAGTTGGATTTGGAAGATTTCCATATAGTGAAGGTAATCTAACTAAAGAGGATGAAAATTATATTGA
TGAAGCAATAGAATATATGAAGTTGACTGATATACAACATAAGTATTTAGATGAATTGAGTGGAGGTCAA
AGACAAAGAGCTTATATAGCAATGGTAATAGCTCAAGATACAGAGTACATATTACTTGATGAACCACTGA
ACAATTTGGATATGAACCATTCCGTACAGATGATGAAGGTACTTAGAAGTCTTTGTGATGAGTTAGATAA
GACTATAGTATTAGTAATGCATGATATAAATTTTGCATCATGTTATTCAGATAATATAGTTGCATTAAAA
AATGGAAAAGTTGAAAAAGTAGGTCGTACAGATGAGATAGTAAATGAAAAAGTTTTAGAAGATATTTATG
AGATGAATTTTAACATTAAGAATATAAATGGAAATCGAATCTGTATTTATTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1824756-1825721 putative iron compound ABC transporter, substrate-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAAAAGCAGCAATAGTAGCAGCAGTAGCTATTATAGGATTAGTGACAGTGTTTGCATTAGGTG
GAAGTAAAAAGAATGAATCAAAAACATCAGAAAATTCAAATAATACCATAAAGATAACTCATAACTTGGG
AGAAACAGATGTAAAATTAAATCCTAAAAAAGTAGTAGTATTTGATTATTCGGCTTTAGATACAATGGAT
GCATTAGGTGTAGCTGAGAATTTAGTAGGACTTCCAAAAACGAGTTTACCAGCATCTTTAGAAAAATATA
AGGATAAGAAGTATGCAGATTTAGGAGGTTTAAAAGAACCAGATTTAGAAGGTATAAAGTCGGCAAATCC
AGATTTAATTATAATAAATGGAAGACAAGAAGATTTTTATGAACAATTGTCAAAAATAGCACCAACAATA
AGTACAAGTAAAGATGATAAGAAGTACTTAGAATCTGTTAAAAATAATATAGACAAAATAGCAAAAATAT
TTGGAGTAGAAGAAAAAGCAAATCAAGAATTTAGTAAAATTGAAAAGAAAATAGAAACTTTGAATAAAAA
AGTAACAGATAAAAATTTAAATGCTTTAACTATAATGGTAAATGAAGGTAATTTAAGTGTATTTGGTGAA
GAATCAAGATTTAGTATATTATACAATAGTTTTGGATTTGAAAATAAAGATAAAAATATAAAAGAATCAA
GTCATGGACAAAATATTACTTTTGAATATATAGCTAAACAAAATCCAGAAGTTATGTTCGTTATAGATAG
AGGAATAGCTACTGGTAGTGATGTAAAAGAAAGCTCAACTGCAAAATCTGTTTTGAACAATGATATAATA
AAATCTATGGATGCATATAAGAATGATAATATAATATATTTAGATTCACCAACATGGTATGTAAATGATG
GTGGTCTAACATCTTTAAATAAAATGATAGATGATGCTTCAAAAGCGGTAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1826541-1828061 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAACAGAATAACCAGTTATTAAGTATAAGTGAAGAGTTTTTTTCTCTTGCAAATGATACAGTGT
TTAAAATAGAAAACTTTTCTAAAGAAAAAAGTAATTACTTAATGACTTTAATAATAATTATATCTATTAT
AGGTATATTAGCATGTATCATATTGATTTTACAATATAGTAAAAAAATGGTTAGACTGGAAAAATTAAAT
GTAGATTTAAAAAATATTGCATATAAAGATGAACTAACAGGAGTAAATACTATAGAAAAATTTAAATTGG
ATGCAAATCAAAATATTTGTATAAATAAGGATAAGAAATTTGCTGTATTCTATATTGATTTTGAAAACTT
TAAATACATTAATGATATATTTGGATATGATTATGGTGACATGATACTGAAAAGATATGCTAATCTTATG
ATGAATGACATAGGGAAATATGAAATATTTGCAAGAGAAATTGCAGATAGATTTGTTGCGTTAAGATGCT
ATGTAGATAAGGAAGATTTAGTAGTAAGACAACGAGATGTAGACAATGAACTAATTAATATAACAAATGA
AATTAAAAATAAACATAGTATTACTGTTGTCAGTGGAATTTGTTGCATTGAAGATGTAAATGAAAAATTA
AGTATAGATGGTTTAATAAATAGAGCAAATTTTGCACAAAAAACTGTTAAGAATAAACCAGGTACTAATT
ATGCTTTTTATAATGACAGTATTCGTAAAAAAATGATTGAAGAAAATACTATCAAGAGTAGAATACATGA
AGCTATTGAAAAAAGAGAATTTATAGTTTATTTACAGCCTAAAGTTAATTTACATAGTCAAAAAATAAAT
TGTGCAGAAGCTTTAGTTCGTTGGCTTACTCCGGATAAAGGTATTATATCTCCAGCAATATTTATTCCAG
TACTTGAGAAGAATTTTTTTATTGCCTTAGTAGATAAGTATGTTTTTGAGGAGGTTTGTAAATGGATTAG
AAAGAGGTTAGATGAAAATAAACCTTTTGTTCAGATATCAGTTAATGTTTCAAGAATACAATTTTATAAC
ACTAAATTTGTAGAAACTTATTCCAATATACAAAATAAATACAGGATACCTAAAAATACTATAGAAATTG
AATTTACAGAGAGTGTTGCTTTTGAGAATCAAAAACATCTTTTGGAAATTATACATGATTTGCATGAAAA
TGGATTTACTTGTTCTTTAGATGATTTTGGAAAAGGTTATTCGTCTTTAAGTGTTTTAAAAGATTTACCA
TTTGATGTTTTAAAGCTTGACTCTATGTTTTTCAAGGCTAGTTTAGATAAAGATAAAGAGAAAATAGTAA
TAAAAAATATTGTACATATGTTAAAAGAGCTTAATATCACAACTGTTGCTGAGGGCATTGAATGCAAGGA
ACAAGTTGAATTTCTTAGGGATATTGGGTGTGATTTAGTTCAGGGATTTGTATTTTATAAACCAATGCCA
ATATTAGAATTTGAAGAAATATTGGATAAAGAGTTTGTTTATAATAGCTAA
>ref|NC_013316.1|:c1828952-1828353 putative tellurium resistance protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTATAGAATTAAAAAAGGGACAAAAAATAAACCTTACAAAAAAGGAAAATAGCGATTTAGGTGAAA
TCTTAGTTAATTTAAATTGGAATCAAAAAGTACAAAAAAAGGGTTTTTTTGGCTCTTTAAGAAGCAGTAA
TATAGATTTAGATTTGGGTTGCCTATTTGAGATGAAAAATGGTGTAAAAGGTGCTGTTCAAGCATTAGGA
AATGCTTTTGGTAGTTTAGACAATCCACCTTTTGCTCAATTAGATGGAGATGACAGAACAGGAAGTAATA
CACAAGGAGAAAATTTAAGAATAAATGGTAATAAAATAAAAGATATAAAAAGAATACTTATTTATGCTTT
TATATACGAAGGTGTAGCTAACTGGTCTGAAGCTGATGGAATTGTAACAATCAAACAAAAACAAGATTCA
GACTTAGTTGTCAAACTTGATGAACATAAAAATGGCTATAATATGTGTTCAATAGCATTGATAGAAAATG
TAAATGATGAGACATTCAGTGTTGAAAAAGTAGTTAAATACTTCAAAGGTCATAGAGAAATGGATACTGA
ATTTCATTGGGGCTTAAAATGGGTTGCAGGAAGAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c1829852-1829055 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTCAAAAAATTATTATGTTTGTTATTATGTCTAGTACTAACTTTAGCTGTGGTTGGATGTTCTA
AAGCTAAAGATGATAAAAAAATTGTTGTTGGTGCTACTTTAGTTCCAGGAGGAGAGTTATTAGAAGAATT
AAAACCACTTATTAAAGAAAAAGGATATACTTTAGAAGTTAAAAACTTTGATGATTACATACTTCCAAAC
GAAGCTTTAAATAATGGTGAAATTGATGCAAATCTATTTCAACATGAACCTTATCTAAAAGAAGCTGTTA
AGGCCAAAGGTTACAAAATAATGGCTGGTAAAAAACTATATGTATGCCCAGCAATACTTTACTCTTATAA
GATAAAATCTGTTGATGAATTTAAAAAAGGAGATACAATTGCAATAAGCAATAACCCATCTTCTTGCTCT
AAGAACCTTAGATACCTTGAAAGTATTGGACTTTTAACGTTACCTAAAGGGGATGGATTAGTTAGTCCTA
AGGACATAATAGAAAATCCAAAGGGAATACAATTCAAAGAGTTAGATATTGCTCAAATTCCATCTTCTCT
TCCAGATGTTACTGCTGCATTTATAGATACTACTTATGCTGTACCTGCTGGTCTTGATGCCAAGAAAAAC
GGAATTTATACAGCTCCTATAAATGACGAGTATGCAAATCTTTTAGCATTTAGAACTGAAGATAAAGACA
GTGAAAAGATTAAAGTTCTACAAGATGTTCTTACATCAGATAAAGCAAGAAGCTTAATTGAAGAAAAATA
CAAAGGTATTGTGATTCCTACTTTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c1831148-1830162 putative lipoate-protein ligase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTATTAATTTATAATGAAAAAACAAACCCTTATTTTAATTTAGCAATGGAAGAATATCTTCTAAAAA
ATTTTGATGAAGACTTATTTATTTTATGGAGGAATGAACCTTCTATAATTGTTGGAAAAAACCAAAACAC
ACTTTCTGAAATAAATTTAGAATATATAAAAGAATATTCTATACCTGTCGTTAGGAGACAGTCTGGTGGT
GGAGCTGTATTTCATGATTTGGGAAATATAAATTTTACATTTATAGCTTGTAACAATAATAATTTTAGTG
ATTTCAGAAGATTCACTCAGCCCATAATAGATTTACTTAAAACACTAGATGTCAATGCCGAATTTTCTGG
AAGAAATGACCTTCTTATAGATGGCAAGAAATTTTCTGGAAATGCTCAATACAACTACAAAAACAAAGTA
ATGCATCATGGTACTCTTTTATTTTCATCTGAAATAAATGACCTCTCAAAAGCATTAAAGGTTAAACCTA
TAAAATTTGAAGGAAAAGGAATAAAATCTGTAAAATCTCGTGTAACCAATATAAGTGAACATTTACATTC
AAAAATGGACATATTAGAATTTAAAGATGCTATAATGGATTATCTTTCTAAAACAAATACTGATAATACT
AATTATTGTTTGAATGAGCATGATATAAAACAAATAGAAAAGCTTACTAAATCAAAATACGAAACTTGGG
ATTGGAATTTTGGTAATTCACCAAAATATACTCTTTCAAATGAATTAAAATATTCTGGTGGAAATGTTGA
GTTTAATTTAAATGTTGATAAAGGCATAATAACTAGTATAAAATTTTTTGGAGATTTTTTTGGAAAATGT
GATGTTGCATTTGTAGAAAATAAACTTATTGGTATAAGGCATGAAGAAAATGCTTTGAGAAATACTCTGG
ATTCTATTGAAATAAATGACTATTTCTTAGGTGCTGATACTGATATTCTAGTTTCTGGAATTTTAGGTGT
TAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1831632-1833362 putative Na+/H+ antiporter [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGAACAAAAAAATTAATATTATTTTTCTGACGACAATCATGTTCATAATGTCAACAGTAATGGTTT
TTGCAGAAGAAGATATAGACACTATTGCACTAGCTAATGCAGAAAAATTTGGGATTTTAACTTTAATACC
ACCATTAGTTGCTATAATACTTGCATTTATAACTAAAAACGTAATAATTTCTTTACTTATAGGTATTCTT
TCTGGTAGTTTTATAATTAAAGCTAGTGGTATTAATGTTTTTGCGACATTTATACAGGCATTTTTAGATT
TAGTAGATAGAGCTTTAGTATCTTTAGCAGACCCTTGGAATGCAGGGATAATACTACAGGTTTTGGCAAT
TGGAGGAGTAATAAATCTTGTTGCTAAAATGGGAGGAGCTAAAGCTATAGCTGAAGCACTTGCTAAAAGA
GCAAAGTCAGCAAAAGGGACACAGCTTATAACATGGTTTTTGGGGCTTTTAGTATTCTTTGATGATTATG
CCAATTCACTAATAGTAGGTCCTATGATGAGACCTGTTGCAGATAAAATGAAAATATCAAGAGAAAAGCT
AGCATTTATAATAGATGCCACAGCAGCACCAGTTGCTGGTTTAGCTATAATATCTACATGGATAGGTCTT
GAGGTTGGTTTAATACATGATGCTTTTGAAAGTATAAGTATAGATGTAGATGCATTTGGTATATTTTTAA
ATACAATACCATTTAGATTTTACAATATATTAATATTAGCTTTCATTGTAATATCAGCATTATTATTAAA
AGAATTTGGTCCAATGAGAAAAGCTGAGATAAAATCTAGAAGTAGAAAAATTAGTATAGACCTTGATGAA
GGCGTAGAAGAGTTGGATGATTTAGCTCCAAAAAATGGAGTAAAATTGAGTGTATGGAATGCTATAATCC
CAATAGGAACATTGATAATAGTTGCATTAGCATCATTTTATTATAGTGGATATACATCTATAATGGGAGG
AGACGATAAGGCTCTGATACAACTATTTACAAATTCTCCATATTCTTTTGAAGCAATAAAAGAAGCATTT
AGTGCATCTGATGCATCTAGAGCATTATTTCAGTCTGCACTTGTTGCAAGTTTAGTTGCTATTATAATGG
CTGTAGTAAAAAAGATTTTTACAATATCAGAAGCAATTGATGTTTGGATAGATGGAATGAAAAGTTTAGT
AATCACTGGTGTAATATTAATACTTGCATGGTCATTAAGTTCAGTAATAAAAGAGTTAGGTACAGCTAAG
TTTTTAATACACCTATTATCAGGTTCACTACCACCATTCTTATTACCAAGTTTAATATTTGGTTTAGGAG
CAATAATATCTTTTGCTACTGGAACAGCTTATGGAACAATGGGTATACTTATGCCACTTGCAATTCCATT
AGCATACTCATTAAATCCTGATATGTCTTATGTAATAGTAAGTACTAGTGCAGTTTTAACAGGTGCAATA
TTTGGAGACCATTGTTCTCCAATTTCAGATACAACAATACTTTCTTCAATGGGAGCTGGCTGTAATCATA
TAGACCATGTTAACACTCAAATGCCATATGCTATATTTACAGCAGTAATCACTATTGTATTTGGGTATAT
ACCAGCTGGACTTGGATTGCCAATATATATAGTATTACCAGTGGCAATAGCTGCTATATTTGTAGGTATT
CAAATAATTGGTAAGAAAGTTGATGAAGCGGAAATAGAACTTGTAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1833784-1833957 hypothetical protein CDR20291_1554 [Clostridium difficile R20291]
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CAACAATTCTGTACAGTATAATTGGCATTATAATTGTAGCATTGAATTTAAAGTTTGCACAGTCGCTGAT
TGGAAAATTTACAAAGTGGATGTCAAACATATAA
>ref|NC_013316.1|:1834763-1837237 putative bi-functional glycine dehydrogenase/aminomethyl transferase protein [Clostridium difficile R20291]
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CTGGCTGGGAAATGCCTTTAGAATATGAGGGTATAAATAAAGAGCATGAGAAGGTTAGAAAAAGTGCAGG
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CTAGTTACAAATGATATAAGCACATTAAAGATAAATGACATTATATATACACCTATGTGTTATGAAAATG
GTGGAGTAGTTGATGATTTATTAATATATAAATTTGGTGAAGAAGATTATTTATTAGTAATAAATGCAGG
TAATATAGATAAAGATGTAGCATGGATAATAAAACAAAGTGAAGGATACAATGTAGATATAAAAAATATA
TCTAGTGAAGTGAGTCAATTAGCAATTCAAGGACCTAAAGCAGAAGAAATTCTTCAAAAAATCACAGATA
TAGACTTAAACTCAATAAAATTTTATAAGTCAATTCCATCAACAAAAGTATGTGGTTGTCCTTGTTTAGT
TTCAAGAACAGGATATACTGGGGAAGATGGGTTTGAGATATACTGTAAAAATAAATATGTAGAAATAATT
TGGAATGAAGTTCTAAAGGTTGGAGGAGAAGATATATGTCCAGCTGGTCTAGGTTGTAGGGATACTTTGA
GATTTGAAGCAGCTCTACCTCTATATGGTCATGAAATAAATGAACACATATCTCCAATTGAAGGTGGTTT
ATCTATATTTGTGAAAACAAATAAAGAATCATTTATTGGTAAATCAATTTTATCAAAAGAAAAAGAAAGT
GGAGCTAAAAGAAAGTTAGTAGGATTTGAAATGCAAGGTAAAGGAATGCCTAGAAATGGATATGATATAA
GGATTGGTGATAAAACAGTTGGATTTGTAACAACAGGATGTGCATCTCCAACGACAGGAAAAATTTTAGG
TATGGGAATTATAGATTCTGAATATGCAAAAGTAGGAAATGAAATAGGTATAGCAATCAGAAAAAAAGTT
GTTCCTGCTGTGATAGTTAAGAAACCTTTTTATAAAAAACAATATAAAAAAGATAATATTATATTAAACA
AAGAAAATAAATTTTCATATATACCTGCTACAAGTGAAGATAAATCAAAAATGTTAAAAGTAGTTGGATT
AAATTCGGTTGATGAATTATTTTCAGATATACCAGAAGAAGTAAAATTAAAAAGAGATTTAAATTTGGAA
ATTGGAAAATCTGAATTAGAGGTAAGCAAAATAGTAAAAAGATTGTCAGAAGAAAACTTAAGTTTAGAAG
ACTTGACTTGTTTTCTTGGTGCTGGTGCATATGACCATTATATACCATCAATTATAAAACATATAACTTC
AAGATCTGAATTTTATACAGCATACACTCCATATCAAGCTGAAATAAGTCAGGGAACTTTACAAGTAGTT
TTTGAATTTCAATCTATGATTGCAGAAATTACAGGTATGGAAATTGCAAATGCATCAATGTATGATGGAG
CAACTGCTGCAATAGAAGCATGTATAATGGCAATGAATCAGACTAGAAAAAGTAAAATAGTAGTGTCAAA
AACTATTCATCATGAAACTTTGTCAGTATTAAGAACTTACTTACAATATAAAGATTGTGAGATAGTAGAA
ATTGACTTTTGTAATGAATATGGGACTACAGATATAGAAAAATTAAAAGCTTCTGTAGACAAGGATACAG
CATGTGTTCTTATACAAACTCCTAATTTCTTTGGAATTATTGAAGAAATGGAAGAAATAGAAAAGATAAC
TCATGAAAATAAGGCTATGTTAATTATGAGTGTAGACCCAATATCATTAGGAGTTTTAAAAACACCAGGT
GAGATAGGTGCAGATATTGTTGTTGGAGAAGCTCAATCACTTGGAAACCCTCTTAATTTTGGAGGTCCTT
ATGTAGGATTTTTAGCTAGCAAATCTAAATATACTAGAAAAATGCCAGGAAGAATAGTTGGGCAAAGTTT
AGATGTAGAAGGTAAAATTGCATATGTATTAACTTTACAAACTAGAGAACAGCATGTAAGAAGAGAAAAA
GCAACTTCTAATATATGTTCAAATCAAGCTTTAAATGCTCTTGTAGCTTCAATATATATGGCTACTATGG
GTAAAGAAGGATTTAAAGAGGTTGGTATGCAGTCTATGAAAAAAGCACATTATACTTACAATAAGCTTGT
ACAAACTGGAAAATATAAGCCAATATTTAAAGGTAAGTTTTTCAAAGAATTTGCTGTACAAGGAAATCTT
AATATAGAAACTATAAATGATAAGCTCTTAGAAGAAAATATATTAGGTGGTTATAATTTAGAATACAATT
ATCCAGAATTAAAAAATTCAACTTTGCTTTGTGTGACTGAGAAAAGAAGCAAAGAGGAAATAGATAAGTT
AGTTGGAATAATGGAGGGATTATAA
>ref|NC_013316.1|:1837237-1838694 glycine cleavage system P protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAATACAATAGTTTGTTGATAGATATATCTAAAAAAGGTAGGAAAGCATACTCACTTCCAAAGT
TAGATATAGATGATATAAAAATAGAAGATATGATTGACCAAGATATGGCAAGACAAAGTGAGTTGAATTT
GCCAGAAGTTGGTGAATTAGAATTAGTTAGACATTATACATTATTATCAAATAAAAACTTTGGAGTTGAT
ACAGGTTTTTATCCTTTGGGTTCTTGTACTATGAAATATAATCCTAAAATAAATGAAGATATGGCAGCAC
TTCCAAACTTTACTGGAATGCATCCATACCAATCTTCGGATACAGCTCAAGGTTCTCTTTCTTTGATGTA
TGATTTATCAAGAAGACTTGCAGAAATTACAGGTATGGATGAAGTTACACTACAGCCTTCAGCAGGTTCT
CATGGTGAGTTTACAGGGCTTATGATTATAAAAGCATATCATGAAAATAGAGGTGACCATAAGAGAACTA
AAGTGATAATTCCAGATTCTGCACATGGAACAAATCCAGCAAGTGCAGCTATGGCAAACTTTGATGTGAT
TCAAATAGCATCTGATAAAAATGGAGCTGTAGACATAAATGCATTAAAAGAGGTTTTGAATGATGAAGTA
GCAGCTCTTATGCTTACTAATCCAAGTACTCTTGGTTTATTTGAAAAAAATATAAAAGAAATAGCTACTC
TTGTACATGAAGCAGGAGGACTTTTGTACTATGATGGTGCAAACATGAATGCTATTATGGGGATAACAAG
ACCTGGAGATATGGGGTTTGATGTGGTTCATCTTAATCTTCATAAGACTTTTTCAACTCCTCATGGAGGT
GGAGGTCCAGGAGCTGGTCCTGTTGGAGTTAAAAAAGAATTAGTACCTTTTTTACCAATACCATTAATTG
AAAGAAAAGAAGATAAGTATGTACTAAATTATGATAGAGAAAAATCTATTGGGAAAATTAAAAATTTCTA
TGGTAATTTTGGAGTTCTTGTAAGAGCTTACACATATATACTAACTATGGGAAGGGATGGACTTAAAGAG
GCTAGTGAAATGGCAGTTTTAAATGCTAATTATATAAAGGAAAGTATAAAAGATGATTATATTTTGCCAA
TAGATACCTTGTGTAAGCATGAGTTTGTATTAGGTGGATTGCCAAGAGGAGAGGCCAATATAAAAACTAT
CGATATTGCAAAAAGACTACTAGATTATGGATACCATCCTCCAACAATGTACTTTCCTCTTATTATAAAT
GAGGCACTTATGATAGAACCTACAGAAAGTGAGAGTATAGAGACATTAGATAGTTTTATAGAAGCTATGA
AAAGTGTTGCTAAAGAGGCAAAGGAAGAACCAGAACTATTGAAAACTGCTCCACATAATACTTTGGTCAA
AAGAGTAGATGATGCAAGGGCAGTAAAGAAACCTATACTAACATGGTCACAAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:1839117-1841474 putative cation-transporting ATPase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAAGGTTAATTTAGAAAGGTATAGTTGTGATATAAATGTTGGTTTAAATAAAAATCAACTTCAAA
GTAGAATAGATGATAATTTAATTAATGCATTTGATAATGGAAAAACCAAAACATATAAACAAATTTTTAA
AGACAATATATTTACACTTTTTAATCTCATAAATATTGTTTTAGTCTGTTTATTAGTTTCAGTTGGTTCT
TTTAAAAATACCTTATTTATATTTATTGCTGTAATTAATACTATTATAGGAGTAATACAAGAGATAAGAG
CTAAAAGATTATTGGACAATCTATCTGTTATAGTTTCAAATAAGGTATCTGTCATAAGAGAAAAAGAGAA
AAAAGAGATTGATGTACAAGAATTAGTATTAGATGATATTATGATTTTAAAAACAGGTAATCAAATTTGT
GCAGATTCAAAAGTTTTAAATGGAAAATTAGAGGTAAATGAGTCTTTGGTTACAGGTGAATCTGATATTA
TTATAAAAAATAAAGACGATTTTTTATATTCTGGAAGTTTTGTAGTTTCTGGAGAAGCTTTTGTAAGAGT
TGAAAATATAGGAAAAGATAACTATGCAAATAAGATAGTTAATGATGCAAAGATTTCTAAAAAACATAAT
TCTCAACTTAGAAATTCATTAAATTCAATATTAAAAATTGTAGGTATAATAATAATTCCTTTAGGAATTA
TATTGTTTGCAAAACAGCATTTTGGAAATGGAGATTCTATAGCTACATCTGTAGTAGGTACAGTGGCAGC
TGTAAATGGTATGATACCAGAGGGATTAACATTACTTACGAGCATTGCTCTAGCTGTAGGAACTATAAAA
CTTGCTAGTCATAAAACTTTAGTGCAAGAACTGTACTGTGTAGAGACTCTTGCTAGAGTTGATACACTAT
GTCTTGATAAGACAGGTACAATTACAGAAGGTAAAATGCAAGTTGATGATATAGTAATGTTGGAAGAAGT
GGATATTAATGAAATAATGGGGAATATATGTAATTCTCTCAAAGATGATAATGCAACACTAAATGCAATA
AGAGATAAGTATAATGTTTTAGATACGTATAAAGCTAAGAATTTAATACCATTTTCTTCAGAAAGAAAAT
ACAGTGGGGTTACCTTTGAAAATAAAGGTACATATTTATTAGGTGCATTTGAGTTTATATTTAAGGAAAA
AAATAAAAAAATTAGAATAGAAGTTGAAAAATATTCTAAAAAAGGAAACAGAGTAATAGTTTTAGCTCAT
AGTGATTCTTATATGGAAGATAATAATATTCCTGAAGATATAAAGCCACTAGCTTTTATATTGATATTAG
ATAAAATTAGAGATGAAGCTAAGGAAACTTTAGAATTTTTTTACAATGAAGGTGTAGATATAAAAATTAT
ATCTGGTGACAATCCTATAACAGTAAGTGAGGTAGCTAGAAAAGCAGGTCTTAAAACGGCTAGTAATTTT
ATTGATGCAACAACACTTAAAAATGATAACGATATATACGAAGCAGTTGATAAATACAGTGTTTTTGGAA
GGGTAAGCCCACAACAGAAAAAACAAATGATTTTAGCATTAAAAAAACAAAATCATACAGTAGCTATGAC
TGGAGATGGTGTAAATGATGTGCTAGCGCTTAAAGAAGCAGATTGCAGCATTGCCATGGCATCTGGAAGT
GATGTTACTAAGAATGTTTCTAATTTAGTCTTATTAGATTCAAACTTTGCATCAATGCCAAAGGTTGTTA
TGGAAGGACGAAAGGTAATTAATAACATTCAAAGAGCATCTTCTTTGTTTTTAGTAAAGACAATTTTTTC
ATTCTTCTTGTCACTATTAACATTATTCTTCTTCAGTAGACAGTATCCATTTGTTCCTATACAATTATCA
CTAATTGGAGCTGTAACAGTGGGTATACCATCATTCTTCTTAGCTCTTGAAGCAAACAAAAGTAGAATTT
CAGGAAACTTTTTACTCAATATATTAAAAAATGCTTTACCAGGAGCACTATGTGTGACAGTAAATGTAAT
TATTGTTTACAATATAGTTGAATATTTAGGCTATAGTTCAAGTGTATTTTCTACAATGTGTGCTATATTA
ACTGGTGTATGTGGTCTTTTAATATTAAGACAACAATGTTTGCCATTTAATAAAGAAAGATTATTTTTAA
TTGTAAGTATGACTATTGCATTTGTTATTGGGATTCTATTTTTAGGTGGATTATTCTCATTTGTAGCATT
GAGTAGAGAATTAATTCTCATAACTATGGCATTAGCAATATTAATGCCAATTATGATAAAAGTTATGTTA
TTTGTCTTGGATGAGATATTAGAGACAATTGTTCCAGATTTAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c1841877-1841560 hypothetical protein CDR20291_1558 [Clostridium difficile R20291]
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GAGTAATAATACTGCCTAATGGAGAAAGAAAAACTTTAGGATTAATGTTGCCAGGAGAATATACTTTTTC
TACTAGAGAAGAAGAAATAATGGAGATGCTTGCTGGAAGTATGGATGTAAAACTGCCTGGAAGCAATGAG
TTTGTAACTTATAAAGAAGGGCAAAAATTTAATGTTCCTAGTGATTCAAGTTTTGATTTAAAGGTTAATG
AAGTTGTTGACTACTGTTGCTCATATATAGCTGATTAA
>ref|NC_013316.1|:1842216-1842971 hypothetical protein CDR20291_1559 [Clostridium difficile R20291]
ATGGCACATATATGCTTTGAGGATATTTGTTATTTGTTATTAAAAGAAGCAATGAAGTTAAAGTTAATAC
CACATAATAAAATTGTATTATTTGAAGATGATTTATCAATAGGTAATATTTTTGATGTAAATAACTACGA
ATTAAGAGAAAATATTTTTAAGATTAGAAATGTTTTTGAAAATAATCCGAAACTATTATTCAAGCCAGAT
TTGTTAGAAGATAGGAAATTATCAAAATGTAGAAATATAATAATATGGTGTGCAAATAACCCAAAAGATT
TGTGTGGAGTATATTATGTAGTGAGTAAGTTTCAAGATAAAAATATAAAGATTGCATTAGTAGATGAAAA
AAAGACAGAAGATGCTCTAATTAGATATTCATTTACCAGTGAAATGTCTCCAGAAGATTTTCCATTCTTT
TTAGATAAGACACTAGAAATTGGCTTTAATGAAAAACTAGAATTTAAAAATAAATGGGATGTGTTAGTTA
AAGAAAATTCTATTTTTAGAGCATTAGTAGGTAACGAAATTAAAAGTGTTGAAGAAACTTATTTTGATAA
ATATATATTAAGAAATATCAGTGACAAATGGCAACCTTTAATTGAAGTGGTTGCAAACTGTATGTTTGAA
GATGAAATGCGTGTAAAAGATTGGTTTATACTTTGGAGATTAGAGAAGATGGCAAGTTTAAAAATAGTAA
AAATAAAAGGAAGTAAAGGGGATTTTTATTCTGATAAGGAGATAAGAAAAGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1844881-1843610 guanine deaminase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAAAGTATTAAAAGGAAATATAATTTTTACAAAAACTTCAGAAACTTTCACAGTATTTGAAAATA
GTTATATTATACTGGAAAAAGGTAAAGTAAAGGGAATATTTAAAGAGATACCTAAGGAATACAAAAACCT
AAAAGTAGTAGATTACACTGATAAGCTTATAATACCTGGTATGAATGACCTCCATGCCCATGCCTCTCAA
TTTAAAAATCTTGGAATGGCTATGGATAAAGAGCTTTTGCCATGGCTTGAAACTTATACATTTCCAGAAG
AGTCAAATTATAAAGATATAGAATATGCAACAAAAATGTATAAAAAATTTGTAAAAGAACTTTGGAAATC
TGGAACTACAAGAATAGCAGTGTTTGCAACAGTACATAAAGAAGCCTCTATGAAACTTATGGATATATTC
AAAGAAGTTGGTCTTGGAGCATACGTTGGTAAAGTAAATATGAATATGAATTGCCCTGATACTTTATTAG
AAAACACTCAGGATTCTATTGCTGATACAGAAGAAATTATAAATAAGTATAGTGATACAGATTCTATTGT
AAAACCAATAATAACACCTAGATTTATACCAAGCTGTACAAGTGAACTTTTAAAAGGTTTAGGAGATTTA
TGTTTAAAATATAATATTCCTATGCAATCACACTTATCTGAAAATTATGATGAGATTGAATGGGTTAGAA
GTCTAGAACCTGAATCTAAATTCTATGGAGATGCATATAATAGATATAATTTATTTGGTCAAACTCCTAC
TTTAATGGCTCATTGTGTTCATTGTTCTCAGGATGAAATAGATTTAATGAGAGAAAACAATGTTATGGCA
GTTCACTGTCCAGCTTCTAACTTTAATGTTGGTAGTGGTGCTATGCCTATCAGAAAATTAATCGATAATA
ATATTAGATTAGCACTTGGATCAGATATAAGCGGTGGACATACATTGTCAATATTTAAAGCAATGGTATC
TGCAATACAATTATCTAAATTATATTGGGTTAATTCTGGTAAGAAGTATAATTTCTTATCTTTATCTGAG
GCTTTTTATATTGCAACCAAAAGTGGTGGAAGTTTCTTTGGAAAAGTTGGTAGCTTTGAAGAAGGTTATG
ATTTTGATGCATTGATTATTGATGATTCAAATTTAAATCATGACAATTATTCTATACTTGAAAGACTTGA
AAGATTTATCTATGTTGGTGATGATAGAAATATCATTCATAGATATGTATGTGGAAAACTAATTGAAGAA
CCTAATATATAA
>ref|NC_013316.1|:c1848267-1847716 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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AACTTGCTGAATTATCTGGCGTAAGTAAAGTAATGCTTTCGCAAATTGAAAAGGGAGACTCAAACCCAAC
AGTAAACACAATTTGGAAAATTGCAAGTGGACTAAATGTTCCATATACTGCAATACTGGAACAACCTCAA
AATGAAACTTTTATTGTATCAAAAACTGATATAGATGTACAAGTTTCAGAAAATAAAGATTATCGTCTTT
ATTGTTATTATCCCAATACACCAACTAGAAACTTCGAATTATTTCAAATGGAATTAGAAGAAGGTCATAG
TTATACATCTGTTGGTCATTCTGAAAAATCACAGGAATATATTATGATTATAGAAGGTCAATTAAAATTA
GAAGTAAATGACTCTATTTATCAACTTAGAGAAAATGACTCTATTTGTTTTTCAGCTGAATCAATTCATA
CATACCATAATCAAGGAGAAAAAACATTGAAAGCAGTAATAATAAATTATTATCCAGTTTAG
>ref|NC_013316.1|:1848458-1849420 cysteine synthase A [Clostridium difficile R20291]
ATGCGTGTACTTAATAATGTTACAGAGGCTATAGGCAATACTCATATGTTACATTTATCCAAAATAGCAG
ATGAATTTGGAGTTCAAGGTAATATTTATGCAAAGATGGAATACTTAAATCCGGGATTTAGTAAAAAGGA
CCGTGTAGCATTACAAATGATTACCGAAGCAGAAAATGCAGGTTTATTAGTTCCAGGTCAAGCAGTTGTG
GAATTAACAAGTGGTAATACTGGAACAGGACTAGCAATAGCTTGTGCATGTAAAGGATATAAATTTATAG
CGTGTATGTCAAAAGGAAATTCTATGGAAAGAGCAAGAATGATGAAAGCTTTAGGTGCTGAAGTAGTTCT
TGTAGACCAAATGCCTAATTCAGTTCACGGACAGGTATCTGGTGAAGATTTGGCACTTGTAGAAATTGAG
GCTCAAAAAATAGCAAAAGAAAGAAATGCATTTAGAGCAGACCAATTTAATTTAGAAGCTTGTAATCATG
CACATGAAAAGTATACAGCAGAAGAAATGTGGGAACAATTGGATGGAAATATTGATGTATTTGTAGATTT
TCTTGGAAGTGGTAGTACTTTTGCAGGATGTTCAAAAACACTTAAAAAACATAATTCTTCTATCAAATGT
TATGTTGTTGAACCTGAAACAGCAGCAATTTATTCAGGTAAAGAAATAACTGACCAAGGGCATAAAATAC
AAGGTGGAGGATATTCTATGGATTTGCCATTAGTAGACAAGAAACTTATTGATGGTTATATTCAAGTTAC
AGACGAGGAGGCAACTGATGTAGCAAGAAAATTAGCTAAATTAGAAGGTGTATTTGCAGGATTTTCTTCA
GGGGCAAATGTGTGTGCAGCAATTAAGTTGTTAAAGAGCAGTGAAAAAGGAAAAAATATAGTTTTAACTC
TTAATGATAGTGGTTTAAAATATTTAAGTACTGATTTATATGAAGAATTGTAA
>ref|NC_013316.1|:1849715-1851559 putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAAAGAGAATTTTAAGAAATTTTATATTTACGGGTAAAAATATTTTAAGTAAACTTGTTTTTATAA
TAAAATATAATTTTAGTACATTAATTTTATTTGAATTATTTCATAAAGGATTAGCCTTATTTTTTATATG
GCCATCTATTAGATATATATTTGATATTTTAATAAAAAGTTTACATATAGTCTACCTAAATATGGATAAT
TTTATAAAAGTTTTGACCAATCCCATGTCAATAGTTCTGATAATACTATCAGTTATAATACTAGCTTTTT
ATGCATTTTTTGAATTTACCTCTGTAATTATTTGTTTTAATAAATCGATAAAATATGAAAAAATAGGGTT
ATTTGAACTCTTTAAAATATCATTTAAGAACTCTATAAAATTGTTATATCCTAAAAATATACTATTATTT
ATATTTGTGATATTAATAATTCCATTAGTAAATACAGTTTTAATTTCAGGGTTTATAGGAAAAATACAAA
TACCAGAGTACATATTAGATTATATAAAGTCTGATATAATTTTAAATATAATCTATATGATTTTTCTTTT
AATAATCTATATTTCGGTTATTAGATGGATTTTTAGCATTCATGAGATAACTTTAAATACAGAAAATTTT
AAAAGAGCAAGAAAAGAAAGTGTTAATCTTATAAAGAGAAAGATTATAAGAACAATTATTTATTCATTAA
TATTATCTTTAGTAGTAGCTATTATTGGATATGCGATTTATCATAGTGGAATTATATTTATAGGCATATG
GACTAAATATTGTACTGATATGGAATTTTTGAAGAATGTATTTATAAATAGATGTATTGCATTTGAAGAA
TATTTTAGATTGATTTTATCAATATTCATTTTTATATTGGACATTGGATTTATCTCAGCAACTTATTATC
AATATAAAGGAGTAAATATTTCTAAAAATAATATTAAAAAAGAGAAAAAATCTATATCAAAAATTGTTTT
TAATTTAGTATTAATATTATTGATTTCTTATATAGAGTCAGTTGCATTTTCTTCACATATAAATGGCATG
TTTAATACGTCATTTTCATTTTATACAACAGCAATTGCTCATAGAGCAGGAGCTGAAATGGCTCCAGAGA
ATACTTTGGCAGCAATAGAAGAAGCTTCAAATGCTAAAGCTGATTATGCAGAAATAGATGTTCAAGAAAC
TAAAGATGGAGAACTTATTGTACTTCATGATTCAAACTTTAAGAGAACTACAGGAGTAGATAAAAATGTT
TGGGATGTAAATTATAATGAAGTAAAGACATATGATGCGGGAAGCTTTTATTATTATGGAAAAGGTTATT
ATGATGAAAAGTTTGTTGGGGAAAAGATACCAACACTCAAAGAAATGATAAAATATTCTAAAGGTAAGGT
GAAATTATTAATAGAAATAAAACTTAATGGACATGAAAAGGGAGACATAGTAAAAAAAGTTGTTCAGTTA
ATTAAAGAAAATAATTTTGAAAATCAATGTATAGTTGCATCTATGGATAAAACTATATTACAAAAAGTAA
AAAAACTGGATGAGAATTTACTGACATGCTATTTTATGGCAATTGCATATGGTGATTTTTCAAAGTTAAA
TTATGTTGATATATATGGAATTGAATCAACTTTTGTTAATAAAACAGTAGTAGAAAAGATTCATAAAATG
AACAAAAAAATCTTCGTTTGGACTGTTAATAGTGACAGTTTAATTGAGAAAATGCTTGACCTAAATGTAG
ATAGTATTATTACAGATAATCCATACCTTATAGAGAGTGCAATTTATTGGAAGAAAAATGGATTTATTAG
TCAAGTGTCAGATTATTTATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1851881-1852465 putative sugar O-acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGACAGAGCGAGAAAAAATGTTGGCAGGAGAACTTTACGATTGTGGTGATATTGAGTTGTTAACTCAAT
GGCATAAAGCAAAAGACCTAGTAAGAGATTATAACCAAACAGATTCCTCGGATTTGGAAAAAAAAGAAAA
AATATTAAATGAATTACTTGGTGGTAAGGATAAAAACTTATGGATTACTGCACCGTATTATGTAGATTAT
GGAAATAATATTTATTTTGGAAATAATTGTGAAGTCAATATGAATTGTACGTTTTTAGATGATAATAAAA
TTATCATTGGGGATAATGCACTAATCGCACCAAACGTACAAATATATACTGCATTTCATCCAACTAATGC
TGGTGATAGATTTGGTAATGTCAAAGAAGATGGTTCATTTGAATTTTGTAAAACTCAAACAGCTCCAGTT
ACTATTGGAGATAATGTTTGGATTGGCGGGGGTGCTATTATCATGCCAGGTGTTACTATTGGAGATAATG
TAGTTATAGGTGCAGGAAGTATTGTTACAAAAGATATTCCAAGTAATATGATTGCATACGGAAATCCATG
CCGTATTATTCGAGAAAACAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1854359-1855339 hypothetical protein CDR20291_1565 [Clostridium difficile R20291]
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CAGAACGTTATTATATAGATAAAGAAAAAGGATGTATAGAAGATACGAGAAGTGGTATCGACATAGGTAA
TGAGAAATTTCAAAATAAGATTAATGTTTTAAAGCAGTTTTCAAATCAAACAGATACAGGTGAATTTTCT
AAAAAAATTGAATTAATGTCAAAGAAAAAACTTGATAATCTAAGTGTGAATGAATATAAGGATATTAGTT
TTTGGAAAGTATTTAACTATAGAGTTACAAATTCACTTATAAATGTAGGAATGTTAATCATTATATCTAT
AATTATATCCAATATTTACGTAGATGAAGTCGTTACTTCGGTAAAAGATATCATACTATCATCAAAAGAG
AAGAAAAAAGCATTAAAGTCTAAAATATTTGTTGCTTTATTAGTTCCATTAGTAATTTATTCTGTTTATT
TAATGGGAATATTTATTATAACTTGTATGCAACAAGGAGTACCTGTTAATGGAGACTTAGAATCTTTTAG
AATAGTAGACAATGTAGTTGCATTGAAAACTAATTTAAGTATAACAAAGTATGTAATATTAAATATAGGC
ATAGAGCTTTTGATGTTTGAAGGATGGGCCATGATAGCCATATTTGGGTCTTTTATAAGTAAATCTTCAA
TATCTTCAATAAGTTTTTTTATATTTATTATATCTATAACTAAGATAATGTCGGTAATCCATATATTACC
TAAAAAATTACTTTCAGTTGTATCAAATGTAAATTATTATGATTTGATATTTGGTTTTAATAAAATAATA
GGAAATTATCTAGGTGATATTATGATATTTAAAGTGAATATAGACATTGTCAATATAGCAATAGGACTTT
TGATGGCAATATTGATAGGTGCTATGTCATTATGTTTTTTAGTAATAAAATCAGATTATATAAGTAGATA
A
>ref|NC_013316.1|:1855353-1856240 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAATTAGAAATAGAAAATCTTTCAAAGATATATGGTAAAAAAGTAGCAAACGACAAGATTACAG
TAACTCTGGAAAATGGAGTTTATGGTCTTCTAGGACCAAATGGAGCAGGAAAATCTACATTAATGAAACA
AATAACAACGTTGATAAAACCTGATGAAGGTCAGATACTTTATAATGGTGAGGATATATTTAAAATGGAT
GCTAATTATAGAAATATTTTAGGATATTTGCCACAAGAATTTGGAGTTTATAAAAATTTTACAGCAAAAG
AATTTTTACAGTATATTGGAGCTTTAAAAGGTTTAAGGGGAAAATATTTAAATAGTAAGATAGGAGAATT
ATTAGATTTAGTAGGTCTTTACGATGTGAGAAATAAGTCTATAGGAAAATTTTCAGGAGGTATGAAGAGG
AGAGTTGGGATAGCACAAGTTTTACTAAACGACCCTAAGATAATAGTCTTTGATGAACCAACAGCAGGTA
TTGACCCACAAGAAAGAGCTAGATTTAGGAATTTAATAGCAAAAATGTCTAGAGATAAGATAATAATACT
TTCTACTCATATAATTTCCGATATAGAATCAGTTGCAAAGGAAACAATAATGATTAAAGATGGCAAACTT
CTAATGAAAGGAACACACAAAGACATATTAAGTCACATGGAAAATAAAGTATATAATGTTCAAGTTAAAA
ATGAATGTGAAGTTGATGATATACAATCTAAATATAAGGTTGTAAGTATTCAAAGTGATATTGATTCAGT
AGTACTTAGAATTGTTTCAGAGGATATTCCAAGTGGGGATAATATACAACCAGTTCAAGCAAAATTCGAA
GATGTATACATGTTTTATTTTGATTTGGAAGATGCAAGGGAGGTGTAG
>ref|NC_013316.1|:1856246-1857019 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATGTATTTAGTTAAAGCTGAAATGATAAAAATATTAAAATCAAAGAGTGTTTGGATAATTTGGCTGT
TTTTAATATTTTTGGGATTTCTTCTGATTAGAAAGTTTGATGTTTTAGATACTTATGCAGATATATTTTA
CAAGATAGAAGGCTCAATACCTCTAATAGGTTTGATAATGTTTATAATAACTTCTGGAAATTACATTAAA
GAATATGATTCTAATATGACAGGTTTAATAAATACAACTAAAAAGGGAAAAAAATCAGTAGTATTATCAA
AACTAGTAGCTAATGGATTAATTTTATCTATTATTAATATTTCTTTTATATTGTTAGTAGGAATTAGAGG
TTTTAGTTTTTTTGATTTTAAAAATTTAAATGAACCGATTCATAACTTATGGTACTTTGGAAATAGTAAT
TTAAATCTTACAGTAATACAAATGTATATAATTGTTATATTGACTACTATTTTTGCTTCTTTTATATTTG
CACAAATAGGCTTAACACTTTCATCTATATTTAAATCGGCTGTAATTCCATTTATACTAGGTGGATTGAT
AATGGCAATTCCATACTTTAGTGTAGGTTTTATACCAGATAAAGCTATAAAATTTATGTCAGTGACTCCA
AATTGGATTATGATGAGCCAACAAATGGTTAGGTATAATGTACCAAGTATTTTGATAGTTTTTTCTATAG
TAATCTCAATTATATTAATGATAGTGTTAACTAAAATAACATATGAAAATTTTACATCAAGCAAAAGGTT
TTAA
>ref|NC_013316.1|:1857131-1857856 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATCGTGTTTTAATAATAGATGATGAAGTAGAAATATTGAAGCTTTTAGAAACTGTCCTAAAAA
AAGAGGGCCTTAATAATATATATACTGCAAAAACTAAAAAAGAAGGATTAGAATTATTTAAAAGTATTAA
TCCTGATTTGATTGTATTGGATATTATGTTACCAGATGGCGAAGGTTATGATATTTGTAAAGAAATAAGA
AAAACCTCCAATTCTCCAATAATATTTTTATCAGCTAAAACCGAAGAATTAGATAAGTTACTTGGACTAG
CGATTGGAGGAGATGATTATGTTACAAAACCTTTTAGCCCTAAGGAAGTGGCTTTTAGAGTTAAAGCGCA
TTTGAGAAGATTAAGTTATTTTAGTGATGTTCAAAACGAAAGTAAAAATCTAAATAAGAATGAAGAAAAA
ATTATATCATTTGGCCCATATATATTAAATGAAAGTAGGGCAGAACTTATAAAAGATGGAAAATCTATAG
GACTGTCTGCAAAGGAACTAAAAATCCTATCTTTATTTGCACATAATCAAAATCAAATTATAAGTAAAGA
AAAACTATGGGATAAAGTGTGGGGAGAAGATTATGTTGGATTTGACAATACTATAATGGTTCATATAAGA
AAAATTAGGGAAAAATTAGAGGATAATCCTTCAAAGCCTGAATATATTCTGACAATAAAAGGTCTTGGAT
ATAAATTAGCAGTAAAGGAAGATTAG
>ref|NC_013316.1|:1857860-1859263 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGTGGAAGATTACTAGAAATTTTATATTTACAATTGTGTTTGTAGCTATATCAGTAGTAATTATAA
ATATTATATCTATATTGTATGTGATTTCAACTAATAGCTTTTTTAAAGTTGTAGATTCTGGAAATAATCC
TGAAGAATTTGCACGTTCTTTTGAAAAAGATTTATATGAAAAAGATGGAGAATTTAAACTATCTAAGATT
GGAGCTGAAAAATTAGAAAAATCAAATTCCTGGATACAGGTTTTAAATGATTTAGGAGAGGAAGTTTATG
GAGTAAATGTGCCAAAGGATACTCCAAAAAAATATACACCCTTTCAAATGGTGAATAATTACAAGTATAT
AGAAACAAAGTATGTTAATTTTGTACTAGAAAAATATTTAAACAAAAAACATCTAAACATAATAGTAGGT
ATACCTAGTAGAGATATATCAAGAATAATTTTAACCTATTCTCAAAATAACATTAAAAAAACTTTAAATA
AAGTTATCATTATAACACTAGTAATTGATAGCGTGGTAGCTTTAGGTGTAGGATATTTATTTAGTAGAAA
ACTTACAAAACCAATTTCAAGCGTACTATGGAGTATTGAGACTATGGCTAATGGAAATTATAGTTTATAT
CTTAAGGACAGAGGTATATATGAAGAAGTTTTTAAAAATATAAATATGTTAGCTGATACTTTAAGAGTAA
ATGAAGTTGAGAGAAAAGAAAATGAAGAGTTGAGAGAGGAATGGCTGGCAAATATAACACATGATATAAA
GACACCTCTAGCATCTATACAAGGGTATGCAGAGATAATTAATGACAAAGATTATGAGTTTGAAGAAGAT
GAAATACGAGAGTATACAGAAATTATATATAATAAGTCTAAGTATATAAAAGATTTAGTTGATGATTTAA
ATTTATCTACTCGATTAAAAAATAATACTATAGTTCTGGACAAGAAAAAAATAAATTTAGTCAGTTTAGT
CAGAGATATAATAATTGATATTTTAAATGATAATAGATATAAAAATAGGAATATTGAATTTGAAAGTAAT
GAAGATTTAATTGAAGTATATGTAGATTCAATCTTATTCAGAAGGGCTATAACCAATCTTATATTTAATT
CAATAGTTCATAATAGCGAAGGAACTTTGATAAGTGTAGAAATTGTAAAAAAAGATAATATAGAAATTAT
AATAAAAGATAATGGAATTGGAATAAGCAAAAGTGATTTGAAACATATTTTTAAAAAATATTATAGAGGT
ACTAATACAGGTGAGATGCATAAAGGTTCAGGTCTTGGTATGGCTATTTCTAAAGAAATAATAGAGATTC
ATAAAGGTAAAATTTATGTAAGTAGTGAAATTGGAATAGGAACAAAAATTATTATAGAGATAAAACAAAA
TTAG
>ref|NC_013316.1|:1859274-1860098 hypothetical protein CDR20291_1570 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATTTTTTTAAAAAAGGTATAAGTGGGTTTACTATTAAGATTTTAGCATTAATATTTATGACATTTG
ACCATATAGCAGCATTTATGCCACAAACAATGCAAATACCAATTTGGTTTCATTGGGTAGGCAGAATATC
AGCACCACTGTTTATATTCATGGCTGTTGAAGGATTTTATCACACTAGTAACAGAAAAAAATATATAAGT
AGATTGTATATTTGGTCTGTTATTATGGCTATAGGAAATCAAATAATTAATAATGTATTTTCACATCCAG
AAGGAGCTATAATTATAAATAACATTTTTTCAACATTATTTTTAATAGCGATTTATTTACAAGCAATAGA
GTTCATAAAGAAATTTAGAAAAGAGAAAGAAATTAAATATTTTATTATAGGATTATTGATGATAATCATT
CCTATAATTTTAGGAATATTTACAGTAGCTTTACTTTTTAAAGTCACTAACAGAGTTATTACTTTATTTA
TGATTTTGGTACCAGTACCATTTTTAGTAGAAGGTGGACCAATTTGGATTATACTTGGGATTATTTTTTA
TTTGTGTAGAGGTAAAAAGTTCAGTTTGAGTATTTGTTATGTTTTGATGTGTATATTTATATTTACAACA
ATGTCAAATGGAGATTATAGTTTAAAAAATTCTATTTTACAAAATTACCAATGGATGATGATTGCTTCTC
TACCTTTAATGTTACTTTACAATGGAGAAAAAGGGAAGAGTATGAAGTATTTATTTTATTTATACTATCC
AATCCATGTATATATATTGTATATCTTAGGAATATACTTAATAAATGGTTTTTGA
>ref|NC_013316.1|:c1861043-1860423 putative NADPH-dependent FMN reductase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTTTTATTGATAAACGGTAGCCCAAACCAATATGGATGTACTTATACAGCACTAAATGAGATTA
CTAAAGTATTGAGTAAACACGATATTAAAACAGAAATACTGTATTTAGGTAAAGAAGCAATCCCAGGATG
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GATCTCGATAATATTGATGGTATTATTATTGGTTCTCCTGTTTACTTTTCTAGTGCAACTGGTCAATTAA
CTTCTTTTCTTGACCGTCTATTTTTCATAGCTGGAAGTCGCATGGCTACAAAATTAGGTGCTTCAGTTGT
GTCATGTAGACGTGGTGGTGCAAGTGCAACATTTGACCAACTAAATAAATATTTTTCAATCAGCAATATG
CCTATTGTATCATCACAGTATTGGAATCAGGTACATGGCTTTACTCCAGAGGATGTTATGAAAGATGAAG
AAGGATTACAGACTATGCGAACTCTAGGAGAAAACATGGCATGGCTTCTTAAGTGTATATCAGCAGGTAA
AAAAGCTGGAATTAAAGAACCACAATATGAAGAAACAATTATGACTAATTTTATAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1861309-1861641 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTATAGACTGTATATCAAATACAGATTTAAGTGAAACAGGATTTAGTTATACACTTTCACTGATTA
GTGGTAAATATAAAATGATAATTCTTTACTGTCTTGTAGAATTTGAAGTTGTCAGATATAATGCATTAAA
ACGTTATATAAATACTATTTCCTATAAAACTTTGAGTTTATCATTAAAAGAATTAGAAGCAGATAACTTG
ATTATTCGTACTGAATATCCTCAAATACCTCCTAAGGTAGAATATAGTTTATCAGAAAGGGGAAAATCTC
TGATTCCAATTTTAGATGCAATGTGTGAGTGGGGAGAGAGGAATAGACCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1862401-1861760 pyrrolidone-carboxylate peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATTTTGTTAACAGGATTTGACCCATTTGGGGGAGAACTAATAAACCCAGCTCAAGAAGCAGTTG
AAAGGGTCAATAATAATATAAACGGTGCAGAAATCATAAAGATAACTATACCAACAGTTATGACAAAATC
TGTTGAAGCTATAGATAAAGCTATTCAAGAGCACAATCCAGATATAGTAATATCAGTTGGACAAGCTGGA
GGTAGATTTGACATTACACCTGAGAGAGTTGCTATAAATATAGATGATTTTAGAATAAAAGATAATGAAG
GTAACCAGGTTATAGATACTATTATAAAAGAAGATGGTGAACCTGCATATTTTTCAAAATTACCTGTAAA
AGCCATGGTAAAACATATGAATGAAAATAAAATTCCAGCTAGTGTTTCAAACACTGCAGGAACATTCGTT
TGTAATCATGTGATGTATGGAATCCTTTATATGATAGACAAGAAATATCCTAATATAAAGGGTGGATTTA
TACACATCCCATATACAACTTCACAGGTAATAAATAAAAAAAATACACCATTCATGTCTTTAGAAGAAAT
AGTAAAAGGTTTAGAATTAGCTATAGAAGCTTGTATTATATACAAAGAAGATGTAAAAGAAATTGGTGGT
GAAATTTCATAA
>ref|NC_013316.1|:c1863354-1862422 hypothetical protein CDR20291_1574 [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAAATTTTATAAACATATCATTGGAAATCTTTTACGCACTAATGGGATTTTTAATGATTGTTATAG
CATATAAGTCTTTTACTACCATAAATAACAATAAGAAATATGGTACATCATTATTTTGGATACTTATATC
ACTGCCATTCATATTTGGTAGATTGATTCCAGCCAATATAATAGGAATAATATTAATATTATCTAGTTTA
TTAACACTTTCTAAACAAGTTGTATTTGCAAAGTATGAAGAACCAGATGAAAATTTTGGAAAAGAACAAG
CAGACAAACTTAAAAATAAAATATTTATACCATCATTAATATTAGCATTTGCTGCAGTAGTAGTAGCTAT
GAGCCTTTCTAATTTTGATAATTCTTCTCAATTTGCAATAGGTGTGGGTTCAATAATTGCATTAATATCA
GCCCTTATAATAACTAAAGCAAAACCTGCTACATCAGTTCAAGATGGCTCAAGATTACTTCAACAAATGG
GACCTGCTAGTATGTTACCACAACTTTTAGTTGCATTAGGAGCTTTATTTACTCAGGCTGGAGTCGGCGA
AGTTATTTCAACCATGATATCTGGTGTAGTCCCTGCTGATAGCAGATTATTTGGTGTTATAGCTTATGTA
TTAGGTATGGTTATATTTACCATGATAATGGGAAATGCATTTGCCGCATTTTCAGTCATAACGGCAGGAA
TTGGTATTCCTTTTGTATTGTCTCAAGGTGGAAATCCTGCTATAATTGGAGCATTAGCATTAACAGCAGG
ATATTGTGGAACTCTACTTACTCCAATGGCTGCTAATTTTAATATAGTTCCAGCAGCCTTGCTAGAATGT
AAAAATGATTATATTGTTATAAAATATCAAGCTCCAGTTGCTTTGGTATTAATTATAGCCCACATATTAG
TAATGTACTTTTTAGGATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1864059-1863376 hypothetical protein CDR20291_1575 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGGAGAACAATTTATGATAAAACTAATCGGTATATTGATAGTTGTAATTGGATTTATACTTAAAA
TTGACACATTATTTACTGTATTATTAGCAGGAGTGGCAACAGGAATTGTTGCAGGATTAGATTTTAATCA
AATTTTTACAATTTTAGGAGATTCTTTTGTCTCAAACAGAGGTGTATCATTATTCATATTAACACTGCCA
GTAATCGGTGTATTAGAAAGATATGGTTTAAAACAAAGAGCTGTTTCTTTAATAGAAAAATTAAAAAGAC
TTACAACAGGAAAAGTACTTACTATATACATGATAGCTAGACAAATAGCTGGTGCTCTATCAATAAGAAT
GAGTGGACATCCTCAATTTGTAAGACCACTTGTTAATCCTATGGCACAAGCTGCTGGTTTAAGTAATAGT
GATGAACTAAAAGAATCGGATGAAGAAGCCATAAAGGCATTATCTGCTGCATCAGAAAACTATGGAAATT
TTTATGGTCAAAACTTATTTGCAGGTAGTAGTGGAGTATTACTTATAGCATCTACTCTAACTCAATTTGG
ATACAATGTAACTGGACTTAATATTGTAAAGGCTAGTACTATTATGGCAGTAATAGCACTTGTAGTGGCT
ACAATCCAGTTTACCTTATATGATAAAAAATTAAACAAAAGTCATAAAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c1865060-1864587 putative flavodoxin [Clostridium difficile R20291]
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AACTATCAGATAATGTCACTATTGTTGATATTAATAATAATAATAAAATTGAGTTATCAAAATTTGATAA
AATTATTATTGGAAGTTCTATATATGTTGGTTCAGTTTCAAAAAAAATACAAGTGCTATGTAATGATAAT
GTAGAGTTATTAAACAAAAAACAAGTTGGCATTTTCCTTTGCTGTGGCTTTTCTGAACAAGCAGATAAAT
ATTTAAAATCAAATTTTCCATCATCCTTATTAGAAAGTGCAAATGCTATTGGAATTTTTGGTAGTGAAGC
TCGATTAGAAAAAATGAAATTTTTAGATAAACTTATTATGAAGGCTGTTTCAAAAGGTAATTATGACAGT
TTTAGAATATCACAGGATAATATAGATAATTTTTTAATAAATCTTAATAGCTAA
>ref|NC_013316.1|:c1865467-1865063 putative FMN-binding exported protein [Clostridium difficile R20291]
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TATTTATATGCATTATTATTGTAATTGTAAGCAACTTAAAGCCAGAAAACTTGGTAGTAAAAGATATAGA
TATTAATAATGTTAAAAATGGCATTTATACTGGAAGTGCTGATAATAACTTGGTAAAAGCTACTGTGTCT
GTTGAAGTTAATAATGGTAAAATCCAAAATATTAATATCTTAAAACACGACCATCTTTTAGGTAAACCTG
CTGAAAAAATTACAACAAGTATTATTAAACAACAGTCTTTAGATGTGGATGCTATAACTTCTGCAACTTA
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>ref|NC_013316.1|:c1866071-1865442 TetR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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AAATTATAAACCAACATGGATATGAAAATTTATCAATAAGAAAAATTGCTACAAAAATAGAATATTCTCC
AACTACAATTTATCTTTACTACAAGGACAAAGCAGAGATTATCAGCGATATGACCAATAAACTTTATAAC
ACAGTAGAAAGTAATGCTATTGACATTATGAATAATTGCTCATCACTACCAATAGATAAACAAATCATAG
AAATTATGACTAGCTTTATAAAAACTCTTTCTAGTGAACCAGAGATGGCAAAAGCTATCATGCATAGTAG
AATGAATATTATATTTGCATCTGAAAATACAAACAATACTCCTAGCAATAATGGTATAAAAATGCTTGAT
AAATTCCTTTCCATTGGAATTGAACAAGGAATATTCAAAAAAAATATAGATAAAAGCTCATGGATGCTTA
TAAGTGCATTGTTAGGATTCGTTTTATGTGTTGTTGAAAATAAACTATATTCTTTACATAATTTTTCTCA
ACTTATAGAAAATTTCTTAGATATTTTAGTGGGAGGACTTTACAATGAAAATTCGCAACAAAGCTACTAA
>ref|NC_013316.1|:1866580-1867548 inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase [Clostridium difficile R20291]
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TAAACTCACCAGAGCTAGAAGTAATTGGAATTACCACATGTTGTGGAAATGTTCCAGCAAATATAGGTGC
AGAAAATGCACTAAAAACACTTCAAATGTGTTCTTCACTAAATATTCCAGTATATATAGGAGAAGAAGCA
CCACTAAAAAGAAAACTTGTAACAGCTCAAGATACACATGGAGAAGATGGTATTGGAGAAAACTTTTATC
AAAAGGTTGTAGGAGCTAAAGCAAAAAATGGAGCAGTGGATTTTATAATAAATACTTTACATAATCATGA
AAAAGTATCAATAATAGCACTTGCACCACTTACAAATATAGCTAAAGCACTTATTAAAGATAAGAAAGCA
TTTGAAAATCTCGATGAGTTTGTATCTATGGGAGGAGCATTTAGGATTCATGGAAATTGCTCTCCAGTAG
CAGAGTTTAATTATTGGGTAGACCCACATGGAGCAGATTATGTTTACAAGAATTTATCTAAAAAAATCCA
CATGGTAGGTTTAGATGTAACTAGAAAAATTGTACTTACTCCTAATATTATTGAGTTTATAAATAGACTT
GATAAGAAGATGGCAAAGTATATAACTGAAATAACTAGATTTTATATTGATTTCCATTGGGAACAGGAAG
GAATAATTGGCTGTGTGATAAATGACCCTCTAGCAGTAGCGTACTTTATAGACAGAAGTATATGTAAAGG
ATTTGAATCATATGTAGAAGTTGTAGAAGATGGAATAGCTATGGGTCAGTCTATAGTGGATTCTTTCAAT
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>ref|NC_013316.1|:1867550-1868113 hypothetical protein CDR20291_1581 [Clostridium difficile R20291]
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CTTTTATAGCTATGGGATTAAGATTACCTGTATACTTAGATTCAATAGGAACTATAATGATAGCTTCACT
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TATTCTCTCTATTTTGCACCAGTTCAAATATCAACCGGATTACTTGCTGGAATAGCATTTAAAAAGAATT
TTTTAAGGGGTTTAAAAACTCCACTAGGAGTACTTTTATTTGCTATTCCAACATCTATAATAAGTTCAAT
AATTTCAGCATTTTTATTTGGAGGTATGACCTCTTCAGGTTCATCCTATATAGTGCAAATCTTGAAAGTG
TTAGGACTGGGAGATGTTTTTAGTGTGTTTGTAACCCAAGTATTTACTGATTATGGAGATAAGCTGTTAG
CAGTTGTTTTAGTGAATTTAGGATTAAATGCAGTTCCAAAAACTTTAAAGGTATCATTGACTGGAGGAAA
ATAG
>ref|NC_013316.1|:1868121-1868810 radical SAM-superfamily protein [Clostridium difficile R20291]
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TATGGGGAAAGTGTTCTTTTTGTGATTATATAGATGATAATTCTAATTTAGAAGAAGAGATGAATAAATT
AAATCTAAGGGTTTTAAAAAATGTAACTGGGAAATATGGAGTTCTTGAAGTCATAAATTCTGGAAGCTGT
TTTGAATTACCTAAGGATACTTTAGAAAAAATAAAGTGTATTATAAAAGAGAAGAATATAAAAAAATTAT
TTTTAGAAAGTCATTGGTCTTACAAAAATAGGCTTAAGGAAATGAGAGAGTATTTTGAAATTCCTGTGGT
ATTTAAAATTGGAGTTGAAACCTTTGACAATGATTTTAGAAATAATATTTTAAATAAAAATGCAAATTTT
AAGACTCCACAAGATGTAAAAGAATATTTTGATTCACCTTGTATTATGATTGGAATAAAAGGACAAACAA
AAGAGATGATAGATAAAGATATAGAGATTATCCTAAATACTTTTGAAAAAGCGACAGTGAATGTTTTTAT
AAATAATTCTTCTAGTATAAAAAGAGATGAAGAGTTAGTGAAATGGTTTGTTAGTAAGTATAAATTCTTG
GATGAAAATCCAAATATAGAAGTTTTATACAATAATACAGACTTTGGTGTAGGAGATTAG
>ref|NC_013316.1|:1868937-1869665 hypothetical protein CDR20291_1583 [Clostridium difficile R20291]
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AAGATATAAAATATAGAGATTTTAATAAAAAGCTTATACCTGGAACAGAAAATATAATAGGTATTAGAGT
TCCTAATTTAAGAAAGTTATCAAAAGAAATAAGCCAAGGGAATTGGAAGGAATTTTTAGAAGTAGCAGAG
GATACATACTATGAAGAAGTTAGGCTACAAGGTATGGTAATTGGCAATATAAATAGTAATTTTGAAGAAA
CTTTATACTATGTAAAAAGATTTATACCTAAAATCGATAATTGGTCAGTTTGCGATGGGTTTTGTTCTGG
TTTAAAGTCTATGAAAAAATATAAAGAAAATATGTATGATATACTTAAAAAATATGTTTATTCAAAGAAT
CCATGGGAAATTAGATTTGCATTAGTTATGTTTTTAATATATTATGTTGATGATAAACATATTAAAGAAA
TATTTGAATACTGTAATAATATACAAAGTGAAGAATATTATGTTAAAATGGGTATGGCATGGTTGCTATC
AATTTGTTTTATTAAATGTGAAGAGGAAACTTTTCTCTATATAAAAAATAATAATTTAGATGATTTCACT
TATAATAAAATGCTACAAAAAATAATTGAATCAAATAGAGTAGATTTAGAAAAGAAGAATATAATAAGAA
GTATGAAAAGAAAGACAAGAAGATGTTGA
>ref|NC_013316.1|:1869679-1870353 putative DNA-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAACAATGAAGACAGAATTGACAAATTTTTAGAACTTCAAAGCAAAGGATTTAAATTTGCAGAGA
TAGCTCAAAATCTAAAGATTAGTCAAAGTACTTTAAGAACTTTTTTAAATAAAAAAGGATATAAGTCAGA
AAAAGGTAAATACATATTAAAAGACGAATTAAATTATAATAAAAGTTTGGATAATAGAAACTTGGAAGAA
GAGAAAGCTAAGGAGTATGAAAAAAGTAAAAAGAATACTATAAGTAATAGAAAAAAAGTAAGCACCAAAA
AAAAGATTTCTAATGAAAAGGCTTTAAGTAAAAGTGTTGAACAAATTGAGTTTAATGATACAGGTTTAAA
AAATGCAAAGCGAAAACAAAATGTTAAGCCTAAGAAAGATAGAAAAATAAATATAACTCAAGAAGATTTA
GATAAGCTTTGTGAAGTATATGATTGGTATTTAGAAGTAAAAGATTACAATATAAAGCCTAAAAAAGTAT
CTAATAAAAAAGATGTACATATAGATGATGAACACATAGATGAATTAAAAACAACAAGAATACGTATAGA
TAAAGAAATATGGAATGATTTTGAAAGATTATGTAGTAATTCGAATTTTGAAAAACATCAAATACTTACA
CAGGCATTGAAAGAATTTATGAAAAAGTATAAAAATCTACTATAA
>ref|NC_013316.1|:1870379-1871215 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAATAGTAAAAAAATCAATTTCTCTAATGATTATATTAACAATATTTATTTTTATGTTGACAG
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GATACATCAACAAAGGTAGAAAATAATTCAACATTTAATATATCCAATGTTGAATTGATATATAATGAAT
ATGATGAGAATAAAAAAATTATATCTTCGGATAGTAAGGCTTTGTTGGATATGACTTTAATGCCTGGGAA
AGTTGCTTACATAGAATGTGGGCATAAAACTTTTGTAAAGGGTGTAGAAGTTTATGCATATGAATATGAG
GCAGAGGGTAAGATTGTGTATGTTAATTTAAAAGAAAATACTATTAATATAAGAAATAATAATATTAAGC
TAGAAAATAGTAGTCAGTATGAGGTGCTATCTACATCAGAACTTAAAAAAGTAAATGAATCAAATGAGGG
AATTACGTATCAAGTAAAAGTAAAAAATTCATCATCAAAAGATTTAGGAAATATTATTCTTAAGACAGCA
GAAGTTAATGAAAATGGAGAATATTTAACAGTAAATCGTGTACCATCATATAAGATTTTAAAGCCTTCAG
AAGAGACAGATATAGATATATTGTGTTCAACAAAGGCAAAAAGTGTTGAAATAGTGGGATATACGTATGA
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>ref|NC_013316.1|:1871231-1871902 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
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TTGAAACTGAAAAGTGTGAAGATGGAGAAGAAGCTTTATACTTAGTAAATCAAAATATATATGATTTAGT
TATTTTAGACTTAATGCTTCCTAATATAAATGGATTTGATATCCTAAAGAAAATGAGAGTTAATAATATA
GATACACCTGTACTTATATTGACAGCAAAAGAAACATTAGATGACAAAGTAGAAGCATTTACTATAGGAG
CTAATGATTATTTGACAAAACCTTTTTATATGGAAGAGTTAGTAGCTAGGGTATACGCTATATTAAGGAC
TAATGGAAAGATAAAAGAAAGAAACGGATTAGAATTTAAATCTTTATATTTAGATACACTAGAAAAAAGA
GTGTATATTGAAAAAGAAGAAATAAAACTTCAAAACAAACAGTTTAACTTGCTTGAGTATTTTGTATTAA
ATAAAGGTTCAATTTTATTAAAAGAGCAGATTTATGATAGAATATGGGGAATTGATTCAGATGCAACTAT
TGAAATAGTGGAAGTATATGTAAGTAATCTAAGAAAAAAGCTAAGTAAATATGGATATGATAAATATATT
AAAACTAAACGTAAGGTAGGATATATATTCGATGATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1871892-1873124 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
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GTTTTTTAATAATCTTTTCTATATTTATATACTCATATTTTAGGGGACTTACATATAGTGGAATTGATAG
TGAGATAAATGATGAACTTGAATATATAGTCTCTCAATTTAAAAGAACTTCATTTTTGAACCCAATAAGA
CTGAAAGATCCTAAAGATATGGTGTATGTATATGAAGATGGAAGGATAAGTTACTATACTCAAAATGAAT
ATTTTGATGAGTTACTTCCAGATAGAAGACTAGATAAAAAAAATTCGTTTTTTAAATACACAGAAAATGG
ATATACTTTTAGAGAATTAAATGTAGATGTAGGTAGATACCAAATACAGATAATTAGAAATATAGATTCT
GAGATGAATTCTTTAAGACAGCTTACATCTGTTCTTATAATTGGAATATTAATTTCTGTAATAATTACTT
ACTTTGTGGCTGTATATCTCACTAGAAAAGCTTTAATTCCAATAGAAACAGCATGGAAAAATCAAGCTAA
GTTTATACAAGATGCTTCTCATGAATTAAGAACACCAATAACAATAGTTTCATCAAAATTAGAAAGTATG
TTAAAATCCCCAGAAAGTACAGTAAATGATGAAGTTGAAACAATAGCTACTGCAATGAAGGAAACTAGAA
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AGAAATAGACTTAGAAAAATTATTGGAAGAAATATCAGAAGACTATATTGACATTGCTGAGTTTCAGGAA
AAAAGATTCGTGTTTAATTCTAAACTGAAGAATAAAGTTATAATAACAGATAAAAATAAATTAAGACAGC
TTATATTAATTTTCATTGATAATGCCTTTAAATATACAAAATTGGGTGATGAGATAGCATTAGAATTAAA
AGAAGATATAGAGGATGAGGTAACTTTACTTATAAGTGACACTGGTATAGGCATAAAAAAAGAAGAGATA
CCTCTTATATTTGATAGATTTTTTAGAAGTGAAAATGTAAGAAATAAAGATTTAGAAGGTTCTGGAATAG
GACTTTCAATAGCTCGCATGATTAGTTTAAACTTATCTATTGATATAAATGTAACTTCTGATGTAGATAT
TGGAACTACATTTGAATTGTCAATACCAAAAAAGTTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1873274-1873591 thioredoxin [Clostridium difficile R20291]
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TCTACAGTACCAACTATGATTATATTTAAAGATGGAAAACCAGTAGAAACTTTAATTGGATTCATGCCAA
AGAACAAAATTGAAATGCAAGTAAAATCATATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:1873608-1874486 thioredoxin reductase [Clostridium difficile R20291]
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GAAATAAAACAATTATCATGTTTGGTAATGATAATTTAAGTAATAAGCTTGTTAAAGCTCCTTCAATAGA
TAATTATTTAGGTTTTTATGATATAAGTGGTGATGAATTAAAAGACAAGTTTAAATCACATATAGATAGT
ATGGATATTTCAATTGAAAATAAAAGAATAAATAATATTTATGCTATGGGAGAATACTTTACAATAATGT
CTGGAAATGATATGTATGAAGCTACTACTGTAATCCTTGCAACTGGGGTAGAGTATACTAGACCAATCAA
GGGTGAAGAAGAATTTCTAGGAAGAGGTGTAGGCTACTGTGCTACATGTGATGCACCACTTTATAGAAAT
AAAAAGGTAGCAGTTATAGGATATAATGAAGAATCTAAAGAAGAAGCAAATTTTTTAAGTGAACTCACTT
CAAAGACTTATTTTATACCTATGTACAAAAAAGATAATCTTATGAGAAGTTCAGATAACCTAGATGATTC
TATTGAAGTTATACATGACAGACCAGTACAGATAGATGGAGATAAACTTGTAAACAAAGTATCTTTTAAA
GAAAACCACATTGAAGTTGATGGAGTATTCGTTATAAAAGATAGTACGGCTCCAAGTGCATTGGTTCCTG
GAATAGAGATTGATGGCATTCATATTAAAGTTGACAATAATATGAAGACTAGTATAGATGGATGCTTTGC
TGCTGGAGATTGTGTTGGAAAACCCTATTCTTATATAAAAGCAGCTGGTCAAGGGCAAATAGCAGCTTTA
AATGCTGTTTACTATTTAGATAAATTAAAGAGGGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:1874756-1875124 ArsR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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AATAAAGAATCATTTAATATATGTGTAGATTTTATAAATTCTATGTTAAGTAATTCTAGTGAAAGCTTTA
TAGATGTATTTGATGTAAATACAATACATCTAGGATGCAGTAAAGAATGTAAATCTATAAAAAAATGTTG
TAAGAGAAGGGAGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1875127-1875498 putative dinitrogenase iron-molybdenum cofactor [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTATGTATACCAGTAGAGGAGAATAAAGGATTGGATAGTAAACCATATGGACATTTTGGTTCTG
CTCCAATTTTTGTTGTGTGTGATTTAGAAAGTGGAGAAGTTAAATCTTTAGATAATGGAGATTTAGATCA
TGAACATGGAAAATGTCAACCATTAAAAGCATTGTCAGGGACAGCTGTAGATGCAGTAGTTGTTGGAGGA
ATAGGACAAGGAGCTATAATTAAATTAAATGGAATGGGAATAAAAGTTTACAGAGCAGAAGGTGATACTA
TAAGTGCTAATTTAGACTTACTTAAAAATGGAAAATTAGTAGAGTTTCCATCAGACCATACTTGCTCACA
TGACGGATGTGGACATCATTAA
>ref|NC_013316.1|:c1876097-1875642 hypothetical protein CDR20291_1592 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATTAATACTGTTCAAGGTGATTCGATTGAAGTTCTTTTAAGACAGCTTGGTGCCACAAGAATAT
CAAAAGTAAGTAGTACATTATATTTTATCAAGTTTGATTTAGGAGACGGTTGGGAAATATCTTATACTTA
TAATATTAATGCTAAAGACCAATATTTTTTACAGAGAATTGAACCATATCCTATTGGTAGAGGTCTATTT
AATGATGAATATGAAATAGTATCATTTATATCAAAGGATTTAAAAAAATTTCTAAATGCTAAAAATAGTA
GTAACTTTAAGACATTTGTTGAAGTTACTAGAAAAGTCAATTCTATCATTGATAATGTAGAGGAACTATT
TTTAAACTACAATGTAGATGGTGATGATTTAAAAACACTTAATAAAGAACTCAATGACATATTAAATGAT
ATTGACTATATAGAAAAACATACAAAAAAAATCTAA
>ref|NC_013316.1|:c1877401-1876136 putative arsenical pump membrane protein [Clostridium difficile R20291]
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TAAACAGATCCGTAGCAGCTGTTGGTGGTGCACTATTAATGATAATATTCAATATACTTACACTTGATGA
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AAAAACTCAGGGTTATTTGAATATATAGCTATCTGGACTGCAAAGAAAGCTAAAGGTGACCCATGGAAGA
TAATGATTTGTTTTGCTATTATAACAGCTATTTTATCAGCTGTATTAGATAATGTTACAACCGTCTTACT
TATTGGACCAATGACTATAGTTATTACACAAATATTAGGACTTAATCCAGTTCCATTTTTAATAACACAG
ATTTTAGCTTCAAATATAGGAGGAACAGCTACTCTTATAGGAGACCCTCCAAATATTATGATTGGTAGTG
CTGCCAATCTTAGTTTTATGGATTTTGTAATAAATTTAGGTCCTGCTGTTATAGTAATACTTGCTATAAC
TATAATATGCTTTAGATTTATTTATGGAAAAGAACTTGTTGTGAATGAAAGAGCTAAAAATGCAATATTA
AAACTAGATGAAAAAAAATCTGTTAAAGATAAACCTCTACTTATAAAAAGCCTTATATTAATAGCATTCA
TACTTTTTGGTTTTATGTTTCACAGTACAATCCACATAGATTCTTCTGTTGTAGCACTGACAGGAGCATC
TATAATGCTTTTAATAGGAAAACAAGATGTAGATGAAATTATGGCAGGTATTGAATGGTCCACAATTTTA
TTCTTTATGGGATTATTTGTAGTAGTTGGTGGACTAGTAGAAGTTGGGATAATAAACAAATTGGCTCAAG
CATTGATTGGACTTACAGAAGGACATCTTGTATTTACAATGTTGTTGATATTATGGTTATCAGCTATAGT
CTCTTCTTTCTTAGATAATATTCCATTTGTTGCAACACTAATTCCTCTTATTTTGACTATGCAAGCTGAA
GGTATTGATGTAATGCCACTATGGTGGGCAACATCTCTTGGAGCTTGTCTTGGAGGAAATGGAACACTAA
TAGGAGCATCTGCTAATGTTGTACTAGCAGGTATAGGTAATAAACACGTTCATCCTATCTCTTTTAAGGA
GTATTTCAAAATAGGTTTTCCACTTATGATTATATCTATTATTATATCTACTGTTTATTTAATTATAAAA
TTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1877871-1879322 putative sodium:amino acid symporter [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTTTTAAATGGTATTTTAACGAGTATTAACAATGCAGTAGTATTTGTAAACAATTACTTATGGT
CGTATATCTTAATTATAATGTTAGTTGTAATTGGTATTTACTTTACTATTAAAACAAATTTTGTACAATT
CAGATATTTTATAGAAATGTTTAGACTTCTGGGTGATGGTACAGCGAATAAAAATGCAAAAAAGGAAGGA
AAAATCTCTTCATTTCAAGCATTTTGTATAAGTACATCTTCAAGAGTTGGAACTGGAAATATAGCTGGAA
TAGCAATTGCAGTGGTAGCAGGGGGACCTGGTGCTGTATTTTGGATGTGGCTTATAGCATTAATTGGTTC
TGCATCAAGCTTTGTTGAGAGTACATTAGCTCAGATTTACAAAGTGAAAGATGGTCAAGCTTTTAGAGGT
GGACCAGCGTATTATATGGAACAAGGTCTAAATAAAAAATGGATGGGTATTTTATTCTCAATACTTATAA
CTATATGTTATGGTTTTGTATTTAATGCAGTTCAAGCAAATACTGTTTCACTTGCATTTAATAATGCATT
TGGAATAAGTAAAATGGCTATGGGAATAGGTCTTGGAATTTTAACTGCAATAGTTATTTTTGGTGGAGTG
CATAGAGTTGCAAAAGTTTCTGAAATAATAGTTCCTGTATTTGCAGGATTATATATATTAGTTGCTTTGG
CTATAGTTGTAATGAATATAACAGAGATACCAAGTGTTATAGCATTGATAGTTGAAAGTGCATTTGATTT
TAAAGGAATGGCGATTGGTACATTTATGGGAGTTGTAATGACTGGAGTGAAGAGAGGTCTATTTTCTAAT
GAAGCAGGTATGGGTAGTGCTCCTAATGCTGCTGCAACAGCACATGTAACTCATCCTGTAAAACAAGGTT
TAATTCAATCTTTAGGTGTTTTTACAGATACTATAATAATATGTAGTTGTACAGCATTCATGGTATTATT
ATATTCAGGTTATAGTAGTAGTGGAGCAACTGGAATTGAATTAGCTCAAGAAGCTTTAACTCATCATATA
GGACCAGTTGGAAATATATTTATAGCAGTTTGTATATTCTTGTTTGCATTTAGTTCTATAGTTGGTAATT
ACTATTATGGTGAATCAAATATGGAGTTTATGAGTGGAAGTAAGACTAAACTTAATGTATTTAGAGTTTT
TGTTGTAGGCATGGTTTTATTTGGTTCACTTACTCAAGTAGATGTAGTTTGGAATCTTGCAGACTTATTT
ATGGCATTGATGGCGATAATAAACTTAATAGCAATAGCACTTTTAGGAAAATATGCATTTATTGCTTTAA
AAGATTATACAAGTCAAAAAAAATCAGGAATAAAAGACCCTGTGTTTATTGCAGATGAAATAGAAGGCCT
AGAAAAGGTATCAGAGTGGCATAGGGAATTATCTGAGGAACATTTAGGATAA
>ref|NC_013316.1|:c1880003-1879542 riboflavin synthase beta chain (6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase) [Clostridium difficile R20291]
ATGATATATGAAGGAAAACTTATTGGAAAAGATTTAAAAATAGGTATAATAAATTCTCGTTTTAATGAAT
TTATAACATCAAAACTTTTATCAGGAGCTGAAGACTGTCTTTTAAGACATGACGTTTCTCCAGAAAATAT
AGAAATAGTTTGGGTACCTGGAGCTTTTGAGATTCCTCTTGTTGCTCAAAAAATGGCTAAAAGTGGTAGG
TATGATGCTATAATCTGTTTAGGCTGTGTTATAAGAGGGGCTACTTCTCATTATGATTATGTATGTAGTG
AAGTCTCTAAAGGGATAGCAAAAGTATCTTTAGACAGTGAATTACCTGTTATATTTGGAATCGTAACTAC
AGAAAATATTGAACAAGCTATTGAAAGAGCAGGTACAAAAGCTGGAAATAAAGGTTATGATTGTGCTATG
AATGCGCTAGAAATGGCAAATTTATTTAAGTCTTTAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c1881089-1880109 riboflavin biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGTTAGAGAAAATACAGATACATTTCAAACAGCCTTTACTGTTACTATAGATGGAGCAGATACTCTAA
CTGGTATATCTGCATATGAAAGAGCTGAAACTGTAAAATTGTTCTGTGATGAAAATTCTACAAGTAAAGA
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ACAGAAGCCTCAGTAGACCTTGCTAGACTTGCAGGTTTTAAAGAGATTGGTCTTATCTGTGAAATAATGA
AAGATGATGGTACAATGGCAAGAGTTGATGATTTAATGATTTTCAAAGAAAAGCATAATTTAAAAATCAT
CACTATAAAAGACCTTATAGAATACCGCAAAATAAATGAAACTACTATAGAAAAAGTATCTAGTGCTTTC
CTTCCAACAAAATATGGAAATTTTGAAATCATAGGATATAGAGATACTTATTCAAATGAAGAACACATTG
CCCTTACTTATGGAAATATAAATATAGAAAATACTCTAGTTAGACTTCATTCTGAATGTTTAACAGGAGA
TGTGTTCCACTCTCTAAAATGTGATTGTGGATTACAGCTAGAATCTTCTATGAAGAAAATTGTGGAAAAT
GGAAGTGGAGTTTTAATTTATATGAAGCAAGAAGGTAGAGGTATTGGCCTTTTAAATAAAATTAAGGCTT
ATAAACTTCAAGAAGAAGGTTACGATACTGTTGAAGCAAATTTAATGCTTGGATTTGAAGAAGATATGAG
AGATTTCTATATGGCTGCTCAAATATTAAAAAATTTAAACATAAAAAGTATAAATCTTTTAAGTAATAAC
CCGGATAAAATAAATCAATTAGAGAAATATGGAATAAAAATCGAAAATAGAATCCCTATTAATGAAGAAA
TTAATGACTTTAATAAGCTATATTTAAAAACTAAAAAAGATAAAATGGGACATCTTTTAGATATTATATA
A
>ref|NC_013316.1|:c1881990-1881325 riboflavin synthase alpha chain [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTACTGGCATAGTAGAAGAAGTTGGAATACTTAGAAAAATTACTGCTAATGGTAAGAGTGGAAAAG
TAACCATACTATCAAATAAAATATTAGATGGCACAAATCTTGGAGATAGTATAGCCGTAAATGGAGTTTG
TCTAACTGTTTCAAACCTCGGAAAAAATGAATTTACAGCCGATGTTATGATGGAGACAATTCGTTCCACA
AATTTAGGTTTATTAAATGCAAATGATAAGGTAAATCTTGAAAGAGCTATGAGTCTTTCTTCAAGATTTG
GTGGTCATATAGTAACAGGTCATGTTGATGGTAAAGGAACTATCTGCAAATTTGAAAAAGATGAAAATGC
AGTTTTAGTAAGTATACGACCTGATAAAAAACTTTTATCTTCAATGATACTCAAAGGTTCTGTTGCTATT
GATGGTGTAAGTTTAACTATATCATATTTAGATGATGAAATATTTAAGGTTTCTATTATACCTCATACTA
AAATTAACACTATTCTCTTGACAAAGAATGTTGGAGATTTTGTTAATTTAGAAAGCGATGTAATTGGAAA
GTATGTTAATAATTTTATGGCTAATAACTACAAGGAATTAAATTCTAATAGTAGTAACCATAAATCAAAT
ATAGATAAAGATTTTTTATTTAAAAATGGTTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1883127-1882024 riboflavin biosynthesis protein [includes: diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase and 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase] [Clostridium difficile R20291]
GTGAATCAAAAAGAAAAAGATATTTATTATATGAAAAAAGCTATTGAATTGGCTAAAAATGGAGAAGGCT
TTGTAAATCCAAATCCATTAGTTGGGTGTGTAATTGTTAAAGATAGTAATATAATAGGCAAAGGATATCA
TGAGAAATTTGGCTCTAATCATGCTGAAGTAAATGCTATAAACAGTGCTAAACAAAGTCTAAAAGACTCT
ACTCTTTATGTAAACTTAGAACCATGTTCTCATTATGGGAAAACGCCTCCTTGTGTAGATAAAATTATAC
AAAATAAGATTAAGAGAGTTGTAATATCTACATTAGACCCAAATCCACTTGTTTGTGGTAATGGAGTAAA
AAAATTAAAAGATAACAATATTGATGTTACTGTGGGAATATTAGAAGATGAAGCAAGAGATTTAAATGAG
GCATTTTTTTATCATATAAAAAACAAAAGACCTCTTTGTATTGTAAAATCAGCAGTAAGTCTAGATGGTA
AAATTGCTACAAAATCACTAGAATCAAAATGGATATCTAATGAATCATCAAGGTATCTAACTCATAAATA
CAGAAATAAATACCAAAGTATAATGGTTGGCATAAATACAGTTTTGAACGATAATCCTTTACTAACTTGC
AGGCTCAATCAAGAAAAAGTGTCTCATCCTACAAGAATAGTAATAGATACACACCTAAAGTTGCCACTTA
ATAGTAATTTGGTTAAAGATAAAACCAGTAAAACTATAGTTTTCACATGTTGCAAAGAAAGTATAAAATT
ATCTATGTTAAAAGAAAATAATGTTGAAACAATAATTTCTCCTTCAAAAAACAACTTAGTAGATTTGGAA
TTTGTAATGTATAAATTAGGAGAGTTAAACATTGATTCTGTTCTAGTTGAAGGTGGTGCTACTCTCAATG
ACAGTCTCTTTAGAAATAAGTTAGTTGATAAAGTCAAATTATTTCTATCACCCAAGATTATAGGTGGTAA
AGATGCACCTACATTCGTTTCTGGAGAAGGAATAAATCATTTGTCAGATTCAACACAGTTAACAATCAAT
AATGTAACTTTGATAGATGGCGATATTCTTATAGAATCAGATGTTTTAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1883569-1886052 ATP-dependent DNA helicase [Clostridium difficile R20291]
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CTATAATAAATTCTATCTTAAGCGAAAAAGATGTGTTAGCTATTATGCCAACAGGAGGGGGGAAATCAAT
ATGTTATCAAATTCCAGCTTTGATTTTAGATGGAATGACAATAGTAATTTCTCCACTTATATCACTTATG
AAAGACCAAGTAGATGCCTTAAAGACTATGGGAATTAGTGCTGCTTTTATAAATAGTTCATTAAGCAGCA
AAGAATTTAATGAAATATTAAATAATATTAGAAAAAATAATTATAAAATACTCTATATTGCTCCAGAGAG
ATTAGATGCACAAGAGTTTATTGAGCTAATAAATAATAACAATGTAAGTCAAGTTGCGATAGATGAAGCA
CATTGTGTATCTCAATGGGGGCATGATTTTAGGTTGAGTTATAGAAGGATTTCTGATTTTATAAAAAATT
TGCCTAAAAGACCTATAGTTACAGCATTTACTGCAACAGCTTCAGAAGAGGTAAGAACTGATATAATAAA
TTTACTGTGTTTAGAAAATCCAGATTATTATATAACTGGATTTGATAGAGAGAATTTATCAATAAATATA
GTAAAATCATCTAGTAAAAATAAGTATATTTTAGATTATATTCAAAATCATAAAAATGAGTCTGGAATTA
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AAAATATCATGCAGGTTTATCTAAAAATGAAAGAAGTAAAAATCAAGAAGATTTTATAAATGATAATGTG
GATATAATGGTAGCAACAAATGCATTTGGAATGGGTATTGATAAACCTAATATAAGATGGGTTATACATT
ACAATATGCCTCAAAGTATAGAAAACTACTATCAAGAAATAGGTAGAGCTGGTAGGGATGGAGAAAAAAG
TGAGTGTGTACTTTTATTTTCTCCAGGAGATGTACATATACAAAAATATTTAATTGATATTGGAGTTGAA
AATCCTGAAAGAAAATTATTTCAGCATAAGAAGCTTCAATACATGATTGACTTAGTTTACAGTAATTCAT
GCTATAGAAAGACAATATTGAGTTATTTTGGAGAAAATTATATAGACAATTGCAATAATTGTAGCAATTG
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AAAAGAAGTTATGGTGTTACTACTATTGTAGATGTACTTAGAGGTTCTAAGAATAAAAAGATTTTACAGC
TTGGATTAAATACTTTGTCTACATATAACATTATGAGAGATTATTCTAGTGAAGACTTAAAGAATTTTGT
AAATACATTGGTTTCTCATGGTTTTTTAGATTTAGTTGAGACTCTAGGCAATGGAAATAGAGGTAGTTTT
CCTACTATAAGATTAAATGAGATGTCTATGAAAGTTTTAAAAGGTGAAGTGAAAGTAGAGTTTAAAGAAA
TTGTTATGACAAAATCATTGGAAGTAGAGGATGAGTTATATAATGCTTTAAGAGAACTTAGACATTCAAT
TGCAAGTGAAGAAAGGATAGCTCCATATATGGTATTTGGAGATGGTACACTTAGAGCCATGTCTAGTAGT
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GAGATTTTGAAGCAGTAATTAAAGAATATGTCGAAAAAAATAATATAAATAAAAAAATAGATGAAAAAAA
TGTCGATTTAAAGAACGTTAATAGTGATTTCTTAGAGGTTAATACAGATAAAGTTTTATATGAAAAACTG
TTAGTCATTAGAGAAGAATATGCAACAAAGGAAAAATTACCTGCATATATGATTTTAGCCAATAAGGCTT
TGAAAGAAATAAGTGGAAGATATCCACTTGATGAAGAACAATTAAAAGATATTTCTGGCATAGGTGGAGT
AAAATTTGAAAAATATGGAGCTAATATTTTGGCAGAGGTTAATAAATATGTAAAAGAAAATAATATTAAT
GTTATTTGGGAGAAAAAGGGCAAAAGGAAGTTAATATTAGATGGAGAAAGTAGAAAAAATAATGAAATAG
CATTAGATTTGCTAAATCAAGGAAAAGATATACAAAGTATCAGTCAAGAAATAGAAGTTTCATTGTCAAC
CATTATTGGATATGTGCATGACTATGTAAAGGATGGACATAGTATATCATTTGAATTAGGACTAGAAAAT
TTTTATAATGAAGATAAAAAGAAGATGATTTTAGAAGTTTGCGAAAAAGTTGGCTATGATAATTTAAATA
ACATAAAAAGAAAACTTCCAGATTCAATAAAGTATGAAAATATAAGAGCTGTGATGCTTGACTCTTATCT
TGAAAACTTAAAAAATAATATTATAGCAGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1886279-1887694 thiamine biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
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TTTTATTTTCAAAAACTATAACTTTAATCTTGGAGGATTGTAATATGAACTATACAACACAAATGGATGC
TGCTAGAAAAGGCATAATAACTAAAGAAATGGAAATCGTTTCTCAAAAAGAACAGGTAGATGTAAATGAA
TTAAGAGAATTAATAGCAAATGGACAAGTTGTTATACCAGCTAATAAAAATCATAAATCTTTAAGTGCAG
AAGGTGTAGGTAAAAATTTAAGAACAAAAATAAATGTAAATCTAGGAATTTCAAGAGATTGTAAGGATAT
AGAAAAAGAACTTGAAAAAGTTAGAGTAGCAATAGACATGAAAGCTGAAGCTATAATGGATTTAAGTAAT
TATGGCAAAACTAGAGAATTTAGAGAAAAGGTTGTTGAAATGTCACCTGCAATGATAGGTTCAGTACCTA
TGTATGATGCAGTAGGATATTTGGAAAAAGAATTAAAAGATATAACAGAAGAAGAGTTTTTAAATGTAAT
AAGACAACATGCTATTGATGGAGTAGACTTTATTACTATACATGCAGGTCTTACAAGAAGTGTTTGCCAA
AAAATAAAAAATCATGAGAGATTGACTCATATAGTATCTCGTGGAGGTTCTTTATTGTTTGCATGGATGG
AATTAAATAATAAGGAAAATCCTATTTATACTAATTTTGATAAAATATTGGATATATGTGAAGAATATGA
TGTTACATTGAGTTTAGGAGATGCTTGTAGACCAGGTTGTATAAAAGATTCTACTGATGGTGTTCAAATT
CAAGAACTTGTAGTATTAGGTGAACTTACTAAAAGAGCATGGGAAAGAAATGTACAAGTAATGATAGAAG
GTCCTGGACACATGGCTATTGATGAAATAGAAGCAAATGTAGTATTAGAAAAGAGATTATGCCATGGAGC
ACCTTTTTATGTTCTTGGACCATTGGTTACAGATATAGCACCAGGTTATGACCATATAACAAGTGCAATA
GGAGGAGCTTTAGCATGTGCTAAAGGAGTAGATTTTTTATGTTATGTAACTCCAGCAGAACATTTAAGAT
TGCCTAATTTAGATGATATGAAAGAGGGTATAATAGCTGCAAAGATAGCTGCTCATGCAGGAGATATAGC
TAAAAATGTTAAAGGTGCTCGTGAATGGGATAATAAGATGAGTAAAGCTAGAGCTGATTTAGACTGGTGT
GAGATGTTTAGACTTGCAATAGACCCTGAAAAAGCTAAGAGATACAGAGATGAATCAACTCCTACTCATG
AGGATAGTTGTACTATGTGTGGAAAAATGTGCTCAATGAGAACAGTTAAGAAAATATTAAACAATGAGGA
ACTTAATCTAATATAA
>ref|NC_013316.1|:1887748-1887942 putative thiamine biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
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ATTTAAAAAGTGATAGAGTTGTAGTTGAAGTGAATTTAGAGATAATTGAAGAATCTAACTACAATACATA
TGTATTAAAAGACGAGGACATTGTAGAGCTTATTAGCTTTATTGGAGGTGGTTAA
>ref|NC_013316.1|:1887935-1888738 putative thiamine biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
GTGGTTAAAATAAAAATATTTGTAAATGAATTATTAACAGATGTTGAGGAAAATACAACTGCTTATAAAG
TTAGAGATAGCTATAACAATAAATGTGATGTATTGGTGTTAAATGGATATCCAATTAAAACAGATATGCC
CCTTTGTGAAAATGATAAATTAACACTTATACAAAAAGGAGTTAAGCCATCACTTGATGAATTGGAAAGC
TTGTTGATTGCTAGACATACTCCAAATATACATAATAAATTAAAAAAAGGGAAAGTTGCTATATTGGGAT
TGGGGGGACTTGGTTCCAATATAGCTATCTCTTTAGCTAGAATAGGAGTGGGAGAACTTTTACTTATAGA
TTATGATGTTGTAGAACCATCTAATTTAAATAGACAACAGTATTTTATAGATGATATAGGAAAACTAAAA
ACTGATGCCATGATAGAAAATATAAAAAAAATAAATCCATTTATAAAATTAAATAAACGAGATATTTTTT
TAAACAAGAACAATATGGATACTATTAAGGATTCAGATTTAATAATTGAGGCCTTTGATGATGCTTCATG
TAAAGCACAGGTATGTAATTATGTATTAATAAATTTAAAAGATAAATATTTAATAGCATCATCTGGTATG
GCAGGTTACTATGATTCAAATATAATAACTACTAAGAAGATAAAAGACAGGTTTTATATATGTGGGGATT
TTGTGAATGAAGCTAAATTTGGTGAAGGGCTTATGGCTCCAAGGGTTGCCATCTGCGCAAATCATATGGC
AAATTTGGCAACGCAAATACTTATAGATATGTAA
>ref|NC_013316.1|:1888924-1889571 thiazole biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
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CAATACTTCCAAATACATCAGGAGCTACTAATGCAGAAGAAGCTGTAAGAATAGCTAGAATATCTAGAAA
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TTTATGCTGGAAGAAGACTTATAGAAGCTAATGCAGCCGCAGTTATGCCACTTGGAGCTCCAATTGGTTC
AAATAGAGGTCTTCAAATGAAAGAAATGATAAGAATAATGATAGATGAGTTGGATATACCAATAATAGTA
GATGCAGGTATTGGAAAACCATCTCAAGCTATGGAGGCTATGGAAATGGGAGCTGATGCAGTACTTGTCA
ACACTGCTATAGCTTCAGCAGGAGACCCTGTACAAATGGCTAGAGCATTTAAATTAGCTGTAGAAGGTGG
AAGAGAAGCATATATTGCAAAAACAGGAAATGTGTCAGAATTTGCAAATGCATCTTCTCCTTTAACAGGT
TTTTTAGGCAATTTATAG
>ref|NC_013316.1|:1889588-1890691 putative thiamine biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
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ATAATGATGTTTTAAGAAGTTTATCAAAAGACAAGCTTGAAGATTTTGATATATTAAATTTGCTTTCTAA
AACTGCAGTAAAACATTTAGAAGATATGGCACAAAAAGCACATAAATTAAGTGTTCAATACTTTGGTAAA
ACAGTATGTTTATATACACCAATGTATATAGCAAATTATTGTGTTAATCAATGTGTTTATTGTAGCTATA
ATATAAAGAGTGGAATAAAAAGAAAAAAATTAACTATGGATGAAATTAGAGAAGAGGGAGAAGCAATTTC
AAAAGAAGGTTTCAAACATCTACTTGTTTTGACTGGAGAAAGTAGTTTTCACTCAAGTGTAGAATATATA
GGTGAGGCTATAGAAATATTAAGAGAGAAATTTCCCTCTATAGGTATAGAAGTTTATCCAATGGAAGTAG
AAGAATATAAGTACATTGTAGATAAAGGTGTTGAAGGATTAACAGTATATCAAGAAACTTATGACGAGGA
AATATATAAGAGAGTACATATAAAAGGCCCAAAATCAAATTATGAATTTAGACTAGATGCTCCTGAAAGA
GGGGCAAAAGCAGGTATGAGGACTTTATCAATAGGTGCACTTTTAGGTCTAAATGATTTTAGAAAAGAAA
CTTTTTTTACAATATTGCATGGGAAATACTTAAAAACGAAATATCCTCATATTGAGCTTTCATATTCAAC
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GCTATGGTATGTATGAGATTATTTGACCCTCATGCAGCTATAAATATATCCACTAGAGAAAATTTAGAAA
TGAGAAGTCATATAATACCTTTAGGAGTAACTAAATTGAGCGCAGGTGTATCTACTGATGTAGGAGGTCA
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ATGCTAAACTCAATTGGTTATCAGCATGTGTTTAAAGATTGGGAAAGATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1890692-1891381 putative thiamine biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTATCTGATAACAAACAGAAAATTATGTAGTGAGGAACGATATTTAGAAGTTATTAAAGAGTCTATAT
TGAGTGGTGTAGAAAATATAATAATAAGAGAAAAGGATTTGGAATATCAAGAGCTAAGAAAATTATATAT
GAAAATAAAAACTAAAATCAATTGTATAGATTTTCAAGAGCAAATATCAGATGAAAGTTTGAAAACTAAT
ATAAATCAAAAAGAGTGTAGAAATAAATTCAAGGTTAATTTTATAATAAATAGTAACATTGAATTTTTTG
AAAAAGTGGATTGTCAAGGTATCCATCTTCCTTTTAAATTATTCTTGAATTTAATTGAAAATAAGTATAA
TTTTAATGAAAATAAAATACTAGGATTATCTTTACATAAAGTAGAGGAAGTAGATTATTTAGAAAAATTA
ATAAGAAATCAAAATATAAAAATAGATTACATAACATTATCACATATATATGAAACTAAATGTAAAGAAG
GATTAAATCCAAAAGGAATTGAGCTTTTAAAAGAAGCTAAAAAGATTACTGATATTAAAATAATTGCACT
TGGGGGAATTTTACCATCTAATGTCAAAGAAACATTAAAATACTGCGATGATTTTGCTATAATGTCAACT
ATAATGAGGTCTAAAGATATTAAAAAAACCATATCAAATTATAATGAAAAGTTGAATTAG
>ref|NC_013316.1|:1891554-1892963 putative C4-dicarboxylate anaerobic carrier [Clostridium difficile R20291]
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TTTTACTAATAGTCTTGATGGCAATATTGACTTGGATAGTACCAAGTGGTGAATTTAGTAGAGAAGATGT
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GTTTTTAAAGCACCAATAGAAGGCTTTATAGATTCAGCTGAAGTTGTAGGTTTTGTTTTAATAGTTGGAG
GTGCTTTTGGTATTGTAAATAGGACTGGAGCTATAGAAGCAGGAATAGCTTCGGTTATCTCTAAGTTTAA
GGGAAAAGAACTTCTTATAATTCCAATATCAATGATTTTATTTGGACTTGGAGGTACAACATTTGGGATG
GCAGAAGAGACATTACCATTTTATATGATATTTGTTCCACTCATGACATCCTTGGGATATGATTCTCTAA
CAGCAATAGCAATTGTATTTATAGGAGCAGCAGCAGGAGCCGCCGCTTCAACAATAAATCCATTTTCAGT
TGGTATTGCACAGGCACTAGCTCAACTTGCTCCTGGTTCAGGAGTAACTTACAGAGTAGTTATTTTTATA
GCATATATACTAATAAGTATAGCATTTGTTATGTACTATGCTAAGAAGGTAAAGGAAAATCCTGAAAGTT
CAATAGTATATGAAATAGATAAAAATAATAAATCAATACTTAATCAAACTTCAACAGAAATAAAAGAATT
TACTTTTAAAGAAGTATCTGTTCTTGCTATATTTGGAATAGGGATGGCAATAATGATTTGGGGTGTTTTA
AGTCAAGGATGGTACATTCCAGAAATATCAATGTGTTTTGCTGCAATAGGTGTGCTTTCTGGATTGGTTG
GTAGATTATCTCAAATTGAAATCTCAGAAAGTTTTATAGATGGAGCAAAAGATTTAGCATCTGCAGCTCT
TGCTATAGCTTTGGCTCGTGGAATCGTAATAATTGCTCAAAATGGATTTATAATAGATACTATATTAAAT
TCCGCAGCAGCCTTTCTAGGTGGGCTTCCAAAGGTTATATTTGTATATTTATCATTTTTCTTGGAAGCTG
CATTGGCATTTTTAATTCCATCATCTTCAGGTCTTGCTTCACTTACAGTACCTGTACTTGCTCCTCTTGG
TGATTTGGTTAATATATCGGCTCAAGTGATAGTAACCGCTTATCAATTTGGTGTGGGTCTTACAAACTTT
ATAACTCCAACTTCAGGAGTACTGATGGGAGCACTTGCAGTAGCCCATATTCCATTTTCAAAATGGGTAA
GATTTATAATGCCTATCTTGTTGATTTTGACAGCTGTATCTCTAGTCTTTTTAACAATAGGTATTTATAT
AGGGTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1893480-1894847 hypothetical protein CDR20291_1607 [Clostridium difficile R20291]
ATGGGATTAAAAGAATTTGATTTTATTGAAGAGTCTATTGATATGTTGAGGACAATGTCACCAACATTAG
AAACTATATCAGATGAAATAGAAGAGTATTTTGAAAATATCTTGGATGAAAAGAATCAAGAATATATAAA
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TTGAGGATGAAAACAAAATATATAGACTTTTGAGAAGATATTTTAATAAAACAGATGACAAAATAAACTA
TTATAATAAAGAGAATAAGAATATTAAATTAAAACTATCTGAGAGGCAACCCAATAAGCAAAAAAATGGA
TTTGAAATATATAAAATAGATGGAGTTTTTGCGTATTTAGATAGAGAAGTAAAATTTGAACTTCAAATTA
AATCTCTTGTAAATGTGTTTTGGAGTGAAATAGAACATAAAATAATTTATAAAAATAATACATATTTACT
TGCTGATAAATTTATAAAGGATATGATGGACTCTATAAAGAATAATCTTACTATGATAGATAATCAGCTT
TTAAGTATTTATAAAAACTTTCATTCAGGGAAGTCTTTTAATATGAAAGTAAGTAAAAAAGAAATTGAAA
AATTATTTGCGAAACTAGTCTATGACGCTTTTTCTGAAAAGATGAATAAAAGTATAGGTTTTGTTGTAGA
TTTTAAAAAACCATGTGAAACTATATTGAACTATTCTTTTAATAAACAAGATATAAGTGATGAAGTTTTA
GGTAATTTTATGCTTGATGAGTTTGCAAGATTAAATGAAATTGTAAACAAGGATATAGATTTTAATGAGC
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TATTATGCCAATTTGAAGAAGATAGCAAGCTTATAATTGAAGATATATATGATTGTATATTTAATAGTAT
AAGTGAGATTGATAGTGTTGAAATTTTATATAACTATAATCTTGAAAAAATAAACTTTACATCAAGTGAA
ATCATAAATTGTATATGTAGAGAATATGAGTGTTATGGTGAATACTTAGAAGAAAAAGAAAAGCTTATGA
ATACATTTAAAGAAAAGATTATTCAAATCTTTGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1894872-1895480 putative molybdopterin-guanine biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
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GAAGAATTATATTCTAAATACGATATTAAAGTTTATAATGATATAGTAAAAGATGTTGGTCCAATTGGAG
GAATATATACTGCTCTTGAATATGCAAAGTATGATATAGTTACAATTGCATGTGATATGCCATATCTAAA
TAATCAAATAGTCGAAAGAATAGCTAATAAAATGAATGATAAAAGTGTGATTTCAGTGACAAATGGAAAG
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TTTAAATGTAAACACTGTTGATGAGTATGAAAAATTAACTAAAGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1895528-1895899 hypothetical protein CDR20291_1609 [Clostridium difficile R20291]
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AAATATTAGATGAACTTAAAAGGAATATGTACAAAGTTGTTGCTATAGATGAAGAGAAAAAACCTATTGA
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>ref|NC_013316.1|:1896078-1896416 hypothetical protein CDR20291_1610 [Clostridium difficile R20291]
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GCTAAAGGTGCAAACGCAGTAATAGCATTTAGACTGTCTTCAGCTTCAGTTATGCAAGGGGCAGCAGAAA
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>ref|NC_013316.1|:1896883-1897386 putative molybdenum cofactor biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
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GGAGGTACTGGTTTTTCAAAAAGAGATATAACCCCAGAAGCAACTAAGGAAGTGTTGGAAAAAGAAATAC
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GAGTGGAATAAGAAATAATTCTATAATAATAAATTTACCTGGAAGTCCTAAAGGTGCAGTTGAAAATCTA
AGTTTTATAATTGATGTTTTAGACCATGGCATAGAAGTTTTAAGAGGAGAAGCTACAGAATGTGCCACTA
AAAAAAGTGAATAG
>ref|NC_013316.1|:1897433-1898392 molybdenum cofactor biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
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GTGTCTATTGTATGCCACCAGATGTAAAATTTGATAAAAATTATATAAATGAAAATCTAAGCTTTGAAGA
CTACAAGTTTATTATAAAGGCTATGGCTGAACAAGGTATAACAAAAATTAGATTTACTGGAGGAGAACCT
CTTTTATATCCTAAATTAAATGAGCTTATAAAATTTACAAAAGAAGAATGTGGAATAAATAACATAGGAA
TGACTACTAATGCTATTGGGCTTTCTGATAGAATTTTTGAGCTTGAAAAATGTGGCTTAAATAAAGTTAA
TATAAGTTTAGATTCTTTGAAGGAATATAAGTATAAATCCGTAACAAGAGGAGGAAACTTAAAAGATGTC
TTAAAATCGATTGAATCTTGTTTAAACTTAGGTATAAAAGTAAAGTTAAATTGCGTTGCTATAAGTGGGT
TTAATGATGATGAGCTTAAAGATTTTATGTTTTTAACAGTTAAATCACCAATTGATGTAAGATTTATAGA
GCTTATGCCATTAGGTGAGGCTAATAGAGTTTATAAGAAGGGTTATTTTAATGTAAAAGAAATGATTGAA
AAAATATATGGTTTATATAAAGTCAAAAATGATGAAAAAAGTACAGCAGAATATTATATGTTTAAAGGAG
CTAAAGGAAGAATAGGAATTATAACTCCATTAAGCTGTTCATTTTGTAACACTTGTAATCGTATTAGACT
TACTTCTAGTGGTGCAATAAAATTATGTCTACATTCAAAAGAAGAAATAGATATAAAACCATTTTTACAT
AAACCATTGTTATTTAGAGAATCTATGAAAGATATAATAAAACAAAAACCAGAAAAACATCATTTAATAG
AAAATAAATGTAGTGATACAAATAGGCGTATGTATGAAATTGGAGGATAA
>ref|NC_013316.1|:1898396-1898866 molybdenum cofactor biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
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GAACGGCCGTAGCTACAGCTACAATTACTCTTAGTAAGGAAGCATTAGAAAAAGTAAAAAATGGTCAGAT
AAAAAAAGGAGACGTATTGTCTGTAGCTCAAGTTGCAGGTATAATGGGAGCTAAAAATACATCTTCAAAC
ATACCAATGTGCCATCAGATTAAATTAGTTGGATGTGATTTAGAATTTGATGTAGATGATTATATGTCTG
CTATTAAGATATACGCAACCTGTAAATCTCTTGGGAAAACTGGAGTAGAAATGGAAGCTTTAAATGCATG
TTCTTTAGCAGCACTTACAATTTATGATATGTGTAAAGCAGTTGATAAAAAAATGGTTATAAGTAATATC
CATCTTGTGGAGAAGACTGGTGGAAAATCAGGAGATTTTAAGTTCGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1898902-1899333 putative molybdenum cofactor sulfurase [Clostridium difficile R20291]
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AGCTAAAAATAAATCATGGGATAGTTGGAGATGCACATGCAGGAAACTGGCATCGTCAGATAAGCTTACT
TGGAAAAGAAAGCATAGATAAAATGAAAATGAAAGGCTTTGACCAATTAAAATATGGAGATTTTGCTGAA
AATGTAACTACAGAAGGGATAGAAGTTTTTTCCCTGCCTGTTGGTACAAAGTTAAGAATAGGGCAATGTG
AAGTTGAAGTAACTCAAATAGGGAAAAAATGTCACAATGGATGTGAAATTAAGAAATTGACAGGTGACTG
TGTGATGCCACGAGAAGGAATTTTTGTAAAGGTTCTAAAAGAAGGAATTATAAATGTGAATGATTCAATA
GATGTAATCTAA
>ref|NC_013316.1|:1900133-1901428 putative permease [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATGGAAGAAGAAAAAATTAACTATGCTCTGGAACAGATTCCAGAGAATCAAAAACGTGGTTGGG
TAGCTATGTTTTCAGTTTTAGTAGCAATAGGTGTGGATTTATCATCTGTTATTTTAGGCGCTGAGTTGGC
ACAGAGTATGCCAATGAAACAAGCAATATTGTCAGTAATTGTTGGTTCATTTTTTTCTGCAATTTTGTAT
ACTACATGCTCTTTGGTTGGTTCATCTACAAGTTTATCTACATCTATGATAACAAAGTATGTATTTGGAG
AAGCTGGAGCAAAAATATTTTCTCTAGTTATAGGGGTTTCTCTATTAGGTTGGTTTGGAGTTCAAGTAGG
TTTCTTTGCACAAAATGCACAGATAATAATAAAAGATATATTTAATTTAGATGTCAGTATGCAGATTTTA
AGCCTAATAGGTGGTCTCTTGATGATGAGTACTGCAATTTATGGATATAAGGCCATGGAGAAGTTGAGTG
TGTATTCAGTACCATTTTTATTAGTTCTTATGATGCTAACTATATTCTTAGCTTTTAGAGCAAATGGAAT
TTCAGTTGATGATAATATGAAATCTACTATGACATTTGCAGGTGGAGTTTCTCTGTCAATGAGTATAATA
ATAGTTGGTGCAATTGTATCTCCTGATATAAGTCGTTGGGCTAAAAGTAGAAGAGACTGTGCTCTTTCAA
GCTTTTTGGGAATACAATTTGGAAATGCTTTTATGATAATAGTTTCGATAGTATTAGTAAAATGTATGGG
AACTTCAGATATTATGAGAATTTTTATTACATTAGGAATTGCTATACCAGGTATAATAGTACTTACATTA
GCACAATGGACTACAAATACAAGTAATGTATATTCAGCATCATTAAGTATAGCTCTTGTACTTAAGAAGG
CTCCTGAGAAAGTATTAACTATAGTCCTTGGTATTATAGCAACATTATTGGCTGTATTTGGAATATATGA
AGGTTTTATAGGATTTTTAAATTTACTTGGAATTGTAATTGCACCTGTTGGTGGTGTATATACAGCAGAA
TATTACATAGTAAAGCAAGAACTTAAAGGCTTTGATAAAGGAGTATTATATAAACCAATAGTTAAACGTT
CAATAGTGTCTTGGATAATTGGTATATTAATAACTTACCTTTCAACATATGGATTTATAACTCTTACTAC
TATAGCACCTTTAGATGGTTTTATAGCAGGGTTTGTAGTACAATCTATTATTGGAAAAGTGCTTTGTTCA
ACAAAAAATAAGCAAGAAATAGACAAAGCAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:1901482-1902561 hypothetical protein CDR20291_1616 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGATTTTTAACAGAAGAAAGTGTAGATAAAATAGCAGTTGGTGCAGCAGTGCTTGGAACTGGAGGTG
GAGGTGACCCATATGTAGGTAAATTGGTTGCAAAACAAGCCATTAAAAAGTATGGTCCTGTAAAAGTAAT
AAGTTTAGATGAACTTGATGATGATGCTTTGGTAGTTCCAGTATCTGGTATGGGTTCTCCTGTAATTACA
ATAGAAAAATTACTTTCAGAAGTAGAGTTAACTACCCCTTTAGAAATAATGGAGAAATTATTAAATAGAA
AAGTGGATGTTATAATTCCTATAGAAATAGGAGGGATAAACTCACTTATGCCTATAGCAGTTGCTGCTAA
AAAAGGACTTCCTATCTTAGATGCAGATTCTATGGGTAGAGCTTTCCCTGAAGCTCAAATGGTAACTTTT
TATCTTGAAGGATATGAGGCATCTCCTGCCGTAATGTCTGATGAAAAAGGTAATTCTGCCATCCTTTATC
CTGTGGATGGAATTTGGTCAGAAAGATTAGCTAGAACTTTAACTGTAGAAATGGGAGGAAGTTCTTCTAT
TAGTGACTATAATTTAAGTGGAGCTCAAGTTAAAAAAGCTGCTATAGGTAATACTCTTACAATAGCTGAA
ACTATAGGAGGGTTTTTACTTGAAAATAAATCTGATTCAAAAGGTGCTGTTGAGAATATACTAAAAGAAT
TGTGTGGATACAAGTTATTTGAAGGAAAAGTAATTGATATTAAGAGAGAGTTGAAAGGTGGATTTACTAG
AGGACATGCCTTTTTTGCTGGGATTAATGAGTATGATGGAGAGTATTCTATATTATTCCAAAATGAGAAT
TTAATTGCCAAAAAAGGTGATACACCACTTTGTATTACACCAGATTTAATAGCAGTATTAGATTTAGAAA
CTGGATTTCCAATAACTACAGAGAGAATAAAATATGGCTCTCGTGTTATGGTAGTAGCTTTTCCTTGTAA
TGAAAAGTGGAGAACAGAAAAAGGAATTGAGACAGTTGGACCTGGATACTTTGGATATGATGTGGAATAT
AAAACAGTAGAAGAATTACAAGGAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1902582-1904126 putative hydantoinase [Clostridium difficile R20291]
ATGTATCGTGTAGGAATTGACGTTGGAGGAACAAATACAGATGCTTGTATACTGGATGGGGAATTAAAAG
TAATTCATTCAGTTAAGGTGGCAACTACAAAAGATGTTGAAACTGGTGTTTACAATGCCTTAAAAAAAGT
TATAGATGAAAGTAAGATTGACCATTCATTAATAAAATATGCTATGCTTGGTACAACTCATTGTACAAAT
GCTATTGTAGAAAGAAAAAGACTTAATAATGTAGCTATGATAAGAATAGGAAAGCCGGCCACTACTGCCA
TTCTTCCATTTATAGATTGGCCAGAAGACTTAAGAGAAAAAATAGAATTAGATTCAATATTGGTATCTGG
TGGATATGAGTTTGATGGTAGAAAGATAAATGAACTTTGTAAAGATGAAGTTGTAGAGTTTTGCAATAGA
ATAAAAGGCAAAGTGGAAAGTGTTGCAATAAGTGGAGTATTTGCTCCAGTAAATAAACAACAAGAAGAAG
AAGTTGCAAAATGGGTTAGAGAAATTTTAGGGGATATTCCTATATCTTTATCAAATGAAATAGGTAATAT
AGGTATATTAGAAAGAGAAAATGGAGCTATTTTAAATTCTGCATTGTCTCAAGTAGGTAAAGCTGTATCT
TTAGGATTTGAAAAAGCACTTAAAGACTTAGGTATAGATGCTCAAATATATTTCAGTCAAAATGATGGAA
CATTAATGAATTTAGAGTATACAATGAAATACCCAATTTTTACAATTGGATGTGGAATAACAAATTCTAT
AAGAGGAGCTTCCTTCTTATCAAAAGTAAAAAATGCAATAGTATTAGATGTTGGTGGAACTACAAGCGAC
TTGGGTGTACTATATAATGGATTCCCTAGAGAATCATCTATTCCAGTTACAATTGGAGGAGTACATACAA
ACTTTAGAATGCCAGATGTTTTAACTATTGGTCTTGCTGGTGGTACATGTGTAAAAGGCGAAAAAGATAA
TATAAAGATAGGTCCTGAAAGTGTGGGATATAGAATAACTGAAGATGCAATAATATTTGGTGGAGACACT
CTAACTTTATCAGATGTTGTTACAAAATTAGATATGGCGTTTGAAGATAGAAAAAGCAATGTTGAAAACT
TAGATAAAGAGTATTGTAATGAGGTATATAAGAAGGTTATTTTAAAATTAGAAGATGCTGTAGACCAAAT
GAAGACTAGTCAAGATGATGTTGAATTGGTTTTAACTGGTGGAGGAAGTATAATTGTTCCTGAAAAACTA
AAAGGCATAAGCAATGTTATAAGACCTCCTCATTATACTGCTGCAAATGCTATTGGTGCAGCTTTAGGAC
AAATAAGTGGAGATGTAGAAAAAGTATACAGTTTAGATAAAATGTCGAGAGAAGATGCCATAGAAGATGC
AAAAAAAGAGGCTGTAAATAAAGCTCTAAAAGCTGGTGCTAAAGAAGATACTATAGAAGTATTAAATATA
GAAGATGTTCCACTTGCATACCTTCCTGGTAATGCACTTCTTATAAAAGTAAAAGTTGTTGGTGATTTAA
TTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1904831-1904289 hypothetical protein CDR20291_1618 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGTTATATCGCATTATTAAGAGGTATCAATATAAGTGGTAAGAACAAGATAATTATGTCTGAAT
TAAAAGCAAGCTTTGTAGAACTTGGTTATTCAGAAGTTTCTACATACCTTAATAGTGGTAATGTTGTCTT
TTTAAGTGATGTAGATGACAACAAGGTTATCTCAAATACAATAAGATTAATGATAAAAAAACAGTTTGAA
TTGGAAATACCAGTTTTTATTATTTCACAAGAGGAGTTAAAAGATATACTAAATAATGCTCCTAATTGGT
GGGGAGATAACAACAAAGAAATATATGATAATCTTATTTTTATGTTTCCTGACTTATCTTATGACGAGTT
TTATGATGAGGTTGGAAATCCTAAAGAAGAGTATGAAAAAGTATATCATTATAAAAATGCTATCTTTTGG
TCTTTTAGTCGTAAAGATTATAAAAAGACAAATTGGTGGTCAAAGACTGCCAGTTCAAATGTAAGTGATA
AGATTACAATTCGTACAGCAAATACGGTAAGAAAAATAGTTGGAATGCGATAA
>ref|NC_013316.1|:c1905263-1904979 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
GTGGCAAAAAATACAAAGCAAACAACGGTTCATATTGATGAGACTCTACTTAAGGAAGTTAAGAGAATAG
GAATTAATGAAAATAAAAGTATATCTCAGATAATAAACGAATCAATAATAGATTATATATTAGTATACAG
AGAAAACGAAGATAAAGAAAAAAATGAACATGATAAGAATCTAAATGAAACAATAAATGAATTTAAAAAA
GAAGAAGAAAAAAGAATGCAAGCAAAAAGTGCTGCTAGAGCTATAGCAGAAGCAAAAAAACGAGTTCTTT
ACTAA
>ref|NC_013316.1|:c1906090-1905326 putative acyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATTACTTAAAATTTGCTACATATCAACTTATAGGTTTTACATCTTCTATACCTAGCCTTATTA
AAATTAAAAAGAATCCTGATAAATTTAGCTTAAAGGAAAAATTTGAATTTATGCAAAAACAAGCTAAAAA
ATCTTTAGATATAGTGAACATAGAGCTTAATATAATTGGTAAGGAAACACTGCCAAAAGAACCACTTCTA
TTTGTTGTAAATCATTCTAGTATGCTTGACAGCTTCATACTAACAGCAAGTGTAGAAAGACCAATTGGAT
GTGTAATTGCAGATGAACCAGTTTGGAGAAATATACCTATATTTAAAGAATGGGCAAAATTACTAAGATG
TGTATATGTAAACAGAAAAAACAATCGTGAGGGTATAAAGAGTATAGCCCAAGCCTCTCAAAATATACTT
ACAGGTCAAAGTATGGCAGTGTTTCCAGAAGGAGATTTAACATGGATTAAAGAACCAAATTCATTGGTTT
CGGAGTTTAGAAGTGGAGCTTTAAAGATAGCATATAAAGCAAAATGCCCTATTGTTCCACTCGTAATAAA
AAATTCAAAAGATACTTATGAAGGATACCAACCTATTGGTAAAATTAACTCTGTTCCTGTCGAAGTCGAA
TTTTTAGAACCAATTTATGACCATATAGAAAATCCTAGACTAAAGTCTTCTGTACTAGGTGAAAATATAA
AAAATAAGATGATAAATACAATAGAAAATTTTAGAAAATCAAATAAAACATTTAAAGAATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1906638-1906372 hypothetical protein CDR20291_1621 [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGAATCAAGATGTGGAATTTTATGTTATGAATGTGGATACAAGGAAAAAGTCAATTGTAAAGGTT
GTACAGATATTGAGAAACCATTTTGGGGTGAACAATGTCCTGTAAAATCTTGTTGTGAAGATAAAAACCT
TATACATTGTGGTCTATGTGATACATTTCCATGTGAAATGCTTAATCAATTTGCATATGACAAAGAACAA
GGTGATGATGGCAAAAGAATTTCTCAGTGCAAAAAATGGGCTGTACTAGCCTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c1907490-1906681 AraC-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAATAATCAATAACATTTTAAATACCTGCAAACAGTATACATATATTTTGCCACATAAATTGT
TAAGACAGTATATAGCACACTATACAATATCTATTCCAGATACAAGTATTAAAGAAAAGCTTACATTAAT
ACCTGATGCTAGTGGATGTATGATATTTAAATTTGACAAAAAAGGTATAGAAAGCGCATTCTGGGGAGCC
ACAACAAAAACTACTATTGTAAAAAATGATATAGAAAATGTACTTTTTAGAGTATTCGTTGAGTTTCGCC
CAGGTGGAGTATATTATTTGACAGGTCTTTCTCAAAGAGAATCTACAGATTTAAAAATTTCACTTGAAGA
TTTTAACACATTATTTAGCTTAGAGGTTAATTCCATTTTTGAAAGAACAAGTACTATAAAGGAATTAGTA
GAACAATTAGATATGTTATTCTTATCATACTTATTGAAATCAAATATAGTAGATATGACTATACCAATTC
TTGAAAATGCTAGAAAACAGAACTCTATTATGTCTGTTAAAAACATTTCACAAATTAGTTGTTATAGTGA
ACGACATTTAAATAGAATTTTTAATAATTCTCTTGGGATGAGTGTTAAATCATACCTTAGATTACTTCGT
ATAAACCTTGTATTACAAGAAGTACAAAACAATAAAAGACCATTTGCAACTTTAGCACAAGATATTGGTT
ATTACGACCAATCTCATTTTATAAATGATTTTAAATCTATTTGTGGTGTTAATCCAACAACCTATATAAA
AAATTTGTCCGATTTTTACAATGAAAAGTATAAATTTTGA
>ref|NC_013316.1|:1907803-1908084 hypothetical protein CDR20291_1623 [Clostridium difficile R20291]
ATGGCATCAAAACAAACACCAAGAAACAATTTAGAAAAGTTTTTAAGAATAAGAGTCTTATCACATACAG
GCGATAAAATACATATAAAGTTACCTGTAAATTTTGCAAAAAGAATGATTGAGAATAATGCTTTGGATTT
ATTTAATGGAAAAGATGATGTAGTAGATGGTAAAAAGGTTACTGAAATATTAGTCAAAGCATTTGACTAT
GATTTAACTGGAGAAGTAGTTCACTTGGAGAGAAAAAATGGAGATATTATTAAAGTTTCAATTGTACAAT
AG
>ref|NC_013316.1|:1908333-1908602 hypothetical protein CDR20291_1624 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAGGGATAACTATGGAAAATAAGGATTTTAAATTAACAATATGTATATTTGCTTTTGTAATTGGAG
TAGTAGTATTATTCTGCTGTATAGGTTTGGGTGAATTTAGTGCAGAGCATATTATTCAACAAAATGGTGG
AATCATGGATACTGACCAATATAATATTTATCTAGACCAATCTATTTCTCAATATAGAAATTTTGGTTCT
ATATTAGCTCTGTTAGGAGGAATAGGGATATTGTTTGATAAATATATCAGAAAATACTAG
>ref|NC_013316.1|:1908647-1908970 hypothetical protein CDR20291_1625 [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAACAGAAATATTTACTGTAAAAATTACACCCTTAGAAGCACAAAAAATGATAAAAGAAAATATTG
ATGCAGATTTAGTTTTTAGTGATTCTTATAATTTAGGAGATGATAAATTTATACTAATTACAACTTTTGA
GAAGTATTACGCAAGAAATAATAGTGATGCAGGATTAATCGTAGTTTATGAAAATACCACAGAAAAAACA
GTTATTAAAGCTACTTCAACAGGCAGTGCAATTGGAGTTTTAAAAATTGATTGGGGTGCAGGTGGAAATT
TACTTAAAAGAGTAAAAAACATACTTGCTGAATATATTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1911717-1910098 putative sodium/phosphate cotransporter [Clostridium difficile R20291]
GTGAATATAGTAATTAGCCTTATCGGTGGACTTGGACTTTTTCTTTACGGAATGAGTTTAATGGGAGAAG
GTTTACAAAAATCAGCAGGAGACAAATTAAAAAAAATTATTGAACTCTTAACAAGTAATGTTGTTATGGG
TGTACTGGTAGGTACAGTCGTTACAGGTATTATACAAAGTTCAAGTGCTACTACTGTTATGGTTGTAGGA
TTTGTAAATGCAGGTATAATGAATCTAAGTCAAGCTATTGGTGTAATAATGGGGGCAAATATAGGTACTA
CAGTTACTGCTCAATTAGTTTCATTTAATCTTGAAGGAATTGCACCAATTGCTTTAGGTATAGGTATTTT
ATTCTATTTATTTACATCAAATCAAAAAACAAAGCATTTATCTGAGATACTTATAGGTTTTGGTATATTA
TTTACAGGAATGGAGTTTATGAAAGATGCAGTAGCTCCACTTGCTGAATATAAAGCATTCACTGATGCAC
TTTTATATTTTAGTAAAAATCCTGTATTAGGTATATTGGCAGGATTTGCCATAACTGGTATTGTTCAAAG
TTCAAGTGCATCTATGGGTATGTTAATAGCACTAGCTTCTCAAGGAATACTTCCTCTATCATCTGCTTTA
CCTATTCTTTATGGAGATAATATAGGTACTTGTGTTACTTCACTTTTATCAAGTGTTGGTGCAAGTAGAA
ATGCTCGACGTGCAGCTGTAATGCATTTAAGTTTTAATGTCATTGGTACAATAATATTTATGCTTGTTTT
AAATAAACCTATATCAGCCATAGTTACTCATTTTGACCCAACTGATACAGCTAGACAAATAGCAAATGCA
CATACTTTATTTAATCTTACAAATGTTATAATATTATTACCATTTTCTAAATACATAGTTAAATTAGCAA
ATAGACTTATACCTATTAAAGAAACTGAATCAGAAATAGTAAATAATACTAAGTACTTAGATGAAAGGAT
GTTTAGCACTCCATCTATAGCACTTGGTAATACTGTACAAGAAGTTGTAAGAATGGGTCATAAAGCTACA
AACTCTTTGGAACATTCAATTGCAGGATTTTTAAATAAGAGCAATGAAGATATTAATAAAGCTTTTGAGT
CAGAAAAAGTTGTCAATAAGTTACAGAAAGATATATTGAACTATTTGTTAAAACTTTCTAAAGAACCTCT
TAGAGACGATGAACGCTTTAGAACAGATTTGCTTTTTAATACTGTAAATGACATTGAAAGAGTCTCTGAC
CATGCAGAAAATATAGCTGAATTGGCCATGAGTGTTAAGGAAATGAACATTAGTTTTTCTGATAGTGCGA
TAAGAGAAATATACGAAATATACAATAAGACAATTACTAATTTTAAGGATGCCTTAATAGTTTTAGATGT
TAAAGATTTTGAGTTAGCAAATAAAGTTTTAGAAGTTGAAAATGAAGTAAATTATTTAGAAAAAACTTTT
AGAAATTCACATATGATTAGACTAAATAATGGAAATTGTACAATTGATGCTGGTGTACTTTATCTTGACT
TACTTACTAATCTAGAAAGAATTTCTGACCACTCAACAAATATAGTAAAACAAGTATTAAAACTTAAACA
AAAAATATAG
>ref|NC_013316.1|:c1913629-1912817 putative ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAGATTGTAATTCATGTCCATCAAAGGGAAATTGTAATAGTCAATCAAATTGTTCTATTGAAAATA
ACCCTAACAATAAATTTGGAAAAATAATTGGTGTTATGAGTGGGAAGGGTGGAGTTGGAAAATCAACTGT
AACTGCTTTACTTGCTAATAAGCTAAACAAAATGGGATATAAGGTTGGTATATTAGATTCAGATATAACT
GGACCAAGTATTCCTAGACTTATGGGTGTAAAAAATGTAAAAGCTTATTCTGATGGCTCTTATATTTACC
CTGTAGAAAACTCAAATAACATAAAAGTAATGTCTATAAACCTTATGATAGATGATGAGAATGAACCTGT
TGTTTGGAGAGGACCTTTACTTGGAGGAGTTGTAAAGCAATTTTATACTGATGTACTTTGGGAAGAATTA
GACTATTTATTAATAGATATGCCTCCTGGTACTGGAGATGTTGCCTTAACGGTTATGCAATCTATTCCTA
TAAGTGGAATAGTTATGGTTTCAGTACCTCAAGATTTGGTATCTATGATTGTATCAAAAGCTGTTAATAT
GGCTAAAAAAATGAACATAAATGTCCTTGGAGTTATTGAAAATATGAGTTATATCCAATGTCCTGATTGT
TCTAAAAAAATCAAGTTATTTGAAGGAGAATCTACTGAAAAGTTTTTAGATGATTTAGACTTAGAGCTTT
TAGGAGAACTTCCTATGACTAAAGAAATTATAGATATTACTCATAATGGAGTTACAGAAATTAGTGATGA
TTTAGATTCAATATTGACTAATGTTGTTGAAAAAATTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1914051-1915202 putative acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATTAAGACCAAGAAGTGCAAAATTAGAAGAATTTGATAAAGTAATAGAATTAATAAACTATGTAT
TTAGAATATCAAGAAATCATAAGCCAACTATGATGGAAGAATTTCCTCTTTTACTAAGTAAAAATAATAT
AGAAAATATGATTATAATATCAGAAGATGATAAAGTGGTTTCTGATGTAAACTATCTAATTCAAGATGTA
TCTATTCAAGGAAATAGATTGAAGGTTGCAGCTATAGGTGGAGTATGTACTCATCCAGATTATGAAAAGA
GAGGCTATTCATCTAAGATATTGGATAAAGTAGAAGAAAAAATGTTTTATGATGGTGTAGATATTGTAAT
TATATCAGGAACAAGAAGTCTATACAGTAGAAGAAATTGTAGTTTGGTAAAGAGTTTTTATAAATATACA
ATAAAACCTGAAGATGTAAAAATAGCATATGAAATAGTTGAATTTGATGAAACTAATTTTGAAAAAGATG
ATGATTTAGATAAAATGCTTGAACTATATAATCAAAATAGTACTAGATTTATAAGAACGAGAGATGAGTT
TCAAAAACTATTGCATGCAGCAACTATTGCCTGGGGACCAATTGGTTACAAGAAGGTATTTATAAAGGAA
AATAATAATATAATAGGATATTTGATAATAAGAACAATAAAAAAAGAAGATTCTACTGTAGGAGAAGTTG
CTGAAATAGGGTTAAACTCTGTAAATGTTGAAAATATATTGAAATATGTTGCAAATAAATTTGGATTAGA
ATATTTAAATTATAAAGTACATGTGAAAAATCTTAAAGACCAGTTGAAATGTAATGGGACAGAATCTTTG
GACTATCAACAAGGAACTATGAAAATAATAAATTTTACTAAGTTGTGTGATAGTTTAAGAAGTTATTTTA
GTCAATATGTAGATTTTGAATTACTAAAATACATGGAATTTAAACAAGTTGAAAATAAATATATTATTAA
ATACAAAGAAGAAGAACTTGTAATAGAAAATTTGGATAAGCTTAATAAACTGTTTTTTGAAAAAAATGAG
GAACAGTATAATGAATTTAAACATCTAAAAAATATATATGAATTTGCTACAAAGGCATTTCCTGTAGATT
TTCCATGGACTGCAAATTTAAATTATCAATAG
>ref|NC_013316.1|:1915320-1915958 putative corrinoid protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGACATACTTGATGATATAGCAGAATGTATATTAAATATGGGTGTAGATAATATAGAGAATTTAGTAA
AAATTGCTATAGATAAAAATATTGATGTGGAAGATATTTATGAATATGGTTTAAACAAAGGTATGATAGG
AGCTTTAGATAAGTTTGAGAATAAGGAATACTATCTTTCAGAAGTTATAGTATGCACAGATGCATTAAAT
AAAGGTATTAATCTTTTGAAGGGAACTGGAAAAGTAAAGAAAAAATCAAAGGGAGTAATTCTGATGTCTG
TAGTAGAAGGAGATACTCATGAGATAGGAAAAAATATTGTAAAAGTAATGGTAGAAGCCACTGGATATAA
GGTTATTGACTTAGGTGTAAATAGAAAAAGTGAAGATATAATAGAAGAAGCTATAAAAAACAATGTAGAT
ATAATAGGCTTATCTTCAATGATGACAACTACAATGGAAAATATGAAATCGGTTATAGACGAGCTTAATA
TGATTGAGATAGATAAAAGACCAAAAGTAATAATTGGTGGAGGACCTGTAAGTATGGAGTTTGCAGAAGA
AATAGGAGCAGATGGATACAGTTCAAATGCTCCAAAAGCAGTTAAATTAATAAACAAACTTATAGGAGGT
GAAGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1915959-1916981 putative methyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTTCAGATATGACTTTACTTCAGTATATAAATAGTGAAGATAGAGGTTTTTTTCTGCCTGATATGG
GTACAAATGGATTGTTCTTAATAAATAAAAAGGCATATGAAGTATATGATAGTGTAGATTTGCAATTAGA
ATTAGCAAAGACTATGGACAAGTATTTTGAATCAGATTTTATATACTCATTCTGTGATGGGATTACATTT
TGTGAAACTCTGGGTTTAGAGACATTAAGACCAGATTATGATTTTCCAAGTGTATTGACACATACTATAA
CTGACAGAGATAAATTAAGAAAATTAGATGTTCCAGACCCTTATACGAGTGGACGTATGCCACTCAATAT
AGAGAGCTTATCAGTTATATCAAAAAGTATTAAAAAACCACTATATGAATCGATACAAGGTCCATTTACA
CTTGCAGGTCAATTAGCTGGAGCTACTCAACTTTTAAGATGTATAATAACTGATAAAAAATTTGTAGAAG
AATTGTTGGAATTTACAACTGAATTGGTAAGAAGATATGCTGTAGCTGCAAATAAAGCAGGAGCAAAATA
TATTTCAATAGCAGAGCCAACGTCAGTAACCCTAAGTAAAGATAGATTTGATGAATATATAGTAAAAAAT
TTAAATAAAATCTACAATGAACTTGATTGTTGGAAAGGTATGCATATATGTGGAGACACCAGAGAATTAT
TAGATAATATGCTAAGTTGTAATATAGATGCAGTAAGTTTAGACCAAATTTTAGACTATGAAGAAATTGC
TCCAATGATTCCTAGAGATATAGTGTTGATTGGTAATTTAGACCCAATAAAACTTCTTGGACGTTCTAAG
CCAGATAAGATTAGAAGAGAGACACTAAAATTGTTAAAGAAGATGAGAGGATATGATAACTTTTTATGTG
ATTTTGGCTGTAACTGCTTAAATACCACTCCAGTAGAAAATTTACAAGCAGCTATAAAAGCAGGAAGAAT
TAATTATAAAGAATTAGATAGGATTGATATTGATGAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:1916971-1917591 hypothetical protein CDR20291_1631 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTATAATAGTAATAAAAATAAATATCTTTTAAAGGATATAAATTTAGAGGATATTTTTATAGATA
AGAATATTGTGCTAAAGTTTTTGGGGTATGGAAATAGAAAAGCTCCAGATACAATTAGTGAAATCGTTGA
AAGAGAAATAAGAAATATAAATGATATTTTAGATATCAAGATATATATAAGTGAAGTTGATATTAATAAA
ACACCTAAAGAATGTAAAAAAGCATTTGCTGTACTATATACAATAGGGGATAAAATTGATATTAAGATGA
ATGACTATATGGAAAATTGCAATATGATGGCAGGGATAGCATTGGATAAAATAGGTATAGTATGTTTAGA
TTATATTAATGAGAAAATAAAAATGTATTTAAAAGGAAAGTATGATAGTCTTAAAATATCGCATGAAATA
TATCCAGGAGATAAAGATTTTGAAGTAGAGAGACAAAAGGATATTTATAACTATGTAAAAAATAAATATA
ATAGTATAGAAATAGAAATCAATGATTATCATCAACTATCCCCCATAAAAAGTGTTGCAATGCTTATTTT
AATGGGAGATGAAGAAAATTTAGAATCAAGATGTAGCAAATGTCCTAGAAAATGCTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1918401-1917715 putative hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGACATATAAATTTATATTTTTTGATGCAGATGATACTTTATTTGATTTTAAGAAAAGTGAATCAC
ATGCTTTTAAAAAACTTCTATCTGAGTTTGATTTAGAATTTAATTTTGAGAATTATATAGAGTCATATAG
AAATATAAGTGATAAGCTTTGGCTCGACCTTGAAAAAAATATTATAACTTTGAATGAACTTAAATTACTT
AGATTTGAACTTTTTGCAAATAAAATATCTTTGGATGTTGATTCTGAAACTCTTAGCAAAATGTACTTAA
ATTTTTTAGGTGAATGTACATTTTTAATTCCAGGTGCAATCGATATATTACAATATCTTAAAAAAAAGTA
TACTATTGTTATAATAACAAATGGAATTTCTGCAGTTCAAAAGAAAAGACTTGAAAATTCAAAAATAAAA
GGATATATTGATGGAATGGTTGTATCTGAAGAGTTGAAAATATCAAAACCAAATCCTGAAATATTTAAAT
ACGCTCTCAAAAAGTTTAATTGTCATGATAAATCTTCTGCCTTAATGATTGGGAATAGCTTAACCTCTGA
TGTCTTAGGTGGAATAAATTCAGGAATAGATACTTGTTGGTTAAATTCCAATAACAGTATAAATTATACT
AATCATATACCAACTTATGAAATAAATACACTTATTGAATTAAAGAAACTACTATAG
>ref|NC_013316.1|:c1918960-1918415 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGATTTAAATTTAGGGGAAAAAATAGCTGAAGTTCGAAAAAAACAAAACTTAAGTATTCGAGATT
TAGCAAAACTAGCTGATGTTACACCATCATTATTGAGCCAAATAGAACGAGGTCTTGCTAATCCATCTGT
AAATTCATTAAAATCTATAGCCTCTTCTCTAAACGTTCCTTTATTTACATTTTTTGTATCTGAAGTAGAT
AAAAAAAACTTGATAGTAAGACATGATAATAGAAAAAAAGTTATTTTACCTGGAAGCAAAGAAGTTATAT
ATGAGATTTTAATTCCAGACTCTAGTGGTAATTTAGAATTTGCAATTATGGATTTAGCTCCAAATACTTC
TTCTTGTATTGATAGGATTACTCATAATGGAGATGAAATTGCATATGTTTTGGAGGGAGAAGTTAAACTT
TTTATGGATGATGATGAATTTACTTTGTCCAAAGGAGATAGTGTAAAAGTTCCTTTAGGAACAAAGCATA
AATGGCAAAATGACTCAAATAGTGAAAGTAAAGTAATTTTTGCAGTCATCTTGTAA
>ref|NC_013316.1|:1919170-1920435 putative gluconate permease [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGGAGGGGACATTATGCAAATAACGACTTTTGGAGCTATATTTGGTTTATTAATAGCAATTATTT
TAATTATAAAAAAATTTCAAGCTGTATATAGTTTAATGTTAGGAGCATTTATTGGAGGATTAGTTGGAGG
AGCAAATATAACACAAACTGTAGATTTTATGGCAAATGGAGCTATGAATATATCACCATCAATTCTTAGA
GCTTTGGCATCAGGTGTATTAGCTGGAAGTTTAATAAAAACAGGAGCAGTAGATAAAATATCAGAACAGA
TTGTAAAAATATTTGGTGAAAAGAGGGCTTTATTTTCGATTGCCATTTCAACTATGGTACTTGCTGGAGT
AGGCGTAAATTTGGATGTATCTATAATAACTGTAGCACCTATAGGATTATATATAGGTAGAAAATTAAAT
TATTCTAAATTGTCAATACTATTAGCTATGTTGGGAGGGGGTAAAGCAGGTAATATAATATCACCAAATC
CAAATACTATAGCAGTAGCAGATAATTTTTCTGTCAATCTCTCTAGTGTTATGATGGCAAATATAATTCC
AGCAATTATTGGAGTTGTTATTACAGTTATTTTAGCAAGTATATTAATAAATAAAGGAAATAAAGTACAA
TCATATGAAATTTTAGAGCAAAGAGAAGATTTACCAAGTTTATTTAAATCATTATGTGGTCCAATTATAG
CTATATTTCTATTGTTTTTAGGAAATGTATCTCCTATAGTTATAGACCCAATGATAGCCCTTCCAATAGG
AGGAATCGTAACTCTAATTGTCACAGGAAACTTGAACAATTCAAGAGAATATTTAGCTTTTGGATTATCT
AAGATGCAAGGGGTATGCATATTATTACTTGGAACAGGGACTATCGCAGGAATTATACAGATGTCTGAAT
TACAACAGAGTACAATAGGTGCTTTACAATTTTTAAATATGCCACAATTTTTATTGGCACCAGTTTCGGG
TATACTTATGTCATTAGCAACAGCATCATCAACAGCTGGTGCTACTATAGCATCATCTACTTTTCATGAT
GCTATAATAAATGGTGGGCTATCACCGATTTCAGGTGCATCAATAGTAAATGCTGGGTCTAGTGTATTCG
AGCAATTACCACATGGCTCACTATTTCATACTAGTTCAGGTAGTATAAACATGGATATAGGTGAAAGATT
TAAGTTAATTCCATATGAAGCATTGATAGGAATAGTAATGACTATAATTTCAACATCTATTCAATTAGTT
TTATAA
>ref|NC_013316.1|:1920522-1922516 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
GTGAATAAAAAAAAGATTGTTATTATAGGGATTATTTATTCATTTTTAGTAGTATTTTCACTTACAAATA
TGTATGTAAATATGGAGTATAATTTAAATGTATTTGAATATATTAAGAAGTCACTTCCATTTACAGAAGA
AGAAAAAAAGTGGTTAGAAAAACACAAGAATTTGATTTACAGCTCTGACCAAAGTTCACCTCCTTTGAGA
TATAAGGGTAAGGAAGATGGACAGTATAAGGGAATTATTGTTGATTTAATAAATTCTCTGTCAATTCAAA
TTGGTAGAGATTTTTATTTTAAACCAAATAATTGGTGGAAAGAATCTTTCGTAAATTCAATAGATGATAG
TATAAAGTTTTTTGACTTGATTCCATCAAAAGAAAGGGCAAATAAATTTATATTTACTGACCCAATATAC
ACTTTGAGTGCAAATATATTGAAAGATAAAAAGTCCCAAGATATAAATAGTTACATGGATTTAAAGGGGA
AAACAGTAGCAATTCCAGAAGGTGATTATTCTATAAATTTTTTAAAGCAAAAAATTCAAGATATAAACAT
TTTATTGACTCCAGATATAAAGACTGGAGTCAACCATTTAATGTCTGGAAAAGTAGACGCAGTTGTTGGT
GATGAACCAGTATTGCGATACTATATAAATAATTATGGACTTTCAAATAAATACAGTGTTTTAAGTAATC
CTATATATACTAAAAAAGCAGTTCTTGCTGTACCTAAACAATATGAAGAGCTGGTTAGTATTTTAAATAA
AGGCATTTTTAAACTTCAGAAAAATGGAGTGTATAAAGATTTAAAGAAAAAATGGTATTCTACGTATAAT
GAAGTTGATGATATATTGTATGAGCGAGGAATTGTGCCTAGTATTTATCTTTTTATAGGTATAATTTTAA
TATCAATTTATGTTTTTTATAGCTATACATATTTGTTAAAGATAGAAATCAAAAGGAAAACAGAACAGGT
AATAGAAAATAAAAAAACTTTAGAGGCAACTTTTAATAGTATTACAGATATAATAATGCTTGTAGATGAA
AATAACAATATAGTAGAATCGAACAAAGTACTATATGACTTTATGGGTGAAATGAGTTATAAGATAGCAG
ATTTGATTAGCATGATAAAAGGTGTTATTAAAAATACCTTCTCTGAAAATACTAATAAAACTAGTGAAAT
AGAAATATACAATAAAATTTTAAAGATAAACACTTTTCCTGTAGAGTATAAAAAAAATAATACTGAGTAT
ATAGTAGTTCTTATTAAAGATATAACTAATGAAAAAATAGTAGAGGCGAAATTACTTAGAGAAAACAAAA
TGATATCTATAGGACAATTAGCTTCTGGGGTAGCACATGAGATAAGAAATCCTTTGGGTATAATAAGAAA
TAATTGCTATCTATTAAAAGATAACGTTACAATGGAAGAAGTGAATGATTGTGTTAAATCAATAGAAAGT
AATGTAGATAGGGCAAGTAATATAATAACCAACTTGTTAAATTTCGCAAGAATATCAGATGATAATTTAG
AACATATAAATATAAGAAATTTTATTGAAAATATAGTGAAACTTCAATATAAAATGTTACAGTTAAAGAA
TGTTGAAATAAAAATTGACTGTGAACATAATTTAGTATGCTATATAAATGGAGAATCGTTAAAACATGTA
TTTATAAATTTAATTTCTAATTCAATAGATGCAATACATCAAGATGGAAAAATTATTATATACTGTTATG
AAAAAAATCATTGTTTATTTATAGATTTTAAAGATAATGGTGAAGGAATAAAAGAAGATGCCCTAAAGGA
CATATTTAATCCCTTCTATACAACAAAACCAATTGGTGAGGGAACTGGTTTAGGTTTATATATTACTTAT
AATGAGATTAAAAAGAATAATGGAGATATAAGTGTTGAAAGTAAATTGGGGGTTGGAACTTGTTTTCATA
TAAAAATTCCATTAAATAAAGAGGTGACTATATAA
>ref|NC_013316.1|:1922516-1923838 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATACTATTAGTTGATGATGAGCTAGAATATGGAGTGGTAATGAAAAAAATTCTACAAAAGAAGG
GCTATCTTGTAGATATAGCACTAAGTGGTGAAGAAGCTATAAATATAATTAAAAAAGATAAAAATTATGA
TTTGGTTTTATCTGATGTTATGATGAAAAATATGGATGGAGTACAGCTATTAGATAGAATTAAATCTATT
AATAGAGATATAGAGGTTATATTAGTTACAGGATATGGAAGTATTGAAAATGCAGTTGATGCTATGAAAA
GAGGAGCTTTATCTTATTTTATAAAAAGTAATCCCATTGAAAATTTATTAGAAGAAGTTGAAAAGGTAAA
GGCAAGTAAAATATCTGTTTCTGTACAAAAAAATAATTTTGAATTTACTTTGGAATCTAAAAATAGAGAT
TTTAATAATATCATAAAAATAGCAAAAAAAGCTGCTTGTAAAGATGTTAATATATTAATCTTGGGGGAAT
CTGGTGTAGGAAAAGATATATTAGCTAGATATATACATAGTATAAGTCCAAGAAAGAATGAGATATTTGT
ACCTGTAAATTGTTGTTCTTTTTCAGAAAATCTATTGGAGTCTGAGTTGTTTGGTCATGAAAAAGGTTCT
TTTACAGGAGCAGTAGATAGTAGAAAAGGTAGATTTGAACTTTCGAATAAAGGAACTCTATTTTTGGATG
AAATAGGAGATATACCTCTAAATGTTCAGGTAAAACTTTTGAGGACACTTGAGGACAAATCTATAGAGAG
GATAGGAAGTAATAAATCTATTAAAGTTGACTTTAGGTTAATTTGTGCTATGAATAAAGAACCAAAAGTG
GAAATATCAAATGGAAATATAAGAGAAGATTTTTTTTATAGAATAAGTACAATAACAATAACTATACCAC
CACTAAGAAAGAGAAGAGAAGACTTAACTACTCTTATAGAATTTTTCTTAAATAAGTACCAAATTGAACA
TGATAAAAAGATACACTCGATTGATAAGGAAGTAAAGGATTTTTTATTAAATTACAATTATCCAGGAAAT
ATAAGAGAATTAAAAAATATAATAAATAGACTTGTAGTTTTAAGTGAAGAAGGCAATTTATCAAAAGACA
ATTTAAATTTAATATCAAATAATGTATACATAGATGATAAAATAAGTATTAGACCTTTAAGAGAAATAAG
AAAAGAGTTTGAATGTGAGTATATTGAAAAAGTTTTATCTTTGTGTGGAAATAATATTTCAAATACAGCT
AAAAAATTGGAGATTAGTAGAAGACAGTTAACCAATAAAATATCAGAGTATAATATTAAGTGA
>ref|NC_013316.1|:1924117-1925403 sarcosine reductase complex component B alpha subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGCTAGAGCTAGGGAATATATTTATAAAAAATGTTGAATTTGGAGAAAAGACAGAAGTAAAAGATG
GAGTACTATATATTAGTAGCGAAGAAATAGAAAAGATAGTATTAGAAGATGAAAGGATTGTAAGTGTAAA
TGTTGAACTTGCAAGACCTGGCGAATCAATAAGAATAGCTCCAGTTAAAGATGTAATAGAGCCTAGAGTT
AAAATTGGAGATGAAAGCAAAATATTTCCTGGAATTATAAATAAAGTGAAGACTGTAGGAAGTGGAAGAA
CCCATGTACTTTTAGGAGCTTGTGTTGTAACTTGTGGAAATATAGTTGGATTTCAAGAAGGCGTAATTGA
TATGAGTGGTCCTACTGCTAAATATACACCTTTTTCAAAAACAAATAATATATGTATTGTTATAAAAGCA
AAGGATGGTATAGATACTCATGATTATGAAGAAGCAGCTAGAATTGCAGGATTAAAAATAGGTGCATATG
TAGGTGAGGCAGGAAGAGAAGTTGAGCCAGATGAAGTCATTGTATATGAGACAAAGCCATTATTAAAACA
AGTAAAAGAATATCCAGACCTGCCAACAGTAGCATATGTTCACATGTTACAATCACAAGGACTTTTACAT
GACACTTATTACTATGGGGTGGATGCTAAACAGATAGTGCCTACATTTATGTATCCAACTGAAATAATGG
ATGGAGCTATAATATCTGGAAACTGTGTAGCACCATGTGATAAGGTTACAACATTCCATCATTTAAATAA
TCCAGTTATACATGACTTATATAAAAGACATGGAAAAGATTTAAACTTTATAGGAGTTATTTTGACTAAT
GAGAACGTATTCTTAGTCGATAAAGAGAGAAGCTCTGATATGGTAGCTAAATTAATAGAATTTTTAGGAG
TTGATGGAGTTCTAGTGACAGAAGAAGGTTATGGGAATCCAGATACTGACCTAATGATGAATTGTAGAAA
ATGTAGTGAAGTTGGAGCAAATGTAGTTTTGATAACGGATGAATTTCCTGGAAAAGATGGCAAGAGTCAA
TCTATAGCAGACGCTACTAAGGAAGCAGATGCAGTTGTTTCTTGTGGTCAAGGAAATCTAGTGGTTCATT
TCCCAGCAATGGAAAAAATTATAGGAACTTTAGATTATGTTGAAATGATGATAGGTGGGTATAAAGGATG
CTTAAATGAAGACGGAAGCATGGATGCAGAGCTACAAATTATAATAGCATCAACTATAGCAAATGGCTAT
AATCATTTGACAGCAAGATATTATTAA
>ref|NC_013316.1|:1925489-1926538 sarcosine reductase complex component b beta subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAAATCAGAGTGGTTCATTATATAAACAATTTCTTTGCTGGTATAGGTGGAGAGGAAAAAGCAG
ATATTCCGCCAGAAAAAAGGGCTGGTGTAGTAGGACCTGGAATAGCATTTCAGAGTCAATTTAATGATGA
TGCAGAGATAATCTCAACTGTAATTTGTGGAGATACGTATTTTGGTGAAAATATTGAGAGTGCAACTCAA
GAACTTTTAAAAATGATAAAAGAAGAAAGCCCCGATTTATTTATTGCAGGCCCAGCATTTAATGCAGGTA
GATATGGAGTAGCTTGTGGGACTATTTGTAAGGCAGTTGAAGAAGAGTTAAATATTCCTGTAGTTACAGG
AATGTATAAAGAAAATCCAGGTGTAGATATGTTTAAATTAGATTTGCATATAGTGTCTACAGGAAATTCA
GCAGCAAGTCTTAGAAAGGTAGTTCCAATAATGACGAAACTAGGTCTTAAATTGGTTAGAGGTGAGGAAA
TAGGACCTCCTGAAGAGGAAGGATATATAATGAGAGGAATAAGAAAAAATTTCTTCCATGAACTTAGAGG
GTCTGAAAGAGCAATTGATATGTTGGTTAAAAAGATGAAAGGGGAAAGCTTTGAAACTGAGTATCCAATG
CCTGAATTTGATAGAGTTACACCTATGAAACCTGTTAAAGATTTATCTAAGATAAAACTTGCCCTAGTAA
CTTCTGGAGGGATAGTTCCAATTGATAATCCAGACAAAATTGAATCTTCAAGTGCTACTAAATATGGAAT
TTACGATTTAACAGATATGGATTCTATGTCAAATAAAGAATTTACAACTATACATGGGGGGTATGACAGA
GCATATGTCCTTGAAAATCCAAATTTAGTTGTACCATTAGATGTAGTTAGAGAGCTTGAAAAAGAAGGTG
TAATTGGAGAATTAGTAGATTATTTTATAACTACTACAGGAACAGGAACGAGTGTTGGCAATTCTAAGAG
ATTTGGAGAAGAGTTTTCTAAGAAATTGTTAGAAGATGATGTAGATGCTGTAATTTTAACTTCTACATGA
>ref|NC_013316.1|:c1927236-1927012 putative ferrous iron transport protein A [Clostridium difficile R20291]
ATGACTGTTTACAACTTAAAACTTGGACAAAAGGGAATTATAGACAATATAGCTGGAAATGAAAAACTTA
TGAAGAGACTTCTAGCCTTAGGACTAATAGATGGCACTGAAGTTGAAGTGAAAAAGATAGCTCCTCTTAA
TGACCCTATAGTGATTAGATTTAGAGGGTTTGACTTAGCTATTAGAAAATCTGATGCAAAAAATATAAAT
TTAAAAAATAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c1928610-1927333 sodium/glutamate symporter [Clostridium difficile R20291]
TTGAATTACAAAGGAGGACTTATTTTGATTACCTTAAGTTTTGATATAGTGCAAACCTTGACACTATCTA
TATTCTTCTTTTTAATTGGTAATTTATTGAAGAATAAAGTTAACTTTTTAAATAATTTCTGTATACCTGC
ACCAGTAATAGGAGGTCTATTATTTTGTTTTCTAAATTTATTTTTTAAATATTTTAATATAGCAGATATA
TCTATAAGTGGAAATTTAATGCCAAATTTTATAACCTTCTTTTTTACAACTATAGGACTTGAAATAAGCA
TAAATCTTATAAAGAAAGGTGGTAGTGTATTATTTAGATATTGGATTTTGTGTGGAGTATTGGCATTTTG
TCAAAATATATTAGCTATTACAATATCAAAGATTATAAAACTTGAACCTCTTTTAGGGCTTATGTGTGGA
AATGTATCTATGGAAGGTGGTCATGGTTATTCTGCTGCATTTGGACTTACAATAGAAAATCTCGGTATAG
AAGGAGCAGTTGGGGTTGGATTATCTGCTGCAACAATAGGACTTATTATGGGTGGTATATTGGGATGTCC
TGTAGCTAAATTTCTAATAAATAAATATAAATTAAAACCATCATCAAATATAGGCTTGTCGATTCCTAGA
TATAATAGAAATCTAAAGAGATTTGGAAGTAAATTTTTTAGAAATAAGAATAGGATAAAAAATAATAACT
TCTCCGAAACAATAACACCATCTGTATTTTTGGAACAGGTTCTTCTCATATTTATTTGTATAAATACAGG
AGAAATTATAAGTAGATGCTTCTATATAACGTTTAATATACTATTACCCTCTGTTGTAACTTGTATGTTT
TCAGCTGTTATTTTTAGAAATTTAAATGATAAGATAAATATATTAGAATTAAATTTTAAACTTATAGATT
TTTTAAAAGAACTTTCATTGGGAATTTTTTTAACTTTATCACTTATGAATATAGATTTATTTGAATTATC
TACATTATTACCTCCTATTCTCTTAATAGTAACTTTTCAAGTAATCTTTATAATCCTATTTTCAATATTT
ATTTGCTTTAGAGTACTTGGAAAAGATTTTGATTCTGCCATCATAATAAGTGGTTTGATTGGACATGGAA
TAGGAGCTACTCCGAACGCTTTGGCAAATATGAGTTCTTTGACACAAAAATATGGTGATTCTCCAAAAGC
CTTTTTGGTTGTACCATTAGTAAGTGGTTTTTTGCTAGATGCTATTAGTATCCCATGTATACTATTTTTT
ATAAACATACTAACTTAG
>ref|NC_013316.1|:1928846-1929835 adenosine deaminase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTGAAAATTTACCTAAGATAGATTTACATTGCCACTTAGATGGAAGTGTTAGAGTAGAAACCATGC
TTGATATAGCTATTAAAGAGAAAATAGATTTACCTTCAAATAATATGGATGAAATAAAAAAATTAGCAAA
GGTTTCTTTTAATTGTACTTCACTAGATGAATATTTAGAAAAATTTGATTTACCCTTAAAAGTAATGCAA
TCTAAGGAAAATTTAAAAAGAATTACTTTTGAACTTTTGGAAGATGCAAGTAGAGAAAATGTAAAATATA
TTGAAATTAGATTTGCACCATTACTTCACACCCAAAAAGGTATGAGTGTTAAAAATATAATTGAGGGTAT
AATTGAAGGAATTAGAGAAGCTGAAAGTATTTATGATATAAAAGGCAATTTAATATTAGGTTGTATGAGA
ACAATGACCTCAAAAGAGGCATTATTAGTAATTGAAGAAGGGAAATCATTTGTAAATAAAGGTGTTGTAG
CAGTAGACTTGTGTGGTCCAGAGAAAGAGGGATTTTGTAAGGAATATAAAGATGTTTTTAAATTAGCAAG
AGAATATGGATATAAAGTTACAATACATGCAGGAGAAGCTGCAAGTGGAGAAAATGTATTGGATGCTATA
AATATTTTAAAGGCGGATAGGATTGGTCATGGGGTAAAAATTAAAGACCATAAAAAGGCGTATAATTTAG
TTAAAGATAAAAAAATATTGCTTGAATTATGTCCAACTAGTAATGTACAAACTAAGACAGTAGATTCTTA
TGAGGTACATCCATTTTATACTTTTTATAAAGATAATTTACATGTAAGTATAAATACTGATAATAGAACT
GTATCAGATATAAATTTAAGTTCAGAACTAAATGTTATATTTGATACTTTTAAACTAGGATTAGAAGACT
ATAAAATTATTTATAGAAATGCAGTAGAAGCTAGTTTTGCAGATAAAGAAACTAAAGAGTATTTGAATAG
TTTAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:1929907-1930647 hypothetical protein CDR20291_1642 [Clostridium difficile R20291]
GTGAAAGATTATGAAGATGTTGTTTATATTAAACTAGTCAAAAAAGAACTTGAAGAATGGAAGAAAAATA
TATTAAAGAAACCTTCTATATTTGACAAAGCATCAAAGGGTATACAGAATAAATTTAATGGAGTATTGCC
AGATAAATATCATGAAATAATTACTTCTTCTATAAAAGTAATGACAAAAACCGTACTGTTTGGATATAAA
TATGCTACAAAGCCACCACTTAGAAATATGTCATTAGAAGAAAGAGAAAAATTAGTTTTAGAAAAAGCTA
AAACTTACAAGACCACAGCAATGATTGAAGGGGCAGGAACAGGGGCAGGAGGAATCCTCTTAGGTTTATC
TGATTTTCCTTTGCTTTTAGGTATTAAAGTGAAATTTTTATATGATGTAGCTTCAATATATGGATATGAT
GTTAAAGATTATAGAGAAAGGATTTATATATTAAACATATTACAGTTGGCTTTTTCTAGTCAACAGCATA
TAAACAAAACTTTTAAATTGATGAATAACTGGGATGAATATGTAAATAGTCTACCAGAAGACATCAATGA
TTTTGATTGGAGAACATTTCAACAAGAGTATAGAGATTATTTAGATTTAGCTAAGTTTTTACAACTAATG
CCTGGAATAGGAGCATTTGTAGGATTTTATGTGAATGGAAAATTAATTGATAAATTATGTGAAACTGCTG
TGTCTGCTTATAGATTGAGGATTCGAGAGCTTAAGTTATAA
>ref|NC_013316.1|:1930847-1931998 putative 2-hydroxyacyl-CoA dehydratase [Clostridium difficile R20291]
ATGACAAATTTGCCAAAACAATTTGATAGCTTCAATGAAGCTAGACAAAAGGGATTTATAAATGCAAAGG
AACTTAAGGAAAGTGGGAAAAAGATGGTTGGAGTTTTCTGTACATTTACTCCAGTTGAAATTCCAATGGC
AGCTGGAGCAACTGTAGTAGGTGTATGCGGTGTTAGTGAAGAGCCAATACCTGATGCAGAAAGGGTGCTT
CCAAGAAATCTTTGTCCTTTAATTAAATCAAGCTATGGACATGCAATAACAGACACCTGTCCTTATTTCT
ATTTTTCTGATTTGTTGATAGGAGAAACCACTTGTGATGGTAAGAAAAAAATGTATGAAGAACTTGCAAA
AGTTAAGCCAACATATGTAATGCATTTGCCAAATACTTCAAAAGGAGAATTTGCCTATAAACTTTGGAAA
GATGAAATGATAAGATTAAAAGAAGAGGTTGAGAAATCTTTAGGTGTAACTATAACTGAAGAAGATATAA
GAACTGCTATAAAAGATAAAAATGAAGAAAGAGAACTTTTAAAAGAGTTTTATGCACTTGGTAAATTAGA
ACCATCTGCACTTACAGGCCTTGAGTTACATAATGTTTTATATCAAGCAGGTTTTAAATTTGACCGTGCA
GAACTTAAACATTCTTTAAGAAAAGTTATAGATGATATGAAAGAAAGATATGAAAAAGGTGAATGTCCTG
TTCAAAAAGATAAGCCAAGAATATTGATAACAGGTTCTCCTATTGGTGGAATAAGCGAAAAAATAGTTAA
AACTTTAGAAGATGCAGGGGCATCAGTCGTTGCATATGAACTTTGTGGAGCTATTAGATCAAACGATTTA
TTGGTTGATGAAGAAATAGAAGATGTATATGATGCTTTAACACAAAAATATATAAATATAGGTTGTTCTT
GTATGATGAATAATGACAATCGTATTGAATTATTAGATAGAATAATAGATGAATATAATGTAGATGCTGT
AATAGATGTAGTTTTACAAGCATGTCATACATTTAATATAGAAAGTTATAGAATAAGAGAATTTGTTACA
AAAGAAAAAAATAAGCCATTTATGTCTCTTGAAACTGATTATTCAAAATCAGATACTGAACAATTAAGAA
CTAGATTTGAAGCGTTTGTAGAGATGTTGTAG
>ref|NC_013316.1|:1932023-1932778 putative (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase alpha-subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAGTATAGGAGTTGACTCAGGGTCAGTGGCAACAAAGGGTGTGCTATTTGATGGTGAAAAAATTA
TTAAGAAAATAATTATACCAACTGGATGGAGCCCTAAAAATACATCTAAACAGGTCTATGAGTTGCTAAG
TAGTGAAATTGACAAAAAAGATATAAAAAAGGTGGTAGGTACAGGTTATGGAAGGGGAGTAATGGATTTT
GCTGATAAGAAAGTAACAGAAATAACTTGTCATACTAGAGGTATTTACTTTTTAAACAAGAACATAAGGA
CTATTTTAGATGTAGGTGGTCAAGATAGTAAAGTTATAAATTTAGATAGAGATGGAAATGTATTTAACTT
TATAATGAATGATAAGTGTGCTGCAGGAACTGGTCGATTTTTAGAGATTACTTCTAACCTTTTAGGAAGC
GATATTGAAAGTATAGATACATTAGCTAAAGGATATGAACCAGTTAATATATCTAGTATGTGTACAGTTT
TTGCTGAGTCTGAAATTGTAAGTCTTCTAGCTCAAAACATTTCTACTGGAGAGGTAGCAGCAGGGATACT
TAAATCTATTGCAAATAAATCCACCTCAATGTTAGCAAGAGGTGAGGTAATAGATGAAGTTGCATTTACT
GGAGGGCTTGCAAAAAGTAAAGAACTAGTAAAAATGATAGAAGAAATACTGGGTAAAAAAATTTTTATTG
CAGAAGATACTCAAATAATAGGAGCTTTAGGAGCTGCTGTAATAGGATTTAGATAA
>ref|NC_013316.1|:1932970-1935357 cell surface protein (putative cell surface-associated cysteine protease) [Clostridium difficile R20291]
GTGAAAAAATTTACTTCAAAAAAAGTAGCAAGGTTTGTTGCACTGTTTTTAATATCTATTTTAGTAATGT
CAACAATTCCTGTGTCAGCTGACAATAGCAATACATTGAATCAGATAAAAAAAGCAGAATACAGTGATAC
TTATAAACAATATCTAAATGATGCTAAAAATGGACGTACAGAAAAATATAATGGAATTATACCAAATCCA
TATCAGTTAGAAGGTACTCAAATTCAAAGTAAAGGAAGAACAGCTCCAACATCTTATGACCCTAGAAAAT
TAGGTCTTATGACATCAGTAAAAAATCAAGAGGATTTAGGAATATGCTGGGATTTTGCTGCAATGGCAAC
CTTGGAAAGTTTCTTGAAGTTAAATAATTATGGAGACTACGATTTATCAGAAGAACACTTAAGATGGTGG
GCTTCAGATGGTGAATATGGATGGTCTGTAAATGATATGGATGGTGCTTTAAATTATGAAGCTATGGGAT
ATTTAACATCTTGGTCAGGTCCTAAATTAGAAAAAGATATCCCATACAATGGTAGAGTATCTAAAGCACA
AGGAGCAAAAAAACCAACTAATATGAATACAGCACCTACTGTTTTTAATGTGACAGATGCTGTGTGTGTA
AGTAATGACATAAATTCTACAAAAAATGCTATATTACAGTATGGAGCAGTAACATCTGGTTATTATGAAG
ATATTAAATATCAAAGTGATGACCAAAATTCATATTATTGTCCAACAAAAAGTTTTAATACAAATCATGC
TATTTCAATTGTGGGTTGGGATGATAACTATTCTAAAGATAATTTTAATGCAAATATTAGACCATCAAAA
AATGGTGCTTGGTTAATAAAAAATAGCTGGGGAGATTATAATTCTGAGGGTGGATATTTCTGGATATCTT
ATGAAGACAAGACACTTATGTCTGATATAGATAATTTTTCAATCAAAGGTGGTAAAAAACCAAATGATGA
TGAGAAGATGTATCAACATGACTATGCAAGTATTGTACCTTTAATTTCAAAAAAGATAACAGCTGCAAAT
GTATTTGATTTCAATAGAGGCGATGAAACTCTAAAATCTGTAATGTTCTTAACTGAAAGTATAGGAGCTA
AGTATGAAGTATCTTATGCTCCAGTAGTAAATGGTATACCTCAAGAAAACAATATGAAAAAATTAAAAGA
AGGTACTGCCCAATATTCAGGATACATAACAGTTCCAATTGATTCTTTTAATATACCAGAAGGAAAGGGT
GCAATTGTAGTCAGTATAGAGGGGAAAAATGGAGAGTCAACTATAGGTTCTGAGTCAAATGTACCAGGAT
ATGATACATTTAAAGCAAAAGCTAATTTAGGTGAAAGTTATATCATAGATAATACTGGAAAATTCTTTGA
TATAAATAGAGATAGTAACTTCTATCCGTGTAATTTTACTATAAAAGCTGTTACAGAAAAGTCTTCTGGT
GAGAGTATCCCGAATGAGTCTTTAATTGGTAGTGATAGATATGAAACTGCTATCAAAGTTAGTCAAAATG
GTTTCAATTCTTCAGAAAATGTAGTTTTAGTAAATGGCAGTTCAATAGTAGATGCATTGGCAGCAACTCC
TTTTACATCTGCTATAAATTCACCAATATTATTGACACAAAAAGAAGCTTTAAATTCAAAAACTAAAGCT
GAGATACAGAGATTAGGTGCTAAGAAAGTATACCTAATAGGCGGAGAAAATTCTATAAGTAAAGAAATTG
AACAACAATTAAAAAGCTTAAATATATCGATAGAGAGAATATCAGGAAGTGATAGATACAAGACAAGTTT
ATTATTAGCTCAAAAGTTAAATGGTATAAAAAATGTATCTCAAATAGCAGTTGTAAATGGAGTGAAAGGA
TTAGCTGATGCAATTAGTGTAGGTGCTGCTGCAGCAGAAAATAACATACCAATCATACTTGCAAATGAAA
AGAGCGAATTGCAAGGAGCTGATGAATTTCTAAATTCATTAAATATAGAGAAATCTTATATTATTGGAGG
AACAGCATCCCTATCAAACAATCTAGAAAGTAAGTTAAAAAATCCAACTAGATTATCTGGTAGTAGTAGA
GACGAAACTAATTCAAAGATAATAGATAATTTTTATAAAAAAGATACTTTAAAAAATGCATTTGTAGTTA
AAAATGGAATCAAGAATCAAAATGATTTAATAGATGGATTGGCAGTTGGTCCTTTAGGAGCAAAAACTGG
GTCACCAGTAATTTTAGTTGGTGATAAATTAGCTGATAGCCAAAAAGAAGTTCTTAAAAATAAGACTTTA
GAAAAAGTAACTCAAGTTGGTGGAGGAGCAAATAAAAATGCATTTAAAGAGTTAGTAAAATTAAAAAGTG
CTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:1936110-1936700 TetR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGCCTAAATCGTATTCTGATAAAGAAAGAGAGTATATAATAAAAAGACTTAAAGAAGAAGCAAGATTGT
GTATGGAGCAATATGGTATTAGAAAAACTACTGTTGATGAGCTTGTAAAACGGGTAAAAATACCAAAAGG
AACTTTTTATCTATTTTTTCAATCAAAAGAATTGCTCTTTTTTGAGGTATTGAGAGATATACATGACTCT
ATACAAAAAGAAATCTTATATGAGATAAATAGAGTAGATGAAAGTATTACATGTGAACAATTGACAGATA
TATTTATGAAATTCTATAGGATGGTTGATAGTACTTCAATTTTAAATCTCATGATAAATGGAGAATTTGA
GATATTGGTGAGAAAGTTACCAGATTCTATAATTGAAGAACACTTTAGACATGATGACTTTGAAATTGGA
GAGATTATATCTTGCATACCAAATGCAAAAAATAAAGACATAGAAAGCTTTAGTGGAGCATTTAGAGTAG
TTTTTCTTACCATGCTATATAAGCGCGAGGTTGGAAGTAATTGTTTTGAAGATGCTTTAAGATTAATGAT
AAACGGATTAGTTATACAACTTATGGAATAG
>ref|NC_013316.1|:1936814-1937659 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATTAAAGTTGATGATTTATCATTTAGTTATACAGATAGAAATTTTTTACAAAATATTAACTTTGAAG
TAGAAAAAGGGGAAATACTAGGATTTTTAGGACCATCAGGTGCAGGAAAATCTACATTACAAAAGATTCT
AATTGGAATGATAACTAATTATGGAGGAAGTGTCATTGTAAATGGAGTAGAGAGTAAAAGACACTCAAAT
AAATTTTATGAAAATATAGGAGTTGATTTTGAATTTCCTAGTTTATATGAAAAGTTGACTGCAATAGAAA
ATTTAAAATATTTTGGGTCTCTATATTCTAAAAAACTACTATCTATTGATGAGTTATTAAAATCAGTAGG
ACTAGAAAATGAAGCAAATAAAAGGGTATCTGAGTATTCAAAAGGTATGAAATCTCGATTAAATTTTATA
AAAGCTTTATTACATAATCCAGATATTTTATTTTTAGATGAACCAACAAGTGGTCTTGACCCGTCAAATA
GCAAGGTTATGAAAGATATAATTTTATCAGAAAAATCTAAAGGTAAAACTATTATTTTAACAACTCATAA
CATGTTAGATGCAACGGAGCTTTGTGACAGAGTAGCGTTCATTGTAAATGGTAAAATATCTGCTTTAGAT
ACACCACATAATCTTATTATGTCAAAAGGAGCTATTAAAGTTAGATATACTTACTTTGATAATGGAGAAA
AAACTTCTGAATGTTTTCTGAACAATACTGCTAATGATAAAAATTTGAATATGCTTATTAAGAAAAATAA
ACTTTTATCAATACATAGTAGTGAACCAACATTAAATGATATTTTTATTGAGATAACAGGGAGGAATTTA
CAATGA
>ref|NC_013316.1|:1937656-1938333 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGCTAAAAAATCTTATTTTAGGAGATATAAAGTTTCAATTTAAGTATGGTTTTTATTTTTTATATC
TTTTTTTAAGTATTATATATATTTGTATTATCAATGTATTTCCAACTTTTATGAGAGAAAAAATAGCTAT
AATTATGATTTATTCTGACCCAGCAGCAATGGGATTGTTTTTTATGGGAGCTATTGTACTTCTTGAGAAA
AGTCAAAGGGTTTTAAATTCCTTAGCTGTATCTCCAGTAAAAGTATCTGAGTATATTTTATCAAAGGTAA
TTTCATTAGGAGTAATATCTAGTATTGTAGCTATGTTTATTGCTATTACATTAAATTTAGATAATATTAT
AATATCAACTATAGGTACCTTTTTTTCTTCTATTATATTTTCTTTGCTTGGATTGATACTTGCAAGTAAA
GCATCTAGTTTGAATCAGTTTATTGTTTTAAGTATTCCTATTGAGATTATATGCTTTATTCCACCAATAC
TCAATGTACTTCTTGACACAAAATCATATGCAAATTTGTACCCTTTTAATATATGTATTTCTCTTATTAG
TGGAGATAAAAATTTTATAATGATTAATATTTTAATATCAATTATAATAATAATTTATTTTATAACTTAT
TATTTTATTTGTAGCAGTTGGAAAAAGGTAGGTGGAGTAAAACTATGA
>ref|NC_013316.1|:1938330-1939046 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAAGATTATAAATGCGTTTAAACAAGAGTTTGAACAAATTAAGAGAGATGCTATGCTTTTTATAG
TATGTGTTTCTCCAATATTATGTGGAGTATTTATAAAATTTGGAATACCATTAATACAGAATATATCACT
TAACAAGTTTTATTATCAATTAAATTTAGAGCCGTATTTCTTGATGTTTGATTTACTTTTAGCTTTTATT
ACACCTTTTATGTTCTTTTTTGCTTCTACAATGGTCATATTGGGAGAAATTGATGACAGCATTTCAAGAT
ATTTAATAGTAACTCCGCTTGGTAAAACTGGTTATCTTATTTCACGATTTGGAATACCAGGTACCTTAGC
ATTTATTATTACTATGATTCTACTTATCTTTTTTTCTCTAACTAAAATTTCTTTCTTGTTAAACTTATCA
ATTTCTTTATTAGTTTTATTACAAGGAGTTATTATATCAATACTAGTGATTTCTTTATCATCAAATAAAC
TAGAAGGAATGGTAATTACGAAATTCTCAGGTGTTTTTATGATGGGTATTTTAGCACCATTTTTTATTTT
AAATAAAGCACAATATATTCTGTTCTTCTTACCAACTTTTTGGATATCGAAGGCATTTAAGGAAGATAAT
TATATCTATATGTTTATTTCAATTGTTATATCATTAATATGGATTTTATTATTATTTAAAAAGTTTAGTA
AAAAAATAGTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1939143-1939406 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATAAAATAAAGATATTAAGAGAAAAATTAGGATTGACACAAGAACAACTAGGAAGATTAGTTG
GAACATCTAGACAGGCTATAAATGCTATAGAAACTGGTAAAAATGAACCTTCAATATGGTTGGCATATGA
TATTTCAAGAATTTTTAATGAACCAATTGAAAGTGTATTTTTATTTGAAGAAAGTGAAAGAAAATCAAGA
GCACAGATAAGTAGGGGAGAATATTATGGCTATAAGAAAGATAAGAACATTTGA
>ref|NC_013316.1|:1939378-1939833 peptide deformylase 1 [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTATAAGAAAGATAAGAACATTTGATGATGAAATTTTAAGAAAAAAGAGTAAGTATGTAGAAAACG
TAGATAATAAGATAAGAGAAATATTAAATGACATGGCAGAGACCATGTACAATACTCCAAATGGAGGAGG
ATTAGCTGCATGCCAAGTAGGAGTATTAAAGCGATTAGTTGTTATAGATTTAGGAGAAGGACTTATTAAG
CTTGTTAATCCTGAAATTATTAAACAAGAAGGGGAACAAATTGTTGTTGAAGGATGTTTAAGTTTTCCAG
AAGTATGGGGTAAATTAAAAAGACCAAAAAAAGTTACAGTGCAAGCTCTAAACGAATACGGTGAGAAAAT
AGAAATTAAAGGTTCAGGTTTTATGGCAAAATGTCTTTGTCATGAGATAGACCATTTAAATGGTATAGTT
TTTACAGATAAAATTATTGAACATGTAAAATTGTAA
>ref|NC_013316.1|:1939885-1940346 hypothetical protein CDR20291_1652 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGATTATGGCATAAGGATTTAATTGATGTATTACCTAAAAATCAATTAGTAAGTCAATGGAGAGAGC
TACTTGCTATAAAAGGTTCTATAGATAAAAAAGGTACTCCAAACCATCTATTAGTGAATAAAGTATTGAA
TTATAGTATAGATGAATTTAAATTTTATACAAAAATTGTACATGATGAAATGTTAAAAAGAAATTATAAA
CCTAATGAACTTAAATATACAAGTATATTAAAATGGAAAAATAGAAATTTTGCAAATGATATATCTAATG
AACATAGTTTAAATTTAGAAAATTTATATGATGATTGGCATAATAAAATGTATTTAAAGCAATGCTTATA
TAATTTAGAAGAAAAAGCAACATGTGGAGGAATACCAATAAATGAATGGAATATATTACTTTGTAAATAT
AGTAAAGATTATGAATTGTGGTCTGGAAATATCATGTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:1940396-1941298 radical SAM-superfamily protein [Clostridium difficile R20291]
TTGTATAATAAAATAAAATATATTCCAATAAATTGTGAAATAGCTTGTAATAAATTAAAAAGGAGTATGC
CATATAAATGGGATTTAAATATTTATCGTGGATGTGAGCATGGATGTAAATATTGTTATGCTATTTACTC
TCATAAGTACATTAACTCCAATAATTATTTTGAAGAGATTTATGTAAAAACAAATATAGTAGAAAAACTT
GAGAGACAACTTAAAAGCAGTAAATGGAAGAAAGAAGTAATCAATATAGGAGGAGTTACAGATAGTTATC
AACCAATAGAAGCTGACTATAAAATTATGCCAGAAATATTAAACCTGCTGATAAAATACAAGACACCAGC
TATTATTTCTACAAAGTCAGATTTAATTTTAAGAGATTACGATTTAATTGATAAGCTATCTAGGATTACA
TATATCAATGTAGCATCTACAATTACCACAGTAAATGAAGATACACAAAGGCTTATTGAGCCAAATGGTG
TGGATTCAATGAGACGATTTAAAATGTTAAAAGAATTTAGAAAAACTAACGCATCAGTTGGTCTACATAT
TATGCCAATTATACCATATATTACAGATGATTTTGATAATATAAATTCGCTATTTAGACATGCAAAAGAA
TGTAATGTACATTATGTTTTACCTGGGACTTTATACTTAAGGGGTATAACTAGAGGTGTTTTTTTTGACT
TTGTTAAAAAAGAGTTTCCTGAATTATTTGATAAATTATCAATACTATATAGTGCAGGTTCACTTAATAG
GGAGTATAAAAATCAATTGTATAAAATGGTTAATGAACTTAGATATAAATATTCTCTATCAAGCAGTTAC
TCTAAAATAATGAAGGAAAAGTTAAAAAACTCAGGAGATGGACAGATATCTTTTTTTGATTAG
>ref|NC_013316.1|:1941668-1942480 hypothetical protein CDR20291_1654 [Clostridium difficile R20291]
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AACAATTATTAAAAGCACATTTAGACACTAATTTTGAAGGAGCAAGTAGAAATTTTAACTTTATCGAGGA
TTCTGTAAATTGGATAGTTACAGTTGCAAATCCAGTTAATTATCCTAATTTACTTGATTTAGGTTGTGGT
CCAGGTTTATATGCAGAGAAATTTGCACAAAAAGGTTATAAGGTAACTGGAATTGATTTCTCAAAACGTT
CTATTAACTATGCACAAAATAGAAATAAGGAGACTAATTTAAACATAAATTACTTGTTTCAAAGTTATTT
AAATATGAACTATAATGATGAATTTGATTTGGCTACTTTAATTTATTGTGATTATGGAGCTTTGTCAACT
GAAAATAGAAGGTTATTAATGGAAAAAATTTATGATAGTTTAAAACCTGGAGGAAAATTAATATTAGATG
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TCTTATTAGAAGTTGAAAATATTGGATTTAAGTCTGTTGAGTTTTTTAGTAATGTTAAGGGTGAAGCATA
TTCTGACGATAGTATGACTATGGGATTAGTTTTACAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1943529-1944290 putative iron-sulfur protein [Clostridium difficile R20291]
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ATATAACAGCAAATTCTTATTCTATTGAAGATAATGAACTTTTACAGCACATCAATAATCATGAGAATAT
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AAAGTAACTAAAGCTGCTAAAAAACTGAAACATGGGTCACCACCAAAAGAAGGGTTAGGTTTTTTGAGTC
ATATTGTAGGGTTATTTGGACAACGATTGTATTTTATCAATAAAACAAATATGTATACAGATAAACTAAA
AATTAATACTGAGGAATGTATTGTATGTGGTAAATGTGTTAATTTATGTCCAATGAAGAATCTAGTAATT
AAAAATTGTATGATTGTTGCAAATGGGCAATGTACAATGTGTTATCGTTGTGTAAATAATTGTGCAAAAA
AAGCAATTACATTGTTAGGTAAAAAAGTTGTTGAGCAGAGCAATATTAAAAAATATATGTAA
>ref|NC_013316.1|:1945404-1945823 hypothetical protein CDR20291_1657 [Clostridium difficile R20291]
ATGGACAAAATTAGTGGAAAATTAACAGTCTTATTTGAAGAACCATTTTGGGTAGGTATATTTGAAAGAC
AAGATGGTAAAAAATATGAAGCATGTAGGGTAGTTTTTGGAGCAGAACCTAAAGAAGTAGAAGTGTATGA
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CTCAAAATGCTCTTAAGCTTCAATATGAAGAAAGAAAACAGGATAGAAAAAACCTAGCTAAAAATAGAAA
AGAAGAAGAAAAAGAAAGAATATTTAATTTGAAACAAGAAAAGAGAAAAGCTAAACATAAGGGTCATTAA
>ref|NC_013316.1|:c1946192-1945926 hypothetical protein CDR20291_1658 [Clostridium difficile R20291]
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AGAAAAGAGCAATTAGAAACGAATGGAGAATAAAAGAAGCTACTCTTATGTCTATAGCAGTAATTGGAGG
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ATACCATTTATACTATTTTTACAATTTTTATTAGTATATTTTTATATTTTAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1946419-1947120 hypothetical protein CDR20291_1659 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTTATAGTAGAAAAAGAAGTTTTTGATAAATTAGAAAATGTATGCTTTGGTGTAGTAGTTGCAA
AAGGAATAGATAATACTAAAGAAATAGAAAGAATAAGCAACCTTTTAGATATAAGTATAGATAGAGTAGA
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CTAGGCATGAACCCAAATAAATTTATGAGTTCGATAGAAGCAATGACAACAAGGGTTGCTAAGAATAAGA
AACTTCCTCATATAAATCCTATTGTAGATTTAGGAAACTCTATTTCTTTAAAATATTTACTTCCAATGGG
TGCTCATGATATGGATTTTAGAAATGATGATGTATATGTTAGATTTTCTAAAAAAGGGGATAAATTTGTA
CCATTTGGAGAAACTGATGTTGAATTAATGGAAGAAGGAGAATTAATTTATTCAGTTGGAGACATGGTAA
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TTAAAGGAAATATTTAATTGTGAAATCAAAGTAGGTTTTGTAGATAAAGATAATCCTGAAATGGAAATAT
AA
>ref|NC_013316.1|:1947235-1947810 Nudix-family hydrolase [Clostridium difficile R20291]
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GGATGGTAGCATCAAGAAAAAGTAGTGAGCAATTAAAAAATATTTATTTGAAGAATGAAGAAGATAGTGT
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ACAGATGAATTTTTAGAACCAGATGAAGAGATTGAAGCGCTTTTAATTTCGCAAGAAGATGCAAAAGAGA
TTTTACAAAGTAATCATAAGATAGACACAAAAGCATTTTTGATTTTACAAATGTTTGTGAGTTTAGGAGC
TAAATTATTTGAATAG
>ref|NC_013316.1|:1948134-1948598 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
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ATGAAAGTAAATATAATAATTTAAACAACAAAGAATCAGGACAAACAACCATTGAAATGGACTTAGATAA
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AAACTTTATGGAGTAATACATGGCATGGAAGCGTTGATAATGATACATTCGCAATTTCTCTTTCTAATAT
ACAAAAAGAGAAAGAGTATGCTATATGCTTTACCGGAATTAAAATAAATCATGCAGTTGTAAAGGTTACT
TTTGAAAGCAATTTAGTTAAGGAGAAAGAAAAACCCTCAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1949235-1950251 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 1 [Clostridium difficile R20291]
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ATATAGTAATAGAATCAACAGGATTATTTACACAAAGAGAAAAGGCAGAAAAACATATTAAAGCAGGAGC
AAAAAAAGTAATTATAACAGCTCCAGGAAAAAATGAAGATATAACTATAGTTATCGGAGTTAATGAGAAA
GAATATGATAATCAAAAGCACAATATAATTTCAAATGCATCTTGTACTACAAATTGTCTAGCTCCTTTTG
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TCAAAGAATATTAGATAAAAGCCATAAAGATTTGAGAAGAGCAAGAGCAGCGGCTGAATCTATAATACCT
ACCACTACAGGAGCAGCAAAAGCTGTGTCAAGAGTACTACCACAATTAGAAGGAAAATTAAATGGTTTTT
CACTTAGAGTACCAACACCAACAGTTTCACTTGTTGATTTAGTGTGCGAACTTAAAGAAAACGTTACATC
TGAGCAAGTTAACTCTGTGTTAAAAGATGCTGCTGAAGGAGAATTAAAAGGTGTTTTAGGATATTGTGAC
AAGCCACTTGTTTCTATAGATTATAAAGGAGATTCAAGATCATCTATTATAGACGCTCTATCCACAATGG
TTATAGAAGACAATATGGTTAAGGTAGTTTCTTGGTATGATAATGAATGGGGATATTCTTCAAGAACTGT
TGACTTAGTAAAATATGTAGCTGAAAAATTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1950646-1951815 hypothetical protein CDR20291_1663 [Clostridium difficile R20291]
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TAGTAGTTGGTTTTGGGTATGTTGGTAGTATTATGGGAGCAGGAATGATGTTCAAAGTAATAATGAGTAC
AGCACATGCTTTACTATTGGAGACAGTTTTCTTAATTATGGCTATGGCAGTTCTTGCAGGCGCATTAAGC
GCACTACTTTCAGAGTTTGGAGTAATAGCGTTAATTAATAAAATTTTCGCTGTATTTATGAAGCCTTTAT
ATGGACTACCTGGTGCTAGTATAGCAGGAGCTATAACAACTTATTTATCAGATAATCCAGCTATTATACC
TTTTGCTAAAGATAAAACATTCACACAGTATTTTAAACAATACCAAGTTCCAGCATTATGTAACTTAGGA
ACAGCCTTTGGTATGGGACTTATCTTAACAACATTTATGATTTCTCAAGGTACAGAATATGTACTTCCAG
CATTAATTGGTAATTTAGGTGCAATTATAGGTAGCGTCATAAGTGTTAGAATAATGTTGACATTTACTAA
GAAGTTTTATAAATACAATCCGGAAGAAGATAAAGCAACAGGAACATTAGAGAAAAAGGATGAATTTAGA
GAAATCAGAGAAGGAAATGTATTTCAAAGAGCTTTAGATGCAATTCTTGAAGGTGGTAAAATGGGGGTAG
ATATGGGAATGGCTATAATTCCTGGAGTCCTAGTAGTATGTACATTGGTGATGTTATTAACTTTTGGACC
ATCTACAGACCCTGTTACAGGTCAAGAAGTTTATACAGGAGCTGCATATGAAGGAATAAAATTACTTCCA
GTTATTGGAGATAAACTTGGATTTATATTAGAACCATTATTTGGATTTACATCACCAGAGGCAATAGCAT
TCCCTATAACTTCATTGGGAGCTGTTGGTGCAGCAATGTCTCTAGTTCCAGAGTTTATAAAGTCAGGAGC
TATAACTCCTAATGATATAGCAGTATTTACAGCTATGGGTATGTGTTGGAGTGGATATTTAAGTACACAT
ATTGGTATGATGGATGCATTAAATGCTAGACAGTTGGCAGGTAAAGCTATTCTTTCTCATACAATAGGTG
GTTTATGTGCAGGAGCAGCAGCTCACTTTATATTTACACTCGTAGGATAA
>ref|NC_013316.1|:1952196-1956449 hypothetical protein CDR20291_1664 [Clostridium difficile R20291]
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GTAATAATATAGTTCATAAAGAATATAGAAGACATTATTCTGATGTAAAAAAATCAGTTAAAGAAGTACT
AAATGGTATATATGAAAAATTGGGAGATATAAATACTACCATTATAATAACTGGTTCAGGTGGAATTGGA
ATATCAAAAAAATTAGGTGTAAAATTTGTTCAGGAAGTTATATCTAGTACAAAATCAATAGAGTATTTTC
ATCCTGAAACTGATGTTGTCATAGAACTTGGGGGTGAAGATGCAAAGATAACATATCTAAGTGGAGGAAT
AGACCAAAGAATGAATGGAATATGTGCAGGTGGCACTGGAGCATTCATAGACCAAATGGCATCACTTTTA
AAGACAGATGCCAGTGGATTAAATGAACTTGCTAAAGGGTATAATGTTATATATCCTATAGCTTCAAGAT
GTGGTGTTTTTGCTAAAACAGATATTCAACCTCTTATAAATGATGGAGCCAATCAGACTGATATAGCAAT
GAGTATTTTCAATGCAGTTGTCGTACAAACTGTGAGTGTCCTTTCTTGTGGAAGAAAAATAGAAGGAAAT
GTTGCGTTTTTGGGTGGTCCATTGTACTTTTTATCTGAACTTAGAGAAGCATTTAAAAGAGTATTGGATT
TAAAAGATGAAAACATAATCTTCCCAGAAAATGCACAACTTTATATTGCTATTGGAGCAGGATTATTATC
AGTAGATGAAGATAATATACAACTAAAATCTCTAATAGAAAAATTGGATAGTATAAAGAATATTGAAGAT
GGAGAAGTAAATTTATTAGAACCTTTATTTAAAGATAAAAATGAGTATGAAGAATTTTCAAGAAGACATG
AAAAAGAAAAAATAAGTTATGTGGACATAAATTCAATAAAAAGCAATTGTTATTTAGGAATTGATGCAGG
CTCAACTACAACTAAAGCAGCACTTATTGATGAGGATGGAAGACTTGTATATTCTTATTATAATAGCAAT
GAAGGAAATCCATTAAAAACAACCATTAAAGTTATAAATGAAGTATATGATATATTACCAAAAAATATTA
AAATATTGAGTTCAACTGTAACTGGATATGGAGAAGGTCTTATTAAAAAAGCTCTTAAAATCGATAACGG
AGAGATAGAGACTATAGCACATTACAAAGCTGCTAAATTTTTCAATAAAGATGTAGATTTTATACTTGAT
ATTGGTGGTCAAGATATGAAGTGCCTAAAAATAAAAGATGGAGTAATTGATAATATAATATTAAATGAGG
CTTGTTCATCAGGTTGTGGCTCATTTTTAGAGACATTTGCAAGTTCTTTATCTATGACAATAGAAGAATT
TGCACATGAAGGTATTTATTCTCAAAATCCTGTAGATTTAGGTTCAAGATGTACTGTATTTATGAATTCT
AGAGTAAAACAAGCTCAAAAAGAAGGTGCAAGTGTTGGAGATATATCAGCAGGGCTATCTTATTCAGTAA
TAAAAAATGCTTTATTTAAAGTAATAAAGATTAGAGATTTAAATGAGATTGGTAATAATATTGTTGTACA
AGGTGGAACCTTTTATAATGATTTGGTGCTTAGAAGCTTTGAAAAACTAATTGGAAAAAATGTAATTAGA
CCTAATATTTCAGGAATTATGGGAGCTTTTGGTTCAGCACTTATAGCTAAAGAAAAATATGAAAGTGGAT
ACAAAACATCCTTGTTATCTAAGGAAGAGTTGAATAATATCAAGCTAGAAGCAAGTGTAACTAGATGTAA
AGGTTGTTCAAATCATTGTCTTCTTACAATAAATAAATTTTCTGATAATGAAATTTTTATTTCAGGTAAT
AGATGTGAGAAGGGTGAAGCTATTTATGGTGATAAAAAAATAGGATTAGAAAAGAAAAAACCAATAAATT
TATTTAAGTACAAATACAATAGAATTTTTAGATACAAACCATTGGAAAAAGAAGAAGCAAAAAATGGGGA
AATAGGGATACCAAGAGTATTAAATATGTATGAAGATTATCCATTTTGGTTTACTTTTTTCAATGCTATG
GGCTTTAGAGTTGTACTTTCAGATAGGTCATCAAAACAGTTATATGAAACTGGTATAACTAGTATTGCAT
CTGAAACAGTTTGTTATCCAGGAAAATTAGTTCATGGACATATAGAAAATTTAATTGCAAAAGGTATAAA
AAATATATTTTATCCAAGTGTAACAAATGAAAATAAAGAGGATTCAAATGCAGATAATTATTATAATTGT
CCTGTTGTAATATCATATTCTGAAGTAATAAAAAACAATGTAGAGAATATAAGAAATAAGAACATAAATT
ATATAAATCCATTTATAAGTCTAAATGATAAGGAAAAATTGAAGAAAAGACTATATGATGAATTATCAAG
ACATTTTTCTGATATAAAAATAACTAAAGAAGAAGTTAATCATGCAGTTGATAAAGCTACTGATGAACAG
AATTTATTTAAAATGGAGATACAAGCAGCAGGTGAAAGAGCACTTAAAGAAATAAAAGAAAGAAATATGA
AGGGGATTGTGTTATGTGGAAGACCATATCATATAGACCCAGAAATAAATCATGGAATGCCAGAGCTTAT
AAATTCATTAGATATGGCAGTGCTTACTGAAGACTCTATATGTCATTTAGCCAATGTACAAAGACCACTT
AGAGTTGTAGACCAATGGGTATATCATTCAAGATTGTATAAAGCAGCTAGTTTTGTAAGAGATAAAAACT
ATTTGGAACTTGTTCAACTTAATTCATTTGGCTGTGGATTAGATGCAGTAACTACAGACCAGGTTCAAGA
AATACTTAATGAAAAATCGAAGATATATACTATTATAAAGATTGACGAAGGCAACAATTTAGGAGCAGCT
AAGATAAGGATGAGGTCCTTAAAAGCAGCTATGTTTGAGAGAGAAAGCAAAAATATAGATGTAAAAAATA
TAAAGGTAAACAGGATACAGTATGCTAAAAATAATCAGATAACGAACAAACATACTATATTAGCACCACA
AATGTCTCCAATACATTTCCAATTCCTTGAAAAAGCTGTTAACTTAAGTGGTTATAATATAGAAATTCTA
AAAGATACTGATAGTAGTGTAATTGAAGAAGGGTTAAGATATGTAAATAATGATGCATGTTATCCAGCTA
TAATAGTTGTAGGTCAGCTAATAACAGCATTAAAATCTGGCAAATATGATTTAAATAATACTTCTGTTAC
TATAACTCAGACTGGTGGAGGTTGTAGAGCTACAAATTATATTGGATTCTTAAGAAAGGCTATATATGAT
GCTGGATTTAAAGATGTTCCTGTCATTGCACTTAGTGTAAATGGAATAGAAGATAGTGGTATAATGGATA
ATATATCACTAAAATTAATCAATAGACTCTTTATGTCTGTTGTTTATGGTGATTTGCTGATGAAAGTACT
ATATAGAGTAAGACCATATGAAAAAGTTACTGGAAGTGCAAATGCTCTATATGAAAAATGGGTTGATATA
TGCAAATCTTCTCTTGTTAAAGCAAAAATTTCTGTATTTACTAGAAATATAAAAGATATAGTAAAAGAAT
TTGATAATTTAGAGATACTAGATATCAAAAAACCAAAAGTAGGTTTGGTTGGAGAAATATTGGTGAAATT
CCATCCAATTGCAAATAATAATTTAGTAGATATATTAGAGCGAGAAGGTGCTGAAGCAGTCGTGCCAGAC
CTTACAAATTTCTTCTTAAGTTGTGCCTTTAATACTATATACAAACACACTCATTTAGAAGGAAGTAGAA
AGAGTAGAATGATAGGAGAAGCATTTATATACATAACTGGAATATATCAAAGAGTATATAAAAAAGCACT
TGATAAGAGTGAGAGATTTTATGCTCCAGCCAATATAAAAAATGTTGCTAAAAGTACAGAACCAGTAGTG
TCATTAGGTAATCAAACTGGAGAAGGTTGGCTTTTAACAGGTGAGATGGTTGAATTATTAAATGAAGGTG
TAGAAAACATTATTTGTATGCAACCTTTTGGATGTTTACCTAATCACATAATTGGTAAGGGTTCTATAAA
AGAATTAAAGAGGTTGTATAAAAATGCAAATATAATACCTATTGATTATGACCCTTCTGCAAGTGAGGTA
AATCAACTTAACAGGATAAAACTTATGCTTTCTAAGGCTTTTAAAAATATATAA
>ref|NC_013316.1|:1956598-1957092 methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase 2 [Clostridium difficile R20291]
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TAGTTAGTGTATACATAGGAGATGAAAAATTTAATAATTTAAAAAATGAATGTATTAAAAAAGGAATTGA
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AAAGTCTTTAATTTAAATATTCGTATTGAAGGGACTGAATTTCAAAAATCAGTTTATAGGGAAATGTTAA
AAATACCTTATGGAGAAACATTGTGTTATTCAGATATAGCAAGAAATATAAACAATCCAAAATCAGTAAG
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GTTAA
>ref|NC_013316.1|:1957208-1957585 hypothetical protein CDR20291_1666 [Clostridium difficile R20291]
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GATGAAAGTACTAAAGCTAAAGTATATGCTAAAGATTTAACTACAACAGTAAGAAAAGAGTATGGTTCAG
AGTTATGTATAGACCTAAAAAAAGATTTAGTTGCTTGTAGAGAAATAATGGATTTCGCATATGATAGTCT
AAAGGAAACTTTAAAAAAAGAATTATAA
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AAAAACCTTCTGTATCAAGAATGTTTATTAAATCCATACCTAATATTACAAAGTATAAAGAAAATCTTAT
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GAAAAGGATATAAACGATACATTATCTAATATTAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:1958862-1960169 hypothetical protein CDR20291_1668 [Clostridium difficile R20291]
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ATGAAGGTAGATTTTGCATATATTTAGATAAAAAATATAGATGTAATGGGAAAATTTATTATAAAATGAC
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CTTTAAGTGAATTTAGTGTAGAAGGTTATATCAATGATGACTGCATAAAATCTAAGAACTCCTATGTTGA
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TACGCAGGTAGAATTGAATTTGATATAAATGATTATGTTGTAACTATAGACAAGCGATATGATTATAGAA
AAGAATTAAAATCAGAATTAAAGTCTAAATCTGGAGCAATAATAACTCATATAGGTAGGATTAGAAGAAA
AGATGGTAGAATTTTTAGAACAAATAATACAATAAATCTTTTAGATAGAATATCAACAGCTTTGAGTTTT
ATGTGTGGAAGATATGTAGGGTTTTGTTTGGCCAAAGGGTATAGAAGTGGTAATGAAGTTTATAGAATAT
GGAATGAAAATCAAATATCTCCTTTTAGATATGTACCAACATGGTCAGATACACTTTCAAATTATCATAA
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GTTGTTGATTGGTACATAGAATCTCTTGGAAGTGCTACCATGGAAAACAATATAATATCTGTACAAATTG
CACTTGAAACTTTGTCATATGTAATTCTAGTGGAACAAAGTAAGATACTTACAGATGAAGCATTTGACTG
TAATTTGGCATCTAAAAATATAAGACTCTTACTTGATACATGTAAGATACCATATGGTAAACATGAATTA
AATATATTTGATAATATAATAAAAAATAAATTTGATGATGGAGTGGATTTAGTTATTTATTTAAGAAATA
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TTAGTAGAAAGGTGTTATGGTGAAGTGGAAGTTGTACCTTGGAACTAG
>ref|NC_013316.1|:1960643-1961446 amino acid ABC transporter, substrate-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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GTTCAAAACCAGATAATGAAAAAGATAAGGATGCTTCAAAGGAATCTAAAAAAGAAGTAGTTGTAGGGTT
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AATTCAAAAGCTGATTTAAAAGATAAAGAAGTTGGAACACAACAAGGTTCAACAGCACTTGATGCAGTGG
AAAAGGATAAAGATTTTATGAATAGCTTAAAAGGTGGAGCACCAGTTCTTTATGATACTTATGATAAAGC
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GGACAAAAGGGTGAAGACAAATACAAGGTATTAAAAGACGATTTTGGATTAGAAGATTATGTTGTAGCAA
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TTTTGACAAAATTTATGATAAGTGGTTTAAATAG
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TATGTATAAGAGAGTAATCTTTCCACAAGTTTTTAAAAGAATACTAGCACCTATTTCAAATGAAGTAATC
ACATTAGTAAAAGATACATCTTTAGTATATATATTAGGATTAAATGATATTTTAAGAATATCTCAAATAG
CAATGAACAGGGAAGCAAGTCTGTTACCATTATTTGAGGCAGGAGCGATATATCTTATATTTGTAGCTAT
ACTTACTAAGGGATTTGAATTACTTGAAAAAAAATATTCTTATTATAGATAA
>ref|NC_013316.1|:1962127-1962798 amino acid ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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TAGAAGAAGGTCAGATTGGAGTTTTACTTGGTAAGTCTGGTGCAGGAAAGACCACAATATTAAGATGTAT
AAATGGTCTTGAAGAATTTGATAGTGGAGAGATTATAATAGATAATGAGGTAATAAAAAATAAGAGAGAT
ATGGCAAAAATACGAGGAAAAATAGGTATGGTTTTTCAAAATTTCAACTTATTTCCTCATATGACAGTCC
TTGAAAATATAATTGAATCCCCAGTTAATGTTTTTAAAGTTCCTAGAAAAGAGGCTGAAGAGAGGGCTAG
AGAACTTTTAAGATTAGTTGATTTAGAAGATAAATTAAATTCTTATCCATTTGAATTGTCAGGAGGACAG
CAACAGAGAGTTGCTATAGCTAGGTCATGTGCATTGATGCCAAAAGTCCTTTGTTTTGATGAACCTACTT
CTGCACTTGATATTGATACTATTCAAAGAGTAGTCAATATAATGAATAGACTTAAAGACAAAGGTATGAC
AATATTAATAATTACACATGATGTTGTCTTCTCAAATAATGTTGCAGATAAAATTATAAGTATAAAAGAT
GGTATAGTAGAAAATGTTCAAATAAAAGAAAAAATTGTTTAG
>ref|NC_013316.1|:1963097-1963459 putative arsenate reductase [Clostridium difficile R20291]
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ATTTAGAATTTGAAGATATAGATATGGTTCAAAACCCTCCTAGTAAAGAGGAGTTAAAATCAATTTATAA
GACTAGTGGATATGATATAAAGAAATTTTTTAATACAAGTGGTATGAAATATAGAGAATTGGGTCTTAAA
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GACCATTACTTTTGGATGGTAAAAATGTATTATTGGGCTTTAAAGAAGATGTATGGAAAAGTACTTTGCT
AAAAGAAGATTAG
>ref|NC_013316.1|:1963895-1964596 hypothetical protein CDR20291_1673 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTATTGAAGATTTATATGATTTTGAATGTGTTCCTTTGAACAATGAGATTGATATTGATGTTTTAT
TTGAAAAGATGATAGAAGATGGAAAAGAAAAAGAATATACACCAATTATAGTCATTGATGAAAAAGTAGG
GCTATTAAGAAAAAATATAGATATGATTACTAAAGAGTATGGTTCTCTTGAAAACTATAGAGAGTATTGT
TTAACAAAATATAATGAAATTGATGTAAATCAATTTTTTGATTTTAGGAAGAGTGAGATTTCAGAATTAT
TAAAGGAGCTAATTGATTTAGAAGATGATTTTTATGATTATAAACATTTTAGACCAATTATAAATATAGA
TATATTTCATGAATATAACAAAGTTTACATAGCTAAAATTCCAACAATTAAACCATATGAAGTATTTGCA
TACATACCTATTGGAGGATTTAATGATTGTCCTAGAGATGAAGAACATATAGCTATTGCAAAATATTGGT
ATGAAAAGCATGGAATCTTTCCAATCGCAATTGGATGTGATACAGTTCAATATTCTGTAAAAAATTTAAC
TAAAGATGGTAAAAAATTTGATGACTTATGTATTGAATTAGTATTTTATTGTGAGGATATTATTATACAA
GGGTATGAAACCTTAAAGGCTCTTAAGGATGTATTAAAACGCTCTACAATAGTGCTTTTTTGGTGGGATT
GA
>ref|NC_013316.1|:1964867-1965685 hypothetical protein CDR20291_1674 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGTAAATTTTGTGAAGGAAAAAGAAAAATTAGATAAATTAAAAAAAATGTTACTTGAATTAGGCA
GTGTTGTAGTTGCTTATTCTGGTGGAGTAGATAGTAATTTTTTGCTTAAGGTCGCAAAAGATACATTAGG
TGAAAATGTTATAGCTGTGACCATTCATGCAATGATGCATTCAAGTAGGGAAATTGAAGAGGCTAAACAA
TATACTCAAAATTTTGGCGTTAAACATATCATATTAAATATAGAAAACTTTGATTTAAAAGAATTTAAAG
AAAATGGTGTTGATAGATGTTATCATTGTAAAAAATATATATTCTCTAAAATAAAAGAGGTAGCAAAAGA
ACATAATATAAAGTACATAGTAGATGGGACAAATATGGATGATTTAGGAGACTATAGACCTGGGCTTAAG
GCATTGAGTGAATTAGGAGTGATTAGTCCATTAAAAGATAGTAGTTTAAAAAAAGAAGAAATTAGGTCGC
TTTCAAAAATATTAGGATTAAATACTTTTAATAAACCATCATTTGCATGTCTTGCAAGTAGGATTCCTTA
TGGAGTTGAGATAACAGATGAAAATTTAAGAATAGTAGAAAAGAGTGAAGAATATCTATTCAATTTAGGT
TTTTCTCAATTTAGAGTGAGAATGCATGGAGAGATAGCTAGAATAGAAGTTGGGCAGGAAGAACTAGGTA
AATTTTTTGAAAATAACAATTTTAATAAAGTTGATACTAAATTAAAAATATTTGGCTTTAAATATGTTAC
ACTAGATATGTCAGGATATAAAATGGGAAGTATGAATTTAAATGTGTAG
>ref|NC_013316.1|:1965740-1966888 putative methylase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATTATACATTAATATCGCCATGTTTTTTTGGAATGGAAAAAATGCTGGCTAGAGAGATTACTA
ATTTAGGATATGAAATAATAAAAACAGAAGATGGAAGAATAACATATAAAACTGATGAGTTTGGAATAGC
AAAGTCAAACATGTGGTTGAGATGTGCTGAAAGAGTACATCTTAAAATTGCTGAATTTGAGGCAAAAAGC
TTTGATGAATTATTTGAAAATACAAAAAGAATAAACTGGTCTAGATATATACCTTATGGAGCTCAATTTC
CTATATCAAAAGCTTCCTCTATAAAATCAAAATTATACAGTACACCAGATGTACAAGCCATAGTAAAAAA
GGCTATAGTAGAAAGCTTAAAGAAAAGTTATTTAGAGGATGGTTTGCTTAAAGAAGATAAGGAGAAATAC
CCTATTTTTGTATTTATACACAAAGATAAAGTAACCATTTCTATAGATACAACAGGAGATGCTTTGCATA
AGAGAGGATATAGAGAAAAGGCAAATAAAGCTCCAATAAGAGAGACTTTAGCTGCTGGGCTTATTTATTT
AACTCCCTGGAAAGCAGGTAGAGTTTTAGTAGACCCTATGTGTGGTTCTGGTACTATATTGATTGAAGCT
GCTATGATTGGTATAAATATGGCACCTGGCTTAAATAGAGAGTTTATATCAGAAAAGTGGAGAACTCTTG
ATAAGAAAATATGGTGGGATGTAAGAAAAGATGCTTTTAATAAGATAGATAATGAATCTAAATTTAAGAT
TTATGGATATGATATAGATGAAGAATCTATAGATATAGCTAGAGAAAATGCTGAAATAGCAGGTGTAGAT
GAATATATAGAGTTTAATGTAGGAGATGCAACTCAATTTAAAAGTGAAGATGAGTTTGGATTTATAATCA
CTAATCCTCCTTACGGAGAAAGATTAGAAGATAAAGACAGTGTTAAACAGTTGTATAAGGAGCTTGGTTA
TGCATTTAGAAAATTAAAAAATTGGTCGTATTATTTGATAACTTCTTATGAAGACTTTGAATATGAGTTT
GGGCAAAAAGCAGACAAAAAAAGAAAATTGTATAATGGTATGTTAAAAACTAACTTTTTCCAATATCCGG
GTCCTAAGCCTCCTAGAAATAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1967024-1968412 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTGTTAAAGCTTATTACTGTAGTAGCCCTGATGATGTTATTTGTTACTGGATGTAATATAAAAA
CTGAATCTCCAGAACAATTAGCGAAGATACCTGACTATGATGATACAAAAAAAGTATTGTATGATGGTAT
TGACCAGTTACTAAAACCAGATTCATCTATGATATTGCCTTCTAATACAAAAGAAGTAGGAAAAATAAAT
AAGGTAGATTTAAACAGCGATGGAATTGATGAATTAGTAGTATTTGAACAAAAAGAAGATTTAAGTAATA
ATGTGAGTCAGGTAGGGTTTGTAACCTTGAGTTACAATGGAGAAAAATACGTACTTGGAGACCATTTTTT
AGAAAATGGCGAATCAATAGAATATGCTAATTTTTATGATTTGGACTCAGATGGATATAAGGAAGTTATC
TTATTGGTTAAATCCAAAGACAAAACGAATATGCATATATATAAAGTAGTAGATAATGAAATAACAAAAA
TATATGACTTGGATGCATCATGGCTTCAAAATAAAGAAGATTTTAATGACATGAAAGTAAAAATTGGATA
TATAGATGGAGATGACAAGTTAGACATATTGATGCTTCATTTGAATAATAAGACTAATGAAATGTTTGCA
AGTGTTGCAAATTTTGATGGGAAAATGAAAATCAAAGATTCTGTTAAGTTTGAAAATGTAAAAAACTTAA
GTGAATTATATACAACATTAGGTAATGTTGCTTCATCTGTTGGAAATTCTTCTGCAGCTATAAAAGGTAT
TGTACTTGATATTCCTATATTGAAAGATAATAACTATATTACGCAGATACTTTATATGAAAGATGGGAAA
ATTAACAAAGCTTTTAGTGATTATGATAAAACTATTACTAAATCTTATTATATACCTGTAGATGATATTG
ACAAAGATAAGATTATAGAAATACCTATAGTTGCAGGCAGTACAGGTAATAATAAAAATACTTATAGTTC
TAAATCATCTGCAACTATAAGTTGGTATAGATGGAATGGAAAAGAAGGTGCTGACTCAAGTTTAATATTT
ACAAGTCAGATATATTATAATTATAAATATAATTTTAAATTATTTATTCCAAATAATTTATTTGATAAAA
TACTTGTTGAACAGGAATTTGTTGGAGAAAAAGCAGTATTTAAATTTTACTATTTTGACTATTCAGATCG
TAAGAATTTATTTAATATAGTAGTAGAGAGTAAAAACAAACTTGAAGATAGAAAAAATACAGGTACTCAA
AACTCTATTGTACTTCAAGAGAGCGATGAATATACTTTCTTACTAGTTGTAAACAATGCAAATGAAATGG
ATAAGCTAGATATGACTATAGACGCATTAAAAGAATATTTCTCATTAATATATGGTTAA
>ref|NC_013316.1|:1968405-1969139 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
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TTGGTATTAGAAGTTTTGTTAGTATAAACTTAAAAAGAGAAGGCTATGAAATAGTTGAGGCAGGTACTGG
AAGAGAAGCTATAGAAAAAATGACAACAGAAAATGATATTACAATAGCTCTTTTAGATGTGATGCTTCCA
GATATAAGTGGTATAGAAGTATGTAAATTTATAAGGGAGAATTTTGACCAAGTAGGTATAATAATGCTTA
CTGCTAAAGCTCAAGAGGATGATAAAATAGAAGGATTTATTTCAGGAGCAGATGATTACATCATAAAACC
ATTTAGTATAAAAGAGCTTTTAGTCAGGGTTTCTGCTCTTCTTAGAAGAGTAGCAAAGGATGATTCAAGT
GTTAAGTCGAGTGAAATAGTTTCTCCACCATTTATACTTGATATAGACAAGAGAAAATTATTTAAAAATG
GAAAGGAAATTGAGCTTACACCAACTGAATTTTCAATAGTGAAATATCTAATATCAAATGCTAAGCAATC
GTTAAGTAGAGACCAGATATTAGACGAAGTATGGGGAACTAACTATTTATATGATTTTAAAATAGTAGAT
GTAAATATAAGAAGGATAAGAAATAAAATAGAAGATGACCCATCAAAGCCAAAATATATACAAACTATTT
GGGGTTATGGATACTGTTTTAGAAAGGAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1969142-1970575 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
GTGTTACATTTTGAAGGTCTGAGAAAAAAAGTAATAAAAAACTATTTTATAATAATTATTATAATGGTTA
CTCTGTTTGAAGGATTGTTCATGTTTTACATACAAAACTACTATTATGATTCTGTCAAACAACTACTTGA
ATCTGAAATAAAATATGCTGATGAATATAATGCTATTACAATGGAAACTACAAGTTTTGAGAAAAAAGTA
AAAAATATATTTGATAAACAACCATTAACTAAAAATTCAGAATTTGGAATTTCAATAATAGATAAAGATA
AAAATATTATATTAGACCAATATGGTTTTAAAAGTAAAGAAAAAGCAAACTATGAAGATGTTAACAATGC
ATTAAAAGATATAAAAACTAAAAATTTAACACCTTATACTTATAGAATACCAGATACAGGGGAGCATGTT
ATGAGTATCTCCTTACCACTTAAGGTAAATAATATAATAGAAGGTGTTGTTAGATATACAGTATCATTAG
ATGCTATTGATAATGCAATATTAAAGCAAGCTACATGGCTTATATTAGCAGGAATATTTATACTTATTAT
AGCTATACTAATAAGTCTTAAATTTGCTGAGACTCTTATAAAACCATTACGAGAGCTAAAGAAATTTGCA
AATGAATTGGCTGTAGGAAATTATAATATAAAATTAGAAAAGATGAAGATTGTAGATGATGAGATTGGTG
ATTTAGCACAGACATTTGAACACATGGCACATGAGATTGACAAAAGTGAAAAATTAAAAGAGGAATTTAT
ATCATCTGTATCTCATGAACTAAGGACTCCTCTTACATCTATAAAGGGGTGGAGTGAAACCTTAGGTTAT
GAAAGTATAACAAGAGAAGAACTAGACTTAGGTTTAGGCATTATACAAGATGAAACAGAAAGACTTATAA
AACTAGTTGAAGAATTATTAGACTTTTCAAGGCTTTCTTCAGACAGGATAAAACTTCATGTTGATATAGT
TGATGTTGAAGGTTTAATTGTAGGTGTTGTAAATCAACTTAAAGTTAAAGCAGCTGAAAAAGATATATCA
CTTTTATTTGAATTTGAAAATGAATTTATAGAGAACATTCAAGGAGATAAAAATAGATTAAGACAGGTTC
TCATAAATTTAATACAAAATTCATTTAAATTTACGAGTCAAGGTGGTTACATAAAAGTTGTAGCTTCTCA
AGATGAAGAGATAACAACCATATCAGTAGAGGATAATGGTTCAGGTATAGAAAAGCAAAATTTAAATAAA
GTGTTAGATAAATTTTTCCAAGAAGATTATAATAAGGCTGGTAGTGGATTAGGATTAGCAATTAGTAATG
AAATTGTAAAACTTCATGGTGGAAGAATGAAAATAGAAAGTGAAAAGAATGTTGGAACAAAAATAACTTT
TAATATAAAAAATAAATTTGCTAAACAAGCATAA
>ref|NC_013316.1|:1970597-1971334 tRNA pseudouridine synthase 2 [Clostridium difficile R20291]
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ATAATATGACTATTCAAGAAAAACTTGAAAATGTTTTAAGTAAAATGACTAATGAAACAGTGGAGATAAT
AGGGTCTGGAAGAACTGATATGGGAGCTCATGCAAGAGGACAAGTGGTAAATTTTAGAACTAATTGTATG
GATTCTTTGGATAAAATTCAAAAATATTTATATGAATATTTACCAGAAGATATAGTTGTAAAAACTGTTG
AAGAAGTTGATGAAAGATTTCATTCAAGATACAATGTAAAATCAAAGACTTATATGTATAAAATTGACAA
TAATAAGTATCACAATCCTTTTATAAGAAAATATGCTACTCATGTAAGTAAAAAATTAGATTTAGATAGA
ATGAGAAAAGCAAGTGAGTATTTAGTAGGAGAACATGATTTTACTAGTTTTGCTTCTTCTAAATCTAAGA
AAAAATCAAATGTAAGAGAAATTTATTCTATAAATATAAAAGAAGATGATAATGTTATAGAAATATATGT
AGAAGGAAATGGATTTTTGTACAACATGGTAAGGATAATAGTAGGTGCTTTGATAGATGTTGGTCTAAAA
AGAAGAGCTCCACAAGATATTAAGTATATGCTTGAATCAAAAGATAGATGTCAATCATCAGATACTGCAC
CAGCTAAAGGACTATGTCTTTGGAAAGTAACATATTAG
>ref|NC_013316.1|:1971905-1973104 argininosuccinate synthase [Clostridium difficile R20291]
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AAAATTATGAAGATATAGATGTTATAGCTGTTTGTGGAAATGTAGGTCAGGAAGATAAAATGGAAGATGT
ATATGAAAAAGCTTTACAAAGTGGAGCATCAAAGGCATATGTGGATGATATAAGTGAAGAATTTGTAACT
GAAACTATATTTAAAGCCGTAAAAGCAGAGGCTAAATATGAAGGAAAATACTTATTAGGAACTTCTTTAG
CAAGACCTATAATAGCTAAAAAATTAGTTGAAGTTGCTCATAAAGAAGGTGCAAAATATATATGCCATGG
ATGTACAGGAAAAGGTAATGACCAAGTTAGATTTGAAGCTACAATTGCAGCTCTTGACCCGACTATAAAA
GTTATTGCACCTTGGAGAATTTGGGATATAAAATCAAGAGAAGATGCTATAGACTATGCTGAAAAACATA
ATATAAAGGTAACAGCAACTAAAGCTAAAATATATTCAGTAGATGCTAACCTTTGGCATGTTTCAACAGA
AGGTGGAGATATAGAGCACCTAGAAAATGAACATAAAAAAGATGTTTATAAACAATGTGTAGACCCAGAA
GATGCATGTGATGTAGCTGAATATGTAGAAGTTTACTTTGAAAAAGGTGTACCTAAAAAAGTAAATGGCG
AAGAATTATCTCCAGTTGCACTGATTCATAAGTTAAATGAGTTGGGTTGTAAACATGGAATTGGTGTTAT
AGATATAGTTGAGAATAGACTTGTTGGTATGAAATCAAGAGGTATATATGAGACTCCAGGAGGAACAATC
CTTTATGAAGCACATAATATTTTAGAAAGTGCTACTTTAGACAAAGATACATTACATTTCAAACAAATGG
TATCTTATAAATACGGAGAACTTATTTACAATGGACTATGGTATTGTAAATTAAGAGAATCTATAGATGC
ATTTATGGAACAAACTCAAGATAATGTTACAGGAACAGTAAAAGTTAAACTTTACAAAGGAAATATAAAA
CCTGCTGGAATATTTACTGAAAATGCTCTTTATGATGAAGGAATATCTTCTTTTGGAAATAGTGAACTTT
ATGACCACAAAGATGCAGAAGGATTTATTAATTTATTCACTTTACCATTAAAAATCAGAGCTATGAAAGC
TGGAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1973321-1974397 hypothetical protein CDR20291_1681 [Clostridium difficile R20291]
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ATGAGTGTATGTGGAATGGTATAGAAGATTTATATATAAATAAAACCGGTGAATGCCTTCCAAACGATTT
TTTCTTTTTACTGTCAGGTTTTGGTTCATTTTGTTATATGAAAACAAATAAAGCTGATTTGAAAAGAATG
GTAGCTTTGGGAGATGGAAGGACAAAACAGATGTATAAATTTTTAGCACCAATTGTTGGATTTGAATACA
AACATCATGAGTTTAAAAAGTATGAGCAAGCATTAAAGAAAGCAAAATCTGAAATTGATGGTGGATATCC
AGTTATTTTAGGAGCTTTAGATATGTATTATCTACCATATTATAAGAAGCTATATCATAAAGAACACATT
CCTTTTCATTATATATTAATGGTAGGATATGATGATGAAAGAATATATCTGTATGATTGTGGTAGAACAG
AATTATTACATCTTTCTTATGATAAATTACGTGAAAGCATGAATTGCAATTCCCCTGGATTAAGCAAAGA
AAATACTATTTGCACAATAAGAATGAATACTTCAAAGAATAAATATAACATTGCTAGAGAAGCTATTGCT
ATAAAGCGTGATATGTTTTTAAATCCATCTAAAGGATTTTTGGGATATAAAGGTTTTGAAAAGTTTATTA
AAGAGTTGCCACAGTGGAACACTGAATTGGATAAAGATGATTATGATAAGATTTTGACCAATATGGTTAT
GTTTTTTGGAACAGTACCAACAATTCCAAATGCAATCAAAGGAATTAAAGAACCAGATACTGTTCAATTT
AAAGGTGGATTTGATAAAATGAGTAGAATGCTCAACAGTATTGGGGAGGAATACAAAAACGACTCTTTTA
TACAAGTAGCTGATATTTTTGATAAAACTGCTATTATAATTGAGAAAATATCCAATATTATAATAGATTA
TTTAACTCAAACATGTGATGATACAGAACAACTTCCGTTATTGTTCTCTGAGGTCTTAGAGCATATGAAA
ACAGGATATTTAATCTTGGATGTATAA
>ref|NC_013316.1|:1974505-1975668 MerR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAACAGTGAAACAAGTTTCTGATTTAACTGGAATAAGTGTGAGGGCATTACATTATTATGATGAGA
TAGGTCTTTTAAAACCAAATAAAATTACAGATGCAGGATATAGACTTTATGATGATGAATCTATTAAAAC
TCTTCAACAAATTTTATTTTTTAAGGAGATTGATATTCCTTTAAGAGAGGTTAAGGAAATAATGTCAAGC
CAATATTTTGATAAGGTTGAAGCTCTAAAAAATCAAAAAAAATTACTTATTTTAAAACGAAAGAGACTGG
ATGAATTGATAGAGCTTATAAATCAAACTCTAAGAGGAGAAGGAAATATTGATTTTAAAGAGTTTGATAT
GAGCGAGTATTTTAATGTTTTAGAAGAATTTAAAAGAGAACATAGGAATAAGATAATTAAAATTTATGGT
AGTGTAGAAAAATACAATGAATATATAGAAAGAGTTAAGTCTAATGAAGAGAAAATTGCTAAAATGGCTA
TAAAACAATATGGAACTATTGAGAAGTTTGCCCAAGCTATAAAAACAAATTTTAGCAGTGATATATTGAA
TTTAGGAGAAAAATTTGATAGATATAAAAATGATTGTTTAAAAGAAAAACATCCAAAATTAAAAGAATTA
TATAGAAAGCTTGTAGAAGATTTAAGTAAGAATCCTTCTTCAACAGACCTTCAAGAAATAGCAAAAGAGA
TAACAGATATATCTAAAAAAGATTATGAAATTTTCTCTATGTATACTGGTGATGACAACTGGTATTATAT
GATTCAAAATTATCTAGTAAATCCTATGTGGATAGAAGAAGTAGATAAAAAGTATGGAAGTGGAGCAGGC
AAGTTTATTGGACAAGTACTAAAGACTTATCTAAGAGATAGAAAACCAAAGATAAATACATTGTATGAAA
AACTTGTAGAAGATTTGAGTAGAGATTGTTCTTCAAGGGAAGTTCAAAGCATTGTTGAAGAAATAGACAA
TGAAATGAAAAGAAGTAATGAATTTTATAAAATAGACAATGGTGAAAGATACTTTGATTATATGTCAGAG
CTTTATTTACAAGATTCTAACTATATAAAAGTAACTGATAAGAATTATGGTGATGGTGCATCTAAGTTTA
TTGGAGAAGCTTTTAAGATTTATTTTGATAATAATAATTGTTGA
>ref|NC_013316.1|:c1976137-1975757 hypothetical protein CDR20291_1683 [Clostridium difficile R20291]
TTGAAATCTACAACATTTGTTATACTATGGACTATCTTATTTGTATTATTTGGATTTTACGTTAACAATA
AACTATATGATTTTACAGAAGGATATAAAGACAATATATCTGTTTTAGAAAAATCTATAGAAAATGAAGA
TTGGGAAAAAGCTCAAAAAGAAGCTGATTCAATATCTACGAGTTGGAATAAAGAAAAAAACCATTGGTAC
AAAGTTTTAAATCATGAGTACTTTGATGAAATAGGATTAAGGTTTAATATTCTGGACAAAGCAATTTATA
CTGAAAATAAATTAAAATCTTTAGAAGAAGTTGAAAGTATAAAAACATATTTGGGAAATATTATTGAAAG
TGTTAAGTTTGATGTAAACTATATATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1976808-1976140 hypothetical protein CDR20291_1684 [Clostridium difficile R20291]
TTGATAGATATGACAGTAGTATTAATAAGAAGTATTATATTATACATAACAGTGCTAATTGCACTTAGAG
TCATGGGAAAAGGTGAAATAGCTGAAATGAACTGTTTTGATTTAGTTATAACACTATTAATTGCAGAAGT
TGCATCTGTCCCAATGGAAAATAATAATATACCAATCATAAATGGTGTTGCAGCAATATCTGGTCTTGTA
ATCATGCAGACTCTTATTTCATTCTTATCATTAAAAAGCAGAAAATTAAGTTCATTTTTATCAGGTAAAC
CTTCTGTATTAATAGATAAAGGAAAAATTGTATATAAAGAGCTTAAAAAAGAAAGAATTAGTATAGATGA
ATTATTAGAACAACTTAGGATTCAAGGATACTTCAACCTAAAAGATGTACAATATGCTATTTTGGAGACT
GATGGTAATCTAAGTGTTGTACCAGCATCAAGCTACAATAGTACTCCTCCAAGAGCTTTTAATCATTTAC
CTATCCCACTTATACTGGATGGTAGAATAATAAATAAAAATCTAGACATAGCTCAAAAAGATACTAACTG
GTTAATGGGTATTTTAAAATCTAATCACATAGAAACTTTTAAAGATGTTCTTATTTGTGTTTTAGATGAA
AATGACAAAATATTTATTCAAAATAAAAAGGGTGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c1977894-1976905 putative exonuclease [Clostridium difficile R20291]
ATGTGCTTTAGATTTATGAAATACAAGTTATTTATAGACTTTGAATTTAATATACTAGATGATAATAAAA
ATAAACCAAAAGAATATAATGGTGCGGAATTAATTTCTATTGGTGGAGTTTTAGTTGATAACGAATTTAA
TACAATAGATAATTATTACTCTTTAGTTAAGCCAAAATACAATAAAATACTTTCAAATAAATGTAAAAAT
TTAACCAAATTGAACCAACTAGATATCAATAATGCTCCTAATCTTTTATATGTTATGGATGATTTTTATA
AATGGTTTTGTAAATTTGATGATGTTACAATATATAATTGGGGTGATTTTGATATAACTGGCCTTCTAAC
TTCATTTAGAGTATATAAATATACAGGTAAATGCTTAGAGTTATTTAATATGATGATTGACATTCAACCT
TTTATATCTCAACATATTACATACAATAATAGAATCTTATCTAAGCAAATATCTTTACTGAATATGAAAA
AAATTTTTTCTGTAGAAGGAGATATTAAACATAACTCACTTTCAGATGCTGTGGATTTAATGAACGTATG
TAAATGCTTTTTCTTTAACTCCCCTAAAAATATCGATATTCTTGAAGAATTATATAATAAATTACCTGCT
CTCAAAACACCTTTATATTATATTCCCTACTTTGAAGATGAAAATTTTGAACTCAAATTTGATAGAACTC
CAGAAGATATAATAATATATCTTAAACAAATATTAACTATACTAAATATAAGTAAAAAAGAAATTTATTT
TAAAAAAAGAAGTGTATTAGTGAATAACTCTAAAATCATTAACTTTAAAAATCTATCTTCTTCTTTCAAA
TTAATAAAACTCAATGAATTTGAAGAATATCCTGATTTTATCTTAAAATTAGGAGATAAAAAGAGTTTTG
TTGAATCTGTTATTAAAATAAATAAAAGTAACAGAAAATCCATAAAAAATTTAATATTAAAATTATCAAA
AAAACCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c1978266-1977919 hypothetical protein CDR20291_1686 [Clostridium difficile R20291]
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TTACAGAGGAATTAAAAAATATACTTATAACAGATTTACAGTCTAACCCGTTTAAAAGTAATATTGAGCT
CAGTATAATACCAGCAAATATAGAAATATTTAAAAAGATAGAAAATATATTAATAGACTCTAAAGTTAAT
TTAAAAATGGGTTGGGAAAGAATACTTATAAATTATATCTTAAAAGATTTATTTGAATTAAATTATGAAA
TAAATAAAAGTTGTAATGAACCTTTGATGTTTAGAGTCATTATATCTATTGATTCTTATGATGCTTAG
>ref|NC_013316.1|:c1979440-1978484 putative L-threonine dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
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AGTATGGAGAACAAAATGTAATCGCTAGTTCAAGGAGAGTAAAAGAAGGTAATCCAGTATGTGAATCTGG
TATATTTGAGATATTAGATGTTACAGATAAGAATCGTTTTTTTGAAATTGCAAAAAAATATGATGTAGAT
ACTATAATTCATCTAGCATCTTTACTTTCTGCAGTTGCTGAAAGTAAACCCCTAGAAGCTTGGAACTTAA
ATATGAATGGATTAATAAATGGCCTTGAAATAGCCAAAGAATTGGATTGTAAATTTTTTACACCTAGTTC
AATTGCTGCTTTTGGTGAAAATTCTCCAAAAAATATGACTCCTCAAGATACATTACAAAGACCTAATACT
ATATATGGTGTGACTAAAGTTTCTGGAGAATTACTATGTGATTATTATCACTCAAAATTTGGAGTAGACA
CTAGAGGTGTTAGATTTCCAGGTCTTATTTCTTATGTTACGCCTCCTGGTGGAGGAACTACAGATTATGC
AGTTGATATATATTATGAGGCATTAAAAAATAAGAGATATAAATCTTACATAGCAGAAGGTACAAAAATG
GATATGATGTATATGCCTGATGCACTTCAATCAATAGTGGATTTAATCCAAGCTCCAGCGGATAAACTCA
TCCATAGAAATGCTTTTAATATTACTGCTATGAGCTTTTCTCCTGAAGAAATAGCTGATTCTATAAAAAA
ATATATTCCTGATTTTGTGATAGAATATGATGTAGACCCTGTAAGACAAAGTATAGCTGATTCTTGGCCT
AACTCTCTAGACAGTAGTAGTGCAGTAAAAGAATGGAACTTTAAGTTTAGTTATGATTTAGATAAAATGA
CCAAAGATATGTTAGAAAAATTATCAGAAAAAGGAATAGGCAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1979881-1980249 hypothetical protein CDR20291_1688 [Clostridium difficile R20291]
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AGGAACACAACACAGATATACCAATCTCAATAGGAAGTGGTATGGGGGTTGGAATGAATGTTGGAAGTGT
TTGTGGAGCTGTAAATGCTGCTGTTGTTATAATAGGGTATTTAAATGGGCGAAATAGTAATTTAGATGAA
AATATAGCAAGGAAGTATTCAAGAGAGCTATTGAATAAAGTAAGAAATAAATACAGCTCAGAAATATGTG
TATCTCTTAAAAAAAATAAAGTAACTTGTGAAGAAATAATAAATTTCACATATGATGCTCTAAATGATAT
GCTAAAAAATCAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1980674-1980919 hypothetical protein CDR20291_1689 [Clostridium difficile R20291]
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CTGAATATAGTGATGAAGAGTTTTATGTTACAGTCTATAAAGATGAAAGTTCTGACTCTGGGTACTATGC
TTTATTAGAAAATAAAGAAGAAAGAGTTGTATGGGATGGAGAAGTTGTTGCCAATAATATTTTTAATAAC
CTTTGGATTGTAGTAAATAAGGTTAAAACTGGATAA
>ref|NC_013316.1|:1981018-1981281 hypothetical protein CDR20291_1690 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATATAGTTATAGTAAGATGAACTTAAAAAAAGGGGATATTGTAGAGGTAAATTTAGAGAAACAAG
CCAATGTAATATTGTTAGACCATATAAATTATGTGAAATTTAAAAATCAAAGAAATTATGATTACTATGG
TGGATTTGCAAAGAAAAATCCATGTAGAATGAGAGTTCCTAATACTGGAACATGGTATCTAGTAGTAAAT
CAAGATGGAAATAGTGGAATAGTAAACTTTTCAATCAATACAATTCAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c1982513-1981566 putative nitrite and sulfite reductase subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAATGTTACAGCAGAACAAAAAAAGGAAGTAAAAGGTAGAGGTTTTCTACCAAGCAGGGATGGAG
AACATTTTGCAGCACGTATAATAACTGTAAATGGTGTAATAAATGCATCACAAGCAAAAAAAATTGCAGA
AGCTGCTGAAAAATTCGGAAACGGTCAGTTAGCATTTACTACTAGACTAACAGTAGAATTACCTGGTGTA
AAATTTGAAGATATTGAAGCTCTAAGTGAATTTATTGCTAGCGAAAATCTAATAACAGGTGGAACTGGAT
CAAGGGTTCGTCCTGTTGTGGCTTGTAAAGGTACTGTTTGTGTTCATGGTCTAGCTGATACACAGGCACT
TGCTACTGAAATACACGAAGAATTTTACAAAAATTGGTATGATGTAAAACTACCTCATAAGTTCAAAATT
GGTGTTGGTGGATGCCCTAATAACTGTATTAAACCTGACCTAAACGATCTTGGAATTGTTGGTCAACGTG
TACCTGACTATGATTCAGAGCTTTGTGTTGGTTGTAAAAAATGTGCTGTTGTAGAGGTCTGTCCTGTTAA
AGCAGCTAAATTAACAGATAAAGGTAAACTTGAAATAGACAGTAATCTATGTAATAACTGTGGTAAGTGT
ATAGAAAGTTGTAATTTTGATAGTATTGAAGAAAAAGAATCTGGTTATAAAGTCTATATAGGAGGGAAAT
GGGGAAAATCAGTTCGTCCTGGAACACAGATTGATAGATTATTTTCAAAAGAGGAACTTATGACTTTAAT
TGAAAAAGCAATTCTTTTATTTAGAGAACAGGGTAACACAGGTGAACGTTTTGGAATAACTATCGATAGA
ATTGGTGCTGATAAATTTATAGAAATGCTTTTATCAGATGAAGTTTTGGAAAGAAAAGAAGAGATACTAG
AGGCTCTTTTACACCTTACAGGTGGAGCTGTATGCTAA
>ref|NC_013316.1|:c1984147-1982516 putative pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase [Clostridium difficile R20291]
GTGAAAGTATTAATTATAGGTGGAGTTGCTGCTGGAACAAAAACTGCTGCAAAAATAAAACGTGAAATGG
GTGATAATTGCTCTGTTACAATACTAAATAAAGGTGATGATATTTCTTATGCAGGTTGTGGTCTTCCATA
TTACGTTGGTAAGATAATTGAAGATAAATCATCTTTAATCGTAAATACACCTGAAAGTTTTTCTAAACTA
ACAGGAGCAGAAGTTCGTTGTGGAGTTGAAGTTACGTCTATTGATAGAAATGCAAAACAAGTAACTTTGA
AAACGCTTTCAACAGGAGAAAAAGAAAATCTAAGCTATGACAAACTTGTAATTGCTACAGGGGCAGACCC
AATAAAACCACCAATACCTGGAATAGATTTACCTGGAGTATTCTTTATGCGTACTCCAAATGATGCTATA
AAACTAAGAGATTCTATTGAAAACGGTATTAAGAGAGCTGTTGTTATTGGTGGAGGTTTCATTGGTCTTG
AAATTGCTGAAAATCTTTCTGCAATGGGTATACGTGTAAGTGTTGTTGATATGGCTGAACATGTTATGCC
TGGATTTGATACTGATTTTGCTGAATACGTTGAAAATCATATGGCTGATAAAGGCATAATGATTTTTACA
GGTGACCAGGTTGTAGGTATTGAAGGTGAAAATAAAGTTGAAAAACTTCGTACTAAAAATAGAGCTATTA
AAACAGATTTAGTGGTTATGTCAGTTGGAATCCGTCCTAACACAGGTTTTCTAAAAGACACAGGTTTAGA
ATTTGCCCCTAATAATACAATTATTGCAGATGAATATATGCTTACAAATGATAAAGATATATACGTAGTT
GGAGACTGTGCTTTTGTAAAAAATTCTTTAACAAATAAACCTACATGGTCACCTATGGGGTCATCTGCAA
ATCATGAGGGTAGAATTTGCGCACAAAATATATCTGGAAAATCTAAAACTTACAATGGTGTTCTTGGAAC
GACAGTAGTAAAATTACCTGAGCTCAATGCAGGAAAAACAGGTCTAAGTAAAGAAATAGCTGAAAAAGAA
GGTTATAATGTTTGCTCTGTAACCATAGCTACCGATGATAAAGCTCATTATTATCCAGGTGCATCTAATT
TTATTATAAGAATGGTTGCTGAAAAAAATACTAGAAAATTATTAGGTGTTCAAGTTATGGGACCTGGAGC
GGTTGATAAAATAGTAGATATCGCTGCTACTGCAATAACTTTAGGCGCTGACCTTTATTCATTAGAAAGT
ATGGACCTTGCATATGCACCACCTTTTTCAACAGCTATTCACCCTTTTGTAGTGGCAGTAAATGTTTTAC
AAAATAAACTTAACGGAGAACTTGATAGTGTTTTACTTGACGAAATTGAGGATTTTGACAGTTGGACTAA
ACTTGATGTTTCAAAAGCTCCTTCTATTCCTAGTTTACGTTATATTCCTGTTGGTGAAATTAATGGAGAA
ATTGAAGGTCTTGCTAAGGATGAAAAAATTCTTCTTATATGTGCTAAAGGTAAAAATAGCTATATGGCGC
AAAATCGCTTAAGACGCTTTGGCTATACAAATACGAAAGTTCTTGAAGGTGGAATACTATTTTATCCAAA
TCTTAAGGTAATGGAGGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1984277-1985194 LysR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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ATATGTATATTACCCAGTCATCAGTTAGCCAAGCTATTTCAGAAATAGAAAAAGAGTATGGTGTTAAGTT
ATTTGATAGAATTTCAAAAAAATTATATTTAACTGAGGCAGGGAAAAAACTTCTTGGATATGGGAGGCAT
CTTTTAGCTGTAAATGAAGAAATGAATGATTGTATGAAGCATTGTGCAAAAAATATCCGTATAAGAGTTG
GGGCAACAGTAACTGTTGGTACATGTGTAATAAGCCCGATAATGTTAGAATTATACAAGGTAAATCCTCT
TATAGAACCTGAAGTATTTGTAGAAGATACAAGACTGATTGCAAAAAAATTACTTAATAGTGAATTAGAT
ATTGCGATTGTAGAAGGAAAAATTAAGCACCCAGATATTGTTACAAAAAGCATTATTAATGATAATCTTG
TACTTATATGTTCACACAAGCATGAGTTCTACAAAAGAGACTCTATAAAAGTTTCAGAACTTTCAAATCA
ACCATTAATTATGCGTGAATTAGGAAGTGGTACAAGAGCACAATTAGAAAAGCAATTAAAAGAATTAAAA
ATCCCAATGAATATTAGATGGTCATGTTATAACTCTGAAGCTATATTAAGAGCAGTTGTAGATAATTTTG
GCATTGCAGTTATATCCGAATTACTTATTGAGGATTATTTAAAAAAGCATCTTTTGTGGGCTTGTGATAT
TGAAGGTATTAACTTACATAGAACATTCGATATTGCATATCATAGAAGCAAGTTTTTTACAGAAAATATT
TCAGCATTTTTTGATATTTCAGTAGAATATGGGAAAAAACAAGCGAGAAAGAAGAGTAGAAGTGTAAACA
GTTTATAA
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TAGTAGGACTAGGATGGGATATTAATAAATATGATGGTGGATTTGATTTCGATTTAGATGCCTCTGCATT
TTTAACTGGAACTGATGGAAAAGTAACGAATGATGGAGACTTTATATTCTATAATAATTTAAAACACGCT
TCTGGAGCTGTTGAATATATGGGTGATAATAGAACAGGTGTTGGTGATGGTGATGATGAACAAATAAATG
TAGACTTATCTAAAATACCTCAAAATATTGCTAAAATATCATTTAGTGTTACTATAAATGAAGCAATTAC
AAGAAGACAAAATTTCGGACAAGTTGAAAATTCATATATAAGAATATATAATGAAGAAACTAACGAGGAA
CTTATTAAATATGAATTGGGTGAAGATTTTAGCATAGAAACAGCAATAGTCGTGGCAGAACTATATAGAC
ATAATGGAGAGTGGAAATTTAATGCTTTAGGTTCTGGATTTGAGGATGGACTTGCAGGATTGTGTAAAAA
TTTTGGCGTTAATATAGGCTAA
>ref|NC_013316.1|:c1986438-1985872 tellurium resistance protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTGTTAGTTTACAAAAAGGACAAAGAGTTAGCTTAGTAAAAGATAATAATCCTGTAAAAAATCTAG
TAGTAGGCTTAGGATGGGATATGAATAAATTGGGTAAAAAAAATTATGACCTAGATGCATTTGCAATAGC
ATTGACTAACCAAGATAAAATGAATGTTAGAGGTGACTTGGTTTATTTTGGAAATCTTAAACACCCTTCT
AAAGCTATTATACACACTGGAGATAACTTAACTGGAAAAGGTGAAGGTGATGATGAACAAATAATTGTTA
ATTTAGAAGACATACCTGAATATGTACATAAAATAGTTTTTGGAGTTTCTATATACAAAGCTAAAAAAAG
AGACCAAGATTTTGGTCAAATGAACAACTCTTTTATAAGATTAATTGATTCAAATTCCAAGCAAGAATTA
TTTAAATATAATCTTCAAGAAGACTTTTCTGGTAAAGTAACAGTTTTGGCAGGAGAAATTTATCGTAGAA
ATGAAGAATGGAAATTTAATGCTTTAGGAATTGGTCAAAATGAAGAGCTTCGTGAATTAATTAATACATA
TAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c1987753-1986893 hypothetical protein CDR20291_1696 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTATTGAAAAAAGATAGAATAACTTTTTCAGAAATTTTAATATTAATTGTAGGCTGTATATTAATGG
CCATTTCTCTTAATTTATTTTTTAATCCACATGCAATCGCTGCTGGTGGTATAACAGGACTTGGAGTTGT
TTTAAATTCATTATTCGGTGTAGAACTTTGGATTGTCAATTTACTTTTAAATGTTCCATTATTCATATTT
GCTTACAAAATACTTTCAAAAAAAGATTGTTTTAAAACGGTTTTAGGAATAATTTTTCTTACCATAGCAC
TTAAGCTTACTGCAAATATGGCTACATTAGATATAACAAATGATATGTATCTTGCAATTATATCTGGTTC
TATTTTAATGGGAGTTGGTCAAGGACTTATTTTTAGAATAAATGGCTCTACAGGTGGAACTGATTTAATG
GCACTCCTACTAAATAAATATTTTCCTACATTTAGTATACCTGTTTTAATGGGTATTGTAGACTGCGTTG
TAGTTGTTTTATCAGGTATAGTAAATAGACAGGTTGAAATTGCACTTTATTCAACTGTGGCTTTATACAT
TTTAGTAAAAGTTAGTGACTTGCTTATTGAAGGATTTAATTATTCCAAATCATTCACTATTATATCTGAC
CTTTCAAAAGATATAAGTAAAAAAATAATGGAAGATTTAGATAGAGGTGCAACTATTCTAAAAGGAGAAG
GTGCATATACTGGAGAAAATAAAAATGTACTTTTAGTAGTAGTTGAAAAGAAAGAAGTTGTCGAATTAAA
AAAATTAGTAAAAAATGTCGACCCTAATGCTTTTATTATAATTACAGATATACATGAAGCTTTAGGTAAT
GGATTTAAAAAAATAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1987902-1988792 putative hydrolase [Clostridium difficile R20291]
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TATACGTAGATGGTAAAGATGCAATTTTAATTGACAGTGGAAATAATAAGGATACAGCTAGACAAGTTTT
AAGATTATTAGAAGAACATAATTTAAGTCCTAAATTAATAATAAACACTCATTCAAATGCAGACCATATA
GGAGGAAATGCATATTTGAAGAATCAAACAAAATGCAAGATTGCTACGACTAAAATTGAAGGATATTTTA
CAGAAAATCCAATATTAGAATCAGCATTTTTATATGGTGGCTATCCAAGTAAAGCACTGAAGAATAAATT
TTTATTAGCAAAGGAAAGTGAAGTTGATTATATTATACCTTCAAATGGCAAAATTGTAGATACAGAACTT
GAAGCGATTTCTCTTCCAGGTCATTATTTTGAAATGATTGGTGTTAGAACTCCAGATAATGTTTTGTTTG
TTGCAGATAGTCTTACACCAGAGAATATAATTACTAAATATCATTTTTTCTTCCTACTGGATATAGATTC
ACAGTTTAAGACACTAGAAAAATTGAGAATGTTAGAGGCTGATTTCTTTGTTCCAAGTCACTCTGTCAAA
ACTACAGATATAAAAAGTTTGATTAATATTAATAAGAAGAAGATGGAAGAAATAATAGATAATATTAAAA
AGGTTTGTTATGAGCCAGTTATGATTGATGAAGTTATTGAAAAAATGTGTGATTTGTACAATGTCAAGCT
TGATGCTAATCAATATGTGTTGGTTGGAAGTACAATACGTTCTTATATAACTTATTTATATGAGAATAAT
ATGGTTGAATATATATTTGATGGTGGTAAGATGATGATAAAAGCTGTGTAA
>ref|NC_013316.1|:1989019-1990764 cell surface protein [Clostridium difficile R20291]
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TTAATAATTTAACTGCAAATGCACAGATTAAAGAAGATTCAATAATAGGAATTGATAGATATGAAACAGC
AGGACTTATAGCAGATAGACAAACTTATGATACTGTAATATTAGTTAATGGAGATAAAAATTTATCTGAT
GGGCTTTCATCAAGTGGATTAGCTGGAGCTATTAACGCACCAATACTTTTGACTAAAAAAAGTGAAATAC
CAAAAGCTACTTTAAATAGACTAGATAATAAGAGTTTAAATGTTGTAAAAAAAGTATATATAATTGGTGG
TTATAATACTATTGAAAATTCAGTAGAAAAAGATATAAAAAGAAAAGGTATTCAAGTGGAAAGAATAAAT
GGTAACAATAGAATTGAAACTAGTTATAATGTAGCTAAAAAAATAAATGAAGTAAGTAGTGTAAAAGAGG
TAATGCTTACAAATGGATTTGTAGGAGAGGCTGATGCTATGAGTATAGCACCTGTAGTTGCAAAAAATAA
AGGAGCTATAATACTTACAGATGGGAAATCAGTTCCATTTAAGACTGAAGGTTTAAATGTTTACGCTATA
GGTGGCAAATCTGCGATAAATGAGGATTTAGTAAATGAAACTAAAGCAACTAGAATCGGAGGAAATGATA
GATTTGAGACCAATAAAAAGGTAATGGAAAAGTTTTATAATGGAGCGACAGATTTTTATATAACAAATGG
ATATCAATTAGTAGATGCACTAACATTATCTCCTTTAGCCAAAGAAAAACCAATCGTTTTAGTTGCTGAT
GGAAGTAATAAAGGTATTTTAAAAGGAGCTAAAAGTATAACAAAAGTTGGAGGTATTGATGCCAATATAT
ATAAACAGTGTTTAGATATGATTAAATATAATAATATGGATGTGACTCCAAATATTTTAAAACACTTAAC
TTCAGTTGAAGGAAATGAAGTTTCTGAAATACTTATAGAATCAGATAATTTAGGTGTGGTTGTTGAAAAG
ACGAATACCAATAAATTTGAGTTTGATTACGTAAGTGTAACTAATGAAAAAAATTGTACTTTTTCTGTAT
ATAAAGAAAATTCTTCTAATAATGTAAAAAATGGAAAGCTAGTTGTAAGTGCTAAGAAAAAAATAGATAA
GAAAGATAGTGATTTGCAAGATATGAATGGCGACAATATGATAAATGCAAATAAAGATAGGATGGTAAAT
GTGATAAAAATTGGAGTTCCCGATAAAATGTATTCTAATTTTAAAGTAGATGTTGAAAGTGGTTCAGTAG
AACTTTATAATATTAAAGGAGGAGCTACTGTTGATGTCAATGACGGAATTGCTAACATTGTTGATAACAA
TGTGACAAATCCTTTCAATATAAATACTAATAGTGGGATTTCAGGTGTAACAGCTGAAACTATATCATCT
GAGATAAAATTTAGAGCAAACAATGGAATTGTAAGTGTAACAGCTACAAATATAAATGGCAATATAAGTT
TATTTGGAAGCGATAATAAAGGTACCTTTGATGGAATATTTAAATTAAATCTGAAAAAAGAACCATCAAA
TTTACACTTGAAGTTAGTTGGAAATGGGATAAATAAATTGCCAGAAGGTTGGTCTAAAGATTATATTTTA
GGAAATGGACAACCAATTATTGAAGTTAAAAATAATGGCATAAATAATATATCAATTGGAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:1991148-1992134 putative sucrose operon repressor (LacI-family transcriptional regulator) [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAATAACAATAAATGATATTGCTAACTTGGCAGGAGTATCTAAAAGTACTGTATCAAGATATC
TAAATAATAAAGATATCAGTGATTCTACTAAAGAGAAAATAAAGACAATAATAGATGAATATGGATATGA
GCCGAATGCATTTGCTCAAAGTTTGAGAGCTAAAAAAACATACTTTATTGGTATTATAACACCGTGTTTA
GATTCTTTTGTAAAATCTAAAATTATGATGGCAATAGATGAAGAACTCAAAGAATTAAAATATACATCAC
TAATTATTAATACTAATAGAAAAATAAGGTCAGAAATAGATAGTATATCAAAGTTAGCTAGTCTAAAAGT
TGATGGAATAATACTAATTGGTACCGAAATAACTAAAGAACATAAGAATGAAATTGAAAAGTTAGATATA
CCAATGGTTGTAGTTGGACAAAAAGTTGATGGTATCAATAGCATAGTGAATGATGATTATGGAGCAGGAT
ATAAAATGGGTCAATATATTGCTAATAAAGGTTACAAAAACATTGTATATTTAGGTGTTGATGAAAGTGA
TATATCAGTTGGTTTAAATAGAAAAAATGGAGTACTTAATGGGTTAAAAGATAAAGGGTATGATGCAAAA
GTATTTTATACTGACTTTGACCAAGAAACGTCTATACAAAGAAGTGGAGAAATGCTAGAAAGTGAAAATC
CAGATATAATAATATGTGCAACTGATAATATAGCAATAGCAACAATGAAAGAAATCAATAAGAGAGGTAA
AAATATACCACAAGATATATCTGTAGCTGGATTTGGGGGATATGATGTATTGTCTATTATAAGCCCTAAA
CTTACAACAATAAAGTTTGAAAATAAAAATGCAGGTAAAGTAGCAGCAAATACGATAGTGAACTTAATAC
AAGAAAGAAAAGAACCACTATTAAAGGAGATTAAATTTGAATTAATAGAAGGTGAAAGTACAATAAATAA
AAATTAA
>ref|NC_013316.1|:1992471-1993952 putative sucrose-6-phosphate hydrolase [Clostridium difficile R20291]
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TATCTTTAAATGATAAATATAAACCACTATTTCATATACATCCACAACATGGACTACTTAATGATCCAAA
TGGATTAGCATATTATAATGGTAAGTACCATGTATTTTATCAATGGTATCCATATGATGCAACTCATGGA
ATGAAGCATTGGGCTTATGTAAGTTCTGATGATTTTGTAAACTGGAATAGAGAAGATGTAGCATTAATAC
CAATCGAAAGTTATGAATCTCATGGAGCATATTCAGGTAATGCGATAGAGGTAGATGGAAAATTGCATAT
GTATTATACAGGGAATATAAAATATAGTGCAGAAGATAGATATGCATATCAAAACTTAGCTATAATGAAC
AAGGATGGTAAAATAACTAAATATGAAAATAATCCAATAGTAAGTGAAATACCAAAAGGATATACAGGAC
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TAAAAAAGGAGTTATAATAGTATATGAATCTAAAAACTCTATAGATTGGAATTTTAAAGGAGAATTAAAT
GTAAAAAATATAGATGAAGATTTTGGTTACATGTGGGAATGTCCAGATTATATTAATATAGATGAAAAAG
ATATATTAATATTTTCGCCACAAGGAGTAGAACCTAAAGGATTTGATTATCAAAATATATATAATGTAGT
ATATGCTATTGGTAATATGGATTTAGATAATTTAACATTTGAAATAGATACAATGAAAGAACTGGAAAAA
GGATTTGATTTCTATGCTCCACAAACATTTATAAAGGACTCACAAATAATACTATTTGCATGGGCTGGAA
TGGGAGAAGTTTTATACCCTACAGATAAAAACAAATGGGCACATTGTCTAACTGTTCCAAGAAAATTAAA
TATAAAAAATAACAAGCTATTGCAAATGCCTGTAGATGAATTAATTAAATTAAGATATGATGAAACAAGT
GGGCAAAATACTATAAAGAATAATATCAATATTATAGAAAATGATGAAAATGTATATGAGCTTAATATTA
ATATAAAAAATATTGACAGCAATAAATTTGGGCTGGAATTATTTTCATCACAAGATGAAGGTGTAAAATT
AGAATTTAACAAATTAGGAAACATTGTAACTTTAGACAGAAGCAACTTTAAAAAAGTTTTCGGTGTTGAA
TATGGAACAAATAGAAAAGAATATATAAATATTGATGAAAATACTAATATCAAAGTACTAGCGGATAGAA
GTGTTTTAGAAATTTTTATAAATGATGGAGAAGTAGTATTTACTAGTAGAATATTTGCTAAAGAAAATTC
TAATCAAATAAGGGTTTATAGTGATAAAATAGTAGAGTATGAGTATACTAAATTTAAATTAAAGCAAGGT
ATTGAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:1993978-1994949 putative fructokinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAGTAATTAGTATAGGAGAAGCTTTAATAGACTTTATACCTAATCAAAATGGTTGTAAATTAA
AAAATGTATCAGAATTTAGAAGAGTAGCAGGAGGAGCTCCAGCAAATGTTAGTGTTGTTGTAGCAAAGCT
TGGAGGAAAATCAAGTTTTATATCTAAGTTAGGAAAAGATGCATTTGGTGATTATATAATAGATGTATTA
AATGAAGTAAATGTAAATACTGATTATGTATTGAGAACAAGTAAAGCAAATACAGGACTTGCTTTTGTAT
CATTAAAAGAAGATGGTAATCGTGATTTCTCATTTTATAGAAATCCAAGTGCAGATATGCTTTTAGAAGC
TGATGAGGTTAAAAAAGAGTGGTTTAATAATTGTCATATCTTACATTTTTGTTCAGTAGATTTAATAGAT
AGTCCAATGAAATTAGCACATAAAAAAGCAATAGAATACGCACTTGAAAGTAATAGTATAATAAGTTTTG
ACCCTAATATAAGATTACCTTTATGGGATAGTGAGCAATCTTGTAAAAAGGCAATATCAGAATTTTTACC
TTTTGCTCATATTGTTAAGATATCTGATGAAGAATTAGAATTTATGACAGGAGAAAATGATATAGAAAAA
TCATTACATAAACTCTTTGTGGGGAATGTTGAACTAGTATTATATACAAAAGGAAAAGATGGAGTAGATG
CATACACTAAAAAAGTAAAAGGTATGTGTAAAGGGGTTAAAGTAAATGCAATAGATACAACCGGAGCAGG
AGATTCTTATATAGGTTCATTTTTATACACCTTATTGTATAAACAAATAACATTGAATGATATAAAAGAA
ATGAAACAAGAAACGTTAAATGAGTATTTAGAATTTTCTAATTATTATGCAGCTCGTAGTACAACTATTA
AAGGTGCGATAAGTTCATATGCAACAAAGGAAGAGATAACTGAATTTATAAAAAATTTATAG
>ref|NC_013316.1|:c1995807-1995205 putative NADPH-dependent FMN reductase [Clostridium difficile R20291]
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TTGAGGAATTAGAAAATTATAATTCAAATATTGAAGTAATATGGTTATATGATTGTAAAATAGAGCCATG
TATTGCTTGTAAAAAATGTCAGGATAACTTATTTGATTTTGGATGTTATTGTAAAGATGATGTTCAGAAA
ATTTTCAAGAAAATTCTTATGTGTGATTTAATTGTTTTTGCTACTCCAATTTATTCTTGGTACTGCACTT
CTCCAATGAAAGCACTACTTGACAGATTGGTGTATGGAATGAATAAGTACTATGGTAATGAGAAAGGCCC
CGCTCTATGGGCAGGAAAACCAGTAGCACTTATTACAACATGTGGATATAGACCTGAAAAGGGTGCTGAT
ATTTGGGAAAATGGTATGAAGCGCTACTGTAAGCATTCACAGTTAAAATATATAGGAATGCTTGTTGAAC
GTGATTTAGGTAAACCTAATTTTATGAATAAAGAAAAAGAAAAACATTCTCGTCAATTTGCAAAACAAAT
TTATTATATTTTAGATAATTCAATTGAAGTAGATAACTGCTAA
>ref|NC_013316.1|:1996055-1997299 putative pyridoxal-dependent decarboxylase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTATATTTAAAATCTTGGAGGTAAAAAATATGTACTCAAATGAAGACTATAAATTTATAGAAGAAA
ATGCACCATGTTATATATATGATGAGACTAATATAATTGAAAAATGTAAGGAATTGAAAAATAATATTTT
AGGTTTTGATTTTTTATATTCTATAAAAACAAATCCATATAACAAAATTGTAAAAAGCATTGCAGAGCAA
GGTTTTGGAGCAGATGCTTCTTCAACTAATGAAGTTATGATTTCATCAGAATGTGGAGTTTCTAAATATG
ATATTTATTATTCATCACCAGGCAAAACAGAGATTGATATAGAAACTGTTTTAGATAAATGCATAATTAT
TGCAGATAGTATTACAGAAATAGAACTTATAAATAAGATATCTAAAAAGCATAATCAGAAAGTTAAAATA
GGAATAAGAATAAATCCTGATTTTACTATGGATGATGATAGTGCTAAATCAAGCAAATTTGGTATAGATA
TAGAAGATATGAGCAGTGTTTTTAAGATGTTAAGTATGTGTGATTATGTATCTGTAGTTGGGATTCATAT
ACATATTAAATCTCAGGTATTGGATTTTGAAAAGTTAGGACATTATTATGAAAAATGTTTTTTTATAGCT
TTAAATTTAAATAAAAGTAAGTATATTAATATTGAATTTATAAATTTTGGTAGTGGACTTGGAGTAGCTT
ATGATAATCTTAGAGAAAATCCACTTAATCTTAAAGAGCTTTCAAAATTAACTCAAAAGATTGTTTTTAC
TAATTCAAACACACTGAAATCAAGACTTCTTATTGAATCAGGACGTTTCATAGTTTGTAAATCAGGTAAT
TATTATGTTAAAATTGTAGATATTAAAGTATCAAGAGGGAAAAAATATCTTATTGTAAAAAATGGACTTA
ATGGATTTATGAGACCTATTATTTCTAATTTAATTGAAAATATTACTTGTGGAGTAGAATTAGAAGGTCA
AGAGCCATTATATACATCAAATCATGCCTTTTCTCTTTCAGTATTAAATAATTTAAAAGAAGAAGAGTAT
GTAAATGTTGTTGGGAATCTCTGTACATCATTAGATGTAATTGCAAATAATGTTAAATTGAAAAAAGCAA
ATATAGGAGATTTGATTTCAATTAGTAATGCTGGAAGTTACTCCTATTCTTTATCACCACTATTATTTTC
GAGTTATGAATTTCCTAAACAATATTATAAAAGAAAAGATGGATATATTGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1997598-1998569 g196 [Clostridium difficile R20291]
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AGTTATTAGGATTAAGAATACTTCAAGGAGTTTTTACGGGTTATGCTACTGCATGTACTACTCTTATTGC
AACACAGACAGATAAAAATCATTCAGGATGGGCTTTGGGTACTCTTGCAACTGCATCAACTACTGGCTCA
TTAATTGGTCCAACAGTAGGAGGATATATAGAATCAATCTTGGGTCTTAAAAGTACATTTATTATAACAG
GAGGATTGTTGTTTGTATCATTTATCATCTCTATTTTATTTGTAGTAGATAATTTTAAACCTAAAGAAAT
AAAAGAATCAATTTCTATACCTAAAGAACAATTAAATATATTGCCAAATAAATTTTTAATTGCATCTATT
TTTGTAACCACATTCATTACTCAACTAGCTTTATACTCTATAGAACCAATTGTAACCATATATATATCAC
AACTTACAAATTTTGCATCAAATGTAGCTTTAATAGCTGGATTGACATTTTCTGCATCAGGATTAGCAAA
TTTATTAGCAGCTCAAAAACTTGGAAAAATGTCAGATAAAATAGGTCCTCAAAAAGTATTGTTAATTTCA
CTTTTATGGGCTGGGATTATATTTATACCACAAGCTTTTGTAAAAACTGCATGGCAACTGATGTTGTTGA
GATTTTTATTAGGGTTGTCAGTTGCAGGGCTTAATCCTTCTGTTAACAGCTTGCTTAAAAAAATTGCACC
AGAAGAATATGTGGGAAAAATATTTGGATATAATGCATCTGCCCAGTATATAGGTTGTTCATCAGGAGCA
TTTTTAGGGGGACAAATATCAGCACATTTAGGTATTAGAACAGTATTTTTTTCAACAAGTTTATTGTTGT
TTATGAATGCACTTTGGATGTATAAATTTACTGGATTGTTTATTAAAGATAAGACTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:1998756-1999133 putative regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
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TAACATCAAAAGAAACTATTGAAGCTATGGAACGAAAATATGGTTGGAAACAAACAACTACATTGACACT
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GTTGTTGGACATAAGGAGTATTTAAGTGTTGAGACAAAAGATTTTTTAAGCAATATACACGACAATTCTT
TACAGAGTTTAATTTCAGCACTACATGATGATGAAGTTGTTGATAAAGATATGTTGGATTTATTTGAAAG
TCATTTTAAAAATTTAGAAGAAGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:1999664-2000323 putative two-component sensor histidine kinase () [Clostridium difficile R20291]
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ATACTAGTCAGTCAAAGACCGACTTAAAAAAACTAAATATGTATTTTCTCTTTTCTGTTTTTCTTATTAT
TTCTTCTTTATATATAAATATAGGAGCTAATAGTAGAATCTTGATATGTATATTTGTAATGTTCGTTTTC
TATAAGTCTAACTATAAGGTTAATATATATAAATGTCTGGTAATCTCATTTTTTTATTGGTTAATATTAA
TAGGTATAAATGGATTAAGTATGTTATTAGTAGCAACAGTAAGCAATTTGGATAATATGAATGTTTTACT
TAGTGGCAGTTTATATAGATATGAAGCAATATTCTTGGGAAAGATAATGTTAGGTATATTACTTTATGTT
TATAAGGCTTCTTTTAAAAATTTTAAAATAAGTAAAAAAGAGATATACATATGTATTCCTATGATAGCAA
ATTTATTGTCATTTTTTGTACTTTATGATTATATTATTAATCTTGTAAAAATCTCTCCTGAAAGAAGAAC
TGCTTTTTTAGTAATAGTTTTACTATTAATATTATCTAACATTTCAATCTTTGTATTAATACATATAATA
CTTAAGATTAAAATTAGGAAAATAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:2000560-2000958 putative two-component system response regulator () [Clostridium difficile R20291]
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ATTTTATTAATGTTGAATACGAGGATAAACGTTTTTCAATTAATAGTAAAGAAGTTTTGTACATAGAAAA
GCAAGAGTATGAAGTAAAGATTTATACTGAAAGTGGTAATTATGAAGTTGGAGAAAATGCTCCTTGTATA
AGAAAACTATTGAAAGAAGAAAATTTTTTCAAATGCAGTAATAGTTATATTGTAAATCTAGACAAGTGTG
AATTTTATCTCAGCAATAATTGTATTTTTGTGAATAATAATTTTATAAGAATTTTAGGTTCAGAAAGAAA
AAAGAAATTAAAAAAGAAATTAGAAAAATTATATGATTATGAAGATTAA
>ref|NC_013316.1|:2001025-2001522 hypothetical protein CDR20291_1708 [Clostridium difficile R20291]
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GAGATTATAATAAAATGATTGAATTAAAGAATAACTTAGGTATCAGTGAAAGAAAGTTAAAATATCCTTG
TATCTATAAACATTTTAAAGGGAAATATTATGCTACAATGGGTCTTAGCAAGGCTATTGATGATATAGAA
AACATATGTGAAATATATGGTAAAGAAAATTTAATCCAAAACAGAAATAAATATAAATTAGTTATTAGAC
ATACTGAAAGAGAAGAAGATATCTATGTTTATAGGGATTTAGATGGAAACCTTTATCATAAAAAAGAAGA
AGATACTAATGATTTAGTTTTATACAAGACCTTATATGATGATACAGGAATATTTGCAAGACCTTTGGAT
ATGTTTTTAGAAAAAGTAGATACAGATAAGTATGTCAATTCAATTCAAGAATACAGATTTGAAGAAGTAT
ATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2001724-2002365 putative phosphoglycerate mutase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAAATACTTTTTATATAGTAAGACATGGACAAACGGATTGGAATATATTGGGAAAAACACAAGGTC
ATGGTAATTCTGACCTTACGCCTCAAGGTATAGAACAGGCAAAAGAACTTTCTGAAGATATTGGCAAGTA
TTCAATTGATTATATTTTTAGTAGCGACCTTGGGAGAGCAATGCAAACAGCTCAAATTTTAGGAGATAAG
CTCAATATTGAAGTTCAAAAAACTGAGGCACTTAGAGAAATGGGATTCGGAGTTTGGGAAGGCCTTTTAA
TAAAAGAAATTCAAAAAGATTATTCAGATATATATGCAACATGGAGAAATGAACCACACTTAGTAAATAT
ACCAGAAGGCGAAACTCTTAAGATTATAAAGGAAAGAGTAGATGCTTTTATAAAGGAACTAAATGAAAAA
TATGATAATAAAAATATAATTCTTGTTACACATTCAATTACATTGAGGGTTATGTTGTTGTCATTTTTAG
AATCAGGTATGGAAAATATATATAGAATTAAGCAAGATAATACTGCTTTAAATATAGTAGAATTTAAAGA
TTATGGACCTGTTATAGTAAAAATGAATGATACAAGTCATATAAAAAATCATGTAAAGATAAATAATTCT
GCACTGGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:2002389-2003642 hypothetical protein CDR20291_1710 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAAGTTATAGTAGTTGGTGGAGGAGCTTCTGGAATGATGGCAGCTTTGTCAGCTTCAAAAAACA
ATAATGAAGTAATATTAGTTGAGAGAAATGGAGAATTAGGAAGAAAACTTAGGGCAACTGGTGGCGGTAG
ATGCAATTTTACCAATAATAGAGAGATAGAAGATTTTTTTGATAAAGTTGTCAGTAATAAAAAATTTCTC
TATAGTAGTTTCTATACATTTACAAATAAAGACCTTATTTCGTATTTTGAAAGTAGAAATTTGGAATATA
AGATTGAAAAAGAAAATGACCACAAAGTATACACTAAAAATGATAAATCTATAGAAGTAATAGAAGTATT
AAATAAAGATTTACTCAATCACAATGTAAAGATAATGTATAATAAGAAAGTTATAGATATTATAACTGAA
GAAATTGCTCTAAAAGATGATTCTAATAAGGACAAGTCAAAGTATCTAATAAAAGGGATTATTTTAGATA
ATGGAGATAAGATACTAGGAGACAAGGTTATTATATCAACTGGAGGAGTGAGTTATTCAAAGACGGGTTC
AGATGGTTCAATGTATAAGATTCTTAAAAAGCATGGACATACATTAAACAAACTATATCCTGCTTTAGTT
CCACTTACAATAGAGGAAAAATGGATTAAAGATTTACAAGGAATATCCATGAAGAATGTGGAAATATCTT
GTAAGATTAAGAAAAGGAAAATATCAAAATCTGGAGACATGCTATTTGCCCATTTTGGGATAACAGGACC
TTGTGTTCTTATAATGTCTTCTTATATTAACAAGATTATTGAAAAGGAAAAGGTAGAATTAAATATAGAT
TTCTTACCAAATTTAAGTACTGATGAAATCTCTAGTATAATCAGAGCATTTCCAAATAAAAATGTTCTAA
ATAATCTTAAGCAAATACTACCTCAAAATTTCTTAAGAGAGATTTTTTCTCTATTATCTTTAGTTGATAA
AAAGGCAAGTGATTTGTCTAAGGCAGATGAAATTAGAATTATTGAGTATATAAAAAATATGAAGCTAACT
TGTAATGGGACTACAGGTATAAACACTGGTATGGTTACTTCTGGTGGTATTTCAGTTAAAGAAATTAATT
CTTCTACTATGGAATCTAAATTAGTTAAGAACTTATTTTTTACAGGTGAAGTAATTGATATAGATGCAGA
AACTGGTGGATATAATTTACAAATAGCATTTTCAACTGGATATCTTGCGGGTATAAGTGTATAA
>ref|NC_013316.1|:2003688-2004338 cytidylate kinase [Clostridium difficile R20291]
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CAAAAAAGCTAAATATAAATTATATAGATACAGGTGCTATGTACAGAGCAGTTACTTATAAGTGTTTAAA
AAGTGGTGTTGATGTCAATAATGAAAAAGAAGTTATTCAAATAGCTGAAAATTCGGATATAGATTTTAAA
GATAACAATATATATTTGGACAAAGAAGTTATAAATGAAGAAATAAGAACAATAGAAGTAAGCAATAATG
TTTCTAATGTAGCAAAAATAAAAGAAGTAAGACAGTTGATGGTTGAAGTTCAACGAAAAATAGGAATGAA
AAGTTCAGTAATACTAGATGGTAGAGATATAGGTTCATATGTTTTCCCAGATGCAGATTACAAATTCTTT
TTAGTAGCTACTCCAGAAGAAAGAGGAAATAGACGCTATAAAGAACTTTGTAATAAAGGATATAATACTA
CTTTAGAAGAAGTAATTGAGGATATAATAAGACGAGATGAAATTGATTCAAATAGAGAATTTGCACCATT
GGTAAAAGCTAATGATGCACTAGAAATAGATACTACAGGAAAAACTATAGAAGAAGTTGTAGAAGAAGTT
GTATCTAAAATAAATCTTTAG
>ref|NC_013316.1|:2004389-2004985 putative acyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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TAGGTGCAGAGAATATTCCAGATAGAGGAAATATAGTAATAGCATCAAATCATAAATCGAATCTTGACCC
TATATTCTTGGCTGCTGCCATAGAAAATAGGGAAATAGCTGCAATTGCAAAGAAAGAATTGTTTAAAGTA
AAGCCATTGGGATTTATATTAAAAAAATTGCATGTTATGCCTATAAATAGAGAAAAACCAGATGTATCTA
CAATAAAAACTATTTTAAGGTCAGTTAGAGATGGTTATGTATTAGGAATATTTCCAGAGGGTACTAGAAT
AAAAGGAGATTCTTTTGGTAAGGCTAAGGCAGGTCTTTCTGTATTTACAATAAAAAGTAAATCTAAAGTT
GTTCCAGTATCAATAATATCTAAATATAAACTTTTTAGTAAAGTAATTGTATATATTGGAGAACCAATAT
CATTTGAAGAACATTTTAAGGAAAAATTGAGTAATGATGACCATGAAAGGATATCACAAGAGATTTTAGA
AGTGATAAAACAAAATTACTTTAAATATTCAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2004998-2005837 putative 4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase [Clostridium difficile R20291]
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ATGAAGTTGAAAAAAATGATTCTGGCATATATGCTTTAGGTCCTCTTATTCATAACAAGCAAGCAGTAGC
AAAATATGAAGAAAAAGGTCTTAAGACTGTGAATGAAATTGATACAATACCAAATCATGAAAATATGATA
ATAAGGTCTCATGGAGTTCCTGAAAATATATATAAGGAAGCCAAAGATAAAAAATTAAAAATTGTGGATA
CTACATGTCCATTTGTAAAGAAAATACATACAGTAGTAAGTGAATATCATAATAAAGGCTATGAAATAAT
AGTTATTGGAGATATGAAGCATCCAGAAGTTATAGGTATAAATGGATGGTGTGAAAATTCAGCTATAATA
ATAAAGACCTTAGAACAAATGGAAAATATGGAATTTAATAACTCCAAAAAATATTGTCTTGTTGCACAGA
CTACAATAAATCCAGAGTTGTATATAAGTATAGTTAATAAACTATCAGATAAATTAGAAGAAATAGTATT
TAATGATACAATTTGTTCAGCTACAAAAACAAGACAAGAATCAGCTAAAGAGTTAGCTAAAGAAGTTGAT
TGTATGATAGTTATAGGAGGTAAACACAGTTCAAATACTCAAAAGTTAGTAAAGGTTTGTGAAGACTTAG
TACCAACTTTTGCAATAGAGACTAAAGATGAATTGGATGTAAATACGCTTAAAAAATATAAAAATTTGGG
TATTACAGCAGGGGCATCTACACCTAATTGGATAATAGAAGAAGTTGTAACATTCCTTGAAAATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:2006151-2007236 hypothetical protein CDR20291_1714 [Clostridium difficile R20291]
TTGTTATTTGGATATATTAATTATAAAACTAGTGGAAATTTTACTAATATCATATCAAAAAACAGAAAAT
TTCAACCCTTAATAGGTGCTTTAATTGGAGCTATACCAGGTTGTGGCGGAAGTCTGGCAATAATGCCATT
GTATATAAATGGAAAATTAAGCTTTGGAGCAATAATTGCAAGTTTAATAGCTAGTATGGGAGATGCAGCA
TTTGTACTTATTTCATCAAATATTAAAATGTATTTTTTTGTCACTATAGTTAGTACAATTACAGGAATAA
TAACGGGACAATTAGTGGATTACTTTAAACTAGAAGAAAAATTAGGGTTAAAAAACCGTAGAAAATCAGA
TAAATATGATATAAGTAAAAATAACCCTAAAGAAAATAAAGAACAACATAATCATGATGAAATAATTTTA
GACACTCTAGCTAAATCTCATGGAAATACAAATAGACTTGCATTTATAATAACACATGGAAAGGGATATA
AATTTTATATAGGAATTATAGTAATCGGTTTTATATTTATGTCACTTGCTCACTCTGGACTTAATCTTCC
TATAATTGAGAAGTTACATTCATTGGAAGAAGTAATAGCAGTGATTGGAATATTATTTTCAATAATTTAT
ATGTGGTGTTTTAAAAAGGTATTTAAAAATTCTAATCAAAAAGAGGAAGAAAATAAAAAGATTTCTTTGC
GAGAAATGCTTATCCATTCTGTTGGAGAAATATCATTTGTAATTACATGGATTTTTATTGCATATCTTAT
TTACGATTTGATAATATTAATTTTAGGTGGAGATGAATACTTAGTTAAACTAGTATTATCAACAGGTGTA
ATAAGTGTATTTATAGGTGCAGGTCTTGGACTTATTCCAGGTTGTGGGATACAAATTGTGCTTATGTCAT
TTTATTTGAAGGGAACTATACCACTTGGTGCAGTGATAGCCAACTCTATTTCTCAAGATGGAGATGCACT
TTTCCCACTTTTAGCAATGGATAAAAAATCTTCTTTATGGGCTATGATTATTACTACTATACCAGCAATA
CTTGTAGGTATGATAGTTTATGCATTTTTAGGTTAA
>ref|NC_013316.1|:2007542-2009239 adenine deaminase [Clostridium difficile R20291]
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GGACAATCATAAATGTATTTACAGAAGAGTTAATAACAGGAGATGTAGCAATAGTAGGAGACACTATCGT
TGGCATTGGCGATTACAAGGGCAATGTAGAAATTGATTGTAGCAATAAATATATATCACCTGGCTTTATT
GATGCACATATGCATATTGAATCTACAATGGTAATGCCAATTGAATTATCGAAAAAATTATTAAAATCAG
GTACGACAACTATCATAGCCGACCCACATGAGTTGGTCAATGTAAAAGGAGCTAGTGCAATAGATTTTTT
ATTAGAATCGACAAAAGATATACCACTTAATGTATATATTATGGTGCCTTCATCCGTACCTGCAACAAGT
TTTGAAACTAATGGAGTTGGTAAATTTAGTGCAAAAGACATGGAGAGTTATGTAAATAATCCTAGAATTT
TAGGTTTAGGAGAGGTAATGTGTTTTAATGATGTTATAAATTCTGAAAATGAAATCTTGGATAAACTAGA
GCTTTTTAAAAATAAAGTTGTAGATGGACATGCACCTAATATAAATGGTAAATCACTTCAGACATATGTA
TGTGCAGGAATAGAAAATGACCATGAATGTATAACTTTTGATGAAGTATATGAAAAATTGAGAGCAGGAT
TAAAAATTTTAATAAGAGAAGGAAGCGCAGCAAAAAATTTAAAGTCTATAGTAAGTGGTATGCTAAAGCA
TAACTTGCCAATTGAAGAATTTATGTTTTGCACAGATGATAAGCACTTAGATGATATAGAAAAACAAGGT
CACATAAGATGGAATATAAAATGTGCGATTGATTTAGGTATGGAACCTGTTAGGGCTATAAAAGTTGCAA
CTTATAATTCTGCAAAAGCATATGGGTTAAGGAAAATTGGAGCAATAGGTGCGGGTTATAAGGCAGATAT
TGTTGTATTGAATGATTTAGACAAAATGGAAGTGGATAGTGTATATAAAGATGGTAATTTGGTAAACGAA
GAGATGTTTTCTAATTACAATTATGAGATTAAAGATAAAGAATTGCTTAATACAGTCAAGTTTAAGTATA
TTAATAAAGAAAAAATACAGTTAAAAGTAAGTGAAAAAAATTATGTAATGGAGATTGTACCTTATCAAAT
TTTGACAAATAAGGTATATGAATCTTTACCATGTGCAGATGGATATTTTGTTCCAAATAAAGAGTATTCA
AAACTTTGTGTTGTTGAGAGACATAGAATGACTGGAAATGTAGCAATTGCTTCACTAAAAGGATTTGGCA
TAAAAAATGGAGCAATTGCTACTACTGTGGCCCATGATTCTCATAATATTATAGTTGCAGGGGATAATGA
TGATGATATTCTAGTAGCTATAAATTACTTAAAGGAAATACAAGGTGGTTATGTAATTGTATCAAATGGA
AAAGTTCTTGCACACCTAAGTCTTCAAGTAGCTGGATTAATTAGTACTTTTACAGCTGAAGAAGTACAAG
AAATTACTGATAATATGTTGGAGATAGCAAGAAAAATGGGAGTTCCAGAGTATGTAGACCCTTTTATTAC
ACTTTCTTTTATGGCACTTCCAGTTGTTCCACAAATAAGACTTACAGATTTAGGTCTATTTGATGTTGAG
GAATTTAAATTTATATAG
>ref|NC_013316.1|:2009591-2010055 putative thiol peroxidase (bacterioferritin comigratory protein) [Clostridium difficile R20291]
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CAGATTTTAAAGGCAAAAAAGTAGTAGTATATTTTTATCCTAAAGATAATACACCAGGATGTACACGTCA
AGCTTGTGCTTTTAGAAATGCATATGATGGATTTAAAAAGGAAGATATACAAGTTATTGGGATAAGTAAA
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ACTTAGTTGCTATAAAAGCTTTTGATGTATGGAAAGAGAAAAAAATGTATGGAAAAACTGCATTGGGAGT
TGTACGTGCGACATATATTATAGATGAAAATGGAATTATTGAAAAAGTCTTTGAAAAAGCAAAACCAGAC
ACAAATGCACAAGAGATTCTTGAATATTTGGAAAAACAGGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:2010065-2010808 hypothetical protein CDR20291_1717 [Clostridium difficile R20291]
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CTTGTTTTATAGATAACACAAAAGAAATAGTGGAAAATATAAAGACATTTGGTATAGAAGATTTTAAAAA
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GGAAAGATGAAGAGTTTGCAAATAGCTGTATTCGAATCATAAGTGGATTGTATGGTGTTGTAAAACCATA
TGATAGTATATATGAATATAGATTAGAAATGCAGACAAAATTACGAGTAGGTGAGTTTAAGAATTTATAC
GAATATTGGGGAAATCGTATATATAAAGAACTAATCAAAGAAAAAACAGCTATCATTAATCTTTCATCAA
ATGAATACAGCAAGTCCATAGAAAAATTTATTAAAGATAGTGATACATATATTACATGTACTTTTAAAGT
AAATAAAAATGGCATATTGAAAGTGGAATCTACACAAGCAAAGAAAGCTAGAGGTATGATGACAAAATAC
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AAAACTTATCTAACAATAGTGAATACATATTTGTAAAAGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:2010936-2013593 putative cations-transporting ATPase [Clostridium difficile R20291]
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CAGAGGAGGGGCTCACCGATACCGAGGCGGAAAAACGGCTTAAAGAGAATGGCTTAAATGAACTTAGAAA
AAAACCACCTAGAACAACTTTACAAATGCTTTGGAGTCAAATTACAGATGCTATGGTTATGATACTAATA
GGAGCAGCAATATTATCTTTGATATTTGGCGAATTTACAGAAGCTTTTGTAATACTAATAATTGTAACAG
TAAATGCAGTTATTGGAATTGTTCAAGAGAAAAAAGCAGAATCATCATTAGAAGCATTAAAAAATATGAA
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GATATTGTTTTTTTAGAAGATGGAGCTATGGTTCCAGCAGACCTTCGTTTAATAGAAACATCAAGTTTAA
AAATTCAAGAGGCTTCTTTAACAGGAGAATCTGTTCCATCAGAAAAAGATGCAGATACAATCTTACCTAA
AGAATGTGTATTAGGAGACCGTAGCAATATGGCGTATACATCTTCAATAGTCACATATGGTAGAGGTGTA
GGTGTTGTAGTAGCAACTGGTATGGATACAGAAGTGGGTAACATAGCACATCTTTTAGATTCACAAGATG
ATTTTGATACTCCTATAAAACGTAAACTTAATACTGTTGGAAAGACATTAAGTGTCATAGGTATTATTGT
ATGCGTTGTTATATTTGCAATAGGTGCATTTTATCAGAGACCTCTCTTGCCAATGTTTATGATTGCAATT
TCCCTTGCCATATCAATTATTCCAGAGGGATTACCTGCAACAGCTACTATTGTAATGGCTTTAGGCGTAC
AGCGTATGGCTAAAAGAAATGCTTTAATTAGAAAATTACCTGCTGTTGAAACATTAGGAGGAGCTACAGT
AATATGTTGTGATAAAACTGGTACATTAACCTTAAATAAAATGACTGTTACACATATTGCTGTCAATGGA
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TTGTTTATGCTGGTGCACTTTGTAATGATGCATGTATTAATCCAGATAAAACAGATGAAATATTAGGTGA
CCCAACAGAGGGCGCATTAATTTTTATGGCCAAAAAATTTGGAATAGATCAAGAAGCTCTTGAAGAAGAA
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AAAAGATTATTGCTTATACTAAAGGAGCAGTAGACGAAATTCTCGACCTATGTACTAAAATATTAACTTC
AAAAGGTGAAAGAAACATTACCGAAGTGGATAAAAAGAATATACACGAATTATGTCTTAACATGTCTAAA
GATGCATTGCGTGTACTTGGTTTTGCTAAGCGTGAGATTTCATCTATACCAAAAGAAGATAGTGAAAATA
TAGAATATGATTTGACATTTATAGGTATGGTTGGTATGATTGACCCACCAAGAACTGAGGTAATTGATGC
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ACAATCGCTCATGAGTTAGGAATATGGAGTGAAGAAAATACTGTGATATCTGGTGATGAACTTGATAATT
TTAGTGATGATGAACTAGATGAAGCTGTTAAAAATACTACAGTATTTGCTCGTGTGTCCCCGTTTGATAA
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CTTCTGACATGATTTTAATGGACGATAGTTTTACAACAATTGCTTATGCAATAAAAGAAGGTAGACGTGT
ATATAGAAACATACAAAAAGTTATACAATTTTTGCTTGTTGGTAATATAGCAGAGATACTTACGTTGTTT
GTAGCAATATTATTAAATTGGGATACTCCGCTTCTTGCTGTTCATATTCTATGGGTAAACCTTGCAACTG
CTACGCTTCCAGCCCTTGCTCTTGGAGTTGACCCACCAAGCAGAAATATAATGAAGCACCAGCCAGTGAA
ATCAACCACTTTGTTTGAAAAAAATCTTATACAAAGAGTTGTTACCCAAGGTATATTTGTGGCAATAATG
ACTATTTTAGCATATAAAATTGGTCTTAATATAGAAAATCATTCTGTAGGTCAAACAATGGCATTTTGTG
TATTAGCATTTTCACAGATGTTACGAGCATTTAGTCAGCGTTCAAATACAGATTCAATGTTTAATAGAAA
TAATGGTAAAAATCCATTTCTTTTAATCTCATTTTTAACTTCTGCATTTTTAATAGCAGTAATACTGTTT
GTACCTGTTTTTAGAAATGCTTTTAACTTAACAGTTTTAAATAACTTAGAGTGGCTTATAACGATTGTTT
TAGCCATAATGTCTGTAATTCAAGTAGAGGTTGGGAAAATTATTAAAAGAAAAAAAAGAAAAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:2013859-2015124 putative O-acetylhomoserine sulfhydrylase [Clostridium difficile R20291]
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CTTTATATCAAAGTACAACTTTTAAATATAGCAGTATAGACCAACTTGCTGAATTATTTGATTTAAAAGT
TGATGGACATATATATTCAAGAATAAGCAATCCTACTATTCAAGCTTTTGAAGAAAAAATAAGTTTACTA
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AAAAAATAGCAAATGTAGCTAAGAGAATTAATGTTCCATTTATTGTTGATAATTCATTAGCATCTCCAGT
GCTTTGTAACCCTTTAAAGTATGGAGCAAATATAGTTACTCATTCTACCACAAAATATTTAGATGGGCAT
GCTTCAAGTGTTGGAGGAATTATAGTGGATGGTGGAAACTTTAACTGGGATAATGGAAAATTTCCAGAAT
TAGTTGAGCCAGACCCAACATATCATGGAATAAGCTATACTCAAAAATTTGGAAATGCCGCATATGCAAC
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TTAAATGTTGAAACACTACATCTTAGAATGGAGAGACATAGTGAAAATGCACTTAAAATAGCTAGATTTT
TAGAAAAACATGAAAATGTAGATTGGATTAATTACCCAGGACTTGAAGATAACAAGTATTATGAGAATGC
CAAAAAGTATTTATCAAGAGGATGTAGTGGTGTTTTATCATTTGGAGTAAGAGGTGGGTTAGAAAATGCC
AAAAAATTTGTGGAAAAATTACAGATAGCATCTTTGGTTACACATGTTTCAGATGTAAGAACTTGTGTTA
TACATCCAGCTTCAACTACTCATAGACAATTAACAGAAGAACAATTAATTGCATCTGGAGTATTGCCTTC
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TTCTAA
>ref|NC_013316.1|:2015154-2016044 homoserine O-succinyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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GTTGAATTTATTAAAATTTCAACAAGAGAAAGTAAAAGAAGTTGTAATGAATATGTTAAAGAATTTTATA
AAACATTTGATGAAGCCAAAGGAGAGTATTTTGATGGCTTTATAATAACAGGAGCTCCAGTTGAACAAAT
GGAGTTTGAAGAAGTTGATTATTGGAATGAACTAGAAGAAATTATGGATTATTCTAAGAGAAAAACTAAA
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CATTCAGAATTGTTGTTTAGAAATTGGATAAAAAACTATTTGATACAATAA
>ref|NC_013316.1|:2016535-2016978 MarR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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TAAAAGTTACAAATAAATCATTGGATATACAAGAACATATTTCAAGTAGTATTTTTGATAGTTATTTTGA
AAATATGACCAGTGAAAAATTGCAAGATATGGAAGATATAATAGAAGGTTTAGAGAAATTAAATAAACTT
TTAACTTACATTGATTGCAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2017009-2018826 cell division protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGATGAACATAAACCCCAAAAAAGGTCAGCACTCTATTATTATACAGTTATAATAATAGTAGTAATGT
TTTTAAATGCTTTAATATTTCCAAGTTTAATGGATAAAAAAATGGTTGAGATTGACTATGGAAAGTTTCT
CACAATGTTGGATACAGGAAAGGTTAAATCTGTTGAGATAGAAAATAATAGAATAGCAATAAATCCATCT
AGTAGCAAGGATAAGAATATATACATAACTGGTAGAATGGATGACCCAGAATTGGTAGATAGACTAAAAA
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GATAATACCTATAGGTATTCTTATGCTATTTGGTAACTTAATGATGAAGTCTATGCAAAAGCGAATGGGT
GGTAATGCTATGCAATTTGGAAAAAGCAACGCCAAAATGTATGTATCTGCTCAAAGTGGAAAAAGATTTA
ATGATGTAGCTGGTCAAGATGAGGCAAAAGAAGCTTTAACTGAAATAGTAGATTTCTTACACAATCCAGA
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ACACTCCTTGCAAAAGCTGTAGCAGGTGAAGCAAATGTACCATTTTTCTCAATATCTGGTTCTGAGTTTG
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ATGTATAGTGTTTATAGATGAGATTGATACTATTGGTAAAAAGCGTGATAATGGAAGTGGATTAGGTGGA
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TAGACGTATACCAGTTGAACTTCCAGACCTTGGAGGACGTGAAGCTATATTAAAGGTACATGCTCAAAAT
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>ref|NC_013316.1|:2019004-2021706 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
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CTACTTGATGGCTTGGAAATTCTTCCTGTAAAGGAGATAGAATATAAATCTATAAAACTAAAAGAATTTG
ATTTAGATGCTGCTTTAGCAAGAAAACCAGAAGTTATATTAGTAGATGAATTTGCCCATTCTAATGTTGC
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TCTTGAAAGGTTCAATGAAGGTAAGATATATAAGAAAGAACAAGCTACTAGAGCAAAAAATAATTTTTTT
ATAAAAGATAACCTGGTTGCACTTAGAGAAATCGCACTTAGAAAAACAGCAGAGAGAGTTAATAAAGAAG
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AAGTCCATCTCCATCTTCAGCAAAAGTTATTAGAACTGCATCCAGAATATCAGACAGTACATTTGCAAAA
TGGATAGCTTTATATGTTGAAACTCCAAACACAGCAAGACTTCCATTTGATGAACAAAAACAACTACAAA
ATAACCTAAAATTAGCTAAGAAATTAGGTGGAGAAATAATTGTTTTACATGGTGAAAATATAATAGAGCA
AATACTTAGAATTGCAAAACTGAGAAATGTAACAAAAATTGTAATAGGTAGAAATCATTCAAGTAATAAA
AGATTTAGTAAAAGATTTAAAAAAGATATAGTTGACAAATTAATTGATGAAGTTGATTATATAGATATAC
ATATAATTCCATATAAATTTGCCTCAGATGTTAAATACAAACCTAAAAAGGATAAATCATCAATAAAATC
TAAATTTAAAATTAGCAAAGTTGATTTTATAAAACTTATATTTATTACTTTGATGATAAGTATTTTAGCA
TATGCAGTACAAAGCATGGGATTTATAAGAGAAAATATATTGTTAATATATATGTTGGGTGTAGTTTTAG
TTTCTATGTGGACTAAAGGGTATAGTACAGGTATAATAAGTTCTGTATTTAATATAGTTCTTTTAAATTA
TTTTTTTACAGCACCATTATATACATTATCTATAGCAGATTCAAACTATATAGTAACACTGGTTGTATTC
TCAATAGTAGGTATAATAACTAGCACTCTTACGTCTAAGATACAGCATGAAGCAGAAACTGCTGCTAAAA
GAGAAGAAAATACAAAAATGATATATCAAATAATTAAGGGATTTTTAAGATTATCAAGTAAAGATGATAT
AGTAAACAAAGGTATAGAACTTTTGTCTCTTAGCTTAAGTAGAGATGTAATTTGTTATTTAAATGTAGAT
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TGGTTCAAAGGGATACTATATACCAATTGTAGGAATGAATTTAACTTTAGGAGTAGTAGGAATATCATGT
ATTGATTCAAAATTGGATACAGAAGATATAAGCTTAATTGAAACAATAATTGCTCAAATGGCAATAGCGC
TTGATAGAGAAATCTTGTCAGAAGCTAAAGAAAATACCAATCTTGAGATTGAAAGGGAAAGATTAAGAAG
TAATCTTTTAAGAGCAGTTTCGCATGACCTTAGAACTCCACTAGCAGGAATATCTGGTGCAGTAAGTACA
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CTCAGTGGTTAATAAGACTTGTTGAAAATTTACTTAGTATGACCAAGATAGATGAAGGGAAATTGGAAGT
TAAAAAACATTCTGAACTGGTTGAGGAAATTATATCAGAAGCGTTACAAAAAATAAAAAAAAGAATTGAA
AATGCACTTATAGATATTAATATACCAGAACAGATATTATTTGTTCCTATGGATGCAAAATTAATAGAAC
AAGTTTTAATTAATTTAATAGATAATTCTTTGAAATATTCAAAGGAAGATTGTAAGATAGAGATAAATGT
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AAGCATATCTTTGACAGATTTTTTACTGGAGAAGAAGGAGCTAAAGATTCCAGAAAGGGTGTTGGACTTG
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GGGTTCAACTTTTAAGTTTAGTTTGCCTAAGGAAAATGAATAG
>ref|NC_013316.1|:2021740-2022438 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
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TAACACAGGATTATGATGTCAAGGAGGCTATAACTGGAAAAGAAGGTATATCTATTGCTGTCTCATATTC
TCCAGATGTTGTTCTTTTAGATTTAGGCTTAGAAGATATGGATGGAATAGAGGTAATAAAAGCTATCAGA
CAATTTTCAAATATACCAATAATTGTAGTTTCAGCTAGAGAGCAAGATAGAGATAAGGTAGAAGTATTTG
ATGCAGGGGCAGATGATTACTTAACAAAACCATTCTCCATAGTAGAGTTATTAGCAAGAGTAAGAGTCGC
ATTTAGACATTCACAAGTAGAAGCTCAACAAAAAGATGATGTTAAATCTACGTTTGAAGTAGATAAATTA
TTGATTGATTTTGATAAAAGAAAAGTTATTGTTGATGATGTTGAAGTCCATTTGACACCTATTGAATATA
ATATTCTTTCATTACTTGCAAAGCATCATGGAAAAGTGCTTACTCATAATTTTATAATAAAAGAAATATG
GGGTAGTGTTATAGGGAATGAGACTAAGTCTTTAAGGGTCTTTATGGCAACATTAAGACGAAAAATAGAA
AAACAACCTGCAAACCCAAGATATATAATTACAGAAGTTGGTGTAGGATACAGATTAAATGATGAATAG
>ref|NC_013316.1|:2022777-2023733 putative cation transport-related, membrane protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTATATACTGAATTTAAATACAAGAGAGACTATTGAAGATTTTAGAGATAAATTTTATGTAGCAGAAA
ATTCTTATCTTATATTAAGTGCTCCAAAAAATTTAAAATTGCTTAAGGAAACTTTGGATATAGATGAAAT
AACTTTTAATGATTGTCTTAAATTTGATGAAATAACCAAACTTGATTTATTTGATAATTACGATTTTTTA
AGCCTAAATACATTTGAACTAAGAGATGGAGAAGCTGTTATAGAAGAAGTAAATATGTATTTATCAGATA
ATTTTATATTGGTTGTAGTGAATGAAGAACACTTTTTATTTGAATTTGTAAAAAATATTATTTTGAAGAA
CTCTCAACTTGAAAAAAATCCAGTTATTAATCTATTTAAGATAAACTACTTGATTCTTAGAGAAGTTATA
AAAAATGGTTTTGAGTCTTTGGAAAAAGTTGAAGAGTTAATTCTTCAAATAGAAGATGAAATGATGGACA
ACATTAATAAGAATCATGTATCTAGAATAAGTGATGTAAGAGGATTAACAAGAATTATAGTTAAGAATAC
TAGACCTCTTTTGTATATTGGGGATAGAATAGTTAAGGAAAATATAAGATATTTAAAATATTCAAATGTA
AAAAAATATAATTTAGAAAATTTTCAAGGTATAGATTTTGGAATTGACAAATTATACAATTTCGCATTGT
CAACACGAGAGTTAGCAGATAAATTATTAGATATTTATTCTTCCAGAGTAGGTGAGAAAACAAATAACTT
AATTACAAAATTAACCTTGTTAACAGCCATATCAGCACCACTTACAATTATAACTGGTATATATGGAATG
AACTTTAGATATATGCCAGAATTAAACTGGATTTATGGATATCCAGCAACTTTATTTTTTATGCTATGTA
TAATTTTTATTGGAATTATAATATTTAAAATAAAAAAATTATTGTAA
>ref|NC_013316.1|:2023910-2024065 hypothetical protein CDR20291_1726 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGGAATATTAAAAGAACTAACAGCAAAACTTTATAGCTTTTTTTACTTTATGTTCTGGGGCTTTT
ATTTTAGCGCTGGCTATTTCTTTTACAAAAATATATGTACTTCCTTTCTGGTGAGGCCTTATTTTAGTGA
TTTTGAGCATAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:2024195-2025208 putative chorismate biosynthesis-related protein [includes: phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase and chorismate mutase] [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGTAGTATTAAAAATGGGAGCAGATAAAAATGAAGTTAAAAAATTAATTGAGGCTATTGGGAGAG
AAGGAGTAGAAGTTAATCCCATAGATGGAACAGAATTAACTGTTTTAGGTTTAGTTGGAGATACTAGTAA
AATAGATGCCAAAAGAATAGAAGCAAATAAGATAGTTGAAAAAGTTATGCATGTAGTAGAGCCTTTTAAA
AAGGCCAATAGAAAATTTCATCCAGAACCTTCAATCATAAATGTTAATGGAATGGAAATTGGTTCAAAGA
AAATTGCTATGATAGCTGGGCCTTGTTCTGTTGAAACAGAAGACCAAATAGTATCTATAGCTAAAGATGT
GAAAAAATCAGGTGCAGGATTTTTGAGAGGTGGAGCATTCAAACCAAGAACATCACCATACGCTTTCCAA
GGATTGAAATATGATGGATTGGATTTATTAAAAAAAGCAAAAGAAAAAACAGGGCTTCCTATAGTTACAG
AAATAATGTCAACACAAGATATAGATATATTTGAAGAAAATGTAGATGTAATTCAAGTTGGAGCTAGAAA
CATGCAGAACTTTGATTTATTAAAAGAATTAGGTAAAACAAATAAAACAATACTTTTAAAAAGAGGATTA
TCTGCTACAATTGAAGAGTGGCTAATGTCAGCAGAGTATATAATGGCTGGAGGAAATGAAAATGTAGTTC
TTTGTGAAAGAGGTATAAGAACTTTTGAAACATATACTAGAAATACTTTGGATTTAAGTGCAATTTTAGC
TGTGAAGAAACTTAGTCATTTACCAGTTATAGTTGACCCAAGTCATGCAGCAGGTAAATCATGGATGGTT
GACTCTTTATCTAAGGCAGCAATTGCAGTTGGAGCAGATGGTCTAATAATAGAAGTTCATAATGACCCAG
CACATGCACTTTGTGATGGAAAACAATCGATTAAGCCAAATGAATATGATGAATTGATAAGTGAATTAAA
GACTATCGCATCAGCAGTTGGTAGAGAAATATAA
>ref|NC_013316.1|:2025230-2026294 3-dehydroquinate synthase [Clostridium difficile R20291]
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AGAATATAGGAGAAGAAATAAAAAAAATATATTTTGGAAATAAGATTTTTATTGTAACTGATGAAAATAT
AGCAAAATTATACTTGGATAAAGTAAAAAATAATTTAAGTGAATCTGGATTTGAAATTAAATCTTTAATA
TTAAAATCTGGTGAAGAAACAAAATCATTTAATACTCTTCCTAAAATATACGATAGTTTACTTGACTTTA
AGTTAACTAGAAAAGATTTGATTATTACTTTAGGAGGAGGGGTAATAGGTGATTTAGGTGGATTTGCAGC
AGCAACTTTTTTAAGAGGTATAAGTTTTATTCAAATTCCAACATCTTTATTAGCACAAGTTGATAGTTCT
GTAGGTGGAAAAGTTGGAGTTGACCTTGAGAGAGGCAAAAATTTAGTGGGAAGCTTTTACCAACCAAAAG
CTGTGTTTATCGACCCAAATGTATTATTATCACTTCCAGAAAAATTCTATAGAGATGGAATGGCAGAAGT
TATAAAATATGGATGTATAAAAGACAAAACTTTTTTCAATAAACTTTTAAGTTTAAAAAATAGAGAAGAA
GTAATGCAACATATAGAATACATTATACATAAATGTTGCTTTATTAAAAAAACTGTAGTTGAAGCTGATG
AAAAAGACTTTGGAGATAGAATGCTTCTAAACTTTGGCCATACATTAGGTCATGCTATTGAGAAATACTA
CAATTTTACGGGTTATACCCATGGAGAAGCTGTTGCCATAGGAATGTATAAGATAACTTTAGAAAGTGAA
AAGATAGGAATTACAAAAAAAGGTACATCAGAACTTATAAAATCAATTTTAATGAATTATAATTTGCCTT
ATGAGATTGAATTAAGAGATAATAAATCTATAGTAGATGCTATATCTCTTGATAAAAAAAATCTAGGTGA
TACATTAAAAATAATACTTTTAAAAGATATTGGAGAGAGTATTATATATAATACTACTTCTAAATTTTTT
CAGGAGGTAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:2026294-2027607 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAAGTCTAAAAATATATCCAAGTAAATTATCTGGAGATGTAAAAATACCACCATCAAAAAGTATGG
CACATAGGGCAGTTATTTGTTCATCTCTAAGCAATGGAAAAAGTAGAATTTCTAATATAGATTTTTCTGA
TGATATAATAGCTACTATAAGAGCAATGACATCATTAGGAGCTATTATAGAAAAGAAAGAAGATATTTTA
GAAATTTCGGGAATTTTTTCTAAAGAAGGTATTTTAAATAGAGAGAATCAGTTGAATCAACCTAAATTGA
CAATAGATTGTAATGAATCAGGCTCTACATTAAGATTTTTAGTACCTATATCTTTAGCATTTGATGGTGT
AAAAAGGTTTATAGGTAGAGGTAATCTTGGAAAAAGACCACTTGATACTTATTATGAGATATTTGACAGA
CAGAATATAAAATATAGTTACAAAGAAAATCAGTTAGATTTGATTATATCAGGTAAGCTTAAACCAGATG
AATTTAGAGTAAAAGGAAATATAAGTTCTCAGTTTATCACAGGTCTATTGTTTATATTGCCTACACTAGA
GAGTGATTCAAAGATAATAATTACTACTGAGCTAGAATCTAAAGGATATTTAGATTTAACTCTTTCAACG
ATAAAAGATTTTGGGGTAGAAATTATAAACAATAACTATAAAGAATTTATTATAAAAGGAAATCAAACGT
ATAAAGCGAGAGATTATAAAGTAGAAGGAGATTATTCTCAAGGAGCATTTTATTTATCAGCAGATGCTAT
AGGAGAAGATATTAGCATATTAGACCTTAAAGAAGATTCTCTTCAAGGGGATAGTGAAGTAGTTGAAATT
TTATCTAGGATGGGAATGGAAATATTAAGAGAAGGCAACAAAATAAAAGGAATAACAAATGGTTTAAATA
GTACTTTGATAGATGCATCTCAATGCCCAGATATAATACCTGTATTATCTGTAGTAGCATCCTTAAGTAT
AGGGAGGACTACAATAATTAATGCTGGTAGGCTTAGAATTAAAGAATGTGATAGACTTCATGCAATAAAT
GTTGAGTTAAGTAAACTTGGAGCAAATATAGAGGAGAAAGAGGATAGTTTGATAATCGAAGGAGTAAGCA
AGTTAAATGGTGGAGTAGAGGTGTGGAGTCACAAAGACCATAGAATTGCTATGACACTTGCAATTGCTTC
TTGTAGATGTGATAAACCAATAATATTAAAAGATTTTGAGTGTGTATCAAAATCTTATCCACATTTTTTT
AAAGATTTTAAGATGTTAGGAGGTCGAATTGATGAGTGGAATATGGGGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2027582-2028664 chorismate synthase (5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate phospholyase) [Clostridium difficile R20291]
TTGATGAGTGGAATATGGGGAAATAATTTAAAAGTATCAATTTTTGGAGAATCTCATGGAAATGCTATAG
GTATAAATATAGATGGTCTTCCTTCGGGGATTGAACTTGACCTTGATAAGATTGATAAAGAAATGAAGAG
AAGAGCACCTGGAAAAAATTCTATATCTACTTCAAGAAATGAAAGTGATATACCAGAAATTCTAAGTGGA
TATTTTAATGGAAGAACTACAGGAACGCCATTATGTGCAATCATAAGAAATAGTGATACTCGTTCAAAAG
ATTATGGAGAGCTTAAAAATTTAATGAGACCAGGACATGCAGATTTCACAGGTAATGTGAGATATTCTGG
ATTTAATGACTATAGAGGGGGAGGTCATTTTTCAGGTAGGATAACAGCTCCATTAGTATTTTGTGGGGCT
ATATGTAAACAAATTTTATCACAAAAAGGAATAGAGATAGGAGCACACATAAAAAAAATTAAAAATATAG
AAGATATGAGTTTTGATTATGTAAATATTTCAAAACAACAGTTATCAAATTTGCAAACTTTGGAACTACC
TTTACTTGATTTATCAAAGGAAGAAGCCATGAAAAATACGATTATAGATGCAAAAAATCAAAGAGATTCA
GTTGGTGGTATAATTGAGTGTGCAGTAGTAGGTATTAATGTAGGGCTTGGAAATCCATTTTTTGACTCTG
TTGAATCTACTTTATCACATTTATTGTTTTCTGTTCCTGCCGTAAAAGGTGTAGAGTTTGGTTTAGGTTT
TGAACTTGCAGATATGTATGGCTCTCAAAGTAATGATGAAATGTATTATGAAGGAAATCAAGTTAAGAGC
AAAACAAATAACAATGGAGGGATTATAGGAGGGATTACTACTGGAATGCCAATAATTTTCAAAGTGGCAA
TTAAGCCAACTCCTTCAATTAGCAGACAACAAAACACAGTTAATATAAAAGATAAAAAGGACGATATTTT
ATATATTAAAGGCAGACATGACCCTTGTATAGTTCAAAGGGCTATACCTGTAATAGAAGCAGTAACAGCC
ATTGGAATTTTTGATTTGATGAAAGGACGATAA
>ref|NC_013316.1|:2028667-2029863 P-protein [includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase] [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGATTTAACGAGATATAGAAATGAGATTGACAATATAGATAAAGAGATTATTCAATTATTTGAAA
AGAGAATGAATACAGTTCTTGAAATTGCCAGACATAAAATGAAAAATAACACTACTATACTTCAAAAAGA
TAGAGAAGAAAAAGTACTAAGTAGAGCCATAGATAATTTAGATAATAAAGCATACTCACAAGAAACGGTA
CAGTTTTTTAATTCTATAATGGAAATTAGTAGAGGATTACAAAAAAGATTGATAGATAATGATGGTGAGC
AGAAAATCGAGTTTAGTTTAGATTCATCAAATAAGAAATTTGATTTGTCAAATGTAAATAAATATAAGTC
TTTAAAAGATGAATTAAATAAAAAAAATATCCTAGTAGGATTTCCAGGAAAATCAGGTTCATTTACAGAA
GAAGCACTAAATAAATTCTTCAACAAAACAATATCAAAAAAACAATTTAAAGAATTTGAAGATGTTTTCA
TAGCACTTAAAAATAAAGAAATAAACTATGGAATAATCCCCATAGAAAATTCATCTACAGGAGCTATCTC
TGAAACTTATGACCTTTTGAGAAAGTACGGTTTTTATATAGTTGGAGAAGAATGTATAAAAATAGACCAA
AATTTAATAGGGATAAAAGACACAAAACTTGAAGATATAAAAGAAATATATTCTCATCCACAAGGTATAG
GACAATGTAGTGAATTTTTAAAACAAAATAGTACATGGAAATTGATACCATTTAATAACACAGCAACAAG
TGCAGAACTTGTAAGAAAACTTCAAGATAAAACAAAAGCAGCAATTGCAAGCAAAAAAGCTGCAAGTATT
TATGAATTAGAAATAATAAGTCCTTGTATAAATGATATTGCAAACAACTATACAAGATTTGTAGTAATCA
GTAATCAAATACACATTGAAGAAGAATCAAACAAAATGAGTGTAGTATTTTCTGTTGAACATGAAGCAGG
AAAACTTTATAAAGTACTTGGATACTTTGCTGAAAATAATATAAATATGACAAAAATAGAGTCAAGACCT
ATGAAAAATGCCTCATGGAGATATTTCTTTTATATAGATTTTGAGTGTTCTATATACAATTCTAAAGTGT
ACGACTTATTAGAATTGATAGAACATAATACAGCATATTTTAAATTTATGGGAGTATATAAAAATAAAAC
TGAATAG
>ref|NC_013316.1|:2029910-2030719 shikimate dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTTTTCGGTCTAGTAGGTGAAAAACTCTCTCACAGTGTTTCACCTCAAATCCACAAGAGAATAT
TCGAGATATTGAATATTGAAAGTGCTTATAAAAACTTTGAAATTCCAAAAGAAGATATATCTAAGCTAGA
CGGTGCTATAAAATTATTAGGAATACAAGGAGTAAATGTTACTGTACCATATAAGGAGCGTATTATGAAA
TATCTTGATTTTATATCACCAGAGGCAAAACGTATAGGAGCAGTTAATACAATTTTACTCAGAGAAAATA
TGTTATATGGTTACAATACAGATTACTTTGGTCTTGATAGTATGTTTAAAATGGCTAATATTGATGTTCA
AGGAAAAGTAGCAGTTATATTAGGAACTGGAGGTGCTTCTAAAGCTGCTCTTACATATTTTATTGATTCT
GGTATAGAAAAGCTTTATGTTTCAACTAGAAAAAAGGATGATAAAAAATTATTAAATAGTAAAGCTATAT
TAATAGATTATGAAGAACTTAAACATATAAAAGGAGATATAATATTAAATGCTACACCAGTAGGTATGTA
CCCTAATGTAGGAATTTCACCAGTGTCAAAATCTATTATACAAAATTTTGATATATTAATAGATTTAATT
TACAATCCTGGAGAAACAGAGTTTTTAAGAATTGGTAATAGTATGGGTAAAAAAACTTGTGATGGATTAT
ATATGCTGGTAGGGCAAGCAATAAAATCTCAGGAAATTTGGCAAGATACTAAAATAGATAATAGTATTTT
AGATGTTATATATAATGAACTAAAATTAGAATTTTTGTAA
>ref|NC_013316.1|:2030731-2031264 shikimate kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAATAAAACAAAAGAAAAATTGATATTAATAGGTATGCCAGGTAGTGGAAAAACTACAATTGGTA
AACTTTTGGCCAAAGAATATAATTGTAGTTTCTGTGATATGGATGATTATATAATTCAAATATCTCAAAA
AAGTATAGCAGAGTTGTTTTCAGAAGGAGAAGATATCTTTAGGAACTATGAGACTCAAGCATGTAGAGAA
CTTTCTATAAGTGATAAAACAGTGATATCTACAGGTGGAGGTGTAATAAAAAAGGATGTTAATATGGAAA
TACTAAAAGAAACAGGTATAATAATTTTTATTGATAGACCTATACAAAAGATTTTGGAAGATATAAATAT
TAATTCAAGACCATTATTAAAAAACGGAAAAGATAGATTGTATAATCTTTATAATGAGAGAATAAATCTT
TATAAAAAATTTTCAGATATAGAGATTTTAAATGATAAATCATTAAATAATGCTGTATATAATATTACAA
ATGCAGTCAGTGAAAATTTTAAATTTGACTTTAAAGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2031285-2032124 putative prephenate dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATTGTTATTGTAGGACTAGGAGTTATAGGAGGCTCTTTTGCTAAAGCATTAAAAAAAGCTGGAT
ATGAAAATGTATTTGGAGTAGATGTAGATTTAGAAACTTTAAAAAAAGCAGAAAAAGCAAAAATCATAAA
AAAAGGATGTACTACAGGTAAAGAGTTATTTAAAAAAGCTGATTTAATTATACTATCTATATATCCTAGA
TTAGTTGTAGATTTTCTAAATAATAATAAAAACTTTTTTAAAAAAGGGACTATAATTACTGATACTACAG
GAATAAAAGAAACACTTATCAATGATGTGTTGCAAATTATTCCAGATGATATAGATTTTATATTTGGACA
TCCAATGGCAGGTAGGGAAAAAAAGGGTATTGATTTTGCAAGTGAACAAGTTTTTAATGGCGCAAATTAT
ATAATTACTCCAACTGGCAGAAACAACATAAAAAATTTAGAGTTAGTTGAAAATTTAATTTTAGAGATTG
GATTTAAAAGAGTAAAAAAGTTAACTTCACAAAAACATGATGAGATTATAGCTTTTACTTCTCAGTTACC
TCATGTTATGGCAGTTGCTCTTATAAATAGTGATGAAGAAGGTAGAGATACAGGTAAATTTATTGGAGAT
AGTTATAGAGATTTAACTAGAATTGCAAATATGAATGAAGACTTATGGAGTGAACTTTTTTTAGGAAATA
GAGATAATTTACTAAAAGTTATAGAAAACTTTGAATCAGAAGTAAATTTAGTAAAAGAAGCTATATTTAA
CAATGATAAAAATAAATTGATAGAGTATTTTAAAAAATCATCAATAAGAAGAGAAGCTTTAGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2032377-2033873 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
GTGAGGTGTAGCTATTTGAAAAAAAATAGATTAATAATAAAGAATATATCAATAGCATTTATAGTACTAT
TCTTTTTTAGTGTATTTACATTCTTTTATATAGGTAATATTAGTAGAGTATTAGAATATGAAACAAATGA
CATAATGACAGTTACAATTACTGGATGGATTATACTTTCATTTTTATTTTTATGTATTATAATTTACATA
TTATATTCAAAAGCAAAGAGTCAAAAAACTATAGAAAAAGTAGCATATACGGATTTTGTAACAGGTTATT
CCAACTGGAGAAAGTTTGAATTAGATGTTACAAATTTATTAAAGAAAACATCACAAAATAATAAATATGC
AATGGTCATATTCGATATTGATAAATTTAAAGCAATTAATGATATATATGGACATAAAAAGGGCAATTTA
ATATTAAAAGATATTGCAGATACTTTAAATGAATTGACTAATATCAATGAAACTTTTGCTCGTGTAAGTG
CTGATAATTTTAATATATTATTAACATATAACAAAAAAGAGGATATAATAAATATTATTAAAAAAATTAT
AGCAAATAATGAACTTGTAAACTTATCTTTTGGAATTTATGAAATCAAAGATAAGGATTTATCTGTAAGT
GTATATAGTGATAGAGCTTCACTTGCAAAATCATCAATAAAAAATAATAGTGATGTAAATTTTGCATTTT
TTAATGATAAATTAAGAGAGAAATTATTACTTGAAGATAAGATAGAAAAAGAAATGGAATATGCTCTTGA
AAGTGGGCAATTCGTAATGTATTTACAACCAAAATATAATATTAAATTAGATAAATTTTGTGGAAGTGAA
GCCCTAGTCAGATGGCAATATACAGAAAAAGAAGTCATATATCCAGGTGATTTTATTCCTATATTTGAAA
AAAATGGATTTATTAGAAAAATTGATATGTACATATTAGAACAAGCTTGTAAAGAAATCCGGTCTTTATT
TGATAAAGGAATTTCACCTTTACCTATATCTGTAAACTTCTCAAGAGTTGATTTTTTAAAAAAAGATTTT
ATTGAAAACATAGTAAATATATGTGATAGATATAAAATACCATATAGTTTAATAGAAATTGAAATTACTG
AATCTAGTATGTTTGGAGATACTGATACTCTATTTAATGTTAGTAGAAACCTACAGGATATTGGTTTTAT
AGTTGCAATGGATGATTTTGGCTCGGGATATTCTTCTGTAAATATGCTTAAAAATATACCATTAAATGTA
ATAAAATTAGATAGAGGATTTTTTGTTGATGATAAAGATGTTGATAAGAGTCAAATTGTTATAAAAAGCA
TAGTTTCTCTCATTAAGCAATTAGGAATAAGGGTTGTTGCTGAAGGAATTGAAACAAGAAGTCAAATAGA
AATGTTAAAAAAAGCAAATTGTGATATTGTTCAAGGATATTATTTTTCAAAACCATTACCAATTAAAGAA
TTTGAAAAATTAGTCTATAAAATATAG
>ref|NC_013316.1|:2033906-2037343 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
GTGATAAGAGCAAAATCGTTAAAAAATGTACTGAGTATTGTTTTAATATTTTTATTTACAATAATTTCTT
TTTCTGATTTTGCATTTAAAACTAATGTCCAGGAAGAAGAAAATAGTAAAATTAATTTAAGGGAAATATC
CCTACAAAGTTCCAATGCTATAAAAATAAAATTAGATAGTTCTCTATCCTTTATTAAAAGTGTGGCAAAT
ATGGTTTCTTATTTTAATACTATAGATAACTCAAAAATAGTTCCATTATTAGCTAACATATCAAAAGAAT
CTGACTTTCAAAGAATCTCTATTGTATCTCCTGATGGAATAAGTCATACCAGCGATGGCAAAATTATCAA
TGTGTCAAAATATCAGTATTTTAAGAAAGCTATTAAAGGAGAAAGCAATATATCTGAAGTTGTGAAATCT
CCAATTGATGGAAAAGATACTTTTGTTATAGCTACTCCTATATTTAATAAGAATAACAAAATAATTGGTG
TTTTATACGGTTCTTACTACAATGATAAATTAGCTGAATTTATAGATATAACAAGTTTTAATAGTGAAGG
GTACATAGATATATTTGAATCTAGTGGTCAATTTGTTTTAAAATCTTCACATACAAACAAACTGATTAAG
TCAAGTAGTAACATATATGATATATTTAAAAAAGCTTCTTTTGATGATGGTTATAGCTATAAAAAAATAT
ATGAAGATACAAAAAATAACAAGAGTGGCTTTACCTCATATGAATACAAAGGAGAAAATCGTTATGCTAC
TTATACACCCATTGGTGTAAATGACTGGTATGTAATTTCTGTGATACCACAATATACTGTAAGAAGAAAC
ATTGATAAAATAAATCAATTAGCATTTTCTCTTATTTTCAAAGTATTCTTATTGTTTATTATGCTTATAA
TATATATTATTTATAAAAACAATAAATCTCAGAAAGATATACTAAAAGCTAACAAAGAAATCTCATCTAT
TACAAATAGCATTCCTGGAGGAGTACAAAAGTGTACCCTGGGTGAAACATGCAATATTAATTTTTTAAGT
GATGGATTTATAGAGTTGTTTGGTTATACAAGAGAAGAAATAAAAACATTGTTTAATAATGATTTTTATA
GTTTAATACATAAAGATGATGTTGAAAGAATAAAAAAAGAAATTTCTAAACAACTTTACAAAAATAAAAC
TATTGAATTAGAATATAGGATTATAACAAAAAATGGTAATACAGTATGGGTTTTAGATAAAGGAGAACTT
ATAACAGAACCTGATGGAAAAGAATATTTTTGTTGTGTAACTGTAGATATTACTAGAACAAAACAATTAG
AACAAGAGATGGAACAAAAAAATCTAGAACTTGAAATGATATCAGAAAATATTTTAGGTGGTATAATTAT
AACAGAATTTAATGATGATTTTACTATAAAATACACTAACTCTGGTTATCTTTCAATGATTGGATATACA
CGTGAACAATTAGAAAATGAACTTAAATACAAAGCTTGTAATCTTGTTTTTTATGAAGATAGAAAGAAGG
CTCTTGAAAGTATACAACATCAATTAAACACAAAAGGAATAGCTGTATATCAACATAGAATAAGAAGAAG
AGATGGTAATATTATCTGGGTTTCTATAAAAGGAAGGCTTATTATTGATGATGATGGTATTGAAAAAGGT
ATTTGGATTCTAAATGACATAACAGATTTAAAAAATGCAGAACAAAAACTTAAAATAAATGAAGAAAGAT
TTAGAATTGCATTAAAGCAAACATCAAATACTATATTTGAGTATGATATAAAAACAAAGTCACTTTTAAA
TACTAGTAAAGAGCTTGATAAATATAATATTTATAAAATTACTAAAAACGTTCCATATTCTCTAGTAGAA
TCAGGAGTTATTCATAAAGATTTTAGTGATGATTTTATAAACATGTATGAAAATGTAATAAATGGAGCAA
AAAAAGCAAGTTGTGTAGTTAAGATGAAACTTCCAGATGAAAATTATATATGGAATAAAGTTACCTTGAC
TACTATTTTTGATGAAGATGGTAATCCTGTAAGAGCAATTGGTATACAGGAAGATATAAGCAAACAAAAG
GAAGCAGAGATAAGATATAATCAAGAAGGTAAGTATCATTCAGCTATATTGTCGGAAGCAATGATAACCT
ATGAAATAAATGTATCAAAAGATACTTTTATCAAAGGAAATGAAAGTTGGCAAAAACCATTTGGAATTAA
GCCTGACAATAATTATTCTGAAATGGTAAAAACTATATCAAACAGTATTATTCACAAAGACAATAAAGAG
GTGTTTTTAAATACATTTTTGTGTAAAAATTTATTATCTGCATATAACAAAAATATAACTGAAATAAAAT
TAGAATATCGAAGAATGAATCAAGAAAATAAAATGATTTGGGTCATTTGCACAATGCACTTAATAAAAGA
TTCTATTACGAATGATATAAAAGCACTTGCTTATGTTAAAGATATTGACAAGCAAAAAAATGAAGAAATT
AAATTAAAATTAAAAGCTGAAAGAGATACTCTTACAGGATTATATAATAAAGGTACTACAGAAAATTTGA
TTAATGATTTCTTGAACTCTGACGAAGCAAGCTTAGGAATGCATGCATTTTTAATTGTTGATATAGATAA
TTTTAAATCTGTAAATGATAATTTAGGACATGTATTTGGAGATAAAGTATTATTTGAAGTTTCTAAACAC
CTAAAACCTATATTTAGAAAAGATGATATAGTAGGTCGAATTGGTGGAGATGAATTTATAGTATTCTTAA
AAAATATTCAGTCTTTTGAGAATACCAAAAAGAAAGCAGAAAAAATATGCGATATATTTAGAAATTCTTA
TACGGAAAATAAAAAGACATATAAAATATCTGGAACAGTTGGAATTTCATTTGTACCAGAACATGGAACT
GTATTTGAAGAACTTTATAAAAAAGCAGACATAGCACTTTATTATGCAAAGAGCAAAGGAAAAGATAAGT
ATGCACTTTATAATAATTGTATCTACCAAAATGAACTTGAAAATAATATAAGTGATAATAATATAAAATT
AGCAAATAAATGTGAGAAATCCAAACCAGTACTTAAAGAAATTCTTGATTCTATTGATAATTATATTTAT
ATAGTGAATCCAAATACTTATGAACTTCTTTTTGTCAATAATAAGGTGTCTCGTTTGGATTTAGAGATAA
AATTAGGAGAAACCTGTTATAAATCACTATTAAAATCTGAGAGACCATGTAATAATTGCCCTCTTAACGG
ATTAGAAGAAAATAAGCATTCAAAATTCAAAATAGAGACAAATACATTTGGTAAAAATATCAGTATAGCA
AGTTGGATTAATTGCATAGATGGAGAATACAACTGTCTTATAGAGTGTATAGATTCTTCTTTATACAAAA
ATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2037361-2038107 hypothetical protein CDR20291_1737 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAATAGTATAACTTTGATACTTGGTATAATATTTACAATTTACTATTTTTATCTCAAAATAGTTT
TTGGAGGAATTTCATTTAGTGAGATTTTCTTAGTTGTAGGAATTGTACTAATTATCTATCAAATATTTAA
GAAAAAAATTAAAGAAAAGAAGGTTTTTTATAGGGTGTTAAAAATAATAATCAGCATTTTTTTAATAGTA
TTTGTAGTTACTGAGAGTTTAATTATTTTTTATCCTAAAAATAGTTTAGAATCAAAAAGTGATTATCTCT
TAATTTTAGGAGCTTCTGTAAAAAAGACTACACCAAGTACAACCCTGAAGGGTAGGTTAGACACTGCATT
GAAATACCTAAAAATTAATGATAATTGTTATGTGGTAGTATCTGGTGGTAAAGGAAGTGGAGAAAAAATA
ACTGAGGCAAAAGCTATGAAAGATTATCTTATAAAAAATAGTATAGATAAAAATAGGATAATAGAAGAGG
ATAAATCCACGAATACTTATGAGAATTTTAAATATTCAAAATTGAAGATAGAAGAACATAGTCAAAGAAA
ACTAAGTGATTTAAAAGTAAAAATAGTAACAACAGATTTTCATGTTCTCAGAAGTAAAATATTAGCATAT
AGAAATGGATATAAAAATACGTCTTTTTATGCTAGTAAATCAAAACTTTCATTTGTACCAACTTACTATA
CAAGAGAATTTTTTGCATTATGGAAAACAATCATTTTTGATAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2038364-2038056 hypothetical protein CDR20291_1738 [Clostridium difficile R20291]
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CATTCGGATTTATAATGGATTATGAAGGAAAATTATATTTTGGAATCGTAAAATATAAAACTTCTTATAA
GCAATTACTTGTAAATCCCAATGTTGAAATTTCTACAACAAGTAAAGTTGGAAAATGGATTAGAATTAAG
GGAATAGAAAAGACTAGATATGAGTTTATATCTAGTCTTTTTATTTATTATCTATCAAAAATGATTGTTT
TCCATAATGCAAAAAATTCTCTTGTATAG
>ref|NC_013316.1|:2040727-2041008 putative membrane protein precursor [Clostridium difficile R20291]
ATGAGATGGATATTAAAAATTATCTTATTTCCAATTAGTATAGCGTTAAGTATTCTCATTGCATTTCTTT
CATTTTTACTTGGCATAGGAACAGCAATACTTTACCTGTTGATGATGTTTTGCATATTTGGAGCAATAGC
ATCTTTTTTACAAAAAGAGGTTACCATAGGGATAGAAGCATTGATATTAGGATTTTTGTTAAGCCCATAC
GGAATACCAATGGTTGGAACAGCTGTTATAGCCGTTTTAACGGGAGTGAAAGAAGCAATACGCTCTATTT
AG
>ref|NC_013316.1|:2041094-2042116 putative conjugative transposon protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTATTTATTTGATGAACAACCTATAGTTGCGAATAAAACTCTTGCTAGAGAAATAGGATTAAACGAAG
CACTCATACTACAGCAGATTAATTATTGGATAGAAATAAATAAAAAATCAGGAAAGAATTATCATGATGG
TAAATACTGGACATATAATTCAATTCGAGCATGGCAAGAAAATGACTTTGACTATATGAGCTTTGATACA
GTAAAAAGAACTTTTTCAAAGTTAGAAAAAGCAGGTTATCTTTTAGTTGGAAATTACAATAAGGATCCAA
GAGATAAAACAAAATGGTATACAATTAATAATGATAAACTTGAAGAATTATATATGGATATGGATTTGAA
AAAACAAAAAATACAAACAGAAGCATTAAAAAATTCTATGCCCAATGCATTAGGGCAAAATGCACCAATG
GATAAGGGCAAAATCAGCCAATGCAATAATGCAGATTGCACTAATGCACAGGTTCAAAATGCACTAATGC
AAAAGGATAATTTGCACCAACCATTACCAGAGAATACAACAAATAATACTACAAATAATACTACAAATAA
TTCAGCATATATTTCCATCCATCCTTCCATCAAAGAAAAGAATCAATTATTTTCAGAGAATATGAAGGGA
GGGAGGATAGATATAAGCTATAAAAATATATATCAAAATTGTTTAGAAGAATTGCGACACCAAACAGGAT
ATTATGAACATATGAGTATTGGGAATAAGAGTGTGGCTGAAGAGTTTGATGAAATATTAAAGATACTGGC
AGATGTAATGGTATTAGATGATGAATCTTTCATTACTATCAACCAAACAAAGATATCTGTACAAGTAGTA
AAGGAAAGATTTAGGAAACTTAATTCAGGACATTTAGAGTACTTAGTAGGAGTATTAAGAGAAAATGAAT
ATAGGATTAGAAATATAAGAGCTTTTGTCCTGACCGCCGCTTATAATGCACCAAGTGGAATAGATGCCTA
TTATTCGGCTCTTGTAAGCTATGATATGAGAGGAGGATATTGA
>ref|NC_013316.1|:2043677-2045557 site-specific recombinase, resolvase family, putative [Clostridium difficile R20291]
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ACTCCATATCCAACCAAAAACAGATGTTAGAGGATTTTGCCCGCCGGAATGGGCTGCCCAACCCTACGCA
CTTTACCGATGATGGTATCTCAGGCACCCGTTTTGACCGCCCCGGATTTTTGGCGATGATGGAGGAAGTG
GAGGCAGGGCGTGTAGAGGCAATCGTCATCAAGGACATGAGCCGGTTAGGACGCGACTATCTGAAGGTCG
GTCAAGTTATGGAGGTTTTGCGGCAGCGAGGCGTTCGTCTGATTGCCATCAACGACGGTGTGGACAGTCT
GAAAGGCGATGACGATTTTACCCCGTTCCGCAACATTATGAATGAATTTTACGCCCGTGATACCAGTCGG
AAAATCCGATCTGTGTTTAAGTCAAAAGGCATGAGTGGCAAGCACCTGACCGGCACTGTGATTTACGGCT
ACTTATGGGACGAAAAACGGGAGCATTGGCTGGTAGATGAGGAAGCTGCCGAAGTGGTACGCCGTATATT
CTCCCTCACGCTGGAGGGATATGGGCCTTACCAGATCGCCTACAAATTATCCACAGATCGGATTGAAATT
CCTGTCGTACACCTTGCCCGCTTCAACGAGGGTGTGAACCGTTCAAAGCCGGTCAAAGACCCCTATGGGT
GGGGATCATCTACCATCGTGAACATTTTGAAAAAACGAGAGTATTTAGGGCATACCATCAATTTCAAAAC
CCGCAAGCACTTTAAGGACAAGAAAAGCCACTATGTTTCTGAGGACGAATGGACGATCTTTGAGAATACC
CATGAAGCCATTATCGACCAGCAGACCTTTGATTTGGCGCAGAAAATCCGCAGCAATGTACGGCGTTATC
CAAACGGCTGGGGCGAAGCGGCTCCCCTCACAGGCTTGCTCTATTGTGCCGATTGCGGCGGCAAGATGTA
TGTCCACCGCACCAACAATGGCAAGCGGGTTTCTCAATATACCTGTTCCAATTATACCAAAGTTCCGTGT
GGGACACTATGCCCTACACAACACCGTATCAATGAGAGTGCTGTCCTGACATTGGTTTCCGACACGCTCC
GGGCTATCGCTGAATATTCGAGAAATGACCGGACGGAATTTATTCACACTGTTCAGGAGACGCAGGTTGC
TCAACAGAGTGCCGATATATCGAAAAAGCGCAGGCGTCTGGCTGCTGCCCAAAAGAGAGCCGGAGAACTG
GAAAAACTGATTTGCAAAATCTATGAGGACAACGCCCTCGGCAAGCTGCCGGATGCACGATATAAGGCGC
TTGATGCACAGTATGCCAAAGAGCAGGACGCACTTGAGATTGAAATTGCAGAGCTGGAAAAGGCTGTTAC
CGGCTATGAGCAGAGCCAGAAATCCGCAGAGAAATTTATAGCCCTAATTGATAAGTATGAGAATTTTGAC
ACTCTGACAAACACCATGCTCAACGAGTTTGTAGAGAAAATCCTTGTCCACGAACGCGCCCGAAAAGGCA
GTCAGGACACCACGCAGGAAATTGAAATCTACTTCAATTTTTTAGGGCGCTATATCCCACCATCCTTACA
GCCAGTTCCTTTAACCCCGGAGGAACAGGAAGAACTGCGGAAAAAAGAAGAACGCAAGGACAGGCTTCAT
CAGAATTATTTGAAGCGGAAAGCCAGCGGCGCACAGAAACAGTATGAGGACAAAATCAAGGCGAAGAAAA
AAGCGGAAATGGACGCTAAGAAAGCCCTGATCCGGGCTGAGGATATGAAAAAAGGTGTTTTTTCTACTAT
CGGTCAGCTACCAAAAGAAGAACCGCGCAAAGGCAGCATAGCAGCCAGCGCAGCAGTCTAA
>ref|NC_013316.1|:2045584-2045937 hypothetical protein CDR20291_1745 [Clostridium difficile R20291]
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AAACTTCTATCGGCAAGTACGGCAGAATGCGAAAATCCTACCTAAAGGAACATCGCCCCATTCTCTACAA
CCATCTGCTGATGAGCGAGAAGCTGTATCCACACCTGTTAGAGATTGAGCGGACAGCACAGGGGCGTGTG
GAAACCATGTTGCCTCACATGATGGAAGTTGCGGGTGTCACGGAGGAACTGAAAGCCTGTGACCCTATGC
GCTGGGTGGGGCTGATGAACACATTAACGGCACAGATTGAGGAAATTTTAATCAGGGAACTGATTTGCAG
CTGA
>ref|NC_013316.1|:2045945-2046253 hypothetical protein CDR20291_1746 [Clostridium difficile R20291]
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ATGAGGTGGTTCAGACCAGCCACGGTTATACATTGATGGCATGGGAACCCCACCGGAATGACTGGTACAG
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GATAAGATTACTGGAAATGACCGTGACCTGACTGTGACAGAAACCGGAGAAATCCAACAGAGGTGTCGGG
AACTTTTGGAAAAGTGCCGGGAACCTTGA
>ref|NC_013316.1|:c2046649-2046281 hypothetical protein CDR20291_1747 [Clostridium difficile R20291]
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GGCGTCTGGCACGAAAAACATTGGCAGAAATGGTTGGGATTGAATGGCGGTATCTTGCCAACATTGAGAA
TCAAGGTGCGATTCCGAGCCTGCCTGTGATGATCCAATTGATTAAGGTCTGCGGACTTCCCGTGGAACGG
TATTTTAACCCGGAGATTATGCGAGAAGAAAGCGAACAGCGGCAACGGGTCAGCCACAAGCTGAAGCTTT
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GCAGAAGGAGGACGCATAA
>ref|NC_013316.1|:2046924-2047667 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGCGGAAAAGCCGATTGACGGAAGGACAAAACAAGGAAAGGAGTTGCGCCATGAATAAAATCCTGATTA
TAGATGATGACAAAGAGCTGTGCGCTTTGATTAAACGTAGCGTACAAGCAGAAAACATAGAAGCTGATTT
TTGTAATACCGGAAAAGAGGGCTTACAAAAATTAAGAGAGCAGGAATACCAGCTTGTGGTGCTGGATGTG
ATGATGCCCGGCATGGACGGGTTTGAAACGCTGGAAGAAATTCGCAAGGAGTACAGCTTGCCGATTTTGA
TGTTCACATCTAAAAATGACAGCATTTCTAAAGTACGGGGCTTACGGGCCGGAGCGGACGATTATCTTAC
AAAACCGTTTGATATGGATGAACTGATTGCCCGTATTGCGTCTCTTATTCGCCGCTACACTCGCTTTAAT
CAGCAAGCTGGAGCCATACAAAAGCTAAATTTTGACGGATTGCAGATTGACCTTGAAAATCGTTCTGCTA
CTACATCAAACGGCACTTTTGAACTGCCCCCAAAGGAATTTGATTTGCTCCTGTACTGTGCAAAACATCA
AGGGAAAATTTTGACCAAACAGCAGATTTATGAGGAAGTATGGGGCGAAGAATATTTCTATGATGACAGT
AACATTATGGCGATTATCAGTCGGCTTCGTAAAAAATTAGAAGTCAATCCTTCAAGCCCAAAGTATATAC
AAACGGTCAAAGGGATTGGCTACCGGTTTAATAAGGAGGTGTAA
>ref|NC_013316.1|:2047673-2048590 sensor protein [Clostridium difficile R20291]
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GGCGTGTAAAAAAACAAATAGCAGAAATGACCGATGTGCTGGTTGATGTGAAAAACGGAAATGGCAACCG
GCGTATTCTATCTGCAACAAATGAACTGACAGCACCTCTTGCCTATGAAATCAATGAGATCGTTGTGGCC
TATGAAAGCAGACTTTCAACTGTACGGCAGACAGAAGAAACCAACCGCCAGCTTATGACGAGCCTTTCCC
ATGACGTGCGAACGCCCCTTACTACTCTGCTTGGGTATCTTGACGCTACACACAAAGGACTGGTCACAGG
AAAAGACCGGGATGATTATATTGAAACCGCCCGTCGGAAAGCCCATGATCTGAAAGAATACATTGATGTA
CTCTTTGACTGGTTCAAGTTAAATTCAAACGAGTTTGCTTTGGAGATCCAGAGCGTTGAGGTTGCAGAGC
TGACAAGAAATATTCTGATCGACTGGATACCGATTTTTGAGGATAAACAGGTTGATTATGACATTGATAT
TCCCGAACAGCCTGTCCGGGTAAGATTGGATATGGATAGCTATATGAGGATCATCAATAACCTTATTCAA
AATGTAATCGCTCACAGCCATGCGGACAAAATCAAAATTTCCCTATCGAAGAAGGAAAATAACATGGAGC
TGCTGCTGGCGGATAATGGAGTGGGAATTGAGAAAGAAGATTTGAAACACATATTTGAACGGCTTTATAA
GTGTGATAAAGGACGCTCTGAAAAAGGCAGCGGACTTGGTCTTTCTATTGTCCATCAGCTTGTAGAAAAA
ATGGGTGGAAGTATAACAGTTGAAAGTTTGCCGGGAAAAGGAACTGAATTTATGTTGCTTTTTCCTTTGG
AGAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:2048689-2049651 putative lantibiotic abc transporter,atp-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGAATACCTTACAGAACAGGAGGTTTTGAATATGGATACAAATTATATCATTGAAACAAAAAATC
TGACAAAGCAATACGGCTCACAAAAGAGTGTGGCCGACTTAAATATCCATGTCAAGCGTGGGAGAATTTA
CGGTCTGCTGGGCAGAAACGGAGCCGGAAAAACCACTACCATGAAAATGCTGTTGGGCTTAACGAAGCCG
ACTTCCGGGGAGGTCAAAATCTGGGGAAAGTCTTTGCAAGGGAATGAAAAGAAGTTGCTCCCCCGCATTG
GCAGTCTAATTGAGTCCCCCGGCTTTTATCCGAATTTGACCGCAACGGAAAATCTGCGTATTTTTGCTAC
TCTACGGGGAGTGCCGAACAGCCATGCAATCAGGGATGCTCTGGATTTGGTCGGGCTTCCTTACAAGGAT
AAAAAGCTGTTTTCGCAATACTCTCTTGGTATGAAGCAGCGGTTGGCGATTGCCCTTGCAGTCATGCACG
ACCCGGAACTTTTAATTTTAGACGAGCCTATCAATGGACTTGACCCTATCGGTATCGCAGAAGTACGTTC
CTTTATTCGTGAGCTTTGTGACGCGCGAGGAAAAACCATTTTGATTTCCAGTCACATTCTTTCGGAGATT
TCCTTGCTGGCTGACGATATTGGAATTATCGACCACGGCGCATTGCTGGAAGAAGAAAGCCTTGCCGAGC
TGGAGCAAAAAAGCAGTAAGCATATCCGTTTTACGCTTTCGGATACTGCACAGGCGGCAAGAATTTTGGA
ACGCAATTTCCATGAAAACCATTTTTCCATACAGGACGACCATAATCTGCGCCTGCACAACCTTGATCTG
CCTGTGGGTAAAATTGTAACTGCCTTTGTAGAAAACGGATTGGAGGTATCAGAAGCACATACCTGTGAAG
AAAGTCTTGAAGATTACTTCAAGCGTGTGACAGGGGGCGAAGGAATTGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:2049644-2050429 putative lantibiotic abc transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
TTGCTTAAACTAATCAAATGCGAATTTTTGAAATTGAAACGGAAGAAATTTATTCCGCTGATTATTCTGG
CTGCTTTCCTGTTTCCAATCCCGCTGACTTATCTGATGACAACGCCCTCTATGATGGAGCGATATACGGA
TCGGGCAGATGCTTTCGATGGACTATTTAACATGGTGTTGGGATATGGTATCCAGTTTTTACTGCCCTGC
ATTATTGGAGTGATTGCCGCTATCCTGTTCTTTATGGAACGCGACAACGATACATTCAAAAATCTGCGTA
CAATTCCCGTAACCAGCACGCAAATGGTGCTTGCAAAGATTATTGTCCTCTTTCTTTTTGGAATTGTTTT
TTGTGTGGCTTCTACCATTGCAACAATTCTTTGCGGAATTGGAACATTAGAAGTTTATGGAATTGGTTAT
AAGCTGTTTTTGGCGGTTGAAACGGGGATCTTCATTACGGCAGGAACACTCCCGTTGATTGTCCTTGTTG
TCTTTTTCAGTAAGACCTATGTTTTTTCCATTTTGTTGTGTGTCTTTTACAGCGTTCTGAACATGAGTGC
TACGGCATTGTTTGACACACTGCCTAAAACTATGTTATGGCTTCTGCCCACGCCACTGACTACATTTTGG
AGTGCGGGAGATATGGCGGCTCATGGAATAAAAATGGACTTGGAGCAAATGACAGGGCTAATTCCCTCAA
CATTTCAAGTTGTATTCATTCTTGGGATCATGGCATTGGTTTCGTTCTTACTAATTGACAGATTATATAA
GCAGAGGGGGGAATAA
>ref|NC_013316.1|:2050432-2051211 putative lantibiotic abc transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGTTCGCATTGTAAAAACAGAATTTTATAAATTGAAAAGGTATCATATCCTTTGGGCGGGCGTTGCAC
TCATGCTCCTATCCGTCCTGCTGACCTTGTTTACCTCTATGGCGAATGATGGTTCCGTTTGGGATTTTGC
CTATCTTACAGAACAGGTCATCAAAAACAATATGTCCATGATTTTTCCGATGTGTATCAGCCTAATTGCT
GGATATATGATTTCTCGTGAGCAGACGGATGACACATTGAAAAATATTCTGACTGTGCCGATCTCTTTTA
AGAAACTGTTGACCGGAAAATTGATTGTGTGCGGCGTATTGTCTATTATTTTCGGGCTGATATGCAGTCT
GTTTACAATCATAGCAGAAATGATTGTGGGATTTCCCGGCTTTGAGATTTCCTTAGCTCTAAAAGCAGCC
TTGCAGATTACTGCGGTTAATTTCTTTTTATATCTTGCGGTTCTGCCGATTATCGCTCTTACTTGTCGGA
GGGCAGGCAGCTTTTTAGTCGGTGTAATCATTGCTTTTGTCTATGGATATGGAGGGATGTTTGCCGCAGG
AAATATGACATTAGCAAACCTTTATCCGATTACCGCAAGTCTTGGAATGGTAGGCTACCGTAGCTATGAT
ACCGCAGTCAACTGGAATATTGGAACCTGTTCTTGCAGTCTTGCGCTTGCTGTCGTTATTTCTGCCATCT
TGATTTTGTGCATGAAAGAACGAGAAGCAACCCAAACAAAGAAAAAGGCCAAAAAGGTAGCTCCAAAGAA
AGGCTGGTGA
>ref|NC_013316.1|:2051219-2051680 hypothetical protein CDR20291_1753 [Clostridium difficile R20291]
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ATGAAATTCTCAATCATTACAATAACATTGTTCAGTCTGCGGGCTCCATAGAACTGACAGGGAAATCGTC
ACTGCAAGGGGAAAAAGAAAAAGGAATTGATGATTATACAGGGACTTATACGGCTGATTATGCGAACTTT
TCAGGTACAGAGTATTTGTTCGGAGGAACTTCCATAAAGAGAGAAGCCGGTAAGGAGCTGTCTATTGATT
GCACCTTGGAGATTACGGAAGGTACTGCAAAAGTATTTTGGATTTCTGGATCTGATGAAGCAGTCACGTT
GATTGAGGCAACCGGAACTTATAGTGACACAATTACACTTCCTGATGGTGGAAATTATATTGGCATTGAA
TGTGAGAATTTCACTGGAAACATTGAATTAAATATTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:2052125-2052538 rna polymerase, sigma-24 subunit, ecf subfamily (ecf subfamily rna polymerase sigma-70 factor) [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGTTACCATCAATTATAACGGACAAGCTGTGGCCGTGGAGGTTACGCTGGAAGTCTATGAATTTC
TTGACCGGGCCGATCACAAAACGGAGAACCTGTTCCATGAACAGCGGCGGCATTGGGATGGCCGGGAGTT
TGACGAGTACATAGCTTTTACCGAGGGCGTGGGCGTTTACAGCGAAACGCCGGAGGAATACCTTTGCCGC
ATGGAAACGCTGCATGAGCTGATGGCTGTTCTGGACACTTGTACCGAGGCCCAGCGCCGCCGGTTCCTGT
TCTATGCGCTTGACGGGCTGAGCCTTGCAGAGATCGGTGTGCTGTGCGGCTGCTCCAAAGTGGCTGTGTA
TCAAAGTGTGGAGGCGGTCAGAAAAAAATTTATAAATTTCTTTGAGAACAGGCTTAACGAATGA
>ref|NC_013316.1|:2052640-2053092 sigma-24 (feci) [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAACAATCAATCTGCGGTGGATGTATCCCCACTACCGGCATGACGAGTTTGTAGATGTTACGGACG
AGGTATGGGCAGCGATGTATCAGGCCAAGCGGGAGATGGAGAACTATGAGCGTCGGAAAGTCTACCACCG
CGCCTACTACTCTCTGGACGCATACAGCTGGCTGGAAAATTACGCGCTGGAACACAGCAGATCGCCGGAA
GATATTTTGCTGGAACGAGAAGAAATGACCACCCGCCTGCATCTGATAGCAGCTCTGCCGGTGGCTCTGG
CTCATGCCACTCCGACACAGGCCCGCCGTGTTCACGCCTACTACATTGCCGGTATCAAGCAGCCGGAAAT
CTCCCGGAGAGAGGGCGTCCACAGCAGCAAGGTCAGCGTTTCAATCCGTCGGGGGCTGCGGAATATGCGC
CGTTGCTATGATGGTCTTTTCCAAACAGAGTGA
>ref|NC_013316.1|:2053067-2053564 rna polymerase, sigma-24 subunit, ecf subfamily [Clostridium difficile R20291]
ATGATGGTCTTTTCCAAACAGAGTGAGGGCGTGCCTATGCAGACCATCAACCTCAAACAATATTATCCAT
TTTGCAAAGAGGACATTTTTGTGGAGGTGTCCGATGAGATCGTCGAAGCGTTTCTTCTGGACAAGAGAGC
CGAGGCCGCCAGAGATCGCAAGATGTTCCGGTATAAGGCGTTTTATTCCCTCGATTGTAACGATGGAATC
GAAAATGCCGCCATCGGCTGGGCGCAGCCATCGCCGGAGGACTACCTGATAGAAAAAGAAGAATTAGCCG
AATACGAAGAATTGATACGGCGATTGTACGAAGCCATTTCCTCCCTGCCGCCTATGCAGGCTCGCCGTGT
TCACGCCCGCTATATGCTGGGTATGAAAGTGAAAGATATTGCCGCAATGGAGGGTATCACGCCATCACAG
GCGGGAAAATCCATCCATGCCGCACTGCGGAGGCTGCGCCGGTACTTTGCTCGACAGAAATGGACGGTCA
ATCTATGA
>ref|NC_013316.1|:2053584-2053883 hypothetical protein CDR20291_1757 [Clostridium difficile R20291]
GTGCCTGACATGAACGAAAAAATTACAGCCCACCCCCAAAAAGAAGAACGGGAGAAAGTCCTGAAGGAGA
TTCGGCAGCTTGAAAACCGAAAGAAGATTTTGGAGAACAAGCAGCGGAACGAAGAACGCAGGGTTCGCAC
CCGCCGCCTGATTGAGCGTGGAGCCGTTTTGGAGGGGATTTTCCCGTTGGCTCCCGACCTTTCCGGCGCA
GAGGTTAAAGCATTTTTGATTGCCCTGTCTCATCTTCCGGGGGCTGCGGAATTGACTGCAAACCTGCCAA
AATCCGGGGACACGCCATAA
>ref|NC_013316.1|:c2055913-2055623 addiction module toxin, rele/stbe family [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAAACCAAATATACCGTCAAGTACACGACCAGTTTCAAAAAAGACTACAAACGAGCCATCAAGC
GTGGCTTGAAGATCGAACTGCTGGAGCAGGTCGTAGCGTTGCTGGCGATGGGCGAACCGCTGCCGGATAA
GAACCGTGACCATGACCTGTCCGGCGATTGGGCAGGCCATCGGGAATGTCACATTCTCCCGGACTGGCTG
CTTGTCTACCGCATAGAAGATGATGTTCTGGTGCTGACGCTGGCCCGCACCGGCACACACAGCGACTTGT
TCGGCAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2056278-2055910 addiction module antitoxin, relb/dinj family [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTATTGTTAAATATTCGTGCAAAGTATTGTTTTCTTCGTGCAAATGGCATATACTATAATTGCC
AGCAGAAAGGGGTTGATCGTATGGCTGGAAATACCACAAACATCAGTATCCGCATGGACGCAGATTTGAA
AGCGCAGGCGGACGCACTGTTTACTGAACTTGGCATGAACCTGACTACGGCGTTTAACATCTTTGTGCGC
CAGTCGCTTCGTGAAGGCGGCATTCCCTTTGAAGTAAGGCTGGAACAGCCGAACAAAGAAACGGTTGCTG
CCATGCTGGAAGCGGAAAGGATTGCAAAAGACCCGTCTGTAAAGGGCTACAATGACCTTGACGAGTTATT
TGCTGACCTGAAAAGATGA
>ref|NC_013316.1|:2056315-2056713 hypothetical protein CDR20291_1761 [Clostridium difficile R20291]
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TACATGAGTGCTGCAACTACATCGGCGGCAACTGTATCGCGCTGGATGATGGGGAGAAATGTGTCTGTGT
CCAGTCCATTTCCTACTCCCTGTTATGCCGGTGGTTTCGGACGGCGGTATTGCCGCAGGATAAGGAACTG
GAAACGGCGCTGTTCCACCGGCTGAATGCTAAGAAATGCGCCGTATGTGGGGCGCTGTTTACCCCCGGTT
CTAACAGGGCCAAATACTGCCCGGAATGTGCCACACGCATGAAGCGGATCAACGCCGCAAAGCGTAAGCG
AAAACAACGGGAGAAATGTCACGCTTTAGGGGCTGAAAAACCCTTGTAA
>ref|NC_013316.1|:2056827-2057561 phage protein [Clostridium difficile R20291]
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TGCTGGAAAGTATGCAGGATGGTGTGCTGTATTCCAACATTCTGCTCAAGCTGTATCTGAAATCGCTGAA
ACATGGTGGACGGCTTCAACTTGACGAGGACATTCCTTACACGGCGCAGATGATCGCCACCATTACCCGC
CAGCAGATCGGCACTGTGGAGAGAGCCTTGCAGATCTTTTTGAAGCTGGGTCTTGTGGAAGTGCTGGACA
GTGGCACATTCTACATGAGCAACATCGAACTTTTAATCGGCCAGTCCTCTACCGAGGCCGAGCGAAAGCG
GGCTGCAAGGCTTCAAAATAAGGCTCTTTCTGCGCCCCGGACAAACGGCGGACATTTGTCCGACATTCGT
CCACCAGAGATAGAGATAGAGTTAGAGAAAGAGATAGAGATAAAGAGAGAGATAGAGAAGGGACGCTCCG
CCCGCGCCTATGGCCGTTACCAGAATGTTTTCCTGACGGACGGGGAACTGGCAGACTTACAGGCCAGCTT
TCCCACTGTATGGAGCCAGTACATCGAAAAGCTATCCGAGTACATGGCTTCTACCGGCAAGCGGTATCAG
AGCCATGCCGCCACCATCCGGCGCTGGGCCGGTGAGGACGCTAAAAAAACTGTCACACCCTCACGCAACC
GGGATTACAGCGTAAAGGAGGATGAAACTGTATGA
>ref|NC_013316.1|:2057726-2058421 replicative dna helicase [Clostridium difficile R20291]
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GCCGCATGGAGCGTATCAAACGCCGAAAGGCACAGGGTTTGCAAGACCGCTATCTCTATGACTACACCTT
TGCCAACGACAACGGCCAAAATCCCCTGATGGACAAGGCCCGCGCATATGTGGAGAACTGGAAAGAGGCA
TATAAGAGCAATATCGGGCTTTTGCTGTTTGGAGATGTGGGAACCGGCAAGTCTTTCTTCGCCGGATGTA
TTGCCAACGCTTTGCTTGACCGGGATGTGCCGGTGCTGATGACGAACTTTCCCACCATTCTGAACCGCTT
GACCAGGATGTTCTCTGAGGACAGGTCGGAGTTTATTGCCAGCTTTGACGAGTATGACCTGCTTATCATT
GACGATTTGGGTGTAGAGCGCAGTACCGAATATGCTATGGAGCAGATGTTTTTCGTCATTGACAGCCGCT
ATCGCAGCCGCAGACCCATGATTATCACAACAAACTTGAAACTGTCCGAGCTGAAAAACCCGCCTGATCT
GGCTCACGCTCGTATCTATGACCGTATTTTGGAACGGTGTGCGCCGATTCTTTTTGACGGGAAGAATTTC
CGGGAAGAAAATGCCGGTGCTACCCGACAGACAGCAAAAGACATTGTAAACAGTAAGCACGATTGA
>ref|NC_013316.1|:2058698-2059102 hypothetical protein CDR20291_1764 [Clostridium difficile R20291]
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TTGAACGAGTAAAGGAGGTCTTTGCGGAACATCTGCGGCAAAGCCCTGATTTTGAACTGCTCTGGTCGGA
CAAGGTAGGCTATGTCTGGCTGGCGATTGGCGTAAATCCAGTCTATGTGGATACCGGTACCAGAATCGAA
TCTGCCGCCGATCTCTGTTACAGGTGTTTGGACGATGTAGCTACGGATGTTTTATATATGACGGGCAACG
ATCACGCGCTGGAAGCAGCCGATCCGCTGGAATTGGCCGAAATCAAGCGGCGCTGGGAGCCATATATCAA
CCAGCTGCCAGACTATGCGTATCTCTGCAAAGACCTGCTGAACGGAAAAATGTAA
>ref|NC_013316.1|:2059876-2060253 hypothetical protein CDR20291_1765 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGCATTTACCAAAGAAAATCCATCACAACGGCATCAGCTATACGCTGGTGGGAGACTACTATATCC
CCGATCTAAAGTTGTCGGAGGAAATCCGCCCCATCGGGCGGTGGGGTCGGATACACAAGGCGTTTCTGCA
AGAACACCGTCCCGGCCAGTACAATGAACTGCTTCTGTCGGGAAAACTCTGGACGTATCTTGCCGATCTG
AACGAGCAGGCCGATGACCGACTGGCGTGTATCATCTCGCAGATGCAGGCTGCGGAGGGCGTCACCGAGG
AACTGAAAGCCCGTGACCAGCTTGCATGGGTCGGGGGCATGAACAGCATCCGCAGCCGGGTAGAGGAAAT
CATCCTGTCTGAGATGATTTTTGTCTGA
>ref|NC_013316.1|:c2061518-2060670 transcription regulator (yobd protein) [Clostridium difficile R20291]
ATGTACGCAAAGCTGACAATCCCGGAGCGGCTCAAAGACCTGCGGGTGGTAGATAAGCACCTGACGCTGG
AACAACTGGCGGAGCAGACCGGCCTGTCTAAATCCGCGCTGGGAAAATACGAAACCGATGACTACAAGGA
CATCAGCCCGTTTGCGATTGCAACGCTGGCGGACTTTTACGGCGTGTCCACCGACTATCTGATGGGGCTG
ACGGAAAATAAAAATCACCCAAACATAGAACTTCAATCTCTGCATCTGAGTGATGATATGGTGGAACTTT
TGAGCAGCGGCAAAATCAACAACCGGCTTCTCTGCGAACTGGCTACCCACCCGAATTTCCGGCGGCTGAT
GATAGATATGGAAATCTGCATCGACCAGATCGCCAATATGCGGGTGGAGCAGATGAATCTGGTGTTGGAG
GCCACCCGGCAGACCGTCATGAACAAGTATGCACCCGGAGAAGATGACCTCTATATGCGGACGCTGGAAC
TGGGGCAGGTGCAGGAAAGCGATTTTTACAGCCACGTCATGCACGATGATCTGGACAGCATCGTCCGGGA
CATCCGGGAAGCACACCGCAAAGACAAGACCACCGCCGACCCGCAGCCCACGCTGGATGATGTGAAGGAA
AAATTTGAGCAGGCCATAGGGCAGGGCAGCGATACAGAAATGCTGATCCACGAGTTCTGCGATAAGTTGC
AGATACCCTTTGAGAAGATTTCCTCGGAGGACTTCTCGGCGTTCCTGCGGATACTGAGCCTGTCCAAGCA
GCTCAAAAGCTCCAACAATATGAGGGGAAAGGCCAGCCCCATTCCTCCCAACCGCAAGGCCAGACGTAAG
CGGAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:2061695-2062177 hypothetical protein CDR20291_1767 [Clostridium difficile R20291]
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CCGATACGCCGGGAGAAATTCCGGGCAGGAGCGGCTTGCAGGCAGACCGGCAGACAGAAACAAGTTTATC
AATCATGCGGGGCGCATGGCTCCGCAGCAAAGAAACGGAGGAAATCATTATGACACTGAGTATGAAAGAA
AAGAAGATTCTCTACGCTTACGGCTGTCCCAGCCACCACAATACGGTGACACGGCTGAAATGGCTGACGG
CACTGACGGTTGACCCGGAGGCCAAACGCCGGATGCTGGGGCTGGCCCGGAAGGTGGAGACGGAGGTGGG
CGAAAACTGGTACGAGGATTTTTACCACCATCTGCGGATGGAGATGGACGAGTACCGCCGCCTCAAGCGC
AGCCTGCGTGTGCTGAAATCTTACACTGATTATGAGGAGGATCTGTATGAGGAAGCTGTCTAA
>ref|NC_013316.1|:2063137-2064138 hypothetical protein CDR20291_1768 [Clostridium difficile R20291]
GTGGAGGCCCAGAACGCCCGGAATGAGAAAACCCGGCACACGGAGCGCAACCGCACCGTGGAGGACTTGC
TGAAAAACAACAAGACCTGCCCGGAGGAAAGCATCTACCAGATCGGCACGATGGGAGAATCCGTCCCGCC
GGACACGCTTTTTTCCATCGTCAATGAGTTTTATGAGGAATTTGAGCGCCGCTTCGGTTCCCATATCCAC
ATCCTGGACTGGGCGCTCCATCTGGACGAGGGGACGCCCCACATCCATGAGCGGCACGTCTTTGACTGTG
AGAACCGCTACGGGGAACTGTGTCCCCAGCAGGAAAAGGCGCTGGAAGAACTGGGCATCCCTCTCCCAAA
CCCTGAGAAGCCCAAAGGCCGGAACAACAACCGCAAGCAGACCTTTGATGCGGTTTGCCGGACGATTCTG
TTTGACATCGCCAGACGGCATGGGCTACATCTGGATCAGGAGCCGTCCTACGGCGGGCGGGACTATCTGG
AAAAACAGGATTATATCCTGATGAAACAGAAGGAGCAACTGGCGGCGCAGGAGCAGAAGCTGGAAGAACT
GACGCTCAAAATTGAGGACGTGGAGACACTGTTAGATGATGTTTCCGATGCGGCCTATGACAAGGCGGTG
GAGGTGGTGACCGATACCGTCCGGCAGGAGACGCACAAGGAAGATATTCGTCTGGTGGAGGAATCGAAAA
AATGGGTGCTTTCGCCGGAGCGCAAAGCTCCAAAGAAGGAACGTGAGTATGCCGCTGAGCGTCTGGATGG
GGTCATTACCAAAATCAAAAACGCCATGCAGCACGCTCTGGCGAAAATCCAGCGGACGCTGATGCAGCCG
GAAGTCAAGCAAGCCGGGAAGGAGCAGGTCAAGAAGAAAGCCAAAGAATCCATTATGGATATTCTGGCAA
AGGCAAAAATTAATGCTGACCGGGATAACCGGGAGCGTTGGGAACGTGAGGGGCGAATCGCCCCGACCAA
AAAGAACGATATAGAGTTGTAA
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GCTGTCAGGCGGACGGGGATGTGATTGATTTTACCGCCCGTCTGTTCGGGCTGAACAAGAAAGATGCGGC
CTTGAAGCTGGCGGAGGATTTCTCGGTCGGCTTTGACGCTAAAGGCCATGACCCGCCCCGCAGGAAGCCG
GGCAAGCGAAAAATCAGCGAGGAACTGCGCTACCGGCAGGCGGAACAGAAATGTTTCCGGGTGTTGTGCG
ATTATCTGCATCTGCTGGAACGCTGGGAGAAGGAATATGCCCCGCAGACGCCGGAGGAAGCATGGAACCC
GCTGTTTGTGGAGGCCCTGCAAAAAAAGCCGTACACGGAGTATCTGCTGGATATTCTGCTGTCCGGCAGT
ATGGAGGAACGGGCCTGCGTGGTCGCTGAGTATGGAAAAGAGGTGAGGAAGATTGAGCAGCGAATATCAG
AGTTTACCGCCAGCCACCCGGCAGGCCGTCATGAGCGCAGCCGAAGCTTTAGCGCCGGAGCAGAGCGTTG
A
>ref|NC_013316.1|:2064800-2066158 hypothetical protein CDR20291_1770 [Clostridium difficile R20291]
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AGAAGGGCCAGCCCGCCAACACCATCGGCAACTGCCGGACGGTGTTCTCCCATGACCCTCTCCTGCGGGA
CGCCATCCGGCTGAACCTCCTGACTGACCGGGTGGACATCGTGCGGGATTTGGGCTGGCGCAGGAACACC
AGCGCCCTGACGGATACGGATGTGAAGTATCTGCTTCTCTATTTTGAGCAGAACTACGGCCTGACCAGCG
AGAAGAAAATGACGGCGGCGCTCTCCATCGTGGCGAATGAGAACTGCTACCATCCCATACAGGACGTGCT
GAACGGCCTTGTGTGGGACGGGACGCCCCGCATCCGCTCCTGTCTCCATCACTTCTTAGGTGCAGAAGTC
AGCGATTATGTAGAGGAAATGTTAAAACACTTCCTGCTGGGAGCCATCCGGCGGGTGTTTTCTCCCGGCT
CCAAATACGAGGAAATGCTCTGTCTGGTGGGCGGACAGGGGGCTGGCAAGTCCAGCTTCTTCCGCCTGCT
GGCGATCCGGGACGAGTGGTTCTCCGATGACCTGAAAAAGCTGGACGATGACCGGGTATTTTTGAAGCTG
CAAGGCCACTGGATCATTGAGATGTCAGAGATGCTGGCCACCAGCAGCGCCAAAAGCATAGAGGAAATCC
GCTCGTTCATCAGTCGCCAGAAGGAAACCTACCGCACACCCTATGAGGCCCAGCCCAAAGACCGGCTGCG
GCAGTGCGTGTTCGGCGGTTCATCCAACACGCTGGACTTCCTGCCCCTTGACCGGGCCGGGAACCGGCGT
TTCCTTCCCATCATGATTTACCCGGAGAAAGCGGAGGTTCACATTTTGGAGGACGAGGACGCTTCCAGAG
CCTACCTGTTGCAGGTCTGGGCGGAGGCCATGACCATCTACCGCAGCGGGAAGTATTCCATGAAATTCAG
CAAGTCCATCCAGCGGCAGCTTGTGGAGGTGCAGAAGGATTTCATGCCGGAGGACACGGAGGCCGGTCAA
ATACAGGGCTTTCTGGAACATTATACCGGCAGCATGGTCTGTTCCAAACAGCTTTTTAAGGAGGCATTGG
GCCACACCTATGACGAGCCGAAGCGGTGGCAGCTTCACAATATCAACGAGATCATGAATACAGTGGTGAC
GGGCTGGAAGCCATTCTCCAATCCCCGGATGTTCGCCGGATACGGCAGGCAGAAGGGCTGGGAACGGGAC
GTTTCCGGCAACGAACTGCCCGGCAACGAAGATGGATTTGTGGAACTGAGCGAGGAAGAATGCCGCCAGT
TGGAGCTTCCGAAGGAGTGGATCGCCTGA
>ref|NC_013316.1|:2066666-2068318 hypothetical protein CDR20291_1771 [Clostridium difficile R20291]
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GCGACAATGAGAGCATGAGCATCAGCAACCAGAAACTCATGCTCCGGGACTTCGCAGAAAAGCATGGGAT
GTTCCAGTATGAGTATTATGTGGATGACGGCTATACGGGTCGCAATTTCAACCGCCCCTCGTTCCAGCGC
ATGATCGCTGACATTGAGGCGGGGAAAATCGGCTGCGTCATCACGAAAGACCTATCGAGGCTCGGTAGGA
ATTATATCGAAGCTGGCAGCTATATCGAAATCTTTTTCCCCAAACACAATGTACGCTATATCGCCGTCAC
GGACGGTGTGGACAGCCTGACCCGTCAGGAAATGGACATCACGCCCTTTAAGAATATCCTGAACGATATG
TACAGCCGGGATATTTCCAAAAAGGTGCTGGCGGGACGCATGACCCGTTCCCGGCAGGGAAAGTTCTGCG
GCGGGCAGCCGCCTCTTGGCCTGATGCGTGACCCGGAGGACAAAGGGCATCTGATCCTTGACCCGGAGAC
TGCGCCGGTGATCCGAAAAATCTATGATATGGCACTGGACGGCTGGGGCTGTATGCGGATCGCAAAGCAG
CTCATGGATGATAAAATCCCCATCACCAGAGTAAAAAGCAATACAGAATGTGACGTGAACTACTATTCAT
GGGGGAGCGCAAGGATCAGCCATATCCTGAGAAATCCCTTTTATAAAGGCGCACATCTTGTCTGCCGGAC
ACACCAGAAAGGCATCCGCTCCAACACTTATGACATTATCCCCCGTGAGGATTGGGAGGTCATCGAGGGC
TGCCACGAAGCGATTGTGACGCCGGAGGAATGGGAACAGGTACAGGACATCATTGACCGCAGGCCAACCA
TTATGAAAGGCAACGCCTGCCCCTTCTATAACCTGTTCCACGGGCTTGTCTACTGCGCCACCTGCGGGAA
GTCCATGCAGGTGCGGTATGAAAAGGTCGGCAGAACCGGGAAGAACCGCTTCACCGGCGAAATGCGGGAG
CCGATTGACAGGGCATACTATATCTGCCAGACTTACAACCGGCTGGGCAAGAACGCCTGTACCAGCCACA
AGATTGAGGCAAGGGATTTGTACAATCTGGTGCTGAAGGATATACAGGAATTGGCGGCGCAGGCCATGAA
GGACGCCGATGCGTTCTACCAGCGGCTCAGCAGCCGGATGGAGCGCCGGTATCTGGTGGACGCTTCCCAG
ACAGAGAAGGAACGGAAACGGCTGGAAGACCGGAATCAGGAAATTGACGGGATGTTTTTGAGCCTGTACA
CCGATAAGGCCAAAGGCGTCCTCACCGAGCAGCGGTTTATGAAGCTGACGGCGGCGCTGGAACAGGAGCA
GGAAGCCAATCAGAAACGCCTGCACGATCTGGCGGTGATGCAGAGCCGGGCGGACGCACAGGAAAGCGAA
GTCCGAACCTTTATCAAGGAAATCCGGCGCTATGCCGCCATTGCGGAACTGGACGAGTCCGTACTGAACC
GGCTTATCAGCAAAATCCTGATCGGCGAGGTTAAGAAGGTGGACGGTCAGAAGGTGCAGGAAGTCAGAAT
TGTTTATAACTTTGTCGGGGAAATCCCGGAGATTGCAGCGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2070518-2068845 hypothetical protein CDR20291_1772 [Clostridium difficile R20291]
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GCGGAAGCATACAGCACCAAAAAATGATACTTCAACGCTATGCGGACGAACACCATTTTTTGAACACAAA
GTTTTTTGTGGACGACGGATTTTCCGGCGTGAGTTTTGAGCGCGAGGGGCTGCAAGCGATGTTGCAGGAA
GTGGAAGCCGGACGAGTGGCGACGGTCATTACCAAAGACCTTTCCCGTCTTGGCAGAAACTATCTGAAAA
CGGGCGAACTCATAGAGATTGTATTTCCCGAAAACGGAGTACGCTATATCGCGATCAACGACGGAGTTGA
CACAGCGCGGGAGGATAACGAGTTTACCCCCTTGCGGAACTGGTTTAACGAGTTTTACGCCCGCGACACA
AGCAAGAAAATCCGCGCAGTTAAACAGGCACAGGCGCAAAAAGGCGAGCGCGTCAACGGGGAATATCCAT
ACGGCTATATCCCAGACCCGAACAACCGCCACCACCTTATACCCGACCCGGAAACCGCGCCGATTGTCAA
ACAGGTTTTCGCTATGTTTGTTAGCGGCGTGCGTATGTGCGAAATCCAAAAATGGCTTGCGGAAAACAAA
GTCTTGACGATTGGAGCGTTGCGCTATCAGCGTACAGGACAGGCGCGGTATCAGCGGGCAATGATCGCCC
CCTATACTTGGCCGGACAAAACGCTCTATGACATATTAGCAAGGCAGGAATATTTAGGGCATACCATAAC
CGCGAAAACTCACAAGGTATCCTACAAGTCGAAAAAGACCCGGAAGAACGAAGAAGAACAACGCTATTTC
TTCCCAAACACCCATGAGCCGCTTGTTGACGAGGAAACCTTTGAACTTGCGCAAAAGCGGATTGCTACCC
GCCACCGCCCGACAAAAGCAGCGGAGATTGATATTTTTTCCGGCTTGCTGTTTTGCGCTGGTTGCAGACA
TAAGATGTATTACCAACAGGGCGTAAATATCGAGCCGCGCAAGTTTTCCTATTCTTGCGGCGCATGGCGC
AACAGGGCAAGGACAGGCAGCGAGTGTACCTCTCATTATATCCGCAAAAACGTACTTCTTGATTTAGTGC
TGGAAGATATGCGGCGGGTTTTGCGGTATGTTAAGGAACACGAACAGGACTTTATCTGTAAAGCTACCGA
GTACGGCGACATGGAAGCGAGAAAGGCATTAGCGCAGCAGCAAAAGGAACTTTTCAAAGCACAGGCGCGT
ATGACCGAACTTGACACGCTTTTCCGCAAGCTGTATGAGGACAACGCATTAGGCAGACTGACAGATGAAC
GGTTTGTGTTTCTAACTTCCGGCTATGTGGACGAAAAGAAATCCCTTGCCGCAAGGATAGACGAGTTACA
ACAGCAGATCGCAACCGTTACCGAGCGAAAAAGGGATATATCAAGGTTTATTCAGATTGTCGGGAAATAC
AGCGACATACAGGAATTGACCTATGAAAACGTCCATGAGTTTATCGACCGTATTTTGATACATGAATTAG
ACCGGGAAACCAACACCCGGAAAATCGAAATCCATTATAGCTTTGTCGGACAGGTTGATACCGAGCAGGA
GCCGACGCAAGTTGTCAACCATGACCGCCGCAACATGGTAGATGTAAAAAGTATCGCTATCTAA
>ref|NC_013316.1|:c2071891-2071454 hypothetical protein CDR20291_1773 [Clostridium difficile R20291]
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TCGGCGAAGCGAAAAGCCACCGCCGCACTCTTGCGAAACGCGCAGCACGCGAAGTTACTTTTTCGGATTT
GAGCGAAAGCGAACTCGCGCAGCTTTTCACAACGGACGAATACGAAAGCGATTATTTCCGTTTTCAAGTG
TCCGGCTTTGATGTACTCGTCAAAAATGAACTGCTTGCCGAAGCCCTTAACGCTTTGCCCGAAAGGAAAC
GCGACATTATCCTTTTGTCCTACTTCTTGGATATGAGCGACGCGGAAATTGGCGAACTGCTGAATGTTGT
ACGCACGACGGTTTTCCGGCACAGGAAATCCGCGCTTGCGAAAATCAAACAGTATTTGGAGGGAAAAGCA
GATGATGAATACCGTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2073348-2072365 hypothetical protein CDR20291_1774 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACGTTTACCTAAATATACGCCTGCGGAAGTACGGAATGATCCATACGGATTTACTTACAAAGAAA
TGTCGGAAGTTATTGGCGAGAATGAAGCAAAAGCCTTATATGAAGAATTATATAAGCAATTACCACGCAA
AAAAAATCTATCAATGTTGGTAAAAAATATTTGCAAAAGCAGTGATACTGAAAAGTATGTTTACGAACTG
AAAGACAACAAATACATTGAAACGGTTTTTATCAAGCGGCGAGATGGTGGAACTGTTTGCGTGAGCACAC
AAGTCGGTTGTCCTGTTGGTTGTATTTTTTGTGAGTCCGGGCGAAATGGCTTTGTTCGTAATCTAACATC
GTCAGAAATCGTACAACAGATTATATTGTTGCGTCGAAAAGTAAACCGTATCGTTTTTATGGGTATGGGA
GAGCCTTTATTCAATTATGACAACTTGATAAAAGCAATCCATATTCTCCGAGATAGATATGGGCTCAACT
TTCCAACCGACGGCATTACCATATCAACAGTTGGTCCGGTCGATCAATTAAAAAAATTGCGCGAGGAACA
TCTTAAAATTCAGTTGACAATATCTTTACACGCAGCAACACAATCTGCAAGAAATCGTATTATTCCTCAC
ATGCGCATATATGCTATTGAAGATGTTGTTAAGCAAGCCTTATCCTATTCTGAAAGGCATAATCGCAAAA
TTGTCTTTGCGTATTTGCTTTTACCGGGTATAAATGACCGGCCCTCAGATGTAAGACAACTTGCAAAATG
GTTTCGGGGCAAAAAAGTTATGATTAACGTGTTACAATACAACCCAACAAGCAATTCAAGAATTAAAGCA
CCACAGAAACGGGAAATAGTTGCATTCAAACATCAATTAGAGCAAGCAGGACTTGAAGTTACTATGAGAG
TTTCTCATGGCAGAGAGATTAACGCGGCTTGTGGACAGTTAGCTAACACATATAATAAATTCAAAAAAAA
ATGA
>ref|NC_013316.1|:c2075183-2074593 hypothetical protein CDR20291_1775 [Clostridium difficile R20291]
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ACGGACTTCATGCTGCCGAGCGTATCCGGCAAATGGACGAAACCGTGGGCATTATTTTTCTCACTACTCT
TACACAGTATGGGCTTGAGGGATATAAATACCATGCGACGAACTACATCATTAAGCCCATGAAATATGCC
CGGCTCAAATCAGAAATGGACAAATTCTTGGAGCGCAGCCAGAAAGAAGATACCCCCTCTCTGGTGATTA
CCAACGATACCGGCAAATATAAGGTGCCGCTAAAATCAATTCGATATGTTGAAACATATAACCGCAATCT
GATGTTCCATACCGAGCAGGAAAATATTATCTGCTATAAGAGCATGAAAGAAGTGGAACGGGAGCTTTGC
GACAAAGACTTTGTGCGCTGCCATACCAGCTACATTGTCAATCTGTTCTATGTGAAAGGCATCAAGAAGC
TGGACATTGAATTGATTACAGGCGAGATCATTCCCATCAGCCAGCCGAAACGGAAAGAATTTATGGAACG
GCTGACGGACTATTGGGGGGATATGCTGTAA
>ref|NC_013316.1|:2076020-2076331 putative conjugal transfer protein (putative single-stranded dna binding protein) [Clostridium difficile R20291]
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GGCTACTTTAAGAAGCGTGAAAAAGAGGGAAAGACTTACAAAAACTTTGTAGTGAAGTCATATAACAAGA
TTGAGAAGAAAGAAGAAAATGAGGAGGAATAA
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CAGATTTGAAGCTGCCGGAGGAACATCGCCCTATCGGAAAGTACGGACGGATGCACCGGGAGTATTTAAG
AGAAGTCCACCCAGCCAAATTGAACACCTTGACCTTGACAGGGGAGTTATGGACATACCTTGCAGACCTG
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AATTGAAACGAACCCAACAAATGGAATGGGTGCGGCGTTGCAATAACATTCACAACCGGGCAGAAGAAAT
TATTTTGCAAGAGATGATTTATTCATAA
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TTGGCATCGGATACCCGGAAATGATGGTGCTGTATGCGCTGGAATCCATGGGAGAACTGACGCAAAAGCA
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TATTTACTGTTGGAGGCCAGCGAGGGCGATAAACGTGAGAAGCGGATCGTCTTGACTGAAAGCGGACAGG
TATACGCCCACAGAATGATTGCGCCTTTACGAAAAGCCGAGGAGAAGGTTTATAGAACAATCGGGAACGA
ACGGCTCCAAGCCATGTGTGAAATTCTTGACCTTTTCAATCTTCTCTTTGAAAGAGAGCTGAGAGGAGGT
CTGGGCAGTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:2077802-2079103 hypothetical protein CDR20291_1779 [Clostridium difficile R20291]
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ATGCCATCGTTGACGGTTTCTTTGTAGGCAACTCAATCGGGGATGCCGGACTTTCCGCAATCAACATTGC
ATATCCCATCACGGCGGTCCTGCAATCCGTAGGGACAGGAATCGGAATGGGCGGTTCAGTCAAATACTCC
ATTCTGAAAGCAGCAGGAAATGAGAAAAAAGCACGGGAGTTCGTTGCCGGTGCAACATGGCTGATGCTTC
TTTTCAGCGCTGTCCTGACTGTCACCGTTTTCTTCACTTCAGAGAAAATCCTTTCTGCCCTTGGTGCATC
GGGCGAGTTGCTTACTCTGGGAAATGAGTATATCAAGGTAATTGCCCTTGGAGCGATTTTACAGGTGTTC
GGCACCGGACTGGTTCCGTTTATGCGTAATTACGGCGGTTCTTTGTGGGCAATGATCGCTATGATCTGCG
GCTTTGCTACCAATATTGCTCTTGACTATACTTTTGTGTGGGTTCTTGGACGGGGCATGTACGGTGCGGC
ATTGGCGACCATTATTGGGCAGGGAGTTACCATGGCGGTTGCACTCGTGTATTGCGCCATCAAAAAGAAC
CTCACTCTGAAAATCGCACCTGTTGATACCCCGAAAACGGCATTTCAGATATTAAAAATCGGACTTGCTC
CATTTGGCTTGACCCTTGCCCCAAATATCTCTCTTGTGATCATCAACCGATTTTCGGTTTATTATGGCGG
ACAGGAGGCTATCGCCACCTATGCCTGTATCTCCTATATCATCTGCATTGTTTATCTTCTTTTGCAGGGT
GTCGGTGATGGTAGCCAGCCGCTCATGAGTCAGTTCTACGGAGCAGGCGAAGAAAAATCGCTCAAACAAA
CCAAAACGCTGGCGTATGAATTTTCCATGGTTTTGGCGGTAATCAGTGCGATTCTGATTTACCTGCTCCG
TGGAAAGATTGGACTACTGTTCGGTTCATCTGCCGAGGTAAACGCAGGGGTCATAAAGGTCATGCCGATC
TTCCTTGTGTCGGTTCCGTTTGACGCCATCACACGAGTTTCCGCGGCGGCTTTCTACGCAACCGAAAAAA
GTGTGCTGTCCTATGTTCTGACCTTTATCGAACCCATCATCATGCTGGTGTTGATGCTGATGCTGCCGCC
GGTGTTTGGCGGTCAAATCACGATTTGGTGGAGCGCCGTATTTGCAAAGGTCATTACCGCATCAGTAAGC
ATTGTGCTGTCCGTTAGATACAGCGCACAAAGAAATCGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2080003-2079197 hypothetical protein CDR20291_1780 [Clostridium difficile R20291]
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AACTATCAAAGCTGACGGGTATTTCCAAATCTGCTCTCGGAAGTTATGAAAAAGAGGATTTTAAGGAAAT
CAATCATGGCAACCTTATCACGCTGGCAGACTTCTATGGGGTTTCCGTTGATTATCTACTGTGCCGGACA
GAGAACAGGGAGCAGATCAACACGTCATTGACGGAGCTGCATTTGAATGATGAGATGGTTGCTCTCCTGA
AAAGCGGTCGGATTAACAACCGTCTGCTCTGTGAGCTTGCCACACATAAAGATTTTATCAAGTTTCTTGC
AGACATTGAGATTTATGTGGACGGGATTGCCACCATGCAGATTCAAAATCTCAATGCACTTGTCGATACC
GTCCGGCATGAAATCATTGAACGGTATCGCCCCGGCGAAGATGACCCGCATTTGAAAGTGCTGCAAGCCG
CCCATATCAGCGATGATGAATATTTCAGCCACATGGTTCTGGATGACCTCAATCTCATTATCCGGGATAT
TCGGGAAACTCACAAAAAGGACAGTGAGAGTGCGCCCCAGACCACCGTTGCCGATGAACTGAAAGAAAAT
CTGGAAGCGGTCGAAAATTTCAAGGGCAGTCGGGATGAAAAGCTGGTCATCCTTTATTGCAAGCAGCTCG
GTATCAACTATAAAAATCTGTCGGAAGAAGAATTCCGCTGGCTCATTCGGATTCTCAAAAAATCAAAGAA
AATGGGAACGCCTATCAGCCAAAGGAAAAAACGGTAA
>ref|NC_013316.1|:2080672-2081013 hypothetical protein CDR20291_1781 [Clostridium difficile R20291]
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GGAGGACGAGAACGGAATCCTGTTTGTCTGCTTCCCTGTCACAGCCATTGCCGCAGTCCTGTCCCGCAGT
CCCATGACGGTCAAGCGTTCTCTGAATGAACTGGAAACCGCCGGACTTATCATGCGGGTGCGTCAGGGCG
TTGGAGAACCAAACAGGATTTATGTGCTGATACCGGGAAAGGAGGACGCTGCCCTTGCCTGA
>ref|NC_013316.1|:2081006-2081302 hypothetical protein CDR20291_1782 [Clostridium difficile R20291]
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CCATTAATGATGAAAAGGTATTGCAGCACCAGTTGAAGCAGCTTACCCGAAAGGAACGGACGCACCGGCT
CTGTACCCGTGGCGGTATGCTGGAAAGTTTTCTGCAAGAGCCGGAACGCCTGACAGATGATGATGTCATG
CTGTTATTGAAACTCATTTTTCACAGGCAGGACACGCAGGAACTATTGAAAAAACTGCTGGAACGGAAGA
AGCCGGAAACCCCTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2081929-2081768 hypothetical protein CDR20291_1783 [Clostridium difficile R20291]
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GGAGACCTTTTTCAGATTTCCTGCTCGGTGTGCCGCTATGTGGGCGGCGGGTATTTAATTGTAAAAGTTC
GGGGCAAGTTGACCCGATGTGA
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CTATGAGGGCAATGGACGAACATGGAAAATGGCTTCCCAAGAGCCGCAAGGTTTATGACCTTGACGAAAA
CGGGGAACGGATAAAACTTCCGTCCGGCAGATGGAAAAGCCACAAGGAGGATACGGTGGATTGGAACGAC
CAGAAGTATTGCGAAATCTGGCGGCATGAATGGGAGGTCATCCAGAACCGCTATCTGGAAGCCAATGACC
GCCCAGAGCGTGTGGACTTGCGTTCCTATGCCAGACAGGGGCTTGATATAGTCCCCACTGTCCATGAGGG
GACTGCTGTCCGGCAGATGGAAAAGCGGGGTATCCAGACGAACATCGGCAACCTGAACCGGGACATCAGA
GCCGCCAACCGCCTGATGAAGTCTATCCGGCAGCTCATTCAAAACCTCAAAGGCTGGATTACCGAGCTGG
GAGAAAAACGAAAAGAACTGCTTGCACAAAAGGCGGCGGAGGAAGCGACACTTCTTCCCAATCTGCTGAT
GAAGTATATGGAGATACGAAAGGAAGAACGGAAGGACTGGACAAGGGCTGGACAGAACCGGGGGACTTCA
CAGGACTTAAAGGCAGTCAGCGAAGCCCTGTCCTATCTCCGGCAAAAGGGGCTTTCCACTGTGGAGGACT
TAGAAGTATTTCTGGAATCTTCCGGGAAATCAGCCGCCGATTACCGCAATCAGATGAAGCCAAAGGAAAC
CCGCAGCAAAGTGATTGACGGGATTCTTGCCAGCCGGACAGACTGCCAGGAATGTAAGCCTGTCTATGAG
AAATACCAGAAGATATTTTTCAAAAAAACAAAGGAGAAATTCAAACAGGAACACCCGGAGGTTGCCCGGT
ATGAGAAAGCCGCCGCCTACCTTGCCAAGCACCCGGACGATAAGGACAGCACCCAAAAGGAGCTGCAAGA
GGAGCAGGAAACGCTTCTGGAAGAAATTGCAGCTCTGAAAACACCGCTGACCGAGGTACAGGAGGATTTG
AAGAAGCTGCGGGACATCCGCTACTGGGTACGGAAAGCCACACCCGGCACAGAGGAAAGCAAAGAGCCGC
CCAAGAAGCAGCCCATCAAGGAAGTCTTGCAGGATAAGACAGACGAGAAAAAAGCACAAAGAACTGCCCC
GGAGCAGACAAAACACAAACAACAGGATATGGAACTTTAA
>ref|NC_013316.1|:2084201-2085529 hypothetical protein CDR20291_1786 [Clostridium difficile R20291]
ATGCAGCCGCCCCAGAGCATTGAGGAAATCAAGGCGGGGCTGGGAACTACCGAGAAAGGCGGTGTCCGTC
AGAGCATACGGAACTGCCTGACCGTATTCCAGCGTGACCCGCTGCTTTCCGGGGCTATCGCATACAACAT
CCTGACCGACCGCAAGGACATCATAAAGCCCATCGGCTTCCACAGGGAAAGCACCGCCCTGAACGATACG
GACATGAAGTATCTGCTTCTCTATCTGGAAGAAACCTACGGGCTTACCAATGAGAAGAAGATTGATAACG
CCATCGGGATTGTGGCGAATGAAAACAAGTACCATCCCATCCGGGACTATCTCAATACCCTTGTGTGGGA
CGGGACAGAACGAATCCGTTTCTGCCTGCGGCACTTTCTGGGGGCTGACGCAGACGATTACACCTATGAA
GCGTTGAAGCTGTTCCTGCTGGGCGCAATCTCACGAGCCTTTCAGCCGGGATGCAAATTTGAAATCATGC
TCTGTCTGGTAGGCGGTCAGGGGGCTGGCAAGTCCACCTTCTTCCGTCTGCTGGCAGTCCGGGACGAGTG
GTTCTCCGATGATTTGCGGAAGTTGGACGATGACAATGTGTACCGCAAGCTGCAAGGTCACTGGATTATC
GAAATGTCGGAAATGATGGCAACCGCCAACGCCAAGAGCATTGAGGAAATCAAGTCATTTTTAAGCCGAC
AGAAAGAGGTTTACAAGATACCCTATGAAACCCACCCAGCAGACCGCCCCCGTCAGTGCGTGTTTGGCGG
CACTTCCAATGCCCTTGACTTCCTGCCCCTTGACCGTTCCGGCAACCGCCGCTTTATCCCCGTCATGGTG
TACCCGGAGCAAGCCGAGGTTCACATTTTGGAGGACGAAGCCGCTTCCAGAGCCTATATCGAGCAGATGT
GGGCAGAAGCGATGGAAATTTACAGAAGCGGCAGGTTCAAGCTGGCTTTCAGCCCTGCCATGCAGCGGTA
TCTCAAAGAACACCAGCGGGATTTTATGCCGGAGGACACCAAAGCCGGGATGATACAGGCGTATCTTGAT
AAGTACACCGGGAGCATGGTCTGCTCCAAGCAGCTCTATAAGGAAGCCTTGAACCATGCCTTTGACGAGC
CGAAGCAATGGGAAATCCGGGAAATCAACGAGATTATGAACCAGTGCATTTCTGGCTGGCGGTACTTCCC
GAACCCAAGAATGTTTTCCGAATATGGCAGACAAAAGGGCTGGGAGCGTGAAAACCCGGCAACGGACTTA
TGCAACCCGTCTGAAAAAACGAGGGACGGTTTTGTGGAGGTCTCAGAACAGATGGAGCTTCCATTCTGA
>ref|NC_013316.1|:c2085797-2085558 hypothetical protein CDR20291_1787 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATCTCTGTTTTGTTTTTTGCCATAGGCAGTTATCCTCCATACATGAAAATAGCCAGACAGAGGGTG
TCGGCAACGAAGTCCGGCAACGGGCTTCAAAAGACCTTGCAAACAATCTCAATCTGGCGATGGTTACTAT
TTATACTTTTCTTTTATTTTTCTGTTGTTTTGGTTGTCATAGGGGAGAAAAGCCCAGAAATAAGGGATTT
TCCCCGGCAACCGGCTCGGCAACGGGATAG
>ref|NC_013316.1|:2085969-2087639 hypothetical protein CDR20291_1788 [Clostridium difficile R20291]
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TCTATTGCAGACTGTCAAAGGACGATGACCTGCAAGGCGAAAGTGCCAGTATCGCAAACCAGCGTGATAT
GCTGGAAAAATACTGCGAAAAGCAGGGATGGGAGGTTGTGGCAGTCTATCAGGACGATGGCTTCACAGGT
CTTAATATGGAGCGTCCTGATTTACAGAGAATGTTGAGAGCCATTGAGCGCAGGCAAATCAACCTTGTCA
TCACGAAAGACCTCAGCCGACTGGGGCGTAACTATCTGCAAACCGGGCATTTGATTGAGGACTTTTTCCC
AAGAAACGGTGTCCGCTATATCGCCATGAATGACGGTATCGACACCCTGCGTGATAACAACGATATTGCC
CCGTTCAAGAATATCCTGAACGAGATGTACAGCAAGGATATTTCCAAGAAAGTCCATTCCTCTTATCTTC
TGAAAGCGCAGAAAGGACAGTTTACCGGGTGTCTTGCCCCGTTTGGGTATCGGAAAGACCCGGAGGACAA
AAACCATCTGCTCATTGACGAGGAAACCGCCCCGATTGTGCGACTGATTTTCGGATATGCCCTGAACGGT
CATGGTCCGAACTATATCCGCAGACGGCTGGAGGAAGAAAAAATCCCCTGCCCCACATGGTGGAACCGGG
AACGGGGGCTTCGCAATACCCGCACCAAATGGGAAAAGAAAGACCCAGAAAAAGGACGGTATATGTGGGA
CTTCTCCGTCATCAAAGACCTTTTGATGAATCCCGTCTACACCGGGGCGATTGCTTCCCAGAAAAAGGAC
TACCGTTTCAAAATCGGCACGATTGGGGAAAAGAAGCCGGAGGACTGGATTGTGGTGGAGGGGCAGCATG
AACCGCTGATTGACCGCATGAGCTTTGACATTGTGCAGAATAAGCTGAAATCCCGCCAGCGTCCGGGGCA
GACCAATGAAATCAGCCTGTTTGCCGGACTGATAAAATGCGGCGAGTGTGGGAAGTCGCTGACGGTACGC
TACACAAACGCAAAACATCCTCAGCAGATTTATTCCTGCAAGACCTACAATGCCTTTGGAAAGAACCACT
GCACCCAGCACCGGATTGATTATGACACCCTTTACAGCCATGTGCTGCGGAAAATCCGGGAATGTGCCAG
AGCCGCCCTGATGGACGGGGAAGCGGTTGCCGACCGCTTGACCAATACCTGTGAAGCCGAGCAGCGGGAA
CAGCGGGAAGCAATGGAACGCTCCCTCACAAGGGACGAGGAACGGATTGAGGTTCTGGACAAAATGGTAA
TGCGGCTTTATGAGGATATGATTGCAGGGCGTATCAGTGAACAGAATTTCAACACCATGCTGGAAAAGAC
ACAGACCGAGCAAGCGGAGCTTAAAGCAAAAGTGTCCGAGGGCAGAAAGCGGCTGTCCGATGAAGTCCAG
CTTGCCAATGACGCAAAACAATGGGTGGAAGCCATTCAGGAATACGCCAATATCACAGAGCTGGACGCAG
CCACCCTCAACCGCTTAATCAAAGAAATCGTCGTGCATGAGCGCATTGACGAAGATAAAACAAGACACAT
TTCTATCGAAATTCATTTTAATCTCAAACCCATCCCAGAGGTGGAACAGGTCACTGCCTGA
>ref|NC_013316.1|:2087833-2088696 putative conjugative transposon membrane protein [Clostridium difficile R20291]
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TAGAGTCCATGTTTCTTGACATCAACGATAAAGTTGGTGCAGTTGCAACAGATGTAGGAAAAACTCCTAT
GGGGTGGAACGGAGATGTATTTGCCTTTATTAAAAGCATTAACGATTCCGTCATTATTCCCATAGCAGGG
CTAATCATCACAGCAGTCCTTTGTATCGAGCTTATCAATATGGTAATGCAAAAGAACAATATGCACGATA
CAGATACTTTTGAATTTTTCAAGTACATCATCAAGATGTGGATTGCTGTATGGTTAGTATCACATGCATT
TGAGTTTTCAATGGCGGTCTTTGATGTGGCACAGCACATGGTAAATAAAGCGGCAGGGGTAATCAATACT
TCTGCCGTTATCTCCGGAGATCAGATAGTAAAAATGGTAGATGGATTAAAGGATAAAGGTCTTGGAGAGC
TTGTCATGATACTCTTTGAAACCTCGCTTATAAAGGTGGCAATACAGGTCATTTCAATTGTGATTATGCT
TGTGGTTTACGGAAGAATGTTTGAGATTTATGTTTACTCATCCATTTCAGCCATTCCATTTGCCACAATG
GGAAACAAAGAGTGGGGACAGATTGGAACAAACTATATCAAAGGATTGTTTGCCATAGGTTTACAAGGAC
TCTTTTTAATGGTTTGTCTTGGAATATACGCAGTATTAGTTAAGACAATACAGATAACAGATATACACAC
AAGTACCTTTACGATACTTGGATATGCGGTTTTGCTAGGGTTAATGATGTTAAAGAGCGGAACACTGGCC
AAAAGCGTATTAAATGCACACTAA
>ref|NC_013316.1|:2089315-2091708 putative conjugal transfer protein [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAAACGAAAAGGCATTGAGAAGTCAAAAGCGGGACTTAAAGAAAAGTAATTGCAAGTCAAAAAAAG
ATAAGGGAGGAATCCTTGACCTTATCTTTAAGAAAGAACCGAAAAGATATACGGTAGAAGATACCATTCC
CTATCTAAGGCTTTTAAAAAGCGGAATATGCCAGCTTGATGAAAAGCACTTCAGTAAAAGTATAGCCTTT
CAGGACATTAACTATCAGCTTGCCTTAGATGAAGATAGGGACTTGATTTTTAATCAATTTGCAAACTTCC
TAAACTCTTTTGATCCAAGTATCAGCATTGAGTTTTCATATATCAATCAGCTCGGACGAAACGAAGAAAT
GAAGTCGGCAATTCAGATACCGGATAAAAAGGACGGTTTCGACGATATACGCTTTGAATTTAGAGAGATG
CTTAAAAGCCAGATTGTAAAGGGAAATAACGGATTGAAAAAATCAAAGTATGTAACCTTTACAGTGGAAG
CGGATAATTTAGAACAGGCAACATCAAAACTTGAAAGACTGGAGATAGATATATTATCGAGTCTTAAAAG
TATGGGAGTAAGAGCAGAAAGCCTAAACGGAGAAGAAAGGCTAAAGATACTTCATGATGTTTTAAATCCA
AATAAAACATTTAAATTTTCCTACAAAGACCTAAAGAAAAGGGAAAGCACAAAGACATATATTGTGCCTG
ATGAGTTTAACTTTACACCGAGTAGATACTTTAAGTTCGGCAAATTCATCGGAGCAACAAGTCATTTTCA
AATCCTTGCCAGTGAGCTTTCAGATAGGATGTTATCCGAGTTTTTGGATATTGACGATAACATCAATATT
TCCTTTCATATTAGGGCAATCGACCAATCGGAAGCCATTAAGATGGTAAAACGAAAAAACACTGATATTG
ATAAGATGAAAATTGAGGAAAATAAGAAGGCGGTAAGAAGCGGTTATGATATGGACATTCTTCCATCGGA
CTTAATTACCTATGGTGAGGATGTAAAGAGCCTCTTAAAAGACTTGCAGACAAGAGATGAGCGAATGTTT
GTGGTAAGTATCGTCTTTATGAACTTTGCAAGGACAGTGCAAAAGCTCGATAACACAATTGCTCAAATAA
GCTCCATTGCAAATAAGCATAACTGTAAGCTGAAAAGACTTGACCATTCTCAGGAACAAGGTTTAGTGAG
CGTGCTGCCTCTTGGTGTAAATAAGATTGAAATAGATAGAGGATTGACAAGCTCATCAACGGCAGTATTT
ATGCCATTTACCACAGAGGAGCTTTTTATCAATTCAAGTAATAGTCTTTACTACGGACTAAATGCCCTAA
GCCATAACCTGATTATGGCAGATAGAAAGAAATTAAAGAACCCAAACGGTCTAATCCTCGGAACTCCGGG
CAGCGGTAAGTCCTTTAGTGCCAAAAGAGAAATGGCAAATGCGATTTTAGTAACAGATGATGATGTGATT
ATCTGCGATCCGGAAGGAGAGTATGGAAACCTCGTAAGGCAGTTTAAGGGAGAAGTCATTAAGGTCAGCA
GTAAGTCGAAGGATTACCTGAATCCTCTTGATATAAACATGAACTACGGTGATGGGGATGCACCGCTGAA
AGACAAGGCAAACTTTATCATGAGTATGCTTGAGCTTGTAGTAGGCGGTAGTGGTCTTACAGCAGAAGAA
AAGTCCGTTATAGATAGGTGCCTTCCTAAAATCTATGAAAAGTATTTTGAACATCCTACTCCTGACAATA
TGCCGATACTTCAAGACCTATACGATATGTTAAAAGGGCAGGAAGAAAAGGTCGGTAAGAAGCTGGCAAC
AGAGATGGAAATCTATGTATCGGGGTCTCTCAATGTCTTTAATCACAGGTCAAATGTGGATTTAAATAAG
AAGCTCCTTTGTTTTGATATTAAGGAGCTTGGAAGTCAATTAAAGAAAATCGGTATGCTTGTTATTCAGG
ATCAGGTGTGGAATAAGGTGTCACAAAACAGAGGAAACAAGGCTACAAGGTACTATATCGACGAGTTCCA
TTTGCTTTTAAAAGATGAGCAGACAGCATCCTATTCCGTAGAGATTTGGAAAAGATTTCGTAAATGGGGA
GGTATTCCAACAGGTATTACGCAGAATGTCAAAGACCTACTTATGAGTAAGGAGATAGAAAATATCTTTG
ACAATACAGACTTTGTCTTAATGCTTAATCAAGCATCAGGAGATAGGGAGATACTTGCAAGAAAACTTAA
AATCTCACTTCCACAGCTCAGATATGTTACTAATTCAAATGAAGGTGAGGGACTCTTATTCTTTGGAAAT
ACCATTGTGCCTTTCATTGATAAGTTTCCGAAAGATACAATTTTATATCAGAAGATGACTACCAAGCCGG
AAGAAGTGAGGTAG
>ref|NC_013316.1|:2091712-2093844 hypothetical protein CDR20291_1791 [Clostridium difficile R20291]
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GTAAAACAGATACGATACCTGAAGAAAGTAAGCTAAAACATAACGATGATTACAGAGGTAAAATCGTTCA
TGAGAAAGAACGGTTTCAGGATAAAGTGCATGAAAAAACAAGTAAGGTAAGTGCTGATAATGAAAAGTCT
TATGGAACATCCAAGAGAAACGAAAAATATAGAACTTCAGATAAGGGAGACGTAAATTCCGCAATTGAAA
CGGGAAGATCAGATTATATTACGGAGGTTAAGGATGGAAAAATCTATGATCCTTTAGGAAAAGACCTTGA
TAATGACGGGATTATAGACAGATACGATAATGACTTTAGAGACAGCAACTATTTTGAATCGACCTATGAT
GTGGAGGATAATCTTTCCCATAAAGAAAAATCATTAGAAAATTCCTTTAAAAATCATAAGACTCAAAAAA
GCAGGTACAAGAGGAAGAACTATTCTGAAAGCCTTTATACAAGGAAAAAGGACGATGCACCAAAGGGAAA
TAAGGCTGATGATAAAAAGGCGGGAAAAGATGCTGTCAGCGGAAAAGTTTATAGCAGCCTATCAAAAGAC
CAAAAGAAAAAGCTAAAAAAAGACATGGTAAAGGTATCTGCCCTTTCAGGACTTGCTAAAGGAAGTGAAA
CTGTAAGAGATTACTTGTCTCATGGAAGTGATGAAAATCAAGGAGTGGAAGCAGGAGAAAAGACAGCAGA
TACAAGCTCCAAGCTCATTCATGGCATAAAGAAGTACTCTGATAAGAAAAGAGCTAAAAGAGGCTATGAC
CTTACAAATAAGGACTATAAAATCAGAAAGCGTAAGTCAAAGTTGGAATTTCGTGATGCCAAAAAGGAAC
TGAAAAAGACGGATGAGTATAAAAGAGCAAGTGCATATAAAAGATTTCAAAAGAAAAATCAGGTAAAGGC
AGCAATTTCTCGTGAGAATAAGTCAAGGCTTAGAGATCGAATTAAAGAGGGACTTATCGGAACACTGAAA
AGCTCAAAGGATATGATTATCCGAAAAGCAAAAGGACTAATGCTTATTTTCATAGGTATCATTATCTTAG
GGACTTTTGTGATTAACTTTGCAGGAACGGGAATGACAGGCTTTATGAACTCTACAAGCTCTGTGCTTAC
AACAAGCTATTTATCAAAGCCAAATGTCCTAAGTGAAATCAATCAGAAATTTTCAGATATGGAGGGTGAG
CTTCAAAGTGAAGTTGACTATGTGAAAGAAAATTATCCTGGATATGATGAATATATCTTAAATAATACAG
AATACATCGGTCATAATGTCCATGAGCTTTTATCCTACATTACATCAAGGTGCGGAGAGGTAAAGAGTGT
ATCGGAAGTAGAATCCATATTAAAAGAATTATTTGAGTCCATGTATGACCTTGAGTATAGGGAAGAAATT
GAAATCAGATACAGGACGGTTACGGAAACCTATACCGATGAAGATGGCAATGAATATACCGAAAGCCACG
AAGAACCTTATGAGTATAAAAAACTCATCGTAACGCTTCATAAAAAAGAGATGGACAGTATTATCCGAAA
GGTCTTTGCAAACTATCCCGATAATCTAAAGCACTATGAAGCCTTGTTCCTTGCACAAGGCAATATGAGA
GAAGCCTTTGGTAATTCTGACCTTATCAGTGCAAATGGAGGTATCGGCGGTGGAAAAGAGTATGAGGCAT
CTACGGAAGTACAAAAGAAGATTGTTAATGCTGCATACATTACGCCATCTCCGGGTGCAGGCTGGTGTGC
CATGTGGGTATCACAGGTCTATCAAAATGCAGGACTTGGATATATAGGCGGGAATGCCTGTGATATGTAC
CGAAACTATACCTTTACATCAGACAGGTCAAAGCTAAAAGTGGGAATGCTTGTGGCAGTTGAAAGCAGCA
GTAGCGGAAGCAGTGCAGGGCTTACCTATGGTCATGTAGGTATTTACATTGGAGATGGAAAAGTGATTGA
TAACATCGGTCGAATAAGAGTAACTACCTTAGATGATTGGATAGCAACATTTTGTAAGCACCATCCCGTA
GGATTCGGTTTTCCGCCAAATGTAAAGAAATAG
>ref|NC_013316.1|:2094070-2095611 putative cell surface protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAACCAGTTTGAAAAAGAATAATAAGTTTTGGACGGTAGCACTTGCGGTAATTGTAAGTATTAGTT
GTATTTTAGGTCTTTGGACGGTTGTTTATGCACAGGAGCAAAAATCTGAAGCTCCAACAAAAAACGAAGC
TGTTCAAACGGAAGTTGAAGTAAATGTAAGGTATATCTTTGAAGATGAAAAGGTCTTTAAGGAAGAAAAG
ATAAAGGCTGAGAAAGGACAACTTATTGATAGCGGAGATCTTCCAATGCTCCCAGATGATATGAAATTCA
TTGATGAATTTCTGTTTTATGAGGTAAAGGGAGATGGAAAAGATGAGATTATCCGTAAGGTAGCAAAGAT
GGAGGTTAAGGATAAGGAAACGCAGACGGAAGAAGAAAAGCCAAAGCAGGATGAATGCACTCAGACAGAA
GATAAGGGAACGCAGACAGAGCTTTCTAAAGACGATATTTCAAAAATAGAAAAAGAGGCAAAAGAGCTTC
AGGATAAACTTGATAAGTTAAATTGCGAACTTAAGGACAAAGACAAATTAAGTGATAAGCAAAAGAATAA
AATTAAAGACCTTGAAGATGAAATTGATAGCCTGAAAGAAAAAATGAAGAAAGATAAGGGAAATAAGGAC
TTATCAGAAGATATGAAAAAGGAAATAGATAAGCTGACGGAAAAGGTGAAAGAGCTTGAGAAAAAGGCAA
CTGAAACAAATAAAGCTCCTGTAACATCACAATCAGTTACACCGATTAGTCCTATTTCCGGAATTAAGAC
AAGTTCAGGTATTTCTCCTCAAACACCACAGACTTCTGTAAGTAGTACCGGTAAAGGCTCATCGGATTCG
GTAAGCTCAGGTAATACTACAAAGGATACCGGTAAAGGCAAAACGGAAGTAAAGGAGAAAGAAAAGGAAG
TTCGCTATCCCAATAAGTTGACGGCAAAAGCTCCTGCGAATAACAGTCAGGATTCATCAATGGGGTCTGC
AAGTAAGAGTGTAAACACCAACAAGGGAGTAGCTTCATCTCCGTCAAAGGCGAGAGCATCCGTTACGGAG
AATAAAGATAATGCAAATAAGGAGTATCCGATTCATCATGGAGATAGCAGCGATAACAAAGAAACGGATC
AGTATTCGGCAGATGCAAGGCAGTTTATTACCTTTCAAACGAAAAACGGTAAGACTTTTCATTTAATCAT
CAATCATGATGAAGATAGTGAGAATGTAATGCTTCTTACGGAAGTATCTGAAGATGATTTGCTTAACATG
GTGGAGAAAAAAGAAGCACCAAAGCAGGAAGTAGTAAAAGAAGAACCTGTTAAGGAAGAAGTAAAGCCTG
AGAAGAAGGACGAAAAGAGTAATTTAGGAACCTATATTATTTTGCTTCTTGTAGTAGGTGGTGCATTAGG
AGCAGGCTACTATTTTAAGGTTGTGAAAAAGAAAGAAGATAAAGAACTTGAAGCCTTAGAGGAGGAAGAT
GATGATTTCTTTTCTGAATCTGAAAGCGAGGAAGAAATAAATGATGCAGATGAAGTAGAAGATGAAGAAT
AA
>ref|NC_013316.1|:2095706-2097412 putative DNA topoisomerase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGTTAGTTATTGCAGAAAAGCCGAGTGTTGCAATCTCCATTGCAAAGGTTATTGGAGCAAATAAAA
AGAAAGACGGATATTATGAAGGAAACGGATATAGGGTGAGCTGGTGCGTTGGACACCTAATTCAAATGGC
AAATCCGGATGCTTATGATGAAAAGTACGCCAAGTGGAATATGGCTGATTTACCGATTATTCCGAGCGAC
TACAAGTATGAAGTAGCAAAGGCAACCAAGAAGCAGTTTAACATCCTTAAAAAGCTGATGAATGATAAGG
AGGTTGATACGGTTATCAATGCGTGCGATGCAGGGCGTGAGGGAGAAAGTATTTTTAGACTTGTATATAA
TCAAGTGAATTGTAAAAAGAAGATGAAACGCCTTTGGATTTCTTCAATGGAAGATAGTGCCATTAAAGAG
GGTTTTGATAACCTAACAGACGGAAAAGACTATGATAATCTCTTTGAATCGGCACAGGCAAGAGCTATTG
CGGATTGGTTAGTCGGAATGAATATTAGTAGGCTCTACTCTTGTCTGTATCAGCAAAATTACAGTGTTGG
CAGAGTGCAGACACCTACCCTTGCCATGATTGTAAAAAGAGATGATGAGATAGCAAATTATCAGAAAGAA
AAATATTACACAGTAGAGCTTTCTATGAATGGATTTACACTCTCCACAGACAGAATTGATGATGAAGTTG
CTGCTGAACAGCTTATAAGTTTAGTAGGCGATAAGATTGAAATTACTGATGTTATTCAAAAAGAAAAAAT
TACAAAGCCTGATTTACCTTTTGACCTAACTACGCTTCAAAGGGAGTGCAATAAATATTTTGGATATAGT
GCCAAGCAGACACTTGACTATACTCAAAGCCTGTATGAAAAGAAACTGATTACTTACCCCAGAACAGACA
GCAGATGTTTAACAGAGGATATGATTGTGAGTACAGTCAACAACATTTTGGGTAAAAATGACTTTGATAC
AGAGCGTATCAAGGTAGTATTTAACTCTAAAAAGGTTACGGACCATCATGCAATCATACCGACAATCAGT
TCAGTAAAAGAAGATGTTTCTGAATTACCTTTAAGTGAAGCAAAAGTTTACTTCCTTATATCCGATAAAT
TTCATGCAAGTGTAGGCTATCCGCTTATTGAAAATACAACAAAGATTGTAGCTTCATTTGACGGTTTTGA
ATTTACAAGTTCAGGTAAGGTAATTAAGGATGAAGGCTTTAGCAAATACCTTAAAGAATACAAATCAAAA
AAGAGTGAAGATGCTGTATTGCCCGATGTAAGTGTTGGTGATGTTTTGAGCGTTGAAAATAAAGAGGTTA
AAGAAAAATTTACCCAACCTCCGAAACACTTTACTGAAGATACGCTCTTAAAGTCTATGGAGATTGCGGG
AAATGATGCCTTAGAAAAAGGTGTAGAGGTGGAAAGAAAAGGTCTTGGCACTCCGGCAACAAGGGCAGGA
ATTATTGAAAATCTAATCTTTAAGAGATTTGTCGAAAGAGATAAGAAGAATCTAATTGCAACGCATAAAG
GAATCAGCCTTGTAACGATTGTAGCAGATACCTTTAAGTCGGCAGAAACGACAGCAAAGTGGGAAATGGA
ATTATCTGATATTGCTCAGGGTAAATCCTCTAAGAAAGAATTTTTAGATGCGATTGAAAATGAGATAAAA
GAAGCGGTTTTGACATATCGCAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:2097497-2098300 hypothetical protein CDR20291_1794 [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTAAAATAAATGTTGAAGGTTCAGAAATCAGCATTATTGCCATAGACAATAGAGATTATATTTCTT
TAACGGATATGGTTAGAAATATTGAGAACGGTTCTGCTTTGATTGAAAAGTGGCTCAGAAACAAGAATAC
AATAGAGTTTTTAGGTATTTGGGAAGAAATGTATAACACGAATTTTAATTCCCCCGAATTCGAGGGAATT
AAAAATGAAGCAGGATTTAACCGTTTTATATTATCGGTCAAGCAATGGGTGGAAAAAACTAATTCTATCG
GTATCGTTGCGAGAGCAGGAAGATATGGTGGAACTTATGCTCATAAAGATATAGCGTTTGAGTTTGCTTC
TTGGGTATCGCCATACTTTAAATTATATTTAATCAAGGAATTTGAACGCCTAAAGGAAGAAGAACAAAAG
AAGTTAGGATGGGATATTAAGAGAAATTTGGCAAAAATCAATTATAGAATTCACACAGATGCCATTAAAA
ACAAACTTGTACCGGATAAACTTTCAAAAGAAAAAATCAATTTTATTTATGCAAGTGAAGCGGATATTCT
TAATGTTTCTCTATTTGGAATAACAGCTAAGGAGTGGCGTGATGAAAATCCGGATTTAAAAGGCAATATT
AGAGATTATGCGGATATATCACAGCTTGTCTGCCTTTCTAATCTTGAGAATCTTAATGCGGTATTTATAA
ATGAAGGCATGAGCCAATCTGAAAGATTGGAAAAATTAAATGCAATAGCTATTGAACAAATGAAGATACT
ATCTGAAAGTGAATCAATTAAAAAATTGAAATAG
>ref|NC_013316.1|:2098383-2107112 putative helicase [Clostridium difficile R20291]
ATGCGAATAAATGATTTTCATAACATTTTGGAGCTAATAAAACAAGATGTTTTGTATAATGAAGCAGAAT
ATCTAAAGCTCCTAAAAGTTGTCGGAAACAATCAAAGGTATGATTTTAGAAGTCAATTAAGTATATATGA
TAAAAATCCTGAAGCGACAGCCTGTGCCAAGTTCGACTACTGGAGGGAACGCTTTAACCGAACGGTTATG
CGAGGGCAGAAAGGGATACCAATTTTAGAGGATTACGGCACATATAAAAAGGTGGACTATATCTTTGATA
TAAGCCAGACAGTTTCAAAAAACAGGGATGTCAACGAGGTCAATCTTTGGAGATTTGATAAAGAAGCCCA
TCAAGATGTCTTAAAGGAAATGATAAAAAGCGAGGGCTATGAGGAAAGTGAAAGCACACTTGAAAACATC
TTTTCTTTAAGCAGACTCTACGGTGATGAAAAAATAGATACCTTAATGAATGAACTTAGAGTAGCGGATG
AGGATAGAATATCATTTACCAAGTTTGTAAGGGACTCGGTAAGCTATGCGGTAGCTTCAAGATTTAAGTT
AGATTATCCGATGGATTATGAGCTTTTAAGAGAAAATTTTCAAAGATTTGACAGCATATCCTTAATGAGC
CTTGGTGAAAGTGTATCGGATATTAGCGGAAAGATTATTGATGAAACCATTCAAAAAAGCAAAGAGCTTG
AGCTTCAAAAAGAAGTTTTAATAGGAAAAGAAGCGGGATATAATAAAATTAAAGAAGAATTAGAGGAGGT
AGAAGAAAATGTATTTCGACGAGATGATCAGGAAAGAAATGAAAACGAGCGAGTTCTCCGAAATGGAGAG
TACGGACGAGATAATAGAAAAAATCAGGGAGAATACGCTAAACAGCTTGGAGGAACAGACGGACTTTATA
AGGAAGTATCCGAATCCGACCTACGCAGTGATGAGGCTGAATTACCTTTCACAGAGCGAGGAGCAGAGCC
ACTTCGAGATGCTTTTGGATCTATACAAGGAGAAGAAGCTGACAGGACACCTGATGGATATTCAGAAACA
GGCAGTAGAGTTTATGAGAGCAGAGAAGCCAAAGTTGATAGCAGCTTGGAAGATAGAGGACGAGAACAAT
CCGCAGTATGGGGCGATGATTTCAGCTCTCAAAGAAATGACCATCAAGGAAGTAGTGGAGATTTAAAAGA
CAATACGGATAAAGGGATAATAGAAGCTGAAAAGGCTTCTTTTTCTTTACCCGAAAATTCTTATGGACAG
ATAAGCCTTACTATTCCGCTAACTGAGAAGGATATAGATACCGTCCTTATTAACGGAGGAAATCATGATG
GCGGTAGGCTTCCTGTTATTGCTGAGTTTTCAAAAGGCAAGAGCATAGAAGAATTGGGAGAATACCTCAA
AGATACCTTTAAAGGCGGAAACGGATTTTACATTGATGAAAGAGAAGTATCTTCCTGGTATTCGGATAAA
GGTATTCATTTAGCTTATGGAACATCGGCAAGAGAGGATAATACACAAATTTTAAGTTGGAGTGATGCAG
CAAGTAGGATAAATGAACTTCTTGACAGAGGTGAGTTTGCTACAAATGTAGAACTTTTAGAGGCACAGGA
CTATGAAAGGGATAGAATTTCAGAATCCTTATGGTATCTAACGCACGATTTAAGCGAAGAAGGAATAGAG
CAAGGATATTTCAACTCTTTTGAAAGAGGTGGTGGCTTTCCGCAAGAAACGAAAAGATTATCTGAAGCAT
TAAAAAATCCTGAATATCTGAAAGAAACAATCAAAGAATATAGCAGGTTTTTAGAAGGATACAAAGAAAG
CAGAAATGTATTAAGGTATCATTATCACAAGGTAGATAGTCTTTATCAGAAGTTGCAAGAACTTGAGCTG
CAACGAAAGGAATATAGTACCAATCTGACAGAACTTCCGAAGGTAAAGCTCTTTATTACAGAAGATGAAG
TCCTTGAAAGCCTTTCAAGAGGAAGCGGCGTTGATAGAGGAAAAGAACGAATCACCAAGTTTTTTAAAGA
AAATCATACTTTGCAGGAAAAAGCCAATTTCCTAAAAGATGAATATGGAATCGGAGGACATTCTCACGTT
GTGTCAGGTGCAATGGGAAGTGATGAATGGCACGATGCAAAGGGTTTTAAATTACAGAAGAATGATTGTA
ATGATGTGTTCCTTACTTGGACAAGTGTTGCAAAGCATATTGATGAGCTGCTTTCTAAAAAACTTTATTT
TGAGGAAAAGGAAACAGAAAGTACGGCAGAGATAGAAGAAGTAAAAGAACCGCAATATTATTCTAAAAAT
GATCCTGGAAATCTAATGCCTGATGAAATTCTTGAAAGAGTGCCAGAGATTTACGCACAGGAGGATGTAG
ATTTAGCGGATAAGCAGGTTCATGCAGCATATATTATTCCTTTTCGTTCAAATTGGACTTGGTATATGAC
GGAGTATGACAGGGAAAGCGGTGATGCCTTTGGACTTGTTCTTGGAATAGAGCCTGAATGGGGATATTTT
AACCTTGAGGAACTGAAAGAATTAAATGCCCAGAGGCTCATTTTAGAGGATTTTCCAAAGACCTTTAGAG
AACTTAAAGATATAGAGCTTATAAAACAAATGGATGAGCAGGAGCTTCAGTTTGTCTTTAATGGAGAACT
TAGCTTTGAAGATAAAGTAGAGCTTGAAGCACCTGAAGAAACAGAAGAAGCTACAAAGCGTGGCACAGTT
CAAGCTACCTTATTTGATTACCTCAAAGAAAGAGAAGAAGTAGAACTGAATGAAAAAGAGGACAGCCTTT
TAGAAGAGTTTGCAGTTAAAGCAGGCGATACCGTCTATTTTAATCATGAAGAATATAAAGTCAGAGAAAT
TTCTAAAAATGAAATCACAGGAAGATATGATTTGTGGCTTGATCCGGTAAGAAGTGGAAACCATCAAATT
CCGATTGTAGACTTTACAGATAATGAGGACTTGCTGAATAAAATAAGTCTTGAAAGACCGAACTTTATTG
TCGGTGATGAAGTTAAATACAAGGACAAAAACCATACCATAACACGCTTTGATGATATGAGAAAGAACCT
AAATACGGTAACGGTGAAGGACAACACCGAGTATTTTGGCGGGATGATAACAAGCTTCGATGTCATTCCT
TATCGTCTGGAAAGCGACCTTGAGAGGGTATTTGAAAACCTGACATATAAACAGCCAGAGCAGACTACTG
AGGAAACTCAAATAAGGAAAGCGGAAGCTCATAACTTTAAAATTACAGAAGAAACGCTCCCTGAAAAGTT
AAGTCCAAGCGAAAGGTTAAATAATAACCTTGAAGCAATTTCCATGCTTAACAGAGTGGAGAGCGGACAA
AGAGAGCTTGACAGTACAGCTCAGGAAGTTTTAGCAAGGTATGTAGGCTGGGGCGGACTTTCCGAAGTCT
TTGATGAAAGCAAGGAAGGTCAGTGGAAAGAAGCAAGGGCTTTTCTAAATGAGAACTTATCACATGCAGA
ATACGAAGCTGCAAGAGAATCTACTTTAACGAGCTTTTATACACCGAAAACCGTAATTGACGGAATATAT
AAGACGCTTTCGGATATGGGATTTAAACAGGGAAACATTTTAGAACCATCAATGGGCATCGGAAACTTTA
TAGGCAATATCCCTGATGAAATGAATAAGTCCAAGTTTTATGGCATAGAACTTGACTCGGTAAGCGGTCG
AATTGGAAAACTACTATACCCTGAAAGTGAAGTGCAGATTAAAGGACTGGAAGAAACCTCCTTTTCCAAT
AACTTCTTTGATGCGGTTATCGGCAATATACCCTTTGGAGAATATAAGGTAAATGACAGGGAGTATAACA
AAAATAACTTCCTTATCCATGATTATTTCTTTGCGAAATCCATTGATAAAGTCAGAAACGGCGGTATTAT
CGCCTTTATCACATCAAGTGGAACAATGGATAAAAAGGATGAAAGTGTAAGACGCTATCTTGCAGCAAGA
GCAGAGTTTTTAGGGGCAATCAGACTTCCAAATGATACCTTTAAGGGCATAGCCGGAACAGAAGTAACCT
CAGATATTATATTCCTAAAGAAAAGGGACAGTATCAGAGAAAGAGATGAGGACTGGATTCACCTTGCTGA
AGATGAAAATGGTCTTACCTATAACAAATATTTTGTAGATCATCCTGAGCAGGTACTCGGCACAATGCGT
GAAGTTTCAGGAAGATTTGGAAACACACTTGCGTGCCTGCCGAAAGAAAATGCCGACTTAAAAGAGCTTC
TGACAAAAGCAAGTGAAGAAATATCCAAAGGATCAACTTATGAAGAAATAGAGCTTTTAGATGATGAAAT
CACTTCAATTCCTGCAACGGATGATGTCAAAAACTTTTCCTATACCGTTATTGATGATGAAGTCTATTAC
AGAGAAAACTCCCTTTTCATCAAGAAAGAGATAACGGATAAGAATAAGGAAAAGATTAAGGACTATCTTG
AACTGAATACTGCCCTTAAAGATGTTATCTACAAGCAGAAAGAGGACTATTCCGATGATGAGGTAAAGAA
AGCTCAAGAAAAGCTTAATGAAGTCTATGACAACTTTTCAAAGAAGCATGGCTTTATAAATAATTTAAGC
AATACCAGAGCCTTAAAAGAGGATAGCAATTTCCCTCTTGTATCTTCCATTGAAATTCTTGATGAAGAAG
AAAACGTCAAGGCAAAGGGGGATATTTTCTCAAAGAGAACCATTACAAAAGCCAAAGTCATAGACCATGT
GGACACTTCCCTTGAAGCTCTTGTCTTATCGGTATCTGAAAAAGGCTATGTGGATTTTGAGTATATGGAA
AGCCTTACAGGTAAAGACAGACCAACTTTGATAGAAGAACTTAGAGGAGAAATTTATCTAAACATCAGAG
AAGAACAAAACTTTTATAGACCATTATCCTTTAACCTTGAAGATGGAGATTTGCCTTTCGCTTGTGCAAA
CGGCAGTAATTCATATAAGTACGGCTATGTAACAAAGGATGAGTACCTAAGCGGAAATATTAGAGATAAG
ATTGCCATTGTAGACAGCTACCTTGCAAAGTTAAGACAAACGGAACGAGAGCTTCCTCATCTTGGCTTTG
TTGAGAATGGAAAAGAAAAAGAGCTGATAAGCTATGAAATGAATCGTTTGGAATATCAAAAAGCAGAGCT
TACCAAAGTTCTTCCAAAGGAATTAGAAGCAAGTGAAATCAATGTGCGTCTTGGTGCGACTTGGATACCG
ATTAAAGATATTGAAAAATTCATCTTTGAAACTTTAAAAACTCCGGGATATGCAAGATGGGATATTAAGG
TTAAATTTTCAAATATTACAAGTGAATGGAATGTAGAGGGAAAAAGCAGGGATAAAGGAAATGACCTTGC
AGAAATGACCTTTGGTACATCAAGGGTAAATGCCTATAAGCTGATTGAAGATGCCCTAAATCTTAAAGAA
ACAAAGGTATTTGACCAGATTATAAATCCGGACGGTTCTAAAACTTCTGTCTTAAATAAAAAAGAAACCA
TGCTTGCAGGACAAAAGCAGGAGCTATTAAAAGAAGAATTTAAGAACTGGATATTTAACGATCAGGAAAG
AAGAAACCGTCTTGTAAAACTGTATAATGAGCGTTTTAACTCAATCCGAAACAGAGAATATGATGGAAGC
AATCTTTCTTTTGAGGGAATGAATACAGAAATTGATTTAAGACCTCATCAAAGAAATGCCATAGCAAGAA
GTCTTTATGGAGGAAACACATTGCTTGCTCATGTGGTAGGCAGTGGAAAGACCTTTGAGATGGTAGCTTC
CGCAATGGAAAGTAAAAGACTTGGAATGTGCAGTAAGTCTTTGTTTGTTGTTCCAAATCACTTAACAGGA
CAAATCGGTCGTGAATTTATGCAGCTATATCCGTCGGCTAATATTATGGTGGCTGATAAAAAAGACTTTG
AACCGAAGAACAGAAAGAGATTTATCGGAAAGATTGCCACAGGGGAATATGATGCGGTTGTTATCGGGCA
TACGCAGTTTGAAAAAATCCCGATGAGTAAGGAATATCAGGAAAAGCACATCCAAGATCAGATTAATGAA
ATCGTAAACTATGTAGAAGAATACAAGCATGACAGAAATCAGAACTTTACAGTAAAACAGCTTGAAAAGA
CAAAGAAAAAACTGGAAACAAGGCTTGAGAAATTAAATGATGATTTTAAGAAAGACGATGTAATTACCTT
TGAGGAACTGGGAGTTGATATGCTCTTTGTTGACGAGGCACATAATTACAAGAACCTTTATCTCTATACC
AAAATGAGAAATGTTGCAGGTATCGGGCAGTCAGAAGCCTTTAAGTCCTCCGATATGTTTATGAAATGCA
GATATATGGATGAAATGACAGGAGGAAAAGGCATAGTTTTTGCCACAGGAACACCTGTAAGTAACTCAAT
GACAGAGCTTTATACAATGCAAAGGTATCTTCAGTATGAGAGTTTAAAGAAAAATCACTTAGAGCATTTT
GATTCTTGGGCTTCCACTTTTGGAGAAACACAAAGCTCCTTTGAACTATCTCCTGAAGGAACAGGATATA
GGGTAAAAACGAGATTTTCAAAGTTCTATAACTTGCCTGAACTAATGAGTATGTTCAAGGAAGTAGCAGA
TATTCAGACTGCGGATATGCTTAACCTTCCTACACCTGAAGCTAATTATGAAGTTATTAAAACTGAGCCT
TCTGAAGAACAAAAGGAAATCCTAAAGAGCCTTTCTGAAAGAGCGGATGATGTCAGAAATAGGGTTGTAG
AGCCGGATGTTGATAATATGCTTAAGATTACCAATGACGGTAAGAAACTTGCCTTAGATCAGCGTTTAAT
CAATCCCCTACTTCCTGATAACCCTGATAGTAAAGTAAATGTATGCGTAAAAAATGTATTTGCTATTTGG
GATAAGACAAAAGAAAATAGGTCAACACAGCTACTTTTCTCCGATATGTCTACTCCAAAAGGAGATGGAG
AATTTAATATCTATGATGATATTAGAGAAAAACTTGTAGCAATGGGAATACCGAAAGAAGAAATCGCCTT
TATCCATGAAGCGAATTCTGATAAGCAAAAGGATGAACTCTTTGCAAAGGTAAGAAAAGGCGAAGTTCGT
ATCTTAATGGGTTCAACGCAGAAGATGGGAGCCGGAACGAATGTGCAAAATAAACTGATTGCACTTCATG
ATTTGGATGTGCCTTGGAGACCAGCTGATCTTGAACAGCGTGCGGGTAGAATTGTAAGGCAGGGAAATGA
AAATGAGAAGGTAAATATCTATCGTTATGTTACAGAGAATACCTTTGATGCCTACCTTTGGCAGACGATA
GAGAATAAGCAAAAGTTCATTTCACAGATTATGACCAGTAAGACTCCTGTTCGTGTGGCAGAAGATGTGG
ACGAAAGCAGCTTAAATTACGCCGAAATTAAAGCGTTGGCAACGGGTGATCCAAAGATTAAAGAAAAGAT
GGATTTGGATAATGAGGTTACAAAACTTAAAATGCTTGAAGCAAACTATAAGTCTAACCGTTACAGATTA
GAGGATAAGGTGGCAAAAAACTATCCTGAAGAAATCGCAAGAACAGAAAAGCTCATAGAAGCTGTCAAAA
AAGATATATCCAATGTAGAGCCTAAAGCGGAAGGTGAAGAAAAGTTTACTTCTATTACCATTGCGGGAGA
AAAAATTACCGATAAGAAATTAGCCGGAGAAAGATTACTTGAAGCTATTTCAAAGGTAAAAATCAATGAA
AGCAAGGTTATAGGAAAGTATAGAAATATGGATTTAGAGGTAAGCTATAACTTCTTTACTAATTCTCATA
ATTTCAGCTTAAACGGTGTTGCAAAGCATTTAGGAGAGCTTGGAACAAGTGCGGACGGTAATATCACAAG
ACTGGATAATGCCCTTGAGAAAATGCCGGAGAAACTAAATATGCTTGAAGAAAAGCTCATAAGTACAAAA
GAACAGCTTGAAAATGCCAAAGAGGAATTAAAAAAGCCTTTTGAAAAGGCAGATGAGTTGAAAACTAAGG
TATTAAGACTTGCAGAGTTAAATAAGCTGCTCGATATGGGAGAGGTGGAAGAAAAGAAAAATGATAATCC
TCTTGTGGAAGATGTAAAAAGAGCAATCATTGACTTCTGTAACAGAGAGTATGAAGAAAATCACAGTTAT
GATGAGTTTCATACTCTATATCCTGACTTAAAGCATATCGGTATCGCCTATACCAATACACCGGATGAAA
GACATGGTATTCAATATGAGCTTAATTTAGAGGAGAAAACTTGGACACAGTACATTGATGATACGCCTAT
TAAAACAGAGAGCTTTGATTATGAAAATAAGGGAGAAAATGAAGCTCTAAGAAATATGAAAAATGAAATT
GAGTTATCTACATTTAGTGATTTGGTTTATGTTGATTCTGAAGATTTAAGAGTAGCAACGGGACTTGATA
TTGACGATGAGGGTAACTTCTATGATCCGTTTGCAAAAGACCTTGATAATGACGGTATTCCGGATAGATA
TGATAGTGATTTTAAGGACAGTGATTATTTTGAGTCAACTTATGATGTGGAGGACAATCTTCATAGCAAA
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GTAAAACAGAAGAAAAACAAAAAATAAAAGAGCAGGAATTTTTAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:2107137-2107814 hypothetical protein CDR20291_1796 [Clostridium difficile R20291]
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ATAAAGACTTTGTTAAAGCGATTATAAGCATGGAAAAGGGTATCAATGATGAAAGTGCTTTAGATAAGCT
ATATGACGCTTATATGGACAATGATAGCCTTAATTTGCTGCATGAGGAGTTTGACTATATGATTGAGGAT
TTAAGGGGACAGGGGCAGATAAAAGACCTGCTTTATGTTCGGGAAGAAAAGGATAATCTTATCAATATTG
TCGGAAATATCGTTGGAGAAGTTGATGTAATTGAAAGGGAAAATAAGAACGGAGAAACCTTTAAGGTAGC
AAACTTCTCCGTAGTATCTAAAGATGATGAGGGAAATAAGTTATATCACAACTGCTCCGTTTATGGAGAA
AAGAGTGATATTCCAAAGGACTTTAAGCAGGGAGATTTTGTCAAACTCTTTGGGCAGATCAGAACTTCCA
TTGATGATAACGGCAAGGAGCATAGCAATATCAGGATACTTTCTTCAAAACTGTTAAAGGCAAAGGAACA
GATGAAAGGACAGGAAGAAAAGAAAGAATCTATACTTGGAGCTATCAAAAAATATCAGGCTGAAGATAAG
GAAAAACCGAAAGAAAAGAAAGAAGCAAGCAAAGAAGCTGAGAGATAA
>ref|NC_013316.1|:2108387-2110009 putative conjugative transposon DNA recombination protein [Clostridium difficile R20291]
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ATGGGATTAATATATTAGTTGGCAATAATGGAACAGGTAAATCTACAATTTTGGAAGCTATTAATCTGGT
TTTAACTGGAACTTATCATGGGAAAAATATTAGGAATGAACTTACTCAGTACCTTTTCAATAAGAATATA
GTGGAAAACTATATTAGAGAAGTCAACGAAGGAGTGAATGTAGAACCTCCTAAAATAATTATTGAAGCGT
ATTTTGATGCAGAAATGCCAAGTTTTTTAGGTGATGGAAATTCTGAAAAAACTAAAGACACCCCTGGGAT
TTGTTTATCAATTAGTTTTGATGAAAAATATAGCAATGAGTATAAAATGCTTTGTAAGAACAAGATAACA
TCGTTGCCAATTGAATATTATGAGGTAAGTTGGATGTCTTTTGCCAGAGAAAATATAACTGCAAGGAGCA
TTCCAATTAAGTCTGCAATGATTGATACGACAAGCTATACTCCTACCAGTGGGTCAGATATATACATATC
GAGAATAGTAAAGAATCTGTTAGATGATAATGAAATTATTAATATATCGCAAGCGCATAGGCTTATGAAA
GAACAATTTTCTAGAGATGAGAATATTGCTAATATAAATAGAAAATTAACGGAAACATCAAATAACGAAT
TGACAATTTCTGTAGATTTCGGTACGAAAACTTCATGGGAAAGCAGCTTGGTAACCCAATTAAATGAAAT
ACCATATAATAACATTGGTAAAGGTACACAATGTATTGTTAAAACACAATTGGCATTAAGTGATCATAAA
ATAGAAAATAAGCAGATTGTGCTTTTAGAAGAACCTGAATGCCATTTGTCATATTCAAACTTAAATATTC
TCCTAGATAAAGTAAATGAGTCAGTAAAAGAAAAACAGATAATAGTTACTACGCATAGTAGTTTTGTATC
AAATAAATTAGGACTTGAAAATTTAATTTTACTAAATCGAGGAAAAACACTACGGCTAGGTGATTTATCA
AATGAAACAAATTTATTTTTTAAAAGAATTGCAGGTTATGATACGTTACGATTATTATTATCAAATAAAG
CAATTTTAGTCGAAGGTGATTCGGACGAACTAATTGTTCAAAGAGCATATATGGACTCTCATAATGGTAA
ATTGCCTATTAATGATGGAATAGATATAATATCGGTTGGAATTTCTTTTTTAAGATTTTTGGAAATCGCA
AAATTGCTAGAATTACGTGTGTCAGTGATAACCGATAATGATGGAAATATTGATGCACTAAATAGAAAAT
ATAGCGATTATTTAGGAGATAATTGTTGTGAGAATATAAATATATATTTTGATGATAGTACCCATGAATA
TAATGGTTCTTTGGAAAATTACAACTATAATACTTTGGAACCGTGTATATATAGATCGAATTCCATGTCT
ATTTTAAACGAGATATTGAATAAATCATATGAAGATCCAGATGATTTACTTAAATATATGAAGGGGCATA
AAACAGAAGTTGCTTTAAAGATTTTTGAAAGTGATAAAGCTATAGAATTTCCACAATATATAAAGGAGGG
TATTCTAATATGA
>ref|NC_013316.1|:2110006-2111073 putative conjugative transposon hypothetical protein [Clostridium difficile R20291]
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ATACTCATAAAAAAATACTAATCCTAACATATACTATTACAAATGAGCAACAAATAATTAGCCGAATTAA
GAATAAAGTTGGTGTAATTCCTAATAATATTACAGTTTCTACATGGTTTTCTTTTTTGTTAAAAGATGGT
ATTAGACCTTATCAAGGAAGTAGATTTAAGGAACGAATTGAAGGAATTATATTTGTAAATGGACAGAACA
ATACGTACGTAAAGAAAACATCCAACAAATATTTTGCCAAAGATAACAGGGTATATACTGATAAATTATC
AGAGTGTGTTGTAGAGTTAAATGATAAATGTAATGGAAAAGTTTTTGAAAGAATCAGTGGAATGTATGAC
TGTATATATGTTGATGAAGTCCAAGATATGGTGGGGTATGATTTGGAAATATTAAAGTGTTTAATAGCTT
CAAGAATTGAAGTGATAATGGTCGGGGATCCTAGACAATGCACATATTCAACTCACTCATCAAAAAAATA
TAAAAAATATAGTTGTGGGAAAATAGATGAGTTTTTAAAAAATGAGTGCAGAAAATTAGATGTAAGAATT
GATGAAACGACACTTAATTGTACTTATAGAAACAATGATATTATATGTAAATTTGCGAATAGTCTGTATC
CAGAGAGAACATCTACAAATTTTGTGCGTAGAGCTGAAGATGAATCAGATGGTGTTATGATAATTGATAA
AGCAGATGTAGAGAAGTATTTGCAGAAATTTAATGCAATGCAGTTGAGAGAAAATAAAAGGACATCCGTC
AATAATGAATATCCATATTATAATTTTGGAGAATCAAAAGGCTTGGAATTCCAACGAGTACTTATATATC
CGACTCAACCGATGTGGGATTGGATTATTAACAATAACACATCTCTAAAAGAACAAAGTAAGGCTAGATT
ATATGTTGCTGTTACACGTGCTGAGAATAGTGTTGTTATTGTACGTAAAGATGCACGACCTTGTAGTCTA
CCAGTGGTGAAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:2111552-2112358 hypothetical protein CDR20291_1799 [Clostridium difficile R20291]
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ATTCATATTATGGAGAACAGAATGCAAATTTGGAAGAAATGATAAATTATATAGAGCAAACATTGTTGAT
AAAAGAGTATTTGCATAGTTTAGAATATGATGTTGATGGCTTAGATGACTTATTAAATACGATAAGTAAT
TCTTATGGACGTAAAGTTTTGAATCTTGGCAATGATAGTAATAAAAGGACGTATCTACTGTATAGAGCAT
TTTCCTTTATAACAGGAAATAATCTACCTACATATACTTTTGGCTGGTATTATGCTGGCAGTAATAAATA
TCAAGATATGGCAAAGGCGTTTGGCGATAGAATGGTCTATCCGTTTGTACTTGAGGTTGAAAATTATATG
AAAGATATTTCTACCGATATGGGGTACGATGAAAATAATGCTCTATATAATATCAATGTTAATAGTTCTG
GAGTTCAAGTCAATATTGCGGAACACGGAAGCACGATTAACGCTGACCAAGAAAATAAATTTAATACTGA
AGAAGTAATCAAGGCAATTAACAATGTAGAAGACTTAATTAAAGGTATGGAGGATGATAACTCCAAATCA
ATACTTAATCAGAATTTAGATAATATAAAAAATGAAATTAAGCAGAAGCATCCGAAGAAAGAAGTATTGA
CTACTTGTTTAAAAAGTATGCATTTTATCACTACTTCCGTAGCTTTAATTCCTGATTTAGCTTTAGGTAT
AAAAATGCTTGCATCATTGATAGGCATTTCAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2113725-2112394 putative conjugative transposon mobilization protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTATAACAAAAATACATCCTATAAAATCAACCCTTAATCTTGCCATTTCATATATTGTTAATGGAA
AAAAAACAGATGAGCAAATCTTAGTAAGCACTCATAAATGCCATCAAGAAACTGCTCATACCCAGTTTTT
AAGAACACGAAATGATGTTGGAACAAACGGAACTGTTCTTGCCAGACACCTTATTCAATCCTTTTTACCC
GGAGAAGCAAGTCCTAAAATGGCACATCAAATCGGTCTTGAACTGTGTAAAAAGATATTAAAGGACGAGT
ACGAATTTGTCTTATCTACCCACATAGATAAAGGGCATATCCACAACCATATCATCTTCAATAATGTGAA
TATGGTAACAGGCAAGTGCTATCAATCCAACAAGAAAAGCTACCACAAAATCAGGTATCAAAGCGATAAG
CTATGCAAAGAAAACAACCTTTCTGTGATTGATGAGTTTTACGAAAGCTATAAGAGAAAGTACAAAACAA
ATGGCAAGTCATGGTATGAAAATGAGCAATCTAAGAGAGGTACTTCTTGGAAAAGCAGACTTCAATTTGA
CATTGATCGTCTTATAAAACAGTCTAAGTATTGGGAAGAATTTCTAAAAAAAATGGCGGAGCTTGGTTAT
GAAATAAAGTATGGGAAACACATAGCCTTTAAACCAAAAGATAAGACAAGATTTACAAGAGCTAAAACGA
TTGGTGAGGACTATACAGAAGAAAGATTAAAAGAGCGTATTACAGAAAATCAATCTATTACAACTCCACC
TGTCAAAAGACGAATCGGAAATATCATCAATATGAATGCCAATGCCAAAGTGAAAGAGAGCAAAGGCTAT
GAATATTGGGCAACCAAACATAACTTAAATACAATGGCTGAGTCAGTTATTTTTATCAGAGAACATGGCA
TTAACTCCATTAAGCAGCTTGATAAATACATTCAAAAAAGTGCTGAAGAAAGACAAGACTTACAAGATAA
AATGAAAGAAATTGACAAGGATATGCAGCTACTTTCCGATACAATGGAGCAGGTTCATACTGTTAAAAAA
TATCGAGCCTACTACAAAGAATATAAAGCAAACCCTTCCGATAAAGCATTTTTTGAGGAGCATAAGGCTG
AAATTACACACTATGAAATAGCTCTTTCAAAGCTAAAAAAATCCTATTCAAAGCTGCCGAATTCAAAGGA
TATTTTAGATAAACTTAATAAACTGCAAGAAAAAAAGAATACCCTTATTCAAGAGTATTCTTCTACAAAA
TCTACTATGGACGAACTTTATCAAATACGAAAGAACTATGGAATTTACATGGGTAAGGAGATGGAACGAT
AA
>ref|NC_013316.1|:2114415-2115572 hypothetical protein CDR20291_1801 [Clostridium difficile R20291]
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GTAAAAAAAGTAATGAAAGCAATAAAATTAAAGAAGGACAATCTATAAGTTCTGAAGAGGCAGGTATGTC
AACTAATGAGAAGGATAAAAATGAAACATTTAAGCCATCAGATTATACTTTAAAAACAAAAAAAGAATAT
GTTTATGAATATTTAGGTCTTAAATTTAAACTTTCAGACAAATTTAAAAAGTATATGGATGATAAAAAGA
TAGCGATGTTAGATGATCAAAGTCCTATAGATAAAGAACTAAAGTATGCTATTTTGACATTTGAAAAAAT
GACAGAAGAACAAAAGAATGCAGTTATAGAAAAGATGGGCGATGGATATAAAAATTGGCAAAATGAGCTT
GAAAGAATTGGGACTATTGGTATATTCGAAAAAAATACATCAGAAGAAAAAATATCTAAAATTACAAAAT
GTGATACTCATACTAAAATAGGAGTTTCAAGTGATGGAAAATACGATTGCTATTTAAGCACAAATAGCGG
AGCTGAAAGTAATCTTCTGGATGAATTAAAAAGAACTGAGATTCAAATTATAGATAAAAAAGAACGTCCT
AAAAATGGTTTTGTGCTATCAGAAAAAACTGATTTAGAAAATACAGAAGCATTTAACAAAGAATCGGTTA
AAGATTTACGTAAACTATCAACAAAGGACATAAATGGCAAGGATTTTACAAGTAAAGATTTTGAGAAGTA
TGATCTTACTATGGTAAATGTATTTGCAACTTGGTGTACAGCTTGTGTAAAGGAAATTCCTGATTTGGTT
GAGGTTCAGAATGAAATGAAAAGCAAGGGTGTAAATATCGTTGGAGTTGTTACAGATACTGTTGATGATA
ACGGTGAAAACAAGGAAGCAATTGAAAAGTCAAAGTTAATACATGAAAAGACAAAGGCTTCATATCCTTT
CTTAATGCCAGATAAGACAAACTTTAATGGTAGATTGAATGGTATACAGGCTATGCCAGAGACTTTCTTT
GTTGATAGTAATGGAAATATTGTAGGTGATACTTATTCTGGGGCAAAGAGTTCAAAGGAATGGAAGCAGG
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>ref|NC_013316.1|:2115733-2116629 putative iron-sulfur-binding membrane protein [Clostridium difficile R20291]
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GTTTTAGGCATTTATTTCAATCCGTTTGGTTTTTAATTACTAATTCTTACTTTGAAGGGTTTAAGACTGG
TAAAATCTACGGTGGGAATTTAAAGAAAATTTGTGTTCCAGGTATGAATTGTTATTCATGCCCGGGAGCA
AAAGGTTCTTGTCCAATAGGATCACTACAGGCAGTAATTGGAAATTCAAAATATAAGATTAGTTATTATA
TAGTTGGGATTTTGTTTTTTATAGGAGCATTGGTGGGAAGATTTGTTTGTGGATGGCTGTGTCCATTTGG
ATTGATTCAAGATTTGCTACATAAGATTCCCTTTTTTAAAAAAGTTGAAACATTTAAGTTTGATAAACAT
TTGAGAAAATTGAAATACATAATATTACTTGTATTTGTAATAATATTACCTTTATTTTTGGTTGATATTT
TAGGTCAGGGTTCTCCGTATTTTTGTAAACTTATTTGTCCGATTGGTATGCTGGAAGGAGGATTACCACT
TGTTTTATTAAATAAAAGTATGAGAAATGCGATAGGTTTCTTGTATTATTGGAAAGGAATCATTCTAATA
GTTACTTTGTTACTTTCTATAATTATATATAGACCTTTTTGTAAATATATATGTCCACTTGGAGCTATTT
ACTCAATTTTTAACCCTATTTCAATATTTAGATATAGATTGGATAAGGATAAGTGTATTAATTGTGGAAA
ATGTAAAAAAGTTTGCCAAATGAATATAGATCCAGTTGAGAATTGCAATCATCTGGAGTGTATCAGATGT
GGACGATGTAAAAATGCTTGTCCAGTGGATGCAATTAGTTATGGAGTAAGAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:2116648-2117925 ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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CTATAGTTCTTTCTTGCTTGTATTCTTGTTTAACAATAATGAAATCAAGCAATGAAATAGAAAAGGCTTT
ATATGAAAGTTCTAATTCTTCAATATCAATAACAAAAAAAGATGGTAAATATTTTAATGTTAATCAATTT
AAAGATATTGAAAAATTAAAAGAAATTGAAGAAAAAATAATTCAATATGATGGATTAGCAAAACTAAAAG
ATGCTAAAGTAGTTAGCGGAGAACAAAGAATAAATAGAGAAGATTTATCTGACGAATTTAAGAATGTTGT
TTCACTCGAAGCTACAAATAATACTAAAAGAAATATTTTATTTAGTAGTGGAGTATTTACAATTAAAGAA
GGCAAAAATATAGGAGAAAATGATAAGAATTCAATTATTGTTCATGAAGAATTTGCTAAACAAAACAATC
TAAAATTAGGTGATGAAGTTGATCTTGAATTACTAGATATTGAAAAAAGTGGAAAAATAAAAAGTCATAA
ATTTAAAATTATAGGGATCTTTTCTGGTAAAAAACAGGAAACATATACAGGATTATCTTCTGATTTTAGT
GAAAATATGGTGTTTGTAGATTATTCAACAAGCCAAGAGATATTAAATAAATCAGAAAATAATAAAATCG
CAAATAAAATTTTAATGTATTCTGGTAGTGCAGAATCTACAGACTTAGCCTTAAACAAATTGAAAGAGCT
TAAAATTGATGAGTCAAAGTATTTTGTTGAAAAAGATTCTAATGCGTTTGAAGAGTCTTTAGAGTCAGTG
AGTGGAATAAAACATATAATAAAAATAATGACTTATTCTATTATGTTAGGTGGGATGGTTGTTCTTTCAT
TAATCTTGATTCTATGGTTAAGAGAAAGAATTTATGAAATAGGTATATTTTTATCTATTGGAACATCTAA
GATACAAATTATAATGCAATTTATATTCGAGTTAATATTCATATCGATACCAAGTATAATATCTTCCTTA
TTTTTAGGAAATGTATTACTAAAAGTAATTGTAGATGGATTCATTAACTCAGAGGACTCAATGATTTCCG
GTGGAAGTTTAATAAATAATAGTAGTTTTATGTTAAATATAACAACACTTGGACAAAGTTATTTAATATT
AATAAGTATTATTGTTTTATCAGTTGTATTTGCTTCTTCATTAATATTAATCAAGAAGCCTAAAGAAATA
TTATCAAAAATAAGTTAG
>ref|NC_013316.1|:2117935-2118591 abc transporter, atp-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGATATATTAGAAATAAAGAATGTAGCATATAGTTATGCAAATTCTAAAGAAAAAGTTTTGTCAGGAG
TAAATCAAAAATTTGAACTTGGGAAGTTTTATGCGATAGTAGGAAAGTCAGGAACAGGAAAATCTACACT
TCTTTCCTTACTTGCTGGACTTGATAAACCTCAAACAGGAAAAATATTGTTTAAGAATGAAGATATACAA
AAGAAAGGATATAGTAATCATAGAAAAAATAATATATCTTTAGTATTTCAAAACTATAATTTAATAGATT
ATTTATCACCAATTGAAAATATTAGATTAGTAAATAAATCAGCAGATGAAAGTATCTTGTTTGAACTAGG
TTTAGATAAAAAACAAATAAAAAGAAATGTTATGAAATTATCTGGTGGACAGCAACAAAGAGTAGCTATT
GCTAGAGCATTGGTATCAGATGCTCCAATAATACTAGCTGATGAGCCTACTGGTAATCTAGACAGTGTTA
CTGCTGGAGAAATAATTAATATATTAAAGACATTAGCTAAAGATAGAAATAAATGTGTAATAGTTGTAAC
ACATAGTAAGGAAGTAGCAGATTCTGCGGATATCATTTTAGAACTAAGTGGTAAAAAGTTGAAAAAAGTA
AATAAAATGAATTTGGAGGTTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:2118591-2119967 ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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TATCTATGTCAACTTTAAGTCTCATTAGTTTATCTATTAAAGATGCTACGGACAGAGCTTCAAAAGAAAC
ATTTGCTAATATAACAAATAGTTTTTCTATGGAGATAAATAGACAAGTAAATCCAGGAACACCTAGAGGT
GGGGGAAATGTAAAAGGTGAAGATATTAAAAAGATATTTCAAACAGATAGTATAGACTCCTATGTAAAAA
GAATAAACAGTGTTGCAGATTTAGTTGATTATGATATTATTGAAACTCAAGAGACTCTTGCGAATCAATC
ACCTGAAAGAGCGAAGAATTTTAAAAGAACAGTTATGTTAACTGGGGTTAACGACTCATCAAAAGAAACA
AAATTTGTATCAGAAGCATATAAATTAGTAGAAGGAAAGCATTTAGAAAATGAAGATAAAAATAAAATCT
TAATGCATAAAGATTTAGCTGAAAAAAATAATCTTAAAGTTGGAGATAAGATAAAAATAAAATCTAATTT
ATTTGATGCTGATAATGAGAAAGGTGCAGATGAAACAGTAGAAGTAGAAATTAAAGGTCTATTCGATGGG
CATAATAGCGGTGGAGTAAGTGCAGCACAAGAACTATACGAAAATACATTAATCACTGATGTTCATACAG
CTGCTAAAGTTTATGGTAATACAGAAGATACAGCTGTATACCAAGATGCAACATTCTTTGTAAAAGGTGA
TAAGAATCTTGATAGTGTAATAAAAGATCTTGGGAAATTAGATATAAATTGGAGAGAATATAATTTGATT
AAAAGTTCATCAAATTACCCTGCATTACAACAATCTATATCAGGTATCTACTCAATTTCAAATAAATTAT
TTGTTGGCTCATTAATATTTGCAGGAGTTGTAGTTTCATTATTATTATTCTTATGGATGAATGCTAGAAA
GAAAGAAATAGCAGTATTACTATCATTAGGTATATCAAAATTAGAAATTTTTGGTCAATTCCTAATTGAG
ATGGTATTTATATCAATCCCCGCATTCGTTGGTTCTTATTTCTTAGCTCAATATACAGCTGATAAGCTTG
GGAATAATATATTGAATAAGGTTACTGGTGATATAGCTAAACAAATAGCTAGACAATCTGCATCTAGCCA
ATTAGGTGGTGGGGCAGAAGCTGAAGGATTTAACAAGACATTATCAAGTTTAGATATAAATGTATTACCT
AAATTCATAATTTATGTAGTTATATTTATGAGTTTAGTACTTCTTGTATCATTGATTATTTCTTCATTCA
ATATATTAAGAAGGAATCCAAAAGAATTATTAATTGACAATAATTAA
>ref|NC_013316.1|:2120065-2120718 two-component system, response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATATTAACTGTTGAAGATGATAATATGATAAGAGAGGGAATAAGTGAATATCTTTCAGAATTTG
GATATACTGTTATTCAAGCTAAAGATGGAAGAGAAGCCTTGTCAAAATTTAATAGCGATATAAATTTGGT
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TTACCAATTCTAATCTTGACTGCATTTAGTGATGAAGAATATAAAATTGATGCATTTACTAATTTAGTAG
ACGGATATGTAGAAAAGCCATTTTCATTGCCGGTCTTAAAGGCTAGAATAGATTCTTTAATTAAGAAGAA
TTATGGACATTTAGAGAAGTTTGAATATAATGATCTATCGGTTAATTTTAATAGCTATACAGCTAAAATA
AATGGTGAAGAAATAGATGTAAATGCAAAAGAACTAGAAGTATTAAAATGTTTATTGGATAATAATGGAC
AAGTGTTAACAAGAATGCAAATTATTGATTATGTATGGAAAGATAGCGAAGAAACTCCTTATGATCGAGT
AATAGATGTATATATAAAAGAACTTAGAAAAAAATTACAATTAGACTGTATAACTACTATAAGAAATGTA
GGATATAAATTGGAGAGAAAATGA
>ref|NC_013316.1|:2120715-2122034 sensor protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAATTAAAGATATTTCCAAAAATGTTCATACAAATATTTTCTGTTCTTGGAATAATAATTATAT
TAGTTCATTCATTAGTTTTTTTTATCTTTCCTAAAACATATTTGGAGACGAGAAAAGAAAAGATTCATAA
TATGGCAAATGAAATTTCTAGTAATATGAATGGAAAAGAAATAAAATATATAGAACAAACTTTGGAGCTT
TATTCTAAGAGTAGTGAAATAAAAGCATTTATAAAAGAAAAAAATAATAAGAATGAAATACAAATCAAAG
ATAATATAAATGTTAATTTAGAAAGTGATAGTAATTCTTTGATAATTGAAGAAAGAGAAATAAAGCTTAA
TGATGGTAAAAAAACAAATCTACAATTTGTTTCTACAGCTGATATGCAAAAAGATGCGAAAGATTTAAGC
CTTAAATTTTTACCATATTCTTTATTAATATCAATTTTATTTTCTGCTATTATTTCTTTAATTTATGCAA
AATCAATAAAAAATAATATACAAGAAATAAAAATTGTTACTGATAAAATGATGAAACTTGATAAAAAAAC
GCGTTTAAAAGTTAGCTCTAATGATGAAGTTGGAGAATTAAAACAACAAATTAATGATTTGTATTCTACT
TTATTAAGAACAATTGACGATTTGGAATTTAAAAATAAAGAAATTTTAAAATTAGAAAAGTTAAAATATG
ACTTTTTTAAAGGTGCATCCCATGAACTTAAAACTCCTCTTGCTAGTCTTAAAATAATACTGGAAAACAT
GAAATACAATATTGGAAAATATAAAGAAAGAGATATTTATATTAATGAATGTATTGAAATCGTTGATAGT
TTAACAAAAAATATTTCTCAAATATTATCAGTTCATTCTATAGAAAATTTGAATAATGATGAAGAATATT
TGAAAATAAATGATACATTAGAAGACATATTAAAAAAGTATGAAATATTAGCAAATCAAAAGAAAATAAC
TGTCAATAATTATATATTAGATGAGAATGTTTATATAGGAAAAACAGCTTTAAAGATTATTCTATCTAAT
TTGATTAGTAATGCGGTAAAATATACTGATGTAAATGGGGTAATTAATATTGGGATAGTTAATGATTGGT
TATATATAGAGAATTCATACGGTAACAATAAAATTTCGAATATGGATAAAATATTTGATGTTAAATTTGA
TTTAAATAAGGAAAATAGTAATGGATTAGGTTTATATATTGTAAGTAATATTCTGAATAATTACAATATA
GAATATAAAGCATTGCAGGATGAAGAATTTTTTATCTTTAAAATTAAAATATTTTCTTAA
>ref|NC_013316.1|:2122558-2122968 putative sigma factor [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAAAAGAGTATTATCTTTATATCAGAGGACAAAAGGTAAAAGTCAGTGAAGATATATATATAGTCT
ACTGGCGAGAAAAAGAACACGAGAAGTATTTAGAGCAGGTGGACAGGAAAAACCACTTGCTCTTTTTTTC
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GAAACACAGATGATGATTGAAGCAGTAAGAAGTGCTATAACAAGGCTCAATGCAGAAGAAAGAGATATTA
TTGAACGCTTGTATTTCAATGATGAAACTGTTCGTTCAGTAGCAAAGCTCAAAAGTATTACACATCCGGC
TTTAATCAAAAGAAGAAACAAAATTCTTGAAAAGCTGAAAAAATTTATCGAAGAACTTTAA
>ref|NC_013316.1|:2129089-2129436 hypothetical protein CDR20291_1810 [Clostridium difficile R20291]
ATGCATGAAAATAAAAAGAATCTATTAGACGGAAGCTTAGCTCAATATAATGATACAGCAGTTCCAAAAA
TACCAGTATTTGCTGGTAACGATATAACTTCAGAAGTTTATTATTTTAAACCTAATCAAGTTCTTAATGC
TCATAGACACCCTAATGGTGAACAAATATTTGTGTTCCTAAAAGGAGAAGGTAAAATGAAACTTGGTGAG
CATGAATGTGATGTAAAAAACGGCGATACTGTATTTGTACCAACAGGAGAGTGGCATGAAATTACTAATG
GAAGCAATGAAGAAATGGTAGCCGTTCAAATTACAAAAATTAATGCTGGAGCAGAATACAGAGGATAG
>ref|NC_013316.1|:c2130635-2129586 hypothetical protein CDR20291_1811 [Clostridium difficile R20291]
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TTAACTCTAATGACAAAAAAGATGAATCTTCTTCGTCTAAAAATCTGGATAAAGTAACTATAGCAGAAGT
TACTCACTCTGTTTTTTATGCTCCACAGTATGCTGCTATTACGAAAGGATTCTTTGAAGATGAAGGTATA
AAGATTGACCTTATAAATACCCAAGGTGCAGATAAAACTATGGCAGCTTTGATTTCAGGTGAAGCAAACG
TAGGTTTAATGGGTCCTGAAGCATCTATATATGTATATAATCAAAACAAAAACGATTATGCAGTGAACTT
TGCTCAATTGACAAAAAGAGATGGTAGTTTTCTAGTTGCTAGGAAAAAAATGCCTAATTTCTCTTACAAT
GATTTAAAAGGAACAGAAATATTAGGTGGTAGAAAAGGTGGAGTTCCACTAATGACTTTTGAATATGTTC
TAAAAGAAAAAGGTCTTACTATTGGAGAAAATCTAAAAGCAGGCAATGTTAATGTAAGAACTGATGTACA
ATTTGGTGTAATGGCTGGAGCTTTTGCAGGTGGAGAGGGTGACTTTACAACAGCATTTGAACCTACAGCA
ACAGCAATGGAAAAAGAAGGTAGTGGATATATAGTTACATCTATAGGAAAAGATTCTGGAGAAATACCTT
TTACAGCATACTCTACTACGAGATCATACATGAAAAACAATAAAGATTTAATTCAAAGATTTACAAATGC
TGTTTATAAAGGTCAATTATGGGTTCAACAAGCATCTAGCAAAGAAGTAGCTAAGGCTATGCAACCTTTC
TTTGAAGATATATCTTTAGAAGATTTAACAACAGTTGTAGATAGATATAAATCAATAGATGCATGGTCTC
AAAATCCTGTATTAAAGGAGGAAGGTTTGAAGAAATTGATGACTGTTATGAAAGAAGCTAAAGAACTAGA
TAAGGAAGCACCTTATAAAGATATCGTAAATACTGAGTTTGCAAACAATGCTATAAAAAATATTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2131021-2131755 hypothetical protein CDR20291_1812 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACAAAATAAATATGATGATGATAGATTTTTTAATAAATACAGTAAAATGGAACGTTCTACAAATG
GATTAGCAGGTGCTGGAGAATGGCATGTTTTAAAAAAAATGTTACCTGATTTCAAAGGAAAAAGAGTTTT
AGATTTAGGATGTGGATTTGGATGGCATTGTCAATATGCAGTTGAGAATGGAGCAATTTCTGCTGTTGGA
GTTGATATTTCAGAAAAAATGTTAAAAGAAGCTAGAAACAAAACGCAACTTGATAATATAAATTACATAT
GTATGCCTATTGAAGATATTAATTTTCCAAAAGATAGTTTTGATGTAGTTATTAGTTCCTTGGCATTTCA
TTATATTCAATCATTTGAAGATATATGTAAGAATATAAGTAATTGTCTTTCAAATAAAGGTAATTTTGTA
TTTTCTGTTGAACATCCTATATTTACTGCATATGGAAGTCAAGAGTGGTACTGTGATAAAGATGGCAATA
ATCTACACTGGCCAGTAGATAGATATTTTGAAGAAGGAGTACGTAAGTCAAATTTTCTAGGAGAAGAGGT
TATAAAATATCATAAAACATTAACAACTTATTTAAATACGTTAATGAAAACAGGATTTGAAATATTAGAA
ATTATTGAACCTCAACCAGAAGAAAAACTGTTAGATACAATTCCTGATATGAAAGATGAGCTACGTAGAC
CTATGATGTTACTTGTATCTGCAAAAAAAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2132388-2131897 putative regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAACAATCAACAACAGGAAGTATATAAAAAATTAGATGAGTTAAGCATACCTTATGAGGCTGTAAATC
ATCCACCAGTTTATACAATTGAAGAAATGGAAGAATTAAAAACATTACATATGGAATTTGTTGTAAAAAA
CCTATTTCTTCGTGATGCTAAAGGAAAAGAACATTTTTTAGTTGTATTAGGTAAAGACAAAAAAGCAGAT
TTAAAAGATATTCGTCAACAAATTGATAGTAAACCTCTTAGTTTTGCATCAGAAGAAAGACTTCAAAAAT
ACTTGAAACTTACTAAAGGAGCTGTGACTCCTTTTGGTATATTAAATGATAAAGAGGCTGTTGTAAAAGT
TGTATTTGATAAGGATTTATTAAAAATGGATAAAATAGGTATACATCCAAATGATAATACTGCTACTGTA
TTTTTAAAATTTGAAGATATGAAAAAGCTTATAGAAGAAAATGGAAACGAAATATACTACGTAGAAGTAT
AA
>ref|NC_013316.1|:2132737-2133120 putative plasmid-related protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTACAGACAAAGTTGTTGGAATCATAGATGAAGAAACGGCAGAACTTGCAGGAATTGAATATACTG
GTAAAATTTATGCTTCTTCTGGTGTTATAAAACATATAAAGAAAAAACATAGATGTCAACTGAGTAAGGA
TATTTTTAATGATATAATAGACACTATAAAAGTGGTATTAAAGTCACCTGAATATATAGGAAGTCATCCT
AAAAAACCTGGAAAAAGTGTGGAGTTTATAAAAAAAATTGATAATTATATTTTAGTAGCTACAGAATTAG
ATACAAAAAAAGGATATTTATATGTATCTTCAATGTATGCTATAAAAGAAGCAAAATTAGAAAGTAGAGT
AAACAATGGAAGAGTAAAACAATATGATGGTTAA
>ref|NC_013316.1|:2133626-2134009 hypothetical protein CDR20291_1815 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATCTATCGAAGAAAATAGAAGATAAAAGAAAAGCTAAACAGAGAGCTGAAAAAGTTAAGAAAGCTA
AAATTGCTACAGCTGGTGTGGTATTAGGAGCTGTTACTGGTGCAGTGAGTGGAGTACTTTTGGCTCCTAA
ATCTGGAAAAGAAACAAGAGAGGATATAAAAGATGCTTCACAACAAATTGCTGAAAAGATAAATATGAAA
ACTGTAGATGTAAAAGGCAAAGTATCTGAGAAGCTAGAGGATAAAAAAGGAAACTTTATAGAATCAAAGA
AAAAAATAAAAAAATATATAGATAACAAAAAGAGTGTTGAAAATTCTAGTGAGGAAGATAAAATAATAGA
TATAGTTGAACCAGTTAGTGTTACTGAGGAATAA
>ref|NC_013316.1|:2133993-2134361 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
GTGTTACTGAGGAATAATATGGACAATACAATAACGATTAACATAAGTATAATATATGTATTATTAGCTA
TACTTGCTTGTATTGCTTTAGTTTATTTAATTATTGTACTTGTTAAACTACATAAGATTTTAAATAATGT
TGGAACTATGTTAAATGAAAATACTCAAAATATAAATACAACTTTAAATAATCTTCCTAATGTTGTAGAA
ACTTTTGGAGAAGTAGGAGAAAATATGAAAGATGTAACAGAAGTAGTTACTGAAGTTACAGCAGATTTTC
TTGTTACTAAAGACAGTGTCAAATCAAATATGGATGTTATAGTCGATATATTGACTATAATTAAAAATAT
TTTTCTAGATAAAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2134913-2134455 hypothetical protein CDR20291_1817 [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAGAACAAAAGTTGTAGAGTTGATAGCAACAGTATGCAGAGAAAACAAACCACATAAATGGGTTG
ATGAAAATTATACTCCTTATGATAAAAGTGGTAAAGTTGAATTAATGTCAATAGAAGATTTAAATGAATT
AATATCAAGCAGTGGAAGAGCAGATTTTCTTTATAGCAGTAGATTACAAAAGCTTCTAAATGAGGTTTAT
ATAAATCAAAGTAGAGCATCTTATATATCAGGTTGTGGATTATTTTGGAGTTCGTATTGGGATATACTTG
AAGAAAAATTTGAAGAATGGCTATATAATTCTTATATCTTTTTTGATGAAGATGATGAATATTTAGAAGG
AATGGAAGATTTTGAGCTTGAATGTAAAGATGTTCTTATGGATGTAATTGAAACAACAAGCATAGATATA
TATGTTCAAATGATAAAGAGGAATATTACCAATTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2135746-2134958 putative phage-related cell wall hydrolase (endolysin) [Clostridium difficile R20291]
TTGAAAGTAGTAATAATACCAGGGCACACTTTAATTGGAAAAGGTACAGGAGCTGTTGGGTATATAAACG
AAAGCAAAGAAACAAGAATACTGAATGACTTAATTGTTAAATGGCTTAAAATAGGTGGAGCTACTGTTTA
TACAGGAAGAGTTGATGAATCAAGTAATCATTTAGCAGACCAATGTGCTATAGCAAATAAACAGGAAACT
GATTTGGCTGTTCAGATTCATTTTAATTCAAATGCTACAACTTCAACTCCAGTAGGGACAGAAACAATAT
ATAAGACTAATAATGGCAAAACCTATGCAGAAAGAGTGAATACTAGGTTAGCTACAGTATTCAAAGATAG
GGGTGCAAAGTCTGATGTTAGAGGTCTTTATTGGCTTAATCATACTATTGCACCAGCAATATTAATAGAA
GTATGTTTTGTAGATAGTAAAGCAGATACAGATTATTATGTTAATAATAAAGATAAAGTTGCTAAATTGA
TAGCAGAAGGTATACTAAACAAATCTATATCAAATTCTCAAGGGGGAGGGGAAAATAAAGTGTATGAAAA
TGTAATCGTTTATACAGGTGATGCTGATAAAGTGGCTGCTCAGATTTTACATTGGCAATTGAAAGATTCT
TTAATAATTGAGGCGTCTAGTTATAAGCAAGGTTTAGGTAAAAAGGTTTATGTTGTAGGTGGAGAAGCTA
ATAAACTTGTAAAAGGTGATGTAGTAATAAATGGTGCTGATAGATATGAAACTGTTAAATTAGCATTACA
AGAAATAGATAAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2136337-2135885 putative phage-related deoxycytidylate deaminase (putative late competence protein) [Clostridium difficile R20291]
TTGGAGGTATATGATTTGAATAAAAAACTTGAAAATAGATGCTCATGGCAAGAATATTTTATGAGACTGT
GCGAAACAGTAGCTGAAAGAGGAACTTGTGATAGAGCTTATGTAGGAGCTATAATTGTCAATTCAGAAAA
CAGAATAGTGTCTACTGGATATAATGGTAGTATTTCTGGAGATAAGCATTGTAGTGAAGTTGGTCATGAA
ATGAGAGATGGACATTGTATTAGAACCATTCACGCTGAACAAAATGCCCTTTATTATTGTGCAAAAGAAG
GTATTTCAGTTAAAGATTGCTCTATTTATGTAACTCACTTTCCTTGCTTAAATTGTACTAAGGCTATAAT
TCAAGCTGGAATTAAACATATATATTATAGAACTGGATATAGAATAGATGAATATGCTATAAAATTATTG
CAATCAAGTAATGTCTTATATACAAAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2136765-2136556 hypothetical protein CDR20291_1820 [Clostridium difficile R20291]
TTGTATATGCAGCATGTAATAAATCTTAGCACTATTTATATTCTATACAAAAAGATATTTGAAGGGAGAT
TAAAAATGGGAATATTAGAAGGCGCTGCAATGATAAGAGAGATTGCAATTAAAATAGCTAAAGAAAAAGG
TATTACAGAACAAAAGGCATGGCCCGAAGCTGTAAAAGAATTTAAAGAAAAATATGAACTTGTATTATAA
>ref|NC_013316.1|:2137144-2137653 putative phage repressor [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAGCGAAAACATTAAAACAATCAGGAAGTCAAAAGGACTTTCACAACAAGAACTTGCTATCAAAC
TGAATGTAGTGCGACAAACAATATCTAAATGGGAACAAGGACTGTCGGTTCCCGATTCTGATATGTTGAT
TTCCATATCAGAGGTGCTTGAAACGCCTGTAAGCACTTTACTTGGAGAAACTATTGTTGAGTCGGAAGTT
GATAGCTTAAAAGTGATTTCTGAAAAATTAGAGATTATAAACTTGCAACTTGCACAAAGAAAAAACATGA
GAAGAAAAATGTTTCATTGGTTATTTATTTTATTATGTGCAGTCATAGTAATAGTTTTTGTGGTCTTAGG
GGGACTAAATAGTCCTTACTTGGATTGGAATTATACCGACCCTGAAACCGCTGTTTTTGGAGTAGCTTTT
CATGCTTTTGAGTGGCTATTTGTCAGATTAGTACCGATTGTCCTTATAGGAGCAATTATTGGAATCTTTT
TGACACGTAAGAAAATATGA
>ref|NC_013316.1|:2138057-2138263 putative lipoprotein signal peptidase [Clostridium difficile R20291]
TTGCAAGGAGGTGTTAATATCAGGCAAATAAAGTCTTTTGTTTTTCCAGTTATATCCTTAATATTCTTAG
ATCAAATTAGCAAAGTTCTTATAGGATTATTCTTAATGGACTTTGAAATTGATATAATTGGGAAATTTTT
AAGATTCAATCCTGTTCAAAATACAAAATTAAGTCTCTGCTATCTAACAAACGGAGCACAAAAATGA
>ref|NC_013316.1|:c2139364-2138564 ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGCTTAATAAAAGATCTGAAGGATATATAAACTATGTTAAAGGTGTAAAAAGAGAAAAAAGAAATG
TATTATTCTACCAGCTATTAATTTTAATTGGTTTTATTGTAATCTGGGAACTTTTAGCTGACTTAAATGT
TATAAATACATTTCTATTTAGCAAACCAAGTGATATTTACAATTTATTTATTCAATATGCATTTAGTGGT
CAATTATTTAAACATATTGGAATATCTGTATATGAAACTGTTCTTGGTCTTGTTATAGGTACTGTATTAG
GTATTTTGGTAGCAATTGCTCTTTGGTGGTCAGAAAAATTATCAAAAATATTAGACCCATTTTTGGTAGT
TTTAAATGCTCTTCCTAAGACTGCTTTAGCTCCTATAATTATAGTTTGGGTAGGTGCTGGAATAGAAGGA
ATCGTCGTAACAGCTGTAACGATTTCTGTTGTTGTTACTATACTTTCAGCTTATAATTATTTTATGAATA
TAGATGAAGAAAAAATTAAGATGTTAAAAAGCTTTGGAGCTACTAAATCTCAAATATTATTTAAACTCAT
ATTACCTGCAAACACAGGAAATTTAATAAATTTAACTAAAATTAATATTGGTATGGCATGGGTAGGTGTA
ATAGTTGGAGAATTTTTAGTTTCAAGATATGGAATAGGCTACTTGATAGTATATGGTTCTCAAGTATTTA
AATTAGATTTAGTAATGATGGGAGTATTTGTATTGGCTATTTGTGCTTGGGCAATGTACGCTGTAGTTAA
TATTATAGAAAAAATATACAATTCCAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2141157-2139559 site-specific recombinases [Clostridium difficile R20291]
TTGAAAGCTGCAATTTATTCAAGAAAATCAAGATTTACTGGAAAAGGTGATTCTATAGAAAATCAAATAC
AATTATGTATTGATTATGCAAAGTCTATTGGTGTAAAAGATTTTTTGATATATGAAGATGAGGGATTTAG
TGGTAGCAATATAGATAGACCACAATTTAAGAAAATGATGCAGGATGCTAAAGATAAGAAATTTAGTTAC
CTAGTTTGTTATAGATTAGATAGGATATCGAGAAATGTATCTGACTTCTCTACTTTAATAGAAAAATTAA
ATGAACTAAACATATCATTTATATCTATCAAAGAACAATTTGATACTTCAACTCCAATGGGAAGAGCTAT
GATGTTTATATCAAGTGTATTTGCTCAATTAGAAAGAGAAACAATAGCAGAACGTATAAAAGACAACATG
TATGAATTAGCCCGTAGTGGTAGATGGCTTGGAGGCAATACACCTCATGGATTCAACAGTGAAAAAATCA
CATTCTTAGATGAAAATCTAAAAGAAAGAAGTATGTATAAGCTTCAAGTAAATGATGAACAAATGGAGAT
TGTAAAGCTAATATACAATAAATATTTAGAACTTAGGTCCTTATCTAAGTTATATAAATATGTCTATAAT
AATGGAATAAGGGGTCCTCGTGGTGGTAAATTTGACCCTAGTTCTTTATCTAGAATACTTAGAAATCCAG
CATATGTAAAAGCTAATGATGAAATTTTAGATTACCTTAAAAATAGTGGTATGGATGTTGTAGGTACTCC
AGATAGAAAATGTGGAATCCTTACCTATGCTAAAAATACATCTAACTCAATAGCAGCAATTGCAAAACAC
CATGGAGTCATAGAACCTGAAATATGGCTTGAAGTACAAAATCAATTAGATAAAAATCGTGATAAAACTC
CAAGGATATCAACTGGAAAAACTGCTCTTTTATCTGGTCTTATAAAATGTGGTAAATGTGGTTCTAATAT
GAGAATTACCTATAAAGGCAAAAAAACTGACAAGGATTTAAAGTATTATTATATTTGTGGTACTAAAAAA
ACACTTGGGTCTGATAGTTGCAACTGTAAAAATCTTAATGGTCCATTAGTTGAAAGTTTAGTTATAGATA
AAATTAAGAATTGTAAAGAAGAGTCTATTATAAGTGCATTCAATAGTAATAACATTAAGACTGATAATGT
TTTTAATATTTTTAAATCTGAGACTAATTTACTTAAAAATCAAATTTTAGATAAGGAAAGACTTATTAAA
AATTTAGTTATAGAGCTTGCAAAAAATACTGGTAGTACTGCTTCTGATTATATAGTTTCCCAGATTGAGA
GCCTAAATAATGAGATTAGTATTTTAAAGGATAAGATTAATATTTTGGAATCTAGTAATATCAATATTAG
TAGTGACAGTATTAATATTGATATTATTGTTAGTAATTTGAAGAGATTTAATGATGAAGTTGATAATGCC
AGTTTAGATGATAAGAGATTGTTATTATCTACTATTATTAATAGTATCATTTGGGATAGCAGTTTAGGAA
ATCTTAATATTGTTTATATGGGTGCTGAAGTGGATAATTCTGTTTCTTTAAGCAATTAG
>ref|NC_013316.1|:2141479-2141661 hypothetical protein CDR20291_1827 [Clostridium difficile R20291]
TTGCATATGGAAATCAATGTTATAGAAATTTTCCCTAAAGATAAAGCTAAACTTAATAAAATAGAAATGG
ATAAAGCTAGTTGGTTTGTAAATATAATAAGTAAAAAATATCCTAAAGAAGCTTTAAATGAAGCATTTAG
TATTTTAGAAAAAGAATTAAATATAAGTAAAGCTAATACATAA
>ref|NC_013316.1|:2141835-2142965 putative ethanolamine/propanediol utilization propanol dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
TTGAATAACTTTGAGATTAAAACTAGAATAAAATTTGGAGAAGGTTCACTAAAAGTTTTGCAAGAATTAA
AAAACAAAAATGTATTAATAATAACAGACCCTTTTATGGTGAAATCAAAAACAATAGATAAAATAACATC
TAATTTAATAAACTCAACATATCAAGTTTTTGAAGAAATAGTACCAGACCCACCAATAGAAGTAGTAGTA
GCAGGAATAGAAGCATTTAAATCTATAAATCCAGACGTAATAATAGCATTAGGTGGTGGTTCTGCAATAG
ATGCAGCAAAATCTATAATGGACTTTTCTAAAAAAATATTAAAAATTAACGAAGTAGAGTTTATAGCAAT
ACCAACAACAAGTGGAACAGGTTCAGAAGTAACATCATTTGCTGTAATAACAGATAGTCAAAAAAAATGT
AAGTATCCATTAGTGAGTGATGATTTACTTCCAGATATGGCAATACTAGACCCAGAGCTTGTAAAAACTG
TACCAAATTTTATAACAGCAGATACAGGGATGGATGTATTGACACATGCTATAGAAGCTTACGTATCTAC
AAATTCTAATGACTTTTCAGATGCACTAGCTGAAAAATCTATAAAGTTAGTATTTAAATACTTAATAAAA
GCATATAAAGATGGAAATGACATAGAAGCTCGAGAAAAAATGCACAATGCATCTTGTTTAGCAGGTATGG
CATTTAACCAAGCATCACTTGGCATAAATCATTCTATTGCACATGTATTAGGTGGAAAATTCCATATACC
ACATGGAAGAACAAATTCTATATTACTTCCTCATGTAATAGAATATAATTCATCAATAGTAGGATATACT
AACACAACTTACTCTGATACAGCTAAAAAATATGCACAAATAGCAGAATTAGTAGGACTTGGGAGTGCTA
ATATAAGAATATCTGTTAGAAATTTAGTAAATGAAATAAAGAAACTACAAAAAGAAATGAATATGCCAAC
TAAATTGACACAATGCAAATTAAGTTTAGAAGATATAACTAATGAAGAAAGAGAAATAGCAAAACTTGCT
ATAAAAGATACTTGTACATTAACTAATCCTAAGGTACCAACTGAAGATGATATAATAAACATATTAAATA
ACATTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2143206-2143556 putative ethanolamine/propanediol utilization protein [Clostridium difficile R20291]
TTGACTGAAGAATCTAAGCAAAGAGTTATTCAAGAATATGTTCCTGGAAAACAGGTTACATTAGCACATA
TCATAGCTAACCCTAATGAAGACATATATAAGAAGTTAGGATTAGTACTTGATAAAAGAGATGCAATAGG
AATACTTACAATAACACCAAGTGAAGCGTCAATAATAGCAGCAGATGTTGCTACAAAGGCTTCAAATGTA
TCTTTAGGTTTTATAGATAGATTTAGTGGTTCAGTAGTAATATCAGGTGATGTAAGTTCTGTAGAATCAG
CGTTAAATGATGTTTTAGAAGTCTTAGGAAATATGTTAAACTTCTCATCTACAAAAATCACAAGGACATA
A
>ref|NC_013316.1|:2143564-2144013 putative ethanolamine/propanediol utilization protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAATATAATATTTATGGGAAAGACAGGTAGTGGTAAAACTACCTTATGTCAAAAACTAGACCAGT
TAGAATTAAAGTATAAAAAAACTCAATCAGTGGAACTTTATAATAATGCAATAGATACTCCTGGTGAGTA
TATGGAAAATAGAAACCTATATAATGCCTTAATAACAACATCAGCAGATGCTAAAATTATAGCAATAGTG
TATGATGCCACACAAGAAGAAAATTATATAGCACCAGGTTTTGCCAGTATGTTTTGCAAAGACGTAATAG
GAATTATAACTAAAATAAATAAAGCTACTGAAAACGAAGTCAATATAGCTTATGAAAGACTATCACTAGC
AGGAGCAAGTCAAATCTTTAAAATAGACACAGTTGATGATATTGGACTTGAAAAATTATTTAAATATCTA
GAAAAATCTAAAAATATAGATGAAGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:2144115-2144690 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGGGAAAAAAATACTATTGGTTGATGATGAACCACTGTTAAGGATGGATACAAAAGATATATTAGAAA
GTCATGGCTATGAAATAATAGGCGAAGCAAGTGATGGATTTGAAGCTGTTGAAATGTGTAAAAAACACAA
ACCTGATTTAGTTATAATGGATATAGAGATGCCAATACTTGATGGTATAAAGGCAGGCAAAATAATATGT
AAAGAAAATCTAGCTGGTGGAGTACTTTTATTAACTTCATTTGAAGATAAAGAATACGTAGAAAAGGCTA
AAAGTATAGGTGCTTATGGATATTTAGTAAAAACAGCAAGTGAAAAATCACTTATCCCAACCATAGAAAT
GTGTTTAAATAAGGTAAATGAATTTGAAAAAATGAAAAAAGATTTAGAAAAAGTAAATTCTAAATTGAAT
GAAAGAAAATTAGTAGAAAGAGCAAAAGGTATACTTATAAGAGAGTTTAAGATTTCTGAGGATGAAGCAT
ACACTAGAATAAGAAAATTAAGTATGGATAAAAGAACTACAATGATGGAAATTGCCAAAATGATTATAAT
AGGATACGATGACTAA
>ref|NC_013316.1|:2144683-2146092 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGACTAATACGATAAAAAAAATATCAACTGCACAAACATACTTAAATAATAACGAAATTGAAAAAATTA
TAGAAGTATCAAAATCCTTAGATTTAATGGCTTCTTTTTATGAGGCTGATGTTTTTATAGATGTACTAAG
TAAATTTGATGATGAAGCAATTGTTGTGGCACATGGTAGACCTAAAGAAAAGTCAATGTACTGTGAAAAT
GTTATAGGTAAAAAGGCTTTAATTGAAAATGAACCAGGAGTTATAAAGTGCTTAAAAACAGGAGAAAGAG
TAAGAGATATTAAAGCTTTAACACAGGAATATAAACTGGTCAAACAAAATATTCAGCCAATAACACTAGA
TGACAAAGTTTTAGCAGTACTAATAGTTGAAAAAGATATAAGTAGTGAAGTTAAGAATGAGTTTAATGCT
AGTGAAGACGAAGAAAATAAAAATTTACATCAGTTTATAAAACTTATCGGAAATAATGACTTTTTAGTTG
ATAATTTAAATTCAGCCATATTAATATTTGATAAAAATGGAAAATTAAAAATTAAAAATCGTATTGCAAC
TGAGATATACAAAAATCTTGGGTTTGGATATGATATACAAGATATGCATTACAATGATTTAGATATAGAA
ACCAACACCTTTGAAAATATATTAATGGATGAAAATTATGATGAGACAAATGAAGTTTCAATAGGTAATA
TGTTTTTTAAAATAAAGACCATATACATCAAAGATGATGAATTTAAGGTTTGCAAAATAGTACAAGATAT
AAGTGATTTAAAGAGAAAAGAAGAAGAATTAGTTTTAAAAACAGTGGCTATAAGAGAAGCTCATCATAGA
GTAAAAAATAATCTTCATACAGTAATATCTATAATAAAAAAACAAAGTAGATTATCTCAAAATGATGAAG
TAAAGCAGTGTTTAGATAACATAATAAACAGAGTATTTGCAATACTTTCAACTCATTATTTACTATCTAA
AGAAGTTGATAATAATATATCTATACGAGAAGGTATCAATTTATTAGTGTCAAATATTCAAGGTGGCTAT
TTATTTAGTAAGGATATAGATATACGTATAACTGGTGAAGATTTTAAAATTAGTGGAGAAAAAGCAACAG
CAATACTTTTGGTTATAAATGAAATACTACAAAATTGTTATGACCATGCATTTTCGGATAGAGAACATGG
TACTATACAAATATTAATAAATAAAGATAACGACTATAGAAATATTGCTATTATAGATGATGGAATTGGA
TTTGATAGTAATAATATAAATAAAAATAGCTTAGGGACATATATAATAGATAGTTATATAACACAGATGT
TAAAAGGAAATATAGAGAGAAAAAGTAATGAGAATGGTACAGAAGTATTAATTACTATACCTACACAAAT
TAATATTTAA
>ref|NC_013316.1|:2146276-2147709 putative ethanolamine/propanediol utilisation protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAGAAGAGTTATTAAGTGTTGGTATTGACATTGGAACAAGTACTACTCAGTTAATTTTTTCTAAAT
TAATAGTAGAAAATACTGAATCAAATTTTTCGGTACCTAGAATAAGTATAGTAGACAAAGAAATTATTTA
TAAAAGCAAAGTTTATTTCACCCCTCTTATTTCAAATAATGAAATAAATGGTCAACAAATAAAAGATATA
GTTGAAAATGAATATAAAAAAGCAAATATATCTAAAGAGGATATACATACAGGAGCAGTAATAATAACTG
GTGAAACAGCTAGAAAAGAAAATGCAAATGATGTACTTCATACTTTGAGTGGATTTGCTGGGGACTTCGT
TGTTGCAACAGCAGGACCTGATTTAGAAAGTATAATATCAGGAAAAGGAGCTGGAGCTCATATTTATTCA
AAAGAACATTCAACTACAATTGTAAATATAGACATAGGTGGGGGAACTAGTAACATAGCCTCATTTAAAA
GGGGAGAAGTAACCGATACTGGGTGTTTGGATATAGGTGGAAGACTTGTGAAGATAGATAAAATAAGTAA
AAAAATAACTTATATATCACCTAAAATAGATAAAATCATAAAAGATAATAATTTAAATCTTCAAGTAGGC
ACAATGGCTACTGTAGAAAATACAAAGCCAATAGTGGATATAATGGTTGACTTATTAATGGAAAGCATAG
GATTAAAGAAACAGACACCTTTGTTTGATTTTATAATAACCAATAAATCAATAAGTATAGATGAAAATAT
TAAAAATGTTTCATTCTCTGGTGGAGTAGCTGATTATATTTACTATGATGGAGAAATAAAAGATTATTTT
GAATATGGTGACTTGGGAATTTTACTTGGGCAAACAATAAAAAATTGTGAATACCTTAAAAAAGTAAATG
TAGTTAAATCTATGGAAACAATAAGAGCCACAGTGGTTGGGGCAGGTTCTCATACTACTGAAGTAAGTGG
AAGTACAATAACTTACACTAGCGAAAAGTTTCCACTTAAGAACTTGCCAGTTTTAAAATTATCAGTTGAT
GAAGAAACAGGTACTTCAAAACAAATCAGTGAAGCTATAAAAAATAAACTTAATTGGTTTAAACTAGAAA
ATGATTTGCAGAAAGTTGCTATAGCCATGATAGGAAAGAAAAATCCAACCTTTTTAGATATACAAGAGTA
TGCTAAAGGGTTTGTAGATGGAATGCAACAAATCATAGAAAATGATTTACCTTTTATAGTAATTGTTGAA
AATGATATGGCAAAAGTGTTAGGTCAAGCAATATATGCATTATTAAATTATGAAAAAGAAATTGTTTGTA
TAGACAGTGTCAAGGTTGAAAATGGAGACTATATCGACATTGGAAAACCTATAGTTGAAGGTAAAGTTTT
ACCTGTGGTAATAAAAACATTAGTTTTTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:2147727-2149091 putative ethanolamine/propanediol ammonia-lyase heavy chain [Clostridium difficile R20291]
ATGATTTTAAATACAAAATTATTTGGACGTACTTATCAGTTTAAAGGCTTATATGATGTAATGGCTAAAG
CTAATGAAGAAAAATCAGGAGATAAATTAGCAGGTCTTGCAGCAGAATCAGCTGAAGAAAGAATAGCAGC
AAAAGTTGTTTTATCACACATAAAATTGGAGGATATAAGAAATAATCCTGCAGTGGCATATGAAGAAGAT
GAAGTAACAAGAATAATACAAGATGCTGTAAATGAAAAAGTTTATGAAGAAATAAAAAATTGGACAGTAT
CTGAACTTAGAGAATGGCTATTGGATTCAAATACTACAAGTCTTGATATAAGAAGAATATCAAGAGGATT
AACTTCTGAAATGATAGCAGCAGTTGCAAAATTAATGTCAAATATGGACTTAGTTTATGCAGCTAAAAAG
ATAAAGGTTACTGCTCACTGTAATACAACTATAGGAGAACAAGGAACATTATCAGCAAGACTTCAACCTA
ATCATCCAACAGACGACCCAGATGGAATACTTGCATCACTTCTTGAAGGTTTAACTTTTGGTATAGGAGA
TGCAGTACTTGGATTAAATCCAGTTGATGACTCTGTTGAGAGCGTTACTAAAGTATTAAAAAGATTTGAA
GAAGTAAAACAAAAATATCAGATACCAACTCAAACATGTGTATTGGCACACGTTACTACACAAATGGAAG
CAATAAGAAATGGTGCTCCTGCAGATTTAATATTCCAATCTATAGCAGGTTCTGAAAAAGGAAATGAAGC
ATTTGGATTTAATGGCGACACTATAGAAGAAGCTAGACAGTTAGCTTTAAAACACGGTACAGCTACAGGA
CCTAACGTTATGTATTTTGAAACTGGACAAGGTTCAGAATTATCTTCAGAAGCACATCATGGAATAGACC
AAGTTACTATGGAAGCTAGATGCTATGGATTTGCTAAAAAGTATGAACCATTCTTAGTAAATACAGTTGT
TGGGTTTATAGGACCTGAGTACTTATATGATGCTAGAGAAGTTGTAAGAGCAGGACTTGAAGACCACTTT
ATGGGTAAACTACATGGCTTACCAATGGGTGTTGATGTTTGTTACACTAACCATATGAAGGCTGACCAAA
ATGATATGGAAAACTTAGCCATACTATTAACAACAGCAGGATGTACGTATTTTATGGGAATACCTCATGG
AGATGATGTTATGCTTAACTATCAAACAACAGGATACCATGAAACAGCATCACTTAGAGAAATGTTTGGA
CTAACAGCAATAAAAGAATTTGATGCTTGGATGGAAAAGATGGGATTCTATAAAGATGGTAAGTTAACAG
AGTTGGCGGGAGACGCATCTGTATTATTAGGATAG
>ref|NC_013316.1|:2149104-2149985 putative ethanolamine/propanediol ammonia-lyase light chain [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGAGAAGGATTTAAAAGCATTGGTAGAACAATTAGTTGGACAAATGGTTGGAGAATTAGATACTA
ATGTTGTATCTGAGACTGTTAAAAAGACAACTGAAGTTGTAGTAGACAACAATGCTTTTATAGATGATAT
AACAGAAGTTGATATAAGAAAGCAATTACTAGTAAAAAATCCTAAGGATGCAGAAGCTTATTTAGATATG
AAAGCAAAAACACCTGCAAGATTAGGTATAGGAAGAGCTGGTACTAGATATAAAACAGAAACAGTTTTAA
GATTTAGAGCAGACCATGCTGCTGCACAAGATGCTGTATTCTCTTATGTAGATGAAGAATTTATAAAAGA
AAATAATATGTTTGCAGTGGAAACTTTATGTAAAGATAAAGATGAATACTTAACAAGACCAGATTTGGGA
AGAAAATTTTCTCAAGAAACTATAAATAATATAAAATCTAAATTTGGTACAAATCAAAAGGTTTTAATAT
TAGTTGGAGATGGGCTTAGCTCAGCTGCAATAGAGGCAAATTTAAAAGACTGTGTGCCAGCTATAAAACA
GGGTCTAAAAATGTATGGTATAGATTCAAGTGAAATTTTATTTGTTAAACATTGTAGAGTTGGTGCTATG
GACCACTTAGGTGAAGAATTAGGTTGTGAAGTTATATGTATGTTGGTTGGAGAAAGACCAGGATTAGTTA
CTGCTGAATCAATGTCAGCATATATAGCTTATAAGCCATATATAGGAATGGCAGAAGCAAAAAGAACAGT
TATATCAAATATTCACAAAGGTGGAACAACTGCAGTTGAAGCAGGTGCTCATATAGCTGAACTTATAAAA
ACTATGTTAGATAAAAAAGCTTCAGGAATAGACCTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2150005-2150658 putative ethanolamine/propanediol utilization protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATGATGTAATTCGTCCTAATATACTAGGAATTAAAATAATTTCGAATATAAGTCCAGAAATGG
CACAAAAACTAGAATTAAAATCACATCACAAAAGTTTAGGTTTAATAACTGCAGACTGTGATGATGTTAC
GTATACAGCTCTTGACGAAGCAACTAAAGCTTCAGAGGTTGATGTTGTATATGCAAAATCAATGTATGCA
GGTGCTGCAAATGCTTCAACAAAACTTGCTGGTGAAGTATTAGGAATAATAGCAGGCCCAAGCCCAGCAG
AAGTAAGAAGTGGTCTAAATGCAGTAGTTGATTTTCTAGAGTATGGAGCAACTTTTATAAGTGCAAATGA
TGATGATTCAATAGCATACTATGCTCACTGCGTATCAAGAACAGGTACATACCTTTCAGAGATAGCAGGA
ATAAGAGAAGGTGAAGCATTAGCTTATTTAGTAGCACCACCACTTGAAGCAATGTATGCACTAGATGCAG
CAATGAAAGCTGCAGATGTTAAGATGTGTGAATTATTTGCACCTCCAACTGAAACAAACTTTGGTGGAGC
ATTACTTACAGGTTCTCAATCGGCTTGTAAAGCAGCATGTGATGCATTTGCAGAAGCAGTAAAATCAGTT
GCAGACAATCCAACAGGATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:2150669-2151370 putative ethanolamine/propanediol utilisation protein [Clostridium difficile R20291]
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AATCTGCAAATGTTAATATTGTAAGAATTGATAAGGTTGGGGCAGGTATTGTTACTTTAACAATATGTGG
AGATGTCGGTGCTGTAAAAGCTGCTTTAGAAGCAGGTGAAATAGCAGCTTCCAGAGTTGGTACATTAAGA
ACATCACATATTATACCGAGAATCCATAATGAAGTAACAAATGCTTTATTCAAAACTAAAGAACCTAAAG
TCTGTGAAGTTTCAGAAGATAAAGAAAAAAACTTTGAGATTACATTGGAAATAACTGATAATGTATCGAA
AAATTTATCAGAAAAAGAAAATGTAATTTTAGATGTCAATGAAAACAGTGGAGATACTGAAAATTTATAT
AGTGATATAGATAAAACAAACAAAAAAATTGAAACAGTTGATGATAGTTTAACAGAAGCTAATGAGGAAA
AAATAGAAAATACTAATGATAAAGAAGTATTGGAACAAGTTAAAATAGAAAATTCCGATTTTGATAGAGA
TGACCTATCAAAGAACAGTGTAAAAAAACTTAAAGCTATGGCTAAGAAATTAGATTCTTCAATAACTTAT
AAAGATTTAAATGTTCTTAAAAAAGAAGAATTAATAAACTTAGTTAAAAAGCTTAGCAGAAGGGATAGAT
AG
>ref|NC_013316.1|:2151373-2152842 putative ethanolamine/propanediol utilisation aldehyde-alcohol dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
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CTCAAGAGAAACTTTCTAAAATGAGTCAAGAGCAAATAGATAAAATAGTAAAAGCTGTTGTAGATGCAGC
ATTTAATAATGCTACTAAATTAGCTAAAATGGCAAATGAAGAAACTGGATTTGGAAAATGGGAAGATAAA
GTAATTAAAAATACTTTTGCATCTATGGGAGTTTATGAAACTTTAAAGAACACAAAAACTATTGGAATAA
TTGGTGAAGATAAAGAAGCCAATACGATAGATATAGCTACACCAGTTGGAGTTGTGGCAGGTCTTATACC
TTCAACAAACCCAACATCAACAGTAATATACAAAACTATAATATCTCTAAAAGCAGGAAATACTATAGTT
TTCTCTCCACATCCAAATGCAAAAAACTGCATACTTGAAACAGTTAATATAATAAGTGAGGCTGCTATAA
AGGCTGGAGCTCCAGAGGATTCAATATTATGTATAACTAATCCAAGTATAGTTGGAACCAATGAATTGAT
GAAACATAAAGATACAAACTTAATACTAGCAACTGGAGGAGAAGCAATGGTTAGAGCTGCTTACTCTTCA
GGAACACCAGCTATTGGAGTTGGACCAGGAAATGGACCAGCATTTATAGATAAATCAGCAAATGTTAAAT
TAGCAATCAAAAGAATAATAGATTCTAAAACTTTTGATAATGGTGTTATATGTGCATCAGAGCAATCTAT
AGTAATAGAAAAATCTATGGAAGAAACTGTTTTAAAAGAGCTTAAAAATCAAGGTGCATATGTTTTAAAT
GAAGAGGAAAGTGAAAGATTAGCAAAATTCATATTAAGAGCTAATGGTACTATGAATCCACAAATAGTTG
GTAAAAGTGTTGAGGTAATAGCAAATTTAGCAGACTTAACAAATATACCTAAAAATACAAAAGTTCTAGT
TGCAAGAGAAAATAAAGTTGGTCACAATGTAGCCTATTCAAGAGAAAAACTTACACCAATACTAGCGTTT
TATGTTGAAGAAAATGTAGAAGCTATTATGAACAGATGTAGAGAAATATTGTTAAATGAAGGTGCAGGTC
ATACATTCTCAATGCATGTAAATGATGAAGAATTGGTAAAAAGATTTGCCCTTAATATGCCAGTATCAAG
AATACTTGTGAATACTCCTTCAGCACTTGGAGGAATAGGTGCATCAACAAACCTTGTACCAGCACTAACA
CTTGGTTGTGGTGCAATAGGTGGAAGTTCAACTTCAAACAATATAGGACCACTTGATTTAATAAATGTTA
AAAGAGTAGCTTATGGAATCAAAGAAATAGAAGAACTTGGAAGAGATAAATCTCAAGTTGAAAAATCAAT
GTTTGACTCAATGGATAAAGAAGAATTAATAAATCTTCTTGTTCAAAAACTAGTCAAAGAACTAGCATAA
>ref|NC_013316.1|:2152938-2153225 putative ethanolamine/propanediol utilization protein [Clostridium difficile R20291]
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CAATGGTTAAAGCTGCAAATGTACAATTAGTAGGAAAAGAGCAAGTAGGTGGAGGATTAGTTACTGTAAT
GGTAAGAGGAGATGTTGGAGCTGTTAAAGCTGCTACAGATGCAGGAGCTGCAGCTGCCGAGAGAGTTGGA
GAACTAATATCAGTTCATGTTATACCAAGACCACACTTTGAAGTAGATGCTATATTACCAAAGGTATCAG
CTGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:2153352-2154113 putative ethanolamine/propanediol utilization cobalamin adenosyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGTGTTTTAACAGAAAACGAAGTAAAAAGAAAAATTGGAAAAAACAAAAATAATATAACTGAATTTT
ATATAGAAAAAGGTCAAATAATAACTCCTTCTGCAAAATCTTATTTAGCTGAGAGAAGTATTGAGCTTAA
ATATGTTGATAAACTTTCAGATGTAAACAATGAACCTAAAGAAGTTGTAAAAGAAGTAGTTAAAGAGAAA
AAATATAAATATACTACTGTATTTGGCGCTAAATTGGATGAAAAACCAGAACATATGACTCAATTAAATG
GAAATCTTTTAGTTTTTAAAGACCATAAAAGAATAATATTGAGAGGAAAAATAGATTCTCTTGAATCAGA
AATACTAAAGGTACAGATACTTTGTCAGAAACTAGATATGCCAAAGCTTGTTAAGGAATTGCAAGAAGTA
TTAGACTTTGTAAGAAATATAATGAGATGTGAAGTTTTAGATGAAAAGCTAGAAGACTTTAAACTTTTAG
GATTAACTCCTCAAGAACTTAGAGAACAATCTCACTATCCTAAAAAATACTTTGGTATAGGACATGAATT
CCCAAGTTATGAAATGGGAGAAGTAGTAGTAGCTATAAATAGTATAAGAAGTAATACACGAGAGGTTGAA
CTTGCAGCCTATGAAGCATTTAAGGGTGAGTATGGAAATGTTCACAGAGAAGATTTAATAAAGGCACTTA
ATAGATTATCGTCAGTATTTTGGATAATGATATATAAGGTTAGAACTAATAAGTATAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:2154126-2154755 putative propanediol/ethanolamine utilization protein [Clostridium difficile R20291]
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TTGAAGCATCAGGAAGACACGTTCACTTAAGTAGAGAAGATGTCGATAAATTATTTGGAGAAGGATATAC
TCTTACAAAACTAAAAGACCTATCTCAACCAGGTCAATATGCATGTAAGGAAAGAGTTACAATAACTGGT
CCTAAAGGAAGTATAAAAAATGTAGTTGTACTTGGACCATGTAGAAATGAAACTCAGGTAGAAATATCTT
TAACAGATGGTTCAACTCTTGGACTAAAAGCTCCTATAAAACAAAGTGGAGACTTAGAAGGTACTTTAAG
TATTAAAATATCAACACAATATGGTGAAGTTGAACTTGATAAGGGGTTAATGGTTGCTAAAAGACATATA
CACATGACTCCTAAAGATGCTGAAAAATTCAATGTATGTGATAAAGAGATAGTTGAAGCCAAGGTGATGG
GTCAAAGACCTTTAACATTTGATGATGTAGTAATAAGAGTGAGTGACAGTTTTAAAACTTATATGCATAT
AGACTATGATGAAGCCAATGCATGTGGTTATTCAAAAGGAACTGTTGCTAAAATAATAAAGAAAGCATAA
>ref|NC_013316.1|:2154797-2155522 putative ethanolamine utilization/propanediol hypothetical protein [Clostridium difficile R20291]
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AAATATCTAATAAACCTAAAGCTGTGATTGTATTTGAACAAGATAACAATAAATTTAACTTATTAAAAGA
TGAATTTGAAATACTAGAATTTGATAAAAGTATAAGGGAATGTGAAATAGTGATAGTTTCAAGACTTTGT
ATGAGGGGGCTATCGAATATAGCACTTGGAAATTCAACAAGTGATGAAGAAAGATTTATACTAAAAATGA
TTATGAAAGGCAAAAAAGTATATGTCCTAGATGAAGGAATTGAATACAAAAAATATAAGGATACTGCACC
AAAAGCATTATATAAGAAATTTATGTCATTTGAAGATGAAATATGTAAATTTGGTGTAGAAATTATAAAA
GACTTAAATGTTATAACTAAAAATAAGTTAAATATAAAGAAAGAACTAGAAAGTACTAGAGGTTCTAAAA
AAGAAGATACAAAAGTTTTAGATAAAGATGTTTTAAATTTAACCAGTGTAGAAAGTGTAAAAATAGATAA
TGAATTTAGTTTGGATTTAAGGAATAAAAAACTTATATCGGAAGCTGACTTAAGAAAACCAACTATAAAT
GGAGTTAAAAACATATTAGTTAATAAAAAAAGTATAATAACACCATTAGCTGTAGATTTTATGAGAATAC
ACCATCTCAAACTAAAGAAACTGTAA
>ref|NC_013316.1|:2155535-2155807 putative ethanolamine/propanediol utilization protein [Clostridium difficile R20291]
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TTTTAGTTGTAAAAATTTTAAAAACTAAAGACACATACAAGGAAGGCTTCATGGTTGCAGCCGATAATGC
AGGAGCAGGAAATGGAGACTTAGTTCTTATATCCAAAGGTTCCTCAGCTAGAGAGTCGATTGAAAAATCT
CATGTTCCAGTAGATGCAACTATAGTTGGAGTAGTCGATTCGTTTGAGGTGTTTGATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:2155800-2156351 putative ethanolamine/propanediol utilization protein [Clostridium difficile R20291]
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TAAAGAAATCTTCAGTTGATGTATTGTACTTAAAAAGTATTTGCCCAGGTAAATTTCTAATAATAGTAGG
TGGAGAAACTTCTTATATAAATGAATGTGTAGATTATGGAATAAAACTTGGAGAAGGATATATTGTAGAT
AACTTCGTAATAAATGCAATTTCACAAGAAATATTAGATGGATTTAAAAATAAGTATCAAAAGCTAGATA
GTATAGTCTCTATAGGCGTTGTTGAAAGTAGTAAAGTATGCGCTGGAATAAAAATGCTTGATAAGACTTT
AAAATCTGGCGACTTAGTATTAGTAAAACTTCAATTATCTTTTGCTATAGGTGGCAAATTAGTATATGTA
GTAGCAGGAGATTTAAGTAGTTTAGAATATGCATTAAAAGAAAGTGAAAATGTAGTAAGAGAAAAAGAAG
TAATATATAAGACTGTAATACCATCAGTAGACAGTCAAATAATAAAAAGTCTAATAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2156351-2157454 putative ethanolamine/propanediol transporter [Clostridium difficile R20291]
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TAGATAAATGTATAGGTAACAAATTTGGTCTTGGAGAACAATTTGAAGAAGGTATAATGGCAATGGGGTC
ACTTGCAGTTGCAATGGTTGGTGTTATATGTTTAGCACCAGTTCTTGCTGATGTATTAAGACCAATTGTA
GTACCAGTATTTAATATACTTGGAGCTGACCCAGCTATGTTTGCTGGAAGTTTATTAGCTAATGATATGG
GTGGTGCGCCACTTGCACTTGAACTTGCGAAAGACCCTAATTCTGGGTTATTTGGTGGATTAATAGTAGG
GGCTATGATGGGACCTACAATAGTATTTATAATACCAGTTGCGCTTGGAATAATTGAAAAAGAAGACCAA
AAATTCTTAGCAACAGGAATACTTGCAGGTATAATAACAATACCTATTGGAGCATTCGTTGGTGGATTAG
TTGCAGGATTCGAGGTAATGATGGTTCTTAGAAACTTAGTGCCAATAATAATATTTGCAGTAGTTATAGC
ACTTGGATTATTAAAATTCGAAAATGCTATGATAAAAGGATTCACATACTTTGGAAAAGGTGTAGTAATA
GTTATAACTTTAGGACTTGCTGCTGCCATAGTTGAAGCTTTAACAGGAATAGTTGTAATACCTGGAATGA
AACCAATCAGTGAAGGTATAGAAATAGTTGGAGATATAGCAATAGTTTTAGCAGGAGCATTCCCATTAGT
GTTTGTTATAACAAAGGTATTTAATAAACCATTAATGGCTTTAGGAAAAGTTCTTGGAATGAATGATGTA
TCAGCAGCAGGCCTTGTTGCAAGTTTAGCTAACTGTATACCAATGTTTGGTATGATGAAAGATATGGACA
ATAGAGGAAAAATAATAAATGTAGCATTCTCTGTATCAGCAGCATTCGTATTTGGAGACCACTTAGGATT
TACGGCAGGATTTAATTCTAATATGATAACACCAATGATAGTTGCTAAATTAGTTGGTGGTATAACAGCA
GTATTGTTAGCTATGGTTATCGCAAATAAGACACTAAGGAAGGAGAATGTATAA
>ref|NC_013316.1|:2157456-2157929 putative ethanolamine/propanediol utilization protein [Clostridium difficile R20291]
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GTGGAACTAAAGACACAGTAGATTTTGTTAGAAATAAAGACATTAGTGGAATAACTTCTATAAAGTTACC
AACTGTAAAAGTTAGTGAATCTGATAGATTAGATACAGGGAATCCAAGTGATGTAGTTTACACAAAAGAT
TTATTTACATTAGAGGAAAGCCCAAGATTAGGTTGTGGTATGATGGAAATGAAAGAAACAACTTTTGATT
GGACTCTAAACTATGATGAAATAGATTATGTAATAGATGGAACTTTAGATATAATAATAGATGGAAGAAA
GGTTTCTGCTTCTTCAGGTGAATTAATATTCATACCAAAAGGAAGTAAGATACAATTTTCTGTACCTGAT
TATGCTAGATTTATATATGTAACATATCCGGCAGATTGGGCATCTCAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:2158409-2158966 possible transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGCATAGAAACAAGTGGCTTAAAAGGAGACGTTATATGGAAGAGATAGTAAAGAAGGAACAAGCAAGTA
TGAATGATATTTTTTTGTATCTTAAAGCTAAATCAAACTCATTATATAAATTTGTAATATTATATAATGA
GTTTATCAATAAACCTAAAGATTATGGAACTGGGGAACTTATAAACATGGTTGAAGTACATATGCTAACA
GCGATTGAAGAAAATCCAGGAATAAGTCCAACTCAGTTAGCTAAAATATGGAACAGAACTAAAGGTGCAA
TATCTCAAACTATATCTAAATTGGAGAAAAAGGGTTATATAACTAAAGAAAAGAAAGAAGGAAATGCAAA
AACTATATTACTATATCCAACCACATCAGGAGTAGAGTTAAGTAAGGCACATAAACTATATGACACCATA
GATGTTACAAGAACATTTGAATACTTAATCAAGGAGTGTACATTAGAGGAGATAGATAGTTTTTATAAAG
TAATTGATTTGTTTATTAATTTATTAGAAGAATCTCCGCAGGAAAATAATGATTCTGAAAAAGTGTAG
>ref|NC_013316.1|:2159345-2160520 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTAAAACAATTAAGTGAAAAATACGAAGAATATGTAATTCAAATGAGAAGAGAATTTCATAAGT
ATCCAGAATTATCTTTTAAAGAAATAAGAACAACCCAAAGAATAAGGGAAGAATTACAAAAAATAGGGGT
CCCTTTTGTATCTATTGAACCAAATATCGTAATAGCTACTATACAAGGCAAAAATGAAGGTAAGACAATT
GCAATTAGAGGAGATATAGATGCGCTTCCAATGCAAGAAGATTCAGATGTTGAATACAAATCAGAATATG
ATGGAATAATGCATTCTTGTGGACATGATGCTCATGGAGCTATGTTACTAGGACTTGCACATATGCTAAA
TGATATAAGAAAAGATTTAAAAGGTAGAGTATTATTAGTTTTTCAAGCAGCTGAAGAAGTTGGTGGCGGA
CACAAGGAGATAATACAGTACTTTAAGGAAAATGGAGGACCAGATAGATTAATAGCTACTCATGTTTGGT
CCGATATTGAAGCTGGTAAAATTTCTGTTGAACCAGGACCTCGTATGGCTGGTGGGTCTGGTTGGAGAAT
AGACATAACAGGTAGAGGAGGTCATGGTTCTAGACCAGATCAAAGCATAGATCCTATAAAGCCAGCTTGT
GATATAGTTTTAAAAGTATCTTCTATACCAGTTAATCATATAAGTGTACTAGAACAATGTGTTGTACATG
CATGTGCAATACATGGAGGAACTACAATAGGAAATGTTATTCCAAACAATGCAGAGGTAATAGGTGGATA
TAGATATTTTACTGAAGAATCAGGCAAAAAAGTGTTTGACATTATAAAGCAAATGAGTAATGGTGTTGGA
CAAGCTTATGGAGTGGATGTGAAGGTTACTCATACTGGAGGCATAGGACCTGTTATCAATGATGAAGAAG
CAGTTAAGATGTCTAAAGAAATAGTTTCTAATATAGATGGATTGGAGTTAGATTCTTATGAGCCAATATG
TGCATCAGATTGTTATGGTGAAATATTAAAAGAGTATTCTGGTTTTTATTGTTATCTAGGGGTAGGTAAC
AAAGAAAAAGGAATAATATATGCACAACACCATCCTAAGTACAATATAGATGAAGATACATTAAAGTTAG
GTTGCGAATTTATGGCTAAATATGCAGTTGAATTTTTAAATAAAAATAATAACTAA
>ref|NC_013316.1|:2160540-2162093 putative aminobenzoyl-glutamate transport protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGGGGGGATGAAAATGCAAGGTGCATTAAAGGAAAATAAGAAAAAAAGTGGTGGAGGATTTTTAGGAT
GGATTGAAAGAGTTGGGAATAAAATGCCACATCCTCTAGCATTATTTACATATATTACATTGATAGTAGT
AGCATTATCTGCAATAGCAAGCTTTTTAGGTTTTTCAGCAACAAGTCCTGCTACAGGAAAGTTAATAAAA
GTTATGAACTTAATAAGTGCAAAAGGTTTAGTACTATTTATGCAAGAGTTTGTTAAGAACTTCCAAAACT
TCCCTGTGCTTGGGGTAGTTTTAGTTATGGCAGTTGCCACAGGAGTTTGTGAAAAGACAGGATTTTTTTC
AACTGCCATAAAAATGAGTTTATCAAAAGTTAAGGGGAATGCGGTTGTATTTATAATAGCTTTTATAGGA
GTATTTGCTAATCAAGCTGGTGATGCTGCTTTTGTATTAGTACCAACTCTTGCAGGAGCAATATTTTATG
GATTAAATAGAAATCCATTAGCTGGTATATTCTGTGGATTTGCATCAGTTGGTGGTGGATTTGCAACAGC
TGTAATTCCTGGGGGATGGGACGTTACGCTAACGCCAATAACTGTATCAGCTGCTCAAACTATTCAACCT
GCATTTGATATGACATTATTAGCTAGTTATTATGCACTATTTGTATCTGCGTTTATAGTAGCTACAGTAT
CAACAATAGTAACGGTTAAATTTATAGAACCTAAATTAGGTAAGTATACTGGTAAACCAGAAGGTATAGA
TGATAATCAAGGTTTTGAGGTCACAAAAGAACAAGCAAAAGCAGCAAAGTTAGCAGGTTTTACAGTTTTA
GCTTATGTAGCGTTATTAATTGCTTTGTGTATACCAGCTAATAGTTTTTTAAGAAGTCCAGAAGGTTCTT
TAATATTTGGAGCACCACTTATGTCTTGCTTACAGTTTTTTATAGTAATACTATTCTTCTTGCCAGGGAT
TGTGTATGGAATGAGGGTTGGTAAAATCAAGACTGTAAAAGACTTAAATGATATATTATGTCAATCAATG
GCAGCAATGGCACCGTTTATCGTACTTGCAATAGTTATAGGTCAATTCTTAACGCTATTCTCAGTGTCTA
ATTTAGCACAGGTACTAGCTATAAAAGGTGGAGCATTACTCAACTCATTGCCACTACCACCACAAGTTAT
AATACTGCTATTCTTAGTACTAGTAGCGTTTATAAATATATTTGTTATAAGCGGAAGTACAAAATGGATG
ATATTTGGACCAGTATTTGTTCCGATGTTAATGCAATTAAACATACATCCAGCATTTACTCAGTTTGTAT
ATAGATTAGGAGATTCTGTAACTAATCATTTATCACCATTAAATGCATTCTTTATAATACTTTTAGCAAC
AGTCCAAAAATACGATAAAAATGCAGGTATGGGAACTATATTCTCAGCTATGATACCTTACACTATAGGT
TACTTTGTAGTACTTGCAGTTTTAGTAGTAGTTTGGATGACAATAGGTATACCAGTAGGAATAGGTGGAC
AAGTTTGGTTATAA
>ref|NC_013316.1|:2162125-2163327 putative aminotransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAACAACTGAAATAAGATACAATTTTGATGAAGTAATAGATAGAAGTGGAACAAACTGTCTTAAAT
ATGATCTTAAGAGTCAATTTATGCCAGAATCTCCAGAAGATGCACTACCACTATGGGTAGCAGACATGGA
TTTTGCATGTGCTCCTGAGATAATTAATGCAATGCATGAAAGAATAGACAGAAAAATATTTGGATATAGC
TCTCAACAAACTGATGATTATTATGAAGCTGTATGTGGATGGTTTAAGAGAAGATTTGATTGGAAAATAG
AAAAAGAGAATATATTCTTTAGCCCAGGGGTTGTGCCTGCGTTAGGATTTTTCATACAAATATTAACACA
AAAGGGTGATGGTATCATAATAGAAAAGCCTGTATACTATCCTTTTGAAGATAAAATAACTAATAATGAA
AGAAAAGTAGTTAATAGTCCTTTAAAGTTTGAAGATGGTCATTATTCTATGGATTATGATGGATTTGAAG
AATTAGCTAAAGATGAAAATAATAAGGTGTTTATATTATGTAGTCCTCATAATCCAGTTGGTAGAGTATG
GAAAAAAGAAGAACTTAGAAAAATAGTAGACATATGTAAGAAATATGATTTGTGGATAATATCTGATGAA
ATACATTGTGATATTATTCGTAAAAGTGAAAAGCATATACCATTAGAAGTAGCATGTCCTGATTATAAAG
ATAGAATAATAACTTGTACAGCTCCAAGTAAGAGTTTTAACTTAGCTGGTATGCAATTATCAAATATAGT
AATCAATAATAAGGAATTACAAGAAAAATGGATGCTTGAAACAGATTCTAAATTAGCTATATTCCTACCT
AATCCATTCGCAATAGTTGCTACTAAAGTTGCTTATAATGATTGTGAAGATTGGATGAATCAAGTAAATG
AGTATATAGATGGTAATATTAAATATGTAGAAGATTTTGTTAATGAGTATATGCCTAAAGTAAAGATAAT
AAAATCTCAAGGAACTTACTTAATTTGGTTAGACTTTAGAGGGTATGGATTAGATGCAAAACAGCTTGAA
TATGTAATGCTTAACAAGGCGAAGGTATTGCTAGATGAAGGATACATATTCGGAGAAGAAGGAGCAGGAT
TTGAAAGAATAAATGTTGCTTCGCCTAGAACAATTATAGAAGAGTGTATGAATAGAATAAAATGTGCATT
TGAAGGATTATAA
>ref|NC_013316.1|:2164274-2165632 hypothetical protein CDR20291_1851 [Clostridium difficile R20291]
TTGAGTAACATAATAACGAATTTAATAGAGTCAGTATTTACTAATCCAATAACTATATTGTTTTTACTTG
CAATAACTGTGTATTCTGTTTTTAAAATAATAGAAAATAACAGAGTATATTCATTTGTAAGTTCAAAATT
AGACGAAATCAATAGAGATTATAAGACAAGTGAGTTTTATAAAAAGGTAAGGGATGACTACTATACATAT
AGTAAAGAAAATCCTTATGCAGACGTAAATATAACTTCATTTATAGAGGAAGTTGTATCTGATTTAAAGC
ATAATAATTTGCCATTGTTAGAAAAAATTAGAAGTATAAAAAATTCATCTTCAATAAGTATATTACTTGG
GGTTTTAGGTACGTTTGTTGGTCTTTCTACAATGCTTTTATGTGTTGATACTAAAGACATTATAAATTCA
CTTCCTTCAACTATTAGTAGTATGCAAACTGCATTTACAACTAGTATATTTGGAGTTGTATTTTCTCTAA
TTATAGGTTACTTTACTAAGATAAAAGATTGTGAACATGTTTTGATACAAATAATGTTAAAATCTGAAAA
TTTACTAACATCTGAAATAACTCATTTTAAGTCAGAAAGAATGGATTTAAAAGTAGAAGAGGTAAAAAAT
ACAATAAAACAAATAAGTAAGTCTATAGAAGCTATTGAAAAATTTGATAAAATATCTAAAGATTTAAATG
ACTTTAATGATGAATTTATCAGTGGTATAGAAGCTTTAAAAAGCCTTTTAGAAGGTTCTCAAAGTTCTAT
TAAGACATTTGACCAGAGCGTAAGAAAATTAGATAAACAGTTTAATATTTTAAATATAAAATTTGTAAAG
CTTTTTGATAAATATGATAATCAAGATAATATAAATAAAGAGATTTTATTTGATATAAAAGAATCTTCAA
AAAATATATACAATGCCACTGAAAGCCAATTCAAAATTAGAGATTATATAAAAAATATAAATGCAGGATT
TGCTCTATATGAAAGAAGTGCTCAAGATTTATTAACTAAATTAATGACCCATGAAAATAAAATCTCTCAA
AATCAAAAAATCCTTTTAGATGAAAAGTTTACCTTAGATGACTCAATAAAAAATCTCTCAAGTATTATTG
AAAACTTTTCTAATGACCTACAAGTTAAACTGGATATGATGTTTGAAAATTCTTTAGATATTCAAGATAA
GTTAGATGTTATGTTTAATAACTCTTTTATGAATGATGAAGTTCCTCTTGATAGTGAGGAATTATTTAAG
GATGATGTTAATAATGTATTTAATCCTTTTAGTGAAGAAATTTATGAGATAGAGGATAAAGAAATAAAGG
TCATAGGTGAGGATGAGTTAAATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:2165625-2166257 hypothetical protein CDR20291_1852 [Clostridium difficile R20291]
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ATTTATTATCTACTGTATTGATGGTTGTGATTCTTATCTTATTTAGCTCAGAAAGTATTTCAGGTTCTGT
TGAACAAGATTTAGCTAAGAATGTCAATGCTTCTGTTGAAGAAACTTTTAAAAAAAGCAAAATACCTGTG
AAGGTAGATAAATCTAATGGGCAAGTAACTTTTGGTGAAAAAACCATGTTTGATGTAGATAGTGATGTTT
TAAAACCAGAGGCTAAAGAAATGCTAAAAATGTTTGTTCCAAAGTACATAGAGACTATTTATAAAGATTA
TGGTGACTATATATCCAAAATAGTTATAGAAGGTCATACAGATGATGTGGGAAGTTATATATACAACTTA
GATTTATCGCAAAGAAGAGCATATAGCGTTGCTAAATTTATAGTGGGAGATGAAATAGGTGACTATAAAT
ACAAAGATAAAGTGACTAAGCATATTATTGCAATAGGAAGGTCAAAAGCTGAACTCATCAAAAATGGTGA
CAATAGCGTGAATAGAGATGCATCTAGAAGAGTAGAACTAAAATACGAAATAAATATTAATCAAAATAAA
TAA
>ref|NC_013316.1|:2166586-2167743 hypothetical protein CDR20291_1853 [Clostridium difficile R20291]
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CTATATCGATTTATTTAACTGGTTGTACTACATCAGATAATGGAAATAATCAATCAAATAATAATGATTC
TTTGTCTAGTAGTATATCAAGTGATAAGAATGTAAAAATTCATTTTATTGACACTGGAAATAGTGATGCA
ATATTGATTCAAGATGGTAAAACTTTTACATTGATAGATGGGGGAGATAATGATGATGAGGGATTAATGG
TAGATTACCTAAACAATCAAGGTGTAAAAGATATTAAATATCTTATAGCTACCCATTCTCATGCAGACCA
TTTAGGTGGACTTGATTCTGTTGTCAAAAACTTTAATATAGAAAATGTTTTTGTATCGAATGGTTCAGCA
GAAACAAAGAGTTATAGGGACTTTATAAATGCTTTAGCAAATAAGGGTTTATCCCCAAGTGTACCGCTTG
AAAATAATAAGTTCTATTTAGAAGATTCTTATTTTGAAGTTCTAAATACAAATGGGGGAGATACTACTAA
TGAACAATCTCTAGTCCTTGTATATACTAATGGGAATGATAAAGTTTTATTTACAGGTGATGCTGAAGAA
GGTACCGAAAAAGAAATACTACCTAAGCTTGAGAAAGTAGACCTTTTAAAAGTAGCTCATCATGGTTCTC
GTAGTAGTTCATCTCAAGAGTTTTTAGATAAAGTAAATCCTGAATATGCGGTTCTTTTAGTAGGCAAGGG
TAATTCATATGGTCATCCACATCAGGAGACAATGAATAAATTGAAAAAAATGGGAGTAAAAGTACATAGA
AGTGATGAGTGTTCAGATATAATATTTGAATCAACAGGTGATGGAGTATTTACAAGTTGTAAAGATGGAA
GTTATAATAAAGGTGTTAGAGAAGATGGAAACTCTGGAAAATCAAACAGTAATACAAGTAAAAATGATTC
TTTTAAAAATAAACAAAATACATTCAATTCAGAAGAAATAGTGTATTTTACTCCAAAAGGTAAGAGTTAT
CACTCTATAAAAAATTGTAGTGGGCTTTCAAGAAGTAAAAAAATATTATCAGGCACAATTGAAGAAAGTA
AGAAAAATGACCCATGTGATATATGTTATGGAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2168571-2167891 SOS regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
GTGTATGGAAATAAAAACAAAATATGTTTGGAAATGAGTGATGTTATGTATTTAGATCTAACTGAAAAGC
AAGTCTTGATATTGGAATTTATAAAGTCTCAAATCACATTAAAAGGTTATCCACCTGCTGTAAGAGAAAT
ATGTACTGCTGTAGGGTTAAGATCTACTTCAACTGTGCACTCTCATCTAAATAAACTTGAAAAACTGGGA
TACATAAGAAAGGACCCTACTAAACCAAGAGCTATTGAAGTTTTAGAACGTAGTAAAGTAAATGATGTTT
CTGGAGCTAATCAAGAAATAATAGAGCTTCCTTTAGTAGGTCAAATAACAGCTGGAGAACCCATTTTAGC
TCAACAAAACATAGAGGAATACATTCCATTCCCTGCCAGTTTAGTAAAGGGCAGTAACAATTTTGTATTA
AGAGTAAAAGGCGAAAGTATGATTAATGCAGGAATTTTAGATGAAGATTACGTTGTAGTAGACAAAAAAA
ATACGGCCTTAAATTCTCAGATAGTAGTTGCACTTATAAATGGTGAATCTGCTACAGTTAAGAGGTTTTT
TAAAGAAGGAAATTTAATAAGACTTCAGCCAGAAAATGATTTTATGGAACCAATTATGCTCAATGACTCA
GAAGTTGAAATTGTAGGTATTGTAACTGGTGTATTTAGAGTTATTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2169757-2168630 putative tyrosine recombinase [Clostridium difficile R20291]
TTGAATAATGATAAGAAAATTATAAAAGTACATAATAAATCAGATAAACCTGATAATATTGTTATCAAAG
AAAATGAACTCATAGAAAAATGTCTACTTTTGGAAAATAAACTTCCTGTATTTATGAAGGATTATTTTAT
ATATTTAAAAGGTTCTGTTGCAGTTTCTACACGACTTGCTTATTTAGAAGATATTAATTTTTTTTGTTCA
TATTTGATTGAAACCAAAGAATTAACAAATGCAGATTGTGTAAAAGATATTACAGAAGATGATTTTAATA
CAATAAAATCAAGAGATATAAATTTATTCTTAGGTGATTATTGCAGTAGATATTACAAAAATACAGAAAA
AAACACATTGATTTTTGAAAATAACAATAGAGCGTTAGCAAGAAAAAAATCATCCATCTCTACTCTATTT
AAATTCTTATACAGAAACTCTCAGATAGATAATAATATAACTGATGGATTCAATCCAATAAAACTTCCTA
AACCTCAGCCAGATGCTATTAAGCGCCTTGAGATAGATGAAGTTGCTAAGATGCTTGAATCAGTAGAAAC
AGGTGAAGGGCTTACAGAGAAAGAAAAGGTATATTGGAGAAAAACTAAATTACGTGACAAAGCTATACTA
GCATTATTTGTTACATACGGGCTTAGATTAAATGAGCTTAGAGAACTCAATATCTCCTCTTTTAATTTTT
CAAGAGGTGAATTTAAAATATATAGAAAACGTGGGAAAGAAGTTTTAATGCCTATAAATCATACTTGTGA
ACATGTAATAAAAGATTATTTGCAAAACGAAAGAACAAGAGATGAACTATTAAATGATGAAGAAAAAGAT
GCTTTATTTTTGTCTCTTCAAAATAAGAGAATTACAGCAAAGGCTATAAGAACACTGGTAAAAAAATATA
CATCTATTCCACTTGATACTACTAGAGACAATGGATATAGTCCCCATAAATTAAGAGCAACGGCTGCAAC
TTCTCTAATCCAAACAGGATTTTCTATATATGATGTTCAAAACTTACTTGACCATGATAATGTCACAACT
ACTCAGCTTTATGCAGCTCATAAGAAAAATGTAAAACGTGATATAGTCAAGAATTTTGAATGGATTGAGG
ACGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2170924-2170079 hypothetical protein CDR20291_1856 [Clostridium difficile R20291]
ATGATTTATATAATCGAAATTTTAAAAATAAGTGTAATAAATATTTTTTGTTTCATAGGAATATTTATTG
TATTTGGATTGATTTTTAGCATTACAGAAAATCTAAATAATAAATTTATCTTTTCATCTTTTGGAAAAAC
TGGAATTATTGTAACTGGAGCTATAGGAACGTTTGTTCATGAATTGAGTCATTTGATAATGTGCTTGATT
TTCATGCATAAAATAAATTCAGTTAAGTTTTTCAGACCAATAGAAAGTAAAAATGATGGTATACTAGGAT
ATGTAAGTCATAGCTATAAAAAAGATAATCTTTATCAAAGTATAGGAAATTTCTTTATAGGAATTGCACC
TATTATAGGTGGAACAATAATGATTATTTTAATTTTTAAGATATTACTGCCAGATAGTTATATGAAAGTG
ACTCAAAATATAGATTTAAAGTTATATGTAAGTATGATTAATAATTTAAATATAAATGGTTTTATACACA
TTATTTTAGGTGATATTTCCAATTTTATAAGAATAATGTTGTTAACACCTAGTGTATATTCATTGAAGTA
TTTTATATTTATGTTTTTAATGTATTCTATATCTACACATATGTCACTTAGTAGTGCTGATTTAAAAAAT
AGCTTAAATGGTCTGAGCTTTATAGTTATAGTTATTTTTGTAATAAGTTCAATTACATACTTATTTGGAT
TTGATAACTTGAATATATCCAGTTTAATAGTTAAGTATAACATATTTATAAGTTTCTTTATGGCAATAGG
GTTTATTTTTTCAATAGTAACTCTCATAATATCCTATATTTTAAGCTTAGTCAGCCCATTTAAAAACTTT
AGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2171325-2170954 hypothetical protein CDR20291_1857 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTAAAATTATTGGTAGAAGAGTATGCAGTATGTAGATTAAATAATGACAGTAAAATACCAACAT
GGATAGATACAGAGAAGTTTTACTCTATAACTAGAACTGATGATGAATTAAGTGTTGTATGTTTAAATAA
TAATATTCCTTCTGATGTTAAGTCAGAAAAGGAGTGGAGAATACTTAAGATACTAGGTCCTTTAGACTTT
TCACTTGTAGGAATTTTATCTAAGTTAAGTAGTTTGTTAGCAGACAACAAAATAAGCATATTTGCAATTT
CTACGTATGATACAGACTATATCTTAGTAAAAGAAAAAGATATAGAAGATGCTTGTAAAATTTTAAGCTG
TAATGGATATGAAGTAGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c2171738-2171478 stage V sporulation protein S [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGTACTAAAAGTTTCATCAAAATCTAATCCTAATTCTGTAGCTGGAGCCTTGGCTGGAGTACTAA
GAGAACGAGGCGTTGCAGAAATACAAGCTATAGGAGCTGGAGCTCTAAATCAAGCGATAAAATCAATTGC
AATAGCAAGAGGTTTTGTTGCACCTAGTGGAATGGATTTAGTTTGCATTCCCGCATTTACTGATATAGAA
ATCGAAGGTGATAAGAAAACAGCCATTAAACTTATAATTGAACCTAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2172871-2171927 acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha [Clostridium difficile R20291]
TTGATTGAAAATAATAGTGAAAAAATAAAAGTCTTAGAAAATGATATTAAACAATTAATAACTATTTCTA
AGGCAAATAATATAGATTTAAGTGATAAAATAAATTCACTTAATGAGAAATTGGAAAAGCTTAAGGAAGA
TGCTTTTTCACATCTATCAGCATATGAAAAGGTAACACTAAGTAGAGATATAAAGAGACCTACGACATTG
GAATACATAGAACATATTTGTTCTAATTTTTTAGAACTTCATGGAGATAGGCTTTTTAAAGATGACCCTT
CTATGGTTGGAGGGATTGGTCAGATAGGAAAGTTTAATGTTACTATAGTTGGACACCAAAAAGGAAGAGA
TACAAAAGAAAATATAAAAAGAAATTTTGGAATGCCTCATCCAGAAGGATACAGAAAAGCATTAAGACTT
ATGAAACAAGCTGAAAAATTTAATAGACCTATAATAACGTTTATTGATACATCAGGAGCTTTTTGTGGTT
TAGAAGCAGAAGAAAGAGGACAAGGAGAAGCTATTGCAAGAAACTTACTTGAAATGAGTAAACTTTCTGT
TCCAGTAATCACTTTTGTAATTGGTGAAGGTGGTAGTGGAGGAGCTTTAGGTATCGGAGTAGGAAATGAT
GTTTGTATGCTAGAACATTCAGTTTATTCTGTGATTTCTCCAGAAGGGCTTTCTAGTATTCTATTTAAAG
ATTCATCTAAAGCTAAAGAAGCTTGTGATGTTATGAAGCTTACAAGTAATGATTTATATGATTTAAAAAT
AATAGATAAGATTATAAAAGAACCTCTTGGAGGAGCACAAAAAGATGTAGAAGCTGTTTCAAAAGAAATA
AAAGCTTATATTTTAGAAAGATTAAATCATTACAAAGATATGGATAAAGAGGAAATTATAGCTCAAAGAT
ATAAAAAATTTAGAAATATTGGAAAATGCTTATAG
>ref|NC_013316.1|:c2173746-2172892 acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit beta [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAAAAAATTTTTATCATCAAAAGAATCTAAGTATGTTACGATTTCTTTAGATGACAACTTTAAAA
AGAATAGTGTAGATGATAAATTTTGGACCTATTGCAAAGGTTGTGATAGTCATGTATTTAGAAAGGACAT
AGAAGAAAATTCATTTGTATGTCCAAAATGTTCAAGACATTATGGCTTAAGAGCAAGAAAAAGAATAAAT
TTATTGATTGATAAAGGAACTTTTATGGAGTTTAATTCTGATGTAGAATTTCAAAATCCACTAAATTTTC
CTAAATACAAAGAAAAAGTAGACTCTTATAAGGAAAAAACAAAAGAGTCAGAAGCTGTTGTCACAGGTTA
TGGAAGAATAAATGGAATTAAAACAGTTATTTGTGTAATGAATCCTGATTTTATGATGGGAAGTATGGGT
TCTATTGTTGGGGAAAAAATAACTTATTCAATAGAGTATGCTGCTGAAAATAATTTACCTATAATTATTT
GTTCTGCTTCAGGAGGAGCTAGAATGCAAGAAGGTATGGTATCTCTTATGCAGATGGCAAAGACTTCTCA
AGCACTTTCTAAGCTTGAAGAAAAATCATTGCCATATATATCAGTTCTAACTGACCCTACTACTGGAGGA
GTAACTGCTAGTTTTGCTATGCTTGGTGATATTATAATTTCTGAGCCAAATACGTTGATAGGTTTTGCAG
GTCCAAGAGTAATAGAGCAAACAATAAATCAAAAACTTCCTGAAGGATTTCAAACTTCTGAGTTTTTACT
TGAAAAAGGTTTTATTGACATGATAGTAGATAGAAGAAAAATGAAGGAATTATTATATCAAATTCTTGCT
ATGCACAAGAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2175122-2173761 biotin carboxylase (acetyl-CoA carboxylase subunit A) [Clostridium difficile R20291]
TTGATAAAAAAAATACTAGTTGCAAATAGAGGCGATATAGCAGTTAGAATCATCAGAACATGTAAAGAAC
TAGGTATAAAAACTGTTGCTATCTATTCTGAAATAGATAAAGATTGTTTTCATAGATATATAGCTGATGA
ATCTATTTGTATAGGACCAAATAATATAAGTAAGAGTTATAATAATATAGAAAATATAATCTATCTTGCT
CTTAAATTAAAGTGTGATGCTATTCATCCAGGCTTTGGATTCTTATCAGAGAATCCTGAATTTGCAAAGC
AATGTGAAGATAATAATATTATTTTTATAGGTCCAACAAGAGAACAAATGATTTTGATGGGAGATAAATC
TAGAGCAAGAGAAACTATGATGGAATTGAATATCCCTGTTGTTCCTGGTTCAGAATCTGTTTTGAAAACT
AAGGAAGAAGCTTTAGAAGTTGCAAGAGAAATTGGATATCCTGTTATGATAAAAGCCTCAAGTGGAGGCG
GTGGAAAAGGTATGAGAATCGTTAGAAAAGAAGAAGAACTTTTTTCAAATTTTGATATGGCAAGTTCAGA
AGCTCTAGCAGCATTTTCTAATAGTGATTTATATATGGAAAAGTTTATAGAAAATCCTAGACATATAGAA
GTACAAGTATTTGGAGATAAACATTCAAATGCAATACATTTAGGTGATAGAGATTGTTCTATGCAAAGGC
GAAATCAAAAAGTAATAGAAGAATCTTTAAGTCCATACCTTTCAGATGAAGAAAGACAAAAACTTCATAA
AATTGCAGTAGATATAGTAAAAGGAGTAGGTTATATCGGTGCAGGTACTATTGAGTTTATAGTTGACAAA
GATAAAAACTTTTATTTTATAGAGATGAATACAAGAATACAAGTTGAACATCCAGTTACAGAGATGGTAA
CAAATCTTGACCTTATAAAACTTCAAATATCTATAGCTAATGGGGATAAAATTCCTTTTAAACAAGAAGA
TATTACTTTTAGAGGTCATGCTATTGAATGTAGAATAAATGCAGAAGATTCATCAAAGAATTTTGCTCCA
TCACCAGGTAAGATAGAATCATTAAATTTACCTGGAGGTTTTGGTGTTAGATTTGATACTTTTGTATATG
CAGGATATACTATACCACCTTTATATGATTCTATGATAGGTAAGTTAATATGTTGGGCTGAAACTAGAGA
AGAATGTATAAGTAGAATATATAGAGCTCTAGACGAAATTATTGTAGAAGGTATTAATACAAATGTAGAA
TTTCAAAAGGCACTTGTAACAAGTGAGGAGTTTAGAGAAGATACTCATCATACCAAATTTATAGAAGATG
TCTTTATGAAGAAAGAATTTGCTACATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2175590-2175138 biotin carboxyl carrier protein of acetyl-CoA carboxylase [Clostridium difficile R20291]
ATGAACATCAATGAAATTAAGGAATTATTAAAGGCCATAGACTCAACTAACTTAGAATATGTAAAACTTG
AAAGTAGCGATTTAAGATTAGAAGTATCTAAAAAAGCTCAATCTACAAGTTCACCTGTTTTAAGTGTACA
ACAAGAATCAGTAGTGGATCTTTCTTTAGAAAAGCCAGTTGTAAACGATACACCTGTCACATCTAATGAG
AATCTATCAGTAGTAGTAGCTCCTTTGATGGGAACATTCTATGATTCTCCAAGTCCAGATGCAGATAGCT
TTGTTAAAGTTGGCGATGTAGTTGAAGAAGGCGACACTTTATGTATATTAGAAGCAATGAAGCTTATGAA
TGAGATAACAAGCGAAATTAAAGGTGAAATAATTGAAGTATTAGTTAGTAATGAAGAACTAGTAGAATAT
AATCAACCTTTATTTAAGATAAAACCATTGTAG
>ref|NC_013316.1|:c2176306-2175860 hypothetical protein CDR20291_1863 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATCTAAATTTTTTAATTGGTACACTCAATCCTTAGGGGGAACTTTTGGCATTATATCATGTATAT
GCGCATATTTAAATGGATACATGTTTGTTTATACAAATAGTGCTAGCAAATATTTTGAAAGTATAGGATT
TCTGGGAATAATTTCAAGTTATACACTACTTCCACTTTGTATGCTTACTTTGATTTTTGGAGTTATATAT
TCTTATACTCCAGAAACATCCGACAAAAGTATTTTTAATATACCTTTTTTTACTTTAAATAAAAGATTAA
TACTTATTACAGTAGTTTTTGGTTTTATAGGTGCTAGAGTTTACTTTATAATTCCTGCAATTCTAATAAC
TTTTAACCTATATAGTAATGTTTTGATAGCTAAATTAAAGTACATCCTATGTAAAAATAAAGAAAATGAT
ACTAATTTGAAAGAAAGCGAAGTCTAA
>ref|NC_013316.1|:c2177734-2176988 hypothetical protein CDR20291_1864 [Clostridium difficile R20291]
ATGTGGGAGGGTACTATGAATTTAGCTAATTTAATACCATTTATTATTTCTGCAGCAGCTTTAAGTCCAA
TAAATTCAAATGATAAGGTTTTGAGCGAAAATCAACTTAAAGATATTTTTCCTGATGCAAATTTAAGAGC
AGTTGTAAAAAGATATATAAACCCAGATGAGATGACTATAAGCAATATAAAGGCTTTAGATGGAGAATTT
TATGCAACTGGTGAGAGCATTTCAAATTTAAAAGGAATATCATATCTTGAAAATGTAGACAATTTTATTT
TTTGGAATAATAATATAAAAGAGGTTCCTAAGGAAGCTTTAAGTCTAAAAGATATGGATTCAATAAATCT
TGCCAATAATTATTTGATTGATGACGATGTAGTAAATTCTCTTTCTCATAATGGTGTGGATGTAAATTGC
GATTTAAATTTTATTGATACAAAAGATAATCAGTATAAACTGGACTCTAAATATCATAATGTTGATATAG
CAAAAGGTGAAAGTATTGATTTGAGAAAAATAATTACGAAGAAAATTGATAGTTATTATAAATACTGGGA
AGTTACTGATAATCTTCCAAAAGATTTAGACTTTATTGTATCTGTAAGTGATAAGAGTGTACTTTCATGT
GAAGATATGATAATTAAAGGTAATAAAACAGGTCAAGCTGTGGTAAAAGTTATACTAAGCGACAAAAATG
ATTTAAATACATCTCAAGAAGTTCTAATCACTGTCAATGTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2178546-2177863 tRNA guanine-N(7)-methyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGTATTTTACTAATTTTTTATATGTAAGGAGAATTATTGTGAGAAGAAGACGAAAAAAAGGTGCAGATG
AAAAGCTTTTAAGTTATACAAAATATGTTTTAAGAGACGATATAGACAAATTAAAAGGCAAGTGGAATTT
AAAGTTTAGAAATGATAATCCAATACATGTTGAATTTGGGACTGGAAAAGGTAAGTTTATAACAACTTTA
GCTAAGCAGAACCCTGACATAAATTATATTGCCATGGAACTTAAGGAAGAAGTTCTTTTAAAAGCTGTTG
AAAAAGCAGATGCTTCTAATTTGAATAATATACTATTTTTATGGGGAGATGTAAGCAATATTTTGGATTA
CTTTGAAGCTAAAGAATTATCGAGAATTTATATAAATTTCTGTGACCCATGGCCTAAAAATAGATGGAGT
AAAAGAAGACTCACTCATTCTGGATTTTTAGAAATGTACAATAGGGTTTTGGAAGATGATGGCGAAATTC
ACTTTAAAACAGATAATGAAAAATTATTCGAGTTTAGTTTAAATGAAATTGCTGCAAATAATTGGCTATT
AAAGAATATTTCTCTTGATTTAGGAAATAGTGAGTATGAAAATAATGTTACAACAGAGTATGAAGACAAA
TTTATGTCACAAGGTATGCGAATATTTAGATGTGAAGCTAAAAAACGTAACTAG
>ref|NC_013316.1|:c2178965-2178645 hypothetical protein CDR20291_1866 [Clostridium difficile R20291]
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CTAATAATATAAGAGTATACTTTGCAGGTGTTGGTTGTGGAGGTCCTTCTTTTGGATTAGCTTTAGATGA
GAAAAAAGAAGATGACTTAACTTATGAAGTTGGAGAATTACAATTTGTAATGAGCTCTGATGAATATAGT
CAGTATGGAGATATAATAATAGAAGATACAGGATTTGGATTTAGAGTTATTCCTGAAAATATGAAAGATC
AAGGTGGAGGAGGATGCTCTGGTTGTTCAGGGTGCCACTAA
>ref|NC_013316.1|:c2179843-2179418 hypothetical protein CDR20291_1867 [Clostridium difficile R20291]
ATGCATGATGAACTGAAAATCAAAATGTACTCATTTACGATGGATTGCAAAGACCCACATGAATTAGCAA
AATTTTATGCAGCGTTACTCAATTGGGAAATAGCATTTTATAATGAAGAATATGCATGTGTTGGTGCTCC
AGGAACAAATCAGGGAACATATCCTGGTATAACATTTCAACGAAATTCTGAGTATAAACCGCCTGTGTGG
CCAGAAAAACCTGAATCTCAACAGCAAATGGCTCATATGGATTTCGCTGTTAATGATTTAGAAGAAGCAG
TTCAATATGAAATTCATTGTGGAGCTACAATCGCAGAGGAGCAATTTACTGATGACTGGAGAGTTATGAT
TGACCCAGCTGGACACCCTTTTTGCTTATGTCAGATGAAATCAATTATGGAAAGTAGCCATTTTTCATTG
TTATAG
>ref|NC_013316.1|:c2180457-2179996 putative glyoxalase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTTGGAGGAGTATTGCTAATTGTCAAAGACATAAATAAATCAAAAAAGTTTTATGAAGATGTTA
TGGAGCAAAAAATTACATTAGATTTAGGAGAACATGTATCATTTGAAAATGGATTTGGATTACAAAGTAA
TTATAAAGCTATAATTGGATATGATTTACCAATATATCAACAATCAAATAACTTTCAGTTGTATTTTGAG
GTTAATGATATCAAACAATGGGAAAGTAAGATAAATAGAATAGGAAATATTGAATTTTTGCATTATATAA
AAGAATACCCATGGGGTCAAAGAACTTTTAGGTTTTATGATTTTGATAAAAATATTATAGAAATTTCAGA
AAGTATGGAAAGCGTCATAAAGAGGCTTTTAAAACAAGGTTTAGCTTTAGAAGAAATTTCAAAACGCACT
ATGTATCCAGTTGAATTTATTACACAATTTCAACAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2181328-2180495 AraC-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAAAAAAGAAAGTATTCATTTTATAAATAAAAATAGGTCACTTATAGTTTGTGAAGACAATTTTG
TTTATCTCTTGCCTTGTATGCAATTAAAAAATTGGATATCGAATTTTACTATATCGTTTCCAAATCAAAC
AATAATTTCTGATAATTACACGATTATTCCTCATGGAAGTGTAACTTTGGTGTTTTTTTATGATGCCACA
GGGTTACATAGTCTATTATTTGGTCCAACTACTAAACCAAAAACAGTAGGAAATATTGCTAATAGATGTG
ATGTTATACTAATTATAGAATTTCAACCTGCTGGTTTTTTCCCGCTTATAGGTATACAGCAAAGTGAACT
TATTGATAAAGTTGTTCCATTTTCTATAATTAATACTTCATTAGATTTAGAAATTAAAAAAATATTTAAT
GAATCTTTATCTATAGATAAATTGATTTTAAAGTTGGAAGAATTATTGATTTCTAATATTAAAATTGAAT
ACTCATATGAGTTTATTTTGGCAATTCAGTTGATTATTCAAAACTCTGGAAACATATCTTCACAAGAAAT
TTCTAAAAAAGTATTTTATAGTTCTAGGCATTTAAACAGACTCTTTAATCAGTACCTAGGGTTGAGTATG
AAGTCATTTTCTCGTTTGGTACGTATTAATAAATCTATAAAACTTCTAAACAATAATAAAACTTCATTGA
TGTATATATGTAATGAATTAGGATTCTATGATATACCACATTTTATTAAAGATTTTAAAATTGTCTGTGG
AATAACTCCTCAAAAATACCGAGCTAATATGTCTGATTTTTACAGTGAAATTGCAAAATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2182299-2181601 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGTTAATATGAAAATTACACATAATAGTTTAGCTGTAGAAGCAAAAAATATTATCAAAGAATATA
AAATTGGAAATACAACAACTCGAGTGTTAAAAGAGGTATCTTTACAAGTAATGAAAGGTGAATTTGTTTC
TATCATGGGTCAATCTGGTTCTGGTAAAAGTACTCTTTTATATATTTTAGGTGGTTTAGATACTCCAACG
AGTGGAAAAGTGTATATGAATGGAGCTGATATATCACATTTTAATGATGAGAAAATGAGCATAATACGTC
GTAGAAATATAGGATTCGTATTTCAATTTTATAACTTAATACCAAATTTAAATGTGGAGGAAAATATAAT
GCTTCCTTTGTTATTAGATGGTAAAAATTTAAAAGATTATAAAAATCAATTAGATGAAATCTTAGATATA
GTTGGTTTAACTGATAGACGTAAACATACACCACGAGAGTTATCTGGTGGTCAGCAACAACGTGTTGCTA
TAGCTCGAGCTTTAGTTGGAAAACCAGAGATTTTATTTGCTGATGAGCCTACTGGAAATTTAGATAGTAA
AACAGGGATAGAAATAATAGATTTACTGAATAAAATAAACAGAGACAATGGACAAACTATAATTATGGTA
ACTCACTCACCAGAAGCAGCCAAAAGTAGTAGTCGTACTATTACAGTTTCAGATGGTTTAATTGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2184779-2182302 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
TTGAAAATTATATTAAAGTATATTTTCACAAATATTAAAGAACGAAAAATTAGAACAGCAGTTATGTTAC
TGTCCATAGTTTTATCAACAGTTTTACTTTTTGTTTCATTCTCAATTGGATTATCTTATGAAAGTGCACA
AAGAAAAATGGCAAAAGGTATGTATGGTACAGCGACTATATCTGTCCAAAGTAAAAATCCAGATGTATTA
ACCAATTTAGAAGACATACCTGATTTAAATGCTATAAAATCAAAGGTTGGTGTATTGGAAAGCTCTGCTA
TTTATAATAAAGGGGGATACTATGAAGAATTTAGTCTTATATCAGCAGACTTAAGTCAACTAAATAAAAT
CAACAAGCCACGATTAGAAAATGGCGATAGTATTACTGATTTTTCTGGTGATAAAATTATTCTTCCAAAT
CGCTTTACATCAAAATATAAAATAAAAAAAGGTGATTCTATTACTTTACAGATTTATGGAAAGTCTTATA
CTTTTCAAGTTAGTGATATTGCATCTTATGATACAGTATTTTTGAGGAATACAAGAGGTGTAAATGCACT
GCTACCCAAAGAGACTCTATCAAAAATTATAAATAAAGGCAGTGGATATACAAGAGTTCTTATAGAGTCA
GAAGAAGAAATGACAGAAAATCTAGTAAATAAATTATCCGAAGAACTTTCCACTGAAAAATATATGGTAT
CAAATACTATAAATGAAACTAAGATAATTTCAGATGCTAGACAAAAGACAATGCCTTTCTTTTTAATAAG
TTTTTTTGCATTAACCCTTAGTATATTTATCATATACAGCAGCTATAAGGTTATTACATTAGAACGTCTT
CCTTTTATTGGAACATTTAGAAGTATTGGTGCCAATGAAAAAACTGTAACTCGTATATTGATGCTTGAAA
GTATATTATACGGAAGTATAGGAGGATTAATTGCTATTCCTATTGGTGTAGTTGTTTTAAATTTAATGCT
TCATGGGTTAGGAAATTCTCTCGAACAAGGAATATCAATTCCAGTAGTAATATCACCCATTGGAGTGATT
ATATCTGTTATAGTAGCAATAATCGTTTCTTCATTTAGTGCATATATACCTGTTAAAAAAGCTAGCCATT
TGCCAATAAAAAATATTGTACTAGGAACAGTAGAAGAAAAGAATGTTTCAAATCGTTCTATACTTTTTAT
AGGAAGTATAATGTTTATTTTATCTATTTTACTTCCAAGAATATCCCCTGAAAATACATTGTATCTAGCT
GGTGGATTTTCATTACTAGGATTAATTGTAGCTACTATTGTGTTGATTCCTCTTATTACTGATATCATGT
CTATAGTTTTTGAGTTTGTTTATAAAAATATTTTAGGGAATGAGGGTAAATTAGCTGCTAGAAATATGAA
AAATAACAAAAATATAATACAGAATATCACTTTACTATTTATAAGTATTTCTGCAGTTATTGCAATAAGT
GTTGTTGGTAACTTTGTCAAAACTTATATAACAGATGTGTTTCGTGACGCAGAATTACAAGGTTTTGCAG
ATGGAAAGATGAATGAAGAGTTTATTGAAAATGTTAGACATATGGATGGAATTAAAAAAATATTACCTCT
TTATGTTATGAATAATGAGATTTCTGGTAATGGTGTAACATTATCAAGACTAGAGGGTACAGATAATATA
AAACTATATAACTCTATGTTTGGAATCAATTATACAAATTTTGAGATAAAAAAACAAGTAATAGAAGCTT
TTAATGATAAACGTTCTGTTATTTTGAATGAAGATACTCTAAAAAAAGTAGGCTTATCTATAGGAGATAC
AATAACTCTATCTAATGATAAGTATGATTTTTCTTATAAAATAGTAGGTAGTTTTAAATCCCGTGCAAAT
GATGTAGAAGCTGTTATACCATCACATTATGCAGTTAATGATTTTGATAAAACTAATTATGGTTTTTTAG
TATATACAGCAGTCAATCCAGATGTTGTTATGATTCAGATAAGAGATTTATTTGGAGATACATATAATTG
GAGTCGTACAGTTGAAGAATTTAATAATGATTCTTTAAATACTATAAGTAGTTTTTTGTCTCCTATGAAT
AAGATGACCTATTTCATTTTTCTTCTTGCTACAGTAGGTATTATTAATAATCTACTGATTAATTATATTC
AAAAAAAACGTTCTATAGCTATGTATAAATCTATAGGACTAAGTGATAAACAAAATATAAAAGTGACATT
GATTGAAGGGTTTACTTCAGGTTTACTTGGAGCTGTTATTGGTATTGTGATATCTATACTTGAGATTCAA
ACTATCTTTATAGTTGCAGGACCAAAAATTTCAATGAAACCAGATTTAGATTTTAAAACATTTATTATTG
TTGGGTTATTGGGAATTATAGTAACTTTAATAGGTTCGATAGTGCCTATTATAAAAGGGAAGAAAATGAA
ACTGATAGAAGAAATTAAGTTTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2186402-2184999 putative two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGCATAAACCTAGTTATAAAACAGTATTTCATTCATACATTATTTTTTTCATGATTTTTATTTGCTTAA
TCCTGACAGTAATAGGTATTTTCTTATCACTTATTACTATTCAGAAACCAAATGGGGAATTTATTCGTAG
TGACTGGCCGAAAAAATTTACAGAAAACTTTAATGAACAAATCATATTTATAGATAATAAGCCACAAGTA
AAACAGTCTGGATTAGAAAAGCTTCGAGAAAATCAATTGTGGTTGCAAATTTTAGATTCTAGTGGAAATA
GAGTTTATGGGTTTTTAGAACCAAAAGAGCATAAAGATTATTATTCTAATTCTGAATTATTAACATTAGC
TAACCAAAATAATTCAAGTAATGGAACTGTATACTTTAATACAATTAAAAATAATAAAAATGACTATATT
TATATTATATATTTTCCATTAAATATATCTAAAGTGAATATGTTTTTTGATGGAAGTAAATTTGTAGGTG
GTAAGTCAATTGTATTTTCAATCATAGGGATTATATTTTTAATAATTTTGATTTCTGGAATTGCTTATGG
TTACTGGGTAACAAAGTGCATATCAAATATTACATCTGCTGTTAGTGATATTTCAAAACGAAGCTATCTT
CCAGTTAATATTAAAGGTGTTTTTGCTGATATATATAATAGTTTAAATATTTTAAATGAAGAAATTCATA
GAAGTGATGAGATACAAAATAAAACTGATATTATGAGAGAAGAGTGGATTTCAAATATAACTCATGATTT
AAAAACTCCACTTTCACCAATAAAAGGGTATGCAGAGCTTCTTACAGATAGTAGTACTAATTATTCACCT
GAAAAAGTATATAAATATGCTTCAATCATGTTAAAGAATATAGAATATACAAATACACTTATAAACGATT
TAAAATTAACCTATCAATTAAAAAATGGAATAATTCCTTTAAATAAAAATAAATATGATTTAGTAAGATT
CTTGAAAGAATTATCCATTGATATTTTAAATTATCCAGAATATGAATCAAATATAGTTGAATTTAAGAGT
AATATAGATAATATTAACTTTGATTTTGATTGTACACTATTAAAACGAGCTTTTAGTAATCTTATTGTCA
ATGCTTTTACATATGGAGATAAAAATACTAAAGTTTGTGTACATATAACATTAAATGAAAGAATTGAAAT
CATTATATCTGATAATGGAAAAGGGATGTCAAGAGAAGAAGCATCAAATTTGTTTAATCGTTATTATAGA
GGAAGCAATACAAAACAAAAAATAGAAGGAACTGGTTTAGGACTAGCAATAACGAAGCAAATTATTGAAG
TTCATGGAGGGAATATATCTGTTGAAAGTATACCTGGATTAGGTAGCTCATTTTATATCACCTTTCCTAT
TTAA
>ref|NC_013316.1|:2186901-2187761 hypothetical protein CDR20291_1873 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAACAAAAGTCGCCAATTTTACTTGAAATGCTTGGACTATTTTTGGGTTGTATATCAATGAGTA
TTGGTATAAATATGTTTTTAAAACCACATACAATTGCTCCTGGAGGACTTAGTGGTCTATCATTAGTACT
AAACAAGGTTACAGGACTTCCAGTATCAGCTATCATGTTAATTATAGGTGTCCCATTAGTAATACTTGCT
TTTAGAATTATGGGTACAAAAAATTCATTAAAAACTTTATTTGGAACAGTTGTATTTTCAGCTATAGTTC
AATTAACAGACCCATTATCAAAACTAAGATTTACTAATGACTTATTATTGTCTTCTATTGCAGGAGGAAT
CCTAGTTGGTATAGGTTTAGGAATAATGTTTAAATCAGATGCTTCTACTGGAGGAACAGACTTAATTGCA
CTCATACTTAGTAAGAAATTCCCAGGAATAAAAGCTACAAAATTCATGTCATGCCTAGATGGAATGGTTG
TTATATCTTCTGGTATAGTAAATCGTAGTTTAGAAACTGCTCTTTACTCTGGTATAGCACTTTGTGTATT
AATAAAAATAGCAGATATGATAATGGAAGGATTTGACCATTCAAAAGCATTTTTTATTATCTCTGATGAG
CCTGAAAGTTTAAGACAAGCTATAACTGAAGAACTTGATAGAGGTCTTACTATTCTTGATGGTAAAGGTG
GATACACTAGAGAAAATAAAGAAGTTCTATTAGTCGTAGTTTCTAAAAAACAAGAACTTTATCTAAAGAG
ATTAGTTAAAAGAACTGACCCTACTGCATTTGTTATTGTTACAGATGTGCATGAGGTTCTTGGAGAAGGA
TTTAAAAATTTAGAGAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c2188600-2188001 putative acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAACAGTATATTTAGATTAATGTATAAAGGGGGATTAGAAATGTCTGATTCTGAATATCCTCAAATGA
AAACCTTAGAAACTAGAAGTTGTATACTAAGACCTGCATCATTAGATGATGTTGAAGATTTTTTTGACTG
TTATAAAAATAAAATAGTAGTAAAACATTTACCATTTAGTGAGCATAAATCTTTAGAAGATACAAGAAAG
TTTATAAAATCATTTTTTCTAAATCCCTATAAAAAAGGGAAAATTGGCCACTTTGCTATAGTATATAAAA
GAGACAATAAAGTTATTGGGAATATGGGGTTTAATAATATAAATCCTAAAGCATTAGAAGCAGAAATAGG
TATATGTATAAATCCAAGCTATTGGGGACATGATTTTGCTACTGAGATAACAAAAAGAGTAATACAGTAT
GGATTTAGAGAACTAAACTTAAATAAAATAATTGCAATAACCTATGAAGAAAACCAAAATTCTACAAAAT
CATTAGATTTATTAGGATTTAAATGTACAGGAAAGTATATCAAAAAAATTCATACTGGAAATACTGTAAA
AAATGTTCCTTGTTATCAATATGAATTGAAAAAACAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2189635-2188748 LysR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATAAAACTTGAACTTTATAAGGTTTTTAATGCAGTTGTAAATAATAAGAGTTTTTCTCTTGCTG
CTAAGGAATTGTTTATGTCACAGCCAGCTGTAAGCCAGTCAATAAAGCAATTAGAAGAACAATTAGATAC
TTTATTATTTTATAGAAACAATAAGGGAGTAAAATTAACTCCAGAGGGGAAAATTCTAAGTGAACATGTC
ACTACTGCATTAAAGTTGATATCATCAGGAGAAGATAGAATAAATAAATTTAAAAAATTAGAATACGGTT
CTCTGAAAATAGGAGTAGGAGATACAGCTGCACGTTTTTTCTTGTTAAAATATTTAGAAATTTTTCATAA
GAAGTATCCACATATACATGTATCTACAATAAATAGAACGAGTAGAGAACTTATATCTTTACTCAAAGAT
GGGAATATAGATATAGCAATTATAAACATGCCAATAGAAGATGATACACTAAATATTGTTGAGTGTATTG
AAATACATGATATATTTGTATGTGCAAATGATTACATAGAATACAAAGGTAGGAAAATATCATTGGAAGA
ATTAAACACATTGCCTTTAATAATGCTAGAAAATAAAGCAAATTCAAGACTTTATGTAAATGAATATTTT
TTATCAAAAGGTATAAAACTAAACCCGGATATAGAATTGGGTTCTCATGAATTACTTTTAGAATTTGCGT
ATATAAATCTTGGAGTGTCTTGTGTTATAGAAGAATTTAGCATAGATTATTTGGAAAATGAGAAATTGTT
TAAATTAGATATAAAAGAGCCAATACCTAAGAGAAATATAGGTTACTGCCATTTAAAAGATATATCTTTA
TCCTTAGCAACCAAAGAATTTTTAAGCATGATATCTAATAACATATAA
>ref|NC_013316.1|:2189754-2190953 hypothetical protein CDR20291_1876 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAGATTAGTTGGAACTGTTTCAAGAGGGGTTAGAGCACCTATTATAAGACAAGGAGATGACTTAG
TTAAAATAGTTGTTGATTCTGTTTTAAATGCGTCAAAAAGTGAAAACTTTGAAGTTAGGGACAAAGATGT
AATTGCCGTTACAGAAGCTGTTGTAGCTAGAGCACAGGGAAATTATGCTCACGTTGACAATATTGCAAAA
GATGTAAAAGATAAATTTGGAGATGATACTGTTGGGGTTATATTCCCAATTTTAAGTAGAAATCGTTTTG
CTATATGTTTAAAAGGAATTGCAAAAGGATGTAGAAAAGTCGTATTAATGTTAAGCTACCCTTCTGATGA
AGTTGGAAATCACTTAATAAGTATTGATGAACTTGATGATAAGGGAATAAATCCTTGGTCAGATGTTTTA
ACAGAAGAAAAATACAGAGAACTATTTGGATATAACAAGCATACATTTACTGGTGTAGATTATGTTGATT
ATTATAAGAATTTAATCAAGGATTGTGGTGCAGAGGTAGAAATAGTATTTGCAAACAATCCAAAAACTAT
TCTTAACTATACAACAAGTATTTTAACTTGTGATATACATACAAGACAAAGAACAAAGAGAATTTTAAGA
CAAAATGGAGCTAAAAAAGTATATTCACTTGATGATATAATGACAGCAAGTGTAGATGGTAGTGGTTACA
ATGACCAGTATGGACTTTTAGGTTCAAACAAAGCTACAGAAGAAACAGTAAAATTATTCCCTATAAATTG
CGATGAAGTTGTAAACAAAATCCAAGGTAATATAAAAGAAATAACAGGGAAAGATGTAGAAGTAATGGTT
TATGGAGATGGAGCTTTTAAAGACCCTGTAGGTAAAATATGGGAATTAGCTGACCCAGTAGTATCTCCTG
CTTATACAAAAGGGCTAGAGGGAACTCCAAACGAAGTAAAATTAAAATACTTAGCAGATAATGATTTTGC
TGACTTATCTGGTGATGAGTTAAAAGAAGCAATTTCAAAATACATAGTTGAAAAAGATAATAAATCTGAT
GATTTAACAGGAAACATGGTTTCTCAAGGTACTACTCCAAGAAGATTAACAGACCTTATAGGTTCTTTAG
CAGATTTAACATCTGGAAGTGGAGATAAGGGTACTCCTATTATTTACATACAAGGATATTTCGATAACTA
TACAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2193699-2191147 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTCTAGTAAAATTTTCAATTCAATATATAAAGCATTATAAAAAACAATCTATATCTATAGTTTTAA
GCATAGTACTATCAGTAGCATTATTGACGGGAATTGGTTCTTTAGTTCATAGTGCAGACAAAAGTAGAAT
TGAAAAGATAAGGGAAGATAGTGGAGATTATCATTATTTCTATAAAGTAGATAAGGAACAACTTAATAAA
ATTAAAAAAAATAAAAAATCAAAGGAATACATTGTAGATAGACTTGGCGTTACAAAACCTAAAAATCAGA
TAGATGAACCTTTTATTATAGAATTTTTAAATGCTGATTCTTCATATTTAGACATGACAGGTAGAAAATT
ATTAAAAGGAACTCTTCCTAGTAAAGATGGAGAGATAGTACTTGACACATATTCTCTAAACAATTTAAAT
GTAAACAAAGAAATTGGAACAGAAATCAATTTAGATGGTAAAATCTATAAGTTATGTGGTATTTTATCAA
GTCTTTCAAACCCAGAAACTGCTATGGAGGGATTTGTAAACGATTATTTGCAGCCTAAAGAAAAGGATTC
TTATATAGTTTATGTAAAATATGATGAAAATAAAAATATTAAAAAGCAAAATTATAAATTTATGAAAAAA
TTCAACATATCAAAAGAAAAAACTTATATAAACTGGCCTCTTTCAGTTGAATTTGGAGTAAAACCACCAA
AGAATATAGAAAAATATAATATATTTGAGTTCTTAAAAAATTTAGAACTAAATACAAATGCAATTATATT
GCTTGTTGGAGTGTTTGGTGCAGCAGCAGTATATAGTATTTTCCATGTTTCAATACTTCAGAGAATATCA
CAATATGGGGTTTTAGAAGTATTAGGCGCTAATAATAAACAACTTTTATTTCTACTATTTTTAGAGTTAT
TTTTACTTTTTATTGTTGGATTTCCTATAGGTTGCTTCTTAGGTATTGGAGTAGCGTCTACAATATATGA
ACAATTTCCACATATATTTTTGAGTAGTGATATTGTTCCAGGAGCATTTTTTATAAGTGAAAAATCTATT
TATTTAGGCTTTTTATTTATCTTATTGTTGTTAATTTTAATTGCTGTACGTGTTGTACATCAGTTGAATA
AATACTCTAGTATAGAATCTATGAAAAACTTTAAGATTACTAATAAGAAAAAGAGAATATTAGAAAGTGT
AAAACACTCTAACATGACAAAAGTATTATCTCATAAATACATGACTCAAAAAAGGGGAATGTTTATTGGA
ATTTTGTTTTCATTATCACTTGGTGGAATTATATTTCTATGTTCTAGTTACTCTATACAGCTTACTAAAA
ACAATAATGAACTTACAATGAAAGCTGATGATGGTTTAAATTCTGACTACCAAATAACTATGCAAACAAC
AGATTTTGATGTAGGTATACCAAAAGATAAAATTTCAAGATTAAACAATGTTGAGGGAATATCAAAAGTC
TATCCAGTAAGATATTTATTTGGAGCTATGCAAATTAAAGAAGAACAACTATTTTGGAAAAATTTCTTTA
AACCTCTTGAAAAAGATTACAGGATAAAGACTTTTTTTGATGGTATTTGTACAAAGCAAAATGAAGGTGG
CTATCTTTTAAAAACAAATATTTATGGTTATAACAATGGTATGTTAGAAGGATTAAATTCTTATATTATA
GATGGGGAGATTAATACCCATGATATGGTTAAAAATAATAAGGTTATAGTTAGACTACCTATGGATGGAA
CTGGGATGTATGATGCAGTTGATATAAATCCAGGAGATACAATAAAAGTTAAAGTGCCAAAGACAATGAA
ACCAACAGGTGAAATTGTTAAATTTAAAGAAGAAAATAAGAATGATTATACAACAAAAGAATTTGTAGTT
GCTGCTACTGTAAAACGTGTGATGGCAAATAACATATATTTCATTGGTGATTATGGTATGGATATAGTTA
TGACGAATGGGCAAATGAAAAATAACTTTGATATCGAAAATTATAATTCAGTAAGTATAAAAAAGACAGA
AGATAGTAACAGTGAGGAATTGTCTGAGAACATAAAAAGTGTTGTAAGTGATGTAAAAAGATGTATCGTA
ACAGATTATACCATTGCTATTGAAAAAAATAATACCTACTTAAATCAAAAACTCTTATTTATATATGGTA
TTGTATTTGTACTTCTTGCAATAAGTTTGTTCCATATAATCAATACAGTAAGCTACTTAATTTTTTCAAG
AAGACATGAGTTTGGAATTTTAAGAGCTATGGGTATTACGGATAATAAGTTTTTACTTATGATGATAAGA
GAAGGTTTTTTATATGGATTCTATGCAAGTATTATAATGGTAATTGGAAGTGTTATTGGACAATTTATGA
TTTATTTTATGGTAAAACGTGTATATTTATATATAAATCCAATTCTTAAAATAAATACACCTCTATACAT
AGGTATGATTATTTTAAATATCACTATTAGTATAGTTGCTGTAATTATTCCAGTAAGACAAATTTTGAAG
AGTGATATTATTTCAGAAATAAATAAGAGTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2194385-2193699 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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ATGGAGTAAGTATAGAAATTGAACGAGATACATTTACTGCTATAGTTGGAACTTCTGGTTCTGGAAAAAG
CACATTGTTAAATATTATAGGTGGATTAGATAATCCAACCTCAGGTGATGTAATAATTAAAGGAAAGAAC
ATATCTAAAATAGGAAAAAAAGATTTGACAGTATTTAGAAGAAGAAATATAGGATTTATATTTCAAAACT
ACAGTTTAATGCCCGTATTAAACACTTATGATAATATAGCTCTTCCTGTTACATTAGATAAAGGAAACCA
TATAGACCATGAATATATTGAAATGCTGATGAAGACATTGGGAATTTGGGATAAGCGTTTAAAATTTCCA
AGCGAACTATCTGGTGGTCAACAACAGAGGGTAGCAATTGCTAGAGCTTTGGCAAATAAACCTGCACTTA
TATTAGCAGATGAACCAACAGGAAATCTCGATAGTAAAACTACAATGGAAGTGGTATGTTTATTAAAAGA
AAGTAGTGCAAAATTCCATCAAACGATACTTATGGTAACACACAATGAAAATATAGCACAAGTATGCGAC
TCAATTATCCATATTGAAGATGGAGTTGTGGTGAATACTGGTGGTGAAGTACTATGA
>ref|NC_013316.1|:c2195370-2194462 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
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GGATACAAGAGCGTCAAAAATTTCTCACCAAGTAAAAAAAATTAAGGATATGATAGAAATAGAGGTAGAA
CAGTCAAAGTCAGAAAAAGAAGCGATTAAAGGTTTAATATCAAATATGTCACATCAATTAAAAACTCCAC
TTTCAAATATAACCATTTATTGTGAACTTCTGGAGAATATAAATATTTCCACATTACAGAAGAAGGAGTT
TTTACAAAAGATGAAAAATGAAACTTTTAAGATTGACTGGTTGTTACAATCCTTATTTAAAATGACTAAA
TTAGAGGATGGAGTTATAGAATTTGAAGTAGAAGAACTACTAATTAAAGATACTCTTATTCAAAGCATCA
GTACTATCTTTAATAAATCAGAAGCTAAAAATATAAGGATAAATCTCGAACCATTTTCAGATATAAAGTT
AGTTCATAATAAAAAGTGGACCATAGAAGCAATTGTAAATGTTTTAGAAAATGCAATAAAATACTCACCA
TCAGATAGCACGATTACTATTTCTGTAATAAAAATGGAGCTATATACGAAGATTACTATTAAAGATGAAG
GAATAGGTATTGATAGTAGAGAACTAAATGATATTTTTAAAAGATTTTACAGAAGTAAAAATGTGGAAAA
CCAAAATGGCACAGGGATTGGTCTATATCTTACAAGATTAATTTTAGAAAAAGAAAATGGAAACATTATA
GTAGAATCTAAACTAGGAAGTGGATGTTGTTTTAGTATATTCTTACAGAATTGTAAGAGTTTAAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c2196043-2195372 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
TTGAACTTATTAATTATTGAAGATGATATAAACTTAAATGAAGGTCTTTTTTATGCATTTGAGAATGATG
GATTTAATGTATTTAAGGCTTATACAAAACAAGAAGGATTAAATATATTTAATAGTAAAAATATAGATTT
TATAATCTTAGACTGCAATCTTCCAGATGGAGATGGATTTGATGTATGTCAAATAATAAGGGAAAAGTCA
GATATACCAATTATAATGCTTACTGCAAGAGACTCAGAAATTGATGAAGTAAAAGGATTAGAAATAGGGC
TTGATGATTATATTACAAAACCATTTTCTTTATCTGTATTAAAGGCAAGAGTCAAAGTAGCAATAAGAAA
AAAATCGAATAATAAAGTAATATATTCCAATGGAATAAAATTGGACCAAAAGTTACTAAAAGTATATAAA
AATAAAGCATGTTTGGAACTTAGCTCTGTAGAATATAAGCTTCTAAGTTATCTAATTGAAAATAAAGGTC
AGATATTATTAAAGGAACAAATTTTACACCATATTTGGGACAGCGAAGAAAATTATGTTGATGATAATAT
TGTATCTGTAAATATAAGAAGACTTAGAGTAAAAGTAGAGGATGACCCATCTAATCCAAAATATATAAAA
ACAGCTTATGGAATGGGTTATTTATGGAATGAGGTAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:2196332-2197369 putative reductive dehalogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTGCAAGAGCAAATTACAAAAAAGATAGTACTGCTTATAATGATTATTATAAGAAAAATCCTGACA
AAAAAGAAATTGATGATAGTATAAGAAATAGACCAAATTTATGTAGTGAAGGAACAATGACTTACAATGA
GTTAAACTCTCCAATGGCAAGTAGTGCATTCGATTTTTTATCTGATATCAAATCTTTATGCGAAGGAAAA
GTTTCTGATACTAAAGTAGATGTAGATGCAAAGTCAATGACAAAAAAAATTAAGGGTCTTGCAAAGCAGT
ATGGAGCTTCTGTAGTTGGTATAACTAAATTAAAAGACTATCATATTTATACAAATAGGGGTAGACATGA
AGAAAATTACGGTGAAGAAATTAATCTAACTCATAAGTATGCAATTGTATTTGGATGTGAGATGGATAAA
GAAATGATAAATAGAGCTCCAATGATATGTGAAGTTATAGAAACATCAAAGTGCTATGTGGATGCATCTA
TCGTCGGCATGATTTTAAGTTACTATATAAGAAATTTAGGATATGATGCTAGAAATCATATGGATGCTAA
TTATTTAGTAATGCCTGTTTTTATAGCTCGTGATGCAGGTTTAGGAGATATAGGAAGAAATGCTATACTT
ACAAATAAAGATTATGGCTCTAGACTTAGATTAGGTGTTGTTACTACAGATATTCCTCTTTTAGAAGATG
AATATGTTGATTTTGGACTAGAAGATTTTTGTAAGGTCTGTAAAAAATGCTCTTTTAACTGCCCTTCTCA
TTCGCTTTCTAATGATATTAAAATTGGTGATGATGGAAAATATAATTGGGTAATTGAACATGAGACATGC
TATATTAAATGGAGATATTTAGGTACAGATTGTGGTATGTGTATATCTGCTTGCCCATTTAGCCAAAATC
TCGAAACTATAAAGAATACTACTTCATTTAAGGGTAATAATGAGCTTATTCAAAAAGCTTTAGATGAGTA
TACTTCAAAATTTGGTAAAAGAATATTTATACCTGGAAATCCATCTTGGTTGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2197527-2198213 two-component system response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAAATATTAGTAGTAGAAGATGATTCTATATTAAATAAAACTCTATCATATAACCTAATTGAAG
ATGGATATATAATTACTTCAAAATTTACAGCTAAATCTGCACTAAAGTCTATTTTTGAATGTGAATTTGA
TTTAATAATTTTGGATATTAATTTACCAGATAAAAGTGGGTTTGAATTATGTAATGAAATAAAGGAAAAT
TACAATATACCAATAATTTTTTTAACTGCTAATGATATGGAATGTGATATGATTAAAGGCTATGAACTTG
GAGCTTTGGATTATATAACAAAACCATTTAATATCAATTTATTTAAACAGAAAGTTAAAGCTTTTTTAAA
TCATCTTACAACAAAAACAAAACAAGATTACTATAGGGATGGATATCTTGAAATTAACTTTTCTGAGTTA
TCTGCCAATATAAATGGAAATCAAATTATATTTACACCATTAGAATATCGTACTTTAAAACTGCTTACTG
AAAATCCTAAAAGTATTTTAACAAGGAAAGTACTTTTAGAAAAACTCTGGGATATAGATGCTAACTTTGT
AGATGAACATACTTTAACATCTGTTATAAGTAGGATTAGAAGCAAAATTGAAAAAGACAATCTTAAGTAT
ATCAAAACGGTATATGGTATGGGATATATGTGGTTAGGTGAAAGAAATGAATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:2198194-2199234 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
GTGAAAGAAATGAATTTTAAAAAATTTTCTTTTAGTTCTATTTATTTAATAATTGCTGTTGGTATAATTT
TTACAGCTATTTTATTTAATATTTCAATTTATCTAATAACTGATGATTTAAAACTAATTGCTCTATTATT
AATATATACAATAGTACTTTGTGGATTTATAGCATTAATAATATTTTTACTTCATAAAAAAATAGTTATA
TTTTGTTCTAAAATATGTCACACTTTAGATAGTATGATGAATAGTGAAGACAATATTGAAATTGAATTAG
AAGAAGAAACTATTTTATCACGTATCAATCACAGATTAATTAGAATGTATGAAGTTATTCAAGAAAATCG
CAATAGTATTGCTATAGAGAAAGCTGATTTACAAGAACTAGTTTCTGATCTATCTCATCAAATTAAAACT
CCTATTGCAAATTTAAAAATGATTAATACTACTCTACTAAATCAAACATTTAAAACAGAAATTCAAAAGG
ATTTTTTAATGGATATGGAAAACCAATTAGATAAATTAGATTTTTTAATGCAATCTATGGTAAAAACCTC
CAGACTAGAGACAGGTATAATCACACTATCTAAAAAGAAAAATTCAATTTATGAAACAATTGCTACAGCA
CTTAGTGGAATTTTGTTTGATGCTGAAAAAAAGAATATTGAAGTTACAGTTGATTGTGACCCAAATTTAT
ATATAATTCATGACAAGAAATGGACTTCTGAAGCTATTTTTAATATATTAGATAATGCTGTAAAATACAC
AAATTCTAATGGTAAGATACGTGTAGCTACAGAATGTTGGGTTATGTATACAAAAATAGATATTATTGAT
AATGGAAAAGGAATATCAGAAAGTCATCAAGCAGAAATCTTTAAAAGATTTTATCGTGAAGAAGATGTAC
ATGACATAGAAGGTATTGGAATAGGTCTATATCTTTCAAGAAAAATTATATCTCTTCAAGGTGGCTATAT
TAAAGTTACATCAGATATTGGAAAAGGGTCGACTTTTTCTATCTTCTTACCTAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2199316-2199981 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTATTTTACAAGTAATTAATTTAAAGAAATATTATGGACAAAGTTCAAACATTACAAAAGCTCTTG
ATGGTGTAACTCTATCTATTGAAAAAGGCGAATTTATTTCTATTGTAGGTACATCTGGTAGTGGCAAATC
CACATTATTAAATATGATGGGAGGATTAGATAATCCTACATCTGGAAAGGTTATTATAAAGGGTAAGGAA
TTATCTACTATGACTGATGAACAGCTTACAATCTTTAGACGCAGAAATATAGGTTTTATATTTCAAAATT
ATAATCTTGTTCCTTTACTTAATGTATATGAAAATATTATCTTACCAATAGGATTGGATGGAGAGACCAT
AGATAAGGATTTTATAAATGAAATTATAAATATGCTTTCTCTTGAAGAAAAATTATATGATATGCCAAGT
AATCTTTCTGGTGGTCAACAGCAACGTGTTGCTATAGCTAGAGCACTTGTAACAAAACCAGCTATTATAC
TAGCTGATGAACCCACAGGTAGCCTTGATAGTAGAACTAGTTCAGATGTACTGAGTTTACTTAAAGTGAC
AAGTAAAAAATTCAACCAAACAATTGTAATGATTACACACAATAATGAAATTGCACAACTAACTGATAGA
ATTATTCGTATTGAAGATGGAAAAATTGTTAACTAG
>ref|NC_013316.1|:2199994-2202411 ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAGAAATAATAATCGCACATTTATAAGAAAAATAGCTTTAAATGATTTAAAAATTAATAAACTTA
AAACATATCTTTCAGGTATCATTATAATGATTTCTACATGTTTATTATTAACAGTGACCTTAGTTTCATA
TAATGCTTCTGTAGATTTAGTTAATGCATCTCCATATCATGCTATATATAAATCTGTAGATGAAAAAGCA
AAAAATATACTATATAAAGATAAAAACCTTAGTGGCGTAGGAACCTACAAATTAATTGGAAGTAATAAAA
AGACAGACTGTATTATGTCGATTGTTTATGCAGATGATACAGCAATTAAACTTATGAATTTTCAACCATT
GAAAGGCAAACTACCTACAAATAAAAATGAAATTGCTATTTCAGAAAAATATTTACAGGAATTTGGTTTA
GATAAAGATATTGGAGATAGCATTAAATTAAATTATTATGATGATATTACGAATAAAGAAGTTCAATGTG
ATTTTATTATTGTTGGATTTCTAGAAAATTATTATCAAGATAATGCCAAGCAATACTATACAGTCGTTTC
AAATGATTATTTTAAGAATATAGCTTCTACACCTTTACAAAATAAAAGTAATACTTTTGACGAGTCAAGA
CCTGATACTGTAGATGTATTAGTTAAACTATCAGAAGAAAATACAGAGAAAGATTCAGCTTCAATTAAGA
CACAGTTAAAGAAAATTGGTTTATCTTTAGGTATTAAGAAATATAATATATACTTAAATGATAACTATAT
TGAATCAAATTTAATTGATGGTGAGCAGATTATTACAGTTTTAGTAGTTGGAATAGTTGTTCTTTTTTCT
AGCGTTTTTGTTATATATAGTATTTTTTATATTTCAGTTGTTAATTCAGTTCAGATGTATGCTAAGTTGA
AATCGTTAGGTATGACTTCTTTTCAGTTAAAAAAGACTATTTCTCTACAAGGAAATATTTTGTCAATTAT
TTTTATTCCATTAGGGGCTATAGCTTCTTGTATAATTGCTTACATAATTCAACCATTAGCATGGCAAATG
ATAGCTGATTTATTTATAATTTTAATTTTATCACTGGTAATGTTTTTAACTGTTAGAATTTCTTTATTTA
AACCAGCTAGAATTATTTCTAAAATATCTGCTATTGAAGCCATGCAATATACAGAAACTAAATTTAGAAA
ACAAGCAAAAAATTTTAGTTATATAAATATAAAAAATCTAGCATTAAAGAATATCGAGTCAAATAGAAAG
AAAAATTTGATTGCATTAATATCGCTAAGCATTAGTGGAGTTTTATTTATTTCAATCGCTAATCTTGCTA
ATTCAATAGATTTCAAAAAACAACTATCTCAACAATTTGTCTATAACGAAGATTATATAATTAGCATTAA
GAGTGATAACTTATATGAGCATATTACAGAAATCCAACAAAATAATCCACTAACAGATTCTCTTAAGAAT
GAAATTAAATCTATTCATGGAGTAAAAAAATTAATTGAATCCAAATCAATTAAAAGTAATATTATAGAAC
CTTACATCAAAGATAGAGACGAAAAACAATTTATTACTCTAATTAAAGGTATTACGCCTGAACTTTCAAA
ATCACTTGAAGAATATATTGTCAGTGGAAAAATAGACTATACACATTTAGATTCAGATAGTTTAATTATA
AATAAATATAGAACAAAATCTTATGGATTAAATTTAAAAGTTGGAGATACAGTTACATTTAATATCTTTA
GTGGAAATGATATTATTAAAAAGAAAATGAAAATTATAGGAATCATTGACAATTCCAATACAGGAGGTAT
GTTTTTTGCTTCAGACAAAACTTTAGAATCTCTAACACCATATAATACAAATTTAGATTTTTCTATTTTA
ATAGATAAAAAGCATTCTAAAGAAGTTGAAGAAAAGTTGTTAAGTATAATTCAGAAAAATTCAAATTTAA
TGCTTTATTCATATGAAGATGATTATAGAATGATTACTAGAGCATTTCAATATATAATTATAGCTTCATA
CATTTTTGTTGGTTTAATTTCTTGCTTTGGTATACTAAATATGACCAATACCCTAATAAACAGCGTTTTA
ATTAGAAAAAAAGAGTTTGCCTTACTTCAAGCCGTTGGAATGACAAGAAAGCAACTGCGAAATATGCTTT
ATAGAGAAGGTCTAAACATAAGTATCAAAGCTATATGTACTTCAAGTATACTAGGTTATTTTGGTTCAAA
TCTACTTTGCACTTTTATAAAAGATGTAATTAGATTAGACTTTATTAATTTTAAATTTTCTATATTTACT
ATTTTAATTTTTTCATTCGTATTAATTGGTATACAAGTTTTAGTGACTGAATTACTTATAAGAAATATAG
AAAAAAAATCACTTACAGAACGCTTACGTTCTCAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2203383-2202592 hypothetical protein CDR20291_1886 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAACAAAACAATACTTAATTGACTTTTATAATACTTATGATGAAGATAGTCGACTTGCATTAAAAC
ATGGAATGGTGGAATTTCTCACTACTATGCATTACATTGATAAGTACATAAAATCAGGTGATTGTGTGCT
TGAAATTGGCGCTGCAACTGGTCGTTATTCTCACACACTGGCACGTCAGGGATATGATGTTGACGCAGTG
GAATTAGTCGAACATAATATAGAGGTTTTCCATAAAAATACTCAATCAAATGAAAATATAAGCATTACTC
AGGGTAATGCTATGGATTTATCTGTTTTCCCAGATAATAAATATGATATTACGTTACTGTTAGGACCACT
ATATCATCTTTATAACAAAGAAGATAAACAACAAGCTTTACATGAGGCAATTCGTGTAACAAAACCTGGT
GGTGTGGTTTTTGCTGCATACGTTATATCTGATGGCTGTCTCATTGACGAGGGGTTCCATAGAGGAAATA
TTAATGTATCTGAATATATTGAAAAAGGTTTGATTGATCCACAGACATTTGCTGCTAAGTCTGAACCAAA
GGATTTGTTTGAGCTTGTACGTAAAGAAAACATTGATGATTTGATGTCTGCATTTAATGTAACTAGACTG
CATTATGTCGCATCAGATGGTTTGGCTTTGTATATGCGTGAAGCAGTAGACTCTATGGATGATGATGCAT
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AATTGACATATTTAGAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2204003-2203416 hypothetical protein CDR20291_1887 [Clostridium difficile R20291]
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GATTTGAAGCTGTAAATGCGAGGAGTATTGCAAGTAAATTACAGTGTTCCACTCGACCAATTTTTACTTG
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GTTAATTATCGTAATTCTAAAAGTGTAAGCCCTTATTTACTGCTTCCGCTTTCATACATTGAATTTGCTC
AAGAAGAAACGTATTTATTTAAGTTGTTATTTATAAATGATTTAGATTTGATGATGAAAGAGGCGAATGA
TTTTTATAAAGAAATTGACAATGAAAAAAAGGCAAGACTTTTTTCGGAAAGCATTGGAATAGAGTTGGAA
TGTGCAAAAGTAATATTTTTAGATTTATTTCTTTATACTCATGGCATAGCTGTCTTAACAGCAACAAAAA
AATTAACATTAGATAGATATAGTGCTGAAAAAATGTTGAAAAATATATTAACAGCTTTTATAAGACAAGA
AAAACCAGATTGGAATTTGTCTATTTGA
>ref|NC_013316.1|:c2205571-2204180 hypothetical protein CDR20291_1888 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAGACTCGCTAGAAGGGAACAACCTCATATAAAATTTGGAATGTTTAAGATAAGAATTCCATTTA
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TGGCCTTAGTACACAAATTTTGGGATTACCCTATGAAGTGGCATGGAGTATGGCTATTATTAACTCAATA
TTATACTGTTTGCATGTTTTTATGGGAGACCCAGTTGTACCTGGCTGGATTACAGCTTCTATAACTCTTA
CAACTGCATATTTGTTAAAGTTCAGCATGGGCATTGAAAGAATACAAGCATTAACAGCTTTACAAATAGA
TTTAGGAATAATATTTATTTTAATGGGTATAACTGGTGTAGCTGGAAAGTTAGTTAGTAAGATACCAAAT
TCTATTAAAGGTGGAATACTAATGGGTGTCGGTATATCGACTATAATATCAGAGTTTAATCCTAAAGGGA
GATTTGATTCTTATCCTATATCTATAACAGTAGGAATTTTGGTTGCTTGTTTTGTAATGTTTTCTGAAAG
ATTTGATACTCTAAAAGTTAAGAATAAATTTTTATTTCATTTAGGAGAATATGGTGTAGTATCAGCTATT
TTAGTGAGTTTAATAGTAGGTATATTTAGTAAAGAAATAGAAATTCCTAGATTTAGTTTTGACAATTTAG
TTTACATAGTAGATTTTAAAAATCTGATAAATACAGTATCTCCTTTTGGAATAGGTTTTCCAAGTGTAAT
GTTATTTATACAAGGGATACCAATGGCTTTTATGATATACATAATTGCCTTTGGTGATTTTATAACAGGT
GAAAACTTAGTACTTTCTGAAAGTGAAAATAGAAAAGATGAATATATAGATTTCAATTCAAATAGGTCTA
ATGTTATAAGTGGGATAAGAAATATTTTTATGGCAATCTTTTCTCCATATATACCAATGTGCGGTCCATT
AGCTGCGACACTTACAGGAAGTGTTGCTCAAAGGTACAAGGTTGGAAAGGAAGCCATGCAGTCTGTTTTT
AGTGGCATGGGTACATTAGTATGGGTTTCAGCAATTTTTATCTGTTTTTATCCAATTGCGCAGATTGCTA
CACCTCTTATACCATTAGCATTGTCAGTAACACTTTTAGTTCAAGGATATTTATGTACAAAGCTATCAAT
GGAGCTATGTAATACAGGTGTTGAGAAGGGATTGATTGGACTTATGGGAGGTGTAATTGCTGCTAAAGGC
GGAACATGGGGACTTGCTGTAGGTTTTATACTGTATTTCATTTTAATTGATTCTAAAAAAAGAAAAGAAA
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>ref|NC_013316.1|:c2207059-2205761 putative acyl-CoA thioesterase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTAAATGTATACAATGTAGAATCATTTGTGGATGAAAGACTTAAGATTATGGTTTCAGACTTAA
TTCCAAATACTAAACTTAAAATAAGTGTGAAAATGGAATTTCCATGGTGCAAGGGAGAAGAATTTTCATC
TTATGGAGTGTTTTGTTCAAATGAAAAAGGAGAAGTAGATTTAGATTTAGTTGAACCTATAGAAGGTACT
TATAAGGCTGATAATTGTATGGGGTTAATTTATTCGCTGGAAAAATCTAAAACTGAAGGTAAAAATTTTG
CAGAAAATATATCTATTGATAAACCAATAATTATGAATATGATATTTGAAACTTCTACTGAAAGAAAAGA
AGTTGAATTAAAGAGAATATTTAAATCAGAAGATATTACCACAAAATACATATCTGATGAGTTTATAGGA
AAATTATTTTATAAACAAAATTCTAATAATAAAACAATTTTAATGCTAGGTGGTTCTGATGGAAATTTAG
ACGCTCTAGACCTTTTAGCAGCTCCACTTGCATCTAGAGGATTCAATGTACTAACAGTTGCATACTTTGC
TTTAGAAGGGTTACCAGATAAATTAGAAGAGGTTCCATTAGAATATTTTGAAAAAGTATTTGAGTGGATT
AGTGAAAATGAAATTACCAGTACTAAAGAAATATTTGTACATGGGACATCAAAGGGTGGAGAATTGGCCT
TTTTACTTGCTTCAAGATATGAACAAATTAAAAAGGTTGTAGTATCACAACCTCACATTTATTGTTTCCA
AGCTCTTAATGGATTGATGAGTGGAAATGATACTTCATCATGGTCATATAAAGGAGAGCCATTTCCATAT
ATCAAAGTAGACAATGATATATTCTTTGAAGAACAGAAAAAAAATATATCAAAAGGTATTCCATTTGGAT
TTAATAGTACTTATAAGAAAAGTCTTAAAAGAGCAGAGAATAGAAAAGAGGCTAGAATAAAAATAGAAAA
TTCCAAAGCAGATATACTTATGATTGCTGGAAAAGAAGATAACATATGGAATAGTTATGAAGCTTGTTTA
GAGGCATTAGAAATCTTTGAAGAAAATAATTATCCATATAACGTAGAATTATTAACATACAATAATATGG
GTCATCCGTTACCAATTCCATATATTATGCCTCTAAAGGAGACTTTATGTATGAGTATGAGTGGAGGGAT
TTTTTCTTCAGGTGGAACTGTAGAAGGAAATTCAAAAGGACAGTTTGAATCATGGAATAGAACTATTGAA
TTTTATAAAAAACTTTTATCAAGTGATTTAAATAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c2208295-2207420 hypothetical protein CDR20291_1890 [Clostridium difficile R20291]
ATGATTACTTTTGATGTAAATGGAGCTATTATCAGATTTGATGATACAAAAAATAATTATAATAAGATAA
GGAAAATCTTTAAATTATATGCTTTAGAAATATCTAAAAACTTTGAGAGAGATTGTTTAAATAGTTTTCA
AAATCTAAAGCAAATATCTGATAGAGGTTTAAGTTTAGGAGAAAAATATATAGAAGAGTCTTTTAAGAAA
GGAATTGAGACTATAGTAAGTTTTGGAATTATAACTATAGATATCGATACCTTTAAAAGCGTTTATTGTG
AAAAATATTTAGATTTTAAGAGACTTTTTAATAACTTGAATAAAACTTTTATTATACCAAATAAAAATAA
AAAAAATGGGCACGCTAGCTTCTTAGAAATAGAATCGACAATAAAGAAAATGAGCAATTATTTATACAAT
GATTGTTTTAAAATTCATTATGCTGTTGTAGATGCCCTTATAGAAAATCGTATAACTGCGGTACATTCTT
ATATTGATGAAGAATCTATAAAAAAATCTAATGCCTTATTTAATAATTATAAAGATGGTTTTATTGGGAA
GGCTGACGAATGCAAAGTAGTAAAACAAATAATAACTTTAAATCCATATAGGGAAGATGTATACGAATTT
TTGGTAAAAGAAGATGGAGATTTTAGTAAGGAAATTGAGAGATTGACTGAATTTTTAGGCTATGATATAA
AAGAATATAAAGCGTCATTAATGGATATTTATATAAATGAGTTAATGGAGAGCGATGAAAATGATGTTGA
AAATGCAAAAGAAAAGATTGAAAAATATGCTAGATATATTGGATGTAGTGATGAGAATTTATATGTAGCA
AGAGTTAATGCCATATATACTTTTGCAAATGCATAA
>ref|NC_013316.1|:c2209174-2208488 hypothetical protein CDR20291_1891 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTGGAGTAATAGCAAATAGTCTAGCAATTGCAGGTGGATGTATAGTAGGTCTTATAATAAAAGGAG
GATTACCTCAAAGAGTAAGTGATACTATAATGAATGGAATTGCCTTATGTGTATTGTACATTGGTATATC
AGGAGCACTAGAAGGAAAAAACACATTAGTGACAATAATATCCGTAGCTGTAGGTGCTCTGATAGGAGAA
TTAATAGATATTGACAAATGGGTAAATAAGTTGGGTGCTTTTTTACAAAGTAAATTTTCTAAAGGAAATA
AAAAAGATTCTATAGCAGAGGGTTTTATATCATCTAGTTTATTATTCTGTATAGGAGCCATGGCAGTAGT
TGGTTCATTAGAAAGTGGTCTTACAGGAAGTCATGATACTTTATTTGTAAAATCTGTTATAGATGGAATA
GCTTCAATTATATTTACTGCTTCTTTAGGTATAGGTGTAATGTTTTCTGCAATATCTGTATTTTTGTATG
AAGGTATTATATGTGTGGGAGCATCATTTTTAAATGGATTTTTAAGTGATCCTGTAGTCACAGAAATGAC
AGCAGCTGGAAGTTTATTAATTATAGGACTTGGTCTAAATGTACTTAAATTAACGAATATAAAAGTAGCT
AATTTGTTACCAGCTATATTTATACCAATATTATTTGGTGTATTTGGAATAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2209756-2209223 putative regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTGATTTAAATAATAAAAAAGAACAAGATGAAAATGAATCTAGCATGAATGAAACTAAAATATATG
ATATTTTGGATAAATTAAATGTTGAATATGATGTAGTAGAGCATGAAGCTGTATATACAGCAGAGCAATT
AGTCATTTTAGATGGAATAACAAAGGGGTGTCAATGTAAAAATTTATTTTTAAGAAATGCCAAAGGAAAT
AAGTATTATCTTATTGTAGTTAAAGGAGAAAAACAAGTTGATTTAAACTCACTTAAAGATAAGATAGGAA
GTTCTAGATTATCGTTTGCTTCACCTGAAAGACTATACAATGTACTTAAACTTCTTCCTGGAAGTGTAAA
TCCTTTTTCATTAATAAATGATACAGAAAGAAAAGTTGAGCTTTACATAGATAAAGATGTAATTAAAGAA
GATTACTTAAATTTTCATCCTAACATAAATACTAAAACTGTAAATATATCTAGAAAAGGTTTTGAAGAAT
TTTTGGAATATTTAAAATATCCAATACAAAGTATAGATGCTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2210432-2209800 putative cyclase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGGTTTTTGATTTAACTCATGTGACACATAATGACATGCCTGTATATGCAGAGCCTAATAGACCAG
ATATCAAGAAAGTAGCTATTATTGAAGAAAATGGTTATCAAGAAACATTAATTAGTGTATTTTCTCACAA
TGGAACTCATATGGATTCACCAAGACATATGTATACTAAAGGTGAGACCCTAGATAAGTTGGATATAGAA
AATTTTGTTGGGAAAGCTTATGTATTGGAACTTGAAAAGGGAAATGAGAATATAGAATTAGAATATCTAA
AAAAATATGAAGATGAAATAAAAAATAGTGATTTTATAATATTTAAATCAGGTTGGTCAAAATTTTGGGA
TAAAAAGCAGTACTATGTAGGTTATCCTACATTAACAAAAGAAGCTGCAAACTATATAGCTAATACTAAT
ATAAAAGGCATAGGAATAGATATGCTATCAGTGGATAGATATAACACATCAGTATTTGAAGTGCATCATA
TTTTATTTGAAAAAGGAAAAATAATCATAGAAAATCTTACAAATTTAGAAAATGTTCCAGAAAAATTTCT
ATTTATAGCAGCACCATTTAAGTATAATGATGCTGATGGAGCTCCAGTAAGAGCAATAGCTATAGTAGAA
TAA
>ref|NC_013316.1|:c2211661-2210522 hypothetical protein CDR20291_1894 [Clostridium difficile R20291]
ATGATATGGATATTTAATGGATATAAAAATAGGAGTAATATTTATATTAGGAGGAACTATATGAAAATAG
CAATATTTTTAGGAGCAGGAGCTTCAGCAGCAGAGAATCTACCTATTCAAAATGAACTTTTTAGCGAATA
TTTTAAAAAACTAAATCCCACAAATTATAATACCAAAATGAATAGAGAATTGTATATTTTCTTTAAACAG
ATGTTCAATATTGATATAGTAAAAGATAATATAGATAATGCAAATTTTCCTACCTTTGAAGAAGTTTTAG
GTCTTTTAGACTTAGCAGAACAAAGAAAAGAAGCATTTAGAAATTTTGGACTAGAAAATCTAAATAACAG
AAGTGATAGTATACGTTTTTTAAGACAATATTTAATACTGCTAATGGCTGAAGCAATTCATAATACACCT
AGAACAGATAATAAATATCATAAACTTTTAGTTGAAAATCTTTTGGAAAATGATTTGCTTCTTGATACTA
CTTTTATTAGTGCAAATTATGATATACATATAGACAATACAGTTACTGGATTAAGAGATAAGAATGATTT
GCCAATTATGCTTGATTATGGTGTGGAGTTTACAAATTTTAAAGAGGAGTTAAATTGGAGAAAACCAAAA
GAACCATTAATCAAATTATATAAGATACATGGGTCATTGAATTGGCTTTATTGCCCCATTTGTAATAGTG
TAACTCTTACACCACATGAAGGTGGTGTCATGAAGCTTATTGAAAATAGTTCAGAGACAAAATGTTTAGA
GTGTGGTGAGTTAACAGAACCTATTATAGTGCCACCAACATATTTTAAGAATATGTCAAACATATTTTTA
AGTAATGTTTGGAATGAAACAGAAAAAACTTTAAGAGATACTGACCTTTTAATATTTTGTGGATATTCAT
TTCCTGAAGCTGATATGCACATAAAATACATGTTAAAAAGAGTGCAGACTAATAGAAAAAAACCTCCTCT
TAAGATAATGGTTTTTAATAATCATTCACAAAAACAGAGAATTACTTTAAAGAAAGAAGAAGGAAGGTAT
AAACGTTTTTTGGGTGAAGATGTTATATTTACTGATAATTCTTTCCAAGATTTTTCGGTAAATCCCTTGA
GGTTTATAAAAAATATATAG
>ref|NC_013316.1|:c2213080-2211734 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAGCAAATTAAAGAAAAAGTAAATTCTCTACAAGATGAAATGATTTCTTCAATACAAGAAAGTG
TAAAAATACCTAGTGTTATATCTGAAGCAACTGAAAATTGCCCATTTGGTGAAAATGTAGATAAAGCTTT
AAGAGGTATATTAGACTTATGTAAATCTTTAGGATTTAAGACAGTATACAAAGATGGATATTATGGATAT
GCAGAAATAGGACAAGGTGAAAAAATGATAGGTATACTTGGTCACGTTGATGTGGTTCCAGAAGGTGATT
TAGAAAGCTGGAATTACCCTCCATTTGAAGCTGTTTTAGAAGATGGTAAATTGTATGGAAGAGGAACACA
AGATGATAAAGGACCTACAATATCAGCAATTTATGCAGTGAAAGCTCTTATGGATTTAAATGTAGACTTT
AATAAGAGGATAAGATTCATTTTTGGGGCTGATGAAGAAAATCTTTGGAGATGTATAAATAAATATAAAG
AAAATAATGAAGAAATACCAAACTATGGATTTACTCCAGATTCTAGATTCCCAATAACAAATGCAGAGAA
AGGTCTTTTACAAGTTCATTTGACTTGTGATAGCAAAAGTGATATAGAGTTGTCAGTTGGAAAGGCTTTA
AATGCAGTTCCAGGTAAAGCAATCTATATTGGAAAATACTCTGATAAATTAAAAAAAGAACTTGATAAAT
TAAATTTTGAGTATACTGTTGAAGGTAATAAAATCTGTATAATTGGAAAAAGTGTCCATTCAGCAGCAAG
TGATACTGGTATAAATGCAGTGGCTAGACTTTGTATAGCTCTTAATAATATAGGTATAGATTCTAATATA
ATTAAGTTTTTAGCAGAAGTTATTGGTGAAGATGCTAATGGAAACAATATAATTCCTAATTGCAAGGATG
ATGTATCAGGTAAACTAACAGTAAATATAGGTAGAGTAACTATTGATAACGAAAAAGAATTTGCAGGAAT
AGATGTAAGGATTCCAGTAACATACAAAAAGGATGATTTTGTAAAAGAGTTAAAGAAAATGACAGATAAA
TACAATTTAAATTATGAAGAATATGATTTCTTGGATTCAATCTATGTTCCAGAAGATACTCTTCTTGTTA
AGACACTTAGAAAAGTATATGAAGAAGAAACTGGTCTTGATGGAACACCACTTTCATCTGGAGGAGCAAC
ATACGCAAGAGCTTTAGATAATTGTGTTGCATTTGGAGCTATTTTTCCAGGAAAACCAGAAACAGAACAC
CAAGCTAATGAATACTTAATAGTAGAGGATATTATAAAAGCTACTCAAATATATGCTCTTTCTATTTACG
AATTATTAAAGATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2214429-2213149 hypothetical protein CDR20291_1896 [Clostridium difficile R20291]
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AAGAAATAATGGAAGAAATAAAAGATAAGTTTGAAGAAATAAAAGAAATAAGAGAATATAATCAATATAA
AGTTTTAAAAGCTATGCAAGAATCTAAACTAAGTGATATGCACTTTAACTGGACTACAGGATATGGATAT
AATGATATTGGTCGTGAAAAAATAGAGGAAATTTATTCTAAAGTATTTAATACAGAAGATGCTCTTGTAA
GACCAATAATTGTAAATGGTACACATGCACTTACTTTATGTATACAAGGTATAGTTAGACCAGGAGATGA
AATTTTATCTGTTACTGGTAGACCATATGATACTTTAGAGGGAGTTATAGGCATAAGAGAAGAAAAAGGT
TCATTGAAAGAGTATGGTGTTACATATGATGATGTAGATTTTTTAGAGGATGGAAACTTAGATTTAGAAG
GAATTAAAAACAAAATAAATGATAGAACTAAACTCGTTATGATACAAAGGTCAAAAGGATATTCTTGGAG
AAAATCACTTTCAATTAGTGATATAAAAGAAGCTATAGAAGTAATAAAGTCTGTTAAACCAGAAGCTATA
GTAATGGTTGATAATTGTTATGGTGAGTTTTTAGATACCAAAGAGCCTACTGATGTTGGAGCAGATGTTA
TGGCTGGCTCTTTAATAAAAAATCCTGGTGGTGGGCTTGCATTGACAGGTGGATATATAGCTGGTAGAAA
AGATTTGATTGAGCTTATATCTTATAGAATGACTTCTCCTGGAATAGGAAAAGAATGTGGTCTTACTTTT
GGAACAACTAGAAATGTACTTCAGGGTTTTTTCTTGGCGCCTTATATAGTATCTCAGGCTGTAATGGGAG
CTATCTTTTGCTCAAGAGCTTTTGAAAAATTAGGATATGATGTATTACCAAAATATGATGACTTAAGAAG
TGATATTATTCAATGTATTAGACTTAATAATGCTGATGAAGTAATAAGTTTTTGTGAAGGTATACAAGAA
GCTGCACCAGTCGATTCTTATGTAAAACCTGTTCCTTGGGACATGCCTGGATACGAAAGTGAAGTCATAA
TGGCAGCAGGAGCATTTATACAAGGTTCTTCTATAGAATTAAGTGCAGATGCTCCAATAAGACCTCCTTA
TAATGTTTATTTTCAAGGTGGACTTACATTTGACCATTCAAAAATGGGGACTTTAAAAGCGATTGAATTT
ATAAAAAAACTGAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2214816-2214556 HfQ protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATACAGTTTTAAATTTACAAGATTTGTTTTTAAATAATGCAAGGAAAGAAAGGATACCTGTTA
CTATATATTTAGTTAATGGAGTGCAAGTTAAAGGGCTTGTAAAGGGGTTTGATAGTTATATAATATTAAT
AGAAGGGGATAATAGACAACAAAACATGATTTATAAACATGCTGTATCAACTATACAACCTGGAAAGTAT
ATTAATCTAACAAATCAAAACCAAAACAACAATAATAATAACAACAGATAG
>ref|NC_013316.1|:c2215880-2214930 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAGGAATGTTATGAAAAAAATACCACTTATAATACTTACAGGTCCAACTGCTGTTGGAAAAACAG
ATTTGTCAATAAAATTAGCAAAAGATATAGATGCAGAGATAATTTCAGCTGATTCTATGCAAATATATGA
ATATATGGATATTGGAAGTGCAAAAGTTACAGAGGAAGAAATGCAAGGAGTGAAGCATTACCTTATAGAT
GAAGTTAAGCCTGACTATCCATTTTCAGTTTCAGAGTTTCAACAAAGAGCAAAAAAATATATACATGAAA
TAAATGAAAAGGGAAAATGTGTTTTAGTAACTGGAGGCACAGGACTTTATTTAAACTCTTTAATATATAA
TATGGATTTTGCACAATCTGATGCCAATAATGAATTAAGAGAAGAACTTCAAAAACAGCTTGCTGAAAAG
GGAATAGATTACATGCATAATAAGTTAAAAGAACTTGATGAAGAATCTGCTAATAGAATCCATAAAAACA
ATACTAAAAGGGTCATAAGAGCTCTTGAAGTTTGTCTAAGTGGTAAGAAAATGAATGATTTTTCAAGTGA
TTTAAAATTTAATGAAGAATATCAACCAATAATAATAGTTCTAAATAGAGATAGAGAACATTTGTATCAA
AGAATAAATATGAGAGTTGATATTATGATTAAAAATGGATTGGTTGAAGAGGTAAAAAAACTTTTAAGTA
TGGGATTTAAAAAAGATATGATATCAATGCAAGGTATAGGTTATAAAGAGATATTGAAGTATCTGGATGG
AGAATATACATACGAAGAAGCTATTGAAATAATTAAAAGAGATTCTAGAAGGTATGCAAAACGTCAGATA
ACATGGTTTAAAAGATATAAAACAGCAAGATGGTTTGATTTAGACCAATATGAAAATATAGACGAATTAA
AAAATGAAATAATCTTATATATTAAAGATTCTATAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2217870-2215903 DNA mismatch repair protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATATAATTAACATCCTAGATGATTTGACTATAAATAAGATAGCAGCAGGTGAAGTTGTAGAAA
GACCTTCTTCTGTAGTAAAAGAACTTATTGAAAACTCCATTGATGCAGGTGCAAATAAAATTTCCATAGA
TATAATTGATGGAGGAAAAAGTCTAATTAAGATTACAGATAATGGAATAGGAATACCTTCAAGTGAAGTT
GAAAAATCATTTTTGAGACATGCTACTAGTAAAATTAAAAAAATTGATGATTTGTATGATTTATACTCTC
TTGGTTTTAGAGGAGAAGCATTGGCATCTATTTCAGCTGTATCAAAATTAGAAATGACGACTAAAACTAA
AGATGAAATAATAGGAACTAAAATATATGTTGAAGGCGGAAAAATAATATCAAAAGAACCAATAGGTTCT
ACTAATGGAACTACCATCATTATAAAAGATATTTTCTTTAATACACCAGCAAGACAGAAATTTTTAAAAT
CTACTCATGCAGAAACTATAAACATAAGTGATTTGATAAATAAACTTGCAATAGGTAATCCAAACATTCA
ATTTAAATATACAAATAACAATAAACAGATGTTAAATACTCCAGGGGATGGAAAACTTGTAAACACTATT
AGAAGTATATATGGAAAAGAAATAACGGAAAATATAATAGATGTAGAGTTTAAGTGCAATCACTTTAAAA
TGAATGGATATATAGGTAATAACAATATATACCGTTCAAATAAAAACTTACAACATATCTATATAAATAA
AAGATTTGTAAAAAGTAAAATAATCATAGATGCAATAACAGAAAGTTATAAGTCTATAATTCCAATAGGT
AAACATGCAGTGTGCTTCTTAAATATAGAAGTAGACCCATCATGTATAGATGTAAATATACACCCCAATA
AACTTGAAATTAAATTTGAAAAAGAACAAGAAGTGTATATAGAACTTAGAGATTTTTTAAAGGTTAAATT
AATACACTCAAATCTTATTGGAAAATATGCTACTTATAGTGATAAAAAAACACAACCTAGAATCGCTATT
AACAGTAGAGAAAAAAGTACAGATTATAAATTAAGAAATAATGATTTATTAGAATCTACTCCTAAAAATA
GTAATATTACTAAAGATAAGGATGAAGTCATTGAAGTTGTGACTTTATCAAGTGAAAAACCAATAAATGA
ATTTCAATCAGTAAGTGAAGTCCTAAATGCAAGTGTAGAAGATGATGTAAAAAACATTAATTATCTAAGT
GAAGATAGTGCAAATGATAATATACAAGAAGAGTTTCAAGTTGATGGAATTAAAAATGAAGGAAATTATT
ACTTAGGAGATAGTATTAAGGACAGTGAAGAAGAATACTTGTGTAGTTCAAAACGCAAGTTTTCCTTATA
TGGATATTCTGTAATTGGAGTTGTATTTAATACTTATATAATTTTGAGCAAAGACGATTCTATGTATTTG
TTGGACCAACATGCTGCACATGAAAGAATACTATATGAAAGATATATGGAGAAGTTCTATAGACAAGATA
TCAATATGCAAATACTTTTAGACCCAGTGGTTATTGAAGTATCAAATGTAGATATGCTTCAAATTGAAAA
TAACTTGGAGTTATTTATGAAATTTGGTTTTGAACTAGAAATTTTTGGCAATAATCATATAATGGTAAGA
TGTGTTCCTACTATATTTGGAGTACCTGAAACTGAGAAATTTATACTTCAAATAATTGATAATATAGAAG
AAATTACAAGTAATTATGATTTAAAAGGAGAGAGATTTGCATCTATGGCATGTAGGTCTGCTATAAAAGC
AAATGATAAAATATACGATATTGAAATAAAAAGTTTATTGGAACAGCTAGAAAAGTGTGAGAATCCATTT
ACATGCCCTCATGGAAGACCTATAATGGTCGAAATATCTAAGACAGAAATAGAAAAAATGTTTAAAAGAA
TTATGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2220724-2217881 DNA mismatch repair protein [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAATAGATATGAATAAATTAACTCCTATGATGAAACAGTATCTTGAAGTAAAAAATAGATATAAAG
ACTGTATACTGTTTTTTAGACTTGGAGATTTTTATGAAATGTTTTTTGAAGATGCATTAGTAGCTTCAAA
AGCTCTTGAAATAGCATTGACAGGAAAAGCTTGTGGTTTAGAAGAACGTGCTCCTATGTGTGGTGTTCCT
TTCCACTCAGCCAATTCATATATATCAAAATTAGTTGAAAATGGATATAAAGTAGCAATAGGTGAACAAA
TGGAAGACCCATCTACAGCAAAAGGAATTGTTAGAAGAGAGGTTATAAGAGTCATCACTCCTGGTACAGT
TTTAGATGGAAATTTACTTGAAAATAAAAAGAATAATTATTTATTATCTTTGTATAAGGATGGTACTAAT
ATAGGTCTAACTTATGTTGATATAAGTACAGGAGAAACTAATGCAACATGTTTAAATGAAGATAAGGTAA
TTGAAGAAATTGCAAAAATCCATCCAACTGAAATAATTATAAATGATTTAGACTTTATAGAAAAGCTTAG
AGATATAGCTACTGTAAGTAATATATACATAAATGAAAGTTTTAGTGATAACTATTTGGATATAAATATA
TTAAAAGAATATTTTCCAGATGTTTATCTACAAAAACTAAAGTTTGATGATAAAGGTCTAATAAAGTCAA
GCTTATCAATTCTTCTGAATTATATATACAATACTCAAAAACAAATAACATCTAACATTAATAATATAAA
TATATACAATTCATCAGAATATATGGTTTTAGATATGTTTACTAGAACTAATTTAGAACTTACTCAAACT
ATAAGAGGGAATAAGAAAAAAGGTTCATTATTACATGTACTTGATAAAACTTCTACAGCAATGGGAGGTA
GACTTTTAAGAAAATATGTAGAAGAACCTTTGATAAATAAATCTAAAATTGAAAATAGATTAGATGTAAT
AGAAGAAATAAAAGATGACTTTATATTAAGAGAAGACCTAAATGATATACTTAAAAATATATACGATATA
GAAAGAATATGTGGAAAGATAGCATTTGAGAGAGTAACACCAAAAGAGTTAATTCACTTAAAAAATTCGA
TAGAAAAGTTACCTAATTTAAAAGATACTATAAATTTATCAAATGCAAAAATCCTAAAAGAGTATGTTTC
AGAAATGGATAAATTAGATGATATATACAATTTAATAGATGAAGCTATTCTAGAAGAACCTACGATAACC
ATAAAAGATGGAAACATAATTAAATCAGATTTTAGTGATGAACTTAAGGAACTAAGAGAGATTTCTAAGA
ATGGAGCCTTTCTTGTAAAGGAAATAGAAAACAGGGAAAGAGAAAAAACAGGAGTTAAATCATTAAAAAT
AGGATTTAATAAAGTTTTTGGATATTATATAGAAATAACAAAAGCCAACTTTAAACAGGCAAAGCTAGAT
GAGACATATATAAGAAAGCAAACACTTAGTAATGCAGAAAGATATATAACTCCAGAATTAAAGGAAATAG
AAGAAAAGATACTACATGCAGAGGAAAAGATTAAATCTTTAGAATACGAGATATTTGTAGAGATAAGAGA
TACAATATATAAAAACATAGATAGAATACAAAAAGTGGCTAAGACTATAGCTAATATAGATGTTTTTGTG
TCCCTTGCAACAGTTGCACATATAAATAACTATGTAAAACCAGCAATAAATGAAAATAATAAACTTGATA
TAAGAAATGGTAGACATCCTGTTGTCGAAAATATAGTAGGAGAGGAGAATTTCGTTCCAAATGATACTTA
TTTAAATCGTGGAGAAAACATTATTAACATAATAACTGGTCCTAATATGTCAGGTAAATCAACATATATG
AGACAAACTGCTATAATAGCTCTTATGGCACATATAGGCTCATTTGTACCAGCAGAGTCTGCTGATATTC
CAATATTAGATAGAATATTTACAAGAGTTGGAGCTAGTGACGATTTATCTCAAGGTCAATCTACTTTTAT
GGTAGAGATGAATGAAGTATCCCTTATATTAAAAAATGCAACAGAGAGAAGTTTAGTTATATTAGATGAA
ATAGGTCGTGGAACTAGTACCTATGATGGGATAAGTTTAGCATGGTCAATAGTGGAATATATTCAAAAAA
ATATTAGATGTAAGACATTATTTGCAACACATTATCATGAACTTACTGATTTAGAAGAAGAGTTTAAAGA
GGTTAAAAATTATTCAATAGCAGTCAAAGAAGATGGGGAAGGAATAATATTTTTAAGAAAAATAATTCCT
CAGGGAGCAGACAAGAGTTATGGAATATATGTTGCTAAATTAGCTAAATTACCAGACGAAGTCATAGAAA
GAGCAAAATATATACTTAAAGACTTGGAAAAAAATCATGTTTACAACAGTGTTGCAATAAATGGAGATAA
AGAAAACAATAATATAATTAATAGTAATTTGGACGAAGAATTAGTTAAGGTAAATCAAAGTAATTTTAAG
AATAAATATGAATCTCTAAAAATAGAACATGAACTTATAGTAAAAGACTACAAACATATAAAAAAGGATT
ATGATAAATTAAATTCTAAATTTAAAGCATTAAATGATGAAGTTGCTTTAATGAAGCAAAATGATGATAA
AGAGAAAATTAATCAAGAAGATTCTGTAAAAGAAGTAGCCTTAACTCAAATCTCTTTTGATAGTGTAAAT
AGAGATATACTATCAGAAGAAATTTTAAATCTGGATATTTTAAATATGACTCCATTAGATGCTATAAACT
CTCTTTATAATCTTCAAAGAAAAGCAAAAGAAATAAAATCTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2221609-2220887 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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AAGTTTTAAAAGATATAAGTATTGATGTTTATGAAGGTGAGTTTGTTTCTATATTAGGGCCAAGTGGATG
TGGAAAAAGTACTATTTTTAATATTATAACTAAACTTACAGATTATGATAGTGGCAAAGTGAATATAAAT
GGTAAATATAGTTATATGTATCAAAAAGATTTACTCTTGCCATATAAAACTATAATAGATAATGTGTCAC
TACCACTAATTTTAAAAAAAGAAAAAAAGAGTAAAGCTAGGTCAATGGTAAAACCTTATTTTGAGGTGTT
TGGATTAAGCGGATATGAAGATAAATATCCTTCAGAACTTTCTGGAGGAATGAGACAGAGAGCTAACTTC
TTGAGAACTTTTATAAATTCTAATGACATAATGCTTTTAGATGAGCCTTTTGGGGCACTTGATTCATTAA
CTAAAACATCCATGCAAAAATGGCTTTTAGATGTTAAGAAAAAAGTAAATTCAACAATACTTCTTATAAC
TCATGATATTGACGAAGCTATAATGCTATCAAACAGAATTTATGTTATTTCAAAAAAACCATCAATAGTA
AAGAAAGAATTTGTTATAGATAGTAGAAAGTTAAATGAAGATAACCTTGAAAATATCATTAAACTTAAAA
AAGAAATAATATCTTTATTGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2222603-2221590 ABC transporter, substrate-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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CTTCAAATAACAATAAAGACAAAAACAATGATAAAGATACTTCTTCTAAAAAAGTAACTATGGTGCTTGA
TTGGACACCAAATACAAATCATACTGGATTATTTGTAGCACTTGATAAGGGTTACTATAAAGAAGAAGGT
TTGGATGTTGAAATAGTACAACCACCTGAAAGTGGAGCAGAAACTTTAGTAGCAACAGGAAAAGCTGACT
TTGGTATAAGCTATCAAGAACAAGTTACTTATGCAAAGACTAGTGAAGATCCACTTCCAATAAAAGCTGT
AGCAACTGTTATACAACATAATACTTCTGGGTTTGCATCACCAAAAGAAAAGAATATAACAACAGCTAAA
GATTTTGAAGGAAAAACTTATGGTGGTTGGGGCTCTCCATCAGAAGAAGCTGTTTTTAAAGCAGTTATGA
AGAAAAATGGAGCTGATTTTAATAAGTTAAAGATAGTTAATACTGGTCAAGATGATTTCTTTGCAGCTAT
GAAAACTGTAGATTTTGCATGGATATTTGAAGGTTGGGATGCAGTTAAAGCTGATTTAATTGGATATGAC
TTAAACTTTATACCAGTAAAAGATTTAGATGAGAGATTGGATTATTATACACCACTTATAATTTCTAATG
AAACTGTGCTTAAAGATAATCCAGAGCTTGCTAAAAAATTCTTAAAAGCTACAACAAAAGGTTATGAATA
TGCAATAAAAAATCCAGAAGAATCAGCAAAAATTTTAGTAAAACATGCACCTGAAGTAGATGAAAAACTA
GCTTTAAAGAGTCAAGAATATTTAGCAAGCAAGTACAAAGATGATGCACCACGATGGGGAGAAATGAAAG
ATAGTGTATGGAACAACTATACATCATTCTTAAAAGAATATAAATTAATAGATAAGGATATGAAGGCAAG
TGATGCTTACACAAATGAATTTTTACCACAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2223395-2222625 ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAACTTAGAAATCATAGATAAAGTCAAAGATAGTATATATCCAATAGCAACATTTTTGTTTATAC
TTATTCTTTGGCAATCTATGGTAGGAGTTTTAGAAGTTCCTCAGTATATACTACCCACACCAGTAGATAT
AATTAATGTGTTTTTTAAAGATTATCAAAATTTATCCATGCATGCTGTGGTTACTATAGGAGAAGCAATA
CTTGGTTTTATAGTCGCAATTATAATATCATTGGTAATTGGAATATTGATGGATTTTGTATCAATAATAA
AAAAATGTCTTTATCCTATTATGTTGGTTACACAGATGATACCTACAATAATTATAGCACCACTTTTTAT
GATATGGTTTGGATTTGGAACAATGCCAAAAGTATTGATGGTAATGCTTACTTGTTTTTTTCCTATATTA
ATAAGTTTTGTAGATGGCATTGAGAATATTGATAAAGATTATTTAAATTTATTTAAGACTATGGACTCAA
ATAAAGTTAATACATTCATTCACCTTAAATTTCCTATGGCAATGGATAAATTTTTTTCTGGACTTAAAAT
ATCTGCAACGTATGCTGTAATGGCAGCAACTGTTGCAGAATGGCTAGGTGGAACGAAAGGACTTGGTGTT
TATATGCTTAGGTCAAAAAGTGCATATGCACTTGATAAAGTATTTGCATCTACTATATTAGTAGTTATAT
TTAGTTTAATGTTTGTAGGAATTGTACAGGCTGTAAAAAAAGTTGTTATAAGACATAGATTAATTGATTA
A
>ref|NC_013316.1|:c2223660-2223370 hypothetical protein CDR20291_1904 [Clostridium difficile R20291]
ATGGTAATCGCAGACATAGCAGTAATGCCACTAAGACCTTACAAAGGTGAAGAAGAAATGTATAAAGTAG
TAGATGCTTGTATTGCTGAAATTGAAAAAAGTGGTCTTAAATGTGAAATAGGAGCAATGAGCACTACTGT
TGAAGGTGATTTTGATGAAGTTTTTGAATTATTAAAAAAGGTACATAAAATCCCTTTTAATCTTGGATGT
GAAAGAGTCATAACAGTAGCTAGAGTAGATGAAAAAGCTGGAGGTCTGACTATAGATGAAAAACTTAGAA
ATCATAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2225299-2224943 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGATATAGATAATAATTTTGAAGAATTTCCAAATATTGAAGAAAGACAAAAAGATTTTAATTGTTCAA
TTGGTTTTACCATGACTGTGATAGGAAGTAAATGGAGGGCAATTATTTTATGGCATATTTTAAAACAAGA
GCCAATACGTTACAGTCAATTAAAAAAAGATGTTGTTCATATAAGTCATAAGATACTGTCACAAGAATTA
AAGTATCTTGAAAGAGATGGACTTATTAAGAGAATTTCTTATCCGACTATTCCTCCAAAAGTTGAATATT
TGTCTACTAAACGTGGTAAATCATTGGAATCTATATTATTAGAATTATGTAATTGGGGTAAACAGTATAT
GAGATAA
>ref|NC_013316.1|:2226030-2227148 transposase-like protein b [Clostridium difficile R20291]
GTGATAGCAGTGAAAAAAGCTTATAAGTTTAGAATATATCCAAATAAAAAACAACAAGAGTTAATTAACA
AAACTTTTGGATGTTGTAGATTTGTATATAATAAATATCTTGCTAAAAGAATAGATGTTTATAAAAACGA
TAAAGAAACTTTTACTTATAAACAGTGTAGTTCTGATTTGACCAATTTAAAAAAAGAATTAAATTGGCTT
AAAGAACCTGATAAATTTTCACTACAAAACGCCTTAAAAGATTTAGAAAACGCATATAATAAATTCTTTA
AAGAAAAAGCAGGATTTCCTAAATTTAAATCAAAGAAAACTAATAGATTTTCATATAAAACTAACTTTAC
AAATGGAAATATCGTGTATTGTGGTCAACATATAAAACTACCTAAACTTGGTATGGTTAAGATAAGGGAT
AAACAAGTACCTAAAGGGAGAATACTTAATGCTACTATATCTAAAGAACCAAGTGGTAGATATTATGTAT
CATTATGCTGTACTGATGTAGATATTGAAGTATTTGAAAATACTAATAATCAGATAGGTTTAGATTTAGG
AATTAAAGAATTTTGTATCTCAAGTTGTGGAGACTTTATAGAAAATCCTAAGTATCTTAAGAAGTCATTA
AACAAACTTGCTAAATTACAAAGCGAATTATCGAGAAAAACAATCGGTAGTTTAAATAGAAACAAAGCAA
GATTAAAAGTTGCAAGACTTCAAGAACATATAGCTAATCAAAGAAAGGATTTTCTACAAAAACTATCTAC
TAAATTAATAAAAGAGAATGATATTATTTGCATAGAAGATTTACAAGTAAAGAATATGATTAAAAATCAT
AAACTATCTCGCTCAATTTCAGATGTATCATGGTCAGAATTTATTCGTCAATTAGAGTACAAGGCTAATT
GGTATGGTAGAAAAATTGTAAAGGTAGGTAAATTCTTTGCAAGTTCACAAATATGCAATAAATGTGGGTA
TAAAAACGAGGAAGTGAAGGACTTAAGTATAAGAGAATGGATTTGTCCTAGTTGTAATGAAACTCACGAT
AGAGATATAAATGCAAGTATAAATATATTAAAAGAAGGATTAAGACTAATAACAATTCAAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2227602-2228357 hypothetical protein CDR20291_1907 [Clostridium difficile R20291]
TTGGCTAAAAATCATCAAGAAAATTATGATGTACATATCAGATTTTTTACACCAACTAATGAAGTTCCTA
TATGTGGTCATGCTACTATTGCTGCCCATTATGTTAGAGCAGTAGAAAACCAATTCAATAACAAAACAGT
ATTTCAAAAAACTGGTGCTGGAATATTACCAGTTGATATTATAAAAAAAGATAATGATTATGAAATAATT
ATGACACAAGGAAAAATTGAAGTATCTCCACCATTACAACAAACCTATCAAAAAAGATTACTTAATGCAT
TTGGTATTTTAAATGAAGATATTCGTACAGATTGTCCTATTGCCATATCATCTACAGGACATTCAAAAGT
TATGATTGGAATAAAGGAATTATCAACATTAAATAGTTTATCTCCAAATTTATATGAATTATCGAAAATA
AGTCAAGAAATAAAATGTAATGGATATTATATTTTTACATTACATAATAAAGAAACTCTACAAGTTCATG
GAAGAATGTTTGCTCCTGCAATTGGTATTTCAGAAGACCCTGTTACAGGAAATGCTAATGGACCTTTAGG
TGCGTACCTTGTACATTATAAAGTAATACCTATACCCAACACAGAGTTTATATTTGAAGCAGTTCAAGGA
GAAGCAATAAAACGCAAAGGCAAGATGTTAGTAAAAGTAATTATTTCAGATAATAAGCCAGTTGAAGTAA
AAATAATTGGAAAAGCTGTAATTGCATTCTCAACAAACATAGAAATCGAATTATAG
>ref|NC_013316.1|:2228582-2229193 NUDIX-family protein [Clostridium difficile R20291]
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GAGCATCTGTTTTAATTCCAATAATAGAAATAAATAACACACACTATATATTATTTGAAGTTCGCTCAAA
AAATTTGAAGCATCAACCTAGCGAAATTTCTTTTCCAGGTGGTAAAATAGAATCAGGTGAGACTCCATAT
GAAGCTGTTATTAGAGAAACTTGTGAGGAACTTGGAACTTTTAGTGACAATATAGAAGTAATATCAAGTC
TTGACCTCCTTATAACACCAGTAAAGTTTATCATACATCCATACTTAGGATATATAAAAAATATTAATAA
TTTAAATATAAACAAGGATGAAGTTGACCATACTTTTTTGGTTCCTATAAAATATCTTTTAGAGAATCCT
CCAAATACTTATAGTAATACTGTAAAAGTTTTTCCAGATGAAAATCTACCATATGGTTCAATTCCAAACC
AAAAAGATTATAAATTTGAAAGTGGAAGTTATCCTATTCTGTTTTATAAATATAAAGATTATGTAATTTG
GGGAATGACAGCAAAAATACTAGAAAACTTTTTAAATTTTTTATCAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:2229491-2229829 hypothetical protein CDR20291_1909 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTGCTGTAGGATTTGTTGTTATAATTGCACTTGCCTTTTTCATTTTAAGTGTACTATTATTTAATG
GAAAAGCCAGTATGCTACTAGCAGGTTATAACTCTATGAGTAAGAAAGAAAAAGCACGATACGATAAAAA
AAAATTATGTAGAAGTTCTAGCATTGTTACTTTTATTGTCTCTATAATGCTATTTATTATGGCATTTTTG
GGATATAGAATAGAGAGTGGTCAAATGGACGAAAAAAAAATGGTTCCCTTTTCTATAATATTTATAATAG
TCATACTTTCCAGTGTATTTTTTAATATCCTCTACTCTAACAAAAAATGTAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2231525-2230236 putative radical sam protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGAACATGATTCAGAAAAATTATGTTCGATGTTAGAAGAGATGGGATACCAAATGTCAATGATGG
TTGAAGAAAGTGATTTAATAATATATAACACCTGTGCAGTTAGAGAAAATGCAGAGCTAAAAGTGTATGG
TAACTTAGGACAATTAAAACATCTAAAAGGAAAAAATCCAGATATGAAAATAGCTGTATGTGGATGTATG
ATGCAACAACCACATGTTGTAGAGGAATTAAGAAAAAAATATAAACATGTAGACCTTATATTTGGAACAC
ATAATCTATATAAATTTCCGCAATTACTTACAGAATCAATAAATTCTGACAAAATGTTAGTGGATGTATG
GGATGTGGATGGAGAAGTAATAGAAGGTCTTAGAAGTAATAGAAAATTTGAATTAAAAGCATTTGTAAAT
ATAATGTATGGATGCAATAATTTCTGCACATATTGTATAGTCCCATACACAAGAGGAAGAGAAAGAAGTA
GAACTCCTGAAGATATAATTAACGAGATAAAAGAGCTTGTTGCAAATGGAACGAAAGAAATCACTTTACT
TGGACAAAATGTAGATTCTTATGGTAAGACACTTGAAAATCCAGTTTCATTCTCAGAACTTTTAAGAAAA
GTGAATGATATAGAAGGAATTGAAAGGGTTCGATTTATGACATCTCATCCAAAAGATATATCTGATGAAG
TAATATACGCAATTAGAGATTGTGATAAGGTGTGTGAGTTTTTACATCTACCAATACAATGTGGAAGCAG
TAGCCTTTTGAAAAAAATGAATAGACATTATACAAAGGAATATTATTTAGAAATAATAGAAAAAGCTAAA
AAGGAAGTTCCAGGTATTGCTTTTTCTACAGACTTAATGATTGGTTTCCCAGGAGAAACAGAAGAAGATT
TATTGGACACTTTAGATGTGGTTGAAAAAGTTAGATATGATTCAGCTTTTACATTTATTTATTCTAAAAG
ACAGGGAACTCCTGCTGCTAAAATGGAAAATCAAATACCAGAAGATATAAAGCATGATAGATTTAATAGG
GTGTTAGAAGCTGTAAATAGGATTTCTGCAGAAATAAATGATGGATATAAAGATAGAATAGTTGAAGTTC
TAGTTGAAGGAAGAAGTAAAAATAATGAAAATAAGTTTGCTGGTAGAACTAGACAAAATAAACTCGTAAA
TTTCGAAGGTGGAAATGATGATTTAATTGGTAAATTAGTTATGGTCAAAATTACTGAACCTAGAACTTTT
TCATTAAATGGGATATTAGTAAATAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2233356-2231920 cell surface protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTCTATAAAAGAATATTAACATTGACTTTAAGTATTTCTTTTGTATTTGCAAATATTCAATTAG
TAGATGCAATATCATCTGTAGAAAAAATACAAGGAAAAAATAAGTATGAAATAGCAGGCAAAATAGCAGA
TAAAAATGCATATAAAACTGCTATATTAATTAATACTAGTAACTCTATTGCAGATGGATTAAGTGCAAGT
GGACTAGCAGGAGCTTTAAATGCCCCTATACTATTAACTGAAAAAAATACTATACCAACTGAGACATCTG
CAAGATTAAAAAATGTATCAAAAGTTTATATAATTGGAGGAACATATTCTATTAGTACATCTGTCGAAAA
TTCATTAAAATCTAAGAAAATGAAAGTTGTAAGAATTAAGGGAAATGACAGAATAAAAACAAGTTATAAT
GTTGCAAAAGAAATAAATTCAATAAAAAAAGTCAATACTGTTATGCTAACCAATGCATATAAAGGAGAAG
CAGATGCTATAAGTATTGCATCTGTAGCAGCAAGAGATAAAGCACCAATAATTCTTACTAATGGACAAAG
TATACCTTTTTCAACTAGTGGTTTAAAGTCTTATGTAATAGGAGGAACAGCTTCAATGAGTACCACTTTA
GTAAACAATACTAAATCTACTAGACTAGGAGGGAGTACTCGTTTTGAAACTAATAAAGCAATAATAAATA
AGTTTTATAAGGATGCTAGAGAGTTTTATATAGCTGGAGCTTATGAATTAACAAATGCACTTGTAGGATC
TTCTTTATCAAAACATGGTCCAATAGTTTTAGTTAATGATGGTAGCAATAAAAGCATTTTAAAAAATGCT
AAGAAGATAACTTCTATAGGATATATAGATTCAAATATAGTACAACAGTGTTTAAATATAACAAATGGAA
TTGGAGATATTAATACTGGGGTTGTAAAAAATGTTAAACCTACTACAAAGACTATAAAAGATGGAATGTA
TAAGGTTGGAAAAGATATATCAGCAGGTGAATACTTAATTACTTCAAACTCAGGAAGTTATGCTTCTTAT
TATGAAGTTACAAGTGATAGTACAGGTAATGCTGATAGTATACTTTCAAATGATATTTTTAGTGGGACTA
GATATATCACCTTAAAGAATGGTCAATATATTAAAATTGAGGATTCAACAATGACATTAGCAAAGTATGC
TAAAGCCCAGAAGGCCAAGAATGGTAAGTTTGGAAATGGTATGTATAAAATTGGATTAGAAATTCCTGCT
GGAGAATATATTATAATGTCAAATTCTTCTGATGCATATTATGAAGTTAGAAATGATAGCTTAGGTAATG
CAGAGGGAATAGTTACTAATGATACTTTTTCAGGAAGAAGATATATAACGGTTGAGGAAGGTCAATATTT
AATATTAAATGATTGTTATTTAATTGAAAATGAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2234734-2234183 putative tryptophan transport protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAACAAATACAAAAAAATTAACTTTAAATGCAATACTTTTAGCGATGGGATTATTAATACATCAAA
TCACACCAGCTATAGGATTACCAATGAAGCCAGATGTACCACTAGCAATGTTATTTGTAATATTGGTTTT
AAATAGAGATGATTATAAAACTTGTTTGATAGCGGGTATAGTAACAGGAATATTTACAGCACTTACATCA
AGTTTTCCGGGAGGTCAAATTCCTAATGTAATAGATAAAACTCTTACAGCAAATATAGTATTTTTATTAA
TGAATATTAGTTATAATATGCCTTTTATAAAAAAATTAGCTAAGAAAACACAAGATACTGTAGTAGTTGC
AATAATAATGCCAATAGGAACTCTTGTAAGTGGAACTATCTTTTTATTAGCAGCTCAAGCTATAGTTGGT
CTTCCAGGAGCTTCATTTACAGCTTTATTCTTAGCAGTAGTATTACCAGCTGTTTTAATAAATCTAGTTG
CAGGAATATTTTTATTCAAGATTGTTAGTCTATCAATAAGAAGAGTTAGTTATCAAGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2235983-2235714 hypothetical protein CDR20291_1913 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAGAAGAAAAAATTGATTGGGATAGCTATATCTTTTCTACTTATAATCAGTATTATAAATCCAT
TACAAGTAGAAGCAGAAGCTATTATTGAGTCTAGTGTATACATTTCTTCAATAAAAGAGAATTATACATA
TGATAATACTAAATTTAAAACTATTAAATCTAAAAGTAGACATAAAAGTAGGAAATATAATAAAAGTAAA
GTAAAGTTGAAAAAACGAAGTATAAGAACTAAAAAAGTATGGATATCAAACTATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2236824-2236339 hypothetical protein CDR20291_1914 [Clostridium difficile R20291]
ATGATATCTGAATTAATGTTAAAAAATTTTGGCAAATCTAGCATCAATTTTAAAACTAAAATTAAATTGA
ATTTAAGAGAAAAACCAGACATAAATAGTTTGAAATTAAAAAGTATACCAGAAGGTAAAATTGTTAAGTT
AAAATGTGTAGATGGAATATGGGCAGAAGTTGAGAGTAATTATGACAAAGGCTGGTTACTTTATAAATAT
TTAGAAAGATTAAGTAATGCTAAAAACAATAGTAATGATACAATAAAAAATAGAAAAAAGAATTACATAG
GAAATATAAGAACAAATGGATTAAGTTTAGAACTTAGAAATGATAGAACATTAGAATCTAAAGTTATAAC
TACAATCCCTGATGGTTTTAAAGTTGAAGTATGTTATAGCGTTGGAAAATGGGCAAGAGTTAATATCAAT
AAAAATGAAAAACGATATTCTGGATATGTATATAATCAATACATAGAAGAGCATTTAAGTTTATAA
>ref|NC_013316.1|:2238520-2238720 cold shock protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATGGAATAGTGAAATGGTTTAATAATGAAAAAGGATTCGGTTTTATATCAATGGAAGGTAGAG
ATGATGTGTTTGCTCATTTCTCAGCTATACAAACTTCAGGATTTAAATCATTAGAAGAAGGTCAACAAGT
AAGCTTTGATATAGTTAAAGGTGCTAGAGGTCCTCAAGCAGAAAATATAACTATATTATAA
>ref|NC_013316.1|:2239658-2240503 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGAACATTATTAAAAGCATAACTTTACTCTTAACATTATTAATTGTGATATTAATGACAGGATGTTCCC
CAAGAGAAAGTGCTAGTGAAGTTGCAAAAAAATATATTGATAAGATGAACTCTGGTGACTATGAAACAGC
ATATAGTTTATTAAGTAAAGATAGTAAAAAAAAAATTAGTATAGAAAATCTTGAAGAATTTCAAAATATT
TTAGTTAGTACAAAAAGAATAATTAGTTATAAAATAGGTAAAGAAAAAATCATAAAAAAATATAAACATG
ATGGAAAAGAATATAAAAATGTTGTTAAATTAGAAGAAACTTTTAATATAAAAAACCTTCTTTATAAAAA
AGATGATTCTCTAAAAGTAAATAGATATTTTGTAGTTGAAAATAACAAATACAAGCTATTATTGTATGAA
AGTTTCAAAAAAGAATTTGGTATTAATAGTATGGACCTTGCTCAACTTAAGCTTAATGATTTTGGACTAA
AATACTTTAAAGAAGTTGACCTTATACTAAAAAAAGCTATTGCTATTAATCCTACTGATTCAAAGCTTTA
TTATGCCCAAGCATGTAATTATATGAATTTTGATGGATTTCCTGGTTATTCAGATACAACATATAATGCT
TTAGATTCAATTAATAATTCTTTAAAGTATTTAGATAAAAATGATTCTGACTACAAAAAAAATGCAAGTA
ATATATATAACTTAAAAGGAGTTATTCTTATGTTTCACAAAAGATTTGATGAAGCACAACAATATTTAAA
TAAAGCCTTATACTTTAACAAAGATAATGAAGACCCAAAATATAATCTAAATACAATAAAAAAACATCTA
AACTAG
>ref|NC_013316.1|:c2240891-2240727 hypothetical protein CDR20291_1917 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTGGTAAACCAAAAGAAAGTGTTAGATTTTTAGACTTTAATGATGTAGCAGAAAAGTTTGGAGAGA
AAAAGGCTGTTGCAATTTTTGATGCCATAGCTGGAAAAAAATCTAAAGAACATATTATCAAAGATATAGA
AAAATTAGTAAAAAATGAAGTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2241765-2241433 putative decarboxylase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATACTAGAGAAATGAAAGAATATAGGGGATTTTACAATAAAAAATTAAGTGAAACAGATGAGTTTT
TTAGAGTATTTGGAAGTCTTGATGATAAGACTTATTCAGAAGGGGCTATAAGTAAAAAAAATAAGGAATT
AATGGGACTAGCTATTTCAATTTTAAGCCGATGTGATGAGTGTATTTGTTATCATATTGAGGGTTGTATT
AATTCTGGAGCAAGTAAAGATGAAATTATAGAAGCTATAAAAATAGGTGTAATTGGTGGCGGGTCTATTA
CATATCCAAACGCAAGATTTGCAATAAAAATTTTAGAAGAATTTAATATATAA
>ref|NC_013316.1|:c2242650-2242009 hypothetical protein CDR20291_1919 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAGCGATAAATAAACAATTTATTTTATCTACTTTAATATGTTTTATACCATTTATTGTATCAA
TATATTTTTATAATAGATTACCAAATGAAGTTGCAATTCATTTTGATAATTATGGAAATCCAGATAATTA
TGCTCCAAAGGTTATAGCAGCTTTTGGTGTACCATTGTTAATGCTATGTATCCATTTGTATACATGGTTT
AGACTTGAGAATGAGCCTAAAAAAGCTAATTTTTCAAATGTTATACAAAATTTATCAAAATGGGGAGTTG
CTATACTTTCAGTAATTCTACAAATACTGATGGTTTTATATTCAACAGGAGTTAGTTTGGAGTCTAATTT
TTATACAGGATTAATTTTAGGAATAATAGTTATTTTATTTGGAAACTATCTTCCTAAATGTAAACAAAAT
TACTCAGTAGGAATAATTTTGCCATGGACTCTTGATGATGAAGATAATTGGAATAAGACACACCATTTAG
CTGGATGGATTTGGCTTATTGGTGGAATATTATTAATTATTAATGCATTTATTAATATTCCTTTTTATAA
TATCTTTGTAATCTTTGTAATTGTAATACTACCATTTATATATTCTTATTTGATGTATAAAATTTCAGGT
AAAAATAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c2242930-2242631 ArsR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGTGTTGGGGTTTCCAGAAACATTCAAAGCTCTTTCAGACCCTATAAGAAGAGAAATATTGGTTATGT
TGAGGGAGAATAAAATGTCAGCAGGAGAAATTAGTGAAAAATTTAATATGACGAATGCTACAATTTCTTA
TCATCTATCTCAACTAAAAAAGGCAGGACTCATATTTGAAACAAAGTATAAGAACTTTATTTTCTACGAA
ATAAATATTTCAGTTTTCGAAGAGGTTATGCTTTGGTTTTCACAATTTATGGAGAAGGGAGAAAAAGATA
ATGAAAAAAGCGATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2244561-2243893 hypothetical protein CDR20291_1921 [Clostridium difficile R20291]
ATGCCTGTTCTTATGGCAATTGGAGTGCCAGTACATCTTGCCATTGGTACAAATAAATTTGCAGCATCAG
CAGGATGTATAAGTAGTGCCTATAGATATGCAAAGTCTGGAAAAATTAATAACGATCTTTTAAAAAAATT
AGTACCATTTACTATTATTGGTAGTGTTCTAGGTGTGAGATGTGTATTATCAATAAGTGAAGAGATATTA
AATGTTTTGGTTGTGGTTATGATTTTAATAGTGGCTATTTACACCTTTATTTCTAAAAATTTAGGTCAAG
AAGATAATTTTGAAGCTGTTAATAAGAAAAATTTAAGACTAGGGATGCTTATGGCTCTTATAATGGGTTT
TTATGATGGTTTTTTTGGTCCAGGTACAGGAACTTTTTTGACTTTTGGATTTATAAAAATATATGGATAT
GATTTTTTACATGCTTCTGCAAATACAAAAATATTAAACTTAACAAGTAATATAACTTCATTGTTATTAT
TCATGATAAATGGTCAAGTAGATTATAAAATTGCTATAGTGTTTGCATTAGTGATGATAATGGGAGCTTA
TGTAGGTGCTAAAGTTGCTATAAAGAAAGGTTCAAAGATGATAAAACCAATATTTTTAGTAATGGCATTA
TTTATGGTCGTAAAATTGGTATATCAAACATTAGTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2246360-2244705 AraC-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGTGGATTTTATTGAGTCAAATAATGAAGTACAAAAATTTGATTGGGGAGAGGTTATGTGGATACACG
AACCATCAAAAACACAATTCAATAGACTTAGTGCTGGAATTGTAAGATTTTTTCCGGGAAACTGCCAAGA
AAAGCATTTTCATTTAAGTGAAGAACAGCTTTTATATGTGATTCAGGGAGAAGGAATACAAATGATTGAT
GGTAAAAAGGTCAATATAAAGGAAACATCTATAGTTTATTGCCCACCATATTCAGAACATGAAATTATAA
ACACTGGTAAAATTGATTTAGTAATATTAATTACTTATGTTCCTCATAAATTTTCGAGTTTGAGACAAAT
ACCTATAGTATTTTCTGAAAACAATATACAAGAGTTAGTTAATGTAAACATAATTGAAAATCTTGCAAAT
CAAATATCTAATATATTGAAGCTTAGAATATCTGTATATGACTTAAAGTATAAAGGAATATTTGAGACTA
AGAAAGAAAATAAATTTTGCGATATTTGTAAAAATATAAAACCGTGTACTAAAAAACTTGTTAAAAGCAT
AAATAATGATAACTTTGAAAAAGTGTACCATTGTGAGTATGGTGTTTCCAGTTTAGAGATACCTATAGTA
TTAGAAGAAAATATAGTTGGATATATAGAATGTGGTAATTTTATAGTATATAAGTCTATTGATATAGATA
AAAATTTATCTGAATTATCAAGTAGTTCTGGTATTGATATAAAATACATAAACAAAATTTACAATGAATT
TCCATTAAATCCTAAAAGTAGATTATATGTATTAAAAGAAAATTTATTAATGATGTCTGAATTTATTCAG
GAAATAGCTAAGAGGAATTTTTTTGAAAATCAACTTAGTATAAAAGATGAGGAGATATTAAAGAGTAGAA
AAGAAAATATAAGACTTGAAGAGGCACTTAAAAAAGCAAATAGTAGATTATTAGAAGAAGAGTATATTAT
TAATCCGATAGATATGTTCAATAATTCTTCAAAAGAATATCCCTTTGAATTAGAACTTTATATTGAAAAA
GAAATTAAAAATATGAATTTAGAAGGTGTTTATAATCTAATAGATACAAACAAATTAAGATATAATGATG
TTAGAGATACTATTCAGGAAATGATATTTGTATTGTCTAGAACAGTGCTTAGAGATTTAGAGGATTTAAA
ACTTATATCTTATTTAAGAAATAAATATAATAAAAAAATATCACTTGTAGACAGTGATGAAGATTTATGG
AATGTATTATTTGAATTTTCCAAAGAGTGTATTGATAAGAATAGAGCATTTTGGAGAAAAGATAAAGGAA
ATCTAATTGAAAATATAAACGAATATATAAAAAAATATTATAAAGAAAATATAAATTTGAATAGTATATC
AGATGTTTTTTTTATAAGTCCAAATTATTTGAGTTCTATTTTTAATGAAAGAAATAAAGTTTCAATAACT
GAGTATATAAATCTTCTTAGGATAGAAGAATCTAAAAAATATCTGTTAGATAGAAGCATGAGTATTAGTG
ATATTTGTAAGAAAGTAGGTTTTAATAACAGTAGTTATTTTTCACAAATATTTAAGAAGTTTAATAGTAT
AACTCCAAATGAATATAGAAAGAATATGCTGGATAATAAGTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2246957-2246589 hth transcriptional regulator merr family [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATATTCTATAACTGATGTATCAAAAATAACAAAAATTTCTTCATCTGCTATTCGATTTTATGAAG
AAAAAGGTTTATTACTTCCTATCAATAGAAAACCAAGTGGTGTTCGCTATTTCTCTGAAGAAGATGTAGA
GCGTCTAATATTTATCAAAGAATTAAAAAATACTGGTTTATCTATTAAAGATATCCATGAATGCTTTCAT
TTTTGTGATATGGGAGATGGTACAATAGATAAAAGAATCCAATTATTTCAACAACATAAGCAAAACATTA
AAAATAAAATACATGAACTAGAAAGTTGTATGGATAAAATAGATGAGAAAATATATTACTTAAAAGAAAA
AAAGATGTGTAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2247106-2247900 hypothetical protein CDR20291_1924 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAATATGCAACTATGATTAAAGAAAAGCTAAATGAAGGAAAGGTCTTATGTGGAGTAGCTGTTT
CACTGTCTGATTCAGTTGTAAGTGAGTTAATCGGTATATCTGGATATGATTTTATTTGGATTGAAGGAGA
ACATAGTGCTTTAGACCGTAAAGACATTCAGCAACATATGATAGCTGCCCATGCTGGTGGTGCTGCTTCT
TTGGTACGATTAGTAAACAGTGACCCTGACCTTGTTAAGCCCATAATGGATATGGGAACAGATATTATTT
GTTTCCCATTTATTAATACAGTAGAAGATGCACAAAAAGCCGTAGCAGCTTGTACTTATCCTCCAAACGG
TATAAGAGGATATAATCCTCAAAGAGCCTCTTATTATGGGAATATGAATTATTTTGACTATGTCAAAAAC
GCAAACAATGAAACATTAAAAATGATGTTAATTGAACAGAAAGCAGGTTATGATAATCTTGAAGAAATAG
TAAAAGTCGAGGGTATTGATATTATAGCATTAGGCCCTGGTGACTTATCTTTAGACATGGGTTTTTCCGG
ATATATGAATAGAATTGAAATAAAAGATATGATTTCTCATGCTGCTGAAATATGCAAAAAATATAAGATG
CCCTTTATTATTTTTCCTACAATAGAAAAGAAAAGTATTGAAGAATGGGTTAATATTGGAGCAAATATGC
TTTGTTTTGCACAAGATACTACCTTTATCACTTATGTTATCAATCAATTATTATCTTTTTATAATGAGAT
TGTACCAATTCAAAAACAACATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2248481-2248053 flavodoxin [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAAATATATATTGTTTATTGGAGTGGAACAGGAAATACTGAAAAAATGGCAAATTTTGTGGCTG
AAGGTGTGAAGTTAAAAGGTAAGACACCAGAAGTTTTAGATGTGAGCTTACTGAAACCAAGTGATTTAAA
AGAAGAAGATAAATTTGCATTAGGTTGCCCATCTATGGGAGCAGAGCAACTAGAAGAGGGGTATATGGAG
CCATTTGTTTCAGAATTAGAATCTATGGTATCAGGTAAACAGATTGGATTATTTGGTTCATATGGATGGG
GAAATTGTGAATGGATGAGAGACTGGGAAGAACGTATGCAAAATGCTGGTGCTACAATTATTGGTGGAGA
AGGAATTACAGCAATGGAAGACCCAAATGAAGAAGCAAAAGATGAGTGTATAGAATTAGGCAAAACGTTA
GCTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2249898-2248957 major intracellular serine protease [Clostridium difficile R20291]
ATGATGAATAAAAGAATGAAACTAATTCCGTATGAAATAAATGAAAATCTAAGAGGTGCAAAAAATAAAT
TCCCATATGGAATAAAACAAATGAATGCTAGGGGAATGTGGGATGAAGGTTATACTGGTAAAAATATTGT
AGTTGGTATAATAGATACAGGTTGTGATATATCTCATCCTCTTTTAAAAGGAAAAATAATTGGTGGTGCA
AATTTTAGTGATGACAGTAATGGAAATAAAAATATATATGAGGATTTTAATGGCCATGGAACTCATGTGG
CGGGTATTATAGCTGCATCTAACTATAATAATGAAGTTATGGGAGTAGCTCCAGATTGTAAATTATTAAT
AGCAAAAGCATTAAATAAAGATGGTACCGGAACATATCAAAGTATAATTAATGCTATTAACTTTGCTGTA
AATAACAAGGTTGATATTATATCTATGTCTCTTGGGGGAAACAAAGATGATAAGAATTTAAAAAATGCTG
TCATGCAAGCAGTAAAAAATAATATTTCTGTAGTGTGTGCAGCAGGTAATAATGGAGATGGTGATTCTAG
TACAAGTGAGTATAGTTATCCAGCCAGTTATGCTGAGGTAATAGAAGTAGGTGCAATAAATGAAAACTAT
TTGGTTGAAAAGTTTAGTAATTCAAATACTACAATAGATTTGGTGGCTCCAGGAAGAAATATTATATCGA
CTTATATGGATAATAAACTTGCTATTATGAGTGGTACTAGTATGAGTGCACCATACGTATCAGGCTCATT
AGCACTAATTAAAGAATGGGCAAGAGAGGAGTTTGAAAGAGATTTAGATGAAGCTGAACTGTATGCACAA
TTAATAAAATGTACGAGAGCGCTTGGAATACCTAGAACGGAACAAGGAAATGGATACTTATATTTAAATC
TTTATAAATACAAGAATAATAGCAAAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2251894-2250239 dihydroxy-acid dehydratase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAGTGATATAAAAAAAGGAATAGAAGGAGCTCCAAAGAGAGCGTTAATGTATGGAATGGGTCTTA
CTAAAGAAGAAATTGAAAGACCATTAATAGGTATAGTAAATGCACAAAATGAGGTGATTCCTGGTCATCT
GCATCTTGATGAAATAGCAGAAGCTGCAAAAAATGGAGTAAGAATGAGTGGTGGTTTGCCATTAGAATTT
CCTGCTATAGGGGTATGTGATGGTATAGCTATGGGGCATGTCGGAATGAATTATTCCCTGGCTTCAAGAG
AATTAATAGCAGATTCAATAGAAGCTATGGCTATGGCACATGGTTTTGATGCTTTGGTACTTATACCTAA
TTGTGACAAGATAGTGCCAGGTATGTTAATGGCTGCTGCAAGACTTAATATACCAAGTATTGTTGTGAGT
GGAGGGCCTATGCTTCCAGGTAAAAAAAATGGAAAAGTATATGATTTTAACTCTGCAATGGAGGGTGTTG
GAGCATGTAAAGATGGAACAGTAAGTGAAGAAGAATTAGAAGAGTTAGCCATGAACTCTTGTCCTGGATG
TGGTTCATGCTCTGGACTTTTCACAGCAAATAGCATGAATTGTTTAACAGAAGCTTTAGGCATGGGTATA
CCATATAATGGTACTGCTGCGTCACATTCTGGAGAAAGAAAAAGAATAGCAAAATATGCAGGTATGTATG
TTATGGAGTTACTTAAGAACGACATAAAACCTAGAGATATTTTAACAATAGATGCTTTTAAAAATGCTAT
AGCTGTTGATATGGCAATGGCTGGTTCTACAAATACAGTACTTCACTTACCTGCAATAGCTTATGAATCA
GGAATAGAGTTTAACTTAGATTTTTTTGATGAAATAAGTGAAAAAACTCCTTGTTTAACAAAATTAAGTC
CAAGTGGAAAACATCATATTGAAGATTTACATATGGCAGGAGGAATACCAGCTATAATGAACGAACTTTC
AAAGATAAATGGAATAAATTTAGATTGCAAAACCGTAACAGGCAAGACTATAGGGGAAAATATAAGAAAT
TGTGAAATAGAAAATGAAGAAGTAATACATACATTAAAGAATCCATATAGTAACCAAGGTGGGCTTGCAA
TATTGAAAGGAAATCTTGCTCTAAATGGAGCTGTTGTAAAAAAGTCAGCAGTTGCAGAAGAAATGTTAGT
TCATGAAGGACCAGCAAGAGTTTTTAATTCAGAAGAAGAAGCTGTAAATGCTATTTTTGGTAAAAAAATA
AACAAAGGTGATGTTATAGTTATAAGATATGAAGGTCCAAAGGGTGGTCCAGGAATGAAAGAAATGCTAT
CTCCTACATCAGCAGTTGCAGGAATGGGACTTGATAAGCATGTAGCACTTCTTACTGATGGTCGTTTTTC
AGGAGCAACTAGAGGAGCATCTATAGGCCATATTTCTCCAGAAGCTATGGAAGGTGGTTTAATCGGACTA
GTTGAAGAAGGAGATATAATTTCTATAAACATACCAGACAAAAAATTAGAGTTAAAAGTAGATGAAGTTG
AAATAGAAAATAGAAAATTAAAATTTAAACCTTTAGAACCGAAAATAAAGCATGGATACTTAAGTAGATA
TGCTAAATTGGTAACATCAGCAAATACAGGAGCAGTTTTAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:2252777-2253457 hypothetical protein CDR20291_1928 [Clostridium difficile R20291]
ATGATATGGACATTTTATTCATTTATTTGCGTTATATTACCATGCTTAATATACCAAATAGTCGTTATAA
AACGAAAAAATTTGAAAGTTGAAAAGAATGTAATGATACATTTAGTATGGGTATATATTTTTTTATTATA
TATCTATCTAGCACTTAGTAAAGCTGGAATTGGTAGCATATGGGATATAGGAAGGTATAGTGGGCTTTTT
AGAATTGATGAAATAAATCTAATACCTTTTGACTCAGTTGGCATCTTAACATATATTTTAAATATAATTA
TGTTTATGCCTTTAGGATTTTTACTACCTTTAATTTGGAAAAATTTTAGAAATATTATCAATGTTTCATT
AACTGGATTAGGTTTTTCATTAGCAATTGAACTTTGTCAATTGTTTAACTTAAGAGCTACAGATATTGAT
GATTTAATGATGAACACATTAGGTGCTGTTTTAGGATATTTTATATGGGTAGGTGTAAATAATTTATTTA
ATCTTATAAAGAAAAAAGATATTTTCCCATCTATATATAAAAATATTATTCAAGATGAAATTGCTATTAC
AATTGATGATGACATAAGCAAAAAAATTACCTCTCTTTACAAAAATGAAGCTATTATATATTTAATACTT
GCTGTTTTAGGAGAATTTTTATTGTTTAATTGGTCCATTATACCTTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2253824-2253567 hypothetical protein CDR20291_1929 [Clostridium difficile R20291]
ATGATAATAATTAGAAGTCAAGATAAAACTAATTTAATGCAGATAAACCAAATTAAAATAGATGGTAGTC
AAGTTTATGCAGTATTTGAAAGTAAAATTGATACTGTAAAAATAGGAGATTATGAAAATAATACAAGAGC
TATACAAGTGTTGGACAATATACAAAACTTCATTGAAAATGGAACAAAATATGATTATATAACATCAAAT
AAAGTCAGATACAATGTTAATAAAATATTTCAGATGCCAGCTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:2254373-2254744 putative phage regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAGTTTAGGAGATAGAATAGCAAATCTACGAAAAGAATTAGATATAAATCAAAAAGAACTTGCTA
CTAAAGTCGGTATAACTGAGGCTAGCTTGTCACGTTATGAAAATAATTTAAGAGAACCTAAAAGTGAAAT
AATAGTTAGATTAGCAAAAGCATTAGAAACATCAACAGATTATTTATTAGGCGTAAATGATAATACAAAA
ATAAGCAAAGAAGATAAATTAATCATAGAGAACTTATCAGTAAGTGAAAAAACAAAAAAGCTCTTAGAAA
AAATATATTCTCTTGAAAAAGAAGATAGAGAAGCTATAGAAAAAATGATTGATAATGCCTATTTAAAAAG
ATTCCTTAAAGAAGAGAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2256442-2255546 AraC-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGGATAAAAATACATATTTTAATAGGAAAGGTCAAGAAAACTTTATAGATATTTTTTTAAAGGATG
ACATTAAAAAAGGAGCAAACTTTAAAAGACATTGGCATGAGCATCTACAAATATATTATTTTATTGATGG
TATAGCATATCTTGAATGTGGATTGGATAATTTTAAGGTAGTGCCTGGAAATATTGTAATAGCAAACAGT
AATGAATTACATTATTTAGAAAGCTTATCAGATAATTTAAAATTCTATAGTATTCGTATTGAGCCCACAT
TCCTTTTTAGTAATCAAGTTGATTTGTTACAAACTAAGTACTTAGCACCATTGGCTTTAAATCATATTGT
ATTTAATAATTTAATTCAAAATGATTTTCTGATTTTAAAATGTATTACAACTATACTTGATGAATATCAC
AATAAAGAAGTTGGATATGAGTTATCTATAAAAGCTAATATCTATCAATTAATAGTACTCTTATTAAGAA
GTCATATTGATAAAATATATTCTGAAGATGAATTTATAAAAAGAAAGTATTCTTTAGAAAAATTTGAATG
TATCTTTGACTTGATAGAAGAAAAATATATGGATAAAATTACATTAAAAGAACTTGCTAGTCGTGTGAAC
TTGAGTGCACATCACTTTTGTAGAACATTTAAGCAAATAACAGGTAAGACTACAATCGATTTTATAAATG
GAATCAGGCTTGATAAAGCTATATATTATTTAAAGGAAACAGATTTAAATATGACAGAAATTGCTATGAG
ATGTGGCTTTGATAGCATAAATTATTTTAGTCGCTTATTTAAAAGGAATTATAATATATCTCCAACTAAG
TATAGAAATGAACATAGAGAAGTTAGTAATGTTATTTTAAAAGAAGATATGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2256584-2258011 putative transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGACAAACTCTTTTAAAAAAGATGATAATAGAAAAAAAATCACAGTTTTATTTGTAGTCATTGCCATGA
CTTTTATGGCAACATTAGATTCGAGTATTATAAATGTTGCTCTCCCAGTTCTTGCAAGCAAACTAAATGT
ATCTCTAGCATCTATTGAATGGGTAATAGCAAGTTACTCAATTATTATTTGTTCAACACTATTATTTTTT
GGAAGACTTGGAGATATTATTGGTAAATCAAGAGTATTCCAAGTAGGTACTATTCTCTTTACATCAGCTT
CATTACTATGTGGATTAAGTAATTCTTTAACTTTACTTATAGTTTGCCGCTTTATTCAAGGAATAGGCGC
TTCTGCCTACATGGCAAACAATCATGGAATTATCACAGAACTATTTCCAAAAGAAAGCAGAGGAAAAGCC
CTAGGGATTCTAGTTACTGCAGTTGCTATTGGAAATATGGTTGGACCATCTGTGGGAGGATTTATTTTGT
CAATATTTGATTGGAATGTTATATTTTTTATAAATATTCCAATCGGTCTTATTGTAATCTTTTTAAATAC
AAAATTTCTTCCTAATAGTAAAAAATCTTCAGAAAATATGGATAAAACTGGTGCTATACTTCAATTTTTA
GGAACAACATTATTTTTTAGTGCTCTAATTAGTGCTCAACAAACAGGATTACTAAATCCATATATATTAA
TTGCACTATTATTATCAATTATTTTTATTATATTATTTTTGATATTAGAAAAAAAACATCCTCAACCGCT
TCTTGATCTTGAAATTTTTAGAAATTTTAAATTTTCATTGAATTTAATTTGTGCTCTTACATCATTCATT
TGTATTGCATCATCAAGTATTTTAATTCCATTTTACTTACAAAGTACTATGAAACTTCCCCCTATTCAAG
CAGGTTTATTTATGATACTATCACCTTTGATTTTAGCCATTTTTTCACCTATATTTGGGAATATATCAGA
TAAAATCAAGTCAGAAAAAATTATTTTAATTGGTCTTCTCGTTATGAGTTTTGGATTCTTTCTAATGTCA
AGATTGAAAGAAAGTTCTGCCCTTATTTTATTTGTAATTTATATATCGATAATATCAATAGGACAAGCTA
TATTTCAACCTGCTAACAATGCTTTGATAATGTCAAGCTGTTCTAGAAGTAAGCTAGGAGTTGTAGGAAG
CATAAATTCCCTTGTAAGAAATTTAGGACAAGTTATAGGTATTACTATTTCTACAACACTTTTATATAAT
TTTATGAGTATTAAAGCTGGATATAGGGTCAATGATTATGTGATTAATAATGATAAAATATTTGTATTTG
GAATGAGAAATGTTTATATTATTGTTACACTTGTTTGCTTAATAGGTGCAATATTAATTGGCTTTTATTT
ATTTAAATATAATAAAAATGAACAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c2260802-2258208 chaperone [Clostridium difficile R20291]
ATGGACGTAGAAAAAATGACTTTAAGAGTTCAAAAAAGTTTAAATGAGGCTTATAACGAAGCAGTAAAAA
ATCATAACCAACAAGTAGATGTAATTCATCTTTTCTCAGCACTTATTAATCAAGAGGATGGATTGATACC
AAATATAATCGAAAAAATGAATATATCAATTGATTCTTTGAGAAATACTGTAAACTTTGAAATTGATAAG
CTTCCAAAAGTATATGGAGAAGGTGCTGACTCACAAGGAGTATCAGCTACTAGAAAAATAAATGAGGTGC
TTATAAAGGCAGAGAGTATTTCTAAAGAATTTAAAGATTCATATATAAGTGTAGAGCATGTTATGCTTGC
AATGATGGAAACAGAATCAAAATCAGCTGTTGGTAAAATATTAAAACAATATAATATAAATAAGAATGAC
TTTTTAAATATTTTATCACAAGTGAGAGGTAGTCAAAGAGTAGAAACACAAGACCCAGAAGGCACATATG
ATGCACTTGCTAGATATGGAACAAACTTAGTAGATTTAGCCAAGAAAAATAAATTAGACCCTGTAATTGG
GAGAGATGAAGAAATAAGAAGGATTATAAGAATTTTATCAAGAAGAACAAAAAATAATCCTGTATTGATT
GGTGAGCCAGGTGTAGGTAAAACTGCAATTGTAGAAGGGTTAGCAGAGAGAATAGTAAGAGGAGATGTCC
CAGAAGGTTTAAAAGATAAGATTGTATTCTCACTTGATATGGGAGCTTTAATTGCTGGTGCAAAATATAG
AGGTGAATTTGAAGAAAGATTAAAGGCAGTTTTAAAAGAAGTTCAAAGTTCTGATGGAAAGATTATACTG
TTTATAGATGAGATTCATACTATCGTTGGAGCTGGTAAAACAGAAGGTTCAATGGATGCAGGTAATCTTA
TTAAACCTATGCTTGCAAGAGGTGAATTGAACTGTATTGGTGCAACTACTTTTGATGAATATAGAAAGTA
TATAGAAAAAGATAAGGCTCTTGAAAGACGTTTTCAGCCTGTAATTGCAGAAGAACCTACTGTTGAAGAC
ACAATATCTATACTTAGAGGTTTAAAAGAAAGATTTGAGATACATCATGGAGTAAGAATACATGATAATG
CTATTGTAGCAGCAGCAAAACTTTCTCATAGATATATACAAGATAGATTTTTACCAGATAAAGCAATTGA
TTTAATTGATGAAGCTGGAGCTATGATTCGTAGTGAAATAGATTCATTGCCAACAGAATTAGATGTTGTT
AGAAGAAAGTTATTTACATTAGAAACTGAAAGAGAAGCATTACTTAAAGAAAATGATGATAAAAGCAAAT
CAAGATTGGATGATATTCAAAAAGAAATAGCAGAGTTAAAATCTAAAAATGATGAAATGACAGCAAAATA
TGAAAAAGAAAAGAGTCAAATATTAGATATTAAAAACTTAAAGGCTCAATTAGACGAAGCTAAAGGTAAA
GCTGAAAAGTATGAAAGAGAATATGATTTCAACAAAGCAGCAGAGGTTAAATATGGTGAAATACCTAAGT
TAGAAGAACAAATAAAGCAGTACGAAGAAAATATGAATGATGGTTCTGAAAATTCTCTTTTAAAAGAAGA
AGTTACTGAAGAAGAAATATCTAGCATTGTATCAAAGTGGACAGGTATACCAGTAACTAAACTAGTTGAA
GGAGAAAGAGAAAAATTACTTAAACTAGAAGATGAACTTCATAAAAGAGTTATTGGACAAGATGAAGCAG
TTACAGCAGTTTCAAATGCAGTAATACGTGCAAGAGCAGGATTAAAAGATGAAAGAAAACCAATTGGTTC
ATTTATTTTCTTAGGCCCTACAGGTGTTGGTAAAACTGAACTTGCAAAAACTCTTGCTAGAAATTTATTC
GATAGTGACGATAATATAATAAGAATAGATATGTCTGAATACATGGAAAAACATGCTGTATCAAGACTAG
TTGGACCTCCTCCAGGGTACGTGGGATATGAAGAGGGTGGTCAACTTACAGAAGCAGTTAGACGTGCTCC
TTATTCTGTAATACTATTTGATGAGATAGAAAAAGCACATGAGGATGTATTTAACATGTTCTTACAGATA
TTAGATGATGGTAGACTTACTGATAATAAAGGTAAGACAGTAGACTTTAAAAATACTCTTATAATAATGA
CTTCTAATATAGGAAGTAATTATCTATTAGAAGCAGGAGGAAATATAACAGAGACTACTAACAATTTAGT
AATGAATGAAATGAAGCATAGATTTAAACCTGAGTTTTTAAACAGAGTAGATGATATTATAATGTTTAAG
CCTTTAGACCAAGAAAATATCAAGAAAATTATAGATATATTTATGAAAGATTTAAAAAATAGATTAAAAG
AAAAAGATATTACTATTGAAGTTACAAATTCAGCAAAAGATGTTATGGTGAGAGAAGGATATGACCCTGT
ATATGGAGCAAGACCTCTTAAGAGATATATAGGAAATACATTAGAAACTATAATTGCAAAGAAACTTATT
GCTGGAGATGTGTATAATGGATGTACTATAGTTATAGATGGAAAAGATGAAAATATTGAAGTTTTAGTTA
AATAA
>ref|NC_013316.1|:c2261435-2260839 hypothetical protein CDR20291_1934 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTTAAAACTTGATAGAAATGTTCTACAGTGGTTTGACTATGTATTTGAGAATGAAAAAACTAGTT
TGAGACACTATAATTTTAATTGTACACTAAAGGAGATTAGTTCTACCAGTTTGAACAAAGTAGCTTTTAT
TTTAGAAAAAAATAACTCTAAGTACTGGAAGCTTTATTTTGAAATACCAGCTGAAGTTACTTTAAAACTT
AAGCAAAACATTCATCCTTTATTTAGGGAATATATATACGAACAAATATCACTGTATAACAATAATCAAA
TTTACAATTTTGTAAATTCAAACATATTAAAAGTGTTTAATAATATTGCTATTTATCAATATAATATTTT
AGAAAATCTATACACTATTGATTTTAAAAAGAGTTTTATAGATAAATGTCAGTATTTATTAATAGGTGAA
AAAAGACTTATAGATGAAGACTTGTATTTAATAGCAAAATCAAAAGAAGTATTCGATTTTTTTAATTCAG
ATGGAACATTTAATTTAACATTGAGTTTCGATATACAAAAAAACGAGAATTTACTTGATAGTCTTTTAGA
GCTTAGAAAATCAATAATTATAAATGAGAGAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2261856-2261452 hypothetical protein CDR20291_1935 [Clostridium difficile R20291]
TTGGATAAGACATTAAAAAAGGATTTAAATCAGGAATATACAGAGAGCAAAAGTTTAGTTATGAATAAAA
GTAAGTATATGAATATTTGTTTTAAGAATTATATTAAAGTAGTAGAAGGAATGTATACTAAGAGGGATTT
AATTCCATTAAAATTAATAAACTCTATGGATAAAAATAATAAGATTAGAAAAACATTATATGAATTATCT
TGTGAATTTGAATATCCAAAAACTTCTTTATCTTCATTGTTTACGGAGTTGAAAAAAATGGATTTTTTAC
AAAGAGTGAAAAATGGTGAGTATATGATAAATCCACATATAGCATATAAAGGTAGTAGAGCTGATAAAGA
AAGTTTATTAGCAGAATATAATCAGATAAAAAGACCTAATAAGGTTAGTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2262222-2262596 GntR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
TTGAATATAGTTATTAGTAATTCGAGTGGGAAGCCAATATATGAACAGATTACTACACAAATTAAAAGTA
TGATTATAAGCGGAGAGTTACCAGAAGGCTCAGCTCTTCCAAGTATGAGACTATTGGCAAAGGAACTTAG
AATAAGTGTAATTACTACAAAACGAGCATATAGCGATTTAGAACGAGACGGATTTATTGAGACAGTTACT
GGTAAAGGCAGTTTTGTATCTAGTAAAAACATGGATTTTGTCAAAGAAGAACAATTTCGTTTAATTGAAG
AATACCTACAAAAAGCAGTTGATACAGCAAAAAGTAGTGATATTACATATGACGAATTAAAAGATATTTT
ATTTTTATTATATAAAGGAGAATGA
>ref|NC_013316.1|:2262593-2263456 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAGTATGGATGCAATAACTATAAAAAATTTAAATAAAACTTATAAAGATTTTAGCCTACAAGATA
TATCTTTTTCAGTACCAAAAGGGAGTGTAATGGGATTTGTAGGTGAAAATGGTGCAGGAAAAACAACTAC
ATTAAAAGCAATTTTAAATTTAATATCTTATGATAGTGGAAATATAGAAATATTTGGTCTTGATAGTAAA
AAAAATGAAAAAGAAATTAAAGAGCAAATTGGGGTTGTATTTGAGGGAAGCAACTTTCATGAAAATTTAA
ACACTGACCATGTTTCAAAAATCATGAGTAAAATCTATAAAAATTGGAATGACACATTATTTAAAGACTA
CTTAAAAAAATTGAGAGTACCAGACAATAAATTAATTAAGGAGTTTTCAAAGGGGAATAAGATGAAACTT
AGTATTGCTGTAGCCTTATCTCATAAACCAAAATTATTAATACTAGATGAGGCAACTAGTTCACTTGACC
CTATCGTTCGTGAAGAAATACTAGATATATTTTTAGATTTTATACAAGATGAAGAACACTCTATTATCTT
ATCTTCACATATTACAAGTGATTTAGATAAGATAGCAGACTATATTACATTTATACATAAAGGAAAAATT
GTATTTAGTGAAAATAAGGATGAATTAATTGATACTATGGGAGTTTTAAAATGTAAACCTAGTGATTTTG
ATAACCTTTCAAGAGAGGATTATTCATATTATCGTAAAAGCCAATTTGGATATGAAGTACTTCTTAAAGA
TAAACATAGATTTATATCAAGAAATCCAAATTGTATTGTTGATAATACGTCTATAGAAGAAATTATGTTA
TTTTATGTGAGAGGTGATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2263456-2264094 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGGTTTAATTTTAAAAGATTTACTTAATTTGAAAGGAAATGTAAAGTTTATACTTTTATTCATCA
TTATGTTTGGGTTTATGTCTTCTTTAGGAGATGGAAATGTTAATAACTTTATAGGTGTTATTATAGTTTT
ATGTACTACAATGATTGTTTCAACATTTTCATATGATGATTTAAATAAATGGGATAGTTATGTACTTACA
ATGCCTATTAATCGCAATGATATTGTATTAAGTAAATATTTAACTATGTTAATATTTAGCTTTATAGGTG
TTCTTGTTTCACTTATTGTTAGTGTAACTATTGGTTATTTTAAAAATACACTTATATTAAATGAAACACT
ACTTATTAATGCACTAATCTTATCAATTTCAGTATGTTTTGGTAGCCTTATTCTACCACTTATTTATAAA
TTTGGTACAGAAAGAGCTCGTTTATTAATGATTTTATGCTTTTTAGTTCCAACACTAGCTTTATTAGTTT
TTAAAAGTATTTTAGAAAATATTAGTTCACCTATTTCTATAGAAATTATACTTAATACACTAGTATATTC
TCTTCCATTTGTTGCTATTTTACTATTTGTGATTTCATATTTTATATCATCAAAAATCTATAGTAAAAAA
GAAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:2264588-2265001 putative acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATTAGAAATTACAGAAAAAATAGAAAAACAAGATGAAGATACTATTTTTCAAGGATTATTAAAAT
ATAATCTTGCTAGACTTGAAGATAAAAACCCAGTGGATTTAGGAATATATATTCGAGATAAAGCAGGTAA
AATTGTTGCAGGTTTTATAGGTGTTACTCATGGTAATTGGCTTTCTATAAAATACTTATGGGTTAGTGAG
AAGCTTAGATATAAAGGTACTGGAAGTCAACTTTTATATAAGACTGAAAAAATTGCTAAAGAACGAGGTT
GTAAATATGTTTTTTTAGATACATTCAGTTTTCAAGCACCTAAATTTTATGAGAAATTTGGATACCATAA
AGTATTTTCACTTGAAAATTATCCTCTAACTGGAAAGAGATATTATTATAGAAAAATACTATAA
>ref|NC_013316.1|:2265192-2266409 N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAGGAAAAAAATGTATGGATTATCTACAAACATTAGGAAAAATAAGTTCAACAACAAATGGTCTTA
CAAGACTTATCTTGACTCAAGAACATAAAAAATCTATTGATTTAATTAGTTCATGGATGGAAGGTTTAAA
TCTTGATATTGAAATTGATGACATTGGAAACGTTATAGGTACATATAAATCAAGCTTTCCAAATGCTCCC
ACATTAGTAGTTGCATCTCATCAAGATAGTGTAAAGTGTGGAGGTATATTTGATGGTATGTTAGGTATAA
TAGTGCCTCTAGTTGGTCTTGAAGAAGCAAAACACAATAATAGGTCTTATCCTTTCAATATTAAGCTAAT
TGCTTTCGCTGAAGAGGAAGGAACTAGATTTGAAACTTCTTTAATGGGAAGTAAAGTTTTTGCTGGTACT
TTTAAAGAGGAACTTCTTAAATCTGTTGATGAAAATGGAATTACACTTGAAGAAGCTGTAACAAAGTTTG
GATTTAATACAAAAAACTTAACAAATTTGCATCCTAGAAAAGATGTAGATGCATATTTAGAATTTCATAT
CGAGCAGGGTCCTGTTTTAGAAAATGAATCTCTTCCTGCTGGAATTGTATCAAGTATTACAGGATTTAAA
AGTTTTAAGATATCAGTAAATGGTAAGTCTGGACATGCTGGTACACTTCCAATGAATATGAGACTTGATG
CTGGATGTTGTGCCTGTGAATGTGTATTAGCTATCGAAAAAGTAGCTAAAACGACTGCTGATTTGGTTGC
TACTGTAGGAAAGATGAATTTCTATCCATCTTCATCAAATGTGGTACCTGAAAGAGCTGAATTTACACTC
GATGTACGCTCTTGTTCACAAGAAATTCTTGATAATTCTGTAGAAAAGATATTTAATGAAATATCACATA
TATGTGAAAATAGAAAACTTAATTATACAAGTGAACTTGCTTTTGAAAATGTTCCTGTACCATGTTCTAA
TAAAATAACAAAAATCATAGAAAAAAGTTTTATAGATTTAAATCTTAATCCTTTTTATATTTATAGTGGT
GCTGGCCATGATGCTCAGGAAATGGATAATATAACTGATATTGGTATGGTATTTATAAGATGTGCTGGGG
GCGTAAGTCATAATCCTAATGAAAGTGTTTCTGTAGATGACTTGGATACTGCTGTAAAAATATTTTTAAA
AATACTAGATAATCTTGATTTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2266571-2267269 putative amino acid racemase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGAAAAATTAATTGGTATTTTGGCTGGAATGGGTCCAAGGTCAACAGCCCCTTTTGTTGATTTAA
TTATTGATGAGTGTCAATCTCAATATGGAGCAAAATATGATGATGAATTTCCAAAGATGATGATATATTC
ATTACCTACCCCATTTTATATTGACCGTCCAATAAATCATGAACTTATGAAAGAAACTATAATTGATGGA
TTACAAAAGCTTGAATCAACTGGTGTAAATTTTATTGCAATGCCATGCAATTCAGCACATATATACTTTA
AAGAATTAAAAGAGTCTATTAATATACCAATATTAAATATTGTAGAAGAAACAGTTAAAAAATTACCTAC
TATCTCACAAAAAGTAACTCTTTTTTCGACTAGTTCAACTTTTGAGTCTACAATTTACCAGAATGGTATA
ATACATAATGGACATGAATTTATATTTAAAGATGAATGGCAAATAAAATTAAACAATCTTATTCAAAATA
TAAAAATGGATAAAGAAAATCCACACAATATTGATATTTGGAATAAACTTATCGAAGATGTTAAAAATGA
ATCTATAGAAAATATAGTAATTGCTTGTACTGATTTAAATGTAGTTTTAGAAAAATCATATCCTTCAATA
AATATTGTTGATTCATCAAAATGCTTGGCTGAATCAGTTGTCAATAAATATCTAAAATTAGTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2268106-2267489 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAATCATATTAGCTTTAACAACTTTTTTATTAGCAATATCTTTAACAGCATGTTCAAGTGCAA
AACCAGAAGATACAATTGATAGTTTTTTTAACAGTGCGAAAAAGTTTGACTTTGAAGGCATGAATAAGGT
AATGGAAAATAATGACGAAAAATATAAGGATATATTAAAGGAATTAGATACAAAAGACCCAAATGCCCAA
TATGTTTTAGATTATCTAAAACAGAATGCATCTAAAATCACGTATACAATAAAAGACAGCGAGGTTAAAG
GTGATAAGGCTACAATCAAAGTAGAATGTAAATTTATAGATTCAACACCATTACTTCAAGAAATAGTAGC
TGAGGCATTTACAAAGATGATTGGTATGAGTTTTTCAGGACAAGACTTAACTGATGAGAAAACAACTGAA
ATGTTAGTATCAATTATGAAAGAAAAACAAAAAAGCGTTAAAGAGACTTATGTTACAAAAACTGTAGAGT
TTGAATGTTCTAAAAAGGATAATAAATGGATAATAAGTTCAGTAAATGATGCAGTAGCTGATGTATTGTT
ATCTAATCTTGTTACAGCAGGACAAGAATTTTCTAACTCTATGAATACACTTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2269255-2268233 ornithine carbamoyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATATAAGTTTAAAAGGTAAGAGTTTTTTGACATTAAAGGATTTTACAAAAGAAGAGATTAGAT
ATTTATTAACTTTATCAAGTTATTTAAAAACTAAGAAAAAAGTTGGCATAAAAGGCGATTTGCTACAAGG
AAAAAATATAGCTTTATTATTTGAGAAAACATCAACAAGAACTAGATGTTCATTTGAAGTAGCAGCTCAT
GATGAAGGAGCATATGTAACTTATCTAGGTCCAAATGATTGTCATATGGGTAAAAAAGAGTCTGTATCAG
ATACAGCAAAAGTTCTAGGAAGATTCTATGATGGAATAGAATTTAGAGGCTTTAAACAAGAAACAGTTGA
AAGTCTAGCAAAATATTCTGGTGTACCTGTTTGGAATGGACTTACAGATGAATATCATCCAACACAAATA
CTGGCAGATTTTTTAACAGTAATTGAAAATGTAGATAAAGATTTGAATAAAGTTAAATTTGTATATGTTG
GTGATGCTAGAAATAATATGGGAAACTCACTGATGATAGGATGTGCTAAAATGGGAATACATTTCGTAGC
ACTAGCACCTAAGGAACTTTGGCCAAATGAAGAATTGGTTAAGGAAATGAAGGAAATAGCCAAGAAATCC
AAAGGAGATATAATGTTGACTGAAAATATTGATGATGTTAAAGGTGCAGATGTTATATATACAGATGTAT
GGGTTTCTATGGGAGAAGAGGAGCAATATGAAGCAAGAATAAATCAACTTAAAGATTATCAAGTAAATAT
GGATATGATAAAGAAAACTGAAAATGAAAATGTTATATTTTTACACTGTCTTCCAGCATTTCATGATTTA
GAAACTAAGGTTGCTCAGAAGATTTATGAAAAGTTCGGATTATCAGAATTAGAGGTTACAAACGAGGTAT
TTAATTCAAAATATTCAAAGGTATTTGAAGAAGCTGAAAATAGAATGCATACAATAAAAGCTGTTATGGT
TTCTACTATGACTGATGTAAATATGAACAATAATTTAATATAG
>ref|NC_013316.1|:c2270551-2269364 succinylornithine transaminase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAACAACAATACAATTTCAAAATGGAATGAATATTTTATAGATACATATAACCAACCCAATTTTG
TCATAGATTATGGTGAAGGAAGTTGTTTTTTTGATACTAATGGCAATAAATACATAGATTTTACAAGTGG
ATATGGAGTATCTTCTCTTGGGTATAGTAATAGTAATTTAAAGAATGCTCTAAAAGAGCAAGTAGATAAA
TTATTACATACTTCAAATTTATATTTTAATGAGCCAGTGTTGTATTCAGGAGAGAAAATAATTAATTCAA
GTGGAATGGCTAAAGTATATTTTTGTAATTCTGGAACAGAAGCAAATGAAACAGCATTCAAAATAGCAAG
AAAGTATAGTAGTGACAAATATGGTAATGGTAGAGGAACTATCATAAGTTTAAAAGACTCTTTTCATGGT
AGAACAATGATGTCTTTAATGGCAACTGGTATGGACAAATACCATAAGTATTTTTATCCTCTTCCCGAAG
GTTTTAAATATATAGAAAGAAATAATATTGAAGATTTAAAAAATAATCTTGATTCCACAGTTTGTGCAAT
AATTCTTGAAGCGATTCAAGGCGAAGGTGGAGTTAATGTTCTTGAAAAAGATTATGTTTTGGAAATAGTA
AAAATATGTCAAGAAAAGGATATTGTAGTGATTTTTGATGAAGTCCAATGCGGTATAGGAAGAACTGGTA
AACTTTTTGGCTATGAATATTTTGATGTAAAACCAGATATAGTTACCGTAGCAAAAGGGTTGGGAGCAGG
AATACCAGTAGGAGGAGTATTGGTAAATAAAAAACTTTCAAAAGTACTAGGAAAAGGAGACCAAGGTACA
ACTTTTGGAGGTAATTTATTAGCTATGGTGGCAGCTTCAGTTGTATTAGATGAGATATCTAAAGATGGTT
TTTATAATGAAGTATTAGAAAAAGGAAATTATATAAGAAAATCTATTGAAAGTTTTAATAATAAAGTTGT
ATTAAAGACAAAAGGTATTGGTCTAATGATAGGAATTGAAACTAATATTGAATCTAGTATTATAGAAGAG
AAAGCTAGAAAAAAAGGATTGCTTATTTTGACTGCTGGAAAAAATGTATTGAGATTTTTACCACCATTAA
CAATCAGTTATAAGGAAATAGATGAGGCTCTTGAAATCCTAAAAGATATATTACTAGAGATTAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c2271441-2270581 acetylglutamate kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTAATATAGAAAAAGCAAATACACTTATAGAAGCTTTACCATATATAGAAAAACATCAGGGAAAGA
CTATTGTAGTTAAGTATGGTGGAAGTGCAATGAAAAAAGATGGTCTAAAAGAATCTGTTATGGAAGACCT
TGTATTAATGAGTTATGTTGGAATCAATATAGTTTTAGTACATGGTGGAGGGGCAGAAATCAATAAGATG
CTAGCAAAAGTGGATATAGAAAGTAAATTTGTAAATGGTCTTAGATATACAGATGAAGAGACCATGGAAA
TTGTAAAAATGGTACTTGCTGGAAAGGTTAATAAAGACCTAGTAAATAAAATACATACAAAAGGTGGAAA
AGCAGTAGGGCTTTGTGGAATGGATAATAATATGATTTTATGTGACCCATATAAAAATTATGAACTTGGA
TTTGTAGGAGAAATCAAAAAAGTAAATGTTGAGCTTATAGAATCTTGTCTAAAGTCAGGTTATATTTCAG
TAATTGCAACTATAGGTGTTGGAGATGATGGAGAGACTTATAATATAAATGGTGACACAGCAGCTTCTGC
TATAGCTAAAGAGTTAAATGCAGATAAATTGATACTTCTTACAGATGTCCCTGGTTTGTTAAGAGAGCCA
GATGAAGAAAAATCATTAATAACAGAAGTTATATTAGAGGATGTTGATAAATTATTTGAAGAAGGTATAA
TTACTGGAGGTATGATACCTAAAATAGAGGGATGCGTAGATGCCTTAAATAACGGAGTAAATAGGGTACA
TATTTTGGATGGAAGAGTTCCACATTCTATAATAACAGAGCTATTTACTGATAGTGGAATAGGTACATTA
ATAAGAAAAGAAAATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2272673-2271456 arginine biosynthesis bifunctional protein ArgJ [includes: glutamate N-acetyltransferase and amino-acid acetyltransferase] [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGATTATAAAGGGTGGAGTTACAGTTTCAGAAGGATTTTTTGCTTCAGGGATTCACTGTGGCTTGA
GAAAAAATAAAGAAAAAAGAGATTTAGCTTTGGTTTATTCAGATGTTTTATGTGATGCAGCAGCAGTAGT
AACTCAAAATAAAGTAAAGGGCAATCCTGTTTATGTTACACAGGAACACATTAAAAATGGAAAAGCACAA
GCTATCATAGTAAATAGTGCTAATGCTAATACCTTTAATGGAAAAGAAGGACTTATAAATGCTTATAAAA
TGGCTAAATTCACTAGTGATAAATTAAATATTAAAGAAAATGATGTTTTGGTTGCATCTACAGGTGTCAT
AGGAAAGCCATTAAATATAAATTTAATAGAAGAAAATATGGATGAATTAGTGAATAATCTAAGTAAACAA
GGTCATATTGGAGCAAGAGAAGCTATTATGACAACTGATATTATAAAAAAAGAAATAGCAGTAGCAATAA
TGTATGGAGATAAAAAAATAACTATTGGAGGTATGGCAAAAGGTTCTGGCATGATACATCCTAATATGGC
AACAACGTTAGGATTTATAACTACAGATGCAAATATTGATGGAGTTTTGCTAAAAGAAGCTTTGAAAATT
GCTGTTGATAAAAGTTTTAATAGAGTTAGTGTAGATGGAGATACAAGTACTAATGATATGGTGATGATTC
TAGCAAATGGAAAAGCAAAAAATGATAGAATAAACAAAAAAGATGAACATTATCAAGTATTTTTGAGTGC
ACTTACATATGTCTGTATAGAACTTGCTAAACTTGTTGCAAAAGATGGAGAAGGATGTACAAAACTAATT
GAATGTTATATAAATGGAGCATTAAGTGAAGAACATGCAGTAAAATTAGCAAAAACAGTTATATCTTCTT
CATTAGTAAAGACAGCTGTATTTGGAGCTGACGCAAATTGGGGTAGAATACTGTGTGCTTTAGGTTATGC
AGGTGAAGAAATAGATATGGAAAAAGTTGATATTATTTTTGAGAGTATGAAAGGATATATTGAAGTATGT
AAAAATGGAAATGGATTAGATTTTAATGAGGAAAAAGCAAAAAAAATCCTTGAAGATGACGAAATAAGTA
TATTAGTAGATTTAAATATGGGCAATGCCAGAGGAAATGCATGGGGATGTGATTTAAGCTATGATTATGT
AAGAATAAATGGAAGTTATAGAAATTAG
>ref|NC_013316.1|:c2273749-2272715 N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase [Clostridium difficile R20291]
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TGAATCATGATAAAGTCGAAGTGACAGCAATAGGTTCAAATTCGTATGTTGGAAAAAATATAGTTGATAT
ATATCCAAGTATAGGATATAAAAATAACATGATATGTATAGAAAATGAAAAAGTTATAGATATGTGTGAT
GTTGTGTTTACAGCCCTTCCACATGGAGTTAGTGAAAAGTTTGTAATAAAAGCAATTAAATCGAAAAAGA
AAGTTATAGATTTAGGTGCTGACTTTAGAATAAAAGATGAAGAAGTATATAGTAAATGGTATGGAGTATC
TTTTATAGATAAAATCTTACATAAAAAAGCTGTATATGGATTAAGTGAAATATACAAAGAAGATATAAAA
GATGCAGATATAATTGCAAATCCTGGATGTTATCCAACTAGTATTTCTTTACCATTGATGCCATTACTAA
GTTCTAAATTGATAAAAAATAATAATATAATAATTGATTCTAAATCAGGTCTTACAGGTGCTGGTAGAGA
ATTATCGATTAGTAGTCACTTTACGGAGGTTAATGAAAATATCACTGCATATAAAATAGGGAAACACAGA
CATACTCCAGAAATAGAACAAAATTTAAGTGAATCCTGCAAAGAAAAAGTAAGTGTAGTTTTTACACCAA
ACTTAATACCAGTAAATAGGGGAATCTTATCAACTATATATTGTACAAAAGAAGATAATATTTCTATAAA
TGATATACATAGAAAATTAACTGATTATTATGAATTTAAAGAATTTATAGAAGTTCTCCCATTAGATAAG
GTAGCTTCTTTAAAGAATGTTAGGTTCTCAAATAAATGTGTCATATCATTACATGAAAATGGAGATACAT
TGATAATCTGTTCAGCTATAGATAATATGATTAAGGGAGCAGCAGGTCAAGCTATACAAAACATGAATAT
AATATTTGGTATTGAAGAAAATACAGGTTTAAAAAATATTGCACCATCATTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2275203-2274439 hypothetical protein CDR20291_1948 [Clostridium difficile R20291]
ATGCAGATTATAGATATAAATATAAATAATATTGACAGTAGACATATATGCTGTTCAATTTCTGAAAAAA
AAGGAGAAAATTGTGTTTTTTCTAAAAAAGCTTGGATGAAAAATAATTTTGATAAAGGTCTAGCCTTTAA
ACGATTTGATGTAAGAGGTAAAGCTTTTATAGAATATATTCCAGCAGAAAATGCATGGTGTCCTATTACT
GCGGACAATTATATATTTATTAACTGTTTTTGGATATCTGGAAAATTTAAGGGTCAAGGATATTCTAATC
TATTGCTACAAGAGTGTGTTGATGATGCAAAATCAAAAGGTAAATATGGATTAGTTGTGCTTTCGTCTAG
TAAAAAAATGCCTTTTTTATCTGATGCTAAATATCTAAAATATAAGGGCTTTTGTTTAGCAGATACATCA
GAACCAAATTATGAGCTATTATATTTTCCCTTTACTGATAATGCTCCTATTCCATGTTTTAAGAATTGTG
TAAAAAAAAGAAAATTAAATGAGAACGGTATAGTTTTATATTACAGTAATCAGTGTCCACATACAGAAAA
ATATGCTCCTATTTTGAAAAAAATTGCAAATTCTAGAGGTATTGATGTAAATCTTATAAAATTCGAAACA
GCAAAAGAAGCACAAAATGCTCCTGCACCATTTACTACATACAGTCTTTTTTTTAATGGTGAATTTGTAA
CCAACGAGATACTTTCTGAGAAAAAGATTGAGAAATTTTTAGATACCAACATTAAAAAAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:2275506-2275979 hypothetical protein CDR20291_1949 [Clostridium difficile R20291]
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ATGTATTTGAAGAATTTGAATCTCCAGATTATTGTGATGAAGGAATTACGACATTTCATCAATTTATAGA
ATATAATTCTATTATTGAAAAAATCAAAGAAAAAACACTCTTCTTTTGGGGTTGTTTTGACTCTAAAAAA
CTTATTGGAGTCTTAGCTATTAGAAATTTAAATCATATATGTATGTTATTTGTAGATAAAAACTATCATA
AACATGGTGTTGCAAAAAAATTAATGACTACAGGCATACAATACTGTATTTGTAATAAATTTAATTTAAC
TGAAATAACTGTAAATTCATCACCTTATGCTGTTGAAGTTTATCATAAATTAGGATTTGAAGATATTGCT
GTTGAGCAAATTGTTGACGGTATACGTTTTACACCTATGAAATTGTTAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c2276905-2276348 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGCGTGTTAGTAGAGAAATAGTTATACAAGCTACATCAGATATAGTTAATAAAGATGGGCTTAACAAAG
TTTCTTTAAAAGTTATTGCAGAAAAGCTAGGAATACGTACACCATCTTTGTACAATCATATAGAAAGTCT
AGATGATTTATTACTTGAAGTAGCTCATAAAGGAATGAGAGAGATGAATAGTCAAATGATAAAGGCGACT
ATTGGAAATTTTGGAGATACAGCTATAAAGTGTATAAGTATAGCATACTTTAATTTTATAATTTCTAATC
CTGGTGTTTATGAAACAATTCAGTGGGCTACTTGGCATGGAAATAATGAAACATTAGAAATCTTTGATGA
ATATAAATCCTTATTAGAAAAACTTATTCTTTCTTGTAATCTAAATACAAAGAATACAGGTGAAGTATTA
AACTTAATAATGAGTGTACTTCATGGTTATTCGACTTTGCAACTTGGGAAATCACTTTTGAGTAAAGAAG
AAGCTATAAAAGGTTTAGCCGATTCTATTGATACTGTGTTATTAGGTATTCATAAAAAATATGATTAA
>ref|NC_013316.1|:2277163-2277861 putative hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAAAAATATTTCGAAATTCATGGAGTTCCTTCAATCCTTTGGGGAAATCCTTCAAGTAAATTAT
ATATTTACATACATGGACAATGCGGCAATAAAGAGGAGGCTGAAGCTTTTGCTAATATTGCAGTTCCACA
TGAGTATCAAGTTTTAAGTGTTGATTTGCCTGAACATGGAGAACGTAAAAGAGAAAAAAATTCATTTAAC
CCATGGCATGTTGTTCCAGAATTAGTATCTATTATGGAATATGCAAAGTGCCACTGGAATCAAATTTCGT
TATATGCAAATAGCATTGGAGCATGGTTTAGTATGTTAAGCTTTGAAAAAGAGAACTTAAGAGAGTGTAT
TTTTGTATCTCCAATTCTAGATATGCAACAGCTCATTTCAAATATGATGCTTTGGGCAAATGTATCAGAA
GAACAGCTTAAACATGAACTAATTATCCCAACTTCATTTGGGCATACTCTTTCATGGGAATATCTACAAT
ATGTAAAACAACATCCTATCACTCAATGGAATGTACCAACAAAAATATTATATGGTAAACATGATGAACT
TACTGAAATCGGTGTTGTAGAGAAATTTGTAGAAAAGTTTAATTGCAACCTTACTATTCTGGAAAATGGC
AAACATTGGTTTAACACACCACAAGAATTAAATTCATTATATGAATGGTTAAATACTTTAGTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2278883-2279350 hypothetical protein CDR20291_1952 [Clostridium difficile R20291]
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CTGGTATAATATTCTTATGTATGATACCTATGTTTTTATATGATTTTAGTTCTGACAAAGTAATCGCTTT
AATTGCAAGAATACTATATTTTTCTGACTACTTTATAGTCATCTTATTCTTGATATTTATAATTAATAGT
ACTAAGTATTCCCCATTCATACTTGAAAATGTAAAAAGGTTTAAAGTAATGGGATGTTGTTTATTGATAA
ACACTATAATTGAATGTGTAATTGGTTATAACTCAAATACTAGTCTTATAATGATATTTGGAGATAATAG
TGGCGGTATCTCACCACTTATGGTTATTTCTTTTATATTTGCACTAATGTGCTTTGTAATTGCAGAAACA
TTTGATAAAGCTATAAAAATAAAAGAAGATAATGATTTAACGATATAG
>ref|NC_013316.1|:2279361-2279576 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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AAATAGATATTACAAATGCAAATTTATCAATTTTAAAAACTGGAAAAGCAAAAGCTATTAGATTTACCAC
TCTAAACGAAATTTGCAAAGCTTTAGACTGTCAGCCAGGTGATATACTTGAATATGTAGAAGATGAAAAT
GATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2280639-2280346 hypothetical protein CDR20291_1954 [Clostridium difficile R20291]
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AAATAAAAAAACAGTTAAAATTGATAGATAATGACCTGTCAGATTTTGGAAGAATATGTATAATAGAAAA
AGAACATTATACGATAAGTGTAAACAGTATAGGTGAAATAAATGTGTATTATGATTTAGAGTACGAAAAT
AAGGTGTATAGAATAGTTTATGAGATTGAAAAGTTATTTAAATCTCAAGTTGGAAGGTTTAGTATATCTA
CATACAGAAATTGA
>ref|NC_013316.1|:c2283127-2282255 RpiR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGAAACAAATGAAATGAAGGACAGTAAACATTTGATATCAAATATACAATCTCAATATACGAGAT
TGAGTAAGGGTCAAAAACTTATAGCACAATACATTTTAAATAATTATGATAAAGTTGCATTTATGACTGC
ATGTAAATTGGGTGAAACCGTAGGAGTAAGTGAGTCTACAGTTGTAAGATTTGCAAATGCATTAGGTTAT
AGTGGATATCCTAAATTACAAGCTGCACTTCAAGAACTCATAAAAAATAAACTAACTACAGTACAAAGAG
TTGAAATGGCACATGATTATTCCGATGATTTTGCAATACTAAACAAAGTTTTAAAAAGTGATATAGATAA
TATAAGGTCTACACTAGAAGAAATTGACGAGAGAGCGTTTAAAGAAGCTTCTAACAAACTTTTAAGAGCG
AGAAAAATATATATACTTGGAATGAGGAGTTCTTTTGTAGTAGCTCAATATTTAGGTTTTTACTTAGATA
TAATACTTGACAATGTTCATATAATTAGAATGGATATGGGAGATGCTTTTGAGCAGATTGTAAGAATAAA
TGAAGAAGATGTAATAGTTGCTATTAGTTTCCCTCGTTATTCTAAGAAATCTTATCAAATTGTCAATTAT
GCTAAAGAAAAAGGAGCCCATGTAATATCATTAACAGATAGCTTATTTGCGCCAGTAGCATCACTTGCAG
ATAACACTCTTCTAGTTAAGAGTAATATGGCTTCATTTGTAGATTCTCTAGTTCCAGCTCTTAGTATTTC
AAATGCCCTTGCTATATCTGTTGGAATGAAGGAAAAAGAAGATATTAAACAGCATTTTGATGATTTAGAG
CAAATTTGGAAAAGATATTCTGTGTATGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2284099-2283521 hypothetical protein CDR20291_1956 [Clostridium difficile R20291]
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AAGGGGACATAGTAATTGATGCTACTATGGGAAATGGGTATGATACAAGGTATCTAGCTGAGAAGGTTGG
AGAAAAGGGCTTTGTATATGCTTTTGATATACAAGAAGAAGCAATAAAGTCTACAAGAAAGAAACTAGAG
AAAGAAGGATATACAGATAGAGTAAAGTTGATATTTGATGGGCATGAAAAAATGAATCAATATATAAAAG
AAGAAGTTTCATGTGTTTTATTTAATTTGGGTTATCTTCCAAGAGCGAAACATTCAATTATAACCAAACC
AGATACAACTTTAAAGGCTATAAAGTTAAGTTTAGAAATGTTAAAAGAAAATGGAGTAATAAGCATTGCC
ATATATACAGGGCATGATGGAGGTCAAGAAGAAAAAGATTGCATATATAACCTTGTCAATAATTTAAATC
AAGATGAATTTAATGTTTTAGAATCTAAGTTTTTAAATCAAGTCAATAACCCACCACAATTGATTTTAAT
TGAAAAGAAAAAAGCATAA
>ref|NC_013316.1|:c2284873-2284157 putative 23S RNA and tRNA pseudouridine synthase [Clostridium difficile R20291]
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AGTAGAATTTGATAATAAAAAAGTAAAACCAAGTGAAAATTATATATATATAGTATTAAATAAACCAGAG
GGATATATAACTACAGTAAAAGACCAATTCAATAGACCCAGTGTAATAGACATACTTAAAGATGTAAGGG
AAAGAGTATATCCAATAGGGAGATTAGATTATGAAACTAGTGGTTTATTAATACTTACTAATGATGGCGA
TTTAACATATAAGCTTACCCATCCAAAGCATGAAATTGATAAAACGTATGTGGCAAGTGTGAAGGGAATT
ATAAGTGATGATGAGATAAGACAATTCGAAACAGGACTAAAAATAGAAGATTACACAACGGCACCTGCCA
AAATAAGGGTAACTAAAGAAAATAAAGAAAAAAATTATTCAGTGTGTGAAATAACTATACATGAGGGTAG
AAATAGACAAGTAAGAAAAATGTGCAAAGCTATAAATCATCCAGTTTTAAATTTAAGAAGGATTTCTGTG
GGGAAAATAGTATTAAAAGACACCAAAGTTGGAGAATATAGATACCTAACAGAAGATGAAATAAAATATT
TAAAATCAATAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2285064-2286149 hypothetical protein CDR20291_1958 [Clostridium difficile R20291]
GTGATTATTATTTTAAAGGAAAATATAAAATATTATTTAATAGTCGTGTTTATTGGAATTTTATTTTTTA
AATTTATTAATACTCCATCAAACTTTATATCTAGTATTGAAGGATTCTTAAAGTTTTTTAGCCCATTTTT
ATTAGCTATTTTACTTGCTTTACTTTTAAATCCACTTGTGATGCTTTTTGAGGTAAAATTCAAAGCACAT
AGACTTTTAGCCATTTTTTTATCTTATATATTTATAGGTTTTATTTTAGCCTTTGCCATTAGGCTATTAA
TTCCATCAATAGCTAATACATTAAATAGATTGATAAATGAAATGCCTATGTATACTGATTATATAGATAG
TTTTATAGAAAAAAATATGTCAAACATAGATTTTCTAAAAACTTTAATTCCTCATATACAACATAGTTTA
GATAATTTATTAAAAGAAGCAAGTAATTTTGTTGGTAAAATTCCTAAAAACTTCTTAATCTATACACTTA
GTATATCTTCTATGCTATTTAATATGACAATGGGATTTATACTATCCATATACATTATATATGACAAAGA
AAAAATTGCATTGGGATTTAAGAGATTTCTATATTCTTCTACTGCTAGAAACAAGGCAGATAACATTATA
GAATTTTTTAGGACTACTCATGATATTTTCTATGATTATTTACTTGGTAGAATATTAGACTCTCTTATTA
TTGGTATAATTGCATTTTTAGGATTTCAATTTGTTATCAGAATAGAAAATGCTTTATTTTTAGCTTCAAT
AATATTCTTAGGTAATATAATTCCCTATTTTGGTCCTTTTATTGGTGCAATCCCTCCAATAGCCATGACT
ATATTATATAGTCCACAAAAAACTATATGGGTCATTGCATTTCTATTTATATTGCAACAATTAGATGGAA
ATTTTATAGAACCAAAAGTTATGGGTAATCAAGTTGGTATAGGAGCTATATGGGTAATATCTGCTATTTT
GGTGGGACAATCTCTATTTGGTTTCATAGGAGTTTTTCTTTCAGTACCAATAGCTGCTGTTGTAAAAACT
TATGTTGATAAATATATAGATAATCGTTTACAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2286981-2286304 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGACAAGGAGGGATTTAATGAGAGGAAGAGTAATTTTATTAATATCGATATTATCTATATTTCTTGTAG
GATGTTCATTTAATAAAAAAGATGAAATAAATTTAGTAGAGCAAGGAAAAACATATTTAGAAAAACATAA
CTATAAAAAAGCTATGGAATCATTATCCTCTGCACTGGAAGAAGATAGTACTAATGAGAATGCAAGAGCT
ATGTATATGCAAGCTATGAGAATGTCAAATATGACGGAGTTTGAAGAATTAAAAAATTATGAGGGTGCAA
TCAAGGAACTTAAACTTATAGAGAAAATCAAAAATGGTTCCTCTGTTATTAAAGAAGAGGCAACTAAAAA
GAAAGAAGAGTTAACTAAATTAGAAAAAGAACAAAACGAAGCAGAGGAACAAAGAAAGAAAAAGGCAAAA
GATACGGCTGGAGAAGATAGGTATAGAGTTGAATCAGATGCAAGGAAATCTTCTTATAGTGGAAGTAGTA
AAAATAATAAATATAGTTCTAAAAATAATGATAAAAAATCAGATAGTAATAAGTCTGACAATAATAACAG
TTCTTCTCAAAATCAAGAAAAGCCAAATAATAGTAATCCAACACCAGCACCAACTCCACAAGATACTACT
GGTGGTTCAGATAGTGGTGGAAATTCTCAAAACTCAAATAATCAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2288472-2287180 diaminopimelate decarboxylase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACTTCATGGAACTATGACTGTAAATAATGATGAATTATATATTGGAGGAGTGAGTTGTTTAGAAC
TTAGTAAAAAATATCAAACTCCACTTTATGTATTTGATGAAGCTTTAGTTAGACAAAATTGTAGAGAATA
TATAGAATATTTTAAGGCTAGAGAGGGAAAAAATAAGGTTGCTTATGCAGGGAAAGCTTTTTTACCTCTT
TACATGTGTAATCTTATAAATGAAGAACAAATGTGTTTAGATGTAGTTTCAGGAGGCGAGTTATATACAG
CTTATAAATCAAATTTTCCTATGGAAAAAGTTTTCTTTCATGGAAACAATAAGACTAAAGAAGAAATAAA
CATGGGATTAGATTTAGGTGTAGGTAAATTTGTAGTGGATAATTTTTATGAATTAGATTTGCTTGAAGCA
TTATGTGAAGATAAAGGTAAAACTCAAGAGATATACTTTAGAATAACTCCTGGTATAGAAGCTCATACAC
ATGATTATATAAAAACTGGACAGATAGATTCTAAATTTGGATTTGCTTTAGTAAATGGAGATTTATTTAG
AGCAATAGAAAAATTAAGTGAATATAAAAATATTAAACTTGTAGGTCTTCACGCTCATATAGGTTCACAA
ATATTTGATGTAGAACCATACATAGATACAGTGGATATAATGATGAACTTGGTAAAAGAAATAAAAGAAA
AATTCAACATACAACTAACAGAAATTGACTTAGGTGGAGGAGTTGGCGTTTATTATAGCGAAGGAGATAA
ACCTAAAACTATAAAAGAGTTTTGTGAAACCATAATCACTAAAGCAGAAACTTCATGTAAAGAGCTTGGA
ATAGAAGTACCTACATTGGTAATAGAACCAGGAAGATCAATAGTTGCAAATGCAGGAAGTACATTGTATA
CAGTAGGTTCTATAAAAGATATAAAAGATGTTAGGGTTTATGTAAGTGTAGATGGAGGTATGACAGATAA
TGTAAGACCTTCGTTGTACCAAGCTAGTTATGAGTGTAGTATTGTGAATAAAATTAATCATGAGGCTATG
AATCATGTAACAATAGCTGGAAAATGTTGTGAGAGTGGAGATATATTAATTGGAGATATAAACATAATGG
ATATTAAAAGTGGAGATATACTTATAACAACATCAACTGGTGCATATGGATATTCAATGTCTTCAAATTA
TAATAAAATACCAAGAGCAGCAGTAGTATCAGTATTTGATGGAAATGATAAGATAATTTGTAAGAGACAA
AGCTATGAGGACTTATTAGCTTTAGAGATATAA
>ref|NC_013316.1|:c2289683-2288490 aspartokinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTATAATTGTTCAAAAATATGGTGGAAGTTCAGTAGCAGATACTGAAAAAATAAAATCAATAGCAG
AAAATATAATAGAACGAAGAAAAGAAAATCCACAAATGGTAATAGTTGTGTCTGCCATGGGAAAATCCAC
TGATGAATATATAACTTTAGCAAAGGAATTGAGTAATGAACCTAGTAAGAGGGAATTAGATGCTTTAATG
TCTACTGGTGAAATGATTTCAGCATCTTTATTATCAATAGCATTAAATGCACTTGGATGTAAAGCTATAA
GTTATAATGCTTATCAGTTAAATATAAAAACGAGTGGTCTTCATGGAAAGTCTCAAATTGATGATATAAA
CGTAAACAGAATTAAAAATAGTTTAGATGAAGGAAATGTCGTGATAGTAACTGGATTTCAGGGAATCAAC
GAAGATGGTGATGTAACCACTCTTGGAAGAGGTGGTTCAGATACGTCTGCTGTAGCTCTTGCGGTTAAAT
TAAATGGAAAATGTGAGATATATACAGATGTTGATGGAATTTATTTTACAGACCCAAGAAAATATTCAAA
GGCTAGTAAACTTGATGAGATTGAATATGAAGAAATGCTTGAGTTAGCGAGTTTAGGAGCACAAGTAATG
CATTCAAGAAGTATAGAGCTTGCACAAAAATATGGTGTTGAAATCTATGTCGGACGTACATGTGGTACAG
AAAAAGGAACATATATAAGAGGGGGAAAAGACATGAAATTAGAGGATAAAGTAATAACAGGATTAGCTAC
TAGTGATGATGACAGTTCTATAACAATAAAAGATTTTAAAGCTGAAAATATATCTAGCTTATTTGAAGAT
ATAGCAACTATAGGTATAAGTGTAGATATGATAAGCCAAACTGCACCTATTTTAGATAAGATAAGTGTAT
CATTTACAGTTCCAAAAGAAGAGTTGGGAGAATGTAAAAAGATAGTATCTAAATATACAGATGAAGAACA
TGTAGTGATTGATAATAATATCACTAAATTTTCTTTAGTAGGTCTTGGTATGAAAAATACTTCTGGAGTT
GCTGCTAAAGTATTTAAGATATTCAATGAAAATGGTATAATGATAAAACTTATAACTACATCAGAGATTC
GTATAACTTGTGCTATAAATTCTGATGATAAGCAAGTAGCTATAGAAAAAATAGCAGAAGTATTTAATAT
ATAA
>ref|NC_013316.1|:c2290661-2290044 hypothetical protein CDR20291_1962 [Clostridium difficile R20291]
ATGACGAATATGGAAAAAGAGATATTACTTTTAATTAGCAGGGTTAGATGTGTTACAGAGTCTCAATTTA
GAAAAATTTATGGAGACCAAAAAAGATACAATAAAAAAAATTTTAAAAAAACTTTGAGAAAAATGTGTAG
TGAATATACACTAAAAAAATATCCTTGTGATGTGGATTATTATAATTATAAAGACCTCTCTTATGTATAT
TATTTAAACGGTAGTAAACTTTTTAAGGGAGATGATTTAATAAAGGCTCTAGTAGGATCAGAATTAGTTG
TTAGAATCAATACTGCAGGTTGTGATGTAAAAAGATTTTACCGAAATGTTAGTGTAGATGATGTGAAATA
CGATTTATTTATTGAATATACAGACCAATTTGGTAATATAAAGCAAGTTTTAGTTGATGTTGACTTAAAT
AATGAAATAGACATTTCTAAATACGAAAATCTTTCTAAAAAAATAGATAAATCTACAATTCCATTTTTTA
AAGTACCAAACGTTTTGGTAGTTACACCAGATAATCTATCCGAATTAAATGATTTAGAGAGATATGATAA
TGAGTATAGCATAAATTTTATAGATTTAGGATTAAATAAACTATTTAATTGTATATAA
>ref|NC_013316.1|:c2292531-2290831 hypothetical protein CDR20291_1963 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACGATATCTTAAAACATATGGAGTTGCATTAATAATTGTAATAATTTATGCATTTATTAAATTAC
CTGTACTAAGATTAGATTTTACATCTTTATTTTCAGTAGGAATAATTTTCTTTGTTGTAGCAGGAATACT
AGATATGATGTTAGATAGAAATGAAAGAGCATCTAAAATGGCTAAATATAATTTTTCAATAGCAATAGCT
TTGCTTGTGTATATTGTAGTAGTTCCCTTTATAACTTCTACACCTGTACTTCATGCAAAATCATATAGAG
AACTATTGGGAAAAGTAACTGAAAGTAAATTTACTGATGACATTAGCCCTGTCAGTGTAAATGACATTCG
TCTTGTAGATGAAGATATGGCAATGAAATTAGGTGACAAAAAGCTTGGAGAAGTTCCTGCAATAGGGAGT
GTATCCAAATTAGGAAAATTTCATATACAAAATGTAGATGGAGAGTTGTACTGGGTAGCGCCTCTTGTTC
ACAGAGACATAATTAAATGGATAACATCTCTAAGTGGTACAAGTGGTTATGTAAAAGTATCAGCTAGTAA
TCCTCAAGACGTCCAATTAGTTCAAGAAATAGATGGAAAGCCAATAAAGATAGTTTACCAACCAGAAGCC
TACTTACATCAGGATTTACAAAGACATTTATACATACATGGTATTGTAAATGTTGGTATGACAGATTTCA
CTCTTGAAATAAATGATGAAGGAAGACCTTATTGGGTTGTAAGTTTATATGAACATAAAATTGGCTATGG
AGGAGCAAATGCAACAGGAATAGCCACTGTTGATGCAGAAACTGGAAAAATAAATGTTTATGATGTTAAA
AACACACCTAAATGGGTGGATAGAATACAACCACAAAGCTTTGTAACAGACCAGATTAAAGACTGGGGTG
TTTATGTTAATGGATTTTTAAACTCTGTTATATCAGAAAAGGGAGTTTTAGTACCAACAGAAGGTACATC
ATTAGTTTATGGCAATGATAACAGGTCTTATTGGTATACAGGTATAACATCTTCAGGTGGAGATGAATCT
ACAATTGGATTTATGTTAGTTGATTCTAGAACAAAAGAAGCTAGATTATATAAACAACCAGGAGCTACTG
AAACGGCTGCAATGAAATCAGCTGAAGGTAATGTTCAAGAAAAAAATTATGAAGCGACGTTCCCTGTAAT
GTATAATATATTGGGTCAGCCAACATATGTATCATCATTAAAAGATAAGGCTGGTCTTGTTAAGAGAGTT
GCATTTGTATCTGTTGAAGATTATAATGTACTTGGAATAGGTGAAGATAAGAATGAAGCATTAAGAAACT
ATAAGGATGCATTAGAATCTAAGGGTAATGATTTAAAACTTGATAATGATTTAAAAGATGAGGTATTAGA
AGGCACAGTGACAAGAATAAGCCCAGATGTGCGAGGTGGTAACACTAATTATTATGTAACTTTAGATTCA
AATAAAGATATAATATTTAGGGCTACTTCAAAAGTATCTAGCGAATTGCCATTGACTCAGGTTGGTGATA
AAGTCAAAATATCGTATTCAAAAGAAGAATCTGGTGTAATAGAAATGTCAGAATTTGATAACCTAAATAT
TGCAAACTTTGAAGATAAAAAAGCAAAAGAAAAAACAGGAACTGATGAAAATACAGATTCCAAAGATTCT
GAAAATCAAGGTAATGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2293494-2292928 hypothetical protein CDR20291_1964 [Clostridium difficile R20291]
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GTAAAAAGCTGTATACACATGTGTCAATATCATTAAATGAAAATCTAAAACCAATGTATTCTTTTGGAAG
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AGAAAAAACACTGTGTGTAGGGTATATTCGTTAGAAGTAGATAATTTACAATATGAAAATCTATATAAAA
ATATAAAATTAATTAGTGATTATAGAGAAGATTACTATTACGATACAATGGCATTAATATATTTACTAAT
GAATATTCAGAGACAATCTGAATATAAATATGTATGTTCAAACTTTGTTGCTGACATGTTAGAAAAAAGT
GAGATAGACATTTTAAATAAACAAGCATTTGAAGTAACGCCAAATGATTTTTATAATTTATCTGGCTTAA
CCTTAGAGTATGAAGGTTTATTATCAGAATATAATTCTAGACAACATTCTTATGTATCAAAAATCGCAAA
CATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2294363-2293650 hypothetical protein CDR20291_1965 [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAAAGGTTGCAAAGATTTTGTTAAGTTTAATTGTTATTGTTTTAGTACTTGCAGGAATTGTTGTAT
ATATCTTGACACCAAAAGAAAGATATGATGTTAGTTCACAAAATAATAAAATCATAGATGAAGAATATTT
ATCAAAAGGCTCATATATAAATTCTATGGAGGTAGTAAAAAATCCACTTAGAATGGTTGGAAAAATATCT
GTTTCAGAGGAAGAGTTTAAAAATTTAATATATACATTGATGCAGAAGCATGGAATTAATGAACTTGAAA
ATAATTTTGTTGAAATGAAAAATGGTAAAATAAAGGTAGCAGGACCATATAAGGTATTTGGTTTGGTAAA
TAGTCAATATGAACTTGAATTGAGACCTACTTTAAAGGATGGAAACTTAGTTGTAAGTCTTGAGAATGTG
AAAATTGGAAAATTTAAACTAAGTGATAAAATGCTAGAAAAAATATTAAGTAACTACAATAAAAAAGTTC
CATTTGAGGTTAATGGAAATAAGATTACTTTGGAAAAAAGTTATCTTTACCCAATAACACTTAAAAATAT
ATCTATAAAAAAAGGAAATGTTGATTTGGATATGGAAGTAGAAATAGATTTAAAATCACAAATAAATGGG
GCATTAGGATATTTAAAGGACTCTGGAAAGGTTCAAGATATACTAAATCATCTGATTAATTTGAAGAAAA
CATCTGTTGGTTAA
>ref|NC_013316.1|:2294655-2296319 putative glutaminyl-tRNA synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAAATGAAACGAACTCATCTAACTTTATAAAGAATATTATTATAAACGACTTAGAAACAGGAAAAC
ATGACAGTATCATAACTCGTTTTCCACCTGAGCCAAACGGATATTTACATATTGGTCATGCAAAAAGTAT
ATGTCTTAATTTTGGATTAGCTAAGGAGTTTAATGGAAAAGCTAATTTAAGATTTGATGATACAAACCCA
TTAAAAGAGGATGTTGAATATGTAGAGTCCATAAAAGAAGATGTAAAGTGGTTAGGATTTGATTGGAACG
AGTTAAATTTTGCATCTAACTACTTTGATGAAATGTATAAGAGAGCTTTAATACTAATAAAAAAGGGTAA
AGCTTATGTATGTGATTTGACACAAGAGGAAATGAGAGAATATCGTGGTACTCTAACTGAACCAGGAAAA
GAAAGTCCTCATAGAAACAGAACTATTGAAGAAAACCTTGATTTATTTGAAAGAATGAAAAATGGTGAAT
TTAAAGATGGTGAAAAAACATTAAGAGCCAAAATAGATATGTCTTCTCCAAATATAAACCTTAGAGACCC
AATTATATATAGAATATCTCATTCAACACACCATAATACAGGAGATAAATGGTGCATATATCCTATGTAT
GCTTTTGCTCATCCAATTGAAGATGCAATTGAAGGAATAACTCACTCTATATGTACTTTAGAGTTTGAAG
ACCAAAGACCTCTTTATGATTGGTTTGTTAAAGAATGTGAGATGGAAAATATACCTAGACAAATAGAATT
TGCTAGACTTAATATAAATAATACTGTCATGAGTAAAAGGAAATTAAAACAACTTGTAGATGAGGGTATT
GTTGATGGTTGGGATGACCCTCGTGTTCCTACAATATCCGGAATCAGACGTAAGGGATATACTGCAGAAG
CATTGCGCAATTTCTGTAGTGAAATAGGGGTATCAAAAGTTAACTCTACGGTAGATAGTCAAATGCTTGA
TTATTTCCTAAGAGAAAACTTACAACCAAAGGCTCCTCTTACTATGGGAGTTTTAAGACCTTTAAAACTT
ATTATAACTAATTACCCAGAAGATAAGATTGAGATGCTTGAAATAGAGAATAATGCTAAAGATGAATCTC
AAGGAAAGAGATTAGTTCCTTTCTCTAGAGAATTGTATATAGAACAAGATGATTTTATGGAAGAACCTGT
TAAGAAATATTTTAGATTTTTCCCAGGAAATGAAGTCCGTTTAAAAGGTGCTTATTTTGTAAAATGTACT
GATGTAATTAAGGATGAAAATGGAAATGTAGTTGAAATACATGGTACTTATGACCCTGAAACTAAGAGTG
GCTCTGGCTTTACAGGACGTAAGGTAAAATCTACAATACATTGGGTTGATGCTAAATCAGCTATACCATG
TGAATTTAGATTATTTGAACCATTAATTCTTGATGATATACCTGAAAATGAAGGTAAACATTTCTTAGAA
CAAATAAATCCTAATTCATTGGAAATATTACAAGGTTTTGTTGAACCTACACAGATAAAAGATTCTAAAC
CTTTTGATAAATTCCAATTTGTTAGAAATGGATTCTTTAGTATAGATAATAAATATACAACTGACGAAAA
ATTTGTATTTAATAGAATAGTTCCTCTAAAAAGTTCTTTTAAACCAGGTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2297325-2296426 hypothetical protein CDR20291_1967 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAGTAAAACTTATATACAATCCTAATTCAGGTGAAAAAAAGATATTATCAAATTTAGACACTA
TCATAGAATTATATCAAGAAAAAAATTATTTATTGATACCCTATAGATTAACTATTAAAGAACCTGTAAA
GAATGCATTTAAGGAAGTTGATAGTTCTTATGAACACATATTGATAGCTGGTGGAGATGGTACTGTAGAT
TTAGTAGTAAATGCAATGAAAGAATTAGACATAAAAATTCCAATTGGAATTTTGCCTACAGGAACTGCAA
ATGATTTTTCAAATGCTCTTCAAATTTCATTTGATATAAAAGAAGCTATAAATGAAATCATAAATTCAAA
ACCAAAGAAAATAGACATAGGGAAAGTCAATAATAAGTACTTTATAAATGTTGCAAGTGCTGGTATGTTT
ACAGATGTATCACAAAGGATAAACACAGACTTAAAAAATTCATTTGGAAGAATTTCTTATTATATAAAGG
GAATAGAAGAAGCATTGTATATGAGGAAATTTAAGATAAAAGTATCTTCTGAGGAAATGTATTATGATGG
AGATATGTATCTTATGTTGATTTTTAATGGCAAAACAGCAGGAAATATAAATCTAGCATATAAGGCTGAA
ATAGATGATGGATATTTGGATGTAATTATTTTTAAAGGAATGCCAATACCAAAATCAATACCAGTTTTGA
TAAGTGTGCTTAGAGGTGATTATTTAGATCAATATAATGGAAATGAAATACTATACTTTAAAACTAAAAA
GGTGCATATAGAATGTGAAGATTCACTTATAACAGATATTGACGGAGAAAAAGGACCAGATTTTCCTCTT
AACATAGAATGCATAAAAGATGGAATAGAAGTTATGGGAATCTGTAGTGAAAAAAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2297990-2297352 hypothetical protein CDR20291_1968 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATCAAAATTTAAATTGGCTTAATGAAAAAAGAATAGAAAAAACAATAAAATCTCTGGAAAACAATA
ATATGAAAGGGTATTTAGTAAGTAACAAAGAAGAGCTTCTTAAAAAAATTGAAGAAATAGTTAAAGTAGG
TTCTCTAGTAGGATGTGGAGGTTCTATGACCTTATTTGAAACAGGAGTGATTGATTTTATAAGAGAAAAA
TATAATTTTCTTGATAGATATGCAAAAGATATCAAACCAGAAGAAATGAAAGAAATATATAGAAAGTCAT
TTTCTGCAGATGCTTATTTTACAAGTACTAATGCGATAACAGAGGATGAAGAACTTTACAATTTAGATGG
GAATGGGAATAGAGTTGCTGCTATGATATATGGACCTGATAAAGTAATAGTTATAGCAGGAGTAAATAAA
ATAGTTAAAGATGTAGATGAAGCTATAAAAAGAACAAAAACAATAGCTGCTCCAGCCAATTGTAAAAGAT
TAAGTACAAATACTGGATGTAAGACTACTGGTATATGTATAGACTGTTCAAGTCCAGGAAGAATATGCTG
TAGTTATACACTTATAAAAAGACAATTAACACCAGAAAGAATACATGTGATTTTTTTAAATGAAGATTTT
GGATACTAA
>ref|NC_013316.1|:c2299324-2298326 hypothetical protein CDR20291_1969 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAACAATCGTTTATAAATGGAAAAGTAAACTTATTAATAGAAAATTACAAAGCATTAAATGAAGTTA
AAGGTTCTTGGCAAATGGGATTGATACAACATAGTTGTGCACTTGCATTTACTCTTAAGAACAAGAGAAT
AAGTCCTAGATTAGTGGAAGAACGAATAGAGCTTATTAAAAAAAATACTGGATTATTCTCTAATTTTAGA
GGATATAATATGTTTTATATGGCAACACTACTTTCGTTTGAATCAAATCCAGAAAGTAGTTTTAAGATGA
TTTTAGATATATACAAAGAACTTAAAAGTGAAAAGTTTTGGGGCGATACATATTTACCACTTACAGCATC
AATAGTTTATGAAAATAGAGAGAAAATGGATTATCTTACATGTATATCAAAAATGAAAATAATATATGAT
TACATGAGGAAAAAACATCCATTTCTAACTTCTAGTGATGACTATTGTAATATAGCACTTATTGCAATTC
ATTCAAAAAATTTAGATGAAGATTTAGAATACATAGAAAAATGTTATGAATTTCTAAATGAAAATGGTTT
TTATAAAGGAAATGATTTACAAGCATTATCCCAAATTCTTTTATTTAGTGATGATAGAACTATGCTTAAA
TGTAAAAAGACTATTGAACTTAAAAAAGCATTTAAAGAAAATGATTGTAAAATGAATTATTATGGATATC
CAATAATAGGAGCAATTTCATTATTAGATTATAGAGAAGATGAAATAATAGAAGAGATAAAAAATGTTTC
AAATAAACTTAAAGAAGAAAAAGGCTTTGGAAATTGGTCTTTAGGAAAAAGTAATAGAGTAATGATTAGT
TCTGCTATTGTAGCTTCAATTTATGCAGATTTGATACGAAATGAGAATAATATAGGCTCTATAACTAATA
ATATATTTTTAAATATTGTTGTTGCTATTCAAATTGCATGTGTAATGGCAGCAACAAGTGCAGCTATAGC
ATCTTCTTCATCAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2299997-2299422 hypothetical protein CDR20291_1970 [Clostridium difficile R20291]
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GAGAAACAAAAATAGATGCAGATCATTGTAAAGAATCTATAGTAAATATAGATACTATAGTAAAGTCAGG
TAAAAGCTTTAATTCCAAGTATAATCAAGGTATGGAAGATTATAAAAATAGTGATGAGTATAAGTTGAAA
GTACAAAAGGAGAAACTACAAAATCAGTTAGGTATTAAAATAAAGAAGTTAGTACCTATAACTTTTGAAG
TTAGTTATTACACAAGTCTTAATCAAGAAAATGGATATGGAGCGATAACTGCTACAGGAGATGATTTAGA
AGATGGTTTTGTAGCAAACAATCACTTGAGTTTTGGAACTAAGATTATTGTAGATGGAAAATTAAAAACT
GTTATGGATAGGGGGTCTAGTAAGTATTTTAGTAATTCTAATGCAATAGATGTATTTGTGCCCAAATGGA
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TATTGTTGAAGAATGA
>ref|NC_013316.1|:2300304-2300576 hypothetical protein CDR20291_1971 [Clostridium difficile R20291]
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CTAAGATAACTAATGACGAAAATAATATTTTGACAGATTTGATAAATGAATCAATTGTAAATTATATTCT
TGAAAACAAAAAACATAACATTGAAAATAAAGATTTAGAAGAAGTGATTAAATTTTACAAAAAAGAAAAT
ACTGAAAAACCTAAAAGTGCAGCAAGAGCTATAGCTGAAGCAAAAACTCATACCCTGTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2301382-2301005 putative regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGACTATTACTAAGATACCACCAGCAGAATTAAAAGTCATGAAATTTATTTGGAGTTCAGATTTTACAG
TAGCATCAAAAGATGTCATTGAAGCTATGGAAAAACTATATAATTGGAAGCAAACTACAACACTAACACT
TTTATCAAGATTAGTAAATAAGCAATTCTTAAGTGCAAGAAAGATTGATAGACATACACATTATACAGTT
CTTATTGGAGAAGAAGAGTATTTACATTTTGAAACAAAAACTTTTTTAGATAATATGCATGGAAGTTCTA
TTGAGAGTTTTATGAAATCCTTGTTCAAAAAGGGGGTAAATGAAGAAGAATTGAACTCTGTTGAAAAATG
GGTTAAAGATATTAAAAAAGATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:2301693-2302835 integrase [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAAAATTTTGATTGGTGGGTTATATATGAATGCATTTATTAGAAAAAGAAATAAAAACTATGTTG
TTTACCTGGAATTTGAAGATGAAAAGACAGGTAAAAGAAAACAAAAAAATATGGGTACTTTTGATAAAAA
AAGGGAAGCAAGTAAAAGACTAAATGAGGTAAAAGAAAGCTTATATAATGATGGTTTTTTAGTACCAAGC
GAAATTACAGTGTCAGAATTTCTATTAGATTTTCTAAATAAATATAGTGAAAATATATCTTTAGCTACAT
ATAATAATTATGTTAGTATTTGTAAAAATTACATTAATCCATCTATTGGAAAATATAAAATACAAGACTT
ACATCCGGTTCACATACAAAACTACATAGATAAACTATCTTATAAACTAAATCCTCAATCAATTAAGATT
CATATAAATATATTGAAACTTGCAATAAAAAGAGCTTATAGACTCAAATTAATAAAAGAAAATGTTATGG
ATAGTATAGAGGCTCCAAGATATAAAAAATTTAAAAATGAGATTTATGATAGAGAACAAATGATAAAATT
ATTAGATTTAGCAAAAAATACAGAAATGGAATTACCTATTAATTTGGCTATTGGATTAGGTCTTAGAATT
TCAGAAGTTTTAGGTCTAACTTGGGATAATATTGATTTTGAAGAAAATACAATAACAGTAAATAAGATAA
CTTCCCGAATTAATGGTTCTGTTATTCTCAAAGAGCCAAAGACAGAAAGCTCTGTTAGAAAAATATCTTC
TCCCAAAGAATTAATGTCTTTATTAAAAGAATATAAAATAAAACAGAATAAAAATTTATTAAAATCTTCC
ATTAGAAATAATAATAATTTGTTGTTTTTCAATAAGAAATGTGAACCTATTGCTGAAGATGTTATGAGTA
AAAAATTTAAAAGATTTTTAGAAAAGAATGAATTACCTCATATTAGATTCCATGATTTAAGACACTCACA
TGTTACTTTACTTATAAATTCTAAAGTACCTATAAAGGTTATATCCGAGAGAGTAGGACACTCAAATATA
AGTACTACTCTAAGCGTTTATTCTCATGTACTTAAAGAAATGGATAAAGAGGCTTCTGACAAAATTTCTG
AAAGTTTATTTAATGCTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2303519-2303043 hypothetical protein CDR20291_1974 [Clostridium difficile R20291]
ATGGTTAAGAAAAGGTTAGTAGCTGTAGTATTGAGTTTAGCTATGATTAGTGTAGGGAATTTTTCATATG
CTCACTCAGGAGGGCATAATTCATCAGGAGGTCATCATAATAAAAATAAATCAGAGTTAACACGTTATTA
TTGTGGAGGACATTCAGCACATCAACCAAATAAAGGTTTTTGTCCTTATGCTAGTACAAAAGAAAATTCT
GGAGTAACAATATCTTCAGTACATAACGAAAAAAATCATAAAAACTATTTTGCAGAAAAAGGGTATAATA
AAGGTTATGAAGATGGGTGTAAAGGGCTTTATAATTTAAGTGTCACAGAAGCCAAATCTGATAATTTATA
TGAAAAAGAGATTTTAAAAAGTTCATATGAAAAAGGATATTTAATTGGATACAATGAATATAAAGCAAAA
AAAGTAGATGATGTAATGAAGAAGATGTTAGATATTCCAATGTTAGCAAGTATATAA
>ref|NC_013316.1|:c2305343-2303718 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTACAAGTTACAGGTGTTGGACTTAGATTTGGTGATAAGGAACTATTTAAAGATGTTAACTTAAAAT
TCACTAAAGGTAATTGCTATGGAATAATAGGAGCTAATGGTGCGGGAAAATCTACTTTTTTAAAAATATT
ATCAGGAGAAATAGAGCCTAATACAGGTAGTATATCTATAACTGATAAAGAAAGAATGTCAGTTTTAAAA
CAGGACCACTTTGAATATGAAGAAGAAACTGTTTTAAATGTTGTTATAAGAGGTCATGAGAGACTTTGGA
ACATAATGAAAGAAAAAGATGCATTGTATATGAAGGAAGACTTTAATGAAGAAGATGGGATAAAAGCTGC
CGAACTTGAAGGTGAGTTTGCAGAGCTTGACGGATGGGATGCAGAAACTAATGCTGAGAAAATACTTATG
GGTCTTGGCATAACGAAAGATATGCATTACAAACAAATGAAGGAACTAGTTGGTGGGGAAAAGGTTAAGG
TATTGTTAGCACAATCACTTTTTGGTAAGCCTGAAATACTATTAATGGACGAACCTACAAACCACTTAGA
TTTTAAATCAATAAACTGGTTAAATAATTTTATAATGGATTTAGAAGAGTCTATAGTTATAATAGTATCA
CATGATAGACATTTCCTAAATCAAATATGTACTAATATAGTTGACGTAGATTTTGGTAAAATACAAATGT
ACGTTGGAAACTATGATTTCTGGTATGAGTCAAGTCAATTGGCTTTACAACTGGCTAAGGACCAAAATAA
AAAGACTGAAGAAAAGATAGCTCAATTAAAGGAATTTATAGCTAGATTTAGTTCTAATGCTTCAAAGGCT
AAACAAGCAACATCAAGAAAGAAACAGTTAGAGAAATTAGAAGTTGAAGATATACAACCATCAAGAAGAA
GATATCCATATGTAGGATTTACACCTGCAAGAGAAATTGGGAATGAAGTTTTAGAAGTACACAATTTAAC
TAAAACTATAGATGGGGTTAAGGTTCTTGATAATGTGTCATTTAGATTGGATAGAGATGATAAAGTAGTA
TTTATGGGAGATGAAATAGCTACTACTGCACTTTTCAACATAGTTATGGGAGAACTTGAACCAGACAGTG
GAGAGTATAAATGGGGAGTAACTACTTCTCAAGATTATCTTCCAAAAAATCATAATAAGTTTTTTGACGG
AGTAGAATATTCTTTGGTTGACTGGCTTAGACAGTTCTCTGAAGAAAAAAGTGAAAGTTTTATAAGAGGA
TTTTTAGGTAGAATGTTATTCTCAGGTGAAGAAGCATTAAAAGAAGCTCAAGTTATATCTGGAGGAGAAA
AGGTTAGATGTATGCTTAGTAAGCTAATGCTTTCAAATGCAAATGTACTTGTATTAGATGACCCTACTAA
CCACTTAGACCTAGAAAGTATAACTTCTGTAAATAAAGGACTTGAAAAGTTCCCAGGAGTGCTTTTATTT
ACTTCTCATGACCATGAATTTATATCTACTATAGCAAATAGAATTATAGAGATAACTCCAAATGGAATAA
TGGATAGAAAAATGGACTTTGATGAGTATTTAGAAAGTAAAGAGATACAAGACCAATTAGCTAAAATGTA
TGGAAAAGATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2306700-2305681 putative molybdopterin biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
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GAGAATTTAAAGGAAGAAAATTTAAAAAGGGTCACATAGTAAAAGAAGAAGATATTCCAGTGTTATTATC
TCTTGGTAAAGATAATTTGTATGTATGGGAAAAGTCAGAAGGAATGGTTCATGAAAATGAAGGCGCATTG
TTTTTAAAAGAACTAACTGCTGGAGAAAATTTAGATTTTAGTGAAATAAAAGAAGGAAAAATAGATTTTA
TAGCAGCATGTGATGGTCTATTAAAGATAGATGTTGATGCACTTTTTGATTTGAATTGTGTTGGAGAAAT
AATGATGGCTACTCTTCATAATAATTTTATAGTAAATAAAGGTTTAAAAGTAGCTGGAACAAGAGTGATA
CCTTTGGTTATAGATGAGAAAAAATTAGAAGATGCAAAAAAAGTAGTTGGTAATAGAAAAATAGTAAATG
TAGTACCTTTTAAACCTAAGAAAGTAGGAATTGTTACTACAGGAAATGAAGTGTTTTATAGCAGAATTGT
TGATAAATTTGGACCAGTAATAGAAGAAAAAGTAAAAGGCTTTGGTTGTGAAGTTATAGGACAGACTATA
TGCCCAGATGATAAAGAAATTATAAAGAGTGCAATAAAAGAATTTATAAGTCAAGGAGCAGAACTTATCT
GTTGTACTGGCGGGATGAGTGTAGACCCAGATGATGTTACGCCAACAGCTATAAAAGAAACTGGAGCTGA
TTTAGTGACATATGGTTCACCAATATTACCAGGAGCTATGTTTTTACTTGCTTATTATGGAGAAGTTCCA
ATTATGGGTATACCAGGATGCGCAATGTATCATAAAACTACAGTATTTGATATAGTTTTATCTAGGGTTT
TAATTGATGAAAAGCTTGATAAGTATGATATAGCTAGATATGGTCATGGTGGCCTTTGTATGAACTGTGA
TGTATGTACTTATCCTGCATGTAATTTTGCTAAAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c2307275-2306697 putative molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATATATATGATAAATGCAGTGATAATGGCATCAGGCTTTGCCAGAAGAATGGGAGCAAATAAACTTT
TATTAAATTATAAAGGCTGTTCTATAATAGAACATGTATTTAGAGAAGTTAGCAAGATTGATTTTCATCA
AGTTGTAGTAGTAAGTCAATATGAAGAGGTTTTGTTATTGTGTAATAAATATGGTTTTGAATATATAGAT
AATAAAAATGCAAATATAGGTCAAAGTGAATCTATAAAATTAGGAGTTTTAAATAGCTCAAAATGTGATG
GTTATATGTTCTTTGTAGGAGACCAGCCATTTATTGATAACTTATATATAGATAAAATTATAAATACTTT
TAAATTAGATAGAGATTTTATAGTAATTCCAAGATACAAAGATATGTGTGGAAATCCAGTCATATTCCCA
TATAGTAAGAAAGAAGAATTGTTGGCACTTAAAGAAGATGAAAAAGGTAAAACCATTTTAAAAAATTCAT
CAAAAATAAAGTATGTAGAAGTTCCTAAAGAAATGTTATTTGATATCGATACAAAAATGGACTATGAGAG
AATCGGGGGTAAATTATGA
>ref|NC_013316.1|:c2308095-2307373 hypothetical protein CDR20291_1978 [Clostridium difficile R20291]
GTGGAACTATCAAATATAATAGAAAAGAATGAAATAATAACTGTAGTTGGAGCAGGAGGAAAAACTTCGT
TTATAAACTATTTTGCAAATTTTTATAGAGATAAATTGAAAGTTCTTCTTACAACAACAACTAAAATATA
TGTACCAAACGATTATGACAATATAATTATTACAATAGATGGAACTGTTATTCCATCTATTTGTCATGGA
ATAACAGTCTGTGGCAGTTATATAAATAATGAAAATAAATTAGTAAGTATTGATTCCTCTATTTTGGATG
AAATTGTAGACCAATTTGATTTAGTTTTAATAGAGGGAGATGGCTCAAAGAGAAAAAAACTTAAAGGTTG
GAATGCTAAAGAACCAGTAGTATATCATAAAACTACAAAAACCATAGGGATATTAGATATAACATCATTT
GGAATGAATATTAATGAAGAGAATATACATAGAGTAGAAATATTTAAAAAAATAGCAAATTTAGATACAA
GTAGTATTAATAGTAGTTCTACAGTAAGTATTGAAAACTTAAAAAATATAGTATTAAATCCAAATGGATT
ATTTAAAAATTATTCTGGAAAAAGAGTATTATTTATTAATAAAGTTGAAAATGAAAAATATAAAAATTTA
GCTATAAAATTAATAGAAAATATTAAAGAATATGAAAGTGAAATAGAGATATTTTATGGAAGCGTAAAAC
AAAAATTTTGTGTAAGATATTGA
>ref|NC_013316.1|:c2309591-2308278 putative transposase [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTAGTAGAGTATATTCTAAAGGAGGTGAGTTCATGTCAAACAGAATAAAAAATATACACTATGGAA
CTCAGAGACAACAATTAAAAAACTTAACTAAAAAAGAATATCAAGCTCTACGAGAGATGTGCTTCTTAGC
TAAGAACTTATATAATGTTGGTACATATAATGTAAGACAGCATTATTTCAATCAAGGAGAACATCTTAAC
TATGAAGCTAATTATCATGTATGCAAAGAAAATGAGAACTATAAGCTTCTCAATAGTAATATAGCGCAAC
AAATATTAAAAGAAGTAGACAGTTCGTTTAGGTCATTTTTTGGGTTAATTAAATTAGCCAAAGAAGGGAA
ATATGACTTTAGAGGGATAAAATCACCTAAATATTTAGATAAAGAAGGATTTTTTAGCATAATAATAGGT
CAAATAAGAATCAAAGAAGATGGGATTTTAAATGTACCTATGTCTCCAGCATTTAAAAAACTATATGGGA
AAGTAAGTATAAAAGTTCCACAAAATATACTAGAGAAAAAAATTAAAGAAATAAGAATAATACCTAAACA
TAAAGCTAGGTTCTTTGAAATTCAGTATTGTTATGAAATACCGAAATCAGAGGAAGTTTCAAATCAAAAA
AATGCACTAGCTATAGACTTGGGTTTAGAAAATTTATGTACATGTGTTACCAATTTAGGTGATAGTTTTA
TCATAGATGGAAAAAGGCTAAAATCTGTGAATCAGTGGGCAAACAAACAGAATGATAAAATAGAATCCTT
AAAATTAAAAAAGAATATAACTGCAATAACAAGAAAACAATTTAAAGTTTGGAATAAGAGAAATAATCAA
GTTAAAGACTATGTAAATAAAACCTGTTTTTATATAATTGATTATTGTGTAAAAAATAATATTGGAAATT
TAATTGTAGGATATAATGCTAAGTTAGAAAAAAGTGATAATATGGAGAGAAAAATATATAGAAATTTTAT
AAGAATCCCATTTGGAGAGATAAAAGGAAAATTAGAATATCTATGTAAAATAAAAAATATCAATTTTATT
AGGCAAGAAGAAAGCTATACTAGTAAGTCTGATTTTTTTGCTGATGATTTTCTACCTGATATCAATGTGG
ACAATGTTAAAAAATATGACTTTAAAGGGGAAAGAATAACACGTGGACAGTACAAATCCAGTGTTGGAAT
CATTATAAATGCAGATGTAAATGCGAGTCTTAATATACTAAAAAAATCACAAGTAGTTAATTTATCTAAT
TTACAGAATAATCCTCAAATATTAAAGCAACCACAGAGAGTAAGAATATCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2312000-2309694 xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGATTAATAAGGGGATAAGAAAGATAGATAGTACAGCAATTGTCACAGGAAAACCTCTATATACTGAAG
ACCTCATTATGCATAAAGATGTTTTGACATTAAAACTACTTAGAAGTCCACATGCTCATGCTAAGATAAA
GAATATAGATACATCAAAAGCCGAAAAAATTCCAGGGGTTGTGGGTATTTATACGTATAAAGATGTACCA
CAGGTCAGATATTGTGTGCCAGGTCAAACAGAACCAGAAGCATCACCTTATGATAGAGTTTTACTTGAAG
ATACAGTTAGATTTATTGGAGATGAAGTAGCTTTAGTGGCTGCTGAAGATGAGAAAACAGCACTTAAAGC
CTTAAAAATGATAAAGGTAGATTATGAGGTTTTAAAGCCTGTGTTTGATGCAAGAGAAGCAGAAGGAAAT
GAAGTTGTTATACATCCAGAAAAAGACATAGTAGAGCCATACCCTTTTGGATTGGATGCAAAAAATAATA
TAGTATCAAAAGAATTTTTTGAATTTGGAGATGTTGAAGCTAAGCTTAAAGAAAGTGATTTTGTGGCTGA
ATCTTCATACAAAACCCAAAGTCAATCGCATTGCATGATGGAAACTCATAGGTCATATTCATATAAAGAT
ATAAATGATAGAATTGTTGTAGTTTCATCATTACAATCACCACACAATGTAAAGAGAATAATTAGAAAAG
TATTGGGTATACCATCTTCAAAAATAAGAGTAATTAAACCTAGAATAGGTGGTGGATTTGGAGGAAAGAA
TATAGCAGCAACAGATATATTTACTGCATTTGTTACTATGAAAACTGGTAGACCAGCAAAATTTGTATTT
ACAAGAAGTGAAACTTTTGTAGGTTCTAATAGTAGACATGAAATGTTTTTTGATGTTAAAGTTGGTGCAG
ATAAAGAAGGAAATTTAAAAGCAATAGAGCTAAAGTCATTAAACAATACAGGTGCTTATGGTGGGAATGG
TGTCTCTGTTTCTTCCGAATCTGGACACAATACCTTACCAATATATAATGATATTGATGCTGTTAGATTT
AATGCTAGAACAGTATATACTAATAGGTTACCAGCAGGAGCACTTAGAGGGTATGGTGCTACACAGGGAA
TATTTGCAATAGATAGTGCTATTGATGAATTGGCACATAAGATTGGAATGGACCCACTTGAATTTAGAAT
TAAAAATATAATAGATAGGTATACCAATGGAAAAGCAGCTGAAGACGAAATATTAAGTTGTGAGCTGAGA
CAATGTATAGAAAAGGGCAAGAAATTAATCAATTGGGATGATAAATATCCATGTAAAGATATAGGAAACA
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AGTCACTATAAGAATGGATGAAGATGGCACATATAAACTATTATCTGGTCTTGCTGACTTAGGTCAAGGG
GCTGATACAATTCAAGCTCAAATTGCTGCGGAAGCTTTAAATACTACTGTAGATAGAATTTCTATTTATA
CAGGTGATTCAGATTTATGTCCCTATGATACAGGAGCATTTGCTTCTTGTACAACAACGGTTACAGGAAA
TGCAACAATAAAGACAGCAAATAAATTAAAAGATATATTACTTTCAGTTGCAGAGTCAAAGCTAGGATTT
AAAAAAGAAGATTTAGAGTTGGGAAAAGACAGGGTTTTTGTTAAAAACGATAATAGCAAGTTTGTTCTAT
TAGAGGAATTGGGTAGAGAATCTGTTGGAGGAATAGGATTTGCTAGTGATGATGTACCAGTAGTTTTGGA
AGCAACAGAATCTTTTGGCATGTTGAAAAAAATAAAACCATTTATAGCAGGATTTGCAGAGATAGAATTA
GATAAAAATACAGGCGAATATAAGGTCATAAATTTTGCATGTGTACCTGATTGTGGAACAGTTATAAATC
CAACTTTAGCTAGAATACAAGTAGAAGGTGGTGTGATGATGGGTATAGGGTTTGCAATGTATGAAGACCC
TATATTTGATAAAGATGGGAGATTATTAACAGATAGTTTCCTACAGTATAAAGTTCCTACAAAAAAAGAA
GTTGGAAATATATTGGTAGATTTTGCTGAGAATTTCGACCCAGGAGGTCCTTATGGTGCTAAATCATTAG
GAGAAATAGTTATACATACACCAGCGCCAGCTATAGCAAATGCAATATTTAATGCTACAGGAGTTCGTTT
AAGAGAGCTTCCTATGACTTTTGAAAAAGTTTATATGGGTATGAAAAATAATAATAAACAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2312802-2311993 putative FAD-binding subunit of xanthine dehydrogenase dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGATGGGGGATAAGATGGTTACTATAAAGGAATATTCAATTCCACAGAGTTTAGAAGAAGCATATAAAA
TTTTAATTTCTAAAAAAAATAATGTTATTTTAGGTGGATGTGGATTTATAAAATTAAGTAATAAAAATAT
AGGAACAGCGATAGATTTAAAAGATATAAATCTAAATTATATAAAAGAGGATGAAAAAAATATTTTGATA
GGTGCAGATACTTCACTTAGAAGTTTAGAAATTGATAAAACTATAAAAAATTACTGTAGTGGAATACTTT
CAAGCGCTGTTTCTAATATAGTTGGTGTTCAATTTAGACAAGGGGCTAGAATTGGTGCAAGTGTATTTTC
AAAGTATGGCTTTTCTGACTTAATACCAGCGCTTTTGGTTGTTGGAGCGAAGGTGAGATTATACAATAAA
GGAATACTAGAGTTAAGTGAGTTTTTGGATAGTGAATTAAGTAGGGATATATTGGTCGAAGTAATACTAC
CAAAAAAAGATGCGATAGCTGTTTTTGACTCAATAAGAAAATGCACAGGAGATTTTTCTGTATTAAATTC
AGCAATGCTAAAAGAAAATGATACTTACAAAATAGCAATTGGGGCAAGACCTCAAAAAGCTAGATTAGCA
CTTGAAGCGAGTAATATATTAAATAAAGAAAAAGATATAGATAAGGCATCTATTGTTGCTAGTAAGGAAC
TTACTTATGGAAGTAATATGAGAGCTAGTAAAGAGTACAGAAAGGATATGGCAAGTGCATTAGTTAAAAG
GATGTATAATGCTATTGAGGAGGGAATGTATAATGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2314251-2312893 xanthine permease [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGCAAAAAGTACATCAAAATTTGAATTAGACGGAATACCACCACTAAAGGAAGCAATACCTTTAG
GGTTACAACACTTAATGGCAATGGTAATAGGTAGTTGTTTACCAGCGATATTGATTGCAAATGCATCTGG
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CAATTATATCCAATACCTTTGTTTAAAGGTTTTAAATTAGGAGGAGGAATACCAGTTATAATGGGAGCTA
CAGCTATGTTTATAGGAGCTGGGGTATCTGTTGCAAGTAAGTATGGACTACCAGTATTATTTGGCTCTCA
AATAATAGCTGGTATAGTAATAATTATAATTGGTTTTGGTCTTAAAAAAATACGATTTATATTTACTCCA
GCTGTATCAGGAACAATAGTTGCATGTATGGGTCTTGGACTTTTTCCAATAGCTATAAAAAACTTAGCTG
GGGGTATGGGCAATGAGACTTTTGGGAATCCAATTAATTTTATAGTTGGAATATCTGTATCTCTTATGAT
ATTAGGATTAAATAAGTATGGAAAAGGATTATTTAAAGATGCATCAATATTAGTTAGCATAATTTTTGGA
TACATTTTATCATTAATTTTGGGTATAGTAAATTTTTCTTCAATTCAGGAGTTTACTTTGGTTGCGCTTC
CAAAACCACTTGCTTTTGGGCTAGATATAAGACTTGAAGTTGTTGTAATGTTTTCAATAATATATTTAGT
TGAGATAGCTGATATAATGGGTGCTTGTACACTTTCTGCGGTAGGAGGGCTTAATAGACAAGTAACAGAT
GAAGAACTTTCTTCTGCTGTTTTAGGAAATGGAGTACTCTCTACAATAGGTGCATTATTTTCTGCAACTC
CAATGGGGATGTTTGGACAAAATTCTGCAATCGTTTCCAATACAAAGGTTGTAAGTAAATTTGTACTAGC
TATTGGAGGAATTGGATTATTTTTGGCAGGAATATCGCCTTTATTAGCTAATTTAATAAGAACAATTCCT
CCCTGTGTGGTTGGAGGAGCAACACTCGTTATATTTTCAACTCTTACAACATCTGGTTTAAGACTTGTTA
GTATGGATGGATTTAATCAAGAAAATAGCATGATATTAGGTCTTTCTATGGCTTCTGGTATTGGATTCAT
GGTAGCTCCTCAAGTTCTTGAAAAATTTCCAAAATTTATAGAGACATTACTTGCAGATTCAAGTGTAGTT
TCAGGAGCAATGGTAGCCATAATAATTCAAGCTTTATATATGGTAAAATTTCCTGGAAATAAAAGTGATA
AGGTTGAGGATAAAAATAAAAGTTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2316689-2315598 hypothetical protein CDR20291_1983 [Clostridium difficile R20291]
ATGGTGATGCAAGTGCAAGAGAAGATTTTAGAGTTATTATATACTATAAATGAAGATGTAGTTAGCATAA
AAAATGATATGTCGGAAGTAAAACAAGAAATGACTGTAATGAAAGAAGATATATCAGAAGTAAAACAAGA
AATGACTGTAATGAAAGAAGATATGTCGGAAGTAAAACAGGAGATAAATGTATTAAAAGGAGATATGTCG
GAAGTAAAACAAGAAATGACTGTAATGAAAGAAGATATGTCGGAAGTAAAACAGGAAATAAATGTATTAA
AAGAAGATATGTCGGAAGTAAAACAGGAAATGATTGTAATGAAAGAAGATATGTCGGAAGTAAAACAGGA
AATGACTGTAATGAAAGAAGATATGTCGGAAGTAAAACAGGAAATGACTGTAATGAAAGAAGATATGTCA
GAGGTAAGACAAGAGATAAATATAATGAAAGAGGATATATCCGAAGTAAGACAAGAAATGACTGTAATGA
AAGAAGATATGTCGGAAGTAAAACAGGAGATAAATGTATTAAAAGAAGATATGTCCGAAGTAAGACAAGA
GATAAATATAATGAAAGAAGATATGTCTGAAGTAAGACAAGAAATGACTGTAATGAAAGAAGATACATCA
GAGGTAAAACAAGAGATAAATGTAATGAAAAAAGACATGTCAGAAGTAAGACAAGAAATAACTGTAATGA
AAGAAGATGTTTCCGAAGTTAAATCAGAAGTAAACTTTATGCAAAATAAAATAAATAACATTAATGAAGA
TATGAATGGAATTAAGGACGAGGTATCCATAGCAAATGAAAAATTATATGGAATTGAAATTAAGATTGAT
AGTCTAGAATGTGAAGATAAATCAATGAAAGAGATACAGATAGAACAGAATAATATTTTAGGAAGTTTAT
TACATAATTCTGAAATAAATAAAGCTACTCATGATAATATAGAACATAACATAGCATATATAAAAGGTGA
CACTAATTCTATAAAAGAGGATATAGCTGAAATAAGAAGAGACTTAAATTTAGTAGAGTTAGCCACTAGT
AAAAATTGGAGTGATATTGTCAAACTAAAATCAGTAAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c2318004-2316919 dihydroorotate dehydrogenase, catalytic subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAATTTTTTAGGTAAAGAATTAAAATCACCACTTATAATAGGTTCAGGACCATTAACATATAGTG
CAGCTGGATGCAAGATATTAAGTGATGCAGGAGCAGGGGCAGTTGTGACTAAGACTATAAGAAAAGAAAG
AGCTATAAATCCAGCACCACATATGGTTAGAAATACAGCTAATGCTCTTTTAAATAATGAAAAATGGACA
GATTTTGAGCCAGAGCAATGGATAGATTTTGAAATACCACAAATGAAAAGAGATGGGACTGTCTGTATAG
CTTCAGTAGGTCATACAATTGAAGAAAGTAGCGAATTAGTAGAGAAAGTTGCAAATGCAGGAGCTGACTT
TATTGAATTAGTATCTTATGACTATAGAGATTTGATACCAATGCTTAAAGATGCAAAGGAAAGAGTAAAT
ATACCTGTAATAGTTAAACTTCCTCCTATGATAGATGAGATAGGCGATTTTGCTAAAAAATTAGAAGAAG
CAGGAGCAGATGCAATAACTGCTTGTGACTCTGTAGGACCAGCATTTAGAATAGACATAGAAACAGGGCA
ACCTTTATTAGGTGGAAATGGAATAGGATATTTAAGTGGAGAAACTATTAAGCCAATAACTTTACAGAGA
ATATATGAAATAAAAAAACAAGTTAATATACCAATAATTGGCTTAGGTGGATGTGTAAGTGGAGATGATG
CCTTAGAAATGATTATGGCAGGTGCTGACTTTGTTGGTATATGTTCAGTAGTAATTTTAAAAGGCGCACA
AGTAATATCTAAAATACATGATGATTTAAAATCTAATCTTAATAGATTAGGATATAATACTATAGAAAAT
GCTTGTGGTATAGTACATAATCATATGGGAGATGTTAATGAAAGACTTAGCTTTGAGTTTACTTATGATG
AAGAAAAATGTACTAAATGTAAGATGTGCGAGAGAGTTTGTGCATATCAAGCGAGAAAATTGAATGATAA
GATGGAATTGAATGAAGAAGAGTGTAGATATTGTGGACTTTGTATATCAGTTTGTAAACCAAAAGCACTT
GGAAGAAAAATTTCATGTTCAGAGCTGAATGTATAG
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TAGAAAATGACATTATAAAAGATATATTGCCAAATGAAGAAGTTGAAATAAAATATAAAAATATTGAAGA
AATAATAGATAAATCAGATGCTATAATAATGCCAGGATTCGTCAATGGTCATATGCATCAATATGGAGTT
CTTTCTAGGGGAATACCGGCAAATGTACATTTTACTGACTTTGAAGGTTTTTTAAATGACTATTGGTGGC
CATTTATAGAAAATAGAATTGGATTGAAAGAAGTGAAGGCAACAACTAAAGCATCAGCAATAGAACTTAT
AGAATCTGGTGTGGTAGCTTTTTGTGATACCCTAGAAGCTCCAAATACAGAAGAAGGAACTTTAATTGAG
CAAGGAAAAATACTAGAAGAAATAGGCATGAAAGCGATTTTATCCTTAGAAAGTTGTGAAAGAATAAGCT
TTGAAAATGGACTTAGATGTTTAGATGAAAATTCTAATTTAATAAAGTGGAGTAGAGAAAATAGTAAATT
AATAAATGGAATAATGTGTACACATACAAGCTTCACATGTTCTGATAGATTTATTAAGAAAGCTAAAGAA
GATGCAAAAAAATTAAATGCACCAATGCAATTTCATTTATGTGAGAGTATATATGAGCCAAACTATGCTG
AAAAACATTTTGGCAAAAAAGCAGTTGACTACTATAATGATTTAGATATATTGGATGAAACTGTATTAGC
ATCTCAGTGTGTAAAAGTAAATGATGAAGAAATAGATATATTAAAAGAAAAAGGTGTAAAAGTGGTTCAT
ATGCCTCTTAGCAACTGTGAAGTAGGTGGAGGTTTTTCTCCAGTACCAAAAATGATTAAAAAAGGCATAA
AAGTGGCACTGGGTACTGATGGATATATAAATGATTTTTTTGAAGTTATGAGAGGTGCATTTTTAATGCA
TAAATCAGTTGAAGAAGATGCATCAGTAATGCCAGCAAATTTAGTATTTAGGATGGCAACAGAGCATGGT
GCTTATGTATTAGGACTTCAAAATTCTGGTAAAATAGCAGTTGGTAATAAGGCTGATATAATAGTTATGG
AAGATGAATTTAAAACTCCTGTGACTCTTGATAATATATTTGACCAGATAGTAGTTCAGGGTAAAAAAGA
ATTTATATCAAATGTATACATAGATGGTAGACATATTTTAAAAGAAAAACAGTTAGTTGATTTAGATAAA
AAAGCTATTGTTAAAGAAATGAAAGAAGTTGCTTGTGAATTTTGGAAATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2321645-2319354 xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGGTAAATAAAGAGGTAAGAAAAATAGATAGTGAAGCCATTGTTACTGGAAAACCAATATATACAGAAG
ATTTAATTTTTCATAAAGATGTTTTAACAATTAAGCTTCTTAGAAGTCCGCATGCTTTTGCGAAGATAAA
AAACATAGATACAAAAAATGCATTAAAGGTAAAAGGTGTAGTAAACATATTCACTTACAAAGATGTTCCA
AATTATAGATATTCAATGGTTGGAGAGTCATATCCAGAAGCATCACCTCATGACCAATTAATACTTGAAG
ACGTAGTTAGATATGTAGGAGATGAAGTTGCTATAATAGCCGCTGAAGATGAAAGGGCTGCTATTAAAGC
TATGAAACTTATAAAAGTTGAATATGAAGTAATGACTCCTATATTGGATGCAAGAGAATCGGAAGGAAAT
AAAATTTTAATCCATGAAGAAGATGATTTGTTTTGTCCATTTGATTTTGGATTGGATGCTACAAAAAATA
TTGTATCGAGAGAAAAAATGGGTAAAGGGGATGTAGAAAAAGAGTTTAAAGAAAGTGATGTAATAGTAGA
ACATTCTTATATGACTCAATCACAAGCCCATTGTATGATGGAAACTCATAGAGCTTATACGTATATAGAT
ACGAATGGCAGATTAGTAGTAACTTCTGCAAACCAATCAGCTTATCATATGAGAAGACAGGTTTCTAAAG
CACTGGGAATACCTCTTTCAAAAGTTAGAGTAATAAAACCAAGAATAGGTGGAGGTTTTGGTGGAAAAAA
CATAGCTGTAACAGAGATATATGCATCATTTGTAACTTGGATGACAAAAAGACCAGCAAAACTAATTTAT
ACTAGAGAAGAAACTTTTGCAATGACTAATACTAGACATCAGATGTTTTTTGATATAAAAATTGGGGCAG
ATAAAGAAGGAAACATAAAAGCTATAGATATGAAAGCATTGAATAATACAGGCGCTTATGGTGATAATGG
ACCTTCAGTTTGCTCTGAATCAGGTCATAATGTACTTCCAACATATAATAATGTACCTGCAATAAAATTT
GATGGGAGAACTGTATATACTAATTTAGTTCCAGGAGGAGCATTAAGAGGATATGGAGCAACACAAGGTA
CATTTGCACTTGATTGTGCAATTGATGAATTAGCGCATAAACTTAATATGGACCCAACAGAAATAAAGTT
AAAGAATATTATAAAAAAACAAACTGAAGGCGGAATAATGAATTTTCCAATAAGAAGTTGTGCACTTGAT
GAATGTATAATTAGAGGTAAAAAACTTATTGGATGGGATGAAAAGTACCCTGTTAGGGATATTGGAAACA
ATAAGGTGAGGGCTGTTGGAATGTCTGTGGGAACTCATGGTTCTGGTATAGCCAACATAGACATGGCAAT
AGTAAATATGAGGATGGATGAAGATGGAACTTATAAGTTGTTTTCTGGGTCTTCAGACTTAGGAACTGGT
TCTGACACAATACTTGCACAAATAGCTGCAAAAGCATTGAATACATCTATTGATAGAATTTCCGTTTATA
CAGGAGATACAGATATGTGTCCATATGATACTGGTGCATACGCTTCTTGTACTACTTATGTAACTGGAAA
TGCTACAATAAAATCTGCTGAAAGTTTAAAACAAAAGATATTAAAAGTAGCACAGAAGAAACTCGATTTA
CCAATAGATGATTTAATACTATATGAAGACAGAGTTTGTTATAGTGAAGATGTAGAGAAGTTTGTTTTGT
TAAGTGAATTAGGAAAAGAATCTGTTGGTGGTGGAAATCAAGAAGTTTTATATTCATCTGAATCTTATGG
TATACAAGAGAGTGCTAAACCATTCTTAGCAGGATTTGCTGAAATAGAGTTAGATAAAACAACAGGGGAG
TTTAAAGTAATAAATTATGCTTGTTCTACAGATTGTGGTACAGTTATGAATCCTGCACTTGCTAGAATAC
AAGTTGAAGGTGGTGTAACTCAAGGTATAGGGCTTGCAATGTATGAAGACCCTAGACATGGTTCTGATGG
AAAGCTTCAAACTTCTAATCTATTACAATACAAAGTTCCAACAAAAAAAGATATAGGAAACATAATTGTT
GATTTTGTAGATAATTATGAGCCAACAGGTCCATATGGAGCTAAATCTTTAGGAGAAATAGTTATTCATA
CACCTGCACCAGCAATAGCAAATGCAATATACAATGCCACAGGAGTTCGTATAAGAGAACTTCCTATAAC
TTCTGAGAAAGTTTATATGGCCATGAAAAAATTAAATCAGGGAGGTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2322459-2321635 putative FAD-binding subunit of xanthine dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
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ATGAAGCTTATGAACTGCTAATATCAAGAAAAAACAACATAATACTTGGAGGATGTGGATTTTTAAAACT
AGGTAGTAAAAATATTGGCTCAGCAATAGATTTAAAAGACTTAGCTTTAGATTATATAAATGAAACTGAT
GATAGCATATTAATTGGAGCAGACACAAGTTTAAGAACTTTAGAATTAAATAAGGTTATTAAAAATTACT
GTAATGGGGTAATTTCAAACGCTGTTTCTAATATAGTAGGAGTTCAATTTAGAAGTGGAGCCAGAGTAGG
AGCTAGCGTATTTGCTAAGTATGGATTTTCAGATTTAATACCTTCATTACTAGTGGTAGATGCAAAGGTT
AAGTTATATAAAAAAGGGGTTATGAACTTAGCTGATTTTTTAGAAAGTGAGCTTGAAAAAGATATATTAA
TAGAAGTTATATTACCTAAAAAAGATGCTATAGGTGTATTTGATTCTATAAGAAAATGTACAGGTGATTT
TGCAGTATTAAATGGAGCAATGTTAAAAGAAGGAAGTATTTATAAAATTGCGATAGGCGCTAGACCAAGA
AGAGCAAAAATTGCCTATAAAGCAAGTGAAATATTAAGTTTAGAAAATGATATAGAAAAAGCTGGTGAAG
TATCAAGTGAAGAACTTTCATTTGGAAGTAATATAAGAGGAAGTAAAGAATACAGAAAAGATATGGCAAA
AGCCTTAGTAGTGAGAATGTATAATAGTATTGGAGGTGAGTGTGATGGTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2322935-2322468 xanthine dehydrogenase iron-sulfur binding subunit [Clostridium difficile R20291]
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GACCAGATGATTTTTTAGCAGATACATTAAGAGAAAATGGATATGTAAGTGTTAAAAAAGGGTGTGATAC
AGGCTCATGTGGGTTATGTACAGTGATGGTAAATGACAAGGCCGTGCTTTCATGTAATTATCTTACTGCT
AGAGTAGATGGTCAGCATATTACAACACTTGAGGGGGTCTTGGATGAAGCAAAGAAGTTTGGAGATTTTC
TTGCAGACGAAGGGGCTGACCAGTGTGGATTTTGTGCTCCTGGATTTATAATGATGGTTTTGGCAATGAA
AAGAGAGCTTCAAAATCCAACAGAAGAAGAAGTTATAGATTATGTAAATGGTAACCTTTGTAGATGTACA
GGATATAAAGGTCAATTAAGAGCAATACATAAATATTTAAACACTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2324410-2322986 putative amidohydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGCGGGGGGAAATAAGAATGATGGATATACTTATTAAGAATGCCATAATAGTAACTGTGAATAAAGAGA
GAGAAGTTATTTTTGATGGGGCATTAGTAGTAAAAGATAACAAGATTGCTGATATTGGAAATTCTAAAGA
GATAGAAAGTAAATATACTGATGTTAAAAAAATTATAGATGCTAAAGGTAAAGTTTTATTCCCAGGTTTT
ATAAATACACATAATCATTTATTCCAAACTTTATTAAAAGGATTGGGAGATGATATGGTACTTAAAGACT
GGTTAGAAACTATGACATTTCCAGCAGCTAACTATTTAGAGCCAAAAGATACTTATGATGCTGCAATGCT
TGGATGTATTGAAGGACTTAGAAGTGGTATAACGACCATGGTTGACTACATGTATCCTCATAGTAAGCCA
GGTCTTTGTGATGGAATAATAGATGCTTATAAAGAATTAGGAATAAGAGGAATACTTGGAAGAGGATGTA
TGAATACAGGAGCTCAATTTGGAGTTCATCCTGGAATAATGCAAGATGTAGAAACGGTTGAAAAAGATGT
AAGAAGATTGTTTGAAAAACACCATAATACAGAAAATGGAAGAATCAAAATAGGAGTAGCTCCTGCAGCA
ATATGGTCAAATTCTCAAGAAATGCTTGAAATGCTATGGAGAGTGGTAAAAGAATATGATGATGCTTTAT
TTACAGTACATATATCAGAGACTCCTTTTGATAGAGAAGCAGCAAAAGAATTGCATGGGCAATATGACAT
AGATGTTTTAGAAAAATTAGGAATACTTGGACCAAATGTGCTTATGGTACATTGTGTGTATCTAACTGAA
AAAGATATGGAACTTACTAAAAAATACGATATGAAAGTGTCTCATAATACAGCAAGTAATATGTACTTAT
CTTCAGGTGTTGCACCAGTGCCAGAAATGCTTAAAAAAGGAATAACAGTTAGTTTAGGAGTAGATGGAGC
CGCTAGTAATAACTCTCAAGATATGCTTGAACTTATGAAATTAACAGCACTTCAACATAAAGTTAATAAG
TGTGACCCATTAGCAATGTCGGCAGAAAAAGTTCTTGAGTTGGCAACTATAGATGGAGCAAGAGCTATTG
GAATGGAAGATGAGATAGGTTCATTGGAGATAGGTAAAAAAGCAGACTTACTAATATTTAATCCAATGCT
TTCACCAAAAGCGATACCTATGCATAATCCGGTATCTACATTAGTATATTCTTCTAGTATGAAAAATATA
GAGAGTGTTATAGTAGATGGAAATATAATAATGGAAGATTCAAAAATATTGACAGCTAATGAAGAGAAAG
CATTAAAAGATGCTCAAGATACAGCTGAGAGACTTTGTGTAAGAGGAACTATAAAAAATAGAATGGAAGG
TCATAAATGGAATAGCCTTTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2325780-2324410 D-hydantoinase [Clostridium difficile R20291]
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AAGATGAAAAGATAGTTGAAATAGGAAATAACTTAGAAATAAATGGTGATAAGGTTATTGATGCTACAGG
TAAAATTGTAATTCCTGGTGGAATAGACACACATACTCATTTTGATATGAATGCAGGTTCTATTACAACT
GCAGATAATTTTGAAACAGGAACAAGAGCAGCTATAGCTGGAGGAACTACTACAATACTAGATTTTGCAG
AAGCCAATGAGGGGGAAAACCTACTGCAAGGTGTAGAAGCATATCATAAAAAAGCAAGTGGAAATTGTTA
TTGTGATTATGGTTTTCATATGACAATTACATGTTTAAATAAAGATACATTTAATCATATGGAAAAACTT
ATTTCGGATGGGATAGTATCTTTTAAGATGTATATGGCATATGATGGCATGAAAGTAGATGATGGAACAA
TATACAGGGTTTTAAAGAAAGCAAGGGATTTAGGTTGTATAGTTGGATTTCATTGTGAAAATGGGGATTT
ACTAGATGTATTGATAGAAGAAAATATACAAAATGGTAATTTAGAGCCAAAATATCATCCACTTACAAGA
CCTAACATAGTTGAGAAAGAGTCTGTTTCAAGACTTGCTGATATAACTAAATTATCTAATTCAAAATCCT
ATGTAGTCCACTTAAGTTGTAGGGAGTCACTTGAAACTGTAAAAATGGCTAGAGAAAAAAATATAGATAT
GATAGTAGAAACATGCCCACAGTATCTATTATTAGAAGACAATTTATATAATAAGAATAAATTTGAGGGT
GCTAAGTATGTAATGTCTCCTCCTTTAAGAAAAAAAGAAGACATAAATTACCTTTGGGAAGGATTGTCTA
GTGGAGATATTCAAACAGTTGGCACAGACCACTGTTCATTTAATTTTAAGGGGCAAAAAGACTTGGGAAT
TGATGATTTTAGTAAGATACCAAATGGAGCACCTGGTGTTGAACATAGGTTAGCACTTTTATATACATAT
GGGGTCTTAGAAAATAGAATAAGTGTAAATAAGTTTGTGGAAGTTACTTCTACGAATGCTGCAAAAATAT
TTGGAATGTATCCTAAAAAAGGTGAGATAGCTGTAGGAAGTGATGCAGATATAGTCATTTTAAATATCAA
TAAAGAAGAAACAATTAGTTATAAAACTCAAAAACAAAATGTAGATTATACTCCATATGAAGGATTTAAG
GTTAAATGTAAAGTTGAAGATGTATTTTTGAGAGGAAATCATGTAGTACAAAGTTGTAATGTTAAAGAAC
ATCCAACAGGTCAATATATTAAAAGAAAAATTACTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2327100-2325913 putative amidohydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAACGAACAAAGAAAACAAGAAGTAACTGAAATATGCCAAAAATTAATTCAAAATCCTAGTTCTT
CTGGAAATGAAGAAGGTGTTGTAAAAGCAATAGAAGAGTCTTTTGAAAAATTAGGTTTTGATAGTTGGTC
AAGAGATAGATATGGAAATATAGTAGGATGTATAAAAGGTAACAAGCCAGGTAAGAAAATATTATTTGAT
GGACATATAGATACAGTTCCAGTTCCAGATGCAAGTAAATGGAGTGTTCCTCCTTTTGAAGGAAAAATAG
TTGATGGAAAGATATATGGTAGAGGAACTTCTGACATGAAAGGTCAATATACTGCAATGATGTCTGCTGT
AGCGTATTTTGCTAAAGACACTAATCGAGATTTTGCTGGAGAACTATATGTAGCAGGTGTTGTTCATGAA
GAAATATTTGAAGGTGTTTCGGCTAGAGAGATAAGTAAGGCTGTTCAACCTGACTATGTTGTAATAGGTG
AGTCTTCAGAGTTAAACTTAAAGATTGGTCAGAGAGGTAGAGGAGAAATAGTAGTAGAAACTTTTGGTAA
ACCAGCTCACTCTGCTAATCCAGAAAAAGGTGTAAATGCAGTTTATAAAATGGCTAATGTAATCCAAAAG
ATACAACAATTAGTACCTCCAACTCATCCAGTTTTAGGTGATGGAATATTAGTTTTAACAGATATAAAAT
CTTCTCCATATCCAGGGGCATCAGTAGTGCCAGATTATTGCAAAGCTACTTTTGATAGAAGATTATTAGT
TGGAGAAACAAGAGAAGGCGTATTAGCTCCAATACAAGCTTTATTAGATGAAATGATGAAAGAAGACCCA
GAATTAAATGCGAAAGTTTCTTATGCGGTTGAAAAAGCTGATTGCTATACAGGAAATACTATAGAAAGTG
AAAGATTCTTCCCAGGTTGGTTATATGACGAAGAAGATGAATTTGTTCAAGCAGCATATAAGGGATTAAA
AGAAGCTGGAATAGATTCAGAAATAACTCAATACTCATTCTGTACGAATGGAAGTCACTATGCAGGTGAA
GCTGGAATAAAAACTATAGGATTTGGTCCTTCTAAGGAAAATCTTGCTCACACAATAGATGAGTATATAG
AGCAAGAACAGTTATTTATAGGAACAGAAGGTTACTATGGAATATTAAAATCTGTATACGGAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2328441-2327227 diaminopropionate ammonia-lyase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAAAGAAATTAAATGGAAAGTAAATAATTTGCCAAAGGGTGATAAGGAAAATTGTATCAAATTTT
TAAATGAAGAAGAAATAACTAAGGTTAGAAATTTTCACAAAAGCTTTCCTCAATATAAAGAAACTCCATT
AGCAAACCTAGAAGGTTTAGCAAAAAAATTAGGTGTTGCAGGAGTATATGTAAAAGATGAATCTTATAGA
TTTGGATTAAATGCATTTAAAGTATTAGGTGGTTCTTATTCTATGGGTAGATACTTAGCTCAAAGATTAG
ATACAGATATATCTGAGTTAGGGTATGACAAATTAACTTCGAAAGAAATAAAAGAAAAATTAGGAGAAAT
AACTTTCTTTACAGCTACAGATGGAAATCACGGTAGAGGAGTTGCTTGGACAGCTAATAAATTAGGTCAA
AAATCTGTTGTATTAATGCCAAAAGGTTCTTCTGAGTTTAGATTAAATAAAATTAAAGGAGAAGGAGCAG
ATGCTAGTATAACAGACTTAAACTATGATGATGCAGTAAGATTAGCTAATGATTATGCAGAAGCTGATGA
TCATGGAGTAATGGTTCAAGATACAGCATGGGATGGATATGAAGAAATTCCAGCATGGATAATGCAAGGA
TATGGAACTATGGCTCAAGAAGCGATAGAGCAATTAAAAGAATATGGAGTAGATAGACCAACACATGTAT
TTGTGCAAGCAGGGGTTGGTTCACTTGCTGGAGCAGTTCAAGGATATGTTGCTTCAATATACGATGAATG
CCCAATAACAGTAGTAGTAGAAGCTGATGAAGCTGATTGCTACTATAAATCAGCAGAAGCAGGAGATGGA
AAACCAAGATTTGTTGGAGGAGATATGCCAACTATAATGGCTGGTCTTGCTTGTGGAGAACCAAATACTA
TAGGATTTGAAGTATTAAAAAATCATGCTGCAGCATTTGTTTCAGCACCAGACTGGGTTTCTGCTAAAGG
TATGAGAACATTAGGTAATCCTTTAAATGGTGATGAAAAGGTAATTTCTGGAGAATCTGGAGCAGTTACA
ACTGGTCTTTTAGTAGCAGCTATGGAAAGAGAAGATTTAGCAGATTTAAGAAAAGATTTAAAATTAGATG
AAAATTCAAGAATACTTTTAATAAGCACAGAAGGAGATACTGACCCTGACAAATATAGAAGTATAGTTTG
GGATGGAGAATATCCAAGTATATAA
>ref|NC_013316.1|:c2329475-2328804 putative iron-sulfur flavoprotein [Clostridium difficile R20291]
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TGAAAGAAGCAGAAACTATACCTGGTATAGAAACTGAGTATTGGTCAGTTAGAGGGAAAAAAATAAGTCC
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GAGCAAAAAATATTGGAGGCAGATGGAATTATAGTAGGTTCTCCAGTTTATGATATGAATATAACTGCTC
AACTTACAGCAGTATTTAATAGACTTCGTCCAATGTATTTAGTTCATCCAGGAAAACTTCAAAATAAGGT
TGGTGCAGCTATAACTACTGGTGGAACTAGATATGGTGGCCAAGAATTGACAAAACTTCCTATAATAAAT
TTCTTCCTAATGCATGAAATGTTAGTATCTGGAGGTTTAGGTGGATGCTATATAGGTGGTACAATATGGA
GTAAAGATGGAAAAGCAAAAGGTGCCCAAGAGGATGAGACAGGTATGGACACAGTAAAAAGACTTGGAAA
AGGTGCTGCAGAGGCAGTTATGGTTTCTAAGTTTGGTCTTGAAAAATGGAATGTCGTAAAAGAAGAATTA
GATGTTAAAAAAGATGAAAAATCACCTCTTAGAGACCACTAA
>ref|NC_013316.1|:c2331774-2329558 putative xanthine dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
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ACGTGGCTGATATGAAACCACAAAATGTACTTTACGCTAAGATGCTTTTAAGTCCTGTAGCACATGCAAA
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ACATCACAAAGAAAATACAATGGTTCATTAAGATTTTATGAGCACAATATACCTGAAAATGAAGTTATAT
TTTCAGATACAGTTAGATTTGTTGGTGACCGTGTTGCAGCAGTAGCTGCAGAGACTCCAGAAATAGCAGA
GAAAGCTGTAAAACTTATAAAAGTTGAATATGAAGAATTGCCAGCTGTATTTACTATACAAGATGCAATA
AAAGAAGATGCTATCTGCATACATGGAGATTCAAATATAGTTTCTCAAAACAACATAAATGGGGGAGATG
TAGAAAAAGGCTTCAAGGAATGTGACTATATATTTGAAGATGAATACTCTACTCCAGCAATACATCATAG
TGCAATAGAGACTCATAGTGTAATTGCACACTATGATTATAATGATAAATTAACTGTACATACACCTTGC
CAAAATACATTTGGATTTAGAATAATACTATCTCAAATTTTTGGGATGTCATTAAATAAAGTAAGAGTTA
TAAGACCTGCTATTGGAGGCTCATTTGGTGGAAAATTAGAACTTACAATTGAACCAGTAGCAGCCGCATT
ATCAAAAATGACAAGAAGACCAGTTAAAATGGTTCTTACAAGAAAGGAATCTATGATATCAACAAGAACT
CGTCATGGGTCTTTTGTAAAATTAAAAACTGGTGTAAATAAAGATGGTGAAGTAATAGCACAAGATATAA
AAATATATACAAATACAGGAGCATATGCATCAAGTGCTTTAAATGTTATAGGAGCACTTAGTCATAAAGT
ATTTAAAGTTTATAAAATACCAAATATAAAGTTTACTGGGATGCCTGTATATACAAATACACCAATAGCA
GGAGCTATGAGAGGCTATGGGTCACCTCAAATATTTATGGCTCAACAGGCTCAATTTGCGAAAATAGCCA
AGGAAATAGGTATGGATTTAGTCGATTTTCAAAATAAAAATGCAGTAGAGCCAGATGATGTCGATATAAT
CTTCCGCGGTTCTCTTGGAAATCCTAGAGTATTGGATTGTATAGAGCAAGGTAAGAAGATGTTTAAGTGG
GATGAAAAGAAAAAACTTCCAAAAGAAGAAGGAAAATATTTAAGAGGTATAGGTATGGCAATAGGTGCAC
ATGGTAATGGAGTTTTTGGTGCACATAGAGATGTTGTTACATTGACTCTTAAATTAAATGAAGATGGTAC
ATTGACACTACTAACAGGAGCACATGATATGGGTAATGGTGTCGTAACTATGCAAACAATGATGGTAGCT
GAAGTTTTAGGAATAACACCTGATAAAGTTGATACATTTGAAACTGATACGGATGCATGTACATTCAACC
TTGGTGACTATGCAAGTAGAGGGGTATTTGTAGAAGGTGGAGGAGCTAAAAAGACAGCAGAGAAATTGAA
AAACCTTATAGTAGAAGAAGCAGAAAAATTACTTGAAACATCAAAAGAAGATTTATATCTAGACAATGGA
TATGTAATTAGTAAACTTGATGAAAATGTAAAAGCATCACTTTCTGATGTCGCAGTATATAGTCAAAGTA
AATCATTAAGAGAGTTAACTGTTGTTGAAGATTATTCTTCACCAGCTGGACTTACTTCTTATGGTGTACA
TTTTGCTGAAGTTTTAGTAGATAAAGAAACTAAGGATATAAAAGTAGTTGATTTTGTAGCTGTACATGAT
GTTGGTAGAGTTATAAATCCTTTAAATTTAGAAGGTCAATTAGAAGGTGGGATTCATATGGGTCTAGGAT
ACGCATTGAGTGAAGAATTGGCATTTGATGAACAAGGTAGACCTAAAGCTACTGATTTTAAAACATATAA
ATTATTTAGAACTGTAGATATGCCAAAATGTCAAGTTGCATTTGTAAATAGTTATGAAAAAGCTGGACCT
TTTGGTGGTAAGAGTATTGGAGAATGTGCTGTTGTACCAGTTGCGCCAGCTGTTGCAAATGCAGTATATA
ATGCAACTGATGTAGAAATACATTCATTGCCAATAAAATTAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2332247-2331777 putative carbon monoxide dehydrogenase, iron-sulfur-binding subunit [Clostridium difficile R20291]
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TGCATGTACTTCGTGAAAAATTAAATCTAACTGGAGCGAAACAAGGTTGTAATAGTGGCAGTTGTGGAGC
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GTTATATACACTATAGAAAGTTTTGCTAATGGAGAAAATCTTCATCCAATACAAGAAGCTTTTATAGAAG
TTGGAGCTGTACAATGTGGATATTGTACTCCTGGTATGATTATAACAACACAAGCTCTTTTAAATAGAAA
TGCATCTCCTAATGAAGATGAAATTAAAGAAGCTTTTAAAGAAAATCTCTGTAGATGCACAGGATATGTA
AAGATTATAGAAGCTGTAAAATTATCTGCAGCTAGATTAGGGGGTAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2333730-2332309 putative amidohydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTATTCAAAGGGGGATTTAAGATGATTGATATACTAATAAAAAATGCAATAATTGTTACAGTTA
ATAAAGACAGAGATGTTATATTTGATGGAGCAATAGCTATTCAAGGTGACAGAATCTTGGATATAGGAAA
TACAGTTGATATTGAGCCTAAGTATCTTGATGCTAAAAAAGTTATAGATGCTAATGGAAAAGTAATATTC
CCTGGCTTTATAAATACTCATAATCACCTGTTCCAAGTGTTATTAAAAGGTTTAGGTGATGATATGGCAC
TTCATGAGTGGTTAAATACAATGATGTTTCCATCAGCAAAATTCTTAACAGAACAAGATACTTATGATGC
TGCAATGCTTGGATGTATGGAAGGTTTAAAAAGTGGTATAACTACAATGGTTGATTATATGCATACTCAC
AATAGACCAGGACTTACAGATGGAATAGTAAAGGCATATAAAGATTTAGGTATAAGAGGGGTTGTAGGTA
GAGGTTGTATAGATTTAGGTATTCACAAAGAGCTTATAGAAGATGTGGAAACGGTTGAAAAAGATTTGAG
AAGGGTATTCGAAAAATATCATAATTCAGAAAATGGAAGAATAAAAATCTGTGTAGCTCCTTCTTCAATG
TGGGCTATATCTGAAGAAATGGGTAAGATGCTTTGGAATATAGTTAAAGAATATGATTCATATTTTACAG
TTCATATATCTGAAACAGAATTTGCAAGAACAGCAACAAAGGATATACATGGAGAAATAGATATAAAATT
ACTTGAAAAATGGGGTATAGTAGGTCCAGAAGTTGTAGCAGTACATTGTGTATGTATAACTGATGAAGAC
ATGGAAATGCTTAAAAAGTATGACATAAAAGTTTCTCATAATGTAGCAAGTAATATGTATCTTGCTTCTG
GTGTTGCACCTGTGCCAGAAATGTTAAAAAAAGGTATAAATGTGAGTTTAGGTCTTGACGGTGCAGCAAG
TAATAACGCACAAGATATGGTAGAGCTTATGAAATTAACAGCTTTACAACACAAAGTAAATAATTGTGAC
CCTCTGGCAATTTCTGCAGAGAAAGTTCTTGAAATGGCTACAATTGAGGGAGCAAGAACTCTTAGAATGG
AAGATGAAATAGGTTCTTTGGAGATTGGGAAAAAAGCTGACCTAGTAATATTTAACTCAATGCTTTCTCC
AAAATCAATACCTCTTCACAATCCTGTATCAACTTTGGTATACTCAGCTAGTATGCACAATGTAGAGAGT
GTTTTAGTTGATGGAAATGTAATACTTGAAAATGGAAAAGTAACTACAATTGAAAGTGAAGAACAAGTGT
TGCTTAATGCACAACTTGCAGCAGAAGAATTATGTAAGAGAGCTAATGTAACTAATAGAATGGAAGGACA
TAAGTGGAATAGCTTATACTAA
>ref|NC_013316.1|:c2335158-2333776 putative xanthine/uracile permease [Clostridium difficile R20291]
ATGTATGGGAGGATTTATTTTATGAAAACACGTAATACTTCAAAATATGATGTCGATGGGATACCACCAC
TAAAGGAATCAATACCTTTGGCCTTACAACATCTGTTAGCAATGATAGTAGGAAATATGGTACCTGCGAT
ATTAATAGCAAACGTGGTAGGACTTAACCAGGGGCAAGCAACAATGTTGATTCAGGGTTCTATGTTAGCA
GCAGGTTTAGCAACGTTTTTACAGTTATATCCAATACCTTTATTTAAAGGATTTAAGTTAGGTTCAAGAT
TACCTGTAATGATGGGAATGAGTTATGTATTTTTAGGAGCTTGTCTTTCAGTAGCAGCTAAAGATGGTTT
AGCAGCTCTATTTGGAGCACAGATTGCTGCTGGGGTAATCGTATTCTTTGTAGGATTTGGAGTTAAGAAA
ATTAGACATATATTCACTCCAATAGTTTCTGGAACTATAATAGCATGTATGGGACTTGGACTATTCGCAA
CAGCTATAAAGAATTTAGCTGGAGGAGAAGGCACACAAACATTTGGAAGCCCAATAAACTTCACAGTAGG
AGTTATAGTTGCTTTTGTAATAATAATGATAAATAAATACGGTAAAGGTTTAGTAAAAAATTCTTCAATA
TTAATAGGAATATTAGTAGGTTATGCTATATCTTTAGTTTTAGGATTGGTTGATTTCTCAGCCGTTCAAG
GAGCAGCTATAGTATCTTTACCAACACCAGCAGCTTTTGGATTAGAATTTAGACCAGAGTTAATAGTAAT
GTTTACTATTATTTACATAATAGGTATAGCTGATATGATGGGTGCCTGTACAATAGCTACAGTAGGAGCA
ATGGATAGAGAGGTAACTGACGAAGAATTAGCATCAGTTGTTTTAGGAAATTCTATAACTTCTATAATTT
CATCACTATTTGCAGCTCTTCCAACTGGAGTATTTAGCCAAAATACAGTAATTGTATCTATGAACAAAGT
TACAAGTAGATTTGTAATAGCACTAGGGGCACTTGTATTATTACTAGCAGGGATATCTCCAGCATTGGGT
GCAATAATGACAACTATACCATCTTGTGTTGTTGGTGGAGCAACTTTAGTAGTTTTCTCATCAATAGCAA
TGTCTGGTTTCTCTATTATGAGTATGGATGGATTCACTGAAGAAAACAATCTTATAGCAGGTGTATCTAT
AGCAACAAGTATGGGTCTTACAACTGCTCCACAAGTTTTAGACCAATTCCCAGAAACAATTGGAACTGTC
CTTGGAGGGTCAAGTATAGTTTCTGGAGCAATAATAGCTATATTACTTCAAACATTATTTAAATTAAAGT
CACGTAAAAGTGCTGAAAACGTTACTTCAAATCTTGAGGAAAATATTGGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2336793-2335435 putative xanthine/uracile permease [Clostridium difficile R20291]
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AGTGTTTGCCACTATCAATGCAACATATACTAGCAATGATAGTTGGAACTGTTACAGTACCTATAGTCGT
AGGAGGAGCTGTGGGTGTTAGCCCTACACAAATAACACTTTTAGTGCAATATGCATTAATAATAGCTGGT
ATATCAACACTTATACAACTATATCCAATAGGAAATATTGGTTCAAGATTGCCTATAATTTTTGGAGTTG
GTTTTACTTATGTACCAACACTTGTAGCAGTCGGAGGAAATTATGGATTAGCAAGCATTTTGGGTGCACA
ATTAATAGGGGGAGTGGCTACAGTATTAATAGGGATATTCATAAAAAAGATAAGAAAATTTTTTCCGAAT
ATAGTTGCAGGAACAGTGGTTTTTACAATTGGATTATCTTTGTATCCTATAGCAATAAATTATATGGCAG
GTGGTGTAAATAGTCCTACTTATGCCTCTATGCAAAACTGGGCAGTAGCGGCTATAACATTAGTGGTAGT
TATAGGTCTTAGTCAATTTGCAAAAGGATATGCAAAATTGGCAGCAATATTTTTGGGAATTATAGTTGGA
TATTGTGTATCTTTAGTTCTGGGTATAATAAATTTTGACCCTATTAGAGAGGCAACTTGGTTTGCGATAC
CTAAACCGCTTGAATTTGGGATGGAATTTGATATGCCTGTAATAATCTCAGTAGTAATTGTAAGTATAAT
CAATGCTGTTCAAGCAATTGGAGATTTATCAGCTACTACAATGGGAGGCATGGATAGGAATATCACAGAT
AAGGAATTATCAAGTGGAGTAATAGGAAGTGGAATTTGTACTATGATAGGAGCTTTGTTTGGAGGTTTAC
CACCATCATCATATAGCCAAAACGTGGGGATGGTAGCTATGAACAAAGTAATAAGTAGATTTGTGCTTGG
AATAGCTGGTATATTTATGTTATTGTCGGGGTTTGTGCCTAAATTTGGTGCATTAATGACTACTATACCA
TATTCTGTTTTAGGAGGAGCTACAATATCTATATTTAGTATGATAACAATGACAGGTATAAAGTTAATTA
TTACAGAAGAGTTGTCATCAAGAAATATTACCATTGTTGGTTTGGCAATTGCCTTAGGCATGGGAATAAC
ATCAGTACCAGCAGCCCAAGAGGCATTTCCTTCATTTGTAAAGTTAGTATTTGGAGAATCTCCAATAGTA
ATTGCAACATTGGTTGCATTCGTTTTAAATCTAATAATACCAAATAAAAGTCTAGAGGATGAGGCTAAAG
AAAGAGCTGTTATGGAAGAGACTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2338153-2337113 putative sigma-54-dependent transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGACAAACACAGTGATTCAGTAATGTATGGTGGAATGGAAGTATATAATATTTGGGGAACAACAACAG
TAGACTCCATAATTGGAGAGTCTGATGTAATGCGTGCTCTTAAGAATAGAATTTGCAAAATTGGAAATAG
TGATTCTACTGTAGCTATAACTGGAGAAAGTGGCACTGGAAAAGAATTAATAGCAAGAGCCATTCATCTC
GCAGGAAACAGAGGGAATAAAACATTCGTTGCTATAAACTGTGCTGCTATACCAGAACCTTTACTAGAAA
GTGAACTTTTTGGATATACAAAAGGAGCTTTTAGTGGAGCAGATTCAAAAGGTAAAATTGGTAAGTTTGA
ATTGGCCAATGGAGGGGTTGTATTTTTAGATGAGATAGGAGATATGCCAATTCAACTACAATCAAAGTTA
TTGAGGGTATTACAGGAAAAGAAGTTTACGAGAATAGGTTCAAATGAACTAATTGATATAGATGTTAGAA
TCATATCAGCTACTAATAGAGATTTATTTGAGTTGGTTAAGGAAAATAAATTTAGAGAAGACTTATACTA
TAGATTGAATGTAATACCTTTAGAAGTGCCTCCACTTAGAGAAAGAGGAGACGATATACAAATATTAATA
AATAATTTTATAGACAAATATTCGAGAAAAATGAAGAAAAACGTGTACCATATAGAACCAGATGTGGAAC
AAATGTTGCTTAAGTATCCTTGGCCAGGAAATATTAGAGAGTTGGAAAATACTATAGAACTGGCATTAAA
CCTTCTTGAGGAAGATGGAATAATACATAAAGGAATAATAAATAGAAAGATACTTGAATATTTTAAGTTA
AATAATATAAATATAAAGTTACTTGAGGAAAGTGACTATGAGATAAGTATGGAACAAGACATACTTACAC
TTGAAGAGTTTGAAAGAGCCTATATAAAGAAAGTGTTAAAGTTTTACGGAAATGATACTAAGTCTAAAAA
ACTGGCTGCCAAAAAACTTGGAATATCACTAGCTACATTGTACAGAAAAATAGATGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2339748-2338480 hypothetical protein CDR20291_2000 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAAAATATATATGTTAAGGAAACCTATGAATGGATAAGGGTAGGTAATGGTGAAAATGAGCTTA
CAGAAATTGAATATGAAAAATTGCTTAAATATCTAGAGAACAATAATGATGTATTAAAAAGTAATATAAT
AGATATTAAATACAAAAAAATTAGATTTATAAACTATGTAGGCATCATATGTTTTGAAAATGTAATACTT
GAAATACTTCCTAAATTGTCATTAAGTGATAATCTTGTAAAAGATAGAGAGATACTATTACAGATGCTTT
CTATATGTAATAAAATTCCAATTACAATGAATGAAAAAATAAGATTGAGTTTGAAAAATTATAATCTCTT
AAATTTTTTTGTTATGTATTTCATTGAGAGTATGCAAACACAGATGAAAAAAGGTATTTATTTTGAATAT
ATAAATAAAATAGAGAACTTAAATGTTATGAGGGGTAAAATATTATTAAGTACATATGCAAAAGAAAAAG
GCATTTCTCCAATGAAAATAAGATGTGAATATGATGAGTGTAGTGAAAATAATTTCTTGAATCAAGTTCT
TAAAAAAGCATGTATATCTATTTTATGTAGAATAAATGACAATTCAATTCAAGGCAAGATTAAAAAAATT
TTAAGCTATTTTCAAAATGTAGATTTAATTTATATAGATAGAAAAAAACTGTTGGGTTATAAATTTTATA
AAAACAATGATAGATTTAAAGATTGTTATTTACTAGCTAGACTTCTACTTTTAAATCTATCTATGGATAA
TAGTCAAAATAATCAAGAGGCATTTTCTATATTATTTGAAATAAATACTTTGTATGAAGAATATATAGGA
ATTTTAATCAAAAGTATATGGGACAATTCATTTAGAGAAACATATATACAAGATAAGAGTAAATTTCTTT
TGAAAAATGAACAAACAGGTAAGAAAAACTTTAATTTAAGACCGGATATAGTTTTATATGACTTAAAAAA
TGAATATGAAATTATAATTGACACTAAATGGAAAGCTATTGAAGTAGATTCAAATGTTTTTTATAGGTCA
AGTGATATATACCAGATGTATGCATATATAACAGCATATGAAAATGCAAAAAGATGTATATTATTATATC
CTTGTATTCAAAAAGATAAGAATTATAGTTCCTGGAAATTATCAGAATCATTTAAGGGTAAGTTTATAGA
AGCAAAAACTGTGAGGTTAGATGATATAAAAAACACAAAAAATGATTTAAAAAAGATAATTTTTAATTAT
AAATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2341675-2339741 putative restriction enzyme [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTGAAAATATAAGAGGTACAGAGTATTGGTTAATGGAAGAATTTTTTTATCAGGAAACAGACACAC
CACAGATTTTTATAGAAGAAAGCATAATTGCACTTGGATTTGATATAAAAATAAATTTAAAAAAAGTATT
CAGTATGGGGAAAAAATCAGAAAAGTATATTAATGAGAATTGTAATGATAAAGATTTTATAAAAAAGTTT
ATGTCGATTAAAAAAGGAGATTATTTTTTATATAAAGCATATCAAAATATAGAAGAAAAAGTTAAATGTA
ATGTGTCTATTGGCATAGTTGAAGAAGATTTTGAAAATGGATATGAATTAAGTCATATTTTAGGGCATAC
ACTACCAGTAAAATGGATGCATAATTTTGATACAGTTTCAAATTGTAAAGTATATACAAGTGAATTTTAT
AAATTAAATAATAATGATATTAGTTCATATTTAGAAATTATTAAGTCACAAGATAAGAAATTATTGAGAA
AAAGAATAGAAGAAAGTGAAAATAATAAATGGTATTTAAAAAACTATTATTATAAAAATGTAGATAAGTG
TGTAGATGATGAAGAATTATTTATTCAGCCCATTAATCTAGAACAATTAGAAAGCCTAAAAAATATAAAG
ACAGATGATTATATTTTATTGTATAATAGCGAGAAAGTAATTTGTGAAAATGACCATACAATGAAGAGTC
TATTTGGCGTATGTCAAGTTATGGAAGGGTTCGATAAAGAGAAAGTAAGTGCTTTGGATGGTGGATATTT
TTTTCCTGTTAGATGGATAGAGTATGGAAAGGAGAATATAGACGGAAATGCATGGGTTATATTTGAAAAT
AATAGTATAGTTGAAAAGTATGTAAAAAGATTTACTAATAAAATGCCATTAAATACTATACTTTATGGAC
CACCAGGAACTGGTAAAACATACAATACAAAACAGATGGTTTACAATCTAGTAAGTGAAACCAGTCTAAG
AAACAAATACTATACAGGTTACTTAGATTATAAAAACAATGTAGAATTTTGTACATTTCATCAATCATAT
GGATATGAGGAATTTATAGAGGGTCTTAAGTCTGATGGTGAAGGCAATTTTAAGCCAGAAGATGGGATAT
TAAAGGATATATCTATAGAAGCATGTTATAATGCATTGAAATTTGAAAAAAAGATGAGCTTTGAGTTGGA
AAAAGATAGCTTGACTTTAGAAACTATAAAAGACAGGAAAAAGAAATTAGTATTAGAAAATATAGAATAT
AGTGAGAGTTTTAATTTTGAAGAATCAGAAAACTATGTTTTAATAATAGATGAAATTAATAGAGGGAATG
TATCTAAAATATTTGGTGAGCTAATAACATTATTGGAAGATGATAAAAGACTTACTAAATCAAATCAAAC
TATTGTCAAACTACCATATTCAAAGGAAAAATTTTCTCTACCTCCAAATTTGTATATAGTTGGAACTATG
AACACATCAGATAAATCAATAGCACTTTTAGATATAGCTTTAAGAAGAAGGTTTAATTTTGAAGAAATTA
TGCCAGATTATGATTTATTGTCTATTGTAGATGGTATAGATATTAGAAAAATGCTATATACAATCAATAA
AAGGATAGAGTTTTTATATGATAGAGACCATGTTATTGGACAAGCTTATCTACTTGCTGTAGAAAATATT
AATGATATAGTAGTAGTATTTAGAAGTAAAATAATACCACTTCTTCAAGAGTATTTTTATTATGATTCAG
AAAAAGTAGGTTTGATTTTAGGAGGAATTGGAAGAAATGAAAAAGATAAATACATTGTTTATAAAGAAAA
ACTTATAGCTTCTGAGTTATTTAAAAATAATAATGCCTCAATAATGGAGAGTAAAGTTAACTATTGTATA
AAACAAAACATATCTAGTGAGGAGCTAAAAAATATATATGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2342426-2341704 hypothetical protein CDR20291_2002 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATTTTAATAAGAATGCTAAAATAATTGGTATTGGAGTTGAAGGTATTAATATAATAAATGAAG
TAGAAGAAAAAATAAAAGCAAATATGGATATAGAAAAAATAAACATAAATCAAGAGATTGAAAAAGAATA
TGTTAGAAGTCTTTTAGATGGTGTAGATATATTATTTTTGATATATTCATCTGAAGATAAACATATTAGA
GATATTATAAAAGCTGTTTCATATATGTCAAACGAAAGAAGAGTTCTATCTATAGGAATGGATTGTTCAG
AGAAAGAAAATAAAGAAGATTTAGAGCTTGGGAGAGAGTTTAAAATCAATAATGATAGTATATTTAAATT
TGTTGATTTAATGAATATCATGGTAGAGTCTATTTCTGATTCTTGCATGATAAATATAGATATTACTGAT
TTAAAAGAAGCTATTGTAGGAGATAAAGGAATTAAGTATTCTTTTGAAGAGTTTGAAGATACAAAGTCAT
ATAGCGAGATAGCTGACATTTTATTTGACAGGATGGAATATATTGGTGAGGAATTTATAAGTAAGAAAGG
AATTGTATTTGTTGAAGGAAGTCCAGAATTTTCTATAATGGAATTGAATGATTTAATAAGTAATATTCAG
AGCAAGGTAGAAGAAAGCTATGAAGTAATATTTTCTTTATATATAAAGGAAAATTTAAATGGAAATATTA
GAGTAGGCTTATTGTATAATTAG
>ref|NC_013316.1|:c2343480-2342476 hypothetical protein CDR20291_2003 [Clostridium difficile R20291]
GTGAAAAGAGGTGTTTATTTGTCGAAGGTAAAAAGATTGACTGATGTTTGGATATATATTAATGATAAGC
AAAAGTTTACAATAAAAGAGTTGTCAGAGGAATTTAATCTTTCAGCTAAAACAATACAACGATATTTAAA
AGAATTAAATAAAATGGGACTTCCAATTCAAGCAGAACAAGGTAGAAATGGAGGTTATAGGGTGCTAAAT
AATAGCTATATACCTCCTGTTATATTTACAGAAAAAGAAGTTATGATTATACTATTTGCACTTAAGTCAC
TTCAGATTTATAATTATAAGTTAATGGAAATAGAAATTAATTCTATAATGAGAAAAGTAAGTTATGAACG
TAAAAGCAGTATAAAAGTAGGTATAGAAAATATTAAAAGATACATTGGCTTTGTAGCTAATGATACTAAT
GATGGAGATTTTAAGAGTAGTAATGTAACTGAGTTTTTTAGAGCTTCTTCAGAATCTCTAATTTTAAATA
TTAAGTATAAGTGTGGTAATCAGATTTTGGAAAAAAACGTATGCCCTATAGGTATATATTTAAATAAGGG
AGCATGGTTTTCACCAGCATATGATTGTAAAAGTGATAAAATAATATTAGTTCATATAGATAATATAATT
GATATAAAAAGAACAGGAGAAAGTAAAAAAATACATATAAACTTGGAAGAATGGTTACATGAAGTATATA
ACAATTTATATGGAAATAGTTCAACTACTAAAAAATTTGGTGAAATTATTTATCTAAATGTATTATTAAC
TAAAGAAGGTGTTTCTAAAATAAAGGACAGTTCTTGGAATTTAGATATGGAGCTAAATGAAGATGGTAGT
GGAATAATTAGTACATTCATAAAGGTTGAAGATATAGATTGTTATGCTTCGATTTTATTTTTTATTGGAA
ATAATGCTAAGGTTATAGAGCCAAAATTTTTGAATAAGCTACTTTATGATAAGGCCAATGAGTTAAGATA
TTTTTATGAAGAAAATATGGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2344019-2343519 hypothetical protein CDR20291_2004 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAAAAATAGTATTAATATAGCACTAACTGCAGCAATTACAGCAATCTATGCAGTTTTAACATTAT
CATTGGGATTTATAAGTTATGGACCAATACAATTTAGGGTAGCAGAGATTATGATGCTTTTGGCATTTTT
AGATAAAGGATATATAGTAGGTCTTACATTAGGTTGTTTTTTAGCAAATGTAATAGGACCATATGGTGTA
CCTGATATAATTTCTGGAACATTAGCCACATTTATAAGTGCAAGTATGATTTATATTACTAGAAAGTTAG
GTAAACAAAATAAAAGTACTTTAGTTATAGCTTCTTTATGGCCAACTGTTATAAATTCGATTGTGGTTGG
TCTAATGTTAAATGTATTCTTTGGGCTTCCATTAATTCTATCTATGATACAGGTAGGTTTTGGAGAATTT
GTAGTAGTAACAATTGTAGGAGTACCATTTTTCTGCTTTTTAATGAAAAAATATAAAAATGTCATTAATA
TTAAATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2344616-2344305 hypothetical protein CDR20291_2005 [Clostridium difficile R20291]
TTGGCTGGTAATCTAAATAATATGAGAGCAGTAAATAATTTTAGAGGAGATAAGAACATTTTAGAATGTT
TAGTCAGCTTTGAGGGTCGTTCAATAAGTCAGAGAAAAGTAAGGGTATTTTTTAAAGAAAAACAAAATCA
AATAGAAATTGATTTTGCAGAAGAGGAAATTTCTAAATTGGTTGAAAATGTTGTTTTAAATACATCATAT
CAAGAAATGTTATATGATGAAATAGAGAAACAACTGGAAATTGATTGTATAGGTACTTGGATGATATTAT
CTAAATTAAAAGATGGTAGTAGAGTTCACTGA
>ref|NC_013316.1|:c2347020-2344756 putative molybdenum-binding subunit of oxidoreductase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATAGTTGGAAAAGGAATCAAGAAAATAGATGGAATGAGTATCACAACAGGAAAGCCTGTATATA
CAGATGATTTATCAGCAAAAAATGCTTTGGTGGTAAAGATACTTAGAAGTCCTCACGCTTATGCAAAAAT
AAAAGATATAGATACATCAAAGGCAGAAATGGTTGATGGTGTTGAATGTGTTTTAACATATAAAGATGTA
CCAAAATCTCGATTTACACTTGCTGGTCAAACATATCCAGAGCCATCTCCATATGATAGATTAATTCTTG
AAGATGTTGTAAGATATGTAGGTGACGAAGTAGCTATAGTGGCAGCTATAGATGAAAAAACTGCAATTAA
AGCAATGAATCTTATCAAAGTAAAGTATGAAGTACTTACACCTGTTTTGGATTTTGAAGAGGCAATAGGA
AATAAAACTATGGTACATGATGAAGATAGACATTGTAACTTTGATATAGGTATGCAAAGAGAAAAAAATA
TAGTATCCCATCATGATTATACAAAAGGTGATGTAGAAAAAGTATTAAGTAATTGTGATGTAGTGATTGA
AGAAACTTATTATACTCAAGCTCAAGCACATGCAATGATGGAGACGTATAGGGCATACAATTATTTAGAC
CATATGGGAAGATTGGTTGTAGTAAGTTCAACTCAAATACCATTTCATGTAAAAAGACATTTATCTCGTG
CACTAGAAATACCAGCTAGCAAAATTAGGGTTATAAAACCTAGAATTGGTGGCGGATTTGGTGGTAAACA
AACTGCGTGTGTTGAGATTTTTTCTGCAATTGTTACTTTAAAAACAGGGAAACCAGCTAAAATAATTTAT
GATAGAAAAGAAACTTTTAATTGTTCAACAAGTAGACATGCAATGAGATTAAAAGTTAGACTAGGTGCTA
CAAATGATGGCATAATAAAGGCAATAGATATAAAAGCACTTTCTGATACAGGAGCATATGGAGAGCATGC
TTCTACAACTATTGGTTTGGTTGGAGAAAAAACTTTACCAATGTATAATAAAGTTGAAGCAACAAGATTT
ATTGCAGATGTGGTATATACTAATAAGATGCCAGCAGGAGCACTTAGAGGGTATGGAGCATCACAAGGAT
GTTTTGCTGTTGAATCAACTATAAATATGCTTGCTAATAAATTAAAAATGGACCCAACAGATTTAAGGTT
AAAAAATGTGGTAACAGAAGGTGAAACTACATTTGCATATGGTAAAACTTTAAATAGTGTCGATTTAATA
AAATGTATAAATAAAGGCAAAGAACTTATTGGATGGAATGAAAAATATCCTTGTAAACATCTTGATAATG
GAAAAATTAGAAGTGTGGGTATGGCAATTACTATGCAAGGTTCTGGTATACAAGGTCTTGATAAGTCTTC
AGCTGAAATAAAATTGAATGACTGTGGAGATTATACTCTTATGATAGGTTCTACTGATATGGGTACAGGA
AGTGATACGATTTTAGCTCAAATGGCTGCTGAGGTTCTTGATACAAGCATTGAAAATATAACAGTTATAT
CAGCTGATACTGACTTAGTTCCATATGACCCAGGTTCATATGCTTCAAGTACTACTTATGTAACAGGTAT
GGCAGTAGTTAAGGCAGCTCAAGACTTAAGAGAAAAAATAATTTCTGCTGGAGCAACTAAACTAGGTGTT
GAGAAGGATGAAGTAGAATTTGATGGTATAAAATTAACTAGTAAAAAAGGTAGCACTTTATTATTCGATA
TAGCAGTTGATTCTACAATTGGTCCAGATACTAATCAATTAATAGGTCTTGCTTCTCATGGTAGCCCAGT
ATCTCCTCCACCTTTTATAGCAGGTTTTGCAGAAACTGAAATTGACACAGAAACTGGAAAAGTTGATTTA
GTAAATTATGTAGCTGTAGTAGATTGTGGAACGGTTATAAATAAAAATCTAGCTAAGATACAAGTTGAAG
GTGGAATTGTTCAAGGGATTGGAATGGCATTATTTGAAGAAGTTAGATACACAGAAAAAGGAAGCATGGA
CACAAATACATTTATGCAATACAAGATTCCAGCTAGATGTGATATTGGAAATGTTAAAGTAGATTTTGTT
GAAACTTATGAACCAACTGGACCATTTGGTGCTAAATCTGTTGGAGAAGTTGTTATAAATACACCTTTAC
CAGCAATACAAGAAGCTGTGTTTAATGGAATTGGTGTAAGAATAAATACACTCCCTATTACACCTGAAAA
AGTTTTTATGGAAATGAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2347473-2347024 putative [2Fe-2S]-binding subunit of oxidoreductase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAGTAAAGATTAATATAAATGGGAAGAAAAAAAGTGTTGATATAGAACCAGAAGAATATCTGGTTG
ATACTTTAAGAAAAGTTGGTAATTTAAGTGTGAAAAGAGGTTGTGACACAGGCTGTTGTGGTTTATGTAC
AGTTTTAATTGACAAGAAACCTACATTATCCTGTGCAACACTGACATTGAGAGCTTTAGATAAAGAAATA
ACTACAATTGAAGGTTTAGAAAATGAAGTTAAAGAATTTAGTGAAGTTTTGGTAAAAGAAGGAGCTGAGC
AATGTGGTTTCTGTTCTCCTGGCTTTATACTTACTGTACTTGCAATGAAGGATGAGCTTGAAAATCCTAC
AGATGATGAAATAAAGCATTATCTTACAGGAAATCTATGTAGATGTACAGGGTATATGGGACAGTTAAGA
GCTATCAAAACTTATCTGGAGGTAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2348261-2347473 putative FAD-binding subunit of oxidoreductase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTACGGTTATGGATATTGTACAGCCAGATACAGTAGAAGAAGCGTACTCAATTTTAAATAAAAGAA
AAACTAACCAAGTAATTGGTGGAAGTGCTTTTTTAAGAATGGGGAAAAAAAGAATAGGAACAGGAATAGA
ATTATCTAAATTAAATTTAGATTATATAAAAGAGTATGAAGATTACGTTGAGATTGGTTCTATGACTACT
TTTAGAACATTAGAAACAAGTTCCATAATAAAAAATAATTTTGGAAGAATAATAGAAGATTCAGTTAAAA
ATATAATAGGAGTTCAGTTTAGAAATGTAGTAACAGTTGGTGCAACAGTATTTTCTAAATATGGTTTTTC
TGACTTGATAGTAGCATTACTTTCATTAGATACGGAAGTAGAATTATATAATATTGGGAGAATTAGTCTT
GAAGAGTTTCTAAATAGAGATTATGAGAAAGATTTACTTATTAAGATATACATAAAGAAGACAAATAAGA
ATGCTTCTTATAAATCACTTAGAAATGCAAAGAGTGATTATCCAATTCTAAATGTATCTGTATCAAAACA
TATGGAACAATTTAAGTTATGTGTAGGAGCAAGACCGCAGAAAGCTACGATTGCAAAACAAGCTAGTGAA
TTTCTATCTAACAATGAAATCAATGAAATTAATATAGATAAAGCAGTAGAAATAGCATCAGAAGAACTAA
CTTTTGGTTCTAACATGAGAGCATCTAGGGAGTATAGAAAAGCTATGAGTAAAGTACTTTTAAAAAGAGC
TATAATGGAGGTTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2349724-2348456 putative Na(+)/H(+) antiporter [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGCATCTATACACACAATTGCCAGCAATAATTTATTGATAATTTTTGCTATTGTAAGTATAACTG
GAATAATTTGTAGTAAGCTTAGTGAAATAATAAAGGTTCCAGATGTAGTGTTATATTTACTTGTAGGTAT
TTTAATAGGACCATCATTTTTAAAATTTATAGATATTCGTGGATTTCAAATAGAAAATCAACTAATACTT
ACATTTGGTTCTGCATTTATTTTATATTTAGGTGGAAAAGAAATAAGTTTAAAAGTATTGAGAAATGTGA
AGATATCTGTATTCTTATTAGCTACTTTAGGAGTTGTGATATCTGCTTTTATAATGCAACAAGTAATAGG
ATTTACTTTTGGGATAAGTGCAATGACTGCTTTACTAGCAGGAACTATAATAGCATCAACAGACCCAGCC
ACTCTTGTACCTATATTTAATCAGGTAAAGATAAAGGATAGGGTAAAACAAACTGTAATAAGTGAATCAG
CTTTTAATGATGCAACAGGAGCTATACTAACATCAGCAGTGTTGGCTGTAATTTTGTCAAATAAATTTTC
ATTAGGTGAAAATATTTATGAACTGGGGACAATGGTTATTGTCGGAGTTTTAGTTGGTTTAATTACAGGA
ATACTGCTTTTGAAATTAGTTAATGATAAACCTTATGGAATATTTAAAGATTTTGCACCAATAATATCTG
TTATTTCAGTTGTAGTTGCATATGAATTATCTACAAAATTAGGTGGAAGTGGATATATGTCTTGCTTTAT
TGTAGGTATAATAACTGGTAACAAGAAAAACTTTAAAATTTGGTTAAGTCAAAAATCTTATGATGCAGAT
TTTTATGTTGCTGAAACTTTAGGTACTATTTGTCGTATGGCAATATTTATAATATTGGGTAGCCAAGTTA
ATTTGGCTCAGTTAAGTAAATATTTTATGCCATCTGTAATTACAGTATTAGTATTAATGTTTATAGCAAG
ACCACTTTGCGTTTTAGTTTGTACACTTGTAGACAGGGAAGCAAAATGGAGTAAAAGTGAAATATTATTT
ATGATGTGGGTAAGGGAAACAGGCGTAATACCAGCAGCACTTTGTGGTATTATTTCAGCAATGAAAGTTC
CTGGATACGAAGTGATTTCATCTGTAGTATTTATGACTATATTAATTACATTAGTAATACAAGGAAGTAC
TACAAAATTAGTAGCTAAAAAACTTGGATTATTAGAAGAAGAAGTGATAAATATAAGTGAAAAAGTATCA
ACTTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2351457-2350375 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAAATTATCCAAAAGAGAAAAAGATTTTATTCAATATGGATTTTTATTATTTTTGATATGTATTA
CTACTTATTTAGTATTAACTACTTTAGATATAAAACTAATACCTAAAATTATAAGGCTAGTAAATAAGAC
TTATATATTTCTTGGCATATTGACAATTATAGTATATATGATAATTGAATCTATTGTAACTCATTTGATA
ATAAATGCAGTTCAAAAAACAAAAGTAAAATTTATTGGTATTAAAATGGCTACAATGGGATTTTACTATA
ACTTAGTTACTCCATTTGCATCTGGGAGTCAACCAATGCAAATATATGCACTTACAAAATATGATGTAAG
CCTTAGTAAATCAGTGGCTATAGTTACTAATAAAACTGTAGTATTTCAAAGTACAGTTACTGTATTTTGT
GGAATTTTAATTTTGCTAAATAAGTCATTACTGATGGAGCAAGTACATTCTGTGAAAGTCTTGATAACTT
TTGGAATGATTATGAATGTAAGTATGTTGTTAGGTGGACTATTAATAGTATTTAGTCCAAAACAAGTAAA
AATGATAGCAGAAGTTTTGATTAATTTTTTATCTAAATTTAAAACATTTAAATTTTTAGATTCAAAACGT
GATAGAATAAATCATTATATTGATGATTATAATTATTCTATAAAAATATTTATTAAAAATGTAAGAATCT
TAGTTTTAAGTATATTACTTACTGTGTTACAATTAATCGCATATTTCAGTATAGTTTATTGTGTGTATAA
AGCCTCAAATTTAAGAGGAGTTTCATATGTACATATAATGACATTACAGGTCTTTTTATATATGGCTATA
TCACCAATTCCAACACCAGGAAATGTTGGAGCTAATGAGGTTACATTTTTTACTATGTTCTCCAATATAA
TTCCAAAAGAATTATTGGGGTACTCTGTACTCTTATATAGTGGGTTTGTATACTATTTTATATTAATAGT
TTCAGGTTTATTTACATTTGGAACGCATTATACATTAAATTCTTGGAAAAAGGAAGATAAAGTAAATTCT
AATTTAGATAAGGTTATTGAAAAATTAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2353155-2351560 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCAATCTAAGTATATTAATAAAAACTAATATAATAAATGAATTTAAATTAAATGCGTTAAAAAAAG
CTGATAGTAGAGAAAAACAAAAAATAATGGGGATGATACTTTCAGTTGTTATTATAACAGGGTTATTGAT
TTTTTATGTAACTAGTATAAGTCTTTCTTTAGTTGATATTTTAAAGCAAATAAATCAGATGGAAATGCTA
CTTATATTTGGATTTGGATTATCAACATTAACAACTATTGTTACATCATTATATAAAACGTCATCATATC
TGTTTCAAGCAAAAGATTTAGACCTTTTGACTAGTTTACCTATAAAAGAATCTACTGTACTAGCAAGTAA
GATATTAATGTTGGTTGGAGCAAACTATTTATTTTCTTCAATATGTATGATTATACCAGCAGTGGTTTAT
TTTTTTAATTCTGATGTAAGTATAACGTATTTCCCTTATTTGATACTGCTATTTTTAGCTTTACCATTAT
TACCAATAGTTGCTTCATCAATAATTTTTATGTTTATAGGACAGATATCATCAAGAATAAAATACAAAAA
TTTAATATTAATTATAGGTAGTATTATATTGATGTTGCTTTATACTCTACTTATGACAAGACTTAACTCT
ATGTCGGTTGAGATGTTAAAGAATAGTGTATCTATTTCAGAGACGATTAGAAAAATATATCCACCTATAT
ATTATTTTGTTGACGCTCTTAAAACAGGAAGTGTAGTTTCCTTTTTAGCATTTATAGCAATTTCAATAAT
ACCATTTTTTATGTTTGTAACATTATTTGCAAAAAAATTTAAAGATATAAATGCTAAGATGAGTGAAGGA
TATAAGTCAAAAACTTATAAATTTAAGAGCCAAAAAACTTCAAGACCTTCAAAAGCTCTATTAAAAAAAG
AATTTAAGAGATATACTTCTTCATTTATATACTTTTTAAATTCATCTGCAGGTTTGTTATTCCTAATAAT
AGGTACAATTTTAATATTATTATTTGGAGCAGATAAAGTGGGTGAGTTACTGAAATTGAATATAGATTTT
AATTTTATAAAAATACAATTATTGGGAGTATTCTTCTTTATAATAGTAATGAATTGTACAACATACTGTT
CAATTTCTCTTGAAGGAAAAAATTTATGGATACTGAAATCTTCTCCAATAGATGAAAGAGAAATATTCTG
GTCAAAAATATTGATGAATTTTTTATTGAATGCACCATTATCTATTTTATGTTTAATATTAGTATCTATA
AGATTAGGTTTTGAAATTCAGTTTATTATTGTATCAATCTGTTTGATTGCAAGTTTTTCAATGTTTGTGG
CATTGATGGGATTATTATCAAATTTATTATATCCAAACCTTGATTGGAAAAATGAGATGGCTGTAGTAAA
AAGAAGTGCAAGTATGATAATTACAATGTTAGTATCATTAGCTTACGTAATTATACTTGGAGGTATATAT
GTATTACTTGGAATTTCGTTTTTAAATATATATATTATTTTGGCAAGTATACTTACTTTTATATTAGATT
TTATGATATGGAGAATTATTTCTACTAAAGGAGTAAGAATATTTAAAAATTTATAG
>ref|NC_013316.1|:c2353972-2353202 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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AAGTAATCAATGTATCTAAATCATATAAAAATAAAAAAGTAGTAAGTAGTGTCTCATTTGATGTAAATGA
TGGAGAGCTTTTTGGGTTTATAGGACATAATGGAGCAGGTAAAACTACTACTATTAAAGCAATTGTTGGA
ATACACGATTTTGAAGAGGGAGAAGTACTAATAAATTCTAAATCTATAAAAAAACAGCCTGTTGAATGTA
AAAAGGAAATGGCATATATACCTGATAATCCAGATTTATACGAGTCATTAACGGGTATACAATACCTTAA
TTTTATAGCTGACATATTTGAAGTTGCCAAAGACAAAAGAGAAGAGTTAATAAAATATTATTCAAATAAG
TTTGAACTCAATAAAGCATTAGGAGATTTAATATCTTCATATTCGCATGGTATGAAACAAAAATTAGCTA
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AGCTTCCTTTATATTGAAGGAAATTATGAGGGAGTTTTGTGACAAAGGTGGTTGTATATTTTTCTCAACA
CACGTTTTAGAAGTTGCTGAAAAAATTTGTGATAAGATTGCCATAATAAAAGATGGAAATATAATTGCTT
ATGGAACTACAGAAGAAGTTAAGGGAAGTAATTCACTTGAAAGTATCTTTATGGAATTAATAGAGAAATA
A
>ref|NC_013316.1|:2354161-2355306 putative ATP-dependent RNA helicase [Clostridium difficile R20291]
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CTCCAACAGAAGTTCAGTCACTTGTTATAGGGAATATAATTCAAAATAAGGATTTATTGATTAATTCACA
GACTGGAACAGGAAAAACACTAGCGTACCTTTTACCTATATTTGAAAAAATTGATACATCAAAAAGAGAA
ACACAAGCTCTTATACTTGCACCTACGCATGAATTAGTAATGCAGATTACAAACCAGGTTGAATTATTGG
CTAAAAATGCAGAACTCTCCGTTACTTCTTTAGCTTTAATTGGGGAGGTCAATATACAAAAACAAATAAA
AAATATAAAAGCAGTAAAACCACACATAGTAATTGGCTCTTGTGGAAGAGTTTTAGACTTGATAAAACAA
AAGAAGCTAAAATCACATAATATAAAAACTATAGTCTTAGATGAAGTGGACAATCTATTGAATGGAAAAA
ATATAACTTGTATAGAAGACATAATAAGAACAACGTTAAGAGATAGACAAATTATAGGATGCTCTGCAAG
TCTTACTGATAGCACTATAAAAATTTGTGATAAACTTATGAAGGAGTTTGAAATAATAAAAACAAAGGAA
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TTAGAAAGGCATTAGCAGCTACAAATCCAAAAAAAGCTATTGTATTTGTAAATAATGAAAAAAATATAGA
AGTCCTAGTATCAAAACTAAATTATCATAATTACAAAGCAATAGGAATTTTTGGAAATATGGAAAAAGAA
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CTCGTGGACTAGATATTGTGGATGTAAGTCATGTTTTTAACTTGGATTTTCCAAAAAGTAAAAATGAATA
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GAGAACTAATAGACATTATTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2356796-2355420 putative xanthine/uracil permease [Clostridium difficile R20291]
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AGAAGGAAATAATTGCAGGAGTAACTACTTTTTTAACTATGGCTTATATAATAGCTGTAAATCCAAATAT
TTTATCTGAGACAGGCATGCCTGCAGGTGCACTTGTTACAGGTACTTGTTTAGCAGCAGCATTTGGATGT
ATTTTAATGGGTGTAGTTGCTAACCTTCCTTTTGCTTTAGCATCAGGTATGGGTCTTAATGCATTTTTTG
CATATACAGTAGTTTTACAAATGGGTGTTCCTTGGGAAGTAGCTCTTACAGCAGTATTTGTAGAAGGTAT
TATTTTTATAGTATTATCAGTAAGTGGAGTTCGTGAGGCTGTTGTAAATGCGATACCAAAAAATATGAAA
TTAGCTGTTACAGGTGGTATAGGAATATTTATTGCACTTATAGGTCTAGTTAACAGTGGAATTGTTATTG
GAGACCAAGCCACTCTTATCAAAATGGGTAGATTTACACCAGCAGTAATAATAACTTGTTTAGGATTAAT
AATTATTGCTGTATTAGATAAAAAAAGAGTTAAAGGTTCTATACTTTTTGGAATAGTAGTGAGTTCATTA
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TATTTAAATTCGAAAGTTTAGCACCAATAGCAGGTAAAATAGATTTAGGATATGTACTACATCCAACAAA
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TACTATTGCTTGTATGGCATTAACATATAGTATAGGTGATGGTTTAACTTTAGGTATATTAACTTATGTT
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>ref|NC_013316.1|:2357242-2358588 putative drug/sodium antiporter [Clostridium difficile R20291]
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GTTTATTTCAACAACTATACAATACAGCTGACAGTATAATAGTTGGTAGATTTATCGGAAAAGAAGCAAT
GGCGGCAGTCTCTGGAGCTAACCCTATAATGTTTTTATTGGTGGCAGCGCTTATGGGTGTTAGCCTTGGA
TTTTCTATTTTAGTGTCACAATTTTATGGCTCAGGAGATTTAAAAAAGGTAAAAGCTACTATTGATACTA
CATATATACTTTTATTTATTGGTTCTATATTAATAAGTATTCTTGGAATAGTATTTGGTGGCCCAATGCT
TAAGCTTATGAATACACCAGAATCCGTTTTTGCTCAATCAAAATTGTATCTTACTATAATATTTAGTGGA
ATATTATTTTCTGCTGGATATAATTCAGTAAGTGCAATACTTAGAGGACTTGGAGATTCAGTAACTCCAC
TTTATTTTCTGATAATAGCCACAATTCTAAATATAGTTTTAGACTTAACTTTTATTGTAGTGCTAAGAAT
GGGTGTTGAGGGCGTTGCACTTGCCACTATAATGGCTCAGGCAGTATCATTTATAATAAGTATAATTTAT
TTAAATAAAAAACATGAAGTGCTTAAATTTAAAATCAAAGGAATTGTATACGATAACAAAATATTTAAAG
ATGGACTTAGATTAGGACTTCCAAGTGGAATTCAACAAATGTTGTTTTCAATTGGAAATATGACTCTTCA
ATTTTTAGTTAATAGTTATGGTACATCTGCTATGGCAGCTTTTGGTGCTGGTCTTAGGATAGAAAATTTT
ATAAGCTTACCTATTATGAATCTTGGTTCTGCTGTTTCTACTTTTGTTGCTCAAAACATAGGTGCTGGAG
AAAATGAAAGGGTTAAAAAAGGCATTCGAGAATCTATAAAAATGACCTTAGTTTTAGCAGTTACAGTTAT
TGCTTTAATTTTGCTATTTAGGGAAAATCTAATTGCTCTATTCAATACTGATAAAGATGTCATTAAAATT
GGCTCTTCTTACTTATTTATAATAGGACCATTCTTTTTATTTATTGGAACTTCTTTTGTACTTTCAAGTG
CAATGAAAGGTGCTGGTGATTCCATGTTTGCACTTATAAGCTCAATAGTATCTTTATGGCTTGGAAGACT
TCCAGCTTCTTATATGCTTTCTAAATTTTTTGGAACAGACGGAATTTGGATGGGTATTCCTTTTGGTTGG
ACTTTAGGTCTTATTGTTACAGTTATCTACTATAAGAAAGGGTATTGGAAAACTAAAGCTATTGTAAATC
ATAGAATCAATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:2358648-2360060 putative sodium:sulfate symporter [Clostridium difficile R20291]
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TAATTCTCTACTTCTCTCTTAATTACAGTTTCAACATAAAATTTTCTATATGCTTATCTTTTTTAACTAT
CTTGATATGGGCTGTAGACTCAGTTGAAAAAACTTTTGTTGCATTGTTTTTTGTAATTCTAGCGTTTATA
TTTAACATTGCACCAATAAAGGTTATTTTACAGTTTTTATTTACAGAAAATTTTTACATAATAATTCTTG
CATACATAATTACTAATGCAGTTACAAAAACAGGTGTCGCAAAAATTATTTCTGAGAAGTTAATTTTAAA
TACTGTAAATACCCCTAAAAAGATGATTCTTTTATCGTATATTTTAGGTATTCTTTTAATATTTTTTATC
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CTGAAGATTCAAAATCTATACTTTTATTTAGTATATTTACAGCATCTACCTTTACATCAATGTTTTTTGT
AAATGGAGACACCCTTCTAAATTATGTTGTACTAGAACTTGGAAATTGTAATATAAATTGGGGTCAATGG
GCTTTTTATATGTCTGTTCCAACTATAATTACTTGTTTTATAACTTATTTTTTATTTATCTTTGTCTTTA
AAAAAGAATTGCATTCAATAAAATTTATTTCTAATGAAAATCTTGAGGGTAATAAACTTCATTTTTCATA
TTCTAATTTAAAAAAAGAATTTAATTTGCTAAACAAAGAGCAAAAACACGTATTTTTATGCCTAGGAATA
ATGTTTTTTATGTTTTTAACTCAGTTCATACATAACATAAACACATTAATTATAATGTCAATTTGTGTAC
TTCTTTTATTACTAAGAAAAATAGTTGGATTTAGTACTTTAAAAGAAATAAATTGGAAGGTCCTTATTTT
TTTTATAGCAGCATTTTCAATTGGAGGAGTGTTAAAGTACTCTGGAGTTGTAGATATAATGGGAAATTAT
TTGATAAAGTTTATACCAAACTCTTCAGAAATTATTTCAATATTGTTTTTGATAACTCTCACAATAATCT
TGAATATATGTCTTGGAAGTGCTGTCACTACATCATCTGTAGTAATACCATTACTTGGAAGTTTACATAT
ACTAAAGGAAAATAGTGTTACTTTATGTCTATTTGTCTACATTATAGTAAGCATACAGTACATATTACCA
TTTCATCATGCTACAATAATGGTTGGTCATGGTGAAAATCTGTATAATAGCAAGGTTATTTTCAAATACG
GTTTAACTTTGATTCCTTTAACCTACTTTATAATAATATGTATAACATTCCCTTGGTGGAAATTTATAGG
ACTAGAAATCTAA
>ref|NC_013316.1|:c2360856-2360182 fructose-6-phosphate aldolase 2 [Clostridium difficile R20291]
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GTGTAACTACAAATCCAAGTATTGTTTCAAAAGAAAAAAAGAATTTTAAGCAACTTATAAATGAAATTGG
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GAGCTATAAAAGACCTTCACAGAAAAGGTGTAAAAATAACTGCTACTGCAATATTCACTGCTCATCAAGG
TTTTTTAGCTGCAAAGGCTGGAGCAAATTATATTGCACCTTATGTAAATAGGCTTGATAATATATCTGGT
GATGGAGTAGCTATGGTTTCAGAACTTATAAAAATAATAGATACTTATAAAATGGATACAAAAGTACTTG
CAGCCAGTTTTAAAAATGCACAACAAGTTATAGAATTAATGCAACATGGGGTGCATAGTGTTACAGTACC
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TGGGAGAATACTTTTGGAAAAGGAAGTAAAACAAATAATATTTAG
>ref|NC_013316.1|:2361130-2361894 DeoR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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AGCTCAGTTCTAAATTTAATGTTACAGAAGATTGTATAAGAAAAGATTTAAAAAATATAGAAAAGATTTC
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AGAAAAGAAATTAATATTCCAACAAAGAAAATAATAGCAGAAAAAGCATTTAATTTAATTGAAGATAGAG
AAACTATATTTTTAGATATCTCTACAATTAACATCTTGCTTGCAAAGTTGTTAGCTGAAAGTAATAAAAA
AGTAACACTTGTTACAAATATGTTGGATATACTAAATGTAGTTACTTCAAAACCAAATAATTTAAATATA
ATTTCCACTGGAGGTTTATTAAATCTCAGTTTAGACGGTTTTGTCGGTACTCCAACTATAGAGTTTATAT
CGAAATATAAGTTTGATAAGACTTTTATGGGAAGTTGTGGAGTAGATGTATTCAACTCTTCACTTACAAC
TTTTGAAATTGAAGATGGTCTCACGAAGAAGGCTATAATAAATTCAAGTAAAAAAGTATTTATAGTTATG
GAAGATAAAAAGTTTAAATTTGATGGAAATTTCAAGTTTGCTCATTTAGAAGATATTAGTTCTATAATTA
CAGAAAAAGCGCCTACTCCTGATATAGTAGATATTTTATCAGAATTTAATGTAAATGTTTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2362481-2362182 hypothetical protein CDR20291_2019 [Clostridium difficile R20291]
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TGAAGAATGAAATGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2364081-2362804 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
TTGAGAAGGATATTTGATAAGTGGGAAAAGTTAAGTATAAAGTATAAGTTATTTTCAATAACGACATCAT
TATTAATAGCGTTAGCTTTAATAATATATCTAATTTTATATTTTTTATTGCCATCATATTATCATGAGTA
TAAAATTGAGTCTCTTCAAGAAAGTTTAAAATCTTTAGTAGATAGTTCAATTCATTTCGATACATATACT
TTAGAAGAAAGACTTTATTATATGGCTAAAGACCAAAATTTGGCTATTTTATTAAAAGATAACCAAGGGA
AAATTGTATATGGTAAGAATGAAGTAGTTATTTTAAGATATAGTAAGTACATGATTAATAGTCTTGAGGA
TGAGTATAGAACTTCTATACCTATATATACTAAAGATGCAAAAGATGGTCCATATACTTTAGAACTCGTT
ATGCCATTACAACCAATTGACGAAGCAAACGAAGTTATAAGAAAACTAATGCCATACATCATATCAATAG
CAATATTGATAGCGATTATTGGAGCATATATATATTCAATTGTAATAACAAAGCCTCTTATAAATATAAT
AGAGAGTGAGAGAGAACAGGAATATAGAAGGAAGGATTTTGTTGCTACAATATCACATGAACTAAAAACT
CCAATAACCATAATAAGTGGTCAAATTGAAGGTATGATTTATAGTGTAGGTAAGTATAAGGATAGGGATA
CTTATCTGAAAAAATCATATGAATGTACACAAGAATTAAAAGATTTAGTAAATGAAATGATAGAGGTTTC
AAAATCAGAAATACTTGAAAAAGATTTGAAATTGGTATCAATAAATATAAGTGAATTATTAAATAGACTT
GTAAAGAGACAAGTATTTTTAATAGAAGAAAAACATATGAAAACTATTTTAAAAATAGAAGAAAATTTGG
AAATTAAAGCAGACCAAGAGAGAATAACTAAGGCAATCAATAATATAATAAATAATGCCATAAAATATTC
TCCTGAAAAATCAGAGCTTATAATTAGACTCTATGATAAAAATAAACGAATAAGTAAAAAGACTTCTAAT
CAAAGAGTGGTTTTAGAAATTGAAAATACTGGTGTAACTATCGAGAAACGTTATTTAGAAGAGATATTTA
ATCCATTTTATAGAATAGAAAAATCCCGTTCAAGAAAAACTGGAGGAAGTGGACTTGGACTTTATATAGT
CAGTCAAATTTTTAAAAGTCATGGGTTTGATTATAGCATAAAAAACAAAGAAAACTCTGTAGTATTCACA
GTAGAATTTAAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2364733-2364065 two-component system response regulator [Clostridium difficile R20291]
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CAGAAGGTTATCAAGTTGATACAGCAAATGATGGGTTGGAAGGTATACAAAAGTTTAAGCAAGGAAGTTA
TGATTTAGTAATATTAGATATAATGATGCCAAACTTAGATGGTTATGGAGTTTGTAAAATGATAAGAAAG
TCATCAAGCGTTCCAATTATATTTTTAACTGCTTTAAATGATGAAGGAGACCAACTTAAAGGGTTTGACT
TAGAATGTGATGATTATATAACAAAACCATTTTCATTTAATCTTCTTATAAAAAGAGTAGAAGCAATTTT
AAGGCGAAGTAACAAGACTATAAATGACAAATTTATAGTTTTTGAAAAATTAAAATTAGATTTAAACACA
TATATTGCAGAGATAGATGGAGAACCTATAGAACTTACACTAAAAGAGTTTAATATATTAAAAGCTTTGA
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AGATACTAGGATTGTTGATGCACATATAAAAAATATAAGAAAAAAAATATCGTTACCATATATTAAAACT
GTAAAAGGAATAGGATATACACTTGAGAAGGATATTTGA
>ref|NC_013316.1|:c2367394-2364893 putative copper-transporting P-type ATPase [Clostridium difficile R20291]
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TAGAAAGAGTAACTAAGAAGATGGATGGAGTATATGACCAAAGTGTAAATATAGCTACTGAAAAACTTAA
AATAGAATATGATAATTCTAAGGTTAATTTTGATGATATAAAGCAGGTTGTAGAAAAAGCAGGATATGGA
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AAGCTGTAGAGAGAGTGGTAAAAAAATTGGATGGAGTAGAAAGTATTAGTGTGAATATTGCAACAGATAA
AGCTAATATAGACTATGACCCATCAAAAGTAAAATTATCTCAAATAAAAGCAGCTATTGAAAAAGCTGGA
TATAAACCAATAGAAGAGGTAAGAAATAAGGTTGATGTGGATGAAGATAAATTGAGAAAAGAAAGAGAAA
TGAAGTCTTTATTTGTTAAATTTATAGTTGCAATAGTATTTGCAGTACCTCTGTTTTATATAGCAATGGG
ACCTATGATAATAAAGCCTATAGGGCCATGGCCTTTGCCAGAAATTATAAATCCTATGACAAATACTTTT
AATTATGCATTAATTCAGTTAATTTTAGTAATACCAGTAATGATAGCTGGTTATAAATTTTATATAAATG
GGTTTAAATCACTTTTTTCTTTAAGCCCTAATATGGATTCTTTAGTTGCAATAGGAACATTAGCCGCATT
TTTATATAGTCTATATACGACACTACAAATAGCCAATGGACAAATTCAAGGTATGCACCATCATCAGTTG
TATTATGAAAGTGCAGGAATAATAATAGCACTTATCTTACTTGGTAAATATTTAGAATCAAAATCAAAAG
GAAAAACATCAGAAGCAATTAAAAAGCTTATGGGGCTACAACCTAAAACTGCAATAGTGTTAGTTGATGG
TAAAGAAGTTGAAACTCCTATAGAAGAAGTAGAGATAGGAGATATACTATTAGTAAAACCAGGAACTAAA
ATACCCGTGGATGGAGTTGTAATAGAAGGATATACATCAGTTGATGAATCAATGCTTACAGGTGAAAGTA
TACCAGTAGAAAAAAATGTTGGAAGTAAGGTGACAGGAGCTAGTATTAATAAAAATGGTGTTATTAAGTT
TAAGGCTGAAAAAATTGGTGGAGATACTGCTCTTGCCCAAATAATAAAGTTAGTTGAAGATGCACAAGGT
ACAAAAGCACCTATTGCTAAACTTGCCGATACTGTATCTGGATATTTTGTACCAATAGTAATTGCAATAG
CTGTAGTTGCATCATTATTGTGGTTTTTAATAGGAGGAAAAGATATAGTATTTGTACTTACTATATTTAT
ATCAGTACTTGTAATTGCTTGTCCTTGTGCATTAGGATTAGCAACACCAACTGCTATAATGGTTGGGACT
GGAAAGGGCGCAGAAAATGGAATCTTGATAAAAGGTGGAGAGGCACTAGAATCTGCACATAAAGTAAATA
CAGTGATATTTGATAAGACAGGTACTATAACAGAAGGAAAGCCAAAAGTAACAGATATAGTATTAAATAA
TAATGTAAAAGAAGAATATCTTATCAAGATTGCTTCAAGTGCAGAAAAAGGTTCAGAGCATCCTCTTGGA
GAAGCAATAGTTAAGTATGGAGAAGAGAAGAATATAAAATTTGAAAAAGTTGATAATTTTAAAGCCATAC
CAGGTGCTGGTATACAAGTTACTATTAATGATGAAAGTATATTACTTGGAAATAGAAAGCTTATGAATGA
CAATAATATAAAGCTTGGGGATTTAGAAGAAAAATCAAATGTATTGGCAAGCCAAGGTAAAACACCTATG
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AAGCAATAGAAATACTTCATGATATGGGAATAAAAGTTGCAATGGTAACTGGAGATAATGCGAAAACTGC
AAATGCTATAGCAAATCAAGTAGGTATAGATATGGTTTTGGCAGAGGTTTTACCAGAAGATAAGTCAAAA
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CTCTTGCAAAAGCAGATATAGGGATAGCAATAGGAAGTGGAACGGATGTAGCCATTGAATCTGCGGATAT
AGTACTTATGAAGAGTGATTTAATTGATGTTCCAACAGCAATTAAACTTAGTCATGAAACTATAAAAAAT
ATAAAACAAAACCTATTTTGGGCATTTGGATATAATACGATTGGTATACCTGTAGCAGCAGGAATATTAT
ATGTATTTGGAGGACCTTTATTAAACCCAATGATTGCAGCAGCAGCAATGAGCTTAAGTTCAGTTTCAGT
CGTATCAAATGCACTTAGACTTAAAAACTTCAAGGCATATAAGAGAGATTAG
>ref|NC_013316.1|:2368477-2370300 GTP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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AAAATAAACATAGTTGATACTCCAGGACACAGTGACTTTTCTTCTGAAGTTGAACGTGTTATGAAAACTG
TTGACACAGTTATTCTATTAGTTGATGCTAGTGAAGGCCCAATGCCTCAAACTAGATTCGTTTTACAAAA
ATCTTTAGAGTTCGGTTTAAAACCAATATTATTTATAAACAAGATTGATAAAAAAGACCAGAGAGCGGAA
GAAGTAGTTAATGAAGTTTTCGATTTATTTGTAGACTTAAATGCAACAGATGAGCAATGCGAATTTCCTA
TAATATATGGTATTGCTAAACAAGGTATTGCTAAACTTGAAATGGATGATGATAGTGAAGACCTTTCTCC
TCTATTTAAAACTATTGTAAATCACGTTGAAGCTTATCCTAATTACGATAATGAACCTCTACAATTCCAA
ATATCAGCTCTTGCATATGATGATTATGTAGGTAGACTTGGTATAGGTAGAATTTACAAAGGTACTCTTA
AAAACAATACACAAGTTGCTATATGTAGAGAAGATTCTGTTGTATCTAAAGGAAAAGTATCAAAACTTTC
TGTGTATGAAGGTTTAAAACAAGTTGAAGTTGATGAAGCTACTAGTGGAGAAATAGTTGTTATAGCTGGT
ATTCCTGATATATCTATAGGTGAAACTATATGCGATTTAGATAGTCCACTACCTATGGAAATGATAAAAA
TAGAAGAGCCTACTCTTTCTATGAACTTCTTAGTAAACGACTCTCCATTCGTTGGAAAAAGTGGAAAATT
CGTTACAACTAGACATTTGAAAGATAGACTTGAAAAGGAACTTGAAGTAAATGTTGGTCTTAAAGTTGAA
CCTCTTGATACTACTGATGGATACAAAGTTTCTGGACGTGGAGAGCTTCACTTATCTATACTACTTGAAA
ATATGAGACGTGAAGGTTATGAAGTTGGTGTTTCTAAACCTGAAGTTTTAATGCATAAAGAAGATGGAAA
ACTAATGGAACCAATAGAAAGAGTTGTTGTAAACTGTCCTGAAGTTTACTCTGGTACTATTATAAATGAA
TTAAACATGAGAAAAGGTATGATGGAGTCTATGTCAATAGAAGGAGACTATGTAAAAATAGAGTTCTTAG
CACCTACTCGTGGTCTTTTAGGATATCGAAGTGAATTTATAAACGCTACTCGTGGAGAAGGTACTTTAGT
TCGTTCATTTGAAAAATTTGAAGAATTTAAAGGAGAAATACCTTCAAGAGGAAATGGTGTTTTAATAGCA
CAAGGACCTGGTGTTACTATGGGGTATTCTCTTAATGCCTTAAGTGATAGAGCTGTAATGTTTGTAGACC
CTGGTGTAGAAGTTTACGAAGGTATGATAATTGGTATGAATTCCAGAAAAGATGATATGGTAGTCAACCC
TTGTAAAAACAAGAAAATGAGTAACGTACGTGCTTCTGGTTCAGATGATGCTATAAAATTATCTCCTCCT
AGAATATTTACTCTTGAAGAAGCACTAGAGTTTATAGAAGATGATGAATTAGTTGAAATTACACCTGATT
CTATAAGACTTAGAAAAAGATTCTTAAATGAACATGATAGATTAAGATATAACAAATCTAGACAAGGTAA
ATAA
>ref|NC_013316.1|:c2371298-2370390 thioredoxin reductase [Clostridium difficile R20291]
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GGTGTTGATATTCAGTTTGATGAGGTTGAAGAGATAAATTTAGAGGGAAAAGTAAAGGTTGTAAAAACTT
CTTCAGGTGAACATAAAGCAAAGGCTGTTATTCTTGCAAATGGAGTTGAAAGACGTAAATTAGGTTGTGC
AGGGGAACAAGAATTTACAGGTAGAGGAGTATCTTACTGTGCAACATGTGATGGAGCCTTTTTTAAAGAT
AAAGAAGTTGCTATAGTAGGTGGAGGAAATACTGCACTAGAAGATGCTTTATTTTTAGCTAATAATTGTA
CAAAAGTGTATTTAATTCACAGAAGAGATAGTTTTAGAGGTGAAGAAGTGTTGGAGAAATCTGTGAAAGC
AAGAGAGAATATTGAGATACTTTACAGTCATGGTGTAGAAAAAATAGAAGGAGAAAAGACTGTATCGAAA
ATAGAAGTAAAAAACTTAAAGACTGAAGAAAAAAGAACTATAGATGTTAGTGGTATTTTTATTGCTATAG
GTCTTAAACCTAATAATAAAATGTTTGAAAATGTTCTTGATTTGGATGAAGGTGGATATATAATTTCAGA
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>ref|NC_013316.1|:2372439-2373920 threonine synthase [Clostridium difficile R20291]
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CAAGTGATGGTGGTCTTTATGTTCCAAGTGAATTTCCCAATGTAAAAAATGAACTTATAAATTTAGTAAA
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AAAAATTGTATAGAAAATGCATATGATGAAAAGTTTGATTGTAGTAGTATAGCTCCATTAAATAAAGTAA
ATGATACTTATTTCTTAGAACTATATCACGGTCCAACTTTAGCATTTAAAGATATGGCACTTACTATAAT
GCCTCATCTTCTTAAAACATCTATAAAGAAAGATAATTTAGAGAAAGATGTTGTGATTCTTACTGCTACA
TCTGGAGATACAGGCAAAGCTGCACTTGAGGGATTTAAAGATATAGATAAAATAAAGATAATTGTATTCT
TCCCAGAAGATGGTGTAAGCCCAGTACAAAAACTTCAAATGAAAACTCAAACTGGAAAAAATACATATGT
AGTTGGTATAAAAGGAAATTTTGATGATGCACAATCAGGTGTAAAGAAGATTTTTTCTGATAAAAAATTT
AATCAAAAACTATTGGATAATAATTATATATTATCTTCTGCAAATTCAATTAATATAGGAAGACTTCTTC
CACAAGTTGCATACTATTTTTATTCATATATGAAATTAGTTAGCAATAGTGAGATAAATTTAAATGATAA
AATAAATTTTGTTGTCCCAACTGGTAATTTTGGTAATATTCTAGCTGGATATTATGCCAAACAAATGGGT
CTTCCAATAAACAAATTGATATGTGCATCAAATGATAATAATGTTCTTTATGATTTCTTTAAAACTGGTG
TATATGATAAAAATAGAACATTGAAATTAACTACTTCTCCTTCTATGGATATATTAATTTCAAGTAATTT
AGAACGATTACTGTTTGAAATATCAAATAGAAATACTGATATTGTAAATAAGCTGTTATCAGACCTTAGT
GATAAAGGAGTCTACAAAATAAGTGATGATATGGAAAAAAATTTAGCCTCATTCTATGGAGAATATTCAA
ATGAAGAAGAAGTTAAAAGCACGATAAACAATGTGTTTAAAAATTATAATTATTTGATAGATACTCATAC
TGCTGTTGCATACAATTGTTATGAAAAATATAAAAAAGAAACTTCTGATAACACAAAAACTGTTATTGTA
AGTACTGCAAGTCCATTCAAGTTTTCTGAAGATGTTCTAAAGTCTATAGATTGTGATTTTAAAGACCTTG
ATGACTTTGCTATAATTGATAGATTATCAAGTATTTCTAAAATAGATATTCCAAAACCTATTAAAAATCT
TAAAAATGCAGAAATACTACATAAAGATATTTATGAAAAAGATGAATTAAAACTAGCTATAAAAAAATTC
TTAAAGGTATAG
>ref|NC_013316.1|:2373930-2374823 homoserine kinase [Clostridium difficile R20291]
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TAAATATATACAATAAATTTTATGTTGAAGAAATTGAAAGTGGTCTTGAAATAGAAGGTTGTGAAGATGC
TTACAAAAACGAAAATAACTTAGTTTATACATCTATGAAGTACTTTTTTGATAGAGTTAAACCAGAAAAA
ATACCTGCTGGTATCAAAATAAAAATCCACAGTGAAGTACCTATATGTAGAGGTCTTGGCAGTAGTGCCT
CTTGTATAGTAGCTGGAGTTATAGCTGCAAATGCTCTATCAGGTGCTAATTTAGATAAAAATCAATTATT
AAATATAGCTTCAGAAATAGAAGGTCACCCAGATAATGTTGCTCCTGCTATTTTAGGAAATATGATCGTA
TCTGTTACTGATAATGAGAATATACATTATGATATTATAAAAATTCCTGAAGAACTTAAATTTTGTGCAA
TGATACCTAATTTTAAGTTATCAACAGAAAAAGCTAGAGGTGTTTTACCAAAGGAAATACCATATTCTGA
TGGGGTATTCAATGTTAGTAGAGTTGCTTTACTAATATCTGCCTTACTAAACAAAAACTTTGACCTACTT
AAAGTAGCTTGTCAAGACAAATTGCATCAAAATTATAGAGGAACTCTAATTGAGAACTACAATGATATTG
TTGAAAAATCTGAACAATTAAATAGTATTGGAGTATTTTTAAGTGGAGCTGGACCTACTATAATGTCTTT
AATAAAAGAAAATGATGATAGTTTTGTGGATAATATGAAAAATTACCTACAAAAACTAAAATCTGATTGG
GAAATAAAAGAGTTATGTTGCGATTCTAATGGAGCTGTTTTAAATATAATATAA
>ref|NC_013316.1|:2375010-2376008 putative 2-nitropropane dioxygenase [Clostridium difficile R20291]
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CTGGAGTTCAAATTGGATATGATGAGGAAGATTTTGAAACTAATACTATAAATGCAAATTTAAGAGCTAT
AAAAAAACATATTTCTAAGGCCAAAGAAATCTCAAATGGTGGTATTATTGGTATTAATTTTATGGTAGCT
ATGAAAGAATATGAAACATACGTAAAGGAAGCTGTTAAAGCTGGTGTAGACCTTATAATATCTGGAGCTG
GATTACCTAATAAGCTACCATCATTAGTAAAGGGAAGTAATGTAAAAATAGCACCCATAGTTTCAACTGC
AAAAGCTGCTAATGTAATTTTAAAAATGTGGGATAGAAAAGAGAAAACTACTGCTGACTTAATAGTTGTT
GAAGGTCCAAAAGCTGGTGGTCACCTTGGATACTCTAACGAGGAACTTGATAACATAGATTCTATAGACT
ATGATAAGGAATTTGTTGAAATTTTAAAGGTTGCAAATACTTATGGAGAAAAATTTGGTAGAAACATACC
AGTAGTTGCTGCTGGTGGTATAACTTCTAGTAGTGATGTTAAAAAATATATAGATATGGGTGCAAGTGGT
GTACAAGTTGGTACAAGATTTGTTGCTACTTACGAATGTGATGCCCATGAGAACTTTAAAATGGCATACA
TAAATGCTAGTGAAGAAGATGTTCATATAGTTAAAAGTCCTGTAGGTCTTCCTGGACGCGCCATAAGAAA
CAAATTTATAGAAGAAGTTAAAATAAATCGTCCAGAAATAAAGAAGTGCTATAATTGTTTGATTCCTTGT
AATCCAAAAGAAACTCCTTACTGTATTTCTCAAGCTCTAATCAATGCAGTTAAAGGAGATGTTGAAAATT
CACTTTTATTTTGTGGAAATGATGCCTATAAAATTGATAAATTAAGTACTGTTGAAGATGTTATCAATGA
ATTGATTTCTGAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2376675-2376163 hypothetical protein CDR20291_2028 [Clostridium difficile R20291]
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GGACACTTATAACAGCAGAAAATGAAGGTAAAGTGAATACAATGACTGCTAGCTGGGGAGGACTTGGAGT
TATGTGGGGAAAAGATGTTGCTTTTGTAGTAATAAGACCACAGCGTTATACTAAGGAATTTATAGATAAT
ACAGATAAATTTTCTCTTACATTTTTTGATGAAGATTTTCGTAAAGAGCTTTCATATTGTGGAAAGGTAT
CTGGTAGAGAAGAGGATAAGATATCACAGATTGGATTTAATATAGAACACTTAAATGATACACCTTATTT
TAAGGAAGCTAAAATGGCTATTATATGCAAAAAAATTTATAGTCAGAAACTTGAACCCCAATGTTTTATT
GCTGAAGGTATAGATGGAAGATGGTATCCACAAAAAGATTATCATACTTTATATATAGCTGAAATAACCA
ATGTACTTGTAAAAGAAGATTAG
>ref|NC_013316.1|:2377195-2378130 putative cations transporter [Clostridium difficile R20291]
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TAAATCTTGTTGAACCTAATCATAGTGAAATCAACGAAATTTCTAATTTATTAAATATAGATGTAGAAAG
CATAGAATCTGCACTAGATGAAGAAGAACGCTCAAGAATAGATGTTGAAGACAATCATACTCTTATACTT
ATAGATATACCAGTAGACGAAAGTGACTCTAATTCTTCTCATTATACTACAATACCCTTAGGTATTATAC
TAACTGAAGAAGCTATTGTAACAGTTTGTGATGCACAGACTAAGATTTTAAATGACTTTATAGTTGGTCA
TATTAAAGATTTTTTTACGTTTAAAAAGACTCGCTTTTTGCTTCAAATTCTTCACAAAAATGCAGCTTAT
TACTTGCATTACTTAAGAAAAATAAATAAAATGACAATCATAATAGAGCGAGAAATTTACAAATCAATGA
AAAACAAAGAATTGGTTCAATTATTGGAATTAGAAAAATCTTTGGTATACTTCTCTACCTCACTAAAATC
TAATGAACTTGTTTTAAACAAAATGGTTAGAACTGCTGGTATAAAGAAGTATCCAGATGATGAAGACCTA
TTAGAAGATGTTATAGTTGAAAATAGACAGGCTCTTGATATGGCTAAAATATATGGAGATATATTGAGTA
GAATTATGGATGCTTTCAGTGCAATTATAAGTAATAATCAGAATAATGTTATGCAAATTTTAACAGTAGT
TACACTAATTTTCTCAATACCTACAATAATATCAGGATTCTTTGGTATGAATGTCATCAACATGCCATTT
TCTAATAACCCAAACGGATTTTGGATAATACTTCTTATTACCTCTATAATATGTATAGTGATTACATTTT
TCATGTCAAGAAATAAGCTATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2380003-2378222 putative multiprotein-complex assembly protein [Clostridium difficile R20291]
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ATACTTTAGGAAATATATATGAAAGTAAAAAACAATTTAAAGAAGCAGAAAAGTGGTATTCAATGGCATA
TAAAAGTGGAAGTGAAGATGCTGCTTTTGATTTAGGTAATATGTACTATAAGTTAGATGGCTATGAATAT
GCTATATATTGGTATGAAAAGATAGCAAATTTAGGTTATTTACAAGCACAAAATAATTTAGGTGTATGCC
ATTTTAAAATGAAAGATTTTGTAAGGTGTGAAAAATGGTTAAAAACAGCAGCAGACAAGAATTTAGGTAA
AGCTTGTTTTAATTTAGGGGTATTATATACTTTTTTGGAGAAAGATGATGAAGCATATGAATACTATAAA
AAAGGTTCTGTGCTTTTAGATGATGATGCAAAATATAATTTAGCAATATTAAATGGAAAAAAGAAAGATA
ATAAATCAACAGTAAGTTTATATAAACAGTTGTACAAGTCAGGTCATATGAAAGGTTGCTTTAACTTGGG
TATGATTATGGAAATAAATGATAATTTAGAAGATGCAGAGAAGTATTATAAAAAGAGTGCTGATAGAGAT
GATGTGAAGTCTGAGTATAGGCTTGCATATGTATATGATAGAAAAGAAGAGCTGGGAGATGCAATTTATT
ATTATGAGAAAGCAATAGAAAAAAATCATACACTTTCTAAGTATAGACTTGCTAATTTATATAATAGAGA
AAATGAGATAGAGAAGGCAAAAACTTATTATAAAATGGCTGCTGAAGATGATATAACAGAAGCAAAAAAT
AATCTGGCAGGTATATATTTTGAAGAAAAAGATTATGAAAATGCTATTAAATATTATGAGGATGCTATAG
CTGTTGGATGCAAAAGTTCCCTTGAAAATCTTGGGGATTTATATTATCAGAATCAAGATATAGAAAAAGC
GATTTCGTATTATTCGAGGATTCCAAATAATGCATCTTGTCAAATCAAATTAGGAAATATCTATGAAGAT
TTAAATAATATTGAAGAAGCCATAAGTTGGTATAAGAAAGCATCTGAAAATGGAGATACGAGGTCTAGTT
ATAGATTGGGGTGTATATATGAGAGCTTAGGAAATACAAAAAATGCTAGAAAGTATTTTGAAATGGCAAG
TAGCAAAAATCATATGAATGCTCGTATACATCTAGGTAGAATTTATTTTAGAGAAGGTAAATTGGAAGAG
TCTAAAATGATGTTTGATACACCTGCCAATGAAAATAATGTGTACGCTCAACATATGGTAGGATTAATTT
ATGATATGTTCTATAAAGATTATGTAAATTCTAAATTTTGGTATGAAAAGGCTAGAGCACAAGGTTGTGT
TGAATCAATATATAATTTAGGCCAAATTTATTTAAAATTAAATGATGACGCAGAAGCTGAGAAATATTAT
AAAGAAGGTATTAAATATGGAAGTAAGAAGTGTGAGTATATGCTTGCAGGTCTTTATTATAAAAAGAGCC
TAGATATGTACATTTCTTTAGCAAATGAAGAGTACGATAATTGTGAAGAGATAGTAGAAGGCTTTCCCAA
TTTAAATATAGACTTTGATGAAGTATTAATTCCTCCATTTAAGTTGCAAGAAGAGGTAATAGATGAAGAA
GAGTATGTACCAATTTATATACTAAATATAAAAGAAAGTTTAGATTCAATGCTAGAAGGGCTTGAAACTG
AAATGATTATAGATGAAGAACATGATAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:2380284-2381210 putative transporter [Clostridium difficile R20291]
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GAAAATTCAACTTATTAGATGACCACTGCACATCTAAGCTTTCAACTTTGACAATGACAGTTTTTTTACC
ATCAATGATAATTAGCTCCATGCAAATTAACTTTGATAGTAAAATGATACAAAAAATACTATTGTTATTA
TTTACATCTTTGATTATGTATATAGTTTCAATTATAATTGCATTTTTATTGAAATACATTTTAAAATGTA
ATGATAAAAAAGATTTGGGAATATATCAGTATATAGTTGTTTTTTCAAATGTTGCTTTTATGGGTTATCC
TGTAATTGAAGCAGTTTTAGGTCATGAAGCAATATTCTATACTGCAATATTCAATTTGCCTTTTAACTTA
TTTTCTTTCACTTTAGGAATTTATCTTTTATCTAAAGGCAGTACAAGTAGAGGTTTTTCAATAAAATCAC
TTATAAGCCCTGCTACAATAGCTATTGTTATTGGACTTTTTTTATTTGTAACAGGACTTAGGTTACCCCA
ATTTATAAACGAGCCACTTGAGATGTTGGGAAGTATAACTACACCAATATCCATGATTATCATTGGAAGC
TTACTTGCTAATTCTTCAGCTCTCGATTGTTTTGTCAACAAAAAATTATATATAGTCACTTTTATAAGAT
TATTGGTACTTCCTGTGATTGTGTATTTTATTCTAAAAGGATGGATAAATGATAAGATGATTTTAGCTAT
ACCAGTAGTAATTTCTTCAATGCCTGCTGCTGCAAATACTGCTATAATGGCTAATCAATATGACTCCAAT
ATAACACTAGCTTCACAATGTGTGTTTTTTACAACACTATTTTCAGTTATATCTATACCTTTTATAAGTA
TTTTACTCTTATCTTGA
>ref|NC_013316.1|:c2382145-2381600 putative acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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CACAAGCTTTTAATGAAATTAGAAGAACATACAGTGTTATGAGAAATACTTTGGCATTAATGAGTGACAG
AGTCGATAAAACTGAAGCTATGTTAGCTTCTTTGGGAGAAAATGATTATATGTTTGTAGCTGAAACTAAT
AATAATGGAGAAAAAGATGTAATAGGTTTTGCTGGGTTACATGTAAATTCTTCTCCACGATTGAGACATA
GTGCAGAAATAGGAATAAGTGTTGCAGAGAATTATCAGGGAAGAGGAGTAGGTAAGAAGCTTATGGAACA
ACTTTTAGATATAGCAGATAATTGGATTATGTTAACTAGAGTAGGATTAGAAGTAATTGTAGATAATGAA
AAGGGATTAAATTTATATAAAAAACTAGGTTTTGAAATAGAGGGAACTAAAAAATATGCTGTAATCAGAG
ATGGAAAATTTGAAGATGTTTATATTATGGGAAGATATAATAAAAATTTAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:2382598-2383721 putative membrane protein precursor [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCAAAAAAACAAAATATTTTTCTTTAATTCTCTTTCCTATTGCTTTACTTTTAAATTTTATAGCCA
GCAAAGTTCCAAATATTGTTGAAAAATATTACTCCCAATTCATAGATAAAATAATTGTACAAATATTGAG
TAAAGTTTCTGGAATTTTCCCATTTTCTCTCTATGAGATTACAATGTACATAATAGTTATATCTATCTTC
TTATTTTTATGTTGTACTTTATCTACAATTTTTAATAAGAAAAAAAATGTGCTTTGGGGAATAAACTATA
ATAGGATTCCACTAGAAACCACACTTATAAATAACTATAATTTAAAAAACAATACCTCTATCCAATCAAA
ACAATATAGTGTTAAAGAGCTTACTAAATTATATAAATTCCTTGTAATTAAAGCAAATGAAACTAGAAAA
CTCACATTACAAGATAAAAATGGTATTGTAAAATCTAATACAGATTATAATGGTGTCATAAATAGAGCTC
AACTAGGATACGATAATATCTTGGATATATTACCTAGTGTTAGTGGTAGTTATTCTAAGCCTAAGTATAT
TATTTCATCAAATCTAATGTGCTATACAGGAATAACTGGTATATACTTTCCTTTTACAGGTGAGGCAAAT
GTAAATATAGCAATACCTGACTTATATATTCCTTGTACAGTTGAACATGAAATAGCACATCAAAGGGGAT
TTGCTAGTGAAGATGAGGCTAATTTTATAGCGTATCTTACTTCTATAAAACACCCCCATATTGATTTTAA
CTATTCTGGATATATTTTAGCTTTAAATTATACTGCTTCTGCTTTAAGTAAGGTTGATTATAATGCATAT
GTTGATATTTCTGCTGGCATTTCAGATTCTGTCCGTAGAGATTTAAAAAATGAAAGTGAATTTTGGCAAA
AATATGAAGGTAAAATTAATGAAATTTCTAATGAGTTTAACAATTCTTACTTAAAAGCTAATGGCGTTAC
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TAA
>ref|NC_013316.1|:c2385018-2384194 hypothetical protein CDR20291_2034 [Clostridium difficile R20291]
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CATTTTCTCTTAGTACGACCAATTCAGAAAAAACAAATGTATACTTAGCAAGTACGGTAAGTACTGTCAC
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AATAGCAAAATACAGTATGATGATACTCCATATCATTGGCCTAGCAATGTTATAAGCTTAACAAATAGCA
GTGAAAAGGCAATTATGGATTATGAGATTACATGCTTAGCATATGATAAAAATGGAAAACCACTTGAGCT
ATATTGGGATGCTCAAAATGTGGCAGCAGATGGCGAAGTAGGAAGTGTTGGATTTAGCCCAGCTGGTGTA
GACTATGGTATTGTTACAGGCATATCTCCTGTGTCTCCAAAATCATATTCACATACTTATAGAAAAATGC
AACAATCACCACCACAGGATATAATAAGTATGTTTGAAAAACAACAAGGCAAGGCATGGGTAGAAAATTG
GTTGAAAGAATGGAAACAAATGGAGAAAGAATATGCAAAGCAAAATGCAATAGCACCAGGTAAGAATCAA
AATGATGCCTTTCTATTGTTTGATAAATGGAAACAATCAACTGGAGAGCATGGTGTAAAGTACATTATAT
CTTGTGTAAAACAAGTAACATTTAATGATGGTAGTATATGGAAAAATTCAGCATATGAGAATTGGTTGAA
AAGTTTTCAAGGGAAGGAAGTTTCAAATAGTGTATTAGAAAATTACTATAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2386421-2385366 4-hydroxy-3-methylbut-2-en-1-yl diphosphate synthase [Clostridium difficile R20291]
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ATAAAGTCTAGTGTAAATATACCAATTATTGCAGATATACATTTCGATTATAAGCTAGCCCTTGAAGCTA
TAGAACAAGGTGTGGATGGAATAAGAATAAATCCTGGTAATATTGGAAGTAGAGAGAGAGTTAAGATGGT
AGTTGAGAAATGTAAGGAAAGAAATTTAAAAATTAGAATTGGAGTCAATGGAGGTTCTTTAGAGAAAGAA
CTTTTAAAAAAGCATGGCTCTGCAACTGCTGAAGCATTAGTTGAAAGTGCAATGGGACATATTAAGATTC
TTGAAGACTTAGATTTTCATAATATAGTTATATCTCTAAAATCATCCGATATTTATAAAACTGTTGATGC
ATATGAATTAATATCAAAAAAAGTTGATTATCCTCTTCATATTGGAATTACAGAATCTGGAAGTGTTCAC
AAAGGAACAATAAAGTCTTCTATAGGGGTAGGAGCACTTCTTCTTAAAGGAATTGGAGATACTGTTAGAA
TATCTTTAACAGGCGACCCTGTTGAAGAGGTTATTGTTGGTAAACAGATTTTAAGAAGTTTGGGACTTTT
AAATGATAAGATTAAAGTTATATCATGCCCTACATGTGGTAGATGTAATATAGACTTAATTAGTGTTGTA
AATGAGGTTGAAGAAAAGATTGGTAGTATGGAAAAAAATATCACTGTTGCAATTATGGGCTGTGCTGTAA
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AAAGGGTGAAATAGTTAGAATGATTGATGGTAACAAATTAGTTGATGAGTTGCTAGAAGAGATTGAAAAA
TTATAG
>ref|NC_013316.1|:c2387608-2386604 putative membrane-associated protease [Clostridium difficile R20291]
ATGACTATAATAGCCGCATTAATACTATTTAGTATAATTGTATTAATACATGAGTTAGGACATTTTATAT
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GAACAAATAAGTCCAAATTCTTTTGGAAACAAGTCTATATTACAAAGATTTAGTACTATTGTAGCAGGAC
CAATATTCAATATAATATTAGCAGCAATACTTTTAGTTCCAGTATTTTTGTATATAGGTTCTCCAACGAC
TAAATTAGGAAAGATAATGCCAGATACTCCTGCACAGGCTGTAGGGCTTCAAGTAGGAGATAAGATAAAT
AAAATTAATGGTAATTCTGTTAAGACTTGGGATGAAGTTGCAAATATAATAAACACTTCTTCTGGTGGAG
AATTAAAACTTAGTATAACTAGAGATGGAAGTAATAAAGTTGTAAATGTAACACCTAAAAATAACAATGG
AAAGTATGAAATAGGGATTCAACCACAAAGAGAAAAAGACTTTTTGGCGTCAATAGTAAATGCATGTAAA
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GGATTGGCAATGCTGTAGCAGGACCAGTAGGTGTTATTGGTATGGTATCAGATGCTGCTCGTACAGGCAT
CATAAATGTAGTGTATTTAGCAGCTGTCATAAGCTTAAATTTAGGTATAGTAAATCTATTACCAATACCA
GCACTTGATGGATGGAGAATACTTATGCTATTACTAGAAGCTGTTAGAGGTGGTAAAAAACTCGACCCAA
ACAAAGAAGGCATGATAAATGTTGTTGGTTTTGGAGCTTTAATGTTATTTATGCTTTTTATCACATATAA
AGATATATTAAGATTATTTCAATGA
>ref|NC_013316.1|:c2388775-2387621 1-deoxy-d-xylulose 5-phosphate reductoisomerase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGATATCAATTTTAGGTTCTACAGGCTCTATAGGTAAACAAACTTTGGATGTGGTTAGAGAAC
ATAGAGATAAGTTTGAGATAGTTGCAATATCAGCTAACAGTAATATTGAATTATTGCTAGAACAAATAGT
AGAGTTTAAACCTAAATATGTAACAGTTTTTGAGGAAAATAAGGCATTGAAATTAAAAGAAATGTTGCCT
AAAAATATAGAAATAGAAGTTTTAGCAGGAATGGAAGGATTAAAAATAATATCATCACTTGATGAAGTGG
ATGTCCTTTTAACTGCTGTAGTAGGTATGATAGGATTAGTCCCAACTCTTTGTGCTATAAAGAAGGGAAT
AGACATAGCATTAGCGAATAAAGAAACGTTGGTAACTGCTGGTGAACTTGTAATGAAAGAAGCAGAAAAA
TACAATGTAAATATTCTTCCTGTTGATAGTGAACATAGTGCTATATTTCAATGTCTAAATGGAGAAAATA
AAAAAAATATAGAAAAGATAATACTTACAGCATCTGGTGGTCCATTTAGAGGAAAGAAAAAGGGAGAACT
TGTAAATATAACTAAAAATGAAGCTTTGAAGCATCCAAATTGGAGTATGGGAAGAAAAATAAGTATTGAT
TCTTCAACGCTTATGAATAAAGGACTTGAAGTGATAGAAGCTAGATGGTTGTTTAGGGTAGAACAAGAAA
ATATAGATGTAGTAGTTCACCCACAAAGCATAATTCATTCAATGGTGCAGTATGCAGATAGCTCAATAAT
TGCTCAATTAGGGTGTCCAGATATGAGACTACCAATACAGTATGCTCTTACATATCCAGATAGAATGGAA
AGTAGCTTTGAAAGAATGAATTTTTCAAAATTTAGTACTTTAACTTTTGAAGAACCAGATTTAGAAACTT
TTCCATGTTTAAAATTGGCCTATGAGTGTTTAAAAATGGGAGGAACTTATTCTTCTGTTTTAAATTCAGC
AAATGAAGTTTTAGTAAGTGAATTTTTAGAGGATAAAATTGGTTTTTATGACATACCATATTACATAGAG
AAGACTTTAGAAGTTCATAGTAGCATAAGCGAACCAACATTAGAAGAAATCTTAGAAACAGATAGATGGA
GTAGAGCTTATGTTGCAAATCTGATAAAAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2389142-2388939 putative regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATTTCATACGCTCCATTATGGAAATTGTTAATTGACAGAAAAATAAAGAAAATGGAATTTGTAAATA
TATCAGGTATAAGTATTTCTGTTTTAGGCAGACTAGGAAATGATAAATCTGTTTCTATGGATACAATGGA
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>ref|NC_013316.1|:2389479-2390060 hypothetical protein CDR20291_2039 [Clostridium difficile R20291]
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CAATATATAAATTTATTGAAAAAATACCCTTTGTAAAAAAAGATAATAGTAATTTTAATTATACAAATTA
CTATATGGAATTTGAAGATATTCCTGAATATTATGAAGTAAATTTCAATAATTATTTATATATTATTACC
AGGTTTTCATTCATTCCAGATGGAACTGAGATATTTTTTACTTGGGAAGAAATCCATTATTGGGATGAAA
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GTACAAAAAACGTTTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2391959-2390148 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
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CTCTATATCATAGTATAGAGCATATTAAAATTATAAGTCACACTGGTACTATTCGCAGTGAAACTCAAAA
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AAGCTAAGAACAGGTAATGGAGAAAATGGATTTCAAAGATGTGATAATAAAGAATTTCAACAAAAACTAA
ATCAAATGGATTCTATGTGGGAATCTATGAAGAAAGAAATTATAAAAGTTAGAAATGGTGCTTCAGGTGA
TAAATTATATAAATTGAGTGAAGAGTATTCTGTGTTGTCTAATCAAATTGTTTTTATATCTGAAAAACAC
TCTAATGCAAAATTGTATTCTTTTGCTACTGCACTATTTATTTATCTTATATTCTCAACAATAAGTCTTT
TAATTTGGGAATATTATAATAAAAAAAGGTTTAAAAGAATATTTTATACTGATAATTTAACAAAAATAAA
AAATCAGGTTGCATTTGAAAACAGAGCGATTGAAATTTTGTACAATGCATCTAACAAAGAGTATGTACTG
CTAAATATTGATATTGACAATTTTAAATATATTAATGATACACATGGATATGAATATGGAGATAAAGTTC
TAATAATAGTTGCAGCTGCACTTTCTAAAACTTTTAATATCAAAGAAACTTGTGCAAGAATTGGTTCAGA
TAATTTTGTAATACTTGCAAAATATAGAGATTCTCTTTTAGAGGATATTCGGGAAATGCTAACTAATGCT
ATAATCTCTGAATTAGATATGAATGTAACTCAAACTATATCTTATTGTATAGGAGCGTACTTAGTTGAAA
TTGATAATTTAGGTTATAAATCCATCAATTCTATAATGGATAAGGCAAATATTGCACACAAGGTAAGTAA
AACAAGAGGAATTTCCTCCACAGTATGGTATAATGAAAATCTGTTAAAACAGTTACAAATGGAAAATAGT
ATTTATAATTATATGTATAAAGCGATAGAAAATGAAGAATTTCATATGTATTTGCAACCTAAATTTCAAA
TATCTTCTTTAAATGTTGTAAGCGCAGAAGCTCTTGTAAGATGGTTTTCTCCAGAACTTGGTTTTTTATC
ACCAGATGAATTTATTCCATTGTTTGAAAAAAGTGGATTTATTATTGAATTGGACTTTTATATGTTAAAA
AAAGCGTGTTCATTTGTAAAAAAAACGTTTATGAAAAAAAATCAATATACATATCCGATTGCAGTTAATT
TTTCAAGGGTTACTATTTACCAAAATAGCTTTTATCAAAGGTTTTTAGATACTGTTAAAGAATATGAAAT
TCCTTTTAAGTATATAGAGATAGAGGTAACTGAAAGTGCTTTTAATGAAATATCTCAACCAGTTATTTCG
ATTTTAGAGGAGCTTAAAAAGTTAGGATTTTTAATTTCGATGGATGATTTTGGATCAGGATACTCTTCAT
TAAGTCTTTTATGTTCTCTATCTATTAATGGATTGAAGTTAGATAAAAGCTTACTTAAAGAAACATTTAA
CCGGGAGAAAGTATATAGTATTATTCAGTGTATTATTGAAATGTCACATCGTATAGGCATGTCTGTTGTA
TGTGAAGGTATTGAAACTAAAAAAGACTTGGAATTTTTAAATACAGTTAAATGTGATGTAGGACAAGGGT
TTTATTTCTCTAAACCGATAGAAGAAAAAGAATTTTTTAACAAATATGTAACTAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2393562-2392783 putative phosphatidate cytidylyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGCTTACAAGAATTATTGCTTCACTAGCTCTGGTTCCATTATTTCTATTTGTTGTATATGGAGGTATTC
CTCTATATATAGCTGAGACAGCAATAGTTTATATTGCATTGCATGAGTTTTATAAGGCATTTAAAATAAA
AGATGTACATCCAATATTCATTATAGGATATTTATTTTCTATTTATTTAGCTGTAAAAAATATTTTTAAT
TTACCATTAGAATATACTTATGCAGTAATTTTTATTTTATTTTTAGCAAGTATAATTTATATGTTGATGG
GCAAAAACAATGTTATAGATGTTTCGATTACGTTTTTAGGAGTTTTTTATATAGGAGTATTTTTAGATTT
TATAATTATAACTATAAATGGATTTGAAAAAGGTAGTATATATGTATGGCTTATATTTGTGATATCTTTT
ATGACAGATATATTTGCATATTTTAGTGGTTATTTACTTGGAAAACATAAGCTAATTCCTAAAGTTAGTC
CTAAAAAGACTATAGAAGGAGCTATTGGAGGAATAATAGGAAGTACACTTTGTTGTATTTTATTTGGATA
TTTATTTGGCATTGATTTGCTTCAATTAGCGATAATAGGAAGTATAGGAAGTGTAATAGCTCAATTAGGA
GATTTATTTGCATCTTCTATAAAGAGATATGTAGGGATAAAGGATTATGGAAAGATAATACCTGGTCATG
GGGGTATATTAGATAGATTTGATAGTGTTATATTAGTTGCACCTTTTGTATATAGTGCGATTAAATTTTT
TATTAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2394309-2393575 undecaprenyl pyrophosphate synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAACAACATTATATATGATATAGACTTAAATAACATACCTACTCATATTGCTATTATAATGGATG
GAAATGGAAGATGGGCAAAAGCTAGATTTCTTCCAAGAACTGCAGGACATAAGGCTGGAGTAGAAACTAT
AAGAGATATAGTAAAAGAATGCTCAAAATTAGGTGTTAAGCACTTAACATTATATGCATTTTCAACAGAA
AACTGGAAAAGACCGAAACTTGAAGTTGACACACTTATGAACTTATTATCTACATACTTAAGAAATGAAA
TAGCTGAACTTCACCAAAACAATGTAAAAGTAACTGCTATAGGAGATATAAGTGCTTTACCAAAAACTTG
TATAAGAGAATTAAACTCAGCTAAGGAACTGACAAAAAACAATACAGGAGTTAACTTAAATTTAGCATTA
AACTACGGAAGTAGAGCAGATATAAAAAATGCTCTTATAGATATAGTAAAAAATTGTGAAAGTGGTAAAA
TAGATATAAACAATATTGATGAAGATATTATAAAAAACTATTTAAGCACAAAGTCTATACCAGATCCAGA
CTTGGTAATAAGAACAAGTGGTGAACAAAGATTGAGTAACTTTTTACTTTGGGAAGTTGCTTATTCTGAG
TTTTACTTTACTGATATACATTGGCCTGATTTTAAAAAAGAAGAACTACAGAAGGCTATATACGTATATC
AAAGAAGGGATAGAAGATTTGGAGGACTTAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2394541-2394338 hypothetical protein CDR20291_2043 [Clostridium difficile R20291]
TTGAAAAAATATTATAACCTTTTAGGTCTTCATGTAGATGAGGTAAAACAATATTTTGATGAGCAAAATA
TAAATTATACCGTAAAATCTATTGAAGGTAAAAAGGATAAAGAAAAACTTGTAGTTCCTAGAGTTATAAA
AATATCTGAGATAGGTGATAGTGTAGAACTGATAATCACATACTTTTCTGACTCCTTAGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2395101-2394544 ribosome recycling factor [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACTGGAAATACATAAGCAATTAGAAGAGAAAATGAATGGGACAATTGATGCTTTAAAGTTTGAAT
TTGGAACTATAAGAGCAGGAAGAGCTAATGCACAAATGCTAGACAAAATAAGAGTTGATTATTATGGAAC
TCCAACTCCAATAAATCAAATAGGTGCTATATCTGTACCAGAACCAAGAATATTAATGATATCTCCTTGG
GATAAATCTGCTATGCATGAAATAGAAAAAGCGATAGCTAACTCAGACTTAGGATTAAATCCATCAAACG
ATGGTGAGGTTATAAGACTTTCTGTACCTGCTTTAACAGAAGAAAGAAGAAAAGAATTAGCTAAAAAAGC
TAGTAAAGCTGCAGAAGAATTTAAAGTTAGAATAAGAAATGAAAGAAGAGACGCCAATGAGAAAATTAAA
AAGATGGAAAAAGGCGGAGAATTAACTGAAGATGAATTAAAAAAAGCACAAGATGAAGTTCAAAAAATGA
CTGATAAATTTATAAAAGAAATAGATACATTATTATCTAAAAAAGAAAAGGACATAATGGAGGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2395831-2395127 uridylate kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAAACCAATGTACAAAAGGGTATTGTTAAAATTAAGTGGAGAAGCATTAGCAGGAGAAAGAGGTT
TTGGTATAAATAATGATGTAGTTAATGATATTGCTATTGCTATAAAAAAAATACAAGAAATAGGTGTTGA
AGTAGCTGTAGTAGTAGGTGGAGGAAACTTCTGGAGAGGCAGAACCAGTGAAGGAATGGATAGAACTACT
GCTGACTATATAGGAATGTTAGCTACAGTTATGAATGCAATGGCGCTACAGGATGCACTAGAAAATATAG
ATGTTGCTACAAGAGTTCAAACTGCTATAGACATGAGACAAATTGCAGAACCATATATAAGAAGAAGAGC
AGTTAGACACTTAGAAAAGGAAAGAGTTGTTATATTTGGTGCAGGAACAGGAAACCCTTACTTTACAACA
GATACAACTGCTGCTTTACGTGCTGCTGAGATGGAAGCAGAAGTTATATTGCTAGCTAAAAATGTTGATG
CAGTATATGACAAGGATCCAAAAGTACATGCAGATGCTAAGAAATTTACAGAATTAAGTTACATGGAAGT
TATACAGAAAGAATTAAAAGTAATGGATTCTACAGCTACATCTTTATGTATGGATAATAAAATTCCAATA
AAGGTATTTGAGCTTACAACAGAGAATATAATAAGAGCAGTAAAAGGCGAAAATATAGGAACTACTGTAA
AATAA
>ref|NC_013316.1|:c2396827-2395916 elongation factor Ts [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTAATATAACTGCTCAAATGGTAAAAGAGTTAAGAGAAAGTACAGGCGCAGGAATGATGGACTGCA
AGAAAGCTTTACAAGAAGCTGAAGGAAACATGGAAAAAGCAGTAGATTTATTAAGAGAAAAAGGATTATC
AAAAGCTGCTAAAAAAGCTGGTAGAGTTGCTGCTGAAGGTCTAGTTGCAATAGAAATGAATGATGATAAT
ACAGTTGCTTCTATGGTAGAAGTTAACTCAGAGACAGATTTCGTTGCTAAAAACGAAGACTTCAAAGTGT
TCGTTAAAGATGCTGCTTGTATGGCATTAGCTACTGATAAAGAAGATATAGCTTCTTTATTAGGTGAAAC
TCATAAAGAGGGAATAACTTTACAAGAAGTTTTAAATAATAGAGTTGCAAAAATAGGTGAGAAATTAGAC
TTTAGAAGATTTGCTAAAGTTGTAACTAATGGACAAGTTGCTGGATACATTCACGGTGGTGGAAAAATAG
GTGTTCTTGTTGAAATGGAAACAGAAGCTAGAGATGCTAAAGTTTTAGAATTAGGTAAAGATGTAGCTAT
GCAAGTTGCTGCTATGAATCCTAAGTATGTTTCAAGAGATGAAGTAGATGCTGAATACATAGCACATGAA
ACAGAAGTATTAACTCAACAAGCTTTAAATGAAGGAAAACCAGCTAATATAGTTGAAAAAATGGTTAAAG
GAAGATTAGAAAAAGAATTAAAAGAGGTTTGTTTATTAGAGCAAACTTTCGTTAAAAATCCAGATATAAC
TGTTAAACAATTAGTTGCTGATGTTGCTAAGGCAGTAGGTTCTGATATAAAAGTTGTTAAAGTTGTGAGA
TTCGAAGTTGGTGAAGGTATACAAAAGAGAGAAGAAAACTTTGCAGAAGAAGTTGCTAAGCAACTTAAGT
AA
>ref|NC_013316.1|:c2397619-2396906 30S ribosomal protein S2 [Clostridium difficile R20291]
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ACCCTAAAATGGCTAAGTATATATTCACAGAGAGAAATGGAATATATATAATCGACTTACAAAAAACAGT
TAAAAAAGTTGAAGAAGCTTACAAGTTCACTAAAGAAGTAGCTGAAACAGGAAAGCCAATCTTATTCGTA
GGAACTAAAAAACAAGCTCAAGATGCGATAAAAGATGAAGCTGAAAGATGTGGAATGTACTTTGTTAATG
AAAGATGGTTAGGTGGAATGTTAACAAACCACAAAACTATAAAAACAAGAATAAATAAATTAAGAGAATT
AGAAAAAATGGAAGAAGAAGGCGTATTTAATGTTCTTCCTAAAAAAGAAGTTATAAAATTAAGAGCTGAA
AAAGAAAAACTAGAAAAATACTTAGGTGGAATAAAAGACATGCCTGAATTACCAGGTGCAATGTTCGTAG
TTGACCCAAGAAAAGAAAACATAGCTATTCAAGAAGCTCATAGATTAGGTATACCAGTAGTTGGTATAGT
TGATACTAACTGTGACCCAGAACAATTAGACTTTGCTATACCAGGAAATGATGACGCTATAAGAGCCGTA
AAATTAATAACTGGTGCTATGGCAACAGCTGTAATTGAAGGTAGACAAGGTGCTGAGGAAGAAGTAGCTG
AAGACCAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2399019-2397826 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase [Clostridium difficile R20291]
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ATTATTCATATGCAGATGGTAAATCTGTAGACAAGTATTCAAAAACATCTATACTTATAGACCAAGAAAC
AGGTAGAGTTTTATATAGTAAAGAACCTGATATGAAGGTACCATTAGCTAGTTTAAGTAAGATGATGACT
TTTTTACTTGCAATAGAAGCTATTGAAAATAAAGAAGTAAAAGAAACTGATAAGGTAAAAATAGACAAAT
CTATTGCATCAGTAAAAGGGTCAAGTTATAAACTTAAAGATGGTGAAGAAGTGCCACTTATAGAGCTTAT
GAGAGGTCTTATGATTGTATCAGGAAATGATGCGGCAATTGCTATAGCAAAACATATTTGTAAAACGAAA
GAAGCATTTGTAGATAGAATGAATAAAAAAGCAAAAGAAATAGGAATGAGTAATACACATTTTCTAAATC
CAAATGGTCTTCCAATATACGATTTAAGCAACCCCAAAAAACCAGCAAAAGAAAATATCTCTACTGCAAA
AGATATAGCTATTCTTGGAAAATACATGTTTGACCATTATGAAAAACAAGTAACAGCTATAACTGATATG
GAGACATATACAAATTCAGATAGAAGTTTTGAAAAAAGCAATACAAATGCATTATTAAGAATTATACCAG
AAGTAGATGGTATAAAAACTGGATATACTGGCAATGCTGGATATTGCTTATCATTTTCTATGGTTGTAAA
TAAAAATGAGAAAAATGAGAAAAAACGTAGAGTAATAGGGGTTGTATTAGGTACTAACCATAAAAATAAA
AGAACCTCTGCTTCATTAGCTCTACTGAAATATGGAAAAGAAAATTTCAATATGAAAAAAGTAATTGATA
AAGATAGCTTTATTGGTAAGAAATATATAAAAGGAATGAAAGAGTTAGAGGTTACATTAAAAGCAAAAGA
TGAACTTTATACAATATTAAAAGATGATGAAAGTATAAAATCAGAAGTTAAGATTAAAAATATAGAGTAC
CCTGTTAAAAAAGGTGATACTATGGGTGTTATAAAATATTATACTAGTTCAGGTGACTTACTTGGAAGTG
TAGATATAGTAAGTAATAATAGTATAGATAACGTATCATTAAAAACAAAATTAAAAATGAAATTTGCAAA
TTAA
>ref|NC_013316.1|:c2400172-2399114 hypothetical protein CDR20291_2049 [Clostridium difficile R20291]
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ATTGTATCTTTCATAAAGAAAATAAGTCTGATGAAGAGATACAGTTGATGATGGATACTATTCATAAAGA
AGAGATAAGTGAATTTAATGGATTTGTTTTTGAAAATGAATTTAATGCGGAAGAAATATTAACTTACAAT
TATAAAATACTGGATTTTTCTGAATCCATATTTAAACAAAAAGCAAATTTTAAAAAATATATTTTTAAAA
AGAATATTATTTTTAACTATACAGAATTTAGAGATAAAGTTTTATTTAATGGTTGTATATTCTTAGAAAA
CTGTGATTTTAATAGAACCATATTTAGTAAAAACTATATAAATGACCGTATATTTGAAAAAGTGAAATTT
AAAGGACCTGATTTGGTAGTTAATAAAGTAGAAAATTTTCCACGAATGGATGGAATAATTTTTAGCATGT
GTACAAAATTTGTGTTAAAGAATGTTGAATATGGAAAAAGTGAGTATGAGCATGGCAAGATAAATTATAG
AATAGCTAGAAATCAAGCAACAAAAATTGGAGAATATGAGATGATAGGATTTTACTATTATAAGGAAAGA
ATTTATAGTAGTAAAATAATGAAACGTTCTAATTATCCTACTTTCAGTGATTATTTAGTTGAAAAATTTT
TTGACCAAATAGCACGTTACACAACAGGTTATGGAGAAAAGCCATGGAATATATTATTAGTGATTATAGC
AATAATAAGTGTTTTTGCTTTATTATACTTATTTGTAGGCATAGAAAGTTCAAATAGCACACTTGTAGCT
TTAGATATAAACAATATAGGTGATTACTCACTAAGTGAGATTTTCAAAATGTATATGGATTTATGGTATT
TTAGCATGGCTACATTTAGTACAGTAGGATATGGAGATATGGTTGCTACAAGTTTGATTGGGAAAGCATT
GGCAGGTATAGAAGTATTTTTTGGAGTTACAATAGGAGCAATTTGGGCATCTGTGATTATTAAAAGAATG
ATAAGGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2401030-2400386 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGAACAACATAGTAAGGTTGGGAATTTCGGTGATTTGTTGAAAGTTTTATTAGATGAAAAAGAATTAT
CAATGGGAGAACTAAGTAAAAAAAGTGGAATTGATAAATCTACTATATCTCGTATAGCTAATAATAAACA
AAGGCCAAATATAAATCATTTAGAAAAGATGGCAATACATTTAAATATTAACCTAGAAGAACTGTTGAAA
GCTTCAGGATATGAATTTAGAAACAGCAATAATCAAATATTTAATGCAGATAGTGATTTTAGTAACTTTG
ATGATATTCTTGGATTTGCAAATTTAATCAATGATAAGAACTTTAATGGAAATATTGAAAAAGAGTTAAG
TAAGTGTAAGTTATATGTCCAAACAGATGAAGGTAAAAAATTACTTTTTGATAATTTTAATAAAAAAATA
GATTCTATTGAAAAACAAGGTCAATTTACAGATAGATTAAGACAAATGTATGCTGATTTTTGTACAGATG
GACTTACAATAAAGAAATATTTATTGATTGGAAGTATGCTACTTTACTTTGTTATATCAACAGATGTGAT
TCCAGACTTCGTGTTCCCAATAGGATTTATGGATGATTTAGTAGCATTAAATATAGTTACAAAATTACTT
AAAAATGATAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:2401215-2401838 hypothetical protein CDR20291_2051 [Clostridium difficile R20291]
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TAAATAAAGTTAAAGTTCCCTTATATTCAAATATAATTATCAGCGTAGTTTGTTCAGCTATTTTAGCAAT
ATCGCTTTTTGCAGGTACAATAGTTAGAGATTTTTTACCTCAAAATATAACAATGTTAATATGTTTCTTT
ATTTTATTTTTATTAGGAAGTGCTAGACTAATTGAAAGTTTTTTTAAATCTTATTTTAAGAAAAAATCTA
TACACTCAAAGAATTATAATTTTAATATGTTAGACCTTGAATTAAATTTTAATGTAAGTATCGAACCTGA
TGTCTTAGATACAAGTAAATCTAAAGTGCTTAAATCTGCTGAAGCATTTACACTTGCACTTGCTTTAAGT
TTAGATGGATTAGCTATCGGTTTTGGTAGTGGCCTTGTAGGTGTGAATTATATACAAGTTATTCTATTTT
CTTTAATATCAAATATAATTGCAGTATTACTTGGTTGTTTACTAGGAAATATGTTTGTTAAAAACGTAAA
TTTAAACTTATCTTGGTTAAGTGGTTTAATCTTGTTAGTCATTGGATTTATGAAGATATGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2403811-2401901 DNA mismatch repair protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAGTAATACATTTGAAAGATTGCAACTAAATGAAGTTAAAGACTTAATAAAAATACATTGTGTAA
GTTCGCTAGGAAAAAATTTAATAGATAAATTAACTCCTAGTGGGAATATTGGAGTAGTAAGAAGGAAATT
AGCAGAAAATAAAGAAGCTAGAAAGATAATTGAAAATAGTAATCACATACCACTTGAAGGATTGTTTAAT
GCAGGTTCTACAATAGATAAAATTGAAAAAGGAATGATAATAGAACCTGTTGAACTTGTAAATATTGAAG
ATTTTTTAAGAGGTTGTAGGAAGATGAAAGCTTTTATGTTAGAAAAAGAATTTTATTCACCTACATTAAG
TTCTTATGCTTTAAATATAACAGAATGTAAAAGTATAGAAGATGAGATAAATTACTGTATAAAATCTAAT
AAAGTTGATTCTAATGCTAGTAAAGAATTAAAAAAGATAAGACGAAATATAGAAATTACAGAAGGAAAGA
TAAAAGATAGATTAAATAAATTTATAACATCAACTGTAAATAAAAAGTATATACAAGAGTTTATAATAAG
TAAAAGAAATGATAGATATGTAATACCAATTAAATCTTCTTATAAAAATGAAGTTAATGGTACTATATTA
GATACATCATCAAAAGGAAATACTGTATTTATTGAACCTATTAGTGTTTCAAATTTAAGTACAGAGTTAA
CTATGCTAAAAGCTGATGAAACTATTGAAGAATACAAAATATTATCTTATTTAACAGAACTTATATTTGA
GAAGATAAGTCAGATAAAATTAAATATAGAGATACTTTCAGAATACGATATGGTATTTGCAAAAGCTAAG
TATAGTCAAAAAATAAAAGGAATTACTCCAAAAATAAATAATAATGGCTATATAAAAATAATTAAAGGTA
AACATCCACTTCTAACAGGAGATGCAGTACCTTTAGATTTTGAAATAGGCAAAAATTATAGAAGTCTTAT
AATAACAGGTCCTAATGCAGGAGGAAAAACTGTAACCCTTAAGACTGTTGGTTTACTAACTTTAATGGTT
CAATGTGGATTTGATATTTCTGCAAAAGAAGGTAGTGAATTTAGTGTATTTGAAAAAGTTTTTGTAGATA
TAGGGGATAATCAAAGTATTGAAAATGCCTTAAGTACTTTTTCATCACATATAAAAAATATTGCAGAGAT
TATGAGTTTATCAAATAATTCTACTCTTGTTCTGTTTGATGAAATAGGAAGTGGAACTGAACCTAATGAA
GGAGCTGGTTTAGCAATATCATTATTAGAAGAGTTTTACAAAATGGGATGTATAACTATAGCATCAACTC
ATTATGGAGAGATAAAAAAGTTTGCTACATTACATCCAGAATTTGAAAATGCTGGTATGATGTTTGATAA
AGAAACGTTAGAACCATTGTATAAGTTAACTATTGGAAAATCTGAAGATAGTAATGCTCTTTTTATTTCT
AAAAAAATGGGAATAAAAAATAGAGTTTTAGATAGAGCTAAAGAATATGTAATTGATAGAAACTACAATT
TAGATTTAGTTAAAAGAAGTAAGCTACAATCTAATATTGAAGATAAAAATAGTTCTGAAGTCATTTTAAG
CTATACAGATTATAATGTAGGGGATAAGGTAAAATTACTAGATGAAGATGATTTTGGAATTGTATATAAG
CCTATGGACAAGTTTAATAATGTAGAAGTATTGTTTAATGATAATTTTATTTCAGTAAATATAAAAAGAT
TACAACTTAGCATAAAAGCATCAGAATTGTATCCAGAAGGGTATGATTTAGATGTATTATTTACTAGTTT
TAAAGAAAGAAAATTAGAAAAAGATATTCAAAGAGGTTCAAAAAAAGCTCTTAAAAAGATTCAGAAAGAA
ATTAGAGAGAATAGAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2405415-2404348 hypothetical protein CDR20291_2053 [Clostridium difficile R20291]
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ATATTTCAAAGTTAAATGGAATTTTAAGAGTAGTAGGATTACCTGACTTACATACAGGTAAAATACCTGT
AGGTTTAGCAGTTGAGACTAAAAATATTATTTATCCACATATAATTGGAAATGATATAGGATGCGGAATG
ACTTTATTTAAAACTGGGGTTCTAAAAAAGAAATTTAAAAAAGACAAATGGATTAAGTCACTTAGTAAGA
TTAAAGATTTGTCCGATATAGAAATAAAAAACACATATAAAGAAGAATGTCCAATTTTAAATTTAGGAAC
TATAGGGAGTGGAAATCATTTTGTAGAAATTCAATGTATAAGTGAAATTTATAATAAAGAACAATTTGAA
CAATTAAAATTTTCATCTGATGATATTATGATGTTAGTTCACTGTGGGTCAAGAAATTATGGAGAAGATA
TTTTAAAAAAATTTTATGATAAAGATGGACTTGAAGTTGAAAGTGAGAAAGCAATAGATTATATTAAAAA
ACATGATAATGCTTTAATGTGGGCAGAGCGTAATCGTGAAGCTATCAGTAAAAAAATTATGCAGTCAATA
GGTACATCTGAAGATGTTGAAACAATATTCTCTATAAATCATAACTTTATAGAGAAAAGGGAAGATAAAT
TTATACATAGAAAAGGTGCTGTTTCAAGTGAAAGAGGAGCTGTGATTATACCAGGTTCAAGAGGCAGTCT
ATCATATATAGTTATGCCTACTGAAAATACAGAGATATCTTTATATTCTCTATCACATGGAGCAGGTAGA
AAATGGTCTCGTTCAGTTTGTAAATCGCGCCTTAAAAGTAAGTATAGTAAAGATACTATAAAACAAACTA
AATTTAAAAGTCAGATTATATGTAATGATGTAAATTTATTATTTCAAGAAGCTCCAGAGGCATATAAGAA
TATAGAGCAGATTATTGAAAGTTTGATAGAATATGAACTTATTCAAGTAGTGGCAACTATGAAGCCATTG
ATTACTTATAAAGGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2406656-2405661 putative serine/threonine protein kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGTATGAGGAGGTGACATGGTTGAATTTTATAGGCAATAGATATGAGGTAGTAAATTCTGATGACGTTT
TAGAAATTAACAAAATCTATAAAGCTAGAGATGTTTTTTACAGGAGAAATGTGTTAATAAAAGTTATAAA
GCACAATAATTATATTTGTGAAGATTTTGTTTCAAATTTAATTGATGAAAGTACTGCTTTAGATGAGATA
AACTCTCCTTATATACTAAAAATAATAGATGTTGGGATTCACTGTACAGAAGAAACAACATTATATTATG
TTGTAAGTGAAGACTTTAATGGTATCGGACTAGATGAATTAATTCTAGGTAATTATCTTCATTTAGAAGC
AATTGTAAACATAATGATACAAGTTTTAAAAGCTTTAGAAATGATACATAGGAATCATTCATATCATGGT
AGTTTAAAATCGAGTAGTATAATAGTAGATACAGAATACAATATAAAAATTTGTGATTTTGGAATTACAA
AAGCAAATAATGGGGTTAATACAAGAAGCTATGGAAACAGGAGATATTTATGCCCACATCAACTATGTAT
AAATTATACTGATAAAGAAAGTGATTTTTTTGCAACAGGTCTTATTCTATTTGAATCTATATTTAAAAAA
TTGCCTTTTGGAGAATCAAATTCAGAAGAAAAAATGCTACAATCTATTGATAAGGGATTAGATTGGAATA
GTATAAAAGCAATTAATGGAAATACAGAACTTATAAATGTTATAAAAAGGCTTCTTGGAAGAAATAATAA
GTATACTAGAGCCAATGATATTATTATTGATTTAAGTAAAGTAATGTATGAAAAAGCATATATAGAAGTT
GAAGATGAGAAAGAAGAAGAACAGAAACAAGACAAAGTTATACAAGTTAAAAAAGAATATAAAAGTAAAA
TGAGAAAAAAATTACATAAAAAACTTGTTGTTGCCGGTCTAGCTATAGTCATGATTTCAATGATTATTAT
TAGTTCCATAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c2408174-2406915 hypothetical protein CDR20291_2055 [Clostridium difficile R20291]
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CAGCTTTAGTTCTAATAATGGGTGGATTTACTTATTTTTTTAACAGTAAATTTCTGTACAATGGGAAAAT
CGCTAAAAATGTATATATAGAAGGAGTAAATGTATCTGATATGACTAAAGCAGAGGCATTAAAAGCTATA
ACAGATAAGTATACTCCAGAAGACTTAAATCTTACTTATGATGGGAAAAAATATACAATATCACCAAAAG
ATATTGATTTAAAATATGATACAGAAGATGTTGTAAAAGATGCTTATGAAAGTACAAAAAAAGGGTCCTA
TTTTCAAAACTTAAAAAAATATATTGATATAAGAGTGAATAAGGCAAATATGAAGATAAAAGCTGAATAT
GATGAGGCAAAACTTAGTTCCAAAGTGTCTTCAATAGCAGATAGTATAAATGTTAAGATGAAAAATGCTT
CTATTAGTGTTGGAAGTGGTGGACTAAGTTATACAGACTCTGTTGTAGGTAGAGAATTTGATTTGGCAGC
AAATAAAGAGTCTATATATAATATGATAAAAAATAAAGAGCATAAAACTTTAGAACTTAAAGTAAATCTT
CAAAAACCAGATATAACAACTGAACAAGTAAAAACTGTAAATTCTGTTATAGGTCAATATTCAACTACTT
ATTCACAAGCTGTAGAGGGTAGGTCATATAATGTAGGATTATCAGCAAGAAAAACTAGTGATGTATTATT
AATGCCAGGTGAAGAATTTTCATACAATAAACTTACAGGACCTAGTAATAAAGCAAATGGTTACAAAGAT
GCACCTGTTATAGTTTATGGTAAGCTAGAACAATCAGCAGGAGGAGGTGTTTGTCAAACATCTTCAACAG
TTTATAATGCGGCTCTTCTTTCGGGTATGGAGATAACTCAAGTTACAAATCATTCATCTGCATCTACTTA
TGTGCCTAAAGGAAGAGATGCTACTGTGAGCGATGGAGGATTAAACTTAAAGTTTAAAAATCCATATAAG
CATCCTGTATATATTAAAAATTATGCAGGTGGAGGAAGTGTATCATCAGTAATCTATGGTAATTCTGGTG
ACAAACCAAATATATCTATAGAGGTAAAACAAACTGGTCAGAATAAATATTCTACATATCGAATATTTAA
AGATTCAAGTGGAAAGGTCATAAAAAAAGAACATATATCAAATAGTTCTTATAAAGAATTAAAAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2409042-2408413 putative endonuclease/exonuclease/phosphatase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATAGTAACCTACAATATTCATAAAGGTATGGATTCAAATAATAGATTAACTCTAACTAAAATGG
GGTTATATTTAAAACAATTGGATTGTGATGTAATTTGTTTGCAAGAAGTATTATATCCTCAATTTTTAGC
TTTAAAAGCTGTTTTAAATATGGATGGTGTCTTTGCTACAAATGTAAAAAAAGTAAATATGATATATGGT
ATTTGTACATTTACAACATCTAAAATGTTAAACAGTAATCATTTTTTCTTAACTAGCAAAAAAGAACAAC
GGGGAGCTCTTTGTATAACTATAGATGCATATGGAAGAATTATAAATGTAATAAATACTCACTTGGGACT
TGATAGGCAGGAGAGAGCAAAACAATTAGACGAAATAATAGACTATAGGAACAGATTAGTGGGGATAGTT
ATTTTATGTGGTGATTTTAATGAGAAAAATGTCTTTTTAAGTATGTTTAATGATATGGCTATTTCACTAA
ACAAGTCTTACTTACCAACATTTGAAAAATCAAACTCTAGAATAGATTACATTTTTGTTAATAAAAATAC
TGAATTAAAAGGATACACAGTAGAAAAAATTTACCTGTCAGACCATTATCCTGTAATAGGTTACATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2410908-2409739 hypothetical protein CDR20291_2057 [Clostridium difficile R20291]
GTGTATAATGTGATTGAGACTGGATTTGTATATTGTAGTTTCTTGGTTGTATTCGTAGGTGTAATTTTTT
TTATGGTTGATAAATTGAAATGGAAGGTATTTGATGTTATTAATCCAATGCTTTTAATATACTTAGGTTC
AGCTATACTTGGATCATTTGGTTTATTTGCACAGAATGAAGATGTTGGAACGTATCAAAACATAATAACA
GTGAACTTCCTTCCATTAATGTTAGTGTTCTTGTTAATTCAATGTGATTTAAGAAAAATATTAAAGATGG
GGCCTAAAATGTTATTATCATTTTTCTGTGCTACATTTACATTTATGCTTGGATTTGTTATAGCATTCAT
AATTTTTAAAAATTCAATGGGTGCAGATTCATGGAAAATTCTTGGGGCAGCATCTGGTTCATGGATAGGT
GGCTCATCAAATATGATTGCAGCAGCTAATGCTCTAGGAGTTGCAGAAGAAGGACTTAGTTATGCAATAC
TTATGGGTTCTATAGGATATACAGTATGGATGTCTGTTTGTCTAATGTCTGTGAAATTTGGACCTAAATT
TAACAAATGGACAAAGTGCGATACAAGTTTTATAGATGAGGTTACATCAAAACTTGAAAAAGAAAATAAA
GATAATACGGCACCTACGTTTGTAGAACTTATGATTTTACTTTCTGTTGGGTTTGGAGTTGCGTCTTTTG
CACAAATTGTATCCAAGATACTTCCAACTTCAGGTATACTTAATGAAACTATGTGGGTAGTACTTGTTGC
ATCTACAGTATCAATATTATTGGGTATGACAAAAATATCAAAGCTTAAAGGGAGTACACTGGTAGGAAAT
GTGTTTATGTATTTACTCCTTGCAGCTACAGGTAGTAAAGCAAATTTCTTTGGATTGTCAGAAGCACCTG
TTTACATAATGTTTGGATTGGTAGTAGTCCTTGTACATGCTATTTCATTTATAGGGCTTGCTAAACTATT
TAAACTTGATTTATTTACTTGTGAAGTAGGAAGTATAGCTAATATAGGAGGAGTAACTACAGCTCCAATG
ATTGCTGGGGTTCACAATCCTGTATTAATACCAGTAGGTGTACTTATGGGGCTTCTAGGAAATATTATAG
GGACTTATTGTGCTCTTGTGGTAACTCAAATATTACATATGTTAGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:2411369-2412409 putative glutamyl-aminopeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTAAATTTAACTAATACTATAAATTTAATGAAAAAATATTTGGACATTCCAAGCCCAGCTGGAT
ATACTGAAAATGCAGTTTTAGAAATCAAAAAAGATTTTGAAAATTTAGGTCTTGACACTATTCTTACAAA
AAAAGGTGCACTTATAGCTACTCTTCCTGGTGAAGATGATTCAAATCAAATAACAATATCTGCACATATG
GATACACTTGGAGCTATAGTAAAAGAAATATCATCTGATGGTACTCTTAAATACCATAAAGTTGGTGGTG
GATGTTGGGCAGCTATAGAGGGAGAAAACTGCACTGTTATAACTAGAAAAGGTAAAAAAATCAGAGGAAG
TGTTGTATTTAAGTATGCTTCTACTCATATATATGGTCAAACAAAAGCTGCCACTGAAAGAAATGAAGAA
ACAATGATTATTAGACTTGATGAAAAAGTATTTACAAAGCAAGATGTATTAGATTTAGGAATAAGTGTTG
GGGATTTTGTATGCCTAGACCATAGATTTGAGGCTACAGAATCTGGTTTTATAAAATCTAGATATATAGA
TAATAAATCAGCTGTAGCAATGGTTCTTGAAATATGTAGATATTTTAAAGAAAACAATTTAACGCCTAAG
CATACTACTAACTTTTATATAAGTAATTATGAAGAAATTGGACATGGTGTTTCTAAATGTTTACCTGAAA
AAACAAAAGAATTTGTAGCAATAGATATAGCACCTACTGGACCAAGTCAAACATCTAGTGAACATGGTGT
AACTATAGTTGCAAAAGATAATTTATCATTATATGATTTTAATTTAAGAAACAAGCTTGTCGATGTTGCA
GAAGACAATAATTTAGACTACGCTGTCGATGTATTTACTTTCTATGGTTCAGATGCTTCAGAAGCTATTC
GTTGGGGAGAAGATGTTCAAATAGCATGTGTTGGTCCTGGAACAAACAATAGTCACCATTATGAAAGAAC
ACATATAGAAGCTATTGAAAATACACTAAAATTACTTATAAATTATATGCTTAAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:2412790-2413041 hypothetical protein CDR20291_2059 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGGTTGCAGTTATAAGTGCTATTTTGGAAGAGCCAAAAGAATGTCAATTTAAATTCAATGAGG
TTGTATCAGGTTTTAAAGGTATTATTAAAGGAAGAATGGGCATTCCTTGCGAAGAAGAAGGTGTCTCAAT
CGTATGTATAGCAGTTGTTGGCGAAATGGATACTATTAATAGTTTGACTGGTAAATTGGGCAACATACCT
CATGTATCTGTAAAAACTAGTATATCAAAAAAAGAAGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:2413056-2414264 putative ATP/GTP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTCTAAATTCTACTCCACAATCGGTAAGAGTACATATAGGTCTCTTTGGTAAAAGAAATGCAGGTA
AATCTAGCATAATAAATGCTATAACAAATCAAAGTGCTGCAATAGTCTCAGATATTGCTGGAACTACTAC
AGACCCAGTATTTAGACCAATGGAAATCCTTCCTATAGGACCTTGTGTTCTTATAGATACTGCTGGTCTT
GATGATGTTGGTGAACTTGGTGAACTTAGAATAGGTAAATCACTAGATGTTTTAGAAAAGACAGATATAG
CTTTACTAGTAGTGGATTGCCAAATTGGTATATCACAAGAAGATTTGTCACTAATTGAAAAGTTTAATGA
TAAGAATATCCCTCATATTCTAATTCTCAACAAAATTGATACTATTAAGAATCAATCAGAAATTTTAAAC
TTAACTAAAAATAAAGTTAAATGTCCAGTTGTTTCTGTCTCATCAACAGATAAAATTGGAATTGAAAATT
TAAAAAATGAAATAATAAAAGTTTTGCCTAAGGATAGCACTGAGTTCAAATTGGTATCAGATTTAATTGA
ACCAAATGATTTAGTTGTTTTAGTTGTTCCAATAGATAAAGCAGCTCCAAAAGGTAGACTTATACTTCCT
CAACAGCAAGTTATAAGAGATATTTTGGATAATGGTGCAATTTCTATAGTTACAAAAGAAGATAGTTTAA
AAGAAACTCTATCTAATTTAGGCAAAAAACCAAAACTTGTTATTACTGACTCTCAAGTATTTCCACAAGT
AAATAAAGATACACCAAAAGATATTCCTCTTACATCTTTTTCTATATTGTTTGCTAGACAAAAGGGAGAC
CTTAAAGAATTGATTAATGGAGCTTATGCTTTAGAAAATTTAAAAGATGGTGATAAAATCTTGATGGCTG
AAGGATGTACCCATCATAGACAAACTGATGATATTGGAACAGTAAAAATTCCTAATATGATTAGAAAGAA
AACTGGCAAAAATATTACTTTTGAATTTAGTTCTGGAGTATCCTTCACTGAAGATATAAATAAATATGCC
CTTGTAGTTCACTGTGGAGCTTGTATGATGAATAGAGCTGGAATGTTATCTAGAATAGAAAAGGCAAAAT
CTTTCAATGTACCTATTGTAAACTATGGTATCTTAATAGCATATGTAAAAGGTATTTTGGAAAGATCACT
TGAACTTTTCAATTATTAA
>ref|NC_013316.1|:2414300-2415385 radical SAM-superfamily protein [Clostridium difficile R20291]
ATGACTAAAAATAAGATTAAATACTTTATAGATAAACTTTACAGCATTAATTCATTAAGTTTTGATGAAC
TACTATATTTAATAGAAAATATCGACAATGAGGAATATAACTTCGAACAAAATTTAAGAAACTATCTTTA
TAAACAAGCTAGCGACATGAGAAATAAACATTATGGAAATAGAGTCTACTTGAGAGGACTTATAGAGCTT
ACAAACTATTGTAAAAATAATTGCTACTATTGTGGAATACAATCTTCTAATAAAAATATCATAAGATACA
GACTTTCACCTGATGAAATACTTGAATGTTGTGATATAGGTTATAAAATAGGATACAGAACATTCGTTTT
GCAAGGTGGTGAAGATGCATATTTTACTGATGATAAAATATGTGAAATTGTTTCAAGTATAAAAAATAAA
TATGAGGATTGTGCCATAACTCTGTCACTAGGAGAAAAGAGTTATGATTCGTATAAAAAATACTTTTTAT
GTGGTGCAGATAGATATCTTTTAAGACATGAAACTGCTACAGACAGTCATTATAAAAAATTACATCCGCC
AAACATTGAGCTTAGAACTAGAAAAGAATGCCTAAAAAACCTTAAAGAAATTGGTTATCAGGTAGGTGCT
GGATTTATGGTTGAATCACCATTTCAGAACAACAAAGACCTTGTTCGTGATTTATTATACCTAAAAGAGT
TAAATCCTCATATGGTTGGAATAGGACCTTTTATTCCACACCATGATACAATTTTTAAGGATTATAAACA
TGGAGATTTAGAGAAGACATTACTTATGCTTTCAATTACAAGACTTCTACTTCCAAAAGTTTTATTACCC
GCTACAACAGCCTTGGCATCTATAAACCCTAGTGGTAGAAATGCAGGTCTTTTAGCTGGTTGCAATGTAA
TTATGCCAAACCTTTCTCCTCAAGAATTTAGAAAACAATATTCTCTTTACGATAACAAAGCCTTTACTGG
TCAAGAAGCTTGTGAATATCACCAAAGTTTAGAAGAAAACATCAAGTCATTAGGACTTGAAGTTGACTAT
TCTCGCGGTGATAATATTGAATGGAGGCGTTTGTAA
>ref|NC_013316.1|:2415386-2416762 radical SAM-superfamily protein [Clostridium difficile R20291]
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AAAAGGTACTTGATAAGGCTGATAGAAGGGAAAAACTTAGTTATAAAGATATAGCTACACTTCTTGAAGT
AGAAGATAAAAAACAACTAGATAGATTATTTAGTATAGCTGGGCAAATAAAAAATGAAATATATGGTAAT
AGAGTGGTTTTATTTGCCCCTCTTTATGTATCAAACTACTGTGTAAATGAATGTGTTTATTGCGGTTTTA
GTAAATGCAACAAATTTAAAAGAAAAAAACTTACCATGGAAGAGATAAAGGAAGAGGTTAAAATATTAGA
AAAAATGGGTCATAAAAGACTTGCTCTAGAAGCTGGTGAAGACCCTAAAAATTGTGATATAAATTACATC
TTAGATTGCTTAGATGCAATTTATTCAACATATAATGAAAACGGAAATATAAGAAGGGTAAACGTTAACA
TAGCAGCTACAAGTGTAGATGAGTATAAATTACTAAAAGAAAAAGGAATAGGAACTTATATATTATTCCA
AGAAACTTATCACAAACCAACATTTATAAAAATGCATGGTCAATCTATAAAAAATGACTATTATTACCAT
TTAACAGCTTTTGATAGAGCTATGGAAGCTGGTGTTGATGATGTTGGTGCAGGAGTTTTATTTGGTTTAT
CTGACCCTAAATTTGAAGTTCTAGGACTTATGATGCACAACGAACACTTAGAGGAAAAATTTGGTGTAGG
TTTCCATACTATATCTTTCCCTAGATTGAAAAAAGCTGAAGGTATGAGCTTAGAAGATTTTCCTCACTTA
GTTTCTGACGATATGTTCAAAAAAATAGTAGCTATAACTAGATTGGCTGTTCCTTTTACTGGAATCATAA
TGTCCACTAGAGAAACTGCTGAAATGAGAAATGAGTTACTAAAATATGGTGTATCACAAATTAGTGCAGG
TTCTCTAACAGGTGTTGGAGGATATAAAGCATATGAAGATGGTGACAATACAGAACAATTCGAAGTTGGA
GACCATAGAAGCCCTGTTGAGGTGCTTAAAGAACTGATTACTGATGGATATATACCTAGTTATTGTACAG
CTTGTTATCGTAAAGGTAGAACTGGCGATAGATTCATGAGCTTAGCTAAAAGTCGACAAATCCATAATGT
ATGTACGCCAAATGCTCTTACTACATTAAATGAATTTTTAATCGATTATGGAGATGAAGAACTTAAAATT
ATGGGTAAAAAACTTATCGCAGAAGAAATAGGTAAGATAGAAAGAGAAGATATAAGAAACATAGTATCTA
ACAATATGACTGCCTTAGAGCGTGGAGAAAGAGATTTATACCTATAA
>ref|NC_013316.1|:2416853-2417281 hypothetical protein CDR20291_2063 [Clostridium difficile R20291]
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TTCAAAAAAATAAAAATATCAAACTTGATAATACACACAAAGTCATTCCTTACCCTAAAAATAGAAAAAA
GGATGATAAAAAGAAAGGTAACAAGAAAAAGAATACAAATACATCTAAAGTAAATAAAAATAATTATGGC
CATTCTTTTTTCAATAACAAATACAAATATAAAAGAAAACCATATGTTATTGCTTTATACACAGTAATTC
TTATTCTTTTAGCTATCTTAATTATAACTAAATTAACAGATAGTACGAATAAAGGTAATTATTCTCGTAA
TACTGTCTCTGATACTCACAAAAACGACATCCGAAATATAGTCTTTAATGAATCAAACAATTTTCTTATT
TGTGGGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2418675-2417356 4-aminobutyrate aminotransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCGAGATAACTAGTCAAATGATAAGTACAGAAGAAAAAAAATATGTTGCTAAAACTCAAAAGATAC
CTTATTATCCAGTAGCATTTAAATCAGGTGATGGTGCAATGCTATATGATTATGAAGGTAATGAATATGT
AGATTTTTTAGCAAGTGCAGGCTCTGCAAATGTAGGTCATGGTAATAAGGAAATCTCACAAGCAGTTAAA
GAACAAATGGATGATATAACACAATATACACTTGCATATTTCCATAGTGATCCTCCTGTAAAATTAGCTG
AGAAGCTTGTGGAAATAGCCCCTGGAGATAATGATAAAAAAGTACTATACAGTGCAACTGGTTCTGCTTG
TATAGATGCTGCTATAAAATTAGCAAGAGGGTATACTGGAAGAACAAAGATAATATCTATGTGTGAATCT
TATCATGGAAGTACTTATGGAGCTATATCTATATCTGCTTTAAGTACAAATATGAGAAGAAAAATGGGTC
CATTGTTACCAGAAGTTTATCACTTCCATTATCCTGATAAAAATAGAACAGCTAAAGAATGTTTAGATGA
GATAGAATATGCTTTTGCACACTATCTACCAGCAGAAGAGGTAGCTGCAATATTTATAGAGCCAATTGCA
GGAGATGCAGGAATAATAGTGCCTCCAGTAGAGTGGGTACAAGGTTTAAGTAAAATATGTAAAGAAAATG
GAATATTACTTGTAAGTGATGAAATACAACAAGGTATGGGAAGAACAGGTAAGTGGTTTGGTATAGAAAA
TTTTGGTGTTGAAGCAGACCTTATAGTTCTTGGAAAATCTGTTGGAGGTGGATTACCTTTAGGAGCAGTT
GTTGGAAGAACAGAAATAATGCAAAGTCTTGATGCACCAGCACATTTATTTACTTTAGCTGGAAATACAA
CAGTGTGTGTCGCTGCTTTAAAATCTATAGAGATAATTGAAAAAGAAAACTTACTTCAAAAGAGTATAGA
AATGGGAGATTATATTAAAGCAGGATTTGAAAAACTAAAAGAAAAATACGATATAATTGGAGAAATAAGA
GGAATAGGGTTATCTATAGGAGTTGATATAGTTAAAGGAAAAGGTTCTAATGAAAAACATCCAGATGCTA
CAGCTAAGATATGTTATAGATGTATACAAACTGGATTAATAATGATATTCTTAGGACAATCTACTTTAAG
AGTACAACCACCTCTAGTAATAACTAAGGAGCAAGTAGATAAAGCAATGAGCATCATAGATTCTGCAATA
GATGATTATTTAAATGGTAGAATTGGTGATGAAGTATATGAAGTAACTCAAGGTTGGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2419752-2418967 hypothetical protein CDR20291_2065 [Clostridium difficile R20291]
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GATGTTCTATAGCAAGCAAAAGAATAATCAACAGAGGTTTTTTAAATGGTCCAATATGCCCTGTTTATGG
TTTTGGAGCAGTAATTGTGATATCACTATTAGGAAGATTTAATAATGTAGTAATAGTATTTCTATTAGGA
ATGATTTTAACTACGATACTAGAATATTTTACAGGATTTATTTTAGAAACCTTATTTCATGCTAAATGGT
GGGATTATTCTGACAGAAAATTCAATATAAAGGGTAGAGTATGTTTAAAAAATGCAATATACTTTGGTGT
AATGTCTGTTTTAATAATAAGATTTATACATCCATTTATAAAATATTTTGTAAGTATAATTCCATATAGA
ATATTAATTTCAATGGCTATAATTACAACACTTTGGACTATACTTGATTTGATTGTTACTATTATAACAC
TTAAAAAATTAGATATAAAGTTAAACTTACTAGACGATATAATTACAGACCTTAATGATATAAATGTGAA
ATTGGATAAATTTGATAGAGGAGAAATACAAGCTTTATTTAAAACAATAAATAACGACGGATTAGAAGTT
AGAGAAAAAATAAACAAAATAAATAGTAAGTTGGACCGTATAGAGTCTAATATTATTTTACAAAAAAGAG
TTATAAAAGCATTTCCACATATAAAACATAAAAAACAACAAGAGCAACTAGAACATTTTAAAAAAATTAT
TAATGAGAAAAGGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2420826-2419867 hypothetical protein CDR20291_2066 [Clostridium difficile R20291]
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TAATGATTATAAGAATAATTTTATTTAGAGATGTACCAATTTACGCTATTTTCAAGGGAACGTTTAGGAA
TGTAAATTTAATTCCATTTTATACAATATATCAATTTATAGTAGATAGTAATCTTGACTTTATGAAAGCT
ACTGTAAATATTATAGAAAATATAGGTATATTTATTCCTATGGGAATTTTTTTACCTATAGTATGTAAAA
ATCTAAATAAAAAAACTATAATTATAGTAATTATACTTGTTAGCCTAGCATTTGAATTAACACAATATAT
TTTTGCTCTTGGAAGTAGTGATATAGATGATGTTATTTTAAATTCATTAGGTGGAATAATTGGAATTAAT
ATTTACATAAACATGAATAAATTATTTCCTAATGATATTAAAAGATTTAAGGCTATAATAGCTACTAGTT
TAGTTTTAGGAGTTTTAGGATTAGGAGTTATTTCTAAAAATTATCATAACTTACTAACTTTTAAATTTAG
ACCTGATAGAAAAATATCAAAAATATTAATTGAAGAAAATAGGGAAATAATTAAAGATATAAATAAAGAT
ACAGTAGATATAGTTGGGACATTTGAGAGCTTTAAAAAAGGAATAATAACTATTAAAGCAGGTTCTAATA
ACAAAGTAAAGAGACCAGAGAATTTAATTGATTCTGATGGAAATATAAGAATTTATTTAAATGAAAATAC
AAAATTAGTATCTTATATAATTACCAAAGAATCAAAAATGGATATAGTTAAATATGAGGAATTTGATGTG
AAGAATTTAGATTTATTAAGGAGATATGATACTATTAATGTTTGGATTGATAAAGAAAATCAGCCAAAGG
ATAAACATGGTATTATGGCTAGTAAATTATTAATTGGATTGTATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2421301-2420984 hypothetical protein CDR20291_2067 [Clostridium difficile R20291]
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TCAATAAAGGAAAAATAGCATCTAATAAAATTGTGTTTAATGCAATAGGAGTACTTACATTTGTACTTTG
TTTTATGCTTTTTAGTTATTATCCTAATAATAATCTTATTGGAAAATTTATTGCTTCTCTATTTTTTATA
TTTGGAGTTGCAGGAGTTATGTTGAAAGAAAAAAATTTTTTATATGCTAGACTTCTTTTAACTGTAGTTA
TAGTTTTTTCTACATTAAGATTGTTCGTTATTCAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2421911-2421408 putative acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGCAACAAAAGGACTACATAGAGTTATATGAAAATGAAGAACTAATAGAGATAAGAGAAGCACGTA
TGGATGATTTGGATACAATAGCAAAATTTAATTATAATTTGGCTAAAGAAACTGAAGGAAAAGAACTTGA
TATGGATGTTTTAACTAAAGGTGTAAAAGCATTGTTATTAGATGAGAGAAAAGGAAAATATCATGTATAT
ACAGTATTTGATAAAGTTGTTGCACAGATTATGTATACATATGAGTGGAGTGATTGGAGAAATGGAAATT
TCCTTTGGATTCAGAGTGTATATGTAGATAAGGAATATAGAAGAAAAGGTATCTTTAATTATTTATTTAA
TTATATAAAAAATATATGTGATAAAGATGAAAATATAGTTGGAATGAGATTATATGTAGAAAAAGAAAAC
ATAAATGCAAAAGCAACATATGAGTCTTTAAATATGTATGAGTGTGATTATAATATGTATGAATACGAAG
TAATACATTCGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2423162-2421963 putative RNA-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAGTTATATTATACAAATCAGTATATAAGAGATTTTACAGCAGAAATAATTGAAATAAAAGAAG
TAGAAAATAAGTATCATGTTTTATTAGATAAGACAGCTTTTTTTCCTGGTGGAGGAGGTCAGTTTGGAGA
CCTGGGAAAAATAGAGAATGATGATGTAATAAATGTGTATGAAGATGGAAAAAATATATACCATGTATTA
GATAAAAAACCTATAAAGATACATAAGGTAAAGTGTAGTATTGATTGGGATAGAAGAGAAGATGGAATGC
ATCAACATTTTGGACAACATGTATTATCTGGATGTTTTTTTAAAACTTTTAATGCAAATACGACAGGTTT
TCATTTAGGAAATGAGTATAGTACAGTAGATATAGAAGGTAATTTAGAAGAGAACAAAATTAGAGAGATA
GAGTTGTTTGCCAATGAAATTATTCGCCAAAATATACAAGTAGAGACATTACTTCCAACGAAAAAAGAAC
TAAAAAAGATTTGGTTAAGACGTGATTTGCCAAATACTGATGAAGAGATAAGAGTAATAAAAATAGGTGA
TTTAGATACGAATGCATGTTGTGGAGTGCATCCAAAATCAACTGGTGAATTGAGAATGATAAAAATAAAG
AAATGGGAAAAACATAAGTCAAGTACAAGAATAGAGTTTCTAGCAGGTAAAAGGGCAGTGGATGAAGTAT
TGAAGAGGGATATATATTTGACTAAAATATGTAGATATTTAAGCTGTAGTGAGGAAGATGCTATAAATGG
TATTGTAAATCTAAATAGTAAAGTGGAAGAGGCTTTAATTAAAAAAAGAAGGCTTGAAGAAGTAGTATCT
ACATATCAGGTCAAAGAAATGATTGAAAAAGCAAATAAGGTTGGCAATATTTCGGTCATTAAAAAAATTT
ATGATGATGAAGATTTGAAATATGTAAATAAGATAGCAAATAAAATTGCAGAATATGAAAATAGTATTGC
ATTATTAGCTGTTAAATTTAATGATAAAATAAATTTAGTTTTTGCATGTTCTAAAAATTTAAAAGATATT
AATATGGGAGTTTTATTAAAGGATGCAATAAGTCTTATAGATGGCAAGGGTGGTGGAAGTAAAGTATTAG
CTCAAGGAGGAGGTAAGAATAATGGAAATTTAGAGGCTACACTTGATTATGCATTTATGAAGATAGAAAA
AACTCTATAA
>ref|NC_013316.1|:2423945-2424913 L-lactate dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAATAAAGCCAAGAAAAATATCTATTGTAGGTTCAGGGCATGTTGGTTCTCATTGTGGATTTAGTT
TAATAACTCAAGGAGTTTGTGATGAACTCTTTATGATTGATATAGATGAATCTAAATCAAAAGCTCAAGC
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TGTAAAGATTCTGACATAGTAGTGATAAGTGTTGCAGACTCTTCAGAAGGGCCTTTACGTAGACAAAACA
CAACTAGATTAGATTTACTAAGACCAACTATTGGAATGATAAAATCTATAGTAAAACCCATAGTTGATTC
TGGCTTTGATGGTATATTTGTAGTCATATCTAATCCTGTTGATGTAGTTACAAATTATATTTGGGAAAAA
TCTGGCTTTCCTAAAAATAAAGTCATTGGAACTGGAACAGCTTTAGATTCAACAAAACTTAGAAGGATTT
TATCTGAAGAAACTGGAATCGCTCAACAATCAATTCAAGCTTATTCTATGGGTGAACATGGAGATTCTCA
AATGGTTCCTTGGTCTCATGTTTCAATTGGTGGTAAACCAATCTTGGACATGATAAAAGACAACCCAAAT
ACTTATAGCAATTTAGACTTACCATCAATAGTTGAAAAAAATAAAAAAACAGGGATAAGTATAATAAATG
GTAAAGATTGTACAGAATTTGGTATAGGTACTGCTTTAGTAGAAATTGTAAAAGCTATACTACACAATGA
GAAAAAAGTTCTTCCAGTTTCTACATTACTAGAAGGTCAATATAACGAAAGAAATGTATTTGCAGGTGTT
CCATGTGTTATAGGAAAAGATGGTATTGAAGAAATTATTGAAATCAATATGACTGAATATGAGCAAAACG
AATTTAATAAATCTTGCTCTGTTTTAAGAGAATGTATTGCACTTTCAAAAACACTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2426160-2425030 hypothetical protein CDR20291_2071 [Clostridium difficile R20291]
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AGTTGTCTAAAGAAACTAAAATAAATAAAAAAGATTTAAAAGCTTTTGAGGAAAATAAGTATGTACCAAA
TATAGAAAATACATTAAAATTATCTAATATATTAAATTTTCCAAAAGAGTATTTTTATAAAAATGAAAAT
ATAAATATCGTTGTAGAGGATAGCCATTTTAACCCTCAATCTAAACTACCTAGAGTAGAAGAGATTTCTT
ATAGAGAAAAAATAATTATAATACATAAAATATATTCATTTATGGAGAATTATATTAAGTTTCCAAAAGA
AAACTTGCCAAATAGAAAAGTAATGTCAGATATTAATATAAGTGATATAGAATCTCTTGCATATAAGACT
AGAGAGTTTTGGGATTTAAATAGTACTCCAATAGTAAATATGGTAAGTTTGTTAGAATCTAAAGGGATTA
TAATATCAGGTATGAATGTAGATAGAAAAGGGGCAACTATCTTTACTCAAAAACAGAGAATTAGTAAAGA
ATCTAAATATCTAATATCTCTGGGTAATGACAAAAAGTCAGCATCAATTAGAAATTATACTTTGGCATGT
GAGCTTGGATATATAATATCAAGTGAATTAAGAATACCAAGTAAGCAATTTTCAGAAGATGAGTATGCCT
GTGCATTTTTATTGCCAAAAGAGAGTTTTTTAAAAGATTTGACTCATCCAGAAGATTTAGATTATTATGT
AGAACTAAAGAAAAAATGGATTGTACCTATATCTGCTATGATTTTTAGAGCATATAATCTAGAAAAGATA
AATTACAAAAAATACAATTATCTTATGAATGAAATGGATAAAAAAGGCTGGTTGATAGAAGAACCACTAG
ACAAAATGAAAGGTTCAAGCCCAACGTATTTAAAAAGAGCAGTTGAATTATTGATAGAAAATAAAATAAT
GAGTGTAAATAGTATAGTATCAAGTTTAGAGGAATTTGGAATAAATCTTTATCCAGAAGACTTAGAATTA
TTGATGGGATTGAAAAAAGGATTGTTATCTCAAGAGGTAAATAAAAAAAGTAAAGTTATAAAATTTGATG
GTAAAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2427272-2426313 putative peptide methionine sulfoxide reductase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATGATAAAACTTGCTACTTTTGCAGGTGGATGTTTTTGGTGTATGGTAAAACCTTTCGATAAGT
ATGATGGAGTTATTAAAGTAGTTTCTGGATATACAGGTGGTCATGTTGAAAACCCTACATATCAAGAGGT
ATGTTCAGGAACTACTGGTCATTTAGAAGCAATTCAAATAACATATGATGATGATATAATAAGTTATGAT
GAACTTCTAAATATCTTCTGGAAACAGATTAATCCTACAGATGATGGTGGACAATTTGGTGATAGGGGAA
CTCAATATAAGACTGCTATATTTTATCATGATGAAGAACAAAAAAATATAGCTTTAGAGTCAAGAGAACA
TCTGGAAAATAGTAAAATATTTGATAGTAAAATAGTGACTGATATAATTCCAGCAACTAAATTCTACGAA
GCAGAAGAAAATCATCAGGATTATTATAAAAAAAGACCATTAAACTACAATATGTATTATAAAGGGTCTG
GAAGATATAATTTTGTAAAAAGTCATTGGGATGGAAACAATATAAATAGGGAAGAGTTAAAAAAGACTTT
AACTCCTATACAATTTGAAGTCACTCAAAATGATATGACAGAAGTACCTTTTGAAAATGAATATTATGAT
AATAACAAAGAGGGAATTTATGTTGATATTGTAAGTGGAGAAGTGTTATTTTCTTCAAAAGATAAATTTG
ATTCTGGATGTGGGTGGCCAAGTTTTTCAAAGCCAGTTATAGATAAATCTATCATTGAGAGAAGTGATTT
CTCACAAGGTATGTACAGAATTGAAGTAAGAAGTGCTAAAGGAAATTCTCATTTAGGTCATGTATTTGAT
GATGGTCCAAAAGAACTTGGAGGTTTAAGATATTGTATAAATTCTGCTTCTCTTAAATTTATACCAAGAG
AAAATATGGAAGTTTTAGGATATGGAGAATATTTAAAACTTTTTGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2428313-2427390 patatin-like phospholipase [Clostridium difficile R20291]
ATGTGGGGGTATATGTATATGAAAAGTTCTAATTTTAATATATTGGCATTTGATGGTGGTGGATTAAAAG
GGGCATTGAGTATATCCATACTTGAGAGGATAGTAAAAGAGTATCCAAATCTATTAAACAATATAAATAT
GTTTGGAGGGACATCTACAGGGAGTCTAATTGCACTAGGACTTGCGTATGGTGTAAGCCCTAAAGAGATA
AAAGAACTTTACTCAATTGAAAATTCTAAGTATATTTTTAATAAAAGTTATGCAGAAATACTCAGACCAA
AGTATGAAAACAAAAACTTAAAAGAAGTTTTATTAAGTATATTTCCAGAGGAACTAGAATTAAAAGATTT
AAATAAATTAGTAATGATACCAAGTTTTTATATAGGAAATGAGGAAAATGCATGGAAACCAGTGTTTTAT
AACAATATGCCAAATTCTTTTACAAAGACTAGCAAAGTTGTAGATGTAGCAATGGCAAGTAGTGCTGCTC
CAGTATTTTTTCCAACATATAATCGTCATGTTGATGGAGGAATAATAGCAACTGACCCAAGTTTAGCGTG
TATAATTCATGCCATTGACAGTGGATTTAAACTTAAGAATACAAGACTTTTTTCAATAGGGACTGGATAT
GTATATAATAGTATAAAGGCAGATACTACTGAATGGGGAGCTATTGACTGGATAATTAATAAAGAACCCG
ATTTACCAATTATATCTATTACCTTAGAAGGAAATTCTCAAATGAGTCAGTTATTTTCTCAAAAACTTCT
TGGAGATAATTACTATAGATTAAATCCTAAGATGGAAAAAGATGTAGCTATGGATGATTGTGATGCATTA
GAATATCTAATGTCTTTAGGAGAAAATTGTGATATAAAAGATGCTTTTGGATGGATAAAGAAAAAGAGCT
TTTATAGAAATTAG
>ref|NC_013316.1|:c2430251-2428659 hydroxylamine reductase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAAATGTTTTGTTTTCAATGTGAACAAACAGCAGGAGGTAAAGGTTGTACTATAAATGGTGTTT
GTGGTAAAAAGGGGGGTACAGCTAACTTGCAAGACGAGCTTACAGGAGTGTTGATTGGTCTTTCAAGAGC
AACTATTGGAAATAAGAATAGACCAACAAGTGAAACAGATAAAATTATGATAGAGGGGCTATTCACTACT
ATAACGAATGTAAGTTTTGATGATGAAGCTATAAAAAGACAAATTGAAAAAACTGAGGTAGAAAAAAGTA
AACTTGTACCTAGATGTTCAGATTGTTCAACAACTTGTAATAGAAATGATAACTATGATATGAAGGATTT
ATGGAATGATAATGAGGATATACGTTCATTAAAATCATTAATCTTATTTGGATTAAGAGGCATGGCTGCC
TATGCATATCATGCAATGGTACTTGGTTATACAGACAAAGACGTAAATGAATTTTTCTATGAAGGATTAA
TAGCAGTTGGAGGAGACTTGTCTATTGACGAACTTTTAGGTCTAGTTATGAAAACTGGAGAAATAAACTT
AAAATGTATGGAATTGCTTGATAGAGCAAATACTGAAACTTATGGAACACCAGAACCGACTCAGGTATCT
ATGAAAATCGAGAAAGGGCCATTTATTGTAGTTACAGGACATGACCTTTATGATTTACACAAATTATTAG
AACAAACGAAAGATAAGGGTATAAATATATATACTCATGGTGAGTTATTACCAGCACATGCATATCCAAA
ACTAAAAGAATATAAACATCTAAAAGGTAATTTTGGTACAGCATGGCAAAACCAACAAAAAGAATTTGAT
AATATTCCTGCTCCAATATTATTTACAACAAACTGTTTAATGCCTGTTAAAGATAGTTATAGAGATAGAG
TATTTACTACAGAAGTAGTTGCTTATCCAGGTATGGTTCATATTGATGAAGATAAAGATTTTTCTAGTGT
AATAGAAAAAGCTCTTGAACTTGGAGGATATAGAGAAGATGTTCATATGACTGGTATTAATGGAGGAGAT
ACATTAACTACTGGTTTTGCAAGAGGTACAGTTTCATCTGTACAAGATAAAGTAGTAGATGCTGTAAAGA
GTGGAGCTATAAGACACTTTTTATTGGTTGGAGGTTGTGATGGTGCAAAACTTGGAAGAAATTATTACAC
TGAATTTGTAAAACAAGCTCCTAAAGATACTGTTATATTGACACTTGCATGTGGAAAATATAGATTTAAT
GATTTAGACCTTGGGGATATAGGTGGCTTACCTCGTTTAATGGATATGGGACAATGTAATGATGCTTATA
GTGCAATTAAAGTGGCAGTTTCATTGGCAAATGCTTTTGAATGTGGAGTAAATGATTTGCCTCTTAGCAT
GGTACTGTCATGGTATGAGCAGAAAGCTGTTTGTATACTTCTTACACTACTTCATTTAGGTATCAAAAAT
ATCTATATAGGGCCTTCTTTGCCAGCATTCTTATCTAAGAATGTATTAGATATATTGGTTGATAAATTTG
CATTGACACCTATATCTACTCCTGAAGAAGATATGAAGAAGATTTTAGGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2431036-2430311 iron-sulfur binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATGAGAAAAATAATTAAAATTGATGAGGGAAAGTGTAATGGTTGTGGACTATGTGTTGAAGCTTGTC
ATGAAGAAGCTATAGGAATGGTAAATGGAAAAGCAAAACTTTTAAGAGATGACTATTGTGATGGGCTGGG
AGATTGTCTGCCAACTTGTCCAACAAATGCGATTTCATTTGAGTATAGAGAAGCAGCAGAATATGATGAA
GCTGCAGTAAAAGCAAATATGGAAGCAAAGAAAGCACAAAAGAAAACTTTAGCATGTGGATGTCCAGGTT
CTCAGTCTAAGTCAATAAATAGAGAGGTTTCAAATAGTACATCTATAAGCAATGATATAGTAGAGATAAA
AGGTTCTCAACTTAATCAATGGCCAGTACAAATAAAATTAGTACCAACTAATGCATCATATTTAAAGAAT
GCAAGTCTTTTAATAGCAGCAGACTGTACAGCGTATGCATATGGAAATTTTCATAATAAATTTATGAAAA
ATAAGGTTACATTAATCGGATGCCCTAAACTTGATGAAGTTGACTATGCTGAAAAACTGACAGAGATTTT
AAAAGAAAATGATATTAAAAATATAGTAGTAACACGTATGGAAGTTCCTTGCTGTGGTGGTATAGTAAAT
GCTGTTAAGACAGCTCTACAAAATAGTGGAAAAATGATACCATGGCAAATAGTTACTATATCTGTAGATG
GAAAAATTGTAGATGGAGAAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:2431177-2431905 putative cNMP-binding regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAACAAATTATCGGTTGCATATGCAACAAGGAAGTGATTATTTGAAAAAATTTTTAGAAAAGCATA
TAGACCTACTTAAAAAAATTCCTCTATTTGAAGGAATTAAAAGTGATGAGCTTGAAGAAATGTTGGAATG
TTTAGGTGTTGTAGATAAGACTTACCCAAAAGATAGTATAATATTCTCTGTTGGAAGTGAAGTTACTTCT
ATTGGAATTATGCTTAAAGGAAGTGCTCATATAATAAAGGAAGATATCGAAGGGAATAGGAATATTGTAG
CTGAACTCTTGCCTGGAGATTTATTTGGAGAGGTATTCGCATGTACTAGACTACATAAAAGTAATGTTAC
AGTAACCACAACATCTTCTTGCGAAGTTTTATTTATAAAGTTTAAAAGTGTAACTGGTATTTGTTCATCT
GCATGTGTATTTCATAATAGGCTTGTTGAAAATATGCTACAATTAATAGCTGAAAAAAACATTTTACTTC
ACAATAAAATAGAATTACTTTCTCGTAAAACAACTCGCGAGAAATTGCTTATGTATTTTTCAAAACAGAT
AGAACAAACAGGTAGCCACCAGTTTACAATTCCCTTTTCAAGAAATGAAATGGCTGATTTTTTATGTGTT
GACAGAAGTTCTATGTCAAGAGAGCTTGGCAAGATGCGAGATGAAGGCTTGTTATCTTTTAATAAAAATA
AATTTGAAATCTTTTACTTTCAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2433340-2432279 putative Sodium:dicarboxylate symporter [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGGACTTTTTAAAAAATTATAAGTCATCAATTATACTTTTAGCATGTACTATAATAGGGGTGATAG
TAGGATTAGTACTTGGTCCAAAAGCTTCAATACTAAAACCATTTGGAGATTTATTCATAAATGCTCTATT
AATGATAGTAGTACCATTAGTTTTTCTTAGTGTTTCTTCAGGTGTTGCTAGTATAAAAAATATGGAACGT
TTTGGAAAAATAATGAAGAGTACAGCTATAGTATTTATGGGAACAACACTTGTAATTGCATTTTTAGGTA
TTACATCTGCATTATTATTTAATCCGTCTAAAGGATTAGATGTATCAAGTGTAAAAAGTTTAATGGTGGC
TCAAGATGCAGAAACTTTAGAATCAAAAGGAACGTTATTAGACCAAGTAGTATCAAGTATTACAGTTAAA
AATTTTGGAGATTTATTTTCCAGTAGCAATTTACTACAATTAGTTATATTTGCAGTTTTAGTTGGAACAG
CAATAGCTATGATGGGAGATAGGGGAAATACAATAAGAAAGTTTTTATCAGAAGGAACGGAAGCAATATT
AAAAGTAGTAAGTATAGTCATGCTTTATGCTCCTATAGGGCTAGGCTGTTATACAGCTACAATAATTGGG
GAACTTGGAAGCAAAATAATTCAAGGATATGTAAGGGTGTTTGTAATTTATTCACTAACAGCAGCCATGT
ATTTCTTATTATTTTACAGTCTGTATGCTTTTTTATCTGCAGGAAAACAAGGGTTTAGACAATTCTGGAG
AAATGCTATAAAACCAATAGCAACGGCACTAGCTACTTCTTCAAGTTCAGCATGTATACCATCAAATTTA
GAAGCTAGTAAAAATATAGGAGTTCCTGATGATATATCAGAAACAGTTATACCTCTTGGAATAAATATAC
ATAAAGATGGGTCAGTTTTAGCAGTAATAATAAAAGTGGCATTTTTATCAGGTATTTTAGGCAGTGGAAT
GGCAAATCCAGCAACGATAGGTCAATTATTTATAACTGTATTTGTTGTTGGAGTATTTATGGCTCCTGTA
GCAGGTGGCTGA
>ref|NC_013316.1|:c2434681-2433932 putative amino-acid ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAAAGTAGAAAATTTACATAAAAGTTTTAAAGGGACAGAAGTTCTTAAAGGTATAAATTTAGAGA
TAAATCAAAGTGAAGTAGTAGCTATACTTGGACCATCTGGAACAGGTAAATCTACGTTACTTAGATGTTT
AAATTATTTAGTTGAGCCTACAAAAGGAAAGATAATGATTGGTGATGTAAAAGTAGATGTAGAAAAAGCA
ACAAAAAAAGATATAGCCAATTTAAGAAAACATACATCTATGGTATTTCAAAATTATAACTTATTTAAAA
ATAAAACAGCATTAGAAAATGTAATGGAGGCATTGATAGTAGTACATAAAAAGAGTAATAAAGAAGCTAG
AGAAATATCTTTAAAATTAATAGATAAAGTAGGTATGTTGGATAGGAAAGATTTTTATCCATCAAAATTG
TCTGGGGGGCAGCAACAAAGGATAGGTATAGCAAGAGCGATGGCAGTAAATCCAAATGTAATATTATTTG
ATGAGCCAACATCTGCACTTGACCCAGAACTTGTTGGAGAAGTTTTAAGCGTTATAAAATCGCTTGCGAA
AGAAGGAATAACAATGCTTATTGTAACTCACGAAATAAATTTTGCAAAAGAAGTTGCTGATAAAATTATA
TTTATGGATAATGGTGTAATAGCTGAAGAAGGAACTCCTGATGAAATATTTAATAATCCTAAAAATGAAA
GAACTGCAAAATTTTTAAATATCGTTAGGAAAGAAGAAGTATTTAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2435980-2434790 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGTCTTGCAAATGATTGAAACTAAAATAAAATCCATTGCACTAAAAAATAGAGAAAAAATCATAA
AAATAAGACGACAGATACACAGTAATCCAGAGTTAGCATTTAAAGAATTTAAAACATCCAAACTTATAAA
AGAAGAGTTAAATAAACTTAAAATAGAATACATAGATGTTGCTGGTACAGGAGTATTAGCTACTATAAAA
GGAAAAAATAATGGTGGGAAAACTATATTGCTTAGAGCGGATATGGATGCCCTTCCAATCAAAGAGGAAA
ATGATTTAGAATTTAAATCAATAAATGATAATATGCATGCTTGTGGGCATGATGCCCATGTTTCATGGTT
GTTAGGAACAGCAATGATTTTAAATGACATAAAAGAAGAATTGAATGGAAATGTAAAATTACTATTTCAA
CCTGGCGAAGAAAAAGGTGGTTCTGATATTGTAATTAAAGAAAATGTACTTGAAGGTGTGGATGCATTAG
CAACTGGTCATTGTTGGCCAACTATTGAATCAGGAAAAATTGGAATCGCTAGAAATTGTGCTATGGCAGC
GACTAATACTTTTGAAATAACAATAATTGGCAAGGGCGGGCATGGAGCAGAGCCTCATAATTGTATAGAC
CCAATTGCAGTTGGAAATGCAGTATATTCATCCATTCAACAGATAGTTTCAAGAAAAATTGACCCAGTTG
TACCTGTAGTAGTGTCTGTTTGTTCTTTTAATTCTGGTGTTTCTAAAAATATAATACCAGATGTATGCAC
ACTTCAAGGGACTATTAGAGCGATAAGCAAGGAACAAGTAATTGAAGTAAGTAAAATTCTAGAAAATATA
GTAAGAAATGTATGTAGAGCATACGGAGCAGATTGCAAATTTGAAAAGAGTACAGGAGGAGATGCTGTTA
TAAATGACAAAAACATGATAGAGCTAGGAAGAGAAAGTGCTTGCAAAATACTTGGAGTTGAAAATGTTGA
AATAATTGATTTTCCTGCAATGACAGGTGAGGATTTTGCTATTTATATGAAAGAAAAACCTGGTTTATTT
ATGTATATAGGTGTAGGAAATAAAGAAAAAAATATAAACTACAGATTGCATAGTAACAAGTTTAATATAG
ATGAAAAATGTCTTAGTATAGCATCTTCATTATTCTCACAACTTGCAGTAGATTATTTATGTCAACTATA
G
>ref|NC_013316.1|:c2436895-2436098 putative amino-acid ABC transporter, substrate-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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CAAAAAAAGAGGAAGTAAAGGATGAAAAAGTTATAACTGTAGCTTCATCTAATTCAGCTGACCCATATTC
TTATGTTGATAATGGTGAGCATAAGGGTTTTGAAGTTGATATGTGGAAAGAGATTGGTAAAAGAAGTGGA
TATAAGATAAAAATGGAACCAACAGGTTTTAGTTCTATATTTGGGATGTTAGATTCTGGTAAAGTTGATG
TGGCAGCCAATTTCTTTGGAATGTCTAAAGAAAGATTAGAAAAATACGATGCTTCTATACCTTATGGTTC
TGATTCTGTATGTATAGCTGTAAAAGATGGAAACAACGAAATTAATAAACTTGAAGATTTAAAAGGAAAA
GTTGTAGCAGTTTCAGAAGGTTCTCAAGGGCAACAGGTTGCAGCTAGTGTTAATAAAGATAATTTGTTTG
AAGAAAAGGTTTATGGTGATGGAACTAATGGTCTTCAAGATTTAGATTTAGGAAGAGTTAGCGCATGGAT
TGATGCAGAACTTACTGTTGTAGGAGACGCTAAAAAAGCTAATATGAAGGTAAGAGTATTAGATGAAAAA
TTATCAGTTACTAATATAGCATACTTCTTTAAGAAAAATGATGAAAAATCTAAAACTATAAAAGAAGATG
TAAATAAAGCAATAGAAGAAATGCTTTCAGATGGAACAGTGAAAAAAATATCTGAAAAATGGTTTGGAAT
GGATGTAAGTGCTGATATACAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2437617-2436955 putative amino-acid ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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TTTTGGCAATAAGTTCATTAGTATTTTCATTAATTATAGGTACAATAGTAGCATTATCATCTTATTACAA
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TTATTCTTTTTATATTTTGGACTAGCGTATATGAACGATTTTGTTAAAAATATGGACCCAGTATTTGCAA
CATCTATAGTACTTAGTTTAAATATGGGAGCTTATATGTCCGAAACGATAAGGGCATCTATACTTTCAAT
TGATAAAGGTCAGATAGAAGCAGCATATGTAATGGGATTAACAAATTTACAAACAATGAAAAGGATAGTG
ATACCACAGGCCGTAAGAGTTGCACTGCCATCATTATTCAATAATTTTATAGATTTAATTAAAGGGTCTT
CTGTAGCTTTTGTTGTTGGAGTAAATGATATAATGGGTGCTGCCAAATCACAAGGAGCGTTGAGTTTTAA
GTTCTTTGAAGTGTATGGAGCAGTTATGGTAATTTACTGGTGCATAATAACTCCTTTAGGGTGGGGGCAA
AAAAAATTAGAAAAGAAAATAAGCAATTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2438521-2437853 putative amino-acid ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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TACTAATATCTATTGTTGCATTTTTTTTATCAATATTATTAGGTGTAATACTTGCCTTTTTCACACAGAC
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CAATAGTAATTTGTTTAGGTGTAAATTCATCTGCATATATGACTGAAATTATACGAGCATCTATTGAGAG
TGTTGATAAAGGACAACAGGAAGCATGTTATGCTTTTGGGTTAAGTAAATATCAGTCAATGGTTAAAATA
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CTTCTTTAGGTCTAACTATAGGAATACAAGATTTAATGGGAGTAGCTCAAGTAGAGGCTGCTTCAAGTTT
TAAATATTTTGAGATATATATGATAACGATATTAATTTACTGGGCAGTATCTATAATATTGAGTAATATA
CAAAGCAAAGTTGAAAAAAGAATAGGAAAGGCATATTAG
>ref|NC_013316.1|:c2439317-2438514 putative amino-acid ABC transporter, substrate-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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GAAATAATAAAAATAAAGAAGAACAAAAAACTATAAGAGTTGCAACATCAGGAACATATTACCCTTTTGC
TTTTAAAGATAAAGATAAACTTAAAGGATTTGAAGTAGATTTTTGGGATGAATTTGCTAAACGAACTAAT
TGTAAAGTTGAATGGGTATTAACTGATTTTAGTGGATTATTTGGATTATTAGAAGCTGATAAAGCAGATG
TTGTATCTGCTCAACTTACTGCAACACCTGAAAGAGAGAAAAAATATGCTTTTTCAGATGCTTATAATTA
TAGTGGAACAAACATTATTGTTAGAGAAGATGATACTAGTATAAAATCAATAGATGATTTAGTTGGCAAG
AAAGTAGGTGTGGGTACTGGAGCAGTAGCAAATGAAATACTAAAAGAAAAGTACCCAAATGATGAAATAA
AAATAGTAAATTATTCAAGTGCAACTCTTAAAGGGAATTATCAAGATCTAGAAATGGGAAGATTAGATGC
AGTAGTTGCGCAGGATGTTGAGGCTTTAATAGCTATAAAAGAACAAAAATTAAATCTTAAAATGGTAGAA
CCTCCAATTCAATTCGGAGCCTGTTCTTTTGCGATTCAAAAAAATGAAAAAGGTGAAAAATGGACAAAAG
AAATTAACGAAGTAATTGAAGAGATGCATAAAGATGGGACTTTGACTAAAATATCTGAAGCCTGGCTAGG
AAAAGACATTACTAAGGAGCCTATTAATGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2440146-2439724 putative iron-sulfur subunit of hydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGTTTATTTAAATTTAATAAAGAATTATGTACAGCATGTGGAGCATGTTTGCTTGCATGTATAG
ACCAAAATGATAATAATATAGACAATGGTGAACTTTTTAGACATGTATTTACAATAGAGGAAGGTGAAAA
TATAGAATATTTTTCATTAGCATGTATCCATTGTAATGAGCCAAAATGTTTAGGTGCATGTCCTAAAAAT
TGTTTTAAAAAAGAAGAAGGATTCGTTGTATTAGACAATCAAAACTGTATAGGGTGTAAACTTTGTGAAA
AAGCTTGTGAATATGGAGCCTTAATTTATGGAAATGATGGTAAGGCAAATAAGTGTAATGGTTGTATTGA
GAGATATAAGTGTGGTATGGATTCACCTTGTGTAATGGTATGTCCTACAGGAGCATTAAAATTTAATAAA
TAA
>ref|NC_013316.1|:c2442337-2440160 putative formate dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAATAAGTATAATAATTTGTATTTATTATTGGGAAAGGAAAATGTTAATATGGATAGTTATAGAC
AACTTAAAGCTAAAATACCCTGTAAGGAAACAGGTATAGAAATAAAGAGGACTTTATGTGATATTTGTTC
TCCAGGAGTACATTGTGGAATTGATGCATATGTTAAAGATGGTAAAGTAATAAAAATAGAAGGTACAAAA
GAACATCCAATGAATAAAGGGTTGTTATGTACCAAAGGTCTTTGCAATAGAGAATATATATATAGAGAAG
ATAGAATAAAAACACCTCTAAAAAGAATTGGAAAAAGAGGTGAAGGAAAATTTAAACCAATATCATGGGA
TGAAGCTTATAGAGAAATAGCAGAAAAATTAAATAGAGTAAAATCTGAGTATGGAGCAAAGCATGTAGCT
TTTTTTACGGGTTATGGAAAGTGGTATAGACCTTTTTTGCAAAGGTTTGCATCTTCATTTGGTTCACCTA
ATTATGGTACAGAATCTAGTTCATGTTCAACATCAGCACAGATGGCTGGAAATGTTGCTACTGGAAGAAA
CTTTACAATGCAAGATATGGAGAATGCAAAAACTTATTTAGGGTGGGGATTTAATCCATACTACTCTAAA
TTTTTAAATAGTGTGAATCTAATAAAATTAAAAGAAAAAGGTCTAAAATTTATAATTGTAGACCCTAGAA
TAACACCGACAACTCAAAAACTAGCAGATTTACATTTAAGAATTAAACCTGGAACTGATGGAGCTTTAGC
TCTTGGAATGGCGAATCTATTTATACAAAAGGATTTAATAGATAGAGAATACATAGAAAAGCATGTACAT
GGATTTAATGAATATAAAGAATATGTAAAATTATTTGATTTAGATACTGTAAGTAGAATTACAGGAGTTT
CTAAAGATAATATAGTAAAAGCTGTTGAGATGTTGTCACAAGGTCCATTTTGTATAAATGAAAGTGCAGC
TCCAATAGTTCATCATCAAAATGGATTTCAAAACTATAGAGCAATGATGTCTTTATCTGCTATAACAGGT
AATTATGATAGAATAGGTGGAAACATACCAAAACAAGATTACTTTGCTGGTAAGATAGGTGGATTCCAAA
CACTAGAAAAAGAGTTTGTAAAAGAAGTTCTACCTAAAAATATAAATGAAAGAATTGGTGGAGAAAGATT
TCCTCTATGGAATGAAATGGTAACTCAATTTCAAGCTATGGATTTACCTAGGCAAATAGAAGAAAAGACA
CCATATGAAATAAGAGCTTTGTTTTGTCATGGGATAAATGCTAGAATGTTTCCTAATTCAGGGAGACTTT
TTAAAGCGTTGCATAGTGTAGATTTTTTTGTGAATATAGATTTATTTATGACAGATACATCAAAATATGC
AGATATACTTTTACCTGCGTGTACATCATTTGAGAGAGAAGAATGTAAGAGTTACCCAGGAGGGTATATT
ACATATACCAAAAAAGTTATTGATAAATTATACGATTCAAAATCAGATGTAGAAATACTTTCAGATTTAG
CAAATGTTATGAATATAGATGATGATTTATTAAAAGCAGGTTATGAAGCAAGTATAAGACATATGTTTAA
AAAGACGTGTGTAGATGTAGATAAACTTAAAGAAAGTGATTTACCATTAAAATGTAAAGATTTTAAGCCA
TATATAGTAGGCTCATATACAAGAGAGGGGTATGATACTAGCACTTCTAGGTTTGAATTAAAATCTACAA
TTATTGAAAAATATAAAGATTTTGGACTGGATGCACTACCAACATATAGAGGATTTAATGATAATATAGA
TAATGAATATACTCATTTATTGACATCAGGAGCAAGAATTTCAAATGCACTACATTCAAGACTTCATGAC
ATCAAACTTTCAAGAATATTAAAAAATGAAGCTAGTTGTGATATTTCCAGCTTGGATGCAAAAGAATTGG
GTGTTATCAGTGGAGATTATATAAAAATAACTACTAAGATAGGAAGTTTGGATGTAAAAGTCAATGTTAC
TGATAGAGTCTTATATAAGAATATACATATGTATCATGGATATAGAGAATCTGATATAAATAGTATTATT
GATGATAATTTTGACCCTTATAGTGGATTCCCTGCGTATAGAAGTTGCAAGTGTAAGATTGAAAAAATGA
ATAGATAA
>ref|NC_013316.1|:2442618-2445797 putative helicase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATAGATATGATATATAAACTAATAAGAAGAAATACAGAACCATCAAGATGGTCAAGAGGTGTAA
AATATTATACTAATCAATTAGTTGATTATATAGACATAGATATTGATGACCTACAAAATAACCTGTTGAC
ATTTCGTGGTGGAGTCAATTCTGAAGATAATTATAGCTTTTATTTTAATTCAATAACTATAGATATAAAG
CACTTTAAGATAATTGAAAATGATTGTAGTTGCGCTGACTGTCAATCAAAGGGCAAAAGTATTTTTATAT
GTAAGCATATAGTTGCTATTGTGATAAAAAGCTTAAAACAAATAAAAAATAAAAGAGATGTTCCTCCTAT
TCTAATAGATATATTAGGTGCAGATAAGGATAAGCTTTCTAATACAAATTCTAAAACAAGCTTAGATTTA
AGCAAGCAATTACTTTCTTTGTTAGACAATACTAAAAGAGAAAGGGTTAATTTAGATGTATTGATAAATG
TGGATTCAAATAAAGCAATTGCTGAATTTAAAATAGGAATTGATAAAATGTACATTTTAAAAAACATTAC
TGAATTTGCATATTCAAAACTTAATGGATATGAATTAGATTTTGGGAAGAAATTTACTTACAACCCCAAC
ATTCATTATTTTGCTGATGAAGATGAGAAGTTAGTAGATATTATAGAAGAATATGGGACAAATCTTTCAT
ACAACTTTTCTTCATCACATTCAAAAAAATTTATGGAGATAAATGCAAGCTCTTTAAAACAATTTTTAAA
TGCTATTAAGTACAAGGATTTTACCCTTATTTTTTCTAAAGAGGAATATCATCCAAAGATATTAAATGAT
ACTCTACCTGTAAGGTTTGATTTTAAAAATATAGAAGATAAAATAGTCTTATATTCTAAAGATTCACTAC
CTGTTCCACTTACTAAAAAAAATGATGTACTTTTATATGATGGCAATATCTATTTATTATCACATAAAAA
AGCTCATGATTATTCAAAAATATATCAAATATTATCAAAGACTAAAGAGTTAAAATTTGATAAAGAGGAT
TCTAAGGATGTTTTAGGATTGCTAGTTCCTAGATTAAAATCTATATCTCAAGAAGTTCATTTAGATGATA
ACATAAAAAATAATATAACAAAAGATTTTAAATCTGAGTTCTACTTTGATATGATTGATGGCAACATATG
TTGTGATGTAAAGTATATATATGATGATGAGGATAAAAAATTTGTGCTCCCCAACATACAAAAGGAAACT
ACTATTGAAAATAAACTTACTTCTTCACAATTTACAAAGGAAAATAATCATTATGTGTTTAAAGGAACTG
ACTATGACCTATTTACATTTTTAGATTTACAATTAGAATCTCTAAAGGAATTTGGAGATATATATTATTC
TGAGAAGTTTAAATTGAAAAAAATATATAACGCTTCATCAATTCAAGCTTCAATCAATCAGACTAACCAG
AATTACCTAGAATTTAATTTTAATATATCTGATATAAATCCAAAAGAGTACAAGGATATTTTGAAAGCTT
TTCAAGAAAAACGTACTTTTTATAAACTTAAAGATGGAAACTTTATAGATTTATCAGAAAGAGAAACAAA
AGATTTTTTTGAATTAGTTGAAAATCTAGATATAATGGATAAATCAAAAAATAATAAAATTTATAAAAAT
AAAGCTCTATATATAAATGATGTAATACGTAGTAAAAATTTAAAGTTTATAGATGGTAAAAAAGAACTAG
ACAGTATATGTGAAAAATTTAGAAATTTTGATAGCATAAATTTAGAAATTCCCGCAAATTTAAATGCAAA
CCTTCGTGATTATCAAATAAATGGCCTCAATTGGTTTAAAGTTTTAGATTATTATAAATTTGGTGGTATA
TTAGCTGATGAAATGGGTCTTGGTAAAACAATACAGACTATTGCATTTTTATTATCATTATCTAATAAAA
AAAGTCTTATTGTTACACCGACATCACTCATTTATAATTGGAAAAATGAATTTGAAAAGTTTGCTCCAGA
TATAAAAGTTTTATTGATACATGGGAATAAAAGAGATAGAGAAAAATGTTTTATGGAATTAGAAAATTTT
GATGTAATACTTACAACATATGGTACTCTTAGAAATGATTTAGAAAAATATAGTGAAATAAAGTTTGATT
ATTGTATATTAGATGAAGCTCAAAATATAAAAAATCCAGTAGCTTTAGTAACTGAGTCTGTAAAAAGTAT
AAATGCAGAAAATAAATTTGCACTCACTGGTACACCTATGGAAAATAATCTACTAGAATTATGGTCTATA
TTTGATTTTATAATGCCTGGCTATCTATATAGTAAAGCAAAGTTTCAGGAATTGTTTATAAATAAAGAGG
ATAATGTTAAAAACCTGAAAAAATTAATAAAACCTTTTATTCTTAGAAGAAGTAAAAAACAAGTTATGAA
AGAACTTCCAGATAAGATTGAAAAAAACTTTTTTGTTGAATTGAATAAAGAGCAGAAAAAGATATATAGT
GTATATTCAAAAGATATACAAGATAAAATGAAAGATAAAAATCTAAAGAAAGATAAAATAGTTATATTTT
CTTATTTAACTAAACTAAGACAACTTTGTTTAGACCCAAGTATAGTAGTAAAAGATTACAATAAAAAAAG
TTCAAAAATTGAAACATGTTTAGAAATACTTAGGGATAGTATAAACGAAAACCACAAAATATTATTGTTT
TCACAATTTACTTCTGTGCTTAAGAACATAAGTAAGGAACTTGATAAGTATAAAATTAAATACCATTATA
TAGATGGTAAAACTAATGCCAAAGAAAGACTTGAACTTGTAGATGAGTTCAATAATAGTATGGATAAAAA
AGTTTTTTTAATATCTTTAAAAGCAGGCGGAACTGGTTTAAATCTTACATCTGCTGACATGGTAATTCAC
TTTGACCCATGGTGGAATCCATCAGTAGAAAATCAAGCTAGTGATAGAGCTCATAGATTTGGTCAAAAAA
ATTCAGTACAAGTTATAAAATTGATTGCTAAAGGGACTATAGAAGAAAAAATAATAAAATTACAAGAAAG
TAAAAAAGAGCTTATAAATCAATTTATAAATGGAGAACTTTCTAATGAAGGTGTATTAAAAAGTCTATCT
GATGAAGAGATAATAGACTTATTTAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c2446846-2446082 putative aromatic compounds hydrolase [Clostridium difficile R20291]
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TTTTACATGGAAATACAGCCTCTTCCAAAATGTTTAATGATATAATCGATTTTTATAAAGATGAATATAA
AGTAATATTAATTGATTTTGTAGGTCATGGAAAATCTCAAATGGTCGATAAATTTTCTGCTGACTTATGG
TTTGATGAGGCTATGCAAGTGATATGTTTTTTAGAAGCAATGAACTATAAAAAAGTAAACATAATTGGTA
GTAGTGGAGGAGCTCTTGTTGCATTAAATGTTGCACTTGAGAGACCTGATTTAGTGAATAAGGTAATTGC
AGATAGTTTTGAAGGAGAAGTTCCTTTAGAGTCATTTGTACAAAATGTTAAAATAGAGCGTGAGGCATCA
AAGCAAGATGATGGTGCAAAAGCTTTTTATATTTATAATCAAGGAGAAAACTGGGAAAAAGTTGTAGATA
ATGATACAGAAGCTATTTTTGAACATTATAAAACTATAGGAAAATTTTTTCATAAGCCTCTAGAAACTAT
GCAACCAGAGGTGCTTTTAACAGGAAGTAGAGAAGATGAGTTTGTATCTCTAATATCTAGTGATTTTTTT
GAAAATACTTTTTCATTACTTCTTGAAAAGATTAAAAATGGTAAAATGTATTTGTTTGATAAAGGTGGTC
ATCCTGCAATTTTATCGAATGGATTAGATTTTTCAAATGTAGCAAAGAAATTTTTAGAGGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2448576-2447083 ATP-dependent RNA helicase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATATACATTTGAAAAATTTAAGTTAAATGAAAAGATACTTAAGTCATTGAAGAGTTTAGGATATA
ATATACCTTCTAGAGTACAAAGAGAAGTTATTCCAAAATTATTAAAAGGTCAAAACTTAGTAGTTAGGTC
AAAAACAGGAAGTGGAAAGACAGTAAGTTTTGCAATACCTTTATGCGAGAATATAAATGTAGATTGCAAT
AATATTCAAGCTCTTATAGTGGTTCCAACAAGAGAATTAGCCTTGCAAGTAAAAGATGAGATATCAGATA
TAGGGAGACTAAAGAAGGTGAGATGTAGTGCTATATTTGGCAAACAATCTATAAAAGACCAAATAGCTGA
ATTGAAACAAAGGGTTCATATTGTTGTAGCTACTCCAGGCAGAATACTTGACCATATAAATAAAGGTTCT
ATTAAGTTGGAAAATGTAAAGTATTTAGTAATAGATGAGGCAGATAAAATGTTTAATAAAGGTTTTGTTG
AACAAATGGAAAAAATATTATTAAATTTACCTAAGGAGAAAATAGTAAGTCTTTTTTCAGCTACAATAGA
TGAAGAGATAAAATATATATGTGAAAAATATATGCTAGATTACAGTGTTATAAATATAGAAGAAAATGAG
AGCGATACTAATCAAAAAACAAGACAAATAGATGACAAAATAATCAAGGCAAATGGAAGAGAGAAGTACA
TCCTTTTAAAAGAATTAATATACAGCGAAAATCCAAAGAGTGTGATAATATTTTGTAATACCAAAGAGAA
AGTATCTAAATTATATAATAAGATGAGTAAAGAGGGTTTTTTAATAAGAGAGTTACATGCAGATTTATCA
CAAGAAAGAAGAATTTTTGTAATTAAGGATTTTAAAAACCAAAAATTTAATATATTAGTTAGTAGTGATG
TAGCGTCCAGAGGAATACATATTGATGATATTTCTTTAGTAATAAATTATGATGTGCCACAAGATAAAGA
AAACTATATACATAGAATAGGTAGAACTGGGAGAAAAGGAAATAGTGGAAAGGCAATTACTATAGTAACT
GAAAAGGATGAAAAATATATAGAGAATATAGAAACGTATATAGGATATAAAGTAAATGAATTAAAAGATA
TAGAAAAAAGTAGAATTACACATGGCAAAATTTTGTTTGAAGAATATTCAAAAGGAATCCTAAAAAAAGT
ATCAAAGAGAAAAAAAGTTGATAAAAATTCTTACAAAAGTAAAGATATAAAACTAAATATAGAAAGTGAA
GTTGTTAAATTATATTTAAATGCTGGTAAGAAGAAGAAAATAAGAGTTTTAGATATAGTTGGTGCATTTA
GTAATATAAAAGGTATAACTAATGATGATATAGGTGTAATTGAAGTTCAAGATTTATGTTCATATGTAGA
TATATTAAATTATAAGGGAGATTTGATATTAAAAAAATATAAGGAGATACCTATAAAGAAAAAAATGGTT
AAAGTGAAAAGAGATATACGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2449443-2448901 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase (cell wall hydrolase) () [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATATGCATAACAGTAGGTCATAGTATACTAAAAGGTGGTAAAAGTACAGGTGTAAATGGTATAG
TTGATGAATACAATTATAATAAAAAATTAGCTCCTATGTTAGCTGAGATGCTTATAAGTCAAGGTAATAC
AGTAGATGTAATAATTTGTCCAGAAAGGCACTTTATGTCAGAAAGAGAAGAATTTTTCTATAGAGTTCCA
AAAGTAAACAGTGGTAAATACGATTTATTAGTAGAGCTACATTTAAATAAAGCTGATGGAACACAATGTG
GTACAGAAGTGCTTTACTATGGCACTGAAGGATTAGAATATGCTAAAAGAGTATCTAATAGACTTGGAGA
ATTATTTGAAAATAGAGGAGCTAAAAAAAGAGAAAATTTATATATATTGAGAAATACAAATCCAGTTGCA
ATACAGATTGAAAGTTTTTTCTGTGATAATGTGAATGATTGTAACAAAGCAAATGAATCAGGTTATGATT
ATATAGCACGATTGATTACAGAAGGTATATTGAATAAAGATATAAATATGTGA
>ref|NC_013316.1|:c2450680-2449733 hypothetical protein CDR20291_2090 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAATAACGAAAACTACTTTTAATGATGTATTTTCAAATGATGCAAATGGAAGTATTATAAAAGTAG
AAAAATATGTTGATAAAAAATGTGCATCTGTATTTGAGATTTTGACCTACACTATTATTGTTACAAATAC
AAGTAGGTACAAAACTGGAAATATATTTTTCAAAGATTATATTTCTAAATATATAGAGTTTATAAATAAT
ACTGTAAAAGTTAATGGCATTATAAAACGTGGATTAGACCCACAGCAAGGTTTTTACATAGGGAGAATAG
ATGCAAGTTGTAAAAAAATAATATCTTTTAAGAGTGTAGTTTTACCAAATTCTGCACATAGGATTATAAA
GAATAGTGCTAATATATACTATTATTATAAGTGTAATCTAGATAAATTCCCAACAAGAATATCAATAGAA
AGTAATAGAGTTTATACTAATGTAAATAAAATTGTATTCAAACAATTGAATATAAGTAATACTTTAAAAG
CTCCTAAAAATCTAAGAGATATATTAAAAGTAAATGTAAATAGTAAAATATTTGATGTTAAACCTATGAA
AAATCTTATAAACAAAGGTAGTAATTTGAAATTATGTAACTCGATAGTTTTTGGGTGTATAGAAGTTGAA
ATAGACTATAGTTGTAAAAATAGGAGTAATTTTAAAACAGTAAATAAGTTTAATGATATTAAAAAAGATA
AGTATTATAAAAATGATATACAAAATAACAATGAAAATATAAACGATTGTAAAAAGCAAATAAGTTTTGG
TGATAATAAGGTAAAAAAAATAACAAAAACTTTTGGATTTTCTTGTTTCATTTGTTCTCCAGTTGGAATT
ATTTATGAAGATATGAAAAATATAAATATAAAAATTGAACATACATCAATAAATGAATTAAATCCAGAAG
AATTATTTGTAAATACATCACTTTTATTGTATTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2451199-2450708 putative phage-related hypothetical protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTATGAAAATAATAAGGTAATATATAATTTTGAAAGATGTGAAAAGCTAGAAAATGCTCTTTATTTAT
CTCAATTTAATACATATAAAAACTTTAAGTTAACTTCTAAAAAAACTGTAATAAACTCATTAGATACATC
TACTTATAATATGAATATTCATAGCATAAGTCTCGTTGATACTATGGAATGTATATCGTCAGAAGATGAA
CAAATGACAGGAAAGAAGTTGATTTTAGTTGGCGATATAGATACTGATGTAACATTAGATTATGCAGGCA
ATAAAAGAAATAGAAATTCTAGTAAAAAAAATACATTTAAATTAAAAATACCCTTTAGTACATTTATACA
AATGCCTAGAAAGATAGAAAATAAAGATAAAATTAATTTAAAGTATCTTATACAAGATATTACTTCATCT
ATTTTAGATGATAATTTATTTATTAGTGTTACTGCAATTATAAGTTATGAAAATAGTTCCAAGATAGAGT
AA
>ref|NC_013316.1|:c2453733-2451433 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAATATTCTCGATATTTATAAGTTGTATGGTTGTTGTAACTACTATTACTGGATGTAGTAGTG
GTGAGGTGATAAAAAATACATCACCTATCAATAGTGTTAAAAATTTGGATTTTAGTTTTGAGGTGAAACC
TGAAATATTTGAGGTATCAGTTGAATCTGGTGGTTCAAAAGAAAAGATATCTGAACCCTCAAAAGAAAGG
AAAGTATCAAATTTTAAAAAGAATAAGACAGAGGCATCGTGGACGTATCCTGATGAAAATATAGACATAA
ATATAAAAAAAGAGGACAGCTATTTAGATGTAAATATTAAATCTAATTTAGAAAAAGAAACTAGTTTTAA
TTGGCCCAAAGTTGAAGGGGAAAGTTATATACTACCACTTTATGAGGGTAAGTTTATACCAAGTAATGAT
AAGTATTGGAAGGAGTATCTAAATGAGTCAACTTATAATGTTATAGAATCTTTTTCAATGCAATTCTTTG
CAGTAAACAAGGCAAAGTATTCTGTGATTTATATTATCGAAAATGAATTTAACAATGTAATTGAATTTAG
TTCTAAAGACAAGATTAATTTTACATTTAAACATGAATATCCAAGTATCAATAAAAATAAGGAGTATGGG
TTTAAAATATATTTGACTAATAAGAATATTACAGATGTAGCAAAAACTTATAAAAATTATATAGTTGATA
AAGGAGAATTTAAAACATTAAAAGAAAAATCTAAGGAAAATAAAAATATTGAAAAACTTTATGGAGCACC
ACATATTTATTTTGGAGATAAGTCTATCATCACAATAAATGATATTGAATGGAATAAATTAAAAGAAAAT
TTATCAGATGATTTGACTAATTGGATGAAAGAGCTTTTAAGTATGAAGTCTGGCAATAGTGAATTTATAA
AAGTAATTAATCAAATAAAAACTCAAGATTATATAGATAAATATCAAAAAAATCAAATAGTACAAGCATT
TAATGAAGTTATGCAGATGAATACTTTTTATAATGAAAAAGTTTTTGAAAGCAAAGATAGAGAAATAAAA
AAAGTATTAGATAAAGGTATATCTAAATTAAGTAGGGTAGAACTTATAGAGTTTAATAAGAAATTATTGA
AATCAAAATTGGAAGAGAGCGTGAATGATGTTGCTACATGGGCAAAATATAATACAACTGATGTAATTAA
TGATATTAATAAGTCTGGTATTAAAAATGCGTGGATAGGATTTGATGATATGGAGGAAGGTTATATATCC
TTAGAGATGGTTAAAAGAGCTAATGAGTTAGGTTATCTCGTAGGGCCATATGATTCATACCACTCTATAC
ACAAACCAGGGGAAGAAAAGTGGAGTACAGCATCATTTAAAGATAAATCTCTATATGAAAATGCTACCAT
AGAAAATAAAAAAGGTGAAAAAGAAACTGGATTTCAAGGAGAAGGAAGAAAACTAAATCCTACATTGTCT
TTACCAAGTGTAAAAGAGAGAGTACAAAGTATATTGGATGAAGGATATGAATTTAATTCTTGGTTTATAG
ATTGTGATGCTACAGGAGAAATCTATGATGATTATTCTCAAAATCATATAACAACACAAACACAAGATTT
AAATGCTAGACTTGAAAGAATGTCATATATAAGAGACCATGCAAATATGGTCATAGGTTCAGAAGGTGGA
AATGATTTTTCAAGTAGTACTATAGCATTTGCACATGGTATTGAGACACCAGCATTTGCTTGGGTAGATA
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AGAAATATTTTCAAAGCAGATACCTGTAAAAGAAAGGTACAAAAAAATATTTATAGACCCAATTTACTCT
CTACCTTTATTTAGATTAGTTTATAATGATTCTGTGATATCTTCCCATCAGTGGTTATGGGGAACTTTGA
AGATTAAGGATGAAGTTGGAAGTAGAATGATGAAAGAAGTATTATATAATACACCACCTATGTATTATAT
AGATAGAACTGAATGGGAAAAACATAAAGATGAAATAATCTCAAACAATAAAGTATGGTCAGCGTTTAAT
AAGAAAGCTATTAAAAAAGAAATGACAGACTTTAAATTTATTTCTGAGGATAGACTAGTTCAAATGACTG
AATATGGAGAAGATTTAAAGGTATTAGTTAATTTTTCTCAAAAAGACATTAAGTACAATGATGAAGTCAT
AAAAGCAAATTCTTTGGTAATATATGATGCTGATAGTAAAGTCATATATAAACCGGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2454674-2453781 putative phage-related cell wall hydrolase [Clostridium difficile R20291]
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ATTCATCTAGAGAGATAAAAAAGGATGATATAAATGTCAGTAAGTATATAAAATATGCTGATTTAGCAAG
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AAAAACGTTAAGGATTCACAGATACAAGAAGTATCAGATTTATTTGTTAAGAATTTTTCTAAAAATAATA
AAATAAATAAGTTAAGTGATATTTTGGATGAGTTAGAATTTAGTAATAGACAAAAAAGATTGGTTGATAA
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AAAGGCAGGTTATAGTACTGCGAAGGATGAAAATGGCAATAGTATATATGCAGCTCGTCTAATAGAATTA
ATTCAACAGTATAATCTTCAATTAATAGACAGCGAAATTCAAAGTGAAGTGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2457185-2454900 maltose phosphorylase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATGTTTATTTAGTAATGTAGATGAGTGGAAGATTATACAAGATAAGATTGAAATCAAAGAAAATA
GATTAGCAGAGTCCATAATGAGTATAGGCAATGGATATATGGGTATGAGAGGAAACTATGAGGAAAATTA
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TGGAAAAATGGGTATCCAGAATACTTTGGTAAAATTCCTAATTCAGTCAACTATATAGGTGTAAGAATTT
TCATAGATGATGTAGAATTAGATTTAGCAAAATGTAAAGTAGAAGATTTTTATAGAGAATTAGATATGAA
AAATGGTATTTTAAATCGTAGGTTTATTGTAAATATAAATGATAAAAAATTTGAAGTTAGGGTTACTAGG
TTTTTAAGTATATCTGTTAAGGAACTTGCAGTAATTAAATATAGTATAAAATCATTAAATTCTAATACTA
AAATAAAATTTGTACCATATTTAGATTCAAATATAAAAAATGAAGATTCAAACTATGAGGAAAAGTTTTG
GAATGGAATTTCTTCAAGTTCTTTAGAATATAAAGGTAGTATTCTTTCTCGAACAAAGGAGAATGCATTT
AATACACCAGTATTCACTGTGGGTTCAATGATGTATATTAAGACAAATGGTGATGTAGAAGCTGTATCTC
ATGAGAGTGATTATAATTACTGTGAAAATTCGATAACAATGGATGTTTTAAAAAATAAGGTTGCAAGTAT
AGAAAAATATGTATCTATAACTTCAACTAGAGATTATAAGGAAAGTGAGCTATTAAGAAAATGTGAAGAC
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CCAACTATTTTCAACATATTATGGAGAAGATTCGCGATTAAATATAGGTCCAAAAGGATTTACTGGTGAA
AAGTATGGAGGAGCTACTTATTGGGATACAGAAGCATTTTGTGTTCCAGTATATCTAGGTGTAGCAGATA
AGGAGGTAACTAGAAATCTTTTAGAATATAGGTACAATCAGTTAGAACAGGCAAAGGATAATGCAAAAAA
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ATAACATTTGAGGAAATCCACCGAAATGGAAGTATAGTATATGCAATATATAACTATACAAATTATACAG
GTGACTATAAATATATAAAAGAAAAAGGAATAGATGTAATAATAGAAATAGCTAGATTTTGGGCAAGTAG
AGTTCATTTGTCTACAAAAAAAGATTTGTATATGATACATGGAGTAACAGGTCCAAACGAGTATGAAAAC
AATATCAATAATAATTGGTATACTAATTGTATAGCTAAATGGTGTTTAGATTATGCTGTAGAAAATATCT
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GAAAATAATATCAAATAAAATGTATCTGCCGTATGATGAGGAACTACAAATAATAATTCAAAATGATAAT
TTTTTAGATAAAGAATTTGTAGAAGTAAAGGATTTACCAAAAGAAAATTTTCCTCTTAATCAAAATTGGT
CTTGGGATAAGATTCTTAGGTCGTGTTTTATAAAACAAGCAGATGTATTACAGGGAATTTACTATTTTGG
AAATAGATTTACTAAAGAAGAAAAAAAGAGAAATTTTGACTTCTATGAAAAATATACTGTCCATGAATCT
TCTTTATCTTCTAGTATTTATTCTATTATTGCCTCAGAAATAGATAACCTAGAAAAGGCTTATGAATTAT
ACTCAAGAACAGCTAGGCTTGATTTAGATAATTACAATAATGATACAAATGATGGACTGCACATAACTTC
AATGTCTGGTTCATGGCTTTCCATTGTACATGGATTTGCAGGCATGAGAACATGGAATGAAACTCTATCT
TTTGACCCTAAGTTGCCAAAAGAGTGGAAAAATTATTCTTTCAATATAAATTATAGAGATAATATTATTA
ATGTAGATGTATGTAGTGATTTAATTAAAATAGAAAATTTAAAAGGTAAACCAATAAAAATTATTGTATA
TGGGAAAAAATATATATTAGAAAAATATATAAAAATTGATAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c2457862-2457182 beta-phosphoglucomutase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTGAAGCATTTATATTTGATTTAGATGGTGTAATTACAGATACTGCATATTATCACTATATGGCTT
GGAGAAAACTAGCCCATAAAGTTGGGATAGATATAGACACAAAATTTAATGAATCTTTAAAAGGCATAAG
TAGAATGGAGTCATTGGACAGGATATTAGAATTTGGAAATAAGAAATATTCATTTTCAGAAGAAGAAAAA
GTGAGAATGGCTGAAGAAAAAAATAATTACTATGTATCATTGATAGATGAGATAACTTCAAATGATATTT
TGCCAGGCATAGAAAGCTTGTTAATTGATGTAAAATCTAATAATATAAAGATAGGTCTATCTTCTGCAAG
TAAGAATGCAATAAATGTATTAAATCATTTGGGTATAAGTGACAAATTTGATTTTATAGCTGATGCAGGA
AAATGTAAAAACAATAAACCACATCCAGAGATATTTCTTATGTCAGCGAAAGGGCTTAATGTAAATCCAC
AAAATTGTATAGGGATAGAGGATGCAAGTGCAGGTATAGACGCTATAAACTCAGCTAATATGTTTTCTGT
TGGTGTTGGAAATTATGAAAACTTAAAAAAAGCAAATTTAGTTGTAGATTCAACAAATCAATTAAAGTTT
GAATATATACAAGAAAAGTATAATGAGTATATAGTTAGGAGAATTATATGA
>ref|NC_013316.1|:c2459969-2458086 cyclomaltodextrinase (maltogenic alpha-amylase) [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAATAAAAATAAAGAAAATATAACTTTAAGTAATCAAATCAAAGGAACAATTCAAAATAGTTTAA
CAAAAGAAGCTATATTACATATACCAATGAGCAATTATGCCTATGGTTATGATAGAGAAACACTACATAT
AAGACTTAGAACTAAAAAAAATGAAGCGAAAAGAGTAATTTTACGAATAGGAGACCAATATGTGTGGGAT
AAAGGAGGTGCAGGAGGAGGAAATTTAAATGCATCTGGAGTTGGTTGGTCTGGTGGAACAAATATAGTAA
TGAGTAAAGAAGTAGAAACTGAATTATTTGACTATTGGATAGCTAAGTGTAAGCCTTTAAATAAACGCTC
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GGAAATGAAAATGATGAAAAGGAATTATGTGAAATAGGTAATTTTTTTGGATATCCATATTTAAATTATA
TAGATATACCTAAAGTGCCAAATTGGGTGAAAGATACTGTTTGGTATCAGATATTTCCAGATAGATTTGC
AAATGGTGACCCGTCTATAAACCCAGAAGGAGTAGATAAATGGGGAGCTATTCCAACCAGAGATAATTTT
ACAGGTGGAGATTTACAAGGTGTGATAGAACACTTAGATTATTTGAGTGATTTGGGAATAAACGGAATTT
ACTTTTGCCCTATTACAATTGGAAAAACCAATCATAGATATGATACGGTAGATTATATGGAGGTAGACCC
TACATTAGGAGATAAAGAGACTTTAAAAAAACTAATAGAAGAAGCGCATAAGAGAAATATAAAAATAATG
TTGGATGCTGTTTTTAATCATATAGGATATTATTCTAAACAGTGGCAAGATGTAGTTCAAAATAAGGAAA
ATTCTCGATATAAAAACTGGTTTTATATAAAAGATATGAGTAAAATTGATACTCCAATAGAACAGATAGA
TGAAAAAAATATACCTTATGAAACCTTTGGGTGTGAAAAATATATGCCTAAACTTAATACAGAAAATTCA
GAAGTAATAAAATATTTATTGGATGTAGGCAAGTACTGGATACAGGAATTTGATATAGATGCGTGGAGAT
TAGATGTTTCAAATGAAGTAGACCATGTTTTTTGGAGAAAGTTTAGAGAAGAAGTCAAAAAAGTAAAACC
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GTTATGAATTACTTGATGTCAGAAGCCATGAAAAAATTCTTTTGTACAGATGAGATAAACGCCGAAGAAT
TTAAGTATATGATAAATGATGTAATGGTAAGTTATCCAATACAAGTTAGTGAAGTTATTTTTAATTTACT
TGGAAGTCACGATACTACAAGAATATTGACTTATGCTAATGGAAATATTGATAGATTTAAACTTGCATAT
ATGTTTATGTTTGTACAAACAGGATGTCCTTGTATATACTATGGTGATGAAATCGGAATGGAAGGAGAAT
TAAGTTCAATATCTGAAGGTCAAAGAAAATGTATGGAATGGAATGAAGAAAAATGGAATAAGGATATATT
TGATTTTATGAAGAAGATTATTAGACTTCGTAAAGAAAATAAAGAACTTAGGTCTATATCAAATGAATGG
GTGTTAGCAGATAAGGAAAATGGAACGATTATATTGAAAAAAGAATCTATTTCTATAATAATAAATAATT
CATCTAAAAATATAATTTTGACGTTACCAGATTATTTAGCAAATAAAAAAGTAAAAGATTTATATGAAGA
AGAAATAGTTGATTTAAAAGAAGAACTAATGTTAGAGAAATACAAGTTCATTATTTTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2461048-2460227 putative phosphoesterase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTAATAGATAATCATATTCATACTAATTTTTCAAGTGATGGAAAGGATTCCATGGAAGATACAA
TAAAAAAAGCTATAAGTATTGGTGTTAGATATTTGACTTTTACAGACCATTTAGAACATGATGAAGATAG
AGGATTTTGCATAAATTATAATGACTATGTTCCAGTATTTAATAAGTTTAAAGAAAAATATAAAAAGGAT
ATAGAGTTATTACTAGGTGTTGAAGTAGGTTACAGAAAACATCTAAAAAATGAAATAGAAGAAATAATAA
ATTCTAATCCTTTTGATTTTGTATTGTGCTCAACTCATACAATTGACAATGTACCTGTTCCATCAAAGGC
GTATTTTAAAGGTCTTAGCAAAGAAGATGCGTATTATAAATATTTTAATAGCATACTTGAAACTAATCGT
GAATTTGGAGATTACAATATATATGGTCATTTGGATTATATATCTAGGTATGGAATATATTCAGATAATA
GAGTTATATACAATGACTTTAAAGATGTTATTGATGAGGTCTTAAAGTCAATAATCAATAATGGGAGTGG
TATAGAGCTAAATACTTCTGGTTATAGATATGGATTAAATGCTATACATCCAAATGAAGATATTCTAAAA
AGATATAAAGAACTTGGAGGATTTATAGTTACTGTAGGTTCTGATTCTCATAGGGTAGAAGATATATGTA
AAGATTTTGATGTGGCCTATGATATGCTTAAGTATCTTGACTTTAAATATGTATCTTTATTTAAAGAAAG
AGAAACTTATTTTGTAAATATAAAAAAAGTTAAATCTAACAATATAGCTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2461592-2461239 hypothetical protein CDR20291_2098 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGAGTAATATTTTTAGTATCATATTTCCTACAATCATAATGGTGCTAATGTTTTTAACTTTTG
CTACAGATATATTTAATATTCCAGATATTCAATCTAAAAGTATTTTTGTTGTGGGAATGGTTTTGATTTT
TCCAATTTCTTTTTTAATACAAGGGATAATTTGTGTATTAAATAAGACTAATTGGATTTTATCTCTTATT
GTGTCTTTAGTAACTTATATAGTATTAATGTATATATTTTTAAATGATTCTGCATATATATATGTTTTAC
TTTATACAGCTTTTTATATGATTGGACATATAACAGCTAAACTCTATTACAAAATTAAGACTTTTAAAAA
TTAA
>ref|NC_013316.1|:c2463076-2461634 cell surface protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAACAATTAGAAGAGTTTTAGCATTAGGTTTAACATTAGCTATATTTCTAATAAATGTACCTAATG
TAGATGCATTAACATCAGATACAATTAAAGGTAACAATATATATGAGACGGCTGGATTAATAGCAGATAA
AAAGAGTTATGATACAGCAATTATGGTAAATATGGATAATTCTATAGCAGATGGTCTTTCAGCAAGTGGT
CTTGCAGGTGCTGTTGATGCTCCAATTTTGCTTGCACAAAAAAATAAGATACCAAATGAAACAAAACAAA
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GCTAAAGAGGTAAATGGTATCAAAAAAGTTGATGAAGTGATATTAACTAATGCATATAAAGGAGAAGCAG
ATACAATAAGTGCTGCACCCGTATCAGTAAGAGATATAGCTCCTATAGTACTTACAGATGGAAAGAGTGT
GCCTTTTTCAACAAGCAATGTAAAAACATATGCAGTAGGTGGGAGTATATCAATGAGCACTAGTTTAGTT
AATAAAACTAATGCTAAAAGACTTGGTGGTTCAGATAGATATGATACAAATAAGAAAGTTATAAAAGAGT
TTTATCCAGATGCATCAGAATTTTATTTGAGTGATGGATATGATTTAGTAAATGCACTTACAGGTTCTAC
AATTGCTAAGGAAAATCCAATTGTATTGGTGTCAGAAAGTAGTGATAAGTCTATATTAGCAGGAGCAGAT
AAGATTACTAGATTAGGTTCAATAAGTGACAGTGTGTATAATAAGTGTGTTTCTGCTGCACAAAATAATG
GCGATTCGTCTACAAAAGGTGAGTCACCTATGAAAAATGAGACAAGCATATTAGGTCAGCCAACAGCTAG
TTTAGAAGCGTGCTTAAAATGGGCAAAATCTAAAAAAGCTAATGATTTATTTATAGAGTTAATACCAATA
TTATATGATACTGCTGTTCAGGAAGGTGTTAATCCTGTTTTGGCAGTAGCTCAATCTGCAAAAGAAACTG
GTTTTTGTAATTTTGGTGGAGTATTAGATGCATCATTTAAGAATCCTTGTGGACTTAAAACTTCTGTAGG
TGGTTCTGATACTGATAAGAATGCCCATTCAAGATTTGATACTTGGGAAGAAGGAATATTAGCTCAAATT
CAACATTTATGCTTATATGCAGGACAAGATGGTTACCCACTTTCAAATCCAGTAGACCCTAGACATGAAA
AATCTTTATTTGGTAAGGCTAAAACAGTTGAAAGTTTATCTAATAATTGGGCTGGAGGTCAATATGGACA
AGATTTAGTAAGAATGATGGGAGAAATTGAGGCAACAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2463749-2464963 putative regulator of a specific sugar metabolism [Clostridium difficile R20291]
ATGATGAGTAACAAACAAGGTTCTAACATCAAAGATGTAAAAATTAAAAATAAGTTAATAATATTGAAAT
TACTTTCTACAAATACACCTATGTCCAGAGTTGATTTAGCTAAGTCTACAGGACTTACTAAAATGACTTT
ATCAAATCTAGTTACTGAACTTATTAATGAAAATATGATTAGGGAAATAGAGTCATCAACTTTAAATGCA
CATTCATCAGGTCGTAAACCTATTTTATTAGATATTTCTAATATATCGCCTTGTATTTGTGGAATCCTAA
TAAGAAGAAATATATGTAAGGTAATTATTTCAGATTTAAAAGGTAATATTGTAAAACAACTTTCTGAAAC
TTACCCTAAATGTCTATCAAATGATGTTTTAAAAGATATAATAAAAAGAATGTTTACTAAAATAATGAAA
ATCAACAAGAGAGATATAATTGGAATTGGTATTTCTTCAATAGGTCCAGTAGATGATATAAATGGTACCA
TACTAAATCCCCCAGACTTTGGAAATGTATCAAACCTAAATATAGTAGATTTTATAAAAGAAATGTCTGA
TTTTCCAATATTTTTGATAAATGATGCTAATTCGGGTGCATTAGCAGAAAAAATGTATGGTTTAGGTAAA
AATATATCAAATTATATATACCTACACATAATGAATGGTATTGGAGCTGGTCTAGTTCTAGAAAATAAAC
TTCATACTGGCAACCTAGGACAAAGTGGAGAAATAGGACATACATCAATTAATTTTAGTGGACCATTGTG
CAGTTGTGGTAACAATGGATGTTTAGATTATTATACAAGTGTCAGTAATCTAATTAAAAGAATTGAATCA
TTGAGCCATATTTATCCTAACTCCCCATTAATTAACTGTAAAGATTTTTCTTTAGTCAAGTTAATAGATG
AGGCAAATAATAAAGATAGTCTTGCCATGTTTTTGCTTGATGAATTTTGTACATACGTATCATATGCATT
AGTTAATACACTTACATTGATTGATTGTAGTTCTATAATAATAGGCTATGACTTTAATATACCTGGTACA
TTTATAGAAAATACATTATTAAAAAAATTGACTGCTTCAGCAAGTTTTTCTAAATATAAAAAAATAAGTG
TAAGGCATTCAAATTTTGGAGCAAATGCACCATTAATTGGCTCTATAGCCATTGTAAGTTATAATTTTTT
TAATGGTAGTATAAATTTTTATTAA
>ref|NC_013316.1|:2465055-2465570 ferritin [Clostridium difficile R20291]
ATGATTTCAGCTAAAATGGAAAAATTACTTAATGAGCAGATTAACCATGAATTATATTCTGCGTATCTTT
ATCTTTCTATGTCTTCTTACCTTGAAGCAGAAGGACTTAAAGGATTTTCTAATTGGTTTTATGTTCAATA
TAAAGAAGAGACAGACCACGCTATGTTTTTTTACAAATACTTACATAATGTAGGAGGAAAGGTTCAGCTT
GATGCTATCCCAATGCCAGATTCAGACTTTACTTCTGCAATGGATATTCTTGAGCGTACGTTAGCTCATG
AAAAAAAGGTTACAGCTTTAATAAACAACTTAGCAGCTGTAGCAAACTCTGAATCAGACTTTAGAACTTC
TCAATTCTTACTTTGGTTTATATCTGAACAAGCAGAAGAAGAAACAAATTGTGAAGACAATATAAAACGT
GTTAAACTTGCTGGAGAGGGTGGTCTATTCTTTGTTGACCAAGAATTTGCTAATCGTACATATGCAGCTC
CAACAAACCCACCTGTGACAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c2467936-2465837 putative acetyl-CoA synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTTGGAAAAACTTATTAGACCAAAAAGTATTGCTATAGTAGGAGTGACTGATAAACTTGGTTTTG
GAAGAAGTGCAGCACTTAGTATAGTAAAAAGTAAGGAAACAGATAGAGTATATTATGTTAATCCCAAAAG
AGAAGAATTGTTTGGGAGAAAATGTTATAAGATGATACAAGAAGTTCCAGAAGTAGTAGACTGTGTAGTA
GTATGTACGCCTAGAAATGTAGTTCCATCTGTATTAAAAGATTCTGGAGAGTTAGGAACAAAGGCAGCAG
TGGTATATGCTAGTGGATTTGCAGAGGAAGGTACAGAGGAAGGTACAGATTTAGAAAATCAACTTATAGA
AATATCAAATACATACGATATGAAAATATTGGGTCCAAACTGCATGGGGTTGCTAAATTGTATAGATAAG
GTTAATCTATGGGCAGGAGGTTCTAAATGGGCTTTAGATACTAAAAAACCTGGTATAGGAATTGTAGGTC
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AAATGGAAATATAGTTACACTAGAAGATGCAGTAGATTTCCTTGTAGATGATGATTATGCATCAGTAATA
GCAATTTACCTTGAAGGTTTAAAAAATCCTCAAAAATTTATAGATGCTTTAAAAAGGGCAGCACAAAAAA
GAAAGCCAGTAATAATATTGAAATCAGGAAGGTCAGAAAAAGGTGCTATTTCTGCTGCCTCTCATACAGG
AAATTTAGCTGGTTCGAGTAAAGCTTTTGAAAGTATTTTTGAAAAATATGGAGTAATTTCTGTGGAAAAT
TTAGAACAGTTTATGTGTTTAGCACAAGCTTTTAGTGTTTTAGATGGTAATTTACCTGCAAATTCTAATT
TTGCAGCAATAAACTTCTCAGGAGGAGAAAATACTATTTGTGCAGATTTAGCAGAAGAAAATGGTGTAGA
ACTTGCAGAAATATCTTCTGAAACTAAAGAAGAAATGAAAAAATATCTTCCAGGATTTGCAACACCTAAA
AATCCACTAGATGCTACAACAGCATTATTCCATGAAAAGGATATGATAGTAGGTTTATTACATACCTTTG
AAAAGGATGATAGTGTTGGATTTACTATGGTAGGTGCAAATATAAGAGATGAAGAAAATGAAATGCATGA
AACCCTTTGTAAAGCTGTAAGTGAAGCTAGAGAACAAGGATTGAAAAAACCTGTGTTTGCAGTTCCTACA
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TTGGAACTACATTTACTTGTTTTAATAAAATGGCTAAGTTTATAGATTATGATTATTCAAAAAGAACTTT
AGAATTTAAAGCTGTTAAGAAAAGAGAGTCAAATAATGTAGTAGCATTATCAGAATTAGATAGTAAGATT
GAGATGAAAAAATATGGAGTACCAGTTCCAGGACAAGGTAATACAAAAAGTATTGATGAATTAGATGAAA
TCTTAAAATATATTAAGTATCCTGTTGTTTTAAAAATAAATTCTTCTGAAATATTGCACAAATCTGATGT
TGGAGGAGTTAAAATAGGAATTAAGAATAGAGATGAGGCAGTAGATGCATATAATGAGATTTTAACTAAT
GTAAAAAAAGCAAAACCAGATGCTAATATTGATGGTATATTAGTTCAAGAAATGGTAGAAAGTGGTATAG
AAATTATTATTGGTATAACTAATGATGACCAATTTGGACCAATGTTATTAGTCGGTTTAGGAGGAGTATT
TGTAGAGGTATTTAAAGATACTACATTATATCCATTACCTATAAATCATGATGAAGCTATTATGATGCTT
AAAAAACTAAAATCATTTAAGCTTTTAAATGGCTATAGAGGAAGTGAGCCTTGTGATATTGATGCTCTTG
CAGATATGATGGTCAAATTAGGAAAATATGCTTATGAAAATAAGGATGAAGTCAAGGAAATAGACTTAAA
TCCAGTGTTTGTATATCCTAAAGGAAAAGGCGTATGTGCAGTAGATGCCTTAATAGTTAAATATAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2468599-2468060 putative subunit of oxidoreductase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAAGAGCTAGTATTTGCAGGGTTTGGTGGTCAAGGAGTTTTAACTCTTGGTCTGATTGTAGCTG
AGTCAGCACTTGAATTGGGGAAACAAGTAACTTGGATGCCTGCATATGGTCCAACTATGAGAGGTGGAAA
AGCCTATAGTGTAGTAAAGTTTTCTGATGAGAGTATAGGTGGGCCTGATATGGAAGAAATAGATGTTTTA
GTAGCAATGAATAAACCATCTTTAGATTATATAAATTTAGTTAAAGAAGGTGGAACAGTAGTTATTAATA
CATCTGCAATAGATGAGAATGTAACATTAAGAGAAGATATAAGTGTAGTTAAAATAAATTGTCAGGAATT
AGCTCAAAAAGTAAACAATCCAAAAGCAGCAAATATAGTAGTACTTGGAGCATTAATTGCTAAAACTGGG
TTACTTGAAAAAGAATTAGCTTTAAAAACTATGTGTGATTTCTTTGAGGAAAAAGGAAAAGGAAAGTTTA
ATGTTCAAAATGAAGCAGCATTCATGGAAGGCTATAATAACGCCATTTGA
>ref|NC_013316.1|:c2469342-2468602 putative subunit of oxidoreductase [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTACAGAAAAATTAACACCTAGCGTTGTTTCAATACCAAACAAGTTTTGCCCAGGTTGTGGTCATG
GAATAGTAAATCGTATAATAGCAGAGGTAATAGAAGAACATGGATATGAAAAAAATCATGTATTAACATT
AGGAGTTGGTTGTGTCTGCAATATGAATTTTAGCTGGAATGGTGATAAGATGCAAACTGCACATGGTAGA
GCTTCATCTACAGCTATAGGAGTTAAAGTAGCACTTCCAGATACATTAGTAATGACTTACCAAGGTGATG
GAGATGCTTATGTTATAGGTCTTTCTGAAACTTTAAATACAGCATATAGAAATCATAATGTGACTGTATT
TGTAATAAACAATAATAATTTTGCAATGACTGGTGGACAAATGTCATGGACCACTATGCCGGGTCAAGTC
ACAACAACAAGTGTAAATGGAAGAGATATAAAGACTACTGGTAGTCCACTGAAAGTTCCTGAGATGGTGG
CAAACTTCTTTGATGTAGCATATGTAGCAAGAGGTTCAGTTCATAGCCCAAAGGAAATAATTAATCTAAA
AAAATATATAAAAAATGCAATAGAAGCTCAATTAAATGGAGAGGGATATTCCTTAGTTGAAATATTAGCA
CCTTGCCCAACTAACTGGGGTGTATCACTAGAGAAATCTATCAAATGGATGGAAGAAGAAATAGTGCCAT
ATTATGCTCTTGGCGAATTTAAGCAAAGGGATGGTGAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2470393-2469344 putative subunit of oxidoreductase [Clostridium difficile R20291]
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CAGGATATCCAATTACACCACAAACAGAGGTAATGGAATTTTTATCACATAGAATGTCTGAACTTGGAAG
AACTTTTATACAGTCCGAAAATGAGATGGCTGCTATATATATGGTATATGGAGCATATGCAAGTGGAATG
AGGTCTATGACGAGTTCTTCAGGACCAGGAATATCTTTAAAACAAGAAGGGATTTCTTACTTATGTGCAA
ATCATTACCCTTGTGTAATCGTAAATGTACAGAGATGGGGGCCTGGTCTTGGCTCATTGGACTCAGCACA
GACAGACTATCTAAGAGATACTAGAGGGGGAGGAAATGGAGATTATCATTTGATAGTTTATGCACCAAAC
AGTATTCAAGAGACTGTAGATTTGATGTATAACTCATTTGATGTAGCGGAAAAATACAGAGTGCCTGTCG
AAATTTTGACAGAAGCAGCTTTAGGTCAAATGATGGAACCAGTAGAATTTCCAGAATTTAAGAAGAGAGA
AGGAGATTTAGGTTGGACTTATGATGGAAGTAATAGAGACCATGCAAAGGTTGCAGATAACCAAAAGCCA
ACTTTTTGTATGGAGAAACGTATGAGAATAACTGAAAATGAACAACAATGGGAAGATTATCAAGTAGAAG
ATGCAGAATATGTGTTTGTAGCGTTCGGTATACCATCAAGAACAACTATGAATGCTGTTAGAAGACTTAG
AGAACAAGGTGAAAAAGTTGGAATAATAAGACCAATAACAGTATGGCCTTTCCCATATAAAGCATTTGAA
AAGGTAAGTAAAGATGTAAAAGGATTTATCTCAGTAGAATCAACAGACACAGGTCAATTAGTAGAAGATG
TTGCTTTAGCCTCAAAGAAAGTATGTAAAGAAAATGTACCTGTGTATGGTTTATTTAGTGGAAATCATAT
ACCAAAAACATTGCAAGTAATGGACACTTATAGCAAAATAAAATCTGGCGAAATCAAGGAGGTGTTCTAA
>ref|NC_013316.1|:c2470646-2470410 putative oxidoreductase, ferredoxin subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACGGGGTGTAGATATGAACTTAAAAATAAACGCAGAGAGATGTAAAAGTTGTGAATACTGCGTTA
TATCTTGTAAAAAAGGAGCATTAAAAATATCAAGTAAGATAAATAAAGAAGGTTATGCTCATGTAGAAGT
TGATGAGAGTAAATGCATACTTTGTGGAATTTGCTATCAGGTGTGTCCAGATAATGTTTTTGAAATAATT
AAAGAAAAAGCATGTCAAGAGGCTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2471764-2470661 putative histidinol-phosphate aminotransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGAAAAATTATTGAGAAATACCGTAAAAGAATTACATCAATATGTTCCAGGTGAACCAATAGAAA
AAGTTAAGGAAAAATATGGTGTAAAAGAAATAATAAAATTAGCTTCAAATGAAAATCCTCTAGGACCATC
ACCAAAAGCAATAGAAGCTATGATTGAAATGCTAAAACAAGGTCAACTTTATCCAGAGCCAGAAGCTAAC
GAACTTAGAAGAAAATTAGCTGAAAAGCTAGATTTAAAACCAGAAAATTTTATTGTTGCTAATGGTGCGG
ATAACGTTATCACTCTAATAGGTGAGGCTTTTATAAATAGAGGAGATGAAGTTATATATTGTAACCCAAC
ATTTCCATCATATAGAACTGCAACTATAAAAAATGAAGGGATACCAGTAGAAGTGCCTTTAACAGAAGAT
TATAAGTATGATTTACAAGGTATATTAGATAAGATTACAGATAAAACAAAATTAATATGTGTATGTAACC
CTAATAATCCAACAGGAACAATTGTGGATGATAAAGAGTTAGAAGAATTTTTAAAGAAAGTCCCTGAAAA
TATTATAACTATATTGGATGAAGCATATATAGAATTTTTAACAGTTCCTAATTATGTGGATGGACTTAAG
TATGTAAGGGAAAATTATAACGTTATAGTAACAAGAACTTTCTCTAAAATATATGGTCTTGCAGGGCTTA
GAGTAGGATATGGTATTGCTAAAGATGAGATAATAAGAACTTTATTTACAGTAAAAGAGCCTTTCTCTGC
AAATCGTGTTGCTATAAGTGGAGCAACAGCAGCACTTGATGATGAAGAGTTTATAAAAGAAACATATGAA
TTAAATAGAGTTGGAATGACTTACTTTAAAGAAGAGTTTACAAAAATGGGGTTTGATGTTGTAGATTCAC
AATCAAATTTCCTTTATGTAGATATGAAAACAGATATACCTAAGTTATTTGAAGACTTGAAAAAAAGAGG
GTTTGTAATAAGACCAAGTGCTACACATGCACGTGTAAGTATTGGAACTATGGAAGAAAATAAGAAATTT
GTAGCAGTTTTAAAGGAAATATTAAATATTAAAGGAGAGCCAAGTATTGGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2473297-2471867 lactose permease [Clostridium difficile R20291]
GTGAGTAGTCAAGAAAGCAAACCAAAAGGAAATCTTATATCAAATTTTAGAGATGATATGAGAGACCCTA
AGAAAAGAGCAATATACACATATTCAAGTTCTATAAACTTAGCGTACAATTTTATAGGTTACTTTGTATC
AACTGTTACAAATATTTTTTTAACTGATGTGGCAAAACTTGGTGTAATTATGGCAGGTGGTATGCAAATT
ATACAATCTTTCATAAAAATTGCTGTAGCTCCTATAACAGGTACAGTATTTGACAAACAACCATTCAAAA
AAGGAAAGTATTATCCATGGCTTAGATATGCACCAGCAGCGTTAGCATTAACATATGGAATATTTTTCAT
AGTTCCATTAATGAAAATAAGTCCAGCATTACTTTTACCTTTGATGACAGCTTTATTATTAATAGCATCT
TGTGCTCAGCAAGTAGTTTTCACTATAATTTATGCTATTTACCCTGTAGTTGCTAAGACACCTAGAGACC
GAGTTATAGGCTCAACTACTACTAATATATTTAAAGAAGTTGGTAAATTCTTAGTAGGTTTTTCATATCC
GTTATTATTAGTTTTATTTGCAGATGTATTAGGTGGAGAAGGAATGGGTTATTTAGGTACCTACTTATTC
TTTGCAGCAGGATGCCTTTTAGTATTTTGGTTTTCTTCAACAGAGATAATAAAATCTGGAGCAGAAGAAG
AAGTTCTTCAAAAAGAAGAGAAGCCAAAGATTAAAGCAAGTGAAATGGCAAAAGCTCTATTCACTAATGT
ACCACTTATGATGGCATTTTGTTTAGAATTTCTTATATGTATAAGATCTATAGGATTAGGACCTTTGGCT
CCATATTATTTTAAATATGTAATAGAAGATGAACGTGGATTAGCAGTATTTTTATCAATCATGCCTTTGG
TAAGTGTAGCATTCATGTTTTTCGCACCAGTGTTTATAAAAATCTGTAGAGAGCAAAAACTAGCTTCAAT
AATTTCTTTTTCTATATGTGCACTATGCCACTTATTGGTTGCATGGACTCCTTGGGGGAAAACTACTTTA
GGAGTAACTATGTTGCTGGCAATTGGTGGAGGTTTTTCAAATGTAGTATCAATAATAAATCTTAATTTCT
TTGCCGGTTCTTGTGATTATGGGCATTGGAAATCAGGAAAAGACTTACCTGGCTTAAGTATGTCACTATA
TCCAGTTGCAATACAAGTAGGAGTATTACTTGCAACTACTATAAGAACAGTTTTAATGAACTCAATGGGA
TATCAAGCTGATATGGTAGTCACAGAAGCAGTTAAATCAGGTTTTATAAATATGATTTCTTATTCTATGG
CAATACCTTTAATAATAGCTGTTGTTATAGCAATACTATATCCAGTAAGTGACAAGAAATTAAACCAAAT
AAGAGAAGAGTTAAATCAAAGAAATGCTTAG
>ref|NC_013316.1|:2473955-2475319 putative sodium/solute symporter [Clostridium difficile R20291]
ATGTTACTTTTAATTGTTACGTGTGCAATATACATATGGATTGGTTTTTATTTTTCAAAAAAAGTTAAAA
CAGCATCCGATTTCCTAATCGCAGGTAGAAATCTTCCTTTGCCTATACTAGCTGCAACCATTGCTGCTAC
ATCTTTTGGAGGAGGGTGCTTAGTTGGTGGAGTTCAATGGGGAGCTGAAAGAGGACTTTGGGTTGGAATG
TATTCTACTATAGGTGCAGCTTTAGCTTGCTTTATAAATGCCTTTTTCGCAGGAAAATTAAGAAGCTTAT
CTTGTGATATAACACCTGCTGATTATATTGAAACTAGATATGGTCATAGTGTATTTTTAAGAGCTTATCA
AAGTCTTGTAACACCAATATCTATACTAGCTATTATGGGTAGTCAATTAATTTCTTTTGGTTCTGTATCT
ACTGCATTTGGTATTCCTTATGATATAGCTGTAATTATAGGAGTTATAGTTATAATTATATATACTTATA
CATCAGGAATGTGGGGAGTTGCAGTATCAGCATTTATTCAACTTGCTATTTGTATAGTGTTTTTGCCAAT
AGTAGCTTATATAAGCTTAAAATTAGTTGGCGACAACCCTTTACTTATGTTACAATCAATGGTAAAAGAA
CCATTCTTTCCAGGAAATAAATCGATTAGTGATTTTATGTATACAGTTTTACCATTAGTTTTAGGCTCAA
TATTTTCTTATGAAAGTTTTTTAAGATATCAATGTGCTGATAATGCTAAAAATGCAGTTAAAAGTAGTGT
AATTGCAGGATTTATACTATTATTTCTTGCCTTCCCTATAGGAATAATTGGAGCTATTGGTGGTAGTTTA
TTTCCAAACATATCATCTGTTCAGGTTTTACCTCAAATGATATCGACTACTTTGCCACCTTTAATATCTG
TATTATTCTTAGCTGCTATATTGGCTGCCATAATGTCTACTGCCGATTCATTAATGACCTCAATGAGTGC
TATTATATCAAGAGATATTTATAACAAATTATTACATCCTAATATAGAATTTAATGATTTAAAAAATACT
CTAAAGTATTCTCAAATTGCATCAGCTTTGACAGCTATAATAGGTGCAATCATAGCACTTAAATTTGATA
GTTTATTAGAATTATTGTTTTGGCCGGCTCCATTATGTACAGGTGTAATATTTGCACCATTTGTAATTGG
TCTTTGCTGGAAAGGCGCTACAAAAAAAGGAGCTATCTATGCTGTTATAGTAAGTGTTATATTGGCATTA
TTAAATATGATTGGTATTCTTACTGTATTTGACAGAATTTTGGTTCCTATAATAGGTGGTTCTATTACAA
TATTTATAGTTAGCAAATTTTCAAAAAAAGATTGA
>ref|NC_013316.1|:2475343-2475996 TetR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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AGCAAGGTTATCATAAGACAACAACTAGGCAAATTGCAGAAAGAGCTAATATAAATTTAGGTCTAATAAG
CTATTACTTCTCAAGTAAAAGCGAAATAGGAGCTATAATATATGAAGATATAAGAAATGAAATGCAGTCT
TTAATCTATAACTACCATGAAGAAGGTACTATGATGATGTTCTTTCTTGCTATGAATGCTGACCTTTGTT
TCCTTCTAAAAAACGAAGCATATAGAAATTTTTATTTGGATATAGCTTATGAAGAAGCTATTTTAAGCTA
TCAAAGAAGTGTAACCGAAATGGTCATGAAAAGATATGTTAATGATAAAGAATCTATAGAACATGATGAA
TTAATACTTTCTTGTATTGGTATACTTGCTATGAAACCTGAAATAATTAGAGTTTATACTTCACACAAGT
ACGATATATCTTCTCAAGCTGTAATAAAGCATTTTACAAAACAGTTTCTTATTAATCTTGGTCATAGTAC
GGATTTATGCGAAGAGATTTTAGAGGAATTGAGTAAATACTATATAGATATAGTTGACAATTTTACTCCA
ATAATAACTCGTGTAAGAACTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2476939-2476115 putative esterase [Clostridium difficile R20291]
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CTAAATATACTGGAGGAGAAACTGATATAATTGTAATTTTGCCTGTAGCAAATGGAAAAGAACTTTTTAG
TGGTAAAGAGATATATGATTTTGAAGGTAAATTTAAAACATTATACTTATTTCATGGTTTAGAAGATGAC
CAAAGCTCATGGATTAGATATACTAATGTAGAGCATTATGCTAAAAATAAAAATATAGCCCTAGTAATAC
CAAGAGTAGAAACTAGTTTTTATACAGATATGGCGTATGGACACCAATATTTTACTTTTGTAAGCGAGGA
ATTACCTAAATTTGTTAGAGCTATATTTCCTTTATCAGATAAAAGGGAAGATAACTTTGTAGCTGGTATG
TCTATGGGGGGATATGGAGCTTTAAAATTAGCACTTTCAAAACCAAAAGAGTTTTCGGCAGTTGCAAGTT
TTTCTGGTTCGCCTGATATGATTCATGAGTTAGAAAATCAACAAATAGAAACCAATGCAGACATTTTATT
TCACGATTTTGGTAGACCAGAAGACGCTAGAAATAGTGAGAATGATTTACTTTACATACTTAAGAACCTT
AAAGAAAGAAATGAAGATATTCCTAAAATTTATCAATTTTGTGGTGATAGAGATTTTTTATATAAAAATA
ATCAGATGTTTAAAAAATATGCAGAGTCTCTGGGTGTAGATGTTGAATATGAAGAGTGTGTAGGGGGGCA
TGAATGGCGTCTTTGGAATTTATGGATAAAGAAATTTATAGATATAATTGGGTAG
>ref|NC_013316.1|:c2478180-2477014 hypothetical protein CDR20291_2112 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATTAATTGGAATACAAAATACACAACAATAGCAATTTATACATTTATAATAGCTGCTAGTAGTA
TTATATTTTATCTAGTATCATCACAAATTGATGTATTTTCTAATAATTTAGATGCTATATTTACAACATT
ACAACCTTTTATAATAGGATTTGCTATTGCATATCTTCTTAATTTTATTTTAAAGTTTTATGAAGACAGA
ATTTTTATAAAAAGTGAGAAATTAAAAAAACTAAAACAAAGTTCAAAAAGAGGCTTGGGTCTTTTATTAA
CATATGCAACAGCTACATTGATACTTTACTTATTTATGCATTTCGTATTGCCACAAGTAATTGAGAGTAT
TGTTGGACTAGCAAATGATATACCTATGTATGTAAACAATGCAACTAAGCTTATTGATAAATTAATGACT
GATTTAAATCTTGATGAGCAATACTTTAATTTGGCAGTTGATAAGTGGAATGAGTTTGTTACATATATTA
TAAAGTTTGTAACAGATTTAATCCCAATATTAGGAAGTATGTTAAAGAATGTAGCCTCTAGTATATGGAA
TATTGTACTAGGATTAATTGTTTCAGTATACTTATTAATTGATAAAGAAAAATTCTATGGATTAAGCAAA
AAAATAACTTATGCAGTATTTACAGAAAAACAAGCTGCCAGAATTTTAGAATTAACTCATAGAAGTAACT
ATACATTTGGAAGATTTTTAGGTGGCAAAATATTAGATTCATTCATTATAGGTATTCTAACATTTGTAAT
ACTTACATTAGTTAAAATGCCATATACATTATTAATATCAGTTATAATTGGTATTACAAATATTATACCT
TTCTTTGGACCTTTATTTGGAGCTATACCATCTACTCTAATAGTGATGTTTGTATCTCCTATAAAAGCTT
TCTGGTTATTGTTGATTATATTAATAATACAACAGATAGATGGAAATATTATAGGACCTAAAATACTTGG
AGATTCAATTGGTATATCTGCATTTTGGATTTTGTTCTCCTTATTGGTTGCAGGAAAATTATTAGGTTTT
ATTGGAATGGTTATAGGAGTTCCAATGTTTGCAGTAATTTATTCTATAATTAAGGATATTGTTGAAAGTA
AATTGGACAAAAAGGGATTACCGACAGATACTTCCGATTACATGTAG
>ref|NC_013316.1|:c2479683-2478319 aldehyde dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATATAAAAGAGTTAGTTAAAATGCAAAGAAAATATTATAATACAGGTAAAACAAGAGATATATCGT
TTCGTATAGAACAGTTGAAGAAACTTAAGTTAGTTGTATCACAAAATGAAGAAAAAATACTTTTAGCACT
AAAGAAAGATTTAAATAAATCGAATTTTGAAGGTTTTATGACAGAGGTAGGCATGTTTTATAGTGAATTA
AACTTTGCTATAAAGAATATAAGAAAATGGAGCAAAATAAAAAGAGTTAAATCAAGTATGGTTAATTTTC
CATCTATATCCAAAGTTGTTCCACAACCTTATGGTGTTACTCTCATAATGTCACCTTGGAATTATCCCTT
TCAATTAGCACTTATACCATTAGTTTGGTCATTAGCAGCAGGGAATTGTGTTATATTAAAACCTTCTGAA
TATTCTGTGTCAACATCTAGTGTAGTTAAAGACATAGTTGAAAATACTTTTTCAAAAGAATATGTTGCAG
TTGTTCAAGGAAGTCAAGAAGAAAGTGAAAAGTTACTATTGGAAAGATTTGATTATATATTTTTTACAGG
AAGTACTAATGTTGGTAAAATAATCATGAAATCAGCATCAGAGCATTTAACTCCTATTACTTTAGAACTT
GGAGGAAAAAGTCCTTGTATCATTTTAAAAGATGCTAATATAGACCTTACTGCCAAAAGACTTACTTGGG
GAAAACTAATAAATGCAGGACAAACCTGCGTGGCTCCAGATTATGTTTTAGTGCATGAAGATAGAAAAAA
TGAGTTAATAGAGAAAATAAAATATTATACTAATAAGTATTTTGGAGATAATCCATGTAATAATGAGCAA
TTTCCTAAAATCATAAATCAGAGACATTTTAATCGGATATTATCTCTTATTGATAAAGATAAGATAGTCT
ATGGTGGAAATTATAATAAGGAGACATTAAAGATAGAGCCAACTATAGTAGACAATGTTAATTGGGATGA
TAATATAATGAAGGAAGAAATATTTGGGCCTATATTTCCCATTTTAACATATAAAGATTTAGATGAAGTA
ATACAAAAAATTATACAAATGCCAAATCCATTGGCACTTTATATTTTTACAAAAAATAAGTACCTAGAAA
ATAAACTTTTAGAAATGATTCCAGCAGGCGGATGTTGTATCAATGATACAGTTACTCATATAGCTACGAA
TTACTTACCTTTTGGTGGTATTGGTGAAAGTGGTATGGGCTCATATCATGGAAAAGCTGGATTCGATACA
TTTACTCACTATAAGAGTGTGTTAAAAAAATTAAATTTGGATGTCCCTATTAGATATGCTCCATACGATA
ATAAATTAATTAAGGTTCTTAAAAAGATAATGTAG
>ref|NC_013316.1|:c2480546-2479995 putative flavodoxin [Clostridium difficile R20291]
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CAAAAAAATATGCTAAATGGCTTTCAGAATTATTGTCTTGTGATATTTTTGAAACTAAGAATATTAATAT
AGAAAAGGTTATGAAGTATGATACGATTATTTTAGGAGGAGGTCTTTATGCTTGTAATATAGCGGGAATT
TCTTTCTTAAAAAAAAATTATAAAGATTTGCAGAAAAAAAATTTAGTAGTATTTGGCGTAGGAGCTGCTC
CATATGATGATGAAGTAATAAAGAAATTAAGAGAAGTAAACTTTAAGGATGAATTAAACAAAGTTCCTTG
CTTTTATTGTCGTGGGGCATGGGATGAGACAAAAATGTCTTTTATAGATTATACTCTTTGTAGTTTTTTT
AAAAAATCTATAGCTAAAAAAGAACGTCAAGGTCTTAAACCAGCAGAAGCACCTTTATTGTCTGGAGAAG
CCTTTGATTGGTGTAATAAAGAAAATTTAACTCCAATACTTAATTATATAAGAAAACTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2481066-2480569 MarR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGATGCAGAAAGTTTAATGAAAAAATATATGGTAGATGATGATAGTAGAAAACAAGCTATATTTGCAA
GTATATTTGTAATGCAAAATAAACTTCAAACTACATGTGATAAATTAGACCCAGAATTAACAATGAAACA
ATGGTTACTTTTAGCTATTGCGGACTCTGTAGATGAAACTCTTACATTAACCAAACTTGGAGAATTAATG
GGGTGCTCAAGACAAAATGTAAAAAAACTAGCTATTGCTTTAGAAAAGAAAGGTTTTATACAAATTGAGC
AAAATGAAAAAGATTCAAGAGCTATCTGTCTTGTGACAAAAGATAGAGTGCAAGAGTATTCTAAAAAAGT
AAGAGGTATGCAGGAAAAAGTATTACAGCTTTTATTTGAAGATTTTACAGAGAAAGAAGTGGAACAGTTA
TTTTTTGGAATTATGAAATTAAGTATAGGAATTGAAAATGTGAAAAATTATGTAGAAAATAATGACGTTG
GAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2482576-2481299 putative GTP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGATATGACGAAAAAAGGAATAACAGTAGGATTAAACATAAATAATAAATCTGAGGACTTTAATGAAC
TAATGATTGAACTTGAAAACTTATGTTCAGCATGTGATATTGATGTTGTAGGGAGTATAACTCAAAATGC
AAAGCAGGTTAATAGAGCATTTTACATTGGGACAGGTAAAGTTGAGGAAATATTAAACTTAATAAAGAAA
GAAAACATAGAGATAGTTATATTTTACAATGAACTTTCTACATCACAACTAAAAAATCTTGAAGAAAAGC
TTAATTGTGAAATTATAGATAGAACGGCATTGATACTTGATATATTTGCACAAAGGGCAAAAACTAGAGA
AGCTAAACTTCAAGTAGAAGTAGCAAGTTTAAAATATATGTTACCAAGACTTATAGGTTCAAATGAAAAT
TTAGGACGTCAAAGTGGTGGAGTTGGTACTAAAAATAGAGGTTCTGGTGAGAAAAAATTAGAACTTGACC
GTAGAAGAATAGAAGAAAAGATAACATCTTTAAATAGGGAGTTGTATGATTTAAAATTCCAAAGAGAAAC
TCAAAGAAGTATGAGAAGAAAATCAAATCTTCCAAATGTAGCTCTAGTCGGGTATACAAATGCTGGTAAA
TCTTCAATAATGAATAAACTAGTAGATATATTTAAAAACTCTGAAGAAAAGAAAGTGTTTGAGAAAAACA
TGTTATTTGCTACACTTGAAACTTCTGTCAGAAATATAGTTCTTGCAAATAACAAAGAATTTTTATTATC
TGATACTGTTGGTTTTGTAAGTAATCTACCACATGACTTAGTAAAAGCATTTAGGTCAACATTAGAAGAA
GCATGTGAGGCAGACGTACTGTTACATGTTATTGATATTTCAAATCCAAGCTATAAAAGTCATATTAAAG
TGACAGAAGATACTTTAAAACAAATAGGTGCAGATGGTATACCTATGATACATGTGTATAATAAAATTGA
TTTAATAGATGTAGAAGTATTGGATAGAATTTTAGATAGTATCGATAAAGAAGGTATATTTGTTTCAGTT
AAAAAAGATATAAATATAGATAAAATGATAAAATGTATTTGTGATAGCATATTTAAAGATTGTGTAAGAT
GTAAGTTCTTAATTCCATATGATAAAGGTCATGTAGTTTCTTATTTTAACGAAAATACGAGCATTATAAA
TACAGAATACAGAGAAGATGGAGCTATTTTAGATGTAGAATGTAGCAATATAGAATATAATAAGTATAAA
AAGTATGCTTTAGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2485118-2483295 ABC transporter, ATP-binding/permease protein [Clostridium difficile R20291]
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GAAAACTAATTGCATATTTATCTAAATTTAAAATATCAATAATTTTAGTAATTGTATTTGCTATTGGTAG
TGCATCGTTTTCTATAGTAGGTCCAAAAATTTTAGGAAAGGCAACTACAAAGATATTTGAAGGGTTAGTG
AGTAAAGTTTCTGGAGGAAACGTAGGTATAGATTTTAATGCAATTGGAAAAATCTTAACCTTTTTACTTT
TCCTTTATTTGATAAGTGCACTGTTCTCTTTTATACAAGGATTTATAATGAGTGGAATTTCTCAAAAAGT
ATCCTATAATTTAAGAAAAGAGATTTCAGCAAAATTGGATAGATTACCAATGAAGTATTTTGATACTAAG
ACGCATGGTGAAATATTATCGAGAATTACGAATGATATAGATACTTTAAATCAAAGTTTAAATCAAAGTA
TGACACAGCTTATAACATCAGTAACAACTATGATAGGTGTTTTGATAATGATGTTATCTATAAGTGGAAT
TATGACATTAGTGGCAGTTTTAATATTACCAATATCAATGTTTGTAATTTCAAGAATAATAAAGAAATCA
CAAAAATACTTTAGATATCAACAAGAATATTTAGGAAATGTAAATGGTCAAGTTGAGGAAACTTATAGTG
GCCAAACAATAGTGAAAGCATTTAATCGTGAAGATGAAGTAATTGAAGAGTTTGATAAACTAAATGATAG
CCTGTATAATTCAGCGTGGAAATCTCAATTTTTATCAGGTATAATGCAACCACTTATGATGTTTATTGGA
AACTTGGGATATGTAATGGTATCAATCTTAGGAGGTTGGCTTGCAATTAAGAAAACAATTGAGGTTGGTG
ACATACAGTCATTTATACAATATGTAAGAAACTTTACACAGCCAATGACTCAGATTGCACAGGTTGCCAA
TTTATTGCAATCAACAGCAGCAGCTTCTGAAAGAGTATTTGAGTTTTTAGAAGAGGAAGAAGAAGTCCAA
ATTGTTGAAAATGCAGTTTCAATAGATGGTTTAGAAGGTAAAATTGATTTTGAAAATGTCAACTTTGGAT
ATAACCCAAACAAGACTATAATAAATGATTTCTCAGTAAATGTTAAACCTGGTCAAAAAGTTGCTATTGT
TGGACCTACAGGAGCAGGTAAAACTACAATAGTTAAACTGTTAATGAGATTTTATGATGTTAATAGCGGT
TCAATACTGATTGATGGTCATAATATTAAAGATTTTAATCGTAGTGAGCTTAGAGAAATGTTTGGTATGG
TTCTTCAAGATACATGGTTATTTAGTGGTTCAATTATGGAAAATATAAGATATGGTAAGTTGAATGCTAC
AGATGAAGAAGTTATAGAGGCTGCTAAATCTGCACATGTTCATAGATTTATTAAGACGTTACCAGATGGA
TATAAGATGAAATTAAATGAAGAAGCAAGTAATGTTTCTCAAGGTCAAAAACAATTATTGACTATAGCTC
GTGCTATTTTAGCTGATCCTAAAATTTTAATATTAGATGAAGCTACAAGTTCTGTCGATACTAGAACAGA
AGTATTGATTCAAAAAGCTATGGATAATCTTATGGAAGGTAGAACAAGTTTTGTTATAGCCCACAGATTA
TCAACTATACGTGATGCTGATATGATTCTTGTAATGAATGAAGGAGATATAGTTGAACAAGGAAATCATG
AGGAACTTCTAAAGAAAGGCGGATTCTATGCCAATCTTTACAATTCTCAATTTGAAGAAGATGAAGCAAT
GTAA
>ref|NC_013316.1|:c2487366-2485120 ABC transporter, ATP-binding/permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAAATTAATTAAATATTTAAAGAAATCGGCATTATCAATAGTAATAATAGTCTGTCTATTGGTAA
TTCAAGCGGTATGTGACCTTTCTTTACCAGAATACACATCCAATATAGTAAATGTAGGTATACAACAAGG
TGGAGTAGAAAACTCTGTTCCATCTGTGATTAGAGAGAGTGAATTAAATAAAATTACTTTATTTATGGAT
AAAAGTAGTAAGGATAAAGTACTAGATAATTATACTTTGCTGAATAAAAAGGATTATGTTAAGTATAAAG
ATAAGTACCCAGGTCTAAAAGATGAATCTCTTTATGAGTTAAATACTAAAGACAAAGACACTATAGATGA
TTTAAATGTTATTTTTGGTAAAGCTATTTTAATAGTATCAGGGCTTGAGGGCGATAGTAAAGAGGTAAAA
GCTATGAAAGCTCAGTTAATGAGTAAACTTCCACCACAAGCTACTCAAAGTGGAGATGTTGATATATTTA
AATTGTTATCAGCAATGCCAAAGGAACAGTTAGATACATTGACTAAAGAGATGAGCAAAGGCTTTGAAAG
TATGCCAGAGAGTATGATAACACAAAGCTCTGTTTCATATGTAAGGTCAGAATATGAGAAAATAGGTATT
GATACAGAAAAAACTCAAAATAATTATATATTATTTACTGGTGCTAAAATGCTTGGTATAGCAATGATTA
GTATGGTAGCTACAATAACAGTAGGATTTTTAGCAGCAAGAGTAGCAGCAAGTGTAGGTAGAAATTTAAG
AAGTGGAGTATTTAGAAAAGTTATGTCATTTTCAAATACTGAAATGAATGAATTTTCTACAGCTTCATTA
ATTACTCGTAGTACAAATGATATTCAACAGATACAAATGTTGATGGTTATGTTGCTTAGAATAGTATTCT
ATGCACCTATAATGGCTATAGGTGGAGTGATAAAGGTTTTAAACACAAATACTTCAATGGCCTGGATTAT
AGCAGTAGCAGTAGTTGCTATCTTATCATTAATTGTAGTGTTATTCTCAGTGGTTATGCCTAAGTTTAAA
CTGGTTCAAAAGCTTGTTGATAAGTTAAACTTAGTAAGCCGTGAAATAATTACTGGTATTCCAGTTATCA
GAGCTTTTAGTACTGAAAAACATGAAGAAGAAAGATTTGATAAAGCAAATAAAAATTTAACTAAAACAAA
TCTTTTTGTAAATAGAGTTATGACATGTATGATGCCTGCTATGATGCTTATAATGAACCTTATCACAGTT
CTTATAGTTTGGAGAGGTGCATACAGTGTTGATTCTGGAGCAATGCAAGTTGGAGATATGATGGCATTTA
TACAATATACAATGCAAATAATAATGTCATTCTTAATGATATCAATGGTATCTATTATGCTTCCAAGAGC
ATCCGTTTCAGCTACACGTATAGATGAAGTATTAGTGTCAGATATAAGCATAAAAGACCCAGAAAAATCA
GAGGCACAAGAGTTTAAGGAAGATAAAAAGGGTCTTGTTGAATTTAAAAATGTTTCGTTCATGTATCCAG
ACGCAGAAGAACCTATATTAACAAATATATCTTTTACAGCAAAGCCAGGAGAAACAACTGCCTTTATAGG
AAGTACTGGTAGTGGTAAGTCAACTCTTATAAATTTAATTCCTCGTTTCTTTGATGTTACTGAAGGAGAA
ATATTACTTGGTGGAGTTAATATAAAAAATGTTTCTCAACATGATTTAAGGGAAAAAATTGGATATGTAC
CTCAAAAGGGAGTATTGTTTTCTGGTACTATAGAATCCAACTTAAAATATGGTAGAAAAGACGCAACAGA
TGAAGAAATGAGAACAGCAGCTGAAATAGCTCAAGCTACAGAATTTATAGATTCTAAACCAGAAGCTTTT
AAAACTGAAATTTCTCAAGGTGGAACAAATGTATCTGGAGGTCAAAAACAAAGACTTTCTATTGCAAGAG
CAATAGCAAAAAATCCAGAAGTTTATATATTTGATGATAGTTTTTCAGCACTTGACTTAAAAACTGATGC
AGCTCTTCGTAAGGCTTTAAAATCAAAAACTGCTGAAAGTACAGTTCTAATAGTTGCACAAAGAATTAGT
ACTATCTTAAATGCAGAACAGATAATTGTTTTAAATGAGGGAGAAATAGTTGGAATAGGAACACATAAAG
AGCTTCTAAAAAATTGCGAAGTTTATGAGCAAATAGCTTTATCACAACTTTCAAAGGAGGAGCTAGCTAA
TGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c2487895-2487434 MarR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAGCAATTCTGAAGAAAAATTAAATGATGTTTTCTTGCAATTAATGCGAATATATTTTATAAGAA
CTCATTTTTATTTTGATAAATTAGGCTTATATCATGGTCAACCCCAAATACTTTTTTCTTTAAAGATGAA
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AAGAGGATGGAAAAAGCTGGACTTGTGGAAAGAAAACAAGATGAAAAGGACCAAAGAGTATCTAGGATTT
TTTTGACAGACAAAGGTTTAGAAATATGTAATAAAGTTGAAGAATTTAACAAGGAATTGGAAAGAGAGTT
TTTTTTAGGATTTAGTGAAGAAGAAAAAATAGTACTTAGAAGACTTCTAATGCAAGTACGAGATAATTTA
AAAGCAGGATGTCATAAGCATGAAGATGAAAAATATTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2488832-2488200 putative carbonic anhydrase [Clostridium difficile R20291]
GTGTATATATTGTACTTTAATAGTGATATAATAATAAAAAAATTTTTAAAGAGGGTGATATTACATATGA
GAAAACTTGAAGAGATATTAGAATATAATAAATCATTTGTAGAGAACAAAGAATATGAACAATATGTGAC
ATCAAAACATCCAAATAAAAAAATAGTAGTCTTATCTTGTATGGATACAAGATTAACTGAGCTTTTGCCT
AAGGCTATGAATTTGAAAAATGGAGATGTGAAACTAATAAAAAATGCAGGAGCTACTATAATGCATCCTT
TTGGAAGTATTATGAGAAGTGTTTTAGTTGCAATTTACGAATTTGATGTAGATGAGGTTATGGTTGTAGG
GCATCATGGATGTGGTATGTGTAATGTTGATACAGATAAGTTACTTGGTAAAATTTTAGATAGAGGAATA
TCTAATGATGTAATACTTACACTTCGTAGTGCTGGAATTGATACAAAACAATGGTTACATGGATTCGATT
CTGCAGAAGAATCTGTAAAAGATAGTATTGATTTAATAAAAGGGCATCCTTTAATTCCAGATGGTATTAT
TGTACATGGTCTAATTATATCACCTGAAACTGGGAAGTTAGACGTTGTTGTAAATGGATATGAAGATAAG
TAG
>ref|NC_013316.1|:2489453-2489791 putative regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
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ATCTATCAATATTATAATGAAAATTGCTACTGCTTTAGACATACCACTTGAATTGTTATTTGCAAATATT
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>ref|NC_013316.1|:2489813-2490130 putative regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
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ATATGGTTGGAGTATCGCCTTGGTATATAACTCAAATCGAAAGTGGTAAAAAGAATCCAAGTCTTAAAAC
ATTCATAAAATTTGTAAATATATTAAATATTTCTGCAGATGTTCTTATAAAAGATATTACTTCCACTGGA
AAAACATATTTAGAAAATGATATAAATGAAGAGTTAAAAGACTTAAATTCAAGAGAACTAAATCTGATAT
CACAGATTATAGACATCATAAAAAAGAATAAAATATAA
>ref|NC_013316.1|:2490280-2490957 hypothetical protein CDR20291_2123 [Clostridium difficile R20291]
ATGATTGTGATTGAAGGTAGTGATAAATTTAAGATTGCAAAAGAATATATTGATGTAGAATATACTCTTT
TTAGCAAAGTAACTTTTAGGTATGAAAAGTTGAAATTTAAAGATAATGCTGAATTGGAAAAAATTAAGAT
GTTTAAATATAAAAATGGCTACATCCCTAATAAATTAAACCTTTCTTTTGGATATGGATTCTCTTCTTAT
AAAAAGCAAATAATTAGAGAAACTGTAGATACTTTAAGATTGACAGAAATTTTTTCAAGCGAGAACATAG
AAGATATTAAATTTATAAAAGATGGTACAAAAAAATTAGAAATTAGCATAGAGAAAGTTGTGAAATTTAA
ACGTCGAAAAAAAAGAAATTATGTTTGTTGCTATTGCCCTGATATGTATAGAGATATAAAACTCGACAAA
GAATCTATCAATAAGATATACAACAGAAAAATAAAAATAGAAAGAGAAGTTAATATTTTTGAAGATGAGG
ATGTTATAATAAACAAGAAAGTATTGAAGTTTCCAAAGTCTTGGACAAAGAATATGCAAAAATATTGGTT
AAGTGAAAATAAGTATCCCATACATTCTACTGTAATTGATGATGATAGATATAAATGTTGTAATGTACAA
TATACAAAAAATAGAGTGATAATATTATATTACATATATAACCATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2492064-2491285 3-dehydroquinate dehydratase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGAGAATATGAAAAGAAAAGTTCAAGTAAAAAATATTACTATTGGAGAAGGTAGACCTAAAATTT
GTGTACCAATTATTGGGAAAAATAAAAAAGATATTATAAAAGAGGCTAAAGAGTTAAAAGATGCATGTTT
GGATATTATAGAGTGGCGAGTTGATTTTTTTGAGAATGTAGAAAATATTAAAGAAGTTAAGGAAGTTCTC
TATGAATTAAGAAGTTATATACATGATATCCCTTTATTATTCACATTTAGAAGTGTAGTAGAAGGGGGAG
AAAAATTAATATCAAGAGATTATTATACTACTTTGAATAAAGAAATTTCTAATACAGGTTTAGTAGATTT
AATAGATGTAGAGTTATTTATGGGAGATGAGGTCATAGATGAAGTAGTTAATTTTGCTCATAAAAAAGAA
GTGAAAGTAATTATATCTAATCATGATTTTAATAAAACTCCAAAAAAAGAAGAGATTGTATCTCGTTTAT
GTAGAATGCAGGAATTGGGCGCAGATTTACCCAAAGTAGCTGTTATGCCGCAAAATGAAAGAGATGTGTT
AGTGCTACTTGAAGCTACAAATGAAATGTTTAAAATTTATGCAGATAGACCAATAATAACAATGTCAATG
TCAGGAATGGGTGTTATAAGTAGATTGTGTGGTGAAATATTTGGTTCTGCATTGACTTTTGGAGCTGCAA
AAAGTGTTTCAGCACCAGGGCAAATATCATTTAAAGAGTTAAATTCAGTACTTAATCTATTACATAAGAG
TATTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:2492858-2493490 streptogramin A acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGACTATTCCAAATTCAAATAAGGTATATCCAAGAAGTAATGATTATCAAACTGTATATCTTAAAAATG
TAATAACAAGGGAAAATATAGAAGTTGGAGATTACACAATATATAATGACTTTTATAATGACCCAAGAGA
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CTTTTCCCATCTTTTATGAAGAATGGAAACTCGATATCAACCATATAACGGACGCTTGGGACAATAAGGG
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GGATTGGCCATATAAAAAAATTCAATCAAACATTAAGCATATTCAATCAGGAAATATTGATAAATTAGTT
TAA
>ref|NC_013316.1|:c2494730-2493861 putative radical SAM superfamily lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATACGATATGCCACTTTACAGACCACCAAGTGAGGCTTATAGTCTTATAATACAAGTCACACTAG
GATGTTCTCATAACAAATGTACGTTTTGTAGTATGTACAAATCTAAAAAATTTAAAATAAAGCCACTAGA
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ATTAAGAAAACTTGGTGTTAAAATGATTTATCTAGGGCTTGAAAGTGGAAGCAATGAAGTATTAGAAGAT
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AATGTTAGGAGCAATTTCACCAGATTATGTGGGTGTACTTAGTTTAATGGTAGAACCTAATACTGAACTT
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AAAAGGTGTATTACCTGATGATAAACAACGTCTAATTGATGAAATTGATTACTATCTAAGTAACCAAAAG
CTAAAAAGAGAAGAATATAGAAGACTATAG
>ref|NC_013316.1|:c2495699-2494827 hypothetical protein CDR20291_2127 [Clostridium difficile R20291]
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CTATGGAACTTGAGAGACCTTTACTTTATGATGAGGTTGAGAACAAAGATGATAAAAATAATAATAGAAA
ATTTAACATAAAGAATAAGATATTTAAGGGAATAGGTATACTATTTGTATTGATTTTGCTTGGCTTTTTC
ATATGGATAAATAAAACATATGAACCTCAAAAGCTGGCAAAAGAAGCTCTAGTCAGCAATAGTAAAGTTG
AAGTAACTGTAAATGAAAACATTTCATTTACACCAAAAGGAAGAAAAGTTTCTAAAGGTTTAATTTTGTA
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GTTGTAATCGTAAAGATGCCACTTAATCTAGCTATACTTGGAACTAATAAGGCACAGAAAGTTATGGATT
CTTACAACAACATAGAACATTGGGTAATAGGAGGTCATTCATTAGGAGGAGTTGCAGCATCAAATTTTGC
ACGTGATAATAAATTAATTGAAGGCGTTGTATTTTTAGCTTCTTATCCAATGGGTGATGAGTTGAAAGAA
TTAGGAAAAAAAGTTATATCTATATGGGGGAGCAAAGATGGAGTAGTCAATTTTAAAAGTCTTGTAGAAT
CAAAACAAAAACTTCCTGATGATACAACTTATGTTGAGATTGAAGGAGGAAATCATGCACAATTTGGAGA
CTATGGAAAACAAAAGGGAGATAATGATGCTATTATAAGTCAAGAAAAACAACTTAATATTACTGCCAAT
AGTATCATTAAATTTTTAAAGAATATATCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2497920-2495899 hypothetical protein CDR20291_2128 [Clostridium difficile R20291]
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TTATATATTTATTTGGAAGTAAAAATACACTTATAGGTGTAGGTATAGTAACAGCTATGCTAACACTCTT
GGAAAGAGATTTAACTATTTCTCCAATTAAAAATTTACTGAAGTATTTAGCAATAAATATAATCTTAGGA
ATACTATCATTTTTTGCAGTACAAAATATGTATTTAGGAGTTTTATTAAATTTTATAGCATTATTTATAA
TAGGGTATGTATTTAGTTATGACTTAAAGAGAGCAGTATATGTACCTTTTGGTCTAATGTATATATTTAT
GGTAAGTATACCTGTAGGAAAAAGTGAATTTCCTATGAGATTGTCGGCTTTAGCTGTTGGAGCAGTTATA
ATAATGATTGCTCAATTTGTTATGAATAGAAATAGGATGAAAAATGTCGGAGATAAAGAACTGATATCTA
TATGTGATGAATTATTAGAAAAAATTAGTCTTTTAAAAAATACTATTAATGATGATAGTTCTATAATTAA
ATCTAGTATGAGAAAAATAGATAGCTGTAATTATAGAATAAATTCTATATCTAAAAATTTGAAAATGGTT
ATTTTTGATAATAGAAAAGATGACTTTTATATCAGTATTAGAGGTATAGACATAATGAATATTTTATTTT
CATTAGAAAGAATAAGTTTAATCATGGAAAGATACAAAAAGGATAGTAAAGAATTTGAAGATGAAGATAT
AAAAAATATTTTAGAAGAAAGTAGCATAAATAGTAAATCAGATGTTCTAGTTGTAGCAACGAAAGAAATA
AACTATATTAAGATGTGTTTAGAAAATAAAGATACCATAACTGATAAAGAGATATTAGGATTTAGAGATT
ATGTTATTGCTCAGGATACTAAAAATATAAATTTAAAAGAAATTTATAGTGTTTTAGAAAATTTATATGA
GTTTTTAGTAGATTATAAAAAAGTAAAATCAAGAGACGAAAAGAAAGCTGAAAGAAAATCAAAGATACCT
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TAAAGATTGCTTTAGCTACAGCTGTAGCGGGTTTTATTATGGATTATTTCCATTTAAGAGATGGAAGATG
GATAATGTTAACTGTCTTTTCATTAACACAACCTTACGCAGAAAATTGTATACAAAGGTCTAGAAAAAGA
ATAGAAGGTACATTTATAGGAGCTGTAATATTTATTGTATTATTTTCAATAATAAAAGATAGTACATTAA
GGTCGTTAATAGTTCTTTTAGCAGGGTATATAAACTCTTATGTAGTTGATTATAGAAAATTAATGGTATG
TGTAACTGTTTCAGCTCTTGGTTCAGCAGTAGTTATGGGAGACCCAAATGTTTTAACCATAAGCAGGATT
TCATATGTAGCATTAGGAGCAATTATTGCATTAATAGTAAATAAGTTTATATTACCATATGATGCTAAAA
CAGGCTATCAACATGTTATAGAAATGTATAAAGGAATAGTTAAAAATATAATTGATGAAGTCAATAAGTC
TATAGAAAATGTAGCTGATGTTTACTATATAAAAAATTTATTATTGATACCATCACTTATTGAAGATAGA
CTTATGTTGATAAATGCTATATATAAAGATAAACATCAAGAGGATTTTTTAGAAAATCAGAAATTACTAA
TAAGTAATATGTATAATCTATATATAAATGTTAATAAAAATAAAATAAAAGATGAAGATGTTGAAAAAAT
ATTGAGAGATACTAATTATATTTCAAATTACAATGTAGATAAGTATGATGAAGGAAGAAGTGTAATTTTA
GAGAGTATTGTAAATACTAAAAGTCTAGGTGACAAGATAATATGTCTAAACTTACTGCAAACTCTAAATG
GTGTCAAAGAAATGTATAGAATAAGTAATATAACTAAAGTTTCAATAAAAGAAGCAGCTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2498964-2498188 putative nitrite transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGCATAAAGAAACTTTGGATAAATTAACTAATGCAGCTATAAATAAGATAAATTTATTAAACACAAGTA
AAGTAAAATATTTGGTATCTTCTGCGTTTGCAGGACTTTATGTAGGTATAGGTATACTTTTGATATTTAC
TATAGGAGGACTTTTGACTGATGCAGGTTCACCTATGACTAAGATAGTAATGGGGTTATCATTTGCAATA
GCACTAAGTTTGGTTATAATGACGGGAACAGAGTTATTTACTGGAAACAATATGGTTATGTCTGCTGGTA
TGTTAAATAAAGGTGTAAGTATAAAAGATACTTCTAAAATATGGGCATACAGTTGGGTAGGTAATTTAAT
CGGAGCTTTGGTTTTAGGTCTTATATTTGTAGGAACTGGTCTAGTAGACAAAGGACCTGTAGCTGAATTT
TTTGCAAATACAGCAGCTAGTAAAGCATCCATGCCATTTACAGCTCTTTTCTTTAGAGGGATTTTATGTA
ATATTCTAGTATGTGTATCAGTGTTGTGTTCGTTTAGAACTAATAGTGATACTGCAAAAATAATTATGAT
ATTCTTATGTTTATTTGCTTTTATAACATCAGGTTTTGAGCATAGTGTAGCAAATATGACAATTTATAGT
GTTTCATTATTTTCACCAACAATAAGTACAGTTACTATTGGAGGAGCTATTTATAATTTAGTAGCTGTAA
CACTTGGAAATATTGTTGGAGGAGCTTTATTTATGGGTCTTGGAACTTATATATTAGGTAAAGAAAAGCT
TAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2499992-2499021 anaerobic sulfite reductase subunit C [Clostridium difficile R20291]
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CTTCTTTAAGAGTTAGAGTACCTGGTGGTCTTATTGACCCTGAGAGTTTAGCTGTAGTTTCTAAAATTGC
AAGTGAGTACGGAAATGGACAGGTGCACATAACTACAAGACAGGGGTTTGAAATATTAGGAATAAATATG
GAAGATATGGAAGAAATAAATAAAATTATACAACCTGTTATTGAAAAAATGAATATAAATCAAAGTGAGA
AAAACGCAGGTTATCCAGCAGCAGGTACAAGAAATATAGCAGCTTGTATAGGAAATAAAGTCTGTCCAAA
GGCTCAATATAATACAACTGAATTTGCTAAAAGAATAGAAAAAGCTATATTTCCAAATGATTTACATTTT
AAAGTGGCTTTAACTGGTTGTCCAAATGATTGTATAAAAGCTAGAATGAATGACTTTGGAATTATTGGTA
TGGCTTTACCAATATATGAAAAAGATAGATGTGTAAATTGTGGAGCATGTGTAAAAAAATGTTCTAAAAT
ATCTGTTGGAGCATTAAAAACAGAAAATAATAAGGTGGTAAGAGATAAAGATAAGTGTATAGGATGTGGA
GAGTGTGTACTAAATTGCCCAACAAATGCATGGACTAGAGATGAGAAAAAATACTATAGATTAGCTATAA
TGGGTAGAACAGGAAAGAAAAACCCTAGACTAGCAGAAGATTTTCTTTTATGGGTAGATGAGGACAGCAT
AATAAAGATAATACTTAATACTTATAGATATGTAGAAAAGTATATAGATAAAGATGCACCAGGAGGAAAA
GAACATATAGGATATATAATTGATAGAACAGGATTTATGGAATTTAAAAAATGGGCACTTGAAGGTGTAG
AGCTTCCAGAAATAACTAAAATGTACGAAAACATATACTGGAGTGGAATTAAATATCTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2500796-2500005 anaerobic sulfite reductase subunit B [Clostridium difficile R20291]
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TTAGAGTAAACTGCAATACAAAAGGTGTATTGCCTGGAAAGTTTTATGAGATATCTATACCTAAATACGG
TGAAAGTCCAATATCAGTATCAGGATATGGAGAGGATTATATTGACTTTACAATAAGAAATGTAGGAAAA
GTAACTAGCGAGTTGTTTAATTATAAAGAAGGAGATTCTTTTTTTATAAGAGGTCCTTATGGAAATGGAT
TTGATGTATCCCTTTATGAAGGAAGAGAAATTGTAGTAGTGGCAGGAGGAAGTGCATTAGCCCCTGTAAG
AGGAATAGTTGAATATTTTTATAATAATAAAGAAAAATGCGAAAAGTTTAAATTAATAGTAGGATTTAAA
TCACCAAAAGATATTTTATTTGCAGATGATTTAAAGAGATGGAGTAAAAAACTTGATATTTTAGTTACTG
TAGATGGAGCAGAGGAAGGATATAGTGGTAATGTAGGATTAGTAACAAAATACATACCAGAATTGGATAT
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TTTTTAAAAAGAGATTTAGATGAAAAGAACATTTGGGTTTCTTATGAAAGAAAAATGTGTTGTGGAATAG
GTAAATGTGGACATTGTAAAATGGATGATACTTACATATGTTTAGATGGACCAGTATTTGATTATTCATA
TGCTAAAAATCTTATTGATTAG
>ref|NC_013316.1|:c2501804-2500797 anaerobic sulfite reductase subunit A [Clostridium difficile R20291]
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TTGCACCAGTTTTAATCCCATTTAAAGGTACTTTTTCAGATACTGATGTTATAAGATACAAGGAGGTAAA
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CAAGTATTGTTTTATTTTACTGAAAAAGAGTTTAAGGAAAGCGATTTAGACAACAAGAAAATTTTAATTT
TCTTAAGAGCTTGTGACATAAATGGTATAAAAAGACTTGATGAAATATATCTAAATAATGGTGAAGAAAA
AGATTATTTTTATAAAAATATCAGAGATAAAGTAAAGTTTGCACTTGTAGGGTGTAAGGAAAGTTTTAGA
AACTGTTTTTGTGTGAGCATGGATTCTAACAAAACTGATAATTATTCAATTGGATTAAATATAGAAGGAG
ATACACTGTACTTAGATATAAAGGATAGTGAATTTGAAGTATTTAATGGAGAAGCAACTGAATTTAATGT
TGATTATGTAACTGATAATTTAATATCTGTAGATGTGCCAGAGAATATTGATTCAAATGAAATTATAGGA
AATTCAATATGGGATGAATATGATACAAGATGTATAGGATGTGGTAGATGTAATTTTGTATGTCCAACAT
GTTCATGTTTTACAATGCAGGATATTTTCTATAAGGAAAACGAAAATGTAGGTGAGAGAAGAAGGGTTTG
GGCTTCTTGTCAAGTAGATGGATATACAGATATAGCAGGTGGAAATTCTTTTAGAAAAAAACAAGGTGAA
AGAATGAGATTTAAAACTATGCATAAAATACATGATTTTAAAAAAAGATTCGGATATCATATGTGTGTTG
GTTGTGGAAGATGTGATGATGCCTGTCCGCAATACATATCATTTTCAAAGTGTATAGAAAAAATAAATGA
TTTAGTAATTAGTAAGGAGGAAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2502898-2502194 cAMP-binding regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGAGATATTACATGTCTAAATTAAAAGATTATAATATTGATAAAGTAATAATTTTTAATAATTTAA
GTACTAAAACGAAGAATCAACTTAAAGAAAAAGCTAAACTAAAAAGATTACAAAAAAAAGAAATTTTATT
TTATGAAAAAGATAGCTTAGACAGTGTTTATATACTTTTAGAAGGAAAGGTATCTATTTTTAAGATAAGT
GAAAATGGAGAGAGAAAAGTAATTTTCATATTAAATAGTGGGGAAGTCATAAATGATATTACATTTGACT
CTTCTAAAAACTCCACTGTTGGCTGTGAAGCATTTGAAAATTCAATTGTAGCTTATTATAGTATTGAAGA
ATTTTTAGAAATTATGCAAAATGATTTTCAACTTACAAAGGATATTATTTCTTATATGGAAAGAAGAATA
AGACGTTTATATAGACAGTTGAAAAATTCTATATCCATAAAAGTAGATAAAAAACTTGCAGCAAAATTAT
ATAGGTTAAGTAGAGAATTTGGAGTTTGCTGTGGAGAATGGACTTTACTAAATGTAAATATTACAGTTAC
ATATTTAGCTGATATGCTTGGCTGTAAAAGGGAGACTGTTTCCAGAATGATAAAGGTATTGCAAAAAGAA
GAACTTATTAAGATTGATAATAAAGGTTTTTATGTTAAAGAAACTGAATTATCAAGGTATTTCAAAAATA
ATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2503794-2502946 RpiR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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ATATAAAAGAAAATATAGATGATGTATTTTATAAACCAATATCACAAATAGCTAAAGAGAGCAATATTGG
TGAAGCAACTATAACTAGGTTTGTAAAAAAAATGAATTTTAATGGATTACAGGATTTTAAAGTTACTTTA
GCACAAGAAATATCAACTATCAATAAAAAAAATATTATAAATAAAAATATACAAAATGATGAGCCAGCTT
TGGATACAGCAAAAAAACTTTTAAGTTCAAATGTAACCACTTTAGAGAACACAGTAGAGATAATCAATAG
TAAGGATGTACATGACTGTGCAAGGCTTATAATAAATGCAAAGAAAGTTTACTTCATAGGCATTGGATAT
TCTGGTATAATAGCACAGGATTCAAACTATAAATTTATGAGAATAGGCCTTAATTGTGTAAGTTTTGATA
GCAGTCATACGATGATAATGATGTCTTCCATAATGGAAGAAGGAGATTTAATAATTGCAATTTCACATTC
TGGTGAAACAGAAGAGATTATAAAAACTGTAAAGCTTGCAAGAGCCAATAATGCTAAAATTATATCAATT
ACTGAAAATAAAAATTCTGAATTAAAGGATATTTCAGATGTACACTTATCTTATGTATCAGGAGAAACAG
TACTGGAAACTGGTTCAATATCTTCTAAATTAGCACAATTTTTCATTATTGATTTAGTATATACACAGGT
AGTAAAAGAACTTTCTAATGAAGCTATTGAAAGGAAAATTAAAACTACAAATGCTATAAAATTGTTTAAA
AATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2504700-2503813 putative glucokinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATTACGTTTGTATAGATGTTGGAGGTACTTCAATAAAATATGGTTTTATTAGAGAAGATGGAT
TTATAATTGATAAATCAAGTCTTGATACTGAAGCAAAGGAAAAAGGTGGAGAAGGAATATTAGCCAAAAT
AAAAGATATAGTAAAAAAATATATAGAGGAAAATGAAATAAGTGGTATATGTATATCAACTGCAGGTATG
GTTGACCCAGTTGAAGGTAAAATACTATTTGCATTAGAAGAATTAATTCCAAATTATAAGGGTATGCAAT
TAAAAAAAGAAGTAGAAAAAGAGTTTAATATAAAATGTGAAGTTGAAAATGATGTTAATTGTGCTGGACT
TGGTGAAGTGTGGCTTGGCGCAGGTAGAGGTGCAACATCTTCTATATGTTTAACAATAGGTACTGGAATT
GGTGGATGTATTATAATAAACAATAAACTGATAAATGGGTTTAGTAATAGCGCTGGTGAAGTAGGATATA
TGAATATAAATGGAAGTTCTTTTCAAGAATTGGCATCTACTAGCAGTCTAATTAAAAAAGTAGCAAAAAT
AAAAAATTTGAATGAAAAGGACTTAAATGGAAAAATAATTTTTGATTTAGCAAAGAATAATGATGAAGAT
TGTTTAAAAGAACTCGATAATATGATAAAATCATTAGCAGTTGGAATCGCAAATATATGTTATGTAATAA
ATCCAGAAGTGGTAATTTTAGGTGGTGGGATTATGGCACAAGAAAAGTTCCTAAAACCAAAAATAGACAA
AGCATTAAAGGAGGTTCTTATAGAGAGAGTTTACAAAAACACTAATATAGAATTTGCAAAGAGACAAAAT
GATGCAGGAATGCTTGGAGCATTATATAATTTTTTAAACAAAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c2505561-2504758 hypothetical protein CDR20291_2136 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATATAGATGTATTCTTATTAATAGGACAAAGCAATGCTAGAGGATTGGGAAATCCAAAAGAGA
GCATCATTCCAAATGAAAATTGTTTTGAATATTTGAGTACTGATGAAATTATAAATATGAGATGTGAGCT
AGAGACTTCAGAAGGTGATGGTACTATAGCACCTGCATTTTCAAATGAATGGAATAAGCTTACTGGAAAT
AAAGTTTGTTTTATTCACAATGCAAAAGATGGTTCAAGAATAAAAAACTGGAATCATGATAATAACTGGT
TTCTAAATGACACTATAGAAAAATTTAATACAGGCTGTACTACCTTAAGTAAACATTATAATATAGAAAA
TAAATACGTTATTTGGATTCAAGGTGAAAGTGATGCAAAATATGGTAGTGATGCATTGTACTATAAAGAA
AGTCTAAAAAAAATTGCGTATAGGCTTAAAGAAGAATGTATGATTGATAAAATGTTTGTAAGTTTAACTG
GTTATTGGCTTGGAGAAGATGAATATTTTATTAGAACAAGACGAATTGCAGCAGCTCAAGAATCTGCTTG
TAATGAATGTGATATACTGTGTGTAGGAAGTAAAATTGCTATGCAATTTCATGACAGAGGATTAACTATT
GATGATGTTCATTACACTCAAGAAGGTCTTAATATGTTAGGAGAGGACTTATGTAAAAATATTTATAAGT
ATCATATAACCAAAGAAAAAAGTGTATTAAGTGATACTATAGACTTATCAGAAGCAAGGAAATATATCTG
TGAATTGGAAAAGATAAGTAAAAGATTTGTGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2506173-2505721 hypothetical protein CDR20291_2137 [Clostridium difficile R20291]
ATGATATTTGGAAATATAAATCATAGTAAGACATATTCAACATTGCATGAAGATTTACTTAGATGTTTTG
AATATGCTAAAGATAATTCATTAATAGATTATGAAAAAGGTACTTATACAATAGATGGTGATGATATTTT
TGTGAATATTGTAGAGTATAAAACTTGTGAAAAAGAAGATAGATTCTGGGAAGCTCATAAGAAGTATATA
GATGTTCATTTGATGCTTGATGGATGTGAACGAATAGATATAAATTTTATAGAAAATTTAGAACAAAAAA
TATATGAAGAAAAGGGCGATTTCTTGCCTCTTGATGGTAAAAATAATGGATACATGGAACTTAGAAAAGG
TGATTTTTTAGTTTGTTATCCAGAAGATGCTCATATGACAGGAATAAAAGTTTTAGAAAAAGAAAATATC
AAAAAAGCTATTTTTAAGGTTTTGGTTAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2507805-2506303 putative sodium:solute symporter [Clostridium difficile R20291]
ATGGTAGGATTTACTTGGATAGATTTTGCAATACTAGTGGTTTACTTATTGGCAGTTTTATTTGCAGGAT
TGTTATTTTCAAAAAAGGAAATGAAGGGAAAAGAGTTCTTCAAAGGTGATGGAACTATTCCGTGGTGGGT
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GGTGGTACTTGGATTTTGTGGTTTGCACAATTAGGTATGTTTATAGCAATACCTTTGACAATAAAATTTT
TCTTACCTCTGTATAGTAGGTTAGAAATAGATACAGCATATGAATACTTAGAAATGAGATACGAAAGTAA
AGGTCTTAGAGTACTTGGAGCTTTGATGTTTATAATATATCAAATAGGACGTATGTCTATCATAATGTAT
CTTCCATCAGTGGTTCTAGCTGGTCTTACAGGAATACCTGTAAATGTATTGATAGTAGTTATGGGTGTAA
TAGCAATAATTTATTCATATACAGGTGGATTAAAGGCTGTCTTGTGGACAGATTTTATACAAGGTATGGT
ATTAATAGTAGGTGTTACAGGGACATTGTTCTATTTAATAGCAAGTATAAATGGTGGTTTTGGAACAGTA
ATGGATACTCTTACAACTGGACACAAGTTCTTAGCAAGTAATGAAGTTATGTTTGATAAAAATATACTAT
CTACAAGTGCATTTATAATATTTATTGGAGCTGGTCTTAATACTTTTTCATCATATGTATCGAGTCAAGA
TATAGTTCAAAGATTTACTACAACAACTGATATAAAGCAACTTAATAAAATGACATATGGAAATGGTGTT
TTATCAATGGGACTTGCAACAGTATTTTATCTAATTGGAACTTGTTTATTTATATACTATACTCAAAACC
CAGATTTAGCTCAAACAGTTCAACAAGACCAAGTATTTGCATCATATATAGCTTATGAATTACCAGTGGG
TATAACAGGAATACTACTTGCAGCGATATATGCAGCTTCTCAATCAACTTTATCGACAGGGCTTAATTCA
GTTGCTACAAGTTGGACTTTAGATATACAAACTATCATAACAAAAGATATAAGTATGGAAAAGCAAACTA
AGATAGCACAATATATATCATTAGGTGTAGGTATACTTTCTATAGCTGTTGCAATAGTATTAGCAAATGG
AGAAATAAAGTCAGCATATGAATGGTTTAATAGTTTTATGGGGCTAGTACTAGGTGTTTTAGCAGGAATA
TTTGTACTTGGTGCATTTTGTAAAAAAGCGACTAAAATGGGAGCATATGTTGGATTCATAGTATCAGCAA
TTTTAGTTGTTTATTTAAAATACCGTATGCCAGAAGTAACTTCTTGGGCATATTCTCTAATAACAATCAC
GACTTCTGTAGTGGTAGGTACAATAGTTAGTGCAATAGAAGCTAAAGTTAAAGCAAAAGTATCTTTACCA
AAAGCTGAGACTACTGTTTATTATGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2508719-2507838 N-acetylneuraminate lyase [Clostridium difficile R20291]
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ATGAAAAAGGGTTAAGACAAATAATTAGACACAATATAGATGTTTGTAAAGTAGATGGTCTTTATGTAGG
AGGAAGTACAGGGGAAAACTTCATGCTTTCAACTGATGAAAAGAAAAGAATATTTGAAATAGCTAAAGAT
GAAGTGAAAGAAGAAATAAAATTAATAGCTCAAGTTGGTTCAGTTAATTTAAAAGAAGCTGTAGAACTTG
CTAAATTTACAACTGATTTAGGATATGATGCAATAAGTGCTGTTACACCTTTTTACTATAAATTTGATTT
TGAAGAAATAAAACACTATTATAATACAATAATAAATTCTGTAGATAATAGATTAATAATATACTCTATA
CCATTTTTAACTGGTGTTGATATGAGTTTAGACCAGTTTGGAGAATTATTTGAAAATGAAAAAATAATAG
GTGTTAAGTTTACAGCAGCAGATTTCTACTTATTAGAGAGAATGAGAAAAACATTCCCAAATAAATTAAT
ATTTGCAGGATTTGATGAAATGATGTTACCAGCTACAGTTTTAGGTGTAGATGGGGCAATTGGTTCTACA
TTCAATGTAAACGGTGTCAGAGCTAGACAAATATTCGAATTAACTAAGAATGAAAAAATATCAGAAGCAC
TTGAAGTACAACATGTGACTAATGATTTAATAACAGATATATTAGGAAATGGCTTATATCAAACAATTAA
ATTACTACTTGAAGAACAAGGTGTTGAGGCTGGATACTGTAGACAACCTATGAAAGAAGCAACTGATGAA
ATGAAATCAAGAGCAAAAGAAATATACAGAAAGTATTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2509460-2508789 putative N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase [Clostridium difficile R20291]
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CTTTTATAATGGGGAGAATGGCTAAGGCTGCTATGGAAGGTGGAGCTGTTGGAATTAGAGCTCAAGGAGT
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AGAAAACGGTGTTCTAGTAATGGCAGACATTTCAAATTATGATGAGGCTATCAAAGCACAAGAGTACGGT
GTAGATTGCGTTTCAACTACACTATCTGGATATACTCCATATACTAAAACATTAGAAGGTCCAGATTTTG
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TTAATAACAGAAAAATTTGTTAAAGCAATTGAAATTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2510224-2509733 hypothetical protein CDR20291_2141 [Clostridium difficile R20291]
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AATTTAAAGTTGAATTATATAAAGAAAAATCAAAATTAAATAGAGAGATTGATGATATTCAAGAAAAGAA
AGCAAAGATATTCTTGGAAATGGGAATACTGACATATCAAAAAATTAGAGAAGATTCTATTAATGATAAT
AGTTTTGATAAATTCTGTGATGAGTTACTAGAACTTGATAAGTTAATTTATGAAAAAAATATGGAAATTA
ATGAAATGGAAATGGCAGAAAGTAATGTAACTTGTGAGTGTGGTTATGTTGGAAATGTAAATGATAAATA
TTGTGCTGAATGTGGTAAAAAATTTGAATTGGAAAATGAATGTGATGATTTTATAATTTGTGGTTATTGT
GAAAGTGAGATAGATACAGAGGCTGAATTTTGTCCATGCTGTGGAAGAAAAATTATAATGGATTTAGAAT
AA
>ref|NC_013316.1|:c2511610-2510246 hypothetical protein CDR20291_2142 [Clostridium difficile R20291]
ATGGGTGAAAAGAAAATAAATAATATGAATTATTCACATAATAATTATTCCAAAAAGACAGGTGAACCAA
CTAGAAAAATAAAAAATAGCCATATCACTCTTAAAAGTAAAGAAGAAAAAATTTGTTCTAGTTGCAATAA
AGAAAATAATACTAAGGATAATTACTGTAAATTTTGTGGAAATGAACTTTATGAAATAGCATCATTAAGA
CCACTTGAAACAAAACTAGACTTGAAATCTAAAATAAAAGAGCTTTCATATCATGCAAATAAAAGAGGTG
TATTTTTAACAACATTTACAACCATATTTATATTGTTTATTATTGCATTGATATTTAAAGCTATTATAAC
TATTCAATTTAATGATATTAGTTATTTAATAAATCCAGCACATATAATCCTAGCTCTCAACTTGGGTCAA
ATTAGTGTATCTATGTCTACCATGATGGGTTCTGGGTTTATAAATGCCAATATAGGTTTGTTGATATTAC
TTATAATCCCTATTTTGGTATTATTAATATCAAACCTAATTTTTATGAGAAAAAGATGTAGAGATTCAAA
AACTGTATTAGCAAATTCTCTAGGAGTTGGAATTTTTTATGGATTAGTTTTAGCTATTTTATCTATTTTT
ACTAATGTAAAAACTAGTTCACATAGTATGTTAGAATATGGATATGCATTAGAATATAGTTATGAATTTT
TTAGTGTTCTTTTAAATGGATTTGTATTAGGGTTTATATGTACATACATAACTACTTATAAAAAAAGTTA
TGAAAAGGAAAATATGTATTTATCTCTTTTTTCAAATTCTATAAGAACATTCATATTAGGTTATGTTTTA
GTATTAGTAATACTATTGGTACTAACTATATCTGATAGTAGTTACTTAAATGAACTAGATATGAGTAGTT
ATTCAAATGGATTAAATTTATTTACTATACTCCCACAAATAGCTAGTTATATGTGGGCTTTTGCAAATGG
AATTTCAGTAACCATAATAAACTCAACAGTATCAATGTTTACTTTAAGTTCTTCATCTTTATTTGGAGAT
ACTAAATTAATGTTTTATGCAATGGGAGCATTGTCTATGTTAATATTATTATTAAATGGATACAAGCTAA
GATTTAAGTATAATACAGATAGTATAAGACCTATAATAGTATTTAGTATATATTATGCATTTTTGATGGG
AATATTGGCTTTATTTAGTACATTTATACTAGATAGTAATATTAATTTCTTTAATACAACTAATTATGGA
ACAACTTTAATAATGCAATTTAAAGTCTTACAAGCTATTGTAATTTCATTTGTATATAGTTTTGTGATAT
CTTTAATAGGATATAAGCTAAATTCAGCTGATTAA
>ref|NC_013316.1|:2511978-2513204 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGAAAGGAATACTTATTTTTATGCTTTATTTTTAATGGAGGCTTATATGAACTTAGAAAAAATAA
AAAAATTTTTTGGATTTCCTCTAGACAAAAAACACAAAGAAAATGTTGAAAAAGAACTCTGCAATTATCT
TTATCATACGGGTAAAATCATTTGCATAATAATAGTAATATCTCAAATAATTATGATGATATCAATCTCA
GCTAGAGAAGGAGGCCCTTTTGCCACACCAAGACGCCAATGGTATTTTTATATGTATGTAACACTATTTT
GTGTATCTTCTGTCTTTATGTTTGTATTTTCTTATCTTTGGAATAAAAAAAAGGATTGTTGTACGTTTTA
TATAAATTTATGGATAATTTATGTGACTTTTTTCTGCCTATGGGGTTGTGTAATTACTCTACTTGACCAG
TTAGGTGGAAATGACCTAAGTGTATTTAGTTATATTATGTTAGCAGCTGCAGCTTTCTCAGTATTAAAAT
TTGGAGAATCAGTAATAGTTTTTGGAGGATGCTTTTTGTTTCTTAATTTATTCTTACCTGGGATTCAAAC
TATACCAGGCAATGAGTTTAGTAATATTGTCAACACATTTTTTATAACATCCCTTGCCATTTTTGTTTCT
ACAATGCTATATAGAAATCGTGTATTTACTTACTATGATAAACTTTTAATTAGTCAACAATATGAAGAAA
TATCTCATATAAATAATTTACTTAACGACAAAGTTATGACAGACGACCTTACTAAAATGAACAACCGTAG
ATACCTTGAAGATATTCTACAAAAAAAATTAATCAGCCATGCAAATCAAGAACCTATAACTGGAATGATG
ATAGATATAGATTATTTCAAACAATTTAATGATAATTATGGACATCAAAAGGGAGACTATTGTCTACAAA
ATATTGCCAAAGTAATTTTAGATTTTACAAGTTCTGAAAATGAACATGCTATACGATATGGTGGTGAGGA
ATTTTTTATATGTATTTTTAACTGTGATGAGACAGATGCTAAACTTAAATCAGAATGTTTACGAAAAATT
ATAGAGTCCTGCAATTTTGAGCGTGATGATGTTCCTTTAAAATGTGTAACTGTTAGTATTGGAGTTTATA
CAAAGAAAATTGAAAAGGCAATAACATTAAATGAGTTTATAAGTAATTGTGATAAGGCTCTATATACTGC
AAAAGAACAGGGACGTAATTGTGTTGCATTTTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2514774-2513377 asparaginyl-tRNA synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAAAGGAATTTATAACAGTAAAAGAATTGTACAGAGAAAAAGAACAGTACATAGGGAAGACTGTAA
AAGTAGCTGGATGGATAAGAACATCTAGAGTATCTAAAAATTTTGGATTTATAGAGCTAAATGATGGAAG
CTTCTTTAAAAATATGCAGATAGTATTTGATGAGAAAGTAGAAAATTTTAAAGAGGTAGGAAAATTAGCA
ATAAGCTCATCTATACTTGTAGAGGGAGAGTTAGTATCTACAGAAGGGGCTAAACAACCAGTCGAAATAC
ATGCAAAAAGCATAGTTGTAGAAGGGGAATCAGATAGTTCGTATCCACTACAAAAGAAGAGACATACGCT
TGAATATTTAAGAACGATAGCACATTTAAGACCAAGAAGTAATACTTTTTCAGCTGTATTTAGAGTAAGA
TCAATAGCTGCCTATGCAATACACAAATTCTTCCAAGAAAGAAACTTTGTATATGCACATTCTCCAATCA
TAACGGGTAGTGACTGTGAAGGTGCAGGAGAAATGTTTAGAATAACAACTATGGATTTAAATGATATTCC
AAAAACTGAAGATGGTAAAATAGACTATACTCAAGATTTCTTTGGAAAAGAGGCTAATTTAACAGTTAGT
GGTCAACTAAATGCCGAGATAATGGCACTTTCTTTTAGAAACGTTTATACTTTTGGACCTACATTTAGAG
CTGAAAACTCTTATACAGGAAGACATGCTTCAGAATTTTGGATGATAGAGCCAGAAATAGTTTTTGCAGA
CCTTGAAGATAACATGGAACTTGCAGAAGATATGATAAAATATGTTATAAGCTATGTATTAGAAAATGCT
CCTGAAGAAATGGAATTTTTTAATAGTTTTATAGATAAAGGATTGTTAGAAAGATTAAATAAGATAGTAA
ACTCTGAGTTTATTAGAATAACGTATACTAAAGCAGTGGAATTATTAATTGAATCTGGTCATGAATTTGA
GTATCCTGTTGAGTGGGGATGTGACCTTCAAACTGAGCATGAAAGATATATAACGGAGCAAATATATAAT
TGTCCAGTGTTTGTTACAGATTATCCAAAAGATATAAAAGCTTTCTATATGAGAATGAATGAAGACGGTA
AAACTGTTAGAGCAATGGATTTATTAGTTCCTGGAGTTGGAGAAATCGTAGGAGGTTCTCAAAGAGAAGA
AAGAGAAGATGTATTGTTAGATAGAATTAATGAAATGGGATTAAGAGAAGAAGATTATTGGTGGTATTTA
GAACTTAGAAAGTTTGGTACTGCTACTCACTCTGGATTTGGTCTTGGATTTGAAAGAATAATTATGTATA
TGACAGGTATGTCTAACATAAGAGACGTTATACCTTTCCCAAGAACTCCTAAAAATGCTGAATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2515456-2515253 hypothetical protein CDR20291_2145 [Clostridium difficile R20291]
GTGATAGTTTTGGAAAGTAAAAAGGCAAGAGCATTAAAAGGTAAAGATAATAAAAGACTTAAAAGTTCAC
TTTTAGTTGGAAATGAGTCGACAGCAGCATGGGCTGATGTTGAAAAATTAAAACCTCATAGTAAAGTTTC
AATACCTTCAATTAAGGGTGTCGAAGAAGCAAAAGACTGGGTTGACAATGGAAGTAAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2517394-2515721 putative germination-specific protease [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAATCTTATTGTATAATTTATCAAGGTGATATAGAATCTGCCCTACAAGAAAATGGAATAAATA
GGTATATGGTTTTAAATAGTCAGCTTGCAGTAATATATGTACCTGTAGATTTTGATGAAACTATTTTAAA
TAATATAATACAAGTTGCTTGGTGGGAAGAATCTGAACCAATGAGCAGTCTAATTGAAATAACTAATAAT
GTAAATAATGGAGAAACCATTACAACAGCAGCTGAAACTGATTATATTTATGAAAATCCATATAATGATA
TAACAGGAAGAGGAATTTTATTAGCAGTTATAGATTCTGGTATAGATTATTTGCATCCTGATTTTATAAA
TGATGATGGAACTAGTAAAGTTCTATATTTATGGGACCAAGAAGCAAATACAAATCCACCTCCAGAAGGT
TTTATTTTTGGAAGTGAATTTACAAGAAGTCAGTTAAATATAGCCATAAATAGAAATGATGGAAGTTTGA
GTCAAGATAATATAGGTACTGGAACTTTAGTTTCTGGTATATTAGCTGGAAATGGAAGGATAAATTCGCA
GTATAGAGGTATTACTACAGAATCAGACTTAATAGTAGTTAAATTAAAATCATATACAGATACTTATTAT
GCTGGAAGGATAAATTATAGTGTTTCAGATTTTTTAGCAGCTATAACGTATGTTACTAATATAGCAAGAA
CAGAAAATAAACCACTAATAATAAATTTGACTATTGGAGTTAAGTCAAGTGCTGTAGCAACTACTTCAAT
ATTAGATACTTTTAATATATTGAGTAGTGCTGGTGTGGTAGTAGTGAGTGGTGCAGGAAATCAAGGGAAT
ACAGATATTCATTATTCTGGCAGATTTAGCAGTGTGGGAGAAGTTCAAGATGTAATAATACAAGATGGAG
ATGACTATGCTCTTGATATAACACTAAATACGAATGGTCCAGATAAAGTGGGAGCACAGATAATATCTCC
TTCAGGTGAAGTTAGTCATGATATAAGGTATTCTCCAGACTTTTATATATATAGAGGAAAATTTAACTTA
GAAAATACTACTTATGCAATGAGATTTATTTATCCATATATTACCTCTGGAAAAGAAAATTTGGAGATAA
GATTAAGAGATATAAAACCTGGAGTATGGATTTTAAGATTGACTTCAGAACTTATAATAAGTGGAGAATA
TGACATATACTTACCAAATAAAAATTTGATAGCTCCAGACACAAGGTTTTTAGACCCTGATTCAGTAGCT
ACTATAACTATGTATGCTGCTAGTGATGATGTAATTACAGTTGGTACATTTAATAATAAGACTGATAGTA
TGTGGATTGGTTCTTCGAAAGGACCAATTAGAGGAAGAGGAATTAAGCCAGATATAGTAGCTTCAGGTGT
AGATATAATATCCACATATAAAAATGGAACATATAATACAGGAACAGGAACAGGAGTGAGCAGTTCTATA
GTCACAGGTGTTTTAGCCTTATTGATGGAATACTTAGAAAAACAGGATAATGTACCGAGATTATCATTGT
TTACACAAGTTTTAAAAACATATTTAATATTGGGTGCTACAAAACTTGAGATATATACATATCCAAATGT
ATCGCAGGGATATGGGATTTTAAATTTAAAAAATACGATTCAACAGATAGCAAATACTCTATAG
>ref|NC_013316.1|:c2520802-2517404 putative germination-specific protease [Clostridium difficile R20291]
GTGATTATAATAAATTATGAATTAATTGTAAAATACAATGGAGATATATTGAGATTAGAAGAAGAATTAG
GTGTATCAGTAGAGATACTTAATTCATCATATGCAATAATAACATCAAGTAATGAAGAAGATGTAAATAC
ACTTTTAACTTATCCAGAAATTGAATTTATAGAAAAGCCTTTTATATTACAGACTCAGGATGTGCAAAGT
TTTTCAAGTACAGGAATAACGGGGTTTAAAAATAGAACTGGTTTAACTGGAAAGGGAACTATAATTGGTA
TAATTGATTCGGGAATAGATTATACTCTACCTGTGTTTAGAGATAGTGATGGGAGGTCTAAGATATTATA
TTATTGGGACCAATCTATTCAAGGAAATCCACCAGAAGGTTTTAGAGAAGGAACATTATATACTAATGAA
GATATAAATAATGCAATAGATGGAAGTATGTATATACCTATTTCAACAACTAGTTTACATGGGACACATG
TTGCAGGTATTTGTGCAACTATTGCAAGTGATGCCAGAATAATAGTGGTTAGAGTTGGAAATATACAGAC
CGATATTTTTTCGAGAAGTACAGAGTTTATGAGGGCAATTAAATTTATTTTAGATAGGGCATTAGAATTA
AGAATGCCTGTTACATTAAATATAAGTTATGGAAGTAATGAAGGTTCACATAGAGGAACATCTTTATTTG
AACAATATATAGATGATATGTGTTTATTTTGGAAAAACAATATAGTTGTAGCAGCTGGAAATAATGCAGA
TAAAGGAGGTCATAAAAGGATTAGGCTTCAAAATAATATTACAGAAGAAGTTGAGTTTATAGTTGGGGAA
GGAGAGCGTATATTAAACATAAATATATGGCCAGATTTTGTTGATGATTTTAGTGTACATTTGGTAAACC
CATCAAACAATCAAACACAAGCAATCTCTCTAACTTCAGGTGAGATAAGAAATACTTTGGGTGAAACTAG
AATAACTGGTTATTTTTACCCTATAGCACCGTACTCTCTTACAAGAAGAGTTACTCTACAATTAAGTTCA
AATACACAGATAACTCCTGGGTTATGGAAAATTGTATTTGAACCAATAGATATAGTAACTGGTAATGTAA
ATATATATTTGCCAACTTCTGAAGGACTAAATAGAAATACTAGATTTCTGATTCCTACTCAAGAGCTTAC
TGTAACAGTTCCTGGAACAGCAAGTAGAGTTGTAACAGTAGGTAGTTTTAATTCAAGAACAGACATAGTA
TCTATATTTTCTGGTGAAGGAGATACACAATTAGGTGTTTTTAAACCTGATTTATTAGCTCCAGGTGAAG
ATATAATATCTTTTTTACCAGGAGGTACAAGTGGAGCATTAACTGGAACTAGCATGGCTACACCTCATGT
TACAGGGGTTTGTTCATTGTTTATGGAATGGGGAATTGTAAATGGAAATGATTTATTTTTGTATTCACAG
AAATTAAGGGCATTACTTTTAAAGGGAGCAAGGAGATTAAGTAATCAATCTTATCCAAATAATTCATCAG
GATTTGGTTTTTTAAATTTATCAGATATAGATTTGTACACTCTATCTAGTATAAATCAAGATTTAGAAAC
GGAGGATATTGGATATAGAAGTATTAATAAGTCATTTAAAGATGAGGAAAATAGGTATAAGTTTATAGAT
GGTTATAATATACAAATACATAATGACTTAGAGAATGAAATTTATATAAGTAAAAATGCAAGTAGACAAT
CAGGAATACTATCAGGAATAGATGTAGTCCATACTCCCGAATTTGAAGAAGAACTAGCTGGGTTAGGTAT
GAGTCAAAATTTTTTTAAGATAAGTGATTCATTAGGTGTACTATCTATAAATAATACAGACTATAGTAGT
ATACAACGAGTTTTGCAACTTCCTTCAATCATAAGAACTGTATCGACTACAAAGATGACATTACTTGGAG
AAATTAATCGAGGTACTTTTGGAGGTGTAGTTGCAACAGAAGAAATGGGCGTAAATTTCTTTAAAAATAA
TCCTAATATTAATATAACAGGAAGAGGGACTCTAATATCAATTGCAGATACAGGAATAGACTATCTACAT
CCAGATTTTATTTATCCAGATGGTACTTCAAAAATAGTATATTTATGGGACCAAACAAAAGAAGGAACTC
CACCTGATGGTTTTTATATTGGGACAGAATATACACGAGAAGATATAAATCGAGCTATCGCAGAAAATGA
CCCTAGTCTATCTCAGGATGAAGTTGGTCAAGGAACTATGTTGAGTGGTATATGCTCAGGGCTTGGAAAT
GTAAATAGTGAATATGCAGGTATAGCAGAAGATTCTGAGCTAATAATAATAAAACTCGGTAAGATAGATG
GTTTTTATAATAGTGCAATGTTGTTTGCTGCATCTCAGTATGCATATAAAAAAGCTTTTGAACTTAGAAG
ACCACTAGTTATAAATATGTCTTTAGGTACCAGTAGCTTGGCAGGTTTAACCAATAGGAGCAATAGTGAA
AAAGCATTCTTTACTAGAGGGTTATGTATAACAGCAGGAGCAGGAAATGAGGGCAATACACAGACACATA
CATCTGGAATAATACCACATGTTGGAGGTTCTGTTGAAGTTGAATTAGAGTTAAATGAAGACGAGGAAGA
ATTATCATTAGAACTTTGGTTAAATAGACCAGATAAAGCTGATGTAATAATAGTATCTCCCACTGGTGAA
GAAAGTAAAAGTGTTGGAATTTCAAATTATAATAAAGTAACAGGTTTATTTGATTTAGAGGGGACTGAAT
ATTCTATAACGTATATATACCCAACAACTTTTTCTGGGCAGCAATTTACTAATGTTACTTTAAAGAATGC
AAAAAGAGGTGTATGGAAGATTCGATTAGTAGGGGTTTATATTATAACAGGAAGATATAACTTATACCTT
CCAAATAGAGAACTTTTAAAAAGTGGAACTAGATTTAGAGAGGTAGACCCTTTTTACACTATAAATTATC
CTGCTATTCAAGATGATTTAATAACTGTAGGAGCCTACAATACTATTAATGGTAGTTTATGGCAAAGTTC
ATCAAGAGGACCAACTATTGAAGACAGGTTAAAACCAGATATAGTAGCACCAGGTGTCAATATAATAGCT
GCTTATCCTGGGAACACGTATGCAACTATAACTGGTACAGCAGCAGCAAGTGCACATGCAGCTGGTGCTG
CTGCAATGTATTTCCAATATACTTTTGTTGATGGTAGATATCCAAACCAAGCATATGTGCAAAAAATAAA
AACTTTTATGCAAGCTGGTGCTAGAAAAGATTCAAACACAGTATATCCAAATACAAATTCTGGATATGGG
CTTTTGGATGTTAGAGGAATGTTTGATGTTTTAAGATAG
>ref|NC_013316.1|:c2522164-2520968 hypothetical protein CDR20291_2148 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTATTGAATTTTTTTATTTATTGAGGTCAAGAGGATTAAATATATCTTTAAATGAATGGATGACTT
TAATTGAAGCATTGGATAAAGGGCTGTGCTATTCAAACTTTTCAAATTTTTACTATCTTTGCAGGATGAT
TTTAATAAAAAGTGAAAGTGATTTTGATAAGTTTGATGCAGTGTTTTTGGAGTATTTTAAAGGTATAGAA
CACCAAGAAGAAATTCCAGAAGAGATTATGAATTGGCTTAAAAAACCAGATATAGATTTAGAAGAGTTTG
AAAGATTGGAACAAAATCCAAATATAAATCTTGATAAATTAAGAGCTAAATTGGAGGAACGAATAAAAGA
ACAAGACTCTCCTCATAATGGTGGTAATTATTGGATAGGCACAGGAGGCACTTCCGAGTTAGGACATTCA
GGAAAAGGGCAAACTGGTATACGTATAGGTGGAAATTCTACTTATGGTAGAGCTGTTCTTGAAGTTGCAG
GAGAAAGAAAATACAGAGATTTTAGAGATGATGAAGTTTTAAATATGCGTCAATTTCAAGTTGCACTAAA
GAGACTTCGTCAATTTTCTACTAGAATAGATGCTCCAAAGACAGAGCTTGATTTGGATAAGACTATTGAA
GAGACTTGTAATAATGCAGGATATTTAAAGTTATTTTTTGAGAAGCCAAGAAAAAATACAGTGAAGCTTT
TATTGCTTATGGATTCAGGTGGTTCAATGAGGGGGTATAGCACTTTATGTAATACATTATTTCAGTCTGT
AAGTAAATCAAATCATTTTAAAGATGTAAAGATATATTATTTCCATAACTGTATTTATGATAGATTATTT
ACAACACCTGAATGTTGGTTAAGTAAATCTATTAATACTGAATGGATATTAAAAAATATAGATAAAAACT
ATAAAGTTATAATTGTTGGAGATGCTTCTATGTCGCCTTCTGAGTTACTTCATATTGGTGGTAACTATCG
TGGTCCATATAATTACACACCTGGTATAGAATGGCTTAAAAGGTTTAAGAGAAAGTACAGTAAAATTGTA
TGGATGAATCCAGAACTTAGAGATGGATGGGATTCAATTAATTATTGGTACCAAACTCAAAGAATGATAC
AAAGTGAATTTAATATGTTTCCACTGACTGTAAAAGGTCTTGAAAAAGCATTGAAAAATTTAATGCTTTC
AAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2523006-2522185 putative ATPase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAAAAAAGAGATATCTAACTTTAGAGGAAGTAGTGATTATGTAGTATCACCAGAATTGATGGCAT
CAGTTAATGTTGCTATTGCTCTTGAAAAGCCACTTTTGATTAAGGGCGAACCTGGAACAGGTAAAACTAT
GCTAGCACAAGCAATTTCAAATGAATTAAAAAAAGATTTAGTAATTTGGAATATAAAATCAACTACAAAA
GCACAAGAAGGGCTTTATGTATATGATACTGTTCAAAGACTTTATGATAGCCAATTTGGAGGAGAAGGTG
TAGATGATATTAGCAAGTACATAAAATATGGTAAACTAGGAGAGGCCTTTAGCTCAAATCAACAAGTAAT
TCTTTTAATAGATGAAATAGATAAGGCGGATTTAGAATTTCCAAATGACTTGCTTTGGGAATTGGATAAA
ATGGAGTTTTACATAAATGAGACAAAAGAAACTGTAAGAGCTAAACAAAGACCAATAGTTATTATAACTT
CAAATGCGGAAAAAGAACTTCCAGATGCTTTTTTAAGAAGATGTATATTTCATTATATAGAATTTCCTGA
TAGAGACATGATGGAAGAAATAGTTAAAGTACATTTTGATAAAGTAGAAGAACACCTATTGGAACAAGTA
ATGACTACTTTTTATTGGATTAGAAGTTTAAAGGACATACAAAAAAAGCCTAGTACATCAGAGTTAATAG
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AATACTACTTAAGAATAATGAGGATATTGAATCTATGCAAAGACACTTATAG
>ref|NC_013316.1|:2523470-2524564 hypothetical protein CDR20291_2150 [Clostridium difficile R20291]
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TTGATAATTACAAATATTTTTTTGGAGTGATAAGTTTATTAATGTCACTACTAACACCATTTATAATAGC
ATTTGTATTAGCATATATATTCAACCCACTAGTAAAGTTCTTAGAAAGTAAATTAAATTTTAAGAGAATA
TATTCGTTACTTCTTACTTATGGTGTACTCATAGTTATACTAATTTCCTTTATATTATTTACAGTTCCAT
CCATAGTAAATAGTTTAGCTGATTTAGTTGCTCAAATTCCTACATACATAGATAAAACAGAGCAGTTCTT
ATTCGACTTAGGTAAGAGTTTACAATCAGTTGACCCTAATACATTAAAAGAGTATGGTGACAAAATTATG
AGTGTAATGCCTAAATTTAGTAACTTGCTTATTGGTTCACTTGGTGGGATATTTAGCACTACATTTTCAG
TTGGAAAATTTATAGTACAATTTCTTTTAGGTTTTATAATTTGTTTCTATATATTATTAGAAAAAGAAAA
ATTCTTACTGTTTACAAAAAAAGTAGTTTATATTTCCCTAGGTAAAAAATATGGAGACTTTATAATAGAA
CTATGTCAAAGCTTAAATTTAAATATTGGTAAATACTTTACAGGTAAGATTTTAGATTCTTTTATAGTTG
GAGTACTTTCTGGAATTGGTCTTTACTTTTTAAAATCTGAATATGCACTATTATTTGGTACACTTATGGG
TGTCATGAATATGGTTCCATATTTTGGTCCAGTAATAGGTATGGCACCAGTTGTAATAATTAATTTATTC
TCCAATCCAACAATTGCTTTAACTTCTTTAATTTACTTAATAATAATTCAACAAGTTGAAGTTACATTTA
TAGAGCCAAAAATCGTAGGTGGACAACTAGGTCTTAGCCCATTCTTTACAATCCTAGCAGTTACTGTTGG
TGGAGGATTCTTTGGTATACCTGGTATGATTCTATCTGCTCCTGTGATGGGCGTTATAAAGATATACTTC
TGTGAGTTTGTAAATCGTAGACATGATAAAATACAAATGGAATAA
>ref|NC_013316.1|:2524715-2525071 hypothetical protein CDR20291_2151 [Clostridium difficile R20291]
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CTTATGCAGATTCTCAAAAGAATGTTCCTGTAAGCCAAAATACTAAATTGACTCAAGAACAAGCTAAAGA
ACTTTTAGTAAAATACAACAATGAAGTTGATTACATATATCAAGGAAATGCTAGTGATTTTGAAGCATTA
AAAGCTAAAAATCTTAATGGTTATGTATTTTTACCAGATGCAGATGGTGATATTGGTTACTTTGTAAATG
AAAATACTTCTGAGATATATTACTTCCACCCAAGTGGATATCTTGAATTAGTTAATCAACAACAAAATAA
TAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2526432-2525164 L-lysine 2,3-aminomutase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGAACAAACTAGAATATCCTTAGAGAGAGCTGCTGAATTAAAATCAAAAATTGATGATTATATTC
AGGCTAGAAAAACGATTAACAGAGGTCTTGAAAAAGAAGAAGAGATAAATAAACGAAAACAGAAAATATT
AAGTATCTTAAATGGAACTGAAGAGGATTGGAATAACTACAAATGGCAATTATCAAATAGAATAACAGAT
GTAGATACTTTATCAAAAATTATAACTCTAACTAAAAAAGAAAAAGAATATATAAAAGAGGTTGGTACTC
AATTTAGATGGGCAATATCTCCATATTATTTGAGTCTTATAGACCCAGAAGATATATGTGACCCAATAAA
ATTACTGTCTATACCAACACATATAGAGTTGGAAGATGAGCAAGAAGATTTGGACCCAATGGGAGAAGAG
TATACAAACCCAGCAGGATGTATAACTAGAAGATACCCAGATAGATTAATAATAAATGTAACAAATGAGT
GTGCTATGTATTGTAGACACTGTCAGAGAAGAAGAAATATTGGACAACAAGATTCTCATAAGTCAAAAGC
TATTATCCAAGAATCTATAGACTATATCAGAGAAAATGAAGAAATAAGAGATGTACTAGTAACTGGTGGA
GATGCTCTTACATTAAAAGATGATTATTTAGAGTGGATTCTTAGCCAACTTAAAGAGATACCACATGTTG
ATTATGTTAGATTAGGTACTAGGACTCTTGTTACAATGCCACAAAGAATTACAGATGAATTTTGCAATAT
GCTAAAAAAATATCACCCTGTATATATAAATACTCATTTTAATCATCCAATGGAAATAACTAAGGAATCT
AAAGAAGCTTGTGAAAAGTTAGCAAATGCAGGAGTTCCATTAGGAAATCAGGCAGTATTATTAAATGGAA
TAAATAATGATAAATTTGTAATGAGATGTTTAAATCAAGAATTACTAAAAATAAGAGTAAAACCTTATTA
TATATTCCAAAGTAAACATGTAAAGGGAACAAAACATTTCAATACATCAGTAGATGATGGTCTTGAAATC
ATGGAGTATTTAAGAGGATATACATCAGGAATGGCTATACCAACATATATAGTAAATGCGCCAAAAGGAG
GAGGAAAGACTCCTTTGCTTCCGCAATACCTTGTATCAAAAGGAACAGATTACGTTATGCTTAGAACATG
GGAAGGAAAAGTTATAAAAATGGAAGATGAACCTGCTGTAGATATAAAGAAACTTATAAAAGAGCAAGCA
CAGGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2528216-2526834 GntR-family transcriptioanl regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGCCAATAAATTCTTTTGAAAACTATCCTATGACATGGAAACCAAAATTAGATAACCGAAAACCACCAA
TATATAAAACTTTAGCAATGTTATTAGAAGAAGATATTAAAAGAGGAAATTTAAATCCTGGAGATAAACT
GCCTCCACAACGGGAATTAGCAGATTTTCTAGATTTAAACTTAAGTACAATAACACGAGCATTTAAACTT
TGCGAAGAAAAGGGACTAATATGTGCAAAAGTGGGAAAGGGAACATTCATTTCTTCTGATGTAAATGTAA
GTAATACATTATTATATCAAACGGAATCAAAAGACATAATTGAATTAGGGACAGTTCATCCTCCATATGA
GCAAAATACATATATTATTGACTTTATTAAAAATGTACTAAAACAACCAGAAATGGATAGGTTTTTACAA
TACATGTCTCCATCTGGCACATATATGCAAAAAAAGTCAATTGCAAAATGGATAGAAAGAAATAATGTAT
ACACCAGTGAAGAAAATATATTATTATCTACAGGAGGGCAAAATGCTATATGTGCAACTTTACTAGGATT
ATTTAAAGCTGGTGATAGAATTGCTACAGATTCTTTAAGTTTTTCTGGAATTAAGTCAATAGCTAAAATG
ATAGGTATTCAATTAGTCCCAATTCCTCAAGAAAATAATGAAATATCGATTGAATATCTTGAAAGTTATT
GTAAAAATGAAAATATAAAAGGCATATATCTTATACCAGATTATCATAATCCAACGACACATACTATGTC
TGATTTATCTCGTAAAAAGATAGCCAAGATAGCAAAGCAATATAATATAATAATTATTGAAGATGCTATA
AATAGCATTTTTAGAGACGGTATACAAACTCCCATATTTTCTTTAGCTAGTGATAATACTATATATATTT
TTAGTACATCTAAATTTTTATGTGCTGGTCTTAGAGTAGCATTTGTAGTTGCTCCAAAACGATATATAGA
AAATTTAGAAAATGCACTATATAATATGAATCTAATGGTTTCTCCATTTACAGCAGAAATAGTACATCGT
TTATTATATTCTCCTATTATAGATAAAATTATAGAAGAGAAAAGAGATGCAATTATAGAAAGAAATGAAG
TTGCTGATAAAGTTTTGTCAGATTATAATTTGATTGGTGATAAGAATTGCAGTTTTCGTTGGTTACTTCT
TCCTGATGAATTGGATGGAAAATCATTTGAAATTTCTGCAAAAAATCTAGGAGTTCAAGTATATTGTGCT
GAACGATTTTCAGTAGGAAACTCTACAGTTCCAAAAGCAGTTCGTATTTGTGTAACAGCTCCAAAAGATG
TAGAAGAATTAGAAAAAGGGCTTAATATAATAAAGTCACTTCTTAAGAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:2528341-2529027 putative amino acid recemase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGACTATAGGCTTAATTGGTGGTATGAGTTGGGAAAGTACCATTACATATTATCAAGTTATTAATA
CAGTAATAAAAGAAAGATTAGGTGGACTACACTCTTCTAAATGTATACTTTACAGTGTAGATTTTCAAGA
AATTGAAGAATGCCAATCTAGTGGAAATTGGGAAAAAAGCGCCAAAATTTTAGCTGATGCTGCAATTAAA
TTACAAGAGGCAGGGGCAGATTTTATTGTTATCTGTACTAATACTATGCATAAGGTATCAGATAAAATAC
AAGAAAGTATACATATTCCATTACTTCACATAGCAGATGTAACTGCTACAGTATTAAGGGAAAAAGAAAT
AAAAAAAGTGGCCTTATTAGGTACTAAATATACAATGGAACAAGATTTTTATAAAAATGTAATTATTAAT
AATGGAATTGAAGTCTTAATTCCAAATGAAGAAGACCGTATAATAGTAAATGACACAATATTTAACGAAC
TTTGCTTAGGAATTATATCTGAATCTTCAAAAAAAGCTTTCTTATCTATTATAGATAAGCTTGGCAAACA
AGGTGCAGAGGGTGTTATATTAGGATGTACAGAAATAGGTCTTTTAATTAAACAAAATGACACTTCTATT
CCACTATTTGATACGACAGTAATACATGCAATAGAAGCCGCACTAAGTTCAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2530748-2529213 hypothetical protein CDR20291_2155 [Clostridium difficile R20291]
ATGATATTTGTAAAAAATAAGAAATACAGAAAAATTGCCATAATTATATCTATTCCTATATTGCTTGTTG
CGCAGTACTACCTTTTTAAATTTGGAATACTTAGACCAATGGTAAAGGGAGTAGAAATTGAAATTGTAGA
TGGGGAATATGTTAAAGATATAGATAAATATGTAGTAAAATTAAATGAAACAGTTACTTTGTCTACAGGT
GAATATATTAAGGTTCCTTCGTATGCTAAAAATCCAAATATTTGGTTTAATGTATTGGATAACTCAGGGA
CTTTAAAAATAGATGGAAATAAAATGACAGCATTAAAGGTTGGGTATTCTTCTGTGGGTATCATGAAAAA
TTCAAGAGTATTAAAAAAGGCTACTATAAAAGTAGTAGACCCAGAGGTAGAATCACTAGATATGGAGATT
AATGGGGATTTAAAACATGTTGGTGATAGTGCTACTATAGAAAGTACAATAGAAGTTGATTATGATAAGT
TTAAAAAATCATATAAGCCAGTTTATAAGAGTAGCAATGAAAATATTTTAAAAATCAAAGGAAATAAAGT
AAGTGCAGTTGGAGTTGGTAAAGCTACAATATATGCTAAGTGTGGAAATAAAGAAATTGAGAGAACATTT
AGGATTCAAGCTAGAGTTGCTGAAATAAATATGGATGATATAAAAATAGAAGTTGACCAAAATGAAAAAT
TGAAACCAGATATAATAACTTCTCCACCTGGTTTAGAACCACCAAAAATATATTATGAGTTAGTAGATTC
AAAATTACCTGTAGAAAGAGCAATAAGTTTAAGTAGTAATGGAAATGTTGTAGGTCTTAGAGAAGGTAAA
GATAGGGTGAGAATAACTTGTGGAGATAAATCTAAAGTAATAACAGTAACAGTAGTCAAAGAAACTATAA
CGAATGACTATATACAAAACTTGGTTGGTTCACATAAAATAGTAAACAATAAAGTTATTATTAAACTTGA
ATGGGATTATATGAAAGATGTCTTTGATTATGATATATATCTTAAAGATAAGTTGTCAGGAGAATCATTT
AAGAAAATTAAATCTATAACTATAAATGAAAGTGATTTAGGTAAGTCTAACAAGGTATATGCAACTATAG
AAGTAGATATGAAGGGTAATCAAAATATAGATTTTGATATTTATGTCATAGGGAAAAAGGATTCAGATAC
AACTAAGCCAAGTAATGTAATAAATATTACTAATGGAAATGGAAATTCAAATAATGATAATAATATTAAA
GATATGAGGGTAGAAAATATATCAGCTAATGTTGATAGAGATAATAATGTCATTAGAGTTAACTGGAGTA
GTATATCTCATAAGGACTGTACTTACAGTATATATGTAAAAAATAATACTAATGGAGATGGAGAATTTAA
TCTATATCAAAGTGATATACAGGGAAATGAGCATACTATAAGTATTCCTGAAGGAGATTTAAATCTAGAT
ATTTATGTTGTTGCAAATTATAATGGAAATAGCTCTCAAAATAGTGATGTTATAAATGTAAGATAG
>ref|NC_013316.1|:2531023-2532072 putative PTS system, EIIc component [Clostridium difficile R20291]
TTGGAAATCAATTATAAAAAAAGAAATTTCAAATCATTTGCTAAAAGAAAAAATATTGAAATTTCTGTTC
AAAGGTATCTTATTGACGCACTAAGTTATATGGCACTTGGTCTTTTTTCGTCCCTTTTAATTGGAACAAT
TTTCAATACATTAGGAGATAATTTCAATATTTCTCTTTTTACTGAAGTTATAAGCCCTCTTGCTAAACAG
GTTACTGGTCCAGCTATAGCAGTGGCTATTGCGTATGGACTTCAAGCACCTCCACTTGTACTATTTTCTT
GTGCACTTGTTGGAGCTTGTGGTAATGAATTAGGAGGACCTGTTGGAGCATTTGTCGCTACACTTTTTGC
TGTAGAGGTTGGAAAATTAGTTTCAAAAGAAACAAAAATAGATATATTGGTTACACCTGCTGTGACAATA
CTAATTGGAGTACTTGTAGCTGAACTTATTGGTCCAGCTGTTTCTGCTTTTATGACTTCATTTGGAAATA
TAATAATGCAAGCTACAACTATGCAACCTATAATAATGGGAGCTTTAGTCTCTGCACTTGTTGGAATAGC
TCTTACATTACCTATAAGTAGTGCAGCTATTTGTATGATGTTAAGTTTAGGTGGTCTTGCTGGTGGTGCA
GCAACTGTAGGTTGTTGTTGCCAAATGGTAGGCTTTGCTGTTATGAGCTTTAGAGAAAATAGAGTTGGTG
GCCTTGTGGCACAAGGTCTTGGGACATCTATGTTGCAAGTACCTAATATAATAAAAAATTGGAAAATTTG
GATACCACCTACTGTAGCTTCAATATTACTTGGACCATTATCTACAACAATATTCAAAATGGAGAATATT
CCTATTGGTTCTGGTATGGGTACTTGTGGATTGGTTGGACAATTTGGAACAGTAACTGCTATGCAAAGTG
CTGGAAAAGGAGGTATATCTATGTGGGTTGGTATACTTTTACTTAATTTTATACTTCCTGCTATTGTAAC
TTTGTTGATTTCAGAATTTATGAGAAAAAAAGGTCTAATAAAACCTGAAGATTTAAAACTAGATGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2533155-2532121 hypothetical protein CDR20291_2157 [Clostridium difficile R20291]
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ACAAAGATATAAGCTTTAAAATTTTGCAAAACCTTTTAGATAATAATAAAGAGATAATTCATTCTTCTAG
AGCTGATATATGGTCTTCAGCTATACTAAATATAGTTTTAGAACAAAATCTTTTATACAATAAGAAGCAT
CCACTACATATAACAAAAAAAGAGTTTTCAAAACAAATAGGTGTTTCTTTAAATACTATAAATAATAAAT
CGTCTTTAATAAAAGATGTTTGTAGTATTGACTTTTTAAATCAAGATACTATAGCTATTTCTAATGTAGA
ATTTTGGGTAAAAGAGACCAATTCCAAATCAAAGTCTGTAGATTTAGATTTAGAAAAGAAAAAAATACTA
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CTGTAAATATAGGTAAAAGTATGATTACTAAAGAAGATAAAGAACTTGGATTTTGGAAAGGTTTATCTAC
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AAAAAAGTATTAGAATATTTAATAGAAATTAATCCTAGTGATGAGCAGGGAATAAGATACAAATTATTAA
ATGTATTAATTAGATTAAATGATAGAACTTCAATAAATAAATTATTTGAACTTTATAAAGAAGAAAAATC
TGCTACATGGATGTACAGTAAAGCTCTTTATTACTTTAAAAATAAAAGTATGTTTTTGGCAAATGATTCT
ATTAAGGTTGCTAGAAGTAAAAATAAGTACGTTGGATTATATTTGTTAGATTGGCGAAATGCTTTTGGTA
GAGAATTTGTTACAGAGGAAGAAAAGGCAGAAGCTGTCTATTACTATGATGAAAACATAGTGGTTTGGAA
TGAAGTTAAAGGTTCTATGGATTGGCTATTAAAAAAAATGTTGGAATTTTCATAA
>ref|NC_013316.1|:c2533520-2533173 hypothetical protein CDR20291_2158 [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAGAAAGAAATCTGAATTACAAGTAGAAGTAAAAGAAAATTTAAATGGTGGTATAGGAAAGGTTA
AGCTTGAAAACATAATACAAAATGAAGAGCTTAAAGGAAAAGGAAGACTATTTAAAAGAGTAGCTTTACC
AGTAGGAAGTTCAATTGGTGTGCATGACCATACAACAGATTTTGAAGTATATTATATACTAAAGGGAAAA
GGTAAAGTATTTGATAATGGGGAATTTGTAGAAGTAAATGAGGGTGATGTAGTGTATACAGCTGATGGCG
AAAAACATTCTATAGAAAATATAGGAGAAGAAGATCTTGAGTTTGTAGCACTAGTTTTATATATGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2537034-2535241 peptidase [Clostridium difficile R20291]
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TTCCATCTTCTGATAATCACCAAAGTGAATATGTAGGAGATTACTTCAAATCAAGAGAATTTATATCAGG
GTTTAATGGTTCAGCAGGGACGGTTATTGTGACTAAAGACGAAGCTGGGTTATGGACCGATGGAAGATAT
TTTATACAGGCAGAATCTCAATTAGAAGGAAGTACAATAAAATTATTCAAAATGGGACAAGAAGGTTGCC
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ATCTGCTAGAGAAGGAGCTACATTAGCTGAAAAATTATCTAAAAAAGGTATAAAGATAGAATATCAGTAT
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AATATTGTGGAGAAAGTTTTAGCTCAAAATTAGCTAGATTAAGAGAAAAAATGAGTGAAAAAGGTACTTC
TACTCATGTAATAACTACTCTTGATGATATAGCATGGTTATTCAATATAAGAGGTGGAGATGTTAAATAT
AATCCAGTTGTACTTTCTTATGCAGTAATAACTTTAAAAGAAGTTTATTTATTTGTTGATGAAAGTAAGT
TAAATGAAGAAATATTAGATGAACTAGCTAAGGAAAATGTTCAAATAAAGCCATATAATGATGTGTATGA
ATTTGTAAAAAATATAGACAAAACTGAAAAAGTTTTATTAGATGGAACTAAGCTTAGTTATACAATTTAC
AATAATATACCTTGTGAAGTTGAGAAAGTTGATGAGTTCAATCCAGTAATGTTTTTTAAAGCTCAAAAAA
ATGAGGTAGAATTAGAAAATATAAGAAATTCACATGTAAAAGATGGTGTGGCTTTCACTAAATTTATGTA
CTGGTTAAAGAAAAATGTAGGTAAGATGGAAATCACTGAAATAAGTGCTACTCAAAAATTAGAGGACTTA
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TGATGCACTATAGTGCAACTCCAGAGTCAAATTATAAATTAGAGGCAGAAGGATTATTTTTAGTAGATTC
AGGTGGACAATATTATGATGGAACTACTGATATAACTAGGACTACAGTTTTAGGACCTATAAGTGATGAA
TTAAAACTACACTTTACTTCTGTAGCAAGAGGAATGATAAATCTTTCTAAGGCTAAGTTCTTGCATGGTT
GTAGAGGATATAACTTAGACATACTATCTAGAAGTTGCATGTGGAATATGGGAATTGATTATCAATGTGG
AACTGGACATGGTATAGGATTTGTGCTAAATGTTCACGAAGCTCCAAATGGATTTAGATGGAGAGTAGTA
CCTGAAAGATTTGATAGTGCAGTTCTTGAAGAAGGAATGGTAACTACTAATGAACCAGGTATATATATAG
AAGGTTCTCATGGTATAAGAACAGAGAATGAAATTGTAGTTAGAAAAGCTGAAAAGAATTTCTATGGTCA
ATTTATGGAATTTGAAGTTGTTACGTTAGCTCCTATTGACTTAGATGGTATAGTACCAGAATTAATGAAT
AAGGATGAAAAAGATTATTTAAACTGGTATCATAAGTTAGTTTATGATAAAATATCACCTTTCTTAACTG
ATGAAGAAAGAGAATGGTTAAAAGTTTACACTAGAGCTATATAG
>ref|NC_013316.1|:c2538678-2537287 putative proton-dependent oligopeptide transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAAGTACAGAAAGCGTATCTAAAAAAAGTGGTCATCCGAAGAGTTTTTGGCTTATTTGCATGACAA
TTTTGTGGGAAAGATTTAGTTATTATGGTTTAACAGCTTTATTGGTATTATTTTTTACAGCAAGTGTAGC
TCAAGGTGGTTTAGGTCTTTCTACTCAAGAAGCAACATCCATGTTTGGCTTATTTACAGGTCTTATATAT
CTTACACCATTAGTCGGTGGCTGGTTAGCAGATAAAGTTTTAGGTCAACAAAAATGTATTTCTATAGGTG
CACTTTTAATAGCAATAGGAGATTTCGTACTATTTGCTTCATCTACATCTATTGCCATGGTTTGGGTAGG
TCTATCAATAATTATTTTAGGAAATGGTTTTTTTAAATCAAGTTGTTCAAATATAGTTGGGGATATATAT
CCTAAAACTGATGTGTCAAGAAAAGATGCAGCATACAGTTTATTCTATATGGCAGTAAATGTAGGAGCAT
TTATAGCTCCAATAATATGTGGATTGCTTTCTGATAATGTATTTGCAGTAAGAGGAGCAAGTGGAGATAT
AGTATCTTATGGATATAAGATGGCATTTTTAATTTGTGGTATAGGCATGATGTTAGGTATGATTATATTT
ACACTTCTTGCACCAAAATTATTAAATGAAGTCGGAAAATATCCTGTGACTAAAGGTAATAAAGGTGAAA
AAATTGAGTATGGACCACTTACTAAGTTGGAGAAAAATAGGATAATAGCAATGGTTATTTTATTTTTATT
TGTGGTCTTATTCTGGACAGCATACTATCAAACACAAAGTTCTTTTATGATTTATGTAAGGGATAATGTA
AATAGAACTCTATTTGGATTTGAAATGCCAGTAGCATGGCTTACATCACTAAATGCTATATTATGTGTGG
CTTTATGCCCAGTATTAGCTACCCTATGGGTTAAATTATCTCATACCAAAAGAGGTGATTTCTCTATTCC
AGTTAAAATGGGATTAGGAATGATAATAATGGGTGTTGGGTTTATAGTTATGGTATTTGCTACATTAGCT
AATGGTCCAGATGGAATGGTAAAGGCTAGTATATTGTTTATAGTATTGACTTATATATTTACAACAGTAG
GTGAATTATTCTTATCTCCTATAGGACTTGCAATGTTCAATAAATTAGCTCCAGCTAAGTATGCTACATT
ATCTATGGGAGCCTGGTATCTAACAAGTTTTTTTGCAAGTTTATTATCAGGAAAGATTGCTGGTTTTACA
GCCACACTTGGTTTTTTACAGATATTTGGAGGAATAGCAACAGTTTTAATAATATTTGGTTTAATATTAT
TGGGAATAAGAAATGTATTAACAAGATTAATGGCTATGGATTTACTAACAAAAGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2540274-2539132 putative protein export chaperone [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTGAAGAAAAAAATCCAAAAGAAAATACATTAGATGAACCTAAAAATTCAGATAATGTAAATTCTA
AAAAAGATGATGTGTCAGATGAAAAAAATACTGATAACAAAGTTAAAAAAAGGGAAATAAAGCTAAACAA
CAAAACACTTAAAGCTATTGTAGCAATTGTTGCAGTAGGAGCTATATGTTTAGGTGGAGGCTATGTTTTT
GGTAAAGAAGCTGGAAGAAAATTGCCTGCTACTTCAAAACACTATAATAGCAGTGAGGTAGTAGCTACTA
TTGGGGATAAAAAAATAACAGGTGAAATGTTAAGAAAGAGAATGGAGCCATTATTTTATTTAAATGCAAA
AACTACTATGACTGATGACGAAATACGTTCATATGAATCAAATATGATTGAAACTATGATTACATCTGAT
ATATTATCCTCTGAAGCAGCAAAAGAGAAAATAAGTATAACTAATGACCAACTAGATGCTCAGTATAATA
ATTTAATGAGTAGTATAGAATCAGCAATGGGAATGACTAAAGAAGAGTTTTTAAAACAGTTTGATTTGAC
TGAAAAATATATAAAAGATGATATGAAAAAAGAGCTAGTAGCATCAAAATATTTAAATGAAAAATCAAAA
GTTACTGATAAAGAAGCAGAGAACTATTACAATAAAAACAAGAGCAATTATTTACAAGTTAGAGCTTCAC
ATATTTTAATAAAAACTGTTGATGATAAAGGTAAGCAAGTTAGTAGTAGCAAAAAAGCTGAACTTAAGAA
AGAAGCTGAAGAAATACTTAAAAAAGCCCAAGCTGGGGAAGATTTTGCTACTCTAGCTAAAAAATATTCT
GAAGATAGTAGTGCAGAATCAGGTGGAGATTTAGGTTTCTTTGGTAAAGGTCAGATGGTGGAATCTTTTG
AAAAAGCAGCCTTTGCATTGAAGAAGGGAGAGGTATCTAACAAACTTGTAGAAAGTGATTATGGATATCA
TATAATTAAGAAAACTGATGAAAAATATCAACCATTTGAAGAGGTAAAATCAGATTTAGTAAGCAGTTTA
ACATCAGAAAAACAAAACCTACTTATACAAAATTTAAAAGAAAAATATAATGTTAAAATTACAGATAAAT
ATCAAATGAAAGCTAAAGAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2541428-2540385 hypothetical protein CDR20291_2163 [Clostridium difficile R20291]
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TAATATTAAAAAACGAAAAAATATTATCTGAAGAAAAGTTGATAGATGAAGAAGGAGTTGTAGTTAATAT
TGATAATGAAATATTAACTAAAGTAGAAGTAGTAAATGATGATAATGAAATAGAAGAAAAAATAATAGAA
GAAGATTGGTTAATTAGTGAAAATACCATAAAATTAGATGATAAAGAAGCAATTATTAATGATAAAAACA
TAGAATTATGTAAAAAAGAAGTTCAAGTTGAAAGTGAAAAAATAGGTTTAAATAAGTTTGAAGGACTTGA
CCAAAATGAAAATTATAATCTAGAAAAAAATGTTATTGAAGAAAAAAAAGTAAGTGAATGTTTGACAGAA
GAAGATTTAGAGTACATAAAAGAAATTAAAATAAAAAGAGGAAAAAGTATAAAAGCTATAAACTTGTATA
CTAAAGAAGAGTGGGTTTTTGACACTCATATACAGTGTAGTAAAAAACTCAAAGTTCCATTAGGATACAT
AAGAGAAAATTTAAAATATGGATATATGGATTACTTTGGAGATGCAATAAATTATTTAAGTGAAGTATTA
AATATAGATGAATACTGCAAAGGTGAATGGAGCTATCTCGATAATAGCAAATCTCCATCTGAGATATTTA
ATATTCTAAACAATAAAATATTTAGTATAAGGCTTTCTAATGAAAAAAGAAATGAAATTTTGACAAATGA
TAAAATTGAAGCATTAAAAATGAATTATAGATTTGAATGTATTGATGAAGAATATGATGAATATTTTAAA
AAATATAAGTCTATAATCAAAAGGGGTGGAAAGAAAAAAGTTGAATTAGTAAATAAAAAAGGTGACATTT
TAGAAATATTTAAGTCTTTAGAAGAATGTGCCATTTATTTGCAAAAGGAAAAGAATGAAGTTATACAAAT
GTTAAAATATGGAGATACAAAAGTAGGAAGAAACTTTATAAGGTATAGTTTGAGAAGTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2542508-2541957 hypothetical protein CDR20291_2164 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAACTTTTAAAGCCAATAACTATACTATTGTATATAGTTTATATTTTATCTGCCGTATTTTTTG
TAGCAAACAAAGAATATGGAAGTCTAGGTCTAGTAGCAATTAGTTTAGTTGGTACTTTCATTTTGAGTTT
TATAAATAAGCAAACTGAAAGATTATTGAGTAAAGAATTATATATAATGCTTGCTTTATTTATAATGTTT
TCATCATTGTTAGGTACTTGTTTTAATTTTTATGATATAAATTATTATGATGATTTTTTGCATTTATGGT
CAGGTATAATATCTTGTATTGTGGCTTTTTCTATAATTAAATACTTTTATACACAAAGAGAGATAAGTAA
AATGAGTAAAGTGTTTTTAGTTATATTTTTATTTATGTTTAGTATGGGAGTAGCGAGTTTATGGGAAATA
GGTGAATTTTTAATGGATACTTTTGTTGGGACTACTACACAGGCCGGGGGGTTAGAAGATACTATGATTG
ATATGGTAGATGCTTTAATAGGCACAATTATAACTATTCCTTATTATAGTAAAAAAATCTAA
>ref|NC_013316.1|:c2544062-2542536 putative oxidoreductase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGAATCATATTGGTTTTTAAACTCAAGTCCAAAAGAATATAACAAATTAGGTGAAAATATAAAAA
CAGATTGTCTTATAGTAGGTGGTGGAATAACTGGATTGACAACTGCATATTTATTAGCAAAAGAAGGTAA
AAAAGTAGTGCTTGTTGAGGCTGATAAAATAGGATATGGAACTTCTGGAAGGAATACTGGTAAGGTAACT
TGTCAGCATGATATATTTTACTCTAAGATAGAGAAAAAATATGGATTAGATAAAGCAAAATCATATTATA
ATGCAAATAATGAAGCTTTAAATTTAGTTGAACAAATAATAGAAGAAAACAATATAAAATGTGATTTTAA
AAGGGAAACTTCTTTTGTATTTACAGAAAAAGAGGATACTATAAAGAATATTAAAGATGAATATCGTACA
TGTAAAAAAATAGGAATAAATTGTGAGTATCATGAAACTATAGAAAATATTCCATTAGATATAAAGGGGG
CTATTAGTTTTACTAATCAAGGTCAATTTAACCCAAAGAAGTATATTGATGGATTGGCAAAAGCAGCAGT
AAATTTAGGGCTAAAAATATATGAAAATACACCAGTAGTAGATCTTGAAAAAGGAAAAATATGTAGGGTT
AAAACAAGAGAAGATAATATAATAGAAGCTGAGAATGTTATAATTTCATCTCATAGTCCATGGTATGATG
GATTGAATTTTTATTTTGCAAAAGAATATGCAGAGCGTGCTTATTTAATGGTTGCAGTTTTGGAAAATAA
ATTAGCAGATGGTATGTTTATAAGTATAGATGACCCATCAATAACTTTTAGACAATATAATAATGGAAGT
GAAAATTTACTGATTTTTGGAGGAGGAGACCATAAAGTTGGCCAGGGAGGAACTGAGAAAGAAATATTTG
ATGATTTAGAGCATTATGGTAAAGAAGTCTTTAAGGTAAAAGATTTTAAGGGGAAATGGTCTGCTCAAGA
TAATATGAGTTTTGACAATGTTCCTTATATTGGTTATATCAACAAAAGAGAAGACAATATTTATGTAGCT
ACAGGATTCTCTAAATGGGGAATTACTAATGGAACTGCTGCTGGAATAATAATAAAAGATTTGATAATAA
ATAATAATTCTGATTATAAAGATACTTTTAATCCATCCAGATTAGGTAGCTACTTTTCAAAAGATTTTAT
AAAGGAAAATGCAAACGTAGCAATAAATTATGTAAGTGGAAAATTAAAAATAGGTAGTGGAGATATGCCT
AAAAATAATGGAGAAGGAAAGATTGTTAATATTGATGGAAAAAGATATGGTGTATATAAGGATGATAATG
GAGATTTTTATATTGTAGACACGACATGTACTCATTTAGGATGTGAACTTAATTTTAACAGTGAAGAAAA
AACATGGGACTGTCCATGTCATGGTTCTAGATTTGACTATAAGGGAAATATACTTGAAGGACCAGCTCTT
AAGCCATTAAAACTTTATGGACATGGTGATAATGATGTTAATCCTAAGTTATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2545407-2544442 putative membrane-associated caaX amino terminal protease [Clostridium difficile R20291]
TTGTTGAATTTACAATCAAAATGGGTAAACTTTTTAAAGCCAACATATGTCAGTGATGAAATAAAAAGAA
AAAAACTACAAGTTATAATATTTTTTTCTATAACTTATGGTTTATCTTATTCACTAGGTTTATTAGCAAT
ATGTTTTAATCATTTAATAGATTCAGAAATTTTAGCTCAATTTATGATGATATTGCCATTATCTTCAGTT
TCTATTGCAAAATTTTACACAGAAGGAAGAAATAATGATAAATATAATTTCTATTCATCAGTAATATTAT
TTTTTATTATTTACTTTTTTATATTTATTATTGAATCATTAAAGTTAATAAGTATTAATCAATTTCAATT
AATGTATTTTATGTTAATTTTAATAAGTAGTTTATGTGTTATTATTTATTCTTATAAAATAACAAGTTTA
TATATTTTTAAAAATTTTAAGATAGGTATTTTGCTAGTTTTTTACTTTTTATTTTCTCAAATTATTTTTG
GATTAATAATAAGTGATAATCAATTTGATTATAAGAATTTCTTGAATTATATTCTTCTTCCTATAATATC
ATTAGTATATATTTATCCTTTTTTATGTGAAGAGTATGGTTGGAGATCTTTTTTACAAAGTATTTTATTT
GATAGATTTGGCAAAAAAATAGGTATTGTAATGGTAGGCACTTGTTGGAGTTTATGGCACTTACCTTTAC
AATTTACACTATATAGTCCTCAAACTCCAATAATTGGAGCTATAGCCCATTTGATATATGGTATTGGACT
TTCTATATTTTTAGGTTATGTTTATATGAAAACTAAGAACATATGGTTTTGCTCTATAATGCATGTTCTA
ATTAATAGCTTAGGATTAATTTTCAATGATTCTGAAATAATTATTAATTACCATAGTATTATACAAAGAT
TGATATTTATACTATTATTTTATACTCCTTTTCTATTTACAAAAGAATATAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2547898-2545979 PTS system, IIbc component [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATTATAGATTTATTAGATGAAAAGTCAATTAAGTTAAATTTAAATTCAAAAACCAAATCAGAAG
CAATAGAAGAATTAGTAGATTTGGTCGCAAATAGTGGAAATTTAAATGATAAAGAAAACTACAAAAAAGC
AATTTTGGCTCGTGAAGAAATGAGTACAACAGGAATTGGAGAAGGTGTAGCTATACCTCATGCTAAAAAT
TCTTCAGTTACTAAAGCTTGTATAGCAGCAGCAGTGTCAAAAGAAGGTATAGATTATGAATCGTTTGACG
GAAGTTTATCAAATCTATTTTTTATGATAGCTGCACCAGACGGAGCTAACAATACTCATCTTGAAGTATT
ATCAAGATTATCTACAATACTTATGGATGAAGACTTTAGAAATAAACTTATAAATTCAAGCTCTGAAAAA
GAATTTAAGGAAATAATAGATAAAAAGGAAAGAGAAAAATTCAGTGAAGAATATCAAGATGAGAAAGTGG
CTGAAAAAAATATAATAGATACTAAAGAGAATGATGCTAATAAGTATCCTAAGGTTTTAGCAGTAACAGC
ATGTCCAACTGGAATAGCACATACATTTATGGCAGCTGAAAGTTTAAATAAAATGGCAGAAAACAAAGGT
GTATCAATAAAAGTAGAAACTAATGGTTCAGCAGGTGTTAAAAATAAGCTTACAAAAGATGAAATAGAAA
ATGCAACATGTATAATAGTGGCAGCAGATAAAAATGTTGAGATGGCTAGATTTAATGGCAAAAAAGTCAT
AAAAACTAAGGTGGCTGATGGTATACACAAAGCGGAAGAACTTATAGACAAGGCTGTAAATGGAGATGCT
CCAATTTACCATGGAGGAGATGGAAGTCACAACGAATCAAATGAAGAAAGTGAAAGTGGATTTAGAAAAG
TATACAAACACTTAATGAATGGTGTATCTAATATGTTACCATTTGTTATTGGTGGAGGGATACTTATAGC
GATAGCCTTTTTACTTGATGATTATACTATTAACCCTTCAAACTTTGGTTCAAATACACCGATAGCAGCG
TTTTTTAAAGGGATAGGAGATAAAGCTTTTGGATTTATGTTACCTGTACTTGCTGGATATATAGCATACT
CTATATCTGATAGACCAGCGTTTGTTGTAGGATTTGTAGGAGGTGCTCTAGCAGGTGATGGTGGTTCAGG
ATTTTTAGGTGCACTACTTGCAGGTTTTATAGCAGGTTATTTAGTAGAAGGGCTTAAGAAAATATTTAGT
GTACTACCAGCTTCATTGGAAGGAATAAAACCAGTATTGTTATACCCTTTACTTGGAACACTTTTGATGG
GAATTATAATGACATTTTTAGTAATACCTCCAGTTACAGCAATTAATAATGCAATGGTTGGATTTTTAAA
TGGTTTAGGCGGAACTTCAAAAATAGTTTTAGGATTAGTATTAGGTGGAATGATGGCTGTGGATATGGGT
GGACCTGTAAATAAAGCAGCATATGTATTTGGAGTTGCATCACTTGAATCAGGGCAGTTTGAAATAATGG
CAGCAGTAATGGCTGGTGGTATGGTTCCGCCACTTGCTATAGCTCTTGCAACTACATTTTTTAAGAATAG
ATTTACTAAAGAGGAAAGAGATTCTGGTAAAGTTAATTATGTAATGGGATTATCATTTGTTACTGAAGGA
GCTATACCTTTTGCAGCTGGAGACCCACTTCATGTTATACCAGCTTGTGTTGGAGGTTCAGCAGTGGCAG
GAGCACTTAGTATGTTGTTCAACGCAGCTCTTCGTGCACCTCATGGAGGAGTATTTGTTATACCAGTGGT
TACCCATCCATTTGCATATATATTAGCTATAGCTGTAGGTGCTTTGGTTGGAATGATGCTTTTAGCATTA
CTTAAAAAACCATTAAATCAAGAAGTATAG
>ref|NC_013316.1|:c2548852-2547935 putative 1-phosphofructokinase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTTATACAGTGACATTAAATCCATCAATAGATTATATAGTTAAGCTAGATGAGCTAAAGACAGGAA
GTACAAATCGTGTAAAAGAAGAATACGTTTATCCAGGAGGAAAAGGTATAAATGTATCTCGCATACTTAA
GGAACTTGGAAATGATAATACATCTTTAGGTTTTATAAGTGGTTTTACTGGAGAATATATAATAAGAACA
TTGGAAGAAAAAGAATTGAAGACAGATTTTATAAAGATAAAAAGTGGTTTTTCAAGAATAAATGTAAAAA
TAAAGGCGTTAAAGGAAACTGAGATTAATGGACAAGGTCCAAATATAGATGATGAAGACATTGATACTTT
ATATAAAAAACTTGATAAGCTAAATCAAGATGATATTTTAATATTGGCAGGAAGTATACCATCTACTTTA
GATGAAAAACTATACGAAAATATAATGGCTAGATTAGAAAAAAAGAATATAAAAGTTGTAGTAGATGCAA
CTAAAAATCTTCTTCTTAATGTTTTAAAATACAAACCTTTTCTAATTAAGCCTAATAACGACGAATTAGA
AGAACTATTTGGTGTTAAATTAAATTCAATTGAAGACATGGTAAAATATGCTAAAAGATTAAAGGAAATG
GGAGCTATAAATGTCTTGGTATCAATGGGAAAAGATGGAGCATTGTTGATTACAGAGGAAGATGAAGTGC
TTATAAGTGATGTCCCTAAAGGAAAAGTAAAAAATTCTGTAGGAGCAGGTGATTCAATGGTAGCAGGATT
TATATCTGGGTATTTGAATACTGGGAAATATGATTATGCTCTTAAATTGGGAGCAGCTTCAGGTAGTGCA
ACTGCTTTTTCATATGACTTAGCCAAAAGAGAATACATTGATAAATTGGTAAATGAGATATCTGTAAAGC
AGTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2550797-2549019 putative transcriptional antiterminator [Clostridium difficile R20291]
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GTGGTATTGCCTTAAGTCAAGAGATAGGATGTTCTTCAAAAACTATACAAAATGAAATAAAGGATATTAA
TAAACAACTTAGAAATGGTAAAATTTTGTCAATAAGAGGAGTTGGTTATAAACTAGAAGGAAGTTTTGAT
GAGGTAAATCTAAATAGCAATCTCTATGATGATGTAGATAGAGTAGAATATATAATCAGAAAAATATTAA
CCTTAAGTAATGAAGAAAAAAATACTATAAAACTTGAAGATTTAGCCGATTCTATGTATGTAAGTGTTTC
AACAGTAAAAAATGATTTAAAAGAAGTAAAAAGAATATTGGAAAAGTATTCAATATCAGTTAAATCTAAG
CATAAACAAGGTATATGTGTTTTGGAAAGTGAAGATAAGATATTAAATTGTATAGTTGACTTAAGCAATA
AGAGAGATAATCAATTGAGTTTAAATGATTTTTTAAATGACGATATAAAGGAAAGAAAACTATTAATAAA
AAAATTATTATTAGACATATTAAATGAAAATGGATTAGTATTAACTGATATAGAATTTAAGAGTGTGTTA
AATAATATATTAGTTATGTTAAGCAGACATAAGTATAATGAAAAAGAATTTATAGAGAATTATATAGAAA
ATTATAGGAGCAAAAGAAGCTCAATTTTAGAAAATGAACAAAACAAAGAAATTATAATAAATTCAATAAA
AACATTTTGTAAAAATTTAAAATTAGCTACATCAATAGATATAAGTAATGATAAGGTATTTGAAGAGTTT
TTATATAAGCATATTAGTAGTTTATGTAAAAAAATAAAGTTAGGTATAAATCAATCACCTATAATGGCTC
AAGATATAAAAATAAAATATCCATTTGCTTTTGAACTAGCTAATATAGCTAAAAAGACAATAGAAAAAGA
TTTGAAGATAGAAATTAATGAAGATGAAGTTGCAAACATAGCTCTACATATAGGAGGAGCAGTTGAAAGA
GCATCTTATAATAATAAAGATAAGGTTTTCAAAACTATAATAGTTTGTACTTCAGGCATAGGCACATCAA
TGTTAATAAAAGCTAAATTAGAGAATATATTTAAGGAAAAATTAGAAATACTAAAGATTATTCCTTCATA
CTTAGTTGAATATATAAAAGTTATAGATGTTGATTTTGTAATATCTACTGTTCCTATTGAAGTAGGAGAT
GTGCCAGTAATAAATATATCTCCAATTTTAAGTGAGAAAGAAATTAGATTAATTGAAAAATATATAGAAA
CAGGAAATATATACCTAGATTTAGATATAAAAAGCCTGTTTGATAGTGAATTATTTTTTACTGATTTGGT
GTTTAAAAGGAAAGAAGAAGTTATAGATTTTATGGCAAGTAAACTTGTACAAAAGGGCTATATAGATGAG
GATATGAAAAAATCTTACTTTGAGAGAGAAAAAATAGCAACAACAGAAATAGGGAATATGGTAACTATAC
CACATGGAGCTATTGGAAAAATTTTTGATAATAAAATAGCAATTGGTATATTAAAGAAGCCTATTTCTTG
GGAAATATCAGATGTTCGTTTAATAATAATGTTAGCCCTTGATAAAGATAAAATATTAGATTATGAAGTA
ATATTTTCAAAAATATATAAAAGAGTAGATTCTATAGCAAAAGTTATAAGTATATGTGAAAATAGTAGTT
TTGAAAAATTTGTAAATTTATTTAATTAG
>ref|NC_013316.1|:c2551549-2550809 hypothetical protein CDR20291_2170 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATTTTAGAGATTTAGGTGGGAACAAAACTGAGGATGGCAGAACTGTAAAGAAGGGATTATTTT
ATAGGTCTGCAAAATTATCAAATCTAAGTGAAAATGATATAAAGATTTTAAAAGAGTTAAATATTAAATA
TATATTTGATTATAGAAGTGATGAAGAAGCTCGTAAACATCCATCAACAATAATATCAAATATAAAAAAT
ATAAGAATACCAGCAATGAGAGAGCTAGAAGAATCAGGAGGAAGTTTTGGTTCTATTGAAGATATGATTG
ATGGATTGTTTGAAAAAGATGGTGCATTTAATATGTTAAATAATAGTTACTATAATTTGCCTATAAATAA
TCCGTCATATAAAAAATTAGTAGAACTTATAAGAGACTATTCTAATTTACCAATATTAAATCATTGTACA
GCTGGTAAGGATAGAACTGGTGTGGGGAGTGCTATAATTCTTATGATTTTAGGGGTATCGAGAGAGAATA
TAATGAAAGATTATCTAAAAAGTAATGATTTTGCAGATAAAGAGATAGAAAGATTTATAGAATATAAGCC
TAAATTTAAGGACATTCCAAAAGAAAATTTAAAATATATATTTGGTGTAAATGAAGAGTATATGAAAACT
GCATTTAGAAGAATTGATGAAGAATACATTAGTGTAGAAGCATATTTATATGGAGAATTTAATTTAAATA
AAGAAGAAATAAGAAAATTAAGAAATCAATATCTAGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:2551823-2552884 hypothetical protein CDR20291_2171 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATATTCAAAAGCAAAAGAATTTTATAATTAAATTTACATATGTAGTTTTAATAACAAGTATTGTAT
ATATTGTATTAAAATTCTTATTGCCATTATTAATGCCTTTTGTAATCAGTTTTATCATTGCATCCATCTT
AAGACCTATTATAAGACTTATTACAAATAATACAAATTTAAATCGTACACTTATTTCTATAGTAATACTT
TTAATTTTTTATGGGTTGTGTATATTTTTATTAGTTAGCTTTGGTGTGAAGATATTTGCAAGTGTAAGTG
ATGTATTTTTTAGACTTCCTGAAATATATAAATCAAGTATACAACCAACGCTAAATACTTTATTTTCAAA
GATAGATGCTAGTACACCTAATGTTAACCTATCATTAATACTTGGTTGGGATAATATAAGTCAATCTATG
ATGTCTTTAGTAGCTTCTATTTCAACAAATGCACTCAATGCTATTGCTAGTATTGCAAGTAAAACACCTG
CATTTATGTTAAAACTTATTATTACTTTAATTGCTTCTTTTTTCTTTACTTTTGACTATCAAAAAATAGT
AAACTTTATCTTAAAACAATTTCCAGAAAAAAGTCAATTTATGATAATAAATATAAAAAATAGCAGTATT
AATGCTCTTTTAAAACTACTAAAAGCCTATGCAATACTACTATCAGTGACATTCTTAGAACTACTTATTG
GACTTACTATCCTAAAGGTTGAAAATGCATTTACTATATCTGTCATCATAGCACTTGTTGATATTTTGCC
AGTCTTGGGTACAGGAAGTATTTTGACACCTTGGATGATTATCTCACTCATTAATGGAAATATTAATTTA
GCAATAGGACTTTTAATACTATACATAATTATAACCGTTGTTAGACAAATATTAGAACCAAAGGTAGTAG
GACACCAAATTGGCCTATATCCTTTAATAACATTAATGTGTATGTTTATTGGAGCTCAACTATTTGGAAT
AGCTGGATTATTTGGATTCCCTATCGCAGCTACAATCATAAAAAACTTACATGATAATGGGATTATTACT
GCATTTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2554291-2553038 hypothetical protein CDR20291_2172 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATTTAAGTGGCATATTTAAATACTATTGTAAAGAGTGTGAAAATACATGGAATAATTCGAGTGTTG
AATTATTTGAGGATATAGAAACGTATAGTAAAGATTCACAAAAAAAGAGGGAAAAAGAATTAGATAAATT
TATAAATACAATATCAGTTCATTTAGAGAGGTATCCAAGTGATGCTGTATTGAGAAAAATGTGGGTAAAA
AAGGGCGAGGTTTTCTTACAAAAGACATTGGAAAAAGAAAATATTTTTAAGTTAGAAAAAATGGATGTAG
AGGATAGAAAAAAATTTTTAGATATAACAAAACAGTTTATTAGAGATGCTAGAAAATTTGATGATGATTT
ACCTATAGGTGATATTATGCAAGCTATGAGGAATGTATGGATTTCAAATGCATTACAATTATTATTTGGT
AAAGAAATATATTATTCAAAAGCTAACTTTGCATATAGTATGTTATATCCATATACTGATAATTATTTAG
ACAATACAAATATAGATAAAAATGATAAGATTTTATTTAATAACTGGTTAGAAAAAAGGCTCCTGGGAGA
ACATATTAAATCTAAGGATTATCATGAAAGTAAAGTATCTCAAATGATAGATTATATTGAAAGTGTATAC
CCTAGAGAAAAGTTTACACAAGTTTATGAATCGTTATTATTAATATTTAAAAGTCAAGTAAATAGTTTAA
AACAACATGGTAAGGAAAATCATTTGTGTAAAGAAGATTTATTATCCATTTCTATTGAAAAAGGAGGTTC
ATCCGTTTTAGTAGATGGATATTTAATAAGTGGATTTATGACAAAGGAAGAAATAGAGTTTTGTATAGGA
TATGGATTTTTATTACAAATATCTGATGATTTACAAGATATAAAAGAAGATTTAAAATACAACCATAAAA
CTATTATTACAGAGATGTCAAAAGAGGGTACTTTAGATAAAGTTGTAAATAAACTAATAAATTTTACTAT
TGAGTTAATAGATAGTTTTAAAATTAATAATAAAAATAAATCTGTAATAACTATGATAAAGAATGATTGC
TTAATGTTAATTTTATTTTCTGTAGTTTATAATGCTGAATTTTTTTCTGTAGGATATATAAAAGAAGTAG
AGAAATTTATTCCATATACAATAGATTATTCATTAGAGATTGAAGAAAAAATAAAAGAAAAATTTAAAAA
TATAGATGTTTTAAATAATGAAAATGAATATAAAGAAATGATTGATATTATTTGTGCAGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c2556515-2554395 putative DNA topoisomerase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAAAAATATTAGTGCTAGCAGAAAAACCTTCTGTTGGAAGAGATATAGCAAAAGTTTTAGGGTCAA
AAAATGAAAAAAATGGTTATATAGAGGGGCCAAAGTATGTGATAACTTGGGCACTAGGTCATTTGGTTAC
ACTTGCTGACCCCGAAAGTTATGGAGAAAGATATAAATCATGGAGCTTAGAAGACCTGCCAATACTTCCC
AAGCACCTTAAGACTGTTGTAATAAAAAAGAGTGGAAAGCAGTTTAATACAGTTAAATCGCAAATGAATA
GAAATGATATAGATGAAATAGTTATAGCAACAGATGCAGGTCGTGAAGGAGAACTTGTAGCAAGGTGGAT
AATAGAAAAATCACAGGTAAAAAAACCTATAAAACGTCTTTGGATTTCTTCAAGTACAGACAAAGCAATA
AAAGACGGATTTGCAAAATTAAGAAGTGGAAAAGAATATGAAAATTTGTATTACTCAGCAATAGCACGAG
CAGAAGCTGATTGGATTATTGGAATAAATGCAACCAGAGCTTTGACAACAAAGTACAATGCACAGCTTTC
TTGTGGAAGAGTACAAACTCCTACTCTTGCAATGTTGCTTAAAAGAGAAGAAGAAATAAGAAATTTCAAA
CCTAAAGAGTATTATGGATTAGAATTAATTGCTACAAAGGGAAATTCAGATATAAAATTTATTTGGAATG
ATAAAAACAATAATTCTTCAACTTTTAGTAAAGAAAAGATAGAATCCATATTAAAAAAAGTAAAAGGTGT
AGACATAAAAATATCTGAAGTAAACAAGTCATATAAGAAAAAATATTCACCTGCACTCTATGATTTAACA
GAATTACAAAGAGATGCAAATAAAATGTTTGGATTTTCAGCAAAAGAAACTTTATCTATAATGCAAAAAC
TGTATGAACATCATAAAGTACTTACTTATCCTAGAACTGATTCTAGATATTTAACATCAGATATTGTTGG
AACATTAAAAGATAGAATAAAAGCTGTAAATATTAGTGATTATTCAAAGATTTGTAATAAATTATTAAAA
AGCAATATTATAGCTAATAAATCGTTTGTTGACAATTCAAAGGTAACAGACCACCATGCAATAATACCAA
CAGAACAGAAGGTATTCATGAGTGATTTTAGTGACAAAGAGCGAAAAATATATAATCTTGTAGTAAAAAG
ATTTTTAGCAGTACTATCTCCTCCTTTTGAATATGAGCAGACAACTATAAGTGCAACTGTAGAAGGAGAA
ATATTTAAGGCTAAGGGAAACAAAGTAATAAATTTAGGTTGGAAAGAAAGTTATAAAGATATTGAAGATG
AAGATGAGTATGAAAGTATACCAAATGTTTTAGAAAAAGATGTACTTAAGGTCAAGGGATTAAAGATAAC
TTCAGGAAAAACAAATCCACCACCATACTTAAATGAGGGAACATTATTGACTGCTATGGAAAAGAATGGT
CTAGGGACAGTTGCTACAAGAGCAGATATAATAGAAAAATTATTCAATTCATTTTTAATGGAAAAGAAAA
ATAAAGAGATATATATAACATCAAAAGGAAGACAATTATTAGATTTAGTTCCAGTAGACTTAAAGACACC
AGAACTTACAGCTTCATGGGAAAAGAAATTATTGGATATTTCAAAGGGAAAACTTAGTAAAAATACATTC
ATAAATGACATGAAAGATTATTCAAAAGATATTGTACTAGAAGTAAAAAATAGTGATAATAAATTTAAAC
ATGATAACTTAACTAAAAATAGATGTCCAGAATGTGGTAAATTTATGTTAGAGGTAAATGGTAAAAAAGG
TAAGATGTTGATTTGTGAAGATAGAGAGTGTAATACTAGAAAAACTATATCACAAGTAACCAATTCAAGA
TGTCCTAACTGTCATAAAAAATTAGAACTTCGTGGAGAAGGTGAGGGGAGAATCTTCACTTGTAGTTGCG
GATACAGAGAAAAGTTGTCTTCTTTCAACAAGAGAAAGCAAGAAGAAAAACAGAAGGCATCAAAAAAAGA
TGTTAATCAATATTTAAAAAATCAAAATAAAAATCAAGAGACATTTAATAATCCATTTGCAGAAGCATTA
GCTAAGCTAAAAAACAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2557221-2558588 putative sodium:solute symporter [Clostridium difficile R20291]
ATGAATCTAATTGATATTTTAAACAAAGTTGATGCTTTTATTTGGGGACCACCCCTACTGGTACTATTAG
TTGGTACTGGTATACTACTTACTGTTAAGCTTGGAGTTGTTCAAATAACTAAACTGCCAAGAGCTCTTAA
GTTAATATTCTCTGCTGAAAACAAAGGTAGTGGTGATGTTTCAAGTTTTGCAGCCTTATGTACTGCTCTA
GCTGCTACAGTTGGTACTGGTAATATTGTTGGTGTTGCTACAGCTATCAAAGCTGGTGGACCTGGTGCAC
TTTTTTGGATGTGGATAGCAGCATTCTTTGGAATGGCTACTAAGTATTCAGAAGGTGTTCTTGCAATAAA
ATACAGAACTAAAGATAAAAATGGTCAAGTGTCTGGTGGGCCAATGTATTACATAGTAAATGGTATGGGA
GAAAAATGGAGACCTCTTGCAATATTTTTCGCTATAAGTGGTATACTAGTTGCACTTTTAGGAATCGGTA
CTTTTACTCAAGTAAATTCAATAACAGATGCAATAAATAATAGTTTCGGGATAGACCCTAGAATTACAGG
GGTTGTATTAGCAGTATTTGTAGCTTTGGTTGTATTTGGAGGACTTAGAAGTATATCTAATGTAGCTACT
AAAATAGTACCTTTTATGGCAGTTATATATGTTGTAATCTGTGGAATCATTTTAATATCTTTTTGGAATA
AAATCCCTGAAACTTTTATGTTAATAATTAAAAGTGCATTTACACCTACTGCTGCTACTGGTGGTTTTTT
AGGAGCAACTATGTCACTGGCAATTAGAAATGGTATTGCTCGTGGTGTATTTTCAAATGAGTCTGGTCTA
GGTAGTGCTCCAATAGCTGCAGCTGCTGCTAAAACTGAATGGCCAGCGGAACAAGGTCTTATATCTATGA
CAGGTACTTTTATAGATACTATTATAATCTGTACTCTTACTGGATTCTCTCTTGTTATTTCAGGAGTGTG
GTGTTCAGACCTAAATGGAGCTGTTATGACACAAGCAGCTTTTAACGGAGCAATTCCTACATTTGGACCA
ATATTACTTACAGTTAGTTTAACATTATTTGCATTTACTACAATTTTGGGATGGAGTTATTATGGAGAAA
GATGTTTTGAATTTCTGTTTGGTGTAAAAGGCATGAATGGGTATAGAACTGTATTTGTGGCTATGGTGTT
ATTAGGTGCTTTCTTAAAGTTAGAAGTTGTTTGGATAATTGCTGATATTGTAAATGGGCTTATGGCAATA
CCTAACCTTATAGCTTTACTTGCATTATCACCTATAATAGTATCTGAAACTAAAAAATATTTTGAACATA
TAAATTCTCCAGAAAATCAGATAAAGAAAAATGCATAA
>ref|NC_013316.1|:c2559408-2558761 sugar phosphate aldolase [Clostridium difficile R20291]
ATGCTAGACTCTTTAAAAGGTAAAGTTGTGGAAATAGCAATTAAAGCAGAGCATTATGGTTTATGTAAAG
AAAAGACTGGTAATTTTAGTATTAGAGATAAGGATACTGGATATATACTTATAACCCCATCAGGTATAGG
AAGAGAAGAATTAAACGTTGAACATATTTGTGTATTGGATTTGAATGGAAATGTAATAGAAGTTGAGAAA
GGTATTAAGCCAAGTAGTGAGGTATTGATGCATATTGAAATATATAAAATAAGGGAAAATATAAATGCTA
TATCACATACTCATTCTTTATATGCAACAGCATTTTCAGTAGCAAAGAAACCAATTATACCAATTGTATA
TGAATCAGTTAATTATGGCGGTTATGTAGATATTGCTCCATACGAAAGACCAGGAACTTTAAAATTAGCT
AAGAGCGTTTCAAAATTACTGATAGATACAGATGCATGCTTATTAGAAAGACATGGGTTGACAACTGTAG
GTAATGATTTAGACGAAGCATTATTAAAATCAAGATATGTTGAAGAGGTAGCAGAAATATACTATAGGTC
TTTAGTATTAAATCAATTTAAAGAACTTGAAGTAGTAGATGTTGATGAGTTTGAATCTTGGAAATACCCA
GAAGAAATAAAGTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2560112-2559426 L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase [Clostridium difficile R20291]
GTGCTAGAAATTTTAAAAGAAGAAGTATTAAAAGCAAACTTAGAATTACCTAAGAAAAAGCTAATTACTT
ATACTTGGGGAAATGTAAGTGGGATAGATAGAGAAAAAGGATTAGTGGTGATAAAACCAAGTGGTGTAGA
GTATAGTAATATGACTGTAGAAGATATGGTTGTAGTTGATTTAGAGGGAAATGTAGTTGATGGCAAACTA
AGACCCTCCTCAGATACTCCGACTCATCTAGTTTTATATAAAGAGTTTGAAGAATTGGGGGGAATAGTAC
ATACACATTCAAGTTGGGCAACAATTTGGGCTCAAATAGGAAAATCTATACCATCTTGTGGTACTACTCA
TGCAGATTATTTTTATGGAAGCATACCATGTACCAGAAAAATGACTAGAGAAGAAATTTGCAATGAATAC
GAAAAGGAAACTGGAAATGTAATCATTGAAGAATTTATGGGAAGAAATCCAATTCATTGTCCAGGAATAA
TTGTAAATGACCACGGACCTTTTACATGGGGAAAAGATGCAAATGAGGCTGTACACAATGCAGTAGTTTT
AGAAGAAGTCGCAAAGATGGCTTATTATACAGAGTTAATGAGTCCTGATAATATTATGGATAAGGTTCTT
ATGAATAAGCATTTTTCAAGAAAACATGGAAAAAATGCATACTATGGTCAAAAATGA
>ref|NC_013316.1|:c2561263-2560187 putative sugar dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
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ATGAAATGGTAGATATACCAGAAATAACAGATACGCAAGTGCTTGTAAATGTAAAATATGTTGGGATATG
TGGTTCAGATTTGCCTAGGTCTATGGTAAGTGGTTTGAGTGGAAATACAAAATATCCATTGATTTTAGGA
CATGAATTTTCTGGTGAAGTTGTTAAAATTGGAGAAAAAGTAAAGCATATTAATGTAGGAGATAGAGTAG
CTGTTGCACCATTAGTACCTTGTGGAAAATGTGATTATTGTAATGAAGGTAATTTTGGCTTGTGTGATGA
TTACAATATAATTGGAACAAGAGTAAATGGAGCGTTTGCAGAATATGTAAGAGTTCCAGAAGAACATATT
TTAAAACTACCAGATACATTGGATTATGAAACTGCTGCCGGAATTGAACCAGCAACTATAGCTTATCATG
GGATTTCAAAGTCTAATATTAGAGTAGGAGATAGTGTAGTTGTGTTAGGATGTGGTCCAATAGGTCAGTT
TGTTATACAATGGGCAAAGGTGTTTGGTGCATCTAAGATTATAGCAGTTGATATTTTTGATGAAAAATTA
GAACTTTCTAAACTTCTAGGAGCAAACTATATACTTAACTCAAAAGAAGTAAATGTAATCAAAGAAATAA
AAAAAATAACAAATGGTGGTGCTGATGTTGTAATAGAGACTGCTGGTAGCCGATTTACACAAGAACAATC
TCTATTTGTAGCAAAAAAGAGAGGAAATATAGTGTTTGTAGGTATATCACACACAGAATTACCACTTAGT
GCAGACGCTACTGAGTGTATATTACGTGGAGAACTTACCTTGAAAGGTTCTTGGAATTCATATGCAAGCC
CTTATCCTGGAAGAGCATGGACTGCAACATTGGATTTTATGGGAAAAGGTGACATTATTTTTAAACCCAT
GATTTCACATAAAATAGGTCTTAATGAAGTGGGTGACTTTTTAAGTAAAATGAGCAAGAGAGAAATTAAT
TTCAATAAAATCCTAGTAGAAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c2562995-2561589 PTS system, IIc component [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAGAATTTATGAAATCTATAATCGATACATTTGGTTCTGCAATTATAGTTCCAATTATAATATTCA
TAATAGCAAAGATATTTAAAGTAACTACTAAGAAATCGTTTCTTTCTGCTGTGTATGCAGGAGTTGCTTT
ACAAGGTTTTACACTGATTTTAAATTCATTTACACCAATAATAACACCAGTTATCAATAGGATGGTTGAG
AGTACAGGAGTAAACCTACCAGTTTTTGATGTTGGTTGGCAAGCAACATCATTGGTTGCATTTTCAACAA
GTGCAGGTATGATATATTTAGGTCTTGGTATATTATTACAAACAATTTTATTTTTGATAAAATGGACAGA
CGTGTTTCAACCATCAGATTTATGGAATAACTATTCTTATATGGTATGGGGAGCAATGGTTATAGGAGTA
ACAGGAAATTTTCCTTTAGGTATAGCATGTATGGTTTTATTAAACTTATATAGTTTATTAATATCAGAGT
TAGTTGCAAAGAGATGGTCTAGTTACTATAGATATCCTAATTGTACAATAATAGCTATGCATAATGTTGA
GGCTTCTGTGTTTGCAGTATTTTCAGACCCTATATACAATAAATTGGGATTAAATAAAATAAAATTAAAT
CCAAAAGAATTAGAGAAGAAATTAGGGTTTTTAGGTGAACCAATTACTTTAGGTCTTTTTTTAGGTATGT
TTATAGGTATATTAGGTAATATGACGAGAATAAATACTATGGAAGCTTGGGGAGAAATAATGAAAGTAGG
TATATCTACAAGTGCAGTGATGGCGATTTTCCCTAAAGTAGCAAGTATGTTTGCTCAAGCATTTGCACCT
ATAACAGAAGCAGCTAGAAAGATTATGCAAAAAGCTGGAAACCGTGAGTGGTACATAGCAGTAAATGATG
CTGTTGGATATGGTGAACCTGCAACTTTAATATCAGGTCTTATATTAATTCCAATAATGCTTGTAATATC
TATGGTACTTCCTGGTAATAAGGTATTACCAGTTGTGGATTTGTTGGCAATTCCATATATGGTTCAAGGT
TTAGTTGCCATACATAATGGTAATATACCAAAAGTATTAGTTTCAGGTATAATTTGGTTTGGATTAGGAT
TATATGTTTGTACATCTACAGCACCATTATTTACAGATATGGCTACAAATATAGGTGTAGCTATACCTGC
AGGAGCAATGTTAATAACAAGCTTTAATATACTAGGAAAACCTTTGATGGGATTAGTTTTCTTTGCATTT
CTAAGTGCAAATCCAATTTATATAGGTCTTTCAGTTGTAATTTACTTTGTTCTATGGGCATTGTTTAGAA
AGAACAAAACAAGTATTCTTGATTATTTAGAAAAACAAGCACTTAAAAATGTAGAAGAAGAGCCTGTAGC
AGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2563478-2563176 PTS system, IIb component [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACAATTTAATGTATTATCAGTTTGTGGTTCAGGGACAGTTACATCATCTATGGTAGCAGGTAAAT
TAAAAGAAGTACTAGGTAATAAGGGGATTTCTATTACTACAACAGAAGCTAGACCAACAGAAGCACTAAA
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CCAACTATAAATGCATTTGCTTGCCTAACTGGTATAGGGGAAGAGGCATTCTTTGAAGAAGTTTTGACTG
TTATTGAAGGCATAGATAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2564047-2563601 PTS system, IIbc component [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGTAGATTTAATATCATTGGGTTTAGAATCTAATGATTATGAAAGTGTTATTGAAGAATTAGGAA
GTATAATGTGTAAAAAAGAATATGTAAAAGAAACATACATAAATGCTGTCTTGGAAAGAGAAAGGACATT
ACCAACAGGTCTAGATATTGGAGAAATGTGTGTTGCTATTCCACATACAGATTCAAAGCATGTAAATGAG
TCTAATGTAGCTGTAGGGATATTGAAAAATCCTGTAAAGTTTAATTCAATGATAGACCCAAAAGATAGAC
TTGATGTAGAACTTGTATTTTTATTAGCAGTAAAGAACCCAGATTCACAAGTAAAACTGTTAAAAGATTT
AATGTCAGTTTTTCAAAATATAAAGTTATTAAAAAATATAAAAAACGCATCAACAAAAGAAGAAGTAGCT
AAATTATTGGATTTTATAGAAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2566983-2564080 putative sigma-54 interacting transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGTTGAGAGATAAACTTGTAAACATCATAAATACAGAAAATAAAAAAGATCCATTAACAGATGTTC
AAATAGCAAAGTTTTTAAGTACAACTAGAGAGAACATAACTAATTTGAGAAAAGAACTTAATATAAGTAA
TTCAAGGCAAAGAAGATATCCTTATTTAAAATCAGCAATTTCGGCAATATTACAAAAGAATAAGAATATT
TCTATATCAGAAATTACAAGGGAATTGATGACAGAAGGCTTTAATATATCGAGAAGAGTTGTGGAGGAAC
TTTTACCTAAAGAAAGTTTAGAAATGGATGTAGTAGAGGAATCTGAAGAAGAATCGAATGACCCATTTGA
AACTCTGATAGGTAATAAAGGGAGTCTTAGAAATGCTGTGGAGCAGGCTAAATCTGCTATATTGTATCCA
CCAAAAGGATTACCAACGTTGATTATTGGGGAAAGTGGAGTTGGTAAGAGTTTATTTTCTAGACATATGT
ATGAGTTTGCAAAGCAAAAAAAGATAGTAAAAGAAAGCTCCAATTTTGTTGTATTTAACTGTGCTGATTA
TAGTGACAATCCACAATTATTATTATCTTTGTTATTTGGATATAAAAAAGGTGCATTTACAGGTGCTGAA
TATGATACACCAGGTCTTGTAGAAGAAGCTGATGAAGGAGTTTTATTTTTGGATGAAATACATAGATTGC
CTCCAAAAGGTCAAGAAATACTATTTTCTATCTTAGATAGGGGAAAGTTTAGGAGATTAGGTGAAACTAA
TGCTGAAAGAAAAGTAAGTATTATGTTGATTGGGGCAACTACTGAAAATGTAGAGACTAATTTATTATTA
ACATTCAGAAGAAGGATACCAATGCTAATAACTTTGCCACCATTACATGATAGATTACTAAAAGAGAAAA
TAGACCTTATATACAATATCTTTCAACAAGAGTGTAATAGAATAAATGCAAAAATATTTGTAGATAAAAA
TGTGATTGAAATACTTGTACTAAAAAAGTTTAGTGGAAATATAGGACAATTACAAAATATGATTCAGGTT
CTTTGTGCAAGAGCTTTTATGAAGTTTATAAATTCCAAAGATGAAGATAGTGAATCGATAGTAGTAGTAG
ATATAAATGAAGTTTTAAAGCTTAAAGATTCTTTTAAAGATGCTGCCTTTCAAGAGATTGAATATACAGA
GATAAGAAAATATTTGAAAAATGCTATATTTATACCATTTAATTTAGAAGAATCATCAGTAAAAGGAAGT
CTTTTAAGTGATGAATATATATTACCAGAGGACATATACAAAACAATTGAAAAGAAATATTATGACCTAA
AATCCCTAGACATTGAAGATATAGATATAGAGAATATTTTATGGACTTTTATTTTAAATAGATTTGCTGA
CTTAAAGTTTAATCTCGATAGTAATGAAGAAATTTTTTCAATGAGTGATTTAAATAGTTTTGTAAGTGAT
AGTTTAGTTAAACTGGTAAAAGAACTTATGAATGATATAGTTGAAAAAAATATGAATTTAGAAGTAAATA
AAAATATGTTCAAATATCTAGCAATACACTTAGAAGAAGCTATAAAAAGAATTAAGCTAAATCAAAAGAT
AATAAATGTAAATTTAGAAAAAATAAAGATTGACTTTTCAAAAGAATATGAAATTAGTAAAAGTTTTGCA
ATAAAAATTGAGGAATCAATTAGTATTAAGATTCCAGATGATGAAATTGGATTTATAACACTCTACATAA
AGTCTGCTCTAAAAAATGAAGTGAAAAAAGATAAAGTAGGGTTAATAATAATTTCTCATGGACGTATAGC
TACAGAGACTGTAAATGTAGTTAAAGAACTTTTAGGTGTAAAGTTTCCTGTGGCTATAGATATGCCTTTA
GATGAAAAACCAATAAATATATACAATAAGGCAGTAGAACTGTCAAAAATAATAGACCAAGGGAAAGGTA
TATTGTTTTTGGTGGATATTGGTTCACTTACAAACATAGGTCAAATAGTAAATAAGAGAACCAATATAAG
CACTAAAACTATTGATAGAGTAGACCTCCTAATGGCACTAGAAGCAACTAGAAAAGTTTCTATGGGAGAG
GAAGAACTTGATGAAATATTTTTTTCTTTGCTAAAAGATAGGATGGGATATAACTATGAATTAGAAAAAC
ACATAGATAAATCAAATGCAATTGTAACATTATGTCTTACTGGAGAAGGAACTGCTAAGTATATAAGTAA
AACGTTGGAAGAAAAGTATGATAACACTAAATGTTATCAAATGAGTGCATTGGATGAAAATTTATTTTGT
AAAATTGAAAATCTAAAAGAGACAAACAATATATTAGCTATTGTTGGGACAATAAACCCTAAGATACCAG
GTATAAATTTTATACCCTATAATAAAGAACTTTTCAAAAATTTGGATATCTATCTATCAAAATCAAAACA
ACAAGATGACAGACCAGTTAAATCGTATGAAAGAATGCTTGATGAGGATTTAGTGATTTTTGAACCAGAT
ATATATTTTAAAAAGGATTTATTAGAATATGTATGTTCAATTCTTATAAATAAAGAATATGTAGAAAAAG
ATTACTTAGATTCTGTTTTACATAGAGAAGAAATGCTTCCAACATATTCTAAAGGAGCTATAGGTGTGCC
TCATGGAGATTCTTCTACTGTAAATAGTACAAGGTTTGTTTTTGTTAAACTAAAGAATCCTATTGATTGG
GGTGTAGGTAATGTAAATTTCATATTTATGCCAGTTTTTCAGGCTAATGATAAAGAGATTGTTAAAAATG
TTCTTGAGATACTAAAAGATGCAGAATTTATGAACAATGCCAATAAGTGTTTTGATAAAGATGCTTTTAG
AAGGATTATATTTGATAAATTTAAACATCTGTAG
>ref|NC_013316.1|:2567461-2567883 hypothetical protein CDR20291_2182 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATACATTTAAAACTGAAGTTTTATTAAAATATTCTGCAAAAGACATATTTAATATATTTACAAAAT
CTGCAAGACTAAATTTTCCTAATTTTAATGAGAAAAAAGCAGTAGGAACATTTGTACAACAAAAAAATAA
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AGAGAAAGTACTATTACTAGATATGAATTAGTACATATTGACTTAGAAAATACAAAACTTATTTTTATTG
AAAGTGAGAGCAAGAGGAATATATTTGGAAAAATCAATTCAGCTCTTGTAAGAGTATTGTTTGGAAAAAG
GCAACCAGAAGAATTTAATAAATTTATAAAAAAACTAGAAATGGAATTGGAGAATAATAGTGTTAATTTA
TAG
>ref|NC_013316.1|:2568792-2570030 putative beta-lactamase inducer [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATTATTTATAGAAGTTATTAAATTTAATATTTACATAAGTCTACTAATTCTTTTTTTCATTTTAT
TTACTAAAAAGATAAGCAAATATACTTTTAAGTTTAATTATTTTATATGTCTTTTAATAGTAGTCAGAAT
GATGTTTATATCTAAAATAAATTTAAATATATTAAATATCAATAATACTACTATTAATATCTATAAACAT
AATCTCGATAATTATATACCATATGACCAGGGCATTACTTTAGATATATTTATGTACATCTGGATATTAG
GAATTATAGCAATCTCTTTTTACTATTTAAGAACAAATTTTAAATTTTATAATTACATAGAAAATTTTAA
AAAAGAAATTTTAGAAATAGATATTACTAGTATCTTAGATGAACAAGCAAAAGAACTAAGTATAAATAAA
AAACTTCAGATATATAAGGTTAAAGGTATTTATTCCCCTGCCATTATAGGTTTAACACGCTGTAAAATAA
TAATTCCAGAAAAAAAGTACAATAATAAAGAGTTAAGATTTATCTTTAAACATGAATTAATTCATTATAA
AAGAAAAGATAACTTATTTAAGCTTCTAATTAGTATAATATGTATCATACATTGGTTCAATCCAATTTTA
TACTTATTAAAAAAATATTTTCATGAATTATGTGAATTATCTTGTGATGAAATTGTGATTGACAAATGTA
CCACGAGTGAAATTAAAGAGTATGCATATATAATATTAAATACAATAAAGTATCAAAAAACTTTGAAGTA
TTCATCATTCGTATCTCAGTTTCTAAATAAAAAAAATATTATTTTAAAAAAGAGGTTAAATTCTATGTTT
AATCAAGATAAAAAGAAAATTAATTTAGGTCTTAAGTTTTTATTAACCTTTATAATAATAGGGTCAATAT
TTTCTATCAACTCCAATTTTAAACAAAATGAAGATGTAGAATATACTATTGCTAAGATTAATTATAATAA
AAATGGAGAAACCTATGGTACACATATAATAGACTCAAATGGAAATTCCATTGAACCAGAACTTATACAA
ACAATAGGTAGAGGTAAAAAAGTCGGCTACGTAAAAAAAAGAGATTTGTACGATTGTGATAATCAACCAA
AGACACCAGAAGAAGCTGTTTTATATACAAGAAAAAGAAATTTTAATATATTTAAAAAAACAATCCCTCT
TTATGATAAAGAAGGTATAAAAATTATAGGAAGATTTGAAATCAATTAA
>ref|NC_013316.1|:2570138-2571523 GntR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGCCAATTAATTCTTTTGAAAATTATCCTATGAACTGGAAACCAAAGAGACCTTCAAAAGGGCAAATAT
TATATAAGGCGCTTGCAGAACAACTAGAACAAGATATCAACAATGGATTTTTATTACCAGGTACTAAATT
ACCACCCCAACGTGAATTGGCAGATTTCTTAGATGTTAATGTGAGTACTATCTCTAGAGCTTTTAAAATT
TGTGAAAAAAAAGGTCTAATAAGTGGAGTTACAGGAAGTGGAACTTTTGTATCTTATGATACGCGTTCAA
ATCTATTCTTGATGTCCAGTAATAATAAAATTACATTTATTGAAATGGGCACAATGAATCCAGATTTCAC
ACTAGAAGAAATGAATACTTTGTTTAAACATATAATTAAGGAAATAGATTTTAAAACTATATTCCAATAT
GGACAAAGAGATGGTGCTAAATGGCAAAAAGAAGCTATTGCCAAATTAATTTATAAAGCTGGGCTTGAAA
CTACATCAGATAGCTTACTTCCTGCAAGTGGTGGACAAAATGCAATTGTTGCTATTTTAGCTGGTTTGTT
TCAACATGGAGATAGAATAGGTGTAGACCCATTAACTTATCCTGGAATAAAGACAGCAGCTAAAATGCTT
GGGATTCAACTAATTCCAATTAAACAAGAAGATAATGAGATTAGTGAAGAAGGACTATTATATGCTTGTA
AAAATGAAAATATTAAAGGTCTATACATAATACCAGATTATCAAAATCCAACTACACATATAATGTCACA
AAATGGACGAAAAATGATTGCAAATATTGCATCTAAATACAATTTAATTGTTATTGAGGATGCTATTCAT
AGTTTACTTAATGAAACACATTTAAATCCAGTGGCTTCCTATCTGCCCAATCAAACAATTTATATTACGA
GTTTATCAAAAATTATTGCACCTAGTTTACGGCTAGCATATATCTCTACACCTAAACAGTATCGAGAGGC
ATTATCAAGCGCATTATACAACATTAATCTATCTCAATCTTATTTTTTAACAGAAATTGCTTATCGCATG
ATTACATCAGGTGAAGCCGATAAATTAATTAATGCACGCCGTAAATCTGCAAGAAGAAGAAACAAGATTA
TTAATCAATATTTATCTGGATATAATCTTTTGGGAAATGAAGAATGTATATTTAGATGGTTGATTCTACC
TGATGGAATAATGGCAGAAAAATTTGAGATACAAGCACTTAAAGAAGGTGTACAGGTCTATGCTTCTGAA
CGTTTTGCTGTTGGAAAAGAAAAACCAATTTCTGCAATAAGAATAGCTGTATGTGCTACAGAAAGCACAG
AAGAACTTAAAGCTGGTCTGAGCGTATTAAAAAGACTATTAGAAGAGAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2571801-2572502 hypothetical protein CDR20291_2185 [Clostridium difficile R20291]
GTGGAAAGAACTCAACAATTAAAAGAAAGCTTTATTGCTTCAATTCCTATATTCTTAGGTTATATACCTA
TAGGTATAGTAGGAGGAATACTATTACAAAAATCTGGTCTTTCACCTTTTCAAATAGCACTAATGGTAAC
TTTAGTATTTGGAGGAAGTTCTCAATTCATTGCAGCTTCAATGATTTCTACTGGTGCAAGTGTAACATCT
ATTGTTTTGACTACATTTATAGTTAACTTAAGACATTTTCTAATGAGTTCTAATTTGAACATGTACATAA
AAAATAAAAGTCCAAAATTTATATTGCCATTTTGTCATACTATAACAGATGAAACTTTTGCAGTTAATTA
TGAAAAATTTACTGCTGGAAATTGGTCTGATAGAAATGCTATTTATCTTAATTTCTTCTGCTTAATTTCA
TCAGTTTTAGCTAATTTTATTGGAGCATTTTTAGGAGAAAGTATATCTATAGACAGTTCTATTTCTGGCT
TCATATTGACTTCTATGTTTATAGCTTTAATAGTTTCTCAAATAAAAAATAAGATTTATATTGTAGTATT
TATATCATCAATCATTATTTCTGTTATTTTATATGCATTATTCAAAAGCAATTTAGTAATAATAGTTGCA
TCAATTTTAGCATCTTTAATTGGTTTCTTTATAGAAGAATCTTACTGTAAAAAGGAGGAATCTTATGAAT
AA
>ref|NC_013316.1|:2572495-2572818 hypothetical protein CDR20291_2186 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATAATTATATATTTTTTATTATAATTGGAATGTACATTGTTACATATCTACCAAGAGTGCTTC
CTATGTTAATTTTTTCAAAAAAAGAGATGCCTGATTTTTTGAAAAAAATCATGAAATTTATACCTGTAGC
AATACTTACTTCCTTAACTGCTAAAGATGTATTTTTTAATGGAGATAGTCTATATTTATCTATAGCTAAC
CCTAAAATTATATCTTTTATGATTGTACTTCTTGTTGCATATAAGTTTAAATCTATTGGTATTTCTATTA
TTACAGGAGTGATATCTATATATTTATTTGGAATTATCTTGTGA
>ref|NC_013316.1|:c2575093-2573024 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
GTGGGCAACTTGGAAAAATATAGAGCATTAAAATTAGTTTCATTAATCATAATATCTATCTCATTTCCAT
TAACTATATTGTTGGCTACAATAGGACTTGCTGAGCCTAAATACAATATACAAAAAACTTCTACAAAGAG
TGGGATTTTTAATATATCTAATGATTTTTATGATAGTAATATATTTGATGAAGGAACAGTGGAAAGCTTA
TTATCTAATTTTAAGATATCTGTGGATAGTCAGTTAACTAGTGAAGAAAAAAGTAAACTCCAAACAAAAA
GTAAAAGTATAGATTTAAGTAGTAATGATTCTGAGTATGATAAAATCATGATTAATAAACAAGCTTCTGA
AGAATATTTAAGTTATCTAAAAAATATAAAAGTGTATGTTATTAATACATATACAGGAGTATTTTATACA
AATACATCATATGGTAATTTAGATGATTTTAAACAAAAAACTAAGAGCTATTGTAATATAGAGATAATAA
ATAATGTAGGAAAGAGCTCGTATATTAAAACAATAAATGGAGAAAAATTTGAACTGAATAATCTGAGTAT
GGAACTAAATGGAGTAGATGAAGCCTTTGAGGCATATGTCTCTTTTCCAGAAGAGCCAACTATAGAAGAT
GGAATAGTATACACTAATTTTCAAATATTTAAACAAGCTACAGAAAAAGTAAGATTATTTTTTGTAGCTT
GTTTAAGTTTAGCAATTGTGTGTTTATTATCTATCATTTTATATAGCAGAATAAAAGGTGAAGTTTTAAA
AAGAAATAATGTATTTTTACTAATATACAGTAAGATACCTATGGAATTTAATGTAATACTAGTATTTATT
TCAATTGCAATTTTAACTATGTATGCTCTTGCTGTATCTTATCATATTGATGTAATTGTATTAGTTTCTT
TATCTTTACTGATAGTATCAAATAATATATTTTTTATAAATGTGCAATTGAGTTATTTAGAAAATAAAAT
GTGTATATTTAAGACAAGTATTATAGTAAGAGTGATTTTATGGTTAATAAAAACTGTAAGGGAGGTCAGT
AACGCTATAAAGAAAGTATCTTTAGCAAGGAAAGTTATTGTTATAGTGATAATATCTTTAGCTTTAATCA
TGGTAATTAGCACTCGAAGTATAGGTATGGGATTACTGTTTTCTATATGTATTTTTTTAGGATTTACAAT
ATATATAACTAAAAGACTTTCATATCTTAGTTACGTAATAGAAGGTACAGAAAGAATAAAAAAGGGAGAA
TTAGATTATAAGATAAAAATTACTGGGAATGATAATTTTACGTCTTTAGCTGAAAATATAAATAATATTG
GAGAAGGTCTTGATAGAGCTATAGAAGAGCAAGTAAAAAGTGAAAGAATGAAGTCTGATCTTATAACAAA
TGTATCTCATGATTTGAAAACTCCACTTACTTCTATAATAAATTATGTAGATTTAATTAAAAAAGAAGAA
TCAATACAACCAGAGTATATAAATGATTATATAAAGGTACTTGAGTCAAAGTCAAAAAGACTAAAATTAT
TGATAGAAGATTTATTTGAAGCGAGTAGAGTAAGTAGTGGCAATATAGAATTACAAATTAGCAAGATTGA
TTTAGTGCAACTATTAAGACAAAGCATAGGTGAACTTGAAGAAAAATTATCTAAAAATAATTTATATTTA
AAATTAAATGTTCCAAATGATAAGGTGTATATATGGGCAGATGGAAGAAGAATGTATAGAGTATTTGAAA
ATCTTTTATCTAATATAGCAAAATATTCCTTAGAAGAAACTAGAGTCTATATTGATGTATATGACTATGG
TGAAAATGTAAAGGTAACTATGAAAAATATATCTTCTTATGAATTAAATTTTGACCCAAGTGAGATTATG
GAAAGATTTAAAAGAGCTGATGAATCAAGGAATACTGAAGGAAGTGGATTAGGGCTTGCTATTGCAAGAG
ATTTAGTAGCTTTACAAGGTGGAAAATTTTATATAGAAATAGATGGAGATTTATTTAAAGCAAATTTAGA
GTTTCAAAAATATGAAGAAGAAATAACAAATATGGAATGA
>ref|NC_013316.1|:c2575972-2575280 two-component system response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGTACAATATATTAGTAGTAGACGATGATAAAGAAATTGTTGATTCAATAGAAATATATCTTAAATCAG
AAGGATTTAAAATATATAAAGCATATGATGGAATGAAAGCTTTGGAAATAATAACAGAGAATGACATTCA
TCTAATACTAATGGATATAATGATGCCTAAATTAGATGGAATCAAAGCAACTGTAAAAATACGAGAAGAA
AGAAATATTCCAATAATTTTAATTTCAGCAAAAAGTGAAGATACAGATAAAATAATAGGATTAAATATTG
GAGCTGATGATTATATAACAAAGCCATTTAATCTATTAGAGCTTATAGCTAGGGTTAAATCAAACTTAAG
ACGATATGTAACTTTAGGTAATTATGAAGATACATGTAAAGAAATTTTAAAAAGTGGAGCTTTGGAGTTA
AATACACTAACAAAAGAAGTTAAAATTGATGGTGAAAACATAAAAATGACCCCAATTGAGTATAAAATAA
TTGAACTTCTTTTAGAAAATAAAGGACGAGTTTTCTCAATAGATGAGATATACGAAAAAGTATGGAATGA
GGAAAGTTTTAATTCAGAAAATACAGTAGCAGTACATATCAGACGAATAAGAGAAAAGATTGAAATAAAT
CCAAAAGAACCAAGATTTTTAAAGGTGGTGTGGGGAGTTGGTTATAAGATTGAAAAATTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2576968-2576768 putative repressor () [Clostridium difficile R20291]
ATGTATACTATGAAAATTAGTAAATTACCAGAAGCGGAATTAAAAGTTATGAGATATATTTGGGAATCAG
AAAAGGTATTAATATCAAGAGAAATCACCAAGTCTATGGAACAAAAATATGAATGGAAAGATACAACTAT
ATTTACAGTATTAAAAAGATTACTAAAGAAGAGAGTTTTTAGAAACGGAGAAAATAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2577441-2577064 putative regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
TTGAAAGAAGAAATATTAATAGAAAAATTATTAAGAGCAGAATTAATAGTAATGGAGTATTTATGTAAAA
AAGACACTCTAATGCCTAAAAAAGAAATTGTAAAAGAAATAAAACAGATTTATGGATGGCATAAAAGTAC
AATAAAAATACTACTAAAAAGGCTAGTTGCTAAAAGGTATTTGGCTAGATATATTATAAATTTTCAATAT
CATTATAAAATAATAATAGATAATAAAGAATATTATACTTTTAAGAAAAAGGTACTAAAATCTAGTAAAA
GCATAAAAATAATGCGTTCACTTACCACTACACATAAAAATGTAAGTAAAGAGAAGTTAGACCTATTAGA
TGAGTATTATAGAAATTTAAAAGAATGA
>ref|NC_013316.1|:2578248-2578742 putative pilin protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATAAAAAAGGATTTACTCTAGTGGAATTATTAGTAGTAATTGCTATAATAGGAATATTGGCAA
TAATAGCACTTCCAGCATTATTTAAAAATATAGAAAAAGCAAAGATAGCTAAACTTGAAGCTGATATAAG
TGCAATAAAAAGTGCATCTCTTAGTTACTATGCTGATGAATCCAAGTATACTGATGGAGGAATGATATCA
TGGGTAAAGAAAGATGGAAAAATAATAATAAATGGGGGTTTTAAAGATGACCCATTAGCAGATAAAATAG
AAAATTTAGGGATGCCTTATAATGGTTCATATCTGTTAATGTCATCTCCTGGTCATGAAAAATATCTAGA
ATTAAGCATACTTCCAGAAGGAGAAATAAGCAAAAGTGGTCTAGATAAATTAAAAAATGATTATGGAAAT
TTAATAGACATAACGAACGATCAAAATAAAATAAATATTGTAATAAAACTTTTAAATAATAAATCGAATA
CTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2579953-2579765 hypothetical protein; hypothetical protein [Clostridium difficile R20291]
ATGACTAAATATGATTTTAATTTCAAATTAAAAGTAGCTAAATTTTATTTGAATAGAGAAGGAAGAGATA
TTTTAATAGTAAAACAATATGGAGTTTATGACCATTCTCAAGTTGAAAGATGGGTTAATATATTAGGAGA
GGGTGCACTAAAAATAAAAAAGTTTTCTATACTATATGGTTCAAGTTAG
>ref|NC_013316.1|:2580115-2580465 putative membrane protein precursor [Clostridium difficile R20291]
ATGATTCAAAAAAAAATTTTTATGGGTTTTTGTGGTTTCCTTGGATTTTTAAGTCTTAGATATTTTTCAT
CTGGCAATGTTACTGATCTTACATATATTGGATTTTTTGCTTTTTTCTCAAACTTTATTATAGCAAAAAT
AAATGGTGATAAAGCAGATGAAAGGTATGTACAAGATGAAAAAGCAGCTATGGCATTTACAGGACAGCTT
GCTATTATAGAATTATTCATTTTATGGTGTATTACTATAGTGTCTAGGAATGTAGAATTAATGTGTGTTT
TACTATCAATTACATATGCAATCACTTTAAATGTTTATGCTATAAAACTTTATATTTTAGAGGAAAAATA
A
>ref|NC_013316.1|:2580467-2580667 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGCCCAAATTCATTTGTAACCTAAAAAAATATAGACAATTAAAAGAATTAACTCAAGAACAATTAGCAG
AAAAAGTAGGAGTTAGAAGAGAAACCATTATGCGTTTAGAAGCAGGAAAGTATAATCCTTCTTTGAAATT
AGCAATAGATATATCAAAAATAGTAGATACACCTATTGATGAATTGTTTATTTTTGATTAG
>ref|NC_013316.1|:c2581744-2580923 integrase, catalytic region [Clostridium difficile R20291]
ATGCAATTATGTGAAATCGCTAAAGTAAATCGTTCTGGATACTATAAATGGCTCAATCGAGATAAAAGTA
ATTTAGAACTTGAAAACATTAAATTAGCAACTTTGATAACTAATATATATGAAGAAAAGAAGGGAGTTTT
TTGCTCTTTAAGGATGACCTTGCAGTTAAACAGAGAGTATAAACTTAATGTCAATCACAAGAGAGTTTAC
AGACTAATGAGAGCCGTAGGCTTAAGGTCTATTTGTAGAAAAAAGAAATTTAGTTATGTTAAATGTACAC
CAGAAGTAATTGCTGAAAATGTATTAAATAGAAAATTTAGTGCAGATAAAACTTCTCAAAAATGGTTAAC
AGATGTAACTGAATTTAAATTAACCAACGGGACAAAGGCTTATTTAAGTGCAATTCTGGATTTAGGTGAT
AGAAGCATAGTTTCATATGTTATTGGAAAATCAAATAACAATAACTTAGTATTCGAAACTTTTAATAAAG
CAATAGAAGTATATCCAAATGCAAAACCTATCTTTCATAGTGATAGAGGCTATCAGTATACTAGCAGGGT
GTTTAAATCAAAACTTTTAACACAAGGCATGATACAAAGTATGTCGAGAGTTGGTCATTGTATTGACAAT
GCTCCTATGGAAGGATTTTTGGGAATTTTAAAAGTGGAAATGTACTATTTAAGGAAATTTGATACATACG
AACAATTAGTCAAAGCAATAGATGATTATATATATTACTATAATAATTTTAGATATCAAAAGAGATTAAA
TTCTATGTCTCCACTTGAATTTAGGAAATATTTAAGTACAGAGATAGCATAA
>ref|NC_013316.1|:c2582487-2581816 full=transposase [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTAAAACTAAAGTATCATCAGAGCAAAAAATCGAAGCAATTGAATCATATTTAAAGGGTGAAAATT
CAGTAATAAAAATAATGGAAGAATTAAATATTGGAAAACGTACATTCAGAGAGTGGATGCGAAATTATGA
AACTTTTGGAAATGATGGTTTAATAAAACAAAGTCACAAATCATGCTATTCTAAAGAGTTTAAATTAAAT
GCTATAGAATCTTATCTAAATGGGGAAGGATCTTATGACACTATCTCAAAAAAATATAAAATGAGGTCTG
TTAATCCACTAAAAGCTTGGGTTAAGGAGTATAATCTTCATAAGGAGATAAAAGAAACCCCGAAGGGAGG
ACTCTTTATGGAGACTAGAAAAACAACATTAGATGAAAGGGTTGAAATTGTTAAAGATTGTATTGAGCAT
GATTTTAATTACAATTTAATAGCAAAAAAATACTTTGTTTCATACAGCCAAGTTAGAAGATGGACTCTTA
AATATAAAGAAAATGGTATAGTTGGTTTAGAAGACCGAAGAGGTAAAGCAAAAAAAGAAGATGAGTTAAC
TCAATTAGATGAAATAAAGTTGGAATTGAAAATTGTAAAAGCAGAAAAACACAAATTACAACTGGAGAAT
GCATTCTTAAAAAAGTTAAAAAACATAGAAAGAGGGTGGTAA
>ref|NC_013316.1|:2583216-2583416 cold shock protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATGGAATAGTAAAATGGTTTAATAATGAAAAAGGATTTGGATTTATATCAATGGAAAGTGGAG
ATGACGTATTTGCTCATTTCTCAGCTATACAAACTTCAGGATTTAAATCATTAGAAGAAGGTCAAAAAGT
AAGCTTTGATATAGTTAAAGGCGCTAGAGGTCCTCAAGCAGAAAATATAACTATATTATAA
>ref|NC_013316.1|:2584051-2584863 ABC transporter, substrate-binding protein0 [Clostridium difficile R20291]
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AAGAAAACAAAGCTAATGATGAATCTAATACTAAAGTGACAACAGCTGATGATTCAAAAGAAAAAGAGAC
TCTTTTTGTCTATTCAGGGGCAGGTTTAAAGAAACCAATGGATGAAATAGCAAAAAAATTTGAGAAAGAA
AATAATGTCAAAGTTGAATATAGCTATGCAGGTTCTGCACAGCTAATAGCTCAAATTGAGACAAGTCACA
AAGGAGACGTATTTATTGTTGGTTCTGAACCAATTTATTCAAAGGCCTTTGAAAAAGAACTTGTAGGTGA
ACATAAAACGGTTGCACATCATACACCTGCAATAGTTGTACCTAAAGGAAATCCAGCTAATATTCAAAAA
TTGGAAGACTTAAATAAAGATGGAGTTAAACTTATTTTGGGAGACAAAGAGTCTAATGCTATAGGTAAGA
CTACACAAAAAATACTTGAAAAAAATAATTTAAAATCTATAAATGATAATGTTGTCTCTACAGCTGCAAC
TGTAAATGAAATGATTGTACAGTTAACATCAAGTAAAGCTGATGCTACAATAGCCACAAAAGATTCGGTC
TTTGGCAATGAAGATGTAGAAGTTATAGAAATTGCCCAAGATAAAAATATAGACCAACTCATATCAGCAG
GAATCGTAAACTATAGTGATAAAAAAGATTTAGCTAATAAATTTATAAATTATATAGAGTCAGATGAAGC
TAAACAGATATTTAAAAAATATGGTTTTGAACCTGTTAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:2584873-2585664 ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
TTGAAAAATAAATTTTTTACTACACTACTTACTGGATTTTTTGCTATAGTCTTTTTTTTTATTGTATCAC
CACTTCTTATGTTAATCATTAAAGGGATAAGTTATGTTCCTATATGCTTAAAATCCGTGGAAGTACAGTA
TGCAATAACACTTAGTATTAAAACATCTTTAATATCTACTATAGTATGCCTTTTATTAGCTATTCCAGTA
GCATATTTTTTACATATTACTAAATTACCATTTAAAAAACTGATTATACAGATAATAAATCTCCCTATGT
CTCTTCCACACTTAGTATCAGGAATTGCTCTTTTACTTTTGTTTGGAAGAATGGGGATTGGAGATTCCAT
TTATAAGATTTTTAAGCTTGATTTTATATTTACAAAGCAAGGTATAGTTTTAGCACAAGTATTTGTAAAT
CTTCCACTTACTATTAAAATACTTCACACTTCACTAAATGAAAGTAATGAAAAGATGATATTTGTTGCAC
GTACCCTTGGATGTAATAGTTGGGAAGCATTTAGATTTATAATTCTTCCAAATCTAAAAACTGGAATCAT
ATCTGCAACTGTAATGACTTGGTCAAGAGCACTTGGTGAATTTGGTGCAGTAGCTATGATAGCAGGTTCT
ACACGTATGAAAACTGAAATTATTCCTACATCTATATATTTAAATATGTCTACTGGTGATATAGACATTG
CAATCGGAATAGCTGTAATTTTGATATTTATCTCACTTACATGCTTGATGCTTTTTGAGATATTTTTTAA
TAGAGAGGTTGATAAGAATTAA
>ref|NC_013316.1|:2585666-2586361 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAAAATAAAAAATTTATCTCTTGATTTACCTAATTTTAAATTACAAGAAAATAGTTTAAATATTA
ATAATCATGAATACTTTGTTTTATTAGGAGCTAGTGGGTCAGGTAAAACTCTATTCCTAGAAACATTAGC
AGGAAGATATCCATCTGCTAAAGGAAATGTATCATACAAAGAAAATTTAATATCAAACTTACCTCCAGAA
AATAGAAATATAGGATTTGTATATCAAAATTTTGAATTATTTCCAAATATGAATGTTGAAGATAATATAA
GGTTTCCACTTAAATTAAGAAAAATACCTATAGATGAACAGATTCTTAAGGCTAACCACTTGTCTAAATT
AATGCAGATAGAAGATATAAAAAATAGGTATCCTAAAAATTTAAGTGGAGGCGAAAAGCAACGAGTTGCT
TTTGCACGTGCCTTAATAGCTGAACCTGATATATTACTTTTAGATGAACCTATGAGTTCATTGGATTATA
TTACAAAAAAACATATAAGCAAAATTTTGAAGGATGTCTACATAAAATACAAACCAACAGTGATTCATGT
TACTCATGATATTTCTGAAGCAATGTTTTTTGCTCATAAGATAGGAATAATGAACAATGGAAAAATAAAT
CATATTTTTGATTTAAATGAAGAAATAAAAAATAAAGGAGAATCTTTTTTCTATGAATATATTTGA
>ref|NC_013316.1|:2586348-2587079 hypothetical protein CDR20291_2203 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATATTTGATATTTTGAGAGATTATCTATTAGTACAAGTCGATAAATATAATTTAAATATGGATA
TGATAAGTATTGTGTCCAAATCTCTATCTTCAAAAGAAGCAATTGGAAATACTAAGCGTAAAGATTTCCC
AATTATAGTTGGTAAAGAAATAATGCTTGAAGCTGACTTTAAAGGAGCTAAAGGACAAGCATTTACTTCT
ACTCCATCTACATTTGAAGGTTCTTTAAAAGACATATTATCATTAGATTTACATGACAATCCTCATGATA
GAAGTCTTTTTATAGCATCATTAAATGCAGTTATGAAATACTTAGGCAAGACGGATAGAACCATTCATTG
TAAAAATAACGAGCCAGAGGTATGTGCAAAAAAATTCCCTGAGTTTATAAAAATGGAATTTGGTAATCCA
AAAGTAGCAATTATAGGATATCAACCAGCCATAATTGATAATATTAAGGACTTTTTCGAAACAAGAGTAT
TAGATTTAAATCCTGAATTTGTGGATACTATTCAATATAATGTTAAGATTGAAGATGGTATACGAGATTA
TGAAGATGTAATATCTTGGGCTGATTTAGTGATTTGCACAGGAAGTACATTATGTAATAACTCAATTATA
AATTTTCTATCACTTAACAAACCAGTTTACTATTATGGAACTACGATAGCTGGTGCATCAAATATTTTAG
GTTTAAAAAGACTCTGTTTTTGTAGTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2587394-2588194 hypothetical protein CDR20291_2204 [Clostridium difficile R20291]
ATGACATTTAAGAATAAAAAATTTACTATAAATAAATATGAAATTCTATCTATTATTCTAGTTTTATGCT
TGATTTTAACCGGTTTTAGTAGCTATGTGAATTATAGTCATAAAAAATTTAAAGATTATGTTGTCTTCTA
TGTTCAGCATCAAGATGATGAAGTGTTGTGGGCTGGGAGTGCTATTGTTAATGCTATAAAAGAAAGAGGA
AAAAATCATGTATTTGTAGTTTTAGTATCTACTGGATGTGGTATATCCGTCTTTGATAAATATAAAAAAT
ATGAAAACCTAACAAATATACAAAAATCAGAATATAGAAATAGAGAATTTTTAGCTTCTCTTAATAGCCT
TGGTGTAATAAGGGAAAATATAATATTATTACCAGAAACAAATACAAATGGTAATACTGACTTCAATTAC
ATGGAAAAAATTGCTCTTACATTTGAAGAAAAATTTAAAAATGTAACTCATATAGCACATACTTATAAGT
TAGATGACCATTTACAACATTTAAAAAATGGTTCTGTTATCCAAAATTTATATAATGTTGGTAAAATAAA
AGATGCTAAATATTTTGTAAAACCTAAATTTGCTGATAAAATAACTTTTAATAATAAGATAGTTTATAAA
GCTCATTCTACTGAAGACTATGAAAAGGTTAAAAATGCCTGTCAACAATACAAAATTGTTGATGAATTAG
AATATAGAGAAGGTATTGGCTATAAGTCTGACCATAAATCATTTGATAAGTTATTAAATAATAAAGATGT
TCCTGCTATACTTCATACACCTAATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:2588735-2589451 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
TTGAATCAAAATATATTGGTTGTAGATGATGATAGAGAGATAGTTGATGCTATAGAGTTCTATTTGAGAC
CTGATAACTTTAATGTTTTAAAGGCATATGATGGACTTGAAGCATTGGACATACTAATCGAAAATGATAT
TAAGTTAATAATAATGGATGTAATGATGCCCAATTTAGATGGGCTTAAAACTACACTTAAAATAAGAGAA
AAAAGGAATATACCAATAATTCTCTTATCTGCAAAATCAGAAGATATGGACAAAATTATAGGTCTTAATA
TGGGTGCTGATGACTATATAACTAAACCATTTAATCCACTAGAACTTACTGCTCGAGTAAAATCTCAACT
TAGAAGGTATATAAATTTAGGTGATTTTAGTAATACAAATAACTCAAATGATACTAATTATATTCTAAAA
AGTGGTGGCCTAGAGCTAAATACAGATACAAAAATAGTTTCTTTAGATGGTGAGGAAATTAAAATGACAC
CACTTGAATATAAAATACTTACACTTCTTATGTCACGAAAAGGTAAAATTTTCTCTTCCCGTGAAATTTA
TGAAAATGTCTGGAATGAAGATGCTTATAGTTGTGAGAGAACTATTGCTGTTCATATTAGAAGAATTAGA
GAAAAAATTGAAATTAATCCAAAAGAACCAAAATATTTAAAGGTGGTGTGGGGCATTGGTTACAAAATTG
AAAAACTTAATTATTAA
>ref|NC_013316.1|:2589432-2591012 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
TTGAAAAACTTAATTATTAATGATTCTAAAGCAAAATTTATTTTATTATTATTACTGTTTCTATTAGTTT
CTATATTATTTGAAGCAGTTTATGATTTGAATAATAACTTTTCTTATAATATTAATTGTTATTATAAAGA
GTTTGCTCTCCCTTATTTTTATTTTTTCGGTACTCCTGTACATTTGTCAAAAGTAGAATTAGAGTTTGTC
TGCATAGGTATTATATTATCAAGTTTTTTATTGACTATACTATGTTTTACATTGTATAAAAAAAATAAAC
AGACTAAAGTCAAATTCTTAGAGAATGTCATAAGCCTTTTTTCTAAGGTAAAAATAGAACTTACACTTAT
ATTAACTTTGATACTATTAACCTTAAGGTTTCATGCATTTACAAGTAATAAAATGTTTTACAACACTAAT
TTAATAATCTACAATTTTATAATTATATCTATAGTCTATATAATATATGAAAATATTAAATATAATAACT
ATAATCTAAAAGATATGTCTATAACATATGTATTCTTTTCAAACTTACTTAGTATGTATAATAAAAAAAC
TATAAATAAAAAATTAGCTATAGTATTTTTAATATCTATAGTTGTACAAGCTATTATCCAATATCTTGTT
TTGATATTCTTTATGTATATATATTATTCTGAGGCAATAGCTATAGTAATTTTATTTACACTTGTAAACA
CAGTTTTTCATTTTTATATATACAACTTTTTATCTGTTAAGTTTAATTACATAAATAACATATCAAAAAA
TATAAAAAATATAGAAAATGGCAATTTAAAGTATAAATTAGAAGTTATAGGAGATGATGAAATATCTACT
TTAGCCAAAAGTATAAATAATATAACAGGTGGTCTTGAAACTGCTGTAGATGCTAATATAAAAAATGAAA
GGATGAAGGCAGAGCTTATCACAAACGTATCTCATGACTTAAAAACTCCACTTACATCTATATTAAGCTA
TGTTGATATGTTAAAAAATAATGACTTTGACAGAGAGACTATAAATGACTATATAAATATTTTAGATAAA
AAATCACAAAGATTAAAATTATTAATAGATGACATATTTGAAGCATCTAAGCTAAGTAGTGGAGATGTAG
AATTTAATATAACAAAAACCGATATAAGAGAACTTTTAATTCAAAGTATTGTAGAGTTTGAAGACAAAAT
TCAAAATAGCAGTTTAGATTTTATAATAGAAACACCTGAATATGCTGTTTTTACCATGATAGATGGTAAA
AAAACTTGGAGAGTTTTTGAGAATCTAATTTGCAATATACTAAAATACTCTATGCCTAACACTAGGGTCT
ATATAGATATGTTTATAAAGGAAGAAAATATAATATTAACGTTTAAAAATATTTCAAATGATAAACTAAA
TCTAAAGCCAGAAGAGTTAATAGAAAGATTTAGAAGGGGTGATATATCTAGAAAAACAGATGGCTCTGGT
CTTGGTTTATCAATTGCTCAAAATATAATTGAATTAGAAAATGCACACATGGAAATAATTATAGATGCTG
ATTTATTTAAGGTAATGCTTACTTTTAGAAGAGTTAATTGA
>ref|NC_013316.1|:c2592826-2591324 putative phosphoglucomutase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAGACCTATATAAACTACAAAATGGTACTGATATTAGAGGAATAGCGTATGAAAATGATTCTAAAG
AAGTTAACCTAACTGTAGAAGAAGTAAAAAAAATAGCTAAAGCGTTTCATATTTGGCTAAAAGAAAAGAC
TAAGAAAGATAAAGTAACTGTTGCCATAGGAACTGATTCTAGGATAACAGGAAGCCAATTTAGAAGTACT
GTTATTGAAACTTTAACTAATGATGATTGTAATGTAATTGATTGTGAGATTGCTACAACTCCAGCTATGT
TTATGACAACTATTATGGATGGATACAATTCTGATGGGGCGATTATGATTACAGCAAGTCACTTACCTTA
TTACTATAATGGTTTAAAGTTTTTCACAGAAAGTGGAGGTTTAGAAAAAACTAATATAAAAGAGATGTTG
GATATAGCTGTTAAAAATGATAGTGTAGACTATGAGGAAGTAAATAAAAAAGGTGAAGTTATAGTAAAAA
ATTTAATAGAAGATTATTCTAATTTATTGATAGATAAAATTAGAAAAGGTGTAAATTCAAGTAAAAATTA
TGAAAAGCCTTTTTCTGGGCTTAAGATATTGGTTGATGCAGGAAATGGAGCTGGTGGATTCTTTGCTGAA
AAAGTTTTACACATACTGGGAGCAGATACGACAGGCAGTCAGTTTTTGAACCCAGATGGTATGTTCCCAA
ATCATATACCTAATCCCGAAAACAAAGAAGCAATGGAAAGCATATGTAAAGCTGTGTTGGATAATAATAG
CAACCTAGGAATAATCTTTGATACAGATGTAGACAGAGCTGCTATTGTAGGTAAAAATGGCAAACCAATA
AATAAAAATGCTCTTATAGCTGTTATATCATCAATAGTATTAGAAGAACATCCAAAAACAGCTATAGTAA
CAGATTCGATTACTTCTGAAGGACTTGCTAAATTTATAAATGAATTACAAGGAAGACATCATAGATTTAA
AAGAGGATATAAAAATGTAATAAATGAAGCTATAAGATTGAATAGTGAAGGTGAAGAGTGCCATTTAGCT
ATAGAAACGTCTGGACATGCTGCTTTAAAAGAAAATTATTTCTTAGATGATGGGGCATATTTAATAGCTA
AAATTTTAATAAAAGTAGCAAAGCTATCCTTGGAAGGAAAGACTATAGAAGAATTGATAGAAAACCTTGA
AGAAGCTCAAGAAGAGAAAGAAGTTAGAATAGGCATTAACAAAGAAGATTTTAGACCATATGCAGAGGAT
ATATTAAAAGATTTAGATTCTCATGTTAAGAGTATTGATGGATGGTCTGTAGCACCAAATAATTTTGAAG
GAATAAGAGTTAATTGTGATGAATCAAATGGAGATGGATGGTTTTTACTTAGAATATCACTACATGAACC
ATTACTAGCTTTAAATATTGAATCAAATAAAATTGGTGGAGCAGAACAAATTTATTCTAAGTTAAAACTT
TTCTTAGAAAAATATGATTTAAAAGGTCTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2593601-2592936 putative ribulose-phosphate 3-epimerase [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTATTATTTGTGCTTCAATAATGTGTGCAGACCAAATGAAGTTAAAAGAGGAATTAGAAGCTCTTG
AAGAAGCAGGTGTAAAATTACTTCATTGTGATGTTATGGATGGAATATTTGTTAAAAACTTGGCTATGGG
ACCAGAGTTATTAAAATCAATAAGTGAAAATACAACAATACCTTTAGACATACACTTAGCCACAGAAACT
CCAGATAAATATATTGATATGATGTCTTATATAAAGCCAAAATATATTTCTTTTCATGTAGAATCAAGTA
CAAATGTAAAAGCTGATATACAAAAGTTAAGAAATTATGGTATAGGGCCAGTGTTAGCAATAAGCCCTCA
AACAAGTGTGGATAAAATAGAAGAATATATAAGTTTAGTTGAGGGTATCTTAGTAATGACAGTAAATCCA
GGGTTTGCAGGTCAAAAGTTTAATCTTTCTGTATTGGATAAGTTGGATAAACTTACAGAGATACTAAAAG
ATTATGATAATCCTCCATTTATAGAGGTTGATGGAAATATAAATAAGGATACTATTAAACTTATGAATGG
TAAAAAAGTAGATATATATGTTGTTGGTACTTCAGCTTTATTTAATGATAAGCCTCCAATTTCATATAAA
GATAAAATAGAAGAACTAAAAGAAAGTATAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2594086-2593640 ribose-5-phosphate isomerase 1 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATATCTATTGGATGTGACCATGGTGGTTATGAATTAAAGGAATATATAAAGGAAAATTTAATAA
ATAAAGGTATAGAAGTTGAAGATGTGGGTACAAATTCAAAAGAAAGTGTAGATTTTCCAATATATGCAAA
AAAGGTAAGTCAAAATGTTCAAAGTAAAAAATCTGATTTAGGCATACTTTGTTGTGGAACAGGAATAGGC
ATGTCTATTGCAGCAAATAAGTTTAAAGGAATCAGAGCAGCTGTTGTTTCTGACTGTTTTTCAGCTAAGG
CAACTAGAGAACACAATAATACAAATGTACTTTGTTTAGGAGAAAGAGTTATTGGGAAAGGATTAGCAAT
GAGAATTGTTGAAGAATGGTTAAATTCAAGTTATAATGGAGAAAGACATGCAAGAAGATTACAAATGATT
GATGATATAGAAAAAGAAAATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2595181-2594261 transketolase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAATAGCAACTAGAGAAGCTTACGGACAAGTGTTAAAAGAACTTGCAGAAAATAAAGATATAGTAG
TATTAGATGCAGATTTAGGAAAAGCTACAAAAAGTATATCATTTAAAGAAGTTGCCCCAGATAGATTTTT
TGACATGGGGATAGCAGAAGGTGACATGATTGGTACAGCAGCAGGTCTTGCTACTTGTGGAAAAATACCT
TTTGCGAGTACTTTTGCAATATTTGCAGCAGGAAGAGGCTATGAGCAAATAAGAAACTCTGTAGCATATC
CAAATTTAAATGTAAAAATAGCAGCTACTCATGCAGGTGTAACAGTAGGTGAAGATGGTGGTAGCCATCA
AGCTATAGAGGATATATCTCTAATGAGAGGTATACCAAATATGGTTGTATTAAATCCAGCAGATGCTTTA
GAAGCAAGACAAGCTATTCTTGCATCTATTGATTATAATGGACCTGTTTATATAAGATTAGGTAGAGCTG
CAACTCCTGATGTAAACAGTGAAAATTATAAATTTGAAATAGGAAAAGGAACTGTTTTAAGAGAAGGTTC
TGACATAACAGTAATAGCTACAGGAATAATGGTAGCAAAAGCCTTAGAAGCAGCAGAAGAACTTGCTAAA
GAAGGTATAAATGTAGAAGTTGTTAATATATCTACAATAAAACCATTAGATGAAGCATTAATAAAAGAAA
CTGCTAAGAAAACTGGAAAAGTAGTTACAGCAGAGGAGCACAGTATAATAGGTGGTTTAGGTTCAGCTGT
ATGTGAAGCTTTAGCAGAAACTAAAGATGTAGTAGTTAGAAGAATTGGTGTTAAAGATGTATTTGGTCAA
TCAGGTACACCAGCTGATTTATTAAAACACTATGGTTTAACTACAGAAGATATAGTAAAAAATATAAAAG
AGTTGTTATAG
>ref|NC_013316.1|:c2595996-2595184 transketolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCACTCTTAGAGATCATTCTAATAATATTAGAAAAAACATAATAAAAATGGTTGCAGAAGCTAAAA
GCGGACATCCAGGTGGTTCATTATCAATAGCTGATATGTTGACAGTATTATATTTTGATAAGATGAACGT
ATGTGCAGAAAATCCAAAAATGGCTGATAGAGATAGATTTGTTCTATCAAAAGGTCATGCAGCACCAGCT
TTATATGCTACATTAGCAGAAAAAGGATTTTTCCCAGAAGAAGAATTAATAACACTAAGAAAATTTGGTT
CTAAGTTACAAGGTCACCCAGACATGAAAAAAGTAGCAGGAATCGATATGTCTACTGGTTCTCTTGGTCA
AGGGCTATCTGCAGCAAATGGTATGGCACTTGCAGGAAAATTAGATAACAAAGACTATACAGTATATACT
ATATTAGGTGATGGAGAAATCCAAGAAGGTCAAATATGGGAAGCTGCAATGACAGCATCACATTACAAAT
TAGATAATTTAATTGCATTTGTTGACTTAAATGGATTACAAATAGATGGTTCTAATGAAGAAGTAATGAA
TGTAAATCCAGTAGATGACAAATTCAAATCTTTTGGATGGAATGTAATAGTAATAAATGGACATTCTTTT
GAAGAAATAGGAAATGCAGTTGATGAAGCTAAAAAAGTTACAGGAAAACCAACTGTAATAATAGCTAAAA
CAGTAAAAGGTAAAGGTGTTTCATTTATGGAAAATAATGCTGCATGGCATGGAACAGCTCCAAATGCAGA
ACAAGCAGAGCAAGCATTGAAAGATTTAGAAGGAGGTCTATAG
>ref|NC_013316.1|:c2597119-2596088 putative carbohydrate dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGCAGTAGTTAAAACTAAACCAGGCTATGATAATGTAGAAGTTTTAGAAGTAGAAGAACCAAAAG
CTACAGGAGACAAGGTTAAAATAAAAGTAGAATATAGTGGTATATGTGGTTCAGATATACATTCATTTAA
AGGTGAATATGCAAATATAAAAGCCCCAGTAACATTAGGTCATGAATTTTCTGGAATTGTTGTAGAAGTA
GGAGAAGATGTTAAAGATATAAAAGTAGGAGATAGAGTTACATCAGAAACTACTTTTGCAACTTGTGAGA
AATGTATATATTGTGAAACTAAAGATTATAACTTATGCCCAACTAGAAAAGGTATTGGTACTCAAGTAAA
TGGAAGTTTTGCTGAGTATGTACTATCAAGAGAAGAAAGCATACATGTACTTCCTGAAAATGTATCTTTA
TTATCAGCAGCCCTTACAGAGCCACTAGCTTGTTGTGTTCATGCAGCTCTTGAAAAGACTACTATAGAAA
GTTCTGATACAGTTTTAATAATAGGACCAGGGCCAATTGGTTTATTATTAGCTCAAGTTGTTAAATCTCA
AGGTGCTACAGTTATAATGTCTGGTGTTACAAAAGATAAGGAAAGATTAGAAATAGCTAAAAATCTTGGA
GTAGATAGAACTGTAAATGTAATGGAAGAAAGTTTGGCAGATGTAGTGAATGAAATGACTGATGGAAATG
GAGTAAACAAAGGATTTGATTGTTCTGGGTTTATGCCAGCAGTTAACGAAGCCTTAAGACTGCTTAGAAA
AAAAGGTACTTTCGTACAAGTTGGAATCTTTGCTAAAAAATTAAATGAAATGGACCAAGAAGCAATAATC
CAAAGAGAGTTACAATATATAGGAAGTAGATCTCAAAAGCCAAGTTCTTGGATTACAGCATTAGATTTAA
TGGCAAGTGGGAAAGTAAATACAGAAGCTTTAGTTACTAGAACTGTTGGTTTAGACGAATTTAAAGAAGG
TATTACAGCTTTAATGAACGGGGAAGAAATAAAAGTAGCAGTAAAATCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2598171-2597119 putative galactitol-1-phosphate 5-dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
GTGAAAGCAGCAGTATTACATGGCACAAATGATATGAGATTTGAAGATATAGAAATAAAACCATGTGAAA
GTGATGAAGTAAAAATAAAAGTTATGGCAGCAGGAATATGTGGGTCAGATCCTCCAAGAGTATTAAAACA
TTGGAAATATCCAGTTCCAGCTATACCAGGACATGAGTTTTCTGGAGTAATTGCTGAAGTTGGTAAGGAT
GTAAAAAATGTAAAAGTTGGAGATAGAGTAGTTGCAATTCCTTTTATACCTTGTAATGAATGTGAATATT
GTAAAAGAGGATTATTTTCATTGTGTGATGACCATGGAATGTTAGGAGCTAAAAGTTTTGGAGCTTTTGC
AGAGTATGTAAATATAAAAGCTACAAATGTACTTCCAATAGGAGATATGGACTTTGAAGATGCTGCAATG
ATAGAGCCACTAGCAGTTGCTATGCATGGAGTACTTAATATAGGTGTTCAAGTTGGAGACGCTGTAGCCG
TAATGGGTAGTGGAACAATGGGGCAGTTGGTAATACAAGGACTTAAAATAGCAGGAGCAGGAACAATTAT
AGCAGTTGATATATCTGATAATAAATTAAGAGAATCAAAGGAATTAGGGGCTGATATAATAATCAATGCT
AAAGATATTGACCCAGTAGAAAAAATAAAAGAACTTACTGGTGGAAAAGGCGTTGACATAGCTCTTGAAT
GTGCAGGTTCAAAAATAACTCAAGAACAATGTTTACTTATAACTAAAAAGAAAAGTAAGATAGGATTTTT
AGGGATAGCATATTCAGATATAACTTTATCAGAAGAAGCATTTGAAAATATATTTAGAAAAGAACTAGAA
TTAAAAGGTTTTTGGAACTCTTATTCTGCACCATTTCCAGGACAAGAATGGACTAAGGGAATCAATCTAG
TTAATGAAGGAAAGATAAAATTAAAAGAAATGGTATCTCATAGATTCTCACTTGAAGATACTTACAAAGC
ATTTGAAATGATAAGAGATAGAAAAGAAGAATTTAACAAAATATTAATTTTACCACAAGGGGTTGAAAAA
TAA
>ref|NC_013316.1|:c2599575-2598301 PTS system, galactitol-specific IIc component [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAAATTATTAGCAGTAGTACAATACATTTTAAATATGGGACCGACAGTAATACTACCAATAACAA
TTGTAGTACTAGGAATGATATTTAGAATTAAGTTTACAAAAGCTTTAAAGTCAGGTCTTACAATTGGTAT
AGGATTTGTGGGTATAAACTTAGTTGTAAACCTATTAACATCAACACTAGGGCCAGCGGCTCAAGGAATG
GTTGAAAGATTCGGACTTAATTTAACAGTAATAGATGTTGGTTGGCCAACAACAGCATCAGCAACATGGG
CTTCACCAGTTGCACCAATATTAATACCAGTTTGTTTATTAGTAAACTTACTATTATTATACTTCAATAA
AACAAAGATATTAAACGTTGATATATGGAATTATTGGCACTTTATAGTAGCAGGTGCAGTTGGATATATA
GTAACAGGAAGTTATGTTTGGGCTATATTCTGTGCAATACTAATGGAGTTATTAGTACTGTTTATTGCAG
AAAAGACAGCAAAAAATGTTCAGGAGTTTTATGATTTAGAAGGTATAGCATTACCAACTGGTTCAACAGC
TTCATTTGCTCCACTTGGATATTTAGTAGGTAAATTTGTTGAAAAAATACCAGGAATAAATAAAATACAA
GCAGACCCAGACTCTATACAAAAAAGATTTGGTATATTTGGAGAACCAATGATGATGGGGATTATACTAG
GTATAATACTTGGAGCACTTGCGGGATATGATGTAGCAGGAATATTCAATGTAGGTATATCAATGGGTGC
AGTAATGTTACTTATGCCTAGAATGGTTAGAATATTAATGGAAGGTTTAATTCCAATTTCAGAATCAATA
AGAGATTTCTTACAAGCAAAATATGGAGACAGAGAACTTTATATAGGTCTGGATGCAGCAGTAGCAACGG
GACATCCAGCAGTTATATCAACAGCTCTTATACTTGTTCCTATAACGTTGTTCTTAGCAGTTATACTACC
AGGAAACAAAGTTTTACCATTTGGAGACTTAGCGACAATACCATTTTATATGGCATTTATAGTGTGCTTT
AGAAAAGGTAATATAGTTCAATCAGTTATAACAGGAACAATAGTAATAGCTATATCACTTTATATGGCTA
CAAACTTTGCAGATGTTCATACACAATTATTACAACAAGCAAATATGATGCCAGAAGGAACAACAATGGT
TACAAGTATAGATACAGGTGGAAACTTGCTAAAATGGGGAATATTGAAATTATCTCAATTAGTTTCTTCA
TTTGGAATATTCTAA
>ref|NC_013316.1|:c2599909-2599634 PTS system, galactitol-specific IIb component [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAATATTAGTAGCATGTGGAGCAGGAATAGCAACATCAACAGTAGTTTGTGACAAGGTAGAGA
GATTAGTTAAGGAAAATAATATACAAGCAGAAGTTATACAATGCAAAATAGCTGAATGTGCAACAAAGCA
AGAAGGAGCAGATTTAATAGTATCAACAACTATACTACCAACAACTTATAATATACCAGCAATAAAAGCA
ACAGCATATATAACTGGAGTAAATACAGCAGCATTAGATAAAAAAATATTAGATGCTTTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2600428-2599970 PTS system, galactitol-specific IIa component [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGTTTATAAATTTTGTAAGTGATAAAGTTATAGACCTTAAAATGGATTGTAAAACGAAAGAAGATT
TCTTTAAAGAAATACATAATAAAGTTTTTGATTTAGGCTTTGTAAAAGAAGAATTTGGAGAAAAAATATT
AGCAAGAGAAAATGTATTTCCAACAGGTTTAAATTTAGGTGATTATGGAGTAGCAATACCACATACAGAT
GCAGAATATATTAAAGAGCAATTTATATCAGTCTGTACTTTTAATGAACCAGTAGTATTTAGTTCTATGG
AAGACCAAGATGAAAAAGTACCTGTAAATTTGGCTTTCATATTAGGACTTAATCAACCACACAGTCAATT
ATCTGTATTAACAGAATTAATGGGAATTATGCAAAATAAAGAGTTAGTTGATAAGTTGATGAGTTCTACT
GATAAAGAAGAAGTTTTAAGGACACTAAAGTCTTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2603941-2601017 putative sigma-54 interacting transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAAAATATTAAGAGAGATACAAAGAGAAGATAAAAAAAATCCATATACTGACCAAGAACTTGCTG
AAATGTTAAATGTAGCTAGGTCTGAAGTGATATCAGTTAGGAAAAAAAATAATATTTTAGATTCGAGAGA
AAGAAGAAAAAAAATATTAATAAAAGATATATCAAAAATTGTAAGTGAAAATCCTCAAATGTCTGAAAGA
AAAATAACTGAAATATTAATAGAAAATGGATATAATATATCGAGAAGTGCAGTTTCAAAATTATTAAAAG
AGGAAAATTTAAATCAGTCAAAGATTGGGATTAAGGATAAAGACCCAGCATCATCAGGAAAGTATGTGAA
GGTGAGTAAAGTTGTAGAAGAAGATGGATTTGAAGAATTGATAGGTATAAAGGGAAGTTTGAAAGAAAAG
GTAAATCTAGCTAAGTCAGCAATAATGTATCCTCCTAATGGCCTTCATACTATAATATATGGAGAAACAG
GAGTAGGTAAAAGTGAATTAGCTACATGTATGTATAAATATGCTATAAAAAACAACATTAAAGAAGAGAA
CAGCCCATTTATAGTGTTTAACTGTGCAGACTATGCAGAAAATCCTAATCTATTGATAGCTCAACTCTTT
GGGGTAGTAAAAGGTGCATATACAGGAGCAGATGCAAATAGAGAAGGTCTTGTAGAACAAGCTAATAATG
GAATATTGTTTTTAGATGAAATTCATAGATTGCCTGCTGCTGGGCAAGAAATCTTATTTTCATTAATAGA
TAGAGGAGAATTTAGAAGGTTAGGAGAAAGTAGTTCTAATAGAAAGGCAAATGTTCTCATAATAAGTGCT
ACAACAGAAAATCCAGATTCTAATTTACTTCAAACATTTAGAAGACGTATACCAATGGTAATAAATTTAC
CTAATATGAGTGAAAGACCAAAATCTGAAAGATATGAAATAATAATAAAGTTTTTTGAAAGAGAAGCAAA
GCGAGTAAACAAGAATTTTATAATAACTAAAGAAGTTATGTGTGCACTTATGAATTATAAGTGTACTGGA
AATATAGGTCAGTTAAAGAGTGATATACAAGTAACTTGTGCTAGAGCTTTTAGTAAATCGATATTTTCTA
GCGATAAGGTAATTATAGATTTAGATAGTTTAAGGGATTATATAAAAAGTGGATATTATGATTGTAATTG
TAAAAATGAAAAGTATTCTGAGTTTTCAGTTGAGGATATATATATAGATATTAGTGAATTGGTGAGTGGA
AAAAATAGAATTTTATCTGATAATGAGATAAGCGAGATATATAATTATGCAGAAAAAGAGCTTAAGGTTT
TGGAAAGTAAGTGCTTTTCAGAAGAAGAGTTAAAAAATGCATTTATAGAAAAGTTAGATAAGAAGTTTAA
TGCTATTAAAAACAATAAAAATTTATCTGATAGAAGAAGTCGAATAGACTGGGGAGGACAATTAAAAGAG
TCTACACTGGAGATAATGGATAAGGTAATTGTATTTATTAAGGAGCAGTTTAAGCATGTAAATCAAGGTC
TGTACTTGGCTCTAGCAATTCATATTGAGCATGCTATAGGTAGGATAAAAGATGGAAAAACTATAATAAA
TCCGAGTTTAGATAAAATAAAAGCATCAATGCCAATGGAATATGAGTTGTCAAGATATATAATGGGTATA
GTAGAAGATTTGACACAAGTAACATTTCCAGAAGATGAGCTTGGATATTTGGCTTATTATATAAATAAAT
TTTGTTATAATGAGGAAAGTATAAAAGATAAAGTTAAAGTAGTAATAGTTACGCATGGTAAAGTTGGAAT
TGAAATGTCTAAAGTTGTAAATCATATTTTAGGTATAGAATGTACACTAGGTATAGAAATAGCACTTACA
GATTCACCATCAGAGGGGATAGAGCATGTATTAGAAGAGCTTCAAAAGATAGAAGCTAGAAAAGGTATTC
TAGTTCTAATTGATATGGGTTCTTTGGTAATTCTTGGTGATGAGGTTGAAAAAAGGCTTGGAATTAGATG
TAAAACTGTAAATAGAGTAGATACATTATTGGCAATGGAAGCAGGAAAACTTGCAACCATTGAAGGAAAA
AGTTTAGATGGTATAATAGCTGATTTAAAGAAAAATAAGAATTATGCTATGATAAATACAAATAAATTTA
GTTACAGAAAAAACGAGTATGGAAAGAAAAATGTAATCATTACTTTATGTTTGAGTGGTGTAGGTACAGC
TTTAAATTTAAAAGAGCATATAGAAAAACAAATTAAGGAATATGGCACTTTAATTGAAGTAAAGCCAGTT
GCTTTTTTAAATAATAATTTAGAAGAAGAGTTAAATGATATTGAAGCTGAATATAATATTATTGCTATCT
GTGGAACTATTGATATAGATTATAAAAACGTGCCTTTTATTTCTTATAATGAGGTACTTGGTAAAAATGG
TATTAATAAAGTATTAGAGCATCTAAATAGTAAACAACCAGCTTTAAATATTGAAAACCAGTTGAATAAT
TTAATACATGAAGATTTGATTTTATACAATTTTGAAGGAATTTCAAAGGAGTATATAATTGATACTCTTG
TTTCAAAACTTGAAGAAGGTGGATATGTTGATTCAAAGTATATATTAAGTGTATATAAAAGAGAAGCAAT
GGGAAGTGTTGTAATGGCCTCTAAGGTAGCCGTGCCACATGGACTTCCAGAAAACGTTATAAAGCCTGCA
ATAGCAATCGCAAGGTTGAATAAACCTATAGTATGGGACAATAAATTTATGGTGGATTTGGTGGTACTAC
TGGCACTTAAAGAAAATAATAAGAAAGAAATACGAAGCTTATTTTCAAAGATTAATGACCAGCATACTTT
AGAAGTTTTATTAAATACTGAAGATAAAAATGAAATAAAAGAACTTTTAAGCTAA
>ref|NC_013316.1|:c2604743-2604093 putative transaldolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGTTTTTTATAGACACAGCCAATATTGAAGAAATAAAAGAAGCAAATGATTTAGGTGTAATATGTG
GTGTAACTACTAATCCGTCTCTAATAGCTAAAGAAGGTAGAGATTTTATAGAGGTAGTTAAAGAAATAAG
TGAAATAGTAGATGGGCCAATAAGCGCAGAAGTAATAAGTTTAGAACATAAAGGTATGATAGAGGAAGCA
GAAAAATTATCTAAGATACATAAAAATATAGTTATAAAAATACCTATGACAGCAGAAGGTCTAAAAGCGG
TGAAAGTACTATCAAGTAAAGGTATAAAGACTAATGTAACGCTTATATTTTCTGCTGGACAAGCTCTTTT
AGCTGCTAGAGCTGGAGCTACATATGTAAGTCCTTTTGTTGGTAGATTGGATGATATATCACAAAATGGT
CTTGATTTAATTGAAGAAATCGTTGATATATTTAGTGTAAATAGTATTGAGGCTCAAATAATAGTTGCTA
GTGTTAGAAATCCAATACATGTTTTACAAGCTGCTAGAATGGGAGCAGATATAGCAACAGTTCCTCTTAA
AGTTATAAACCAAATGATTAAGCATCCTTTGACAGACAAAGGAATAGATAGCTTTATGAAGGATTGGGAA
GGTGCTTTTTTAAAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2605379-2604807 xanthine phosphoribosyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGGCTTTACAAGAAAAGATATTGAGAGAAGGCAGTGTTTCAGGAAATGATATACTAAAAGTTGATA
GTTTTTTAAACCATCAAATTGATGTAGCTTTTTTAAATGAAATAGGAAGAGAATTTAAAGAGAGATTTAA
AGGAGAAAAGGTGGATAAGATATTTACAATAGAGGCTTCAGGAATAGCTATAGCATCAATTGTTTCACAG
TATTTTGATAATGCACCTGTAGTATTTGCAAAAAAATCAGAATCTAAAAATTTGGATAAAGATGTATATG
AAACTAATGTATATTCATTTACTAAGGCAAGAGAGTATTCAGTTAAAGTTTCTAAAAAGTACATAAACAA
AGGCGAAAATATATTGATAGTGGATGATTTTTTGGCAAATGGAAGAGCTGCTCTTGGACTTAAAGATTTA
ATTGAGCAAGCAGAAGCTAACTTAGTTGGAGTAGGAATTGTCATTGAAAAAGGATTTCAAGCTGGAGGAG
CACTTTTAAAGGCTAATGATGTAAGATTAGAGTCTTTGGCAGTAGTTGAATCTATAGATAATGGAACTGT
AAAATTTAGGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2606920-2605769 mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGGCGATTCAGTTTGGAGCAGGAAATATTGGAAGAGGTTTTATTGGAAGCTTGTTAGTTAAGT
CGGGTTATCATGTAGTATTTGCTGATGTAAATGAGGAGATATTAAACTCAATAAACAAAGATAAAAAGTA
TACTATACACATAAGAGATGTAGAATGTATAGATGAAGTAATTGATAATATAAGTGCGGTTTCATCTATA
AAAGAAGAAATAATAGATGAGATTGTACAGGCTGAAATAATAACTACAGCAGTTGGACCTTTAGTTTTGA
CTAAAATAGCCTCTACAATTGCAAAAGGTATAAAAGCTAGAAAAGAAAAGGGATTAACAAGTAATCTAAA
TATAATAGCATGTGAAAATGCAATATACGCAAGTTCTTCTTTAAAAGAAGAGGTACTTAAGTATTTAAAT
AAGGAAGAAGTAGAATATTTAGAGATGTATGTTGGTTTTCCAAACTGTTCAGTTGATAGAATAGTTCCTC
CTGGTAAAAACGAAAATCCTCTTGATGTAACAGTTGAAAATTTTTATGAGTGGAATGTTGAAAAACAAGG
ATTTAAAGGGGAAATACCAACTATAGTTGGAATGAATTTAGCTGATAACCTTATGGCTTATATAGAACGT
AAATTGTTTACACTGAATACAGGTCATGCTATAACAGCTTATATAGGATATTTAAAAGGATATAAGACTA
TAGAAGAGAGTATAAAAGATAAATTTATCTGTGATATAGTCAAAAGTGCAATGGTAGAAAGTGGAGAAGG
ATTGATTAAAAAATACAATTTTGACTCAGAAGTGCACTATAAATATATTGATAAAATTTTAAATAGATTT
AAAAATCCATATCTTAATGATGATGTATTAAGAGTCGGAAGGGAACCATTAAGAAAACTAAGTGATAAAG
ATAGATTGATTAAACCTTTAATGACAGCAAAATCATATGGATTATCAGTTGACAATTTGATTCTTGGAAT
AGGTGCAGCGCTTCATTATAATAATAGTGAAGATACTCAAAGTGTAGAATTACAAGAGTTGATAAAGTCT
ATTGGGGTAAAAAAAGCCGTTGCTAAAATAGCTAATATAAGCAATGACGAAGAAATTTTAAATAATATCG
AAAAAAGTTATATATTTATGAAAAATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2607361-2606939 PTS system, mannitol-specific IIa component [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAAGTATTGAATGAGAATAATATATTTTTAGGGTTAGATAGTGTTTCAAAGGAAGAAGCTATAA
CTTTAGCAGGAAGAAAATTAGTTGAAAATGGATATGTAAAAGAAGAATATATACCAGCAATGTTAGAAAG
AGAAAAAGTAATGACTACATATATGGGAATGGGAGTTGCTATTCCACATGGTGTAAATGAAGCAAAAAAA
GAAATATTATCTTCTGGAATAGTTATATTACAATTCCCTAATGGTATAGATTTTGATGGAGAAAAAGCAT
ATTTATTAATAGGAATAGCTGGTGTTGGAGATGAACATTTAGAAATACTATCTAATATAGCAGTAGTTTT
AGATGATGACTTAACAGAAAGACTAAAAAATTCAAATGACAAACAAGCTTTTATGGAAGCTTTTGCCAAC
TAA
>ref|NC_013316.1|:c2609529-2607391 putative transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
GTGGATAATTTGAAAAAAAAGAAGATTACATCTAGGCAAAAAAAGATAATACTAATGATAGTAGAAAATT
CAAAGAAAAACATTCCAATAACTATTTCTGAGATTGCAGGGACTTTAGAGCTAAGTTCAAGAACTGTACT
TAGAGATATGTCTGGAATTGAAAAATGGTTTGATGAAAATGATTTTAACTTTGTAAAAAAACCAGGAGTG
GGATTGATTTTAGAGGAAAATATAGAAAATCAAAACTTTATAATTGAGTTGTTAGAAGAAGAAAAAATAG
AAAAAGAATACAGCAAGGAAGAAAGAAATTTAATTATATTATCAAAGCTACTAGTTTCTAACGAGCCAGT
AAAATCCTATTATTTTGCAAAAATATTAAAGGTATCTGAAGGGGTACTGAATAATGATTTTGCCTTAGCA
AGTAAATGGTTGGAAAGATTTGATATTGAGCTTGTTAGAAAACCAGGGCTTGGTGTCTACTTAAAAGGTC
AAGAAAAAAACTTTAGAGAGGCATATGTAAATCTTATATACGATTCATTCAATGAAAAAGAAATACTAGA
TATGGTCAGAAATATAAGTGAAAATATACAAACAGATAAAGCAATAGAAATTTTAAGTGAAAATAGACTT
TTAAATTTAATGGACAGGTGCATAATAAGAAAAGTTGAAGCTACATTAACAAAGAAGCTTTCAGATTTAG
ATGTAAATTTAGCTGATAGTGCATATATAGGGCTTGTAGTTCATATTTCATTAGCCTTACAGAGGATAAA
AAATGGTGAAAATATAACTATGGATAAAGAGTTTCTAAAAGAATTATCTATAACAGAAGAGTTTAAATTA
GCTAAAGAAATCGTAAAAGGTATGGAAACAGATTTTAACATGGATATACCAGTAGATGAGGTTGGATATA
TAACTATGCATATAAGAGGTGCAAAGCAAAGGTCATCTTCAAACCATAAGGCTTTAAACTTAGATGATAT
AGAAATAATGGAAATTACAAATAAGATGATAGATTTGGCGGAAGATGAATTTAAAATAAGTTTAAAAAAT
GACGAGAGGTTATTTAAAGACCTAGCAAATCACTTAGGGCCTTCTATAAATAGATTGAATATGGGATTAG
AAATAAGAAATCCTCTTTTAGATGAAATAAAAAGCAAGTATTCATATGCCTATGATGGAGTTGAAAAGAT
TTCTAGAATTATAAAAGATAAACTAAATATAAATTCAATACCTGAATCAGAAATAGGATATATTGCAATG
CACTTTGCATCAGCCATAGAAAAAAATCTTATGATGAATACTAATATAAATATTGTTGTGGCATGTCCCA
CTGGAATAGGTACTTCAAGATTCTTATCAACTAAGATTGAAAATAAATTTCCTAATTTAAATATACTTGA
AACCATATCAGCTATAAACATAGATGAAGAGTATTTAAAAGAAAAAGATGTTGATTTAATAGTGTCTACA
GTTGAGTTAAATACAAGTTTAAATTATATATGTGTAGGTCCATTTATGAGTTTAGATGATGAACAGATAA
TCAAGGAAAAAATAAAATCTATAGCTCAAAATAAATTAATCAATTTAAATGCGAAAAATGATACTAAAAG
TAAGAATAAAGTATATGAACAGATAACAGAAAGTATGAATATAGGAAAAGATATTCTTCAATTTTTAGAG
GAAATTAGATTTGAAAAATTTGAAAGTAAAGATTTAAGTGAGCTTATTGAAGACTCATCAAAAATATTTG
CAAAATCTAGTGAAGATATAATCTCTATAAAAGAATCGTTAAAAGAAAGATTAAAAATCTCAATTCCATA
TATAGAAGAATCAAAAATTCTATTGTTACATTGTATGAGTGAAAGAATAGATATTATGAAGTTATCAATA
ATAAAACTAGAGAATAGAATCGTGCTAGATTCAAATGAAGAAATCGATAATGTAGTTTTTATGTTACTTC
CTAAAAATTCACCAAGTTATCAAAGACAAATAATGAGTGAAATAAGTGGTTCATTAATAGACAATATAAT
TTTTACTAATAAGATAAATAAATTCTCTATAGAAGAGATGACATTAGAGGTAAAAGATATAGTTTTTAAT
TTTTATACAAACAGATTAAAAGCATTTATAGATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2610979-2609555 PTS system, mannitol-specific IIbc component [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAGTTCTAATCAATCGACAATAAAGACATCTATACAGCGAGTAGGGAAATTTTTAAGTGGTATGG
TAATGCCAAATATAGGAGCTTTTATAGCATGGGGTCTTATAACAGCATTATTTATACCAACAGGATGGAT
GCCTAATGAAAAATTGAGTACTATAGGCGACCCAATGATAAAATACCTTTTACCACTATTGATAGCTTAT
ACTGGTGGTAAAGCAATAGCAGGACAAAGAGGTGGCGTAATAGGTGCAGCAGCAGCTATGGGAGTAATTG
TTGGTGCAGATATACCAATGTTTATCGGAGCAATGATAATGGGACCATTTGCAGGATGGGTAATTAAGAA
GTTTGATAAATTTGTAGATGGAAAGATACCAACAGGATTTGAAATGTTAGTAAATAACTTTTCAATAGGT
ATAATAGGTATGCTTCTTGCAATACTAGGATTTTATGCAATTGGACCAGCAATAGTAGCAGGGACAGCTC
TTATAGAATCTGGAGTTCAATTTATAGTTAGCAAAAGTTTATTGCCTCTAGTTTCAGTATTTATAGAACC
TGGAAAAGTATTATTCTTAAACAATGCAATAAATCATGGTATATTAGGGCCTATAGGTATAGCTGAGGCA
AAAGAAGCAGGTAAATCTATAATGTTCTTACTAGAAAGTAACCCTGGACCAGGTTTAGGAGTTCTATTAG
CATATTGGATGTTTAGTAGAGGAAGTGTAAAACAATCAGCACCAGGAGCTGTAATAATACATTTCTTTGG
TGGTATCCATGAAATTTACTTCCCATATATTTTAATGAATCCAGTTTTAATATTGGCTACAATGGCAGGT
GGAGCAGCAGGAATATTGACTTTTTCAATATTAGGAGCTGGGCTTGTAGCAGCACCATCACCAGGAAGTA
TATTTGCACTTATGGCACTAGCTCCAAAGGGAGGATTACTTCCAGTATTAGCAGGAGTTGCAGTGGCAAC
AGTTGTATCATTCTTAGTGGCAGCACCATTTGTTAAGAGAGCTTCAGCAAATCAAAGTGAAGAAGACAGT
ACTTCTTTAGAAGAAGCTAAAGCAAAAATGAGTGATATGAAATCTGCAAGTAAGAACTCTGAGAAAAATA
TTGAGGAAAAACAGCTTGAAGTAAATGAGATTAAGAAGATTGTATTTGCATGTGATGCAGGAATGGGTTC
GAGTGCAATGGGAGCTTCCAGATTTAAAAATAGAATAAAAAACTTAGACTTAAATATAGAAATTACAAAT
TCATCTGTTGATAATCTTCCAGATGATACACAAATAGTAGTAACTCACAATACATTAGTTGAAAGAGTTG
CTAAGAATAATTCAAGTGTTGAGATAGTTTCAATAAACAATTTTTTAAATGACCCAAATTTAGATGCATT
ATTTAAAAGATTAGAATCTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2611575-2613074 inosine-5'-monophosphate dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGGCGTTTTATTTTGATACACCATCACATACTTTCAGTGAATACCTTCTTGTACCAGGTTTCTCTTCTA
CTGATTGTATACCTGCTAATGTAAGTTTAAAAACACCTGTTACTAAATTTAAAAAGGGCGAGGAAGCAGA
TATTTATATGAATATACCTTTGACTTCTGCTATTATGCAATCTGTTTCTGATGACAAAATGGCTATTGCA
CTTGCTAAAGAAGGTGGTATTTCATTTATATACGGTTCTCAAACTATTGAAAATGAAGCTGCTATGGTAG
CACGTGTTAAATCCCACAAAGCTGGTTTTGTTGTAAGTGATTCAAATATTAAACCTGATAACACATTAAA
AGACATACTTGACTTAAAAGAAAAAACTGGACATTCTACAGTAGCTGTTACTGAAGATGGAACTTCAACT
GGTAAATTATTGGGTATTGTTGCAAGTCGTGATTATCGTATAAGTCGTATGGATTTAGATACTAAAGTTA
GTGAATTTATGACTCCTATGTCATCTATAGTTTATGCTAACAAAGATGTTACTTTAAAGGAAGCAAACAA
CATTATATGGGACCACAAACTTAATTCTCTTCCTGTACTTGATGATAATGGTAATCTTATGTATATGGTA
TTCCGTAAAGATTACTCTTCTCATAAAGAAAATCCACTTGAACTTTTAGATTCTTCTAAGAGATATGTAG
TTGGAGCTGGTATTAATACTAGAGACTTTGCTGAACGTGTTCCTGCTTTAGTTGAAGCTGGTGCTGATGT
TTTATGTATAGATTCTTCAGAAGGTTTTTCTGAGTGGCAAAAAATAACACTTGATTTCATTCGTGAAAAA
TATGGTGATACAGTTAAGGTAGGAGCTGGAAATGTAGTTGACCGCGAGGGATTCCTTTACCTAGCTGAAG
CTGGTGCTGACTTCGTTAAAGTTGGTATTGGTGGTGGTTCTATATGTATAACTCGTGAACAAAAAGGTAT
AGGACGTGGACAAGCTACTTCTATAATTGAAGTTGCTCAAGCTAGAGACGAATACTTTGAAAAAACAGGT
ATTTATATTCCAATTTGCTCTGATGGTGGTATCGTTTATGACCATCATATAACTTTAGCTTTAGCTATGG
GTGCAGATTTTATAATGCTTGGTAGATACTTCTCTCGTTTTGATGAGAGTCCAACTAACAAAGTTAATAT
AAATGGTAGTTATATGAAAGAGTATTGGGGAGAAGGTTCTGCTCGTGCTAGAAACTGGCAAAGATATGAC
CTTGGTGGAGATAAGAAACTTTCTTTTGAAGAAGGTGTTGACTCTTATGTGCCTTATGCTGGTTCTTTGA
AAGACAATGTAACTCTTTCTTTAAGTAAAGTTCGTTCTACTATGTGTAACTGTGGAGCACTTAGCATTCC
TGAACTTCAAAAAAATGCTAAACTTACACTTGTATCTTCTACTAGTATAGTTGAAGGTGGAGCTCATGAT
GTTATGTTAAAAGATAATAGAAATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2614316-2613159 putative toxic anion resistance protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATTTAGATGATATACCAGTTATGCCAACTTTGACACTTGACCCATTTGGAGAAGAATCAAACA
CTAATGATATAGATAATTCTGACTTATTAATGAAAAAGGATGAAAAAGACCCAGAAGAAGAAAAACTGTC
TGAATCTGAACGCAAGATGGTAAAGGAATTTGCGGAAAAAATAGATATTACAAATACAAATATGATTTTG
CAATATGGAGCTGGTGCTCAAAAAAAGGTAGCAAGTTTTTCTGAAACAGCTTTAAAGAGTGTAAAAACAA
GAGATTTAGGAGAAGTTGGAGATATGCTTACAAATCTAGTTACTGATTTAAAAGCATTTTCAGCAGATGA
AAAAGAACAAAGTGGTTTTTTAGGAATTTTTAAAAAGGCAAATAATAAAATTTCAAATTTAAAAACTAAG
TATGATAGTGCAGAGGTAAATGTGGATAAAGTAAGTAAAGAGCTTCAAAAGCATCAGGTTAAAATATTGA
AAGATATAGCAATGCTTGATAAGATGTATGAATTGAACTTAGCTTACTCAAAAGAGCTTACTATGTATAT
TATAGCAGGAAAACAAAAATTAAAGGATATGAAAGAATATGAAATGCCAAAGTTGAGAGAAAAAGCTCGT
TTATCTGGTTCAACAGAAGATGCTCAATCTGTAAATGATATGGTTTCACTTTGTGACAGATTTGAAAAGA
AAATTCATGACTTAGAATTAACTAGAATGGTATCGCTTCAAATGGCTCCTCAGATAAGATTGGTTCAAAA
TAGTAATAATCTGATGGCAGAAAAGATTCAATCAACTATAGTAAATACCATTCCATTATGGAAAAATCAA
ATAGTGCTTGCTCTTGGAATTTCTCACTTAAATCAAGCTATGAAAGCACAGCGTGAAGTTAGTAATATGA
CAAATGAGCTTTTATTGAAGAATGCAGAAACTTTGAAGATGGGAACAATAGAAACAGCAAAAGAATCAGA
AAGAGGAATTGTAGATATAGACACAATTAAGAAAACTAATCAATCTCTAATATCTACTATTGATGAGGTA
GTTAAAATACAACATGATGGTAGAATAAAGAGACAAGAAGCAGAAGTTGAATTATCAAAAATAGAAAATG
AACTTAAAAGTAAGCTTCTTGAATTTACAGTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2615351-2614431 hypothetical protein CDR20291_2226 [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAAATCAGAAAATTTTTCAAAAAAATCTGTATTAATAAATTCATTTTTAAGTAAATTTTTAAAAA
TAATTGGATGGGGTTTGGTAAGCTTATTTACATTATCAGCCTTAGTACTTTCAACTATTTCCATTATAAT
TGGATGGGCTGTAATACTTCCTATTCAAGTATGTGCAGTATTTTTACTTATAGGAGGAGTTTGTATTTTT
AAAGGTAAGAGATTAGGAGACCAAATTTCTCGTTATAAAAAATATTGTACAATTATAAACAATAGAAATA
TTATTCCAGTAGAACTTATTGCAGAAAACACATCTAAATCATTAAATTTTATAATAAAAGATGTACAAAA
GATGATAGACAAAAACTACTTTATAAATACTTATATTGATAAAAGAAATAATCAGATTGTGTTAACAAAT
GAAGATTTTATTCCACCAAGATATGAAGATGTAGCATATGAAGTCAAAGAAGAAGAAAAGACTGATGAAT
CCAATGAAGTTGATACAATTATAAATAAAGGAATGAATTATCTAACACAAATAAAAGAAGCTAATAAAAA
TATTAAATCAGAATCAATGGGCGATAAAATTGTACAAGTAGAAGATGTTACAAGTAAAATATTTGATGTT
GTAAAACATGACCCATCAAAACTTACTCAAATACAAAAATTTATGGATTATTATCTTCCAACCACTTTAA
AACTATTAAATTCATATCATACATTGGAAGAACAAGGAATTGATAGAGAAAATATAACAACAACTATGGA
AAGTATTGAAAATACAATGAATACGATTGTAGTAGCTTTTGAAAATCAATTGGACTATCTGTTTGAAGAT
GAAGCCATTGATATTTCTACAGATATTACTGTTTTAGAGAATATGTTAGTCCAAGAAGGATTAACGAGTG
GTAAATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2616756-2615638 NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGCACTTAGAGTAGTTCCAAAGATATTTTATTTTGATACATTTAAAGAATTTAATGAAGAATTTA
AAATAGGAAAAAATGATTTAGTAATTACTAATGAGTTTATATATGAGCCATATATGAAACCTCTTGGAAT
AGATACAAATTTAATTTTTCAAGAAAAGTTTGGAACAGGTGAACCATCTGATGAAATGATAGACTCCATG
ACAAAGGAAATGAAGAAATACAATTTTGATAGAATTATTGCGTTTGGAGGAGGAACAATAGTTGATATAT
GTAAGATATTAGCACTTGATGTTCCAGAAAAGTCTATTGATTTATTTGAAGGAGAAGTATCACCTAAAAA
AGTAAAAGAGTTAGTAGTAGTTCCTACAACATGTGGTACAGGTAGTGAAGTAACAAATGTAGCTATTGCA
GAGTTAAAATCTAAACATACTAAAAAGGGGCTTGCAGTAGAAGAAACATATGCAGACTATGCAGTGTTAA
TTCCAGAGACAGTAAAAGGGTTACCTTACAAATTCTTTGTTACAAGTTCGGTAGATGCTCTTATACATGC
TATTGAGTCTTATCTTTCTCCAAAAGCAAGTCCATTTACAGAGATGTATTCTCTACAAGCAATAAAAATG
ATTATGGATGGGTATAAGAAGATAGTTGATAAAGGAGAAGAAGAGAGATTTAATCATCTTAGAGACTTTG
TACTTGCATCAAATTATGCAGGAATTGCTTTTGGAAATGCTGGTTGTGCAGCAGTTCATGCACTATCTTA
TTCAATAGGTGGAGCTTTCCATGTTGCACATGGTGAAGCAAATTATCAGTTCTTTACTGAAGTATTTAAG
ATGTATTCTAGAAAAAAACCTAATGGAAAAATTATAAAATGTACAAAAATTTTAGCAGATGCCCTTGAAT
GTGACCCTAACTGTGATGTTTATGGAGAATTAGAAAAGTTTTTAAATAAATTAATAGCTAAAAAAGCTTT
GAGAGAATATGGAATGGTGGAAAGTCAGATAGATGAATTTACAGATAGTACAATAGCAAATCAACAACGA
CTACTTGCTAATAATTATGTAGAGCTTAGTAGAGAGGAAATAAGAGAGATATTTGCAAATCTTTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2618083-2616776 4-hydroxybutyrate CoA transferase [Clostridium difficile R20291]
TTGAGTTGGCAAGAATTGTATCAAAGTAAATTATGTAGTGCTACAGAAGCTGTAAAACAGATTAAAAACG
GTGATACTGTAGTATTTGCACATTGTGTAGGTGAACCTCCTGCACTAGTAGAGGCTATGATTGAAAATGC
TGAACAATATAAAGATGTTGAGATTAAACATATGGTAAGCTTGGGTAGTGGTGGATATACTGCTAAGGGA
ATGGAAGCTCATTTTAGAGTAAATCCAATGTTTGTAAGTGGAAATGTAAGAAAGGCAATTGAAAATGGAG
ATGGTGATTTTACACCTGCATTCTTCCATGAAGTACCAAAGTTGCTTAGAGAAAAAAGATTAAAATGTGA
TGTTGTTTTAGCACAGGTAACTCCACCAGATGAACATGGGTATTGTAGCTTAGGAACATCAGTTGATTAT
ACTTATGAAGCCATTAAAACTGCTAGAACAGTAATTGTTCAAGTGAATGACCAGTTTCCTAGAACCTATG
GTGAGGTAGTCCATGTATCAGAGTTTGACTATATAGTGGAAAAATCACAACCTTTATTTGAACTACAACC
TGCAAAGATTGGAGAAGTAGAAGAAGCAATTGGTAAAAATTGTGCTTCATTAATTGAAGATGGTTCTACT
TTACAGCTAGGTATTGGTGGGATACCAGATGCAGTTATGTTATTTTTAACTGATAAAAAGGATTTAGGGA
TTCATTCAGAAATGATTTCAGATGGGACTTTGGCCCTTTATGAAAAAGGTGTTATAAATGGTAAATATAA
AAATTTTGATAAAGAAAAAATGACAGTTACCTTCTTAATGGGTACTAAAAAATTATATGACTTTGCAAAT
AATAACCCTGCAGTAGAGGTAAAACCAGTAGACTATGTGAATCATCCAGCAATTATAATGAAACAACATA
AGATGGTTTCTATAAATTCTGCTATACAAGTTGATTTAATGGGACAGGTAGTTGCAGAGGCTATGGGACT
TAGACAATTTAGTGGTGTTGGAGGTCAAGTTGACTTTATACGTGGAGTGTCTATGGGGGAAGATGGAAAG
GCAATTATAGCTATGCCTTCAATAACTACAAAAAAAGATGGTACAGTAATTTCAAAAATCGTATCTATTG
TGGATGAAGGTGCACCTATAACGACATCAAGAAATGATGTTGACTATATTGTAACAGAATACGGTATAGC
AGAATTAAAAGGAAAATCTCTTAGAGAAAGAGCAAGAAATTTAATAAATATAGCTCATCCAAGTGTAAGA
GAAAGTCTAGCAGTAGAATTTGAAAAGAGATTTAAGGAGAAATATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2618382-2618107 hypothetical protein CDR20291_2229 [Clostridium difficile R20291]
ATGACCTGTGGAGTTAGATTTTGTGGGGGCTGTAACCCTAGATACGAAAGAGGGAAGGCTCTTACAATAA
TCAAAGAGCACTTCAATGGTAGGGTAGATTTTAGCATAGCACAAGAGAACGTCGAGTATGATTTGCTACT
TATAATTGGAGGATGCGCAACTCTATGCGCATCCTATCAACAATATAAAGTGAAAAATGAATGTGTTAAG
ATGTGGGATTTTAGCCATATAGAAAGAGTTATAAATGTGATTGAATCAGCAATTTGTGAAACTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2620013-2618517 gamma-aminobutyrate metabolism dehydratase/isomerase [includes: 4-hydroxybutyryl-coa dehydratase; vinylacetyl-coa-delta-isomerase] [Clostridium difficile R20291]
ATGGCATTAATGACAGGAGCTCAATATATTGAAAGTTTGAGAAAATTAAATACTAAGGTTTATATGTTTG
GTGAAGAGGTTAAGAATTGGGTTGACCATCCTATGATTAGACCATCTATAAATTGTGTAGCAGCAACTTA
TGACTTAGCTCATGACCCAGAATATGCAGATTTAATGACAGTTACTTCAAATATCACAGGTGAAAAAATA
AATAGATTTGGTCATCTTCATCAAAGTGTTGATGATTTGATAAAAAAAGTAAAAATGCAAAGACTATGTG
GTCAAAAAACAGCTTCTTGTTTCCAAAGATGTGTTGGTATGGATGCGTTTAATGCAGTGTATTCAACAAC
ATTTGAGTGTGATAAAGCCCATGGAACTAATTATCATGATAATTTTGTAAAATACTTAACTTATATACAA
GAAAACGATTTAGTAGTTGATGGAGCTATGACTGACCCTAAGGGAGATAGAAGTCTATCACCTAGTGCTC
AACCTGACCCAGATATGTTCCTTCATATAGTAGAAAGAAGAGAAGATGGGATAATTGTAAGAGGAGCAAA
GGCACATCAAACTGGTTCAATAAATTCACATGAGCACCTTATAATGCCTACTATAAGTATGACTGAAGCA
GATAAAGACTACGCTGTATCATTTGCAGTTCCTTCAGATGCTGAAGGTGTGTTTATGATTTATGGAAGAC
AATCTTGTGACACCAGAAAATTAGAAGAAGGTGCAGATGTTGATTTAGGAAATAAGGAGTTTGGAGGTCA
AGAAGCTTTAGTAGTATTTGATAATGTATTTGTTCCAAATGATAGAATTTTCTTATGTGGAGAATGGGAT
TTCTCTGGTATGTTAGTAGAGAGATTTGCAGGATACCATAGACAAAGTTATGGTGGATGTAAAGTAGGAG
TAGGTGATGTAATAATAGGAGCAGCAGCTTTAGCAGCTGATTATAATGGAGCAAACAAAGCTTCACATAT
AAAAGATAAACTAATAGAAATGACTCACCTTAATGAAAGCTTATATTGCTGTGGTATAGCATGTTCATCA
GAAGGTCACAAAACAGAAGCTGGAAACTATCAAATAGATTTACTTCTTGCAAATGTGTGTAAACAAAATG
TAACTAGATTTCCTTATGAAATAGTAAGACTTGCAGAAGATATAGCTGGAGGGCTTATGGTTACTATGCC
TTCAGAAAAAGACTTTAAATCAGACCTTAAAGTTGGAACAAGTGGAATGACTATTGGCGAAGTATGTAAC
AAGTATTTTAAAGCTTCTTCAGTGGCTTCAACAGAAGAAAGAATGAGAATATTAAGATTCTTAGAAAATA
TATGTCTTGGTTCATCTGCTGTTGGTTATAGAACTGAGTCAATGCATGGGGCAGGTTCACCACAAGCTCA
AAGAATAATGATTTCAAGACAAGGAAACATAAATCAAAAGAAAGAATTAGCTAAGAAAATTGCGGGAATA
AAAAAAGAGGAAGCTTTAAATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2621597-2620206 succinate-semialdehyde dehydrogenase [NAD(P)+] [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAAGCAGTGGAAAACTTTGAAGATTTAAGTAAGGAATACATTAATGGTTATATTGAGAGAGCAA
GAAAAGCTCAAAGAGAGTTTGAATGTTATACTCAAGAACAAGTAGATAAAATAGTAAAAATAGTTGGAAA
AGTAGTGTATTATAATGCTGAATATTTAGCTAAACTTGCTGTAGAAGAGACTGGAATGGGAGTATATGAA
GATAAGGTAGCTAAAAATAAAAGCAAAGCAAAAGTTATATATAACAATTTAAAAGATAAAAAATCAGTTG
GTATAATTGATATAGATAGAGAAACTGGAATAACAAAGGTAGCTAAACCAGTTGGAGTAGTAGCGGCAAT
AACTCCTTGTACAAATCCAATCGTTACACCTATGAGCAATGCAATGTTTGCACTTAAGGGAAGAAATGCA
ATTATTATCACACCTCATCATAAAGCAATTGGATGTAGTACAAAAACTGTAGAGATGATTAATGAAGAAT
TAGAAAAAATAGGAGCTCCAGAAAATTTAATACAAATACTTGACCAACAATCAAGAGAAAATACAAGAAA
TTTAATTTCATCAGCAGATGTAGTAATTGCCACTGGAGGAATGGGAATGGTAAAAGCTGCGTACTCAAGT
GGAAAACCAGCACTTGGTGTAGGGGCAGGAAATGTTCAATGTATCATAGATAGAGATGTAGACATTAAAG
AAGCAGTACCTAAAATCATAGCAGGAAGAATTTTTGATAATGGTATCATTTGTTCAGGTGAACAGTCAGT
AATAGTAGCAGAAGAAATGTTTGATAAAATAATGGATGAATTTAAAAATAACAAAGGTTTTATAGTTAGA
GATAAAGTACAAAAAGAAGCTTTCAGAAATGCTATGTTTGTAAATAAATCTATGAATAAAGATGCAGTAG
GTCAATCAGTTCATACAATTGCAAAAATTGCAGGTGTTGAGATACCAGAAGATACAAAAATAATAGTAAT
AGAAGCTGATGGACCAGGAGAAGAGGATATTATTGCAAAAGAAAAAATGTGTCCAGTTATATCTGCATAC
AAGTATAAAAGTTTTGAAGAAGGTGTAGCTATTGCAAAAGCAAATTTAAATGTAGAAGGAAAAGGACATA
GTGTATCTATACATTCAAATACAGTTAAAAATATAGAATATGCAGGAGAAAATATAGAAGTATCAAGATT
TGTTATTAATCAATGTTGTGCTACTAGTGCTGGAGGAAGTTTCTTTAATGGTCTTGCACCTACTAATACT
CTAGGTTGTGGTTCTTGGGGAAATAACAGCATCTCTGAAAATCTTGATTATAAGCATCTAATTAATATTT
CTAGAATTGCTTATTATATGCCAGAAAATGAAGTCCCTACAGATGAAGAACTTTGGGGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2623172-2621628 succinyl-CoA:coenzyme A transferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATGAAGGAGCATTTGAAGAATTAAGTGGAAGATTAAGAAATAAAGAATTGTGTGATTTAATAA
TGAATGCAGATGAAGCTGCTAAAATTATAGAGGATGGCATGGTTATTGGAGTTAGTGGATTTACACCTTC
AGGCTATCCAAAAGCAGTACCATTAGCAGTTTCAGAAAGAGCTAAAAGTGGAGAAAAGATAAAATTAACC
GTATATTCAGGAGCATCTTTAGGCCCAGAAGTTGATGGAGCATGGTCAGAAGCAGGTATAATTGAAAGAA
GACTTCCTTATCAAACTAATTCAATACTTAGAAATAATATTAATAAAGGTGTTGTTGATTATATAGATAT
GCACCTAAGTCATTCTACTCAATTTTTAAATTATGGAACTATACCTAAAGTAGATGTAGCTATAGTAGAA
GCACTTGCAATAACTGAAGAAGGGAATATTATACCAACTAGTGGGATAGGTAATTCTCCATCTTTTATAA
AAAGTGCAGATAAAGTAATAGTAGAGATAAATCTTGCAAAACCAATGGAAATGGAAGGTATGGCAGATAT
ATATATTACGGAAAATCCACCAAATAGAAAACCAATAGAAATAAATCATCCTAAGGATAGAATTGGAACA
ACATATATACCTTGTGGTTTGGATAAAATTGCAGGAGTAGTAATTACCAATATGCAAGATAAGACCCGTC
CATTGGGGGTTGTAGATGAAGCTTCGAAAAAAATATCAAATAATATTATTGCTTTTTTAAGAGAAGAAGT
AAAGGCAGGCAGATTATCAAAGAATTTACTTCCTCTTCAATCTGGTGTAGGAAGTGTAGCAAATGCAGTA
TTATATGGATTATGTGAATCTGAATTTGAAAATTTAACTTGTTATACAGAGGTTGTACAGGACTCTATGT
TGGATTTAATAAGAATGGGTAAAGTTACAATGGCATCTACTACATCTGTAAGTCCATCTCCAGAAGGATT
AATAAAATTTGAAAAAGATATTGATTTTTTTAAGGATAAGATTATATTAAGACCTCAAGAAATTAGTAAC
AATCCAGAAATAGCCAGAAGAATTGGTGTAATTGCAATGAACACTGCAATTGAAGTTGATATTTATGGAA
ATGTAAATTCTACTCACATAATGGGGTCAAAGATGATGAATGGAATTGGAGGTTCTGGTGATTTTGCTAG
AAATGGAGCAATAACTATATTTAGTACTGAGTCGATTGCAAAAAATGGTGATATATCATCAATAGTACCT
ATGGTATCTCACGTAGACCACACTGAACATGATGTAATGGTAATTGTAACAGAACAAGGATATGCTGATT
TAAGAGGTCTTGCACCTAGAGAAAGAGCTATAAAAATAATAGAAAATTGTGCCCATCCAGATTATAAAGA
ACAACTTAGGGATTATTTAAATAGAGCTTGTAAAAGTGGAGCAAAACAAACACCTCACATATTGGACGAA
GCTTTATCATGGCATAGTAAATTTATGAGTACAGGTACAATGAAAAAGGCTGAAACTTTTAAAAGTGCAT
TATAA
>ref|NC_013316.1|:c2624602-2623199 hypothetical protein CDR20291_2233 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGGGAGTGATTTAGTGAAGTTTGAATTGATGGATTTTTTAATGAATCCTTTTGTCCTTATGTTTG
CTGCAGTAATTACAGGAATTTTATTTGGAAAAATTAAATTTGGGAAGTTTAATTTTGGGGTATCAGGAGC
ATTATTTACAGGATTATTTATTGGATGGCTTGCATATAGCTTGGGGAATCTAATAATAGCAAAAGGAGAA
ACAGCAGCAGGATATAAGGCAGCAACTGTAATGATGGGGAATGGAATTATTTCTTCTGACTTCTTTGATT
TCTTTTTAATAATATTTGTTGCAGCAGTTGGTCTATTGGCAGCAAAAGATATGAAAGCTGTATTAAAGAA
GTATGGAGCAAGATTTGTAATTTTAGGAGTTCTTATAACTTTTATAGGTGGCTCTATGACTTATGCAATG
ACTTTACTATCAAGTGATAAAGGAAGTAGTGCTTATGAAGTTTCTGGCGTTTACACAGGAGCATTAACAA
GTTCGCCTGGATTAGCTGCTGCTTTAGAAACAGCTGGTAAACATGCAGAAGATGTATCAAAAGAATTTGA
AAAAGCTTCAATAAAAGATAAAAAAGAAATTTTAAAAGTAGTCGACCCAGAAGGCAAATTGGATGTGAAT
ACAACTACATCACTGACTCAAGAGCAAATAGATAAGTATATTGCATATGCTGAAGCTGGTGTTGGTATAG
GTCATGCAGTCGCATATCCTTTTGGAGTTTTAATAGTAATCTTAGGTGTAAATTTCCTTCCAAAATTATT
TAGGATGGACCTAAAAGAAGAAAGAAGAAAATATGAGAAGGAAATGAAGGAAGCAAGAGATAGTGTTTCT
GGTAAAACGATACCAGAAGTTCCATTTAATATAATAACATTTTTCTTGACATGTTTAGCTGGATACTTAG
TTGGAGGAATACATGTATTTATGGGACCACTAGGGTACTTCACACTAGGCGCAACAGGAGGTTCACTAAT
TGTATCTCTAGTTCTTGGATATATAGGTAAGATAGGGGTAGTAAATTTCAGAATGGAAGAAAAGGTTTTA
AATATTTTAAAACAAATAGGGCTAGTATTTTTCTTAGCAATAGTTGGATTAAGATATGGTGGAAAAGTAG
TTGATTCAATTATGACATCTGGTATGCACCTAGCCTTAGTAGCAATAGCAGTAGGTGTTACAGCTATGAT
GATAGGATTCTTAGTTGGCAAATACGTATTTAAATTAAATTGGATTTTATTATCTGGAGCTGTCTGTGGT
GGTATGACATCAACACCAGGTCTTGGAGCTGCTGTTGATGCTCTTGATAGTGATGACCCAGCAGCAGGTT
ATGGTGCTACGTATCCATTTGCATTATTAACTAAAGTTATATTGGTTATAGTTTTACACAAACTTCCAAT
GTAA
>ref|NC_013316.1|:2625019-2625891 LysR-family regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATAAACTATTTATACTATTTTCAAACTGTCTGTAAATATAAAAACATGACTAAGGCTGCGGAAA
GTATTCATATTTCTCAACCATCCATAACATTAGCAATTAAAGAATTAGAAAAAGAACTTGGCTTTGAACT
TTTTTACAGAATAGGTAATAAAATAGAATTAACGCCTGAAGGAAAAATTTTTTTAGACAAGTCAAAACAT
TTTATAAAACAATTTGAGGATTTTCAATGTGACGCACTTGATTTAGGAAAAAAGAGAAAAGCTTCTCTCA
AAATAGGTATTCCTACAGTTTTAGGTACGTTTTTGCTTTCAAAAATACTTCCTAGATTTAATGTAATTTA
TCCAGATATAGAGCTTAAAATTTTTGAAGTTCCAACATTTGTTGGAGCTAAAATGATTGAAGAATCTACA
CTTGATTTTTGTATTGGTATAATTGACAGTGATATTTATGATGATATAGATTCAAAGACAATCTATAAAA
CAGAATTGTACTTAGTTACAAATCCCAAAAATGAATTGGCAAAACATCCCATTATATCAAATTATATGTT
AAAAAATGTACCTTTTGTAATCTTATCTGAAGGTTCTTATCACTATAAGATTATTACAAAAAGACTTGAA
AAAGCTAAGCCAAATATAATTTTACACTCAAATCAACTTTCTACCATACGTTATTTACTAGAAAATGACT
TGGCTTCAACAATATTGTATAAAGAAATATTTCAAAATACAGAAAATCTCTGTTCAATACCATTAGAACG
TGCAATTACTGCAAATATTGGAGTTCTTTGGAGAAGAAATCAATACATATCTCATAGTATGAAACTTTTT
ATTGAGTATATGGCATCTATTCATATAAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c2626677-2626078 hypothetical protein CDR20291_2235 [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAAAAAACATAAATTTATAAAAAATATAAAAAAAGCCTGGTATAAAATCAAATTAATTGATAGAT
GCCTTATAATTGTAATGGCAATATTAATGTTTCAATCTATATATAATTTATTTGTTAATGAAGTAAATTC
ACAAGATACTACAACTATTGATGTAGTAGTAAGAACCACTTCAGCAGCTATATTTGGGTATTTTTTAAGT
GCTAATTTTATAAAGAGACCTTTAAGGAAGTATACAAATACTGATGTATCTTCAAATCTTTTTATAGATA
ATAATTTACCCCCAAAAGGTCAAGAGTCTAGTCAAAATAATATAATGAATGTCAAAAATACCATTGGATT
TACTTCAGAAGCTGATAATTATGAAAAGAAAATACCTATTAATAATAATGAAGGTTTTGAAGAAGGAGAA
ACTAGTGAATTGCAAATTATTATAGCTACTGTAATTTGTATAGCAGCATTAACAGTACTTTTTGTTGTAA
GAAATTTTACAACTACAACATCAGCTTCTTTAGGTACTATTTCACAGATGAGAGATTTTGTCTCAGGATG
CGTGGGTTTTTTGCTAGGTTGTCCAAGTAAACCTGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2627869-2626790 putative Xaa-Pro dipeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCAGAGTAAAAAATGTAGTAGGATTGTTGGGAACTAAAGGTGTTGATGCACTATATCTAACAAAGA
AAACTAATGTAAACTATATAAGTGGTTTTCCTGATGAAGAAGCATATGCAGTGATTTGCAAAGATGGAAA
CTTTTTAGTTACTGATAGTAGATATATGGAGCTTGCAGAAAAGGTTTGCAAAGATTTTGAAATTATAAAT
TGGCATAATTTTGATAGAAGTGTGGCAAAGGCAGTTAAAAGTGTATGTGATAAAGTGGGTATAAAGAAAC
TTGGGTTTGAAAGAACTAATATAGTGTTTGATAAATATGAAGAACTTAAAAATCTGATTGAGAAGGATAA
TGGAGAATTAATACCTACAGAAAATATTGTAGAGACTTTGAGATATGTAAAAGACAAAGATGAAATCAAA
AATACAAGAAAAGCTTGTGAAATAGCGGATAAGGCATTAGAAGAATTGATTCCACATATAAAAGCTGGAG
TTAGCGAAATTGAACTGGCTACAAAGTTAGAGTACTTTATGAAAATGAACGGAGCACAAAATATAGGGTT
TGAAACTATACTGATATCAGGAGCAAAGACTTCATTGCTTCATGGTAAGCCTAGTGATAAGATTATAGAA
AAAGGTGATTTTGTACTTATAGACTATGGTGCTATGTATAATGGCTATATATCTGATACAACTAGAACTT
TTATAGTTGGAGGAGCTTCTGAAAAGCAATTAGAAATATATAATTTAGTTAAGGAAGCTCAAAATGTAGG
GGTTGAGAACATGAAAGCTGGTGTACATGCGACAATTCCAGATGCTGAGATAAGAAAAGTTGTCAAAAAA
TATGAAGACTATTACTATCAAGGTATAGGACATGGAGTCGGTAGGGATGTTCATGAAGAACCTTTCATTG
GTAATTATGGTGATAAAATCATAGAAGAGGGATGTATAATAACAATGGAACCAGGTATTTATTTCCCTGG
ATGGGGTGGAGTTAGAATAGAAGATACTGTTTTGATTACTAAAAATGGTCCAGAAAGACTTACTAAATTC
CCTAAAGATTTGATGATTTTAGACAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2629324-2628179 glycine/sarcosine/betaine reductase complex component C alpha subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAAAAAAAGTAATCGCAGATGTATTCTTAGAAGTAGCTAATGCAATAGAAAGCGGCGAATTTGGCA
AAAAAGTAAAAATTGGTGTTACTACACTTGGAAGTGAACATGGTGTAGAAAACATGGTTAATGGTGCACA
ATTAGCAAAATCTAATTTATTTGATATTGTGCTTATTGGACCAAAAGTGGAAACTGACCTTGAAGTAGTT
GAAGTTAATGATGAAAAAGAAATGCATGCAAAAATGGAAGAATTATTAGATTCAGGATATATTGATGCTT
GTGTTACTATGCATTATAATTTTCCAATAGGTGTATCTACAGTAGGTAGAGTAATAACTCCAGCAAAAGG
AAAAGAAATGATACTTGCAACAACAACAGGAACAAGTGCTACTAATAGAATAGAGGCAATGGTAAGAAAT
GCCATTTATGGTATTGCTACAGCTAAATCAATGGGTAACAAATGCCCAAAAGTTGGAATACTTAATGTTG
ATGGAGCAAGACAAGTTGAGAAGTGCTTAAAAGAATTAAAAGATAATGGATATGACATGGAGTTTGCGGA
TTCAATTAGAGCAGATGGTGGATGTGTAATGAGAGGTAATGATTTACTTGTAGGTGCACCTGATGTTATG
GTTACTGATACATTATCTGGAAATATATTTATGAAAGTATTTTCTTCATATACTACAGGTGGAGATTATG
AAGCTCAAGGCTTTGGATACGGACCTGGAGTTGGAGAAGACTATGATAGAAAGGTACTTATAGTATCAAG
AGCATCAGGTTCTCCGGTAGTAGCAAATGCTTTAAAATACGCTTATGATGTTGTAAAGGGAGATATAAGT
AATGTTGCAAGAAATGAATTTGCAAAGGTTAAAAAAGCAAAATTTGATGACATTATATCCTCTCTTACTA
AAAAAGAAGTTAAAGCTGAAAAAGTAGAAGTTAAAATGCCAGATAAAGAAATTGTTACTCGTCAAATAGC
TGGTGTTGATATAATGGATTTAGAAGATGCAGTATCTGAGTTATGGAAAAACGGAATCTATGCTGAAAGT
GGTATGGGTTGTACAGGTCCAATAGTTTTAGTAAATGAAGCTAAAGGAGACTTAGCAGTTGAAACTTTAG
TTAAAGCTGGATATACTGCAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2630882-2629335 glycine/sarcosine/betaine reductase complex component C beta subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGTGCACAAAATGACTTATCCAGTTTTAAAAGGGGCAGGCTATGTACTTATTCATACTCCAGATA
TGATAGTGCAAAATGGAAGTACTTGTACAGTTGAAAGAGCAACAAATTCAGATTCAGAATTTTTAAAAGA
AGTAAGTAATCATATAAGAAGTTATGAAGATGTAGTTAACTACATGCCAAATCAAGTTTATATAGGAAAT
AGAAGACCAGAAGAATTAAGAGATTTACCAATGCCATGGTGTGAACAAAAGATTGAGGGAACTAGAAATG
GTAAGTTTGGAGAAATAATGCCTCAAGATGAGTTCATAGCTTTAATGCAAATAAGTGATGCATTTGATTT
AGTAAAATTATCACAAGAATTTATTGATGAAGTAAAGCCAAAAATCGAAAATAACTACCCTGAAATTGCA
CCATTTGTAGGTAAATTAAAGGGTGATGATATAGAAGAAGGTAAAGAATTAGTAGCAACACACATAGCTG
AAGGATTATACCATGATGGAAAATTTGTTGGTTATGTAAAAAGAGCACATGATGTAGATGTTAACTTAAA
TGCCCATACAATGTTTGAAAATCTAGTAGTAAAAGCATCTGGAGTTTTATCTGCTATTCAAATGCTAAGA
CATAGCAAAATAGACCCTGCTGAAATAGATTATGTTATTGAGTGTTCAGAAGAAGCTTGTGGAGATATAA
ACCAAAGAGGTGGAGGAAACTTTGCTAAATCAATAGCTGAGATAGCAGGACTTCAGAATGCAACTGGTTC
TGACACAAGAGGATTTTGTGCAGCACCAACTCATGCATTAATTCAAGCAGCAGCTTTAGTAAAAGCTGGC
ATACATAAAAATGTAATGGTAGTAGCAGGTGGAGCAAGTGCTAAACTTGGAATGAATGCTAAAGACCATG
TTAAAAAAGGTCTTCCTGTACTTGAAGATGTTGTTGGAGGATTTGCAGTACTTGTATCTGAAAATGATGG
TGTAAATCCAGTTATAAGAACTGATTTAACAGGTAAGCATACTGTTGGAACTGGTTCTTCACCACAAGCA
GTTATGACAGCACTTATAACTTCAGGTCTTGATAGAGCTAATTTAAAAATAACAGATGTTGATGTGTATT
CAGTTGAAATGCAAAACCCAGATATAACTAAGCCAGCAGGAGCAGGAGATGTTCCAGAAGCAAACTACAA
AATGATAGGGGCACTTGCTGTTAAACGTGGAGACTTAGAAAAGAAAGAATTGAAAGATTTTGTTTCTAAC
AAAGGATTACCAGGATGGGCACCAACTCAAGGACATATACCATCAGGAGCTCCTTATATAGGATTTTTAA
TAGATGATTTAACTACAGGAAATAGAAATAGAGCTATGATAGTTGGAAAAGGTAGTTTATTCTTAGGAAG
AATGACTAACTTATTTGATGGAGTATCTTTTATAGCTGAAAGAAATACAGGTGTTACTGAAGAGACTTCA
GGAATATCTAAGGATGAAATTAAGAAGATAATAGCTGAATCTATGAAAAAACTAGCATTAGATATGTTAG
AAGAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2632434-2631385 glycine reductase complex component B gamma subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAAAACTAAAAGCAGTACATTATATTAATCAGTTCTTTGCTGGTATAGGTGGAGAAGAAAAAGCTG
ATACTAAGCCACATGTGGCAGAAACTTTACCTCCAATAAGTTTACAACTTGATAAATTATTAGGTGAAGA
TATTGAAATAGTTGGAACAGTAGTTTGTGGAGATAGCTATTTCAATGAAAATATTGATAGTGCAAGTGAA
GAAGTTTTATCAATGGTAAAAGGTTTTGAACCACAACTTTTCATAGCTGGTCCTGCATTTAATGCTGGTA
GATATGGGGTTGCTGCTGGAACAATAACTAAAGTTGTAAAAGATGCTTTGAATATACCAGCTTTAACAGG
TATGTATGTTGAAAATCCAGGAGCAGATATGTTCAAAAAGGATGTTTATGTAGTAGAAACTTCTGATTCT
GCAGCAGGTATGAGAAAGGCACTTCCTAAGATAGCTAAACTTGCAGTAAAACTTGCTAATGGAGAAGAAA
TTGGAACTCCTAAAGATGAAGGATACATAGCTAGAGGAATAAGAGTTAACTACTTCCATGAAGACAGAGG
TTCTAAGAGAGCTGTTGACATGTTAGTTAAGAAAATAAAAGGTGAACCATTTGAAACTGAATACCCAATG
CCAAACTTTGATAGAGTTGACCCAAGTAAAGCTGTAAAAGATTTATCAAAATGTAAAATAGCTTTAGTTA
CTTCTGGTGGTATAGTTCCAAAAGGAAATCCAGATAGAATAGAGTCTTCTTCAGCTTCTAAATATGGAAC
TTATTCTATAGCAGGAGTTATGGATTTAACAGAAGAGACTTATGAAACTGCACATGGTGGATATGACCCA
GTGTATGCAAATTTAGATGCAGATAGAGTATTACCTGTTGATGTTCTTAGAGATTTAGAAAAAGAAGGTG
TAATTGGAAAATTACATGAGACTTTCTATACAACTGTAGGTAATGGTACATCTGTTGCAAACTCTAAAAA
ATATGCTTCTGAAATTGGAGCAGCATTAGTGGCTGATGGTGTAGATGCAGTAATATTAACTTCTACATGA
>ref|NC_013316.1|:c2632939-2632466 glycine/sarcosine/betaine reductase complex component A [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTTACTTAGTAATAAAAAGGTTCTTATAATAGGTGACCGTGATGGTATACCAGGACCTGCGATAG
AAGAATGTGTAAAAACAGTAGAAGGAGCAGAGGTTGTTTTCTCATCTACAGAATGCTTTGTCACAGCTGC
TGGGGCTATGGACTTAGAAAATCAAAACAGAGTTAAAGATGCTGCTGATAAATTCGGAGCTGAAAATGTT
GTGATTTTACTAGGTGCTGCTGAAGCCGAAGCTGCAGGTCTTGCAGCCGAAACAGTAACTGCTGGAGATC
CAACTTTCGCTGGACCACTTGCTGGAGTTGCCTTAGGATTAAGTGTTTACCACGTTGTTGAGGAACCAAT
AAAATCATTATTTGATGAAAGTGTATATGAAGACCAAATAAGTATGATGGAAATGGTTTTAGAAGTTGAA
GAAATAGAAGAAGAAATGTCTGGTATAAGAGAAGAATTTTGTAAATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2634337-2633051 glycine reductase complex component B alpha and beta subunits [Clostridium difficile R20291]
ATGCGTCTTGAATTAGGGAAAATCTTTATAAAAGATATTCAATTTGGTGATGTAACAGAAGTAAAAGATG
GAGTATTATTCATCAATAAGCAAGAGATGCTACAAGAAATTGGTGGAGATGAGCATATTAAATCTATAGA
TATAGAATTAGCTCGTCCAGGTGAAAGCGTAAGAATAACACCTGTAAAAGATGTTATTGAGCCAAGAGTA
AAAGTTGAAGGTAATGGGGGAATCTTCCCTGGTATCATGTCTAAAGTTGATACTGTAGGAGAAGGAAAAA
CTCATGCTTTAAAAGGTGTAGCTGTTGTAACTACTGGAAAAATAGTAGGTTTCCAAGAAGGTATAATAGA
CATGACTGGAGAAGGAGCTAAGTATACTCCATTTTCTAAATTAAATAATGTAGTAGTAATAGCTGAACCT
ATTGATGGTTTAAAACAATACGCTCATGAAAAAGCTGTTAGAATGATAGGATTCAAAGCAGCAATGTACT
TAGGAGAAGTAGCAAGAAATCTTACTCCAGATGAAGTTTCAGTATATGAAACTAAACCTCTTCTTGAATC
AATAAAAGAATATCCAGAGCTTCCAAAAGTAGGATATGTTTACATGCTTCAGACTCAAGGTTTATTACAT
GATACTTATGTATATGGAGTAGATGCAAAACAAATAGTACCAACTTTATTATATCCAACAGAATTAATGG
ACGGAGCAATTGTAAGTGGTAACTGTGTTTCTGCATGTGACAAAAACCCAAGTTATGTTCATATAAACAA
TGGGGTTGTTGAAGACTTATATGCACGACATGGTAAAGATATAAACTTTGTAGGTGTAATTATAACTAAT
GAAAATGTTTACCTAGCAGATAAAGAAAGATCTTCAAACTGGACTTCTAAATTATGTAAATATTTAGGAT
TAGATGCAGTTATAGTTTCACAAGAAGGTTTTGGAAATCCTGATACTGACCTTATAATGAACTGTAAGAA
GATAGAAATGCAAGGTGTTAAAACAGTTATAGTTACAGATGAATATGCTGGACGTGATGGAGGTTCTCAA
TCACTTGCAGATGCAGATGTAAGAGCTGATGCTGTTGTAACAGGTGGAAATGCCAACCAAGTTGTAGTTC
TTCCTAAGTTAGATAAAGTTATTGGACATTTAGAAGTAGTAGATGTAATAGCTGGTGGTTCTGATGGAAG
TTTAAGAGCTGATGGAACTATTGAAGTTGAAATCCAAGCTATAACAGGTGCAACTAATGAAACAGGATTT
GGTCATTTAACTGCTAAAGGATATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2634923-2634606 thioredoxin [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAGATTTAGATAAGGCTACATTTGAAGAAGAAGTTTTAAATGCAGAAGGTTTTGTATTTGTTGATT
TTTGGAGTGAAGGTTGTGAGCCTTGTAAAGCTTTAATGCCAGATGTTCATAAATTAGCTGAGACTTATGG
GGATAAAATAAAATTCTGTAAGATGGATACAACAAAAGCTAGAAGATTAGCTATAAAACAAAAAGTATTA
GGTCTTCCAACTATGGCTATATACAAAGATGGAGAAAAAGTAGACGAAGTTACTAAGGATGATGCTACAG
TTCCTAATATAGAAAACATGATTAAAAAATATCTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2635955-2635008 thioredoxin reductase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATGTGTATGACTTAGTAATAATTGGTTCAGGACCAGCTGGGCTTGCAGCAGGTCTTTATGGAG
CAAGAGCAAAGTTAAAAACTCTAATCCTAGAAAAAGACAAGACTGGTGGACAAATTGTAATAACACATGA
AATTGCAAATTATCCAGGGTCAGTTCCAAATGCAACAGGACCAAGTTTAATAGCTAGAATGGTTGAACAG
TGTAAAGAGTTTGGAGCAGAAATGCTAAGAGATAACATTGTTGATACTGAGCTAGATGGAGATATAAAAG
TTTTAAAAGGGGAAAAGGCAGAATATAGAGCAAAAGCAGTAATAATAGGAACAGGAGCAACACCAAGAAA
GATTGGTTGTCCTGGAGAAAAAGAACTTACTGGTAAAGGGGTTTCATATTGTGCAACTTGTGATGCAGAT
TTCTTTGAAGATTTTGAAGTATTTGTTGTAGGTGGAGGAGACAGTGCATTAGAAGAAGCAATGTATTTAA
CTAAATTTGCTAGAAAAGTAACAATTGTACATAGAAGACAAGGATTTAGATGTGCTAAGAGTGTTGAAGA
AAAAGCAAAAGCTAATCCAAAGATAGAGTTTTTATTAGATACAGTAATTGAAGAAATCAAAGGTGATGGA
ATATTAGAATCAGTTGTATTTAAAAATAAAGTTACTGGAGAAACTCATGAATACTTTGCAGATGAAGAAG
ATGGAACAATGGGAGTATTTGTGTTCGTTGGATTAGATGCTCAAACTGATTTATTCAAAGGTAAAGTTGA
TATGGATGAAAAAGGTTACATAATAACTGATGAAGATATGAGAACTAACATACCAGGCGTATTTGCAGCA
GGAGATTGTAGATCTAAGACTCTAAGACAGGTTGTAACTGCAACTAATGATGGCGCAATTGCATCTATAG
TAGCTGAGAAATACATTGATGAAAAATTTGGGAACTAG
>ref|NC_013316.1|:c2636422-2636051 putative glycine reductase complex component [Clostridium difficile R20291]
ATGATAATAATTACGAATAATCCAAAAGTAAAAGAAGAAGTTCAAGGCAGAGAAGTTTTGTTTAAAGACA
CAACTTATATTGGAATCTTAGAAGCAAGTAGAGATTTGATACATGAAGGTTATGAACTTTTATCTCATCC
ACTCTATGGGAGTGTAAAACCAAATGAAACACCTTACAGGACTGTTATACTAAAGAAAGGAAATCGTTTG
GATATAAACTCTTTAACCTTAATTGAAGAAGCAATCATCACTGCAAGTAAATTTCAGGATAATAAAAAGA
CTCCAAAATGGACAGAAAATGTCCAAGACGATTTTAGAGTAATTGATTATGATATATTTTATAATACAAT
ACAAAGAATGCAGTATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2638662-2636968 putative oligoendopeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGTTTTCAGAGTTTAAGTATGAAAGACCCAATTATAATAGTATGAAAAAAGAGTTTTTGAGTTGTG
TAGAAGATATAAATAATTCTCGTAATTATAAAGAGCAACAAAAAAATATACATAAGATTAATTTATTAAG
AAATAAAATAGAAACGTTGTCAAATATAGCTTCGATAAGATATAGTACAGACACATTTAATAAATTCTAC
AAAGAAGAAAAAAATTATTGGGATGAATATATGCCTTTGTATGAAGAATTAAATTCACATTTTTATAATG
CTATTGTAAATTCAAAATTTAAATATGATTTGATAAAAGAGTTTGGAGAACAATTTTTCACAATAGTAGA
GTATTCTTTAAAAAGTTTTTCTAAAGAAATAATAAGTGAATTGCAGGAAGAAAATAAATTGTGTTCAGAG
TATACTAGACTTTTAGCTTCAGCTGAGATAATGTTTGATGGGAATATAAGAAATTTATCTGGTATGGGGA
AATTCATGTATTCTAAGAATAGAAAAACAAGAGAATTAGCAAACAAAGCATATTATAATTTCTTTGAAGA
AAATGAAACTAAATTTGATGACATATTTGATAAATTGGTTAAACTTAGAGATAAGATATCTAAAAAACTA
GGTTTTGAAGATTTTGTAGAGCTTGGGTACGTTAGAATGATGAGAAGTGACTACAGAGAAGATATGATAA
AAAATGTTAGAAAACAAGTATTAAAATATGTTGTTCCAATGGCCAATGAGCTTTATGAAAAACAAGCTAA
AAGAATTGGTCTAGAATATTTAAGTTACATAGATGAAGGCGTGGAATTTTTAACAGGAAATGCAAGTTTA
AAGGGAGATTCAAGATACATAATTCAAAATGGTAAAAGGATGTATTCTGAACTGTCAAAAGAAACAAATG
AATTTTTTGATTTTATGTTAGAAAATGAACTTATGGATTTAGAAACGAAAAAAGGAAAAGGAGCTGGAGG
GTATTGTACTTATATACCAGATTATAAGTCACCATTCATTTTTTCTAATTTTAATCAAACTGCTGATGAT
ATAGATGTGTTAACACATGAGGCAGGACATGCATTTCAGTTGTATATGTCTAGATGGATTGATATGCCAG
AAATTAATTTTCCAACGCTTGATAGTTGTGAAATCCATTCAATGAGTATGGAATTTATAACATGGCCGTG
GATGGATTTATTTTTTAAAGAAGATACAGATAAGTACAAATTCACTCACTTATCATCTTCAATTAAATTT
ATACCTTATGGAGTAATTGTTGATGAATTTCAACACTATATTTACAAAAATCCTAATGTAGATAAGTCAA
AACGAAAAGAAATCTGGAGATTTTTAGAGAAAAAATACTTACCTCATAGAAAATATGGTGATAATTCTTT
TTTAGAGAGAGGTTGTTGGTGGTTTAAACAAGGACATATATTTAAAAATCCGTTTTATTATATAGATTAT
GTATTAGCTCAAATTTGTGCGTTACAATTTTGGAAAAAAATGATTCAAGATAGAGATGCAGGATGGAAAG
ATTATATAAATATCTGTAAAGTTGGAGGAACAAAATCATTTTTAGATATTGTGAGTATGGGAAATTTGTA
TTCTCCATTTGATGATGGCTGTATTGAGTCTATTATAGGTGATGTTAAATCTTGGTTTGATGAAATAAAT
GACAGCAAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:2639154-2639975 putative hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGTACAAATTAATCGCACTAGACATTGATGGAACAATATTAAATACACAAAAAAGGATTACTCCTGAAG
TCTTTGAGTCCATTCAGGAGGCAAAAAGGGCTGGGGCAAAAGTAGTTATAACAACAGGCAGACCTCTTCC
TGGTGTAAAAGAACTTCTAAATCAACTAAATTTAACAGATGAAGGTGATTATGTTATATGCTTTAATGGA
GCAATTATTCAAGAAGTTAAAAGTGAGAAAATCATACATGATGTAGAAATGACTTTAGATGATTTTGATT
TTATATATAATAACGTTTGTAAAAAATATAAGACTAAAATACACATAAATACAATGACAAATTTAATTAC
ACCAAATGAAGCACCTGGAAAATATACACTTCATGAAGCGAAATTAAATAATATAGAAGTCAAATATATA
CAAAAAGATAAAATTGATGAATCTATTAAAATCTGTAAAATTATGATAGTTGATGAACCAGAAAGATTGG
AAGAAATCATACAGCAACTACCTAAAAATTTATTCAATAAATATACTATAGTAAGGTCTGCTCCTTTTTA
TCTAGAATTTTTAGGTAAAACTACTAATAAAGGAACTGCTCTTAAAACATTATGTACGAATCTAAATATA
CCTATAGAAAATGCTATTGCTGTTGGCGATGAAGAAAATGACCAACATATGATAAAGTATGCAGGTCTTG
GTGTGGCTATGGGGAATGCACGTAATAGTATAAAGGAAATTGCAGATTATGTTACTGATACTAATAATGA
AAATGGAGTTGCAAAGGTTATAAATAAATATATACTTAATAAGGCTATCTAA
>ref|NC_013316.1|:c2640752-2640267 hypothetical protein CDR20291_2247 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTCAAATAGAAAAATACAATAGTTTGGATAATACACAACAGAAAATAAGAATCTCTATTATGGATA
TGATAATAGATAAAGGTTCTAGTGTTACACTTCAAGAAGTGACTGAATATGTAAGTAAAAAGTTGAATAT
AGAAAAAGAATATATAGAAAGGACACTACAATATTTTATTTATGAAAATATAATGGTTGTTGATGGGAAT
AGTATAAATTTTATATATCCTGTATCAGCATTGCAAACAAATCATAAAGTAACTTTGAGAGATAATAGAA
GTTTCAGCGCAATGTGTGCTATAGATGCTATAGGAACCTCTTGCACATTCAACCAAGATATAAAAATAAA
CTCTATTTGTAGTGCTACAGGTAAGGAAATAGAAGTAATTATAAAAAATGAAAAGATTGAGTATGTGAAT
AATCCAAACTTAAGAGTGCTTCATATAAATCTTGATAAGCATCTAAATTGGGCTGCTAGTTGCTGA
>ref|NC_013316.1|:c2641535-2640765 putative aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGTTTGCAGATTAATGAAGTTAAGTGTAAGAGATATAAATAAGACATTTGTAAATAATAGAGTAC
ATACAAAGGTTTTAGAAGATATAAGTATGGATATAGATGATGGACAATTTGTCTGTCTTTTAGGACCATC
AGGTTGTGGAAAAACAACTTTACTTACTATAATAGGTGGGTTTCAAAAATCAGAACGTGGAGATGTTTTT
ATAAATGATAAAAGAGTTAAAAAACCGGGCATAGATAGAGCTTTTATATTTCAAAATTATGCTTTATTTC
CTTGGAAAACTATAAGAGGTAATGTTCTATTTCCTATGAAACAGCAGAAAATACCAAAAGAAAAAAGAGA
AGAAATGCTAGAAGAACTTTTGGTTATGTCAGACTTGAAAGGAAAAGAAAAACTGTTTCCGCATCAATTA
TCTGGAGGAATGAAACAAAGAGTGGCCATGATAAGAGCTTTAGCATGTAATCCAGAGGTATTACTAATGG
ATGAACCATTAGGAGCTGTAGATTTTCAAATGAGACAAAATTTACAGGAAGAGCTAGAACGAATATGGAT
AAAGAAGAAAATAACTGCATTAATGGTAACTCATGATGTTGATGAAGCTGTATATATGAGTGATAGAGTT
ATAGTAATGTCGAGAGATAAAGGAAGAATTATTGATGATATAAATATAGATATTCCAAGACCTAGAATTA
GAGGAAGCCAAAAATATGAAGAGTACAAAAACAAATTAACTGATACTTTATCAAAGTGTTATGAAGTTTA
A
>ref|NC_013316.1|:c2642847-2642284 hypothetical protein CDR20291_2250 [Clostridium difficile R20291]
ATGCAGTGGGCTCTGAGTTCAGAGGAAATAGATATAGCAATCATATGTAAAGATGCTGCAAAACAATATG
TAAATGTAAATAGTGGATTTGAAATTGTTGGTACTGTAGTTCAAAATTCTGATATATTTCTATTAAGTGA
TAATAATCCTGAAAAGATAGGAGTCATTCAAAATAGAGATTACCAGTCAGAATTGGTTAAAAAATACTAC
AAGAATGTGGAAGTAGCTCCATTATTAGGGACTGCACTAGCATATGGATTAGAAAGTAATTTAGTAGATG
GTGTTGTAATAGATTGCATAAAGTCAATTGGGTTAGAGGGTAAAAGAAAATCTACAACTAAATTAGGAGA
TTATGATACCTATGTATTAGTTGTAAGTAAAGAGTTTAAAAAAAGTAAAGCATATAGTGATTTTATAACA
CTTTACAATAAAAGTGTTGATGCTTTAAAGAATAAAGCTACATTTAAGAAAGCATTAAAAGAGTACAGGA
ATATAAGAAATATAGATATGGAGGAAATAAGCAATTGGAAATTAAAATTTCTAAAGATAAAAGCGATAGA
TTAA
>ref|NC_013316.1|:c2643081-2642857 hypothetical protein CDR20291_2251 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGAATATAAAAAATATAATAATACTTTTTATCATTATTTTGGGAAGTATATTTATAATATTTTTTA
ATTTTGAAGATAAAGAAGAAATAAAAGGAAAATTAAGAATAGGGGTATCTGATGATACCTCTGGTTTTGT
AATAAATTATATGGTAAATAGAGACTACTTTGAAAATATAAAAGTAAGTGATATAATGGATATTTTTACA
ATTAATGATTGCTGA
>ref|NC_013316.1|:c2644177-2643086 putative sulfonate ABC transporter, solute-binding lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTATCTAAGAAGATTCAAGCACTAATCTTATTTGGTGTAATGGGTACATCTATATTAACAGGAT
GTAGTAGTAAACCAAAAGAAAAAGAAGAAGCAAAAGCTGGAAAAGATGATTATACAATAACAGTAGGTTA
TTATAATTGTGACCATATGACTGCGGGACCAGTAGCAGAATCGGCAGGAATATATAAAGATTTAGGTCTT
AATGTAAAAACTGTTGGAAATGGTAAAGTTCCTGAAGCTATGGCAGCAGGAAAAATGGATGCAGGTTACA
TAGGAACTAAGGGGTTAGTTGGAGCAATACCTAAGGGTTCACCAATAACAATAGCAGCTAACAACCATAC
TGGTGGTTCTGAATATTTAATAGTTTCAAAAGATATAAAAGAACCTAAAGATTTAATAGGTAAAAAAATT
GCAACAGATATGAGTGATTTCTTATGGACAAGTGATTATGGTCCAGAAACAGGTCTACCAACTGACCCAT
CAAAATATGAAGTTGTAAATATGGATTCAGACAAAGATAAATATTTAGCTCTTAAAACTGGGAAAATTCA
AGCTTTTACATCTTGTGACCCTTGGGGTTCTGTAGCTGAAAATGACGGTGCAGGAAAAATAATAGCATCT
ACTCAATATAAAGAAAAAGCTAATGGCAAAGAATATAACTGTTGTTCATTCTCATTAAACAAAAACTTTA
TAAAAGAACATCCAGATTTAGCAAAAAAATTGGTTCTAGCACATACAAAAGCAATAGAATATATATATAC
AAATCCAGCTGAAGCAGCTAAAATATTTGCAAAATATTATAATGTAGAAGAAGAAGTTGCACTTAGAACT
ATCTATAAGAAGACTGTTGGAGAAGGTAGAACTCTTACTTGGAAAGTTACAGGTGAAGAATATAAAAATA
ATTTACAAATGTATAAAGATTTAAAGGCTTTAGATGATATACCTAAATATGAAGATACGATTGATACAAG
CTTATTGGACTCTTGTGGAGCTGATGATTTTGACAAATTTATAAAAGAAAAAGTTAACCCAGAGTTTCCT
GAAGGTATGAGTTATGAAGACTGGAAAGCAAAGGTATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2644670-2644212 hypothetical protein CDR20291_2253 [Clostridium difficile R20291]
ATGCTTAAAAAGATAGTTATAATATCCTGTATAGTAGTTGTGTTAATCATTTTATCAAAAATAGTTGATG
ATAACATCAAAGAAGATGCTTCTATTCCAAATGTGAATAAAGAAACATTAGAATATTTTAGAAAAAATTA
TAAAGAAGACATAATAACTTGTGCTGAAGAAGATTTAAATAATGATGGGAAAAAAGATTTAGTAGTTATA
TATAAAAAAAGCAATAATTCAAATGAAATGGTAGTCGTAGTTTCTGATAAAAATAGCCACTATATAACAA
AGCCAATACCAGCACCTATAGAGAATCAAACTATAACCTTTAAAAATATTGATGATAAAGCACCAATAGA
AGTAATAGTATCAGGGTCTAAAAATGGTAATGTAGGATATGCTATTTACAGAGTAGAGGGTAAAAAATTT
GTTGATTTATTTGGCGAAGATATGGACAAATGTTGCTAA
>ref|NC_013316.1|:c2645748-2644663 putative permease [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATATTAGAAATTGTTTTAAATGGAGTTAAAGATACTATAGTAGCTTCTATAGTTACACTGAATG
GAGCATCAGGATGGCTTATGATAAGTTTTATATTGGCAGGTGTACTTCACAATGTTTTAACTCCAAGAAG
GTTTCAAAAACAACTTGGAAATAAGAAATTTTCTTCTTTAATTAAAAGTACTATCTCAGGAATGTTTTTA
CCAATATGTAGTTGTGGAGTAATACCACTTGGAATAAGTATGTATTATTCAGGAGCATATTTAGGACCAG
TACTTGCTTTTATGACATCAACTCCAATAATAAATCCAATAGCTGTAGTTCTTTGTCTAGGTCTTTTAGG
TCCTAAAGTTACAATCATTTATCTAATAGCTGGTTTTTTAGTACCATTTTTAGTAGGATTTTTAGGAAAT
TGTTTTGGAAAAGAAGAATTATCACTTTATAATGATTCAGAGGAAGAAGTAATAGAATTAGAAGAAGAAA
AAAGAAGTTTTATGGAAAATATGATTGATGGTCTTAAATGGTCTTTTGGTGAATTAGCCCTTACTATTAG
TAAATATGTAGTAATGGGTATGGTTTTTGCAGGATTTATAACAACTATTTTTCCAAATAGTATAATTCAA
AAATATTTAGGAAATCCAGGTTTGCTATCTCTTGGAAGTATAGCAATACTTGCATGTGTTATGTATGTAT
GTGCTGTAGGACATATACCGTTTATAGCAGCCCTTGTTGCAAGTGGAGCATCTCCTGGTATAGCGATAAC
ATTTCTAATAGCTGGAGCAGCTACAAATCTACCAGAACTTATAAGCATGTTTAAACTTATTGGAAAAAGA
ACTGTTATTATATATTCTGTAACTTTGACACTGTCCTCAATAATAATTGGATATATAACAAATTTACTTT
TAGTGAATAATAATTCAGTAAATTTAGATGCAACAAATTCTTCAATACAGTTGGCAAATAAACTAATGTT
AAATATACCTGATAGTTTTGAGTATGTATGTACTATTTTAATTATTTTATTTGCATTTAAATCAACAATA
CCAAAGATGAAAGAGGTCATAGGAAATCATGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2645975-2645775 hypothetical protein CDR20291_2255 [Clostridium difficile R20291]
GTGTTTATAAAAAAAATGTCAGAAAAGTATGCTGATAAATTGGAAATAAAATTATATCAAGCAGGGAAAG
ATTTTTCGTATATAAAAAAATATGGGATTATAACAAAAGGAACTTTAATAATAAATCAGAAAAAGAAATA
TGATAGATTAAATAAAGATACAATTGAAAGGGCAATAGTAGAAGCTATAAACAATAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2646454-2646122 hypothetical protein CDR20291_2256 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTAGCTTATATTTTTAGTAGTACTAATACACATAAAATTCTAGACAAAATGATAATACCACAAC
TTGAACAAGGAACTCATGGAGTAGACGTTCTAGGGATGTTTTTCTTTATGGATAATACCTTATTTTTATC
TAAAGGTAATCCAGTAGGCGAGAGACTAAGTAAATTACATGAAAAAACTGATATGATAATAATGGCTTGT
GACCAATGTGCTATAGAAAGAGGTATAGAGAATAATTTGGTTGATGGAGCTACAATTGGATGTTTCCCAA
ACCTATATGCTTGTTTAGGCAGTGCAGGTGTGGACCAAGTTATAACGTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2647546-2646710 nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTATTTGATTATTGATAGAATGATACAGGATGCTTTGATAGAAGATGTTCCAAGTGAAGATATAA
CAACTAATTCTATTGTGGATGAAAATTCTAAATCTACTGTAGATTTAATTTGCAAACAAGATGGTATAAT
AGCTGGCTTAGGTGTATTTAAGAGAGTTTTTGAGATACTTGGTGATGTAGATGTAAAATTATATAAAAAT
GATGGTGATAGAGTAAAGAATCGTGAAAAGATAGCTGTATTAACAGGTAGTACTAGAAACTTACTTGTAG
GAGAGCGTGTAGCATTGAATTATTTACAGAGAATGAGTGGTATAGCTACTATTACAAGTAGGTATGTTGA
AAAGCTTGAAGGTACAAATACAAAATTATTAGATAGTAGAAAAACGATACCTAATCTTAGAATATTAGAT
AAGTATTCTGTTAAAGTAGGTGGAGGATGCAATCATAGATTTAATTTATCTGATGGAATATTGCTTAAAG
ACAACCATATTGGGGCTGCTGGTAGTGTTAAGAAGGCAGTTGAATTAGCTAGAAAAAATACTTCTTTTGT
TAGAAAGATAGAAGTGGAAGTGGAAACTTTAGACATGGTAAAAGAAGCAATAGAAGCTAATGCAGATATA
ATAATGTTGGATAATATGAGTTTGGAAATGGCAAAACAAGCAGTAGATATTATAAATGGAAGAGCCATTG
TAGAATTTTCCGGAAATGTAAATTTAGATACTATAGAAGATATAGGAAAAATTGGTGTGGATGTTGTTTC
TGTAGGAGCGCTTACACATTCTGTTAAAGCTCTCGATATAAGTATGAAGAATTTGAGAAATATATAA
>ref|NC_013316.1|:c2648828-2647527 L-aspartate oxidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTAGAACAAGATGTTTTAATAGTTGGAAGTGGAGTTTCAGGATTATACTGTGCATTAAATTTAG
ATAAAAGTTTAAATGTGCTAGTAGTATCGAAATCAACAATTGAAAACAACAATACATATCTTGCACAAGG
TGGAATTTCAACTGCTAGAAATATTGATGATATAGAATCCTTTGTAGAAGATACAATGAAGGCTGGGCAG
TATAAAAATAGAGTTGAAGCAGTTCAAGTACTTGCAGATGAATCTATAGAAAATGTAGGGCAGATAGTAG
AATATGGTATGCCTTTAGACAAAGAAAATGGAGAGATAGATTACACAAGAGAAGGAGCACATAGTGTAAA
TCGAATAGTTCATAGTAAGGATAATACTGGAGAAGTTGTTTTTAAAACTTTATTAAAAGAAGCTAAAACT
AGAGAAAATATAACTCTTATAGAAGATGCATATCTTTTAGATATATTAAAAGATGGCAATAAATGTATAG
GAGCTAGAATTTTTAAATCTAAAAAAGAGATTCATGTTTTTTCAAAAATAGTAGTTTTAGCTACAGGTGG
AATTGGTGGGCTTTTTAAAAATTCTACTAATCAAAGACATCTTACAGGTGATGGAATTGCAATAGCTTTA
AGAAATAATATAAAAATAGAAAATTTAGAATATATTCAAATACATCCTACAGCCTTTTATGAAGAAAATA
ATGAAGGTAGGAGAATGCTTATATCTGAATCATTAAGAGGAGAGGGAGCTAAACTTTTAAATAAAAATAA
AGAAAGATTTGTGGATGAACTTCTTCCTAGAGATGTAGTTTCAAAAGCTATTTTTGAGCAAATGGAAAAA
GATAAATTACCTTATGTGTATTTAGATGCAACACATTTAGATAGTGAATATTTAATTAATAGATTTTCTT
TTATTTATAATGAATGTTTAGCTAGAGGAACAGATATAACGAAAGAATGTATAAAGGTATCTCCTGCACA
ACATTATTTTATGGGCGGGATACATGTAGATTTGGATTCAAAAACATCTATGGAAAATTTATATGCAGTT
GGTGAAATTAGTTGTACAGGTGTTCATGGAGCCAATAGATTGGCAAGTAATTCATTACTTGAAGGGCTTG
TATTTTCAAAAAGAGCAGCTAAAAATATAAACTCAGTTATAGATAATGTAAAAGTTAAGTTTATAGATGT
ACCAGATATGGATATAGATATAGAACAGGTAAAAAAAGAAAATAAAATATTAGTCATAAAAGAAATTGAA
AGAACAAGTGAGGATTTTGGCGATGAATTATTTGATTATTGA
>ref|NC_013316.1|:c2649755-2648841 quinolinate synthetase A [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAAAGATTTAACATATCAAATCAAAGAGCTAAAGAAAGAAAAAAATGCAATAATACTTGCCCATT
TTTATCAACCACCAGAAATACAAGAATTAGCAGATGCAGTTGGTGACTCATATTATTTAAGTGAGATTGC
TAGAGATTGTAAAGAAGAAGTGGTTGTATTTTGTGGAGTAAGGTTTATGGGAGAAAGTGCTAAGCTATTA
TCACCTGAAAAAACTGTATTGATGCCAGTAAGTAACGCTGGGTGTGCTATGGCAGATATGGTAGATGAAG
AAGGCGTGATAAAATTAAAACAACAGTATCCAAATGCTTTGGTTGTATGTTATATAAACTCTACAGCTAA
AGTTAAGGCACATTGTGATGTTTCTGTTACATCTTCTAGTGCAATTAAAATACTAGAAAACATAGATAAT
AAAGAAATTATATTCCTTCCAGATAAAAATTTAGGAGGATATATTGCAGAACAATTTCCAGATAAAAACT
TTATATTTTGGGACGGATATTGTAAATACCATAACAATATAAGAGCTGAAGAAATAATTGAATTAAAAGA
TAAGTATAAAAATGCAGAAGTATTAGTACATCCAGAATGTAAAAAAGAAATAAGAGATTTAGGAGATTAT
GTAGGTAGTACATCCGGAATAATAAAATATGCTACTAATAGTAAAAACAAAGACTTTATAATAGCAACTG
AAGAAGGTATATTACATGAATTAAAGAAAAATAATCCTAATAAAAACTTTTATATTCCTGGTGGAAAAAT
ACTATGTACAGATATGAAAAAGACAACATTAGAAAATTTATATAGTACACTTAAAAATATGGAAAATGAA
GTTATTGTAGAAGATGAAATCATGGAAAAGGCTTTAAATTCACTGCTTAACATGCACAAATTAGCAGAAG
GATAG
>ref|NC_013316.1|:2650131-2651630 putative carbon starvation protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTATACAAAGACCAAAAAATTTTATAAATGGGGTGATATTATGACAACATTCTTAATCGGCTTGGCTA
TATTACTAATAGGAGGTGCTTTATACGGTGCTTATTGTGAAAAAGTATTTGGCCCAGATGACAGAAAAAC
ACCTGCACTTGCTCAAAGTGATGGAGTAGACTATGTCCCAATGAAAAAATGGAAAAATAGTCTAATTGAG
TTGCTTAATATAGCTGGTACAGGACCAATTCTAGGACCTATCCAAGGTATATTGTTTGGTCCAATAGCAT
TCATACTAATACCTATTGGCTGTGTATTTGGAGGAGCTTTGCATGACTATATGAGTGGAATGATTAGTAT
AAGAGAAAAAGGAGCACAAATGCCTTCTCTTATCAGTAGATTTTTAGGTAATAAAGTATTTCAAGTCTAT
AATATATTCCTTTGTCTTTTAATGCTTTTAGTTGGTGCAGTTTTTATTTATACACCTGGGGATTTAGTTG
TTACTCAAATTTTAAATATGAAATCGACTATAAATAATCCAGTTGTCTGGATAGTTTATGGACTTATCTT
TCTATATTACTTGTGTGCAACACTCTTTCCAATTGATAAAATCATAGGAAAGGTATATCCAATATTTGGA
GCTATTCTACTTTTATCTGCTGCTGGTGTTGGAATTGGAATCTTTACACAAGGTTATGATTTAGCTAATT
TAAGTCTTGCAAATTGGAAAGGTATTCATCCTGATGGTATTCCTCTTATTCCTACATTCTTTGTTACAGT
TGCTTGTGGTATCGTTTCTGGATTCCACTCAACTCAAGCTACTCTTATAGCAAGATCAGTTTCAAATGAA
AAAGAAGGAAAAACTACTTTTTATAATATGATGATTTTAGAAGGTTTAATTGCAATGATTTGGGCTGCAG
CTGCTATGGGTATTTACAATAAAGGAATACCTAAGGAATTAGTAGGTTCTCCTGATGTAATAGGTTTGGT
TGCAAGAGATTTACTTGGTTCTATTGGTGGTATCATAGCTATAATAGGTGTAATTGTTTTACCAATAACT
TCTGGAGATACAGCTTTAAGATCTTTAAGATTAATGCTTGCAGATTACTTTCATTATGACCAAAAGGAAA
AGAAACATCGTGTTATATTGTCAATCTGTATATTTATTCCTGTCATAGCCATTCTTATATTTGCAAAGCT
TAGTGCTTCTGGATTTAATATATTGTGGAGATACTTCTCTTGGAGTAATCAAACTATTGCCATATTTGCA
TTTGCAATGATTACAGTTTACCTTATAATAAAAGAAAAGAATTATATTATAAGCTTAATTCCTGGTATGT
TTTATTCTTTTGTTATATTCAGTTATATATTTAATGCTCAAATTGGATTTAACTTAAACATAAATATATC
ATATGTTTTAGCTGCCATATTTACTGTATTATATGCTATTTTAACTGTACGCTCTGGTAGAAAGTTAAAA
AGCAAAGCGGATACTAAATTGGCTGACTAA
>ref|NC_013316.1|:2651853-2652281 hypothetical protein CDR20291_2261 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATAAATTACATGAACTTGAAAAAAATCTACCAGAAACATCTTGTTCTTTTTGCACACATCTTT
CATTTAAGGGGCCTAGCCTAGACTATAGATATGATATTAGATGTGTTATTTCAGATACAAAGCCTGATTT
TAGAGGATGTTGTGAATATTTTGAACCAGAATATACAGAATTAAATACAGGAGATTTAGACAATCTATAC
ATAAACTTTCTTGAGACATGCCTCAAGGTAAATTATAATGATTACATCAATTCTATGTATTGGAAGTTAT
TTAAAGAAAGAACCCTACTAGAAAACAATTTTAAATGTTCTATATGTGGATCAACTGAAAATGTTGATGT
GTATCATGTTAATAAAAATTTAGGAAGGGAAACTTCCAAAGATGTAGTTGTTAAATGTGATAAATGTAAT
TGTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2652341-2652649 hypothetical protein CDR20291_2262 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATAATAATTTAAATTGTGCTGCTACTAATTGTGCTTATAATACTAGTGGATATTGTTATGCTG
GTAGTATAAAAGTAGATGGAATGCAAGCAACTACTACAGAAAATACTTATTGTGCTTCTTTTGAAGACAA
ATATACATCTGGTATAACTAGTCGTTCTAATGAAACTAACCAAGTTGATACAGATAACATTCATTGTGAA
GCTGTAAAATGTAAATACAATAAAAATGAACTTTGCAAAGCTGAAAAAGTTCATATAAATGAAAGAAATG
CAAGTTGTGAAACTTTTGAAATGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2653818-2652796 hypothetical protein CDR20291_2263 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGATAACAAAGGATTGGCACGTGATAGTTCAAAATATAAAATTGTTTCTATATCTGTCGTAGTAA
TTATTCTAATTACATTTTGGTATATGTTAAATATGGTGCTTTTAACATTTATTATGACTTTTATTTTCTA
TAACTTGCTTGTAGCCACAAGAAAACGAATTAAGAAGTTTTCTTCTTTAAATATTCCAGATTCATTGATA
ATTATAGTGTTATATGCACTATTTGCTATATTGTTAGTATTGATTAGCTATGCAGTTGTACCAATAATTA
TAGTTCAACTTACAGAGCTGAGTAGGGTTTTTAGTGATTTTGATGTAAATCAATTTGCTCAATCTTTAGG
ACCAAAATTGTATCCTATTGTCTCAAAGCTGGATTTTAATAAATATATTTCACAAGCAGGGCTACTTATA
GCATCAACAGCAACAAAAGTTGGAAGTTTTGGAGTAAATATATTATTGGCATTTTTACTGAGTTTACTCC
TTTTACTTGAAAAAAATGAAATTAAAAATTTTGGAGATAAACTTTCTGATAGTAAGATTTCTTTTATTTA
TAATTCGCTTGTATTTTTTGGAAAGAGCTTTGTTAAAAATTTTGGTGAAGTAATGAAAGTACAAGTTATG
ATTGCCTTTATAAATTCTGTTGTTTCTATGATTTTCTTAGGTTTCATGGGATTCCCTCAAATATGGGCTT
TAGGATTTATGATTTTTGTGTTGGGTCTTATTCCAGTAGCAGGAGTTATAGTGTCTTTGATTCCATTAAC
TGTAATAGCATTTAATACAGGAGGAATAACAAAGGTTTTTGGAGTTTTACTTATGATTTGTATAGTGCAT
GCAGTAGAAACATACATATTAAACCCTAAGTTGATGTCGAATAGAACTAAACTTCCAGTTTGTTTTGTTT
TTATTATTTTACTTGTAGGAGAACATTATTTAGGTGTATGGGGATTACTAATTGGAGTTCCAATATTTAT
GTTCCTTATGGATATTCTGGGTGTTAAATTTACTTCTAGGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2654499-2653993 NUDIX-family protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATTATGGGATTTATATAATGCTGATGGAATTAAAACAGGAAATGTTATAAAAAGAGGTAATTCTA
TTGAAGAAGGTTATTACCATTTGGCAGTTGAAGTGTGGATTTTAAATAGTAACTCTCAAATTTTAATTCA
GAAAAGGTCTAAAAGTAAAAAGACATTGCCAAATATGTGGGGAATGACAACTGGATGTATTGTTTCTGGG
GAAGATAGTTTAGAAGGAGCAATTCGCGAAGCAAAGGAAGAAATAGGGATAGATATAACTAAAGATGAGA
TGAAAGTTTTTAGAAGTATGATTCATGAAGATACTCTTTGGGATGTATACTTAGTTAAAAAAGAATATGA
TATATCCAAAGCTATTTTACAGGAGGAAGAAGTAAGTGATATAAAGTGGGTAAGCACAGATGAAATAAGA
CAATTACTAAAAGAGGGTTTGTTTTTTGAATATCCAGAGATGTACGAATTGCTATATGAGATAGATAATA
ATAAATTAAATATATGA
>ref|NC_013316.1|:c2655259-2654558 hypothetical protein CDR20291_2265 [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAAAAATAAGTTTAAAAAGTATGATAAGATTATTTTCAGGTTTTTTTATATTTGCAATTTCTTCTG
TGCTTATGATTAATGCACATGTAGGTCTTATGCCTTGGGATGTACTTCACCAAGGTTTATCTATAAAGCT
AGGCATAACTATAGGTCAGGCTTCTATAATGGTAGGAGTTGTAATTGTTATATTGGATGCAGTTTTTGGT
GAAAATATAGGATGGGGTACTTTACTCAACATGACATTTATAGGAATTTTTATTGATTTAGTAATATTTT
CTGGAGTGATACCTCATGCAAGCAACACTTATATAGGTGTGTTTATGGTTGTTATAGGAATTATTTTGGC
AGCTATAGCAAGTTTTCTATACTTAGGTGTTTGTTTAGGAAGTGGACCGAGAGATGGGCTTATGATTGCT
CTTCAGAAAAAAACTAATAAATCTGTACGTCTTGTTAGAACAATTCTTGAAATACTAGCATTAGTTGTTG
GGTGGTTATTAGGAGGTTCTGTAGGTATTGGTACGCTTGTAAGTGCTTTAGGTTTAGGATATGTATTACA
AATAGTGTTTAGAATATTTAAATTTGACACAAAGTTGCTGAAACATAGATTTATTATAGATGATATAAGA
GAATGGAAGGAAAAGAGAAGCAATGAACATAAATGTAAATCAAGTATTGTAATAAAAAATGAGCAGAATT
AA
>ref|NC_013316.1|:c2656547-2655477 butyrate kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGACTTACAGAATATTAGCCATAAATCCAGGTTCTACTTCTACAAAAATAGCAGTATATGATGGAGAAG
AACAAATTCTTGTGAAGACGATAGACCATCCAGCTGAAGAGATTGCAAAATATAATACTATACAAGACCA
GTTTGAAATGCGTAAGGAAGCAGTTTTGAATATTCTTAAAGAAAATAGTATAGACTTAAAATCTCTTAGT
GCAATAGTAGGAAGAGGTGGAGTTTTACCACCAGTAAAATCAGGAGCATATCTAGTAAATGAAGAAATGA
TTGATGTACTAAGACATAGACCAGTACTTGAACACGCTTCCAATTTAGGTGCTGTTGTGGCACATGCAAT
ATCAGAACCTCTTGGAATCAACTCATATATTTATGATTCTGTTGCAGTAGATGAGCTTATAGATGTAGCG
AGAATATCTGGACTTTGTGGAATGGATAGATCAAGTGCAGGGCATGCATTAAATACTAGAGCAATGGCTT
TAAAATATGCTAAGGATAAAGGAAAAGATTATAAGAGCTTAAACTTAATAGTAGCTCACATTGGTGGAGG
AGTAAGTATTTATCTTCATGAAAAAGGAAGAATGGTTGATATGCTATCTGATGATGAAGGACCATTTTCT
CCAGAAAGGTCAGGAAGAGTACCTGCTACAAAATTAGTGGCTGCCTGTTATTCAGGTCAATATTCAGAAA
GAGAAATGACTAAAAAGATAAGAGGTAAAGGTGGTATAGTTTCATACCTAAATACTGTAGATGCTAGAGA
AGTTGAAAAAATGATAGCAGAAGGAAATGAAGAAGCAAAAATTATTTATGAAGCAATGGCTTATCAGTTA
GCAAAAGGTATTGGAGAGTTAGCAACTGTAGTAGATGGAAAGGTAGATGCTATAATTATAACAGGTGGAA
TTGCATATTCTGAAATGTTTACTTCAATGGTTAAAAAGAAAGTTGAGTTTATAGCACCAGTAGAAATTAT
GGCAGGAGAAAATGAGTTGGAATCACTTGCTTTTGGAACTTTAAGAGTACTAAATGGAGAAGAAGAAGCT
AGAATTTATAGTGAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2657175-2656600 putative indolepyruvate oxidoreductase subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGACTAAGAGTATACTTTTGGTAGGTGTAGGAGGTCAAGGAACTATACTTGCTAGTAAATTATTAACTA
TGGGATTGATGGAAGCTGGATATGATGTAAAGATGAGTGAAATACATGGAATGAGTCAAAGAGGAGGTTC
AGTTTCCTCACAAGTTAGATATGGAGATTGTGTTCATTCTCCAGTTATAGAAATTGGTGGAGCAGATATA
TTAGTATCTTTTGAAAAAATGGAAGCTTTAAGATGGTTCAATTATTTAAAACCAGAAGGAAAAGCTTTAG
TAAATAATCATAGGATAGATTCTATGACTGTTTTAATCGGAGGAGCTGAATATCAAGAAAGTGATATAGA
TGCAGAGTTAAGTAGATTAAATGCAAAAGTTATAAATGCAGCTGATAAAGCTGAAGAACTAGGAAATTCA
AAAATAATGAATGTTATTTTATTAGGATGTCTAGTTAAATCTATGCAATTAGAGTCTATTGATTGGGAAA
AAATTATAAGTGAAAATGTTAAACCAAAATTTGTTGAATTAAACATAAAAGCTTTCCATGAAGGTATGGA
AATGGTTAGCAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2659006-2657177 indolepyruvate oxidoreductase subunit [Clostridium difficile R20291]
GTGGACTATGAATTTAATAATTGTAGATGGAGGGAATTTTATATGAAACAATTGATGACAGGTAATGAAG
CAATTGCACGTGGAGCCTATGAGGCTGGTGTTAAATATGCATCTGCATATCCAGGGACTCCAAGTACAGA
AATATTAGAAAATATAGCAACATATAAAGATGCAATAGTTGCAGAGTGGGCTCCAAACGAAAAGGTAGCA
CTTGAGGCTGCTATAGGGGGTTCAATTGCAGGAGCAAGAACAATGGCTTCTATGAAACATGTTGGTTTGA
ATGTTGCAGCTGATCCAATATTTACTTATGCATATACAGGGGTAAATGGTGGTATGGTACTTATTACAGC
AGATGAGCCGGGAATGCATTCATCTCAAAATGAGCAAGATAATAGGATGTATGCAAAATTTGCAAAGATA
CCTTTATTTGAACCATCAACTAGTCAAGAAGCTAAAGATATGATAAAAGAAGCTTTTGAAGTTAGTGAAA
AATACGATACACCAGTTTTATATAGAGTTACAACAAGACTTTGTCATTCAAAAGGATTAGTGGAGTGCTA
TGATAGAGAAGAAGTTGAAATTAAAGAGTATGTTAAAAATGCTAAGAAAATGGTAACTGTTCCAGCAAAT
GCTCAAATAAGAAGGGGCGTTGTTGAAGAAAGAATGGAAATCCTTAAAAAATTCTCAAATGAAACTGATT
TAAACTACTATGAAATGAATGATACAAAAATAGGTGTTATAGCTTCTGGTATGTGTTGTAATTTTGCCAA
AGAAGTTTTTGGAAAAAATGCATCATATATGAAACTAGGATTTACAAATCCATTACCTTATGAAAAAATA
AAAGAATTTGCAGAAAAAGTTGATAAAATATATGTTATAGAAGAAAATGACCCATTTATAGAAGAACAAA
TAAAAGCATATGGAATAGATTGTATTGGAAAAGATGTAATACCACCATATGGAGAAATGACACCAGATGT
TTTAAGAAAAGCTATATTTGGAAAAACAAATGATACTATAGAATACAAATCTGAATTAGTAACACCAAGA
CCACCAAGTTTCTGTGCAGGATGTCCACATAGAGGATTCTTCTATGAACTTGGAAAGAGAAAAAATTTAA
TAGTTGGTGGAGATATAGGTTGTTATACTCTTGGATTTGCTCCTCCATATAATGGAATAGATTATGTTGT
TTGTATGGGTTCTGCTTTTGGAACTGCACATGGAGCTCAAAAAGTTCTTAATATGAAGGATGATAATGAA
AAAAGATTGGTAGGTGTACTTGGAGACTCAACATTCTTCCATACAGGAATAAATGGACTTTTAGATGTTG
TTTACAATAGAGGTAATTCTATTTCGGTTATATTAGATAATAGAATAACTGGAATGACAGGTCACCAAGA
AAACCCAGGTTCAGGGTATACTTTACAAGGTGCTAAAACTAAAGAAGTTGATATAGAAGGATTAGTTAAA
GCTTGTGGAATAGAACATGTAAGAGTTATAAACCCTAACAATTTAAAAGAAGTAAATGAAGCACTAGATT
GGGCTTTAGCTATAGAAGATGAACCATCAGTAATAATAACAAGATGGCCATGTGTACTTAAAAAATTCTC
TAAAGAAGATATAGAAGAATTTAATAATCCATTTAAGACTAAGTGTAAAGTTGACCATGATAAATGTATA
GGATGTAAATTATGTTTGAAAACTGGATGTCCAGCTCTATCATTTGATAAAGAGAATAAGTTATCAAATA
TAGATAGAAATCAGTGTGTAGGATGTGGAGTATGTGCACAAGTTTGTCCAAAACAAGCAATAGTTAAGGA
GGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2660284-2659025 putative aspartate aminotransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTCAAAGTATGGTTGGTAAGCATGCAATGTGGCCAAAAGAAAATGATGTTATATTTAGCATATCTG
GTAGAGCTCAAGCAGCAGAGAAGGCTTTTGGTATGGATAATGTAATAAATGCAACAATAGGCGCTCTAAT
GGATGATTCAGGAAAATTAATAACAATGAAAACTGTATATGAAGAATATAAAGCATTAGATAACTGTGAG
ATAGGTGCATATGCAGCTCTTGAAGGTCAACCAGACTACTTAGAAGCAGTTAAAAAAGTATTTTTCAGAG
ATTACTTACCAGAAGGACATATAAGAGTATTAGCTTCACCAGGAGGAAGTGGTGCAATAAAATTAGCTGT
ATGGAACTATACTAATGAAGGAGATGAGGTATTAACATCTGATTGGTTTTGGAGTCCATATGTAAGTATA
GCTGAAGAGGCTAATAGAAAAGTAGTTAATTACCAACTTTTTGATGAAAATAGAAGGTTTAATTTTGAGT
CGTTCAAAGAAAAATTTGTAAATATAGCAGAAAAACAAGGTAGAGTCTTTACAATTATAAACACACCAGC
GCATAATCCAACTGGATATAGTGTTGCAGATGATGAGTGGGATAAAATATTAGACTTATCAAAAGAAGTC
GCAAAAGATAAAGACAAAAAGATAATATTTTTCGTAGATTCAGCATATATTGACTTTGCAGGTGATGATG
ATGTATGTAGAAAGTTTTTTAAGAAATTTTCTAATTTGCCTGAAAACGTTCTCGTATTGGTTGGATTCAG
TATGTCAAAAGGATTTACAGCTTATGGTATGAGAATGGGGGCTATAATTTGTATATCTTCAAGTGAAGAT
GTAGCTGAAGAGTTCCATTACTCATGTGTTCATTCATGTAGAGCAAATTGGTCAAATTGTAATAGAAGTG
CCATGGCAGTATTATCTAACATTGTAAATGACCCTAAAAAATTCAAAGAATATGAGGATGAAAAAGAAAT
ATACAAAAACATGCTTACTAGAAGAGCAGATGTATTTGTAGAAGAAGCTGAAAGAGTAGGATTAGAAATT
CTTCCATATATAGCAGGTTTCTTTGTAAGTATACCATGTGATAATCCAAAAGAAGTATGTGAAGAATTGA
CTAAACATAATTTATTTGCAGTTCCATTAAAAATGGGCTTAAGATTTGCAGTTTGTGCAGTTTCTGAAGA
TAAATGTAAGAAAGCACCAAGTATTATAAAAGAAGCACTTGAAAGTTTAGAAGTAAAAATAAATAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2662546-2660546 putative sigma-54 interacting regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
GTGATTTTGTTGCGAAAAAAAATAGGAATTATAGCCTCTGATATTGAATTAAAAGAAAGAATAGAAGAAT
TATATAGAGAAGATGTAGAAAATGGAACTATAATAATCGACATACTTAACCTAGACTTAATGGAAAATCA
AGGTCGTATACTTGTTGAAAAAGGTGCCCAAGCTATAATTGGTAGAGGTGGAGGTTATAGTTTAGTAATA
GATACAGTAAATGTACCTGTTATACCAATGAATATGAAGTCAACTGACCTTTTAAGAGCAATAGAAATAG
CAAAGAAATATTCTAAAAAAGTAGTATTGATTCTTGGAGACAATGAAGTTTCTTTTGACTATGTTGGCTG
GAGAAATGTCATAAGTACTGAAATAACTGAAGAATGGTTTGAATCTAAGTATGAGATAAGAAGTAAAGTT
GTAAAATATATAGACCAAAAAGATGAAGTTGTAATCGTAGGAGGAGGTTTGGCATGTTCTTTTGCAAGGC
AATATGGAATTGATAGTGTATTTGCAACTGCTAGTGATGAATCTATAAGAGAAGCTGTAGAATATTGTAA
AAAATTATTGGATACATTAGGTGAAGAAAAGTTTAATAATGAAGTGTTACGAAATATACTTGATGGTATA
AAAGATGGAGTAATTGCTATAGATAGTAATGGTAGTATAATTTTGTACAATGAAAGTGCAAAAAACATGC
TTAAAGTAGAGAGAAAATGTGCACTTAATAAATACATCTTAGATGTATTTCCTAAAATGGAGTGGATGTT
AGATTGTTTACATGAAAAAGAGGATGTAGAAGATAGAAAGATAAGAAATATAAATAATCTAATTGTTAAT
ACTAGGACAACATTAATAAAAGTTGATAATAGTACTTATGGAGTTTTAGGAATAATACAAGATATAACCA
AGCTACAAAACTTAGAAAGAAAAATAAGATTTGACTTGAATCAAAAAGGTCTCTATGCTAGATATACTTT
TGATGATTTTTTATTTAAAGATAAATTAACTAGAGAATTTATTGAAGAAGCTAAAAAAATTGGAAAAAGT
GATTATACAACTTTACTTTATGGAGAAAGTGGGTCTGGTAAAGAAATTATAGCTCATAGTATACACAATA
TAAGTAAAAGAAAAGATAGGCCTTTTGTTGCTATAAATTGTGCTACTATAGCAGAAAATTTACTTGAAAG
TGAACTTTTTGGCTATGAAGAAGGTGCATTTACTGGTGCTAGAAAGGGTGGAAAAAGAGGACTATTTGAA
CTTGCTCATGGAGGGACTCTTTTTTTAGATGAAATAAATAGTCTATCCTTTAATATTCAGACAAAACTAT
TAAGAGTAATAGAGGAACGTCAAATAATGAGAATTGGTTCTGATTATATAATACCTCTGGATATAAGGAT
TATAGCAGCAACGAACGAATCTTTAACCGAAAAAATAGTTATGGGTACATTTAGAGCAGACTTATTTTAT
AGATTGAGTAGTTTAGAGATAAATATACCTCCTTTAAGAGACAGAAGAGAAGATATAATACCTTTGTTTA
ACAATTTTGTAAATGAAGTATTAAAGGATGATGGTCTCAATGGAATAAACAGTATAGATGAAAATTTTGT
TTTGACTAAAGATGAAATGGATAAGCTATATAATTATAGCTGGCCTGGAAATGTAAGAGAGTTAAAGACA
ATAGCTCAAAAATATGTTGTGACAGGTAAAATTAAATTGAGACAAGATAGAGATTTTAAAACTAAAAAAT
TACTTCCTAACTCTGAAGTAGACAAATTTAATTCTGAAACGACAGCAAGTGTAGAAGTCCAAGATGAATC
TATAAATATAAGTAAGATAAATGATGGTAAGATAAGTATAGATATAAAAGAAGTAAATAAGTATGTTGAA
GAAAAAATAATAAGTATGCTTTTTGCTCAGGGACTTTCTAAAAATGAAGTTGCACAAGTTCTTGGAATAA
GCAGGACATCTTTATGGAAGAAATACAATAAAAATATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2664449-2662554 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
GTGATTTACTTGAAAAGGAGTTTAATAGAAGATTTAAAGAGAAATATAAACAAGATAGAATACGATATGT
TGACTAAATTCTATCTAAATTTGACAGATTTAAACTACATCTTGGATTATCACAAAGACCTTTTAAATAC
AAAACTAGAAGATAATAGTAGAGTCTATACTTTATATTTAATTAGCCTTATAAACTATATAAAAAAAGAT
AGAGAAGCATCATACAACTATTTGATAGAGTCATTAAAGTATATTAAAAAATTGTCATTAAAAGAAGATT
CAGATATAATATCTAAAATTTATATTTATCTTACTTTATCAGCTATTTCTATAAGAAAATATGATAAGGC
AAATAATTTTTATTTCTCAGCAAAAAAAGTTATAAGACAAAATCATTTAAATGAGTTGCTAGTCTTGTTA
AATATGAGTTTATGTGTAGAAATAAGTGCTTTATATCAGACCAAAACGGATGTAATAGCTTTAGTAGAAG
AAGTGTCTTTTTTTAAAACTTTAAAAAATAAAGCTCTTGTAAGTAGGGCAAATTATATATTTGGGAGAGT
TTATCTATATTTATTTAATAACTTTATAAAAAGTATGGAGTACCTAATTGAATGTCTAAAACTGGCTCAA
GAAAATAATTTATATTCTATAGAGGCTTTTTGTAAATGTATAATAAGTTTGTGTTATTTAGAGAGTGGAA
ATAATGTAGAAGCTATAAAATACATAAATAATGTATTAGATGTTGCGCACAGTAAGAACTCAATATCAGT
AACTGAAAGAGTGTCTATAAAGATAGACCTTATATGGGCATATTTAAAAGAAGATATGAATAAAGAAGCA
GAAGTTATTTTATTAAAGACTATAAAATTAATGAAAGTTGTTGAAGGTGTATATAAGGATTATTTATATT
CATTTATATTTTTATATTCAGCTGAAATTGAGTTAAGGAAAGATAATTGTAGTTTTGAAAAGGTAAATAC
CTATTTAATTTTATCAAAAAATATATATAAAAGTTTTGGCGATGTTTTTATATATAATTCTAAACTAGAT
TACATATATAAGTTGTATGGAGATTTATATATAAAATTTGGTAATATAGATGAAGGTATAAGTTGTTATA
TAAAAGGTTTAAATTTAGTTAAAAAGAGTTCATTGAATCTTAGAAAAATATCTATATTTTATGGGCTAAT
AGCAAATGGATATGAGCTAAAAAAAGATTTTAAACTGGCAATAGAATATTATAAAAGTATGGATTGGTAT
TCTGATAGGTGGGAAAAAAATAATTCCTATAAAACATCTCAAGCAATTCACAAACAATATGAACTCAGAC
AAAAACAAGAGAGTTTAAGATTACTAGTGGATGATAATAAGAAATTAGAAAATGATATTTTAAAAGATGG
ACTTACTAAACTATATAATAGAAGATATTTGGAACAGCAGTTGGATTTATTTAATGGAACCAGAGACAAA
AATATGGTTGCAATACTAGTCGATATAGATTGTTTTAAAAGTTATAATGATAATTATGGTCATCTAGCAG
GAGATAAAGTTATAGTTAAGGTAACTGATATTATAAGAAGTGTATTTATAGATATTACCGAACATATAAT
CAGATATGGGGGAGAAGAAATTTTAATACTAGTAGATTCTATAGAATCAATCGGTGTTGAAGAGATTGAT
AATATAGAATTATATATTAAAAGAGTTTTCAAACTTCTTGAATTTGAGGGTATTGAACATATATATTCTA
AAATAAAAAACTATATAACTATAAGTGCTGGAGTAAGTATAAAAAGATGTCGTAGTAGAAAAGATGTTGA
AATATTAATTGAAGATGCAGATAAGAACCTATATAAATCAAAAAAAGCAGGTAGAAATCAATACATTATA
ATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2666275-2664467 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAAACTAACCTTGAATGAAAGATTATTGACTAATAACGATTTTGTTGAAAATAAAATTGGTGTAG
TAAAGAATTTAATTGATTGCTATAAAACTGAACAAAATAGTTTAATGTTATTAAAATCAAATTTTTTGCT
AGCTTTATTATATGGTATTCAAGGGTTTAGTGAAAAAATGAAAGAGTATATTTTGATTTCCTGTAAATAT
ATTGATAAATGCTTACCCAAAGATTATAAATTTTTAGCACGATTTTATTCACAAATAGCTATTTTAAGTT
TAAAAAATGAAGATGTAAATAAGGCAAATTTATATATGGATAAATTTAATCTTATTTGTGATGAAAATAA
TTTTCTAATTGAAGAAATTATTTTTAAATCACAACTTATTTACATTAAGGCAAGTAAGTGTATAGAATCT
TCTGTAATAATTAAAGAAATAGAAACATTGTATATAAAGATAAAAGAAATTAACGATTTTAACTGTAAAA
AAATATATTTTTTTATTATTGGTAAAATATATTTTTTGTTTTTGGATGATGCTCTAATTGCTAAAGTAAA
TTTTTTAAAAGCAAGAAAATATGCAGATTTACTAAAGGATATGCAAGTATCTTCACTATGTAATATAAAG
ATAGGTGAGTGTGAATGTTCATTTGAAAATTATGAATGTTCCATAGAATATTTAAATGAAGTAATAAGCA
ATAAAAAGTATAGAAATGTAAATATAATTCAAAAATATAGAGCATCAAACAACATAACTAAAATATTAAT
AAAGACTAGAAATTATCCTGTAGCAATAAATAATTTAGCAAAATCTGAAGTATATCTAGAAAAAATTAAA
AATCAGAGCTTAAAAGAAGTAGAGAAGTTTGATTTATTTATAAGTTTAGCTATGTATTATGCAAAAAGTA
ATGAAAAATCTTTTGAACAATCAATATGCTATTTAGATAGAGCTAAAAACATCTTAAATATGATAAAAAA
TATAGAAGAATATACAATATATGATTTAGAAATAATTTATCATCAGGCAAAGATATATTATATCTTTGGA
TATTATGACAATGCCTTAAACACAAATAAAAAACTCCTTGAAAAATCTAAAAATGCTAAAAATTATAATT
ATGTGAAGTTAGCATACAAGAATATATATTTGTGTTTTGAAAAGATTCAAAATTATGAAATGAGTATGAA
ATACTTTAAAATGTATTATGAGTTAAAAATGATGTATATAAAAGCTCGAAATAGAAATTATATAGATTCC
TTAAATTATAGACATGAGTATATAGAAACAGAAATAAATAACATGAGAAAAGTAAAACTTGATTTAGATA
AAAAAAAATATGTTGACCATTTGACAAGTGCATATAATAGAACTTTTTTGAACGATTTTTTAGAAAAACA
AGAAGTTAGTGAATATTGCACAGCATTTATGATAGATGTAGATTACTTTAAAGAATACAATGATACTTAT
GGACACTATAATGGAGATATTGCTCTTAAAAATATAACTATAATAATAAAAAAATATCTAAAAAAAGACA
TGTTTATGATAAGGTATGGTGGAGAAGAATTTCTGATATTATCTGTATGTAAAGATTATAAAAAAAGCAA
AATATTTGGAAGAAAATTATGTAGGATTGTAAAGAAATTTTTAAACAATAATTTGACAGTTAGTATTGGC
ATTGATACATGTAAAAATAGTAGTATAGATATAAGAGAAATAATTGAAAATGCTGATAAAGCTTTATATA
AAGCAAAGGAAAGTGGTAGAAATAGATGTTTGCATTATCATGATTTTAAGAATTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2666858-2666439 hypothetical protein CDR20291_2273 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTTATACAAGTTTATATATGATGATAAGGAATATTTATTAAAAGAGGAGAACTGTAGTGCTTTAA
TAAATGATGAAGAAAATCCAGTTCAAGGAGTAAGTATTTCAAAAATAATTGATATACTTAATGAAGCAGA
AGAAGTTGATTTTGATGTAGAATATTATCAAGAAGCATGTCCATTATGTTTAGAAGGAGTAAAAGAAAAG
AAAAAATTCTTTCCTTTTTTAGAATATCACTTTTATATTTTCAGTAAAGATGGAGAATATGTAATAAGCA
ATATATCTGTTGATTATAAAGGACTATCTTTTAATAAACTATCAAGGGCAAATAAAGTTGATAATAGTTA
TATTGTAAGTGTGATAATTTGTGAAAATTGTCAGGATTATATAGTTCAGATAGAAAATTGTATAGTTTAG
>ref|NC_013316.1|:2667684-2668706 putative dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTACAATGACTTACTAAAATCAGCTAGAGAGAACTTTAATGGAACATGTAAAGTATGTAAAATTT
GTAATGGATTAGCTTGTGCTGGAGATGTTCCTGGTATGGGTGGTAAAGGAAGTGGTTCGTCTTTCATTGA
AAATAGAAAAAGTCTAGAAAAAATAAAGATAAATATGAGAGTTATACATAATGTTTCAAAGCCAGATACA
TCCATAGAATTATTTGGTAGAAAAATGAGTTCTCCTATATTCGCTGCACCTGTATCAGGTACTCTATTGA
ACATGGGTGGTAAAGTTTCCGAAAAAGAATACATAGAGCCTGTTGTTAGAGGTTGTTCTAATTCTGGAAT
TTATGCTATGGTTGGCGATACTAATGTAGATACTTTTTTACTGGATAATTTAGATGTGTTGAAAGATAAT
AGTGGAAATGGAATTGTATTTATAAAGCCTTGGAATAATTCAAAGATAATAGAAAAAATTAGATTGTCTG
AAGAAGCAGGTGCTTTTGCAGTTGGTGTAGACCTTGATGCTTGTGGACTTATTAATAATCAATTTCAAGA
AAATCCTTTTTCTCCTAAGACAATTGATGAGATTAGAGAATTGGTTGAATCTACTAAATTACCTTTTATT
ATAAAAGGAATTATGACTGTAGATGATGCTTTGATGGCTGTAGAGTCTGGTGCTAGTGCCATTATTGTTT
CAAATCATGGTGGAAGAGTACTTGATTATACTCCTGGTACTTGTGAGGTACTTCCAGATATAGCTAAGTC
TGTAAAGGGAAAGATAACAATACTTGTTGATGGTGGAGTTAGGACTGGTGTTGATGTAGTTAAGATGCTT
GGATTGGGTGCTGATGCTGTTTTGATGGGAAGACCTTTTGTTACTGCTTCTTTTGGCGGTGGTCTTGATG
GTGTGGAGTTTTTTATAGAGAAGGTTAGGAATGAGTTATGTGAGACTATGATTTTGACTGGTTGTCAAAA
TGTTAAGGATATAGATGGTAGAGTTATATGGAATTTATTGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2670465-2669443 putative beta-lactamase inducer [Clostridium difficile R20291]
ATGCTATATGTTTTTGACAATCTTATAAAGACAACTATTGTATGTAGTTTTGGTATTTGTCTATTATTAT
TTTTGAAAAGATATTTTTTTAAGAGGTTTAGTAAGAGATTTAATTATTATATTTGGTTGGTAATAGTCTT
TAGAATGTTACTTTTTCTATTTAATTATACAGTAATGTATGAAGTAAAAGAGCCCAAGGAAAATACAGTA
GGAAATAATATTACACAAATTGATGTTTCTATAGATAATGATTTTATGCTGTATTTAGTTTATTTATGGT
TATTTGTAACTATAGCCATTGCAGTTTATACATTTATGGAATACACAAAATTTAAAAATCTCGTTGTTGA
TGTATCTTATGATATTGAAGATCATGATGTAAATTGTATCTATAAAAATTTGTTAAAAGAATTAGACATA
AAAAAGAAAATTGAGTTAAGAGGTTCTGATGAATTGATAAGTCCAGCAGGTATGGGATTATTTAAATCTT
ACATATTCTTACCAGACTATACTTATAGTAAAGATGAGTTAACTTGGATTTTGAAACATGAATTAATGCA
TTTTAAAAACAAAGATATTTTAATAAAGTTTTTAGTTTTGTCTGTTAAAATAATGTATTGGTTTAATCCA
CTTGTTTATATAATGAGCAATAAAGTAAATCTAGATTGTGAATTATGTTGTGATGAAAGTGTTTTGACTG
ATTGCTCTTTAAAAGATAAGAAAGCATATGCGTTAGCACTTATAAAGTCAATTAAACTTAGTAAGAATTA
TAATAGTGGTATTTTAACAACTGAATTTAATAAGACAAATTTGGAAAAGAGACTTGATAGTATTATTAAG
AAAAAAGGGAAAAGTGGAATATTGATGTTATTGATTTTGTTTACATTATTTTCAGTTACATATTTTAATT
TTGAAAGTATTAGTTTTGATAATTCAAATTATTTAAGAAATATAGGGATTTTAGAAAAAACAGGCGCAGA
TCTTAAGGAAGAAGATGATATTAGCATGAGAGTTGTAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2670847-2670470 putative beta-lactamase repressor [Clostridium difficile R20291]
ATGATGATAAGAAAAATACCACAAGCAGAACTAAAAGTAATGAAATTTATTTGGAAAGTAGATGCTACAG
TGACATCAAAAGATGTTATTGAAGTTATGGAACAAAAATATGGTTGGAAACAAACCACTACACTAACACT
TTTATCGAGGTTAGTAAAAAGAGGATTCTTAAATGCTCAAAAAATAGACAGATATACACATTACACAGTA
ATAGTAAAACACAAAGATTATTTAAGTTTTGAGACAAAGGATTTCCTAAGTAATATACATGATGATTCTT
TGAAAAGCTTAATTTCAGCATTACATGATGATGAAAATATAGGTAAAGACACGCTAGATTTTTTAGAAAG
TTATTTTGATAATTTAAAGAATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2673121-2672594 putative peptidoglycan-binding/hydrolysing protein [Clostridium difficile R20291]
TTGGTATTTGCAAATACTACTACTGATGTAGATACATCAAAGGATGATGATTCAATAATAAGTTCATGTA
CTATAACTGGTTATGAATTTACATATGAAAACGCACCACAATCTGTAAAATTTGATTATGAAAAAAAATG
TGAAGCGCTAAATATAAAACCATCTAAAAATGATATAATTTTTGTTAACAAAGATTCTATAGATGCAAAT
GATGTAGAAAACTATGTTGAGCCAAAAGCATATATTATTAGATATAAAAAAGGTTATGTTTTTGAAGTTA
CTGGACCTAAGAGTTATACATTAAATGTAAGTAATACTGTAGTCGGATATAATCGTGTTGAATCAGGTAA
TCCTGTGCATTTAGTTCAACTTTTATGTAGAACCTTAGATGGTTCAAGTATTGATGATGATAGTGAATTT
GGACCTGCTACATATAATGCAGTTAAGTCACTTCAAGGAAGACTTGGATTAACAAGAGATGGAATTGTTG
GAAGAAGTACTTGGGATGCAGCTGGAAGACGTCTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2674281-2673247 putative beta-lactamase inducer [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATTATATGCTATATGTTTTTGAAAATCTTATAAAGACAACTATTGTATGTAGTCTTGGTATTT
GTCTATTATTATTTTTGAAAAGATATTTATTTAAGAAGTTTAGTAAGAGATTCAATTATTATATTTGGTT
GATAATAGTCTTTAGAATGTTACTTTTTCTATTTAATTATACAATAGTGTATGAAGTAAAAGAACCCAAA
GAAAATGCAGTAGGAAATAATATTACACAAATTGATATTTCTACAGATAATAATCTTATGTTGTATGTAG
CTTATTTATGGTTAGTTGTAACTATAGTCATTGCAGTTTATACATTTATAAAGTATACAAGATTTAAAAA
TCTAGTTGTTGATGTATCTTATGATATTGAAGATAATGATGTAAACTGTATCTACAAAAACTTGTTGAAA
GAATTAAATATAAAAAAGAAAATTGAATTAAGAGGTTCTGATGAATTGATAAGCCCAGCAGGCATGGGAT
TATTTAAATCTTACATATTCTTACCAGACTATCCTTATAGTAAAGATGAACTAACTTGGATTTTGAAACA
TGAATTAATGCATTTTAAAAATAAAGATATTTTAATAAAGTTTTTAGTGTTATCTGTTAGAATAATATAT
TGGTTTAATCCACTTGTTTATGTAATGAGCAATAAAGTAAATCTAGATTGTGAATTATGTTGTGATGAAA
GTGTTTTGACTGATTGTTCTTTAAAGGATAAGAAGGAGTATGCATTAGCACTTATAAAGTCAATTAAACT
TAGTAAGAATTATAATAGTGGTATTTTAACAACAGAGTTTAATAAGACAAGTCTGGAAAAGAGACTTGAC
AGTATTGTTAAGAAAAAAGGTAAAAATGGAATATTGGTGTTATTGATTTTGATTACATTATTTTCAGTTA
CATATTTTAATTTTGAAAGTATTAGTTTTGATAATTCAAATTCTTTAAGGAATATGGGGATTTTACAAAA
ATCAGGAGTAGATCTTAAGGAAGAAGATGATATTAGCATGAGAGTTATAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2674648-2674274 putative beta-lactamase repressor [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAGAAAAATACCACAAGCAGAACTAAAAGTAATGAAATTCATTTGGAAAGTAGATGTTACAGTGA
CATCAAAAGATGTTATTGAAGCTATGGAACAAAAATATGGCTGGAAACAAACTACTACACTGACACTTTT
ATCTAGGCTGGTAAAAAGAGGATTCTTAGATGCTCAAAAAATAGACAGATATACACATTACACAATAAGA
GTAAAACACAAAGATTATTTAAGTTTTGAGACAAAGGATTTCCTAAGTAATATACATGATGACTCTTTGA
GAAGCTTAATTTCAGCATTACATGATGATGAAAATATAGGTAAAGATAAGCTAGATTTTCTAGAAAGTTA
TTTTGATAACTTAAAGGATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2675773-2675291 putative membrane protein precursor [Clostridium difficile R20291]
ATGATGCCTAATAAACTTATAAAAAATTTACTAAGTGGTATATTACAAATTTTATTTTTTCTTTTAGGGT
TAGTAATTGTTGTGGGAGGATTTAAAAGTTTTATGTACCTCTGTTTTAGTGGAGAAGCAACTCTACAAGG
CACTATTTCTGGAATATTAATGTTTATTTTAGGTGTATCATATTTTATCATTATAAAATCATTGATAGAA
GTATTAAGTAGTTCTGAACATAGCTTATTTGTAAAAGATAATGTAAAAAGATTTAGGATTATTGGATATC
TTTTGCTTTTAAACTCTATAATGGAGTTTATTTCAACTTTTGGTACTACTGGAAAAGGAATGAGATTCCT
AGATTTAGGATTTGGATTTTATTTTACTGTTCCAGTATTTGTATATTTTATAACTTCTCTTATGAGTTTT
GTAATTGCAGATGGATTTGTAAAGGCAATAAAGATAAAAGAGGATAATGATTTAACTATTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2676769-2676065 hypothetical protein CDR20291_2282 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAATTTGTTATTGAGGATGCATTTTGGAATCTATTTCCTAGTGCAAAAATTGGAGTTATTATTT
GTAATGATATAGATAACTCTATAAAAGATGAAGACTATAAGAAAATAATTTTGAAGGGAGAAGAAGAAGC
ATTAAAATACTTGGAGGACTCAGAATTTAGCAACAACCAAGTGATTAAAGTATGGAGAGAGGCATTTAAA
AAATTTAAAACGAAAAAAGGAGCAAGGTCTTCTATTGAAGCATTATTAAAAAGAGTTCATAATGGAAATA
ATATAGGAACTATTAACCCTTTAGTGGATATCTACAATTTTATCTCATTAAAATATGCATTACCTTGTGG
AGGGGAGGATATAGATAAATTTATAGGAGATATTAGGCTAACTAGAGCAATTGGTAATGAGGAGTTTATC
CCACTAGGGACAGATGAAAATTCATTTCCATATGAAGGAGAAATAATTTATAAAGATGATGGTGGAGCAA
TTTGTAGATGTTGGAATTGGCGTGAAGCAGTGAGAACAATGCTTACTGAAGATACTAACAATGCCTTTTT
ATGCATTGAATTAGTAGATGAAAGTAGATTTAAAGAATTTGAAAATGCTTTAAATGAATTAGCTAAAATA
GTTCAAGAAAAATTGGGTGGGAATTGTAAAATTTCAATTTTAGATATTGATAATAAAGAGGTATCAGTGG
ATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2678139-2677123 putative transglycosylase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGTTATTACAATGATAATGATAATAATAAAATAAGACGTAAAAAAATTAGTAACAACAAAGATAGTA
ATAAAAAATCTAAACATTCTTATACTTCGGCAAATAAAAAAAATAAAAGTCCTAATACAAGTTCCAGTAA
AAGAATGAGTGAAAAAGTAGATTCACAGAATCTTATAAAAAGAGATAGAGATAGTTTTACAAGAGATAAT
GTAAGACCTTTAAATACAGATTACAATCAAAGAGAAAGAAGAAGAGTCGAGTATAAACAAAGAGAGAAAA
AATTAAAAAGTAAAAAAAGAAAAAAACAAAAAAGGATTAGAATAGTTAGGGCATTATTATCTATTATGTT
AGTTGCACTAATTATATTTTCAGTGGCAGGTGCAATATTTACAGTTTCAGCTATAAAAGGGTCACCAGAA
GTTACTAAAAAGTTAATTAGGTCTAAATATATAAGTAGTGAGGTTGTAAGTATAAAACAAATGCCAAATG
ATTTAAAACATGCAATAGTTTCCATAGAAGATGAGAGATTTTATAAGCATAAAGGAGTAGATGTTATTTC
TCTAGTTAGGTCAGTATTAAACAATGTGTTTACAGATACAACACAAGGTGCAAGTACTATAGATATGCAA
GTTTCAAAAAACCTGCTTACTAGTAATGATAAAACTATGAAGCGGAAAATAAGGGATATGTATAATGCTA
AGCAGATGAATAAGATTATGACTAAGGATGAAATTCTTGAGGCATATTTAAATAATATGTATCTAGGTAA
AAATGCATATGGAGCTGCAAAGGGAGCTGAAGTCTACTTTGGTAAAAAAGTTAGTGAATTAAATTTAGCT
GAGTGTGCTATGTTAGCTGGTATGACAAATAATCCTGCAAGGTATATTGACCATGGAGAGGCTAAGAAGA
GACAAGTGATTGTACTGTATAAGATGCATCAGCTTGGTTATATAACTGATAAGGAGTATAGAATAGCAAA
AGCTGATGACACTCCATTTAAATCAGAAATTGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2678773-2678267 putative DNA polymerase III, epsilon chain [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAATATGTAGTTGTGGATTTAGAAACTACAGGATTAGATCCATATAAAGGTTGTGAAATAATAG
AAATAGGAATAACAGAAATAAAAAATGAACAAATTGTAAAAAACTATTCAAGGTTGATAAAACCTAAGGG
GATAATTTCTTCATTTATAACAGAATTGACACATATAAGTAATGAAATGGTAGAAAATGAAGAACCACTA
GAATTAGTTTTACCTAGATTTAGAAAATACATAGGTGATAGAACTATAATTGCACACAATGCGAAATTTG
ATTTAAAATTTTTAAATTACTATCTTAGGATGTTAGATTTAGAACCAATAAACAATTATATATGTACAGT
AGAATTATTAAAAAAATGTAAAAGTTATAAAGGAAAAAACAAGAAACTTGAAACAGCTTGTGCTTATTAC
AACATAGAGAATATAAATGCTCATAGAGCTGACAGTGATACATTAGCAACTGCAAAACTATTTTTGAAAA
TAAAAGATGAATATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2679600-2678932 hypothetical protein CDR20291_2285 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATATAACTAGTTATTTTACAACAATACTATGTGTATTTATATGCTTATCATCTGTATTTATAT
TTACTCAACTAGCTAGAGTATTTATTAATAAGAAGAAGATTAATCAAAAAATTAAATCAAGAAACGGATT
TAGGTATGATAGAGATTTTATTGAAGCCAGAAGAGAAGAAATACATATAAAGGATAACAATAATAATAAA
AATAAGAGTAACAATAAGAAATTAAAGGAAGAAAAAGTATTTAAATACGATAATGGTGATTTATATAAAG
GTGAGTTTGTTGATGGAAAGAAAAATGGATTTGGAATATATATTTTTTCAAGTAAGGAAAAGTATGAAGG
ATTATGGAAAGATGACAAGATGCATGGAATAGGAAAATATACTTATAGAGATGGTTCAATATATACAGGT
GAATTTAAATACGGATTAAAAAATGGTTTGGGAAAATTAACATATCCCAATAATGACATTTATAAGGGAT
ATTTTTTAGATAATAAGAAAAATGGTAAGGGTGTATTATATAAAAATGATGGAAATAAACAAGCAGGAAT
ATGGGAAAATGATGAACAATGTAAAAGTTTAGATTTTAAAGATTTAAATAATAATAAAATAAATAATGTT
TATCAAAATAGATTAAATAACAATAAATTAAAAGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2680519-2680013 hypothetical protein CDR20291_2286 [Clostridium difficile R20291]
ATGGGTTTTAGAGAAGTAAAAATTGAGGAACTACAGTTTAATCCATTTACTAAGATTGGCAAAGAATGGT
TACTTATAACAGCTGGTGATTCAGAAAAGTTTAACACAATGACTGCTAGCTGGGGTGGTGTTGGAGTCTA
TTGGGGTAAAAATGTTGTTACAACTTACATAAGACCACAGAGATATACAAAAGAATTTGTAGATAGTAAT
GATACATTTACAGTTGCCTTCTTTGATGAAACGTATAGAGAGGCTTTAAATATTTGTGGTACTATTTCTG
GTAGAGATATAAATAAAATAGAAAAAGCAGGACTTACACCATATTTTGTGGATGATACGGTAGCTTTTGA
AGAAGCTAATATGATTATAGTATGTAAAAAGCTATATCATGGTAATATGCCACCAGAAAACTTTGATGCT
AAAGAAAATGATAAAAAATGGTATCCAGAGAAAGACTATCATACTATGTACATTTCAGAAATTATAAAAG
TTCTTGTAAAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2681926-2680889 putative exonuclease [Clostridium difficile R20291]
GTGTTTATATTGAAAAGAGTATATATAGATTTTGAAATGAATATGCCAAATTCTAAATCAAAAAGAGCAG
TATTTAATTCTGATATAATTGCAATCGGAGCAGTTATGTATGATGAAAAAACAAAAAATATTGATAAATT
TAAATCTTTAATAAGACCAGTAAGTAATGAGGAGTTATATCCTCATATACAAGAATTAACACATATATCT
TCTGAAGAATTGAAGAGTGCACCAAGTTATGAAGAGGTCATGAGAAAATTTAAAAAATGGCTTGGCATAT
TTTCTGATATTAAAGGAATATATACTTTTGGTAATTTGGATTTGACATGTTTCAATAACACAGATATGAG
AAGTGCTAAAAAAAATAACCATCCAAGGTTTGTAAATAATATTAGAGATTTATTTGTAGATATAAAAGAA
AAATATATAAATTGTGGTATGAGATGTATGAACTATATATCATTGAAAAATTTACTTGAATTTGTTAACT
TAGAGTTTAGTGGAGATGCCCATGACCCATTAAATGATGCATATAATTTATTTATTTTGGATGAGGCAAT
CACAAATAATGTAGATATACAAAATCTTTTAATAATACGTGACATAATAAGACCACCATTTAACGATATA
AATTCTAATTTAGATAATTGTTTTAACAAATTTAAGGAGTCATTATATAAAAAAGAAGGAAATTATAATA
TTGTAGATTTTTCTGTTGAAATAATAAAAACTGTGAGAATGTACTTATTAACAATCATAGATGTAAATAT
ACAAAATTTAGAAATTATGAAAGATATAAATAAAAAAATGGATACTATAGATAAATTGAAAGATATAGAG
GAAGGCTATTTTTATTTATTAGAAGATGTGTACCTCGACATGAAAGATGTATTAGAAGATTTAATGCTTT
ATAGAATGAATGAAGATGAGTACAAGTATGAGATAAAAAATATAATAAAAATGTTTGATGAAGACTTAGA
TAATGAAAAAATATATATAAATAAATGTAATAACTTAAATGTTGTTAACAAGATATAA
>ref|NC_013316.1|:c2682825-2681965 hypothetical protein CDR20291_2288 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTGAACTATCAGGAAAAGGCTGTGAAATTATAGTTCCTTTTGAGGAAAGACTTCCAGTAAGAGATA
TAGAAAAAAGTATAATAAAGAAATATAGAAAAAATTTATGGTCTAAGTTTATGAAGTCAATAAGAGATTA
TAAATTGGTTGAAGAAGGGGATAAGATAGCTGTAGCGATTTCTGGTGGAAAAGACAGTATTCTTATGGCT
AAAATGTTTCAAGAGTTAAAAAAACATGGACAAGTTAATTTTGATGTTGAATTTATTGCTATGGACCCTG
GATACCATGCAAATATAAGACAATTACTTATAGATAATTGTGAGTATCTAAATATACCAATACATTTATT
TGATTCAAGAATATTTGAGATAGCAGATGAAATAGCAAAAGATTATCCATGCTATATGTGTGCAAGAATG
AGGAGAGGAGCATTATATTCAAAGGCAGAAGAATTAGGGTGTAACAAACTTGCATTAGGTCATCATTATG
ATGATGTAATAGAGACAACAATGCTTAACTTATTGTGTGCTGGAAATTTTAAAACAATGCTTCCTAAACT
TAATTCTACTAATTTTGAAGGTATAAAAATTATAAGACCACTTTATTATATAAGAGAAGAACATATTATA
AGATTTATTCAAAATAGTGGTATATGGCCATTAAATTGTGCATGTATGGTTGCTGCTAAAAAAACAGGTA
ATAAAAGATATGAGATAAAAGACTTAATAAAGAGCTTAGAATCAAATTTTAAAAATGTAGAAAAATCTAT
ATTTAAGGCAGCAGAAAATGTAAATCTTGATTCAGTACTTGGTTGGCAAAAAGATGGGGAGAAACATTCT
TTCTTAGAAAATTTTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:2683104-2683313 hypothetical protein CDR20291_2289 [Clostridium difficile R20291]
TTGGAAAATAAGACTAGAGATATCAAAAAAAATTGTGGTCCATCTTTGGCTAGACCATACATTAATAATC
AAATTTTCACAGAAATGTACTGCCTTTCTGATGCATTAAAATTTGGAACTATATTTCCAGAACTAAACTT
ACTAGAGTCTGAAATGTACAACAAAGAATTATATGCTAAGCCAAAAAAATATAGAGGAGGTAGAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:2683313-2683579 putative spore-coat protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGACTCATCTAGAGCTGAACTTATGAGAAAAGTTCAGGAAACATCTTTTGCATGTGTTGATATGA
ACTTATATTTAGACAATCACCCTGATGATAAAAATGCTATCAACACTTATAATTCATTATGTAATCAATT
TGCGCAAGCTAGATATGCTTACGAAAATAAATACGGTCCTTTAACTAACTTTGGGTATGCTCCAAGTAGA
TGCCCTTGGCAATGGGCTGACCAACCTTGGCCTTGGGACAGAGAATTTAATTATTAG
>ref|NC_013316.1|:2683608-2684180 putative spore-coat protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTGGATATATCAGAAAACTATACAACACCCAGTTAATATAAAAACTTGTGACCCTAGAATGGCTAAAT
TTCTTATAACTCAATTTGGTGGGCCAAATGGAGAACTTGCTGCATCTTTAAGATATTTAAGCCAAAGATA
TACAATGCCTACTGGTAATATGCGTGCACTTTTAACAGATATTGGTACAGAAGAGCTAGCTCACGTTGAG
CTTATATGTACTATGGTTTATCAATTAACTTCTGATGCAAGCCCAGAAGAGTTAAAAGCTGCAGGTCTTG
GTTCAAACTATGCTCAAAATGGATATGGAATTTATCCAACAGATTCAAATGGTGTTCCATTTGATGTAAG
ACCTATAGCAGTTATGTCAAATCCCGTAACCGACTTACATGAGGATATGGCAGCTGAACAAAAAGCACTT
GCAACTTATTATCAACTTATAAACCTAACAGATGACGTTGATGTTATAGATGTATTAAAATTCTTAGGTC
AAAGAGAAATAATTCACTATCAAAGATTTGGTGAAGCTTTAATGGATGCTTACGAGTTAGAAGAATCTCA
AAAAATGTTCTAA
>ref|NC_013316.1|:c2685604-2684414 putative cell wall hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTTAATCAAAAGAGAATAGCAGCCAGTATAATGGCAACTGCGATAATAATGCCTACTATGGGGA
ATTTAGCATATGCTAATGAGTCTGAAGTAGAGAGTGTGAGTATAGAAAGCAGAACAATAACAGGGAATGC
GGTAAATTTTAGAAAAGGACCAGGTACAAACCATGAATCAATGGGGAAACTTTACAAAGGTGATAAAGTT
GAGTACGTAGGAAAAGAAGGTTCTTGGGTAAAAGTTAAATATAATGGAAACACAGGTTATGTGCATGGAA
ATTATGTAGCAATAAATAGCCTTGGAAGTAGCAATGAAAGTAGTGATACTTCAGTTAAGTCGACAAAAGT
TGTAACAGCAAAAGGATTAAATTTTAGAACAGGACCAAGTACAAGTAGTTCTAAAATATCAACACTAGGA
TATGGGACTGAAGTCGGATACATATCTGAGTCAAATGGATGGTCAAAAATAAGTTCTAATGGTAGAGTAG
GTTATGTTTCAAGTAAATATTTAGGAACTAGTGTAAATGACTCTACAAATGAAAATGTTGAAAACAGTTC
AAATGACCTTGTAAAGGGTACAAAGGTTGTAACAGCAAAGTCATTGAACGTTAGAACAGGACCAGGTACA
AGTCATTCTAAAATAGCTACATTAAGTTATGGTACTGAGGTTGGAAGTATTTCTGAAAGTGGAGGATGGA
CAAAAGTAAGTTATGGCAATCAAACTGGATATGTGTCAAGTCAATACCTTGCTGAAAAAGGTTCTGTTGA
TACTTCAATTCCATCTTATTCGACTAATTCTCCAAGTCAAGGAGCTGATAGTGTAATAAGTTTTGCAAAG
ACACTACTTGGAAAACCATATGTATGGGGAGCAGAAGGTCCAAATAGTTTTGACTGTTCTGGATTCACAC
AGTACGTTATGAAAAAATCTGCAGGAGTTAGTATACCAAGAGTATCTAGAGACCAAAGTAAGTATGGAAC
ATATGTAAATAGAGGAGACCTTAGAAGTGGAGATTTAGTATTCTTTGATACACAAGGTTCAAATAATGGT
TCTGTAAGTCATGTTGGAATATACATAGGAAATGGAGATATGATACATGCATCTTCAGGTTCATCAAAAA
AAGTAACAATATCTAATATAAATAGTAGCTACTATTCAAGTAGATATGTAAATGCAAGAAGAGTTTTATA
A
>ref|NC_013316.1|:c2686295-2685864 deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGTACAATTTAAAAGTAAAAAAATTAAATGATGATGCTATAATACCTAATTTTGCTCACAAAGGTGATG
CTGGTATGGATTTGTATTCTATAGAAGAGGTTGTAATACCTCCTGGAGAGACTAAACTTATCAAAACTGG
GATATGTATAGAGCTTCCTACTATGACAGAAGCGCAGGTAAGACCTAGAAGTGGGCTTGCCTTAAAGCAT
TCTGTTACTGTATTAAATACACCAGGAACTATTGACGAAGGATACAGAGGAGAGCTTAAAATTATATTAA
TAAATCATGGGAAAAATGATTTTAAGGTTGAAAAGCATATGAAAATTGCTCAAATGATAGTAAAACCTAT
CTATGATATTAACATAGAAGAAGTAAAAGAATTAAGTGACTCCGAAAGAGGAAAAGGTGGGTTTGGCTCA
ACTGGATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:2686408-2688636 putative DNA topoisomerase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACTTGTACTTGCTGAGAAACCATCTGTGGCAAAAACTATAGCATCATTTTTAGGTGCAAAGACCA
GACAAGATGGTTACTTTGAAGGAAATGATTATATAATTACTTATGCAGTTGGACACTTAGTATCATTATA
TGATATGAAGGATTATGATAAAGATAAATACTCTGGCTCTTGGAAAATGAACAATTTCCCATTTGTTCCT
GAGGATAAGTTTAAATTTAAGATTGATAGTTCTAAAACTAAACAATTCAACACTGTAAAAAAGCTTTTGA
ATAGAAAAGATGTAGAATATGTAATAAATGCCACTGACAATGACCGAGAAGGAGAACTTATAGCATTTTT
AATATTTTTACTGGCAAAAAATAAAAAACCAGTAAAAAGAATCTTGGTAAATGAATGGACACCAGAAGAT
ATTACAAGAGGTATAAAAAACCTAAAAGATGAATATGAAATGAGAAATCTTCAAGCTGCTGGATATACTA
GGCTTATTACTGACTGGTTGATTGGAATAAATTTCACTTCTGTTGCTACATTGAAATATGGAAATGGGAA
ACTATTAAACATAGGTAGGGTAATTCTTCCAACAGTTAAATTAGTCTATGATAGAGATATGGAAATACTA
AACTTTGTTCCTAAAACTTATTATGAAATAGAAGGACATTTTAAAGCTGAAGCTGGTGAATATAAAGGTA
AATATGTTAAGGGTAAAGAAAGTAAATTTGATACACTTGAAGATGCAAATAAAATTATAGCTTCAATTAC
ATCTGAAACTGGTAAAATACTAGATAAAAAAGTTACTATGTCAAAGGAATATGCACCAAAACTTTTTAGT
TTGACATCACTTCAAGGATATATAACTTCTAAGTATTCCAATTTTACATCTGATAAGGTTTTAAATGTCT
GTCAATCTCTCTATGAGGGTAATGGTAAGGGTGGATACATAACTTACCCTAGAACTGATTCCATTTTCTT
AGAAGAAAGTTTGGCTTCAAAAGCTTCTCAAACTTTAGATAAATTAAAGGTTGGTCTTGAATATGAAAAT
AAAATTAAATTTTCTAAAACTAAAAGAGTTTTTGATTCTTCTAAAGTAGACTCCCATAGTGCTATAATTC
CAACTTATATAATTCCAAAAAGTTTATCTAAGGATGAACAATTAGTTTATGATGCCATAAAAGATAGATT
TGTAGCAAACTTTATGCCTCCTGCTGAATATGAGAATACAGAAATTAAGACTGAAGTAGATAATTGTACT
TTCTTAACAAAAGGTAAAGTGCTTAAATCAAAAGGATACCTTGAGGTATATAATAAGGAAGAAAAAAACG
ATTTACTTCCACTTGTAAATAAAGATGATGTTGTAGATGTGTTAGAAATAAAACCATTAACTAAGCAAAC
TACTCCACCTAAACCATATACTGAGGACACCCTTTTAAAGGCTATGAAAAATTGTGGTAAAAATGTGCCT
GAAGAAGATACAACAGTGCTATCTGGATATTCGATTGGAACATCAGCCACACGTGCTGATGTGTTAAAGA
AGATAAGTCAAGTGGGCTATGTAAAGAAAAAAGGGAAATCTTATTCTATAACAGACCTTGGGAAAAATTT
AGTTGAAATTTTTCCTGTTAAAGACTTATTTGATGTAGATTATACTGGAAAACTTGAAAAAAGTTTAAGC
GATATTCAAAAAGGAAAGTATACAAGAAAAGAATATCTTACTAATATCATTAGTTTTATATATCAAAATG
TCAATATTATAAAACAAGATGCTTCAAAAAATATAAACACAGAAGCATATACTTTCGATTCAAAAACTAA
AAAATTTACTAAAACAAAAGAAAAAAAACAGAAAAAAGATGTAACTAATACTGAAAAAGAAGTTGCTATA
TCAAAAGATTCTAATAACAAAAAAGAAGTTAAAAATGGTGATGAAAATCAATCTCTTGGCAAATGCCCCA
TTTGTCAAGGTGATGTACTAGAATTTGACAAAGGCTTTGCTTGTAAAAATCATAAAGAATGTAAATTTGT
TATTTGGAAAAATGATAAGTATTTAAGTCTTTATAAAAAGAAAGTTAACAAAACAATGGTCAAAAATATT
TTAAAAAAAGGTGAAACTAAAGTAAAATCTTTAACTGCTAAAAACGGTAATAAATTTGATGCTACATTAA
AATATGATAAAAATCCAGATACCGGCTATTTCAATTGGAAAATAGAGTTTGACAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c2689232-2688747 MarR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAACAACAATATACTTAAAATAGCGGACTCTTTTTTAGATTTTTTATTTGTGCTTGAAAATAATA
TATTTAAAGAAAGCGATTTGTTAAAAAAGTTTCAAAATAACTCTGATATAATGAAAGCTTATTTTGAAGA
ATGTCCAATGGCTCCATCACATGCTAAGGTAATTCTTTATCTTATGACATCAAATTCATCATCAATTTCT
CAAATAGCTTCTAATTTAGGAATTTTAAAATCAAATATGACTCCGATTATTGACAGATTAGTGGAACATG
GTTTAGTCAATAAATTTCCTGACCCAAAAGATAGAAGGATTCTTAGGGTTGAATTAACAGATAAAGCATT
TAAATTATTTGATGCAGTAAAAGCTATTCTCAAAGAATCTCTAGTAAAAAAATTATCTAATCTTTCTGAA
GAGGAACTAACTTTATTAGATGAACATACATTAAAGTTATCAGAAATAGTAAAGAAATTAGGTTAG
>ref|NC_013316.1|:2689460-2690707 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
GTGCAATATATAATAGGAGGAGATATGAAAAGATATTTAATAGTTTTCTTAATGTGTAGTTCACTGTTTT
TAGTTGGATGTGGAAAAACAAAAGAATCTGAACCTGAGAAACCAATAGCAGTTTCTGTTCAAAAAGCAGT
AGGTGGAGAAATTGAAAACACAAATTCTTTCTCAGGAACTACAAAAGTTAAAGATGAAACAGCTGTTACT
GCACAGACTGTTGGCACAGTTCAAGAAGTGTATGTAAAACTTGGGCAAAATGTAAGAAAAGGAGATGAAT
TATTGAGTATAAGCAGTCCAGAGCTAGAAAATAGTGTAAAGCAAAGTAAAGCCTCACTAGATTTAGCAAA
AGCAAGTTATTCAAGTGCCACTGGTGGTTCATTAGAGGCACAAGTAAATCAGGCAAAAACAGCTCTTGAC
AATGCAAAGATTCAATATGAGGAGTCTCAAAGAAATTATGACAATAATAAGATTCTTTATGAACAGGAAG
TCATTAGTTTAGACCAATTTAAAAAAATAGAGTTTTCTTTAGAGCAAACAAAACAACAGTTAGATTCTGC
TCAAAGAGCATACGATACAGCAACTTCAAAAAGTATACCTCAAGCTAAAGCACTTGCTAAAAAACAGCTT
GACCAAGCTCAAGTATCATATAATTTAGCAATGAGTAATTTAGACAAATTAACATTAACATCTCCAGTAG
ATGGTACAATAACAGCTAAAAACTTTGATTCAAAGGAAATGATAACACAATCACAACCAGCTTTTATTAT
TTCTAATCCTAATATACTAGAAGTTGATTTAAATGTAGCAGAATCAGATATAGGTAAATTTAAGAAAGAT
GGAAATGTAGATGTTATAATTGAAGACCAAAGGATTTTAGGAAAAATAGATTATGTACCTTCAGTAGTTG
ACCCTCAGACATCTTTATATCCTGTTAAAGTACTTGTAAATAATGCAAACAACAAATTTAAGGCAGGTAT
GTCTGCACAAGTAAACTTAAGTATTGAAAAAGAAAATGGTGCTGTTACAGTGCCTAAAAAAGCAATATTT
GAAGAAAATGGTAAAAAATATGTATACATAGCAACAAAAGACAATATAGCAAAGAAACACTTGGTTCAAA
CTGGAATTGTAACAGAGGATAAAATAGAAATTAAAAGTGGTGTAAGTGATAAAGATACAGTGATTATTGG
AGGAATAAGTCTTATTTCTGACGGAACTAAGATATTTCCTGTAGAAAAGGAGAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:2690711-2693845 putative multidrug efflux pump, membrane protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTAACACAGACTTCCGTTAAACGTCCTCTCACAATCATAATGGTCTTTTTAGTATTAATAGTTT
TTGGTGGTATTGGATATAAAAAAATGTCAATAAATCTAATGCCTGATATAGAAATACCAGTTGTAATGGT
CATGACTACTTGGACAGGTGCTGGTCCTCAAGACGTTGATGAACAAGTTAGTCAAAAAGTTGATGAAAGT
TTATCTGCCGTTTCAAATGTAAAATCTACTATATCAAGTTCACAAGAAAGTGTTTCTATGGTAGTTGCTC
AGTTTGAATTTGGAACTAATTTGGATGAAATAATGAATGATGTTAGGTCTAAAGTTGATGCATTACAGAC
CAGCCTCCCAGATGATGCAGCAAAACCAACAGTTTTAAAGCTGGATATGAATGCACAGGCTATAGGTCAA
CTTGTCATATCTGGAGGAAATGAAAATAGTTCACAAGCCTTAAGAAAATACGCTGAAGATGTAATTCAGC
CTAAAATAGAATCCATAGATGGTGTTACTTCAGCAGACCTTAAAGGTGGAGAAAAAGCACAGGTTAATGT
AATAGCTGACCCAGCTGTTCTTTCAAATTATGGAGTTAGTTTATCCACTATAAAAGGTGTCTTATCCTCT
AGTAATAAAACATTCCCTTATGGTTCAATTACTCAAGGTGAGGATAAAATAGTTTTAAGAGCAATTGATA
AATTAGAATCCCTAGATGATATAAAACAGATTCAAATTCCTGTAAAAGGAGGAAATACAGTTAGATTAGA
TAATCTTTGTAGTGTAGATTATGGATATGCAGACAAAGATAGTATTTATAGATACAATGGAAAAGACAGT
TTGGTAATAGATATTTCTAAACAACAAGATGCCAACACTGTAAAAGTTATGCAGAGTGCATACAAATACG
TAGATGAATTGAATAAGGAAAATCCTCAATTTAAAATTAAAATTGCTAATGATACAAGTTCATACATAAG
TGAATCAATAAACAGTGTAATGAGCAACTTGCTTATAAGTGCTGTTATCGCATTTATTGTAATATTTGCT
TTCCTAAAAAGTGTAAGAGCTTCACTAGTTGTTGCAGTTGCAATACCAATTTCTATAATAGGTGCTATAG
CAATTCTCTACTTTACTGGTGAAAGTTTAAATCTTATTACTGCAAGTTCATTGGTAATTTCAGTTGGTAT
GGTTGTTGATAATGCTACAGTTGTAATTGAAAATATATTTAAATATAGGAAAAGTGGCAGATTGAGTCTT
GATGATTGTGCTATTGAGGGAACAAGAACTGTAACAAATGCAATACTTGCATCAACATTGACCACGATAG
CAATATTCTTACCTATCATGTTTACAGAAGGTATAGCTAAAATAACTTTTGGGGCATTAGGTAAAACACT
AATAGCTTCACTAGCATTCTCCTTTATAGGTGCAATTACACTCGTTCCTAGTGTATTTGCAAAATTAAGC
AGAGGAAAAAATAGTCAAAAGATGCAAGAAAAAGATAGTCCTATATTTGATAAGGTAAGTGAAGCATATA
AAAAATTATTAAGTGTATGTTTAAGACATCAACGCTTAGTTGTAATATCAAGTTTACTTATTTTTGTAGC
TTCCTTATTTGGAATGGGATTTATAGGTATGGACTTTATGCCTGCAGCAGACAAGGGTGAATTATCTATT
TCTATAGAACTTCCAAAAGGTCTTAGCCTAGAATCCAATGATTACTATGTATCTATGACTGAGAAAAAAG
TCTCAGATATTCCAGAAATTAAAACTTTAATAACAACTTTGACATCAGATTCAAATAATAGTAAAGCAAG
TATAGCAATTGAATTAGAATCTCAAAAAAATAGAAAAAGAACTACTGATGAAATAGAAAAAGAGATAATT
GATAGAGTGGCTACTGTACCAGATTGTAAAATAAATGTAAGTCAAAACAGTAGTGTTATGGGTGGAGCTG
GAGGAGCAGACTTCACATTAGAAATGAAAGGTCCTGATTTAGATGTATTAAAAATACTGGGAAAAGAAGC
TGAAAAAGAATTTAGCTCTATAAAAGGATTTAGAAATGTTGAAACTTCTCTTACAGATACAACACAAGAA
GCTCAATTTACTATAGATAAACATAAGGCTCAAGAATATGGTGTAAATACTGCTGAAATTGCAGGCATGT
TACGTACAGCAATAAATGGTGACTCCGTAACCACTGCTACTATTGATGATTACAAAGTGGATGTAAACCT
AAAATTTAAAGCAGATACTATTGATAGCTTAGAAGATATAAAGCAACTAAAAGTAAACTCTGCAACTGGA
AAAGAAGTTCCTCTTGGTGCTTTTTCAGATATAAAAATGGCAGATGGTCTACAATCTATATCTAGGACTG
ATGGAGATTTTTCTGTAAATATAACTGCTACACTTGACAATTTAGATGCTGGTACTGCTACAAAACTAGC
ACTAGAAAAAACGAATAAAATGGTAATTCCTAAAGATTACTCTATAGGTGTTGGTGGTGAAACAGAAATG
ATGAATGAATCTATGGCAAGTCTTGGATTTTCAATGGTCATAGCTATAGCATTAGTTTATATGGTAATGG
TAGCTCAGTTTGAATCATTTAGTAAACCATTTATAATCATGTTCTGTGTTCCATTTGCATTCGTTGGAGT
TGTGCTTTCGCTTCTAGTTAGTGGTCAAAGTTTAAGTACTGTCGGTATGCTAGGTATAATCTTACTTATC
GGTATTGTTGTTAATAATGGTATAGTTCTTATTGACTACATAGAGCAACTTAGAAAAACAAATCGTAACA
ATGATTTAATTGGTTTGGTTTCAATTGGTTGTGCAGCAAGATTAAGACCAGTCTTAATGACTACAGCAAC
AACAATTTTAGGTATGTTGCCAACAGCACTATCTCTTGGTGAAGGTGGAGAAACTATGCAACCACTAGCC
ATAGTTATAATGGGTGGTCTAACTGTATCTACACTTATAACTTTGGTGCTTATACCTACTATATACTTAA
TATTTGATAAATGGGAAAATAAGTTTTCAGACAAAATGCCTAAAATATTTGGTAAGATAACAGATAAAAT
AGGAAGTATAAAACGTAAAATAATAAAGAAACCAAAATTGAAAGCTAAAGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:2693879-2695177 putative multidrug efflux pump, outer membrane protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCAAAATAGTTGCAATTGGCTGTGGTGTTGGTATAATAACTGCCAATTTAATCCCAGTTTACGCAG
ATAATAATACTTCTTCTATAAACAACGTTGATAATTCTATTTTAAGTGACTCAAATAAAAGAACATCTGA
AAAGGAAATTTTGACTGCTAGAGAAGCTGTTAGTGCTGCACTTAAAAATAGTGAAAAATTAAAAATGAAA
TCAGAAGAAATAAAAATGTTAAAAGAAAAGTTAGAAGTACAAGATGAGTTTGATAGTTTTACTGGAAGTG
ACAACTCGTTTCCATACGACCAAATTGGACTTCTTAAAAATCAAAGTGAACAGGCTAAAGGCTTTATGGA
GGACCAAATAGCAAATGATATTACTAATAAATTTAACGATTTAGTTTCAAGAGAAAATGAGCTAGATAAG
ATAAAAAACAATCTTGAAATAAAAACTAAAGAAATTAAAGATATGAAATTAAAAAAAGATTTAGGGTTAG
TAACATCTTTAGAAACTGAATCAGCTGAACTTGAACTTCAAACACTACAAAATACTCAAAAAGCTAAACT
TCAAGAACTAAAAAACAATCAAGACTATTTTAAGTTATTGACTAATATAGATTTAAATAATTATCAATTG
GATAAAGAATATAGATTTGAATCTTTTAGAGTAGGTGGCTCAGTTGATTCATATATGGAAGGTAAGGTTA
ATGAATATTTAAAATACGACCAATTGATTTTAGAACGTACAGAAGAAAGCTTTAATGATAAAGATGAGAA
CAAAGCAGATTTACCAGATAGACCTAATCTTACAAGACCAGTTGCTCCTACAAAACCAGAGCAAGGTAAC
CTAACTGATGATGAATACAAGGTTCTTATGGATAAGTATGAAAAAGACTACAAGAGATATGAAAAAGAAG
TTGAAGCATACAATCTTGAAAGACAGACTTATGCTGCTGGCCTTACTACTTATGCAAATTATCTTCAACA
AAAATTTAATACCGAAAATGGTCTAGTAACATTAGAAGACAGTAAAAAAGCTCTTAAAAAAGGGTTAATT
GATAGCTATGCTCAATTACTTGCTTTAGAAGATACAATTCAGATTACTAAAAAACAACTTGATTTATCAG
AAAAACAATTAAAAAATACTAAATTAAGATATGATTTAGGATTAATTACTCTAACTGATTATAAAAAACA
AGTGGTAAGTAATCAAGATGCTAAAAATAGCTATGACACTCTTATTGTGAATTATAACTCACTAAAAAAT
GGTATAGAAAAACCTTGGATACTTAATACTGGAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2696214-2695387 transposase [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTAGGAAGTATAGTATTTCTAGTATGTGTAAGTTGATAGGTGTGTCAAGAAGCGGTTACTATAAAT
GGCTAAGTTATTCTAAAAAATCTTCCGATAGGGGTATCAAAGATAGAATTATTAAGGATTATATAATTGA
AATACATAAAAAATATAGAGGAACTTACGGTAGAAAAAGAATTTGTACTTATTTAAATAAAATACTTGAT
AGCCCTATTAATCATAAGAAAGTATATAGGTTGATGAAAGAACTAGGAATTAAATCTATTATTAGAAAGA
AAGTATATAGACGTAAGTTTAAATCATATGAGGTATATGATAATATATTAAATCGTGAATTTAGAGCTAA
TCAACCATTAGAAAAAATTTGTATGGATATAACATACATACCTATTGGTAAAAAATTCTTATACATGAAT
GTAGCCAAAGATTTATTTAATGGTGAAATAGTGGCATATGAGATAAGTACAAAAATGGATACTAAATTAG
TTAATAAAACAGTAAATCAACTAATAAATATGAATTTAGCTAAAGATTGTATTTTACATACAGATCAAGG
TTCACAATATACAAGTAGATCTTACTCTAAAAGGCTTAAAGATAATGGTATTATACAATCTATGTCCCGA
AGGGGCAACTGCTGGGATAATGCTCCTATAGAAAGTTTTTTCAGTCATTTTAAATCTGAATTAATATATT
TAATTGATACTACAGATCCAAAGGAAATGATTAGTCTAATAAATGATTATATTTATTTTTATAATAATGA
AAGAATACAATTAAAAAACGGAATGAGTTCGATTGAATATCGAACTCATTCCGCATAA
>ref|NC_013316.1|:c2697039-2696770 hypothetical protein CDR20291_2300 [Clostridium difficile R20291]
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GTAGTATATGCCCACGATGTGGATTTAAAGTAGCAGATGAGAGTCTAAAAATAAGATGTCCAGAACCTAG
TTGTAGGGCTTTGGTATCTAGGAAACTGGATTATTGTCCTAAATGTGGATGCAAACTTAGAGGATATAAT
ATTTCTGAATTTGTTAACATGGTAAGATGTAAAATAGATGAGACATTTGATAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2699871-2697229 pyruvate, phosphate dikinase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGGGATTTAACAATGGAAACTAAGTATGTTTATAGTTTTGGTGAAGGAAGCAAAGACATGAAATCTT
TACTAGGAGGTAAAGGTGCCAATTTAGCAGAAATGACTAAGATAGGCTTACCTGTCCCTCCTGGATTCAC
TATAACAACAGAAGCATGTAATGATTATTATGTTAACAATGAAAGTATAAGAGCAGAGATAATAAAAGAA
ATAGAAGAGCATTTAGCTACTTTAGAAAAAGACTTAAATAAAACATTAGGATGCAATAAGAATCCATTAT
TAGTATCAGTTCGTTCTGGTGCAGTATTCTCTATGCCAGGAATGATGGATACAATTCTTAACCTAGGTCT
TAATGACAATAGTGTTGTTGGCTTAGCAGAGGCTACACAAAATGAAAGATTTGCATATGATAGTTACAGA
AGATTCATACAAATGTTTTCTGATGTTGCTATGGAAGTTCCAAAATATAAATTTGAAAATGTATTAGACA
GAGTAAAAGAAGCAAAGGGATACACAGTTGATACAGAACTTACAACTGATGATTTAAAAGAAATAGTAAA
AGAATTTAAAGCAATTTATAAAAAAGAAATAAAAAATGATTTCCCACAAGACCCAAAAGAGCAATTAATG
CTTGCAATAGAGGCTGTATTTAGATCATGGAATAATCCTCGTGCAATCGTATACCGTAAATTGAATGATA
TAGCTCATAACTTAGGAACAGCAGTAAATATTCAATCAATGGTATTTGGTAATATGGGAGAAACTAGTGG
TACAGGTGTTGCATTTACTAGAAATCCAGCTACAGGAGAAAATAAATTATTTGGTGAATTTTTAATGAAT
GCACAAGGTGAAGACGTTGTTGCAGGTATAAGAACTCCTCAAAATATATCAACTCTTGCAGATGTAATGC
CAGCTGTATTCGATGAATTTGTAAAAATTACTCATATACTTGAAGGTCATTATAAAGATATGCAAGATAT
AGAGTTTACTATAGAAAATGAAAGATTATATATACTACAAACTAGAAATGGTAAGAGAACAGCAGCAGCA
GCAATAAATGTAGCGGTTGATTTAGTTGAAGCTGGAATAATTGATGAAAAAGAAGCTATCATGAGAATTG
AGCCTAATCAATTAGACCAATTATTACATCCAAAATTTGAAGATAAGGCATTAAAAGAAGCCAAGGTTAT
AGCAAAAGGTTTACCAGCATCACCAGGTGCAGCAAGTGGTAAAGTTTATTTCAATGCTGATGATGTAGTA
AAAGCAAATGAAAAAGGAGAAAAAGTAGTTTTAGTTAGATTAGAGACATCTCCAGAAGATATAGAAGGAA
TGGTTAAAGCAGAAGGAATCCTTACAGCTAGAGGTGGAATGACATCACATGCAGCAGTTGTTGCTAGAGG
TATGGGTAAATGTTGTGTTGCTGGATGTGGAGAAATAAAAGTTGATGAGTTTAATAAAGAAATAAGAGCA
CTTGATGATGTAGTTATAAAAGAAGGTGAATACATTTCTATAGATGGTTCTACAGGAAATGTGTACCTAG
GAGATGTTAAGAAAACAGAAGTATCTTTAACTGGAAACTTTGAAAAATTAATGAACTGGGTAGACAAACA
CAAATGTATGATGGTTAGAACTAATGCAGATAATCCTAGAGATGCTCGTGCAGCTATAGAGTTTGGTGCA
GAAGGTATAGGTCTATGTAGAACTGAGCATATGTTCTTTGATGAAGCTAGATTGCCAGCAGTTAGAGAAA
TGATATTATCTAATACAGTAGAACAAAGAGAAAAAGCTCTTGAAAAAATATTACCAATGCAAAGAGAAGA
TTTTGTAGAGTTATTTAAAGTTATGGATGGAAAACCAGTTAATATAAGATTACTAGACCCACCACTACAT
GAATTTTTGCCTCATGATGATGAGACTATAGAAGAACTTTCAAAATCTATGGGAATAAAAGTAAGTGATA
TTAAGAAGAGAATAGTTGATTTAGATGAGTTTAACCCAATGCTTGGACACAGAGGTTGTAGACTTGCAAT
AACTTATCCTGAAATATGTGTAATGCAATCTAAAGCTATAATACAAGGTGCTATAGAAGCAATCAAAGCA
GGTGTTAAAGTTTCTCCAGAGATAATGGTTCCATTAGTTGGAGAAGTAAATGAGTTAAAAATAATAAGAA
AAATGATAGTAGAAACTGTTGACGCTATAATAAAAGAAGAAGGTATAGAAGTTCCTTATACTGTAGGTAC
TATGATAGAAATACCTAGAGCTTGTTTAACTGCTGATGAAATAGCACAAGAAGCAGACTTCTTCAGTTTT
GGTACTAATGACTTAACTCAAATGGCATTTGGATATTCAAGAGATGATGCTGGTAAATTCTTAGGTCAAT
ATGTAGATGAAGAAATATTAGAAAAAGACCCATTCCAAGTACTAGACCAAAATGGTGTTGGTAAGTTAGT
TAAGATGGGAGCTAAATTAGGTAGAGAAGTTAAACCAGAATTAAAACTAGGAATATGTGGAGAGCATGGA
GGAGAACCATCTTCAGTAGAGTTCTGTTATAGTGTAGGACTTAACTATGTATCTTGTTCACCATTTAGAG
TGCCAATTGCTAGACTTGCAGCAGCTCAAGCATCTATAAAAAATCCTAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2700759-2699917 hypothetical protein CDR20291_2302 [Clostridium difficile R20291]
ATGCTGGTGAAAAACCTAATTATATATGCAGTATCAGATTCAGTAGGGGAGACTGCACAACAAGTTGCAA
AGGCATGTATGTCTCAGTTTTATGTGAATGAAACTTATGAAATAAAAAGATTTCCATACATGATTAATAA
AGGAGTACTACTTGAAACTTTGGAGAATGCAAAAGCTGAAAACGCTTTAATTGTATATACATTAGTTGAT
GAAGAATTATGCAGTATTGTTGAAAGATATTGCGAAAGAGAAGGTCTTAGTTGTATAGATTTAATGACAG
ATATACTAAGAGAAATAAGCAAGAGAACAGGAAGAAAACCTAAAAGAGAAGCTGGTATAATTAGAAAATT
AGATGAATCTTACTTTAAGAGAGTTGAAGCTATAGAATTTGCAGTGAAATATGATGATGGAAAAGACCCT
AGAGGTGTTCTTCAAGCAGACATAATTTTAGTGGGAATATCAAGAACATCTAAAACTCCTTTGAGTATGT
ATTTAGCTAATAAAAATATAAAAGTAGCTAATGTTCCATTAGTTCCAGAAATACCAATTCCTAAAGAAGT
GTTTGAGATAGATACTAAAAAGATAATAGGTCTTACTAATTCACCTGAAAAGCTGAATGAGATAAGAACC
CAAAGATTAAAAGCTTTAGGATTGTCCAGTAAAGCAAACTACGCTAATTTAGAAAGAATACTTCAGGAGT
TAGATTATTCAGAAGAGATAATGAAAAGAATTGGATGCCCAGTAATAAACGTTTCAAATAAGGCAATAGA
AGAAACAGCAGGTATAATTTTAGACATAATGAAAGAAAATGGTCTAAAGATATACAAAGAAATAGAAATT
TAA
>ref|NC_013316.1|:c2701404-2700766 hypothetical protein CDR20291_2303 [Clostridium difficile R20291]
GTGATTATTATTCAGCTTAATGAAAGACAACTAAAAATTATAGATATAGTTAAGGAAAATGAACCAATAA
CGAGTGAAAGTATTGCCTCCAGCTTGAATGTGACTCGTGCTACACTTAGATCTGATTTAGCTATATTAAC
AATGACAGGAATATTAGACGCAAGACCAAAAGTTGGATATTTTTATTCAGGAGTTAGTGAAATAAATTTA
ATTGGTAAAAGTGTAAAAGAAAAAACAGTAGAGGATATAATGAGCATGCCTGTACTAGCTAAGAAGGATG
AAAGTATATATGATGTAATAGTCACTATGTTTTTATCTGATGTAGGGAGTATAGTTATTATAGATGAGAA
TGAAGAGTTATGTGGAGTTGTTTCCAGAAAAGACTTGCTAAAAGCAACTATAGGAGGTTCTGATATAAAT
AAAATGCCAATAGGTATGATAATGACAAGAACTCCAAATGTAGTCACTTTAACTAAAGGAGCAAGTGTTT
TATTAGCTTCAAGAAAAATAATAGAACATGAAGTAGATTCGATTCCGATTGTTGAATATAAGGGAGAAGA
CAAAAATCATATGAGAGTTGTTGGGAGAATATCAAAAACCAACATAACTAAGCTATTCTTAGAAATAGTT
GACAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2703132-2701840 hypothetical protein CDR20291_2304 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAGATTTAAACAGAAAACTTGCAAAATTGGAAGAGGAAGGTAAAAAAATAAAAGTAGCTCTTATAG
GAGCTGGGCATATGGGAAATGGAATGGTAAGCCAAATGGCAAATATGAAAGGTATTGAAGCTTCTATTGT
TGTAGATATAAATTTGGAGTTGGCTCATAAAGCTTTTACTGATGCAGGAATAGATGAAGAAATTATAGAT
AATGTAACAAATGAAAAGGATGCAGAAATAAAATTACAAGAAGGAAAAGTATTGACATGTAATGACTTTC
TTGTGGCTTGTAAAACTAAGTCAATAGATGTAGTTATAGATGCAACTGGGGGTATTGCAATTGGTGCAGA
GATAGCATTAAACTCTATTTTAAATAAAAAACATATAGTTATGTTAAATGCTGAAACTGATTGTGTTGTT
GGACCAATACTTAAAAAATTAGCAGATGATGCTGGAGTGATATTTACAGGTTCTGCAGGAGATGAGCCAG
GTGCAGTAATGGAATTATTTGATTTTGCAGATGCAATGGGGTTTGAAGTTAGAGTGATAGGTAAAGGTAA
AAATAATAAATTAGATTTAGATTGTAATCCTGATACAGTTAGAGAAGAAGCAGAAAGAAAAGGAGCTTCA
CCTCATATGATAGCTTCTTTTAAAGAAGGAACTAAAACAATGGTAGAAATGGCTTTAATGTGTAATGCAA
CTGGATTTGTGCCTGATGTAAGAGGTGGTCATGGTATTGAAGCTACAGTTAATGAAGTACCTAAGAAATA
TGCATTAAAAAGCGAAGGTGGAGTATTAGATAATTATGGTGTAGTTGATTTTGTAAATGGTATAGCACCT
GGAGTTTTCGTAGTAGTAGCCCATAAATTAAAAGCAGTTAATGATGAACTAAAATATTTAAGTATGGGTG
ATGGACCTAATTACATATTATATAGACCATATCATTTATGTAGTTTAGAGACTCCTTTATCAGCAGCTAT
GGCAGTCTTAGACCATAAGGCTACAATAGTACCTAAAGCTGGACTAGTAGCAGAAGTTATGACTATAGCT
AAGAAAGATTTGAAAAAAGGTGAGTTTATGGATGGTTATGGAGCATATACATGCTATGGTACTATAGAAA
AATACGATGTAGCAAAGGCTATGAATGCTGTACCTATTGGTTTGATAAGTAAAAAGACTAAAGTTGTAAA
AGATATTAAAAAAGGTGAAGTTATAACTTACGATATGGTAGAGATAGAAAAAGATACTACTTTATATCAT
TTAAGACAATTGCAAGAAAAAATATTTGGGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2703525-2703169 PTS system, IIa component [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATATGAAGTTAAGATAAGTGGGATAGGCAGTTTAGTTAAAGAGTTAATGGATGAAAGCAATTGTC
TTATTATATATGATGAAACCATTAATGATGACGACTTAAAGGATATATCTGTAATTCATTCGATAGCAAC
ATTAAAAAGTGATGTTGAAATAGGAGATACACTTACTATAGGGAATAGAGATTATTGTATAGTTTCAGTT
GGTGATATTGCTCAGAAGACTCTTAGAGAAATTGGGCATTGTACAATCAAATTTGATGGAAAATGTGAAG
TAAATTTACCAGGAGAAATACATGTGGAAATAGGAAATCCAGATATAACTATTGGAGATTTAATAACTAT
TTCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2703919-2703560 hypothetical protein CDR20291_2306 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTATTAGTAATTTTATTTGTTGCTTATATTTTAAATACTATATTTATAATGAAGCAGAATAAAT
TGTATTTTAAAACTTTAAATAGAGCTAAAAAAAAGGGTGATATAGTGTCTACAGGCAAAAAGAAAAGCTA
TTTTTCTAAAGGAAGTATAGCCATTATATCTTCAGATTCAGATGGGTTTATAAAGTTTGGAGAAATTTTA
AAAGGGCGTACAGTAATGGCTAAATTTAAAGAGATTGAAGAAATAGAAGGATTAGATATATATAGTGCAG
AGCAAAAATTTAAAGATGAAGAGAGTATTGTACAAGCTATAAAATTTATAAAAGAAAAAATAAATGTTTC
TTTTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2706027-2703988 putative transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
GTGAAATTTTATGTATTAATTTGGTTTCAAATTTGTACTAGAATGAAATCAAGGAGGAGATACAAAATGA
GTGTAACTGAGAAAATTCCTTCTATTGACCGCAAGATATTTAAGATATTGATTATGTGTAGTAAAAAAGA
GTTTGTGAGTATTAATTCAATAGCAAATGAATTGAATGTCACAACTAGAAGTGTAAGGACGTATATAAAA
CAATTGAATAAAGATTTAGGTAATGATATAGCAGTAATCAAATATATAAAGGGTCAAGGCTATAAACTAG
AAATAAAAGATGAGCAGATACTCAATAAGATTATTGATATGAATAGAAAAAATGTATTTTCATTAAATTC
AAAAGAAGATAGAGTAGAGTTTATACTAAATTACTTGATAGAACTAGATGGATTTATTACACTTGATAGT
TTAGCTGATGAGATGTGTGTAGGAAGAACTACTTTAGTAAATGATTTCCAGTATGTAGAAAAAGTTTTGG
CTTCATATAATTTAAACTTGATTAAAAAACAGAATACAGGTATGAAATTAAATGGAAATGAACTTGATAT
TAGACTGTTTATATTAAATCAGTTGTATAAAAACTCAAGGAAAGATTTCAGTAATTCAAAGTATTTTAAA
GGAATCAAAAAAGAAGAAATCATAAATTTAGAAGAAAAACTATTGACTTTATTTAAAGAAAATAATTTTT
ATGTTACAGATGAAATGTTAAGAGAAGTTATTAACTACATAGTAGTTTTAGTCTATAGAGTAAAAGAAGA
AAAGAAAGTAAAAGACTATGATGTAAAGTTTGATTTACTTAAATCATATGATGAATACTTTATTGCTAGG
GAAATAAAACATATAATATCAGGAATGTTTGAATGTACTTTAAATGATGAAGAAATTATTTATTTAACTA
TACCATTAGTTAGTGGAAATGCACCAGCATCAGAATGTGCTTTAAATAGTAGTAGAATTAGTAAAAACAT
TGATGAGTTGATGGAAAATATATTTAATCAAATATATGTCGATATGGGTATTTTTATAAATGAGGATGAA
TTAAGAGTAGGTCTAGGATATCATCTTAGTTTTACTTTAAACAGGCTATTATTTAATATAAAGTTAAAAA
ATGTTTTGTTAGAAGAGATTAAGCAAAATTATATACTTCCATTTAAATTAGCACAAATAGCAGGAAAAGT
AATAGAGAAAAAGTATAACTTAGAAGTTTCAGAAGATGAGATTGGATATATAGCAATCCATTTCAGTGGA
TATTTAGAAAGAAATAGCAGTAGATTCTATTCAATAAAAAAAATAGCAATTATATGTAGTACAGGTCTAG
GAACAGCAAAACTATTGAAAATAAGAGTAGAAAAACTGATAGGAAATAATCCTAAAATTGATACTCTTTC
AAGTTTTAATTTGAGAAATATTAACTTAGATGAATACGATATAGTTTTTACAACTATTGATTTAGACACA
TCGAATATAAATACAATAGTATTAAAAATAAATACAATATTTGATGAAAACAAATTAAGAGAACAATTAA
AAACAGTATTGTGCCTAAGAGAAGGGAATATTGACACTACTAATTCTACAAATTTACTAATAAATAATTT
GTTAGATGAAGATAAATTTATGATATTAAATGAAAAGACTATACTTGCTTCATTAGAAAAAATGATGGAC
CATCTTATGGATTTGGGATGTATTGATGATAAGTTTAGAAAAAATATAGTCAATAGAGAAGAAAAATCTC
CCACAGTATTTGATAAAGGTTTATTATTTCCTCACTCTGTAAATGAAAAATCAGATAAGTTTTTAATGGC
AGTTGGAATTTTAGAAGAACCAATAGAATATGCAAATAGAAGTATAAAAATAATTCTTATGACAATGTTT
CCATGTGAGAATAAGATAGACTCAGACTTATTAGTAAAAATTTATGAAGAAGTTTTAAAGATAGGCCAAG
ATGTAAAATTAACGAATAAGATAAGTAAATGTAGAACTTTTTTAGAATTTAAAAAGGTGTTACTTAAAAA
CCTTATATAA
>ref|NC_013316.1|:c2707196-2706183 PTS system, glucitol/sorbitol-specific IIbc component [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGAGAATAAAATATTAAAAATAGAAAAGGGAACTTCAGGCTGGGGAGGTCCTTTGTATATAAAAA
AAGAAGGGAATAGAAATAAGATACTATCAATGACTGCTGGTGGTATCCATGAAGTAACATTAAAAATAAA
AGAACTACTGGGTTGTGAAATTGTAGATGGATTTAAAACTGGAGTTTCTGATGAAGAAGTAGCAGTAGTT
ATTATTGATTGTGGTGGAACTGCTAGATGTGGAGTTTATCCAAAGAAAAAAATACCTACAATAAATGTAA
ATCCAGTTGGAAAAACAGGTCCTTTAGCAAAATTTATAACAGAAGAATATTATGTATCAGATGTTAATCC
TAACTGTATAAGTGTTGTAGATGGGGAAGATATGCCACAAAAATCTCAAGAAAATAAAAGCGAAAATAAG
AGTTCTATTAGAAAGCCTGATAATTATGATGAGGTTAAGTCAAAAGCACAAGGTGAATATGCTAAAAAGA
ACATAATACTTTCTATTGGTCAAGGGGCAGGGCAAGTAGTATCAAAATTTTATGATGCAGGTCGAGACAC
TATCCAAATGGTAATGAATAACGTAATACCATTTATGGCATTTGTAAGTATGCTTATGGGAATTATTTTA
GCATCTGGACTGGGAGACTGGATTGCAAGAGTTATATCTCCACTTGCAGGTAATATTGGTGGATTATTGA
TTATATCAGTAATTTGCACACTTCCATTCTTATCACCAATACTAGGACCTGGTGCAGTTATAGCTCAAGT
AGTAGGGACTCTTGTAGGTACACAAATTGGTCTTGGTGCAATACCAGCATATTTAGCACTTCCAGCTTTA
TTTGCAATAAATGGGCAAGCTGGATGTGATTTTGTACCAGTAGGATTAAGTTTGGGAGAAGCAGAACCAG
AAACTGTAGAGTATGGTGTTCCAGCTTTATTTTACTCTCGTTTAATAACTGGTCCAATAGCTGTTATTAT
TGCATATGGAGTTGCAGTATTTGCATTGAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2707754-2707209 PTS system, glucitol/sorbitol-specific IIc2 component [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAACGTTATTACAGGTCTAAGTAAAGGTGCAGAGTGGTTTATCGGTTTGTTTCAGAAAGGGGGAG
AACAATTTATAGGTCTTGTTTCAGGTACTCTTCCAACGCTAATTGTATTAATGGTAGCTATTAACTCTTT
GATTAAGATAATTGGTGAGGAAAGAGTTAATAATTGGGCTTCTAAGCTAGGAAAGAACTCTTTTACAAGA
TATATTCTACTTCCATTAGTATCAGTATTTTTCTTGGGAAATCCTATGTGCTATACATTTGGTAGATTTT
TAAAAGAAGAGCACAAAGCAGGATTTTATGATGCAGCAGTTTCATTTGTACATCCAATTACAGGTCTTTT
TCCACATGCAAATGCAGGAGAACTTTTTGTATGGTTGGGAATATCAGCAGGTTTGACTACTTTAGGTAAA
GAAACTACTACACTGGCATTGTGGTATTTTATAGTTGGTCTAATTGTAATTTTTATAAGAGGTATAGTAA
CAGAAAAAATGTATGCTTTTCTAACAAGAAAAAATAGAGCAACAAATAAGGCTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2708966-2708130 AraC-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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ATTATCATTTAACACGCTTATTTAAGTCTATGTTTGGTGAGAGTGTAGGAAGTTATATAAAAAAAAGACG
ATTAGTAAGTAGTACAAAAGAACTTTTATATAGTGATAAAAAAGTGATAGATATAGCTATTGGTAGTGGA
TTTGAATCTTCGGAAGCATTTAGCAGAGCATTTAAATCTATATACAAGGTTAGCCCTATAGAATATAGAA
AAAATAGAATTGATGTATTTGTTGGTAAAAAGAAAAAATTAGAGTTAGATTTTATGAGACATCTTGTTGG
AAATATAACGATTAAACCAGTTATAAAAGAAATAGAAAAAATAAAGGTAATAGGTATAAAGGATAAAGTA
ATTTTAGAAAATAATTCATTACCTGACTTGTGGGAGAAATTCAGAAAAGTACATCATATTGTCCCAAATA
CTTTGCCATCAAAGAGAGTTTTTGGAATCTGTGAAGCAATCTCTGAAATACACCTAGTTAGTGAAAGTAT
GGAATTTAATGAGATAATAGGACTTGAAGTTAATAGTTATGATGTGATTCCAAATTCATTTGTTTCAAAA
ACTATTAAGGAAGGAAAGTATGCTATATTTACTCATACTGGTAGCTTAGATAACTTAGACAAAACTTATG
AATATATATGGGGTACTTGGTTTTTAAGTTCAAAAGAAGAACTGGATATAAGAGATGATTTTGAAGTATA
TGATGAACGATTTTTAGGTCCTAGTAATGTGAACTCACAAATTGATATTTATATACCTATAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2710320-2709151 hypothetical protein CDR20291_2311 [Clostridium difficile R20291]
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TAAGAAATATTGAATTGAGTGGTACAAATTATGAGATAGGATACAGACTAGGAGAATTGGTTGCTAATAT
GCCAGAGATAATAGAAGGTCAGATTAATAAATCTAATCTGGTAAGCAAAAAAGAAGAAAAAGAGATGATA
GAGTTGTTTGATAAATATTGTCCAGGTCTTAATGAAGAATTGCAAGGTTTTGCTGATGCAATTCAAGTGA
ATTGTAATCAAATTTTATATTATACTATGACTTATCTTAAACCAGGTTGTAGTCAAGTTGCATTAACACC
AGAATTAACTGAAAATGGGCATGTACTATTTGCACGTAATTTCGATTTCTCACACAATATGGAGGATTTT
GTTTTATGTAAAACTAAAGTAAATGGAAAATATGCACATATAGGTACTACCGTTATGCAATTTGGAAGAG
GTGAAGGTATGAATGAATGTGGATTAGGTGTAAGTCAGTCATCATGTGGTATTCCTGTAGGCAATTCAGA
TGGTTTGAGAAAACCAGCAATTGTAGGTTTACAGTTTTGGGCTGTTATTAGATATTTGTTAGAAAATTGC
AAAGATGTAGATGAAGCATTAGAATATTTAAAAGATATGCCAATTGCATACAATATTAATTTATTGCTTG
CAGATAAGTCTGGAAACATTGCACTTGTGGAGACTTTAGATGGGAAAAAAGAAGTAAATATAATCAACAG
TTTAGAAAGTAAGAGAGAATATTTTTTACACTCTACTAATCATACACATATTGATAAACTTCATAAATTA
GAACCACAATCAATGAAAAATTCTATTCATAGATATAAATTAATTAAAGAATATATAAATAAGGCTAAAA
AAATTGGAGAGAAAGAGTTAATGAATTTATTGTCTTTAAAGTATCCAAATGGCTTATCTTGTAATTACTA
TAATGATTTTTTTGGAACTTTAAAAAGTATAGTTATGGATTTAAATATAGGAAAGTTTAATATTTTATGG
GGTGGACTAGAGAATAAATGGGAGAGCTACTATTTAAAAAATGACATTAAATCTATAACACAGAGGATAA
ACATAAATATTGAAAAAGCACCATCTGACTTTTTTGATTTCATTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2711638-2710502 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAAAGAATAATACAAGTGGCTGATTCAAAGAAAGAAAAAATTCTAGGGCTATGTCAATCTTTAT
ATGATGAACCAGAAATTGCTTTGCAAGAATATAAATCTGCTAAAAAAATATCAGAATTTCTAAGAGAAGA
GGGTTTTGATGTTGAGGAAAACTTGGCAGGTATGGCTACAGCTTTTAAAGCAACCAAGAAAAATGGAGAT
GGTCCTAAAATAGCATTTATAGCAGAATATGATGCTCTTCCAGGCAATGGACATGCATGTGGACATCATT
TAATTGCATCTATGGGAGTTGGAGCTGGAATAGCTCTTTCAAGTATACTGGATACTTACAAGGGAGAAGT
AAGTATAATTGGAACACCTGCTGAAGAAACTGGAGATGGAAAGCCTTACTTGATAGAACATGGTGTATTT
GATGGCTATGATGCAGCAATGATGATACATCCAAATTCAAAAACTTGTGTAACACCTGAAATTATAGCAA
TAGGAGGTCTAGATTTCATATTTACTGGAAAAGCATCTCATGCAGGAGCTAAGCCATATAACGGAATAAA
TGCTTTAGATGCAGTAGTACTACTATATAATAATATAAATGCACTAAGACAACAATTAGTAGATGGAACG
AGAATACATGGTATTATACTAGAAGCAGGAACTGCTGCAAATGTAATACCTGATATGGGAAAAGTAAGAT
TAGAGATAAGGGCAAAAGAACAAAATTACTTTGATGAAGTAGTAGAAAAAGTGAAAAATTGTGCTAGAGG
TGCTGCAATAGCCACTGGATGTGAACTTGAATTTTATCACTTTGAACCAACTTGCCAAGGATTAAATGAA
AATAAAGTTTTGGTAGACATATTTACAAAGATTATGGAGGAATTTGGAATATATGAAGATGAACAAGTAA
TGTTAGGTTCAACAGATATGGGAAATTTAAGTCAAATAATGCCATGTATACATCCTTTGATGAAGTTTTC
TGAAAATGGAGAAGAACTACATACAAAAGAATTTTTGGAGGCTTCTATAAATTCATATGCAAAAGATAGA
GTAATTGATGGTATAAAAATATTAGCTTTAACAGGATTTAATTTATTTGAAAATCCAGAGTTATTGAAAA
AAATGAAGGAAGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c2713157-2711694 sodium/proton-dependent alanine carrier protein [Clostridium difficile R20291]
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TAGGATTATATTTTTCAATGAAATTAAGATTTTTTCAAATAAAAGATGTAAAAGAAATGTTTACTCTTTT
GCTTGAAGGAGATAGCTCTCATGTTGGAATATCTTCGTTCCAAGGTTTTGCTACATCTATGGCAGGAAGG
ATAGGAACTGGAAATATAGCTGGTGTAGCTGTAGCGATAGCAATGGGAGGGCCAGGAGCATTAGTGTGGA
TGTGCATAATGGCTACATTAGGGTCGGCAACTGCATTTGTAGAATCTACTTTAGCTCAGATATATAAAGA
TGAGCATGATGGACAGTACAGGGGAGGTCCTCCATATTACTTTGAAAAAGGTCTTGGTTGGAAAAAATGT
TCAATTTTATTTTCAGTGGTTGCAATCATAAGTTATACATTTTTTATGCCTGGCACACAATCAAATACTC
TATATCTAGCAATGAATCAAGCATTTGGATTTTCAAAAATGACAATAGCAGTTACATCTTCTATTGCACT
AGGTATAATAATTTTTGGAGGAATTAAAAGAATTGGTTTATTTGCTGAGAAAGTAGTACCTATAATGGGT
GGAGCATACCTTATTATGACATTGGTAATAATCATAGCAAATATAAATCTAGTTCCAGGAGCTATTATGA
CAATGTTTAAATCTGCATTTGGATTTGGTTCGGTTTTTGGAGGGATGTTAGGTTCAGCAATATCTTGGGG
AGTAAAAAGAGGTATATACTCAAATGAAGCGGGAGAAGGTTCTGGAACTTATGGTGCAGCAGCAGCAGAA
GTGAGTCACCCAGCCAAACAAGGATTAGTCCAAGCTTTTTCTGTTTATGTAGACACACTATTAATATGTA
TGGCTACAGGTATTATGATTATAATAACAGGAATGTATAATGTTACAGATGTTTACACAACATTACCAGG
TGTAGAACCAGGTCCACAATATGTACAGAGTGCAATAAATACATTACATCCTCAATTAGGTGATATTTTT
ATAGCAATAGTTTTACTACTATTTACATTTACAACATTATTAGCCTTCTCATACATGATGGAGACCAACG
TATCTTACTTAGTGACTAGAATTAAGGCAGAAAAACATGAAAAGCACATAATTAATGTCTGTAGATTTAT
GCTTATAATATGTGCAGCAATGTGTTGCTTTATAGAACCACTTACAAGTTGGGCACTTGGTGATATATGT
ATAGGTGTATTAACATATATAAACTTAGTTGGTATATTTACACTAAAAAAACCAGCTATAAAAGCATATT
ACGATTATCAAAGGCAGAAAAAGATGGGAGTAAAAAGGAGCGATAGAACTTTTAATCCTATAGAATTAGA
TATAAGAAATGCTGAGTTTTGGGAAAATAGATACTTAAAAGAGGATAAGCATGAGTTAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2714995-2713733 putative transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAGAAAAAGAAAACGGTATAAAGTTTGGAAAGTTAATGTTTCAACTTGTTATTATAGCAATATCTT
GGGAATTAGTTTATATTATACCATTTATCCAATATACATTATATGATCCAATCCTAAAAGCATTAGAATG
TACAAACACTCAACTAGGTTTTCTACTTACAATTTATGGGTTAGGTAATATATTTGGAGCTCCTATAGGA
GGCTGGTTAGCAGATAGATTTGATTATAGAAAGATAATTTTAGGTTCTGTATTTCTTAATGGAGTAGTAT
CATTTTTATTTGCATTTAATATGAACTATCCATTTGCAGTTGCTACTTGGGTAGGTTGTGCAATCACATC
ATTAGTTATGAACTATCCTTCTATGGTAAAAATACTTAGAGTTATAGGAAAAGATAATCAAGGTAAAGTT
TATGGATTCAATGAAGCTATGGTTGGAGTTTCTGGCGTAGTAATGGGAGCAATATTCTTATATATTTATA
CATGCTTTTCAACTCCTGTATTGGGTATGAGATGGGTAATGATATCTTTAGGAATATTATCAATAGTGAT
GTGTCCAGTATTATGGTTTGTAATTAAAGATGTAGATATCAGAGAAGACAAAGAAGAAGAAGCAAGTGAA
AAAATGTCTGCTGGCGATTTTATGACAGTACTAAAATCACCAAACACTTGGCTAGTAGGAATAAGCATAT
TCTGTGTATATTCATTCACAGTTACAATGTCTTATTTTACACCATATATAACATCAGTACTTGGAGGTTC
TGTGGCATTGTCTGGGGCATTAGCAATAATAAGACAACATGGTCTAAAATTGTTTGGAGCACCATTTGGA
GGATATTGTGCAGATAAAGTAAAATCACCTACAAAAGTACTACTACCAATATATGTATTTGGTATAGCAG
TAATAATTTTATTCCTAGTACTACCTGCATCTACTCCAATGACTATCTTTATAGCTTTAACATTTGTAGT
AGGTATATTAGGTTACATGGGAAAAGGTATATACTATGCAGTTCAAGATGAAGTAAAAGTTCCAGTTAAA
TATTCAGCAACTACTATAGGTATAGCTGCAGCTTTAGGATTTTCACCAGATGTATTCCAATTTGCATTAA
TAGGACACTGGATAGATACTTATGGCAATAAAGGTTACACATATACATTTATATTCCAGATAGCAATTCT
AATAATTGGTATACTATCTTGTTTATATATATTAAAAGTTAAGAAGAAAAGAGAAAGTAAGTTAGAAGCA
TAA
>ref|NC_013316.1|:c2716227-2715019 putative aminotransferase [Clostridium difficile R20291]
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AGAAGGTGGCAAGTGGTGGAACTGTTATATCTTTTGCTGCAGGGCTTCCTGACCCAAATTTATTTCCAAT
AGAAGAGATAAGTGAAATAACTCAAAAAGTACTTAATGAAAGGGGAAAATTTGCCCTAGCATATGGACCT
ACTAAAGGTGAAGATGAGTTGTTAGATCTATTAGTAAAAAGAATGAAAGAAGAAGAAAATATTGATACAA
AAGCAGAAAATATTATAATAACTACTGGGTCACAACAAGGGATAGCATTAAGTGCTATGATTTTACTAGA
AAAAGGAGATATAGTAGTTACAGAAAATCCAAGTTACTTAGGTGCAATAAATGCATTTAGACCTTATGAA
TGTGATTTTTTAGGAGTAGATACTGATGATGAAGGAATGGTAACAGATGATTTAGATAAATTATTATCTG
AAAATTCTAACATAAAGGTAATCTATGTAATACCAACATTTCAAAATCCTACAGGAAAAACATGGTCTTT
ACAAAGAAGAAAAGATTTTATGGAAGTCGTGAATAAGTATGATGTCATAGTAATAGAAGATAATCCTTAT
GGAGAAATAAGATTTACACCAGAGCCTCTACCTACACTTAAATCTCTTGATACTAAAGATAAAGTATTAT
ACTTAGGTTCATTTTCAAAAGTATTATGTCCAGGGTTTAGAGTTGCTTGGATGTGTGGTAATGTAGACAT
CATAGATAAGGCAGAACTTTTAAAACAAGGTATAGATTTACAGTCAAATCAATTTTCGCAAGTACAAGTA
ATAGAATTTTTAAAGAAATACAACTTAAATGAACATATAGAAAAAATAAGAGCAGAGTATAAGAAAAGAT
GTCTGCTAATGTTAGATGCTATGAAGAAACATTTCCCAGAGGAAGCTAAATATACAGAACCAGATGGAGG
AATGTTTATATGGGTTGAACTTCCTGAAAGTATAAATGTAGATGATTTATTGGATAAAGCCATTGATGCT
GGAGTTGCTTATGTTTCTGGAGAGTCCTTCTTTGCAAATAATGGTCCAAAAAATACTATGAGACTTAACT
ATACAACAATGTCAGAAGAACAAATCGTTAAAGGTGTTGAGATACTTGCAGAAGTTATAAAAAAAGAACT
CAATTATGCTTGTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2717150-2716257 phosphate butyryltransferase [Clostridium difficile R20291]
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TTGCAGAAGACAAAGAAGTATTAAAGGCTGTGAAATCAGCAACAGATTTAAACATTATAAAGCCAATTCT
TGTAGGAGACAAGGATAAAATAGAAAGTATATCAAGAGAAATTGGATTAAAAGGTCATGAAATAATAGGT
TGTCAAAATCCCGATGAATCAGTTAAAAAAGCTGTAGAGATAGTTAAAAATAAGGAAGCTAAAGTTCTTA
TGAAGGGATTAGTAAATACAAGTGTCTATATGAGAGCTATATTAAATAAAGAAACGGGTCTTAGAACAGG
AAGATTATTAAGTTTGCTTGCAGTATATGAATTACCTCAATATCATAAACTTCTTTATTGTACTGATAGT
GGAATAAATGTATCGCCAAACTTAAATCAAAAAAAAGATATAATGACAAATGCACTTCTTACTATGAAAA
GTATAGGCATGGAAAATCCTAAAACTGCGATACTTACTGCAAATGAAATGGTAGACCCTAAGATACAATC
TACAGTGGATGCCAACCTACTTGTAGAGATGGAAAAATCGGGAGAAATACCAAAGTGTATAGTGGAAGGT
CCAATAGCATTTGATGTAGCATTTGATGCACATGCAGCAGAACATAAAGGTATTAAAAGTAATATTGCTG
GTGATGTTGATTTATTAGTATTTCCAAATATAGAAGCAGGGAATATATTAGGAAAGTCATGGCTTAGATT
TAATAAAGCTAAGTGGGCAGGTATAGTTTTAGGAGCAACAAATCCGATAATTTTAGGTTCACGTTCTGAC
ACAGCTGAAATAAAAATAAATTCAATAGCATTAGCGTGCCTAGCATCACAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2718226-2717168 butyrate kinase [Clostridium difficile R20291]
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TTTTGAAAAAAAATATAACCCATACAAGAGAAGATTTAAAAAATTTTTCTAAAGTATTTGATGAATATGA
TTATAGAAAACAACTGATAGTAGATATTTTAAGTAGTGAGAATCATAGTATAAATTCTTTTGACGCAGTA
GTTGGTCGTGGTGGACTTATGAAGGCTATAAAAGGTGGTACCTATACTGTGAGTGAAGAAATGATTGAGG
ATATGAGAAATGAAATAAATGGGGAACATGCATCAAATTTAGGTGCATTATTAGCTAAAACTATAGCTGA
TGAAATAGGAGTACAATCATTTGTAGTAGACCCAGTTTCTGTAGATGAATTTGATGATGTATCGAGGATT
ACAGGAATATCAGACATAGAAAAAGCAAGTTGGTTACATGCATTAAACCATAAAGCTGTTTCAAGAAAAA
TTGCACAAAAACTAGGGGGAAAATACGAGGATTATAACTTTATTGTAGCTCATTTAGGTTCAGGAATATC
GATTGTAGCACATAAACAAGGCAAAATGATTGATGGAAGTGGTGGTAGGTCTGATGGTCCATTTTCTCCA
GAAAGGAGTGGTGGATTACTTGCATATCCTCTTATAGAATTGTGTTACTCCGGAAAATATACTCATGATG
AAATGGTCGCAAAAGTAAGTTCGATTGGGGGAATGTACGATTATTTAGGAACAAAGGACATGATAGAAAT
TGAAAACAGAATCAAGGAGGGTGATGAAAAGGCAAAACTTATAATGGATGCATTTATTTATCAAGTAGCA
AAAGAAATTTCTATGTATGGAGCTTCACTTTCAGGGAATGTAGATAGAGTTATCTTGACAGGAGGGATAT
CTCACTCAGAAATGGTAGTCAAAGGAGTAGCAGAAAAAGTTTCATATCTAGCTCCAATAGAGATAGTACC
AGGAGAGATGGAAATGGAGGCACTTGCTCTAGGAGCACTTAGAGTACTTAATGGAGAAGAAATAGCAAAA
ACTTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2718922-2718383 putative oxidoreductase subunit [Clostridium difficile R20291]
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ATGTTGCATATAAGGCAGAAAAGAAAATTACATGGTTCCCATCTTATGGAAATGAGATGAGGGGAGGAAG
TGCAAATTGCAATGTTGTTGTAAGTGATGAAAAAATTGCAAATCCTTGTGTAAAAAATCCAGATATACTA
TTGGGAATGAACAGCGTATCAGTAGATAAGTATGAAAGTTTAATGAAAAAAAATGGTTATATGTTTGTCA
ATGAATCACTAGTAAGTAAGGATAGAAAGTACAGAGAAGACATTAATGTTATAAAAGTACCTGTTACTGA
AATAGCACAAAATTTAGGCAATGAAAAAGCTGCTAACATTTGCATGTTAGGTGCTATGGTAAAGAGTTTG
GATTTATTTACAAAAGAAGAATTTGAAAGTGGTATGTGTGAATACTTTGAAAATCAAGGCAAAGGTAAAT
TCAATTCTAAAAATGTAGAAGCATTTGAAGCAGGATACGACTACGAATGA
>ref|NC_013316.1|:c2719654-2718935 putative oxidoreductase subunit [Clostridium difficile R20291]
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AGGTTGTAATCATATGTTTCAATTTAGTATGAATGTAGATGTTGTCGTTCCACCTCATGGTAAAATGGGT
GCAGCAATGGCAGCTATGAAAAGAGTTAGACCAGATAAATATATATTTACAATAGCTGGAGATGGTGGAG
CTTATGCGATAGGGCTTGGGGAAACTATGTCAGCTGCTACTAGAAATGATAATGTTATATTCCTTGTTAT
GAACAATAATATGTTTGCAATGACAGGAGGGCAAATGGCTCCAACTACTATAGAAGGTCAATATACAGCT
TCTACTCCAGCGGGTAGAAATTACGCAGATCATGGTTCAACATTTGATGTTGTAAAAGTTATGGGAAATT
TAGATATAGCATATCTAGCAAGAGGAACAATAACTAACCCTAAAGAAATAAATACAACAAAAAGATACAT
CAAAAAAGCTCTAGAAAAACAAAAAGAAAAGAAAGGTTTTTGCTTAATAGAAGTGCTTGTACCATGTCCA
ACAAACTGGGGATTAAAGCCAGTAGATGCTATGAAGAGAATTGAAAATGAACTTGTTCCAAAGTATCCAC
TTGGAGAATTTATTGATTAG
>ref|NC_013316.1|:c2720733-2719657 putative oxidoreductase subunit [Clostridium difficile R20291]
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ATGCAGGTTATCCAATAACACCACAATCAGAAATATTAGAAATGATGGCATGGAGACAAAAAGAAGTTGG
AGGAGTATTTATCCAAGGTGAATCAGAAATAGCCAGTGTAAATATGGTTATGGGAGCAAGTGCACTTGGA
GCAAGAGCTATGACTTCTTCATCTGGTCCAGGATTTTCATTAAAACAAGAAGGTATTGCATATTGGGTAT
CAGCTGGTTTGCCAGCAGTTGTAGCATGTGTGCAAAGATATGGTATAGGTGATGGATTTATAGGAGCTGG
TCAAGATAATTATTGGCAAGCAGTAAAAGGCGGTGGAAATGGAGATTATCATTTAATCGTGTTAGCGCCT
AACAGTGTTCAAGAAAATATGGATATGGCATATGAATCTTTTGAATTGGCTGAAAAATATATGCATCCAG
TACTTATACTTTCTGATGCTACAATAGGTCAAATGGTAGAACCTTGTATAGCACCACCAATGAAAGAATA
CGATATGGATAAAGCTCCATGGGCTGCAAAAGGAACACCTGTAGGAGAAAAAAATAAAGTAATAACTGAT
ATAACATATTTTGAAGACCAAGATACATGGCAAAAAGGGTATATAGAAAAAATGAGAAAAGTTCAAGAAG
ATGAACAAAGATGGGAAGAGATAGAAATAGAAGATGCTGAAGTGGTATTTGTGGCATACGGTATTTCATC
AAGAATAGCAGAAGGTGCAGTTAGAGATGCTAGAGCAAAAGGAATGAAATTAGGTCTAATAAGACCAAAA
ACATTGTGGCCTTACCCAAGAAAAGCATTTAAGAAATTAAGTGATTCATTGAAGGGACTTGTAACAGTTG
AAATGAACATGATGGCACAGATGAAGGAAGATGTAATTATAGCATGTGATAATAGATTTCCAGTATATTC
AGTAGCAACAGCTCAATATATGGCAGAAGTAAATCAATTAATAGATTTTGCTCAACAGATTATAGATGGA
AAAGCTAAGCAAGAGGAGGTATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2720959-2720762 putative oxidoreductase ferredoxin subunit [Clostridium difficile R20291]
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ATGCAATAAGTCTTTCTGACTACACAAATAAAAAAGGCTTTGTAACTATTAAAGTCGATGAAGAAAAATG
TATTCAATGTGGCGCTTGTTATACAATGTGCCCTGATTTAGTATTTGAGATATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2722009-2721242 IclR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAGAAATAATAAATGCATTAGATAGAGCCCTAGACATAATTTTGCTGTTATATCATGAAAAGAGAG
AAATGGGAATAACTGAAATAAGTAAGGCTATGGGAGTATATAAAAGTACTGTACATAGAACTTTGGTTAC
TCTTGAAAACAAAGGTTTTGTTATACAAAATGCAGAGAATGGTAAGTATTGGCTAGGAATAAATTTATAT
GCAATAGGTATGGTTGTGGGAGAAAAAATGTCATTGACTGAAATAGTAAAACCATATACGAAAAAATTAA
ATCAAGAATTTAACGAAGTAGTTAATGTATCTATATTAGAAGAAAGAGCTCAAGATTCTCCAAGAAGTAT
CATAATACATAAAGAGTATGGTTCAAATCAATTACTTTCAGTAAATCCATCCGTTGGTTCAAGTAGTGAA
TGTTATTGTTCAGCAGTTGGTAAATGTCTTATGGCATTTAATGATTCTATAGATTTTGAAAAATATAGAA
AAACACCAATACACAAGTATACAGAACATACAATTGATAATTGGGATGATATGATGCTTTTTTTAGCAAA
AATAAAAGAACAAGGATATGCTATAGATGATGAAGAACTAGAACATGGACTAACTTGTATTGGAGCACCT
ATCTTAGATAAAAATAATAAAGCTATTGCAGCCATAAGTTTGTCAGGTCCAACTATAAGAATGAGAGAAG
GGGACTTTGAGTATAAGATTAAAAGAGTTATAGAAACTGCAAAAAGTATATCTGAACTTTTTAGATGA
>ref|NC_013316.1|:2722289-2723836 putative nitrite/sulphite reductase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAATTTTAAAAAGATATTGTTAAATGAACTACCTAATTTTAAAGAATATTCTTCAAAATTTTTAA
ATGGAGAAATAAATAAAATGCAATATAAGGGATTTTCTGGTGGATATGGTGTTTATGCTCAAAGAGACAA
AAAATCTTTTATGATAAGACTTAGAGTATCTGCTGGAGTTTTATCTCAGTATCAACTTAATAAAATCTAT
GAAATAGCTATTAAACACAACTTAGATAAGATACACTTAACAACTAGACAAGCTATACAATTACACGATT
TATCTATAAATTCAATTGTTGATATCATGGAAGAAGGAATAAAAAATGATATATTCACTAGAGGTGGTGG
TGGTAATTATCCTAGAAATGTCGGATTATCTCCATTATCTGGAGTTGACCCTAGTGAAGTCTTTGATGTT
ACTCCATATGCAGTTGCTACTGATAAATATTTTATCAAAAATGCTACTACATACCATTTACCTAGAAAAT
TAAAAGTTTCTTATTCTAATTGTTACACAGATACTGCTCATTGTAGTATACAAGACTTAGGATTTGTTGC
TACTTTGAAAAATGATGAACCATATTTCAGAGTTTTCTTAGGTGGAGGTCTAGGTAAACAACCCAAAGTT
GCTTTAGAACTTGATGAACTTATAAAGCCGAAAGACGCCTTATATTGTGTTGAAGGTATGATTAAATTCT
TTATGGATTATGGAAATTATGAAAATAAAAACAGAGCTAGGGTTAGATATATGGTCGAATCACTTGGTGA
AGAACTATTCTTAGAAAAATTTAAAGAATACTATAAATTAGAAAAAGAAAATGGTAGTCTTGAACTCAAT
ATTGAAGAAATAGATTACTCTAAACCTGGAGTTAAAATAGATATACAAGATTCTAGACTAATACCTCAAA
AACAGGATGGTTTATACACTGTATATATACATCCAGTTGGAGGTATTTTGTTAACAAAGGATTTAAGTAC
TTTACTTAAAGAATTAGATAATGTTGAAAATCCTATGATTAGACTAGGAATGACAGAGGGATTATATATT
TTAAATTTAAATGGAAATGAAGCAAAAAGAATATTAGAAATAAGTAAAACTATTAGTTGTAATTCTCAAT
TAGAACAAAGTATATCTTGCATAGGTGTTCCAATTTGTCAAATGGGCATACAAAATAGTCAGAAAATGTT
ACATGAAATCATAGATTATTTTAGATTACAAAATAATGAAGAAATTTTAAATAAAGCACCTAAGTTATAT
ATATCAGGATGTTTAAATTCATGTGGTGTTCATCAAGTTGGTAGCATAGGTTTATGTGGTAAAAAGAAGA
ATGTTGATGGTATATCTACAGATGCATTTGAATTATTTGTTGGAGGCAGTTTTGAAATAGGTAAGACTAG
ATTGGGAAAATCACTTGGAGATTTTAAAGCTAGTGATATTCCTGAAATGCTTTATAAAATATCGGACGCA
TCATCAGGCAATTTTTATGAATGGGTAAATTCAAATGATAATATTTTAAACAAAATAACTGATAAGTATA
AAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c2726068-2724002 glycyl-tRNA synthetase beta chain [Clostridium difficile R20291]
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AACAATTAAAAAACAATCTTAGTAAATTATTTGATGAAAATAGAATAGCTTTTGATAAAATAAATGCGTA
TGGGACACCAAGAAGACTTACTTTAGTAGTCGAAGGATTGAGTGATAGACAAAGTGATTTAGAAGAGGAA
ATAAAGGGTCCTGCTAAGAAAATTGCTGTTGATGCAGAAAATAATTTAACAAAACCAGCATTAGGATTTA
TAAAAAGCAAAGGATTAAGCGAATCTGACATATATTTTAAACAAGTTGGAAAAGAAGAATATATATTTGC
GACTATAAAGCAAGATGGAAAAGAAACTTCAGAAGTACTAAAAGACATATTACCAGAGACTATAAAATCT
GTAGTATTCCCAAAAGCTATGCGTTGGGGAGGAAAAAATCTTAAATTTGCAAGACCTATAAGATGGATAG
TTGCATTGTTAAATGATAAAGTATTAGAGTTTGATTTAGAAGGAATAATATCTTCTAATGTAACAAAAGG
TCATAGATTTTTAGGTGAAAGTACAATAGAAGTTGATTCTATAGAAGATTATTTTGAAAAATTAGAAAAA
AATTATATAGTTTTAGACCAAAACAAGAGAAAAGAAATGATAAGAAAACAATGTATAGAAGTAGCAAATT
CTTTAGGTGGAGAAGTTGAATTTGATGAAGATTTACTTGAAGAGGTAACTTATTTAGTTGAATATCCAAC
TGCTTTTTATGGAGAATTTGATGTGGATTATATAAAACTACCAAAAGAAGTTGTTATAACTCCTATGAAA
CAACATCAAAGATATTTTCCAGTACTTAAAGAAGGAAAACTGTTACCTAACTTTATAGCTGTTAGAAATG
GTGATTCTTACAGAATAGACAATGTTAAAGCTGGAAATGAAAAAGTTTTAGAAGCAAGACTTGCAGATGC
TTTATTTTTCTATAGAGAAGATACTAAGAGAAACTTAGAAAGCTACATAGAAAAATTAAAAACTGTTGTA
TTCCAAGTAAAACTAGGAACTATTTACGACAAAACTTTAAGACTTGAAAAATTAAGTGCTGATATACTTG
ATAGTTTAGGTTTAGTAGATGAAAAGGCAGATACTATAAGGGCTGCTAAATTATCTAAGGCAGATTTAGT
TACTGGAATGGTAGGAGAATTTGATGAATTACAAGGTTTTATGGGAAAAGAATACGCAAAAGTTGGAGGA
GAGAATGATGTTGTAAGTGAAGCTATTTTTGAACATTATCTTCCAAGATTTGCAGGAGATATACTTCCTA
AGACTAATGCAGGGGTTGCCTTATCAATAGCTGATAAGTTGGATTCAATAGCAGGTTTCTTTGCTATAGG
AATACAACCAACAGGTTCTCAAGACCCATATGCTTTAAGAAGACAAGCTTTAGGTATACTTAGTATACTT
ATGGACAGAAAAGTTGCTGTGGATATAAAAGTACTTATTGAACATGCTTTAGATAATTATTCTGAATTAG
ATTTTAATAAAGAAGAAGTTGTTGAGCAAATAATGAATTTCTTCAATGAGAGAGTAAAAAATCTATTTAA
AGATTTAGGAATAAGATATGATGTTGTTGATGCTGTTTTAAGTTCTGATATAAATGATGTTTCTGATATG
CATATGAGAGCTTTAGAGCTTAATAATTGGCTAGAAAAAGATGAATTAGTGGAGATGCTTACTGCATTTA
ATAGAGTTTCTACTCTAGCTCAAAAAGCAGAAAGTGATAAAATTGATGAATCTTTATTAAAAGAAGATGC
TGAAATTAGACTTTACAATGAATTTAAACAAGTAAAGGTAAAAGTTAATGAATTATTAAAGGATAAGAAA
TATGGTATTGCTTTAGATGAATTTGCATCTTTAAGACCAGTAGTTGATAATTTATTTGATACAGTTATGG
TTATGGATAATGATGAAGCTATTAAGAACAATAGACTTGCTTTACTTAAACAAGTATATGATACTATGCT
AGAAATTTGTGATTTATCTAAAATTGTTTATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2726946-2726068 glycyl-tRNA synthetase alpha chain [Clostridium difficile R20291]
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CTTATGATATTGAAAAAGGTGCAGGAACTATGAATCCTAATACTTTTTTAAGATCATTAGGACCTGAGCC
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CTATATCAACATCATCAATTCCAAGTTATACTAAAACCTTCTCCAGATAATATACAAGAATTATATTTGG
AAAGTTTAAAAGAGATTGGAATTGACCCAAGTGAGCATGACATAAGATTTGTTGAAGATAACTGGGAAGC
TGCTACAGTTGGTGCTTGGGGACTTGGATGGGAAGTTTGGCTAGATGGTATGGAAATAACTCAATTTACG
TATTTTCAACAAGTAGGTAATATTGAATGTGAGCTTGAGACAGGAGAAATTACATATGGATTAGAAAGAT
TAGCTATGTACATTCAAGAAGTTGATAGTGTTTATGATTTAAAATGGAATGATAAAATAACTTATGGTGA
AGTATTTAATAAAGCTGAGTATGAAAACTCAATGTACGCATTTGAATTATGTGATGCAGATATGTTGTTT
AATCTGTTTGATATATATGAAAAAGAAGCATTAAGACTTATGGAAAATGGCCTTGTAATACCTTCATATG
ACTATGTGTTAAAATGCTCTCATGCATTTAATACATTGGACGCAAGAGGTGCAATAGGAGTTAGTCAAAG
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GAAATGGGATTCCCTCTTTTAAAGGACGGTGACAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2727705-2727106 hypothetical protein CDR20291_2326 [Clostridium difficile R20291]
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AATATAAAGTTTCAATTAAAAGAGCTTCTTAGAAAAAGTAGTGTAGTGAGAATAATAGTTGAAAAAGATG
GAAAAACTATGATGAACATTCCTTTAACAGTTGGAGTTGTTGGATTAGCTTTTGTACCATTAGCTACTTT
AGTTGGATTATCAGCTGCTGTTATAAGTAAATATCGTATAAAAGTTCAAAATGAAGAAGATGGAGAAATT
GTAGATTTAGGTGAATTGAATGAAGAAAAACTTCACGTTTTGAAGAATATGATAACTAATGCAGCAAAAG
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ATCTGAAAAGAATAAAGAAGACGAAGACGAAAATAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2728471-2727698 DNA repair protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATAATCCTGAACACCCAGGGGATAGTACTTAAAGCTATAAGGTATAAGGAAAGTGACATAATACTTA
CACTATTTACAAGAAAGCTTGGAAAAGTATCTGCAATAGCAAAAGGAGCTAAAAAAAATAAGAGCTCTTT
GCTTTCATCATCACAATTATTTTCTTATAGCAATTTTACCTTAAAAAAACAAGGTAATATGTACAAGGTT
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ATATTACAAAATTAGTTGAAAATTCTATACTTGAAAATCAGACTAATAATAGGCTATTTATATTACTTGC
GCAGACTCTGTATTTGTATACACAGGATAATACAGACAATAGGTTTATAACAGCAGCATTCGAGTTAAAA
TTTTTAGACTATATAGGATTTAAACCTATAGTAAATAAATGCATTAATTGTGAATGTAAAATTTTACAAA
ATTCTGTGTTTAATATCTACGAAGGTGGTATACTATGTAGTAAGTGTAGTAAACTTTTTGATAATAATAT
AAAATTAGACTTAACAACTATAAGTCTTATGGAATATGTATTAAGAAATGATATTTTAACATGTAGTAAA
GCTAAAGTATCAAAATATATAACACATGAACTTGAGAATATTCTAGACAAGTATTTGAAAGTTTATGTTG
ATAATATTAATTTTAAATCATTACACGTATTGCAAAGTGTAAAAAATAATAAGGGAGTGGATAATGATGA
GTAG
>ref|NC_013316.1|:c2730044-2728665 putative Mg2+ transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAGGAAACTGGATGCTTCCCAAGATTTATTATATGAAGTAAAATCATTAATTGATAATAATAAAG
TATTGGAGTTAAGAGAATTAATAGAGGAATATCATATAATTGATATATTCGATATAATGGAAAATTTAGA
GGAAGACATGAAAATTCAATTATTTGAAGTACTTCCTTTAGATATGGCATCTTCTATATTAGAAGAAGGT
AGTGTAGAGTTTTTTATTAGTATTTTATCTAAACTGGATGTAGAACACTCGAAAAATATACTTGAACTTA
TGTCTCTTGGAGATATGGCAGACAAGTTGAGTGAACTTGAAGAAGAAGAAAGAGAACACATAATAAATCT
TTTGAATCAAGAGAATGCCGATTATGTAAAAGAGTTACTATTCTATGATGAAGATTCTGCTGGTGGAACA
ATGACCACTGGATATATTTCTATAAATAAAGATATGACAGCTCTTGAGGCTATAGACCATATGAGAGAAG
AAGCTGAAGAAGCTGAAACTATTTATTATATATATGTGGTTGATGATGAAGAAAAACTAGTTGGAGTATT
GTCATTAAGAGAATTAATAATAGCTAGAGACGCAAATATAGTAGAAGATTTGATGAGTGAAAATATAATC
TCTGTTTATGTAGATGAAGATAGAGAAGAAGCAGTAAGATTAGTATCTAAATACAATTTAATAGCAATTC
CAGTAGTAGACAGACAAGAAAAATTAAAAGGAATAATAACAGTAGATGATATAATTGATGTAATGGAAGA
AGAAGCAACTGAAGATATGTATAAATTTGCAGGAAGTTCAGAACATGAAAGAGAAGTTGCTGAAAAAGAA
AACCCTACATTGAGAGAGCAAATAATATCAGCACTTAGAGGACGATTACCTTGGTTAATTATTACCTTGG
TTGGAGGGTTGTTGGCTTCGTTAATACTTTCTAACTTAGACTATATAATGAATCCTGTATATGCTCCATT
AGTATTTTTTATACCTGTAGTAATTGGTATGGGTGGAAATATTGGAACTCAATCATCATCTGTTACAGTA
ATAACATTATCTAATAAGGATTTAAATTTTAGCAATGTGGTTAGAGAAGGTATTGTAGGTATTATTACAG
GTCTTTTGTGTAGTATAATAACAGGTATTGTAATTTACTTTGTTATGAGAAAGTTAGACATTGTATTAAT
TGTTTCAATATCATTATTTATAAATATGGTTTTAGGTGCAACAATAGGTGCGTTTATGCCTGTTTTATTA
AAAAAAATGGATGCAGACCCATCTACAGTTTCATCACCAATTATATCTACAGCTCTTGATATAACTGGTA
TAGCAGTTTACTTTATAATAACAACGGCATTATTGTCAAAAATTGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2730949-2730056 GTP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTCAAATCAGGTTTTGTCAGTATAGTGGGTAGACCAAATGTAGGAAAATCTACTTTAATGAATAATG
TAGTTGGAGAAAAAATAGCTATAATGAGTGATAAGCCTCAAACTACAAGAAATACAATACAAGCAGTATA
TACAGATGAAGAAATGCAGATAGTATTCTTAGATACACCCGGTATTCACAAACCAAAAAATAAATTAGGT
GAATTTATGGTAAAGGCAGCAACAGAAGCTTTTAAAAATGTAGATTTAATATTATTTGTAGTTGATGATT
CTAAAAAAATAGGTCCTGGAGATAGAAAGATAATAGAGGATTTAAGAAGTGTTAAGACACCAATAATTTT
AGTTGTAAACAAAATAGACCAACTAGACCAAAAAGATGAGCTATTTGATATAATCAAAATGTATGATAGA
GAAGGTATTTTTAAAGAAATAGTACCAATATCAGCATTAAAAGGAAAGAATACGGATACCTTAATAAAAG
TTATACAAAATTATTTAGAAGAAGGGCCAAAGTATTTTCCAGATTATATGATTACAGACCAGCCAGAAAG
AGTATTAATAGCAGAACTTATAAGAGAAAAAGTTCTTCACTATCTTAATGATGAAATACCTCATGGTGTA
GCTGTTGAAATTGAAAAAATGAAAGCGAGAAATGATAAGGAAATAGTAGATGTATCTGCTGTAATATACT
GTGAAAGAGATTCACATAAGGGAATAATAATAGGAAAAAATGGTAGGAAACTAAAAGGAATAGGTAAGTC
AGCAAGACAAGATATAGAATTGCTTTTAGGTTCACAAATAAATCTTCAATTATGGGTTAAAGTCAAAGAA
AATTGGAGAAATTTACAAAATTATATAAATAATTTTGGATATAATGATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2731414-2731013 cytidine deaminase [Clostridium difficile R20291]
GTGGATAACATAGAATTGTTAAGGTTGGCAGAAGATGCCAGACAACATTCTTATGCTCCTTACTCAGGTT
TTAGAGTAGGTGCAGCTCTTTTAACTAAGAGTGGTAAAGTTTATACTGGATGTAATATAGAATGTGCATC
ATTAGGTGGAACAAATTGTGCAGAAAGAACAGCTATTTTTAAAGCAATATCAGAGGGTGATAAGGATATC
TATAAAATAGCTATAGCAAGTGATAACTCAGAAAATAATGAGCAAACATATCCATGTGGAATATGCAGGC
AGGTAATTATAGAGTTTGGTTCTGATATAAAAATAATAACGGGATATACTAAAGGAGAGGTGTTTGAGCA
TAGTATAAAGGATTTGTTGCCAAACTATTTCTCTGGAAATGATTTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2732252-2731533 putative membrane-associated kinase and phosphatase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACCAGAAAAAACTCGTCAAGGTATAATTAAAGCATTTAATGCAGCTATAGAAGGGATATTGTATA
CATTTAAATTTGAAAGAAATATGAAAATACATTATTTAGGTTCAGTTGCTGTTCTTATAATAAGTTTGTT
TTTTAACTTTTCAAAATTAGAAATGATAATGTTACTTATGTCCATATGCTTAGTTGTAGTTGCCGAAATG
TTTAATACAGCTATAGAAAAAGCTGTTGATTTAGTAACTGATGAATATCATGTTCTTGCTAAGATAGCAA
AAGATGTTGCAGCTGGAGGCGTTCTAGTGGCAGCACTAAATTCAGTAGTAGTTGGATATATTTTGTTTTA
TGATAAATTGACAGATATATCTGGAATATTAATTTATAAAATAAGAGAATCAGAATTACATATAACCTTG
ATATGTATATTATTGGTTCTTATAGCTGTTGTAGTTGTAAAAGCATTGACTTCTACAGGTACTCCTCTAA
AAGGAGGAATGCCAAGTGGTCATGCTGCCTTAGCATTTGCTATAGCAACTGCAATTACACTTATGACTGA
AAGAGTTGTTGCCTCTACTCTTGCATATATAATGGCTGTATTAGTTGCCCAAAGTAGAATTGAAGGAAAA
ATACATACCTTTTGGGAGACTATTGCTGGAGCTTTATTAGGTGTGTTGATAGCTATATTAGTATTTCAGC
TTGGAATGTTCTATAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2732719-2732258 hypothetical protein CDR20291_2332 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATTTGATACTAGATGATAGACAAGATAAATTAGAAGTAAGTGAGGAGTTAATTGAAAAGATAAAGG
ATATAATCATAGAATGTTTAGATTATGAAGGATATGATGATAATTATGAAGTGAGTCTTTCTTTTGTAGA
TAATAAAGAGATTCATGAATTAAATAGAGAATATAGAGGAGTTGATAGAGTGACTGATGTTTTATCATTT
CCTCTTTTAAGTGATGATTTTGAGGATGTTGAGTTAGAAGAAGAATCCCTAGGTGACATAGTAGTATCTC
TTGAAAGAGCCTTAGAACAGAGTATAGAGTATAACCATAGTTTTGAAAGAGAAGTATGTTTTTTAATATG
TCATAGTATGTTTCATCTTTTAGGTTATGACCACGATACAGATGAAAATACAAAAGAAATGAGAGAAAAA
GAAGAACACATATTAAATAAGTTAAACATAACAAGGGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c2733792-2732776 PhoH-like protein [Clostridium difficile R20291]
TTGATAATACAAAAGAAATTTACAATAGCAGATGGTAACTTTGAAAGAGAGTTATTTGGCAACTTTGATG
AAAATGTAAAATTAATAGAGAAGACTTTAAATATAGATGTAATACTTAGAGAAGGCAATATAATTTTAAT
TGGAGAAGAAAAAAATGTAGATTCTGCATTAAAACTTATGAATGAATTACACCAAACTGTATCAAATGGT
AAGCATTTAGATAAGCAGAGTATTTCTTATTCATTATCTCTTTTGCTTGAAGGAAGTGAACAAAAAATAA
AAGAACTTGAGGGGACAATCGTCATAACTCAAAGGGGAAAAGCTGTTCAACCTAAAACTTTAGGTCAAAA
AGAATATATAAAACTTATAGAAAATAATGATATAACTTTTGGTGTTGGACCTGCTGGAACAGGAAAGACT
TATCTTGCGGTTGCTATGGCAGTAAAAGCTTTTAAAAGAGATGAAGTTAGTAGAATTATACTTACAAGAC
CAGCTGTGGAAGCAGGAGAGAGTCTAGGTTTTTTACCAGGAGATTTAAAGGACAAAGTTGACCCATATTT
AAGACCACTATATGATGCCTTATTTGAAATGTTGGGTGCTGATAAATTTAATAAGTATTTAGAAAGAGGT
ACTATTGAGGTTGCACCACTTGCATTTATGAGAGGTAGAACACTTGATAATTCATTTATAATATTGGATG
AAGCTCAAAATACTACTTCTGAACAAATGAAAATGTTTTTAACTAGACTTGGATTTGGCTCTAAAGCTGT
AGTTACAGGAGATGTAACTCAAACAGATTTACCACAAAATAAGAAGAGTGGTCTAATACAAGCTACAGAG
ATCCTTAAAGGTGTTCCAGGTATTGGGTCTATAATGCTAACAGATAGAGATGTTGTAAGACATGAGTTGG
TACAGAGAATAATAAGAGCTTATGAGAAGCACGACAAAAGAGAAGAATTTAAAAAAGAAGAACGTAAAAA
AGTGAAAATGCAGGAAAAGACTTTCAAAAGAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2735137-2733830 putative stage IV sporulation protein [Clostridium difficile R20291]
GTGGAAGGAGTAGGACTCGAACAATTTTTAAATCATCTTATAAGAAATGGGATAAGTGTTTACAATGTAA
CTAGAATAAAAAATACTAAAATGGAGTTTCATATAGATAGACAAGATATAAAAGAATTTAAGAATGTTTA
TAGAGGAAGTAAGTTTGATATAAAGGTAAAGCAAAAAACTGGGGTCCCTTTTATTATCAAAAGAGTTTAT
AAGCACAAAGGTATGTGGATTTGTGCTCTTGTTTCTTTATTTTTATTGATGTCTACATCGCAGTTTGTGA
CAGATGTATATATACAATCTCCTGAAGGTATAAAAAAAGAAGCTCTTAGAAATGAGCTTTATAAGGTTGG
AGTAAGACCAGGAGTCTATAAGAAGAGTATTGATAGAAAAGAAGTTAGAGACCATATGATGTCAAAATTT
AATGATGTGGCATATTTATCTATCAATGTAAAAGGAACAAATATATTTGTTACTGTTACAAAAAAGGCAG
AATCCCTAAAATCTACAGACCAATCAAATTATTGTAATGTAATTGCTTTAAAAAATGGTATAATAGAAAA
GGTAATCCCTAGAAGTGGTAAATCAGTTATTAAATCTGGAGACATAGTCCAAAAGGGAGATGTCTTATTA
AATGGAGCTAATACCAAGTCAATACCAGAAGTATGGGCAAGTACTTTTTATGAGTCCACAAAAAAGGCAA
GTTATGTAGATACTGTAAATAAAAAAACTGGAGAAAAGAAAAATATATATACACTAAGTTTTTATGATAA
AGAGTTTACAATGAGAAAAAATATAAAATATAAAGATTATGTTGTTGAAAATAAAGAAAAAAAACTATCA
ATAGGAAACTATACTTTTCCAATAAAGATAAAAACGAGTACTTTTTATGAAACAAAAAAGGTTGAAGTAA
AAAGGAATAAAGAAGAGTTAAAAAAAGAATTATCTGAAAAAGCTTTAAAAGAGTTAGAATACATAATCCC
AGCTTCGGCTAGAATAATAGATGTAAAACATAACTTTAAGGTTAATAAAAATATGTTAGAATATTTAATA
ACAGTTCAAACTAGTGAAAATATTGCTAAAATTTATCCTCTTAGTAAGTCAGAAGCAGAAAGGTTTATAA
AGGAAGAAAGTAAACCAGATGAAGGTGAAGAGGAAGTTCCTTCCAATCCAGAAAAAAGACCATTAAATGA
TATAAGAAATGAGTTTGATGAGGATAATAAGGATAATAAAGACCAAAACAATTCTGATGAAAATAATAGT
AATCAAAATAGTAATAATAGTCAAAATAATAATAGCAATAACAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c2735428-2735186 hypothetical protein CDR20291_2335 [Clostridium difficile R20291]
ATGCTTATGTTAGAAATATCCACTGATTTACAAGTAAATCAACCAGTTATTACTGTTACAAGTAATACGT
TTATTAGTATAGAAAATTATCTATCAATATTAGAATATGAAGTTGATTTAATAAGAATAAAGACTAAAGT
TAAAACAATTAAAATATCTGGGGATAAACTTTCACTTAAGTATATTACTGATAGTGAGATAGGTATAAAA
GGGATTATCTACAATGTTGAGTATGTTGATTAG
>ref|NC_013316.1|:c2736198-2735635 putative sigma 54 modulation protein [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAATAATAGTATCTGGGAGACAAATGAAATTAACTGACGGAATAAAAGGATACGTAGATGGAAAAT
TAAGTAGGTTAGAAAAATACCTTGATCCTGAATCAGAAGTGAAAGTAACAGTAAGTGCGAAAAAGGATAG
ACAAAAAGTGGAGGTTACAATAATTCCTATTAACGGTCAAATAATAAGAGCAGAAGATGTAGAAGATGAC
TTATATGCAGCAATTGATATTGTTTGTGACAAATTAAGTAGACAAGTTGTCAAATATAAAACTAAAGTTA
AAGACAAAGTTCAAAATAATAAGAGCATAAGATTTGAAAATCTTGACTTTATAGATAATAGCAGTGAATT
TGATGATTATGATTATGATGATGAAGAAGATGAAAATATAGTAATAGAAAGAAGAAAGAAATTTAATGTA
AAACCTATGAGTTCTGAGGAGGCGATACTTCAAATGGAACTAGTAGGACACAATTTCTATATGTTTAGAA
ACCAAGATAATTTTGAAATAAACATAGTGTATAAGCGTAAAGCTGGTGGATATGGTTTAATAGAACAAGA
TTAA
>ref|NC_013316.1|:c2736888-2736391 probale sensory protein [Clostridium difficile R20291]
TTGATTATATCAGTAAAAGAGATTAGGAATTTTTTGATAAACATATTTATACCACTAATAATAGGTTACT
TAAGTAGCATCTTAACAATGATTATCAGTGGAACAGATATTTCAACCTATTATTTACAACTCACAAAGCC
AAGCTTTGCACCACCAGCTTTTATCTTTCCTATAGTTTGGACTATATTGTACATATTGATGGGTATATCT
TCATACCTAATATTAAGAAAGGGTTACAACTTACCTAAGGTAAGAGATGCAATTTTTTATTATGGATTAC
AACTTGTATTAAACTTTATTTGGAGTATACTATTTTTTGGATTTGGACTTAGATTTACAGCTTTGATAGA
TATAATAATAATGATTTTGGTTTCTATAATAATGATTTCGAAGTTTTCTAAAATAGATAAGAGATCTGGA
TACATAAATTTGATTTATTTAATGTGGCTTGTTTATGCAGGATTTTTGAACTATTTTATATGGTTTATTA
ATAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2737442-2736999 putative tRNA binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTCCCTTAAGCAAAAGTTACAAGAGGATTTGAAATCTTCGATGAAAAACAAAGATACAGTGAGAAAAT
CTGTAGTAACTTTAATAAGAGCTTCTATAAAGCAGTATGAGGTTGATAATAGGGTCGAGCTTGATGAAGA
TGGAATTATCGATGTAATAGCAAAACAATTGAAGCAACGTAGAGATGCATTAGTTGAATTTGAAAAAGCT
GGAAGAGAAGACTTAATAAAAGAAACAGAAGGTGAAATTGAAGTTTTAAAAGAGTACCTACCTCAACAAT
TAAGCGAAGAAGAGTTAGAAGAAATTGTAAAATCTACTATATCCGAAGTAGGGGCAACTTCTATGAAGGA
TATGGGAAAAATAATGTCAGTTATCCAACCAAAAGTTAAAGGAAGAGCTGACGGAAAACTTATAAATAAG
TTGGTAAAACAAAACTTACAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2737651-2737472 30S ribosomal protein S21 [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAGAAGTAAGAGTTAGAGAGAATGAAACATTAGACAGCGCTTTAAGAAGATTCAAGCGTCAATGTG
CAATGTCTGGCATCATGTCAGAAGTGAGAAAAAGAGAGCACTATGATAAGCCAAGCGTTAAGCGTAAGAA
AAAAGCTGAAGCAGCAAGAAGAAAAAACGCTAAGAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2738164-2737814 histidine triad nucleotide-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGATTGTATTTTTTGTAAAATAGCGAACGGAGAAATACCTTCAACTAAAGTTTATGAAGATGATAGAG
TCTTAGCTTTTAATGACTTGAACCCAGTTGCTCCATATCATATATTAGTTGTACCTAAAAAACATTATGA
TAGTTTAATTGATATTCCTGATAAAGAGATGGACATTGTGTCACATATTCATGTTGTTATTAATAAAATA
GCTAAAGAGAAAGGTTTTGACCAAACTGGATTCAGAGTCATAAATAATTGTGGAAGTGATGGAGGGCAAG
AAGTTAAACATTTGCACTATCATATTTTAGCTGGTAAAAAGCTTCCTAATTACGAAGCGGGACAAAACTA
A
>ref|NC_013316.1|:c2739505-2738207 putative radical SAM superfamily protein [Clostridium difficile R20291]
TTGAAAAAAGTAGCTTTTTATACACTTGGGTGTAAAGTTAATCAATATGAAACAGAAGCTATGCTAGAAC
TATTTGAGAAAGATGGTTATGAACAAGTCAATAGTGAAGAGTATGCTGATGTTTATGTTATAAATACATG
TACAGTTACTCATATGAGTGATAGAAAATCTCGTCAATATATAAGACGAGTTAAAAAGAAGAATCCAGAT
GCAATAATAGCCGTTGTAGGATGTTATTCTCAGGTATCTCCAGAAGAAATTTTGGATATAGAAGAAGTAA
ATTTAGTCATGGGTACAAATGATAGAAGAAAGATTGTTGAAGAAATTAAAAAGATAAATTCAAGTAAGAA
AGTTAGTACAGTTGATGACATAATGAAAGTTAAAGCTTTTGAAGAAATAGAAATCAGCCAAACTAATGGA
AAGACTAGAGCATTTATGAAAATACAAGATGGATGTGACAGATTTTGTACTTATTGTATCATTCCTTATG
CCCGAGGACGCGTTAGAAGTAGAGATATTGATAGTATAGTCGATGAAGTGAAAAAATTGGCTAATAATGG
CTATAAAGAGGTTGTATTAACAGGAATACATGTTGCCTCTTATGGAAAAGATTTAAAGGATAGGGATATT
AAACTTCTTGATGTAATAAAACAAATAAACCAGATAGAAAAAATAGAAAGAATTAGGCTTAGTTCTGTTG
AACCAATTTTATTTACAGATGAATTTGTAAATGAAGTTTTAAAGATGGATAAAGTTTGTCCTCATTACCA
TTTATCACTTCAAAGTGGATGTGATGAAACTCTAAAAAGAATGAATAGACGATACACAACTTTAGAGTAC
AAAACTATTGTAGATAGATTGAGAAGTAAAATGCCAGATGTGGCAATAACTACAGATGTAATAGTAGGTT
TTCCTGGAGAGACAAATGAAGAGTTTAAAAAAACGTACGAGTTTTTAAAAGAAATAGAGCTTTCACAAAT
GCATATTTTTAAATATTCACCAAGAAAAGGAACTCCAGCTGCAACTATGGAAAATCAAGTTGACCCTCAA
ATGAAACACTTTAGAAGTGAACAACTTTTAAATTTAAGTAAAGTAAATTTTAATAAATTTGCAACTAAAT
TTATCGGCCGTGAGCTGGATGTTTTGTTTGAACAAAATATAGAAGGCAATAAATATGAGGGATTAACTTC
AAATTATATAAGAGTTGTTGTTGAAAGTGACAAAAATATACAAGGTCAGATATTAAAAGTGAAAATAAAT
GATGTAAAAGATGAATATGTAGAAGGAATTTTGCTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2740265-2739507 hypothetical protein CDR20291_2342 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAGATTTTTTGTTGAAAAAAATAATATAAATCTACAAGATAAAACTTGCACTATAGAAGGTGAAG
ATGTAAAACATATTTCAAAAGTTTTAAGATGCAAACTAGGTGAGAAACTTGAAATATGTGACAAGAATAA
TAATGAGTATATTTGTGAGATAATGAATATAGATAAGAGTATAGTTAATTTAGAGATTTTAGAAAAAGTT
GATATAAATAGAGAATCAGAACTTAAAGTAAGGTTATACCAGGGACTTCCAAAAGCTCCAAAAATGGAAA
TGATACTTCAAAAATTAACTGAAGTGGGTGTAGAAGAAATAATATTAGTTCAAACTAAGAGAAGTGTTGT
TAAAGTTGATGACAAAAAAGAAGATAAAAAATTTGAACGTTGGGAAAGAATAATTTATGAAGCAGCAAAG
CAAAGCAAAAGAGGTAAGATACCAAAATTAAGAGGTGTTTTAAGTTTTAAAGAAGCTTTAGAAGATATGA
AAAAAAATAATGTAAATATTTGCCCTTATGAAAATGAAAGAACAGTTTCAATAAAACATGCACTAAAAAA
ATGTGATTCTAATATAGATAGTGTTGGAATTTTTATAGGTCCAGAAGGTGGATTTTCTGAAGAAGAAATA
GAGCAAATACAAAAAAATAATTGTAATGTTGTATCATTGGGGCCTAGAATATTAAGAACTGAGACAGCTT
CTGTTGTAGCATCAACAATAGCTTTGTATGAACTAAGTGATTTAGGAGGAGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2741231-2740284 putative ribosomal protein L11 methyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATTGGATAGAAGTAACTATAAAAACAACAACAGAAGCAGTTGAACCTATAACGAATATACTAT
ATGAACAAGGAGCTGGAGGAGCTGTAATAGAAGACCCAAAAGACTTTTTATTCCAAAAGAAAAATGAACT
AGACTGGGATTATGTTGAAGAAGAAGTATTTAAAAAGAATGAAGAAGATGATGTTCTTATAAAAACTTAT
GTTTCTGAAGAAAAAAATGTGATGGAATTTGTCGAAATAATAAAGCAAAAAGTTTTAGGATTAAAAGATT
TTGGTATAGATATAGGTGAAGGAAGTGTATCATTGGACCAAGTAAATGAAGCTGATTGGGCAAATGCATG
GAAAGCATACTACAAACCAACAAAAGTAGGACAAAGGGTAGTAGTAAAGCCTACATGGGAAGATTATGCT
ATGCAAGATGGGGATTTAATCATAGAGCTTGACCCTGGAATGGCATTTGGTACAGGGACACATGAAACTA
CTAGTATGTGCATTAGAGAATTAGAAAAGTATGTGAATAAAGATTCTAAAGTATTTGATATTGGATGTGG
TAGTGGAATCCTTGCAATAGCAGCAGCTAAATTAGGAGCAAAAGAAGTTGTAGCTGTAGATTTAGATGAA
GTGGCTGTAAAAGTTGCAAAAGAAAATGTTCTTGAAAATAAAGTTGAAAAAAGTGTATCTGTAATGCATG
GTAATTTAACTGATGTAATAAAAGATAAAGCGGATGTAATAGTTGCAAATATAATAGCTGATATAATAAA
GATACTTGCAAAAGATGTTCAAAACTTTATGAAAGAAGATGCTATATTTATATCTTCAGGTATAATTTTG
GATAAAGTAGAAGAAGTTAAAGAAAGCTTAATTGAAAATGGATTTGAAATAGTTGAAGTTCAAAAATTAG
GTGAATGGTCAGCAATAGTTTCTAAGCTTAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2744080-2741672 putative ATP-dependent helicase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATATCATGCAAAAAGAAATATTAGCTAAGTCATATAATTTAAGAACTAATCAACAAGAACAAA
CATTAGTTGAACATATTAAGGATTTATTTGAAGTATTAGAATCTATATTAGAACTAAATCTATATTCAGA
TAAAGATGTAGAGATACTAAAAATATGTTGTGCTTTGCACGATTTAGGAAAAATTAATTCAATTATGCAA
CAAAAAATGGAGATTAATAATAAAATATCGTATAGTTGCTCAGAAGAAGAGAGGAAAAAGTTAGAGTCTG
ACAAAAAATCTTTAAAAAAGATAGCAAGACACAATATATTTTCTGGAGCATTTTTAAAAGATATATTAGA
AAAAATGAACTTGTTAGAAGAAGATAAGTTATATATATATAAAAGTATAATGTTACATCATGGAAACTAT
GAAGATTATATGAGGTTAAGTACTAGTAAAGTTCAAGAAGAAATTTATGATTATATTGAAAAAGGCATTT
TAGAAAAAGAAGAGTTTAATCTGAAAGATATAGAAAGTTATATAAATGACATTTTAAATGTAGATTTTAA
ATTTGGTGAAGATGTATTGGATTATGATTACATAGATAAATTAAGTGAAAGTATGTTTATAGACAGTGAT
TATAACAATGGTCAAATAGATGATTCAGTTTTAAATTATAGAAAGTTTAAGTATATTTTATATAAAGGGA
TGCTGAACTTAATAGACCATAGTGCATCAAGTAGACAGAAAGGTATAAAATTTTATAACGATTTTACTGA
TGAAGAAATTGATGATATGATTTTAAATGAGATATATAAGAGTCAGGGTAATTTAGAAAAAAATAATATA
GAGTTCAATACTATACAAAAAAGGTTGAGAGAACTTTCTGGAAGAAATGTTCTGACTGTTGCATTTACAG
GTTCAGGAAAAACAGCTGCAGATTATAGAAAGACTTTTAAAAGAAAATTCTTTTTAGTGCCAAATAAAAT
ATCAGCAGAAAGTTTTTATAGAAAAAATATTTTTCAAAATAAAAATGATTTAGATACAAGAAGTAGTAAT
GATTACATTGGATTACTTCATGGAGATATAAACTTATATTCAGAGAATGAAGATAATGGAGAACATGATT
TTGTATTGACATTAAGGGATATAGATTTGAGTATAAATTTTTGTAAACCTTGTGTAATTGCAACAGTTGA
CCAGTTATTACTTAGTATGTTTAAATTTCCGGGATATGAAAAAATATTCGCAGCCGTAAAAAATGCATCT
ATAACTGTTGATGAAGTACATTTATTGGAACCAAAGATGTTTTTGATTTTGATATATTTTATGCAGTTTG
CATGCAAGTACTTAGATGTTGATTTTCACTTAATGACAGCTACACTTCCAAAATCATATAAAGAGCAAAT
GATAAACAAGGGAATTATTTTTCAAGAAGAAAGTAATGAAAATGTTACTGATAAAGGAGAAATAGTTTTT
ATTGAGAGCAACAAGGAAGAAGAAATTTGTGAAGGTAAAGATGTAAAGGTTTCTTTTATAAAGGAAAAAG
AAATCAAGTCAATAGTTGAAGGTGCTTTAGAAAATAAACAAAAAATTCTTATAATAAAGAATACTATTGA
TTCAGTCAATAGAACATATGAGTTTTTAAAAGAAAATTTATCTGATAAGTATGGTGGTGTAGATATAGAT
GTTTTACATAGTAGATTTAAGTTCAAAGATAAAAAAGAGAAATATAGTAAAATATTAAATGGAGAGGGTG
ATATTTGGATATCAACTCAATCAGTAGAAATATCCTTGGATTTGGATTTCAATATAATAATAAGTGATTT
AGCAACTATGGATAGCTTAATACAAAGAATGGGTAGATGCAATAGAAATAATAAATATGAATATGGAAAC
TTTTATATTCTACCTAGTGAAGATAAAATTTATGATAACAAACTTAAGAACACAACTAAAAACATCTTAA
AGGACATATTAAAAACTAACTCTATTTTTACAATGGGGATTAGAAAAACTATTTTGGATGATTACTATGA
TAATAGTGTAGTTAAAAACTATTTTGAAGAGAATTTTATAAGTTGTGATAAAGAAATTAAGAATATTTAT
GGTATAAATAAAGAAATTTTTGATGGATTGGATTTAATTTTTAATTTTGAACCTTACAAAAATATTGTTG
ATAGTAAGAAGGAAGCAGCTAAAATTTTTAGAGATGTTGATGTTAGTTACAAAATTATTCTGGAAGAAGA
TTTTTATAAGGAAGATAGGGAGTTACAACAAGATTCGATTCAAGTATCAGGGTTTATATTTAATAGATTA
TATTATTATGGATTAATAAGCAAAGTAGAAGGATACATGGTACTAAAATCTAGTAGTAAGTTTGAGTATA
ATAGTACTGTAGGCTTAATTTTGAAGTGA
>ref|NC_013316.1|:c2744913-2744107 hypothetical protein CDR20291_2345 [Clostridium difficile R20291]
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AATATATAAGTACTTTAAATTTACCATCTAAGACCACAATAATGGGAATGATAACGTATTTATGTGATAG
AAGATTAAACTCTGATATAGATATAGGAATAATTGGAACACATCATCATAGAGAACTAGAATTTTCAAGA
GGAGAGAACATTGATTTTTGGAATGAATATACAAATATGAGAAAAGGCAAAGATAAAGAAAAGTTTTTGC
TTCAAGGAAACTACTATGATTACTATAAAGAACATAAAGCTCAAAATAGCATATTAAACTATGAAGTTCT
TAAAGAAGTAGAACTGACTATATTTATTTCTTGCAAGGATGATGAAGAACTTGAATTTATTAAAAAAAAG
CTTGAAAGTCCATGTAAATATGCAAATTTAGGAAGAAAAGAAGATTTTGTAATACCAAGTGAAAAAGGGT
GTTTTGTGAAAGAAGTTGAGTTAAAAGAGGTTATGCCTATGAATACTCGTGATGCTATAAAAGAAAATAT
AAAATTAAAGAATACATATGTAAGAGTTGACTTAAGAGATAAAGAGAATGTCGAGACTATAATAAATCAA
GGTGTATTGATTGCATTACCTTATAAATATAAAGATTTAGAAGCAAATAGAGATGATAGAGTTTATGAGT
TTTGCCATTATATATATGTTGATAATGATGGTATATATCCTAAAAATATTAAGGTAAATGTATGTAATGT
ATGTATTGATACAAAAGAAGTTTTTACATGGCTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2745942-2744929 hypothetical protein CDR20291_2346 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGAAAAAAGAGTAAAAGGAGTAACATTAACTATACTGACAGAAAGCCCAGTTCCACTTTCATATG
ACCAAGGGTATGGAAATTATACACCAATAAAAAAAGAACAATATAGAGAAAAAATACATGCAAAAACTAG
TATAGCCACAATAACATATGATTTAAGAAGAATGCTCCACCAAGAATATGGTTGGAATTTAAGTAATATT
ATTTTTGGGAAAAAAGGAAATATATATCCATCTATTAAGCAAAATGTAGGATGTGTAGATGAAAATGGAT
TAGAGACTGATGTATTTGGTTATTTGATACCACTTAAAGATAAAGGTTCTATAAGTAAGGCTTCTCCGCT
TAGAATAATACCTTTTAGGTCATTAAATTCATATAGAGGTTCAACACAGTTGATAACAAATAGAGGTTTT
TTAAGTAGCGAATTTGGTAGAAAATATTATGATGAGAAGGAAGAAAATGAAGTACTTAGAGATGAAAACT
TTCCAACATCACAAGCATTAGCAATAGAAGAGACTTTATCAGATTACTACGTTTATACAATAACATTGGA
GCTTGATAGAATAGGAGTAGTAGAAGTAGAAGATGGAAAGTTGCTTTTACCAGAAGAAAGAAAATTTATG
AGTAAGGAGTTAAGAGAAAAAGCAGTAAAAGATATATTAGATGCAATTACTGTGTTTACAAGAAACATAA
AACATTCATCAGTACTGTTAAAACCACTTGCAGTAATGGGTGGAGCTTTTGATAAAGTTGTACCGTTTTT
TTGGGATGATGTAGATTATAATGCTGATAGTGGTGAGATAAATTTAGAGGGAGTCATAGAAACTATAGAA
AGTTATAGCCTTAAAGAAAGTAACACAATACTTGCTATCAATGACAAATTAAAAATTTCTAATAAAAAGG
AATTAAATAAGTTTAATTTAAGTAAATACCCTGTAAAAGAGATTAAAAATCTAGCAGATAGATTGGAAAT
TGGAGAAGATAATATGTGGTATTTAAAAGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c2747437-2745962 hypothetical protein CDR20291_2347 [Clostridium difficile R20291]
GTGAGAGAAATAAAAGCTAAATTTTATAGATCAGGTGATATTGTAAGAGATATTGGCATTGTTTACTTTT
ATGAATTACTAATGGATTTAAAAAACGAACTAGAAAAAAATGATTATAAGCTAAAATTTACTTGTGAGTT
AAATAGAAATTATTTATCTTTAGAATCTGCAGAATATATAGACCCTAAGTATATATCTGATTATATATTA
GAAAATCAACTTTTTAAGGTATTTAAAAATGGGAAAAAGGAAACCTTAGAAAAAATATTTAGTAATATAG
ATAATTTAACGTATGTAAATTTTATTGAAGAATTAGATAAATCTTCTGCAACTGAGAAACAAAAGGAAGG
GATTAAAAAAGATTTTAAAAACAGAAGATTTCCATATGTTAGAAATAGTGGTAAGTATGGATTAAACACG
AGTTTAGAAAATATGGAAACAAATGTAAAAAGAATAGTAGATACTGTAATTAAATCAAATATAGAGATAG
ATGAAATAGATAAACTTGATTTGACACAATATGAAGAAAAAGATAGTGTATGTAATGTTTGTAATATAAA
TAAAACAACAAAACTAGATATTGATTTAAGAGAGCGAAAGGACTCTAAGTATAACTTTTTATTTAGAGGT
GCAGAAAAATCAGGCTTTAAAAGAAGTGGACAAGTTGAAAGTAATATTTGTTTTGAGTGTGAATTTTTCA
ACTTAATGTGTCTTTTATATATAAATTTAAAAAGACCAATGGTTTTTGCATATACGAATGATTTAAGGGA
ATTAGCATTTTTAAATCATAAGATAATGCTTAAAAGAAAGATGTATTCAGATAAATCATTTTATAAAAAA
CTTTTGCATGAAAAAATAAGTTCGATTAGACTATATAGGTTTGATATTGATACGAATAAAGGTATAATTC
TAAAGTTTGACTCTATTATAGAGTATAAAGAATTATTAAAAAAAATTGAACTTATAGATATTATAGATAA
TTATAATTTTTCAAGAGAGCCAGGGAATACTAGAAATTTGGGTAAAAAAATGATTGATAATGGGAATTTA
TCAAATTTAAAAGAATTATTACTTGATAATATAAGTGTTTTAAGGCAACTAACTGGAACTTCTCGAGAAA
TGGATTTTGTATCTAGCTCATATAATATCGGTTTATATATAAAATTGTGTTGGATTGTAGATGGAGGGGA
GGAGTATAAAATGAAAAACTATATGGAAAGTAATTTAATATATTCAAGAGTAGGTAAAGACTTATTTAAT
AAAATGACAGATGAATCCAGAAGAAAAAATTTTTCTATGAAAGTGATTCAACTACTTAAGTCTAATGATA
GAACTCAGCTATTTCAAACTATAATGCATGTGTTAGTTTCTAATGGAATCTTAATAGGAGAAGGGTTTGT
AGAAGGTCTAATGCAGAGTTCTGAATTAGAATTAAATACGAATGTAGGTCTATTTATTCAAGAAATCATG
AAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2748179-2747442 hypothetical protein CDR20291_2348 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCAGAATTTCAATTTTTATGGAGTCATGTAATGGCAAATTTCCAAATGAAAATTCAATGTTGTCAG
TTTCCTTTATAAAAAATATTTTAAATGCAGAAAACAAAGATTTTGCTAAAAATATATTTAACTATGGGGA
AGAAAGAAAAAACAATAAGCAAATAAAGGATATAAATACAGCCATCTACATACCAAATCTTATAAGAAGC
AAAAATGAGTTGCTTGTTGATGGAGATATAATATTCAATATAAGTTTTTATAATTATTCTATGTTCAGTA
AATTATACAATGGAATTTTAAAAGTAAAGGAGCTAGAATATAAAGGTTATAGATTTAAAATAAAAAATAT
AAAAATACATAAAGAACACGAGATAAAAGAAAATGGTGTTATATTTAAAACTATGTCTCCTATAATAGTA
AAGAATAAAGAAGGTAAATATTTAGATGTAGAAGATTCAAATTATATAGAATGTTTAAACTATATAGCTA
ATCTAACTCTGGAGAGTATAAGAGGTAGTGGGCTTAGAAAGCCATTGGAATTTATACCTCTTAACTTCAA
AAAAAGAGTGTTAAAAGAAAAGATTCGTGGATTTAAAGTGAGAGAATATTACTATATAAATGCTTATGCA
GGAACATTTTTTTTAAAAGGAAATATGGAAGATTTAAATGCACTGTATAAAATGGGAATTGGATATAGAA
GGACGGAAAATGCAGGAATGGTTGATATATTAAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:2748438-2749547 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAGAAGTAATTTTAAAAAATATATCAAAACTTTACTCAAATGGATTTAACGCAGTAAAAAATATAA
ATATAGACATTAAAGATAAAGAATTTATCGTTTTAGTAGGACCATCTGGTTGTGGTAAATCGACTACACT
TAGAATGATTGCTGGTCTTGAAGAAATCTCTGAAGGAGAACTATACATTGGAGATAAACTTGTCAATGAT
ATAGAACCAAAAGATAGAGATATAGCTATGGTTTTTCAAAACTATGCTTTATATCCCCACTTATCTGTTT
ACGAAAACATGGCATTTGCACTTAAACTTAGAAAATTGCCTAAAGATGAAATAGACAAAAAAGTTAAAGA
AGCTGCTAAAATATTAGACTTACTACCTCTTTTAAATAAAAAACCTAAAACATTATCTGGAGGACAAAGA
CAAAGGGTTGCCTTAGGACGTGCAATAGTTAGAAATCCTAAGGTATTCTTAATGGATGAACCTCTATCCA
ACTTAGATGCAAAACTTAGAACTGCTATGAGAACAGAGATAACTAAGCTACACCAACAGCTTGGAACTAC
ATTTATCTATGTAACACACGACCAAGTTGAAGCTATGACTATGGCTGATAGAATCGTAGTAATGAAGGAT
GGAGTAGTTCAGCAGATTGCAACTCCACAAGATGTATACGATTATCCAGCTAATATATTTGTTGCAGGAT
TTATTGGAGCACCACAGATGAATTTTATTGATGTAATATTAATAGAAGAAAATGATAAAATTTATGCACA
AAATGAACATATTAAGCTTAAATTGAATAAAGAAAAACACTATGATTTAATAAAAGACAATTATATTAAT
AATGAAGTTGTTATAGGTATCAGACCAGAAGATATTCATGTAGAAGATACTTTTATTAAATCTAATCCAG
ATACTTGTTTTAAATCAAGAATTGAAATAAAAGAACTTATGGGAGCAGAAACTTATGCTCACTTAAAACT
AGGCGAAAATACGATAACAATTAGATTTGACAGTAAAAACAGAATTAATGTTGGTGATGACTTAACACTT
TCAGTTGACAATAGTAGAGTACACATATTTGACAAAGAAACTACTTTAGCTATAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:2749577-2750344 hypothetical protein CDR20291_2350 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGAGTTAAAAGATTTTTTAGAAAGACAGCTTAATAAAAAAATAAATATCTATCCCTATGAAAACC
AAAAGTTAGATGCTAGTAGCCATTTAGTTACTTTCAATAATGCTATTTATGTTATTGATTTTCTAGATAA
AAATAATCTTGATAATTTAAAAGGCAACTTTTATTTAATTTACCAATCTCATATAGACTTTGAATACCTA
AAAAATATTTTTTATAATTTATTTGAAGATATAAATATAATACAACACAATGGTTTTTTTATAGTAAATT
CTAAATATAATTTAGATATTAATGTAACTACACAAAATATAATTGAAACTGAAACTTATCAAAGTACTTA
TATTTTTTATCTTGGTGAATTAGATAGTAAAGCTGATTTTTATTTTAGATTACAGTTATGTTCTGATTTA
CTACCTCATATTATAAAAGACAATGCTGAAAATAAGTTTTTAAATTTGTTTGACCTTATTAGATATAAAA
CTTTAGATTTAATTAATGAGGATAATATACTCAATAAATTAATAGATTTTAATAAGATTAAATCTATTGA
CGAAGAACTTCTATATACAGGAATAAAATTTATAAATAATGATTTAAATATTTCTAAGACATCTACTAGT
ATGTTTTTACATAGAAACACGCTAGTATATAGATTGGAAAAGATTAATGAGATACTTGGGTTTGATTTAA
AGAATTTTGAAAATGCAATGATTTTTTATCTAAGTGTCAAATCTTATTTTCTCTATAAAAAAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2751905-2750532 putative transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGGGTAAAACAAATGCTAGAAGAACGCTTTTTTTGATAGCAATAGGTTCAGGAACTATGCTGAATCCTC
TTAATTCTTCTATGATTTCACTTGCTTTACATAGTATACAAAATGATTTTCATATTAGTTTTACAACTGT
ATCTTGGATTGTTTCAGCATTTTACCTAGCTAGTGCTATTGCACAACCAGTTTCAGGTAAGATAGGAGAT
TTAATAGGTAGAAAGGTCTTATTTTTGAGTGGTTTGATGCTTGTAATTTTATCAGCATCCATAGTACCAC
TTGTTCAATCATTCTTTATATTGATTTTTATAAGAGTAATTCAAGCAATTGGAACAAGTACCCTATATCC
ATCTGGAGTTGCTCTTATACAAAATAATATAAAAGAAAGACAATCTTCTGCATTAGCAGTTCTAACCATT
TTTGCTTCAACTACAGCAGGATTAGGTCCGACACTTGGAGGATTATTGTTGGACTTAGGAGGATGGCATG
CTATATTTCTTGTAAATATACCTGTTGTTTTGGTTTCTATATGCTTAGGGTATTTTTTATTCCCAAAAGA
AGTAAAAGAAAAGAAATCTATAAAAGAAACTTTAAAAAATGTTTTGTCAAGATTAGATATTATTGGCATA
CTTCTATTTTCAATTGCAATGATTTTTATATTACTATTTTTGCTATCTATGAAGGAATCTTTTAACTTAG
AACAACTTGTATTTGGTATAATACTGATGTGTCTTTTTATTTGGCATGAATTGAGAACAAAATTGCCATT
TATAGATATTAAGCTTTTTGTAAGTAATCCTAAATTGTCAAAAGTTTACTTGCAATTTATTATATTAAAT
TTCTTTAATTATATTTTGTTTTTTGGTCTTCCTAGTTATTTTCAAGATGCCTTACATTATAGTGCAAAGT
CGACTGGATTATTTATGCTATTTATGTCTGGTATAGGTATATTTATATCTCCATTAACTGGAAAATGGAT
AGATAAATCTGGAACTAGATTTCCTCTTGTTACATCATCAATCTTTATGTTTATTAGTGCAGTACTTCTT
TCAGTAGTTTTTATCCATATACCTGTAATAGGAAAGGGTATTATATTATCATTAGCAGGTATTAGTTATG
GAGTTGGTAATGTAGCCCTGCAATCCTCTATGTTTGAAGAAAGTCCTCGTGACAGTATAGGGACAGCTTC
TGGTCTGTTTCAAACTAGTCGTTATTTAGGTTCTATTTTAGCAACTGTTTTACTTGGAATGGTATTTGAA
GGAAATATAACATCAGAACAATTTCAGATATTAGGTTATGTTATGGTGGTCTTAGGTACAATAAGTTTTT
TATTAAATTTTATATTAAAGAAAGAATTAAGAAAAGTAGAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2752876-2751941 glucokinase [Clostridium difficile R20291]
ATGTATTATATAGGTGTAGACATAGGAGGAACAGGTATACAAGCAGGAGTAGTTGATAACTATGGGAAGA
TAATTTTTAGGTCAGAGTGTAAAACAGTAATTGAAAAAGGCTTTGAAGGAATACTTAATGACATAAAAAT
AATGATTTATAAGTTGTTGGAAGATAATAAACTTACTATGAGTGACATAAAATCTATTGGATTTGGTGTT
CCAGGTTTTATAAATAAAGAAGGATTAGTAACTTGTGTAAATTTAAAATGGAATAAAAAAGCTTTTAATA
AAGAGTTAAAAAGAAGATTTCCAGATGCTGAAATTCATGGAGAAAATGATGCAACAGTAGCAGCACTTGG
AGAAGCAAAGTTTGGAAGTATGAAAGGTGCTAATGTTGGAGTATTATATACTTTAGGAACTGGTGTAGGT
GGAGGAATAGTAATTAATCAAAAAGTCTTTTCTGGAGCACATGGATTGGGTTCAGAAATAGGTCATCAAA
TTATAGGAGAAAACTATTTTAATTGTAATTGTGGAAATAATGGTTGTGTAGAAACTTTTTGTTCAGCAAC
TGCAATTATAAAGTATTCTCAAAAACTGATAGAAGAAGGAGAAAAGAGTAGGATTTTAGATTTGGCAGAG
GGAAATTTAGAAAATGTAAATGCAAAGATGGTGTTTGATGCATATAGAGAAAATGATTTAGTGGCAATTA
AAGTAATAAATAGATTTAAAGATTATTTAGCAAAAACTTTTGCAAACACAATAAATTCTTTAGACCCAGA
AATTATATCTATAGGAGGAGGCATTTCTAAATCTAGCGATATAATACTTGATGGAATAGAAGATTTGGTA
AGAAAATTTGTATTATACAAAACAGAAGATATAGCTACAATTACATGTGCAACTTTAGGTTCAGACGCAG
GAATTATAGGAGCAGCTTTTTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2754996-2753842 chaperone protein [Clostridium difficile R20291]
TTGAGTACAAAAAGGGATTATTATGAAGTCTTAGGTATCAGTAAAGATGCAGAAGCTCAAGAGATAAAAA
AAGCTTATAGAAAATTAGCAATGAAGTACCATCCAGATAGAAATCCTGGAGATAAAGAGGCGGAAGAAAA
ATTTAAAGAGATAAATGAAGCTTATGAAGTTCTATCTGATGATACAAAGAGAAAAACTTATGACCAGTTT
GGACATGATGGATTAAATGGTCAAGGTGGTTTTGGTGGTCAAGGAGGATTTGGCGGTCAAGGCTTTGGTG
GTTTTGAAGATATGTTCGGAGATATATTTGGTGACATGTTTGGAGGAAGCTTCGGAGGTGGAAGAGCAAG
AAGAAGAGGGCCTCAACGTGGTGCAGATATAAGACAGAGTGTTACTATATCTTTTGAAGAAGCTGCATTT
GGTAAAAAGATGTCTATAAAAGTAAATAGAAGTGAAGAGTGTGAAGAATGTAATGGAACTGGAGCAAAAC
CAGGAACATCAAAGAAAACTTGTTCAACTTGTAATGGAACTGGCCAAGTTAGAACTGTTCAAAGAACTCC
ATTTGGTAATATAGCAAGTTCAAGACCATGTAGTGCCTGTAATGGAACTGGAGAAGTGATTGAATCTCCA
TGTAGTAAATGTCATGGAACTGGAAATACAAGAAAAGTTAAGACTATAGAAGTAGATATACCTGCTGGTA
TAGATGATGGTCAAATGATAAAACTTTCTGGTCAAGGTGAAGTAGGAGAAAAAGGTGCTCCAAGAGGAGA
CTTATATATTGTAGTTAATGTTAAGTCACATCCACTATTTACTAGAGATGGAAATGATATTTATTTTGAA
ATGCCAATTACATTTGTTCAAGCAACTTTAGGTGATGAGATAGAAGTACCTACTTTGGATGGAAAAGTTA
AATATAGTGTGCCAGAGGGGACACAAACTGGAACTGTATTTAGACTTAAAGAGAAAGGAATCCCTAGAAT
TAGAGGTAATTCAAGAGGAGACCAATATGTTAAGGTTGTAGTTGAAATTCCTAAAAAATTAAACGATAAG
CAAAAAGAACTATTGAGAGAATTTGCGAAGGAGTGTGGGTCGAACGTCCACGAAAAGAAGAAAACCTTCG
GACAAAAGATAGAAGATATGTTTAAGAAAAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c2757054-2755207 chaperone protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAAAAATAATAGGAATAGATTTAGGAACAACAAATTCATGTGTTGCAGTGTTAGAAGGTGGAGAAG
CACAAATAATAGCAAATAGTGAAGGTATGAGAACTACTCCATCAGTAGTAGCATTTACAAAAGATGGTGA
GAGAATAGTTGGAGAACCTGCAAAAAGACAAGCAGTTACAAATGCAGATAAAACAATAACTTCTATAAAA
ACTCATATGGGAACTGATTATAAAGTAAATATAGATGGAAAATCATATACTCCACAAGAAATATCAGCAA
TAATATTACAAAAATTAAAATCAGATGCAGAAAGTTACTTAGGACAAACAGTAACAGAAGCAGTTATAAC
AGTACCAGCTTACTTTACAGATGCTCAAAGACAAGCGACTAAAGATGCTGGTAGAATAGCAGGGCTTGAT
GTTAAGAGAATAATAAATGAGCCAACAGCAGCAGCTCTTGCTTATGGTATGGATAAATTAGACCAAGAAA
AGAAAATATTAGTATTTGACTTAGGTGGAGGAACTTTTGACGTATCTATACTTGAAATAGGAGATGGAAC
TTTTGAAGTTTTAGCTACAGCTGGTAACAATAGATTAGGTGGAGATGACTTTGACCAAATAGTAATAGAT
TATTTAGCAGATGAATTTAAAAAAGCTGAAGGTGTAGATTTAAGAAATGATAAAATGGCTCTTCAAAGAT
TAAAAGAAGCAGCAGAAAAGGCTAAGAAAGAATTATCATCAACAATGAGTTCAAACATAAACTTACCTTT
CATAACTGCTACAGCAGAAGGACCAAAACACTTAAATATAGATTTATCAAGAGCTAAATTTGAAGAATTA
ACTAGAGGTTTAGTTGAAAAAACTATGGAACCAACTAAGACAGCTTTACAAGATGCAGGACTTTCTACAG
GTGATATAGATGATGTATTATTAGTAGGTGGTTCTACAAGAATACCAGCAGTACAAGAAGCTGTTAAGAA
GTTTATAGGAAAAGAACCTCATAAAGGTATAAACCCAGATGAGTGTGTTGCAGCAGGTGCTTCTATACAA
GCTGGAGTTTTAGCAGGGGATGTTAAAGATTTATTATTACTAGATGTTACTCCATTATCTCTTGGTATAG
AAACTATGGGTAATGTAATGACTAAGATAATAGAAAGAAATACTACAATACCAACTAAGAAGTCTCAAAT
ATTCTCAACTGCTGCTGATAACCAAACAGCTGTTGATATACATGTTCTTCAAGGTGAAAGAAGTATGGCT
TATGACAATACAACTTTAGGAAGATTCCAATTAACAGATATACCACCAGCACAAAGAGGAATACCTCAAA
TAGAAGTTACTTTTGATATAGATGCAAATGGTATAGTTAATGTTTCAGCTAAAGATTTAGGTACAGGAAA
AGAGCAAAAAATAACTATAACATCAAACACTAATTTATCAGAAGCAGAAATAGAGCAAAAGATAAAAGAA
GCAGAAATGAATGCAGAAGCTGACAAACAAAAGAAAGAAAAAATAGAAGCATTCAATCAAGCTGAATCTA
CTATATATCAAACTGAAAAAACTTTAAATGAACTTGGAGATAAAATAAGTTCAGGTGAAAAAGAGGATAT
AGAAAAAGCTATAGCAGACTTAAAAGCTGTAAAAGATAATCAAGATGCTACAGCAGAAGAACTTAAGAAA
GCTACAGATGAAGTAATGACTAAGTTCCAAAAAGTATCTCAAGAAATGTACCAAAAAGCAGCTCAAGAAC
AACAAGCGGCACAAGGTGCAGAACAAGCACAAGACAATGGACCTAAAGATGACAATGTAGTAGATGCTGA
CTTTAAAGAAGTAGATGAAGATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2757766-2757146 heat shock protein [Clostridium difficile R20291]
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CTCAAGTAGAGTTAGAAGAGGAAGTTGTTAATGAAGAATGTGAAACATCAAGTGAAAAAACTGATGAAAA
AGAAGTTGATGATGAAAATGTAACAGATATAAATTCTAAGTTAGCAGAAAAAAAATTGCAGGATGAGTTG
GATGAATTAAATGATAAATATCAAAGACTTCAAGCCGAATATGCAAACTACAGAAGAAGAACTCAACAAG
AGAAAGAGACAATAGGCGTATTTGCAAATGAAAAAATAATAACTGAGTTGATACCAGTTATAGATAGTAT
GGAAAGAGCCTTAGATGCATGTGAAGATAAGGAAGATACTATGTATAAGGGTATAAGCCTTGTACATAAA
CAATTAATAGACACTTTGGTAAAATTTGGAGTAGAAGAAATAGAAGCAGAATCTAAGGAATTTGACCCTA
ATCTACATCTAGCAGTTATGCAAGAAAGTGTAGATGGAGTTGAAGCAAATCAAATAGTAATGGTACTTCA
AAAAGGATATAAGCTAGGAACTAAAGTTGTAAGACCTTCAATGGTTAAAGTTTCTTGCTAA
>ref|NC_013316.1|:c2758842-2757796 heat-inducible transcription repressor [Clostridium difficile R20291]
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TTAAAGATTATATAGAAACAGCTGAAGCTATAGGTTCTAGAACAATATCTAAAAGACATGATTTAGGTGT
TAGTGCTGCTACCATAAGAAATGAAATGGCTGACCTTGAAGAATTAGGGTATTTAATTCAGCCTCATACT
TCTGCGGGTAGAGTTCCATCTGAAAAAGGCTATAAGTTATATGTAAACTCTCTTATGAGTAAAAGCGAAT
TGGATGATAATGATAAGATTCTTATTGAACAATGTATGAATCATAATATAAATCATATAAAAGAATTGAT
TCATGAAACCTCTAAGCTATTATCGCAACTAACAAACTATACAACTGTAGCAGTTACTAAGAGTTTAATA
AATCAAAGTGTTATAAAGCACATACAGTTGGTTGCTATGAATGACAATAATATTTTACTTATAGTTGTAA
CAGATAAAGGGGACTTAAAAAAAGCTAACCTTACAACTAATGTATATTTAGATCAATCTAAGTTAAATTT
GATTTCTGATAATCTTACAAGGAAGCTTTTAGGTAAAAGTATAACAGATTTGGATGATAATCTAATTGCT
TTTATTAAATACGAAATAAGTGAGTATTCTGGACTTATAGATGAGCTTTTAAATGCTTTGAACTCAAATA
TGAAAGAAGAAGATTTTTCTCTATCATTAAATGGAGCTACTAACATATTTAGTTATCCAGAATTTAATGA
TGTATTAAAAGCAAAGTCATTTTTAAATATGTTGGAAAAAAAGGAAACAATAGCTGACATAATTAAATCA
AAGGGAATACAAAAAGACAATCTAAATATAATAATTGGTAGTGATAATGATTGTGAACTGGCACAGGATT
GTAGTATAGTTACAGCAACTTATAATGTAGATAGAGACTTGGTTGGGCGAATAAGCTTTATAGGCCCTAC
CAGAATGGATTATGCTAGAATTTACTCTATAATAAATTATATGAGTTTATTAATTAATAGAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2760093-2758918 oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase [Clostridium difficile R20291]
ATGCTAGGACTTTATGTACATATTCCATTTTGTGTGAAAAAATGTAAGTATTGTGATTTTAATTCTTATA
AAATGGACATAGATTCAAAAAAAAGATATATAGAAGACTTAAAAATAGAAATGAAATTATATAGTAATAA
ATTATATAAAGATAATAAATATAAAAATAAAGAATGCTGTAGTCTAAATAAAAATGACAAAATAACGAGT
ATATTTGTAGGGGGAGGTACACCTAGTATACTAACATCTGATGAAATAAGAGAAGTATTTATAAGTATAA
AAGAAATGTTTGATATAGATGAGAATGCAGAAATAACTATAGAGTGTAATCCTGGGACATTAACATTAGA
AAAATTAAAAACTATGAAAGAGATTGGCATAAATAGACTTAGTATAGGGCTACAGGCCATTCAAGAAAAG
CATTTGAATTTTATAGGAAGAATACATACTTATGAAGAATTTGAGAAAAACTATAAAGATGCATTAAGTG
TAGGTTTTAAAAATATTAATGTAGATTTAATGTACAGTCTTCCAAATCAAACTCTATGTGACTGGAAGGA
AACTCTTGAAAAAGTTGTACACTTAAATCCAACACATATATCAGCGTATTCCCTTATACTAGAAGAAGGA
ACTGAACTATATAATATGTATGAAAGTAATAAATTTGAGCTTATAGATGAAAATGTAGATATAGAAATGT
ATGAGTATACAATAAACTACTTAAAGTCAAAAGGATATAATCAATATGAAATATCAAATTACTCAAAAGA
AGGCTATAATTGTGAGCATAATATTTTATATTGGGAATGTGAACATTATATAGGGATTGGAGCAGGAGCT
TCTGGCTATATTAATGAGAACAGATACAATAATGTAGAATCTTTAGAAGATTATCATTTAAGTTTGGTAA
AAAGAGAAAAACCAATACAAGAAAATGAAATTCTTTCTGAGAAAGATATGATAGAAGAAAAGATATTTAT
GGGGCTTAGAATGAATAAAGGCATAAAATTTGAAGATTTTAAAAAAAAATTTGGAATAGATTTTAGAGAG
AAGTATAATAAGCAAATAGAAATGCTATTAGCTAGAAAGCTTATAAATCAGAGCTTTGAAGGTATACAAT
TAACTCAAAAAGGAAGAGAAATATCTAATAGTGTATTTATAGAATTTATGGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2761578-2760265 amino acid transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGCATACTCAACTACAAAAGACTATTGGTCTTTCAGCGGCTCTTTCTACTGTTGTAGGTATGGTTATAG
GTTCGGGAGTTTTTTTTAAGCCACAAGCAATATACACTACAACTAATGGAGCTCCAGGTCTAGGTATTAT
AGCGTGGCTTTTAGGTGGTTTTATAACAATAACTGCTGGGCTTACAGCTACAGAAATTTCAGCTGCTATA
CCAAAAACTGGTGGTATGATGATTTATATCGAAGAAATATATGGAGAAAAGTTAGGCTTTTTAACTGGAT
GGATGCAAACTGTATTATTTTTCCCAGGTACATCAGCAGCATTAGGAGTAATATTTGCTCAACAAGCATC
TGAACTTTTAGGAATGAGCCCAAATAATATGGCAAATGTACTTCCTATAGCAATTGGAGTTATACTATTT
TTAGCGTTATTAAATATAATAGGTTCATCCTTAGGAGGAAAAGTTCAGACAGTAGCCACTATTGGAAAGA
TGATACCTTTAATTTTAATAATAGTCTTTGGATTTATTAAAGGTCAAAGTAGTGAAGTATTAAATCCATT
TGTAGGAGATGGTGTAAATGCATCAAATGCACTTGGACAAGTATTAATAGCTACTTTGTTTGCATATGAT
GGTTGGATAAATGTTGGAGCTATATCAGGAGAAATGAAGTCTCCAGAGAAAGATTTACCAAGAGCAATAG
TTGGTGGTTTATCATTAGTTATGGCAGTTTATATTATAATAAATATAGCTTATCTTTGGGTAGTACCAGC
AAGTGAATTAGCAACAGTTACTTCCCCAGCTACATTAGTAGCAACAAGATTGTTTGGAAATATAGGTGGA
AAAGTAATAACTGTGGGTATATTAATATCAGTATTTGGGACATTGAATGGATATTTATTAACAGGTTCAA
GGATACCTTATACATTAGCTGAAATGGGAACTTTACCAGCATCTAAAACTCTTTTAAAAGTAAATTCTGG
AGGTTCTCCTGTAAATTCAATACTACTTATAACTGTGTTAGCCTGTGTATATGCATTATCTGGTCAATTT
AATCTTTTGACAGACTTAACTATATTTTCAATATGGGTATTTTATGTATTGACTTTTATAGGTGTTATGA
GGCTTAGAAGACAAAAGCCAGATTTACACAGACCATATAAAGTCCCTTTATATCCAATAATACCAATTAT
AGCTATACTAGGTGGACTGTTTGTAATAATAAATCAAATATTGACTTCAACAATTATATCTTTAGGTGGA
ATATTTATAACACTATTAGGTTTACCAGTTTATTATTATATGAAAAAAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2763223-2761811 putative poly(A) polymerase [Clostridium difficile R20291]
TTGTGGTATATTTTAAGTAAACTCATAGAGAATATAAGTAAGAATATATTAAAGAAGAATAAAAAGGTGA
TATTTATGATTAATATAGAAATTCCTAAAAAAGTAGACTATATAATTAAAGAATTAGAAACGAATGGTTA
TGAAGCTTATGTAGTTGGAGGATGCGTTAGAGATTGTTTATTAGAAAGAGTTCCAAACGATTGGGATATA
ACAACTAGTGCTAGACCAGAAGTGGTAGTAGAATTATTTGAAAAAACAATTCCAACTGGTATACAACATG
GGACTGTAACAGTTATGATTGAACATGAACCATTTGAAGTGACAACTTATAGAATTGATGGAAATTATAG
TGATGGTAGACATCCAGATTCAATAGAATTTACAAATAACATAGTTAAGGACTTGTCAAGAAGAGATTTT
ACTATCAATTCAATTGCATACAATTCAAAGACAGGATTAGTCGACCCATTTAATGGCTATGAAGATATAC
AAAATAAGTATATACGTTGTGTTGGAAATCCAGTAGATAGATTTGAAGAAGATGCACTTAGAATGCTTAG
GGCAGTTAGATTTTCAGCACAACTTAATTTTAAAATAGCTGAAGGTACTAAGCAAAGTATTCATAAAAAA
GCAGATTTGATAAAAAATGTTTCTATCGAAAGAATCCAGACAGAGTTTAATAAAATATTAGTATCTGATT
CATCTAAATTAAACTTATTAAAATCAACAGGTTTGTTGAAATTTATAATTCCTGAAATATGTGAATTAGA
AGATGTTACTCAACACAATCCATATCACATCTATGATGTACAAAAACATACTTTAATATCTACAGAAGTA
ATTGAAGATGAACTGTATTTAAAACTTACAATGTTGTTTCATGATTTAGGTAAAAAAGTAACTAAAACAA
CTGATAAAAATGGTGTTGACCATTTTTATACTCATAGTAGAGAATCTGTAAAGATTGCAAAGAAGATTTT
GAGAAGACTTAAGTATGATAATTATACTATTAATAAAGTTTTAATATTAATACAATATCATGATTATAGA
ATAGAACCTAAAAGGAAGATAATTAAAAAGTTATTAAATAAACTTGAAGATGTTGAATTATTTGAAGATT
TAATAAAAGTTAATTGGGCTGATACACTTGCCAAAAACCCAAAGTATGCAAAACAAAAGATATTAAATCT
TATTGAGTGTGAAAAAGAATTTAAACATATAATAAATCAAAAGGAGTGCTTTAATCTTAAAGATTTAGCT
ATTAATGGAAAAGATTTGATATCTATAGGTATAAAACCAGGTAAAGATATAGGACATATTTTAAATAAGA
TGCTTGAAATAGTCATAAATAATCCAGAATTAAATGAAAAAGAAATACTAAAAGAAAAAGCATTAAATAT
ATATACATTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2765104-2763299 GTP-binding elongation factor [Clostridium difficile R20291]
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TAGCTGATAGATTAATACAACAAACTGGGCTTGTTAGTGAAAGAGACATGAAAAGTCAATTACTTGACAA
TATGGACCTTGAAAGAGAAAGAGGAATCACTATAAAGCTTCAAAACATAAGATTAATGTATAAAGCGAAG
GATGGAAATGAATATTATTTAAATCTTATAGATACACCTGGACATGTAGACTTTAACTATGAGGTATCAA
GAAGTTTAGCTGCATGTGAAGGAGCACTATTAGTAGTTGATGCAGCTCAAGGTGTTGAGGCACAAACTTT
AGCCAATGTTTATCTTGCTATAGACCAAGATTTAGAAATATTACCAATAATAAATAAAATAGATTTACCA
AGTGCAAGACCAGAGGAAGTAAAAAATGAAATAGAAGATTTAATAGGGCTTGATTCAAGTGAAGCTCCTC
TTATTTCAGCTAAAACTGGTTTAAACATAGAAGATGTTTTAGAAGATATTGTAAAAAATGTTCCTCCACC
TAAGGGAGATAATGAAGCTCCATTAAAGGCATTAATATTCGATTCTTACTATGATGCTTACAAAGGTGTT
GTAGCTTATGTTAGAGTATTTGAAGGAACTGTTAAAAAGGGTATGACAATAAAAATGATGAATACCAATA
AAAAGTTTGAGGTAACTGAAGTTGGTGTTATGGCTCCAGGTCAAACTGAACTTAGTGAATTATCAGCAGG
TGATGTTGGTTATATTGCTGCTAGTATAAAAGATATAAGAAGTTGTCGTGTTGGTGATACAATAACAGAT
TCAAATAATCCTACAGAAGAACCTTTACCAGGATACAAAAAAGCTACTCCAATGGTATATTGTGGTATAT
ATCCAGGAGAAGGAGAAAAGTATGAGAATGTTAGAGATGCTCTTGAAAAGCTTCAAGTAAATGATGCTGC
ACTTGAATATGAAGCTGAGACTTCAGCAGCACTAGGATTTGGTTTTAGATGTGGTTTCTTAGGTCTTTTA
CATATGGAGATAATGCAAGAAAGACTTGAGAGAGAATTTAACCTTGATATAATTACTACAGCTCCATCTG
TTATATATAGAGTTACAAAAATGGATGGAGAGGTTGTAATGATACAAAATCCTGCAAACTTACCAGAACC
ATCTGAGATAAAGATGATAGAAGAGCCTATAGTAAAAGGAGATATAATAGTTCCTAAAGACTATGTGGGT
GTTGTTATGGAGCTTTGCCAGGAAAGACGTGGAAATATGTTAAATATGGAATATATAGATGAGAGAAGAG
TAATGCTTCACTATGACCTTCCTCTCAATGAAGTTGTTTACGATTTCTTTGATGCTTTAAAATCGAGAAC
TAGAGGTTATGGTTCTCTTGATTATGAGGTTAAAGGTTATGTAGCATCTACACTTGTAAAACTTGATATA
TTAATCAATAAAGAACAAGTGGATGCACTTAGTTTTATTGTCCATGAGACACGTGCTTTCCCTAGAGGAA
AGGCAATGTGTGAGAAATTAAAAGGAGAAATTCCAAGACATCAGTTTGCTATACCTATACAAGCTGCTGT
TGGTAATAAGGTTATTGCAAGAGAAACAATAAGCGCTCTAAGAAAAGATGTTCTTGCTAAATGTTATGGT
GGGGATATATCTCGTAAGAAGAAACTTCTTGAAAAGCAAAAAGAAGGTAAGAAGCGTATGAGACAAATTG
GTTCTGTTGAAGTTCCTCAAAAAGCATTTATGTCTGTACTTAAACTAGATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2765637-2765386 hypothetical protein CDR20291_2361 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCCGATTAGAAAAAAATATAGAAAGTAAAAGTAAACTAAGAAAATACAAGTATATTATGAGAATCT
TATTTTTGATTACTATGATTATAGGTACATCAGTTTGTGTATTTATAGTAGACAGTAATGCAAAAAGTAT
GCTAGGAATGAAACAATATGATTTTCCAAGTATTAAATTTGATATAACAAAATTTGATTTTGACATACCA
AATTTTGATATACATGAAATCATAAAAAAATTTAATAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c2766687-2765668 putative stage II sporulation protein P [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAAAAAATGCATTAAAGTAGTAACCTTGACTTTTATATTAGCATGCATTTTACCAGGAAAATCAT
TAGCTTTGAATCAGGATGATTTTTTAAAGTTTTTAGTAAATTCATCTTATCCAGAAGCTAAAGTCGAAGG
AAATGATACAGAAAATAAAAAGAATAATAAAAATAAAGAAACAAGCAAAGAAAATAAGGAAGAAAGTAAA
GAAGAAAACACTAAATCTAAAGATGCAAGTAAAGTTGATAATAAAAAAGAGAGTGAAAAAGAATATATAA
AACTTTATGTTGGTAAAGAAAATGTTCCAGATATTGAGTCAAAAAATTCAGACACAACTGAAACTAACAC
AACATCTAGTTCAGATTATAAGGATGATTTAAGAGTAACCAAAGAAAATCCAAGAATTTTGATATATCAT
ACTCATGGATGTGAGACTTATTCAAATTCACCTGATGGAAATTATCATTCAAGAGATAAGAAAAATTCAG
TAATGGAAGTAGGAAGTGCATTAACTAGTGCTTTAGATAGCAAAGGATGGGGTGTAGTCCATACTACTAA
ATACCATGACTATCCATCTTATAATAACTCTTATGCAAGTAGCTTAAAAACAATACAAAGTATATTACCT
AAATATAACTCAGTGGATATAGCGATAGACTTACATAGAGATGCTAGGGATTTAACTAATCCAGCCACTA
AGGAAAAAGACCATTTAAAATATACAACTATGATAAATGGAGAGAGAGTATCAAAGTTCTTCTTTGTTGT
AGGAGGTAAAAATACAAATAGAAAACAACTTAGAGCTTTAGCAGAAGATATAACTGCTTTTGCTGAGAAA
AAGTATCCTGGTCTAGTATCTCCAATAGTAGAAAAAGACTATGCTAGATTCAATCAGTTTGCAGTTAAGA
ATCATATGTTAGTAGAAATAGGGAATAACGCAACAAGTGTAGAAGAATCTAAGGCTACTACAAAGTATTT
AGCCGAGATTTTAGATGAATATTTTAAACAAAAAAATTAG
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GTATTCCTGGTGTAAAAATAGAAACTAAAGAATTAGAAAATTGCATTGTAACTAAAGTTGAAGTAATAGA
CAGGCAAGGCGCAGAGATAATGAATAAAGATATAGGAAAGTATATAACTCTGGAAAGTAATCTTATGAAG
TTTGATGATGATGAGTCGAGAGAAGAAATGATAAGTTATTTAAAAGAGGAGTTAGTAGATATATTTGGCC
AAGACAAAAATAAAAAAACCCTGGTAATTGGTCTTGGAAATAGAAATATTACTTCTGATGCGTTAGGACC
AAAGAGTGTATCAAAAACACTTGTAACTAGACATCTTTTTAAAAATTATAATAAAGACTATGATGATGAT
TTCACTGAGGTATCAGCTTTAAGCCCAGGAGTTATGGGTGTTACTGGAATAGAAACTAGTGAAATAGTAA
AGTCATTGGTTGAAAAAGTAAAACCAGATAGAGTAGTAGCAATAGACGCATTGGCTTCAAGAAAAATGGA
AAGAGTAAACTCTACTATACAGATATCAACAGCAGGAATATCACCTGGTGGAGGTGTTGGCAATACTAGA
AAATCTCTAACTAAAGAAACTTTAGGCGTGGATGTTATTGCAATAGGCGTTCCAACGGTGGTTGATGCAG
CAACTCTTACAATAGATGTCTTAGATATGGCAATAGACAATTTAATAGCTCAATCAGAAGAAACAGAAAG
TTTTTATGAAATGTTGAAAAAACTTAAAGAAGAAGAAAAATATCATCTAATAAAAGATTCGTTAGACCCA
TATGACAAGAACTTAATAGTAACACCAAAGGATATAGATGATACAATCGAAAATCTATCTATAATAATAA
GTGAAGGCTTAAATAGGTCTTTACATCCAGGTAGATTGGTATAA
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GGTGGAACTATTTGCGACAAGCAGAAGTTTTGTCTAACAACTATCATGTGATACTTCCTACATTGGATGG
TCATGGAGAAGAATATGAAACAACATACATTTCTACAGAGGATACAGCAGATAAGTTGATATCATATATA
GATGAAAATTGCAGTGGACATCTTTTCGCTTTGTGTGGGGTATCACTTGGTGGTCAAATTGTCATGGAAC
TTTTATCTCGAAAACCTAATATTACTAAAAAAGCAATTATTGATGGTAGTATTTGCTACCCAAGACCTCT
TATGGCAAGGTTTTGTATTGCTGGTATTCGATTTTTTGGAGGACTTTTGTTTAGTGAGAAGGCTTGTCGC
TTTCAAATTGCTATGATGCCAAAATTGTTACCTGAAAATATGCAATATCCAGATGAAATAAAAGCGTATT
ATATGACAGATATGCCACATGTAAGAAAAGAAACATTCTATAATATGTATCGTACTTATATGATGAACTA
TACACTTAAAGAGAATGTTAAAAAAACCACAGCACAAGTAATGTACTGGTATGGAGAAAAAGAAATGAAG
TGCGTTAAAAAATCTGCAAAAATGTTTCAGTCTTATGTACCCTCTTGTGAGATTTATGAAGCTAAGGGCT
ATAATCATGGGTATTTATCGCTTTATCTTCCAAATGAATGGTTGGAAATTGCAGAACCATTTTTCCAAAA
GGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2769332-2768811 hypothetical protein CDR20291_2365 [Clostridium difficile R20291]
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GTGCTCGCACATCTGATATTGTAAAGTATTTAAATGATATTCCTCGTGCAACAGTTTATCACCATGTAAA
AATTTTAGAAGAGAACAATATGATTGAAGTAATTAAAGAAAATCGTGTGCGTGGTACTATTGAAAAGGTT
TATGCACTAAAGGAATATACAACATCTATGGAAGGAGAGACCTTCGTTGCACTTTCTACAGCATTTTATG
TAGGTCTGATGCAGGAAATGAATGAATACTTTAGCAGAAAAGAGCAAGACCATAAAAAGGATAATGTATT
TTTCTCTTCAGCATTACTATATATGAGTGATAATGAATATGAAAATCTTCTTAAAAGTATAGCTGATTTA
TTGAAACCATATATAGAACAAAAGCCTAAATCAAATCTAAAACTTAGAAAACTTTCAATTATATCTTCTC
CACCTGTGGTTGATAATGATAAAACAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2769931-2770197 30S ribosomal protein S20 [Clostridium difficile R20291]
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GAAAATCTCAAATAAAAACTGCAATAAGAAGATTCGAAGATGCTGTTGCAGCTGGAAACAGAGAGGATGC
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>ref|NC_013316.1|:c2771376-2770384 hypothetical protein CDR20291_2367 [Clostridium difficile R20291]
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ACGAAGGAATGCTTGATTTTAATTTAGATATAATAGATGGGAAGGAAATAGTCTTAAATCAGCTTATAAG
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GGAAAGAAAAAGAATTTTACAGATAGTGATGAGAAATACTTAATAGAGCATTTAGATAATATTCCAGACA
CTACAACTATAGTTTTTGTTGTATATGGAGATGTAGACAAAAGAAAATCATTAGTTAAGAAAATAGGAAA
CAATGGAATTGTTTTTGATTGTGATAAGCTTTCTGATATGGATTTATTTAAATGGATAAAAAAATCTTTT
GCTTTAAATGATGTTATAATAGATAATTCTCAAATCATGTATTTTATTGAACAAGAAGGATACAGAGATA
AGAGCAGTGAAAAGACATTATCTGATTTAGAAAATGAAATAAATAAAATAAGTTCCTTTGTTGGTAAAGG
GAATAATGTAACCAATGACGTAATTGATAAATTATCTCAAAAAAAAGTTGAGAATGATATATTTAAATTA
ATCGATTATATTGGAGAACAAAATGCTTCTAATGCAATGAAAATATTAAATGATATGATACAAGAAGGCG
AATCTGTATTAGGTATATTTTCTATGATAGCAAGACAATTTAAAATAATTATGCAAGTAAGACAGTTACA
ACTTGATGGATATTCAACAAAACTTATAGCTGATAAATTAAAAATGCATCAATTTGTTGTAGGAAAAGCA
TTAAAGCAAACTAAAAATTTTTCTGATGATATAATTGTGGAAATATTAAACTATATATTAGAAAGTGATT
ATAAAATAAAAACAGGTCTTATAAGAGATACTTTAGCAGTTGAAATGTTGGTTAGTAGATACTGTAAAAG
AGAAGCAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2773982-2772798 hypothetical protein CDR20291_2369 [Clostridium difficile R20291]
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ATACGGAGAGTTTTATGAAGTACTATTTTAATGATAAATATAAATCTGAAAATACTGTAGTAGCTTTAGA
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ACATCATATGTAGTAGGAGTTTCTACACTTCCAGAGGGAAGAGGAGCTGGATATATGAACAAAGTAATGA
AATTTACTTTAAACGAATTGTATAAAAAAGGGCAATTAGTTTCTATATTGATGCCTATTGACTATAGACT
TTATAGAAGATTTGGATATGAGCATTGTTACGACCAGATTGAATATACTATTAACACAGATGATTTAAAA
AATTTTAAGTCAAGTGGAAAAATGATAAAGTCTAATTTATCACAAATTGATGATTTGATACGAATAGATA
GAACTTTTTTAAATGAGGTTAATGGTAATGTGTTAAAAGATGAACATTATTATGAAAACTTATTTAAAGA
GATTCAAAGTGAAGATGGATTTTTATACATTCATGAAGGAAATGAAAAAGATGGATATATAGTTTATTTT
CTTCAGGAAGATAAAATGTTTGTCAGAGAGTTATTTTATAAAAATATAGATGCCCTTAAATCAATGCTTA
AATTTATATATAATCACAATACTCAATGTAAGATAGTTACTATATCTACTCCTACAATAGATAAGATAAG
ATTTATATTAGACAACCCTAAAGATAGTGATATAAAAATAAAACCTTTTATGATGGGAAGAGTTATAAAT
GTAAAGAAGTTTATTGAAGATATAGATATTGAGAAGGATATTAATAGCTCATTTAATTTATTAATAGAAG
ACAAGTTTATAGATGAAAATAATGGTCTATTTAAAATTTCTATACAGAATAAGAAGGTATCTGTAGAGCA
GTTAGATAAAAAAGGTGCAGAAAAGCCTCAAGAAGATTTTGATATTAAATTAGATATAAATACCTTAACA
CAGTTATCATTTTCTTATATAGATGTAAATGAAGCTATTTTCTTAAATGATATAAAAGATGTTTCAGAAG
AAACACTAGAAACACTTAATTGTATTTTTTCTAAAAAAAATACCTATATAAATGAATATATATAG
>ref|NC_013316.1|:c2774896-2773991 hypothetical protein CDR20291_2370 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTTTCAAAGATATTGAACTAAATTCAAAAAAAGAGTTAGACCCATATTTTGATTTAGTAGATTATG
AAGCTTGTGAGTACTGTTTTAGTACTTTATATATGTGGCAACATGTTTATAAGACAGGATATTATATAGG
TGAAGATTTTGCCGTTTTAGTTGGGGAATACGAAGGAGATAGTTTCTCAATATTACCACTTGCTAAAAAA
GATAAACTTCCAGAAGTTGTAGATTTTGTCCTTGAATATTTTTCTAAAAATAATAAAAAAATATACTTAA
GAGGTATTACTACTGAAGTAGTAGAGTTTTTAAAAGAAAAATATCCAGGTAGATTTGAGTATATAGAAGA
AAGAGATTTATTTGACTATATTTATGATGCAGAAAGTTTAAGAACTCTAGCTGGTAAAAAGAATCAAAAG
AAGAGAAACCATATAAACTATTTCTTAAAAGAGTATGCAGGTAGATATGAAGCTAAATTATTAGATAAAG
AAAACTTTGACGAGTGTTTAGTACTAATGAAGGAATGGGAAAGTAATAAGGAAGAAAATAATGAATTTGA
TGAAAGTATGGATGACGAATTAATAGGTATCAAAAAGATATTTAACCATTATGACATATTAAAAGATAAG
GTAAAAGTGTTTGGTGTTTATGTGGATGGAAAATTAGAGGCTTTTAGTATAGGAGAACTTTTAAATCCAA
ATATGGCATTGATTCATATAGAAAAAGCTAATCCCGATATAAGAGGTCTGTATCCATTTATAAATCAACA
ATTTTTGGTAAGTGAATTTAAGGACGTTGAGTTTGTAAATAGAGAAGAAGATTTAGGTATTGAAGGATTA
AGAAAAGCTAAACTTTCTTATCATCCTTGCAGATTTGTTGAAAAGTACAGTGTTAGGGAGGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:2775084-2775920 metallo beta-lactamase superfamily lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
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TACTATCTATACATATAATTGATGTTGGACAAGGTGATAGTATTTTAGTTCAAACACCCACAAATAAGAA
TATATTAATTGATGGAGGTGATGAAGATAGCGAAAATATAATTATTAGTTATCTTAGACAAAAAAGAATA
AAAACTATTGATATTATAATAGCAACTCATCCAGATTCAGACCACATAGGAAGTCTTGATAATGTTATAA
AAAAATTTAATGTAAACTCCATATATATGCCTGAACAATCAACTGATAGTGAGGCTTATCAAAATCTAAT
AAATTCTTGTACGGATAAAAACTTATCTATTCAGCATCTCTATAAAAATGATGTTTTAAACATAGATAAC
AATATAAATATATATGTATTAAGTCCATCATATATACAAGAAGAATCTAATTTAAATTCTATAGTTTTCA
AATTAACTTTTAACGATAATTCTTTTTTATTTATGGGTGATGCTGAAGAAGAAAATGAAAAAGAAATTTT
ACATTCTTTTAAATTAAATAATATTAATTTTATAAAAATAGGTCATCATGGAAGTAATTCTTCTTCATCT
TTAGAATTTATAAAAAAAATTAGTCCAGATATAGCTGCAATATCATGTGGATATAAAAATCAATATGGTC
ATCCACATAGGGAGGTTATTAATAATCTAAAACAAAACCATGTATCAATTTATAGAACAGATAGAATAGG
AGATATTGTTTTTTATAGTGATGGAGAAATTATATTTACAAAATATAATTATGAAATAGATACATAA
>ref|NC_013316.1|:c2776769-2776062 hypothetical protein CDR20291_2372 [Clostridium difficile R20291]
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CAAATATAATAGTATTTGGAGTTGGAGGAGTTGGTAGTTTTACTGTTGAAGCTTTAGCAAGAGCTGGAGT
AGGCAATATTACTATTGTAGATTTTGATGATGTAGATATAACCAATATAAATAGACAAATACCAGCCCTA
CATTCAACTGTAGGAAGGTACAAAGTTGATGTCATGGAAGAAAGAATATTAGATATAAATCCTAATATCA
ATATAAAAAAAATAAGAAGTCTTTATAATAAAGATACTAGTGACGAAATACTAACTGAAAGATATGATTA
TGTTGTGGATGCGATAGACATGGTAAGTTCCAAAATACATCTAATTGAAACTTGTGAAAAAAAAGGGTTG
AAAATAATAAGTTCTATGGGTATGGGAAATAAATTAGACCCAACTAAAATAGTCGTTACAGATATACACA
AAACAAGTACTTGTCCTCTAGCTAAAGTTATGAGGAAAGAACTTAGGGATAGAGGTATCAAAAAGTTAAA
AGTAGTATATTCTACTGAACAACCAATAGAACTTAAGAAGAAAGTAATGAATGGTAGAAAAGTAACACCT
GGTAGTGTATCATTTGTCCCATCTGTAGGAGGTTTAATAATCGCATCTGTAATAGTAAATGAACTATTAG
GACAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2778098-2777259 hypothetical protein CDR20291_2373 [Clostridium difficile R20291]
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CGGGATACTCTGCGCTTAATAAACAAGTAACATTAGTAGTAAGGGGAGAAGAAAGAACTATATCAACATT
TAGTTCTAATGTAGGAGACCTTTTAGAATCTCAAAACATTAGCTATGATGCAAATGATATAGTAACTTTA
GATGAAAATACAAAGTTATCTAATGGAGATAAAATAGAAGTAATTGATGTAAAGGAAAAAACAGTTGTAG
AAACTAAAGACATTCCATTTGAAGTTACAGTTGTTGAAGATGGCTCTTTATTAAAGGGTGATTCTAAGGT
TAAAGAAGAAGGAAAGTCTGGTAAAAGTGAATTAATATATAAAGAAACTTATCACAATGGAAAGAAAGTT
GAAAAGGAATTTGTGAAAAAGGTTGTTAAAGCTGAGCCAGTAAATAAGGTTGTAAGCAAAGGGACAAAGG
TAGAAATGCAAGTAGCCTCATCAAGGGGAGAAAGTTCAAGAAGAATGGCTTCATCATCATCTAGTAGCAG
TAGTAGTAACAATGGTAAAAATATGAGAGTGGTAGCAACTGCATATACTGGTCATAGTATAACTGCAACA
GGAACAAAACCTAAGTGGGGAACAATAGCTGTAGACCCTAAGGTTATACCATATGGAACTAAAGTTTATA
TACCTCAATTTGACATGGTGTTTACTGCAGAAGACTGTGGTGGAGCAATAAAAGGAAATAAAATTGATAT
CTACATGAATGATTCAAAAACGGTTTATAACTGGGGAAGAAAAACTATAGATATACGTATATTAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2779021-2778347 uracil-DNA glycosylase [Clostridium difficile R20291]
ATGGTTAACTTAGGAAACGATTGGGATGAATTATTGAAAGAAGAATTTGAAAAAGATTACTACTTAAACT
TAAGAAAATTTCTTATAGAAGAATATAAAACACGCCAAATTTTCCCAAATATGCACAATATATATGAAGC
TTTAAAACACACTTCATACAAAGACACAAAAGTCTTAATATTAGGACAAGACCCTTATCATGGAGATAAT
CAAGCTCATGGTTTAGCTTTTTCAGTTCAACCACAAGTGAAAACTCCACCATCTCTATTAAATATGTATA
AAGAATTAAAAGATGATTTAGGTTGTTTTATACCTAATAATGGATATTTAATGCCTTGGGCAGACCAAGG
AGTGTTACTTTTAAATACTGCTCTTACTGTTAGAGCGCATGAAGCTAATTCTCATAAGAACAAAGGATGG
GAAATTTTCACTGATAGAGTAATATCTATTTTAAGTGAGCGTGAAGACCCAGTTATTTTTGTACTATGGG
GAAGTAATGCACGTAAAAAAGTAGAGTTGATTGATACAAGTAAACATTATATTTTGGAAGCACCTCATCC
AAGCCCATTGTCAGCAAGTAAAGGCTTTTTTGGATGTAAACACTTCTCTAAGATAAATGAAATTTTGAAA
AAGCTAGGAAAAGAACCTATTAATTGGCAGATAGAAAATATATAA
>ref|NC_013316.1|:c2779429-2779058 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAAAAAAGACATTCTTCTTATTTTAGGCATTTTGGTTGTTATTATAGCATGTTATGGGATAATAA
ATGTTATAAATTCTAAAAATGCTGGAAATATTGAGATTTATGTAGATAATAAATTGTATAAAACTGTTTC
AATAAATGCCAAAGAAGAATTTAAAATAGAGAATAGAGGGGGGTATAACATAGTAAAGATTCATGATAAA
GGGGTTGAGATAGTAGATGCTTCATGCCCTGATAAGGTTTGCGTACATACTGGATTTATAAACAAGCCAA
GTCAAAGCATAGTTTGTATACCTAATAGAGTGAGCATAAAAATAAATACAAATGAAAAGAATGATAATCA
AGAAGATATAATTTCTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2779496-2780554 hypothetical protein CDR20291_2376 [Clostridium difficile R20291]
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GGAGTTCAAGCCAGAATACTAAATATAGTAAAACTAGCTACTACCTTGGTACAGTAAACGAAGTTACTAT
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AACAAAATGAGCACTCATATACCAGGAAGTGATGTTTCTAAAATAAATGATAATGCTGGTAAAAAATTTG
TCAGAGTTTCTGATGATACATTTTTCGTCGTAAAAGAAGCTATACAATATTCCAAATTATCAGATGGATA
TTTTGACATAACAATTGGTCCATTATCAAATTTATGGGCTATTGGAACAGATAAAGCTAAAGTTCCAAGT
GATTCTGAGATACAAAAACTTCTGCCTCTTATTGATTATAAGAACATCATATTGGATGAAAAAAATAAAT
CTATAAAATTAACCAAAGAAAATATGAAAATTGATTTAGGTGCCATAGCTAAAGGATATGCTGCTGATAA
AATTGTAGCCTATTTAAAATCAGAGGACGTAAAAAAAGGTTTAGTAAACTTAGGAGGAAATATATTTACT
TTAGAAGATGGTAAAAATGATAAACCTTTTAAAATAGGCATTCAAGACCCCACTAGTAAAAATGGTGAAT
CCATAGGAAACATAGAAACCACAAATAAATCTGTTGTTACTTCTGGAATTTATGAAAGATTTATCGAAAA
AGACGGAAAAATATATCATCATATGTTAAATCCATTTACAGGGTATCCTTTTGAAAACAATCTAAGTAGT
GTTACAATAATTTCTGATAAATCTATTAATTGTGATGCCTTATCCACTTCTACATTTGGACTTGGTCTTG
AAAAAGGTATGGATTTAATTAATGAAATTGATAATGTAGATGCTATATTCATAACTAAGGATAAGAAAGT
ATATTTAACTAAGGGTATAAAAGATAATTTTAAACTTACAGATAAATCTTTTTCTATTGAAAAATTAAAT
AAACAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2781923-2780745 putative aminotransferase [Clostridium difficile R20291]
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GAGATAAATTTGGAGATATTAGAGAAGATTTTGTACCAATGTGGATTGCTGATATGGATTTTAAAATACC
AACAGAAATAGAAAACAAATTTATTGAAGCTGTAAGAAGAGGTGTATTTGGATATACATACTGTTATGAT
GAATTTTATGATTCAGTTATTGGTTGGCAAAAAAATATGCATGAGGTAAATGTAGAAAAAGAATGGATTA
CATTAACTTATGGAACTGTATCAACACTTCATTATGTAGTACAAGCTTTTTGTAAGAAAGGTGATAGTAT
AATATTAAACACACCAGTTTATGACCCCTTTGAATCATCAGCAAAAAAACAAGGTGTAAATGTAATTTGT
AATACATTAGATGTTGTAAATGATAGATATTATATAAATTTTGATAAATTAGAAGTTCAAATTAAAGAAA
ATAAGCCTAAATTAATGATGTTTTGTACACCACATAATCCATCTGGAAGGATATGGACAATTGAAGAAAT
GACAAGGGTAGCAACTATATGTAAAGAAAATAATGTTATTTTGGTTGCAGATGAAGTACATGCAGAGCAT
ATTCATTATGGTAAATTTAATTCAATACTTAAGATTGGAAAAGAGCTTTTAGAAAATGTTATTCTACTGA
CATCACCAAATAAGGGCTTTAATCTTGGTGGATTAAAGACTTCTTATTCAATAGTTATAAATAAGAATAT
AAGGGATAAATTTAGAAATAAATTAAAGCAAAATTCTATAACTTCTCCAAATGTGTTTGGAATAATAGGA
TTGATAACCGCTTATAATGAATGTCATGAGTGGTTAAGTGGTGTAAATGAATATATAAAATCAAATTATG
AACTTTTAGAAACTTGGGTAAATAAATATAATAAGATAAAATTGATGAAAATGGAATCATCTTACTTAGC
TTGGATGGATATAAGTGGATTAGGTATAAGTGCAAGTGAGTTTACAGATAAATTGGCTATAGATACAGGA
GTATTATTAGAAGATGGGAGTCATTTTGTAAAAGATGGTGAGAAGTATGTTAGAATAAATTTAGGAACTC
AAAAGGAAAATGTAATTGAAGCTTTAAATAGAATGGATTTATTTTTAAAGTCTTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2783041-2781977 Xaa-Pro dipeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAAGATAGAAAAAGTAAGAGAGTATTTTAGAGAATATGATATAGATGGATTTCTTATAAATAGTC
CTACAAACAAGTTTTATGTTGGAAATTTATTTAGCTCTTCAGGTTATGTTTTTATAACGAAAGAATCACA
ATATATAATAGTAGATTTTAGATATTTTGAAGAAATTAAAAGAAAATCTAGTTTGTTTAATGTAGTATTA
ATGGACAAAACTAGAACTCATTTTGATATAATTAATGATATTTGTAGAGAGCAGAATATAAAGGAAATTG
GATTTGAGGGAAATGAAGTATCTTTTGATTTATATAGAAGTATGAGTAATAAGTTAAGTGCAACCTTAAA
ATCAGTTGATTTATCTACATTAAGGGAAACAAAAAATGAAGACGAAATAAAATATATAAAAAAAGCTTGT
GAAATAGTTGATGCTACATTTTATCATATAGTAGACTTTATAAAGATTGGTATGACTGAAAAGCAAGTTG
AAAATGAAATTGTTAGAATTATAAAAGATTTAGGTGGTCAAAAAGAATCTTTCGATACAATAGTTGCATC
TGGGCTTAGAGGAGCATTACCTCATGGAAAAGCAAGTGAAAAAATTATAGAGTATGGAGATTTTGTTACT
TTTGACTTTGGTGCTAAGTATAATAATTATTGTTCAGATATTACCAGAACCATTTGTATGGGTACTATAA
ATAAAGAGTTAGAAGAAATATATAATATAGTAAGAAAAGCTAATGAAGAGTGTATAAGAGTTTTAAGACC
GGGAATGACTACTGGAGAGATAGATAAAGTTGCAAGAGACATAATTGGTTCATATGGATATGCCAATAAT
TTTGGTCATAATCTGGGTCATGGTGTAGGAATTATGGTTCATGAATATCCTGCCTTAGCTCCTGAATCAA
ATGAAGTATTAAAAGAAGGAATGATTGTAACTATAGAGCCTGGTATATATGTTCCAAGTCTTGGAGGCGT
AAGAATAGAAGATGATGTACTCATAACACAAGATGGATGTATGAGATTGACTACATCTACTAAGGATTTA
ATAGTTGTAAGCTAA
>ref|NC_013316.1|:c2784408-2783146 PTS system, IIc component [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAATTAAGAAAAAAGTTATAAACAGTTCAGGTGCTTCTACAACAGGAGGAAATAATGTAGGAAAAT
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AGGTATATCATATATGATACCAGTTTTAGTAATGGGTGGACTTATAGGGGCCTTATCTCAATTAATACCA
TATGCTATATTAGGACTTGACCCATCTGTAGGTATAGTTGATGCTATGAACTCAGGAGAATTTACAGGGT
TCAAGCTTAGTCTTTTAAATATAGCACAATTAATGTCAAATTTCGGATTTACTTTGTTTGGATTTGCGAT
ACCACTGTTTGCAGCATTTTGTGCAAACTCTATAGGTGGAAAAACAGCTTTAATTGCAGGATTTATAGGT
GGATATATAGCTAATAAACCTGTAGGTGTACCACAATTCATTGATGGACAATGGACTGAAGTTGTTCCAG
TTGCATCAGGATTTTTAGGTGCAATACTAATAGCATTCATAATAGGATATTTTGTAAAATGGTTAAATAA
ATCTATAAAAGTTTCTCATAACTGGTTAGCTTTTAAAACAACATTTTTAATACCATTAATAGCGTCATTA
GCTTGTATGGTATTGATGATATTTATAATAACTCCATTTGGTGGATTAATTAATGAAAGTATGAAAAACT
TCTTAACAGCAGCAGGAGCAGCTGGAGAATATGTATATGCAACAGCTTTGGCAGCAGCTACAGCATTCGA
CTTAGGAGGACCAATAAATAAAGCAGCAGGATTCGTTGCACTTGGTTTAACTACAGAGAATGTACTTCCA
ATAACAGCAAGAACAATAGCTATAGTTGTTCCTCCAATTGGATTAGGATTAACAACATTATTAGATAAAA
GATTAGTAGGAAGAAGAGTATATGATAGACAATTCTATCAAGCAGGAAAAACTTCTATATTCTTATCATT
TATGGGTATATCTGAAGGAGCAATACCATTTGCACTTGAGAGACCAGGTTTTGTTATACCTTTAAACATA
GTTGGAAGTGTAATAGGAGCTATTACAGGTATAATTCTAGGAGCAATTCAATGGTTCCCAGAGTCAGCTA
TATGGGCATGGCCTCTAGTAGATAACTTATTTGGATATATAATAGGTATAGCAGTTGGTGCTATATTCAT
AGCAGTAGGAAATATATTCTATAGAAATAAATTAATAAAAGATGGTAAACTTGTTGTAGATTATATCGAC
TAG
>ref|NC_013316.1|:c2784750-2784433 PTS system, IIb component [Clostridium difficile R20291]
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AAATGAGTTAACAAGAGATGATATATTAGGAGCAACTATGATAATACATGCAGTAGCAATAACACCAGAA
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>ref|NC_013316.1|:c2785264-2784809 pts system, IIa component [Clostridium difficile R20291]
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TAAAATTTATATCAAAAAAAGCTAAAGACTTAAATTTGGCAGAAGATGAGAGCTTAGTATATGAAGGTTT
AATGGCTAGAGAAGAACAATTTACTACAAATTTAGGAGAATCTATAGCAATACCTCACACTAAAAATGAT
GCAATTGAAAATCCAGCAGTAGTAGTATTGAAGTTTAATGAAGATGTTGTTTGGAATGAAGGTGAGGATA
AGGTTAAATTAGCAATAAGCTTACTTATGCCAGGAAAAAGTAAAGAGAATATTCATCTTAAATTATTATC
ATCTCTTTCAAGAAAATTAATAAATAAAGAATTTAAAGATTCTCTTTTAAAAAGTGATAATGTTGAAGAA
ATATCTAACTTAATAAATGAAGCTTTAGGTTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2787168-2785279 transcriptional antiterminator [Clostridium difficile R20291]
ATGATAACTAAGAAACATGCAATAATAGTAAAGAGTTTAAGCAATAAAGATGGATATATGACATCAAACG
AATTAGCTATCAAATTGGATGTGTCTACTAAAACTATTAAAAGATATATAGCAGATTTAAATAGTGTTTT
AAGCAAATATGATTTGGTAATAGCTTCTTCTAGAGGTATAGGATACAAGTTAAGCGGTTCTAAAAACAAT
ATAGCCAGAGCTGTTAAAGAAGCAAATAAATATATTGATGGTTTTTTAGATGACTCTGAAGAGTCAAGAA
TGTCAAATATAATATGTATGCTTATTAATAGAAATTATATGAGTATAGAAGCAATGGCAGAAGAATTAAA
TCTAAGTATAGCCGCTATAAATAAATTGTCTAGTAAGCTTAAAAGAAAACTTGAAAAGTATGACTTAGTT
ATAAAATCTAAACCTTACTATGGAAGCTATATACATGGTGAAGAAATTAATATAAGGCAATTAATTACTG
ACTATGCAATAAAATTAGATGAAAAAAGTAAAGTGAAGGTGTTTTTAGATGACATTAGTGAAAACGATAT
ATACTGTATAGAAAGTATTTTAGAAAAGCACTTAAGAGAAAAAGATACAATAATTTCAGATAAAGATTTT
AATCTTTTGCTTTCAAAAATAATTGTTTCTGTATTTAGGAGTAAGAGAGGTCATAGTAACAATATAAACT
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AATTGGATTTAAACTTATTGAAGATGAAGTAATTTATATTTCAAATTATTCTGGTGTAATAGCTTATAAA
GGTACACAAGGAAGAAAAAACACAAGTGAAATTGAGGAACGAATAAGTAGTGTTATAAGTAGTGCACTTC
AAGATATATTCCTTATTTCAGGTAGTGATTATACAAAAGATGATGAGTTTATGGTTGCAATCTCTGACCA
TATAAAGAGATTTTTAAATAGAGCTAGAGCTAATGTAAAATCAAATAATCCTTTACTTCATCAAATAAAA
GAGAAGTTTCCTATAGCTTTTAATTTAGCCGTGTTTTTATCAAATAAACTAGAAACTGAGTTTAATTTAA
AACTTGATGAAGATGAGCTTGGATATATAGCTATCCACTTTGCTGCTTCAAATGAAAGAATGAAAAAAAA
TACTAGTAAGAAAATTTGTATAGTTTGTCATTATGGGATAGGAACAGGACAACTTATTTCTGAAAAGCTA
AAACAGAATATAAGTGATTTAAGTGTTGTAGGTGTTTATCCAGTTAGATATCTTGATATGGCTATAAGTC
AAGATGTTGATTTGATAGTATCTACCGTTGAATTAAAAGGATATGAAAAACCTGTCTTATATATAGAAAA
TATATTTGATGATAGCTTAATTGAAAACGTAAACAAAGCCTTTTATGAAAAGGAAGAAAGAAGAAAGATA
ATAAGTAACATGTTTGATGAAAAAGCTTTTTTCAGTATAAAGGCTAGTACTAAAGAAGAGGTCATAATTT
CACTTTCAAATAAACTAAAAGAAAGAGATTTTATAGAGGAAAGTTCTATAAAAAGTATAATAGATAGAGA
AAATATTTCATCAACTGAAATAGGAAATCTAGTAGCAATACCTCACACAATAGTGAAGGGAGATAAAAAA
TCTATAATAGGAGTTGGAATACTTGAAAATCCAATAATTTGGGATAAGCAAGAGGTTCAGCTAGTATTTA
TGGTATTTTTTAATACTAAAGAAAAGCATAATTTCTCGATATTTAAATACCTTTATAATTTTATAAAAGA
TGAAGGAGGAGTAAGAGGAATTATTAAAATATGTGACTTTAATAAATTAATGGCACTGATAGGTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2788617-2787256 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGTTGTTTAAGGCAGAAAGCAAAAAATATGAAAAAGAATTTTTAAAATTATTGGAGCAATGGGTTA
GTATACCTTCATTTTATGATAGAAAAACTGTATCTAAAGATATGCCTTTTGGAAAAGGAGTATATGATGC
ATTAAACTGGTTTGAAAATCTAGGTAGAGAAAACAATTTCAAAGTAAAAAATATAGATAATCATGCTGTT
CAAATTGAATATGGAAATGGTAAAGAATATGTAGATATATTTGGACATTGTGATGTTGTAAATCCAGGTG
AAGGATGGGATAGTGAACCATTTAAACTAAATATTATAGGTGATAAATTAGTTGCTAGAGGTGTATCTGA
TAATAAAGGACCTATGATAGTGAATTTTTTAGCACTAAAAATGATAAAGGATTTAGATATTAATTTAAAA
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AAGAGCCATATGGTGTATGTGGATTTACTCCAGATGCTAAATTTCCTGTATTAAATGGAGAAAAAGGTGG
AGCAATAATAAAGTTAATTTCAAATATAGACGATAAATCTTTATATATAAGTGGTGGAATAGAGTTTAAT
ACAATACCAGATAAAGTTTATATAAAGAATGTAGAAAAATTGGGTAAAGATAATATATGTTTTGATATTA
ACAATATATCGATAAATTATGATAATGGCAATTATATTGTGTATGGAAAAGGTGGTCATTCATCTAAACC
CGAAAAATCAATAAATCCTATATTAGCTACAATTAAACTTTTGTCAGAAAATATTGATGAAAAATGGACA
AAAGATTTATATAAGTTGATAAATCAAGATAATATAAATGGAAACTTATTTGGTTTAAATATTGAGGGGA
AATGTGGGATTTTATCAATAGTGCCAACAATAATAAATATAGTAGATGGAAAATTAGAAGTAGTTTTAAG
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AATATTAATAAATTTGAGCTTATTGGGGAAAATTTAAAGCAAGCAAATTATATAGATAGAAATTCAAAAC
TTGTAAGAAGTTTGCATGATATATATATAAAGTATTCTGGAGATTTGAAAAATGATGTTAGAGTAACTAG
TGCAGGAAGTTATGCTTCTGAAATGAATAATTCAGTAATATTTGGTTGTGAATTTCCTGATGGTAGCTTT
GGCAATGTCCATAGTGCGAATGAATTTGCTAGCTTAGATAGATTTATAACTGCAATAGGTATATATGCAG
AGGCAATAATTACATTATGTAATAAAATATAA
>ref|NC_013316.1|:2788790-2789734 mannose-6-phosphate isomerase [Clostridium difficile R20291]
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TTAATTATGAAATAGATTCGCCAACAACTGGTGAATGTTGGGCTATAAGCTCTCATAAAAATGGAGATTG
CTTAATAGAAAATGGAAAATATAAAGGTAAAAAACTATCTGAATTGTGGAATAAAAATAGAGAATTATTT
GGAAACACACCTGGTGATAAGTTTCCTTTACTTACAAAAATATTGGATGCAAATGATAATTTATCAGTTC
AAGTCCATCCAAATGATGAATATGCTAAGAAAAATGAAAATGGAGAGTTAGGTAAGACAGAGTGTTGGTA
TGTAATAGATTGTTCTGATGATGCAGAAATTATAATAGGTCATAATGCAAAATCTCATAAAGAATTTGTA
AATATGGTAAATAATAATGAATGGGACAAACTACTTAGAAAGGTTAATATAAAAAAGGGAGACTTTTTCT
ATGTTCCAAGTGGTACTATACATGCTATATGCAAAGGAACATTGATTTTAGAAACTCAACAAAACTCAGA
TACTACTTATAGAGTCTATGATTATGATAGAACTGACAATTCAGGTAATAAGCGTGAACTTCATGTTCAA
AAATCAATAGATGTTACGAATGTTCCTCATATAAATTTCGATACTGACTATAAAATCGTATCAACATCAG
ACTTTAAATGCACAACATTTGTGTCAAACGAATTTTTTAGTGTTTATAAATTAGATGTTTTTGGAAAATG
TAATTTTACACACAATACACCTTTTTCTTTATACAGTGTGTTGGATGGAAATGGAAAACTTATACACAAT
TCTGTAGAATATAATTTAAAAAAGGGTATGCATTTTATACTGCCAAACGACTTTGGAGATTTTAGTTTTG
AAGGTAATTTAGAGATTATATGTTCTCACATATAG
>ref|NC_013316.1|:c2792540-2789853 putative sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCCTTTTATTTATAATAATGGGCTCAGTACTTTTATTATTTATTATAAAAGATATAGAGAAATATG
AAACTTTATTACATGCCATATATACGATATTTTTAGTAGCTACAGGAGTAATTATATTTAATACTACAAA
ATTTAAAGTAGATTCATTTTCTACATTTTTAGGATTAATTTTTATAGCTACTGGAGTATTGGAGTGTATA
TATTTATTTAATTCCTTGGGGATTAAAACTAAGTCTATAATGGAGATTAACATCACAATATCAGCAATAA
CAGATTTATTTCCTATACTGGGTGTATACTTAAGTTTTAAATTTGTTAAGGATAACAAACAAATTTATTC
AAGTATAATTTTATTTATAGCAACTGCTACATTAACAATAACATCTTTATTCATAATATCAGGAATTTGT
GACTATCTGGGAAATGGTAAATCACAATATGCTTTAGGAGTTATAATATCTATATTCATAATAATTATTT
CTATCATTAGTGGAATTGAATTAAATTCAAGTTCAAATAAAGGTAAATGGGAATATGATGAAAAAAAGAT
TTTTAACAGAATAATAGTAATAATAATTTTATCAAGAGTTCCAAATCTATTGCATATAGTTATTGATAAT
AGAAATGTAGAGCGGATATTATCACAGATAATAATAAATGTAGCCTTATATTATTTATATAATTACATAG
TATCTAAGAATATTAAGAAAACAGCACTGGAATTGCATGATACGAATGAAGAATTAACAAAAAAAACGGA
AAGTTTAAAAGAAAAGAATAAAAAATTAATCTATGAGACAGAAAAGATAGAGGAACTTAAGGGAATACTT
ATGAAAAGAGAATCTAGGCTACAATCTACATTAGATGTAGCAGTAAATAGCATAGTAGTGTTTAGCAAAG
ATGGAGAAATTACATATGCAAATAAGAGCTTTAGAAATACTTTTGGAGACTATAAAGAACAAGATAAATT
GACTGATAAAATAAAAAACTTCAATGATTTGATAGAAAGCATTCATTATGTGTTTGTTCATGAGAAGAAT
GCAGAGAAACTTATTAGTACAAGCGATAATAAAGTTTATCAAGCTATATTTGCACCTTTAATTATTGCTT
CACAAACAGAAGGAGTATTGTGTGTACTAGAAGATAAGACTAAGAAAAAGGAGTACGAACGCAAACTTAT
TGAAGCAAATAAGAGAAGTAAAGATTTTTTAGAAAGTATTGGAGATGGCATAGTAGTGCTTGAAGGTAAT
AACAAAATATATGTTAATAATGCATGTAGGGAAATTTTTAAAAATAATTTAGAGAGTATTGATTTTTCAT
TAGTATGTAAAAGTGAAGAAAGTATAGAAAAAAGATATGTAATAGATGGTGAAGTAAAGTATGTAGAGAT
GAGTTTTTCTCAGTATACTAATGCTGGTACTAATAAAACTATTATTGTAATACGTGATACAACCTCTCGA
AAAATATCTCAAATAAAACTTGAGGAAAGTCAATCATCATATTCAAGATTTATAGATATATTACCTGATG
GCATATGCTTATTAAAAGAAGATTTAAGTATAAACTATGCAAATAAGTCGTTTTTAGATATGCTAGCTTT
TACAAACATAGATGATATAAAAGATTCTAATATTAAACTATTAATGAATGCGAATACTGAAGAAAAAATG
AAATTTACGGATAATATGGCTAAAGTTTTAAATGAAAATAGAAGTATACTTTTACTGGAATATGAATTGA
TAAATAGTTATGATGATATAGTAGAAGTAGAATTAAGTGCATTACCTTTTGCTATATACAATACTAGATA
CATAATGCTTATTATAAAAGATTTAGTACATAAGAAATATTCCGAGCAAGCAGAAAAAGAACTGCTTGAA
AGATTTAAAACAGATAAAATCAAAACGGAGTTTTTTGCAAATATGTCTCATGAATTAAAAACTCCACTAA
ATGTTATATCTAGTTCAAATCAACTGGTAGATTCTTTCTATAGAAATGAAAAGATAAAAGATTACAATAA
CAATATTAAATCTCATGTGGATTTAGTTAGACAAAGTTCTTATAGGCTTCAAAGATTAATAAATAACATT
ATAGATTTAACAAAGATGGAGTCTGGGTTCTATACACTAAAACTTGCGAAATACAATATTGTATCTGTAA
TAGAAGACTTATTTATGAATATAGAAGAGTATGCACTTAGAAAAGACATAAAAATTCTTTTTGATACAGA
CCTTGAAGAAATTAATGTTTATATAGACAAGGTTGAAATTGAGAGAATTATGTTGAATCTATTGTCAAAC
TGTATTAAGTTTACTGATAATGGAGGCTGGATATATGTAAGTATTCATTATAAAATAGATAAAGTAATCA
TAAGTGTAAAAGACACTGGAGTTGGAATACCACAAGATAAATTAGAATTGATTTTTGAAGAATTTTCACA
AGTTGATAAGACTTTATCCAGAAATACTGAAGGAAGTGGAATAGGGCTTGCTATAGTTAAGAATCTAGTA
AGTCTTCATGGTGGAGATATAGAAGTAGTAAGTGAAGTGAATAAAGGCACAGAGTTCTTAATTTCACTTC
CAATGAAGGGATTTAGTAGTGAACATTACACAGAAGATAAGAGAATATATAATATTCAAGAAAAAATAAA
AATAGAATTTTCTGATATATACTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2794579-2792696 selenocysteine-specific elongation factor [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATGTAGTAATTGGAACAGCAGGTCATATTGACCACGGAAAAACTACTCTTATAAAAGCATTGA
CTGGAAGAGAGACTGATACATTAGATGAAGAAAAAAAGAGAGGTATTTCAATAAACTTAGGATTTACTTA
TTTTGATTTACCAAACAATAGAAGAGCTGGAATTGTTGATGTCCCAGGACACGAAAAATTCATAAAAAAC
ATGTTAGCTGGAGCATCAGGAATTGATATAGTTTTACTTGTTGTAGCAGCAGATGAAGGGGTTATGCCAC
AGACAGTTGAGCATTTAGATATTCTAAGCTTTTTAAATATCAAAAATGGAATAGTGGTTCTAACTAAGTC
TGATACTGTAGATGATGAATTTAGAGAGCTAGTAAAAGAAGATATTTGTGAAAAAATAAAAGGAACTTTT
CTTGAAGATGCTGAAATAATTGAAGTTGATTCTATATCTAAAAGAGGTATAGACACTCTTATTGAAAAAA
TAGATAAAATGAGTGATGATATAGAAGATAAAAATGAAAACTCTCCAGCAAGACTTAATATAGACAGAGT
ATTTTCAATAAAAGGGTTTGGTACTGTAATAACAGGCACTTTAATAGAAGGAAAGATAAGTATAGAAGAT
GATTTAGTTATATATCCACAGGTATTAAAAACAAAAATAAGAAGTATACAAGTTCATGGAGAAAATAAAG
ATACAGCTTATGCAGGTCAAAGAACAGCAATCAATATATCAAATGTAAAAGTGGATGATATAAAAAGAGG
AGATGTTTTAGCTGCACCAAACTCATTAGAGGAATCAATGATGTTAGATGTAAAATTATCATTGGTAAAT
CATTTAGATAAAGGATTAAAGCACTGGGATAGATTAAGATTGTATCATGGAACTAGAGAGATACTTTGTA
GAGCAGTTCCACTAGATAAAGAATTAATTGAAAGTGGAGAAAGTGGCTATGTTCAGTTGAGACTTGAAGA
AAGCATAGTATCTAAGAAAGGTGATACGTTTGTAGTGAGACGTTATTCTCCAATGGAAACTATAGGTGGA
GGTGTAATAATTGACCCATCTCCTAAAAAACATAAGAAATTTGATGAAAAAGTTATAGAAGCATTAAAAA
TAAAAGAAAAAGGCGAACTAAAAGATATAATAGAAGAGTACTTAAAAAGGAATTTAAAAAATTATCCAAA
TATAAAAGAAATAATGAGCTATAGTGGTGCTCATGAAGAAGATGTAAAAAGAGCGCTTGAAGCACTTATA
TCAGAAGATAAAGTATTTATTATAGGAAATATGTATATGCATATAAATCAATACAATAAATTAAAAGAAA
ATACAATAAAGCTTTTAAGTGAGTACCATAAGAAGTATAGGCTTAGAAAAGGGATACTAAAAGAAGAAGT
AAGGTCTAAGATAGAGAGTAATTTTAAGACTAGGGAGATGGATATTTTATTAGAAAAATTGTCTACAGAA
AATGCTATAAAAATAGAAAATAATATAGTATCTCTATTAGATTTTGAGGTTATTTTAAATGATAAGCAAA
AAGAAATAGCAAAAAAAATAGAAAAAAGATTAAAATCATGTGGAGTTTCTTCTATACTGACAATAGATGA
AGTTTCTGAAGGAAATCATAACTATGCTGAAGTATTGGAGTCAATGATAGGTAATAAAGTAGAGAAATTA
GATGATTTGTATATAATGGACAAAGATATTTATGAAAATGCAAAGAACATTTTGATAAATTATATAAAAG
AAAATAAAGAAATAACATTAGGAGAATACAGAGATTTGATTGATTCTAGCAGAAAGAATTGCATGATTAT
ATTGGAAAACTTCGATAGAAACAAAATAACTAAAAGAGTAGAAAACAAAAGAATTTTGTTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2796105-2794693 L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase (selenocysteinyl-tRNA(Sec) synthase) [Clostridium difficile R20291]
GTGATTGTTTTGAGCAAAAGAGAATTGTTTGCAATGTTGCCTTCAGTTGATGAAGTATTAAGTGATAATA
GAATTGTAGAAATAATAAATGAATATCCTAGAAGTTTAGTTTTAGAATCTGTGAGAGAAGTAATAGATTT
AAAAAGACAATTTATATTAAGATTAAAAGAAGATGCATCAAACTCTGTAACAATAGAGTTTGGTGAAATA
ATAGAATCTGCAATAGAGAGAGTTAAGTTAAATTACTCATTATCTTTAAAAAAAGTTATAAATGCAACTG
GTACAGTTATTCATACAAATTTAGGGAGGTCTTTACTTAGTGAAGATATAAAAGATGAATTATGGTGTGC
TGCTTCAAGGTATTCAAACTTAGAATACGATTTGGATAATGGAGAAAGAGGTTCAAGATACTCTCATTTA
ACTAGTACAATAAAAAGACTTACTGGAGCAGAAGATGTACTAGTTGTAAATAATAATGCAGCGGCAGTAC
TTCTTGTACTTAGCACAATGGCTAAAGGAGGAGAAGCAATTGTATCTCGTGGAGAATTAGTTGAAGTAGG
TGGTTCATTTAGGATTCCAAGTATAATGGCTCTTAGTGGTGCAGAATTAGTTGAAGTTGGTTCAACTAAT
AAAACTCATTTGAAAGATTACAAGGAGGCCATTACAGAAGATACAAATGTATTGATGAAGGTTCATACAA
GTAATTATAGAATAATGGGATTCACAGAGAGTGTTTCTATAGAAGAATTGGTTAATTTAGGTAAAAAATA
TAAACTACCTGTAATAGAAGACTTAGGAAGTGGAGTTTTTATAGATTTATCAAAATACGGTTTATCTTAT
GAACCAACTGTATTGGATTCTATTCGACAAGGTGCAGATGTAGTAACTTTTAGTGGAGATAAGATGCTTG
GAGGTCCACAAGCAGGTATTATAGTTGGGAAAAAAGAGTATATAGAAAAAATGAAGAAAAATCAACTTAC
TAGAGCACTTAGAGTTGATAAGCTTACAATATGTGCTCTTGAAGCAACATTGAGAATGTATTTAGATGAG
ACAAAAGCTATAGAAAATATACCTACTTTAAAAATGTTGACATATAAAATTGAAGAATTAGAAGTAAAAG
CAAATAAACTATTTGAAAAAATAACTGCTTTAAACTTAAATGCAAACATAAATATAGAAGATGGATTTTC
ACAAGTGGGAGGAGGGTCTATGCCTCTTGAAACTATAAGTACAAAGGTAATATCAATAACTCCTGAACAT
ATGAATGTTTCATCTTTAGAAAAAAAACTAAGACTTAGTGAAGCACATATAATAGCCAGAGTGTATGATA
ATAAATATGTACTAGATGTAAGAACTATATTTGATGATGAATTTGATGTAATAGTTGCGGAATTGAGAAA
AGCATTTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2797073-2796123 selenide,water dikinase [Clostridium difficile R20291]
TTGCCTAAAAATGATAATATAGAAAATTTATTAGTAGGACTAGATACAGCAGATGATGCTGCAGTTTATA
AATTAAATGATGATATGGCACTTATCCAAACTTTAGACTTCTTTACACCAATGGTAGATAACCCATACGT
ATTTGGTCAAATTGCTGCATCAAATTCACTATCAGATGTATATGCTATGGGAGGCAAACCTTTGGTTGCT
ATGAATATTGTTTGTTTTCCATCATGCCATGATATGGATGTACTTGCGGAAATATTAAAAGGTGGGTTTG
ATAAAGTGAAAGAAAGTGGAGCACTTTTGGTTGGAGGGCATACTGTAGATGACAAAGAGCCTAAATATGG
TCTTTCAGTTTCTGGGATTGTAAGTCCAAATAAAGTTTTATCAAATGCTACTGCAAAACCTGGTGATAAG
TTAATTATAACAAAACCAATTGGAGTGGGTGTATTAAATACAGCCATGAAAGAAGGTATGGTAGAACAAC
ATATAGCAGATAAAGTAATAGAAATAATGATACATTTAAATAAATATGCAGCAATGAGTTTTGAGAAATT
TGATGTAAATTCGGTTACAGATATAACTGGTTTTGGTCTACTTGGTCATACTTTAGAAATGGCCAAAGCT
TCTGAAGTAAGTATTGAAATTGAATCAAAACATGTACCAATTATTGAAGGTGCAATAGAAATGGCACAAA
TGGGAATTATACCTGCTGGTATGTATAAAAATATGCATTATGTATCTAAAGATGTAGAAGTTGTAGGAAA
TATAGAAGTTGCAGTTCAAGATATTTTATACGACCCACAAACATCAGGAGGGTTGTTAATTTCAGTAAAA
GAAGAACTTGCAGAGGAACTTGTAAAAGATATGAAATTAAATGGAGCAATAGAAGCTAAAATTATAGGTT
CTGTAGTTCCAAAAGGGGAAAAATATATTACAGTTTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2797965-2797261 putative competence protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAAAGGTAAAATTTATTTCGTTTTTTGTTTTATTTATTTTAATAATATCATCAATAATCGTTT
ATAAATCGCTTATTTTCAAAGATGATATTTATGTTGTAAGTAAAAAAAATTTACCTAATGAAAAAACACA
TGTTGTAGAGAATGAAATTAAAGGTGAAGATAATAATCACAATAAAGTAACTAAAGACATAGATAAAAAT
TTTCAAAATAATAAAATAACTATATACATAAGTGGAGCAGTAAATAGACCTGGAATTGTAACTATAGAGT
CAGACAAGAGACTTTATGATGCTGTAGAATTACTAGGAGGAACGACAAAAGAAGCAGATTTAAATGGAGT
CAATCTATCAGTAAGATTAGAAGATGAACAACATTACATAATACCTAAAATAGGTGAAGCAACATCTGTT
ACAAGTAATGATGATTCCAATAAACCAAATCAGAAGAATGAGTCAAGAGGTGAGCCTAAAAATAAATCCA
ATAAAAATATATCTAACGAATCAAAAGTAAATATAAATGTAGCGACTATAGAAGAGTTAGATTCTCTACC
TGGGGTTGGAGAAGCTACAGCCAATAAAATTTTACAACACAGAGAAGAAAATGGACAGTTTAGTTCAATT
GAGGAAATAAAAAATGTAAATGGTATTGGAGATAAAAAGTATGAAAATATAAAAGATTTAATTTGTGTAG
ACTAA
>ref|NC_013316.1|:2798045-2799334 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (putative sporulation-specific penicillin-binding protein) [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGAAATTTATCACTTTTATTAATCTGTTTATTGATATTTACTTCATTTTTAGGAAGCTCTAATA
TCTCTTTTGCAGATAATGAACCAGCTATAGTTGCTAAACATGCAGTTTTAATGGACTATGAGTCTGGCAA
AATACTATATAATAAGGATGGAAATTCTAAGCTTTATCCAGCTTCAACAACTAAAGTATGGACAGCTTGT
TTAGTTCTAAAGGAGGTTAAAGATTTAAATCAAGTAATAGAAATTAAAGATTTACCTCAAATAGATGGCT
CTAGTATGTATCTAAAAAATGGGGAATCTTTTACTGTAAAGCAGTTACTAGATGCTCTTTTGGTTCATTC
TGCTAATGATGCTGCTTTTGTATTGGCTAGATATGTTGGTGGTGGCAATGTACAAAAATTTATTGACCTC
ATGAACTCTGAGGCAAAAAAAATTGGAGCTACTAATACTCATTTTAATAATCCTCATGGATTACCAGACC
CAAATCACTACACAACAGCTCATGATATGGCTCTCATAGCTAGAGAAGCTATGAATAATGATACTTTTAG
ACAAATTGTAAAAACTAAGTCACTTAAATTTGAAGCTACAAAAGCATATCCTTATGAGAGATACTTTGTA
AACACTAATAAGTTTTTGACATCACATGATAAGATTACATACAAAGGTCAACCTATAAATATAAAATATG
ATATAGTTGATGGTATAAAAACTGGATATACTGATGCTGCTGGTAAATGTCTTTTATCGAGTGCTGTAAA
AGATGGCAGAAGAGTTATCGTTGCTGTATTTAATTCAACTAATGCTGATTTATATTTAGACTCACGTATT
CTGATTGATTATGGATTTGATAACTTTAAGTGTGCTACTATTGTTGATAAAGAAAAATACACAGATACTA
AAAAAGTATTGTTTACAAAACAACATGAATTGATTTATGAACCAAAAAATAGTTATAGGATATTCTTAGA
AAAAGATGAATCTCAAGGCAATTATGATACCAAAACAGAGTTAAATAAAATTGATTTGCCTATAAAAAAA
GGAGCTAAGGTTGGTACTTTAAATGTATATAATAATGGTAAACTAGAAAACAGTATAGACTTAATTGCAA
AAAATAATCTTGATAGCAGTCTTCCATTTTTTACTGGAAATAATATTTTAATGACTTTTGTTAAGATTAT
TGCAGGTATTCTAGTGCTTTTAGTTTTATTTATAATAGCTTCAAATATAAAGAAGAAAAAAAGAAAAAAA
GCTAGAAGTAAAAAAAATATGAAAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2799799-2799461 hypothetical protein CDR20291_2391 [Clostridium difficile R20291]
ATGAACTTATTAGTGATTGGTGGTCATGAAAGAATGGAAAAAGATTATATGGTTATGGCCAAGAAAAAAG
GTTATAAGACAAAGGTATATACTACCATGTCATCTAAATTAAATAATTCTATAGGAAGACCAGATGCAGT
TGTCATACTTACATCAACTGTTTCACATAAGATGTCTAGAACGGTTGAGTCTCAAGCTAAAAAACAAGAT
ATATTAATCGTAAGGCATAAAAATAGTAGTAAGGTAGCATTTAATGAATGTCTAGATATGGTTGATGAAT
GTCTGGGAAATTGTTCAAAATGTAAGCTTAAAGACAAACAAAAACAAAAAAATATATAG
>ref|NC_013316.1|:c2801364-2800048 argininosuccinate lyase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTATGGGGCGGACGCTTTAGAAAAGCGGAAAATCAACTTATGGAAGAATTTAATAAATCTTTTG
GCTATGATTGTGTACTGTACAAAAAAGATATCGAAGGAAGTGTAGCACATGTTCATATGCAAGTAAAATG
TGGACTTTTAACAGAAGAAGAAGGAAAGTCTATAACAGAAGGTTTAAAAGGGATACTTGAAGATGTAGAA
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ATTGTATGCTAAAGAAAAAGCAAATGATTTGGTGGGTTTAATATCTGAATTTAAAGCTACTATAAAAGAT
GTTGCTGACAAAAACCCAGTGATGATGCCAGGCTATACTCATCTTCAAAGAGCTCAAGTAGTGACATTTA
AGCATCACTTAATGGCATATTATAGTATGTTTGATAGAGATGAGAAAAGAATAAAAAATGCTATAGAAAT
ATTAGATGAATCACCTTTAGGCTGTGGAGCTTTAGCAGGAACTACGCATGATATAGATAGAAGTATAACT
TGTGAACAATTAGGATTTAAAAAAGTAGTAGATAATTTTATGGATGGAGTAAGTGATAGAGATTATTTAC
TAGAGCTAATGAGTGATTTTTCAATTATAATGATGCACTTAAGTAGATTAAGTGAAGAGTTGATACTTTG
GAGTTCTCAAGAATTTGGATTTGTTGAGATAGATGATTTATATACAACTGGAAGTAGTATAATGCCTCAG
AAGAAAAATCCAGATGGTGCAGAGCTTATAAGAGGTAAGACTGGCAGAGTATATGGAAACTTATTTGGTC
TTTTTACAGTAATGAAAGGAATACCATTAGCATATAATAAAGACATGCAAGAAGATAAAGAAGGTTTTTT
CGATAGTGTACATACTCTTGAAATGTGTATACAAATAATGGATAGAATGATAGCCACACTAAAGGTAAAT
GAGGATAAAATGAAACAAGCAGTAAAAAATGGTTTTTTAAATGCAACAGAAGTTGCGGATTATTTGGTTA
AAAATAATGTTGCTTTTAGAGATGCACATGGTATAGTAGGAAGTATCGTTATATATTGTGAAGATAATAA
AAAAGCAATAGAAGATTTAACATTAGAAGAATTACATAAGTTTTCAGATGCTTTTAAGGAAGATATTTAT
GATTTTATCGACTATGAGAGTATATTAAATAAGGGAATAAAAAAGAATTTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2802562-2801741 putative hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGATATAAATTAATTGTAACAGATATGGATGGAACTTTATTAGGCAATAATCATAAAGTTACAGATG
AAAATAAAACTGCACTACAAAAAGTTATAAAAAGCGGTATTAATGTAACTTTAGCAACAGGAAGAGCCTT
CGATTCAGCTAAATGCAATGTAGATTTTCTTAAAGAGGACATGCCAATAATAGCTTGTAATGGTTCATTA
ATAAGAGAGCAAAATGGAAATATAATATATTCAAATAAGATTGATACAAGAACATGTTTAAACATTTTAG
ATGTATTAGATAAATACGATATTTACTACCAATGTAATAGTATAGATTCTATGCTTTCGAAAAAAATAGA
AGGACGTGAAGATAGATTAAGTGTATTTTTAGGCTCTGAAACAGAAGTAATTGTAAAAGATGATTTGAGA
GAAGAAATCTTTAAAAAAGATATACTAAAATTTGTAATCATAGAAGAAAAAAATCCATCTATTTTGGATG
AAATAAGAAAAGAATTGAGAAAAGTTCAAGGAATAAAGATAACTTCTTCATGGCCAAACAATATTGAAGT
CATGAATGAAGGTGTTGATAAAGGTAATGCAGTTAAAATTTTAGCTGAAAAAATGAATATAGACAGAGAA
GATATAATTGCATTTGGAGACAATTACAATGACATAGAAATGATAAAGTTTGCTGGTCTTGGGGTAGCTA
TGGGAAATGCAGAAGAATTGATTAAACAAGAAGCTGATTATGTTACAGATACAAATCAAGACAGTGGAGT
TGCAAAGGCAATTTATAAATTCCTAGAGTTAAAAGAATCACTTAGCTCTTAA
>ref|NC_013316.1|:2802923-2804026 putative histidinol-phosphate aminotransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACTAAAAATTAACAAAGCTATTGAAATGCAGTTGAAAAAAAGTTATGCAATAGAATCTGGACATT
CAGAAGATGTATTCGAGATAGACTGTGGTGAAGGTATAAATACCGTGTCTTACTCAAGCAAAGCTGTAGA
AGCTTTTAATGCTTTAAAATTTGATATGATAAGAGGATATCCTCATTCAATTGCTTTAAAAGATAATATA
GTCGATTATTGGAAAGATTTTATAGCATTAGATACTGACAGAATTTGTTTGGCAGATGGTTCTATACATG
TTATTTACCTTTTAAATAGACTATTTATTGAAAAGGGAGATAAAGTTTTAGGATATTCACCTCAGTTCTC
AGAATATGAGACAGATATAAAAATGCATGGTGCAACTTATGATTATGTTCTTTTAAAGAAAGAGGATAAT
TTCAAGTTTAATGAAAAAGAATTTATTGAAAAAATAAATCCAGAATATAAAGTAATTTACATAGACAATC
CAAACAATCCTACAGGACAAATTATACCTTTATCATCAATTGAAAATATAGTAAAGGAAGCAGCTAAATA
TGATATAGCAGTTATGGTAGATGAAGCTTATGGTGAATACATGCCAAAAGAAAATTCAGCTGTCAAGCTT
CTAAATAATTATGATAATGTAATTGCTTTAAAAACATTTTCAAAAGGATTTGGTTTAGCAGGACTAAGAG
CAGGATATGCAGTTCTTCCAGAACAACTTGTTAGCCCTATTAAAAAGATTTCTACTCCTTACGAAGTGTC
TGAAATATCTCGTAGTATTGCAGCAAATTTATTAGATGATGTTCAATTTATAGAAGAATTAAAAGAAAAA
ACAAAAGATATAAAAAATCAATTACTAATTCCATGGAAAAACCTTAATATAGCTGAAACTAGTGATACTG
TATCAATTATGACAGTTGAACATAAAAACAAGGACATAGATTTACAACAAGAGTTTGCTAAATTAAAAAT
AAGAGTTATATCTGGAAGTGATTTTACTGGACTTGATAAAAATTTCATAAGATTTAGAATGCCTGAAGAA
AAAGAATTACCTGAAGTTATAAAAGCATTCCAAATAATCGATAATATAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2806723-2804084 cation-transporting ATPase [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTTACAAAAGTACTTATCAAGAAGTAATTAAAAATTTAGACTCAAGTTTATCTGGTTTGAGTAAAG
AAAGAGCAGAAGAGTTGTTGGAAAAAAATGGAGCTAATGAATTAAAAGAAGCAGATAAGGTTCCTACTTA
TAAGCTTTTCCTAGAAAGTTTTAAAGACCCATTAGTAATAATTCTATTGATAGCTGCTTTAGTACAAATA
TTTTTAGGTGAAACAGTGGAGTCTATAATAATTTTTGCAGTTATTATTATAAACTCTGTTCTGGGTGTTG
TACAAACAAAAAAAGCAGAAAGTTCATTAGAAAGTTTGAAAAATTTATCTGCACCAAACGCAAAGGTAAT
AAGAGACAATAAAAAAATGACAATTCCAGCAAAAAATCTAGTAGTTGGAGATATTGTATTCTTAGAAGCT
GGCGATTACATACCAGCAGATGGAAGGCTTATAGAAGCACAATCTCTCAAGGTTGTAGAAGGGATGTTAA
CTGGAGAATCAGAACCAGTTTTAAAGCATACAGAAAAAATAAGTGAAGATGTAAGTTTAGGTGACCAGAA
AAATATGGTATTTAGTGGTGCTGTAGTTGTTTATGGTAGAGGTTCTTTTGTAGTGACTGGAACAGGTATG
GATACTGAGATGGGTAAAATAGCTGGGCTTTTAGAAAGTGCTGAAAATAAACTTACACCATTGCAACAAA
AAATAGAGGATTTTAGTAAAAAACTTGGTGTAGGTATTGTAATACTTGCTCTTTTAATATTTATAATTCA
AGTAGCAAGAAATTACTTTATGGCTGGAAATGGAGAAATGACACAAATTATTTTAGATTCATTCATGTTC
TCTGTAGCAGTAGCAGTAGCAGCTATACCAGAAGCTCTATCATCAATAGTCACTATAGTATTGGCTGTTG
GAACAAATAGTATGGCAAAAAAACAAGCCATAATAAGAAAATTACCAGCAGTAGAAACTTTAGGTTCAAC
AAGTGTAATATGTACTGATAAAACAGGTACTCTTACACAAAATAAAATGACAGTAGTTGATTATTATATG
TATGGAACTAATAATGATGAGTTAGATAAAGAAAAAGTAAACTATTCTTATCATGCTAAATTATTGACTA
TGGTTTCTACATTGTGTAATGACTCTCATATAACTAGTGATGGTAAAGAAGTTGGTGACCCAACAGAAGT
GGCTTTAATAAATTATTCAAGTAAAAATGATTTAGATTATGATAAATTAAGAAGTAAGTATATCAGAATA
AATGAAATACCATTTGATTCAGACAGAAAGCTTATGTCTACTGTAAATAGTATATATGGAGATTATATAA
TGTTTACAAAAGGTGCTCCAGATATTGTGTTTAGTAGATGTAAATATGCTTTGAAAAATGGTTCAAAAGT
AGATATAACAGATGAGATAATAGAAGAATATAAACATAAAAATGAAGAGTTTTCAAATAGAGCACTTAGA
GTATTAGCTTTTGCAATAAAAGATGTCCCAGAAGAAGATTTTATACCTTCAATTGATGACGAACATGACA
TGACATTGGTTGGAATAATGGCAATGATAGACCCACCAAGAGAAGAAGTAATGGATGCAGTAAAAGAGGC
AAAGAGTGCTGGTATAAAAACTGTTATGATAACTGGTGACCATAAAACAACAGCAGCAGCAATTGCAAAA
GAGATTGGTATAATGGAAGAAGGAGACTTGGCTCTTACTGGAAAAGAGCTTGATGCTTTGAGTGAAGAAC
AACTATATGAAAAACTAGAAAATATAAGTGTATATGCCAGAGTCTCGCCAGAAAATAAAATTCGTATAGT
AAAAGCATGGCAACATAAGAATAATATAACAGCAATGACTGGTGATGGTGTTAATGATGCACCTGCATTA
AAACAAGCAGATATAGGAATTGGTATGGGAAGTGGTACTGATGTAGCAAAAGATGCTTCTGCTATGGTAT
TGGTTGATGATAACTTTGCAAGTATAGTAAATGCTGTTGAAGTTGGTAGAACAGTATACAGTAATATAAT
AAAATCAATTACTTATCTATTTGCAGGAAACTTAGGAGCTATAGTATCCATAGTATTTGCAGTGTTTGCA
GGTTGGTCAAATCCATTTACAGCTTTACAACTTTTGTTTATAAACTTAGTAAATGACTCTTTACCAGCAA
TTGCATTAGGGTTTGAAAAGTCAGAAAAAAATATAATGAATAAACCTCCTAGACACCCGGATGAAAGTAT
ACTAGCAGGAGGAACATTGAAGGCAGTTGCTATAAGAGGTTGTATAATAGGTGTAGTTACAATAATTGCA
CAATATATAGGATTACAAGTATCTCCAGAACTTGGAGTAGCAATGGCATTTTCAACATTGATATTAGCTA
GAATAATGCAAACATTACCTGCACGTTCTAATAATCAAACAGTAATAAAATTAGGTTTTTTCAGCAATAA
ATACGTTATAGGAGCAGTTTTAGTCTGTCTTGGGCTTTACTCTTTAACACTAATACCAGTGCTAAGAGGA
ATATTCTCTATACCAACAACGTTTGGATTGTACCAGTTGGGGATTTGCCTAGGGTTAGCATTAATTTCAT
CAATATTAATGGAACTTAACAAATTAATAAATAGAAGTGAAGTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2807695-2807048 putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGAAAATTTGTGTAGCAATAATTTTTGCTCTATTTATAGTTTTTGTAGAAATGTTTATTGATA
GCTCTAGCGAAGGAAGTAAAATTATGACAGCTGAATTAAGTAAATACAGGAAAGGCGTAAATGTATTATC
AATAAACAATATTATAGTAGCGAATAAAAAATATAGTTTGCCCAAAGATTATTCTCCTCAGGAAAGCAGT
GAAGCGAGAGATGCTTTTTATAAAATGAATAAAGATGCTCAAAAGTCAGGATTAAATTTAAAAGCTTTTA
GTACATATAGAAGTTATGAATATCAAGATAGATTATTTAAATCATATGTAAAAGAACATGGAGAAAAAGA
AGCAAATAGATTTTCAGCTAAACCTGGAGAGAGTGAGCATCAAACTGGACTTGCTTTTGATATTGGAGGA
GATGACCAGTCTTGTTGGGCAAATAAAAAGTTCAACAATACAAAAGAAGCTAAGTGGTTGTATGAAAATG
CATATAAATATGGTTTTATACTTAGATATCCAGAAGGTAAAGAGAATATAACAGGATATATGTATGAATC
TTGGCACTATAGATATGTTGGAACTGAACATAGCAAAAACTTTGCAATGAATAATTTGACTTTAGAAGAA
TATTTACATATAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:2807956-2808864 TetR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
GTGAAAGGAGATAATAAAGTGACAGAAAAACAAAGGCTCATTATAAATATTGCACAAAAAATTTTTGACC
AAAAAGGTTTTCAAAATACTTCAATATCGGATGTTGTAAAAGAGTGTAAAATGTCTAAAGCTACTTTTTA
CAAGCATTTTGAAACTAAGGAAAGTTTTATCTGCGAAATAATCAATTATTATGATGAAAAGTTTTTAGAA
ATTATACATTCCATAAACGAAAATAATGACATTCCATCATCAGAAAAGTTAAACAGAAAGATAATTGCTG
TATGGAAAAATATTTTTTCTAGAACTACCATAAATACCTATATAAGAGAAAATTTTTCTGAAGAGCAACG
TAAGGCTACAAGTAAATTGCAAACAAAATCACGAGCTAACTTATTGAATGAATACAAATTAAGCTTATTT
GATAACTATGGTGATAAAATAGAAAAAATTATATTTGATTTAGTTTTCTTATTGGATGCTCTAATTCATC
AGTTTATATACATTATTCATGTACAAAAAAGAGAAATAAATGTATACTTTATTGCCAAATTTACTATACA
AATTCTAGATTTAGTTGTAGAAAATATGGATAATCTAAATCCTTTAATTGAAAAATCAATGTTTTTACAT
AAACAAGAAGATGAAGTTTACTTTTCCCTTCATAATAAATCGCTATTTTTTAAAACGATACAAGATATAG
AAGAACTAATCAAAACTGATACTTCTCTCCTTGAAAATCCTAAATTACTAGAAGCAATAAAAAAATTATA
CGTCGAGGGAAAAAATCAACAATATGATTCTTTAATTATGGATGCAATGATTGCATATTTAGAAAAAGAA
GACACTTTAAGACCAAAAGTACTTTTATTGAACAGCATTAAAAATCAATTAAAAAAGGAGACGTTATAA
>ref|NC_013316.1|:2808868-2810268 putative transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAACCCAAAGTAACAATAAAAAAGGAAATTTAATAATAGCAATTGTAATGACTGGTGCTTTTATAA
GTTCTCTCAGTCAAACACTATTGTCAACAGCATTACCTAATATAATGTCAGATTTTAAAATTACTGCTGA
TATTGGTCAGTGGTTAACAACAATTTATCTACTTATTGCAGGTATTATTGTACCCACAACAGCTTATTTA
ATAAATCGATTTAGTACTAGAAAGTTATTTATTACATCAATGTCTATCTTTTCTATAGGATGTATTATTG
CACTTTTTTCTAATAATTTTTCAACTATGTTGATTGCTCGTGTGTTGCAGGCAATGGGTTCTGGTTCTCT
AATGCCACTTTTACAAGTTATTATACTCTATTTATGCCCTGAGGAAAAACGTGGTGCAGCTATGAGTTTA
GTTGGTATTACAGTAGGATTTGCTCCAGCAATAGGTCCAACTTTATCAGGATGGTTAGTAGATTCATTTG
GTTGGCATAGTTTATTTCTGTTTCTTTCCCCTATTGCTATATTAGATGTTATACTATCATTTATTCTATT
AAGAAATGTTGGGGAAACTCAAAAACTAAAGTTAGATATACCTTCAATAGTACTATCATCTCTAGGTTTT
GGTGGTTTATTAATTGGATTTACTAATCAAGGTAATTATGGGTGGACTAATATTGCCACATATTTACCAA
TATTAATAGGAATTATGTCATTAATTTTATTTACATTGCGTCAATTAAAATCTAAAGAACCTTTTTTAGA
ATTGAGGGTTTTTAAAAATAAACCATTTCTTATTTCTACAATATTAATTATGATTGTATATGCCTCAATG
ATGTCTGCTACATTAATGATTCCTCTGTACGTTCAATCTGTAAGAGGATTTTCTGCATTATCTTCAGGTT
CATTAATGTTACCTGGTGCTATATTGATGGTTGTACTCAATCCAATTGCAGGACGTCATTTAGATAAATA
TGGACCTCATGCTCTATCAATATTAGGAACAGGATGTTTGTTTTTAGGAACTTTATCCTTCGCTTTTTTA
GGCAGAGATACATCTTTAATTCATGTGTCATTGATGTATTGTATTCGTATGATTGGTATTTCAATGGTTT
TAATGCCATTAACTACATGGGGAATTAAAACATTAGATAGAGAACTTATATCTCATGCCACAGCAATTAA
TAACACACTCCGTCAGATATCTGGAGCTATAGGTTCTGCTATACTTATTACTATAATGACAAGTGCTACT
AAGAAAGCTCATATGAGTTCAAACATGCTGTCTAACATTCATGGAATAGATGTTGCATTTTCAATAGCAG
CTACTCTTGCATTTACTGGTTTAATTGTATCTATATGTTTTATAAAAAGACATCAAATTATTAGAAGTTA
A
>ref|NC_013316.1|:c2811111-2810392 hypothetical protein CDR20291_2399 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAGAATATTTAGAGGAAACAAAAATGTTAAATTATAATGAACCACAACTTAAGCTTTTGGTAT
CATCAAAGAATTGGTTGGAATTAGATGATTTTCATAAAATAAAATCTATTTATGAGTTTGTACAGAATGA
TATTTTATTTGGATATAATGCTTCTGATATGTTAAGCGCAACACAGGTATTAAATGATGGTATGGGACAA
TGCAATACAAAAGCTACTCTTTTAATGGCATTATTACGTGCAGTGAATATCCCTTGTAGGCTTCATGCTT
TTGATGTAACAAAAGATTTTCAACGAGGTGCTACATCCAAATTGATTTCACTATTAGCACCAAAATATAT
TCTTCATACTTGGGTAGAGGTATTTTATCAAGATAGGTGGATTGCTCTGGAGGGTGTCATAACTGATAAA
AAATATTTAGAAGCAATTCAGAAGAAGTTTTTTAATCATGGTGGAACGTTTAAAAAGTATGCAATAGCTA
CAAATGATTTGAAAAATACATCTATTGATTGGGATGGTAAAGATACTTTTATCCAAAAAGAAGCTATCGT
GTATGATTATGGTATTTTTCCATCACCAGATGTATTTTTTTCTACTCATTCACAACATATGTCAAAATTA
AAAAATTTCATATATGTACATCTTATCAGAAAAATAATGACAAAAAATGTATGTAAGGCTAGAAACAATT
ATATTGATAAAAACGAATGA
>ref|NC_013316.1|:c2811946-2811158 AraC-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
GTGATATTTTTAGAAGAATGGGGTGATGCAATGAACATTATAAATAAAATTTTTTGGCAAGAAGATAGGA
TTGGCATGATTACAAATAATTTAGAGGCAGATACACATAGCCACTGCATGTTACAACTGTTCTTAGGGAT
AGAAGACAGCATTGAAATAACAGTCAATGAAAAATTAGTTAAATGTAATTGTATCATAGTAGATAAAAAT
ATCTCTCATTCATTTTCAGCAAGAAAAAAAGTTTATTACTCTGCTATTATTGAACCTACATCTATATATG
CAGAACAGCTTACCTCAAAAATGAATGATTTTGGCTACTGGATATGTGACAATGATGGATTAGAGAAATT
ACGTCAACAAGGAACTTTTTTGATATATAACTCTAGTAAAGAACAATATTTAAGATTTATGGAAATGCTT
AATAACTATTTGAATATACCTATAACTCTCAAACATTATGATGACAGAATTACTGAATTGCTCAATTTAT
TACGTACTTGTAATTGTGATAATCATACTATTTCAAGTTTTGCAGATAAAGTGTCCCTATCAGCAAGTAG
ATTATCACATCTGTTTAAAGAACAAATAGGGATACCTTTAAAAAGCTATATCTTATTTCATCAAATGGAG
TGTGCTTTTAGAGAATTACTTTCTGGGAAAAATGTTACCGAAGCTTCTATGACTGCTGGATTCGATACTC
CATCACACTTTGCAGGGACAGTTAAGCGAATGATGGGAATGCCTGTTTCTTTATCTTTGAAAGATAGCGA
ATTTTTGAAAGTATATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2813399-2812047 putative 6-phospho-alpha-glucosidase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTATTACTATTGTTGGTGGAGGAAGCACATTTACTCCAGGTATTGTTAAGTCAATTGCGTTAAGAG
AAAAAGAGTTAGAGCTTGAGGAAATTCGCTTATTTGACATTGATAAAGAACGCCAAGATAAAGTAGCTGT
AGTTGTCAACTGGATACTAAAAGAAGATGTTAAAACAGATGTTAAACTAACTGTAACTAATTGTGAAAAA
GAAGCGTATACAGATGCTACATTTATATTTGCACAAATGCGTGTTGGTAAATATGAAATGCGTGAGCAGG
ATGAAAAAATTCCATTGAAATATGGTTGTGTAGGTCAAGAAACTTGTGGTTGTGGAGGGATGGCATACGG
ACTGCGTACAATACAACCAATGATAAAGGTTATTGATGATGTAGAGAAATATGCTAAAAAAGATTATTGG
ATATTAAATTACTCTAATCCTGCTGCAATCGTTTCTGAAGCTTGTCGTAAGTTAAGACCAAATGCAAGGA
TTATAAATATCTGTGATATGCCAATAGCTATTATAGATATGATAGCGGAGTCATTAAATATCAATGACGT
TCATAATATACGCTATGATTATTTTGGTCTAAATCATTTTGGCTGGTTTACTTCAATAGATTATAAACAT
AGAGACTTAATGGAAGAGATTAAGGAATACATAAAAGAAAATAAAATATTATTACCAAAATCTTATATAG
AAAACTTAAATAAAAGTCGTAGTACAGGAAATCGCCATGCTGTAAGTAGCTGGATACATGTTTGGGAATC
TGTTTATACAATGTTAGAAAGCTTCCCAAAATATCTGCCAAACACTTATTTAACATACTATCTTTTAAGT
AAAGAAACAGTGGAACATTCAAACATAAATCGTACTCGTGCAAATGAGGTTATGGAAAGCCGTGAAAAAG
ACTTATTTGAAGGTGTGAGACATTACTTAGAAACTGGAGAAATTTCTGAAAAAGTATTTTATGCAGGTTC
ACATGGAGATTGGATTAGTGATTTGGCAGTTTCAATTAAAAATGATACACGTAGTCGTTTTTTAGTTATA
ACTGAAAATCGTGGAGCTATACCAAACATGCCATATGATGCAATGGTAGAAATTCCAGCATATATTGGTA
AAGATGGTCCAGAAGTTATTGCTCGAGGTCCAATACCTCTATTCCAACAAGGATTAATGATGCAACAACT
TAACAGTGAAAAATTGATAGTAGAAGCTTATATAGAAAATAGTTATGAAAAAGCTTTACAAGCATTCACA
TTAAATAAAACTATTCCAAGTATGAATGTTGCTAAAGAAATTTTGGATGAAATGATAGAAGTTAATAAGG
AATACTGGCCAGAATTAAGATAG
>ref|NC_013316.1|:c2815001-2813496 PTS system, IIbc component [Clostridium difficile R20291]
ATGGTTCAGCCATTAATGTATTTATCGAGTGCAGGAATATTAATGGTGGTAGGTGTACTACTTACAAATG
ATATGTTATTAGGAGTACTTCCATTTTTTAAATGGGAGCCAATTCAAATATTTGGAAGCCTAATTTATAA
CTGTATAATGGCTATTATTAATAATCTTGCTGTTATATTTGCTATAGGTATTCCTGCTGCACTAGCAAAA
AAAGAGAAGCACAAAGCAGCGTTAATAGGATTTATGAGTTATATAATATACCTTACAGCTTCCAACACTA
TGTTAACATCACTAGGTCAACTAGCAAAAGAAAGCAAGATGCTTGGACTGATAGGGACTGGACAAGCTAC
TATTTTAGGTATTCAAGTTGTAGATACAAGTGTATTTGGTGGAATTATTTTAGGGTGTATAGCTGGATAT
GTATTTAATCGTACAAGCAACAAAACATTTAAAGGAGCTTTACAGATATACTCGGGAGCAAATTTTAGTT
TTATATGCATGTTCTTTGTATCCATTTTAATTGGAGTTGTGAGTAACTTTATATGGCCATTAGCTCAACA
AGGAATAGCTTCTCTTGCAAATGTCATCAAAGATACAGGTACATTTGGTTTATTCTTATATGGTTTTTTA
GAGAGAATATTAGTACCAACTGGACTTCATCATTTAATCTATACACCATTTCAGTTTTCTGATTTAGGAG
GAGTGCTTAAAGTTGGTGCAGATACAGTTTCAGGAGCCTATGCTATAGTTATGACAGAAATGAATTTACC
AGTTGAGCGTTTCTCAGATAGTATATACTACATGGCAACTGGATTTACAAAGATGTTTGGTTATATAGGT
ATAGGAGCTGCCTTTATTTATACTGCATATAAGCAAAATAAGAAGAAAGTTAAGGCAACGATTATTCCAC
TAATAATTACGGCAGTATTAGCCTCTGTAACAGAACCATTAGACTTTATGTTTGTATTCTGTGCACCACT
TTTATTCTTTGTACATGCAGTTATAGCTGGTCTTTTTATAGCTTTATTAAAAATATTTGATGTTACTGCA
TTATGTGGAGGGAACTTATTAGTATCAATTATAATGAATACTACAGTAGGTGTAGAAAAAACACACTGGC
CAGTAATGATGATATTAGGACTTGCACAAATTATTGTATATTTTGTAGTATTTAGTTTTTTAATTAAGAA
ATTTAATTATAAAACTCCAGGTCGTGAAGATGAGAGTACAGCTACAGGCGAAGAACAATCAAAACAACTT
AATTTAGATGCAGGTATAGAAAATATAATTGATGGGTTAGGCGGAAAAGAAAATATTAATACAGTAGAAA
ATTGCATCACTAGATTACGTGTTAATGTAAAAGATGAAAGTAAGATTAATGAAGATATAATTAATTTAAC
GCCAAATAGCGGGATTGTAAGGAAAGGAAAAGATATACAAATAATTTTTGGACTTCATGTGCATGAGGTA
AGACGTGCAGTAGAAGATTTTTTAGAAGCTTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2815912-2815097 transcriptional antiterminator [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAGTAGTAAAAATCTTTAATAATAATGCATTATCTACAGTAACTAATGATAGGAAAGAAGCTATTT
TACTAGGTCTTGGTATAGGTTTTAATAAACGTCCAGGAGATAAAGTTAATGAAGATAAAATAGAAAAGAT
TTATTATGTTCAAGACCACATGCAAACAAAATTTTTAGAATTATTAAAAAATGTTAGTCCAGAAGTGATG
GATGCTTCACAACAAATTATAAGTCTTATACCAGGAAATGAGGGAAAATTTAATAATAAAGGGATATTAT
CTTTAGTGGAACATATTAGTTTTGCAATAGATAGAATGAAAAATAATGTTTTTTTACCTAATTTAATGCT
TTTGGATATAAAGATGATGTATTCAAAAGAGTTTGAATTAGGAGTAAAAGCTTTAGAAATTATATATAGA
GTATGTCATATCCATTTGCCTGAAGATGAAGCAGGTTACATAGCTTTACATTTTGTCAATTTACAATCAA
ATGATAATTTGGCATATGATACTTTAAAATTTGTAAAAGGTAGTATTGATTTGATTAAAGAATGTTATGG
ATTAGAATTAGACGAATCGAGTTTAAGTACATTACGTTTTAGAACTCATCTTAAATTTCTTGCTCAAAGA
ATTTTTAAGAATGAAATTTGTCAGGATGATAAAATGATTGAAATGTATGATTATTTAATTAACAATCATC
CTAAAAATAAAGAATATTTAGAAAAGTTAAATGTATATATTGAAAAGGAGTTTAGGTATAAATTAGATAA
ACCTGAAAAAATTTATCTACTACTACACCTAACAAAAATCTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2816415-2815933 PTS system, IIa component [Clostridium difficile R20291]
GTGTTAAATTTTTTCAAGAAAAATAAAAGCTATAAGTTACATGCAGTAGTGAGTGGTAACAGCATTAATA
TTGAGAAAGTAAACGATTCTGTGTTTTCAAAAAAGTTAATGGGAGATGGAGTTGCAATTATTCCTAATAG
TAATGTTGTTGTAGCCCCTTGTAATGGTAAAGTAACTGTGCTTACAGAATCAAAGCATGCCTTTGGTATG
GTCTCAGATGAGGGTGTTGAAATATTAGTCCACATAGGAATTGATACAGTTAATTTACAGGGTGAGGGGT
TTAAAAATGAAGTGTCTCAAGGAGATACTGTTAAAAAAGGTAGTCCAATAATAAGTTTTGAAAGAGAAAA
AATAAATTCTCAGGGAATTGATTGTACAACAATAATAATTGTATTAAATCATAGCGAATTTTCAGAAATA
AATTGCATGGTAGAAAATGAAGTTGTTGCAGGGCAAGATACTGTTATTGAAATTATGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2817079-2816699 putative translation inhibitor endoribonuclease [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACATGAAGTAATACATACTAATGATGCACCAGCAGCTTTAGGACCATATTCTCAAGCTATAAAAG
CTGGAAACTTATTATTTGTATCTGGACAAGTTCCTCTTGTACCAGAGACTATGGAAGTAGTTGAAGGAGA
TGTACAAGCTCAAACTGCTCAATCTTTAAAAAATCTTAAAGCTATATTAGCTGAAAGTGGAGCTGATTTT
TCAAATGTAGTTAAGACTACAGTATTTATAAAAGATATGAATGAATTTGGGGCTATAAACGAAGTTTATG
CTGAATATTTTGGAGAAAATAAACCAGCAAGAGCTTGTGTAGAAGTTGCTAGATTACCAAAAGACGTTAA
AGTTGAAATAGAAGTAATAGCTGTATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2818391-2817174 threonine dehydratase catabolic [Clostridium difficile R20291]
ATGATGAATGTTACCTTAACAGATGTGAAAGAGGCTAGAGAGACCATTAAGAACATAGTAAAAAGAACTG
ACTTACTTGAAAGTGTTAAACTTAGCGAAAAAACAGGAGCAAATGTGTTCTATAAATGTGAGAATCTTCA
AAAAACAGGTTCTTTTAAATTAAGAGGAGCTTGTAACAAAATAGCGAGTTTAACAGATGAAGAAAAGGCA
AATGGAGTTATAGCTTCAAGTGCAGGGAATCATGCTCAAGGAGTTGCATTGGGAGCAAAAATGACTGGTA
TAAAATCTACAATAGTAATGCCAGCAACTGCGCCTTTAGCAAAAGTTAGTGCAACTAAAGGTTATGGAGC
AGAAGTAGTTTTAAATGGTGCGGTTTATGATGATGCATATGCAAAAGCTGTTGAAATACAAAAAGAAACA
GGAGCAACTTTCTTACATCCATTCAATGATAAGTATGTTATAGCAGGACAAGGAACTATATCTCTTGAAA
TTTTCGAACAATTAGACAATAAAGTTGATACTATACTATGCCCAGTTGGTGGAGGAGGAATCATCTCTGG
TGTTGCTGTTGCAGCAAAAGCATTAAATCCTAATGTAAAAATAGTCGGTGTTCAAACTGCAAATATACCT
TCAATGAAAGAGTCAATAAAAAATGGAAAAGTAACAACAGCATTTAATGATACTACAATAGCTGATGGTA
TAGCTGTTAAAACTCCAGGAGATTTAACTTTTGAAATAATAAATGAATTGGTTGATGAAATAGTAGTGGT
TGAAGAGACAGAAATTGCAGAATCAATATTATTTATGATGGAAAGTCAAAAAATAGTTTCAGAAGGTGCT
GGTGCTGTATGTACAGCTGCTATATTAAGTGGTAAGTATGTACCAGCAAAAGATGAAAATGTAGTTTGTA
TAATATCTGGTGGTAATATAGACATAAATACGTTATATAGAATAATAGGTGTTGCTTTAGCTAAAGAAGG
AAGAAGATATTCATTTAGTACAATTATGGAAGATAAGCCAGGAAACTTTGCTGAGTTAACTAGAATAATA
AGTGAGAATGGTGGAAACATTTTAAGTGCTAATCAAGGTAAATTATCAGCAGGGGAAGCTCTAGGAAAAC
AAAGTGCGGAATTTATATTAGAGACAATAGATTATGACCATATAGCTAGAATAAAGAAAGCTATAGAAGA
AAAAGGTTTTAAAATTATAGAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:2819050-2820678 L-aspartate-beta-decarboxylase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATCATACTTATAAAGAAATCAAAAACATATATGGAAAAATAAGCCCTTTTGAATTTAAGGACA
AATTAATAGATATTGCAAAATACACTGCAAAAGAAAATAACAGAGAATTACTTGATGCAGGTCGTGGAAA
TCCAAACTGGACTTGTTCAACTGCTAGAGAAGCCTTTTTTACTTTTGGTCATTTCGCTATTACTGAAACT
CGTTCTAATTGGGATTTAGGTCATTTGGCTGGAATGCCTCAAAAAAAGGGTATTAAAGAAAGATTTTTTA
AATTTATAAATGAAAATATAGATATGCCTGGAGCATATTTAGCTAGAGATATTATAAACTTTGGTATAAA
TGAACTTGGATTTGATGGAGATGAATTTGTTCATGAACTAGCTGATGGAATTATTGGTGATAACTATCCA
CTTCCAGATAGAATGTTACCTCATATGGAAAAAATAGTACACGATTACCTAGTTCAAGAAATGAAATATG
ATATATCAGGTAAATATGGTGATGTAGAAATTTTTGCTGTTGAAGGTGCTACAGCTGCTATGTGCTATAT
ATTTGATTCATTAATGGCAAATGAACTTCTAAAAAAAGGAGATACAATAGCCTTAATGACTCCAATATTT
ACACCTTATCTTGAAATACCTAACCTTCCTCGTTACGACTTTAAAGTGGTAAATATAAATGCTAATGAAG
TTGATGAAAAAGGTGCTCATACATGGCAATATACAAAAAAAGAATTAGAGAAACTTCGTGACAAATCTAT
TAAAGCTTTATTCGTTGTTAATCCTAATAATCCTGCTTCTATAGCTATGGATGAAATATCTTGTAATAAT
CTAATAGATGTAATTGAAAATTATAATAAAGATTTAATGATAATATCAGATGATGTATATGGAACTTTTG
TAGAAGATTTTTCATCCTTAATGTCAAAACTACCTTACAACACTGTTGGAGTATATTCTTATTCAAAATA
TTTTGGAGTTACAGGATGGAGACTTGGTACATTTGCCCTTCATAAGAAAAATGTTTTTGATAAGAAAATA
AATGATTTAACTGGAGAATTAAAAAAATCAGTAGATAAGCGTTACAGTGATATGAGTCTTAACCCTTCTA
GTCTTTCATTTATGGAAAGAGTTGTTGCTGATAGCAGACTTGTTGCTCTCAACCATACTGCTGGTCTTTC
TACTCCACAGCAAGTACAAATGGCGTTTTTCTCTGCTTTTGCATTGATTGACAAAGTAGATGCCTACAAA
AAACTCAATATGAGTATCTGCCATAGACGTCAAAAACTATTATTTGAAGCTTTAGAGCTTCCAATTAATG
AAAACAAAAACAATGCTGCATATTACACTCAATTTGATATTGAAGAATGGGCTAAATTAAACTACGGAGA
AGACTTATTTAAATTTATAAGTAAAACTGCATCTCCAGTAGATGTTCTTTATAAATTAGCTAATGACTAT
TCAGTAGTTTTACTTAGTGGAAATGGATTCTATGGCCCTGAATGGTCAATTAGAATATCTCTAGCAAATC
TATATGATGAAGCTTATACTAAGATAGGAAAAGCCATAAGAGAGATATTAAATGGTTATATCGTTGAATG
GCAAAAAATTAAGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2820799-2821794 putative L-asparaginase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTATTAAGAAAAAAGTTGCCATAGTTTTTACTGGTGGAACTATATCTATGACAGTAGATGATAAAG
TCGGAGCAGCTATACCAACTTTATCAGGTGAACAAATACTATCAATGGTTACCAACATTGATAAAGTTGC
AGATGTTGAAGTTTTTAATTTTGATGAAATTCCAGGACCTCACATAACACCTTATAGAATGATGGAATTG
AAAAATTATGTAAATGATTTATTAGCAAGAAAAGATATTACAGGTGTTGTAATAACACATGGTACAGATA
GTTTAGAGGAAACAGCTTATTTTCTAGACCTTACAATTGACAACATCAAACCTGTAATAGTCACAGGTGC
TATGAGAAGTAGTTCTGAACTTGGATATGATGGTTCAAGTAATTTATCTGCATCAGTTTGTACTGCAGTA
TCCAAAGATGCTATGGGAAAAGGAGTCCTTGTAGTTTTAAACAATGAAGTATTATTAGCTTCTGAAGCTA
CTAAAACAAATACTCTTTCTCTAAATACATTTAAATCTCTAACTAGTGGTCCATTAGGAATAATTGACTG
CAACGAACTTGTCCTTACAAGAGATATTGTAAATAGAACAATTATAGATACTGATAAGGTAGAATCTAAA
GTTGCCTTATTTAAAGCATATGTAGGAGAAAATGCTGACTTTATAAGATTTGCTGTTGATAGTGGTTATA
AAGGTATAGTTATTGAGGCAATGGGTATAGGTAATATTCCTCCTCAAATGCTTTCTGGAGTTGAATATGC
TAGAGAAAAAGGACTTCCTGTAGTTATAGTTTCTAGATGTCATTCAGGTAGAGTATTCGATAGTTATGGT
TACTTTGGTTCTGGTAGAGATTTAAAAAATCTTGGTTGTATATTTGGTGGGGACTTGCCAGGTCAAAAAG
CTAGAATAAAACTTATCTTAGCACTTGGAAAAACTGATAACCTTGATGAAATCAAAGATTTCTTTGAAAA
AGGAATCTATTGCTAA
>ref|NC_013316.1|:c2822638-2821952 hypothetical protein CDR20291_2409 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGGGGTGTGTACAAATGGAGACTGTATCAAATAATCAATCAAGTGTAGAAATTCAACTCAGTCTGT
TTGAAGCTATCAAAGATTTATTGTTAATTAATCCTATTTTCTTGTTGGGAATTATCTTGATTGGTATTTT
CTTAGTTGTAATATTCAAGAAAAATAGTGATATTCCAAAGGTAAAAACATCTATTTTATCACTGGCAATG
TATTACTACTTATGTTTAACACTATCGCATATTGTTGGTATCCCTACATTCAGTGAATATATAAGACTGT
CACAGTTAGGGGAAACGTTCTTTAATCCAAACATAAATCTTATTCCTTTTAGTGATGGATTTAGTTTGAG
TTTTATTTTGAATATTTTACTTTTTGTTCCATTAGGTTTTTTATGTCCGCTTATCAGCAAAACCTTTGAA
CGGTTGAGAAATACATTCTTGATTGGTTTTGGATTATCTCTCTTTATCGAAACTATTCAGCTTTTTACGT
TACACAGAGCAACCGATATAGACGACTTACTCACGAATGTAATTGGAACAATAATAGGCTATTTCTGCTT
CAAACTGATTGCTAAATTGCGAATTGTAAAACTACATTCAGATGATGACTCTATGGAACAGGATTACACA
GTATGTATTCCGATTGCCATTATAATAGTTGCCCTTATATTAGGATTTTTTAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2825878-2823458 leucyl-tRNA synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCGTATATAATTTTAAAGAAGTAGAATCGAAATGGCAAAAAATTTGGAAAGATAATAATCAGTATA
AAATGGATACTGCACAAACTGAAAAACCTAATTATTACACATTAGAAATGTTCCCTTATCCATCTGGAAA
AATACACATGGGACATGTTAGAAATTATTCTATAGGTGATGTTGTCGCAAGATTCAAAAAAATGGAAGGA
TATAATGTACTTCATCCAATGGGATGGGATTCTTTTGGATTACCAGCTGAAAATGCAGCTATAAAACATG
GAATACATCCGCATAAATGGACAATGGAAAATATAGAAGAAATGAAAGAGCAATTAAATTTATTAGGTAT
TAGTTATGATTGGGATAAAGAAGTTGCAACTTCAACTCCAGAATACTATAGATTTACACAAGAAATATTT
TTGAAGTTTTTAGAGCATGGGCTTGCATATAAGAAAAAATCATATGTTAACTGGTGTCCTTCTTGTGAGA
CTGTTCTTGCAAATGAGCAAGTTGTTCAAGGAGCATGTGAGAGATGTAAAGCAACAGTATTAAAGAAAGA
TTTAGAACAATGGTATTTTAAGACTACTGAATTTGCAGAAGAATTACTTAATGACTTAGATACATTAGAT
GGATGGCCAGAAAAAGTTAAAACAATGCAAAAAAATTGGATAGGTAAAAGTACAGGAGCAGATTTAGTTT
TTGATATAGATGGAACTGATAAATCTATGACAGTATTTACAACTAGACCAGACACAACTTATGGAGTTAC
TTATATGGTACTTGCTCCAGAGCATGAATTAGTTAAAGAATTGGTTGCAGGGACTGAATATGAAGCAGAT
GTTGAAGCTTTTGTTCAAAAAATGCATACTATGACAGAAATAGAAAGAACAGCAGCTGATGTAGAAAAAG
AAGGAATGTTTATAGGTAGATATGTTATAAATCCTTTAAATGGCAAGAAAGTTCCTCTATGGATAGCTAA
CTATGTATTAGTTGAGTATGGAACGGGTGCTATAATGGCAGTTCCAGCACATGATGAAAGAGATAGAGAT
TTTGCTGAAAAATATAATTTAGACATAATTGATGTAATAACAGAAGATAACAAAATGATAAATTCAGAAG
AATTTAATGGATTAGATGCTTCAGAAGGATTTGAAGGAATAATCGATAAGTTAGAAAAAGAAGGTAGAGG
AAAGAGAACAATTAATTATAGACTTAGAGACTGGTTAGTTTCAAGACAAAGATACTGGGGTTGTCCTATA
CCTGTGGTTTATTGTGATGAATGTGGAATAGTTCCAGTTAAAAAGGAAGATTTACCAGTTCTTTTACCAA
CAGATGTTGAATTTACTGGAAAGGGAGAATCTCCACTTACGACTTCAAAGCAATTTATGTCAACAACTTG
TCCTCACTGTGGAAAACCAGCTAGAAGGGAAGTTGATACTATGGATACATTCGTTGATTCTTCTTGGTAT
TTCTTAAGATATGTGGATAGCAATAATGAAAATGAACCATTTAGTAAGGAATTAGTTAATAGATGGCATC
CAGTAGACCAATATATAGGTGGAGTAGAACATGCTATAATGCATTTGCTTTATGCAAGATGGTTTGTAAA
GGCATTTAAGAGTATGGGAATGGTAGACTTCAATGAGCCATTTAAAAACTTACTTACTCAAGGAATGGTA
CTTATGGATGGTTCTAAAATGAGTAAGTCTAAAGGGAATACAGTATCTCCTATGGATATAATAGATGAGT
ATGGAGCAGATACTGCAAGACTTTTCGTATTATTTGCAGCACCACCAGAAAGAGATTTAGACTGGTCAGA
GCAAGGTGTTGATGGATGCTTTAGATTCTTAAATAGGGTTTATAGATTGGTTGACGAGTTAGCAGATGTG
GTTAAAAAGGATGTAGAGTTTGGAGAATTAAATTCCCAAGATAAGGATATGAGATATACTATACACTCTA
CACTTAAAAAAGTTACTGCTGATTTAAGTGAAAAATTCGGATTTAATACTGCTATATCAGCTCTTATGGA
ATTAATAAATGATATGTATAAATATAAAGAGTTAGATAATATAAACGAAGCAGTTATAAAAGAAGGTGTA
CAAACTATAGTAACTATAATTGCACCATTTGCCCCTCATTTAGGTGAAGAACTATGGACTATGATAGGTA
AAGAAGGAAGTGTATTTGATATAGACTGGCCTAAATATGACGAAAAAGCTTTAGTAAAAGATGAAATAGA
AGTTGTTGTACAAGTTAATGGAAAAGTTAGAGGAAAATTAACTGTTAACTCAAATATATCTAAAGATGAG
ATGGAAAAGGTAGCTTTAGAAGATGAAAAAATAAAAGGATTAGTTGAAGGTAAAACTATAGTTAAAGTTG
TAGCTGTACCTAAAAAATTAGTAAATATAGTTGTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2826582-2826232 hypothetical protein CDR20291_2411 [Clostridium difficile R20291]
ATGACAGTGGAACAAATGACAAAAATAGCATATGATGCCATAGAAGATAAACTGGGTCAAGATACAGTTA
TAATAAATATAGGAAAAGTTTCTAGTTTGTGTGATTATTTTATTATTACTACAGCATCTTCTCAGAGACA
GGTAAAAGCTATTGCTGACAATGTGGAAGATGAATTAGCAAAACTAGGATTAGAGCCAAGAGGTAAAGAA
GGACAAGGAACTCAAACTTGGGTACTCCTTGATTATGGAGACATAATGGTTCATGTATTTAATGAGGAAA
ATAGAGGGTTTTATAATTTAGAAAAATTATGGAAAGATGCACCTTATATAGATATTGACACATTAGCATA
A
>ref|NC_013316.1|:c2827271-2826699 putative metal dependent phosphohydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAACTTAGAAAATATTAACCAAAGACTAAATCAAATGCTACCAGTGGGGAGGCTTAGCCATTCAAGAA
ATGTTGCAAAATGTGCTGAAAAATTATGTGAGATTTATGGATGTGACAAAGAAAAAGCTTACTTAGCAGG
AATGATTCATGATTGTGCAAAGTATTTAAGTGACAAGGAAATAGAGGATTATGTAAATAAGTATGAAATA
TATTTAGACCCAATAGAGGATGGAAATCGTTCCTTGTCTCATAGTGTAATTGGGGCGTACATATGCGAGT
ATGAATTTGAAGTAGAAGATGAAGATATTATAAATGCAATCAAATATCATACAACAGGGAGAGAGGACAT
GTCTCTTTTAGAAAAAATAATTTACATAGCTGATTTAATTGAAGAAGGAAGAAAATTTCCAGTTGTAGAT
ACATTAAGAGAATTAGCATATGGAGGGAAGCTTGATGAAGCACTTTTAACTTCTTTTAATAATACTTTAA
TGTTTGTCATCAATAAAAAAGAAGAGATACATCCAAGAACAGTTATGGCAAGAAACTATCTAATTAAAGA
AAAGTTATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2827961-2827272 nicotinate-nucleotide adenylyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAGTGAAAATCTAGTTAAGATGGCAGAGTTGAAAAATACTGAAAAACTAGAGAAATTTAATCGCC
ATAAAGGCAAAATCAAAATAGGTATATTGGGAGGTACTTTTGACCCTATACACTATGCTCATTTAGCAAC
AGCAGAATTTATTAGAGACAAGTATGACATTGACAAAATAATCTTTATACCATCAGGAAATCCACCACAT
AAATTATGTATCACTACAGATAAGTATGATAGATATAATATGACACTTCTAGCAACTGAAAGCAACGAAG
ATTTTTTAGTTTCAAAAGTAGAAATCGAAAGAAAGAAAAGGACTTATACAATAGATACATTAAAATACTT
AAAGAAAAAATACAAAAATGCAGACATTTATTTTATAACAGGTGCAGATGCAATTTGTAGTGTTGAAGAG
TGGAAAGATGTAAAGAAAAACTTTGAGTTAGCTACTTTTATAGCCGCAACTAGACCAGGAATTAGTTTGT
TAAGGTCACAAGAGACTATAGAAAAACTAACTAAGAAGTATAATGCTGACATTATAACAGTTTATGTTCC
ATCACTGGATATATCGTCCACATATATAAGGGAACAGCTAAATGAAGGCAAGTCAATACGTTACTTAGTA
CCCGAAAATGTAGAAAATTATTTATATGAAAATAAACTATATCAATATGGAGATGATTAA
>ref|NC_013316.1|:2829028-2831031 glycogen branching enzyme [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGTCAAAAAAGATTTAAAATTTTAGATATTGATGTATACCTACAACCATTTGAATCTGATATAA
AAAAGCGAATGAAACATTATGAGGATATGAAATCAAAAACATTGAAAAACTATAAAGATTTTAGTTCTTT
TGCAAATGCTCATCTTTACTATGGATTTCATCAGACAAATGATGGATTCTTCTATAGGGAATGGGCTCCA
AATGCAGATAGTTTGTCACTAATTGGTGACTTTAATAATTGGAATAGAAAATCTCATCCTCTAAGAAAAA
TTGGGTCTGGTAATTGGGAAATATTTATTCCTGGTCAAAATAGCTTACCTCACAAATCAGAGGTAAAGGT
ACAAGTTACTGCAAATGGAAAAACATTTGACCGTATACCATTATATATAAAAAGAGTAATTCAAAAAGAT
TTTGGTGGATTTAATGGACAAATATGGCAACCAAAAACTCCATTTATCTGGACTGACAATAATTTTGACT
TAAAAAACATAACTTCTCCACTAATCTATGAATGTCATATAGGTATGTCTACTGAAAGCGAATCTATTGG
AACTTATAATGAATTTACTGAAAAAATACTTCCTAAGATAAAAAAAGCTGGATACAATACCATTCAGCTT
ATGGCTATTATGGAACATCCATATTATGCATCTTTTGGATACCAAGTTTCAAACTTTTATGCAATCTCAT
CTAGGTTTGGTACTCCTGAAGACTTAAAAAACCTCATAAACACTGCTCATTCAATGGGGATTGCTGTTTT
ATTGGATTTAGTTCATTCTCATGCTGTAAAGAATACTTTAGAAGGAATAAATGAGTTTGATGGAAGTGAA
CATCAATTTTTCCACTCAGGTTCAAAGGGAAATCATCCTGCTTGGGGTACAAAACTTTTTAACTATGGTA
AACCTGAAGTAATACATTTTTTGCTTTCAAATATAAAATTTTGGTTAAATGAGTACCATTTTGATGGCTT
TAGGTTTGATGGTGTGACTTCAATGTTATATCATAACCATGGTCTTGGAGTTTCATTTGATAGTTATGAA
AAATATTTTAGTATGAATACAGATATTGAAGCTATAACATATCTCCAATTTGCAAATGAATTAATAAAAG
AAATTAAACCTAATTCGATAAGTATTGCAGAAGATATGAGTGGAATGCCTGGTATGTGTATCCCTATAAA
AGACGGCGGAATTGGATTTGACTATAGACTCGCAATGGGAGTACCTGATTTTTGGATAAAAACTATCTCT
AACTTATCTGATGAAGACTGGGATTTGGGAAAAATGTGGTATGAACTTACTACTAGACGACCTGGAGAAA
AAAATATAGGATATTGTGAATCCCATGACCAAGCATTAGTTGGCGATAAAACAATTATTTTTTGGCTAGC
TGACAAGGAAATGTACTGGAATATGGAAATAAACTCAAATAACCATGTTATCAATAGAGCAATATCTCTT
ATTAAATTAATTAAATTAATAACTTTTTCTCTAGCAGGTGAAGGATATCTAAATTTTATGGGAAATGAAT
TTGGACATCCTGAGTGGATTGATTTTCCACGAGAAGGCAACAATTGGAGCTATAAGTATGCCAGAAGACA
ATGGAGCCTTTCAGAAGATAACAACTTAAAGTATAAACAATTATTAAATTTTGATAAATCTATGCTCGAA
CTTACAAAATACAGTGATATTTTTATCCAAAATAGTCATGAACTTATACATATGGATAATGATAAAAAGA
TTTTGGTGTACAGTAAGGGCAAATATTTATTTATATTTAATTTCCACCCTAATCTAATACAATCAGTTGA
TATTTCAAAGTTTCAAAATACAAACTACAAAACGATATTAAATACTGATATGGTAGAGTTTGGAGGAAAC
ACAAAAAAAGAAAACTTAAGAGATTATGATGTATACTTTAGCTCAACTCCTCCTTCTTCTAAAATGCCTA
TTGCCTCTCGTACAGCAATAGTACTTTTAGATAATGGCATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2831645-2831334 hypothetical protein CDR20291_2416 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATTATTACAGAAATAGTTGAGTTTAATGTGGAAGAAAATTTATCAAAAGAAGAGTTTATAGAAA
TTGTAAATGACTTAGAATTAAAATTTCATTCTATTCAATCTGGTTTTATTGATACTGAGCTTTTATATGA
TGAAAAGTCTCAAAAGTGGATTATGATACAACATTGGGAATCTATAGAAGACCTCAAGAGTGCTTCTAGT
AAAATGTTTAAAGATTCTTCAACTGAGAAATTTAGAAAAGCTTTAAAGAATCAAACTGTTAAGATGAATA
TAATACCACAAATTAAAAGTTGGAAATTATAG
>ref|NC_013316.1|:c2832541-2831723 hypothetical protein CDR20291_2417 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTATCAGTTACAAGATATTCAATCAAAAATGTTCGTTTAAAGCCGTGGGTAAAGTTTATTTGGTATT
TTGAAACAAAATCAAATATACTGTTAAATAATAAGTTACTTCCTACAGACAGTATAGATATTATTCTTAA
TCTTTCTGATGTTATGGAATATAAAATTGAAAATCAAGACTATACTGCTAGTAATATGCATTTTAATGGA
ATAAGGGATAAACATGGATTTATTATTCAACATGGAAATATACGTGTTATAGGGATTTCTTTTTATCCAT
TTGGTCTCTATCCATTTTTAAAGATACCAATTTCAGAGTTTAACAGACAAATTGTTGACTTAGAAGCAGT
ATCAGAACTATTTGCCAAAAAATTGGAAGAGTCATTAAATCCAACACAATCAGTAGAAAAAATTGTTTTA
TATTTAGAAGAAATGTTATTATCCATATTAGAAGAAGATTTAATTTCAAATAAATCTGTAAAGCTTCTAA
ATTCATTTATATATGATAATAGATATAGCAATATAAAAGCATTTTGTGATAATACAAATATAAATATTAA
AACATTGGAAAGAATCTGTTTAAAATATACAGGGTATACACCTAAGATTTTAAAGAGAATTTACAGATTT
AAAATGGCAAGTAGTCAACTTATTTATAATTATAAAGATAATGAACTTTTTGATTTTATTTATGAAAATG
AGTACTATGACCAAGCACACTTTATAAAAGAATTTAAAAAATTTTCAGGGACGTCACCAATTAAATTTAT
TGGTGAGAATAAGACGATTAAAGAAAATATAAAGTACAACTATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2833165-2832641 hypothetical protein CDR20291_2418 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGTTACAGCTAAGCAAAAATTTACAACGAAAGACATGGTGGAAACCTCACTATTAATAGCATTAG
TATTTATTGCAACTAAATTTATAAATATAAGATTACCAATATCTATAAATGGTGGGCTTGTGCATTTAGG
AACAGCAATGTTGTTCATATCAGCAATAGTATTTGGAAGTAAAAAAGGTGCTTTATCAGGAGCTATTGGT
ATGTCACTTTTTGATTTAATATCTGGGTGGACTTTATGGGCACCGTTTACCTTTATAGTTAGAGGAGTTA
TGGGTTATTTACTTGGAAAGATTGCATGGGCAAATGGTAATAATGGGAATAATTTTTTAATCAATGTAAT
AGGAATATGTGTCTCATCAATTTGGATGTTATTTGGATATTATATAACAGAAGTTATACTTTATGGTAAT
TTTATAGTACCTCTTACTTCAATACCAGGTAACTTAATGCAAGTATTGATAGGTCTTATAATAGCGCTTC
CTATTTCTAAGGTATTGAAAAAATGTATAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2834326-2833184 putative aminotransferase [Clostridium difficile R20291]
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AAAAAACAACAAATCCAGATATAGATATTGATTTTGTTGAATTTTATAAAAAGACATGCGAGAAGTTTGG
CAATATAGTTGGAACAAAAAACGATGTTTACATATTGAGTGGTGAAGGAATATTAGGGCTTGAAGCAGCA
TGTGCATCACTTACCGAAAAAGGAGATAGAGTACTTGTAATTGACAATGGTATATATGGAGAAGGTTTTA
AAGATTTTGTAACAATGTATGGTGGGGAGTATGTGCTTTTTTCAAGTGAATATACTAAAAGTATAGATAT
TGATGAATTGAAAGCATTTTTAGATGAGGATAGTAATTTTAAATATGCAACAGTAGTGCATTGTGATACT
CCAACTGGCGTATTAAATGATGTAAGCAAAATATGTCCATTACTTAAAGAATATGGAATATTAACTGTAG
TTGATTCTGTAGCAGGTATGGTAGGAGAAAGATTAAGTGTGGATGAATCTAAAATAGATATAATATTAGG
TGGTTCACAAAAAGCTATTTCTGCACCAGCAGGACTTACTATAGTTGGAATAAGTCAAGATGCAAAAAAT
TGTATAAAAAATAGAAAAACTGATGTAATAGGTTTTTATTGTAATTTAAATATATGGGAAGGCTATTATG
AAAAAAAATACTTCCCTTATACAATGCCAATAAGTGACATAATGGGGCTTGATAAAGCACTTGATAATAT
ATTAGAAGAAGGAATAGAAAATGTATTAGATAGACATGAAAAGATAGCTTATAGTGTTAGAAAATCTATT
GAGGAATATGGTCTAGAACTATTTTTAGAAGAAGGATATTCTAATACAGTCACAGCTATAAAAATTCCTG
AAAGTATAGGAGCTTTAAAACTTACTGATTATATGCTTAAAAATTATAATACACTTGTTGCAACATCACT
AAATCAATATATGGATACTATTTTAAGAATAGGTCATATGGGAGAGAATGCAAATCTAAATAAAATAGAG
CATGTACTAAATGTCTTGGATAAAAGTTTAAGTGCATTAGGATTCAAAGGAAATGAAAATTTGTTGAATT
TATTTAATAAGTATTATTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2836992-2834605 ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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TCACTATAATACTTTCTACTTTAATGCTTTCTTCTATTGGAATTTATATTGTTGATGCAGGAGCATATCA
AAAAGAAAATACTATAAAGTATTCAGGTAATTATCAAGGTATATTAGCAAATGTAGATGAAAAACAGGCT
GATATATTGAGTAATCATGCAGATGTTGAATTAACTGGTGAAATGAATGGAGTAGGTGTTGAAAAACTGG
AAGATGATTCAAATATTTCTCTAGCATACATGAATGAAGATGCTTTGAAATTAAATAGTTTTGAACTTAT
CAAAGGAAAATTGCCAACAAAAGAGAATGAAATTGTGTTAGATAGTGGAGCTTTAAAGGCACTTGGTTAT
AAAAATAAAGACTTAGGTGAAAAGATAAAAATATCTTATAATGACTATAAAAATGATAAAAAAATTGAAA
AAGAGTTCGTTATAAGTGGAATCTTAAAAACTAGCGAAATATCTGAAGCAGGTAAATATTATTATGCTAT
TATATCAGAATTATATATGAGAAATACTAGAGATATGTCACAAGAAGATTTTAATATTTATGTAAAATTT
AATGATAAAAGTAATTTATCAATAGAGCAAGCAAAAGAAAAATTAGATAAAATTGCTAATGATATAGGAC
TTGATACTATTAATACTGCTGTAAATGAAAATTATATAAATGCTTTAAAACCAGATATGGAAACGATTAT
GGGTGGAGGTTTTGTAGGATTAGTAATTGTATTATCTAGTATTTTAGTAATATACAATATATTTTATATT
TCAATAGTTACAAAAGTTCAAGAATTTGGAAAACTTAGAGCAATTGGTGCAACTAAGAAACAAATAAAAA
ATATAGTGTTTAAGGAAGGGTTTATATTAGCCGGAATAGCAATACCAATAGGAATAATTTTAGGCTATGT
ACTTGCAAATATTATAATAAAATCATTTATGGATATAGATGTAAAATCATCACGATTACCAGTTATATTA
TCGGTTGTGGTAATAAGCTTTATATCTGTTGTTTTATCACTTTTAAAACCAATGAAAGTAGCATCAAAAG
TATCCATTGTTGACGCAGTAAGATATACAGGAAATAAAATAAGTAATAAGAGTAAGAGAAAAGGATATAA
AAATATAAATCTAAAGAGATTATCACATGCCAATTTAGAAAGAAATAAAAAACGTACTTACATGACATTG
GCATCACTTATACTTAGTGGAACTATATTTATAACAGTATCAACTGCTTTAGAAAGTTTTGATGCTGAGA
AAATGGCAAGAGAACACTTTCCTTATGATATAGAAGTTAGACTATCTGGTTATGAAATGAACAGTGATAA
AAATCCTAAAAATAATTTGAATATTTTACAAATGGATAATCCTCTAAGTAAAGATTTTTTTAATCAAATA
AAGAACATGGAAGGAATTAAAAGAATAGAATCTGCAAGAAGTGTAAAAATTGGTATGGAGGACTATGATG
TTGAATTTAAGTATGACCTTTTACAAAGTATAAATGAAAATGATGTAAAATCATTAAACAAGAATCTAAT
AGATGGAAAAATAAATCTTGAAAGACTGCAAACTGGAGATGAAATAGTAATTACTCATGTTGATACAGCA
AAAGAAATGGGAGTAAAAGCAGGAGATAAAATAAGATTAACTTTATATGATGGAGATAAAAAGATAAAAA
AAGAATTTAAAGTTCAAGCAATAGCTATGGGGGTTCCAAGTTTTGGTATAGGGAAGGATTTTATTGATAG
AACTTTAAAATACGATTCAACTAGTAGCTTGGGAATATATACAGAAGAAGGAAAGTATCAAGAAATCAAA
GATAGTATCAAGAAGATTGCTAAAAATAATGGATTTTTAGAGACTGATTTTATAGATAGTAGAATTGAGT
CAAATAAGGCTGTTATTTCATTTATAAAGATAATGGGATACACGCTAACAGGCATAATAGGTGTGATTGG
ATTTATGAATCTTGTCAACACAATGATAACTAGCATAGTTACTAGAAAAAAAGAACTTGGTATGCTTCAA
GCTATTGGTCTTACTAATAAACAATTAGTGAAAATGCTTAATTCAGAGGCAATGTATTACACTTCTGGAA
TGATGATAGGAAGTATTTTATTTGGAGGTATATTAGGGTATATTGCTGTTATATTTCTAAAAAAGACTGG
ATTATCTTATGCAACATATTCTTTGCCAATAGTACCAATCTTGTTGATGATTGTGTGTATTCTTATAGCT
CAATTTATAACAACTTATTTGATAGGACGAAGTTTTAATAAAGAATCTCTTATTGATAGAGTAAGATACA
GTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2837668-2836985 ABC transporter ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATACTATATACTGAAAATTTATCAAAGCATTATGGAAAAGGAGAAAACTTAGTAAGAGCTTTGG
ACAATGTTAACTTAGAAATAAATGAAGGTGAATTTGTTGCAATAATAGGAAAATCAGGTTCTGGAAAAAG
TACACTTTTACATATGATTGGAGGTCTTGATATACCTACATCTGGGAAGGTGTATATAGATAATAAAAAT
ATATTTACATTAAAAGAAGAAGAACTAGCTGTGTTTAGAAGAAGAAAAATAGGGTTTATATTTCAAAGCT
ATAATTTAATTCCATCTCTTAATGTATGGGAAAATGTAGTGTTGCCAATCGGTCTAGATGGTAGAGAAGT
AGATGAATCTTTTATAAAAGAACTTTTGAAATCATTAGGACTTGAAAATAAACATGACGTTTTACCAAAT
ACATTATCAGGTGGTCAACAACAAAGGGTGGCAATAGCAAGAGCATTAGCTACAAGACCAGCTATAATAC
TTGCTGATGAACCAACTGGAAACCTAGATTCTAAAACATCTGATGAGGTTATGAGTATATTAAAATCTAT
GTCTAAGAAGTACAGTCAAACTCTAGTTATGATAACTCATGATGACAGTATAGCCCAAATGGCTGATAGA
GTTATATTCATAGAAGATGGCAGGGTGTCAAAGGTTGGTGATAAAAATGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2839095-2837785 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGCTAAAAAATATGAACCTCAAAGATGGTTTAAGTGTGAAAGATGATTATATAATGAGAAGAGTTATTG
TATATTCTGTTTTATCTGTACTAATAGTAACCCTTGTATTTATACTTTTTGAATATAGCAGATTACATAA
ATTGTATGAACATCAAATAAAAAATACTCAAAATATTGCTGGAATATTGATTGAAAAATATCCTAATGAT
GAAATAGATATAGTAAATTCTATTTATAATTCCGATTATAGTAAGGTGTCTACTGGAGAAAAGGCATTTA
AGAAATTTGGCTATGGATTGGAAAATAAAATGTCAAATGATAAAAATTTTAGTTTATACTTAAAATCTTT
TTTTAAGGAATCATTTTTTATTTTTTTAATGATGTTTATAGTAGTTATAGGTATAATATATTATTTTATA
AGATACATAAATAAAAGATTGAGTAAAATTTATTTTATAGTAGATAAGATGGCACAAGAAAACTACTTGA
AGGACACTACTGAGTCAGAAGAAACTGGTTATCTAGTAGAATATAATGAGTATTTTAAAGAAGGTACATT
TAGTAAGATAAATAACTGTCTATATGAGCTTAATAGAAGTTTAAAGATAAAGTTTATTAAATTAGAAAAA
GAAAAAGAAAGTGTAAAATCATTAGTAACAGATATTTCTCATCAATTAAAAACTCCTTTAGCATCCTTAA
AATTATACAATACATTACTTATAGAAGAAAAATTAGAAGAAGATGAAGCCAACGAGTTCTTATTAACCAA
TAAGGCTTCTATAAATAAATTAGAAAATTTAATAAATTCTTTAGTGAACATATCAAGGTTAGAAATTAGC
ATGATAAACATAAAAAAAGAAGATAATGATATAAAAAATACTATTCTAAATGCAGTAAAAAGTGTTACCC
CTAAGGCTAAGAGCAAAAGTATAACATTAAATTTAAATGAATTTAACAGTAGAATTATACCACATGATAA
AAAGTGGACTGAGGAGAGTATTTTTAATGTATTAGATAATGCTGTAAAGTACACACAGGTAAATGGAGAA
ATAAATATATCTGTAGAAGAAACTGCTAATTTCTTTAAAATTATAATAGAGGATAATGGCATAGGGATTG
AAAAAAATGAGTTTAATAATATATTTAAACGTTTTTATAGAGGTTCTGCTGATGAAATTGAATCTGTAGA
AGGTAGTGGGGTAGGATTGTATTTAAGTAGAAAGATTTTAGAAGAACAAGGTGGAAATATTATAGTTTCT
TCAAAAGTAGGGATAGGGAGTAAGTTTTCTTTGTTTCTTACAACTATGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2839817-2839089 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGATGATGGAGGATATAGGGATGAATAATATATTACTTTTGGAAGATGACAAATCTTTAAATAGAGGAA
TTAGTTTTAAATTAAAAAAAGAAGGATACAATGTTTTTAGTGCATTTGGTATAGAAGAAGCAAAAAATAT
TTTCGCAAAAGAAGAGATATGCTTAATTATTTCCGATATAGGTCTACCTGATGGTAGTGGTTTTGACTTT
TGTGAGGAGATTAGAAAGAAAAGTGATGTTTACATAATAATGTTGACAGCTCTTGATGAAGAGGTGGATA
TTGTCACAGGATATGATTTAGGTGCAGATGATTATATCACAAAGCCTTTTAGCTTGATGGTATTAATATC
AAAAGTGAATGCGCTTATGAAAAGAGTAAATACAGTAAAAAATTATACTCTATTAGTTTGTGATGATTTA
TTCTTTTATTATATAGAAAATAAATTAATTATAAGAACAGATGATAAGGAAGAAGAGATAATTTTAAGTA
AGACAGAGACAAAACTATTAAAATATTTGATGGAAAATTCTATGCAGACATTGACTAAAGAACAACTGTT
AGAATCTTTATGGGATAGTAGTGGTAATTTTGTAGATGATAATACGATTGCAGTAAATATAAGAAGACTT
AGACAAAAGGTTGAAAAAAATCCATCTGAACCTAAATATATAAAAACAGTAAGAGGGGTTGGATATATGT
GGGGAGAAAGGAGTATAAAAAAATGCTAA
>ref|NC_013316.1|:c2841941-2840100 putative membrane-associated 5'-nucleotidase/phosphoesterase [Clostridium difficile R20291]
TTGAAGATTAGAAGGTATTTAATTTTGGTAATTATAATTCTAATTACAACAAGTCAGAGTTTTATTTCTT
ATGGGCTAGAGCGATTTGAAGAAATAACCATTTTTCACACTAATGATATACATGGAAGATATGCTGAAGG
TGATGACCATATACAAATAGGAAATCTAGCCACATTGAAAAAAGAAACTCCAAACTCAATTTTAGTAGAT
GCAGGAGATTGTTTGCATGGACTTCCAATAGTAAATATGGATAGAGGGAAAAGTGCAATTGAATTAATTA
AATGTGCTGGATATGACTATATTACTCCTGGAAATCATGACTTTAATTATGGAAAAGATAGACTGTTTGA
GTTATCTAAAAGTGCTAATTTAGGAGAGAATACTTTAAAATTTTTATCATCAAATATTTTTGAAAATGGA
AAAAAAGTTTTTGATAGTAATGATATAAAAGAAATAGATGGAATAAAAATAGGATTTTTTGGACTCTCAA
CCCAGGAAACAAAGAACAAAACTGGATTTAAAAATGTGGAAGGATTAGAGTTTAAAAATCCTATAGAAAG
TGCAACAGAACAAGTAAATGAATTAAAAGGAAAAGGTGCCAATGTAATAGTTGCAATATGTCATATTGGT
ACAAATAGTTTAAGTAAGCCAAATAGTATAGATATAGCAAATGAGGTTCAAGGAATTGATTTGATTATTG
ATGGACACAGCCACACTAAGTTTGAAAATGGTAAACAAGTGGGTGATACATTGATTGTAAGTGCAGGACA
ATATTTAGAAAATATTGGCGAGATAAAACTAACTTTGGATACTAATGATGTAGAAAATATAAAAATAGAA
AATAAATCAGTTAGATTAATTGGAAAAGAAGAAGCATTAAAGTATAAGCTTGACTACGTTGTAAGTAAAA
AGGTTGATGAAATAAAAGAACAACAAGAAAAAATATTAGATAAAGTTATAGGTGCAACTACAAATACTCT
AGATGGTTCATATGAAAATGTAAGGACAAAAGAAACTAATTTGGGTAATTTAATAAGTGACATTTTACTA
GATAAAACTAAGGCTGATATTTCTTTATTTAATGGAGGGAATATTCGAGATACGATAGAAAAAGGCAATA
TAACAAGAAGAGATATTGTAGATGTATTTCCTTTTAGCAATACTATAGTTACCAAAGAACTTACAGGAGC
ACAGATTAAAGATGTATTGGAGCATGGAGTAAAACTTTATCCAGAAAAAAGTTCAGCCTTTTTGCAAGTG
GGAGGAATTTCATACTACTTTAATCCTAAACAAAAAGAAGGCGAAAGAATAACAAGTATTCAAAAAGAAG
GAAAGCCATTAGATTTAAATAAAAAGTATGTAGTTGCAACGAATGATTATATAGCCTCAGGTGGAGATGA
ATTTCCTTGTTTTTCAAAAGAGCCAATACTAAAGGAATTTGGAAATTTAGAGAGTGCAGTCATTGAATAT
ATAGAGTACAAAAAAGAAATATCAAAAAATGTAGATGGAAGAATTGGTATTAAATCTAAAGATGAGTTAA
TAAGCAAGAATCATGAGAGTGATTTGATATTAAGTGAAAATGAAAAAAATATCAATGATAATGAAGAGAA
TCTATCTAATAATATAAAAAGCTCTGATAGTGACAAAAATAAAAGCTTAGATAAAACAAGTGCTAGAGAA
AGTTCTAATCAAGGAATATCTAAAAGAGAAGCTAAAGAAAAATCTCCTAAAACAGGAGATTTAGGTTTTT
CAAATAGTATAATTATATTTATAGTTTCAAGTACATTGATATGTTTATTGAATTTTAATCAAAAAGAGTT
AAAGGATAAAAAGTCAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2843038-2842154 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTATTAAAGAAAATTACTATTTTGTCATTGATTACATTAACCTTAGTTGGTTGTAGTAACGGAG
AAGATAAAAAAGTGGTTGAAGGTTCTAAGAAAATTCAAAATTCTAAAAAAGATGAACAGCCTATAATAGT
ACATAAAGATGCAAATATATTGAAAGATAGGTATGAGCCACCAAAAGGATTTAAAAGAGTTGATGTAGAA
AAAGGTAGTTTTGAATCATTTCTTAGGAATACTAAGCTAAAAAATTATGGAGAGAAAGTAAAGTATTATG
ATGGAAGAATTAAGGAATCAAAAGGTATTTATGATAGTGTATTTGATGTTGATATTGGCAATAGAGATTT
GCATCAATGTGCAGATGCGATTATGCTTATGAGAGCAGAATACTTGTATCAGAATAAACTATATGATGAA
ATAAGTTTTGATTTTGTTGATGGTTTTAAGGCGAAGTATTCAAAATGGGCACAAGGATATAGAATTTCAG
TAAAAGATAGTGGTTCAAGCTGGTATAAAGCAACTGAATATTCAACATCTTATGAGAGTTTCAGAAAGTT
TATGGATATAGTGTTTGCATATTCAGGAACGTTATCTCTTGAAAAAGAATTGGAGCCTGTAAAAGTTGAG
GATATGAAAATAGGAGATGTGTTTATAGTTGGTGGAAGTCCAGGACATGCAAGTATAATTATGGATATGG
CAGAAAATGAAAAGACTGGTAAAAAGGTATTTATGATAGCCCAAAGCTATATGCCTGCACAACAAACGCA
ACTTCTTATTAATCGTAAAAATCCAAATTTGAGTCCTTGGTATAGTTTAGATTTTGAAGGTGATTTGACA
ATACCTCAATGGACTTTTAAAAGAGACCAGTTGAAAAGATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:2843246-2844163 ribonuclease Z [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGATTTAACTTTACTTGGATGTGGTGGAAATGTACCTATGCCAAACAGATTTCTATCCTCTGTAT
TTATAAACTATAAAGGTAGAAAAATACTAATTGACTGTGGTGAAGGTACTCAGGTATCTATGAAGCTAAA
AAAATGTGGCTTTAAAGATATAGACTTGATTTGTATAACCCATTTACATGGTGACCATATATTTGGACTT
TTAGGACTTTTATCAACAATTGGGAATAGTGGTCGTACAAGTGATTTAACTATAGTTGGTCCAGTTGGAA
TAGTCGATTGTATACGTTCTATGAGAAATTTAGTAGAATATGTACCATACACTTTAAAAATTATAGAAAA
CCCTCAAGGCAATTTTTCTTTAGATAATAAAGTTTTAAGAAATTTAGAAATTTCAACAATCAGTTTAGAA
CACTCTATAGAGTGTTTAGGATACAGTTTTAATTTTAGAAGAAACCCTAAATTTGATATAGATAAGGCAA
CTAAAAACGAAGTTCCTAAAATATTATGGAACAAACTCCAAGAAGGTCAAAATATAGTTTTAAATTCAAA
ACAATACACTCCAGATATGGTCTTAGGAGAATTGAGAAAGGGAGTTAAGATAAGTCTTACAACCGATACA
AGACCTATAGAATCAATACCAGATTTCATAAAAGATAGTGATTTATTTATATGTGAAGCCATGTATGGTG
ATGATTTAGATATATCAAAAGCTGTTAGAAACAAACATATGACTTTTAGAGAAGCTGCTAATCTTGCAAA
ACTTGGAAATGTCAAACAACTTTTACTGACCCATTTTAGTCCTTCTTTAGACATACCTAGTATGTATTTA
GAAAATGCTACTAATGTTTTTGAAAATACTATTCTTGGAGAAGATAGATTAAGCTTGCGTTTAAATTTTG
ATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2845662-2844292 NADH oxidase [Clostridium difficile R20291]
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GTATGAGTGCTGCAGCAAAATTAAAAAGAATAAAACCTGAGTATGAAGTTGTTGTTTATGAAAAAACTGA
AATAGTATCTTTTGGTGCTTGTGGATTACCATACTTTGTTGGTGGTTTTTTTGATGATGCTGATGAATTA
TTAGCAAGAACACCAGAGAAACTTAGAGAAGCTGGAATTGATTTAAATATATTTAGAGAAGTCGTTGAGG
TTGATAGTGAATCTAAGAAAATAAAAGTAAAAAATATAAAAACAGATGAAATATATGAAGATTACTATGA
TAAATTGATGATAGCAACTGGAGCAAGAAGTATTATGCCTCCTATAAAAAACATAAAATTGAAGAATGTT
TCTACATTAAAAAGTTTATATGATGGAGAATATCTAAAAAAACTTTTAAGTAATGAAGATAATAAAAGAG
TGACAATAATAGGAGCTGGTTTTATAGGGTTAGAAGCAGTTGAGGCATGTAAGAAATTAGGTAAAGATGT
AGATGTAATTCAGTTAGAAGATAGAATATTGCCACAAGTATTTGATAAGGAGATGACGGATGTATTAGAA
GAAGAAATAAATAGACATAATGTTAATTTGCACTTGGATGAAATGGTTGTAGAACTTTGTGGAGAAGATA
AAGTAGAAAAAGTTATAACAAACAAAGGGGAAATAGATACAGATGTAGTAATAATTGCTACTGGTGTGAG
ACCTAATACCGAGTTTTTGTCAAATACTAATATAAAAATGCTAAAAAATGGAGCTATAGTAGTTGATGAA
TATGGAAGAACTTCTGTAGAAGATATATACTCTGCTGGAGATTGTGCAACTATAAAGAATATAGTAAGTA
ATGAAAATGTATATGTTCCTTTAGCTACTGGAGCTAATAAATTAGGTAGGATAGTAGGAGAAAACCTAGC
AGGAAGAGAAGTATCTTATCAAGGTTCACTATCTTCAAGTTGTATAAAAATTATGGATATGGAGGCAGCA
TCAACTGGAATTACAGAAAAGCAAGCTAAAGATTTAGGCATAAATGTCAAATCTAAATTTATTTCTGATT
ATAATCAAACTCATTATTATCCAGGAAGAAATAAAATATATGTAAAACTTATTTATGATGCAGATACAAA
AGTTATTTTAGGCGGACAAGTGGCTGGGTTTAAGGATGCTGTCCAAAGAGCAAATGTATTGGCAGCTGCT
ATCTTTGGAAAAATGACCACAAGTCAACTTGGAATGTTAGATTTATGTTATGCCCCACCATTTGCAAGAA
CATGGGATGTTTTAAATGTAGCTGGAAATGTGTCTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:2845998-2847356 sodium:dicarboxylate symporter family protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATTACAGATTTTAAAACGATTTTTTTCATAATATTACTTCTAGGTACATTCTTTATTGTTAGACAAT
TTGAAAAGAAAAAAATAAAATTTTCATTGAGAACAATATATGCTACAGTACTAGGACTCATATTGGGAAT
CATAATACAAGCTTTTGCTGGTTTTCCTAATGATACCACTCAAGTCACTTGGCTACAAGAAGTAAGCAAG
TGGTATAGCCTATTTGGTTCTGGATTTATGGACTTATTAAAAATGTTAGTAGTACCTTTAGTTTTCTTAT
CCATTATAAAAGTAATTATAAATATGAAAGATAACAATCTTGGAACTCTGACATTTAAATCTTTAGGTAT
GCTTCTTGCTACTACTGCTATAGCTGCAATTGTTGGAATTATCGTTGCAAATATAATGAAGTTAGGTGTA
GGAGCTAATATGCCTACTTTAGTTGAAAATCAAGAACTTAAAGAAATAAACTCTCTTGTGGATACTTTAA
GAGGATTACTACCATCTAATCCTGTAATGGCTATGGCAAATGGAAATATTGTAGCTACAATAATATTTGC
TACATTTATAGCTACCTCAATAAAGAGATTAAGTAAAAAACACTTTGAAACAATAAAACCATTTATAGAT
TTTATAGAAGCATCTTACAAAATAATTGTAAGTGTGTCTATGACTGTTATTAAATTTATGCCTTATGCTG
TGGTTGCTCTGCTTGCAAATACAATAACTTCACAAGGTATTAGCTCAATAGTATCTGTTTTACAGTTTAT
ATTAGCTCTTTATATATCAGTGGCAATATTATTTACCATACATTTAATTTTTATAACTTTAAATGGTCTA
AATCCCATTACTTATATAAGAAATTCAACTGAAGCTTTACTTCTGGCATTTACTTCACGTTCTAGTTTAG
GAACATTGCCTGTAACGATAGAAAGTCTAGTACAAAATCACGGAGTTGATGAGGGTGTATCAAGCTTTAC
AGCAAGTTTAGGTGCAAATATGGGTATGAATGGTTGTGCAGGTATATATCCTGCTTTAATGGCTGTAACA
CTTGCCAATATGGCTGGAGTAAACATGGATATGAGCCTTTATGTTATGTTGTTAATTGTTATAACAATTA
GTTCGTTTGGAATAGCTGGTCTTCCAGGAACTGCTACAATGGCCGTTTCAGTTGTTATCTCTGGAGTTGG
TCTTGGTTCTTATTTTCCATTAGTTGGTGGTATACTTGCAATAGACCCTATACTAGATATGGGACGTACC
ATGATAAATGTTAATGGTGCTATGGTATCATCAATTACTGTAGGAAAATCACTTGGAAAAATAGATAAAG
AAGTATTTGGTAAAAAAAACATTTCTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2848645-2847437 hypothetical protein CDR20291_2429 [Clostridium difficile R20291]
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TCTTTAATATTTGTTATTCTGGAAAAGATATGATACAGGAGATAAAAAATTCAGTTGCTGAAAAAAGTAG
TTTAAAAGATACAATATCATCTATTGATAACACAGTAAATGACAAAGTAATATATAAAAATACGTTCATT
GAAACTTATGGCTACTTACAAAAGTTAATGGGTAAAAATGAGTTTTCAAAATTTAGTGTTGTAAAAGATA
CTTCTGGAAAGATGCATTATACATATTTTGCTAAAGCTCCAAATCCAGTTGGTGTGATAGCAGATAGGGT
AAGAAAATTTTCTGAGGAAATGGAAAAGCAAAACACTAAATTAGTTTACTTAATGACTCCAGATAAGTAT
ATAAAAGGAGTGACAAAATTTCCAAAAGGAATACCTTATTCTTATAGCAATGAGACAGCAGATAATTTTT
TAAATCAACTAAAAAAGTATAATGTGGACTATATTGATTTTAGAGAAAATATTTTAAAGAGTGGTATTCC
AAAAGATGATTTATTTTTTAAAACAGACCATCACTGGAAAGTAGAAACTTCTTTTTGGGCATTTGGAGAA
TTAGTTGAGCAACTTAATAAAAAATACAATATGAATTTAGATGAAAATCATTACTATAGAGATAAAGAAA
ATTATAACTCAATTGTATATCCTAAGTCATTTCTTGGTTCTATGGGAAGAAAGACTGGTATCTTATATGG
TGGTATAGATGATTTTACATTAATTTATCCTAAATTTAAGACTAATTATACTTATTATACAGATTCTAAA
TCTCAAAAATTTGAATTAAAAGGAAGGTTTGAAGAGAGTTTAATATTATCATATCCTTTTAATGCAGACC
TTGATTTAATGGATGGTCAATCAGATAAGTATTTTACATATTTATTGGGGAATAGACCATTAGTTAAAAT
AAAAAATATAGAAAATCCAGATGGATTAAAAGTGCTGTTTGTTAAAGATTCTCTAATTGTACCAACAGCA
GCATTTTTTTCCTCTGTTTGTTCATCTATAGATATGATAGACCCTAGATATTATGATGGAGATATACTAG
AATATGCAAAATCCCATGACTATGACTTTGTTTTTATATCTGTATATCCCCAAAATCTTACAAAAGAATT
TTTTCCGTTTTGTAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2850078-2848660 putative polysaccharide O-acetylase [Clostridium difficile R20291]
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GGTTTAACCGAACGATACAGAACATGATATTGCTTGCTGTTAGTTTATTTTTTTATGCTTGGGGAGAGCC
AAAATTTGTTGTTATCATGATAGTTTCCATAATAATGAACTATATATTTGGTTTACTAGTAGATAGATAT
AGGGAAAGTAAAATAAAAGTAAAAGTTTTTTTAGTTTTGATGTGTGTATATAATATAGGTGTTTTATTTA
TATTTAAATATCTAGCTTTTGCGCTAAGAAATATTAGTGAACTTATTAATACTGAACTAACTATACCTAG
TATTGTTTTACCTATAGGAATTTCATTTTTTACATTTCAGGGAATGTCTTATGTTATAGATGTATATCGT
AGACATGGAGAAGTCCAAAAGAATCCTTTTTATGTGGGACTGTATATAGCATTTTTCCCACAATTAATAG
CAGGTCCTATAGTTAGATATGAGAGTGTGGCAGAACAAATTCTCAATAGAAAAGAAACTTGGAATAAATT
TTCTATTGGGACTTGCAGGTTTATAACAGGTCTAGGCAAAAAAGTATTAATTTCAAATAACATGGCTATA
GTAGCAGACTATATTTACACTATGAATAGTCAAGGAGAAATAGCTGCATCACTTGCATGGCTTGGTTCAA
TAGCCTATACTATGCAAATATTCTTTGATTTTTCTGCTTATTCAGATATGGCTATAGGTTTAGGTCTTAT
GTTTGGTTTTAAATTTGAAGAGAACTTTAATTATCCATATATATCAAAATCAATTAGTGAGTTTTGGAGA
AGATGGCACATTTCTTTGGGAATGTGGTTTAAGAGCTATATATACTTTCCGCTTGGAGGTTCTAGAGTAG
CAAATAAAGATATTATGATTAGAAATATGTTTATAGTGTGGTTATTTACTGGAATATGGCATGGAGCAGA
ATGGACATTTGTAATTTGGGGGATTTTAAACTTTGTTTTCTTGATTATAGAGCGATTTATAATGTTTGAA
AAGATTGAAAATCACAATTTTATAAAACATATTTATGCGTTATTAGTAGTTAACTTTGGGTGGGTATTGT
TTAGGTCACCTAATTTAAAAGAAGCATATAATTATTTCAAAGCTATGCTTGGAGGCAATGGAGTTATATG
GAGTGATTATACATATATGTTTTTAAAAGAATACTGGGTTTTCTTTATATTTGCATTTATTTTTAGTGTA
CCTATTGCAAAGAAAATCAATAAGTTTGTTGTTGAACAAGCTAAATATAGTATGATATTTAACGTATTTT
ATCCAATCTCAGCTATTTTATTGTTCTTTATTTCTGTGACATATTTAGTAACTGGAAGCTATAATCCATT
TATTTATTTTAATTTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2851211-2850096 hypothetical protein CDR20291_2431 [Clostridium difficile R20291]
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CAAAATATCTTATTTTGGTGTTTATTTTTTTTATAAATACTACTTTTATAAGTTCAGCGACAAGTGATAA
AATTTTAGATTTATCCTTTAAAAAGATAGAGACTGATTTAAGTTCTAGGATTACATATGAAGATACAGGT
GTAAAAATAGAAACAGATAGTTCTAAAAGTGATAAGGAACGTTATTTATATATTTACCAAAATATAAAAG
AAAATTGGAGTATGTATAATAATTTTTATATTGAAATTCAAAATAAAAATAAAAGTTCCCAGAAAATAAA
TTTAAGTATACAAAGTAAGAATATGCTTGAATTTAGGTTAAAAGAAGGTAGTGAAATATTTTTGGAAGAT
AAAAATATAATATATTCAGATAAAATAAAAGAAGGATGCATAGAAGTACCAGGTGAATTTGAAGGCAAAA
TTTATGTGAACTTTAATAGCCTTATAAATGAGAAAAGTAATGTTGTGCTGGACTCAAGTATGCTTTCAAA
CATTGTTAGTTGGGGAATTACATTTATTCCATCTGATGAAGAACATAATATTGTTATTATAAAAAAGATA
TCTTTATTGTCTGAAGAGAAATTAAGTTTTTTACATAATATTAAAATAACTGGCAATGAAGAAGTACAAA
TACCAGTATTGGGTCAAAGTATAAGTCAGTATGAGGTATTAGGTCTTAAACGTGATTCTAAAATTAAGTA
TTCTCTTATGGGAAAACAAGATAATGTGAGCATATCTCAAAATGGTAAATTAACATTAAGTAATAAAGCC
GAACCTGGACAAATTATTTTACAAGTTAATGTTGATGATAAGTTTAAAATTGGAAGGAAAATAGCATTAA
CTGAATCTTGGAGTATTAATAAAAAAGATAAGGATGGTGTTCCATATACATTGGTATCTCCTGAGCAATC
ACCAACAGTACAATATATGAAAAAAATAAACTTTATGAATAACATCATAACGTTTGTTCGAATTTTATTT
GTATCTCTAGTAATAATATGCTTTGGAATATATTTATATTGGAAAAAATGTTCAAAAACTAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2853489-2851183 cellulose synthase catalytic subunit [UDP-forming] [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAAAAATTCAAAAAAGATACTTATAACTTTAACTATTATTACTAATATCGTATATATATTGTGGA
GAATTTTTTACACAGTACCTAAAGAAGAAGGGATGTTTGCCTTAATCTGTGCTATAATACTTCTTTTTGT
AGAGATAATGGGTATGATGGAAATGTTTGTACATTATTATGGTATGTCAAATATTGAGTATCCTGAAAAA
CCAGTCATAAGTGAAGAACTTTATCCACATGTAGATGTATTCATTGCAACATATAATGAGTCTGTTGATT
TGGTGAGAAAAACTGTAAATGGATGTATTCATATGCAGTATCCAGATAAGAAAAAGGTACATATATACAT
ATGTGATGATGGAAATCGTGAAGAAATGCGTATTCTAGCAGAAAAAATGGGTGTAAATTACATAACTAGA
ACTGAAAGAGAAGGAGCAAAAGCTGGGAATTTAAATAATGCAATGCAACATACAAACTCTCCTTTGATTG
CTACGTTTGATGCAGATATGATACCAATGCATGACTTTTTAATTGCTACAGTACCATACTTTTTGAAAAA
TGAGCAAGCTAAAAAAGATGGAGAAAAAGAGGAGTATGAAAAGGTTGGTTTTGTGCAAACTCCACAGAGT
TTTTATAATCCAGACTTGTTCCAATTTAATCTGCACTCTGAGGGAAGGATTCCAAATGAGCAAGATTATT
TTTACAGAGATATTCAATTGGCTAGAAATAGGACAAATTCTGTAATTTATGGTGGTAGTAATACAGTTAT
TTCAAGGGAAGCACTTGAAGAAGTTGATGGATTTTATACTTATTCTATTACAGAAGATTTTGCAACAGGT
ATCTTAATTCAAAGTAAGGGGTATAGATGTTATGCTATTCCAGAAGTACATGCATCAGGTTTATCTCCTA
CAGATTTAAAAAGTCTTATTAAGCAACGTGAAAGATGGGCACGTGGATGTATACAAACTGGTAGACGTCT
AAATATTTTGTTTAGGAGAGGTTTAGGTTTTTGGCAGAAAATAAGTTATATTTCTTCAATTACTTATTGG
TATGCAAGTATAAAACGCTTTGTATATATAATGGCACCTATTTTATTTTCTGTGTTTAATGTGATTGTAG
TAAAATGTACATTACTTCAAGTATTGGTATTTTGGTTGCCAATGTATATTTTAAGTAGTTTATCTCTTAA
AATATTTTCTCAAAATATAAGAAATACTAGATGGACCAATATATATGAAACTATAATGTTTCAGTCTTTA
ATGCCAGCAGTAATACTTGAAACGTTTGCAATATCTAAAAATAAATTTTCAGTAACAAATAAGAATAAAT
TAGAAGAAAATAGAATGTATAAGTTTTTACAGGGAATACCTTATTTTATTTACATGGTCTTATCTATCAT
AGGAATTTTAAAAATGTTTGTAGCAATATTTAAAATGAGTTCAATGACATATTCAGTTGTATTATTTTGG
TTGATTGGAAACCTTTTTAACCTTGTTATGGCTACATTATTTATATCAGGGAGACAACAGTTAAGAAAGT
CTGAGCGTTATATTGCTGAAATTGATTTTAAGTTAAAGCAAAACTCTTATGTTCTTTCTTCAAAAACGAT
TGATATATCAGAAAATGGGTTTGCATTTTTGCTAGAAAATCCAGAATATATTTCCCCAGAAGAAGAGTTC
GAGGTAGAGTTTAGAGAAAAATCAGGAAATGAAATGTATATAGCTAATATGAAAGCAAAGATTGTTAATG
TTGTGGAAGTAAATTCAAAGTGGAAATATGCAGCTTATATTACACATATTGAAGATAGTGAAATAGATAA
TTGGATGTGTATTGTTCACGATAGAATACCTACTTTACCGATGACAATATCTAATCAACTAGGTTTCTTT
GATGATTTGCAAATTAATGTAAAAAAACGTATTGAAAAGATTAGAACATTATCACGAAGAAGTCCAAGAA
TCAATATGAATTTTCAGATGGATATAAAAAATACAGGTAAATTAAGAATAGTAAATTTTAATTATCAATA
TGTATTATTAAATTTTGAGAATAAAAATATTTATCCTAAAGAAATAGCATTGGAAATTAATGAAAATATT
GTGTTAGAATGTGATTTATGTGAGGGTAAAATCGATGAAAGAGGTCTCTTATATAAAGTAAATAACATTG
ACAGCATAATGCAAAATTTCTTTTTAAGAGATGAAATGATGGATTGGATATTACAAAATAAGACAATTCC
TGTTTCAAATCCTAGTGAAAAGAAGGAAAAAAGTATAGATGAGTTTGAACCCATGGAATATATTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2854543-2853494 endoglucanase (cellulase) [Clostridium difficile R20291]
TTGAATAATATTATATGGAAGATAACATTGTTTGGGGGGATTAATATAAAAAGAATAGGTATTATTATAA
TGTTTTTTTTAAGTATAGCTTTTATTGGATTTTATCTTGCAATAAGAGGTAACAGTGATACAGTTAAGAT
GCAACGAGGGATAAATATAGGTAATGCACTAGAATCACCTAAGGATTTTCCGTGGGATGTAAAAATGTCA
AATAAGTTTTTTGATGATATAAAAGATGCAGGTTTTGACACAGTACGTATACCAGTAAGGTTTTCTGATT
ATACGTCAGATTCTGATAATTTTAAAATTGATGAAGAATTTTTTAAAAAGATTGATAAATATGTAGATTA
TGCATTGGATAAAGACTTAATAGTTGTGTTGGATTTACATCATTTTGAAGAAATTATGAAAGAACCAAGA
GTTCATAAAGAAGAGTTTTTAAAAATATGGCAACAGATAGCTAATAGGTATCAAAAATATGATAAAAAAT
TGGTATTTGAATTATTAAATGAACCTAAAGAAAATTTATCTTCACAATTACTAAACGAATACATTGAAGA
AGCAATAAAGATAATTAGAAAAACTAACCCTAAAAGAACTATTATAGTGGGACCATATAATTTCTATCAA
ATTGATTATTTGAATGAATTAAATGTTCCAAAAGATTCTAATATAGTAGTTTCTTTTCACTATTACGAAC
CAAATGATTTTGCATTTCAAGGAAACATTTATCATAATGGATTTGAGCACTTGAGCAATATTACTTGGGA
AGGAACAAATGAACAAATGGATTATTTAAAAAAAAGGTTTGATATTGTAGAAAATTGGGCAAATAAAAAT
AAGGTAAAAATATTCTTGGGTGAATTTGGAGTAACAAAAGAAGCACCAGAAGCTTCAAGAAGAGCTTGGA
TAAAAGCTGTAAGAGAAGAAGCTGAAAAACGAAACTTTTCATGGGCTTATTGGGAGCTTGCTTCTGGATT
TGGTATATACAATCAAATTGAAGGGACTTGGGATAGAGACATATTAAGTGCATTAATAGAAAAGAGGTGA
>ref|NC_013316.1|:c2856527-2854779 hypothetical protein CDR20291_2434 [Clostridium difficile R20291]
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CTTGGAAAGAGAAGGATTTGGATATTGTAGTAGCTAAAGGTGAAAAATTTGCATTTCAAATTATGCTAAA
AGCAACAGAAGAATTTAATTGTACAATTGATAAAAGCAGTACTATATCATGGAAAGGACTGGAAAATAGA
GTAAGATTAGCATTAAATGTGCCTAATAGTTTAGAAAATAATTTTAGTATAAATATATTAGGATATGTTC
AAGATGATACAAAGGCATTTGTGAATGATGCTATTTTAAGGGATAAAGATGTGTTAGTAGAGCAATATTT
GCCTCAAACATTTTGGATTGAAGGTCAAGTACCAGAAGATTTTGAAGAAAATAACCTTAATATAGGTATT
GATATATTTAAAAGCTTTGGATATGAAGATGAAGAAAAAGTTTGTACAATTGATGTTCCTGTAAAAGTAA
GAAATGTCGTGCTAAAGCCTTTAGATAAAAGCAAGTTCTTTTTAGATTTATGGCAACATCCAAGTTGTTT
AGCTAGAATGTATAAAGTTGAGTTATGGTCTGATATACATTTTGAAATAGTCGATAACTATTTAAAAGAA
TTAGCATCTTTAGGAGAAAAAGTTGCAACAGTTATAGTTTCAGATTATCCATGGGCAGGGCAAAGTTGTT
ATAAAGTTTATAAAAATCCATCAAACCTATATGAATATAACATGGTAAGTGTATCAAAAGGATTGGATGG
AAAGATTAAATGTAACTTTGAGAGTATGGATAGGTATATAAGCATAGCTGATAAGTATAAAATGTCTAAG
GAGATAGATTTATTTGGTCTATTAGGTAATTGGTGTGCTGGTGAGTTTGGAAATCCTGTAGAAGGTTATA
AGGACCCTATAAGAGTAAGATATTTTGATGAAAATGATAAAGTATTTAAATTTATAAACAATACAAATGA
TTTAAAAGAATATATAGGATTAGTATTAAATCATTTAATAGAGTGTGGATTATGGGATAGAGTAAGGATT
ATAGCTGATGAACCAAATAATCCAGAAGTAGTCAAAGAGTGTATAGAATTTATAAATTCTACTGTAGGTA
CTCATCAAGTTAAATATAAATCAGCAACTCACGACCAAAACTTTTTAGATAGAGCTAAAGATGAAATTGA
TGATATGTCAATAAATTTAAAACTTACTATACAAAATTATAAAGATATAGAAAATCTTAAGAAAAAAATC
AATGACAAGGGTGGGATATTGACTTGGTTTGTATGCTGTTTTCCAGAGAAACCAAATAGTTTTTTAAGTT
CTCCTTTTGTAGAAAATAGAATAATAGGATGGTATACTTATTACTTTGGTCTTGATGGATTTTTAAGATG
GGACTATAATTTATGGACAGAAGACCCTTGGAAAGATTCAAGTTACAAATTCCCTATTTGGAAAGCTGGA
GATATGTTCTTTGTTTATCCTGGAAAAGATTTAAAGCCAGTTAGAAGTGTCAGAATGGAGAATTTAAGAT
TTGGAATACAGGACTTTGAGTTATTTACAATGTTAGAAAAAGAAAAGGGCAGAGAGTATATAGAAGTTGA
GCTTATGCAAGAATTATTAAATAAAAAAGAAAATGCTGAAATTAAAGGTTTTGGTGACATAGAATTAGGA
TATTCACTTGATAATTGGGGATATGATAAAGTTAAAAAATATGTATTAGAGTTGTTAGACAGAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2857393-2856584 putative sugar transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAACAGCAAGAAGATTATTAAGTGATGGTTTACTTTTATTTATAGCGTGTGCAAGTTTGGTACCTT
TTATATACATGTTGATAATATCATTGAAGATAACATATAACTCATATAGTTTGGATATATCTTTTTCAAC
AGTAACTCTTCAAAACTATATAGATATCTTTACTAAAAAAGGATTTGCACAATATTTTTTTAATACAGCA
ATAGTATCTTTTTCAGGTGTATTATTAAATTTAGTATTTAGTACATTAGCAGGATATTCTTTTGCGAAGA
TGGATTTTAAAGGTAGTGATAAGTTATTTTTATTTATGATAATGACTTTAATTATACCTTCCCAAGTTAC
AATGATACCACTATATATAATAATGAAACACTTAGGATGGATAAATAGTTATCTTGCACTTATTATGCCA
ATACCAACTGCATTTGGCGTATTTATAATGAGACAAGCTATTTTAGGAGTACCAAAAGAGTTATTAGAAT
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ATTAATTACACTAGCAATATTTACTTTTATGGGAGCATGGAACGAGTTTATGTGGCCTCTTATAGCTACA
ACTAAAGATGCAATGAGAACATTAACAGTTGGATTATCTACTCTTAAGACATTCCAGATAACTAATTATG
GACAGATGATGGCAGGGGCTACAATAACATTTTTACCTCCATTTATTTTCTATTTGATTTTACAAAGTAA
ATTTGTTGAAGGTGTGTCTTTGTCTGGTATAAAAGGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2858326-2857409 putative sugar transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAACTTAGTTAGAGAGTTTGAAGAAAATTCAAAAAGAAAAAAAACAAAATTAAATATTAAACCAT
ATATGTATATATTGCCATTGGGAATAATTTTAGTGGCGTTTTATGTGATACCAATAATAATGTCAATATA
CTTTAGTTTTACAAAGTATAATATTATTAGTCCAGCCACTTTTATAGGTTTAGAAAATTATAAAAAATTA
TTTACAGATGAAACATTAAAAGTATCTATTATAAATACTATTAAATTTACTGTTGTTGTAGTACCTTGCC
AAACTATATTATCATTGATTTTGGCAGTTTGGATTACAGGAAAAGGAAATAGTAAAATAGCTTCATTTGC
TAAAGGTGCTATATTTATACCAGTATTATCATCTATGGTTTTGATAGGTATGGTATGGAGGGCTTTATTG
AATGGAGAAGGTTCTATTATATATCAGGTATTAGGTGCCTTTGGAATAGAATCATCTAAACTTTTAGGAG
ATAGTAAGACAGCATTACCTACACTTATGTTTATATCTATGTGGAAAAATATAGGGTATTTCATGGTAAT
TTATATTTCAGCTATAATGAATTTACCAAAACACTGCTATGAAGTAGCGAAGGTTGATGGGGCTACAAAA
CTTCAAGAATTTATAAAAATAACTGTACCTTTATTGAAACCAACTACAATAATGGTTGTATTTTTAGGGT
CGATATGGTCATTACAAGTATTTGACTTAATTTATACTGTGACAGGTGGAGGTCCAGGTATATCTACTAT
GAGTATAGTTATGCATGCATTTAACTTAAACTTTAAAAACTTTAATTCTGGATATGCAATGACTGTAGCA
AACGTATTATTTTTGTTAATAGCAGTAGTTTCGATTTTACAAAATAAGCTTGTAAAACGAGACAATTCAG
ATTTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2859734-2858424 putative sugar transporter, substrate-binding lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAGAAAATAAAATGGAGGGAATAAAAGTGGGTATGTTAAAAAAATTATGTTCACTAGCTATGG
TAGCAATTATGACTACAACACTTATAACAGGGTGTTCAAGTGGAAATGGAAAAGATTCAAAAAAGGATGG
CGAAAAAGAAAAACTAGTTCTTTGGATGCCACCAGTAGAAAATAATATGAAGGAAGTTTGGGACCCTATT
TTAGATAAATTTGAGGAAAAAAATAACTGTGAAGTAGATTTACAGATAATTCCTTGGGATAATTATTCTG
AAAAATTTGCAACAGCTATAAGTGCTGGCGAAGGTCCAGATGTAGGATATATGTATGCAGAAATGTATCC
ACAGTTTATAGAAAGTGGAGCAGTAGAAGATTTGACTAACTATGCAACTAAAGAGGATAAAGAGCAATCT
ATTTATATAAAAACATCTGAAATGATGGGTGGAATGTATGGTATGCCATTCCAAGCAGCAAATCCAGGGG
TATTATACTATAACAAGGATATTTTAGAGAAATTAGGAGAGAAACCTCCTAAGACATGGGAAGATTTTAA
AAGAATTTGTAAAAAAGCAACACAAGATACTGATGGTGATGGAAAGATAGACCAATGGGGATTAGCTCAG
GGATGGGGAGCTAAAACTTTTGGTAACTTAAACTGGAACTGGTATCCTTATTTATGGCAAGCTGGTGGAG
ATATTTTTAATGATGATTTAAAATCGGTTAAATTTAATGATAAGAGTGGTTTAGAAGCAGCTAATTTCTT
AAAAGAATTACAAGCATATGTGCCTGAAGATTCTTTATCTAAAGATAGTAATGAAATGATAGAAAGCGTA
TTTGGACCAGGGAAAGCAGCATTTACAATAATGTTATCTTCTGCTGCAACAAGTGTATTTGATGAATCAT
TCCCGGATTTAAATTGGGGGTTTGTAACTGGACTAGAAGATAAGAAAGCAGCAACTTTTGGAGCAGTAGA
CCATTTATCTTTAATGTCATCTGCTAAAAATAAAGAACTTGCATACAAGTTAATACAACATATGTTAAGT
GTTGAATCAATGACAGAATTTCATAAAGCAATACCAAGAGCACCAATAACAAAAGGTGAACCATATCAAG
GTGATGAAAGATTCAAAGAAATGGTGGAAAATGACAAAAATGTATATAGACCATTAGTAGTAGGACCTCA
TGGAGTTGAAATATATGAATATTTATGGAAAGAACTTCAAACTATGATTTCAGGAGATAAAACTCCAAAA
CAAGCATTAGATGATGCTGCAAAATATTCAAATGATTTATTAGCACAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2860797-2860057 putative phosphosugar isomerase/binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTTAAATACATAGATGAGATAAGAAGATTAATTGATATAATAGAAAACGAAGAAAAAGTCAATA
TGGAAAAAGCAGTACAAATCCTTGTTGAAGCAATAGAAAGTAAAAATGCTATATTTTCATTTGGAGCTTC
ACATGCAGGAATATTAACAGAAGAATTATTCTATAGAGCAGGTGGCTGTGTTCTTATAAATCCAGTATTT
GCAAAATCTCTAATGTTAGATACAGCGCCTATAACTCACACAAGTAAGATGGAAAGATTAGAAGGATATG
GTACAGCTCTAGCTGATAAAACTCCAATTAAAAAAGGAGATGTAGTTATAGTTCATTCAGTATCTGGTAG
AAATCCAGTAAGTATAGAGTTTGCTATGAAAGCTAAGGAAAATAAGGCAATAGTAATATGTATAACTAAT
TTAAGTTACTCAAAAAGTGTATCTTCAAGACATTCTTCAGGAAAAAAACTTTATGAAGTATGCGATTTAG
TGATAGATAATCATGGTCAAAAGGGAGATGCCTGTGTAGAGATAGATGGATTAAACCAAAAAGTTAGTCC
AACTTCTACTGTAATAGCAACTACTGTGATGAACTCTATTATAGCTCAAGCTACTCAGGAATTAGTTAAT
AAAGGGCTAAAGAATCCTCCGATTTTCTATAGTGCCAATATTGATGGTGGAGATGAGTTAAATAAGAAGA
TTTTTGATGAATATAAAAGTGTAATTCATTATGAATATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2862059-2860800 phosphotransferase system, C component [Clostridium difficile R20291]
ATGCTTGATTTTATTTCAAATAATATTTTACGTAATCCATCTATGTTAATTGGATTAATAGCAGCATTTG
GTCTTGTACTACAGAAAAAGAAAGCATCTGATGTTATAAAGGGGTCACTACTTGCAGCTTTCGGAATTAT
AATTATGGAGACTGGAACAGGTATGTTAGTTAGTTCAATAGCACCAATTAATGGAGCTTTCCAAAGTATA
AGTGGTGGTGCAGTAACAAAAGGTTTAAGTGATGTTACTTTTACTGCAAGTTATGGTGGAATTATAGGTT
TAGCAATGTTTGCGGGTTTAGCTATTCACCTAATGATAGCAAGATTTACTCCTATTAAGACAATCTTCTT
AACAGGTCACATGCTTTATTGGTTCCCATTCATATTTGTAGCTTCAGGAGTTGAAGCTGGATTAAATGGT
GGAGTATTAATAGCTTTTGCAGCAGTATTATCAGCACTCTATTGGTCAATAATGCCTTGGTTATTAAGAA
AATATGTGTTTGATGTTATAGGAGATGATTCTTTTACATTAGGTCATCCATCTGGTTGTTTAGCACTTAT
ATCAGGATTTGTTGCTAAATTAGTAGGAAATAAAGAAAAATCTACAGAAGATATAAACATACCTCAAAGT
TTATCATTTTTTAGAGAAATATCTATAAGTGGTGGAATGGCAGTGTTTTTAATGTTTATAGTTGTTGGGA
TAGTAATACCAGGTGCGTTTAAAGATAGTAATGAGTTTATTGGAACGTATGCAATAAAGCAAGGTCTTTC
TTTTGGAGCAGGTCTTATAATAATGCTTCATGGGGTAAGAATGCTAATAAATCAAATAATGCCAGCATTT
CAAGGTATATCTGAAAAAGTTGTGCCAAATGCACTACCTGCTTTTGACTGTCCAATATTATTTAATTATA
AACCAAATGCTGTATTAATAGGATTCTTAGTTGCTATGCTAACATCTACAGCTATGATTTTAATATGTAA
CTACTTTAATGTATTTAATTTGCTACTTATACCACTTGTTATAACTTCATTCTTTGAGTGTGGAGCAGCA
GCAGTAATAGGAGAATCACAAGGTGGTATACGTGGAGCTATAATAGGTACAGCTATAGCTGCAATATTTA
TGGTAGTTTTAGTAGGAATATCTGCTGTAATTTACTCAGGAACTATTCAAAATTGGATACTAATATTTGG
AGGTAACGACCTTTCATTATTTGGTATAATTAGTAAGTTTATAGGTTCACTATTTGGAGGAATATTATAG
>ref|NC_013316.1|:c2862479-2862192 phosphotransferase system, B component [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGATATTAGCAGTATGTGGTTTTGGTGTAGGTTCATCAATGGTATTAAAAATGACAATACAAAAGG
CTCTAAAGCAGTTAGGTATAGAATGTGAAGTAGAAAATACAGATATAAATTCAGCTAGAGGTGCTGATTG
TGACTGTATATTCACAAGTCAAGAATTGTTAAATGAATTAAAAGGAACTTGTAATGTAGATGTATATCCA
GTTAAAAAGTACATGGATTTAGCAGAAGTCACAGAAGTTGTTCAAACTTTTTTAAGTGATAAAAATGATA
AGAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2864411-2862492 putative bifunctional protein [includes B component of phosphotransferase system and transcriptional antiterminator] [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGGAAAGGGCTAAAAAAATATTAGATTTTATTATTAAAAATAACAATGTAACATCACAAGAACTAC
AAGAAAGGTTTAATGTTTCAAAGAGAACTATTTATTACGATATTCTAGCTATAAATGAACAACTAGGAAA
AAGTGGTAATATAAAAAATGTAAAACACAAATTTATATTTGAAGGTAATTTATGTGATGCAAGGAAAATA
ATTTCAACTGAAGAAGATAAATTTTTAGATAGTGATTACAGAAAAACTTTTATATTAAACAAGATATTAC
TTGGCGAAAAAATATCAATAGAAAAACTAACAAATGAAATGTTACTTTCAAAAAACACAGTAGTACAAAC
AATAACTGATGTAAAAAAATACCTTCAAACAATGGGGTTAAGATTAGAGTATAAGGGAAAGTACAAAATT
ATAGGTGATGAATACGTTATTAGAGAGCTGTTTCTGATAATTGTTCAAGAAAATGTACTGGAAATTAATT
CTATAAGTAAGGAAGTAAGTAGTTTCGATACAAAAGGACATATAAAACTTACTGATTATTCTTTATTAAA
TCTAACTAAGTTTGTGGAATTTCTAAATAAAAGGATAAGAGATGGGAAAACATTATACTCATATAAATAT
CTAAATGAAGCTAAAAAAATTAGTTACTTTAGTAATTGTAAAGAACTTTTATGTGAAGAAGCCAATGAAA
ATGAACAAGCCTATATATGCACTTACATAAGTTCACTTCCTAGCTTAAATAGTGAAGTTAAGGAAGATGT
TGTTGAAGAATATGTAGATAAACTTATAGATAAGTTTGAAGTAAATACAGCAATAAAATTAGAAAGTAAG
CATGAGTTTAAGAAAAATATTTTAAGGCACCTCCACTCTTCTTACAACAGAATACGATTTAAGTTTCCTA
TTAGAAATCCAATGTTAGATGAGACTAAGTATAAACATGAGTCACTTTATAAAATTATAAAATCAATTAT
AGAAAATGAAGAAGAGTTTCCTGTATTTGAGGGGATAAGAGAAGAAGAGATAGGATTTATAGCAGCGTAT
TTTGGAGGGTATTTAAGAGGGTCTAGGGATAATGGCCTAAGAAGAAATAAAGTCTTACTAGTTTGTCCTA
ATGGTCTTATGGTATCAAAGAGTTTGGAAATACAACTATATAAATACATACCAACCATAGAAATAGTAGG
TATAGTGTCCATTAAGCAACTAAAAGAAGTAAATGTATACTACGATTACATAATTACAACTATAGATATA
CAAAATGTAAACAATGTAATTGTTGTAAATCCTCTTTTAACATCATCAGATGTTCAATTACTTATGAACA
AACTAATAAGTGTAAAAGAAAACGAGAAGTATTTCAATCTTGAATTAATAATACAAGCTATAAGAAAAAA
TGGAGTTATCAATAATGAAGAAGCACTAAAAGCTGATTTATTAAACATAATACACAAGATAGATGAAGGA
GAGATGTATCAACCAATGTTAAAGGAATTAATTAATGCAGAAAGGGTCAATATAATAAAAAGTGTTAGAG
ATTGGAAAGAAGCAATAAAAATAGCCTCAAAGCCATTGTTAGAAGATAACTCTATAGAAGAGTTATATAT
AGAAAATATGATAAAGTCAGTTGAAAAATATGGACCATATATTGTTTTAGCTGATAGATTTGCTCTACCA
CATGCAAGTTCTAAAGAAGGAGTAAACAAGCTTGCTATGTCTTTACTAATAGTAGAAGATGAAGTTGATT
TATTAGGAAAACCAGTAAATATATTTATGGTATTAGCTGCTGTAGATAACACTACTCACATTAGAGCATT
AGCATCACTATCAGAGATGATGTACGAGGAAGAAAATGTAAAACTAATAATTAATGGTGATAAAAGTTCA
ATACTAGAACTTATAAATAAGCAAAATTAG
>ref|NC_013316.1|:c2865279-2864755 hypothetical protein CDR20291_2442 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGATAGATTTAGAAATGATTGAACTATTTGAGCAGTTAGAGGAGATATTTAGAAGTGCTTCTACAA
TCCCTTTCTCACATAAATGCACAGTGGATAAAGATGAGGTTTTAGCAATAATTAATGATATAAGAACTTT
AATACCAGAAGAAGTAACACAGGCAGTATGGATTAATAAAGAAAGAAATAAAATAATAAGTCAAGCTAAG
CAAGATGCTACAAATATAGTTGAACAAGCGAAAAAAGAAGCTGAGAGAATACAACAAGAATATCAAGATA
ATATAGAGGAATTAAAGAAAAATTCTGAAGATGTAGTAAAGGCATATGTAGAATCCAGCGAACCTGTTGT
TCAAGCAGACCAAAGAGCAAAAGATATAGTTGATAGAGCTGAGAGAATAGCCAATGAGATAAGAATTGGG
TCAATTGAATATGCAGAGGATGTGCTTTCTAGTGTTGAGTATAATTTAAGAGAAATATTAGAAGAAGTAA
AAAGAGATAAAGCTGAACTTAGACCTAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2865780-2865283 phosphopantetheine adenylyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATAAACCTAGAAAAGCTATATTTGCAGGAAGTTTTGACCCAATTACTAATGGACATTTAGATA
TTATTTGCAGGGCTTCGAAGTTATTTGACGAATTACAAATAGGAGTATTAAATAATCCTAATAAAAAGGG
TCTATTTAGCTTTGATGAAAGAGTAAAACTTATAGAAAAAAGTACAAGCCATTTAAATAATATAAAAGTT
GTGACTTTTGATGGTTTATTAATAAATTACTGTCAGGAAAATGGGATTGGAGCATTAGTTAGAGGTGTGA
GAAGTGGTGCTGATGTTGATTATGAACTTCAGATGGCACATATGAATAGAGAGCTTAATCCAGATATAGA
GACTATAATTTTACCAAGTTGTACAAAATATTCATTTATAAGTTCATCTTTAATAAAAGAGGTTTTGCTC
TTTGATGCTGATATAAAAAATTTGGTTCCAAAGATTGTTTTGGAAGAATTAAAGAAAAAAACTAGTGGGG
GTAATTGA
>ref|NC_013316.1|:c2866336-2865782 hypothetical protein CDR20291_2444 [Clostridium difficile R20291]
TTGAGAGTAATTTCAGGAAAAGCGAGAGGATTAAAACTAAATACTCCAAAAAATGAAGATGTAAGGCCAA
CTACAGATAGAGTAAAAGAGTCTCTATTTAATATGATAAATTCATATATAATGGAAAGTGAAGTTCTGGA
TTTATTTGCTGGGACTGGTTCTTTAGGAATAGAGTGCTTATCTAGGGGTGCCAAGTCATGTACTTTTGTA
GATATCAGTAAGGAAAGCATAGATATTGTTAAGTCCAATGTAAAAAAGGCAAGAGTTGAAAGTGAAAGTA
TTATTTTAAACCTTGATTTTAAGACTGCAATAGATAAACTTAAATTACAAAATAGTAAATTTGACATAAT
TTTTATGGACCCTCCGTATTATAAAAATATGTTTATAGAAGCTATTGAAAAAATTGATAATTCTAATCTA
TTGAACGAAGATGGAATAATAGTTGTAGAACATGATACGAATGATTTATTTCCAGATAAGATATGTAAAT
TGGAGAAAACTAGAGATAAGAAATATGGAAATACTACATTAACTTTTTATAAGATGGAGGCATAA
>ref|NC_013316.1|:c2868464-2866395 ATP-dependent DNA helicase [Clostridium difficile R20291]
GTGATATATTTGTTGGATTTATATAAAGATGTTCAATATGTTAAGGGAATAGGACCTAAAAAAGCAGATA
AATTAAATAAACTGGGTATATTTACACTAAAAGACCTATTGTATTATTTTCCAAGACAATTTGAAGATAG
AAATAATCTAAAGAAAATAGCACAATTAGAAGATGGTGAGAAAGTTACGATAAAAGCAGTAATATCAAGT
ATAAATACATTTAGCCCAAAAGAAGGTATGACTTTAACAAAGATTGATGTAAAAGATGAGACAGGCTCGG
CTAAATTAGTGTTTTTTAATAAAAGTTATATAAAAAATACTTTTCGTCCAGGAGATTCAATATTAGTTTT
TGGGAAGGTTAAGAAAAAATTTAATAACTTAGAACTTACATCATGTGAATTAGAATATCTTACTAATTCA
CCTAAGAATACATGTAGATTTATGCCTGTGTACCAGCTTACATACGGTGTTACAAATAAAGAAATTATGA
GTATAATTAGAACAGTACTTGAAGATAAAGAATTAATTATACAAGAATATATGCCACAAAGAATTATAGA
AAAATATAGGCTATGTAGTATAGATTTTGCAGTTAGAAACATACATTCACCAAGTAGTAAGGAATCATTA
AAAATAGCTTTATATAGAATTGTATTTGAAGAATTACTTATACTACAACTAGGGTTGTTTGTATTTAAAA
GTGGCAGAAATAAAGAAGATGGAATAAAGTTTGAAACAAGTAAAGACTTAAAAAAAATAATAAGTGCTTT
ACCATTTAAACTGACTAAAGCTCAAAACAGGGCATTAGATGAAATTATACAAGATATGAATTTAGAGAAA
ATAATGAATAGATTGGTACAAGGTGATGTAGGGAGTGGTAAAACAGTAGTAGCTCTCTTAGCACTTGCAA
ATTGTGTTTTAAATGGTTATCAGGGCGCTTTGATGGCACCTACAGAGATATTAGCAGGGCAACATTACAT
TTCACTTACTGAGTCTCTAAAAGATTTTGGAATAAATGTAGGTCTATTAATAGGTAGTCTTACAAAAAAA
CAAAAGGATACAGTATTGGAACAAATAAGGAATAATGAGATTGATATATTAATAGGTACACATGCACTAA
TTGAAGATAAGGTTGAATTTAATAATATTGGTTTAGTTATAACAGATGAACAGCATAGATTTGGTGTTAT
GCAAAGGAGCAAACTTTCATTGAAAGGAGCAAATCCTGATATATTAGTAATGACAGCAACACCAATACCA
AGAACTTTAGCACTTATACTCTATGGAGATTTAGATATTTCTATTATAGATGAACTTCCTCCAGGAAGAC
AGCCAATAGAAACAATTGCTATTGAAAAAAGTAAGCGAGATAGAGCATATAATAACCTTGTAAGAAGAGA
GGTTGAATCAGGAAGACAAGTGTACATTGTATGTCCTTTGGTAGAAGAAAGTGAAGCTATAGAAGCTAAA
TCAGCAGTTGAACTTGTAGAGGAATTAAGAGCTGAATATTTCCACGATTTAAGGCTTGGATTGCTTCATG
GTAAAATGAAATCGAGTGAAAAAGACGAAGTAATGGAACGTTTTAAAAATAAAGAAATAGATATTTTAGT
TTCAACAACAGTTATAGAAGTTGGTGTCAATGTCCCAAATGCAACATTAATGATAATAGAAAATGCAGAA
AGATTTGGACTTGCACAATTACATCAGCTTAGAGGGCGAGTTGGAAGAGGTAGTCATAAATCGTATTGTG
TACTAATTTATGATTCTAAAACAGATGTATGTAGACAAAGAATGGCTATAATGGAAGAGACCAATGATGG
TTTTAAGATTTCAGAGAAGGATTTAGAAATAAGAGGACCTGGAGAATTTTTTGGGACAAGGCAACATGGT
CTTCCAGAACTTAAAGTAGCAAACTTATTTAAACATATAAAAATATTGAAGTTAGCACAACAAGAAGCTC
GATATATATTGGGTGAAGATAATAATCTACAATTGAAAGAAAACATGGCACTCAAAAAAGAAATTATAGA
TAAATTTAAAGATACATTGAAAGAAATTTCATTAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2870176-2868533 putative phosphatase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTCAATATATAGATGGTAAAAGGTTAAGGGAGATGTTTATTTCAGGTGCAAACAATCTCCAAAACA
ATAAAGAGTTAGTTGACAAGTTAAATGTATTCCCTGTACCAGATGGAGATACAGGAACTAATATGTCATT
AACAATATCTTATGCCTTAAAAGAATTAGCAAAAGTTGAAAATGATAATATATCAGATATCGGAAAAGCA
TTATCTAAAGGTTCTTTAATGGGAGCTAGAGGAAACTCAGGAGTTATACTTTCACAAATAATCAGAGGTA
TAGCTAAATCTATAGAAGGAAAAAGTAAATTATCAACAGAAGATTTAGCAAAAGCTTTTAAAAATGGTTC
AGACACAGCATATAAAGCTGTAATAAAACCAATTGAAGGAACTATACTTACTGTAGTTAGAGAAAGTGGA
GAGTTTGCAATAAAAACTGCGAAAAAAGAGAAAGATGTAGTAAAGTTTTTAAGTATGCTTGTGAAGGAAT
CAAATTCTTCATTAGAAAGAACTCCAGACCTTCTAAAGAATCTAAAAGAAGCTGGTGTAGTTGACTCTGG
TGGAAAGGGTCTTGTACTTATATATGAAGGAATGTTAGCTTCTATAAAAGGCGATAACATAGAAATAAAA
AATGTTGACCTAGATACTAATATTTCAACAAGTATGGATTTTGCAAAGAGTACTACTAGCACAGATGATA
TAAAATATTGCTATTGTACAGAATTTATTTTAGAAAGTTCTAAGGTAGAAGATACTAAAATAAGAGACAT
AATGATGGCTTATGGTGATAGTCTAGCAGTAGTTGGAGATGATGGAGTCATAAAGGTACATGTACACACT
AATGACCCAGGAAATGTACTTCAAGAAGCTCTAAAGTACGGTCAATTATTAACTATAAAAATAGAAAATA
TGAAGTTACAACATGAAAATACATTACTGGATGTAGAAGAAAAGAAAGAAAATGATAGTGAACCTTTAGA
AGAAGAGAAAGAGTTTGGGTTTATAGCTACTTCTATGGGTGAAGGTTTGGCAAATATATTTAAAGATTTC
GGAGTTGACCATATAATAGAAGGTGGTCAAACTATGAATCCAAGTACTGAAGATTTTATGAATGCTATAA
AGCATATAAATGCTAAAAATATATTTATTTTCCCAAATAACAGCAATATAATAATGGCTGCTAATCAGGC
AAAAGAATTGAGTGATAAAAATATAATAGTTATACCTACAAAAAATACGCCTCAAGGATTTGCTGCATTA
GTAACTTTTAATGGAGAATTAAGCGAAGATGAAAATAAAGAAGCTATGATGAATGCTTTAAACTCAGTTA
AATCAGGTCAAGTAACTTTTGCTGTTAGGGATACAGTGATGAATGAAATTGATGTTAAAGAAGGTAATAT
AATTGGAATTGCAGAAGGAAATTTATTATCAGCAGGAGATTATGTGGATGAAGTAACATCAAACCTTATT
GAAAAGTTGGTTGATGAAGATACTGCTATAATAACATTATTCTTTGGTGAAGATGTTACAGAATCTCAAG
CAAATGAACTACGTACTTCTTTAGAAGAAAAGTTTGAAGATGTAGATGTAGAGTTATATTATGGAGGACA
ACCTCTTTATTATTACTTAATTTCAGTTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2870545-2870195 hypothetical protein CDR20291_2447 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTGCAAAGGTAACGAATCAATATGGAAATATAGAAATAGATAATCAAGTAATAGCTCAAGTCGTAT
ATAGAGCTGCAATGGAAAGTTATGGCTTAGTAGGTTTAGCATATAAGTCTAAAGGAATAGTAGAGCTATT
AAAAGGCGAGAACGCAACTAAAGGTGTAAGAGTTGAGGAAGTAGAAGAAGATGCCATAGCAATCGAACTT
TATGTTATAATACAATATGGTACAAATATATCTACTGTTGCCAATAATATAATAGATAGAGTAAAGTATG
TAGTTGAAAAAATGACTGGCGTAAGAGTTACTAGAATTGATATTAATGTACAAGGAATAAGAGTTAAGTA
A
>ref|NC_013316.1|:2870906-2871094 50S ribosomal protein L28 [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAAAAGTATGTAGCGTATGTGATAAAGGTAAGGTTTCTGGAAACCAAGTATCACACTCAAATAAAC
ATAATAAAAGAACATGGTCAGCTAACTTAAGAAGCGTAAGAGCGATTATAGATGGAGCTCCTAAGAGAGT
AAAAGTTTGTACTAGATGTTTACGTTCTGGTAAAATTGAAAGAGCTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2871980-2871504 hypothetical protein CDR20291_2449 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTAAAAAGAAGCAATGAAAAACGAGAAGAGTACAGAAGAATGTATTCAGATAAAGAAAGTTTTT
TAAGTTTGATTCAAAATTTTACAAGTGTCTCAATAGCAAAAGAATTAACTCTTAAAAATATAGAGTTAGA
AACATCTTTTATATGTGAATATAAAGGAAAAGAAGTTGATATAATTTATAAGGTATTTTCTAAAAGTGGC
AAAGTATCACATTATATAGTGTTAGAATTTCAAACAGAAATGGATACTGAAATTGTCCCAAGATTGAAAT
CGTATAGAGAACAAATTTGGAAAAGTTTTATTATGAAAAAAAGCCTTGAAGAAATAGAAGATAAAAATTT
TAAACTTCCTAAAGTTATACCAGTGGTTTTATATAGTGGACCTGAAAGGTTAAGTAGAAAAAAAGGAATT
TTGGATATTGTAGAATCTATATCGGAGTTCAGTAATAATTCTAGTATGAAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:2872199-2872960 MerR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATATACAGTTCAAAAATTAAGTAAACTAGCTGGTATAAGTACTAGAACACTTAGATATTATGATG
AAATAGGTCTTCTTAAGCCACTTAAAATAAATTCTTCAGGTTATCGTATATATGGTCAAAATGAAGTTAA
TAAACTTCAACAAATACTTTTTTATAGAGAATTAGGAATTAACTTAGAAAATATAAAAAACATTATAAAT
TCACCAAACTTCGATAGTTTAAGTGCGTTAAAAGAACACCATAATAAATTACTAGCCAAAAGAAAGCAAA
TTGATTTACTAATAGAAAATGTAACTAAAACTATAGCTCTGAAGGAGGGAAAATACACTATGACAGATAT
AGAAAAATTTGAAGGTTTTAAAGAAAAGATGATTGATGAAAATGAAAAAAATTATGGAACTGAAATTAGA
GAGAAATATGGTAAAGATATTATAGATACATCAAATAAAAAGCTTAAAAATATGTCTAAGCAAGATTATG
AAAATTGGCAAAACCTAAATATCGAAATAATTAGTAAACTTAAAAAAGCTTTTAAAACTGGTGATGCCTC
TAGTGAACTGGCTCAGGAAGTTGCAAAATTACATCATAAATGGTTGAGTTACACTTGGAACACATACTCT
AAAGAAGCTCATTCCTCTCTAGCACAGATGTATGTATATGATGAACGTTTTACATCATATTATGATAGAG
AACAACCTGGATTAGCTAAGTTTTTAAGGGATGCTATAGTAATATATACAAGAGATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2875148-2873220 putative transcriptional antiterminator [Clostridium difficile R20291]
ATGCACAAGAGATTGCTCACGTTGTTTAAATTATTAAATGAAAGTGATGATAAAATTACTTGTAAAACTT
TAAGTAATCATTTAAAAGTGAGTGAGAGAACTATAAGAAATGATATTACTTCTATAAATGGAACTTTAGA
GAAAAATGGTGCTATTATTAAAATAAAAAAAGGAGAAGGATATTATATAGATATTCTTAATTTAGCATTA
TACCAACAGTATCTAGCATTAATATCTGATGATATTATGGATTCAAGTGAAATACCAGATTCTCCTATAG
AAAGAAATCAATATATTTTAAAATATATTCTCTATAACAATACATATATAAAACTAGAAGATTTAGCTAA
TAGCTTGTATGTGAGTAAATTTACAATACTAAATGACATAAAAAGAATAAAGCCTATTTTGTCAAAGTAT
AATTTAATATTAGTTTCTAAGCCATATTATGGAGTTAAAGTTGAAGGGAAGGAAATAGATATTCGAAGAT
GTATTTCTAATAATATGATAAATAGGAATTTTGAAAACTATATAATTGGAATTACAGATAGAGAAATAGA
ATTATTTAATAATGTAGATTTAATAGAGCTTCAAAGGGTAGTGTTAAGTGAAATTAATAAATTTAATATA
AATTTTCTAGATTTTAATCTAAAAAACTTTATTATCCATTTAGCTATTACTATAAGTAGAATACTTGATG
GTTACTGCTTAGATAATGTTTTAGATGTTGTTTTAACAGATTTTCAATCGAATACAACTGTTGAAAATAT
ATTTAATTATATTGAGAGTAAATATACTATAATTATTTCAAAGGCAGACAGAGTTTATCTATATAATCAT
TTTATAACTAAAAGTTCTCTTTTGGATAACGTTTCCAATAGGGTGGATACTAAAATTATAGAGTATGTTG
AAGAAATTTTAGAAGTAATCAACAATCAATATACTTTTGACCTTAGAAATGATAGTGTATTATTTGATGA
TTTAGTACTGCACTTTAAATCAATTCTCAATTCTAAATCTTATAATTTAAATAAGGTGAATCCCCTTATA
AATACAATAAAGAGTAATTATCCTTTAGCATTTGAAATAACTTTAAATGCTATAGAAAAAGTTTTTAAAA
ATAGTATTTACTCTTTAACAGAAGATGAAATTGGATATGTATCCCTGCATATAGGTGCTGGAATAGAGAG
ATTTTTTCAAAATAATATTAAGTGTAAAAACGTAGTATTAGTATGTGGTTCAGGGTATGGTTCAAGTAGG
TTATTAGAGGTTCAATTAAACAAAGTTTTTCATGATAAAATAAATATACTTCAATGTCTATCATTTAATC
AATTTTTAGCTAGTGAATTGTCAGATGTAGATATAATAATATCGACAATTCCTTTAAATCATGATAGTAT
TCCTATTGTATTAGTGGATTTAAAACTATTAAAAAAAGATATAGAGAATATATCTAAGTCAATCACTAAT
AATTCCCATATTTATAGTAATCTTTTGGACAATTTCTTTGATAAAAATTTATTTATTGTTAATCCTAAAA
TCAAAGATAAAGATGAGCTTATAAAGTTGATGTGCAACAAATTAACTCAAAGTGAAATTGTATTTCCATC
ATTTGCTGAATCTGTATTTTACAGAGAAAGTTTATCTTCTACCAATATAGATGATTTTTTAGCTATACCT
CATCCTATGGAATTAAGCTCTATAAGAACTAAGATTTGTATTTCCATATTGAATGAACCAATATATTGGA
GTGAAGATTCTACTGTTAAATTAATCATGATGTTAGCTATAAATAAAGATGATTATATAAAAATAAACTC
CATTTATGATATCCTTTTAAAGATAATTCATGACAATGATATTAGAGATAGTATATCTAATTGTAATGAT
TTTGATAATTTTCTTTCCATAATCAAGTCTATAGTATAG
>ref|NC_013316.1|:2875382-2875834 PTS system, IIa component [Clostridium difficile R20291]
ATGGTACTACAAGAAAAATATATATTTATAGATAAAGACTTAAAAAGCAAAGAAGAAGTATTAAATTTTA
TTGCAGATAGTGCTTATATACTAGGTATTGCAACTAATAAAGAGGCTCTTTTAAAAGACCTTCTAAAAAG
AGAAAATGAATTTCCAACAGGAATAAAAGATGGATTTGCGATACCTCATACAAAAAGTGTAAATGTAAAG
GAAGCTTCCATACTCTATATTAAAACAACTAACGAGTTAGAGTGGAAAACTTTAGATGATAGTAAGGTTA
GATATGTATTTAGTTTGTTAGCCCCACATAAAAATGAAGGAAATATACATTTAAAAACTCTATCTAAATT
AGCCACATGTTTAATGGAGGATGATTTTACAAGTGAAGTTAAAAATGCTAGTGATGCAAGTCATTTAGTA
AAATATATAACTAATAAAATGAAGGAGGAATAA
>ref|NC_013316.1|:2875837-2876145 PTS system, IIb component [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATAGTAGCAATAACATCATGTATAGCAGGATTAGCACACACACCTATGGCAGCAAAAGCTTTAG
AACAAGCTGCATCAAAAATGGGTCATGAAATCAAAGTAGAACAACAAGGTGCTATGGGACGAGTAAATAC
TATAACAAAAGAAGAAGCACAAGATGCGGACTTTATACTTATAGCATCTGACCAAACTATATCTGGAATG
GAAAGATTTGATGGTAAAAAAGTGATAAAAGTCAAAATAGGTATAGCGTTAAAAAAACCAGAAGCTGTCT
TAACAAAGTGTATAGAAGCTATTTCTTAA
>ref|NC_013316.1|:2876259-2877365 PTS system, IIC component [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAAAAAAATAAATCTCTTTTAAGTGAACTTAAGGGACACTTAATGACAGGTATCTCATATATGT
TGCCACTTGTAATAGGCTCATCTTTAGTTGTAGCTATCCCAAAGCTTACAGCTTTAGCAATGGGTATAAC
AAGTTTAGATGCTTATAAAAATGTATCTGGTTTTTATCATATTCTTTACTTAATGGAACAAGTTGGTTGG
ACTGGCATAGGTCTATTAAATACGGTATTAGCAGGATTTATAGCATTTTCAATAGGTGAGAAACCAGCTA
TGGGTGCAGGTTTTATTGGTGGGCTCATAGCAAGTAATACTAATGCAGGATTCTTAGGAGCAGTAATAGC
AGGTTTCTTTGCTGGGTATGTTTGTAAGTTTTTAAAGAAAAAAATTAAAATATCTGGGTCAGCATCAGGA
ATGATGCCACTTATAATAATGCCACTTATAACAGTTGGATTAACTGGTTTTTTAATGAGTGTTGTATTAG
CAGGACCTTTAGGAAACATAAATACTTCATTAAATGCTTGGGTAGCTGAAATGTGTCAAAATGGAACAAA
TTCGGTGGTATTGGCTTTAATTTTAGGCGCAATGATAGGATTCGATTTAGGTGGACCAGTAAATAAAGCA
GCTTGGATGGCAGGAAATGCATTATTGTTAGAGGGAATCTATCTACCAGCGATATTGGTAAACTGCGCAA
TAGTTATACCTCCACTAGGATATGGTTTAGCTACATTCATAAGAAAATCAAAATTTTCCAATGCATTAGC
TGAAACAGGAAAAGGCAATATAGTTATGGGTATAATTGGAATAACAGAAGGTGCAATTCCTTTCACTTTA
ACAAATCCATTAAAATTAGTTCCTGTTAATATGATAGGATGCGCTTTGGGTGTAGGATTATCAGCTTTGT
TAGGTGTACATGCTATAATGCCTCCAGTTGGTGGATTATATGGATTTATATCAATAGGTTCTGGATGGGC
TTACTTAGTAGGTGCAATATTTGGAGCTTTAGTAATAGCAATATTATCAACAACTTTAGTAGACTTCAAT
GAAGATGAAACTACGGAAAATACAGAATTTGATGAAATAGAGTTAGATATAATGTAA
>ref|NC_013316.1|:2877440-2880118 putative glycosyl hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGACAAAAGTACATGTAGTTCCACACAGTCATTGGGATAGAGAATGGTATTTTACAACATCAA
GGTCAAAAATATATTTAATGAAAGATTTTCAAGATATATTAGACATATTGGAAGAAAAAGAGGACTTTAA
ATACTTTACTATGGATGCACAAGCTTCTCTCTTAGATGATTATTTAAAATGGAGACCTCAGGATGAATAT
AGAATAAGAGATTTAGTTCAAAGAAGAAGATTAGTTATTGGACCTTGGTATACTCAAACAGACCAATTGG
TTATATCAGGAGAATCTATAATTAGAAACCTTTACTATGGAATAGATAGATGCAATGAATTTGGTGAACC
TATGAGGGTTGGATATGTACCAGATTCTTTTGGGCAATCAGCTCAAATGCCACAAATATACAGAGGTTTT
GGAATAGATAGTTCATTATTTTGGCGTGGAGTTTCTGATGATATGGTAGATACAACAGAGTTTATATGGA
AAGGTTCTGATGGTTCAAAAGTATTAGCAGTTCAAATACCATTTGGTTATTACTATGGAGGTAATATACC
AGAAGATGATTCAGATTTAAAAGAATATTTAAAAGATATAATTGGAAAACTTAAGGTTAAAGCTTCTACT
AATAACGTATATTTTCCAAATGGATTTGACCAAGCACCAATAAGAAAAAACCTTCCTGATATATTAAAAA
AAGCTAATGAAATAGATAATGAAAATGAATACGAAATAAGTAATATAGAAAACTATATAGATTCAGTAAA
AAATGAAAGAAATGAATTTACAGAGCTTAAAGGTGAATTTTTAAATGCTAAACATATGAGAATACACAAA
TCCATATTCTCCTCAAGGTCAGACCTTAAAATAATGAATAACAAATTAGAAAATTATATCACAAATGTAC
TTGAACCATTATTAACATTAAGTTATTCACTTGGAAATGAATACCCTCATCTAGTTATAAAAGATATATG
GAAACTTATGTTTGAAAATGCAGCTCATGACAGCATAGGTTCTTGTAATAGTGACACAGCAAATGAGGAT
GTATACACAAGATACAAACAAGCCAGAGATTTGAGTATAAATTTATTAGATTTGCATATGAGACTTATAA
GTACTCAAATCAAAAATAATAATGAAGAAATAACATTAACAGTATTCAATGGATTCCCAGAAGTCAGAAA
TGAAGTTGTAGAATTTGACACTTATATTCCAGGTCAAGATTTTGTGATAAAGAATAAAAATGGAGAAATT
CTTAATTATATAATAAAAGAAAAAGAAGATATTACAAATTATATATTAACTCAAACAATAAGATTAAACC
CAAGTAAAAAAATATATATACCCAAAACTGTATATAGAGCAAAAATTGCACTTTCAGTAAAAGATATACC
ACCAATGGGATATACTCAACTAGTTTTTGAATTGGATACTAAAAATAAATGTGAAATAGAAACAAGTAAT
TGCAAAGAAATAGAAAACAAATATTACAAAATAACAGCCAATAAAAATGGTTCATTAGAAATATTAGATA
AAGAATCTAGTAAGACTTATAAAAACCAAGCTGTAATTGAAGACAATGGAGATGATGGAGATTCATACAA
CTATTCTCCTCCAAGAAAAGATATTTATGTTTCATCTTTAGATTCTGTATCTTCAGTAGAAGTGCTAAAA
TCAAATATTCAAGAAGAAATGATACTTAAATATTCATTGACCATACCAGCTTCACTGGAAGAAAGGTCTA
TAGGTAAAGTTTCTGTGAAAATGCCAGTAACAATGAAAATTACCTTAGAACCTAAAGAACAAATAATTAA
GTTTAATGTTAATATAAAAAATAACCAAGCACTATCTCATAGAGTAAGAGTTTTATTTAATACAGAAATA
GCATCTAAGTTTTCTATAGCAGATCAACAATTTGGAATAATACAAAGACCAACAGTATTAGAAAAAGACC
TTGCATTATGGAAAAGAGACAATTACTCATGGCAAGAAAAACCTATAACTATCGAACCAATGCAAAGTTT
TGTTACTTTAGAGGATGGACAAAGAGGAATAGCATTAATAACTGGTTGTGTAAGAGAATATCAAATAGTT
GGTGATAATTTAGATACAATAGCATTAACACTATTCAGGTCATTTGGATATATGGGAAGAGAAAATTTAC
TTTATAGACCAGGAAGAGCTTCTGGAGAAAAAATAATAGCAACACCAGATGCACAATTACTTAAAGAGTT
AAACTTTGACTTTGGTCTTTACATATATAACAATAAATTTGATGAAGCAAATGTAGCTAATACAGCTAAG
AGATTCTTAACACCTATACAAATATATGAATATGCTGATTTTTTAAATGGTAGACTTCTATTTGCATTCA
ATGACGAAAAACAAATATATGAAAATGAATTTAGTTTGATGAATGTAAATAATTCAAATTTCACAGTAAG
TGCAATAAAGAAAGAAGAAAAAGGAGATGGAATTGTAGTTAGAATCTTCAATGGTATGAAAAATGAGGAT
GCTAAGGGAAGTCTTAACATCAATAAAAATGTCAATGATGCTTATAGTGCAATGCTCGACGAAATCTATG
ATAATAATAGCAAGCTTAAAGTAAATACTAAAACTGTAGAGGTAAATTCTTTATCACATTGTAAAGTACA
AACAATAGTAATTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2882771-2880435 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
GTGTTGGATACAAAATTGAAAAAATTTAAAGATAAATATATAGTTACTATTATAGTTTTTATACTTATGT
TATCAGCATCATTAGGTATGATTAGTCAATATTCTACTATACAAGCAGGTGCTAAAGGTGGAGCAAAGAA
TCCATTTGAACAGGAAAGCTTTGTAGATAGTATATATAAAGGAAGTTATGTTTTATATCATAATATGAAG
GAAGAACAAGAAGGTAAGATGATACAACCATCAAAGCTATTTATCAATGAAGAAACTATGAACTATATAA
AAAATGTAAGTAAAGAAAAAGATACTTATGATGGTTCAGAAACTTATTATACAGATGATAGTATTAATGC
AGATTTTAATGAAAACTTTGAAAATTGGGAGCATTTCATTAAAGCGTCAGGAAAGAATTTAAAGTACTAT
TTAGTTGATAAAGAAAGCAATTTTGAATTTTTTAATGATAATAAAGAATTAGGAGTACTTGATACAACAA
AGAATGATGCTTCAAAAGAAAATTCTGATGAAAATCAGTCAAAAAATACAGAAATGAATGATGAGGAAAG
ACAAAAGCAGATTACAGATATAAAGGAAAACTATAGATTCTACGTTGTAATGAATTTTGATAAAGATGGA
AAAGTAAATATTGTGGATTCTTATGGAGTAAATCAAAAAGTTATTAATCAAATGTTGTTATCTAAAGCAA
GAGAAGATTTAATGGATACAAGTTTAGGAGGAAATTCAATTTCATATAAGTTATCTCCAATAAAAAATAT
AACATTAGTATATGCTGTACCTAAAGTAATAAGTAAAGGTGATAGTGTAGAGTATGGTTATGGAAATACT
TATTTTGATGATGGTATAATTTCATATATAAGCAATGTAGAAAATAATTCTTATTATAAGATTTCTGGAA
TGATTTTAAAAATTATATTAGCTATAGTTGTTATTGTAGCTTTAGCATTCCCATATAGAAAATCTAAAGA
GTTGCTAGGATTTGATACATTATTAAGAATACCGTTAGAGATACTCTTTATTGCTCTTGCTATTATACAG
GGGCTTGTAGATTTATATCCTACTGTTATAATAAGTAATACCTTGAGTGGGAATTATGTAGAGTACCTTA
TAAACAATGACATAAGTGCTAAAATGGCTAGCATATTGGTAAGTTTAATGAATTTAACTTATTGGTTTGT
AATATTCTCAATAATATTTGTATTTATAATACTTTTAAAACATATTTTAAATGTTGGAATAAGAGAGTAT
TTTACAAAACATACTGTGACAGGAATGTTTTTTGTATGGTTAAAAAAAGCAGGAAAAACAGTTATTAATC
AAATTAGAACAATAAATCTAAAAGAAAAGCCAAATAAAACTATAGTTACAATTTTGGGAATAAATTTATT
GATTATAGTTATAATGTGTAGTATGTGGTTCTTTGGAATAATACTCGCATTAATATATTCAGTAGTATTA
TTTAAGATACTGTCAGATTACTCTAAAAAGACAATATATGAATATAATCAACTTTTAGATGTTACAAAGA
AAATTTCAGATGGAAACTTAGATGTAAATATGGAAAAAGATTTAGGATTTTTTAATCCTATAAAAGACGA
ATTAGGAAATATTCAAACTGGATTTAAAAAAGCTGTTGACGAAGAGGTTAAGAGTCAAAAGATGAAAACA
GAGCTTATATCAAATGTATCACATGACTTAAAAACACCTCTAACATCTATAATCACTTATATAGATTTAT
TAAAAGATGAAAGTATAACAGATGAAAATCGTAAGTTGTATATTGATACATTAGACAGAAAGTCACAAAG
ATTGCAACATCTAATAGAAGATTTGTTTGAAGTAAGCAAGGCAAATAGTGGAGATGTTTATTTGAATATA
GTAAATGTGGATATTGTATCTCTAATGAAGCAGACACTTTTAGAATTAGATGACAAACTTGCAGATTCAT
CTCTAATAGTAAAGAATAACTTTTCTAATGAAAAAATAATATTACCATTAGATAGTCAGCGTACATTTAG
AGTATTTGAAAATCTTATAATAAATATAAGCAAATATGCAATGCCAAATTCAAGAGTGTATATTGATATT
TTAGAAACAGATAATAAAGTAAATATTATGCTTAAAAATATGTCTGCATCTGAGATTGATTTTAGTGTAG
ATGATATAATGGAGAGATTTGTAAGAGGAGATAAATCACGTAACACAGAAGGTTCTGGTCTTGGTTTAGC
AATAGCAAAAAGTTTTATAGAATTACAGGGTGGTAAGATGAATATAAGTGTGGATGGTGATTTATTTAAA
GTTACAATTACTTTTAACAAAAATTAG
>ref|NC_013316.1|:c2883459-2882743 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTCATATAATATTTTGGTGGTAGAAGATGAAAAGGAGATCGCAGATGCTATAGAGATATATCTAT
TAAATCAAGGATATAATGTTTTTAAGGGATACAATGGATTAGAAGGTCTTAAGGTTATAGAAAACCAAGA
AATACATTTAGCTATAGTTGATATAATGATGCCTAAAATGGATGGTATAACACTTACAATGAGGCTTAGA
GAAAACTATAATTTTCCAGTAATAATGCTATCTGCAAAATCAGAAGAAGTTGACAAAATAATGGGGCTTA
ATATAGGAGCAGACGATTATGTAACAAAACCTTTTAAGCCATTAGAACTATTGGCTAGAGTTAATTCACA
ACTTAGAAGGTACACTAAGTATCTAAACATGGTTGGAAATAAAGAGCAAAAGGTAGAAAGTGATGATAGT
GTGTTTGCAATAGGCGGATTAGAATTAAATGAAAATACAAAAGAAGTTAATATTGATGGAAAATATATAA
AAACAACTCCTATAGAATTTAAAATACTAAGTTTACTTATGAGAAATGCAGGAAGAGTTTTTTCTGCTGA
TGAAATATATGAAAGAGTTTGGAATGAAAATGCTATAAATACAGATACAGTTATGGTACATGTGAGGAAT
ATAAGGGAAAAGATAGAAATTGACCCAAAAAATCCTAAATATTTAAAGGTGGTGTGGGGTGTTGGATACA
AAATTGAAAAAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2884530-2883874 putative nitroreductase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATTACAAGATACTATTTTTAAAAGACAAAGTGTAAGAAAGTTTAAAAATCAAGATGTATCAGATG
AAGATATTTTAAAAATGATAAAAGCAGCAGGTGCAGCACCATCAGGCAAGAATATTCAAAACTGGCATTT
TGTTGTTATAAAACGCCGTGATTTAATGGAAAAGATAGCAGATGTGATAACTAAAAAGCAACAAGAAATA
CTTGTGGAAATGGATAAAGTATCAGTGGATAAGGCTAATAGATTTAGAAAATTTGTTAAAAACTTTACAC
TATTTTACTTAAAAGCTCCAGTTTTAGTATTAGTTTTTACAAAGGTATATAATCCATCAGGATATTATGA
ATTAGAGCTTATAGATGCACCTAAGGAGACTATAGATAAATTATTTATAAGAAATCCAGGTATGCAGAGT
CTAGGTGCTTCAATTGAAAACTTTACACTATCAGCAATTGAACTTGGATATGGTTCTTGTTGGTTGACAA
GTCAAAACTATGCAGCAGATGAGATAGAAGCTGTTTTAGAAGCAGAAACTGGTTTTGAAAAGGGAGAGTA
TTTTTTAGGTGCAATGTTAGCTCTTGGAGTGCCAGAGGACAATTTGAAGAGTCCATCTAAAAAACCAGTA
GAAGAAATATGTACATTTATAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2885214-2884585 putative hydrolase [Clostridium difficile R20291]
GTGGTAGATAGTATTATTTTTGATTTAGATGGAACATTGTGGGATTCAACTGAAGAAGTATGCAAAGTCT
GGCAGGATGTTTTAAGTAAACATAAGGAAATAGAATTAAGTGTCACAAAAGATTTATTTAGAAGTCTTAT
GGGGCTTTCTTTTGAGGAAATAGCAAATCGTTTATTTCCAAATTTAAGTGAAGAAGAAAGAATGAATTTA
TTGAATGAATGTTCTTTGAAAGAATGTGACTATTTATCTGAAAATGGAGCTAAATTATTTGATGATATAG
AAGATACTCTTAAATTACTATCTAAAAAATATAAATTATTTATAGTAAGTAATTGTCAAGCTGGATATAT
AGAATCTTTTTTAAAAGCACATAAACTAGAACAGTATTTTATAGATTTTGAATGTCCTGGTAATACTGGT
TTGCATAAAGGAGAAAATAATAAACTTATAATTGAAAGAAATAAATTAATAAATCCAATCTATGTTGGTG
ATACGCAAGGTGATGCAAATAGTGCTAAGTTTGTAGGTATACCTTTTATATATGCCAAATATGGGTTTGG
GAATGTAGATGTATATGATTATTTTATAGATTCATTTAAAGATTTGTTAGAACATGATATATTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2885986-2885345 putative thiamine pyrophosphokinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATCTGTATTGTTTTAAATGGCGAAATTGAAGATTACGAAGTTACAAGAGATATTATAATTAAGG
AATGTTATGACTGCATAATATGTGCAGATGGAGGGGCAAATCACACTTATAAAATGGAAATAATGCCAGA
TTATATATTAGGAGATTTAGATTCAGTAGAAGAAGAAAAGATAAACTTCTATAAAAATAAAGGTGTTAAA
TTTGAAAAATTTCCATCTAAAAAAGATGAGACTGATACAGAGCTTTGTCTTTTTTTAGCTAAGACACTTA
AAGCAAATCATATTGATTTTTTTGGTGCTTTAGGGGGAAGGATTGACCACACTCTTGCAAATATAAAGCT
ATTATATTATTTAAAAGAAGATGGTATATATTCTAGGATACTTTCTGATAAAGAAGAGATGTATATAGTT
GAAAATGAGGAAATTTCATTGTATGGAAACCCAGGGGACACTGTTTCTGTAACAGCTATAAAAGGTGATG
CTAAGGGTGTAACACTTACTGGCTTAGAATACCCTCTCGATAATTATTATATGAAATACTCTGTACCTAT
TGGAATATCAAATGTTATGTTGAGTAATTCTTGTAAGATTAAAGTAGAGCAAGGCTGTGTACTTGTAGTT
AGAAATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2886666-2885995 ribulose-phosphate 3-epimerase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTAAATTAGCACCATCAATATTATCAGCAGATTTTGCAAAATTATTAGAAGATGTAAGAAAAGTAG
AAAGTGCAGGATGTGAATATCTTCATATCGATGTAATGGATGGACACTTTGTACCAAACATTACATTAGG
ACCACTTGTAGTCAAAAGTTTAAAGAAAGAAAATATAAATATGGTATTTGATGCTCATCTTATGATAGAA
AATCCAGACCAGTATATTGAAGAATTTGTAAAAGCAGGATGTGATATAATAACTGTTCACCAGGAGGCTT
GTGTTCATCTACATAGAACTATACAAAATATAAAATCACATGGAATAAAAGCTGGTGTAGTACTTAATCC
AGCTACACCAGTAGATACGATTAAACATGTACTACCTGATTTAGATATGGTATTATTAATGTCTGTTAAC
CCTGGATTTGGAGGACAATCATTTATTCCTTGTGTTTTAGATAAGATTAAAGAGTTAAAAGCTATTATAG
ATAGTCAAGGATTAAACATTGATATAGAAGTTGATGGTGGTATAAGCCCTAAAAACGTAGCCGAAGTTGT
ACAAGCAGGAGCTAATGTAATAGTAGCAGGTTCTGCAATATTTGGAAGTGATGACATTCAAGAAACAGTT
AATTTATTTAGAAAGAATGCTTCTCTTGAAGAATTAGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2887591-2886671 putative ATP/GTP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTGTTTATATAAATTTTATAAAGGGAGGCATTTGATGCTAGAAGGAAAAATTATAAAGGGGATTAGTG
GATTTTATTATGTAGATACTTATAATGGTATTTATGAATGTAAGGCTAGAGGGATATTTAGAAAGCAGAA
AATAACACCTTTGGTTGGTGATAGAGTCAAAATAAGCATTGTTGATGAAGATGAAAAAAAGGGTATCTTA
GAAGAAATCGACAGTAGAGATACAGAACTTATAAGACCTCCTATTGCAAATGTAGATAAAGCATTAATAG
TATTCGCAATAAAAAATCCTAAACCAAACTTATCTCTTTTAGATAGATTTATAGTTTTGGCAGAAAAAGA
AAATTTAGAAACTGTAATAATCCTTACAAAAGCAGATTTAGATGATAATGATACATTAGAAACTGTTAAA
AATATATATGAACTTAGTGGCTATAAAGTCATTCCTGTAAGCAATATTACTAAGTTAAATATAGATAAAG
TAAAAGAAGAATTAAAAGAAAATGTAGTAGTGTTTGCAGGACCATCTGGAGTTGGAAAATCAAGCTTATT
AAATGAAATAGATGAAAATTTTAAACTTCAAACAGGAGTGGTAAGTGATAAAATAAAAAGGGGAAAACAT
ACTACTCGTCACGCTGAACTTTTAAAATTGGAATTTGGTGGAATGGTTGCAGATACACCAGGTTTTAGTT
CCCTTGCACTTGAAGATATAGAGGAAGTTGAACTTAAAGATTATTTTATAGAATTTGATAAATTTAATGA
TTGTAAGTTTGGTTCAAAGTGTATTCATGAAAATGAACCTAATTGTGCTATAAAAGAAGCTGTTACAAAT
GGAGAAATATCTAAAGAAAGATATGATAGTTATATACAGCTGCTACATGAAATAAGACAAAATAATAGTA
GGAGGTATTAG
>ref|NC_013316.1|:c2888390-2887653 putative short chain dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAAGAAAACCGTTTTAATTACAGGAGGAGCTAGAGGGATTGGTAAAGCTATGTCTAAAGCTTTTG
CAAAAGAAGGTTACAATGTATTAGTAAATTTTAATAAGTCAGAAAATGAAGCTAAAGAGTTGTATACTAT
ATTAAATGAAAAAAATTTTTCTGTAAAACTTTTTAAGGCTGATATTTCAAATAGAGAAGATGTAGAGAAT
ATGGTAGATTATTGTATAAAAGAATTTGGAGGATTGGATGTACTTGTAAACAATGCTGGTGTAAGTCAAG
ATAAGTTGTTTACAGATATAACCGATGAAGATTGGGATAATATGATGAATATTAATTTAAAAGGAAGCTT
TTATTGTTCGCAAGTTGCTTTAAAATACATGATATCAGAAAAAAAAGGAAATATAATTAATATATCTTCA
ATCTGGGGTATATCAGGTGCGTCTTGTGAAGTGCATTATTCTATAACAAAAGCAGGTATAATAGGTATGA
CAAAGGCATTAGCTAAAGAAGTAGGACCATCAAATATTAGAGTAAATAGCATAGCTCCAGGTGTCATTAA
TACTGACATGTTATCTGGATATAATGAGGAAGATATAGACGCTCTTGTGGAAGAAACCCCTCTAATGAGG
CTAGGAACTCCAGAAGATATAGCAAATTGTGCTATTTTCTTGGCATCAGACAAATCAAATTTTATCACTG
GTCAGGTAATTAGTCCAAACGGAGGATTTGTTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2890513-2888498 serine/threonine-protein kinase and phosphatase [Clostridium difficile R20291]
GTGGGAGATACAATTTTAGGAAATCGATATGAAATCATCAGGAAGATTGGTGATGGAGGAATGGCCTTTG
TATATGAGGCTAAAGACAGATTATTAAACAGGACTGTTGCACTTAAAGTACTTAGACCTGAATTTGTAGA
TGATGATGAATTTCTAACAAAGTTTAAAAGAGAGGCAGAAGCAGTAGCAAGTCTTTCACATCCAAATATA
GTAAATGTTTATGATGTTGGTGAAGATGGAAAAGTTCACTACATTGTAATGGAGTTTGTAGATGGGAAGA
ATCTAAAAGAGATTATACAAGATGAAGGTATATTAGATGAATATACTGCATTAGATATAACAAAACAAAT
AGCTATGGCACTTAGTGCAGCGCACAAAAAGGGGATTATACATAGAGATATAAAACCTCATAATATTCTC
ATATCAAATGAAGGAAGAGTAGTAAAAGTGGCTGATTTTGGTATAGCCAAAGCTGTTTCAAATTCAACAA
TGACTAATATTGGTAGTATAATAGGTTCAGTGCATTATTTTTCACCAGAGCAAGCTAAAGGTAAATTTGT
AACTAATAATGCTGACCTGTATTCTCTAGGTATAGTTTTATATGAAATGTTGATAGGAAAAGTTCCATTT
AGGGGAGATAGTCCAATTTCTATAGCACTTCAACACATTAATGATGATATAGACTTTACATCAGAAGAAA
AAGTTAGGATTCCTCAAAGTGTAAGAACTACAATAAAAAAGCTTACAGAAAAATCTAGCGCAGATAGATA
TCAAACTGCTGAAGAATTGATAGAAGATATAGAGTATATAGAAAAAAATATTGATTTAGATTTTATAAAA
GAATATGATGATTTTGCAACTAAGAAAATTGATGAAAAAGAAATTAATAAAGTTGTAAATCCAACACTTG
CAAAACCAGCTCCTGAAAAAGTGGTTAAGCCTGTTGAAGTAGCTGATTTGGATGATGATGAAGATTACTA
TGATGATTTTTATGAAGAAGATGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAGATAATGAGAGCTAAAAAGAAT
CAGAGACCTAAGAGTACTCCAAGTAAGAGAACTAAGAAAAAGAAGAAAAAACAGGAAAGCCCAAAATCTA
GAAGAAGATTAAAAGTAATTGCGGCTGTTTTGATACTGATATTGTGTGCTCAAGTATTCTTAGCATATAA
GTTTTTATTTGCTGGAGGGTTTGGCAATAAATCTTTGACTGTTCCTAATCTTGTAAATATGACATTAGAA
GAAGCTCAAAGTGCTGTTGAAAAAGAAGGATTATACCTGAGTGTAAAAAGTGAAGAGTATAATAGTGAAG
TTGATGAAAATTGTATAATATCACAGACACCTGAAGGTGGAAGTACAAATGTCAAAAAGGGTGATACTAT
AAATGTTGTCGTAAGTAAAGGTTCAAGTCAGGCATCTGTTCCTAATGTGGTGGGACTTACTTTGAGTAAT
GCAAAACAACTTATTGAAGAAAATAACTTAAAAGTGGGAACTGTTAAGTATGAATATAGCTCAATATATA
AAGAAGGTACAGTTTTAAGTCAGAGTCCAGGTGCTGGCTCATCAAGAGCTCAGGAAGGTGATGAGGTAAA
CCTATATGTAAGCAAAGGTTCAGAAAAATCAAATACACAGACTCCAACAGTACCAGATAAAAAACCAACA
ACACCAGAGAATAATACACCAACAGAACCTGGTTCAAACTCAGGGAACAGTGGTGGAAATTCAGGAAGTT
CAAACTCAGGAAATAGTGGAGGAAACTCAGGCAATAATGGAGGTAACTCAGGAGGTTCAAACTCAGGAAA
TAGTGGAGGAAGCTCAGGAGGCTCAAACTCAGGAGATAATGGAGGAAGTTCAGGAGGTTCAAACTCAGGA
GATAATGGAGGAAGTTCAGGAGGTTCAAACTCAGGAGACAATGGAGATAGTTCAGGAGGCTCAAACTCAG
GAGATAATGGAGGAACTTCATCAGGAACTGGCGCAAACATTGGTAAAACAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2891282-2890530 serine/threonine phosphatase [Clostridium difficile R20291]
ATGGTTTATAGTTGTGCCTCCCATATAGGAAAAATAAGAAAAAACAATGAAGACTATTGTGAGGGAGAAG
TTATAGATACAGAACATGGTCCAATAGGAATATTTGCCATAGCTGATGGAATGGGTGGACATAAAAAAGG
TGAAGTCGCCAGTAAATTAGCAGTAGAAAATATAATTGATTTTCTAAAGGAAAACTTATTACAACATGAT
AATGTAAAAATAGACTATATAGATGATATATTAAAACAGGCTTATAATAATGTAAACTCAATTGTGCACA
AAAAATCTATGGAAGATATAGAATTTGAAGGAATGGGAACTACATTAGTTACGGCTATAGTGTATAATAA
TGTCTTATATGTGGCAAATGTTGGAGATAGCAGATGTTATTTGTTAACAGATGAAAAATTTGATAAAATA
ACTATAGACCATTCCGTGGTTGAAGAACTTATGATGGCCCATGTCATTACAGAAGAAGAGGCAAGAAGAC
ATCCACAGAGAAATAGAATAACTAGAGCAATTGGAACAGATGATATGGTTGTTGTAGATATTTTTAAGAA
AGAAATCAAAAAAAGTGATATAATACTTCTTGCGACAGATGGATTAACTGGGTTTATTGATGATGAAGAT
ATAAGAGATTTAATATTAGATTATGAATATGAGAGAACTAGTAATATAAGTGAAGAATTGATAAGTATGG
CCAATGATGTTTCTGGTAAAGATAATGTTTCGGTTATAGTGATAAAAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2892333-2891302 radical SAM protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAGAAAAAGATAGTATTAAAAAATTTTACTGAAGATGAACTTAAAGAATTTATGAAAACTATAG
ATGAAAAGCCCTTTAGAGGAAGTCAAATATTCTCTTGGATATATAAGGGTGCAAAAACTTTTGATGATAT
GAACAATATACCAAAAAGTTTGAGAAATAAATTAGAAGAGGTTTCATGTATAGGGAATATAGATATAGAA
TTAAAGTTAGAATCTAAGGTAGATAATACAAAAAAATATTTGTTTTTATTAGATGATGGAAATATAATAG
AAACTGTGATGATGGATTATGATAGTAGAGTTACTGTCTGTGTTTCTAACCAAGTAGGTTGTAGGATGGG
ATGTAATTTTTGTGCATCTACAATGGATGGATTAATTAGAAACTTAGAGCCATGGGAAATTTTAGACCAA
GTTATTAAAATTCAAGAAGATACTGGTAAGAGGGTATCAAATCTTGTATTGATGGGGAGTGGTGAGCCAC
TTGATAACTTTGAAAATACAAAACAATTCTTAAAAATAATTAACGAAAAAAATGGTCTTAATATAGGGTA
TAGACATATAACTCTTTCAACTTGTGGAATAGTACCTAAAATGTATGAGTTGGCAGACTTAGAAATAGCT
ATAAATTTAGCTTTATCACTTCATTCACCATATGATGAAGAACGAAGAAAAATTATGCCTGTAGCAAATG
CTTATTCTATTGAAGAAATATTGAATGCATGTAGATATTATATAAAAAAGACAAATAGAAGGGTTACATT
TGAATATTCTCTTATAAAAGGAGTAAATGACTCAGAAAAAGAAGCAAAGGCATTAGCTAAGCTCCTAAAA
GGTATGCTATGTCATGTAAATTTAATTCCAATAAATAAAGTTGAAGAAAGAGAATACGAAAAGCCAGATA
AAGCATTTATTTATAAATTTAGGGATAGTTTGGAGAAGAACAATATACCTGCCACAGTTAGGATGTCTAT
GGGTTCTGATATTAGTGGAGCTTGTGGTCAATTGAGAAGAAAATACAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2893666-2892341 ribosomal RNA small subunit methyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATGCAAGAGAAGTTGGATTTAAAGTATTATGTGATATAGAAAAAAATGACAATTATTCAAATATTG
CAATAAATAAGCATTTTAAAAATTTAGAAATAAGTGATATGGATAGAGGACTTGCAACAGAGTTAATTTA
TGGAGTAATAGAAAATAAATATTATTTAGATTATATAATCAATAAACTTTCAAAAATAAAGGTAAAAAAA
ATGTCAACTTATGTTAAAATCTTTTTAAGAATGGGAACATATCAGATTTTATTTTTAGATAGTATATCAG
ATTATGCAGCAGTTAATGAAACTGTAAAATTATCTAAGAAATATGATAAAAAATCTTCTGGTTTCATAAA
TGCTATTCTTAGAAATGAAATAAGAGCTAAAGAGACTATAATGGACATAACTGAGGAAGATAGTGTAAAA
TACTTATCTATAAAGTATTCCTATAACTCTTGGATTATAAAAAACTGGATAGATAAATTTGGACAAGAAT
TTGCTGAAGATTTGTTGGAAGCAAATAATGAAAAGCCTAGTATCTATATAAGAACGAATACACTTAAAAT
AAGTAGAGAAGAACTTATTGAAAAATTAAGTGAAATGGGTATTGTATGTTTAAAAGTTCCTATGGTAGAA
GAAGCTATTAAAGTCGAAAAAATGAAAAATATAGAAAAAAATGAATTATTTAAGGCTGGTTTATTTACAA
TTCAAGATATAAGTTCTATGATAGTAGGGAAAGTAATTAATCCAAAAGAAGGTTCATTTGTTTTGGATGT
ATGTAGTGCTCCTGGAGGGAAATCTACTCACTTAGCTACTTTAATGAACAATACGGGTCAAGTAGTAGCT
AGAGATATTTTTGAGCATAAACTAAAGCTTATAAACTCTACTGTAAATAGATTGGGGCTTAAAAATGTGT
TTGTAGAAAGATTTGATGCTTCTGAGATTGATGAAAATAGTATAAGTAAATTTGATTATGTTTTAGCAGA
TGTTCCTTGCTCTGGTTTTGGTATAATAAGACGTAAACCAGAAATTAAGTATAAGAAAGAAGAAGAGTTA
AAAGACATCACTTCTATACAAAAGAAAATTTTAGAAAATGCATCTAAATATGTCAAAGTTGGTGGAACTT
TAGTATATAGTACATGTACAATTCAAGATGTGGAGAATATAAATATAGTTACTTCTTTTGTTGAAGAAAA
TCACAACTTTGAATTTGTTCCAATTGATACAGTAAATGTAGACTTAGACAATCAAGATAAAGGATATTTA
AAGATATATCCTAATATTCATGGTATAGATGGTTTTTTCATAGCAAAATTAAAGAGAATAAGGTAG
>ref|NC_013316.1|:c2894429-2893728 putative membrane-associated neutral zinc metallopeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGTACCCTGTATATGGCGGTTTTTGGGGATTTGACCCAACAATGGTTGTATTAATTCCAGCTATATTAC
TTACTATATATGCACAATTTAAAGTGAGTTCAACAACAAATAAGTATTTAAGAGTAAATACACGTCGAGG
ATATACTGGAGAGCAAACAGCAAGAAGAGTACTTGATTCAAATGGTTTGTATGATGTAAAGATAGAAATG
GTTAGAGGGCATCTAAGTGACCATTATGACCCAAGAAGAAAGGCTGTAAGGTTGTCAGAAGATGTATATT
ATGGAACATCTATAACTTCTGTTGCAGTAGCTGCACATGAGTGTGGTCATGCCATACAACATGCTAAAGG
TTATGCGCCTCTTCAAATAAGAAGTAGTTTAGTACCAGTAGTGAATTTTGCTTCAAGTATATCTTGGTTT
TTAATATTTTTAGGATTTATTATGGCTGGTCCATTTTTAAAAATTGGTATACTATTGTTTTCGGCTTCAG
TGTTATTCCAAATAATAACATTGCCTGTAGAATTTAATGCTTCAAGTAGAGCAATCGTTCAACTTGGGAA
TTTAGGTATTATAGATGAAAGTGAGTCAAGACAAAGTAGAAGAGTACTTTCAGCAGCAGCTTTAACATAT
GTTGCAGCAGCATTGGTTTCAATACTTCAATTACTTAGATTGTTACTAATAGCTCAAAGAAGAAATGACT
AA
>ref|NC_013316.1|:c2895250-2894498 hypothetical protein CDR20291_2469 [Clostridium difficile R20291]
ATGACAGATATAAAGAAGTATTTAACAAGTGTTGGGATTTTGATTTTAATATTAGGAATTTTGATAGGAG
TTGTTAATTTTTTTATAATAAGTTTAACTCAAATATTCTCCTTGATGATAAATATTATAATAATATCACT
AATACTTATAATACTATGTTCAACAGCAGTTACTTATAGAGTAATTAAAGGAAAGTATGTTAACTCAAAT
ATAATGAAAATAAATTTTAATATTGTCAGTGGATTATTTCCTATTATATCTTTCATTGCATCATCATTTG
GTATGTCAAAAAGTGATATTAGAAGAATATATATAAAGTTAAATAATGAATATATATACAGTAATAAATA
TAATTTTAATCCAGAGGATATAATAATTTTAATACCTCATTGTATTCAAGAGAATAGTTGTAAATTAAAA
GTTACTAATGATATAGATAATTGTAAAGAATGTGGAAGATGCAACGTAGGAGAATTAATTAAGCTAAAGG
AAAAAACTAATGTAAAAATATTTGTAGCTACAGGAGGAACCCTAGCTAGAAAAATTATAATGGATAATAA
ACCTAAAGCTGTTGTAGCTGTTGCATGTGAAAGAGATTTGACATCTGGAATACAAGATATTAAGAAAATT
CCTGTTTTAGGTGTATTTAACAAAAGACCTAATGGACCTTGTGTAAATACTAATGTAGACATGATGGATA
TTGAAAAAGCTATAGACTTTTTAACAGGAAAAAATATATTAATTTGTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2896189-2895260 methionyl-tRNA formyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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ATGAAATATTGGGTGTTGTAACTCAACCAGATAAACCAAAAGGAAGAGGTAAAAAACTAGGTATGAGTCC
AGTAAAAGAACTGGCAATTGAAAATAATATACCTGTATATCAACCAGTAAAGGCTAGAGATAAAGAATTT
ATAGATAAAATTAAATCTTTAAATCCAGATGTAATAGTAGTTGTAGCTTTTGGACAGATACTTCCAAAAG
AAATATTAGAGATTCCTAAACTTGGATGTATAAATGTTCATGTTTCTTTACTTCCAAAATATAGAGGTGC
GGCACCTATAAATTGGGTAATAATAAATGGTGAAGAAAAGACTGGTGTTACAACTATGTATATGGATGAA
GGGTTAGATACTGGAGATATGATACTAAAGACAGAAGTAAATCTTGATGAAAATATAACAGCAGGAGAAC
TTCATGATAAAATGATGAATATAGGAGCAGAAACTTTAAAAGAAACATTAAGATTAATTGAAGAAGGAAA
TGCTCCAAGAGAAGTACAAAATCATGAAGAATTTTCCTATGCGCCAATAATGAATAAATCATTAGGTAAC
ATAGATTTTTCAAAAAGTGCCAGAGAAATACACAATTTAGTTAGAGGAGTAAATCCATGGCCAAGTGCTT
ATACTATCTATAATGATGTCATAATGAAAGTTTGGAAAACTAAAGTGTTAGATGAAAAAAGCACAAAAGA
TGTAGGTACAATAATTGATGTAAGCAAAGATGGGATAAAAGTAAGTACTATAGATAATGTACTTTTAATT
GAAGAAATTCAGATGCCGAATAAAAAGAGAATGTTGGTTGGTGAATATATAAAAGGGAATACTATAGAAA
CTGGTTTAGTATTGGGTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2896644-2896204 peptide deformylase 2 [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTTTAAGACAAATAGTTCAAATAGGAGAACCAGTATTAAGAAAAAAATCAAAAAAGGTTGAAAAAA
TTGATGAAAAGATAATACAATTATTAGATGATATGGCAGAAACTATGTATGATGCAGATGGTGTTGGACT
GGCTGCACCTCAAGTTGGAATATTAAAAAGAGTAGTAGTAATAGATATTGGAGAAGAGCTTATAGAACTT
ATAAATCCTGAAATAATAGAAACATCTGGGGAGCAAATAGATGAGGAAGGATGTTTAAGTGTTGTTGGAG
AAGCTGGAAATGTTAGAAGACCAAATTATGTAAAGGTCAGAGCTTTAAATAGAAATGGCGAAACAATAGA
GTTAGAGGGAGAAGAACTTTTAGCTAGAGCATTTTGTCATGAGATAGACCACTTAGATGGAATTTTATTT
GTTGACAAAATAGAAAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c2899187-2896662 putative primosomal protein N' [Clostridium difficile R20291]
ATGAACAATATATTAAATTTAAGTAGAGGTTTTATAATGAAAAAATATGCAAAGGTAATAGTTAGAAGTA
ATACTATATATACAGATAATTTATTTACATATCAAATTCCTGTATTTTTATCTGATGTAATAAAAATCGG
GCACAGAATATTAGTACCATTTGGAAAAGGTAATAAACCAACAGAAGCCTTTGTATTTCAATTTACAGAT
AGCTTAGATGAAAAAATAAAAATAAAAGAAATTATTGATATATTAGATGAAAATCCAATATTTAGAAAAG
AAGATTTAGAGTTGGTTTATTGGATGAAAAATAGATATTTGTGTACTTATATAGAATGTATAAATTTGAT
ATATCCAAAGGGATACAAATTAAATAATTATAAAGTAGTCCTATTAGGTGAAAGTTTAAGTGGATTAAAT
GAGATTGAATTGAAGGAAAAAATATCAACTTTAAGTGATAAAAATAGAGAAATAGTAGAGAAAGTGATTG
ATAGTAAAGGTAAAATTAAGGTTGATAAGTTAAAATATATACCAAACTTAAATAGTTCTTTGTACACAAT
GAATAAAAATGGAATTATAAAATTATGTTGGGAATATAAAAATCACAAAAATGAAAAGAAAGTATGTTAT
ATATCTTTGAGTTTAGAAAGTGATAAGATTGACGATTATATAGAGCAAAATAAAATAAATGTGGGAAGTA
AACAAAAAGAGATATTAAGTTTTCTTAAAAATAATGAAAATGTAGAGATAAATGATTTATTGGATTTATT
AAATGCTTCAAAACAAAGTATAAATTCTCTAAGTAAGAAAAAGCTAATAACCCTAGAATTTAAGGATTAT
TATAGAGAGCCAAAAAGTATTTACAAATCCGTACTAAAAAGTATAAAATTAAACAATGAACAACAAGAAG
CAGTTGATGAGATAAAGTCGAATATGTTTGTAGATGATAAAAAACCATACTTAATTCATGGAGTAACTGG
AAGTGGAAAAACTGAAGTTTACATGGAAATAATAGAATTTGCTCTAAATCAAGGCTTAGACAGTATATTC
TTAGTACCTGAGATAGCATTAACTCCTCAAACAATAGATAGGCTAAAGAGTAGGTTTGGAGATTTAGTTG
GAGTGTTCCACAGTAAACTATCTGAAGGAGAAAAACATGATGTTTACAAAGCTGTCAAAGCAGGTAAAGT
AAGAGTGTTAATTGGAGCTAGGTCAGCTTTATTTGCACCTTTTAATTCCTTAGGCTTAATAATAATTGAT
GAATGTCATGAGTCATCATATAAGTCTGAGAAGAATCCAAAATTTAATGCTATAGAAGTTGCTAGATTTA
TGGCATTAAAAAATAATATAACTCTTATTTTAGGTTCAGCAACGCCCTCAATTGAAGAGTATTATAGGGC
AAAATCTGGAGAATACAAACTTATAAATATAAAAAGTAGAGCAAATGATAAGCCTCTTCCAAACATTGAA
GTGGTAGACATGAAAGATGAATTAGATAAAGGAAATAGAAGTATATTTAGTTTGAAATTACAAAAAGAAA
TACGTTATGCGATTGAAGAAAATAATCAAGTGATACTATTTTTAAACAGAAGAGGTTATGCAAATTTTGT
ATCTTGTAGAAAGTGTGGATATGTGTTTCAATGTGAAAATTGTGATATATCTTTAACTTATCATAAGAAA
AGCAATACTGGAAGATGCCACTATTGTGGATATGAGAAAGAAATTCCAAAAGAGTGTCCTGAATGTAAAA
GTACTTATGTTAAGCCATTTGGAGTTGGAACTCAAAAAATTGAAGAGGAATTAAAATATATTTTTCCAGA
TATAAAAACTTTGAGAATGGATAAAGATACAACTTCAAAAAAAGGTGCTTTAGATGAGATACTAAATAAA
TTTAAAGATAAAGAAGCAGATGTACTTATTGGAACACAGATGTTAAGTAAAGGGCTGGATTTTGAGAATG
TAACTTTAGTAGGTATTTTGTCTGCAGACATGATATTAAATTTTCCAGACTTTAAAAGTTTTGAAACTAC
ATTTCAATTGATAACTCAAGTCTCTGGAAGAGCAGGGAGAGCTGATAAAGAGGGAAAAGTAGTACTTCAG
ACTTATGACACTGAACACTATGCTATTAAGCATGCTATTGAATATGATTATGAGGGTTTTTATGAAGATG
AGATAAAAATAAGAAAAGCATTTGGATATTCTCCTTTTAATAATATGTTAAGTGTAGTTGTTAGTGGTGA
AGATGAAAGATTAGTGATAAAAAATATAAAAAATATGCATGCATCATTGATTTATTTATTAGAAAAAAGG
GGTATAAATGATTTAGGATTTATATTAGGTCCAAATCCATGTTCAATATCAAAAATAAATCAAAATTATA
GATGGCAAATACTCTTTAAAGATGAAAATATTGAAATTAATCTCTTAAAGGGTATAATAAAATATATATG
TATAACAAAACGAGATTTGATATTTGATAAGAATATCAATGTATCTATAGATATTAATCCAAACAGTGTA
TTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2900667-2899426 coenzyme A biosynthesis bifunctional protein [Clostridium difficile R20291]
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GCATAAGTGGCGGTATAGCTGCATATAAGGCTTGTGATGTTGTAAGTAAGTTAAAAAAACTAAATGCAAA
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AATTATGTAGTAGAAGATATGTTTGAAGAACCAAAAACTTGGGAAGTTGAACATATATCATTAGCAAAAA
AAGCAGATTTATTCTTAATAGTTCCAGCAAGTGCAAATGTTATAGGCAAGATTGCAAATGGTATAGCTGA
CGATATGTTGACAACTACTGTTATGGCAACCAAAGCACAGGTTCTTATAGCACCAGCTATGAATACTAAT
ATGTATGAAAATCCAATTGTTCAAAAAAATATACAAACTTTAAAGAGCTTTGGATATAAATTTATTGAAC
CAGAAAGTGGGAGGCTTGCATGTGGAGATATTGGAACAGGCAAATTAGCTAATCCAGACATAATAGTAGA
GGAAGTTTTGACTAATCTTACTAAAGAGCAAGATTTAAAAGGTCAAAGTATGATAGTTACAGCTGGTCCA
ACTGTAGAGAGTATAGACCCAGTAAGATATTTAACTAATAGGTCTTCTGGTAAAATGGGATATTCTATAG
CAAGAGAAGCTATAGCTAGAGGTGCTGATGTAACATTAATATCAGGTCCTACAAATCTTTCTATTCCACA
AAATCTTAAAAAATTTGTTCAAATAGAGTCAGCACAAGATTTGTATGAAGCAGTAGTATCAAATTTAAGT
GAAAATAAAATAGTAATTCAAAGTGCAGCAGTTGCAGATTATAAACCAAAAACTTATTCTGACAAAAAAA
TTAAAAAGAAGAATGATGATTTATCAATAGAACTAAGTAGAAATTATGATATTGCTTATGAAATAGGAAA
AATAAAAGAAGATAAGATACTAATTGGATTTGCAGCTGAAACTAATGACCTTATAGAACATGCCAAAGGA
AAAATAAAAAAGAAAAATTTAGATTTTATTGTGGCAAATGATTTAACTAAAGAAGGTGCTGGTTTTAGAG
CTGATACTAATATTGTAAAAATAATAGATGTAGAGGGAAATATTACTGAGTATCCTAAGATGAAAAAAGA
AGAAGTAGCCAATGTTATTTTAGATAAAGTTAAAGCGTTGCTTGAGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2900896-2900630 DNA-directed RNA polymerase omega chain [Clostridium difficile R20291]
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CAAAGAGAGCAAGAAAATTAATTGATGGAGAAGAACCATATGTTTCAAATAAAACTAAGGAAAAGCCTGT
ATGTGTAGCAACTAAAGAAGTTGCAAGTGGAAAAATAACATATAGATTATTGACAGAAGAGGAAATAGAG
ATAGAAGAAGCTAGACATCATGCTGAGCAACACCAACAAATTTCAGAAGAGGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2901516-2900899 guanylate kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTGTGAAAAAAGGATTATTGCTAGTTGTATCAGGACCATCAGGTGCAGGAAAAGGTACTATTTGCA
AAGAACTACTTAAAGAAAATGATACAATAAAACTTTCTGTATCAGCTACTACAAGAAAACCCAGAACTGG
AGAAGTTGATGGAGTAAATTATTTCTTCATAAGTAAGGAAAAGTTTGAAGAGATGATAGAAAAAGGTGAG
TTTTTGGAGTATGCTCAAATTTATGATAATTTTTATGGAACTCCAAAAGCGGCAATAATGGAATGTTTAG
AAAAAGGACAAGATGTATTACTGGAGATTGAAATGCAAGGAGCAAAACAAATAAAAGAAGTTTGCCCAGA
GGGAGTATTTATATTTGTACTACCACCATCACTTGAAGAATTAAAAAATAGAATTGTTGGAAGAGGTACA
GAAACAGAAGCTGAAATAGAGAAGAGATTTAGCTGTGCATATGAAGAAATTAAAATGATTAAGGATTATG
ATTATTTTATATTTAATGAAGATGTAAAAACATCTGCTAAAGAAATAGAAGGTATAATATCATCTGAAAA
GAATAAAGTTAGCAGATATAAAAATATTATAATAGAGAAATTTAAGGAGGAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2902427-2901546 hypothetical protein CDR20291_2476 [Clostridium difficile R20291]
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GTAAAACGATAAATCATAAGTATTCAGATATAAACATACGTCTTCCAAGAAAAATTTCATTTTTAGAGGA
TAAAGTTAGAAATTTAGTAAAAAATTATGTAAAAAGAGGAAGAGTAGATTTATACATAAAGTTTGACTTA
TTAGGCAAAGAAGATGTAAACTTAAATTTTGATGAGGGATTAGCATCTCAGTATATAGACATACTAAAAG
AAATAAAAAATAAATTTGATATTATAGATGATATTAGCGTTATGAATGTTGCAAAGTTTCCTGATATTGT
GAAAATAGAAGAAAAGGAAGAAGATGAAGATTTATTGTGGTCAATGTTGAATCAAGCAGTTGAAGATGCA
TTAATCAAATTAAGAGAAATGAGAAGTGAAGAAGGTAAAAAATTAGCTGAAGATATTGCCATGAGATGTG
ATTTATTAAAAAATCATATAGAAGAGATTGAAAAATATTCAAGTAGTGTTGTAGAAGATTATAGAGAAAA
ATTGAATTTGAGAATAAGTGAATTACTGGATGACCCAAGTATAATAGATGAGAATAGATTAGCACAAGAA
GTTGCAATATATGCAGATAAAAGCAGTATAACAGAAGAAATAGTTAGATTTAAAAGTCATATAGGGCAAC
TTAAAAATACTATATTTAAAGACGACTCTATAGGTAGAAAAATAGATTTCTTAATACAAGAGATGAATAG
AGAAACTAACACTATAGGTTCGAAGTCATCTGATATAAATATAACTAATTTAGTAGTAGAAGTAAAAAGC
GAATTGGAAAAAATAAGAGAACAAATACAAAATATAGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2903261-2902431 diaminopimelate epimerase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTTTGGAAACTACATGGAATAGGAAATGATTTTATAGCAATAGATGGAAGATTCGACCAGATAA
ATCCATCTGATTATACTGCTTTAGCAAAAAAAGTATGCCATAGAAGATTTTCTGTAGGAGCGGATGGATT
GTTAGTTGTGAAAGATTCAAAAGTTGCAGATGTAGAAATGGTATATTATAATTCTGATGGTTCAAGAGCA
GCTATGTGTGGAAATGGCCTTAGATGTTTTTGTAAATTTGTTTATGATAATTGTATAGTTAAAAAAGAAA
GTTTTACAGTAGATACATTAGATGGTATAAAAGATATAAAAATAAATCTTACCAATAGAGAAATAAACTC
TATAAGAGTCAATATGGGAAAAGGAAGTTTTATAGCTAAGGATGTTCCTGTACTTACAAATAAAGAACGT
TTTGTGCAAGAAAGTATAAAGGTTTTAGATAGGGAGCTTAAAGTTACTTCTATGTTGATGGGGGTTCCTC
ATACAGTAGTTATAGTAGATGAATTAGATGTAGATGATGTTTGTAAATATGGAAAAGAGATTGAAAATAA
TAAAATATTTCCTGAAAAAACGAATGTAAATTTTGTAAAGGTAGAAGATAAGTATAATATACATGTTTAT
ACTTGGGAAAGAGGTTGTGGATATACTTTAGGTTGTGGTACTGGTATGACTGCATCAGCAATAGTGTGCA
ATTTACTTAATATGGTAGAAAGTAGTGTAAATGTAACGTCTCAAGGTGGAACAGTTAAAATAGATGTAGG
AGATTTCTCTTATATGACAGGTCCAGCAGTAAAAATATGTGAAGGTGTTTTGGAGGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2904582-2903548 low-specificity L-threonine aldolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGATTTATCGATTTAAGAAGTGATACTGTTACTATGCCTACTGACGAAATGAGAGAAGCTATGGCAA
AGGCTCCTGTTGGAGATTCAATCTTTAGAGATGACCCTACTGTAAATAAACTTGAAGAATTAGCAGCAGC
TAAAGTTGGAAAAGAAGATGCTATTTTCCTTCCAAGTGGAACTTTTGGGAATCAATTAGCTCTATTTACT
CATTGCCTAAGAGGGCAAGAAATAATTATTGGTAAAGGTTATCACATTGTAACTCATGAGGTTGGGGCAC
CTGCTGTAATAGCTGGAGTTCAGCTTAGAACTATAGATGAAGACGAAAGTGGAGCTCTAAATCCTGAACT
TGTTGAAAAGGCAATTAGAAGAGATGACATACATGAACCACAGACAGGGCTTATATGTGTAGAAAATGCA
TATTCAGGTGGAACTGTTGTGAGTCTTGATAATTTAAGAGAAATTAAAAAAATAGCTGAGAAACACAACT
TACCAGTACATTTAGATGGAGCAAGATTATTTAACGCAGCATTAACTTTGGGTGTAGAAGCTAAAGAAAT
AGCAAAGTGTTGTGATAGTGTTATGTTCTGTGTGTCAAAAGGTTTAGCTGCACCAATGGGTTCTATACTT
GCTGGAAGTAAAGAATTTATAGCAAAAGCTAGAAGAAAGCAAAAAGTTATGGGTGGGGGAATGAGACAAG
TAGGTATAGTTGCAGCAGCTGGTATAATTGCCATTGAAAAAATGACTTTAAGATTGAATGAAGACCATGA
AAATGCAAAATATTTAGCTTGTGAATTAAATAAAATTGATGGCATTGAAGTAAACAATGTTAATCCAGAT
ATAAGTATGGTATTTTTTAAGATGAGTGAAGATATTATAAAAGAGGATGTTTTAATAAAAGAATTTTTTG
AAAGAAATATAAAAATTAATAAAATGGAAAATGGTGAATATAGATTTGTAACTCATGTAGATATTACTAA
GGAAGATTTAGACTATGTTTTAAAAACACTTAAAGAATTAATAGGTGTATGTTAA
>ref|NC_013316.1|:2904878-2906653 fibronectin-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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TAGATAAGATACATCAACCTGAAGATGATGAGGTAATTTTTAATATAAGAAATAATAAAGAAAATTTTAG
ATTGGTTTTAAGTGCAAGTGCCTCAAATCCTAGAGTTTATCTTACAAGTAATTATCAAAAAGAAAACCCT
CTAAAAGCGCCTATGTTTTGTATGTTACTTAGAAAATACATACAAGGTGGAAATATAGTAGAAATTTCTC
AAATAGGTTTTGAAAGAATAATAAAAATAAGTGTTGAATCTTTAGATGAATTAAAAGAAAAGACAGTTAA
AAATATTATGATTGAAATTATGGGAAGACATAGCAACATAATAATAACTCATGGTGAAGAAAATAAAATT
ATAGATTCTATAAAAAGAGTCCCTTTTAGCATAAGTAGAGTTCGTCAAGTTTTACCTGGTCATGATTATT
CATTACCACCAGAACAAAACAAACTCAACCCTCTTGATGATATATCTAAGGATTTGTTTATTAAAAACCT
AGAAGAATTGGAAGGACCTATCTTTAAGTCTATATATTCTAAATTTCTAGGTATAAGCCCTATTATAGCT
AAAGAAATTTGCTACAGAGCAGGTGTAAATCAAAATGCTATCATAAAGGATATATCTGATGAACAATTTG
ATTCTTTACACAAAGTATTTTGTAATTTATTCAATGATATAAATTCTAACAAATACTCCCCTTGCATTAT
TATAGATAAAAAGGTGGATAAGGTAGTTGATTTCAGTTGTATAAACCTTACATTATTTAGCGATTTATCA
TATATAAATAAGGATAGTATGTCTCGTATTCTAGAAGATTTCTATAGAACTAAAGATATTAAAGACAGAA
TTAATCAACGTTCATCTGATTTAAAGAAGAGTATATCTGTTAAGCTTGATAGACTTTATAATAAACTTAA
AAAACAAGAAGAAGAATTATCAGAATCCGAAAATGCAGACATTTATAAGATAAAAGGAGAATTGATTACT
TCATATATTTATATGGTAGAAAAAGGTATGGAAAGTATTGAAATTGCTAACTTCTATGATGAAAATTGTA
ATGATGTAACAATAGAATTAAATAAAAACTTGACACCATCTGAAAATGCTCAAAAATACTTTAAAAAGTA
TAACAAAATGAAACATGCTAAAGTCGAGATATCTCATCAAATTTCCTTAAATAAGGAAGAAATAGATTAC
TTAGAAAACATAGTTTTAAGTATTGAAAACTGCGAAAATTTAGCTGAATTACAAGATATAAAAGAAGAAC
TTGCTAAGGTTGGATATATCAAGACTCAAAAGAAAAACAGTAAAAAGGATACTATCCCATCTACAAAACC
TCATGAATTTGTGTCTTCTGATGGATTTAAAATATTGGTTGGTAAAAACAATAAGCAAAATGACTATCTT
ACACTAAGACTTGCTGATAATGATGACTTATGGATGCATACAAAGAATATTCCTGGTTCTCATGTAATAA
TAAAGTGTGCTGGTAAGGAAGTCCCTGATAATACTGTATTTGAAGGAGCTATGCTAGCAGCATTCTTTAG
TAAGTCAAAACTTTCTTCTCAGGTGCCTGTAGACTATACTAAGAGAAAAAATGTGAAAAAACCTAGTGGT
TCTAAACCAGGTATGGTTATTTATGAAACTAACAGTACTATTTATGTTACTCCTGAAGAAGAAACAGTAG
CCAAGCTTAAGGTTAAATCTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2908637-2906868 putative antibiotic resistance ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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TTATAGAATCTCTCCTTATATTTAAGTGTGTTAAGGAGGGATTTTTTATGTTGTTAGTAAAAGTAGAGAA
TTTAAAGAAATATTATGCAGATAAATTAATTTTGGATATAGATAAACTTGAAATATTAGAAAATGACAAA
ATAGGTCTAGTTGGTTCAAATGGTCAAGGAAAAACAACATTATTAAAAGCAATATTGGGTGAAATAGAAA
TTGATGAAGGATATACTTACCTTACAGAAAGCTATTCTTATATAAGTCAGAGTGAAAATAATATTGAAAC
ATGTAGTCATAGTAAGGAGAAGAGTCTTTTAAATGCTCCAGATAAATTTGAAGAATACTTATCAGGAGGG
GAAAAGGTTAAGTTAAAAATAGCAGATGCGCTGAGTAATAAGAAAAATATCATAATAGCTGATGAGCCAA
CTTCAAACTTAGATAAAAAAAGCATTGGGCTTTTGGAAGATATGTTTAAAAGGCATGAGGGAGCATTATT
ATTAATATCTCATGATAGACGTTTTCTGGATGAGTTATGTACAACTATATTAGAACTAGAAGATGGAAAA
CTAAAAGCTTACAAAGGCAATTACACTGATTATTTAATGCAAAAAGATGAAGAAGTAAAAAGAGCTGATT
TTGAGTATCAAGAATATGTTAAAGAGAAAAAAAGGCTTGAAAAAGCTCTTTTATATAAAAAAGCTTTAAG
TGATGGCATAAGAAAGACACCAAAAAGAATGGGTAATTCAGAAGCTAGGTTGCACAAAATGGGTGGTCAG
ACTAATAAGAAAAAGTTGGACTCAAATGTGAAGGCTATAAAAAGCAGAATTGATAAACTTGAGGTAAAGA
ATAAACCTAAAGTTTCTAAAGAAATGAACATTAAGATTCAAGATGGTATGGAGATAATTAGCAAAAATCT
ATTAGAGGTAAAAGATATGACTCTAAAGTTAGAAAATAAGCTCTTGTTAGATAATGTTTCCTTTAAGATA
AAAAGAGGTAAAAAGATAGCATTATTAGGTGATAATGGGTGTGGAAAAAGTACTCTGATAAAAGAAATAT
TGGCTGATAAAAATGACAATATAAAAATAAATAACAAGGTAAAAGTAGGTTGTTTTGACCAAAATCAAAG
TTTATTAGATGAGGAAAAGAGTGTTCTATACAATACTAAAGTTAATAGTTCATTTGATGAATCTTTTATA
AGGATAAACTTAAGCCTATTTGGGTTTAAAGGTGATGATGTCTACAAAAAAGTAAAAGTACTTAGTGGTG
GAGAAAAGGTAAAAATAGCACTATGTAAAATAATATTGGAAGATAATAATTTTTTAGTATTTGATGAACC
AACAAATTACTTAGATATAAAATCTATGGAAGCACTGGAAAAGGCACTGATAAATACTGATAAAACTATG
CTTATAGTGTCTCATGATAGAGTATTTGTATCACATATTTGTAACTATATTATAGAGATAAAAGATGCTA
AAATAAGGGAGTTTGATTGTAATTATGACGAATATATAATTAGCAGAAATAAAAAAACTCCTAGTAGAGA
CAAGCAAATCAAAAAAGAGAATCTTCTAGTATTAGAAAATAGACTTACAACTGTTATATCTATGTTATCT
ATAGAAAAAGATAATCTAAAAAAAGAATTGTATGAATCAGAATATAATGAATTACTAAAACAAATCACTA
AATTAAAAAATAGCTTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2910030-2908819 uracil permease [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAACAATAATGTCTTTACAACATCTATTAGCCATGTTTGGAGCGACAGTATTAGTTCCCATTT
TGACAGGTTTTAATCCGTCAGTTGCAATTTTCTGTGCTGGTGTTGGTACATTGATATTTCATTTTTGTAC
GGAAGGAAAAGTACCTGCCTTTTTAGGTTCAAGTTTTGCGTTTATACCAGTTATACTAGCAGCTAAAGAG
GCGTATGGTGGAGATTTAGCATATGCTCAAGGTGGTATAATAGTAGCAGGATTAATTTATATTATAATGT
CGATTATAGTAAAAATAGTTGGTGTAAATAAAATTAAATTATATTTTCCTGCACAAGTTACAGGAGCTAT
GATAGTAGTTATAGGATTAAATTTATTGCCAACAGCTTTTAGTATGGCTTCAGCTAATTTTGTAATAGCA
TTTATAACTTTAGCAATAGCAATTTTAACCAATAAGTTTGGTAGAGGATTTATAAAACAATTAGGAATAT
TAATAGCCGTTTTTTCTGGGTATATAATCTGTTTACTGTTAAGGTTAGTAGATATAACTACTATTACAGA
AGCAAGTTTATTTGCAATACCGAACTTTACAGTTCCTAAGTTCAGTTTAGGAGCAATTGTGATTATATCT
CCAGTTGTATTAGCTGTATTTATGGAACATATAGGAGATATGACTACTAATGGTGCTGTAGTAGGTAAAA
ACTTTATAGAAAATCCAGGATTAAATAGAACATTACTTGGGGATGGATTTGCGACTATAGTTGCAGGGTG
TTTAGGAGGACCAGCCAATACAACTTATGGAGAAAATACAGCAGTACTTGCTATAACTAAAAACTATGAC
CCTTCAATACTTAGACGTACAGCAATATTTGCTATATTGCTTGCATGTGTAGGAAAGTTTGGTGGATTTC
TTCAAAGTATACCAGGTTCAGTTATGGGTGGAATTAGTATAATGCTATTTTCAATGATAACTTATGTAGG
ATTAAAAACTATAAGGGACAGTTCTTGTGTAGAAAGTAAGATAAATATATTAATAATAGCAGTTATATTA
TTAATAGGTCTTGGAACAACATATTTATCTAATAAAGGCATTTCTATTGGAATCCCTATAACAAGTACAG
TAAAGATAACTGGTCTTAGTTTAGCTGCAATTGTTGGAATTGTATTAAACAGAATTTTAAATAATCAGGA
TTTTAAAGTTGAAGAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2910847-2910314 PyrR bifunctional protein [includes: pyrimidine operon regulatory protein; uracil phosphoribosyltransferase] [Clostridium difficile R20291]
ATGGTAGAAAAAGCTCAATTAATGGATGAAAAGGCAATAGCAAGAGCAATTACTAGAATAAGTCATGAAA
TAATTGAAAGAAATAAAGGTGTAGAAAATCTAGTTTTAGTTGGAATAAAAACTAGAGGTGTGCCAATTGC
AAATAGAATTTCTAAGAAAATAGAACAAATAGAAGGAACAAAAGTAGATACAGGAGATATTGATATAACT
TTATATAGAGATGATTTGGAAAAAATTCATGTTGAACCTGTAGTTAAAGGAACTTATTTAGATTTTAATG
TAAATGATAAGACAGTAGTTTTGGTTGATGATGTTTTATACACTGGAAGAACTGTGAGAGCTTCACTAGA
TGCGATTATAGATATAGGAAGACCTAAATCAATACAATTAGCAGTTCTAGTGGACAGAGGGCATAGAGAG
TTGCCTATAAGAGCAGATTATGTAGGAAAAAATGTACCTACTTCTAGACATGAAATTATATCTGTCAGTT
TATTAGAAATTGATGGAGAAGATTCAGTTACAATCAAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2912117-2911206 putative pseudouridylate synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATGAAGTAAAAGAGTTTTTAGTACTTGAAGAGGAAGAAGAAGTTAGACTTGATATTTATCTAGCAG
AACAATTAGGTGATATGTCAAGAAGTTATATACAAAAAATTATAAAAGATGGAAAAGTAAAGGTCAATAA
TAAAGTAGAAAAAGCTAAATATCTAGTTAAAGAGGAAGATAATATTGTTATAGAGATACCAGAACCTAAA
GTATTAGAGGTTTTACCTCAAGATATTCCAATAGATATTGTATATGAAGATGATGATGTCTTAATAATAA
ATAAACCCCAGGATATGGTTGTTCATCCCGCTCCTGGAAACTATGAAAATACACTAGTAAATGGGATTTT
ATATCATTGTAAAGATAAGTTGTCGTCAATAAATGGAGTTATTAGACCTGGTATAGTTCATAGAATAGAC
AAAGATACTTCTGGTCTTCTTATGATAGCTAAGAACAATTATGCACATAATTTTCTAGCAGAACAGTTAA
AGGAACATACTATAACTAGAGAGTATGAATTTATATGCTATGGTGTGGTTAAAGAAGATAAAATAACTGT
TGATAAACCTATAGGGAGAAATCCTAAGGATAGATTAAAAATGGCTGTAGTAAAGGATGGAAAAAATGCA
ATTACTCATTTTGAAGTTGTAGAAAGATTTGATAAGTTTACACATATGAGAGCTAGGCTTGAAACTGGTA
GAACTCATCAAATAAGAGTTCATGCTTTGTCTATAAATCACCCACTTTTAGGTGATTTTGTATATGGTCC
AAAAGAAACTAAATTTAAATTAAAAGGACAAACTTTGCACGCTAAGAAGTTGGGATTTATACATCCTACC
ACTAAGGAATATATCGAATTTAATTCAGAATTACCTGAGTATTTTAAGGAAGCTATTAAGAAGATAAAAT
AA
>ref|NC_013316.1|:c2912568-2912122 lipoprotein signal peptidase [Clostridium difficile R20291]
TTGCTATATATATTAATAATAATTCTACTCATAGGCTTAGACCAACTGTCTAAAATATGGGTATTGAATA
ATTTGGTAGATGTTTCAACAATACCAATAATAAATAATGTATTTCATTTAACTTATGTCGAAAATAGAGG
TGCAGCATTTGGATTATTACAAAATAATCAGTGGATATTTATAATTGTTGCATTACTTGCAACAGTATTT
GGATTATACTATCTTAATACAAGGAAAGTACATATATTTGGAAGGTTGGGAATTATATTAATTATATCTG
GTGCATTAGGAAATCTAATTGATAGAGTACGATTAGGTTTTGTGGTAGATTACTTCGACTTTAGAGTTAT
ATGGGAATATGTATTCAATGTAGCTGATGTATTTGTAGTTGTAGGAACTGTGTTTTTATGTATATATGTT
TTATTTTTTGAAAGTAAAAGTAGGTGA
>ref|NC_013316.1|:c2913657-2912878 putative oligosaccharide deacetylase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAAAGCAATATGGGGTATATGTATATGTTTATTATCCATAGTAGGTGTATATACATATAACCATA
ATACACATAATCAAAATAGTTCAAAAGAAACCTATACTTTAAATGACAATATAAAAGACGATTATGAAGA
TGTAATAATAAAAAAAGGAAATGAGGATGAAAAGATTCTAGCATTGACTTTTGATGATGGTCCAGATGAG
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AAAAAGTAGAATATAACAAAGAATTATTAAAAAGGCAATATGATGAGGGGCATGAAATAGGGAATCATAC
ATTTACACATATAAATGTTGCAAAAAATAGTTATGGTAGTGTTGAAAAAGAAATAACAGATACACAAAAT
ATTATAAAAAGTGTAATAGGAGTAGAACCAAAGATATTTAGACCTCCATATAGAGCCATGAGTAAAAGTG
TCTGTGATATTATAGTTTCTAAAGGCATGAATATAATTCTTTGGTCAAACTTAGACCCTAGAGATTGGTC
TAACCCTGGTGTAGATACAATTATAAATACTATTCTTACAAAGGTCCAAAATGGTAATATAATACTTTTA
CATGATTATAACACTAAAAGAAATGATAAATCACAAACTATACAAGCTTTAGAAGTAGTAATTCCTAAAT
TAAAAGAGAGAGGATATAAATTCGTAACAGTATCTGAACTTATACAACATTTAGATAAAAATAAGCAAGT
GCAAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c2914189-2913707 putative general stress protein [Clostridium difficile R20291]
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TGAAAGATAATACCTTGTTTGGAGACACTACTAAACATACTAGTGAAAAATATTCATCAGGAGAATTATC
TAGTTATGACAATCATATTGGAGATATGGGAACGGATTTATATATGCAAAATATGCAAAATAGTTTAATA
AATCATGAAGAAGGAAGACTGTATCAAATAGATTCAGCATTATCTAAAATAGAAAATGGAACATATGGGT
TTTGTGATTTATGTCACAATCAAATAGATTTAGAAAGATTAGATATATTACCTGATACAAATTTATGTAA
CAATTGTGCAAAAAAAGAAAATGCTTTATTAGGTGATGCAATGCAAAATCCTGATGTAGAAGATTCTAAC
TTTTATTCAGAAGACCTAACAAATTTAACTGATTTAAATAAAAATGGAACATTGAGAGATTAG
>ref|NC_013316.1|:c2915794-2914373 putative carbon starvation [Clostridium difficile R20291]
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AGGTTTTTGGAATCAATGACAAAAACCAAACTCCAGCTATAGCTTGTAGGGATGGAGTAGATTATGTGCC
AATGAAATGGAAGAGAATCTTTTTAATTCAGTTTCTAAATATAGCAGGGTTAGGTCCGATATTTGGAGCT
ATACAAGGGGCGTTATTTGGACCATCAGCATTTTTGTGGATTGTGTTTGGAACAATCTTTGCAGGTGGAG
TACACGATTTTGCTTCAGGATATTTATCAATGAAGAACAAAGGTACATCTGCATCAGAGTTGGTAGGTCT
TTATCTAGGAAATGGTGCAAAAATAGCAATGAGAATATTTAGTGTTATTCTTTTAGTATTGGTTGGAGTT
GTATTTGTAACAGGTCCAGCAGGATTATTAAAGACATTGACAGGTGTAAACGCACAAATATGGGTTGGAG
TGATAATACTTTATTATATTATGGCTACTGTTTTACCAATAGATAAATTGATTGGTAAAATATATCCTTT
ATTTGGAGCAGCATTATTAATTATGGCAGTAGGTGTAGCTGGAGGATTAATAATAAAGGGGTATAACATA
CCAAATATAAATTTACAAAATATGAATCCAAATGGAACACCTTTATTCCCATACTTATTTATAACAATAG
CATGTGGAGCAATATCAGGTTTCCATGCAACTCAATCACCACTTATGGCGAGATGTGTTGAGAAAGAGAG
TGAGGCAAGACCAGTATTTTATGGGTCAATGGTTGCAGAAGGTATAATAGCTTTAGTTTGGGCAGCAGCA
GCTATGTCATATTTCCATGGTATACCTCAGCTTAATGTAATATTTAATGATGGTGGAGCAGCAACTGTTG
TAAATACAGTATCTGTTGGATTAATGGGACCTATTGGAGGCGCTTTGGCCATACTTGGTGTTGTAGCATG
TCCTATAACTTCAGGGGATACAGCATTTAGAAGTGCTAGATTAACAATAGCTGATGCAATGAATTATAAT
CAAGATGCAGTTAAAAATAGATTTTTAATAGCTTTGCCATTATTTGCTGTAGGGGTTGCCCTTACATTTA
TAGATTTTAATATAATTTGGAGATATTTCTCTTGGGCAAATCAAACACTTGCTATGATAATGTTGTGGAC
TGGTTCTGCATATTTAGTCAAAGCAAATAAAAATCATTACATAACTACATTGCCAGCACTTTTTATGACT
GTAGTAACATTTAGTTATATAATGCAGGCAAAAGAAGGATTTAGACTTCCAGTTAATATATCTAATGGAA
TAGGTATTGTAGTTGCAATAATCCTTGGACTTTTATTTTTTAAAAAAGCTAAGGATATAAAAGAGCAAAA
TGCTCATAAATTAGCAAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2916710-2915940 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAGCTATAATAGTGGAAGATGAATTTCCGGCAAGAAAGGAATTAAGATATTTTATTGAGAATAAAA
GTAGCATAGAGGTAGTAAATGAATTTACTAATGGTATAGAAGTGTTAGACTTTATTCAGGAAAATAAAAT
AGATGTAATTTTTTTGGATATAAATATACCTCATCTCGATGGAATGCTTCTTGCAAAAACATTAAATCAG
TTTAAATCAAGGCCTAAAATTGTTTTTATAACAGCGTATGAAAATTATGCAGTAGATGCTTTTTCTTTAG
ATGTATTTGATTATGTACTGAAGCCATATTCTGAAGAGAGAATTATTTCTATGTTGAATAAATTAGAAAA
AAGTGAGATGAGTGATATTGAACTGTCTAATAGCAATAGTAATTTATATAAATATAAAAAAGAGACAGTA
AATCAGGAGATAGAAGAAATAACACATAAAATTAGCCTTTGGAAAGGTGATAAATTGGTTGTAATAGATA
TTGATGATATATATTATTGTGAAGCTAATGAAAGGCAGACATTTATATATACTGAGAAAGAAAAGTTTAT
ATTAAAAGAAGGCATATCAGAAGTAGAGAATCTTATAAATGATAAAACATTTTTTAGAACACATAGGTCT
TATATCGTAAATTTAACCAAAGTAAAAGAAATTATACCATGGTTTAACAATACATACATATTGAAATTAA
AAAATAGTGACTATGAAGTAACTGTAAGCAGAAGCAAAGTAAAAGAATTTAGGCTGTTAATGCATATATA
A
>ref|NC_013316.1|:c2917917-2916715 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAACATCAATTTTAATCGCATTAATAGAAAAGACAAGCCTCATTGTAGTACTGTTTCTTCTAATAA
CAAAGTTAAAAATATTTAAGCAGATATTTCAAAAGGAAGAATATAGTTTTAATGACTTGGTCTGTATAGC
ATTAGTTTTTACTTTTTTAGCCATATTTGGAACTTATAGTGGTATAAATTATATGGGGTCAATAGTAAAC
ACTAGAATAATATCTATAGTATCAGGTGGCATTTTATTTGGTCCAATGGTAGGTATTACAGCAGGAGTTT
TTTCAGGGATTCATAGATATTTTATGGATATTGGGGGGATAACATCTGTTCCATGTCTTTTATCAAGTAT
ACTAGCAGGTGTATTATCAGGATTTCTATATAAGAGGATACCAAAGCAACATAGAGTAATGTATGGTATA
TTGGTAGGTATGATTTCTGAAAGTTTTACTATACTACTTATATACTTAATATCATATCCACATTCTTTAG
CAATTCAAATAATTGTTGGGATATATTTACCTTTAATTGTTGGACAGATTGGAATAGGATTTGTTATATC
TATAGTAGAGGGGATTGAGAAAGATAAAAAAGATATAGAAGCGAGAAATAAAGCAGAAATAAAAGCACTT
CAAAGACAAATTAATCCGCATTTTTTGTTTAATTCCCTAAACACAATAGCTTCATTTATAAGATTTAGTC
CAGATAAGGCTAGAGAGTTAATAATAAATTTATCAACTTATCTAAGATATAATCTTGAATATAGTGATAA
CTTAATTGATATAAATAAAGAGATTGAACAAGTTAAATCTTTTGTAGAGATAGAAAAAGCTAGGTTTGGA
GAATTACTAACTGTATCTTATGATATAGAAGATGTAAATATAAAGATTCCAAGTTTGATTATACAACCAT
TAGTGGAAAATGCGATAATACATGGTATTTTAGAAAGTGGTAGAGCTGGTGTAGTGAAAATATCCATAAA
AAAGTTACCTTATTCATTAGAAAATACTGTGAGAATATCAATAGAGGATAATGGTATAGGTATAAGTGAG
GAAATTATAAATAATGTATATCAAGATAATATGCCAGAAAATAAGATTGGACTTTATAATGTACATTTAA
GGCTTAAACTGATGTATGGAAGAGGGCTTAATATAAGAAGAACAGACAATGGGACTTTGATAGTATTTTA
TGTAAAGGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:2918789-2919535 putative response regulator [Clostridium difficile R20291]
GTGGATATATTAATTTTTGATAATGATGTTTGTTTTGGAATAAAACTAAAAGAAAAAATAAATAATATTT
TAATAAAAGAAGGTTTTGATAACGATGTTATAAGATTATATTATAATGCAAATTTGTTATTAAAAGAACT
TACTGAAAAAAATAAAGTAAAAATATATTTTATAGTTGTAGATGCAAAATACAAGATAAGTAATGAATTA
TGTGATGGATTATGGATAGCACAAAAAATTAGAGAATCAGATTATATTAGTCCAATCATATTTCTTACAA
ATCATATAGAAATGATTTTAGGGATCTTCGATTATAGGTTAGAAGTTATGGACTTTATATTAAAACATGA
TATGGAAATTGCTGAAAGTAAAATAAAAGCTTGTATTAAAATTGCTCATAAAAGATACGTTAAAGAAAAA
AATTATCGCTCTAATTTTTTTACTATCTACTCAGATTCCTCACTATGGAAAATTTCATTTGATGAAGTTA
TATATTTTGAAACAAGCGCTATTCCACATAAAATAAAATTAGTGACTACTTCAAGAATATTTGAATTCTA
TAAAAGTTTAAGGTCTTTATCAGATTTAGATGCATGCTTTATTCGTGTACATAAATCTTTTGTAGTTAAT
AAATATCATATTGTTTCTCTCGACCTAAAGAAAAATAATATTAAAATGAGTAATGGCCATATATGTCGTA
TATCTAATACATATAGAAATATTTTAAAGAACATTATTAAAACATAA
>ref|NC_013316.1|:2919925-2921316 cdta (adp-ribosyltransferase enzymatic component); cdta (adp-ribosyltransferase enzymatic component) [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAATTTAGGAAACATAAAAGGATTAGTAATTGTATATCTATATTGTTGATATTATATCTAACTT
TAGGTGGTTTGTTACCTAATAACATTTATGCACAAGACTTACAAAGCTATAGTGAAAAAGTTTGCAATAC
TACTTACAAGGCTCCTATAGAAAGACCAGAAGATTTTCTTAAAGATAAAGAAAAGGCTAAAGAATGGGAA
AGAAAAGAAGCAGAAAGAATAGAGCAAAAACTTGAAAGATCTGAAAAAGAAGCATTAGAATCATATAAAA
AAGATTCTGTAGAAATAAGTAAATATTCTCAGACAAGAAATTATTTTTATGATTATCAAATAGAAGCAAA
TTCTCGAGAAAAAGAATATAAAGAACTTCGAAATGCTATATCAAAAAATAAAATAGATAAACCTATGTAT
GTCTATTATTTTGAATCTCCAGAAAAATTTGCATTTAATAAAGTAATAAGAACAGAAAATCAAAACGAAA
TTTCATTAGAAAAATTTAATGAGTTTAAAGAAACTATACAAAACAAATTATTTAAGCAAGATGGATTTAA
AGATATTTCTTTATATGAACCTGGAAAAGGTGATGAAAAACCTACACCATTACTTATGCACTTAAAATTA
CCTAGAAATACTGGTATGTTACCATATACAAATACTAACAATGTAAGTACATTAATAGAGCAAGGATATA
GTATAAAAATAGATAAAATTGTTCGTATAGTTATAGATGGGAAGCACTATATTAAAGCAGAAGCATCTGT
TGTAAGTAGTCTTGATTTTAAAGATGATGTAAGTAAGGGGGATTCTTGGGGTAAAGCAAATTATAATGAT
TGGAGTAATAAATTAACACCTAATGAACTTGCTGATGTAAATGATTATATGCGTGGAGGATATACTGCAA
TTAATAATTATTTAATATCAAATGGTCCAGTAAATAATCCTAACCCAGAATTAGATTCTAAAATCACAAA
CATTGAAAATGCATTAAAACGTGAACCTATTCCAACTAATTTAACTGTATATAGAAGATCTGGTCCTCAA
GAATTTGGTTTAACTCTTACTTCCCCTGAATATGATTTTAACAAACTAGAAAATATAGATGCTTTTAAAT
CAAAATGGGAAGGACAAGCACTGTCTTATCCAAACTTTATTAGTACTAGTATTGGTAGTGTGAATATGAG
TGCATTTGCTAAAAGAAAAATAGTACTACGTATAACTATACCTAAAGGTTCTCCTGGAGCTTATCTATCA
GCTATTCCAGGTTATGCAGGTGAATATGAAGTGCTTTTAAATCATGGAAGCAAATTTAAAATCAATAAAA
TTGATTCTTACAAAGATGGTACTATAACAAAATTAATTGTTGATGCAACATTGATACCTTAA
>ref|NC_013316.1|:2921369-2923999 adp-ribosyltransferase binding component [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATACAAATGAGGAATAAAAAGGTATTAAGTTTTTTAACACTTACAGCTATAGTTAGTCAAGCAC
TAGTATATCCTGTATATGCTCAAACTAGTACAAGTAATCATTCTAATAAGAAAAAAGAAATTGTAAATGA
AGATATACTCCCAAACAATGGATTAATGGGATATTATTTCACAGATGAGCACTTTAAAGATTTAAAATTA
ATGGCACCCATAAAAGATGGTAATTTAAAATTTGAAGAAAAGAAAGTAGATAAACTTCTGGATAAAGACA
AATCAGATGTAAAATCTATACGATGGACAGGAAGAATAATTCCTTCTAAGGATGGTGAATATACATTATC
AACTGATAGAGATGATGTCTTAATGCAAGTAAATACTGAGAGTACTATATCAAATACACTTAAAGTTAAT
ATGAAAAAGGGTAAAGAATATAAAGTTAGAATAGAGCTACAAGATAAAAATTTAGGTTCAATAGATAATT
TATCATCACCTAATCTTTATTGGGAATTAGATGGTATGAAGAAAATTATACCAGAAGAAAATTTATTCTT
AAGAGATTATTCTAATATAGAAAAAGATGATCCATTTATCCCAAATAACAATTTCTTTGACCCAAAGTTG
ATGTCTGATTGGGAAGACGAAGATTTGGATACAGATAATGATAATATACCAGATTCATATGAACGAAATG
GATATACTATTAAGGACTTAATTGCAGTTAAGTGGGAAGATAGTTTTGCAGAACAAGGCTATAAGAAATA
TGTATCAAATTATTTAGAGTCAAATACTGCTGGAGATCCATATACAGATTATGAAAAAGCTTCAGGTTCT
TTTGACAAGGCTATAAAGACTGAAGCAAGAGATCCGTTAGTTGCAGCATATCCAATTGTTGGAGTAGGTA
TGGAAAAATTAATTATATCTACAAATGAACATGCCTCTACTGATCAAGGTAAAACTGTTTCCAGAGCTAC
TACTAACAGTAAAACTGAATCTAATACAGCTGGTGTGTCTGTTAATGTAGGATATCAAAATGGATTCACA
GCTAATGTAACTACAAATTATTCCCATACAACAGATAATTCAACTGCTGTTCAAGATAGTAATGGAGAAT
CATGGAATACTGGATTAAGTATAAACAAAGGAGAATCTGCATATATAAATGCAAATGTTAGATATTACAA
CACAGGTACTGCACCTATGTACAAAGTGACACCAACAACAAATTTAGTGTTAGATGGAGATACATTATCA
ACTATCAAAGCACAAGAAAATCAAATTGGCAATAATCTATCTCCTGGAGATACTTATCCCAAAAAAGGGC
TTTCACCTCTAGCTCTTAACACAATGGATCAATTTAGCTCTAGACTGATTCCTATAAATTATGATCAATT
AAAAAAATTAGATGCTGGAAAGCAAATTAAATTAGAAACAACACAAGTAAGTGGAAATTTTGGTACAAAA
AATAGTTCTGGACAAATAGTAACAGAAGGAAATAGTTGGTCAGACTATATAAGTCAAATTGACAGTATTT
CTGCATCTATTATATTAGATACAGAGAATGAATCTTACGAAAGAAGAGTTACTGCTAAAAATTTACAGGA
TCCAGAAGATAAAACACCTGAACTTACAATTGGAGAAGCAATTGAAAAAGCTTTTGGCGCTACTAAAAAA
GATGGTTTGTTATATTTTAATGATATACCAATAGATGAAAGTTGTGTTGAACTCATATTTGATGATAATA
CAGCCAATAAGATTAAAGATAGTTTAAAAACTTTGTCTGATAAAAAGATATATAATGTTAAACTTGAAAG
AGGAATGAATATACTTATAAAAACACCAACTTACTTTACTAATTTTGATGATTATAATAATTACCCTAGT
ACATGGAGTAATGTCAATACTACGAATCAAGATGGTTTACAAGGCTCAGCAAATAAATTAAATGGTGAGA
CGAAGATTAAAATCCCTATGTCTGAGCTAAAACCTTATAAACGTTATGTTTTTAGTGGATATTCAAAGGA
TCCTTTAACATCTAATTCAATAATTGTAAAGATAAAAGCAAAAGAAGAGAAAACGGATTATTTGGTACCA
GAACAAGGATATACAAAATTTAGTTATGAATTTGAAACTACTGAAAAAGATTCTTCTAATATAGAGATAA
CATTAATTGGTAGTGGTACAACATACTTAGATAACTTATCTATTACAGAGCTAAATAGTACTCCTGAAAT
ACTTGATGAACCAGAAGTTAAAATTCCAACTGACCAAGAAATAATGGATGCACATAAAATATATTTTGCA
GATTTAAATTTTAATCCAAGTACAGGAAATACTTATATAAATGGTATGTATTTTGCACCAACACAAACTA
ATAAAGAAGCTCTCGATTATATCCAAAAATATAGAGTTGAAGCTACTTTACAATATTCTGGATTTAAAGA
TATTGGAACTAAAGATAAAGAAATGCGTAATTATTTAGGAGATCCAAATCAGCCTAAAACTAATTATGTT
AATCTTAGGAGTTATTTTACAGGTGGAGAAAATATTATGACATACAAGAAATTAAGAATATATGCAATTA
CTCCAGACGATAGAGAGTTATTAGTTCTTAGTGTTGATTAG
>ref|NC_013316.1|:c2925652-2924651 tryptophanyl-tRNA synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTGAAAAAAAAGTTATATTTAGTGGAGCACAGCCATCAGGCAAAATGACTTTAGGAAATTATTTAG
GAGCTATAAAAAACTGGACTGAACTTCAAGATAATTATGATTGCTATTATAGTATAGTTGATTTACATGC
AATAACAGTACCTCAGGACCCTAAAGTTTTAAGAGCGAATGCTATAGAATTACTTGCTCAATATATAGCT
TGTGGATTAGACCCAGAAAAAAATACTATATTTATACAATCACATGTCAAAGAGCATGTTGAACTTATGT
GGGTATTGAATACTATGACTTATATGGGTGAATTAAGTAGAATGACTCAATTCAAAGATAAATCACAAAA
GAGTGAAGCAAATCTAAATGCAGGTTTATTCACATATCCAGTTCTTATGGCCGCTGACATATTGTTGTAT
CAAACTGACCTAGTTCCAGTTGGAGATGACCAAAAACAACATTTAGAATTAGCTCGTGATTTAGCAAATA
GGTTTAATAATAGATTTTCACCTACTTTTGTAGTTCCAGAAGGATACTACCCAAAAGGTGGAGCAAGAGT
GATGAGTTTGCAAGAGCCAACTAAAAAAATGAGTAAATCCGATTCAAATGAAAATGCATTTATACTATTA
GCAGATGATTCAGATTCTATAAAGAGAAAGATAAAAAGAAGTGTTACTGATTCTTTAGGTGTTGTAAAAT
ACAATGATGAACAACCAGGTATTAAAAATCTAATTGATATATATTCTAATTTAAGTAAAAAGAGTGTAGA
AGAGATTGTAAACATGTATGAAGGAAAGGGTTATGGCATATTTAAAGAAGATGTGGCTGAAGTAGTATCA
GAAGCTTTAAGACCTATAAGAGAAAAATATGTTGACCTTCTTAATAATAAAGATTATTTAGAAAAAATAT
ATAGTATGGGAGCAGAAAAAGCCGAAAAACAAGCTAGAAAAACTCTTAGAAAAGTTTATAAAAAAGTTGG
ATTTATAGAGAGAAGATACTAA
>ref|NC_013316.1|:c2926373-2925675 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAACGTAATAGGAATTATAGGTGCAATGGATGAAGAAGTTAGTATTTTAGTTGATTTAATGGATATTA
GAGAGACTATAAAAAAAGCTAGCTTAGAATTTTATAAGGGAATTTTGAAAGGTAAGAATGTAGTGTTAGT
AAAGTGTGGTATAGGTAAGGTTAACTCTGCTCTTTGTGCCCAGATACTAATAAGCGAATTTAAGGTTGAT
GCTATTGTTAATACAGGTGTTGCAGGAGCTTTAAATGAAAAACTTGATGTTAATGATATAGTAATATCAA
CTGATGCTATACAGTATGATGTAGATACTACAGCATTTGGAGACCCTAAGGGAGTTATACCAAGAATGAA
GACTTCTGTATTTAAAGCAGATGAAAGACTTATAGATGCTGCTTACAAATCTTCTGTGGAAGAAGTAAAG
ACTCATAAAGTATTAAAAGGAAGAGTAGTTACAGGAGATAAATTTATAAATTCTAAAGAATTAAAAGAAG
AATTAGTAAATGATTTTGGTGGATATTGTGGAGAAATGGAAGGTGGAGCTATAGCTCATGTATGCTATTT
AAATAATACTCCATTCGTAATAATAAGAGCAATGTCTGATAAGGCAGATGGAAGTGCTGATGTTACTTAT
GATGTATTTGTACATGATGCTGCCAATAACTCTAAAGACATAGTTTTAAATATGTTAAAATCAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c2928150-2926747 putative amino acid permease [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAGAAAAAAATAGGCCTATGGAGTTTGGTATTTATGAATGTATCAGCTTTATATGGTATAAGAT
GGATAGCTAAGTCTACAGCATCAAGCTTTGGTTTAGGATTAGGTGCAATACCTATGTGGTTATTATTCTC
ATTTATATACTTTGTACCAGGAGCTTTAATTTGCGCTGAATTAGCTTCTACATATCAAAAGGGTGATGGA
GGTCTTTACGATTGGGTTAAGGAAGCCTTTGGAGAAAAGTATGGATTTTTAGTTTCTTGGTTAAACTGGA
CAGCTAAAATATTTTGGTATTCTTCATTTTTAACTTTCTTAGCAGTAAATGTTTCTTATACAATAGGAAA
TCCAGCTCTTGCTGATAATAAGATGTTTGTACTTATATTATCTTTAATAATATTCTGGGCATTATCTCTT
ATAGCAACTAAAGGAATAAGTTTTACAAAAATATTTACTAATACAGGTGCATTAGGTTCAACAATACCAA
GTGCTATACTTATAATATTTTCATTTGTAGCAGTATTTATGTTGAAAAAACATGATATAGCTTCTACATA
TACAATAGCTTCAATGACTCCAAAACTTAATATGGATGCATTTGTTGCTATATCAGCTATAATGTTTGGT
TTAGCAGGAGCAGAGACTGCTGCTAACTTCATAACAGAAATAGATAAGCCTGAAAAGAACTTCCCTAAGG
CAATATTAATATCAGCTGGAATAGTAGCTTCATTATATGTATTAGGTTCAATTGCAATAACAATGATAAT
ACCACCAGACCAAATTACTGCTTCTAAAGGTGTATTAGATGCACTTTCTGCTGTTTGTACGTCTTTAGGA
ATTGGTTCTTGGTTGGTTCAATTAATAGCTTTTGGTATAGCTTTCTCAGTATTAGGAGCAATAGTTCTTT
ATATAGCATCACCAATAAAAATGTTATTTGGTAGTGTTAAAAAAGGAATATTTCCAGATAGTTTGGTAGA
GGTAAATGAACACAAGATACCTTCTAAAGCAGTTATACTTCAAGCAATAATAGTTACTATAATACTATTG
GTGACTACATTAATGCCTTCTGTTGATGCTATATACAATGTTCTTGTAACTATGACAGCATTAACTGCAT
TATTCCCATATGTATTATTATATGCTTCTTATATTAAACTAAGAAAAGAGAGACCAGATGAAATTAGACC
TTATACTATGGCAAAATCAACAAGTACTTGCCTAGGTTTAGCAAAAATGGTTTTAGTTGTAACTGTAGTT
GGTATATTATTATCTGCAGCACCAGTTATGCCGACATTTGCTGAAAATGTTATATATGAGATAGAGATGA
TTGGTGGAGGTCTTCTAGTTATATTATCTGGTCTATGGTTATGGAATAGATATGAAAAGAAAACAGCTAA
ATAA
>ref|NC_013316.1|:2928647-2929723 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGCTCAAAGATTAAATGCTGTACTTGAACAAATGAAAAAAGATGATATTTCTCAAATGTTAGTAA
GTGACCCTACTTCTATATTTTATCTTACAGGAGTACTAATCCATCCAGGTGAAAGATTATTAGCATTATA
CTTAAATTTAAATGGCAATAATAAATTATTTATAAATGAATTATTCCCAGTTTCAGAAGATTTAGGTGTT
GAAATGGTTTGGTTTAATGATACTCAAAATCCAGTAGAAATAATAACTGAACATATAGACAAAAATGCTA
CTATGGGTGTTGATAAAAACTGGCCAGCTAGATTCTTATTAAACTTAATAGAATTAGGTGGAGGAAGTAA
GTTTGTAAATTCATCTTATATAATAGATACTTTAAGAATGTGTAAAGATGAAGAAGAAAAAGAGTTAATG
AGAATAGCTTCAAAATTAAATGACAAGGCTATGGAACAACTTAAAGCTACTGTTTCTGGTGAACTTACAG
AGAAACAACTTGTTGGTAAATTATCTAAAATATATGAAGACCTAGGTACTGATGGATTTTCATTTGACCC
TATTATAGGTTTTGGACCTAATGGAGCTAATCCACATGGTGAACCTGGAAATGCACTTGTGAAACCAGGA
GATGCAATAATATTAGATATAGGTTGTATAAAAGATAACTATTGTGCTGATATGACAAGAACTGTATTCT
ATAAAGAAATACCTGAAAAAGGTAGAGAAATATTTGAAATAGTTCTTGAAGCTAATAAGAGAGCTGAAGC
TATTGTAAAACCAGGTGTTAGATTCTGTGATATAGATGCTGCTGCTCGTGACTACATAACTGAAAAGGGA
TATGGACAGTACTTCACTCATAGAACTGGTCACTCTATAGGACTTGAAGTTCATGATAAAGGAGATGTAT
CTTCTATAAATACAGATACTGTACAACCAGGAATGATATTCTCTATAGAGCCAGGTATATATTTACCAGG
TGAGTTCGGAGTTAGAATAGAAGATTTAGTACTTGTTACTGAAGATGGTTGTGAGATATTAAACAAACAT
GACAAAGAAATATGTGTAGTTGGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2930668-2929826 hypothetical protein CDR20291_2497 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAAAATAAAATTGATAGTGGACAGTGCATGTGACTTACCTGATGATATAATAGAAAAATACAACA
TAGAAGTTGTTGGTTTAAATGTATCTTTTGGAGAAGAAAGTTATATATCTGGAAAGGAAATAGATAATGA
AACTTTCTATAGAAAAATGAGTGAGAGTAAAGTACTACCAAAAACATCATGTCCTTCTCCTGATAAATTT
TTAGAAGCATACCATTGTCAGGAAGAAAGTGTATTGGTGATTAATATAAGTTCAGGATTATCTGGGACTT
ATAATAGTGCACTTTTAGCAAAAGATATGTTTGAAAAGGAAGGAAATAACAAAAAAGTTGAGGTTATAGA
TTCACTTAGTGGGTCAATTGGAATAGGACAATTAGTGTTAAAAGCAGCAATATTAATAAAAGAAGGAAAA
GAAATTGAAGAGATTGTTTCAATAATAAATAAATATAAAGATAATCCTCCATTTTTTGGAACACTTGAAA
CTTTAGAAAATGCTATTAAGGGTGGTAGAATAAATCCAATAGCAGGAAAAATTATAAATACCTTGAATTT
TAAGGCGATAATACAAGTTGCAGATGGCGTTGTAACTCCTATAGATAAGGCAAGAGGTGAAGGAAACAGT
TTGAAAAAGCTGATTACTTTAGTAGAGTCAAAAATTAAAGATAAAGAAGAAAAGGTTTTATTTATAGGAC
ATGCTAATTGCCCAGAAAAGGCTCAAAAGGTAAGGGAAGTTATGGAAAAGGATGTAAAATACAAAGATGT
TGTAATCTGTGAAATTGGTTCAGTGATGGGGACATATACTTCAAAGGGTGCAATCTTAATAACTGCAATA
TAA
>ref|NC_013316.1|:2930852-2931424 TetR-family trancscriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAACAAATAATATGAAACAGGCTATTTTATCATCTGCAACCAATTTAATAGCCAAAAATGGAGTTC
AAAATACTAGCCTTGCTGATATTGCAAAAGATGTAAATATAAGTAAAGGTACTTTGTATTATCACTACGC
ATCTAAAGATGATATTATATATGATATTGCGGATACTCATTTAGAAGTTATAACTAGTGCTATACTAAAC
TGTGTAAAAAATGTCAAATCAAAAAATTCTCAAATAGAAATGGTTAACTTAATCTTAGAGAAAATATCTA
CTATAGAAAGTCGTGGTAGGGTACATATGTATCTTATTTGTGAGGCAATTACTTCAAATAATGATTTAAA
GGAAAGAATAAGATTAAAATATATTGAATGGAGAACTACTCTTAAATCTGAAATTGTTGAATCACTAGAA
AAATATAATAGTAGCGAAAATGAACAGGATGCTGAATCATTTTCTTTTTTACTCATGTCAATAGTTGATG
GTTTAGTTGTCCAAAGTTTATTAAAAACAGAAAAAATACCTTATGAAAATATAGCTTCTTTTTTAGTTAA
TCATTGGATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2931922-2931587 hypothetical protein CDR20291_2499 [Clostridium difficile R20291]
ATGTATACTGTAGTTAATGGGGTACATGAAGTATTCAATAATATACTAGGAGGTATAAGAATTATGTTAA
GAGAGAGATTTGTAGTAAGAAATCATCATAATCCACATACAAGTGGGTGTTGTGGGACTGGAGGAGAAGG
ATGCTGTGGAGGAGATAACCATGAACATTCACATCAACATTCTCACAGTCATGGGCATGAACATGAGCAT
GTAAATGGTGTAGGTCACGACCATAATCATGATGATGGTTTTTCAGGTACTCATGAGCATAGCCATGAGC
ATACACATACACATGGTCATGAACATTCAGATGGGCATACACATGAACATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2932786-2931986 hypothetical protein CDR20291_2500 [Clostridium difficile R20291]
ATGATTCTATCAACCTTAGGAATAAATTTATATCTAGCACCAGCCAAGTTATTAAGTGGAGGAGTAGCTG
GAATTTGTGTTATATTATACAAATTATTTGGTATAAATCAGGGAATATCAAGTTTCTTGATGAACATACC
AATATTTATTATAGCTAGAAAGTATTTTGATAATAAATTTTTGCTAATAAGTTTTGTCAATATGTTACTG
TTTTCTCTAGCACTGGGGCTAACACAAGATATTGCTAAATATTTCCCAATAGATGATACTATGCTACAGT
GTATTTATGGTGGTGCATTAACTGGTATAGGTATGGGGTTAACTTTTAAAGCAAGAGCTACTGCTGGAGG
ACTTGATATAATAGCAGCCATAATGAAAAGAAAGTATGATATACCTATGAAAAATACATTTTTATTTATT
AATTTTTTTGTAGTATGTGCAGGAGCTTTCTTATTTGGAGCTAAATTGGTGATGTACACTTTAATTACAA
TGTATATAATTTCTTTTACTATGGATATAGGAAAAGATTGCTTTGATAGAAAAAAATCTATACTTTTAAT
ATCAAATAAATATGATGAAATATCCAAAGTGATAATGAATAAAATGGGTAGAGGAGTCACTTTTTTGGAG
GCAGAAGGTGCATATACACAAAATAAGAAAAAGATGATTTATTGCATAATATCTGCAAATGAAATAGGTA
AATTTAAAGATTTAATTTATGATATGGATAGTGAAGCTTTTATTTCTGTCAATAACGTTGAAGAAGTAAA
AGGTGGAGGTTTTAAGGATAAATTTCTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2934061-2932943 transposase-like protein b [Clostridium difficile R20291]
GTGATAGTAGTGGAAAAGGCATATAAGTTTAGAATGTATCCAAATAAAAAACAACAAGAGTTAATTAACA
AAACTTTTGGATGTTGTAGATTTGTATATAATAAGTATCTTGCTAAAAGAATAGAAGTTTATAAAAACGA
TAAAGAAACTTTTACTTATAAACAGTGTAGTTCTGATTTGACCAATTTAAAAAAAGAATTAAAATGGCTT
AAAGAACCTGACAAATTTTCACTACAAAACGCCTTAAAAGATTTAGATAATGCATATAAAAAATTCTTTA
AAGAAAAAGCAGGATTTCCTAAATTTAAATCAAAGAAAATTAATAGATTTTCATATAAAACTAACTTTAC
AAATGGAAACATTATGTATTGTGGTCAATATATAAAACTACCTAAACTTGGTATGGTTAAGATAAGGGAT
AAACAAGTACCTCAAGGTAGAATACTTAATGCTACTATATCTAAAGAACCAAGTGGTAGATATTATGTAT
CATTATGCTGTACTGATGTAGATATTGAAGTATTTGAAAATACTAATAATCAGATAGGTTTAGATTTAGG
AATTAAAGAATTTTGTATCTCAAGTTGTGGAGACTTTATAGAAAATCCTAAGTATCTTAAGAAGTCATTA
AACAAACTTGCTAAATTACAAAGAGAATTATCGAGAAAAACAATCGATAGTTTAAATAGAAATAAAGCAA
GATTAAAAGTTGCGAGACTTCAAGAACATATAGCCAATCAAAGAAAGGATTTTCTACAAAAACTATCTAC
TAAATTAATAAAAGAGAATGATATTATTTGCATAGAAGATTTACAAGTAAAGAATATGATTAGAAATCGT
AAACTATCTCGCTTAATTTCTGATGTGTCATGGTCAGAATTTGTTCGTCAATTAGAATACAAGGCTAATT
GGTATGGTAGACAAATTGTAAAGGTAGGTAAATTCTTTGCAAGTTCACAAATATGCAATAAATGTGGGTA
TAAAAACGAGGAAGTTAAGGATTTAAATATAAGAGAATGGATTTGTCCTAGTTGTAATGAAACTCACGAT
AGAGATATAAATGCAAGCATAAATATATTAAAAGAAGGATTAAGACTAATAACAATTCAAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2938145-2935038 isoleucyl-tRNA synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGGCGAAATTTAAGCCATTGGTAGACAGTTCTGTAAAACAAGCAGAAGCACAAGTTTTTGATTATTGGA
AAGACATAAATATACTTGAAAAAACTTTAGAAAAAGGGAAAGATGACCCAAGTTTCGTATTCTATGAAGG
ACCTCCAACAGCTAATGGAAATCCTGGAGTACACCATGTTTTATCTAGAACGCTTAAAGATTCAGTTTGT
AGATATAAAACAATGTCTGGTTATCAAGTAAAGAGAAAAGCTGGTTGGGATACACATGGATTACCAGTTG
AAATACAAGTAGAGAAAGAGTTAGGTCTTACTAGCAAGCAACAAATAGAAGAATATGGAATAGCTGAATT
TAACCAAAAATGTAGAGAGTCAGTTTTCTCATTTGAAAAACAATGGAGAATAATGACTGAGAGAATGGCT
TATGAAGTTGATTTAGATAATCCATATATAACTTTAGATAATAACTATATAGAGTCTGTATGGTGGATAC
TAAACAAATTCAACAAAGAAGGATATATATATGAAGGGCATAAAATACTTCCTTATTGCCCAAGATGTGG
AACTGGTCTTGCTAGTCATGAGGTTGCACAAGGATATAAAGAAGTAAAAACTAATACAGTTATAGCTAAA
TTTAAGAAAAAAGATGCTGATGAATACTTCTTAGCATGGACAACAACTCCATGGACTTTACCATCAAATG
TTTCATTAACAGTAAATGCTGATGTAGATTATTTAAAAGTTAAAAAAGGTGATGAGGTATATTATGTATC
TAAACCTTTAGCTGATAAAGTACTAGGTGAAGATTATGAAGTTTTAGAAGAAATGAAAGGTAAAGACCTA
GAAGGTTTAGAATATGAACAATTAATGCCTTTTGTAGAAGTTGACAAAAAAGCATTTTTTATTACAGTAG
GAGATTATGTAACTACTGAAGATGGAACTGGTATAGTTCATACAGCACCAGCATTTGGTGAAGATGACTA
CAACACAGGTAAAAGATATGATTTACCAGTTATTCAACCAGTAGATGAAACTGGTAAATTTACATCTACT
CCTTGGGAAGGTAGATTTGTAATGGAAGATGGGCTAGATGTTGAAATAATAAAATGGCTAGCTTCTGAAA
ATAAATTATATAGCAAAGAAAAAGTAGTTCATAATTACCCACACTGCTGGAGATGTCAAACTCCATTAGT
ATACTATGCAAAACCAAGCTGGTATATAGAGATGACTAAACTTAAAGATAAATTAATAGAAAATAATAAT
GGTGTAAAATGGTTCCCAAGTTTTGTAGGAGAGAAGAGATTTGGAAACTGGTTAGAAAATCTAAATGACT
GGGCAATATCAAGAACTAGATATTGGGGAACTCCACTTCCTATATGGAGATGTGAATGTGGTCATACAGA
TTCAGTTGGTTCAAGAGCTGAATTAGCTGAAAAAGCTATAGAAGATGTAAATCCAGAAACAGTTGAACTT
CATAGACCATATGTAGATGATATACACTTAAAATGTGAAAAATGTGGAAAACCAATGACAAGAGTAACAG
AGGTTATAGACTGTTGGTTTGATAGTGGGGCTATGCCATTTGCTCAACACCACTATCCATTTGAAAATAA
GGAAAATTTTGACCAATTGTTCCCAGCTGACTATATATCAGAAGGTATAGACCAGACTAGAGGTTGGTTC
TACTCATTACTTGCAGTATCAACATTTGTATTAGGAAAAGCACCATATAAGAGTGTTTTAGTTCCAGACC
TTGTACTTGATAAAGATGGTAAGAAAATGAGTAAATCAAGAGGAAATACAGTAAATCCAATGGAATTGTT
TGACCAATATGGAGCAGATGCATTAAGATGGTATTTACTATATGTTTCTCCACCATGGACTCCAACTAAA
TTTGATATGGATGGATTAAAAGAAATCCAAAGTAAATTTATAGGTACTATGAAGAATGTATATAACTTCT
TTACTTTATATGCAAACACAGATGATATAAATCCAACTGAATTTTTTGTAGAATATAAAGATAGACCAGA
ACTTGATAGATGGATATTATCTAAGTTCAATAATTTAATGAAAGATGTAGAAGAAAATTTAGCTATATTT
GAGTTAAATAAAACTTTAAGGATGATACAAGATTTTATAAATGATGATTTATCTAACTGGTATATAAGAC
GTTCAAGAAGAAGATTCTGGGCAACTGAATTAACAGAAGATAAAAAAGCAGTGTACAATACAACTTATGA
ATTGTTACATGGTCTTTGTAGAGCTATAGCTCCATTTGCACCATATATGTCAGAAGAAATGTATAGAAAC
TTAACAGGAGAAGTATCTGTTCATTTAGCTGAATATCCTAAATGTAATGAAGAGTTAGTAGATACTAAAT
TAGAAGAAAAAATGGATTTAGCTAAAAACTTAGTTACTTTAGGTAGAGCTTCAAGAGAAGTAGAAAGAAT
AAAAGTTCGTCAACCATTACAAAAAGTGTTAGTAGATGGTAAGTTTGAAGATACAATAAGTGATGTAGTT
GATTTAATAAAAGAAGAGCTTAATGTTAAAGAGGTAATATTTGCTAAGGATTTAGATGAGTATATGAACT
TTAGTTTAAAACCAAACTTTAAGGAAGCAGGGCCATTATTAGGTTCTAAGATGAATTTATTCGTTGGAGC
ATTAAGTAAATTAAATGCTCATGAAACTGCTAATAAACTTGAAAAAGGTGAGACTTTAACAGTTGATTTA
GATGGCGAAGCTTTTGAATTTAATAAGGATTTAGTATTAATAGGTATAACTGCTAAGGAAGGATTTAATG
TATCTGTTGAAAACAATCTTTTTGTTATACTAGATACTAAGCTAACTGAAGAGTTGATTAATGAAGGTTA
TGCTAGAGAATTTATATCTAAAGTACAGCAATTAAGAAAATCTAATAACTTTGAAGTATTAGATAATATA
GTAATAGAATACTGTGGTGATGATGAAATTGCTAAGGCTGTTGACCATTTTAATGAATATATCAAGTCTG
AAACTTTAGCTTTAGAAATAAACAGAGTAGATGATAAATCTTTAGAGGAACAAAACTTAAATGACCATAT
GACAGGTATAAAAGTTATAAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2939172-2938645 cell-division initiation protein [Clostridium difficile R20291]
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TTGATGAATTTTTAGATATCATCAAGGAAGATTATGAATCTCTATGTAGGGAAAATACAGCTCTTAAAGA
AAAATTAGGGTTATATCAAGACCAAGTAAACAAGTATGAAAATATTGAAGAAACACTAAAAGCTACTTTA
ATAACTGCTCAAAGTGCAGCAGAAGACACTTGTAGCGCGGCTAATAAAAAGGCTAAGATAATTGTTGAAG
AAGCTGATTTAAAAGCTAGACAAATTATAGAACAAGCTAATAACCGTGTCATAGAGATAAGAAAAGAGTA
TGATGCTTTAGTCAAAGAATTTAAGATATTTAGAAATAAATTTAAATCACTGTTAGAAGATGAAATAAGA
AGTGTTGATGAGATTTTTTATGATGTAGATGAAAAATGTGTAAATGCATTTGAAGGAACAACAGTGTATA
ATTATAGTAATGATGAAGCTGCTACAACTTTAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2939992-2939207 putative RNA-binding cell division protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAAATTAAAACTAACAAATCACATAAAGGATATAGACTTGAAAAATAAAATGTTTAAAGTGATAG
ACAAGGCTAATAGTTGTATAAAAAACTATGATGTTAAGTCTACGGAGTTTCTTAATCCATATGAAGTGAA
AAATGCTGTAGCAATATTAAATTCTACAAATGAAATAAAATACAGTGTGGATGGAGGTTATGAACAAGCT
GAAAGAAGCACTGTATTTATTTATCCATTTTACATGGAATATGAAGATATAGAAGATACTCTTAGATTTT
TACAAATAGAAGGGAATTTCAAGTTTAAAAATATATCTCATAAAGATTACTTAGGGTCAATACTGGGTCT
AGGTATAAAAAGAGAAAAAATTGGAGATATAATTATACATGATAGCTTTTGTCAAGTAGTTGTAAGTAGT
GATATTTGCGATTTTATAATTGTAAACTTAGAAAAGGTTTCAAGAAATAATGTAATTGTAAAGGAAATTT
CCAGAGAAAATATTGTTAATAGTTCTTCAAAATATAAAGAAGTATCATTTACAGTATCTTCAGATAGGTT
AGATTGTGTGATAAGTGGTATTTACAATATATCTAGACAAGATAGTGCAAAATACATAAATGGAGAAAAA
GTCCATGTCAATTATGAAAAGATAACTTCAACTTCTAAAATAGTAAAAAATGATGATTTGATTTCTATTA
GAGGCAAAGGAAGAGCTAAGGTAACACAAATAGGAGATATTACCAAAAAAGGAAAAATAAAAGTTCAAGC
AAGATTAATTGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2940259-2940002 hypothetical protein CDR20291_2505 [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAACAATAAGAATTGCACTTTATTATCTTTTAGATATAATAGCATGGATGATAGTTATAAAAAGCT
TGATGACTTGGTTTCCAAATGGAAGACAAAGTAAAATTTTTAATATTTTGGAAAATCTTACAGAGCCAAT
AGAAGGGCCAATAAGGTCTATAATGTATAAATATACAAATGGACCTATAGATTTTTCTCCTTTAATTGCA
ATAGTATTATTGATGTTCCTAAGACAATTAGTATTGGTTATATTCTAA
>ref|NC_013316.1|:c2940736-2940278 hypothetical protein CDR20291_2506 [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAAATGGAATAATATCTAAATTTAAGAATTGGATAGTTGATGAAGAAGAAGATTATATTGAAGATG
AATATGAAAGTGGCATGGACGATATAGTTCAAGAAGAAGAAATGAACAGTGGCTTTAGTACTGCAAAAGC
AAATAAAATTGTAAATTTACATACAACTAGCCAAATGAAAGTTGTAATAGTTGAACCTAAGGTTTATGAT
GAAGCTGCAACTATAGCAGACCATCTAAAACAAAGAAGGGCAGTTATAGTGAATTTGGAAGGATTGACTA
ATTCTGAAGTTCGTAAATCTATATTTAACTTTATGAATGGGGCAGTTTATGTATTAGATGGAAGTATACA
AAAGGTTTCTAAATCAATATTTATACTAGCTCCTAATAATGTGGATATAGATGCAAATATGAAAAAAGAA
TTAGAAAGTAAAGCATTCTTCCCTTGGCAAAATAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2941480-2940776 putative alanine racemase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGTTCTATTAAAGATAATTTGTCTGAGATAAGAAACAAAATTGATAAAGCTGCAAAAAAAGTAGATA
GAGACAGCAAAGAGATTACCCTTTTGGCAGTCACAAAGACTGTTGATGTAGACTTAGTTAATGAGGCAAT
GAGGGAAGGAATCACTTCTGTTGGTGAAAATAAACCCCAAGAATTAGCTAGAAAGTATGATATTATAGGT
GACAAATTAAACTGGCACCTGATAGGAACTTTGCAAACCAATAAAGTTAAGTACATAATCGATAAAGTTT
GTATGATACACTCTTTAGATAGAATTGCATTATGCGAAGAAATTCAAAAACGTGCAGAACAAATAAACAG
AGAAATAGATTGCTTAGTACAAGTGAATATATCTAAAGAAGAGTCTAAGCATGGACTTGATAGAGAAGAA
GTTGTAGATTTTGTCAAAGAAGTGTCAGAAAAATATAAAAATATAAAAATAAAGGGTCTAATGACAATGG
CACCTTTTATAGAAGATGAAGATGAGATAAGAGGTGTATTTAAAGGTCTTAAAGATTTATCAAAACAAAT
AAAAGAACTAAACATCCCTAATGTAGGGATGGATGTTTTGTCAATGGGAATGAGTCACGATTATGAAATT
GCTATAGAGGAAGGGGCTACCATTGTTAGAGTTGGAACATCAATCTTTGGAGAAAGAAACTACAATAAAA
AATAA
>ref|NC_013316.1|:c2942098-2941490 hypothetical protein CDR20291_2508 [Clostridium difficile R20291]
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CGTTGGTGTTAAAAAATGAAAAAGTTGATGCAAAGATTCCTGTAAAAGGAACTATAGAAAAAGATGCCAA
TGACCAAAGTAATTATCTATCTACATACATCAGTAAAGAAGATTCTAATAACTTTGAAAAAAATCAAAAT
GTAATAATTGAATATCATGAGCAAAAATTAGATGCAAAAGTTTACAAAATATATGAAAATAATAATAAAA
TAATGGTAAAATTAAAAATAAGTAACCAAATTGTTGCAAATCAGGATACAAGTGTCGAAGAATTTGATAT
AATATATAATCAGATGGAATGTTTAAAAATACCTAAAACTTCTATAAAAACAAAAGACAATAAACGTGGT
GTATATGTAATTGATGAACAATCACAAAGTGTAAAATTTGTCATATTAGAAGGAATAACTTATGAGAATG
AATCTTCTGTATTTGTGGATTATTATAAAAATGACATAAATGGAGTTACAAGTGTTAATCTATATGACAA
AATAATTTTAAGACCTAACAGTATAAACACAAATATAAGGATAAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:2942506-2943546 hypothetical protein CDR20291_2509 [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAGAAATTTTATTAGGAACAGGTTTACTTTTATTGGTTCTATGTTGTTTCACAATTTTTAGTTACA
AGGCCCCATATGGTATGAAGGCTATGGGAGCTCTAGCAAACGCTGCATGTGCTACTTTCTTAGTAGAGGC
ATTCAACCTTTCTTTACTTGGTGATGTTTTAGGTATGGAATTTTTTAGAAGTGTTGGAGCTGCTAATGGT
AGTCTTGGTGGAGTTGCTGCTGCTATACTTGTGCCTTTAGCCTTAGGTGTATCTCCAGTTTATGCAGTTT
TAATAGGATTATCTTGTTTAGATTTTTCTATATTATCTGGATTCGTTGCTGGATACTTTGTTTCTTTCTT
AATTAAGTTTATAGAGAAAAAAGTGCCACCTGGAGTGGATTTAGTGGTTGTAATTCTTCTATGTGCACCG
CTATCTCGTCTTATAGCATCAAATGTAGACCCATTAGTTAATAGTACACTACTACAAATTGGACAAGTTT
TGATAGAAGCTACCAACATTAGCCCTATAATAATGGGAATTATACTAGGAGGCATAATAACAGTAGTTGG
AACGTCTCCACTTAGTTCAATGGCTCTTACATCTATAATTGGTCTTACTGGTCTTCCTATGGCAATAGGA
GCATTAGGTGCTTTTGGTTCAGCTTTTATGAACTCAACACTATTTGCAAAATTGAAATTAGGTTCTAAAA
AAGATATTATATCTGTTGCTATTGAACCATTAACCCAATCAGACATAATTTCAGCTAATCCAATACCTAT
ATATTCTACTAATTTCTTTGGAGGAGCCTTTTCTGGTATCATTGTAGCCTTGATGGGTCTTGTAAACATG
ACACCAGGTACAGCTACACCTGTGGCTGGTTTTGCTATAATGTTTGCTTATAATCCAGTTCAACAAGTTC
TTATAACAGCTGGTTTATGTGCTTTATTCAATGTAATTGCAGGATTTTTAGGTTCAAAAATATTCAGTAC
CTTTAAAGTTCTTACTGCTGGTGAAATACGTGGTACTGATGTAGAAGAAGAAATTGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2945373-2944009 cinserved hypothetical protein [Clostridium difficile R20291]
GTGATAATAGTGAATGTAGGAAATATACTTGAAACAATAAAGATGATAGATGAAGAACAGTTGGATATAA
GAACTATAACTATGGGGATTTCTTTATTAGATTGTATAGACCCTGATGGAGATAAAGCTAGAGAAAAAAT
ATACAATAAGATTATGAGTTCTGCTAAAGATTTGGTGAAGGTTGGAAAAGATATAGAGCGTGAATTTGGT
ATCCCAATTGTAAATAAAAGGGTATCAGTAACTCCAATTTCCATTATTGCAGGTGCAACAGATGAAAATG
ACTATGTAAAGTTTGCACAGACATTGGATAAGGCTGCAGAGGATTTAGGTATAGATTTTATTGGTGGATT
CTCAGCATTAGTTCAAAAGGGATATACAAAAGGTGATAAGATACTAATTAAGTCAATTCCAAAAGCTCTA
GCAAGTACTAATAAAGTATGTGCTTCAGTAAATGTAGGTTCTACAAGATGTGGTATAAATATGGATGCAG
TGAAAGAAATGGGAGAAATCATAAAAGAAACTGCAGAATTAACAAAAGATGCAAAAGGTTTTGGTTGTGC
AAAATTAGTAGTATTTTGTAATGCAGTAGAAGATAATCCATTTATGGCAGGAGCTTTCCATGGTGTTGGT
GAGGCTGATAGAATTATAAATGTTGGTGTAAGTGGCCCTGGTGTTGTTAAGAGAGCTTTAGAGAAAGTAA
AGGGAGAGCCTTTTGATGTTGTTTCAGAAACAGTTAAAAAGACTGCATTTAAAATTACAAGAGTTGGACA
ACTTGTGGCAAAGGAAGCTTCTAGTAGATTGGATGTTCCATTTGGGATAATAGACTTATCACTAGCTCCT
ACACCTGCTATTGGTGATTCAGTAGCAAATATATTAGAGGAAATGGGTCTTGAAGTTGTTGGTACTCATG
GGACTACAGCAGCATTAGCACTTTTAAATGATGCTGTTAAAAAAGGTGGAGTAATGGCATGTTCACATGT
TGGAGGACTTAGTGGAGCGTTTATACCAGTATCTGAAGATGCAGGTATGATTGATGCTGTTATTAAAGGT
GCTTTAAGTATAGATAAGCTTGAAGCAATGACTGCTATTTGTTCTGTAGGTCTTGATATGATAGCTGTGC
CAGGAAATACTACAGCAGGTACGCTTGGAGCTATGATAGCTGATGAGGCAGCAATAGGTATGATTAATAA
TAAGACTACAGCCGTTAGAATTATACCAGCCCCAGGATGTGATGTAGGTGATATGGTAGAATTTGGAGGA
CTTTTAGGACGAGCACCAGTAATGCCTATAAGTACAAATTCATCTGAATTATTTACTCAAAGAGGAGGAA
GGATTCCAGCTCCTATACATTCATTTAAAAATTAG
>ref|NC_013316.1|:c2945659-2945390 hypothetical protein CDR20291_2511 [Clostridium difficile R20291]
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ACAAGCAAAATATCAACATAGTAGATATATCACAAAAAATATTACAGGATTATTTTACTATGATTATGAT
AGTTGATTTAGAGAAATCATTAAATTCTTTTGAGAAAACGGTTGAGGACTTGGTTGAAAGAGGTAAGAAA
TTATCAGTGGATGTAAAAATTCAGCGAGAAGAAATATTTAATTCAATGCATAATCTGTAG
>ref|NC_013316.1|:c2947889-2945949 hypothetical protein CDR20291_2512 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGTATGAGATATTTATTTTTATGAGTATAATAGTTTTGTGTTTTATAAGTTTTCCACATAAAG
TTTTTGGACAAGAGGAAAATTGTCTTGAAGATTTTGAAAGGTGGGTTCAAGAAAATAAAAATAATAAAGA
AGAAATAGTTTATACTCTTTCTTGTAATATGGTAATAGATGAAGAGTTTAGATTTTATATTCCTTATGAC
AGTAATTTTACAATAGATACCAACAAATATAAAATATTGATAAAAAATCATGGGAGATTTATTATTGATG
ATAATGAATTGAATATAATAGGTGAAGGAGGAAAAGAAGGAGTAATACATATAGAAAATGGTGGAAGTAT
AAGTATTGGTATAAACAACATAATTGCTACTGATGGGACAGCCTTATACGTTGAAGAAGGAGGAGACTTA
CATATTAAATCATCCTACGAATCTGTTGAAAAAATAAAGGCAAATGGAAAAGATGCAATAGGAATTTATA
CTGAAAATGATATTAGAATACTAAATAAGGATATTGAAGTGAATGGAGAACATGCTATAGGTGTTTATTC
TAAAGGTGATGTTGAGATAGAAGAAACTTCAATAAAAGCATATAGTAGCAACAATGAAAGTGGGTTACTA
AGAGATAATAATAAGTTGGCACAATCAATTATATCAGAAAGTAAGAAAGTTTATATAATTGATGATTATA
ATGAGCTTATACCCTCTATAGCTAAAGATTCTGGCTATAATATTGTGAAATGTTGTCATAGGGGAATTGG
TGTATTTAGTGATGAAATAAAAGTAAGTAAAGATGATAAAATAGAAAATATAAAATTTCCCAAATATATG
GTATTAGAAACATCTAGTGGTAATCAACTTGATATAGATGTAGAATGGGATTTTACTGATTATTATGAAA
AGTTGGAAAAGGGAGAAAATTTTGATATAACAGGAAAGTTTAAAACAGAAATGTTAAATAAAGAAAAAAT
TATAATAAATGATGATGTAGTTCCTATTTTGAATGTATCTGTTATAGAGAAAAAAACAATAGACAATTTG
GAACTGGAATTTCAAAATACAAAAAATGGATATGTAGCTGTTTTATTTTATGATATGCCGTATAGTGCAA
GTAAGGTTTTTGTTGAATATTCAAGCGATGGAATCAATTGGATATCTGAAGAACAGGAGGATATTAGAGA
TCAAGCTATACTTTTTTTTGAAGATTTTAAGTTGCGTTGTTTTAGAGTAAAAGTGGTAGGAGGATTAAAA
GAAGGGTATTCAAATATAGTTTTTAAACCAGGATTTATAATGGGAGGCGGAGACAACCAAGAGACGCCAG
ATGATGAACGGGAAAATGATGATATTGATGGTGACCGTGGAGGAGGAGGTAGAGACGACCCGGATAGAGA
TGAGGATGATAACAATCAAGATGGGAATAATGGAAATGAAAATAATGATAGTAATAACAATCAAAACAAT
AATAATGAAAATAATAATTCTGATGAGAAACAACCAAATACTCCTAAAGATGATGTAGAATCAAGTACTG
ATAGCAATGAAAATAAAAATCCTCATGATATACCTAAAGACGGTAATAAAGAAAATAATTCTGATAAAGA
AAAAGGATTTTACAATAAAAATCCAATTACAGAAAATGATGATAATTATGATTTAAGCTCAAAATCAGTA
TTTGGTACCAATGAACATTCTTTTCCTTATAGGGAAAGTATTTCTAACAAAAATCAAGATACAAATAAAA
ATAAGTCAAATATAAGTGATTATGATGGAATAATAAATAATAATTATAAATTAGAATCTAAAGAATATAA
TCTAAAAAAAGATATTATTTTTTTATTTTGTATACTAACACCAATTATGATTGGTTCTATATTAATTGTA
AATCCTGATACTAGAAAAAGTATAATTAAATTCATAAAATTAAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2949566-2948073 stage IV sporulation protein A [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAGGAGGAATAATATGAATAATAACATATACGAAGATATATCCAAAAGGACTCAGGGGGATATAT
ATATTGGAGTAGTTGGACCTGTAAGAACAGGAAAATCAACTTTTATAAGAAAATTTATGGAAAAGTTGGT
TATACCTAATATAGACAATGAATTTAAAAAGGATAGAACAAGAGATGAGATACCCCAAAGTGGTTCAGGT
AAAACGATAATGACAGTAGAACCAAAATTTGTACCAGCAGATGGTGTAGAAATAAAAATAAAAGACACAG
TATCTTTAAAAGTAAGAATGGTAGATTGTGTTGGATACATAGTTGAAGGAGCTTTAGGGCATGAGGAAGG
TGGAAAACAAAGATTAGTATCCACTCCTTGGTCACAAGAAGCTATGACATTTGAAAAGGCAGCAGAGATA
GGAACTAAAAAAGTTATAAAAGACCATTCTACAATAGGGATAGTTGTCTTGACAGATGGTTCAGTTACTG
GAATTGACAGAAAAAGCTATGTAGAACCAGAAGAGAGAGTTATACAAGAATTGAAAAATCTTAAAAAACC
ATTTGCAGTGGTTTTAAATACGTTAAGTCCAAAAAGTGAGGAAACGAGTATGCTTAGAAGTGAATTGGAA
GAAAAGTATGAAGTTCCAGTTCTTCCAATGAATGTGGTTGAAATGGAAGAAGAAGATATAGAGGAGGTTA
TGGAAGCTGTATTATATGATTTTCCACTTACAGAAATAAGAATCAACTTACCAAAATGGGTTGAAGGTCT
TGAAAGAAATCATTGGATAAAAAGTAGCATAATAACAACATTAAAACAAAGTATTATAGATATAGGTAAA
ATAAGAGATATAGAAGGTATTATACAAGGATTTTCTGAGTTAGAGTTTTTGGAAGATACAGGTGTTGATA
ATGTAGAGCTAGGAGAAGGTGTTATAAATATTGATTTACAGACAAAGCAAGATTTATTCTATAATGTCCT
TGAAGAAAAAAGTGGATTTAAAATTGAAGGAGATTATCAACTGCTTAGTCTGATAACTAGACTATCTAAA
GTTAAAAATGAGTATGATAAAATAGAAAGTGCTTTAATAGATGCCAAGATAAAAGGATATGGAGTAGTAG
CTCCTTCTTTAGAAGAACTTAGTCTGGAAGAACCAGAAATAATGAAACAAGGAAAACAATATGGTATCAA
GTTAAAAGCCAATGCACCATCACTTCATATTATAAAAGCAGATATATCTACAGAGGTCTCTCCAATAGTT
GGAAATCAAAATCAAGGTGAAGAGATGATAAAATATCTTATGGAAGTATTTGAAGAGCAACCAGCAGATT
TATGGGAATCAAATATGTTTGGTAAGTCACTACATGACTTAGTAAAAGAGCAATTACAAAGTAAATTATA
TACTATGCCAGAAGAGATAAGAGTTAAAATGCAAAAGACTTTACAAAAAATTGTAAATGAAGGAAGTTCT
AATATTATAACTATTTTGTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2951015-2949720 hypothetical protein CDR20291_2514 [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAGTTGAAGTAAATAAACCAAGCATTTGGAAAAATTTCAAAGTCTTGATAATACTCTTTGTAGCAG
GAGCATTTATATATGCTTTACCATATTTAAAGAATTATTATTATGATACTTTTGCACAAGCATTTAATCT
TACAAATACACAAATGGGAAGCTTAGGAAGCATTTATGGTCTACTTGCAATGGTATCATACCTTTTTGGT
GGTTTTTTAGCAGACCGTATTTCAGCCAGAAAATTGCTTTCAGGTTCTTTAATTATTACAGGAATATCTG
GTCTTGTATTAACACTTTATCCTCCATATATTGTTGTGTTTTTAATCCATGCCTTATGGGGAATAACAAC
AATACTTACTTTTTGGCCAGCTCTTGTAAAAGCTGTTAGAATGTTAGCATCTGAAAATGAACAAGGAAAA
GCTTTTGGATTTATGGAAAGTGGTCGTGGAATTACCAATGCAATTCATCTATCTCTAGTATTGATACTAT
TTGGGTATATTTCATCAAAAGTAAGTGATAAATCTGGTCTTACAGCTATTATAGTATTATACTCGGCAAT
AAATGTAATAGTTGGAGTATTAGTATTTTTCAAATTAAAGGATAATGAAAAAGAGGTATCAGCAAAATTT
GATAAAGAAGCCTTTTTTGCAGTAATAAAAATGCCTCATACATGGATAATAACAATAATAATGTTTTGTT
CATATTCAGCTAATATGTCATTTTATTATTTTACGCCTTATTCAACTGAAGCATTTGGAGCTACTGTGGT
GTTTGCATCTGCAATCTCAATATTAGCTCAGTATTGTAGACCAGTAGCATCAGCTGCTTCTGGATTACTT
GGAGATAAAGTAGGTTCATCAAAGATTATATCTTATGGATTTATACTTATGATTGCAGGTCTTTTAGGTG
TAATATTTACACCAACAAAATCATCTATGATTTATATACTATTGATTGGATGTGTTGCAATATATGTATC
TATGTATGCAATTCAAGGTTTACACTATTCGTTACTTGAAGAAGGTAATTATTCATTATCAATATCAGGA
ACTGCTATAGGAATAGTTGCTACATTAGGATATCTTCCAGAAGTACTTTGTCCTTTAGCAGCAGGGAAGA
TATTGGATGCATTTCCGGGTGTAACTGGATATAGGTACTACTTCATAGTTCTTACTATAGTAGCCATAAT
TGGATTGGTGTTTACATTTATATGGATGAACATGACAAAAGAAAGACGTAAAGAACTTATTGAGATGAAT
AATAAGTCAAATGAAAATACTACTAAAGTCAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2952644-2951199 amino acid permease family protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTTGAATAAATTTGAAATTGGAGGAATTACAGTGAAAAAGAAAATTGGATTTTGGGATTTAGTAT
TTATGAATATATCAGCACTATTTGGGATTAGATGGATAGCTAAATCTACTGCCTCTAGTTTTGGATTGGG
TCTTGGTTCTATACCAGTTTGGTTATTGTTTGCTTTTATATTCTTTGTTCCTGCATCACTTATATGTGCA
GAGTTGGCTGCAACATATCCAAAAGATGGTGGACTTGGAGAATGGGTTAAACAAGCCTATGGAGAGAAGT
GGGGATTTATGGTGTCATGGCTAAATTGGACATCAAAGATATTTTGGTATTCTTCTTTCTTGACATTTTT
AGCTATAAATATTGCATATATGCTTGGAAATCCAGATTTATCAAACAATAAGATGTTTATTTTAGCACTT
TCACTCATAATATTTTGGCTGTTGTCCTTAGTAAGTACTCGTGGGATGGCATTTGGAAAATTTTTTACGA
ATACAGGAGCATTAGGTTCTACAATTCCTGCTATATTACTTATAGTGATGGCATTTATGTCTGTAGTTAT
TCTCAAAAAAGCTCCATCAGCATCGATATATACAATCCAAAATATAATACCAAAAATAGATGCCAATTCA
TTAGTTTCTATATCTGCTATAATATTTGCATTATCAGGAGCTGAAACGACTGCTAATTTCATAACCGAAA
TGGATAATGCTAAGAAAAACTTTCCTAAAGCTATATTAACTGTGGCTGTTTTAATAGGAGGAATCTATAT
CTTAGGTTCAGTAGCAATAACAATGATACTTCCTCCAGATAAAATTGCAGCGTCTACAGGGATACTAGAT
GCATTAGCTAAAGTTGCACAAGATTTAGGTATAGGAAGTTGGTTTATAAGAATAGTAGCATTTGGAATAA
CTTTATCAGTACTAGGAGCATTAATACTTTATATAGCAGGTCCAGTAAAGATGCTTTTTGGAAATGTAAG
AGAAGGTGTATTTCCTAAGCAATTGACTGTTACAAATAAATACAATATACCATCAAATGCAGTAATAGTT
CAGGCTATAATAGTGAGTCTACTTCTTGTAGGAACAAACTTATTACCATCAGTAGATAATATATACAATG
TTCTTGTTACTATGACAGCATTAACAGCATTATTTCCATATGTCTTGCTTTTTACATCTTATATTAGACT
TAGAAAGACAAGACCAAATGAAGAAAGACCATATTCAATTGCAAAAAGTGATTCAGTTTGTATCAATATT
GCCAGAATGGTACTTGTAGTAACTGTAGTTGGCATACTTTTCTCAACGGCACCAGTTATGGAGACTTTAA
AAGATAATATAATCTATGAGATTGAAATGATAGGAGGAGGTCTTTTTGTTATAATAACAGGTTTAATGCT
ATGGAAGAACTATGAAAAAAAGATATCTAATAACTCTGGACGTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2953799-2952660 cobalt dependent x-pro dipeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAAATAATATGAGACTAGAAAGATTGAGAAAGTACATGAATGAAAAAAGCATTGAAATTGCTTTAA
TATTTGAACCAGACAATCAATTTTATATTAGTGGATTTAAAGCAATAACTTATTCTAGACCAATTGTAAC
AGTAGTAACTCAAGATAAAATAGAATTAATAGTACCTGGATTAGAAGAATTACATGCTAAAGAAGTTGCA
AAAGTTGATAATGTATATGTGTATTATGAAATACCAGAAATGAAAGAACATGGAATATCACATAAACATT
ACTTAGATATAATTTTAAATAAATACCCTAAAGGAACAACTGTTGGAATAGAAAAAGATATAGTATCTGC
AAGTTTTTCAGAGTATATAACTGATAAGTCATTTGCTATCAAAGATGTTGGAAGTAAAATATTTGAAATG
AGATATGTAAAAGATGCAAAAGAAATAGAATTTTTGAAGATAGCAGGTTACCTATCTGATATAGGAATAA
AAGGGTCTTTAGAAAATGTTAGAGTTGGGATGAGTGAATTGGAGTTTGACGTTGCGGGGGATAATGCTTT
ACTAAAATATGTTTCTGAAAATTATCCTGATACATATATAGGATTTGCAAACTGGACTTGTTCAGGGATT
GATAGAACAGCACAACCTCATTTAGATTCCAATACTAGGATACTTCAAAGAGGAGATATAGTAATACATA
GTAGACAGGTTTGGTATGAAAACTATAGAGCAGAAAATGAAAGAACTTTTATTATAGGTAAACCAACAGA
AAGACAAAAAGAAGTGTTTAAGATTGCAGTAGAGGCTCAACAAGCTGGATTAGATACAATAAAAGCTGGT
ATACCAGCAAGAATGGTGGATGAAGCAGCAAGAGCTGTTGTTGCAAAGTATGGTCTAGAGTTATATTCAA
ATCATAGAATTGGTCATGGTTTAGGTTTATCAGAACATGAAGAGCCATATTTAAGATTTGACAATGAATT
AATATTAGAAGAAGGAATGGTATTTTCTATGGAGCCAGGGATATATATACCTGGAGTTGGAGGATTTAGA
CACTCAGATACAGCAATAGTAGGTAAGAATGGTGCTACAATTATAACTAATTATCCAAGAAGTGTTGAAG
AACTTATACTTGATATTTAA
>ref|NC_013316.1|:2954118-2954768 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGACAAATAAAGAATTACAAAAGAAAAGGATATTGATGTATTTCATAGAAGCTGCTCAAAATATTATGG
AAAACGAAGGTATAGAAAATATTACACTTCGTAAGGTTGCAGATATGGCTGGATATAATAGTTCAACTCT
ATATAAATACTTTAAAAATTTAGACCATTTAATATCATTTGCATCTATAAAATATTTTAAAGATTATAAC
TTGAATATTTCAAGATGTATAGAAAATGTCAATGATGAATATAAGAAATATATAATTATGTGGAAATTAT
TTTGTAAGCATTCTTTTGACAATGCTCAAGCTTTTTATCAGGTATTTTTTAACTTGTCTAGTGATGAACT
TAGCTATATAACAAAACAATATTATGATATGTTTCCAGAAGATTTAGGTATTCATGATAGTGACATATCT
TTAATGATTACAGGAGAAAGTATAAAGGAAAGAAATAAGATACTATTAAACAATCTTGTAGATACTGGAT
ATATACCAGCTAAAGATTTAGACATAATCAATGATATAATTATTTCTTTTTATCAAAATCTATTATTCTT
AAAAAAGAACACAGGAAAAAATTCTGGTGATGATGAATTAACTATGAAAATGATTTCTTCTATTGAATAC
ATAATAAAACATGCTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2955944-2954925 glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(P)+] [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGAAAGTATGTGTATTAGGTACTGGAAGCTGGGGAAGTGCATTAGCTTTAGGGCTTGCAAAAAAAG
GTAATGATGTGAGCATGTGGACTCGAAAAGAGGAACAAGCTAAAAAAATAAACAGAACTAAAGAAAATAC
AGACTATTTACCAGGAGTATTATTTCCAAACAATATAACTATAAGTACTGATATAGAAAAAACTATAAAA
GATTGTAAGGTAATAGTTTTAGCAGTTCCATCACAGGCTGTAAGAAGTACTTGCCAAAAAATAAAACCAT
TTATAAAAGAAGGACAAGTTATTGTTAATGTAGCTAAAGGTCTTGAAAAAGGGACTGGGCTTAGATTATC
TCAAGTCTGTGAAGAAGAATTACCACAAAATCCATATGTAATACTATCTGGGCCATCTCATGCTGAAGAA
GTAGCAAGGGATATTCCTACTACCGTAGTAGTTGCTTCTAAAGATTTAAAAATAGCACAGATGATACAAG
ATTTATTTATGAGCCCTAAACTTAGAGTTTATACGAATCCAGACATAGTTGGAGTAGAACTTGGAGGAGC
ATTAAAAAATATTATAGCATTTGGAGCTGGGATATGTGACGGATTAGGGTATGGTGATAATGCAAAAGCT
GCCCTTATGACAAGAGGTATTAGTGAAATGAGCAGACTTGGAATTGCTATGGGAGCTAATATGTCTACCT
TTGCAGGTCTTTCAGGTATTGGAGATTTAATAGTTACTTGTACAAGTATGCATAGTAGAAATAGAAGAGC
TGGTATACTCATAGGTAAAGGTATGAGTTTAGAAGATACTTTAAAAGAAGTAAAGATGGTTGTAGAAGGC
ATAACTGCTACTGAAGTAGCACATGATGTTGCTGAAAAATTAGATATAGATATGCCTATAACTAATGCTA
TATATTCTGTAATAAATAAAGGTTCAAATCCTAAAGAAGTTGGAATAGAACTAATGATGAGAAGTAAAAA
GCATGAAATGGAAGAAGTAGTTTTAGGTGATGATATATAA
>ref|NC_013316.1|:c2956589-2955975 hypothetical protein CDR20291_2519 [Clostridium difficile R20291]
GTGGAGATATTTAGTTATATAATTATTGCTGTAGTTGCATATCTTTTAGGAAATATATCTACCTCATACA
TAGTTGCAAAGCGAATTGCTGGGGTTGATATAAGGACTCAAGGTTCTGGTAATGCAGGTTCGACAAATGT
ACTTAGGACACTTGGAAAAAGAGCAGGAGCAATGACATTTTTAGGTGATGTTCTTAAAGGTGTAATGGCT
GTTTTAATATCAGAATTTGCAGCAAGATTGGTTGGAATAGATACTCTTTTAGCTGGATATCTGGCAGTTA
TATGTGTTGTAGCAGGTCATAATTGGCCAGCAGTTTTAGGATTTAGAGGAGGTAAAGGTGTTGCAACTTC
ACTAGGTGCAATGCTAGCTGTAAATCCAGTAATAACACTAATGTGTCTAGCAGTATTTATATTGGTGGTA
GCTATAACAAAGTATGTTTCATTGGGTTCTGTTGTAGGAATAGGATGTTCACCAATATTTATGATTATGG
TAAAAAATAAAGCTGGTTTAATAGTAGCTCTGTTCTTAACTGCATCAGTAATATATAATCACAGAGCAAA
TATAAAGCGATTATTAAATGGGACAGAGAGAAAAATTGGTCAAAAGAAAGAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2957949-2956624 putative GTP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTATAAGTAGGCCAGTTGTAGCTGTAGTTGGGAGACCAAACGTTGGTAAGTCTACAATATTTAATA
AATTTGCAGGAAAAAGGATATCAATAGTTGAAAATACACCTGGAGTTACAAGAGATAGAATATTTGCTGA
AGTAGAGTGGTTAGATAAATATTTTACATTAGTGGATACAGGAGGAATTGAACCTGATAGCGAAGATATA
ATATTATCTCAAATGAGAAATCAAGCCATGCTTGCAATGGACATGTCACATGTAATACTTTTTATAGTTG
ATGGTAAAGCTGGAATAACAGCTGCTGATAAAGAAATTGCACAATTGCTTAGAAAGACAAAAAAACCAGT
AATCTTAGTGGTTAATAAGATTGATAGTCAAAGTCAATTTGATAATATATATGATTTTTATGAGTTGGGA
TTTGGAACGCCTTTTGCAGTTTCAGGAGCCAATAGTATGGGATTTGGAGATTTATTAGATGAGATAGTTG
AAAATTTTCCAGCAGGATTAGATACAGAGTATGAAGAAGATATAATAAGAGTAGCTATAACAGGTAAACC
AAATGCAGGAAAAAGTTCTATACTCAATAAGATACTTGGAGAAGAAAGAGTAATTGTAAGTCCAATTGCA
GGAACTACTAGAGACGCAATTGATACTTATTTTGAAAAAAATGGACAGAAATTTCTTCTAATAGATACAG
CAGGGCTTAGAAGAAAAAGTAAAATATATGAGACAATAGAAAAATACAGTGTAATAAGAGCTATGAGTGC
TGTAGATAGAGCAGATGTAGTATTGATAGTAATAGATGCCTTAGAAGGTGTAACAGAACAAGATACAAAG
GTTGCAGGTATAGCACATGATGAAGGAAAAGGATGCATATTTGTAATCAATAAATGGGATTTAATAGAGA
AAGATAATAAGACTATGAGTAATTACACAAAAGATATAAAAGAAAAATTTCCATTTATGATGTATGCTCC
AATCGTATTTGTTTCTGCAAAAACTAATCAAAGAATGAACAAGATACTAGATACAGTTGAATATGTGTCA
AATGAACATTCTAAGAGAATATCAACTTCAGCACTGAATGAAGTAATTGGAGAAGCTGTAATGTTAAATC
AACCACCATCTGACAAAGGTAGAAGACTAAAAATTTACTATGGGACTCAAACTGACATTAGACCTCCTAA
AATTACATTGTTTATAAATGATAAGGATTTAACTCACTTCTCATATCAAAGATACCTTGAGAATAAGATA
AGAGAAAATTTTGGATTTGAAGGAACTTCCATAAAGTTTGAGTATAGACAAAAAAATAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2959317-2957977 hypothetical protein CDR20291_2521 [Clostridium difficile R20291]
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TTGCAGAAGAAATAGGTATAGAGGTAGGAGATTTACTTATATCTGTGAATGAACAGCCAATACATGATAT
AATAGAGTATAGATTCTTACTAAGTGATGAATATTTAGATGTAGAAATACAAAAAAAAGATGGCGAAGTC
TACATATACGAGATAGAAAAAGACTATGATGAAGATTTGGGTGTTGAATTTACAAATCCGATAATTGACC
AAGCTAAAAGCTGTAGAAATAAGTGTATGTTTTGTTTTATAGACCAATTGCCAGAAGGTATGAGAGAAAC
TCTTTATTTTAAAGATGATGATTCGAGATTATCTTTTTTACAAGGAAATTTTGTCACACTTACAAATATG
AGTGAAGAAGATATAAATAATATTATAAAATATAGAATAAGTCCTATAAATATATCTGTGCATACAACTA
ATCCAGAGTTAAGACAAAAAATGATAAGCAATAAATTTGCAGGAAAATTATATGGTATAATGAAGAGATT
GGCAGATGCTCATATAGAAATGAACTGTCAAATTGTTTTATGTCCAGGTATAAATGATGGAAAGGAATTG
GATAGAACAATAAAAGAACTAGCTCAACTTTATCCATATGTAAACAGTGTTGCGATAGTTCCAGTTGGGA
TTACAAAGCATAGAGAAAATCTAGTAGAATTAAATATATTTAATGATAAGAGCGCAAGTAAAACTATAGA
GCAAATACATCAAATACAACAGAAATATCTTGAAAAATTAGGTACTCGATTTGCATTTTTATCAGATGAA
TTTTATATACTATCTAATAGTGAATTGCCTGGATATGAAGAATATGAAGGTTTTTTACAGTTTGAAGATG
GTGTAGGTATGATACGTAAGTTAAAAACAGAGATTGAAGAGTATCTAAATATATTGCCTGAGAATATTCT
AAAAAGAGAGAAGAAAGTATCAATAGCTACTGGTCATTCTGCATATGAATTTATACAGAGTATGGCAGAT
GCTATGATGGACAAGTTTAAAAATCTTCAAGTAAATGTATATGAAATCAAAAACAAGTTTTTTGGAGAGA
CAATAACTGTATCAGGTCTTTTAACAGCTAAGGATTTAAAAGAACAACTTGAAGATAAAGAATTAGGAGA
AGCTCTTTATATAACAAGAAGTATGCTAAAAGCAGATGAAGAAATTTTCTTAGATAATATTGAATTAAAT
CAATTAGAAGAACTTATGAGAATAAAAATTATCCCTTGTTTGAATGAAGGAAAAGACTTTGTGGATAAAA
TTTTAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2959743-2959543 hypothetical protein CDR20291_2522 [Clostridium difficile R20291]
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GTGGAGGTTGTCCAATATTTTATGCAAATGATGAGAAAGACTTACAAAATAAGGCATTGTTGATGTCAAA
GTGTGTAGGTGGAATGGTTCATGATATGACAAATGGGACGTTAATCATAGTAAAACATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2960677-2959745 hypothetical protein CDR20291_2523 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAGAGTATTTTTTGTTGCTGTTATTATTGGTATAACATCTAGAATTATAATGTTGAATTTAGACC
AAAAACAGTATCCAACGCAACCAAATGTTTTACTATCTCAACTTATATTAGCATTCGTCGCTTCTTCATT
AGGAGCATTATTGGTTCCAGCTCTTATAAATCGTTCTTATACATCCATAACATTTTTATCTCTAGCAGCA
GAACAATTTAGACAAGTGAGAGCAAATAGAAGAAATACATTGCAAAATTTAGAGGAAGTTCAACTTGTAA
AGAGAGGTGCTGCATTCATAGAAGAGATAGCTAGAACCTATGAAGTAAGAAATTATATGTGTATAGTTAC
ATCTTTTTTAACAATAGGATTGTATTATGTAATACTTGCAGAAACGAAAATAAGTGAAGGGATGAGTTTG
GTAATAAGTTCAATTTGTGGATTAGTGTTAGCCTTTATATTAAAAAAACTTCTTACTAGAAAAAGTATTG
GAGACATAGCTGATGTAATGCCTGCTGAAATTAGTTTTGTGGACGAATCTATACTAAAGGTGGGAGATTT
AAAAGGTATAACAAATATAGGTCTAAAAAGTGATAGAGAAGTATATATTAATAGAGGTGTAGGAATACAA
ATAATTCCTAAAAATAAGGATTATGCTAATGCAGGAATATTATTTGACTCCGGTCAAAGACAAGCAATAG
TATACAATATATATTCAAGGTTAGGTTTATATGGAGATTATGGAGAACCTTCATTCGTACCATTACCTAG
AAGAAATAAAGAGGATGAAAGTATAATGATTGCTTATTTACCAGTAGATAAGAATATGGAAAAAGTAATG
GAAGCTGTAAAGTCATGCCCAATACTTTCAAGCTCTAAAGGAAAAAACTTATCACTAAAAAATTATAAAA
TAGGAAAGAAAGGAAGTGCATAA
>ref|NC_013316.1|:c2961654-2960722 hypothetical protein CDR20291_2524 [Clostridium difficile R20291]
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TATGTAGAGGATTAGTTTTAAGAGTTACAGACAAACAATACCCATCAAGACCACAAGATTATTTAGAACA
GATAATTATATCTGGGCTTTCAGCTTCGTTAGGTGCTATAGCATTACCTGCACTTATAGATAAGGAGTTT
GCAGCCTTGACATTTTTTGCAGTAGCAATACAACAGTTTCAAGGTCTTGCGGAACAAGAAAGAATAACAC
TAAAGAATATTGATAATGAAGAATTAGTACCAAAAGGAGATGCTTATGTTGAAGAAATAGCATCTACGTA
TGAATCTAGAAGTTATATAAGTCTTTTTTCTGCACTAGTATCTTCGATAGTTTATATCGTTTTTGCAAGA
AAGTATGACCTTAGCTTTTTTCATTGCACAATTTTAGCTATTGTGTCAGGAGCTATTGTTGGCTTGATTT
TTAGAAGATTTTTAAGAAGAAACAGTATAGCAGATATAGCAGATATAGTTCCTGCAAAAATAAGTTTTGA
AGGACCTATTTTAATGGTAAATGATGTAATAATAACTAATATAGGTCTAGAAAGTACAAGAGAAAAGTAT
AGAAATGAATGTCTGGCCATAGAAGTTATACCAAGAGATTTAGGTGCATTTGGAATAGTAAATGATATAG
GGCAAAGACAAGCTATAATACATAATCTATTTATTCATATGGGGATAGATAGAGATGTAGATGAGGTTGA
TATTGTTGCTATATCTAAGACCAATTTAGAAAAAAGTACTGTGGTTATACCATATATGCCAATACTCAAA
GATATAGATGTCATGATAGATGTAGTGAAAAGTACACCTATCATAGAAACATCAAAAGGAAAGCAGAGTG
ATTTTTCTAGAAAGACTTTGTAG
>ref|NC_013316.1|:c2962998-2961709 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
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GATATACAATAACATTAAGGAAATATTTAAAAGAGTTTATATACGTCTCAAAAAAAGTAAGTAATAATGA
ATATCATGCTAGGCTTAACATATCAGCCAAAGGAGAACTTGGTGAATTAGCTAGAAATTTTAATCATATG
ATAAAGAATATGGATAAAACCTTAGAAGAAGTACAGTATAAACATTTACAGTTAAGATCTATATTAAAGA
GTATATCTCATGGAATTTTGGCTATAGATGTAAATGGAAATATACTTCTGATAAATGATGAAGCAAAAGA
AATGATAAAGAGTGAACCAAATCAATTAGTTGAAGGTCATAATATTAATGTTGTAATAAAAGAAGAAGAA
ATATTAAAACAAATACTTCAATTTATTGGTTCTAAAGATAATGAAACTGCTAATATTACTACTAAAGATG
ATATCGTATATAAGATAAAGGTAGACCCAGTTTATCTTCAGAATACTAACAACGTAATAATAGGTTCGAT
AGTAAATATAGAAGATATTACTAAAAAAGTTAAACTTGAAAATATGAGAAGTGATTTTGTTGCAAATGTA
AGTCATGAACTTAAAACACCACTTACATCTATAAGTGGGTTTGTTGAAACACTAAAGTCAAATGAAAATA
TAGATGTGAATACTAGAAATAGATTCTTAGAAATAATAGAAAGCGAATCAGATAGATTAAAAAGGTTGAT
TGATGATATATTGCTGTTATCATTTGTAGAAAATAAAGATACTCTTCTTATGGAAAATGTTGTAGTATAT
GATGTATTTAAAGAGGTATATGAAATAACTCAACATTCAGCTAGTGAAAAAAATATAGAAGTTTTATATA
AATGTGATGATAAATCAATAAGTATACTATCCAATAAAGACTATATAAAGCAAGTGTTCTTAAACCTAGT
TGATAATGCTATAAAGTATACCCAAGATAATGGGATTGTACAAGTTGTAGTGTTAAAAGATGAAGAAAAA
ATCGTAATTAAAGTTATAGACAATGGTGTAGGGATACCAAAAGAAGATGTAGAACGAATATTTGAACGAT
TTTATAGGGTAGATAAAGCAAGAAGTAGGGATGTAGGAGGAACGGGTTTAGGATTGGCTATAACAAAGCA
TATAGTCAAATCACTAAATGGATGTATAAAAGTAAAAAGTGAACTTGGCATTGGTAGCGAATTTATAGTT
ACAATATTACAAAAAAATTTCCTTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2963719-2963027 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAATACTAAAGTGCTTGTTATAGACGATGAAATGCATATAGTTGAGCTATTAAAATTCAATTTGGAGG
TGTCAAATTACGAAGTTAGTTATTCATATGATGGATTTGACGGATTTATAAAGGCTAAGGAAATTAAACC
AGATTTAATACTTTTAGATTGGATGTTACCAAATATAAGTGGAATAGAAGTTTTGAGAAAAATAAGAAGT
GATAAGGACTTAAAAAATATTCCTGTTATAATGCTTACTGCTAAAAATATGGAAAATGACAAGGTTGAAG
GGCTTGAAATAGGTGCTGATGACTATATAACTAAGCCATTTAGTATAAAAGAGTTGTTAGCTAGGATTAG
TTCTGTTTTAAGGAGATATAATTTGACTAGCTTAGGTGAAGAAAACAATATACTTACTACAGGCAATTTA
AAACTAGATTTATCAAAACATGAAGTTACCAAAGGCTCTGAAAAGATAGAGTTAACTCTTAAGGAATTTG
AATTGTTAAAATTATTAATTCAAAATAAAGGAAAAGTACTTTCAAGAAATTATCTTTTGGATAAAATATG
GGGGTATGAATACTATGGAGAAACTAGAACAGTAGATGTTCATATAAGATATTTAAGAAAAAAAATAGAA
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>ref|NC_013316.1|:c2964492-2963734 hypothetical protein CDR20291_2527 [Clostridium difficile R20291]
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AAGAACTTGATGAAAAATTAAATTCTGTAAATCTAGTTATAACATGTAAGAATATAGATGCAAAAAATAG
AGAAGATATGTTAAAAGTATGTAAAGAATGTGATTTGACATTTGAAAATATAACTAGTAATTCTCAAATA
CATTCAGATATAGTTAATATAGTCAATAAAGATACTATAGGGAAAAGAAGAGATGGAGATGCACTTATAA
CAAACTTGGAAAAAGTACCACTTTTACTGTTTACAGCAGACTGTGTACCTATATCAATTATAGATGCTAA
AAATAAAGCCATAGGACTGGCTCATGCAGGTTGGAGAGGGACTTTTAGTAATATAGGTCATAAAACAATA
AAATTAATGTCTGAATGCTATAAAACAGTTCCTGAAGATTTAGTATGTATAATTGGGCCATCAATTGGAC
CATGTTGCTATGAAGTGTCTGAAGATTTAGTAGAAAAATTTAACACAATTCTTACAAATAATGATGAAAA
GTTCTATATAATAAAAGAGGGAAGTTACTATTTAGATTTATGGAAAATTAATGAGTATATGCTTAGATGT
AGTGGAGTTAAAAAAGAAAATATAATAAATTTAAATTTATGCACTAGTTGTAGAGCAGATAAATTCCACT
CTTATAGAAAACATAATAAGGCATCAGAACGAATAGGAACGGTACTACAGATAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2964953-2964492 putative ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGCAATGTCCTTATTGTAATTATAAAGAATCAAAGGTAATAGATTCTAGACATACAGATTTAAAATCTA
TCAGAAGAAGACGTGAGTGTGAATCATGTAAAAAGAGGTTTACTACGTATGAGAAAATAGAAACAACTCC
TTTAATGGTCATTAAAAAGGATAATAGTAGAGAATATTTTGATAGAGAAAAGATAAAATATGGATTGCTA
AAAGCATGTGAAAAAAGACCTGTTTCTATTGAAGAGATTGAAAGTATTGTTGTACATATTGAAAATGAAA
TAAATAAATGTTTTATAGAAGAAATTGAAACCAAAAAAATCGGTGAGATGGTAATGGATAAATTGAAAGA
GTTAGATGAGGTTGCCTATGTAAGATTTGCTTCTGTGTATAGACAATTTAAAGATATAAATACTTTTGTA
AATGAACTTAAAAGTATACTGATAGAAAAAGGAGACAAATGA
>ref|NC_013316.1|:c2965238-2964975 hypothetical protein CDR20291_2529 [Clostridium difficile R20291]
ATGATTAGAGTTTCTGATATAATGGAAAAAGAAATTATAAATGTAAAAAATGGAAAAAGGATGGGGTTTA
TAATAGACATAGACATGGATATTCACGAAGGTAAGGTAGTCTCATTTACCATTTTTGGAGATGGAAGTAG
AAGTTTTTTTTCAAGAGGAGGGGATGAAGAAGTTATATTTTGGAATGATATACTTAAAATAGGTTGTGAT
ACAATAATAGTAAATATAGGTTCAGAATTAAGCTTAGATGAGTTTGAGATATAG
>ref|NC_013316.1|:c2966115-2965342 RNA polymerase sigma-G factor [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAGTTAATAAGGTTGAAATATGTGGTGTTAATACATCAGAACTTCCAGTTCTTAAAAATAAGCAAA
TGAAGGAACTTTTATTACAAATAAAAAATGGTGATGAAGAAGCCAGACAACAGTTTGTAAGAGGAAATTT
AAGATTAGTCTTGAGTGTAATAAAAAAGTTTAACAACAGAGGAGAAAATATAGACGATTTATTTCAAATA
GGTTGTATTGGTCTTATAAAAGCTATAGATAACTTTGATTTAAGCCAAAATGTAAGGTTTTCAACTTATG
CTGTTCCTATGATTATAGGAGAAATTAGAAGATATCTAAGAGACAATAACCCAATTAGAGTAAGTAGGTC
ATTAAAAGATATAGCATATAAGGCACTACAAGTTAGAGAAAGATTAATTAGAACAAATTCTAAAGAACCT
ACAGTATCAGAAATAGCAAAGGAATTAGAATTAGAAGTAGAATCAGTTGTAATGGCACTTGATGCCATAC
AAGACCCAATATCTCTGTTTGACCCAGTATATCAAGACAATGGAGATGCAATATTTGTTATGGATCAGGT
TCAAGATAAAAAAGATACTGATGAAAATTGGTTGCAAGAAATATCACTTAAAGAAGCTATTAAGAAATTA
AATAGTAGAGAAAAGTTGGTATTAGATTTAAGGTTTTACAAAGGAAGAACTCAGATAGAAGTTGCTGATG
AAATCGGTATATCTCAAGCACAAGTATCAAGAATTGAAAAAAATGCTTTAAAAAATATGAGAAAATATGT
ATAA
>ref|NC_013316.1|:c2966929-2966207 RNA polymerase sigma-E factor [Clostridium difficile R20291]
ATGTTACGATTGAAAGAAAGAATAATAAGCTTTATTACTATGTTAGGTATTAAATTAAAAATAATAAAGC
CAAAGGGAATATACTATATGGGAGGGGCAAATATACTTCCTCCTCCATTGAAACCAGAAGAAGAAATGGA
GCTTTTACAAAAGCTAGAAACAGATGAAAGTGTAAAGTCAATTTTAATAGAAAGAAATCTTAGATTAGTA
GTCTACATATCGAGAAAATTTGAAAATACAGGTATAGATGTAGAAGATTTGATTTCAATAGGAACTATAG
GTTTGATAAAAGCAGTTAATACTTTTAAACTGAATAAAAATATAAAATTGGCAACTTATGCTTCGAGATG
TATAGAAAATGAAATATTAATGTACTTAAGAAAAAATAATAAAAAGAAAACAGAAGTATCATTTGATGAA
CCTTTAAATATAGATTTAGATGGAAATGAACTTTTATTATCTGATGTATTGGGTACAGAAAATGATGAAA
TATACAAAATAATTGAAGAAGAAATAGATAGAGATTTGTTGGTTATGGCACTTGACAGATTAAGTGACAG
AGAAAAGCAAATTATGGAATTAAGATTTGGTCTTATTGATAAAGGTATTGAAAAAACACAAAAAGAAGTT
GCTGGAATGCTTGGAATATCACAGTCCTACATATCTAGACTTGAAAAGAAAATAATCTCAAGGTTGCAAA
AAGAAATGAAAAAATTTGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2967826-2966954 sporulation sigma-E factor processing peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAAAGGTTTTAAGGGGGGATACATGGTGTATATTGAGTACTATGTTATAGAAAACCTAGTAATAA
ATTATATTATTATAAGTTGTACTTCTATTCTTACTAAAAGATATAATCCTAAAAAAAATAAGTTATTGGG
GGCTAGTTTAGGAAGTGCCTATTCTGTTGCTTATTTGTATCCATCAATGAATATACTATTTACTGTACCA
TTTAAAATAATAATCATGAGCATAATAACTTTAATTTCATTTAGAAGCAAGAGCAAAAAAGATTATGTTC
ATGTAGCGTTAGTTTTTTATCTAGTAAACATTTTTATTTCTGGAAGCACTTATTTTATAATTTATTTTAC
AGGAATAAGTCACTTAAAAATATCTTTCTTAATTGCATGTACTTATGTGAGTTGTGAATTATTAAAATAC
ATTTATAAAGATTTGAAAATGCTTAAGTACATTAAGGAGCTTACAAAGACTATAAATATAAACTTACTAG
AAAAAAGTTTTTGCTGTAAAGCTTTAGTAGATAGTGGTAATTTGTTAAAAGACCCAATAAGTCAAAGTGA
TGTAATAATAGTTAAGTCTAGTGTGTTAGAAGGATTTATTCCAGAAAAACTATTAAATATTAATTATGAA
GATATAGATATGAAGAAAGCACAAGAAATTATAGGAAGTTTAGATGATAAAACTTCAGGTAGAGTTAGAA
TAATACCTTATAAACATGCTGGAAGTAATAAGACAAGCATAATAATAGGCTTAAAAGCTGACTATATAGA
AGTAGATGAGCAAAAGATAGGAAATATAATACTTGGTATTTCAAATTTTAATGATAGAGAATATGGAGCA
ATAATGAATCCAAATATATTGCCTGGATTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2969391-2968117 putative extracellular solute-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATTAAACTAAAAAAGGTTCTTTCTTTAGTTATGGTAGGGATTCTATCAGTATCAATTCTTGCAGGAT
GTTCAAAAAAAGAAGATTCTAAAGGCAAAGAGGGTAAAGAAAAATTAGTTGTATGGTCTGCACCATTAAC
AGACCATGATGCAGATGCATGGAAGCCGATATTTGAAAAATTTGAAAAAGAAAATAACTGTGAAATTGAA
TTTCAGATAGTACCATGGGATAACTACGCAGAAAAATATGCAACAGCAATAAGTGCAGGTGAAGGTCCAG
ATATAGGATACATGTATGCAGAGATGTTCCCTCAATTTATAGAAATGGGTGCAGTAGAAGATTTAACACC
TTATTTAGAAAAATCAGGAACTTCAGATAATTATCTATACTTAGATGATGCAAAAATGATGGGTGGTATT
TATGGTTTACCTATAGAAGCTGCTAATCCAGGCGTATTGTACTACAATAAAGATATACTAGAAAAATTAG
GAGAAAAACCTCCAAAAACATGGGATGATTTTAAAAGAATCTGTGAAAAAGCAACAAAAGATACTGATGG
AGATGGAAAAATCGACCAGTGGGGTCTTGCACAAGGTTGGGGTTCTAAAGTATTTGGAAGCTTAAACTGG
AACTGGTATCCGTATTTATGGCAAGCTGGTGGAGATATATATAATGATGATTTAAAATCAGTTAAATTTA
ATAATGCAGAAGGCTTGAAAGCTGCAAACTTTATAAATGATATGAAAAAGTATATTCCAGAAGATGCTTT
ATCAAAAGATAGTAATGAAATGATTGAAAGTGTATTTGGACCAGGAAAAGCTGCATTTACTATAATGCTA
TCCTCTGCTGCTACAAGTACATTTGATAAATCATTCCCGGATTTAAACTGGGGATATGTAACATCATTAG
AAGATAAGACAGTTGGAAGTTTTGCTTCAGTAGATGATTTAACATTAATGTCAGCATGTAAAAATAAAGA
ACTTGGATTTAAACTTCTTGAGTATATGTTAAGCAAAGAATCAATGGAAGCTTTCCACAAAGAAATACCT
AGAGCTCCAGTTGCTAAAGGTGAAAAATACCAAGGAGACCCAAGATTTGAAGAAATGGTGACAAGAGATA
AACATATGTATAGACCATTGACAGTTGGACCTCATGGAGTAGAGATATATGAATATTTATGGAAACAACT
TCAAATGATGATAGCTGGAGACATAACTCCAGAACAAGCACTAAATGAATCTGCAAAATATGCAAATGGA
TTACTAGCACAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2970835-2969675 cell division protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATGCTAAACTTTGACGTAGAATTAGAAGAATGTGCACAAATTAAAGTAATAGGTGTAGGTGGCGGTG
GAAACAATGCTGTCAATAGAATGGTAGAAGCTCAACTAAAAGGCGTTGAATTTATATCAGTAAATACAGA
TAAACAAGCTTTATATACATCAAAAGCTGAATATAAAGTTCAAATAGGAGAAAAATTAACTAGAGGACTT
GGAGCAGGAGCAAATCCAGAAGTAGGGAAAAGAGCTGCTGAGGAGAGTAAAGATGAAATAGTAAAGTTAC
TTCAAGGAGCTGATATGGTCTTTGTAACAGCCGGAATGGGCGGTGGTACTGGTACAGGAGCTGCTCCAGT
GGTTGCAGGCTTGGCAAAAGAAATGGGGATACTTACAGTAGGTGTAGTTACCAAACCTTTTGCATTTGAA
GGTAAGATAAGAATGAAGAACGCTGAAGGTGGAATAGCAGAACTTAAATCAAAAGTAGATACTCTTATAA
CGATACCAAATGATAGACTTTTACAGATAGTACAAAAAAATACATCAATGTTAGATGCTTTTGCAGTTGC
AGATGATGTATTAAAACAAGGTATACAATCAATTTCAGACCTTATAGCAGTTGAAGGGTTAATAAACTTG
GACTTTGCAGATGTTACTACTATAATGAAAGACAAGGGACTTGCTCATATGGGTATAGGTAGTGCTAGTG
GTGAAACTAGAGCAATTGATGCTGCAAGACAAGCTATTCAATCTCCACTTCTAGAAACATCAATACAAGG
AGCTAAAGGAGTACTTCTTAATGTTACAGGTGGTCCTAACTTAGGATTATTTGAAGTTAATGAGGCATCA
ACTTTAGTTATGGAATCCTGTGACCCAGAAGCAAATGTTATATTTGGAGCTTCTATAAAAGAAGATTTAG
GTGATGAAATAATGATTACAGTAATCGCAACAGGATTTGAAGGATTACAAAATGGTGCCTTAGATTTAGA
TACTAAACCTAAATCAAGCATACGTTCTTCATTAAATACAACAGTAAAACAAGCTGTAAAAGAAATTGAA
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AGAGCATGGAGATACCTACATTCCTAAGAAGAAGAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2971375-2971022 hypothetical protein CDR20291_2535 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTGTGGGTTTTAGGAGGATTAGCATTTGGTGTAGTAGTAGGTTACTATATTCCATTTACATATTCTA
TGGATTATTCCATATATATGTCAGTAGCTATTCTTGCAATAATGGATTCTATTTTTGGAGCGATAAAATC
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TTATTGACTTATATAGGAGAAAAGTTAGGAGTTTCTCTTTACTATGTTGCTGTACTAGTTTTTGGTATGA
GATTGTTTAATAACTTATCTATAATTAGACGATATATTATTAGTAATATTATGAACAAAAAACGTAAAAA
TTAA
>ref|NC_013316.1|:c2972148-2971474 hypothetical protein CDR20291_2536 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGAAAATAGTTATATTAGGAGCATTCATATTAGGCATTTTCATATCAACTTATATAAAATCAC
TAGACCCAAATAGAGTATACATAACATTAGGTCAAACTGAAAGTATTGAAAGTGAGGTAGAAAATACAAA
AAAAGAAATAAAAAATTTAAAAGAAACTCTTAAAAACAACAAAAAAACTTTGAATGAATATAAAGAAGCA
AAAAAGAATGGAAATGAATCTATCCAAACACTTATGCAAAAAGAGCTTGAAGAAGTTAAAGAATTAAGTG
GTTATTCAACTGTTACAGGGCCAGGCATAACTATTACTATGAGGGATAGTGAGAGAGAGTTAAAAGACGG
ACAGAATCCAAATGATTTGATTATACATGATATAGATATTTTGAGAGTTTTAAATGATTTAAAAAAGGCT
GGAGCAAGAGCAATTTCTATAAATGGGGAAAGAGTACTAGCAACAAGTAAGATAAAATGTTCAGGAGCTA
CTATTACAGTAAATGATACTACATATGGACAACCATTTATAATAAAAGCTATAGGAGATATAGATTTATT
GAGTGCAGCTATAAACTCTCCAGAATCATATGCTAAATCTCTTAAGGATATATATGGAATTAATATAAAA
GTTCAGGAAAATAATGGGAATAAAGTGAATTTATTTGCAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2972851-2972153 hypothetical protein CDR20291_2537 [Clostridium difficile R20291]
TTGAAAAAAAGATTTATAAATAAAAGTATAATCATAGGAAGTGTTGTATTGGGTGTTCTTGTTAGTTTAC
AACTTAAAATTATTAATATAGAAAATAGAGGGATGACAACTTTTAAAAGAGGAGAGCAACTTACAGAAGA
ACTTAAATCTTTAAAAACAGAAAAAGAGAATCTACAATCAGAAGTTAATAGTGTGAAGAAAGATATAGAG
ACTTATAGAGGCAAAAACAATAAAGGAGAACAAGACATACTTAAGTCAGAAATAGAAAAATATGAAACAT
TAGCTGGATATACAGATGTTGAAGGAACAGGCATAAAAATTGAGATAAATTCTACAAAAGACTTAGGAAA
CTCTGATAAAAATGATAGTATACTATATAATTATGATTTATTATTGTCAATGATAAATAAATTAAATTCA
GCACAAGCAAGTGCCATATCTATAAACGACCAGAGAATAGTTTTTAATACATATATGTATTTAAAAGAAG
ACAAGCTTTGTATGAATGACACTGTCATAAAAGAACCAATTATAATAAAAGCAATTGGTGATTCTGATAC
ATTGGCTTCGGCACTTAATATAAAGTATGGTATTGTCTGGGAAATAGAAACATATTATAATGCCAAAGTA
AAAGTGACCAAAGAAGACAATATAGAAATAAATGGTCATAGTGATATAAACAAAGCAGAGGGGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2973578-2972874 putative cell division protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGTTTTAGTTTTTATACTTATGTTATCTTTTTGTATATGTATAATTGTAAAAAGTGATTTATTTG
ATGTAAAGAAAATAGATGTAATTGGAAATAAGAGGGTGACCAAATCAAATATAATGAAAGAACTAAATAT
AAATCTAAATGAAAATATTTTTGCATACAATTTTAAAGATATGAAAAATAAACTTATAAAAAATCCATAT
ATAGAAAATGTGGAAATAAAAAGAAAACTTCCCAATAAGATAATTATAAGTTTAAAAGAAAAAGAAATAT
TTGCAGTATTAAAAGATGAAGATAATTATTGTTATATAGATAAAAAAGGAAATTTATTGGAAGAACTAAG
AGGTTCTAATGAAAGTAAAAAAGACTTGATAGTAGATGTAGATTATAGCGTTGATGATAATAAATCTATA
AAATTTAAAAATTATAAAACTAAGGAGAATGTATTTAAAACTTTAAATTATTTAAAAGAAGAAGGAATTT
ATAGAAAAATAAATTATGTAAACTTAAAAAAAGAAAGCAATATAGAAATGCTTACAAGAAGTAATATAAA
AATCTTACTTTCTAATGATGATAACTTAGATTATAATATATCTAGGGTAAGTAAAATTCTGATTGACCTG
CAAAATAAAAATACTAATGGAGGGACTATAAATCTTAACTATGGAAAGTTGGCAGTGTATAGTCCAGAAG
GATAG
>ref|NC_013316.1|:c2975110-2973884 UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl-(penta peptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTTTTATTATCAGGCGGTGGAACTGGAGGGCACGTGTATCCAGCTATAGCTATTGCAAACAAAA
TAAGAGATGAGCATCCAGACGCTGAGATAATTTTTGTTGGGACGGAAAAGGGAATAGAGTCAGAAATAGT
TCCTAAGTATGGATTTGAATTAAAGACTGTAACAGTTCAAGGTTTTAAGCGAAAAATAGATTTCGATAAT
GTAAAAAGAGTTTTTAAGCTTTTTAAAGGTTTGGAGCAATCAAGAAAGATTGTTAAGAAATTTAAACCAG
ATATAGTTATAGGAACTGGTGGATATGTTAGTGGACCTGTTTTATTTAATGCATCTATGGGGAAAATACC
AGCCATAATACATGAGCAAAATTCTTTTCCTGGTGTAACTAATAAGATTTTATCTAAAACAGTTACAAAG
GTACTTACAAGTTTTGAAGATTCGCATAAAAGATTTCCAGAGGCAGCAGAAGATAAATTAGTTTTTACAG
GAAATCCAGTTAGAAAAGAAATTTTATTATCAAGAAAAAATATTGCAAGAAAGAATCTATCAATAAGTGA
CGAAAAAAGAATGGTACTTTGCTATGGTGGTAGTGGAGGTTCAAGAAAAATAAATGATGCAATGAGACTT
GTAATAAAGAATATGGTAAATGAAGATATAGCTTTTATATTTGCTACAGGCAAAAGCTATTATGATGAAT
TTATGGGAAGTATTAGCGATATAAATCTTAAACCATACCAAAAAGTTGTGCCTTACTTAGAAGATATGGC
AAATGCACTTGCAGCAAGTGATTTGGTTATAGGTAGCGCAGGAGCAATTTCATTAGCTGAGATAACGGCT
CTTGGAAAGCCATCTATAATAATACCTAAAGCTTATACTGCTGAAAATCATCAAGAGTATAATGCCAAGA
GTATAGAAAAACAAGGGGCAGGAATTGCTATTTTAGAAAAAAATCTAACTCCAGAGAGCCTAAATACAGC
AGTATTTAAACTTTTAGGAGATAGAGAACTTTTAGTTGATATGGCAAATGCAAGTAAAACTATAGGTAAG
CCTGAAGCCATAGACCTTATATATGATGAGATAATGAAAGTATACAATTCAACACAAAAGTCAACTTCTA
AAAAAACAAAAAAGGAAAAAGTTATTAAGGAAGTAAAAGAAATAAAAAAAGAAACGACTCCAAGTATAGA
AGGTCAAGCTAAGGTAATAGGAATAAAGAAAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c2976258-2975128 cell division/stage V sporulation protein [Clostridium difficile R20291]
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ACACTACTATGCTTTTAGTATTTGTAGGAATAGTTATGGTGTTTAGTGCAAGTTTTATACAATCTTCATT
TAAACACAATGATGCGTACTATTTTCTAAAAAAGAATGTAATATATGCTGTACTTGGATTTATAGTTATG
ATTATTACATCAAGAATAGATTATAGTTTTTGGAAGAAAAATGCTACAGCAATTGGAGCTATAGCAGTAG
TATTATTATTGTTAGTTTTGACCCCTTTAGGGATAGAAGCAAACGGAGCAAAAAGATGGTTGGGAATAGG
AGCTTTAACATTTCAACCTGCAGAAATCGCAAAGTTTGCTACAATAATATTAACTGCAAAATTAATTGAA
AAAAATTATGATAAAATAAAATCTTTGACAAAAGGTGTTGTACCACTTCTCGTAGTTCCAGGGATATTTT
TTGCGTTGATAATACTTCAGCCAAATTTGTCAACAGCAGGTACTGTAATTCTAGTTACTTTTGTAATGAT
ATTTGTTGCTGGAATGGATATGAAAATTGTATTTGCTATGATAGGGAGTGGGGCTGCTTTATTTGCTGCA
TTAGTAATTGCTGAACCCTATAGACTTAGTCGTGTTACATCATTTTTAGATCCTTTTCAAGACCCTCTTG
GTAAGGGGTATCAGGTAATACAAGGTCTATATGCACTAGGTTCAGGTGGATTGTTTGGTCTAGGCTTAGG
AAAGAGTAAACAAAAGTATTTTTATATACCAGAGCCACAAAATGACTTTATATTTGCTATAATAGGAGAA
GAGTTAGGATTGATTGGTTGTATAATAGTTATTATGCTATTTGTAGTTTTAGTCTACAGATGTGTAAGAA
TAGCTTTGAAGACTTCTAATGTATTTGCTTGTATGGTTGTTATAGGTATAGGTGCACAAATTGGAATACA
AGCAGCTTTAAATATAGCAGTTGCGACATCATCAATGCCAGCTACAGGTGTAGCACTACCATTTATAAGT
TATGGAGGAACTTCACTCACCATCTTTATGGGAGCTGTAGGAATAGTGTTAAACATCTCAAAGCATGTCA
AAATTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2977665-2976310 UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase [Clostridium difficile R20291]
ATGGACTTAAAAGGAAAAAAAGTTTTATTAGTAGGACTTGCAAAAACTGGTATATCTACAATTAAACATT
TAGATAAATTGGGTGCAAGTATAATCGTAAATGATATAAAAGATGAAAATAAATTGAGAAATATACTTGA
TGAATTGAAATCTATAAATGACATAAAATACATATTAGGACATCACCCAGAAGATGTAGATGATATAGAT
ATGGTTGTAGTGTCTCCAGGTGTACCACTAGACCTACCATTCATATTGAAATTAAAAAATTCAGGCAAGT
ATATAATTGGTGAGGTAGAATTAGCTTTTAAACTATCGAATAATCCAATTTTTATAGGGATTACAGGTAC
AAATGGAAAGACAACTACAACTAGTTTGGTAGGAGAAATTTTTTCAAGAGCAAAACGAGATACATATGTA
GTTGGTAATATAGGAAATCCTGTAATAGATACTATAGAAACTTCAAGTGAAGAGTCTGTGTTAGTAACTG
AACTAAGCAGTTTTCAGCTTGAGAGTATAGATGAATTTAGACCTAAAGTAAGCGCAATATTAAATATTAC
AGAGGACCACTTAAATAGACACCATACTATGGAAAAATACATAGAAGCAAAGGCAAATATATTTATGAAC
CAAACTGTTGAGGATTTCTGTGTGTTAAACTATGATGATGAGGTAGTAAAATCTTTAGCTGATAAATGCA
ATGCCAAAGTAATTTACTTTTCAAGAACTAAAAAAGTAAATGGAGGAGTATATTTAGAAAATAATGACAT
AATAATAGATATAGATGATAAAATCAAATTTCTAAATAAAGATGATGTAAGTTTACCTGGAGGTCATAAC
TTAGAAAATTGTATGGCAGCTATAGCAATAGCATATGTCTGCAAAATTGATTTAGAAGTTACAAAGGATG
TACTTATGACATTTAAAGGAGTGGAACACAGACAAGAGTTTGTAAGAAATTTAGACAATGTAATATATGT
AAATGATTCAAAGGGAACTAATCCAGATTCCACTATAAAAGCTATACAGTCTTATGATAGACCTATAATA
CTTATAGCAGGGGGGATGGATAAGGGAAGTAATTTTGATGAACTTCTTGAAACTGCAAAGTCATATGTTA
AATCATTGGTCTTATTAGGAGAAACTGCATCAAATATAGAAAATTGTGCTAAAAATAAAGGATTTAATGA
CATACATATAGTAAAAGATATGGAAGAAGCAGTTAAGACTTCTTATGAAATTTCAAAAAGTGGAGATATA
GTGCTTCTTTCACCAGCTTGTGCAAGTTGGGATATGTATGAAAGTTTTGAAGTAAGAGGAAAAGACTTCA
AAGATAATGTAAACAATTTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2978652-2977684 phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide-transfera se [Clostridium difficile R20291]
ATGATGTTAGGAATAACAGAGCTTACGTACACCGCATTGATTGCGTTTTTAATAGTAATTATAATAGGAC
CAATATTTATACCAATGCTTAGAAAATTTAAATTTGGTCAGACAGTTAGAGATGATGGACCCCAAACACA
TCTAGCTAAAAACGGAACACCTACTATGGGTGGAATTATAATGATTGTTGCAATTCTAATAACTGGACTT
ACAAGAGTAAAAGTTAGTCATGATATGGCAGTAGGTCTTATATGTATTGCAGGTTTTGGTTTTATTGGCT
TTTTAGATGATTTTATAAAAATAAAGCTAAAAAGATCACTTGGACTAAAAGCATATCAAAAAATAATCCT
TCAAGTTGCATTATCTTTTTATGTTGCTTTTTATCAGTATACATCATCATCAAGTGCTTCACAACTTATG
ATACCATTTACAGATTTTGTGATAAATGTTGGAATATTATATATACCAATAATGATGTTTATAATCGTAG
CAATAGTAAATGCTGTAAACTTGACTGATGGATTAGATGGATTAGCATCAGGAGTAACATTAATAGTTTC
TGTATTCTTTATGCTATTTGCAAGTTCTATTGCTGGAAATACAGAAGTCGCAGTTTTAGCAGCAGCAACT
GTTGGAGCATGTTTAGGTTTCTTAGGATTTAATTCATATCCGGCTAGAGTGTTTATGGGCGACACAGGTT
CAATGGCATTAGGAGGTGCAGTTGTAGCATTTTCAGTTCTAACTAACTCAGTGCTTATAATACCTATAAT
TGGAGGAATTTATTTTGCGGAGGCTCTATCAGTTTTGATTCAAGTTGGATATTTTAAGGCAACAAGAAAG
AGATTCTTTAAGATGGCTCCAATACACCACCACTTTGAACAGTGTGGTTGGCCAGAAACAAGAGTTGTAT
TTATTTTTTGGATTATAACAGTTGTTTTAGCTTGGATAAGTATAATAGCAGTATTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c2980066-2978693 UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D-ala nine ligase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGTGCTTAACAATAAAAGAGTTAGTACTTGCAACTAATGGGAAGTTAATATATGGAGATTATAATG
ACTGTGTAAGTGATATAGTTATAGATAGCAGGGAGGCAAGTGCCCAAAATGCATTTGTAGCCATAGTTGG
AGAAAATTTAGATGGGCATACATTTATGAAGCCTGCATATGATAGTGGATGTAAAACTTTTATAAAAAAT
GAAAGTAATGGAATAAAATTAGAAAGTTCGGATATAAATTTAATAGAGGTAAAAGATACATCTTTGGCTC
TAGGAGATATTTCAAAATACTATAAAGAAAAATTTGATATTCCATTTATAGGTGTTACAGGTAGTGTGGG
AAAAACTACTACTAGAGATATGATTTACTCTGCCATATCTGCAAAGTTAAATATACTAAAAAATGAAAAA
AACTTAAATAATCATTTTGGAGTTCCATTGACTTTATTTAATCTAAATAAAGAACATGAGTGTGCTGTAA
TAGAGATGGGTATGTCTGGATTCAATGAAATAAAATATTTAGTGGATATAGTAAATCCTAAAATTGCAGT
CATATCGAATATAGGATTATCACATGTAGAAAAACTGGGTTCACAAGAGGGTATTTTGAAAGCAAAGATG
GAGATTACTTCAAACTTTGATGAAACAAATACTTTAATTGTAAATGGAGATGATAAGTTTTTATCTACAT
TAAAAGAAAAAGAACATGTATATAAGTTAAAAACATTTGGCTTTAATAAAAACAATGATATTTATTGTGA
AAGTTATACTATGGAAGAGGATAGTTTAACATTTATATGTGTAATAAATGGGAAAAAAGAGGAAATATTT
ATACCAACAATAGGAGAACATAATATATATAATGCAATGTCTGCTATATTAGTTGGTTTGTGTCTAAATA
TTTCTTTAGATTATATAAAAAAAGGTTTAAAAAATTTTAAAGGGACAAAAATGAGACTAGACATAATAAA
AAATGAAAAATTAACAATAATTAATGATTCATATAATGCTAGTCCAGATTCTATGGATGCTGCTTTAAAG
ATACTTGGAAGATATAAAGGTAGAAGGGTAGCGATACTTGGAGATATACTAGAAATGGGTGAAATTTCAG
AGTATGGTCATAGATTAGTTGGAAAATCATCTATGAATAATACTGATATTATAATAACTATAGGTGAAAA
TTCAGTGTTTATTGGAGAAGAAGCAAAACAATTAGGATTCAATTCAGCCAATATATATCACTTTGAGAAT
AGAGAAGATGTGTTTAACAAGTTAAATGAATTAGTAAAAACAGGAGACACTATTTTAGTAAAAGGCTCAA
GAGGCATGAGATTAGAAAAAATAGTCGAATATCTAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c2982212-2980233 stage V sporulation protein D (sporulation specific penicillin-binding protein) [Clostridium difficile R20291]
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TTTGCCTTGTTATTAGGACTGGGTACCTACAACTTATGAAGGGAAATTGGTTGAGTACAAAAGCACTAGA
ACAACAAACAAGAGATATACCAATAGAACCCAAAAGAGGAACTATATATGATAGAAATATGAAAGAATTA
GCAGTAAGTGTAACTAAGTATACTGTTTGGTGTAAACCTGTGGAAGTAGAAGATAAAAAAGAAGCAGCTG
AAAAGGTAGCTGAGATTTTGGATGAAGATTATAAAGATATTTACGCTTTAATAAGCAAAAAAAATATGGC
TCTTGTAAAAGTAAAAAGATGGATAGATGATGATAAGGCAAGTCAAATAAGAGATGCTAAATTAAGTGGA
ATATGGGTAGCAGAAGATAATCAAAGATATTACCCATATGGGAATTTTGCGCCATATGTGTTAGGACATA
CTTCTTCAGATGCAACAGGTATATCTGGTGTAGAAATGCAATATGATAAAAAGTTAAAAGGAAAGCCTGG
AAAACTTATAGTAAGTACTGATGCCTCAGGAAGAGAAATACCACAAGGAATGGAAAAATATTATGAGCCT
GTACAAGGTAATGGTCTTGTGTTGTCTATAGATGAAGTAATTCAACACTATACTGAAAAAGCAGTACAGA
AAGCTTATGAGTTAAATAATGCAAAAAAGGTTACTGCAATAGCTATGAACCCTAAAACAGGTGATATACT
TGCTTTAGCATCAAAACCAGATTATGACCCTAATGACTCAAGAACGCCAATATATCCATATTATCAAGAA
GAACTTGAAAAATATAATGATAAAGATAAAATAAAAGGCTATTATCAAATGTGGAGAAATCCAGCAGTAA
GTGATACATATGAACCAGGTTCTACATTTAAGCTTATTACATCTTCCAGTGCTCTTGAAGAGGGAGTAAT
TAAAGATGGAGAAAAATTCACATGTACAGGTAGTGTAACTGTTGGAGGAAGAAAGATTAAATGTTGGAGA
CATTACAGACCTCATGGAACACAAGAATTTAAACAAGCAGTACAAAACTCTTGCAACCCAGTATTTGTTG
AATTAGGAAGCAGATTAGGTGTTGGAAAAATGTATGATTATATAGAATCATTTGGCCTTATGGATAAGAC
AGGTATAGATTTACCAGGAGAAGCTAAGGGAATACTGTATAACGAAAAAAATGTAGGACCAGTTGAATTG
GCTACAATATCATTTGGTCAATCTATATCAGTAACTCCAATACAACTTATAACAGCTATATCATCAATAG
CTAATGGTGGAGATTTAATGCAACCAAGAGTGGTAAAATCTTATACTGACAATAAAGGAAATATAACTGA
AACAGTAAAACCAAAAAAAGTAAGAAGTGTTATATCTAAAGAAACATCTAAAAAAATGTTAGAAATTGCA
GAATCAGTTGTAACTGAAGGTGGAGGAAAGATAGCATATATACCAGGGTATAGACTTGGTGGTAAAACAG
GTACAGCTCAAAAAGTTATAGATGGTAAGTATGCTCCAGGAAAGTATATATGTTCATTTGTTGGAATAGC
ACCTTGTGATGACCCGCAAATAGTAGTTCTTGCTATTGTTGACGAACCAACAGGAGTAAGTGCATTTGGT
AGTACTACAGCAGGACCAATAGTGAAAGAAATAATGAATGACTCTTTAAAATATTTGGGAGTTAAACCAG
TATATAAAGAAGAAGAAAAAGCTGAGTATGAAAAGAAGCAAGTTAAAGTGCCAGATGTAAGAAATCTAAA
AATAGGAGATGCTGTAAAGGCATTGGAGGATGCGAAGTTAAAACCAGACTTAGATGCAGATATAGAACTT
CCAGAAGATACAAAGGTAAAGGATATATTCCCAAAACCTGGAGTAAAAGTTAATGAAGACTCAAGTATAA
CCCTATATTTTGAAAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c2982571-2982224 hypothetical protein CDR20291_2545 [Clostridium difficile R20291]
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GAAATAAGAAAAAAATAGGAGCTAAATGCATTTTACTGATTGCAATTTTTTCAGTAATAATATTGAATCT
ATGTGGTTATTCAAAAATCTCGGAAATGAAGTACGATATCTATTATTTACAAAAAGATTTAAGAAAAAAA
GAGATAGTATTAGAGGAACTAAAGGCAAAAGAAACTGAAAAAACATCAATAAAAGAAATTGAGCTAAAGG
CTAAGGAATTGCTCAATATGGACTATCCAAAAGATGGACAAATAAAGTATATAGATGTGGATAACTAG
>ref|NC_013316.1|:c2983992-2983057 S-adenosyl-methyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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TGTATGTTGACTGTACTATGGGAGGAGCAGGACATTCTAAAGAAATAGTAAAAAAACTGTCAGATAAGGG
ATTATTTATAGGGTTTGACCAAGATAAAAATGCTATAAGCACAGCAAAAGAGAGATTGAGTGAATATGAA
AGTAGAGTGAAGTTTGTTCACAGCAATTTTGAAAATATAAAAGAGGAATTAGAAAAAATAGGAGTTTACA
AAATTGATGGTGTATTAGCTGATTTAGGAGTTTCATCTCATCAACTTGATGAAGCTGATAGAGGATTTTC
TTATATGCAAGATGCACCACTTGATATGAGAATGGATGTTAGGTGTGAGTTTTCTGCATATGATGTTGTA
AATACTTATACAGAAGATGAATTAACTAAGATAATAAAAGATTATGGAGAAGATAACTGGGCTAAGCGTA
TAGCTAAATTTATAGTTGAAGAAAGAGCAAACAAACCAATAGAAACTACAGGAAAATTAGTAGATATAAT
TAAAAAAGCTATCCCTAAGAAAGCTAGAATAGATGGACCTCACCCAGCTAAAAGAACTTTTCAGGCAATA
CGAATAGAAGTAAATAATGAACTTGGAGTAATTACAAAGATGATAAATGATGCTTCTTCTATAATGAATA
AAGGTGGAAGAATATGTATAATAACATTCCATTCATTAGAAGATAGAATAGTGAAAAATGCATTTAAGCA
TTTAGCATCAGATTGTATATGTCCACAACATTTACCTATATGCCAATGTGATAAAGAATCTGAGGTGAAA
ATAATAACTAGAAAACCTATATTACCTAGTGAGGAAGAAATAGAAGTAAATCCACGTTCAAGAAGTGCTA
AGCTAAGAGTAGCAGAAAAAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c2984768-2984022 prolipoprotein diacylglyceryl transferase [Clostridium difficile R20291]
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TGATTTTAGGAACTTTAATAGCAATAAAAGAAGCAAAAAGAGTGGGAATTAAAGATGATGATGTATTAAA
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TACTATGCTCAAAATATGTCTCAAATTTTTAATTTTAGAGGTGGTGGACTTGCTATACATGGAGGGTTAA
TTGGTGGAATATTAGCTGGTTATATATACACTAAGATTAAAAATATTAACTTCTTAAAAATGGCTGATAC
AGTTATACTTGGAATGCCTTTAGCACAAGCTATTGGAAGATGGGGAAATTTTATTAATGGAGAAGCACAT
GGAGGTGCTACCAATTTACCTTGGGGAATAATGGTTGATGGAGTAAAGGTACATCCAACTTTTTTATATG
AGTCCATATGGGATTTTGGAATATTTATAGTTTTATTACTATTTAGAAAAAATAAAAAATATGAAGGTCA
AGTTATAGTTACTTATATAACTTTATATTCAATAGGAAGATTTTTTATAGAGGGATTAAGAACAGATAGT
TTAATGTTAGGACCACTTAGAATGGCACAAGTTATAAGTCTAATTGGAGTTATTGGTGGCATAATTGCAC
ATGTTTATTTATCAAAGAAAAATAAACATAATATTAGTGAAGAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2986466-2985165 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
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AAAATGGATTAGATGTATATTTTATGCCTAAAAGGGGTTTTATGAAAAAGTATGCTATTTTGGCTACTAA
TTATGGTTCAAATGACTTAGAATTTGTACCAATTGGAGAAGATAAGAAAATTAGAGTGAATGAAGGTATT
GCACATTTTCTAGAGCATAAGATGTTTGAGCAACCTGATGGAGGAGATGCATTTGATAAATTTTCAAAAT
TAGGAGTAAATGCAAATGCATTTACTAATTTTACAATGACAGCCTACTTATTTTCTGCTACTGAAAATTT
TTATGAGAGTTTAGAACATCTAATTGACTATGTTCAAACACCTTATTTTACAGATGAAAATGTTGAAAAG
GAAAAAGGTATAATAGCACAAGAGATAAAAATGTACAATGATGACCCTGATTGGAATGTATACTTTAATT
GCTTGAAGGCAATGTATGTAAATTATCCTGCTAGAATTGATATAGCAGGTACTGTTGATAGTATATATAA
GATAACTAAGGAAGAGCTATATAAATGTTATAATACTTTCTATAATCCAGGAAATATGGCTTTATTTGTT
GTTGGTGACTTAGATGTAGAAAAAGTTATAGATGTAACTAAAAAGTCAAACAATTACAAAGTAGACAAAC
TCTCTAAGAGTATAGAAAGATTTTATCCAGAAGAACCAGAAAGTGTAAAAGAAAAAGAGGTTATAGAAAA
ATTCCCTATATCTATGCCTATGTTCAACATAGGTTTTAAAGATAGTAATGTTGGTTTAAAAGGGAAAGAA
CTTTTACGTAAAGAGATTGTAACTGATATACTTGTAGGGATGTTATTTAAAAAAGGAAGTAAGCTCTATG
AAGATTTGTATATGCAAGGTTTAATAAATGAAAATTTTGGAGCTGGATTTTCGTCTCAAGTGGATTATGC
TTTTAGCATAATAGCTGGAGATTCTAAAGAGCCTAAAAAAGTAAAAGAAATAATTCTTGATTATATAGAA
AAATCAAAAAAAGAAGGATTATCAAAAGAAGAGTTTGAGAGAACTAAAAAGAAAAAAATAGGGTCATTTA
TTAAGTGCTTTGATTCTATAAACTTTATAGGTAATAGTTTTATATCTTATGTTTTTAAGGATATAAATCT
ATTGGATTATTTAGATGTTATTAAAGATATTACTTTTGAGGAAGTTGAAGAAAGATTAAAAGAGCATTTT
AAAGAAGAGTATTGTGTTATTTCTATTGTAGAACCTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2987731-2986466 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
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TTAAATCGAATCTTATAAGTTTATATGTTCAGAGACTATTGGATGAAAAAGAAACTACAAAAAATGCTCT
AATACCATCAATAATAGCAAGTGGAAGCGCTAAATATCCTAGTGCTAGAGCAATATCCAATAAATTAGAT
GATTTATATGGTTCATCTATGGGAGCTGATGCTGTAAAACGTGGAGAACGTCAAGTATTGAGTTTTAAAG
TAATTAACATAAGTGAAAAGTATTTAGATGAGAGTATATTTGAAGAAGTAGTAGAATTTTTTAATGAAGT
AATAAATAATACGCTTGTTGTAGATGGTGGGTTTAAAGAAGAATATTTAAATATTGAAAAAGAGAATTTA
AGAGAAAAGATACAATCAATAATAAATGATAAAAAGGAATATGCGCAAGATAAATGTATTGAGGCTATGT
GTAAAGGAGAGAGATATAGTGTAAGTGAATTTGGTTATGAAGATGAAATAGATAGTATAACTTCAAGAGA
GTTATATGAACATTATAAAAACATACTTAAAACATCACCTATAGATATAGTTGTAGAAGGTAATTTTGAT
GAAGATAAAGTTGTAGATATAATAAGTAAAAATCTAAAATTTGAAAGAGAAGAAATTATAAATATACCAA
GAGCAGATTTTATAAAAAATGTGGATGAGGTAAAAGTTATAGATGAACAAATGGAAATAACTCAAGGTAA
GTTAGTTATGGGTTATAGAGCAAATGTGGATTATGCAGACATAGATAAATATTATGCTTTAGTAGTTGGG
AGCAATGTCTTAGGTGGTGGTCCACACTCTAAATTATTTGTTAATGTAAGAGAAAAAGAAAGTTTATGTT
ACTATATATTCTCTTCAATAGAGAAGTATAAAAGTATCATGTTTATATCATCTGGTATAGAAACTAAAGA
TTATGATAAAGCTGTAGAATTGATAAAAAAACAAGTAGAAAGTGTAAAAGCAGGTGATATATCTGATGAA
GAATTAGAAAACAGTAAACTTGCTTTAGTTAATTCTATGAAATCTATAACTGATAATATAGGTGGTATGT
CTGATTTTGTTTTCTCTCAGTCTATGGCAAAGACAAATTCTGAAGTACAAGACATAATATCTAGTATAGA
AAAGGTTACAAAAAAAGATATAGTTGAAGCTATAAAAAATATAGAGCTTGATACTGTATACTTCTTGAGA
AATTAA
>ref|NC_013316.1|:2988047-2989144 putative GTP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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GTGCAGAATCTGCAAATTACCCTTTTTGTACAATAGACCCAAATGTGGGAGTTGTATCTGTTCCAGATGA
AAGATTAAACAAACTACAAGAATTATATAATTCTGAAAAAATAGTTCCTACTGCTATAGAATTTTGTGAT
ATAGCAGGTTTAGTTAGAGGTGCTTCTAAAGGAGAAGGTTTAGGAAATAAATTCTTATCACATATAAGAG
AAGTTGATGCAATAGTTCATGTTGTTAGATGTTTTGAGGATGAAAATGTTGTACATGTAGATGGCTCTGT
AGACCCACTTCGCGATATAGAAACTATAAACTTAGAATTAATTTTCTCAGATATAGAGATTCTTGAAAGA
AGAATTAATAAAACTCAAAAAGCTGCTAAGGCTGATAAAACTTTAGGTTCTGAACTTGATTTATTAAAAT
CAATAATGTCTACTTTAGAAGAAAGTAAGTGTGTAAGAACTATGGAATTTACAGAAGATGAACAAACATT
CGTAAATTCATTGGATTTACTTACATCTAAGCCTGTAATATATGCTTCAAATGTATCAGAAGATGATTTA
GCTGATAATGGAGAAAATAATAAATATGTTCAACAAGTTAAAGCATTTGCAGAAACAGAAGATGCCGAAG
TTGTTGTAGTATGTGCACAAATAGAAGCAGAAATTTCTGAACTTGATTCTGCTGAAGAAAAGAAAGAGTT
TTTAGAAACATTAGGTCTTGAACAATCAGGGCTTGATAAGCTTATAAAATCTTCTTATGCTTTACTTGGT
TTAATTTCATTCTTAACTGCTGGTCCAAAAGAAGTTAGAGCATGGACTATAAAAGTTGGAAGTAAAGCTC
CTCAGGCAGGAGGAAAAATACATTCTGATATAGAAAGAGGATTTATCAGAGCAGAAACAATAGCCTTTAA
TGATTTGGTTGAGCATGGTACTATGGCTGCTGCTAAAGAAAAAGGGTTGGTTAAATTAGAAGGTAAAGAA
TACATAGTTAAAGATGGAGATGTAATATTATTTAGATTTAATGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c2991902-2989623 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
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CAATTTCCTGTTTGATTTATGGTTCAAGGTTGAATAAGACATTAGGTGAAGAAACGAATCAATATCTTTC
AGAAATAGCAAATCAAAGCGTCAATGTGTTAAAAAAACAAATTAATGGAGATATAAAGTTACTAGAGTCA
ATTTCAATATTTATTGAGGGAGAAGAGTCTTTTGAAGTAGATAATATCCTTTCTATACTAAAAAGACAAG
CTATTAATAGTTCATTTAAAAGAATGGGAGTTATTTTACCAAATGGTACAGCATACACTACAGATGGTTA
TATAGAAGACTTCTCTAAAAGAGATTATTTCTTAAAATCAATGCAAGGAGAAGTGGTTATAACAGAAAAA
TTAAAAGATGTAATAGAAGATGATAAAAATACCAATAGTAATATTAATGTATATTCTGTGCCAATTTATA
AAGATAATGAGGTTAAAGGAGTTATATTTGCCACACATAGTACGAAGTTGTATGAAAAAATACTTTCTGT
ACCTACATTTAATGGAAAAGGATATTCTTATATAGCTAGAAGTAATGGTAATATTGTTTTAAATCCAAGC
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CTAGTATCAATAATATGAAGTCAAATATAAAAAACTTTAAATCAGGTTCATTAAGTTATAGTATGTTTGG
AAAAGGATATTATTTAAGTTATGCCCCAATAGGAATCAATGATTGGTATCTTTTTTCTGAAGTTCCTAAA
ACTGCTATATCTGAGAAATCATACGCTATTATAAAACTTACATTATCAGCATGTGTAGTGTTGATTATAA
TCTTTACGGCATTAACAATTTATATACTATTTATACATAAAAAGAGTAAGGAAAAATTGGAAGAATTTGC
TTTTAAAGATAACGTTACAGGTATTGGCAATTCAAATAAATTTAATCTTGAAGGAGGAAAATTTTTATCC
TCTCATGAGAAAAAGAATCTAGTTTTAATTTATTTTGATATAGATAAGTTTAAGCTAGTAAATGATAGGT
TTGGGTATGAAGAAGGAGATAGAGTATTAAAGGAAATAGCAGAGATAATTAAGAATATATTTAAAGAGCA
ATCTGTATTTTCAAGAATTTCAAATGACAATTTTGCTATAATATTTGAAAAGAAAAATAATAGAGAGTCA
ATTATAGAAATATGTGAACTTATACGTAAAAAATTGTCAATGATAAAAACAAGTTTGGGAGTAGAACTCA
ATTTAATTCCATCCATAGGTGTATATTTTGTTGAAGAGGGAGAAACAAATATTTCTACCTGTCTTGACAA
AGCTATGATTGCAAAAACTACAGTAAAAAGAAAATATTTAAAAGTTTATGAGATTTATGCTGAAAATTTA
AAAGAAACTCTCATAGAAGAACGTGATATTGAACAAGAAATGCATGATGCTTTAAAAAATGAACAATTTA
AAGTTTATTTACAGCCTAAGGTTGATTTATCAACTACTAAAATTGTAGGTGCTGAAGCGCTTGTACGTTG
GCAACATCCCAAAAAAGGTCTAATAAGTCCAGGTGTATTTATTCCTATTTTTGAGAAAAATGGTTTTATA
ACAGAATTGGATATGTTTGTATTTGCCCAAGTTTGTAAAAATTTTAAACGTTGGGAAAATGAAAATTTCC
CCACATTTCCTATATCAATAAACTTATCAAGAGTACATCTTGAGAATCCAGGTTTTATTTCTGAGCTTGA
AAGAATAACAAAAGAATATGAAATTGAACCAAATTTAATTGAGATTGAATTGACAGAAAGTGCAATATTT
GACAATACAAAAATATTATTTAAAATAATGCAAACTTTGAAATCTGTTGGATTTAAAATTTCTATGGATG
ATTTTGGTTCTGGTTATTCTTCTTTAAATATGCTTAAAGATATGCCAATTGATGTATTGAAATTAGATAG
GCAATTCTTTATAACAGTGGGAAATGCAAAAAAGAGTCAAATTGTAGTTTCAAGTATTGTTCAAATGGCA
AAGCAACTTGATATAAAAGTTGTTTCAGAAGGTGTTGAAACTGTAGAGCAAGCAGAGTTTTTAAGGTTTA
TAGGTTGTGATATGGCCCAAGGATTTTTATTTGCTAGACCAATGCCAATAGAAGAATATGAAAAATTAAT
ATTAGATAGATATAGTTTAAATAGAAAAGAAACAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c2993627-2992173 putative UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2,6-diaminopimela te ligase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTAAATGATATTATACAGGGGTTGGATATAATCAATGTCAAGGGTGAATTAAATATAGATATTA
ATAATGTACAATATAATTCAAGAAAGGTTACAAAAGGTACATTATTTATATGTATAAAAGGATTTGTGTC
AGATGGTCATAAGTATATAAAAGATGCCATAGAAAAGGGAGCAAGTGCATTTCTTGTTGAAGAAGATGTA
GAAATAAAAGGATGTACATTTATAAAGGTAAAAGATACAAGAAAAGATATGGCAAAAGTAGCTGATAATT
TTTATAATCATCCATCTCAGAAATTTAACGTTATAGGAGTTACAGGTACTAATGGAAAAACTAGTATAAC
TACTATACTAAATGAGATATTAACTTTAAATAAGAATAAAGTTGGACTTATAGGAACTATAAAAATTTTT
GACGGAGAAAAAGACATTGTTTCCAATTCAACAACTCCAGAAAGTATAGATTTACAATATCATTTTAATA
ATATGTTGGATAATGGATGTGACTACTGTGCGATGGAAGTTTCATCACATTCATTGGCATTAAATAGAGT
TGATGAAACAGACTTTAAACTAGGCATATTTACAAATTTAACACCAGACCATTTAGATTTTCATAAAGAT
TTAGAGGATTATAGAAAAGCAAAAGAAAAATTATTTTTTAAGACTACTATGGCAAATATAATAAACATAG
ATGATGAAGGTGGAAAAAAGATATATGAAAATATAAAAGGTATAAATGTACCTTGTTACACTTATGGTGT
TGATACTAAGGCTGATTTTATGGCTAGAGATATAAAATCAGATTCGGATGGAGTATCTTATAGATTAATA
ACACCTTCATATGAAGAAGTAATATTTATACCAGTTCCAGGAATGTTTACAGTATATAATACTTTAGCAG
TTATAGCTGCTTGCTATGTACTTGGCATACCTAAACCAATATATAAAGAAGGTCTTAGACTTTCTAATGG
AGTATCAGGAAGGTTTGAAACAGTTCCAAATGATAAAGGTATAAGTGTAATTGTAGACTATGCTCATACT
CCTGATGCACTTGAAAATGTACTAAAGACAACTCAACAATTTGCAGAAGGAAAAATAATTTCTGTGTTTG
GATGTGGTGGAGATAGAGATACTGAAAAGAGACCTTTGATGGGAGCAATTGGACAAAAATATTCTGATTT
ATGTATTATAACTTCTGATAATCCAAGAACTGAAGAACCAGAGGCAATAATAAAAGATATACTTGAAGGA
ATTGACAAGAAAAAAGAAAATTACCATGTTGTTGTTGATAGAGAACAAGCTATAGCAGAAGCTATAAGTA
TGGCAAAAAAGGATGATGTTGTAATTATAACAGGTAAGGGACATGAAACTTATCAAATTATAGGTAAAGT
TAAGCATCATTTTGATGATAAAGAAGTTGCAAATGAGTGTTTAAGTAAAATGTAG
>ref|NC_013316.1|:2993722-2994660 AraC-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
TTGAAATATTGCAAAAAATGCTCTATAATTTTCTATAATATAACTGAGGAAAGGTCTTCTATAAAAACTA
TGGATAATAAAATCGGGTACTTAAACGATAACTTTAAAATATTTAATATTAGAGATAAAAAAGATATACA
ATTTGAATACCATAATCATGATTTTAATAAGATAATTATATTTATAAATGGAAATGTAACTTATTTTGTT
GATGGTATTCCCTATAAACTAAAGCCTTGGGATATACTCTTTATCAGCAATAATGAAATCCATAAACCAG
TTATAGATTCAAATGTCTTTTATGAGAGAATTGCAATATGGATTAGCCCAGAATTTATGAAAAAAAATAG
TGATGCTACTAGTGACTTAGAAAAATGTTTTAAAATAGCTACGGAGAATAAATGCAATAGATTGCGTTTA
AATATACATGATATTGAATCTATTAAGAGTTTTATTGAGCAAATAAATATTTCCGAATCCAATACTGAAT
TTGGAAATGAAATATTGAGAAATGCATTATTTATACAACTTATGATATTCTTAAACAGAATTTTCCTAAA
AAATGAAAATATGGAATCAACAGAAGACGTTTTTTATGATGAAACTATTAAGAAAGTATTAAACTATATA
AATTCAAATATAGATGATAAGCTTTCAATAGATAGCATATCGTCTGAATTTTTTATAAGTAAGTATTATC
TTATGAGAAAATTTAAATCTCATACTGGAACGTCTATACACAATTATATAGTTCAAAAAAGATTAATTTT
AGCAAAGTCACTAATAACCAATGGTTACCTTATGAGTGAAGTTTGTAATAAATGTGGATTCAACGATTAT
TCTAGTTTTGTAAGGGCATTTAAAAAAAACTACGGTGTATCTCCTAAAAATTATATAAACAATAAAAATC
CTTTAGATATTACTCTTTTAGATGAATAG
>ref|NC_013316.1|:c2995365-2994874 PTS system, glucose-specific IIa component [Clostridium difficile R20291]
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CAGATTCTGTATTTTCAAGTAAACTGATGGGGGATGGATTTGCAATTAAATCTAGTGATGGATTGATTTA
TTCACCAGTTGATGGAACTATTGGAGTTATATTTCCAACTAAGCATGCAATAATAATAAAATCCAAAAAA
AGTGGAGTAGAAATACTTATACATTTAGGGATAGAAACTGTAAATTTAGAAGGAAATGGATTTGAAGTAT
TTGTGAATGTAGGAGATGAAGTAAAAGCAGGAGAAAAATTAGTTAAAATGGACTTAGAATATATTGAAAA
AAATTGTCTATCAACAATAAGTCCTGTAGTATTTACGAATTTAGAACAAAATCAGAAATTAAGCATTAAA
AAAGGAATAACTACAGCAAAAGAGGAGAACAGAGTAAGTATATTAAGATATGATATTGAAAAAATAGGAT
AG
>ref|NC_013316.1|:c2998130-2997249 putative transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAGGGAAATTGTATTTTGGGAGAGATATTGATTATGATTATTCAACAAATTTATAATAATAATG
TTGTATTAGTTTTAGATGAAAATATAAAAAAAGAATTAATACTAACAGGATGTGGGATTGGGTTTCAAAA
AAAGAAAGGTCAAGAAATAGATAAAAGTAAAATTGAAAGAACTTTTGTAATACAAGATGAAAGCTTTTTA
GATAAAATTAGCAAACTAGCAAGCCAGGTTGATGAGAAATTTTTTGAGATTAGTACTGAAATAATTGCTT
ATGCAGAGGAGAATTTGAATACTAAGCTTTATGAATATATTTATGTAGCACTTACTGACCATATTGCATT
TGCAATTAAAAGATATCATGAAAATATAACTATAAAGAATGATTTACTACATGAGATAAAAAGAATACAT
AAAAAAGAATATGAGATTGGTAAATGGGCTGTAGATTATATAAATAAAGAATTTGATGTGAAATTTCCAG
TAGATGAAGCTGGTTTTATAGCAATGCATATAGTAAATTCAAACTATAAGGGAAGTTCAAAGGAATCACT
GTTAATTACTAAAATTGTAAAAGACATACTAAATATTATAAGATATTATTATAGAGTTGAATTTAAAGAA
GATGATATAAATTATGATAGGCTTTTGACTCATTTAAAATTCTTTGCAAAACGATTAGTAAAAAAAGAAA
AAATCAATGATACAAATAATGAAATTATAGATATAATTAAAGTAAAGTATGAAAAGGATTATGATTGTGC
ATATAAAATAAAAACTCATGTAGAAAAGAATTATGATTACTATGTAAGTCAAGATGAACTACTTTATTTA
ACATTACATATCAAAAGAGTTATATCTGTACTGAATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c2998832-2998338 putative Na(+)/H(+) antiporter [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAACTTTAGTAACATTGTTGGGATTATTGGTTTGTACAAAGATTTCAACTGTATTTAGCAAAAAGT
GGAGTAATATTCCTCTTGCAATATATCAAATTGTACTAGGGATTATATTGTCTATTTTGCCGTTTAAATT
ATCATTTTCATTTAATCCAGAAATATTTGTAATATGTATCATAGCTCCATTATTATTCAGTGAAGGACAA
AATGTATCAAGAAAAGAGTTACTAGAGCTTAGAAAACCAATTTTGCTTCTTGCATTTGGTTTAGTTTTGA
TAACCGTGTTTGCAGGTGGAATCTTTATACATTTTCTTATTCCTAGGATGCCATTATCTGTTTCACTTGC
TTTGGCAGCAGTAATATCTTCAACTGATTTAGTAGCAGTAAAATCAATCACACAAGGATTAAATTTTCCT
AAAAATATGATGAGTATACTTGAAGGTGAATCTTTATTAAATGATGATGATAGAATCATAAATATAATGG
AATAA
>ref|NC_013316.1|:c2999955-2998984 oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
TTGAAAAAAGAAGAGAGTTTATTAAAAGTAGAAGGTCTTAAAAAGTACTTTGAAGTTAAATCTGGATTAT
TTGATAAGGAAATTAAATGTGTAAAGGCAGTAGATGGAATTTCTTTTGATTTAAAAAAAGGAGAAACTTT
GGCTATAGTTGGAGAATCGGGATGTGGAAAATCAACTGCAGGAAGAACCATCCTTAGATTAATTGAAAAA
ACTGAAGGTAAAGTTGAATTTAATGGTGTAGATATATATAAGTTAGAGAAGGAAGAACTTAGAAAGTTAA
GACCCAAAATGCAAATGATATTTCAAGACCCATATAGTTCATTAAATCCAAGATTAAATGTGGAACAAAT
AATATCAGAGGCAGTTATAGAACATAATTTAGTGCCAAAGAATGAAATAAAAGATAATATATTAAATGTT
GTAGAAAGTTGTGGTCTTTCTAAGTACCATTTAAATAGAAAACCAGATGAGTTTTCTGGAGGTCAAAGAC
AGAGGATAGGTATAGCAAGAGCATTAGCATTAAATCCAGAATTTATAGTTTGTGATGAACCTGTTTCTGC
ACTAGATGTTTCTATTCAATCTCAAATTATAAATTTACTTATGGATTTACAGGATAAATATAAACTCTCA
TATTTATTTATATCTCATGATTTGAGTGTAGTAAATCATATTGCACATAGAGTTTGTGTTATGTATCTAG
GTTCTATAATAGAAATTGCAACTAAAGGAGAACTTTACTTACATTCTCAACATCCATATACAAGAGCACT
TATGAGCGCAGTACCAGTACAAGACCCTACAATTAAGAAAAATAGAATTATATTAAAAGGAGACATACCA
TCTCCAACAAATCCACCAAGTGGATGTAAGTTTCATACAAGATGCCCTTATTGTAAGGAAATATGCAAAA
AAGAGATTCCAGTTTTAAAAGAAATATCAAGAAATCATTTTGTTGCATGCCATCTAGTATAG
>ref|NC_013316.1|:c3000933-2999956 oligopeptide transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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GTGTAAATGAAGTAAGTTTTAATATAAATGAAGGTGAAACTATTGGAATAGTTGGAGAATCAGGATGTGG
TAAGTCTGTAACAGCCATGTCTTTGATGAAGTTACTTCCAACATCAAAAATAGAAGGTGGAGAAATAATC
TTTCGAGGCAAAGACATTTTAAAGATGAATGAAGATGAACTTATGGTAATAAGAGGGAATGAGATATCAA
TGATTTTTCAAGAACCAATGACATCTTTAAACCCAGCGTTCACTGTTGGAAGTCAAATCATTGAAGGTAT
TATGATACATCAAGATTTATCAAAGGAAGAAGCTAAGAAAAAGGTAATCGATATGATAAAACTGGTAGAA
ATACCAAGAGCTGAAGAAATATATAATTCATATCCACATGAATTATCAGGTGGTATGAGACAACGAATAA
TGATAGCTATGGCTTTATCATGTAATCCAAAATTACTTATAGCTGATGAACCAACAACAGCTTTAGATGT
TACTATTCAAGCTCAGATTTTAGATATAATGAAAAATATAAAAGAAAAATTAAACACATCTATAATGATG
ATCACACATGATTTGGGAGTAGTTGCAGAAATGTGTGACAAAGTATTAGTGATGTATGCTGGTAAAATTA
TAGAAGTGGCAGAGGTTGTTGAATTATTTAAAAATCCAAAACATCCTTATACTATTGGACTTCTAAAATC
AAAGCCTGTTCTTGGAAAAAACAAAGATAAAAGATTGTATTCGATTCCAGGACAAGTACCAAATCCAATT
GGAATACCAGATTCATGTTATTTTAGTGATAGATGTGAAAAAGTATGTGATAAATGTAGAACTCAGATAC
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>ref|NC_013316.1|:3001116-3002711 oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein [Clostridium difficile R20291]
GTGTTAAATATTATTTTATGGAGGTTTTATAAGAATATGAAATTTAAAAAATTGGCATCATTAATCTTAG
TTTCATCATTAATGCTTACATTTACAGCCTGTGCTTCCAATGATAAAGACAAGTCTAGTGGAAGCAAATC
TGGTGGAACTGTTGTAATACCTATGGCAAGTGACCCAGATATAATCAATGGAGCTTTTGCAAACGTTAAA
GAAGACTCTCTTGCATCAAATATAGTTTATGCTCCTCTTTATACTTATGAAAAAGGGAATTTAGTAAATT
ATTTAGCAGAAAAAGTAGATTTTAAAGATAGTAAGGAATTAACTATAAAATTAAAATCCAATTTAAAATG
GCATGATGGAAAACCAATAACTGCTGAAGATGTCTTATTTACATTTAATACAGTTTTAGACGAAAAACAA
AATTCACCATCAAGACAATACTTATTGGTGGGTGAAAAACCAGTTAAAGTAGAAAAAATTGATGATTTAA
CAGTTAAGATTACTTTACCAACTGCAAGTGAATCTTTCTTATATGGTATATCTAAAATTTCTCCAATACC
AAAACATGTATTTGAAGGAGAATCAAATATAGCTAAGTCAGAAAAAAATAATAATCCAGTTGGTTCTGGT
GCATTCAAGTTTAAGGAATGGAAAAAAGGTGAAAGCATAGTATTTGAAAAGAATGCAGATTATTTTGGTG
GAGAACCTAAGGCAGATTCTATAGCGCTAAAAATAATTCCTAATGAAGCATCTCAAGAAGCAGCTTTAAA
TAATGGCGAAATTTCACTTATGAAGACATCTGCTGAAGGATATGAAAAGGCAAAATCAAACTCAAACTTA
CAAACTTATACTTATAGTGAAGAAAGATTAAACTACATTGTATTTAACCAAAATATATCAAACATGGCTA
ACAAAGAAGTAAGACAAGCCTTATCATATGCCTTAAATAGAAATGAAATGATAGAATCAGCATATGGAAA
AGAAGGTTCTGTACCTGCTAAATCTATATTAGTTCCAGAAGCAGACTTCTATACAGAAGAAGGTGTTGAA
GGATATGACCAAGATACAAATAAGGCTAAAGACTTATTGGATAAAAGTGGTGTTAAAATTGATAAATTAA
AAATAGGTTATAACACAGGTAGATTTGGGCATAAAAACTATGCCTTAGTAGCTCAACAAGAGTTGAAAAA
AATTGGTATAGAAGCTGAAATAGTTCCTTATGAAAGTAAGGCATTCTTTAATATACTATTTAGTAATAGC
ACTGAATGTGATATGTATGTAAATGGTTATGCTTGGGGATTAGAACCAAACCCATATAGAGGTATGTTTG
AAACTGGTCAATATTGCAACCAAACTAAATATTCTAATGCTGAAATAGATGCTTTATGGGAAAAAGGATT
TACTGAGTTAAACAAGGAAAAACGTAAAGAAATATACAAACAAATACAACAGGATATATCTAAGGATGCA
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>ref|NC_013316.1|:3002817-3003776 oligopeptide ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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TTGGACTTTTAGAATTAGCTCCTGGTGACCCAGCAGATGCATATATAAATCCTTTAATGTCTTCACAGGA
TATTGAAAATATAAGGGTTAATATGGGGCTTGATAAACCAGTATATATAAGATATTTAAACTGGTTGAAA
AACACTTTAAGTGGAAACTTAGGTATTTCTTATATAAACCATATGCCCGTTACAGAACAAATTATGGAAA
AAATGGGAAATACATTTATTCTTATGGGTACTTCTTTGATATTTTCAATATTGGTAGCTATACCTCTTGG
AATATTTTTAGCTGTAAATAAAAATTCAATAACTAGTAAAGTATCATCTGTTTTTAATTATATAGGTGTT
TCTATCCCTTCTTTTTGGATAGGTATGATACTCATTTCAATTTTTTCAGTTAAACTTAACATTTTCCCAT
CAGGAGGTATGCATACTATTGGAAATGATAGTATTGGAGATTTAGTAAAACATTTAGTTTTGCCTGTAAT
AACTTTAGGTCTATATAATACTGCTATTTTTACAAATTATGTAGAAGCTAGTGTAAATGAACAATTAAAA
AAACAATATGTTATTACAGCAAGAGCAAAAGGATTATCAGAAAAAGTCATACTATTTAAACATGTCTTGA
AAAATTCACTGACATCATTGGTTACAATCCTAGGCATGAGTATACAAAAATTAGTCACTGGTGCATTTGT
TACAGAAGTAGTTTTCTCTTGGCCAGGTATGGGAAGATTAATGATTGATTCAATTTTTTCAAGAGATTAT
ACTGTAATTATGGCAATAACTATGTTATCAGCACTATTTTTAATTTTAGGTAATTTAGTTGCTGATATAC
TATACTTATTAATTGACCCTAAAATAAAATCTAGCAAAGGAGGATTCTAG
>ref|NC_013316.1|:3003779-3004591 oligopeptide ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
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TAATAATCATATTAATTATAGCTTCTTTTATATTAAATATAGACTCTAATGCAATTGATACTACTTCTAA
ACTTCAAGAACCTAGCTTAAAGCATATCTTTGGTACAGACGAACTTGGTAGAGATTACTTCTCTAGAGCT
CTTTATGGTGGAAGGATTTCACTTAGTGTTGGTATTTTATCAATGCTTATCTCTGTAGTATTTGGTACTG
CTGTAGGTGTTATTAGTGGATATATTGGAGGTAAGCTAGACCAATTCTTGATGAGATTAGTAGATATGCT
TATGAGTATACCAAGTTTCTTAGTTTTGATTGTATTAAATACTTATCTAACACCTAAAGTTTCCACTATT
ATACTAATTATTGGATTCTTAAGTTGGATGGAAGTTTCAAGAATTGTACGTGGCGAAACATTAAAAATAA
AGGAAAATGAATACTGTTTAGCTGCTAAAGCTACTGGTATCAAGACTAGAAATATACTATTAAGACATAT
AGTTTTAAACTTAAAAGAGACTATTGTAGTCGCTGGTTCGTTAAATATTGCTAATGCTATCTTAACTGAA
TCCGCTCTTAGTTTTTTAGGTCTTGGAATCCAATTACCTCTTGCATCATGGGGTAATATGCTTCAAGATG
CTCAAAGACATATTTTTGACAAGTTATATTTAGCTGTATTTCCAGGATTACTTATATTTTTAACAGTCAT
AAGTTTGACTATAATAAGCAAAAAATTTTCTAGTAATACTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3005708-3004806 LysR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGATATAAAACAGTTGAAATATTTTGTTGAAATAGTGAAATCTGGTTTTAATTTATCAATAGCATCTA
AGACACTTCACATATCTCAACCAGCATTAAGTCAAATTATAAAAAATTTTGAAGAAAGTGAAGATGTATA
TTTATTTGAAAGGTATAAAGGTAGGTTAAATGGGTTAACACCAGCAGGAGAAAGATTTTATGTAAATGCA
GAACATATTATAAATGAATACAAAAATATGATGGAAGATTTAAGAGAAGATTCAGTTCAATTTAAAGGAA
AAGTTAGAATAGGAATACCTCCACTTATACTTGGAATAGCATTTTCAGATGTAGTTGCACAGTTAGTTGC
AAATAATCCAGATATAGAATTTGATATAGTAGAGAAGGGTGCATATGACTTAAATAGAATGCTTATCTTG
CAGGAACTAGATTATGCAGTACTGTTACATCCACATAAAATTGATAAAAGTGTAGTAACTGAACATGTGC
TTCAAGAAGATGAACTTACAGCATTTTTAAATATAAATCATCCACTTGCTAAGAAGGATAAGATAGATTG
GAACGATTTGAATGAGCAATTACTTGCAATATTTAATCCTACTTTTATGATACATCATAAGCTAATGCAA
AAATTTACTGATGAAAATGTTAAGTTAAAAAGATATATAATGTCTGGTTCATGGGATTTTTTGTTGCTAT
CAACCACAAATTCTGATTTTATAACAATTTTACCATCACCAGTTCATGATTTTTTTGAAAATAGCAAAAT
TATAGAAAAGCCTTTTAATCATCCTATTACATGGAAAGTTATACTATGTAGACCTAAAAAAGAACGTTAT
AGCCATGTAGACCAACATGTATTTAAATTTATTATAGATTTCTTTAGTAAAAAGAACTCTTAA
>ref|NC_013316.1|:3006063-3007241 putative acetyl-CoA acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGATGTAGTAATCGTATCAGCAGTCAGAACACCTATAGGAAGTTTTGGAGGTGTATTTAAAAATA
CTTCAGCTGTTCAACTTGGAACTATCGCTGTTAAAGAAGCGATATCACGTGTAGGACTTAATTTATCTGA
AATAGATGAAGTAATAATTGGAAATGTTCTTCAAACAGGGCTTGGACAGAATGTTGCTAGGCAAATTGCT
ATAAATTCAGGTATACCAAATTCTGTTCCAAGCTACACAGTAAATAAATTATGTGGTTCAGGGCTTAAAA
GTGTTCAGCTAGCTGCCCAATCAATCACATCTGGTGAAAATGATGTGGTAATTGCAGGTGGTACTGAAAA
TATGAGCCAAGCTCCTTATATCGTTCCAACTGCTCGCTTTGGTAGTAAAATGGGTGACATAACCATGGTA
GATAGTATGCTAACAGATGGCCTTATTGATGCTTTCAATCAGTATCATATGGGAATAACTGCAGAAAATA
TTGCAACTAAATTTGAATTTACTAGAGAAATGCAAGATAAATTGGCATTAGAAAGTCAAAATAAGGCTGA
GAATGCTATAAAAAACAACCGCTTTAAAGAAGAAATCGTTCCAGTAGATGTTTTAATACGTCGAGGAAAA
ATAGAAACTATTGATAAAGATGAATATCCTAAATTAGGCATGACATTTGAAGGTTTAGCTAAACTTAAAC
CTGCATTCAAAAAAGATGGTACTGTAACAGCTGGAAATGCCTCAGGTATTAATGATGGTGCGGCTATGTT
AATACTAATGAGCCAACAAAAAGCAGACGAACTAGGTATTAGACCACTTGCTAAAATAAAATCCTATGCT
TCAGCTGGTGTTGAACCTGAAGTCATGGGTACTGGTCCAATCCCTGCAACTAGAAAAGCACTGAAAAAAG
CTGGACTTAGCATCAATGATATAGACTTAATAGAAGCAAACGAAGCGTTTGCTGCCCAAGCATTAGCTGT
TAAAAATGAACTTCAAATAGATTCATCAAAGTTAAATGTTAATGGTGGTGCAATAGCATTAGGACATCCA
ATAGGAGCAAGTGGAGCTAGAATACTTGTTACCTTAATTTATGAAATGCAAAAACGTAAAGTTGAAACTG
GACTTGCAACACTTTGTATTGGTGGTGGTCAAGGAATATCAATGGTGGTTTCACGATAG
>ref|NC_013316.1|:3007250-3007906 butyrate--acetoacetate CoA-transferase subunit A [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAATAGTTAGCATTGATGAAGCTCTATCTCATGTAAAAGATGGAGATACAATAATGGTTGGTG
GATTCATGGCCAATGGTTCACCAGAAAATTTAATTGATTATTTATGTAGTAAAAATATAAAAGATTTGAC
ACTAATTTGCAATGATACTGGCTTTATTGACAAAGGAGTTGGCAAAATGGTTGTAAATAAGCAATTTAAA
AAGATAATTGCTTCTCATGTAGGATTAAATAAAGAAACTGGAAGACAAATGAACAACAATGAAACAGATG
TTGAGTTAGTTCCTCAGGGAACTCTTGCTGAACAAATACGTGCAGCTGGTTATGGTCTAGGAGGTATACT
CACACCGACTGGTATTGGTACTCTTGTTGAGGAGGGAAAGCAAAAAATTGTTGTCGATAGCAAAGAATAC
CTTCTTGAAAAACCAATTTATGCAGATGTTGCTCTTCTATTTGCATCAAAGGTCGATAAAGCAGGTAATC
TAGTTTATAAAGGCTCTATGAACAATTTTAATAATTTAATGGCATCTGCTGCCAAAATTACAATAGTTGA
AGCAGATGAAATCGTTGAAATTGGTGACATTGACCCAAATGAAGTTAATACACCAGGTATTTTTGTGAAT
TACATCGTTGAAGGAGGTAATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:3007906-3008571 butyrate--acetoacetate CoA-transferase subunit B [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAAATTAGAAATGCAAGAATATATTGCAAATAGAGTATCTAAAGAATTAAAAGACGGAGCCGTTG
TAAACCTTGGAATAGGTCTACCAACCAAAGTAGCAAATTATATTCCGGATAATGTAAACGTTATCTTACA
ATCTGAAAATGGCTTTTTAGGTTTAGGTTCAGCCGAAGATGGAAATTCAAGTGATGAAACTATTGTAAAT
GCAGGTGGTCAACCAGTTACTATACTTCCTGGAGGATGTTTCTTTGATAGTGCTACTTCTTTTGGAATAA
TCAGAGGAGGTCATGTTGATATAACTATTCTTGGCGCACTTCAGGTTGACAAATATGGCAATATAGCAAA
CTATATGATTCCAGGTAAGATGGTTCCAGGTATGGGTGGAGCTATGGACCTAGTAACTGGAGCTAAAAAA
GTTATTGTAGCAATGGAACATACTTCAAAAGGTTCTGCAAAAATATTAAATAATTGTACTCTTCCACTTA
CTGCAACAAATGCTGTAGATTTGATAGTTACTGAAATGGGAGTTATGGAAGTAACATCAGATGGAATTTT
ACTTAAAGAAATAAATCCAGCTTTCACATTAGATGATGTTATTTCTGCTACTGAAGCTCCTTTAATATTG
TCAGATTCATTAAATGGAAAAATATCTGTTGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:3008670-3009452 D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATGGTTAAAGATAAAGTTGTATTCGTAACAGGAGCTGCAAGTGGAATAGGTAAACAAATAGCTG
AATCGTTCTTAAAAAATGGTGCTAAAGTAATGTTCTCTGATATAAATCAAGAAGCTTTAAATAATACCAT
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AACCACGCTATAGATAAAACTGTTGAAAAGTATGGCAGATTAGATATATTAATAAACAATGCTGGACTTC
AACATGTTTCTATGATAGAAGATTTCCCAACTGATAAATTTGAATTTATGATAAAAATAATGCTGACAGC
ACCTTTTATAGCTACTAAAAAAGCATTTCCTATAATGAAAAAACAAGGCTTTGGTCGTATAATAAATATG
GCCTCAATCAATGGTGTAATAGGATTTGCTGGAAAGGCTGCTTATAACTCAGCAAAACATGGACTTATTG
GACTAACAAAAGTTGCTGCTCTTGAAGCTGCCGATTCTGGTATAACAGTTAATGCTTTATGCCCTGGATA
TGTAGATACTCCACTTGTCAGAGGTCAGTTTAATGACCTTTCAAAAACTCGTAATATACCATTAGAAAAT
GTCTTAGAGGAAGTTTTGTACCCACTTGTACCACAAAAACGCCTATTAGATGTTCAAGAAATTGCCGACT
ATGCTATGTTCCTAGCAAGTGATAATGCTAAGGGTATTACAGGACAAGCTTGCTTACTAGATGGAGGATA
TACTGCACAATAG
>ref|NC_013316.1|:3009514-3010848 putative permease [Clostridium difficile R20291]
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TTCATATAACTATAGCTGCTCCAATAGCAACTTTAATAGTTGTTCTCTTAAATAAAATGGATGTTGTAAC
ATCAATGCTAGGTGCTGACAAAAACAATTATATGGGTGCACTTGGAAACTATATAATGAGTTATTTTGCA
ATATTCTTATTAGGCTCAATACTTGCTAAATTTATGGAAGAAAGTGGAGCCACTGTATCAATAGCTGATT
TTATTTTAAATAAAGTTGGCTCTAATCATCCTTATAGAGTTTTAGTTGCTATATTTATAGTAAGTTTTAT
ATTAACGTATGGTGGTATAAGCTTATTTGTAGTTATGTTTGCAGTCATTCCACTTGCAAGAACTCTATTT
AAAAAACTTGATATTTCTTGGAACCTTATTCAGATACCACTTTGGCTTGGTATTGCAACAATTACTATGA
CTATAATTCCTGGAACACCAGCCATTCAAAATGTTATACCTATTCAATATCTAAATACGTCTCTTACTGC
AGCTACTATACCAAGTATTGTAGGTAGTATAGGTTGTGCTACGTTTGGACTTGTCTATATGAAATATGCT
CTAAACAAAAGTATTAGAAAAGGTGAAACTTACGCAACTTACACTTCAAAATTAGAAGAAGAATCTTTAG
ATAGAGAATTACCAGGATTTTTTGCAAGTATTTTTCCTCTATTAGCACTCGTAATTATAGCTATAACTGG
AAGTACTTTTGGTTCAGAATTTATGAAAAAAAATGTAATTTACATAGCTTTAATAGTTGCAATTCTTTTA
TCTGCTTTTTTATTCCATAAATTTCTATCATCTAAGATACAGACATTGAGCATAGGTGCTAGTGGTTCTA
TAGGTCCTATATTTGCTACATCTTCTGCAGTTGCATTTGGAGCAGTAATAATGGCTGCACCTGGTTTTGA
TGTATTTAGCAAACTTATAATGTCAATACCAGGTAGTCCACTTATAAGTCTTACTGTTTTGACTTCAACA
ATGTCAGCAATAACAGGGTCCTCTTCTGGTGCATTAGGAATAGTAATGCCAAACTTTGCAGATTATTATT
TAAGTACTGGTCTAAATCCAGAATTAATTCACCGTGTTGCTACAATAGCCTCAAATATACTAACTATAGT
TCCACAAAGTGGTGTTTTTCTTACATTCTTAAGCTTATCTAAGTTAACACATAAAACTGGATTTAAAGAA
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ATTAA
>ref|NC_013316.1|:3011345-3012271 putative Calcium-chelating exported protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATGAGAAGAAATATACCAACAAAATTAAAAACTATATTAGCTTTAGGAGTGTTAACTTTAGCAACAG
CTTCAAGTGCTGTTACTGCAAGTGCTTCATCACTTGAAAATAATGTAAATATAAGTAACAAAAGTTTAGT
ATATAGTAATACTAAATACAAGTTTTCTGCAAAACCAAATTGTTCTGTAAAACCAGAACTTAAACCTGAT
AAAGATAACTCTTGTAAGGATAAGAATCATAATGACAAGAATTGCAACAACACTAATAAACCTGAGGACA
ACAATAATTCAGACTCTACTAATAAGCCTGATAACAATAAACCAGAGTCTAATAAACCTGAGGACAACAA
TAATTCAGGCTCTACTAATAAACCTGATAACAATAAACCAGAGTCTAATAAACCTGAAGACAACAATAAC
TCAGGCTCTACTGATAAACCTAATAACAATAAACCAGAGTCTAATAAACCTGAAGACAACAATAATTCAG
ACTCTACTAACAAACCTGATGATAATAACAACTCAGGCTCTACAAGTGAAAATTTTTCAGCTTACCAAAA
AGAAGTTGTCGACTTAGTAAATATAGAAAGAGCTAAAGCTGGATTAAATCCTCTTACTCTTGATTCTTCT
ATATCAAATGTTGCTACAAAAAAATCTCAAGATATGATTGATAACAACTATTTTTCACACAATTCTCCAA
CTTATGGTTCTCCATTTGACATGTTGAAAAAATTTGGAATAAGCTATAAGACAGCAGGTGAAAATATAGC
TATGGGTCAAAAAACTCCTAAAGAAGTTGTAAACGCATGGATGAATTCTGAAGGTCACAGAAAAAATATA
ATGAATCCAAATTTCAGTAAAATAGGTGTTGGAGTAGCACAAAAAAGTGGTGGTTCAATTTATTGGACAC
AAATCTTTGTAGGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3016202-3012663 pyruvate-flavodoxin oxidoreductase [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTAAGTTTATGAAAACACTTGATGGAAATACAGCTGCAGCTCATGTTGCCTATGCGTTTACAGATG
TAGCAGCTATATATCCAATCACACCATCTTCAACTATGGCTGAAGTAGTTGATGAGTGGGCATCACAAGG
AAGAAAAAATATATTTGGACAAACAGTTAATGTTGTTGAAATGCAGTCAGAAGCAGGTGCATCAGGAACA
TTCCACGGTTCTTTACAAGGAGGAGCTTTAACTTCTACTTTTACAGCATCTCAAGGTTTATTATTAATGA
TACCTAACATGTATAAAGTTGCAGGAGAGTTATTACCAGGAGTATTCCATGTAAGTGCTCGTGCTTTGGC
ATCTCAAGCGTTATCAATATTTGGGGATCACCAAGACGTTATGGCTGCTAGACAAACTGGATGTGTATTA
TTAGCTTCTGGTTCAGTTCAAGAAGTAGCTGATATAGCACCTGTTGCACATTTAGCTGCAATAGAAGGTA
GATTACCATTTATACATTTCTTTGATGGATTCAGAACTTCACATGAAATCCAAAAAGTTGAATTACTAGA
AAATGAAGATTATGCAAGTTTATTAAACTTTGAAGCAGTTCAAGCATTTAGAGATAATGCTTTATCTCCA
AATCATCCAGTTGCTCGTGGTACTGCTCAAAACCCAGATATATATTTCCAAACTAGAGAAGCTTCTAATA
AATACTATCAAAATATAGTAGGTATAGTTGAAAAATACATGGAAAAAATGAGTAATTTAACAGGTAGAAA
ACATAGTTTATTTGATTACTATGGAGCAGAAGATGCTAAATACGTATTAATAGCTATGGGTTCAGTAACA
GAAACAATAGAAGAAACTATAGATTACTTAAATGCTAAGGGAGAAAAATATGGTTTAGTTAAAGTTCATT
TATATAGACCATTCTCAATGAAACATTTCTTAGATGCTATGCCATCTACTGTTGAAAGAATATGTGTACT
TGATAGAACTAAAGAGCCAGGTTCAACTGGTGAACCATTATACTTAGATGTACGTGATGTATTCTATGGA
AAAGAAAATGCTCCTATGATAATAGGTGGAAGATACGGATTAGGTTCAAAAGATACTACTCCTTCAGATA
TAAAAACTGTTTTTGATAACTTAGTTTCAGAACAACCTAAAAATGGATTTACAGTAGGTATAGTTGATGA
TGTAACTAATACTTCTTTAACTCCATCTGAGCCAATAAAAATAGCTTCTAAAGGAACTATAAGATGTAAG
TTCTGGGGATTAGGTTCTGACGGTACTGTTGGAGCTAATAAACAAGCTATCAAAATAATCGGTGACCATA
CTGAAAAATATGCTCAAGCTTACTTTGATTATGACTCTAAAAAATCTGGTGGTATAACTATGTCTCACTT
AAGATTTGGTGATACTCCAATAAGAGCTACTTATTTAATAGATGAAGCTGATTATATTGCCTGTCATAAA
CAATCATATGTTTATCAATATGATTTATTAAAAGGTCTTAAAAAAGGTGGTACATTTGTACTTAACACTA
TATGGGACCAAGCAGGACTTGAAGAACATTTACCAGCTCATATGAAACAATATATAGCTAAAAATGATAT
AAAATTCTATACAGTTAATGCTGTTAAACTAGGACAAGAAATAGGTCTTGGAAACAGAATAAACATGATA
ATGCAATCTGCATTCTTTAAATTAGCTGAAATAATACCAGAAGAAGATGCTGTTAAATACTTAAAAGATT
CTATAGTTAAAGCTTATGGTAAAAAAGGTGAAAAAATAGTTAATATGAACTATGCTGCTGTTGATGCAGG
AATAAATGCTTTAGTTAAAGTTGAAGTTCCAGCTTCTTGGGAAAATGCTGTTGATGCAGATAAAGGAGAA
GTTAAAGAACCAGAATTTATAAAAAATATACTAAGACCAATGACTGCACAAGAAGGAAACAACTTACCAG
TAAGTACATTCAATGGTATAGAAGATGGAACATTCCCTTGTGGTACTGCAGCTTATGAAAAACGTGGTAT
AGCTGTTGATGTTCCTGAATGGATAATAGATAACTGTATTCAATGTAACCAATGTTCTTTTATATGTCCT
CATGCATGTATAAGACCAGTATTAGTTACTGAAGAAGAATTAGCTAATGCTCCAGAAGGATTTGAAGCTA
AAAAAGCATTAGGTAAAGGATTAGAAGGATTAAAATATAGAATTCAAGTTAGTCCACTTGACTGTACAGG
ATGTGGAAACTGTGCTGACATATGTCCAGCTAAAGAAAAAGCTTTAGTTATGAAGCCAATAGATACTCAA
CTTGATACAGAGTTAGATAATTGGGCATTTGCAGTAAATCCTGATGAAGTAGCTCCAAAAGTTGATGTTA
TGCCTGCAAATACTGTTAAAGGAAGTCAATTTAGACAACCATTAATGGAGTTTTCAGGAGCATGTGCTGG
ATGTGGAGAAACTGCGTACATTAAAGTAGTTACACAATTATATGGAGATAGAATGATGATAGCTAATGCT
ACTGGATGTTCTTCTATATGGGGAGCTTCTGCACCATCAATTCCTTATACTTGTAACCATGAAGGTAAAG
GTCCATCTTGGGCAAATTCTTTATTCGAGGATAATGCTGAATATGGATTTGGTATGTACACAGCTGTTAA
GCAAATAAGAAATAAAATAGTAGATGCTATGACAGAGTTAGTTTCTATGGATATCTGTGAAGATGCTAAA
GCAGTATTTACAGAGTGGTTAGATTCTAGAAATGATGGAGAAGCTTCTAAAGTAGCAAGTGCTAAGGTTG
TTGAATTATTAGAAAAACCAGCTTGTGATTGTACAGATGAAAAAGCTAAAGAATTAGTAAAAGCTATAAA
AGATAGAAAAGATTATCTAGTTAAGAGATCTCAATGGATACTAGGTGGAGACGGTTGGGCATATGATATT
GGTTACGGTGGATTAGACCATGTTCTTGCATCTGGTGAAGATGTAAACGTACTTGTATTTGATACAGAAG
TATATTCAAATACAGGAGGTCAAGCTTCTAAAGCTACTCCAGCTGCTGCTATGGCTAAGTTTGCTGCTTC
AGGTAAAAAATCTAGAAAGAAAGATTTAGGAATGATGGCTATGACATATGGAAACGTATATGTAGCTCAA
GTTGCTATGGGGGCTGATAAAAATCAATTTATCAAAGCCGTTTTAGAAGCTGAAAAACATGATGGGCCAT
CTCTAATAATAGCTTATGCTCCATGTATAAACCATGGATTAAAAGAAGGTATGGGAAGAACTGTGGCTAA
TGAAGCACAAGCTGTTGCTTGCGGATACTGGCATTTATACAGATTCAATCCAGAAGTAAAAGCTGAAGGT
AAAAACCCATTCACTTTAGATTCAAAAGAACCAACTGCAAGCTTCAAAGATTTCATACTTGCACAAGTAA
GATATTCTGCTATAGCTAAACAATTCCCAGAGGAAGCTGATGGATTATTTGCTAAAGCTGAAGCTGATGC
TAAAGAAAGATATGAAGGATACAAAAAATTAGCTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3017289-3016720 putative propanediol utilization protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTACCAATAGCATTATCTAATAAACATGTTCATTTGAGTCAAGCTGATATAGACGTATTATTTG
GGGCGGGTCATGAGTTAACTAAATTTAAACCATTATCTCAACCAGGGCAATATGCCTGTGAAGAAAAAGT
GGATTTAGTAGGACCAAAAGGAACTTTAAAGGGAGTTAGAGTACTAGGACCAGCTAGAGCTCATACTCAA
GTTGAAATATCTTTAGCAGATGGTTTCCCATTAGGAGTAAAAGCACCAATAAAAGAATCTGGTGATATAG
CTGGAACTCCAGGTGTTAAATTAGTAGGACCTGCTGGAGAAGTTGAAATGAAAGAAGGAGTTATAGTTGC
TTCTAGACATATACATATGAGCAATGAAGATGCTGCTAAATTTGGTGTAACTGATAAGCAAATAGTAAAA
GTTAAAACATCTGGACCAAGAGCATTAGTATTTGAAAATGTATTAGTAAGAGCTAGTGATAGCTTTAATC
TAGAAATGCATGTTGATATGGAAGAGGGAAATGCAGCAGGCGTTAAAAATGGAGATTTAGTAGAATTAAT
AGTTGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3017969-3017361 putative iron-sulfur flavoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGGATTCAAACGATAAAAAAGGACTTAAAAGTACAGAGATTATAATAATAAATGGAAGTCCAAGAATTA
ATAAAAATTGCAGTTTTATAGCAAATAAAGTAAAAGCTATGCTAGAAGAGTGTGGGTTAAGTTGTAAAAT
ATTTAATATCTACAATATGGATATTGAATATTGCACAGCATGTGGATTTTGTGAAAAAACAGGGTATTGC
AAGTTTAATGATGATATGAAGCCATTATATAAAATGTTTGATGATTCAAAAGGAACTATAGTAATAAGTC
CTGTACATTTTGATTCAATATCAGCTAAATTAAAGACTGTTGTTGATAGAACTCAAGCTATATATGCAAG
TAAATATGTATTAAATAAACCTTCAATTGATAGAAATAAGAAACGGATAGGAATGTATATTGCAGTGGGG
GGGAGTAAATCATATGATTCACAGTTTAAAGGTGGACAGATTGTTATGGATTTTTTCTTTAAGAGTATAA
ATACTAAACTTTTACACAATATATATTTAAACAATACAGATGATGTATCTTATATAGATAATCAAGAATT
TAAAGATATAATATATAAAAATTTAAAGATATATATTGATTCAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3019740-3017977 putative regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGACTAATGGCAGTTATAAAATGAAGAATTTAGTGGAGATATCCGCTATGGTGACGGAATCTACAGATT
TTTTTAATATAAAAGATGACATAATAGAAAAAATGTTAGAAGTTGTTCACCCTACAAAGGCATGTGTAAA
TCTATTTTATAAAAATGATTCTAAATATGCCTACTTAGTATGTTCGCAAACCTTAGAATATGTACCTCAA
ATTTTTCCAATAAATAGTCTTAAAGGTGCAAAAATTGATTTTGACACATATCCAGAGTATATACATGAGG
CTGTAAATGAAAAAAAGATAATATATGTGGAAAATGTATTTGAAGATTCTAGAGCAGAAGGTGAACGAGA
TTTAGCAAAAGCTGAAGGTTATATTGGGAGAATAGTTTTTCCTTTTATAATAAATAATGTAGTTGTTGGA
TTTATGACTTGTTTTTTAAAAGAGGATGATTATATAACAGAACAAGATATAGATTTTATATCATCTGTTG
CATCACTCTTAAGTTTATCAATAGAAATAACTAATAAAAATAATAATGTACAAATTTTAATTGATAAACT
AAGAGGCTCAATAAGTGCCATAAATGAAGCTACTAAAAAACTATACCTTAATAAGAGTATTGATGGCTTT
TTGGAAAATTTAAGTAAACAAGCGTGTAATATTACTAATAGTAAAGAAGCTTTAATAATTATAAATAGTC
ATCATAATAAGGATACTATAGTTAGTTGTTATAATGTTGAGCAAAAAAAGAAAACAAATTTATATCCTAT
GATTGATATGTTTTTAAAGAAAGAGTCATTAGGGGGATACCTAAATAATTTAAAACCATGCTCAAAAAAG
GGCATAAATTTGGAAAGTTATATATATTACAAACTTCAGGATAAAAATGAGACTATAGGATGTATAGTTT
GTGCAAATAGTAAAAACTATACTAGTGATGATTTAAATATTCTTAGTATATTGTCCAAACAAGTTTCTGT
TGGGATGCAATTATATGAACATAATGAAAAGGAAGTAAAACACAAAGTTCTTGAAAATGAGTTGAACATA
TTAAATAAACAACAACAGCTTATTATGGATAAAGGTAAAATGGATTGTAATGATGAGAAAGAACTTTATT
TTTACCATAAACCAGCAAGGGTAGTAGGTGGAGATTTTTATTATGCTACAAAAGTGGATGACGAACATAT
AGTTTATATTGTTGCTGATGTAATGGGACATGGAATGGTATCAAATTATGTTGTTGCAATGATAAAAGGT
GCTTTTAAAGTATTATGCAATCAATACAATACACCAAGAGAAATAATGACAAATTTAAATAGGATGTTAT
ATGATGAATTTGACAAGATGGGAGTATTTACAACTTGTTTGATAGGTATTATAGATACTAAAGAAAATAT
GATTACTGTGTCTAATGCAGGTCACTATAGTCCTGTAGTTGTAAAGAAAGATGGCACAATAGAAAATAAT
TTAAATTGTAAAAAGGGCATACCTATTGGAATAATGAAAGATGCTACTTATGAAAATAATACTCTTTCAA
TGGAAGATTATGCAATGGTATGTATGTACACTGATGGAATTTTAGAGATAAAAAATTCATCAAAAGAAGA
GTATGGTATAAACAGATTAGAAAACTTTCTAAAAGAAAATTTTAGATTAAATCAACAGTTAATAGTAGAA
AATCTAAAATTGGATTTAAAGAATTTCTCATCAAAAGATAATTATGATGATGATATTTTAATAGTTATGT
TAAAGGATAGGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3020250-3019783 hypothetical protein CDR20291_2574 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATGTTAAATGGGATAATAAAGCTTTTTTATTCTGAAATTGTAAAAACAAAGATTAATAACCTAG
ACTCAAGTGGATATTCTTTAAGAGATGAATGTAAAGAAATCAGAAATATAACTCTAAAGATAGATAGCGT
ATTTTTTAAGCTTTTAAAGTTGGCTTTTGGTTCAATACTGCTTATGATAGCTTTTAATTTAAACATGATT
CTAGGTATAGGAGTGTTTTTAATTGGTGTAGTTTATATACTATATAAAAGAAATATGGAAGAACAAGTAA
AAGAGCATATAAATAATGTGAAAAATAATATCGACATCTCTAAAATAACTTTTATGGATGAAAAAGGGAG
AACAGGTCTAAATGCATTGATTACATTACTTCTTATAGGATTATTGACAGGATTTAACTGGATATTAGTT
GCTAGTTTTGTCGTTGTTTTTGTTTTTACTATAAAGAATGTATGTTAA
>ref|NC_013316.1|:3020433-3020894 hypothetical protein CDR20291_2575 [Clostridium difficile R20291]
GTGCAAATAGAACAACTCGATTTAGAAACGAGAAATAAAATATACTGCTATACTAAAAAAATTCTTAGAA
AATATCAAAAAGGCATAACATCTGGAAAATTAACAGCAGATAAATTTGCAGATAATATATTGTCTCAACA
TTTTATCAGTAGTATACTTAATGAAAAAATAGTCAATGAGACAAATTTTAAGATATCTTATAGAAACTAT
ATAGAAACTTTAATAAATATTCAAAATGAAAATTTATCTAACTTAAGAAAAAAATCTACTAAAACTGCAA
AATGTTTCAATATCTCTCAAATAACCCAATTAAAAAACTTACTAAGTAATACTGGTTATAATTTATTAAT
TCCATATAAATACTTAACTGCTAGAGATATAGAAGGAATCGTTACTCTTATTAATACTGGGTCTATTGAA
CTTGGAAATGAGAGAATCTATAATTATATATCAAAAGCATAA
>ref|NC_013316.1|:c3021567-3021346 small acid-soluble spore protein A [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAAGTAACAATAACAACAACAGAACAGTAGTACCAGGAGCAAAAGAGGCTTTAAACCAAATGAAAT
TAGAAATAGCTAATGAACTTGGTATGAGTAATTATCAACAAGTTGATAAAGGAAACCTTACTGCAAGAGA
AAATGGTTATGTAGGTGGATACATGACTAAAAAATTAGTTGAAATGGCTGAACAACAAATGGCTGGAAAA
AGCAACAGATAG
>ref|NC_013316.1|:c3022838-3021651 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGCCGCATCAACTGCATGTGAGAAAGGCTATGATGTAACATTAATTGAGAAAAATCATAAATTAG
GAAAAAAACTTGCAATAACAGGAAAAGGTAGATGTAATATTACTAACGCTTGTGAAATAGAGGAATTAAT
AGAAAATGTACCTACAAATGGAAAATTTCTTTATAGTGCTTTTTATACTTTTACAAATGATGATGTAATA
AGTATGTTTAATAATCTTGGAGTAAAGACTAAAACAGAAAGAGGAAAAAGGGTTTTTCCAGAGAGTGATA
AAGCCTTTGATATTGTAAATGCTCTTGAAAGACAACTTAAAAGTAAGAAAGTAAATATATTATTAAATTC
AAAAGTAGAAAAAATAATATCTAAAAATAATAAAATTGAGAAAGTAATTTTAAACGATAAAAAAGAAATT
AAGTGTGATTCAGTTGTAGTAGCAACTGGTGGATTAAGTTATCCACTTACTGGTTCTACTGGTGATGGAT
ATAAATTTGCAATTTCACAGGGGCACACAATTATAGATACAAAACCATCTTTAATTGGTATAGAAGTACA
AGAAAGTTTTACAAAAGATTTAGAAAAATTATCATTGAGAAATGTTGAAATAAGGGTGTTTAATAGCAAA
CAAAAGAAAGTTTATAGTGATTTTGGAGAACTTGAATTTACTAGATTTGGTTTAGATGGACCTATAATCA
AGTCTGCAAGTTGTAGAATGAAAGATACAAGGAAAGAAAATTACACTATATTATTAGATTTAAAACCTGC
ATTAGATGAGGAAAAACTGGATAAAAGAGTTCAAAAAGATTTTCAGAAGTATACAAATAAAAAATTTGAA
AAAGCATTAGATGATTTACTTCCAAAAAAACTAATACCTATAATAATAAACTTAAGTGAAATTAATGCAA
ATACGGTTGTTCACCAAATTTCTAGAGAGCAGAGAAAAAACTTAGTCCATTTATTAAAAAATTTAAAGTT
TACAGTAAAGAGATACAGACCTATTGAAGAAGCTATAATAACTTCTGGTGGTGTAAAAGTAAACGAAATA
AATTCAAGCACAATGGAATCAAAATTAGTAGAAGGTTTATTTTTTGCTGGAGAAGTAATAGATATAGATG
CATATACAGGTGGATTCAATTTGCAAATAGCTTTTTCTACTGGATATTTGGCAGGTTTTAATTGCTAA
>ref|NC_013316.1|:c3023871-3022939 putative membrane-associated phosphatase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATATTCAGTTAAATATATTATTATTTTTCCAAAATTTAAGAAATCCAATTTTGAACTTTATATTTC
TTGTCTTTACAATAAGCACAGAAGCACCGTTATTAATATTAATTACAACAATTATATACTGGTGTATAAA
TAAAAAATGTGGACAGAAAATACTGTTTGCTATAATTGGAAATTTTGTTGTAAATTTAGGCATCAAAGAG
TTTGTAAAAGCTCCCAGACCAATAGGAATAAAAGGTCTTGAATCATTGAGAGTTTCTACTGCTGGTGGTT
ATTCTTTTCCAAGTGCTCATACTCAAACTGCAACAACATTTTGGGTTAGTATTATGACTATATTTAAAAA
GAGATATCTTCATTTAATAGGTGCAGTTATGGTTTTAGGAGTAGGATTGTCTAGGCTGTATTTAGCTGTT
CATTGGCCAATAGATGTGATAGTGGGTTGGATGTTAGGAATATTTTTTACAGTTATATTTATAAAAATAT
TTGACTATATTGATGATAATAAAAATTATATTTTACTTGTAGTTTTACTTATACCATTTATAATAGTAGC
TATATTTCTAAATAGCCCTGAATATTTTGAAAAATTTGGTATAATAGTAGGATTTGTATTTGGATATATG
GTTGAGGATAGATTTGTTAAATTTAATACAGATAATAATAACAAAAAAATAAATTTTAGCAATAAAAATA
AGGGGAGTAAAAATATAATTTTTTCAAGAATATGTAGGTTTTTGGTTGGGATAGTAACAATAGGAATGTT
ATATATTGGCATTAAGTTGTTTATTTCAATGTTAATAGTCACTTTAAATATAAGTGACTCTACTATGAGT
ATAATTTTTATGAATTTTATTAAGAATACAGTAGTTGTTTTTTATGGAATAGCAGGAGCTCCAGCATTAT
TTAAACTTTTAAAATTAAATTGA
>ref|NC_013316.1|:c3024487-3023960 putative phosphoribosyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGTACAAAGTTACAGGAAAAATGTTGACAGAAGAACAAATAAAAGAAAAAGTTTATGAATTAGGAAAAA
AGATAGAAGAAGACTTTAAAGGCGAAGATTTACTAGTGGTAGGTATACTTAAAGGAGCTAGTGTATTTGT
TTCAGATTTAATAAGATGTATAGATTTGGATGTAAATATAGATTTTATGAGTGTTACAAGTTATGGAAAC
TCAACAGAGTCTTCTGGAACAGTTAAAATATTAAAAGATTTAGATGTAGATATTGAAGGAAAGAATGTGT
TGATTGTAGAGGATATAATAGATTCTGGTTTAACATTAAGTAATCTAGTTGCAGCTTTAAAAACTAGAAA
TCCAAAATCTTTAAAACTATGTACTCTACTTGACAAACCTCAGAGAAGAAAAGCTAATATACCTGTAGAC
TATGTTGGATTTGTTATAGAAGACAAATTTATTGTTGGTTATGGAATAGACTATGCTGAAAAGTATAGAA
ATTTACCTTATATAGGTATAGTTGAGGATGTAGAATAG
>ref|NC_013316.1|:3024638-3025792 putative aminotransferase [Clostridium difficile R20291]
TTGTATTATAATCTATATGTACATATATTAATCAGTTATTTTTATCGATTATATAATTTTATTTTTGGAG
GTACTTTTATGAGCACAAATCATGGAGCTAATTTATATAGTTTATCTAGTAAGTATGGCTTTTCAAAGGA
AGAATTTATGGATTTTAGCTCAAATATAAATCCTTTTGGTACATCAAGTTTAGCCAAACAATACATTGTA
AACAATATAGATATGGTATCTATGTATCCTGACCCTGATTACATAGACTTAAAAACTTCTATATCCAATT
ACTGCAAATGTTCTATAGATAATATAGTACTTGGCAGTGGAGCTACAGAACTAATTTCATCATTTATACA
TACAATTAATCCTAAACAGGCTCTTTTACTCTCTCCAGCCTATTCAGAGTATGAAAAAGAGTTATCTAAA
ATTAATTGTTCTATAGAAAAATACTTTGCAAAAGAAGAAGATAATTTTCATATAAATTTAGAAAATCTTA
TAAAAACTATCAATGCTAAAGATTATGATTTGGTAGTAATCTGTAATCCTAGTAATCCAACTGGATTTGC
ATTTACTAAAGTAGAAGTGAGAGAAATTTTAAAAAATACAGACTCATTTTTAATGATTGATGAGACTTAT
GTAGAGTTTACTGATACAGATACATACTCTTGTACTCAATTAGTTGATGATTATTCTAATTTATTCGTTA
TAAGAGGTACATCAAAATTTTTTTCAACGCCTGGAATAAGGCTTGGATATGGTCTTATATCTAACACTAA
TGTCAAAAATGAAATAAATAAAAATCTAGATTTATGGAATATAAACATAATAGCTTCTAAAATGGGGGAA
ATCATGTTTAGTGATTTAGATTTTATATCAAATACTATTTCCTTAATGAACACTGAAAGAGATTACCTGC
TTAAAGAGCTTAAGAATATAAAAAGCTTAGATATATACAATACTAAAGGTAATTTCATATTGTGTAAAAT
CAAAACAAAGGAATTAACTGCTAAATCGCTTCGAGAACAACTGCTTCCACAAAAAATAATAATAAGAGAT
TGTTGTTCATTTGAAGGTCTAGATGAGTATTTCTTTAGAGTATGTATATTAAAACCTAATGAAAATAAAT
TATTAATATCATCTCTTAAAGCAATTTTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3027123-3025879 putative sodium:dicarboxylate symporter [Clostridium difficile R20291]
ATGCTTAATTTAAAAAAGTTATGGAGGGTAAATATTATGAAGAAAAAAATAGGTTTAGTGCCCAAACTAA
TCATCGGTATCATAGTCGGTATTTTAATCGGAAGTTATGCACCAGAAATAATAGTACAAATATTAGTAAC
AGTTAGTACCTTATTCTCAGCATTCCTAAAATTTGTTATACCATTTATAATTATAGGTTTTGTAACAGCA
GGTATAGCTGATTTAGCAACAGGTGCAGGAAAGTTATTGGGGATAACTACGGGAATAGCATATGGTTCTA
CCTTAATAGCAGGATTATTATCATTTGCAGTATCTACATTAATCTTCCCAAATTTTATTGATGCAAGTGT
TGCAAGTCAAATTGGAGACCCAGAGGCAGGAATGTTAGCTCCAATATTCACAATTCCATTAGAGCCTATG
GTAGATGTAACAGCTGCAATCGTATTTGCATTTGTAATGGGACTTGGAATATCAGCTTTAAGAAATCATG
GAAAAGGAGAGACTTTATTTAATTTCTTCCAAGAATTTCAAGGAATCGTAACGAAAACGTTGTCAACAGT
GATTATACCTTTATTACCTTTATACATAGCAGGAACTTTTGCAAATATAACTATAGCAGGGGAAGTATGG
ACAATATTAGGGGTATTCTGGAAAGTATACTTAGTAGTAATACCTTTACATTTTGTATATATGGCATGTC
AATTCACAGCAGCAGGTGTATTTTCAGGAAAAAATCCAGTAAGAATGTTAAAAAATCAAGTACCTGGATA
TTTAACAGCTATAGGAACTCAATCTTCAGCAGCAACTATACCAGTTAATGTTGGTTGTGCAGAAAAAAAT
GGAGTAAGTAAGCAAATAAGAGAATTTGTTGTACCTCTTTGTGCAACAATACATTTATCAGGTAGTATGA
TATCAATAACAGGATTTACAACTGCAGTTTTAATGATGAATGGTATGCCACATGGAATAGGTGTATTATT
CCCTTATATTGCAATGTTAGGTATAGCAATGGTTGCAGCACCAGGAGCACCAGGTGGGGCTATAATGAGT
GCACTTCCTTTCCTACCAATGGTTGGAATACCATCAGATGGTGGGCTTGCAAGTTTAATGATAGCTTTAT
ACTTAACTCAAGACAGTTTTGGTACAGCATGTAATGTATCAGGAGATAATGCAATAGCAGTAGTAGTAGA
TAAAATAAATGATGGAATGAGTAAAAAAGGAAACAAAGAAGAGCAAAGTGCTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3027637-3027248 hypothetical protein CDR20291_2582 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGTTTTTAAAAATAATCATTAATATAGTTTTAGATATTTTAAAAAAAATTTTGGTCAGATTTAAAA
ATGCTAAATTTGGTTTGGTTTTTGTATTTGATTTACTTAAACTACCTGATTTTATGACAGATAAAAGAAT
CAATATAGTTGATAAAATAAAGGTAATTTCTGTATTAATTTTTACTATATCCTACTTTGTATCTGGGGTT
GATATAATTCCAGAGATGATTGCAGGGGCATTTGGTTTTATAGATGATGCTATAGTTTTAATTTGGAGTA
TAGGTATAGTGAATGAAGAAATTAATAAGTATAGAGTTATTATAAAAAAAGATAAACATTCAAATATAAT
TGAAAATGTAGAATTTTCTATAAAAGATGAAGAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3028742-3027741 aspartate--ammonia ligase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCACAATAATACCAAAGGATTATAAAAGTAGTTTGAACGTAATTGATACACAAATAGCTATAAAAA
AATTAAAAGATTTTTTTGAAATGAGACTAAGTAATGAATTAAATCTTATAAGAGTTTCTTCTCCGTTATT
TGTATTGCCAGAAACAGGTGCAAATGATAATTTAAATGGAGAAAAGGCTGTAAGCTTTGATATACCATTT
ATGAATAAAAATGCAGAAATTGTTCAATCACTTGCAAAATGGAAAAGATTAGCCCTTAAAAAATATGGGT
TTGAAGTTGGTAGTGGTTTATATACAGATATGAATGCAATAAGAAAAAATGAAGAATTAGACAATATACA
TTCTCTTTATGTAGACCAATGGGATTGGGAATTGGTTATAGATAAAAGTAGTAGAAATGAAAAGACTCTA
AAAGATGTTGTAAAAAGATTGTATGGAGTATTTAAAGATACTGAAATTTTTGTATGTAGTATGTATGAAG
GTATAAAAGAAATATTACCAGAAGAAATAACTTTTATAACATCACAAGAGTTAGAAGATATGTATCCAGA
ATTATCACCGAAGGAAAGAGAAGATAAAATTGTAAAAGAGAAGAAAGCAGTATTTATAACTCAAATAGGA
AAAACATTAATATCAGGAGAAAAACATGATGGAAGAAGCCCTGATTATGATGATTGGGAATTGAATGGGG
ATATATTATTTTACAATCCTGTTTTAGATTCAGCATTAGAATTATCTTCAATGGGAATTAGAGTTGATGA
AGAATCTCTTGATAGACAATTGAAACTTGCTGGATGTGAAGAGAGAAAAGAGTTTGACTATCATAAGATG
CTTTTAAATGGCGAACTTCCGTATACAATTGGTGGAGGAATTGGTCAGTCAAGAATATGTATGTATTTCT
TACAAAAAGCTCATATAGGAGAAGTACAAGTTGGAGTATGGCCACAGGATATGATTCAAAATTGTAGTAG
TGCAGGAATTGAATTATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3030380-3029190 putative aminotransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAGTATAATTTTGACAGAGTAATAGATAGAGTAGGAACAGATTGTGTAAAATGGGATTTTAGAA
CTAATTGTTCAACAAAAGCACAAAAAGATGGTTTGCCTTTTTGGATTGCTGATATGGATTTTGAATGTGC
AGAACCAATAATAGAAGCATTACGTAAAAAAGTTGAACATAAAATATTTGGATATAGTTCAAATGATAGT
GATAAATACTTTAATGCAGTTTGTGATTGGTATAAAAGGAGATTTAACTGGGAAATAAATAGAAAAGATA
TTATTTTTAGTCCTGGTGTTGTACCTGCTGTTGCTATTTTAGTAAGAATATTAACTAATTCTAATGAAGG
TGTAATAGTCCAAAAACCAGTGTATTACCCATTTGAAGCTAAGATAAAGAGCAATAATAGGGACATTGTA
AACAATCCTCTAATATATGAGAATGGTACTTATAGGATGGATTATGATGATTTAGAAGAAAAAGCTAAGT
GTAGCAACAATAAAGTACTGATACTTTGTAGTCCTCACAACCCTGTTGGAAGAGTTTGGAGAGAAGATGA
ATTAAAGAAGGTTGTAGAAATATGTAAAAAATATGACCTATGGATAATAGCTGATGAGATACATTCTGAT
TTAGTTAGAAAAGGATTTAAACATACTCCTTTACAGTCATTATGCCCAGAGTACAAGGATAAAATAATTA
CATGTATAGCTCCAAGTAAAACATTTAATCTGGCAGGAATGCAGTTGTCTAATATAATAGTGAATAATGA
TGAACTAAAAAAGAAATATCAAGAAGAGGTTACAGCTGTTGGAGTTGCAACTTCACCAAATCCCTTTGCT
ATTGTAGCTACAATAGCAGCATATAATGAAAGTGAAGACTGGCTTAATGAATTAAATGATTACTTAGATA
ATAATATACAATTTATTGATGAATACTTAAAAGAAAACCTACCAAAAGTAAAACTTGTTTATCCAGAAGG
AACATATCTAGCATGGTTAGATTTTACTGCTTATGGATTAAATGAAGTAGAACTTGAGGATTTAATGTTT
AAAAAAGCTAATGTATTATTTGATGAAGGTTATATATTTGGAAAAGAAGGAATAGGATTTGAAAGAATAA
ATGTAGCTTGTCCACAGTCTTTATTAAAAGAATGTATGGACAGATTAAAGACTATATTTGAAAATTTATA
A
>ref|NC_013316.1|:c3031782-3030661 putative amidohydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAACTAACAAAGATTATATTGAGTATGTACATAAAGTGTATGATTATCTACACACTATACCAGAAA
AAGGATTTGAAGAATATAAGACATCAGAGTTTGTTTTAAAAGAGCTTGAAAAAATGGGGTTTGAAAATAT
TAATAAAGGAGTTGCAGGAACTGGTATTATAGTAACTATAGATTCTAAAAAAGAAGGACCAGTATTTGCT
ATAAGAGCAGATATGGATGCATTGGAATTTATCATAGATGGAGAAAAGAAAATGATACATGCTTGTGGTC
ATGATGGTCATACTTCTATGCTTTTAACAGCTGCAAAGTTAATAAAAGAGAGAAATTTAGTAAAAAGAGG
TAAGTTAAAAATACTTTTTCAACCAGGTGAAGAAAAATTATATGGAGCATTAAGAGTAATTGATTCTGGT
TTGTTGGATGATGTAGAAGAAATGGTAGGGATGCATTTAAGACCTGGACAAGATTGTAGGTTGGGAAAGG
CGATACCTGCAATGTACCATTGTGCTAGCTGTATAATGCAATTTACGATTAAAGGTATCACTTGTCATGG
TTCTAAACCACATTTAGGAGTAAATGCAGTAGATGCTGTCTGTTTAGCAGTGAATGCAATAAATGCAATA
AGAGTAAATCCAGCTATACCAAATTCTATAAAAGTAACAAATATATCAGTTAAGGGAGAAACTTATAATA
ATATACCAGATGAAGCATTTATGGCTTTAGATATAAGGGCAGAAAGTAATGATATAATAGAAGAATTAAA
AGAAAAAGCAATACATGCTGTAAAAACTGCTGTAAGTTCTATAAATGCAGAAGCTGTACTAATTTCCAAA
GATGGAGTACCAGCAGCAGAATTTGATGAAGAACTTGTAAACTTGGCTGAAGAAACTATAAAAGATGTAT
TGGGAGCTGATGCATCTATAGGTATATTTAAAAATTCTGGTGGAGAAGATTTCCATTATTATACACAAAA
ACTAAAATGTAAAACTACATATATTGGATTAGGAGCTGATGCTACACCAGGATTTCATAATCCAAATGTA
ACATTTGATACGAAAGCTTTAGAATATGGTGTAGATATATGGTGTAGATTGGTTGAAAAGAGATTGGGAT
AA
>ref|NC_013316.1|:c3032328-3031843 putative permease [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTGAGGTAGCAAAAAAAGAAGTAAAAGTTAAAAAAGGAAATGTGATAGATGCGTTTATTGGAGGAG
CTAGAAATGGATTCCAAATAAGTACAAATTCAATGGCTCCAAATGTCATCTTCGGTTTTGCTATAATTTC
TGTGTTCAATTTAACAGGTCTTTTGGATGTAATAGGGACAATATTTACACCTGTAATGAGTATCTTTGGA
CTTCCAGGTGTTGCAGCAACAGCTATAATGACAATATTTATATCAATGGGAGGAGCATCTGGAGTAATCG
CAGGTTTATTTACAGCAGGTCAAATAAGTCAAGCACATGTTGCAATTCTATTGCCAATGTTATTGCTTTC
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ATGTTTGTTATAGCAACTTTAAATGGTTGTATTGCAATGCTTATAATGAATTATTTCGTAGTATAG
>ref|NC_013316.1|:c3032998-3032330 hypothetical protein CDR20291_2587 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAATTAGAATCAACAACAGAAAAAGTTGAGGTAAAATGGTATGGGTATGTAGCATTAATATTGG
GAGCATTATTTTTTTCAGGAATATTTAAAGATGCACCAGGACCATTAAAAGTATTGGATTTTAACAATGT
ATTAGGTTCTTTTGGAACATTGGGAACAATTAATGATGGTGTAGGTACATTAGCTTCAAACTTTAGAGGT
GATGGAGGTACTGGCCCTCGAGATGGATGGCTATATGCATTGACATTAATACCATCAGTTATGTTTGCAC
TTGGAGTAGTTAGAGTTATAGACCACTTAGATGGAATGAAGGCAGCTCAAAAGCTTCTTAGTCCACTATT
AAAGCCATTATTAGGGTTACCTGGATTTGCAGGACTAACTTTGATAGCTAGTTTACAGTCTACAGATGCA
GCTGCATCTATGACTAAAGAACTTAAAGATGATGGGTATATAGATGAAAAACAAAAAGCTGTATTTTGTG
CATTTCAATTTTCAGGTGCGTCTGCAATTACGAATTTCTTTGCTTCTGGAGCAGCACTATTTCCATTTAT
AGGAGATGTACCAATATTTATACCACTTGCTTTAATATTAATTATGAAGTTTGTTGGGGCGAACTTACTT
AGATTATATTTAAATAAATTTGACAAGGGGGAAGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:3033388-3035412 putative sigma54-interacting regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAAAAAGAAGTTAATCCTTATAACATATGATAAATTAAATAGTGACCACTACAAAGAAGAATTAA
CAAACTTTTTTGGAGACGAAATAATCATAGAAACACAAAATATACTTGATGGAATAAAAGAAAATTTAGA
GGGAGAGGTAGTGCTTTCTCTATCACCTTTAACTAGTAATTTTTTAATAAAACATTTTAAGGAAGATATT
GAAATTATTCATGGAACGAAAGCACTTTCAAAACTTGGATATGAAAAAATGATGAAACTACCTCCAGGTA
CAAAATCGTTACTTATGACAACCAATAAAACTTCAGCATTTGAGATGGCTACTTATCTATATAAAATTGG
TATAAATCATATAGATTTTGTACCGACATATCCAGATTGTGATGAAATATATGATTTAGATACAGCTATA
ACACCAGGTCAGATTAGATTTATACCAAAATACATAAAAAATATTGTTGATTTAGGTTGGAGAAAAATCT
CATTAGATACATATATGTCATTATTAGTAGTATTAAAACTAAAAAATGAGAAATTTATAGAAAAACTATA
CAAATTGTCCAAGGAGACACTAAGTCATGATTTCTTAAATACGTCATTAGATAATATATCTAAATTAAAA
ACTATACTTTACATGACCATTGATGAAATAGGTGATGGTCTAATATTTTTCAACACCTTTAACAAGGTTA
CTTTTGTAAATAAGTCTTTACTTAATATGTTGGAACTAGATGAAAAACTTATAAAATCACCTTCCTTAAT
GGAATATATGCCAAAGAGTTTCTTAGATAAAATTACAAAGAACTTAAATATCGATAATATGATTATATAC
ATAGACGAAATAGATAAAAAATTCATACTTTCTAAAAAACCATTTTATCTTTATAAAAATATAGAGGGTT
GCTTAATTACATTAAAAGATGTAAACAATATAGAAATATTAGAACAAAAAATAAGAAGTGATTCTGTCAA
AAGAGGTTATGTAGCTAAATATAAATTTAATAATATTATTGGAAATAGTTCTATTATAAAAGATTGTATT
AAAAGGGCAAAAAAAATGGCTCTTACAGATAATCCTATATTAATAACAGGTGAAACAGGAACAGGTAAAG
AAGCCTTTACTCAGTCAATACACAATCATTCAAATAGAAAAAATAAACCTTTTGTAGCAATAAATTGTGC
TTCATTACCAAGTGAATTACTTGAAAGTGAACTATTTGGATATGAAGATGGTTCTTTTACTGGAGCAAAA
AAAGGTGGAAAAAAAGGATTATTCGAATTAGCTCATACTGGCACTATATTTTTAGATGAGATAGGAGATA
TGCCACATGATTTACAGGTTAAACTTTTAAGAGTCTTACAAGAAAAAGAAATTAGAAAAATTGGTGGTAC
AAGTATTATTCCAATTGATGTGAGAATATTAGCTGCCACAAATAAAGATTTAGAAAAATTAATTATAGAA
AATAAATTTAGGATGGATTTATTTTATAGGATAAGTATGTTCACTTTAGATTTACCTCCTCTTAGAAAGA
GATTAGAAGATATACCTCTTCTTTTAGAATCATTTTTAAAAGAACTTCCCTATAAAAACATAAAACTCGA
TAAGAGTCTTTTAGAAGCTTTAAATTCATACACTTGGATGGGGAATATTAGAGAACTGAGAAATTGTGTT
GAATATATGGCTTACATGGGTTCCAATTATCTTACAATAAATGATTTACCTCAAAACATATCTTCAAAAT
TAAATAATAATCATATGTCAAGTAATATGTCTATATTCAATGATTTAAACCAATATGACAAAAACATATG
CATTTCTATCCTAAAATCATTGCACATGAAACCAATGGGGAGGACAAAGTTAATGAAATTTATGGAATAT
AATGTCACAGAATACGAAGTAAGAAATATGCTAGAATATTTGACACGCAATGGATACTTAATTTCTAGTA
AAGGAAGAAAAGGCTCATCAATAACTGAGAAAGGCATAAAAATAATAGAAAATAATATAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3036829-3035642 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGCTTAGAAAAATAACAGCATTTATGCTATCCATATGTTTAATTATTGGACTTACAGGTTGTAGTTTAC
TTGTAGGCAAGAAAGATAAAGAGAAAATTATAGATGATTTTAAAGTTGCAGTGGTAACTCAACCATTATC
TGAAAATAAAGTACAATACAATATGGTGGAAGAGATGACAAAAGAATATGAGGAAGAGAATAAAATTGAT
AAAGACAAAGATGGTCAAACTAAAGTTAAACAAACTATAAAACATGTTGTATTGCCAGAGAATTTTACTT
CTAATATAGATAGTGCTATTAATAAGATAGTAAAGTTGGCTGACGATAAAGAAGTTCAGGCTATTGTAGT
TTCAACTGACCAAGCAGGGCTTTTACCTGCTTTACAAAAGGTAAAGGAAAAGCGTCCAGAAATAATAACT
ATTTCTGCCCCTATGGGAGATGATAAAAACCAATTAAGCCAATTTGTTGATGTGAATCTAGGGGTTAGTG
CAGAGGAAAGAGGAAAAGTATTAGCTGAACGTTCAAAAGAAATGGGAGCAAAAGCTTTTATTCATTATGC
CTCTACAGATGATTTGAAAGATGTTAATATAGCCAAAAGATTAGAAATGATTAAAGAGACTTGTAAAAAT
ATAGGATTGCCATTTGTACAAGTTAATACTCCAAATATAAATACTGAAGAAGACAAAAACAAAGTTAAGC
AGTTTTTAAATGAAGATATTGAAAAACAAGTTAAAAAATATGGAAAAGATATAAATGTATTTGGTGTAAA
TGAGTATATGGATGAAGTTATATTGACTAAGGCTTTAGAATTAAAGTATATAGTTGCAGAGCAAAGCAAT
CCATCACCAATACAAACGTATCCTAGTGTTATGGGTCTAAAAATATCTGAAAAAGATGCTCAAAATTATG
ATAAAATAAACGACATGATAAGTGAAAAGGCTAAGGCTTTTGGTATGTCAAATAGACTTGGTGGATATCC
TATGCCAATGGATGCTTTTCTACCATCAGTAGCAATTTATCTTGCTACTGAAATGGTGAAACAAGATTTA
ACACAAGAAGATGTATGTGACCCAGATTATTTAGAGGCGTTTACAGAATTAAGATTTGGAATCGGTTCAG
AATTTACTCCTTTAACAGAGGTACTTTATAATTATCAATCAGTAATTTTAAGCCAATTAATTTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3038302-3037031 putative branched-chain amino acid transport system carrier protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAGATATTTTTATAGTTGGTTTTGCTTTATTTTCTATGTTCTTTGGTGCAGGAAATCTTATGTTTC
CTCCATTTTTAGGGATGGAATCCGGCAAAGACTGGTTAATTCCTCTTATTGGATTTGTTGTTGCAGATGC
TGGTATAGCAATGCTTGTTATTATAGCAACAGCAAGATGCAAGGGAAGCATGGATGATGTACTTAGGAGA
GCTGGTAAAGGGTTAGCAAGAGTAATGAGTGTAGCTGCTCTAGCATGTTTAGCACTTCTTGTAATACCAA
GAACTTGTGCAACAACATATGAAATGGGTATTATGCCTATATTTGGAGACCATGGACCAGTAGCTAAAGC
TATATTTTCAATAATCTTCTTTGGGTTAACTTTAGCATTTACTATTAGGTCTTCTAAGGTTATAGACATA
ATAGGTAAGTATTTAACTCCAGCGTTATTATTAGTATTATTTGTTTTAATAGTAAAGGGTATAATTTCTC
CAGCAGGACCTATGAGTCCTGAGCATATGATAGATAAAAATCTATTTGGTGAAGGTATATCACAAGGTTA
TCAAACAATGGACGCTCTAGGTGCAGCATCTATGGCAACTATAATGTTGATGTCTATAATAGCTAAAGGA
TATACATCAGATAAAGACCAAATAGGAATGACTATTAAAGCTGGTTTTGTAGCCTGTGTATTTCTAGCAG
TAGTATATGGTGGTCTTACTTATTTAGGTGCAACAGTTTCAACTTTATATGATACTAGTATACCTCAAGC
ATCTTTATTAGTTGAAATAACTAGTATATTGTTATATGGTCAAGTAGGAAAGGTAATTTTAGGTGTAATT
GTGGCACTTGCCTGTCTGACTACTTCTACAGGTTTAACAGCATCAATATCAACTTATTTTGAAGGAATAA
GTAAGGCGAGTTATAAACAACTGGTTATAGGTATATGTGTAGCTAGTATGCTTATATCAAATTTAGGTGT
TGATTCTATAATAGCTATATCAGTTCCAATCCTACAAACTATATATCCTGTTTTATTAGCAATAGTTGTT
ATGGAGTTGGCTGGTAAACATATAAAGAATGATAATGCTTTTAAAGGTGCAGCATATGTTACATTAGTGA
TTAGTCTATTATCAGCTATAAATGGAATGACAGGAGCTGTTCCATTTATACAAAGCTTGCCACTCGCAGG
TTTGGGCTTTAACTGGGTAATACCAGCTATATTGGGTGGAATAGTTGGTAACTTTATAAAAAGCAACAAA
CAAGTAGCATAA
>ref|NC_013316.1|:c3039096-3038443 conserved hypothetical pentapeptide repeat protein [Clostridium difficile R20291]
ATGACTAAAATTATTAAAGTGCAAAAACCTAAATTTACAGGAGAATTAGAAATTATTGAAAATCTTGAAG
ATATACTTGAAGATATATTTAATGATGAAAAAATATTTAATAAAATTATAGAAAATGAAGTTATAAGTGA
TTTAGATTCTGTAAGAGTTAGCTTTGAATCTTGTATATTTAGAAATGTATCCTTTGAAAATTGCAATTTA
AAAAAGATTGATTTACTTGATGTGGTATTTGAAAACTGCAATTTATCAAATTCATTTTTTGATGGAGGAA
GTATATACAGAGTTGAATTTAAAAATAGTAAATTGATAGGAGTTAGATTTGATGATTGTATACTTAAAAA
CGTTTTGTTCAAGGATGTTTTAGGTAAGTATTCTAACTTTTCATTCTCTAAATTTAAGATAGTTTCTATC
TTAGATTCAAATTTTGAAAATTCTGTATTTCAAGAAGTAAAAGGTGACAATCTAGTATTTGAGTATACAA
ACTTAAAAAAAGCAAACTTTAATGGAACTAAACTTTCTGGCATAGATTTTACCACTAATAATATTGAGGG
AATTGAGATTGGTATAGATGAGATTAGAGGAGCAATTTTTGATGTGTCACAAGCAATTGATTTAACGAAA
TTGATGGGAATTATCATAAAATGA
>ref|NC_013316.1|:3039600-3040943 putative permease [Clostridium difficile R20291]
ATGGTACCAAACACTAACAATGTACAACCAGATGGAAATAATTCATCATTAAGCTTTTTAGACAAAATGT
TTAAATTTAGCGAACGTGGCTCTAGCCTTAAAACAGAAGTAATAGGTGGAGTTACTACATTCTTAACAAT
GGCATACATAGTTTTCGTAAATCCAGCAATATTATCTGAAGCTGGAATGGATAAAGCCGCCCTTATAACA
GTTACCATACTAGCTACAGCCATTGGTACACTTATATTTGCGATTTTAGGAAATGCACCATTTGCTCTAG
CTCCTGGTATGGGATTAAATGCATTTTTCACATACTCTTTGGTTATAGGTGCAGGAATCCCATGGCAAAC
AGGTCTTGGGGTAGTTTTTCTATCTGGATGTGTCTTCTTTACACTCGCAGTAACAGGTCTTCGAAAGACA
ATTGCAGACGCAATTCCTAGAGAATTGGCAGTAGCATCTTCAGCAGGTATAGGTCTTTTCCTTGCTTTTG
TTGGTTTAAAAAATATGGGTGTTATAATAGCTAATCCAGATACTATAGTTTCACTTGCAGATTTTACACC
AACAGTTTTAATAGCTCTTTTTGCTCTTATCTTAATGGCAATACTAGAATATAAAAAAGTTAAAGGTGGA
ATATTGATAAGTATAGTAGTTGCAACAATAATATCTGTTATATTTGGATTTGTGGAGTTGCCAACAGCAA
TAATCTCAACACCTCCTAGTATAGCACCAGTTGCTTTTAAATTAGATATTGTAGGTGCATTGAAATTCTC
ATTAATTGGACCTATATTCTCTTTCATGTTTATAGACATGTTTGATTCATTAGCATTTCTTATTACTTGT
TGTAAACAAATGGGTCTTGAAGATGAGAATGGTGAAATAAAAGATTTAGGAAGAATGTTATATGCAGATG
TTTCTTCTACTTTAATAGGCTCATTCTTAGGAACTAGTACTGTTACAACATTTGGAGAATCTGCTTCTGG
TATCGCAGCAGGTGCAAGAACAGGACTTGCTTCAATAGTAACAGCAGCATTATTCTTAGCTACACTTATA
TTTACACCATTGCTTGGTATAGTTCCTACTTACGCTGCAGCTCCTGCACTTGTAATGGTTGGTGTATTCA
TGTTTGAAAGCATAAAACAGATTGATTTTGCTGATAGCAAAATAGCTGTACCTGCTTTTGTTACAGTTTT
ATTGATGCCTTTAACTTATAGTATAAGTATTGGTTTATGCTTTGGATTTATTTCATATATAATAATGCAT
GTGGTAGCTAAAGAAACTGATAAAATCAGTATTACACTTTGGATTATAGGTTTACTTGCAGTTGTAAACT
TAGTTCTAAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:3041090-3042454 putative amidohydrolase [Clostridium difficile R20291]
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GAAGTATACTTATTGAAAATAATATTATAAAAAATGTTGGTAAGTTTGATATTAATATTGTAGATAAAGA
TGCTGAGATATATGATGCTAAAGGAAAAATACTAATGCCAGGGTTAGTCAATACACACGTTCACTTATCC
CAACAATTAGGACGTGGTCTTGCAGATGATGTTGTACTTTTAACTTGGCTTAGAGAGAGAATCTGGCCAT
ACGAAAGTAGCTTCAACTATGAAGATTCATTGATTTCATCTACTGCATGTTGTGTTGAATTGATAAAATC
TGGGGTAACTACATTTTTAGAATCTGGTGGTCAATATGTAGATGCTATGGTTGAAGCTGTTGATAAAACT
GGACTTAGAGCCTGTTTAGCTAAATCAGTTATGGATACAGGAGATGGTCTTCCTGAAGCATGGCAAAAAA
CTACTGATGAGGAAATCAACACTCAATTAGACTTATTCCATAAGTTTAATAACACATCTAATGAGAGGAT
TAAAATATGGTTTGCATTAAGAACTATTTTTAATACAACTGAAGAATTGCTTATTAGGACTAAAGAGTTA
GCTGATAAATACAATACAGGTATACATATGCATATTGCTGAAATAGCTGATGAAATTTCATTTGTAAAGC
AAAACAACGGAGTTGGAACAGTTGAATATCTTGATAAACTAGGTGTATTAGGACCAAATCTTTTAGCTGC
TCACACAGTTTGGCTTACTCATAAAGAAATTGATTTATTTAGATTACATGATGTAAAAGTTTCTCATAAT
CCAGGTGCAGCTATGAAAGTAGTTCTAGGATTTGCCTCAATTCCTGAAATGTTAGAAAAAGGAATACCTG
TTTCAATTGGTACTGATGGAGCTCCTTCAAATAATAGAATGGACCTTATGAGGGATATGTATCTTACATC
ACTAATACATAAAGGTAGAACTTTAAACCCAACTGTCGTACCAGCTGAAGAAGTCTTAGAAATGGCTACT
ATAAATGGAGCAAAATGTGCTTTACTAGAAAAAGAAATTGGTAGTCTTGAAGTAGGAAAAAAAGCTGATA
TGATTATTCTAAATCCAGATACAATTCATTGTTTACCAATGCATAATCCAATTGGAAATATAGTTTATTC
TATGACTAGTGAAAATGTAGATTCTACTATTTGTGATGGTAAATGGTTGATGAAGGAAAGAAAAGTATTA
GTTGTAGATGAATCTGAATTATTAAATAAAGTTAAAAAACAAGCTTCTAAAATAAAAGATAAAGCAGAAG
TTAAAATTCCATCTAAATTTAAAATCATAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3044497-3042632 hypothetical protein CDR20291_2594 [Clostridium difficile R20291]
GTGGAGAATGTTTTTAAGCGATTGCAGGAATTTAATGGTTATGATGGATACAAAGAATCATTTGAAATGA
ATTACCTATGTATATATGAAAGTATACCGTTAAGAGAACAAGTAGAACTTGCAAATAATCTAGTAGATGA
AATTTTAAATATGTATAAAAGTGAATCTAATGAAATTTATTTATTGGAGGATAGTAATTCTAAGTCTTTA
ATTTGTTATTTCGAAATTTTTATGAAAAAGATAAATACTTTGGTAAAAGAAATGATTATTGATGAGAAAT
GGTTATATAAATTAACTAAAGAATTAATATATAAGAGTAAAAAAGTTGAGTATGTAAAACTAGGGTTAGT
TTTAAGTGAGAAATATCTAAATGTAGAAAACTTAAGAGAAGTTGTAGATACATTTTCTAAATCTGGAGAA
TACGTATTTTATCTGAGTAATACTATTAAAAAACTTGAATTTTACAATACATATTTATTTAATTTATCTA
AAAAGGCTACAGGTTCAATAAAAGTATTTGCTATTGTTAATATGGAAAATTTAGATTCTAAAATAAATTC
CTATCTAATTGAAGATGGTTATAAGGATACAAAGTACGAACGATTATTGATGAACTATATTATTTCAATT
GTAGATTTGAATGAATATCTTGAAAAACGAGATTTAGATAAAGAAAAGATAAATAATTTAGCACGTCTTA
TATGCAATTACTTGCTAAGTGTAGAATTTAAATATATAGGTAATAAATTAGAATTAGTGAATCGATTTTT
ACCTACTGTAGTAAATTATGGGACTAACTTTGAAAGTTTATATTCAATTTTCCTAATAGCTATAAACGTC
TTAAAAGATGAAAATATAGAGTACAATAAGATTGAATTTGAAAAAGAAATAAATGATATCTTGCTCAGTG
AAAAATGGAAAAATATATATTTTGAAGCATTAAGAGATGCTAGTGGAAAAACAGAAGATATTATAAAAAT
GTCAGAAATTTATGATGTAAACTTATCTTTTGATGACTTGTTGCCATATCTGAATAGAGATATTAGAGAT
TTTGAGGTATATTGGCATATATCTAAAAAGGGAACGACAAGTTCTAGATTAAAATTATTAAATTTTTTTG
AAGAGACGTTTAAAATAGATGATTTAATTGGAAAAATGAAAGATATAGAAAAAGATAAATTGACTCAAGA
ATATTATGATGATATGTTATTTTTTATTGTGCTTAAAGGAAGTAAATCACTATATCCTGAAGGAAAGAAT
ATATCTTTAAAAGGAATATTTGGAAATATAAATGAAGTAAGAAAAGAATCCATAAATATCTTAAAAAGAT
ACAGAGAGAAACTATCTCTTGAAGAATTAAAAATTGTTAAAGAAGCGTATGAAAAAGAAAAAAATGTTAT
ATTGAAGGATGAATTAAGAAGAGTATTATATGAAAGTAATAATTTAAAAAAAGAATTTGTAAATATTGAA
AAAATAAAAGTAGATGAACATGGTAAGGATATCTATTTGACTTCAATAGCTGTTGCTGGTTCAAGGTTTA
GAAATAGAGAATATCTTGAAAAAGAATTGGAGAAGAGTAAGATATACTATTTAACTAGAGAGAAAGATAA
TCTATATGATGAAAAAGCTATTAAAATAGTTGGTGAAACTGGATATGTAATAGGCTATGTCCCAAGAAAA
GAAAACTATATTTTGAGCAATTTATTAGATGGAGGAAAACTGCTGTATTGTAGAGTAACTGAATATAATT
TATATGAAGATTGTATCTACGCAAATGTGTACTTGAGTTATAAAGATGTAATTGAAACAGTTGAAAACTC
TTTAAAGATGGTTTTAGATAAGAGTAGAATAAAACTTATAAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3045950-3044733 putative transport protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAACAATAAAAAATATTATCCTACTGCCATAGCGTTGTATTTTTCATATTTTTTACTTGGTATTGGAA
TTTCAATTTTAGGACAATACAAACCAGAATTTTCATCAATGTGGGGGGCTAAAACACTATCAGATGGAAC
ATTGGATGTAAGTATTGTTTTAGCTGTTATTGCTGCACTAGGATTAGGGAGACTTATATCTTATCCATTT
GCAGGACCTATTTCAGATAAGTATGGAAGAAAAGTAAGTGGTCTTATAGGAAACTTTCTACATGCAATTT
TCTTTGTTGGAATTGTATTTTCACCAAATTTTTATATAGCATATGTATTTGCAATAATTGGAGGGGCAGC
AAATTCATTCTTAGATACCTGTGTAACTCCTTCTTGTATGGAGATATTTGCTAGTTTAGGAACAATAGCA
AATATGTTTACTAAATTTACAATAGCTTTAGCACAATTTTTGCTTCCTTTTATAATTGGATTTGTTGCAG
CAAATTCAATATCATTTAAAGTTATTTTTATAGTAACAGCGATTCTTATTGTAGTAGATGCCATTTTGAT
AGCTGTGTTACCATTTCCACCAGCTAATAATGTTATTGATAACAAAGGCAAAACAGTTAAATCAGAGAAG
ATGAAATTTACACCAACAAGTATAGCTCTTGTTTGTATTGGATTTACATGTACATCTACATTTGTATTAT
GGTTAAATTGTAATCAGGAATTGGGTAAATTGTATGGGATGGCTGACCCTACAAAAATTCAATCCTTTTA
CTCAATGGGAGTAATATGTGCAGTATTAATAACTTCTTTACTTATTAAAAAATATATTAAACCAATAAGA
ATATTAGTTATATATCCTATAATAGCTTTACTTATGCTATTAATTGTATATTTTGTTCAAACTCCAACTA
TTTGTATGTTAGGGGGATTTGTAATAGGTTATTCAGCAGCAGGAGGTGTTCTTCAGTTAACAACGTCAAC
TGCAAATGAAATGTTTCCAACTAATAAAGGAAAAATAACATCTATAGTTATGATTGCATCTAGTATAGCA
AACTATGTTATTTTAAATATAGCAGGTATTATTACAAAATCAGGGGGAGTTAATGGACCAAAATATGTTG
TATTGTTTAATGTGGCAATAACATTTGTTGGAATTTTACTTGCATTGTTTGTAAACATGAGATATGAAAA
AGAAAAAGTGTATGATTATGATGTCTAA
>ref|NC_013316.1|:c3047013-3046150 NAD-dependent shikimate 5-dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAATTTCAGGTAGAACAGGATTATTTGCATTAATAGGTACACCAGTTGGTCACTCTAAATCACCAG
TGATGTATAATTATAGTTTTAAGAAATTAGATTTAGATTATAGATATTTAGCCTTTGATATCACAGTAGA
TAAGGTAAAAGAGGCACTTTTAGCAATAAAAACTTTTAATATAAAAGGAGCCAATGTTACTATGCCATGT
AAATCTGCTGTTACAGAATATATGGATGAACTTTCTCCAGCAGCTCGTATAATTGGAGCATGTAATACAA
TTGTAAATGACAATGGAAAGTTAGTTGGTCATATAACAGATGGAGTAGGCTATGTTCGTAATTTAAAAGA
AAATGGGATAGAAGTTAAAGGTAAAAAGATTACAATTATGGGTGCTGGTGGTGCAGCAACTGCTATACAA
GTACAATGTGCTTTAGATGGAGCAAGAGAAATATCTATCTTTAATGCTAAGGATGATTTTTATAAAAGAG
CAGAGCAGACAGTTGAGAATATAAAAAAAGATGTACCAGAATGTGTTGTTAATCTATATGATTTAGAAGA
TACAAACAAACTTTATGAGGAGATAGAATCAAGTGATATATTGACAAATGCAACTCTTATTGGTATGAAG
CCTTATGACAATGAAACAAATATAAAAGATACTAGTGTTTTAAGAAAAGACTTAGTAGTAACAGATGTCG
TTTATAATCCTAAGAAAACAAAAATGATTGAAGATGCTGAAGCTAATGGATGTAAGGCTATTGGTGGATT
AGGAATGTTATTATACCAAGGAGCAGAAGCTTTTAATCTATATACTGGATTAGAAATGCCTGTAGAAGAA
GTTAATGAATTATGCTTTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3049017-3047095 putative NADH-dependent flavin oxidoreductase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGATTAGTTCTATGTTTACACCTATAAGAATTGGTTCAATGACAGTTCCAAATCGTTTTGTAGTTC
CCCCTATGGGAAACAATTTTGCAAACACAGACGGTACTTTAAGTGAAACTTCTAAGGCTTATTATCTTGA
GCGTGCTTTAGGTGGTTTTGGATTAATAACTATAGAATCTAGTGTTGTAGACAAAAAAGCAAAAGGAGGT
CCTCGTAAGCCTTGTTTATATGATGATAGCACAATAGATAGTTTTAAAAATGTAATAGATGCTTGTCATG
ATGCAGGTTCGAAGGTATCTATACAATTACAACATGCTGGTTCTGAAGGAAATGAAAAAGTAGCAGGACA
TCCATTAAAAGCTGCTTCTGCAATACCTGCATCAAATGGTCGTAATACACCACTAGCAATAACAACAGAA
GAAATATATGAACTTATAGAATCTTATGGAGATGCTGCATTACGTGCACAAAAAGCTGGTGCAGATGCTG
TTGAAGTTCACTGCGCTCATGGATATCTGGTTAGTAGTTTTATATCACAAAGAACAAATAAGCGTGTAGA
TGAGTTTGGTGGATGTTTTGAAAATAGAATGAGATTACCTCGTCTTATCATTGAAAATATACGTAAAAAA
GTAGGAAATTCTCTAGCAATATTATGTCGTATAAACAGCACTGATGATGTTCCAGGAGGAATTGATATAC
ATGATAGTTCAGTAATAGCAGCATATCTAGAAGGTTGTGGAATAGATGGACTTCATGTTTCACGTAGTAT
ACATATACATGATGAATATATGTGGGCTCCTACGACTTTACATGCTGGATTCAGTGCAGAATTAGTTACT
GAAATAAAAAAAGCTGTTAGTATACCAGTAATAACAGTTGGACGTTATACAGAGCCACAGTTTGCTGAGT
TAATGGTCAGACAAGGAAGATGTGATTTAGTAGCATTCGGTAGACAAAGCTTGGCTGACCCAGAAATGCC
TAATAAAGCTAAAAATGGAAAACTAGACGAAATGATACCATGTATTGCATGCTTACAAGGATGTGTACCA
AATATGTTCCAAGGAAAACCTATAGCCTGTCTTGCAAATCCTATATTAGGACATGAAGCAGAGCTTAAGC
CAGCTGAAATTAGCAAAGAAGTTCTTGTTGTTGGTGGAGGTGTTGGAGGTATGCTTGCAGCATGGGTATG
TGCTAAAAGAGGACATAATGTAACTTTAGTTGAAAAATCTGAAGTTCTTGGTGGGCAAATGCGTTTAGCT
GCATATCCTCCAGGGAAAGGAGATATTACTAACTTAGTTAGAAGTTATATTTCAAAATGTAATCAATATG
GTGTAAAAATATGTACTAATACAGAAGCTACAGTAGAACTTATAAAGGAGAAATCACCTGATGTAGTTAT
TATAGCTACTGGAGCAACTCCACTTGTACTTCCTATACCAGGAATCAATGATTCAGGATTAATTCATGCT
GTAGACCTTCTTGATGGTAAAAAATCTTGTGGGAAAAAAGTACTTGTTGTTGGAGGTGGAATGGTTGGAT
GTGAAGTGGCAGCCTTCCTTGGAGAACAAGAACATGAGGTTACTGTTATTGAGCTTAGAGAAGAAGTTGG
TGCAGATGTAATTTCAGAACACCGTAAATTCCTTATGAATGATTTTGAAAATTATAATATACATACCATT
ACTGGTGCAAAAGTTTCTAAATTTTATGATGATGGTGTCGACTATTTACTTACAGATGGCACAGAGCATG
ATTTAAAAGGTTTTGATTCAGTAGTACTTGCTATGGGTTCTCGTAATTACGACCCATTAAGTGAAGTTAT
AAAAGAAGTTGTAAAAGAAACTTATATTGTTGGTGATGCAGTAAAAGCTCGTAGGGCATTAGATGCAACA
AAAGAAGCTTTTGAAGTAGCATTAAATATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3049944-3049096 hypothetical protein CDR20291_2598 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATCAAAAAAATCTTAATATTCCAATTACAATTAGTTCTTATACATTGGGAACAGAAGTTTCAT
TCCGTGATAGAGTTCGTATTGCAAAAGAAGCTGGATTTGATGGTATTGGATTGCGTGCTGAAAATTATAT
TGATGCAAAAAATGCAGGTGTTACAGATGAAGAAATGATTGCAATTCTTAATGAATATGATATGAAAGTT
ACAGAAGTAGAATATATAACTCAATGGGGAACAGAAGAAGATAGAACTGAAGCTCAAAGAGAAAAAGAGC
AAAATGTTTATCATATGGCTCACTTATTTAATGTTAAACATATAAATTGTGGATTATTAGAGATGATACC
AGAAGAACAAATTATAACTGCATTGGGAGAATTATGTGACAGAGCAGGTGAACTTATTATAGGTCTTGAG
TTTATGCCATATAGTGGTGTACCAGATTTGGCTACTGCATGGCGTGTTGTGAAAGGATGTAATCGTGAAA
ATGCAATGCTTATATTAGATACTTGGCACTGGGCTAGAGCAAAGCAGACAGCAGAGGACCTTGCACCTGT
TCCAGCAGATAAGATAGTATCAATTCAAGTGTGTGATGTTTTAGAAACTCCTTATGAAAAACTTAGGGAT
GAATCACTACATGACCGTTTGGCTCCAGGTGAAGGATATGGAAACACAGAGGAATTTGTGAAAATAATAA
AAGAACACAATATATCACCAAGAGTCATAGGGGCAGAAGTAATATCTGATTCTCTAATATCTAAAGGGTT
ATCCACTGCTGCTGAAACTGTATTTAATGCAACTAAAAAAGTTTTGGATAAAGCATGGTCTGAAGTATCT
CCAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:3050357-3051238 LysR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
TTGAATTTATATCACTTACGCTATTTTGTTACATTGGCACATTTAGAACACTATACAAAAGCGGCAGAAA
ATTTATCTATAACACAACCAAGCTTAAGTCATGCTATTTCTTTACTAGAAAATGAACTTGGGGTGGCTCT
ATTTGAAAAAGAAGGTAGAAATATAGTCCTTACTAAGTATGGAAAAATATTTTTAAAAGATGTGGAAAAA
TCATTAGAAATTTTAGATTCAAGTGTAAAATCATTAAAAATAACTGGTACTGGTGAAGGACAAATAGACT
TAGCTTTTCTTAGAACACTTGGTACTGATTTTATCCCAGACATAGTGCATAAATTTTTAAAATCTAATCC
TGCTAAATCAATAGATTTTAAATTTCATACTGGTGTAACTACTGACATTATTCAAGGTCTTAAAGAAAGA
AAATATGATATTGCATTTTGTTCGAAACTTGAAAAAGAAAAGGGAATTGAATTTATACCTGTTGCCAAAC
AAGATTTAGTACTAATTGTACCATATAGTCATCCACTAGCTGCAAAGGATACTATAGATTTAAAAGAAAC
CATACCTTATCCTCAAATAGTATTTAATCAGAGAAGTGGTCTTAGATATATAATTGATGATATGTTTAAA
AAAATAAATCAACAGCCTAATATAGTCTATGAAGTAGAGGAAGACCAAGTAATTGCTGGATTAGTTGCAA
AAAATTTCGGAATTGCTGTAGTCCCAAATATGAATATGCTTAGCTTTACAAAAGTAAAAGTAATTCAGAT
TATTCACCCAAGTTGGGAAAGAAACTTTTACTTAGCATTTATAAAAGATAGATATTTGCCTCCTGCAATT
AAAAACTTTAAAAACTTTGTCATTAAAAACGCTCAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3052309-3051446 hypothetical protein CDR20291_2600 [Clostridium difficile R20291]
ATGCTATCATCATATGTTAAGAGGGTGAGTAAGATTATAAAGAAAAAATATATAATGTTTATTGATGAAA
GTGGAAGAGCTGATATAAATCATGAAGACCCATTTACATTGACAGGAGTAATTTTTGAATATAAATATGC
AGTAAGTCAAGGCGATTATGTATGTTCTTTGAGGAAAGAAATGGATGCATTTAAAGAGTATTGTTTTGGA
ACCAGTAACATAGGAATACATTTGACAGATATATCAAGAAAATCAAGAGCATTTGAGAAGTTTGATGATT
CACAGATTAAGTTATTCTATGATGAGTTGCCTTTATTTCTATCTAGATTAGAGTGTACTATAATATCAGT
AACAGTAGATAAAGCTAGATTAAAGAAATATTATGCACCTTCAAAGGAACCGTATGTTGTGGCTTTTATA
CATGTTCTTCAGAATTTTTATTCATTTGTAAATAATGAAACTGTAGAATCTGCACGAATAGTTATAGAGT
CAAGGGATGATGTCTCAAACTTAAAAGTACAAAAGGCGTTTTTTGATGTATTTAATAATGGAACAATATA
CTTAGATATAGATGAAGAATTAAGAGATAAGGTTAAGGGTTTTATAATTGCCAAAAAAGAAGATGCTGAC
TATAGAGAAGGTTTAGAAATAGCAGATATTTTATGTAATCCTCTTAGCAGAGCAAGAAGAGGGTTAATAG
AAGCTAATCCAAAGTGTATGCAATATGGAGAAAAAAACAAAATATTCAAATCTGTCAGAAACAAAATATA
TACTCCAACGAGTGTGAATGATATAAGAAATTGGGGATTTAAAGAAGTTCCTATTGTAGAGCCTGTTGGA
CCATGGCTTGAAAAAATGCGTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3054425-3052464 cell surface protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTCTAAAAGAGGGGGAAGTTATAGTGAAAAAAAGTCTAAAAAAGTATTTAGTACTAGCACTGACTT
TAGTTTTAGTATTTGCATGTGGCGTACCAGAATCAAGCGCAGCCAGTAAACATGTGATTATAGTAAATTC
AAGAAAGAATACTCTAGGATATTTTGTAAATAATAAACTTGTAAAAGAATTTAGAGTTGCAACAGGTAAA
AAGGGGTCAGAAACACCAACAGGGAAAACAAAAGTAGTTAACAAGATAAAAAATAGACCATATTATAAAG
GTAATATACCTGGAGGAAGTCCAAGAAATCCATTAGGAGATAGATGGATGGGATTAGCATTAAAAGGAAC
TTATGGAGATACATATGGAATACATGGAAATAATAATGAGAGTTCTATAGGAAAGCATATTTCTGGTGGA
TGTATAAGAATGCACAATAAAGATGTTAGATGGTTATTTGACCAAGTTCCTGTAGGTTCAGATGTAATTA
TAGATTATAGTAATGACAGCTATGTAAAGATAGCGGCAAAATATAAGATAAATCTAAATCAAACAGGATG
GAAAACAGAAAATGGTAAGAAGTATTATGTAAAATCTGATGGAACATACCAAAAGAATAGTTGGCTAAAA
GTAAATGGAAAAATGTATTACTTTGATGCTTCAGGAGTAATGCAAACAGGATGGAAAGCAATTAATAACA
AAAAATATTATTTAGGAACTGATGGAGCAAGAGTATCTGGATGGAAAGTAATAGACGGAAAAACTTATTA
CTTTAACTCAGATGGAGTAATGCAAACAGGATGGCAAGAAAAGAATGGAAAGAAATACTATCTAGGATCT
GATGGTTTATCAGTAACAGGATGGCAAGAAATAGATGGTAATAAGTATTACTTTGACAAAACAGGAATAA
TGCAGACAGGATGGCAACAAATAGATGGTAAGTCTTACTATTTAGACAAAGATGGAAAGATGCTAACTGG
TTCTCAAAAAATAGATGGGAAAGATTATACTTTTAATGAAGATGGAACTATAAATCCTACATGGGATACA
ATTATAGGTGCAAATAGATTTGATACAGCTAAAAAGATAAGTTCAGTTGGAAACTGGAATGCTGATAGTT
CAGATACTGTAATATTAGTAAATGGTAATGCAATAGCTGATGGTATAACAGCAACTCCTTTAGCAAGTAG
CTATGACTCAACAATACTACTTACTAATACAGCTAATTTACCAACTGAAACTGTTGAAGAAATGAAGTTA
TTAGCACCTAAAACAGTAATCTTGATAGGTGGAGAAAATGCAATAAGTTCTAAATTAGAGCAAGAAATAA
AAACTACTTTCAACACAGAGACAAAGAGAATAGCAGGTCAAGATAGATATCAAACTGCTACAAGAATAGC
TGAAGAACTTGGAAATCGAGAAGAAATAAAAACTGCATATATGGTTTCTGGAAATGGGGAAGCAGATGCT
TTATCTGTAGCTTCTAAAGCTGGGGAAGAAAAACAACCTATAATATTAGTCAATAAAGATGGAATTACAG
AAGAATCTTATAAATGGCTAACAGAAAGAAAATTAGAAAATGCATACTTTATAGGTGGACCAAGTGCAAT
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TAGTTAGTAAATCAGATGCTTTAGTAGATGCTTTATCAGCTGGACCATTAGCTGTAAAATTACATTCACC
AATAGTTTTAATGGATAATTCAGGATTATCATTAGAGCAACAAAGAGTATTTGCAAATAAAAAAGTTGAA
ACTCCTTATCAAATAGGAGGCGGAGTATCTTATATAGTAATGGATAAATTAATGGATATTCTTGCAAAAT
AG
>ref|NC_013316.1|:c3055523-3054510 UDP-glucose 4-epimerase [Clostridium difficile R20291]
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GTTATGAAGTTGTTATAGTTGATAACTTAAGTAATAGCAACTCAATAGTGGTTGATAGAATTAAGGAATT
ATCTAAAAAACCAGTAAAATTTTATAATATTGATATCAGAAATAAAGATGAAATGCATGTTGTATTTAAA
GAAAATAATATTGAATCAATTATACACTTTGCAGCTTTAAAAGCAGTTGGTGAATCAGTAGAAAAACCAA
TTGAATATTACAGCAATAATCTAATAAGTACCTTAAATTTATTTGAATTAATGAGAGAATATGGTGTTAA
AAAGTTTGTATTTAGTTCTTCAGCTACTGTATATGGAGACCCACATACTTGTCCTATATTAGAGGATTTC
CCACTTTCTGTAACCAATCCATATGGAAGAACTAAACTTATGATAGAGCAGATGTTAGTAGATATATCAA
AAGCAGATAAGTCATTGGATATAGCTCTTTTAAGATACTTTAATCCAGTTGGTGCTCATAAAAGTGGTAG
AATAGGTGAAGAACCAAATGGAGTTCCGAGCAATCTAATGCCTTATATAACAAAAATAGCAGTAGGTAAA
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ATGTATTAGATTTAGCTGCTGGTCATGTAAAAGCATTACAAAAATTAGAAGAAAATCCAGGACTTGTTGT
TTATAATTTAGGAACTGGAAAGGGTTATAGTGTTCTTGATTTAGTAAAAGCATTTTCTAAAGCAAGTGGA
AAAGAAATACCATATAAGATTGTAGGAAGAAGGGCTGGAGATGTAGCCATGTGTTATGCAGATTCTTCAA
AGGCAGAAAAAGAGCTTGGATGGAAAGCTAAGTATGAACTTGAAGAGATGTGTGAAGATTCATGGAGATG
GCAAAGTATGAATCCTAATGGGTATGAAGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3056492-3055548 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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TGCAGATGACAGTTAAAAAAGCAATAATACCAGCAGCAGGGCTAGGAACCAGATTTTTACCAGCAACAAA
ATCACAGCCCAAAGAAATGCTTCCTATAGTAGATAAACCAACTTTACAGTATATAATAGAAGAAGCTATA
GAATCGGGAATTGAAGAAATTCTTATAATAACAGGTAGAAATAAAAAATCTATAGAAGATCATTTTGATA
AATCAGTTGAATTAGAGTTAGAACTAGAGCAAAAAGGTAAGACAGAGATGTTAGAAATGGTAAGAGACAT
ATCAAATATGGTAAATATTCATTATATAAGACAAAAAGAGCCAAAAGGTCTTGGACATGCAATTTACTGT
GCAAAAAGTTTTATAGGTGATGAACCTTTTGCCGTATTATTAGGTGATGATATAGTAGATTCAGATGTTC
CGTGCTTAAAACAATTAATAGATACTTATAATGAGTATAAAACAACTGTATTAGGTGTTCAAAAGATAGC
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GATAAGATTGGTTTTTTAGAGGCAACAATAGACTTTGCTCTAAAGAGAGAAAATTTAAAAGATGATTTAA
TGGACTATATGAGAAAAAAAGTAAGTGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3056935-3056615 hypothetical protein CDR20291_2604 [Clostridium difficile R20291]
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ATAATGAAGTTTATTACGAGATTGATTTAGATGAAATTTTAAATGAAAACTATATAGATGAAGATATAGA
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ATATAGATAGTGATATAAAAGGCATCTTAGATGAAATTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3058916-3056925 hypothetical protein CDR20291_2605 [Clostridium difficile R20291]
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ACTCAAAAGAATATAAAAAGCTTCATATAACAAATCTAGGGAATATAATAATCAGCAAATCAGATGAAGT
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GAAGATTCTCAAATAATTGTCTATGGAAATAACTTGCCTTTTTACATAAAAAGTGAAAATTCAAGTAAAA
ATGTTACAGCAAATTTGACTATGAAAATAACTTTGGATGAATATGATTTAATCTGCAAAAGTCAAAGAGA
ATTTATATTCTATCTAAAGGATAATATGACTATATTAAGTTTAGATGACAATAAGTTTTATATGGGTGGA
ATTAATAAAGATAATGAGAAGTTTATATTTATCAGTGGGAAAAATAGATTTGAAATAAATTTTGATGATA
TAGAAAGATACATTTTAGAAGATAAAAGAGTGTCATTGAAGGGATACTTTCATATGGAAAGAGAGGGGAT
TATAGTAAGGTCTGTATCTATATTTAATAACAATATAGATAGTGTAGTTCCATCTGATTTAAATGAGAGA
GTTAAAGATAACCAAAAAATAGGAAATCTTCCTAAAGATTGTGATATAGTATTCTGCAAGATATCAGGAA
ATATAGATGGATTTGATTATAAAAACACAAACATGCTTTTAGTAAAATATCAAGACCAATTAATTTTTAT
AAATAAGAAATCTAAGAAGACTATTGTAAAGTCAGCGAAAGATAATTGTTCTAAGTTAAATTTAGGAGAA
GATATAATATTATATGATAATAAAAATGTATTTAACCTACATATAAATGATAAAAATAGAGAAATTATGC
AAATAGATGACTTAAAAGATATAGAAAATGAAATAGTGGGATATACATTAAAACATGCTCCATTTTTTAT
TCAAGAAGATTTCGATAGCTTGACTATTCTAAAGTCTTTTCAAAAAGAAATCATATCTATAAAAAATAGT
GATATAAAAGACATTGTAATTAATAAAGAACTTGAAAACGAAAATTCTAATTTTGTAGAAACGGAAATAA
AATTTAATAATCAAAAAGTACTTTTAAACTTAAGTAAAAATATGGTTCAAAAACTTATGCAAGATGTATT
TATATATGCAAAGCAACCTCTACTTAAAGAAAATTCTATTGAAGTGATATATAAGAATTGGTCTAAAGCT
ATGAATGATATGATAATATTTAATTTTTTTGGAAATATTTACTATATGAAATCTGAATTTGATAAGATTT
TAGAAAAAGAGTTAAATGATGAAATAAGAATAGAAGTTATAAATTCACTTTATAAGCAAATACAAGAACA
AAGAAACAATTTAGATTTATTGTCAGCATATATGCCAAGAATATTAGAAAATCAAGAAATAGATTTGTTT
GAAAAGTATAATACTAAACTTGATGTACAAGTGTTTAAGCAGATTAAAAATCTATTGTCTGACTTATCAT
ATAATATAAGCAGTTATTTAAATGAAGTTGAAAAAAGTTTAGACAATATCATCTTTGTAATTTCAGGAGA
AGATAAGAAGAAATACAATTATAGAATGTTAAAAGAAAGTGAAAGTGCAAGTCTTGATGTATTTTTAAAA
CAAGCCATATCAAGATTAAACCATTTAGTAGAAAATATGTATCCTTATTATGTAGATGAAACTAGTAGGG
AAATGTTTAAGTTATTTGAGTTATTGTGGAAAAACTATAGAAATATTGATGATGATAGTATAAAAGAAAT
ATTATTCGAGAGAATAACAAATACATATGTATTTAAACAATTGACATTAAATAATAGTACAAAAGAAAGA
AGAAAAGACATAATTGAAAAAATATATAACTCTGTTGATTATGGAACCAATAAACTAGATGAAAATATGT
TTTTCACAGGAGGAATAAAGTATGTCAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3061581-3059038 putative surface protein [Clostridium difficile R20291]
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CTTATTGGCAAATGGATAGTAGATAAGTACATACCTGAAATAGATGAATTAGAAAAAGATTTAGAATTAA
CTACAGCAAAATGTAGAAAGTATGTAAATAAGGCTATGAAAGAGGGATTAGACTCTCTAAAAGCCAATGA
TTTAAATAGTTTTTTAGCTTATGATAAAATGGAACTATCAGAGAGAAGAAGACGTTTAGAAAAGGATTAT
AAGGTTTTAAACCTATATAAAGACCTCCTTAATATATCTCTTAGAAAAATAAGTTTAGAAAAGAAAGAAT
GTGGAGATTTATTTCTTAAAAATCAAGCAGATGCGAAAAGAGAATTAAAAAGAGAAATTATATTCTGTGT
AAACAAAATATTAGCTAGCAATAAAGATGTGGTACCTAATAATGTGGAAGAGAATAACGAACAAGACAAA
GTAGAAATAAAAGCAACTGAAATTGAGGATTTGCAATTAGGTAAAGATAATTCAGAAAATGACATGCTAC
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TAAGTTAAATAGCTTAAATAATGAAAGTATATCTCAAACAATACACAATGAATATAAGAAGTTATGTGGA
TTAGAAGAACTTCATTCTGTTGAAGGATATGGTTTTGGCAAAGAAATTATTAAAGATTTTGCTTGTGCAA
CGGTTGTATTAGAATTTTTAAAGAGAAGAAATAGAGACCTTATAGAAGGTGCAATGAGACTGACTATAAT
TGGAGAATTTGGTCCTGAAAATTTTAAGGAATTTGTGGACTATGTAATTAAAAATAAAACAGAAATTAGT
GAAGATACATGGAATAAAGCACAGAATCTAATAAAAGATAACTATAGTGAATTAGAAAATCATGAAATTG
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GATAGTAATAATCAAGATATAGGTGACGTTGTAGAAGATAAAGATACTACAGATAAAGAGTACGACAGCA
ATAAAGAAGATATAATTGAACCAGAAAATAAAAAGAGTAAAAAGAAGGCTAAATTATTTGGATTTATTAA
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AAACCAGTTGAAAATCATCAAGCAAAATCAGAAGAAATAGAGCAAAATGAATTAAAAGAAATAAAACAAG
AAGAACCAAGTCAACATATAGAAGAAGAACGTAGTGTAAAAATAGAAAAACCAATAAATAATAACTTAGA
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AAAGAAATAAAAGAAGAAAAATTAGAAAATGAAAAATCAGTAGTAATACCTATTAAAAAGAAAGAAAATA
GTAATAAAAAATCTAAAAATTCTTCTAAGGACAAATATAGAGAAAACAAGAAAGAAATGAAAAATTATGT
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ATAAAGAGAATATTCCAAAGTCATCAACTCAACAACAAGCTAACAATAAATTAACTGAGGAAGAGAAAAA
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GCACAAGCTGAAAAGAAAGCAAAAGAAATGGAAGCATATAAAGATGGTAAAGGTGTATATTACACTGTTT
ATGCAGGTTCACTTAAAGTTGAAAAAACAGCAAAAGAAACAGCAAAAGAATATGAGGCTAAAGGTATTTC
TTCAACAATAATTCAAGAAAATGGATACTATAAAATAAAAATAGGTGATTATTCTCAATATGGAGAAGCA
CAAGAAAAATGTAATGAACTAGCTAAGAAATCTATTGATACATATATAGCTATGTATGATAAGTACTATG
ATTATAAGTTAGAAGAATTAAAAGAATCAGCTCCTTCTTTGAGTGCTGAAGAACTTAAACAAAAATATGA
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>ref|NC_013316.1|:3062325-3063002 putative sortase B [Clostridium difficile R20291]
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TATACTCAAAACTTACCAAATACAATCATGATACTAAAACATCCTCAGAACTTCAAAAAAAAGAATATAA
AAAAGAGGATTTATCAAAGATTAACAGTGATTTTAAATTTTGGCTTTCTGTTGAGAATACAAATATAAAT
TATCCAGTTGTACAATCTAAAGATAATTCTTACTATCTTGACAAAGATTTTTATAAAAAAGATTCTATTT
CTGGTACACTGTTTATGGATTATAGAAATAAATCTATTGATGACAAAAATATCATAATATATGGACATAA
TATGAAAAATAAAACTATGTTCAACAACCTAAATAAGTTTAAAGATGCTGACTTCTTTAAAAACAATAAT
AAAATAAAAATAACCTTGAATGGAAAAGAATTTTTATATGATGTTTTTTCTGCTTATATTGTAGAATCTG
ATTATGATTATCTAAAAACAAATTTTAACAATGAATCTGATTATCAAAATTACATAAATGATATTACTTC
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TATGAATTTGATGATGCCAGAATGGTGATTCATGGTAGATTGATTTAA
>ref|NC_013316.1|:3068261-3069199 putative polysaccharide deacetylase [Clostridium difficile R20291]
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ATTCACAAAACAATCAAAACGAAAATCAAAATAAGGAAACACAGTTACAAGAAGATAAGGAAAAAATAGA
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AATGATAATAATAAATTAGATGTATCTTCTTTAGATAACACTACTCTTGATTGGTTTTATATACCTAACA
ATAAGCATAAAACACCAGAAGTAAATACGGACATTGAATTTAAATTTTCTGACTATGATGCCCTATACAA
TGGACCTACAAAAGATGGTCAAAAAACACTATATCTTACATTTGATGAAGGTTATGAAAATGGATACACT
ACAAAGATACTCGACACTCTAAAACAAAACCAGGTTAAAGCAGTTTTTTTTGTTACAGCTCCATATATAA
AAGAAAATAAAGATTTAGTAAAAAGAATGGTTTCTGAGGGACATATAGTTGGAAATCATAGTAAAACCCA
TCCATCTATGCCAACAAAAACAAGCAATCTAAAAAACTTTAATGACGAATTATATGATGTTGAAAAGTTA
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GCTTGGCAATGACTAAAAATTTAGGATACAAGACTGTATTTTGGAGTTTTGCATACAGAGACTGGGATAC
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GATATGAATTTGAACTCTTGGAGTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3070945-3069572 hypothetical protein CDR20291_2609 [Clostridium difficile R20291]
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TTTCGAGAGTTATAAAAAATTCTAATACAGCATTTTTTGTAACTGGATTTGTTATGTTAGTTCTTTCTTG
GTTTTTCTGGCCAACTCCAGCTGTTGCCTTAGTTGGAGCTGTATTTTTACCTGTTGCTATGAGAGCTGGG
CTACCAGCAATTGGTGTTGCAGTAGCATTAAATTTATTTGGTCATGGTCTTGCCTTGTCTACAGACTTTG
TTATTCAAGGAGCTCCAAGTATAACAGCTGGTGCAGCAGGTGTTGCAGTATCATATGTTATAAATGATGG
TATGATTTTGTTTTGGGTGATGGGAATCGTAACCATATCTATGGCATTTTATACATTAAAAAGAGATATT
AACAAAGGAATGTTTAGAGAAGAACTAAAAGGTTTTGAAAGTGAAGAAGTAGAAGAGTTCAATGGAAAAT
CTAAAATAGCAACTATTTTAGTAGCTCTGGGATTTCTTGCTGATATAATTGTTATGTATATATTTGACCT
AAAAGGAGGAGATGCATCAGCTCTTTTGGGTGGAACAGCAGTATTTTTAATAATAATTATAAATGTTATA
AATTTTGGCAAAGATAGTCTTGAAAATGTATGTGAGAATATAATTGATGGTTTTGTGTTTGGGATAAAAA
TATTTGGAGCAATTATACCAATAGCAGCATTTTTCTATATGGGTGAAGTTGCGCCCTTGACAGGTGTATT
TGGAAAAGTATTAGCACCAGGTTCACAAGGTTTATTATCAGATATAGGCATAGCTCTTTCTCAAACAATA
CCACTTAATAAATTTGCCGTATCAGGTATAGAAACTGTAGTGGGGGCAATAACTGGGCTTGATGGTTCTG
GATTTTCTGGGATTTCATTAGTTGGTTCACTTGCCTCTGTATTTGGAACTGCTATAAATGCAAGTGTTGG
TGCATTAGCTGCATTAGGACAAATCAGTGGTATATGGGTAGGTGGAGGCTGTCTAGTTCCTTGGGGTCTT
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CCGGATTGGTTGTAACAACCATAGTAGCAATGTTTATTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3072454-3071132 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
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TGGCTTTCATTTTAAATATACCATTTTACTCTGCTGTTGAATCTATAGTAAAAGATGTATCAGAAGGGAA
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AGAGCAGATGATGGAGATGATATAGCAAAATGGAATAGTGATAATTGGTTTGTTTCTATGAAGATATATA
AAGGAAATAAGGTTTTTTATGATACATTATACTATCCTAATGAAGTACCTGATAAGAGTGAGGAAAATGA
GTTTTATAGCAGTCCCATGGCTAGAAACTATGAGATACAATTTTCTGATATTAAAGCTAATATAGTTGTA
GTAGCTTTATTTAGATTTAGATTTCAAAATTTTATAGAAGCAATTTCTATTACATTTATGGCACTTACAT
TTATTATAACATTTTTACTGTTGTTTAGTAGAAAGATAAAGTACCTAAGGAAAATAGAAATGGGTATAAA
GATAGTAGAGAGTGGCAGTTTAAAGTATAGAATCCCAGTAAAAGGTAATGATGAATTATCATCACTTGCA
TCTAGTATTAATGAGATGAGTCATACATTGGAGAATCAACTTATAAAAGAAAGGGAGATGAAGAATAAAA
ATAAAGATATAGTAACTTCGATATCACATGATGTTAGAACTCCATTAACATCAGTAATTTGTTATTTAGA
TTTGATCAAAGACCATAAATACAATAGTCCTGAGCAATTGGAACAATACATAAAAAATGTAAGGTCTAAA
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TATTTTTAATTAAAGTAGAGGATTCTAAATTACTAATTATACAAAAAAATAGAGTAAGTAATTTTTCTAA
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AATGTAAATTCAGATGATAAAGAATTTGCTATTGAAATATCTATTCCAGCAAAAGAATCATAA
>ref|NC_013316.1|:c3073151-3072447 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAGAGATTCCAAAAAAAATTTTAGTAGCTGATGATAATCCTGAGATTAGGGAAATCGTAGAAA
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AAAGAGTTATGTGTCAATTTAGATACTCAAGATGTTACACTAAATGGAGAACCTGTGTTTTTGACAACTA
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AAAAAGTTAGAAAAAGACCAAAAAAATCCACAATATATAAAAACCGCATGGGGAAAGGGGTATTATATTG
ATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3074398-3073334 hypothetical protein CDR20291_2612 [Clostridium difficile R20291]
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GGTATGAAAGCTTTAAACCAAAAAACTACTCTTTTAAAATGTATGGGATATGCTTTTATTGGATTTTATT
TTAGTTCTATTACGCCTTCAGCATCAGGTGGTCAACCAGCACAAGTTTATTATATGAAAAAAGACGATAT
AAATATATCATATTCTTCACTTATACTATTAGTCATTGTTGTTATTCACCAAGTAGTTATACTGGCATAT
AGTGGAATAATGTTCATTATGGAACGTGAGTTTATATTAAATAATGTAAGTGGTATGAACATTTTACTAA
TATATGGTGTAATAACAAATGTTGCTCTTGTCATTGGAGTAATTGCAATTATATTTTCAAAAAAACTTGT
AAACAATTTTATAATATCAATAACAAATTTATTAGGTAAGTTAAGAATAATAAAAGATGTTGAAAGTTCA
AGAAAAGTTATAATATCTCAAATTGAAGAGTATGTTAAAGGTGCTCAATATATAAAGCAGAATCCAAAAC
TTGTAGTCCAAATTTTAGTCATAACTATTGTACAAATAACAGCTATGTTTTTAGTTCCTTTCTTTGTATA
CAAAGCTTTTCATCTATCAACATATACTGTATTTGAGATATTAGCGATACAATCCTTGCTTAATATTGCT
GTTTCTTCATTACCATTGCCAGGGGCTGTTGGAGCTTCTGAAAATAGTTTTATGACATTATTTAAGATAT
TTTTCCCTGGTCACTTATTAGTTCCGGCAATGTTACTTAGTAGGGGAATAAGTTTTTATGCATTTGTAGC
TATAAGTGGATTGATATGTATAGTAGTACATGTAAAATCTTCTGAAAAAGTAAAAGCAGTGAAAAAAGTT
GCTTATGTAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3075099-3074401 putative polysaccharide deacetylase [Clostridium difficile R20291]
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ATAATAAACTATTAAATAAAGAGGTATTAAAAAATATGGCTGGAGAAAATGAAATTGCACTTACATTTGA
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TAGTTGGTTTACATTCATTGGAACACAGAAATGCATGGCTTTATAGTTATAGTTATGTTAAAAAAGATTT
TATTGAAAGTACAAATATAATGAAAAATTTAGGTGTAGATGTAAACTACTATCGTCCACCATGGGGTCAT
ACTAATATATTTTCAAATTCATTTGTTAAAAAATATAATCTAAAAATGACTTTGTGGGATGTAATGGCAG
AAGATTGGGAGAAAGATAGTACAGTAGACATTATTATAAACAAGTTAATGAGTAGAACAAAAGAAAATTC
TATAATTTGTTTACATGATGCAGGTGAAAATTCAGGTGGTGCAGTAGGTGCACCTGAGCGTACTATTGAA
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>ref|NC_013316.1|:c3076187-3075090 putative UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl-(pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGGTATTAATTCTTACAGGAAAATTTGGTATGGGTCATTACTCAGCATCAAATTCTTTAAGTGAAG
ATATAAAAGCAAAATTTGATAATTCAGAAATAACAATTAAAGATATATTTGAATACATTATGCCTAACTA
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AAATGTGCTGAAAATGGAAAGAAAGATATAAAATTTACTTTTTCAGATTATTTTTTAAATAAATTAGATA
CATTACTTCATGAAGTACAACCAACAGTAGTTATTTCAACTTTTCCATTTTGTTCTCAATTAGTATCAAG
ATATAAGGAAAAATATAACTCAAATCTTCCTTTAATAACATGCATAACTGATATAAGTAGTCACTCAGAA
TGGATTAGTAAAAATACAGACTGTTATTTAGTAGCTAGTAAATCTACTAAGGAAGAACTTGTTTTTAAAG
GAATAGATGAATCTAAGATTAAAGTTAATGGTATTCCAGTAAAAAAAGAATTTAAAAGAATAGAACATGT
AAATCATTCAACTAAAAAAAATATTCTTATAATGGGTGGAGGATTAGGATTACTGCCTAAATCAGAACAA
TTTTACAAAGAATTAAATAGTTTAGAAGGAGTAAAAACTACTGTAATAACTGGTAATAATAAAAAAATGT
ACTATAAACTATATGGTAGATATGAAAATATAGAGGTAGTAGGTTACACCAATGAAGTATATAAATATAT
GAAAGATTCTGACCTTATTATTTCTAAACCAGGTGGAATAACACTATTTGAAACAATTTATTCAGAACTT
CCAATATTGGCATTTAATCCATTTTTACAACAAGAGATAGATAATGCTAGTTTTATATTAAATAATGAAA
TTGGGAGAATACTTGGTAAAAATAAAAAATACTATGTAGATGAGATAAAAGATTTAATTTATGATGATGC
TACTCTTAAAGAAATGAGCAGTAACATGAAAGAATTAAAAAAACAATTTGACAATAATACCTTAGAGAAT
ATTTTATTTTCACTTGATGAACAAGGAGCGTGTAGAGAATGTATGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3077754-3076510 putative serine hydroxymethyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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TTTATCTCAAGGTGGACATTTAACTCATGGTGCTCCAGTTAATATTTCTGGTCAATATTATAAATTTTAT
GAATATGGTATAGATAAAGACAGTGGACTTATAGATTTTGATGAAGTTAGAAAGATAGCACATGAAGTAA
AACCTAAAATGATAGTTGCAGGAGCAAGTGCATATCCTAGAGAAATAGATTTTAAAAAGTTTAGAGAGAT
AGCTGATGAGGTTGGAGCATTGCTTATGGTAGATATGGCTCATATAGCAGGTCTTGTGGCTGCTGGTATT
CACCAAAATCCATGTGAAGTGGCTGATTTTGTTACAACAACAACTCACAAAACTTTAAGAGGACCTCGTG
GGGGTGTTATTCTTTGTAAAGAAAAATATGCTAAAGACATAGACAAAGCAATATTCCCTGGTATTCAAGG
TGGACCTCTTGAACATATAATTGCTTCTAAGGCAGTTTGCTTTAAAGAAGCTTTAAGTGATGAGTTTAAA
GAATATCAGGTACAAGTTGCTAAAAATGCAAAAGCCTTAGCTGAAGAACTTATTAAAAGAGATTTTAAAT
TGATTTCTGGAGGTACAGATAATCATTTAATACTATTAGATTTGATTAATAAAAATATAACTGGTAAAGC
AGCAGAAAAGAGATTGGATGATGCTTATATAACAGCTAATAAAAATACAATTCCATTTGATCCAAATGGT
GCTCTTGTTACAAGTGGAATAAGACTTGGTACTCCAGCTGTAACTACTAGAGGTATGAAAGAAGAAGATA
TGGCAATAATCGCTGAGGCTATAGACCTATGTTTAACTTATGATGAAGAATCTAAGGCTAGAACATTGGT
TGTTGGTTTAACTGAAAAATATCCTTTATATGAAGAATATAATATTATGGATTAA
>ref|NC_013316.1|:3078083-3078871 hypothetical protein CDR20291_2616 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATCAAAATGAGGAACTTGAATATAAGAAAAATATTCTAAAACTAGCTCTATTTGTAGGGGAACTGA
TGATAAAAAATGGAGCTGAAACATCTAGGGTTGAAGACAGTGTCCTTAGAATATGCAGGTCAAGAGGGTT
TTATCATGTAAATATTTTTACAACTCCTACAGTAATAATTATTTCAGATGAGAAATTTGATGGCTTTTCG
TTTATGAAAACGATTCAATCAAGAGGTATAAACTTAAACAAGATTTCTTTATTAAACAGTTTTTCTCGAG
AATTTGTTAGTGACAAAGAGTATGATATTGATAATGCCATTGCACGTCTTTATGAAATCCAAGATGTAAA
ACCTTATCCTTTATGGTTATTTTACTCTTGTACAGGAATTGCATCTGCTTGTTTTGCTTGTTTGCTTGGA
GGGAATTATGTATTAAATTTTATACTTACGTTTATAATAGCAATCTTTGCTGCAATTACTTATGATAAAA
CGATGAAGATAAGTGCAATATCTGCATTTTCCTGTTTAGTATCTTCTTTTTTAATTGCACTTTCAGGAGT
TCTACTAGTTGAAATAGGCATTTTAGATGACCCTAAAATGCTTATAGTCGGCGCTATAATGCCACTACTC
CCAGGAGTTGCTTTTATAAAAGCTATTAGAGATTTAATATCAGGGAATTTAATATCAGGAATTTCTCGTG
CTTTTGATGCTGCTATGATTATTATTGCAATTGCTTCTGGAGTTGGTTTTGTCCTTGATACATGGTATAG
AATAGGAGGTCCTTTCTAA
>ref|NC_013316.1|:3078871-3079344 hypothetical protein CDR20291_2617 [Clostridium difficile R20291]
ATGACTGATATGTCTATGATTTTGCATTTTTTATTTTCAGGTGTTGCAACTGCTGGATTTGCTGTTTTCT
TTAATGCTCCACTATATCTACTTCTTCCAGCTGGAGTAACTGGCGGAATTGGTTGGATTGTATATGTTTA
TTTATTTAATTTTACTACAAATGCAGTTTTTGCAGGTTTTATTGCTGCTGCTTTGGTCTCAGCGTGTAGT
GAGACTTTAGCAAGAAAACTAAAGCAACCAGCTATTGTGTTCGTAATTCCAGGTATTCTTCCTCTAATAC
CAGGAATTGGGCTATATAATACAATGTTGTCTTTGATTCAGAAAAATTATTCTTTGGCTATGTCAAAAGG
TACAGATGCGCTATTTCTAAGTGCTGCAATAGCACTTGGTGTATTAGTTGTAACTTCTTTTGTAAGAACA
TTGAATCTTTTGAAAATCAGAAAAAACTTTATTCCTTACAGAAAATCAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3079876-3079436 putative regulator of the sigma(E) factor [Clostridium difficile R20291]
ATGAATCAACAAGGATTTATTATGGAAATTGTTGATGATAGAACTGCAAAGTTAAAAATGCAAAGACATT
CAGCTTGTGCTGCTTGTGGAAAATGTGCTACTACAAATTCAGCAGAGTCAAAAGAAATATTAGTAGAAGT
AGACAACACAATTGGTGCAAAAGTTGGTGACCATGTAGAAGTGAGTATGGATAATATGAATGTATTAAAA
GCAGCTGTAATGGCTTATATAATACCTCTTATAGCACTTCTTGTAGGAACAATAGGGACTTATTATATAT
TGGGGGCAATTGGAATGACAACTGGAGTTGAAGCCATAAGTGGATTAGTTGGAATTTGTCTTACAATAAT
CTGTTATTTATACTTAAAGAAGAATGACAAAAAATTTAGAGACAGTAGAGAATTTATACCAGTAATAACA
AGAATATTAATTGACCTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3080184-3079891 hypothetical protein CDR20291_2619 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGAAAGAAAATTAGCACCAAACAATGAGAGGGAAGCTCTCATAAAAAGATTAAAAAGAATAGAAG
GTCAAGTTAAGGGGATACAAAAGATGGTGGAACAAGAACGTTATTGTGTTGATATATTGGTTCAAATATC
TGCTATAAGGTCTGCTATAAATAGAGTAGGCACAATTATCTTAGAGAATCATATAAAAGGATGTGTAGCA
GAAAGCATTAAACATGATGATGCTGATAAAACTGAAGAGATGATAAAAGAGCTTATGGATACTATAAATA
AATTTACAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3080628-3080227 hypothetical protein CDR20291_2620 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAATGTCTTTACTGTAATAGGGATATAAAGTCACCAAATAATAAATTAGCTATAAAATATGATG
ACAATATGAATATATATCCATGTCGTGCAGAATGTAAGGAAAAAATTGAAGAATATATAGCAAAAAAACC
TACATATAAGTTTATAAATATATTAGAGGTTCTTTTAGGTGTGGGCGGAATATTCTGCTTTTTGAGTAAA
TGGACTATTGCAGCCCAAGTTGTACTTGGAATTGATGCACTGGTTATATTTTTATTCCCATTGGCAGGAT
TTAAGATGAATGGAAAGTTAAGTATGGAACAAACTAAGAATCAAAGTAGGTCTATTGCAATATCAATTTT
GGCATTTATAGTAATAATAACCGTATTATATTTTAAACAAGTTGGTAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:3080861-3082981 putative sigma-54-interacting regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACAAATGGAATTAGCTATTGTAAGTTTAAAAAAAGACGCTGGAGAAATTTATGAAAATCAAATAA
GGCAATTCTTAGGTGATAATCTAAAGATAAATTTATACTCATTTGAAGAGGGAAATTTAAAGTTTTTTAA
AGAAAAACTTATACTCCTATCTGCTTATTTAAAATACGATGAAATAGTAAAATTATCTCACTATGATGCT
CAAATCATTGTTCCCAAGTTGACATTTGAAAAGAACAGTATTGATATGATATCCAAATTAGAAAAAGATA
AAATTATTTATGTATATAACTTAAGTAAAGATATGGCAATAGAAACAATTTCTTTAATACATAGATTAGG
AATAGACAATATAAATATCCTGCCCTGCTATCCAGAGATTGAGTTTACTCCCACAGATGCTGTAATCCTA
ACTCCTGGCGAAAAAATCCTGCCTAAGTTTAAAAATTGTGAAGTTGTAGATTTAAAATACAGAATAATAG
ATTTAAGTTGTATTGTTGAAATTGCTACAAAAACCAAATTAAAACATCTAATAAAAGATGACCTAATAAA
AAAATACGTAGAAAAAATAATTCCTACAAGTTATAGTACAGGTGAGTTATTGTTAGATGCAAATAAGTTT
GAAAGACAATTTGATTTGTTACTATCTATAATTGATGATGGAATTATATGCACAAATAATGATGGAATAA
TTCAATTCTATAATCATATAGCTAGAAAAATTTTGTCTATAAATGCAAATGAAATGATTGACTCATTTGT
TGGTGATTGTATAAAAGACATCAATTTTCAAAACATATTGACCAATAAAACTCCATTTTTTGAGAAATTG
ATTAAAATAAATCATATTGATATAAATTTAGAGATTAAACATATACAATTAAATGTATTTGATGGATTTA
TACTAAAGATGACAAAGTTTTCTCAATTAGAAAAAAAGCAAGCTAAATTAAGAGCACAACTAGTAAACTC
TGGTAATATCAGTAAATACACATTTGATGATATATTAGGTTCTAGTATACAAACTATTAATACAAAAAAA
ATTGCTAATAAAATGGCTCAATCAAATTCATCTATCCTTATAATTGGTGAAAGTGGTACTGGTAAAGAAT
TATTTGCTCAATCCATTCATAGTGCTTCTAGGAGAAAAGATGGTCCCTTTGTCGCAGTAAATTGTAGTAC
TTTTCAAGAAAATCTACTGCAAAGTGAATTATTTGGCTATGATGAAGGGGCTTTTACTGGTGCTAAAAAA
GGTGGGAAAATTGGTTTATTTGAATTAGCCAACAATGGAACTATATTTTTAGACGAAATTGGAGAAATGG
ATTTAAATTCTCAATCTAAATTACTTAGAGTCATACAAGAAAAACAAGTACGACGTATTGGTTCTAATAA
TGTCATTGATATTGATGTAAGAATAATTGCAGCTACTAATAGAAATTTAAAAGAACTTGTATCTAAAAAT
ATGTTTAGAAGAGATTTATATTTTAGGTTGAATGTTCTTCCCCTTAAAATACATCCACTTAGGGAAAGAG
CTGCTGATATATTTGAAATTTTTGGTTCATTAAAATATGATATTCCATGTAATTTTATTCTAAGTGAGGA
AGTAAAAGAAATCTTTAAAATGTATAGATGGGAAGGAAATGTAAGAGAATTAAGAAACTTAGGAGAATAC
TTCTGTTACTTGGGAAAAGATATTATAGAAATATGTGATTTACCTGAATATATATTGGACACTATAGATT
CAAATTATAGTAGAACCGTTTGTAATAAAGTAAGTGATAATATAAAAAAGTATCAATTCAACATTGGCAA
AGACAAAAACATCATGAAATACGACTATAATTTTAAAAGGTCACTAGATGAATACATATTTATATTGGAT
AATTTAAAAAAGGCTTATGATTTAAAAGAAAGAATAGGTAGAAAAAGCTTATGTAAAATAGCTTTAGAGG
AAAATAGATTTTTGACAGAACAACAGATTAGAAATATGCTTTTAGAACTACAAGACTTTGGGCTTGTAGA
CATACTTGTTGGTCGTGGAGGTTCAATTATAACATCAAAAGGAGTAGAATTTCTAAAAAATATAAATAGG
TCTAACAAGTTAAACAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:3083119-3084372 putative aminotransferase [Clostridium difficile R20291]
GTGAATAAATATTTTTTATTATCAATATTGGCACGTTGTTTGCTTAATATTATTAACATAAAATTAAAAT
TACTGGAGGTATTTACAATGAATTATAATTTTAATGAGATTGTTGATAGAAGCAATAATTTTTCATCTAA
ATGGTCAGAAATGGAAAAAAAGTATGGAACTAATGATTTACTTCCTATGTGGGTGGCTGACATGGATTTT
AAGGCTGCACCTTGTATAATTGATTCCTTAAAAAATAGACTAGAACAAGAGATTTATGGCTACACAACAA
GACCAGATTCTTACAATGAATCTATAGTAAACTGGCTAGATAGGAGACATAACTGGAAAATAAAAAGTGA
GTGGTTAATTTATAGTCCAGGTGTTATCCCAGCTATAAGTCTTTTAATAAATGAACTCACAAAAGCAAAT
GATAAAATAATGATACAAGAACCAGTTTACAGCCCTTTTAATAGTGTTGTAAAAAATAACAATAGAGAAC
TAATTATAAGCCCATTACAGAAACTAGAAAATGGAAACTATATAATGGATTATGAAGACATTGAAAACAA
GATTAAAGATGTAAAATTATTCATACTTTGTAATCCTCATAATCCAGTTGGTAGAGTATGGACAAAAGAT
GAATTAAAAAAACTAGGAGATATTTGTCTTAAGCATAATGTAAAAATCATATCTGATGAAATACATAGTG
ACATTATATTAAAAAAACATAAGCATATTCCTATGGCATCTATTTCTAAAGAATTTGAAAAAAATACAAT
TACTTGTATGGCTCCAACTAAAACTTTTAATATAGCTGGTCTTCAATCATCATATGTAATACTACCTGAT
GAAAAAGACTATAAATTGTTAGATGATGCTTTTACCAGAATTGATATAAAGAGAAATAATTGCTTTAGCT
TAGTTGCAACTGAAGCTTCATATAATAATGGTGAATCTTGGCTAGAATCATTTTTAGAATATTTAGAATC
TAATATAGATTTTGCTATAAAATATATAAATGAAAATATGCCAAAACTTAAAGTTAGAAAACCAGAAGGT
ACTTATTTATTATGGGTAGACTTTAGTGCACTTGGATTAAGTGATGAGGAACTAGAAAGTGTACTTGTAC
AAAAAGGTAAAGTTGCTCTAAATCAAGGAAACAGCTTTGGCATTGGAGGAAGTGGGTATCAAAGAATAAA
CTTAGCTTGTCCAAGAAGTATGCTTGAAGAAGCTCTTATAAGAATAAAAAATGCAATTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:3084397-3085839 putative malate-2H(+)/Na(+)-lactate antiporter [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATGAATACAGAAAGAAAAATACCTTCATTTAGATATTCCTTGTTAGTAATGCTTGCAATAATAG
CTCTAACATCAGTTGGTATAGTTGTATTTAATGCTTCTATAACTACAATGTTTTTACTTTCATGGCTTAT
AGTAGTTCCTGCAGCCACGAAACTTGGTTATACTAATGATGAAATAGAAGCTTTTGGATTTGAAGTTGGT
AAAGATGCCTTTCAATCAAACTTAATTATACTTTCTGTTGGTGTACTAATAGCAGCTTGGATAGCTGCTG
GTACAATACCAACAGTAGTATATAGTGGACTAACAATAATAACCCCTAAATATTTTCTGCTTACAACATT
AATCGTATGTTCATTAACTTCTGTTGCTACTGGTACATCTTGGGGGACTCTTGGAACTTCTGGTATAGCA
ATGATGAGTATTGGTACTAGTATGGGTATTCCTCTTGGTTTAACAGCTGGTGCAGTCATTTCTGGTGCTT
TCTTTGGAGATAAGATGTCACCTCTATCAGATTCTACAAACTTAGCTGCAGCAGTTTGTAAGACAGATGT
AATTACACATATGAAGCATATGTTTTATACCACAGGACCTGCATACGTAATATGTATAGTTCTGTATACA
GTAATTGGATTTAAGTATTCAAATAATACTATAGACTATGTTCAAATAAATCAAATCAAGGATGTATTAA
ATTCAAACTTTCATATTGGTTTAGTAGCAATGATTCCAATAATATTTTTATTATTACTTTTATTGCTACA
AAAGCCACCCATTATATCTATACTAAGTTCAGCTATCATGGGACTTATTATAGCAGTATTTCAAGAAGGA
GAAAAAATAGGTGATATTTTAAATTACATGCTATCAGGATTTACTATAGATACTGGATTTGTCTATGCCG
ACAAACTATTAAATCGTGGTGGAATAATGAGTATGGCTGAAACCGTTTTACTAGTATTTGTAGTTTTCGT
TATTGCCGGTATTCTCCAAAAAACTGGATTCTTAGAAGTACTGCTTCAACCTCTTATAACTAAAATAGGA
AAATCAAGAACTAAATTGGTTGGGTCTACTTTTATAGTAAGCTACTTTGCAAATGCATTTAGTTCATCAA
TGATGTTTACTTCTGTATTTGTCGGAACTCTAATGTCTCCAATATACAAAGAGTTTAAATTAAAACCACA
AAATCTATCTAGAATTATAGAAGATACAGCTACACTTGGTGGTCCATTAATACCATGGAATTCAAATGCT
GTTTTCTGTGCTCAGACTCTTGGTGTAAGCCCACTAGAATTTATTCCATATTGTTTCTTAAGTTGGATTA
CACCTATAATTTCATTTATTTATGGTGTAACTGGTTTTACTATGCTTACATACACAGATGATGAAATTGA
AGAGTTAGAAATATTTGATACTGCTCAGAGAAGAGTTGATTGA
>ref|NC_013316.1|:c3087692-3086187 cell surface protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATGTTACTTAAATTATTATGTTATACTATTTTAAATAGGAAACATTTAGATACTATAATTTTAGGGG
GAGTCAAGATGAAATTAACTAAATCAATATCATCAATGCTATGCTTAGCTCTAGTTTTAAGCTTATCACC
AGTAGCATATGCAAATGAAATAAGTAGAACAACAGTGGAGAATACTTTAGTAGGTCAGGACAGATACCAA
ACTGCTGTTGAAGTAAGCAAAAAAGGATGGAGTAGTGCGAATGAGGCTGTAGTTGTAAATAGTGAATCTA
TTGTAGATGCATTAGCTGTAACACCATTTGCTAAATTAAAAAATGCTCCTATATTATTGACAGAAAAAAA
TAATCTAAATTCACAAACTGAGAAAGAATTAAAAAGATTAGGAGTTAAAAAAGTTTATATAATTGGTCTA
TCTAGTTCTGTATCAAATGATGTGCAAAAACAGTTAGAATCTAATAATTTAACTACTGATAGAGTTGGTG
GTAGTGATAGATACCAAACAGCTTTGAGTATAGCTAAAAAAATAGAAGGATTAAAAGATATATCAGAAAT
AGCTGTAGTAAATGGGTACACAGGTCTTGCAGATGCAGTTAGTATAGCTTCTGTAGCTGCTACTAATGGA
ATGGTTATACTTCCAGTATCTGATGCATCTGGTATATCTAGCTTTAAAGATTTTATAGAATCTAAGAATA
TAAATAAATCATACATAATAGGCTCTACTAATGCTGTATCAGATAAAATAAAACAAAGTTTACCTAATTC
AGAAAGAATAGGTGGAGCAGATAGAAATGAAACTAATGGTAAAGTAATAGAAAAGTTTTATACATCTAAT
AAATTAAACAATGTATTTGTGGCTAAGGATGGAATGAAAAATCAAAATCAACTTATAGACGCTCTAGCAG
TAGGAGTACTGGCATCAAAAGAAAATTCTCCTGTACTAATCGTAGGAGAACAATTAAGTGCAACACAAAA
GAGTGTATTTTTGAATAAAAATGCTACCTCTATAACTCAAGTTGGTAGTGGAGGAAATGAAAATGCATTT
AAAGAATTAAAAGATTTACAGGCAAATAGTAACAATAAGAGAGTAATGTATGTAACTAATACAGATAAGG
TAAATATAAGAAATGATGCTACAATAGAAGCTTCTGTTATAGGATATCTAAATAATGGTGATGAAGTAGA
AGTTTTAGATGTGTTAAAAACTGGATGGGTAAAAATAAAATACAATGAAGGTATTGGATATGTTAGTGGG
TCTTATTTGACAAATAATAAGCCTGATAATAGTAATGAAAATATAAAAATAAAGTATGTAAAAGAAAAAG
ATGGTCTAAATGTTAGGAAAGGACCAAGTACAGAAGATGAAAAAATAGGTCACCTTTCATATGGAAGCAA
AGTAGAAACAATAGAAATATTTGCTACTGGATGGGTAAAAATAAAGTATAATGGTGGATATGGTTATGTA
AGTAATGATTACTTATCTGATACACCAGTTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:3087985-3088854 LysR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGATTTATTGCATCTTAAGTATTTTCAAACTGTTGCTAGAATGGAGCACATAACAAAAGCATCACACA
AGTTAAATATAGCACAGCCAGCTTTAAGCAAAACTATATCTTCCTTAGAAAAAGAACTTGGAGTTCAGTT
ATTTGACAGAAAAGGAAGATATATTGTTTTAAATGAGTATGGAAGATTGTTTCTAAAAAGAGTAGATAGC
ATTTTAGATTTAGTAGAAAGTTCAAAAAAGGAGTTACAAGACACTTCTTTAGAAAATTCAGGAGAAGTAA
AGATATTATCTCCTGCAGCGGCTAATGTGTTACCATCACTTTTGAGTAATTTCAGAAAACTATATCCCAA
TATTACTTTTAATGTGTCACATACTTTGCCATCATCTTATAAAAAAAGTGATTTTGATTTGTACATATCT
TCTTCATTTACAAAGCTAAACTCAGAAAATAGCATAACTTTAACATGCGAAGAAATACTATTAGGAGTTT
CAATAAACCATCCTTTATCATTAAAGGATGAAGTATATCTAAGCGAAGTTTCAGATGAAAACTTTATAGT
TATAACGAAGGGTGAGAATTATAGAGAGGTAATTGATATCCTGTGCGAATCAGCTAATTTCAAACCCAAA
ATAGCATTTGAGTCTGATTCACCATATACAATTTATGCTCTTATAAAATCACTTCAAGGAGTTGGATTTA
TATGTGGAAAATCATGGGGATTATCTCAAGACCCTGAGATTAAGTTGTTACATATCAAAGATATTGAATT
TAAAAGATATTTAAATCTTTCATGGTTTAGCGAAAACTATGAATCTAAAGCTGTGTTGTTGTTCAAAAAC
TTTCTTATCAACTATTTTAAAAATATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3089772-3088966 putative carbon-nitrogen hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGTCGTAAGGTGAAAATAGGTATAATTCAACAACACAGTGTACTTGGAGATGTTAAAAAAAATATAG
AAAAAGCAGTAGAGATGATAGATGACTTAGGAAAACATGGGGCAGATATAATTTGTTTACCAGAACTATT
TGCTACAGGATATAATTTAGAGTCTTTAGGTGGAGTTAAAACATTAGAATTAATAAGAGAACATAATAAG
TACATAGAGGAATCAATGTCAGAAGCTGCTAAAAGAAATAATGTATACCTGATATCTCCATATGGAACCT
TAGAAAAAGGGTCTACACATGTTTATAATTCAGCAGTTATATTTGATAGAAAAGGTAAGATTATGGGAGA
ATACTGTAAAAATCATCTGTGGTCATTAGAAGCAGTATACTTTAAAGGAGGGGAAAAAGTAGAGGTATAT
GATGCTGATTTTGGTAGATTTGGTGTAATGATATGTTATGATGCAGGTTTTCCAGAAGTATCCAGAGAAT
TGACATTAAAAGGTTCTGAAATAATATTTATACCATCTGCATGGAGAATACAAGATGAAGATATGTGGGA
TTTAAATGTATCTCAAAGAGCTTTAGAGAACACTGTATATACAGTAGGTGTAAATTTAGTAAGTAATGAC
TCTAATTTAATACTATTTGGAAAGAGTAAAATATGCAATCCTAGAGGTACTGTAATAACTCAATTAGATA
CATACAGGGAAAAATATGTATTATCAGAGATTGATTTAGATGAAATAAAAAAGTATAGGGAAGATATACC
CTATTTGAAAGACAGAAAAAGTAGCTATAACATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3091018-3089786 putative cytosine permease [Clostridium difficile R20291]
TTGCAAGAGAGAGAAGAATTAGTTTTAAATCCAGTTCCAAAAGAGGAAAGAGTTGGATGGTTAGCTCCAT
TGTTTAATATGCTTGGTTCTAACATAGCTATATCTGAACTAATGGTTGGAGGAACTTTAATTTTAGGAAT
GACTCTTTCTAATATGATTATTACATCAATTATAGGGAACTTAATATTAGTTGCAATCATTATGATACAA
GGTTATATAGGTTACAAAGAAGGGTTAAATACGTATGTATTAGCTAAGGGGGCATTTGGAGAGATAGGAG
GAAAGTATCTTATATCTCTATTACTTGGTATAACTAGTTTTGGATGGTTTGGTGTACAAGCAGGGGTTGC
AGGACTATCAGTACAAAAGATATTCCCAAGTGTAAACCTAACATTAGTTACAGTTATACTTGGATTATTT
ATGGTTGTTTTTGCACTGTATGGCTTTAAAGCTATGGCTAAATTTAATTACTTAGTTATACCACCACTTA
TGATATTAATGGTGTGGGGAGTTTTTAAAGCTTTTTCTACTTATGGAGTTGAAGCTATTTATAATTATAC
TCCTCAAACAACTATGAGTATGGTTGAAGGTCTTAATATTGTAGTAGGTCTTGTTATAGTTGGTGCAATT
ATATCACCTGACCAGTTAAGATATACGAGACGAGTAAAAGATATTTGGATTATCAGTTTTTTAGGTCTAG
GGATTATTTCATTATTCCAACAAGTTGCAGCTGGTGTAATGTCTATGGGAGCACCTACTTGGGATATAAC
AGAAGTATTGGCTAATTTAGGTTTTGGATGGGTAGCGTTTGTTATTTTAATACTTGCATCTTGGTCAACA
AACGTATCAAATGCTTATTCTGGTGGATTAGCATTAAAAACTATTTTTCCAAATGTAAAAAGAAATGTTT
TGACTTTAGTTGCAGGTCTAATAGGTACAATAATAGCAGCTACTGGTATAATATTTAAATTTCAGTCATT
TTTATCTTTCTTGGGAATCGCAGTTCCTGCAATAGCAGGAATTATGTGGTGTGAGTATTATTTTATACAA
GGAAGAACTTATAAGCATAGAGAAGGAATAAATTGGATTGCAGTAATAAGCTGGTTAATAGGTTTTGCAG
CGTCGTATTATAGTTCAAAAATAAATTTCTTAATACCTCCGATAAATGGAATTGTAGTGAGTATGGTTAT
TTATTATATATTAATGAAATGTTTTGGAATCAAAGATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3093264-3091477 putative aspartyl-tRNA synthetase [Clostridium difficile R20291]
TTGGAAACTTTAAAGGGTTTAAAGAGAACTCACTACTGTGGAGAGTTGAGAGAAAAAAACATAAATGAAG
AAGTCGTACTTATGGGATGGGTACAGAAAAAAAGAAATTTAGGTGGTCTTGTATTTGTTGATTTAAGAGA
TACAAGTGGATTATGTCAAATAGTTTTTGATACAGATGTAGATAAAGAAGCTTTTGAAAAAGCTGAAAAA
TTAGGGGCTGAATTTGTAATAGCTGTAAAAGGAAAAGTATGCGAAAGACAATCTAAAAACCCTAATATGC
CAACTGGTGATATAGAAATATTTGCAACTGAACTTAGACTTTTAAACAAGTCAGAAACTCCGCCTATTTA
TATAAAAGATGATGATGATGTTTCTGAAGCACTAAGATTAAAATATAGATACTTAGATTTAAGAAAACCA
TCTATGCAAAGAAATTTAAAATTAAGACATAAAGTAATGAATATTACAAGAAATTACTTATCAAACAATA
GATTTTGCGAAATAGAAACACCATTTTTAATAGCTCCAACACCAGAAGGAGCAAGAGATTATCTAGTACC
AAGTAGAGTTAATCCAGGAAAATTTTACGCATTACCACAATCACCACAATTATATAAACAATTATTGATG
GTAAGTGGTATGGATAGGTATTTCCAAATAGTTAAATGCTTTAGAGATGAAGATTTAAGAGCAGATAGAC
AACCAGAGTTTACACAAATAGACTGTGAAATGTCTTTTGTCGAGCAAGAAGATGTTATGAGTATGATTGA
AGGTTTGCTTGAAGCGATATTTAAAGAAGTTTTAGATGTAGAATTGGCACTTCCACTTCCTAAGATGACT
TATGCAGAAGCTATGTCTAAATATGGTTCAGATAAACCAGATACTAGATTTGGATATGAGTTAACAGATA
TATCTGATGTTGTTTGTAACTGTGGATTTAAAGTGTTTGCTGATGCTACACAACCAGGAAAAAGTGTTAG
AGGTATAAACGTAAAAGGCAAAGCTGACGACTTTACTAGAAAACAAATATCATCACTAGAAGAACATGCT
AAGACATATAGAGCAAAAGGTCTTGCTTGGATGAAAGTAGGACAAGAAGGAGTAACTTCTCCAATAGCAA
AATTCTTTAATGAAGAAGAAATGAACGCTATACTTACAAAAATGAATGCTGAAGTAGGAGATTTACTTTT
ATTTGTAGCTGATAAAAACTCAATAGTATTTGATGCTTTAGGACAAGTTAGACTTGAAGTAGCAAATAGG
CTTAATCTATTGGATAAAAATGTATATAACTTACTATGGGTAACTGAGTTCCCAGTTTTTGAAGAAGATG
AAGAAACAGGCACATTTTCAGCAATGCATCACCCATTTACATCACCTATGGATGAAGATTTAGACAAGTT
AGAAGAAGGTGATAAGTCATCTTTAAGAGCGAAAGCTTATGATATTGTATTGAATGGTTATGAAATAGGT
GGAGGAAGTGTTAGAATATCAAATTCTGATATTCAATCAAGAATGTTTAAAGCACTTGGTTTCACAGAGG
AAAGAGCTAATGAAAAGTTTGGTTATTTATTAGAAGCATTTAAATATGGTACTCCTCCTCATGCTGGTCT
AGCTTTTGGTCTTGATAGACTTGTTATGTTACTTGCAGGAACTGATAATATAAGAGAAGTTATTGCATTC
CCTAAAAATCAAAATGCTGTTTGCCCTATGACAAATGCTCCTACATTGGCGGAAGATGAGCAATTAGAAG
AATTAAGTATAAAAGTTGATATAAAAGATAATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3094600-3093338 putative histidyl-tRNA synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTGACTAAAGCTCCTAGAGGAACTAAAGACATAACTCCAAAAGAGGCTTACAAATGGCGTTATGTAG
AAAATAAATTTAGAGAAATATGTGCTTTATATGGATATGAAGAAATGGTAACACCTATATTTGAACATAC
AGAACTTTTCAAGAGAAGTGTTGGAGATACTACAGATATAGTTCAAAAAGAAATGTATTCTTTTAAAGAT
AAAGGTGATAGAGAAATTACCTTAAAGCCAGAAGGTACAGCAGGTGTAGTAAGAGCATTTATAGAAAATA
AATTATATGCAGATACTCAACCAACAAAATTATTTTATGTGACACCTTGTTTTAGATATGAAAGACCACA
AGCTGGTAGACAAAGACAATTTCACCAATTTGGAATAGAAGCACTTGGAAGTGATACTCCTTCAATGGAT
GCTGAAATAATCGCACTAGCTGTTCAATTTTTTAATGAAGTTGGATTAAATGATTTGGTAGTGAGTATAA
ATTCAGTTGGCTGTCCAGTTTGTAGAAAAGAGTACAATGCTTTATTAAAAGAGTATCTTGACTCAAAAGC
TGATATATTGTGTGATACTTGCAATGAGAGAAGAGAAAAAAATCCAATGAGGGTTATAGACTGTAAAAAT
CCTACATGTAAAGAAAATATCAAAGATATACCATTTATTGCAGACCATTTGTGTGATGATTGTAAATCTC
ACTTTGATAAACTTCAAGAATACTTAAAGGAAATGAATATAAACTTTGTAATTGATAAAACAATAGTTAG
AGGCTTAGATTACTATAGAAAAACTGCTTTTGAAATTATATCTAATGATATAGGAGCTCAAAGTACTGTA
TGTGGTGGAGGAAGATATGATGGTCTTGTTGAACAATTAGGAGGACCAAAAGGTATAAGTGGAATTGGGT
TTGGACTAGGAATTGAAAGACTTTTACTTACACTTGAAGGTAATGGAATTGAAATAGAAAACCCTCAATC
TACGGATATATTTATAGTAACTATAGGTGAAGAAGCAAATACAAGAAGCTTTAAATTATTAAAAGACTTG
AGACAAAATCATATAAGTGCAGATAAAGACCATATAGAGAGAAGTGTTAAAGCACAATTTAAATATTCAG
ATAAAATAAATTCAAAATTTACAATAGTGATTGGAGATGATGAGCTTAAAAATGACACTGCGACATTAAA
AAATATGAAAACATCAGAGCAAACTACTGTAAAATTAAGTACATTAGTTGAAGAATTAAAGCAAAAGCTG
TAA
>ref|NC_013316.1|:c3096146-3094590 putative coproporphyrinogen III oxidase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTGTATGTTTTTTTAAAAGGACATGATTATAAGTATGAAGTAGCAGAACTTATAAAATTGTTTACCA
GTGAATTTAAGTTTAAAGACTCTAATGCTAACAATAATATAGAGTCAAAGCATTTAATAAATAGATTGAT
TTATGAGAATGGTGTATTATTCTCAAGTACTGAATACTATGAAAATGGAAATTTAAAGTACGAGTCAATA
CAGAATATAGAAAATATGAATCTTGAATTTTTAGATGGATTTGATAGTAGCAAAACGATTGAAGAATTTC
TTAATAGACTAGATAGTGAAAGTAAGAGGAACTTTAAAAAGCTGTGTAAAGAAAATATCAAAAAAAGCAT
GTTTGTAGTGCTTAAACAAGTATTTAATTCTTATGTACCATGGGGAATTTTGACTGGTATTAGACCAGTC
AAAATTGTCCACAATTTAATGGATAAAAAGCTAGATGATAATAGCATAAGAACCATTCTAAAAGATAATT
ATTTTATAATAGATAAGAAAATAGATTTAGCTCTTGAAATAGCTAAAAGAGAGCGATTATTTATGTATCC
TATAGATAAAAATAAAATTTCTCTTTATGTAAGTATTCCATTTTGTCCAACTAGATGTGTATATTGTTCA
TTTCCTTCAAATTCATTAAAACAATTTGGACATTTAAAAAGAGAATATGTTTATAAATTGATTGAAGAAA
TTAAGGGGTTTGCCAAAGTTATTAAGGAGACTAAGAAAGAAGTTGAAACTCTATATATTGGTGGTGGAAC
TCCAACTACACTTGATGAGGAAGAATTAGATTTGCTTATAAATTCATTGTTCAATGAATTAGATTTAAGT
AAAATTAAAGAATTTACTGTAGAAGCAGGTAGACCTGACACTATTACAGAACAAAAACTAAGAGTGTTAA
AAAAACACAATGTTAGTAGAATTAGTATAAATCCTCAAACTATGAATGATGATACCTTGGTAAAGATTGG
AAGAGAGCATAGAGTATCTGATTTAGTAGATTGCTTTAATATGGCTCGTAGAATGGGATTTGATAATATA
AATATGGATATAATTTTAGGTCTTATAGATGAAGAATTAAATATGGTAAAGAACACATTGGAGGAGATAA
AAAAACTTTCTCCTGAAAGCCTTACAGTTCATACATTAGCCATAAAGAGAGCATCCAACTTAAATATAAA
TATGGATAGGTATAAAGAACATCTAACACAATATGAAGAAATGGTAAAAATGATAGATTTATCAATGAAA
TATGCAAAAGATATGGGATTAAATCCATATTATATGTACAGACAAAAACATATGTTGGGAAATTTAGAAA
ATATAGGTTATGCTAAAGAAGGATATGAGTGCATTTATAATATACAGATTATGGAAGAAAAACAAAGTAA
CTATGCATTAGGTGCAGGTGCTATATCGAAATTTGTTTATGTAGATGAAGATAGAATTGAAAGAGTAGAA
AATGTAAAAAATGTTGAACAATACATTGAAAGAGTAGATGAAATGATAAAAAGGAAGAAAGAAGAGGTAT
ATAAAAATGTTGACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3096851-3096237 putative hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTATAAAAAAATTTGTAGATAGTTATTTTGGAGTAAATACTTATGTATTAGGTGATGAAAAGACTA
AAAAATGTGCAGTTATAGACCCAGGTGGAAGTTTAGTAGAGACATTAAGTTTTGTAAAAGAAAATGAATT
AAATATTGAATATATTATCCTTACTCATGGGCATGGAGACCATATAGGATATGTTAAGGATATTAAAGAA
AAAACTGGTGCTAAAGTAGTTGCACATGTTGATGAAAAAGAATTATTAAATGATAAAAATAAAAATCTAA
GTTATACAATGAGATGTGGAGCGCAAGAGTTTGATGCAGATATCTATGTGAGTGATAAAGACAAGCTTGA
ACTTGGTGAATTAAAAATGACTTTCTTGCATACTCCAGGACATACTCAAGGATGTATGTGTATAAGAGTT
GAAGATGAAATGTTCACAGGAGATACTTTGTTTGCTGGAAGTATTGGTAGAACTGATTTATATAGTGGAG
ACTTTAACCAAATGGAAAAATCACTTAAGAAATTATGCAAATATGAAGATGCTGTTAGAGTATATCCTGG
ACATGGACCAACCAGTACTCTAGGGGTTGAAAAGAAGACAAATCCTTACATGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3097315-3096866 putative D-tyrosyl-tRNA protein [Clostridium difficile R20291]
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ATAAGGGGTTACTAGTATTGTTAGGAGTGACTCATGATGATAAATCAAGTGATGTAGATTATATGATTGA
TAAAATATTGAATCTGAGAATTTTTGAAGATGAAAATGACAAGATGAATTTATCTCTAATGGATATAGGT
GGAGAGCTTTTAGTAGTATCTCAATTTACTTTATATGGAGATTGCAGAAAAGGAAGAAGACCTGGATTTA
GTAATGCATCTAGACCAGAACTTGCAAATAACCTTTATGAAGAATTTGTAAAAAAAGCAAAAGATAAAGG
TGTGACAGTTGGTACAGGTCAATTTGCAGCTCATATGATGGTAGAGTTAACTAATGATGGTCCAGTAACA
ATACTATTAGACTCAAGTAAATCTTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3099547-3097340 putative GTP pyrophosphokinase [Clostridium difficile R20291]
ATGCATGATAAAGAATTACAAGAAATAATTGAAAAAATAAAAGTTTATGCACCTAATGCAAATTTTGAAA
TGGTTGAAAAAGCCTATAATCTTGCAAAAAAAGCGCATGAAGGACAATATAGAAAATCTGGGGAACCATA
CTTTATTCATCCATTAGCAGTTGCAAATATTTTAATAGAGATGGAATTAGATATTGAAACTATAACAGCA
GGTTTACTTCATGATGTTGTAGAAGATACAGAATATACCTATGAAGACATAAAAAAAGAATTTGGCAAAG
AAGTAGCGGATTTGGTTGATGGAGTAACTAAACTTGGTCAAATAAAATATCGTTCGAAAGAAGAAACTCA
ATCTGAAAATTTAAGAAAAATGTTTTTGGCAATGGCGAAGGATATAAGGGTTATACTTATAAAACTTGCT
GATAGATTGCACAACATGAGAACATTAAAATACATGCCTCCAGAAAAAGCAAAGTATAAAGCAAAAGAGA
CACTTGAAATTTATGGTGGTATAGCTCATAGATTAGGAATTTCCAAGATAAAGTGGGAACTAGAAGACAG
AGCATTAAGATTTATGGACCCAGAAGGGTATTATGATTTAGTTAGTAGAGTATCAATGAAGAGAAGTCAA
AGAGAGGATTATATTCAAGGAATTGTTGAACTTCTTAAAGATAAGTTTAAAGATTTAAGTATACCATGTG
ATGTATATGGTAGACCAAAGCATTTTTACAGTATATATAGAAAGATGCAAAAAAAACATAAGACTTTTGA
AGAGATTTTTGATTTAACAGCAGTAAGGATATTGGTTGATAATGTAAAGGATTGCTATGCAGTACTTGGT
ATAGTTCATACATTATGGAGACCTATTCCAGGAAGATTTAAAGATTATATAGCAATGCCAAAACCCAATA
TGTATCAATCATTACACACCACTGTTGTAGGTCCTGATGGAGAACCTTTAGAGATACAAATAAGAACTCA
TGAGATGCATAATATAGCTGAAAATGGTATAGCAGCCCATTGGAAATATAAAGAAGGTATCTCTAGCAAA
GAGTCAAAGGTTGAAGAAAAACTTCAATGGTTGAGACAGATGATGGAGTGGGAAAAAGATTTAAAAGACC
CACAAGAGTTTATGGATGCACTTAAAGAAGATGTATTTAATAGTCAAGTTTATGTATTTACGCCAAAAGG
AGACGTAATTGAATTACCAGCAGAATCAACACCTATAGATTTTGCCTATAGAGTTCATACAAATGTAGGT
AATAAATGTGTAGGAGCTAAAATTGATGGAAGAATAGTTCCTATTGATTATAAGCTTCAAAATGGTAATA
TTGTCGAGGTACTTACATCATCTAATTCTAATGGACCAAGTAGGGATTGGCTTAATATAGTGAAGACCCC
AAATGCAAAAAGTAGAATTAGACAATTTTTCAAGAAGGAAAGAAGAGAAGAAAATGTTGACCGTGGAAAT
ACAATATTAGAAAGAGAATTTAAGAAGCATGATATACCACAAAAAGACCCTCTTGTTGAAAAATATATGG
CATTAGTTGCTAAGAAATTTAATCAGCCAAGTGTTGAGGACTTAATTGCCACTGTAGGTTATGGCGGTAT
AATGTCATCTCAAGTGGTATCTAAGGTAAAAGACCTATATTTAAAAGAGGTTAAAAAAGCTAAAAAGGAA
CAACAGATACAAGAAGAAGATTTAAATAAACACAATATAAGTGAAACAGAATACAGTAAAAAGAGAAAGA
AAAACGCATCACAAGGAATTATAGTAAAAGGGCTTGACAATATCTTAGTAAGATTTGCTAAGTGTTGTAA
TCCTCTTCCAGGAGATGAAATTGTAGGATATATTACTAAGGGTAGGGGAGTAGCCATACACAGAGCTGAT
TGCCCAAATGCAAACAATAATGGTGATTTCTTCCAAAATAGATTGGTGGAGGTTTCATGGAGTTCAGCAG
GAAAAGGTAAGTTTGAAGCGGAAATTCAAATAAAAGCTATTGACAGAAGAGGAATTGTTAATGAAATAAC
TCATATTGTTGCAATGGATAAACTTAGTTTAAACGGAATAAATGCAAGAAAAGGTAAGGATAGTATTGTA
AGTATAAACTTACTTGTAGAGGTTAATGACACAGAGGAATTAAAAATTCTAATGAAAAAATTAAAAGCAA
TTCCTGGTGTAGAAAGTATTTATAGAATGACAAATTAG
>ref|NC_013316.1|:c3100133-3099621 adenine phosphoribosyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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CAACTCTATTTAAAGATGGAGATGCATTTAAATATGCAGTGGATTCTATAGTTGAAGAATTGAAAGATAA
AGATGTAGATTTAGTAATAGGGCCAGAAGCAAGAGGATTTTTGATGGGTACACCTGTAGCATATGCTTTA
GGAGTAGGATTTGTTCCAATTAGAAAACCTGGAAAGTTACCAGGTGAAGTTGAGAGTTATGAGTATGGAT
TAGAGTATGGTACAGATACTTTAGAGATACATAAGGATGCAATTAAAAAGGGTCAAAAAGTAGCAATAGT
AGATGATTTATTGGCTACTGGTGGGACTATGGAAGCCGCTGCCAAGCTTGTAGAAAAATTAGGTGGAGAA
GTAGTTTCTATGCAATTTTTGATTGAGCTAAAATTCTTAAATGGGAGAGAAAAGTTGTCTAACTATGATG
TTAATTCTCTTATAAAATACTAG
>ref|NC_013316.1|:c3102596-3100146 putative single-stranded-DNA-specific exonuclease [Clostridium difficile R20291]
TTGAAAAAATGGATATTGAAGTATAAAGGTAAGATAGAGGAAAGTGAATTTAGCAAAAAACTTAATATTT
CCCCGGAAATCTGCCAAATTTTAAAAAATAGAGGGATATGTACTGAAAAAGATTCAGAAATATTTATGAA
TCCATCTTTAGATTATTTAAGAGACCCTTTTTTAATGAAAGATATGCAAAAAGCTGTTGATAGAATAAAG
TTAGCAGTTGAGAAGAACGAAAAAATTTGGATTTACGGAGATTATGATGTTGATGGTGTATCATCTACAT
CCATCTTGTGTTTATATTTTAAGAGTATAGGTTACAATGTTGATTACTATATTCCTAATAGATTAGAAGA
AGGGTATGGTATAAATGAGGATGCTATTAAGCTTATAAGCTCTAGGGGATGTGACTTGATTATAAGTGTT
GACTGTGGAATTACATCAGTGTCTGAGGTCAATACAGCGAATGATTTGGGCATAGATGTTATAATTACAG
ACCATCATGAATGTCAAAGTGAAATTCCATCAGCCTTTGCAGTAATAAATCCAAAACAAGAAGATTGTAA
TTATCCATTTGATTCACTATGTGGATGTGGTGTAGCATTTAAAATGATTCAAGCCTTGACTCCAAAAGAA
GAATTTAAAACTAGTATGTATAATTATTTGGAAATAGTAACACTAGCAACTATTTGTGATATTGTTCCAC
TTATAGATGAAAATAGAATAATTGTAAAAAATGGTTTAAAATCAATGAAAGAAGGCAAAAATATTGGATT
AAGGGAGCTTATAAAAGTTTGTGGTGTAGAAAGTGATAAGATAGGTTCTTCTCATATAGGTTTTGCAATA
GGTCCTAGGATAAATGCTTCAGGTCGATTGGGATATTCTTACTTAGGAGTAGAGCTATTTACTACTCAGT
CACAAGAAGAGGCAGTAGAAATAGCTAGTATATTGGAAGAAAAAAATAATGAAAGACAGATGATAGAAGC
TAAGATGTATCATGAAGCTGAAGAAATGCTAAAGTCTAATAGCAGATACAATGATGACAAAGTGTTGGTT
TTAGCCAAAGAGGGTTGGCAACATGGAATAATAGGAATTGTAGCATCAAAGTTAACTGAAAAATACTACA
AACCAACAATTCTTCTAGGTATAGAAAATGGGGAGGCTACTGGTTCAGCGAGGTCAATAAAAGGATTTAA
TATATTTGAAGCTCTCATAAAGTGCAAAGACTTGATGACTAAGTTTGGTGGTCATGAACAAGCAGCAGGG
TTATCCTTGGATTCAGACAATGTAGAAATTTTAGCAAATGAAATAAATAAATTTGCAGATTATAATTTAA
CTGAAGATGATATGATAGAGAATGTAAATGTCGAGTTTGAATTACAAGAAAATGTAATAAATTTAAATCT
TGTAGAAGAATTACATAAGTTAGAACCCTTTGGATTAAATAATCCTAATCCTAGATTTATAGTTAGAAAT
TATATTTTAAAAGATTTGAAAGTTATAGGTAAGAATCAACAACATCTGAAATTAAGTATAGAAAAAGAGA
AAAGCTATGAATGTATAGGATTTAATATGAGTCATTTAAAATCAATGTATAAAGTAGGAGACAAAGTAGA
TGTACTATTCCAATTAGATGAAAATAACTATATGGGAAATAGGAAAGTACAATTTTTACTTAAAGATATA
CGATTGGCTCGACCTAAAAGTGCAAGTAATGACAAACTTTCATTGAAATTAATGTCAAAAATAATACCAA
AAGATACTCAAAGCCTGTATAATATATCTGTGTCTGATTTTGAATTATTTGATGGAAATACAGATATAAA
TATATTTGATTATTTTGAAAAAGATACACTAATAATATCTAATTCTATAAATGGATTTTATAGAGCAATG
TCAGATATATCACTTATAGATTTGGATTTTAACATAAATTACAATATTATTGAAGATGTTAGCAAAAATA
CTGATAAATTAGAGCTTATATTTTCTCCTAATATTGATAAAATAGACTTAAAAAGATATAATAATATTAT
TCTTTATGATTATTTATACAATAAAGGCGAATATTCGTATATATATGAGAATAAAAGAGAAGAAAGTGAA
ATTATAAAATATTATAATAAAACAGACCTATTATATTTAAAGAATGTAGTTAGTAATATAGTTCCATCAA
GAGATGAATTTATAACAATTTATAAACAAGCACTTATAAAAAAAGAAATTGATTTGGATATGGTAAATAT
AAGGGAAACTTTTAATGTAATTCCATTAAAGTTTTTTACGATATTAAATGTATTTAGAGAATTAAATTTA
CTTGACTTTAATTTAAATTATGAAAAAAATTCTGTACTCATAAGAATATTGCCAAAACCACAGAAAAAAT
TAGACTTAAATGAGAGTTTAATACTCAATAATCTAAAAAATTTAGAAAAACAATACAATAGCAGTTATTA
G
>ref|NC_013316.1|:c3104273-3102609 putative ubiquinone biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
TTGAGAATAAGTTATAGAAATTTAAAGCGATATAGAGAAATTGGATATGTTTTAATAAAGTATGGTTTTA
GTTTTATTGTAGAAAGACTAAATATAGAAGGAATTGCCTATAAAATACCACTATTTGACCCACCAGAAGA
AATAAAAAATATGACAACTGGTGAGAGAATGAAAAGAGTTTTAGAAGAACTAGGACCTACATATATAAAA
ATAGGACAGATATTGAGTACAAGAAAAGACTTGTTAGACCAGGATATAATTGATGAAATATCAAAACTCA
GAGATGATGTAGAGAAATTTGATTCAAATATAGCTATTGATATATTTAAAGAAGAAGTGGGTTTAAGTAT
AGAAGAAATATTCTTAGAATTTAAAGAAGAACCAATAGCAGCAGCTTCAATTGGTCAAGTTTATGAAGGT
GTACTTAAAACGGGAGAAGAAGTAATCGTAAAAATTCAAAGACCAAATATAGAGAAAATAATAAAATCTG
ATTTAGAGATTCTTAGAACTATTGCAAATACTTTAAAAGATTTAAAAAAGGATTTTAATTTAGATTTAGT
ACAGATGATTGAAGAATTTCAAACTCAATTAATGAGGGAACTTGATTATACATTTGAAGCCATAAATGCA
ACTAAATTCTCTAGGATATTTAAAAATAGTGATGAAGTATATATACCTAAAGTATACTCAGAATATAATA
CTAAGAAAATTTTAGTAATGGAGAAAGTTAATGGTACAAAGTTAAGTGATGTAGAAAAAATAAGGAGACT
AGGTTATAACACAAAAACTATTGTTGAAATAGGAGTTAGGTCATTTTTTACACAGGTATTATCTCATGGA
TTTTTTCATGCAGACCCACATCCAGGTAATATATTTGTAGTTGCTAAAAATAAGATAGCATATATAGATT
TTGGAATGATTGGAATTATTGATAATAAAACTTTAAACCAATTAAATGAAATTGCATTAGCAGGTGTAGA
AAAGAATGTTGACAAGATAATATATCTATTGATAGAAATGGATGCATTAAATGGAGAGGCTGATATTAAG
GGACTTAGACAGGATTTACTTTATCTAATACATTATTACTATGATATTTCTATAGAAAAAATAAATGTAA
CAGATATATTAAATGAACTATTTAGGTTTTTTAGACAGTATAAAATAGTCATGCCTGCACAATTTGTAAC
TCTTGCAAAGACAGTTATAACATTAGAAGGAACAAGTAGAACTTTAAACACAGATTTTTCTTTTGGTTCT
ATGGGAAAAGAGTTTATGAAACATCATTATAAGAGTAAATTTAACCCTAAAAATGTTGTTTTAAGTTCAA
GACAAAATGTAGAAGAAATATTACTGGACATAAAAACTATTCCAAAGCAATTAAAAGCAATTTTAAAAAA
TATAGAAAGAAATAATATAAAAATGCAAATTGAAGATGTTAAAATGACGAGGTTAGAAAATTGTATAATA
GAGCTAACATCTCAAATATCTTTGAGTTTAGTGTTGGCATCTATTATAGTAGGTTCTTCTCTTATAATTG
CATCTCCAAATATAGAAAATAATATATGGATAAAATTTACTGCAATAGCGGGTTTCTTTATATCCTTTAT
AATAGGCCTTTGCTTAGTTATAAGAAGTATTAGGTCAAAATACAAAAAAGATTAG
>ref|NC_013316.1|:c3105068-3104571 putative transferase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTAGAGATTATTTAGAAGATAAACCTTTAATTGACGAAAGTGTATTTGTGGCAAAATCAGCAGATG
TAATTGGAAATGTTAAAATAGGCAAAGATTCAAGTATATGGTACAATGCAGTAGTTAGGGGTGATGAAGG
ACCAATAACTATTGGAGAAAACACTAATATACAAGATTGTTCTATAGTGCATGGAGATACAGAAACTATA
ATTGGTAACAATGTAACAGTTGGGCATAGGTCTATAGTTCATGGTTGTAAAATTAGTGATAATGTGTTAA
TTGGTATGGGTTCAATAATATTGGATAATGCTGAAATAGGAGAATATACTCTGATAGGAGCAGGTACACT
AATTACATCTAATAAGAAGTTTCCACCAGGTGTTTTGATAATGGGTTCTCCTGGTAAGGTTGTTAGAGAG
CTTACAGAAGAAGATAAAAAATATATTGATGAATCTTATGAATGGTATTTAGAGGCAGCACAAAATCAAA
AATATTAG
>ref|NC_013316.1|:c3106476-3105097 putative radical SAM family protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTATGATACATAAATTTTCTATGAATGGATATAATATCGTTTTAGATGTGAATGGTGGAGCTGTTC
ATGTGTTAGATGATGTTGCATACGATTTGTTAGATTTTTATAAAGAAAAAAGTAAAGAAGAAATATTAGA
GATATTAAAATCAAAATATCAAGAAGAAAAAATAAATGAAGCATATGAAGAAATATTAAATTTGGAAAAA
GAAGGTCTTTTATACACAGAAGATACATATCAATATCATCCAAGCTTTGTACATAGAGAGCCTGTAGTAA
AAGCTTTATGTTTAAATGTAGCTCATGATTGTAACTTAAAATGTAAATACTGTTTTGCAGCTCAAGGTGA
TTTTGGAGGAGAAAAAGAACTTATGAGTTTTGAAGTTGGTAAGGCAGCAATTGACTATTTGATTGCTAAT
TCAGGAAGTAGAAAGAACCTAGAGATAGATTTCTTTGGTGGAGAGCCTTTGATGAACTTTGAAGTTGTAA
AACAACTGGTTGACTATGGAAGAAGTGTAGAAAAAGATTATAATAAAAATATAAGATTTACAATAACTAC
AAATGGTGTACTGTTAAATGATGAGATTATAGATTATATAAATGAAAATATGCATAATGTAGTTTTAAGT
TTAGATGGAAGAAAAGAAGTTAATGATAATATGAGACCAACTTTAAATGATAAAGGAAGTTATGATATTA
CATTACCACGATTTAAGAAACTTGTGGAAAAAAGAGCAAAAGATAAGTATTATTATATAAGAGGTACTTT
TACAAGAGATAATTTAGATTTTTCAAAAGATGTTATGCATTTTGCAGATTTAGGATTTAAATTAACCTCT
GTAGAGCCAGTCGTTGGAGATGAGAGTAATCCATATGCACTTAGAGAAGAAGATTTACCTAAGATATTTG
AAGAGTACGAAAAATTTGCTGTAGAGTATGCAGATAGACAATTACAAGGAGATGGATTTAAATTTTTCCA
TTTTATGATAGACCTAAATCAAGGTCCATGTGTAATAAAGAGAATAACTGGATGTGGAGCTGGAAATGAG
TATCTTTCTGTAACTCCAAATGGAGATATCTATCCATGTCATCAATTTGTTGGAAATGAAGAATTTAAAA
TGGCAAATATATTTGATGAAGAAATAGTACTTCCAGAAAATTTAAAAAATATGTTTAGAGAAGCTCATGT
ATATACTAAAGAAGAGTGTAAACAATGTTGGAATAAGTTTTACTGTTCAGGTGGATGTCATGCAAATGCG
ATAAACTTTAATAATGACATATCAAAACCATATGAATTAGGATGTGAAATGCAAAGAAAACGTACAGAGT
GCTCTATAATGATACAAGCTAAGTTAATGTTAGAAGGAGCAACCAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3106927-3106781 autoinducer prepeptide [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGTTTATTGTAAGATTTATGAAGTTTGCTAGCTCATTGGCACTTAGCACTGCTATTTTGTCAG
CTAATAGTACCTGTCCTTGGATTATTCATCAGCCTAAAGTACCCAAAGAAATCAGCAATCTAAAGAAGAC
AAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3107535-3106957 accessory gene regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAAAAGATATGCTGAAAAAATGACATCTGTTTTAATTTGTAATAATATGATAGATAATAATGAAT
CTAAAGTCTATTCTTATGGATTTGAAATATTAATAGCTTTCATAGTTAATATAACCACCATGCTGTTTAT
AGGTTTTTTATTTGGTAAATTTACATATGTATTATTTTTTTTAATGTGTTATTGTCCAATAAGACAATTT
TCAGGAGGGTATCATGCAGACAATTATTTTAGATGCTTATTAACCTTTATTTTTATAATTTTATCTACAA
TCTTAATTATAGAAAATATAAATATAGACTTATTTAAAAATATTATTATGATTATTGCAAGTGTTAGTTG
GGTTGGAATTTGTGTTCTGTGTCCAATAGAACATAGGAGTAACCCTATAAGTGATAGGGAAAAGTTTGTT
TATAAGAAAACTGCTATATTTATATCTACAGTAGTGTTATTGATAACAATTTTAAGTCTTTCTTTGAGTA
TATTTGTAGATTATTTCACATATAGCGCATTTGCCATGTTTTGGATTTTTGTGATGTTAGTATTAGGTAA
GTTAAAAGCTAAAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3109333-3107903 hypothetical protein CDR20291_2641 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATATAAAGAATAAAATTAAATCTATATTTTTACCAGAAAAAAATGACTATTTAGATGATGAAGAAT
TTGAGTATGATATAGAAAATAATGAAGAAGATTTAAAGGAAGATAACAAAGTACATTTAAATGATTTAAG
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GTAAAGCAGGATGGTACTATAATTGAGTTTGTAAAGGACAAGACTTATAAAGTATGTATGGAAGCAGTAA
AACAGACATATAAAGCTCTTAAGTATATAACAAATCAAAATGAGGATATTTGTATAGAAGCAGTAAAACA
GAACTACAGAGCTTTGTACTACATAAATAATAAGACAGAAAATGTACTAATTGAGGCTATAAAAAATGCA
TCAACTTATGATGTCATGGAAGTATTTAAATTTGTGGAAGATCAAACAGAAGATGTATGTCTAGCATTTA
TAGAAAGGGCATCTAAAAATGATGTTGCAGAGATATTAAAAGGAATAAAAGAGCAAACTCCAGCCATATG
TTTAGAAGCTGTAAAAAAAGATGGAAAATCTTTAGCTTATGTAAAGGAACAAAGTAATAGTATATGTTTA
GAAGCTGTAAAAGAAAACTACAGTGCACTATCTTGTGTAAAAGAGCAAACAGAAGAAATATGTATAGAAG
CAGTAAAACAGAATGACTTTGCATTGTATTATGTAAATGAACAGACAGAAAAAATATGTATGGAAGCAGT
AAAAAGAAGTTATATGGCTCTACAGTATGTAAATAAGCAAACAGAAGAGATTTGTTTGGAAGCAGTAAGA
ATTGATGGAAGAGCATTACAGTACGTAAAAGAGCAAACAGAAGAAATTTGCTTGGAGTCAGTTAGACAAA
ATGGAAAAGTATTGCAATATGTAAAAAAACAGACTGAAAATATATGTATAGAAGCAGTAAGAGGTTCATT
TGAAGAACTTGAAATAAAAGAAATATTAAGTTATGTAAAGATACCAACAGAAAGAATATTTGTAGAAGCA
GTAAAGCAAAATGGAAAAATTCTTAAATATGTAGAAAATCAGACAGAATTAATATGTTTAGAGGCAGTAA
GAGAAAACTATAATGCTTTAGCTTATGTAAAGGAACAAACAGAAGAGATTTGTTTAGAAGCAGTTAATCA
AAGTTATGAAGCGCTTAAATATGTGAAAGAACAAACAGAAGAAGTTTGTCTAAAAGCAGTAAAACAAGAT
TATAGAATGTTGAAATATGTAAATAATCAAACAGAAAAAATATGTTTAGAAGCAGTAAAGCAAAATTATA
GAGCTTTAGAATTTGTTGATAATCAAACAGAAAAAGTTTGTCTTGAAGCAGTAAAACAGAATAGAAAAGC
ACTACAGTATGTAAAACAAAAACAAAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:3109677-3110342 hypothetical protein CDR20291_2642 [Clostridium difficile R20291]
TTGAAAGGAAACATAGTACAATATAATTTTGCAGATATAGAGGAAGAAGTATATTCGTTGGATTATGCTA
TAGCATGGAATACAGATGAGGAAAACGTAAACATAATACCATTTACAAATAAATTCTGTAAAGAATCTAT
AGAATCTTTTTGCCTAGGTAAAATTAATAACTTTGTTGAAATATTAAATGAAGGTTTTGTTGAAAATCAT
CATTATGTACATTTAGATAAAATGATTAGTGTTCCTAAGAAAAAGGTTAATTTAGTATATCAACAAGACA
CACATGGTTATCTTCTAAGAGATGATAATGACAACCTTATTCCTGCAAAAATAACTTCAGAGCAATCTAA
ATCTATATCAAGTAAGATGGAGTTATTCTGTGCTGGTGAAGAAAAATGTTTAATTAATATATTACTAAAG
GCTGACCCATCATATATTTTAGATGTAGATAGTATAAAAGACAAAAACATTCTAAATCTAGGTTATGAGT
CTATTGACAGATATAAAGAATACAATTTTGATGATGATAAGATTTTAATATTTTTTATAAATAAAAAACG
TTATTCAGTGATTATGAAAAAAACAAACAACTCTGATAACGATTTAGTTTCCAGAAACAATGCTATTAAA
GAATTATTTACTAATAAAGCAGGAAATCTTAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3112846-3111134 phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTTACAAAGGAATAGGTGCTTCTCCTGGTGTTGCTTTAGGGAAAGCGTTAGTAGTTGAACATAGTG
AATTAGTAATTGAAAAAAAATCTATAGATAATGTTGAAGCTGAAATTGCTAAATTAGAAGATGCAGTTGC
AGTTTCTAAAGAAGAATTAGTAAAAGTTAAGGAAAAGGCTTCTGAAGAATTAGGAGCAGAGGAAGCAGAA
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CTGAAAGTGTAAATGCAGAGTATGCTTTAAATGAAATAAAAGAGATGTTTGTTAGCATGTTTGAGTCTAT
GGACAATGAGTACATGAAAGAAAGAGCGGCAGATATAAAAGATGTTACAAATAGAATACTTAGACATATA
TTAGGAATTAAAGTTGTTGATTTATCTGCTTTAAGCGAAGAAGTTGTATTAATAGCACATGATTTAACTC
CATCAGACACAGCAACTATGAATAAAAAAATGGTTTTAGGATTTTTAACTGATATAGGTGGAAGAACTTC
TCATACTGCTATCATGTCTAGAACTTTAGAAATAGCTGCAATCGTTGGATTAAATGATATAACTTCAAAA
GTTAAGGATGGAGATTTTGTAGTTTTCAATGGAGACACAGGTGAAGTAATTGTGAATCCTGATGAAGAGA
CTATAAATAAATATACTGAATTAAAAGCTAAGTATGAAGATGAGAGAAAAGCATTACAGCTATTAAAAGG
AAAACCATCTGTAACTTTAGATGGAAAACATGTGGAATTAGCTGGTAACATAGGAACACCTAACGATATA
GAAGGTCTAATAAAGAATGATGCTGAAGGTGTTGGTCTTTATAGAACAGAATTTTTATACATGGATAGAG
ATTCTTTCCCAACAGAAGAAATACAATATGAAGCATACAAAGCTGTATTAGAAGGAATGGATGGAAAGCC
GATAGTTATAAGAACATTGGATATAGGTGGAGATAAAGAATTAAGTTATTTAAGTATGGAACCTGAAATG
AATCCATTCTTAGGTTACAGAGCAATAAGACTTTGCCTAGATAGAAAAGATATATTTAAGACTCAATTGA
GAGCTTTATATAGAGCTAGTATTCATGGAAGATTAAGAATCATGTTCCCAATGATTTCATCTTTAGAAGA
ATTGTTACAAGCTAAAGAAGTTGTAAAAGAAGTTTTAGCAGAACTTGATTCTGAAGGTGTGGCTTATGCT
AAAGATGTAGAAATTGGTATGATGATAGAAGTTCCATCTGCTGCTGTAATATCTGATGTATTGGCTAAAC
ACGTAGATTTCTTCTCTATAGGAACTAATGATTTAATTCAATACACTTGTGCAGTTGATAGAATGAATCA
AAAGATAAGTTATCTTTACAATCAATTTAATCCAGCTGTTTTAAGACTTATAAAGACTGTTATAGACAAT
GCACATAAAGAAGGAAAATGGGCAGGTATGTGTGGAGAATCTGCCGGAGACCAAAAAATGATACCAATAC
TTTTAGGTATGGGATTAGACGAGTTCTCTATGTCTCCAATATCAATACTTCCTGCTAGAAAGTTAATAAC
TTCAGTTAAAGAGTCAGATATGAAAAAATTAGCTGATGATGTACTTAATATGGGTACTGCTGAAGAAATA
AAAAGCTATATAGAAAAGACTTTTAATATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3113459-3113199 PTS system, phosphocarrier protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAAGTAGTTAGTATCAAAAATGCAAGTGGATTACATGCTAGACCAGCAGGAATGTTTGTTAAGA
AGGCAGCTGAATTTAAATCAACAGTAGAGGTTGTAGCAAAAGACAAAACTGTAAATGCAAAATCAATAAT
GGGAATAATGAGTTTAGGTTTAGCTCAAGGAGAAGAATTAAAGTTAGTTGTAAATGGAGAAGATGAAGAA
GTAGCTTTAGCTGCAATGGTTGAATTAGTTGAAAGTGGATTTGGAGAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3114862-3113651 putative phospholipase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGGATTAGTTTTAGAAGGTGGAGGAACAAAAGGAGCCTACCAAATAGGTGCATATAAAGCTTTAA
GAGAGCTTGGTATAGAGTTTCAAGGAGTAACTGGCACATCAATTGGTGCTTTAAATGGAGCATATATAAT
TCAAAATGATATTGAAGTAATGGAAGATATTTGGTTAAATTATGACTATACTCATTTTATGAATATTGAT
AGAGAAACCTATGAGAGGTTTAAAAATGTAGATTTCACTACTAAAAATCTCAATGCAGTGTTTGAGCTTA
TAAATAAAGCTAGAAAAAATGAAGGTATAGATATAAGCCCATTAAGACAACTAATGGAGACAACATTAAA
TGAAGACATAATAAGGAAATCAAAAAAAGACTTTGGACTTGTTACGGTCTGGTGGGATAAAAAAATTAAT
CCATATCCATTGTATATCGAAGATATACCTAAAGGAAGATTGATTGATTATTTAATTGCTAGTTCCAGTT
TGCCTATTTTTCAAACGAACATGATGGATGATAAGTTGTATCTTGATGGAATGTTTTGTGATAACATGCC
AATAGGACTCTTGGAAGACAAAGGTTATGAAGATGTTGTTGTAATTAGGTTGATTGATGATTTTATTGGG
AAAATGAATCTAAATCGACATCAAAATATAAATATAAAAACTATAATACCATCAGAATATCTAGGAGGTT
CTCTTAATAAAGATAGAGATAATGTAGAAAAAAACATCCGACTAGGTTACTTAGATACTATGAAAGCATA
TGAAAGATGCACTGGAATTAAGTATTATTTTGATGTAGAGTATAAATATAATGAAGAATATTGTTTTGAT
AAATTTAGAAGTATGAGCAATGAAACAATACAATATATCTGTAATTTATTGAATATAAAAAGAGATGCTT
CACTTAGAACTGTTATGGAAAGTGTAATACCAAAGCTTGGTGAGGTGCTTGGATTGCCAAAGGACTTTTC
ATATAAAGATTTGTTTTACTGTATATATGAAAAGAAACTTGAAGAAAATAATATAAACAGGATAAAATTA
TATGATTTTAACAAGGTTATAGATGTTGTAAATACAAATATTGATTCTAATAGAAATTTAGCTTCTAATT
TTGAAGTTAGACCTAAAATTAGTATTAAAAAGAACAAAAACACAAAATTATTGACAAATTGTATTATAAA
AGACATAAAAAATCAAAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3116827-3115094 putative DNA modification methylase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATGATATATCTCAAGATAATTTTCTACTGTCTAAAGAGTATGAGAATAGCTTAGATGTAGATACTA
AAAAAGCAAGTGGAATATATTATACTCCTAAAATAATTGTAGATTATATTGTAAAAAAAACTTTAAAAAA
TCACGATATAATTAAAAATCCATATCCACGAATACTTGATATTTCCTGTGGGTGTGGAAATTTTCTTTTA
GAAGTATATGATATTTTATATGACTTATTTGAGGAAAATATATATGAATTGAAAAAGAAGTATGATGAAA
ATTATTGGACTGTTGATAACATACACCGTCATATATTAAACTATTGTATATATGGTGCTGATATTGATGA
AAAAGCTATAAGTATATTAAAAGATAGCTTAACAAATAAAAAGGTAGTAAATGATTTAGATGAATCTGAT
ATAAAGATTAATCTATTTTGTTGTGATAGTCTTAAAAAGAAATGGCGATATAAGTTTGATTACATAGTGG
GTAATCCACCCTATATTGGTCATAAAAAACTTGAAAAGAAATATAAAAAATTTCTCCTAGAAAAATATAG
TGAAGTTTATAAGGATAAAGCTGACTTATATTTTTGTTTTTATAAAAAAATTATAGATATTTTAAAGCAA
GGAGGGGTTGGCAGTGTTATAACTCCAAGATATTTCTTAGAAAGTCTATCAGGTAAAGATTTAAGAGAAT
ATATTAAATCAAATGTCAATGTTCAAGAAATAGTGGATTTTTTAGGTGCAAATATATTTAAAAACATAGG
GGTATCTAGTTGTATTCTAACTTTTGATAAGAAAAAAACAAAAGAGACATATATAGATGTATTTAAAATC
AAAAATGAGGATATATGTATAAATAAATTTGAAACATTGGAAGAACTTCTAAAGAGTAGCAAATTTGAAC
ATTTTAATATAAATCAGAGATTGCTATCTGACGAATGGATACTTGTAAATAAAGATGATGAAACTTTTTA
TAATAAGATACAAGAAAAATGTAAATATAGCTTGGAAGATATAGCAATAAGTTTTCAAGGAATAATTACA
GGGTGTGATAAAGCGTTTATTTTAAGTAAAGATGATGTAAAGTTGAACCTTGTAGATGATAAATTTTTAA
AATGTTGGATAAAAAGTAAGAATATAAATAAATATATAGTAGATAAAAGTGAATATAGGCTAATATACTC
AAATGATATAGATAATGAGAATACAAATAAAAAGATACTAGATGAAATTATAGGGCTATATAAAACAAAA
TTAGAAAACAGAAGAGAATGTAAAAGTGGAATAAGGAAATGGTATGAACTTCAATGGGGTAGAGAAAAGC
TTTTCTTTGAAAGAAAAAAGATAATGTATCCTTATAAATCAAATGAAAATAGATTTGCTATAGATTATGA
TAACAATTTTTCAAGTGCAGATGTATATTCTTTTTTTATAAAAGAAGAGTATTTAGATAAATTTTCATAT
GAATATCTAGTTGGAATTTTAAATTCCAGTGTTTATGATAAATACTTTAAAATAACTGCTAAAAAAATGA
GTAAAAATATATATGATTACTATCCTAATAAGGTTATGAAGATAAGGATTTTTAGGGATAATAATTATGA
AGAGATAGAGAATTTATCAAAGCAAATAATATCAATTTTATTAAATAAGTCTATAGATAAAGGAAAAGTA
GAAAAATTGCAGATAAAAATGGATAACTTGATAATGGATTCTTTAGGTATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3117265-3116867 hypothetical protein CDR20291_2647 [Clostridium difficile R20291]
ATGATTTCAGAAGATGTAGATTATTCAATAAGAATCATAAGAGCTATATTTAATAATGGAGAAGATAAAC
CAATAGATGCTAAAATGATATTAAAAAGTGAAGATATACCAATACTAACACTATACAGACTGCTTAGAAA
GCTTTGTGCAAACAATATTCTTACTTTTAACAAAGAAGATGGCAAGACATACATGTTAAATGTGTCATTG
GATACAATAAGTCTAAGAACTATTGTAGAAGTAATTGATGGAAAAATATATATAAATAAATGTACGAGAT
ATGTATCTAATTGCAGTAATTGCTTAAAAGGTTGTAAAGTAAATCGTGAATTGCTAGAAATAGAAAAAGA
AATTTATAAACTTTTATCGAGAAAATCTATAAGACAAATACTAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3118815-3117268 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAAATAGCATGACAAAAATTTACAGTTTAAATAAAATAATTTTTATTATAATTGGAATTTTAG
GAATAGTTTTACTTACAAGACATATTGAGGTAGATATTAAAGTTTTAATTTTAATTTTATTAACTTTGTT
TAGTATAAATGTATTTATTTCATATCTTAAAATTAAGTTGTATGAGGATAAAATTAATTTAGGATTGATA
AATAATTCAGATAAGTTTATAAATATTACTAAAGATGAGAACTTCCTAAAACATGTTCAAAATTATATTA
TCAGTAATGAAAAAGAAAACTGTGTAATGGCTTGTTTTGATTTATGTAGACTCAAACTTATAAATGATAT
ATATGGTTATGAGCTAGGGGATGAAGTGTTAAATAATATTTTAAGTAACTTAAAAAATTATTTTGGAAAA
GAAGCTATTTATGGAAAGTTAAAAAGTGATGTTTTTGTATTAATAATAAAGCTTGAAAATAGGGAACAGA
AGATTCCTTATTTAGTAAATCTTATCAAGAATAAAATTATGATATTAAGTCAGATTGACAGTTTTAAAAT
GGATATAAATATTGAGGCTTCTATTGGAATTTATAAATTTAACAATAATGAAATTGATATAAAAAAAGCT
ATAGATAATGCTGATATGGCAAGGCTTAAATCAAAAGGACTAAAGCACATAGAGTATGTAGAATTTGATA
ATGCTATGGAAGAAGAAATACAATCAATTATGAAAATAGAGAGAGATTTATTCTTGGCTATTAAAAATAA
AGAGTTTGTAATTCACTATCAACCTAAAGTTGATTCAAGTACAGGTAACATTATAGGTTCAGAGGCATTG
ATAAGATGGTTGCACCCATCATTAGGCATGGTTGGACCAAATAAGTTTATACCTATAGCTGAAAAAAATG
GTCTGATAAACAATATTGGTAGATGGCTAATTCAAGAAGTTTTTATTACCATTAACAAGTGGATTTCAGA
AGGTATAAATGTCTTACCAGTCTCAATAAATCTTTCTAGAGTAGAACTATATAAAAATGATTTAGTTGAT
TTTTTTAAACTGATGTTTAATACATATAATATTCCAAAAGAACTTATAGAATTAGAAATTACAGAAACGA
CAGCGCTAAGAGATGTAAAATTTATAAGTGAAAGGCTTTATGAGATTAAATCTTTAGGTATGAATATATC
ATTAGATGATTTTGGAGTAGGTAATTCAAATTTTATCAATCTTAAGGGGATACCACTAGATATTATAAAA
ATTGATAGGTCACTTATATTGGATATAGTTACAAATACAAAAACAAAGTTTATGGTGAAAGCAATTATTA
ACCTTTCACATGATTTAAACGTAACTGTTATATGTGAAGGGGTAGAGGATATGCATCAGGTCAAAGTCTT
AAGTGAACTGGGATGTAATTTCATACAAGGTTATGTATTTTTTAAACCTTTGGATGAGATGAATTATAAA
AAACTTCTTACTGACGGAAGTTATATAAATCTGAAAGATACTCTTTTAGATAAATGCATGACAGTTGAGG
AGGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3120035-3119130 putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase [Clostridium difficile R20291]
TTGAAAAAAAAACTTCTTGATGGTAAAATAACACTAATAATATGTAAAAGTGTAAAAATTTATACCAAGA
AGGGTGAAGAAATGTCAAAAGGCAATAATAACAATAATTCAAGAAACAAATCTAAAAAGACCAGTCATCT
GAATAGAAAAAAGCGAAAATTAAATAAGAAAAAGTTAGCAGTGTTGATTTGCTTTACAGTTTTATTTTTA
TTTATTGCATTTAAGGCTACTCAAGGTGTAGTAGCTTTGGTAAAAAGTATGGATAAAAGTAATAAAACTA
GTCAACAACAAAAAGTTAACTCAGAACAATTTGACCTTGGTAATGAAGAGGAAAATAAAAAGAAAAAATA
TACTGTATTTATAGACCCAGGTCATGGAGGCAATGATAAAGGAACTGAAAGCAAGACCAGTAATAGATAT
GAAAAAGACCTAAATCTACAAATTGCAAAAAAATTAGCAAATAAATTATCTAAACAAAAGGATATTCAAG
TAGTAGTATCCAGAACTGATGATACATATATATCATTAAAGGATAGAGCTATCTTAGCAAATAATAGTTC
TGCTGATGTGCTTGTTTCTATTCATTTAAATGCAGAGAAAAATGGTAATACAGCAACAGGTATAGAAACT
TGGTATAGGAATAAAGCTACAGATGGTTCAAAAGAACTTGCACAGACAGTACAAAGTACTATAGTATCCT
ATGTTAAAGTTAGAGATAGGGGAATAGTTGAAAATAACTTTGAAGTACTTAGAGAATCAAATATGCCTGC
TATATTAATAGAGTGTGGTTTTTTAACAACACCTTCAGAGGAACAAAAAATAATAAATGAAAAATATCAA
GACCAACTTGCGGAAGGAATTGTTCAAGGTGTACTTTCATACCTAGATTCTAAAGGGAATAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3120722-3120078 undecaprenyl pyrophosphate synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAATACCAAAACATGTAGGAATTATACCGGATGGAAATAGAAGGTGGGCAAGTCAAAATGGTATGA
CAAAAGATAAAGGATATGAAAGTGGAATAGACCCTGGATTAGAGTCTTATAGATTATGTAGAGATTTAGG
CTGTGAAGAGGTGACTTTTTATGGATTTACAACTGATAATACAAGACGTCCATCAGTGCAGACAAAAGCT
TTTACAAAAGCATGTATTGATGCTGCAAATATATTAATAGATGAAGGTGCTGCTTTATTAGTTGTAGGAA
ATACAAAATCTCCAATGTTTCCAGAAGAATTATTACCATATACTAATAGAATTAAAGCCAAAGAAGGTCA
AATAAAAGCAAATCTTCTGGTAAATTATGGGTGGTATTGGGACTTAAATAATATATCAGGAGTAGAAAAT
GTAAATAAAAATAATATACAGGATTACATACAGTCATTTGATGTATCCAGACTAGATTTAATAATCAGAT
GGGGTGGAAGAAGGAGATTAAGTGGTTTCCTTCCTGTACAATCAATTTATGCAGATTTTTATGTTATAGA
TAATTATTGGCCAGATTTTAAGAGTGACGATATAAAGGACGCATTTAGTTGGTATGATACACAAGATGTC
ACTTTAGGTGGATAA
>ref|NC_013316.1|:3120861-3121331 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAATTTTAATATTGTTTTTTTCGATAATCTTATCATTAGGAATGGTTAGTTGTTCTTCAAGTG
GTGATTACAAAAACGTTTCTACATCAAAAATAAAAAAAGCATTAAAATCTTCTGATTTACTTATAAAAGA
ATCAAAAATCTTTGATGCAAAGGACTTTAACTATTTTAATGATGTAGAGGAAGACATAATTCAAGGTTTT
GTAATTAATTCTTCTGAAAAATTATCTCTAGAAGATATTATCGTTATAAAAACTGACGAGGTAGATAAAA
TATATAAAACTCTAGAAAATTATAAAAAAGATATGATACAAGCACCTTTTGGAGAAGGACATGGAGAAAA
AATCAATTCTGAAATAGCAAATAATACTATAATTGAGAAAGCAGGTAGATATGTTTATTTAATTTCTGCT
GAAAATGCAACTCAAATAGAAAACAAAATACTGAATATCATAAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3122242-3121454 putative hydrolase [Clostridium difficile R20291]
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TTTATAAAGTATTTAAAAAATTAAGAGAGAGAGGGATAATGTTTTCTGCTGCTAGTGGCAGGCAGTATCA
AAATCTTATAAAAAAATTTGAAGATATAAAAGATGATATGATGTTTATATCAGAAAATGGAACACTAGTA
GTATATAAAGGAAAAGAAATATTATCAAATCCTTTAAATAAAGAATTAGTAAATGAAATCATAGAGACAA
CAAGAAGTATAAAAGGGAAAAAAATTGTAATGAGTGGGAAAAAATACGCTTATATAGAAAGCAAAGATGA
AGCGTTTATACAAGAGGTTAGTACTTATTATGCAAAGTTTAAAATTGTAGACGATTTGACGAAAGTAGAA
GGCGATATATTGAAGATAGCTGTATTTGACTTCAAAGGTGCAGAACATAATAATAATATCTACTTTGAAA
AGTTTTCTGATAGAGCTCAAGTATGTATTTCTGGAGTGGAGTGGCTTGATTTAACTGCAAAAGGTGCAAA
TAAAGGGAGTGCCATAAAAAAAGTACAAAAAATGTTAGATATAAAATATGAAGAAACTATGGTATTTGGT
GACCAGTTAAATGATGTGGAAATGATGAAAAGTGCCTATCATAGTTATGCCATGGAAAATGCAAATGAAC
ATTTGAAACAAATTGCTAGATTTAGAGCAAAAAGAAATACTGAAAATGGCGTTGTAGATAAGATAAAAGA
GGTCATAAAAATTGGATAG
>ref|NC_013316.1|:3122610-3123566 putative penicillin-binding protein repressor [Clostridium difficile R20291]
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GATATGTTTTTACTAAATTAAAAACTATACAAGATGATAGTATAAATACAGAGGCGCTTAGTAGTAATGA
CTATAAAAACGAAGAAAATATCACAAACATATTATTGTTAGGTACAGATGCAAGACCAGGAGAAGAAGTT
TCTCGTTCTGATGCCATGATGATACTTACTATTGATAATAAAAATAAAAGTCTTAAGCTAACTTCATTAA
ATAGAGATACTTATGTTGATATACCAGGACGTGGAGAACAAAAATTAACACATGCCTACGTATATGGACA
AGCTAACTTATTAATAGAAACTATAGAAGAAAACTTCCAACTTGATATACAAAACTACGCCGTAGTTGAC
TTTTTCTCTTTTATGGATATAGTTGATGCTTTAGGTGGAGTTACTGTTACTGTTGATAAGAGTGAAATAA
GAGAATTAAATAAATTTATTCCTGAAACTTATAAATGGAATAAAAATGACAATAAAGGTTCTCTTAAATA
TATAAGAAATTCTGGTGAGCAAAAATTAAATGGATATCAGACACTTGCATTTTCTCGTATAAGAAAAAAT
GATAGTACAGATGAAAGAGATAGAAGACAAAGAAGTGTTATACAGAGTTTAATAAATGGTGTTAAGGATT
TACCAGTCACTAAATATCCTAATCTAGTTAACACAATACTTCCGTATGTAAAAACTAATATGAATCCTAA
TGAAATAATATCTTTAGGAAAAGAACTTTTAAGTATAGGAAATTTAAATTTGAAATCTATGGAGTTTCCT
CTTTCTACTGAAAATGGTAGAAAAATAGGTAATGCAGGCTATGTAATACCTTTTGAGGAATATGAACTAG
ATGCAATGCATGATTTCATATTTAAAGATATTATGGTTGAAGATTAG
>ref|NC_013316.1|:3123851-3124816 putative penicillin-binding protein repressor [Clostridium difficile R20291]
TTGTCAAAATTAAAGAAATTTGTTATACTACTGGCTTTCTTGGTAGTAATATTCCCTATAAGTGTCTATG
GATATTTTTATTATAAATTATCTGCTATTCATGACTCGAGCATAAGTAGTGATTTATTGGATAACAATGA
CCATAAAAATGAAGATGGGATAATTAACATACTACTTATGGGAACAGATGCTAGACCAAATGAAGATTCT
TCAAGGTCAGATGCTATGATGATACTTACTATTGATAACAAACACAATGATATCAAACTTACATCATTAG
CTCGTGATAGCTATGTAGACATCCCTGGTCATGGTAAACAAAAACTTACTCATGCTTATGCTTATGGACA
AGCTGATTTATTAATACAAACAATTGAAGAGAATTTTAATATTGATATTCAAAATTATGCTTGTGTTAAT
TTCGAATCATTTATGTATATAATTGATGCTATTGGTGGCGTTGAGGTTACTGTTGAAAAAGGAGAAATAC
GAGAACTAAATAAATTTATTCCTGAAACTTATAAATGGAATAAAAGTGATGATAAAGGTAGCATACAATA
CATTAGAAACTCTGGAAAGCAGACTCTAAATGGATATCAGGCACTATCTTTTGCACGTATCAGACACAAC
GATACAGCCTTTGCTAGAGATGGCAGACAGAGACAGATTATACAAGCTATAATCAAGAAAACGGAAACTT
TACCTGTTACTAAATATCCAGGTTTATTAGATGCAGTTCTTCCATATGTTAAAACTAACATGAAGCCTAA
TGCAATACTTTCTTTAGGAGCTCAAGTTTTAAAAATGGGTGACTTAAATATTAAGCAATTTGAATTTCCT
ATTGATGATGAAATTCATAGTACAGGTGGTATATATGGAAAAGCTGGATGGGTTCTTAGATTTGACCCAG
ATACTTTAGACATATTACACGATTTTATATTTAATGACATAGAGTTTAAACAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3127125-3125014 cell surface protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAATAAGTATATTAGTATTATCATTGATAATGACACTTACTATGTGTAGTGTAAGTTCATTTG
CCGATTCATCAAATGATAAGGAAATGAGAGCTGCTTGGATATCTACAGTTTATAATTTAGACTGGCCTAA
GACTAAGAATAATGAAGCCAAGCAAAAAAAGGAATACACAGATTTATTGGACAAACTAAAAAGTGTAGGA
ATAAATACAGCAGTGGTTCAAGTAAGACCAAAATCAGATGCTTTATATAAATCAAATATAAACCCATGGT
CTGAATATCTTACCGGTACACAAGGTAAAGACCCTGGATATGACCCATTACCATTTTTAATAGAAGAAGC
ACATAAAAGAGGAATGGAATTTCATGCATGGTTTAATCCATATAGAATAACTATGGCAGATGAGAGCATA
GATAAATTGCCAGCAAACCATCCAGCAAAGAAAAATCCAAGCTGGGTAGTTAAACATGGAAATAAGTATT
ACTACGACCCAGGTTTACCAGAAGTTAGAAAGTACATAGTGGATAGTATAGCAGAAGTAGTTCAAAATTA
CGATATAGATGGAGTTCATTTTGATGATTACTTCTATCCAGGAGTAAGTTTCAATGATACTGCAACATAC
CAAAAATATGGAAAAGGACAAAATAAGGATAATTGGAGAAGAGAAAATGTAAATACTCTACTTAGAGATG
TAAAAGCGTCTATAAAGAGTATAAAGCCTAATGTTGTATTTGGTGTAAGCCCAGCAGGTATATGGAGAAA
TAAGAGTAGTGACCCAACAGGTTCAGATACATCAGGTAATGAAAGTTATGTAGGTACATATGCAGATACA
AGAGCATGGATAAAACAAGGATTGATTGACTATGTAGTTCCACAACTTTACTGGCCAATTGGTCTTAAAG
CAGCAGATTATTCTAAATTAGTGGCATGGTGGGCTAATGAAGTAAAAGGAACAAATGTAGACTTATACAT
AGGACAAGGTATATATAAGCAAGGTCAATCTAGTTATGGTGGACAAAATATAGCAAAAGAAATAGTACAA
CAAGTAACATTAAATAGAAAGTATAGTGAAATAAAAGGTAGTATGTATTTCTCAGCTAAAGATATAGCAA
ATAGTACTTCTATACAAAAGGATTTAAAGAGTTTATATTCTAGTAGTGAAGAACCAGTTACTCCACCATC
TAATGTTAAAGTGGAGAAATTAAGAGGCGACGAAAGATATGACACAGCAGTAGCAATAAGTAAAAAAGGT
TGGGCTACAAATTCAGATACAGTAGTATTAGTAAATGGGTACTCTATAGTTGATGGCATAACATCAACAC
CACTTGCTACATCAAATGATGCTCCTATACTATTGGTAAATAAGGATAATATACCTACATCCACTAAGAA
TGAGTTAAAAAGACTTAATCCAAGTAAAGTTATTTTAATTGGAGGAAATAACTCTATTGGAGATAAAGTT
GAGAGTGAGATAAAAGATACATTGTCAAATGTATCAATAAATAGAGTTGGTGGTTCAGATAGATATAGTA
CATCTTTAATGATAGCAAAAGAATTAGTAAAAACTAATCCAGTAGAAAAACTATATATAACAAGTGGTAC
AGGTGAAGCAGATTCTCTTTCTATAGCTTCAAAAGCAGGAGAAGAAAAGCAACCAATAGTACTAGTATCA
AAAGATAATGTAAGTGATGAAGTTTACAATTGGATATCAGATTTAAAAGTAAAAGATGCTTATTTTATAG
GTGGTAATCTAAGTATATCTGATTCAGTAATAAATAAGCTGGATAAGGTCATTACAAATGATGTATCTAA
AAATAGAATAGCTGGAGAAAATAGAGAAGAAACAAATGGAAAAGTAATACAAAAATTCTATCCAAATGCT
GAATATTCATCAATGTTTGTAAGTAAAAGTAATCAATTGGTAGATGCATTAACATCAGGTCCTTTAGCAG
CTAAATTAAAATCACCAGTAGTTATGCTTGGAAATAGTGTAACATCTGCTCAGAAAACTGCTTTAGAGCC
TAAGAAAACTGCTCTAGTATACGAAGCTGGAGATGGTATAAATCAAAACACATTAAACACTTTCTTAAAC
TTAGTTAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3128134-3127427 putative cell-wall hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGATGAATATTAAAAATAAAAAACATATATTGAAAAAATTTATAGCTATGGTGTTAATAGCAGGAGTTG
TCACAGTAGAAGCAGGAGCAATAACGGCTAGTGCAGCAGAGCCAACTAATTCACCTATGAGTGCAACAGT
AGACCAGTGTGATTTTTTAAATGTAAGAAGTGGAGCTAGTGCAAATGATGCAGTAGTAGGAAAGATAAAC
ACAGGAGACAAAGTTGAAGTTTTAGAATTACATTCAAATGGATGGATTAAAATAAAAAGTGTTGACAATG
TTACAGGATGGGTAAATGGAGATTATTTAACTATTCAAGGTGGAAATGTAGATGCAAAGGTACAAAATGT
TTTAAACTTAGCATTTAAGCAACAAGGTAAGCCATATAGATGGGGAGCAACTGGACCAAATGCTTTTGAT
TGTTCTGGGTTCACTTCTTATGTCTATAAAAATGGAGCAGGGGTTAATTTACCAAGAGTATCAAGATCAC
AAGCAACAGTAGGAAAGAAAGTATCAAGAGCAGAATTAAAACCAGGAGATTTAGTTTTCTTTGGTTCAGG
TGGTTCAATAAATCATGTTGGATTGTATGTAGGAGATTCTAAATTCATACATTCACCACAAACAGGAGAT
GTAGTAAAAGTTACTAGCATGGCTCCAGGAACTAATTATGCAAGAAGACTTATAACTGCTACACGTGTTT
TACAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3130246-3128333 capsular polysaccharide biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
ATGCGAGAAAGTATAGATTTAGAGAAAGAAAGCTTTTTTAATAGGCTTTTTAAAAAATATAAATTTAGAC
ATTTAACACTATTAATTCTAGATATTTGTAGCGTACTAGTAGCGTTTCGAATGTCTTTAAGCTTGACAGG
TAATTTAAATGCATTTACCACTAATGATATAATAATTTCAGTGTGTATATATATAGTACTTCATATAGTA
TCATTTAGATTGTTTAAGTGCTACAACACATTATGGAGATATGCAGGAGAAGAAGAAATTATATCTATTT
TTGTGGCAACTTTAGCTTATTTAATTCCGATTTATATAATAAATAAATTATTAGGGTTTGATTATCCTAT
AATGTTTTATGTATTAAATACAATATTTATTATAATGTTTACAAGTGGCGCAAGAATAGCTTATAGAGCT
ATAAGAATAGTCATGAACAAGACATATTCTAGAGGAAAGGTTTCAAATATCCTTATAATTGGTGCAGGAG
ATGCAGGAGAAATGGTTATACAGGAACTAAAAAGAAATTCAGAACTTAAAAAAGTAGCAGTGGCTATAAT
TGATGATGATAAAGATAAAATTGGAAGAATAATCCATAATGTGAAAATTGTAGGAACAACTTCGGATATA
AAAGCTGTGGTAGAAAAGTACAATGTAGATGAGATAATCTTTTCAATAGCAAACATAGAGAAACGTAGAA
AAAAAGAGATTATTGATATATGTAAAAACACTAACTGTAAAATAAAGACAATACCAGGAATTTACGAAAT
TATAGATGGAAAAGTTGATATAAAACAGATTAGAGAAGTAGAGATAGAAGACTTGTTGGGTAGAGAGCCT
ATAAAAACAAATTTAAGAGAGATAAGTAATTACATTGAGGGAAAAGTAATCCTAATAACTGGAGGAGGAG
GCTCAATTGGTTCAGAGCTTTGCAGACAGATTGCAGGATTTAATCCTAAAGAGCTTATTATAGTTGATAA
TTATGAAAATAATGCTTACTCAATACAACAAGAATTACTTAGAAAATATAAAAATAAATTAGATTTAAAG
ACAGTAATAGCATCAATAAGAGAAGAAAAAAGAATGGATGAAATATTTAATAAATATAAACCAGAAGTGG
TATTTCATGCAGCAGCACATAAACATGTTCCTCTTATGGAATCGAGCCCTGGCGAAGCTATAAAGAATAA
TATATTTGGAACTTTAAACATAGCTGGCTTGTCTTCAAAATATAGAGCTAAGAAATTTGTCCTTATATCT
ACAGATAAGGCTGTAAACCCTACTAACATAATGGGAGCTACTAAAAGAGCTGCTGAAATGATTATACAGA
CTATGAATGCTGAAAGCCAGACTGAATTTGTTGCTGTTAGATTTGGAAATGTGCTTGGTAGTAATGGTAG
TGTAATTCCACTTTTTAAGAAGCAAATTGAAGATGGCGGACCAGTGACAGTTACTCATCCAGATATCATT
AGATATTTTATGACAATACCAGAAGCAGTAGGCTTAGTTATACAAGCTGGGGCTATGGCTAAAGGTGGAG
AAATATTTGTGCTTGATATGGGAGAACCTGTAAGAATATTGGATTTAGCAAAAAACTTAATTAAATTCAG
TGGATTTGAGCCAGATGTTGATATAAAAATTGAATTTTCTGGTCTTAGACCAGGAGAAAAGTTGTATGAA
GAACTACTTATGTCAGAAGAAGGTCTGTTGGATACAGAGCATAAAAAGATTTTTATTGGTAGACCAATAG
ATGTTGATAGAGAAAAAATAACAAAATACTTAAAACTTTTAAGAGAAATTACTAACAATGAAGAGGTTGA
AAAAATAGATGGTATTATGAGGGAATTAGTGCCAACTTATATTAAACCAGAAGATGCTAATATCAAAGAA
ATTGCAACAACTAGAGAAAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3131421-3130330 putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGACTGTTTGTTATTTAGCTGATGGGTCAAATCCTCATACTTTAAAATGGTGTAGTTTTTTTAAAA
ATAAAGGATATGACATTCATGTAATCTCTTTAAATGGAGGTCACATGGAAGGAATAAAAATTTATAATTT
TGGTTCTAATGTAGAAGAATTAAAAAATGAAAATATTTCTAAAAAAACGGGATACTTAGGTTCAATAAAG
CAGATAAAGAAGCTAGTAAATGAAATAAAGCCAGATATATTGCATGCACAGTATGCAAGTAGTTATGGAT
TTATAGGAAGTCTACTTGGGTATCATCCATATATTATTTCTGTTTGGGGTACTGATATTTATGATTTCCC
TAATAATGGTTTTATACAAAAACAAATTATAAAACATAACTTTAGAAAAGCAGACTATATCTTTTCAAAT
AGTAGAGATATGGCTAAAGAGGCTAATAAATATACAGCTAAACATGTAGATGTAACCTTTTTTGGAGTAG
ATATGGATAGGTTTAAGCCTATGGAAGTAGAAAAAGAAGACGCTTTTGTAATAGGAATTATAAAGAGTTT
AGAAAAAAAATATGGAATAGAATATTTAATACAAGCATTTAAGATGCTTAAAGATGAATATAAAGATAAG
AAAATAATTCTTAAAATAGGTGGCTCTGGAAGTCAGATGGACAACCTAATAAATTTAGCTAAAGAATTGG
GTATAGAAAATGATGTTCAGTTTTTAGGAAGAATATCTCCAGAAAATGTAAGCAAGACTTTTAATTCTTT
TGATGTAACTGTATTTCCTTCTTTAAGAGAGGGATTTGGAGTGGCAGCTATAGAATCAGAAGCATGTGAA
GTACCTGTTATAGTTACAAATGTAGGAGGACATCCAGAATCTGTATGGGAAAATGAAACTGGCTTAATTG
TAGAACCAAAACAACCAGAAGAAATAAAAAATGCTATAATAAAACTAATGGAAAATGATGAACTTAGACT
TAATATGGGTAAGAAAGGGCGTCAATTTGTTAGAGAAAATTATGAGGTTAATTTAAACTTTAATGATATA
GAAAAAATTTATGATTCTATATTTGATAAATATAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3132770-3131427 putative UDP-glucose 6-dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGCCATTAAAAAAAGAGTATAAGTTTTATATACTTGGAGGTAAAAAAATGAAAATAGCTATAGCTGGGA
CGGGATATGTAGGTTTGGTTACAGGTGTTTGTCTAGCAGAGGTAGGCAATGAAAATGTAGTCTGTGTTGA
TGTAGATGAACAAAAAGTTAAATCAATGAAACTTGGAATAGCACCTATATATGAAGAAGGCCTAGAAGAA
CTTATGGTTAAAAATTACAACAGAGGAAGAATAGATTACACTACAGACTATAAAAAAGCTTATGAAGATG
TAGATGTAATATTAATAGCTGTAGGTACACCTGAGAGAAGTGATGGCTCAGCCAACCTAGATTATATAAA
GGCAGTTGCAAAGCAAATAGCTGAAACTGTGACAAAAGATACTCTAGTAGTAATAAAATCTACAGTTCCA
ATTGGTACAAATGAAGAGATAGAAGATTATATAAATAGAAACCTAAAAAATAATGTAAAAGTAGAGCTTG
CATCTAATCCAGAGTTTTTATCACAAGGAACAGCAGTAAAAGATACTCTATATGCTTCAAGAATCGTTAT
AGGTGTAGAAAGTGAATGGGCTAGAGAAATATTAGAAGAAATCTATAAGCCTTTTAATCAACCTATAATA
GTTACAAATAGAAATAGTGCTGAGATGATAAAATACGCATCAAATAACTTCTTAGCTCTTAAAATATCAT
TTATGAATGATATTGCAAATCTTTGTGAAATAGCAGGAGCTAACATAGAAGATGTAGCTTTAGGAATGAG
TTATGATGATAGAATAGGAAGTAAGTTTTTAAAGGCGGGAATAGGGTATGGCGGTTCTTGCTTTCCAAAA
GACACAAAAGCTCTTCACTGGTTATCTGAACATAATGGTTATGAATTAAAAACAGTAAAAGCTGCAATAG
AAGTTAATGAAAGTCAAAAACTTAAATTAGTTAGAAAGGCATCTAAGTTAGTAGAGAGCTTTCAAGATAT
GAAAGTTGCTGTTTTAGGTTTGACTTTTAAACCAGACACTGATGATATAAGAGAAGCACCATCTATACCA
AATATAAAATATTTGCTTGAAAGAGGGGCAAGAGTTACTGTATACGACCCAATTGGTGTAAATAATACTA
AGAAAATATTTGGTGACTCTATACTTTATGCTGATTCTGTAGATGATGCGATAGAAGATGCAGAGATATG
TTTTATAATGACAGAATGGAAAGATGTATTAAATTATGATATACATAAGTATAAGGAAAAGATGAAAAAT
CCTTTAGTCCTTGATGGAAGAAATTGTTATAAAATTAAAGATATGGAAGAGTTAGGAATTGAGTATTATT
CGATAGGAAGGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3133500-3132748 putative teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGAGCCTTTAGTATCGATAATTACTCCTGTTTATAATTCAGAAGAGTTTTTATCAGAGACGATAA
AGTCAATCCAAAATCAAACTTATAAAAATTGGCAGCTTTTATTAGTGGATGATTGTTCTAAGGACAATTC
AAGTGAAATTATAAAAAGTTTTCGAAAAGAAGATGCTAGAATAAAATATATAAAGCTTGAAAAAAATTCT
GGAGCTGCAGTATCTAGAAATGTTGGTATTAAGAATGCGGAAGGTCGATTTATTGCATTTGTAGATAGTG
ATGATTTATGGGATAGTAGAAAATTAGAGATTCAGATAGAATATATGTTAAAAGAAAATGTAGGTTTTTC
TTTTACATCTTATAGATATATGAGACAAGATGGGTCAAAAACGAATAAGGTTGCAAGAGCTCCTAAGAAA
ATTGACTATGAAGGATTACTTAGAAATACTATAATAGGATGTTCTACAGTGGTCATTGATAAGGAGATTG
TAGGAGAGTTCAGCATGCCTTTGGTAAGAAGAGGACAAGATACTGCGACCTGGTTACAGTTACTTAAAAA
GGAAAAATATGCATATGGGATTCAGGAGGATTTAGTGAATTACAGATTAGTTGGAAATTCTATATCAAGT
AACAAGATAAAAGCATTAAAACGAACTTGGAATACTTATAGAAATGTTGAAAATTTAAGTTTACCAAAAA
GTCTATATGTATTTTGTTTCTATGTTTTTAATGCCATTAAAAAAAGAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3134456-3133548 putative beta-glycosyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAAATATAAATTTACTGTATTTACTCCGACGTATAACAGAGCTCATTTACTTGAAAATTTGTACA
ATGATTTAAAAGCTCAAACTTATGATTTCAATGATTTTGAATGGTTGATTGTTGATGATGGAAGTAGCGA
CAGTACTAAAGAGTTAGTTGAAAAATTTATATCAGAAAATAAATTAAATATAAGATATATATACAAAGAA
AATGGAGGAAAACATACTGCAATAAATCTAGGTGTAAAAAATGCAGATGGAGAGCTATTTTTCATTGTAG
ATAGTGATGATGGTTTAATTAAAGATTCTCTTGAAATTGCTAATGATGAGTGGGATTCTTTAGAGAATAA
AGAAGGATTTAGTGGAGTTGTTGGACTTTGTGTATATCCAAGTGGAGATTTGATAGGGACAGAAATGCCT
GAAGATAAGAAAATATGTCACTTTGCAGACCTATATTTTAAGTATGGCGTTAAGGGAGATAAAAGCATAG
TATTTGTAACTGATGAGCTTATAAAATTTCCTTTTCCAGAAAGAAAAGAAGTGAGATTTTTACCAGAAAG
TGTAGTATGGAATGAAATGTCTAAATACTATAAAGTTATATGTGTAAATAAACCTATGATAATAAGAGAT
TATTTGGATGATGGTTTGACTAAGAATATATTAAGTAAAAATGCATTAAGAGGTAGAGCATTAGAGTTTT
TATATTTAATAAATCAAAATACATATCCATTAAGTAGATATCCATATATGTGGATAAAAAATTACATAAA
TTTAGCCAGATACTCATTGTTGTCTGATAGTCATTATTTTGGTGAATTAAGAAAAGTATCTGATAAATTG
TTGTATTTAGCATTATTCCCATTAGGATATTACAAATATATTGGACAAAGAAAATTAGTATCTAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3135227-3134478 putative teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAAGAATTTAGTATCTATAATTACTCCCATGTATAATTCTGAAAAATTTATTGAAGCAACCATAA
AATCAGTATTAAACCAAACTTATCAAGAATGGGAAATGTTAATTATTGATGATTGCTCAACAGATAATAG
TCCTAATATAGTCAAATCTTATATGCAACAGGATAGTAGAATAAAATGTATAAAGACTGAGACTAATAAG
GGTGTCTCTAATGCTAGAAATTTAGCACTAAGTAAGGCAACAGGACAATTTATAGCTTTTTTAGATAGTG
ATGACCAATGGAATAGCAGTAAGTTAGAAAAACAAGTAAATTTTATGTTAGAAAATGACTATGTAATTTC
ATTTACTTCATATGAACTGATGGATGAAAATGATAAAAAATTAAACAAAGTAATAAAAGTTCCACCTAAT
GTAGATTATAAAAGATTATTAAAAGGAAATATCTTAGGATGTCTTACTGTTGTGATTGATAAGTCTAAAT
TGGATTTTGAAATAAGAATGAGTGGTGTAAGACATGAAGACTATGTTTTATGGTTATCGATATTGAAAAA
AGGGCATATTGCTCATGGAATAAATGAAGTTCTAGCATTATATAGAAAATCTAGCAATTCCCTAAGTGGT
AATAAAATAAAAGCTGCTATGTGGACTTGGAATATATATAGAAATATAGAAAAAATACCTTTATACAAAG
CTATATACTACTTTATTAATTATGGAATAAACGGAATCAAAAAAAGTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3136446-3135256 putative minor teichoic acid biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGATGGTGTTTATGGACAAGGTTAAATTTTTAATAAATATGCTTTTGGCTTTTTTTATATATCCAT
TTAATAAGCATAAGTTTAATGGTAGAGATATCTGGCTTATAGGTGGACATTCAGGGGATATATACAATGA
TAATTCAAAGTTTTTTTATGAGTATATGCTAAAAGAACATAATGATGTAGAAACTTATTGGGTAGTAAAT
AAAGACAGTAAAGTATTTGATAAAATTCCAGGCAAAAAATTAATAAGAGGAAGTGTAGAAAACTATCTGT
ATTATTACAATTCAAAAGCTATAGTATTTTCACATGCACCATCAGCAGATATAGCACCATACAATTTTGC
TGTACCTGTTCTTAATTATTTTCATAAAAAAACGATAAAAGTGTTTTTAAATCATGGGACTATAAGCTTT
AAAAAAAGAAAACCTATGAACAAAAAGTTCAAAAATATTATAGATAACCTATATAAAAGCTATAATATAG
TTACAGCAAGTTCTGAATTTGAAAGAAATGTTATGGTAAATGATTGGGGAATGTTAGATGACTCAGTTTA
TATAATTGGGAATGCAAGATATGACAATTTACCAACAAATGAAGTTGCACAAACTCGAGATATATTATAT
ACTCCTACATGGAGAGATTGGATAAAATTTAGTTCAGGAAAATTTACGGATACAGATTATTTTAAAAATA
TAATGAATTTTTTAAATGATGACAAATTAAATAAAATATTAGATGAGAAAGATATAAATGTAAAAATTTA
TATGCATCATCTTATGCATGAGTTTATAGATGATATAAAAGAAAATATAACAGGAAAACGAATTGTGTTT
TTAGATAAAGGGGTAACTCTAGCAAATGAAATCAGAAAATCAGCTGCAAATATAACTGATTATTCAAGTG
TAGCCATAGACTTTTTGTATATGAATAGACCTATCTTGTTTTACCAATTCGATTTGGATGAATATATGGA
AAAAGTTGATTCATATATAGATTTAAAAAGTGAAATGTTTGGGTCTTTGGCTTATAATAATGATGAAGCC
GTGAATAAACTTATTGATATTATTGAAAATAATTTTGAGGTTATGGATAACCAAAAAAATGAAAGAAATA
AGTTTTTCAGATATAATGATAATAAGAACTGCAAGAGGATATATGATTGTGTATTAAGTAAAATTAAATA
A
>ref|NC_013316.1|:c3137285-3136446 putative glycosyl transferase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAATATCATTAATAATGCCAACATTAAATAGATATGATGATATATACTTACTTATGGATAGCTTAG
AAAATCAAACTTACAAAAACTTTGAACTTATAGTAGTAGACCAAAATGATAATAGCAAAGTTAAAGAAAT
AGTTGATAAATACATTGATAAGTTAGATATAAAGTATATAAAAAGCTCTAAAAAAGGATTGAGTTATAAC
AGAAATGTAGGCATAGATAATGCTGTAGGGCAAATTATAGGTTTCCCTGATGATGATTGTGTCTACGAAA
ATGATACATTAGAAAAAGTTATAAATTTCTTTAATAAAAATGAAGATTATAAAATATACAGTTGCAAAAC
TATGGATTCAAATAAAGTTGATGCATTTAAGAAAATGTATGATGGAACTTGTGATATCACAAGTTCCAAC
GTTTTGGATACTATAACATCCATAACTTTTTTTATTGATTTTGAAGGTAAAGATTATACAAGATTTGATG
AAAAATTGGGTGTTGGTGGAGAGTTTGGTGCTGGTGAAGAGATAGATTATGTTTTAAACTTATTGAGTTT
AGGTTTTAAAGGAAAATACTTTGGAAATGATATAATTTACCATCCTGCAAAAAAACATTCTAAATCTAAA
GAAAAGTATCAAAAAGATTATAATTATGGAAGAGGCTTTGGAGCGCTTTGCAAAAAGGAAATAGTCTATA
GAAAAAATTATACGTTTGCAAAAGTTATGGTATCAAAACTTGTAAGAAATATAGGGGGTCTTATATTGAG
TTCCAATAGAGATTATCATAGTGCCACTATAAAAGGAAGAATTAATGGATTTAGACAGTACAAGTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3138445-3137288 putative polysaccharide polymerase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGACTTTAAATGATGATAGAAATATTATGATTAGAAAATATCTTTATATATTTGTTTTGTTTATCA
TATTACTTAGAAAGTATATGATATCATTTATTGACCCAAATATAGATATAGGGATGATTAAATCAGCGTT
ATTTTATTCTTCAATAGGAATACTAATGCTACTTTTTTTATTTGATAAGAGAAAAAGTATAACAGAAATG
GTACTAGTTGGAGTTTGTGTCTTACTTTATTTATTAAATAGGGAAGGAGCTATATTATTAATCGTTTTAT
TAGCTGTATCAGCTAAGCAAATAGATGATAAATTTATAGTTAAAAATTATTTAATAATATCGGCATGTTT
TTTAATGGTAGCTATATTATTATTTAATTTATTTCCTTCATTAATATTTAATCAGGAAGTCCACTATAGA
TATATAGAAAAAATAGATATGCTTGTTACAAGAATGGATTTTGGACTTGGTAATCCAAATAGTGTATTTT
ATCATATGGTTACTATATATGCAGCATATATATTCTTAAGATATAAAGATTATAATAAATGGGATAGAAT
AATTTTATTTGGTTCTGCATTTTTTGTTTATCAAACCACATATAGTAGAACTGGATTTTTCACTATATTA
GCAGGATTAATATTTGTAGAAATAATAAGATGGATAGATATAAAAAAAATAAAAGGACTGCCAATGCTCC
TAAAGACATTACCAATAATACTTACTCTATTTAGTGTAATTATTGGTACAATATTTGATAAAAGCACTTT
ATTAAATAGATTATTAGCAAGTAGACCTAAGTTCTGGCATGTATACTTGGCTGAAAAGGGGAATTTTCTA
AAACCTTTTGGAAATTCATATAGTCCTGCTATAAAAGCAACTAATCCATTAGATAGTTCTTATGTATATA
TAATTAGTGTACTAGGAGTAGTTGCTTGTATATTATTTATGTATTTGATGTATAAAGGAATAGAAAGCTT
TATAGAAAAAGATAAAAAAGCATATTTAGTAGCTTTATTTATATTTTTACTATACTCTTTTGCAGAAAAT
TTATTATTAGAAGCTTCATTTAGTTTTGCAGTAGTATTACTAATAAAAGAAGTGATATTAAATGATAAAA
GGGAAATAGATTTGTGGAAGATGAAAAGTAGGAGGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3139183-3138461 putative polysaccharide biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
TTGATTCCTAAAAAAATACATTATGTATGGTTTGGTGGTCCAAAAGGAAATATAGAAAATATATGTATAA
ATTCTTGGAAAGAAAAGCTTCCAGAATATGAGATAGTAGAGTGGAATGAAAAAAACTTTGATATAGAGAA
AGAAATAAAAGGAAATAAGTTTTTGGAAGAATGTTATAAAAGAAAACTTTGGGCATTCATATCTGATTAT
ACAAGAATAAAAGTACTCTATGAACAAGGTGGAGTTTATATGGATACAGATATGCAAATATTAAAGGATA
TAACTCCTCTTTTAGAAAATAATAGGCTAATCTGTGGGTATGAAGATGATAGAGAGTATATAAATGGTGC
TATAATAGGTGTAGAAAAAGGACATCCTTTTTTAAAAGACTTATTGGAGTATTATGAAAAAGAAGTACTT
ACTTCTTCATTGTTTACAATACCAAAAATAATGACTCATCTTATGGAAAAGAATTATAAGAAGATTGACC
CAAATAATTATGAAGAAGGAATACGTGTTTACGACAAAGAATATTTTTATCCTTTTGGATTTAAAGAAGA
CTTTACACCAGAATGTATAACAGAAAACACTTTTGGGATACATTGGTGGGGAAAAAGTTGGGCTAAAAAG
AGAAATTATTTCTTAGAAAGCAAACACTTAACAGGTGTAAATAAGATATGGAAGTGTTGTAAAATATTTG
CAAGTAATACTTTACGAAGCTAA
>ref|NC_013316.1|:c3140268-3139195 putative mannose-1-phosphate guanylyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTATACAATGTCATAATGGCTGGAGGAGGAGGAACTCGTTTCTGGCCACTTAGTAGACAAGAAG
TACCTAAACAGCTTATAAATTTAAGTGGAGAAGATGCTTTAATAAACGAAACTATAAACAGAATAGATTC
TCTAGCAAAAAAAGATGATTTATTTATAGTAACCAATGAGAAGCAATTGGAAGCTTTAAAGGATATAGTA
AAAGATAAATGTTTGGATAGTAATATATTGCCAGAGCCATGTGCCAGAAATACAGCAGCAGCTATAGGCT
TTGCAGCATTTAACATAATGAAAAAATATGGTGATGGTGTTATGTGTGTATATCCAGCTGACCATTATAT
AAAAGATGAAAAAGAATTTAAATCTATTTTGGAAAAAGCTATCTATATAGCAGAAAATAATGATAAACTA
GTAACTATTGGGATAACTCCTACATTTCCATCAACAGGATATGGATACATAAATTTTAATAGAGAAAATA
CGATAGAAGATGTTGCATATGAGGTAGTGGAGTTTGTAGAAAAACCAAACTATGAAATTGCTAAAGAATA
TGTAAACTCTAAAAAGTATGTATGGAATAGTGGAATGTTCGTATGGAAGGTATCTAAAATATTAGAAGAT
TTTAAGAGATACTTGCCAAAAGTATATGAAAAATTAGAATATATAAGTAAATACTTAGGAACAAAAGAAG
AAATGGAAAAAATAAAAGAAATATACCCAACTATACAATCAATCTCTATAGATTATGGTATTATGGAAAG
AAGTAATGATGTTATAGTAGTTCCTGGTGATTTTGGATGGAATGATGTTGGTTCTTGGGATTCTCTAGGT
GCAATATATCCAACTGATGATGAAGGTAACATCAAAAGAGGTGAAAATATTACTATAGATACTAAAAATT
CAATTATATATTCAGATGACAAATTAATATCAACAATAGGTATTAGTGATTTGATAGTAGTATCTACGAA
TGATGCAGTTATGGTTTGTAGAAAAGATAAAGCTCAAGATGTCAAAAAAATAGTAGAACAGTTAAAAGAA
GAAGATAGACAAGAATATATGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3141996-3140290 putative phosphomannomutase/phosphoglycerate mutase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATTATAAGAATAATTATGAGATGTGGTTAAATTCTCCTTATTTTGATGAGCAAACAAAAAATGAGC
TATTAAGCATAAAAGATGATGAAAAAGAAATACAAGATAGATTCTATAAGAATTTAGAGTTTGGAACAGG
TGGTTTAAGAGGTATAATAGGAGCGGGAACTAATAGAATCAATATTTATACTGTTAGACGTGCGACACTG
GGCGTTTTAAATTATATCATGAAGACTCAAGGAGAAGAAGGTAAACAAAAGGGAATAGTTATAGCACATG
ATAGTAGATACATGTCTAGGGAGTTTTGTATAGAAGTAGCAAAGACTTTAAGTGCTTATGGTGTAAAGGC
TTATATTTTTGAAGAATTAAAGCCTACACCAGAACTTTCTTTTGCTGTTAGATATTTAAAGTGTGCTATG
GGAATAGTAATAACAGCAAGTCATAATCCTAAAGAATACAATGGATATAAAGTATATGACTCAGATGGTG
GTCAAATCTGTATAGATATGGCAAATGATATAATAGCAGAAGTTAATAAGATTGATGATTACAGCACTAT
TAAAAGTATAGATTTTGAAGAAGCTTTATCTAAAAATTTAATAACTATATTAGATAATGAAGTAGATGAT
GAGTTTATAAAAGCTGTTAAGAAGCAAGTTTTAAGACAAAATATAATAGATGAATACGGGAAAAAATTAA
AAATAATATATACACCTATTCATGGTACAGGAAATAAACCAGTAAGAAAAGTCTTAAATGAATGTGGTTT
TGAAAATGTAATGGTAGTTAAGGAGCAAGAATTACCAGATTCTAATTTTTCAACAGTAAAGTATCCTAAT
CCTGAAGAAAAGTCAGTGTTTAATATAGCTATTGAAATGGCAAAGAATAATGACACTGATTTGATAATAG
GAACAGACCCTGATTGTGATAGAGTAGGTATCGTTGTAAAAGATTCAAGTGGTGAATATGTAGTCTTAAA
TGGAAATCAAGTCGGTTCACTTTTAGTTAGATATATATTAGAGAGTTTAGTTGAAGAAAATAAACTTCCT
AAAAACAATCCTACAATAATAAAAACTATAGTTACATCAGAACTAGGTGCAAAAATAGCAAAGGCTTATA
ATGTAGATTGTTTAAATACTTTAACAGGATTTAAATTTATAGGAGAAAAAATAAAAGCGTTTGAAGAAAG
CAATGATAGAAGTTTTATAATGGGATATGAGGAAAGCTATGGTTACTTAATTGGAACTCATGCTAGAGAT
AAAGATGGTGTTGTATCTTCACTTATGATATGTGAAATGGCAGCATACTATTCTTCAAAAGGTATGAACT
TGTATGAAGCTTTGATAGATACATATAATAAATTTGGATACTACAAAGAGGACTTAAAGTCAGTAACTTT
AAAAGGTATAGATGGAATAAAAAAAATAAAAGAGATGATGCTTTACTTTAGAAGTGTTAAAATAGATAAT
GTGGCTGATGTAAAAGTAGATAAAATTTTAGACTATAAAGATGGTGTTGATGATTTACCTAAGTCAGATG
TACTTAAATTTTTACTTGAAGATGGCTCTTGGATAGCTATAAGACCTTCAGGTACAGAACCTAAAATTAA
ATTTTACTTTGGAGCAAATTCAGACAATCAAGAAGATGTAGAATTTAAGTTGAACAATTTAATATCTTAT
ATATTAAATGTAGTGGATTCTATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3143597-3142038 putative transmembrane virulence factor MviN family protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAAAAACAGCTAAAGCAGCATTGTGGATTATGGCAGCCACTATGTTTTCAAAAGTATTAGGTTTCC
TTAGAGAACTTGTACTTGCAAATTTCTATGGGACAGGTATGTATGCAGACGTATTTGTATTAACATTAAA
TATACCTGGTTTAATCATAGCAGTCATAGGCTCTGCAGTTGCTACAACTTATATACCTATGTACTTTGAG
ACAAAGAAAAGACTCGGAGATGAAGGTGCCTTAAAATTTACTAATAATGTTTTAAATATATGCTATATAA
TGGCTATAGTAATAGCTATTATTGGGCTTTTATTTACAGAGCAATTTGTTACAGTATTTGCAGCAGGATT
TAGAAACGACCCTGCTAAGTTCCAAGCAGCAATATTATTTACTAAAATAATGATTTCAGGAGTTTTATTC
CTAAGTGGAAGTAAGATATTTAGTTCGTTTTTACAGGTGAATGACAGTTTTGTAATTCCTGGGCTTATAG
GAATCCCATATAATATTATAATAATAGCAGCAATAGCACTAAGTGCAGGTAAAAACGTATGGATACTACC
AGCAGGAGCACTATTGGCTATGGCGAGTCAACTATTATTTCAACTGCCATTTGCATTTAAGAAGTCCTAC
AAGTATAAGCCATATATAAACTTAAAGGATGAGTCTATAAAAGAATTAGTAAACCTAGTATTGCCTATGT
TGGTAGGAGTAGCTGTTGGACAGTTAAATATATTTGTTGACAGATTATTGGCAACTACTTTGGGTGATGG
AAAGTTGTCTGCTCTTAACTATGCAAATAGGCTAAATGAGTTTGTTATGGCATTATTTGTTACATCTATA
ATAACAGTTATATATCCTAAGCTAGCAAAAATGTCTGGTAAAGATGATAAAGAAGGATTTATAAGTACTA
TTGTAAAATCTTCAAATTGTATTATATTGGTGGTGCTTCCTATATCTATAGGAGCTATTATATTAGCAGA
GCCTCTTGTTAGGATATTATTTCAAAGGGGTAAATTTGATGCGTTATCAACAGATCTTACATCTATAGCG
CTTAGATTATATTCACTAGGTTTATTGGCTTGTGGAGTAAGAGATGTCTTATATAGGGCATTTTACTCTC
TTTCAGATACAAAAACGCCAATGATAAATGGAAGTATAGCTTTAATAATAAATATAGTTCTTAATTTAAT
ATTGATAAGACCATTAGGTCATGCAGGTATTGCTATATCAACTAGTACATCCAATATAATTACAGTTATA
TTGTTATTTATATCTCTTAAAAAGAAAAATGGATATTTTGGAGGGGATAAAATTATAAAGACTGGTCTAA
AAAGTTTGGTAGCATCTGGTGTGATGGCAGTAGCTACTTTATTGATATATAATAATCTATATGCATTTAT
GGGTTCAGGAACAATTAAAGAAATTATATCAGTTGGAGCTGGAGTATTAGGTGGAGCTTCTGTATATACT
GTATTGATAGTTTTATTTAAGGTAGAAGAGATGGACTTAGCTTTTGAATTTTTAAGAAAAGGAAAACAAA
AACTACTTAGAAGAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3144767-3143712 cell surface protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATTAAAAAAATTTCTACTATATTATCGTTAGTTTTGTTAATCTCTATTTCTAGCACAATAGAGGTAT
TTGCAGATGCAAATCCCAAAAGAGAATTGATAGAAGGGAGTATACCAGAGATTTCGACAGAATTAAATAA
AAGAGCATTTAAGGATTCTAAAGAAGTAATTCTTGTAAATGAAGAGTCAATTGTAGATAGTATAAGTGCA
ACACCTTTAGCATATGCAAAAAATGCTCCAATAGTTGTAACTAAGAGTAAAAATCTTGGTAGAGTAACAA
GAAATTATCTAAAAGAACTAGGTCCAGAGAAGGTTACGATAGTAGGTGGTTTAAAGGCAGTATCTAAAGA
TGCTGAACGTAATATAGAAAAAATGGGAATAAAAGTAGAAAGAATAAGAGGAAAAGACAGATATGATACA
TCTTTAAAGATAGCTAGAGAAATGTATAGAACAGTAGGATTTGATGAAGCATTTTTACTTAGCTCAACAA
CAGGATTAGAGAATGCCATATCTGTATATTCTTATGCCGCTAAAAGTGGAATGCCAATAATATGGGCTAA
AGATGAAGGGTTTGAGGAACAAATTGATTTCTTAAAAGGTAAGAATCTTAAAAAAATATATGCATTAGGT
GATTCAAAAGAATTTATTGCAGAGATTGATTCTAACTTGAAAAATATAGAAGGAATAAAGCAAATAAATA
AGTCAAGTACAAATGTTGATTTAATAAAGAAGTTTTATGATGAAAAAGATATAAAGAAAATCTATACTGC
TAAATTAGACTTTGGTAGCAGATCTGATGTAAACGAATATATTTCTTTGGGAGTAGTATCAGCAAAAGAA
AATATGCCAATACTGATTTGTAGTGATAACTTAAGTCGTGCACAAGATAAATTCTTGAAAGATAGCAATA
TAAATGATGTAGTTGAAGTTGGGTATACAGTAGGTGATTATAGTCTATTTAAGAGCATATTTAATCTAAC
ATTCTTATCTTGTATAGTATTAATACTATTATTACTATTGATTACATTTAGGGCACTTAGATATGAGTCG
AAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3145560-3144862 putative glycosyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGTAACTATGTCTGGATATACTAATGATGAGTGTGAAATACCTAAAATTAAAAGCTATCCAGGGG
CAGATAAAGAAATTGCAAGTGAGATTGACTATAGCATAGTAAAAGGAACGGTTTTATTCGACTTGTACCA
AAGAATTATGGATTTAGTTTTATCTATAATAGGACTTGTGATAGGTTTACCTTTAATAGCAATATTTGGA
ATTCTTATTAAAATAGAGGACAAAGGACCAATAACTTATAAGCAAGAAAGACTAGGAAAATGCGGGAGAA
GATTCTATATATATAAATTAAGATCTATGAGAACAGACGCAGAAAAATTTGGCGCACAATGGGCTGAAAA
AGATGATCCTAGAATAACTAAGGTTGGAAAGTTTATTAGGAAAACTAGAATTGATGAGATTCCACAGCTG
TTTAATATATTAAAGGGGGATATGGGCTTAATAGGCCCTAGACCAGAGAGACCGAACTTTACTGTTCAAT
TCAATGAGGAAATACCTGGATTTATCAACAGGCTCGCTATAAAACCTGGGCTTACAGGTTGGGCACAAGT
AAATGGTGGATACGAAATCACTCCTGAAGAAAAACTTAAAGAAGATATTTACTATATAAAAAATAGGAGT
ATATTACTTGACTTTAAGATACTCTTTAAAACTGTTAAAGTAGTATTGACAGGAGACGGAGCTAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3147795-3145768 cell surface protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATGAAAAAAACAACAAAATTATTGGCAACAGGAATGTTGTCTGTAGCAATGGTGGCACCAAACGTAG
CTTTAGCGGCTGAAAATACTACTGCAAATACAGAATCTAATTCAGATATTAATATAAATTTACAAAGAAA
AAGTGTAGTGTTAGGAAGTAAATCTAATGCAAGTGTAAAATTTAAAGAAAAATTAAATGCTGATTCAATA
ACATTAAATTTTATGTGTTATGATATGCCACTTGAAGCTACTTTAAATTACAATGAAAAGACAGATTCAT
ATGAAGGTGTAATAAACTATAACAAAGACCCAGAATACTTAAATGTATGGGAACTTCAAAGCATAAAAAT
AAATGGTAAAGATGAACAGAAAGTTTTAAACAAAGAAGACTTAGAGTCTATGGGATTAAATCTTAAGGAT
TATGATGTTACACAAGAGTTTATAATAAGTGATGCAAATTCAACAAAAGCAGTAAATGAATATATGAGAA
AAACTTCTGCGCCAGTAAAAAAACTTGCTGGAGCTACTAGATTTGAAACTGCTGTTGAGATAAGTAAACA
AGGTTGGAAAGATGGGTCTAGTAAGGTTGTAATAGTTAATGGAGAATTAGCAGCAGATGGAATTACAGCT
ACTCCACTTGCATCTACATATGATGCACCAATATTACTTGCAAATAAAGATGATATACCAGAAAGTACAA
AAGCAGAATTAAAACGTCTAAATCCAAGTGATGTAATAATTATAGGTGATGATGGTTCAGTTTCACAAAA
GGCAGTATCTCAAATTAAATCTGCTGTAAATGTAAATGTAACTCGTATTGGTGGAGTTGATAGACATGAA
ACATCTTTACTTATAGCAAAAGAAATAGATAAGTATCATGATGTTAATAAAATATACATAGCAAATGGAT
ATGCTGGTGAATATGATGCTCTTAATATTTCATCAAAAGCTGGTGAAGACCAACAACCTATAATATTAGC
TAATAAAGACTCTGTACCACAAGGTACATATAATTGGTTATCTTCACAAGGTTTAGAAGAAGCTTATTAC
ATAGGTGGTAGTCAAAGTTTATCATCAAAAATTATAGACCAAATATCTAAAATAGCAAAAAATGGTACTT
CAAAAAATAGAGTTTCTGGAGCAGATAGACATGAAACAAATGCAAATGTAATTAAGACTTTCTATCCAGA
TAAAGAGTTGAGTGCAATGTTAGTTGCAAAATCTGACATAATAGTTGACTCAATAACAGCAGGACCTTTA
GCAGCTAAATTAAAAGCTCCAATACTTATAACTCCAAAGACTTATGTTTCTGCATACCATAGCACAAACT
TATCAGAAAAAACAGCAGGAACAGTATATCAAATTGGTGATGGGATGAAAGATAGTGTTATAAATTCTAT
AGCATCTAGTTTATCAAAACACAATGCACCAACAGAACCAGATAATTCGGGTTCAGCAGCAGGAAAAACT
GTAGTGATAGACCCAGGTCATGGGGGTTCTGATTCAGGGGCAACAAGTGGATTAAATGGTGGAGCACAAG
AAAAGAAATATACTCTTAATACAGCATTAGCAACTACTGAATATTTACGTTCAAAAGGTATAAATGTTGT
TATGACTAGAGATACAGACAAAACAATGGCTTTAGGAGAAAGAACAGCATTATCAAACACTATAAAGCCA
GATTTATTTACAAGTATACATTACAATGCGTCTAATGGAGCTGGTAATGGTGTGGAAATTTATTACAAAG
TAAAAGATAAAAATGGTGGAACAACTAAGACTGCAGCATCAAATATCTTAAAAAGAATACTAGAAAAATT
TAACATGAAAAATAGAGGAATCAAGACAAGAACACTTGATAATGGAAAAGATTACCTATATGTGTTAAGA
AATAACAATTATCCAGCAATACTTGTTGAATGTGCATTTATTGACAATAAGAGCGATATGGATAAGTTAA
ATACTGCAGAAAAAGTAAAAACAATGGGAACTCAAATTGGAATAGGAATAGAAGATACAGTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3149104-3148046 hypothetical protein CDR20291_2673 [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGTCTGCAATAATCCTGGGACTTGGATGAGAATGTATCCTCAATTAAGACATGCTGTATGGCATG
GTGTAACACTTGCGGATTTTGCATTTCCTTTTTTTGTTATATCTTTAGGTGTTACAATTCCAATATCAAT
AAATAGTAAACTAAAAAATAATAAATCCACACTGAGTATAATACTTAGTATATTCAAGAGAAGTATCTTA
TTGATATTATTTGGATTTTTCTTAAATTACCTAGGAAATCCTGATTTAAATTCTGTGAGAATACTTGGAG
TACTTCAACGTATGGGATTAGTCTATTTTGTGACTAGTTTAGTATATTTACTACTAAAAAAATTAAATGT
TGGAAGTACTGCTACAATAATTACTTTTCTATGTATAGCTACATTTATAATAGTTGGGTACTACATATTA
GCAAAACCTTATGGATTTGAGCTAGAAGGTTCTCTTGCACAGTTAGTGGATTTACATTTCTTCAAGGGAC
ATTTGTACAAGCCAGAATTTGAACCAGATGGTTTTTTAACTAGTATAGTAGCAATTTCTTCAGGTATGTT
GGGATGCACTATGGGATGTGTACTTTTAAAAGAAAACATAGGAGAATATAAAAAATTCTTTAAAATACTG
GTTATGAGCATAATCCTGCTAATAGGTGCTTTTATCTTTAATCAGTATTTTCCATTTAATAAAAGATTAT
GGTCTAGCTCATTTGTACTTTTAATGGCTGGCAGTTATGGTATGTTACTGTCAATATTTTATTTTATATG
TGACATCAAAAATAAAAGTAAAATATTTACCCCAATAATAGCACTTGGAAGTAGCCCTATTTTTACATAT
ATGTGCCTTGAGATATTGAGTCATGTTTTTTGGAATGTTCCAAAACTTACGAACAAAGTCGATTATCCAA
CTACCTTGGTAGAGTGGACTACATATGAACTTATAACACCTTGGGCAGGTACAACTTGGGATTCTCTTAT
ATTTTCTTTATTGTATGTCCTATTCTGGGTTATAGTAATGTCTATAATGTACAAGAAAAAAATATTTATT
AAAATTTAG
>ref|NC_013316.1|:3149103-3149603 hypothetical protein CDR20291_2674 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGGCTATTGATAGCCCTCTTATTATATCTATTGATTTAATCCTACTATTCGTAAGTTTAGAATCTA
CAACATTATTTGAAATTTTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATT
GCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTA
TTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGC
TATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATTGCTATT
GCTATTTAGATTATTTTTCTTTATTCTAGTTTTGTCAATACTTTTATTTATTTTTTTGTTACATTCAATT
CCAATCCCCATGTTACCTCCCCAAAGCTTATTCAAATATATACTAAACTACATATTTATCTATAAGTCTG
TTTGTATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3151244-3149667 cell surface protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGCACCAAAAACTATTTTAACAATACTGACAATAGCGCTTACTTTAAGTAGCATTTCTATAATAC
CATCATATGCACTTACAGAGGAAAAATTAATAGGTAATGGTAGATATGAAACTGCTGTAAAGATAAGTCA
AAAGGCATACAGTTCTAGTTCTAATGTAGTGTTAGTTAATGACAATTCATTAGCTGATGCACTTTCAGCT
ACACCATTTGCAAAGGCTAAAGGAGCACCAATACTTTTGACAGAAAGTGATAAGCTAGATGATAGGACTG
AAAAAGAGATAAAACGTCTAGGAGCTAAAGATATTTATTTGATAGGAGGTACTGCTGTACTTAATAAAGA
TATAGAGAACAAGTTAAAAGGTAATGGACTTAATGTAGAAAGAATTAATGGTAAGGATAGATATGAAACT
TCACTGATTTTGGCTAATAAGCTTAAGGATATAAAAGATATTAAGGAAGTTGCTGTAGTAAATGGTGAAA
AAGGATTAAGTGATGCTGTTAGTGTTGGAGCACCAGCAGCTCAAAATAAGATGCCTATAATTTTGTCTAG
TCCTAAGGACGGAGTAGAAGCATTTGATAAATTTATAAGAGATGAGAAAGTTATAAAAGCATACGTAATT
GGAGGAACAAATTCTGTTTCAAGAGCTGTAGAAAAGAGCCTTCCTAATGCAGAAAGAGTGAGTGGAAAAG
ATAGAAATGAGACTAATGCCAAAGTTATAGAAAAGTTTTATACTGATACAAATTTAAGTAATTTATATGT
AACTAAGGATGGTAGTAAAAATGAGAATCAACTAATAGACTCGTTAGCTGTTGGAGTATTGGCTGCAAAA
AATGAGTCTCCTGTTGTTTTGGTTGGTAATAAATTAAACACGAAACAAAGGGATATACTTAGTACTAAAA
AATTAAATACTATAACACAGGTAGGTGGAAATGGAAATGAAGAAGCTTTTGATGAAATTAAGAGTTTACA
AGAAAAAACTGTGTTTGAAGCAAAAACTGTTGAGGAATTAACTGATATGATAAATATAGCAAGTCCTAAT
GATATTATAAACTTTAAACCAAAAGAGAATACTGTAAATGAAGCTTTTAGAATGGTAACAAATAAACCAA
TAACTGTGAATATAAAGGGTGATTGTTCAAAGACTCTTACAGTAGATATGCCTAATGGTGAAGTGAATAA
CTATGCTACTTTGGTAAATGTTATAGTTAGAAATATTGGAGAAGGTGGATTTAATAACCATGATACAATC
ACTATATTGTCAGTTCGTGACAAAAATGGTAGAGTTATAGAAAATACTAGAAATTCAGATATAGATACGT
TGATGATATTAGCTTCTGCTAATGATACAAAATTGATTAATGATGGATATATAGGAAAGCTTATAGATAA
TTCATCTAATAGTGATATAACTAATAATGGTACTATAGATAAAAAAGTTAATCAAGTTGAGAATTTAGAG
GCTAAAGTAGATTCAATTGAAAAAGCTATAGATTCTATAAGTCAAAAAGTCAATAAAATACAAGATATAC
TAGATAAGATTGGATTTCTAAAGAAATTTCTTAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3153952-3151541 cell surface protein (putative cell surface-associated cysteine protease) [Clostridium difficile R20291]
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CAACAATACCTGTCTCAGCAGAAAACCATAAAACTCTAGATGGAGTAGAAACTGCAGAGTATTCTGAAAG
TTATCTTCAATACCTAGAAGATGTCAAAAATGGAGACACAGCAAAATATAATGGAGTAATACCTTTTCCA
CATGAAATGGAAGGTACAACACTTCGAAATAAGGGCAGAAGTAGTCTTCCATCAGCATATAAATCAAGTG
TAGCATACAACCCAATGGATCTTGGTCTTACTACACCAGCAAAAAATCAAGGAAGTCTTAATACATGCTG
GTCTTTTTCAGGTATGTCAACTTTAGAAGCATATCTTAAATTAAAGGGATATGGAACGTATGACTTATCA
GAAGAACATTTAAGATGGTGGGCAACTGGTGGAAAATATGGATGGAACTTAGATGATATGTCAGGTAGTT
CAAATGTAACAGCCATAGGATATCTGACAGCATGGGCAGGTCCTAAGTTAGAAAAAGATATACCATATAA
TCTTAAATCTGAGGCACAAGGTGCAACTAAACCTTCAAATATGGATACTGCACCTACTCAATTTAATGTA
ACAGATGTTGTTCGTCTTAATAAAGATAAGGAAACTGTAAAAAATGCTATAATGCAATATGGTTCAGTGA
CATCAGGTTATGCACATTATTCGACATATTTTAATAAAGATGAAACAGCATATAACTGTACAAATAAGAG
GGCTCCATTAAATCACGCTGTAGCGATAGTAGGATGGGATGATAATTATTCAAAAGATAACTTTGCATCT
GATGTAAAACCAGAATCAAATGGAGCATGGTTAGTAAAAAGCAGTTGGGGAGAATTTAATTCTATGAAAG
GATTCTTCTGGATTTCTTATGAAGATAAAACTCTACTAACAGATACAGATAACTATGCAATGAAATCAGT
ATCGAAACCAGATAGTGATAAAAAAATGTACCAACTTGAATATGCTGGTCTTAGTAAGATAATGTCAAAT
AAAGTAACAGCAGCAAATGTATTTGATTTTAGCAGAGATTCTGAAAAACTTGACTCTGTTATGTTTGAAA
CAGACTCTGTAGGAGCAAAATATGAAGTATATTATGCACCAGTAGTAAATGGAGTTCCTCAAAACAACTC
AATGACAAAACTTGCAAGTGGAACAGTATCATATTCTGGATACATAAATGTACCTACTAATTCTTACAGC
TTACCAAAAGGTAAAGGAGCAATAGTAGTAGTTATAGACAACACAGCAAATCCTAATAGAGAAAAATCAA
CTTTAGCATATGAAACTGATATAGATGGATACTATCTATATGAGGCTAAAGCAAACTTAGGTGAAAGCTA
CATACTTCAAAACAATAAGTTTGAAGATATAAATACATATAGTGAATTTTCTCCTTGTAACTTTGTTATA
AAAGCTATAACAAAAACATCTTCTGGACAAGCTACTTCAGGAGAATCTTTAACTGGAGCAGATAGATATG
AAACGGCAGTTAAAGTTAGTCAAAAAGGATGGACTTCTTCACAAAATGCAGTATTAGTAAATGGAGACGC
AATAGTGGATGCTTTAACAGCTACACCATTTACAGCAGCAATCGACTCTCCAATTCTTTTAACAGGAAAA
GATAACTTAGATTCAAAAACTAAGGCAGAGTTACAAAGATTAGGAACTAAAAAAGTTTATCTAATAGGTG
GAGAAAATTCTTTAAGCAAGAATGTACAAACTCAACTTAGTAATATGGGTATATCAGTAGAAAGAATTTC
AGGTAGTGATAGATACAAGACTAGTATATCTCTAGCTCAAAAGTTAAATAGTATAAAATCTGTTTCACAA
GTTGCAGTGGCAAATGGTGTAAATGGACTTGCAGATGCAATAAGTATTGGTGCAGCAGCTGCTGATAACA
ATATGCCAATAATACTTACTAATGAAAAGAGTGAGTTGCAAGGTGCTGATGAGTTTTTAAATTCATCAAA
AATAACTAAGTCTTATATAATTGGTGGTACAGCTACTTTATCATCAAATTTAGAAAGTAAGCTTTCAAAT
CCAACAAGACTTGCAGGAAGTAATAGAAATGAAACTAATGCTAAGATAATAGATAAATTCTACCCTAGCT
CAGATTTGAAATATGCTTTTGTTGTTAAAGATGGTTCAAAGAGTCAAGGAGACTTGATAGATGGACTAGC
AGTAGGAGCATTAGGTGCTAAAACTGATTCACCAGTAGTTCTAGTTGGAAATAAGTTAGATGAAAGTCAA
AAAAATGTACTTAAGTCTAAGAAAATAGAAACTCCTATTAGAGTTGGTGGAAATGGAAATGAAAGTGCTT
TTAATGAACTAAATACTCTTTTAGGAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:3154179-3154574 putative cell wall teichoic acid glycosylation protein [Clostridium difficile R20291]
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TAGTTTCGTATTTATTTTTTACTAGAGTTATTTTATTTAATTTTATGGTTGCAAATGCTTTGGCATGGAT
ACTTGCTGTTTTATTTGCTTATGTTACTAATAAGTTTTTTGTATTTGAAAGTAAAAGAATTGAAATAAGG
TTCGTATTTAAAGAATTTTTGTCTTTTGTTAGTTTTAGGCTACTTTCTGGTGTCGTTGAAATGTTAATTA
TGTATGTAATGATTGATTTGCTTTTTGTAAATGATGTTATTGTAAAAATATTTACTAATATAGTTGTTAT
AGTTTTAAATTACTTGTTTAGCAAGATGATAATTTTTAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3156457-3154622 cell surface protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATATCAAAAAAGATAGTGTCTTTGTTAACTATGACATTTTTAACTGTTACATTATATGGAAATA
CATCTAATGCATCTACAAAAGATACATTAACAGGTTCTGGAAGATGGGAAACAGCAATAAAAATAAGTCA
AGCAGGATGGAAAAAGTCTGAAAACGCTGTGCTAGTAAATGATAATTCAATAGCAGATGCTTTATCAGCT
ACTCCATTTGCTAAAGCAAAAGATGCACCAATATTATTAACTCAAAGTAATAAATTGGATAGTAGAACAA
AAGCAGAATTAAAAAGACTTGGTGTGAAAAATGTATATTTAATAGGTGGTTCAATTGCATTAAGTTCAGA
GATTGAAAAGCAGTTAAATGCAGAAAATATAAGTTTTGAAAGAATATCTGGAAATAGTAGATATGATACT
TCTTTAAAATTAGCTGAAAAGCTAGATAGGGAAAAATCTATATCTAAAATAGTAGTAGTAAATGGAGAAA
AGGGTCTTGCTGATGCAGTGAGTGTTGGAGCTATAGCTGCTCAAGAAAACATGCCAATAATACTTTCTGA
TTCAGAGAATGGAACTGAAGTAGCTGATAATTTTATAGATAGTAAAGATATAGAAAAATCGTATGTAATA
GGTGGTACATATTCTATTTCTAATTCTGTAGAAAGAAGTTTACCAAATGCAACAAGAATAGCAGGTAGTA
GTAGAAGTGAGACAAATGCAAAAATTATAGAAGAATTTTACAAAGATACTGATATAAAAAATATTTATGT
AACAAAGGATGGTACAAGGAGTAAGCATGATTTAATAGATTCTTTAGCTGTGGGTGTATTAGCTTCTAAA
AATGGTTCTCCAATACTTTTAGCAGGAAATAAGCTAGATAGTTCTCAAAAAGATGTGTTAAACACTAAAA
TTATAGATAAAGTTATTCAAATTGGCGGATTGGGTAATGAAAATGTTGTAGAAGATGTAATAGATATGCA
AGAAGAAACTAAGTATACTGTTGAAACTATTGATGAACTTAATGTTGCTATAAAAAAATCAGATGCAAAT
GACATCATAAGATTTAAGCCAGAAAAAGATAAAAATATAACTAATTCTTTTAAAATAGAAACAAATAAAG
CTATAACTATTGAATTTGATGGTATATATAAACAATCAATAACTATAGATATGCCAAATGGAGATATAAA
AAACTTTGGGGACATAGATAATGATCTAGTAATAAATAATATAAAAAATGAGACTTTAGTTAACGAAGGA
AGTATACAAGGGATAGATGTTTATGATGAGAATGGATGTAAAATAGAGAATGAGGATTCTGGAGAAATAT
GGCTTATAACGATACTTAAAAATTCAAAAGATGTATATATTTTGAATCGTGGAGAAATAACTAAAATATC
TAATAATTCTTCTAGTGTAACAATAAAAAATTCAGGTAATATTAATACTATAAGTGGAAGTGAAGAACCA
TCAATAAGTGGTAAAAAACCTATAACTAATGATACAGATAAAGATGAAGATAAAAAGGCACGTGGTTTAT
ATCCTAAAGTAGAATCTTGTATACCTGCTTTAAAAGATTATGTAAGAATAACTATATCAACAAAACCAGA
GAGTTCAAAGTATAAAATTTATTATAGAGTAGTTGATGAAAAACCATCTGCGAAATATGTTGGAGAAAAA
ATTAGTACTAAAGGTTGGAGTATGGTTACAATATCAAATCAATCTTTTATTGAAAGAGCCAAAGATGGAT
CATATATAGAAGCAGTAGAAATAGATACCTCAAATAATGAAGTTTCACGATGGGGAAAATCTAGCATTAC
AGATGATGGAATTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3157197-3156490 hypothetical protein CDR20291_2679 [Clostridium difficile R20291]
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TTGAACATGTTGAAAAAAGTGATACACATGTCATATTATGCACAGATGGTAGTAAATCTATAATAAGAAA
AGTTTTGGATGATGGAGGGTCATGTTCTTATCATATTAAAGATGTTCATAAATACTCTTTATCAGAAAGT
GAATTTTCAAAAGATAGAGATGAAGAATTTAAGGATAGCTGTGAAGCAATGGGTGTAAAAGAAAGTAATA
TACATATAGAAGATAATAGAGCACATGATGGTGAGTTAAGTAAAGAAAAGGCAAGGGAAATAATACTTAA
GTACTTAGAAGAATATCCAGATGCAAAAGTAAAAACTGTTACTCCGTTTAAAGCTAGTGGAATACATGAA
GACCATAGGGCATTAGGAGAAGCTGCACTAGAGTTATATAAAGAAGGCAAAATAAAAGATTTAAGATTTT
ATGTAGAACCATACGACTATAAGGATTTTAAAAAAGTTAATCCAAATGTAGAGGTATGGAAGGTATTACC
TAGTCAAGAGGAGAAGTTATTAAGTGCAATGAATGCATATAAAAAATGGAATCCTGAAAGTGGACATTAT
GCTATAGGATATCATTCAGTAAAATCTCATTTTGATGAGCTAGCTATAAATAAAATACAGTATGTACATG
CTCCATAA
>ref|NC_013316.1|:c3159175-3157304 cell surface protein (putative S-layer protein precursor) [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAAAAAATCTTTCTGTAATTATGGCTGCTGCAATGATAAGTACATCAGTAGCTCCAGTTTTTG
CTGCAGAAACTACACAGGTAAAAAAAGAAACAATAACTAAGAAAGAAGCTACAGAACTAGTTTCGAAAGT
TAGAGATTTAATGTCTCAAAAGTATACTGGTGGTTCTCAAGTTGGACAACCAATATATGAAATAAAAGTT
GGCGAGACTTTATCAAAATTAAAAATAATAACTAATATAGATGAATTAGAGAAATTAGTAAATGCTTTGG
GAGAAAATAAAGAACTTATTGTAACTATAACAGATAAAGGGCATATAACAAATAGTGCAAATGAAGTAGT
TGCAGAAGCAACTGAAAAATATGAAAATTCAGCAGACCTTTCCGCTGAGGCTAATTCTATAACAGAAAAA
GCTAAAACTGAAACTAATGGAATTTATAAAGTTGCAGATGTAAAAGCTTCATATGATAGTGCTAAAGATA
AGTTAGTTATAACTTTAAGAGATAAAACAGACACAGTAACTTCTAAAACTATAGAGATAGGTATTGGTGA
TGAAAAAATTGATTTAACAGCAAATCCAGTTGATTCAACGGGAACAAACTTAGACCCTTCTACAGAAGGA
TTTAGAGTAAATAAAATCGTTAAACTAGGTGTAGCAGGAGCTAAAAATATTGATGATGTCCAATTAGCTG
AAATAACTATAAAAAATAGTGACCTAAATACAGTTTCACCACAAGATTTATATGATGGATATAGATTAAC
TGTTAAAGGTAATATGGTAGCAAATGGAACATCAAAGTCAATTAGTGATATTTCATCAAAAGATTCAGAA
ACAGGAAAGTATAAATTTACTATTAAGTATACTGATGCATCTGGAAAAGCAATAGAGCTTACTGTAGAAA
GTACTAATGAAAAAGATTTAAAAGATGCCAAAGCTGCATTAGAAGGTAATTCAAAGGTTAAATTGATAGC
TGGAGATGATAGATATGCAACTGCAGTGGCTATAGCAAAACAAACAAAATATACTGACAATATAGTTATA
GTTAATTCAAATAAACTAGTTGATGGATTAGCAGCTACACCACTTGCTCAATCTAAAAAAGCACCTATAT
TATTAGCATCCGATAATGAAATACCAAAAGTAACTTTAGATTATATAAAAGATATAATTAAGAAAAGCCC
ATCAGCTAAAATATATATAGTAGGTGGAGAATCAGCAGTATCAAATACAGCTAAAAAGCAATTAGAATCA
GTAACTAAGAATGTTGAAAGACTAGCTGGAGATGATAGACATATGACTTCTGTAGCAGTAGCAAAAGCTA
TGGGGTCTTTTAAAGATGCATTTGTAGTAGGTGCGAAAGGGGAGGCTGATGCTATGAGTATAGCTGCCAA
AGCTGCTGAACTTAAGGCTCCTATAATAGTAAATGGCTGGAATGATCTTTCAGCAGACGCTATCAAATTG
ATGGATGGAAAAGAGATTGGTATAGTTGGTGGTTCTAACAATGTATCTAGTCAAATTGAAAATCAACTTG
CTGATGTTGATAAAGATAGAAAAGTTCAAAGAGTTGAAGGAGAAACAAGACACGATACTAATGCTAAGGT
TATAGAAACATATTATGGAAAATTAGATAAACTATATATAGCAAAAGATGGATATGGAAATAATGGTATG
CTAGTAGATGCATTGGCAGCAGGACCTCTAGCAGCAGGTAAAGGTCCAATACTTCTAGCTAAAGCTGATA
TAACAGACTCACAAAGGAATGCACTTAGTAAAAAATTAAATCTTGGTGCAGAAGTAACTCAAATAGGTAA
TGGAGTTGAATTGACAGTAATACAAAAGATAGCTAAAATACTAGGTTGGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3161935-3159590 preprotein translocase SecA subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAGTTTTAGATGCAATCTTAGATAAAGCGGATGAACAAGAAATTAAAAAATTAAATTTAATAGTAG
ATAAAATAGAATCTTTAGAAAAAGATATGGAAATCAAAGAGAATGAACAATTAAAAGAAATGACAAATAC
TTTTAGACTTAGATTAGACAAAGGTGAAAGTTTGGATGATATACTTCCAGAAGCATTTGCTGTTGTTAGA
GAGGTCTCAAAAAGAGTTTTAGGAATGCGTCAATATAAAGTTCAGTTAATTGGAGGTATAGTAATTCATC
AAGGAAAGATAGCTGAGATGAAGACTGGTGAGGGGAAAACTTTAGTTGAGGTAGCTCCAGTATATCTAAA
TGCTTTAACAGGAAAAGGTGTACATGTAATTACAGTAAATGATTATTTGGCAGAACGTGATAAAGAACTT
ATGCGTCCAGTATATGAATTTTTAGGATTGACTGTAGGTGTAATTTTATCTAACCAAGACCCAAGTATAA
GAAAAGAACAATATAAATGTGATATAACTTATGGAACAAATAGTGAATTTGGATTTGACTATTTAAGAGA
TAATATGGTGCCAGATTTGTCTCATAAAGTACAAAGGGAACTAAACTTTGCCATAGTAGATGAGATAGAC
TCAATATTAATAGATGAAGCTAGAACTCCACTTATTATTGCAGGAGATGGTGATGAAGATTTAAAACTTT
ATGAGTTAGCAAATAACTTTGTAAAAACTGTTAAAGAAGAAGACTTTGAGATGGATAGAAAAGATAAAAC
TATAGCATTAACAGCAAGTGGTATAAGCAAAGCTGAGTCATTTTTTGGTATAACAAACCTTACTGATATA
AAGAATATAGAATTATATCATCATATAAATCAAGCTTTAAGAGGTCATAAGCTTATGGAAAAAGATGTTG
ACTATGTTATCTCAAATGGAGAAGTAATGATAGTTGACGAATTTACAGGAAGAGTAATGGATGGTAGAAG
ATATACAGATGGACTTCACCAAGCTATAGAAGCCAAAGAAGGTGTTGAGATAAAGAATGAATCTAAAACT
ATGGCTACTGTGACTTATCAAAATTTCTTCAGACTATATGAAAAACTTTCTGGTATGACTGGTACTGCAA
AGACAGAAGAAGGGGAATTTGAGTCAATCTATAAATTAAATGTTGTCCAAATACCAACTAATAGACCAGT
TATTAGAGCTGATTTGCATGATAAGGTATTTAAAACAGAAGAAGAAAAGTATAGTGCTGTTGTAGAAGAA
ATAATAAGGATACATAAGACTAGACAGCCAATACTCGTGGGAACAGTTTCTGTTGAAAAATCTGAGAAGT
TATCTAAAATGCTTAAGAAGCAAGGTATTAAGCATCAAGTCTTAAATGCTAAACAACATGATAAAGAGGC
AGAGGTAATTTCTAAAGCTGGTAAATTAGATGCTATAACGATTGCTACAAATATGGCAGGTAGAGGTACG
GATATTTCTCTAGGTGCAGGAGATAAAGAAGAAGAAGAAAAAGTTAAAAATTTAGGTGGTCTTTATGTTA
TAGGAACAGAAAGACACGAATCAAGAAGAATTGACAATCAGCTTAGAGGGCGTTCTGGTCGTCAAGGAGA
CCCAGGTACATCAAGATTTTTTGTAAGTCTTGAAGATGATGTAATAAAGCTTTATGGTGGAAAAACTATA
GAGAAACTTATGAAGAGAACAAGTTCAAAGGAAAATACGGCTATTGAAAGTAAAGCACTTACAAGGGCTA
TAGAAAGAGCACAAAAAGGTGTAGAAGGTAAGAATTTTGAAATAAGAAAAAATGTTCTTAAATATGATGA
TACTATTAATGAGCAAAGAAAGGTTATATATAATGAAAGAAATAAAGTGTTAAATGATGAAGATATAAAA
GAAGATATTCAAAAAATGGTTAAAGACATCATACAAGAAGCAGGAGAAACTTATTTAATTGGAAGAAAAA
GAGATTATTATGGATATTTTAAACATTTATATAGTACATTTATGCCTGCAGATACATTACTAATACCCGG
TGTAGATAAAAAAAGTGTCCAAGAGATAATTGATAGCACATATGAAATTTCAAAAAGGGTTTATGACTTG
AAAAAGATGATGATTGGTATTGATAAAGTTGCGGAGTTAGAAAAAACAGTACTTTTAAAAGTGGTTGATC
AATACTGGATAGATCATATAGATGCTATGGAACAGTTAAGACAGTATATAGGTCTTAAATCTTATGCTCA
AAAAGATCCGTTTAAAGAATATGCTTTAGAAGGATATGATATGTTTGAAGCTTTAAATAAAAATATAAGG
GAAGCAACAGTACAATACTTATATAAATTTAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3164448-3162172 cell surface protein (S-layer precursor protein) [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAGAAGAATATAGCAATAGCTATGTCAGGATTAACAGTATTAGCTTCTGCAGCACCTGTGTTTG
CAGCAGAAGATATGTCGAAAGTTGAGACTGGTGATCAAGGATATACAGTAGTACAGAGCAAGTATAAGAA
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ACTTTAGCATCTACTATAAAAGTAGGAGCTGAGCTTAGTGCAGAAGATGCAAGTAAATTATTGTTTACAC
AAGTAGATAATAAATTAGACAATTTAGGTGATGGGGATTATGTAGATTTCTTAATAAGCTCTCCAGCAGA
GGGAGATAAAGTAACTACAAGTAAACTTGTTGCATTAAAAAATTTAACAGGTGGAACTAGTGCAATAAAA
GTAGCTACAAGTAGTATTATTGGTGAAGTCGAAAATGCTGGTACTCCGGGAGCAAAAAATACAGCTCCAA
GTAGTGCTGCAGTTATGTCTATGTCAGATGTATTTGATACAGCTTTTACAGATTCAACTGAAACTGCTGT
GAAACTTACTATAAAAGATGCTATGAAAACTAAAAAGTTTGGTTTAGTTGATGGAACTACTTATTCAACA
GGTCTTCAATTTGCAGATGGAAAAACAGAAAAAATTGTTAAATTAGGAGATAGTGATACTATAAATTTAG
CCAAAGAATTAATAATAACACCTGCAAGTGCAAATGATCAAGCTGCGACTATTGAGTTTGCTAAACCAAC
AACACAATCTGGAAGCCCAGTAATAACTAAACTTAGAATATTGAATGCAAAAGAAGAGACAATAGATATT
GATGCTAGTTCTAGTAAAACAGCACAAGATTTAGCTAAAAAATATGTATTTAATAAAACAGATTTAAATA
CTCTTTACAGAGTATTAAATGGGGATGAAGCAGATACTAATAGATTAGTAGAAGAAGTTAGTGGAAAATA
TCAAGTGGTTCTTTATCCAGAAGGAAAAAGAGTTACAACTAAGAGTGCTGCAAAGGCTTCAATTGCTGAT
GAAAATTCACCAGTTAAATTAACTCTTAAGTCAGATAAGAAGAAAGACTTAAAAGATTATGTGGATGATT
TAAGAACATATAATAATGGATATTCAAATGCTATAGAAGTAGCAGGAGAAGATAGAATAGAAACTGCAAT
AGCATTAAGTCAAAAATATTATAACTCTGATGATGAAAATGCTATATTTAGAGATTCAGTTGATAATGTA
GTATTGGTTGGAGGAAATGCAATAGTTGATGGACTTGTAGCTTCTCCTTTAGCTTCTGAAAAGAAAGCTC
CTTTATTATTAACTTCAAAAGATAAATTAGATTCAAGCGTAAAAGCTGAAATAAAGAGAGTTATGAATAT
AAAGAGTACAACAGGTATAAATACTTCAAAGAAAGTTTATTTAGCTGGTGGAGTTAATTCTATATCTAAA
GAAGTAGAAAATGAATTAAAAGATATGGGACTTAAAGTTACAAGATTAGCAGGAGATGATAGATATGAAA
CTTCTCTAAAAATAGCTGATGAAGTAGGTCTTGATAATGATAAAGCATTTGTAGTTGGAGGAACAGGATT
AGCAGATGCCATGAGTATAGCTCCAGTTGCATCTCAATTAAGAAATGCTAATGGTAAAATGGATTTAGCT
GATGGTGATGCTACACCAATAGTAGTTGTAGATGGAAAAGCTAAAACTATAAATGATGATGTAAAAGATT
TCTTAGATGATTCACAAGTTGATATAATAGGTGGAGAAAACAGTGTATCTAAAGATGTTGAAAATGCAAT
AGATGATGCTACAGGTAAATCTCCAGATAGATATAGTGGAGATGATAGACAAGCAACTAATGCAAAAGTT
ATAAAAGAATCTTCTTATTATCAAGATAACTTAAATAATGATAAAAAAGTAGTTAATTTCTTTGTAGCTA
AAGATGGTTCTACTAAAGAAGATCAATTAGTTGATGCTTTAGCAGCAGCTCCAGTTGCAGCAAACTTTGG
TGTAACTCTTAATTCTGATGGTAAGCCAGTAGATAAAGATGGTAAAGTATTAACTGGTTCTGATAATGAT
AAAAATAAATTAGTATCTCCAGCACCTATAGTATTAGCTACTGATTCTTTATCTTCAGATCAAAGTGTAT
CTATAAGTAAAGTTCTTGATAAAGATAATGGAGAAAACTTAGTTCAAGTTGGTAAAGGTATAGCTACTTC
AGTTATAAATAAATTAAAAGATTTATTAAGTATGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3166263-3164674 surface surface protein [Clostridium difficile R20291]
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GGATTAGCAGGAACAGTTAAAGCACCTATATTATTATCACAAAGAAACAGTATACCATCAGACACAGAAA
AAATGTTAAAAGATGTAAAGAAGGTTTATATAATAGGAACTGAAGATTCAATAGGAAAATCAGTTGAAAA
TGAATTAAAGCAAAAAGGAATAGAAGTTAAAAGAATAGGTGGTAATGATAGAATTGAAACAAGTTATCTT
ATAGCAAAAGAAATAGCTTCAATAAAACCTATAGATAAGGTTTTTATAACTAATGGTTATACAGGTGAAG
CAGATGCTATGAGTGCGTCATCAGTAGCATCAAGAGATGGATCACCTATAATTTTAACTAATGGTAAAAA
TGTTCCATTTGAGAAAAAAGAAGGTGTGCAATGTTATGCTCTTGGTTCAGAGGAGATAATAAGTAATGAT
TTAGTTAAAAAAACTAATGCAGTTAGATTAGCTGGAGAAGATAGATTTGAGACTAATAAAAAAGTTATAA
AACATTTTTATAGTTCGGCAAAAGAATTTTATCTTTCTAAAGGTTATCAATTAGTAGATGCAGTTGCTGG
TTCTTCTATAGCAAAAAATGCACCTATTGTATTAGTTGACGGAAATAGTGATAAGTCTGTACTTAGAAGT
GCTGATAAGATTACAGCACTAGGAGGAATAGATGAAAAGACACTAGAACAATGTTTAAGTGCATCATCAC
TGGATGCAAGTGCACCAACAATAACTGTTGGAAATTTAAATATTTATCAAGGTGATAAGTTTGATATAAG
TAAACTGAATATCGTAGCAAAGGATAGCAATGGTAACGATTTGACACCAGAGCTTATAGGAAATATTGAT
ACTGATAAGGTGGGTAAATACAAAGTTACTATAAAAGCTACTGATATTGGTGGAAAGACTACATCAATAA
GTGTAGAAGTAAATGTACTTGAATATAAGACTAATGATATGAATAGTAGTGAGTTTAAAAGAATGGTTTC
TAGTGAAATGTATAGTTTGGTAAATTCATATAGAAAAGAAAAAGGTAAAGAGCCATTACAAGTTTCTAAA
AACTTAGAAGGACTTTCTAATTCCTGGTCTAAGTACATGGCAGATAAAGGTCAGTTTTCACATGTAATAA
ATGGTAAGAAATCTGTTGAAGTATTTACTGGATATGGCTTGAGAAGTGAAGAAAATATAGCTTTTGTACC
ACTTGTTACAAAAAGTACTTATACAACAAAGGATGCTAGAGAAGTAGCAAATGTAATATTTACAGTTTGG
AAAAAGTCAGATAAATATAATGAAAATATGTTAAATAGTGATTTTGTATATACTGGGTTTGGATTATATA
TATTGCCTAATGGAGAAGTGTATGCTACACAAGAATTTTTAAATAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3168083-3166482 cell surface protein [Clostridium difficile R20291]
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GGATTATCGGGAGCTACAAAAGCTCCAATACTATTTACACAACAAAATAAGATACCAGCAGACACAAATA
GATGTCTAAAAAATATCAAAAAAGCATATATAATAGGTACAGAAGATACTATAAGTAAATCAGTAGAAAA
AGAACTAGATTCTAAAAATATAGAAGTCAAAAGAATTGGTGGAGAAGATAGACTAAAAACAAGCTATTTA
ATAGCTAAAGAAATAGCAACTATAAAAAAAGTGGATAAAGTACTATTAACTAACGCATATAGTGGAGAAG
CAGACGCAATGAGTGTATCATCAGTAGCTACTAGAGATGGAGCTCCAATCATACTTACAGATGGAAAGAG
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ACTTTTTTAATAGTGCAGATGGATTCTATGTATCAGATGGATACCAATTAGTAGATGCAATAGCAGCTGC
ACCACTTACTAAAAACTCTCCAATGGTACTAGTAAATGATGGAAGCGATAAAACTGTATTAGAAGGAGCT
AAGAATATAACTTCTGTAGGTGAAATAAATGAGAAGGTAATACAACAGTGTATAAATGCTTCAAAGTCAA
ATGGACAACCACCAACAATTACAGTTGGAAGTACAGAGATATATAAGGGTGAAAAGTTTGACACTGGCAA
GTTAAACATAGTGGCTAAAGATAACACTGGGAAGGTATTACCAATAGAAGTTGATGGGTTTATAGATACA
AATAGAGTAGGTACATACATATTGACATTAAAAGCTACAGACGAATGGGGAAAAAGTACAGGAAAAAGAG
TAGAAATAAAAGTGTTGGATGATAAATCCTATGATTACAACAGCCCAGAATTTAAAAAAATGGTATCTAC
TGAAATGTATAACTTAATCAATTCCTATAGAAAAGAAAAAGGCAAAGAGCCTTTGGTAGTATCTAGTAGG
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GAAAAAATGCTCCACAAGTATTTTCTGAGTTTGGAATGAGAAGTGAGGAAAATATAGCATATATTTATAT
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>ref|NC_013316.1|:c3170330-3168450 cell surface protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAAAGAAAATCTTTTATAAGAACTATAGCAGTATCAACTATGGCAGTAGCTGTAACTGGTAGTG
TTACATGTGCATATGCAGCTCCAGTTTTACAAGGAACAAAAACGTATGAGAAAGTAAATACTATAGATAT
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GTAGTAGATAATGAGCAGAAAGAAAAGATTACTTGGTCTGATAATATAAAATCTCAGATAAAAAGTGGAA
ATGCAAATGCTACTTGTAGAGTAGAATACAACAAATCAAGTAATACAACTACATTAGATATATATGTTAC
ATCAAATGAAGATTTACTAGACGGAAATAGATTGAATATAGGAAGAATATCTGTAAAAAAATCTGGCAGT
AACTCAAATGCTGACTATAAAGTTTTAGGAAAAGGAACAAGCGATAAACCAGCTTTAAAAATTGTAACAT
ATAACAACAAAACAGTGGATTATGAAAATATAAACTCTGATGAAGGATTAATATTTACCCTTATTAATGA
GAGTGAAGTAAAACCAATTGGTGGAACTGGTTCTAGTAAAAATGACCCTGAGAAGTATAAGGTAGAGAAA
AGTGAAGCACTTGAATATTTATTAAACAATATTAGGATAAACTATTCTATTGTTAGTAAAGAAACACAAG
AAAGTGGTTCAAATGTAATATTAAAACTTGGATTAGCACAAAAAATAACTAAGGGAAGAAAAGCTACAAT
AAATAAATATGTTGAAGTTACACTTCCAAAAAGTTTAGAATACATAGTTGAAAATGAATTATCAAAACCG
GATGAATTACCACCAGATAATGGCAATGGTGGAAATAATGGTGGTGGAAGTAATTCAGGCGGCTCGTCTA
GTGGTGGAAGTTCTGGAGGAGGAAGTTCAAGTAATTCTACATCTAATGTCACAGTCAAAAAATTAAAAGG
TGCTGATAGATTTGAGACAGCTACCAAAATATCTCAAAGTGGTTGGACAAAATCAGATACAGTTGTAATA
GTAAATGGAGAAGATAAAAGCATGGTGGATGGGCTTACAGCTACACCACTTGCTAGTGTAAAAAACTCAC
CGATTCTTTTATCATCAAATGAAAAGCTTCCTCAAAAAACTGTAGAAGAATTGAAAAGGCTAAATCCATC
AAAAGTAATTGTGATAGGTGGAAACAACTCAATGCCAAATTCAGTTGTTGAAGCTATCAAAGCTGTAAAT
TCAAAAATATCAGTACAGAGAATAGGTGGAGATACAAGATATCAAACTTCTATTAATATAGCAAAAGAAA
TAGATAAGACGAATAATGTAAGCAAATTGTATATAGGGGCAGGAAATGGAGAAGCAGATTCATTATCAAT
AGCATCACTGGCCGGTAAAGAAAAAACTCCAATAGTACTTACACAAAAAGATGGTGTAGATAATGAAGCT
GTACAATTTATTAAATCAAATAAGGTGTCAAATATATACTTTATTGGTGGAATAGAAAAAATATCTAACA
AGGCTATTGAACAAGTTGGAAAAATAGCAAACAAAGATATATCAAACAATAGGGTGGCAGGTCAAACTAG
ACAAGAGACGAATGCCAAAGTAATAGATAAATTCTACTCTCAATCTAAACTAGATGGAGTTGTAGTTGCA
AATCAAGATAAACTTATAGATGCTTTAGCAGTTGGACCATTAGCAGCTAAAAACAATTCACCAGTTATAC
TTGCTACAAATACGTTAGATAAATCACAAGAATCATCATTAAAAGGTAAAAATTCATCAAAGTTGTTTGA
AGTAGGTGGAGGAATAGCCTCATCTGTAGTAGATAAGATTAAGAGTTTAATTGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3176503-3170540 hypothetical protein CDR20291_2686 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGGCAATATCTTGTGTACTAGCAGTATCTATGTGTAGTGCACCACTAAATGTTTTTGCAGAAC
CTATATTAGAGGGGAAGCTAAGGGCAGTTGAAAAATCAGTTACAGAAAAGTTAAGGGGGAATCTTGAAGT
AGATTTAAATTTTTCACTGCCAATAAAAAATAGCGAGTCAGAAAGTATGACTAATATGCAGTTACGATTA
AAAGATGATAGTAACAATAGTGGAATAATAAAGCTTGGAGAAAAAGATTCAGGAACAGTAAATATTGGGA
CAGATAATATAGAATATACTATAAAAAAATTATCTGCAAGTAGAAGTGAAATAAAAAATAAAGATGAGAA
TGTATCATATTATAATATTGTATTTAATAATTTACCTGTTGGAAAATACAATATAGAAGTCTCTGGAGCT
GGATTTAAGAACAAAGAAATTAAAGACATTGATATATCAAGTTATTCACAAAGAGTCTTATTAAGCAATA
GAGCAAGTGTAGATAATAAAAATAAACCTTTAAATTATGAATTATTCTTAATGGGTGATGTAAATGGAGA
CGGTAAAGTAGATAAGAGTGATTATAATAAGGTTTTAGAGAATATAGATTCAAATAAAAGAGAATTTGAT
TTAAATAGAGATGGAAAGGTAGATATTGTTGACTTAGATTATGTACAGAAAAATTTAGGACAAAGTGAAG
ATGCAAAAAGCCTAGAAAGTATAGTATCTACCAATCCTATAGTAGATACAAGTAAGGTTGAATTAAAAGG
AAATAGTGATGTAGATATTAATGGTAATGTAGAAAATTTATTTAGTGGAGAAAATAATGGAGTTACAATA
TCTTCAAAAAATGATGAAATATCTGAGGAAAAACCAGCAGTAATGGATATAGCTTTATCAGAAGCACTTA
ATATGGAAGTCATCAATATAAAAGCTCCAGAAGGTACTGCTCCAGCAAAAGGAATAGTTGAGGTTACTGA
CGAAGATGGTAATGTTCAACAGATTCCTTATGAAAATAAAGAATATATGAAAAACTTAAAAGATAAGGAG
CAACAAGAGGAAGTAAATAACGAACAAGAAGAAGTAAATCAAGAAGAAGTAAATAATAAAGATGAAAATA
AAAATCAGACTGATAATAATTCAAATAATAAAGATGAAAATAATGATAAACAACAGGAAAATAGCGATAA
ACAAGAAGTAAACTCTAATACCAATCAAGATAAAAATAATGATAAAGAAAATTCATCAATGGATAAACCT
AATTCAGATGAAGATACTCCAAAAGAAGGGGATAATATCAGTAAAGATGATAACTCTACAACATCTACAT
ATAGTAGGGCAGCATTAGAAACATATACAGATGTTCAAAATAGCGATATAGTAATAAATCTTGGTAAACA
AGTAGCAGTAAAAAAGATAACTATAAAAATAACAGCTACAACAGCAAACGATAGAAATCTTGCAGAAATA
TCAAAAGTTGAATTTTTAAACAATGTATATAAAGAAATACCAAAGCCAGAGATGAACATACCTAAAATAA
ATAAAATATCGACTAGCACTGCTGTTGGAAATGAAAAAGTATCTTTTTATTGGAATAATGAAGTAAATGT
ATCAGCATACGAACTTATACTAGATAAAATTGATAGTAAGGGAAAAGTATTATCTACTAAAAAATTACAA
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TAAATGGAGATTGGTCTAGTGGTTATAAAGATGCAACGCCAGAAAACTTAGATGGAGTACCAGAAAATGT
AGACTCAAACTATAAACCTATACAATTTAGCCCAGATAGCATATTAGAATTTCAAGTTGTTCCAGACACA
AAACCAGAACCACCAGAAGGTATAAATGTTAAAGGTAAATTTAAATCTCTTGATGTAAGCTGGAAAAATC
ATAAACAAGCTAAAGACTTTGACTTGTACTATAAAGAAAAAGGCTCTAATGGGTCTTGGATAAAATACAA
TGATAAGCTTATTCGTGGGACAAGTTTAAAAATAGAAGGTCTTAAGGATAACACAACATATGAAGTTAGA
ATGACAGCTACTAACCACTTGGGAACTAGTGGAATGTCTAAAACATATATAGGTACAACTGAAAGCATAG
ATGCACCAACAACACCTAACTATAGATTAATTAATACTCCTAAGGAGAATGGTGGATTTGGAATACCAAC
AAATCACATTGTAGATGTTGTTTATCCAGCAGGATATGACAAAAGTGAATATAGTGATAAAAATCCATTT
GATAAATTCAATGTAGTAGATGGAGACTTCACAACACATTGGACATTCCCAACATATAATGCAGCTGAGG
GAACGAATAGAGGACCAATAATAACTTTTGATAAATCTTATACTATGGATACTTTTATGGCTACACCTCG
TTTTGATGTTTCTGATAAGACAATAAATGACTTTGAGATACGATATTGGGATGAAAATGGTCAATTACAC
AATCTGGGGGATGTTCCTTTTGAAACAAAGACAGACCCTGTAAATAATAATAAGTATGTAATGGTTAGAT
TAAAAGAACCAATAACTGCTACTAAGATACAAGTAAGTGTTTGTTCATCTTATTCATATAAGTCTAATAT
ATCAGAACTTAAGTTTTATGAGTATGACAGTATAGAAGATGATGTAAGAAATCTATTTATGGATGACCTA
CAAGTTGAATTAAAAGAAGATGTAACTCAAGAAAAAATAACTGAATTAAAAGATAGATTAAATACTCCAG
ATAAAGCTAGTGGAGAATATCATCCATATAAGACAGTTATTGATAGAGAATTAAAATTAGCTCAAGACTT
ATATAATGATAGAGCCACACTTACTGATGTAACTACTGTAAATCAAGAAATAAATAAATCAGGAAAATAT
AAAGATAAAAACGGACAGTATACTGTAAATTCCAATAACTTAGGCATGCAAAATGACTGGCAGGCATTAG
GAGTAGCTGCTAGAGCAGGAGATGAAATAACAGTATATGTTGGAAGTAAAAGTGGAAAAACTCCTAAGTT
GATATATACACAGTACTATGGAGAATCTGGTGCATATAAGAGTGGAGAAATAAATCTTAAAACTGGAAAA
AATGTAATTCAATTAAGCAAACTTCATAGTTTAGATATAGAATGTGGAGGAAGTTTATACATAAGATACC
CTGAAGATACTCCAAGTGGAGGAGATATAAAAGTACGTGTAGCAGGAGCTACTAAGATACCACATCTTAA
TCTAAATGGAACAATAAATGATAAGAGTCCTGCGGGAGTTTCTGAATCTAAGAAAAAGATAAAAGCATAT
ATAGAAGAATTAGCTAAATATAAAGATGCTGTAAAAGGAGAACCATATTATCCAGGAACAAATATTGGTA
ATTCATATGAATATTCAGAAAAAACTGGTGTGTTAAACACTACAGATATTGAAAGTGATAAAGTAACATT
AAATGTTCCTGCAACAGCTGTATATCAAGGAATATCAAAAGGAAATGCTGATTTAAATACACAAGTAGAT
AGATTATATAATAGTATGCTTGCATGGGAACAAATAATGGATTTAGTTTACTCAGAAAGAGGAGTATTTA
AAACACAAGATTTAGATGGTAATGGAACTGTAGATGATAATGAATTTAACTTAACTAAAAATGATATGGC
TCCAAAATCTCGTATGAACATAAAATACCAAAGAATGTTTATTGGAGCATTTATGTATGCTTCTGGATTA
CATGTAGGAGTAGAATATGGTTCAGTTCCAGGGCTTATGAATGGAGTACCTTTCCAAATAGATGATAGTG
GAAAAGCTACAGGAGGAAACTTATTTGGATGGGGAATAGGTCATGAAATAGGACATGTTACAGATATTGG
AAAGATGACATATAGCGAAACTAGTAACAATGTACTTGCTTTACTTGCTCAGACCTTTGATGATAAGACA
CATTCAAGACTTGAAGGTTCAACAATGGATAAGATATATGAGCATGTAACTTCAAATAGCTTAGGTATAC
CAAGCAATGTATTTGAAAGGCTTGGAATGTTATGGCAATTACATCTAGCTTATGATGATGATTTTACGGG
TTCAATGTTAAAGAATAACTCAGATGCTGATTTAAGTAATGATACATTCTATGCAAAGATTTCAAGAAAA
TACAGAGCACTTTCAAGTAGTGACCCAATTAATAGTTTACCAAAAGACCAAATGCTAGTAGCAATGGCAT
CAAGTGTTGTTGAAAAAGATTTAAGAGATTACTTTAAGGCATGGGGAGTAGAAATTACACCAGAATTAAA
CAGTATAATGGATAGTAAGAACTATGAAAAAGAATCAAGAAAGATACAATATGTAAATGACGAAGCTAGA
AGAAAGATTTTAAATGAAAATATAGCTAGTATGGCAAAAGATACTAAAGTAAGTGCTAGTTTTTCTGATG
GAATACAAAGTGGTTCTCTAGTTAAATCTAATAAAATATCTATAGACCTAGATGTAGATAAGGATAAAGA
TAAGATACTAGGATACGAAATAATAAGAAGTGATGGAAATTATTTAGATGGTGAAAATGGAACACAGGTA
AAATACAGAACAGTTGGATTTGTGGATGCAAAAGGAAATAGTAAGGCCAAATTTACTGATAGTATATCTC
CTCTTAATAACAGAGCATTTACATATAAGGTAGTTGCATATGATTATCACCTAAATCCAACAGAAGAATT
TGAAGTTGGCACTGTAAAATTATCAGATGAAGGGAAAATAAATAAATCAGCATGGTCATTCATAACAAAT
ACTGTTTCTGACGGTGATGTTAGAACTGAAAATGACTCACATGGACCATTACAAAATCCTGAAATTGATA
ATATAAAAGATAATGATGTAAGTACTACATATAAAGGAAAGATAATAAGTAAAGCAGAGTGGAACAAAGA
CCCTCAAAAAGACCCTGATATAAATGTAGAAGAAAATCCATATATAATAGTAGACATGAAAGAAACATTA
CCTATAGTAGGACTAAAATATACAAAACCAGAGGCAGAAACTAGGAAGTTCTCATTAAAAGGATTATTTA
ACTTTAGAAAGAATACTAGCACAACATACAATCCTTTAACTAATTACAAGATACAAGTAAGTAATGATAA
AAAGAACTGGGAAGATGTAAGTCAAGGAACTTTTGAATATGGACAAGATTTAGTTGGTGGAGGAAAAGAC
CAAGATAATGAAGCTAGAGTTACATTTAATAAAGATGATAAACTTTGGACATACCAAGCTAGATATGTAA
AACTAATCTCAAACAATAAGTCTAATATAGAAGTTGCAGAATTAGATATAATAGGACCTCCAGGTGATAA
TATAGAAATTGGCACAATGAATAATGCAGACCAAACTCGTACTAATGGAATTGGAAAGTTAGCAGAAGAT
TATGTATATCAAAGTGATGACCCTAGCACAAGTGAAGATGAAACAGGTAAGATTCCAGCAGGTTCAATAA
TTATTACAGGTGAATACAGTGGAAATCCAGCATTTAATTTACCACTACTTATAGATAAAAACAATAAGAC
TATATCTGGAGAAGCACTTTTATTTGCAGAAGTTCCAGAAAAAGGTGAATTAGGTGAAATCAGTAAAGGT
ACATGGGTTTACTATATGCCAAAAGAAAACTTTGATTCTTTAAGTGATAAGGTTAAGGCTGAACTATATA
GATACAATGACCTTCAAGGAGATACGCCAGTAGGTCAAAGATTTGTAAGTGATACAATGTATGTACCTGT
AGGAGCTAAGAATTATGATGAGTTAAAGACAATAAGTCTTACTGATAGTAATAGTAAAGCTAGAAAAGCT
ACAAGAAATGCTATTGATGTCAGTAATAAGAAGGTTATAACTGTAAGCAATAAAGTAAAGGGTAATATTG
TTAGAGATAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3178317-3176884 cell surface protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGTACATTGGGGGTAGAAAATAATATGAAGAATAGTAAAAAGATATTAGCTATAGGACTTACAC
TATTTTTAGTAATGGTAAATACTCCTATGGTAAATGCGTTGACATCAGTTGAGCAAATAAAAGGGAATGA
CAGATATGAGACAGCAGCAAAAATAGCAGATAAGCAAAACTACAATACAGCAATACTAATCAACTCAGAT
AATAGCTTAGCAGATGGTCTAAGTGCAAGTGGTTTAGCTGGAGCCTTAAATGCGCCTATTTTAATGACAA
AGCAAAATCAGATTCCAAACACAACTATGGAAAGATTAAACAAAGCAAAGACTGTGTATATAATAGGCTC
AGAATCAACAATAAGTAAAAATGTTGAGAATCAGTTATTATCCAAAAAGAAGGTTGTACAAAGAATATTT
GGTGAAAATAGATTTGATACAAGTATAAAAATAGCTGAAAAAATCAAAGAAATTAAGCCAATAGATAAAG
TAATTATAGCCAATGGATTTACAGGAGAAGCAGATGCGATAAGTGCATCACCAGTAGCTGCTAGAGATGG
AGTACCTATAATACTTATAGATGGAAATAGTGTGGGATTTGACACGACAGGCTTAAAGAGTTATGCGCTT
GGTTCTAGTGAAATAATCAGCGACGAATTAGTTAAGAGCACAAATTCTATTAGATTGGGTGGCACAGATA
GATTTGAAACTAATAAGATAGTTATACAAGAGTTTTATAAAAATAGTAAAGAATTTTATCTAAGTAAAGG
CTTGCAATTAACAGACGCTTTGGTCGCCTCTACAATAGCAAAAAATGCTCCTGTAGTTTTAGTTGAAAAT
GGCAGTAACAAGAGTATTTTAAGTGGTGCAGACAAATTGACTGTACTAGGAGGCATAAATCAGAATGTTA
TCAAGCAATGTATAAATCAAGCTTCACCAAATCAACAAGGGTTATATTACAATCCAAATGATAGAGCATT
TAAAGAGAGAATAAAGGGTAAAGTATATGCTCTTACAAAGCAGTATAGAAAAGATAATGGAGTAAGAGCG
TTATCTGTAGCAAGCAGATTAGAGGGTCTAGCAAATGATTGGTCTAATTTAATGGCAAATAAGAAGACTT
TATCTCATACGATAAATGGAAAAAATTCATATTCTACTTTTTTGAAATACTTAGATTGGAGTGAGATTAA
ACCTGGATATATAGCAGTTCAAGGTGAAAATATAATTAAATATAAAATTTCAGATAAACCTGTATATACA
AATAGAGATGCAGATGATATAGGAAACTTTATTTTTAATGAGTGGAAGACAAATCCAGAAGAAGGAACTA
ATATGTTGCATAAAGGGTATGAAATAATGGGATTTGGTATAGCTATAACAGGAGATAAGAATCTATATGC
TACACATGAATTTTATGGAAGATATAAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3180644-3178749 cell surface protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAGCAACAAAAAGAGAAGTATGGCAATAGTAATGGCAGGTGCTACAGTTATGAGTGCAGCAGCAC
CAATATTCGCAGACAATACTGTGACAGAAAATGTTGATAAAAATTACACAGTAAGTGCGAAAGATTCTGC
TAAACTAATCGAAGAGGTTAGAAAAGCATTAGAAGTTAAGTTTGAAGATACAAAAGCAGGAGCAAATGTA
AATGATAGAGTTTACGATATAAAAGTAGACAATGTAAACTTAACTAATGCAACTCAATTACAAAATAAAA
TAAACTCTTTAACAGAAGGGCAAAGTTTAAAAGTTACTATTCAAGATAAAGGACATCAAGTGTTAGGTGG
AAAAGTAGTTGACTATAAAATTGAAAACTACAAAACTGCTCAAGAAATAGTAGATGCAGTTAATGCTTAC
AATGCAACTTTAGCAGAAGATTCTGATAACAAGTTAACAGCAACTATAAAATCTACAAATACAGTTGAAG
TAAAAAGAGCAAAAGATTCAGCAAATGTTATTACATTAAATGTAGGAGACCAACATTTAGATTTCTCAAA
AGTGATAACATCAGAAGAAGGTACTTTTGAAGGTTATGAAAAGAGTTATAGTGACATAGATTCAAAAGAA
TTACATACGATAACAGTTAAAAACGCAGATTTACAAGACATATCAGCAGAAGAATTATTTGATGGAATTA
GATTAACTACATTAGGAAGAGAAATAGTTAATAAAGTTAAAAATGGATATGCTTTAACATTTGAAAATGA
AGCAATCCTTACTCAAGAACAAGAAGATAGTGATGATAAAGATAAACCAGAAAAATCAAGCTTTGATATA
GTTTTAAGCAAGGCAAATGAAAAGTCAGAAACAATAAGTGTTTCAAGTAAAAACCATAAGTTAGTTAGAG
ACTTACACAAAGTATTAACTGATGTAAAAGATGGAAAAGAATTAAAAGTAGAGGTTTTATCTGGTGATTC
AAGATTTACAACAGCAGTAGAAGTTAGTAAAGAGAGATTCAAAGATGGAGAAGCAGAAGCTATAATTTTA
GTTGGAGAAGATGCTATAGTTGATGGATTAGCATCAGCACCACTTGCCTCTCAAAAAAATGCACCAATAT
TATTATCTAAAAAAGATTCACTACCATCAGAAATAGAAGCTGAAATATTAAGAGTACTTGGAAGTAATCT
ATCTTCTAAGAAAATATATATAGTAGGTGGAGAATCTAAAGTATCAAAAGAAACTGAAGAAAAACTTTCT
AAATTAGGTGTAAGTAAAGTTGAGAGAGTTTCTGGAGAAGATAGATTTGAAACTTCTTTAGAAATAGCAA
AACAATTAAAAGATACATTTAAGACTGCTTTTGTAGTAGGTGGAAATGGAGAAGCTGATGCTATGAGTAT
ATCAGCTAGAGCTGCTCAATTTGGTGCTCCAATAATAGTTACAGGTAACGAATTAGATGCAAATGCTGAA
AAATTATTAAAAGGAAAAGAATTAGAAATAGTGGGTGGAGAAAATTCTGTATCAAAAGAAGTTGAAGACA
AATTAGTTGATATAGATTTAAATAATAAAGTTGAAAGATTAGCTGGAGAAAATAGAAAAGATACTAATGC
TAAAGTAATCAATAAATACTATGCAGGTGCAACTAAAGCATATGTAGCAAAAGATGGTTATGTAGGTGGA
AATGGACAATTAGTTGATGCACTTACAGCAGCACCACTTGCAGCTAGTTCAAAGGCTCCAATAGTATTAA
CTACAGAAGAACTTTCTAAATCACAAGAAGAAGTAGTTGAGTTAAGACTTAAGAATGCTACTAAGTTAGT
ACAAATAGGTGAAGGAATAGCTAAAAACGCTATTGAAAAAATAGCAGAAAAAATAAACTTATTTACTAAG
AACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3181859-3181479 hypothetical protein CDR20291_2689 [Clostridium difficile R20291]
TTGAGAGGAGGTTTTTTTATGGGAAAATCTAATTATATTTTTAAAGGTCTAGGATATGCATATATAATAA
CTTTGGCTGTTTTATTAGTGTATAACTTATTTTTGACATTTACAGATATTGGTGGAGATAATATAACTAT
GGTCTCATCATTTATAACTACTATTTCTGCAGCTATAGGAGGGTTTTACACTTCAAAACACATGAAAGAA
AAAGGACTTATGTATGGACTTTTAGTAGGACTTTTGTACATAGTATGTATTTTTTTGACTGTGTTTTTAG
CACAAGAAAAGTTTGTATTTGAAGTAGGGATGATTTATAAGTTATTGCTAATATCAGCAGCAGGAGGCAT
TGGAGGCGTATTGGGTGTCAACTTTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3182192-3181899 putative protein translocase subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGCCACAGCAACAAATAATTATGAGTATAGGTCTATGGGTAGTAGTAATCGCAATCTTTTATTTCCTAA
TGATTAGACCTCAAAAGAAAAAAGACAAACAATTAAAAGAAATGAGAAGTAGCCTAAGTGTAGGAGACAA
GGTCATTACAATAGGTGGAATAGTAGCTAATGTAGCTAAAGTTGAAGATGATGTTGTAATATTAGAATTA
GGACCAAATAGAACTAAAGTTCCATTTGAAAAATGGGCTATAGGAACTGTTAAATCTAAAAAAGAAGAAA
TAGAAGAAGACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3183465-3182326 queuine tRNA-ribosyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGGTTAAGGAGAACTTTATGTACGCAGTAAGATATGAATTGATAAAGACTTGTAAGCAGAGTGGTGCAA
GGTTAGGAAGATTACACACTCCACATGGGATTATTGAAACACCAATATTCATGCCAGTTGGAACTCAAGC
AACTGTAAAATCTATGACACCAGAAGAATTAAAAGAGATTGGTTCACAAATAATACTTAGTAACACATAC
CATTTATATATGAGACCAGGTCATGAACTTATAAAAAGAGCTGGTGGTCTTCATAAGTTTATGAACTGGG
ATAAACCAATACTTACAGATAGTGGAGGGTTCCAAGTATTTAGCTTAGGGCCTTTAAGAAAGATAAAAGA
AGAAGGTGTAGAATTTAGGTCACACTTAGATGGTTCAAAACATTTTCTAACTCCAGAAAAAGCTATGGAA
ATACAAAATGCATTGGGTTCAGACATAATGATGGCGTTTGATGAGTGTGCACCATACCCATCAGATAGAG
AATATGTAAAAAATTCTTTAGAAAGAACAACAAGATGGTTAAAAAGATGTAAAGATGCCCATAATAATAC
CGACAAACAAGCTTTATTTGGTATAATACAAGGTGGGATGTATAAAGACTTAAGAGAACAATCAGCAAAA
GAAATAACTAGTATTGATTTACCAGGATATGCTATTGGTGGGCTTAGTGTTGGAGAACCAAAACCACTTA
TGTATGACGTGCTAGAGCATACAACTCCACTTATGCCACAGGATAAACCAAGATACCTAATGGGAGTTGG
TAGTCCAGATGACTTAGTGGAAGGTGTTATAAGAGGAGTAGACATGTTTGATTGTGTCCTACCTACTCGT
ATCGCTAGAAATGGAACTGCAATGACTAGCCAAGGTAAAGTAGTAGTTAGAAATGCAACTTATGCTGAAG
ACTTTACTCCACTTGACCCTGAATGTGATTGTTATGCTTGTAAAAACTATTCAAGAGCTTATATAAGACA
CCTTATAAAAGCAAATGAAATACTGGGTGCAAGATTAATAACTACTCATAATCTTCACTTTTTATTAAAT
TTAATGAAACAAATAAGACAAGCGATAATGGAAGATAGATTACTTGATTTTAGAAATGAATTTTTTGCAA
AATATGGATATGAAATATAG
>ref|NC_013316.1|:c3184011-3183526 hypothetical protein CDR20291_2692 [Clostridium difficile R20291]
ATGCATAGTTTACAAAAACAAAAAAAGAATAACCCTATATTAAAGATTGCTTTTATATTTGAACGTGTTT
TAGCAGTAGTAGTTCTAATAGCAGTATTTTTAGGAACTATAGATGTTCTAAGACTTATGTGGGGAGCATA
TATAGTTGATTTTCAAAATCCAGTACAATACAGTCAGCTTAATGATTTTTTAGCACAAATATTACTTTTA
GTAATAGGTGTTGAACTTGTAGTAATGCTATCTCTTCATATACCAGGAGCATTTATTGAGGCATTACTTT
ACGCAATAGCTAGAAAAATGTTGCTACTGCCTAAAAATGAAGGTATGATAGATGTTTTAATAGGAGTTAT
AGCTATAGCAGGACTATTTGCTATAAAAAAGTTTTTAGTAACAAAAGACAAGAGTGCTCTTAATATAATG
AGTATTCATGATGAAGAAGCAATTAAGGAGCAACAGAACAAAGAAGACGAAGATAAATCTATTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3185048-3184023 S-adenosylmethionine:tRNA ribosyltransferase-isomerase [Clostridium difficile R20291]
TTGAAAACAAGTGATTTTAAATTTGACTTACCACAGGAACTTATAGCTCAAGTTCCTATAGAAGATAGAG
CTAGCTCAAGATTGATGGTATTAGATAAAGAGACAGGTAATATTGAACATAAAGTATTTAGAGATATAAT
AGAATATTTAAATCCAGGAGATTGTTTAGTATTAAATAATACTAGAGTTATACCAGCTAGATTAATAGGA
GAGAAGCTTGAAACTGGAGGTAAAATAGAGTTTTTATTATTAAAAAGAACAGAGGAAGATACTTGGCAGG
CTTTAGTAAAACCAGGAAAAAGAGCAAAAGTAGGGACTAAATTTTCTTTTGGAAATGGAAAGCTAATTGG
AGAAGTTGTAGATTTATCAGATGAAGGTTCAAGAATTATAAAATTCCTTTATGATGGAATTTTTGAAGAA
ATATTGGATGAACTTGGAAATATGCCACTACCTCCATATATCACTGCTAGACTAGATGAAAAAGAAAGAT
ACCAGACTGTTTATTCAAAGCATAATGGTTCAGCAGCAGCACCTACAGCAGGATTACATTTTACAGAAGA
ATTGTTAAATAAAATAAAAGAAAAAGGTGTAGATATAGCTTTTGTAACTCTACACGTTGGTTTAGGCACT
TTTAGACCAGTAAAAGTAGAAGATGTTTTAAATCACAAGATGCATTCAGAATATTATATGGTTAGCCAAG
AAGCAGCTGACAAAATAAATAGAGCGAAGGAAAATGGAAACAATGTAATATGTGTTGGTACTACTAGTTG
TAGAACTATAGAATCAGCTTGTAATGAGGATGGAAAGATGAAAGAAACTAGTGGATGGACAGAAATATTT
ATATATCCAGGTTATAAATTTAAAGTTTTAGATAAACTTATTACTAATTTTCATTTACCAGAATCTACAC
TAATAATGTTAGTAAGTGCTATTTGTGGAAAGGATAATGTTTTAAATGCATATAATGAGGCAGTAAAAGA
AAGATATAGATTCTTCAGTTTTGGAGATGCTATGATTATAAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3186385-3185366 holliday junction DNA helicase [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAGGTTTTGAAGATGAAAATAGGATAATAACTTCTACAATGAAGATGGAAGATATAGATATAGAAA
ACAGTTTAAGACCAAAAACTTTAGAAGATTATTTGGGTCAAGAAAAATCCAAAGAACAACTTAGTATATT
TATAGAAGCAGCTAAATCGAGAAATGAGCAGTTAGACCATGTGCTTTTATATGGACCACCAGGTCTTGGA
AAAACTACACTAGCAAGTATAATAGCAAATGAGATGGGGGTAAATTTAAGAATTACGTCAGGACCCGCAA
TAGAAAGAGCTGGAGATTTGGCAGCCATACTTACGAATTTAAATGAAAATGATGTTTTATTTATAGATGA
GATTCATAGAATCAATAGAAGTGTTGAAGAAGTTTTATATCCAGCAATGGAGGATTTTTGCCTAGATATA
ATAATAGGGAAAGGGCCATCTGCTAGAAGCATAAGACTTGACCTTCCTAAATTTACACTTATTGGAGCTA
CTACAAGAGCTGGTATGCTTACAAATCCACTTAGAGATAGATTTGGTGTTATTTGTAAATTGGATTATTA
TACAGTTGATGAACTTTCAAAAATAGTACTTAGGTCTTCAAGCATCTTAGATGCAGAGATACAGTCTAAT
GGAGCATTAGAACTTGCAAAACGTTCAAGAGGGACTCCAAGGATAGCAAATAGATTACTAAAAAGAGTTA
GAGATTTTGCACAAGTCAGAGCTGATGGAAAAATAACTGATAAGGTGGCAAAAGATGCTCTGGAACTTTT
AGGAGTCGATAGTTTGGGTCTCGATTTTGTAGATGAGAAGCTTCTTATGACTATAATAGAAAAATTTAGA
GGAGGACCAGTGGGTTTAGATACATTGGCAGCTTCTATTGGAGAAGATAGAAATACAATAGAAGATGTAT
ATGAGCCATATTTGCTTCAATTAGGATTTATAAATAGAGGTCCTAGAGGAAGAGTAGCCATGCCATTAGC
ATATGAACACTTAAAAATTCCATATCCTAATGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3187094-3186492 holliday junction DNA helicase [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAGTTATATAAAAGGTACAGTAGAAGAAATTTATATAGACAGTATAGTTGTTGAAAATAATGGGA
TAGGATATAAAATAAATGTATCATCCAATACAATAATGAATTTACAAGTGGGAGAAGCCACAAAAATATA
TACTAAATTAATTGTAAGAGAAGATGATATGAGTCTTTGTGGTTTTGTAAGTAGGGAAGAACTTAAGATG
TTTGAATTACTAACATCTGTATCTAAAATAGGACCTAAGGTGGCGCTTTCAATACTATCATTTGCATCAT
CAGCACAGTTAGGAGCATATATTTTAAGTGAAGACATTGGAAAATTATCCAAAGCTCCTGGTGTTGGTAA
AAAGACAGCAGAAAGAATCGTCTTAGAGCTTAAGGATAAGGTAGACAAAAATAACATAGAGTTTGAACCA
ACGTTATTATCACAAAAACCTACCTTGATATCACAAGATGAGTCTGTAGATGCACTTGTAGCTTTAGGCT
ATACTTTGTCGGAATCAAAAGAGGCAGTTCAAAAATGTAAAAAAGATGGTATGAATACAGAAGCTATTAT
AAAGAAAGCTCTTACATATATAATGAGTAAATCCTTGAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3187596-3187087 crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC [Clostridium difficile R20291]
ATGATAATATTGGGGATTGACCCAGGTATAGCCATAGTTGGATATGGTATAATTGAATACAAAAATAGCA
AGTTTAAAGTAATCGATTATGGAGCAGTTACAACACCTGCCCATATGAATATATCGAGAAGATTGGAACT
TGTGTATAAAGGAATTGATACAATAGTAAAGAATTACAATATAGATGAAGTTGGAATGGAAGAATTATTC
TTTAACAAGAATGTAAAAACAGCTATAACAGTTGCACAAGCTAGAGGTGTTACTATGCTTGCATGTGCTC
ATAATGGGAAGCCTGTATATGAATACACTCCACTTCAAGTAAAACAAGGTGTAGTTGGATATGGGAGAGC
AGATAAGGCACAAGTTCAACAGATGGTAACTTCATTTTTAAGTCTAAAAAAAGTTCCAAAACCAGATGAT
GTTGCAGATGCTTTAGCTGTGGCTATTTGCCATGCTCATTCAAACAAACTTGAAAAAACTCTAAAGAATA
TAGGTGGTAAGTATGTATAG
>ref|NC_013316.1|:c3188537-3187908 hypothetical protein CDR20291_2697 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTGAAAAGAAGAAAAAAGAATTATTTCCTTGGAAAATATCTGCCTTAATACTGGTTGGAGTATTTG
TATTAAGTAGCGGAGTTTATATAGGGACAAGATTAAAAAATAATGGAGTTCAAACTAGTAAAGTTGTAAG
TGCTAGTGCGAATATGGACGAAAAGTCAAAAGAAGCTTTTGGATTAAATAAAAATTGTGAAGTTTGGCTT
CAAAGTGAAGGCGAAAATGAAACTAACTATAAGAGAACACTTACAATGGCTGGGATAGTTCCAGAGTCAT
TATTAGATAAGACAAAATCAGAAATAGTATCATATTTTAAAAAAGAATATCCAACTAAAAAAATAAAGAG
TATGGATAAAAATGAAATCATATTGGTAGAATCTAAATATAGTGATAATAAAGATGTACAAGCAATGAAC
GCTACTATAAAAGGTAAATATACTATTGAAAATGATAATGGAAATATAGCACTATATAAATATGATGATA
GTGGAAGTAAAACATTAGTAGAAAAAACAAAAATAAGAGTAGATTCACTTCCTAAAACAGTTCAAGATGA
AATCAAAAAAGGTGTAGTTATGGATACTGAAGAAGAGGCCTATTCAAGATTAGAAGACTTTGCAAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:3188740-3189063 hypothetical protein CDR20291_2698 [Clostridium difficile R20291]
TTGGAAAGAATAAACTGTAATGTAATTAACTGTTCACATAACAACAGCCATATATGTTATGCAGATAAAA
TTTTTATAAATGGTGAAAAAGCTCACAATGACAGACATACTTGTTGTAGTTCATTTTTAGATGAATCTAT
TTATAGTAATTTATCTAGCAACGTTAATAATAGAAATTGTGAGGAATTAGTTTGTACTGTAAAAAATTGT
AAATACAACAAAGATGGTAGCTTATGTACACTTGATAATATATTGGTTGCTCCTGAAACTGATAGAGTAA
ACCTTTATATTGAAACATGTTGTTCTAGTTTCGAATGTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:3189331-3190185 hypothetical protein CDR20291_2699 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTACATTTTATATTCAATTTCTTTATTTTGTAATTTATAGCTTTATAGGATGGTGTTGTGAAACTA
CATATTGTTCAGTTTTACAAAAACAATTTGTAAATAGAGGTTTTTTAAATGGTCCATTTTGCCCTATATA
TGGATTTGGAGCATTAGCAATAGTTGCTACCTTGACTCCTTTTGTACACAATATTCCTTTGTTATTTTTG
TTTAGTATAATTATAACTAGCATAATGGAGTATTGTACGAGCTTTATTTTAGAAAAAATATTTAATATGA
CTTGGTGGGATTATTCTAAACATAAATTTAATATTCATGGAAGAGTTTGTCTGGAAAACTCACTTATGTT
TGGTGTATTATCATTGATTGTAATGCTTATAGTACATCCTATTGTGGTTGACTTTATTAACTCTATCTCT
AAAAATGTGCTATTTATATTTGCTATATCTATAGAAATTTATTTTGTTTTAGATTTAGTTATCACAGTCC
ATACAATTTTACAATTAAATGGTAAGTTAAAACAAATCAATCTTATAATTAAGGAATTAAAAGATAAGAA
AGAATACTACAAACTTATTACACAAGAAACTATAGAAAACAAACTTGAATCTTTAGTTGAAAATAGACTG
GATACTTTGGAAGATAGATTTGAAATACTTAAGGAAAAAGAAAACTATCGCTATGCTAAAAATCGTATTG
ATGAGCTAAAAAATAAACTTAATACTTTGCTGTCTAACCACAAATTACTTCATAGACGTATAATCAAAGC
ATTCCCCAACATAAGCTCTAATAAGCATACAGATATTTTAAATAAAATCAAAGAAAATATTAAATCAATT
AAAAAAGATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3191807-3190371 hypothetical protein CDR20291_2700 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAGAAGTAAAACCAATTAGCATAGATATACTTAATACTTTTAAACAAGTAGATGAGGACAGATTAA
ATGAACTTCTTGCAGATGAGCTTAAGCATTTAGATAGAAAAATTGTTGTATTAGATGATGACCCAACAGG
TGTACAAACAGTTCATGATATTTCTGTTTATACTGATTGGGATAAGGATAGTATGGAACAAGGTTTTAAT
GAGAAAAATAGTATGTTTTTTATACTTACTAATTCAAGGGGATTTACTGTTGCTCAAACTACAAAAGCAC
ATAAAGAAATTTCAAAGAATATTGTGGATGTATCAAAGAAAGTTAATAAGGATTTTATAATCATAAGTCG
TAGTGATTCTACTATGAGAGGACATTATCCTGTTGAAACTAATTTATTAAAAAGCGAAGTAGAGAGATTA
TCGGGGAAGTTATTTCAGGGTGAAATAATAATGCCATTTTTTAAAGAAGGTGGTAGGTTTACTATAGATA
ATGTACATTATGTTAAAGAAGGAGAAATACTTGTACCAGCAGGAATGACTGAATTTGCAAAGGATAAATC
TTTTGGATATAAATCATCTGATATAGGTGAGTGGTGTGAAGAAAAGACACATGGAAAGTACAAATCTAGT
GATATGATATATATTTCTTCTAAAGAACTTAGAGAGCTAAATATTGAAGCTATAACAGAAAAACTTAAAA
AAGCTGAAGGATTCAATAAAATTATTGTAAATGCAACCGATTATGTAGATGTAAAGGTATTTACAATTGC
GTTTATACGAGCAGTAAATAGTGGTAAGGAATTTATGTTTAGAAGCGCTGCTGCCATAACAAAAGTACTT
GGCGGAGTGAGTGATAAGGAAATGCTTACTAAGGATGAGTTAGTATCAAAAGGTAATACCAATGGAGGAA
TTATACTTGTTGGTTCACATGTGAATAAGACTACCCAACAGTTAGAAGAACTTAAAAATTGTAAATATCC
AATAGAATTTATAGAATTTAATCAACATTTAGTTCTTCAGGAAAATGGTCTAAAAAATGAGGTAAAAAGA
GTTATAAAAGTTGTAGAGGAAAAAATAAGCAGTGGTAAAACTGTTGCTGTTTATACTAGACGAGAGCGTT
TTGACTTGGATACGAATGATAAAGATAAACAGCTTATGATTTCTGTAGAAATATCAGATGCAGTTACCAG
TATAATTGGTATGCTTAATGTAAGACCAAATTTTATTATAGCTAAGGGTGGAATTACTTCTAGTGATGTT
GGTACTAAAGCACTAAGAGTAAAAAAAGCTACAGTAATGGGACAGATAAAACCTGGTATACCAGTATGGA
TGACAGGCAAAGAAAGCAAATTTCCTAATATGCCATATATAATTTTCCCTGGAAATGTGGGAGAGATTAG
CACACTTAGAGAATCAGTTGAGATATTGATGGGGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3193260-3191878 putative gluconate permease [Clostridium difficile R20291]
ATGATTACAGGATATGGACTTTTGATAGCATTTGTTATATCTATAGGAATTTTACTTGTATCGATTATTA
AATTTAAAGTAAATCCGTTTTTGGCATTACTGATAACATCTATAATTACAGGCTTTATGGTTAGAATGCC
TATAAATGAAATATCAACCACAATATCGACTGGATTTGGAAATACATTAGGTAGTATAGGTATTGTAATT
GGACTTGGAATAATATTTGGAAATATTCTTTCAGAATCAAGAGCAACAGAATCTATTGCAAAGGGGTTGT
TAGCTAAGACTGGAGAAAAAAACAGTGCTTTAGCAGTAACTACAGCAGGTTTTTTAATTTCAATTCCAGT
TTTTATGGATGCAGCTTTTGTTATAATGATGCCTATAATTAAGTATGTTTCGAGAGTAACTAAGAAATCT
CTAATGGTTTTTGTATGTGCCTTAGGAGTTGGGACTATAGTAGGTCATGCACTTGTAATACCTACACCAG
GACCTTTAGCAGTTGCAGCAAATGTAAATGCAAATGTAGGTAGTTTTATACTTTATTCTATAATTGTTGC
TTTTCCAGCAGTTCTTATAGGTGGATGGATTTATGGAAAACGTTTTGAAAAATATCCAGCTTATGCTATT
GATGAGAATGATAGAGAAAAAAATTTAGAAAAGGGAAAAGATAGCATAAAAATTGAAGATGATGATTCTT
CTAAAGTACCAGGTTTTGGAATTTCTATGTTTTCTTTATTGTTCCCAATACTTCTTATACTTATATCAAA
TGTATTTAGTATGTTCTTAGAAAAAGGTTCTACAATGAGTGGAGTACTTGCATTTATAGGAGATAAAAAC
ATAGCAATACTTCTTGGAATATTGGTGGCAATAGGATTTTTAAAGAGATACATAAATAAACCTATGGGAG
ATGTAGTTATTGAAGCTGCTGATTCAGCAGGGCTAATATTATTGATAACAGGTTCAGGTGGTGCGTTTGG
CAGTGTTATAAATGCAAGTGGTATAGGTAACTTCTTAGTTGATACTATGTCTGGTCTTAGTATATCAGTT
GTAGTGCTTGGATTCTTATTAAGTGCTTTGCTTAGAATTTCTCAAGGTTCTGCTACTGTAGCCTTAGTAA
CAACATCATCAATTTTAGGACCTACAATTTTGGCAACTGGAATGTCACCAGTTTTAGTAGGGCTTGCTAT
ATGTGCTGGAGGAGTTGGTTTCTCCCTTCCAAATGATTCTGGATTCTGGGTACTTTCAAGATTTAGTGGA
TTATCAGTTAAAGATACTTTAAACTCTTGGACAATTGGAGGAACCATTGCTGGAGTTGTAGCATTTATAA
TGGTTTTATTGCTTAGTGTTATAAATGGAATTATACCACTTCCAGGTCTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3194301-3193396 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGGTTATAAAATGAAATTGGGATTTATTGGATTAGGAATAATGGGAAAGCCAATGGCAAAAAATT
TATTAAAAGATGGATGTAATCTTTTGGTGTATGACATTAATAAATCTGCTGTGGATGAACTTATATCATG
TGGAGCAAAATACGCAAGTGTTTTAGAAATGGGTCAAGAATGTGATATTGTATTTACAATCCTTCCAAAT
GGAACTATTGTTCAGGATATATTATTTGGGATGGATGGATTGGCAAAAACTTTAAAAGAAGGAAGTATAG
TAGTCGATATGAGTTCAGTTACTCCTACAGAATCAATATTGTGTGCAAATAAATTAAAAGATATGGGCTT
AGAATTTATAGACTCACCAGTAAGTGGAGGGGAGCCAAAAGCGATTGATGGTACACTTGCTTTTATGGCT
GGTGGTAAGGAAGAAATTTATAAGAAAGTAGAGCCATTTTTTAATATAATGGGAAGCTCATCTATTTTAA
TTGGAGATAATGGTAGTGGAAGTGTTACAAAACTTACAAACCAAGTAATAGTTAATTTGACGATAGCAGC
AGTTTCTGAGGCATTTGTACTTGCAGCAAAAGCAGGTGCAGACCCAGAAAAAGTATATAAGGCAATAAGA
GGAGGCCTAGCTGGTAGTACAATATTGGATGCGAAGATACCAATGATTATGAATCGTGATTTTAAACCAG
GTGGAAAAATATCTATTAATTTGAAAGATATTAAGAATGTAATGCAAACAGCACACAATTTAGATGTACC
GCTACCTATGACAAGTCAATTATTAGAAATTATGCAGACATTAAAAGTACATGGACATTTGGAAGATGAC
CATAGTGGAATAGCACAGTATTTTGAAAAGTTGGCAGGTGTTGAAATAAAAAAACACAATAATTAA
>ref|NC_013316.1|:3194697-3195362 GntR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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TGATAGAAAATGAAATATATTCTGAAACAAAACTTGCTAGTGAAATAGGTATCTCTAGAACACCTATAAG
AGATGCTCTTCAAAGACTTAGTCAAGATGGATTTATAGATATAATCCCAAGCAAAGGATTTAGAATCCAT
CAAATTACAGCAAATGAAATTGTAGAGATATTCCAAATACGCTCTGCAATAGAAGGGTTTTGTACTTTTT
TAATTACAAGTCAATACAAAGAAGCTAGGGCAGTAGAAACTATAAGTAAATTAAAACATCTTTTAGATAA
ACAAAAAGATATTTTACTAGGTGATAAAAATTTAAACTCATTTGCAGAATACGATACATTATTTCACACA
ACTATAGTTTCATATGCTCAAAATACTGAATTTGACAAAATGTTTAACAACTATATGTACAGAATAAAAA
AATTAGCTCTCGATTCATTATCACATGAAGGAAGGCTTGAAACAACATTAAAAGAACACACAGATATTTT
TAATAATATTGCAAATGGATGTATTGAAGATGTTTACAAAACTACTCTCATTCATATGGAAACTCCTAAA
TACATTAATTTAGAAGATTTTTGTAACAATAAGTGA
>ref|NC_013316.1|:3195470-3196018 hypothetical protein CDR20291_2704 [Clostridium difficile R20291]
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GTATGGCATGCAAACATTTTGGTGACTTATATTTTTATTTTTCCAAAGTGTTATTTGAAGAGTTTGGTGA
AGATAAAACTATCGAAATACTAAGAAAAGTTTTATTTGAAAGGTCTGAAGAAAGAGCTATTGCTATGAGA
GAAAGAGCTCTTGAAAATGGAGATGAATTAATTGCAGACAATATTATTAGCACAACTGATGTTCCATTTC
TAGGATGGGTTCCTGAATTTAAAGAGTTACATTGCCCTTATGGAGCTTCCTGGCTTTTAAGATTTGAGGA
AAACCCTTGGTTTAAAAAATTCGCTTCTCTTTACTGTGATGTTACAGATACTACTGTAGCTGAAGTATTT
ACAGGAGATACGTCCCATAAAATAACAAAAAACATTCTATGGGGAGATAAAAGTTGTGAAAGAATATATT
TCCATGATGACAAGGTATCTGAAGGTAAATATACTTATGGAAATAAAAACTGTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:3196280-3196588 hypothetical protein CDR20291_2705 [Clostridium difficile R20291]
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ATACTAGAAAGAGTTTTGAAGAAGGTCATACACATTTAAAGCATTTTGAAGCAGCAAAGACAGCTATTGA
TTTAGCAATAAATAAAAAGATTCCTAGAAGCAAAGATGGATATTATCTGACTAGTTTAATTCGCATAAGT
GATGATGGTTATTACATTGATAAGTTAAGCGAATTGTTATATGTTAGAGAACAAAAAGGTAAAAAAGAAA
AGTACTGTAATTCTGGTTATCAGATGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3198540-3196750 ABC transporter, ATP-binding/permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGTCTAAAGGTTTTAAGAAAACAATTGGTAGACTTCTTCCATTTGTAAAGAAATATAAATTTT
CCTTTATTATAGCTATTATATGTATAATTTCAGCAGCTACTATGAATGCACTTGCACCTAAAACTGAAGG
ATTGATAATAACACAATTGACTAAAGATGTAATTAGTATCGCAAAAGGAGTACCAGGGGCTTCCGTAAAT
TTTGATTATGTAACAAAAATATTGGTGATTTTAGCATGTATATATTTTGCTAATGCAATTTTTACGTATA
CTTCAAGTTTTCTACTTACGAATGCTATTCAAAACACAATGAGAGATTTAAGAAATGAAGTCGAAAATAA
AATAAGAAGATTGCCTATTAGTTATTTTGATAGTAATAGTTTTGGAGATGTATTAAGTCGTATATCAAAT
GATGTAGATACAATATCAAATGCATTGCAACAGAGTTTTATGCAAATTGTAAACTCAATCTTAGTCATAA
TTTTGGCACTTTCAATGATGTTTACAATTAATATATATATGGCTCTTATAGCTCTTTTTATAATTCCAAT
TAGTTATTTTGTATCTAAATTTGTAGTAAAAAAATCTCAAAGTAGATTTTCATTGCAACAAAATGCTCTT
GGAAAATTAAATGGAAAAGTACAAGAAATGTATACTGGATTTAATGAAATAAAACTATATGGTAAAGAAG
AAGATTCTATAAAAGAATTTAAAAAAGTAAATCAAGAACTTTGTGAAAATGGATTTAAGGCACAATTTAT
ATCAAGTATGATGAATCCTATGGTTTCATTAGTAACTTACTTTGGAATTGCAGCTGTGGCAGTTGTCGGT
TCTATATATGCAGTAAGTGGAGGGATAACAGTAGGAAATTTACAAGCATTTGTGCGTTATATATGGCAGA
TAAATCAGCCACTTTCACAAATGACTCAGTTATCTACAGTAATACAATCTTCTTTTGCAGCTATAGAACG
TGTATTTGAAATTTTAGACGAAGAAGAGGAAATACCTGATGTTGAAAATCCAGTTAAGATAGAAAATGTA
AAAGGAAATGTTACATTTGAGCATGTTAATTTTGGATATGGAGAAAATTCAACTTTAATAGAAGATTTAA
ATGCAGAAGTAAAAAGTGGTCAGATGGTAGCTATTGTTGGACCTACTGGAGCAGGTAAAACAACATTAAT
AAACTTATTGATGAGGTTTTATGATGTAAAGAAAGGTGCTATTAAAATTGATGGAGTAGATATAAGAGAT
ATGAAACGTAAAGATTTGCGTTCAATGTTTGGTATGGTGCTTCAAGATACATGGTTATTTAATGGAACCA
TTTTTGAAAATATAGAATATGGTAGATTTGGAGCTACTAAAGAAGAAATTATACAAGCAGCAAAAGTAGC
AAATGTTCATCACTTTATAACCACTCTTCCAGATGGATACAATATGTTCTTAAATGAAGAAGCATCTAAT
ATATCTCTAGGGGAAAAACAGCTTTTAACCATAGCTAGAGCTTTTATATCAGACCCTTCAATATTGATAC
TTGATGAAGCTACTAGTTCTGTTGATACTAGGCTGGAACTTATGCTTCAAAAAGCAATGAGAAATCTTAT
GAATGGTAGAACTAGTTTTGTTATAGCACATAGACTTTCTACAATTCGCAATGCTGACTTGATTTTAGTT
ATGAATAATGGAAGTATTATAGAGCAGGGGAATCATGATGAATTAATGGAAAAGGGTGGATTTTATGAGA
AGCTTTATAATAGCCAATTTGCAGACAAAGAATCAGAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3200306-3198540 ABC transporter, ATP-binding/permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATTACACTATCTCAAAAATTAAGAAAGGAGAAAAATATGAAATTAATTTTAAGTTATTTAAAGAATT
ATAAGTTATTAATAGTATTAAACATACTGGCTATATTTAGTTTTGCATTAGTCGAGTTGGGGATTCCAAC
TATAATAGCTAAAATAATTGACAATGGTATTGCAAATCAGAATATAGCTTACATAAAACAAATGGGAATA
GTGATTGTTATTATTTCTATTATAGGGGTTGTAGGTAGTATATTGTTGGGTTATTGTTCTGCTAAGGTAT
CAACAAGTGTAACCAGAGATATAAGAAATGACATATTTGAGAAATCACAAGAATTTTCACATACTGAATA
CAATAAATTTGGAATTTCTTCAATGATTACAAGAACAACGAATGATGCATTTCAAATTCAACAATTTGTT
AATATACTACTAAGGACTGCCTTATTAACTCCAGTTATGTTCATCATAAGTATAATAATGACAATTAGAA
CAAGTGTGGAACTTTCTATAGTATTGGCTATATCAGTACCTTTTATAATTATTGGAGTAGCAATAATAGC
AAAAGTATCTCAGGCAATATCTTCAAAACAACAAAAAGGACTAGATAAATTAAACCTTATATCGAGAGAA
AATTTAACTGGAATAAGAGTAATTAGAGCTTTTGGAAATGATGATTATGAAACAGAGCGATTTGAAAAAA
CAAATACATATTATGCTAATGTTTCTAAGAAACTATTTAAGCTTATGTCAATTACTCAACCAGCATTCTT
TTTACTATTAAATATAGCTGTTTTGGCTGTATTTTGGATTTCAAGTGAGAAGATAAATATTGGAGAGCTT
CAAGTTGGACAGTTGGTTGCATTTTTGGAATATCTTTTCCATGCCATGTTTTCAATTATGCTTTTTTCAA
TGGTATTTATTATGTATCCAAGAGCAGAGGTATCTGCAAATAGAATAAAAGAACTTTTAAATGAAGAACC
ATTGATAAAAAATCCTGAAAATGGAATTAAGGATACTGAAAATAAGGGTATCATAGAATTTGATAATGTA
ACTTTTACCTATCCAGATGGAGAAGCTTCTGTACTTAAGGATATTTCATTTACTGCAAAAACAGGTGAAA
CAGTCGCTTTTATAGGAAGTACTGGTAGTGGGAAAAGTACTCTAATTAACTTGATACCTAGATTTTACGA
TGTAACAGAGGGTAGCATTAAGATAAATGGAGTAGATATAAGAGAATATGATTTAAAAGCTTTAAGAAAA
AAGATAGGATTCATACCTCAAAAATCACTGCTTTTTACTGGTAGCATAGCAAATAATATTAGATTTGGGA
AACATAAGGCAGGAGAGTCAGAATTAGAATATTCCGCAAGAGTTGCACAAGCATATGAGTTTATATCAAA
AAAACCTAGAAAGTTTGATGAATTGATTAGTGAAGGTGGAGCAAATGTATCAGGAGGTCAAAAACAAAGA
CTTTCTATTGCAAGGGCTATTATAAGAAGACCTGAAATATACATTTTTGATGATAGTTTTTCTGCACTTG
ACTTTAAAACGGATGCAATACTTCGTGCTAAATTGAAGAAGGAAACAAAAGATGCAATTGTATTGATTGT
TGCCCAGAGAATTAGTTCTATTATTGATGCTGATAAGATTATAGTACTCAATGAAGGACAAGTTGTCGGA
ATGGGAACTCATAAAGAATTATTAAAAAACTGTGAAATATACTATGAAATTGCAACATCTCAGTTAAAAA
AGGAGGAATTAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:3201365-3202477 putative amino acid racemase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATTTCAGAAGTCGCTACTCCAAATTTTTTGCTAGATTTAGACCAGTTAGAAAAGAATATAGATA
AAATTCAACAAATTTGTACAAATAATAATAAACAACTTTGGCCTATGCTTAAGACACATAAAAGTACTTA
CATAGCGAGACTTCAAAAAAATGCAGGTGCTAGTGGTTTTCTAGTTGGAACACTTGATGAAGGTGAAGCT
CTGATAAAAGCAGGTTTTGAAGATATTATGTTGGCTTATCCTTACATGGGAGAAGTAAATATAAATAGAA
TTGTGACTATGGCATCAAAAATAAATTTAATCTGTGCTACAGATAATATAGAATGTGCTAAGGCTTATAG
TGAAGCTTTTTCTAAATCAAAAATAGAGTGCAAGCTACTTATTATTGTAGATTGTGGCTTACACCGTTTT
GGGGTTGAACCAGAAAAAGTGGTTGAACTTGCTACTGAAATTTCTAAGCTAGAAAACATCAAGATTGTTG
GTATAAGTTCGCATCCAGGTCAAGTGTACGGTTGTAGTTCTCCAGAAGGTGTTCCAGATGTTTGTGTTCA
AGAAGATTCTTCTATGGAGAAAGCATACAAAGCTCTAACTGATAATGGATTTAATATAGAAATTGTCGCT
TCTGGTAGTACTCCAACAGTTGAAGCTGAAGCTGCTTCTAAAACTATAACTGCTGTAAGACCTGGAAACT
ATGTATACTATGATGCTATACAGATAGGTTTAGGTTGTGCTACTGAAGATATGTGTGCTCTTACTGTTGT
GTGTACTGTAATCTCAAAAAATAGCAGTGGATATTATTTAATTGATTGTGGAAGTAAGTGCCTTGGACTT
GATAAAGGTGCACATGGAAATAGTAGTATTGTTGGTTATGGTAGGGTATGTGGACATCCAGAACTTACTA
TTGATTCACTTTCAGAAGAAGTTGGAAAAATTAAAGTAAATGGTGAAACTGATATAAAAATTGGTGATAG
AATAAGAATTATACCTAATCATTCTTGTTCCACTGCAAACTTGACGAGTAATTTATTAGGTTTTAGAGGA
GATACAATAGAAAAAGTCATAGAAGTAGATATTCGTGAAAATTCAAAACAAATCATCCTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3203487-3202660 transposase [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTAGGAAGTATAGTATTTCTAGTATGTGTAAGTTGATAGGTGTGTCAAGAAGCGGTTACTATAAAT
GGCTAAGTTATTCTAAAAAATCTTCCGATAGGGGTATCAAAGATAGAATTATTAAGGATTATATAATTGA
AATACATAAAAAATATAGAGGAACTTACGGTAGAAAAAGAATTTGTACTTATTTAAATAAAATACTTGAT
AGCCCTATTAATCATAAGAAAGTATATAGGTTGATGAAAGAACTAGGAATTAAATCTATTATTAGAAAGA
AAGTATATAGACGTAAGTTTAAATCATATGAGGTATATGATAATATATTAAATCGTGAATTTAGAGCTAA
TCAACCATTAGAAAAAATTTGTATGGATATAACATACATACCTATCGGTAAAAAATTCTTATACATGAAT
GTAGCCAAAGATTTATTTAATGGTGAAATAGTGGCATATGAGATAAGTACAAAAATGGATACTAAATTAG
TTAATAAAACAGTAAATCAACTAATAAATATGAATTTAGCTAAAGATTGTATTTTACATACAGATCAAGG
TTCACAATATACAAGTAGATCTTACTCTAAAAGGCTTAAAGATAATGGTATTATACAATCTATGTCCCGA
AGGGGCAACTGCTGGGATAATGCTCCTATAGAAAGTTTTTTCAGTCATTTTAAATCTGAATTAATATATT
TAATTGATACTACAGATCCAAAGGAAATGATTAGTCTAATAAATGATTATATTTATTTTTATAATAATGA
AAGAATACAATTAAAAAATGGAATGAGTCCGATTGAATATCGAACTCATTCCGCATAA
>ref|NC_013316.1|:c3204657-3204148 hypothetical protein CDR20291_2710 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTCAACAAAATACTGGAAATGCAATTGTAAATAGTAAACCTAAGAAAACTGCTGTTGAGATATTTA
TGGGGGGAGCAAAAAAAGGTTTTTACATAGGTGTTGAACAGATATTACCAGCCATGATAATGGGTTATGT
AATAGTGCAGTTTTTACAATTAACTGGTTTAGTTGATATTTTAGGAAATATTTTTGGTCCAGTAATGGGT
ATTTTTGGACTACCTGGGGAATCTGTTGTAGTTTTGATAGCAGCATTCTTTGCTAAGGCAGCAGGAGCAG
CTACAGCTGCAAACTTATTTGCACAAGGTCTAATCACTGCACCACAAGCAACCATATTAATTATGCCATG
TATGTTAATGGGTACTCTAGTTGGTCATTATGCCAGAATAGTGCTTGTAGCAAATGCCAGTACTAAGTAT
AGAATGTTACTGTTGGCAGTTCCTATATTTGATGCAATAGTGGGGATGTTGATAGTAAGAGTTTTACTCA
CTGTTATGGGATTAATGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3205306-3204659 hypothetical protein CDR20291_2711 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATGTAACAGCTGGAGATAATAAGGTAACATGGAAAGGGTATTTATCTTTATTTGTATTGATAGTAT
TATTTTCAGGAGTATTTAAAGATAGTCAAGGCTTCCTTAAAGCATTAGATTTTGCTAATCTGACAGGTTC
ATTTGGTACTATTGCAGATGGTGTAGACTTTATGGGTAAAGGAGGAACGGGAGCAAAAGATGGTTTCTTA
TTTGCTCTGACTTTGATTCCAACTGTCTGTTTTGCTGTAGGTCTTATAGATGTAGTTGAATCTATGGGAG
GAATGAAAGCAGCATCAAAGATATTTAATCCATTACTTAGACCTCTGCTTGGTATACCTGGAATAGCAGG
AATAGCATTTGTATCTTCATTTACTAGTTCAGATGTAGCCTCAATAATGACGAAAGAATTATTTGAAAGT
GGGGAAATAACAGATGATGAAAGAACTATATTTGTAGCATATCAATATGCTGGTTCAGCTGTTATACTGA
ACACAATAAATACTCAAGCTCCACTTTTACCAATAGCATTATTGGCATTAGGTCCAATAATCCTTATAGA
GATATTCTGTAAAATACTTGGTGCTAATCTAGTTAGATTAATCATAGGTGTAAGAAATAAAAAGAATAAG
GCTAAGGAGGCTGTGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3206492-3205320 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATACATATTTAAATGAAATTTCTAAGTTTGTTGATGAGAATAGAGAAGAAATAGTTTCATTATGGA
AAGAGATTGTTAATATAGAAAGTTATACACATTGTAAAGAAAGTGTAAACAAGTTAGCTGAGAGATTAAA
GCTTGAATTTGAAAAAGAAGGTTTGGATTGTGAACTAGTAGATGTTGGGGAAAATGGTAATACATTGATA
GGTACACTTGGTTCTAATATAGATAAAAAGCCGATAATTTTTTCAGGACACATGGATACTGTCTTTGAAA
CAGGTACATTTGGAGAGAATCCATTTAAAATAATAGAAGGAAAAGCATATGGCCCAGGTGTTTTAGATAT
GAAGGGGGGTATAATAATCTCTTTATACGTTATTAAAGCTTTAAATAAAATAGGATACAAAGAAAGACCA
ATAAAAATAGTATTTTCTGGAGATGAAGAGATAGGTCATAAAGATTCAACTGGTGCAGATGTTATATTGA
GGGAAGCAAAAGGTGCTCTTTGTGCTTTTAATATGGAAACTGGATTAGTAGATAATAGTTTATGTATAGG
TAGAAAAGGAAGAATAGGATGTAATATACATGTAAAAGGTGTAGAAACACATGCAGGTAATGATTTTGAA
GGTGGAAGAAATGCTATAGAAGAAATGGCTAATAAGATACTACGCATACAAAAATTGACTAATTTAGATG
TTGGAACTACAGTAAGTGTAAGTGTGATTAAGGGTGGAAGAGTGGAAAATTCTATTCCAGAAGATTGTAG
TATAAAAGTAGACCTTAGATTTGAAAAAGTAGAAGAAATGGAGAATGTTAAAGAACAAGTTAGAGAGATA
TGTAAAGAAACTTACATAGAAGGAACTTCTACAGAAGTTAATTTTATAAGTGAAATGATGCCATTTGAAA
CTACAGAAGATGTTATGAGATTTCATACATTTGTAAATGAAGTGTCAAGAGAAAATGGATTTGGAGAATT
AAATGCTAAGAGACTTGGAGGTAGTTCAGATGCAAGTTATTTAACTATTGCAAACGTTCCTACAATCTGT
TCATTTGGTGTAAGAGGAGAATGGAACCACACATCAAGAGAATATGCAGTAGTAGATTCTATGTTTGAGA
GGGTGAAATTAATTTCTACAGTTATTTTAAACTTAGATAAATTTGAGGTATAA
>ref|NC_013316.1|:3206760-3208136 hypothetical protein CDR20291_2713 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATATAAAATTGGTTTTTTGACAACATCTTATTTTATGTCAGATAAGTTTAAACAAGCTCTTAAAG
AATTAAATGATACTTGTGAAATTACATTTATTGAGCTTAAAGGGGAGAATCCTTTTAATAATTTACCTAA
TATATACTATGAGCAAGTAGATAATTTTGATGGATTTGTATGCAGTGGTATAGTTCCATATAGTGAACTT
ATAATAAATATAAAAGACATAAAAGTTCCATTAAATTTTTTAAAGCTTGATGAAAGAGATTTTTATAAAT
ACTTATTCAAATTATTAAATAGCCAAAAAGATATTGACTTTACAAAATCATTTATGGATTTTTTAAGAGA
GGACAACAATTATTATGATATATATTCATTAATAGACTCTAATAAATGTCCATATACAATTAAAGATTTT
AATATCCCTCAACCTGTATATGACTTTAAAAAATTAAATGATAAATTATTGGAAATACATTTAGACTTAT
TGCGAGATAATAAGATTAACCTTTCTTTTACTAGAAATTACATCATTAGTTGTGAACTTAATAAGCTTGG
ATATGATTGTATTTACATGGTTCCATCTACAGAATCAATCCTGAATACATTTAAATCTCTGGTGAATGAA
ATAACATTACAAAACTTAGACAAAAATAAATCTGCAACTTGTATAGTTACAGTAAATAGTTCAGAGTACA
TAAATGAAGATTTGATATTTAAAAATGATGAGATACAAAATCAAATATATAACACTATATTAAATTCTCT
ATCAAGACATGGATTCTATGGAGTTCAGGTCAAAAAAAATGATATGAAAATAGAGATACACACTACTAAA
GAAATATTAAACAATATGACCAATAACTATACAGATTTTTTTATTTCAGAAGATTTAAAAGAAATTAAAT
ATAGCTTAAATATAGGTTGGGGCATTGGAAATACAAATATTCATGCAGAGCAAAATGCTCGTCAGGCTAA
TGGTAAATCTGCTTCTTTGAATGGAAACTGTACTTTTATAGTAAATGATACTAATGATACAATAGGCCCT
TTATATTCAAATAAAAATTCTAATAATATTGAAGATAGCTCAATAGCCAATAAAGTTGCTTCTTTTATAC
CTCTATCTAATACAAATGTATCTAAAATCATGTGTATGATTAATGATAGAAATTCAAATAATGTGTCAGC
AGAAATATTAGCAGACTATATGAACATAACTCTTAGAAGTGCTAATAGAATATTGAGTATCTTATATAAA
GCAGGAATTGCAACTATTGTAAATACAAAACTCGATAATCAAAGAGGAAGGCCAAAAAAAATATATAAAG
TTGATTTCTTATCTTTTCTAAATAAGATGCAGAAATTAAATTCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3209220-3208387 hypothetical protein CDR20291_2714 [Clostridium difficile R20291]
ATGACAATTAAAGAAGTTGAAGAAAAAACAGGATTGACACGCTCTAATATTCGTTTTTATGAGAACGAGA
ATTTAATTAAACCCCTTCGTAATGAGCGTAATGGCTATAGAGAATATTCAGATGAAAATGTAGAGGACAT
CAAAAAAATTGCATATTTACGTACACTAGGAATTACTATTGATGATATCCGTAATATTATATTACAGAAA
GTATCTTTAGTTGAAGTTGTAGAGAAACAGGAGAAAGTTCTCGAAACTAAAATATCAGACTTAGAAAATG
CAAAAACTATGTGTAATAAAATGTTAGAATCTGATGAGCTAAGTTATTTGAATTTGAAAGTAGAGCAATA
CATAACTGAGTTGCCAGAATACTGGAATAAAAACAAACCTGTTTTTAAACTTGACTCTGTAAGTTTCTTA
TATATATGGGGAGGGAAAATTACCTGGGGAATTATTACTATTGCTTGTTTGTTGATTGCAATAACAGTAT
TTCCAAAGTTGCCACCTCAAATTCCTATCCAATGGAATAATGGTGTAGCTAATTATGTAGATAAAAAATT
TATTTATGCCTACCCTGTCATTTGTGTTGTATTCAGAATCCTTTTACGTCCATTTATATGGAGATGGTTA
CAAATACATGCTTTTTATAGTGATACTATTGCAGATTATTTAACGAATTTTATGTGTTTTGTAGCGTTGT
CTATAGAAATATTCTCTATACTTTTTATTTACAATATTGCCAGACATGTTACAATAATTATTTTTATAGA
TATACTTGTATTTATTGTTTTACTGATAATAGGTGTGTATAAATTATTTAAAAAATACAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3211963-3209549 putative flavodoxin [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGTTTAGTTTTATATTCAAGTTTAACTGGAAATACTAAAAAGATTGCTTATGCTATATATGATG
AAATTCAAGAAGAAAAAGACATTAAAGATGTAAATGAATTAGTTGATGTTCAGTATGGTATTGACTATGA
AAATTATGATATAGTATTCTTAGGCTATTGGGTGGACAAGGGAATTTGTGATAAAAATTCAAAACAAGTG
CTTGAAAATATTCACAATAAAAAGATAGCACTATTTGGAACAATGGGAGCAAGTAAAAAAGGAAGTTATG
GAGCTAGTATAATAGAAAAGATAGAATCAATTATCCCAAAAGATAATGAAATATTAGGTTCATTCATATG
TCAAGGTAAGATAGCAGAAGGATTGAAAGCAAAATATAAAGAGATGTTAAAACTTTCTCCTGACAACGAA
CATATTCGCCAACAATTAAATAACCATGAGGAATCTCAAAGTCATCCAGATGAACAAGAAATATATGAAG
CCAGTATGTTTGCAAAAAATATGATGATTAAAGCTAGTATTGTGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3211198-3210080 transposase-like protein B [Clostridium difficile R20291]
GTGATAGAAGTGAAAAAAGCTTATAAGTTTAGAATGTATCCAAATAAAAAACAACAAGAGTTAATTAACA
AAACTTTTGGATGTTGTAGATTTGTATATAATAAGTATCTTGCTAAAAGAATAGAAGTTTATAAAAACGA
TAAAGAAACTTTTACTTATAAACAGTGTAGTTCTGATTTGACCAATTTAAAAAAAGAATTAAAATGGCTT
AAGGAACCTGACAAATTTTCACTACAAAACGCCTTAAAAGATTTAGATAATGCATATAAAAAATTCTTTA
AAGAAAAAGCAGGATTTCCTAAATTTAAATCAAAGAAAATTAATAGATTTTCATATAAAACTAACTTTAC
AAATGGAAATATCGTGTATTGTGGTCAACATATAAAATTACCTAAACTTGGTATGGTTAAAGTAAGGGAT
AAACAAGTACCTAAAGGGAGAATACTTAATGCTACTATATCTAAAGAACCAAGTGGTAGATATTATGTAT
CATTATGCTGTACTGATGTAGATATTGAAGCATTTGAAAATACTAACAATCAGATAGGTTTAGATTTAGG
AATTAAAGAATTTTGTATCTCAAGTTGTGGAGAATTTATAGAAAATCCTAAGTATCTTAAGAAGTCATTA
AACAAACTTGCTAAATTACAAAGAGAATTATCGAGAAAAACAATCGGTAGTTTAAATAGGAATAAAGCAA
GATTAAAAGTTGCAAGACTTCAAGAACATATAGCTAATCAAAGAAATGATTTTCTGCAAAAATTATCTAC
TAAATTAATAAAAGAGAACGATATTATTTGCATAGAAGATTTACAAGTAAAGAATATGATTAGAAATCGT
AAACTATCTCGCTTAATTTCAGATGTATCATGGTCAGAATTTATTCGTCAATTAGAATACAAGGCTAATT
GGTATGGTAGACAAATTGTAAAGGTAGGTAAATTCTTTGCAAGTTCACAAATATGCAATAAATGTGGGTA
TAAAAACGAGGAAGTTAAGGATTTAAATATAAGAGAATGGATTTGTCCTAGTTGTAATGAAACTCACGAT
AGAGATATAAATGCAAGTATAAATATATTAAAAGAAGGATTAAGACTAATAACAATTCAAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3213145-3212051 putative oxidoreductase (FAD-binding domain) [Clostridium difficile R20291]
ATGTATTGTAATTTATTAAAACCAATTAAAATTGGAAATTTGGAATTAAAAAATAGAGTATCTTTTGCAC
CTACAAGCATGGGTCTTAAATTGGAAGAAAAAATTAAAAAGTTTTCTGATATTGCTAAGTCAGGAGTAGC
TCTGATTACTCTAGGAGATGTATCTATTAGACCTAGTTTTCATAAGGTAGCTATAAGCCTATCGGATGAA
GATGGAGTCATTAAATACAAGAAAATTGTAGATGAAATACACAATTCTGGTGCAAAGGTATCAGCACAAC
TATTTTGTTCAGATTATGATGTTAATTTAATTAAAGATACTATGAAGATGGGAATTACTTCACATGATGA
GATAAAAAAAATAATGAATGACGGAGTAAAAGATTACATAACAAATATGCCCAAAGAAGAAATTAAAAAT
ATTATAAATTTATTTAAAGTAACAGCATTGAATGCAAAAAAAGCAGGTTTTGACATGATTCAAATTCATG
GTGATAGGCTTGTAGGAAGTTTTTCATCAAGTATATTTAATAATAGAAATGATGAATATGGTGGAACGTG
TGATAATAGAAGTAGATTTGCAAGCGAAATAATTAGTAGTATCCGAGATGAAGTTAAGGACATTCCAATA
GACTATAAATTTGCAATAAGACAAGAAAATCCTCATTATGGAAATGCAGGAGTTTTACTTTCGGAAGTTG
AGTATTTTGTTAAAAAATTTGAATCCCTAGGTGTAAACAGTTTTCATGTAACACTTGCAAATCATTCAAA
ATTAGAAGATACTATACCAACCAATAATCATCCTTACTTTAAAGATGAAGGCTGTTTTTTATATTTAGCT
GATGAAGTAAAGAAACACACAAATCTTCCAGTATGTGGGGTTGGAAAATTGTCTAGCCCAGATTTTATAG
AAAGTATTATTTCAAATAATAGAGTAGATATGGTTTCTATGTCAAGACAATTACTAGCAGATAGTAATTG
GTTACAGAAAGTAAAAGATGGAAGAGTAGATGAGATTAAAAAGTGCTGTTATTGTAATAAGAAGTGTGCA
GATGCTTTACAAACACGCTCTCAGTTTGGATGTATACTAGATTAG
>ref|NC_013316.1|:c3213593-3213147 putative MarR-family regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGATTTTAAAAATTTACAGTATGAAAGTTTGTCATATATTATTTGTAACTTGCAAAAAAACTTTAAAC
TTTATTGTGAAAAATGTTTAAAACCATATAAACTTACGAATGGTCTATATTTCTATTTAATTTATATTAA
TAAAAATAGGAATTGTTCTTTGAATGATGTTTCTACAGAATTTGAAGTTGATAAAGCTCATACAACAAGA
ACTATATCTAGGTTAGAACAAGATGGATACATAGAAAAAATCCAAAACCCTAATGATAGTAGAGCTTTTC
AGTTGAGAGTAACAGATAAGGGTGAGGAAGTATTAGGGGATATAAAAAACATATTTTCAAAGTGGGATAA
CCACATAAAAAAAGAGTTCTCAGATACAGAATATAAAGAACTGGTAAAGAATTTACATGTGGTAAAGGAT
ATAAAAACAGCTGTGGAGGAAGGATAG
>ref|NC_013316.1|:3213899-3215089 putative aromatic amino acid aminotransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGATATCTAATAAAATGCAAACTTTAGTTGCAAATAGTTCTGTTATAAGAGCTATGTTTGAAGAAGGAA
AGAAACTTTCTGATATTTATGGTGAGGAAAATGTTTTTGATTTTAGTATAGGAAATCCAAGTGTTGAACC
TCCAGAGACTATTAAAGCAGTTATAAATGATATTTTAAATGAAGAATCTCCAAATTTAGTTCATGGATAT
ATGAACAACTCAGGATATGAGGATGTAAGAGATGCTATTGCTGAACATATAAATAAAAAAGATGGATTAA
ATCTTACAAGAGAAAATTTAATTATGACTTGTGGTGCTGCTGGTGGTCTAAATATTATTTTAAAAACTCT
TTTAAATCCTGGTGATGAAGTTATTGCTTTTGCACCGTATTTTGGTGAGTATAAAAATTATACAGAAAAC
TATGATGGAAAATTAATAGAAGTTCCTACAAATATAGAGACTTTTGAACCAGATTTAGATGCTCTAAAAA
ATGCTATTACTCCAAAAACAAGAGCTTTAATAATAAACACTCCAAATAATCCTACTGGTGTCATATATTC
TGAAGAATTATTAAAAAATCTTGGAGAATTATTGGATTCAAAACAAAAAGAATTTAATACAAGCATATAT
CTAATTTCTGATGAGCCATATAGAGAAATAATTTATGATGGTGCCAAAGTTCCTTGTGTACTAAAATACT
ATAGAAATTCATTTATAGGGTACTCTTATAGTAAATCATTATCTCTACCTGGTGAACGTATAGGATATAT
TGTTGCTAATGGGCAAATGGATGATTTTGATGATGTTATGTCTTCATTAAATGTTGCAAATAGAATACTT
GGATTTGTAAATGCTCCTTCTCTTTTTCAAAGGGTTATTGCAAGAAGTTTAGATGCAGAAGTTGATGTAA
ATATTTATAAAAAGAATTTTGACCTTCTATATAATAGTTTAATCGATATGGGATATTCTTGTGTTAAACC
TAATGGTACATTCTATTTGTTCCCAAAAGCTCCAATTGAAGATGATAAAAAATTCTGCAATGATGCAAAA
CAATTTAATTTATTATTAGTACCAGGTTCTTCTTTTGGTTGTCCAGGTCATTTTAGAGTATCATATTGTG
TATCTTATGATAAAGTTAAAAGTTCTTTACCAGCATTTGAAAAATTAGCCAAATTATATAATTTAAAATA
A
>ref|NC_013316.1|:3215208-3216221 hypothetical protein CDR20291_2720 [Clostridium difficile R20291]
TTGAATATTCTTATCTATAGTACTAATATAAATTACAAGGAGGTGTTTGACTTGAAAAAAGGTTATGTTT
ATATAATACTGACTACCTTATTTTTTAGTTCAATGGAAATTAGTCTAAAAACTGTCACTAATGACTTTAA
TCCCTTACAAATAACTTTATCAAGATTTTTTGTTGGCGGTTTAGTCTTACTACCTTTTGCTGTAAAAAGA
TTAAGAGCTCTTAGTCTTTCTATTACAAAATCAGACTTAAAATACTTTGCATTTTTAGGTTTTATGTGTG
TAGTAGTAAGTATGTCATTGTATCAACTGGCTGTTCTAAACACAAAGGCATCTGTAGTTGCTGTTTTGTT
CAGTTGTAATCCAGTCTTTGTAATGCTTTTAGCTTACTTAATTTTGAAGGAAAAAATATATAGGCACAAT
GTAATTTCACTTATATTAGAAGTTCTTGGAATTATAGTTATAATAAATCCATTGCATACAAAACTAACTC
TTAGTGGAATATTCTTAACATTATCTTCTGCTATTATTTTTTCAATGTATACTGTATTTGGTAAAAGAAA
AACCTTAAAATTTGGTGGAATAGTTGTAACTTGCTTTAGCTTTATATTTGGTAGTTTGGAAATGTTGATA
TTGGTTTTACTCACTAAAATTAATTTTATCGCAGATATATTAAATAAAAATAAACTTCATATATTTGCAA
ATATCCCTATTTTTAGTGGATATACCTTACACAATATGCCCATTATGATTTATGTATTCGTATTTGTTAC
AGGTGTTGGTTATGCACTTTACTTTATGGCAATGGAAGCTACATCTACTAGTCTTACATCTTTAGTATTC
TTCTTTAAACCAGTACTATCTCCAATACTAGCATTATTAATACTTAAAGAAATTATCCCTATAAACATGG
TTATAGGAATTTTATTGATAGTAATTGGTTCAATAATTTCTATTATACCTACGATAATTACTCAAATGCA
TAATAAACACGTTGAAGCCTTGTATAAGGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3217001-3216339 hypothetical protein CDR20291_2721 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGACCAAGTAAAAAATTATTAATAGCTATAATATCAATATTCTTAATAAGTTCAGTTCCAGTAAGTG
CACATGCATATAGTACTACTATACAACAAAATAAAGACACACTTAGTCAAATAGTAGTTTTTCCAACTGG
AAATTACAATAAAAACGAAGCTAATGCTATGGTAAATAGATTAGCTAATATAGATGGAAAGTATTTAAAT
GTATTAAAGCAAGATAACTTAAAAATAAAATTATTAAGTGGAAAGTTAACAGATGAAAAAGAATATGCTT
ATTTAAAAGGTGTAGTTCCTAAGGGATGGGAAGGTACTGGAAAAACTTGGGATGATGTTCCAGGCTTAGG
TGGAAGTACAGTAGCTCTTAGAATAGGATTTAGTAACAAAGGTAAAGGGCATGATGCAATAAATTTAGAA
TTACATGAAACAGCACATGCAATAGACCATATAGTATTAAATGATATATCTAAATCAGCACAATTCAAAC
AAATATTTGCTAAAGAAGGTCGTTCTTTAGGTAATGTAAACTACTTAGGTGTATATCCAGAAGAATTTTT
TGCAGAAGCATTTGCATATTACTATTTAAATCAAGATACAAATAGTAAGTTAAAATCAGCTTGTCCACAA
ACTTATAGCTTTTTGCAAAACCTAGCTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3220326-3217372 putative collagen-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAAAGGAAATAAAAAGGCATTATTAATTAGTTTAATTATGATTTTAAGTATGGTGGTGTCTACAA
TATATCCAACTGTATCTTATGCTTCAGAATTAGGAGAGAATAGTCAGATTCAAAGTGGTTCAACTAATTC
ATCAACTGGAGAGGAGAAGGAAAGCGACAATAAAAAACCAGAACAGACTCCAGAGAAAGATAAGGCAACA
GATAATAAAAAACCAGAACAGACCCCAGAGGAAGATAATTCAACAGATAATAAAAAACCAGAACAGACTT
CAGAAGAAGATAAGTCAACAGATAATAAAAAGCCAGAGCAAACTCCAGAAGGAGAAAAGCCAATAGATAA
TAAAAAGCCAGAGCAAACTCCAGAAGGAGAAAAGTCAATAGATAATAAAAAGCCAGAGCAAATACCAGAA
GAAGATAAGTCAACAGATAATAAAAAGTCAGAACAAGCTTTAGAAGATGAAAAACCACTAGACAATAAAA
ATACAGAAAAAACTCCAGAGGAAGATAATCTATTAGAAGATGAAAATTTATTGAAAGTTTTAGAAGAAGA
ACTTAATGAAGACTATGGATTTGTTGTAAAAATTAATAACAATACAATAGAAACGGAATCAATGAAAAAA
ATATCATTTAATTTAACTTATACTCCAACATCAAAAGGAATACAAGCAGGAGATTCAATAACTTTTAAGG
TGCCAGATGTATTCAATAAAGTTAATTTAGATTATACAAGTGAATGCTTTGATAAAACAGAAAGTAATGG
AGAGTATACACTTACATTTAGAGAATTACCTAATGGCCAAAGTGTAATGCAAGGTAAAATAGGTTTGGAA
GCATATGTTAAAAAGGTTGATGAAGATACTAATGCAAAAATACATATTGAAACCACTGGAAAAATAGAAA
GTGGAAGTGGAGATATAGATGTAGAAATAAAACCTGGAGATAAAACGGATGTTCCAGATGCTAAAGGAAC
ACTTAAAAAGCTTGTTGAAGGAAGAAAATCAACTACTGTATTTATGCCAGTTAAAAATAAAGATATAAAT
TACAGTATACAAGTAAATGAAAAGCAGGAAGAGTTAAAAGATATTATTTTGTATGATGAGCTTCCTGAAG
GATTGACATTGATAAATGGTTCTGTAAGTGTAGTAACAAGTGATGGAAAAGAAGTTAGTGATTTTAATAT
TGAACAGAGTAAAAATTCTATTTCAGTTAATTTTGGAAATATAGATAAATCGTATACTGTTAAGTATAAG
GCTAGAATCAGTGACAAAAATGCAAAACATGGTAATAAATATAAGAATGTAGCTAGGATTGAATCTGATG
GTAAGAAGATACAAGAAGATGATGCTACTGTAAGTATATTTGATAGAGGAGATAATTATCTTCTTACTAA
AGGACATTCAGGAGCAACAAATATTACTCAAGTTGGTCAAGTAATAAACTATCAGATTTCAATAAATGAT
GATAAATCACCAATAAGTAATGTTGTTATAACAGATAATATACCAGAAGGTATGAGATTGACTACTTCAG
GAGAGGATGGGCATGATTTTAGAGTTGTAGAAGTTCCAATGAATGGGAGCTGGACTCCTTGGAGTAAAGA
AAAAATTGCCAATAATATTTCATATAAAGTAGAAGAAAAAAGAAATGAAAGTGGGCAAGTAGATAAAGTT
ATAACTGGATTTACAATTAATCTCAGTAAAGAAGAAGTAGAATCAAAGTTTTTTATAGCTTATACATTAA
AGGTAATTAGTATTGAAGATAGTTATATAAATAGAGCTGTCCTTGATGCAAATAATAGTGAAATTGATAA
AAATGATGAGATAAACTTTAAGAAAAATTCTGGATTAATAAGCGCAAAAAAAGAAGTTGATAAAAAGGTT
TTAAATAGTAGTGATAACCAGATTGTTAAATACAAAATCAATATGTCAACTTATGGGGTTTATGATGCAG
GACAAGTAAATCTTTTGGATGAAGTAAACCCATCTCTAAAAATATCTAATATAAAATATTCTGATAATCT
TGAACTTAAAAAAGAAGCTGGAGATGGAAAAAATACAATAAGATTAGTAAATAAATACGAATTTAAACAG
ATAAAAGAAGGGGAACCTGTGCAAAGCTGGGTTACATTTGATGCAGACTTCACAAATGTAAAAGTTGGGG
AGACTATACAAAATGTGGCTCAGATTAATGGTTCAAGTCCTCCGGGAGTAGAGACTACTAAGCAAGGTTA
TGCTTTTGAAGCTAAAAAAGTGGATGCTTTAGATAAAAATGTACTTTCAGGTGCTAAGTTCAATTTAGAA
GATGCATTTGGAAATATAGTAGTTAAGGATTTAGTTAGTGATGAAGATGGTGTAATTCAATCTAGTGTAA
AAAAACCAGGAATATATTATTTAGTAGAAGTGATGGCTCCAAGTGGATATGAAAAACTGAAGGATAAAAT
TAAGGTTGAAATTGGTAATAAAGATATTGGTAGAATAGTAGATATCGGAAATATAGAAAACATAAGACAA
GAAAATCCACCAGTAAATCCACCTGTACCGCCAAATACAGATGAACCAATAGTAAATCCACCAGTGCCAC
CAAGCACAGATAAACCAAGGAAACCATCAAATCCATCTGATACAGAGGATACTATAGTTATAAATCCACC
AGTACCACCGTCAGAAGATATAATAAATCCTCCAATACCAGAGATATTGAATCCACCAGTACCACCATCA
GAAGAGGTGATAGAAACTCCTGTTAAACAGATTGTTCCAATACCAGAAGTGGTAAAGCCATCAGTGTCAG
AAGAAAAAAATAATAAAGCTAAAGATGATACTTTGGTAAATCCACCAGTACCACCAAAAACAGGGGATAG
TACTACAATTATTGGAGAAATACTTTTAGTTATAGGAGCTATTGTAGGACTTGTCGTATTAAGAAGAAAT
AAAAATACAAATTAG
>ref|NC_013316.1|:c3221828-3220650 putative cation efflux protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTTCCAAAATCCTAGTCAAAACATTTATCAGAGATAGCGAAAACGTTCAAAATACAGATGTTAGAA
ATAAGTATGGTTATGTAGCTGGTGTAGTAGGTATATTGTCCAATTTACTTTTATTTGTGATAAAGGTATT
CATAGGAATGTTCACATCTAGTATAGCTATAATGGCTGATGCATTTAATAATCTTTCTGATATGGCATCT
TCAGCAATAACTATGATAGGTTTTAAATTAGCAAGTAAGCCAGCTGACAAAGAACATCCTTTTGGTCATG
GAAGAATAGAGTATTTATCAGCATTAATAGTAGCATTTATGGTGATGTTGGTTGGACTTCAATTTGTAAA
GTCATCTATAGAAAGGATAGTAAATCCAATTCCTGTAAAATTTGAAGTAATACCACTTATACTTTTAATT
GTATCTATAATGATTAAAATCTGGTTGAGTCGTTTTAATAAATTTGTGGGAAATAAAATTGATTCTTCAG
CCTTAAAAGCAGTTTCACTTGATGCTTTAGGAGATGTATTTACTTCAAGTTGTGTAGTTATATCATTTAT
TGTAGCTAGATTTACTAATTTTCCTATAGATGGATATGTTGGTATCGTAGTATCATTAGTGATACTTTAT
GCTGGTTTCTCTCTTGTAAAAGATACTATAAATCCTCTTTTAGGAGAAGCACCGGATGAAGAAATGGTAA
ATTCTATTATAGAGCTATTGTTATCTTATAAATATATAATAGGTACACATGATTTAATTATTCATAACTA
TGGAGTTGGTAGATGTATTGCATCTATACATGCAGAAATTCCATCCAACATAGATATAATGGAAATACAT
GAAATTATAGATACTGCAGAGAGAGAAATATCTGAAAAATTAGATATATATCTAGTAATTCACATGGACC
CAATATGTCTTGAAGATAAAGAAGTTATGTCAGCCAAAAAAGAACTTGAAGAAATACTTAAGAAAAATAG
TCTTGTAAAATCTATGCATGATTTTAGAATAGTTGGAAAAGGAAGCAAGAAGAATTTAATATTTGATATA
GTAGTTAATCCTTCCGAATTTTCCAAAGACATGTCAGAGGATGACTTAAAAGAAGATATAACAAAATTAG
TTAAGGAGATAAATCCTGAATATAATTGTGTAATTGTTGTAGATAAGGATTTTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3225224-3222450 putative transport-related ATPase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGTATTATAATAAACCTACCAAAGAAGTATTAAAATACTTAAAAACAAATCCAGAAATTGGACTTG
ATGATAATGAAGTAGAAGAAAGGAAGCTTAGATATGGATTAAATGAATTTACTATAAAAGAAGGTAGAAC
ATTTTGGGACGAGTTGGGAGAAAGTTTGACAGAACCTATGATATTAATTCTCATAGGAGCAGCAGTAATA
AGTTCTTTTGTGGGAGAATTACATGATGCATTAGGTATTTTAGGGGCTATTTTTATTGGAATTTCTATAG
GCATAATAACTGAAGGAAAATCTAAAAAAGCAGCTCAGGCCCTGTCAAAATTAACAGAAAATATAGAAGT
AAAAGTACTTAGAAATGGAAAGATAATTAAAATATCAAAAAATGATTTAGTACCAGGAGATATTGTATAT
ATAGAAACTGGAGATATGATACCAGCAGATGGAAGACTTATACAGTCTATAAATTTGAAACTTAGAGAAG
ATATGCTAACAGGAGAATCTGATGATGTAGCTAAGAATGCTGATGCTGTATTAGATATGGAAGTAGTTTA
TTCTAAAACAGAAATAATCGAACAGGATGCAATACCTGCAAAGCAAGTCAATATGGTATTTGGAGGGACT
CTTGTAGCATATGGTAGGGGCATAATGGTTGTCACTCATACTGGTGATAAGACAGAGATGGGTAAGATAG
CACAGAATTTATCAAATGAAGACCAGCAAACTCCACTTCAAATTAAATTAGGGAAGTTGGGTGCTAAAAT
AGCAGGAATATCAGGCGTAATAGCTACTTTATTGTGTATGTTTATGATTATACAGATGCAGAGAAAAGGT
ATGTTAATTTTAGATACAAGCAGTATATTATCTTTCTTACAATCATTAGAACCTGCTAAAAATGCATATA
TGGTTTGTATTGCATTAATAGTTGCAACTGTTCCAGAAGGTTTGCCAACTATGATAAATATTACCTTAGC
TATAACAATGCAAAAGATGGCAAAGATAAATGCATTAGTAACAAAGAAAGAAGCCTGTGAAACTATAGGT
TCTGTTTCTGTAATATGTTCCGACAAAACAGGGACTTTAACACAAAACAAAATGATGGTAGAGGTAGCAT
ATGTTGATGGTAAATATATAAGTGGAGGAGAGTATCAAAGTAACAGCTATTTTGAACAAAACTGTATAGT
AAATTCAACTGCAGATATAGAAAAAGAAGATAATTCATTTAAATATATAGGAAGTGCAACAGAGTGTGCA
TTACTTTTATATCATAATGATAAGAACTATAATGAAATGAGAAAACAAACGTATTTGATATCACAAATAC
CATTTAGTTCAGAAGAAAAGAAGATGTCAACATTAATTCGTCAAGAGGATTCAGATATATTACTTTCAAA
AGGTGCTCCAGAAGTATTATTAAAAAAATGTTCTTATGTACAACAAGGAAAAAATATTGTTCCAATAACT
CCAAAAGTAGAAAAAAGTATTTTAGATGAGATTAAGAAGTTACAAATTAAATCTATGAGAACATTAGGAT
TTGCTTATAAAAAAATGAGTAATTCTAAAACAGAAGTTGCAATGACTTCAGAAGGTGAATTGAATTTAAT
AGGAAATTCAAGAAGTTATATGAAGGAAGATAATTTAGTTTTTAGTGGATTTGTAGGAATAGTGGACCCA
TTGAGAGAAGGGGTCAAAGATTCCATTGATAAAGCATTTAATGCAGGAGTAGATGTAAAAATGCTTACAG
GAGATAATATAAATACAGCAACGGCTATTGGAAATGAATTAGGATTATTAAATGATGGGAAAAAGGCAGT
TGAAGCAACATATATAGATGTATTGACAGATAAAGAACTGAGAGAAGAAATTAAAGGAATATCTATTGTT
GCAAGAAGTAAACCAGATACAAAAATGAGAATAGTTTCAGCGCTTCAAAAAAGTGGCGAAGTTGTAGCTG
TAACAGGTGATGGTATAAATGATGCCCCAGCTCTTAGTCAAGCAGATGTTGGAATTGCAATGGGTATTTC
AGGAACAGAAGTATCTAAAAATGCAGCAGATATAATATTGACTGATGATAGCTTTAGTACTATAGTAGAG
GGAATAAAATGGGGAAGAGGTATATATGAGAACTTTCAAAGATTTATACAGTTTCAGCTTACTGTAAATA
TAGTAGCATTTATAATTGCTATAATATCTCAACTTACTGGTAAGGATATGCCATTTACTACAATACAATT
ATTATGGGTAAATATAATAATGGATGGTCCTCCAGCCCTAGCATTAGGATTAGAACCTGTTAGAGATTAT
GTATTGAAAAGAAAACCAATAAATAGACATTCTGGAATAATAGCTAGGTCTATGTTTGTAAATATTATTA
TAAATGCTATTCTTATAATTACAATTGTATTTACTCAATCAGCTTTTAATATATTGGGAGCTACATCAGA
AGAACAAGGTACTGTTATATTTTCTTTATTTGCGTTCAGTGCCCTTTTTAATGCATTAAATTGTAGAGAA
TTTGGTTTAAATAGTACAATACCAAATTTCTTTAAAAATAAACTGGCATTGCAAATAATAGTAGTTACAG
GGATAATTCAAATAATATTTACACAAGTGTTCCAGAGTTTCTTTAATTCTGTTTCTTTGGACTTTGATAT
GTGGATAAAAATAATACTATTTGCATCCACTATATTATTGTCAAATGAATTTGTAAAGCTAATACTTAGA
ACAATGAAAAATAGTAGAAGTATGAACTCTAATAGTAAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3226652-3225396 serine hydroxymethyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAAAACAACAAAAATTTCAGACCCAGAGTTATACAAGATTGTAGCTGATGAGTTGGTTAGACAAG
AACACAATATTGAGATGATAGCTTCTGAAAGTACAGCACCAACAGAAGTACTTGAATTAAGTGGATGTGT
ATTTACAAATAAAACAGAAGAAGGCTATCCAGGGGCTCGTTTTCAAGCAGGTTCTGAAGAAGCAGATAAA
CTTGAAACCCTAGCAATAAAACGTGCAAAAGAAGTATTTGGAGCAGAACATGTAAACGTACAACCGTATT
CAGGTTCTACAGCTAACTATTGTGTATATTCATCAATATTAAAACCAAATGACACTGTTTTAAGTATGCG
TCTTGACCAAGGTGGACACTTGACACATGGTAGCGCAGTTAATTTTTTACATGACATTTATAAATATGAA
TTTTATGGGGTAGACCCAAATACTGGACGTATAGATTATGATGCTCTTGAAGCAAAGGCAAAAGAATGTA
GACCAAAACTTATAATTGCAGGGGCAAGTTCATATCCAAGATTAATAGATTATGAAAGAATATCAAAGGT
TGCAAAAGAAGTAGGAGCTTACTTTATGGTAGATATGGCACATGTTGCAGGATTAGTCGCAGCGAAAGTA
ATACCTAGTCCTGTACCTTATGCAGATTTTGTTTCTTCATCTACGACAAAGACTTTCTGTGGACCAAGAA
GTGGTATTGTACTTTGTAAAGCAGAACATGCAAAGAAACTCGATAAAGGTGTTTTTCCAGGAACATTAGG
GTCTATACATCTTAATACAGTTGCAGCAAAAGCCTTTTCACTATTATATTTAAGTACAGATAAATTTAAA
AAGATAATGGAGCAAGTTGTAGTAAATGCTCAGACTCTAGCTTCTGAACTGATTTCACATGGTTTTAGTA
TTGTAAGTGGAGGTACTGATAATCATATAGTAATGGTTGACTTAAGAAGTAAGAATCTTACAGGAAAACA
ATTTGAAAAAGCTCTTGAATATGTAGGAATAACAGTTAATAAAAATGTTATACCTGACGACCCACAATCA
CCATTTGTAACTAGTGGTGTTCGTATAGGTCTTACATCAATATCTCAAAGAGGTCTGAAAGAAAAAGAAG
TTATACAGATAGCAGGAATAATGAATAAGGTAGCAGAAAATATTGATAATAAAGAAGTATTAGATGAATG
TAAAGCAGAGGCACAAGAACTTATATCTAAGTTCCCATTATATCCAGAAGGGTATTTTGAAGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3228226-3226724 putative aminobenzoyl-glutamate transport protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGGCACTAAATGTTGTAGAGAGAGCAGGAAATAAACTTCCAGACCCAGTAACCATATTTTTATTAC
TATGTATAATTGTTGTAATATTGTCAGCAGTTATATCTAATTTAGGAGTAGAAGAAATACATCCTTCTAC
AAAAGAAGTTGTAAAGGTAGTAAATCTACTAGAGAAAGAGCAGATTCAATCATATTTAGGTAGCATAGTT
ACAAACTTCCAGTCATTTGCTCCTTTAGGATTAGTACTGGTTACAATGCTTGGAGCAGGTGTTGCTGAGA
AATCTGGATTTATGGAAGTGTTAATGAAAAAGGGTATAAGTAAAGTTCCACAAAAACTTGTAACTGTAGC
AATCGTATTTGCAGGTATGTTATCACATACAGCAGCAGATGTAGGATTTATAATATTACCACCACTTGCA
GCACTTGTGTTTTTAGGAATTGGAAGACATCCTCTTGTAGGTATGTTTGCAGCTTTTGCAGGTGTTGCAG
GGGGATTTGCAGCAAATGTTATGCTTAGTACTACAGATGTATTGTTAGCTGGATTTACAATACCAGCAGC
TCAAATGATGGACCCATCTTACCAAGGCAATCCAGCAATGAATCTTTATTTTGCTTTTATATCAGCGATA
GTTTTAACTTTTGCAGGAGCATTTGTAACTGAAAAATTTATAGCTCCTCGTTTTACAAAATATAATGATT
CAACAAATGATAAGGATATACAGGAATTGAGTGAACTTGAAAATAAGGGTATAAAATACGCTTTATTATC
ATTGTTAGTTGTAGTAGTAGTGATAGTTGCCTTATGTATAGGTGACAATGCATTTATGAAAGATCCAGAG
ACTGGTTCTATACTATCTAGTAATGCACCTTTAATGAAAGGTATAGTTCCTATAATCACTATTATATTTT
TAACTCCAGGATTAGTGTATGGAAAAGTAAGTAAGAAGATAAAAAGTGACAAAGATTTAGTATCTATGAT
GGGTAGTAGTATGAGTGATATGGGTGGATATATAGTCCTAGCATTTATAGCATCCCAGTTTATTAATTTA
TTTAATCTTAGTAACTTAGGAACAATTTTATCAATAACAGGAGCAAAATTACTAGCAGAGTCGGGGATAC
CTAGCTATGGATTGATAATAGGATTTATATTGCTATCTGGATTTATCAATTTATTTGTAGGAAGTGCTTC
TGCAAAATGGGCGATTTTAGCACCTATATTTGTTCCCATGTTTATGCTACTAGACTTTAATCCAGCATTA
ACTCAAATAGCTTATCGTATTGGAGATGCTTCAACAAATCCAATAAGTCCACTTTTTCCGTATTTTCCAG
TTATATTGGCCTTTGCCAGAAGATATGATAAAGATATAGGTATAGGTACTGTCATATCGAATATGATTCC
ATACTCAGTGGTATTTACATTAATAGAAATAATAATATTGTTACTATTCATGGGTATTGGCATACCATTA
GGACCTGGTGGAGGAATATCTTACGTTTTATAG
>ref|NC_013316.1|:c3229507-3228317 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGCATGAACTTATTTTAATCTCAGAAAAGTATAAAGAAGATATTTTAGATTTTTTTACAGATATTCATA
TGCACCCCGAATTAAGTTTTAAAGAATTTAGGACTACAAAAGCTATAAAAGATTTATTAGTAAGTTTAGA
CATAGAAATATTAGATTTAGGAATGGAAACAGGAGTTGTTGGATTATTAAAAGGGAAGTATGATGGTCCC
ACAGTAGCACTGAGAGGAGATATTGATGCATTGCCAATATATGAAGAGGTTGATATTGAGTATAAATCCA
GATATGATGGTATAATGCATGCATGTGGGCATGATATACACACATCTTGCCTTGTAGGATGTGCATATGT
ATTGTCTCATATTAGAGATAGTCTTCATGGAAATGTAAAGTTTATATTTCAACCAGCCGAAGAAGTCAAT
AAAGGTGCGAAGATGCTAGTGGAACGAGGAGTAATGGAAAATCCAAAAGTTGATGCTATATTTGGACTTC
ATAATCATCCAGATATACCTTGTGGAAAAATAGGTGTTAAGTTAGGTGGGTTAATGGCAGCAGTAGACAC
TATTAAGATAGAAGTAAATGGATTTGGAGGTCACGGAGGTATACCAAACAGAACAATAGACCCTATAGTA
GCATCAAGTGCAATTATAATGGGTATTCAAACCATAGTAAGCAGAAACATAAGTCCATTAGAATCAGCTG
TTATATCAATAGGTACTATAAATGGAGGGACTGCAAATAATGTAATTTCAGAAAAGGTAGATATGACAGG
TACATGTAGAAGCTTTAGTAATGAAGTACGAAAGAAAATATCAGAAAATTTAGAAAATATAGTTTGTGAG
ATAGCTCGTGGATATCAAGCAACTGCAAAGCTAGATTATTTATTTGATTTACCAGCTGTTATAAATAGTA
AAGAGATGTACACAATAGCTTGTAAGTCTGTGTGTGATTTGTATTCAGAAGATGCTATAGTTGATCCAAT
ACCTTCTACAGGAGGAGAAGATTTTTCTATATTTATGGAAAAGGCCCCAGGATTTTTTTACTGGTTAGGG
GTAGGCAATAAAGAACAAGATTGTATATATCAGTGGCATAATCCTAAATTTAAAGCTGATAAAAATTCTA
TATTGGTAGGTACAAATGTACTATGTCAGTCTGTTATAAATTATATGGATAAATTAAAAAATAAAATTTA
A
>ref|NC_013316.1|:c3230834-3229746 hypothetical protein CDR20291_2728 [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAGACAAAGTGAATATGAAAAATATTATCTGTATTGCAGGCGCTTATCTAGCAACAGCAATTGGTT
CTGGGTTTGCTACTGGTCAAGAAATTCTACAATTTTTTGCCTCACAAGGGTATATGGGTTTAATTGGAGC
ATTAATATCAATGGTATTGTTTTCATTTCTTGGTGCTGAAGTTATAACTAGAGGTAGAGAATTAAAACTT
AAAGAACCAACAAGAATTTACACTTTTTATTGTGGGAAGATTTTAGGAAAATTTTACGAATGGTTTAGTC
CAATATTTTTATTTGGGATTCTTATAGTAATGATTTCAGGTGCAGGCTCAACTTTAACTGAATACTATGG
TATAAATCCTTACTTAGGAAGAGTATTGATGGCTGTTGCTACTTTAATTACAGTGTCTATGGGTTTAGAA
AAATTAGTAAGCATACTTGGACGTATTGGACCAGTGATAGCAGTATTTACAATTGCTGTTGGATTAATAA
GCTTGTTTAAGCATTTTGATGGTTTATCTATGGTTGGAGAAGCTATGAAAAATATTGAAGTTACAAAAGC
ATCAGAAAGTCCAATCGTTTCTGGTGTAATATATAATACATTAAATATTATTGTAATGATTGTTTTTTTA
ACAGGAATGGGAGCTTCTATTGAAAGTAAAAAGGATGCTTTTTGGGGAGGTTTATTAGGTGGAATAGTGT
TTATGACTGCTGGTATAGTTATGTATTTGGCTATGATTTCAGATATAGGAAATTTGTATATGAAAGAAAT
ACCATCACTTTATTTAGCAGATAATATATCTCCTATTGTAGGTGTATGTTTTTCAGTTGCATTAATATTA
GGTATCTATACAACAGCTGTTCCACTTTTATGGTCTGTAACCAATAGAATTGTTGAAGATGAACATCCTA
AATTTAAATTGGTAACAACAGTAATAGCTATTTTGGCTTGTATAGGTGGTTTTTTACCGTTTGGTAAATT
AGTAAACATTTTATATCCATATACAGGTTATATGGGGCTTTTAATTTTAGTCTGTATGGTGTATAAAGCA
ATTACATGTAGAAAAAAATCAACACAAAGTCAGGAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3231817-3231119 putative two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAGAGCACTAATAATAGATGATGAAGAAGCTGTTCTAAAAATAATAACACATTTTATAGAAATGA
AAGATATGCCAATAAAAATTGTTGGTAAAGCAACATCTGGTGATGAAGCAGTAGATAAAATCATTGGTTT
AGAGCCAGACATAGTTTTTATAGATATTCAAATGCCAATATACAATGGGTTAGAAGTAATAGAAAAAACA
TCTCATTTATCTAAAAAAATAAACTTTGTAGTAATAACTGCATTTAACTATTTTGAATATGCTCAAAAAG
CTTTGAGATTAAATGTAAAAGATATACTCCTTAAACCATTGGATATGAAAGAATTTACTAAGTCTGTAGA
AAAAATTATTGGATATCAATATACCAATAATGATTTATTAAATGAGATACTGGAATATATAAATCTAAAC
TATAGCAATGACTTAAAGTTAAATGATTGTGCTAGATTATTTTTAACCAATCCATCTAATATATCTAGGA
TTTTTAAAAGTAATTTAAATACAACTTTTATATCATATCTAAATCATATAAGAATAGAAAAATCTATTGA
ATTACTTGAAAATACTACAAAAAGTATAAATGAGATTGCAGAAATAGTTGGATATAATAGCCTAAATAAC
TTTTATAAAAACTTTAAGATAGAAAAAGGAATGACTCCAAAAGTTTATAAACTGAACACTAAAAATTGA
>ref|NC_013316.1|:c3233436-3231931 putative two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
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AAGCTATGAATATATACATTGCAGTAACTATGCCTGGTAAGAAACATTTTAATCATGTTCATTATGGTCA
AGAGCAGATGATATATATTTTAGAGGGAGAGGGTTTGTATATTATAAATGGAGTTTGGAAGCCATTTTAT
CAAGGTATGATTTTTTATATAGAATCTGGTAGCACACATGAAACTATAAATACAGGCGATAGAGAAATAA
AAGAACTTATTGTTTCAAATAATGTAGATGATGTAGGAGAGAGTGAAGTTATAGATATTAATCCTAATAA
TTATTTAAAGAAGACCTTGATAAATTATAGTGAAAGTACATTAAATTTGTATGCAGCAGTAGAATCAATT
CGTGGTCAATTTATAGACCCGTTTAAAATTCCATTAATTATATATGATGATTCATGGAATATAGTTTTAA
AAAACCCTTATTTTCCACTTTTTTGTTTTGAAAAATGTAATCCTATGAAATTTCCTCAAAATTGTGATTG
TATGAATCAAAAAAGTAGCAATCAATTTGTATGTGAATATGGGATAACTATATATAATATACCAATACTG
TACAAAAGCAATAGCATAGGTGTTATAAGAGGAGGGTATGTACTATTATCTGATTTAAATTTAGATACAG
AGCATAATAATTTATATGATATTCCAGAGGGAGCTGCTAGAAGTATAAAACGCCTCTTGAAACAAATATC
TAAAAATATAATAAATTTTTGCTCTTTTAATGATATAAGAAAGGATTTACAAGAAAAAGAGAAGACTATA
GCAAGAACATATCATTATGGAGAGCAACTTGAAATGAATTTAAAAGTAGCTCAAGATATGGTTACTAATT
TAAGAATAAATCATCACTTTTTATTTAATACATTAAATTCAATGGCAAGCATAGCACTAGATGATGGTAG
TTATGATTTGTATAGTGCAATAATAGATTTATCAAGAATGTTTAGATATACAATGAGGTCTGATTTAAGA
TTTGTAGAATTAGAATCTGAAATATTATACATTAAAAATTATTTGAATTTACAGAAATTACGTTATGGAG
ATGCACTTAAAGTAAAATATCTTATTCCAGAGAAGTTATATAACCTTTCTGTGCCTTTTAACTTTATTCA
ACCTATCGTAGAGAATGCATTTACACATGGATTTAGAGATATTGACACAGAAAAGCGAATTGAAATAATT
GCAAGATTAGATTCTCAGTATGCTATTATAGAGATTCATAATAATGGAACTATCTTAGATGGAAATAATA
TAGACAAAATAAAGGCAGGTATTCGTAGTAATAATGGTCATGGTTTGTCTTTAATATATACAAAATTCAC
ATCTGCTTATGGAAATAATTTTGATATGGATATAAAGTCGAGTGATAATGAAGGAACTTACATAATGATT
AAAATTCCTATTGAAAATTATAAGGAGTATGTATAG
>ref|NC_013316.1|:c3235075-3233804 seryl-tRNA synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGCTTGATATAAAAAGAATAAGAGAAAATTTAGATTGTATAAAAAAAGCAATGGAAAGAAGGGGCGAAA
AAGACTTTAACCTTGATGAAGTAGTTAAGTTAGATGATGAAAGAAGAAAGATTCTTCAAGAAGTTGAAGT
TATGAAACATAAATTAAATACAGCATCTAAAAATATACCAAATCTTATAAAAGAAGGTAAAGATGTAGAA
AATGAAAAGATTAAACTAAAAGAGTTATCTGATAAAATTAAGGTAATAGACCAAAATCTTAAAGAAGTAG
AAGATAAGATGGAATACCTATTAATGAGAATACCAAATGTACCACATCCAGAAGTACCACAAGGTGAAAC
TGATGAAGATAATGTTGAGGTAAGAACTTGGGGAAAGACTACTACCTTTGATTTTGAATCTAAGGCTCAT
TGGGAAATTGGAACAGAATTAGGTATACTTGATTTTGAAACAGCGAGTAAAATAACTGGTTCAAGATTCA
CTCTTTACAAAGGATTGGGTGCTAGATTAGAGAGAGCATTATTAAATTTTTACTTAGACACGAATACAAA
AGTAAATGGATATACAGAAGTCATTCCACCATTTATGGCAAATAGAAATAGTTTTTTAGGTACAGGACAG
TTACCTAAGTTTGAAGAAGATATGTTTAAAATAGAAGGTCTGGACTATTTTATGATTCCAACATCAGAAG
TTCCTTTAACTAATATACATGCTAATGAAATACTTAAATTTGAACAATTACCAATAAATTATACAGCTTA
TACTCCATGTTTTAGGTCAGAAGCTGGTTCTGCTGGAAGAGATACAAGAGGTTTAGTAAGACAGCATCAG
TTTAACAAAGTAGAAATGGTTAAAATAGTTGCACCAGAAGAATCTTACAATGAGTTAGAAAAGCTTACTA
ACAATGCGGAAACTATGCTACAATTATTGAATCTGCCTTATAGAGTAGTAAAGATATGTACAGGTGATTT
AGGATTTACGGCTTCTTTTAAATATGATGTAGAAGTTTGGATGCCAAGTTACAATAGGTATGTTGAGATT
TCATCTTGTTCAAACTGCGAAGATTTCCAAGCTAGAAGAGCAGGAATAAGATTTAAAAGAGATAAAGATT
CTAAAGCTGAATATGTACACACATTAAATGGCTCTGGGTTAGCTATTGGAAGAAGTGTTGCAGCTATATT
AGAAAATTATCAACAAGAAGATGGTTCTGTGGTTGTTCCTGAAGTTTTAAGACCATATATGGGAGTTTCT
GTTATTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3237496-3235892 putative amidohydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAAAAAATTTATTACAATGGAAATATCATCACAATGGAAGATTCAATATGTGGAGATGCTATTC
TTATAAAAGATAAAATAATAAAAAAGATAGGAACAAAAGAAGAAGTATTTGCTTTGAAAAATAAAGATAC
AGAAATTATAGATTTACAAGGTAAGACATTGATGCCATCTTTTATAGATTCACATAGTCACTTGATAGCT
TTTGCTACTACTCTAAAGCTAGTTCCTTTAGAAGATGCAACCAGTTTTAAAGACATAGTAAAAAAAATAC
AGGATTTCAAAGAGTCGAATAATATAAAAAAAGGAGACTGGATAATTGGATTTTCATATGATAATAATTT
TTTAGAAGAAAATAAGCATCCAGATAAGAGTGTACTCGATAGTGCATCTTCAGAAAATCCAATACTAATT
TCACATGCTTCTGGTCATATGGGAGCTGCAAATACATTGGGGTTAAAACAGCTTGGTGTTACCAATGAAA
CACGTGACCCAGAAGGTGGACATATAGGTAGAGTAGAAGGCAGTGAAGAACCAAATGGATATTTAGAAGA
AAATGCATTTTTTAATGTAGCATCTAAAATAAAACAACCATCATCAAATGAGATTTTTAATTCAATTGAA
AAAGCACAGAACATATATCTAAGCTATGGTATTACAACAGCTCAAGAAGGTTTAATGGAAGAAAATCAAT
TTAACATTTTAAAAGCAATGGCAAATCAAAATAAATTAAAAATGGATGTTGTAGGATATGTAAATTTGAA
AAAAAGTAAGTCTGTATTAGATAATAATAGGGAGTTTATAAAAAAATATATAAATAGATTTAAAGTAGGA
GGTTATAAGATTTTCTTAGATGGTTCTCCACAAGGTAAGACAGCATGGTTGAGTAGACCATATGAAAATT
CAGATGATGGTTATTGTGGATATCCTATATACAAAGATGAAGAAGTAGAAAAGTTTATAGATATTTCACT
AAAAGAAAAGATGCAACTCTTAACTCATTGTAATGGAGATGCAGCAGCAGACCAGTTGATAGATGCGTTT
GAGAAAGTTTTAAACTTAAAAGAGCAAAGTAGTGAAAATAATATAAGACCAGTTATGATACATGCTCAAA
CAGTAAGAGCAGACCAGATTGATGATATGAAAGTAATAAATATGATACCTTCATACTTTGTAGCTCACAC
ATATTATTGGGGTGATATTCATATCAAAAACCTTGGAGAAGATAGAGCGTTTAAGATTAGCCCACTTAAA
ACAACTATAGAAAAGGGATTAATTTACACTCTTCATCAGGATACACCAGTAATAGCACCTAATATGCTGG
AAACAGTATGGTGTGCTGTAAATAGAATTACAAAAAAAGGTATACAAATAGGAGAGAATGAAAAGATAAG
CCCATTAGATGCTTTAAAGGGTGTTACTATAAATGCAGCATATCAATATTTTGAAGAAGATAAAAAAGGT
TCAATTAAAGAAGGTAAATTAGCTAATTTGATAATATTAGATGAAAACCCACTTACAATCGACCCTATGA
AAATAAAAGATATTAAAGTATTGCAGACTATAAGAGAAGGAGAAGTATTGTATTCTTTGAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:3237882-3238808 nitrilase (carbon-nitrogen hydrolase) [Clostridium difficile R20291]
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AAACTGTTGAAAAAGCATTAGGATTAATTAAAGAAGCTGGTAGAAAAGGGGCAAATATCGTAGTTTTCCC
TGAAGCATTCATACCTGCATATCCAAGAGGTCTTTCATTTGGATTTGTTGTTGGAAGTAGAACAATGGAA
GGTAGAGAAGATTGGAAAAGATACTATGATAATTCTGTACCAGTTCCTAGTGCTACAACAGATTTATTAG
GAAAAGCAGCACAAGAAGCAGGAGTATATCTATCAATGGGTATAACAGAAAGAGATGGTAATGATATAAA
TTGTACCCTTTATTGCACAAACTTATTTTTCTCTCCAGAAGGTAAGCTAATTGGTAAACACAGAAAACTT
AAACCTACAGGAACAGAAAGATGTATTTGGGGAGAAGGAGATGGAAGTACTCTTACAGTAGTTGATACTC
CATATGGAAAAATGGGTTCGTTGATTTGTTGGGAAAATTATATGCCATTAGCTAGAACAGTTCTTTATGC
TAAGGGTGTAAAACTTTACATAGCCCCTACTGCAGATTCAAGAGAAGAGTGGCAAGCAACTATGAAGCAT
ATTGCTTTAGAAGGAAGATGTTTTGTAATTGGATGCAATCAATATGTTGAAAAAAATATGTATCCAACTG
ACCTTAACTACTATAAGGAGCTAGATGCAGAACCAGAAATTATGTGTCCAGGAGGAAGTTGTATAGTTGA
CCCTTTTGGAAAATATGTAGCAGGTCCTATTTTCAATAAAGAAGAAATGCTAATAGCTGATTTAGACCTA
GAAAAAATAGTACTTAGTAGACTAGATTTTGATTCAGAAGGTCACTATTCAAGACCAGATGTATTTGAAT
TAATTGTTCATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3239926-3238928 putative zinc-binding dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAAAATTTAAATCACTATATATTACAGAAGAAGAAGGAAATTTTAGAAGAAATATAGTTGAAA
GAGAAGTAGATACATTGCCAGAAGGCGAAGTTCTAATAAAAGTAAAATATTCTTCTCTAAATTACAAGGA
TGCACTTTCTGCAAATGGTAATAAGGGTGTTACGAGAAAGTATCCTCATACACCAGGAATTGATGCATCT
GGTATAGTAGAATCTAGTAGTTGTGATGATTTTAAAATTGGAGAAGAAGTTTTAGTAACAGGTTATGACT
TGGGAATGAATACTTCTGGTGGTTTTTCAGAATACATAAGAGTTCCTTCTAGTTGGGTAGTTAAACTTCC
TAAAAATCTTTCACTAAAAGAAGCAATGGATTATGGTACAGCAGGGTTTACAGCAGCTTTATCTGTGTAT
AAATTTATAGATTCTGTAGACAAGAATATGGGAGATGTATTAGTCACTGGTGGTACTGGAGGAGTTGCTG
TAATTGCAACTAAAATATTGATTAAATTAGGTTATTCAGTTGTAGTTTCAACAGGAAAATTAGAAGAACA
AAAAGAAGTATTACTAAACTTAGGTGTTAAAGATGTTATACATAGGTCAGAAGTGGATGATAACTCAGGA
AGACCTCTGCTTAGACCAAGATGGGCTGGAGTAATAGATACAGTAGGAGGAAATACTCTAGCAACAGCAA
TAAAGACAACTAATTATTGTGGAGCAGTAACAACTTGTGGTAATGCAGGAGGAGTTGATTTTACAAGTTC
AGTATATCCATTTATCTTAAAGGGAATTACTTTATATGGTATAGATTCTGTGGATTGCCCAATGAACTTA
AGATTAAAAATATGGGATTTATTATCAAATGAATGGAAATTAGATGATTTAGATGATATGGTAAATGTAG
TATCATTGGAAGAGTTAAATGATAGTATAGATTCGATAATGACAGGAAAACATGTTGGAAGAACAGTAGT
TGATTTAGAAAAAATATAG
>ref|NC_013316.1|:3240030-3240467 MarR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGATAAATATATTGTACATTTCATAAGTAAAACAAAGGCTAGTATGATTAAATTCATTGAAAATA
AACTCAGTAAAAATGGTTTAGGTGAGTTAATACCTACTCATGGAAATATTTTAACTGCACTTTATGAAAA
TAATGGAATACTTACAATGAAAGAAATTGCAGCTAAAATAGGAAAAGATAAATCCACTGTTACAGTGTTG
GTTAATAAACTTATAAACCTAGGATATTTAGAAAGACAAAAATGTACAAATGACAAACGTATCACGTATA
TAAAGCTTACAAAAAAGGCACTGCTTATAGAAGATACTTTTAATAGCATCTCAACACAAGTTAAAGAGAC
AGCATACCATAATATTACAGAAAATGAAAAACAAGAATTTCTTAGAATTTTAAAAAAAATTAATGATAAT
TTTAAAAATGCTGACTAA
>ref|NC_013316.1|:3240553-3241140 rubrerythrin [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTAAAAGATAGTAAAACTAAAGAAAATTTATTAAGAGCTTTTGCAGGTGAGAGTCAAGCTAGAA
ATAGATACAATATTTCTGCATCTGTAGCAAAAAAAGAAGGATTATATATAATAGAGTCTTTATTTAATTA
CACTGCTGACCAAGAAAAATCACATGCAAAACAATTCTTTTCTAAATTAAAAGAATTTGCTGGTGAAAAT
ATAAGTATATCAGGAGCATACCCTGTAGATTTATATGACAAGACAGCACAACACCTTAAAGCTGCACAAC
ATAATGAGCTTCAAGAGTGGGATGATGTATATAAAAACTTTGGAAAAACAGCACGTGAAGAAGGATTTGA
ATCTATAGCTAAGTTATTTGAAAATATAGCTGAAATAGAAAAAGTTCATGGTGATAGATTTGGTAGATAT
GCTACTGATTTAGAAGAAGGTACTTTATTCAGAAGAAATGAAGATATACAATGGATATGTACACATTGTG
GCCATATACATATAGGTAAAGAAGCTCCAAAAGCTTGTCCTGTATGTCTTCATCCACAAGGATATTTCTT
AGATTTTAAAAACTCATTATTTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3242060-3241440 hypothetical protein CDR20291_2737 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGAATTAATATCTAAGAAAGATTTATTGAGCAAAACTAATATATCTTATGGTCAATTATATAGAT
GGAAAAGAAAAAACATAATACCAGAGGAATGGTTTATAAAAAAATCAGCTTTTACAGGTCAAGAGACTTT
CTTTCCAAGAGATAAAATACTAGAAAGAATAGAGTTAATATTGTCTATGAAAGAAGAGACTTCTCTTGAT
GATATTGCAAATATGTTTATGAAAAAGGATATTAATAAGGAATTTGACATTGATTTTATTCTCAGTAAAG
AAGTTATATGTAATTATACCAAAGAAATATTTCAAAATTTATATAAAAAAGAGCAAAGCATAGGTAAAAA
AGAACTGCTTATATTGAGCATAATAGAGAAGTTTTTAGTTAAATCTATAATAACTTTTGAAGAGTTAAAA
TTGATAGTGAATATAATAGAAGAAAATTTTACATCAATATACAATGAAAGTGGAAAGATTTATTTGTTTA
GAAAGTTTGGAGTTCCATTCGTAGTAGGATGTCTGGATTATAAAAAAGTAAAGTTTGAAAAAGATGTAGT
TAAGATTATTGAGATTGACTTGACAAAAGAAATAAATGATATAAGTATAAAGTTATCATAG
>ref|NC_013316.1|:c3242835-3242068 hypothetical protein CDR20291_2738 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAAGGGTCTATAAAAATACTTGGAGAAGGCTTTATAAGTAGTGGTGAGTATGAAAATATAAAAA
TCGTGGGAAGTTCTAAATCAAAAGGAAATGTTAAAAGTAACGAAGTAAAAGTCCTTGGAGATGCAAAATT
TGAAGGTGACATCAATATAAAAAATTTTGTTGTTAACGGAAAAACTATTATAAGAGGCAATCTTAAAGCA
GAGCGTGTAAGAGTGAATGGTCAACTTAATATAGAGGGAGATGCAGAAATAGATGACTTAGTTATAACTG
CTCAACAGAAAGTGGATGGCAAACTTAAATGTAATAATGTTACAATAAGAGGACAATTAAGTGTAAATGA
AAATATGTATGCACAAGATATAAAAATCTATGGCGAAATGAGAAATAAATCAAATATAGAATGTGAAGAT
ATAAAGGTATATGGAGTAATAAAATGTGATGGTCTTTTAAATGGAGAAAATATATATGTTTATTCAGGAG
GAGGTTCTTATTGTAAAGAGATAGGGGCAACTAATATAAAAATAGGAAGAAGCAAAGATGCTTTTTCATT
AATTAAAATCATTAATATTTTTTCAGGAAAGTTTAAATGTAATTTGATAGAGGGAGATACTATTGAATTA
GAAGATGCATCAATAAAAGATATACGAGGCAAAAGCATATCTCTAGTAGATAATTGTGACGTTGGAAATA
TTGAATACAGTGATAATTTATCAGTTTCAGATAATTCTACTGTAAAAAACAGTATAAAGGTGGGCTAG
>ref|NC_013316.1|:c3243697-3242876 hypothetical protein CDR20291_2739 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGAAGAATTAAGTTCACTAAGATTTGATGGTGTTGGAAAATGTAAAGGTGGAATTTTTGATAATG
TTAATATATCAGGAACAGGCAAAATAGAAGGAAGTGTAAAATGTAGTAAATTTGATTCTTCTGGTTCAGC
AAAAGTTTTTGGGACAACAGAATGTAATGAATTTTTTACATCTGGTTTAAGTAAAGTAGAAGGAAACATA
CTGGCATCAAAAGTTGAGATATCGGGACTTCTTAGATGTACAGGAAATATTAATTCTGTTGAAATTGATA
CTAGTGGAATTATTAATGTAGAAGGAAGTATAAAATCGGATATTATTCATGGAGAAGGATATTTAAAAGC
AAATGAGAATATAGATTGTGAAAATATCAATTTAAGTGGAATCTTGGAGTGTAATGGATTTTTGAATTGT
GAAGAAGTTAATATTAGTTTAAATGGAACTTCTAATTTTAATGAAGTTGGAGCAAGTAGTATAAATATAA
AAAAGGGGCATGGAGATTATTGCAAAAAATTTCGTATGCTAGAAAAAAAGCATATCAACTTTGAAAAAGT
GTCTTCAAATTTAATAAGTTTAGGTCTATTATCAATTAGAAAGTATACAGAAAGTAAATTGTTTGCAAAT
ATTATAGAAGCAGATGAAATAAGCTTAGAAAATAGTGAAGTCAAAGTTGTAAGAGGAAAAAATATTAAAA
TAGGCAAGGGATGTTATGTAGAAAGTTTGGAGTACAGTGAAAGTATAGAGATTGATGAAGATTCAATAGT
TGGTGAAATAAAGAATATAAGTGAAAAAATAAAATTAAAGAAGGATAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3245979-3244054 putative bifunctional protein [includes phosphonoacetaldehyde phosphonohydrolase; 2-aminoethylphosphonate:pyruvate aminotransferase] [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGCTATAAATATGAAAAAGATATATGGAGAAAAAATAAAAGCAGTAGTATTCGATTGGGCTGGAA
CAACAGTAGATTATGGATGTTTTGCACCTCTTAATGTATTTATAGAGATATTTAAAAGAAGAGGTATAGA
TGTAACAATGGAAGAAGCAAGAAAACCTATGGGAAAATTAAAAATAGACCATATAAGAGAAATGTGTGAA
ATGGATAGAATAAAAAATCTTTGGTCAGATAAGTTTGGTAAAGTGCCAACTGAAGATGATGTAAATGAAC
TTTATGCTGAATTTGAGCCAATGTTATTTGAGACATTAGAAGAGTATACGACTCCAATTCCTCATGTTGT
TGAAACTATTGAAAAGTTGAGAAAAAATGGATTAAAAATAGGTTCTACAACGGGTTATACAAGAGAGATG
ATGAACATAGTTGAACCAAATGCAGCAAAGAAAGGATACTCACCCGATTTTCTTGTAACACCATCAGAAG
TATCTCAAGGAAGACCGTATCCTTGGATGTGCTATAAAAATGCTGAAGCTTTAGGGGTGTCTCCTATGAG
TTCTATGGTAAAAGTAGGAGATACAATAAGTGATGTAAAAGAAGGCGTAAATGCAGGAATGTGGAGTGTT
GCTGTAATAAAAGGTTCAAGTGAGTTAGGGCTTACACAAGAAGAAGTAGAGAACATGGATAAGGAAGAAT
TAAAAGCTAAGATGAGTATAGTTTCAAAGAAATTTAAAGAGGCAGGTGCACATTTTGTAATAGAAACTAT
GGCTGAGTTAGAAGATATACTAATAAAAATAGAGAATGAAACTATTAAATCAGATTTTGTACCAGAAAAT
GATTACATATTACTTACACCAGGACCACTATCTACTACTAAATCAGTAAGAGCATCTATGTTAAAAGATT
GGTGTACTTGGGATGTTGAATATAATAACCTAGTACAAGATGTTAGAAGAAGATTAGTATCTCTAGCAAC
CCAAAATACAGATAAATACACAAGTGTATTAATGCAAGGAAGTGGGACTTTTTCAGTAGAAGCTATAATA
GGAAGTACTATTTCAAAAGATGGTAAACTTCTTGTAATTGCAAATGGAGCATATGGAAAGAGAATGAAAG
ATATATGTAATTATCTTAACATAGAATTTGTTGACTGCACATTTAAAGATATAGAAGCAGTGGATTTAAA
TGTAGTAGAAAATTTATTAAAAGAAAACAAGGATATAACACATATATCAATGGTTCACTGTGAAACTACT
ACAGGTAGATTAAATCCTATACAAGAGGTAGGGAAACTTGCAAAAGAATATAACAAAATTTATATAGTTG
ATGCTATGAGTAGTTTTGGGGGAATTGAGATTGATGTTGAAGATTTTAATATAGATTTTTTAGTTAGTAG
TTCTAACAAATGTATACAAGGAGTACCTGGATTTGGTTTTATAATAGCTAATAAAGAGAAATTATCTAAA
TGTAAAGGTATAGCTAAATCATTATCTCTTGATGTGTATGCGCAATGGGAGACTATGGAGAAAAATAATG
GTAAATGGAGATTTACTTCACCTACACATGTTGTAAGAGCTTTTTATCAAGCTTTATTAGAATTGGAAGA
AGAAGGTTCTGTTGAAAAAAGATATGCTAGATATAAAGAAAATCAGTTTACAATAGCTTCAAGATTAAAA
TCTTTAGGATTTGATACTTTGGTGAATGATAATGCTCAATCACCTGTAATAACAACTTTCTTATATCCTA
AAAATGCAAAGTTTGAATTTATGGAATTTTATACTTATTTAAAAGATAATGGATTTGTTATCTATCCAGG
TAAATTGACTGATATAGATACATTTAGAATAGGTAGCATAGGTGAAGTTTATCCAACTGATATGGAGAGA
CTAGCTGATGTAATAGAAAAATTTATCAATAGATAG
>ref|NC_013316.1|:c3247028-3246243 DeoR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTTTAAATTCGATAGATAGAAAAAAAGAAATACTTAAATTATTAGATTCAAAAGGGAAGGTAAATA
CTAAAGAATTAGTAAAAAGATTAGAAGTATCATCAGAAACAATAAGAAGATATTTGGAAGAATTAGAAAA
TGAAAATAAATTAAAAAAGGTATATGGTGGTGCTATAAAAATAAATTATGGAGTGATTGAACCAGAACAT
ATAAAGAGAAACAATACTAACCTAGATAAAAAACAAAGTATTGCTAAATACGCAGCTAAGTTTGTAAATG
ACAATGAGTCAATTATCATAGATGAAGGTACTACCAATTTGCAGATTGTAGATTATATAATATCTGTAAA
CAATTTAAAAATTATTACAAACTCTTATCCAGTTCTATCAAAATTGATTTCTTATGAGAATCAAGGTTTG
TTTGATGGAGAAGTTATATTTATTGGTGGAAAAGTAAATTTAAAACACCAAAGGACAGCATGTCCAATGT
CAATAGACACTATGAAAAACTTATACGTAGATAAAGCTTTTATATCTAGTGAAGGTATACTTGATAGTTT
TGGAATTAGTAGTATAGACCAAAATAAGGCATTGTTGTCAAAAGAATATATAAAAAATTCAAAGGAAAGT
TTTGTATTATGTGATAGTTCTAAAATAGGAATTGCTAGTATGTATAAGATAGCAGATTTAGAGGAATTAG
ATTTTGTTATTTGTGATGTAGAACCTCCGAATGAATGGAAGGATAAGTTAAATGAGATAAATATAACATG
GATAGAAGCAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3247475-3247245 D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2 (D-alanyl carrier protein) [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAGAAACAGTTATAGAAATATTTGAAGATGTATTAGGGACTGATGAGATAAGAGAAGATTTAGACC
TTAATTTATTTGAGACGGAACTTTTAGACTCATTAGCTATAATTGAAGTTTTACTTGAAATTGAAAATAG
ATTAGGGATAGAGCTTCAACCAACTGATTTAGAGAGAAAAGATATGTCTACTGTAAATAATTTAGTAAAA
TTCTTGGAGACAAGAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3248642-3247494 D-alanyl transferase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTTTTTCACAGTATGGAGATTATTTTTATCTTTATATATTATTATTAACATCAATACCAGCAGTAA
TTTTAGGTCTAATGGGCAAGAATATAAAGTATTATGGTATGTTGGCAAGTTTGTTTATGATATTCTTAAT
AGTAGGAATTGATGTCCAGCTAAAGTATTTGGTAATATTTATTATTCTTGAAGTAATAATAGTTAAAGGA
TATGAATATGTAAGAAGAAAAACTAAAAATAAATACATATATTGGGGATTCTTGTTTGCATCAATGCTCC
CAATAATAATAAATAAAATATCTCCAGTTACTTCTTTTGGAATAATTGGATTTATTGGAATATCATACTT
AAATTTCAGAACTATACAAATGGTTATTGAAATTTATGATGGAGCTATAAAAGAAGTTAAAATTTCAAAG
ATGCTTTATTTTATGTTATTTTTTCCAACTTTAAGTTCTGGACCTATTGATAGGTCAAGAAGATTTGAAC
AGGACTTGGAAAAACACATCTCTAGAAAAGAGTATATAGAAGAATACTTACTGCCAGGAATAAAAAATAT
TGTCATGGGAGTAGGTTATAAGTTTGTTATAGCATTTTTGATAAATACATATTGGGTATCAAGAATACCT
AAAGATATGAGTTTTATAAATATTTTAAGTTATATGTACGCATATAGTTTATACCTGTTCTTTGATTTTG
CAGGATATAGTTTATTTGCTATAGGTACAGGGTACATATTTGGAATACAAGTACCTATAAACTTTGACAA
GCCATTTATCAGTAAAGATATGAAAGAGTTCTGGACAAGATGGCATATAAGTCTTTCAAGATGGTTTGGA
GATTATATTTTTTCTAGATTTGTTATGTCATCAATGAGAAAGAAAAGATTTAAGAAAAGGACTACTGCTG
CTCATGTGGCTCAGATGATAACCATGATAACAATGGGATTTTGGCATGGTCTAACTTGGTATTATGTTGC
TTATGGTGTATACCAAGGATTGGCACTTGTGTTAACTGATATATATCAGCGAAAATCTAAATTTTATAAA
AAACATAAAAAAGATAAATGGTTCGAGAGAGTGCAGATTTTCATTACATTCCATATTGTGTGTTTTGGAT
TGCTGATATTCTCAGGTTATTTAGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3250156-3248642 D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1 (D-alanine-activating enzyme) [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATTATTGAAGGAATAAAAAAATATTCAAATACAGATAGAACAGCACTAATGTGTAATGGAGATA
AACTTTCTTATAAAGATTTAAATGAATATTCAGATGCTATATCAGTATTTCTAAAGGATGTATACAAAGA
AGAGGATACTCCTATAGTAATTTATGGAAATAAAGAAAACATGATAATGGCATGTATGATAGGAGCTTTA
AAATCAGGTAGAGCGTATGTGCCTCTTGATATTAGTTTTCCAATTGATAGAGTTTTTGAAGTCACTAAAG
AGATAAAACCAAAAGTAATATTTAATTTTAGTGATGAAAGAAATTTTGGAGATATCAATGTAATTGATAT
GGATAAATTAAATGATATAATAAATGAATATCAGGGAAAATCATTAGATAAAGAAAACTGGGTAAAAGAT
GATGAAAATGCATATATACTATTTACTTCAGGAAGTACAGGAAAGCCAAAAGGGGTTCAAATAAGTTCAA
ACAATTTAGATAGCTTTTCAGATTGGATAAGCCCATATCTAAACATAGATGGAAGTGAAAAAGTAATAAT
GAACCAACCAGCATATTCTTTTGACCTTTCAGTTACAACAATATACCCTGGTCTTATCCATGGAGCTACA
TTATTTTCAATATCAAAAGATGTATTAGCAGACTATAAAGAACTATTTAGACAATTTAGTATCTCAGATA
TAGCTGTATGGGTGTCAACTCCTTCTTTTGCAGGAGTATGTATAACTGAAAAAGAGTTTAATAGTAAAAT
GCTTCCTAACCTTGAGTCAATGATATTCATAGGAGAAGCACTTTCAAAAAATCTTACTAAAGAACTTATG
AGTAGATTTCCAAACACAAGAATTATCAATGGATATGGACCAACCGAGGCTACTGTTGGTGTAAGTGTAA
ATGATATGACTCAAAAAGCTATAGATGATGAAAAAAGTCTTCCAGTTGGATACCCTATGTCAAATTGTAA
AATAAAAATACTTGATGAAGATGGAAATGAACTTAAAGAAAATGAAAAGGGTGAAATTATAATAATTGGA
CCATCAGTTTCTAAAGGTTACTTCAATAATAAAGAAAAGACTGATGAAGTATTTTTCTATGATGAAATAG
ATGGTGTAAAGTGGAGAGCTTATAAAACTGGAGATATGGGATATCTTTTAGATGGAAATATATATTATTG
TGGAAGAAAAGATTTTCAGATTAAATTAAATGGATTTAGAATTGAAATAGAAGATATAGAAAATAATTTG
AGAAAAGTACATAATGTAAAAAATGCAGTAGTTTTACCAGTATATAAGGACGAAAAAATTGCTTACTTAA
AAGGTATTGTTGAGTTAAATGAAAAGAATGATTTAAGTAATATTAAAAATGGGATGATAATAAAAAAGGA
ACTTGGAAAGTATATACCTTCATATATGATTCCAAGAAATATTTCAATAATCTCTGAGTTTCCAACAAAT
ATCAATGGTAAAATAGACAGAAAGAAACTTATGGAGGAAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3251467-3250277 putative D-alanine transferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAAATTGATATACTTTATTACACCTTTTATAATAGGCGTAGTATTTTTATTTGGGTTAGACAAAT
TTCTTGATTCTAAAACTGATGAACTTTTGAGGGAGAAAAATCTACTTCCAATTATGGATGATACTTTAAG
TGATATAAAAGATAAAGGGGTTACAGCAAATAATCATTTTTTAAGAGAAAAGGATATTATGATTTTGGGG
TCATCAGAACTTAGTAATTCAACAAAACAACATCCAAAGTACTATTTTAATACAAATAGGAGTAAAAATA
AGGTGTTTGCAATTGGGAGAGCCTATACTCAGACATTACAAGATGCTGCAATATTAGGAAGTATGAATCC
TAATATTGATAATAAGAAAGTTGTCTTGTTAATTTCTATGCAATGGTTTATGGAAAAAGACGGAGTCACA
AGTCACCATTATCAGTCTAGATTTTCACCAATACAATTTTATCGATTTTTAGATAATCCAAAAATATCTA
AACAAAATAAGATTGAATATGCAAAAAAATCAAGTAAGCTATTATGGGGAAGTGATGAGTATAAAGCAGA
AGCATTATATGCTAAGCTATATGAACCTAAGACATTTCCTGAAAAAGCTGAAAAGGTGCTTTTAGAGCCT
TATTTTCAAGGAAGAAAGTACTGTATAGCTCTTAAAGAAAAGGGTATTCTTTATAAACGATTAATTAAGC
TAGATAAAAAGAGAGCAACAAAAAGAAAAAGACCAATAAATTGGTCATATGAGAGAAAGAAAGCCATTGA
AGATGCTAAAAAAAGAGTTGGTAAAAATCCACTAAATATTGATAAGTACTATTATAAAGAGCATTTTAAA
GATGGTATAGAGCAATACAAAGGAAGAGACAAAGATGTAAATTTATTAACATCTAAGGAGTTTGAAAATT
ATAAACTGATGCTAAATGTATGTACTGACTTAGGTATTAATCCAGTTGTTGTATTAATCCCAAGTATGGA
TAAATTCTATAATTTGACTGGTATTTCTGAAAAAGAAAGAAATCAGTACTACGATAAAGCACAAAAAATA
GCAGAAAGCAAAGGCTTTGAAGTTCTAAACCTTAAAGATAAAGGGTCAGATAAGTATTATTTAAGGGATG
TAATGCATCTTGGTACGAAAGGATGGGTAGATGTCTGTGAGAGATTATTTAAAATATTTAAAGAACAATA
A
>ref|NC_013316.1|:c3252775-3251756 putative oxidoreductase [Clostridium difficile R20291]
ATGATGGGTAAAATAAGATTTGGTATTGTTGGGACAAGCAATATAGCAAATATATTTCTAAGAGCTGCAT
CTAGGGTTAAAGATTTTGAATTGGTTGCTGTATATTCTAGAAATTTAGAAAAAGCTAGAGAATTTGGAAC
TCTACATGGAGCAAGTATTTTTTTTGATGATTTAGAACAAATGGCTAAATCGAAGGATATAGATGCTGTA
TATATAGCTTCTCCAAATGCATTACATTCAAAGCAAGCCATTACTTGTTTAAAACACAAAAAACATGTGC
TTTGTGAAAAGTCGTTAGCATCTAATTTAAAAGAAGTCAAATCAATGATAAAAACAGCCAAAGATAATAA
TGTATTGCTTATGGAAGCTATGAGAATTACATGTGTTCCAAACTTTAAAGCAGTTAAAGAAAACTTGTAT
AAAATAGGGAAAATAAGAAGATTTTTTGGAAGCTATTGTCAGTATTCTTCAAGATATGATAAATATAAAA
ATGGAATTATAGAAAATGCCTTTAAAAAAGAGTTGTCAAATGGAGCTTTAATGGATATAGGAGTGTATTG
TATACATCCTATGGTGAATTTATTTGGTGCTCCAAAAACTGTAAAGGCAGTTTCTCATATACTTCAAACT
GGAGTGGATGGAGAAGGTTCAGCTGTATTTCAATATGATGATATGGATGCAATAATTCAGTATTCTAAAG
TAGCTGATTCTTATATACCATCTGAAATACAAGGAGAAGAGGGAAGTATAATAATTGAAAAGCTTAATCT
ATTTGAAAAAGCTATTATTAAATACAGAGATGGAAGAGAAGAAGATATATCTATTCCAAAAGAAAAAGCA
GAGGAAAAGCCTAGAGAAATAGAAGGAATGTATTATGAACTTGTAGAGTTTATAAGTCTTATAAATAACA
ATAAAATAGAATCAAATATAAATTCTCATGAAAATTCAATAATAGTAATGGAAATTATGGATGAGATAAG
AAGACAAAGTAGTATTGTTTATCCAGCTGATAGTATATAG
>ref|NC_013316.1|:c3253535-3252951 hypothetical protein CDR20291_2747 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATGAGAAAAAATAAGTATAAACAGCTAGGAGGAATATTCATGGATAATGTAGGTTCTCTATTAT
ATTTTTTATTTAATTTTTTCTTGTATGGTTTTATAGGTTGGATAATTGAAAACTTATATAGTTATTATAA
ACAAGGGCATTTTCAAGAAGATGGATTTTTAAATGGTCCATTTAAACCAATGTATGCAATTGCAATGTCG
ATTATAATAGAGGTCTCAAGATTTATTGACCCCAATAATATATTTGCATTGCTTTTATTATGTCTAGTAG
TGCCGACAGTAGTAGAATATATTACAGGAATACTTATGAAAGTATATTTTAATAAGGTCTATTGGGATTA
TTCAGATTATAAGTACAATAGTAGAGGAATAGTATGTCTAAAGTTTTCTGTATATTGGACTATATTGACA
TTTATTGGAGTTAGATATTTTCAAGTGTATATAGTTGATAGTTTATATAGTCTTATAATACCTTATTGGC
CAATTCTTGTAACTATACTTTTAGTAACATTGTTTGTGGATGAAATTCTTACTATAAAATTTTTGAGGGG
AAATAAAGATATAGTAGAAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3254271-3253591 putative hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAAAAGTAGAAGGAATTATTTTTGACATGGATGGAGTTTTGTTTGACTCAGAGAGAATTTCTCTTG
AATTTTGGATGGAGACGTTTGAAAAGTATGGATATACTATGACTAAGGAAATTTATACATCAGTTATGGG
AAGAAATCGTAAAGGAATAATAGAAGGTCTTACAGATATATACGATAGTTCTGTACCAATAATAGATTTA
TATGACGAAAAAACTAAAAATATGATTGAATTTATGGAGAGGAAGGGAGCTCCTATCAAATTAGGAGTCA
ATGAACTAATCTCTTTTTTAAAGGAAAATGGATACAAAATGGCTGTTGCAACATCAACAAAGAGAGAAAG
AGCAGTAAAGAGATTAGCTAAGGCAAATTTAAAAGATTACTTTGATGCTATAGTTTGTGGAGATGATGTT
GTAAACTCTAAACCAAACCCTGAGATATTCTTAAAAGCAGCTAAAAAGATAAATGTTAATCCCCAAAATT
GTATTGTCATAGAGGATTCGCCTATGGGAGTTGAAGCTGCATACAATGGTGGGATAAGATGTATAAATGT
ACCAGATTTAAAAGAGCCAGATGAGCAAATTAAATCACAATCACATAAGATACTTGAAAATTTACTGGAA
GTTAGAGAATACCTAAAAAGTTTGAACTCTAAAGAATGTCACAATCTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3255589-3254300 putative transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGCGGGAGTTATTAAAAGTAACACTTATAGTAATGCTTGTTTTGATAAATGCTTTTTTTGTAGCTTGTG
AATTTGCTATGGTAAAACTTCGTAGTTCTAGGATTGATACCATGATAACTGAAGGTAATAATAATGCAAA
AAGATGTAAAATAATAAAAGACAACTTAAATTCCTATCTTTCTGCATGTCAACTTGGTATAACACTTTGT
TCACTTGCATTAGGTTGGATGGGAGAATCTACAGTTAAAGAGTTAATTTTACCAATAGTAAGTGTATTTA
ATCTTAGTGAAAGTATTATATATACTATATCAATTTCCATTTCTTTTTTAATTATAACAATGATGGAGGT
TGTAATAGGAGAGTTGGTTCCTAAAGCTTTAGCACTTTATAATACAGAAAAAATAATGTTGAGTACATCT
TTTTTATTAGTAGGATTTTATAAGTTAACATATCCAATAATATATTTTTTCAACTTAAGTACTGATTTAT
TTCTTAAACCATTTGGATATTCACAAGCTGATGAGGTTGATGAACCCCATACAGGTGACGAAATAAGACT
ATTAGTAGAAGAAAGTTATAAAAGTGGACTTATAGATGAATCAGAGCAAAGATTAGTTGATAATATTTTT
GAATTTGAAGAAAAGAAAATTAGAGAGATAATGGTTCCTAGAACTGATATGGTATGTATATATGAAAGTG
ATTCTGAAGAAAAGATATTAGCTATTTTAAAAGAGGAAGGTGTTACAAGATATCCAGTATGCAGAAAAAA
TAAAGATGATATATTAGGTTTTGTACATATAAGAGATTTATACAATCAAAAGATAAATGAAAATAAAATT
GAACTAGAAGAAATATTGAGAGATATTATATATATATCTGAAAATTTAACTATAGATAAAGCTCTTGAGA
GAATAAGAAAGGAAAAACTTCAACTTGCTATAGTTGTGGATGAATATGGTGGTACATCTGGTGTGGTAAC
AATAGAAGATATACTAGAAGAGATAGTTGGAGAAATTCAAGATGAATTTGACAAAGAAGAGACTCATATT
AAGAAAATAGGAGCAGGTTCTTACTTAGTTGATGGAACTGAATCTATCAACTATATTAATAAGTATTTTG
GACTTGATATAGAGCATGATGGATTTGACAGTATAGGTGGGTGGATATCCTATATGCTTGGTTCAAATAT
TAAAGTAAACCAAAGCGTAACTTTTGAAAATTACAATTTTACAATATTAGAATTGGATAAATTGAGGGTT
GTAAAATTAATCATAAAAAGTGTAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3257653-3256052 putative D-aminoacylase [Clostridium difficile R20291]
TTGATATATGATTTAATCTTAAAAAATGGATTTATAATAGATGGTACAGGTAATCCTGGTTTTTATGGAG
ATATAGCAATTAAAGACAACTTAATAGCAAAAATAGATTCTAAGATAAATAGCAATACAAATAAAGAGAT
TGATTGTTGTGGAAAAGTTATAACACCTGGATTTATTGACCCTCATGTTCATGAAGAAATAGTAGCAATA
CTAGATGGTAAATTTGAAAAGTTTCTAAAACAAGGAGTTACAACAACTATAAATGGTAATTGTGGACATT
CTATAACACCATATTCTTCTGAAAATGTATATGAATATATGTATAAAAATGGTCTATTACTTGAAGAAGA
AAAAAAGTATCTTATAGATAAAAATAAATGTTGGAATAATTTTACAGAATATTGTGACCTTATATCTAAA
AGTGGTATTTCTGTCAATATGGGATTCTTGTTGGGGCATGGGACTATAAGATGGAGTGTTATGGGAGGTT
CTAAGGATAGACCTCCTACAGAAAAGGAAAAAAATGAAATTACAGATATAATAAATGATGGAATGAAAAG
TGGTGCTTTTGGAATATCTACTGGATTGGCATATATACCAAGTAAGTATGCTGATATTGATGAACTTGTT
GATATTGCAAGGCAGATTAAAGAGCATGATGGTATATATACATCTCATATTAGAGATTACATAGGAAGAT
ATAATGCAGTAAAAGAAGCCATAGAGGTTGGGCAAAAAAGTGGTGCTAGGGTTCAAGTATCTCACTTAAG
TCCAGTTGAAATAGAAGCATTTGATGAGATATTAAAGGCTAGGTATAATGGTGTTGAAATAATGGTTGAC
ACAGTACCAAGAAGTTCTGGGCATTGTATGAAGAAAAAAAGAGTAATTCAATTTATTATGGCAATATCAT
CTAGTCTATTTGAATTAGGTATAGATGGGGTAATGGATGATCTTAGAAATGAAGAGGGAAGAACACTTAT
ATTAAAAGAAGCATTTATACTTGGAGATAGGGGGAGTATAATACTTCTAAACACTAAAGATATTAATATG
GAAAAGAAATCAATACGTGAAATAGCTACACAAAAAGGAATAGATGAGGACAAGTTATTACTCGATTTAC
TTTTAGATGGAGACGAAGAACTTATCTTTTGTTTAGGAGGAATGTATAGAGCTGATTTCCCAGATAAACT
ACATGATAATAAAATAATTGATAATCCATTTGTTATGGTTGGTTCAGATTGTTTGTTTAGTGTGGGTGGG
GATATGTCATGGTTTGAACTACAAAGAAGAGGAGCTTTTCCAATTTTCTTCAATATGTACAGAAAGTCTG
GTGTTAGATTGGAAGAGATTGTAAGAAGAGTTACTTCATTACCAGCTAGGCAATTTAAAATAAAAAATAG
AGGTATTATTAAAGAAGGGTTGATAGCTGATATAGCAGTTATTGACATGGATAACTATAGTTATTCTAGG
TCAGAAGATATTGATTTTTCAAAGCCACAATTACTAGCCAATGGTGTTGAATATGTAATTGTAAATGGAA
AAATTGCGTTAGAAAATGGAGAGATTACTGAGAATAAATGTGGTGAAGTATTAAAAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3258441-3257764 hypothetical protein CDR20291_2751 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAAGTAAAATCTATATACAATGAAGAATATTTACCTTTTATGATAAGGTATGGAAGACTAACAC
TATCTTTAGGTATTATAGCAGCATTAGTTCCTGGAATAATTTTGAGCTTTGGATTTGGTATTATGCCTCC
AATATCAGCATTATTAGCAAGTACAATGGCAATTGTCAGTATGAGTGCTCCAAATTACATAATAGAACCA
GTTTCTTATTCACCAATCTTAGGTATCCCAGGAACTTATATGAGTTTTCTTTCTGGTAATATATCTAATA
TGAGGCTACCATGTTCAATAGCAGCTCAAAAGGCAGCAGAAGTTGAATCAGGTACAGAAGAAGGCTCGAT
AATATCTACAATAGGAATAGCTGTATCTATTTTAGTGAATATAAGTATACTAACTATAGGGGTAATTTTA
GGAGGAAGCGTATTATCTAAAATTCCAGCTGAAGTAGTAGAAAAATTAAACTTAATTTTACCAGCTCTAT
TTGGGTCAGTTTTTGGACAAGTATTTTTACAAGATAAAAAATTAGGTCTAGTAGCAATTGTAATATCTGT
ATTGACTATTATATTATCAAAGCAAGGTATAATACCACAGTCTCTAGTAGTTCTTATATGTGTATTTGGT
ACTATATTAATTGCAAGAGCTATGTATAAAGATAAGCTTAGTGACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3259149-3258454 hypothetical protein CDR20291_2752 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATTATTTAAAATTAGCTAATCATCCACTTTTGTGGATAGCGAGTACAGTAGCAGTATCAATAGTAG
TGGTACAATCCCTTATATTTGCTATAAAATCTTGCAAAGTTGGTAAAACAATGGGAATAACAGATAAACA
AATAAAGTCAGCTGTTAAGAGTAGTGCTATTTCAGCTATTGGGCCTTCAATGACTATATTTGCTGGAATG
GTATCGCTTATAGTAACTATGGGTGGGCCTATAGCATGGATGAGATTATCATTTATAGGTTCTGTAATTT
TTGAATCAATGTCAGCTGGATTTGGAACAGATGCATTAGGTATAACTTTAGGTTCTCCTGAAATGACAAA
ACTTGCATTTACAAATGCAGTTTGGACTATGATATTAGGTTCTTTAGGATGGATAATATTCACATTACTA
TTTGGACATAAACTAGATAAGATAACCAATGTTATATCTAGTGGCAAGAAATCATTTATACCAATAATAT
CTCTAGGAGCAATGTTGGGTTCATTTGCATATCTAAATGCTGATAGGGTGTTGCGTTTTGATAATGGAAC
AATTGCATGTATAAGTGGAATGGCTATAATGGTAATATTGTGTATGCTTGAAAAGAAGAAAAATATAAAA
TGGTTAAGAGAGTGGGGGCTTACAATATCAATGTTTAGCGGAATGATAATAGCTTCAGTAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3260400-3259201 putative dipeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGTCAGCTTACAAAGGATATGAAGCCTATAGTTATTTAGAAAAAGGAAAAGATATTTCATCTATTG
AGATGTGTAAAGGAGATAAAAGAGTTAAAGAGTACCTTATTGAATTAGATGATATTCAAGAAGCTAAGGT
TAAAAGTATAGTGGATGAAAAAATATTTATATCATTACATGAACATCCAGTATTATTTCCAGAACACCTA
GAAAGAGATATATTTGAATATAATAGGGAAGGTAAACAAAGATGCGCTTATGAAGCATTATCAAGAGGAT
ATTATGATGCTATATTTGATAATTTAATGGATGGTGTATGTACGATAACATCAAATTCAGGGTGGAAATG
GGATGATATATTAATAGATTTAGGCATGAGACTATGTGATTTAGCTCATCAAGATTTTGTCATAAAGTGT
GAAAAAGTAGAAGATATATGCAGAGCTAAAAGTGAAGGTAAAGTAGCATTGATACCAACATTAGAAGGTG
CAGCACCAATAGAAAATGAACTTGATAGAATAGATATACTGTATGGATTTGGTATAAGGTTAATGGGTAT
AACATACAGCGAATCCAATGCATTAGGTTCAGGACTAAAAGAAGAGAAAGATGGAGGTCTTACAAATTTC
GGAAAAAAAGCTGTTGAAAGAATGAATAAAATTGGAATGGCAATAGATTGCTCTCACGTTGGAGTTCAAA
CTACACTTGATGTAATAGAATATAGCAAGGACCCAATAATATTAAGCCATGTTGGGGCAAGAAATTTATG
GAACACAAAGAGACTAACTCCAGATGAAGTATTAATAGCATGTGCTAAAAAAGGAGGGGTTATAGGTGTA
GAAGCAGCACCTCATACTACAATAACAGAGAAGAATAAAGAACATTCAATAGAGTCATTTATGGAACATT
TTGAGTATATTAAAAATTTAGTAGGAATAGACCATGTAGCTTTTGGACCAGATACAGTATATGGCGACCA
TGTAAAATTACACTCAGTACTAGCTGCTAAATTTGATATAAAAAAAATAACAGGTACAAAAGAACATCCC
AAAGTAGAATATGTAAAAGGTCTTGAGAACCCAACAGAAACTTCAAAAAACATTGTCAGATATTTAGTAA
AGCATGGATATAGTGATGAGGAAATAGAGAAGGTACTAGGTGGAAATATACTTAGAGTACTAAAACAGGT
TTGGAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3262706-3260661 putative sigma-54-dependent transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAACATAATATTTTATTTGTATCAACTGATGACAAAATAAATATAGATATATCAAAACAATTGG
AAAATATATTTGGAGAATTTTGTAATATAGATAACTTGGTATATGTAAATAGGATAAATATTGAACTGTC
AAGCTATGAGCTTGTAGTATGTTCAGACAATGATATAAAGGAATATATACATAATAATATTGATAAAAAT
ATACTTATTGTAATAGTACATCGTACTATAAATATTGAAAATATAAATCAGATAATAAGTATAGAAAATG
ATTCTGATGTTATGGTTATAGATGCTTATAAAGAGTCAGCAGATGAAACTGCCAAGATAATTAGAAAACT
AGGATTAATTCATATTAATCTAATACCATATTATCCAGGTTGTGATAAGTCTAAATGTGAGATTGGAATT
ATTACGGGAAGCAGAAACAGCATACCACAAAACATAAAGCAAATAATTGACATAGGTGATAAGGTAATTG
ATATAAATACAGTTATAGAAATCTTTACAAAACTAAATATATCTATAGATAAATTACATATTATTAAGGA
AAAATACAATGAAGATACAGTAAGTGGATATAGGTATTATACAACTATGAATAAAACCATGAAGAGTTTT
TTGGAGATTATAGATGAAGGTATTGCCTCTGTTGATAAATTAGGAAAATTTATATATTGCAACAAAGTAT
TTTCTAATCTAGTTGGAATAGACCAAAATGAAATTATATCTAATAACTTTATGGACTTATTTAGTGATAA
GGTTGTCAAAAAAATATTTTTTCAAGAAGATGAAGTTAATGATGAAGTAGTAAATTTAAATAACAAAAAA
CTGATAATTAATAAAGTAAATGTTTATGAAAATAATGAACGAATAAAGAGTATTATAAGCATTAAAAATA
TAAGTGCAATTCAAGTGCTTGAGGACAAGATTCAAAATAAACTTCAGTCAAAAGGTTTTGTATCAAAGTA
TACATTTGAGAGTGTTGTAGGTGAGAGTAAAATAATAAAAGAAAAAATTAATATTGCAAGAAAAATAGCA
ACTACAGACTTTTCTGTGTTGATACTTGGAGAAAATGGAACAGGAAAAGAAATATTTGCCCAGGCAATAC
ATAATGAATCTCTAAGAAAAAACAAGCCATTTGTTGCAGTTAATCTATCTTCTTTGTCAGATACACTTAT
TGAAAGTGAACTTTTTGGCTATGATGAAGGAAGTTTTACAGGAGCAATAAAAGGTGGAAAAATGGGTATA
TTTGAAAGAGCGCATACAGGAACAATTTTTTTAGATGAGATAGGTGATATATCTTTAGATGTACAGCAGA
GATTGCTAAGAGTATTACAGGAAAAAGAAGTTATGAGAATGGGCGGAAGTAAAATTATACCAATAGATGT
TAGAATTATAGCTGCAACAAATAAAGATTTAAAGAAAAAAATTAAAGAAGGTTCTTTTAGAGAAGATTTG
TATTATAGGATTAATGTATTACATATAGAGATACCTAGACTTAGAGAACGTAAGGAAGATATACCTCTTA
TAAGTAAGTATTTTTTAGATGAAATAAATAGCAACAAATGTTTTACAGAGGAATCAATGCAAGCTTTAAC
ATTGTATGAATGGCCAGGAAATGTAAGAGAGCTTAAAAATTTAATTTATTATATTGATACTATAGTTGAG
GAAGATAGAGTAGATTACGAGCATTTGCCAGAACAATTTAGATTTGAAAAAAACAATACTTTAGTTAATG
AAAATTTCGATTCAATTATCTTAGATTTCAAACAATCTAATTTCTTTGAGGAAAGTATATGTATATTGAA
CAGTATAGAAACTTGGAATAATAAAAATATATTATTAGGAAGAAATAAACTGCAAGAGATTTTAAAAGAA
AAAGATATAGTTTTAAGTGTAGACCAAATTAGAAAAAGAATAGATAAGTTAAAGAGCCATGGTTTACTTT
TATCTGGAGTAAAAAAACAAGGTAGTTTTATAACTGATGAAGGAAAGAACTTTATATCATATGTAAAAAT
TAAGGGAGTGATATAG
>ref|NC_013316.1|:c3263926-3263117 putative esterase/halogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGTATTATGTATATGTGAATGATATAAACATAGCAGTATATGATTTGAATCCGAGTGCTAAAAAAACTG
TACTTTTTATACATGGTTGGCCCTTAGGACATAAGATATTTGAATATCAAACAAATATATTGCCAAAACT
CGGATATAGAACAGTTTCAATTGATTTAAGAGGTTTTGGTAAATCTGATGCAACATCAGGAGGATATACT
TATAGCCAATTAGCAGACGATATTTATAAGGTGGTACATGCTATTGGATTAAAAGACTTTACCTTTGTTG
GTTTTTCAATGGGAGGAGCAATCGTACTTAGGTATATGAGTTTATTTAATGGATATGGAGTGTCAAAATT
GGTATTAGCTGCAGCTGCTGCACCATCATTTGTACAAAGACCTCCAGAATTTCCATATGGTATGACACGT
GAAGATGTAAATAAATTGATAGCACAAGCATGTACTGATAGACCAGAAATGGTAACCGATTTTGGAGAAA
AAGTATTTGCATCAAATCCACCAGAAAGCTTTAGAAGATGGTTTAATGATATTGGTTTTAGTGCATCAGG
TATTGGCACTATTGGAACTGCTGTATCTTTAAGAGATGAAGAATTATTTAATGATTTAAAATGTGTAAGA
GTGCCTACTGGTATATTTCATGGGAAATTAGATGAAATATGTCCGTATGAATTTGCAGTTTTTATGAATG
AAAAAATAGAAGATTCAATTTTATATACTTTTGAGTATAGTGGTCATGCTATATTCTATGATGAGCTTAA
ACTATTTAATCAGGAATTTTTACAGTTTTTAGAGGAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3264543-3264010 putative bacterioferritin [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTGATGCACATTACGACATGCACAAGCGAAATGGATATTCAAGTGATGAGCCATATCCAGAGATAA
AAGTTTTAGGTCTAAATAAGTATTATGCAGAATTATTGATGGATGACTATGCCGGAGTATCAAGTGAATT
TACGAGTGTAAATCAATATCTATACCATAATTTTGATTTAGATGAAACGCATAGAGAGTTAAGTGAAATG
TGGATAAATATATCTATAACAGAAATGTTACATATGGAGATATTAGCAAAGACTATAAGATTATTGGGTG
GAAATCCTGTATATAGAGGTTCTACAAGTTCTTGTGGTGCATATTGGAATGGTGGTTTTGTATGTTATGG
AAATTCTATTTGTAACAGATTAAAACTAGATTTGCATTTGGAGCATGTGGCTATTAATAATTATTATAAA
GATATAAGTCTTATTGAAGACCCTTATATAAAAGCTATATTAAATAGAATAATCCTAGATGAAAAACTTC
ATGTAAGTTTATTTGAAAAGGCAATAGAGAAGTATTGTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3266745-3264670 hypothetical protein CDR20291_2757 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTGAAAGGATTATCTTTTCGTAATGCAAGACGACAAGCAGGAAAGTACCTTATTTATTGGTGTTCCT
TAATAGGCTCTGTAGCTTTGATTTATGCTTTTAACGCTTTGATATTTTCCGACGTAATGCAAGAACTTTC
TAGTATACTTAATAATGGAGGAAGCGATGAGTTTTCTTATATGATTATCATATTTTCGTTCATTATTACT
TTTATTTTAGGCTGGTTTGTTAGTTATATGATGAATTTTATATTGAAAAAAAGAAGCAGAGAAATAAGTA
CTTATATGATATTAGGAGTAGATAAAAAACAAATTGTTAAAATGCTTTTTATAGAGAATCTTTTATTAGG
TGCTTCTGCTCTTATTGTTGGATGGATTCTAGGGATATTTGTTTCTAAGGTTTTGGAATCTATTGTTATT
AATATGTTTCATGGAAAGTATTCTTTATCTCCGGATTTTTCATTAAAAGCTGCTGGGATGACTTTTTTAT
ACTTCTGCATAATATATTTAATTGCTCAATTAAAAAGTAATAAAAAACTTGTTAAAATGAAATTAATTAA
TTTGCTTAATTATGATCGATATAATGAAAATGTATTAATTCACCAAACAAAAACGAAGTCTATTATGTTT
TGTGTGTCTGTTTTGTGTGGAGGTATGGGTATTTTTTTCTTTTCAATACCTAGTGGTAGATTAACAGATG
TATTTCTTGGTTTATTGTTGATTGTATTTTGTCTAATCGTATTATTTATGGGATTTGGATCTATTGCACA
GAATATGTTTGAAAAAGGGATGAATTGGAAATATAAGAAATCTCACTTATTTTTGTATCGTCTACTGGCT
TCAAAGATAAATGGAATAAGCATTATAATGGGTATTATCGCAACTCTTTTTACAGTATCAATTGCTTGTA
TTGGAATAGCTAACTCATTTTATTCTGTGATGAATAAATCAGTGGATTTACAACAATTTGATGTGAGTAT
TTTTCACCCGAATGAATCATATGATTTTTCTTCATATGAAGGATATTTATCAGAAACGAAAGGTGTGAAA
AAGGATTATTCTTATACTCTTTACACAGAAGAAAAAACATCCTTTATGAAGGTTCGTAATAATATCCTTT
CTAAATACTTGAAAGATATAGGGCGAGATTTACAATATAAGGATTATACTTTTGCAGAAAACCAGTTTGA
CACATTTATGAAATATAGTGATTACAATATACTAAGAAATATGTTGGGTTTAAACCCAATAAAGATGGAC
AAAAATCAATTTATCATCCATTGTATGCCTTATCTTGCTGATGCATATAAGAATTATATTGGAGAAAAAT
ATAAACTGACAATATCAGATAAGGACTTAAGTATTGCAGGTATTTATATAGAGAACTTTTCACAGTATGG
AGGATATGGAAATGGACAAGAATATATTATTGTCATTCCAGATTATTTAATTGATAATATGAAACCTCTG
TATAGTCTTTATGTTGCTATTACAAGTGAGCCTTTGGATAGTGCTTATTTTACTGAGTTTCAGAAAAAGT
TTGATACTTTAGAAAATCTTAATTCTGGAGTAGTAGTAGCAGGTAATCAAGGCTTTGTTTCTAAATTACG
ATATGATAATAAGGATTATATAAGTGGAAAGTATGCTATGCAATCTACTGGTCAAGCCATTATCTTGATA
TTACCACTTTTTTATTTGGCACTCATTATATGCATTATTGGTACAGTCATTCTCTCTATTCAATTATTGA
GCGAAAATAACATTATCATAAAACACTATGGAATGCTTCGAACTTTGGGGATGATTGATAGTGAAGTAAT
AAAAATCTTAAAGAAACATGTTTGTTTATATTTTTCGATTCCATTAATTCCTGCAGTAATATTTGGTGGA
ATATTGGTATCAGTTTTTTCATACAACATGTTTAATATTTCTTTTGATGCTCCAGTATTTTTTAATATTC
AGATTCCTATCTTACATGCTGTAGCCATTACGCTTATTAATTTTGTAGTAATATATTGTATATATGTTTT
TATTACATATGTAGCACTAAGGAAAGAAATATTGCATATCAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3267494-3266748 putative lantibiotic ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGCTATTACGAGTAGAGAACATTGAGAAATATTATGGCAATCAGAAAATACTTACAAAGGCCTTGAATG
ATGTGTCATTTCAAATTAATACAGGAGAGTTTGTCAGTATTATGGGAACTTCTGGCTCTGGTAAAACTAC
TTTGTTAAATTGTATTGCTACAATTGATACAGTAAGTGCTGGAAAAATTTATCTTGAAAATCAAGATATT
ACTGAACTATCCGAAGAAAACTTAACTGTTTTTCGTCGTGATAATTTAGGTTTTGTTTTTCAGGATTCTA
ATTTATTAGATACTCTGACATTAGAAGAAAATATAGCACTTCCACTTACAATAAAAAAAGTTTCTCCTGT
TGAAATTACTAATAGTGTGTATAATATTGCCACACAATTGAAAATTGAAGAGATACTTTCGAAGTTTCCT
TATGAAGTATCTGGTGGTCAGAGGCAACGTTGTGCAGTAGCTCGTGCAGTTGTAACAGAGCCCAAACTTA
TTTTGGCAGATGAACCAACTGGTGCATTGGATTCTAATTCATCTAAAACTTTAATGGAACTTTTGGAAAC
TATAAACACCATATTAGAGGCTACGATTCTTCTTGTCACACACGACGCTATTTCAGCTAGTTATACTGAG
AGAATTTTATTTCTAAGGGATGGGAAAATTTTTAACGAACTTAGAAAAGGAGAAAAATCCAGACTTACTT
TCTATCACGAAATTTTGGATGCACTTTCTTTGATGGGAGGAGATTGA
>ref|NC_013316.1|:c3267903-3267508 sortase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAAGGATATTAACTATATTATGTGTTGTACTCGTTTTGTTTATTTCAATTACAGGATTGGATT
CGATGGGTTTTTTCTCACGAAGTATCATACCACTAAGGTCTGAATATGCTTCTTTTATTAGAAAAAATGG
AACTATTACAGAAGTAAAGTTTACTGGTCCCTTTAATCATAATAACATTGATTTAAATAAAAATGTAGAA
GATACTAATAAAAATGGAGATGATAATGAATTAACAATAAAATACGATATTGAAGTAAAAAAATCTCTAA
TTTCATCTAATGAACCTACTATTCAAATTCAAGACTCTAAAGAAAGCATATATGTATATATCTTGAATTT
TTCAGATAAGACAATAATAATTAAAAATGGAAAAATTGTTGACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3269038-3268016 two-component system, sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGTTTTGTAATTTTCTTCAAGATAAAGTATTAGTTATACTCTTAAATATTTGTTGTGCAATTTCAT
TAGTGCTATATCTTCATCTTATAGGGATTGGTCAAGGAGAGTTGACTCTTCTTATAGCCGCTTGGGTCGC
AATTTTATTTTGTTGGATATGTTTTTGTTATCAAAAACAGAAAAAAGAAATTATTAAGTTACGTCGCATT
GTAGACGAATTGGATAAAAAATATCTGTTTATTGAAATGATTGAAAAACCTACTTCTAACATAGAACGTG
AATACTACAATATTATTAGATTATCATTGAAATCTATGACAGATCATGTTTCTCAAATACATCGTGAAAT
GTACGAATATAGACAATTCATTGAACAATGGGTACATGAGATAAAACATCCTGTTACAACATCAGAACTT
ATATGTGAAAATTATAAAAATGAACATACACGAAAAATTCGTTTTCAAATGGAAGAAATAGAACGTCATA
TTGAGCGTGCATTGTACTATGCTCGCCTTGGCCATGTTGAAAAAGATTATTTAATTTCTGAAATAACATT
AAAGTCAATTGTAGAAGAAGTATTAGCAAAGAATAAATTGCTTCTTATACAAAATAATATTCATATTAAT
ATACAGGATTTGGAGTATAGTGTATATACTGATAAAAAGTGGATAGTTTTTATTTTAAATCAAATTATTA
TCAATAGTGTTCAGTACAAAAGTGATTCAGCTGAAATTTCATTTTTTGCAATAAAAGAAGACAAGAGTGT
TAAGTTTACTATAAAAGATAATGGTATTGGCATCAAAGAAAGTGAAATTTATCGAATTTTTGAATTAGGT
TTTACTGGCAGTAATGGAAGGACTACAAACAATTCTACAGGGATTGGTCTTTACCTTTGTTATGAACTGT
CTAAGAAAATGGGAATTGATATAGATGTGTCCTCCAGCCTTGGTGAATACACAGCAATAACATTGAATTT
CCCAATAAATACAGCTATCAATATGCAGAAGCAGTGCAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3269649-3269035 hypothetical protein CDR20291_2761 [Clostridium difficile R20291]
ATGCAATTCTTTGAAAATAATGGCTATAGTACACAAACATTGGATACAAATAATTGTGATGTACTTCAAG
TAATCCAAGAATCAACACCTGACTTAATTCTCTTGGATATCAATTTGCCTAATATAGATGGTTTTTCTTT
ATGTAGACAGATTAGGAATTGTTCTACTATACCTATTATTTTTATTACAGCAAGAGATAGTGCAATTGAT
GAACTAAATGGTTTGACTATGGGGGGAGATGACTATATTACAAAACCATATAACTTACCTTTGCTTTTAG
CAAGGGTAAAGAACCTACTTAAAAGAGTAGATTCATCAGATAAACAGAAAATTAAATATAGAGAGATTAT
ACTCAACCTTATTTCAGCTACAGTAGAATACCAAAATGCTGTTATAGAACTTTCAAGAACTGAACTAAAA
ATCATGTATTATTTGTTTCAGAATGTAGGGAGTATTGTGCCTCGTATAGATTTGGTAGAATATTTATGGG
ACAATCATATTCATATTGATGATAATGCTTTAAGTGTAAACATTACAAGGCTTAGAGAAAAGTTAAGGGG
TATAGGTATTACTGACTTAATCATTACAAAACGGGGGATGGGATATAGGATATGA
>ref|NC_013316.1|:c3271141-3269792 putative regulatory protease [Clostridium difficile R20291]
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TATATTATTATACAGGAGAAAATTTAAGTATAAATATATATGAAGGAGAAGTTGAGAAATACAATCTTGA
TAAATCTTTTGGTTTATCTTTTAGAGGTAAGGTAAATGGAAAGATAGGTTATTCTTATACAGAAATTTTA
GATGATAAAGCTGTTGATATGTTGATAAAAAATGTAAAAGATGGAGTAAACACTATTGAAAATGAAGATG
TACAATTTATATATGAAGGAGATAAGCACTATAATGATGTAAAGACTTATTCTAAAGAGCTAGAAAATTT
AGAGGCAGATAAGTTGATTGATTTAGCTTTAGAAATGGAAAGAGAGACTAAAGCTTATTCAGATAAGGTG
GTAAATTTATCTAAATGTACTATATCTTATTCTGTATCAAGTAATGGTATATCTAATACTAAAGGTCTTA
ATTTAAGCAATAAAACTAATATGCTTATAGGGTTTGTAGTTCCTATCATAGAAGACAATGGACAAAAATA
TGATGGAATAGGATATAATAGAGCAAATTCTATTGAAGAAATAAAACCTTGTGAGATATCAAAACTTGGT
GTTGATAATGCTTTATCTAAAGTAGGTGGTAAGAGTATTCCATCAGGTAAATATAAAACTATATTGCTTA
ATGAAGCTATGGTATCTTTGCTTAGCACATTTTCTGGGATATTTAATGCAGATTCAGCTCAAAAAGGATT
ATCTTTATTGAAAAATAGAGAAGGAGACATGATAGCATCTCCTATAGTTACAATAGTTGATGACCCACTT
TTAGAAAATGGTATGGCATCTACTCCTTTTGATGATGAAGGAGTAGCTACATTTAAAAAAGAAGTTGTTT
TAAATGGAAAGCTTATAACTTTACTTCATAACTTAAAAACGGCTAATAAGGCAGGTGTAAAGACTACAGG
AAATGGAATAAAATCTTCATATTCATCACCTATAAGCATATATCCAACTAATTTTTATATAGATAAAGGA
GATAAATCTTTAGATGAAATTATAAAGGATATAGATGAAGGATTGATGGTTACTAGCTTTGCAGGGCTTC
ATTCAGGTGCAAATTCAGTAACAGGAGACTTTTCTTTAGCTGCCAAAGGCTTTTATATCAAAGAAGGAAA
AAAAGTATTTCCAGTGGAGCAAATTACAGTAGCAGGAAACTATTTTGACCTGTTGAAAGATATTGAAGTT
ATAGGGGAAGATTTAGAATTTCCAATGAGTAGTATAGGTTCACCTTCAGTTGTTATTAAAGAGCTATCAG
TAGCTGGAAAAGATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3272535-3271153 putative regulatory protease [Clostridium difficile R20291]
ATGCTTTCAAAAAATATAGCTTCTAAGGTATTAGAAAAGTGTCTAATTACTGGAGGAGATTTTGCTGAGA
TTTTTGAAGAAGACACTATAAATAATTCTATTAGTTTAATTGATAATAAAGTAGAAAATGCAATAGGTGG
AAGAAATTATGGTATAGGAATAAGAATATTTAAAGGATTGAAGAGTATATATGCTTATACAAGTGACAAT
TCATTAAATAGTCTGTTGGATGTAGCATACAAAGCTGCTGTTGCTTTAGGTAAATTGGAAGATGGAAAAA
GTGTAATATTAAATGACAGTATTAAAATAAATAACATACATAATATAAAAATTTATCCAAATTCAATAGG
AAATAGAGATAAAGTAAGTGTTATGAAGGTTGCATATAAGAGTGCAAAAGAATTTAGTAATGATATATCT
CAAGTAAGTGTTAGCTATTTGGATAAAGACCAAAAAATATTAATTGCAAACACTGAAGGTATATATGTTG
AGGATAGAAGAATAAGAACCAGACTAGGGATAAGTTCAATTGCATCTAAGGGTAATGAAAATCAAACTGG
ATTTGAAGGTCCTGGAGGTTGTAAAGGGTTTGAAATATTTGAAGAAATAGACCCAGAATATTATGCAAAA
GAATCAGCTAGAGTAGCGCATACTATGTTGCATGCTAAAAATTGTCCTGCAGGTAATATGATGGTAGCAA
TAGATAATGGATTTGGTGGAGTAATATTTCATGAAGCTTGTGGACATTCTTTGGAAGCTACATCAGTTGC
AAAGGGGAACTCTGTATTTGCAGATAAATTAGGTCAACAGATTGCTTCCACAAAGATTACAGCTATAGAT
GATGGTACAATACCAAACTACTGGGGTTCTATGAATATAGATGATGAAGGAAATCCAACTCAAAAGAATA
TACTGATTGAAAATGGAATTTTGAAGTCTTATATGATAGATAAACTTAATGGTAGACGAATGGGAATGAA
TCCTACAGGAAGTTCTCGTAGACAGAACTACAAATTTGCACCAACTTCAAGGATGACTAACACTTATATT
GCTGCTGGAGAAGATAGACCAGAAGACATTATAAAGTCAATACCAGATGGACTTTATGCTAAAAAAATGG
GTGGTGGTTCTGTAAATCCTGTAACAGGAGAGTTTAATTTTGCAGTTTCAGAAGGTTACTTAATAAAAAA
TGGAGAAATACAAGAGCCAGTGAGAGGTGCTAGTTTAATTGGAAAAGGTAGCGATATACTTATGAATATA
GATATGGTTGGGAATAACGTAAAACAAGCTCAGGGGATGTGTGGCTCATCATCAGGAAGTATACCAACTA
ATGTAGGCCAACCTATGATAAGGGTAAAAGAAATTACTGTAGGTGGAAGATAG
>ref|NC_013316.1|:3272779-3273993 putative oxidoreductase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATCAAGAATATGTAAAAGGAAATCCTATTTTTACTAATATTAATAAAGTTCCAAGACAATTTCCAT
ACCTTACTGATGATATTGATACTGATGTTATAATTGTTGGTGGTGGCGTAACTGGATGTATTTGTGCTTA
CTATCTAGCTAAAAACAATATAAAGTCTGTCATTCTTGAAAAAGGAAGGATTGCACATGGAAGCACTAGC
GTGACAACTTCTCTATTACAGTATGAATTAGATGACAATTTGATAGATTTAACAGAGGTTATGACTCTAA
AAGATGCTCTAAAAGCATATAACCTTTGTACTTCAGCACTTGAAGAATTAGATACATTTATAAAGCTATA
TGGAAATAAGTGTGATTATGCCAAAAGAGATACTCTACTTTATACTGCCAACAAACTTGAAATTAAGGCT
ATCAAAGAAGAATATAACTTAAGAAAAGAAAATGGATTTGATGTTGAATATATTGATGAATCCACAAACC
CTTTTAGCTTTGATTTAAAATCAGGATTGATAGCAAAGAATGGAGGACGAGAATTAGACCCATATAAATA
TAGTCACCATTTGATTGATGTAAGTTTAAAAAATGGTCTTCAAGTATATGAAAATACAGAAGTAAAAAAA
GTAGATTTATCAAATGATAAGGTTACTGCTGAAGTATCGTATGGATACAAAGTTCATGGTAAAAAATTAA
TTGTAGCTACAGGGTACAATACAAGTTTATTTACAAAAAGAAATTTTGCAACTAAGTCAAATACTTTTAA
TATAGCAACTAAACCACTTAAAAACATAGCTTCTTGGAAAAACAACATTTTAATTAGAGATAACTGTGAC
CCATATAATTATCTAAGAACTACTAAAGACAATCGATTAATTATAGGTGGTGAAGATGTAAGTTTTGATG
ATATAGAAAATGAAACTTTAGCCAATGAAAAGTATGATATTTTAGAACAAAGATTGAAAAGTATGTTTAA
GGATATAAAAGACATTGAAGTTGAATATAAATATTGTGGTTGTTTTGCTTCAACTTTAGATAATTTAGGT
TTTATTGGTCCAGATAATAAAAATAACAATCTATGGTATTGCTTAGGTTATGGAGCAAATGGTATACTCT
TTGCAATATTAGGAGGTATAATGTTAAGTGAATTATATCTTGGCAAACAAAATAAAAATATGAAATTATT
TAAAGTAGATAGATTTGATAAATAG
>ref|NC_013316.1|:3274170-3276083 putative sigma-54 dependent regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATATGGAGGAATTATTATGAAAGAAATACTCGTTATTGCTCCCACTAAAGGAACCTATGAAAAAT
CAATTCACATAGTTAAAAAAAACAAATATACAAATATTGATGTTGTATTTGGCAATCTAAAAGAAGGTAT
ACCTCTTGCTGAAAAAAGTATTAATCATGGTACTAGAATTATCATAAGCAGAGGTGGAACTTACAATATG
TTAAAAGCTACTTACAATATACCTATAGTTGAAATTAAAGTAGATGCTTATGATATTATAAAAAGTTACA
AAGAGGTAAAAAATTCCAACGAACCATTTGGAATAATTGGATTTAATAATGTCATCTACGGTTTCGATAT
TATAGAAGAAATATTGAATAAGAAAATAACTATGATTGAAATTGAAAAAGAAGAAGAAATTTATGATGCT
ATAGAAAAGTACAGAAAGAAAGGTATAAACACATATATAGGAGATACCACTGTTGCACATATTGTTAAGA
GACTTAATTGTAAGGGAATATTAATCGAATCTAGAGAAGAAAACATACTTAGAGCCATTCAACAAGCAGA
ACAAATACTCGAAGCAACCAAGGATGAACAAAAAAGAAGATTACAGATAGAAGCTATGACAGATTTTGTA
CATGATGGAATAATAACAGTTGATAAAAATTTTAAAATAACATTATTTAATAAGAGTGCTGAAAAAATAT
TTGGTATAAAAAAAGAAAATGCACTTTATCATAATGTTGTAGATGTTATCCCAAACACAGTTCTTCCACA
AGTAGTTGAGACTATGGAACCTCAAATTGGTGAAATACAAAATATAGGGAGTACAAAAATTATTACAAAT
AGAGTTCCAATAATTGTTGATGGCCAGATTCAAGGGGCTGTTTCAACATTTCAAGATAGCAAGGAGATAA
GTTCTTTTGAACATACAATAAGAAGGAGCTTATTAAGCAAAGGTCTATCTGCTAAATACACTTTTGATAA
TATAATTCATGCTAGTGAAAAGACAAAAGATTGTATAGAACTTGCAAAAAAATATGCTTGTTATGATACT
CCTATGATTATTACTGGAGAATCTGGAGTTGGTAAAGAATTATTTTGTCAAAGTATACATAACTATAGTA
AGCGTAAAAATGCACCTTTTGTTGCTGTAAATTGTGCTGCCATACCTCCATCTCTAATAGAGAGTGAGTT
TTTTGGTTATGAGGAAGGTTCATTTACAGGTGCTAGAAAAAAAGGTAAAGCAGGTGTATTCGAACTAGCA
CATGAAGGTACAATCTTCCTAGACGAAATAAGTGAAATCCCTCTTGAACTTCAAGGTCGATTATTGAGGG
TATTGCAGGAAAAACAAGTTATGAGAATTGGTGGTGATAAAGTTATTCCTATAGATGTAAAAATTATCTG
TGCTTCAAATAAAGACTTAAAAAATATGATGCGCAATGGTTTATTTAGACAAGACCTTTATTTTAGAATA
AATATACTAACATTATATCTTCCTTCATTAAAAGAAAGAAAAGAAGATATTATAAAATTATCAGAATTTT
TTATACATAAATATTCAAGCAAATACAATAAAACGCCTTTAATTATCACTCCAAATATTAAAAAGGCACT
TCTTGAACGAGAATATGAAGGTAATATAAGGGAATTGGAAGGTATGATGGAAAGGGCTGTTATTGTGGAA
TCATTTGACTCGATTTTATTAGAAAAGGTTAGCAATGAATATACAAATAATATAGTTGATAAAGATAATA
GTGATTTTGAATGCAGTAATTTAGATTTAAAAACTTTAGAAAAAAAATATATCTATAAAATTTATAACGA
AAATAATAGAAATACTACAAAAACCTGTGAAATTCTAAAGATAACTCGCTCCACTCTATGGCGTAAGTTA
AAAGAAATAGAAGATGATGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:3276354-3277328 2-keto-3-deoxygluconate permease [Clostridium difficile R20291]
ATGCACATCTTAAAATCAGTGAAAAAGATACCAGGAGGACTTATGGTCTGTCCCTTGTTATTGGGAGCAC
TATTTAATACAGTATGTCCACAAGCTCTTGAAATTGGAGGATTCACAACATCCTTATTTAAAACTGGTGC
AATGAGTATACTTGCTCTATTTTGTCTATGCAATGGAGCTCAAATCAATATCAGGCAAGCTGGTAAGCCA
TTGACTAAAGGTATAGTACTTACAGCAACAAAATTTATAATTGGTGCAGTATTAGGTATTATTGTTAGTA
AATTTATTGGACCTAAAGGTATAATTGGTATTACACCTCTTGCCATAGTTGCTACCATGACTAATTCAAA
TGGAGGTCTATTTGCTGCTCTTGCAGGTGAATATGGTGACTCCACAGATGTTGGAGCAATATCTATCTTA
TCTCTAAATGATGGTCCTTTTTTTACAATGCTTGCTTTTGGAGTAACTGGACTTGCAAATGTACCTATAG
TAGCACTATTTGCAGCACTTATACCAATACTACTTGGATTTATACTTGGTAACCTTGATGAAGATATACG
AGAATTTCTTGCACCTGGTACAACATTATTAATTCCTTTCTTCGCTTTTCCTTTAGGAGCAGCATTAAAC
TTTAATCAAATTATAACTGCTGGACTACCTGGAGTTGTACTTGGTTTAGGAGTTACTATAATAACAGGTA
TGGGTGGCTACTTTGTAATGAAACTTATACGTGCAGAACATCCAGCAGTAGGTGCAGCTACAGGTACAAC
AGCCGGAAATGCAGCTGGTACTCCTGAAGCTTTAGCAGCTATAGACCCTACTCTAGCTACAATAGCAGCT
GTTTCAACAGTACAGGTTGCTGCTGCTATTATTGTTACAGCAATATGTTGTCCAATGTTAGTTTCCTATC
TAGATAAAAGAGAAAAAAAGAAAAAATCTATTTTTAAAACAAATAAAAATATTGAAGTAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:3277349-3277624 altronate hydrolase (N-terminus) [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGCAATTATTCATGCAAATGAAAAAGATAATCTAGTTACATGTGTCAGACCTTTAGTTAAAGGTG
AAAAAGTTTCAATTGATGGAAAGTCTTACATAGTAAATGATAATATACCTGTCTTTCATAAGATGGCTAC
AGAAGATGTAAAAAAAGGTGATGTTGTATACAAATACGGTGAAATTATAGGAATTGCAACAGTTGACATA
AAAACTGGTGACTATGTTCATGTACATAACATTGAAAGTACACGTGGTCGTGGAGATAAAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:3277637-3278800 putative altronate hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTAATGGGTTATTTAAGAGAAAATGGTCAGTTTGGTATTCGTAATCATGTTTTAATTATTCCAA
CATCTGTATGTTCAAGTGAGACAGCTACAAGAATAGCATCACTTGTGCCTGGAGCAATAGCAATCCCTCA
TCAACATGGATGTTGTCAAATTGGTTCTGATATAGAGCTTACAGCAAAGACATTAATAGGATTTGGAAAA
AATCCTAATGTTGCCGCAGTTTTAGTAGTTGGTCTTGGATGTGATGGTATTCAAGCAAAAGAATTAGCAT
CTGAAATAGCTACAACAGGAAAAAAGGTAGATTACGTTGTTATACAAGAATGTGGTGGAACATTAAAAAC
AGTTTCTAAGGGAACTGAAATAGTAAGTAAAATGGCTCGTGAAGTATCAAAAGAAGTAAGAGTTGAATTT
GGTATGAGTGAAATTACATTAGCACTTGAATGTGGTGGTTCTGACCCAACAAGTGGAATAGCTTCAAACC
CTTCAATAGGCGTTGCATCAAACCTTCTTGTAGATGAAGGTGGAAGTAGCATACTAAGTGAGACTACAGA
AGTAATTGGTGCAGAACATTTGTTGGCTACCCGTTTTGAAGATGAAGAAATGAAAGATAAGTTTCTTAAA
TTTGTAAGTGATGTAGAAAAAAGAGCAATTGCTATGGGAGAAGATTTACGTAGTGGTCAACCTACTCCAG
GTAATAAAGCTGGTGGACTTTCAACAATTGAAGAAAAATCACTTGGGTGTATGTATAAGGCAGGCAATAA
GCCATTCAAAGGTGCTCTTGAATATGCTGATATTGTACCTCCTGATAAAAAAGGATTATATTTTATGGAT
ACTCCAGGTCAAGATATAGATTCTATCACTGGTATGGTAGCAGGTGGTGCACAAATTGTAATCTTTTCAA
CTGGTAGAGGTACTCCAACAGGAAGCCCTATTTCACCAGTTATTAAAATCACTGGGAATAGTGATACATA
CAACAAAATGCCAGACAATATCGATATAAATGCAGGTAGAATTATAACAGATGGTGCTAAAATAGCAGAT
ATAGGTCAAGAAATATTTAATGAAATAATAGAAGTCTGTAATGGTAAACATACCAAAGCTGAAAGTCTTG
GTCATAGAGAATTTGGCATTTACAGAATTTCATCTACATTTTAG
>ref|NC_013316.1|:3279137-3281155 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAACTTTGAAAACACAAAAAATAAAAAAATAATAGCTACTTTACTATTGACACTCCTTTTAATCGTGT
CATTAACATGTGTCAATTTTATTATGAATCTAAATAAAGTAACACATAATGAAACAGAACGATATCTTGT
AGAAGTTTCACAAAGTATTTCCACTACAATTAATGTGAAATGTAAAAGTATATTTAGGACACTATATTCT
ATGGGAGATACTTATTTTGAGATTAATGATAGTGAAAAAGAAGTCAATAGATACTTATCAAAAAAATTAA
AATTATTTGAATTTGATTGGTTAGGTATTATAGATTCTAATGGAAATTTTGTAAGTGCCCTTAAAGATAC
AGGTAATGTTAAAGGACAAGACTTTTATAGAAAAGCCCTTCAAGGTAAAGAAACAATTACTCCTGTTAAA
TCACAATCTGGTACATATGGAATTTTATATTCTGTACCACTATACAATGGCGATAAAATTGTTGGAGCTG
TTGCTGCTTGGAATACTATTGATACTATGAGAAATTTATTAAGTGTAGAAAGCTTTCATGGTGAAGGATT
TTCCCAAATTATCGACCAAGATGGAAATTTTATTGTAAGTTCAGCAAACAAAAATGCTCCAAAAAATGTG
GTAAATTTTTTTGACATGATTAAACACCAAGGAAAACAGGTTGATAAAAATAAACTTGAAGAAATGAAAA
TAAACTTAAAAAAGAACAAAACTGGTTCTATGTATTATACATTAAATGATGGTATTTCTAAGGCAATGCA
TTATCTTCCATTACAAGAAGAAAACTTATACCTCCTTTCAGTTGTTCCAACAAAAACAGCAAGTGCACAG
TTTGATTTACTTCTAAAAAAAGCAATCTTCATCAATATTTTAATTGTTATACTATTTTTATTGCTTATTA
TATTGATTATGTTTATAAATCAAAAGAACAGGGCACAACTTATAAAAATCGCCTATGTAGACTCTGTAAC
TAAAGGTTACAGTAAAGCACGTTTTGATATTGAAGCTAAAAAAATTATACAGTCATCTTCATCAGAAAGC
TATTCATTGGTATCTATAAATATTCAGAAATTCAAACTTATTAATGATTCTTTTGGTAGTGAAGCAGGAG
ATAAAACATTAAAGTACATACATGATGTCATTAGTAATTATCTAGAACCAGGAGAATTGCTTTGTCGAGT
TTCTAATGACCAGTTTAATGTACTTATTAAAACTATTCCTCAAAAAGAAATTCTTAAGTACATAGAAAAT
ATCACCAATGATATTAATAGTTTCAATAAAAATGAAGAATGTAAATATTTTATAGCTCTATCTATAGGTG
TATATAAAATTGATGACCCAAATCTACCTTTAGTTTCAATTCAAGACCGTGCAAATGTTGCACGAAAAAA
TAATAAAGGAAACATTGGAAATCATCCACTTTATACATGTGTTTTTTATAGTGATTTAGAGCGTTTAAAA
ATGATTAAAGAAAAAGAAATGGAAAATAGAATGGAGGAAGCATTAAATAATAACGAATTTATAGTATATC
TTCAGCCTAAAATAAGCCTCAAAGATAATACTATTGTAGGTGCAGAAGCATTAGTAAGATGGCAAGACCC
AAATAAAGGCCTTATACCACCAGACGAGTTTATTCCTTTCTTTGAAAAAAATGGTTTTATTACAAAACTC
GACCACTATGTTTTTGAAAAAGTATGTAGTATGATAAGAAAATGGATAGATAATGGAGAAACTCCAATGC
CTGTTTCAGTTAATTTTTCACGTGCTAATTTAAATAATATAGATTTTTTAGAAAAATACAGAATGCTTCG
TAATAAATACAACATTCCTGCTAAGCTCTTAGAAATTGAATTAACTGAAACACTTGTATTTGAAAATCTC
CAAAAATTAATTAATATAATAGACCAAATCCATGAAGAAGGTTTTCAATGTTCACTAGATGACTTTGGAA
GTGGATACTCTTCACTCAATATGTTAAAAGAAATAAAAGTTGACACATATAAAACTTGA
>ref|NC_013316.1|:c3282852-3281512 putative drug/sodium antiporter [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGAATCAAGAAGCATTAAGACATGAAAAAATATGGATTTTATTATTTAGGTATTCGATACCGGCAA
TAATAGCAATGATGGTAACTTCACTTTATAATGTAGTAGATAGAGCTTTTATTGGTTCTATGGAAGGTAT
TGGCTCTATAGCTATTGCAGGTCTTGGTGTAACTATGCCAGTATTTACTCTAATAATAGCTTTTGGAATG
TTGGTATCAGTAGGTGCTAGCACAAGATTGTCTATAAAATTAGGGGAAAGAAATAGAGAAGAAGCAGAGA
AGATATTAGGTAATGCTTTGACATTATCTATAATTATCTCTTTAATTATAACTATATTAGGATTAGTTTT
CTTAGAAGATATACTTTTTATTTTGGGTGCAAGTAAAGATTCAATATTTTATGCAAAAGACTATATGAGT
GTCATATTGATTGGAAGTATATTTAATTTAGTTGCATTTTCTCTTAATAATGCAATTAGAGCAGAAGGTA
ATCCAAAATTAGCAGCAAGGACAATGATTGTAGGATGTGTATTAAACCTGATATTGGACCCTATATTTAT
ATTTGTGTTTAATTTAGGTATAAAAGGAGCAGCTATAGCAACAGTACTATGTCAAATAGTAGTATTCTTT
TGGGTAACATATTATTTTATAAGAGGGAAGTCCACTTTAAAACTAAAAAAATGTAACTTAAAATTGAATA
AAGATATAGTAAAGAAGGTATTTGCAATAGGAATGACACCTTTTGCTATGGAAGTAGCTATAAGTATAAC
TCACATGTTTACAAACAATTCTCTAAAGGTTTATGGTGGAGATTTAGCTATTGGGGCTATGACAGCACTT
ACATCTATTTTATTGATGTTTATGATGCCTGTGTTTGGATTGAATCAAGGTATGCAAACTATAATATCAT
ACAATTATGGTGCAAAACAATATGAACGTGCAAAGAAAACTTTAATATTATCTATCATAGTGTCAGTTGT
CATATTGTCATTTGGATTTTTAATAGTACAAGTTTTCCCAGAAGTATTTGTAGGTATATTTAATAAAGAT
TCAGATTTGATGGATATAGCAGTAAGAGGTATAAGCATAAATCTAATTACATTGCCTATAATGGGGATTT
CTATTGTAGGACCTGTGTATTTTCAGTGTATAAGTAAAGTTAAACATTCAATGTTTTTAACTCTTTTAAG
ACAATTTATTTTATTTATACCATTAATCATTGTACTTCCAATTCAATTTAATTTAGATGGTGTTTGGTTG
GCACAGCCAGTTGCAGATTTTATTGCTATGATAATCGTATTATTATTCTTAAAAAGGGAATTTAAAACAA
GCCGAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3283646-3282864 putative ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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TAAATATACCAAAAGGAAAAATAACTACCATCATAGGGGCTAATGGTTGTGGAAAATCGACAATACTTAA
AACTATAGGTAGAATTATTAGCCCTAATAGTGGGAAAATATATATAAATGGAGAGGACATCTACAAAAAG
AAGTCTAAAGAAATAGCAAAGGATATGGCTGTACTTCCACAAAGCCCTCAAGCTCCTAGTGGTCTTACCG
TTTCAGAATTAATTTCTTATGGAAGATTTCCTCATAAAAGTGGATTTGGTAATTCTAGTAAAGAAGACAG
AGAGATTGTAAATTGGAGTTTAGAAGTTACTGGAATTGCAGAATTTAAGGATAGAAATATGGAAGATTTA
TCAGGAGGACAAAGACAAAGGGCATGGATAGCTATGGCTTTGGCACAAGAAACTGATATATTATTACTGG
ATGAGCCTACAACATATTTAGATTTGGCACATCAATTAGAGATACTAAAATTATTAGATGAACTAAATAA
AAAACAAGGAAGAACTATTGTCATGGTAATACATGAACTTAATAATGCAGCAAGATTTGCTGACCACATG
ATAGGTATTAAGAAAGGTAAAATAGTTTGTGAAGGTGATGCATATGATGTTATGACGAAGGATAATCTAA
AAGAATTATTTAATATTGATGCAGAAATAGCAACAGACCCAAGAACAAATAAACCAATTTGTATAACTTA
TGACATGGTGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3284683-3283661 putative ferrichrome ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATATTATAAAAATAAATTCTAAAACATTACTTGTTATATCAATTTTAATGGTGCTTATTTTTA
TCACTTTTTTATTGAGTTTAAATATGGGCTCATTTTCTATAGAACCAATGGATGTTATAAAGACTTTTTT
AGGGCAGGGTCAGCGTAATCATGAAATTGCAATATTTAAATTAAGATTACCAAGAATAGTAATAGCACTT
TTGGTTGGTTCTGCATTATCAACAGCAGGTGTAATACTTCAAGGAGTTACAAAGAATGATTTAGCTGATT
CTGGAATTTTGGGAATAAATTCAGGTGCTGCATTGTTTGTAGTAGTTTATATATACCTTATGAATGGTAA
TGTATATGAAGGTATGAGTAACTTGACTGTATTTACAATGCCTATTGTTGCACTTATAGGAGCTTTATTT
GGAGCATTTCTTATATATTCTCTTGCATGGAAAGGTGGTATAAATTCGTCAAGATTACTACTTATTGGTA
TAGGTGTAAACATAGCTTTTACTTCAATTTTGACGATATTCCAATTGAAATTTACAACACAAGAATTTAA
TAGGGTTATGGCATGGACATCAGGAAGCATTTGGGGAACCAGTTGGAAATATGTAATAGCTGTGCTTCCA
TTTATAGTGATTTTTATGGGTATAACTATTTATAAATCTAAATATATAGATGTTTTAAATTTGGGTGATG
AAGTATCTATAAGTCTTGGTGTAGATGTAGAAAAACAAAGAAGAAGACTTATAATATATGCAGTAATTTT
ATCTGGTGTATCGACAGCAGTAGCAGGTAGTATTTCATTTTTAGGTTTAATAGCTCCACATATAGGTAGA
AAAATAATAGGACCAAAGCATAAAAGATTAATACCAGTATCAGCATTGATAGGAACATTATTACTTTTAA
TAGCAGATACTATATCAAGAAATCTTCTAGCACCTATAGAAATACCAGTAGGTATAGTAGTTTCTATAAT
AGGAGTGCCGTACTTTATTTATTTAATGTTGGTAAATGATTAG
>ref|NC_013316.1|:c3285702-3284689 putative ferrichrome ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
TTGACTAAGCTGAGTAAAAAAAATATAACTTATTTGTTGATATTAGTAAGTATAGTTGTACTTGTATTTG
GAATTGTATTATCCATAACTATTGGGGCAAAAGATATGAATCTATCAACTGTCATAGATAGTTTGATAAA
AATGGAAGATGGAATAAATATGAGAATAGTAAAGGATGTTAGACTTCCAAGAGCAATAGCAGCTGCACTT
GTTGGAGGGTTTTTAGCAGTTTCTGGGGCAATAATGCAAGGAATAACGAGAAATCCTATAGCTGAACCAT
CTGTTATAGGAATTACACAAGGAGCTACATTCGCAATTTCGATATCACTGGTACTTCAAAAAAAACTTCC
TCAACTTATACATGGAAGTTTTAGTGTAATGATGTTTGCATTTATTGGAGCAAGTATAAGTGGATTATTT
ATATATTTTATAAGTTCTAAATCAAGAGGAAGAGTTAATAATGTAAAATTAGCTCTTGCAGGAGTCGCTC
TTGGTACATTGCTAATTTCTTTGGCATCAGCAATATCTATGTATTTTAACCTATCTCAACAATTAAGTTT
CTGGATATCAGGAGGGCTTGTAGGAGTGAAGTGGGAAGGTATAAAATTGCTATTTGTAGCTGGTGGTATT
GGATTTATTTTAGCTATTATTATGGCTCCAAGAATAACTATATTAAGTCTTGGAGAAGAAGTGGCAATAG
GATTAGGACAAAAAACTAACTTTGTTAGATTTATATGTATAGTACTTGTAATATTAATGACTGGAGCATC
TGTGTCAGTGTCTGGTAATATTATTTTTATAGGTCTTATAGTTCCTCAAATAGCTAAAGGAATAGTAGGT
TCAGATTATAAGTATATAATACCGAGCTCTTTAGTATTAGGAGCTGTATTGCTTGTATATACAGATATAT
TAAGTAGGATGATAAATCCTCCATATGAGACACCAGTAGGTTCTATAACAGCACTTATAGGAGTGCCAAT
ATTTATATACCTTGTTAGAAAGGGGGAGAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3286768-3285830 putative ferrichrome ABC transporter, substrate-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAATAAAATCACTTGCAATATTTATATCTATTATAACTACGTTAGTACTTGTTACAGCATGTT
CAGATAAGAATACAGAGGATAAAGATAAATCAGAGACAAGAGTTGTACAATCTGTTAAAGGAGAGGTTAA
GATACCATCAAATCCTAAAAAAATAGTTGATATATCAGGAAGTAGTGAAGAACTATTATTAGCAGGTTAT
AAGCCTGTTGCAACAGCAAATGTAGACTCATATGAAACTGATAAATTACCAAGTTACATAAGAGAAGAGC
TTAAAGGTGTAAAGATAGTTGGGCACTCAATGATGGATACTATGGATATGGAAGCTATATTAGAAGTAAA
TCCTGATTTAATAATAATGAGTCAAAGACAAGAAAAAATATATGACCAATTAAAAGAAATAGCTCCTGTA
GTTATGATGAAAGATTATGCAAATGACTGGAGAAGCAAGTTAACTGATGTTTCAAAGTTATTTGACAAAG
AAGAAGAAGCTAAAAGTTGGCTACAGAAGTATGATGAAAAAGCTACAAAGTTAGGTAAGGAAGTTATAGA
AAAGAATGGAGAAAAAACTTATTTACCAGTGTTGGCAAGTTCAGGTCAATTTATGGTATTTAGTGATGGT
GGAATAGGTACTCTAATCAATGATGATATGAAATTAGCTAGACCTAAGAATATGCCAAAACAGGATGGAA
TAACACTACCAATGGTAAGTATGGAAGGTTTAACAGATATAGATGCAGACCATATAGTTGTAATTGCTAC
AGAAGCAGATAAAAAAGATTTAGAAAATAGTGCTATCTGGTCTCAAATAAGAGCAGTAAAAGATGGTAAT
GTAACAATACTTGATGCTGCTCCATTTTTCAGTCAATCATACAATCCAATTGGAAAAGAGTTATTATTAG
AATCAGTTAAAAATGAATTAACAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:3287011-3287502 hypothetical protein CDR20291_2775 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTAGTAAGGAGGATTCAAAACATGGTACATTTAGTATATTGTGATAATGCAGGAAAAAAAGGAG
AAAAGGTCTTAGATAAAATCTTGGCTGGAACAAAAACAATGGTTATTAGAGGTGCTGCTGGTAGAAAAAT
ACCACATAGTAGAGTATTTGAAGATGAGTTACTTTATTTTATGGAAAAAGGAACTGGAAAAATATCTGCA
AAAGCCACTGTTAAAAAAGTAGAAAACTATGTTAAATTAACAGAAGATGAAATTTCTAAAATTTTAAATG
AAAATCAACCAAAATTAAATTTATCTGAAAAGCAAAAAGTTCGTTGGCATAAAAAATGTTTATGCTTAGT
TGAATTTGAAAATGTTGAAGAAATAACACCTCTTGATTTTGACCATCAAGGAAATATGGATGATTGGCTT
ATTGTTGAAAAAATTGAAGATGTAGTTGTTGGTACTAGTATACCTTACAATTATGAGAAGTCTAAATTTT
AA
>ref|NC_013316.1|:c3287931-3287614 PTS system, lichenan-specific IIa component [Clostridium difficile R20291]
ATGGATGAGAAGATGATAGAGATATCTTTTGGAATAATTGGATTTGCAGGTGATGCGAAAGGGCTAGCAT
TTGAAGCAATAAAAGAAGCAAAGAGCGGGAATATAGATAAAGCTAGAGAATGTATTGAAAAGTCGAAAGA
ATCAATTCATAAAGCTCATAAATTCCAAACAGAATTGATACAAAATGAAGCTAATGGTAATAAAACTGAA
ATAAGTGTTATACTTATTCATGCACAAGACCATTTAATGACAGCTATGAATTTTCAACAATTAGCAGAAG
AATTTATAGATGTATATGAAAGATTAGAAAGTAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3288675-3287944 hypothetical protein CDR20291_2777 [Clostridium difficile R20291]
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CTCATAATAATGGTATAGTTAGGTCTACTTCTATGATGGCAAATATGCCTGGGGTAGAACATGGAGTAGG
CTTACTTAAAGAAAATAAAACTTTAAATTGTGGAGTTCATATGACTTTAAGTTGTGGTAGACCATTATTA
TCTAACTTAAAAACTATTGTTGATAAAGACGGTTTTTTTATTAGGAGGATTACAGACGAAATTATTGAAA
AAATGGATTGTGATGAGATTTATAGAGAACTTTGTGCTCAAATAGATAGGGTAAAAGGGCTTGGAATAGA
TATATCTCATTTAGATAGTCACCATCATATCCATACTTTAGTAAGTTTAAAGCCAGTAGTAGAGAAGATT
GTAACCAAGTATAATCTTCCAATAAGAGGTGGATTTGAATATAATTTAGAGTATTCTAAAGTAGTTCCTT
TAATAGATAGTTTTTATAAGGAAAATGTAAGTGAAGAATATTTTATAAAAAATATAGACGAAATAATGAA
GTATGATGTAGTGGATATTATGTCTCACCCAGCTTTTTTAGATGATTATATTTTAAATTCTACATCTTAT
GCTATTGATAGAACGAAAGAGCACAAGATACTTACATCTAAAAAAGTCAAAGAATTTTTAGAAAAGAATG
GATTAGTCATATCAAGCTATAGAGATATTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3290011-3288701 6-phospho-beta-glucosidase [Clostridium difficile R20291]
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TTATAAATAGATATGAAGAGTTACCTGTAAAGGAATTATGGCTTGTAGATATAGAAGCTGGAAAAGAAAA
ATTAGAGATAGTTGGAAATCTAGCTAAGAGGATGGTAAAAAAAGCTGGAGTAGATATGAAAATAAATCTT
ACTTTAGATAGAAGAGAAGCTCTAAGAGATGCAGACTTTGTGACAACACAACTTAGAGTAGGTCTTTTAG
ATGCGAGAATAAAAGATGAAACTATTCCTTTATCTCATGGAGTTATGGGGCAGGAAACTAATGGTGCTGG
AGGTTTATTTAAAGCCCTTCGCACAATACCAGTTATATTTGATATAATAAAAGATGTGGAAGAATTATGT
CCAAATGCATGGATGGTGAATTTTACAAATCCAACAGGAATAATAACAGAGGCTGTATTCAAATATACTA
ATTTTAGAAGATATATAGGTCTATGCAATGTGCCAATTCATTTAAAAAATGATGTTGCCAAACTATTTAA
TGTAGAAAGTGACAGAATAAGTATGGATTTTGCAGGTCTTAATCATATGGTTTATGGTCTAAATGTATCT
TTAGATGGAGAAGATGTTACAAAAGAAGCAATTGATAAGTTTGTCAAAGCAGATATAAGTATGCAAAATA
TAAAGGCAATTGATTTTAATGCTGAATTTGTAAAATCTTTGGGTGCAATACCTTGTCCATATCATAGATA
CTACTATAAAACTAAAGAAATGCTTGAGGATGAGTTGAGAGAGTTTAAAGAGGGAAAAGCTAGAGGTCAA
GTAGTTAAAGAATTGGAAGAACAATTATTTGAATTATATAAGGATGAAAAATTAGATGTAAAACCACCTC
AACTTGAAAAAAGAGGAGGGGCTTACTATAGTGATGCTGCTTGTAATTTAATAAGTTCTATATACAATGA
CAAAAAAGATATCCAAGTAGTTAATACATTAAACAATGGTTCTATAAGAGATTTTAAAGATGAACAAGCG
GTAGAAGTGAGTAGTGTAATAACCAAAAATGGTCCAAAACCAATAAGTATAGGATATTTACCAGATTCTG
TGCATGGATTAGTAAGCCAAATCAAATCATTTGAAGTATTGGTAGCTAAAGCAGCTGTATATGGCGATTA
TGAATCTGCTCTTTTGGCACTTTGTATAAACCCATTGATTCCATCTGATGACTTAGCAAAAACTATATTA
GACGAAATGTTGGAAGCTCATAAAGATTATCTTCCTAGATTTAATAGATAG
>ref|NC_013316.1|:c3291401-3290088 PTS system, lichenan-specific IIc component [Clostridium difficile R20291]
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ACTTAGTAGCAGTAAGAGATGCATTTATAGTAATGATACCTATAACTATGGTAGGTGCCTTGGGAACATT
GATAAATAACTTACCATTGGAAGCATACAAAAATTTGATGGCAAGTATATTTGGAGAAAATTGGACCACA
TTTGGAGGCGACCTTTGGTGGGGAGCAATAGGTACAATGGCAGTATTCTTAGTAATAGGTGTTGCTTATT
TTCTAGCAAAATCTTATGAGAGTGATGGGTTACAATCTGGGCTTATAGCTTTATCTATCTTTTTTATAAT
GGCTCCACAAATTGGTAAAATAGTTCCTGAGGGAGGAACTACAGTAGTTGAAGGATGGGGAATGATACAA
CAAACCTACTTAGGTACAGCAGCTTTATTCTCTTCTATATTAATAGGATTATTATCAACTGAGATATTTG
TAAGATTATCTAAGGTAAAGAAATTAACTATAAAAATGCCAGATGGAGTTCCACCAGCAGTTTCAAGATC
ATTTGCAAAGTTAATACCAGGAATGTTAACTATAATGATATTTACTGTAATAGGAATATTTATAAAAATG
CTTTCTAATGGAAGTTTCTTAACAGATATTTTAAATACTTATTTAGGAGCACCGCTATCAAATGTAGCTG
ATAGTCTAGGTTCTACAATGCTTATTGCATTTATAATTCATATACTTTGGACTGTTGGACTTCATGGTGC
AAATATAGCACTTCCTTTTACAGAAACTATACTTATGAAATTAGGTGGAGAAAATGCTGCCTTGGCTCAA
GCAGGAGCAACGGAAGGATACCATGTACTTGCAGGTGCATTCTTTGATGCATTTGTATATTTAGGTGGTT
CTGGAATGGTATTGGGATTAATAGTAGCTTTATTAATAGCTGGGAGAAGACGTAAAGAAATGATAGTATT
AGGTGGGCCACCTGCAATATTTAATATAGGAGAACCATTGATATTCGGACTTCCAATAGTTTTAAATCCT
ATATTTATGATTCCATTTGTACTTGCACCAGTGATATGTAGTGCTGTATCATACTTAGCAATAGATTTTG
GATTAGTAGCACCAGTAATTTTACCTAAAATACCTTGGGTAACACCTCCTATATTAGGTGGAGCGATGGC
TACAGGTGACTGGACTGGTGGAGCTTTAGCACTATTTAATTTAATATTATCAATATTAATATATATTCCA
TTTGTCATAGCGTCTGAAAAAATGGAAGCTAATAAATTGAAAATTAACAACTAG
>ref|NC_013316.1|:c3291734-3291423 PTS system, lichenan-specific IIb component [Clostridium difficile R20291]
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CAGCAAAGGAAAACGGTATAGAAGCAAAAATATGGGCTATATCAGAAGTGAACTTAAAAAATGAAATAGA
AAATTGTGATGTCTTACTTTTAGGGCCTCAAGTTAGATATGTATTAGGAAAAGCAACTGAAATGGCAAAA
CCATATAATATTCCAGTAGAAGTTATAAATATGATGGATTATGGAAGATGTAATGGAAAAGCTGTGTTAG
ATAGAGCTGTAGAGTTAAATAGTTCAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3292638-3291934 GntR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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AAGGGGATTTAATCCCTTCTGAAAAACAGCTGAGTGAAGAATTTAATGTAACTAGAATGACTGTAAGGTC
TGCACTTAATAATCTAGTTAAAGAAGGCTATATAACTAGACAAAGAGGTGTAGGTAGTATAGTTATTGCA
AATAATATATATGATAATATATCGTCTGTAAGTGGATTTACTAAAGAGATGGAAAGTAAAGGCTATAAAG
TATCTAATATATTGGTATCTCTTGAAATAGTTCAGGCAGATGAAAATTTATCAAGTAAGTTGAATATAAG
TTTAGAAGAAAATGTTTGGGAAATAAAAAGAGTAAGATTAGCCAATGATGCAAGAGTTTCATATATGATT
ACTTATATGCCAGTTAAGTTATTTCCAAATTTAAATAAGACTCATTGTGAAAATTCTCTTTATAATTTTG
TTGAAGAAGTGTGTGGATACAAGATAGCCATGTCAGAGAGAGAAGTACAAGCTGTAATATCGAATGAAGA
ATGTATGGATAATCTAAAATTAGAAGAACCAGAGCCACTTTTATATATAAGCCAAATTTGTAAGTTACAA
AATAGTGAGATTTTTGAGTACTCACACACATATCACTATGGATATACATTAACTTTGAATGCTGTTGTCG
AATAA
>ref|NC_013316.1|:c3294004-3292733 putative drug/sodium antiporter [Clostridium difficile R20291]
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CAGCTGGTTTTTTTCCATGGCTTGCAATGGCATTTATTATGATTTCAAAAGTAGGTGGAGAGATAAAAGT
AGCACAAAGTATTGGTGCAAATAATATAAGCACTACTAAATCATATATGAAGTCAGCAATAGAAATAAAT
ATTATACTAGCAATAATATATACAATTTCTTTAATAGTACTTAATAAACAATTGATAGGTTTTTTTAGAT
TAGGAGACTTAGAAGTTATAACCATGTCTAGACAGTATTTGATAATAGTAGCTCTAGGTATGGTATTTTA
TTTTATTAATCCAGTATTTACTGCAATTTTCAACGGTCTTGGAAATAGTAAAACTCCTTTTCGTATTAAT
ACAGTAGGATTAATAACTAATATTATACTTGATCCTATATTAATTTTTGGATGGGGATTTGCTCCAAAAC
TTGGTGTTGCAGGAGCTGCTATTGCAACTGTATTTGCTCAGATAGTAGTTACTACATGTTTTATATATAT
AATAGTTAAAAGTAAAGAAGAATATTTTAAATTAAGACTATTTAAAGAAATAGAGACTAAATATTATAAA
GTTCTGTATAAATTGGGATTACCTATAGCAATACAAAGTGGTATGTTTACAGTATTCTCAATGCTATTAG
GAGTAATAGTAGCATCATGGGGGCCTGTGGCTGTTGCAGTACAAAAAGTAGGCTCACAAATAGAAGCAAT
TTCCTGGATGACGGCTGAAGGGCTATCAGTTGCATTAGGCAGTTTTGTTGGACAAAATTATGGTGCCAAG
AAGTATTCTAGAATAAATAAAGGTTGCAAAATAGCTATAACTGTATCTTCTGTACTTGGGATAATAACTA
CTTTGGTATTAGTATTTGCAGGAGAGAGTATATTTTCTATTTTTATAGATGAAAGTGAGGCAATAGAAAA
AGGAGCAATTTATCTTAAAATATTAGGCTATTCTCAATTTTTTATGTGTTTAGAAATAATAACAACAGGA
GCTTTCAAAGGATTAGGCAGAACCTATATACCTTCTATTATAATTACTATACTGACTGGTGCAAGAGTAC
CATTGGCTTACTTTATATCTAGACCAGAAATGTTGGGTCTAAATGGTGTATGGTGGAGTATAACCTTATC
AAGTATATTAAAAGGTATATTAATGATAAGTCTATTTATATCTTTATTAAAACTCGGAAAGTTGTACAAG
ATGTCTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:3294593-3295738 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATAAATAAAAAATTTAATAGAGTTGATATGCAGGTTTCAATACTTACTGCAATTATTGTAATAA
TATCTTCCTCATGTGTATATTTTTTTAATTATACATTAACTTATAAGAGCATGATATACTCTTTAAGTGA
GAGGTCAAAACATATCTATGAATATGTAGAGAGAAATATTGATAAAAATACCTTTACTGAAATTAATTCT
AAAGAAGACCAATCAAAAAAGTCTTATAAAAGTTCTAAAATCCTATTAGAATCTGTAAAAAATACTACTG
GAGTCATGTATCTATATACTGCTAAAAAAACAAAAGATGGATCACTAGTATATGTTGTTGATGGTTTAAA
TTCATCTAGAAGTGATTTTAGAAATGCTGGTGATTTGATAGAAAAAGAGATTTGGGGAGATCTTAACAAA
GCATTAGATAATCATATATTGTTACCTAAAAAGATTAAATCAACATCTTGGGGATACATATTTATATCGT
ATTTTCCTATTCACAATGATGTTGGTAAGGTTGTTGGAGTAATAGGAATTGAATTTGAAGCAAAACATCA
ATACAATACATTTAAATTTATAAGTATAGTTACACCAATAATAGCATTATTAACTTGTCTAATATCAGCA
TTGATTGCAGTGATTCTATTTAAAAGAATATCTAATCCTACATATACTGATTTTGCTAATACAGATTATT
TAACAGGCCTAAAAAATAGAAATGCTTTTGAAATAGATATGAATAACTTAAACAATTCAAATCTAAAGAA
TCTAATATCTATCATATCAATAGATTTAGACGGTTTAAAAAAGATTAATGATAAATTTGGCCATCAGACA
GGAGACTTATATATTAAGCAAGCAAGTAAAATTATACAAGATGTAATAAATAAAAAATATATAGTTTATC
GTATTGGAGGTGATGAATACATAATTATTCTAAAAAATTTATCTCACAAAGAAATAAATAGTATTATAAA
TAATATTAATTTAAAAATAGTTGAAGAAAACTCAACTAATGAATTAAAATTATCAATGTCTATTGGATAT
GCTATTTTTGATGAAAAAGTAGATGTTTCTTTATTTGATACATATCGTCGTGCAGATTCTCAAATGTATG
ATAACAAAAAGAAAATTAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3297546-3295828 ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATAATGCTATAAGTTCTAAAAGTATAAGTCTTAAATCAAAAATGAATTTAGATATAAAAAAAT
GTATGCTTACAGTATTAGTTATGTCTTTAGTAATATTTTTATTAGCACCTATAATATATCTATTTGTACA
GGCTTTTTTAGATAAAGATGGAGTCTTTGTAGGATTACAAAACTTTCAAGAATACTTGGCTTCTGAATCT
CTATTAAATTCTCTAAAAAATACAGTATTTGTATCAGTTATATCAACTGTAATATCACTAACACTTGCAT
TAGTATATGCATATGCATTAACTAGAACAAAGATTAAATTTAAAGGTTTTTTTAAATCATTAGCTATGTT
TCCTATGTTTGCTCCAACAATGATGCATGCAATAGGTCTAGTATATTTATTTGGAAATCAAGGTTTGGTA
ACTAATTTACTTGGAGTGCATGTTCCAATATATGGAGCAGTGGGAATAATATTGGCACAAATTATATATG
TATTTCCTCAATCCTTTCAAATACTTTATATATCTCTAAGTTCAACCGATTATAGACTATATGAAGCTAG
TAATACTATGGGGATAAGCAAGATAAGAGAATTTATAAGCATAACAATCCCAAGTATAAAATACTCTTTA
ATAAGTTCTGCATTCGTATCATTTACATTATGTTTTACAGATTTTGGAGCTCCAAAGGTGATAGGAGGAG
AGTTTAATGTATTATCAATAGATGTATATAAGCAAATTATAGGGCAACAGAATATGCCAATGGGAGCAAC
TGTATCAATATTACTTTTAATACCTGCAATAATATCGTTTATAGTAACTAAAAAAATTGAAAAAAATCAA
AACTCATATATAACTTCAAAGTCAATTCCATATAAGGTTAAAACTAATAAGTTAAGAGATAGTATTTTAG
GAGGGGTTGTAGGAATTATTGCATTTGGTATAATAGCTGTAATGTTAACTGTAATCTTATCCTCATTAAT
ATCAGTTTGGCCATATGATTTAAGACTTACACTGGAACACTTTTCTATGAAAAACAGTATTGATGGAATT
AAACCATTTATAAATTCAATAAAAATGTCACTATTGACAGCTATTCTAGGGACGAGCTTTGTTTTCTTAT
TTGCATATTTAAATGAAAAAACAGAAAAAGCTCCATATTTAAAATCATTTGGGTATTTTTTAAGTACATT
GCCTATGGCATTGCCAGGATTAGTTTTAGGTATAGCTTATGTATTATTTTTTAATAAATTAGAGTTTAAT
TTTATGGATACAATATACATTAAAAATTTGTTTAATGGATTATATGGAACATTACTTATAATGGTTATAT
GTAATATAGTTCATTTCTTTTCAGTAGCATTTATAACAGCTACTACTGCTATTAAGAAAGTAGATAAAGA
ATTGGACATGGTAGCTAAATCAATGGGAATAAACAGCGCATCAATTCTTAAGAACGTAACTATACCACTT
TGTTTGCCAGCAGTTTTAGAGAACTTTATGTACTTTTTTCTAAACTCTATGGTGACAATATCAGCACTAG
TTTTTATATATACTGCAAGTTCAAAAGTAGCTGCAATATCAATTGTACAACTAGATGATAAGGGGAGTAC
TGCACAGGCAGCAGCACTAGCTGTGTTAATATTAGTCACAAATATATTAGTGAAAGTAATATATGAATTT
ATAAAGAATCGTTTAGAAAAAAGAACAAACTTTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3298540-3297551 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTACTTAAAAATAAATAATGTGTTTAAAAGTTATGACCAAAAAAGGGTTTTAAATAATATTAGTT
TGGATATTGAAGAAGGGGAATTTCTATGTTTACTCGGACCTAGTGGATGTGGTAAAACTACATTACTTAG
AATAATAGCAGGTCTTGAAGATGTAAATAGTGGAACTATAATTCTCCAGGATAAAGATATTACAAATTTA
GAGCCATCAAAGAGAGGTTTTGGTATAGTATTTCAATCATATGCATTATTTCCGAATATGACTGCTTATA
ACAATATAGCTTTTCCACTAAAAGAGAGAAAAGTTTCAAAAGAAAAAATAGATAATAAAGTTAAGGAAGT
ACTTGAAACAGTTGGATTGACTAATGAAGCTCATAAATATCCTAAAGCATTATCAGGTGGGCAACAACAG
AGGATTGCAATAGCAAGAGCATTAGCTCTTGAACCAAAGTTTTTACTTTTAGATGAACCAATGTCCGCAT
TAGATGCAAAGGTTAGACACAAGCTTAGAATGGACATTAAAAGATTACAAAAAGAACTTAATATAACGAC
AATAATGGTAACACATGACCAAGAAGAAGCTATAACTATGGCAGATAAAATAGCTATTCTAAATGGAGGA
GATATAATGCAAATAGGGACTCCAGAAGAAATATACCAAAATCCTCAAAACCTATTTACAGCTCAATTTA
TAGGAGATACAAACTGTTTTGATAATGGAGATTCTATATTAACTGTAAGACCAGAATATGTTCAAATAGA
GAAATCGACAAAAGAAAACTACCAAGGTATAATATCAAATATAGAGTTTAGAGGGAATTTATTGAGAGTT
GAAATAAAAGATAAATTAAATGAAAATTTCATAATAAGTGATGTTTCTATAAAAGAGTGGGTTAATTTAA
ATTTAGTAGAAGGTGACCTTGTAAAAATAAGTATAGACGAAAAATACTATTTAAAGTATCCAAAAGTTAA
AGGAGCATAA
>ref|NC_013316.1|:c3299757-3298636 ABC transporter, substrate-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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ATATGAAAGAATTTATATTTACTTGTCTGTGCATTGTAGTGATTACATTTATGACAAGTTGCATATCAAC
AACACCACAAACTACTCAAGGAAAAGGAAATAATAAACTTACAATATATGCAGCACTAGAGGAAGAGCAG
ATAGCTTATTATATGGAAGGTTTTAGAGAAGAGTATCCCAATATAGATGTAGAGATAGTTATGGATTCTC
ATGGTGTAATAGCTTCAAAACTATTAGCAGAAAAAGATAATCCACAAGCAGATATTATATGGGGATTATC
AGCAATGAACATGATAGAGCTAAAAAAAGATGGTGCACTTGAAGCATATAAGCCTAAAAATTATGATAAA
GTTGATAAAAAATTTAAAGATACTGAAGATGATGTATCTTGGGTAGGAATGAGTGTCCCAGAGACAGCAA
TAGTAGTTAATTATAAGGAACTTAAGAAACTAGGTATAGATATTCCAAAAAGTTATGAAGATTTAATAAA
ACCAGAATATAAAGGACTTATAACAATGCCAAATCCAGCATCATCTGGAACGGGGTATCTTACAGTATCA
GGGCTTATTCAAATGATGGGTGAAAAAGATGCTTACAATTACATGGATAAATTACATAAAAATATAGCTA
CATATACACACTCAGGTTCAAAACCTGCGAAGTTAGCTGGCTCTGGAGAGTATCCAATAGGTATTACACT
TGGATATAGAGCTACACAACAATTATCTAGTGGAGAACCTATAGAGGTTGTATTTCCAAAGGAAGGTTCA
GGTTGGGACTTAGAAGCAAATGCCTTAGTTAAAAAAGATAATATAAAAAAAGAAGCAAAGCTATTTTTAG
ATTGGGCAATAAGTGATTCAGCTATGGATAGATATGCACATGAAGTAGCAGTTACTTCCATAAAGACATA
TAATCCAGTTCCAAAAGGTTATTCTAAACAACCATTTGAACAGCTTATAAAAGAAGTTGATTTAAACTCT
GCTGCCAAAAACAGAAGTACAGTACTTAAAACTTGGGAATCAAAATACGGTTCAAAATCTGAAAGTAAGT
AA
>ref|NC_013316.1|:c3300630-3299962 V-type sodium ATP synthase subunit D [Clostridium difficile R20291]
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CAAGAGGTCATAAGCTTCTTAAAGATAAACTTGATGAACTTATGAAACAATTTCTTGAGATTGTAAGAGA
AAATAAGCGATTGCGTGAAGAAGCAGAAAATGCTCTTGATACTGCTTATAAAAACTTTATAATCGCAAGA
GCAGTTATGAGTCAGGAGTATCTGGGTTCAGCACTTATGATGCCAAAGCAATCAGTTTCAGTAGATGTTT
CTACGAGAAATATAATGAGTGTTGATGTTCCTGTGTTTGACTTTAAAACTGAAAACAATCAAAGTGATAT
TTATCCTTATGGTCTTGCTTTTACATCAGGTGAATTAGATTCTGCTATGGAAGCTTTCTCAGATGCTATG
CAACCACTTTTAAGACTTGCAGAAAGTGAAAAAAGTGCACAGCTTCTTGCACAAGAGATAGAAAAGACAC
GTAGACGTGTTAATGCTCTTGAAAATGTAATGATACCAAATTACATTGAGACTATTAAGTATATAGCTAT
GAAGCTTGAAGAAAATGAGAGAGCAAGTACTACTAGACTTATGAAGGTTAAGGATATGGTGCTTAAAAAA
GCACTTGAAGAAAAGAAAAAAAATGATTTGGTTGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3302009-3300636 V-type sodium ATP synthase subunit B [Clostridium difficile R20291]
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TAAAATTTGATGAACTTGGAGAAATTGAACTTTCAAATGGAGAAATTCGCCGTTGCAAAGTTCTAGAGGT
AAATGGAGATACTGCACTTGTTCAGCTTTTCGAAAGCTCAACAGGTATAAACCTTGCTGAAAGTAAAGTT
CGTTTTTTAGGAAAGAGTCTTGACTTTGGAGTTTCACCAGATATATTAGGCCGTGTTTTTAGTGGAATGG
GTAGACCTATTGATGGAGGTCCAGAAATTATACCAGATAAAAGACTTGATATAAATGGAGCTCCAATAAA
TCCAGCAGCACGTGATTATCCGGCCGAATTTATACAAACTGGAGTCTCTGCTATAGATGGACTTAATACA
TTGGTTAGAGGGCAAAAACTTCCTATATTCTCAGGGTCTGGTTTGCCACATGCCAATCTTGCAGTTCAGA
TTGCAAGACAGGCAAAAGTACGTGGAACTGATTCTAAGTTCGCCGTTGTATTTGCTGCAGTTGGTATAAC
TTTTGAAGATGCTGAATTTTTTATAAGCGATTTTAAAGCAACTGGTGCAATCGACCGTTCTGTAGTGTTT
GTAAACCTTGCAAATGACCCAGCTGTAGAGCGTGTATCTACACCTAGAATGGCACTTACAGCAGCAGAAT
ACCTTGCTTTTGAGCAAGATATGCATGTACTTGTTATAATAACGGATATTACAAACTATGCAGAGGCATT
GCGTGAAGTTTCAGCAGCTAAAAAAGAAGTTCCAGGACGTCGTGGATATCCAGGATATCTTTATACTGAC
CTTGCTACTATGTATGAAAGAGCAGGAAAAATGAAAGGGCATGAAGGGTCTATAACTATGATTCCAATAC
TTACAATGCCTGAGGATGATAAGACACATCCAATTCCTGACCTTACAGGATACATTACAGAAGGGCAAAT
TATACTTAGCCGTGAACTTTATAAAAAAGATATACAGCCTCCTATAGATGTTTTACCATCACTTTCTCGT
CTAAAAGATAAAGGTATTGGTAAAGGTAAGACTCGTGAAGACCATGCAGATACAATGAACCAGCTTTTTG
CAGCTTATTCAAGAGGTAAGGATGCAAAAGAACTTATGGCTATACTTGGTGAATCTGCACTTTCTGAGAT
TGATTTAATGTATGCTAAGTTTGCAGATGAATTTGAGAAAGAATATGTTTCACAAGGATTTAGAACTGAT
AGAACTATTGAGCAGACATTAGAAATCGGATGGAAGCTTCTTAGTATGTTACCAAAAAGTGAACTTAAAC
GTATCCGTGATGAATATTTTGAAAAATATATGCCTAAGGAGTGA
>ref|NC_013316.1|:c3303784-3302006 V-type sodium ATP synthase subunit A [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAACAGGCACAATTGTAAAGGTGTCAGGACCGCTTGTTGTAGCGGAGGGCATGAGAGATGCGAATA
TGTTTGACGTCGTAAGAGTTTCAGATAAACATCTTATAGGCGAGATTATAGAAATGCATGGAGATAAAGC
TTCTATACAGGTTTATGAGGAAACTTCCGGTCTAGGACCAGGGGAAGAAGTAGTTTCTCTTGGAATGCCT
ATGAGTGTTGAACTTGGACCAGGTCTTATTTCAACTATTTATGATGGTATTCAACGTCCACTTGAAAAAA
TGTATGATATTTCAGGTACTAATATAACTAAAGGTGTTGAAGTATCTTCACTTGATAGAACAACTAAGTG
GGAATTTAAACCTAAAAAATCTGTTGGTGATAAGGTTGTAGCAGGAGATATAATTGGTGGCGTTCAAGAA
ACAGCAGTAGTAGAATGTAAAATTATGGTTCCTTATGGAGTTAAGGGTACTATAAAAGAAATATATTCTG
GTGAATTTACTGTTGAAGATACAGTTTGTGTTATTACAGATGAAAAAGGTAATGATATACCTGTAACTAT
GATGCAAAAATGGCCAGTTAGAAAAGAAAGACCATATAGAGAAAAGAAAACACCAGATTCACTTCTTGTT
ACAGGTCAAAGAGTTATAGATACATTTTTCCCAATCACAAAAGGTGGGGTAGCAGCTATACCGGGACCTT
TTGGAAGTGGAAAAACTGTTACACAGCATCAGCTTGCTAAATGGGCAGATGCAGATATAGTTGTATATAT
AGGCTGTGGCGAGCGTGGAAATGAAATGACAGATGTTCTTCTTGAATTTCCTGAATTAAAAGACCCAAGA
ACAGGCGAGTCACTTATGCAAAGAACTGTGCTTATAGCAAATACATCAGATATGCCAGTTGCTGCACGTG
AAGCTTCTATATACACTGGTATTACAATAGCTGAATATTTTAGAGATATGGGATATAGTGTTGCACTTAT
GGCAGACTCTACATCAAGATGGGCTGAGGCTCTTAGAGAGATGAGTGGTCGTTTAGAGGAGATGCCTGGT
GAAGAAGGTTATCCTGCATACTTAGGTTCACGTCTTGCTCAATTCTATGAGAGAGCAGGAAAGGTAAATT
GTCTAGGTATGGATGAAAGAGAAGGAACACTTACAGCAATTGGTGCAGTTTCTCCTCCTGGTGGTGATAC
ATCAGAACCTGTCAGCCAAGCAACGCTTCGTATAGTAAAAGTATTCTGGGGTCTTGATGCATCTTTAGCA
TATAAACGTCATTTCCCAGCAATTAACTGGTTGACTAGTTATTCACTCTATCAGGAAAAAGTTGATGTAT
GGGCAGATAAAAATGTAAATGATAATTTCTCAGCTCAAAGAGCTCAAGCTATGAAACTTTTACAAGTTGA
ATCTGAACTTCAAGAAATAGTTCAATTGGTTGGGGTTGATTCACTTTCAGATGGAGATAGATTGATACTA
GAGGTTACTCGTTCTATAAGAGAAGACTTCCTTCATCAAAACTCTTTCCATGAAGTTGATACTTATACAT
CACTTCATAAACAATATAGAATGATGGGACTTATATTAAAATTCTATAAGTCAGCACAAGATGCTATCAA
GCAAAATGTTACTATAAACGATATTATCAAGCTTTCAGTTCTTGAAAAGATTGGTCGTGCTAAGTATGTA
GAAGAAGGCGATATAGATGCAGCTTATGATTCAATTGAAGATGAAATAGACAACGAGCTTGCAGACCTTA
TTAAAAAGAGGGGGGCTGAAGAACTATGA
>ref|NC_013316.1|:c3304224-3303901 V-type sodium ATP synthase subunit G [Clostridium difficile R20291]
ATGCTTATGTATAAGGTAGGAGTAGTTGGAGATAAAGATAGCATCATGGGATTTTTAGCTCTTGGAATAG
ATATCTTCCCAGCCTATGATAGTGACGAAATTAAAAAAAGTATACATAAGTTGGTTGAAGATGAATATGC
GATAATTTATATTACAGAACAGGCATCATTGCTTGCAAAAGAATCAATAGCAAAATACAAAGATTACCAA
CTTCCTGCCATTATAGTTATTCCAGGTATTGGAGGAAGTATGGGATTAGGTATGAATGAAGTAAGAGAAT
CTAGTAAACGTGCTATAGGTGCAGATATATTATTTAAAGAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3305188-3304211 V-type sodium ATP synthase subunit C [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAGAAGAAAAAACTTATCCCTATGCCGTTGCACGAATAAGAGTGCTTGAAAAACAGCTTCTTAACA
GACAAATGTTTATTCAAATGGCAGAAGCCAAAAGCCCTGAAGACTCTTTAAGAATTATAGCTGAGGCAGG
TTATGCTGATACATCAAATAATAATATACATAATTTTGAGAATATTTTGACTCAAGAATTATCAAAGACA
TATGAAATTCTTAAAAGTCTAGCTCCTGAAGAAAAATTTGTTGATGTATTTCTTTATAAAAATGACTATC
ACAATTTAAAAGTGCTGATTAAAGAAGAAATTTCTGGTGTAGATGGTGAGAAATATTTAATTGATGGAGG
TACAATTCCTCTTATTAAGCTTAGAGAATCTTTAGCAAATCGTAGTTTTAGTGATTTACCTAAGATAATG
TCATCAGCTATATTAGAGGCATTTGATGTTTATAATAAGACACAAAATGGCCAGATGGTTGATATTGTTC
TAGATAAAGCAACCTTTACCAGTATGAAAGAAACTGCTAAAGAAAGCCAAAACAAATTTGTAATAGATTA
TGTTATGAAAGTTTGCGATTTAACAAATCTAAAGAGTTTTATAAGAGTCAAAAATATGAAGAAAGATTTT
GATATGTTTATGAATGTGTTTGTTTCAGGTGGCTCACTTGATAAGGAAAAATTCTTAGAAGCTTTTTCCT
CAGATACTCCAGCATCATGTTTTAAATCTACTTCTTACTCTGATGTCTGTAAAAATGGCATGGATAGTGG
TTTTACTGTCTTTGAAAAACTTTGTGATGACTATCTTATGGAATATGTTAGAGGAGCAAAATTTAAGCCT
CTTACATTAGAACCACTAATTGCATATTTATATGCTAAAGAATCAGAGATAAAAACAATTAGAATTATTT
TGACTAGTAAGCTTAATAATATAGACGCAGATACTATAAAAGAAAGGCTAAGGGATGCTTATGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3305766-3305203 V-type sodium ATP synthase subunit E [Clostridium difficile R20291]
ATGGGTAATGAACAAAAAATGATTGACAGAATTATAGCTGATGCCAAACAAGAAGCACAAGAAATATTGG
ATAAAGCTAAAAGTGAAGCAGATTTAAAAGTAAATTCAGCTAATGAAAAAGCTGAAAAGGAAATGGCTTC
CTATACAAAGCTTGCAGAGGCAGAAGCAGAAAAAGCGGCTTCTAAGGAAATATCAGGAGCTTATATGGAG
GCTAAAAAGCAAATATTATCAAAAAAACAAGAGATTTTAGAAGAGGTAATTTTAGAAGCTAAAAACAAAC
TTTTAAATCTTAAAGATAATGAATATGAAGAGATTATACTAAACATGATTGAAAAATCAAATTGTACAGA
TGATTCAGAGATAGTATTATCTAAAAAAGATAAAAAAACATTAAAAGATGTGCTATCAAAAAAAGGCATT
AAAGTGTCTGATGAAACTAGAGATATTACTGGAGGTTTCATAGTTAAAAAAGGTGACATTGAGTACAATT
ATTCATTTGAAGCCATAATTGCAGTAGAGCATGAATATATTGAACAAATTGCAGCAGAAATTTTGTTTAA
TTAA
>ref|NC_013316.1|:c3306309-3305818 V-type sodium ATP synthase subunit K [Clostridium difficile R20291]
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TTGCAGGTATGGGTTCTGCTAAAGGTACTTCAATAGCAGGTCAAGCCGCAGCAGGTGTTGTAACAGAAGA
CCCTAGTAAATTCGGTCAACTTCTAGTTTTACAACTTCTTCCTGGTACACAAGGTCTGTATGGATTTATC
ATAGCTTTCCTTATTTTATCAAAAGCAGGGATTATTGGTGGAGATGCAATACCAACATCAGCTCAAGGTT
TACAACTTCTTATGGCAGGACTTCCAATTGGTTTAGTTGGTTTAGTATCAGGTATAGCACAAGGTAAAGC
AGCAGCAGCAGGAGTTGGAATAGTTGCAAAAAGACCTGAAGAACTTGGTAAAGCTATAACATTTGCAGCA
ATAGTTGAAACATATGCTCTTTTAGGACTACTTGTTTCTTTCTTAGCTTACAATGGAATTGCAATTGGTT
AA
>ref|NC_013316.1|:c3308237-3306312 V-type sodium ATP synthase subunit I [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAATAGTTAATATGAACAAAATATCTATTGTTGGCTTAGAAGCTCAAAAAAGCCAGATTTTAAAGC
TACTTATGAACCGTGGGTTTGTTCAGATTGATGATAGTGCCTTTCTTACTGAGGAGGAGGAATTAAAAAA
TTATCTTGTAAAAGATAGTGAAGAATCTGAAGTTATAATGCTAGAGCAGAAAATGTCTCATGTAAACCAA
GCAATTAATATTGTTTCTTCACTAGTGAAACAAAAAAAATCCCTACTTGCACCAAAAAGAGAGTTTAACA
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AGGTACAATAAGGTCTAACATAAACTTACTTAACAACAATAAAAGTATGTTAGAACCATGGGTGAACTTT
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ATATTGATGCTTTAAGAGTAAAATTAGAAGATGAAATACCAGAAAGTGTTATTGGGATTGTCAATTCTGA
CAAGTTAATGAACTATGTTTATTTAATTACTTTAAAAGAAACTTTTGATGATGTTTTAGAAGTTTTAAAA
GAATTTAATTTTTCAGTGGTTTCATTACCAAATGAAGAAGGTACACCGTTACAAGCTATCAAGAAATACA
ATGAAATGATAATTAGGCAGGAAAACGTTTCTAAGGACAAAACAGAGGAAATTAAAAGACATGCAGATAG
TATACACATGCTTGAAAACCTATATGATTTTTACACTATAGAAAGAGACCAAAAAAAGATTATAGAGAGA
CTTGTCAAAACAAAAACAACATTCTGTCTTAATGGTTGGTTACCAAGCAAAAGGGCAGATGAATTAATTA
AAGAAATTACAGAAAAGTTTGATTGTTGTGTTCAGACTGAAGAAGGAAGTAAAGAAGAAGGCTTCCCAAT
TCTGCTTGAAAACAATAAATTAGTAACACCTTTTGAAAGTGTAACTAACATGTACAGCTATCCAAGTACA
AAAGATATTGACCCAAATACAATTTTAACTTTCTTCTTTGTTGTATTCTTTGGAATGATGCTAAGTGACG
CCGCATATGGGTTAATAATTGCAGTAGTCTGTGGATTTGTTGTATATAAATTAAAGATACAAAAAGGTGA
AGGAAATTTAATTAAACTTATTGGTATCTGTGGAGTTTCAACTACTGTATGGGGTCTTATATTCGGGGGT
ATTTTGGGGGATTTAATTCCTATAAAAGCATTAATTAATCCTTTAGAGGATGTTATGACACTTATGGGAA
TGTCGTTACTGTTCGGTATTATCCATATATATGTAGGTTTGGGAATAAAAGCATATACATTAATAAGAAG
TGGAAAGGTAATAGATGCAATCTTTGACATAGGTTTTTGGTATTTGTGTATAACAGGTGTATGTCTACTT
ATAATACCTTTTGTTGCAGGGGACATAGGTGTATTTTCAGAAGTAGGAAAATATTTAGCAATTATAGGTG
CTATAGGTCTTGTACTTACTCAAGGAAGAAGCTTTAAAGGTATTCCTGTTAAGCTTTTTAAAGGATTTTC
AAGTCTCTATGGCATAACAAGTTATTTTGCTGATATATTATCTTATACAAGAATTATGGCGCTTTGTTTA
ACAACAGGAGTTATAGCACAAGTTATCAACCTTTTAGGGGCTATAGCTGGTCCGATACTTGCAGTTGTAA
TCGGTGTTGTAGGACACACAATAAACCTTCTTATAAATGCACTAGGTGCATATGTTCATACAAGTAGGTT
ACAGTATGTAGAATTTTTCAATAAGTTTTATGAAGGCGGAGGAGTTCCTTTTGTTCCGTTTAAGTATAAA
ACAAAATATACAAGCATTAATAAAAAGGAGATGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3308550-3308239 hypothetical protein CDR20291_2795 [Clostridium difficile R20291]
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TTACTGATGCAGAGTCTATCAGAGCTGATGCTGTAAACAAATGTGAAAGCATATTTGCTGATGTAAGAAA
ACAAGCAAAGCTTATGGAAGAAACTCTTATTGAGAAGGCAGTCACCGACAGTAGAGCAGAGGTTGATAAA
ATCTTAGCTAATGCTAAAAGTGAATGTCTGAAAATTGAAAAAACTGCTGAAGAAAGAAAAAGTAAGGCTA
TTGAAGCGGTTATTGGAAAGGTAGTGAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3309455-3309180 hypothetical protein CDR20291_2796 [Clostridium difficile R20291]
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AAACAAGAGAACAACGTGATGTTATGGATTCATTTTGTAAGGTTGTTACATCTAGAGGTTATGATATAAC
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GCATATCCTATTGAAGATTGGAGTGATTGGTACGAGGATTTTTTTATAATGTTGTCGAATATATAG
>ref|NC_013316.1|:c3310979-3309570 putative peptidoglycan-binding exported protein [Clostridium difficile R20291]
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AATTTACACCAGATGATAAAGTTCAAAAGATAAAAGATAGTCAAAGCGCTATTGGATGGATTGGTGGAAT
ATTTAAATCTAAAGAGTATAATAATATGATAACTCTTTCATATAATAAAGATTTACTAGAAAAAAGGTTT
AATGCTTTATCTTGTTTTGATAGTAAAAATGTTGTAGAACCTAAGAGTGCTTATCCTAAGTATGATAGCA
CTAAAAACGCTTATGTTATAGTACCAGAGGTACTTGGAAACAAAGTGAAAAAAGATGATTTTTATAAGTT
AGTACAAAACTCAATTAATTCTGGGAATACTTCTATTTCTCTGGATGAAAGTAAAGTTTATGAAGCACCA
AACAACACAAAGGATTCAGAAAAGTTGAAACAAGCTATTAAGACATTAGATAAGTATGTTGGTGTAGTCG
TTACATATGATTTTAGTGACCGTAAGGAAACTTTAGATGGTTCTGAAATTAATAAATGGTTAAAAGTAGA
CTCAGAAAAGAATTATGACATAACTTTTGATAATGATGCTATGGTAGAATATACAAGAAGTTTAAGTAAA
AAATACAGTACTTTTGGTGACTCAAGACCATTTAAAACTGCCACAGGTAAAGATATTACAATTTCAGGTG
GAATTTATGGTTGGTTGATAGATAAAAAGAAAGAAGCTGAAGCATTAGTTGATGTTGTAAAAGCTGGTAA
AAATGTTACAAGAGAACCTATTTACATACAAAAAGCTGTATCTCGTAATAAAGATGATATTGGAAATACA
TATGTAGAGATTAGTCTTTCTGGCCAACATATGTGGTTCTTTAAAAATGGAGAAATGCTTGTATCAACAG
ATGTTGTAACAGGCGATTTAGCTAGAGGATTTGCTACACCATCAGGTATATATCCTCTTAATTATAAGGC
TAGAAATGTTTCATTAACTGGTCAAGGTTACAGTTCACCTGTAAGTTATTGGCTTCCATTTAATGGGAAC
ATAGGCATTCATGATGCTACTTGGAGAAATTCTTTTGGTGGAGGTATATATAAGTCTTCAGGTTCACATG
GATGTGTAAATACACCTTTTTCTAAGGCAAAGAAAATATATGAAAATATAGAACCAGGTACACCAATTAT
TTTATACTAG
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CAAAAGTAGCAGTAAATAAAAGCTCAGAAAAATTAATTAATGAAATAAATGAGTTTTGTGATACTATAAA
TCAAAGTCTAAAAGTTGAAGACATTACGAAACTAGATAAAATTAAAGATGCAAGAAATGCTTATAAAGAG
CTTGGAAAAAATCCAAGTAGATATAGAACATCTTCAGAAGCATTGGTTAGAAGAATTATTCAAGGGAAGG
GTCTTTATACAATAAATAATATAGTAGAAATAAACAATTTAATATCAATAAAATCATTATATCCAGTAGG
TACATATAATGTAAGCAAATTACATTCACCAGTATGTTTTACTGTAGGAGATGAAGGAGAACAGTATAAG
GGTATTGGGAAAGAATTAATAAATATAGAAAATCTTCCTATATTGTCTGATTCAGTGGGTAAATTTGGGA
GTCCAACTAGTGATTCTGAAAGAGCAATGATAACAGAAGATGCAAATGAAATATTAATTTGTATATTTTC
TTTTAGTCAAGAATCTGATATTGAAGAATATTTTGGATATGCTAAGGAGTTACTTAAAGAATATGCTGAT
GGAAAAGATATAGAAACTAAAATAATTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3314484-3312265 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
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GGTATATCTATATAGAAGATACAAAACATCTTCTTATGTCAGAGGCAAAAATACATATAAAAGAAGTTGC
AGTACAAGGCTCTCAACTAGCACAAAGACAAATTGAAAAAGATTTAGATGTTTTAAATATTTTTTCTAAC
TATTATGCTTTAAATCAAGATATACCTAATGAGGAAAAAATGAAAAATCTTTTAGATGAAATGGAAAATC
AAAAATTTTACACTATGGCAATAGTTGATATAAATGGTAATGCTGAAAATACCAAAGGTGATAAGTTTTC
AGTGAAAGATAGAGAATTTTTCAAAAACTCAATTAAAGGTAAGAAGTATGTTTCAAGTCCATATGTTGAT
GAAGTAAATAAGTCTATAAAGAAGATTACTATTTCAGTACCATTATTAAATAATGATAAAGTAGTTGGAG
TTTTATATTGTACTTACAATATCAATACTCTGATGAAACTTATTAATGTATCTTTTTATGAAAATAATAG
TATATCTTATGTTGTAAGAAATGATGGTACAATTATCCTTCATCCGCAAGAGGATAGCCTATCAAAAAAT
ATTTATAAATTGTTAAAACAGGATAATGATATTCGAGAAATAAATAGATTAAAAAAAGAATTGCAAGAAA
ATAAAACAGGTGCAACTGTATTAAATATGTTGGAAGAAAGAAGATATTTAGGATATGCTACTATGGATAA
TGGGAATAGTGAAAATAATTATATAAAAGATTGGAATTTGATTTTTTCAATTCCAGAAACTGTTGTATTT
AGTAATTCAGAACAAATAATCAACAGAGCTATATATGCAGTGTTATTTATTATATTAATATTTATTGCAA
TTATTTTTTATATAATTTATATAAAAAAATCCAATGAAAAAGAAATATTAAGTTTGGCTTATGAAGATAA
AGTTACCCATATAGGAAATCAAAATAAATTTTATAGAGAGTGTAGTAAGTATCTTTTAGATAAACCATCT
TTAAATTATATTATAGTATATTTTGATATTAATAACTTTAAGATGATTAATGATACTTTTGGATATGAAT
TTGGTGACAATTTATTAATTACGATAGCAAAAGCTTTAAAAGAAGAATTAACAGAAGGTGAAGTATATGC
ACGACTTTCAAGTGATTATTTTGCAATTTTCTGTGATTATAAAAATGGAAAAAATAAACGTATAAGAAAA
ATTGATAGTATACGAAATAATATTGAAAGTAATTTGAGTATAGTATTTGAAATTTCTCTGTGTGTGGGTA
TTTATTTTGTTGAAGAAGGTGAAGTAGATATCCAAAAGGCTGTAAATAAAGCAAATATGGCTAGGTCTGT
TGCTAAAGGTAAAAATATAAATTATGCTATTTATAATGAAGATGTTAGGAATAAGCTTAGTGAAGAATCA
ATGATTTTAGATGATATAAAAATAGCATTGGTAAAAAATCAATTTGAAGTGTATTATCAACCTAAGTTTT
CACTTGTAACTGGAGAAATGATAGGGAGTGAAGCACTAATAAGATGGAATCATCCAGAACATGGTTTTAT
AAGTCCCGCAGTATTTATTCCAATAGCAGAGAAAAGTAAGTTGATTTTAAAAATTGGGAGATTTGTATTT
GAAAGGGTTTGCAATGATTTATCTGAATGGAAAAAGCAAGGTAAAAAGATAGTTCCAGTTTCAATAAATT
TATCTAGAGTTGAGTTGTATCAACCAGATATTGTAAAATTTATCAATAAAACAATACAAATGTATAATCT
AAGTTCAGATTTAATTGAAATAGAGATAACAGAAACTGTGGCTATTAATGAGTTAAATATTTTAAAGAAT
GTTTTAAATGAGTTGAGGAAGTATGGATTTTCTATTTCTATGGATGACTTTGGTACAGGATATTCTTCTA
TTAGTTGTTTAAGAGATATGCCAATTGATATATTGAAACTAGATAAGTCTTTTCTTAATGGTATTGAACA
TGATGAGAGAAGTCGCAATATAGCAAAATCAATAGTGTCTCTAGCAAAATCACTAGATTTAGTTGTAATT
ATAGAAGGTGTTGAGAGTAAAGAACAAGCTGAGTTAATGAAACAATTTGGATGTGATTTAGTTCAAGGAT
TTTATTTTGCACGACCAATGCCAGCTAAGAATTTTTTAGATTTACTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3317414-3314760 aldehyde-alcohol dehydrogenase [includes: alcohol dehydrogenase and pyruvate-formate-lyase deactivase [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTCATAAAGAACAAGTAATAATAGAAAATAAAAAAGAAAATGAAGTTATGTCAGTTGGTTTAGATA
CTGTAAATAACGTTGAAAGCTTAGTTAAAAAACTAGCAAAAATCAGAGAAGCTCAAAAAATATTTGCTAC
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CTAGCTATAATGGCACAAAAGGAAACTGGTATGGGAATTGCTGAAGATAAGGTTATAAAGAATCATTATG
CCTCAGAGTATATATATAATGCATATAAAGAAACTAAAACTTGTGGTGTTATAGAGAAAGACGAAGCATT
TGGTATGACTAAAATTGCTGAGCCAATAGGTGTTATTGCAGCAGTTGTACCTACAACTAATCCAACTTCT
ACTGCTATCTTTAAAGCACTTTTAGCTTTAAAAACTAGAAATGGAATAATTTTCTCTCCGCATCCAAGAG
CAAAAAATTCTACTATAGAGGCTGCAAAAGTTGTTCTTGAGGCTGCTGTTTTAGCTGGAGCTCCTGAAGG
CATAATAGGATGGATAGATGAGCCATCTTTAGAATTAACTACAACTGTTATGAAAGAAGTGGATTTGACC
CTTGCTACAGGAGGTCCTGGAATGGTTAAATCAGCATATTCATCTGGAAAACCAGCTATTGGAGTTGGTG
CAGGTAATACTCCAGCAATAATTGATGAGAGTGCAGATATAAAAACTGCTGTAAACTCAATTCTTGTATC
TAAGACTTTTGACAATGGTATGATATGTGCTTCTGAACAATCGGTTATAGTATTAGAAAATATATACAAT
GAAGTCAAAAAAGAATTTAAAGAGCGTGGTGCTTATTTATTAGATAAAGATGAAACAGAAAAAATAAGAA
ATATAATTTTAGTAAATGGAGGATTAAATTCTAAAATAGTTGGGCAAACAGCTTGTACTATAGCAAAACT
TGCAGGCTTTGAAGTCCCAGTAGATACTAAGGTTTTAATAGGTGAAGTAGAATCAGTTGAAATAGAAGAA
GCTTTTGCTCATGAGAAACTTTCACCAGTACTTGCAATGTACAAGGCCAGTGATTTTGATAATGCAGTTA
GAAAAGCAGAAAAATTAGTAGAAGATGGTGGATTTGGGCATACATCTTCATTATATATTGATGATGTAAA
TCAAAGAGAAAAACTTGATAAGTTTACTTCAGCCATGAAAACTTGTAGAATTTTAATTAATACTCCTTCT
TCTCAAGGTGGTATAGGGGACTTATATAATTTTAAACTAGCTCCTTCTCTTACTTTAGGATGTGGGTCTT
GGGGTGGAAATTCAGTATCTGAAAATGTAGGAGTTAAGCATTTACTTAATATTAAAACAGTAGCTGAGAG
GAGAGAAAATATGCTTTGGTTTAGATCACCAGGAAAAGTTTATTTCAAAAAAGGTTGTTTAGGGGTAGCA
TTAAAAGAACTTAAAGATGTAATGAATAAGAAGAGAGCTTTTATTGTAACAGATACATTCCTTTACAATA
ATGGATATACTAAAGCAGTTACTGATTTATTAGATGAAATGAATATTAAGCACACTACATTCTTTGAAGT
AGAACCAGACCCAACTTTGGAATGTGCTAAGATAGGCGCTAAAGCTATGAGAGAATTTAATCCAGATGTA
ATAATATCTATAGGTGGAGGAAGTGCAATGGATGCAGGAAAGATAATGTGGACATTGTATGAGCATCCAG
ATGTAGATTTCCAAGACCTAGCTATGAGATTTATGGATATAAGAAAAAGGGTATATACATTCCCTAAAAT
GGGTGAAAAAGCTAATTTTGTAGCTATACCAACATCAGCAGGTACTGGTTCAGAAGTAACACCATTTGCT
GTTATAACTGACCAAGATACAGGGGTAAAATATCCATTAGCAGATTATGAACTGATGCCAAATATGGCTA
TAGTTGATTCTGATATGATGATGAATATGCCAAAAAGCTTAACATCTGCTTCTGGTATAGATGCATTAAC
TCATGCATTAGAAGCATATGTATCTATGCTTGCAACTGATTATACAAATGGATTAGCTTTACAAGCCATT
AAGAGTATATTTGAATATCTTCCACGTGCATATGATAATGGTGCAAAAGACCCAGAAGCTAGAGAAAAAA
TGGCAAATGCTTCTACAATGGCAGGTATGGCTTTTGCAAATGCATTTTTGGGTGTTTGTCACTCTATGGC
TCATAAATTAGGTGCTTTCCACCATGTACCACATGGTGTTGCAAATGCTCTTTTGATAACAGAAGTTATG
AAATTTAATTCTTCAGATGCACCAAAGAAAATGGGAGCATTCTCTCAATATAAATATCCAGAAGCATTAA
AAAGATATGCTGAAATAGCTTCATTTTTAGGATTAAAGGGAAATTCTGATGAAGAGAAATTCCAAAGTTT
ATTGGTAGCTATTGAAGATTTAAAACTTAAAGTTGGTATTCCTAAATCTATAAAAGAGTTTGGAGTTGAA
GAACCTAAGTTTATGGATTCAATAGATGAAATGGTGATTCAAGCATTTGATGACCAATGTACAGGAGCAA
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>ref|NC_013316.1|:3317918-3318118 hypothetical protein CDR20291_2801 [Clostridium difficile R20291]
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GAATAGTAACTTATTATGTAGATAATTTGTTTATTAGAGGACTATCAGTATTTGTTTTAATTATGTCCTC
TTCTTTTGTATCAACAACAGTTAGATTGATATTTGAAGAGTCAAAACGATATAAATTCTAA
>ref|NC_013316.1|:c3318916-3318326 dipicolinate synthase, B chain [Clostridium difficile R20291]
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TAGAGTTAGAGAATTTGGTTAAAGAAGGAGCTAATGTACACACTATATTTTCAGATGTATCACAAAATAT
CGATTGTAGATTTGGAAATTCTGAAGAGTTTATGAAAAAAGCATATGAACTTACAGGAAATAAACCTATA
GTTACGATTGAAGAGGCAGAACCATTTGGACCTAAAGGGATTGCTGATATTATAATAATAGCTCCTTGTA
CTGGAAATACTGCTGCAAAATTAGCAAATGGTATTACAGATTCACCAGTATTAATGGCAGCAAAAGGTCA
TCTTCGTAATGATAAACCACTAGTAATATCAATATCAACGAATGATGCTCTAAGCTTTAATTTCAAAAAT
ATTGGTATTCTCCTTAATTCTAAAAATATATATTTTGTACCTTTTGGTCAAGATAATTGCAAAGCAAAGC
CTAATTCTATGATTGCACATACTGAGCTAATAATTCCAACTATAGAACTTGCTCTAGAGAACAAACAGCT
ACAGCCTGTTATAAAAAGTCCACATCAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3319848-3318919 dipicolinate synthase, A chain [Clostridium difficile R20291]
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ATATAACTGTTATTGGGGGAGACCTGCGACAAGTGTACATGGTAAAAAAACTAATTAATAAAGGGTATTC
TGTAGTCACTTATGGGATATCAAATGAAATTATAAATGGAATCGTTGGAAAATCAACTTCACTAGCTGAA
GCACTATCCAAAAGTTCCATTATTTTATGTCCAATTCCATTTACAAAGAATCAAGTTAATATTGAAAATA
CGGATGATTGTCTTGATGCTACTATTGATAACTTGCTAATTAATTTATCTCCTAATCAAATATTATTTGG
AGGTAACATACCAACTAAAGTTTGTAAATTTTGCGAGCAACACTCTATTCAGATTTATGATTTTATGAAA
ATGAATGATGTTGCTATTTTAAATGCAGTTGCTACAGCTGAAGGGGCTATAGCAGAAGCTATTAAAAGAA
GTATAATCAATATACATCAAAGTAACTGTTTAGTATTAGGTTATGGAAGATGTGCACAAATACTTGCAAA
AAAATTATACGCTTTGGATGCAAATGTATGCGTTGGTGCAAGAAATAATGATGCAAGAAGTACGGCTAAT
GCATTTGGATATTCCAGTATTTCTTTAAGTCAACTTGATGAAAAACTTTTACAATTTGATTATATTTTTA
ACACCATACCAGAGTGTATTTTAACGAAAGAAAGATTAGAAAAAGTATCACAAGAAGTAACTATTATAGA
TATAGCTTCTTCTCCTGGAGGAGTAGATTATTCTGTTGTTAAAGAAGTAGGGATTAATGCGACTCTTTGC
CTTGGGCTTCCTGGTAAATATTCACCAAAGACATCTGGTGAGATTCTTGTTAACGCTATAGAAAATATTA
TAAATGAAAGAAGGGATTAG
>ref|NC_013316.1|:c3321261-3319870 putative AMP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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TCAAAAAATATTCCTATTATTTGTCATTATAATCTTTCTAAAAAAGTATTAGATGATATTTTATTAAAAA
ATAATATTTCAATCATTATATCTGATGAATCTATGGACGTTATTGATTTATATGATGATAACAATAATGA
AGTAGCAAAAAAAGTTAATTTTTCTATTTTTAATCCTAAATTTAATCTATATATGTATCAATATAAGAAC
CTTATAAATTATTTAGATAAAAGTATTTGTATGGGAGCTTTATCTTCAGGTTCTACAAGTGTTCCAAAGG
TATTATATAGAACATATGAGAGTTGGGCTGGATTTTTTCCTATACAAAATGGTATTTTTAATATCTCTGG
GGAATCAATCTTGTTTGTTAATGGAACACTTAGTTTTACAGGGAATCTAAATTCTATAATGTCAGTATTA
TATGAAGGAGGTAGTATTGTAATAAGTTCAGGTCTTAATTGTAAATCATGGATAAGGACAATAAAACAAT
ATAATGTAACTAACATATACCTTATACCTACAAAACTTCAACTTTTGGTTAAACACTTAAAAGAACCAGT
ACTCAAAGTAGTAAGTATTTTTACAGGGTCTCAATTATTATTTGAATATACTGCAAGAAATCTAAAAAAA
TATATGCCAAAGTCTGAAATTATTTTATACTATGGGGCAAGTGAATTAAATTATATTACATATTTATGCT
ATGATGAACTAATTGAAAAACCTCTAAGTGTAGGCAGACCATTTCCAGGAATAGATATATATATTAGAGG
AGGAAAAATTTTTGTGAATACAGAATATGCAGTATATAATGCAACCAAACCTTATTCTGTCAATGATATT
GGATATTATGATAATGATGGATACTTAATATTTGAAGGAAGAAGTGATGACATTGTAAATATTGGAGGAT
TTAAAGTTAGTTCTGCTAAGATTGAAAATGAAGTTAAAAAAATTCCTCAAATTGAAGATGCAATTGTATT
GCCGTACTCAGACACTATAAGAGGAAATCAAATTGTATTATTTGTAATAACTATAGACAAAATTACGAAG
AAAGATTTGTTGATTAAAATGAAAGATAATCTAATGAAAAATGAAATCCCAAAGAAAATTATCTTTTTAA
ATTCATTTCCATATACCTCTTCTGAAAAGATAGATAGATTAGCATTATTAAAAATGTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3322401-3321265 putative thiolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGGAAGTTTTTATATTAGGAGGATTGAGAAGTCATATAGGTCTAAAAAATGGAATTTTTCAATTTG
TTCAACCTGAATTACTAGGAGCAAGTGTTTTAAAAGATTTAATTAAAAAGTATGAAATTGACAAAATTGA
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GTGTCAAATGAAGTACCTGCTTTTACTGTGGATATGCAGTGTGCTTCTGCTATGATGAGTATAGACATAG
CTTTTTCAAAGGTTAAATCTGGTCAGTGTAATTTAATTATTGCAGGTGGTTTTGAAAGTAGTTCTCTACA
ACCAATGCGCACATATCATAAGAATGATAAGCGATATAATACAAATAATCCAAATTATACAGTTGCTCAA
TTTTCTCCTGATGATAATAGTCAAAATAGTATGCTCGAAGGGGCGGAAAGAGTAGCAGAGTTATATCAAA
TTGAGAGAGCAGACTTGGATTTTTGGGTAAAGGAAAGTCATAAAAGAGCAAAAGAAGCAAGAGAAGAAAA
AATACTTGAGGATATTATATCTCCTATAAATAATAGTACCTATGATGAAGGTATACGTGATAAGATGAGT
CAAAGGTTATTAGATAGGATGCCACCAATTTTAGGAAAAGAAACTATTACAAATGCAGCAAATTCATGTC
TTATTAATGATGGAGCTTCATTTATTATAATATGTTCTAAGAAGTATTTAGAACATGTAAAAAAGAAGCC
TAAAACAAAAATTATTAATACATGCACAATAGGAACAGATGCAACCTTAAGTCCAACATCAGCGATACAA
GCAATGGATAAACTTTTAGAGATAGAAAGCCTTAATTATTTAGATGTATCTGCTGTTGAATTTAATGAAG
CATTTGCAGTTATAGATGTGTTGTTTCAAAGAAAGTATCCAGAGTTAATAGAGAGATATAATATATTTGG
TGGAGCTTTAGCGTATGGACATCCATATGGTGCTTCAGGTGCAATTATTACATTACATCTTTTAAAAGCA
TTAGAAAAAACTAAGGGTAGATATGGAATTTGCTCTATAGCTGCAGCTGGTGGTCTAGGTTCAGCTTTAC
TGCTTGAAAGGGTGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3322996-3322433 putative biotin synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGGGAATTATAAAAATGAAAAATACTAAAGTAAATATTCAAGATTTAACTAAAATGTCAATATGTG
TAGCATTATTGTGTATATCATCTTACATATATATACCATTGCCATTTACTCCAGCAGGAGTAACAGCACA
AACAATAATGATAAATTTGATAGCTTTGATTTTAACACCAAGACAAGCATTTAGTACAGTTGGTGTATAT
ATAATGATAGGTTTAATTGGGATTCCAGTATTTGGTGGAGGTACATCTGGTATTGGAAAGTTGTTAAGCC
CAACAGGTGGTTTTTATTTTGGGTTTTTGTTTGCAGCACTAATTATTAGTTTATTAAAAGGACGAAATAA
TGATATTAAGAGATATATACTAATAACAATTTTTGTTGGAATGCCTATTATATATTTTATGGGAACAGTA
TTTATGTGCTATTTTAATCAAATGACAGTAGAAGCAGCACTTTTTGCAGCAGTAGTACCATTTTTAATTG
GAGATACAATAAAGTCGGTTATTGCATCTTTTTTAGGCACTAAACTGAACAATGTACTCAGAAGAAATCT
ATGA
>ref|NC_013316.1|:3323302-3324081 hypothetical protein CDR20291_2807 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTTAATGAAAATAATATAAATAATATAGATGAAGAGTTAGATGAACTTAGTAGGAAAGTTTACT
TAGAGTCACCAGATTTTTGGATAAGTATTTCTGACAAAATAATAGATAAAGTATTTGATGAAATGTTATT
ATTTTTTGCAGTTAAATATAACTATTTCAATATAGTATGCTTTGCTATTGAAAACAATTATCTGGATTTA
AACATGCCTTCAAAAAACAAAAAATACACTAATATAATGGAGCATTTGTTAGATACATCAAAACAGAATG
AAGATAAAAAAATTTATAATTATCTTCTAAGCTTAAATAAAGGTAATAACCTAGATGAAAGACCAATTTT
AGATGAATTAAACTGTAATATTAGTAGTGATACTTTTGAAAAAAAAGATATATATCTTCCAAAGTACTTA
TGTCCAAGTTGTAATTCTAATATATTTGATACAGGTTATAAAGTATCAAATGACATAACATATAAATTTT
CTTCTAAAGAAGCTGAACCTATTGAAATGTCTAGTGAAGTTTCTTCTATCAGATGTTGTAATTGTGATGA
ATTATTAGAAGATATTACACTTAATAAACTATATAACCTATGTAAAATTCAAAACTGTAATAATTGTGGT
TCTAATTTAACTAAGGTAGGAATTATTGCAAAGAAAAAAATGAACTTTGATGAGAATACTGAAAAATTTA
AAGATGTCTCAACATCTTACTGTTGTGGAAATTGTGACTCTGAAATAAACTTATCTCAAAGAGAACATTT
TAAGATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3324965-3324537 putative acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAAGAAATTAAACAATAAAGACATAAATAAAATCATGGAAATATGGGAAAAAAGTACAATCAAAG
CACATGACTTTATAAGTAAAGAATACTGGCAAAATAACTACAATACTGTTAAAAACGAATATATACCTAT
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ATAGGAGCTTTATTTATAGAACCCAAATACCAAAATCTAGGTATCGGAGGTAAACTTTTAGATTATGCAA
CTAAAAAATATAAAAGTCTAAGTTTAGCAGTATATAAAGATAATAAAAAAGCAGTTGTGTTTTATAATAA
AAAAGGTTTTAATATAGTAAAAGAACAAGTAAATGAAGATTCAGGATTTAAAGAGTACATAATGGAATAT
AGTAAATAA
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GGATACTTAGAAAATATTTGACTTGGACGCAAAATTCTGTTTTTGAAGGCAATATTACTGATGGAAAGTT
ACATAAATGTATTTCTGAAATAGAAAATATTATTGATAATAGCGAGGATTCAATCTATGTTTATGAGATA
AAAAATCCTAATTCAATTAAAAAGAAATGTTATGGGATTGATAAGTATTCTGATGAAATGTTTATATAG
>ref|NC_013316.1|:c3328205-3327225 hypothetical protein CDR20291_2811 [Clostridium difficile R20291]
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ATTTAGAAGGTGAGAAAAAAATATTACCAGTAGAACAAGTTGATGATATTCATATATATGGAGAAGTAGA
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AAGAAATATGAGATATTACAAAGTTGATGAAAGTTTAATTGATACTATAAAGGATGAACTAAATGATTTG
AATGATGTCAAAGAAATATCAGAACTTATGGGTAAAGAAGGCAGAATAAGAAAAACATACTATAAATCAT
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TAGAGTGTTATAAATTAATTAAACATTTTATAAATGATGAAAGGTACAAAGTTTTAAAGGTGTGGTGGTA
A
>ref|NC_013316.1|:c3328759-3328208 hypothetical protein CDR20291_2812 [Clostridium difficile R20291]
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TAAAAATAAATTATTATTATGTATGTAAAAGAAAACTATGGCTATTTTCTAAAGGAATAACTATGGAACA
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ATGTTGATTGATGATATCTTGAAGCTAGATATAATAAAGGACGAGTATGTAAAAGAAGTAAAAATAAGTT
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AGAGAAAAAAGGAACTATAAATTATGTTAAGGAAAAGAAACAAGAAGAATTGATATTGACAGAAGAAAAA
GAAAAAATTATTGAAAACACACTTATAAATATAAATGAAATAAATATGCAGTTATCTCCTCCCAAAATTG
AGAAAAAACATTATTGTACAAAATGTGCTTATTATGAATTTTGTTTTGTGAAGGAGGAGTAA
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ATGTATTAAGAGAAAGTTATGGAAAAAATATAAATAGCTTAGATTTTCTAGAGGAAGAGATATTTTGGCA
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AGCAGAATGGATACTAAAATAAATGAACCTAAAATAGTAACTCATTTAGAAAATAATGTAGGCCATAATT
ATCTTTCTCCTGCATTTATTGATTATAGTTATATAGACAGGAAAAAAAATAAAGAACTTAGAGCAGTATT
AAATCAAGTTATTGTATATCATCATGAAAGAGATATCTTTATAGATAAAGATTTTAAAAATTTAATACAA
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GTGGAATGCAATAATGTTATAAATATAGGAGAACAGACAGAAAATTATTTAATGAAAGAGTTTGGTAGTT
TGAGAGAGGCTCAATCATTTGCTAAATCTAATAGAAATAAGAATATAATACTGATTGCATCTACAGGAAT
GGGAAAAACAGAAACTGCTTTGATTTGGATAGATAAGGATAAAGCATTTTTTACACTACCATTAAGAGTA
AGTATAAATGCATTATTTGATAGGGCTAAAAATATAATTGGAGTAGGAGAAGCAAATGATACATTCTTAG
GTCTGTTACATTCAACAGCAATAGATTATTTAGAAGAAAGTAATCAGGAAAATTCAAGTGAGATTGTAGA
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ATTCACCAGAAATAGCAGCTGTATTGGTAAAAGGTATAGAAATGATACATAAGATAGGTGGCAGATTTAT
GATAATGACAGCTACTATGCCAACCATATATATAGATGAATTAAAAAAAAGAGGTGTAATGAATAGTAAC
TTAGCTGACTTGACATGTAACACAGAAAAAATAAGACATTGTGTGTCTATTGTAGAAAATTCAATAGATG
AAAACTTAGGTAAAATAATACAAAGTGGAATGAATAAAAAAGTTCTTGTAATAGTAAATACAGTTAAAAG
TGCTGTAGAAAAATATGAGTTAATAGAAGAAATAGTTAAACCAAAAGGAATAGATGTCAACTTAAATCTT
TTACATTCTATGTATATACAAGAAGATAGAGCAAAATTAGAAAAATATATAAAAGAATTTGCAGATAGTG
ATAGTAATGGTATTTGGATTACTACACAATTAGTGGAAGCATCCCTTGATATTGATTTTGATGAGCTTCA
TACAGAAAATTCAACACTTGACAGTCTATTTCAACGATTTGGTAGATGTTATAGAAGTCGTGAGTATGAA
GAAAATAGCCCAAATATATTTATATATACAGAAAAAGCTACAGGAATAGGTAGTATTTATGATAAGGATA
TTGTAGAAAAAGGACTTGAGCTACTGAAAACTTTTATAAATGGAAAAGAATGTGTGAAGATGAAAGAAAA
ATATAAGGTAGAAATGGTTAAGATACTATACTCTAAAGAAAGTCTAGAAGGTACAGCTTTTGAAAAGAGA
TTTACCAGTGCTTTAAATATTTTAGATACTATAACGCCATATAGTTTAGGTTCTAAAGATGCACAAAATA
TACTTAGAAATATTGAAGGATATACAGTAATTCCAGAGGATATATATAATAAAATTGAAGAAACTTTAAT
CAAAGATTATGAAGAGTTGGGACAAGAGCTTATAAATGCATATAGTAATGATGATAGACAATTGATAAAT
AAAATAAAGTCTAAGAGAAAAAAAGCAAGAAGAGAGATAATTAAAAAAACTGTAAATTTACCAATATATA
AAGCTAAACAAAATGTAATTGACATACAGGTGAAAGGTCTTGAAGATTTAAAAATACTTTTATATAAATA
TGATATACACGAAAATAAGCATACAAAACAGATATTTGGTAAAGGTGTGCTTATAAGTAATGAAATAGAC
CAATTTATTTGA
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CAGAGACATATCCACTGCCTCCATATTCTACAATAAATGGATTAATTCACAAAATATTAAATGCTACAGA
ATATATACCATTTAATATAAGTGTACAGGGAACATATGAAAGTATATTTAATAATTACCAGACAACATAT
TTTTATAAAAAAGATAGTATTACATCTATGCCAATGAATAGTCATATGCTATTGAATGTAAATTTGATAA
TTCATATAGGTGGGGATTTTGATTTATTGGAAGAAATATATGATAGTTTATTAAATTATGACGAGCACTT
ATCATTAGGTAGAAAAGAAGATTTAGTAAGAATTAATGATATTAGATTTGTAGAAGTCAATAAATTTGAA
GTAGATGAGGATATACAATTAGATGATTATGAAAATTATAAGTTATCAGAATGTAATATAAGAATGCCTA
TATATATACCAAAAACAAGTTTACAAGATACAGATATAGATGGTATAAGTTACAGACTCAATAATTACTA
TGATAATAATGCTGTGGAAGATAAAAAAAGGGTTTGGAATAAGGTAGATAGTTATTATGTTGAGGATGGA
AATACTATATCAATTGGAGATATATTATTAGATAATGAAGGAGATTTATTATATTTTAATAATATAAATT
AG
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ATATATCAGAATTAAAAAAATTAAGTAGAGATGATGGAAATATATATACATTTGCATCTCGCCAGTGTTT
AAGATATGACATAGTACGATTAGCAGCAGAATTGTTTAATTGGAATTTACAGGTTGTCGATAAAGAAAAA
GGTACTATTCAATTTAAAGACAATATAAGTATAAGAGAATCAGAAGAAATGGATTTATTTGGATATATGA
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TAATGCAATTTCCCTTGAGCCATATAGAAGTGACATGGACTTTTTAAATAATAAAGGATTAGCAGATAGA
ATAGGAGAACATCCTAATCTTGCTAACATAGAGCAACATTTAAGTTATTATACATATACAGTGACTATAG
ATTTATCTAAAATAGGTAAGGATGGAGATATAGAACTTGATAATAAAGAGAAATGTAGAAGAGTAGTAGA
ATTTTTAGAAATAATAAAAGTATTGAATAGAAATATTAGAGGTAGACAAGAAAATTTATCTCCTCTATTT
GTAGTAGGAGGAGTATATGAAATAGCAAATCCATTTTTCTTGGGTAGAATTAAATTAAAAGGAGATAAAA
ATGGATTTAAAATAAATAAGCAAGCTATAGAAGAAGTAATTCAAGGTACTTTTTTAGGAAAAGATTTAAA
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GATAATTTTTTAAGTGTAGATAAATTTTTTGGACAACTAGTTAAAGAAGTAAAGGAATATTATGGGGTGA
ATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3334602-3332725 hypothetical protein CDR20291_2816 [Clostridium difficile R20291]
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AGAAAGCAGATAAACAAGCTGAAATATTTATTATGGAAGATTATATCGAATTTGATAGCTTATTTCTTGA
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ATTGATTACAGTATAAATTTTATTAAATCTAAGCCTGATAGAATCAAAGATGGAATTAAGAAAATTAAAG
ATAGTGTGAAACAACAAAATGATAAGATTAAAAAATTTGATGAAGAAAAATTTAACCTGATAAAAGAGAA
GCTAGATAGCATGTCTAAGATAAAAAGTTATGATGAATTTGACAGTTTAGAAGCTTTAGTAGATGAGACT
ATAGATATATTTAAAATAAAATCAATAAATGACAGGCTTACAGCAAATCTTTATAAATATGTAGTTCAAG
ATAATTATTTTGGACAAGTTAGTTTTTTTAATGTTGCTAAGGCGAAATTAGATTTAGATGGATTAAAACA
GATAATGTTTAATGATTATTTAAGACAAATTATATATTTTGGAGAGTTAGCAGATTTATTAGAAGAGAAT
GACTATGATAAGTTGAAAAACTATTTAAATGATAGATTAAATAGTATAGCTAAGGATATAAATGAAAAAA
AAGTTAGTAAGTCTAGTATAAATACTATAGAAAAAATTATGAAGGAAATAAATAAAAACTTTATAAAGAA
AAATAAAAGCATAGAAGATATAAAAGAGTATATGGATAGTTTAGAAGTATGTGAAATGTGTGGTTTATAT
AAGGGAATATTAGATGAATACTCAGAAAGTAATTTTGCTCCACTTGGAGTAAGCACCAATAATGCTAGGA
ATATGTTTTGGAATCAGGCGTATGTACCATCAATATGTGATATTTGTAAGCTAATATTGTTCTGTACTCC
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ATGGATACTTCTATAAATGAGCTTTTTGAAAGAAATAATAGTTTAAAAGCTCAAAAAAGTGAATATTCAG
ATTCCAAAGATGAAAATCCTTTTAATCAGCTTATAAAAAGTATAGTAGAAGAAAATACATTAAAAAGTGA
ATGGCAACTTCGTAATATACTTTTTGTGGAATTTAAAGCAAGTATAGATTCTAAAAAATGTAAAATAAAT
TATTTTAATATTCCAACTTATTTAGCAAAATTTTTTACAGACAAGTATGCAAATAAAAAAATACAAAGTA
TCTATGATTACAAGCTTAAATCAAATGTACTAGATTTACTCTTGAAAAATAGGGACTTGAAGCATCTAAC
TAATAACATTTTAAGAAATAAAGTTAAAAATGATATGGAAAGCAACAACAAATCAAATATATCAGGAATA
GATTGTTTTAGAGTAGTCCAATTAAGAGCATTAATAAATAGCTACAAAAAGGGGGTATATAAAATGGATA
GTAAAAATTTGGAGAAGAATGATGAAAAGCTGAGAATAATTTATTATTTAGGTTGTGATATACATGACTA
TTTTGTTAATAAAAATTCTAAAAATAAAATAGATGGAGTAAGCTATAAACTTTTAAATTCAGTTAAAGTC
GGAAATAAAAGTGATTTTATGGATACAATTATAAGAGTTTTTATGTCAGCTGAAAAACAGATTCCAGCAT
TTATTTTAGATATAGAAATTGAAAAAGATTTAGACTTTGAATCTATAGGTCATGCTTTTATATCTGGATT
AATTTCTGGAAAATATGAAGGAAAAGACAAACTACCAAACGAAAAGGAGGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3335345-3334608 hypothetical protein CDR20291_2817 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATGAAAATTGAATTTAGTACAGGTTGTATACCAATATCTTATAATTCGCTCTTTATGAGTATTA
TAAAAGAAGCAATAAGAAAATCTAATGAAGATTACTATAAAAACATGTACTATTATAAAGAAAAGAATAA
TAAAAAAACTAAAAATTTTACATTTTCGGTTTATATAAAAAAGTATAGTATTGAAGGTGACAATTTTATT
ATAGAAGATAAAGTAATATTAAATATAAGTACTCCAGATTTAGAATTGGGTTTTCATATATACAATGGGT
TAATGACTTCTAAAAAATGTTTATATAAAGCCTATGAACTTACAAGAATTAGAATCGATTTATCAAGAGA
AAAGAAGGTAACAGAAGAAAGGGTACTATTTAATGCATTGTCTCCAATCTGTGTAAAGTCTAAAGAAGGA
AAATTCTTGGAGATAACTGATGATAGATACATAGAAGAACTAAACTATATAACTAATGAAGTGGTTAAAA
ATTATAGGGGAAATGGATTAAAAAGAAAGTTAGAATTTGAAAATATAGGTCTCAAAAAGATAGTAGTTAA
AGAGAGCTTAAGAGAATTTAAAAAAATAACAGGTAAAGAGTATCAATATATTAATGGTTACAAAGGTAAA
TTTATATTGAAAGGTGATATTGATGATTTAAATCTTATCTACAATCTAGGAATTGGTTTTAGACGTGCTC
AGGGATTTGGAGATGTAGATATTTTAGAATGGAGGTGA
>ref|NC_013316.1|:c3336340-3335423 hypothetical protein CDR20291_2818 [Clostridium difficile R20291]
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AAAGGCAAATAAAAAGTTACAAGATGTATTTAGAGCAAGCTGGTATATTTATAAATTCAACACCTGGGAT
TTATGGTGGTTATGAAATAGATAAATGTAATAGCATATCATTAATTAAATTATTAGATAGTGAAGTTTCA
ATTCTAGATATGATAAATTCACAGTTAGAGTATAATAATGATATTTACAAAAATGAATTTAATAATATTG
TAGAAAAAATAAAAGCAGTATTAAATACAGGAGAAAAAAGCGATACATATATGGATTATTTTACAGTTCA
AGCACAACGTAATTGTGATTATAAGTCTGAAAAAAATAAGTGTAATGAAATAATTAGAGCATATACCACA
AAACACAAATTTTGGATAGAATATTATTCATTAAATTCAGGAAATAGTGAAAGAATTGTTCATCCATATG
GTTTATTTAATTATAAATCAGATACTTATATGGTAGCTTTTTGTGAAAAAAGATTTAAGTTTATAGACTT
TAAATTATGTAGAATTAAAGATTATAAGGTTTTAGAAGAAAAATATAATGTAGATAAAAGTTTTAGTTGG
GATGAATATAGTAAAAATAGTATAGGAATTTATAAAGGAGAAGAAATTAATGTTGTTATAAAAATTAGTC
ATCCATTTTCAATAATTATAAAGGAAAAAGTTTGGGTTAATAATCAACAAATCATAGAATATGATGATAA
ATCTATAATGTTTAAAGCTAAAATGAGAGGTTATGAGGAGATAAAAAGTTGGATTTTAAGTATGGGAGCT
TATGTTGAGGTTGTAGAACCAGATAGACTTAGAAATGATATATTGTCAGAGATTGAAAAAATGAAAAAAA
TTTACTGA
>ref|NC_013316.1|:c3338535-3336619 ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATAAAACAGTTTGCTATTAACAATATTTCAAGAAATATTAAAGCGTATTTAGGATACTTAGCAA
GTATTGTTATATCATCTTCACTGCTATTTTCTTTTATTATGTTTACAAGTCATCCAGATTTAGATGTATC
TCAATTTCCTGATTATTTAAAAGAAGGTCTCAAGATGAGTAAGATAATTGCATATCTATTCTTATTCTTC
TTTGTGTTTTATTCAGTTAGTGTGTTTCTTAAAAGTAGATATAAAGAATTTGGAATACTTTATATTACAG
GTATATCAAAACGCCAAGTAATGAAATTAATCTTTATAGAAAATATGATAATAAATATAGTATCTTCTGT
AATTGGAATAATAATAGGCTTAATCTTTGCAAAGATATTTTTAGTGGTTATGTCTACTTTTTTAGAATTA
TCGCCATTAAAATTCTATATACCATTTAATGCGATATTGTCTACTTTAATCTATTTTATGATTTTAGCTG
TATTAACATCAATATTTACTTATTTTATAGTTAAAGAAAATCAGGTGTTGAAGTTACTTAAAGGTACAAA
AACTCCAAAACCAGAGCCTAAAACATCACTAATGCTTGCTATATTAAGTATTTGTTTGTTTATAATAGCG
TATTATAATGCTATTACCTCAACCGACCAATATACAACATATCTGCGCTTAGTTCCAGTTACATCCCTTA
CTATAGTAGCAACTTACTTGTTCTTTTCTCAATTTAGTGTATTTTTTATGAAGAAGCTAAAACTAAACAA
GAGATTTTATAGAAAAAATACAAATATGCTTTGGATTTCGAACTTGATTTATAAGGTAAAGGATAATGCT
AGAATATTTTTCTTGATAACTATAACTTCTGCAGTAGCATTTACTGCTATAGGTACAGTTTATTCCTTTT
GGAAAGATGTAGAGCGTCAAATTAATTTAATATATCCTAACACAATATATTATTCAACAATGACATTGCA
TAATGACCCTAAAAAGCCTGATAGCAAAGAAAAAGACAAGGAAAGAATGATGTTTATAGAAAATAATCTA
AAAAAAGAGAATGTAGACTATACAAGGACTAATGGTGAATTTAAAACTGTATTTCCCAAGAAAAGTGATT
TTAATGTCAGAATTATGAAAGAATCTAAGTACTTAGAAATTACAGAAACTATAGGGGTTAAGCCTATAAG
TTTTGAAGATAATGAATGCATATCATTATTATCATCAAGTTTACCAGGAAATAATAACGTCAAAGAAAAT
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AAAATATGTATGTGGTAAAGGATAATTTTTATGATAGTATAGAATCAAAATTTATAGTGGATAGATTTAC
TGCATTTGAAGTAGAGGATTCAAGTAAAACTATAGAGATATGCAGAGAATTTGAAAATAAATTTAATAAT
GAGTCAGGGATGCAACCATATTTGTTTTTCTCTAAAGAATTAATGATAGGAACTGGGAAATTAATATATT
CTACATTTATATTTTTAGCAATATTTATAGGTTTAATTTTCTTTGTTACTACAAGTAGTTTTTTATATAA
TAAATTTTATATGGATTGCCAAGTTGATAAGAAAAAGTATGAGCAATTAAATAAATTGGGGATGACATAT
AATGAGATTAAAAAAGCTTCAACAATTGAGATTGGAATAGTATTTTTGTTTCCTTATGTAGTGGCTGTTA
TACATTCAATATTTGCCCTTACTGCACTGAAAAATTCTTTTGATATAGAAGTAGCATCATCAGCTGTTTT
GGTAATGGGAAGCTTGTTCTTGGTTCAAATAGTTTATTTTTTAATTGTAAGAAATAATTATTTAAAAGAG
ATAAGGTTAAATTTAGTCAATTTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3339281-3338535 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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ACATAAATTTTAGTATAGAAGATGGAGAATTTGTAGGAATTATGGGTCCATCTGGTAGTGGAAAAACTAC
TCTTTTAAATATGATTTCTACTATTGACAAGCCAACTACAGGAACTATGGAATTAAAGGGAAAGAATCCT
TTATTGTTAAGAGGTGAGGAACTTGCATTATTTAGAAGAAGAGAGTTAGGTTTTGTATTTCAGGATTTTA
ATTTATTGGATACATTAACTATAGGAGAAAATATAGTATTGCCATTGACATTAGATAAGGTCAGTGTAAA
AGAGCAAGATGAGAGATTGAATGAAGTATCTACAATATTAGGTATAAAAGATTTATTAGGAAAAAGAACT
TTTGAAGTATCAGGTGGTCAAGCTCAGAGGACTGCTATTGCTAGAGCATTGATTAACAATCCATCAATAC
TTTTAGCAGATGAACCAACAGGTAATTTAGATTCAAAGTCATCAAAGGTTGTAATGGAGCTATTTCAAAA
GATAAATAAAGAAAATAAAGTTACTACTATGATGGTAACTCATGACCCATTAGCAGCGAGCTACTGTAGT
AGAATCTTATTCATAAAAGATGGGTCTATATATAATGAAATATATAAGGGTAGTAGTAGAGAGCAGTTTT
ATCAAGAGATAATGGATGTACTTACATTATTGGGAGGCGATAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3340236-3339385 undecaprenyl-diphosphatase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTTAGATGTTATTTTTATATTGAAATCAGTCATAATAGCTATAGTAGAGGGGTTTACAGAATTTA
TTCCAGTTTCATCTACAGGTCATATGATTTTGGTTGGTAATTTAATAGATTTTAAGGGGCAATTTGCTGA
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GATAGCGTTATAGAATTTTTTAAATTTATATTTACTGGCGGAAAAGAAGGAAAGATTGGTTTTAGATTTG
GAATGAATGTAATTATAGGTTGTATACCATTTGCGATTATAGGAGTTCTATTTTATGATAATATAAAATC
ATTGTTTAATTTACAATCTGTAATTATAGGATTTATAGTGGGTGGGATTTTATTATTAGTAGTAGAAACT
TTGTTTAGAAAAAAGAATCATTCAACAGATAATATAGATAAAATTACTCCAATACAAGCTTTAAAGGTTG
GGACATTACAAGTTTTGTCTGCATGGCCAGGTATGTCAAGGAGTGCATCTACTATTATGGGTGGATGGAT
AGCAGGACTTAATTCTCCTACAGCAGCTGAGTTTTCTTTCTTTTTAGCAGTACCAGCTATGGTGGCTTCT
TCAGGAAAAGATTTATTTGAATTTGATTATTCAATAATGACACCAACATTGTGGATTGCTTTGGTAGTTG
GGTTTATAGTAGCTTTTATTGTATCAATAATAGTTATGGAAAAATTCGTGAATTTTTTAAAGAAAAAACC
AATGAGAGTGTTTGCTGTATACAGAATAATCATGGGTGTAGTACTTGCAGTATTAGCTTTTACTAACATA
ATTAGTGTATAG
>ref|NC_013316.1|:c3341488-3340484 two-component system histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGTTATTTTTAAAAGATTATAAAGGTTATATTTTTATATATTATATAGGCATAGTTATGACAATTA
TTTACTGTAATCTTATGAAGTTTATTAGTTTTGGAGAGAGTTTATATATTCTTTTATTTAGTTCTTTTAT
ATTGTTATGTTTTTTAATATATAAGTATTATAAAAATAGAGAAGTATATAATCTGTTTGAAAAAGGAATA
CATTCTTTGGAGGAGTCATTTTTGTATTTAGGAAGCTCATTCTTGGGGAGAAATATATCAGTTATTTTAA
AACAACAACATAAATTGTATCAATCAATGATACAAGAGCATAAAAAGATACATAGTGAACATTTAACTTT
CATCAACCAATGGATTCATCAGATGAAAACACCAATATCAGTTATAAGCCTTCAGCTTCAAGATTATGAG
GGAGAAGAAGTAACTGAAAATATAAGAAAAGAAATAGATAGATTAAATAAAGGGTTAGATATGGCTATGC
ATTTTGCAAGGGCAGATAATTTTCAGAAAGACTTTATAGTTGAAAAAGCCAAATTAAATGAAATTGTATC
TAGTATTGTAAATGAAGAAAAAAGGTTATTTATAAAAAGTGGAATGATTCCTAAGATTCAAGTAGACAAA
TTTACTTATGTTTATACAGATGTAAAATGGATGAAATTTATAATAGGTCAATTAATTACAAATGGAGTGA
AATATTCTAAAGATTATAGTAACTACCTAACTATAAAATCTGAAGAAAATAATAAATATGTAATTTTAAG
TATAATAGATGAAGGAATTGGAATTGTTTCTAAAGATTTAAAAAGGGTATTTGACCCATTTTTTACAGGA
GAAAATGGTCGTAAGTTTGGAGAATCTACAGGTATGGGTCTTTATCTAGTAAAAAAGGTATGTGATGATT
TAGGTCATAAAGTAAGTATAAAATCAGAAGTAGGAAAAGGTACAGAAGTTTCAATCTACTTTAATAAAGA
TGTAAATAGTTTGATAAAGATGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3342190-3341498 two-component system esponse regulator [Clostridium difficile R20291]
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AATATGGATTTGAAGTGATTGTTGAAGAGAACTTTGATGATATAATGATTACATTTGAAAGTTTTAAGCC
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GTGGAGCAGATGATTATATAACAAAACCTTTTTACTATGATGTAGTAATGGCAAAAATAAAGAGTCATAT
AAGAAGGGTATATGGTGAATATTCACCTAAAATAGACGAAAGAATAGTGGAGCTAGATGGATTAAAGTTT
TATCCAGAAAGGTTAGAACTAGAATTAAATGGTGAAAATCTAATTATAACTAAAAAAGAAGGTATACTGA
TTGAATGTCTTATCAAGAGATACCCAAAAGTAGTAAGTAGAGATTATCTTTTAGAAAAGATATGGGATGA
TATTGAGTTTGTAGAAGAAAATACTTTAAATGTAAATGTTAGCAGGATAAGGAAAAGATTTGAGGAATTA
GGTATAGATAATGCTGTTCAGACTGTCCGAGGGTTAGGATATAAATTAAATAAGAATTGGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3343463-3342504 ABC transporter, substrate-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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CTAAAAAAAATAATGGAGAAAAACTTTCAGAAATAAATTTAACTTATGTAAAATCACCATTAAATGTTCC
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CACGAAATTACTACAGGTCCAGAGCAAACACAGGCTTTAGCTGCTGGAGAAATAGACTTCTTACATGCAC
TAGGTGGTACGTCAGCTTTAATAGCTGCATCTAATGGAGTAGAGTTAAAGATATTAAACACTTATAGCAG
GTCACCAAAAGGATTTATGATTTTGACTAATAATAATTCAATAAAATCAGCAGCAGATTTAGTAGGTAAG
AAGGTGGCAGGTCCAAAAGGGACTATATTACATCAGGTATTGATTTCAGCACTTGATAAAGAAGGATTAA
GTATGGATGATGTGGAATTTGTTAATATGGGTATTCCAGAAGCATCAGCAGCTCTTTCTGATGGTAGCGT
AGATGTTGCATTGATTGCTGGTCCAGCAGCTCTTAAAGCTATGAAGTCAGGTAGTAAACTTGTAGCAAAT
GGTGAAGGTTTAGTAGATGGTATAATAGTAACTGCTGTTAGCACAGACTTTGCAGAGAAACACCCAGAAA
TAGTTGAAAGATTTATGAAGGTTGAAAAGGAAACTTTAGAATATGTAAATAATAATTTTGATGAAGCTAT
GGAAAAAGTAGCTAAAGAAGTTGATTTAAGTCTTGAAGAAACTAAAGAATTATATGCTTGGTATGATTTT
AGTTTAGATATAACAGATAAAGATATATCTTCGCTTGAAGATACACAAGACTTCTTAATAAAAAATAAGT
TACAAGAGAAAAAAGTGAATATAAAAGAATTAATCTATAATGCTAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3344374-3343496 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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AAGAACATGTAGTTCTTAGTGATATCTCTTTAAACATAGATAGAAACCATATAACAGTAATTTTAGGTGA
AAGTGGTTGTGGAAAGACTACCTTGCTTAGAGCAATTGCATCACTTGAAGGTATAAATAGTGGTGAGATT
AGGTTTATTAATGATAATAAAGAGTATAGACCTAATGTTGGTTTTGTTTTTCAGGAGAGCAGATTAATGC
CTTGGTTAAACGTAAGTGAAAATATAGCTTTTCATAATCAAAGAAAAAATACTATTTTAAACAAGGTGCT
TAGAAAATTTAAACACAATAAAAGAATTATTGGTAAAATTATAAATGATAATTTTAGAAGCTTAGAAACA
AATGATAATTTGAACAAATCAAATAAATATAATAGGAAAAGTAATATTGATGTAGAAAAATATCTTAAGA
TGATGAACTTGCAGAAATTTAAAAACTCTTATCCAAATGAATTGTCAGGAGGTATGGCACAGAGAGTAAG
CATAGCTAGAGCTCTTTCTTTCAATCCAGATATGTTGCTTATGGACGAGCCTTTTTCGGCATTAGATTAT
TTTACAAGGATTGATATGCAAAATGAAGTTATAAAAATACATAAGTCAACTAATAAAGGCGTAATATTTG
TAACTCATGATATTGATGAAGCGTTAAAGATAGGCAAAAAAATAGTTGTTTTCACAGACGAAAGAAAAAT
AAAAGAATTTAATATAGAAGATGGTTATAATAGAGATTTAACTTCAGAGTACTATATTAAATTAAAAAAA
GATATTTTAATGACAATGAAATCAAATAAAGACATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3345149-3344367 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGTCAATAAATTTAATAATAAGTTTTTAAGGCTAGTAAAGAGTGTTCTGATATTTTTTATAATTCTTT
TATTATGGAAAATTACAAATTATCTTGGTATTTGGAGTGATTATATATTACCATCACCCGAAAAGGTATA
TAGTACATTTTTAAATATGATAAGTGATGGTTCAATATTTATTAATGTATATGCAAGTATGAAAAGAGTT
TTGATAGGTTTTGCAATAAATACTGCTATAGGTGTGCCTTTAGGGATATTCTTTGGAATTTATAGTGGAG
TATACGAATACTTTAAATCTCTAATAAATTTTTTAAGGAATACACCTCCCCTTGCTTTAATACCAATGCT
TATATTATGGTTTGGTATAGGAGAGGAATCAAAAATTATAATTATAGTTTTAGCATCCTTTTTCCCAATC
TTTACAAGCACATTGAAAGGGATTAAAAATTGTGACTCAAAACTGATTGAAGTGGGTAGAGTATTTGAGT
TTTCAAAGCTTCAGATAATATTTAAAATAATAATACCAAATGCCATTCTTGATATTGCTGTTGGGTTAAA
GTTAGCTCTTGGATATAGCTTTAGAGCAATTATTGGGGCAGAACTTGTAGCAGCTTCATCTGGTCTTGGA
TACTTGATATCTGATGGAAAAGAAATGTCTAGAACAGATGTTGTTATTGTAGGTATAATCGTAATTGGAC
TTTTAGGAATAATTACAGATTACATATTTTCGATTATTGTGAAGAAGGTAAGTAAGGGAAAGATGGTGGA
AGCATATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3345779-3345150 hypothetical protein CDR20291_2827 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAATATCTTCTAATAAATCCAGTGGCAGAAAGAATGTATGGAGAAAAGTTTCACCTTATTAAAG
CAAATTTGATAAAAAAGGGGTACATAATAGCAGAATGTGAACCACAGTTAGAATATGTAAAAAAGCAGTA
CAAAGAGTATACAAAAAAGACTGAAAATACAATGTTGGATTGTAGATGTCCAGAAAGTATAAGTCTTTTA
AAAAGAAATAATTTGATAAATAATTTTGAAGTACCTATGATAGAACCAATATTAGTAAGGACTTGTAGGG
TTTTATACGATAAATATATAAAAAGTAAAGATGATATGTTGGTAGTAACCTGTCCATGTACACAATTAAG
AGACTTTGCAAGTGAAAAGTTTAAGGATAAGGGTAATGCTATGTTTTATACATGGAAAGAGTTTGCTGAA
CAAGAAGGTGTAAAATCACTTGGAAAAATAGATGAATCACCAATTCCATTAGGATATTTCAAAGATACTT
TTGAAAAAGTTCTTGAAGTATCAAGTGAAGACGAAATATTAAGTGAAATACAAAAAATAAGAAATGGCTT
TGAAGATAAGTATGACATAGTAGAAATGTTTTATTGTAAAGATGGTTGTAATAATGGAGATGGTTTGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3346800-3346174 hypothetical protein CDR20291_2828 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATATGAATGGAGAAAAAGAGATAAAGAGTTATATTTACCTAAAAAGAATCCTGTAATAATTGAAA
TACCAGAACAGAAATTTATCATGTTAAAAGGGAGTGGAGACCCAAATTCTAAAGAATTTATTGAAGCAAT
AGGAGTACTTTATTCTTTGGCATATGCAATAAAAACCATGCCTAAAAAAGGAATTGTACCAGAAGGGTAT
TTTGACTATACGGTTTTTCCTTTAGAAGGTATATGGGATAAGGGAGAAAAAAGTAAAGGCTTAGATGTAC
TTATTAAAGAAGATTTAATTTACACTATAATGATACGTCAGCCAGATTTTGTTACACAAGACCTGTTGGA
TAAAGCTACTGATATAGTAAAGAAGAAGAAACCTCATAATCTTCTTGAAAAAGTTAGGTTTGGGTCTATT
AATGAAGGGCTATGTGTTCAAATGCTTCATATAGGTTCATATGATAATGAACCAGAAAGTTTTGACATTA
TGAACGAATTTTGCAAAAAAAATAAACTTATAAGAAAATCTTACACACATCGTGAAATTTATATAAGTGA
TGCTAGAAAAGTATCGCCTGAATCATTGAAGACGGTTTTACGTTTTGAAGTAGAAAGGGAAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3347847-3346876 ribonucleoside-diphosphate reductase beta chain [Clostridium difficile R20291]
ATGACATTTAATTTACATAAAATACATAATGCAGTTAACTGGAATAGAGAAGAAGATGGATTTACACAAG
CTTTTTGGGAACAAAATGTAAAACAATTTTGGCTTCCTGAAGAAATATCTGTTTCTAAAGACATAAAGGT
ATGGAATGAACTAAGTAATAAAGAAAAGGAATTATATAAAAAAGTATTGGGTGGTTTAACATTACTGGAT
ACAAAACAGGGGAATAATGGAATACCATCTATGATGAGTTTAACAGAAAACCTACAAAGAAAAGCTGTCT
TGTCTTTTATGGGGACTATGGAAGAAATACATGCAAAAAGTTATTCTTCTATATTTATGACTCTACTTTC
TAATTTAGAAATAGATGAATTATTTGAATGGATAGAAACAGAACCAACATTACAAAGAAAGGCTGATTTA
GTTTTAGCTCAATACGAAAATACTACAAATCAAGAGGGATTATACCTATCAATGGTTACAAGTGTATTTT
TAGAGAGTTTCTTGTTTTATTCAGGATTCTTTTATCCATTGTATCTATCTGGTCAAGGAAAGATGGTAGC
TAGTGGAGAAATAATATCGCTTATTCTTAGAGATGAGTCTTTACATGGTAAGTATATAGGATTGCTAGCA
CAAGAAATATACGATTCATTTGATAAAATGGATAAGAAGATGTTAGAAGAGAAGATGTATTCTATACTTT
ATAGCCTTATGGAGAATGAGATAGAGTATACAAATGTTATATACAGAGAAAGTGGGCTTGAAAAAGAGGT
TGTGAACTTTTTAAAATACAATGCGAATAGAGCTTTAGAAAATCTAGGGTTTGAGAAGCTATATACTGTA
GATGCTATAAATCCAATTGTATTAAATGGTCTTAGCACTGAAACCAAAACACATGATTTCTTTTCAACTA
AGGGTAATGGATACCAAAAAGGAGTGTATGAGGAATTAGAGGATGAAGATTTTATAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3349959-3347860 ribonucleoside-diphosphate reductase alpha chain [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTGGATAGAGCTTAACAATCAAGTGATAATTAAAAATGAACAAGGTAAGTACCAATTGGAAAAGG
ATAAGGAAGCCTTAAGTAGTTACATAGAAGAATTTATACAACCAAAGTTGAGAAAATTTAATAACCTAGA
AGAAAGATTGAAGTATTTAATAGATGAAGGTTATTATTTAAAAGAAGTAATAAATCAGTATAGCATAGAT
GTTATTAAAAATATATATGATATGATTGATAAACATAAGTTTGAATTTCAATCATATATGAGTGCAAATA
AGTTTTATCAAAATTATGCATTAAAGAGCAATGATGGAAAGGAAATATTAGAAACATATAATGATAAAGT
GTTAATTGTAGCTTTGACACTAGGAAATGGCGATAAAGATTTAGCTTTAAACTTGGCAGATAAAATAGTA
AAACAAGAATTTCAACCAGCTACACCTACTTTTTTAAATGCTGGAAGAAAGAGGGCTGGAGAAATGGTAT
CATGTTTTTTACTATCTGTAGAAGATAGTACAGAAGGTATATCATATGCTATATCTTCATCAAATCACTT
ATCAAAGATTGGTGGAGGAGTTGCACTAAATTTATCTAAACTTAGAGCATCTGGCGAATCTATCAAAGAT
ATAGAAGGTGCAGCTGGAGGTGTTGTTGGAGTAGCTAAAATGTTAGAACAATCATTTAGTTACTTTAATC
AAATGGGAGCTAGACAAGGTTCTGGTGCGGTGTACCTTACTGTATTCCATCCTGATTTTGAATTGTTGAT
GGATACTAAAAAGATAAATGCAGATGAAAAAATAAGACTTGCTACATTATCATTAGGAGCTATAATACCA
GATAAATTTATGGAGTTGGCAGAAAAAAATGAAGTAGCATATGCATTTTATCCTCATACTGTGTATAAGA
AATATGGAGTTTCTCTTGATGAGATAGAAATGGATGAGTGGTATGATAAATTGGTTAATGATAGTGATAT
AAGAAAAAAAGAAATAAATCCTAGGCAGATGTTGACAAAAATAGCACAAATGCAACAAGAAAGTGGATAT
CCATATGTAGTGTACATAGATACAGCTAATAGAGAACATACATTAAAAGATGTTGGAATTATTAAAATGT
CTAACTTATGTTGTGAGATATTTCAATATCAAACACCTTCAGAAATAGAGGGGTATGGAGGAAAAAATGA
ATGGGGACAAGATATAAGTTGTAACCTAGGTTCTTTAAACATAGCCAATGTAATGGATAATAAAACTATA
GAAAGTACAGTTGAAACAGCAATAAGAGCACTGTCATTTGTAGCAGATAGCACAGATATAAAACCAGTGC
CAACGGTAAGCAATAGTAACAGCAAGTCTCATTCTATAGGATTAGGAGCTATGAATTTACATGGATACTT
AGTAAGAGAAAATATTTTATATACTTCAGATGATGCTATAGATTTTTCTAATGTATTTTTTGCAATGGTT
AGATACTATTCAATTAAAGCTTCTATGAAAATAGCCATAGAAAGAAATCAAACTTTTGAAGGATTTGATA
AATCAGAATATGTTAAGGGAAGAAATAGCAAGGTTTTATCAAAATACTATGAACAATCTTATCTACCTAA
GTCAGAAAAGGTAAGAGCATTATTTGAAGGGATTTATATACCAACAAAAGAAGATTGGACAAAATTATTG
GATGAAGTAAAAGAAAAAGGGATATATAATGCATATTTAATGGCAGTAGCACCAACTCAAAGCATTAGTT
ATGTTCAAAATGCTACATCAAGTATAATGCCAATTACTGAGCCAGTAGAAGTAAGAACATATGGAGACTC
TACTACAATATATCCAATGCCATTTTTAACAAATGATAATATGTTGTATTATCAATCAGCATACAGGATG
GATATGAGAAAGGTCATAGATTTAGTGGCAACAGTTCAAAACCATGTTGACCAAGGTATATCAACAACAC
TGTTTGTTACAGATGAAAAGACAACTAGAGATATAGCTAGACATTACATATATGCCTATAAAAAAGGTTT
GAAAAGTTTATATTACACAAGAACAAAGATGACAAGAGATACTCATGAGTGTCTAGTGTGTTCAGTATAG
>ref|NC_013316.1|:3350422-3351162 hypothetical protein CDR20291_2831 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGGTGATTTTAATGAAAACTATTTCTAAACAAGAATTAGAAAAAACACTTGAGAAACATTATTTAT
GGCTTAAAAACAATAATGCTGGAGAAAAGGCAGATTTAAAAGAATTAAGATTAGAAAATATGGACTTAAG
AGGATACTGCTTAAGTAATATTGACTTTTCGTGGTCTGACCTTATCAATTTAAATTTAGAAAAAGCAGAT
TTAGAAAACTCTATTTTTAATAATTCTTATCTTTCGGATTGTTCATTAAAAAATTCTATATTAAAAAATG
CAGACTTAAGTGGTGCAAATTTTAGATTTTGTGACTTATCTAACTCAGATATTAGAGGAGCTAATTTAGA
AAATTCCAATTTAGAACATGCTACTTTAAATGGAGTAATATCAGATGAAAGTACCCCTTTTTTTAAATTG
TATTGTCCTGAAACAGGAGCATTTATAGGCTATAAAAAATGTTTTAATTTCAGAATGGTACAATTATTAA
TACCCAGCGACGCAAAAAGAGTGTCTGCTACATCAAATGCTTGTAGATGTGATAAGGCAAAAGTACTGTC
AATTACTAGTATAGATGGTAAAGAATCTTTTAAAAGTGCTCGTGCATATGCTGATGAAAATTTTATATAT
AGAGTAGGAGAAACGATTGTAGCTGAAGATTTTAATGAAAATAGATGGAAAGAATCGACTACAGGGATTC
ACTTTTTTTTAACTAGAGAGGAAGCTATTGGTTATCTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3352478-3351282 putative iron ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTGAAAACTAATAATTTAAGTGTAGGATACAATAACAAGGTAGTTATAAGTAATATAAATGTAGAAG
TAAAAAATGGAGAAATACTATGTCTTTTGGGAAGTAATGGAGCTGGAAAAACTACCCTATTAAGGTCCTT
ATCTAAACTTATATCACCAATAAAAGGTGAAATATATTTGAATGGTGTAAACATAAATTGTATATCAAGA
AAAGCATTATCAAAAAAAATGGCTTTAGTACTTACAAATAGATTATTAGGTGATTTAATGACTGTACAAG
ATATAGTCAATATAGGAAGGTATCCATATACAGGATTTTTTGGGAGTCTATCTAAGAAAGATTTAATAAT
GGTAGATGAAGCATTGGAGTCTGTAGATGCCTTACATTTAAAGAAAAGATATTTTGATGAACTAAGTGAT
GGAGAAAAACAAAAGGTGTTGGTTGCAAGAGCTCTTGTTCAAGAACCAGAAATAATTATATTAGATGAGC
CTACAACTCACTTGGATATAAAACATAGATTGGAGCTCATAAACATACTGAAAAAATTAAGTAAAGAAAA
GTCAATATCAGTAATACTTTCATTGCATGAAATAGACATAGCATTAAAAAGTTGTGATAAAGTTGCTCTT
ATAAAAAATAATAAAGTCATAGCTTATGGTCAGCCTGAAGATGTAGTAGATGAGGATATTATAAATTCGC
TTTATGAATTGGATGATAAAAACTTTAATAGTCTTTTAGGTTCAGTAGAAATTAGTAATAAATCTAAAAA
TGAAGTTTTTATAATTGGTGGTGGGGGTAAAGCAACACCAATTTATAGAGCTTTTACTAAAAAAGGTATA
GGTCTGTATTCTGGAATAATACATGAAAATGATATTGATTATGAAATTGGTAGAACTATGGGGATAAAGA
TGTTTACAGAAAATCCATTTGAGCCGATAAGTGATGAGAGTTTCGATTTGGCTATTAGAAATTTAAATGA
TTCCAAGATTATAATAGATACAGGATTTAGTGTAGGAGAGACAAATAAGAGGAATATAGATATTATAAAA
GAGGCTTTAAAACTGGATAAAAAAGTTTATTCTTTTAGAAATAGAGATGAGAGTAAGAAGTATTATGACA
GTTTGGATAGTAAGATAGAACATATAGATAAAGTTTCTCAAATAATCAATAGTGCAGATATAAATAATTT
ATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3353906-3352788 transposase-like protein b [Clostridium difficile R20291]
GTGGTAGTAGTGGAAAAAGCTTATAAGTTTAGAATGTATCCAAATAAAAAGCAACAAGAGTTAATTAACA
AAACTTTTGGATGTTGTAGATTTGTATATAATAAGTATCTTGCTAAAAGAATAGATGTTTATAAAAACAA
TAAAGAAACTTTTACTTATAAACAGTGTAGTTCTGATTTGAACAATTTAAAAAAAGAATTAAAATGGCTT
AAGGAACCTGACAAATTTTCACTACAAAACGCCTTAAAAGATTTAGATAATGCATATAAAAAATTCTTTA
AAGAAAAAGTAGGATTTCCTAAATTTAAATCAAAGAAAATTAATAGATTTTCATATAAAACTAACTTTAC
AAATGGAAACATTATGTATTGTGGTCAACATATAAAACTACCTAAACTTGGTATGGTTAAGATAAGGGAT
AAACAAGTACCTAAAGGGAGAATACTTAATGCTACTATATCTAAAGAACCAAGTGGTAGATATTATGTAT
CATTATGCTGTACTGATGTAGATATTGAAGCATTTGAAAATACTAATAATCATATAGGTTTAGATTTAGG
AATTAAAGAATTTTGTATCTCAAGTTGTGGAGAATTTATAGAAAATCCTAAGTATCTTAAGAAGTCATTA
AACAAACTTGCTAAATTACAAAGAGAATTATCGAGAAAGACAATCGGTAGTTTAAATAGAAATAAAGCAA
GATTAAAAGTTGCAAGACTTCAAGAACATATAGCTAATCAAAGAAATGATTTTCTGCAAAAACTATCTAC
TAAATTAATAAAAGAGAACGATATTATTTGCATAGAAGATTTACAAGTAAAGAATATGATTAAAAATCGT
AGACTATCTCGCTTAATTTCTGATGTATCATGGTCAGAATTTGTTCGTCAATTAGAATACAAGGCTAATT
GGTATGGTAGAAAAATTGTAAAGGTAGGTAAATTCTTTGCAAGTTCACAAATATGCAATAAATGTGGGTA
TAAAAACGAGGAAGTGAAGGACTTAAATATAAGAGAATGGATTTGTCCTAGTTGTAATGAAACTCACAAT
AGAGATATAAATGCAAGTATAAATATATTAAAAGAAGGATTAAGACTAATAACAATTCAAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3356684-3355554 putative iron ABC transporter, substrate-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTTAAATCAAATGTTTTAAAGCAGTTTTTTTTAATTGCTATGGTAATTTTTATGGTAGGAGGTC
TTATAGGGTGTAGTAAAAGTGACAAAGAGAATAAACAAGCTAGTACTGGTAAGAAATTAGAATTAAAATA
TGCTAGTGGATTTAGTGTTGAAGATTTAGAAGATGGAATTAAAAAAGTAACTGATGGAGATAATCGAGAA
CTGATTTTAATCCCAAAGAAGATTAAAATTCCTGAAAAATATAAAAATGCTAATATAGTTAGAACGCCTG
TGGACAATGTATTAATAGCATCTACAACACAGGCTTGTTCTCTGAGAACAATAGATGAACTAGATAGTAT
AAAAGCCGTAACAACAGAAGAGCAGTACTGGACTATTAAAGAAATTAAAGATTTAATGAAAGATGGAAAA
ATACATTACGTTGGTTCAAATTTAGCACCAGATTATGAAAAAATAGTAGACTTAAATCCTGACTTAACTA
TAGTGAGTAGTGGTTTATCAGAGGCTGATACAAAATTTATTGACAAATTAAAAGAATTAGGGCTTAATTA
TGTTGTAGACAATGAGTATAAAGAGCAAAATCCATTTGGAAGAATGGAGTGGACAAGTTTAATAGCTGCA
TTTTATGATAAAGAAGATATGGCTACTAGTGAACTAAATAAAACTGTACAAAAGGTAGAAGAAGTAAGTA
AAAAAATAAAAAACAAAGCTAAACCTAAAGTTGTATGGGCATCTGTATATGAAGGAAGTGCTTATATAGC
TCCTAAAGATTCATATGTGGATAATATGATAAAAATGGCTGGTGGAATAAATGCATGTGCTTCAATAGAT
TCAAATGAAGGGCGAGTAAGTATTGAACAATTGCATGAAGTTGCAAAAGATGCAGATATATTTGTATACT
CATCAAGTTCAGATTATGCACCAAATTTAGATTCTATAAAATCTAGTGCACCTGTATTGGCTGATTTGGA
TGTTGTAAAAAACGGAAACCTATGGGTGTTTGCTCCAGATTATTATCAATCAGTAGATAAGACGGACGAA
TTAATAGTAGATTTAGTTGAGATGTTCCACCCAGGTACTACAGGTGAAAAAATCAAACATTATATAAATT
ATGATAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3358039-3357146 putative dihydrodipicolinate synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGCAGAATTTTTGACACCAGTTGTTACAATATTTGATGAAGAAGGAAATTTAGATAAAGAAGGTA
ATAAAAAAGTGTACGACCATCTTATAGATGGAGGTGTAGATGGACTAGTCATAATGGGAAGTACTGGAGA
GTTCTTTAATATGTCTATGGATATGCAAAAAGAACTTATAGATTTAGTAACTAGTCATGTAAATAAGAGA
GTAAAAGTGTTTATAGGTACAAGTCGTATGTGTATAAATGAATCTATAGAACTTTCAAACTATGCACATA
ATAGTGGAGCAGATGGCGTTATGATAATAAGCCCTTATTATTTCTCTCTTGATGATGATAGTATTGAGTT
ATTTTATAGTGAAATAGCTAAGAATACAGAGGCTGAAATATATTTATACAATTATCCAGATAGAACTGGT
TATGATTTAAGTCCAGAACTTACATTAAGACTTGCAAGAAAACATAAAAACATAGTTGGATATAAGGATA
CAGTAACTTTGATGGGACATACCAGAGATTTAATAAATACTATGAAAATAGAGTTCCCAGAATTTAAGGT
TTATAGTGGTTATGATGAAAACTTTATACATAATCTAATGTCTGGGGGAGCAGGTTGTATAGGGGGATTA
TCAAATTTAATTCCAGAAGTTTGCTCCAAATGGGCTGAAGCTTACAATAATAGAGATATGGAGAAGGTTA
TAGAAATTCAAAAATATATTAATAAAGCAATGGATTTTTACTTAATAACCAATCCATTTATACCAGCAAT
GAAAAAAGCTATGAATATCAGAGGGTTACAAATAAGTGATTATATGACTGCTCCATTTGTAAAACCAAAT
GAAAAACAAGTATGTGAAATTAAAAAATTGATGAATAAATTAAATATATGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3359021-3358119 putative isomerase/hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGTTTGTAAGTTTTACTGAAGGAGAAAATGAATGTAAAAGAACTGGAGTTTTTTCTAAAGATGAAT
TATTTATTATAGATGTTAACTCTTTAAATCTCAGTAGAAATTTTAAGGATTTAAATGAATTAATTCAAAA
TGTATCTAGTGAAGATATTATTAAGTTGAAAACTATTATAAATGAAAGTATATTCTATAATTATGATGTT
TTTAAAAGAGAGAGATGTACTGTACATGTTCCTATAGAAAAACCAATACATGATATCTTATGTGTGGGAG
TGAACTATAAAGACCATCTTGAAGAAACTCAAACTCACTTTGATGATAGTTTTGAAGAGCCACAAAAAAC
GGTTTATTTTACAAAACGTGTGACAAAGGCAATAGGTCCAGAAGATGAGATAGATGGTCATTTTGAGATA
AATAATCAACTAGACTATGAAGTTGAACTTGGAGTAGTAATAGGTAAAACAGGTGTTAATATTAGAAAAG
AAGAGGTAGAAGATTATATCTTTGGTTACACTGTTATAAATGATATTTCTGCTAGAAAGTTGCAAAAAGA
ACATGTTCAATGGTTTAGAGGAAAAGGATTAGATACATTTACCTCTTTAGGTCCATGTATTTTACATAAA
AGTGCAGTTCCTTTTCCCATAAAACTTAAAGTATGTAGTAGGGTAAATGGTGAAGAAAGACAAAGTTCTA
ATACAGGATTATTCATATCAGATGTTTCAGACATAGTTTCAGAACTTTCAAAAGGTATGACTTTAGAGGC
TGGAGACATTATAGCTACTGGAACACCTTCTGGAGTAGGGATGGGATTTTCACCTCCTCGATATATGAGT
AGTGGAGATGTAGTTGAATGTGAGATTGAGAGTATTGGAATTTTAAAAAATTACATTAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3360231-3359071 putative carbohydrate hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTTTATGGATATAAAAGACCAGATGGAAGAGTTGGTATAAGAAACCACATATTAATATTGCCTA
CGAGTGTGTGTGCATCAGATACAACTAGAATAATAGCATCACAAGTTCAAGGGGCAGTTACCTTTAATAA
TCAGAATGGATGTTCACAAGTACATTCAGACCAACAATTAACTATGGATGTTATGGCTGGTTATGCAGCA
AATCCAAATGTATATGGTGTAATAGTTGTATCTTTGGGATGCGAAAATTGCCAAAATGATTTGGTAGTTG
ATGCAATAAAAGAGAGAACAAATAAGCCAATAAAAACTCTTGTAATACAAGAAGAACATGGAACTTTAAA
AACTATAGAAAAAGCTGTTCGTTATGCTAGAGAAATGGCACAAGAAGCTTCTTTGCTTAGAAAAGAAGAA
TTTCCAATATCTGAACTTATACTAGGAACTGAATGTGGTGGGTCTGACCCAACAAGTGGATTAGCAGCAA
ATCCATTAATAGGTGAATTAAGTGATAAACTTGTCGATTTAGGAGCAACATCAATTTTAAGTGAAACTAC
TGAATTTATAGGTGCAGAGCATATACTAGCTAGGAGAGCAGTAAATGAAGAAGTAAAAGAAAAAATATTA
CATATAGTACATAGATATGAAAATTCATTAAAATTGGTTGGAGAAGAAGTTAGAGAAGGTAATCCATCTC
CTGGAAATATAGCTGGTGGTTTAACAAGTTTAGAAGAAAAATCACTTGGTTGTATACATAAAGGAGGTCA
TAGACAAATAAGTGAAGTATATGATTATGCCAAACAAATTGATAAGAAAGGTCTTGTTATAATGGATACC
CCTGGAAATGATGCTTCATCTGTTGCTGGTATGGTAGCAGGAGGAGCACAAATAGTGGTATTTAGTACAG
GAAGAGGAACACCATCAGGAAATCCAATAGCACCAGTAATAAAAATAACTGGAAATAAAATAACTTTTGC
AAATATGGAAGATAATATGGATTTTGATGCTAGTCCAGTTATCTATGGTCCACAAACAATGGAAGAATTA
ACAGATGATTTGTTAAATATGGTTGTAGATGTAGCAAATGGAAAACAATCAAAAGCAGAGTCCCTTGGAT
ATACTGAAATGGCAATAGCTAGAGTATGCAACTATGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3360692-3360387 putative carbohydrate hydrolase (N-terminus) [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAATGCAGTGATAATTGATGAAAAAGATAATGTTGCAGTAGCTATTGAAGCAATAGCTAAAGGTA
ATGAAATTAGTTTTAAATTAAAAGACAAAACAGTAAAAACGATTACAGCACTAGATAATATAACTATTTA
TCATAAATTGGCTATAAAAGATATGGCCCAAGGTGATAAAGTTACTAAATATGGTGAACATATAGGAGAA
GCAAATCAGGAAATAAAAAGTGGTCAACATGTACATATTCATAATGTTAGAAGTGTTAGAGAGGATTTGG
ATAAACAAGTTATGACTAATATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3361764-3360790 putative carbohydrate permease [Clostridium difficile R20291]
ATGATAATGGATTTTATTAAAAAAATTCCTGCAGGTATGATGATAGTGCCAATGTTTATAGCAGCTTTCA
TTAATACCTTTTGCCCAGATATTGTACAAATAGGTTCGTTTACGACAGCAGTATTTTCAAGTGTTGGGTC
TGCAACTATAATTGGGGTTCAACTGGTATGCTTGGGAACTCAGCTTCAATTTAGAGAAATGCCAAAAGTT
TTAAAGAGAGGTGGTATACTTCTTGGTTCTAAATTTGCTATAGGTGCTTTGATAGGTATACTTATAGGAA
AGCTATTTGGAATGGATGGTGTCCTTGGTCTTACAACATTGGCTGTTATAAGTGCAGTTACAAATAGTAA
TGGTAGTATATATCTTTCATTGATGACTTCATATGGAGATGAAACAGATTGTGCAACTATGAGTTTACTT
ACTTTAAATGATGGACCATTTTTTACATTAATAGCTCTTGGGACTTCAGGTCTTGCAAATGTGCCATTGT
TGTCATTATTAGCTGCAATAGTGCCAATACTTGTTGGTATGATAATAGGAAATTTTGACAAAAAAATGAA
AGAGTTTTTAGAGCCAGGGTGTAATTTACTCGTACCTTTTGTAGGGTTTGCACTTGGTAGTAGCATAAAT
CTTGCAAGTATACTAAAAGGAGGTTTATCAGGAGTATTACTTGGATTAATATCTGTATTTGTAGGAGGTA
TATTTATAGTATTCTGTGATAAATTTATAGGAAAACGTCCAGGATATGCAGGATGGGCTGTAGCTACAAC
CGCTGGAAATGCAATTGCTGTACCTGCTGCTGTTGCATTAGTTGACCCATCATGGCAACCATATGTTGCA
ACAGCTACAACACAAGTGGCAGCCGCAGTAGTTGTCACTGCAATATTAGTACCTCTTATAACTAGTTGGT
GGGCTAAGAAGTATGGATGTCCTAAGTTCCCAAAACAAAATGAGGATGGTACAATAACAGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:3362347-3363123 IclR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGACTTCAGATAATCATCGCCCAACAGCTAGGATATTAGATATTTTAGAAGCATTAGCAGAATCCGAAA
ATGGATATACTCTTACAGAAATAGCAGATGTTATCAATGCTCCAAAAAGTAGCATCTTTCCTATAGTTCA
TACACTTAATGCTAGAAAATACATTACTATTGATAAAAACACATCCAAATATTCTATAGGGATACGTTCT
TACACATTAGGGTCTTCATTTTTTGAAAAAAGAACTATTTTTAACTATATAATTGACGAAATGACTAATA
TAGTTAATTCCTGTTCTGAAACTTGTCAGCTTGGTATACTTGACAATAATGAAGTTCTTTATATTGGAAA
AGTAGATTCTCCAGAACCAATTAGACTTATTTCTTATGTTGGAAAAAAAATACCTGCTAATTGTACAGGT
CTTGGAAAAGCTCTTTTATGTGATTTTGACAAGGAAAAACTAATAAGCTTATATCCAGATGGTCTAAAAG
GTTTTACAGAAAAATCAATTACAGATTTTGATGTTTTATACGACCAGCTTCTTGAAGTTCAAAGAACACA
AATAGCTTCAGAGTGTGAAGAATCAATGGAACACCTAAAATGTCTTGCCGTACCAATAAGAAAAAATGGA
TGTATAAGAGCTGCTGTTAGTGTAACACTGCCTTTATTTAGAGCTAATGACGAAAAAATAGAACTGATAA
AAAAATTACTCTTAAATGCTCAGAAAAATATTCAATCAATGATGGAAGAACGTAATGAAGACATTGTAAT
AAATTAG
>ref|NC_013316.1|:3363456-3364601 putative alcohol dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCACTTATTATGTACCACCAATAAATTTACTTGGGAAAGGATGTCTTAATGAAGCTAAAGATTCAA
TTAAATCATTAGGAACTAAAAAAGCATTTGTTGTTAGTGATAAATTTCTAGTTTCAAATGGTACTGTAAA
AAAAGTAACAGATATTTTATCTCAGATAGATGTAGACTTTGTTGTTTATGATGAAGTTAAACAAAATCCA
ACCGTAACTAATGTGGATAAAGGACTTAAAATATTAAAATCAGAAAATTGTGACTTCGTTATAACTATAG
GAGGAGGTTCTCCACAAGACTGTGGTAAAGCTATCTCTATATTAGCTACTAATGGAGGAGATATTAGAGA
CTATGAAGGTATCAACAAAACTTCTAAAAAATGTCTTCCTATCGTAGCTATAACTACTACTGCTGGTACA
TCTGCTGAAGTTACAATAAACTATGTTATAACTGATGAAGACAGACATGTAAAGATGATAATGGTTGATA
CCAACTCACTAGCTACAATGACAGTAAATGACCCAGAATTAATGATTAGCAAACCATCTAATTTAACAGC
AGCAACTGGTATGGATGCACTAACTCATGCTGTAGAAGCTGTAGTAGCTAATGGTGCTTATGATGTTACA
GATTCAACTGCCTTATATGCTATAAAGCAGATATTTAAATACCTTCCAAGAGCTGTTAAAAATGGTAATG
ACATAGAAGCTAGAGAACAAATGTGTTATGCTTGTTTTTTAAATGGAATTGCCTTTAGTAATGCAGGTCT
TGGAAATGTACATGCTATGGCTCATCAATTAGGAGGTTTATATGATTTACCTCATGGAGTATGTAATGCC
ATGCTACTTCCAATAGTTGAGGAGGAAAATGCTAAATCAGCCCCTGCCAAATTCCGACCAATAGCTGAAG
TTATTGGAATGGATGTAAATAATAAATCAGATAAAGAGTGTGTTGACTTTGTAATAGATAAGATAAAAGC
TCTTTCTGAAGAGGTTGGAATCCCAAAATCTTTAAAAGATGTAGGTGTTGATAATCCTAATTTTGAATTG
CTTGCAGAAAACTCTATGAAAGATGCTTGTGCTGGTGCTAATCCTGTTTTCTTTGATAAGGAGAAGATTA
TAGAATTGTTTATGAAAATATCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3365625-3364756 hypothetical protein CDR20291_2843 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAGGATGGATATGTGTGAAATTAACTAAACTAAATATTAAAAAATATAGAGCACCTATATATAAAT
ATGCTTTAGCAAATGTAAATTTGAGGTCTGCTAAATCTACTAATTCAAGTATCATAACAGTAATACCTCA
GGGAGCTAAAATGGAAGTATTGGATGAAGAAGATGACTGGATTAAGGTGATGTACAATTCTCAAGAAGGA
TATGTGTATAAGGATTTGGTATCAGTAAGCGAATATGCTTGGAGTAACTTAAACTTAAGAGAAGATAAAT
CTATAACTTCCAATATAATTACAGTAATTCCTGAAAAATCTAGGGTTGAAGTCCTTCAAGTAGATGGAGA
TTGGAGTAAGATTGTATATGATGATAAAATAGGATATGTTTTTAATTATTTTTTATCAACTGATGGGAAT
AAACCAAATGAATTAGATTATAAGTATTTTTATACTGACATGATTAAATTTGTTAACGAAAATAATATTA
AAAGTACTAGCGATTATCTAATTGTAACAGACCTTAGAAATAAATATACTTATATTTTTAAGAAAGATAA
TGGAGGCTGGGGGCAACTTTACAAGTGGCAATGTACTATAGGCAAGCCTGAGACTCCAACTATAACAGGT
ATATTTTATATAAGTGGAAGAAAACCTTCTTTTGGAACGGATGAGTATTCAGTTAAGTATGCTACTAGAA
TTAAAGGTGGATATTACTATCATTCTGTGCTATATGATTCAACAGGAAGTTATATAATAGATGGCAGACT
TGGTGAAGCTCTTAGTCATGGATGTATAAGATTAAGTACGGAAAATGCAAAGTGGATATATGATAATATA
CCAGATACAACAACAGTTATAATTCATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3368215-3366827 putative pyridine-nucleotide-disulfide oxidoreductase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAACATTTGATGCTATAATAATAGGATTTGGAAAAGGTGGAAAAACATTAGCAGGAGATTTGG
CAAACAGGGGATTAAAAGTAGCTTTAATAGAAAAGTCAAACAAGATGTATGGTGGGACATGTGTAAATGT
GGCATGTATACCAACAAAAAGCTTAGAAAATTCAGCAAACAGCGTAAAAACAAAGAATATAAATTCTTGG
GATGAAGTACAAGCTGAATATGAGAAAGCTATAGATAAAAAAGAAACTTTAATTACAAAACTCAGAGAAG
CTAACTATAATAAATTAAATTCAAATGAGAATGTAACTATATTCACAGGAATGGGAACTTTCATTGATGA
AAAAACAGTTCAAGTTAAAACTGAAAATGAAATTTATGAGTTAGTAGCAGATAATATATTTATTAATACT
GGTTCAAGACCATTTATACCTAATATTAAGGGAATTGAAAATAAGAATATAGTATATGATAGTGAGTCTC
TTATGAATCTAAGAGTTTTACCTAAAAAAATGACAATTATAGGAGCTGGATTTATAGGTTTAGAGTTTGC
TGGTATTTATAGTTCATTTGGAGCAGAAGTTACAATATTAAACTCTAATAATGGCATTTTACCAAATGAA
GATGTTGAGGATTCAGAAGAAATAATAAAATTACTTGCAAAGAGAAATGTAAAAATTGTTAATAATGCAA
ATATAAAAGAGATTAAAGAAGTTTCTGAATCAGCAATAGTAGAATATGAAGTAGATGGTAAATCTAAAGA
ATTAACAAGTAATATGATACTTGTAGCTACAGGAAGAAAAGCAAACACTGAAGGGCTAGGGCTAGAAAAT
GCAGGTATAGAATTAAATGAAAGAGGATTTATTAAAGTCTCAGAAACTCTTAAGACTAATAAAGAGCATA
TATGGGCTATAGGAGATATAAATGGAGGTCCACAATTTACTTATATATCATTGGATGATTATCGCATAGT
TATTAATCAGTTATTTGGAGATAAGACTAGAACAACTAATGATAGAAAGAATATCCCAAATTCTATATTT
ATAAGTCCAGCATTTTCAAGAGTTGGTCTTAATGTTAAACAAGCTAAAGAAAAGGGATATGAAGTATTAG
TGGCAAAGATGCCAGTAGAAGCAATTCCAAGAGCTAAACAGATTGGCAAGGCAGATGGGTTTATAAAAAT
AGTGATAGATAAAAAATCCAATAAGATACTTGGAGCTAGTATGATATGTGAAAATTCAAGTGAGATTATC
CATCTTATTCAATTAGCTGTAGATTTAGAAGTAGAGTATACATATTTAAGAGACCGTGTTTATGCACATC
CAACTATGACAGAAGCTCTTAATGATATTCTATCTCCTAATATGATAAAAGAAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3369613-3368336 putative cytochrome C biogenesis protein [Clostridium difficile R20291]
TTGCAAAATGTAAATTTATTTTTAGTATTTATAGAAGGTATAGTATCATTCTTTTCACCATGTATACTGC
CAATTTTGCCTATTTATTTGAGTATATTGTCAAATAGTAGTGTAGAAAATCTAAAAGAAGGAAAGACGAG
TTTTATAGGAAGTTCTTTATTTAAAAATACTATATTTTTTGCTCTTGGAATCTCAACAACATTCTTTATA
TTGGGTTCATCAGTAAAAGTATTGAGTATGTTTTTTAATGAAAATAAAGATTTAATAATGTTTATTGGTG
GGATTATAATTATTATCATGGGATTATTTTACATGGGAATAATTAAATCTTCAATATTGAATAGAGAAAA
AAGATTTAATGTTAAGTTTAAAGAAATGAAAGCAATAACAGCTTTTATATTAGGTTTTACGTTTAGTTTT
GGATGGACACCTTGTATTGGTCCAATATTGGCATCTGTATTAGTCATGGTTTCAAGTTCAAGTAATCATC
TTAGTGCCAATCTTTTAATAGCAGTATATACTATTGGTTTTATTTTGCCATTTATAATTACAGCTATGTT
TTACAGTAAACTATTTAAAACTATAGATAAGATAAAATCTAACATGGAAATTATTAAAAAAATAGGTGGG
ATTATACTTATAGTATCAGGAATATTAATGATGGTAAATGGATTTGGAAGTATAAGCAAACACTTTAATA
CGTCACAAAATAGCAAAATTGAAAGCAAGCAAGAAGAAAATAAGCGAGAAAATTCTACTGATAAAGAAGA
AAATTCTGATGGTAATAATAGTCAAAAAGACTCTAATAATGACAATAATGATAACGGGTCTAATGATGAA
GATAGAATAAAGTCTATTGATTTTACTTTAACAGACCAGTATGGTAAAACACATAAATTAAGTGATTATG
AAGGCAAAGTTGTATTCTTAAATTTCTGGGCTACATGGTGTCCTCCATGTAAAGAAGAAATGCCTTATAT
AGAACAACTGTATAAAGACTATAATAAAAACAATGATGATGTAGTAATTTTAGGAGTAGCTTCACCTAAT
TTAGGTAGAGAAGGTTCAAGGGAACATGTAGTTAACTTCTTAAAAGACCAAGGTTATACATTCCCTGTTG
TACTTGATGAAGATGGAGCATTAGCATATCAATATGGAATTAATGCTTTTCCAACTACATTTATAATTGA
CAAGGAAGGATATGTAACTCAGTATATTCCAGGAGCTATGGATAAGGCAACTATGGCATCATTTATTGAA
AATCAGAGAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3370085-3369750 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGTACAACATAGATGATATGATATATAATTGTCCAGTAGAAGCTTTATCAAATATTTTAGGTAAAAAAT
GGGTGGCTATAATTATATGGAAAATACAAGAAGATAAGAAACGATTTGGAGAGCTACAAAGAGCTATACC
AGACTGTAGTAAGAAAATGTTAGTTCAACAACTAGATTTTTTAATTGAACAGGGGATTATAGTCAACCAA
AAAAAGTTGGTTAATAATGTTGTAGAGTCAACATATTTTTTAAGTGAATCAGGATTACGATTGCTTCCTG
TCATGGAAAAAATGATTATGTGGAGCAATAAAAATTTAAATTGTGATAAATACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3373154-3370554 putative glycosyl hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAAAGCACATATTGTTAATCATACACACTGGGATAGAGAATGGTATTTTACTTCTGGAGATGCAT
TAGTACTTAGTGAACAACTATTTACAGATGTAATTGATGAATTAGAACGTAATCCAGATGTAAGTTTTGT
ACTTGATGGACAACTTTCTATTTTGGATGATTATGTACAATTACACAAAGAAAAAATAGAAATCATTAAA
AAGTTAATAAAAGAAGATAGACTACATATTGGACCATGGTTTACTCAAACTGATGCATTCTTTGCTAGAG
GAGAGTCTATTTTAAGAAACTTAATGATTGGAATTTTTGAAAGTAAAAAGTATGGTAAGTATATGAAAAT
TGGGTATTTGCCAGATACATTTGGATTTAATGCACAGATGCCTATACTATTAAAGCATGTAGGTCTTGAT
AATATATTCTTTTGGAGAGGTATACATCTTGGTAAACATGTTCAATCACCATATTTTAAGTGGAAAAGCT
TAAATGGAGAAAGTTATATATATGCAGTAAATATGCCACATGGATATGGAACTGGTATGCTTTTAGAGCC
TTCATTAAAGTATGTTAATGGACGCTTAGACCCAGCTATTGATTTTATTAAATCATATACTGATGTAGAT
GAGGTGTTAATACCTTCTGGGAATGACCAGTTAAATATAATAGGTGATTTCAAAAATAAAATTAAAGCGA
TTAATGATATCGGAAAGTATTCATATATAACGAGTTCATATCAAGAGTTTTTAAAATATATAAAGTCCAT
AGAATCACTAGAAAGCTATAGAGGTGAATTTAGAGAACCTGTATTAGCAAGAATACATAAATCAATTGGT
TCTAGTAGAATGGATATAAAATTAGCATGTGATAAACTAGAAAACAAGCTGATTAAAAGAATAGAGCCAT
TATTAGTAATTGCTAAAAAGAGTAAAATTGAAATAAGCAATCAGTTACTTATAAATACATGGAAAAAACT
TTTGGAAGGACAAGCACACGATAGTCTAGCTGGATGTGTAACTGATACTGTAACAGATTATATTCTTCAC
CGTATAAGAGAAGCAAATGAAATATGTGACAGTATTGAAAATACTATTGTAAAAAAGATTTCAGAAGGGC
TTAAATTATCTAAAAATGATATTTTAGTATTTAATACAGAAGCTAAGCGTTTTAATGGATATAAAGAGAT
ACAAGTTGTAAGTGATAGTAAAAATATTTATTTTAAAGATAATTTAGATGCTACTATAATTGAAGAAACT
TATGTAAAACCGAGAGAAAATGTATTAGAAGAAACACCTGCTGGCAACGTATTTATTGAAGAATCAGGAT
ATTATATATTAAAAGTAAGAATAAATGTACAGCTTCCTGCACTTGGTTATAAAGTTGTTAGTTTTGAATC
AAGTGATAAAGAAATGGTATCACTTGATAAATCTAATGACACTTTTATATCTAATGATAATTATAAGATA
ATCTATGAAGATGGAAGCTTAAATTTACAACTTAAAGATGGAACTTACATATCAAACTTTTTAATATTAA
AAGATAGTGGTAATGCAGGCGATACCTATGACTTTTCTCCATTAAAAAATGACGAGGATATAAAACTTTC
ATTTGATAGAGTGTATACAGAAAAAACTTTAGGATATGAAAAGTTGGTGGTTAAAGGTACTACTTTACTA
CCACTTACATTAGAAGATAGAAAAAACAAATATCTTAATGGGAAATTAAATGTAAAAGTAAGTATTGTCT
TATCCAAAGAAAATCCATTGATGGATGTAAAACTTTGTGTTGATAACACGATATATAATCATAGACTACG
TGTTCATATAAAAACTGATATAAAAGATAATAAAAACATAGCATCATTGCCATTTGGATATATAACAAGA
GAAAATGGAGTTTTAGACAACTGGGAAGATATTTACAGTGAAATGCCTATAGATTTAGAACCTTTGGAAA
GTAATATTACTCTAACAAACCAAAATAGAAGCTGTACTGTATTTACTAGAGGAATAAAAGAGTATCAACA
TATTGAAGATGAAATTGCATTGACCTTACTTGCTACTACAGATGAACTAGGAAAGCCTGATTTATTATAT
AGACCAGGACGTGCTTCTGGTGATACAACTAAAAAAGGTCATATAAGAATTAAAACAGATAAAGCTCAAA
TGCTTAAGAAATTAGAATTTTCATTTGCAATATATATGGATTCTAAATCATTTGATGAATTGGAAATTGC
GAATTTAACCCACAATTATCTAAGGGAATGTGTAAATTATCAATTACAGGATTACAATTTCTTTTTATAT
CGTATAGATAATAAGATTCAAAAATCAATTGTCAATAAAACTGTAAGTAGAGAATTAGAAATAATATCTT
TACCAGAAAAATATCTTATATCAGCATGTTATCCTTCTTATTACAGTAAAGATAAATTTATAATAAGAGT
GGAAAATCCAAGTAGTAATAGAATGATATTGGATGAGCAAATATTTAAAAATAGAAATGGGAAAATTGTA
AATGCAATAGAAGATGTAGAAGAAGAACAGGTATATGAAATAGCACCTTTTGACGTTATTTCAATATTAT
TGGATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3374389-3373274 PTS system, IIc component [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGGAAATGTAATGTTGAAAAAGATAGTCTCTGAGTTAAAAAAGCATGTCTTAACTGGAATCTCAT
ATATGATTCCATTAGTAATTGCAGGTGCTATGATAATGGCAATATCTCGTGTAGGTGGTTCTTTCTATAA
TATACCAGATATATGGGATGCTAAATACGCAGAAAGTGCTAGTAGTATTGTTAGATTATTACATGATCTA
GATGGATTTGGAGGTACTGCATTAGGATTAATGTTTCCTGTAATTGCTGCATTTATAGGATTTTCTATAG
CTGATAAATTAGCTATTGTACCAGGTCTTGTTGGAGGTATGATTGCTAAAGATATAGGTGCAGGATTTTT
AGGAGCTTTGGCAGTTGGTCTTATAGCAGGATATACATGTTTGTTTATTAAAAATCATGTTAAATTACCA
AAATCAGCAGCTTCAATAGTACCAATATTTATAGTACCAGTATTTGGAACATTAATCACTGTTGTATTAA
TCAATTATGTGATAGGTATACCTTTTGCCACATTAAATACTGGATTAGAAAATTGGTTAAATGGATTATC
TGGTACAAATCAGATATTAATGGCAGCTATTATAGGGGCTATGATGGCAGTTGACTTAGGTGGACCAGTT
AATAAAGCAGCTTTAACAACATCACTTGCATTATTAACAAGTGGAATTTATGCACCTAATACTGCTGCAA
TGGTAGGAATAGTTATACCACCACTAGGATTGGGACTTGCTACTATACTAGCAAAACAAAAATATAATAA
ACAGTTACGTGAAGCTGGGAAATCATCTCTTATAATGGGTTTAATTGGAGTAAGTGAAGGAGCAATTCCT
TTTGCGGTAGAATCTCCATTAAAAGTAATACCTTCATGTGTAATTGGAACAGCAATTGCTTCAGCTATGG
CAGTTGGTTTAGGTTCAGTAAATGCAACTCCAATTAGTGGATTTTATGGATGGTTTACAGTAGAGAATTG
GCCAATGTATGTGTTATCAATAGCAGTTGGAACAGTAATTGTAGCTGGATTAGTTATAGTATTGCGTGGA
AATCCAGTGATTGAGGATGATGAATTTGAAGATGATGATTTTGATGAAGCAGAGTGGGAATCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3374710-3374390 PTS system, IIb component [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGAAAAATTATAGCAGTTACAGCATGTGCAACAGGAGTTGCACATACATATATGGCAGCTCAAG
CGTTAAAGAAAGCTTCAAAAAAGATGGGTCACCTTATAAAAGTTGAAACACAAGGAGCTACAGGAATCGA
TAATGAGTTAACTACAAAGGATGCACAAATTGCAGAAGTAGTAATATTTGCAGTAGATACTAAAGTCAGA
AATGCTGAACGTTTTGAGGGAAAAGAAATACTAGAAGTACCAGTTAATGCACCTATAAAGGATGCAGAGA
AAGTAATAAATGATGCATTAAAGTTAATTGACACTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3375174-3374713 PTS system, IIa component [Clostridium difficile R20291]
GTGAAAATATCAGATGTATTGAAAAAAGAGCAAATTGTTTTTAATCTTGATACAAATACAAAGGAAGAAA
CAATAAAAAAATTAAGTAGTATATTTGTTGAAAATGGGATTGTGGACAATGAAGAAGAATATGTTAAGTC
TGTTTTGGAAAGAGAAGAACATTCAACTACAGGTATTGGTAATGGTATTGCTATTCCTCATGGAAAAAGT
GATGCTGTCAAAAAATCTTCTATAATATTTGCAAAGACTAAGCATAAGATTGAGTGGGATGCTTTAGATG
AAAAACCAGTAGATAGTATTTTCTTATTGGCTATAAGCAATATTGATAAGGATAGCAATCATCTTGTACT
ATTATCTAAATTAGCAACTAAACTTATGGATGATGACAATGTAGATGCACTAAAATTAGCCAATTCAGAA
CAAGAAATAATCAATATATTTAGTGAAGAAGGAGAGATGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3377138-3375174 putative transcriptional antiterminator [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAACTGATATGATTCAAAATCGTGAAATTAAAATAATAAAGTTTTTATTAAAAGAAGGTCATACAA
CTGTAAAAGCAATAGCAGATGATTTAGATGTTTCAGAAAAAACAGTTTCAAAATCTCTTAAAGAAGTAGA
AGCAGTGCTTAAAAAGATAGGTCTTTCTTTAATAAGAAAACCTAAGATAGGTGTTTATATTGATGGAGAT
TTAAAAAAAATACTTCCTTACCTAGATAATAAAGGAAGTCAAATTCCTACAACCAGAGAGGAGAGAGTTA
TCTATATATATTCAGTACTTTTAAAGAGTAATGATTATATTACTATACAACAACTTTCTGATGAACTATA
TATAAGTCGTGGAACTATTGAAAGGGATTTATCAGAAGTTGAAAAACTGCTAAAAAACGAAGGGATTTCC
ATATATAAGAAACCTAGTAAGGGAATAAAGTTAAATATAAGTGAAAGAGATAAAAGACAACTTACTGCTA
AGTTTATACATAAATTTTGGAGTAGAAACTGGTATATTAAGCAAGAGCAAGAAAGCTTTTATCAAGCATT
TGAAAAGATACAGGCAGATGTAAATGGTATTTTTTCGGAAGATGATTTATCAATAATTATTGATATTCTT
AGGAATTTCAGCAGAGAAAGAAAATTTGAGTTCTCTGATTATGAATTTCAGTCATTAGTTATTCATTTGG
CAATAGCTGTAGAGAGAATTAGAAAAGGCGAATATATAGAAGAAAGTTTGTATATTGGTAATATAGAAAA
TAATCAAATGTCAAATACCAATTATTTAGCAAAACAATTAGAAGAAAAATTTTCAATATTATTACCAAAA
TCTGAAATTGGATATATAAATTTACATTTAGTAGCGGCTGACCAACATAGAGATACTAATGAACTAAAAA
ATACTTCAACTAATCCTTGTGAAACAAGTACAAATAATATATCAAATCTTCGGGAAATTATAAAAAATAC
ATTGTATGAGACAGCTTATGACAAGGATTTAATTGATGGATTGACTTCACATGTACATTCATCAATAAAT
AGACTGAAATATGGACTTAGTATTAAAAACCCATATGTAAATACAATCAAACAAAACTTTTCTTTATCAT
TTGAGCAAGCTTTAGATTTAAAGAAAGTAATTGAATTTATATATGATATTAGAATAAATGATGATGAATG
TGCTTATATAGCATTACATTTTGAAGCTTTTAGAGAAAGAATGAAAGAACTTCCACAAAATATTAGAGTA
ATTCTAGTATGCAGTACAGGATTAGGTTCATCTAGGTTATTGTCTGCAAGAATAAAAAAATACTTTCCAA
TGATAAAGATTGAAAAAGTACTTTCCGTACAAGAATTAGTATCCAGTAAAATTGATGCAGATTTAGTAAT
AAGTACTATTTATTTAGAGTTAGAAACAATTCCAACCATAGTAGTTAGCCCTATTTTAAATGAAAGTGAT
ATAAGAACCTTGGAAAGAAATATACAAAATGTTTCATGTTGTACTTCTAAGAAGTATAAATCTTTCAGAA
ACCTAATCTTTGAAGAAAATATATTGTTAAATATTGAAGCTTCAAACTATGAAGATGCAATTAAGTATAT
AACAGATAACCTAATAAAAAAAGGTTTTGTAAAAGAAGGTATAGCTAAAAGTGCAATTGAGAGAGAAAAT
TTATCTTACACGTCTTTTCAGTCAATAGCTACACCTCATGCTAATCCTAGTTATATTAAAAAATCTAATA
TATCTGTTGCAACGTTAAAAAATCCTATTACATGGGGAAATGAAAAGGTGGAAGTTATTTTCTTTATTTC
ATTAGAAAATGACAAAAACCTAGAGCTTGATGAAATATATGAAGTTTTTTATGACTTTATTGACAATAAA
AAAAATATAAATGACATATTAAGTGCAACTTCCACAAAGGAAGTGTACGATTTGCTATTGGAGGAGAGTA
TATAG
>ref|NC_013316.1|:3377286-3378158 putative sugar uptake protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGGAAATAGTTTAATGCTGACAATAATTATTGCTTTACTTCCTGTAATGGGATGGGGATTGATGC
CCATAGTTGCAAATCTAAAGAAAAGTTCTCCTCATGAACAGCTTTTAGGTACATCCATAAGTGCGTTTAT
ATTTTCCACTATAATAACTCTGGTTATACATCCTGAAATTACATTTTTTTCATTTTGTATAAGTATGATT
TCTGGCATATTCTGGAGTTTGGGACAATTAATGCAGTTTAAAGCAATTCAAATTGCTAGTGTATCTAAAG
TAATGCCAATTTCAAATGGTTCACAATTAACTTTTACGACATTATTAGCTGTAATCTTGTTTAATGAATG
GACCAGTTCTAAAATGTTACTGATTGGTTCTTTATCAATATTATGTATAATACTTGGTATACTTCTCACT
AATTATCAAACTAAAAAATCTACAGATAAAAATATGTTAAAATGTGTTGGAGTTGTATTATTATCATCTC
TATTTTTATCATTATATGTTGTAACTAATCAAATATTTTTAATTGAAGGATATAGAATTATATTACCTCA
ATCTGTTGGTATGTTGATAACTTCATCTATTATTGTCAAGTATTTTTCTAAAGAGATTGTATATAGGGAA
AATGTTTTATTCAATTTAATTACTGGTATATTGTGGTCAATAGCAAATTTAGGTATGTTCATAACGACTA
ATACATTGGGAGTTACAATAAGTTTTTCTATCTCTCAGAGTTGTGTGATAGTAGCCACTTTAGGAGGGAT
TATATTTTTTAAAGAAAAGAAGAACAAAAAAGAATGGCTTGCTATTTTTATTGGTATAATACTAATCATG
TCTGGTGTCTTTATGTTGAGTATTATAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3378869-3378402 hypothetical protein CDR20291_2854 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAACAAAAGAAGAATATTTAAAAGAAGTTAGAAACATATCAGAAGAATACTTTAGAAAAGGAGAGT
TTTTTTGCTCTGAAGCAGTTCTTCAGACAATAAATGATGCTTTAGGCCAACCTTTAAGTCCAGAGATAAC
TAAATTAGCATCAGGATTTCCGATAGGACTTGGAAAAGCTCAATGCCTTTGTGGAGCGATATCTGGAGGA
GAGATGGCTTTAGGTATAGTATATGGAAGAGTACATGGAGAAACTATGAATCCAAAGATGTTTGAGCATG
CTAAAGGTTTGCATGATTATATTAAAAAAGAGTATGGTGCAACATGTTGTAGAGCTATTACAAAGAAATG
GGATGGTGATAACTTTATGTCTCCCGAAAGAAAAGAGCACTGTATTAAAATAACAGGTCAAGTTACAGAG
TGGGTTGCAGATAAGCTTATAGAAGATGAAAAACTTAATATCAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3379906-3378974 putative transporter [Clostridium difficile R20291]
TTGAATTTATTAAAAAAATATCCTATACCTATTGCAAGTTTGATTTTGTCAATTTTTACTTTAGGTAACT
TATTACAATCTTATAGTGAATCATTACGTAATGTAATTGGATTTATAGGATTTATTTTGTATGCAATTTA
TATAGTCAAAATAATATTACTTAGAAAGGGTGTTAAAGAGCAATTAGAGAACCCTTTAATATCAAGTACA
TTTCCAACTATAACAATGGCAACAATGATATTTGCTACATATATAAAACCATTATCTTTAGAATTAAGTA
TTATGATTTGGAGCATAGGAATTGTGGGTCATCTTGTGTTAATAGTTTTATTTAGTAAGAAGTTCTTAGT
TAAATTCTCAATAAAAACGGTATTTCCATCTTGGTATATAGTATATGTTGGGATAGTTGCAGCTAGTGTT
ACGGCACCAGCATTTAATCAACTTTTGATTGGCAAAATTGCTTTTTGGATAGGATTTGTATCTTATATAG
TTCTTATACCAGTAATTTTAAAGAGAGTATGGATAATCAAGGAAATGCCTGAACCATCTTTACCAAGTAT
AGCTATATTAGCTGCACCAGGGTCACTATTATTGTCTGGATATATTAATTCTTTTTCAGATAAAAATAAT
GTAGTATTATACTTGTTATTCATATTATCAATTGTATTTTATATTATAGTTTTGGGATACTTACCGAAAT
TATTAAGATTGCCTTTTTATCCGAGTTTTGCTGCATTTACATTCCCTATGGCAATAAGTGCAATGGGTAT
GAAACTAATGAATGGTTATTTAACTAAATCAGGTCATTTTATAAGTTGGATTTCATATGCTTCTAAGTTA
GAAGAGATAATTGCTACAGTGATTATTTTATATGTTTTAGTTTTATTTATTATATATCTTAGTAAATCTG
AAACTACATCTAAAGCTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3381019-3380075 hypothetical protein CDR20291_2856 [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGTAAGTGTGAGTAGAAGAACTGATATACCTGCTTTCTATAGTAAGTGGTTTTTTAACAGACTTA
AAGAAGGTTTTGTTTATGTAATTAATCCAATGAATCCAAAACAGGTTAGTAAGATAGAGTTAAATCCACA
TACTGTTGATTGTTTTGTATTTTGGACAAAGGATGTAACTCCAATGTTATATGATTTAAATAAATTAAAA
GACTATAAATATTATTTTCACTATACTATAACATCATATGGAAAAGAAGTAGAGACATGTATTTTAGATA
AAAGAAAGGTAATAGATTCATTTAAGGAATTGTCTAGAAAAATAGGCAAAGAAAGAGTAATTTTAAGATA
CGACCCGATTTTCTTAAGTGAAAAGTACACAGTAGATTATCATATCAAAGCATTTGCGAGTTTATGTAAT
CAGCTTGATGGATTTACAGAAAAATGTATAATAAGTTTTATCGATTTATATAAGAAAACAAAATTTAATA
CTAAAGCATTACATATAAAGCCAATAGAAATTACAGAAATAGAAACATTATCAAAAGAAATTTCTAAGAT
TGCTCATAAGCATGGGATAATACTTGAAATGTGTTCTGAAGAATATAATTTAAGTAAATTTGGGATTGGA
AAAAGTAAGTGTATTGATGATAGATTAATATCAAAAATTATAGGATGTGAAGTAGAGGTAAAAAAAGATA
GTACACAAAGAGATATTTGTGGATGTGTTAAAAGTGTCGATATAGGACAATACAATACTTGCAGACATTA
TTGTCTGTATTGTTATGCTAACTTTAATTATGCAAAAGTAGAAGAAAACTGTAGGCTTTATAAAGAAGAT
AATAAATTACTCATAGATACTTTAAGAGATGATGCAAAAATAAGCATTAGAGATATGAAGACTATTAAAG
TAGATAAGAATAAACAAATTAGTATATTTGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3382799-3381363 hypothetical protein CDR20291_2857 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGGAAGAACTGGGATTAAAGATGGAAGATGGATTAATGTAGTAGAAAGAGGTATTAAAAATGATG
GTTCGTACAACATAGGTCCTGATTTACAGGATATTATTGATGAAATAGAAACAGATTTCTGTGTCTTATA
TTTTCCAAAAGGAAAATACTTATTTACAAGTGGTGTTAAAATTAATAAAGAAATTGTATTACAAGGTGAT
TCTAATTCACCTACAGAGACTACACAATTTATAACTCGTGGAGTAGAAAATATGAGTATTATTACATTGA
CAGGGAAGAAACAATGTATTAAAAATATAAATTTCTATTCTGATAGTTGTGAGATACAGGTAAATGAAGA
ACCACCGACAAAAGGTAATCCTAAATATCATTATGAGATGATTATTAATAAGAATGAAAAAAATGTTGAG
ATGAATAATGTATCAGCAATTCTGTATGATAATAGTAAGAATATGATTAAAGGTCTAGGTCATTATGAAA
ATATTTATATAAGTGGTTTTTCGGGTACAGGAATTAGGATACCATATTACTCAATTGTAAATGATATTAC
AGTTTCATCTTGTGGGTTGGGTATTGATACAGGAATAGACACAATTATTTCTAATAGTAGAATATCTAAG
TGTCAAAATGGAATGAGGATTAGAACTGGAACTAGCATAAATAATGTAAGAATTGAAAAAATACAGAAAG
TTGGTCTTATAAGTAGTCAAGTTAAGGATTATGAGGGATATGGAAGTTATAAAATTAATAATATTACGAT
TGACCAATGTGGGTATTGTGGTTTTTTATTTGACTCAGTGAAAGGTAGTTATTTTTCTGGTATTATAAGA
AGATGTGGGCAGTATTATTATAATACAGATTATGACACATATTTAAGTATTAAAGATAGAGTAGAAGAAG
CATATTCTTTATTTTATGGAAATTATTTTACAGAATGTAATATTGATTTAGTTAGTGATAATAAGGATAA
CTGGGATGATGGCTTAGAATATAAACATAAAGTTTATGTATTTAAAACCCTTCAAATACCAAAATTAACA
TTGAGATGCAATATAGATGCCTATGATTATATCGTTAAATCGGTACATGGAGGAGGTAATTTAATGTTAA
AAAATAACTTTAACAATTATATATTTATTGATTCATCTAGTCCAGAAGTTATTAATGGAATTAATTTTAA
TTATCAAAAGAATGGAAACCTGTTAAGGTTAAATAATGGTAAATTAAGTTATAAAAATGGAAAGGAAGAA
ACAGCTATATTCAGACCTAATTATGGTCTTATTGTAGCATCAACAGATTCAGAATGTGAACAAATAGAGA
CTAGCTATGGAGGAAAATGGGAGAAGCTTGGTTCTGAAGTAATTGGAAAAGAAACGGTATATTATTATAA
ACATCATGAACCAGATAAAACAAACCAAATAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3384409-3383009 hypothetical protein CDR20291_2858 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGAGTCTATAATAATTAAAGATATAAGTGGCTGGATTAATGTACTTGATTATGGGATTTGTAATG
ATGAAACAAAAGATGTAAGTTCCAAGTTGCAAGAGATTATAGATGCTGCACCAGAAGATTCTATTATATA
TTTTCCAAAAGGAAAATACTTATTTGAAAGTGGTGTTAAGATTAAGAAACGATTAACCTTATGTGGAGAT
TCTTATATTTTGGCGAATGTTCCTAAAAACACTGCTGGAGTAACACAATTTACTTTTAAAGGAAAGAAAA
ATCCTAAAAGTGAAAATATAGCAATTATAACAGCAAAAAGTGTAAGACACTGTATTAAGAGCATTTGCTT
TTATTCAGATAGTTGTGATAGAGATATGACATCTAATCATGAACCTCCAACAGATGGAAAACCTAGATTT
CATCATAATGTAATTATAAATTATAGAAATATATCGGCTATTGTATGTGAAGATAAACAGGGAGAACCAG
GTCATTATGAAAACTTGTTTTTTAGTGGTTTTTCTGGAATTGCACTTGATATGCCTAATAATTCTACAGC
AAATGATATTACAGTTTTTACATCCGGACTTGGAATTAGTACAGGGGAAAATTCAACGATTGCTAACAGT
AAGGTTTGGGGCTGTGTTGATGGAATGATAATTTCTACTGGAACTTTTATAAATGGTATGAGGGTAGAAG
AAATAAAAAAAGTTGGAATTAAAAATATTGGTAGAGGTTTAAATTTTATTACAAATATCACAATTGACCA
ATGTGGATATTGTGGAGTTTGGTTTGATTCTATATCCAATGTTCAGATATCAGGAAATATCACAAGGTGC
GGACAGTACTATTATGATGTAAGCTATGATAATTATTTAATGTTGGATAATAGAGTTAAAGAAGCATATT
CTTTATTCTATGGTAATTTATTGGAGTCAAGTAATATAGTTTTGTCAAATACCAATAAAGATAATTGGGA
AGATTTCAAAGAGGATAAGCATAAGGTGTATCTTGTAGAAGCACTTGAAACCAAGAATGTACTATTAACA
TGCAATATAGATGCTACTGACTGGATTGTTAAGTCAGAAAAAGGAAATTTAACGTACAATAATATGCGAC
AAACTGTTATATTTTACGATGGAAAACTAAGTAGTATCAATGGAATTGGTATATCTGATGAAGATTATGG
GGATAAAGTCAAGATAAAAAAAGGAAATATATATATAAATAGTAAGGATAAGGTTATTAAGATGCATAAA
CCAGAGGTAGGTGACATTATGTCAACAATTATTAAAGATGAAAATATACTTTCCGCTCATTATGGGGGAA
CATGGGGGAAAATTGGTGAAAAAATAGAGTTTGGAATAACTGTACACTATTATAAATTGATAGAGAAATA
A
>ref|NC_013316.1|:c3385782-3384436 hypothetical protein CDR20291_2859 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAATTGAAACTAAAACTCCAGATTGGATTAATGTACTAGAATTAAACAGTAAAATAGATATTACTT
GGAAATATGATGTAAGTAATATGATACAAGATATTGTCTCTGATAAGTCACTAGAAGGTTCCATTATATA
TTTTCCAAAAGGTAATTACTTATTTGAGAAAGGTATTAAAATTAGTCAACAAATAACACTTCAAGGAGAT
TCTTATTATGGAGGAGATAATCAAGTATCAAATTTAGATAAAAAACAATCAATCGTAGGAACAACCAATT
TTATAACCCGAGGAGTTTCTAATATAAGTATTATTACATTGGAAGGAACAAGTCAATGTATCAAAAATAT
TAATTTTTATTATGATAGTCATGATATAGAGAAAATACCACCTAAAAATGTATCTGCTATTACAGAATAT
GGAGAAACACAAGGACTATTTCACTTTGAACACCTGTTTATTTCTGGATTTTCAGGAATAGGGATTGAAA
TTCCATACTATTCAACTGGCAATGATATCATTGTTAGTTCATGTGGTCTTGGTATGAGGCTTGGAGAGAA
GTCAATGCTTTCTAGTAGCAAGATTTATGAATGTAAAAATGGAATGGAGATTACTACTGGTGTTAGCTTA
AATAATGTGAGAATAGAAGAAATAAGAGAAATAGGTATTAATAATAAAGGATTTGGTTTTAACCTGATTA
TGAATCTTATGGTCGACCAATGTGGATATTGTGGATTTATGTTTGAAAAAATGTGTTATAGCCAGATAAC
TGCCAGAATTACTAAATGCGGTCAGTATTATAAAAGTGTTGATTATAATACTTATGAGAATATGGAAGAT
AGAAAAGAAGAAGCTTATTCCATTTTTTATGGAGATATTTTAGAAAATTGCAATATTGTATTGATGAATA
GTAATATTGATACCTTAGAAAATGATTCACTTGATGAACATAAGATATATGTAATCAAGGCAAATGAAAC
AAACAAAGTAATGTTAACATGTTATGCTGAAGCAGATGAGCTTATACAGTGCGCAAAGGGCAACTTGTTG
CTAGAAAATGGTGAAAATACTTATAAATTTTATAATGGTGAGATTTGTTCTGTAGGAGGTGTTCAAATTT
CTGATATAGATGAAAAAGATTTAATCAAAATAATCGAGAACACTCTGTATATAGATGATAAAGGTAAGTA
CTTAATGGTTCCTAGATTAAAAAAGAATACTGTAATATATTCAGTACTAGATTCTATAGAAGAAATAAAT
AAATTACATGGTGGAATATGGGAACAGATTGATGTAAAAGTATTAGCTGGGGAATCTATGTACTATTATA
AAAAGATAAAAGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3386857-3386150 putative iron-sulfur-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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GTGTAGACATTGTTCGCTTTGTTGATATATCTGAATTTCCAATAAATCAAACACAAGGTTTTTCTAAAGC
AATTTTATTTTGTATAGGGTTATCAAAAAAATTTATTACAGATATATACAATAACTTACCTACAGATAGT
GATGAGTTTTTGGAAAAAGAGGAGAAAGTAGAAGAATTAGCTGACTGGATTTCAAAATATATTCAAAATA
AAGGATATAGAGCGTATTCTCAATCGGAGAAAAACAATCTAGAACATGGATATTTTGAAAAAGCCTATAT
TAATCCAGAAATGCAATCAGGGATTAGTCCTTTACCACATAAGACAATAGCAAATATTAGTGGCATTGGA
TTTATGGGAAAAAATAATTTGTTTGTAACAGAGGAATACGGATGTGCTTTTAGCATGTGTACAGTACTTA
CAGATGCTCCAATTTCTGTTGAAAGATATCCTTTGATTGATTCAAAATGTTTAAATTGTAATGTTTGTGT
AGAGAACTGTCCTGCAAAAGCTATACATGGAAATGAATGGACTTTACCTGGAAAAAGAGAATCTATTATT
GATGTTTCAAAGTGTTTTTGTGCATTGAGGTGTATGATGAGTTGCCCATGGTCATTAAGATATGCAAATC
AAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3387632-3386886 hypothetical protein CDR20291_2861 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATTGAAAATCTTTCTATTGATGATATTAAACGAGGCTATATATTTAATGATGATTTAAATTGTT
ATAGTTGCATTAAATGTACAAAAACATATGAGGTAGGAGAAATATATAAAATAGGTAATAGATTCTTTGA
AGCTTCAAAAGCTATTGAACTTCATATGGAATTAGAACATAGTGATTATTTAGAGCAATTGCTTAATAGT
GATTCAAAGTACAACACATTGACTGAAAATCAAAAACAATTATTTCAATTATTTATTAGTGATTTACCAG
ATAAGGAGATAGCAAAACAGGTTGGAGTATCCACATCTACTATACGCCATCAAAAATTTATTTTCAGAGA
AAAAGCAAAACAGGCTAAGCTCTATTTAGCACTATATGAATCTGTATTTGAAGATAAATCTAATAAAAGT
AGTACTATAATACCAATCCATGAACATGCTCGAATGGTAGATGAAAGATATGTAGTAACTGAAGAAGAGA
GAAAACACATTTTGGATACATCATTTGAAAGTATGAATCCTTTAAAATTAAAAGTATTTTCTTCAAAAGA
AAAGAAAAAGGTCGTAATTTTATCTAAGATTTTGGAACAATTTGAACGTGGGAAGAAATATTCAGAAAAG
GAAGTTAATCAGATTTTAGAATCTATATATGATGATTTTGCAACAATTAGAAGATATTTAATTGAGTATG
GCTTTATGAGTAGAAATAAAGAATGTACAAAGTATTGGTTAACATAA
>ref|NC_013316.1|:c3388459-3387989 PTS system, glucose-specific IIa component [Clostridium difficile R20291]
ATGTTCAAAATGTTTAAAAAAAAATCAATAAAATCACCCATATCAGGAAAAGTAATAGAGTTATCTAAAA
TACAAGATGGTGTATTTTCTCAAAAAATTATGGGAGAGGGTGTAGCTATAGATTCTACAGGAGACATTGT
ATATGCTCCAATCAATGGAAAGATAGTAGTAGTAGCAGAGACTAAACATGCATTTGTAATAGAATTAGAA
AATGGGATGGAACTTCTTATTCATGTTGGTTTAGATACTGTAAATTTAAAAGGCGAAGGTTTTGAGGCAT
TGGTGAGTATGGGAGAACAAGTGAAGGAAGGAACACCAATGTTGAAAATTAACCGTCCTTTGATTGAATT
AAAGGGTATATCACTTATTACTCCAGTTACAATAACTAATCATTCAGAGTACAATATGAATACATGTAAT
GTAGGCAATAGCGTTGAAGGTGGGAAAGATACTGTAATTGAGTTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3389082-3388483 putative phosphosugar isomerase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGATATTTAAAAACAATGGTTGATGTTATGACTACTGAAATGAATGCCATAAGATGTTTAATAGATG
AAGCAGGAATAGAATATGAAAGTATAGTTAGTGAAATTGCAAATTGTGAAGGCAAAGTAATTTTTATGGG
TGTAGGAAAATCTGCACATATAGGTAAGAAATTGGCAGCTACATTTGCTAGTACTGGTACACCTAGCTTT
TTTGTACATGCAACAGAGGCAGTGCATGGAGATTTAGGAATGATTGAAAGTAAGGATATTACAATTTTAA
TATCAAATAGTGGAAATTCTATGGAAGTGGTAAACTGTATAAAATATATTAAAGCAATAGGTTCTAAGAC
AATTGCATTTACTTCAAACAGAAATTCAGTACTGGCAAAAGAGTGTGATTATGCTTTAATATATCCTGCA
AAGGATGAAGCAGACCATTTAAATCTAGCACCAACAACATCATCTACAATTACTTTGGTTTTAGGAGATT
CTATTGCATGTGCATTATCTAAGAGTAGTAATTTTGGTTCTTCAGATTTTTATAAGTACCATCCAGGAGG
AAGTTTAGGTGAGAAGTTAAAAACAGCTAACAATGGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3390284-3389100 putative bifunctional protein: repressor/cystathionine beta-lyase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTAATTTTGATAAAAAAGTAGACCGATTGGGTACATATTGTACCCAGTGGGACTATGTAGAAGATA
GATTTGGTAAGAAGGATTTGCTTCCTTTTACAATTTCAGATATGGATTTAGAGTTTCCATTTGAAATAAC
AGAGGTGTTGCAGGAAAGGTTAAATCATAGAGTTTTGGGATACAGTAGATGGAAACATGATGATTTTAGA
AATTCAGTTACGAATTGGTATATTAAAAGATTTAATTGTAGCGTTGATAGTAACTGGATATATTATAGTC
CAAGTGTAATGTATTCAATTAGCAAACTTATTGAGATGTTAAGTAATGAAGGAGATGGAATCCTTATAAA
TACTCCTGCATACAATGCTTTTTATGATGTGATAACAAATAACAATCGTAATATTATAAAGTCACATCTT
GTAAATAGGAATGGATTCTATTCAATTGATTTTAATGATTTTGAGAAAAAGTGTAAAAAATCTAAGATAT
TTATTTTATGTAATCCTCACAATCCAACTGGTAGAGTATGGAGTGAGTTAGAACTTGTTAAGATGATAGG
AATTTGTAAGAATAATGATGTCAAGATAATATCAGATGATATACACATGGATATTGTATATGACAATAGA
ATGACACCTATCTTAAATGTTGCAAAGGACTATTTAGATTCTGTATTCATTTGTACATCAGCGTCTAAAT
CTTTCAATATACCAGCATTGACTGGGTCATATGTGATTATACCAAATGAAGGTATTAGAAATAAATTTGA
AAATATCACTAGATACCGTGATTTTGTAAATTCGCCAGCAATTCTAGCAATATTAGCTACAATGGTCTGT
TATGATGACTGCGAATATTGGTTAGATGAACTATTAAAATACCTTAAAGAGAATCTTAAATATACGATTG
ATTATATAAAAGATAATTTAGAACCATTGAAATTGGTCATGCCAGAAGGCTGTTACTTTGCTTGGATAGA
TTTTTCCGAACTTAAAATAAGTGGTGAGAAATTCCAAAAATTATTGATGGATATTGGAGAAGTTGCTATT
ATGTCGGGGTCTGTATATGGTGAAGAAGGTGAGTTTTATTTAAGGTTAAATGTGGCATGTTCAAGAGAAA
AACTTGAAGATGGTTTAAATAGGATTAAAAAAACTATGGATTATATTGCAAAAAGAACTTTATAG
>ref|NC_013316.1|:c3391854-3390277 PTS system, maltose and glucose-specific IIbc component [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAAATAAGTTAGGTTTATGGAACTTCTTCCAAATGTTAGGGAAAACGTTTATGTTCCCAATAG
CACTACTTAGTGTTTCTGGGATGATGCTAGGACTTGGGGCAGGTTTTACAGACCCTAAGATGATTGAAAT
GGTTCCATTTCTAGGGAATGAATATGTTAACTTAGTTTTAAACTTCATGTTAACAATAGGATTATTTGCA
TTTAACAACTTGGGAGCATTATTTGCAATGGCAATTCCACTAGGATTATTAAAAAAAGAAAAAGAGTTTG
GTGCTTTTTCAGGATTAGTAGGATTTATAGCAATGCATATAGGTACAAATTTTTATTTAACAAGAGCTGA
TTTGTTAGTACCAGCAGAACAGATGTCAACTAATGGTCAAGCTATGATTATGGGTATACAAACATATAAT
ACAAGTGTTTTAGGTGGTATTGTAGCAGGATTAATTGTTTATGCAATATATGATAAAGTTAGTAATTTAA
AGATACCAGAATCATTAGGATTCTACAGTGGACCAAGATTAGTTCCAATTGTTAGTTTAATAGTTATGAG
TATAGTTGGATTATTAATACCTATTGTTTGGCCACCATTTTTCAATGCATTCCAAAGTTTAGGAAGATGG
ATTTCTTCAGCAGGACCATTAGGATATTTTTCATATGCAGTGGCAGAAAGAGTTACAATTCCATTTGGAC
TAAATCATCTTGTAACATCTGTATTCCGTTTTACACCAATAGGTGGAACTGCTGTTATTGATGGAGAAAC
GTACTTTGGTACATTGAACATGTTTATGGCATATGTAGAAAATAATCAGATTATACCTCTTGATTTAGCT
GGTAAAATGGAACAAGGTAAATTGATGATTCAATATGGATTAGCTGGTGCTGCATTGGCTATCTACCGTA
CAGCAAAACCAGAAAATAGAAAGGCACTTAAAGGACTTTTAATATCAGGAGTGTTGACAGTTATTATAGG
TGGTATAAGTGAACCAATAGAGTTTCTATTCTTATTCATATCACCAGCATTATTTGCTTTCCATACATTT
ATGAATGGTCTAGCAAACATGGTACTTCCATACTTAGGCGTGTTGATGGGATTCACAGGAGATTTAATTG
CATTTATAAGTTTTGGTGTGTTAAGAGGAACAGCTACAGGATGGCCAATAGCAGTATTAGTAGCAGTTTT
ATATTTTGCAATATACTATTTTGTATTTAAGTGGGCAATTATTAAGTTTAATATAAAGACCCCAGGACGT
GAGGATAAAGAAATAAAAGTATCTGAAGGAAATGGTTCAGATTTCAAAAATTTGTCTACATATAAAGGAC
AACAAATGATATCTGCTTTAGGTGGTCAATCTAATATATTATCACTAGATAATTGTGTAACTAGATTGCG
TTTAAAACTACAAGATGTATCATTAATAAATGAGGATGCAATTAAAGAGGCTGGTGGTATAGCAGTTGTT
AAATTGGATGAGCATACAATACAAGTAATTATAGGAACTCAAGTGTATTCTTTAAGAAAGCAGATGGATA
AAGCTATGGAAGGTCATTTGGAGGCATGTAATGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3393043-3392207 transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
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TCACTGGTGCTGGAGTAGGATTTAAGAAAAAAGTAGGCGATTTGATAGATGAAAATTTGATTTCTAAGAA
ATATTTTGTTCAAGACGATCAAAGGGACAAATACAATCAAATACTTAATAAGACCTCTATTGAATACTTT
AAAATTTCAGAAGAAATTATAGAAAAGGCTAATGAAGTTTTAAATACTCAAGTGAATGATTCAATAATAT
TAGCCTTAACTAGTCACATAGAATTTGCTGTCCAAAGAGAAAAACAAGGTATAAAATTACCAAACTTAAT
ATTGAATGAGACAAAACAACTTTATAGGGAAGAATTTAAATTTGGATTATGGGCAATTGATGAAATTGAA
AAAAGGATAGGAATAAAATTGCCTGAAGATGAAGCAGGATATATTGCTATTCACATAATCAATGGTTTGG
AAAATTCTCAAAAAGATGAAGGTATTAATATACTAGAGTTTTCAAAACAAGTTATTCAGATAATTGAAGA
AGTACATGGATTTAAATTGGATGTAAATTCATTAAATTATACTAGACTTATAACTCACTTAAAGTTTTTT
GTTCAAAGGATTCTCCGAAAAGAAACTTACAATGATAGTGATATTGAAGATATGTATAAGTTAGTGAATA
AAAATTACAATAAACCTAAAGTGTGTACTGAAGAAATTGCAGCATTGGTATTAGACAGATTTGAATATAA
GATTAGTAAAGAAGAAGAATTATATTTAATGATTCACATAAATAAAATAACAAACAGTGGTTGTTAG
>ref|NC_013316.1|:3393929-3395203 putative aminotransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGCAATTCATGGATGTATCTAAATACATTGAAGGTGCAAACCTTAAAGTTAAAACTAAAAATGGTGAAA
CTGTTAAAAGAATATATTTTAACAACTCTGCCACTCCATTAGTTTTAAAAAACGTAGTGGATAACTTAAA
CTGTGAGATTCCTTGGCTTACTTATATTAATGCTCCAGGAATAATCTCAGAAAAAAATACTTTAAAATAT
GAAAATGTACGCTCTACTATCCTCAAACTTATTGATGGAGACGAAGAAAAGGATTCTGCTATTTATGTCA
AAAATGCTACAGAAGGAATAAACTTCTTAGCAAAATTTTTTAAAGATGAAAATCCAGATAAATTTATTAT
TACCACAGCAATGGAGCATATGGCTAATTACCTACCTTTTAAAGTTAATTTTCCTACAAAAGTTGTTGGA
ATTACAGAAAAAGGAGAACTTGATTTATGTCAATTAGAGAATATACTTAAAAATTATGCTGGTAATGTAT
CTCTCGTTACAGTTACAGGAGCTAGTAATGTCACAGGTATAACCACTCCTATATATGAAATAGCAAGAAT
AGCTCATAAGTATGGTGCAAAGATATTGGTGGATATTGTGCAAGTAATTCAGCATAAACCTTTTTCAATG
ATGCCACATGAATGTGATGAGCATATAGATTTTGTTGTTTTTAGTGCTCATAAATGTTATTCTCCACTAA
ATGGAGGAGCTCTGGTAGGACCTAAAAAATTCTTTGAAAAATTTAATCCTGTACTATATGGCTCAGGTTC
TACCAAATTTGTAAATGATAACAAAATACTATATGCAAACGTACCCCAACGTTTTGAAGCAGGATACCCA
GAGTATTTTGGAACTCTTGCAATGGGAAAAGCACTGAACACTTTAAATAAAATTGGTCTAAACAGAATTT
CAAAATACGAAAGAGAATTATTTTTATATGCTAAAGAAGAAATGAGTAAAATACCTAATATAATAATATA
TGGAGATAAATCAAATAATGTAATTATCCCAAATATATCTTTTAATATAAGTAATATGTATTACAAAGAT
GTAGCAAAATATTTAGTTGATAACTTTGGAATAGAAACTGGAGCTGGAGTAGTAGGTGCAGATATTTATG
TACAAAAATTATTAGGTATAAGTCCAAAAGAAGCATACGTCAGATTTATGAGGGAAAATCCTGTAGGTCT
TGTTAGGATAAGCTTAGGAATGTACAATACTTTTGATGAGGTGGATAGCTTTATACATGCTATTAAAACT
TTGGCTTTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3395727-3395410 thioredoxin [Clostridium difficile R20291]
ATGGTAAAAATAATAAATAATAATGAATTTATAAATGAAGTAGAAAATAAAGATGGTTTAGTAGTTGTAG
ATTTCTTTGCGACTTGGTGTGGACCTTGTAAGATGCTATCACCAATATATGAAGCTTTAGGAAATGAGAT
GGTTGAAAAAGCAAACTTCTTGAAGGTGGATATAGACCAAAGTATAGAATTAGCTCAGAAATTTGAAGTA
TCTACAGTACCAACTATGCTAATATTTAAGGATGGAAAACCTGTAGATAGATTAATAGGTTTTATGCCTA
AGGAGAATTTAAAAAACAAAATTGAATCATATATGTAA
>ref|NC_013316.1|:3395994-3396746 putative sugar-specific transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAATATAATTAATGAATTACAAAATATAGGATTTACTAAATACGAATCTCAAATATACATATCAT
TATTAAAGGAAAGCCCTTTAACAGGATATGAAATAAGTAAATTATCAGGTGTACCACAATCAAAAGTCTA
TGAAAATATAACAAAGCTATTAAACAATAATATAATTATCAATGTTGGAACTGACCCTATTAAGTACATA
CCCATAAACCCTAATGAATTATTAAAAAATAAGAAAAAAGAATTTGATAATTCTATGGATAATCTAAAGA
ATAGCTTACAGATATTAAATAAAAATAAAAGTGTAGAATACGTTTTAAACATAAAAGGAGATAAAAATAT
ATTAAAAAAAGCATTAGAAATGATAAAAAATGCAAAACAAGAAATTATAATTTCTTGCCCTTATGAAGAA
ATTCTTGAATTAAAAAAAGAACTCCTAATTGCTTACAAAAAAAATATTAATATTGAAATACTACTTTTAG
AAAACAAAAGTCTGAAAGGTCTTGATAATATTCATACTCATGGAGGTAATAAAACTACACTTGAAAATAA
AATGCTTTACAAAGGAATTATTTTGATTGTAGATAATGATGAAATATTGACAGGAAACTTATCAGAAGGC
AGTGAGGCCATTTCAATTTGGACAAAAAACTCTAACATTTTATATATTGGAGTTCAATACATAAAACATG
AAATTTATATTTCAGAACAAATAAAAGGAGGTTATAAAAATGAACAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:3396733-3397614 hypothetical protein CDR20291_2870 [Clostridium difficile R20291]
ATGAACAAAATTAAGATTAAACAAGTTGATGCTTTTACAACTATACCTTTTGGTGGAAATCCTGCTGGTG
TCGTTACTGATGCCTCTAACATTTCTGATGAAATTAAGCAGAATGTGGCTAAAGAAATGAATTTATCAGA
AACTGCATTTGTTTCAGAGTCAAATGTTGCAGATTTTAAGGTACAATTTTTCACACCAGGTTTAGAAGTT
GATTTATGTGGTCATGCAACAATAGGTACTTTCCATGCACTTTTGGAAGAAGGAAGGCTTAATACTAATA
AGAGTATATTTTATCAAGAAACAAAAGCTGGTGTATTATCTGTAGAGCTTAAGGAAATAAATAATGAAAA
TATATTTATGATGGAACAGAATACACCTGAATTTGAAAATTTAGATAATTACAGAAAAGAACTTGCACAA
ATGATAGGTGTGCATGAAGATAGACTTCTTGAATATCCTATTATAAAGGTAAATACTGGACTTTGGTGGC
TTGTATTTGGTCTAAAATCTTTAGATGATTTAAAAAATATCTCTCCAGATTTAAATAAAATCAAAAAATT
TAGTGGTGATAATAATATAATTGGTATAACTCCATTTTGTATAGAAACTATAGATAAAAAGTGTGACTAC
CATTTAAGATCTATAGCACCATATGTTGGAGTTACAGAAGACCCTGTATGTGGAACTGGGAACGCTTGCG
TATCATCTTATATAGTACATCACAATATTTTAGATAAAACTAGTTTTATTGGTGAGCAAGGTAACTTTAT
AAACAGACCTGGAAAGGTATATGTAAATATAACTAGAGAAAACAATGACATAACTTCTGTAAAAATTGGA
GGAAGTGCTTATACTGTTTTAAGTGGTGAAATTATGTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3399195-3397840 proton-dependent oligopeptide transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCTCAACAGTAAAAAAGAAGGGTAAATTTCCTATGGGATTTTATATCTGCTCAACAACTTTCTCAT
TTGAAAGAGCAGCATATTATGCTTCAAAGTACTTAATATATATATTCCTTACAACAGCTATAGTTCATGG
TGGTCTTGGAATAGATAAAGGACAAGCTGCTATAATGCAAGCCAACCTTGTTGCATTCACATACCTTGCA
CCTATAATTGGGGGATATATATCAGATAGATGGATAGGAGCTAGATATACTATACCTATAGGTATGCTTA
TCATGGGGGTAGGTTACTATCTTGGTTCTATTGCAACTACAGTTTCTATGGTAAATGCAATGATAATCTT
AGTTTCGATTGGTACTGCATTCTTTAAAGGTAACGTATCTGCGGTAAATGGACAGCTTTTTGATAGTCAA
GAAGAACTTGATACAGCATTTTCAGTACAATATTCTTTTGTTAATATAGGTTCTTTTATTGGTACTATAG
CAGTTGGTATTCTTTACCTTAAAACATTTGCAAAAAATGGTGTACTTGGATTTTCTCAATGTTTCTTTAT
AGCAGCTGTACTTTGTGTAATAGGTGCAATATGGTTCATATATGGATGGAGATTCCTTGGAAATGCAGGA
AAGAGACCTTTTAAAGAAGGTGTAGTTGCTGAAAAAGTTGAAGAAAAAGATAAGTCTCCTCTTACAAGCA
TGGATAAGAAGAGAATTTGGGCTATTATACTTATATCATTCTTCTCTGTAATTTTCTGGGTATTCTGGTA
TCTAACTTATCTTGCAGTTTATGATTATGGTGCAGCATTTGTAAACATGAATGTTGGAGGATTTGATGTT
CCTCTTGCTTGGTTTGACTCATTAAATTCACTTGTATGTATAGTATTAGGACCAGTTCTTGGAGCATTAT
GGTTTAAACTTGCTAGTAGACCACAAGGAGATATGAGTTTATTTAAAAAGACAGGTCTTGGATTAATATT
CTTAGGTCTTGCATTCTTAATGCTTGTTGGTGCAGAATTTTCAAGAGGAGTTGGAGCTCCTGAAACTGCT
AAAGCTAGTATACTATGGATAATCATGTTTGGTATTCTTTTAAGTCTTGGTGAAATGTTATTCTCACCAC
TTGGTAACTCTTTTGTAAGTAAGTATGCACCTAAGAAGCTTCTAGGTGTTCTTATGGGAGTATGGACATT
TGCTACTTTTATAGCTGGTAAAGGATATGGATATATATATGCATTTACTCTTAAATTTGATATGATTAAA
GTATATACTATAATTCCAGTAATACTATTTGTTGCAGCGATATTATTATTCTTATCTGATAAGACATTAA
GTAGACTTGTTGAGGATGATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3401612-3401103 putative regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGTGATGTTTTTGTTTAAGATTGATGATTATATAATGTATGGTATGACAGGAGTCTGCAAAGTCATGG
ATATAACAAATGAACGATTTACAAATGGAATAAAAAAAGAGTATTATGTATTGAGTCCTATTTATTCTAA
TAATACAGTAATAAAAATTCCTGTAGATAATGAAAAAGTACCAATGAGAAAGTTACTTTCTAAAATTAAT
GTGCTTTCATTAATAAATGATATTCCTAATATGGATACATCATGGATAGATAATGAAAAATTAAGAAGTG
AGCAATTTAAAAAAATACTCAGAGGTGGTAAATGTGAAGAGTTAATAAAATTAGTAAGAAGTATAGATAA
TAACAGAGAGTATGTAAAATCTATTGGTAAAAAAACACATCAAGCAGATGATAATATAATGAAAGAAGCA
GAAAGGTTATTAAGTGAAGAATTTGCAACTATTTTAGATATTTCTCCTAATGAAGTTAGTTCATATATTT
CAAGTCATATACCTCAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3403232-3401823 hypothetical protein CDR20291_2873 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATTATTTTGATAAACAAGCAAAAGAGCTTTATAATAAAGCAAGTGAAATTATAAATACTCATT
CTATGCTAAAGGCAAATCGTGCTAATGAGAAATTTGATATGGATATACCACAAGATTTTAAGTATGAGTT
TTTTAGTCTTGTAGATAAAGTGAATTTAAGTCTTATGGAAGAAGAAGATAATTTTTATGGATATTTTTTG
TTTCAGATGTCAAGAGAAATAAGATTTGATATAAGTAGTCCTACAGGCGTGAATTTTAAGGGAGCTAAAT
ATGTTATATATTTTAATCCAATAATCTTTTTAACGCTTGACATAAAGCAAATGGAGACTACAATTAAACA
TGAAATTCATCATATATTATCTATGCATTTGATGAGAGCAAAGGAGTTAAAAGGAAAGTATAGTACATTG
GCAATTAATATGGCAATGGATATAGTAGTAAATAAATTTCTAAACAATTTACCACCATATGCAACTACCT
TAGAGTGGGTAAATTTAAAATATTCCTTAAAACTTGAACCATATGAACCTTTTGAATATTATGTAGAAAA
GATTCAGACTGAATTAGATTTGATGGAAGTGGATGAAGATGGTGAGGAAGATGATAGTGATAAATATGGA
GATGTAGAAATTGATTATAGCCCCGAAAGAACTCATGATATATGGGATGAATCCAATGAGATAGATAAAA
ATACCCTTAGAGAATTTACTGAAAAATTTATTAACAGTTCTCAAAAAGGTAAAGTTCCTGCTTATTTAGA
AAGTATGATATCATCACTTAAAAATAGTAAGGGTGAATTGCCATGGAATTTATATCTTAATAGAATAATG
GGAACAGTTGAAAATAATAAAAAGAAGACTATAACAAGAAGAAATAGAAGACAACCAAATCGTTTAGATT
TGAGGGGAGAACTTAGAAGTCATAAGGCAGAAATAGCAGTTGCACTTGATGTAAGTGGAAGTATTAGTGA
TGAAGAATTTAAACAAGCTATTAAAGAAGTTCTTAGTATAGTGAAAAACTATAATCATGAAATTACAATT
ATAGAATGTGATAATGAAATTAGACGTGTATATAAAGTGAGAACTGAAAAAGATATAAAAGATAGAATTA
GGATAGGTGGAGGTACTAGATTTTCTCCAGTCTTTGAGTATGCTAATAATAAAAAGATTAATTTGTTAGT
CTACTTTACTGATGGTAAAGGTGAAAATAAACTACAAGTAATACCTAGAGGGTATAAAATTTTATGGGTT
ATTTCTGGAAGAGGAGATAAAATTTCATTAAAAGAACCTTATGGAGCAGTTAAAAAACTTACTAAGGTTA
AAACAAATGATGAAATATTAGAAATAAATGATGTAAGAAATGATGGGTACTCAATGAATAGCCAAGCACC
AATTTTATAG
>ref|NC_013316.1|:c3404366-3403236 hypothetical protein CDR20291_2874 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTTATAGACACATTAAAAAGCGTTGACTTAATATTATCCACTGGAGAAGTACCTTTAATAGTAG
GTGAAAGTGGAATAGGAAAAACAGCTTTAGCAAATAAGCTTGCCAAAGAAAATGATTGGAGTTTAATTGT
TATTGATGGAAACTTACTTAAAGAGGGTGAAATAGGTGGTCTTCCAACTATAGAATCTTATGTAGGAGTT
AATTCTAATGGATATAAGACTGAAAAGAAAACAACAGTGTATGCTGTTCATAACAAATTAAGAGAAATTG
ATGAAGAGATATCTAAAAGTAAGACAGTTCTTTTATTTATAGATGAGATAAATCGTTGTGAGCATACAGT
ACAGCAAGAACTTATGAATTTAATTTTAAATAGAGAAATTAATGGATATAAACTGCATGATGATGTAAAG
ATTTTAGCAGCAATGAATCCATCAAGTAAATATGGTTCAGATTTTGATTATCAAGTGGTAGATATGGATG
CAGCCCAAGAAAATAGGTTTGTTTGGTTAAATATGGAGAGTGACCATACACAATGGATAAAATGGGCAAT
AGATGAGGGTATTGAAAGAAAAGTTATCGAGTTTATTTCCACTTTTCCAGAATATCTGCATAAAATAAAT
GAAGATGATGTAAGAGCTACTCCTAGAAGTTATGAGAGAGTATCTAAAATTTATAAAGTTTATAAAGAAA
AAAATAATTCTATTCCTAGAGCAGTATTTTTAAATGTTGTAAAGGGTAATGTAGGTAAAGTTATTGCAGA
AGAATTTATAAGTTTTATTGAATCAAACTCTGAACCATTAATATCCTATGAAGATGTTTTTTTAAGAGAA
TCTATTGATGAGCCCATTGTAGAAAGAGTAAAAAATGAGAGTCATACAAGACTTTATCTATCAGCTATGA
ACATTCTAAAAGACTTAGAATTAAATATTAAGAATGATAAATATGAATCAAACCACTATATTAATAGATT
TATTGAATTTTTAAAAATGTATCCTGTAGATTTAATGATAGGTATTATGAAGGATATTAGAAACAGTTAT
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TAAGGGGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3405181-3404378 hypothetical protein CDR20291_2875 [Clostridium difficile R20291]
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CTGATGAAATGAAATTGTTAGCTATTAAAGAAAATGGGCTTGTACTAGAATATATAAATAATCCAACCAG
AGAGATGCAAGAACTAGCAATAGATAATAATATTAGAGCAATTAAATTTATAGATAATCCAACAGAAGAT
ATGATGATAAAAGCAGTAAATGAGGGATGGAGTATACTGGATTATATCAAAAACCCAACTGATAAAGTTA
TTGAAATGGCTATAAATCAAGCAGGATGGGCAATTAAATATGCTAAAAATCCAAGTGAAGAATTACAACT
GTTAGCAGTAAGAAAAAATTATGATTCGATAAAGTTTATAAAACAACCTTATGAAAGTGTACAAGAGGAG
GCAGTAAGAATAAGTTATGATGCCTTGAGATATATAGATTCACCTAGTTATAATGCAGAACTTATAGCTA
TAAAAAATAATGAAGCAGCTATTAGCTTTATAACTGATTTAGATAAAAATAAAATGTTGGAATTTTTAAA
AGTGAATATTTTAGTGATTAAGTACATTCTGAAAAAAGTATCTAAAGATGAATTAGAGAGTGTATTAAAA
GAAGTATTATCCAAAGAAGATGTTGAGGAAAAGTATATTAGAGATTTTTTGAATTGTAGTGTTATAGATA
GAAATAGCGAAAGTATACCAATAGATAAAATTATGTTTATTTATAAATATGGAAGTAAGACAGCAAAAAA
AATAGCTGTAGATGAGAAATTAAAGATTATGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3406489-3405563 proline iminopeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAACTTGATTATTGTTTATAATTACAAATTGGAGGAGATAAATATGAAAATTACTGAAGGATATATGC
CTTTTAAAGGTTTTAAAACGTATTACCGTATAGTAGGAGAAAATACGGAAGGGAAGAAGCCATTAGTATT
ACTTCATGGAGGTCCAGGTTCTACACACAACTATTTTGAGGTATTGGATAAGATAGCTGAAAGTGGTAGA
CAAGTAATAATGTATGACCAAATTGGTTGTGGAAATTCCTTTGTAGAAGGGCATCCTGAGTTATTTAATG
CAGATACTTGGATAGAGGAGCTTATTGAACTAAGAAAACATCTAGGACTTGATGAAATTCATCTGTTAGG
TCAATCTTGGGGAGGTATGCAGGCTATTTGGTATGCTATTGAATATAAACCAAAAGGTATTAAGTCTTAC
ATCCTTTCATCTACTCTTTCTTCTGCAAAACTTTGGGAGAAAGAACAAAAAAGAAGAATATCATATATGA
GTGAGGTTGACCAAAAAGCATTGCTTGATGCAGTAAATACTGGAGATTACTCTAATAAAGAATATAATGA
TGCATTAGAAAGATTTATGGAAATGTATTGTGCAGGTGAAGTGACAGAAGATTCTCCAGAGTGCCTGAGA
AGACCTAAAAAATCAGGTTCTGAAGCATATATTGTAGGATGGGGACAAAATGAATTTTCTCCTACAGGAA
CTCTTTCTGGATATGAATTTACAGATAGATTACATGAAATAAAAGAGCCTTGTCTAGTAACTAGTGGAGC
AATAGATTTATGTTCGCCATATATTGCAAAGACTATGTATGATAGAATACCTAATAGTAAGTGGGAGTTA
TTTGAGTATTCAAGACATATGCCATTCGTTGAAGAAAATGAGAAATATATAAAAGTCTTAACTGAGTGGT
TGAATGCGAACGATTAA
>ref|NC_013316.1|:3406894-3407874 hypothetical protein CDR20291_2877 [Clostridium difficile R20291]
TTGCATTTGAATAATATTAATTCACTTAAAGTAATAAAATTATCTCTTGGATGTTCTCTTGCTATATTCA
TTGCTTGGCTATTAAAATTAGAATATTCAATGGTTGCTGGAGTTATAGTACTACTTACAGTAAAGGACAC
TAAAAGAGAAACTCTTAAAGGCTCCATTGGAAAGATTTATGGTTTTCTTTTATGTACTATTTTTTCATAT
TTATGTTTTAATATTTTAGGATATAATTTGACTTCATTTTCAATATTTATATTTATAATTATACCACTTT
GTTTTTTGTTAAATATTCAAGATGTTATTGCTATGTGTGTAGTCATAGCATCCCATTACTACCTTCAAGG
AGAAACTTCTATCAAATGGATTTTAAATGAAGCTGGAATATTTGCAGTAGGAACTGGAATAGGTGTCTTA
ATAAATATGTATATTCCAACAAATATACATAAAATCCATGAAGTTCAAAAAAAGTTACAGGAAGAAGTGA
GTATTGTACTTATAGACATTGCAGATATTATTGTAAATCCTAAAAAAGAAAATGGATATAGTAGAGATTT
ATATAAATTAAATTCACTTATTGACAGCAGTATTTCTGAAACTTACGATAATATTAATAATACTTTATTA
AGTGATACTAGATTCTTCTTAGAACATATGGATATTATAAAAAGCCAACGGGATATCTTAGAAAATTTGT
ATAGTTATGTATCTCAACTAAATTCTACACCACCACAAGCTCACATTCTATCTGCTTTCATACATAAAAT
AGGTTATACTGAATTTGAAGCTGAAACAGGCAATCTTCTTCTTGAAGAATTGAAGAGATTAATGCTTAGT
ATGAAAAACCATCCTCTACCTGTTGACAGAACAGAGTTTGAAAACAGAGCTATTTTATTCCTATGCTTGA
CTGAGTTAAAACAATTTTTAGTTAATCGTAAACATGCTCAGATGCTTAGAGATAATAATTTTTATAAATA
A
>ref|NC_013316.1|:c3409021-3407990 hypothetical protein CDR20291_2878 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAAAATTAGGAAGTTAGCTACCAAGTTATTGATTACAACAATTGTTTTAGTCTCAGGTATGAGTA
TGACAGTTTATGGTATGACAGCCAAAGAGGTAACAGCAAAAACACCAAAAAGCTATGTCACTGGAACCAA
TAGCGTATATGGTCCAAAGCTGTCACAAGCCCAACTAAACTCAGTAGCACAAGCAACAGCAGATTTTATG
AACAATAAAATTACAAAGAACATGACTACAGACGCTAAGATTTTAGTTGCCTATAATCACATTAAAAATA
ACACAACATATGTTGACTGGAATGCAGTAGAAGGAGCGAATACTGCCTATACATTGGTTACTAAAAAAGG
TGCATGTTCAGGAATGGCTAGGAGCATGAAAGCTTTGTGTGACGCTATGGGAATTGAATCTTATTATGTA
CACAGCACATCAAATGACCACCAGTGGAATCTTATACGTTTTGGTGATGGGCGTTTGTATCATGTAGATA
TTGATGCTAATAAATCAGCAGGAAAGGATATCATATACAAGAGTCTTAGCCACCCATTACCATTTGATAA
GACAGCATATCCAACAGTTGGAGCAGTAGCACAAACGCAAAAACCAGCACTACCTGGGAAGCACACTATG
TTACCACATCAAGACGGGGCAAAGGTTGTTGGAAAATTTGGAGATATAAAGGATAAACATGTAATGTATG
AAGGTGTTAGATGTGTTGTAATTAATTCATCAGTGAATACAGTTACATTTCTAGGTAGTAAATCAAATTT
AGACCCATCAAATCTTACAATTGCTGTAATAGGATTTATGAACACACCATATGGGATGTTTGCATTAGCA
CCAGAAGGTGAACCTGTTGAATATCCTTTTAAATATGATAAGCCATTTTCTTTAGATTTTAGTGGTAAAA
ATCGTTCTGGTGCAGAATTAGCAAAGTACTGTAAAAAAAATGATGTGACTATTAAAATAGAAATCACTGA
TGAAAAAGCTAATATTGGACTTGGTCAAATAATGTATATTCGATATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3410484-3409633 putative phosphosugar-binding transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTGCATTTTAAAATTAAAACAGATATTTGAAGATTTAACGGAAGTAGATAAAAAAATAGCTGATT
ACATACTTAATAATACAGAGGCTATAAGTAAGCTTTCTGTATCAGAATTGGCGTCAAACTCAAAAACAAG
TACAGCAAGTATAGTTAGGTTTTCTAGAAAAATGGGATATTCGGGTTTTGGGGATTTAAAAATTGAGATA
GCTAAAGATTTGATGGGCAAAGAAAATGAATACACATATGTAGATGAAAACTATGATTGTAATATAGATA
GTGTTATAAACAAAATTACAAACAAAAACATAGAGACTATCAACCAAACAAGGTTGTTGAATGAAAAAGA
TATAATAAAAGAAGCAGTTGAACAGATAATAAAGGCTAAAAATGTATATATATTTGGAGTAGGTGGTTCG
GCTTTAGTTGCACTAGATTTACAGATGAAACTTTTAAGGATAAATAAACAGGCATTTACCTCTTTAGATA
GTCATACACAACTTATGGTATCTTCAAATGTAGATAAAGAAGATATAGCTATAGCAATATCTTACTCTGG
AGAATCAAAAGAAGTAATAAAGTCTATAGAAAATGCAAAATTAAAAGGATGTAAGGTCATTTGTATAACT
AAATATAGTGACAATCATCTTAGTAAGATTAGTGATTTAAAGCTAGTAGTACCAAATATAGAAAAAAGGC
TTAGAGAAGGAGCTATTTCTTCAAGAATAGCAATGCTTACGTTGATAGATATAATATATATTTCTATAAT
TCAAGAAAACTTAAATGAGGCAGAACAGAAACTACAAGAAACAAAAAGGATACTTGATTATTTAAATATT
AATAATGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3411421-3410501 putative acyl-CoA reductase/dehydratase [Clostridium difficile R20291]
ATGTATTTTTTAGGTGTAGATGGTGGAGGAACGAAAACAACATTTACATTAGTAGATGAAGAATTAAATA
TAGTAGGAACCATAACCAAAGGAACTTGTCATTATAATCAAATAGGATTTGATAATCTAACGAAATTATT
AATAACTGGGTTGGAAGAAGTTTGTAAAGATGCTAAGATAAATGTAGAAGAAATAACGTATGCATTTGTT
GGACTTGCTGGATATGGAAAAATAAAAGAAGTATTGTATGCATTAGAAGTAGCAACAAAAAATGCATATA
GTCATATAAATTATACTCTAGGTAATGATGTAGAAATAGCATTAGCAGGTTCTTTAAATGGGGAAAAAGG
TATAAATATAATTGCAGGTACTGGTTCAATAGCACAGGCTTTAGATAAAGATGGGAATCTTCACAGATGT
GGAGGATGGGGCTATGTATTAGGAGATGAAGGTTCAGCGTATTATATAGGAATGGCTACCTTAAAAATGT
TCACAATGCAGTCTGATGGAAGGTGTTCAAAGACAAAATTATATGATTTAATAAAAAGACATCTTAATAT
AGAGAATGATTATGACATAATAAAATATGTAAATGATGGAATACAAGGAGATAGAATAGAAATAGCAAAG
TTTGCTACGATATGTTTAAAAGCAGTTATTGAAGGTGATAATACTGCTAGTAAAATATTTGATGATGCAG
CTTATGAATTAAGTAGGCTTATAATAGGATTAGAGCATCATTTTGAACAAGGTACAAAGATAAAGGTATC
TTATTCAGGTGGAGTGTTTAAGTCAGGAGATTTAATATTAGAGCCACTTAAAAAATATTTGAATAAAACG
AGATTTGGTATAGTGAGACCAGTGTTGACTCCAGATTTAGGAGCATGTTTACTTGCTAAGAAGAAATATT
ATAGTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3412445-3411531 putative sugar-phosphate isomerase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAATAAAAACTTTAGAAAATTTAGTTACAGAAGGTAGAAATAAGAATACATTGCAAATAGATAAAG
AAGATACATTAGGCATAATAGAATTAATAAATAACGAAGATAAAACTGTAGCCTATGCTGTTGAAGAACA
AAAGGAGAGTATAGCAAAAGCTGTTAATATAATAGTAGATAGAATGAAGCAGGGAGGTAGATTATTCTAT
ATAGGAGCAGGTACCAGTGGGAGGATAGGAATACTAGATGCCACAGAATGTCCTCCAACTTACGGAGTGG
ATTTTGAGCTTGTTCAAGCTATAATAGCTGGTGGAAATCAAGCAATATTTAAAGCAATAGAAGGTGCTGA
AGATGATAAAGAACTTGGAAAGCAAGATATAATAGATAGAGGAGTTACATCTAAGGATGTTATATGTGGT
ATAGCTGCATCAGGAAGGACTCCTTATGTTATAGGTGCAATGGAGTATGCTAAGGAATTGGGGTGTGCAG
TACTATCAATAACTATGAATCCGAATAGTGAAATGAGTAAAAAAGCGGATTTACCAATAAACATTATAGT
AGGGGCAGAAGTAATAATGGGTTCAACTAGAATGAAAAGTGGTACAGCTCAAAAAATGGTATGTAATATG
TTAACAACAGCTTCTATGGTTAAGATGGGAAAAGTATACTCAAACTTGATGGTAGATGTTAAGACATCAA
ATGAAAAGTTGGTTGAAAGAGCAAAAAGAATAATAATGATAGCTACAAATGTAAAATATGACGTTGCAGA
AAAATTCTTAGAAGAAGCAGATAATAGAGTTAAATTGGCTATATTTATGATAAAAAGTGGTTTAGATAAG
GATAGTGCAAAGAGTATCCTAGATAGACAAGAAGGTTATATAAGTGAAGCTTTAAAATCAATAGAAAAAT
TGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3413650-3412544 hypothetical protein CDR20291_2882 [Clostridium difficile R20291]
ATGACACAGATGGGAAGATTAGGAATATCAATTTATCCAGAAAAAACAACATCTAAGGAAATATATGATT
ATATAGATAAAGCTGCTGAAAATGGATTTACACGTATATTTTCATGTTTATTATCAGTTAAAGATACTAA
AGAAAATATAATTAAAAAATTTAAAAGTATAAATGAATACGCTAAGTTTAAAGGTTTTGAGGTAATACTT
GATGTAAATCCCAGAGTATTTGGTGAATTAGAAATAAGCTACAAAGATTTGACTTTTTTTAAAAAGACGA
AGGCAGACGGAATAAGGCTTGATATGGGATTTACAGGTTCTGAAAAGGCCTTAATGACTTTTAATCCTCA
AAATCTTAAAATAGAAATCAATATGAGTAATAATACTAATTATATAGATACAATAATGGACTACCAACCA
AATAAAGAAAATTTGACAGGATGTCATAACTTTTATCCACATAGATATAGTGGATTAAATTTAGAACACT
TTATAAAATGTACAGAAAGATTTAATAAGTATGGATTAAGAACAGCAGTTTTTGTAACAAGTCAAAATGA
AACCACATTTGGACCATGGCCTGTAACTGATGGGCTTCCAACAATTGAGATGCACAGAAATCTACCTATA
GATATTCAAGTAAAGCATATAATAGCTATGAATAATATAAATGATATAATAATATCAAATTGTTATCCAA
CATATGAGGAGCTAAAGGTATTAGGTTCTATGAGAAAAGATATGGTTACATTTGATGTAGCAATAGAGGA
AAATATACGAGAAGTTGAGAAGAAGATACTCTTTGAAGAAATACATTTTAATAGAGGGGATATATCTGAC
AGTCTGATAAGGTCTACTCAATCTCGTGTTAAATATAAAGGATACAAATTTGAACTATTTAATACTCCTA
AAATAATAAAAAGAGGAGATATAGTAATTGAAAGTAGTGAATATGGTCATTATGCAGGGGAGTTACAAAT
AGCCTTGACTGATATGAAAAACAGTGGTAAATCGAATGTAGTAGGATATATAAGAAAAGAAGAATTATTT
ATATTAGATTATATTAAACCATGGCAAAAGTTTGATTTTAAACCCTCAACAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3415220-3413874 PTS system, IIc component [Clostridium difficile R20291]
ATGCTAGATAAATTTACAGAATTTTTAGACAGTAAATTATCAACTTCTATGGCCAGATTGGCAGAACAAC
GTCACTTAAGAGCTGTAAGAGATGGAATCGTAGCTTCATTACCACTTATAATAGTTGGGTCATTTTTCTT
GATATTAGCATTTCCTCCATTACCAGATTCATGGGGGGTAACTCAGTATCTAAAGGAAAATGCAGTTACA
ATATTACTACCATATAGAATGACATTTTTTATTATATCAGTATATTCTACATTTGGCATAGGTTATAGTT
TGGCAAAGTCATATAAGTTAGATGGATTGACAGGAGGTTTATTAGCTACAGCTACATTCCTTTTGACAAT
AGTTCCTACTGCAATAGAGGGTCTTACCCCTGATTTATTAAAGATAGTTGAAAAGAGTCCAGAACTTTTA
GCTTGGTATAATTCAATTCCTCAAGGATGGCAAATGCCAATGGCTAATCTTGGTGGAGGTTCAATGTTTG
TTGCTATTGTAACATCTATAATAGGTGTTGAGATTTATAGATTTACTGACAAATCTAAATTCAAGATAAC
CATGCCAGAAGCAGTTCCAGCATCAGTCACAAGGTCTTTTGAAGCTCTGACACCAGCCGCATTAATAATA
ATTTTAATGGCTATTGTTACTTATTTCCTAGGGTTTGATTGGCATGGCTTCATAGCTAAATTAGTAACTC
CATTAGTTTCAGCCACTGACACATTACCATCAGTAATTATACTAATATTTTTAATAACGTTTTTTTGGTC
ATTTGGAATACATGGTGTATCAATAATAGGTTCATTGGCAAGACCTTTATGGATACAATTATTAGATGCT
AATACAGCTTCATATGCTGCGGGTCAAGCAGTTCCAGGTATTGCTGCTGAACCCTTTTTTCAATGGTTTA
TATGGATTGGAGGTTCTGGAGCTACAATAGGCTTAGCTTTACTTCTTGCATTTAGAGCAAAATCAGCTTA
TGGAAAGTCTTTAGGAAAAGCAACTGTAATACCAGCAATATTCAATATAAATGAACCAATAATATTTGGA
GCACCAATAGTATTAAACCCAATATTAATAATACCATTTGTTGTGGCACCAATAGTAATGGCAACAGTTT
CATGGTTTGCTATGAGTGCTAATTTAGTATCCAGAGTAGTAGTTACTGCTCCTTGGACATTACCAGGACC
AGTAGGGGCATATTTAGCCACTGGTGGAGATTGGAGAGCTTCAGTTCTTAACTTATTATGTATAGCTATA
TCAATAATAATTTACTATCCATTTGTCAAGATGTACGATAAGAGATTGCTTCATGAAGAAAAAGTTGAAG
AGCAAGAAGCTTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3415617-3415309 putative PTS system, IIb component [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAGTATTATTTGTTTGTTCATCAGGGATGTCAAGTGCTATAGCAGTTAATGCATTACAAAAAGAAG
GAGCAAAAAATGGAATAGATATAGATGTTTTGGCTGTTGGTACTCAAGAGTTTGAGAATGAAGTTAAAAA
TGGATGGGATATTGCTATGGTAGCTCCACAAGTCAGACATAGATTTGACTATTTAAAAGCTTTTGCTGAT
GAGGCTAGTGTACCATGTGCATTAATACAAGCACAAGCTTATAGTCCATTAGGAGGACCAAAGTTATTAA
AACAAGTTCAAGAGTTGTTGAGTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3416186-3415878 hypothetical protein CDR20291_2885 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGAAAAATCAAAGAACAGATTATAATATTCCAACTATAAGTTTTAAAAGTGGATTAATACTAATAG
TTTCATCTCTAGTAAGTACTGTAGTTTTTCCTTTGTTATTATCTATATTTGGAATAGATAATAGATTTGG
AGTTGTTATAGGAAATTCATTAATTACATCTTTTGCAGTTGCATATACAAGATACTTTGTTGAAACTAAG
AGAGGTTTTTCTTTGGGATTTTTTAGACTGTATATTTTATTTGTTTTATCATTTGCAATAATAGGTTACT
TCTGGATATATAAAGGAATACATATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3417429-3416269 hypothetical protein CDR20291_2886 [Clostridium difficile R20291]
ATGATAACTATGTATAGTGTAGGTTTAATGTCAGGAACTTCCTTAGATGGAGTTGATGCAGTACTAGCTG
AAATTAGTGGGAATGGTAGAAATACTAAAGTTAAGCAAATAGAATTTATAACTCTAGAAATTCCTAAAGA
TATAAAAGACGAAATAAGAAAGTGCTGTATAGAAGAGGAATCGAGTGTTGATTTAATCTGTAGCTTAAAT
TTTAAGCTTGGATATTTATTTAGTAAAGCTGTAAAATCAGTGTGTCATAAAGCAAACTTTCATATAGCAA
ATTTGGATTTTATCGCATCTCATGGTCAAACAATCTTTCATATACCAAGAAGTTATAATAATTTTGTATC
TTCAACGCTTCAAATAGGTGAACCAGCAATTATAGCATATGAAACAAATACAAAGGTAATATCTAATTTT
AGAGTAATGGATATAGCAGCAGGTGGAGAAGGTGCTCCATTAGTACCATATAGTGAATTTTTATTATATA
GTGATAAAAATAAAAATTTAGCACTTCAAAATATTGGTGGAATAGGAAATATTACTATAATACCTAAATC
ATGTAACATAGATGATGTATTTGCATTTGATACAGGACCAGGAAATATGATAATAGATGGAGTATGTCAA
AGATTATTTAATAGAAAGTATGATAAAAATGGATACTTTGCATCAAAAGGTAAAATTAATGAAGAAATGT
TAAAAGATTTGATGAGTCATAAGTATCTTAGTCAAGCGCCACCTAAAAGCACTGGAAGAGAGGTATTTGG
ACAAGTCTATTTGGATAACATGCTTAACAAATATAAACATGTAGATAAATATGATTTGATAGCAACAGTA
ACTATGTTTACGGCAAAAGCTATATATTATAATTATAAAAACTTCATACTTCCAAAGGTTAATGTAGATA
CTTTATTAATTGGAGGTGGAGGAGTTCATAATCTAACTTTAATAGGATATATAAAAGAGTTATTATTAGA
GGTTGAAGTATTAACTCAAGATGAATATGGGTATTCTTCTGATGCAAAGGAGGCTTTGGCATTTGTAATC
TTGGGCAATGAAACATTAAATAATTCTTTTTCTAATGTAATATCTGCAACAGGGGCTAAAAATAAAGTTA
TTTTAGGGAATATAACACCTAAACCTTTTGGAGGTAAATGA
>ref|NC_013316.1|:c3418878-3417859 two-component system sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGCTAGTAAAATATTTAAAAGGTAGGTCTAAGTATATTGCTCTACCTTTAGTTGTAGTTAGTATAATAA
ATATCTATTTATTTGCTATAGATATTTTAAAAAATAGATATTCAGAATTAATATACTTAGATTTTTTAGT
GCTGTTTATAATAATGGTATTTTTTGTTATAGATTATATAAATTTTAGAAATAGTTATATAAATTTATAT
AATTGTATAGAAAATAGTGGTGAAATAGACAGTTATTTAATTGATGGACAATCTTTTGAAGAAAATCTAA
TAAAAGATATTATAGAAAACTTAAAAATAAAAAATAATAGTGACATAGAGACTTATAAACAATCATTAAA
AGAATTAGATGATTACATAGCTAAATGGGTTCATGAAATAAAAATTCCAATATCTTCTTTAAGTATAATT
ACAGATAGGTTAAGTAGCATAGAAGATAGTTTGGATATTAAGAATCAGGTTGCAAAGATAAATTTTTTAG
TAAACTCTATTTTGTATAGTAGTAGAAGCAACACTATGTTTGAAGATGTATTTATAAATAAATTTAATTT
AGAAAAATTGGTAAAAATGTCTATAAAAAATAATTCATTTTTGCTTATAAAAAATAATGTAGAAGTTAGT
TTGAATGAATTAGAAAATGATGTTTACACAGATTCTAAATGCATGTCATATGTTTTAGACCAAATTATTA
ATAATGCTATAAAGTATTCAAAGGAAGTTGGTAAGATTGAATTTAATTCAAAAAAGTTAGAAAATGGAGT
GGTATTATCTATAAAAGATTTTGGTATAGGTATAAATGAGGAAGATATATCTAGGGTTTTTGACAAGGGA
TTTACGGGGAAAAATGGAAGAAATCAATTGTATAAGTCTACTGGAATGGGGATGTATTTTGTAAAGAAAA
TGATAGATAGTTTAGGGCATGAGATTGAGGTATGTTCGAAAATTGGTTCATATACAATTTTTAATATCTA
CTTTTATGATATATCGGATTATTTAAGCCTAGATAGTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3419567-3418878 two-component system response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGAATATACAAATGTATAGAATTTTATTAGTAGAGGACGATATTGATTTATCAAAAGAGATTGCGT
TAGCACTTGAAAAATGGGGATTTAAAGTAGAATTAATTGATGATTTTGAGGTAGTATTAGATGAATTTAT
GGATAAAAAACCAGATGTAGTACTTTTAGATGTAAATTTACCATTATATAATGGATTTTACTGGTGCGAA
AAAATAAGAGCTATTTCAAATGTACCATTAATATTTTTATCATCAAGAGATTCTGATATGGATTTAATAA
TGGGTATAAATAATGGAGCAGATGATTATATTACCAAACCATTTTCTATAGACATATTGGTTACCAAAAT
AAATGGTATAATAAGAAGAGTCTATAATTATAGTGATTCTAATAGTATTTTGTATTGTGAAGATTTGATG
TTTGATGTGGGGAAAGGGATTATAAAACATAAGTATAAGGATAAAAGTATAGAGTTGACTAAAAACGAAA
TAAAAATTTTAACATTATTATTAAAAAATAAGAATAGGGTTGTATCAAGGGAAAGTCTTATGATGACTCT
ATGGGATAATGATGAGTTTGTGACAGACAATGCACTTACTGTAAATATGAATAGATTGAGAAGTAAAGTT
AAAGAACTAGGTTTTGATGATTTTATAAAAACTAAGAAGGGGATAGGATATATAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3421611-3419704 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
GTGAGTATACTTGGAATTGCTTATAATAATTTTAAGAGTAACATAAGAACTTATCTAGCATTTTTTATAT
CTATGGTTTTTTCAGTAGTTGTGCTGACTAATTTTGAATTATTAAGATATGGAGATGCTATAAATGTGTT
ACAAGAGGAAAATAAAAAATTTACACTATCAGTGTTAGTAGCTGTAATAATGATACTATCAGTATTTTTA
TTTTTCTTTATATGGTATGCAACAAATATATTTTTTAAGAATAGGTCTAAAGAAATTGGAATATTGTCCT
TTATGGGATTAGATTTATATACTATAGGAAAAATATATTTTGTAGAAAATATGCTTATAGGAATAAGTTC
TTGTATAACAGGAATAATTATAGGGATAATAACATCTAGATTTTTTCAAGTAGTGATAATAAAATTATCT
GGATTTAATATAAAGGTATCTAATGGACTTAGCATAGAAGCTATACTATATGCTACTTTAATCTTTATTT
CTATATTTATAATAATGGCTGTAAAAGGTTTTATAACAATATGTAGAAGTAGTGTAATAAATCTAATCAA
TATATCTAAAAAACAAGAAAAAATACCAAAGGTAGGAATAGGTATATATATATTAGCTATAGTATCACTT
ATAGTAATAGGATATGGATACTATCTTTCTACGAATATAAGAACTGGAGATATAACTAGTGTACTACCTG
TTATAGGTATAATAATAGTAGGTACTTATGGCTTATTCAAATCAGTTATGCCTGTTATATTTGATATTAT
AATCAAAAATAAAAAAATATTATTTAATGGAAATAATATAATTGCGATAAACAATATAAACTACCGATTA
AATAAAAACTATAAAACTTATGCTATAATAGCTATAATTATAACTACAACAATATCAACTCTTGGTGCTT
CAGTTGCTATGAAGCATATACATAAGAATGCCCAAGAACAAAGAAATGTGTACACTATTAGCATAGTTTC
AATGGATAAAGATGAAGTGAATAAAAAACAAATAGAGAACATAATAAAAGATACTAATAAGATAAAGTAC
TCCGTAAATCCAGAACTAACAATCTTAAAGAAAACAGATATAAAAGAAGCTTATGATACAACAGATACTA
TAATGAAATATAGTGATTTTTGTAATACTCTTAAAGTGAATGGCAATGATAAAGAATTAAAAGAGTATGG
TGAAAGATTAGTTAGTGGAAATAATGTAATAGAGCTAAAAAGTCCTCAAACGATAGCATCAATAGCTACA
AAAGAAGTCAAGACAAAACTTGATGGTCAGTTATATAATATTTCAAGGGGAGAAGTAAAAGTTCCAGTAT
TAGGGACAGGACTTAATCAAAGTATTATAGTGGTAAATGATGATACATATTTTAAACTAAGAGATAAGGG
TCAACAAGTATATTTTTATGGTGCAAAGGTATTTCAAGAAGAAAATAGCCAAGTAATGTTCAACAATATT
GAAAAGAATTTAAGTTTAAAAAATGGATATATTCAGAATGGATATAAAGCTCAAGGTGAGAGTCAATGGA
TGAAGTTTGCATATGTAGTGCTTGTGTTTTTATTCTTAGTCTTTGCAATTGTAGCTGGAAGTATAATATA
TATGAAAATATATAGTGATGCATATGAAGATAAAGAGAAATACAAGATTTTATTAAAAATAGGTACTACA
GAAAAAGATATAAATAGAGCTATACTTAAAGAAGTAGCTATATTTTATACTTTGCCAATGTTAAGTGCAA
CTATATCTAGTTATTTTGCATTGAGATTAGCAGGAGATTTATTGATGAACGATTTATCTGGTATATATAT
ACTAAGTTTAGTGATATGTTTGATAATATTCGTAATATATGGAGCAGTATCTGTTAATAAGTTTAAGAGT
GTAGTGTATAAAAATTAG
>ref|NC_013316.1|:c3422364-3421612 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAAATATTAAAAATAAAAAATATATCAAAAGATTATGGAATAAAAGGATTTAAAACAAATGTGT
TAAAAAATATATCTCTTACAGTCAATGAAGGTGATTTTATAGCAATAATGGGTCCATCTGGTGCAGGAAA
GACAACATTGCTAAATTTAATGTCTACACTTGACAAACAAACTTCAGGAGAAATAATACTAGATGGAATT
AATATATCAAAAGTAAAAAATAATGAACTATCAAAATTAAGAAGAGAAAAAATAGGGTTTATATTTCAAG
ACTATAATCTATTAGACAATATGAAACTAATGGACAATATAGCACTTCCTCTAGCATTAGGAAAAAAGAA
AAGCAAGGAGATAGAAGCTAAGGTATTTTCTATAGCTAAAAAATTTGGATTAGAAAATCATTTAGATAAA
TATCCATATCAGTTATCAGGAGGACAAAAACAAAGAGGCGCAGCAGCTAGGTCATTAATTACAAATCCAG
CAGTCATATTTGCTGATGAACCAACAGGTGCTTTGGACTCTAAATCAGCATATGAACTTTTAGAATCATT
AGAAAAAATAAACAGAGAAAACAACGCTACTATTATAATGATTACACATGACCCTCTAACGGCAAGTTAT
TCAAATGAAGTATATATGATAAATGATGGAAATATAAAGTGTAAATTAAACAAAGGAAATAGTAGAAAAG
AATTTTATGGAAAAATTATGGATATGCTAGCCTCTATGGGAGGTGAGATGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3423836-3422682 putative proton/sugar symporter [Clostridium difficile R20291]
ATGATTAATAAAGCGATTAAATTTAAATTTATCATATTCTATTTTTTCTCATATATTATTTTTGCCTTTG
CTTCAACAAAATTCACACCTTTCTTATCAAAATTAGGTTACTCAGCGTTTGAAAGAGGAATTATATTATC
GAGCTATGCAATAACCAATATATTATTTCAATTATTATTTGGAGTATTAGCTGATAAGTATCAAACAATG
AAAAAAATTGTTTTAATTAGTTTATCAGTTTATGGAATTGCATCAGTTATTATGTTTTCTACTGAATCTG
CAACTTTTATAATATACTTATTACTTGTTGCTTTATCAGGAGGATTATTAAATACTTGCTGTAGTTTATA
TGATACATGGATAATAGGTTGTGGAGATAATATTAATAATTATTTGTCATTTATTAAGACTTTTGGGTCG
ATTGGATGGGCTATTGGAAGTATGGTAGCATCTTACTTGATTCTTAGATTCTCATATTTTGGATTATCTG
TAGCGATTGGTTTAATTGTAGTATTACTTATTATAAATATACTATTATTACCTGATATTGAAAAGATTAA
TAAGAAAATAAATGTAACTAATAAAGATATTATTGAATTATTAAAAGATAAAAAATATATCTTACTAGTA
TGTATTTTATTCTTATTATACTCAATGGTGGTAGCAAATAACTGTACTGTAATAGATAAAATGATAGCTT
TAAATGCTACAAATTCTCAGATATCTTTAAAGTGGTCTTTACAGTCATTATTAGAGATACCAACATATCT
GGCTGGTTCTTATTTATTAAAAAAATATAGCAGTTTAAACTTATTAAAATTAAGTGCTATTATGATAACA
GTTCAGTTTCTATTATTTGCTTTAACAAATGATTCAAATATCATTATTATACTGTGTGTTTTTCAAGTGT
TTTCTACTCCTTTAATTTTAATTACTTCAAAAAGATTAATATTTGAAGTTTCTCCTAAAAAACTTAGAAG
TAGTAGCCAATTAATAGCTTTAAGTATATTTATGGGAGGTTCATCTCTGATTATTCCAACTGTTGCTGGT
TTTTTGAGTATTAATATTGGGTATAATTATACATTAATGATATTAAGTCTTTTTGGATGCTTAGCTTATG
GCTTGATAGTCTTATTGAATTATCTTCAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3424306-3423839 PTS system, IIa component [Clostridium difficile R20291]
ATGTTCTTTAAAAGAAAAAAAGAAGCAAGTACAATTAATTCATACATTGATGGAAAAATAATTAATCTTG
GAGAAATTCCTGATAAAGTATTTTCAACTAAGGTAATGGGAGATGGATTTGCTATGATAGCAAAGGACAA
TATTCTTAAATCACCGACTAAAGGAGTAATAAGTTTTATTGCTCAAACTAACCATGCTATAGGAATTAAA
TTGCAAAATGATGTTCAAATTCTTATTCATATTGGATTGGATAGTGCAACAACAAAAAAAGAAAACTTTA
AATTAGAAGTTAAACAAGGTCAAGAAGTTAATATGGGGGAAAAGTTAGTAGAAATTGATAATAAGTTACT
TGAAAATACTTTATATATTCCTTTAGTTATTGTAGAGAATCCTAATACGGTAAAATATCATCTTTCAAAC
TTAAATCAGGAAGGAAATAGTGGTATTAAAGTTATCAATTTTGATTGA
>ref|NC_013316.1|:c3424808-3424320 hypothetical protein CDR20291_2893 [Clostridium difficile R20291]
ATGATAACAAATAAAATAAAAAATATAACAGCAGTATTAAAAGATGAAAATATATTTCTTTCAGTGGTTA
TGGTTTGTTTTCTAATATTACCTGTTTTATATATAGTGTATTTAGAATTGACATCATTATTTACAAACAT
TTCATTTTCACAACTTTTAAACAATGATGTTAATGCAAGTTTAAATTTAATCTCTAACTTTAGTGCAGTA
TACAGTGCATATGTTATTTACAATATAAAAAAGAATAAAGAGATAAAAGAAAACATGATTGCTTTCTATT
TAGTCTTATTAGGGCAGATATTCCAAATTTACACAATAACTATTGTTATCATGTTTACCTATATTTATAA
ATTTGTTGGAATTAAACAAATCATAAGCAGTATTAAAGAACTACAATGGGGAAAGAGCTATAAGGCTCTT
TTTTCCTCAATTGCAGTATGCTTAATATCGTTATTTGTAATGATAATTAGAATAAAGTTAATTATGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3426153-3424822 putative maltose-6'-phosphate glucosidase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAGAAAAAGACAGAGGATACTAATTGCTGGTGGGGGTAGTACTTATACTGCTGGAATTGTAACAA
TGTTAATTGAAAGTGTTGCTAAATTTCCTATTGAATCAATTAAATTATATGATAATAATGATGAGAGACA
AAGAAAAGTTGCTGAAGCATGTGCAATAATTGTTAGAGAGAAAAATCCAGAAATTAAATTTAGTTATACA
ACAAATCCAGAAGAAGCATTTACTGATATTGATTTTGTAATGGCACAAATTCGTGTTGGTTTATATGCTT
TACGTGAACAAGATGAAAAAATTCCATTAAAATATGGGGTTGTTGGTCAAGAAACTTGTGGGGCAGGTGG
AATTGCCTATGGATTAAGAACAATAGGTCCAATAATCGAAATGATTGATTATATGGAAAAATATTCTCCA
AATGCTTGGATGCTTAATTATTCAAATCCAGCAGCTATAGTTGCAGAAGCATGTCGTGTATTAAGACCAA
ATTCAAGAATTATTAATATTTGTGATATGCCAGTATGTTTAGAGGAAATATTTGCTAGAATTTTAGGTTT
AAATTCTCGTAAAGACTTTGATGTTAGATATTATGGATTGAATCATTTCGGGTGGTGGACAAGTATTAAG
GACAAAGAAGGAAATGATTTAATGCCTAAATTACAGGAATATTGTGCTAAAAAAGGATATGAGGAATTTA
CACCTCAAGGTCAACACAAAGAATCTAGTTGGTTAGAAACTATGAGAGCAGCAAAGGACTTATTAGAAAT
AGAACCGACTACATTACCTAATACTTATTTAAAATATTATTTAATGGCTGATGAAACTGTTGAACATGCT
AATCCAAATTATACAAGAGCAAATGAAATTATGGATAGAAGAGAAAAGGATACATTCGAAGAATGTGAAA
GAATTATAAAAAATGGCACAGCAAGGGATACATGGTTTGATGCAAGTGAACATTCTCAATTTATTGTTGA
ATTAGCTTGTGCATTAGCATTTAATACTCAGGAAAGATTTTTACTGATTGTTCCTAATAATGGAGCTATT
GAAAATTTTGCAGATGATGCAATGATTGAAATTCCTTGCCTTGTTGGAAAAGATATGGTTGAACCTATGT
CTATAGGTAAAATTCCAACTTTCCAAAAAGGTTTAATGGAACAACAAGTTGCTTCTGAAAAATTAGCTGT
AGAAGCATGGATAGAAAAAAGTTATCAAAAATTATGGCAGTCGTTTACTATGAGTAAAACTGTTCCAAGT
GCAAAAGTAGCAAAAGAAATCTTAGATGAAATGATTGTGGCTAATAAGGATTTCTGGCCAACTTTTAAAT
AA
>ref|NC_013316.1|:c3427753-3426167 PTS system, IIbc component [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGAGGGGAGTAATTTATATGATGAAGAAAATACAGCGTTTTGGAGGGGCAATGTTTACACCAACAC
TATTATTTGCTTTTGCCGGGATAATGGTTGGATTCTCAATTGTATTTCAAAATCAGTCAATTATGGGTTC
ACTTGCTACACCAGAAAATATTTGGTACCAATTTTGGGGTGTAATATCTAGTGGAGCTTGGATGGTATTT
AATCAATTACCATTATTATTTGCTATTTCTTTACCAATAGCACTTGCAAAAAAGCAACAAGCAAGAGCTT
GTATGGAGGCTTTAGCAACGTATTTGACTTTTAATTATTTTGTAGGTTCTATGTTAAGTTTTTGGGGAAA
AAGCTTTGGAGTTGATTTCGCAGCTGAAATAAGTGCTGGAAGTGGACTTGTAAGCATTGCTGGTATTAAA
ACATTAGATACTGGTATGGTTGGTGCTTTGTTAATATCAGGTATTGTCATTTATATTCATAATAGATTTT
ATGATAAAGAACTACCAGATTTTATTGGATTATTTAGAGGCTCATCACTTGTAGTTGCAATTTGTTTCTT
TGTTATGATACCAGTTGCATTATTAACTTGTTTTATTTGGCCTCATATTCAAAATGTTATTAGACATTTG
CAAACGTTTTTTATAAATAGTGGAAATATAGGAGTTTGGTGTTATGCATTCTTACAAAAGATTTTAATAC
CAACTGGATTACATCATTTTGTATATGCACCAATTTGTTATGATAGTGTTGTTGTTCCAGGTGGTACATC
AGTATATTGGGCTACTCATATTCAGGACTTTCAAACTTCAGCTAAGACTCTAAAGGAAATGTATCCAATC
GGATTTTCATTATCTGGATTATCGAAGGTGTTTGGTTCATTAGGTGTATTTGGTGCTTTCTATGTAACTG
CAAAGCCAGAAAAAAAGAAAAAAGTATTAGGTTTAATGATTCCTGCTACTCTTACTGCAGTATTAACTGG
AATTACTGAGCCGTTAGAATTTACATTTTTATTTGTAGCACCACTTTTATTCCTAGTACATGCATTTTTA
GATGCATGCTTGCAAACGATTTCGTTTGCCTTAGGAGTTGTTGGTGATTTTGGTGGAGGAATTATTAACT
GGGTTGTATTAAATTGGCTTCCTCTTGGAATGTATCACTGGAAGGTATATGTTGTTCAAGTTGTTGTAGG
GATTATATTTTCATTTATCTGGTTCTTTTTATTTACTTTCTTAATTAAGAAGTTTGATATGAAAACTCCT
GGTAGAGAGGAAGATAATGAAGAAACAAAACTATATACTAAAAATGAATACTTAGAAACTAAAGATGAAA
AAGGAAATAAATTGAGTAAAGCCTCTCAACAAGCATCTGAATACATAAAATTAGTTGGTGGAGCAGAAAA
TGTTGTAGATGTTACAAACTGTGCTACGAGGTTGAGATTAACCTTGAAGGATGACTCAATTATTTCTAAA
GAAGAAGATTTTAAGGTAGTAGGTGCACATGGTTTAGTGCATAATGGAAAAGCTATTCAGATTATTATTG
GGCTTTCAGTACCAAGTGTAAGAGAAGAATTTGAAAATTTATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3428686-3427901 phosphosugar-binding transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAGATTAGAAGAAATGATTTTTTTAAATTATAATAAATTGAATGATACAGATTTATTAATATGGAAAT
ATATAACTGCAAATAAAAAACATTGTAGTAAGATGTCAATAAATGAACTTGCTATGAAATGTAATGTGTC
TCGTGCAACTATTACAAGATTTGTTAAAAAATTAGATTTAAAAGGTTTCAGTGAGTTTAAAGTATTATTA
AGCTGGGAATCAGAAAAGGTTCATGTCATAGAAAATCAGTCATTTGATATTGCATGTAATTCAATAATTA
AGTATGTTGAAGATCAAAAAAATAAAGATTATGATGCATTGTGTAAACTTCTTTATGAATCAAGAACAAT
ATACGCTTATGGTTCAGGTGATATTCAAAATGTGGTTGCAAAACAGATAAAGAGAATGTTCTTATCATGT
CAAGAAATAATATATGATTTTGAGGGAAGAACATTTGATGATTCTTTTTACAATATTGTCAGTAAAAATG
ATGTTATGATTATTATATCCCTAAGTGGTGAGAATGAGAATACACTTAATATTGCTAGAAGATTAAAATT
AATAGGAACTAAAATAATTTCAATTACAGAGTTTAAAAATAATACATTGACTGATTTAAGTGATGAATCA
ATTTATATTTCAGCGACTAATATCTCATTTTTACAAATGCACCCTAGTTATAAATTGACAATGTTATATT
TTATATTGATTGAGTTATTATTTATTAAATATAGTATTTATAAAAGGCATAGAATGATTACAGAAGGGAT
TGATTGCAAATTGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3430052-3428853 hypothetical protein CDR20291_2897 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGAAAGTATTATTTTTAGTAATTATTTTAGCATTTATAATCTTATTAGGTAATTCTACTTATT
CTCAAAAGAATCAGTTGTCTGAAGAGGAAAAGGTGGATGACTTTAATTATGTGTATAATGTTGTAAAGAC
AGGATATCCATATCTAGGTGTAAATAAGAGACTTAATAATATTGATTGGTTAGCAAATAAGGATGAATAT
ACAAAACGAATAAAAAACACTGAAAATGATGAAGAATTTATAGAAGAACTGTCATCTATATTATCTGATT
TAAATAATAAACACACAGAAGTAATAGATAATAAGAAAAGATATGAACTTTTTAAGAAATCATACTCTAA
TAATGATTGGTATGATTTTCTTAATGATAAAAAAGTTGTGGATAGATATGACTCTATGAATCTTAAAATA
AAAATGCCAGATGATATTTTTGTAAAAAAAGAATTAATTTTAAAGGATGTTATTAAGGGTCAGATTGGAT
ATATGTATTTACCATCAATGTCATCAAAGAATGGCTCTATAAATAATGATTTAAAAATAATTGGAGATTA
TATTAACACTTTAGAAAAACATAAAGCTTTAATTATTGATATAAGAGGTAATTTAGGTGGAAGTGATAGG
TATTGGCAGGGAATCGTATCTAAACTCATAAAAAATGATGTCAAAATAAATGGTTATAGAATTTATAGAA
ATAATAATGAAATAGTAAAAAAATATACAAATGCAAGAAATATAAAATTAAATCCTGTAGAAAATTTACC
AGCAAGTGTAAAGGAAAATGCACCTAAAGAAATTATAAAAGATTTTAATGATTTTGAAGATACTTCCTAT
ACTATAAAATCTACAGATGATTCAAAATTTAAGGGTAATATATACTTACTTGTTGATAGAAAAATATATT
CATCATCAGAGTCATTTGCAATGTTTTGTAAAGAAACTAAATTTGCGACTTTAGTTGGTGAAACTACTGG
CGGAGATGGAGGGTGTATAGACCCTGTATTGTTTAATTTAAAAAATAGTGGTCTAATAGTTAGAATGGCA
AGTTGTATGTATTTAAATAAGAATGGAATATGTGATGAGGAATTTAAAACTATTCCAGAATTTAAAGTAA
AAGATTGTAAAAGGACTGCTGATTTTAAAGATGATAATTGCATAAGAAAAGCACTAGAACTTGAAAATAT
TAATTATTAG
>ref|NC_013316.1|:c3431938-3430574 xylose isomerase [Clostridium difficile R20291]
ATGTGTAAAATATTAGGAGGACATGAAATGAGTGAAATATTTAAAGGAATAGGACAGATAAAATTTGAAG
GAGTAAAATCTGACAATGAATTAGCATTTAGATACTACAATCCTGAACAAGTGGTAGGTAATAAGACTAT
GAAAGAACACTTAAGATTTGCAATGAGCTATTGGCATACTTTATGTGGAGAGGGTAATGACCCATTTGGA
GTAGGCACAGTAGAGAGACCTTGGAATAATGTAACAGACCCAATTGAGATAGCAAAGATTAAAGTTGATG
CAGGATTTGAATTTATGTCTAAGATGGGAATTGAGTATTTCTGTTTTCATGACAGAGATATAGCTCCAGA
AGGAAGAGATTTAGAAGAGACAAATAAGATATTAGATGAAATAGTTGAGTATATAAAAGTTAATATGGAA
AAGACAGGTATAAAGTTATTATGGGGAACTGCCAATATGTTTGGAAATCCAAGATTTGTTCATGGTGCAT
CTACAACATGTAATGCAGATGTATATGCATATGCAGCAGCTCAGGTTAAAAAAGCTATGGAAATAACTAA
GTACTTAGGAGGAGAAAATTTTGTATTCTGGGGTGGAAGAGAAGGTTATGAAACTTTACTTAACACTAAT
ACAGAACTTGAAATGGATAACTTTGCAAGATTCTTACAAATGGCTGTAGATTATGCTAAGGAAATAGGAT
TCACTGGCCAATTCTTAATAGAGCCTAAGCCAAAAGAGCCTACTAAACATCAATACGATTTTGATACTGC
TACTGTTTTAGGATTTTTAAGAAAGTATAATCTGGATAAATACTTCAAAATGAATATAGAAGCAAACCAT
GCAACACTTGCAGGACATACTTTCCAACATGAATTAAATATAGCAAGAATAAACAATGTTTTAGGTAGTA
TAGATGCAAATCAAGGAGACCTATTATTAGGTTGGGATACAGACCAATTTCCAACAAATATATATGATGC
AACACTTGCTATGTATGAAGTGTTAAAGCAAGGTGGAATAGCACCAGGAGGATTTAACTTTGACTCTAAA
GTAAGAAGAGCATCTTTTGAGGTAGAAGACTTATTCCTAGCTTATATTGCAGGAATGGATACATTTGCAA
AGGGATTATTAATAGCTCATAAATTATTAGAAGATGAGGTATTTGAAAACTTTACTAAAGAAAGATATGC
AAGTTTTAGTGAAGGTATAGGTAAGGATATAGTAGAAGGTAAGGTTGGATTTAAAGAGTTAGAATCTTAT
GCACTGCAAATGCCAGTTATAAAGAATAAGTCTGGAAGACAAGAAATGCTAGAAGCTATACTTAACAGAT
ATATATATGAAGTAGATACAATTTCTAATAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3433557-3432007 xylulose kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGTTGGAGTATGTATTAGGTGTGGATATTGGTACATCAGGTACTAAAACAGTTTTATTTGATAAAC
TAGGAAATATTATAAAAAGTTGTACATATGAATATCCTCTTATACAAGAGAAATCAGGTTGGGCAGAGCA
GGATGCAAATGATTGGTGGAAAGCTGTAGTCGAATCTATAAGAGAAGTAGTTCAAAGTTCAAATATAAGC
AGTGAATGTATAAAAGGAATTGGATTATCAGGGCAGATGCATGGTCTAGTTATGCTGGACAATGAAGGTA
AAACATTGAGAAACTCTATAATATGGTGTGACCAACGAACAGTAAAAGAGTGTGAGGAGATAACTGATTT
AGTAGGTGAAGAAAGACTGATTGAAATAACTGCTAATCCAGCGCTTACAGGATTTACAGCATCAAAGATA
TTATGGGTTAGAAACAATGAACCAGATATATATATAAATACTAATAAAATACTTCTTCCAAAAGATTATA
TAAGATACAAATTGACAGGTGAATATGCTACAGAGGTATCAGATGCAAGTGGTATGCAGTTGCTCGATAT
AAGAAAAAGAGATTGGAGCGATGAAGTACTAGAAAAGTTAAATATAGATAAAAATCTTTTAGGTAAAGTT
TATGAATCACAAGAGATTACAGGTTATGTGACTAGAGATGTAGCAAGTTTGACAGGGCTTAAAGAAGGAA
CAATAGTGGTAGGAGGAGCTGGAGACCAAGCAGCAGGAGCTATAGGAAATGGAATAGTTAAAGATGGAGT
AGTTTCATCTACTATAGGTACATCAGGTGTAGTATTTGCTTATACGAAAGAGCCAAAAATTGATAAAGAA
GGTAGAGTTCATACTTTCTGTCATGCAATACCAAATACATGGCATGTTATGGGAGTTACTCAAGGAGCTG
GATTGTCATTAAAATGGTTTAAAGATAATTTCTGTCAAAGTGAAGTGGAAGTTTCAAATTCTTTAGGTGA
AGATGTATATGAGATTATAAATAATCAAGTAAGTCAAGTACCAACAGGATGTAATGGATTGCTTTACTTA
CCATATATGATGGGAGAAAGAACTCCTCATCTTGACCCTTATGCAAGAGGTGTGTTCTTTGGATTATCTC
CAATCCATTCTAAAAAAGAAATCGCAAGGTCAATAATGGAAGGTGTTTCATATAGTCTTAAAGACTGTAT
GGATATAATAGAGAATCTTAATATAGACGTTAATGAAGTAAGAGCCTCAGGTGGAGGTGGAAAAAGTAAA
GTATGGAGACAGATGCAAGCAGATATGTTTAATCAAGATGTATATACTATAAATTCAAGTGAAGGACCAG
CACTTGGAGTTGCAATTCTTGCATTAGTAGGAGCTGGAATATATGAAAATATACAAAAAGCTTGTGATGC
TATAATAAAAACTTCAACTAAATTAGAACCAATAAGTGAAAATGTAGATACATACAAGATATATCATAGA
TTGTATAAAAGAATATACAAATCTTTGAAAGATGACTTTAAGTTATTAGATGAAGTAGTTAATACAAAAA
TAAATAATTAA
>ref|NC_013316.1|:3433699-3434925 xylose repressor [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAAATAACCTTTTATTTTTGTGTAAAAAGTATTACAATATTATTTTAAGGAGGAATATCAAATTGG
TTACTGATAAATACACTATTCGAGAAATGAATGAAAGATTGGTACTTGAACAAATTATAAAAAATGGTCC
TATTTCTAGGGCAAGTATAGCTTCTACTATAGGATTGAATAAAGCAACTATATCCGCTATTACCAAAAAA
CTTATTGATGAATCTCTAGTTCATGAAATAGGAATTGGAAATAGTACTCATAGTGGCGGAAGAAAACCCA
TATTATTAGTATTTAATAAATGTGCAGGGATTTCTTTAAGTATGGACATTGGATACGACTATATATTTTC
TTCTCTATCTTACTTAGATGGAACTATTATAAATTCTAAGAAATTAACAGATATACAAGTAAGTAAAGAC
AATGTTATACAATTGATAGATGAAATTATAAATAGTTATAACATATCCAAAATAGACACTCCTTATAAGG
TAATTGGTCTTACTTTGGCTATACATGGGATTACTTGTGAAAATAAAGTATTGTTTACTCCATATTATAA
TCTTAATGAGATTGACTTATATAGCATCCTTAGCAAAAAGTATGACTTTCCTATTCATATAGAAAATGAA
GCAAACTTAACAGCTTTAGCTGAGAATACTTTTTCAACTGTACATAACTCACTACTTAGTCTCAGTATTC
ACAGTGGATTTGGTTCAGGCATTATAATAAATAATAAATTATATAGCGGCAGAAATGGTATGAGTGGAGA
AATTGGTCACACTATCATCATGCCTAATGGTAAACTATGTCCTTGTGGAAATCGTGGCTGTTTAGAACAG
TATTGTTCAGAAAAAAAGGTATTTGAACAGCTTTCTTCTTTAGAAAATATTCCTAAAATAGATTCTGATA
TAGTAAAGCAACTATATTATGAAGATAACCAGAATGCCAAAAAAGTTATTCATGAGTTTTGTAGTTACTT
AACAATAGCTATAAATAATGCTATTACAACTTATGCTCCTGAAATAATATATTTAAATAGCCAAATAATT
AGTGATATCCCTGAGATATTACAGATTACAAAAGATATGTTAGTTAGCTCTTTTAACAAAGGAATAAATA
TAGAAATTTCATCATTAGGGTCTGAGGCATCTCTATATGGTGGCTCTGCCGTAAATATCAAGAGCTTTTT
GAATATACAAAATTTAACTTTAATTAATGAAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3435467-3435081 PTS system, IIa component [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTCATGGCAATATGGCTGAAGAAGTCTTAAATTCTGCAAAAATGATAATAGGGGATTCTATAGATT
ATCCTACTGTAAATATGAAACAAGATGATGGAATAGAAGGAACAATAGAAAAATTAAAAAAAGCTTTAGA
AGTGTACAAGGAAAGTTCAGAAATAATTATAATGGCAGATTTACTAGGTGGAACTCCATGCAATGCTGCT
TTATTAGTAGCCAATGATGACAGTCGAATTAAAATTATTTCAGGGCTAAATTTAGGTATGGTTATTGAAT
CAGCTTTTTTAGATACAAAGGAATTGGCAGCAAAATTAGAGAAAATAGGTAAAGATAATATTTCTATGGT
TGAACAAAATGCAAGTTTATTATCTGATGATGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3436000-3435506 PTS system, IIb component [Clostridium difficile R20291]
ATGATATTAGATATGGAAATGAAAGGTATTAAAAATATTCGTATAGATGACCGTTTAATCCATGGTCAAG
TTGCAACTATGTGGAGTAATAAATTGGGTGTTACAAGATTAATGGTAGTAAATGATGCAGTAGCTAACAA
TTCTGTTCAAAAACAAGTTTTAAGAATGGCTACACCTGCAGGTATAGCGTCATCTATAATTACAGAAGAG
ACTGCTATAAAAAATATTACTGCAGGAAAGTATGAAGGACAAAATGTATTATTAATTGTTAAGTCTCCTG
TGGACCTTATTCCATTTGTAGAGGCAGGATTTAAAATACATAATATAAATGTAGGAAATATGTCAAGTAG
AAAAGATACAACAGTTCTAAGACCTAATATCAGTGTTACTGAAGAAGAGAAAGAAGCATTTAAAAGACTT
TTAGATGAAGGAATTGAAATTACAACTATAATGACGCCTGATGATAAGAAAACTTATCTTGTAGACATCT
TATAG
>ref|NC_013316.1|:c3436817-3436008 PTS system, IId component [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTGATAAGGTATCATTAAATAAATCAAATGAAAAGGTGAAAAAAAGTGTCTTATGGCGCTGGTTTT
TTACTAGTTCTGTTTCTTCAAATTATGAGAAGATGCAGGCCTTGGCATACTGTTATGCAGTACTACCTTT
TTTAAAAGTAGTATACAAAGATAATCCAGAAAAGTTACAAAGTGCTGTATTAAATCATTTACAATTTTTT
AACACTAATCCTTGGGTTGCCCCTTATATTTTGGGTATTAATGTAGCAATGGAGGAGTTATCAAGTGAAG
AGACTGAAGAGGCTGTTGCTTCAATTAAAACAGGCTTGATGGGACCAGTAGCAGGTTTAGGAGATAGTTT
ATTTGTCGTTATTCCGTGGACAATTTTTGGAGCTATAGCAGCTAATATGGCGATAGATGGAAGTCCATTT
GGAATCTTACTGTGGATTGTAGTGAGTGTAGCATTGAAATTATTAAGTATACCACTATTTAATGCTGGCT
ATACATCAGGTACTAAGCTAATATCTTCAATTGAAAAAAGTTTAAAGATTTTAACTGAGAGTACATCTAT
TTTAGGTTTAATGGTTGTAGGTGCATTAATACCTTCAGTTGTAAAAGCTAATGTTGCTTTGAACTTTCAA
CAAGGTGATTTTACAATGAAAGGTCAAGAAATATTAGACCAAATTATGCCTGGGTTAGTTCCTGCAATTT
TAGTTGTGATTGTTTATTGGGCTCTTAAAAAGAATATAAAACCTATATACTTAATTTTAGGAGTAATGGT
TGTTTCAATAATTTTATATGCATTAGGTATTTTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3437589-3436810 PTS system, IIc component [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGCCACAATTATGGCAATTATTATTAATCGTACTATATGGATTTTTTATAAACTATGAAAAAAATT
CAACAATGTTTGGAACATATCAACCAGTAACAGCAGGTTTTATTACTGGTCTTATCTTAGGAGATATAAA
TACAGGGTTATATATTGGAGGTACATTACAGCTATTATCATTAGGTATTAGTAACTTTGGTGGAGCATCA
ATACCTGATTATCAAACAGCAAGTATAGTAGCCACATTTATAACTATTACGACTAAGCAAGAAGCATCTG
TAGGAATCTCTATAGGTATTCCAGTTGCTTTATTGATGGTACAATTAGATGTTCTTAGAAATACTATTGG
TATATGGCTAGTTCATAAAGCAGAAGATGGAGCTAAAAAAGGAAATTATAAAAATATAACCTATATGCAA
ATGTTAGGAGTACTATTAACAGCAGCTACAACAGGTATTCCAGTTGCTCTATCTGTAATATTTGGACCTT
CTTTAATTAATACCATTTTGAAATATACACCTGAATGGTTAACAGGTGGTTTAACAGTAGCTGGAGGACT
ACTTCCAGCAGTAGGGATAGGATTATTACTTAGATATCTTCCTGCTAAGGAGTATTTTAGTTACTTAGTA
ATTGGTTTTGTTTTAGCAGTATATATGAAAGTACCATTATTAGGTGTAGCTTTAATTGGTGGAGCAATTG
CACTTATAATTTACAAAAAGAATTTGGAAAATCAAGAACAACAATATACTGTAGTAGGAGGTATGGACGA
AGATGAGTGA
>ref|NC_013316.1|:c3439667-3437589 glycosyl hydrolase [Clostridium difficile R20291]
GTGATAAAAATATCTGAAGACTATATTGAAAAAAGATTTGACAATGAACTATTGCGAATAGAAGCATGGG
GAAAAAACTCTTTACGTATTAGGTCGTTTGTAGACCAAAATTTTGTTGATGAAAACTATGCTCTTAACGA
AAAACCTAAGTTAAATAAAGATGATATTACAATTAATAAAAATGAAGATGGAAGTGCAATCATTAAAAAT
GGAAAGATAAAAGCTGTCTTAGACCATAGAGATAGAATTACTTTTTATAATGATAAAAATGAAATATTAT
TGAAAGAATATATTCGATTAAGAGCTGTAAAACATGATGATGGTGGAGAAGATGTAGGGACAATTGAGAT
TACCAAAGACTTTAACTCTACTCTAAAGTTAAAATCAAGAGAATATCGACCAAGCTATAGTGGAGAATTT
GAAGTAACTACTAGATTTGAATCTGAGCCTTCTGAAAAGATTTTTGGAATGGGACAATATCAACATAAAT
TTTTAGATTTAAAGAATACTGTTTTGGAGTTAGCCCAAAGAAATTCTCAAATATCAGTTCCTTTTTATAT
TTCTAGTCTAGGTTATGGACTTTTATGGAATAATCCGGGAATTGGAAAAGTATCTTTTGCTAAAAATATG
ACAGAATGGAAGATGTTTTCTACAAATTTTATAGATTATTGGATTACTTGTGGAGAAAGCCCAAAAGAGT
TAAATAAAAATTATTCTCAAGTTACTGGAACTGTTCCTATGATGCCTGAAAACCTTTTAGGACTATGGCA
AAGTAAACTAAGATATAGAACTTCAGAAGAAGTTTTAGATGTTGTGAAGGAATATTCTAAAAGAGGAATT
AAGCTTTCATCAATTGCAATTGACTATTTTCATTGGCCTAAGCAAGGTGAATATAAATTTGACTTAGATT
ATTGGAAAAATCCTAAAGAATTAGTTAAAAAATTGAAAGAAGAGTATTCAGTAGAACCAATAGTATCTGT
ATGGCCTACAGTTCAAAGTGATGCAGAAAACTACAATGATTATTTAGAAAATGGCTATTTAGTCAATGTT
AATCGTGGTGTTAGAATGACAATGCAAATTCAAGGAAATACAGTCTTTGTAGATATGACAAATGAAAATG
CAAGAGAATATGTTTGGGATAGAATAGATAAAAATTATAAACAACTTGGGATTGACTATTATTGGTTAGA
TGTAGCTGAACCTGGCTATTCTGTGTATGATTTTGATAACTATAGATATAAAAAAGGAAATGTTTTAAGT
TGTGGTAATATTTATCCTATTGATTATTTAAAAATGATTTATGATGGTTTACATAATGACATAGAGTCTG
TTGTAACTCTTGTAAGAGGAGCTTGGGCAGGAGCTCAAAAGTATGGAGCTTTAGTATGGTCTGGTGACAT
TGATTCTAGTTTTGAGGCTTTTAATAATCAAGTAAATACAGGGTTAAATATGGGACTGGCAGGTATACCA
TGGTGGACTACTGATATTGGAGGTTTCCATGGAGGAAATCCTAAAGACCCAGAATTTAGAGAACTTATGG
TAAGATGGTTCCAATATGCTACTTTTTCACCAATTTTGAGAATGCATGGAGATAGATTGCCTCATAGTAA
ACCATTATCAAATAAAGGTGGAGGCTCAATGGTAACTGGAGCTCCTAATGAAATATGGTCTTATGGTGAA
GAAGTTGAAGTAATTCTTACAAAATTCATAAAAATTAGAGAGAGCTTAAAAACTTATTTAAAAAAACTGA
TGAAAGAAGCGCATGAAGATGGAACACCAGTTATGAGAACTTTATTTTATGAATTTCCTGAAGATGATAA
AACTTGGGAGGTGGATAATACATATATGCTTGGAGATGAAATTTTGGTAGCTCCAATAATGAATTATAAA
GATAGAAGTAGAAAAGTATATTTACCAAAAGGACATACATGGGAAAATATATTTAGTGGAGTTAGTTATG
AAGGTGGGAAAACTTATGAAGTTGAATGCCCGCTGGAAGAAATTCCTATTTTCCTAAAGCAAGATTCCAG
TTATAATTTTAAAGAACTAAAAAATATTTTGGGAGAGGTGAAATCATAA
>ref|NC_013316.1|:c3440979-3440458 hypothetical protein CDR20291_2906 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAGAAATAGAGAGATTGTAGTAGTATGTCATTGTATATTAAATTGTAATTCTAAAGTAGAGGGAT
TGTCAGAATTTAAGGGAGCACAAAATATAGCGATAAATTTAATAAATAAAGGGTATGGAATAATTCAACT
ACCATGCCCAGAAATGATTATGTATGGAATAAATAGGTGGGGACATGTAAAAGAACAGTTTGACAATTTG
TTTTTTAGAGAACAATGTAGGCAAATGTTAATACCTCATGTAAGGCAGTTTAATGAATATTTAAAAAATG
ATTATGATATAAAAAGTATCATTGCAATAGATGGTAGTCCAAGTTGTGGTTATAATAAGACATGTAGTTC
TAAACGTTGGTTTGGTGAGCTAAGTGGTTGCAATGAATTGATGGATAAAATAAATGATATACAAATGGTG
GATGGGAAAGGTATTTTTATAGAAGAGCTAGAAAAGCTACTTAAAGAATATAATTTAGAGATACCTATAG
TTGGATTTGACGAGCTTAGAGAAGATAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:3441145-3441711 hypothetical protein CDR20291_2907 [Clostridium difficile R20291]
TTGGATACTAAAAAAGTCACATTTTCTTCAATATGCATAGTTATTAATATTGTCTTAGGTATGGTTATAT
CTATGATAAATATACCATTATTATTTTTAGATACAGTTGGTACTGTACTTGGGGCTGTCGTATTAGGTCC
TTTTTGGGGTGCTCTTATTGGTGGGTGTACAAACTTAGTTTTAGGTGTTATATCAGGTCCTACAAATATA
CCTTTTGCTCTTGTAAATATTGTTCTTGGTCTTATTGTTGGATATATTTCTAAGAAAAAAGGTTTTGGTT
ATAAAGAAGCTATTATTACAGGAGTAATTTTATCTATTGTTTGTCCTTTAATTGGTACTCCTATTTCAGT
TTTATTGTTTGGTGGTTTAAGTGGAAGTGGTGCTGATTTATTGGTTGGTTTTTTAGTTCAGTCTGGTCAG
AAGATATTTACTGCTGCGTTCTTTCCAAGGATTCTTAGTAATATAGTAGACAAACCTTTGTCTTGTATTA
TGGTGGTATATTTTATAAGTAAAATGCCTAAAGGTTTTATAAAACAATATAGTAAAAATACTTCTAGTTC
ATATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3443991-3441928 hypothetical protein; hypothetical protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGCAGGAGAAATTGAATTTCTTAGTTATTTAGAGGGGTCAAACAAAAGTTTTGTAGTGCCTGTAT
ATCAAAGAAATTATAACTGGAAGAAAGAACAATGTAAAAGATTGTTTGATGATTTAGAGGATATAATAGA
TTCTGGATTTAGAACTCATTTCTTAGGGTCAGTTGTATCTATATATAGTATGGGAAAAGAATATTTAATA
ATAGATGGACAACAAAGAGTGACTACTGTGTCAATATTATTGATTGCCATGTGTCAAATAATAAAAGAGT
TTGGAGAATCAAAAGGAATTATTACAACAGAAGAACAGATTAAGGAGTGTTATCTTATAAACAAGCACTC
AAGAGATAAAGATGGAAAAATAAAGTTAAAACCAATAGCAGAAGATAGAAAAGCTTACTATGAACTATTT
GAAGAAGAAATGAATACAGATAGAAATTCTAATATAGTTTCAAATTATTTATATTTTTATAATAGAATAA
AAGAAGATAATATATCAATAGATGATTTGTTTGATGCTATACAGAAATTAACTATAGTAGAAATAGAGTT
AAAAAATGGTGAAGATGACCCTCAATTAATCTTTGAAAGTCTAAATTCAACTGGCTTAGATTTAAGTGAA
GCTGATAGAGTAAGAAACTTTGTGTTAATGGGTAGAAGCTCTAAGTTACAAGAGGAATTTTATAATAATT
ATTGGTATAAAATTGAAAAAAATACAAGTAGCAACGTAAGTAGCTTTATAAGAGACTATTTGACTATAAA
GGAGAGAAGTATACCGAATAAAAATAAAGTATATTTTAGTTTTAAAAGGTATGTATCAGATAATGGTATA
GATATAGAAATTTTATTAAAAGATTTACTTAAATTTTCTAACTATTATAGAGAGATATCTTATTCATGTA
CTGATGATAATGATGTAAACAAAGTTTTGAAAAGGATAAACAAACTTGAAATATTTGTATCATATCCGTT
TATATTAGAATTATTTAATGATTATAATGAAGGTATAATAAATAAAAAAGTACTTGTAGAATCCCTTAAT
TTAGTAGAATGTTTTATATTAAGAAGAATAGTATGTGATGTACCTCCGAATGCACTGAATAAAGTATTTA
TGAACTTAGGAAGGGAAATTAAAAAATTTAGTGATTATAAAGAAAACTATTCTAATATATTAAGATATAT
TTTTATAAATAAGAAATCATCTCAAAGATTTCCTACTGACAGTGAATTTTCAAATGCTTTTGAAACTAAA
GATATATATAATACTAAGTCAAAGAATAAGTTATATATACTTGAGAGGTTAGAGAATTATAATAATAAAG
AAATTGTTGATTTAGAAAATTTAATCAATAATAATATGCTAAATATAGAGCATATAATGCCACAGACATT
AACAAATAAATGGAAGGAATCACTAGGAGATAACTATAAGGAGATACATGATAAATATTTACATACAATT
GGAAATTTAACTTTGACAGGATATAATTCAAAACTAAGTAATAAAACATTTGAAGAAAAGAAAGAAATGG
AAGATGGATTTAAAGATAGTAGGCTTTATCTAAATAAATATATTTCATCTATAGATAAATGGAATGAAGA
AGAAATAAAAAATAGAACTAAGATATTACTAGATAGAGCTGTAGAAATTTGGAAATATCCAAGTGTTACA
TATGAACCTCCAAGTAACAGTGAAAATATATTTACGTTAGAGGATGATGATGTTAATTTTACAAATGAAA
GTATAGTATCATTTAGTATATTAGGAGAGTCATATAAGGCTAAAAATTGGACAGAATTTTATGAACAAGT
TGCTCTTACTTTATATGATTTGGATTCTGTAAGGTTTAACAGTATTGTAGACAAGACTTATAAAAGAGAT
TTTATAGATAATATTAAGTCTAGAGATGTATATAAATTAAGAAAAGGTATTAAAATATCAGAAAATATAT
ATTTAGAAACAAATTTAAATACAGAGGCTAAATTAAATATAATTAGATTTTTACTTAATGAGTTTGATAT
AGAGTTAAATGAAGTAATATTTTCCATAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3447707-3444372 type i restriction enzyme r subunit [Clostridium difficile R20291]
TTGGGTAATTTTGACTTTTTACAAAAGAAGAAAAATTTCAATAGTTTTAATACTGCTTGCTTAGAAGCAG
AAAAAAGTATACTAGTTAGCCCATCTACTTGTGCAACTATAACAAGAAGAGCTTTAGAGCTTGCAGTAAA
ATGGCTATATGCTAATGATAGTGATTTAGTATTGCCTTATCAAGATAATCTTAGTACGTTGATTCATAAT
AATAGTTTTATAGAACTTATAGACTATGATATGTTACCTTTATTAAAATATATAGTTAAATTAGGTAATT
TATCTGTACATACTAGTGCGAACATAGAGAGAGGAGAAGCAATACTTTCACTTAACAATTTGCATCAATT
TGTTAGTTGGATAGACTATTGTTATTCAGATGAATATACAGCAGAAGACTTTAATGAAGATTTATTACTT
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AAAAGCTTGAAGAAGTAATAAAAGAAAATGAGAAATTAAGAAAGTCACTAACTGAAAAGAGAAAAGTTAA
TACTGTAAACTACGATTTCAAGATAGACGAAGTAAACGAATTTGAGACAAGAAAAAGATATATAAATATA
GAATTAAAGCTTGCAGGTTGGGAATTTGGAAAAGATATAGGGGAGGAAATAGAAGTACAAGGTATGCCTA
ATGAAAGTGGTGTAGGATATGTAGATTATGTTCTTTATGGTGAAAATGGTAAGCCATTAGCAGTAGTTGA
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AAGAGATATAGTCAAAGACCAGTAATATTTTTGACGAATGGTTTTGATATGTATATTTGGGATGACTATT
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GAAGTCTTTAAGTTCTGTAACAATAAATGATGAAATATCCAATAGATATTATCAAAAAGAAGCTATTAGG
GCTGTATGTGAGGCTCTTGAAAATAAGCAACGCAAAACTCTTTTGGTATGTGCTACTGGTACAGGAAAAA
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AATTTATTGGATAGCAAAGACAGCCCAGAAGATGCTAGGATGATATTTTCTACATATCCAACAATGATGA
ATGCAATTGATGATACGAAGTCTAAGGATGGAAAGAGATTGTTTACACCTGGTCATTTTGATTTAATTAT
AATAGATGAATCGCATAGAAGTATTTATAAAAAGTATAAGTCAATCTTTGATTATTTTGATTCTTACTTA
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TGAGTTTAAGACTAAGATTATGGAAGATGGAATTAAGTATGATGAGCTTTCTGATGAAGAGAAGGAAGAA
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TATTTAATTCTGACACAATAGATTTAGTTTTAAATAAGCTAATGACAGAGGGGTTGAAAATAGAAGGAGA
AGAAAAGATTGGTAAGACTATAATTTTTGCAAAGAATACAAAGCATGCTAGGGCAATAGTTGAAAGATTT
AATAAACTGTATCCAAAGTATGGTGGGAACTTTGTAAAAGCAGTTGACTATAGTATAAATTATGTAGATT
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ATAGAAGGTAAGTATGCAGAACTTAGAAAAGAATTGTTAGAAGAACTTATAACTTCTGTAAAAGCTTTAA
ATGAGGATAGTTATATAGTTAGGATGAATTTAAGTTATGTACATAAGTATAAAAATGAAAATGTTTGGAG
CAATATTGGAGCAGTAGCACAAAATGAGATAAGAGAATATATATCACCACTCATAACTTCATATAGTGAT
GATGAATTGGCTAAAAGATTTGATGTAGTTATGTATAATATACAACTTGCATACTTACAAAATAATAATG
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GTAGAAGAAGTACGTATATCATTAAGAGAGCTTATTAAGTATCTTGAAAAGTCTAGTCAAAAGATATATT
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GAATTATAAAAAGAAGGTAGAGTATTATTTAAATAGCCATAAAGATGAATTAGCAATATTTAAATTAAGA
AATAATAAAAAGATAACAAAGCAAGATGTTGAAACGTTGGAGGAAATACTCTTAAAGCAGTTAGGTAATT
GTGATGATTATAAAAAGGAGTTTGGAGATACTCCAGTAAGTCAATTAGTGAGAAAACTAGTGGGATTGGA
TAGAGAAGCTGCAAATGAAGCTTTTTCAGAGTTTTTAAATAATAAGAGTTTTAATACTAAGCAAATACAT
TTTGTTAAACTTATAGTCGATTATGTAGTCAAGAATGGATTTATAGAGGATAACAAAGTGTTGATGGAAG
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TAAAACTATAAATAAAATTAAAGAAAATGCATCAGAGATAGGCTAA
>ref|NC_013316.1|:c3448185-3447757 hypothetical protein CDR20291_2910 [Clostridium difficile R20291]
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ATGACCTGCAAAACTTCAAAATCTTATATGATAAGGAAGAAATGCCTGAGTTATGGGCTAGATACATAAA
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GATTTAAACATAAAATCTAAAAACTTTTATGACTACCTTTTAGCTTGTGAGTATCACAATTTATTACCTA
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AAGAAATAG
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AAGAAAACACTAGTTATTAATAAAACTAATAAAAATATAATAGTATCGACTGGCTTTTATGTTTTAAAAC
CATCAAAAGAAATATTGCCTCAATATTTATACCATTACTTAAATAGTAGTTATTTTCTAAATCAAAAAAA
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TATAATTTAAAAGTGCAAGAAAAGGTAGTGCGTGTTTTAGACAAGGCTCAAGAGTTAATAGATAAAAGAA
AAGAGCAAATAGAAGTATTGGATGAATTAGTTAAATCAAGATTTATTGAGATGTTTGGTACCCCATCAAA
GAACGAAAAAAACTGGGAAATTTCAGAAATAGGGAAATATTTAGATGTTTTAACTGATTATCATTCAAAT
GGTAGTTATGAAACCTTAAGAGATAATGTAACTCTTTTAGATACAAAAGGTTATGCCTTAATGGTAAGAA
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TGAAAAATCAAAGGTGTTTGGTGGTGAGGTTATAATAAATAAGATAGGTAGTGCAGGTAAAGTTTATTTA
ATGCCATTTTTAAATAAACCAGTATCTTTAGCTATGAATCAATTTATGCTTAGATTTAATGAAGATAAAG
TGAATCATATATTCTTATATAACCTTTTACTAACATCCTATATGGAAAGTAAAATAAAAGAGAAAGTAAG
AGGAGCTGTAACAAAAACGATAACTAAAGATGCTGTTAGAAAAATAAATATTATTGTACCTCCTATTAGA
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AAGAACTAGAAGATAACTTTAACTCATTAATGCAAAAAGCTTTTAAAGGAGAATTGTTCAACTGA
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ATCCATTAGAAGTTATAGAACAATTTACATATCTTTTATTTATTAAAGGATTGGATGAAGTAGAAACAAA
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AGATGGAGTAAGTTTTCTAATGAAGGAAACTCAGAAAAAATGTATGAAATAGTACAAAATGAAGTGTTTC
CTTTCATAAAAAAATTACATGGAAATAAAGAATCAGCTTATGCAAAGTACATGGGAGATGCAATATTTAA
AATTCCTACGCCTCTTATGTTATCTAAAATAGTTGATGGTATTAGTAATTTAGAATTAAGTAAGGATAGA
GATACAAAGGGAGATTTGTATGAGTATTTATTATCCAAAGTGGCTACAGCAGGTACTAATGGTCAATTTA
GGACTCCAAGACACATAATAGATATGATAGTAAGACTTATTAAACCAACACCAGAAGATATTATAGTAGA
CCCGGCAGCAGGTTCGGCAGGTTTTTTAGTATCATCACAACAGTACTTAAGGGATAATCATTCAAGTCTT
TTCTTAGTGCAAGGGCTGAAGGAGCATTTTAATAATGGTATGTTCTATGGATTTGATATGGATAGAACTA
TGCTTAGAATAGGTGCTATGAATATGATGTTGCATGGCGTTGACAATCCTAATATAGAGTATAAGGATTC
TTTATCGGAGGTTAATACAGATAAAGATAAGTTTACATTGGTGCTAGCAAATCCTCCTTTTAAGGGAAGT
TTAGATTATGAAGCAGTGTCAGCAGATTTATTAAAAGTGACTAAGACAAAGAAAACAGAGTTATTATTCT
TGGCACTTTTTTTAAGAGTTTTAAAAATTGGTGGAAGATGCGCATGTATAGTGCCAGATGGAGTATTGTT
TGGTTCAACAGGTGGACATAAATCGATAAGAAAAGAAATAGTTGATAATCATAAATTGGAAGCTATAATA
TCAATGCCAAGTGGTGTATTTAAGCCATATGCAGGGGTATCTACAGCTATAATGATATTTACTAAAACAG
GGACAGGTGGAACTGATAAGGTATGGTTCTATGATATGAAAGCTGATGGTTATTCTTTGGATGATAAGAG
AAATGAGATAAAGGATAGTGATATAGAGGATATTATTAAGAGATTTGATAATCTTGATGGGGAAGTAGAT
AGAAAAAGAACAGAGCAAAGCTTTTTTGTTGATGTGGAAGAGATAAGAGAGAATGGGTATGATTTATCTA
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>ref|NC_013316.1|:c3452959-3452090 tagatose-1,6-bisphosphate aldolase [Clostridium difficile R20291]
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GAGAAGGCAAGTGTTCCAGTGGCAATGCACTTAGACCATGGTTCAAGCTTTGGACTAGCTATGCAGGCAC
TTAGAGTTGGATATACTTCTATTATGATTGATGGTTCTCATGAAAGTTACGAAGATAATATTTCAATATC
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AGAGAACAGGGGTATCATCTTTGGCAGTAGCAATAGGTACGGCACATGGACTATATAAGGGAGAGCCAAA
GCTTGATTTAGATAGATTATCTGAAATTAGAGAGGTTGTATCAGTTCCATTAGTATTACATGGTGGGTCT
GGAATACCAGATGAGGTTATTAAGGAATCTATAAAAAGAGGTATTTGCAAAGTTAATTATGCAACTGAAT
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GGAAAAGCAATAGGGACAGTGAAGTGTTAA
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AGAAGAAGGAAATTTATCGTTTGGTCAAAAGTTGTATAAAGACTTAATGAATGGTGTATCTCACATGTTA
CCTTTAGTAGTAGCAGGTGGAGTACTTACTGCTATATCATTTTTATGGGGGATTTATTCATTTGACCCAA
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TCCTGTATTGGCAGCATTTATAGCTCAATCTATATCGGGAAGAGCTGGTATGTTGGCAGGACTTGTTGGA
GGAATGATATCATTTGATACAGGTTCGGGGTTTTTAGGTGGAATCATATCAGGATTTTTAGCAGGTTACT
TAGTTAAACTATTTGTACATTTGTTAAGAAAATTACCACGACAATTAGAAGGTCTTAAATCGATTTTTAT
AATTCCTATTGTCAGCGTAGGTCTTGTGGGTGTAGCAATGTTGTTACTTGGTGGACCATGTTCAGCACTT
AACAATGCTATGATGAACTTTCTATCGGGGTTACAAAATTCAAGTCCTATAATTTTGGGAATAGTAATAG
GATGTATGTCAGCATTTGATATGGGAGGTCCAGTAAATAAAGCAGCATATGTAACTGGAACTATGCTTCT
AGGACAGGGAAATTATTTATTTATGGCAGGTGTATCTGCAGCTTGTATAACACCACCATTGGTAATAGCA
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GGAGGGTTTTTGGTTCTAGGATTAGTCAATAAGCCACTTTTATGGGTAGGGTGTATATTTGTAGGTTCAT
TAGTAGGTGCTGTACTTTATATGATGGTTACACCTAAAGTAGTAAATGAGAAAAATACTATAGAAAATAC
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AATAACGAAGAAATCAAATCAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3455854-3454898 putative tagatose (1)-phosphate-kinase [Clostridium difficile R20291]
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TAATGGAAAGGGATTAAATGTAACTTTTGTACTAGGTCATTATGGTATAGAATCTAAGATATTAGGATTT
TTTGGAGGATTTTCAGGAAAATATATAGTTGAAGAAAGCGAAAAGAGAGGATTTGACGTATTACCTACTT
GGGTAGAAGATACAACTCGTATAAATATATTTTTAAATGATGGAAGTGATGAATTTAAATTTGTAAACTC
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TACTTATCAATAAGTGGAAGTCTACCTCCTGGTATTGATGATAATTACTATGAGGATATATTTAAAATTT
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>ref|NC_013316.1|:c3456672-3455920 phosphosugar-binding transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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ATATATTTTGGCAAGAGGGCTTACTGAATATGTAGCAAAAGAGTTTAGTCTTAAATTGCAATTACTTGAT
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TATATTGAGGGCAAATTTAAGTATCCATATAAAGTTTTAAAAACTATAGCAGATTTAATATTTTTAATTT
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TTCAATTGTTAGTAAGATGATTTCTGTTAATAAAAAAAGGTATTACTCAAGTATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3459131-3457674 6-phospho-beta-glucosidase [Clostridium difficile R20291]
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TGAAGAGGGATTAAAGTTTTATGATAATCTTATAAATGAAGTAATAGATAATGGTATGGAACCTATTGTA
ACACTACTCCATTATGAGACTCCTTTGAATTTAGTATTAAAATATAAAGGATGGTCTAATAGAAAAGTAG
TGGATTTCTTTGTTAGATATGCAGAATTAATATTAAATAGATACAAAGATAAAGTTAAATATTGGATAGT
TATAAACCAAATAAATTTAATGTATCATGAATCATTTAATTCAGTTGCATTTTGTGTAGACCAGGTAGAT
GATGTAGAAGAGGCCAAATATCAAGCTATTCATCATCAATTCATGGCTACAGCTTTAACTAAGAAGCTTG
GAAAAGAAATAAATTCAGATATGATGATAGGGATGATGATGGCAGATTGTACATCTTATCCAGAAGATTG
CGACCCTGAAAATGTAGTATTTGCTTTAAAAAGAAATAGAATACAATATTTTTTTACTGATGTAAGTTTT
AGAGGGGAGTATCCAGCTTATATTAAGAGATTCTTCAAAGAAAATAACATAAATATAGTTATGGAAGAAG
GTGATGATAAAGTGTTAAAAGAGAATACTATGGATTTTCTAGCTCTATCATACTATTACTCTACAACAGT
ATCAGCAAGTAAAAATACCATGAATCCAATTGATAATGTAAAAAATCAATACTTAAAAGCAAATCCTTGG
GGGTGGGCAATTGACCCTAAAGGATTATACAATACTTTATCTCAATATTATGATAGATATCAAAAGCCAA
TAATGATAGCTGAAAATGGATTTGGAATGCATGATAAATTTGAAGATGGAAAAGTTCATGATAGTTATAG
AATAGATTATTTAGGAAAACATATAGAACAAATAGGTGAAGCTATAGCTGATGGAACCGAAATATTAGCT
TATTGTATGTGGTCGCCAATAGATATAGTAAGTTGTTCATCTCAAGAAATGGAAAAAAGATATGGATTTA
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TAAAAATGTAATAAGAACTAATGGAGAAGAATTAAAAGAAAAAGTAGATAGTTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3459506-3459153 PTS system, IIa component [Clostridium difficile R20291]
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GCGAGTTAAATATAACTATGTCTTTAGTAGGAATAGTAAAGTCTATAGAATATAAGGTAAATAATAGTAA
ATGA
>ref|NC_013316.1|:c3460782-3459535 PTS system, IIc component [Clostridium difficile R20291]
ATGGGGAGATTGTTTATGAATAAATTTATAGATTTGTTAAGTGAAAAGTTTACTCCTGTTGTAAATAAGA
TAACTAAGAATATATGGGTACAATCAGTTCAATCAACTATAATGAAAGTTTTGCCTATGGTATTTGTAGG
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AATTTGAAAGTATGAGTGTAGTAGCTGGTCTTGCAGGTGCTGGATTAATGTTAATGATGATTCGTCCAGA
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GCAGGATTATTCTCCGGATTAATAATGTCTTTATTTGGGTCTTTCTCATTTTTTGGTGAAGATTCAGCAC
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ACTAATTTATGGACTTAACTTTGATATGTTTGAAATAATAGTTAGGATATTTAAACCAGTATCAGATATA
GCACAAACATTGCCTGGATTTGTACTATTAAACTTCTTAGTAGTATTTTTATATTCTTTAGGTATAAGTG
GATGGGTATTATCCCCAATAACTTATGCAATTCAGCTTAGTGCAATTGCAGCTAATGCAGCAGCTGTAGC
ATCAGGAGGGCTTGCAACTAATATATATACTTATGAAGTTGTTCAAACAGGTTGGATAACTTTAGGTGGG
TGGGGAGCAACATTACCACTAGTGCTAATGATGTGTTTATCTAGAGCTGGAAGAATAAAAGCAATCGGAA
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ATGGGATTTGTGACAATTCCGAGTAAGGTGTTTAATTTATGGTATCTTCCTTTTGGTATATCTACTTTTA
TGGTAAATCAAGATGTTAGAGGGCTTATTGTTTTAGCAATAAATATAGTATTGCTATTCATGATATGGTA
TCCATTTTTTAAAGCTTATGAAAAAGAAGAACTAAAATTAGAGAGTCAAGAAGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3461107-3460790 PTS system, IIb component [Clostridium difficile R20291]
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>ref|NC_013316.1|:3461274-3463268 transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
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AATTCTACTGGTGAATTTATATTATCCTCTAAAAAAGGATATAAAGTAAATCTCAATAATAACTGTCAAA
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TAATAGTAATGGAATTAATATATTTGATTTAAGTGAAGAATTGTTTGTTAGTCCAGCTACTATTGAAGGG
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TGATAACTATAGACAGAATAAAAAAGAATAACTACATAGAATCTGTCGAAGTAGTAAACTACATAGATAA
TAATAATGATATAAGCATTTCAAGAGATATATCAAATTTTTTAGAGTCTGAATACAATTTAACTTTAACT
AGTGCAGAATTATACTACTTAGTATTTCAGTTAACAAACAAAACCACAGTCTTAAATTATCATGAAATGG
ATACTAAGTCATTGCCAAATTATATAGATGAACATTTTGTTAAATTAACTAAAAAAATAATTAAAAATGT
ATATGACTTATACTTTATAGATTTATCTGATGATGAATTTGTTGTAAAATTTACTCTTCATGTAAAAAAT
TTAATCAGTAGGGCTAAAAATAATCAAGTTTTGAGAAATCAAATACCTCAGAAGTTAAAAGATTCCTACC
CTCTGATATATGATATATCTGTTTATATTTGTAATCAAATTCAAATTTTAGAAAACATAGAAATAGATGA
AGATGAAATATCGTATATATCTCTTCATGTAGGTTCATTTTTTGATAGACAAAAATTACTAGAAGATAAA
ATTCTCTGTGCATTAATTACTCCAAATTACTATGATTTACAATTCAAAATAGTAAGAGACCTCGAGAAGA
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GATGTTCTTATAAGAGAAAAAATGTCTTCAACTGCATTTAATAACAATGTAGCAATTCCTCATAGCATGA
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TGAATAGAATAGCTTATCTTATTCAAAATATCTAA
>ref|NC_013316.1|:c3464545-3463391 glycerate kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATATTAATTTCTATAGATTCTTTGAAAGGAAGTTTATCTTCAATAGAGGCAGGAAATGCAATAA
AAAAGGGGATATTGAAGGTTAAAGAAGATGCGCAAGTAAAGATATTGCCACTTGCTGATGGTGGTGAAGG
GACAGTAGATGCTTTAGTTCAAGGGATGAATGGTAAAAAAGAGACTATAGAAGTTACTGGACCAATAGCT
AAAAAAGTGGATGCAACATATGGATTATTAAAAAATACAAGTACAGCAATAATAGAAATAGCTCAAGCAT
CAGGATTAACATTGGTTCCGACTGAACTTAGAAATCCTTTATACACTACAACTTATGGTGTTGGGGAAAT
AATAAAGGAAGCAATAAATAAAGGCTATAGAAATTTTATAGTTGGAATAGGTGGAAGTGCTACTAATGAT
GCTGGGATAGGTATGCTTCAAGCCTTAGGGTTTGAGTTTTATGATGAAAATAACAAGTTAGTAGGATTAG
GTGGAAAAGTTTTAAATGAAATAAGACATATAAAAATAGAAAATAGATTAAAGGAATTAGATGAATGTAA
GTTTAAAATAGCCTGTGATGTAAATAATCCGCTGTTTGGGAAAAATGGAGCTGCATACATATATGGGTCT
CAAAAAGGTGCAACATCAGAAATAATTGAGGAGTTAGATAATGGGCTTAGAAATTTTTCCAAAGTAGTTA
AAAATTACTTAAGTAAAGATGTAGCTAATGTAGAAGGAGCAGGAGCAGCAGGAGGATTAGGTTTTGCTTT
TTTAGCATTTTTAAATTCAAAATTAGAATCTGGAATAAAAATAATATTAGAAGAAATTAAATTAGAGGAA
GAGTTAAAAGATGCAGATTTTGTCATAACTGGTGAAGGTAGATTGGATAATCAAACTGCTATGGGCAAGG
CTCCAATAGGAGTTGCAAAACTGGCAAAAAAATATGGGGTAAAAGTAATAGGTTTGGCTGGAGCCACAAC
AGAAGATGCAGTTAAATGTAATGAAGAGGGTATAGATGCTTATTTTTCTATAGTAAATAGAGCTATGACA
ATAGAAGAAGCAATGGATAAAGCAACTGCTAGTGAGAATATGACAGCTACAACAACACAAATATTCAATC
TTATAACTAGTATACAACAATCAAAAAATATGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3467442-3464827 putative glycosyl hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAAATGTACACATAGTTCCTCATATGCATTGGGATAGAGAATGGTACTTCTCAACTGAGGAAT
CTAGAATATTACTTGTAAATAATATGGAAGAAATAATGGATATGTTAGAAAATAATCATAACTATCCATA
TTATGTGATGGATGGTCAAACTGCTATATTAGAAGATTATTTAGCAGTTAAGCCTGAATGTAAGGAGAGA
ATAAAAAAATTAGTTCAAGAAGGAAGGCTAATAATAGGTCCTTGGTATACTCAAACTGATGAAATGGTAG
TTGGTGGAGAATCCATACTTAGAAATTTACTGTATGGAATAAAAGATTGTGATGAATTTGGAGAATATAT
GAAAATAGGATATTTACCAGATTCATTTGGTCAAAGTGCTCAAATGCCGCAAATACTAAATGGGTTTGAT
ATAAAATACTCAATGTTTTGGAGAGGATGTTCTGAAAGAAAAGGAACTAATAAAACAGAGTTTAATTGGA
AGAGTGATGATGGGTCTTCTGTTTTGGTTCAAATACTTCCATTAGGTTATGCAATAGGAAAATATCTACC
AATGAATGAAGATGAGCTAAGAACAAGAATGGATAAATATTTACCGGTTCTTGATAAGGGTGCAACTACT
GACCATATAATACTTCCAAATGGACATGACCAAATGCCAATTCAAAAGAATATATTTGAAGTTATATATA
AATTAAAAGAATGTTATCCAGAGAGAAAATTTTTCTTAAGTAGATATGAAAACATATTTAAAGAGCTAGA
AAAAAATAAGGATATAGATACAATAAAAGGGGAATTTTTAGATGGGAAATATATGAGGGTTCATAGAAGT
ATATTCTCAACAAGAATGGATATAAAATCAGCAAATGCTAGAATAGAATCAAAGATAACCAACATATTGG
AGCCACTAGCTTCTATTGCATATTCTCTAGGATTTGAATATCATCATGGATTAATAGAGTTAATTTGGAA
AGAAATAATGAAAAATCATGCTCATGACAGCATTGGATGTTGTTGTTCAGATAAAGTTCACCAGGAAATA
ATGAATAGATTTTTCTTAGCTGAGGAAAAAGTAGACCAATTAATAACATTTTACAAAAGAAGAATAGTTG
ATGCAATGAGTTGTGAAATGGCTTTAGATAAGTTAGTAGCATTTAACTTAATGCCTTACAATAGGAATGA
AATAGTGAACGCCCAAGTTATAACTAAAATGAAAGCATTTGAAATATTTGATAAAGATAATAATAAGTTG
GATTTTGAAGTGGTACATAAAGAAGTAATAGATGCAGGATTAATAGACCGTCAAATTGTTCATTATGGAA
ACTATGATTCATTTATGGTATATACAATAAACTTTAAAGATAAAATACCTGCAATGGGGTATAAGGCGTA
TATGATAAAAGAAGTTGAACATATGTTAGAAAAAGCTTATGAAGTATGTGACATGGTAGATAATGACTTT
TATACTATTCAAGTTAATGAAAACGGGACATTAAAGATATCTGATAAAAAATTAAATAAAACTTTTGAAA
ATGTATTATTGATGGAAAATGGAGGAGATGAAGGAGATGAGTATGATTTTTCACCACTTCCAAATGAGAA
ATTAATATTTAACGATAATATAGTAGCAAATTCCACTATAAAGAAAAATAGATTTAATAATGAGATAAAG
ATAAATTATAGATTAAAAGTACCAAAAGATATACAAGCTAGAAAAAATAATAGAGCAGATTCATTTATTG
ACTTTGATATAGTTATAAATGTTCCAAATGATAAAGCTATAATAAATGTAGTATTCAATATAAATAACCA
AGCAAGAGATTGTAGGGTTAGAACTTATATACCAACAAATATAGCTTCAAAGTTTTCTGTGTCTGATAAT
CAGTTTGGACATATAAAGAGAAGTGTGTATGATGATGCTATGGAAGTTTGGCAACAGGAAGAATGGAGTG
AAAGACCAGATTCTATATATCCAATGCTAACATTCGTTGGATTGTCTGACAAAGAGCATGGAGTAGCTGT
TCTTACAAACAGTACAAGAGAGTTTGAAATAGTAGGGAAAAAATTTGACACAATAGCTATAACATTATTT
AGAAGTGTAGGATTCCTAGGTAAAGAAGAAATGGCAAGACGCCCAGGTCGTCCATCAGGAATAAAGTTGC
CTACTCCAGATTCTCAAATGATAGGAGATATAAAAATAGACTTAGCAATAGTCACTCATGAAAAATCTAC
ACTAGAAGCAAATGTTGCAAATATGGCTAAAGAGTATTTAACAAAAATACAAACTTATAATAAAATACCA
TATAATGCTATGAAATTGAATCAATCAGAAATAGAAGTAGATTATTCATATAGTTTACTTAAGGAAACTA
ATAAGGACCTTGTGTTAAGTGTTGTAAAAAAGGCTGAAAAAGAAGAGGCATTAGTAGTTAGATTTTACAA
TTCTAAAGAAGAAACAAAATCAGCTAACGTAGTATTTAACAAAAATATTAAAACAGCTAAATGGACTAAC
CTAAATGAAAAAGAATTAGAATCTATATCAATAGATAATAACTCTGTAAATGTAGAGTGCCTAATGAACC
AAGTTAAAACTATATTGGTTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3469511-3467586 PTS system, EIIabc component [Clostridium difficile R20291]
TTGGAATTTAAGAAAATCACAAATGAAAACCTTGTTTTTTTAAAACAAAAAATAAAAACAAAGGAAGACG
CAATAAAGTTCTTAGCAAGAAAGCTATATGATGAAGGCAAGTTAACATCTTATGAGGAATATTTAGAAGC
TGTAATGTACAGAGAAACTTTATCTCCAACAGGTTTTGAAAGAGGGCTTGCAATTCCTCATGGAAAATCT
AAGTCAGTTAAAGAAGCTGCATTTGCAGCTATGACCTTAGAGACACCAATAGAAAATTGGGAAAGCGTAG
ACTCAAATAATAAAGTAGAGCTAATATTTTTAATAGCAGTACCAGAAAGTGAAGGTGGAAATACACACAT
ACAAATACTTTCTGAGTTAGTTACTAGACTGTCTAATGAAGATTATATGAATATGTTGTTAAATTCAAAA
ACTAAGAAAGAGTTATTTAATAACTTAGATATAAAAGAAAAGAAAGAACAAATAAAAGAAGAGATTAGGA
TTCAAAATGAATCAAAAAAAATTGTATTAGCAATAACAGCATGCCCTGCAGGTATAGCACATACATATAT
GTCAGCAGAAGCATTAATTAAAGCTGGCAAAGAAATAGGTGTGGATGTGTATGTAGAAAAGCAAGGAGCT
AATGGTATGGTGGACCCTCATACACCAGATATAATAAAAAAGGCAGATGCAATAATATATGCAACAGATG
TAGCACCTAAAAATACAGAAAGATTTGAACATTTGCCAAACATAAAAACGTCAGTAGCAGCTCCACTAAA
AAGGGCAAAAGAAATAATATACGAAGCTTTAGAAGTAGCACAAAAACAAGGTAAAGGTGATTATATAGAA
AAATCATCTGATATATCATATTGTGAAAAATCATCATGGAAAAAAGATGTAAAATCAGCAATACTTACAG
GAGTATCTCATATAATACCACTTATTGTGGCAGGAGGTATGATACTTGCATTTGCAGTATTAGCATCTCA
AGCATTTGGTTTACAAGAACTATACAATCAAGAAGGTTCTTGGTTATGGCAATTAAGAAAGCTTTCTGGA
GGGATGTTAGGTACATTGATGGTTCCAGTATTATCAGCATATATGTCTTACTCACTAGCTGAAAAACCAG
GTCTTGGACCAGGATTTGCAGCAGGTCTAGCAGCTGATTTAATAGGTAGTGGATTTCTTGGAGGTATGTT
AGGAGGTTTACTTGCTGGTTATATAGTAAAATTTTTAAAGAAGAATATACCAGCCAAAGGCACATTAGCT
GGATTCGTAAGTTTTTGGGTATATCCAGTAGTTGGTTCTTTGGTAGTAGGTTTATTGATGTTATTTGTAA
TAGGAAAGCCTGTAGCAGCACTTAACAATGGTCTTATAAATTGGTTAAATGGGATGACTGGAATAAATGC
AATACTACTAGGTGCAATAATAGGAGCTATGGTTTCATTTGACTTAGGTGGACCAATAAATAAAGCAGCC
TATACATTTGCAATAGGAGCAATAGCAAGTGGAAATTTTATACCTTATGCAATATTTGCATCAGTTAAGA
TGGTCTCAGCTTTTGGAGTTACAATAGCTACTGTTTTAGGCAGAGATTTATTTTCAGAATCAGAAAAGGA
AATAGGAAAGCAAACTTGGATATTAGGATTGGCTGGAATAACTGAAGGTGCAATACCATTTATGATAGAG
GACCCAATCCATGTTATACCATCATTAGTAGCTGGTTCAGCCATAACTGGGTCTATAGTAGCATTCTTCA
ATATAGGTCTTCAAGTGCCTGGAGCGGGGATATTCTCATTGGCGCTTTTAGAGGGAAGTATGTCAGGATT
TATTATAGCATCAATATGGTTCTTTGCGGCAGTACTTGGAGCTATAATATCAGCAATATTATTAATAATA
ACTAGGAAACAAAAAAATCAAAGAAAGATACATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3470396-3469641 phosphosugar-binding transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATAAAATAGATGGAGGAGAAACTATGGAATTTTATGAAAGAGCAAAAAAATATGAGTATAAAT
TTACAGATACAGAAGACATGATAATTGAGTATATGAGAAAAAACAAAGAAGAAATAGTAAAATTATCAAT
ACAATCTTTAGCAGATAAATTTTTTACTGTCCCAAATACCATAGTTAGGCTATGTAAAAAAATGGAGTAT
GATGGTTTCTCTCAACTAAAAAACAATTTAAAAGAAGAGTTAAAAAATGAGGATAAAGAGCCAAAAAATG
GTTTTGAATCAGATATAAAAAAGACATTAGAGCTAATAGATTATGAAAAAATAAATAAAGTAGCAGATAT
AATTCAAAAATCTAGGAGTATTATAGTTTATGGAATAGGTCAAAACATTCCTTTATGTGAGATATTAGTA
AAAGAAATTAGAGGTGGGCATGATAATATAACTTACTATAGCCAAAGACATGAAGTACTTCATGATATAG
GAAAATTAGGTGAACAAGATATGTTTTTCGCGCTTAGTTTAAGTGGAGAAACGAAAGAAGTTATAGAAGC
AGCAAAGACAGCAGTTAATAAGGGTTGTAAGGTAGTAGCTCTAACACATATATGTGAAAATCAATTGCAA
CAAATTGCAGATATAAGTTTATATTGCTATTCAACAATTAAACAAGTAAATGGGTACAATATATCAGATA
AGGTTCCAATTATGATGATTATGAGAGCAATAATAGAACAATACTGGTTAAGATAG
>ref|NC_013316.1|:c3471408-3470629 putative cellobiose-phosphate degrading protein [Clostridium difficile R20291]
ATGCATAAAATGAAGAAATTAGTAGTTAGGGCAGATGATATAGGATATTCAGAAGGTGTTACACTAGGGA
TAATATCTTCTTATAAGAACGGTATTGTTACAAGTGCTGGAATCATGGTGAATATGCCTTTTTCAAGACA
AGCTATAGAAATGGTAAAAAATGATGATGTATGTTTTGGTTTACATGTTAATTTAGTAATAGGAGAACCT
TGTTGTAAAGAACATATTAAGATAAAGAATTTGTTAGATGAAGGTGGAAAATTTGTTTCTAGCAAAATAA
GAAGAACGCAACTACTGACAGGTAAAGAGGTTTTTAATTATGAAGAAGTATATGAAGAAGTTTGTGCTCA
AATTGAAACTTACAAGTTGTATATGAGTAAATTGCCTGAGTATATTGATATACATGGTATAGAAGAAGAT
GTATCAATATCAGCAATGTGTGATGCTGCAAAAGAATACGGTATACCAAGTTGTCCCTATTATTTAGATT
CATGTATTAGCATGCCAAGTAAATATCCTCAGAATGATTTTTACAAGTTAAATAAATCTTTTGTTAAATT
ATTTGAAGAAAAATATATAAATTTAGATAAAGATATAACATTGATGGTTACTCATCCAGGATTTATAGAT
TATAGTCTTATAAAATCATCTTCTCTTATTCAAGAGAGAGTATATGAACATGCAATGCTATGTGATAAGG
AAGTTAAAATGTGGTTAAAAAGAAATAATATTGAATTGGTTGATTTTAAAGATATTTTCAAGTCTAATAA
TTATATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3472849-3471401 PTS system, IIabc component [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAGGTTCTTAAACAAAATGATGCAACAACTGTCACTTTTAGGAAAGACTATGCTGGTGCCAATAG
CTGTAATGCCAGCAGCAGGTATATTAGGATTATTATTTGGTCCAAATATGCTTAATGTGCCAGCTATATC
TAATATATCTAATATAGTATTTTCAAATGTGGACTACTTATTTTTATTAGGAGCAGTTAGTGCTTATTCA
AAGTCTAAAGACAAGACAAGTGTAATGGTTGCAGCCGTAGTTGCATATATGATATTTAAGTCAAATTTAG
AGTTATTGAATGATACATTAAATGCAGGTGTATTTGGTGGGATAATTGTTGGAGCTTGTATAGCATGGAC
TTACAATAAAACATATAAAGTTAAAGTTCCAGCATTTTTAAGCTTCTTTGCAGGAGAAAAATGTGTAATT
ACACTATCACCAGTGGTTGCTTTAATTTTATCATATATATTTAGTTTATTATGGATATATCCACAAGCTG
CAATGAATCAATTTGGTTTTTGGTTGGGAGGAGCTGGTGCAATAGGAATATTCTTGTTTTTATTCTGTAA
CCGTGCACTAATACCAACTGGGTTACATCAAGTTTTAAATGCTTACATATTATTTGAAATGGGTGAATAT
ACAACATCAACAGGAGAAGTTATAAGAGGAGAAATTCCTAGATTTATGGCAGGAGACCCAAATGCAGGAT
TCTTCTGGACAGGATTTTACATAATTATGATGTTTTCAATACCTGCTATTTCTTATGCTATATATAAAAC
AGCACAAGATAAAAAGAAGCAAGAAGTAAAAGGTGCAATGACCGCTGGAGCATTGACTTCTTTTATGGCA
ACAGTAACTGAACCAATAGAATTTTCGTTTTTATTTGCATCTCCAAAGTTATATATAATTCATTCTTTTT
ATTCTGGTCTAGGTGGAGTTGTACTATATTTACTGGGTGCTCGCTTGGGTTCATTTAATGGAGCAAGTAT
AATTGACTATGTCTTAAGTTTTAGTTATGGAGATAAAGCGTGGTTAGTTATACCTGTAGGAGTTGTATTC
TTTGTATTATATTATGTAACATTTAAATATATAATAATAAAAGATAATGTACAAACACCAGGACATGAAG
TTGAGATAGAGATAGGTGATAAAGTTAGTGAAAAAGAAAAGAATTTAAAACTTTCTCATGGTAATTTTTC
ATATATGGCTAAGCAGATAATTAAAAATTGTGGTGGTTATGAAAATATAGTGACTCTTAATAATTGTATG
ACGAGGTTACGTTTAGAAGTGAAGGATGCCACTATTTTGAATGATGATAATATTAAAAAAACAGGAGCCA
AAGGGGTAATTAAATTGAGTAATACATCAGTTCAAATCATCATAGGAACGGATGTTGTTAAAGTAAAGGA
TGAGATGGAAATGCAACTTGATGAGTTGAGAAAGCAGGCAGATGCATAA
>ref|NC_013316.1|:3473219-3473941 GntR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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GTAATATGATGCTGCCTACTGAACTTCAACTTATTGAAAGGTTTTCATGTAGCAGAAACACTGTACGTAG
AGCAATTTCTCAATTAAACACAGAAGGATATGTTCAAAGTATAAAAGGCAAGGGTGTTGTAGTGTTAGAA
AATAGTTGTTCTAATGATTTTTTTCTAAATATGCACAATTTCAAAGGTGTAGAATCGATTGTAGAAGATA
AAAAGGTTAATACTGCTACTAGTGTTCTCCACTTCAGCAAAATCTTAATTGATAATAAGTTATCTAAAAA
GACAGGTTTTAAAGTTGGTAGTGAAGTATATTACCTTCACAGACTAAGATATATTGATAACATACCTAAA
ATTCTCGACATTAACTATTTTCTATGTAGTATAGTTAAAGACCTTGATGTTTCTATAGCACAAGGCTCTA
TTTATAAATATATAGAAGAGTGTATAGGTACAAAAATTGTTTCATCCAGAAAGATATTTAAAATTGAAAA
AGCTACAGAGCTTGAGTTAAAAACGCTACCTCTAAATGATTATAATTGTGTTGGTGTTATTAAAAATAGT
GTATATACTGATGATGGAAAGCTCTTTGAATATACAGAATCAAAGCATACACCTGAAACATTTGTATTCA
TGGATGTTACTCAAAGATATTAA
>ref|NC_013316.1|:3474138-3475805 trehalose-6-phosphate hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATTGGTGGAAAAAAGCAACTGTCTATCAAATATATCCAAAAAGTTTCAAAGATAGCAACAATG
ATGGTATAGGTGATATAAATGGTATTATAGAAAAATTAGATTATCTGTATTCTTTAGGTGTTGATTTATT
ATGGTTGACTCCTATGTACGTTTCTCCTCAAAGAGATAATGGATATGATATAGAAGATTATTATAATATA
GACCCAAAATATGGGACAATGAGTGACTTTGAAAAACTCTTAAAAGAAGCTCATAAAAGAGACATAAAAA
TAATGATGGATATGGTCCTAAACCATACATCTACTGAACATAAATGGTTTAAAGAATCTAAAAAAAGCAA
AGACAATCCATATCGTGATTATTATTTCTGGAAAGATGCTAAACCTGATGGTTCTGTTCCTAATAACTGG
ATATCCAGATTTAGTGGAACTGCTTGGAAATATGATGAAACTACTAACCAATATTATTTACATTTATTTG
AAGAAACTCAAGCTGATTTAAATTTGGAAAATGAAAAGGTTCGTGAAGAATGTTACAAAGTACTAGAATT
TTGGGCTGATAAAGGTATTGATGGTTTTCGTTTAGATGTAGTCAACCTACTCTCCAAAACACCTGGATTA
CCTGATGACCCTATAACAGGGCCAAAAGGAGATGGAAGAACTCATTACGCTGATGGTCCTCGTATACACG
AATATTTACATAATATGAATCAAAAAGTTTTCAAACCTAAAAATATAGTTACTGTAGGTGAAATGTCATC
TACTACACCTGAAGAGTGTATCAACTATACTAGAGAAAATCGAGAAGAACTATCTATGGTTTTTAGCTTC
CATCATATGAAAACAGATTATAAAGGAGGCGCAAAATGGACTAATGAAATGTTCTCTCTGGATAAATTAA
AAAAAGCACAATCTGACTTTCAATATAAAATGTATGAAGGAAAGGGATGGAATGCTCTATTTTACTCTAA
TCACGACCAACCTAGAGCTTTATCTCGATTTGGAGATGATAGATTTTTTCGTCAAGAAAGTGCTAAGATG
TTAGCCATAACACTATTTGGTCTACAAGGTACTACATACATATATCAAGGTGAAGAAATAGGTATGACAA
ATGCCTACTTTACTAAAATAGATGAATATGATGATGCTGAAAGTAAGAATGCATACTATCATATGATTAA
ATCTGGTATTGATGAAAAGGAGGCATTGCTTATACTTCAACAAAAATCCAGAGATAATGCCCGTACTCCT
ATGCAATGGGATAATACTATTTATAAGGGGTTTTCTAATCATAAACCGTGGTTAAAAGTTAATAATGACA
ATATTAGTGTAGAAAATGAGCTTAATGATTCTCGTTCAGTATTTTATACTTATCAAAGATTAATCAAATA
TCGTAAACAATATGATATTTTTACAGAAGGTACTTATAGATTGTTAGATGAAAATCATAAAAATCTATTT
GTTTATGAAAGAGAGTATAAAAACCAAAATCTTCTTGTTATAAGTAATTTTACTCATGATAATGTAGTAT
ATAAATTACCTGAAACTTATTTGAATAAATTAAACTACACAATACTTGAAACCAATTACACTAGAGATAT
AATTGAAAATAAAATGGAAATAAAACCTTACGAAAGTATAATGATATATTATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3477220-3475901 putative amino acid permease [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAAGGCATTAAGTTAGGTTTTTGGAGTATTGTACTATTAGGAATCAATGCAATAATAGGGTCAG
GTATATTCGGGTTACCTGGTGATGCTTATACAGATATAGGTCCAGCAAGTATATTAGTATTAGTTTTTTG
TATGCTTTTAGCTGTTTCTATTGCTTTATGTTTTGCTGAAGCAGGTAGTTGGTTTGATACTGATGGAGGG
CCTTATCTTTATGCAAAAGAGGCATTTGGAGATTTTGTTGGATTTGAAGTTGGATTTATGAAGTGGATAG
TTAGTATGATTGCTTGGGCTACTATGGCAAATTTTTTTGCTGTAACACTATCATCTGTATGGCCACAAGC
AGCAGAACCACTTATTAAAAATATAATAATTGGTATATTAGTTGTAGGACTTGGGATTATAAATTTTATG
GGAATGAAACAATCTAAGCACTTAAATAATATCATGACTATAGGAAAATTATTACCAATAGTTTTATTTA
TAGCTGTAGGATTATTCTTTATAAAGGGTTCTAATTTTACCCCATTTGTAATAATACAAAAGGGTCAAAG
TGCGTCATCAGCTTTTGTAGCAGTATCTATAACTTTATTTTATGCTTTTACAGGATTTGAATCTTTAGCT
GTTGCAGCAAAAGATATGGAGAACCCTAAGAAAAATGTACCTAAAGCATTGGTAATGGTAATGTTTGTAG
TATCAGTAATATATATGCTTATACTGGGAATAAGTATAGGGGTGTTGGGTAATGGCTTGGCAGGGTCAGC
TACTCCTGTTGCAGATGCTGCCATTAAGATGCTAGGTCCTATAGGTGGGTATATAATTACAATAGGAACT
ATAGTATCTGTTGGAGGTATAAATATTGCATCATCCATATTTACACCAAGGTCTGCTGCTGCTTTGGTTG
AACAAGGATTAATGCCTAAGTCTATAAGAAAAACTAATAAAAATGGAGCTCCTTATATAGCAATTATAGT
ATCTGTCATAGGAACTTTACTAATAGCATGGTCGGGTTCATTCACAACATTATCTCAAATAAGTGTTGTA
TCTAGATTTATTCAATATATTCCTACATGTTTAGCTGTACTAATATTGAGAAAGAAGTATGCTGATAAAG
ATGTAAATTTTAGAATACCTGGAGGAGCAATTATACCAATATTTGCAGTTATTATAAGTATATTATTACT
GATAAAAGCAGGTATTGATGAACCTATGAAGATAGTTTGGGGATTAGGTGGGATGATAATTGTAGTTCCT
ATATATTTCTATATGACTAAAGTATATTCAAAGAAATATAATGATGTAGAAGTCAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3478007-3477261 putative glutamine amidotransferase [Clostridium difficile R20291]
GTGAAGAAATTGGTTAAAAAGAAATATCCAATAATAGGAATATCAGGTAATTTACTAATTGATGAAGGAG
GAATGTTTCCTGGCTATGAAAGGGCTTATGTAAATAATGATTATATACAATCAGTAGTTATGTGTAAAGC
TATACCATATATTGTACCGATTGTATATGATGATGAGATTATAAAGGAGCAGGTATCTAATATAGATGCG
CTTATACTATCTGGGGGACAAGATGTAAATCCACTCATATGGAAAGAAGAACCTCATAATAAGTTGGGGG
CAATATCACCAAAGAGAGATAGTTTTGATATGAAATTATTAAAACATGCTTTAGATATGAAAAAACCAGT
TTTAGGTATATGTAGAGGAGAACAAATTATAAATGTAACTGAAGGAGGTAGTTTGTATCAAGATTTATCT
TTAATTGAAGGTGCTTATATTAAACACAATCAGCAACATCTATCTAATGTACCTACACATACAGTACAGA
TAAAGGAGGGGACAAAATTATATGAAATATTAGGAGAAAAAGAAGTTTTAGTTAATAGTTTTCATCACTT
AGTTGTCAACAAAGTAGCACCAGGATATATTGTTTCAGCTACATCTAAAGACGGTTTAATTGAAGCTATA
GAAAAGGAAGGAAGTGAGTTTGTAATAGGGATACAATGGCATCCAGAAATGATGACTAGAGATTATGATA
ATATGAAAAAAATATTTATGGCAATAGTTAAAGAAGCATCTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3480260-3478251 putative sigma-54-dependent transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAACAATAGCAGTAGTAACTGATGGGTTGTCTAAATTAGAATGTTTCTTAAATAAAAATCTAGAAA
TGATATTTAAAGATAAAGTAATGATAAAAAATTATTATTTAAATAAAATAACAGAGAAGGAATTAATAAA
AGATGACATAATATTGGTAATGATAGATGATAGAGTATTAAAAATAAAAAAATATGTAGAAGATGTCTCA
AAGATAATAACTATAAATAGGAGCATAAAGCAAAAGGATATATATAAGTTATTTTCATTGCCAGAAGAAA
TAGATGTATTAGTAGTAAACGATAATAAGCATACTGTATTGGAAACAATATCTAATTTATACAATATAGG
AATAAACCATTTGAATTTTATACCATACAATCCCAATGAAGAATATAGAAATATTAAGATAGCTATAACG
CCAGGAGAGTCAAGTTTAGTTCCAAAATATATAGAAGAAGTTATTGATTTAGGCCATAGGTATATTGATA
GTTCAACGTTTATTCAAATAATAGCAAAACTCAAACTGGATGATAAAGAAATTACTGAGAGGCTAATTAA
GTATACAGATGAAATAATTAGTTTATATTCAGGAATAAATACTAAATACAAAGAACTTACTATAAAAGCA
GATGAATTAAATTCTATAATAAATTTATCAAACTTAGGTATGGCAATGGTATCAGATAAGGGAAACATAA
TTATTTGCAATAATAGTTTAAGGGATATACTAGATATTCAAAGTAATATTATAGGGAAAAATATAGATGA
ATTAGAGAATGAGAATATTAAAAAGATTTTTAGTTTGAGTAAGGCACATGATGAAGTTATAAAATTTAAT
AATAAGTACTTAAACGTAAATAAGTATAATATAGAGAGTTTTGGAAGGGTTACTGGGTATTATTTTTGTA
TTCAAGAAATAACTTATATAAGAAAATTGGAGCAAAACCTATCAAAGAAGCTTAGAGAAAAGGGACAAGT
TGCTAGATATACTTTTGATGATATAAAAACAGTTTCAACGAAGATGGAAAGAACTAAGAAATTAGGTATG
AAAATAGCTGAATCTGATTATACAATTCTTATAACGGGAGAAAGTGGAACAGGAAAAGAACTTATGGCTC
AGTCTATTCATAATGCATCACCAAGACATAGTCAGTCATTTATAGCGATAAACTGTGCAGCTATGCCAGA
AAATTTACTTGAAAGTGAACTTTTTGGATATGAAGAAGGTGCTTTTACAGGAGCTTTAAAAGGAGGTAAA
AAAGGATTATTTGAACAGGCTAACAATGGAACTATATTTTTGGATGAAATAGGAGACATGCCTATATACT
TACAAAGCAAATTACTTAGAGTATTACAAGAGAATCAAGTAATGAGGGTTGGAGGAGAAAATGTAATAGA
TATAGATGTTAGAGTAATTGCGGCTACAAATAAAAATTTATTAGAAATGATAAAAGGAGATAGATTTAGA
GCAGATTTATACTATAGGATAAATGTATTGCCCATAAATATACCACCTTTAAGAGAGCGAAAAGAAGATA
TAGAAGTTATGTTAAAGCATTTTATGAAAAGGAAGAGAGCAATTAGTCAAGGTGTTCAAGACATTATTAA
TGCATATGAATGGCCAGGTAATATAAGAGAATTAAAAAATACTGCTATGTATATTAACATTATGAGTTCT
GAGGATGTTATTTTAATAAATGATTTACCTCATAACTTATTAAATATAACTGAAGATTTTAGTAAAGAAA
TAAGCATATTAAAGGATAGAACATCTATAGAGAAAGTAAAGTTAGTAATGGAGTGTTTAAAAAATGCCAA
TAATCTTAATAAAAATATAGGTAGAAATGGTATTGTTAATTCAATAAATGAATTAGGCTACAGTATAACA
GAAGGTGAGGTAAGGGGAATACTTAATATGTTAAAAGAGCTGGATTTGATAATATGTGAATCTGGTAGAA
AGGGAAGTGAATTAAATAGAAGGGGAAAAAATATATTAAACAGTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3482131-3480698 6-phospho-beta-glucosidase [Clostridium difficile R20291]
ATGGTACTTAGAAAAGATTTTTTATGGGGTGGAGCAACAGCAGCAAATCAATGTGAAGGAGCATGGAATT
TAGATGGGAAAGGTCCTTCTTGTTCAGATATGTGTACTGGGGGTTCTCAAAAAGTAAGTAAAAGAATAAC
GAGAGTTATAGAAAAAGGAACATTCTATCCAAGTCATGAAGCAATAGATTTTTATCACAGATACAAAGAA
GATATAGCTTTATTTGCAGAAATGGGATTTAAGGTATTTAGATTTTCAATAGCATGGACTAGAATATTTC
CAACTGGAATGGAGAAAGAACCAAATGAAGCAGGACTTAAATTTTATGAAAATGTGATAGATGAATGTTT
AAAATATAATATAGAACCATTAATAACAATATCTCACTATGAAATACCATTTGCAATAACAGAGAAATAC
AATGGATGGGTTTCAAGAGAGGTAATAGACTTGTATATGAATTACTGTGAAACAATATTTAAAAGATATA
AAGGAAAAGTAAAATATTGGCTGACATTTAATGAAATAAATTCAGCTACAATGCCTATGGGAGGCTACTT
ATCACAAGGAATATTAAATGAAGGGACTACAGATTTTATAAACCAAGTAGATATACCTCAACTTCGTTTT
CAAGGGTTACATCATCAATTTGTAGCAAGTGCTAAGGCTGTTAAATTAGCTCATGAAATAGATTCAAATT
ATCAAGTTGGATGTATGCAAATATTTGCAACAATGTATCCTTATACTTGTAATCCAGATGATGCAGTTAA
AACTCAAAGAGATAGTAGAGTAATGAATTATTTCTGTGGAGATGTACAAGTGCGTGGCGAATATCCAACT
TATATGAATAGATATTTTGGAGAAAATAATATTGAAATAAAAATGGAAAAAGGAGATTTAGAAATTTTAA
AAGAAGGTTGTGTAGATTTTTATACATTTAGTTATTATATGTCTACATGTGTAAGTAGTGATTCTAAAGA
AGATAATACAAGTGGCAACATATTAGGTGGAGTGAAAAATCCATATCTTAAGTCTAGTGAATGGGGATGG
CAAATAGACCCTGAAGGGCTTAGATATGCACTAAATGAAATTTATGATAGATATAGAATACCTATGATGG
TAGTTGAAAATGGTTTAGGAGCTTATGATAAAAAAGAATCTAATGGAGTGATAAATGATGACTATCGTAT
AGAGTATTTAAAAGCACATATAGAGCAAATGAAGGAAGCTGTAGAAGATGGTGTTGATTTATTTGGATAT
ACTCCATGGGGATGTATAGATTTAGTAAGTGCATCTACTGGTGAGATGACCAAGAGATATGGGTTTATAT
ACGTGGATAAGTATGATGATGGAAGTGGAGACTTGTCTAGGATTAAGAAAAAGAGTTTTGACTGGTATAA
ACAAGTAATAGAATCTAATGGTGAAAGGTTATAG
>ref|NC_013316.1|:c3484134-3482218 PTS system, IIabc component [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAGATATGAACAACTATCAAAAGAAATCATTGAGAATGTAGGAGGGAAGGATAATATTAGCAGTT
TATCTCACTGTATAACGAGGCTACGTTTTAAATTAAAAGATGAATCAATAGCAAATGATGATGTGCTAAA
AAAAATGGATGGTATAGTTACTGTAATGAAAAGTGCAGGTCAATACCAAGTAGTTATTGGTAATCATGTT
CCAGATGTTTATGAAGTTGTGTGCGATTTGGCTGGATTAGGAGGAGATACAATAGATAATTCAGATTCAG
ATGCGCCAAAAGGATTACTTAATAAGTTTATAGACATAATATCAGGAGTTTTTCAACCAATATTAGGAGT
TCTGTGTGCTGCTGGTATGATAAAAGGATTTAATGCAGTATTTACAGCATTGGGTTTGTATGGAGAAACT
GATGGTGCATATATTATGTTAAATGCAATCGGAGATGCAATGTTCCAGTATATGCCAATAATTCTTGGAT
ATACAGCTGCTAAGAAATTCAAATTAAAACCATTTATTGGAATGCTTATAGGTGCAGTTTTATGCTATTC
AGGTATTCAATTAGATACTCTAGCATCTATAGGTCAACCTTTATACAATCTATTTACTGGAACAATATTT
GAATCACCAGTATATATAACTTTCTTAGGATTACCAGTAATAGCAATGAACTACACTTCAACAGTAGTAC
CAGTAATTATAATAGTATTATTAGCAGCTAAGTTGGAGAAAGTGTTTGCTAAAATAATACCAGATGTAGT
AAAGAATTTCTTTGTACCAATGGCAGTTTTATTAGTTTCTTTACCATTGGGATTTATGGTTATAGGGCCT
ATAGCTACCTATGCTTCTAATATAGTTGGAAATGGATTTTTAGCTTTATTTAACTTTTCACCAATTTTAT
GTGGTGTATTAACTGGTTTATTGTGGCAAGTGCTTGTAATATTTGGTCTACATTGGGGATTAGTACCAAT
AGCTATGTCAAACCTTATGACTATGGGGTTTGACACAATATTAGTGGGAGCATTTGTACCATCTTTTGCA
CAAACATCAGTAGTAGCAGCAATGTACTTTAAATTAAAAGATAAGAAGATAAAAGAGCTGTGTATACCTG
CAGTTATTTCAGGGATATGTGGTGTAATAGAGCCTGCAATATATGGAATAACTTTACCAAGAAAAACACC
ATTCATATATAGTTGTGTAGGTGGTGCTGTGGCAGGAGCTGTAATGGGGATAATGAATGTAAAAAGTTAT
GTAATGGGTGGACTTGGAATATTTGGTATACCTAATTATATAAATCCAACAACTGGAGATATGAAAGGTG
TTTATGCAACTATAATAGCAATAATAGTAGCTATTGTAGTAGGATTTGTTTTAACATTATTTTTTTGGAA
AGATGATTCTATAGTAGAAATTTCTAAAGATAATAATGGGCAAGGCGTTGTAGAAAAAAACAAAAGAGAA
GTAGTATATAGCCCAATAAAAGGTGAAGTAAAGGCTTTGGAGCAGATACAAGATGCAGCGTTTTCAACAG
GTATATTGGGAAAAGGTGTAGCAATAACACCTAAAGAAGGAAAAGTAGTGGCACCATTTGATGGGACTAT
AATGACTTTATTTCCAACAAAACATGCAATAGGAATTATATCTGATAATGGTTGTGAACTATTGATACAT
ATAGGGTTAAATACTATTCAGTTGGAAGGTAAACATTTCAAATCTTTTGTTAATCAAGGGGATAAGATTA
AAAAAGGTCAGACATTAATAACTTTTGATATAGAAAGCATATCAAAAGAAGGATATTGCTTAGAAACACC
AGTAGTTGTTACTAATTATTCTGATTATGTGGATATTATAGAAAATACACAAAAGCATGTAAATAATAGT
CAGGAATTGATAACTGTTTTAGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3485068-3484208 transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
ATGATTATTGAAAAAATACTCAATAATAATGTAATTATTACAACTGATGAAAATCATAAGGAAATAGTAG
TTATGGGGAGAGGTTTAGCTTATAAAAAACGTACAGGAGAGCATATATCAAAGGATAAAATTGATAAGAT
ATTCAAACTTTCAGACCCAAATATATCTGATAAATTTAAAGAACTAATAGCAGATATTCCTATAAGATAT
ATGGAATTATCAGATGAAATAATTTTATATGCTAAAGAAAAACTAGGGAAAAGATTAAATGATAGTATTT
ATATTTCTTTAACAGACCATATGTATACTGCAATAGAAAGAGCTCGTGAAGGAGTAAGTGTAAAAAATGT
ATTACTTTGGGATATAAAAAGATTTTATAAGAGTGAATTTAAAATAGGGTTAGAAGCATTGGATTATATA
GAAAAAAAATTTGAAATTAGACTATCAGAAGATGAAGCTGGATTTATAGCACTGCATATAGTTAATGCAC
AAATGGATCAAAGTATAAAAACTATATATGAGATTACACAAATAATACAAGAAATTTCAAATATGGTTAA
ATACCATTACAGAATAGTATTTGATGAAGATTCAGTTTATTATCATAGATTTATTACTCACTTAAAGTAT
TTTGCAGAACGAATTGTTAGTAATAATTTACATGAAAATAATGAAGATGATTTACTAAATGTAATAAAAG
TTAAATATAAAAATGCTTATAAATGCATAGAAAAGTTGGATGAATTTATACATAAAAAATACAACTACGA
TTTAACAGATGAGGAAAAATTATACTTAACTATTCACGTTGAAAGAGTGGTAAGTAAAAGTATTAAGTCA
GATATAAATCCTAATAATTAG
>ref|NC_013316.1|:c3486606-3485419 putative amidohydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGAGAGTATAAAGAAGAGAGCTTATGAGATAGAGAATGAACTTGGAAAAGAAATTGAAGAAGTTT
GTAATTTTATATTTAACAATCCAGAATTAGGGGAAGAAGAATACATATCATCAAAATACTTAGTAGAGAA
AATGAAGGAATATGGATTTGATACAGTTTATCCATATTGTAATATGGAGACTGCTTTTAGAGCTGAATTA
GGAGATAATGATGGACCTACCATAGCATTTTTAGCTGAGTATGATGCACTTCCTGGATATGGAGACAATA
AAGAACCAGCTCATGCTTGTGGGCATAACTGGATTGCAGCATCTACACTAGGAGCTTGTATAGTATTAAG
TAAGTTAAAAGAAAATTTTAAAGGAAAAATTGTACTAATAGGAACACCAGCTGAAGAAACAACAGGAGGA
AAATGTGATTTAGTTAAGGCAGGAGCTTTTGATGATGTTGATGTAAGTTATCAAATGCATATAGAAGCTT
TTAATAATATAAACTGTAAGGCTTTGGCAATAGATTCATTAGAGTTTAGTTTTGAAGGGGTATCAGCACA
TGCAGCTAGTCACCCTCATATGGGAGTTAATGCACTAGATGCAGTACAACTTACTTTTGCTGGGATAAAT
GCACTAAGACAACATGTAAAATCAGATGTTAGAATACATGGAATAGTTTCAAATGGAGGAGAGGCTCCAA
ATATAGTTCCAGAAAAAGCAGCTTGTAAGTTTTTTGTAAGAGCTGCTGAAAGAAGTTATTTAGATGAAGT
GACTAAAAAAGTTATAAACTGTGCAAAAGGTGCAGAGTTAATGACAGGAGCTAAGCTTTCTTATAGATAC
TTTGAAAATTCTTTTGACAACATAATAAATAACAAAGTACTTCAAAAGATAACAAAGAATAATTTGATTG
AGTCAGGTATAACAGATATATTAGAAGGTAAAGATGGTCCAGTAGGTTCTACAGATATAGGTAATGTAAG
TCAAGTTTGCCCTACTATGTATACAGAAATAGCCTTAGATATAAGTCCAATGGTATATGTTCATGAAAAA
GAATTTCTAAATTATGCAAATTCTGAGGAAGCTTATGATAAACTTCACAAAGCAGTAAAGGCAATGGTAG
GATGTGCATTAGAAATTTATTTAGAAGATGGACTACTTGATGAGATTAAGAAAAACCACTTAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3488011-3486620 putative C4-dicarboxylate anaerobic carrier [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCAGTTTAAAAAAGAAAAAGTTTACTATGCCACAGACACTTACAATAATATTTTCGCTAATAGTGT
TAATGGCAATTCTTACTTGGATAGTGCCAAGTGGAAATTTTGAAAGAGTAGATATAGACGGAAGGTCAGT
TGTTGTAGCTGGAACTTATGAAAAAGCACCATCAAATCCACAAGGAATTACTGATGTATTTACAGCACCT
ATAAACGGATTTATAGATGCAGCTGAAGTAGTTGGATTTGTTTTAATAGTTGGAGGAGCTTTTGGGATAG
TTAATAAAACAGGGGCTATAGAAGCTGTTATAGCTCATACTGTAAATAAAATGAAGAAGTTTCAATTTTT
AATAATACCGATTTCAATGATTCTATTTGGACTAGGTGGGACGACGTTTGGAATGAGTGAAGAGACACTA
CCTTTTTATATGATATTTATTCCACTTATGACCAGTATGGGATATGATTCATTGACAGCAGTGGCCACAG
TATTTATAGGAGCAACAGCTGGATTTGGAGCAGCTACTACGAATCCTTTCTCTGTAGGAATAGCACAAGC
ATTATCACAAATAGTACCAGGTTCTGGAATAGAGTTTAGAGTTGTTATGTTTATAATATATATGGCTATA
TCTATAGGATTTGTTATGATGTATGCCAATAAAGTTAAAAAAGACCCTAAAAAATCTTTAGTACACGATA
TATCACTAAATCAAGAATCAATGGTTAATAGTGATACAAATATAAAGGAATTTACAAAAAGAGAAGCCAT
GGTAATAGCCATTTTCACAATAGGTATGGCGATTATGATATATGGAGTTTTAAGACTAGAGTGGTACATA
ACTGAAATTGCAATGATATTTACAGCTATAGGTATAATATCAGGAATAGCATCAGGGCTTAAACAAGATG
AGATAGTTAATTCATTTATAAGTGGAGCAGGAGATTTAATTACAGCAGGGTTATGTATAGCATTTGCACG
TGGAATCGTAATAATAGCAGAAAATGGATTTATAATAGATACAATTTTAAATTCTGCAGCAAATTTATTA
AATGGATTACCAAAAACTATATTTATAAATTTAACTTTCTTAATAGAAGGATTAATAGCATTTTTAATAC
CATCAGCATCAGGGCTTGCATCACTTACAATACCTGTACTTGCACCACTTGGCGACTTAGTAGATGTATC
AAGACAAATGATAGTTACAGCTTATCAATTTGGTATAGGTGTAACTAACTTAATAACACCTACATCAGGT
GTTTTAATGGGAGCACTAGCAGTAGCCAATATTCCTTGGTCAAAGTGGGTTAGATTCGTAATTCCTTTAA
TGGTAGTATTAACAATTCTTGTAATGGTATTTTTGACAATAGGATTATATCTAGGATTCTAG
>ref|NC_013316.1|:c3490258-3488606 PTS system, IIbc component [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGGATAAATTACAAGTACTTTCTGGAGCAATGATGATACCTGTTATATTACTTGTTGTAGCAGGAG
TATTTATAGGATTAGGGTCAGCTTTTGCAAATATGGAAAACGTTTCTGCATTAGGGCTTAGCGGACTAAT
AAAAGAAGGGTCATTTATAAATGTATTCTTTAAAGTAATAAACGATTTAGGATTTATGGTAATGAGATAC
TTACCAATATTCTTTGTTACAGGTATAGCTTTTGGATTATCTAAAAAGGAAAAAGGATGGGGTGCATTAG
GAGGAATTGTTTTATTTATAGGAATGCACACAGTTATAAGTACATTGTTAGCATCAAATGGTATAAATTC
AGATACAGTTACAGCAGAAGCGTTTATGGCATCTGGATTAGGAGAGGCAGAAGCATATAGTCGAAGTTCT
TTATATGGTTCTTTCTTAGGAATCTTTTCATATGATTGTAGTATATTTGGAGCTATAATAGCTGGATTTG
TAGCTAGTGCAGTACATAACAAATTTGTTGACATAGAACTTCCTAGTGCATTATCTTTTTTCTCAGGTCC
AAGATTTTCAATGATTATGATGTTTATAGCATCAATAGTATTGGGTACAGCAATGTACTTTATATGGCCA
CCAGTAGGGTTGGCATTATCTAAACTTGGTAATTGGATAGGTTCTAGTGGATTATTAGGAACATTTACTT
TTGGAGCAATGGATAAAGCATTATTACCATTTGGTATACATCACTTAATTGCATTCCCTATAGAATATAC
AAGAGTAGGTGGAACAATGGAAGTAGGTGGAGCAATTTACGAGGGTGTTAATAATATAAGATTAGCTCAA
ATGGGAGACCCAGATACACTATCTTATATAACTCGTAACTTCACAACAGGTCGTTTATTAATACATTTTG
CAATATTACCAGCAGCAGCTTTAGCTATGTATAAGTTGGCTGATAATGCTAATAAGAAAAAAGCAATAAG
TATATTGATACCAGCAATAGTAACAGCCATGTTGGTAGGGGTAACGGAACCAATAGAGTATACATTCCTA
TTTGTTGCACCATTATTGTATTTTGTAGCATATGTACCACTGGCAGGATTGACGTATGTATTTACAGAAA
TGTTTAATGTTTCTATAATGGGAGAATCATTTAGAAATATGTTTCCTAATTTATTACAACCACAAAAAGT
GGATGCGTTACCATTATTATTTTTGATACCAATATTTTTTATAGTTACTTATATAATATTTACATGGGCA
ATTAAGAAGTTTGATATAAAAACACCAGGAAGAAGTTCAGAAGAAGTTAAGCTTTATAGTAAGAAAGAAT
ATAGAGAAAGACAATCTGTAGATGCTGGTAAAACAGCATACAACAATGCAGTAGAAGAGGAAGTAGATGA
TAAAGATACAAAGCTTGTACATTCTATAATAGAAGGTTTAGGAGGAAGTAATAATATAAAAAATGTTACA
AACTGTGCAACTAGACTTAGGGTAGAGCTAAATTCAATTGATGGATTCTATGAAGATGGTTTCTGGGTAA
ATGAATTGGGTGCAAGTGGAGTTGTTAAAAAGAAAAACTCAGTTCAAGTTATATTTGGTCCACGAGTTAT
TACAATAGCATCAAAGCTTAAAGCTGTACTTGGAGTAGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3491681-3490278 putative dipeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGTAAACAAAGAACTAATTATTGATTATTTAAAATCCAATCAAGAAAATATCATAAAGGATATTA
GAAGTTTAGTTGAAATACCTTCAATTAGAGATGAAAGTACAACAGATATAAATCAACCATTTGGGATAGA
AATAAGAAATGCCTTCGATAAGCTTATTCAAATAGCAAAAGACAAAGATTTTGTTGTAAAAGACTTTGAT
GGATATGCAATTCATATAGAATATGGAGAAGGAGAAGAAGTAGTAGGGGTGCTTAATCATATAGATGTGG
TGCCAATATATAATAAAGAACTTTGGAAGAGTAAACCTTTTAAAGTATGTCAAAAAGATAACTATCTTTA
TGGTAGAGGAGTTAATGATAACAAAGGACCTTTGATAGGGATTTTATATGCATTACTTTTCTTAAGAGAA
CTTAATGAAAAGCCGAAGAGAAAGATTAGATTGATAGTGGGTGGAGCTGAAGAGACGACTTGGGAATGTA
TGGAGCATTACTTTAGTGTCAATGAACAGCCAAAATTTGCATTTTCTCCAGATGGAAACTTCCCAATAGT
AAATGGAGAAAATGGTATTTTATACTTCAATCTAAGAAAGAAAATAGATAAAGATAAATTTAGAAATCAC
AATTTAGTTGATATAAAGTCAAACAAAGAAGATGGATTTGTATGTGACAAAATTGAGGCTGTTTTTAAAA
CTGATGATAAGAAAGATTTAGTAGAATCATTAGCTTATTATACAGAGATAGAAGAACTAGAAGAAGGTAA
AGTATTAGTAAGATATACAGGAGAAAGGGCTTTATCGAGAAATCCACACAGGTCATATAACTGTGCATTT
AGTTTAGCAAAAGATTTAGAGAAAATTAAAAAGCTAAATGATAAAGGCGTTATAATAAGGGATATTTTAA
ATTCATACTTTACAGATGATAATCATGGAAAAAAATTAGGGATATATAAAGAAGATGTAGATATGGGAGT
TTCTACAATATGTATAATGAGTATCTTCTTAGAGAAAAATGAATTGAATATGAAAATAGACTTTAGATAT
CCTAAGGGTATAAGTTGGGAGTTTATAACTAATAGAATTAATGAAATTGGGAAAAAAGAAAATTTAATAG
TTGATATATATAAGGATTTAAAATTACTGTATGTAAAACCAGATAGTGAATTAATAAATAAATTATCAAG
TGCATATAAACAAGGTTTTGGAAAAGAAGCCGAACTTTTTACAAAAGGAGCTGCATCTTATGCAAGAGTG
TTAAAAAATGGAGTTGCATTTGGACCCACAATAGAGGGAGATAATCCAAATTCACATCAGGCAAATGAAA
ATATAAGTATAGATACATTATACAAAGCAATAGAAGTATATATATATGCATTATATAGCCTGGCATTTCA
ATAA
>ref|NC_013316.1|:c3492436-3491945 putative PTS syste, IIa component [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAATATATTTAAGAAAAAAGAAAATAAGATTGAGAAAATATATAGCCCTTTTAAGGGAAATTTAG
TGAACTTAGAAGATGTTCCAGATGCAGTTTTTGCCCAAAAGATGATGGGAGATGGAGTAGCAATAATACC
AAATGAAGGTAAGTTATATTCTCCTGTTGATGGTGAAATAGTCAATGTATTTGATACAAAGCATGCAATA
ATGATTAAGAGTAATGATAATACAAATATATTAATACATGTAGGTTTAGAGACAATGTCACTAGAAGGAA
AGCCGTTTGATGTTAAGGTAAAGGCAGGAGATAAGGTAAAAGCTAAAGATTTAATAATGGAAGTAGATTT
AGATTTTATAACGTCAAATGATTTAAATATAATAACTCCTGTAGTTATAATGGATGATGCTGATTCTGTT
AAGAGAACAGTAAAAGATAGGATAGAACCTGGAAATGTAGATATTAATAGCATAATAATGGAAGTTGAAT
AG
>ref|NC_013316.1|:c3493274-3492462 putative hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGCGATATAAATTAATTTGTACTGATATGGATGGTACTTTGATGGGGAAAGGATTTGAAGTATCAGAAG
AAAATATTAAAGCACTAAAAGAAGCTATGGAAAAGGGTATCAAGGTAGCCTTAGTTACGGGAAGACCTTA
TAATGCTATGAAATATTTTACAAGTGTTTTAGGGGATGATATATATATTATATCAACTAATGGGACATAT
TTTAAATTAATGGGATATGAGTATAAGAAGGTTTTGAGCAAAGAAGCTATAAAGAAAATCTATACAATAG
GTGAAAAGTATAATTTAAACAAACATTTTAAAGGCTGTAAAATAGTTATATCCAACAATGAAATAGGTGA
AGAACATCCATATAGATTAATAAATAGTAAAAATAAAGAAGAAGACAGAATTGAAATAATAGAAAATGCA
AGTTGTGAAACTTTATTAGAAAAAGCTGATAATGAAATTTTAAAATGTATACTTTTCTCAGAAAACGTAG
ATTCTTTGAGAGAAGCAAAGGAAGAATTTAAAAAACAAGAAGATTTAGAAGTAGTAAGTTCTGGAAAGAT
AAATTTTGAAGTTATGAGTAAAGGTACTTCAAAAGGTATTGCAGTTAAAAAATTTTGTGATATATTAGGT
ATAGATAGCAAAGAAGTTATTTGTATAGGTGATAATGAAAATGATATATCCATGATTAAATTTGCAGGTC
TTGGTATTGCTATGGGAAATGCTACAGATGAAGTAAAATCTATGGCAGATTTTGTAACTGATACTAATGT
AAATGATGGTGTAGCAAAAGCTTTAAGAAAAATATTATCATAA
>ref|NC_013316.1|:c3494438-3493287 alcohol dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTAACTTTTATCAACCATCAAGAATAAATTTTGGACAAGGAACTTTAAGTGAACTACCTAGAATAA
TAGGAAAATATGGAAAGAAATGTTTGTTAGTTACTACTCCAAATGTAGAGCCATTAGACAAGTTATATAA
AAGAGTTACATTGAATTTAATAGAAAAAGGTATAGAAGTTGTACACTTTGATAGAGTAGAGCCAAACCCA
ACTGTAGAATTAATAAATGAAGGGTTCGAATTAGCTAAAAAAGAATCTGTAGATGTTGTTTTAGCTGTTG
GAGGAGGTTCAAGTATAGATACTGCAAAAGTATTAGCATTGACTTTTGGTTTAGAAAAAATAGATTGGGA
TTATATGTTTAGTACATATACAAATCCATTTAAAATATACGATAAGGTAAGTGAAAAAGAATTACCATTA
ATAGCTGTATCAACTACTTCTGGAACAGGAAGCCAAGTTACACAAGCAGCAGTAATATCGAGAGGAAGCG
AGAAAAATACAATATTTCATCAAAATTGTTTCTCAAAAGAATGTATAGTTGACCCAGAGCTTATGTTAAC
TCTGCCAGAGAGAATTACTGCATCAACAGCATTTGATGCTTTTACTCATGCATTTGAAAGTTATATAAAT
CCAAATGCTAATGACTTTACAGAGATAATGTCTGAAAAATCTATGGAATTAGTCATTAACTATCTACCTA
AAGTAATGGAAGATAAAAATAATATAGAATACAGAACAAAGTTAGCAGTAGCAGATACATTAGGAGGAAG
TTCACTGGCAAATGCTGGAGCAGCAGCACCACATCCACTAAGTGAAATAATAGGAGGAGTTACACATATT
CCTCATGGTGAGGCTTTGGCTATAGTGTTCCCAAAATTTGCAGAAAAGTTCTATAAGGATAATATAGAGA
AATTTGCCAAAGTAGCGAGAATGCTAAACCAAGAATTAGAAAAAGTGGAAGATGATGAAGCAGCTAAAAC
TTTAGGAAATGAAATAGAAAGTTTTTTAAAGAGAGTGGGACTTAAGACAAAAATGTCTGAGTTTAATGTA
ACAAAGGAACAATTAGAACAAATAACAAGCTGTCCAGTTTTAGGATTTTTACCTTTTGGAAAGAAAGAAG
ACCTTGTTGAAATATTAGAAAAATCTTACTAG
>ref|NC_013316.1|:3494708-3495349 putative phopho-sugar aldolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATATTTGATAGACAGTGCTAATCTTGATGAAATTCAAAAGTGTTTAAAGTATGGATTTAAGGGAA
TAACAGCTAATCCATCTATGTATCTTAAAGAGAAGGTAAACTTCCATGAATTTATTGAGACATGTACTAA
TTTAAATCCAGAAATATTAACTGCTGAAGTCATTGGAAATAATTTATACGAATTAATTAATTCATGTGAT
AAGATATTAAATATAAATAAAAACACTATAATAAAAATAAATTTCTCTGAAGTTGGCTTAGAACTTATAA
ACATATTAAATAGTAAAGGTGTAAAAACTGCATGTACCTTGATTTTCAATGTAAATCAAGCATCATTAGC
TATAAATGCAGGTGCTGATTACCTATTCCCTTTTATAGGTAGAAATGATGAAAATGGGAATGATGGTATA
AAAAACCTTACAGAAATATGTAACCTTATATCAATAAATGGATATAATACTAAAGTTGTTGCAGCTTCTA
TTAAAAATGTATTCCACTTAACTCAAGCATCTCTTTGTGGATGTGATTATGCAGCTGTAACATATGATTT
ATTTAAAAAAGCTTCTTTTAACCAGCTTACAGTAGATGGTGCCAATACTTTTGAAAGAGATTGGTCCAAG
GTTAATAAATAG
>ref|NC_013316.1|:3495375-3496919 putative transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
TTGAACAAAAGATTATTAGATATTGCTGAATTATTACTCAACAGCTCAGACTATATTACTGTAGATACTA
TTGCCGAAGAATTAAAAGTTAGTAATAAAACTATTCGTAATGACCTTGTTATTTTAGATGAATGGCTTTT
AGAGTTTAATTTATCCCTAGATAAAAAAACTGGTTCAGGGGTTATTATTCTAGGTAATGAAGATATAAAA
CTTAAAGTTATTAGAGATATCAATGATAAATCAAATTGTATATATGCATACTCTCCTGAAGATAGAAAAA
GGTATATTCTAAGTAAATTATTTATTAAAAATTCTAAGTTTAGGATTCGTGATATTTGCAATGAACTACA
TGTTAGTAGAGCTACTGTTCATAAAGACTTGGTAGTTATTCAAAATTTTTTGCAAAACTTTAAAGTGACT
CTAGTTAGAAAAACCAATAATGGAGTATATTTAGAGGGAAAAGAGAAAGATATTCGAAAAGCAGTTTTTG
AACTTGCTACTGTTAATAAAAGTTATACTGAACTTAAAGAAATATTATTCTCGAACTCTAATGAATGCAA
AGATACCCCATCAACAAAAATATTTAAGGAGCTATTTAACTATGATTTTGAGAAATTATCTCAAATCACT
CTACACACCTTACAAGTAGAAAAAAGTAACCTTAGTGATGAGTATTATATAAACTTCTTAATACATATAG
CTATATGTATTAAGAGAATTTCAATTAAAAGATATATTAACTTATCTGAAGGTTTTTTTAGAGAATTATT
AGAACATGAATACTTTGAAAAATCAAAAATTTTATGTGCTAACCTAAGTGAAGCTTTTGACGTAGAATTT
ATTGATGAAGAGGTCTGTTATATACTTCTTCATATAGAAGGATTACTTAAATCAATAAAGAAAACTACTA
CTCTTGAACCTCTTAAAAATGAAGAAATTACAGAGTATAATCTATCTGAAGCAATAGCTGTTCATTGGGG
AAGTATACTAAATTTAAACTTAAAGGATGATTTAATATTAATAAAGTCTCTTGCTAATCACCTTAAATCA
GTTCTACACAGAATAAACTATGGATTTACTATTACAAATCCCATATTAAATGATATAAAGAGAACATTTC
CTTATACTTATAAGGCTGCTAAAGAGTCTAATACTGTTATCAAACAGTTGATGAATTATGAAGTCAATGA
TGACGAAATAGGATATCTTGCTTTATATTTAATATCAGCAATAGATAGAAGCAAATCTCCCCTAAATACT
ATTTTAATATGTCACTGTAGTGATGGTGTATCTAATTTATTAGTCCAAAAGTTAAGTTTTGAATTTAATC
AGATTAATATAGTTAAATCTATACCTCTATCTTCTATTTCATTTACGAACTTTGATGATGTGGACTTAAT
ACTAACCACTGCTCCTGTAGACTTTGAACATAATGCTGAACTGATAAATATAAATGCTCTTTTAAGTAAG
AATGATATTTCCAGACTTAGTACAATTATAAAAAAACTATATTCTGAAAAAAATAAAATATTATCTTATA
AATAA
>ref|NC_013316.1|:c3497762-3497136 hypothetical protein CDR20291_2946 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAGAAATGATAAAAGATTATTTACTGATAACAATATCAGCATTTTTAATGGCATTAGCAGTTA
ATTTTTTCTTTGCAGAACATACATTAGCTCCAGGAGGGATAACAGGATTATCAGTCGTACTTAGCACATT
CTTATCAATGCCTGTTGAGAATATATCATTAGGAATATCTATGCCACTTTTAGTAATGGGATTATTATTT
TTAGGGAAAGGTTTTGGAATAAAAACATTATATATAACTCTTATGGGTCCATTATTCTTAAAAGTAATAC
CACAAACTCACATAACTGACAATCTATTAGTAGCAGGAGTGATAGGTGGGTTATTGGTAGGAACTGCTAT
AGGGATAGCAATAATAAGGGGCTGTAGTACTGGTGGAACTGATTTAGTTGCAATGCTTATTAATAAGGTA
ATTAAGTTTCTGAAGTTGCCAGTTATATTATTTATGCTAGATGGATTTATAATAGTAGCATCTGGAATAA
TAAGTAAGAATTTTATGATATCTATATATTCATTGATATCCTTATTACTCATAATAAAAACAATAGGATT
TGTAACTACAAAGTTTGGTAAGAATACTGAAGAAATTAATAATATAAATAATGCTTGCGCTCAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3498613-3497897 putative pentose-5-phosphate 3-epimerase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACACATAAAAATAGCAGCAGGATTAGCACATGTAAATTACGGTCATATATCAGCCGTAGTTAAAG
AAGCAATGGATGCAGGTGTAGACTACGTACATTCAGATGCAGCAGATATGCATGACTTAAAAAATATGCA
ACTTATGGGTGGTCATCAAATAATAGAAGCAATAAGACCAGTGACAGATAAACCAATAGAATGCCATATA
TACACAAGAGATTGTGATAGATTATTTATAGAAAAAATAGCAGCAGCAGGATGTAACTTGTTGATAATAC
CAGCAGAACATTTTTTAGGCGCTCCTCTTGCATACATAATAAATTACTGTAGAGAATTTGGTATGAAAGT
AGGATTAACAATTGGATGTTACACACCACTATGTTTTGTTGATGAAGCTATATATGATATAGATAGATTG
CAAATAGTCGTTCATGGTGTTGATGAAACTGATGGAAAAGATAACTGGGGATGGAGAAAGAGTGCTGTTG
ATTTAGTAAAAAGAGCTAGAAAAATGATAGACGAAAAGAATCCTAAGTGTGAATTAGCAATAGATGGTGG
ACTAAGAGCAGACAATATGGAGCCATTAATAGAATGTAATCCAGACGTTGTAATATTATCTTCAGCAATA
TTCAAGGATAAAGATGGTATAACAGCAGGTGTTAAGAATTGTAGAAAAGCTATAGATGAAGCAGCTACAA
AGTTTGGTTTAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:3499010-3500242 putative phosphofructokinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGGGAGATGTAAAATGAGAAACTGTATTATTGCCCAATCTGGAGGCCCTACAGCTGTTATCAATG
CTTCTGCAGTTGGTATTTATGAAAAAAATTTAGAAACTAAATACTTTGATAAAGTATATTTTGGTATCAA
TGGGATTGAAGGTATATTAAACAAAAATATAATAGATTCAGACTCCTTAAACAAAGATAATGTATTAAAT
TTAAAGCAAACACCTTCGTCTGGTCTTGGTTCTTGTAGATACAAACTGGCTGATTATAAAATAAATTCTT
ATGATTATGATAGAGTTATAAATATACTAGATGAATATGAAATAGATACATTATTTTATATAGGCGGAAA
TGATTCTATGGACACAGTGATGAAATTTTCTCAATACTGCAAAAACACTACTTGTAAAATAAAATTTATA
GGGATTCCTAAAACAATAGATAATGATTTATTAGGAACTGACAACTGTCCTGGATTTGGTTCTGCTGCAA
AGCTTATTTCTACACTAATAATGGAAACATACTTAGATTTTTCTATATACAAAAATAATGGTATATTTAT
AGTAGAAACCATGGGTAGAGATACTGGATGGTTAGCAGCTTCTTCTTCACTAGCTAGACTTAATGATACT
CCACTTGTTGATTTAATATACCTTCCAGAAATTGATTTCTATGAAGATAAGTTTATAGAAGATGTTAGAA
AAATATTTAAAGAAAAAAATAAGGCTTATATAGTTGCATCAGAAGGTATAAGGGATAAATACGGGAACTT
TATATGCGAACAAAAAACTTCTGCTCATGATAAATTTGGTCATTCCCAATTAGGTGGAGTAAGCAACTAT
CTAAAGAATCTTATAGTATCATCATCAATTACAACAAGAGTAAAAACCTTAGAACTTGGTGTAATACAAA
GATGTGCTATGCATTTAGCTTCAGATACTGATTTAAAACAAGCAGCTGAAGTTGGTGCATATGGGATAGA
ACTATCTAAAAAAGGATATACAGGAGTTATGGCTATCATTAATAGAACATGCAATAATCCTTATAAGTAT
GAAGTTAGTCATACTGATATTTCTAAAATAGCTAACAAGACAAAATATTTTCCTAAAGAGTGGATAAATG
AAGAATGTAATTATATAACTGATGAAGCCCTAAATTATCTATATCCACTTATTCAAGGTAAACCAGATAT
CAAATATAAAAATGGACTACCTTATTTTTCAATTATTTACTAG
>ref|NC_013316.1|:3501836-3502954 transposase-like protein b [Clostridium difficile R20291]
GTGATAGTAGTGGAAAAAGCTTATAAGTTTAGAATGTATCCAAATAAAAAACAGCAAGAGTTAATTAACA
AAACTTTTGGATGTTGTAGATTTGTATATAATAAGTATCTTGCTAAAAGAATAGAAGTTTATAAAAACGA
TAAAGAAACTTTTACTTATAAACAGTGTAGTTCTGATTTAACCAATTTAAAAAAAGAATTAAAGTGGCTT
AAGGAACCTGACAAATTTTCACTACAAAACGCCTTAAGAGATTTAGATAATGCATATAAAAAATTCTTTA
AAGAAAAAGTAGGATTTCCTAAATTTAAATCAAAGAAAATTAATAGATTTTCATATAAAACTAACTTTAC
AAATGGAAACATTATGTATTGTGGTCAACATATAAAACTACCTAAACTTGGTATGGTTAAGGTAAGGGAT
AAACAAGTACCTAAAGGTAGAATACTTAATGCTACTATATCTAAAGAACCAAGTGGTAGATATTATGTAT
CATTATGCTGTACTGATGTAGATATTGGAGTATTTGAAAATACTAATAATCAGATAGGTTTAGATTTAGG
AATTAAAGAATTTTGTATCTCAAGTTGTGGAGAATTTATAGAAAATCCTAAGTATCTTAAGAAGTCATTA
AACAAACTTGCTAAATTACAAAGAGAATTATCGAGAAAAACAATCGGTAGTTTAAATAGAAATAAAGCAA
GATTAAAAGTTGCGAGACTTCAAGAACATATAGCTAATCAAAGAAATGATTTTCTACAAAAATTATCTAC
TAAATTAATAAAAGAGAATGATATTATTTGCATAGAAGATTTACAAGTAAAGAATATGATTAAAAATCGT
AGACTATCTCGCTTAATTTCTGATGTATCATGGTCAGAGTTTATTCGTCAATTAGAATACAAGGCTAATT
GGCATGGTAGAAAAATTGTAAAAGTAGGTAAATTCTTTGCAAGTTCACAAATATGCAATAAATGTGGGTA
TAAAAACGAGGAAGTGAAGGACTTAAATATAAGAGAATGGATTTGTCCTAGTTGTAATGAAACTCACGAT
AGAGATATAAATGCAAGTATAAATATATTAAAAGAAGGATTAAGACTAATAACAATTCAAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3505484-3504294 putative amidohydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATTTTTTTAAAGAAGCGCAGTCAATAGAAGGGGAAATTATTAGATGGAGAAGATATTTACATG
AAAATCCCGAAATTGGTTGCAATCTACCGAAAACAGTAACCTTTGTTACCAGTACTTTAGAAAAAATGGG
ATATTCTCCGAAATTGACGTCTAATAATGGAATAGTAGCTGTTTTAGACAGTGAAAATGGTGGAAAGACC
TTATTATTAAGGGCAGATATGGATGCACTTCCTATTATGGAGGAGACGGATTTACCTTTTAAAAGTAAGA
ATAAAGATGCATCTCATAGTTGTGGACACGATAATCACACAGCAATGCTCTTAGGAGCAGCTAAAATACT
TATGGATAATAAGCACTTACTTAAAGGTAGAGTAAAGTTTGTATTTGAACCAGATGAAGAGAGTACCAGA
GGTGCAAAATCAATGATTGATGATGGTATATTAGAAAATCCTCAGGTCGATGCAGCTATGGCATTTCACA
GTATGGTGGGTAAATTTCTTAACACAGGTCAAGTAGCTTATTCACGTGGTCCAGCTATGGCATCTGCGGA
TATATTTGAAATAACAGTAGAAGGAAAAGCAACTCATGGAGCAAGCCCTGAATTTGGAGTGGACCCAATA
AACATAATGTCGCATATACAAATAGCATTAAACACTATACTTTCAAGAGAAAAACCTCAGAAAGAGCCTG
TAGTTTTAACTATTGGTATGTTTAATGCAGGAAACGTACCAAATGCTATACCAAATAAAGCATCTATGTC
AGGAACTTTAAGAACATTTGACCAATTTGTTAGAGAAAAATTAAAAAATAGAATTATTGAAATATCTACA
GGAATAGCTAAATCATTTGGAGGAAATGCTAAAGTGGAATTTAAAATGGGGACTCCCGCAGTTATAAATG
ATTTGGATGTAGGAGATGAGATTGTATCTTATGTTAAAGAAATTATAGGAAATGAGAATGTAATAGACTT
TCCATCTGCAATGGGTTCAGAAGATTTTTCAGAGATTTTACTAAGGGTTCCAGGAGTATTTTTATGGATT
GGAATGGGAAGTATTAGTCAGGGATATAATTTTGGTATGCATAATCCTAAAGCAATTTTTAATGAAGAGG
GATTAGTTTATGGTTCAGCTTTATTTGCTCATTGTGCAGTAAAATGGTTAGAAAATAATTTTAGTAGATA
A
>ref|NC_013316.1|:c3506969-3505590 putative amidohydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGGAAGTATATCTATAAATGAGATAGATAAAAAAAGATTCAAACTTGATGATTTAAGTAAGAAAA
TATGGGAAAACCCAGAAAAAGCATTTAAAGAATTTAAAGCATGTGAAAATACAGCAAACTTTCTAAGAAG
TGAAGGATTTGATGTGGAAGTAGGTGTAGGAGGTTTAGCCACGGCTATTAGAGCTAGTTTTGGTTCAGGT
AAACCAGTTATAGGTTTTATGGGAGAATTTGATGCATTACCTGGTTTAAATCAAAAAGTTTCAACAAAGC
AAGAAGCATTTGAATTGAGTGCATATGGTCATGGATGTGGGCATAATTTATTATGTACAGCACATGTAGG
GGCAGTAGTAGGACTTAAAAGAGAGATGCTAGAAAATAACTTAAGTGGGACTATAGTATTTTATGCATGT
CCAGGAGAAGAACAATTAACAGGTAAAGGATTTATGGCTAGAGGTGGAGCATTTGAAGGGTTAGACTTAG
CTATAAATTTTCATCCAAATAAAATTAGTGAAGCTACAATTGGTACTTCAACAGCTGTTAACTCTGTAAA
ATTTCACTTTAAGGGAAAGACTGCACATGCAGGCTCAGACCCTCAAAATGGAAGAAGTGCACTAGATGCT
GTGGAACTTACTAATGTGGGAGCTAATTATTTGAGAGAACATGTTACTTCTGATGTAAGGATTCATTATA
CAATTACAGATGGAGGAGTAGCACCCAACATAGTTCCTGATAAAGCATCAGTATGGTATTATACAAGAGC
TTTAAGTAGAGAAGCTGTAGAAAGTACATATGAAAGACTTGTAAAGGTAGCAAAAGGAGCTGCAATGATG
ACTGAAACTGAAGTTGAAGTAGAGTTTTTAGGAGGTTGTTATAATACTTTAAATAATCATGTTTTAGCAA
ATCTTGTATCAGAATGTATGAATGAGATTAAACAAGAGCCTTGGACTCGAGAGGAATTGGATTTTGCAGC
TGAATTAGATAGACAAAGCCCACAACAATATAAGGCTATGATAAGTAAATATAATTTGCCAGAAGGAACT
CATCTATATTATGGTGGAGGAAATGTTACAAACTTTAATAGTTATGGTTCTACTGATATTGGAGATGTAA
TGCATATAGTTCCGACAGCATACTTTTTTACAGGGTGTACGAATCTAGGTGCACCAGGTCATAGCTGGCA
GTTTACATCTTGTGCAGGAAGTTCTATAGGAGAAAAAGGTATGATATATGCATCAAAAATCATGGCTATG
TTTGGAGCCAAAATATTAAATAATCCAGAGATAGCTAAAAAGGCAAAAGAAGAGTTTGATAAATCTATGA
ATGGTAAAACATATAAATGTCCTATTCCAGATGATATTCCAACTCCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3508208-3507000 hypothetical protein CDR20291_2953 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATTTTTGGAATCCACTTACTTGCTTTACTGTATGTGTAATGATTTATGCTTTTAGTGAGTTTT
TATCTAAGAAAACAAAAGGTGCAATTTCAACATTGTTATTTGTATGTATTATATTTTTACTAGGATTTTG
GACAAATGTTTTACCAAAAGACATTACAGGAGCATCAGGGATATTAGCTGCAATGAGCAACTTTGGTATA
GCTTTATTAATAACTAACTTAGGAACACTTATAAATCTTGAAGACTTATGTCATGAATGGAAAACGGTTG
TAATTGCATTAGTAGGTATTGTAGGAATAGGGGTTGGCTGTTTAACAGTGGGTAGTATGTTATTTGGTAG
AGAGTATGCTTTAATAGCAGCACCTCCAATAGCAGGTTCTACTGTTGCCGGTATTATCGTAACAACTGTT
GCAGAAGCTGCAAATAGACCTGAACTTGCTGCATTTGTAATTCTAGTATTATCATTTCAAAAGTTCTTTG
GCATTCCGATAACTACATATTGTATAAATAAAGAATTAAAATTTAAAAGAGATAACGGGGATTTTTTGAA
AGATGAGTCAAAAAGTAATTTTAGACTTCCAAGTATGAGAATTTTTAAAGAAGATTTAGGTAAAAAATCA
TCTACTCTAGTGTATCTTGCAAAGCTTTCATTTGTTGCTATGATTGGTAATTTTGTAGGATTGGCTACTT
TAATACCAGGATTTACCCCTGCAAACTATTATTTAAATCCTAATATAGCATGTTTGTTAGTAGGGTTGAT
TTTTACACGAATAGGTTTTTTAGAAAAAGGAATTTTAGATAAATCTCAATCTAATGGAATTATAATGTTT
GGTTGTATGTTGATGTTACCTGGAGGACTTGCTAAGGTAACTCCAACAGCATTGTTTGGGATGATTGTTC
CAACTATAGGAATACTTGTTGTAGGTTCTGTATTTATAATATTATTTACTGCAATTGTAGGAAAACTATT
GGGATATTCTCCAAGAATGTCAGCTGCAATTGGTGTAACTTGTATGCTAGCTTATCCTGCAACACAGATA
ATTTCCAACGAAGGTATTGATGCTATGGAAGGAACTGAAGAAGAAAAACAAAGGGCAACAGATTATTTAT
TACCAAAGATGATTATAGGAGGATTTGTTACTGTAACCATTGCATCAGTGGCATTTGCTAGTATAATAGG
TCCAATTATATTTGGTTGA
>ref|NC_013316.1|:c3510686-3509232 6-phospho-beta-glucosidase BglA [Clostridium difficile R20291]
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GTGATAACAAAGGACCTGCAATTATGGATTTTGTAACTAAGGGCTCTTATGAAACGCCAAGAGTAATTAC
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GATATAGCTTTATTTAAAGAAATGGGATTTAGTGCATTAAGAATATCTATAGATTGGTCAAGAATTTTTC
CAAATGGAGATGATGAAAATCCTAATGAATTAGGGATTAAATACTATGAAGGTCTGATAGATACATTAAT
AGAAAATAATATAGAACCTATTGTAACACTATATCATTTTGAATTACCTATGAATTTAGTACATAAATAT
GGTTCATGGAATAACAGAAAACTTATGGATTTGTATTTAAAGTACAGTGAGACTGTAATAAGAAGGTTTG
ATGATAAAGTAAAGTACTGGATTACATTTAATGAGATGAACCATATTGACCCTCAAACAGAGCACTCGGA
TATTTTTACTTATATGATAGCAGGTATTAAGTATAGTGAAATAGAAAATAAGGTTCAAACATTGGCAAAT
GTAGGGTATAATATGACTTTGGCGGGTGTAAAGGTTGCAAAGTTGGCTAGAGAAATCAATCCCAACAATA
AAGTTGGATGTGTATTTGGACTAAATCCAATTTATCCATACAATTGTAATCCTAGTAATGTGTTAAATGC
ATTTTTAGATAATGATCGTGATTATTATCAAATTGATGCAATGTGCAATGGGAAGTTTCCCCAATATAAA
TTAAAAGAATATGAAAAAAATAATATAACTATTGAAGTGACTGATGAAGACAAAAAAGCATTTAAAGAAG
GTAAGTTAGATTTTATAGGTCTTAATTATTATTTTTCAAGTGTATCTACTCCAAAAGAAAATTTATCAGG
TGATAAATCTTTATTTGGTGGGATTCAAAATCCATATTTGGAACAAAGTAAGTGGGGATGGGCAATAGAC
CCTATAGGTTTAAGATTTACCTTGAACTATATTTACAGAAAGTATCAATTACCTATCTTAATTACAGAAA
ATGGTTTAGGGGCATATGATAAAATCGAAGAAGATGGAACTATAAATGATGATTATAGAATTGAATATTT
AAGTAAGCATCTATCTCAAATGAAGTCTGCAATTGAAGAGGATAATGTTGAATGTTTTGGATATTTGATG
TGGGGACCAATTGATTTAGTCAGTGCAACTACAGGTCAGATGAGTAAGAGATATGGATTTATATATGTTG
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AATAAAATCTAATGGAGAAGTTTTAGATTTTTCTACGGATATAGTAGTAGGGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3512577-3510706 PTS system, beta-glucoside-specific IIabc component [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATATAAAGATTTAAATGAAAATATAATAAAACTTATAGGGGGAAAAGAAAATATAAAGTCGGTAG
CGCATTGTGTTACTCGTTTAAGACTTACTTTAAATGATAGAAGTATCGCTCAAACAGAAGAAATTAAAAA
ATTAAAAGGAGTAATTGATGTAGTTTCTAATGATGTTGCTTATCAAATTATAATAGGTACTCATGTTGTA
GATGTATATAACGAGTTTATGTCTATGATAGGTTTAAGTTCAAGTGAATCAAGTATAAAAAGTGAAAGAA
AAAAGGGAATTAGAGGTATCAAAGGTATATTTAATTCCATCTTTGTGGTAGTCTCAGAGACTATGACTTC
AGTAATTGAAGTACTACTTGCAGCTGGTATACTCGCAAGTATATTAGCACTTTTAAATATGTCTGGCATA
CTTCAGAGTGATAGCCCTACATATCAAATATTAGATACATTAAGAAGTGCTACATTTCACTTCTTACCAG
TATTAATTGCAATAGCATCAGCAAAAAGACTTAATGTAAATCCCTATATAGCAGTAGTGTTAGCAGTTAC
GTTATTATCGTCATCAATAGATGGTGTAGAAGGATTAAGTTTATTTGGTATAAATTTACAGGCTACAACT
TATGCAAACAGTTTTATTCCAATACTTTTAGGAGTATGGGCAATGGGAATTATAATTGAAGGTTTGAAAA
AAATATTACCTAAAGCACTACACTATTTTTTAGTTCCAGTGTTATCTTTAATAATAACCCTATCAGTTAC
ATTAACTGTATTTGGACCTATTGGTATGTGGATTGGTGATGGATTAAACTATGCATGTATGTTTTTAATT
GATACATTGGGTAATTGGAGTGTTGTTGCACTGTATGCAGCTTTACAACCACTCTTAATAGTTTTTGGTG
CAGCAAACTTTACTATGCCTATATCTTTAAATTCTGTGACAACATTGGGGTATGACCCAATTTTTATGGG
CGCTGCAACAATATCTGATATTGCAGTTTGTGGTGCAATGTTTGGATATTTCTTAAAAACTAGGAATAAA
GAACAAAAACAATTATTTGGGACAGTAAGTTTTAGTGCACTTATGGGAGTTACAGAGCCTTCAGTGTTTG
GTGTGTTTATGAAATATAGAAGACCATTTGTAGCAGTAATGATAGGTGGAGGTATAGGTGGTTTAATAGC
AGGTTTAGCTCAAGTTAAAACATATGGAATGGTTTGGGGATTAGCTGCATTACCAACATATCTTGTTGGA
GGAGAGGCATCTAACTTTACATTTATGATAATAAGTGTAGTAGTATCATTTGTAGCAGCAACAGCAGCTT
CCTATTTACTAGGAATACCTTCAGATGAAAAAGAAGAAGTTAAGGGTGATAATGAAAAAGAATTAGAACT
AATAATCAACGAGAACAATTCAAGAACTATTAGTATTGGAAATGTTGCAAAAGGTCAGGTAATTGCACTT
GGGGAAGTTAATGACAAAGCATTTTCCTCTGGAGCATTAGGTAAAGGGGTTGGAGTTATACCTAGTGAAT
CAAAATCAACTGTTATATCTCCTGTAGATGGAACTATAACTATAGTATTTCCAACTAAACATGCATATGG
TATAGTGACTGATGAAGGATTAGAAATATTAATTCATATTGGTATAGATACTGTAAACTTAGATGGAAAA
TTCTTTGAAAGTCTTGTAACACAAAATCAAAGGGTTAAAAAAGGAGATGCTTTAGCAGTATTTGAATCTG
ATAAAATTATAGAGGAAGGCTTTGATTCTACTATAATAACTGTAGTTACAAATACTAGCGATTATTTAGA
TGTAATCTCATCAAATGATGAATCAGAAGAATTATTAACTGTAATAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3513427-3512567 putative beta-glucoside bgl operon transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
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TTGTTAAAGGAATTGGCTTTAAAAAAAGAGTGGGACAAGTAATAAATGAAAATGAAATAGAGAGAACATA
TATACTAGATTCATACGATATGCTAGAACACTTTAGTTATCTACTACAAAACTCAGACTCCAATAATATA
GTTCTTATTAATGAAATAATTGAATATGGTGAGAAAGCTTTAAATATAAAGTCAAGTGATTATCTAAGCT
TAACCTTACTAGACCATTTAGAGTTTTTACTTAAAAGATGTGAAAAGAATCAATTTATAAAAAGTCCTTT
GGTATGGAATGTTAAAAGATTTTATCCAAAGCATTTTGAAATTGGAATGCATGCACTAAAATTAATTGGT
GATAGTAAGGGAATTAATCTTCCTGATGATGAGGCAGTATCAATAGCACTTCATTTTGTAAATATGGAGG
TAAATAAAGAGTCTCATGATAGTACAATTGTAGAGTTGAGAACTTTAGCAGATATAGTTTCTATAATAAA
ATATCATTTTAATGTAGAGCTAGATGAAACTTCAACAAATTATATGAGATTTACTACTCATCTACAGTAC
TTTATCCAAAGAATTATGTCAGATGAAGCTTCAATAGATGAAGATAATTCTATAGATTTATATAAACAAG
TAAGTCAACTTTATCCAAAGTCATTTGGAAGTGTTCAAAAGATAAGAAAATATATAAAATCACAATTTAA
TGTCGATATATCTATAAGTGAAGAAACTTATTTAATGTTGCATATAAATAGGGTGACTCAAAGACTGGAG
GCAAAATCAGATGAAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3514554-3514150 hypothetical protein CDR20291_2957 [Clostridium difficile R20291]
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ATAAAAACTGCATTAAACCATGGAAAGATGCTGAAACATATATTGATAAGTATATGGTAAAACAAGATAT
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AAAGTGTATTACAAAGATGACCCTCGATATGAGTATCAATATTTTTATAGTGATAATTATCATGCTCTAT
ATGTAAATAAAGTAATGTTACAAATTTATGATGTGGAAAATAATAATAAACTTTTAAGAAGTAATGAGGA
ATTAAAAAGTGTAAAGTATCCACCAATATATCTTAAATATAAGCCAGATAAATGA
>ref|NC_013316.1|:c3515933-3514746 putative glycosyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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AATTAGTGGATAGAGGAAATGAGGTATTGTATTATTCTTTTAATGAATTTAAAGATAAAATTGAAGGTGC
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AAGGATTTTCCTGGATTAATTGAGATGATAGTAGATACTACTATTTCTTTAGATGAAAAAGTTTGTAGGG
AACTTAAAGATTTTAATCCAGATTGCATTGTATCAGATTCATTAAGTTTTTGGGGAAAGTTATTTGCACA
AAAACTTAATATTCCATATGTATGCTCTACAACAACTTTTGCATTTAATAAACATACAGCAAAGTTGATG
AAACAAAACTTTATAGAAATTATACGTATGATTTTTGGTGTAAGACGCATTAATAAAAAAATAAAGCTTT
TACAAAGAAAAGGGTATGAAGTAAAAAATTTTATTTCTATAGTTTCTAATGATAATGATACGGATACCAT
TGTATATACATCAAAAGAATTTCAACCAATGGTAGAAACCTTCTCTAGTAAGTATTCATTTGTAGGTCCA
TCAGTATCAAAGTTGATTATTAAACCTAAAGAGAGAAAAAGAAAGTTAATATATATTTCGCTTGGTACAA
TTAATAATAAAAATGTTAGCTTTTATAAAAACTGTATAAATGCATTTAAAGATTCTGATGTTGATGTGAT
TATGTCTGTTGGTAGAAGTACTGATATTAAAAGTTTAGGAAATATACCAAATAATTTTGAGGTTAAAAAT
AGTGTTGAACAGATTGCTATACTTCAAAAAACTGATGTGTTTATTACTCATTCTGGGATGAATAGTGTTA
ATGAAAGTTTATATTATGGAGTACCCATGGTATTATTTCCTCAACATTCGGAGCAGAGAATGGTAGCTAA
GAGAGTTGTTCATTTGGGAGCAGGAATTATGTTAAAAGAGGATAAGTCCGAAAGTATTAAAAAAGCAGTA
TTTCAAGTTATAAATGACAATGAATATAAAGAAAATGCAACTAAACTATCAAAAAGCTTTTATAATGCAG
GAGGCTCAAAAAAAGCAGCAGATGTAATATTACAGATTATATGTAATAGTAGACAAGTTGACATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3517930-3516317 conjugative transposon site-specific recombinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACAACAGATTTACAATACTGCACTTTATCTTAGGTTAAGCCGAGATGATGAATTACAGGGCGAAA
GTTCCAGCATTACCACACAAAGAAGTATGTTGCGTCTATATGCAAAAGAACATCATTTGAATGTGATTGA
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ATAGAGGCAGGAAAAATCAACTGTGTTGTAACGAAAGACCTTTCCCGACTTGGCAGGAACTATATTATGA
CAGGACAATATACAGAATTGTATTTTCCCAGCCATAATGTCCGTTACATAGCGATTGACGACGGTGTAGA
CAGCGAGAAAGGCGAAAGTGAGATTGCACCATTTAAGAACATCATCAATGAATGGGTGGCAAGAGATACA
AGCCGTAAAGTGAAATCGGCATTTAAGACGAAATTTGCAGAGGGTGCTCATTATGGTGCTTATGCTCCAT
TAGGATATAAGAAACACCCTGACATCAAAGGAAAACTGCTGGTTGATGATGAAACAAAATGGATTGTTGA
AAAAATCTTTTCCCTAGCCTATCAAGGTTATGGTAGTGCCAAAATCACAAAGGTACTGCGAGAGGAAAAA
GTTCCGACAGCGTCTTGGCTGAATTTTACAAGGTACGGTACTTTTGCACATATCTTTGAGGGAAAGCCCG
AAAGCAAACGTTATGAGTGGACGATTGCTCATGTCAAGGCAATCTTAAAAAGTGAGGTTTATATAGGCAA
CAGCGTTCACAATATGCAGTCTACGGTTTCATTCAAGAGCAAGAAGAAAGTGCGTAAGCCCGAAAGTGAA
TGGTTTCGAGTGGAAAATACCCATGAACCGATTATTGACAAAGAAGTGTTCTATCGTGTGCAGGAACAGA
TAAAATCAAGACGTAGACAGACAAAGGAAAAAGCAACACCGATATTTGCAGGGCTTGTCAAGTGTGCGGA
TTGTGGCTGGTCTATGCGGTTTGCAACGAATACGGCAAATAAAACGCCTTACAGTTATTATGCTTGCAGT
TACTACGGGCAGTTTGGCAAAGGTACTTGTTCTATGCACTATATCCGTTATGATGTGTTGTATCAAGCCG
TATTGAAACGATTGCAGTATTGGGCTAAGGCAGTACAGCAGGACGAAGAAAAGGTGCTGAACAAGATACA
GAAAGCAGGCAATGCAGAGCGAATACGGGAAAAGAAGAAAAAGGCAAGTGCCTTTAAGAAAGCCGAGAAC
CGACAAAATGAAATTGACCGTTTGTTTGCGAAAATGTATGAAGATAGAGCCTGTGAGAAGATAACAGAGC
GAAATTTTGTGATGTTGTCTAGCAAGTACCAAAAAGAACAAATAGAACTGGAACAGCAGATAACCAACCT
AAGAGAAGAATTAAGTAAAATGGAACAGGATATGATAGGTGCTGAAAAGTGGATTGAGTTAATCAAGGAG
TATTCCGTACCAAAGGAACTGACAGCACCGTTATTAAATGCAATGATAGAAAAAATCCTTATTCATGAAG
CAATAACGAATGAGGATAACGAAAGAATACAGGAAATAGAGATATATTACCGATTTATTGGAAAAGTAGA
CTGA
>ref|NC_013316.1|:c3520156-3519077 hypothetical protein; hypothetical protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGATATGAAATTTATTGAAACATTAAAGCAAAAGAGAAATGTCTGTGATTATTCGCAATCACGAC
TGGCACAGGAACTACAAATCAACAGGCAGAACTTAAATGAAATTGAAAACGGAAAAACAAAAGCCAGTAA
AGAAATGAAACATATACTCTTACATTATCTTGATTATTGTAATTGTACACAGCCTTTCACTTTAACGATT
GACTATCTGCGTGTTCGTTTTCCTACCACAGACGCATTGGAAATTATAAAAAATGTGCTGGCAATGAAAA
GCGAATATTTTATACATGAAGATTACGGAATGTATGCTTATGAAGAACAGTATATCTATGGGGATATTAG
TGTAAATGCTTCTAAAGATAGTTCTATGGGTGTTTTATTGGAATTAAGAGGTATGGGGTGTCGGGACTTA
GAATATGTTTTACAGGTAAGAGGGATAGACTGGTATTGCTTTTTAAGATGTTGTATAGATTATCAAGGTG
TTTTTAAACGCATAGATTTAGCAGTCAATGATATGGGCGGATTGCTGGATATAGAAATTCTAAGGGAACG
TTATTATGCTAACAAGGTATGGAAACGTTCAAGAACCCATGAAGCAGTAGACAGCGGAAAATTATCGGGT
ACACATGGAGATACTGCAAAAACTTTTTATATCGGTTCAAAGAATAGTTCTATCTACTTTTGCTTGTATG
AAAAAGAAAAGGAACAAAAAAGCAAGGGTATAAAAACAGATATTAAGAACCGCTTCGAAATTCGTTTAAA
AAATGGAAAAGCAGGACAAACGGTAGAGCAACTTGTTTTTTCAAGAAATCCCGAACAGACCATAGCAAGC
TTTATTCTCACACAGATAGATTTTCCCGATTATATTTTATGGGATATATTTTTAGATAATGTAACGACCT
CACTTCCGTTTATTATGACACCTGTTGCTGTTAATATGGATAAAATAAAACGCTGGCTAGAAAGACAGGT
CATGCCCTCTTTATTGATGATAAAAGAGATTGAAAAGAAAACAGGAGCAAATTATCTGGAAGAAATCGAC
AGGCATACAAGGCTAACAGAAAAGCAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3521183-3520536 hypothetical protein CDR20291_2961 [Clostridium difficile R20291]
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CAATATTTATACTGTGTTTTGGAATAGTTTTAGGAACTTTTGCAAAATTTTTAGATACTACAGCAAGCAA
TACTTTACCATTTATATTTGAATATTTAGATATTAGTAATTTTTTTGGTCGTTTTGCTATATGGTTATTG
ATTGCTTTGTACATTGCAATTTATAGTCATTCTTCCATAAGAGCATCATTAAATGTGTTAGTATTTTTCA
TTGGAATGGTTTCAAGTTATTACCTATATTCGTATTTTGTTGCTGGATTTTTTCCAAAAAATTATGCAAT
GATTTGGCTTGGTTTTACTGTCATTTCTCCATTGTTAGCTTTTATTTGTTGGTATGCTAAGGGGAAAAGC
AAAATATCTTTTATACTTTCAGTAATAATAATTGCAATTTTATTTAATTTTACATTTATTTATGGTTGGA
TTTATTTTGATGTGTATTCAATTTTAGAAGTGATAGTCTTTGGTTGTGCATTAATAGCTTTAAAACGTAA
CACCTTTAGGGAGACAACGTATATGATATTGAGTGCAGTTGTTATTGCTGTTATACTTAATATGTTAGTT
CCATTTCATTTTGGTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3524324-3522375 predicted enoate reductase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAGAAAATATCCAAATCTATGTAAGCCAATTAAAATTGGAAATGTAACATTCAAAAACAGAATGT
TTTCAGCACCTATGGGGGGAACAGACATAACAGCAGATTGTACAATTGGCTCAAAATCAACAGCCTTTTA
CGAATTAAGAGCAAAAGGTGGAGCAGGTGCAGTTACAATTAGTGAATGTATGGTTCATCCAGAAACAGAT
GGTTCACATGCATATCATCTAGACTTAAAAATAGTTGATTCCTTAGCAAGTTTTACTTATACAGCAGATG
CAATTCGCCGTCATGGAGCAATACCAAGTGTAGAACTATCTCATTCAGGACAATATTCAGGAACTTATTT
AGTTGACAAAGATAAGAAGCGAGGATTATCACAATGGGGAGTAAGTCCTAGTGTTCGTCCTGATGGATTA
GAGATAAAAGAACTTACAGAAGAAATAATTGCTGAAATAGTAGAGTCATATGGAAATGTTGCAGCATTGG
CTAAGAGAGCAGGGTTTGAGATGATTATGATTCATGGTGGACATGGCTGGCTAATCAATCAATTCTTATC
ACCTTACTTTAATAAAAGAACTGACAAATATGGTGGTTCTTTAGAAAACAGAGTTCGTTTTGCTAAAGAA
GTTTTAGATAGTGTTCGTAAAGCAGTAGGTCCAGGATTTCCAATAGAGTTTAGGATGAGTGGTTCTGAAT
TATTTGAGGGAGGGTATGATTTAGATTATGGAACAGAAATTGCTAAATTATTGGAATCAAGAGTAGATTT
ACTTCATGTATCAGCAGGTACATACCAAAGAGGGTTTGCAGTAACACATCCTTCTATGTTCTTAGAACAT
GGATGTAACGTATATCTTGCAGAAGAAATTAAAAAACATGTAAATATTCCAGTTGCTACTATAGGAGCAT
TAAATGACCCAGAAATGATGGAAGAGATAATTGCTAGTGGAAAAGCAGATGTTATTTACATGGCTCGTGC
ATTACTAGCTGACCACGAATTACCAAGAAAAGTTATGAGTAATCAAGATGAAAAAATAGTGAAATGCCTA
AGATGCTTCACTTGTATGGCAGAACGTGCTACCACTTCTACAAGACGCTGCACTGTTAATCCACTTATTG
GACGTGAATTAGATGGAACTGAAGTTGTTTCAGTATTAAAACCTAAAAAAGTATTAATAGCAGGTGGTGG
ACCAGGAGGATTGCAAGCAGCCATTACAGCTGTAAAGCGTGGACATAAAGTAATACTTTGTGAAAAAACT
AATGAATTAGGTGGAATTTTAAAGGGAGAACAAGCACTTCCATTTAAGTATAAAATGTATGAATTAGGAA
ATACTTTTGGAAAAATAGCAAAAGATTTAGGTGTTGAAGTACGTTTAAATACAACAGTTACAAAAGAATA
TGTTGAAAATGAAAATGTCGATGCATTAATTATAGCAGTAGGGTCTGAACCTCTTGTTCCACCAATAGAG
GGTCTTGATGGAGAAAATGTAGTAATAGTTAATGATTATTACGTAGAAAAAGAAAAAGTCACTGACGAAG
TAATAGTTTTAGGTGGAGGATTAGCAGGATGTGAGGCTGCAATTCACTTAGCTCAAGAAGAGAAGACTGT
TCACTTAGTAGAGATGAGAGCAGAACTTGCCCCAGATGCAAATATAAGGCATCGTCCAATATTATTAGAA
GAAATAGAAAGACAAGGTATATATGTATATACAGAACATAAGGGTTTAAGTGTAACAACAGAAGGTGTAG
TATGTATGAATAAATCTGGGAATAAAATAAATATTCCAGGAACCTCAGTAATATGTGCACTTGGACAAAA
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>ref|NC_013316.1|:c3525648-3524296 nitrate/nitrite transporter [Clostridium difficile R20291]
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AAAGATGGATTATATTAATTGCAAGTTGTTTCATCAATTTATGTATTGGTTCAATATATGCGTGGAGTGT
ATTTGCATCACCTATGGCAGAACATTTAAATAGTCTTGCTGGAACAACTTTTACAGCTGCTAGTTTAGCA
ATTGTATTTACAGTTACAAACTCAGTTGGACCTATTACTATGATTACAGGGGGAATGATAAATGATAAAT
TTGGTCCTAAAAAAGTTGTATTTGTAGGAGGATTAATTTTTGGTATAGGTATGATATTGGCAGGTTTCTC
AAAAGGATTGCCTATGTTGATTTTATCATATGGGATAATAACAGGTCTTGGGGTTGGCATGGTTTATGGA
TGTACAATAAGTAATTCAATTAAATTTTTTCCAGATAAAAGTGGATTAGTTGGTGGTATAACAACAGCAG
CTTATGGGTTTAGTTCAGTAATAATGCCTCCAGTTGCTAATTGGATAATTAATAAATATGGAGTAACTTC
TGCATTTAAATCAATAGGTTTAGTATTTCTTATAATTGTATGTGTTTCTTCTTTCTTTATCAAAAAATGT
CCAGCAGATTTCACACCAGAAGGATGGGTACCACCAGAGAAAAAAGGAAAAGTAAGAGTTGTTATTAATA
AAAATTGGAAAGAAATGCTTTCAACACCTATATTTTATCTAATGATTATAATATTAACTTGTGGAGCTTT
CTATGGATTAATGTGTGTGTCATTAGCATCTTCTCTAGCAACAAATATGATTGGGATGACAAGTTCAGAT
TCAGCAATAGTGGTTTCAATTTTAGCCTTGTTTAATACATTAGGCCGTATTGTTGCAGGATATATATCAG
ATAAAATTGGTAGAATAAATACTTTATCAGGTGCATTAGTTATTTCAATTTTTGGTTTATTATGTTTGTT
ATTCTCAAGAGAAGGAGATGTAGCAACATTCTATATTGGAATAATAATTATAGGTATATGTTTTGGTTCA
TTTATGGGAATTTTCCCAGGATTTACAGTAGATAAATTTGGACCTAAAAATAATAGTGTAAATTATGGAA
TCATGTTTATTGGTTTTGCTTTTGCAGGATATATTGGACCTGCAGTGATGAAAAATGTATATTCTGTAGA
TGGCAATTATCAAAGGGCTTTCATTATAGCTATAATTATAGCTTTAATAGGTTTTATATTAACATTTTTA
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AGAAAATATCCAAATCTATGTAA
>ref|NC_013316.1|:3525846-3526403 transcriptional regulator, padr-like family; transcriptional regulator, padr-like family [Clostridium difficile R20291]
ATGCGAACTTTAAAGTATGCAATTTTAGGATTATTAAATAGAAATCCTATGACTGGTTATGATATCGTAA
AGGAGTTCAATTTTCAATTAGCTGAGTTTTGGAATGCAAAGCATAGTCAAATATATCCTGAACTAAAAAA
ATTGGTAAATGAAAAGCTTATTGTATATGATATTAAAATTAGTGGTGATGTATTAGAGAAAAAGTTATAC
ACAATCACAGAAAAAGGTAAAGATGAGTTCTTGAAATGGCTTGAAAAGGATGAGCCAATGGAAAGAACCC
CTAAGGATATTTTTCGTCTTAGAATGTATTTTTCTAATAATTTAGATATAGATACTAGGCTTATTTTACT
AGAGCATCAATTGCTTCAACACCAAGAAAGAATTACGTTCTTGTACAGTCAAATGGAGCGTTATAGTGAA
GTTCCTCCTCTTGATAGTAATGATTTTGGTGATTATATAGTTCTTGATGGAGCTATTATCAGGGAACAAG
GTGCTATAAAATGGCTAACAAATTGTATTAACCATCATAAAAATTTGGATAATACTACTTTGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:3526848-3527597 putative flavodoxin [Clostridium difficile R20291]
ATGATTTTATATTTTAGCGGTACTGGTAATAGCCGATATGTGGCTCGTAAAATTGCACAAGAATTAAATG
ATGAACTGATATCACTAAATCAACTTATAAAAGAGGAAAAAACAGATGAATTAATATCAGCAGGTAAACC
ATTCATATTCGTATGTCCTACTTATGCATGGAGATTGCCAATAGTGGTTACAGATTTTATAAAAGAAACA
AAATTTCTAGGAGACAACAGAGTTTACTTTGTAATGACTTGTGGGGGAGATACAGCAAAATCCATAAACT
ATATTCAAAAACTATGTAAATACAAGGAATGGCAATTAAAAGGTATGGCAGAAATTAAAATGCCAGAGAA
TTATATAGCTTTATTTTCTACAACAGACAAAGAAACATCAAAACAAATGATTAAAGAAGCAGATAAACAA
ATATATAGGATTATTTCTGATATACGCAATGAAAATGAATTTGAAACTATTACTCCTAGTGGCTTAGGAG
GTACAATTAAAAGTGGTATAATAAATACAGTTTTTTATAAGACAATTATTAGTGCCAAAGGATTTCATTA
TACTGATAAATGCATTGGCTGTGGAAAATGTGTAGAGCTATGTCCTTTAAATAATATTAATTTAAAAAAC
AAAAAGCCAGTTTGGAAAAATAGCTGTACTCATTGTATGGCATGTATTTGTGGTTGCCCCACTGAAGCTA
TTGAGTATAAAAATAAAACTCAAAACAGAGAAAGATACTATTTAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3528128-3527763 ArsR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAAGAATGTCAACAAAGAATGCAAGAAATAACATCTAAATTTAAAGAATGTCGCAAAGCTATCT
CTGCTATGGGTGATGAGACTAGACAATTGATTTTAATTGCTCTCTTAGAGAGTGATTTTAATGGTATACG
AGTGGGAGAAATCACAAAAAAAACACATCTTTCTCGTCCTGCTGTATCTCATCATCTTAAGATATTAAAA
GAAGCAGAGATTGTTAATTTGCGTAGAGAAGGAACGAAAAATTATTATTATCTTGATTCAAAAAAATCAC
AATGGAAGTCACTAACAGAGCTAATAAATCTTATATTTGTTGGAATACAACATATTAGTGAAAATGATAT
AAGAAAAGGTGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3528926-3528144 putative nitroreductase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATGAAATACCAACATATAATAGAAGTTGACAAAGAACTTTGCATTGGATGTGGGCTTTGTAAAA
ATGATTGTCCAGTAAACAATATAATTATAGAAAATAAAAAGTCAGTAATTAAAAAACAAGATTGTCTAAT
GTGTGGACATTGTGCAGCAATATGTCCCACAAAAGCTATTACCTTGACAGGATTTGATGAACCTCCTATA
GAACTTACAAATAAGCCAAAGCTAGATTCAGATGAATTACTAATGGCAATTAAATCTAGAAGAAGTATAC
GTAAATTTAAAGACAAAGAAGTTTCTTCAGAAATTGTAAAGCAAATTATTGAGGCAGGTAGGTATACCCC
TAGTGCTAAAAATTCACAAGATGTATCATATATTGTTTTAGACAATAAAAAGTCAATTTATGAAAACGAA
GCAGTGAAATTTTTTAGAAAAATAAAACCTATTGCAAATATAGCTATTAAATATTCAAAAGAAGTTGAGA
TTGACGATAACTTTTTCTTTAAGCATGCTCCTATTGCAATAATGATAATTACAAAAGATAAGATTAGTGG
TTCACTTGCAGCATCAAATATGGCATTAATGGCAGAGTCTTATGGTCTAGGTGTTTTATTTAGTGGATAT
TTTTCAGATGTAGCAAATAATTCGCCAAAATTAAAAAAGCTTTTAGGTCTAAAACGCAGTAATCATGTTC
TTACAACATTAGTAATTGGATACCCAGATGTTAAATATAGACGTACTGCACAGAAAGAAGTAGCAACTGT
TAGATACTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3530758-3529331 6-phospho-beta-glucosidase [Clostridium difficile R20291]
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AAGACGAAAGAGGATTGGCAAATGTAGATGTATGTCCAACAGGAAAAGATAGAACAGCAGTTATTACAGG
GAAACTAAAAATGTTTGATTTTGATGATGAGCATTATTATCCAGCTAAAACTGGTATTGATATGTATCAT
AATTATAAAGAAGATATAAAGTTATTTGCTGAAATGGGATTTAAAGTATATAGAATGAGCATTGCATGGA
GTCGAATATTTCCAAAAGGTGATGAAGAAACACCAAATGAAAAGGGACTTCAATTTTATGAAAATATATT
TAAGGAGTGTAAAAAATATAAAATAGAGCCTTTAGTCACTATTACACACTTTGATTGTCCAATGCATTTA
GTTAAAAAGTATGGTGCATGGCGTAATCGAAAAATGATAGGTTTCTATGAGAAATTATGCAATGTTATCT
TTAGAAGATATAGAGGATTAGTGAAGTACTGGCTAACCTTTAATGAAATAAATATGATTTTACATGCTCC
ATTTATGGGTGCTGGTATTTGCTTTGAAGAAGGTGAAGATGTTGAAAAGATAAAATATCAAGCTGCTCAT
CATGAGCTTGTAGCTAGTGCAATTGCAACTAAAATAGCACATGAAGTTGATTCAAATAACTTAGTTGGAT
GTATGTTTGCAGCTGGAAGTGTATATCCTTATAGTTGTAATCCTAATGATGTATGGGAAGCTACAAAGTT
AGATAGAGAAAATTACTTCTTTGTGGATGTACAATCTAAAGGTAAATATCCTAACTATGCGTTAAAGTAT
ATGGAGCAAAAAGGTATTACACCAGAAATGGAACCTGGTGATATTGAATTATTGAATAAATATACAGTAG
ATTTTATTTCATTTTCATATTACAATAGCCGTTGTGTTAGAACTGATGAAAATGCAGATGATATGGCTGA
AGGAAACATATTTACATCTGCTAAAAATCCATATCTTTCATACAGTCAATGGGGATGGCCAATTGACCCA
TTAGGTTTGAGAATTACACTAAATCATGTATATGATAGATATGAAAAGCCACTATTTATTGTAGAAAATG
GATTAGGTGCTAAAGATATAGCTGATGAAAATGGTTATGTAGAAGATGATTACAGAATTAATTATCTAAG
AGAACATATAAAAGCTATGCATGATGCAGTTTCTATAGATGGGGTCGATTTATTAGGTTATACTACATGG
GCACCTATTGATTTAGTAAGTGCTGGTACAGGTGAAATGGAAAAGCGTTATGGATTTATATATGTAGATA
GAGATAATAGTGGTAATGGAAGTCTAAGAAGAATGAAAAAGAAAAGTTTTGAATGGTATAAGAAAGTAAT
TGCTTCAAATGGTGAAGATTTATATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3532747-3530819 PTS system, IIabc component [Clostridium difficile R20291]
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TAGTACACTGTATTACAAGATTACGTTTTACTTTAAAAGATGAAAGTATAGCAAATGACAATGTATTAAA
AAACATGGAAGGTATTGTTACTGTAATGAAAAGTGGAGGACAATATCAAGTAGTTATAGGAAATCATGTT
GAAGCTGTCTATAAAGATGTAGTTGAAATAATTGGTTTAGATGATTCAAGTACAAGTTCAGAAACTAAAA
AATCAGGTAATATACTAGATAAAGGTATAGATATAATATCAGGAATTTTTCAGCCAGTGTTAGGAATAAT
GGCAGCTTGTGGTATGCTGAAAGGATTTAATGCATTATTTGTAGCAATGGGATTATATAGTGATGTATCT
GGTGGTTATATGGTAATAAATGCAGCAGGAGATGCATTATTTACATTCCTTCCTTTGTTCTTAGGATATA
CTTCAGCTAAGAAGTTTGGATTAAAACCAATGTTGGGATTAGCACTAGGAGCTGCAGTATGTTATCCTGC
TATACAAGGTAGCAGTATATCAGCAGGAGCAGATGTGATGTACACTTTATTTAAAGGAACAATGTTTGCA
TCACCAGTATATATTGATTTCTTTGGACTACCAATTGTATCAATTGATTATACTGGAACAGTCGTACCAA
TTATATTTATAGTGTATTTTGCTTCTAGGTGTGAAAAATTATTTAATAAGTTTGTTCCAGATTTAGTTAA
GTTTTTCTTTGTGCCAATGCTTACATTATTAATAACAGTGCCTGTTGCACTTATAGTTATAGGTCCTATC
GCAACATTTGGTTCTACACTTATTTCACAAATTGTAATTTCAATAAGAGATTTTAGTCCACTATTGGCAG
GTGCTATAGTAGGGTTTACTTGGCAAATTCTTGTTATTTTTGGTATGCACTGGGGATTTATTCCTGTATA
TATAAACAATGTTATGACTTTAGGATATGATAATGTTATGATGCCATTCTTTGCTTGTACATTTGCAAGT
TCGGCAGTTGTGTTGGCAATATTTTTCAAGACTAAAGATAAAAAACTAAAAGAGATGACAATACCAAACT
TTATATCTGGTATATTTGGAGTTACAGAGCCAGCAATTTATGGAGTATTATTGCCTTTAAAGAAACCATT
TATAATAAGTTGTATTGCTAGTGGGATTGGAGGCGCTTTCTACGGATTCTTTAATCTTAGAAAATTTATA
ACTGGAGGTATGGGAATATTTGAACTTCCAGCAATGATTGAACCAGATGGGGGAATGGGCAACTTAATAG
TAGCTCTTTCTGGTATAGCTATATCAATGGTCGTAGCTTTTGTATTAACTATGATTTTATATAAAGATGA
GAAAGTAGAAGAGTCTAAAAAAGTAAGAAATAAGGGGAAAGAAGAAATAAAAGAAGTCAAGTCTACTAAA
TTAGAAAGAGAAATAGTAGCAAGTCCTATAAAAGGTGAAGTATTAAAATTAAGTGATATAGAGGATGCAG
CATTTGCATCTGGTGTACTAGGTCAAGGGGTGGCAATAATACCTAGTGATGGAAAAGTAGTTGCTCCAGT
AGATGGTGTAGTTACAACCTTATTTCCTAGTCTACATGCTATAGGGATTCTTTCTGATACAGGTGTTGAA
GTGCTTATTCATATTGGATTAAATACTATTCAATTAGAAGGGAGAGGTTTTGAGGCATGTATAAAACAAG
GTGATAGAATTACAAAAGGTCAAACTATATTAAACTTTGATGTTGATGCAATAAAAGAGTTGGGGTATAG
TACTGTAACTCCAATTGTTATTACAAATTCATCACAATTTTTAGATGTAGTAGAAACAGAAAGTAAAAAT
ATTGAATTAGAAGATAATCTAATTACAGTCTTATTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3533755-3532892 transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
ATGCTTAAAAGGAGGATAATCATGATAATTAATAAGATATTAAACAATAATGTTGTAATCACATTAGATG
ATAATGATGAAGAAGTTATCGTTATGGGTAAAGGAATTGGTTATCAAAAATCAAAAGGCAATCTAATAGA
TAAAACTAAAGTAAATAAAGTATTTAGAATATCAAATAAAGAAATATCAAACAAACTACAAGAATTACTC
AATAATATTCCTATAGAACACATGAAATTATCAAGTGAAATTATAGAATACGCACAAATAAAGTTAAACA
AGAAGCTAAATGAAAGTATTTACATATCCTTAAGTGACCATACATATTCTGCAATTCAAAGAATGAAAGA
AGGAATAAATGTAAAAAATGCAATTCTTTGGGAAATTAAAAGATTTTATAAAGAAGAGTTTGAAATTGGA
ATGAAAGCACTAGATATTATTGAAAACAAAACAGGTATAAAATTACCAGAAGATGAGGCTGGATTTATAG
CCTTTCATATAGTGAATGCTCAGTTAAGTGAAGGTCATACTTTGGCATCTGATATTACGAAGTTAATACA
AGAAGTACTTAGCATAGTTAGGTATCATTTTAGGATAGAATTTCATGAAGAATCAGTGTTTTATTATAGA
TTTATAATGCATTTAAAGTTTTTTGCGCAAAGATTGCTTTTAGATAGTGCACATGAAGGTGAGACAGACA
AAGAATTACTAAGCATTATTAAATCTAAATATAATAAAGAGTTTGAATGTGTAGTTAAAATTAAAAATTT
CATTAAAAAACAATATAACTACATATTAACAGATGATGAGCTTATATATTTAACAATACATTTAGCTAAA
GTAGTTAAAGACTCAAATATGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3535451-3534051 PTS system, IIabc component [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAATAAATATGAAGAAGTAGCTCAATTGATAATTGATGGACTTGGAGGAAAGGATAATATAATTG
ACTTAACTCATTGTATGACACGATTAAGGTTCATCTTAAAAGATGAAAAGAAAGTCAATGCAGATAAATT
AAAATCTATAGATAAGGTAGTTGGAGTAAACTCAACTTCAACTCAATATCAGGTCATAATAGGTAATGAG
GTAGGTGTTGTATTTAATGCAATAATAAATAAGGGGATAAATACCACAGGAGATATTAAAAGCGATATAA
AAAATGAAAATAAAAAAAATAGTATTTTAAATAATATAATAGATACAATAACTGGTTGTATGACACCTAT
GATACCAGCCCTTACAGCATCTGGGATGATAAAAGTTATATTATCTCTTTGTACCACTTTTAATTGGCTA
TCATCAAATTCAAGTACATATAGAGTATTAGATATAATAGGAGATGTAGCATTTTACTTTATGCCTATAA
TACTTGCAATAAATGCAGCTAAAAAATTTAATGTTAATACATCAATAGCAGTTATAGTAGTAGGTGTGTT
TTTACATCCAAATTTCTCTGCATGGGTATCAAGTGGGGACCCTATATCATTTATAGGAGTACCAATTCAA
GGTGTTATATATGCAGCATCTGTTATCCCTGCACTTTTAACAGTATGGATGATGTCATATATAGAAAAAT
TCATTAATAAATTAACACCTAGCATGTTAAAAACAATTTTAAATCCAACTTTAGTATTATTAATAAGTGC
GCCAATAGCATTAATAGTAATTGGACCAATAGGAAATTTCTTAGGAGAGGGATTAGCTAGTATAATAAAT
TTACTACAAGGAAGGTTAGGATTTATAATGGTTTGTTTATTAGCAGCTGCAATGCCATTTATCGTTATGA
CAGGGATGCATCATGCATTGACTCCTATATTCATATCAGCATTTGCAACTACAGGACAAGAATCGCTAAT
ATTAATATCTCAAGTTTGTGCTAATTTAGCGCAAGGTGGCGCGACATTAGCTGTAGCATTAAGAAGCAAA
GATAGTAAGATGAAACAGTTAGCATCAGCTGCATGGATATCAGCTATCATGGGTATAACTGAACCAGCTC
TTTATGGAGTTACATTGAAACTTAAAAAACCTGCTATGTTAGCATCTATAGGAGCAGGAATCGCAGGGTT
ATTTGCAGGAATTACTCATGTGACTTTATATGTTCCACAAAATAGTATAATGGCAGTACTTGGATTATCA
GGGGAAAAGGGAATTTCAAATATAGTAAATGGACTTATAGTTATATTTATAGCATTGGTTGCTCCATTTA
TTATGACATATGTTTTTGGAGTTGAAAAAAATGTTAAGGAAAGTACAGATAATGTAGTAGAGGAAGTATA
A
>ref|NC_013316.1|:c3536161-3535490 beta-phosphoglucomutase [Clostridium difficile R20291]
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ATGAGATAGCAAAATCGCTAGATATAGAAATAGATGAAACTTTTAATGAAAAATTAAAAGGCATAAGCAG
GGAAGAATCATTAGATAAAATATTGTTATCTGCTAATAAAGTAGATAGTTATACTAAAGAGGAAAAGTTA
AAGGTGTGTGAAGAAAAAAATAACATTTATATAAAGTTAATAAACTCATTAACATATAAAGATATATTAC
CAGGGATAAATGAGCTTATAAAAGAACTTAAAAAAAATAATGTGAAATTGGGAATAGCATCTGCTAGTAA
GAATGCACCTAGGATATTAGAATCTTTGGGAATAAAAGATGAATTTGATTGTATAGTAAATCCATCCTTA
TTAGAAAGGGGAAAACCATATCCTGATATTTTTATTGAAGGGAGCAAGATGCTAAATTTAAAACAATATG
ATTGTGTAGGAATAGAAGATTCTTATTCAGGTATTAAAGCTATAAATGCTGCCAATATGACATCAATTGG
TGTGGGGAAAAAAGAAGTACTAGGAAAATGTGACCATATTGTAGAAGATACTAGCTTATTAAATTACAAT
ACACTATTACAAGCTTGGAGTAAAAAGATTAATTTGGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3538553-3536163 putative glycosyl hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTTAATATTTACTACTAAGGACCAACTTATAGAGCAAGGGTTTAGTAAGGATACAATAAAATCCA
ATGAAACGTTGTTTACACTAGCTAATGGACATTTAGGAGTTAGAGGGAATATTGAAGAGTCCGATTTTAA
TAATGAGTATGTAGATAATATGGGTACATATGTAAATGGATTTTATGAAGAATCTCCAATTACATATGGA
GAAAGCGCTTATGGCTATGCAAAACAAAATCAGACTATCTGTAAGTTACCTAATGCTCATATAGTAAATT
TCTCTATTGAAGGAGATTGCTTTGATTTATCAAAAGGTATTACAAGTGAACATACTAGGATACTAGATTT
AAATGAAGGAATTGTTAAACGTTCATTTATATGGGAAAACTCTCGTGGTAGAAAAGTTAAAGTATCTATA
GAAAGATTAGTATCACAAGATATAGAAGAATTAATGATGATTTCATATACAATAACACCATTGAATTTTA
ATGGAAAAATAAAATTTAAAAATAAAATGGAAAATAGTATGGAGAAGTTTAATTGTGAAAAAGTAGATGA
CCCAAGAGTGGCATCTATAAATAAGAAGCAATTTAAAATTAATGTAAAAAAATATAACAATAAGTATTTT
ATGAATTTAGTTACAGAAAGAAGTAGATTAGGGTTATGGTGTGGGTTTGATTCATATATTACTTGTGGAA
ATATTACAAATGAGACCTATAATGTTTCAGATGAATGTATTGAGCGAGAAATAGAAGTCTATGCCAAAAA
AGATGAAAGGTTAAATTTAGAAATTGTTGTAGGCTATAGTAGAGTATATTCTGATTTAAATCTAAATGAA
GAACGTTTAAAATCATTAGAATGTCTGGAGTCGTTAAAATGTTTAGAATCAGAAGCACATTTAAAATCAT
TAGAATTGGTTTTAAGAGAAGCATGTAATATTGGATTTGATAAAGTCAAAAATATTCAGAGAAAGAAAAT
GAATGAGTTTTGGACAACCTCTGATGTAGAGATTGAAGGCGATAAAACTCTTCAACTGGGTATAAAAACC
AATTTATTTCATATTTATCAATCAGCAGGAAGAGATGGAAAGACTAATATATCAGCAAAAGGTCTTACAG
GTGATGGCTATGAGGGGCATTATTTCTGGGATACAGAAATGTATATATTACCATTTTTTATATATACTCA
ACCATCCATTGCTAGAGCTTTATTAGATTATAGATACTCAATCTTAGATGCATCAAGAGAAAGAGCTAGG
GAACTTGGAATAAATAAAGGTTGCTTATATTCATGGAGAACTATAAATGGTAATGAATGCAGTGCATATT
ATCCAGCAGGAACAGCACAGTTTCATATAAATGCAGATATAGCTTATGGTATTAGAACGTATTTTGAAGC
AACTAATGATGAAGAATTTATGATGCAAAATGGCTTAGAAATTCTTATAGAAACAGCAAGATTTTGGGTT
GAATTTGGAGATTATATAGAATTAAAAAATAATAAATTCTGTATAAATGGAGTAACAGGACCAGATGAAT
ATACAGCAATAGTAAACAATAATTACTACACTAATTTAATGGCTAAATATAATTTAATATATGCAGTACA
GATGGTAGATAAATTTAAGCATAATTTATTTTCAAATGAAGTATTTAGAAAAGTTAAATTACAAGAATAT
GAAGTAAAAGACTGGATAAATGCCGCTCAAAATATTTATTTACCATATGATGAAGAGAAGAAAATAAGCA
AACAAGACGATTCATTTTTAGAAAAATCAGTATGGGATTTTAAAAATACACCAAAAGAAAAATATCCATT
ACTTCTCAATTATCATCCATTAACAATATATAGATATCAAGTAAATAAACAAGCAGATACTGTACTTTCA
GCGTTGCTTTTCCCTGATGAGTTTAGCTTAGAACAAAAGAAGAGAGATTTTGAATACTATGAAAAAATAA
CTACTCATGATTCATCTTTGTCAAGGTCAATATTTGGAATGATGGCAAGTGAAATTGGAAATCATGAAAA
AGCTTATAACTATTTTATGGACACAGCATTAATGGATATTAATAACCTACAAAAAAATACAAGTGATGGA
ATACATGCTGCTAATATGGGTGGAACATGGATGAGTTTAGTATATGGATTTGCAGGAATGAAAATAAAAA
AGGATAAATTAAGTTTTGAACCAAGGATACCTAAACACTGGAAAAATATTAAATTTAATATATTATTTAG
AGATAATTTAGTTTCTGTAAATATAGAAGAATATAAATCTTATTATAAGTTAATCAAAGGTAAAAACATA
AGCATATTACATGATAATAAAGAAATAAAATTATCAAAGAACATAATAGAAGTTAATAATTGTTTTAAAG
GGAGTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3540027-3538579 putative 6-phospho-beta-glucosidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTAGGGAAAGATTTTTTATGGGGAGGGGCAATTTCAGCCAATCAAAGTGAAGGATTTTATTTAG
ATGGAGGAAAAGGTTTATCTCAGTTTGATAAACTCCCATTAAATGATAAGAGATTAAAAGATGTATGTTT
AGATGAGGATAATATTTTAAATGAAAATAATCAATACTATCCAAGTCATATAGGGATTAAATTTTGTGAA
AATTACAAAGAAGATATAGCAATGTTAGCAGAAATAGGTTTTAAATGTTTTAGATTTTCTATATCTTGGT
CAAGAATATTCCCAACAGGAGAAGAAAGTGAACCAAATGAAAAGGGATTACAACTTTATGATAATATAAT
AAAAGAATTAAAAAAATATAATATAGAGCCATTAATAACGATAAGCCACTTTGATATACCTTATTCTCTA
GTTGAAAAATATTCTGGGTGGGCTGATAGGAGAGTGGTTAATTTATATGTAAAATATGCTGAAATTTTGA
TGAAAAGATATAAAGATGATGTCAAATACTGGATTCCTTTTAACGAAATGAATATGATAATTCATATTCC
ATATATAGGTGCTGGGTTAACTTTTATAGCTGATGAAAATCAACTTCAGAAAAAATATCAAGCAGCACAC
CATCAATTATTAGCTAATGCAAAAACTATAGAAATAGGAAGGTATATAAATAAAGAATTTAAGTTTGGGT
GTATGTTAGCTGCTGGAAAAACATATCCATACACATGTAAACCAGAAGATGTATTTGCAACTTTAGAGCA
TGAAAGGCATAATTTGTTTTTTTCTGATGTTCAAGTTAGGGGTGTGTATCCAAGCTTTATGAATTATTAT
TTAAAATCAAATCAAATAAAATTAATAATAAAAGAGGAAGATTTATCAACACTTAAGGATAATACTGTAG
ATTTTGTATCTTTTAGCTATTATTCTAGTGCTTGTAGTTCAGCTAGAGCTGAAGGTTTAGAAAAATCAAA
GGCAAACGGACCAGAAACCATAAAAAATCCATATCTTCCAAAATCAAATAGTGTATGGCAAAACGACCCT
GTAGGGTTAAGAATAACTATGAATCAGTTATATGAAAGGTATCAGTTACCTTTATTTATAGTAGAAAATG
GACTGGGTACTCAAGATATTGTAAATGAAGATGGAAAAATAATTGATGATTATCGTATAGATTACATGAA
AGAACATATTAAAAATATGATTCTTGGAGTAAATGAAGATGGAATAGAGCTTATAGGATATCTTATGTGG
GGATGTATAGATGTAACCAGTGTAAGTGAAGGAAAGATGACAAAACGATATGGCATAATTCATGTTGATT
CTGATGACTATGGAAGAGGCTCATTTAAAAGAACTAAAAAACAAAGTGCTTTTTGGTATAAAAAAGTAAT
AGAAACAGATGGAGAAATTTTATTTAATGATATGGAAACTCATGCATAA
>ref|NC_013316.1|:c3541319-3540432 AraC-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAATATATTTAGAAATGCCTAAATTAATACATGAATTTCCTTTTCGTAGTCTATCAAATGAAGGAG
AAGTATTAACAACACCACACTGGCATAAGGAAATAGAAATATTACTTATAACAGAAGGTGTAGTAAATCT
ATTTATAAATGACAAGCCTATGCAATTAAAAAAAGGCGAGATAGTGATAATAAAAGGAGGAGATATTCAT
TATATACTGCCATCACCGGGAAGTGAAAGATTAGTATTTCAATTTGATATATCTTTTTTTAATGATTTAA
TTTTATTAAATGAGGAAAAAGAAAGCTTAATTAATTTATTCAGTAGTATAAAAAAATGTAGTAGAGATTG
GTCAGCAAAAATAAGAAAGTCAGTTTTCGATATATTGATAGATATCTACAATGAAGACCTATACAAAATA
GAAGGATATAGTTATGCAATAAAAGGTAAAATGTATAATTTAATTCCTATATTATATAGACAGATTCCTA
GAGAAATTGAAGAAAATACAGTAGAATATGAAATAAACTCTAAAGAGATATTAGAGAGATTGAACAATAT
ATTCAAATATGTAGAAAAAAATTATAAACAACCTATAAAATTAGAAGATGTGTCTTATGAAGTAGGATTT
AGTGTATATTATTTTACTAAATTTTTCAAAAAAAATACAGGAAAAACATTTATAACTTTTTTAAATGAAT
ATAGATTAGAAAAAGCAAAGTGGATATTACTTAATAACAATATATCCATTGTAGATTTGGTTGAAGAAGT
TGGTTTTGGAAGTACAAAAACTTTTTACAGAGTATTTAAAGAAAAAATTGGAGTCTCTCCATTAGAATTT
AAAAAAAGATATAATAGCTTGGAGAAAAAAGGGGGTGCCTCAAAATGA
>ref|NC_013316.1|:c3541868-3541419 PTS system, IIa component [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAATTAGAGAAATATTAACAGAAGAAAGCATTATTTTAGATTTGAAATCAACTACAAAAGAAGGCA
TAATACAGGAATTAGTAGATAAATTATACGATACAGGAAGTATAACTTTAAAAAGTAAGTTTATAAAGGC
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AAATATGTAAAGAAGGCATCCATAGTAATAGGTAAATCTAAAAAAGGTGTAGATTGGCCAAGTATAGATG
GCTTACCTGTAAAGGTAATAATTATGTTTGCTATGCCACAATCTGGAGGCAATGAAGATATGATATTAAT
ATCTAAAATAGCTTACATTTTAGGTGGTAAAAATATAAGTGAAAGACTTTTAAATGTACATACAAAAAAA
GAAATATTAGATATATTTTATGAAGTGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3543765-3541858 transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
ATGCTTGTGTCGAGGCAAATTGAATTTCTTAAATTGATACTAAACGAAAATAAATATAGACCTATAAAAT
ACTTTAAAGATAAATTAAATGTATCTGATAAAACTTTACAAAAAGATTTGAAGATGATTGAGAAATATTT
AGAAACTTTTAATATAAAAATTGATATAAAAAGAGGCTATGGAATATTAATAGAAGATTTAGCAAAGAAG
AACATAGACTTAATTAATAGTTTAAATATACAATCGAAGGAAAATAAATCTTTATCAGTAGAGCAGAGAA
GAATGGAGATTTTAAAGTATTTATTACTAAATTCAAATAATATAACTTCAATAAATCAGTTAGCAGATAA
ATATTATGTAAGTAAAACTTCTATAGTAAATGATTTTAAATATATAGAGGCATGGATAAAAGAATACAAT
TTAAAACTTAATAAAACTTTAGAAGGAACTAAGATTATAGGTAAAGAAGTGGATATAAGGAAATCGATTG
CCAAAATGATGGATGATTTATTAGATGAAAATTATGAACAACATGATATATCTGAGTTAACAAGATTAGA
TTCTGCTACATTTAGTGCATTGATAAATTTATTTGATATTGATTCTATTATATTTGTAGAAACTATAATT
ACAGAATTAGAATACAATTTAGGATATACTATAAATCAGCCCTACTATATAAATTTAATTACCCATATAC
TTATATGTTTAAAGAGAATCGAAGAAGGTAATCAAATAGAATCTCAGGAAGAAAGAGAAATTTCTGTAGA
TAATTTGGACGAGTTAGTATATAAAAATGTCACTACACTTATAGATAAAATAGAAAATAGATACAGAGTA
AAAATAACGAAAGATGAAATTATGTACATATATATTTTTTTGGTATCATCTGGATTTAGTAGCGAAAATA
ATAGTAGTTATAATGATGAATCAGATATATTAAGTGAAAGTGAAAAAGTTTCATCTATAATGATAGAGAA
TATGTCACAATTTTTAAATATAAATCTCAAAAATGATGACTTACTACAAAAAAGTCTAGCATCTCATGTA
AGGCCTATGTTAAACAGATTAAGATATGATATCCAAATAAAAAACCCGTTGTTAGGAGAGATACAAGAGC
GATTTTCAGATGTGCTGGGATTATGTATGATGACTATAAATATTATGACAGAGTATGATAATCTGAAGAA
TATTAGTATAGATGAAGTTTCGTATCTTGCCACATATTTTCAAGCGGCAATAGAAAGAAATATGAGTAGT
AAAAGAGTAATAGTAGTTTGTCATACAGGATATGGAACATCTCAGCTCCTTGCAGCCAGATTAAAAAGAG
AATTTCCTGAATGGACTATAGTTGATATAGTTCCTATGCATCAGTTGAGTAAGCGAAATTTAGATGATGT
AGACTTTGTAATATCTACTGTAAACTTAGATTTGAAAGATAAATTACATATAGTTGTATCAGTACTATTA
ATGGAAAGTGATATTAATAATATAAAAAATGCTTTACTTTCTAAACCTAAAAAAAGTATGAACTTAGATA
CAAACTTATTAGGAATGTATTTAGAAGATAATATATATTTTAATTTTGATGTAGCTCAGATGGAAAGTTT
AATAGGTGTGAATTTAGGGAGTAAATATGAATCTATTTCATTAGGAAAAGATTTGAATATATATATACAT
AAGCAAAGTAAATTAAATAAAGGGATAATGAATATCAATAATGTTACTAGAACGATTGATATTTATTTAG
AAATTAGTAATCAAAGTTTTTTAAAGAATATTTTAATGGAAATATCAAATTTATATAGGCAAAAGAACTA
TATAAACTATATAATAGATTGCAAGAGCAAAGAGGATATTAAAATATTATTTAAGAATAATCTATTGGAG
AAAACAAATGGAAATTAG
>ref|NC_013316.1|:c3545928-3544033 PTS system, IIabc component [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGGTAAAATACTACGAAGCGATTGTATTGTACTAGATAAACAATTACAAACAAAAAAAGATGTAA
TTAATTATATGGCAAATCATTTGTACCATGGAAATTATATAAATAATAAAGAAAAGTTTATAGCTGATAT
TAATAAACGTGAAAAAGAATCATCAACTAATATGGGTAATTTAATAGCTATACCTCATGCTAAGTCAAAT
GTAGTAAATCAACCTGTAATGATGTATTTAAGAACAGATAGAGAGATTACAGATAATGATGGTCAAAAAC
TTAGGTCATTTTTTATGATAGCAGTTCCAGAATCAGGTTCAGATGAACATCTTAAGATTATATCTAAACT
AGCTACATATCTAATGGAAGAAAATTTTCTTAAGCATCTACTAAGTGCAGAAACTCCATACGAAATATTA
AGTATATTTAATAATAAAGCTGCAGAATCAGGAGATTTTAGTAATAATCAAAATAAAGGTCTTATAGTTG
GGATAACAGGATGTCCAACAGGTATAGCTCATACTTTTATGGCAAAAAAAGCATTAGAGGAAGCAGGGCA
AGAACTTGGATATGAAGTTAAAATAGAAACTCATGGAGCTATAGGTGTAGAAAATAAGTTGACTAAAGAA
GATATAAAAAGAGCTGAATACGTAATAATAGCTTGTGATAAAGAAGTTCAACTGAGTAGATTTATAGGAA
AGAAAGTGCTACAAAAGAAAGTAGTAGATGCTAAGAATGTTTCATTAGCTAAAAATTTAATTATAAACGC
TGAAAATGGAATGGCTAAAGAAATTAAACCAGGTGGAAAGACTTTAGAAGATTCAAAAGAAATGCTTCAA
GGGTCAGAGACAAAGGGTGTTTATAAGCACTTAATGAGTGGTGTATCTGAAATGATTCCATTTGTAGTGA
TAGGTGGAATTGGTATAGCCATAGCATTTATGTTTGGTATATTTGCATCAGACCCAACTCATGAAACATA
CAACCCTATAGCTGGATTCTTTGGACAACTTGGAGGCGATTCAGCATTTAAGTTATTTATACCGATACTT
GCTGGTTTTATAGCTAAATCAATAGCAGGAAGACAAGGATTTCCTCCTGCTATGATAGCTGGTTTTATGG
CAGTTATTGGAGGTTCAGGGTTTATAGGTGGTATGGTAGCTGGTTTTGCAACAGGATATATAGCTTTAGG
AGTAATGAAGATAACAGAAAATTTACCAGATGTATTAAAAGGAGTAAATGCTGTATTGATATGTCCACTT
TTGATTGCATTTACGAGTGGAGCTATAATGTTCTTTGTAGTTAATACGCCAGCATCATGGTTAAATGAAG
CTTTACAATCTTGGTTACAAAGTATGTCTGGAACTAATAAAGTATTATTAGGTGCAATATTAGCAGGGAT
GATGGCATCAGATATGGGAGGACCTATTAATAAAACAGCTTCAGCTTTTGGATTGGCTATGTTTTCAAGT
AATATATTTGAGCCATCAGCAGCATTAATGGTAGGAGGAATGGTACCTCCATTAGCGATATCATTAGCTA
TGTTAATATTCAAAAATAAGTTTACTAAAGAAGAAAGAAAGTCATCTCTACCAACTGCTATAATGGGGGC
ATCTTTCATAACAGAAGGCGCAATACCGTTTGCAGCTGCAGACCCATTAAGAATGATTCCAGCAAATATA
ATTGGTTCTTGTATAGGTGGGGCAATCTGTATGAGTTTAGATATAACTTTAATGGCACCACATGGGGGAA
TATTTGTAATACCATTTGCATGTAGTGCACCAGTTGCATATATAGCTTGTATATTGATTGGTACAGTAAT
AACAGCATTGATTATAGGGGTAGCAAAGCCTACTATAAGAAGTGAAAACAGTGAAGTTGAATTACTTGGT
GCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3546842-3545964 putative sugar-bisphosphate aldolase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAATCAATATGAAGGAAATGCTAAAAGTGGCACAAGAAAATCAATTTGCTGTACCAGCATTTAATA
TAGGAAGTGGGCAAATACTTAAAGCAGTAGTACAGGGTGCTAACGAAAAAAATGCACCAGTAATACTTGC
AATACACCCAAATGAGCTAAGTTTTCTAGGCGATAGCTTTGTAGTTAGTTGCATAGAAGAAGCAAATAAG
AGTAAAGTACCTATGGTAATACACTTAGATCATGGGGAAAATAAAGAACAAATATTAAGGGCAATAAGAT
GTGGATTTACATCAGTAATGATTGATGGCTCACATTTACCATATGAAGAGAATGTAGCTATATCTAGGGA
AATAGTAGAAATAGCAAAAGGATTAAATGTGTCCGTAGAAGGAGAACTTGGAACAATAGGAACAACAGGA
ACATCAAGTGAAGGTGGTACTGATGAAATAATATATACAGATTCAAAATTAGCTAAGGATTTTGTTGAAA
AAACAGGAGTAGACACACTAGCTATTGCAATTGGTACAGCACATGGTATATATCCAAAAGGTTTTAAACC
AGAGCTTAAACTAGATTTATTAAAAGAAATAAGAGAAGTAGTAGATATACCTTTAGTTCTTCATGGTGGT
TCATCAAATCCAGATGAAGAAATAGCACAAGCAGTTAAACTAGGAGTTTGTAAAATAAATATTTCGAGTG
ATGTTAAGTCGGCATATTATAAGAAGTGCAGAGAACTATTAGAACAAAACCCAAGCTTATATGAGCCAGA
TACTATATATCCACCATGTATAAAAGCTGCAAGAGAAGTTATAGAGTTTAAAATGAATCTATTCAATGCT
ATAGATAAGTTAAAGTGCTTTTATAAAAATAAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3549087-3547393 putative abc transporter permease protein y4fn [Clostridium difficile R20291]
ATGATTAAAAAAATAAACCGTAGTAAATTTACATCTAAAAATGTTATTTTTATTGTTTTATACAGTATAT
TATTTTGGATTTTGATTGGATATATTATCATACCAATAGGCAATACTTTTGTACAAGCATTCCAAGGTAA
AGGTGGATATTCTTTTGAAGTTTTTAAAGAATATTTTTCAAATACTAATAATTTAAGGGTAGTAAGCAAT
ACTATAATTTTGGGATTGGGTTCTGTGTTCGTATGTGGAATTATGGGAATATCACTTGCCTTATATATGA
CATTTGTTTGTGATAAACATAAGAAAATCATACATATTCTTTTACTAAGTCCAATGATGATTCCTGGAGT
AATTATGGTAATTGCATGTATTCAGATTTATGGAGAAAGTGGAATAGTTACAAAATCTATAGAAATTTTA
CTCCCCTTTATCAAAAAACCTTATGATTTTAGTGGATTAAAGGGAATTTTATTTGTGGTTGCTTATACTC
AGTATGTATATTTTTATTTAAATGTATATGTTGCCTTAAAATATGTGGATTACTCAACAGTTGAAGCTGC
AAAAGGAATGGGAGCATCAAAGCTAAGAGTATTTTTTGATGTAATATGGCCTGTTATTACACCTGCTGTT
ATAACTTCTACTATTATAACTTTTGCATCAGGGATTAGTTCTTTCTCAGCTCCAAATCTTATAGGTGGTG
GTTTTAAAGTTTTAAGCACTCAAATTGTTAGGTCTAAGGCTAATAACCATATGGATATAGCTTCAGTTCA
AGTAATTACTTTATTACTAATGGGGATTTTATTTATGATTTTATTACAGTATTATGGCAAAAAATATGGA
GTAGTGCCATCCTTAAAATCTCAAAGTTATAAAGTTCATAATAGAAAAAAAGACTTATTTACATTTGTAT
GTAAGGTTATTATTGAAATACAAATTATTATGATTATGCTTCCTATAGTTACTATTGTGTATTTATCCTT
TGTAAGCACACATTCAATTATGACAACCATATTTCCTAGAGACTTTACACTGGAAAACTATCAGATGATT
TTCCAAAAATCACGTGTATTACAGCCTATATTAAATAGTTTCAAAATGTCTTTAATGGCAGTAGCAGTAG
GATTGATAATTACTGTACCAGTATCATATTTAGTAATTAAAAAGGATACTGCATATAATCGACTAGCAAA
ATTTATTATAATGTTACCTTGGAGTATGCCTGCAAGCGCCATTGCAGTTAACCTAATTAATACATTTAAT
CAAAAAAGTATATTTGCTTTTAATGAATCCTTAATAGGAGGTTTTTATATTGTACCTATAGCATATACAA
TTTATGCTCTACCATTATTATTTTCATCCAATGAGGTTGCTATGAAGTCAATAAATTTAGGACTAGAAGA
ATCATCAAGGAGTTTAGGTGCTGGAAGGATAAAAACCTTTTATAATGTAATAGTTCCAAATATGATGCCA
GGAATAATTTCAGGAGCTATATTAGTATTCATTCGTACAATTGGGGAATATACAATGTCAGCCTTGCTTT
ATGGTGTTTATAATAGACCTATTTCAATTTCTATTGTAACTAATATGCAAGAATTTAAGATAGGAGTATC
TATGGCTTATGGTGTATTAGTAATTGGTATATGCTATATAGCATTAGGAATAATTTTTAAATTAGATAGA
AAAAGATTTACATAA
>ref|NC_013316.1|:c3550081-3549089 spermidine/putrescine abc transporter atp-binding subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAATATAGAATTAAAAGAAATTAATCATTATTATGGAAAAGAAAAAGTATTACATGATATTAATA
TATCTATTAAGGAAGGAGAGTTTTTTACTTTACTAGGTCCTTCTGGATGTGGAAAAACGACTATTTTAAG
AATAATTGGTGGATTTATAAAACCTTCTTCTGGAAGTATTTATGTTGGTGATAAAAACATTACCAATTTA
GAACCAGAAAATAGAAATATGGGAACTGTTTTTCAAAACTATGCACTGTTTCCAAATATGACAGTTGAAG
AAAATGTATCTTATGGATTGAAAATAAAAAAGCTGTCTAAAAAAATTATAAAGGAAAAATGTGATAATTA
TTTAGAGCTGTCAGGAATGAAAGATTTTAGGAAAAAAAAGATTGATGAATTATCTGGTGGACAGCAACAA
AGGGTGGCAGTAGCAAGGTCATTAGCGACTGAGCCTACTATGCTTTTATTAGATGAGCCAATGTCTAATC
TAGATATAGCTTTAAGAATCAAGATGAGAGAAGAAATAAGAGAGATACAGCAAAAGACAGGTATTACTAC
TTTATTTATTACCCATGATCAACAAGAAGCCTTAGCTATTTCTGATAGAATCGCTGTAATGGATAAGGGT
AAAGTTCTTCAAATTGGTGTGCCAATAGAAGTTTACAAAAGCCCATTGAATGATTTTGTAGCAAACTTTG
TAGGTACTTCAAACTGTATTGGAAAAGAAGATTATGTTAATTTTAATATTGAAAAAGAGACAAAGCCTTA
TATTTATAAAAGACCTGAAGAAATGATATTATTGCAAAATACAAATCAAAGTGGTTTTGTAAAAGTAAAA
GTAGAATCTAAGAATTTTCTAGGAGCAATTTTAGAATATACAGTATCAAATGATGGGAAAAAATATCAAG
TAACTGAGCTTAATAGACTGAATAATAGCAATAAATTAAACGTAGGGGATATGGCATATTTAGGTGTGCT
ACAAGGTGACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3551055-3550429 hypothetical protein CDR20291_2982 [Clostridium difficile R20291]
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GTACAATTTATATGGGCAAGGAGATAAAAATGGAACTAAAAATTAGTGATTATAAATTATTATGTAATAA
AGGTAGTGGCGCTTTTAACGAAGATATCGTAGGTTTATCACCTTATGGGGCATGGGTACTTGATGGAGCT
ACAGGTTTAAATAATAAAAATTTAGTCTCTACAGAAAGTGATGCCAAATGGTATGTAAGTTGGTGGAATA
GTTATCTTCATGAGAATATGGAAAGAGAAGATAGCTTAAAAGTAATTATTAAAGAAGGCATTGAGGAGAT
AACAAAAGAGTACTACAAATTAACAGATGATAAAGAAGTAGAAGCAATAGATATTCCTTCTTGTTCATGT
TCTATATTAAAGTTTTATAAAGATAAGATAGAGTATTTACTTTTAGGAGATTGTACTTTATTAGTTAACA
ATAATGAATCTGTGAAAATTTTAAAAGATGAGACTTTATGTGAACTTGATAAAAAAGTATTTGATTTTAT
GAAAGAAGCCAAAGATGCTACAAACCTTACTTTAAAGGAGAGAAAAGCCGAGGTAATGCGATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3552278-3551235 abc-type fe3+ transport system periplasmic component-like protein precursor [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAGAAAAATAGCAGTTGTTTTATTAACTGTAGCAATGTTATTATCACTTGTAGCTTGTAGCAATG
ATAACACATCAAAAAGTGATAAATTAGAGGATACATTAGTAGTATATACTACACATGGAGAGGATATGCT
AGGAGCAATTTCTGAAGAATTTACAAAGGAAACAGGAGTTAATGTTGAATTTATAAACTTAAAAGGTGAA
CTAGCAGACCGTGTTAGAAGTGAAAAAGATAATCCGCAAGCAGATATAATGTTTGGTGGAGATACATCTA
CATACATGCAATTAAAAGAAGAAGGATTATATGAAAAGACTGAACCAAGCTGGAATAATGAATTAGACAA
GTCTTACAAAGATTCAGATGGATATTGGTATGGAACTATAAAAACACCAGTAATGATGTTTTATAACACA
AAACTATTATCAGCTGATAAAGCGCCAAAAGATTGGAGTGATTTAACAAAAGAAGAATACAAAGACTTAA
TAGTTACTAGAGATTCATTATCATCATCTATGCGTTCTACTATTAGTAACTTAATCAATTACTACTCAAA
TACTAAGAGTGAAGAAGAAGCTTGGAAGTATCTTGAGGATTTAAATAAGAATATAAAGAATTACTACAAT
AGTGGAAGTGTCATGTATTCAGCAATAGGTAAAGGTGAAGCTACAATATCTGTTGCAGTATTAAGTGATA
TAATAGAGAATAAAGAAAAAAATAATATGCCATTAGAAGTTGTAGATGCAGAGAGCGGTTCTGTAGTAAT
CACAGACTGTGTAGCAGCTCTAAAAAATGCACCACATCCAAATGCAGCAGCTAAATTTGTAGATTTTGTT
GGAAGTGCTAAGGTTCAAGCTATGGTTGCAAATGATTTTAATCGTATTCCAACATTAGATTCTGCACTTA
AAGATTCACCAAAGTGGATGTCAAAAGAATATAAAGCTATGGATGTAGATTGGTCTGTAATTGGAAAAAA
TCAGTCTAACTGGATTGAAAAGTGGGAAACAGATATAATAGATAACAATAAAACTATAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3555002-3554373 hypothetical protein CDR20291_2984 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGAGAAAAGTATATATGTATGTATTCGATACTATGTCAGATTGGGAAGTTGGATATCTAACTG
CTGAATTAAATACAGGAAGATATTTTAAAAAAGGATTAAAACCACTAAAAGTAATTACAGTAGGAGTTGA
TAAAAATCCTATTATAACAATGGGTGGATTAAAAGTTTTACCTGAGATTACAATTGACGAGCTTAATATT
GAAAGTAATGACTTATTAATTTTGCCAGGGGGAAATACTTGGACATCTATAGGTCATGAGAAAATATTAG
AAAAATCTAAAGAGGCTTTGGAACAAAGGTCTATAGTTGCAGCTATTTGTGGTGCTACTTTAGGGTTAGC
TAAAACAGGTTTACTAGATTTTAGAAATCATACAAGTAATGATTTAGAATTTTTAAAAATGGTGATACTA
AGTTATTCTGGAGAAAAATATTATAAAATGGAATCTGCGGTTAATGATGAAAATTTAATTACTGCTTCTG
GAATTGCACCATTAGAATTTACAGTACAAGTTTTAAAAGTTTTAGATGTTTTTAAAGAAGAAGCATTAAG
TTCTTGGTTGAACCTTTATAAGACGCATGACTCTAAATATTTTTTCGAACTAATGAATTGTAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3556042-3555080 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTAAAATTGATAATATGATGTCCATATTATGGATGTTAAACTCAGACAAAAAAGTTACCGCAAAAC
AAATATCTGAAAAACTAGAAATAAATATAAGAACTGTCTACAGACACATTGATGCATTATCTGCTAGTGG
AGTACCTATAATTTCAGATACAGGTCATAATGGTGGATATACACTTTTGAATAATTTCATCAAAGCACCT
CTTTTTTTCGATACAGAAGAACAAACTGCGTTACTTCATGCAGCTATATTTGCTAAAGAAGAGGGAAGTT
TCTTAGATGACACACTAGACAAAGCAACCTCAAAGTTAAAAATGTATTCAAATCAAAAACAAGAAGAAAC
TTTAACAAAACATTTAATAGGTTTTGAAGTAATAAAACCAACTGGAAAAATATCCATAGAATCTGTACTT
AAAAAGTTAAAAAATAGTATAGCAAATGAATTATCTGTAGAAATCAACTATCGTACAGCTCATGAAGAAA
AATCAAAATGTAGGATTATAAATCCATATGGAATTGTACGTTGGAATAATAATTGGTACATAGTAGCATT
TTGTCAAATGAGAAATGAGATTCGTAGTTTTAGGGTAGATAGAATTAGTAGTGTCATAGAAACATCAAAT
ACTTTTAATAGGCCAAAAGAATTTTCAGCAAGTGAATTTTTTATAAGAGGGATTATGGATGAAACAAAAG
ATGAGGATAATCTTATATCATTAGTTATAGAAGGAAAGATGAATGCATTGGATAACTTATGTCAGCATTG
GCTTCTAGGATATTATTTAAAAGAAAGGACTTCAAATAAAGCAATATTTAAACTTCAAGAAGAGATAATA
TTTACATATGTACCGAATATACTTATACCTTATAGAAAATCTATACAAATAATTGAACCATTAAGCCTTA
GGGATAAAATGGTTGAAGATTTACTCGAATTAATTAATCATTATCAAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3561382-3557027 hypothetical protein CDR20291_2986 [Clostridium difficile R20291]
ATGCCAGTAATTAATAAATACAAAATTATAAATTTTAAATTTGGTATGGGACAAGAAAGAATACTTAGCA
ACAGAACCATGGAACTGTATGGAGAAAACTTACAAGTAGAAGCAGAAAATACAGCAGGCAAAACTATGAG
TATTCAAACTATCATACAAAGTATTTGTCCACTATCGGATGTAGCCAAACCGTTTACTGCAATATATAAT
AAAAAAGAACCATTATACTCAATGACTGAATGGTTGCTAGATGATGGTAAAACGTTATTATTAACGGGAA
TAGGATTTGAGAAAAAGGCTGGATCATCTAAAGAAGAAGGGAAAGAAAAAAAGGACGATTTATACAAATA
CTTTATGTTTATTATAGAAGAATCTAAAGAAATGGAGGTTGATATAGATAATATACCTTTATTAAAAAAC
AATGACAAAGGTATAAGGATAGTACAACCTTTAACGGCCTCACAAGACTATATAAAAATGCTAAGAGATA
AATATGGAAAAAACAAAGTACACTTCTTTAATAATTACTTAAGAAAACAACATAGAGAAAAATTAGAAGA
ATATGGAATTAACCAAAGTGAATGGAAAGAAATTATTATAAAACTTAATAGTAATAACAAAGAAGGTGGA
CTATCAGACTTTGTTAAAGAACATAATACTTCAGAAAAACTTATAAGAGATAAAATATTACCTTTAATAG
AGACAAGCTTAACAACAGAAGAATTCGCTCCAATATTGCAAATTAAGGAACAAGTAAGAAAGTGTATAAA
TAATATTATAGACATGAATGAAAAATTATCAGATTATAAAAACTATAGAGATTTAAACATTAGAGTTGAA
AGTTTACAAAATAAAATAAATAGGATCCTATTCATAGAAGAAGATAAAAATAATGTATTAGGAGAATTAG
CTAATCTATATGTACATATAGAAAATAAACGCAATGAATTAAATGAAGAAATAAAACAGTATCAAAAAAT
GAAAGCATCAAAAGAAGAGGAATTTAAGATAGTAGAATATGAAGAAGATAGCTATGAGTATTTTAGAAAA
GAAAAAGAGATACAAGATACTCAGGTAGAATTTGATAAAGCCAAAAATGAATTAAATGATAAAATAGAAG
AACTAGAATTAGATGAACAATATTTAAATATATCAAAGTTCAAAAGAAAAAAGAAGGGGCTAGAAGAAGG
GGAAAAAGATAAGATAGAAAAAGAAAGTGAAAAACAAAGAAAAGAGGTAAATCAAGAAGAAATAACGGCT
ATTATAAATCGTCTAGGTAGCAGTATTCATTATTGTTTAAAGGAAGAAAGTATTATAAATAATGAAAAAC
TTAAAGAAAATACAAACAACAATATAGCTATACAAGAAAAAAAGAATCAACTTAATGATGACAAAAGTAA
GCTCACAAAAGTATTGATAAGTAAAAATTCAGAAATTAAATATATAGAAGGCAAAGAACGTGATTTTAAT
AATCAACTACATGAATTTAAACTTAATAACACTGATATTAAAGGCTTTATTTCTAATAATTTTTTAGGCG
AAGTAATAGATTATACTAGGTATATAAATTATTTAAATATAAAAGTAAAATCAATAGAAGAAAATCTTGA
ATCGAAAGTCATGCAAATAGAAGAATCGAATAAACTTAAGGATGATATAAATGAAGCTATAAATAATCTT
AAATTAGATAATCATGAATCTTATATGAAACTGCAAGTATTAAAAACTAGAAAGAAAGATATAGATAATT
TTAAAGAAAAATATAAAATCATTAAAACAAGATTTGAAATAGACAATGAATTAGATAACTCTACTAAACT
ATATAAAGAGGTAAAACAAGAGCTTAACAAAATGAAACTTCAAGTACAGGACTTAGAAAATAATAAAAAG
CAATTAGAAAAAGAGCTAGAAGATTTACAAAATTATAAAGATATAATTTTCGAAGAAGAAATATTAACAG
ATCTAGAAAGAAATGGAATAAAACCTATTGAAGGCATGAAATATCTATTAACCTTAGATGGAGATTTAGA
ATACAAAAATAATCTCATATCTAAAAATCCATTGCTACCATATTCTATAATAATTACAAATAAAGAGTAT
CAAAAACTGAAGCAAATAAACTTAAAAAATAAAACTAAAATCTCAATGCCTATATTTGTAAGAGATAACA
TAGAAGATACTTTTATAACTACATCTAGTAACCTTGTAATTAGTAATGGATTAAATATACTATCTTCTTT
CGATAACAAAGCTTTAGATCCTGAAAAAAGAGAAAAGGATATGAATCTAATCAAAGAACAAATAAATAGT
ATTCGAGATAAAGTGGAGCAATATAAAGCAGAAATTGAAATATTAGAAGAATTTAAACTTCTAACTAATA
AAATTGATTTTACAGCTGAAGACTTATCCATAGATGTGAAAATTGAAAATTATAAAAAAATTATATTTGA
AATAAACAATAAAATTAAGAGTAATGAAAATAATGAGAAGAATTTATCTAATAAAATTAAAGAACTTTAC
GAAAATAAAGAAAAGCTATTAAATAACAAGAATATATTATTTAATAAATTGAAGGACATTAGAAATATAC
AAGATACATATTCTATAATTTTAGAAAATAAAAATGAAATAACTAAGTTAAAAACAAGTATTGAAAAAAT
CGAAGAAGAAAAAAAAGTTATTAAAAAATCAATAGAAGATATTGATGTTAATATATTTAATTTAAATTCA
GAAAAAGATAGGATAAATAGGCATATAGATGATACAGAAAGCAAGATAAATAAATTTAAGATTTATGAAC
CTATTAAACTTGAAAATGCTAAACTAGAAGAATTAGAAATAAAATACAAGAAATACTTAGAAGACCCTAC
AAAAAAAGAGATTGAAACATTAAATTATGAAATCTCAGTTTGCTTAAAAAGAATAGAGAGTATTACTATA
GAGTTAGAAGAATTTAGACAACTTATTAGTAGTGATAATTTTGAAAATATACCTATATTATTCACAATAG
AAGAACTTAATAAAAGAATAGTTTTAAATAAAAGTAAGGTTGATGAACTACGAAAACTTAAATATAGTAT
TAAAAGCGACATAGATAAAAATCAAGGTTCATTAAACACTAAGAGGGAGGAGATACTTAAAAAATTTAAT
GGAAAAGAACCTTTATCTACTAGCTTAATAGTGAACTTTAATTTTGAAGAAAGAAAAATAGATATAAAAA
AAGATATAAAGGATATTGGTGAAATTATAGAAGGTAATAGAACTACTTGTCAAAATCTAGAACAGGAATT
AAGAGACTTAAAGAAATATAAAGTAGAAAGAAAAGCTATAACCTATCAACCTGAAGATATTTTTATTGAA
AGTAAAAAACTACAATCAAAACTGCAAAATGTTGAATATAATTTAATTAAATCTATAAATAGCTATAAAA
ATACAATATTAGAAATAAAAGAATTTAATTATAAGCACATGGAAAAATACAAAAACTTTATAGAAACTTT
AAATGTAAATAAAGATAATTACTCTCGACAAAAAGAACAAGTAGAAATAGTATTACTAGTTATAAGAGAA
GAAATAAGCAAATTAGAAAAACATAGCGAACAACTAAGAAAAGAAAAGACTATAATATCAAGGCAAATAA
AAGATTATGTTATGGACTGTATTGATGAATTTAAAATCATAAATAAACTTGGTAAACATAAAGGACAAGC
CTTATTCAACATATCACTACCTAAATCTGATAAAATAGAAAATAGTTTGAGCTTAGTAGATATGCTAATG
GATGAAATTGTAGAAGAAGCAAACCTAGGTGATGTTGAACAAAAAATAAATACCTTTTATATTTTAAATA
AGACTCTTAATATAGGGAGAATTCCTGTATCAGTTATAAAATATGAAATAAATAGAAATGAAACTATAAA
GTGGAACTCTATTAATAACGAAACAACAGGAGGACAGAGATTTTGTATCTCATTTATTGTGACAATATTG
TTGATGGAATATAAAAGATATGATAGAAATGCAATAGTTGATGAAAGTAAATATAAGGGTAAGGTACTAC
TTATGGATAATCCTTTTGGAGAAACGTCGCAGCAAGATTTCCTTAAAGAAATATTTGAACTTGCTAAAAA
ATTCAACGTTCAAATTATATCCTATACTCATGTAACAAATGCTTCTATAAGAGCAATGTTTAATAAGATT
TATTTAATGACAGTTGAAAAAACTACTTCTAATAAAGAATTTGTGGATATTAATGAGATTAAGCAAAATA
AAACTGATGAATTGGTGTATATGAGTAAATTTTATATAGGTAATAAAGAAGAATTAATTCAAGAGGATAT
ATTTAGTTTAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3562097-3561369 hypothetical protein CDR20291_2987 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATATCTTTAAATGACTATAAAATAGCCAATGAAATATTTTATAGATTACTTAAAAAAAGTGAGT
TAAAAGAAAAAGAAGCTAAAGAATTATTTTTAGCTTATATAAATAACAGTAATGTAAGGTATGCTTTAGA
GGCAATTTGTGAAGTATCTAAAATAAAAATAATATTAATTTCAGATACCTTATACTTAATACCAAATAAT
GACAATGATATTTTTGGGTTTGACTATAGAAGAGAATCTTTATTAGGGAAAGATTTAAAAGATAGTTATT
TAGGATATTTGATAATGACAATAATATTTTCTGAATTTACAAATGGGGTAGCACCAGCATCATATATTCA
AGTATTAAACTTACTGGATTTAGTACAAGAATCCTTAGAACGTTCAATAGCTCGTGATAATCTAGAAGAA
ATAGAAAAATCATGTGAGTTTAATATAACTATCTTAAAGAACTATTGGGAAAGTAAAAGAAAGTGGGACG
AATCTAGTAAGAAAGGAATAGAAACAACATCAGCAGATTTCCAAATAGGGTTTATTAGAAAAATAATTAA
TTTCTTAAAAAATGAAGGCTTAATTGTACACATTGAGGATGAAGATAAGATAAAACCAACTAGAAGATTT
CTTGATCTTATGAATAATTATTTTTTAGATGAAGAAAGGAAAGTATTAATAGAAAAACTAGTTTTAAGAA
AAGGGGAAAGTATTAATGCCAGTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3563734-3562115 hypothetical protein CDR20291_2988 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAATGATTAATATTTTAGAAGGCTACAATAAGAGAGTAAACTGTATAGGATCTTATTATCTTATTG
CAACTCTTGCTAACAATAGAAATAAATTTAAAGAATTTGACAACATTCAATTTTACAATTTATTAATTCA
AGTTTTGTGTTATATATTTGATAGATCTCTTAGAAGAAAGAACTGTTTAAGAGATGATATTAAGGATTTT
ATTGAAGAAATAAATCGTATGGATTATAAAATAATGCTTTCAGAGGATGACTTAAAGGATTTAGCAAACT
ATATAATTAATGGATTAACCAATAGTGGTAAAGTATATCTATTTACCTACTATTCTTTAGAACAAGAAAA
ACATATAGATGAAAGTATTAAAATTATAGAAGATAAAAATGTAAAAATAAATAATCAGGAAAGACTATCC
TACTCCTTAACAACAGAGGGTTATAGATTGTTGTTATCAACAAAAGAATATGATGAACTATTCCAAATTC
AAATATCACAAATGATTGCAAAGTTAAGGATAGAAAAGGGTGATTATCAAGGCGCAAAGGAAGATATTTA
CGATATAATAAATACCTTAGAGATTCATCAACAGAAAATTGATAATTATATAAAAATAATAAAAGTAAAT
ATACTATATATAAAAGAAGAAAAATATTCAACAGTAATAGATACAACTGTAGAAACACTTTTAGAAGAAA
TGGACAAATATGAAGAATTAAAAAAAGAAGTAAAACTATTAATCAAAGATAAAGAGGACTACTTGGAAAA
GGATGAGGATATAGACAAAGAAAAGATAAAAAATATAAGAACTCAACTATTACAAATGAAAGAATTAATA
GATGGAATAGTTTTAGCAAAGTCTACAGCCACAAATTTGTTATCTAGAGTTCAAGATTTTAGAGAAGAAT
TTAAAGAAATACTTAAAAAACTATTAACAACTCCAGTAATTAAAAGATTCAATTTCAAGGAAGAAATCTT
AGATAGACTTGAAAAAGACAGTGATTTTTTATTGATAATAAGAGAATTATATATATCTTTATTTAAAGTA
GAGTTGCCAAATCGATTTAATATTGGAGTGGCATATCAAGAACAGAAACTATTAAATACTAGAGAAATTG
AAAATGAAATAGTTAATAAAGACGAGTTAGAAATTATTGAAAATAAAGAGAAGGAGGAACGTATAAATTA
TTGTGAAAATTACTATTTTGATTTTTTTAAATACTTAATTAAATATGGACTTGAAAAAGGACAATTTACA
TTAGAAGAATTTCTAAAAAATTATCTGAAATATGACAAAGTTATTTACTTAGAAATAACTAAAGACTCCA
AATTGATGAGAGATATAATAATTTACTTCGCTAATCAAAGGGAAAGTATCAATATCAAAAAGATAATCAG
AATGTTAGAAAATAGTGCCTTCTCACCAAATACAGATTTTCAAATTGAAAGATTAATAGAACGTTTATTA
GTAGAAGATTTTGAACTATTAAATAGCGTTAGCCATATTAAAAGTAATAAAATATTTGAAGATGAAATGA
AAATAAATACTGAAATAAATTTAGAAACTATGACTGCAGTTAAGCTAGAAATAGCAAATATAAAATTTGA
AATAATCTAA
>ref|NC_013316.1|:c3564744-3563734 hypothetical protein CDR20291_2989 [Clostridium difficile R20291]
ATGATTACAAAAATAAAAAAGACTTATATATACCTTAAGGAAATACAAAAAATATACAAAATCAATGAGC
ATAAAGAACTAGTACACATAATAAAAAAACTAATAAATGATAATAAAATAAAACCAATAAAAACCTCAGA
TCTAACACCTCAGCATGAGCAATTATATACAAAGTATAGAATAATAAAACAAGAAACAGAAGAAGATAAA
AAAATATTAGAAGAAATAAATTACAAAATATGTGATAAATTAAGTATAGATTATTATAGAAAAAACTTAG
TACACTATAAAAATAATAGAGTTGCAATAATGGATTTAAATAGTTATCTTATTAAAAAATCTGATAATCT
ATCAAAGAAAATATCGATTAACGAAAGATCTTATGAAATATTTAAGGATGAGAAATTCATAAGTAGTAAA
GTAGGAAAAGAAGTACTAAAAAACTTAAAAATAGATCTAATAAAGGATTTAAACGTATATAAGACACCAG
AGCCATTCATATATTTATCAATAAATCGTATATCTCCACAAAAAATATTAATTATAGAAAATAAAGACAC
TTACATAACAATAACAAAAATGCTATTAGAAGGAAAAGAAATACTTAAAAATAAAATAGATACTGTTATA
TACGGAGAAGGAAAAAAAATAATCAACAGTATTAAAGGATTAAAGGAAGATATAACAATTGAATATCTTA
CAAATAAAGAAAATGAATTTTTATATTGGGGAGATATAGATAAAACTGGATTATCAATATACACTTCCCT
AAAAGATACCAATGAAATTAATAATATAAGATTATTTGAAGTTGCTTATGAGCATATGATAGATAAAACA
AAGGAAAATACCTTGAGGAATATCCCCAAAAATCAAAAAGATAATTTTGAATGTGGATTAGAAAATATTA
ATAACCTAAACTTAAAAGAAAGTATTAAAAATATTTTAGTACAAGGAAAATACATACCTCAAGAAGCTCT
AAATAGATTCGACTTGGAGGAATATAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3567768-3566476 hypothetical protein CDR20291_2990 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAGAACAATTTAAAAATTCTATAAAAAATATTAAATCAAACAGACCTCTTGTATCAGTCCAAGATA
TTGTGAATTTTATTGATAAAGGAGAAAAGTACTTGAAATTATCAATAGATGAAATAGATGAAATGGAAAT
TTTACAAGGAATAGTTATGAGTCCTGATTATCAACGTACATATAAATCATCAAACAAGGAAGAAAGTTCT
ATAATTGAATCTCTTTTAATTGGAATACCAATACCTGAAATATTTCTTGTAAAAATAGGTGTAAATGATA
TGCAAATAAGACATGTAATGGATGGGCAGCATCGTTTGAATGCTATATATAGGTATGTTAAGAATAAATA
TCCACTTAAAAATTTAGATATATTAGGCAATGACCCACTATATGATAATAAAAGGTTTTCAGAATTAGAG
AAAAAAGATAAAATTAAAATATTAGGAAGTCATTTATCAATTCTAGAATTTGATGGTTTTGATAATCCAG
AAATAGAAATAGAATTATTTAAAAGATATAACAGAAATACAAAACCATTAGAGATGCAAGAAATCGAGAT
GGCAACATATTTTTCAGAAACTAGTAAGTATATAAGTAAATTTATAAATACTCTAATAAAAGATAAATAT
AAGGATGAAATAGATAAATCAGAATATAAATATGCTAATTACAAATCAGATTTACTTAGAATATATAACA
TAACTAAATCTCGTAATGATAAACAAAAAAATCATCAAGAAATATGTATAATATTTAGTATTTTAGAAAA
TGGGCTACAAGAAAATATCAGAGATGGAGTTACAGCCTCTAAGAAATTTTTAGAGTATAAGTCAATTCAG
TATAAAAATAATGAAAGTGAAAAATTAGAGTTATTAAAAGATAAGTTTGATGAGTTTAATAGGATGATAC
TGAAAATATCTGAGAAGATAGAATATCCATTCTCAACAAGTTTAATATCTGATGATAAGCAAAGACAAAG
TAAATACTTGATAGGAGTATCTATTGTGTTGGCTTCTATTTGTTATTATTATGATATAGACTTGGAAAAT
AATTATTTAATACAAGATATTAAAAAAATAATATCTTGTTCACCCATAGCAGATATAGAATATAAGGCGT
CTTCAACTAATATGAAAAATATGATTCTATACTTATTTATAAAGAATAAAATACAAGATAATAAATTTGA
ATCATTAAATTTAAAAAGAGATAAAATTAAAGAAATAAATACTTTAGTAATGAATAATGATGGTTATTTA
AATGAACAGACAAGGCTATTAGAAATATATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3568982-3567768 frg domain protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGGGGAGAAAATGCAGTCAGTAATATGTAAAATTTTTGATAATAAATTACTAATTAGTAATGATTTAA
GTGAGCAGGATGATGTATTATATGAGGTAATGGATAAATTTATAGATGATATTGAATATATTTCAAAATT
AGGAGATGAGCAAATTAAAAGTATGCTTATGGAGGTAAATAAATTTGAAGAAGATTCAACTGAATTTGAA
CTATATATGAAAAACTTATGCTATTTAAAGCAATCATATTTTATAGATACTAATGATAAAAGTGAAATAA
ATTCTATAGATATAGATATATTAAAAAATGTTAAAATAGAGGACTTAGTTGATATAACTAATATTAAATT
AGAACGAAATTTAAATATAAATATAGAACATATATCTAAAGCTGTAAATAAAATATATGAAGAAAATGAA
AAGTGGAAAGAGTATAATATACAAAATACTATGTCTAAATATATAGGTATACCTGAATCAGAAGTTATAT
TTATATCAAATTTGAGTCAGTATGTTTCATTTTTATCTGAACTAGATAACGCAGGCGACTATGTATCTAG
AGGGCAAAAAGATTGTATGTATGAATTATTACCATCATTACATAGAAAATATAAAAAAGACTATGGTATA
CATTCAGATGAATACGAGGAAGCATTCAAACAAAAAATAATTTATTATGATAAAGAAATAAAAAATAGAT
CGAGTGAAGAATTAAGAGCTGAAGGGCAACATTTTGGACTACCAACAGAATATTTAGATTTCACAGAAGC
TCATTTAATATCATTATTATTTGCAATAGAAGACTATAAATATACAAAACAGCATTCAATTGTGTACTTT
ATAGACTCTATTTCTTATAATACTGACACTATAAAAAGATCTGAGAAGTTAGTAAATTATTCAGATACAT
CTGCAATAGATAATTGTAGTAAATTTTCATCAAGATCATTTTTTATAAAGGTAGGGAATTCAAATGAAAG
AATACATTTTCAAAAAGGATGTTTCCTAAAAGTATCATCAGAAGATAAAGGCGAATTTAAGGAAAAATTA
AAAAAGTATTGTAAAGTAGTAGTTATTAATAAAGATGCTAAAAAAGAAATATTAAAAGAATTATTTAATT
TAGGTATTACATTTGAAAATATTTATCCAGATAAAGATAATGTAGTTAAATCTATAAAATTCTATTATGA
TGAGATAGTAGGGGGAAATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3570648-3570313 transposase, is4 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATTATGAAGAAGAAAATAATTATTATATTTGTACAAATGAGAAAAAACTATTTGCTAATAAAATAA
TAAATAGGAAATCAAAAACAGGATATAAAAGTGAAATAACATGTTACATTTGTGAAGAGTGTAGTAATTG
TCAATATAAAAGCAATTGTATTAAGAGAAGTAATAGTAAGGTTCCTCTTAAAAATAGGACTAAAAACTTA
CAAGTATCTAAGTCGTTTCATGAAAAAAGAAAAGAAAACTTAAAGAGAATTATGAGCCTCGAGGGGGATG
AACTTAGAGTGAATAGAAGTATACAAGCAGAAGGAGCTTTCGCTCAAGTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3571341-3570895 hypothetical protein CDR20291_2993 [Clostridium difficile R20291]
TTGATTGCACAGTTTACAAACTTTCTTGGAGATAATAATGAAATTTCAAAAGACACAATATTTATTGATG
GTACAAAAATAGAGTCATCTGCTAATAGATATACTTTTGTTTGGAAAAAAGCTGTAAATAAAAATATGGC
TAAAATGGTGAATAATATATCTGACTTCATATTGAAATGTGAGATTGATGTTGGCATTAAAATAGTTTAT
GAAGATAAAATTAAAATCTATCATTTAAAGAAACTAAAAAAAATATCAAAAGAAGCAAATGTAGCATTTA
TTCATGGAAAAGGAAATAGAAAATCTACTAAAAACCTTCATATAATGGGTGAACGAAATAGTTGTTCTAA
AACAGATAACGATGAAACTTTTATGAGAATGAAAGAAGATCATATGAAAAATGGGCAACTGAAACCAGCA
TATAATATACAATTTGGTGTAGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3575021-3573036 crispr-associated helicase cas3 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATTTATATGAATATAAAGCTAAATCAGATGGGACAAGTATAGATAAGCATAATGAAGATATGA
ATTACATAATGAATCAATTAGTTAGCATATATAATATATCTAATGATATGAAAAATGATTTATATGAGGC
AATTGTATGTCATGATGTAGGGAAAGTAGTAAAAAGCTTTCAAGATAATATTGAAAGTAGCACAAGAAGA
GTTAGACATGAGTTATTATCAGCAAGTATTAAGTATTTAAATAGAGGTCAGAAGTTAGCTATATTAACCC
ACCATAAAGATATAAAGTTTCTAGAGGGTCAAATAACAAATTCTATTTATGAAATTGAATTAAAGGAATT
AAAGGAACTATTAGATATTGAAGTAGAAGATATAAGACCATTTATAAAGGAAATATCAAGAGCAAGAAAT
GATGATACTAGAAAACTTGAAAATATATTATTAAAAGGTTACTTGCAATATTGTGACCATATAGCTTCTG
CGGGAATTAAAAGTATAGATAAAGGATTTAATTCTATTAAAGATTTTAGTATACCAAAGGGTGTAAGTTA
TAATTCAATACAAGAAAAAGTTTTAAATATGGATAAAAATGAAGATATAATGATAATGGCTATGACAGGT
CTTGGAAAAACAGCAACATCATTGTATTGGAGTAACCTAGTTCAAAATGAATATAAAAGTAAGAGAGTGT
ATTATATACTTCCTTATACAGCAAGCATAAATTCTTTATATGAAAATTTATATAATAGAAATATAAGCGT
AAGTATGTTACACAGTAAAGCTCCATATTTTTTGAATAAAATTAGTGATGAAGAAGATATAAAACAACTT
TACCAGATATACAAAAAGAGTGTAAAACAAATTAATGTATGTACTATATTTCAATTAGTAAAGTCAGTAT
TTTCTTGTAAGAGATTTGAAATGCTACTATCACAATTAAAAGATAGTATATTTATAGTTGATGAAATACA
TTGTTTTGATACAAGAGTATTGTGTTATACATTGGAATTTTTAAAATATTTAAAAGAAAACTTAAATGTA
AAAATATGTATAATGAGTGCAAGTATACCAACTTGCTTAAAAAAGTTAATACAGGAAAGATTGCAAATAA
GTACAATTATTGAACCAGATAGTAAAGATTTAATATTTAGACATAGATTGAATAGATTAAGTGAAGGAAT
ACTTGATAGCATACATAAAATAGAAAATGATTTAATGCAAGGAAAAAGAGTATTAATATGTGTTAATTCA
GTAGATTTATCTCAAGAGTTATATGGAAGGCTTCAAAAATATAATCCTAAATTAATACATGGTCGATTTA
ATACTAGAGATAGAGAGCAGGCAGAAAAAGGGATAGAAGAAAGCTTCTTATTGATAGGTACTCAAAGTAT
AGAGGTAAGTTTAGATATAAGTTATGATGTTCTTTATACAGAGTTAGCTCCTTTAGATTCATTGTTACAA
AGGTTTGGTAGAGTAAATAGAAGGGGAGATAATGCTGAGTTGAGCAATATTTATATATATGATTATGATA
GAAAGCTTAATATATATGATGAAGATATAATAAATAGGACTGATATAGTAATATCAGATATAATACATAA
TGATAATTCTATAGTTGATGAGAGTAAAGTTCCATCTTATTTAGATAATGTCTATTTAGATATAGATATG
GATAAATATAATAAACATAAAGTTGCTTTAGAGATTATAATGAAAAATATGAGGTTAGGGGTATGGAATA
AATCTGCTAATAATGATATGTTAAATAATGATACTATTAGTGTTGTGCCTGAATGTCTTTTAGAAGAGTA
CAAGTTGTATATTGATAAAAAAATGTATTTAGAAGCGAGTTCATTATTTGTAAATGTATCTGTAAAAAGA
TACAATTATAATAAAAAGATGTTTTATGAATGTGGAGATATAGTTGTTACAAGTTATAGTTATAATGATA
AACTAGGTCTAATATTTGATTGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3576102-3575032 crispr-associated autoregulator, devr family; crispr-associated autoregulator, devr family [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATAAAAATTCAAATAGAATGTTAAATATAGGCTATGCAATAGAAGTTTTATGTGGGCGATTAA
ATGGAAGTAGTAGTGAAGTAGAAAAGAAAAATAATTCATATAAGAATTCTACTTATACTAAAAAAATAGG
GAGCAGAAGTAGAATCTCAAGTCAATGTCAAAAATACAATCAAAAGCTATTTATGGAACAAGTTTGTGGT
TATGAACAAAATGTTAAAACTAAAGATGGGAAACAAGTAAAATTGGTTCCAAACCCATTTAAATATGCGA
CAGATGATATATTTGGGTTTATGATGGCGGAAAAATTATCTATAGAAGAAGATGTATACAAAGAATTATC
AGATGAAGAAAAAGAAATATATAAAAAAAATAAAAAGAAATATGAAGTAAATATAACTAAAAAAAGAAAG
TCAAGATGGCAAATGAACTCTTTAATAAATGTATCAAATAGAAAAGTTGAATGGGAGTGGAATGTTTGTG
GAACTACAGGAGATAGTATGCCATATCAAGTTGAGGTATATTCAGGGGTACATACAAATATAGCAAATCT
TAATATAGGAAAGATAGGAGAATATGATATATCTGATATAGCAAGTGAGCATAGAGATTATACAACTTTA
GAAGCTAAATCAATTGGAGTTGAAAAGTTAGATAAAGAAGAAAAGTTTAAAAGAATAGAAGCTCTCCTAA
AATCACTAGAATACTTAAGTGTAGAAGGTAATAAGACAAATCATCTAACTGATACAAAACCCAAATTTGT
TATATTGGGAGAGTATTCATGGGGAAATAATGTATTTCAGGGTATTATCAAAGAAAATGGCTTAGATGTA
GAGATGTTAAAAGAATCTATAGAACAAAATGAAGAATTTAGAAAAAGCGATATATGGATTGGAATAAATA
AATTTTATGATGATACATTTAATGAGATAGAAGTTAATAATGAAAAGGAACAAATAAAGAAGTATTTAGA
AGAAGAGTTTGAAGAGTATGATTTTATGAAAATATCAAATGTACATCAAGCTTTTGAAAGTTACTTAAAA
TATTTAAAGGAGACTTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3577289-3576123 hypothetical protein CDR20291_2996 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAGAAGTTACAATGTATTTGTTGATAATGGTCTATATGTGTTGGCTTATTATCTGAACAAAGATA
TTAATGATATAACTTATCAAGATATAGAGAATAGTATAGATTTAATGAGTGATAAAATTGAAGAATTTGT
AAGTTGCGAAAAATACTCTAATTTAAAAAGTATGTGCTTTAGCAATTCTACGCTAACTCAACCAAAAGGA
AAAGTTACTTTAAATGAGAAGTTAAAAGGTTTTGTTAAAAATCAAGGAGATGAATATTGTAGTTTATGTG
GTCAATATAAGGCCAAAGTCAAAATTGAAGATAAAGAATACAATATAGGGAGAAGTTATATGCCTAATTT
GGTTGCAAATACATTTTATAATTTCTCCAATAATTTGCAAGGTTTGAATGTATGTCCATATTGTTTAGTA
TTGACTATGTATTCAATTCTGAATTGTAGAGTAAGTAGGTATGCTTTTTTATACAATTCTACATCAAGCG
AATTTATGGAAGATTATACTTTCCATATTCAAAAAGAAAATTTAACTGATGTAGAGTTAGGAGCAAAGAA
AGAAAAAGAAAAGTATTCAATTGTAAAATTATTAGAAAGTCTAGTGTGTAAATATAACTTATTTAATGGT
GATATAGAGCAATATATGTTTAATAACTCTGGTCAATCTCAGGATATTCAGGTAAATAGAATAAAAAATA
AATATGTGAATTTATTAATAAAATTACAGGAAAAAGCACTACTATCAAACTTTGAAAAGTTACATTTGGA
TAGGTATATCTTGAATGGTACTTTAGAAAGCAATTATCTCAGAGAAGTATATAGGGTAAAAAAGGAAGAA
AAAATGGATGAGAAAGAACAAAAGAATTTTGATGAACTTGTTATTTTTTTAAACAGGGAGGTAAATGTAT
TGAAAAAAGTCAAAATAGATATAATAAAAAAATTAACGGATAAATTAAAAACTAGTGACTTAGATATAGA
CAAAATATATAAGGAGCTTAAAATGTTAGGAAAATTTTATGCATATGAGGACTGGTTAGTTAACTTAAAT
GAAATGTATTATGAAAAAACTGGAGAAAAACTATTTGAAGCAGAGGATTATATTGAGTTGGATGATATAA
GAAGCTTTAGACAGATTAAAAATTTAATATTAGTAAGTTTAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3578055-3577291 crispr-associated protein cas6 [Clostridium difficile R20291]
ATGCATTTAGTAAGAAGACATTTGATACTCACAGTGGATAATGAAGTTGTATTAGATTACAATTACCAGT
ATGAGCTAATGAAAAGGATATATGAAGCTATAGAAATTAATGATAAAAGAAAAGCACTAAGTCTTCACAA
TGAAGGCTATAAGGTGGATAAGAAAGTATTTAAATTATTTAATTACACAATTATGTTTGAAAATGCTAAG
TATTTAAAAGAGGGAATACATTTAAATCCCCAAACAAAAATCAAATTAATTTTAAGTGGATATGATGATA
TATTGAATAATATTATAAAAGGTTTTATTAAATGTAAAGTATTTAAATTGAATAATATAGAGTTTAAAGT
TTCAGATATAGAAGAAGATTCAAAGAAAAATTTTAATAATATAACACTTTATAAAGTAAGGTCACCTATT
GTAGCAAGTTTATATGATTTAAAAAGTAGGAAACAAGTATACTTAAATCCAATGCAAGAAGAGTTTTATA
AAGCATTACATGATAATTTAGGAAATAAGTATAAGCTTATACATAATAAAGAATATACTGGTGAACTATA
CTTTGATATTGAGGATGTATTAGCAGTAAAAAAGAAATATATAACTAATATAAAAGGAAAAGGATTTATA
ATTGGATATACAGATTTTGAAATATTTGTACAAGCTAATAAAGATATGCAAGAAGTAATTTATTATTGTG
GATTAGGTGAAAAAAATAGTATAGGAATGGGGTTACTAACTTATATAACTTCTAGGAGGGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3578693-3578046 crispr-associated protein cas5 family [Clostridium difficile R20291]
ATGATATTAAATAAAATCGAAATAATTGGAGATATGGCTCACTTTAAAATTCCTATGCATAGCAAGATAC
AAAGAACATATGAAATTCCACCAATATCAACAGTTGTCGGAATTTTAAAAAATATATATGGTGAAGAAAT
AGATGATTTTATATTAGGATATGTTATATATCATGATGGTACATTTAAAGATTTACAGACTATATATAAA
GAAATCAATCCAAATGTAAAAACATTGACAGATAGCGATAGATTTCAAACTGATGTATGTCCCATTGAAT
ACCTAATTAATCCTAAACTTATCATATATACTAACATAGATAAAAATATAGAATTTAATGAGCCGCTATG
TTTAGGTAAGACTAATTGTTTAGCGAAGGTATTATCTTTAAGTGAAATTGAAGTAAATCTAATAGATAAA
AAAGCTATTGGATACAATCAATATACAGATATTAATATTGGAGATGGAATGATAAAAAGAATAAATACAT
TGACAGAGTATAATGAAAAAAAAGGTTATTATGATATATATTCTTCAATGGTAAGAGAAAATGATGAGTT
TGAATATGGTAAATATTATGATGAAGATGAGCAACAGAATATTTTTTTATGGAAATGGAAAAAAGGGGGA
GTAATTAAATGCATTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3580300-3579173 hypothetical protein CDR20291_2999 [Clostridium difficile R20291]
ATGATAATACCTAAGTTAGAGCCTAATGATAGAAAAAGAGAGTTTAATAAATACTCATCAGAGCAAATAA
ACAAAGTAGTTTATAATTATTTATTTAAAAATAATATGAGTAATAGAAAGATAGATGATGAGATACTAGA
TTTATCATCAAAACAAAGTAAAGGTTATCAATCAATGGGTATAGTGCATCATTTAGGAATAAATAAAAAT
CATAAAGGTATTTTTACAGGATACACAATAGATAAAGCAATTGAAGTTCTTAAGGAAGATGAGATACATT
TCAAGCAGATTATTAATATACTTTTAGAAATTAGAAATATAAATGAGTATCCTATAATAGTTGACTCTTG
GGAGTTATTAGATGAGAAAATAGCTTTAAAAACAATTGATAAATCTACATTAAAACATAATGGGACAGGA
GTTCCAATAGAAATAAGATATTTTTTTGAGATAAATAATTTAGGAAAGAATGAAAAGAAAAATGTGAATT
TTAAATATAATGATAATTATTATAGTGCAGTTATAGAGATGGATAAATTAGAGAATCCAAGAAGTAGAAT
AATTTGGAAATCTAAGTTTAGAGATTTACTAAGAAGTATATTTTCTGAGTATTATGAGAAATTCTTAGAA
AATAAAATAGAAGGAAAAACAAATTTACCTAAAATAAGATTCATAAAACTTGATAGTAATAATTTTAACA
TAGAATTCATTTTTACTGCTGAAATAGAAGACGATGTATTAGAGGAGATAAGTCAAGATAATCCTTTGAA
CATTAATACTATTAATATAGAATTAGAAACTGAAATTAGAAAAGAAGGGAAAGTTAAATATGTTTATGGG
AAACAGTATGAGCGTAACCCCAGAAATAGAATAGAAGCAATAAAATATCATGGCACAAAGTGTATTGTAT
GTGGGTTTGACTTCGAAAAAACGTATGGAGATAGAGGTAAGGGATACATAGAAATTCATCATATTAAACC
ATTAAGTTCTGTTGGAGAAGAAAGCAATATAAATCCCAAAACAGATTTGGTGCCAATATGTTCAAATTGT
CATAGAATGATTCACAGGAAGAAAGATAATGTTTTGAGTATTGATGATTTGAAGCAAATTATAAAAGATA
GTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3582330-3581095 putative phage-related replicative helicase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAATGAAGACATGTTTTATCATGAGGAACATAAATACATATTTAATGCTATAAAAGAAATAAATA
AGAGAAATGAAGTAATAGATATAATAACTCTTACAGAAGAATTAAAGAGAAAAGGTCATTTGAATAATAT
TGGAGGTATAAGCTATATTACCAGTTTGTCAACAATAGTCCCAACAGTATCAAATTTCACGAGTTATGTC
AGTATAGTTATTGAAAAATATAAAAATAGAAATATAATTGATAAATTCAATAAGTTCAATCTTGGAGAAA
TAGATGATAATACTCTTATATATCAGTTAGAAAATGATATAAATAAAGCCAATCAGAAATTAATAAAAAA
GGATTCAAGTATAACAGCCATATCAGAGAGAGCCTTTGAATATATAAATGATGAAATGAATGAAGGTATT
AAGACTGGAATAAAGTTCTTAGATGATACTATAGGAGGTTTATATGGAGGTGAACTAACTACAATAGCAG
CCAAAAGTGGAAGGGGGAAAACAGCATTAGCTTTACAAATACTTAGAAATGTAATATTTCAAGGAAAGAA
AGTACTTTTTATAAGTGGAGAAATGAGTGATATACAGATTCTGTTTAGAAATATAGCCTCACTAACTGGA
ATATCAGTTGTAAAAATGAAAAATAGAAATCTAAATGATGATGAAATAGTCAAATATATACAAGCTTTAA
GCATAATAAATCAAGAAAATAACCTTTATATAAATGACTCTGTAAATACAGTATCAGGGATAAAGAGAGA
AATAAAGAGTACTAAGCCTAGCTTAGTCATAATTGATTATTTGCAAATTTTGGATTATGAAGGTAAAGAA
GTAGGAGAAGCTAAATTTGCTGACTTATCAAGGCAAATAAAAAAGATTACTTTAGATTTTAATATACCAG
TTATTCAGCTTGCTCAATTAAATGATGAATTGAAGGATGAAAGACCTAAAGGGGATAGAGTAATGAGAAG
CTCAAAGCAGATATATATGGATTCTAATTCAGTTATATATATTCATAGACCTACAGAAAAAGAGGCTCTT
AATTATTGCAAGACAATGGGAATTGAGGATATAAGAGAGTTGAGACGAAGAGAAAAAGGTTTTGGTGCTA
ATTTAAGTGAGATTATTGTTGCCAAAAATAGAGATGGTGAGTCAGGATTTAGACCATATTGGTATATAGG
AAATTTGTTTTCTTTTGAAGAATGTAAGAAGATACAAGAGATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3583191-3582442 hypothetical protein CDR20291_3001 [Clostridium difficile R20291]
TTGCAATTGAGCAATAAAGGGTGGATAAAGCTTTACAGGGAGTTGTTGGATAAATCAATTTGGAAAGATA
TTAAACCAGAAAGAAAAGTAATATTAATAACTCTATTACTTATGGCTAGTCATAAAGAAAATCATGTTTT
TATAGATAATAAAAGGATAAAAATAAAGTCTGGACAATTTATTTCTTCTTATAGCAAAATAGCTGAAAGA
TGTGGTAAAGGAGTTAGTTATCAAATGGTTAGAAGTTGTTTGTTGGTTTTTAAAAATGCTGGTTTTCTAA
CATACGAAACAACAAACAAATATATAGTCATAACTATTGAAAACTGGGAGCTTTACCAAGAGAACATAGA
AAATCAACAACCTAATCAACAGACGATTAACAATCAATCAACAACAATCAAGAATATAAAGAATGAAAAT
AATATTATATATAGTGAAATTATAAGCAAATTTAACTCAACTTGTATTGAACTTTCAAAGGTCAAGAAAC
TAACAGACACAAGAAAGAGGAGAATAAATTCAATAATAAGAGAATATGATAAAGAAGCTGTATTAGAGGT
TATAAATATAGTTAGTAAAACAAGTTTTCTGAATGGAAATAATAATACAGGATGGAAAGCAAATTTTGAT
TGGATAATGAATTCAAGTAATTTTACCAAGATACTAGAGGGCAATTATCATAGCAAGGAAATTGTCATAA
ATAAAGAGACAGGAATATATAATCCAGATGATTCACAATTAAAGTGGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3583521-3583207 hypothetical protein CDR20291_3002 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAGAATAATAATTTAGAAGTTTTAAAGACATTACAAGCTACTTTAAACATTATTGTAAAGAATG
AAGAAGAAGCACAAGAAAAAAAGCAAGGATATAAAATTATTGAAAATGCGAAAAGAAATAAAGCTGAACT
TATAACATGTAAAGAAGCATCTAAGCTTTATCCTATAGGAGAATCAAAATTTAGGCAGTTATGTCACTCT
AAAAATAAAGGTTTCCCTTGTATATGGATAAATAATCGAGTATACATAATAAAAAACAAATTGGATGATT
GGTTTATTGAAAATGCAAATGGTATCAAGTTATAG
>ref|NC_013316.1|:c3583725-3583525 putative phage transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAATCAATTTAAAAATATTTAGGATTAAAAAAGGTTTAAAGCAACAAGAACTGGCAGATAGAGTTG
GTATATCAAGATATTATTTGTCAAACTTGGAAACAGGTAAGGCTAATAATCCAAGCAATGATTTGATGAT
TAAACTATCTAGAGCTTTAGATACAACAGTAGAAGAATTATTTTTTAGTAAGGAGGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:3583794-3584636 putative phage DNA-binding protein [Clostridium difficile R20291]
GTGCTGTCAATAAGAATATATTATTTTTCTGTTCTCATTTGTGTACTTTTGGGATATACTTTATACGAGG
TGATAATATTGCAAATTGGAAAAAACTTAAAAAAGATAAGAAAACAAAAAGAACTAACACAGATTCAACT
TGCTGAAATTAGTGGCATCTCAAGAAATGCTCTAATAAATTATGAAAATGATAAAAGAATACCTAGTATA
GATACCTTATCAAAACTCGCTAAAGCTTTAAAAATTGAAAAGACTATCTTTTATTTTGATATTGAAAATG
AAGTAATGACTAATGAAGATGTTTTATATTTTTTACAGTCTTTATTCCCAGAAGAATACTATTCTTTTGA
TGAATTTTTAAATGCTATTTCAAATCTTATGGAAGATGATGATATTAGGATTACCTCAAGTTTATTGCTA
GGTGCTTGGTCTGATAAAGACCAATATTATAAACTTGGTGAAAAATTAGAACTAAATGAAAATCAAGTTT
ATAATTGGATACTTTCAGATTGTGTATCTAATACTGAATTAGATTTTTCATTACATCCTGATGATATAAA
AGAAATTATTAAAAATGATGTTCTTATAAAACAATCAATTGATGAATTATTAGATATTGGTCTATCAGAA
GAAAATATAGAAGCAATCTATGATTACTTTAGTGAGGCAACAGATAATGGGAGTAACATTCGACTAAAAA
AGTTAATATCTCAAAAAGAAAATATGACTATTAAAAATAATGATTACTTTAAATTATTACAAGAAAATAA
TGAATTAAAGGAAAAAAATAAAAAGCTTGAAAATACACTTAAAGAAATAAAAAAACTACTAACTAAAATA
TAA
>ref|NC_013316.1|:3584887-3585378 putative phage repressor [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAATAATACAATCGGAGAAAAGATTAAACAATATAGGAAATCGATAAATATGTCAAGGAATGAGC
TAGCCAACAAGATTGGTTGTTCAGTTCATGCTATAGCTAAATATGAGCAAAATCAAAGAATACCTAGTCT
AGATATGATAAGAAAAATATCTACTGCTTTATCAATTGCCATAAATAAACTCATTGTTGAAGAAAATGAT
TTAGATACTTTAACAAATAATAATATTAATTTAAAAGTATTTGATAAAGAGTTGGATTTAGTAGTTCACA
TATTAGAAAATTATGGTTATGATATAAAAACAGACTATAAAAAAAAGTTTGAAATTACAGATAATGCAGA
TACAATAAAACCAATTAGCTTAAGCTTCTCTGACTTCAAAGACTTCTCCAAAAATCTAAATTGGGTGATA
AATGGTCTTGTTGAAAATTTTATACAAGAAAACTCTAATGGTCTTATTGAAGATGAGGATGAAGAATATT
AG
>ref|NC_013316.1|:3585452-3586222 hypothetical protein CDR20291_3006 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGGAGCTAAAATCATGAATAAATCATATATACCAAAATACACACATAAATTCCCTACGAATCTAC
CTCATGGAGATAAAAAGTATACTTTAACATACATTAGAAGAATGATAAGTGAATTTGTATATGATATGGG
TAACCTAGAAAATAACCCCTTCACATTCCCAGAAGTACAAACATTACTTGATGGTATAACAGTAGGTGGA
CATAAATTAAGTGACCAAAATCAAATACTAAATATAAAATCATCATGGGATTATATAATAAAATTAAGTA
ACAAAGAAAACTTATCTTTAAATAAAGATACAATTTGCTCTATACATAAAATAGTTGCAAAAGATGAAGC
TCTAATTGTTGGAGATTTTAGAAACGGTAACATAGGTATAGCTGGTACTACTCAATATGAGTGCATAGAA
GCCACTCTATTAAATAATTTATTTATAAGTGACATAAGTATCATAAATAAAATAACTAACCCCTTAGAAA
AGGCTATAATAATAAATTTATGGTTGTCCTATTGTCAATTCTTCTATGATGGTAACAAAAGAACTGCTCG
ACTTACCTCAAACCTAATACTTATAAGTAATGATATAGGAGTTCTATCAATACCAGCCAAACATAAACAA
GAATACAACACATTAATGCTAAACTTCTATGAAACACTAGAAGCTGATGAAGTTATAAAATTCTTATTAG
AGAAATGTATTACATTCTTCGATGGATATAACTATAAATCATATAAGGAGTTGTTTAAAAATGGCAACTA
A
>ref|NC_013316.1|:3586212-3587378 phage integrase [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAACTAAAAGAGCTAATGGAGAAGGCTCTATCGGAAAATATAAAGATGGTTGGCGTTCTCGTATAA
TGATTGGTTATAATGAAGATGGAAAACCAATAAGAAAAGAATTTTATGGTAAAACTCAAAAGGAAGTTAA
AGATAAACTTGATGCTTATAAAAAACAATATTATTTAAGTTCTGATATTTCAGATGATAAAATAACTTTA
GAGCATTGGTTTTACAATTGGTTGTTTGAATATAGAATAAAAGATTTAAAACCAAAGTCATTTGAAAGAT
ATGAAAGCATCTATCGTAATTATATTAAAGATACTGATTTAGGCAATGTTAAGTTAAAGGACTTAAGAGT
ATCTCACATGCAAAAATATTACAATAGATTGCTTGATTCCAATAAAAGTATACCTACTATAAGGCAAATA
AACACTAAACTGAAAACCTGCTTATCAGAAGCTGAAAAACAAGGTCTTATACAACGTAATTATTGTACTA
TGGTAAATATACCAGTTGAGAAAAAGGAAAATAGGCTTGAAATATTGACTCTTGAACAACAAAAGAATTT
TATAAAAGCTATAGAGGGGCATAAATTAGAAGTATTATTTTTGGTTGCTCTTGGTACTGGACTTAGATTA
GGAGAATTATTAGGACTTAAATGGTTTGATATTGATTTTAAAAATTCTAATTTAACAGTTAAAAGAACCC
TTCAAAGAACATATTTTATAGATAAAAATGGAAATAGAGAGCTTAAAGTATTAGAGCAAGAACCAAAGAC
ATCAAATTCTTACAGGACTGTACCTATTCCAAAAGATGTTTTAAATAAATTGAAAGAGCATAAAGTAAAT
CAAAATGTGGATATATTAAAGGCTGGAGAATTATATAGAAATGATAATTATGTATTTTGCAATGAATTAG
GTGTCCCTATAGATGATAAAAGACCTTTAAGGAATTTAAAATCTATATTAAGCAGCTTAGATATAGAACC
TATAAAGTTTCATGGTCTTAGAAAAACTTATGCAACTAGACTTTTTGAGAATGATGTTCCTCCTAAAACT
GTACAAGTTTTAATGGGTCATTATGATATATCAATAACTTTAAATATATATACTCAAGTTATGGAAGATA
AGAAGGTTGAAGCTGTAGAAAAGTTGGATAAAATATTTTCATTGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3588182-3587730 hypothetical protein CDR20291_3008 [Clostridium difficile R20291]
GTGGCAAAAACGCCTAATATTATCTTCTTAAGAGATTCTTTAGATTTTGGAAAAGGATTCTATGTAACCA
GTATAAAAACACAGGCAATTAACTGGATAGAACGTTTTAAGAAAAGGGGTAAAAAAGCATATTTAAATAG
CTATTCTCTAGATATTGATAAATTAAAAGAAAACTGCAAGGTAAAAATCTTCAATAGTTATAATTTAGAA
TGGCTTGACTTTATATTAGAATGTAGAAATATGAGTGATGTATATATGAAATATGATGTTATAATAGGTG
GAATTGCTGATGATAAGATTTACAATACAATAGAACTGTATCAAGATAATCTTATTGAAAAAGATGAAGC
TTTAAAAAGATTAAAATACTATAAGCCAAATGAACAAATATGTATAACTAATCAAAATGTAATAGATAAA
TATTTAAAGTTTAGATGTGAAGAGGAGGTATAG
>ref|NC_013316.1|:c3588436-3588209 hypothetical protein CDR20291_3009 [Clostridium difficile R20291]
TTGAGGTTTGTAATGGATGAAAGAAAACTAGAATTTTCTATTTTTTGCATTGAAGCTTTAGCAGAAAAGT
TGAATATAGATTCAGAAGGAGTTTATAAACTTCTTAAACATGATACTGATATTTTAGATAACTATATAAT
ACCTTGCTATGAAGCACTACATTCTCAAAGTAAAAGTTATATAGTGGAAGATTTAATACAAGTGCTTGAA
GAAAAGGGCGTGATGTAA
>ref|NC_013316.1|:3589335-3590240 hypothetical protein CDR20291_3010 [Clostridium difficile R20291]
TTGGAATCAAAAGAAAAAAGTATATTGAGAGCAACACATTTTGGTATTATAAAAATAGGTGAAAAAGATT
TAAATTGTGCTGTACTAGAAAATGGTTCAAGAATCATAAATAAAAGTACAGTATTCAAAGCTTTTGGAAG
AACAAAGCGTGGTAGAAAAAAAGATGAAATTCGTGTACCTTCTAAGCCTAATCTACCAAGTTTTATTGAT
GCAAAGAATCTATCTGATTATATTTCAGATGAATTAGAAGATATGCTTATAAATACAATAAAATATAAGA
CTAAAAACGGAAGAATTGTGGAAGGTTATCCAGCTGAAATAATACCTCTTATATGTGATGTATATTTACA
AGCAAGGCTTGATAATAAATTAGCTGTTCAGCAAGAAGGACTAGCTATAGCAAGCGAAATTTTAGTAAGA
AGTTTATCCAAAATAGGGATTGTAGCATTAGTTGATGAAGCTACAGGATATCAATATGATAGAGATCGTG
ATGAGCTGCAAAAAATATTGTCTATGTATATTTCTAAAGAGTTTTTACCTTGGACAAAAAGATTTCCTGA
TGAATTTTATAGACAAATGTTCAGATTAAAAAACTGGACATACCCTAGACCAAGTTCTAAGAGACCTGGA
ATAGTTGGAACATACACAAATAAATATGTTTATGATTTATTACCTCCTGGAGTTAAAGAAGAACTTCAAA
GAGTTAACCCCACAGTAAAACCTGGGCAAAGAAAACATAAACATCATCAATTTTTAACAGAAGATATAGG
TAATGATCATTTAAAAAATCATTTATTAAAGGTTATAACCTTAATGCAAGCATCAAAAGACTGGAAAGAT
TTCAATGTGCTTTTTAATAGAGCTTTCAATCTACCTGTACAGCTCGAAATCGAATATGATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3591876-3591421 SsrA-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTGGTAAAAAAATATTAGCAACAAACAAAAGAGCAAGACATGAATATTTTATAGAAGAAACTTATG
AATGTGGAATTGAATTAAAAGGAACAGAAGTAAAATCAATAAGACAAGGCAAAGTTAACCTAAGTGATGG
ATTTGCATCTGTAGATAATAGTGAAGTATTTTTAAAACAAGTTCATATAAGTCCATATGAGCAAGGAAAT
ATATTCAATGTTGATTCTTTAAGAGTTAGAAAACTATTACTTCATAAGCATGAAATAAGAAAACTTATTG
GAGCAACTACTATAAAGGGGTATTCACTTATACCACTTAGTTTGTATCTAAAAAACGGTAAAGTTAAAGT
AGAGATTGCCTTAGCAAAAGGTAAAAAACTATATGATAAACGTCAAGATATGGCTAAGAAAGATGCACAA
AGACGTATAGAAAGAGAAATGACAGGTAAGTATTAA
>ref|NC_013316.1|:3592517-3593344 hypothetical protein CDR20291_3012 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATTTAAGCAAAAAAGTAAAAATTTTAGAAAATGCATCAGATGGCAAAAGCGAATTTGAAATATTAG
AATTTGAAAAACTTGAGGGAGCTTCTAGCCCATTAATGGCAATGGGATTATATTTTGCTAGAGAAGCTGG
TTTGAAAGCTAGACAAATTAAGATAAAATTAAATAATTCATCAATAAAAACAGAAGCTGGTGCATTATAC
TATTATAAAGGAAATATATCTTCTGAAACTAAGATTGGTGGTGTTGGAGGTCTTTTTAAAAAAGGAATAT
CAGGAGCACTTACTAATGAATCAATGATGAAACCTGTATACAAAGGTACTGGAGAAGTTTATTTGGAACC
TTCTTTTAGACATTATTTATTTATGAGTCTTGATAATGATTCTATAATTGTTGATAAAGGATTATTCTAT
TGTTGCTCTGATACAATAGAAGTAAAAGCATTTACACAAAAGAACTTCTCATCTGCTTTACTTGGTGGTG
AAGGCTTCTTCCAAATAGAATTAAGTGGTACTGGTGTAATCGTTCTGGAATGTGTTGTACCTCAAAGTGA
AATTGTAGAGTATGAATTGAAAAATGGAGAAGAATTAAAGGTAGATGGTAACTTTGCAATAGCAAGAACA
TCTGGGGTTAATTTTTCTGTTACAAAATCAGATAAATCTTTAATTGGTTCTGCTTTAAATGGTGAAGGTT
TCTTAAATACATTTACTGGTAATGGTACAGTTTGGCTAGCTCCAACTCAAGTAATGTATGAAAAACTAAG
TTTTGGAGCAATGCCTACTAATGATAATATGAATAATAAAGTTTCTAAGCAAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:3594253-3594825 putative acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
TTGTTAGTAAAATTTTTAAAGATTTTATGGATAGATATAAATAGTTTTACTTATTTTGTAAAATTTAAAA
TACCATTAATTACCTTAAATATTTTAATAGGAGGACATATGAATTTAAATAAAGTTAAATTTACTGAAGA
ACATGCTATTGAAGTTACTAATTGGAAATATGAAGGTAAATATTCAATATACAACCTACCTCCATGGGAG
GAAATTAAAAAGAAGAATTTTTCACTATCAAAAGAAGATAAAAGAAAAAATTTTATAAGTTTTATAAATG
ACAATAAAGAATTGATAGGTTTTATAAACTTATTGGATGAAGGAAGTTATGTATTCTTTGGTATTGGTAT
AAAACCAGATTATTGTGGAATGGGAATTGGCAAAGAAATAATTAGCCTAGGATTACAAGAATGTAGAAAT
AAATATAGTACTAAACCAATTGTATTAAATGTAAGAACCTGGAACATGAGAGCTGTAAAATGTTATAAGT
CTCAAGGATTTAAAATAGTTGAGACTCAGGTACAGAAAACGCATTTAGGGGATGGAGAATTTTTTGTTAT
GAGGTATCAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3595637-3595092 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATTCCTCTAATACAAGGAGTAGCTAATTTAGACAGAATTTCAACAGCTATATGTTTAGAAAATTATG
TTGCAATAATAGGGATAGTAATGTTGGTACCTGTATTTTCGCTAGAGCAATCAAAAGAAATTGATGAGAT
AGTATCTTCAAAATCATTATCTCAAGTTATTGTACAATTAATTAGGATACTGATGTCAATTATAGGTATA
GTGGTATTAATCATAGGTTTTGTAAATGTTTTAATATATCTTGGATGTAATTTTCCAGTAGTTGAGTATA
TTATTGGAAGTTTCGCATCAGCTATGTTTATAGGAAGTTTAGGAATGTTTTTCTCAAATTTATTTAATAA
TACAATCATAGGTTACATGATATCTATAGGATATTTAATTTTAAATATGATGACTAAAGGCAAGTATGTT
GGAAAATTTTTTATAATGTCTATGAGTCAAGGTAGTTTTGATGAGAAATATTGGCTGATACTTGGAAGTG
TTGTGTTGATAATTGCATCTCTCTTAATAAAACCAATAAAAAGGAAGATTAGGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3596955-3595666 putative ABC transporter, permease permease [Clostridium difficile R20291]
ATGAATCTATTTATAAAAGAATGTAAAAATATATTAAAGAGTATGGTATATTATATTTTTATTGTAGTTT
TAGTTTTTTTCTATATTTCTCAACTTGGAAGTTCAGTTTCAAATGATGTAAGTAAAAATATTCCTAATGA
TGGAAATCCATTAGTTGCTCCACAAAAAGTAGAGAATATTGACGAATATTACTCTGTACACAATCAATAT
CCATATGGTCAAAAAGAATCTATGAAAACAGAAAAGGTCATTCCAAATGCAACTATAAACCTAATTAGAG
AATATCAAAAAAACACATATACAACGTATCCAACAGGGGTAGTTAAGTATATAAAATTAGACCAAAATAA
AACGAAGACCATAGAAAAATATATAGAAGAAATAACTGGTAAAAGTATTAGCGAAATAAATTTAATTTGG
AAAACTGATGAAAGTATAAAAATAGATTATTCTAAAGTATCTCTTGAAAGATTTGAAGAAATAATGCAAA
GAGTAGACGACATTTTAGGAGGAGGGTCTGCATATGCTTTTGACAAGTTACAAAGATTTGGAGTAGTTCC
AGTTACCTATGATGAAGCTATGAAGAATTACAACTATACAATACAAAAAGATAAAGTTAGTAATGGGTAT
GCAAGAATTTTTTGCGATTATATAGGTATAGTTTTAAGTATATTTCCAGTATTTGTGGCAGTTTTTATGT
CACTTAAAGATAAGCGTTCAAGAATGAGAGAGATTATTTATTCAAAACAAGTATCTTCATGCAAAATAGT
TTTATCAAGATATTTTGCACTTGTCTTTATAATGATATTGCCTGTATTAATTTTAGGTATGAAAGATTTA
CTTCCTTTGATTTTCTTTGCTAAAGATAAAGGTATATCTATTGATAACTTAGCATTTATAAAATATACAT
TATGGTGGATACTACCAACTCTTATGATAGTTACAGCTGTAGGAATGAGTATTACTATATTAACAGATAC
ACCAGTAGCAATTATTGTGCAATTAATTTGGTGGCTTTACAGTATAAATTCTACAGGACTCAAAGGTGAT
TATTCAACAATGGGGCTAATGATAAGACATAATAGTGTATTAAATGGGGATATTATTATACAAAACTTCA
ATCAAATTATGATTAATAGAATTGTGATAAGCTTGGGAGCATTGGTGCTTGTTTTGTTAGCTATATTCTT
ATATGAGCAAAAAAGAAGGGGGAATCTTGATGTTTGGGCAAAGTTTTCAAAACTGTTTAGTTCTAATAAA
AGAAAACTTCAAATTAAGCACTTTAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3597824-3596952 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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ATCTTGAAATCGACAGTGGTATGTTTGGTCTTTTAGGAAGAAATGGAGCAGGAAAAACCACATTTATGAG
AATTTTAGCCACTTTATTATCAAAAACAGAAGGTTCAATACATATGTGTGGAGTTCCTATTGAGAATACT
AAGGAAATTAGAAATATGGTTGGTTATTTGCCACAAGATTTTTCAATGTATCCTAACATGACAGTATATA
AAGCAATGGATTATTTAGCAGTTTTATCGGATATACCACTAAGAAAAAGAAGAAAAATTATAGCAAAGTT
ATTAAGCAAAGTAAACCTTACTAATTATCAAAATGTGAAAGTAAAATCTTTATCTGGAGGTATGAATAGA
AGGCTTGGGATAGCACAAGCATTAATTCATAATCCCAGAGTTTTAATAGTGGATGAGCCGACAGCAGGTC
TTGACCCAGAAGAACGTATAAGATTTAGAAATTTACTATGCGAAATTGCAAATGATAGAATCGTTATTTT
ATCTACACATATTGTTGGAGATATAGAAGCTACATGTGAAAACGTAGCTATATTGGATAGTGGAAAAGTC
ATATACAATGGCTCAACAGAAGCATTAGCAAAACTAGCTGAAGGGAAAGTATATAGTATTGAAGTAGATA
AAAAAGACATTGAAAATATAAAAAGTAGATTTATAGTTATAGGAATGTTGACTCATGGTGGAAAGGCTAT
ACTTAGGATTATATCAGATGATAAACCTTTTGAGACAGCAGTAAATTGTAATCCAACTATTGAAGATGGC
TATATGCTTATAATGGGAGGAGATAATATATGA
>ref|NC_013316.1|:c3598845-3598354 hypothetical protein CDR20291_3017 [Clostridium difficile R20291]
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ATTTACAAGATTTTGTTTTTGAAGATGCCAACGAAAATAGTACTATCAATATTGATAAAGCATGGCATGC
CATTCACTTTACTTTGACAGGTTGTCCTTTTGGTGGAGATGATGAGAATATATTTAGCAAATTAGTACTA
AGTGGAAACATACTTATGGAAATTGATGGAGAATTTCCTGTCATGTTGATTACAGCAAATGATGTAAAAA
AACTATCAAAAGCAATGAACAGTTTGGAAGAACAAGCATTTAGAAAAAGATTTAATATTAATGAGATGTT
AGAAAATAATATTTATCCTGTTATGAATGATGAGAGTGAAGATGATTTTTTTGAATATGTATGGGCAAAT
CTAATTGAGCTTAAAAAGTTTATACAAGAAGCATCTGATGATGGACTAGCTGTAATATTTTTTATAATGT
GA
>ref|NC_013316.1|:c3602074-3599939 ribonuclease R [Clostridium difficile R20291]
ATGATACCAGGACTTAAAGAAAGTTTGCTAGGATTAATAAATGAAAGTGCATATAATCCTCTAAAAAAAG
AAGAATTAGCAGAAATATTTGATATACATTCATCAGAAATGCCAATGTTTTATAATTTTTTAAATGAATT
AGAAGAAGATGGTTATATCTGCTTTACTAAAAAAGGAAAAATAGTATCTCCCAATCAAATGGGATACTTT
GTTGGAAAATTTGTATCACACAAAAAGGGTTTTGGATTTGTAGAATCTGATGTTGAATATACACAGGATT
TATTTATCTCAAGTGACAATATAAATGGTGCTATGCATAACGATAGAGTTATGGCAGAAATAGTAGTACC
TGCAACTGAAGAAAAGAGAGCAGAAGGAAGAATAGTAAAAGTAATAAAGAGAGAAATAACTAGAATAGTA
GGTACTTTCCAATCAAGTAAAACTTTTGGATTTGTAACACCAGACAACAAGAAATTTACTAAAGATATAT
ATATACCTAAAAAACATTTTAGTGGAGCAGTAGATAATGATAAGGTAGTATGTGAAATTACAGTATGGCC
ACAAGAGGATAGAAAACCAGAAGGCAAAATTATAGAGATACTAGGTCAAAAAGGTGAAAGAGGCGTAGAA
ATAGATTCTATAATAAGAGAACATGGTCTTCCAGAAGAATTTCCAAAGAAAGTATTGCAAGAAGCAGAAG
CTGTAGCTGTTGAGATTCCTCAAGAAGAGATAAAAAGAAGAAGAGATTTAAGAGATTTAAACATATTTAC
TATAGATGGAGATGACGCAAAAGACTTAGATGATGCCATATCAATAGAAGTATTACCTAATGGAAACTTC
AAACTAGGAGTTCACATAGCTGATGTTACACATTATGTAAGAGAGAAAAATAAACTTGATAAGGAAGCCT
TAAAAAGAGCTACATCAGTTTATTTAGTAGATAAAGTAATTCCAATGTTGCCAAAAACTCTTTCAAATGG
AGTATGTAGCTTAAATCCATTTGAAGATAAGTTAACTCTTTCTATATTTATGGAAATAGACCATAAAGGA
AATGTGGTTAAACATGAAATATGTGAATCTGTAATAAATTCAAAAGCTAGAATGACTTATACAGAAGTAT
CTGATATATTAGAAAAGGATGATGAAAAACTTAAAAAGACTTTTGAACATGTTGTTGAAGATTTTAAAAA
TGCTGAAATTTTAGCTAAGATTCTTATGTCAAGAAGAGAAAAAAGAGGAGCTATAGACTTCAATTTCCCA
GAGGCAAAGATAATTCTAAATGGAAAAGGCGAAGTTGTAGATATAAAGCCATATGAAAGAAGAATATCTA
ATAAGATAATAGAAGAATTTATGCTTATAAGTAATGAGACAATTGCCGAACATTTTTACTGGATGGGAAT
ACCGTTTGTGTATAGAATACATGAGACACCATCTTTGGAAAAAATGGAAGAATTGAGTAAGTTTATATCT
ACATTTGGATATATAATAAAAGGTGATAAAGAGGAAGTACATCCAAAAGCATTACAAGGTATAATAGAGA
AAATAAAGGGCAAAAAAGAAGAAGGAGCTATCAGTACTATAATGCTTCGTTCTTTAAAACAAGCTAAGTA
CTCACCAGAATGTAGTGGACATTTTGGATTAGCAGCTAAATTCTACTGTCACTTTACTTCACCAATAAGA
AGATATCCTGACCTTCAAATTCATAGAATAATAAAAGAATCTTTAAATAATAAAATAAGTGGAAAAAGAC
AAGAACAGCTTACTACTATAGTGGATTATGCATCTGTTCAATCATCCGAGAAAGAAAGAAAGGCAGAGTT
AGCTGAAAGAGATGTACATGATTTCTATAAGGCTCTTTATATGAAGGATAAAGTTGGTCAAGAATTTGAG
GGTGTTGTATCTAGCGTAACTTCATTTGGAATATTTGTTGAGTTAGATAATACTATAGAAGGATTGATAA
GACTTGCAAATATGAATGATGATTACTATATTTATGATGAGAGTTCTTATAGTGTTTTAGGAGAAAGAAC
TAAGAAGTCATATAAGATAGGAGACCTTGTTAAGATAAAGGTTGAAAGTGTTAATGTAGATTTTAAAGAA
ATTGACTTTGAGATAGTTGAAAAAATAGAGGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:3602655-3603284 hypothetical protein CDR20291_3019 [Clostridium difficile R20291]
TTGGAGGAGATAAAATTGGAAGAAGTAATTGCAAAAATTATTACTATAGAAAATGGATTCAAAGAAATTG
AAAACATTGCTAAAAAAATTGTAAAAAATAATGACTCAAAAAAGTGTTATTATCTATCAATCTACTTATA
TAGGTCAGAATATTATCAAGTAAGAGAATTGGCTGTGTTTATACTTGGTTTTATATCAGTAACTATTTCT
GAAGCTTTGTTATTTTTAAAAGACAATGTGAGTAAAGATGAAAACTGGAGAGTACAAGAAATACTAGCTA
AATCATTTGATTATTATTGCAGTGAAGTAGGATATGAAAAGGCACTTCCTGTTATAAAAGAATGGCTTAA
TTCTGATAGTCCAAACATAAAAAGGGCTGTGACAGAAGGTCTTAGAATTTGGACTAGTAGAGACTATTTT
AAATCTAATCCTGACGTTGCTATATCACTACTTTCTAGTTTAAAAGAAGATGATAGCGAATACTTGAGAA
AGTCTGTAGGTAATGCTCTTAGAGATATAAGTAAAAAATATCCAGATTTAGTAAAAAAAGAATTAGATTC
ATGGGATATATCAAATAAAAAAGTTGAGTTTGTATATAAGCTTGCTTCAAAATGTATCTTGGCAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:3603302-3603664 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
TTGAAACTTCGTGATGAGTATACTTGCCCATTAGAACTAACACATGATATGATAAAAGGCAAATGGAAAT
CTATTATATTATGGAGATTACGCATAGGACCAACCTCCTTATCAAAACTTGAAAAGGAAATCAATGGTAT
TAATCAAAAGATGTTACTTGAACAACTTAAAGAATTAATTGAATTTGGTCTTGTAGATAAAAAGACATAT
AAAGGTTACCCACTTAAAGTTGAATACTCACTTACACCTATTCGAGGGAAACAAATATTGGATGCTTTGG
CTATAATGCAAGATATAGGAATTAGCTTTATGTTGGATAATGGTATGGAAGATATTCTTAAGGAAAAAGG
TGTTTTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:3603770-3604267 putative phosphatidylethanolamine-binding regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTAACTAGTACAGGTATAGTAAATGGTGTTATAGAAGATAAATACGGTAAAAGAGGAACTCAGT
TCAATGAAGGTGGTATGCCTACATATTCACTACCTCTAAAGTTTGAAGATGCTCCAAAGAATACAGTATC
CTTTGCTGTATTTTTAGAAGATAAAGACTCTGTTCCTGTATGTGGGTTTGCATGGATACATTGGTTAGCT
GTAAATATAACAAAAGATGAGTTAAATGAAAATGAAAGTGTAACAGCTACTGATTTTGTACAAGGGACTA
CTAGTTGGCATGGCAAACTAGGAGGTCTTGACAGATTAGAGGCCAGTGTATATGGTGGAATGGCTCCTCC
AGACAGACCTCATGTCTATGAAATACATGTATTTGCACTTGATACTATCCTTGACCTTGAAAAAGGATTC
TATATGAATGAATTTTTCAAAGCTATTGAAGGGCATGTTTTAGATACATTTACACTAAAAGGAAGCTATT
CTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:3604691-3605089 hypothetical protein CDR20291_3022 [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAAAAAAATAGAGCATGTGGTCATTACTAATAATAATATAGAAAATTATATCAATTTTTATAAAA
AATTTGGTTTTTCATCTAAAGAAATGAGCGAAAAGTATAAACTTAAGGCTAGAAATGTTAAGATAAATCT
TAACATAAAAGGTTATAAATTTTTACCTTATGTTAAAAATTTAAAAGCAAGTAGAGATAACTTATGTTTT
AAAATAAACACAAATATTGATGAGCCAAAAAAATACTTAGAACAAAATGAGATTCAAATTAAGCGAGGAA
TTGTAGAATGTACAGGTGTCTTTGGTAATATGAAATCTATTTATTTGAAAAAAACTAATGGAAATTTAAT
TGAATTATCAAATCATAGAATCACGGAGAGTAAACCTTGGAAAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:3605128-3606015 putative transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGTCACTTGGATATGTTCTAAAAAAATTAGGTCTATTTGATACTCATACTTTAAATAAAATGAATAATG
TCTGCTTCAAGTCTTTCTTGCCATTATTATTATTTTTTAATATATACAATACAGATTTAGATGGTTCTCT
TAATTTTAAGCTTATGGCTGTAGCTGTTATAATTATTTTTTCAATCTTCTTAATCTTAGTCTTTATTATT
CCTAAAATTGAAAAAGATAATAAGACAAGGGGTGCATTAATACAAGGTGTATTTCGTAGCAATTTCGTTA
TATTTGGTATTCCTGTGACAATTTCACTATTTGGCGATAAGAGTATTGGAGTCACATCTTTATTAATTGC
AGTTATTGTACCTATGTTTAATGTATTATCTGTTGTAATTCTTGAAATTTTTAGAGGTGGCAAAGTAAAT
ATAAGACATATGATTAAAAGCGTCTTAACAAATCCACTCATAATCGCCTCTTTTATAGGATTGACAATGC
TAATTTTAAATATTAATATACCTACATTTTTACACAAAACTATTGGTGATATTTCTAAAATAGCTACTCC
TTTATCACTTATAATTCTAGGCGGATCTTTTAGTTTTTCTGCTATAAAGGGGCATATAAAAACCATTATA
TTGGGCGTATGTGGAAAACTTATACTTGTACCTTCTATATTTTTACCAATTAGCATTTTTCTTGGATTTA
GAAATGTAGAATTAACTTCACTTATGATAATGTTATCTGCTCCAACTGCAGTTTCTTCATTTACAATGGC
ACAACAGATGGATTCTGACAGTGAATTAGCTGGACAAATTGTAGTATTTACTTCTGGATTTTCTATAATT
ACAGTATTTTTAATAATATTTATTTTAAAGCAGAATAATCTTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3606623-3606399 putative subunit of preprotein translocase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCAACATTTTAATGGGTGTGCAAGTAGTGCTAGGGATTTTACTAGTAATTAGCATAATGCCTCAAG
ATTCAAAAAATGCTTTACCTTCAGAATTTGGTGGAGAAGGAAGTCAAGCTTACTTTAAACCAAAAGGAAA
ACAAGCATTTCTTGCTAGAGTTACAAAGATAACAGCAGTATTATTTTTTATAAATGCATTGGCATTACTT
ATAGTTAAGAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3607247-3606741 gcn5-related n-acetyltransferase; gcn5-related n-acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTAGAGATTATACGAGCTACAAGTGAAAATGCTATAGAAATGGGTTTTATACATTCTTGTTCGT
GGAGAAAAGCGTATAAAGGAATTATTCCAGATAAGATAATAGATGAATTCACTTCTGAGAAAAGAGCAGA
AGTTTTTCAAAGTGTTATTCCAAAAGCTGAAGAGGAATATTATCTTTTTAAAGTGAATGGTATACCTGCT
GGTTTTGCTTCATTAAATAGAAGTCAAGAGGATAATGCTCCAAAATGTGTTGGAGAAATATATTCTATAT
ATTTCCATCCCGATTTTTGGGGAACATCTGTGACAAAAAAAGGATTACAATTTTGCATTGATAGATTAAG
CAATTTAGGATATTCATATATAACGATATGGGTTCTAAAAGACAATACTAGAGCTATAAATTTCTATAAA
AAAAATGGTTTTACTTGTGATGATTTTGAGAAAGAGATACATATTGGAAAAAAATTATTAGAAGTACGTT
ATTCAAAAAAGATATAG
>ref|NC_013316.1|:c3609172-3607880 enolase [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAGTTATTGAATTAGTATATGCTAGAGAAGTATTAGACTCAAGAGGAAATCCAACTGTAGAAGTTG
AAGTAGTATTAGAAGATGGAGCAATGGGAAGAGCAATAGTTCCATCAGGAGCATCTACAGGAGCTTTTGA
AGCTGTTGAATTAAGAGATGGAGATAAGGGAAGATACTTAGGAAAAGGTGTAGAAACAGCTGTTGCTAAC
GTAAATGAAATAATAGCACCTGAAATAGAAGGAATGGATGCATTTGACCAACCAGCTATAGATGCAATCA
TGATAGAATTAGATGGAACTCCAAACAAAGGTAAATTAGGAGCTAATGCTATATTAGGTGTTTCAATGGC
AGTAGCTAGAGCAGCTGCTGATGAAATAGGTTTACCATTATTCCAATATTTAGGTGGAGTAAATGCTAAA
CAATTACCTGTTCCAATGATGAACATATTAAACGGTGGAGAGCATGCTGATAATAACGTTGATGTTCAAG
AGTTCATGATATTACCAGTAGGAGCTTGTTGCTTTAAAGAAGGTTTAAGAATGGGAGCAGAAGTATTCCA
TTCATTAAAGAAAGTTTTAGGAGAAAAAGGATTAGCTTGTGGTGTTGGTGACGAAGGTGGATTTGCTCCA
AACTTAGGTTCAAACAGAGAAGCTTTAGAATTAATAGTTGAAGCTATAACAAAAGCTGGATATAAGCCAG
GTGAAGATGTTATGTTAGGACTTGACGTTGCTGCTACAGAAATGTACAACAAAGAAACTAAAAAATACGT
TTTAGCAGGAGAAGGAAAAGAGTTAACTGCTGCTGAAATGGTTGCTTTATATGAAGATTGGTCAAACAAC
TTCCCAATAATAACTATAGAAGATGGTTTAGACGAAGAAGATTGGGACGGATGGAAGTTATTAACTGAAA
GATTAGGAAATAAATTACAATTAGTTGGTGACGACTTATTTGTTACTAACACAGAGAGATTAGAAAAAGG
AATTGAAAATGGAGTAGCTAACTCTATATTAGTTAAAGTTAATCAAATAGGTACAATAACTGAAACTTTA
GATGCTATAGAAATGGCTAAGAGAGCAGGATATACTGCTGTTATATCTCACAGATCAGGAGAAACTGAAG
ATTCTACTATAGCAGATTTAGCTGTTGCAGTAAATGCTGGTCAAATAAAAACTGGTGCTCCATCAAGAAC
TGATAGAGTTGCTAAGTACAACCAATTATTAAGAATAGAAGAAATGGTTGGAGAACAAGCTAGATACTGT
GGATTAAAATCTTTCTATAATTTAAAAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3611292-3609760 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase [Clostridium difficile R20291]
ATGATGAAAAAACCAGTTGCTTTAATTATTATGGACGGGTTTGGATACAATAAGGATGTTAAGGGAAATG
CAATTGCTGAGTCCAAAACTCCTAATTTAGATAGAATAAAAAAAGAGTATCCAAACACATTGATAAATGC
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GCAGGTAGAATAGTATATCAAGATTTAACTAGAATAACAAAATCTATAAAAGATGGTGACTTTTTTGCTA
ATAAAGTTTTATGTGAAGCAATGGATAATGCAAAAGAAAATTCTCTTCATGTAATGGGACTTTTGTCTGA
TGGAGGAGTACATTCACATATAGACCATCTTAAGGCTATAATCAAAATGGCAAAAGATAAAGGCGTACAA
AAGGTGTATGTTCACGCATTTACTGATGGTAGAGATACTGACCCTCAAAGTGCATTAGAATATGCCAAAG
AAGTACAAGCTAGTATGGATGAAATTGGAGTAGGTGAATTTGCTACAGTTTCTGGTAGATACTACGCTAT
GGATAGAGATAAGAGATGGGAAAGAGTAGAACTTGCATACAATGCCATGGTTAGAGGTATTGGTGAAAAA
GCAAATTCTATTGAGGAAGCTATTCAAAACTCTTATGATGATGGAAAAAATGATGAGTTTATAATGCCAA
CAGTTATTATGAAAGATGATAAACCAGTTGGAAGTATAAAGGAAAATGATTCAATTATATTCTTCAACTT
TAGACCAGATAGAGCTAGACAAATAACTAGAGCTTTAGTTTGTGAAGAGTTTGATGGATTTAAAAGAGAA
GATATTAAAAACTTCTTTGTATGCTTAACAGAGTACGATATAACTATAGAGAATGTGCATATAGCATTTG
GACCTCAATCTTTAGCCAACACTTTAGGTGAGTATCTAGCTAAAAATGGAAAAACTCAACTTAGAGCTGC
TGAAACTGAAAAGTATGCACATGTAACTTTCTTCTTCAATGGTGGAGTAGAAGAGCCAAATAAAGGTGAA
GAAAGACTATTGATACCTTCTCCAAAGGTTGCAACTTATGATTTAAAACCAGAAATGTCAGCATATGAAT
TGACAGATAAAGCTTTAGATAAATTAGGAGAAGATAAGTTTGACTTTATAGTATTAAACTTTGCAAATCC
TGATATGGTAGGTCACACAGGAAGTATAGAAGCGGCTATAAAGGCTGTTGAAACTGTAGATACTTGTGTA
GGAAAATTGATAGATAAAATAGTAGAGTTAGGTGGAAGTGCAATAATAACTGCTGACCACGGAAATGCTG
AATATATGTTAGACCCGGAAACAGGAAAAACTGTAACGGCTCACTCTATTAATCCAGTACCATTTATTGT
AGTTGGTCAAGAATATGAAAGTGCAAAATTATTGGATGGAGGAAGATTATCTGATATAGCACCGACTGTT
TTAGATATGATGAAGTTAGAAAAGCCAGAAGAAATGACTGGTCATTCACTTATTTCAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3612044-3611301 triosephosphate isomerase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAAACCTATAATTGCAGGAAACTGGAAAATGCATAAAACAATAAAAGAAGCTTTAGAATTTGTAA
ATGAAGTTAAAGATAAAGTAAATTCTGATAAAGTAGAAGCTGTTATATGTGCACCATTTACTTTATTAAA
GGATTTAAAAGAAGCTACTAAGGGTACAAATATAAAGATAGGTGCTCAAAATATGCACTTTGAAGAAAAA
GGAGCATTTACAGGAGAAGTTTCACCTCTTATGTTAAAAGAAATAGATATGGACTATGTTGTAATAGGAC
ATTCAGAAAGAAGACAATACTTCAATGAAACTGATGAAACTGTAAACAAGAAAGTTTTAAAAGCATTAGA
AGTAGGAATAGACCCAATATTATGTGTTGGAGAAACTTTAGAACAAAGAGAAGCTGGAAAAACTAAAGAT
GTTTGTAAAGTTCAAGTTGAAAAAGCTTTAGAAAATGTTCTTAAAGATGATTTATCAAAAGTAGTTGTTG
CATATGAGCCAATCTGGGCTATTGGAACTGGTAAAACTGCAACTGCTGAAGATGCTAATGACGTTATATC
TTATATAAGAGAAGTTATAAAAGGATTATATGGAGAATTAGCTAATGAAGTTAGAATACAATACGGTGGA
AGTGTTAAACCTTCAAATGTAGCCGAAATAATGGGTCAAAGTGATATAGATGGAGCTTTAGTAGGTGGAG
CTAGTTTAGCTAGTAATGATTACCTAGACCTTGTTAATTTCTAA
>ref|NC_013316.1|:c3613272-3612070 phosphoglycerate kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAATGCTTAACAAAAAAACTATAGAAGATATTGATGTGTGCGGAAAAAAAGTATTAGTAAGATGTG
ACTTTAATGTGCCATTACAAGATGGTGTAATTACTGATGAAAATAGATTGAACGGAGCTTTACCAACTAT
TCAATATTTAATTTCTAAAGGGGCAAAAGTTATATTATGCTCTCACTTAGGAAAGCCAAAAGGAGAAGCT
AAACCAGAATTATCTTTAGCACCAGTAGCAAAGAGATTATCTGAGATGTTAGGAAAAGAAGTTGTATTTG
CAGCAGACGATAATGTTGTAGGAGAAAATGCAAAGAAAGCAACTGAAAAAATGGAAAACGGAGATGTAGT
ATTATTAGAAAATACTAGATATAGAAAAGAAGAAACTAAAAACGAAGAGAATTTCTCTAAAGAACTAGCA
TCACTTGCTGAAATATTTGTAAATGATGCATTTGGAACTGCTCATAGAGCACATTGCTCAACAGTTGGTG
CAGGCGAGTTTTTACAAGAGAGAGTTTGTGGATACTTAATTCAAAAAGAATTAAAATTCTTAGGAGAAGC
TGTTGCAAACCCTGTAAGACCATTTACAGCTATACTTGGAGGAGCTAAAGTTTCTGATAAATTAGCTGTT
ATAAACGAATTATTAGAAAAAGTTGATAATCTAATAATAGGTGGAGGAATGGCTTATACATTCTTAAAAG
CTCAGGGTTATGAAGTAGGAACTTCTTTACTTGAAATAGATAAAGTTGAATATGCTAAAGAAATGATGGA
AAAAGCTAATAATAAGGGTGTTAACTTATTATTACCAGTAGACGTTGTTATGGCAGACCACTTTGCACCA
GATGCTACTCCAATAGTAACAGAAGATGCTAATGTAAAAGAAGATTACATGGGACTAGATATGGGACCTA
AGACTATAGCAAACTTTGTAAAAACTATAAAAGAATCAAAAACTGTAGTATGGAATGGGCCAATGGGAGT
ATTTGAATTTGAAAACTTTGCAAATGGTACATTATCAGTAGCTAGAGCTATGGCAGAGTTGACTGATGCA
ACTACTGTAATTGGCGGTGGAGATAGTGCAGCAGCAGTTAATCAATTAGGATTTGGTGACAAGATGACTC
ACGTATCAACAGGTGGAGGAGCATCACTAGAATTTTTAGAAGGTAAAGAATTACCAGGTATTGCAGCATT
AGATAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3614501-3613494 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 2 [Clostridium difficile R20291]
ATGGTTAAAGTAGCTATAAATGGATTTGGAAGAATAGGAAGATTAGCATTAAGAAAAATGATGGAGCAAC
AAGATAAGTTCGAAGTTGTTGCAATAAACGACTTAACAGACGCTAAAATGTTAGCTCATTTATTTAAATA
TGATACAGCTCAAGGAAGATTTAACGGAGAAATAGAAGTTAAAGAAGGTGCTTTTGTAGTAAACGGAAAA
GAAATAAAAGTAACAGCAGAAAGAAATCCTGCTGACCTACCATGGGCTGAATTAGGAGTAGATATAGTAT
TAGAATGTACAGGATTCTTTACATCTAAAGATAAAGCTGAAGCTCATATACAAGCAGGGGCTAAGAAAGT
TGTTATATCTGCACCAGCTACTGGAGATTTAAAAACAATAGTATTCAACACAAACAGTGACATATTAGAT
GGTTCTGAAACAGTTATATCAGGAGCTTCTTGTACTACTAACTGTTTAGCTCCAATGGCTAAAGTATTAA
ATGATAAATACGGTATAGAAAAAGGATTAATGACTACTATACATGCATACACTAATGACCAAAATACTTT
AGATGGTCCTCATCCAAAAGGTGATTTAAGAAGAGCTAGAGCTGCTGCTGGAAACATAGTTCCAAACACT
ACAGGAGCTGCAAAAGCAATAGGCTTAGTAATACCTTCATTAAAAGGAAAATTAGATGGGGCAGCACAAA
GAGTACCAGTTGTAACTGGTTCAATAACTGAATTAGTTTGTACATTAGGAAAAAATGTTACAGTTGAAGA
AATAAATGCAGCTATGAAAGAAGCTTCAAACGAATCTTTCGGATATACTGAAGAAATGTTAGTATCTTCT
GACATAATCGGAATAAGCTACGGTTCATTATTTGACGCTACTCAAACAAAAGTTATGGAAGTAGATGGAA
AACAATTAGTTAAAGTTGTTTCTTGGTATGATAATGAAATGTCTTATACTTCTCAATTAATAAGAACTTT
AGGATACTTTGCACAATTAGCAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3615583-3614561 central glycolytic genes regulator [Clostridium difficile R20291]
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CTATTTTAAGACAAATATCTTTAAGTGAACCAATAGGTAGGAGAACATTATCAAATGTATTAGAGATTAG
TGAAAGAATAATCAGGTCAGAAACTGAGTTTTTAAAAGAACAAGGACTTATAGACGTAGCTGTATCTGGG
ATGACTATCACTAAAGAAGGTTCTGATTTGTTAGATAAACTTAAGGACATCATGAGTGACATCATGGGAT
TGTCTAAGTTACAAGATAGAGTCAGAGAAAAGCTTGGAATAAAAAGGGTAATACTAGTTCCTGGAAGCTG
TGATGAAAATGGAAGTTTACTAAAAGATGTAACTAGATATGGATGCGAGTATTTCTTAGGCATTTTAAAA
GATGGAGATATCGTTTCAATAACAGGAGGAAGCACTATGTTGGAGTTTTCAAACGTTATTAAAACTGATA
AGAGATATCCAAACTCTACAATAGTTCCAGCTAGAGGAAGTATGGGAACTGATGTAGAGATGCAATCTAA
CAATATAGTTGCTTCAATAAGTAAGAAATTACATTCTAATTGCAAACTTTTACATATACCAGATGAGTTG
GATGAAAGTGCAATGAAAACTCTTAGCCAAGTGCCAGAGATTAAGACAACTTTGGAGTATATTAAAAGAA
CAGACATTTTAGTTTTTAGTATAGGTAGAGCAGATGTCATGGCAAAGAGAAGAAAACTTCCAGAAGACAA
GGTTGATGAGATATTATCTAAAAATGCAGTTGGAGAAGCATTTGGATATTATTTCAACAAAGATGGAGAA
ATAGTTTACAAACTGAACACTGTTGGAATTGATTTAGAAACAGTTAAACAAGTAAAAGAAACTATTGCAA
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AACAGATGAAGAAAGTGCTTATAAGATATTGTCATTATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3617726-3616380 RNA polymerase sigma-54 factor [Clostridium difficile R20291]
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CATTATCAATATTAAATATGAGTAAGTTAGAGTTAGAAGAAGAGATAAAAAGAGAAGCAGAGAATAACCC
ATTAGTTGAAGTCGAGAAAAGTGGGGAGATAAATTGGGAAGAGTATATAAAAGACATGGATAGGTCAAGA
CGTTTAGATAGAACAGAGATAAGCTATAATCCTGATAATGAAGTTAATCTAGAAAATTTAGTTAAATATT
CGTCAAATTTATATGAAGATTTAAAATTTCAGATAAGCCTGTATAAACTTACAGACAAAGAATTGGAAGT
CTGTGAGTATATAATTGATAGTTTAGATGAGGATGGATATTTAAGAACTGAGGAAAAAGTAATTGTTGAT
ACCTTAAAGATAGATGAAGAACTTTTTGAAAAATGTTTAATTAGTGTTCAGCAGTTGGAACCTAGTGGAG
TAGGGGCAAGAAGTCTTTCAGAATGTCTGATGATACAAATGGCTAGTTTAGGAATATATAATGAAATTTT
AGAGGAAATCGTTACAAAAGACTTAAATTTAATTGCAAATAATAAATATAAAGAGATAAGTAAAAAGTAC
AATATGTCATTACAAAAATGTGTTGAACTAATAAACATAATTAAGACATTAGACCCCAAACCAGGAAGAA
CTTGTTCAGTAGAGAAAAGTGTATACATTCAACCTGATGTAACAGTAGAAAAGATTGATGATGAATTTAT
TGTATATTTAAATGAGAAAGATTCTTACCAAATAAGAATCAATAGTTATTATAAAGACATATTAAAAAAT
TCACAGTCTGATGAAAGTGCAAAAGAATTTATAAAAGAAAGACTAAATTCAGCAACAGGACTTATGAAAA
ATATAGAGAGTAGGAAAACTACAGTACTTAAGATTGCAGAAGAGATAGTAAAAGCTCAAGATGAATTTTT
GAGAAAAGGGACAAAATATATAAAACCTTTGAAAATGAAAGACATAGCAGAAAAATTAGAATTTCATGAA
TCTACTATAAGTAGAGGTGTAAATGGTAAATATATGCTAACACCTTTTGGCGTATATGAATTTAGGTACT
TTTTCAGTAGCGCCATTGAGACTGAGAATAATGAAATGGCATCTAGTACAAGCATAAAAAAAATTATAAA
GGAAACAATAAAAGACGAAAATAAAAAGAAACCTTTAAGTGATGACCATATATCTAAGTTATTAAAAGAA
AAAGGAATCAATGTTGCAAGAAGGACAGTTGCCAAATATCGTGAAGAATTAGGAATCCCATCTTCAAGTA
AGAGAAAAGAATACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3620439-3617878 xanthine dehydrogenase, molybdenum binding and iron-sulfur binding subunits [Clostridium difficile R20291]
ATGGTAGAATTTATATTAAATGGAGAGAAAGTTGTTGCAAAAGAAGGCAAAAAACTTTTAGACTTCCTTA
GAGAAGATATGAATATAACTTCAGTTAAAAATGGCTGTTCAGAAGGTGCTTGTGGAACATGTATGGTTAT
AATAGATGGTAAAGCTACTAAAGCATGTGTATTTAAAACTGATAAATTAGCTGGGAAAAACATAACAACT
ATAGAGGGATTATCAGAGAGAGAAAGAGATGTTTTTGCATATTCTTTTGCTAGTCAAGGAGCTGTACAAT
GTGGATTTTGTATTCCAGGTATGGTAATTAGTTCAAAAGCACTTATAGATGTTAATAATAATCCTACTGA
AGATGATATAAAGAAAGCTTTAAAAGGTAATATATGTAGATGTACAGGGTATGTAAAAATAATTAAAGCT
GTCGATTTAGCAGCAAAGATTTTTAGAGAAAATATAGATGTGCCAAAAGTAAACTGTAAGGGTCTAGTAG
GTGAAAATCTTCCTAGAGTTGATGCAGTTGGCAAAGCACTTGGATATTCTGAATATGTAGATGATATGAG
AATTGAGGGTATGATTTATGGTTCAGCAGTTAGAGCTAAGTATCCTAGAGCTTTAGTTAAAAAAATAGAT
ATAGAAGAAGCAAAAGCTTATCCAGGAGTTGTTGCAGTTCTAACAGCTAAAGATATTCCAGGAACTATAA
AGGTAGGGCACTTAAAGAAGGATTGGGATACTTTAATACCAGAAGGTGAAATAACTAGATATTTAGGAGA
TGGAATAGTTTTAGTAGCAGCAGAAACTAGAGAAGCGTTAGAAGAGGCCAAAAAGCTAGTTAAGATAGAT
TATGAGGAATTAACACCATTAAGTACTACAGCAGATGCACTTAGAGAAGATGCTCCAAAGATACATGAGA
CAGGGAATATACTTGTTAAGGAACATTTAGTAAGAGGAAACGCTAAAGAAAAGATAGAAAATTCAAAATA
TGTTGTAACTAAAAGATATACTACACCTGCTACAGAACACGCATTTTTAGAGCCTGAATGTGCAGTAGCT
GGTCCTTATGAAGATGATGGAGTAATAATCTATTCAACAGACCAAGGGGTGTTTGCCACTCAACATGAAT
GTGCAGATATGTTAGGGTTACCATATGAGAAGGTAAGAGTTATAAACAAAATGGTAGGAGGAGGGTTTGG
TGGAAAAGAAGACATGAGTGTTCAACACCATGCAGCCTTACTTGCATACCATACAAAGAGATTTGTAAAA
GTACAGTTAACAAGAAAAGAAAGTATTATTGTTCATCCAAAACGACATGCCACAGAAATGGAATTTACGA
CAGCATGTGATGAAAATGGATACTTAACGGGTATGAAGGCAACGATAATATCTGACACAGGTGCATATGC
CTCTCTTGGAGGACCAGTGCTACAAAGACTGTGTACTCATGCAGCAGGACCATACAATTATCAAGATATT
GATATAACAGGAACAGCAGTATATACTAATAACCCTCCTGGAGGAGCATTTAGAGGATTTGGAGTTACAC
AGAGTTGTTTTGCAACTGAATGTAATCTAAATTTACTTGCTGAAATGGTTGGAATATCTCCTTGGGAGAT
AAGATATAAAAATGCAATAAGACCTGGGCAAGTTTTACCAAATGGTCAATTTGCAGATGAAGGAACAGCA
ATGGCAGAGACACTAGAAGCTGTAAAAGAAGAGTATGAAAAGCATCCACGTGCAGGTATAGCTTGTGCTA
TGAAAAATAGTGGGGTTGGAGTTGGTATACCTGATGTTGGAAGATGTAGATTGGTGATAAAAGATGGCAA
AGTTCACATAAGAACAAGTGCTTCTTGTATAGGTCAAGGGCTTGGTACTGTTATGACTCAAGTAGTTTGT
GAAACTGCTAGCCTACTTCCTGAAAATATAGTGCATGAAGTTCCAGATACTCATTTAACACCAGACTCTG
GTAATACTACGGCTTCAAGACAGACAGTATTTACGGGAGAAGCTACTAAGGTTGCATCAAATAAGTTAAA
AGAAGCTTTAGACTCTGGCAAAACTTTACTTGATTTAGAGGGAGAAGAGTTTTATGGAGAATATGAAAGT
ATTACAGATAAAATGGGTTGTGACAAAGAAAATCCAGTAAGTCATGTTGCTTATGGATATGCAACACAAG
TTGTAATTCTGGATGAAAATGGAAAACTAGAAAAAGTAGTAGCAGCACATGATGTTGGAAGAGCTATAAA
TCCAATCAGTTTAGAAGGTCAAATAGAAGGTGGAGTAGTTATGGGTCTTGGATATGCTCTAACCGAAGAT
TACCCAGTAGTTAACTCTGTTCCTACAGCTAAGTTTGGTACATTAGGTTTATTTAAATCTACAGATATAC
CAGAAATACAAGCTTTAATAGTTGAAAAGAACAAAGATTTATTGGCTTATGGGGCAAAAGGTGTAGGAGA
AATTTGTACAGTTCCTACTGCACCAGCAGTACAAAATGCCTATTATGTATTTGATAAAGAATTTAGAACT
GAGCTACCACTACAAAATACTCCATATAGTAAAAAAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3621824-3620433 D-hydantoinase [Clostridium difficile R20291]
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AAGATGAAAAAATAGTCGATATAGGTCTTGATATATCAAAAGAAAATGATGAAATAGTTGATGTTAGTGA
TTCTTATGTTATACCAGGAGGTATAGATACACACACACACTTTGACTTAGATACAGGCGTTACTAAGACA
GCAGATAACTTTGAGACAGGAACAAAAGCTGCTATAGTAGGAGGAACTACTACTATATTGGATTTTGCTA
CACAAGCTAAAGGATGTTCTTTGAAAGACGGATTAGAAGAATGGCATGAAAAAGCTAAGGATAAATCCTA
TTCAGATTATGGCTTTCATATGGCTATAACAGATTGGAATGACTCGGTTTGTAATGAAATGGAGGATATG
GTGAAAGAGGGAGTATCTTCATTTAAACTGTATATGGCGTATAAAGGAAGCCTTCAAGTTGATGATGGTG
TAATCTTTGAAGCATTGAGAAAAGCAGAAGAGATAGGAGGGATTATTGGTTTCCATTGTGAAAATGGGGA
CATAATATGTGAACTTGTGGATAAAGCAAAGTCAGAAAATAATTTATCTCCAAAATATCATCAATTAACT
AGACCAGCTATAATGGAGGCAGAAGCTACATCAAGACTTATGAAGATAGCTGAAGTTGCAAACTCAAAAG
TATATGTAGTTCACTTAAGCTGTAAAGAATCCTTAGAGGAGGTTTTAAAAGCTAAGCAAAGAGGTGTGGA
TGTAATAGTTGAAACTTGTCCTCAATACCTTCTATTAAATGATGAATTATATGATTTAGATGGATTTGAA
AGTGCTAAGTATGTAATGTCACCACCTTTAAGAAATAAAGAAAATAATGAAATATTATGGAATGCTATTT
TAGATAATCAAATAGACACTATAGGAACAGACCATTGTTCTTTTAATTATAAGGGACAGAAGGAACTTGG
GATAAACGATTTCAGTAAGATACCAAATGGTTCTCCAGGTGTAGAACATAGGATGAGTCTTTTATACACA
TATGGAGTCTGTAAAAATAAAATATCTATCAACAAGATGGTAGAAGTAACATCAACTAATGCAGCAAAGT
TGTTTGGAATGTATCCTAATAAAGGAACTATAGAAATAGGCAGTGATGCAGATATATTAGTCTTAAATCC
AAACAAAAAATCCAAAATAGAAGCAAAAAAACAATTACAAAATGTAGATTATACACCTTATGAAGGGTAT
GAAGTGGATTGTCAAATAGAACATGTTTATTTAAGAGGAAAAGAAGTAGTTAGAGATGGAGAATTAATTT
GTAATACTCCAAGTGGGAGATATATAAATAGGCGTCTAACAAAGGGGGCTAGAGAATGGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3623216-3622107 putative dihydroorotate dehydrogenase, catalytic subunit [Clostridium difficile R20291]
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ATCTGTATTACCAGCTGATGTACCAAGACCATGTATGGCAAAAACTAATAGTGGTTTTTTAAACACAGAA
TTATGGTCAGAGCTTCCAAAAGAGCAATGGATAGAGGAAGAATACAAAAAGGTAAAAGAAACAGGGCTTC
CAGTAATAGTAAGTATGGGATATTCAGCAGAGCAAATAGCTGAGGTTGCTCCTTTAGTAAAGCCTTATGC
AGATGCAGTTGAATTATCTACTCATTATGTAGGTACAGACGTTGCACCAATAGTAAATGCTTTAAAAGCT
GCAAAAGCTGTTTTAGATGTACCAGTATTTATGAAAATGAGTCCTCATACTGACATTCAAACTATTGCAA
AAGCTGTTGAAGAAGCAGGTGCAGATGGACTTGTAATGATAAACTCATTTGGACCATGTATGGCAATAGA
TGTAAATACAGGATACCCTATAATGGGAAGTAAAGCTGGATACGGATGGTTATCAGGTGCACCAATAAGA
CCTCTAGCAATAAGATGTATATATGAAGCTTCTCAAGTTGTAAATATACCAATAATCGGTGTTGGTGGAA
TCACTTGTGGAAAAGACGTGGCTGAAATGATGATGGCTGGAGCAAGTGCTGTTCAAGTATGTACAGAAGC
AATCCTTAAAGGGCCTTCTATCTATGGAAAAATTGCTAAAGAATTAAATGAATTTTTAGATGAGAATGGA
TATGCTGATGTTAATGAAATAAAAGGATTAACTCATAAGAAAATGGCAGCTAGAGGGTTTAGAACTCATT
CAGTAGCTCCAGTAGTGGATGATAACAAGTGCATCAAATGTAAGCAATGTGTAACAAGCTGTGTATACGA
AGCTTTAGAAGTTACAGATAAGTTGAACATAGATGCAGACAAGTGTTTTGGATGTGGATTATGTGTAACT
AGATGTCCAAAAGGAGCTTTAAGCATCTGCTACAATCAAGTAGAAGCTATGAATGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3624760-3623408 xanthine permease [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTCAAGATAAAAGCCCTAAAATAGCTCCAGTAGATGAAAGGTTACCTGTATCCAAATCTTGGGTAT
TTTCACTACAGCACGTTTTAGCAATGTGTGCAGGAGCAGTAGCAGTTCCTATGATGATAGGAAGTGCTGC
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ATACAAAGTGTTGGTATAGGAAATATTGTAGGTGCTAAAATACCAGTAATAGAAGGAACTAGTTTTGCCG
CTGTGGCAGGTATGACAGCAATAGCCTCATCATATAGTGATTCACAAGTTGCAATACAGACAGTATTTGG
CTCTGTAATAGTAGCTGGATTGTTTTGTATATTACTTGCTCCAGTATTTGAAAAATTAATAAGATTTTTC
CCTAGTGTAGTTACTGGAACAGTTGTTATGGTAATAGGTATTTCACTATTTCCAGTTGGGATAAAATGGA
TAACTGACAACAAATTGGAAGCGGTTGAACCAAACTCATTAGCATTAGCTTTAGCAGTATTGGCAATAAC
TTTACTTTCATTTAAATTCTTAAAAGGAATTTGGAATAGCACAGCTATATTGGTAGGTATAGTACTTGGT
ACACTACTTTCCATGGCAGTTGGAATGGCAGATTTTAGTGCAGTAAATGGAGTTGGTTGGCTTAACTTAA
ATGTACCTTTAAAATTTGGAATGCCTAGATTTGAACCATCTGCAATACTATCATTGTGTTTGATTATGTT
GGTACTTATGACGGAATCAGTTGGTAATATGATAGCTATTCATGAAATGGTAGACAAAGAAGTAACAGGT
AAAAATATTAAAAGAGGTCTATTTGGAGATGGAATATCTACAGCATTATCTGGAATATTCAATTCATTTC
CAATAACTCCATTTGGTCAAAATACAGGAATAGTAGGTCTTACAGGTATAAAATCAAGATTTATAGCAGT
TTACGCAGGGGTTATATTGCTAGTACTTGGATTCTTACCAAAATTTGCAGCAATAATAGGAGCAATACCT
AAGCCTGTTCTCGGAGGCGTAGGATTTGCAATGTTTGGAATGGTAATGGTTGGAGGAGTAAAAACTTTAA
GCAAAGTGAAATTTGATGGAACTAAAAATGGGGTTATAGTAGCAGTTAGTGTTGGTTTGTCTATGATACC
ACTAACAAATCCCGATTTCTATCATAATTTCCCAACTTGGGTACAAACAATATTCCATAGTGGAATAACA
ACAGGTAGTTTATCAGCAGTGCTTTTAAACATATTCTTCAATGAACTAGGTTCTAAAAAAGAAAAAAATA
ATAAAGTTGAAGAAGCAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3626287-3624959 putative amidohydrolase [Clostridium difficile R20291]
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TAGTAATAAATGATAATCTAATTGAAGATATAGGTACTACAGAAGAAATGAAAGCTAAATATCCAGTACA
TGAATTTATAGATGCAGGCAAGAAAATAATCATGCCGGGTCTAATAAATTCACATATGCATATATACAGC
TCATTTGCTAGAGGAATGGCAGTTCCAGGAAAACCTTCTGAGAACTTTTTAGAGATACTAAATAATTTAT
GGTGGAGACTTGACAAACAGCTTACACTGGAAGATACAAAATACAGTGCATATGCAACGTATATAGAATG
CATAAAAAATGGTGTAACAACAGTTTATGACCATCATGCAAGTCCAAATGCAATTGAAGGCAGTTTGTTT
ACAATATCAGATGTTGCAAAGGATTTGGGAATTAGAACGTGTCTTTGTTATGAAGTGTCTGATAGAGATG
GTGGAAATACAATCCAACAAGGTATCAATGAAAACGTAAACTTTATAAAATACGCTCAAAAAGATGATAC
AGACATGATAAAAGGAATGTTTGGGCTTCATGCTGCATTTACACTATCTGATGATACATTAAATAAATGT
GCTTCAGAGATGGCTGGTCTTGATACAGGTTACCATGTACATGTTGCTGAAGGACTAGCAGACTTACAAT
ATAATGTAGATAAATATGGAAAAAGGGTTTTAGAAAGATTCAATGATTTTGGAGTACTAAAAGAAAAAAC
AATAGCAGTTCATTGTATATATATAAGTGCAGAAGAAATCAGTCTTTTAAATAAAACAAATACATTTGTA
GTTCATAATCCAGAATCTAATATGGGAAATGCAGTTGGATGTTCTCCTGCAATAGAGTTATTAAAAAGGG
GAGTTACAGTAGGATTAGGAACTGATGGATATACTAGCGATATGTTTGAATCATTAAAAGTTGCCAATAT
AATTCACAAACATCACTTAAAAGACCCAAGAGTTGGATTTGAAGAATCACAAACAATGTTATTTGATAAC
AATAGAAAAATAGCTAAAGCTTATTATAAAAATGACCTAGGAGTACTTAAAAAAGGTGCTTATGCAGATG
TTATAGTAGTTGATTATATACCACATACTCCATTGACAGAAAATACAATAGGGGGACACACTATTTTTGG
AATGAGTGGAAGAAGCGTAGATACAACTATTATAAATGGAAAAGTACTTATGAAAGATAGAAAGTTAATA
AACATAGATGAAGAAAGTATTCTAGCAAAAAGTAGAGAATTAAGTCAAAATCTATGGAATAGAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3627898-3626315 D-aminoacylase [Clostridium difficile R20291]
GTGAGAACTTTAATAAAACATGGGCTTATAGTAGATGGAAATAAAACACCAGCATATGAAGGAGATATTT
TAATAGAAAACGAGAAAATATTAAAAATATCACAAGATTTAAACGAAGAAGCTGACAAAGTTATAGATGC
AAAAGGTAGAGTTATATGTCCAGGTTTCATAGATACTCATAGCCATTCAGACCTAGTTATTTTAGTTAAT
CCATATAATGAGGTAAAGATTAGACAGGGAATTACAACAGAAGTGTTGGGCCAAGATGGTATATCTATGG
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AATTGATTGGAAATATGAAACAACAGAGAATTATTTAAAAATGATGGATTACAATGGGGTAGGTTTAAAT
GAAACTTATTTAGTACCTCATGGAAACGTTAGAATGGAAGCTATGGGACTTGAAGATAGACCTGCTACTA
AAGAAGAAATTCAAAAAATGTGTGAAATCACAGAGAGAGAATTAAAAGCAGGAGCTATAGGATTGTCTAC
TGGACTTATATATATACCTTGTGCATACTCATTGACTGAAGAAATTATAGAGATGTGTAAGGTAGTAGCA
AAATATGACGGAGTATTTGTAGTTCACCAAAGAAGTGAAGCAGATACAATTTTAACTTCAATGGAAGAAA
TCATAGAAATTGGAAAACAATCAGGAGTAAAAGTTCATTTTTCACATTTTAAGGTTTGTGGTAAAGCAAA
CTGGAAGTATATACCACAAGTTATAGAGCTTTTAGAAAAAGCAGAAAAGGAAGGAATAAGAGTATCTTTT
GACCAATATCCATATGCAGCAGGAAGTACAATGCTTGGAGTAGTTTTACCTCCTTGGGCACATTCTGGAG
GAACTGATAAGTTAATAGAAAGATTAAGCGATGAAAACGAAAGAGCAAAAATGAAAAAAGATATAGCAAA
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ACAGAAAAGAATAAAGATACAATTGGTAAGAGCTTATTAGAAATTGGAAAAATGAGAGGAAAAGACCCAT
TAGATGCAACGTTTGATTTATTAAAAGAAGAAGAAAATGCAGTTGGGATGGTAGATTTCTATGGATTAGA
AGAACATATAATAGGATTCATGAAAAGAGACGAGCAAAATGTGTGTACAGATGGTCTTTTAGCAGGTAAA
CCACATCCAAGAGCTTATGGTTCTTTCCCTAAAATACTAGGAAGATATGTTAGAGAGTTGAATGTACTAA
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ATTAAAAGAAGGATATTTTGCAGATATAGTTATATTTGACAAGGATACAGTTAGTGGTTGTGATGATTTT
ATCAACTCTATGCAGTACCCTACAGGTATAGATTACGTAATTATAAATGGAAATTGTGTTGTTGAAGAAG
GAAAATACAATAAAATTAAAGCAGGAAAAGTACTTAAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3629101-3627914 putative amidohydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAATGAAACAAGAAAAAAACAATTAACTGAAGTATGCCAAGACTTAATAAGAAATGCTAGTTATT
CAGGTCAAGAAGAAAACGTAGTAAAAGCTATAGAAGAAAATTTTGCTTTACTAGGTTTTGATAGTTGGTC
AAGAGATAGATATGGAAATATAGTAGGATGTATAAAAGGAAATAAACCAGGTAAAAAAATATTATTTGAC
GGGCATATAGATACAGTTCCAGTTCCAGATGCAAGTAAATGGAGTGTTCCTCCTTTTGAAGCGAGAATAG
TAGATGGGAAAATATATGGTAGAGGAACTTCTGATATGAAGGGGCAAGTAAGTGCTATGATGGCTGCTGT
TTCATACTTTGCAGAAGATACTAACAAAGACTTTGAAGGTGAATTGTATGTAGCAGGTGTTGTTCATGAA
GAAATATTTGAAGGTGTTTCAGCTAGAGAGATAAGTAAGGCTGTTCAACCTGATTATGTTGTAATAGGTG
AATCTTCAGAATTAAACTTAAAGATAGGTCAAAGAGGTAGAGGAGAAATAGTAGTAGAAACTTTTGGTAA
ACCAGCTCACTCTGCTAATCCAGAAAAAGGTATAAATGCAGTTTATAAAATGGCTAATGTAATCCAAAAG
ATACAACAATTAGTACCTCCAACTCATCCAGTTTTAGGTGATGGAATATTAGTTTTAACAGATATAAAAT
CTTCTCCATATCCAGGAGCATCAGTAGTGCCAGATTATTGCAAAGCTACTTTTGATAGAAGATTATTAGT
TGGAGAAACAAGAGAAGGCGTATTAGCTCCAATACAAGCTTTATTAGATGAAATGATGAAAGAAGACCCA
GAATTAAATGCAAAAGTTTCTTATGCAGTTGAAAAAGCTGATTGCTATACAGGAAATACTATAGAAAGTG
AAAGATTCTTCCCAGGTTGGTTATATGATGAAGAAGATGAATTTGTTCAAGCAGCGTATAATGGATTAAA
AGAAGCTGGAATAGATTCAGAAATAACTCAATACTCATTCTGTACGAATGGAAGTCACTACGCAGGTGAG
GCTGGAATAAGAACTATAGGATTTGGTCCTTCTAAGGAAAATCTTGCTCATACAATAGATGAGTATATAG
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>ref|NC_013316.1|:c3630648-3629434 diaminopropionate ammonia-lyase [Clostridium difficile R20291]
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TAAGAGATGAAGAAATTGCAAAGGCTAAAGCTTTTCATGAGAGCTTTCCACAATATGAAAAAACTCCTTT
AGTTAAATTAGATAACTTAGCAAAATCACTAGGCGTAAGCGGAATATATGTTAAAGACGAATCTTATAGA
TTTGGTTTAAACGCATTTAAAGTTTTAGGTGGTTCTTACTCTATGGGTAGATACTTAGCTCAAAGATTAG
ATACAGATATATCTGAGTTAGGGTATGACAAATTAACTTCAAAAGAAATAAAAGAAAAATTAGGAGAAAT
AACTTTCTTTACAGCCACAGATGGAAATCATGGTAGAGGAGTTGCTTGGACAGCTAATAAATTAGGTCAA
AAATCTGTTGTATTAATGCCAAAAGGTTCTTCTGAATTTAGATTAAATAAAATCAAAGGAGAAGGTGCAG
ATGCTAGTATAACAGACTTAAACTATGATGATGCAGTAAGATTAGCTAATGATTATGCAGAAGCTGATGA
CCATGGAGTAATGGTTCAAGATACAGCATGGGACGGATATGAAGAAATACCAGCATGGATAATGCAAGGA
TATGGAACTATGGCTAAAGAAGCTATAGAACAATTAAAAGAATATGGAGTAGATAGACCAACACACGTAT
TTGTTCAAGCAGGAGTTGGTTCACTTGCTGGTGCAGTTCAAGGGTATGTTGCTTCAATATATGATGAATG
CCCAATAACAGTAGTAGTAGAGGCTGATGAGGCTGATTGTTACTATAAATCAGCAGAAGCTGGAGATGGA
AAACCAAGATTTGTTGGAGGAGATATGCCAACTATAATGGCAGGGCTTGCTTGTGGAGAACCAAACACTA
TAGGTTTTGAAGTGTTAAAAAATTATTCATCAGCATTCGTTTCAGCACCAGACTGGGTATCTGCTAAAGG
TATGAGAATATTAGGAAACCCTCTAAGAGGAGATGAGAAAGTAATCTCTGGAGAATCTGGAGCAGTTACA
ACTGGAGCATTAGTTTCAATCCTTGAAAGTGAAGATTTAAAAGACTTAAGAGAAGCTTTGAAACTAGATG
AGAACTCTAAAGTATTATTAATAAGTACAGAAGGAGATACTGACCCTGATAAATATAGAGATATAGTTTG
GAATGGTGAATGCCAAAGTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3631810-3631271 hypothetical protein CDR20291_3041 [Clostridium difficile R20291]
ATGCAATATGCGATAGAGCTATATTATGATAAAAAAACGGAAAAGCAACTTTTTGATTTATCTAAAAAAA
TCGCTGATGAAAAAATTAGTACGAAGTACTTAGAATGGAAAACAAGACCTCATCTTACTTTGGCTTGTTT
CAATGATGTGGATGAGGCTTGTTGCATAGACAAGCTAAAGGGGTTTGCACAAAACCATAAGGTAATACCT
GCTTACATTGGTTCAGTAGGCATGTTTAATGATACTAAAACGGTGTTTGTATCACCTATAATGAATAGCA
GTATGTATCAGTTTCAGAGAGAATTATATGAGGTACTACAAGATTTTGATTCAAATGGTTGGGAATGGTA
CCACCCCAATCGTTGGGTACCCCATTGCACAATAGCACTTACTGGAGATGATGAAAGTGAGGCTTTTTTT
CGGGCAAGTGATGTATTACTGCGTGAGTTCAAAAAAATAAGTGGTGAGTTTGTCTCAATAGGATTGGTTA
AAATTACATTTCCTGTGGAAGAAATTTTTACAGTGAATATGAATAGGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3633704-3631887 putative sigma54-dependent transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGGGGAAACTATGTTAAGTAAATTAAAAGAATTTCAACAAGAAATGATAAAATACACTGAAACAGTAG
CTAGTGTGTTAGATGTAGATATTGAAATAGTTGATGATAGATTAATAAGAATTAGTGGTACAGGTCTGTA
TAAATCAAAGATAAATGAAAGCGTTGTTACAGAAGGATTTATTTACGACAATGTTATACAGACAGGTCAG
GAATTAGTCGTATTGGATATATGTGATAATCAGCTTTGTATAGAATGTTCCCATTACATGAAATGCCTAA
ATAAAGTAATAATAGCAGTTCCAATAAAGTATAATAATCGAACTATAGGAGTAATTGGTGCTATTAGTAC
AGATAAAACTAAAAAAGTAGAAATAAGTGCAAAAATAGATAATTATTTAAAATTTGTCAATCATATATGC
GATTTAATTTCTATGAAAATAGAAGAACATGAAGCGTCAAAAAATAGCAGTAGAAAAATGGATATGATGA
TAGAAATCATTGAAAATGTTGAAAAAGGCGTTATAATACTAGACATAAATAGCAAAATATCTTATATAAA
CAATATAGCTCTAAAAAAATTAGATATATATAAAAATATAATAGAAAATATAGTAAATATAGTATCTGTT
GAATCTTCCTCAAATGGACATGAATTACTAGAAATTGATATTGATAACAAAATTTATAATATAAATGCCA
AAATAATTCCGGTATATCCATATATAAATCAATACGACAAAATAATAATATTTGACAAGACATATATCAA
TCATAAAGGACATGGAAAAGTCAATAGTGGCTGGGGAAATAGTGATATAGAGTCTATAATTGGAAATTCA
GAGGCAATGTTAAAAGTAAAAGAGAGAACTAAGAAATTAGCAAAGTCAAATTCAACTGTACTTATAACTG
GGGAAAGTGGTACGGGTAAAGAGCTAATTGCTAGGGCTATACATGCTGAAGGTAGCAGATGGAACAAGCC
ATTTATTGCGATAAACTGTGCTGCTATTCCAGAAAATCTCCTTGAAAGTGAGCTATTTGGCTATATAAAA
GGTGCATTTAGTGGAGCTAGTAGTGGAGGTAAAGTAGGTAAATTTGAACTTGCAAATGAAGGTGTTATAT
TTCTTGATGAAATAGGAGATTTGTCAATGCCTTTACAAGCAAAGTTACTTAGAGTTTTACAAGAGAGAAA
ATTTGCGAGAATTGGGTCAAATAAACTTATAGATTTAGATATAAGAGTGATTGCTGCTACAAATAAAAAC
TTATTGAAATTAGTAAATGAAGGTAAGTTTAGGGATGATTTATACTATAGATTAAATGTAATTCCTATAA
ATTTGCCACCTCTTAGGGAAAGAAAGGATGATATTGAGGCAATAATGATGAAGTTTGCTTCTAAATATTC
TTTAGAATTAGGTATTCAGTTAAATAAAATAGAAGAAAATGTAATGAATATGTTGATTAACTATAATTGG
CCGGGAAATATAAGGGAACTGGAAAATGCAGTTGAATATATGATGAATTTGGTTGGAGATGATGGAATAA
TATATAAAGATATGCTTCCATTGGATATTTTAAATTATTATAATATTAATGGAAATGTTTGTAAAAATAA
GGATATAAATATAATATTTGAAGATGACATAGTTGGAGGGATAGTAGAGAATCAGGAAAGGATACTTTCA
ATTAAAGAATTAGAGTTGACTTACATAAACAAGTTGTTGAATAAGTATGGAAGAGATACAAAGACGAAGA
AGAAGATAGCAAAGGATTTAGGTATAGGTTTGGCTACACTATATAGAAAATTGGAAGAGGAACAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3634477-3634100 putative regulatory endoribonuclease [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAAAAGTAGTAATAGCTACAGAGAAAGCTCCAGGAGCAATTGGACCATATTCTCAAGCAATTCAAG
TTGGAAACATAGTTTCTACATCAGGTCAACTTCCAATAGATATGAAGACTGGCGAGTTAGTATCTGACCC
AAAAGAAGCAACAAAAGCTTCTTTAGATAATGTAAAAGCAATATTAGAACAAGCTGGTACAAGTATGGAT
AAAATATTTAAGACTACAGTATTCGTAAAAGATTTAAAGGATTTTAATGATATTAATGAAGTATATGCTA
CATATTTTAAAGAAAATCCACCAGCAAGGTCATGCGTACAAGTTGCTCAATTACCAAAAGATGCAGTTTT
AGAAATTGAAGCAATGGCAGTATTATAA
>ref|NC_013316.1|:3635328-3635813 hypothetical protein CDR20291_3044 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCAAAAGTGAATTAACGGCAGAAACAACAGAAGAAATGTTAGAAGTACTAAGTGGTAAAGATTATG
ATATTGCATGTCATTTACATGAACTTGGTAAATCATTAGATTGTAAAATTGAACCAAAAACAGGTGCTCG
TTCTTACAAAATAGTATATTCAACTAAGAAACCAAAACGTAGCTTATTTACTATTGAATGTAATGAAAAA
AAATGGAGAGTTAAAGCAAATCTTTTTCATCTAAATACATATAAAGATGCTGTGGAGGAATGCTCTAAAA
CTATTAAAGATAGTATAACTAAAACTCGTACTTGTAAGAAATGTAATTCAAAGTGTATTGGAGGTTCTTC
GTTTGATTTAGATGGAAAGTCTTATCTGACTTGCATAGGAAGTGGTCATTATTTTGCAAATATGGAAGAA
ATGGATTGGAAAAACCTAGAAAAATTAATTACTAAAGAAAATAATATTATGCAGGAATCTGTATAG
>ref|NC_013316.1|:c3636552-3636013 putative iron-sulfur flavoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAAAATGTATTAATAGTATCAGCTAGTCCTAGAAAAGGTGGAAATTCTGACTTATTGTGTGACC
AGTTTATACAAGGGGTATTAGAATCTAAAAATCAAGTGGAGAAGATATTTTTAAAAGATAAAGATATTAA
CTATTGTACTGGATGTGGTGCTTGTTATGAAAAAGAAGCAAGTTGTTCACAGACAGATGACATGGGAGAA
ATTCTTGAAAAAATGATTGGGGCAGATGTGATTGTTTTAGCGACTCCCGTTTATTTTTATACTATGAATG
CGCAAATGAAAACTATGATTGATAGAACTTGCTCTAGATATACTGAAATTTGTGATAAAGATTTCTATTT
TATCGTTGCAGCAGCAGATGAAAATGTGGCTGATATGGAAAGAACAATAGAAGGATTTAGAGGATTTACA
TCATGTCTAAATGGTTCTAAAGAAAAAGGTATAGTATATGGTGTAGGTGCTTGGAATGTAGGTGATATTA
AGGGAAGTAAGGCAATGAAACAGGCATATGAAATGGGTAAGTTGGCTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3636958-3636545 MerR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGACGATTTCAGAAGTTAGTAAAAAATACGAGCTTTCAGCGGATACTTTACGATATTATGAACGAATTG
GTTTAATACCACCTGTAAATAGAAATAAAAGTGGAATTAGGTCTTTTACAGAAGAAGATTGTGAGTGGGT
TAATTTCATAAAGTGTATGAGAGGTGCAGGTCTTTCTATTGAGACATTAATTGAGTATGTAGCTATGTTT
CAACAAGGGAGCAGTACTATCAAAGCTAGAAAAGAACTTTTAATAGAGCAGAGAAACCAACTAGCAAAAA
GAATAGAAGAAATGCAAAAAACTTTGGAACGATTAAATTTTAAGATTGATAGATATGAAGAAGGTATTAT
TGAGAAAGAAAAAGTATTAAAGAGCAGTAGAAATAAGAAAATGGAGGCAGTATCTTATGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3638115-3636994 putative oxidoreductase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGCAAAAAAATTAGGATTTGGATTAATGCGTTTACCAATAAAAGATGAAAATGATGTTACAACTA
TTGATATGGAACATTTAAATAAAATGGTAGACACTTTTTTAGAAAGGGGATTTACATATTTTGATACAGC
CTATGTGTATCACATGGGAAAAAGTGAGATAGCACTTAGAGAATCTCTAGTAAAAAGACACAAAAGAGAG
AGTTTTACTATAGCTACAAAACTTCCATTAATGGCTTTAAAGAAAAAAGAAGAGCAAGAAACCATTTTTA
ATGAGCAATTAGAAAAATGTGGTGTAGACTATTTTGACTACTATCTTTTACACAATATAGGCGTGTCACA
TTATGAAGTAGCTAAAAAATTTGATAGCTTTAAGTTTATTGAAGAAAAGAAAAAAGAAGGAAAAATAAAG
AATATTGGTTTTTCTTTTCATGATAGTGCAGAACTATTGGATAAAGTCTTGAGTGAGCATCCAGAAGTAG
ACTTCGTGCAATTACAGATTAATTATTTAGATTGGGATAATGAAAGCATACAATCTAGAAAATGCTACGA
GGTGGCAGAGAAGCATAATAAGCCTGTAATTGTTATGGAGCCAGTAAAAGGAGGTACACTTGCAAAGATA
CCAGAAAAAGCAGAGAAATTATTGAATGACTACAATCCAGATATGTCAATTTCATCTTGGGCAATACGTT
TTGCAGCAAGTAAAGATAATGTTATGATGGTCTTAAGTGGGATGTCAAATATGGAACAATTATTAGACAA
TACAGGATATATGCAAAATTTCAAACCATTCGTACAAGAGGAATATAATATTATAGATGAAGCAGTAGAG
ATTATCAACGAATCAATTTTAGTTCCTTGTACTGCCTGTCAGTATTGTGTAGAAGGCTGTCCAAAAAATA
TCGCTATTCCAAACTATTTTGCGCTGTACAATGCAGAAAAACAAGCTCTTAATACTGGATTTTCAACACA
GATGGTTTACTATAATAATTATACTAAAACTTATGGAAAGGCCTCAGATTGTATTGAATGTAAACAATGT
GAAGAAAGCTGTCCTCAACACATTAAAATTATAGATGCTTTAAAGAATGTAGCAGAAACCTTTGAGAAAT
AA
>ref|NC_013316.1|:3638714-3640366 cell surface protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATAAAAATTTAGCTATATTAATATCAGGTATGATGTTTTTTTCTAGTTCTTCAGCAATTTTTG
CAGACAATACTACAAAGCAAGAAAGATTAATAGGTAAAACAAGATATGAAACAGCAGTAGAAGTAAGTAA
ATTGGGATGGGTTCAATCAAAAACAGCCATTATAGTTAATGGTAATTCTATTCAAAGTGCGCTTTGTGCA
AATCCATTTGCTAAGCTAAAGAATGCACCTATACTTTTAGTAAACAACAACAGTATTGAAAATTCAACTA
AGGCTGAGCTTAAAAGGCTTGGTGTAGATAATGTGTACATTGTAGATAGTGGAAATAGCATTTCTTCTAA
AGTAGAAAATGAAATAAAATCACTTAACATAAAAATAAATAAAATAGTAGGAAACAATATATATAAAATG
TCTACAAATGTACTTAAAGAAATAGATAAGATAAAAAAGGTAGAAAATGTTGCAGTTGTAAATGGACTAA
AGGGATTATCTGATGCAGTTAGTATAGCTTCTCCAGCAGCAATACATAATATGCCTATAATATTAGTATC
AGATGAAAACAGCAATGATAGTAGTATAAATTTCTTAAACAATAGGTCTATAAAAAAATCTTACATAGTT
GGAGGAAATAAGATTTTATCAGACAATACAGTAAAGAAATATCCAAACAGAGAAAGAATCAGTGGTTCAG
ATAGAAACAATACTAATGCAAAAATTATTGATAAATTTTATAAAGATAAAAAAATAAATAATGTATTTGT
AGCTAAAGATGGTATTAACCAAGAAAATGCATTAGTAGATTCATTATCAATAGGAGTATTAGCTGCTAAA
GAAAATTCTCCTATAATGATATCTAATGGTAGCCTTGTAAATAGTCAAAAGGAATTTATTAAAAATAAAG
ATATAGATGAAATAACACAAGTAGGAGGAGGATATAATCAAAAAGCATTTGAAGATATTTTAAAACTAAA
AAATGTGAACATAAGAAATAAAACTAAAAAAATATCTTTAATACAGGCTAAAGAAATATTAAAACAAGCT
CTTCCAGGAAGCGATATTTTAGTTTGTTATTATGATGAAGATGATAATGAATATGACTGCAAAGTTATAA
AGGATAATATCCTATATGAGATAGAAATTGATGCCTACTCTGGTAAAATAATAGAAATTGAAAAAGATGA
TGACTTAAATGATAATAATTTAGGTACACAAAATATATCATTGGATAAAGCTAAGTCTATAGCATTAGAT
GCTGTTCCTAATGGTAATTTAATCTATTGTAAATATGATGCTGAAGATAACGAATATGAGGCTAAAGTAA
TAAAAAATAAGAAAACATATGAATTAGAGATAAGTGCATTTGATGGAAGAATTGTAGATATTGACATGGA
CAATGATTCTGATGATGACTTTGATGATAATGATAAGAATAACTCTAATACTAATGACAACAGTTCTATT
ATTAGTGCTGAAAAAGCTAAATCAATAATGCTAGATAAAGTGCCTGGTGGGAAAATAGTAAAATTTAAGT
ATGATGAAGATGACAAAGAATATGAAGGTGAAATAATAAAAGGAAAAATTGAATATGAGATAACAATTAA
TGCAATTACTGGTAAAATATTAGAATTTGAAATAGATGATTAA
>ref|NC_013316.1|:3640663-3641412 abc transporter, atp-binding protein; abc transporter,atp-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATACAATATTAAAAGTAAATAACATAACTAAAACTTATAATAAAGGGCAACAGCCGAGTTTAGATA
AGGTATCCTTTAATGTATCAGAAGGTGAATTTATAGGTATAATGGGAGCTTCTGGCTCTGGGAAAACAAC
TCTGCTTAATGTATTATCTACAATTGATAAACCAACAAGTGGAGATATTTTCATAAATAATATAAATTTG
AAATCGCTTAATGACACTTGTGCTGCTGATTTTCGTAAGGATAATTTAGGCTTTATCTTTCAAGAGTATT
TTTTACTAGATAGTCTTACAATTTTCGAGAATATTTCAGTACCTCTTACACTTCAGAAACTCAATCCAGA
TAAAATAGAAAACATGGTAAAGAGTCTAGCTGAACGATTTGACATAGCTTCTCAATTAAATAAATACCCA
AATGAATTATCTGGTGGGCAAAGGCAGAGAGCTTCAGCAGTTAGAGCAATAGTAAAACATCCTAGTATTC
TCTTTGCAGATGAACCAACAGGAGCTTTGGATTCTAATTCAGCTACTGAACTACTCCACTCACTACAGGA
AGCAAATGAGGAGTTGAAAACAACAATTTTAATGGTAACACATGATGCCTATGCAGCAAGTTTTGCAAAT
AGAATTTTGATTTTTAAAGATGGTCATATCATTAAAGAATTAAATAAACAACCGAATAATAGACATACAT
TTTATGAGTTGATTATTCAAGAAATTGCAAAATTGGATACTAAAAGATAG
>ref|NC_013316.1|:3641425-3643452 abc transporter, permease associated with salivaricin lantibiotic; abc transporter, permease associated with salivaricin lantibiotic [Clostridium difficile R20291]
ATGAACATTTTTTATATGGCAATAAAGAATCTTAAAAAAAACTTTTCATTCTATTCTCTATATCTACTTT
CAGTCTCTTTTGTTATTACTGTATTTTTCGCATTTACTTCATTCTCTGTTAATAAGATAATGCTAGAAAA
AATTTCAACTGATGGTAGAGTTGAATCTATGTGTAATGTTATTTCGATATTTTTGATGGCATTTGTCATC
TTCTATATGGCATACTCAAATCGATTCTTCTTGAGACGTCGTACAAAAGAATTAGGCATATATGCTTTAC
TTGGCTATCGTAAGTTTACAATATTATCGCTACTTACCTTTGAAAATGTATTAATTTGTAGTGGAGCTTT
TATTACTGGATTGGTATTAGGAGCATTGTCACATAAGGGTATTGTCTTTGGAATTACAGCACTACTTAAT
TTATCAATTGATAATTCACAGATACCATTTTTTAATATAAATGCAATAAACAAAACAATTATCTTTATAG
CATTAGTTGTTTTAGTCTTAGCTATATCAAATGGTAAATTTCTTTATAAGACTTCACTTGTAAAATTGAT
AAGACATGAAAAAAGTGCAGAAAAAAAATTAAAGTTCAGAAAAATTCCAGCCTTTATGGGATTTATTATG
ATTTTAAGTGGGTATTGTTTATCACTAGATATTCTTCGTGGAGCTAAATCAGTATGGGTAAGTATTGGAT
TTTATCAAATGGGCTTGATAACTATGATTATCATTGTAATTGGTACAGTTCTCTTTATCAATTCCTTTCT
TCCATATATTATGCAAAAGAGTAAAAAAAATAAACGTACTTTCTACACAGATATGAAGATAATAGCTATT
CCAAACTTTATCTATCGTATACGTTCAAACTCTAAAACTCTAATTATGCTTACATTACTCTCTGCTACTA
CTTTGACAGTTTCAAGTGTTATGGCACTGTCCTTATACTACCCTATTGCATCTGTTTCGCGTATTGCACC
TTCAGAGATAGAATTTAGAGTAGAAAAAAATAAACAAATAGAAGATGTAAAACAAATTGTCAGTCAATAT
ACGTCTAATACAGATGATATTATTTTTACACAGACAAATATTTATAAGGTAAAATCTTCATCAAAAGACC
TTCCATTTGAATATGAAATTGGTACATCTAAGAATAATTTATCTAATAGTAGTTCTTCTAAAGAAGTTAT
TTCAAGAGAATCAGGATTTGAATGTATATCTTTTTCTGATTATTATACTTTATTAAAGGCACAAAATCGA
ACAAAGCTACTAAAACAACTTACCCCTTTAAGGGATAATGAATGTATTTTAATGAAATATCAACCAAATA
ATGATGGATATAGTGAAAATGGAACGATTTATCCATTACTTATTAATGGTAAAGAAACACCTGTAGCTGT
AAGGGAAACATCATTAAACAATGCTATTTCTTTTGCCAATAGCGTTGGAACACTTATCGTTAATGATAGT
ATATATGAGCAAATAGCACAAAATAAATTACCAATGACAAGCATTTTAAGTATTAATGGTAAATCAATTA
AAAATAATGAAAATTTATATAGTAATATTTCAGATTATTTAGATGGAAGCCCTTATTTACAAGGATATTC
TCACAGGATAAATGATTTATTATCAATTAATAGTTCTACATTTCTGTTAATCGGATTTCTTGTGGTATTA
TTCTTTATTGCTGTTGGAAGTATTTTATACTTTAACAATATATCAGCAATTTCAGATTCAACATCTGATT
ATAAGATTTTACAGAAAATGGGTTATGATAATATACAAATTAAAAAAATTATTAAAAAACAAGTATTGCC
ATTTTTTAATATTCCGTTTTTACTTGGTATATTGGACTGTATATTTGCTACCTTGGTTTATAAGACTGCT
TTGATGCAGAATTTACTTGGAAATTCATTTTCACAATACATACCTGTGATTATTGCAATTTTCTTAACTT
CTGTAGTGTATTTGATATATTATATACTTACTATTAAATCCTGTTGTAAAATTGTATTAAAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:3643596-3645179 possible sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
TTGACAAATTTTAATTTAAAAATACTATTTTTAGGAAACTACATTCTATCACTTCTCTTCATGGGAATAT
CTACAAGCACTGAAACTTATATGAATATCCAAAGCATTATTCCCTTAATAATTTCAACATTATTACTCAT
AGACATCACATATATAACCTCTTGTAATGTCCGAGAAAATAACATTATTTCATTATTTTGTGGATTACTA
GCACTAGACAGTTGGTATTTACTCTTATCATTTGTAACCACACCAATAGGCACTATTATTTTTAAAATAT
TAAGCACAGTTATAGTGTATGTCTCTATTAAATTTATATTTTTATTTTTGTTTCAAGGTAGTGGATACAA
TTTCCGTAAGATAACAGATATTTTATTGCTTATCACCTGCATTGGTGCAATTGTAGGAGCATTTATTTCT
AACAGAACGTATGCTTGTATGTACGGAATACAGTTTGTTGTTAGTATAATAAGCTTTTTATATATTATTT
TTTATCATTTGAAAAGGGTTGTTTTTGTCATAAAAAGCGAAAAAAAGCCTATATCGATTTCAGTATTTAT
AACAATTATAGGATTCCTTACTTATTATTTTTTTACACTAAGAATATCAAATCATATTGGTAATTTTGGA
ATCTATCTAACTGTATTGGTATTTTTTATGAGTATTCATGGTATTGCACTTAAAGAAAATGATAGTTTTC
CTATTTCAACAGTTTTTAACATAAAACAAAGGGCTATATTTCTTTTTATAAGTATTTTAGTAATTAGCTT
GGTCGTACTATTTGCCAATGGGAATTTTTCTATAATATTAATAGCTATAAATGTTTTATTTATGCTTATT
TTCCTCTGTAACATTATTTTGGAGTTTAACCTTAGAGATGAAAAAAATAAAGTAGTTAAAAATAGCAAGT
ATACTTTTGCATTAGAAAAATTACAACAAGAAGAACAACTAAAAACAGAGTTTTCTAATTTTTTACATGA
TGACATATTACAGAACCTGCTTTCAATAAAAAACATGATGAGTAAGTCATATCGCCCAGAAGTTCAAGAT
ATTATATATGAAACACTTAACAATCTAAATACATGTATAAGAAATCAAATGCAAGACTATCATCCTGTTA
TTTTAAAAAATTTAACAGTAAAAGAAAATTATCAGAATTTAATTGAAAGTGTTTCTTCATCCTTTCCACA
AAAAAACATTTGTGTTTCATTTAAGTGTTCTGATACTTTATTCTTAGTTGAACCATATGATATATTGATA
TATCGACTGATTAAAGAATTATTGACAAACGTGTATAAACATTCAAATGGTAGCCATGCATGGATAGCTT
TAGCACTAGAAAAAAATATAATAAAATTAAATATTAATGATAATGGTGTGAAAAATACATCTTTTAAAAC
ACCTTTAGATATAACTAAAATTACTTTTGATATAATAAAACACAAAGGGATTATATCAATTAAAGAACAA
GTAGAAAATCTAGGAGGAACGATAAGTATTTCTGATAATATACCTCATGGAGTTTGTGTACAGATTACAA
TCCCTATGAAAGGAGATGGTTCTTATAAATATTTTGTTAGTTGA
>ref|NC_013316.1|:3645151-3645771 salavaricin two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGTTCTTATAAATATTTTGTTAGTTGATGACCATATGCTTTTTGCTAAAAGCTTGTCAATTGCACTAG
AAGAATACGAAGAAATCGAACAGTTTTATTCCACACAGGACATCCATAATCTTTCAGAAATGATTCAAGA
TAAAAAAATAGACATTGTCTTAATGGATATAAACCTTAGAGGCTTAAGTGAATGTGATGGCTTAAAAGTA
GCTTATAATTTATTAGAGACTAATTCAACTATTAAAATAATAATCTTGACTGGATACGACCTCCCAGTTT
ATAAACATGAGGCTAAAAAAATAGGTATCTATGGATTCCTAAATAAGAATATTAGCCCTGATAGTTTAAT
TGATTCATTATTAAAAGTCTATCAAGGGGTAACCTGTTTTCCATCTGAAAATACTGAAGTAATTATTGAA
GATTTAACTAATATGGAGAAAAGAATTTTACAGCTTATCTGTAGTGGTAAAAAAAGAAAAATAATTGCTG
ATGAATTGTATATAAGTGAAAGAACATTATCAAATCATTTACAACACATATATGACAAGCTAGATGTTTC
ATCATCAGTTGAGGCTATTACAAAAGCCATTAAAATGGGTTATATTTCTCCAGTATATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3646885-3645959 putative phage-related protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAATAGTTTTTATCAATTAAATTCAGCAGTATTATATTTTAATGAAAAAAGAGATGTAAATAGAA
TAAGGTTTAATCACTATGTAATGAGAAAAGAAAATATACAAAGATTAAAAGGAACTCTGCCAAGAGGACA
ATTTATGATGACAGTAAGGAAAGCTGCATCTGACCTTGATGTATCTATATCTACAATAAGTAGACTTGTA
AATGAATTTATAGATTTAGGTATATTGAGATTAATAAGTAGGGGAGTAAAGGGAAATTGTTGTTCTGTAT
ATAGTTATGTTTGTTCTGAAAATAGTAATGCAGAAATTGTAACAAAGAATAGTGATATTTTCAAAAATAT
AGAGAAATACATTGATGCAACTATTAACAATAACCAAAAAACAATGAAATATAAACATAGAGATGAGTTG
TTCAAGAACAGTAATACCAACACATACAGCCGTATAAATCAAGAGAGTATAGACAAAGATTATGATTTGA
TAATTCATACTGGGTATGAAACAGAAAATGAGACAAAGAAAAAAGAATTATTAAAAAATAATTTAAATAA
AAAGAATTTAAATAAAAATACCTTTGAAAATTTGGATGAAGATTTGACTGAAGATTCTACTTATAAAAAT
CCAGAAAGCATACATGAAATTATTATAAGAAAATTAAATAGTGAATCAGGAAAAAATTTTAAAGCTGATT
TGAGTATAACTAAGGCACTTATAGATAAAAGATTAAAAGAAGGGTATAGTTTAGAAGATTTTTACAAGGT
TATAGAGGCAAAGGTAAGAAGATGGAGATATACAGATATGGAAATATATATAGAACCAACAATTCTGTTT
GGGTATGAATTTGAGTCGTATTTAAATGAGGAGAGTTCTTTATCTGCTTGTAATTATGGTGATATGTGTT
ATGAAGATATGTATTGA
>ref|NC_013316.1|:3647495-3648415 AraC-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGACAAATGCTAAAAGTAAAAAAGAATATCTAAATCGTATTTGCAAAGTGCAAGACTATATAGAAGAAC
ATTTACATGAACCTCTTTCTCTTGATGAACTTTCTAATATAGCAGGTTTTTCAAAATTTCATTTTCATAG
AATCTTCAAAGCAATAGAAAAAGAAACTTTGGCACAATATGTAAATAGGCTAAAACTAGAAAATGCAACT
GCTTTTCTTATTCATCGAACTGACATGACTGTTACTGATATTGCACACTACTTCGGCTTTACTGATTCAG
CAGTTTTCTCGAGAGCATTTAAAAATTACTATAAAATAAGCCCTATAAAATATAGAAACAATTATAGCAA
GAATTGCAAAGAACCATATAAAATTTCTCAGTACAATAGAAGCATATCAAAACCTAAATGTAAGAATACT
AGAGAGGTTAAAGGTGAAATTGAAATTCTAGAACTTGATAATATGAATACTATTTACACTAGATATACTG
GTTCATATGGTAATCTAACCAGTACTTTCCCAAAACTTTTAGAACGGTTATTCACATATGCAAGTGAGCA
GAATCTACTTGGACTTGAAAACACACAAATATTAGCCATTTATCATGATAATCCACAATTTACACAGGAG
CATCAATTAAGGACTAGTATTTGCATGACCATTCCAGATAACATTGTTGTCAAAGAGAATGACAATCTTG
GCAATATGATAATCCCTTCTGGAAAATATCTTGTGGGACATTTTGATATTTCAAAATCTGAATATAGTGA
TGCGTGGGATTTTATGTATAATGAATGGCTATCAAATGGTAATTATAAGCTACGTGCCTCCTTCCCTTTT
GAAGTATATCTTAACAACCCACACAATCACCCTCAAAATAGACACTTTGTCGATATATATTTACCTATAG
AACCTTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:3648501-3650921 putative excinuclease ABC subunit A [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGAAATAAAAATTAATGGAGCAAAGATACACAATCTTAAAAATATAGATGTTTCTATCCCCAAAG
ATAAGCTTGTTGTTGCAACAGGTGTCAGTGGCTCAGGTAAGTCTAGCCTTATGTTTGACATTGTATTTGA
GGAAGGTCGTAAACAATATCTGCAATCTTTAGGTATACTTGCAGGTATTGATAGTGAGGATAAGTTTGAT
AATATTCAAGGTTTAGCTCCCACTATAGCTGTTCAACAAAATATTATTCGCCAGAGCAATCCTCGTTCAA
CAGTAGGCACAAGAACCAATATTCTCAACATGCTTGCACTATTGTATTCAGTAGAAGGTCAAATAATGTG
TACTATGTGTGATACTCCTGTAAGCGATAATCTAATTTGCAATAATTGTGGGTATGAGGAAGAACGATTA
AGACCAAGTTATTTCTCATACAACTCTTCAGATGGAATGTGTATGAAGTGCTCTGGACATGGTGCATATT
TTGAGATTAATATTGAAAAATTAGTCCTTGATAAGCATGATACCCTAAAACAAGTCTTAGATAGAGCAAA
GATTACACCAGGATATTTGAGAGTATTTTCTAAAAAATTCAACGATTATTTAGACATACAATTCTTACAA
CTACCTGAAGAAATAAGAAATGAAGTACTCTATGGTCATTATGAAAATGGTAAAAAAAGTTCCTCTTTAT
CAAAGGTATTTCACAATCGTTACAAAAGGGGTGAGGATTTAAATGGAGTTTATACTATGACTGCCTGTTC
AGATTGCAATGGTTTTAAAATTGGTGAAGAAGCACGTAGAGTACTTTTAAACGGAAAACATATTGGAGAA
CTTGGAAAAATGACGATTTTAGAAATTGATGATTTCCTTAAAATCTTAATAAACCAAGGTAATTTAAACA
CATTTGGTACAAATCTTGTAAATGATATTTTATCCAAAACTCGACATTTAATAGAATCACGATTAGGTCA
TCTATCCTTATACCGAGAAATGTCAACTTTGAGTGGTGGGGAAATGCAAAGACTATTTTTAAATTCACAT
CTCGATTCAGAGATGGACTCATTAATTTATGTGCTTGATGAACCAACAGCTGGATTGCATGAATCAGAAA
AAATAGACATCTTAAAATCAATAAAGAAACTTAAAGATTTAGGCAATACGGTCATAGTAGTTGAGCACGA
TAAAAACACAATTGAAATGGCAGAACATATTATTGATATTGGTCCAAAAGCTGGTGTTGAAGGTGGTCAA
TTAGTATATCAAGGAGATTTAGAAGGTCTACTTCAATCCGACAAATCACTTACTGGGCAGTATCTATCTG
GAAAATATCCAATGCCTAATAGAACAAGCAATAAAAATATTACACATACTGATAAAATACCTTGTATAAC
TATTCAAAATGCAAATACAAATAATCTTAAAAATGTAACTGTATCATTACCTTTGGGTGCTATGGTTGGA
ATATCTGGAAAATCAGGTAGTGGCAAGAGTTCACTTATATCAGACACCCTACTTCCTCTTCTTAGAAGCC
AATTTAATAACCATACTATCAATAATCAAATAAATTCTTCAGATAGCGAAATAGGTGATGAAGACGATTA
TGCAGTTATTGAAACTATTGCAGATAGACTGATTGGTACTAAACATATTTCTGGATATTCAGAGATATCT
CAATCTCCTATTGGCAAAAATATGAACTCAACTCCTGCTTCTTATATTGGTATATGGGATAAGATACGTA
CACTATTTGCAGGTCAGCCAGAATCGTTAGAACGAGGATTTACAGCTGGTCATTTCTCATTTAACTCCAA
AGGTGCTTGTCCTAAATGTAGTGGTAGTGGATATGAAAAGGTCTGGTTAGGAAATAATCTAAGTATAGAC
CATATATGCAGTGAATGTCAGGGAAAAAGATTTAATGATGAATCTTTATCTATTAAATATAAAAATAAAA
ATATACATGATATTTTAAATATGAGTGTTTCTGAATCTGTACATTTCTTCAAGGATATTCCAAATATTGT
TTCACACTTAAATGTATTAGAACAAATAGGTATGGGGTATATAAAATTAGGCCAACCTACACCGACTTTA
AGTGGTGGTGAATCCCAAAGAATCAAACTTGCAAAAGAAATTGGTAAAAAACGAAATGGTAATATCCTTT
ATGTATTGGATGAGCCAACTACTGGTCTAAGTCTATATGATACTTCTAAGTTGATTCAATTATTAGATGA
ATTGGTGGAAAATGGAAATTCTGTAATTGTTGTTGAACATGATATAGATGTATTAAATGTTTGTGACTGG
ATTGTTGAGCTTGGTCCAGAAGGTGGTGACAAAGGAGGTTATATAATTGCAGAAGGTTCTCCAAAAACTC
TAAAAGAAAATCCAAAATCTATAACAGGGAGGTATCTTTAA
>ref|NC_013316.1|:3650921-3651943 putative penicillin-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAAACAATTGCTTAGATTTAATATTTGAAAAAGTAGACCCTTCAAGTGTTGGCATGAGTTCAG
AAAAGCTCTCACAACTGGAACCTTTAATAATCTCACAATATAGTAATATAAATGGAATAATTATTGCAAG
AAAAGGAAAAGTTGTCTTTGAAAAGTACTATAATGGATATAATGCTGATGATACTTTTCATGTTGCATCA
GTTACAAAAAGTATTATATCAGCCTTAATAGGTATTGCAATAGATAAAGGATATATAAAAGATGTTGACC
AAAAGGTTGTTGATTTTTTCCCTGAATATACTTGTAGTCCTTCTGAAATATGTAAAAAAGCAGTAACTAT
ACGTCACCTACTTACAATGACTGCACCATACCCTTTTAAAAATATGACTGAGTCTTTAGAAAGACTTTGC
AAACAAAAAGATTGGATAAAATATACCTTGAATCAACTTGGTCAAAAAGGCGAAATTGGTACTTTCAAAT
ATTCTTCAGCTGGAACGCACCTACTTTCAGCTATTATAACAAAAACTACTGGAAAATCTGCTCGTGAATT
TGCTAATGAGTACTTATTTAAACCTATTGGTATGAAAGTTATACCAGATTATGATATGAAAGATTTTGGT
TTTGAAGATTTCTTTGGAAAAAATCTTAAGGGTTGGGCAAAAGATAGACAGGGTTATTCTATAGGTGGCT
GGGGACTTACATTGAGTGCTAGAGATATGTTGCGATTTGGTTTTCTGTATTTAAATGATGGTATTTGGAA
TAATAAACGTATTATATCTAAATCGTGGATTGAAGAATCGGTTAAAATGAATAGTAATGAATACGGTTAT
CTGTGGTGGATATGTAAAAAAGATGGTGTTTTGTGGTATTCAGCAATGGGAACTGGAGGAAATGCTATTT
GTTGTATTCCACAATATGACTTAGTAATAGCCATACCATCTAAAATAGTGTTTAAACCTCGTGATAGATG
GGAGTTTATTGAAAAATATATACTTACTTCTATAATAGATTAA
>ref|NC_013316.1|:3652058-3652804 MerR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGACACTTACACGACATCAGAGGTAGCAGATTTAATTGGTGTACATCCTAATACAGTACGTTTATATG
AAGAACTAAACTTAATACCTAAACCTAAGCGTAATACCAATGGTTATCGTATCTTTAATGATTTTCATAT
AGAACAATTTAGATTTGCTCGTACAGCCTTGAAAATTGAAGTGGTACAAAGGGGATTAAGAAAAGATGCC
CTTGAGATTGTAAGAACATCAGCGAATAGGGACTTTGATAAGGCTATTAGTCTTGTAAATCAATACTTGC
AACAATTAGAAATAGAAAAATCTAATGCCGAGGAAGCACTTACTATTGTTGCACAGATTTTAAATGGAAA
TACTCCAGAAACAAATAAACTCTTTTTAACTAGAAAAGAAACTGCAGAACACTTAAATGTTACAATAGAT
ACTTTAAGAAATTGGGAAATGAATGGTTTGTTAAAAGTAAAAAGAAAACAAAATGGTTATCGTGTATATA
CTGATGAAGATATAAAACGACTTAAAATTATAAGCGCACTTCGTTGTGCAAACTATTCTCTTTCAGCTAT
TTTACGAATGTTAAATGCTTTATCTTCTAATCCTAATACTAATATTAAAACTGTCCTTGACACTCCAAAA
GATGATGACGAAATTATCTCAGTGTGTGACAAACTGATAACTTCATTGAAAGAAGCTGAACATAATGCAA
AAACCATGAAATCTCATCTTCAAATTATGAAAAAACAATTTTCCTAG
>ref|NC_013316.1|:3652836-3654140 multidrug resistance protein [Clostridium difficile R20291]
GTGTTATCCTTAAGAGCAAGAAAAATTCAACACACAAATCAAAGGAGGAATAGGATGGAAAACAAAAATA
CTAATTCTACATGGAAGAAAAAAGTCATTCTTTTTTTAGCAAGTCAATATATTTCCTTATTTGGCTCATC
ACTTGTACAAATGGCAATGATATGGTATGTCACACTTCAGACATCATCAGGTGTATGGGTAACAGTTTTA
ACTGTATGCTCCTTTATACCTCAAATGATAATTTCTTTTTTTGCTGGTGTATGGGCAGACTACTACAATC
GAAAGGTACTCATAATTGTATCAGATTCAACAATTGCTATATCTACATTAGTTCTAATTCTATTTATGAT
GTCATCAAATGGCACAACAAGTGAATTAATAGCCATATCAGTAATATCTGTTATACGTTCACTAGGAAGT
GGTGTACAAACACCTGCTGTAAACGCAATGATTCCTCAACTTGTACCAGAAGAACATTTAATGCGTTTTA
ATGGTATAAATAGTAGTCTACAGTCTATAGTACAATTTATAGTGCCTATTGTAGCTGCTGCAATACTTGG
ATTTGGTAATAAAATAAATCAAGTTCTTTTAATTGATGTATTTACTGCAATTATTGCTATTGTATTATTG
ATATTCATCAAAATTCCTAAACATAATATACCAAAACAAACTGAAAAAGTCTCATTTTTTGCAGATATGG
TATCAGGGATAAAGTACTGTTTTTCAGATAAGTTCATTAGAAAAGTGCTTTTCACTTATGGAGCATTCAT
GCTTCTTTGTGTTCCATCAGGATTTCTTATAGGACTTCTTATTGAACGAACATTTGGCAAGGGTTATATA
TACCTGTCTATTATTGAAATGATTGGATTTTTAGTTATGGTTTTAGGTGGATTGATTATAGGAGTTTTTG
GTGGTTTTAAAAATAGAAATAAGACCTTTTTTCTAGCAATATTATCCTATGCTATTTTTTCAATTATTCT
AGGTCTTGTAACACAAGCTTGGCAATTTTTTATATTTATGTTTTTTACGAATTTTTCAATTCCAATTATT
CAAGCATCAGCTATGACTATGTTGCAAGAGCATGTAGCACCACAAATGCTAGGTCGAGTTCTTAGCTTAC
CTATTATTATATATACTGGTTTTATTCCTCTTGGTATGATGATTTTCGGACCAATGGCAGATGTAATTTC
TATTAATAATTTAATAATCGTAGCAGGGATTATACTTTTATTTTTTGCTTTGGCTATCCCCTATTCAAAA
CAATTTTACAAGCAAGGAATATCTAAGTCAAATGAATCCGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3655590-3654622 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTGTATAATTTCCTTCTTTTTACCAGTTGTTATGGCGATTTTAATAAATTTTATGGGAACAATTGATA
TATCTTCATTAGGAGAGATACGTTTTGGTATAGTGAAGGATACACTTCCTGTACAAACAGAGCAGTGGTT
GAAGAAGTATGGTATGGTAAGTGTATATGACACAAAAATGCATTTAATACGTGAAATTAAGGATATTAAA
ACGGACACAATTGGAGTTGTTAGAGATGGTAAAGGAATAAAAACTATGCTTTATGGAAATGAGATTAATG
CTATAAAAAATGTTGGAAAGACATTGCCAGAGATGTTTAGACTAAAGGGTGATTTAAAAGATGTTGAGGT
TACAATATTGCCTAAAGATAGTATTTTAAAAGAGTTTCAGAATGTTTTTATTGCTATGATTTTAATTACT
GCTATGTTTATGGGATGTACCTTTAATGCAATGAATATTATATCTGAAAAAGAAGATGGAATATCATTTA
TAAATGAAGTTTTGCCACAGAGTAGAAGTCAGTATATTATACAAAAAGTATTTTTGGGTCTTTTATGTGG
GTGTTTATCTTCAATGATAACTGTATTTATATGTTTGGATATTTCAATATTAGATATGATAATGATGTTG
TTACTCGTTGTATTTTCAGCATTTATTTCATCACTTATAGGTTTATTTATTGGAAAGTTGTCAGAAGGTC
TTATGGTAGGAATTGTTTATATTAAAATAGTAATGATTTTATTTATAGGTGCTCCTTTGTTAATATATCT
TCTAGGGGTTAATACCAGCGGTATAGGGAATTTATGCTATATAATGCCATCAGTTGCTACATTTAATGGT
ATTATGGAGATTATTAATGGTAATGTTATTATTATAAAAGATATTGTAATTTTGGTTGTACATTGTGTAG
TATGGTTTATGATATATATTATTTTAGATAAAAAAAGAAAGTTATCTTTTAGTAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3656666-3655638 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTATTCTAAATTTTTTACCTTAGTAAAAAAAGATTTTTGGATGATGATTTATGGTAAATTTTTTGTGC
TGACACTTGGCTCTCTCATACTTTATTCGTGTTATATTAATTTTGGTTATGTAAAGTTTATGGATGAAGA
TAGTTATCACAATAATGTATATCTATATAATCCAGAGAATATAAGCATGAGTGCATCTCCATTAATTAAT
CAAGTTTCTTCTATAGGTGAATTAAAAGCAAAACTTGATGAAGATACAAGTGCAGTTTGTATTGATATGA
GTTCCAGTAAGCCGAAAGTAATTTTACATGAAAGTATTAAAGGAGTTGACAATTATAGAGCTGACTATGC
ATTGTCATTATTATCATCAGAAAAAGACCATAATAGCAAAATATCAGACAACAATGCAATAATTCAAATT
AATGATAAGGATACATCTGAGATAAAACAAAGAAAAGACATGACTTGTGAGATTTTATTCTTTGAAATTG
TAGCTATTGGATTTTTAGGGATTGCCTCTTTATTATTTAAAGAAAAGCAGATGGGAGTAATGCGTATTAC
TGGTATTTTACCTGTAAAAAGAAGTCTTTTTATATTATCAAAGATATTTGCTTTTTTGATATGTGACCTA
TGTTTTACAGTTCTTTTAGTAGTATTTAATATTGGATTTTTTGAAGGAGTAAAAATACTTCCACAAGTAT
TAGTTCAAGCTAGTATTTTATCAATTATTATGTCTTTGATTGGAATAGGATGCTCAATGTTATTGAGAGA
TTTTAAGCAATTTTCTCTTATATATCTTGTGGTTGCTGTATTCATAACTACACCTATATTTCTATCTGCA
AATACATCTTTTGAAATAGATTGGATTAAATATCATCCCTTCTATCATGTTTATAGTCAGCTTAAAAATG
CGTTTTTCATGAATTTTTCAAAAGAATTAGTTTATTTTGTAGTGTGTTCTTTGACAATAATAGTTCTATT
TTTACTTGTAAAATATATTTTTAATAAAGAGTTGGTTAGGGAGGGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3657511-3656666 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAAAGTAGGAGAGTTAAAATTTTCTTATGGAAAAGATAAACAGATATTGCATGGACTTAATTTTG
AAGTAAAAGAAGGAGAAATCTTTGGATTCCTTGGACCTAATGGTTCAGGAAAATCCACAACACAGAAAAT
CTTAAATGGCGTTTTAAAAGGTTACAATGGGCACGTATCCCTTTTTGGGAAGGAAGTTAAAGCATATACA
GAGTCTCTATATCAAAAGATTGGTGTTTTATTTGAATTTCCTTATTTATATACCAATTTAAGTGCAATTG
ATAATTTAGAATATTTTTCGTCTTTTTATCCTAAAAATCAAAGGAGAGACATATATGAACTCTTAGATTT
GTTAGAGTTTAAGAAAGAGTTTATAAATAAGCCTGTATCATCCTACTCAAAAGGTATGAAGCAACGTATT
AGCATGGCAAGAGCATTGGTAAGTAATCCAAAGTTGTTATTTTTAGATGAGCCTACTAGTGGACTTGACC
CATCTGGAGCTGTACTATTTCGTAAGATTATTGAAGAAGAACGAAAAAAAGGAACAACTATCTTTTTGAC
TACTCATAATATGCTAGATGCAGATTTAATGTGTAACAATGTGGCTTTTATTGCAGATGGCAAGATTATG
GTAATAGATAAACCCAAAAATTTAAAAATGAAAAATAGCAATAATAAAGTTGAAGTGGAATTTGTATATA
ATGGAAATCGAGATATTGAAATTGTAGATATACAAGAGTTAGAATCTGGAATAACTTTTAAATATGATGA
AATCTTAAGTGTACATTCAAAAGAACCTACACTAGAAGAAGTTTTTATTAAATACACAGGAAGGATGTTA
GTGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3659046-3657916 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAGTTTAAGAAAGATTATAGAAAAACTGAAAAATGTAGATATTTCAAATTGGATTAAACAAAATT
TTGGACTATATTCAGTTAGAAAAAAAGTGTTTTTACTTTCTAAATTATCAGGAGCGTTAATTATATTATT
TTATCTGGTTGTTGAAGAATTTTCGATAAACTCTAAATTTGAATTTTGGATTTGGTTTATAATACTGGTT
ATATTTATTATGAGTATTGATTTTTTATTGGGAAAATTTATTTCAGAACCAATCACATCTATAAATAAAT
CTGCAAAAAGTATGTCCCAACTTGATTTTTCTAATCCATGTACTGTAAATACTAATGATGAATTTGGAGA
ACTTTCTAGGAGCCTGAATACAATGTCTACAAATCTACAACAGGCATTATCAGACCTAGAAAGTGCAAAT
ATTCAACTTGAAAAGGATGTAAATAAGGAAAGAATGCTATTGGAACAAAGAAAGGAGTTGGTAGATGCAA
TTTCACATGAAATGAAGACTCCACTTGGCATTATACGTGCGTATACAGAGGGGCTTATGGATGAAGTTGA
TGAAGAAAAAAAGAAAAATTATATGAATGTTATAATAGAAGAAACTGATAGAATGAACAATATGATTGTA
TCATTATTAGACTTATCTGCATTGGAAGCAGGAGTTTCTAAACTTAACCCAGAGCGTTTTGATTTTATAG
AGTTTGTTGAAACTGTGGCAGGTCGTCTTTTAATTGATATACCAGATGCCAATTTTTATTTTACATATGA
TTTGCCAGAGTATGAAGTTTTTGTAGTGGCAGATAAAATGAGAATGGAACAAGTAGTAGAGAATCTAATT
ATTAATGCAAAGAAGCATGTTGTATATAATGGTAATTTAGATTTATCGATTACATGTGAAAATGGCTTGC
TTTTATTTGAAATTTATAATGATGGTAGGATTATAGAGCAAGATGAGATTTCAAAGATTTGGTCTAAGTT
TTATCGTAGTGTTCAATCTCAGCGTAAAGGAGGTTCAGGTCTAGGGCTTGCAATTGTTTCACAAATACTT
ACAATGCAAGGGTTAGAATATGGAGTGAATAATCGTGATAGAGGAGTAGAGTTTTATTTTATGATTCCAA
TTGATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3659714-3659043 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTAAAATACTAGTTGTAGAAGATGAAAAAAGGATGCAAAGTATTATTGTAGAATATATGCAAAAGG
GAGGATATACTTGTATAACTGCTAATGATGGAGTCGAGGCACTTACAATATTAAAGAGCAACAATATAGA
TTTAATGATATTGGATATTATGATGCCGTATTTAGATGGATTTTCAGTGTGTAGAGTTTCACGTGAAATG
ACTAATATACCTATTATCATATTGACAGCTAAAGGTGAAGAGGAGGACAAATTAAAGGGTTATGAATATG
GCGCAGATGATTATATAACAAAACCATTTAGCCCAAAAGTACTTTTAGCAAAAGTTAATGCCTTGTTACG
TAGATACACTACTGATATTCCCAAAAATTCATTGAGTTTAGGAAAGATTTTTATTATGGTAGCATCAAGG
CAAGTGTATGTAGAAGATAAATTGATTGATTTAACATATAAAGAATTTGAATTATTGCGTTTATTTATGG
AAAACCCTAATCAAGTTTTTTCCAGAGAGAAGCTTTTAAATTGTATATGGGGATATGATTTTGAAGGAAA
CACACGAACTGTAGATACACATATAAAAACCTTACGCAAAAAGCTTGGTAGTGAAGGACACCATATAGTT
ACATTAATTCGTTCAGGATATAAGTTTGAGGTTAAGGAATGA
>ref|NC_013316.1|:c3660578-3659928 hypothetical protein CDR20291_3064 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATTTCATTTCAAGTATATTGCAAGGATTATTAAGTATATTATTTAATTTTACAGGTGATTTTGGAA
TTTCTATTGTACTTATAACTTTAATAGTTAAATTAGTACTTATGCCACTATCATTAAAACAAAGATTTTC
TGTAAAAAAACAGCAAGAATTAGCTGAAAAAATGGAACATATAAAAGAAAAGTATAAGAATGATACTAAA
GAATTGGAAAAGCAAATACAAGTAAGTTCTGTAGAAAGTATGAAGAGTATGCTGGGATGTCTTATAGTTT
TGGTTCAAATGCCAGTAGTATATGCTTTATATCATGTATGTTTAGATATGACAAAGGAATTTACAACAAT
TATAATTCCATGGATTGCTAATTTAGGTACATTTGATAATTTGTTTATATTACCTTGTATATATACATTA
ATTATGTTAGCTTCAAATTTAGTGAATTATATACCATATTTAAAAATAAATTCTCAAGTAAAGTTTAACA
AACAAATGGCTGTGGTGACTACCATAACAAGTCTTATACTAACTGTTAGAACTCCAGTAGCCATAGGTCT
GTACTTTATAACAAGTGCAATTTATTCATTAATTGAAGATATTTGTTTTAGAATGTATTTTAATCGAAAA
AATAGAATAGTGACAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:3661426-3662019 putative nitroreductase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAGTGATTCTATATCAAAAAGACGAAGTATCAGAAAATATAAAAATCAAAGCATTTCACATGAAA
CTATAGAGAAAATAATTGAAGCTGGAATAAATGCACCTTCATCTAAAAACAGGCAACCATGGCGTTTTGT
TGTCATCACTGAAAAGGAAAAAGAATCTATGCTTAAAGCCATGAGCAAAGGTATTCAAAATGAAATTAAT
GATAATGGGCTTCTTCCAGGAAGTCGTCAACATATCGCTGGTGCAAATTACACAGTTGAAATCATGAAAC
AAGCTCCAGTAACAATTTTTATTTTAAATATATTAGGTAAATCACCTTTAGAAAAGCTATCCCCTGAAGA
ACGATTCTATGAAATGGCAAACATGCAATCAATTGGAGCTGCAATTCAGAATATGTCGCTTACAGCTGTG
GAATTAGGTCTAGGTAGTCTTTGGATTTGTGATGTATACTTTGCATATCGTGAATTATGTGAATGGTTAA
ATACAGATAGTCAATTAGTGGCAGCAATATCTTTAGGTTATCCTGACGAAGAACCATCAAGAAGACCTAG
ATTACAATTAAGTGATGTGACTGAATGGAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3664364-3662961 putative Na+ driven multidrug efflux pump [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGAAAAATATAAGGAGCCATTGGAATATGAAAAGGTTTCAAAGTTATTAACTAAGTACGCAATTC
CTAGTATTATAGCAATGTTAGTAAGTGCTTTATATAACATTGTTGACCAAATATTTATTGGGCAAGGTGT
TGGTGTATTGGGTAATGCTGCTACAAATGTCACTTTTCCACTAACAACAATATGTACTGCAATTGCATTA
TTATTAGGAATTGGAGGAGCGTCTAAGTGTTCATTGGAATTAGGTGCTAAAAATTCAGAAAAAGCTACAA
AAGCAGCAGGAAATTCTATATGCTTGATGGCTGTTTTTGGAATAAGTTTATTTATAGTAGTATCAATATT
TTTAACACCACTATTAAAATTCTTTGGCTCTACATCAGAAATACTACCTTATGCACACACATATACAAAA
ATTACATCAATTGGATTACCATTTCTTATAATGTCCACTGGAATGAGTAAATTGATACTTGCAGATGGGA
GACCAAAAGCTTCTATGTTTTGTATGTTAATAGGAGCAGTTATTAATACAATTTTGAATCCATTATTCAT
TTTTGTTTTTAATATGGGAATTGCTGGGTCTGCTTTAGCAACTGTTATTGGGCAACTTATATCTTTTGGA
ATAAGTGTTCATTATATAAAGAATTTTCAACATATTAAATTACATAAGAAAAGTTTTAAATTAGATAGTA
TAATTTATAAACATATATTTGCGCTAGGTTCAAGCTCATGTTTTAATCAATTAGCAATGACTGTAACACA
GATAGTTATGAATAATACATTGGCATATTATGGGGCTAGGTCAGTTTATGGAAGTGAGATTCCACTTGCT
TGTGTCGGTATCATTATTAAAGTAAATATGATTTTTATATCTATAATTATTGGTATATCACAAGGTATGC
AACCAATTATAGGGTATAATTATGGGGCTGAAAAGTATAATCGTGTAAAAGAAGCATATAAGTTTGCAGT
GGGAAGTGCAACTATTATATCTGTTATTGCATTCTTATGTTTCCAATTCTTCCCAAGACAAATTACGTCT
ATATTTGGTAACGGAAATGAGACTTATTTTATATTTGCAGAACATTATTTTAGAACTTTCTTGTTCTTAA
CATTTATAAATGGTGTTCAAATAGTATCATCAACTTTCTTTACATCAATTGGGAAATCAGTGTTGGGACT
TTTTACTTCTTTGACTCGTCAAATTTTATTTTTAATTCCATTGATAGTAATTTTACCAATGTTTATGGGA
ATTGATGGAGTAATGTTTGCAGGACCAATAGCAGATGCAGCAGCGGCAATGGTATGTATATACTTTGCAG
TTCATGAAATGAAATCCTTGACTATAAAGCAAAATAATTTGATGAGTAACCATAATAAGATTGCAGAGGT
ATAA
>ref|NC_013316.1|:c3664839-3664348 MarR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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ACAATACAAATTATATTGACAGGAAATTGGCGGATATTGGAATCAATAATAGCCAATATTTTTATGTATT
ACACATATGTAATAATCCAGGTATTACACAGGACACTATATTTGAGAAAATTCTTGTGAATCCTAGTAAT
ATAACGAGAGCTTTGGCAAATTTAGAAAAAGAAGGCTTTATAACAAGAGAACCAGGTGTAAAGGATAAAA
GAACATGGCATTTATATCCTACAGAAAAATCTTTAGAATGTTATGATGAAATACTAAAAATAACAAATGG
GTATGTTGAGGAGTTGTTGAGTTCATTTGAGAAAGAAGAGCAAGAGTTGTTTATGTCAATGTTAAAGAAA
GTTGCATTTTTAGCTATTGATATGAATGAAGAAGCAAAATTGGAGGCGAAGGAAAATGGAAGAAAAATAT
AA
>ref|NC_013316.1|:3665155-3665670 PadR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAGAATACATTATTTTAGGATTTTTAATGGAAAAAGAATTAAGTGGATACGACTTAAAACAAATAA
TGTCAGAAAGTACCTCGTACTTTTTTGACGCCAGCTTTGGAAGTATCTATCCTGCACTTAAAAGATTAGA
AACAAAAGGATATATACACTATCACGAAGTTATAGATGGTAGCAAATTAAAAAAACTATATTCCATAACT
AATACTGGTAAAGAAGTATTTCTCGAATGGTTAAAGAAACCTATAAATTTTTCTAAAACAAAGCAAGACC
ACCTTGTTAATATATTCTTTTACAAGTATCTACCCAAAGAAATAATTGAAACAAACTTAAAAATGTTAAT
AACTGAAGTAGAATTACTTCTAAATAAATTAAGTAAACAAAAAATTGATGTAGAAGAAAATCATTGTATT
GACCAATATACATATATGTATGCCACAATGATTTATGGAGTTGACTATTATAATTTTGTTATTAATTGGT
GTAAAGATTTACTGAAAAATCTATAA
>ref|NC_013316.1|:3665710-3666222 hypothetical protein CDR20291_3069 [Clostridium difficile R20291]
ATGGACTTTATGAAGCTTTTAATACATGATTTAACTGACAAAGAATTAGAAAAGTTATTACCCAAGCTTG
ATGACAATATAAAAATACTTCCAAACACAAAAGAAATCCACAAATGTATTGGTCGTTTTGGTTGCTGGAT
TAAAACTCCTTCTGAATGTGTTGTAAAAGATTATTACAGCAACATGGGTAAACTTATAAATGAATCCGAT
GGAATTATTATAATAAGCAGATGCTGTTACGGAGGGTTTAGCCCTTTTGTCAAAAACGTACTTGATAAAA
GCATTAATTATATTCTTCCATACTTTGTAATAAAAGATAATATGATGCGTCATAAAAGCAGATATGATAA
ACAGATAAATTTAAAAGCTATATTCTATGGAGATTGTATTACAGAAGCTGAAAAAGAAACTGCTACGAAA
TTAGTAAATGGAAATGCTATAAATTTCAATATAAAAGAACACTCTGTTTGTTTCTATGAAAATATACAGG
ATATAAGAGGTGAATCCATATGA
>ref|NC_013316.1|:3666219-3666869 hypothetical protein CDR20291_3070 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATAGTAATGATAAATGGTAGTCCAAAAGTAAATAAAAATAATTCACAGTATTTTTTATCTGAAT
TAAAACAACTTATTCAAAATGATAATAAAGTTTTTACATTTAAAGTAGATAGCACATCTAAGTATCCTGA
CGCTCTTAATGCCATACTTAATTGTGATAGATTAATAATAGCATTTCCTCTTTATGTAGATGGTATTCCA
TCTCATTTACTTCATTTTTTAGAGAAATGTGAAAAATTTTTAAAAACACAAAATAAAAAACCTATTCCAG
TGTATGCAATAGTTAACTGTGGATTCAATGAAGGTGAACATAATCATTTGGCAATTCAAATGATAGATCA
TTGGTGCAAAAAAATCAACTTTACATGGGTTCAAGGTATTGGAATTGGAGCTGGGGAGATGTTTGGTTCA
CTAGAATCCGTACCTTTGGGTAAAGGACCTAAAAAAGATTTAGGAATTGCATTAAAAGAACTTTCAAAAA
ATATACTTAGTGATAATATACATATAGATGATTCCAACAAAAGTACTATTTTTATTTCACCTAACTTCCC
TAGATTCCTATATAAACTTATGGGGAATCATCAATGGAATACTCAAGCTAAATCAAATGGATTGACTAAA
AGTGATATACTAAAGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3667783-3667004 hypothetical protein CDR20291_3071 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATACTGTAAAAGAAAAATTGGCAGAGTCACTAACTTCTGATACTACTGATATTTTACCTTATT
TGCCTTATTTATTACAAGATTTTTGGGAATTAGGAAGTTCACCAGAACAAATGTTACAATTATTTAGAAA
GCATATACCTTTTAATGAGGATACAAAAGTTTTGGATTTAGCTTGTGGAAAAGGTGCTGTATCTGTGAAG
CTTGCAAAAGAGTTGAATATACATATCAAAGGTATTGATTTGATACCTGAATTTATTGATTATGCGAGAA
GAAAGGCTATTGAATATAAGGTTGATGCTTTGTGTGATTTTGAAATGAATGATGCTAATAGTTCTGTAAA
AATTGAGCACGATTATGATTGTGTGATTTTTGGAGCTGTAGGGGATATTTTAGGTAATTATAAAGAAACT
ATAAGTAAGCTATTACCTACAATAAAAAGTAAGGGGTTCATTTTAATTGATGATGCATATGTAGTAGATA
AATCTACAAATGAACAGCTTAATTTTGAGAGGGTGTATCCCACTTACAATGAGTGGTGTATATTGTTCAA
AGAATTAGGTCTGAAACTAATTGAATGTATACCATGTTTAGAACTTGAAAATGATGTTGAAGAGGAAATG
AACTGGATTATAACTCGTGCAAATGAGCTAATTAAAAAATATCCTTCTCAAAAAGATATGTTTGAACAAT
ATGTTATTAGCCAAAAAAATGAATATACTGATTTACAGCAGGACCTTGTTGGAGCAACTTGGATTTTACA
AAAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3668146-3667895 hypothetical protein CDR20291_3072 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGTAGAAAACGAATTACTTAAAAACCTAGATAGATTGCATACAACAGAGTTAGGCGTTGTAAGAA
TTAAGAAAAATCTTTCTTTGGAGACAAATGATGTAGTGAACTGGTGTAAAACTAAAATAGAATCTCCAAA
TGCCATTATTAATAGAAAGGGAAAAAACTGGTATATAAGTGTATATGATTGTATTATAACAGTAAACGCT
CACAGTTATACAATTATTACAGCTCATAAAGAAAAGAAATGA
>ref|NC_013316.1|:c3669208-3668477 AraC-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAACAATTTGATTACCATTGAAAAAACTTTAGATTATATAGAAAAACATCTTTTAGATGAGATGT
TAGATTTAAATGTAATTTCTAAAGAGATAGGCTATTCAAAGTACCATTTACATAGAATGTTTACATCAGT
TGTCGGATTTAGTATACATAATTATATACAAAGACGTAGACTAACTGAAGCAGCAAGAATGCTCATTTTT
ACAGAAAAACCAATTATTGAAATTGCTTTAATCTCGGGGTATGACACACAACGTTCTTTTTCAACAGGGT
TTAAAAAAATGTTTAAGCATAGCCCTAAGTTTTTTAGAAAACATCAAGATTTTTTACCACTACAATTAAA
ATTTGATATTAATAATAGAAAAAGGTTACATGGAGGTATGGTTTTAGATGTTAAAAAAGTTAATTGTACA
GATATAAATATTGTTGGCTATTCTGGTAAAGTAAAAAAAGGATTTCATGTTATTGGAAAATGTTGGAGGG
ATTTGCATAAAAATAAAGAGTTGATAGAAAACAAGGTAGACTTGGATTTTTTAATTGGAGTTAATGATTA
TAGTAATTTTAAAGAAATTGAAAATAATCCTACATTTACATATATTGCAGGTGTTCAAGTAGCTACTTTT
GGTAAATTCCTAATGGAATGGAAAAATTCGTATTACCGAAAAGTAATTATATTGTTTTTACTTTTATTGG
GAAAAATGAGGATAGTATGCAAAATGTTGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3670307-3669546 putative osmoprotectant acid ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGACACCTATTATACAATTTAAAAATATTAAAAAACAATATAATGATAAAACTATAATAGATAATCTTA
ATTTAGATATAGAAAAAGGAGAGTTTTTGACTGTAATTGGTTCGTCTGGTTCTGGTAAGACAACACTCTT
AAAAATGATTAATGGTCTGATTTTGCCAGATGGAGGAAATATTTTGATAAACCAAACAGATATCAAAAAC
GAGGACTTAATTAAATTAAGAAGAAGAATAGGATATTGTGTACAAGGAAGTGTTCTTTTTCCTCATATGA
CTGTTGAAGAAAATATTTCATATGTACCAAATCTCCTAAGTAAAAAGAATAAATTAGAAGTAAAAAGTGC
TGTAAACAAGTGGATGGAAATAGTGGGATTGCCAAATGATATGAAAGTGCGTTACCCATCAGAATTGTCA
GGTGGTCAGCAACAACGTGTAGGGATTGCAAGAGCTTTAGCTTCTTCTCCAGAAATTTTATTAATGGATG
AACCTTTTGGTGCAGTTGATGAGATTACACGAAAGCAATTACAAAAAGAGATAAAAGAAATTCATAAAAA
AACAGGAGTTACGATTATCTTTATTACGCATGATATTTATGAAGCTTTGATTTTGGGAACAAAGACTTTG
GTATTAAATCATGGAGTTGTTCAACAGTATGATACTCCTGAGAATATTTTAAATACTCCTGCTAACCAAT
TTGTAGACCAGTTATTGAATATAAGAAAATCTATAATAGATGATGATAATTTAAAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3671858-3670323 putative osmoprotectant ABC transporter, substrate-binding/permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAATGATATTCTAACCTTATTATCTGAAAGAAGTGATTTTTTTATAAAGCTATCCATAGAACATT
TGATGATTTCTATTATTTCTATAATAATTGCGATTGTTTTGGGTGGTATAATTGGTATTATTGTAAGTGA
ATTTCATAATTCTTCTAAACCTATATTGGGAACTATCAATTTTCTATACACCATTCCATCTATTTCTATG
CTAGGATTTCTGATACCATTTTCCGGAATTGGAAATACTACTGCTGTTATTGCACTTACCATTTATGCAT
TATTGCCAATGGTTAGAAATACATATACTGGAATTACTAATGTGGATAAAAATATTCTTGAAGCAGCTAG
GGGAATGGGCAGTACAGATTTTCAGATATTGTATAAAATAAAACTTCCATTAGCCCTACCTGTTATTATG
TCTGGTATTAGAAATATGGTGATTATGACAATTGCATTAGCTGGTATCGCTTCATTTATAGGTGCTGGAG
GCCTAGGTGTAGCCATATATAGAGGAATCACGACAAATAACACAGCAATGACAATTAGTGGAAGTATACT
TATTGCTCTATTAGCTTTAATATTTGATTTTATTTTAGGGCTGGTAGAAAAATTTTTTCAACGAAAAAGA
AAAAAGAAAAATAGGAAAAAAGTTTTTGCCATTCTAGGAAGCCTTATTCTTATAGCAACTATCTTTACGT
CTTATTTATTTAATCCTTCAAAGACTCAAACTATTCATATTGCTACTAAACCTATGACTGAACAATATAT
TCTTGGTGAGATGTTGGATATTTTAATTGAAAAAAACACAGGTCTAAACGTGGAAATTACACAAGGCATA
GGAGGGGGAACATCTAATATCCAGCCAGCTATGGAGAATGGAGAATTTGACATTTATCCAGAGTATACAG
GTACAGGCTGGAATATGGTACTTAAGAAAAATGAATTATATACTGAAAGTATGTTTAGTAAACTACAGTC
GGAATACAAAACTAAACTTAAAATGCAATGGACTGGTATGTATGGTTTTTCTAATAGCTATGCATTAGCA
GTTAGAAAAGAAGTTGCAGATAAATATAATTTAAAAAATATATCAGACTTAAAAAATGTATCTTCTAAAT
TGACATTTGGAGCTGAATATGACTTTTATGAGAGAGAGGATGGATATACTCCATTGTGTAATACATATGG
ACTGAACTTTAAAGATACAGTTGATTTAGATATTGGATTAAAATACCAAGCTATCAATGAAGGTAAGATT
GACGTAATGCCTATATTTACAACTGATGGTCAGTATAGTGTTTCAGATGTTATAGTTCTAAAAGATGATA
AAAATTTCTACCCATCTTATCAATGTGGAAATGTTGTTCGTTTGGAAGTATTAGAGGAAAATCCAGAACT
ATCAGAGGTATTTAAGATGGTTGGAGATATTTTGACTGATAAAGAAATGGCTAAAATGAATTATGACGTA
GAAAACAACAATTTAGAACCTAGAGAAGTTGCTTGTGAGTTTCTGAATAAGAAAGGTCTTTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3674512-3672272 putative nogalamycin resistance protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCAATGAATTTATAATTTTAAAAGGTTGCAAAGAGAATAATTTGAACAATATTTCCTTAAAAATAC
CAAAAAGAAAAATAACCATATTCACAGGGGTGTCGGGTTCTGGAAAGTCATCTATTGTATTTGAGACAAT
TGCAAAAGAATCACAACGCCAACTAAATGAAAGGTTTAGTACATTTGTAAGAAGTTTTTTACCTAAGTAT
GGAGAGGTTAAAGCTGATTGTATAGAAAATCTGTCAACACCAATTATCATAGACCAAAGTAGACTTGGTG
GAAATTCAAGGTCAACCCTAGGTACTATTACAGATGTAAATTCCTTTTTAAGAGCTTTATATTCAAGGTT
TGGTAGTGAGTATATAGGTAATGCTAATATGTTTTCTTTTAATGATATTGATGGTATGTGCCCACACTGT
CATGGGCTTGGAAAAAAGCTAGTTCCTAATATGAACCAAATTCTTGATATGAATAAATCATTAAATGAAG
GTGCTATATTGCTTTCAGGGTTTGGAGTGGGTTCTTGGCATTGGAATATATTCGCTGAATCAGGATTTTT
TGATATTAATAAGAGGATATGTGATTATTCAGAAGTAGAATTGGAAAAGTTTTTGCATGGTAAAGCAGAA
AAGATTAAGATAGAAAATGCTGGTCAAACTAACATGACATATGAGGGATTAATGGTTAAATTTAATCGTC
TATACTTAAGTAGAGATGGAGAAATATCTGAGGCTACTAAGAAAAAATTGAGTAAACTTCTTATAGAAGA
TAGATGTCCTATATGTGATGGAAGAAGACTTAATGAAGGAGTATATAGGTCTTTAATTAATGGTTATAAT
ATAGCAGATTTAACTAGTATGCAAATTGATGAATTGGCTGAAGTTATTAAAAGTATAAATGAGCCAGAAG
CACAACCTTTAATTAAAGGAATAATAGAAAAGTTAAACAGTATCATAGATATAGGTCTTGGATATTTAAC
ACTGGATAGAGAGACATCTTCTCTATCAGGAGGGGAATCTCAGCGTATAAAGATGGTTAAGTATTTAAAT
AGTAATCTTGTTGATTTAATGTATATTTTTGATGAACCAAGTGTAGGACTTCATCCAAAAGATGTGTATA
AATTAAATAATCTTTTAAAAAAATTGCGTGATAAAGGGAATACAATTATAGTTGTTGAACATGACCCAGA
TGTTATTAAGATTGCAGACCATGTTGTAGATGTAGGACCAAAGGCAGGTAAGTATGGTGGAAAAGTTGTG
TATGAAGGCAGTTATAAAAATCTACTTACAAGTGGTACTTTGACAGGGAATGCTTTAAGTAAATTTCTTC
CTATTAAAGAAAGTGTAAGAGAACATAGTGGATATTTAGAAATTAAAAATTGTAATAAAAACAATTTAAA
AAATGTATCTATTAAGATACCTAAAGGTGTATTGACTCTAGTTACTGGAGTAGCAGGAGCAGGTAAAAGT
ACGTTGATTAAGGATGAATTTTTAAAGCAAAATCCTAGTGCTGTACTTATAGACCAAAGCCCTGTTTCAG
CAAATTCAAGGTCGAGTTTGGCAACATATAGTGGAATTATGAACAACATAAGAAGCATATTTTCAAAAAC
AAATGGCGTAAATGCTTCTTTATTCAGTTCAAATTCAGAAGGAGCTTGTGATAACTGTAAGGGTTCTGGA
ATAGTAGAAATGAATCTTGCTTTTATGGAGAGTATAAAGAGTACCTGCAATGTTTGTGAAGGTAAAAAAT
TTAAAAAAGAAGTTTTAGAATATAGGTTTCAAAGGAAGAATATAATTGAAGTTCTTGAAATGTCTGTTTT
AGACGCAATTGAGTTTTTTAATTTAAAACAGATTAAAACGAAATTACAATGTATTGAAAAAATGGGTATT
GGATACCTTACTTTAGGACAAACTCTTGATACTTTGTCTGGAGGAGAGTGTCAAAGATTAAAGCTTGCTA
GTGAATTAAATAAGGAAAGTTCAGTGTATATATTAGATGAACCAACAACAGGTCTTCATATGGCTGATAT
TGAGAATTTTATAAGTATAATTGAAGAGATTGTAGATAATGGAAATACGGTCATAATAATTGAACACAAT
ATAGATGTAATTAAAAGAGCTGATTGGATTATTGAGCTGGGACCTGAAGGAGGGACAAAAGGCGGGAGAG
TAATATTTGAAGGTATCCCAAAACAATTATGTAACAATAAAATATCATTAACAGCAAAATATATAGTATA
A
>ref|NC_013316.1|:c3675839-3675039 hypothetical protein CDR20291_3077 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAGTAAAACGAAGTACATAGGAATAAGTATATTAATATTATTGATGATATTTTTAATTGCAAAGA
ATTTTAACGGAAAACTTGAAATACCTATTCCTGAGAGTAATAGTAGAAAATTTAAATCAGCAGCAGTGTT
TTATCCTCAACATCAAGATGATGAGGTTTTATGGGGAGGAAGTGCCATTGTAGATGCTATAAAACAGTGT
GGTGTTGATAATGTATATGTGGTATTAGTATCAGATGGTTCTGGAGTTAACGTTTTCAAAGCTAACACAA
AATTTAGAAACTTAACTAGGAAGCAAAAGGAAGAGCTTAGAAATAATGAGTTTAAATCAGCTTTGAGAGA
GCTTGGAGTGAAACCTCAAAATGTGATTATACTTGCAGATATAGATAAAAAGGAAGGCACACATTATGAA
TTAATGGAAAAGACTATATTGGATTTTGAACATAAGTTTAAAGGCAATGTGACCCATATAGCCCATCACT
ATAAGTATGATGACCATATAATGCATAGAAAGAATGGGGAAGTTTTAAAGAAACTTAAACGTGAAGGTAA
GATAAAAGATGACTTGTATTTTGTTAAGCCAAAATATGTAAAGTATATACCAAGAAATGAAAGAGCTATC
TATAAAGCAATGGATTTTGATGACTACAATAAGGTTAAGAGTGCTTGTTATGAATATAAGGTTGTAAATT
CAAAGCGTAAAATGTATGGTATAGGATATATTTCGGCACATAGTTATTTTGAACATCTTCTAAATGACCC
TGAACTTACGTCTGTATTAAGTGAAGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3677105-3676230 chaperonin [Clostridium difficile R20291]
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ATACAGTAGAAGAAGCTAGAAGATTACATGAAACTACAAAAGTAGCAACAGCAGCACTTGGAAGAACATT
AACAGCCACATCTATAATGGGATTAATGATGAAAAATGATAGTGATAAATTGACTGTAATAATAAAAGGT
GGAGGTCCAATTGGAACTATTATCGCCACATCAGATTCTAAGGGAATGGTAAAAGGATATGTAGGAAATC
CACAAGTAGAGGTTGAAGACTATCCAAATGGAAAGTTAAATGTAGCAGCAGCAGTAGGTACAGAAGGTGT
TGTAAAAGTTATAAAAGACTTAGGTCTTAGAGAACCATATAATGGGACTTATCCATTGGTAAGTGGAGAA
ATTGCAGAAGACTTTACTTATTATTTTGCTGTATCAGAGCAGACTCCATCAGTAGTAGCTTTAGGTGTTC
TTACAAAAGAAGATGAAGTAGAGTTTGCTGGAGGATTTATAGTTCAATTAATGCCAGATGCAGAAGAAGA
GACTATTGCTAAGTTAGAGGAAAATGTAGCTAAATTACCTTCTATAACTAACATGTTAAAAGAAGGAAAA
TCACCAGATGATATATTAAATATTGTTTTGGATGGTTTGGAACCTAAAATACTTGATACCTGTGAAGTAG
GGTTTATGTGTGAATGTTCAAAAGAAAGAGTAAAAACTGCTTTGGTTGCAATTGGTAAAAAATCATTGGC
TCAGATAATAGAAGAAGATAAAAAAGCAGAAGTTGGTTGCCAGTTCTGTAATAAGAAGTATATGTATAGT
GAAGAAGAGTTGCTTGAAATTTTAAAGGAAATGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3678247-3677390 putative methyltransferase [Clostridium difficile R20291]
GTGAACGTGGATGGGCAGGACTTACAGCTAAGGAAGCAGGAAGAATTGGAGGTATGCTTACATCACGCAA
AAAGAGGCTTAAAAAGATTGTGGAGGAGCAGAATAAAAAGGATGAGTCAATATAGTGATTTTGCGTTTGT
ATATGATGAACTTATGAATGAAGTTGATTATAATGGTTGGGTTAAATATATAGAAGATATAATAGATAGT
GAAGGTGTAAAAGTAAAAAATATATTGGAATTGGCATGTGGCACGGGTAATCTTACAATTCCATTGACTA
AAAAAAATTACGATATAGCTGGTATAGATATATCTGATGAGATGCTTAGTGTAGCAAGAGAAAAGGCAGA
AAAAGAAGGAGTAGAATTAGTTTTACTTCAACAAGATATATCAGAGCTTGATTTTGAAATATCTGATTTG
GACTGTGTGCTTTGTGCTTGTGATGGATTTAATTATATAACTTATGATGATGATTTGGAAAATGTATTTT
CAAAGACATATGAATTATTAAAGAAAGATGGAATATTCATATTTGATATAAGTTCTTTTTATAAATTAGC
CAACATATTGGGAAATAACATGTATGGAGAAAATAGAGAAGATATAGCGTATATGTGGCAAAATTACTTT
GATGAAGAAGAGAATCTAATTGAAATGGAACTTACATTCTTTATTAAAGATGAATGTGGAAAGTTTGAAA
GATTTGAAGAGATACACCAACAAAGAGCATATACTGAAGATGAGATAGTTGATATGCTTGAAAAATCTGG
ATTTAAGGATATAAAATATTATGGGGATTTTACATTTGACAAACCCAGTGAAGAAAGTCAAAGAATCTTC
TTTGTATGTAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3678377-3678123 small acid-soluble spore protein [Clostridium difficile R20291]
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CAAATGATGATATAATGAAATATGAGATAGCCTCAGAACTAGGTCTTATGGATAAAGTTGGTGAACGTGG
ATGGGCAGGACTTACAGCTAAGGAAGCAGGAAGAATTGGAGGTATGCTTACATCACGCAAAAAGAGGCTT
AAAAAGATTGTGGAGGAGCAGAATAAAAAGGATGAGTCAATATAG
>ref|NC_013316.1|:c3679617-3678499 putative amidohydrolase [Clostridium difficile R20291]
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TTGGGAGAAAAGAGTATAAGACTTCAAAATATATAAGAGATTATCTTGATAAATTAGGAATTGAGTATGA
AGTTTATTTAGAAACAGGTATAGTAGGTGTAATAGAAGGTAAAAGACCTAAAAAAGATATTGCTTTTAGA
GCTGACATAGATGGTCTTCATAGTGAAGAAGGGGTAAAACATTTATGTGGTCATGATGGACATGCTACTA
TATTACTTGGATTAATTGAGTATTTAAATGATAATAAAGAAGACTTAAATGATAATATAGTATTTATATT
CCAACCAGCAGAAGAAGGTCCTGGGGGAGCAAAAGCTTTAATAGATGAAGGAGTGCTTAGAAAATACAAT
ATTGATGAAATATATGGGCTTCATATATATCCAGAGTTACCAGAAGGTTATGTAGGTACAAGAGAAGGCT
ATTTTATGGCTCAAATAGGAGATATCGACATAGAAATAGTGTCTAAAAGTGGACATGGGGCTATGCCACA
AAATGGTATTGATGGTATAGTGATAGCTTCAAACTTTGTAAGCTCACTTCAAACTATAGTGTCTAGAAAT
ATAAGCCCAATAGACAATGCAGTGTTGACTATTGGTAGAATTGAAGGGGGAGCTAGAAGAAATATAATAG
CTGAAAATATAAAGATGGAAGGTACTATGAGATGTTTCAGCCCAGAAGTGTATGAGAAAATGAAGCTTAG
AGTTAGAGAACTTGCTAGAGGGTTTGAATTGGCTTATAACTGTAAGGTTAATATAAATATTATAGATGAT
TATATTGCTGTTAAAAATGACAAGGATTTGTATCAAGAGTTTGTAGAGGCTATTGGAAGTGATACTGTTG
TAGAGTTAGAGCCACTTATGATATCAGAAGATTTTTCTTATTATCAAAAAGAAGTTCCAGGATTATTTTT
TATGTTGGGTTCAAGAAACGAAGAAAAAGGATTTGTAAATGGTCTTCATAATATAAACTTTAATTTTGAT
GAAAAGATATGTGTAAATGCATTGAATGTTTATTCAAAATTATTAAAATACAAAGAAGCAATAGATTAG
>ref|NC_013316.1|:c3681016-3679823 L-serine dehydratase [Clostridium difficile R20291]
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GAGCAGCAGAGAGATTTAAGAATGAAAACCCAGATGCAGAAAGTTTTAGAGCAATATTATATGGTAGTTT
GGCAGCTACAGGGAAAGGTCACTTAACTGACTATATAATTGAAAAAACTATAGCACCTAAAAAAGTCGAA
ATTGTTTGGGAAGAAGATATTATAAAAGATTTTCACCCAAATGGGATGAAGTTTGAAGCTTTAGATAAAG
ATAAAAATGTAACAGCTGAATGGACTGTATATTCTGTAGGTGGAGGGACTATAGCAGAAGAAGGTCAAAG
AAACAGTAAAAGCAATAGTATATATCACTTAGATACTATGGATGAGATAGTAAAATGGTGCAAAGAAAAT
AATAAGACTTTGGTAGATTTTGTGTTGGAATGTGAACCAAAAGACATAAAAGATTATATAAAAACTATAA
AAGATGCTATGAGAAAATCTATTGATGATGGACTAAGTACAGATGAAATAATACCAGGCAAGTTATTATT
AAAAAGAAGAGCAAGTACATTTTATAATGCATATAAAAAAGATAAGAGCTTCTCAACACTTGTATATGCA
TATGCACTAGCAGCTTCAGAGCAAAACGCTTCTGGTAATATAATAGTTACAGCACCAACTTGTGGTTCTG
CTGGAGTAATACCAGGAATATTCTTTGCAATGCAGGATTTCTATAATTATGATGACGAAAAAATAATTGA
AGCACTACTTGTAGCTGGAATAATAGGTAATATAATAAAAACTAATGCTTCAATATCTGGAGCAGAGGTA
GGGTGTCAAGGTGAAGTTGGAGCAGCTTGTTCTATGGCAGCAGCAGCAGTAGCATACTTAAAAGGTGGAA
CTATAGACCATATTGAATATGCGGCAGAAATAGCACTTGAACATCATTTAGGAATGACTTGTGACCCTGT
ATATGGATATGTTCAAATTCCATGTATAGAAAGAAATGCAATGGCAGCTCAAAGAGCTTATGATGCAGCT
AATTATGCATTATTAACTGATGGCTCACATTCTGTCTCCTTAGACCAAGTTGTTGAAACAATGAAAGAAA
CTGGTATAGATATGATGGATAAGTACAAAGAAACAGCTAAGGGTGGACTTGCTAAACATTTCTTCTCTTG
CTAA
>ref|NC_013316.1|:3681339-3682220 dihydrodipicolinate synthase [Clostridium difficile R20291]
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AATTAGGTGAATTAATCGAATATCACATTGAGAATGGCACAGATGCACTAGTTGTTTGTGGAACAACAGG
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AGAATACCTGTTATAGCAGGTACTGGTTCAAACAATACTATGTTGTCTGTTCATATGAGTCAAGAAGCTG
AAAAATTAGGGGTGGATGGTCTTTTAATAATAACTCCTTACTATAATAAGACTAATGAGAAAGGTCTTAA
ACTTCACTTTGAAACAATAGCAAATAGCGTTAAGTTGCCAATTATTTTATACAACGTACCAGGAAGAACT
AAAGTGAATATAAAGCCATCTGTTGTGGCCGAACTTGCTAAAATAGATAATATAGTTGCTGTGAAGGAAG
CAAGTGGAGACTTAGCTCAAGTTGCAGAAATAGCTAAATTAGTACCTAAAGACTTTGCTATATACTCCGG
TAATGATGATACTATACTACCACTATTATCATTAGGTGGAAGTGGTGTTATCTCTGTACTTGCTAACATA
TGTCCTAAAGAAACACATGATTTAGTAACTAAATTCTTTGAAGGTGATATTGAAGGCTCAAAAAAATTAC
AACTTGATATGGATGCTTTAATTGCTGCTTTATTTATAGAAGTAAATCCAGTTCCTGTTAAAACTGCCAT
GAACATTTTAGGTTTTAATGTTGGTGATTTAAGACTTCCTCTAGCTGAAATGGAAGAAACTAATCTTAAT
GTGTTAAAACAAGAATTGACAAATTTTGGATTTAAGTTTTAG
>ref|NC_013316.1|:3682645-3683646 aspartate-semialdehyde dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
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AAGAAAGAAATTTTCCAATAGAAAATCTATTTTTATTCTCTTCTTCTAAATCAGCTGGTTCTAAAGTAAT
GTTTTGTGGTAAAGAATATATAGTAGAAGAATTAAAGGAAACTTCATTTACTGATAGAGGCATACAAATA
GCATTATTCTCTGCTGGTGGAAGTATTAGTGAAAAGTATGCTCCAATAGCTGCTTCAAATGGAATCTTAG
TAGTAGATAACTCTAGTCAATGGAGAATGAATCCAGATGTGCCTTTAGTAGTTCCTGAGGTTAATCCAGA
AGCCATAAAAAATCATAAGGGTATAATAGCTAATCCTAACTGCTCTACTATACAAGCTATGGTTCCCCTT
AAAGCTCTTGATGATAAATACAAAATTAAGAGAGTTGTTTACTCTACTTACCAAGCTGTATCTGGTTCTG
GTGTTAAAGGTGTTGAAGATTTAGAGAAAGGAATGAACGGTAATCCTACTGGATTCTACCCTCATCAAAT
CTCTTACAACTGTCTTCCTCATATAGATTCATTCACTGAAAATGGATACACTAAAGAAGAAATGAAAATG
GTAAATGAAACTATGAAAATACTTGATAACTATGATTTAAAAATAACTGCAACTACTGTAAGAGTTCCAG
TAAAAAATGGTCATAGTGAATCTATAAATGTTGAGTTTAACAATCCATTTGAGTTAGATGATTTAGTAAA
AACACTTGAAGAAGCTCCAGGTGTTGTAGTAGTTGATAATCCTGCTAAAAACGAATATCCAACTGCTGTA
GAATTTGATGATAGAGATGAAGTATTTGTTGGAAGAATAAGAAGAGATTTTAGTGTTGATAATGGTGTAA
ATCTTTGGGTTGTTGCTGACAATATAAGAAAAGGTGCTGCAACTAACGCAATTCAAATAGCTGAAATGGC
TTTATCATACGATTTAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:3683763-3684650 dihydrodipicolinate synthase [Clostridium difficile R20291]
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AATTAGGTGAATTAGTTGAATACCAAATAGCTAATGGTACTGATGCTATAGTATCTTGTGGTACTACTGG
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AGAGTTCCTGTTATAGCTGGAAGTGGTTCTAATGATACTATGCACTCAGTTAACTTAAGTCAAGAAGCTG
AAAAATTAGGAGTAGATGCTCTATTAATAATAACACCTTATTACAATAAAGCTAATAAAGCTGGACTTAA
GCGTCATTTTGAAACAATAGCTAACAGTGTTAAACTTCCAATTATACTTTACAATGTCCCTGGAAGAACT
TGTGTAAATATAAGTCCTAGCCTTATAGTTGAACTTGCTAAAATTGATAACATAGTTGCTGTAAAAGAAG
CTAGTGGAGACCTAGGACAAGTTGCAGAAATAGCTAGTTTAGTTCCAGATGACTTTGCTATCTACTCTGG
TAATGATGATACTATACTTCCTTTATTATCTTTAGGAGGTCAAGGAGTTATATCAGTACTTGCTAATGTT
TGCCCTCAAGAAACTCACGATTTGGTAGCTAAATTCTTTGAAGGCGATATTGAAGGTTCTAGAAAATTAC
AACTTGGTATGGATGCTCTAATCGCAGCTTTATTTATAGAAGTAAATCCTATACCAGTTAAGACTGCAAT
GAATTTATTGGGATTCAATGTTGGAGATTTAAGATTACCTCTAGCAGAAATGGACCCAGCAAATTTAGAA
GTGTTAAAGAAAGAATTAGTTAACTTTGGACTAAAAGTTAATGCATAG
>ref|NC_013316.1|:3684717-3685466 dihydrodipicolinate reductase [Clostridium difficile R20291]
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ATAATGAATTAGAATTGGTTTGTGTTGCAGCTAGAGGTCTGGATAGCTATGAAGGCGACCTTAAAATTTA
TGAAGATATGAGTACTATAGTTGAGGAAGCTGATGTAGTTATAGATTTTTCTCATCACTCTAATTTAGAT
AATATCTTATCTTACGTTTTAAAGACTAAAACACCTTTAGTAATTGCTACTACTGGATATAATGATAACG
AAATGAACAAAATACGTGAAGCGGCTAAAGTTATTCCTGTATTCCAATCATATAATATGTCTCTTGGTGT
AAATGTATTAGTAAAATTGGTTAAAGATGCAGCTAAATTACTAGAAGGATTTGATATAGAAATAATAGAA
AAACATCACAACAGAAAAGTAGATGCCCCAAGTGGCACAGCTGTTATGATTGCTAACGCTATAAAAGAGG
TTTTGCCAAACGTTGAAAATAATTATGGTAGATATGGTCGTAGTGCAAAAAGACAACCAAATGAAGTTGG
TATTCATGCTATAAGAGGTGGAAATATTGTTGGCGAACATGATGCTCTATTTGCTGGAGACAATGAGGTT
CTTACAATAAGCCATCAAGCTCAATCTCGTGGTATCTTTGCAAGTGGTTCTATAGCTGCTGCCAAATACT
TAGTTAAGCAAAAACCAGGATTTTATAATATGGACAGCATGTTGGGATAA
>ref|NC_013316.1|:3685690-3686406 2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGGTAAATTTAAACGATGCTTATGAAATAGCAAGGTATATAAAAGAAGTTAAAAAGAAAACACCTGTTA
AGGTATATGTAAATACTAACTCTTTACACTTCCAATCAACTGATAAATTTAAGGTATTTGGAAGTAATGG
TTCTTATATATTTGTAGGTGACTATGAGGATATAATGGAAGTATTAGATAAACATGGGAATGATATAACA
GATACTCATGTAGAATATGATAGAAGAAATTCTGCTATTCCTCTAAAAAATACTTTAAATGAACATGCAA
GAATTGAGCCAGGTGCAATAATAAGAGACATGGTTACTATAGAAAAAAATGCTGTTGTAATGATGGGAGC
TGTTATAAATATAGGAGCTGTTATTGGTGAAGGTTCTATGGTAGATATGAATGCTGTTATTGGAGCTAGA
GGAACTCTTGGTAAAAATGTTCACTTAGGTGCTGGTGCTGTTGTTGCTGGTGTTTTAGAGCCACCTTCTG
CTACTCCTGTTATAGTTGAAGATGATGTTTTAATAGGAGCTAATGCAGTTATTCTTGAAGGTGTTAGAAT
CGGTAAAGGTGCTGTTGTTGCAGCTGGTGCTGTTGTAACTACTGATGTAGAAGCTGGTGCCGTTGTTGCT
GGTTCTCCTGCTAAAGTTATAAAAATGAAAGATGAAAAAACGGCTGACAAAACTAAGCTTATGGAAGACC
TTAGAAATTTAGACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3687681-3686677 hypothetical protein CDR20291_3088 [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAGTGATAGATATGTTAAAAGAAGAAAAAACTTATCAAGAGAAAGACGCAAAAGTATTCAATGGAG
TGGCAGCTTTGATAATGATTGTATTATTTTTAGTAGTTTCAATAGGTATCATGGTTTTTGGGATAGTAAA
ACTTGATAGTGGATTTACTGGAATAGGTTCACTTATGTTAATTTTGGGACTTGTATTTATAGTAGTAGAT
TTTATCCTATTTTTTGGGCTAAAAATGATTAATCCTAAAGAAGCTATAGTTCTAGTTTTGTTTGGTAACT
ATTATGGAACTATAAAAAAAGAAGGGTACTATTGGGTGAATCCATTTTGTTCAGCAATAAACCCAGCAGT
ATCAAGAATTAATGTATCGAAATCTTCATCTGATGAAAAGGTAGATATATCAACTAATTCAAGGGGCAAA
AAAGTATCTTTAAAAACAATGACTCTTAATAATGAAAAGCAGAAAGTCAATGATTTATTGGGAAATCCAA
TTATAATAGGAGTGGTTGTAATTTGGAAGGTTATAAATGCAACAAAGGCAGTATTTAATGTGGATAATTA
TAATACATTCTTATCTATTCAGTGTGATTCTACTATTCGTAATGTTTCAAGACTTTATCCATATGATGTA
TCTGAAGATGGAGATGAAAAATCTCTTCGTGGTAGTAGTCAGGAAATAGCAGATAGATTAAAAGATGAAT
TACAATCAAGGGTTGACATTGCAGGAATTGAAGTGTGTGAAGTGAGAATTACTCATCTTTCTTATGCACC
AGAGATTGCAGCAGCAATGTTACAACGTCAACAAGCAGAGGCTATAATAGCAGCACGTAAAAAGATTGTT
GAGGGGGCTGTAAGTATGGTAGAGATGGCATTGACTAATTTAAGTGAAAATAATGTTGTGACTTTGGACG
AAGAACGTAAAGCAGCTATGGTAAGTAATCTGTTAGTTGTGCTTTGTGGCAATAAAGATGCACAACCAGT
AGTAAACAGCAGTTCTATTTATTAA
>ref|NC_013316.1|:3688143-3688862 dihydrodipicolinate reductase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAAGAGTTTTAGCAGAATGTGTAAAAAAAGATAATGAATTAGAGTTGGTTTGTGGTGTAGCTAGGT
CTGCTGATGAAAAAGGTCATCATAGTGATACAAAGCTTTACAAAACAATGACTGATGTAACTGAAAAAAC
TGATGTCATAATAGACTTTTCACATCATGAGACTTTAGAGCCAATATTGTCATATGCTCTAAAAAATAAT
ACACCTGTAGTATTAGCTACTACTGGATATGATGAAAATGACTTAAATAAAATAGAAGAAGCATCAAAAA
ACATTCCTATATTATTATCATCAAATACATCTCTTGGAGTGAATATATTAATAAAATTAGTTAAGGATGC
TTCAAAGATGTTAGAAGGTTTTGATATTGAAATCATAGAAAAACATCACAATAGAAAAGAAGACGCCCCT
AGTGGAACTGCTACTATGATAGCTAATGCAATTAGAGAAGTCTTGCCTGAAAGTGAAAATACACATGGTA
GATATGGTAGAGATTGTAAAAGAAAACCAAATGAAATTGGAATACACTCTATAAGAGGTGGCAATATAAT
CAGCGACCATGATGTCATATTTGCAGGTGATAATGAAGTTCTTACATTAAGCCATCATTCTCAATCTGAT
GAAGTATTTGCAAACGGTTCTATAGTTGCAGCTAAATTTTTAATTGGTAAGCAATCTGGACTTTATAAAA
TGTCAGATATACTAGGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3691084-3689444 exosporium glycoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTGATATTTCAGGTCCAAGTTTATATCAAGATGTAGGTCCAACAGGGCCAACAGGTGCTACTGGTC
CAACAGGACCGACGGGGCCTAGAGGCGCAACCGGAGCGACCGGAGCAAATGGAATAACAGGACCAACAGG
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GGAACAACAGGTTCTACAGGACCAACAGGAAATACAGGAGCGACTGGAGCAAATGGAATAACAGGTCCAA
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GAATGGGATAACAGGTCCAACAGGAGCAACAGGAGCAACGGGAGCAAATGGAATAACAGGTCCAACAGGA
AATACAGGAGCAACGGGAGCAAATGGTGCAACCGGACTAACCGGAGCAACTGGGGCAACGGGAGCGAATG
GGATAACAGGTCCAACAGGAGCAACAGGAGCAACGGGAGCAAATGGAGTAACAGGTGCTACAGGCCCAAC
AGGAAATACAGGAGCAACAGGTCCAACCGGAAGTATAGGAGCAACGGGAGCAAATGGAGTAACAGGTGCC
ACAGGTCCAATAGGAGCAACAGGTCCAACCGGAGCAGTAGGAGCAACAGGTCCAGATGGTTTGGTAGGTC
CAACAGGCCCAACAGGCCCAACCGGAGCAACCGGAGCAAATGGTTTGGTAGGTCCAACAGGCCCAACCGG
AGCAACCGGAGCAAATGGTTTGGTAGGTCCAACAGGAGCGACCGGAGCAACAGGAGTAGCTGGGGCAATA
GGTCCAACCGGAGCAGTAGGAGCGACAGGCCCAACGGGAGCAGATGGAGCAGTAGGTCCAACCGGAGCAA
CCGGAGCAACAGGGGCAAATGGAGCAACAGGCCCAACGGGAGCAGTAGGAGCAACTGGAGCGAATGGAGT
AGCAGGTCCAATAGGTCCAACAGGTCCAACCGGAGCAAATGGAGTAGCAGGAGCAACAGGAGCGACCGGA
GCAACAGGGGCAAATGGAGCAACAGGCCCAACAGGAGCAGTAGGAGCAACGGGAGCAAATGGAGTAGCAG
GTCCAATAGGTCCAACAGGACCAACAGGAGCAAATGGAACGACCGGAGCAACAGGGGCGACCGGAGCAAC
GGGAGCAAATGGAGCAACAGGTCCAACAGGAGCGACCGGAGCAACAGGAGTGTTAGCAGCAAACAATGCA
CAATTTACAGTATCTTCTTCAAGTTTAGGGAATAATACATTAGTGACATTTAATTCATCATTTATAAATG
GAACTAATATAACTTTTCCAACAAGTAGTACTATAAATCTTGCAGTTGGAGGGATATACAATGTATCTTT
CGGTATACGTGCCATACTTTCACTTGCAGGATTTATGTCAATTACTACTAACTTTAATGGAGTAGCCCAA
AATAACTTTATTGCAAAAGCAGTAAATACGCTTACTTCATCAGATGTAAGTGTAAGTTTAAGCTTTTTAG
TTGATGCTAGAGCAGCAGCTGTTACTTTAAGCTTTACATTTGGTTCAGGCACGACAGGTACTTCTCCAGC
TGGGTATGTATCAGTTTATAGAATACAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3692001-3691462 hypoxanthine phosphoribosyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATATAGAAACAAAAAAATGGGAAGTATTGTATTCAGAAGAAAAAATTAAAGATAAATTAAGGGAAT
TAGGAGCAATTATAGAAAAAGATTATAAAGATAAAAATCTTATGGTAGTTTCTCTATTAAAAGGTAGCTT
TATATTTTGTGCAGACTTAGTTAGAAATATAAATTTACCACTTAGAGTTAATTTTATGACTACATCTAGT
TATGGAAACAATGAAGAAAGTACTGGAAAGGTTAAAGTGGTTTCAGATGTGACTACTGATATAGCAGGAT
ATGATGTTTTGGTTGTAGACGATATTACTGATTCTGCACTTACTATGGATTTTGTGTTAAAACATCTAAA
AGCTAAAAATCCTGCTAGTTTAAAATGCTGTGTTCTTTTGGATAAACCAAGCAGAAGAAAAGTTGATTTA
GTGCCAGATTATTGTGGATTTGAAATAGAAGATAAGTTTGTGGTTGGATATGGGTTTGATTTTGGTGATT
ATTATAGAAATGTTCCTTATATATTCAATGTTACTGATGAAGATAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3693636-3692329 hypothetical protein CDR20291_3092 [Clostridium difficile R20291]
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AACCAGTAGCCTTAGCTCTAGCATGTGCAAAGGCAAAGGAATTATTAGGAGAAGAAATAGTTGAAAATCG
TATGTTAGTTAGTCCTAGTATCTACAAAAATGGCATGTGCGTAGGTATACCAGGTACTGAAAGATTAGGA
TTAAAAATTGCAGCAGCTCTAGGTATAGTAGGTGGCCATTCTGAAAATGGATTAAGTGTGTTAGAAACTC
TAACAAAAGAAGAAGTTAAAATAGCTGAGGATTATATGGATAATACTCCACTATCAATAACACCTGCTGA
TACAAGAGAGAAAGTATTTATAGAAGTTGTGTTAAAAGGAAAAAATCATATTGCTAAAGTGAGAATAAGA
ACTAAACATGATAATTTTACGTTCTTAGAAAAAGATGGAGAAGTATTATTAGACAATGAACCAAAAGTAT
CAGCTTCAAATGATGCGGCAGAAAAAGCTGAAAGTTTAATGGATACAGTAACTATACAAGAATTAATAAA
AAATGTAGAAGAAATTGATTTTAAAGATATAGAATTTTTACTAGATGGAGTAAAAATGAATGAAGAGATG
GCTGAATATGGATTAAAACAAAAAACTGGTATTGGTGTCGGATATGGAATTAAAAAGTCTATAGAAGAAG
GTCTTTTAGGTAATGATGTTATAAATTATGCAATGATGTTAACTGCTGGAGCTTCAGATGCAAGAATGGC
AGGCGTAAAAATGCCTGTTATGAGTTCAAATGGAAGTGGAAATCATGGATTAACAGCAATTCTTCCAATC
GTTGCTTATAATAAAAAATTCCCACAATCTGATGAAAAACTAGCAAAGGCTTTAGCTATATCTCATCTAG
TAACTGGTTATATTAAGAACTATACAGGAAGATTATCTGCTGTGTGTGGATGTGGTGTTGCTGCTTCTAC
TGGAGCAACTGCTGGTATCTCTTGGCTTATGAATGGTACTGAAAAGCAAATAGAAGGAGCTATAGAAAAT
ATGATAGCTGACTTAAGTGGAATGATATGTGACGGTGCGAAAGCTGGTTGTGCATTAAAATTATCTTCTG
CAGCATCTGCAGCTATACAAAGTGCTATAATAGCTAAGCAAGATTGTTTTGTACCACCACTAAATGGTAT
AGTTGGTTCAAGTGTTGAGCAAAGTATACAAAACTTAGGTAGAGTAAGTGACAAAGGTATGTCTATAACA
GATGAGATAATCTTAAATGTAATGAATGATATGAATAAAGTTGACTAG
>ref|NC_013316.1|:c3695836-3694061 putative sigma-54 interacting protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATGGTTATGATAGGTTTAGAATATATAAAATCTGATATTCAAAATATAGCTGAAGCTATAGTATCAG
TACTCAATATAGATGTAACTATAGTAAATAAGGAGTTATTTAGGATTGCAGGTACAGGAGTATATATAGA
CAAAATAGGTGAGAAAGTAGATAAATATACGGCTTTTAAAAAATCACTTACAGAACAGATCACAATACTA
ATTGATGACCCAAAGAGTAGTGATGTATGTAGGGAATGCTATAAAAGTGGGGCTTGTGTAGAGTTTGCAG
AGGTGTGTTGTCCTATTATATGTGATGGCGATTCTCATGGCGTTATAGGCCTTATAGCCTTTACAAAAGA
ACAAGCACAAATTATAGAAAATAATAAAAGTGGTCTTATAAACTTTTTAGGCAAAATGGCAGACTTAATA
TCTAATAAATTAAAAGCACAAATTAAAACTTATGAGCTTGAATTAGAAAAGAAAAAATTAGAGACACTAT
TAAACAATATGGACAAAGCTGTTGTGTCTATTGATGTGGATGGAAAAATTGATAAATATAATTCAAAATT
TAAAGAGCTTTTCAATATAAAGGATAGTATAACTGGCAAAAACATATTTGTCGAATTAGATTTTATAAAG
AAACCTTCTATAAATAACTTTAAGAAAGACAAATCGTGTAGTTTTTTTTATAAAAGATACGGATATGATT
CGAAGGGAATATACAACATCAATAAAATAGTATTAAAAAATGAGTTAAAGGGATATGTTATTGATTTTAT
AGATAAAAGAGATGCTATAAAAAACTACAATAAGATGAATAAAGATTATAGAATAAAATTGGAAAACATA
ATTGGAGAAAGTGTAGCTATAAGAAATTCTAAAAAGGAAGCCCTAATAGCTTCTAAATCAACATCAACAG
TACTTATTACTGGGGAAAGTGGAACGGGTAAGGAGCTATTTGCAAGAGCCATACACAACCATAGCAATAG
AGTAGATAATCCTTTTATAGCTGTAAACTGTGCTGCTATACCAGACAATTTATTAGAGAGTGAATTATTT
GGATATGAAGAGGGAGCTTTTACTGGAGCTAAAAAAGGTGGAAAGCTTGGAATGTTTGAAGTAGCTCATA
AGGGAAGTATATTTTTAGATGAAATAGGAGATATGAGTTTGCATTTACAGTCAAAGTTATTGAGAGTATT
ACAAGAAAAGGAACTTAATAAAATTGGAAGTAAATCAAATGTCTCAATAGATGTAAGAATTATTGCTGCT
ACAAATAAAGATTTAGAAAAAATGGTTCAAAATGGCACTTTTAGAGAAGATTTATATTATAGATTAAATG
TTATACCTATAAAATTACCAAGTTTAAGAGAGAGAAAAGAAGATATCCCACTTATAATCAAGCATATGGT
TAAAGAGTATTCAAAAAAATTAGATAAAAATGTTATTGACATAGATAGCAGGGTTGTTGATGCTATGATG
GAATATAAGTGGCCAGGGAATATAAGAGAGTTGCAGAATATTATTGAATATAGTGTGAATATGTCTTCTT
CTTCAATAATCACAATGAATGTAATTCCTCAAAAAATTAAGAATACCTCTGTAGAAGAGTTAGAAGTTAA
AAGCGATAGGATAATTCCACTTGATGAACTAGAGAAGATTGAGATAATAAAAGCTTTAAATAAGTACAAA
GATTATAAAAAAGATAAAGAATTAACAGCTAAAGCACTTGGAATATCAAGAGCTACATTATATAGAAAAA
TTGAAAAATACAATATAATTTCATAG
>ref|NC_013316.1|:c3696617-3696048 hypothetical protein CDR20291_3094 [Clostridium difficile R20291]
GTGAAAAGCATATTATGTCAGATAAATAAACAGCCAGTTAAAGCTAAATATACATCTGATGAATTAGAAT
GTTTTTTGGATACAATTGAGTATAATGTAGGTGATAAAATATTGCTTGTTGGTCATATAGGAAACCTAGG
CAAGAGATTGAGAGGTCTTGGAACTTCTGTAACTATACTGGAGAATAGTAATTATGAAGATGTCTGTTAT
TCTCTAGTGTATAATGAAAATTGCAATGTAGTTAAAGGTAAGTTAGAGTTTCTACCATTTGATGATAATC
AGTTCAACAAGATAATAATAGTTGACCAATTTAATGTTATTACAGATTGTGAAAAAGCTTCATCTGAAAT
ACAAAGAGTGTTAAAGGGCAATGGAGAGGTTATATTAGAGGATTTAAATTTAAAGAATTTAAAAGTTAAG
TTAAATTATCTTAAACATAAATTTTGTGGTTCTGTTGCAAAGATTCACTATCCACATGAAGTATTTAATA
TATTTTCAAGATTAAACTTTGATGGTATGATTAAAGAGTCAAATAAATTAAAATATATTTATGTGGGAAA
AAGAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3697436-3696801 single-stranded DNA binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGCTGTTAAAGATGAGAATAACGTAGTAAACTTAAGAGGGGAGTTAGACAATAAGCTAGAATTTA
GCCATGAGATATTTGGAGAAAAATTTTATAATATGAAAATAAAAATAAACAGACTAAGCGATTCTTTTGA
TATACTTCCAATGACTGTATCAGAAAGACTTCTCCAAGATATTGACCTTGATAAACAAAATTTAGTCAAT
GTCGTAGGCCAATTAAGATCATATAACAAAACATTAAATAATAAAAATAGATTAGTGCTTACAGTGTTTG
TCAGAGAAATAAAAAGCATAGACGAGGAAAATAAAGACCCTAATAGTATATTTTTAGATGGATATGTATG
TAAGGAACCTGTGTATAGGAAGACACCTTTAGGAAGGGAAATAACCGATTTATTAGTTGCTATAAACAGA
CCTTATAATAAATCTGATTATATACCATCAATAGTTTGGGGTAGAAATGCTAAATTTGCAAAGAATCTAA
AGGTTGGTGATAGAATACAGCTTTGGGGTAGGGTTCAAAGTAGAGAATATGAGAAAAAAATAGATGAAAA
TAATGTGGTCAAAAAAATGGCATATGAAGTATCCATATCGAAAATAAAAAAATTGGATGAAAATAACAAT
GAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3698985-3698104 hypothetical protein CDR20291_3096 [Clostridium difficile R20291]
ATGGTAGCAATCTTAAAGGCATTATATGTAGTATTCGCAGCAATCTTTGCAGTTGTGTTTGGTAAAGACG
TAGCTAAAGCAAACAAAGAGGGGAAACTAGAAGAACAAAGTACTCCAAAAGTTGCTGTAACAGGATTTAT
AACAGACTTCTTTGATACATTAGGAATAGGGTCATTTGCTCCAACAATAGCAATGTCAAAGGCTTTAAAG
TTAAATATACCAGATAAAAAAATGCCTGGTACATTAAACGTAGCACATACTATTCCAGTTGTTACAGAAG
CATTCATATTTACATCAATCATACCAGTTGATGGTGTTACTTTAGTATCTATGGTTGTGGCAGCAGCAGT
TGGTTCATATATAGGTGCAGGAATAATAGCTAAGATGGACGAGAGAAAAATACAACTTGTTATGGGTGTA
ACTTTAGCATTAACAGCAATATTAATGTTATTAGGTCATCCTTGGATTAACGTATTACCAGGTGGAGGAA
ATGAATTAGGTCTTACTGGTGTTAAATTGGTAATAGGTGTAATAGGTAACTTTATACTAGGAGCTTTAAT
GACAGCTGGTATAGGTCTATATGCTCCAGGTATGGCAATGGTTTATTTCTTAGGAATGTCTGCAAAAGTT
GCATTCCCAATAGTTATGGGTTCTTGTGCATTATTAATGCCAGTTGCAAGTATGAAATTTATAAAAGAAG
ATGCATATACTAAAAAAGCATCAGTTATAATAGCTATATGTGGTTTAATAGGAGTTTTCGTAGCTGCATA
TATAGTAAAAACTCTACCAATGGATATATTAAAAGCATTAGTAATAGTAGTTATAGCTTATACTTCTGCT
ACAATGATAATGGCTGCAAATAAAAACAAAAAGACTGCTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3700112-3699105 putative proline racemase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTTAGCAGAAGTATACAAGCTATAGACTCTCATACAGCAGGTGAAGCAACTAGAATAGTTGTAG
GTGGAATACCTAACATAAAAGGAAATTCTATGCCTGAGAAAAAAGAATATTTAGAGGAAAATCTAGATTA
TTTAAGAACTGCTATAATGTTAGAGCCAAGAGGACATAATGATATGTTTGGTTCTGTAATGACTCAACCT
TGTTGCCCAGATGCTGACTTTGGAATAATCTTCATGGATGGTGGTGGATACCTTAACATGTGTGGCCATG
GTACAATAGGAGCTATGACAGCAGCTATAGAAACAGGTGTAGTTCCAGCAGTAGAGCCTGTAACTCATGT
AGTTATGGAAGCTCCAGCAGGAATAATAAGAGGAGACGTTACAGTTGTAGATGGAAAAGCTAAAGAAGTA
TCATTCTTAAACGTACCAGCTTTCTTATATAAAGAAGGTGTTGAAGTTGACTTACCAGGTGTTGGGACTG
TTAAATTTGACATATCATTTGGTGGAAGCTTCTTTGCTATAATACATGCAAGTCAATTAGGTTTAAAAAT
CGAACCTCAAAATGCTGGTAAATTAACTGAACTAGCTATGAAACTTAGAGATATAATAAATGAGAAAATA
GAAATACAACATCCAACTTTAGCTCATATAAAAACTGTAGACTTAGTTGAAATATATGATGAGCCAACTC
ATCCAGAAGCTACTTACAAAAATGTAGTTATATTTGGTCAAGGTCAAGTTGACAGATCTCCATGTGGAAC
TGGAACAAGTGCTAAATTAGCTACTTTACATGCTAAAGGTGAATTAAAAGTAGGAGAAAAATTCGTATAT
GAAAGTATATTAGGAACTTTATTCAAAGGTGAAATAGTTGAAGAAACTAAAGTTGCAGATTTCAATGCTG
TAGTACCTAAAATAACTGGTTCTGCTTATATAACTGGATTTAATCATTTTGTAATAGATGAAGAAGACCC
ACTTAAACATGGATTTATTCTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3700614-3700132 hypothetical protein CDR20291_3098 [Clostridium difficile R20291]
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ATTTGATAGATAATGATTCTGACATAGACTTGTTAGGAGTGGTTGTAGTTGGGACATCAGAGCACAATGA
ATGGAAAACATTTTTAGCAACTAGACTTGGAAGATGGATTGAATCATTGCGACCTGATGGAGTGATTATA
ACTTTAGATATGGCAGGAAACCAGCACATTGATTTTACAAATGCTATAGCAGAGTTTGTAAAATCAGATA
TACCTGCAGTAGGTCTTACTATTATGGGAGCAGATGGATTAGTAATTACCAATCCATATTTGGATAAAGC
TACCATAATTGATTATAAAAAGACAACAGGCTACATAGAAACAGAAGTAGTTGGAGACAATCACATGGAT
GAAGTTGATGTTAAAAAAGCATTGGCTTTCCTAAAATTAAAAATGCGTAAAGACGCAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3701099-3700632 hypothetical protein CDR20291_3099 [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAATAGGACCTTCAACAAAAGAAACATCTCTTCATCACTTTAGAGACCCACTTTTAGACATAGTTG
AAAGTGATAAGGATGTAGATTTACTTGGAGTAATAGTAGTAGGAACTCCAGATGGAAATGAAAATAAAAC
CTTTGTGGGACAAAGAACGGCCGCTTGGCTGGAAGCCATGAGAGTAGATGGAGCTATAGTTTCATCAGAT
GGTTGGGGAAACTCACATGTTGACTACGCTAACACATTTGAGGAAATAGGAAAAAGAGATATACCTGTAG
TTGGAGTTACATTTAATGGGACTCAAGCTAAGTTTGTTGTAAGCAATCAATATATGGATACCATAGTTGA
TATGAACAAATCAAAGGAAGGTATTGAGACAGAAGTAGTTGGAGAAAACAACACAAATGAAATAGATGCT
AAAAAAGCTTTAGCATTTTTAAAACTTAAAATGAGAAAACATGGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3701872-3701114 hypothetical protein CDR20291_3100 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGAAAAAATAATGAGAAGACTTGTTATAAAACCGTTTCATATGAATGAAGTTAATTTCGGTTCAA
AAACTTCTATAAAGAAAGATGTACTTACAATAGATTTATCAAGTATAGATGAAATAAAAGAAAGAGAAGA
GTTAATAACAGACATAAAAGTAGACATTATAAAACCTGGAGATTATGATAGAGAAATTAATACTATTATG
GACATTATACCAATATCAACAAAAGTTTTAGGCAGACTGGGAGAGGGTATCACACATACTTTAACGGGTG
TATATGTAATGTTAACTGGTGCAGATGAAGATGGAAATCAAATGCATGAATTTGGTTCTTCAGAAGGAAT
TTTGAAAGACCAAATGGTATTTGGGAGATATGGAACTCCATCAGTTGAAGATTATATAATCCATGTAGAT
GTAACTTTAAAGGGAGGTTTACCTTTTGAAAGAACACTTCCACTTGCAGCATTCAGAGCATGTGATGATT
TTATACAAGAAATAAGAGCGTCTTTGAAAATGGAAGACGGAAGAAATGCTACTCAAGTTCGTGAATATTT
TGACAAAATTCGACCAAATGCAAAAAAGGTTGTCATAGTAAAACAAATAGCAGGTCAAGGTGCTATGTAT
GACAATCAGTTATTCTCAAAGGAACCTAGTGGATTTGAAGGAGGAACATCAATTATAGATATGGGAAATG
TACCTATGATTATATCTCCTAATGAATACAGAGATGGTGCCCTTAGAGCTATGACTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3702677-3701952 proline reductase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCCTTACAACAGTACAAGGACTTCAATCTGAAATATTCGTTCCAATAACACCTCCTCCAGTTTGGA
CTCCTGTAACTAAAGAATTAAAAGATATGACTATAGCTTTAGCTACAGCAGCTGGTGTTCATTTAAAATC
TGACAAGAGATTTAATCTAGCAGGAGATACTACATTTAGAGCTATACCTAATACAGCTACAGTTGATGAA
ATGATGGTATCACATGGTGGATATGACAATGGAGATGTAAACAAAGATATAAACTGTATGTTCCCTATAG
ATAGATTACATGAATTAGCTGCAGAAGGATTTATCAAAGGAGTAGCTCCTATGCACTATGCATTCATGGG
TGGTGGAGGAAACCAACATGTCTTCACTGAAGAAACTGGTCCTGCTATCGCTGCTAAACTTAAGGAAGAG
GGAGTAGACGGTGTAGTTATGACAGCTGGCGGTACTTGCCATAGAACTGCCGTGATCGTGCAGAGAGCAA
TAGAGGAAGCTGGAATACCTACAATAATAATAGCAGCTCTTCCTCCAGTAGTTAGACAAAACGGAACTCC
TAGAGCAGTTGCTCCATTAGTTCCAATGGGTGCTAATGCTGGTGAACCACATAATATAGAAATGCAAACA
CATATATTAAGAGATACATTAGAGCAATTAGTTGCAATACCATCTGCTGGTAAGATAGTTCCATTACCAT
ACGAATATAAAGCTCACGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3702999-3702715 hypothetical protein CDR20291_3102 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAGGTTAAAATATATCTCATCAGAGACTTTTTATGAAGGTATTATAGTTGACATCAAAGGTGGTG
GAGTGACTATAGACCTAAAAGGTAGACTTGGACAATTTAAAATACCTAATAGAATGCTTATAACTGACTA
CGAACTTAAGATAGGTCAAGAAGTTGGATTCATGCTAAGCTATCCTGAGGTATTAAGTCCAGAGCCTAAT
CAAGAGTATGTAGAAAATATTAGGAGAGAAAAAGAAAAACAAGCAGAAATGCAATCAAAACAAGAAGAAA
AATAA
>ref|NC_013316.1|:c3704960-3703080 proline reductase subunit proprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAATAACTTTAGAAACAGCTCAAGCCCATGCAAATGACCCAGCAGTTTGTTGTTGTAGATTTGAAG
CGGGAACAATTATAGCGCCAGAAAACTTAGAAGATCCAGCAATATTTGCAGACTTAGAGGATTCTGGATT
ATTAACAATACCAGAAAATGGATTAACTATAGGTCAAGTACTAGGAGCTAAGTTAAAAGAAACTTTAGAT
GCACTTTCTCCAATGACTACAGATAACGTAGAAGGATACAAAGCAGGAGAGGCTAAAGAAGAAGTAGTAG
AAGAAACAGTAGAAGAAGCAGCTCCAGTATCAGAAGCAGCAGTAGTTCCAGTAAGCACAGGAGTTGCAGG
TGAAACAGTTAAAATACACATAGGTGAAGGTAAGAACATAAGCTTAGAGATACCTTTATCAGTAGCTGGT
CAAGCAGGAGTTGCTGCTCCAGTAGCAAACGTTGCTGCTCCAGTGGCAAGTGCAGCAGCAGAAGTAGCTC
CAAAAGTTGAAGAAAAGAAACTTTTAAGAAGCTTAACTAAAAAACACTTTAAAATAGATAAAGTTGAATT
TGCTGATGAAACTAAAATAGAAGGAACTACTTTATACATCAGAAACGCAGAAGAAATATGTAAAGAAGCT
AATGAAACTCAAGAGTTAGTTGTAGATATGAAGTTAGAAATAATAACTCCTGATAAATATGAAACTTACA
GTGAAGCTGTATTAGATATACAACCAATCGCTACTAAAGAAGAAGGCGAATTAGGTTCAGGTATAACTAG
AGTTATAGATGGAGCTGTAATGGTATTAACTGGTACAGATGAAGATGGAGTTCAAATAGGTGAATTTGGT
TCTTCAGAAGGTGAGTTAAATACTACTATAATGTGGGGTAGACCAGGTGCTGCTGACAAAGGTGAAATAT
TCATCAAAGGTCAAGTAACAATAAAAGCAGGAACTAACATGGAAAGACCAGGACCTTTAGCTGCTCACCG
TGCATTTGACTATGTAACTCAAGAAATAAGAGAAGCATTAAAGAAAGTTGACAACTCTTTAGTAGTTGAT
GAAGAAGTAATAGAGCAATACAGAAGAGAAGGTAAAAAGAAAGTTGTTGTTATAAAAGAAATAATGGGAC
AAGGTGCAATGCATGATAACCTAATATTACCAGTTGAGCCAGTTGGTACATTAGGAGCTCAACCAAACGT
TGACTTAGGAAACATGCCAGTTGTATTATCTCCACTTGAAGTATTAGATGGTGGTATCCATGCATTAACT
TGTATAGGACCTGCATCAAAAGAAATGTCAAGACATTACTGGAGAGAGCCATTAGTAATAAGAGCTATGG
AAGACGAAGAAATAGATTTAGTAGGTGTTGTATTTGTTGGTTCTCCACAAGTAAATGCTGAGAAATTCTA
TGTATCTAAGAGATTAGGTATGTTAGTTGAAGCTATGGAAGTTGATGGAGCTGTAGTAACTACTGAAGGT
TTCGGAAACAACCATATAGATTTCGCATCTCACATAGAGCAAATAGGTATGAGAGGTATACCAGTAGTTG
GTGTAAGTTTCTCAGCTGTTCAAGGTGCTCTAGTTGTTGGTAATAAATACATGACTCACATGGTAGACAA
CAATAAGTCTAAGCAAGGTATAGAGAATGAAATATTATCTAACAACACTTTAGCTCCAGAAGATGCTGTT
AGAATAATGGCTATGCTTAAAAATGCTATAGAAGGTGTAGAAGTTAAAGCTCCTGAAAGAAAATGGAATC
CAAATGTTAAATTAAATAACATAGAAGCTATAGAAAAAGTTACAGGAGAAAAAATAGTATTAGAAGAGAA
TGAGCAATCTCTACCAATGAGTAAGAAGAGAAGAGAAATATACGAAAAAGACGAAAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3707179-3705389 sigma-54-dependent transcriptional activator [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGTACTACTATAAAGGGGGGGACTTTATGTTTTCGATACCAGAAGTAAAAAAAGTAGAAGAGGTAA
TGGATACAAAATTTACAACTATAGACGAAGACACAAGAATTGAAGATGCAATAAAAGAAATGATAAAAAG
CAACACAAAAACTCTAATGGTAATAGATTCATCTGACCAATTAAAAGGCATTATATCCATGACGGATATA
CATAATCTTTATGAGATGCATAAAAAGTATGAAGGTCAACCAGTAAAACTTATAATGAAGAAGGATGTAA
TATATGTCAACGAAGGTTTAACCTTAGATGAATGTAGAGATATAATGATATTAAAAAATATAGGGATTCT
TCCTGTTCTTAGAGATAATAAAATTATTGGAGTTCTAAAACAAGAGCACATTAGGGACTATCTATATATG
CATTTAGAAGATTATGGATTGACTTTGAAGTATATTATAGGTCAAATTAAAGAAGGAATTTGTGCTATAA
ATAACGAAGGTGTTGTTATCTTGTGGAATAAGTTTATGGAGGAAAGGTATGATATAAAGTCTGAAGATAT
AGTTGGTCGACCGATGAATGAATTTTTGGAAAATACTATTTCAGAAAAAGTACTAAATAGTAAAGTTGGA
ATGAGTGACTTGTATTTTACAGATAAAAAAGAAAATATGTATGCATTAGTTCATGCAAATCCTATATTTT
ATAAAGAAGAATTTATCGGTGTTGTATGTACAGAAGTTGATGTTACAGAAGCTAAGATATTAGCTCTTGA
ACTTGAAAAAGTAAATGATACATTAAAATATCTAAAGAACGAAGTCAAAAATTTATCTAAAGGTAGTTTT
GATAAGATTTTAGGTAAAAGTTATAAATTGGAAAAATCGAAAGCGATTGCAAAACAAGTGGCTAGAACAA
ATAGTAGCATATTTATTTGGGGTGAAAGTGGTACGGGTAAAGAAGTATTTGCAAGAGCTATTCATGATTA
TAGTGAGAGAAAAGGTCAATTTATACCTGTTAACTGTAGTGCCATACCAAATGAGTTATTTGAAAGTGAG
TTTTTTGGGTATGAATCAGGTGCATTTACAGGAGCAAGTAAAAAGGGTCGAATAGGTATATTTGAACTTG
CAAAAGATGGAACTGTATTTTTAGATGAAATTGCCGATTTACCTCTTAGTATGCAAGCAAAGTTGCTTAG
AGTATTACAGGAAAAAGAAATAAGAAGAGTTGGTGGAGATACCACAATAAAAATAAATCCTAGAATAATA
TCAGCTACCAATAAAGATTTGAGTAAAATGGTAAAGGCAGAAAAATTTAGAGAAGATTTATACTATAGAT
TAAATGTTGTTGAAATAAAGATTCCTCCACTTAGAGAGAGAAAAGAAGACATAGGATTATTGGTTCATAG
CTTTTTAGAGGAGATATGTAAACAAAATAATAAGCCTGTTCTTACAATTAGCAAAGATGTAATAGATATA
TTTCAGAATTATAGATGGAAAGGTAATATTAGAGAATTAAAAAATACGATTGAAAATATTGTTGTATTGT
CACAAAATTCTAAAATAGATGTAGATGATGTACCAAGTTATATGATGGATTCTACAAATAATAGTACTGA
AGAAGAAGAGTATCCCTTAGATTTAACGAAGGCAACTCAAAAAATTGAAATAAAGAATATAACCAAGGCA
CTTAAAATGTCTAATGGAAATAAAGCTAAAGCAGCTAAGATATTAAATATACCCAGAACAACTTTGTATT
ATAAGATAGACCAATACAAAATAGATGTGTCTAAAATATGA
>ref|NC_013316.1|:c3709263-3707950 putative electron transfer protein [Clostridium difficile R20291]
TTGAACAAACTATATTCTATTTTATTAAAACAACACGTTGGTGGTCCAGATAAGCCAGTAGTAAGTGTTG
GAGATGTAGTAAAAAAAGGAACTCTAATCGCAGAACCAACTGGATTAGGGGCAAATATTTATGCCAGTGT
TAGTGGAAAAATAAGTGAAATAAATGACCAAGCGATAGTAATTGAAGCTGATGAAGTACAAGAAGATACT
TTTGAACCATTAAAAGGAGAAGGTATACTTGACTTAATTAAAGAAGCTGGAGTAGTAGGAATGGGTGGAG
CAGGATTCCCTACTCATGTAAAATTAAACATAGATTTAAATGGTGGAACAATATTAGCAAATGCAGCTGA
ATGTGAACCTTTATTAGCTCATAATATAAAAGAAATAGAAGAAAGACCAGAAATAGTTTATCAAGGTATA
AAATATGCTATGGAAGTTACTAATGCTGGAAAAGGTATGCTAGCAATAAAAAGCAAGCATCCAAAAGCAA
TAGAAGCTTTCAAAAAAGTAATAAAGCCAGGAGACAACATAGAAGTTGCAGAACTAGTTGATATGTACCC
AATGGGAGAAGAGAGAGCAATAGTAAGAGACGTTCTAGGAAAATTACTTGAGCCAACTCAATTACCTTCA
GAGGCTAATGCAGTAGTAATAAACGTAGAAACACTAACTAGAATAGTAGAGGCTGTTGAGCAAAAAAGAC
CAGTTATATCTAAAAATATAACTGTAGTTGGTCAATTAAACAGTGGAAAAGAGTCTATAGTATTTGAAGA
TGTGCCAATTGGAACAACTGTCGGAGAATTAATTGAAAGAGCTGGTGGAATAAAAGGTGAATATGGTGAA
ATAATCCTAGGAGGACCTTTCACTGGTAAAGCTACTACTTTAGATGCTCCAATAACTAAAACTAGTGGTG
GTATAATAGTTACTATGCCATTTGTTAATGAAAAGAGAAAAATGGGTCTTTTAGTCTGTGCATGTGGACC
TAATGAAGAGAGAATGAGAGATATAGCAACTAAAATGGGAGTTACTGATATAGTATCAGTTCAAAAATGT
AAACAAGCTCAAGAAATTAAAGGTGCATTAAAATGTGAAAATCCAGGACACTGTCCAGGACAAGCTCAAA
AATGTATTGAATTTAAGAAAGCTGGAGCAGAAGTTATATTAATAGGAAACTGTACTGACTGTAGTAACAC
AGTAATGGGTTCTGCACCAAAATTAAAGTTAGGTGTATATCATATTACTGACCATGTAATGAGAACAGTT
AATCACCCATTAATAAGAAGAATAAAAGGTGACGTAAGATTAAAAATAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3710416-3709652 putative polysaccharide deacetylase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGAGAAGTTAAAAGGACTAAAGCTTTGATATATAGTGTTTTATTTTTTTCATTATTATTAGTGT
TAATATTTGTTTTTGTTTATGGAATAAAATACATATGTTCTAAATACGACAATTCAAAAATGCCTATATA
TAAAGTTGATACAAATGAGAAAAAAATAGCCTTGAGTTTTGATGTAGCATGGGGAACTGATAATATGGAT
GATATTTTAAAAATTTTAGATAAACATAATGTAAAAGCTACCTTCTTTTTAGTTGGTAGTTGGGTGGATG
ATAATGAAGAAATTGTAAAAGCTATAGATGAAAAAGGACATGAAATTGGAAATCATTCAAACACTCATGC
CAATTTGAAGGAAATATCAAAAGAAGACATAACAAAAGAGATAGAAACTACATCAGAAAAAATATATAAT
ATAACAGGAAAAAAGACTAATTTATTTAGACCTCCTTTTGGGGACGTAAACAATAAAGCTATGGACATTT
GTAGTGATTTAGGTTATAAAGTAATTAAGTGGGATGTAGATTCTATAGATTGGAAGGAGCTTGGACCAAA
TCATGTAATTGAGAAAGTAATAAAAGAATCTCAACCTGGTTCAATAGTTTTATTCCATGCTAATATAAAT
GATGTAGATAACTATTTGGATACTATAATAAGTCGACTAAAAAAAGATGGATACAGTCTAGTCAAAATAT
CTGATTTGTTGTATAAAGATAATTATGTAGTTGATTCCAATGGAGTGCAAAAAACTAAGAATTAA
>ref|NC_013316.1|:3710689-3710910 small acid-soluble spore protein B [Clostridium difficile R20291]
TTGAGGAGGAAATTTACTATGTCAAATTCAAACAGAACAGTAGTTCCAGAAGCAAAAGCTGCTTTAAACC
AAATGAAATTAGAAATAGCTAACGAAATAGGTTTATCTAACTATGAAAACATAGATAAAGGTAACTTAAC
AGCTAGAGAAAATGGATATGTTGGTGGATATATGACTAAGAAATTAGTTGAAATGGCTGAAAGACAAATG
GCTGGAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:3711091-3711636 hypothetical protein CDR20291_3108 [Clostridium difficile R20291]
ATGATATTTATGTTTGAAAACTCGTCTGAAGAATTAGCCTATCACAAACTTTTAATTTTATATATATTAG
AAAAAATTAAAATGGATTTAACTAATTCTCAAATAACTCAAGTAGTATTAGAGACTGAGATGATGAATTA
TTTTTCATTACAACAGCTTTTATCTCAGCTTATGGAATCTAAGTTTTTGACTACATATAAAGACTCTGAC
AGAGAATATTATGCTCTTACTCAAAGAGGCGTAGAAAGTCTAGAATACTTCTTTAATCGAATACCTACTA
GTGTTACTGAAAAAATAGACAAGTATATAGATTCTAACAAAGAAAATCTACTAGCAGATACTCAAGTAAA
GTCTAGTTTTGTAAAACAAAGTGATAATGAATTTATTGTCAACCTTAGAGTCATAGAAAATCAGTCTAAC
TTAATAGATTTAAATCTAAATGTTTCATCAGAGAAACAAGCAAAACTTATTTGCAATAACTGGAAAAATA
ATGCATCTTATATGTATGCCGAAGTTATCGATTTACTTATAAGAGACATACATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3712506-3711640 hypothetical protein CDR20291_3109 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATCTATATTTCTAACTACTTATCAAAGAGTATTAGCATAGTTGATTATTCTACACTTGAACTAG
AAAAAGAAATAGTATTAGAAGATAATATATATCCACACCATTTTTGCATAGAAAAAGAAAAAAATTTAAT
ATACATACCTAGTTCAAGTAATGGGATACTTTATGTCTTAGATTTAAGTAATGATAAAATAATTGATACT
GTCTCTATAGGAGGAAGTCTTAGTCAAGTTGTACTTAGTGATAATGAATTGTTTGTGGCAAATGAAGATT
CTAATAGTATATATGTACTAGATAAAAACACATTAAATCCAATAGGAATTATTGGAGTTGATAATATGCC
ACATGGATTTGACTTTGATAGAGAAAGTAAAAAATTATATGTACCGTGTATAAACTCGATAGTATGTATA
GATACAATTAATAAAAATATACAAAAGAAAATAAATATGGACTTTAGAGCTTGGCATATAGAGCTTGATA
AACAAAAGAAAGAAATGTATATATCAACACTTGATGGAAAGCTTATAATAATAGATGAAGTAAGCATGGA
TATAAAAAAGGTATTATATGAATTTTTATTACCAGTAGAAATAAGATTTAATTATAGTGGCAAAAAAGTT
TATGTTGCTGATTTGGGTTATAATAATGTAAGAATTTTAGATTATACAACGAGTAGATACATTGGAAATA
TTGAAATAAATGGGATTCCTCAAGGCTTAGAAATATCTAAAGATGAAAAGCTACTATTTGTATCAGATAC
ACAAGAAAATTCAGTAAAAGTTTATGAAACTGCAAACAATAAATTAATAAAAGAAATCAAGGTAGGAAAA
GAGCCTACAACTATAATTTGTTTGTAG
>ref|NC_013316.1|:3712654-3712899 hypothetical protein CDR20291_3110 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTAACATTTAATCCAAGTGGTGTATGTTGTAGAGAAATGATTTTTGAAGTTGATGAAAATAATG
TGATTGTTGATGCTGAGTTTATAGGAGGATGTAATGGTAATTTATCAGGACTTAGAAGCTTAATAATCGG
CCAAAATGCTCTTGAAGTTGCTGATAAATTAAACGGTATTGACTGTGGTGGAAAAGGTACTTCTTGCCCA
GACCAATTATCTAAGGCTATACGTCAATCTATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3714311-3713013 putative folylpolyglutamate synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATATGAAGAAGCATTAGAGTACATATCACAAACTAATAAATTCGGTATAAGATTAGGATTAGAAA
ATATCGGAAAGTTATTAGAATTATTAGGAAATCCACAAGAAACTTTGAATATAATACATGTAGCTGGAAC
TAATGGAAAAGGTTCTGTGTGTTCTTTTGTTTCTAATATACTAAGAGAGTGTGGATATAAAGTTGGTTTA
TATACATCTCCATATTTAGAAACTTTTACTGAGCGTATAAGAGTAAATGGACAAAATATACCACAGGATG
ATGTTGCTAGAATAATTGAGTTAATAAAAGAAAAAATAGAGATTATGGTAAAAGAAGGCTATGCATATCC
AACAGAATTTGAAGTGGTTACTGCAATGGCATTTTATTACTATTCAGAACAAAAGGTAGACTTTGTGGCA
TTAGAAGTTGGTTTAGGTGGCAGATATGATGCTACAAATATAATAACAAAATCACTTGTAAGTGTGATAG
TATCTATAAGTTTGGACCATACAGGTATACTTGGAGATACAATAGAAAAAATAGCGTACGAAAAGGCTGG
AATAATAAAGGAAAATGGAGTAGTACTAGTATATGACCAGACTGATGAAGCGAAGGATGTTATAAAGTCA
GTTTGTAAAGAGAAAAAAGCTAAATATATAGAAGTTGATTTTGATGATATAAACATAAAAAAATCAGATA
TAAATTCTCAAATATACGATTGTACTGTAATGAAAGAAACTTATAGAGACCTTGAAATAAAATTGATAGG
TGAACATCAAATAAACAATTCTATCTTGGCAATTAGTGTAATAAAATATCTAAAAGACATAAATAAATTA
GCAAATATAAATGAAGAATCTATAAGAAAAGGACTTATAAATACTAAATGGCCAGGAAGAATAGAAAAGA
TAAAAGAAAATCCAATTTTTATAATAGATGGTGCACATAATGAAGATGGAGCAAAATCTTTGGCAAAAGC
ACTTGATAAGAATTTTAAAGGTAGAAAATTAACCTTATTAATAGGTATGTTAGAAGATAAAGATATTGAT
AGTGTTTTAGAGATATTGTTGCCACATTTTAATAAGGTAATAACAACAACACCAAATAACCCAAGGGCCA
TAAATTCAGATATATTAAGAGAAAAAGTATTAAAATATGTAGATGATGTAACATCAAAGCATGAGATAGA
GGATGCAGTAAATTATACATTAGAAACATCAAGTGAGGATGATATTATAATAAGTGCAGGTTCATTATAT
ATGATTGGTACAGTGAGAACTTTAGTAAAGAAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3715475-3714444 putative serine protease [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGAATATATGTGATATGAATAATAAAGTTAAGGTTGCAGTATTAGATACAGGAATAGACAAAGAAC
ATGATTACTTAAAAGATAATTTAGTTGGAGGAATTGCTTTTGAATGTATGCATGATTATATCTTTATATC
AGATAAATTTGATGATGAAGATGGTCATGGAACTGCTTGTGCATCAATAATAAAGAAAGAGTATGAAGAT
GTAGAGTTATTTGTAATAAAAATTTTGAGAAAAGATGGTATTACAAATATAAAAGTTCTTGAAGAAGCAT
TAAGATACCTTTTAGACACTAACATAAGATTAATTAATTTAAGTTTATCAGTCATAGGAGTAGAGAGTGT
TAAGGGCTTATTTGAAGTTTGTTACGAATTGTTTAGAAAAGGAAAAATAATAGTATGTTCACTCGCTAAT
GATTTTGATTTAAGTTATCCAGCTATGTTTAACAATGTTATAGGTGTAAGAGGATTTACTTTAGATGGAG
ATGATTCATTTTGGTACAACAAAAAATATGATGTTCAATGTGTTATGGATAGCAATTCATATATAAGTTG
TGATATAAATAATTCCTATAGATTACCACCAAAATGTAATAGTTATTTATCAGCAAAGCTTACTGGTAAA
ATAGCTAAGATATTATCAGAAAAACCAGGCATAACAATATCTGATTTAAATGATAAGCTTGAATCATTAG
CAACTAGAAATCATTGGGATAGTTGTGATTTTGATGAGTGTAGTAGAATTGTAAACTTTAAATTGGATTT
GTATGACAAAGAAAATGCTCTTCTTATGAAAGTTGCTGACGTTGTTAGGGATTGTTTAGATATTGAAGAT
AATAATGAAAAACTCTTTAAGGGTAGCCTTTTTAATAAGGAGATAGGTTTGGTTTATGATAATTGTTTTA
ATCTGTTGAAAAAGCTAGAGCATAGATTTGACATAAAGTTTAATTATATGGACATCTCAAAATATGACTT
AGTTTCAATATATACACTGACTGAATTAGTGGAAAGATATAAAAACTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3717231-3716521 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGTTCAGGGTAGTTATATGTGATGACGAAAAAATACAAAGAAGCATACTAAAAGAGTTTACAAAAAAAC
TTTTGTCTGAAAGATGTCTAAATTATCAAATACTGGAATTTTCCTGTGGAGAAGATTTAATATCCAAATA
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AAAATAAGAAAGTTTGATGAAAAAGTAGAAATTATATTTACAACAGCTTTTTCAGAGTATGCCCCCCAAG
GTTATGAGGTTCGTGCTTATAGATATTTAGTAAAGCCTATAGAGTATAGTAACTTTGCAATGGGTGTAAA
TCTTTGTATTGATAACCTTCAAAGAAAGAAGGAGCGTTATATAGTTTTAAATAGTAAAAAAGGATTTAAT
AGAATACTGATAGATTCTATTTTATATGTTGAAACTGTAAAGAGAGATTTAGTTGTACATACAATAGGTA
GAGATTATAAAGCTAATATGAGCATGAAACAAGCAGAAAAATTACTGTGTGAAAATGGCTTTTTTAGATG
TCATACAAGTTTTATTGTTAATTTAAGAAGAATAGAAGATCTTAGGGATAATATGATTACTATTAATGAA
CAATTTATACCTATAAGTAAGTATAGACTTAAAGATTTAAAAGTAGCATTAACAAGCTTGTTATGTGATA
TAATGTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3720322-3717656 valyl-tRNA synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATACGAATTTATCAAAAACTTATAACCCAAAAGATTTTGAGGCTAGGCTATATAAAAAATGGA
TGGATGAAGGGTATTTTAAATCTAAACCAAATCCAGATAAAAAACCATTTACAATAATGATGCCACCACC
AAATATAACAGGGCAATTGCATATGGGACACGCTCTTGACCATACACTTCAAGATATATTAATCAGATGG
AAACGTATGGATGGATATGAAGCTTTTTGGCTTCCAGGAACTGACCATGCTTCTATAGCAACAGAAGTTA
AAGTTGTTGAAAGAATAAAAAAACAAGAAGGCAAGACAAAGTATGAAATAGGTAGAGAAGAATTTTTAAA
GAGAGCCTGGGAATGGAAAGATGAATTTGGAGGAAAAATATCTAATCAGCTTAAACAACTAGGTGATTCT
TGTGATTGGGATAAAGAAAGATTTACTATGGATGAAGGGTGTAATGAAGCAGTTATAGAATTTTTTGTAA
GCCTATATGAAAAAGGTCACATATACAGAGGAAATAGAATAATAAACTGGTGCCCAGATTGCAAAACTAC
TTTATCAGATGCAGAAGTTGAACATGAAGAACACGACGGAAACTTTTATCATATAAAGTACCCACTAAAA
GATAGTGAAGACTTTTTAGAAATAGCTACAACTAGACCTGAGACAATGATAGGAGATACTGGTATAGCAG
TAAATCCAGAAGATGATAGATATAAACATTTAATAGGAAAAACAGCAATACTTCCATTAGTAGGAAGAGA
ACTTCCAATAGTTGCAGATAGTTATGTTGATTTAGAGTTTGGAACTGGTGCAGTTAAGATGACTCCAGCA
CATGACCCTAATGATTTTGAAGTAGGATTAAGACATAATCTTGAGCAGTTAAATACTATGAATGAAGATG
GAACTATGAATGAAGTTTGTGGAAAATATGAAGGTATGGATAGATTTGAGTGTAGAAAAGCTATCGTAGC
AGACTTAAAAGAACAAGGTTACCTAATTAAGATAAAAGCGCATAATCATAATGTAGGAACTTGTTATAGA
TGCCATACAGTAGTTGAGCCTAGATTATCAGAGCAATGGTTTGTTAAGATGGAAGAACTTGCAAAACCAG
CTATAGATATTCTTAAAAAAGGAGAATTAGAATTTGTTCCAGATAAATTTGATAAAACTTATTTACAATG
GCTAGAAAATATAAGAGATTGGTGTATATCAAGACAATTATGGTGGGGTCATCAAATACCAGCTTATTAT
TGTCAAGAGTGTGGAGAAATAGTAGTTGCTAGAAAAATGCCAGATAAGTGTCCTAAATGTGGAAGCACTC
ATTTTAAACAAGATGAAGATGCCTTAGATACTTGGTTCAGTTCTGCATTATGGCCTTTCTCTACTCTAGG
ATGGCCAAATAAGACTGAAGCTTTAGATTATTATTATCCAACAAGTGTACTTGTTACAGGATACGATATA
ATATTCTTCTGGGTAGTTAGAATGGCATTTGCAGGTATGTTCTGTATGAATGAAAAGCCATTTGACCATG
TTTTGGTTCATGGATTAGTAAGAGATTCTCAAGGTAGAAAAATGAGTAAATCTTTAGGAAATGGTATAGA
CCCATTGGAGATAATCGAGCAATATGGAGCTGATGCCCTAAGATTTACATTAACAACTGGAAATTCCCCA
GGAAATGATATGAGATTCTATATGGAAAGAGTAGAATTTGCTAGAAACTTTGCAAATAAGTTGTGGAATG
CATCAAGATTTGTATTTATGAATATTGATGAAGATATAATTAAAAACATGACTAGAGAAAGTGTTAAAGA
GGACTTAACTCTAGCTGATAAATGGATAATATCAAGAGCAAATAATATTGTAAAAGAAGCAACTAATAAC
ATGGATAAGTTTGATTTAGGAATAGCACTTCAAAAGATATACGATTTTACTTGGTCAGAATACTGTGACT
GGTATATTGAAATGGTTAAACCTAGATTATATGGGGAAGATGCAAATGCTAAATCTGCAGCATTATATAC
ATTAACTTATGTTCTTGAAAAAATATTAAAATTATTACATCCATACATGCCATTTATAACAGAGGAAATA
TATACTCATCTTCCTACTGTTGAAGGATGTATAATAGTATCTGAATGGCCAAAATATAATGAAGAAGATA
ACATGGCTGAAGAAGAAGATATGATGAACTTATTGATGGAAGGTATAAGAAGTATAAGAAATGTGAGAGC
AGAAATGAATGTACCACCTTCTAAGAAAGCTAAATTGATAATAATCCCAAGTGAAGAAAAAATAGAAGCT
ATTGAGCTTGGTAAAGACTATTTTATAACTCTAGCATCTGCTTCAAATGTAGAGATAGCAAAAGATAAAT
CTAATGTTCCAGAAGATGCAGTTGGAGTAGTTATTGATGGTGTTGAAATATTTATACCTCTTAATGAATT
AGTTGATTTTGAAAAAGAAATTGAGAGATTGTCTAAAGAAAAGAAAAAGTTAGAAGGCGAAATAAAGAGA
GTTAATGGAAAGCTTGCAAATCAAGGTTTCTTAGCAAAAGCTCCTGAAAGTTTAATTGAAGAAGAAAAAG
TAAAAAAAGAAAAATTTGAAGAGATGATTAAATCTGTTGAGGAAAGATTAACAAATTTAGAATCTAAAAT
AAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3721788-3720961 putative polysaccharide deacetylase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATTAAAGATAATAAGGCTGTTTTTCATGTATTTATAAGGATATTTCTTATAGCTGTTTTAATTT
TAACTGGAACATTATTGGAGGAAAAAATTAATAATGTTCCAGTTGAAAATATAAGTTCAAAAGGTGAAAA
TACACTGGAACTGCTTTCTCAAAGTAATACTTTAGGAGAAATCATATACAAAGCATCTCAAGAAGAAACA
AAAGGTCCAGGGGCTACTTCTGAAAAAGTAGCATACATAACAATAGATGATGGTCCATCAAAATATACAA
ATGCACTACTTGATATTTTAAAAGAAAATGATGTCAAAGCGACATTTTTTATGCTTAATCAAAATATGAA
AAATCACAAGGAAGAAGTAAGGAGAGTCTTGGAAGAGGAAAACTCAATAGGTTTTCATAGTGTAAGTCAT
GATATACATAAGTTATATAAAAGCCCAGAAGTAACAGTTGGGGAATTTAATACATGCAATAATACTCTAC
AAGAAATAACTGGTCAGAGTTCAAAATTAATAAGATTACCATACGGAAGTAAACCATATATGCCAGAAGG
TTCATATAATAAACTTATGGCAAATGATTATTTAATTTGGGACTGGAATTTGGATACACAGGATTGGAAG
TCTTCTACAAGTCAGATAGTAAGTAATATATTATATTATGGAAGAAAAAGAGATGAATTAGTAGTATTAA
TTCATGAGAAAGAGCAAAGTTTAAATGCTTTAAATAATATTATAAGAATCTTAAAAGAGAGAGGATATAC
AATATTGCCAATTACAGAAAATATAACACCTAAAAATTTCTGGCAAGAAAACTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3723290-3721836 iron-only hydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGTACTATTTTTTATGAATACTAGAAATGACAATTCTAAAATACTAGAAATATATAAAATGAAGC
TTTTTGGCGAACTTGTAAAAGCAGTGTGGAATGATGATATAGAGGATATTGAAAACTTACCTAATAAAAT
TTTAAATGAAGATTTAAAGGATAATTTAAATAATTATTTTAGTGGAAAATTTGATAAAGATACTATGGTA
AATTTAATTAGGGTAACTATGGGATTGGATGTGACAGAAGATACAGATAAAAATTTAAAAGAGTCACTAC
ATGAAGCTGTAAATTTAGATGAAGTCAAAAGACCAATAATATCTGTAATATCAGATGCTTGCAAATATTG
TGATGAAAATAATAAGGAAGATGAGTCATGTAAGATAAGAAGTAAGCATATTAATTGTAATGAGGAAGAT
GTATGTAGTGCTTGTGGTGATTGTGTATCAAGATGTAAGTTGGGTGCAATTTCAGATAAAATAGAATTTA
TACCAATGATAAAATTGTTAAAAGATATAAAGAGCCCTGTATATGCAATAGTTGCACCAGCTTTTGTAGG
ACAGTTTGGGAAAGATGTAAGCCCTGGTAAATTAAGAACTGCATTAAAAAAGATAGGATTTGAAGATATG
ATAGAAGTTGCTTTGGCAGCAGATATGCTTACTGCAAAAGAAGCATATGATTATTATGAGCATATGAAAA
AGGACGAAGAAGGATGCTTTATAACTAGTTGTTGCTGTCCTATTTGGGTTAGTTTGATACAAAATAGTTT
TCCTCAGATATTGGAGAATGTATCACCATCCGTTTCTCCTATGATTGCTTGTGGGAGAGCTGTAAAAATT
TTAAATCCAGATGCTAAAGTTGTATTCATAGGTCCTTGTATGGCAAAAAAGAAAGAAGCAATGTTAGAAG
ATATAAAAGATGCAGTTGATTTTGTGCTTACATTTAAAGAGTTGCAAGAAATATTTGATGCATTAGAGTT
AAATCCAGCAATAATGGATGAGAGTAATAGAGTAGAGGCGTCCCTTTCAGGTAGAGTTTATGCTAGAACA
GGAGGTGTAAGTAAAGCAGTTAAGTTATCAGTCAGAAGAATTGACAAAAATATAAAATTTGAAGAAAAGG
CATTTGAAGGAACAAAAGAGTGCATGGACGGTCTAAAGAAAGTTCTAAATAAAGAAATAGAAGCTACATT
TATAGAAGGAATGGGGTGTGTAGGAGGCTGTGTAGGAGGTCCGAAGCGTATTTTAAGTGTGGAAGAAGGT
ACTAAGAATGTTGATGAATATAGTGAAAGTACGAATATGGAAACTCCATTTGATAATTTAAATGTATTAC
AATTTTTAACTTCTTTGGGAATCAAAAGAGTAGAATCTTTAGGAGAAAAAGAAGAAGAAAAGGTTAAAAA
AATATTTAGTAGAGATATAAAAAGTAATAAGAAAGAGAATAAATATAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3724213-3723359 hypothetical protein CDR20291_3117 [Clostridium difficile R20291]
ATGGGTATGAGGACTATAAAAACAGGAATTAGTGTCACTTTATGTATGATTCTTGGTAACTATCTAGTAG
AGAATATGTTTTATTCTCTAGTAGCATGTATAATTTCTGTTCAAGATACGGTAAAAGGTTCTTTAAAGAC
AGGAATCAATAGAGTGGAAGGTACTATTTTAGGTGGTATAATAGGATTCATATTTGCCATCATTAAAGCT
GGAGACCCTTTTTTATGTGGTCTAGGAGTAATGTGCTCAATATATTTATGCAATCTGTTTAAAATAAAGT
CAGTAGTAGTTGCCTGTGTAACCTTTCTGGCTATACATCTAGGTGTAGGAAATAGTGACCCTGTGTATTA
TTCTTTACATAGAGTGTTAGATACATCTGTAGGTGTTTTGTTTGGAGTACTTGTTAATTATTATGTGGCT
AGACCAAATTATCTAAATAGTGTTATAGATGAATTTAAAAAGATAGAAGAACTTTCAATGTTACTTATTG
AAGATAAAATTCTTAGAAAAGAAAATTTAAATGTAGAGAAATTTGAAGAAGAAGTAGAAAAATTAGAAGA
AATATATTCAAAACTTATTGATGAGTTGGATTATAGTTTGAGTGAAACTAATATAGAAAAAATTGAGAAT
GCCTTAAGGATATGTAGAGAAATACATTTTCATATGCAGTCTATAGAGTTACTTGAAAATAAACTTTATT
TGAAAGAGCATACATATAAATACCTTAAGAAAACATATAATGTGGATAAGCTAGACTGGAATATAGATGA
AGAAAAAAGCCCCGTATTCAACTATCATCTAATGAAAATAATGATTGAAATAGAGTTGTTGAGAAAGCTA
AATAAATCATATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3725039-3724386 putative phosphate transport system protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGTCAATAATAGTTTAGATATAAGTATTGATACTTTAAAAGAACAAACAGTACTTATGATGGAAAAAT
GTGAAGAAGCAATAGAAAAGTCTGTGACTTGTATGATAGAGAAGGATTTAGAGGGTGCAAGAAAAGTAGT
AGAAGATGATGAAGAAATAAATAAATTAAGAGAAGAAATAAGAGATAAGAGTATAGAGCTAATAGTATTA
AAGCAACCAATGGCAAGGGACTTAAGATTTATTTATTCATTAGGTAATATATCGATAGAGTTGGAAAGAA
TAGGAGATTATGCAGCAAATATAGCTAGAGAAATGTTGAAGATAGGTGGAGAGGCTTATATAAAAGAGCT
GATAGATATTCCTAAGATGGCAAAAGAATGTAAGTCTATGATGTCTCAGACTAGAGAAGCTTTAATCTTA
TTTGATGCAAGTATAGCTTATGATGTTGGAACTAAAGATGATATTGTAGATGGATTGTATGAACAAGTAC
AAATTGATTGTTTAAAAATAATGCATGAAAATTCAAATACTATAGACCAAGGAGTAAAACTTCTACTTAT
AGGAAGATACCTTGAAAGAATTGGAGACCATATAACAAATGTATGTGAGAAGATAATTTTTGCAATTGAG
GGTAAAATGGTTGAGATAGGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3725831-3725067 phosphate import ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATTAATCGATAAGATAAAAATGAGTGTAAAAGATTTGGATTTATTTTATGGTGATAAGCAAGCAT
TAAAGAAAATAAATATGGATATAAAAGAGAATAAGGTTACTGCTTTAATAGGTCCATCTGGATGCGGAAA
ATCAACTTTTATAAGAACGTTAAATAGAATGAATGACTTAATCGAAGATGTAACAATTAAAGGAAACATT
TCTGTTGATGGAGAGGACATATATACCTCAGATGATGTTATAAATCTTCGTACTAAAGTAGGAATGGTAT
TTCAAAAACCAAATCCATTTCCTATGAGTATATATGATAATGTGGCATATGGTCCTCGTACACATGGACT
AAGAGATAAGAAGCAATTAGATAAAATTGTAGAAGAAAGCTTAAAAGGTGCAGCTATTTGGGATGAGGTT
AAAGACAGGCTTAAATCATCTGCACTAGGACTTTCTGGTGGTCAACAACAGCGTATATGTATAGCAAGAG
CAATTGCTATGAGACCAGAAGTTATTCTTATGGATGAACCTACATCTGCTTTAGACCCAATTTCAACATT
AAAAGTAGAGGAACTTATAGAGGATTTAAAAAAAGACTACACAATAGTCATAGTTACACATAATATGCAA
CAAGCTGCTCGTATATCAGATGAAACAGCTTTTTTCTTAAATGGAGAGGTTATAGAATTTAGCGATACAA
AAACTATGTTTACCACTCCTGTAGATAAAAGAACAGAAGACTATATAACAGGTAGATTTGGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3726674-3725850 putative phosphateABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAAGTTCAAAGAGAATCTATTGAAGTCATTAGTATATCTATCAGCACTATTTACAATAGTATCAT
TAGTCATTATAGTGGGATTTATATTTATAAAGGGAATTGGCAACATGAATTTTAATTTCTTATTTAGCAA
TTATTCAGCATCAGGTGATGGTGGTATACTTCCAATGATAATTACAACATTATATACAGTAGTAGTTTCT
ATAGTTGTAGCAACTCCTATAGGAATATTGGCTGCTATATATTTACAAGAATATGCTAAAAAAGGAAAAG
CAGTTACAGCTATAAGATTTGCAACTGAAAGTTTATCAGGGATACCATCTATAGTATATGGATTATTTGG
AGGAATTTTCTTTGTAGTTACATTAAAAATGGGATATTCCATAGTTGCAGGTTCACTTACAGTTGCAATA
ATAATATTACCAGTAATAATTCGTACAACAGAAGAAGCTTTAAAAACAGTTCCTCAAGCTTATAGAGAAT
CATCATTGGCATTAGGAGCTACAAAATTTCAAACTTTATATAAGGTAGTACTTCCAAGTGCAATACCAGG
AATCTTATCTGGAGTAATCTTATCAGTTGGTCGTATAATTGGAGAATCAGCTGCAATATTACTTACAGCA
GGTACTGTAGCCAAGATGCCAGGTGGAATATTTGATAGTGCAAGAACATTAACTGTACACTCATACTTAC
TGACTAAAGAGAGTGGAGATATAGCAACAGCAGCCAGTATAGGAATTGTTTTAATAGTAATTGTATTAGC
ACTAAACATGCTAGCAAGATTTGTTGCTAAGAAATTAAATAAAGCTAATTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3727593-3726676 putative phosphate ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATAGTAAAATCTAGATTAGTAGGTTTAGAAAAAAATGACAATAATGGCAATAAGACAAAATACGTAA
TTGAAAAAGTAGCAAAAAATATTTTTCTACTTAGTGCTTTAGTAGCAGTTGCAAGTTTACTTTTGATAAT
AGGATTCGTATTTTATAAAGGCTTAAGACCATTTATATTTGAAGGATATTCATTTATAGACTTTTTAACT
GGTGCAGATTGGGTTCCTTCTGCCAATAAATTTGGAATATCATCTATGATAGTAGCATCAATATTTGCAA
CACTTGGAGCACTTGTGATAGGAGTACCTGTTGGTATATTAACCTCTGTATTTATAGCAGAAGTAGCACC
TAAAAGATTAGCAAAAATAATGTCACCAGCAGTTGAACTTTTAGCAGGTATACCTTCAGTATTATATGGT
GTATTTGGTCTTGCAGTGATAGTTCCAACTATACAAAGTATATTTAATCTTCCAAAAGGTCAAAGTTTGT
TAGCAATAGTAATAGTATTAGCAGTAATGATGTTACCAACAATAATATCTGTATCAGAAACAGCAATAAG
AGCAGTACCAAAAGCATACAAAGAAGGTTCATTAGCACTTGGTGCATCAAAAATAGAAACAATATTCAAA
GTTGTACTACCTGCTGCGAAATCTGGAGTATTAGCTGCAGTAGTATTAGGAGTAGGAAGAGCTTTAGGTG
AAACAATGGCAGTAATACTTGTTGCAGGAAACTCACCAGTTATGCCAACTGCAATAACAGATAGTGTAAG
ACCACTTACAACTAATATAGCACTTGAAATGGGATACGCATTTGGTACACATCAAGAAATGTTATTTGCA
ACTGGAGTAGTATTGTTTACATTTATATTAATTTTAAACTTAGTTTTAAATAAACTTTCAAATAAGGCGG
TAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3728730-3727975 hypothetical protein CDR20291_3122 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGATTGAACGACAAACTTCCAGTGCACAAATGAAAGCTCAAGAACTTTATAGAAAAGTAGATACTC
CATTTGAGATATACCCAGGTTATTCTAAAGATGCTTTCGATTATATAATATTTTACATTTTTATATTATT
AATTATATGTGTTGCAATTACTGCACCTACTTTTTCTGGTGAGTATCAGACACAATCAGATAGCATCCTT
CGTTGTACGAAACATGGACATACTCGTCTAGCGTTTACTAAAATATTAGCTCTATTTTCTATATTTATAG
TAATGTTTGTTGTATGTATTTCTATCCATTTGGCAATTTCTGATTTAGCTTTTGGTACTGAATGTTTGAA
AACCTCATTTCAAATGTTGTTTTCTGTCATTAGTCTAGTAAATATAAATTTACTACAAGCACAGATTCTT
ATAGCTATTGGTGGTCTAATTTCAATACTTGCAATGGTTAGTTTAACATTATTTTTATCTGCAAAATGTA
AGGATTCTCTTACTTCTATGCTGATTGCTTTTTCTATTTGCTTAATTCCTATGGGAATAGGTGTTAGTTG
GATTGGATACCTATTACCACCAGGGGGAATTGGTCTTAAGATTAGTTTATTATATCAAATGACATCATTT
AATTTCTTACACTTAGGAGGTATGAGTTTTTGGACACCACACATTATACTGTTTTTCTCAGTGATAGAAA
TACCTATTTTTATATTTTTGGCTATTCGTACCTATTGCAAACATCAAGTATCATAA
>ref|NC_013316.1|:c3730098-3729211 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATTAAAAATTGAACATGTGACAAAAAAATTTAAGGATAAAATTGCTGTAGAAGATGTTTGCCTTA
CCTTAACACCAGGTGTGTGGGGATTTCTAGGAGCAAACGGAGCAGGTAAAACTACCTTGATGAGAATTAT
TACAGACATTATGAAACCTACCAATGGCAAAATTCTGTATAATGGAAAAAATATTTATATAATGGGTGCT
GAGTACAGAAATTTACTGGGATTTTTACCACAAGAATTTGGTTTCCCACAGGATTTTTCTGTAAAAGATT
ATTTAGAATATATAGCAGCATTGAAAGATGTACCACCAAGAGAAGTAAAAGGAAAAATTAATAATCTATT
GGAAATTCTTACATTATCTGATGTAAAAAATAAAAAGATTATTAAATTATCTGGTGGAATGAAACGACGA
GTGGGAATTGCACAAGCCATGTTAAATGACCCTAAAATCCTTATAATGGATGAACCAACAGCAGGGCTTG
ACCCTGGTGAGCGAGTGAGATTTCGTAATTTTATTTCAGAATTTTCTCATAATCGTGTTGTCCTAATATC
TACTCACATTGTATCTGATATTGAGTACATATCAACTCAAAATGCTATTATGAAAAGTGGAAAAATTCTT
GATGTGGGAACAACCGATAAACTGGTTAAGAAAGTAGAGGGCAAAGTATGGGAATGTCTTATATCAAATA
GAGATATTTCAAAATATGAAATGAATTTACGTATAATCAATCAGCGTAGTGAAAAAAACAATCAAGTATC
TATTCGTTACTTGGCAGAAAAGTCACAAATTGATAACTCTATTGCTGTTGAACCACGACTAGAAGATTTA
TATTTATGGTTATTTCCAGAAGCAGTTTATAGTAAGGAGGGGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3731418-3730243 sensor protein [Clostridium difficile R20291]
TTGGGGTGTTGGTTACAAGATTTGACACCTATTTTTCTTGTCAAGAAGGGATGTAGTATTATGAAAAAGA
TTAATAATTTTACTTATAGGAAACTAAGAGATAAATATAAATTTATAAAAAGAGAAAAAAATACAGAGGC
GTATTTAAAGTATAAATTATATATAATGTTAGCTATCTATACAGGTATAGTATTGGTTTTAATGTTTATG
GCTGATTATACGTTTTCAAATTTTTCAAATCCTCTTGTTAAATGGCTTAAGTTGAGAAGAGATGTATTAT
TTTTTTTGGTTTTTATAATTGGATATATCACTATTTTCAATTTTTATTGGAAAAAACCATGGAATTATTT
AAGAGAAATCATCAATGCAACACATACTATTTATCAACAAAATGATGAATTGGTTGAACTATCTAAGCCA
TTAAAGGAAATAGAGCAACAAATGAACCAAATTAAGATGTCTGTTTTGTTAAGTCAACAAGCAGTGAAAG
AGGCTGAAAATAAAAAGAATAACCTTGTGATGTATCTAGCACATGATATAAGGACACCACTTACTTCAGT
TATTGGGTATTTGAGCTTATTAAAAGAAATACCTAATATGGATAATTCTCAAAAATCTAAGTATACTGAA
GTTGCACTTGACAAAGCACAATATTTAGAAAAACTTATCAATGAACTTTTTGAAATAACACGATATAATT
CTAATCAAATCAAAATTAATTTCGAAAAAGTAGACCTATATTATATGTTACTTCAATTAAAGGATGAATT
TTACCCATTGCTGTCTGAAAAAGGAAATAGAGCCATTCTAAAAGCAAATGAAAGTTTAACAATAAAAGCA
GATTCTGAAAAACTTGCAAGAGTGTTTAATAATATCTTGAAAAATGCTATTGCTTACAGCTATCCTAATA
CAGAAATTATTATCTCAGCGGTTCATAAAGACAGCAAGGTAGATATTGCTTTTAGAAATTATGGACAGAC
AATTCCAGAAGAACAACTTTCTGCTATATTTGAAAAGTTCAATCGTTTAGATGAAGCTAGAAAATCTGAT
ATGGGTGGTGCAGGTTTAGGGCTTTCTATAGCTAAGGAAATTATAAATTTGCATGGTGGTGATATTACTG
TTCAAAGTAAAGATGAAGTCACAACATTTACTATATCGCTTCCTACATCTATTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3732092-3731394 hypothetical protein CDR20291_3125 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTGGAAAAATTTTAGTTGTAGATGACGAACGTGATATAGCTGATTTAATAGAAGTCTACCTTACAA
ATGAAAACTATATTGTTTATAAATTTTATTCTGGTCTTGATGCACTAAACTGCATTAATTTAAATGAATT
TGACCTTGCAATTTTAGATGTTATGTTGCCAGGAGTAAATGGATTTTCTTTATGCCAAAAAATCCGAGAA
AAATATACTTATCCAATCATTATGTTAACAGCTAAGGATGAAGAAACAGACAAGATTACAGGCTTAACTT
TAGGTGCAGATGATTATGTTACTAAACCTTTCCGACCTTTGGAACTTGTTGCTAGAGTGAAGGCACAGAT
TAGAAGATATAAGAAATACAGTGGAAGTTTACAATCTGGTGAAGAACTTTCACATATTTTTTCTTTTTTA
GGTCTGGAATTGAATACCCAAACATATGAATGCCATTTAAATGGTAAAGCTCTTTCACTTACTCCAACAG
AGTTTTCTATTCTACATGTATTATTGAAAAATAAAGGCTCTGTGGTAAATTCAGAAAATCTTTTTCATGC
TATCTGGAAAGATGAATATTACAATAAAAGTAACAATACTATAACAGTTCATATTCGCCATCTTCGTGAA
AAATTAGGTGATACTGTAGATGAAGCAAAATATATAAAAACAATTTGGGGTGTTGGTTACAAGATTTGA
>ref|NC_013316.1|:c3733154-3732474 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAACTAAGATATTGATAATAGATGGAGACAAGGATAATTGCCAGAAGCTAAAAGGATTTCTGGAGG
AAAAAGAAATAAGTATAGATTTAGCATATAATTGTGAAGAAGCTATTGGAAAAATATTTAGCAATAAATA
TGATTTAATATTTTTAGAAATAATTCTAACTGATGGTGATGGATGGACTCTTTGTAAAAAAATTAGAAAT
GTAACTACTTGTCCAATTGTTTATATGACTTATATAAATGAAGAACAAAGCATTTTAAATGCTTTAAATT
CTGGCGGAGATGATTACTTAATAAAGCCTCTAAATTTAGAAATATTATATGCAAAAGTAAAAGCTATTTT
AAGAAGAATGAACTCATATGTAAATAATAATGAAAATAATACAAAATTAGAGGAATATAATAGAACTAGT
GGAGTAATAAAGTTAGAAGACAAAATAATAAAATTGACTCCAACAGAAAATAAGCTGTTAAACTTTTTTA
TAGAGAATCCTGAAAAGACTCTGACTACTAAAGAGATATATGAACATGTATGGATGAATGAGTACTTAGA
GGATAACTATAGTGTGGTAGTTGCAGTGAATGGATTAAGAAAGAAAATAGAGAAAGATTATAAAAATCCT
CAGAAAATTATAACAATAAGAGGAGCAGGATATTATTTTAATAAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3735219-3733204 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGTATAATATACTAAAAGGAACTCTCATTGTATTGATAGTCTCTCTGTTGGCAATAGCAGGAT
TAAATCTTCTGTATAAATATGATAATAAATATACATATAAGTCTATTAGAGCAAGTAATGGAATTTTAAC
TATAGATAATGATACTTTCACTAAAGGTAAACTTGTCTTTCTGATAGATGACTGGGAGTTTTATAATCAT
AAAATATTTAAACCGAATGATTTTACAGAGCAAGATATAAAACCAGAATATGTTTTTATAGGTCAATATC
CAGATTTTTCTATGAGAAAAGGGAATCAGTCACCATATGGGAATGCTACTTATCGTATGAGAATAAAAAA
TGAAGGTGAGGATAAGCTACTAAGTTTAGAGCTTCCTGAGATTTTTTCCGCAAGTGAAGTATGGATAAAT
GGAGAAATAGTTTCTAAATTAGGAGATGTAGGAACAGAAAAATATAGACCCAAAATTAAAAATTCAGTAG
TAAGTTTTATTGCAAAGAAAGATACAGAAATTATAATCAATGTATCGAATTTTTCACATTATTATAGTGG
TTTGTATTATCCGCCTGCATTAGGAGAAACAAAGGACATAAGTAATATGATGTTTTATCGATTACTTTTT
TATAGTATAATTTGCTTCACAACTTTTGCAATAGCTATATTTTCGTTGTCTGTATGGTTTCTTTCAAACA
AAAGTAAACTTTACTTATATTTTGGATGTATGTGTGTTTTCTTTGCCATCCATGTATCCTATCCCTTTGT
ACATTTGTTAGGACTGCCTTTGGTAAGCTTTACATATGCGGTTGAAGATTCGTCCTATTTTATGGTAGTT
TTATGTATTATTTGTATAAATGGAAGTATATCCAAAATAGAAGAAGATAAAGTGTATAGATTTTTAATTT
TACCATTAGGAATTACAATGAGTATCATATCTATAGTGATACCAATTATTCTTCTTCCATATGATATGTA
CTTTGTCAACATATATGGGAAATTAATAGACATATATAAATATATTGTATTTATATATATATTAATGTCT
TCGCTGGTTTCAATATATAAAAAGACATGCTCTGAGCATATAAGTTCTTATATTTTAGTTTCAGTAAACA
CTGTTTTTGGAATTAGCATATTATTTGATGCAGTTACTAGTAATAGATTTGAGCCTATATTTACAGGGTG
GCAAACAGAATATTGTGGATTTATAATTGTTATTTTATTTTCTCTTATGATGATAAACAGGAATAGAATA
ATAATAAAAGAGAATGAAAAACTTACAAGGAATCTTGAACATGAAGTTGAAGTGAGAACTAATGAACTTA
CAACATTGTTAAATGAACGTAAAAAATTCTTGGCAGATGTGGCACATGATTTAAAGGCACCTGTTTCAGC
TATACAATCATTTATAGACTTGATAAAGGTTGGTAATATTCATGTAGATGAAGAGACAAGAACCTATCTT
TATGCTATAAATCAAAAGTCAAATGAAGTACAAAATAGAGTACGTAGTTTGCAAGAATTTACATCACAAG
ATAAAAGCATTGGTATTAGTGAAAAAATATGTCTAAATGATTTTATTAAAGAGATATATGAAAATAACTT
GCCAGATACACAAGCATGTGGTGTAAACTTTGAAACTTACATATTGGAGAAAAAAATATATGCAAAGATA
AATAAAGAGATGCTTACAAGAGCATTTGAGAATTTAATTTATAATGCTTTGACATTTACTCCATTTGATG
GAAAGATAATTTTATCAATGGATAAAGAAGATGGATTTGCAATTATTAAAGTTTCTGATAATGGAAAAGG
TATACCTCCAGAAAATATACCAAAGGTATTTGACAGATTCTTTACAGAAAGAGATAATAATGAGCCAAAA
GGGCAAGGGCTAGGGTTATATATTGTCAAATCCATTATAAGAGAGCATGGCGGAGAAATCTTTGTAGATT
CAGAACTAGGAAAAGGAACTGTTTTTACAATAAAATTAAGTCTATGTTTTTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3735968-3735291 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAATTTACTGGTTGTAGATGATGATGTTGATATTTTAAATATAAATCAAATTTATTTTTCTAATA
TAGGTTTTAATGTATATACATCAGAGACTGCTAAAGATGCTATGGATATAGTAGAGCGTATAGTTTTAGA
CTGTATAATTTTGGATATTTCATTGCCAGATATAGATGGATATAAAATGTGCAATGATATAAAAGAAAAG
GTTAACATACCTATAATATTTTTATCTAATTATGAGCATGAAGAAGAAAAAGTTCGGGGATTTTTAGCTG
GGGGGGATGATTATATAACAAAACCTTATAGTTTAAAAGAACTTGAACTTAGAATATATGCTCGTATGAG
GCAGTACAAAAATATTACATCAGTTCCTAATGTGTTAAAGTTTTCAGCGTTAGTAATAAATGTAAATTCA
AGAAAAGTAACTTTTGATGGAGAAAGTATAGATTTAACTACTATGGAATTTGAAATATTATTGTTTCTAG
CTGAAAACAAAGAACAAGTATTTTCGAAGATAGAGATATATAACCAAGTTTGGAAAATGCCTGATATTGG
AGATCAACATACAGTGCAGGTTCATATTGCACAGATGAGAAAAAAAATTAATTCTTTAAGCAGGGAGCAT
CAATACATTCAAACCGTATGGGGAAAAGGATATAAGTTTGTACCATAA
>ref|NC_013316.1|:c3737706-3736864 putative phosphate ABC transporter, substrate-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAAAAAGAAAATAGGCGTTCTTTTAGCTAGTACAATGTTAGTTGGAGCTTTAGCAGTAGGATGTA
GTTCTAACTCAGGAGGTTCAGGTGATTCAGGAGATTCAAGCAAAGTTTCTGTTTCAGGTTCAACTTCAAT
AGGTCCTCTTATGGAAACTATCGGAGAAAAGTTTCAAGAAAAAAATCAAGGTGTTAGTGTAGAAGTACAA
CAGATTGGTTCTTCCGGAGGTATAAAAAATGCCATAGAAGGAACATCTGAAATAGGAATGAGTTCAAGAG
ATTTAAAAGATGAAGAAAAAAGTGCTGGATTAAAGGAAACTAAAATAGCAATAGATGGTATAGCATTGAT
AACTAATACTGCAAACTCAGTAAAAAACCTGACAATGGACCAAGTTAAAGGTATATATACAGGAAAGATT
ACTAACTGGAAAGAAGTAGGAGGAAATGATGCACCAATAGTAATAGTATCAAGAGAAGAAGGTTCAGGAA
CTAGAGATGGATTCCAAGAAATTGTAGGGTTTGATTCAGAAGAACTAACTAAAGATGCACAAATAAGTGA
TGGTTCAGGAAATATAAAAACTACAGTTGAAGGAAATGAAAATGCTATAGGATATATATCATTTGGATAT
GTTGATGAGAAAGTAAATAGTTTAAAAATAAATGATGTTGAAGCAACTGATGCAAATGTAATGGCTAATA
AATATCCAATATCAAGACCATTTATATTAGTTAATAAAGAAGATGGTTTGTCAGAAAAAGGGAAAGCTTT
AATAGATTATATATTAAGTGATGAAGGACAAGCACTTGTTTCAGAAAAAGGATTTATTAAAGTTAATCAA
TAA
>ref|NC_013316.1|:c3739742-3737958 putative endopeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAACTGATAGAAGTACAATAGAAGAAAAGTACAAATGGAAGATAGATAAGATGTACTCCAGTAAAG
AGGAAATTGAAAAAGACATAAGTAAAGTAAAAAATCTTATCCAAGAAGTAAAAGAATATAAAGGGAAGCT
TTCTGAGAGTAAGGAGAACTTATATAAAGTATTAAATATCTCTGAAAATGCATCTAGGATTGTTCAAAAT
TTATATGTATATACTCATATGAAACAACATGAAGATACTAGAATTAATGATAATCAAGGAAGAGCCACTA
AGACAGAAATGTTATCTACTGATTTAGGTGTGGCTACTTCTTATATAGTTCCAGAAATACTGGCGATAGA
AGAGAATAAGTTAAGTGAATACTTAAAAGATGAGAAGCTATCCTTTTATACAAAATATATAAAGGATATA
TTGAGAGATAAACCACATACTTTGAGTGAACGAGAGGAAGAAATACTTGCAGCTACATCAGAATTATCGA
CAATTCCAGAAAATGTATACGATATGTTAGCATATGCAGATATGGAATTTCCTGAGATAGAAGATGAGGA
GGGTAATAAGGTTAAGCTTTCTCATTCAAACTACTCTTTATTTATAAAAAGTAAGAATAGTAGAGTTAGA
AAAGACGCTTTTGAAGGTGAATTTTCAACATATGAGAAATATAAAAATACATTTGCCTCAACGCTTTATG
GTGGAATAAAATCAGAGATATTTTACGCAAAAACTAGAAAGTATAATTCAGCAATAGAAGCGTCTTTATT
TTCAGATGATGTAAGTTTAGATGTTTACAATAATCTTATATCAGCTATAGATAAAAGTATTCCTAATCTA
AATAAATATGTTGAGCTTAAAAAGAAATTTTTAGGATTGAATGAAATACACATGTATGATTTGTATGTTC
CTTTGACAGATAAATTTGACATGGATATACCATATGATAAAGCACAGGATATCATATTAGAGGCACTTAA
ACCTTTAGGAGAAAAATACTTGAAGGTCATAAAAAGTGCTTTTGATGAAGGGTGGATTGATGTATATGAT
AATGAAGGTAAAAAAGGAGGAGCTTATTCTTGGGGAAGTTATGATTCACATCCTTATATATTAATGAGCT
ATAAAAATGACCTTAATTCTCTATTCACTTTAATTCATGAATTAGGGCACTCTGTTCACAGTCATTATTC
AAGAACAAGTCAACCATTTTTATATTCGGACTATAAGATATTCGTTGCAGAAGTTGCATCTACATTAAAT
GAATTACTTCTTATAAATTATTTATTAGAAAATTCTAAGTCTAAGGATGAAACTATATACTTATTAAATT
ATTATTTAGAACAATTTAGAACTACAGTTCATAGACAAACTATGTTTGCTGAATTTGAAAAAATTGTACA
TCAAAGGGTAGAGAGTGGAGAACCACTTACTGCTGATGAATTTACTAATATATACTACAAATTAAATGAA
AAGTATTACGGAAAATCTGCAATAGTAGATAAACAAATAGGAATAGAATGGGCGAGAATACCTCATTTTT
ATTCAAACTTCTATGTATATAAGTATGCCACAGGGTTTTCTGCTGCAAGTGCTTTAAGTCAACAGATACT
TTCAGAAGGAAGTACTGCAGTAGATAGATATATAAACTTCTTAAAAAGTGGAGGGTCAGAATACCCACTA
GAACAATTAAAATCTGCTGGTGTAGATATGACTAAAAAAGAATCTATAGAGGAAGCCTTAAATGTATTTG
CTGAATTAGTTAATAAACTAGAAAAAGAATTATAG
>ref|NC_013316.1|:c3740473-3739808 putative cation transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGATTGATATAGGAAGTAAGGAGATAGCAATAAGGTTACTATTAGCACTAATAATAGGAGGAATAATAG
GCTTAGAGAGAGAAAAAATAAGACAGTTTGCAGGATTTAGGACACATATACTAATTGCAATAGGTTCTTG
TATTGTTTCAATAACTTCGATTCAATTATTCTTTGATTATAATTTGTATACAAATGCTGACCCAGCAAGA
ATGCCTGCTCAAGTATTATCTGGAATTGGTTTTTTAGGTGCAGGAGCAATTTTAAAAAATAAAGGTGGAG
TAAAAGGGCTTACTACAGCTGCTGGGATGTGGGCAACTGCATGTATTGGTATAGCAGTTGGATATGGTTA
TTATGAATTGGCAATTCTAGGTGGATTATTTGTAATGATAGCATTATTTGTGCTTAGGATAATCAATACG
TTTTTATTTAGCCAAGAAAAGAATGTATTGATATTAAAATTAAGCAATTTGGACTCTATACCTTTTTTAT
ATGATAAATTTGAAAAAAATCAACTTATCGTAAGAAATATGGAAATAGAATGTCGTAATGAAGAATACTG
GAAGGTTAATTTTTTTGTATCTTATGCTAAGAGAATACACTTACACGACGTTATGAAAGAAATAAATATG
ATAGAAGGAGTAATAAATGTAGATTATTTGGACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3740839-3740624 hypothetical protein CDR20291_3132 [Clostridium difficile R20291]
TTGTTTGATAAAATGTATATAAAAATATACAAATTTGTAATAGTGGTGATTATTATGGCGAACAATGAAT
TAGAAGCGTTAAAAAATGAGATTGAAGCAGTTAGGGAAGAGATAAATACATACATAGAATATCCAGAAAT
ATTTCAAGAAGAGTTAGTAGAATCAAGTAAGAAAATAGATATATTAATAAATAAATACATGTACCTAAGC
AAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3741372-3740863 hypothetical protein CDR20291_3133 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAACTAGAAAAATGACATTTTTAGGTCTTATGATAGGGTATAGTTTAGCTTTATATGTACTAGAGA
CATATATACCAAATCCTCTTATAGTTATATTTCCAGGGGCAAAATTGGGTTTGAGCAATATTATAACTTT
AATTTCATTAATGTTGTTAGGTGTCAAAGATACTGTTATAATTGTTACTATCAGGGTAATTTTGTCATCA
ATATTTGCAGGCCCTTTATCATATCTACTATTTAGTATAGGAGGAGCTTATCTGAGTCTTTTATTTATGT
ATTTAGCGAGTAAAATAAAAGATTTATCACTAATAGGGATAAGCATTATAGGTGCAATAGGGCATAATAT
AGGTCAATTAATAGTTGCAAGTTTAATCATAGAAAATATACTTGCTATAGGGTACTTACCATTTATGTTA
ATGGCATCATTAGTAACTGGTATGTTTGTAGGCTTAGTATCCAGGTATACAATACCTAAATTAAAGCATT
TTTATAGTAAGTTTTATTGA
>ref|NC_013316.1|:3741578-3741796 putative ferrous iron transport protein A [Clostridium difficile R20291]
ATGACTGTTTACGATTTAAAAATAGGAGAAAAAGGATTTATTAATAGTATAGATGGAGATATTAAATTAT
CTAAAAGATTGCTTGCACTTGGATGTATAAATAGTACTGAAATAGAAGTTAAAAAGGTTGCCCCACTTGG
AGACCCAATTATAATTAGATTTAGAGGCTTTGACCTTGCGATTAGAAAATCTGATGCTAAAAATATTTCT
TTACAATAA
>ref|NC_013316.1|:3741814-3743760 putative ferrous iron transport protein B [Clostridium difficile R20291]
GTGATTAATGTAGCATTATTAGGAAACCCAAATGTCGGTAAAACTACTGTTTTTAATCTACTTACAGGTT
CAAATCAATATGTAGGTAACTGGCCTGGTGTTACTATAGAAAAAAAAGAAGGATTTCTTGGAAAAGAGAT
AAAGGTTGTCGATTTACCTGGTATATATGCAATGGATACTTTCTCAAATGAAGAAAAGGTTTCTAAATCA
TATTTAGAAAATGAAGATGTTGATGTAATAGTAAATGTAGTTGATGCTTCTAATTTATCAAGAAACCTTT
ACTTAACAACTCAACTTATGCAATTTAACAAGCCTATAGTTATATTGCTTAATATGTTAGACATTGCAGA
ATCTAAAGGAGTTAATATAGATGCCAAAAAATTAAGTGAAGAACTTGGAGTAATTGTTGTTCCAATTATA
GCAAAAAAGAAAAATGGTGTTGATAGGATAGAAGAAGAGATTAAGGGAGCTACGCAAAAAGCTTTTATAT
ATCAGAAAAACTTTGGAAGTGAAACAGAAACATATAAAAAATTAGAATCCATTTTATCGAGATGTACAAA
AACTACATATACACAAAAGAAATCTATCAGTGATAAGATAGACAATATAGTCTTGAATCCTATATTAGCA
TATCCGATATTTATTGGTGTATTGTTCCTCTTATTTAAATTTACCTTTGACTGGGTCGGAGGACCACTAC
AAGAGGGATTTGCTAGTCTTATAGAGGCTTATATTTCTGCACCTGTTAGTGATATGTTATCTAACTCTAG
CCCATGGTTTAAATCACTTATAGTTGATGGAATAATTGGAGGTGTTGGTGGTACTTTACCATTCTTCCCT
TTAATATTTACATTATTCTTTGGTATATCGTTGTTTGAAGATAGTGGATACATGTCAAGAACAGCATTTT
TAATGGATAAAGTTATGAGAAAGGTTGGTCTATCTGGTAAAGCTTTTATACCTATAGTTATGGGTATGGG
ATGTTCTTCTCCAGCTATAATGGCAACTAGAACATTGGAAAGCGAAAAAGATAGAAGAGTTACAGCTCTT
ATTGCACCACTTATGACTTGTGGAGCAAAGCTACCTATATATGCACTATTTGTAGCTATATTCTTTCCAC
ATAATGCTGCTTTAGTAACTACGTCACTGTATTTGGTGGGTATAGTTATGGCAATTGTAGTTGCATTATT
CTTAAATAAAACAGCCTTTAAAACAGAGGCTGAACCATTTATATTAGAATTACCAGAATATAGAATCCCT
ACTATAGATGCACTTATTAAAAATACTTGGAATAAATCAAAAGGTTTCTTGATAAGAGTTGTTACTGTCA
TGTTTGCAATGTCAGTCGTAATTTGGGGACTTTCTTCATTCAATGTTTTTGGATATACAGAAGATATAAA
TGTAAGCTTCTTGGCTACTCTAGGTCATATTATATCTCCTATATTCAAACCTCTTGGTTTTGATGATTGG
AGAACTTCAGTTGCTATTTTAAGTGGTCTTGGAGCAAAAGAAATCGTAGTAAACTCTTTAAATATACTAT
ATGGTAATCTAACTGTTGTCTTACCAACAATATTTAATGGAGTTACTGCATATACATTCTTGATATTTAC
TGCTTTATATACTCCATGTATAGCTGCACTTGCAACTATGAAAAAAGAATATGGCAATAAAATGATGTTT
ACATCATTTGCATATCAATTTATACTAGCATGGATAATGGCTTTTATAGTTAAAAGCATAGGTGGAGTAC
TATTTATGGGTAATTCAATAATGGAAGCTTTGATAGGTGGAATAATTATAGTCCTTGCACTCTTTATTCT
GTTTAATAAATTCAAGTCTACAAAAAACGGAAATGTCTGTAGTGGATGTTCTATTTGCTCTGGATGTCCA
AGTGCTAATTCTTGCTCAAGTAAGGAAGACAGCAATAAAAAAAGTAATACACACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3744975-3743920 putative phosphosugar isomerase [Clostridium difficile R20291]
ATGACAATACAAGATTATATGTTAGAAACACCAGTTAGAATGAGAGAAATTATATCTAATGCAGATAGCT
TATTTAATGAAGTTAAGAGAGCAAATCTAAAAAAGATTATAATAACAGGTTCAGGTACTAGCTATCACTC
AGGAGTGCAAGTGCAACCATATTTACAAAATTTATTAGATATAGATGTTGTGAAAATGTATCCATTTATG
ATAACTGAAGATACATTCAAGTTTGATAATGAAAATACCCTAGTAGTAGGTGTATCTCAAGGTGGGAGTA
GTTATTCTACATACAACGCTATGAAGTTAGCTGAAGATAAGGGTTGTAAAATAGCATCTATGGCAGGTTG
TAAGAATGCTTTAATAGATGAGATTTCTGATTATATATTAACAGTAAATTGTGGTGAAGAAAAATCTGGA
GCTAAAACAAAAGGATATTATTGTACAAAGTTAAACTTAATGTTATTAGGTCTTCAAATAGCTAGAGAAA
AAGGTACAATATCTAGTGAAAAGTACAATGAGGAAATAAATAAGATATTAGATGCAATTAATAGATTTGA
AGCAGTGTATAAGCTCTCTAAACAATGGATTGAAAGAAACAAAGAAAAGTTAGTTAATTCTAAAGAAATA
AGAATAATAGGTCACTCTGATATATATGGAGATACATTAGAAGCAGCATTAAAATTATTGGAAACAATGA
GAATACCTGTAACTGGGTATGAGTTTGAAGAGTTTATACACGGTATATATAATGCTATAAATAGTGATTC
TACTATATTTATACTAGATACAGGAAAAGAACCTAGAGTAACTAAGATGATTGATGTACTTTCTGGTTGG
ACGGAAAATGTATTTGCTATAGGTAGAGATGTTACAGAAAATGATAAAAATTTAAAGATTGATATCACAG
ATAATCCTTACTATCAAACATTTAATTTTATAGTACCTATACAACTAATATGTGGGGAAATACCTACATT
AAGAGGCGTAGACCCAAGTGTTCCAAAAGATACTAGGTTCCACATGAAGTTAGGTAGCAAGAAACTGAAT
AAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3745790-3745023 PTS system, IId component [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTTGGCGTTCATTTGCTCTTCAAGGTGCATTTAATTACGAAAGAATGCAAAACTTAGGTTATTGTT
ATTCAATGTTACCTGCAATAAAGAAGCTATATAATAAGAAAGAAAATCAAGCAAAAGCAATAGAAAGGCA
TTTAGAGATTTTTAATACAACGACAGTGGTAGTTCCTGCTATATTAGGTATAACAGCAGCTATGGAAGAA
GAAAATGCTAATAATCCAGAATTTGATGAAAGTTCAATTAGTGCTGTTAAAACAGCTCTTATGGGACCTC
TTGCAGGAATTGGTGATTCATTATTCTGGGGAACATTTAGGATTATAGCAGCAGGAGTAGGAGTATCACT
TGCAAAAGAAGGCAATATCTTTGGACCACTATTATTCTTATTATTATACAATATACCAGCATTTGCCCTT
AGAATATTTGGACTTAAGTATGGTTATAAAGTAGGGGTAAATTCTCTTGAAAGAATACAAAGAGAGGGAC
TTATGGAGAAGATAATGTCTATGGCTACAACTGTCGGTTTATTCGTTGTAGGAGGAATGGTTGCAACTAT
GTTGAGTATAACTACTCCTTTGAAATTTAACTTAAATGGTGCAGAAGTAATTTTACAAGATATACTAGAT
AAAATAATACCTAATATGTTACCTTTAACCTTTGCATTTTTAATATATTACATGTTGAAGAGAAAGGTAA
GTGTAACAAAATTAACTATAGGCACTATAGTAACAGGAATCGCTTTACATGCTATAGGTTTGTTATAG
>ref|NC_013316.1|:c3746607-3745816 PTS system, IIc component [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAGTACAAGCTACTATGTTAGCTATTATAGCAGGAGTTGGTATACTAGATGGGCGTATATTTGGTC
AATCTATGTTTGATAGGCCAATAGTTACAGGTATGTTAGTTGGATTAGTTTTAGGAGACATAAAATCAGG
AATTATGATTGGTGCACAGCTTGAATTAATTTGGATGGGAATTGCAGGGATAGGTGCAGCTACTCCTCCA
GACGTAGTAACAGGAGGTGTATTGGGTACAGCTTTTGCTATATTATCAGGTAATGGTGCAGAAGTTGCTT
TAGCAGTGGCAGTGCCAGTAGCAGTATTAGCACAATCTCTTGGAGTATTAGTTAGAATAATAAATTCGTA
CTTTTCTCAAAAGGCAGTTTTCTATGCTAAACAGGCTGATTTTAAGAAAGTTACCATAATGATGTGGTTG
CCAGTAATATTATTCTTTTTAAGTACATCAGTTCCAACCTTTTTAGCAATTATGATTGGTGCTGATAAAG
TTACAACATTGATAAATGCAATACCTAAAGTTATATTAGACGGATTGGGTGTTGCAGGAACATTGTTGCC
AGCAGTAGGTTTTGCGTTGCTTATGGATATGTTGATTTCAAAAAAGATGTCTGTATTTTTCTTTATAGGG
TTTTTGTTAGCATCTTATGGTGGATTAGATATAACTGCTATAGCTTTATTTGGAGTATGTGTAGCATTTG
TACTAAACTTTTATATCAATAACAAAGAAAATAATCAAAATCCTCAATTAGCAATGAATACTTTAACGGA
AGGAGAGATTGACTTTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3747069-3746647 PTS system, IIa component [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAATTTCTAATTGCAACACATGGAGAATTGTCTAGAGAACTTGTTGACACAAGTAAATTAATAA
TTGGTTCATTAGCTAATATTGAGTATTTTTGTATGACAAAAGATAAATCAGCAGATGATGCTGAGAAAGA
AATTAGAAGTATATTATCAAATAATAAAGATAGTGAAGAATTTGTTGTTTTAACAGATGTGTTTGGTGGA
AGTGTGGCAAATATATGTACAAACTTACTTTTGCAAGGGTTCAAATTTGAATTGTTGACAGGCGTAAATT
TACCAATGCTTTTATCTATATTCTTATTAGTTGAGGAGGATACAAAACTAATAGTTAAATCAGGCTTAGA
GGAAGCAAAAAATGGAATTGTTTATGTAAATGAGTTATTAGAAAATCGAAATAAAATCAAAAATGTAATG
TAA
>ref|NC_013316.1|:c3747564-3747085 PTS system, IIb component [Clostridium difficile R20291]
ATGGTATCTTTGATGAGAATTGATGACAGATTGATACATGGTCAGGTTGCATATGGATGGGCAACATCAC
TAGGTATAAATGTAATACTAGTTGCAAATGATGAAGCAAAAAATGACCAAATGAAAGCTATGTCACTGAA
TTTAGCGAAACCTAGCAATGTAACTTTATATATAAGGGGGGTAGAGGAATCTGGAGAAATAGTAGAAAAA
TTTGCTTCTTCAAAGAAAAGCAATGTATTAGTGTTAGTAAAAAATACCAGAGATGCTTTAGTTGTAGCTA
AAAATTCAGGAGGAGTATTAAAAGAAATAAATGTAGGAGGGTTAAGATATGAAGAAGGAAAAAAGAAACT
TACAGATTTAGTTGCTGTTGATGATGATGATATAAATAACTTTAAAGAAATAGGTGATTTAGGAATTGAT
ATAGAACTTAGAATGTTACCTAGAGACAAAAAGAAACAACTATCAGATTTAATAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3750452-3747696 putative transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGGATGAAATTTTAAGTTTTGTAAATGAATGTGTATTATTTAACAACTTTGATGAACTTAAAAAAG
AAAGTGGCATAATAACAGAAGATATAGTAAAAAAGTTTAATTTAAGTAGAACTCAATCAAGTAGATTATT
AAATGATTTAGTAAAATCTGATAATCTTATAAAGATAAACAGTAGACCTGTTATTTTTTTACCTAAAAAT
AAAATAAATGATGTAGTAGGACCTACAAAAAAAAGTATTTATGAAAATTTAGATGAACTTAAAAATGAGT
GTAAATTATTAAAGCAAGAGACTGTGTTTAATAGTATCATAGGATATGATAATAGCTTAAAAGAAGTAAT
CGAACAAATAAAAACCGCTGTACTTTATCCAAATGGCGGACTTACAATAATGCTGACAGGTGAAAGTGGA
GTAGGAAAAACTTTTTTAGCCAAGATAATATACAAATATAGTGTAAGCAGTAATGTATTAGAAAAAAATT
CTCCATACAATGTGTTAAACTGTGCGCAGTATTATAATAATTTGGAGTTATTGTCTAGTCTATTATTTGG
GCATGTAAAAGGAGCATATACTGGAGCAAATGAATCTAGAGCAGGTCTAATAGAACAATCAGATGGTGGT
GTTTTATTTTTAGATGAAGTACATAGATTAAATAGTGAAGGTCAGGAAAAGTTATTTACATTTATGGATA
CAGGTACGTTTTCTAGGATTGGAGAGAATGGAGTAATTAGAAAAGCTAGGGTAAGATTAATATTTGCAAC
AACAGAAAGTCTATCCAAATTTTTGCAAACTTTTTTAAGAAGAATACCCATAAATATTTATGTTCCCAAT
ATAGAAGAAAGAGGGACTATTGAAAAAAGAAAGATTGTAGAACATTTTATTTATGAAGAAAGTAAGGTAC
TTGGCTTGCCTATAGAGATAACTCAAATTACATTAAATACGATTTTAAAGATAAAATTCAAGGGGAATAT
AGGTGAATGTAAAAATGTAATAAAATATGCATGTGGACGAGCTTATGCAAAAAATCAAAGAAGAAATGGA
AATATTTTTGTTACTCTTCAAGACCTCCCTAGAAATCTTTATATAGAAAATGTAGATATATTTCAATTCC
AAAGTGGTAAAAGCAAAAGCATTATCTTTTCTCCTAAACAATTTAGTATTGAAATGTCAAATGGAAGAAA
TAAAAGAAATATAATCTATCAAAGTTTCATAAAATGTTTAGACTACTTTGATAGACTAGAAAAAAATGAA
ATAACAAAAGAAATATTTAGTAAAAAGAGTTCTAATCTAATGATTAGACTAATGGACAATTTAGTCTTTT
CAAATAATGATGAAAATAATAACGTACTTATGGAGCTTATAATATCGATAATGCAGGATATATTTAGAAA
TTTAGAAGTTAATAACAATATAAAATACGATGGGAATAATGTATTGGCATTTTCGTCTTATCTTTATTTG
AAGGACGAATCTTATCAATTATCTGATGAGTATAAAGCTTTAGAAAGTAAATTACTAATATATTTAAAAA
AAGAGAGTTACAAAGAATACTCTATAATAAGTAAAATATCAACATTAATAACGAATAGATTGGATATGTA
TCTTAATAATGTAGATACAATCATAATGATTATATTTATTAAATCAACAATTATAAGAATGAAATTTAAT
CAAGTTAATGCGACTATTATAGCACATGGATATGCTACTGCCAGTAGTATGGCGAATGTATGTAATCGGA
TGTTGGGTAAAAATATATTTACAGCTATTGATATGCCTATAGATGCTACCATTGCTGATGTATCAAAACA
AATGTCTAGATACCTAGAAGGAGATAGGATAAAGAATGGTTTAATTGTGTTATTTGATATGGGCTCTCTT
AATCTTATCTATGAAGATTTAAAAAATAAGATAAATGGGCCAATGTTATTTATAGACCAAATATCCACTA
TTTCTGCACTAGAAGTAGGAAATTTATTAATGCAAGGTAAAAACATTGAACAGATTGCAGAAATTATGGA
TGAAGAAACTAAACCTAATATACAATTGTATTATCCTCAAAAAAATAAAGAATATGCTATAATATCATCT
TGTTTTACAGGGATAGGTACTGCTATAAAAATCCAACATCTACTTTCCGAAAGTTTAATTGGGATAGTTG
ATGTCAAAATAATACCTTATGATTATGATAGTCTTGTTTCTATGGGAGATAAAGAACCAGTTTTTGAAAT
GTATGATGTGATGGCTATAGTAGGAACTGCTAATCCAAATGTGAATGGGGTGGATTTTATATTGTTAGAG
GATATAATATCAGGAAAAGGAGAAGATGATGTTTTTAGAATATTTAGTAGAGTAGTAGAAAATGAAAAAA
TAAAGAACATAAATGATTCTATTGTAAAGAATTTTTCATTAATTAGAGTAATAGACAGTCTAACTATTTT
AGATTCAAAAAAGATAATAGAGAGAATAGAAGAAGGAATCAATGCTATAGAAAATATTCAAAAGAAAAAA
CTTCCAAATGATAAAAAGATTTCTTTATATGTTCATTTAAGTTGTATGATTGAAAGATTAGTTAGACAAA
CTGAAATTGAAGAGTATACTGATATGGATTTGTTAATCAAAAACCATCATAGTGAAGTAAAACTAATAAA
AAATGCATTTAGTGTGCTAGAAAAGAGTTATAGTGTGCAAATACCAATTTCAGAGATAGGATATATTTAT
AATATTATCTATGGTCTACCACAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3751853-3751050 pyrroline-5-carboxylate reductase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAACTTTAGGATTTATTGGTTCAGGGAATATGGGAAGTGCAATGATAGGTGGCATAGTACAGTCAG
GATTAGTAAAGGCAGAAGATATAACTGTATCAGATTTAAGCCAAGTTGCCTTAGATAAAGTAAAAGAAGA
ATTTGGAATAAATACTACAACTGATTCAAAGGTAGCTGTTACAAATTCTGATGTGGTAATAGTAGCACTT
AAACCTAATATATGCGAAAAGGCTTTAACTCCACTTAAAGAATTAATAGATGCAAATAAAATAATAGTAT
CTATAGCAGCAGGTAAAACTATAGAAAGTCTGGAAAGTTTTATAGGTTCAGATAAAAAAATAGTAAGAGT
AATGCCTAATACTCCAGCCCTTGTTGGCGAGGGAATGTCAGCTCTTTGTAAAAATAGTAATGTAACAGAT
GAAGAGTTAAATATGATTAAGGCTCTGTTTGAATCTTTTGGTGAGGCAGAAATAGTATCAGAATATTTAA
TGGATACAGTTACAGGTATTAGTGGTTCTTCTCCTGCATATGTATTTATGTTTATAGAAGCTATGGCAGA
TGCAGCAGTATTAGCTGGAATGCCAAGACAACAAGCTTATAAATTTGCATCTCAAGCAGTAATGGGGTCA
GCTAAGATGGTTCTTGAAACTGGAAAACATCCAGGTGAATTAAAAGATATGGTTTGTTCTCCAGCAGGAA
CTACTATAGAAGCTGTTAAGGTATTAGAAGAAGAAGGCTTTAGAGCAGCAGTTATAAAATCTATTGTTGC
TTGTATAGATAAGTCTAAAGATATGAGCAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3754547-3752178 putative formate acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAAGAGGAACTTTTGAGAGAACTAAAAAATTAAGAGAAGAAAGTATTAATGCAGAACCACACATAT
CTATTGAAAGAGCAGTACTTATGACAGAAGCTTATAAAAAATATGAGGGAAGTGTAGAGATTCCTGTACT
TCGTGCTTTATCATTTAAGCATTATATTGAGAATAGAACTCTTAGCATAAATGATGGAGAATTAATAGTA
GGTGAAAAAGGTGATTCTCCTAATGGAGCACCAACATATCCAGAAATTTGTTGTCACACAATGGAAGATT
TAGAAGTAATGCACAATAGAGATATAATAAATTTTAGCGTATCAGAAGAAGCTAGAAAAATACATAAAGA
AGAAATAATTCCTTTTTGGAAAAAAAGACAAACAAGAGATAAGATAATAAATGCAATGACACCTGAGTGG
TTAGCAGCATATGAAGCAGGTATGTTTACAGAGTTTATGGAACAAAGAGCCCCAGGACATACAGTTTGTG
GAGATACAATATATAAAAAAGGATTTTTAGATTTAAAGAAAGACATAGAAGCAAGATTAAAAGAGCTAGA
TTTTCTTAATGATTTAGATGCATATAATAAAAAAGCAGATTTAGAAGCTATGGCAATAGCTTGTGATGCA
ATGGTTATATTAGGTAAAAGATATGCTGAGAAAGCAAGACAAATGGCAGAAGAAGAAACAGATGAAGCTA
AGAAAAAAGATTTATTACTAATTGCTGAAACTTGTGATGTTGTACCAGCTCACAAACCAGAAACTTATCA
TCAAGCTATACAAATGTATTGGTTTGTTCATATAGGGGTTACTACTGAACTTAATATATGGGATGCTTTT
ACTCCAGGAAGACTTGACCAACATCTAAATCCTTTCTATGAAAGAGATGTAGAAAATGGAATACTAGATA
GAGATAGAGCACAAGAATTACTTGAATGTTTATGGGTTAAATTTAACAATCAGCCAGCACCACCAAAAGT
TGGTATAACATTAAAAGAAAGTAGCACATATACAGATTTTGCAAATATAAACACTGGTGGAATAAATCCA
GATGGTCAAGATGGTGTTAATGAAGTTAGTTATATAATACTTGATGTTATGGATGAAATGAAATTGATAC
AACCTAGTTCAAATGTTCAAATAAGTAAAAAGACTCCTCAAAAATTCTTAAAGAGAGCTTGTGAAATATC
AAGAAAAGGATGGGGTCAACCAGCATTTTATAATACTGAAGCAATAGTTCAAGAGCTTATGGAAGCTGGA
AAAACTATAGAAGATGCAAGACTTGGTGGAACCAGTGGTTGTGTTGAAACTGGATGTTTTGGTAAAGAAG
CATATGTTCTAACTGGATATATGAACATTCCAAAAATACTTGAATTAACATTAAATAATGGATATGACCC
AATTAGTAAAAAACAAATAGGTATTGAAACTGGAGACCCTAGAAATTTCCAATCTTATGAGGAACTATTT
GAAGCATTTAAAAAGCAATTACATTATATGATTGACATAAAAATAGAAGGAAATGCTGTGATAGAAAATA
TATGTGCAAAACACATGCCTTGTCCACTTATGTCTACAATAGTTGATGATTGTATAGAAAAAGGCAAGGA
TTACCAAAGAGGTGGAGCAAGATACAACACTAGATATATACAAGGTGTTGGTATAGGAACTATAACAGAT
AGTTTAACAGCAATAAAATATAATGTATTTGATAAGAAAAAATTCGATATGGATACATTGCTTAAAGCAC
TTGATGCTAATTTTGAAGGATATGAAGCTATACTTAATTTAGTTTCAAATAAGACTCCTAAATATGGAAA
TGATGATGATTATGCTGATGAAATAATGCAAGAGATATTCAATGCATATTACAATGAGGTAACTGGTAGA
CTAACTGTTTGTGGTGGAGAATACAGAGTAGATATGTTACCAACAACTTGTCATATATACTTTGGAGAAA
TTATGGGAGCAAGTCCAAATGGTAGACTTTGTGCAAAACCAGTTTCAGAGGGAATTTCACCTGAAAAAGG
TGGAGATACTAATGGACCTACAGCAGTTATAAAATCTTGTGCTAAGATGGACCACATAAAAACTGGTGGA
ACATTATTAAATCAAAGATTTGCACCATCAGTAGTTCAAGGAGAAAAAGGGTTAGATAATATGGCTAATC
TAGTAAGAGCATACTTTAATATGGATGGTCATCATATACAATTTAATGTATTTGATAAAAATGTACTGTT
AGAGGCTCAAAAGAATCCTAAGGATTATAAAGACTTAATAGTTAGAGTTGCAGGATATAGTGACCATTTC
AATAATTTAAGTAGAACACTACAAGATGAGATAATAGGAAGAACTGAGCAAACATTCTAG
>ref|NC_013316.1|:c3755460-3754552 putative pyruvate formate-lyase 3 activating enzyme [Clostridium difficile R20291]
ATGAATCCATTAGTTATAAACTTACAAAAATGTAGCATACATGATGGACCAGGGATAAGAAGTACAGTAT
TTTTTAAAGGGTGTCCACTTGAATGTGTTTGGTGTCATAATCCAGAGAGTCAAACATATACAAAACAAGT
TTTGTATAATGAAGAAAGATGTTCAAAATGTGAAGCATGTATAAATATATGCCCTCATAAGGCAATTTAC
AAAGGTGAAACAAAAATATGCTTAGACCAAGATAAGTGTGAGTTTTGTGAAACTTGCTTAGACTATTGTG
TAAACAATGCAAGAGAGATTGTTGGTCAAGAGTATTCTGTAAGAGACTTGGTTAAAGAGATAGAGAAGGA
TAGAATTTTCTATGAAGAATCGGGTGGTGGAGTAACACTATCAGGTGGAGAAGTAATGGCTCAAGATATG
GACTTCATTTGTGGAGTAATAAACATGTGCAAATCAAAGGGAATCCATGTAGCAATTGATACATGTGGCT
ATGCAAAGTCAGAAAATTATGAAAGAGTTGCTAAATGTGCAGATTTGTTTTTATATGATATTAAGCTTAT
TGATGAGGATAAGCACATAAAATTTACAGGAAAATCAAATGACTTAATACTGAAAAATGTTAAGATTTTA
AGTGAATTAGGGGTTAACATAAATATAAGAATACCATTAATTGTAGGAGTAAATGTAGATGATGAAAATT
TAGAGGTTAAAAAAATGATAGAGTTTTTAAAGCCTTTGAATATACAAGCAGTAAGTCTTCTTCCATATCA
TAATATTGGTAAACACAAGTATGATAAAATTTATAAAAAGTATGAAGGAGAAGAACTACAAAGACCATCA
GAAGAAAAATTAGAGGAAATAAAAAGACTGTTTGAAGCAAGTAATTTCAATACTAAGATTGGAGGGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3756884-3755805 putative protease [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAAGAAGAAAGAAAGGGATAAGTTTAGTAATATTAGTTGCTATAATAAGTTCAATACTTAGTAGTT
TTCTAACAATAATTTTAGTTAAGGACAATTTAGTAAGCAAATCTACAGGAAGTTCTACGCCGATAGTTGT
AAATGATGATGGTAAGAGTCAAAATATTTATCAAGCAGTTGCAGAAAAAGCTACGCCATCTGTTGTAGGT
ATTACAACAACTAGTGTTGATACTAGTAATATGTTTGCAATACCAACTGAAACACAAGGTGTAGGAACTG
GAATCATAGTTGATTCAAATGGATATATACTTACTAATTCTCATGTTATATCAGATGGTCAAGCTACAAG
TGTAAATGTATTATTCAATGATGGTTCAACAACTTCAGGTAAAGTAGTATGGTTTGACCAACAACTTGAT
TTAGCTATAGTTAAGGTTGATAAAACTGGACTAACACCAGCAGAATTTGCTGATAGTGACAAAGTAAAAG
TTGGAGATATATCAATAGCAATAGGTAATCCTCTTGGATTAGATTTTCAAAAAACAGTTACTCAAGGGAT
AATAAGTGGATTAGATAGAACTATACAAACAGAAAAAACTAATATGACTGGTTTATTACAAACTGATGCA
AGTATAAATGCAGGAAATAGTGGAGGACCATTGTTAAATCAAAAAGGTCAAGTAATTGGTATAAACACAG
CAAAAGCTTCTCAAGCAGAAGGATTAGGATTTGCAATACCAATCAATACAGCTAAGAGTATAGTTGAAGA
AGTAATCAAAAATGGAAAATATGAAAAAGTAACTTTAGGCATAAAAGGTACAGATGTATCAAATTATGAA
GCAGCAACAGGTACAAAATTAAGTACTGATAAAGGTGTTTATGTTGCAGAAGTAATATCTGGTTCATCAG
CAGAAAAAGCTGGAGTAAAGGTAGGGGATATTATAACTAAAGTAGGAGATACAGATATAACAGGTATGAA
TGATTTAAATAAAAAGTTGTATACTTTCTCAAAAGGTGCTAGTACAAAAATAACAGTAAATAGAGGCGGA
AAAGCAGTAACAATAAATGTGAATTTCTAA
>ref|NC_013316.1|:c3758389-3757040 glucose-6-phosphate isomerase [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAAAAATAAATTTTGATTATAGTAAAGCTACAGAGTTTTTTTGTCAAAACGAAATAGATGTCATGC
AACCATATGTAGATGTTGCGCACGACATGTTACATAATAAAACTGGTTTAGGAAATACTTTTTTAGGATG
GATAGACCTTCCTAAAAATTATGATAAAGAAGAGTTTGACAGAATAAAAAAATCTGCTGAGAAGATAAAA
TCAGACTCAGATGTTCTTCTGGTAATAGGTATAGGAGGCTCTTATTTAGGTTCGAGAGCTGCTATAGATA
TGGTAAGTCATTCTTTTAGGAATGGACTTAAAAAAGAGCAAAGAAAGGCTCCAGAAGTATATTTTGTAGG
GCATAATATAAGCTCAACATATATTATGGATTTATTAGATATAATTGAAGGAAAGGATATTTCTGTAAAT
GTAATATCTAAATCAGGAACTACTACAGAACCAGCTCTGGCTTTTAGAATATTTAAAGATTACTTAGAGA
AAAAGTATGGTAAGGAAGAAGCAAGAAAGAGAATTTATGCAACAACAGATGCAAGTAAAGGTGCACTTAG
ACAGTTAGCTACAGAAGAAGGATATGAGACTTTTGTAATACCAGATGATGTAGGTGGTCGTTTTTCTGTA
TTGACAGCAGTTGGGTTACTTCCTATTGCTGCTGCTGGACTTGATATTGATGCTATGATGAAAGGCGCAA
ATGATGCTAGAGAAGCATTTCAAAATCCTGACTTAAAAAGTAATGATAGTTATAGATATGCTGTTGCTAG
AACAATTTTACATAGAAAAGGAAAAGATGTAGAGTTATTAGTGAACTATGAACCTCAACTACATTATGTA
AGTGAGTGGTGGAAACAGCTTTATGGAGAAAGTGAAGGAAAAGAAAATAAAGGTTTATTCCCTGCTTCTG
TAGATTTCTCAACAGATTTACATTCTATGGGTCAATACATACAAGATGGAAAAAGGCTTTTATTTGAGAC
AGTACTTAATGTTGAAAACTGTAAGAGAAATATAACTATAAGTTCAGAGGAAGTAGACTTAGATGGTTTA
AATTATTTAGCAGGTAAGACTGTAGATTTTGTAAATCATAAAGCTTTTGAAGGAACTCTATTGGCTCATA
CAGATGGAAAAGTACCTAATTTAGTAATAAATATACCTCAACTAGATGAGTATAATTTTGGATATTTAGT
TTATTTCTTTGAGAAGGCTTGTGGAATAAGTGGATATTTATTGGGAGTTAATCCATTTGACCAACCAGGA
GTAGAAGCTTACAAGAAAAATATGTTTGCTTTACTAGGCAAACCAGGTTATGAAAAAGAAAAGGAAGAGC
TAGAAAAAAGACTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3760261-3758654 putative sodium-dependent phosphate transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGGGTGGATTAGGTCTGTTCTTATATGGTATGAACCTTATGGGAGAAGGTCTTCAAAAATCTGCTGGGA
CAAAGCTAAAAAAGATAATAAAACTACTTACTAGTAACCTATTTATGGGAGTTTTGGTAGGTACAGGAGT
TACAGCAGTAATACAAAGTTCAAGTGCTACTACTGTAATGGTTGTTGGTTTCGTAAATGCAGGAATAATG
ACTTTAAAACAGGCAATAGGAGTTATAATGGGTGCTAATATAGGGACTACTGTTACAGCCCAATTGGTAT
CTTTCGACTTAACTGGTATGGCCCCAGTAGCATTAGGTGTAGGTATTATACTTTATTTATTTGGAAATAA
GCCTAGAATAAAAAATATAGCCGAAATACTTATAGGTTTTGGTATATTATTTACAGGTATGGATTTTATG
AAGATGGCAGTGGAGCCACTAAGAGACTATCAAGGATTTACTGACCTACTTGTTACATTTGGTAGATATC
CACTACTTGGATTATTATTGGGATTTGGGATTACAGCAATAATACAAAGTTCAAGTGCATCTATGGGTAT
GTTGGTTGCACTGGCAGCAGAAGGTCTAGTGCCATTATCAGCAGCACTGCCAATTCTTTATGGCCAAAAT
ATTGGTACATGTGTAACTTCACTGTTATCAAGTATTGGTGCTAACAAAAATGCACGAAGAGCAGCTATGA
TGCATCTAATCTTCAATGTTTTAGGAACGGTGATATTCTTAATATTCTTGAATAAACCAGTAGTAAGCAT
GGTTACAAGTTGGGATCCAAGCAATGTTGCAAGACAAATAGCCAATACACATACATTGTTTAATATAATA
TCTGTATTGATACTTTTACCATTTACAAATCTTATTATAAAACTAGCTATAAAGCTTGTTCCTGATAGAG
CAGGTGATATAGATGAAGATGAAACTAAAACTATTAAATATATAGATGATAGAATGATAGAAACTCCTTC
TATAGCTCTTGCAAATACGATAAAAGAAGCACTTCGTATGGGTGAGAAGGCGAAGGAAAGCCTAAATGCA
TCTATGGAAGCCTTAGTAGAACATTCAACTGAAAAAATAGCTAAGACATATAGACGAGAGAGATTAATCA
ATGATTTACAGAAAGCTATTTTAAATTACTTACTTAAACTTTCAAAAGCACCTTTAGATGATGATTCAAG
AGAAGTTGTGGATACTTTGTTTAATACAGTCAATGATATAGAAAGAATTGGTGACCACGCTAAAAATATA
GCTGAATTATCGCAAGTTGCAATAGATTCAAATATTTCTTTCTCAGAAGAAGGACAATCTGAACTTGATG
TTATGTATAATAGAGTTGTTTCAGCATATACTTATGCATTAGAATCAATGAGAACTGATAATGTTGATTT
AGCTTGTAAGGTTATAAAAATTGAAGAACAAGTTGATATAATGGAGAAATCTTGTAGAGCTAATCACATG
TATAGATTGAACAATAATCTATGTAGTATAGAAAATGGAGTTATTTATTTAGACGTAATAAGTAATTTAG
AGAGAATATCTGACCATGCTGTCAATATAGCACAACAAGTTATAGCGAAGAGATTAGGAAATGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3762112-3760406 hypothetical protein CDR20291_3148 [Clostridium difficile R20291]
TTGGGTAGAAAATCTAGTAAAAGAGAATATAGAAGTTATATTTGTAGAAAGCTAGGAATAACCCTAGCTT
TTTTATATTACAATCTAAGAGAGGAAAACAATATGTTAAGAGTATCTAATGTAAAACTTGGAATTGATAA
AGATATATCTTTATTAAAAGATGTTGTACTTAAGAAGCTAAAAATAAAAGAAAAAAACTTAGTCAAATAT
AGTATATATAAAGAATCTATAGATGCTAGAAAAAAAGGAAAAATGGAATTTGTTTATTCTGTAGATGTAG
AAGTCAAAGATGAAAATAAAATACTTAACTCAAAAATAAAAGATGTAACAAAAATAAAGGAAATCAGATA
CATAAATGTACCTGTGGGTGATAAAAAATTAAAGAATAATCCTTTGGTAATTGGTAGTGGACCAGCTGGT
TTATTTGCAGGTCTGCTTTTAGCTCAAATGGGTTATGAACCAATCATACTTGAAAGAGGTCTTGATGTAG
ACAGTAGAACCAAAGATATAAGTGATTTTTGGACAACTAGAAAATTAAAAAATAATTCAAACGTTCAATT
TGGAGAAGGTGGAGCAGGAACTTTTTCGGATGGTAAACTTACAACTAGAATAAAAGATATACGATGTAGA
AAAGTATTAGAAGAGTTAGTTCAGTTTGGAGCACCAGATGAAATATTATACTCACATAAGCCACATGTTG
GAACAGATATATTAAAAAATGTAGTTAAAAATATAAGAAATGAAATAATAAGTTTAGGTGGTCAAGTTAG
ATTTAATTCAAAAGTAACAGATATAGTTGTATCAAATGATTCTATACAATCTGTAATAATAAATGATACT
GAAAAAATAGATACAGATACAATTATACTAGCTGTTGGACATAGTGCAAGAGATACTTATGAAATGTTGT
ATTCAAGAGGTATAAAAATAGTTCAAAAACCTTTTGCAATAGGAGCTAGAGTTGAACATCCACAAGATTT
AATAAATAAAGCACAGTACAAGGATTTTTATAATCATCCTAGGTTAGGAGCTGCAGATTATAGACTTATA
GAGCATGTTTCAAATGGAAGAACAGCATATACTTTTTGTATGTGTCCAGGAGGTAGTGTCATAGCATCTG
CATCAAATGATTTTGAAATAGTTACAAATGGTATGAGTGAACATGCAAGAGATAAAATAAATGCAAATAG
TGCATTTTTAGTAAATGTAACGCCAGAAGATTTTAAGAGTGATAATCCACTAGCAGGTGTTCATTTCCAG
CAGAAGTATGAAAAATTAGCTTTTGAATTAGGTGGAAAAAATTACAATGCACCAGTTCAGCTTGTTGGAG
ATTTTATAAACAATAAGACTTCTTTGAATTTAGGAAGTGTTGAGCCATCATATAGACCAGGATATACACT
TACAAATTTAAGTGAATGTTTGCCTAGCTTCGTAACAGAGACTATGAGAGAAGCGTTTATATCTCTTGAT
AAAAAATTGAATGGGTTTGCAATGTATGATGCTGTTTTGACGGGAGTAGAAACTAGGTCATCATCACCAA
TAAGAATAGTAAGAGATGAAAATACTTTAGAATCAGTGAGTATTAAGAATCTATATCCATGTGGTGAAGG
CGCTGGATATGCAGGTGGTATAGTTACAGCAGCAGTTGATGGTATAAAATGTGCAGAAAAAATAATACAA
AAATACACCAATAATACAAAAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3762375-3762058 hypothetical protein CDR20291_3149 [Clostridium difficile R20291]
ATGGACTATATAGGAATAGAAAATATAACACCTTATGAAAATACATATGAATTTAGTGTATATGAATATG
ATGATGAAATCACCTTAGGTAGTGAAAAGTTATATGTGTGTGAATTAAGGGTTGTATTGATTAAAGTTAA
TTCTCTGTATGTTGAAAGATTGCATAAATCAGTTGAAGCAATGGTCTTAGTAAAAAACTTGAAAAAGGAT
TTAGATAAAACACTTGTTGTAAACAAAATAAAGAATTTTGTGCTAGATGAGATTTGGGTAGAAAATCTAG
TAAAAGAGAATATAGAAGTTATATTTGTAGAAAGCTAG
>ref|NC_013316.1|:c3762745-3762380 hypothetical protein CDR20291_3150 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTCTTAGTTTAGGAAATGCAATTGCTGTATCAACGAACTTTATAAAATCTAACCCAGCTGTACCTG
TGTACAACGGAGAAGAAATATATGCAGTTATTTATCATATAGAAATAGGATATAATAATGGTGTATCACC
TGATACCAAACAATATATAATAATAGACTATAAAGAGTTTGATTTATCTATGGATAAAAAAAATGAACTA
ATAAATGTTGCTAAAGAGTACTGTAAATCTAAAGGTATTGTAGAAAACGAAAACCTTGAAATAAACCTTT
TAGACAATGAAGAAGCAGAGAACTTCTTAGAAAAGGTGTTTAATAACATGAAGGTTATAAGAGGTCTTAT
AACTAAAAAAGGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3763875-3762826 putative protein translocase [Clostridium difficile R20291]
GTGGAAGTCATATTGTTAGGGAGAAATGAGCTATGCCCTTGTGGAAGTGGCAAAAAATACAAGAAATGTT
GTTTAAATAAAGATATTGTTTCAGAAAGAGCATGCAGAAAAACTGAACTTTCACAAAAACAATATACAGA
TTTATATTCAAAGTTATATGATTATTCAAGACAGGATAAGTTTAAAGAAGAATGTGAAAAAGCTAAAGAA
ATGTTTTATATAATGCAAAATGATAGTGTAAATGAAAAATTTGAAAGATTTTTTAATACTTATTTAATAC
AAGACCACATAATGGAAAATAAAAAGGTTATGACAGTTGGTTTTCTTGAAGAAAATGGTGCAAACCTAAG
TCAATCAGAAGTATCAATATTAAAAAGTATGTTTGAATCATACGTAAGTATTTATGAGGTAAAAGAAGTT
TCTGCTGGAAAAATAGTATTAAAGGACTGTTTAAGTGGAAATGAACTTTGTACAGAAGATGTAAAACTTC
TGAGAAGTTTTAAAATCGGAAGTTGTATGATAGCTAGAATAGTTGATATTGAAGGAACTAACATATTGAT
AGATATAACTATAAGTATATCAAATGAGGTTAAAGATATAATTTTAAAGGATATTATGAATCTATTCAAT
CAATATCAAGATGTATACAAAGATATGAAGTCGTTCTTAATTTATCATACACATATACTATACAAGTATA
TACAACAGCTTTTAGACCCAAGTATAGCTGAATATTTAAAGAGAGAAAGAGATAAAAACGATACAAAAGT
TAATTCAGAAAATGAATTAGCTGAAGAAGAATGTAAAGTTTTAGATACTCTTAAAGAAAATGTAGAAAAA
GAAAATATAGATGCATGTATAGAGTTTTGGAATGAATATAAGAAAAATCATGAAAATATAAAAGGAGCTG
AAAATGGTTGGGCAGCTGCTGTTGAATACTATGTTAAAAAAGAAGCAGGACAACCTATAACTCAAGTTCA
AATATCAAAGAAATACGATATAAGCTCTAGTACACTAGGAAAGAGATACAAAGATTTAAAAATATCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3764700-3764116 hypothetical protein CDR20291_3152 [Clostridium difficile R20291]
TTGAGATTAAATAATAGAGAAAAAAATCTACTTAAAATATTGTTAATATTAGTTATTATATTGGCAAGTG
ATATAGCAGTAAGTTATTTGGAAGAAAACCTAACTAGTTTGAAGAATGAAAAGCAAAATATAATAAATAA
AATAAATAATCAAGATAATTATCAAATAAAGGATAATAAGCATATAGATGATAAATATATAGAAAGTGTT
GAATTAAATAAAAATGAAGAATTGAAAAATAATTTTAATAACTCATTTTTAGATAAAAAAACAAATAAAG
ATATAGTGTTATTAGTAGAAAATGAACTGAGAGATATTGTGAATGTAGAATATATTAATCAAGAAAGTAG
TTTAGATAATCACAATAAAAAACAAGTTAATTTAGAAATAAAAGTTAATGGAGAACTTGCAAATGTGTTG
AAACTTGAAGGTGTAATGAAGAAGTTAAGACTAAATAATAAACTTGAAAAGATAGAAATTAACAAATTAA
AAGTCAATAATTTTGATGTTCAAAATATTCCAAATGAATATAAACAAGAAAAAGACAATATTGTTGAATG
TAAAATGACAGTTAGAGTCATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3765158-3764715 hypothetical protein CDR20291_3153 [Clostridium difficile R20291]
GTGAAAGTGGATAAAACAATAAATTTTCTTAATGGATTTAAAAAAACTAAACCATGTAATAAAATCTATA
AAATAATAATAGTCTTAATTTTAACGTGTATTTTATTTAAATCATTTATGTATGTGAAATCTATAAATGA
ACTTGAAGATTATATAAATCAAAATAAGCTAGTGGATAAATCAAAGCACACTTTACCAACAACAGATAAA
ACTAGAGAGAAATTTTCTAAAATAAAACTTAATGAAATAAAAAAAATATATGAAACAATTGGAATAAATA
GTATTACTAAAATATCGATAGATAAAAATAAGCTAGAGATGGAAGGTGTGTGTAGTGATTTAGATGTTTT
AAACAACCTAAGGAAAATAAAGTACATAAAATATTATTACATAGACAGTATTGTAAGAGATGGAGAATAT
TATAGATTTAGAATAAAAAGTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3766031-3765159 hypothetical protein CDR20291_3154 [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTATAATTAAAAAAATTCTAAACTTAGAAATAAATGATGATTATATAAGGCTTGTATTTTTAAGAA
AAAGTCATAAAAAAGTTTTTATAGATAAATCAATTATAAAAGAGATTAACTTTGATATAAAAAATGATAG
TAATTCGATTGAGAAGATTAAATATATAGAAGATGTAGTTAGATTTGTAAAAGAGGAGATTGGTAAATCA
AAAATATTATATAAAAATTTATACTTTAACATTCAAATTCAAGATATAGTCATTAGAAATGTTGAAGTTC
TAAATACTAAGAAAAAAAGAGACATATTAAGCATGATTGAATTTGAAATAACACAATACATTCCAATAAA
CATAAATAACTATTCAATAAAATATAAAGTTATAAATTCTAAAAATGATAAATTGAATATACAAGTAATT
CTTTTCCCAAAGAGTATTATTCAATTAATTAAGAACATTTCAGAAAATCTAAATATGAATCCAAAGACTA
TAAATATAAATTTTGATATATTACAAAAGCTTATAAACTTAAATTTAATAGAGAATTTTTCAGAAGAAGG
GGTATTTATAGAATGTAAAAAAAGTCAGTTAATTATAAATATAACAAAAGATAAAAAAATAAGAGAAACA
TACTTGCTATCAAAAGAGGGAAAATCATATGAGTTCATAAAAAGATTATTAAGGGATTTTAAGTATGTTT
ATTACTATGGTATAGAAAATTGTTTTATTGAAGAATACTTTAAATATACAGATAAATCTATTGAAGTAAA
TCCATTAAGATTAAAAGATAAAGTAAAAGTAGAAAATAATTTTGATGCAGATTTAGAAGACAATAGGATA
AATTATATAAATAGTATAGGAATGATTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3766443-3766084 putative type IV pilin [Clostridium difficile R20291]
TTGATAAATTTGATAAATAAAAAACGAAAAGGATTTACACTTGTTGAAATGATTGTAGTAGTAACTATTT
TAGGCGTTATATCTAGTATAGCATTAGTTAAGTATAGTAAGGTTCAAGAAAGTGCCAAATTAAATGCAGA
CTATACGAATGCTGCTAATATAGTAACTGCAGCTAGCATGGCAATTAATGATGATGAAAAGACAATAGAC
TCTCTAAGTGTAGAAACATTGAAGGAAAAGGGATACCTAAATACTGTTCCAGTTCCTCAGAGTACATCAG
GTAAATTCGAACTTGTCATAAATGATAGCGGAACAGATATAAGCGTAAATATAAATTCTAAACAATTTTA
TCCAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3767582-3766497 putative type IV pilus-assembly protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGATTATCTAAAAATATATTTTATAATTTAGAAAAGTTTTATTTAGTATTAAATAGAATCAGTGATA
AAGAAATTAGAGTAATTTGCAAAGAGATAGGCATATTGCTGGAATCTGGATGTGAAATTACAAAAATATT
TGAAATCATTGAGAGTCAGTCAAGTAAAAAAGTAAAGAATTTGCTTAGTATAGTATCAAATCATATTCAA
AAAGGTAACTCAATAGCAGAATCATTTCAAATAACAGGTATATTTTCTAAATTCTTTATAAGTATGATAA
AAGCAGGAGAAACTAGTGGAAACTTAGATATAATAATGAGTGATTTATCTAATTATTATGATAAAGAATA
CAAATTAAAAATGAAAATAATAACTATTTCAATATATCCAATAATACTTATAATATTATCTATCTTATCA
ATGTTGTTTATATTCGTATTTGTAATACCTAATTTTCAGGTGGTTTTTACCAACAATGGAATTGAACCAC
CTTTAATAACTAGAGTTTTAATGGGAATATCTACAGTGGTTACAAATAACTTAGCTTATATAATATTTAG
TTTTATATTGTTTTCAATAGGAAGCATTTATTTCTTTATAACAAATGATAATATAAAAAAATTGATTAAT
TCGTTAAAATTCAAAATACCTTTTATAAAAAAAATTAATCAGTTAGTAGCTACAACAAGATTTTCAAGGG
CATTGTCCGTTTTAATTAGCAGTGGAATACAAATTGTGGAAGCTATAGACATGTCAGCTAGTGTTATAGA
CAACGAATTTATTTATGAAAGGTTAAAGATTTCTAATAATTATATAAAAAAAGGAAATAGCATAGGTAAA
TCTTTGAATTTAGCAAATGTTTTTCCAAAATTATTTATTTCAATGGCAAATACAGGAGAAGAAAGTGGGA
AACTAGATAAAAGTCTAAATGTAATAAATAAATTTTATGAAAATGAATTAAATAACAAAATAGAGCAAAT
AATGAAATTTATAGAACCTATGCTAATTGTATTTATGGGATTAATTATTGGCACTTTTATTTTAGCAATG
GTTGTTCCTATGTTTGATGCAATTACTAATTTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3769132-3767753 putative type IV pilus-assembly protein [Clostridium difficile R20291]
GTGATTAATATTATATTAGAGGAAAGCAGTTTGCCAATGTTAATACCAGAAAAACTTGCAAAGAAATATA
ATGTATTTCCAGTTGAGTTTCAAGATGATAATTTAGTTGTAGAAATAGAAGATGAGGATATTTATGCTCT
ACAGGACTTGAGATTAGCTACAGGTAAAGAAATTATATTGAAGAAGGAGAAAAAAGAACTTATAAGTGAA
AAGATTGAAAAATATTATAATAGCTTTGAACTTGATGAGGATTATGCAAAAAAATTATTTGAAAATCTTT
TAGAAAAAGCTATAAAAGAAAATGCAAGTGATATACATATAGAACCATTTAAAGAACATTTAATAGTGAG
AATGAGGGTAGATGGAGAACTAAAGGAAGTATCAAAGTTTTTAGTTGATGTCTATCCATCATTGTCTACG
GTTATAAAATTAAAGGCATCAATGGATATAACAGAAAAAAGGCTTCCTCAGGATGGTAGGGTGGATATAA
AGTTAGGTGGAAATTTAATTGACATTAGAGTTTCATCAATACCAACTGTCTATGGTGAAAAAATAGTTTT
GAGGATACTTAATAGAGATACTTTTTTAAAAGACAAATTAGAACTTGGTTTTTCAGAGGAAGCTATAAAA
TCTATAAATCGTATAATAAATAAAAGAGCAGGAGTATTATTAGTGACAGGTCCTACAGGTAGTGGAAAGA
CTACAACAGTATATTCCTTATTAAATGATTTAAAAGGAATAAATAAAAATATTATGACTATAGAAAATCC
TGTAGAGTATAAGATGGATGGCATAAGTCAGATTCAAGTAAATTCAAAAGTAGGGTTGAGCTTTGATGTA
GGTCTTAGAGCGATATTAAGACAAGACCCAGATATAATAATGGTCGGAGAAATAAGAGATGCAGAAACAG
CTAAGATAGCAGTAAGAGCAGCTATAACAGGTCATTTAGTTATAAGTACTTTACATACTAATGATGCAGT
ATCTTCCATAGCTAGATTACTAGAAATGCAAATACCACCATATCTTTTAAATGCCTCTCTTATAGGTGTT
ATATCTCAAAAGTTGGTTAGAAAAGTTTGTAATCATTGTAGCCATGAGATTATGATAAAAGATAATTTTA
GTGGAGATGTAAATACTAAGGTAGCTGTAGGGTGTGAAAAATGTAATGATAAAGGATACTTTGGAAGAAC
AGCAATTTATGAAATCTTAGAAATTAATGATGATATAAAGACATGTATAAGAAATATGGAGGATTCTAGT
ACTATTAAAGATGTGGCACAAAATAATGGAATGATAACATTTGAAGATAGCTGTAAAAGACTAATAAATG
AAAAAATAACGACATTAGAAGAGTGTTTAGTAGTAAATGAAATGATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3769805-3769125 hypothetical protein CDR20291_3158 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAACAATATGTGTTTATAATACTAGCAAGTACTATTTTAGGTATACTTGTTGGAACCATATTTA
GAGATTATAGCAATGAAGAAACAGTTTATACAAGCAAAGACAAGTCAATAAGAAAAGAAATAAAAATGAC
AAGAAAATCTATAAAAGAATTAACCAAAGAGAAAGACAAGTTAGATAAAGAAATTAATTCAATGAAACAA
AATCAAAAAAATTCTGAAGAAATATCAGAAATAGAAACACTTAGAGATAGTCTATCATATTCAGATGTAA
AGGGTAGTGGGATAATATTAAGTATAGATGCTATAGATGAAAAAACAGGGAATATAGCTAATAGTATAGA
CTATAATAAGATTCTTGTAAAAGTTATAAATGAATTAAAAGTAAACGGAGGAAAATACATAGAAATAAAT
GGTCAAAGAATTAATCAATATTCAGAAGTTGTACTTGCAGGAAGCCATATAAATATAAATGGAGTTCCTG
TAGCACAACCATATGAAATAAAGTGCATTGGAGATAAGGAGAAATTATCTAATTATGTAGATAAAGGTAG
TAAATATTTAGATAGCATACAAACCAATTATCCAATGAAAATAAGCATAAAAACTGAAGAAAATATCTCT
ATGAAAAAAATGAATATACCTAATAAATTAAAGTATATAAAGGGTGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3771276-3770197 putative ATP/GTP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGGAAAGGTAAAGAAGGCATTCCCAGGTGGAAATACATCACAAGGCTCATATTCTTTTTTTGACT
ATATAATTCCTGAAAATGTAAAAAGAGTTTTTTGTTTAAAGGGTGGACCTGGAGTAGGAAAATCCTCACT
TATGAAAAAAATTTATAAAGAGTTTTTGCATAGAGGATATGATATTGATTTATATCATTGTCCTTCTGAC
CCAAGTTCGTTGGATGGTTTAGTTATAAAGAAATTAGGCGTGGTACTTATGGATGCAACTGCCCCACATA
CTATGGACCCAAAGCTACCTGGAGCTTTGGATGAGATAATTAATTTAGGTGATTACTGGAATACAGAAGA
ATTAGAAAAGAATAAACAAGAAATATCAGTTTATGATAAAGATATTAGTAATTCATTTAAAAGAGCATTT
AAGTTTTTAAAGTCAGCAGAACCAATTTTTAGAGACATAGAAGAAAAATATTCTGATTGTATGGATTATG
GCAAAGTAAATTTGGTCACAGAAGAATTTATAAAAAGGTTATTTGATGGAGTTAAAAGCACAGGAAATCT
AAAAAGAGAAAAGCATTTATTTGGTTCAGCTATAACTCCTGTAGGGTGTTTAGATTATACAGAAAACATT
TTAAAAGATGTAAAGAAAGTCTATTATTTAGATGGAGAAATAGGAACTGGGAAAACTACATTATTAAACA
AAGTATATAAGAAAGCTACTGAAAAAGGTTTAAATGTAGAAGTTTATCATTATCCACTTATTCCAGAGAA
AATTGAAACTGTACTATTAACTGATTTAGATATAGGCATAACTATAAGTACGACTTTTAAAGAAGAAGAT
ACAATTGATTTAAATCAGTTTTTAAATAGAGAAAAACTACTTAAATATGAAGAAGATATTAAATTTGATG
AAAAAGTTTTAGATGATTTAATTTGTTGGGCAGTACTAAATCTTAAGAGAGCCAAGTCTAAACATGATAT
TATAGAAAGTTACTATAGTCCTAATATGAGATTTGATGAAGTAGGGAAATTAAGAGATAAGTTAATTAAA
AGAATTTTAAAATATGAGGAAAACTTATAA
>ref|NC_013316.1|:3771854-3773224 putative transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACAAAAATGGATAGTATTGATTATCATCTGTATTGGTGTATTTATGTCTACTCTTGATGGAAGTA
TACTAAATATCGCAAATCCTACAATTGCTGCTGACTTTAAAATTAACATGTCACAAATTCAGTGGGTTGT
AACAGCTTATATGCTTGTTGTAACAGCTACTATGTTATTTTTCGGAAAACTTGGTGATAAAGTAGGTTCA
AATCGTCTATACGCATTAGGATTTTTTATATTTACAATAGGTTCTTTTCTGTGTAGTATGTCAAACAATT
TATCAACATTAATTTCTTCAAGAATCTTTCAGGCAGTTGGAGCAAGTATTTTAATGGCTACTGGGCTTGG
TATAGTTTCCAATGCATTTCCAGCAAATGAAAAAGGAAAAGCTATAGGAATCACTGGAGCTGTAGTTGGT
ATAGGAAATATGAGTGGTCCTGTAATTGGAGGTATAATTTTAGAACATTTTGGATGGCCTTCTATTTTTA
TTATCAATATACCTATTGGTATTATAGCAGTCTTTCTTGGCATTAAATTTCTGCCTAAACCTGTTTTGGA
TGAACAAAACAAGAGCTTTGATATTTCAGGTCTTCTACTTTTCGCATCTTGCACTACGCTTATATTACTT
GCAATGAATGAGAAGGGTAATACAAGATTGTATTTAGGTATAACAGCACTTATAATCTTCTTATTGTTGG
CATTAAGAGAAGTAAAATTTGAACAAAGCTTTATTGACCTACCTCTATTTAAAAATAGAAACTTTACTGT
AGGCAATATCATTGGAGTAGCTTGTTATTTTCCTCAAATGGCAGTATCTTTTCTACTTCCATTTTATTTA
GAACAATTAAAAAATTTATCTCCTATGATGGCTGGTTATGTAATGACTGTACATCCACTTATTATGGTAC
TTATAGCACCTATTGCAGGTTCACTTTCTGATAAACACGGTGCAAAAAACATTCTAACAGCATCTTTTTC
ATTTATGACCATCTCACTAGTTGGAATGGCACTTTTAAAAGCAGATTCTCCATTGTATCTTTTAATTGTA
TGTTTAGTTATTTTTGGACTTGGGCTAGGAGCATTTAGTTCACCAAACAATAGTAGTATTTTAGCAGATG
TTCCTCCTCAAAAACAGGGGTACGGAGGCAGTTTTCTTGCAACTATTCGTAATTTATCATTTGCTCTTGG
AACAGCATTTTTTAGTAGTTTTTTTGCACAAAGTCTTACATACAATCAAAAGTTTAAAAGTCACACATCA
GCCTATGTTATAGCTAGCAATCAGTCTTATTGGATTGCAGCATCAGTATGTTTTATAGGGCTTATACTAA
CTGTTTTCTTTATGAGAAAAACAGATAAATCTATTTCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3774073-3773489 putative GTP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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ATGTTGGAAAATCATCAATAATAAATACATTGCTTAACAGAAGAAACTTCGCTAGAACCAGTCAAACACC
AGGAAAAACTAGAACTATAAATTTTTATCTAATAAATAATGAATTTTATTTTGTAGACCTTCCAGGCTAT
GGATATGCAAAGATAGCTAAGTCTGAAAAAGAAAAGTGGGGAGGTATAATGGAAAGATATCTAGAAAGTA
GACAAGAGTTATGTTCTATATTCCTACTTGTAGATATTAGACATGAGCCTACAGCAGATGATAAGCTTAT
GTATGAATGGATAAAGCACTTTGGATATAACTGTGTAGTTATTGCAACTAAGGCAGATAAAATATCTAGA
GGACAATATCAAAAACACATAAGTATAATAAGAAAAAAATTGCAAATGGAAAGTAGTGAAAAAGTAATTC
CTGTTTCTTCACTAAAAAAGACTGGTGTTGAAGAATTATGGGAAGAGATTGTAAATCAATACAATCAACA
TGGATATGAAATAACAGTAGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3776459-3774090 ATP-dependent protease La [Clostridium difficile R20291]
ATGTTGATGGAACAAAATTATACTAAAATAGATCATGAATTACCATTAATTCCTCTAAGAGGATTAGCTA
TATTTCCATATATGATATTAAATTTTGATATAGGTAGAGAGATATCTCTTAAAGCTTTAGACCAAGCTAT
GATGGATGAAGAACTTATATTTTTAACTTCTCAGAAAGAAGCAGAGGTAGATGAGCCAGGAGAAGAGGAT
TTTTATCATGTGGGAACAATCTGTAAAGTTAAGCAAATGATAAAATTACCAGGAGATACAGTTCGTGTTT
TGGTTGAAGGTGTATCAAGGGGTAGAGTAAAGAAAATAGAACAAGAAGATGGGTATTTCAGAGCAGTAAT
AGAAGAAATAGTATTTAATAGTGATAATTTGGATAGTGAAACAGAAGTTGAAATTGAAGCATTTGTAAGA
AATGTATTTGATGCCTTTGAAGAGTATATAAATATTGGAAATAGGGTATCACCAGAAATATTAATATCTC
TAGCTGATATAGAAGATGTAGATAGATTTATAGATACGATAGCTGCAAACATATATCTAAAATCAAGCCA
AAAACAAGAAATATTAGAAGAATTTGATATTAGAAAAAGACTTGAACTTATTTATTCTATATTATTAGAG
GAAATAGATATATTAAAAATAGAAAAGAAAATAACTTTAAGAGTAAAAAAACAGATGAATAAGGTTCAAA
AAGAATATTATCTTAGAGAACAATTAAAAGCTATACAGAAAGAATTAGGTGAAGAAGAAGATATAAATTC
TGAAGCAGATGAGTATAGAGAAAAGCTTAAAAAAATAAAAGCACCTAAGACAACCAAAGAAAAAATAGAA
AAAGAGATAGATAAATTTTCAAAAATATCTTCTATGTCTCCAGATGTATCTGTAAGTAGAAACTATTTAG
ATACTATATTCTCATTGCCATGGAATAAAGAGACAAAAGATAAATTAGATATAACTAAGGCAAAAGATAT
ATTAGATGAAGACCATTATGGATTAGAAAAAGTTAAGGAGAGAATACTAGAGTATCTAGCTATAAGAACT
CTTGCTAAGTCACTTAAAGGGCCTATAATATGTCTAGTTGGTCCTCCAGGAACAGGAAAGACATCTATAG
TAAAATCAATCGCCAGAGCATTAAATAGAAAATTTGTAAGAATATCTTTGGGTGGAGTTAGAGATGAAGC
AGAAATAAGAGGTCATAGAAGAACTTATGTAGGTTCAATTCCAGGAAGAATAATTAATGGGGTAAAAGAA
GCCCAAACAAAAAATCCTGTATTCTTATTTGATGAGATAGATAAGATGGCAGCAGATTATAAAGGTGACC
CAGCTTCAGCAATGTTAGAAGTATTAGACCCAGAGCAAAATAAGGACTTTGTGGACCATTACTTAGAAAT
ACCTTTTGATTTATCAAAAATACTATTTGTTACAACAGCAAATAGTCTAGGTAATATACCAAGACCATTA
TTAGATAGAATGGAAGTAATAGAAGTATCTGGGTATATAGAAGAAGAAAAATTAAATATAGCAAGAAAAT
ACCTACTTCCAAAACAGATTAAAGAACATGCTTTAAAAGAAAACTTTATAAAAATAGATGATGAAACTTT
AAGAAGTATAATTAACCATTATACAAGAGAAGCTGGTGTAAGAACACTAGAAAGAACTATTGGTAAGATT
TGTAGAAAGGTTGCCAAAAAATACGTTGAAGACCCAACTCTTGAAGAGGTTGTTATAAATAAGTCTGACC
TAGAGACATATCTTGGAAAAGACATGTTTAAGTATCAACTTGCAGAAGTTAATCCTCAAATAGGATTAGT
AAATGGTCTTGCATGGACAGCAGTTGGTGGAGTTACACTTGAAGTAGAAGTAAACGTACTTAAAGGTAAA
GGAGAAATTGTATTAACTGGAAAATTAGGAGATGTTATGAAGGAATCTGCGAAGACAGGTATCTCTTATA
TAAGGTCAATAGTGGACAAGTTTGATATAGACCCTGAATTTTATAAGACGAATGATATTCATATACACAT
TCCAGAAGGCGCTGTTCCAAAAGATGGACCATCAGCTGGTATAACTATGGCTCTTGCAGTAATCTCAGCA
CTTACTAAAAGACCTGTTCCTGGAAATATAGCAATGACAGGAGAGATAACTTTAAGAGGTAGAGTCTTAG
CAGTAGGAGGGGTTAAAGAAAAGTTATTAGCAGCTCATAGAGCTGGTATAACAAAAGTATTAATTCCTAA
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>ref|NC_013316.1|:3776633-3777145 chromate transport protein [Clostridium difficile R20291]
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CTCTTATACAAGATGAACTTGTAAACAAACAAAAACTTTTAGAGCAGGAAGAATTTATTGATTATTTATC
CATAGCTCAAAGTTATCCTGGAGTACTGGCAGTTAATATATCTGTATTATTAGGATATAAACTTTATGGT
ATACCAGGAGTTCTTATATGTACCTTAGGCTCTGCTTTACCATCATTTTGTATAGTCTTAGTCTTATCGT
ATCTATACTTTAAAAATTCATCATCTAAAATTTTAGATGGATTTTTTAAAGGAGTTGCGCCTGTTGTAAT
AGCTCTTATATTGTATTCTTTTACGAGCATGTTCAAGAAACTACCAAAGTCTAAAACTAACATACTACTA
TTAATTATAGCAGTTTTATCTGTTGGTGTATTCAATATAAGCCCTATTTATTTAATAATTGGAGGAGGTG
TATATAGTCTATGTCAGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:3777133-3777660 chromate transport protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAGAAATAATACTACTCTTCTTAATATTCCTTAAAATAGGGGCATTTAGTTTTGGTGGCGGTTATG
CCATGCTACCATTTATCCAGCAAGAATTTATATCTAAATATCACTTTATAACTAATCAAGAGTTTTTGGA
TTTACTTGCTATATCACAATCTACACCAGGTCCTGTAGCAATAAATAGTGCTACATTTGTAGGATTTAAG
ACTGCTGGCTTCTTTGGTTCTCTAGCTGCAACTATTGGTGTTACAATTTTTGCATTAATAGGTCTAACTA
TTATATCAAAGTTATTTTCTAAATTTAAAAATAATAAAAAGGTAGAAAACTTATTGACAGTTCTTAGACC
AATTACTCTAGGATTCATATTATCAGCAGCTTTTTCATCTGCCAAAGAAGTTAATTGGGATTTATATGGA
ATAATTGCATTTATAGCATCATTTTATCTTTTATATAAAGGAAAAATTGGTTCCATTGCAATTGTATTCG
TCTTTGGTATTCTAGGTATATTACTCACATTTTTATGA
>ref|NC_013316.1|:c3778981-3777731 ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit [Clostridium difficile R20291]
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GATTAATTGCAGGTCCAAATGTATATATTTGTGACGAGTGTGTTGAACTTTGTGACGAAATTATTCAGGA
AGAAATAGAAGATACTATAGATGAAGATACTACATCTTTACCAAAACCAAAGGAAATGATGGAGATTCTA
AATGATTATGTAATAGGTCAAGAAAAAGCTAAAAAAGCTTTATCAGTTGCGGTTTATAATCATTATAAGA
GAATATACAGTAAAAAATCTAGTAGTAAGGATATAGAAATTCAAAAGAGTAATATACTTTTATTAGGACC
TACAGGTTCTGGAAAGACATTACTTGCTCAAACTCTAGCAAGAACTCTAAATGTACCTTTTGCAATGGCA
GATGCTACATCATTGACTGAAGCTGGATATGTTGGAGAAGACGTTGAAAATATACTTTTAAAACTTATTC
AAGCTGCTGATTTTGATATAGAAAAAGCTGAAAGAGGTATAATATATATAGATGAGATAGATAAGATTGC
AAGAAAATCTGAAAACCCATCTATAACTAGAGATGTTAGTGGTGAAGGTGTTCAACAAGCACTTCTAAAA
ATATTAGAAGGTACTGTTGCAAATGTTCCACCACAAGGAGGAAGAAAACATCCCCATCAAGAATTTTTAA
AGATAGATACTACTAATGTATTATTTATATTAGGTGGAGCTTTTGATGGATTAGAGAAGATAATTCAAAA
ACGTGGTGGAGATAAAACACTAGGTTTTGGAGCTAAAATAGAAAGTAAAAAAGAATTAGATTTAGGGAAG
CTGTATGAAAAAGTACTTCCAGAGGATTTATTAAAATATGGTATAATACCAGAGTTTATAGGAAGAATAC
CAGTTTTAGCTACTTTAGAGTTGTTGGATGAAGATGCATTAATGCAGATATTACAGGAACCTAAAAATGC
TCTAGTAAAACAGTATAAAAAGTTATTGGAGTTAGATGATGTTGAGCTAGAATTTGAAGAAGGTGCTCTT
CGTGCAATCGCTAAAAAGGCTATAGAAAGAAATACAGGAGCTAGAGGACTTAGAAGTATAGTTGAAAGCG
TAATGATGGAAACTATGTTTGAAGTACCATCTAGAGATAATATAAAGAAGGTTATAGTAACAGAGAAATC
TGTGAACGAAGACTCAGTAAATCCTATCATAGTACTTAAGGATCAAGAGGAAAGTGCATAA
>ref|NC_013316.1|:c3779584-3779000 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit [Clostridium difficile R20291]
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GCTATTATTTTTAGAAGCTGAAGACCCAGACAAAGATATACATTTATATATAAATTCTCCAGGAGGAAGT
ATAACTTCTGGAATGGCTATATATGATACTATGCAATACATCAAACCAGATGTAAGTACTATATGTATAG
GTATGGCTGCTTCTATGGGAGCATTCTTGTTGGCAGCAGGAGCAAAAGGAAAAAGACTAGCACTACCAAA
TAGTGAAATAATGATACATCAACCATTAGGTGGAGCTCAAGGTCAAGCAACAGATATAGAAATTCATGCA
AAGAGAATTTTAAAAATAAAAGAAACTTTAAATGAGATATTATCTGAAAGAACTGGTCAGCCATTAGAAA
AAATTAAAATGGATACTGAACGTGATAACTTCATGAGTGCACTAGAAGCCAAAGAATATGGTTTAATAGA
TGAAGTATTTACAAAGAGACCGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3781076-3779733 trigger factor [Clostridium difficile R20291]
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AAATAAGGCTTATAATAAAAGCAGAAATAAATACAATATACCTGGATTTAGAAAAGGTAAAGCTCCAAGA
ATTGTTATAGAGACTCAATATGGAAAAGGTATATTCTACAATGATGCTATAGAAATATTATTCCCAGAAG
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AAGTAAAGATAATGGGTTGGTTATGGTTCTTAATGTAGAAGTTAAACCAGAGTTTGAATTAGGAAACTAC
AAGGGTATAGAAATAGCTAAGGTTGAGAATACTGTAAGTGACGAAAATGTTGATGCTAAACTACAAGAAA
TGGTTGAAAAAAATGCCAGATTAGTAAGTGTAGAAGACAAAGCTTTAGAAGATGGAGATACAGCTATAAT
AGACTTCGAAGGTTTTGAAAATGGTGTAGCTTTTGATGGTGGTAAAGGTGAAAATTATAACTTAGTTATA
GGTTCAAACACATTTATACCAGGATTTGAAGAACAATTAGTAGGTAAAAAAGCTGGTGAAGAAGTAGAAG
TTAATGTTACTTTCCCAGAAGAATATCACTCACAAGATTTAGCTGGAAAACCAGTTGTATTTAATGTAAA
AATAAATGATGTAAAAGTAAAAGAATTATCTGCACTTGATGATGAATTTGCTAAAGATACTAGTGAATTT
GATTCTTTAGATGAATTAAAAGCAGATGTAAGAGCTAAGTTAGAAGAAGAAGCTAAAAATAGAGCAGATG
CAGAAACTAGAAATTCAGTAGTAGAAAAAGTTGCTGAAAATACAGAAATAGAAATACCAGAAGTTATGAT
ACAACATCAAATAGATAATATGTTAAATGAACTTAACTACCAATTACAATATCAAGGATTTGGATTACAA
CAATTACTAGAGATGACTGGTAGAACTATGGAAGAATTAAGAGAAGAGAGAAAAGAAGATGCTAAAAAAT
TAGTTAAGTCTTCTTTAGTATTAGAAGCAATAACTAAAGCTGAAGGAATTGAAGCAACAGAAGAAGAATT
TAAGGCTGAGTTAGAAAAAATGGCTTCTGCTTACAATATGGAAGTAGAAAAAATAGAAGCTTCTTTAAGA
GATGCTGACAAAGAAGATATAAAAGGTCAAATAAAAATAAGAAAAACAATAGATTTATTAGTTGATAATG
CAACAATAGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3781683-3781213 putative phosphoesterase [Clostridium difficile R20291]
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AAGAATGTGACCTAATAATTCATGCAGGAGATAACTTTACTGATTCAAGATATATTCATAGCATGACTAA
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GCAAATAAAACCATATTCTTATGCCATGGAGATAAGTATGGTGTAAAATATGGAACTAATATGTTAGAAA
AAAAGGCAACTGAAGTTGATGCTGATATAGTTATATTTGGCCATACCCATACCCCATTTAGAGAAATTAA
AGATGGTGTACTTTACATAAATCCTGGAAGCACTTCACTTCCAAGAGGAGTATCGTATAAAAGTTTTGTC
ATTATGGATATAGAAGAAGATGACATAAAAATTGAAGAAATACGCATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3783032-3781683 ribonuclease Ph [Clostridium difficile R20291]
ATGACCAGAAGTTATGATAGAAGTAACGAACAGATAAGACCTGTAAAGATAACTAGAGATTATACAAAGT
ATGCAGAAGGTTCTGTTCTTATAGAAATGGGAGAGACAAAGGTTATATGCACTGCATCAGTGGAAGAAAA
AGTTCCTCCTTTTTTAAGAAATAGTGGTACTGGATGGATAAATGCTGAATATTCTATGCTACCAAGAGCA
ACACAACAAAGAAAGATAAGAGATGCATCTAGGGGAAAAATTGATGGAAGAACACAAGAAATACAGAGGT
TAATAGGAAGAGCAATAAGGTCTGTTGTAGACTTGAATAAATTAGGAGAAAGAACTATTTGGGTAGATTG
TGATGTGATTCAGGCAGATGGTGGAACTAGAACTGCATCTATAACAGGGGCATTTGTAGCAGTTGCAGAA
GCAATATATAAATTATATAAAGCAAAGACAATAAAAGAGATGCCAATAACAAATTTTGTATCTGCAATTA
GTGTTGGTATTGTAAATGGAATACACATGCTAGATTTATGTTATGAAGAAGATTCTAAAGCACAGGTAGA
TATGAATATAATAATGACTGATAAGTGTGAGTTTGTAGAAGTACAGGGGACAGGAGAAGAGAAACCTTTT
TCAAGAGCAGATTTAAATTTATTGTTAGAGTTAGGCGAAAAAGGGAATAAAGAATTAATAAGGCTTCAAA
GAGAAGCTTTAGGTGAAATAGCAGATGAGATATTGGGTATGGATTATGGTAATGAAGTAGTGATTGCTAC
TAATAATGCTCATAAGCTAGAAGAAATAGGTGAAATCTTAAAAGATTTTGAATATAAAGTGTACTCTTTA
AAAGATGTTGATTTAGCAGGTATAGAGATAGTAGAAGATGGAAAAACATTTGAGCATAATGCGTTGATAA
AAGCTAGAGCAATAGCAAAAAAGACTAAACTTATAGCAATATCAGATGATTCTGGCTTAGAAGTAGATGC
TTTAGGCAAAAAACCTGGTGTTTATTCAGCTAGATATGCAGGAGAACATGCAACAGATGAAGAAAATAGA
AAAAAACTGTTAAAAGCTATGCAAAATGTACCAATGAGCAAAAGAAATGCAAGATTCGTCTCTGCAATAG
CAGTAGTTTTTCCTGATGGAAAAGAATTTGTAGTAAGAGGAATTTGTGAAGGAATGATAGGATTTGAAGA
AAAAGGTAAAAATGGTTTTGGATATGATAGCTTATTTATAGTAAAAGGATATGATAAGACTTTTGGTGAA
ATACCTAGTGTTATAAAAAATTCAATCAGTCATAGAGCAAACGCACTAAAACTTATGAAACAAGAGTTTA
TAAAAAGGGTAGTGAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3785225-3783192 DNA ligase [Clostridium difficile R20291]
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ATTATAATCAAGATAGCCCAGAAATATCAGATTATGAATACGATAAGTTAATGAAGGAGTTAATTTCTTT
AGAAGAAGAACATCCAGAACTAAAGAGAATTGATTCTCCAACAAATAGGGTAGGAGGTAAGCCATTAGAT
AAATTCAATCAAATTGTACATAAAACTCCTATGTTGAGTTTATCAAATGCTTTTTCAGAGCAAGATTTGA
GAGATTTTGATAAGAGAGTTCAAGAATATGTGGGAGAAAATGTTGAATATGTTGTTGAATTTAAAATAGA
TGGTCTTTCTGTAGGTCTAACTTATAACAATGGAGAGTTTGAAAAAGGAGCAACTAGAGGAGATGGAGTT
GTAGGAGAAGATATTTCTCAAAACTTAATGACAGTAAAAAGCATACCTCTTAAGATAAATGATAAAAAAG
AACTAATAGTTAGAGGAGAAGTATATATATCAAAAGATAATTTTAGAAAAGTAAATGAACAACAAGAAGA
ACAAGAACAGCCATTATTTGCTAATCCAAGGAATCTTGCAGCTGGTTCATTGAGACAATTAGACCCAAAA
CTAACAGCAAAGAGACCATTAGATATATTTGTATTTAATATGGAAAATATAGAAGAATATGATTTAGAAA
GTCACAGTGAATCACTAGAGTACTTAGAAAAACTAGGATTTTCAGTAAGTCAGAGTTATAAAGTTTGTAA
AAGTATAGATGAAGTTATTGAGCATATTGAATACTGGACAGATAACAGGGGTAATTTAGACTACGAAATA
GATGGTATGGTAATAAAAGTAAACAATATAAAACAAAGAGACGAAATGGGATATACAGCCAAAAGTCCTA
GATGGGCAATTGCATATAAATTCCCAGCAGAAAAGAAGAAAACTAAAATAGTAGATATAATAGTAGAAGT
TGGGAGAACTGGTACAATAACACCTTCAGCAATTCTTGAACCAGTCAGACTTGCAGGTACTACTGTAAGT
AGAGCTACACTTCACAATGAAGATTATATAAGAGAAAAAGATATAAAAATAAATGATACAGTATTAGTTC
AAAAAGCAGGGGACATAATACCTCAAGTTTTAGAAGTTATAAAAGAGGAACGTACTGGAGATGAAATAGA
TTTTAAAATGCCAGAAAAGTGTCCAGTTTGTTCAGAGCCAACAATAAGATTAGAAGGAGAGGCTGCTGTA
AAATGTATCAATATGTCTTGCCCAGCCCAAATAAGAAGGGGAATTATACACTTTGTGTCAAGGGATGCAA
TGAATATAGATGGATTGGGAGAATCTATAATTACACTGCTATTAAATGAAAAAATTATTCAAGATGTATC
TGATTTATATTATATAAAAAAGGAAGATGTAGTCGACCTAGAGAGAATGGGCGAAAAATCTGCTGACAAT
TTAATAAATTCAATTGAAAAATCAAAAGAAAATGATTTATGGAGACTTATAAATGGATTAGGTATTAAAT
TTATAGGAGTTAAAGCAGCTAAGATACTTGCATATAACTTTAAGGATTTAGATGAAGTAATTTCTGCAAC
TAGTGAGCAACTAGAAGAATTAGAGGAATTTGGAAGTATAATGGCAAACAGCGTTGTCGAGTTTTTTAAG
GAAGACAAAAATATGAACGTTATAAACAAGTTAAAAAATGTAGGAGTAAATACAAAATCATTGGATAATA
CAGGTGAAAAAGTAGAAAAAATATTTGAAGGGATGAAAATCGTATTGACTGGTACACTTCCTACATTAAA
AAGAAATGATGCGAAAGATATGATAGAAAAAAGAGGTGGAAAAGCTACATCTAGTGTTAGTAAATCGACA
ACATTTGTTTTGGCAGGTGAAGAAGCTGGTTCTAAACTTACTAAAGCAAATGATTTAGGAATTAAAGTTA
TAGATGAAGAGAGATTTTTAGAATTATTAAAGTTATCATCGAAAGATGAAGTAAAAGCTGTATTAGAGAG
TTAA
>ref|NC_013316.1|:c3786340-3785402 putative D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTTTTATTTACAATAAATTATGGAAAAGAAAAATTTGATAAAATAAGAGAATTAGGCTATGATG
TCATACATTACTCTGAAGATAGTATTGAAAATAATGAGGATGTAAATACAGCAGATGTACTAGTTACATA
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ATAGACCAACTTCCAAAAGAAGAGGTATTGAAGAGAAATATTAAGATAGCTAATAATAGAGGCGGATATA
GTGTACCTATTGGTGAAAGTATTGTATTGTATATTTTAGAAATATATAAAAATAGTGCAAAATTTTTTAA
ACAACAACAAAATAAAGAATGGAAGATGGATTTTTCTGTATCAGAATTGTATGGACAAAGAGTTGGATTT
TTAGGAACAGGTACTATATCTTCAGAAGCAGCAAAACGATTAAAAGCTTTTGGTGTAGAAATATGGGGTG
TCAATACTGATGGAAGTAGTAAAAAATACTTTGATAAGTGTTTTGCTACTGAAGATATGAATATTGTATT
TGAAGAATGTGATATAGTAGTTGTAGCAATGCCTTCTACAAAAAGTACAGATGGAATAGTAAACAAAGAT
ATGTTTAAACTTATGAAAGATGGTTCTGTATTTATAAATGTAGGTAGAGGAAATACAGTTAATCAGAAAG
ATTTAGAAGAATGTGTAGAGAAATTTAGAGGGGTAGCACTAGACGTATTTGAAAGTGAACCTTTAAACAA
GGACAATAAGTTGTGGGAGTGCGAAAATGTCATAGTAACTCCTCATAATTCTTGGGTGTCAGATAAAAAC
AAAGAGAGAACATTTAATATGGTTTATAATAATTTGAAACACTATATAATGGAGAATAAACCTGTAGATA
ATGTTGTAGACATATCAAGAGGCTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3786873-3786442 hypothetical protein CDR20291_3172 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAAAATGTCATTTGAAAAAATAAATAATAATAACCTAGATAAAATACACAATAGGAAGTGTATTA
TGCTTGTAAACTTTAATAAAAAAGAATTATCATTAATTAAAAACGTAAGTAACTTTGCTGGAATAAGAGA
CCATATAATCTTAAGTGAAAAAAACGGAGAGAATATAATAAGAGACATTTTAGATGGAAATATATCAAGT
GAATGTGAAAATGGGATTAAGAGTAAGTCTGTAATATTTAATAACACTCCAAGCACACAAGTAAATGCAT
TTTTAGAAGGTCTAAAAAAAGTGAGAATAAATAGACCTTTTACAGCTATGGTAACAGAGACATCTATTGA
TTGGACATTGAATAATTTAATAGAAAATTTAGTTCAAGAACGTAATGCTATGTCTTTAGGAAAAACAATT
GAACATAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:3787052-3788335 putative transporter [Clostridium difficile R20291]
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GTATGTTAATACAAGCTGTTCCATTTAGTATTGTAGCAAGTATACAGCCTCAATTTATAAGTTATGTTGT
AGAAGGAGAAGGCTTTAGTTTAGCTTCTTTTTCTCTAATATTCACTATTGGTACTATTGCCTCAGCAATT
GCATCACCTTTTATAGGTGTATTATTTTCTAAAGTCAATATTAAGATACTATATTTATTAGGTTGTATAA
TTTCTAGTATTGCTTTTGCTACTTTTTCTATATGTACTGAACTATGGCAATTTTACACTGTATCATGTAT
TGTTCAAATTGGCGCTACAATTATATCTGCTATAGGAATACCTGTTTTAATAAGTGCTTGGTTTGATGAA
GAAAGCAAAGGAAAAGCTTTGGGCTTTGCTTTTGCTGGTGGTTCTATTGGTAGTATATTTCTACAACCAC
TTGCAGTTCGCTTATTAGCAACTCAAGGATACAGTCATTCTTATCTAATATTTGGAATTATAGCATTAAT
AGTTGGTATACCTGTAATATTATTCATACTCAGGATGCCTAAAGATATTAATGAAAAGGTAAAATCTAAA
GGTAAAAAAGAGAAAGCATCTGATACAATTTCTCCTTCAGTATGGGGTTATACATTAAAAGAAGCTAAAA
AAATTAAATATTTTTGGATTATGACTATTGGATTTATATTTGTTGGTATATATGTTTCATCATTATCCGT
ACAATATCCAACTTATCTTAGAAATTATCTAAATCCTATTCTAATAGGAACAGTAGGCTCCACATTTGCT
TTATTTGCTCTCATTGGTAATTTATTTGGAGGATTATTGTTTGATAAATTCGGTCAAACAAAGCCACTTA
TTATATCTTTTGTATTGGTTCTTATAGCAACTTTATCATTACTATTGGTAGATAAATCTTCTACTTTTGC
ATTTGTATTTGCCATTTTGAAAGGTCTTTCTGTATTTGCTTATATGATTGGTCCTGCTTATTTAACTGGC
TCTTTCTTTGGTCAAAAGGAGTTTGGTAGCATATATGGAATCGTACAATTAATTTTTGCAGTGGGATTTG
CATTAGGTTCAACATTATTTGGATTGTTAGTTGATAATTTTGGATACAGATTTTCTTGGTCTATTATAAT
TTTATCAGTTATAATTGCCTATACTTTACTTATTATAACTTCTATAGGAATGAAAAAATTGAATAAAGAA
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>ref|NC_013316.1|:c3788928-3788413 electron transport protein [Clostridium difficile R20291]
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CATAAAGACAAAAGAAGTAAGTGCTCCAATACAGTGTAGACATTGTGAAGATGCTCCTTGTGCAAAGGCA
TGTCCAAATGGTGGTATAGTTAGGGTTGGGAACACAATAAAAATAAATGAAGAAAATTGTATAGGATGTA
AGACTTGTATGTTAGCATGTCCTATAGGTGCAATAGACATAGTTACATTAAAAGATGTAGATGAAGGAAA
GCTTTGCTTTAGAGAAAGAATGACAGCAAATAAGTGTGATTTTTGTATAGAATCGCCAGAAGGGCCTGCA
TGTGTAAATGTTTGTCCAACTAAGGCATTTACTATAGTTAAGGATGAGGATATAGATAGTAAAGTTAAAA
ATAAGAGAAAATTAGCTATATTGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3790304-3788928 hydrogenase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAATAAATATAGATAAGGATTTATGTACTGGATGTAGAGAATGTTCAAAGGTCTGTCCAGTAAATG
CTATTGAAGGTGAAGAGGGAAAGCCACAAGAGATAAATTTAGATAGATGTGTTATGTGCGGTCAATGTGT
TCAAACTTGTAAATCTTATGCCTCAGTTATAGATGAAGGATTTGAGTTTTTACAAGAGAAAAAACAAGAA
AGAGAGATACCAGAGTCTATAAATGAACCTATATTTGCAGCATACAATGTATGTGATATAGATAAGGTAA
AGAAAGCTTTAAGTGACCCAAATGTATTCACTATGGTCCAATGTGCACCAGCAGTTAGAGTTGCTTTAGG
AGAAGATTTCGGATATTATTTAGGATACTTAGGTGCTGGAAAAATGGCAGCAGCACTTAGAGCTTTAAAT
TTTGATAGAGTCTACGATACTAATTTTGCAGCAGATTTAACTATAATGGAAGAAGGTAGTGAATTAATTA
AAAGAGTGACAGAAGGTGGAACTCTTCCAATGTTTACATCTTGTTGTCCAGCTTGGGTAAAATTCATGGA
AAAAAATTATCCTAAATTAACTAATCATTTATCTTCTTGTAAATCACCTCAGCAGATGGGTGGTGCAATA
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GTACATGTAAAAAATATGAATGTGATAGAGAAGAAATGGATTCTAGTGGATATAGAGATGTAGATGTAGT
ATTAACTACTAGAGAACTAGCTTATTTAATAAAAGACATGGGAATTGATTTTAAAAATTTAAGAGAAGAA
AAATTTGATAGTCCTTTAGGTAGTTATAGTGGAGCTGGAACTATCTTTGGTGTTACTGGTGGGGTTATGG
AAGCTGCTATAAGAACAGGATATGAGCTTATAACTGGAGAAAGTATTCCTGATGTAGAAGTAAAACAAGT
AAGAGGAGAAAATGGTTTTAGAAAGTCAACTATTAAAATAGGAGACTTAGACTTAAGAGTTGGAGTAGTA
AGTGGATTAAAAAATGTAATACCAGTGCTTGAAGACTTGGAAAAAGGAAAATTAGATGTAGATTTTATTG
AAGTTATGACTTGTCCTGTTGGGTGTGTAAGTGGTGGAGGTCAACCAAAAATTTTACTAGAAGAATATAA
GGAATTGGCTTATGAAAATAGAACAAAAGCAACATACGTGCATGATGAACATTTAGCAATTAGAAAATCT
CATGAGAATCCTGATATTAAAAAACTGTATGATGAATATCTGGTAGAACCATTAGGAGAAAAATCTCATC
ATCTATTACACACTACATATTGTATAGGAAAGGAAGTGGCTAAGTGA
>ref|NC_013316.1|:c3790880-3790329 electron transport protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATAAAATAGGCTCTTTTGTAATAGCGGACCCAAACAAATGTACAGGTTGTAGAGCTTGTGAAG
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GCTCCTTGTTTAAACTCATGTCCACAAAAAGCTATAGTCAAAGAAAACAATATTATGTCTGTAAATGAAG
AAAAGTGTATAGGATGTAAAACTTGTCTGCTAGCATGTCCTTTTGGAGCTATAGACTTACTTCCACAATA
TGAAGATGGTAAAGAAGTAGAACAAGTAATTTTAGATGAAAATAAGAAGATAGCTTATAAATGTGACTTA
TGTAAAGACAATGAAAAAATAGCTTGTATAAGTGCATGTCCTCAGGAAGCATTAAAACTTGTTACTCCAA
TAGATGACAAAAAAGCTAAGAATAGACAAGCTGCACTTAGTTTATTGTTAACAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3791111-3790938 hypothetical protein CDR20291_3177 [Clostridium difficile R20291]
ATGTGTACTAAAAAAGAAGAACAAAAATGTTCAAAGTGTGAAATCTGTGGAGTATTAATTGACGATACTG
ATAAGGTGTATAATAACACATACAATTTGTGCAAAAAATGTAAACGAAATATAAGTACTGAGAAAATAGT
GAAATATATAAATATATATGATGAAAGTAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3791955-3791122 formate dehydrogenase accessory protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAACAATATATACTCAAAAACTAAATTACAAGAAAATAGTAAGGATAAAGTTTTTGAAAATAGTTATA
GTCTAGTGGACTACAAATATTTAAATTCTTTTAATGTAGAAGTAAGCAAAATAAATGAACATGAAGTATC
AATAGATAATGAAGAAATAATTGCAGAATATCCACTTAGTTTTATTTTAAATGATAAATATGTAAATACA
TTTTTATGTACCCCATATAATTTAGAGGAACTTATAGTAGGATTCTTGAAAACAAAAGGATACATAGAAA
ACAAAAAAAGCTTATTAAAATTTGAGATAAATGAGAGTGAACGTTTTGCAAAAGTAACTATTCAAGAGAA
ACAAAAAAATCAAGATGAGCAAATTATATTTTTAAATTCACTAGACTATATAACATGTGCTTCTGTAAAG
AGCAATATAAAAATAAATTATGATACGATTTACAGTATAATGGATAGAAATTTAAATTCATCAGAATTAT
TTAAAAATACTGGTGGGGTACATAGCGTATCTGTATTTAATTTTGATAAAAAAATAGTCACTTGTGAAGA
TGTAGCAAGGCATAATGCAATGGATAAGGCTATTGGATTTTGTGTTTTAAATGACATAACATTAAAAGAT
AAAATTGTGGCTGTAAGTGGAAGAATATCATTGGAAATGATATTAAAAGCAGCTATGACTCAAATTCCTA
TTGTAGTATCAAAATCAGCACCGACTAATTTATCAATAGAGCTTTCTAAAAAATTAAATATAACGCTTAT
TGGATTTGTAAGAGGAAGACGGATGAATATTTATGCAAATCCACAGAGAGTTATCAAAAAGTGA
>ref|NC_013316.1|:c3794148-3792004 formate dehydrogenase h [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGAAAAAAATTTTAACAGTTTGTCCATACTGTGGAGCTGGATGCCAATTATATCTAGTAGTAAAAG
ATAATAAGATATTAAGAGCTGAACCGGCTAATGGTAGAACAAATCAAGAAAGTTTGTGTTTAAAAGGTCG
TTATGGATGGGATTTTCTAAATGACCCTAAAATTCTAACACCTAGGCTAAAAAAGCCAATGATAAGAAAA
CAAGGTGTACTAGAAGAGGTTGAATGGGATGAGGCTATAAACTATACAGCTTCAAGACTAAATGAAATTA
AAGAAAAATATGGACCTGATTCTATTATGGGAACAGGTTCTGCAAGAGGACCTGGTAATGAAGCAAACTA
TATAATGCAAAAATTTATGAGAGCTACAATAGGAACTAATAATGTTGACCATTGTGCTCGTGTACATGCA
CCATCTGTAGCCGGTCTGGCTTACTCATTAGGTAGTGGTGCAATGTCTAATTCTATACCAGAGATAGAAA
ATGCAGATGTTTTATTTATATTTGGATATAATGGAGCAGATTCACATCCAATAGTGGCAAATAGAATAGT
AAAAGCTAAAAAAAATGGTGCTAAATTAATTGTTACTGACCCTAGAGTAACTGAATCTGCAAGAATTGCT
GATATACATCTACCTATAAAAGGTGGAACAAACATGGTTTTAGTAAATGCTTTTGGAAATGTATTAATAG
AAGAAGGTCTTTACAATAAAGAATTTGTTCAAAATCATACACAAGGATTTGATGAGTATAAAGAAATTGT
TAAACCATATACAGCTAAATATGCTGAAAAGATTACAGGAATCCCAGAAGAGCTTATAAGAAAAGCTATG
AGAGAATATGCAAAAGGGAAAAAAGCTATGATACTTTATGGAATGGGTGTCTGTCAATTTGGTCAAGCTG
TTGATGTAGTTAAGGGACTTGCATCAATTGCTCTACTTACAGGTAATTTTGGTAGAGAAAGCGTTGGAAT
AGGACCTGTACGTGGACAAAATAATGTTCAAGGAGCTTGTGATATGGGAGCTCTTCCTAATGTATATCCT
GGCTATCAAAATGTAACTGATGATAAGATAAGAGAAAAGTTTGAAAAAACTTGGGGGGTAAAATTATCTC
CTAATAATGGTTATAGTTTAACTCAAGTTCCAGACTTAGTACTAAAAGAGAAAAAGCTTAAAGCTTATTA
TATATTTGGAGAAGACCCAGTGCAAAGTGACCCAGATGCATCAGAAGTTAGAGAAGCATTAGATGAATTG
GAATTTGTCATTGTTCAAGATATATTTATGAATAAGACAGCACTTCACGCTGATGTTATACTTCCAGCTA
CTTCTTGGGGAGAACATGAGGGAGTATATACATGTGCAGATAGAGGATTCCAATTGATGAGAAAAGCTAT
AGAGCCACAAGGAGATGTAAAACCAGACTGGCAAATTATAAGCGAAATTTCTACAGCAATGGGATATCCT
ATGAATTATAAAAATACTAAGGAAATATGGGACGAACTTAGACAATTATGTCCAAGTTTCTTAGGTGCTA
CTTATGAAAAGATAGAAACTCAAGGATGCGTTCAATGGCCTTGTAAGAGTGAAAGTATGGAAGATAAAGG
AACTATGTATCTGTATGAAGGTCAAAAGTTTTCTACTCCTAATGGTAAAGGTAATTTGTTCGCTGCTGAA
TGGAGACCCCCTATGGAAGTTGAAGATGATGAATACCCATTTAGTTTATGTACTGTAAGAGAAGTTGGAC
ACTATTCAGTAAGAACAATGACTGGTAATTGTAGAACACTTAGTTCATTAGAAGATGAACCAGGACGTGT
TCAAATAAATTCTAATGATGCTGAAAAATTAGGAATTGAAGATGATGAATTAGTTAGAATTAGTTCAAGA
AGAGGAAGTGTAATAACAAGAGCAACAGTTACTGATAGAGTTAAGGAAGGTGCAACATATATGACTTATC
AGTGGTGGGTTGGAGCTTGCAATGAACTTACAATAGCAAATTTAGACCCTATATCTAAAACACCAGAGTA
TAAATATTGTGCTGTTAAACTTGAAAAACTTGAAGACCAAGAATTAGCAGAAAAATGTGTAAGAGAAGAG
TATCAAAGTTTGAAAGACAAAATGACAGCTACAAATATCTAA
>ref|NC_013316.1|:c3795457-3794399 hypothetical protein CDR20291_3180 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAGACTAAAGAATATTAGAAAGAGTTTACTACAGTATACATTTTTATTTTTGTTAATAGGTATAA
CAATTTACCTAGTGTTTAAAACATTGGATATTAAAATGCTATCAAATGTTATGGTTATGGTAGATAAGAA
GTTTTTATTCATAGGTGCTTTGGCAATAATGTGTCACATAATGCTTGAAGGAGTAGTAATGAAGATAATT
ATAGAAAGCACTCACAAAGTTAATATTAGATTTATTGGTTTTAAGCTAGCCATTATGGGATTTTATTATA
ATTTAATAACTCCTTTTGCTTCAGGAAGCCAACCAGTACAGATATATGTACTTAAAAAATGTAAAATGCC
ACTTAGTAAGGCAAGTGCAGTTGTTACCAATAAGTCTATTATTTTCCAAATAGTGGTTACTTTTTATTGT
ACAATACTTGTATTAATGAATTTTGCTATGTTAGAAAAACAAATGAAAATGATTATGCCTCTAGTGTTTC
TAGGGATAGCCATTAATTCATTTGTCTTAATTATGATAATATTAGTTATTTTAAACCCTAAAAAAATAAA
ATATTTTATGAGAATTACTATAAAGCATTTATCAAAAATTAAGTTTTTAAAATTTTTAGATAATAAGATT
GAATCCATAGAAAGTTTTATAGATGATTATAGTAAAGCAATAAATTTTTTTGCAAAGAATAAAAAGGTAT
TAATTTCAACTATAATAGTAACTTTTATTCAATTAAGTGCTTACTTTAGTGTTTCATTTTGGATATATAA
AGCATTTAATTTACAAGGTTATAGCTATATTTATATACTGACATTACAAGCATTTTTATATATGGCAATA
TCTCCAATACCAACACCTGGGAATGTAGGAGCTAATGAATTAGCCTTTTTCACTATATTCAAATCAGTAT
TCCCTCAACCTTTGATGGGATATGCAGTATTTTTATATGGTGGATTTATGTACTATTTAATTCTGATTGG
AAGTGGAATATTTACTGTAATTACTCACTATAGAATGAAAAATAGAATTGGCAGAAATATTGTTTTAAGT
GAAAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3796327-3795668 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTAAGATATTAGTAGTAGATGATGAGTTAGATATGTTAAAGTTGATTGAAAATGTGTTGAAAAGAG
ATGGACATGAAGTAAAGGTAATTAGTGATGTAGAAAAGGCTATGAACATGGATTTTAATTATTTTAATCT
AATAATATTAGATGTTATGATGCCTAAGATGGATGGTTTTGAAGTATGTAAAACTATAAGAAATAAGGTT
GATTGTCCAATACTGTTTTTGACAGCAAAAAATATGGAAAGTGATATTATGTACGGTCTTGGCATAGGTG
CAGATGACTATATAACCAAACCTTTTGGTGTAGGAGAATTAAGGGCTAGGATAACTGCTCATTTAAGGCG
AGAAAGTAGAGAAAAAAAGAATTTATTAACTATCTCAAATGTTCAATTTAACTTTTTAGGCAAAGAAGTT
TCAATTGATGGTAAAAAAATTAATTTTACTAAAAGTGAATATCTAATATGTGAATTTCTAGCAAAAAATA
AGGGACAAGTATTTTCAAAAGAAAGAATATATGAGTCGGTATATGGTTTTGATGGAGAAAGTGATATAAG
TACTATCACAGAGCATATAAAAAATATACGAAGCAAATTAAAACAATATGATATTTATACAATAGAAACT
GTATGGGGGATAGGGTATAAATGGGTGTAA
>ref|NC_013316.1|:3796638-3797267 hypothetical protein CDR20291_3182 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATGAAAATATAACAAAAAATAATTATAATGTTCCATTTGACTATGTTCGAAAAAAACTCAAAGAAT
TAGACCCTCATACAATTAGTAATTTAAGTAATATACCTTTCAATAATGATTTAAATAGATTCACACTCAA
TTTTTTTGATAGACAATATATTATAGACTATCCAAGTGGAGAAGTTTGGAATAGTAATGGTAGCCTTTGC
AATAACTTTGAGCTTAAAATCTTGATAGTTAGATATTTAATCAATGCTAAAGGTATCCCTAGAACTAATA
AATATGTAACTTTTAAAGAAATACCAGGAGGCAATGTTTATTATCCAAATTTTTTAAACAGGACTCTATA
TAGGCTTTCAGAAGTTTTTACATCTCAAATAGACAAATATAAGTTAGTTATGGAGAAAATTGGAGCTGAA
AAAGTAAACATGGGAGATTTAGCTTATAGGTTTACATATATGGGTAATACATCTATGATATTTATACTTT
GGTTTGGAGATGATGAATTTCCTCCAAATTCAAATATATTATTTGATTCTAATATAGTTTATTACTTCAA
TGCAGAAGATTTAGCAGTTGTTCCTGATACAGCTATAAATGCAATTTTAAATAAAATAAATCAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:3797335-3798168 hypothetical protein CDR20291_3183 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGTAGAAAATCAATCTTTATCAGATATTGAAATAATATTATCACACAGGTATGATAATGGTGCAG
ACTATTGGACTACACCTGATAAGCGTTTAATAAAAGGTTCTCCTTTCTCTACTCTTGATAGTGTACTTTA
TCTATTAGAGTTAGGTGTGAACCCTGATGATACTTTACTTAAAGAATGTGCTGACTTGATATTTAGCACA
TGGCGAGAAGATGGACGTTTCAAACTATATCCAAATGGAGGTATTTACCCTTGTCATACTGCAAATGCTG
CTAACGTACTCTGTCATATGGGATATGCATCTGACATTAGAATGCAAAAAACGTTTCAACATTTTTTAGA
TACACAGTATACTGATGGTGGGTGGCGTTGCAATAAATTTAGTTTTGGTCGAGGTCCAGAAACTGAATAC
TCAAATCCACTACCAACTCTTAATATATTAAATGCATTCCGTTTTAGTAATTATCTAAATAAAGAATCAA
AACTTGACAAAGCTGTAGATTTTCTACTTGACCATTGGACTATTAAAAAACCACTCGGCCCTTGTCACTA
TGGAATTGGCACATTATTTATGCAAGTTGAATATCCTTTCCGTAATTATAACCTATTCCTTTATGTCTAC
GTTTTATCATTTTATAATCGTGCAAAAAAGGATAAGAGATTTTTAGAAGCATTGAAGATACTTGAATCTA
AAATGATAGGTAATAAAATTGTCGTTGAACGTGTAGTTCCAAAACTATCTAAATTATCTTTTTGTAAAAA
AGGCGAGTCAAGTGAAATAGCCACAACACACTATTACGAAATATTAAAAAACCTAGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3799052-3798264 hypothetical protein CDR20291_3184 [Clostridium difficile R20291]
ATGTGTATATTGGAGTTAATAAAATTTGAGCTTAAAAAAATAGAGCTTAAACATGTGTTAATATTTGTAA
TTATTTCTATATTATGCATATTTATTACAGGCATATTAGATTATAATGAGTTAATATTTTATAATGATGT
ACCTATAATGGATACATATTCTATAGCAGGATGGTTAGGAATTATAAAGATATCAGATGTTTTTATACCA
ATAATGTCAGCAATCACAATAATTTATGTGTTTTCAAAAGATTATTTGGGTAATATAAATGAGATACTTA
CTTTATATAATAAAAAAAAATATAATCAATTTATAGTATTTAGATGGTGTGTTATATTAGCTATATATAC
TGTATTATTATTAATTTCAATTACAATAGTATATACATTTACGTCAGTGAAAGGTTTTAACATAGACAAA
ATAGATTTTGTTTATAGTGTAAAGCCAATAGATGTGTTTTTAAAGACATTTCCTACATTATTATGGTATA
CAACATTTCCACTAATGATATTAACATTAACAAAAAATAGATTTACAACAATAGCAATATTAATTACATA
TACATTTGCTGATATATTTTTTATTTTACATATGTACCCATTTGTTAGTATGATTAATGTAAATGGATTT
TATATTCAAAAGATGTTTTATATGCCTAATAATATAGATGTTAGATTTAATGAATTAAAGAATTATTTCT
TTATAAATAGAGGTTCTCTAGTAGTTATTTCTATAATAATAGTTTTTTATATAGCAAGAAAATCAACGGT
TTTAAAAAAGAGTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3799925-3799053 abc transporter, atp-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAACAAGTTAGAAATAAGAAATCTAAATTTTAATTACAAAAATAAAAAAGCTCTGGATAATATAA
ATTTAACCCTAACAGATGGAGTAGTTGCATTATTAGGTCCTAATGGTGCTGGAAAATCAACATTAATGAG
GTTATTAGTGACTCTTTATGAAACTTCAATTGGAGAGATAGAATTAAATAATATAAAGTATAGCAAAAAC
AATGAGAAAATCAAGGCAAATGTAGGATATATACCTCAAGATTTTGATATGTATAATAATATAAATGGGC
AAGAATACTTAGAGTTTGTAGCTAAAATGAGAGGTGTATCTAAGAATGATTTAAAGAAACATATACAAAA
AGTAGTATCAAAAGTTAATCTGGACAAGTTTATAAATAATAAAATAGGTACATACTCAGGTGGTGTAAAG
AGACGACTAGGTATAGCACAGGCTTTAATAGGTGATTCTAAGTTAATAGTTATGGATGAACCTACAGTTG
GTCTTGATCCAGAGCAAAGGAATGAATTTAGAAGATTGTTACCAGAAATAAGTAAAAATTCTATAGTATT
AATTTCAACTCACATAGTAGAAGACATACAATTTAACTGTGACAAATTAATTATATTAAATCAAGGCAAA
ATATTATATGATGGTACAATTAATAAATTTATTGATATGGTTGAGGTGTATTCAGTAGTAGTTTCTAATG
ATGAATTTGAATATTTAGAACGTAATATTGATATTATTGATTATAGAAGAGTTAAAGATGGTGTGCAAGT
AAAGTATATAGGTAAAAATACAGAGAAACTTAAGGATAGCTTAAGGATAGATACAACTTTACAAGATGCT
TATATAAACTTTTTACATAAGGAGTTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3801718-3799940 hypothetical protein CDR20291_3186 [Clostridium difficile R20291]
TTGAACTTATTAAATATAGTTGAATCTATTGTAAGTTGTATCAAAGGATTGGCTAGGAGGGGCATAAATA
TGAGTAGTATTAAGGTTATATCAGACTTTATAACCAAAATAATTAGAAAAAATATTTTATTTGCAATAAC
AGTTATTATTATAAATTACCATCTCATACAACGATGGACACATATATCCAATAGAGGAATTTCATTTAAT
GATTACTTATCCTTGAGTGTATATACTTGTATGACAATTAGTATTTTAACCATGTTAAATGTAATTTTTT
ATATGAGAAAAAGTTATGATACTGTAAAAATATTATGTAGAAATAATTTTGATTATTTTTTAGGTATTTC
TGTTGCTGTAACTAGAAACAACTTTATATTTTGTTGCATACCAATTATATATGCTATAGCATACTCAAGT
TTAATAAGAACATTATCAATTGTAACGATTAAATCAACTATATTTATATTGGTATTTGAATGGTTTTTAC
CACTTACTATTTTATCTATAGTGATATCATTTATTTCAGTTATTATAAATAATTTAATACTAAAGATTAC
CTTATCATCAGTATTTTTATATTTAACATCAACTAAGATGTTGGATAGAGTTATTGATATTAAAGAACCA
TTTTTTAAAGCATTATTTAAATCACTTAATATATTTGAAGATCAATCATATGCTTACTATTCTGATTTTG
TAGGGAAAGTTAATAATTCAGCATATGTTATAGATAAGATTATACCTACACTATTTGCAATTACTTTAAT
AATAGTAGCATATCTGATATTAAATGATATTAGAAAGAAACAGATTAAATCATTAATAGTTATAGTAGTG
TACAGTATTTTATTTATTGGATTAAATTATATATCAATAGATATGTCAACATATAGAGATGAGGAACGTA
GTTATGGAGAGTATTTAAAGAAATCTAATATTAGTGATATTAAAATAAAATCGCATGATATGAAGATTGA
CTTTAAAAGCAAGTCAAATATAAAAGATAGAATTGTTTTATTAAACACATCAAATGAAGAGTTAACAAAT
ATTAATATGATTTTAGATGAAATATTTGATATAAAATATATAAAAGTAAATTCGGAAAATATAAAATTTA
ACAAAAAAAAGGATTTAATTGAAGTTAATTTAAAGGAAAGTTTAGAGCCTAATGACGAGGTGACATTAGA
TATAGAGTATGAAGGCTATATTAATGTGTTGACATCTTGGAATCAAAATAAATATATAGCTACTAAAGAT
GATATTATGCTTCCACCAGGTTCTTTAGCGTGGTACCCAAAAGTAAATCAATCAAGTTGTATGGCTTATA
AAATAAATTTAAGTTCTAAAAATAATGTCTATTCAAATTTACCTTTACTGAATAAGACTAGTAATTTTTT
AAAAAAAGATTATATATTTGAAGGAAAGTCAAATGATATTGCAATATATGCAGGTGAGTTTAAAGAAGAG
GTAAAAGATGATATAAAAATAATCTATCCATCAGATAGTAATGTAAATATGGATATAGAGGAAAAAATTA
AATTTTTAATTGAAACAAGAAATGAAATATTAGGTGATAGCAAAGCATCTGTAGATGCTAAAAAATATGT
AGATGAAGTAGATAATGTTATGGAATCAATAAAAAGAAAAAAAATTAATATGATATTAGTTGCTGACTTA
CCTAGCAATGAATTTTTATATGAAGACTCAAAGGGAGAGAAAATTAGCATAACTATTTATCATTGGCTTT
CAGGAAATATCCTTATAATAGATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3802376-3801795 accessory gene regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAAAAGATTATCATATAAATTTGCCAATATATTAGTTAATAATGAGATTGTAGAAAGTGAAGATT
TTGAAATATATAGATATGGATTTGAAACTTTGATTTATTTCATAGTTAATATTTCGGTAGCATTATTTAT
AGGAATTATTTTTGATAGATTTATACATACAGTTATATTTTTAAGTTGTTATTGCACTTTAAGACAGTTC
ACAGGAGGTTATCATGCTAGGAATTATAAAGAGTGTACATTAACATTTGCAGTTATTTATTTGATAACTA
TTTTTTCAGCTAATAATATAGATATAAATAAATATAAGTATTTATTAGTATTATTAATGATTATTAGTAT
ACTAACAATTTACAAGTTAGCTCCTTTAGAACATAGAAACAAACCTCTTAGTGAAAGTGAGAAAAAGCAT
TATAGAAAGACTGTGCAAAAAATACTATTCGTAATAATATGTTTAATTATTTTATGTAAAATACTTAATA
TTTTTCAGCAATATGTGATTTATGCAATAATTTCTATATATTGGATTGCTATATTAATATATATTGGAAT
GAAGGTTAATAATGATCAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3802575-3802435 autoinducer prepeptide [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAATAGCGTTAAACTTACTTAAAAACATCTCAGCATTAAGTTTTGGGATAGCTGTATTATCAG
CAAACAGTGCAAGTTCTTGGGTAGCACATCAGGCAAAAGAGCCACAAGCTTTACAAAAACTAAAAAAATA
A
>ref|NC_013316.1|:c3803903-3802587 sensor histidine kinase virs; sensor histidine kinase virs [Clostridium difficile R20291]
ATGCTAACAAATCTAAGTATAGGATTTTGGAATATTATTAATTTAGTTTCAGGTACTATAGATTGGATTA
TATTTTTTTTAGTAATCCACTTAGTTGGAAAGAGGAAAATATCTAATATAAGATATATATTTACAACAAT
AATTATATTTATATTTATGGCATACATAAATGTAGTTAAAGTGTTTCCAAATATTAAGATTCTTCTATGT
ATGGTAATAGGAATATCATTTTATATAACATCATATGAAGATAAAATATATAAAAGTATAATAGTTAGTT
TATTGTTTTGGCTAGGATTAATGATTGCTGAAGGTTCTGCAGTAGGTCTAGTAGTATTTATAAATAAATT
AAATAATATTAACATAACACAACATGAAAACTTATTTAGAATACAAGCTATTATTATGTCAAAGGTATTT
TTATTTATAGGTTTTATATTGTTTAAGTATTTTAAATTATCTTTAGATTTTAAACCTAAAGATATGATAC
TAATAGGAATACCTATATTATCTAATATAGTTAGCTTATTACTTATATTTGAATATAATTTAAGAGTCAA
TACAATTACTACAGAAAACTTATTTATATTTATATTTGCAATTTTATTGATTTTATCATCAAGTATAATA
CTTTTAATAGTAATAGGGAAAATTGTACAAGACGATAAATTAAATCTAGAGTATGAACTTATAAATGAAA
GAATAAAAACAAACTACAGGAATTATGAAAATATAAACGAAGTTCATGATAGATTAAAATATGTTTATCA
TGATTTGAAAAACCATATGATTTGTATAAAAAATTATGACACTAAAGAAGAAATTATATCATATATAGAT
AACTTAGAGTTTCAGATAAGTGAATTTGAACATTTTAAAAATACTGGAAATAAAACATTAGATTTAATTT
TAGCAGAAAAAATAAGTATTTGTAAAAAGTATGATATTCAAATTGAAGATAACATAAATATATCTAAATT
AAACTTTATTGAAAATAATGATATATGTTCAATATTTGCAAATTCACTAGATAATGCAATTGAAGCATGT
ATGGATATAAATAATGAGCTAGAAAAAAGAATAGAAGTTAAAGCTACATATATAAATAAATTTGCAATAA
TAAAATTTATAAATACTAAGGTAAATGATATTAAACTTATTGATAAACGTATTCAAACTAGTAAGGATGA
TGATAAGATACATGGAATAGGACTTGCTAGTATTAAATATATAGTAAATAAATATGGTGGTGAAACAATA
GTTAATTACTCAGATAATGAGTTTATATTAAAAATAATGATACCAATAAAAAGTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3804664-3803897 dna-binding response regulator, lyttr family [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAGAAATTTTATATATTTATTAAAAATATATAAGAAAGGATGTTTAAGAATTGTGATTAGTATAG
GAATATGTGATGATGAACTACATTATCGAATAAAAATAAAAGATATATTAAGTGAAATATTAAGTTCATA
TCCTATAAATTATAACATATATGAATTTTCATCAGGAGAAGAGTTACTAAATAACTATCCTAAAGATTTA
GACATATTAATTATGGACATACAAATGAAAACAATAAATGGTATGGATACTGCTAGGAAGATAAGAGAGT
TTGATCATAAGTTAGAAATAATATTTGTTACTTCATTTGTAGAGTTTATGCAAGAAGGTTATGAGGTAAA
AGCATACAGATATATACTAAAGCCAATAAATAAAGAAAAAATTTCTAAAAGTGTATTACCTTGTATAAAT
GAGATGATGAAAAAGAGAAATAATTACTTAACTATAAATGTAAAAAATTATGTAGACCGAATTAAAATAG
ATTCTATTACTTATATAGAAACAGATAGACCGAATATATTGATTTATACACATGATGATATGTATATTAC
TAAAATGAGTATATCTAAAATAGAAAAGATATTAAATGAATATGGATTTTTTAGATGTCATAATAGCTAT
ATAGTTAATTTAAAATTAGTAGAATCAATGAGTGGAAGTACTGTTATAGTAGATGGCAAAAGTATTCCAA
TAAGTAAATATAGAGTTAAAGGCTTGAAACTTGCTATAACTAATATATTAGGGGATATAGTATGCTAA
>ref|NC_013316.1|:c3805620-3805045 hypothetical protein CDR20291_3190 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAATTACTTGGGAGGTGGAATATATCTCCCAGTTACCTGTAATTAGGTATTGTAAGAAATGTG
GAAAAAAGACTGAATATATTTGTTCAGGTTTATTTAGGGTTAATGCTCAACATAAATATTTGGATATATG
GTTAATATACAAGTGTTCAAATTGTGATTCAACATGGAACTCAACTATATATTCTCGTGTCAATCCAAAA
AGCTTAAATCCAGAAACACTAGAACAATTCCATACAAACGATTATAATCTTGCTAAGCAATATGCTATGA
ATACGGAACTTTTACATAGAAATGGAGCAGAAGTTGGTATTCCAGAGTATAAAATAGTAGGACAAGAAAT
TAATATTAATGACCTTACACAAGTTCATATTATTAGTAAATATCCATGTCAGTTAAAGGTATCAACATTA
TTACGTGAGAAACTAGGTTTATCTAGGAAGGTATTTGACGAAATGTTGGATTGTGGGATTATTAGAAGTA
ACTCAGGAGTTGATTTAAAGAAAGGTAAATTAAATTATGAAATTATGTTAGATATAGGCAAGGAGAAGCA
AAAGTCTTCAAATTGA
>ref|NC_013316.1|:c3806191-3805913 hypothetical protein CDR20291_3191 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCTATAAAAAAGCAATACATATATTACCAGAAGAATTACTTGAATTGATACAGGAATATGTAGATG
GAGAATATATCTATATTCCTAGAAAGTCTAATAATAAAAAAGAATGGGGAAGTAGTACGTCTACTCGTGA
AGATTTATCAATTAGAAATATGCAAATTTATGAAGATTATCAAGTTGGATATGATTTGAAATATTTATCA
GAAAAATATTACTTGTCTTTGAAAAGTATTCAAAGAATTGTATTACAAGAAAAAAGAAAAGATAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3807261-3806500 hypothetical protein CDR20291_3192 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATAAGATTGAAACATCAATGAACAACTTTGTAAAAAATTATCATAAATCAAATAATATAACTA
CAAAGTGGCAAGAACTTTTGTTTGCTTATGCATCTGCTGAAGATGATATGTTTCAGAAGCTAAAAAGTGT
TGTAGGAACATCTCATGCTATGCCAAAAGATTTTCTGGAAAATGGAAAAACTATAATTACATATTTTATA
CCTTTTGATGAAAGTGTAAATAATAGTAATATTGGAGGGTTTGAATGTTCTGAAATATGGGCAAGAGCGT
ACATAGAAACTAATATGTTGATTTCAAATTTAAATGATTTCTTATGTGAAGAACTAGAGAAGATGGGGGC
TAATTCATATGCTATTCCTGGGTCGTATAATTTTGACAGTGAAAAATTGGTAAGTGACTGGTCACAAAGA
CATGTAGCATTCATAGCAGGTCTTGGAACATTTGGTTTAAATAATATGCTTATTACAGAAAAAGGGTGTT
GTGGAAGAATAGGAAGCATAATCACAAGTTTAGAATTAGAGCCAACTAAAAGACCAGAAAATGAATACTG
CTTGTATAAACATAATAATAGTTGCAAAAAATGTGTCAACAAATGCGTGAAAGAAGCTTTAAAAGAAGAT
GGATTTAATAGGAATAAGTGTTATGAAATGTGTATGATAAATGAAAAAAAATACACTTATATAGGTGGTT
GTGATATTTGTGGAAAGTGTATAGTTGGGGTTCCTTGTTCGGTAATAAATCCCTCAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3809466-3807430 putative exosporium glycoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAGAAATAAATATTTTGGACCATTTGATGATAATGATTACAACAATGGCTATGATAAATATGATG
ATTGTAATAATGGTCGTGATGATTATAATAGCTGTGATTGCCATCATTGCTGTCCACCATCATGTGTAGG
TCCAACAGGCCCAATGGGTCCAAGAGGTAGAACCGGCCCAACAGGACCAACGGGTCCAACAGGTCCAGGA
GTAGGGGGAACAGGCCCAACAGGACCAACCGGTCCGACTGGCCCAACAGGAAATACAGGGAATACAGGAG
CAACAGGATTAAGAGGTCCAACAGGAGCAACAGGGGGAACAGGCCCAACAGGAGCGACAGGAGCTATAGG
GTTTGGAGTAACAGGCCCAACAGGCCCAACAGGCCCAACAGGAGCGACAGGAGCAACAGGAGCAGATGGA
GTAACAGGTCCAACAGGTCCAACGGGAGCAACAGGAGCAGATGGAATAACAGGTCCAACAGGAGCAACAG
GGGCAACAGGATTTGGAGTAACAGGTCCAACAGGCCCAACAGGAGCAACAGGAGTAGGAGTAACAGGAGC
AACAGGATTAATAGGTCCAACAGGAGCGACAGGAACACCTGGAGCAACAGGTCCAACAGGGGCAATAGGA
GCAACAGGAATAGGAATAACAGGTCCAACAGGAGCAACAGGAGCAACAGGGGCAGATGGAGCAACAGGAG
TAACAGGCCCAACAGGCCCAACAGGGGCAACAGGAGCAGATGGAGTAACAGGCCCAACAGGAGCAACAGG
AGCAACAGGAATAGGAATAACAGGCCCAACAGGGGCAACAGGAGCAACAGGAATAGGAATAACAGGAGCA
ACAGGGTTAATAGGTCCAACCGGAGCAACCGGAGCAACCGGAGCAACAGGCCCAACAGGAGTAACAGGGG
CAACAGGAGCAGCAGGACTAATAGGACCAACCGGGGCAACAGGAGTAACCGGAGCAGATGGAGCAACAGG
AGCGACAGGGGCAACCGGAGCAACAGGTCCAACAGGAGCAGATGGATTAGTAGGTCCAACAGGAGCAACA
GGGGCAACAGGAGCAGATGGATTAGTAGGCCCAACAGGTCCAACAGGGGCAACCGGAGTAGGAATAACTG
GAGCAACCGGAGCAACAGGAGCGACAGGTCCAACAGGAGCAGATGGATTAGTAGGTCCAACCGGAGCGAC
GGGAGCAACAGGAGCAGATGGAGTAGCAGGTCCAACCGGAGCAACAGGGGCAACAGGAAATACAGGAGCA
GATGGAGCAACAGGTCCAACAGGGGCAACAGGTCCAACAGGAGCAGACGGATTAGTAGGTCCAACAGGAG
CAACCGGAGCAACAGGATTAGCAGGAGCAACCGGAGCAACAGGCCCAATAGGAGCAACAGGTCCAACAGG
AGCAGATGGAGCAACAGGGGCAACCGGAGCAACAGGTCCAACAGGGGCAGATGGATTAGTAGGTCCAACC
GGAGCAACGGGAGCAACAGGGGCAACAGGTCCAACAGGCCCAACAGGTGCTAGTGCAATAATACCTTTTG
CATCAGGTATACCACTATCACTTACAACTATAGCTGGAGGATTAGTAGGTACACCAGGTTTTGTTGGCTT
TGGTAGTTCAGCTCCAGGATTAAGTATAGTTGGTGGAGTAATAGACCTTACAAACGCAGCAGGGACATTG
ACTAACTTTGCATTTTCAATGCCAAGAGATGGAACAATAACATCTATTTCAGCATACTTCAGTACAACAG
CAGCACTTTCACTTGTTGGTTCAACAATTACAATTACAGCAACACTTTACCAATCTACTGCACCAAATAA
CTCATTTACAGCTGTACCAGGAGCGACAGTTACACTAGCTCCACCACTTACAGGTATATTATCAGTTGGT
TCAATTTCTAGTGGAATTGTAACAGGATTAAATATAGCAGCAACAGCAGAAACTCGATTCTTACTAGTAT
TTACTGCAACAGCTTCAGGTCTTTCATTAGTTAATACTGTAGCAGGATATGCAAGTGCAGGAATTGCAAT
AAATTAG
>ref|NC_013316.1|:c3810621-3809545 putative glycosyl transferase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTGCAATAAGTTTGTGCATGATTGTTAAGAATGAGGAAGAAGTTATAGGCAGATGCTTAGAATGTG
TAAAGGATATAGTAGACGAAATTATAATTGTAGATACCGGTTCTACAGATTCCACAAAAGAAATAGTCTC
AAAATATACAGACATGGTGTACGATTTCGAATGGATAGATGATTTCTCTGCTGCAAGAAATTTTTCATTT
TCTAAAGCTTCTAAAGACTATACTATGTGGCTTGATGCAGATGACATAATTTTAGAAGCTGATAGAGAAA
AATTATTAAAGATTAAAGAAAGCTTGGATACTTCCATTGATATTGTTATGGCAAAATACAATGTATCCTT
TGATGAAAATGGTAACCCAACTCTCTCATATTATAGAGAACGATTGTTTAAAAGAAGTTCTAATCATAAA
TGGGTTGACCCTATTCATGAAGTAGTACCTCTTTTTGGAGAGGTATTTTATTCTGACATTGCAATATCTC
ATAAAAAGCTTCATAGACAGGACCCTCTAAGAAATCTTAGAATTTTTGAAAAAATGATTTCAGAAGGAAA
AACATTGGAGCCAAGACACCAATTCTATTACTCTAGAGAGTTGTACTATAATGCTAGGTATAAAGAAGCA
ATAGAAGGTTTTACTAAGTTTTTAGACTCATCAAGAGGATGGATTGAGGATTGTATCAGTGCCTGCAGAG
ATTTAGCCACATGTTATTACTTAATTAATGATGAAAAAAGTGCCTTATATTCATTGTTTAGAAGTTTCGA
ATTTGATGAGCCAAGAGCAGAAATTTGTTGTGACATAGGAAAGCATATGTTTGATAGACAAAAATATAAA
GAAGCCATTTTTTGGTATAAGGTAGCATTAACAAGAGATAAGAATGATACTAATGGAGGTTTTAAGTCAA
ATGATTGTTATGGATATATACCATCTATACAATTAAGTGTCTGTTATGACAGGTTAGGAGAATCAGATAA
AGCTATTTATTATCATGAAAAAACAAAAGAAATCAAACCTAACGATAGTGCTGTTTTGCACAATGAAAAT
TATTTTAGTAAATTTAAAAATAGTTGA
>ref|NC_013316.1|:c3811527-3810943 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTTAGTGCCACATGTAATTGAACAAACAGGTCAAGGGGAAAGGTCTTATGATATATATTCAAAAT
TATTAAAAGATAGAATTATATTTATAGGAGAAGAAATTAATGATGCTATTGCAAGTTTAGTAGTAGCTCA
ATTACTGTTTTTAGAATCAGAAGACCCAGATTCAGATATAATTATATATATAAATAGCCCTGGTGGCTCT
GCTACATCAGGATTTGCTATATATGATACTATGAATTATGTCAGATGTGATGTATCGACTATCTGTATTG
GTATGGCTGCAAGTATGAGTGCTTTTTTACTTGCAGGAGGAACACATGGAAAAAGATGTGCTTTACCCAA
TTCAGAGATTATGATTCATCAGCCAATGGGAGGAGCTAAAGGTCAAGCAACAGATGTAAAAATAGCTGTA
GATAATATATTGAAAATAAAAGAACGATTAGATAAAATTCTTTCTGAAAATACAGGTAAATCAATAGAAG
ATATTAGAAGAGATACAGATAGAGATAATTTTATGACTGCACTAGAGGCTAAAGAGTACGGGCTGATTGA
TTATATAATGAATAGGAATGAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3811982-3811524 AraC-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGATAATTGATTATATAGAAGAAAATCTTACAGAAAATCTAAATTTAGATAAAATAGCTTATATTG
CTAATTATTCAAAATACCATTTACACAGAATGTTTACAAATGTTGTAGGATGTACTATCCATCAATACAT
ACAGAGGAGGAGACTTACTGAAGCAGCTAGACAACTTATATTTACAGACAAATATATTATAGATATAGCT
ATTACAGTAGGATATTCTACACATCAATCTTTTACACTAGCATTTAGAAATTTATATAAAGAATCTCCAC
AAGTATATAGAAATAAAGATGAATTTTATCCTATTCAACAGAGATTTGTTTTAAATCTAAATCATCAAAT
TCAAAGCGAAAAATGTATTTCTTATGCAAATATGAATTATAAACAAAGAAGAGATGAAATCAATTCTTAT
CTTAACTTTAATATTAATTGTGAGGTGAAAGTAGCATGA
>ref|NC_013316.1|:c3813620-3812205 GntR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGTGGATTACGATTAATAGAAATAGTAATATATCATTATCAAGACAAATTTATTGTGAGATAAAAGATA
TGATTCTGGATGGAAGCTTAAAGTTTGAGCAAAAACTGCCATCATCTAGGACTTTATCAAAAGAACTATC
TGTATCTCGTAATACAGTTTTAGATGCATATAATCAATTAATTGCAGAAGGATATTTGGAAACAAGGAAT
GGATATGGAACAATTGTAGCTAAAGGAATATCAGGGCATAAAGTTGATTTTAAGTTAAATGATACTTTTA
GAGATGAAAAAGATTTACATACTAATAAACAAAAAAATTATATAGATTTTCGTTCAGGAGTTCCAGAATT
AAAACTATTTCCACGCAAAGAACTTTCAAAGCTATATAAACAAATACTGTATGATTTATCAGATTCGGAT
TTCAGATATGGAAGTACAGCTGGTGTATGGGTTTTAAGAGTGGAAATATCTAAGTATTTATTTCGTACTA
GAGGAATTAGATGTAATTCCAAAAACATTATGATTGTTTCTGGTTCAACACAAGGTTTATCTTTAATTTC
ACAGCTTTTATACAAAAGTAATAAAAAGGTTGCTGTAGAAGACCCTATTCATAAAGGCTTATTAAAGGTT
ATTTCATCTATTGGATATTCAGTTGTTGGAATTAAAGTAGATGATAAGGGAATGAATACCAACTTAATAA
AATCAATAAAGGGGATTTCTTTTGTTTATACTACACCTTCTCATCAATATCCATTAGGAGGGATTTTACC
TATTCAAAGAAGACTAGAGCTTATTAAATGTGCAACAGAGAATGATTACTATATAATTGAAGATGATTAT
GATAGTGAATTTAGATATGAGGGTCAACCAATTAGTTCTCTTTATGAACTTAGCCCAAATAAAGTAATTT
ACATAGGTTCTTTTAGTAAAATATTATCTCCAGCTATTCGTGTTGGATTTATGTTATTACCAGACAATAT
TTTAGAAAGCTATAAAACCTTAAAAATGTACTCTGATGTTCATACAGAAACAATATTGCAATATGTATTA
GCTGAATTTATTGGAAATGGAGGTTTAGAGAAGTACATATTTAGAATGAAGAAGTTGTACAATAGAAAAC
GTAAATATCTCATAAAAGTTTTAAACACGGAATTTAAAAATGAATTTAAAATAAAAGGTGAAGCAGCAGG
GCTTCATATAGTTGCTCATTTCTATAATGTTAAATTTACGGAAAGTTTAATTCATAAAATTTTTGAAGCA
GGTATAAAAGTTTATCCTATACAACAATATGCAATTGAGAATATATTAGAATATGACCATGAAATTATAC
TAGGTTATGCTCATCTTAGTTTTGATGAAATTGAAAAAGGTGTAAAAATACTCAGCAAAATAATACATAT
GAATCAAGGTACATAG
>ref|NC_013316.1|:3813735-3814403 hypothetical protein CDR20291_3198 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAGAAATATCACATAAAGTTAAAGAAATTTATCCCAATATTAAATTTGGAGTTATGGTTATAAATA
TTACACATTCAAAACCTAATAAAGAAAATTTTTTAGTTCTTAAAAACTCTACAATTAAAAATATTATAGA
ACAACACCCAGAATACAATCGTAAAGAAAAAATTAAAACAGAGCCTGTTTCAAGTTATATAAAGTATTAT
AAAAAATTCAAGAAAACTTACCCTGTATTGCTTCAATTAGAATCTATTCTATTAAAATCAAAAGGTATCC
CAGATGTAGGTGTAACAATTGAGTCAATGTTTTTAGCAGAATTGAAAAATCTTCTTCTAACAGCAGGTCA
TGACCTTGATAAAATGGAATTACCTTTGAAAATAGAATTAGCAAATGGAAGTGAACATTTTTATGGTATA
GGTGGTAAAGAGCATATTTTAACAAAAGATGATTTATTTTTATCAGATAATATTGGTATATTATCTAGTA
TTCTTAATGGCCCTGATAATCGAACAGCTATAACAAAAGATACTAAAAATATTATGTATTTTGTATATGG
ACCTGATAAAATATCAGAAAAGCAAATTCAAGACCATTTAAATGACATAAAACACTATATTTCAAGTGCT
TTTCCAGATTTAAAAGTTAATTCAATTGATATATTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3815097-3814579 putative nitroreductase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTCGTTGAACTTACAAAAAAAAGATATTCTTGCCGTAATTATCAAGATAGAAAGGTTGAAAAAG
AAAAACTTGAGAAGGTTTTAGATGTTGCAAGAATAGCTCCAACTGGTGGTAATCGTCAACCTCAAAGATT
GATTGTTATTCAGGAAAAAGAAGGTATAAATAAACTTTCTAAGGCTGCCAATATATATGATGCTCCATTA
GCAATTCTTGTATGTGGAGATAAAGACAAAGTTTGGACAAGACCTTTTGATGGGAGACAACTTACAGATA
TTGACACAAGTATAGTTACAGACCATATGATGTTACAGGCAACTGAACTTGGATTGGCAAGTGTTTGGGT
GTGCTATTTTAATCCAGATATAATTAGAGAAGAGTTTAGTTTGCCAGATAATCTAGAACCAATAAATATA
TTATTGATGGGATATGAATCTAAGATACCAGAGAGCCCAGAGAGACATGAAAAAACTCGTGTTCCTTTAA
GTGAAATTGTTTCTTATGAAACTCTTTAA
>ref|NC_013316.1|:3815249-3815572 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAATGTTTAGATAATTACAGTTGCCCAATAGAAGCAACACTTGCATTGATTGGTGGTAAATATA
AGACACTTATACTTTGGCATCTTAAAGACACTATATTGAGGTTTAATGAATTAAAAAAATTAATTCCTAA
AGCAACGCCTAAGATGTTAACTCAACAATTACGTGAATTAGAATCAGATGGTTTAATTATAAGAGTGGTT
TATCCTGTTGTTCCTCCAAAAGTAGAATACTCGCTATCTGATTTTGGAAAGAGTATTATTCCAATTTTAG
ATTCCATGTGTGACTGGGGTTCTGATTACTTAGAAAGTCTATAG
>ref|NC_013316.1|:c3816161-3815577 putative protease [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTTTTAGTTTTTTTAGCAAAAGGTTTTGAAACTATGGAATTTAGTGTATTTGTAGATGTTATGG
GATGGGCTCGTAACGATTATGGGCATGATATTGATGTAGTGACTTGTGGATTTAAAAAACAAGTTATGAG
TACATTTAATATACAAGTATTAGTTGATAAGACGATAGAAGAAGTATGTGTTGATGATTATGATGCCCTA
GCTATTCCTGGAGGATTTGAAGAATTTGGATTTTATGATGAAGCATATGATTCATCTTTTTTAAATCTAA
TAAGGGAGTTTAATTCAAAAGAAAAAATAATCGCTTCTATTTGTGTGGCAGCATTGCCAGTTGGAAAAAG
TGGTGTTTTAAAAAATCGTAAAGCTACTACATATCATTTGAAAAATGGTAAAAGACAAAGACAGTTAAGT
GAGTTTGATGTAAATGTAGTTAATGAACCAATTGTTGTAGATAAAAATATTATAACCTCATATTGTCCAG
AAACAGCTCCACATGTAGCTTTTAAGCTTTTAGAAATGTTGACATCTAGAGAACAAATGGATGAAGTTAA
ATTAGCAATGGGATTTAAACTGTAA
>ref|NC_013316.1|:3817548-3819086 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTTATTAAAAGTAACTAATTTATCACAATGTTTTATGGATAAATCACTGTATGAGAAAGCTAACT
TTGATTTATTCAAAGGTGAACATATAGGTGTAGTTGGCCAAAATGGTACAGGTAAAAGTACATTAATTAA
AATTTTATTGGGAGAAGTTGTTCCAGATTCAGGAGAAATCAAGTGGCAACCTAATATCAATATAGGCCAT
TTAGACCAATATGCAGAAATCAATAGAGATACAACAATATCACTCTATTTACACACTGCATTTGAAGAAC
TTTATAAAATAGAAAAGGAAATGAATTTACTCTATCAAAAAAGTGCTATATCTGAAAATGAGCAATATCT
AATCAAAGCATCAGATTATCAGGAACAACTAATAGCAAGTAATTTCTATTCTATAGATAATGAAATAAAT
AAAATAGCAAATGGTCTTGGATTAGATTCAATAGGAATGAATCGTGTTGTTGAAGAGCTTAGTGGTGGGC
AAAGGGCAAAGGTAATTTTAGCAAAATTGCTACTTTCTAACCATGATGTTCTATTATTAGATGAACCAAC
AAACTTTTTAGATAAAGAACATGTTGAATGGCTCTCAAATTATTTAAATACATTTAATGGGGCATTTATT
GTAGTTTCCCACGATTTTGATTTTTTAGAAAAAATTTCTACAGGTATTCTTGATATAGAATTTGGTATGA
TTAAAAAATATCATGGAAAATATTCAGAGTTCCTTAAACAAAAATCACATTTAAGAGAAGATTATATTAG
AAGGTATCAAGCACAACAAAAGAAAATAGAAAAAGAAGAGACATTTATACGTAAAAATAAAGCTGGAGTA
AATTCAAAAATTGCAAGAGGAAGACAAAAACAATTGGATAAAATAGAAAGAATAGCTCCTCCTAGTTTTA
CAGGAAAACCAAATATTCAATTTTCAGAAATTGAAATATCGGCTCAAAATGCTCTTACTATAACAAATCT
TGAAGTTGGATACTACTATTCTTTACTTCCAAAATTAAATTTTTCTGTTGATGGAGGTCAAAAAATAGTT
ATAACTGGTTTTAATGGAATCGGTAAATCTACCTTGTTAAAGACATTAGTCAAAGATATTCCTCGTATAT
CTGGAGATTTCCAGTTTTCAGAACAAGTTAAAATTGGTTATTATGAGCAAGATTTAAAATGGGAAAATCC
TGATAAAACCCCACTTCAAATAGTAGCAGATAAATATCCAAAATTAAATACAAAAGAGATTAGACGTCAT
CTAGCCAGATGTGGTGTGAAGGAAGAGCATGTTTCAAGGAGTGTATCTACTTTAAGTGGTGGTGAACAAT
CTAAGGTTAAATTATGTTGTATGATGTTATCTCCTTGTAATTTTCTTATTCTGGATGAACCAACCAATCA
CTTTGATGCAGAGACAAAGGATGCTTTACAAAATGCTTTGAAACAGTTTAGAGGAAGTATAATCCTAGTT
TCCCATGAAGAAAAATTTTATAAAGGTTGGATTGATAAAGTGTTTAATATAGAAAAACAATTAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3820194-3819358 two-component system response regulator [Clostridium difficile R20291]
TTGAATTTGTCTATTAGAGATGTTACTATTAGTAATGTAAAAGCAAGAGTAGTGAATATAAAAAAACAAG
ATATTGATACTGCAAGATTAGAATATAATAAATTTTTATGGAGAGATTTCAATATGGATACATATTTTAA
TAAAAAAATATTACTTGTTGATGATGAAAAAGATATAGTAGATTTAATTGAAGAAGTACTCATAAATGAT
GGTTTTAAAAACATTATTAAAGCTTATAATGGTTTAGATGCTATTTCGCTGTGTAAGATAGCATGTCCAG
ATGTTGTCATTCTTGATATAATGTTACCAGATATAGATGGTATAGAAGTGTGTAAAAAAATTCGAGAGTT
TTCATACTGTTCTATTCTTTTTTTATCATCAAAAAATGATGATATTGACAAAATACTAGGTCTTAGTAGT
GGGGGAGATGACTATATAACAAAGCCATTCAGTCCAAGAGAAATTGCTTTTCGAGTTAAAGCGCAATTAC
GTAGACAACAGTATCAAAGCATTGTACCATCAGATAGTGCAGTTATTAAAATAGGAGATATTACTATTGA
TATAGAAGGAAACCGTGTATATAAAGATAGAAATGAGATTGAGTTAACTGGAAGGGAGTATCATCTTTTA
AGCTACATGGCTCAAAATGTAAATAAAATTATAGGAAAAGAAAGACTCTATGAACAAGTATGGGGAGTAT
ATAGTAGTATTTGTGACAATACAATTATGGTGCATATACGACATATAAGAGAAAAAATTGAAGATAACCC
CTCAAATCCTAAAATACTTATAACGGTTAAAGGACTAGGATATAAACTTGTGAATAGAATCGATTAG
>ref|NC_013316.1|:c3821926-3820526 putative multidrug efflux protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTACAGAAAAATAAACAAAATGAGTGATGTATATTATTCAGAAAATCATGAACAAGATAATCTTTATG
AGCAAGATAATTTACTGGCACAAAGATTTAATTTATTTACTCTATTGAAGTTTGCATTTCCTACTATTTT
TATGATGATTTTTATGGGGTTGTATACAATCGTAGATACTATATTTGTATCAAGATTTATTAATACAAAT
GCTCTATCAGCAATTAATATTGTATGTCCAATTATTAATCTTATAGTTGGAATTGGAACTATGCTTGCCA
CTGGAGGAAGTGCTATTGTAGCACGTAAGATGGGAAATGGTGATATTGAGGGAGCAAATAAAGCTTTTTC
TTTAATCGTATTATCAGGAGTTGTAATTGGGGTAATAATTACTGGTATAGGTATTGTATTTATGGATTAT
ATCATTATATGGTTAGGAGCAAGTGAAGTTTTAATTAAATATTGTCGTTCATATCTTTTTATTATCTTGG
TTTTTGCTTCTGCAAATATACTACAAGTATTATTTCAATGTTTATTTGTAACAGCTGGAAAGCCTCAATT
TGGATTATGGCTAGTGTTAGGTGCTGGGTGTGCTAATATAATTCTTGACTATGTGTTCATTGTTCTGTTA
CAAATGGGTATTAGTGGAGCAGCACTTGCAACTGGAGTAGGATACCTAATTCCTACCGTTTCAGGTATGG
TTTTCTTTTCAAAAAATAAAGAGTTACTTAAGTTTTGTATACCCAGACTAGATAAAAGAATATTATTTGA
AGCTTGTTTTAATGGTTCATCTGAAATGGTAGGTCAACTATCAACAGCAGTTACTACTTTTTTATTTAAT
GCTATGATGATGAAATTAATTGGTGAGGATGGAGTTGCAGCTATTACAATAATTATTTATTCTCAATTTC
TTTTAACTTCGCTTTATATAGGTTTCTCAATGGGTGTTGCACCAATAATAAGTTATAACTATGGAAGTGA
AAATAATACACAGTTAAATCATGTTTTTAAGATTTGTATATTATTTATTTCAGTGGCATCTTTATTGGTA
TTTATCTTTTCTATATCATGTTCACCAATCATTGTAGAGATTTTTTCTCAAAGAGGAAGCCGAGTTTATG
AAATTGCAAGGTCTGGATTTTATATATTTTCTTTTAGTTTTATTTTTTGTGGGTATAATATTTTTACTTC
GTCTATGTTTACAGCATTGTCAAATGGCAAGGTCTCTGCAATATTATCTTTTCTACGTACATTTGGATTT
ATAACTATAGGTTTATTGATACTGCCAAATATATTAAATATAAATGGGATATGGTTAGCAGTACCAAGTG
CTGAGATTTTAACTTTATTTTTAACCATTTTTTGTATATGTAAGTATAAGAATAGATATAAATATATGTA
G
>ref|NC_013316.1|:c3822981-3822190 ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAAAATTTGAAAATAATATTTATGTTATTAAAAATGAAATTATCAAAGATGATGGTATTTAGAT
TTGATTTTTTTGGAGCATTTTTTGTAGATAGTTCATTATTTATATTACAACTTCTAATGTTTAATAGTAT
ATATTCTCATGTAGACTCAATAGGGGGATGGCAACAAGGAGAGATGTTAATATTTATAGGAACTTTCTCA
TTAATAAATGCGATAAATATGACGATTTTCTTTTTTGGTATTTATGATATTCCACGAAAAATCCAAGAAG
GAGAATTAGACTACTATATTACAAAACCATTAGACCCACTATTTAGGTTAACATTTGAAAATATTAATAT
TGGTTCATCACCATTAATTCTAGCAAGTATACTTATTGTTTTATATGGAATATCTAAGTTAAACTCAGAG
ATAACTTTAGTTATGATAATAATATATATTTTCATGGTGTTATTGATGACATTACTTTTTTATGATGTAT
GTATCATACTTAGAACAGTTTCATTTTTTGTTATATCATCTTCTGCGATAATGAGATTAGAAGATAATTT
ATTGCCAATGAATATGAAAATTCCTGGTGTAATATATGAAGGTGTTTTTAAAGTATTATTCTATTTAATC
TTACCATATGGAATTATGTCGACAATTCCGACTCAAATTTTGGCTGGGACAATAACAATTAATGGATTAA
TATACTCAATTTTAATTGTATTTTTGTTTACATTGTTTATGTGGAGATTTTGGAAGTTAGGTATGAGACA
TTATAAAAGTGCAAGTAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3823844-3822981 ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTATTATGAGCAACTATAATGAAGCAAGTTCAAATTATTCAATGTTTTATAAATTTAAACAAAGTA
TTAGAAGGTATTATGAAGTAGCCAAAATTAACTTTAAAGTGCAACTTATCTGGAGATTTGATGTGGTGGT
TAATATGGTGTTTACGATTGTAAAAATTTTATTTGCTTATATTTTATGGAAAGCAATTTTTGGTGAAAAT
AAAATAGTCTCTGGTTTTACATTTAACTCTATGTTGTCTTACTATATAATAAGCTCATTTTTAGCAGGTA
TTGATATGTCAAAGAGTACCAGTGAAGAGATATGTAATCGTGTAAAATTGGGCACATTTTCAAAGTACAT
GATTATTCCAATTAATGTTCAAAATTATTTTATTGCTAAAAATTTTGGAATGACATGTTTTTATTTTGTA
TTTAATATGATTTCTGCATTTGTATGGATTTTTATATTTAAAATAGATTTTGCCTTTACATCAAATCCAG
TTCAAATATTAATTTCAATTTTGATGATTTTTCTAGGGTTTATTTTTATGATGAAACTCCACTTCTTTAT
TGGGATTTTGTCATTTAAATTTCTTGAGATTAGTTTTTTTAGAATGATAATTGAAAATATTGTTGAATTT
ATTACAGGAACAATGATACCACTTGTACTCTTACCAGAAACTATAGTAACAGTTATGAAGGTATTTCCAT
TTTATTATACAACATATTTGCCATCTATGTTACTAATAGGTAGAAACAGCAATGAGGCAATACAAGGATT
AATTATTCTAGCATTATGGGTTTTATTTTTTTCTGTAGTAAATAAAGTTATGTATAAAAGAATGAGAACA
TTATTTGATGGGGTGGGTATATGA
>ref|NC_013316.1|:c3824832-3823822 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGTAGTTAAAATGAGTATAATTGAACTTAATGAACTGACTAAATCTTATAGAAGATTTGAGAAAA
AGGCAGGATTTATGGGGAGTGTAAAGTCTTTATTTAATAGGAAATATACAGAAAAAACAGCTATATCGTC
ATTTGATTTAAAGATAGAAGAAGGAGAATTTGTTGGATTAATAGGTCAAAATGGAGCTGGCAAAACTACT
CTTATTAAGATGTTAACTGGTATTATTGCACCGTCTTCTGGAGAAATATCTGTTATGGGTTATTACCCTA
ACAAATTAGAAAATAATTTTAAAAAACAATATGCTGTTGTTATGGGCCAAAAAAGTCAACTATTCTTTGA
ATTGACACCAGCAGATACGTTTCTTTTATTTAAAGAATTATATGATATATCTAATGAAGAATATAAAAAA
AACTTGGATTACTTTATCGAATTATTTGAGGTATCTGACTATTTAAATGTTCAAGTTAGGACGCTTTCTT
TAGGAGAAAGAATGAAAATGGAATTAATAGTAGCCCTTCTACATAATCCAAAAATATTATTTTTGGATGA
ACCAACTATAGGCTTAGATGCTATAGCCCAAAAACAAATTAGGTATTTCCTAAAAGAAGTAAATGAAACA
AAAGGAACTACTATTATACTTACTTCTCATTACATGGAAGATATTAAGAGTCTCTGTAGTAGAAGTATTG
TTGTAGAAAATAGCCGTAAAATATATGATGGTTCTACAGAGAAACTATTTAATCATTTTCAAAAATATAA
AAAAATAACAGTTAGTTTTTCCAATGAAACTAACATTGTATTTCCAAAAGATTGTAAAGTTGTTGAACAA
ACAAATCATAAGACATCAGTAATTGTGCTAAAAGAAAGAGGAAATGAAACGATTAAATGGATTTTTGATA
AATATGATGTTAAAGATGTAATGATTGAAGAAGAAGATATAGGTAGTATTGTAGAGAGAATATATAAGAA
AGGAAGTGATGAGTATTATGAGCAACTATAA
>ref|NC_013316.1|:3825520-3826476 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATAATACAATACAAAAACAATTAAGAGATTTATCAAAAAAAATTTGGCATATTTATATTTTAA
ATCCAGAAGAAGAAAACCTTAAATTTATTATTTCCTTATTAGATAACAACCTTGCATTAATTGGAACAGG
AAAACATGAATTTTACGAAACATTAGAAGAATTTATTATAGGTCTTGAAAAAGACCAAACAGAATCAGAG
CAAATAGACTTTGAGATTATAGATGAGTGGTATTCATGTACCAAAGTTACAGACGAAGCTTTTATAGTAT
ATGGTACTCTTTGGGTAATAGAAAAAGATTACCTAGAAAAAGATATCTATGTAGAAATGGATACTCGATT
TACTATGGTATACAGAGTTACAGATGATATGATTAAACTTATCCATGTTCACCATTCTATTCCAAACTTT
GACCAAATGAAAGATGAGTATTACCCTAAAACAATAACTGAAAAAGCACAAGAAGCACTAGCAATGGCAA
ATGAATTTAAACTAAAATCAGAAAAAGACCTTATGACTGGACTATACAATAGACATTTTTTTGAAGTACA
CATAAAAGAAATGCTTAAAACTGTTTCATATGGATACTTTTACATCTTTGATTTAGATAATTTTAAACAG
GTAAATGATATCTTTGGTCATGTTCGAGGAGATGAAATACTAATACAGTTTTCAAATATTTTGACTAAAG
TATTCGTAAATGATGCTATTATTGGAAGACTTGGTGGAGATGAATTTGCTGTTTTTGAATATAGTAATCA
ATCAAAAGAGAATGTTGAAAATAAAGCAAAGAAAGTTTTAGAATTATGTCTAGAGAGTAATTCTTGTTCT
ATAGGTATATCTAAATTAGAAAATAAATCTGATACTTTCCAGTCTTTATACAAACAATCGGATTATGCTT
TGTATTATTCAAAACGAAATAATAAAGGAAACTTTAGTTGGTTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3827425-3826877 putative exported protein precursor [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGGGCTAGGATTTTATGCAGCAGCATTGTCAGGTAGCTCATATCAGAGAATAGGCTTTGGAAAAC
TTGACCCTATAGAAGTAATAGCCGATGGAGATTGGATTTCTTACAAACAAGCTCAAGATACACTTACAGT
AATCAGGAATTTTTTAAATAGTTTTGACTGGAGAAATGCATCTGAGATGGAAAGAGCTAATAGAGCTGCA
AAATTGGTAACCGAAGCAAAATATGTAGACTCTAAATATTGTAACATAGTCTATGGTAATCTGGTTGATA
AACGTGGTGTATGTGGAAGTTTTGCAAGTAGCTTTCATTTATTAACAAGGTTAATGGGAATGGATTCACT
ATCTATATTAAATCCATCATTAAATCATGCTTGGAACTATATACAAATTGATGGGAAATGGTATAGGTCT
GATGGGTCTGAAATATCAGCTTTTGGTGGAGCATTAGACTTTGATTACCGTAAATTAAAGGATGCAACAA
GAGAGATGACTACTTACTATGATGCTAAGGCATTGTCTATATTAGGATTTAATCAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3828225-3827527 hypothetical protein CDR20291_3211 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATATCTAGTCAATATAGAAGTCAATATTCATTTAGACATGAAAGTAATATAAATAATACAAGAA
TAAATGAAAGTATGGTTAAGAAAAATGAAACTGTAGGAAAAGACACTTATTTATCTAATATTATGAAACA
AAAGCAAGAACTTAATGATAGAATTAGAGATTTAAAATATAGACAAGAGGTTTATACTAAAAAAATAAAT
GAAGCAATTAAGAACTTATATAAATCAGAAATAAGAGAAACAACTAATAACTTTTCTAATATAGAAATAG
GTATTAAAAATAGCATTATAGAAGATAAAAATAAAAGTACAATGTTAGATGAAAATTCAACTTATCTAAA
TACAAATGATGAAAAAGAATCTTTAATCACTAAAGAGTCTAATGAAAAAATTGAAGAAGAAATATTAAAT
GATGAAAAATTAGAAGAGTTAGAACAAAAAAAGGATTATAAAGAGGATTCTAATAAAAAAGAGAAAGTAT
CTGAGGACTTATCTTTAGTAGGTAAAACTCGTGAAGAGCTTGAAAATATGCTTAAAAATTTTATAAATTT
AACACAAGAAGAAATAATGAAACTTGAGTCGAGAATAGAAAAGTTAGATAAAGATGCTGAAGAATACAAA
CAAAATTCAAAGACTAATATATTTGATAAAACAGATGAACAAAAAAAACATATAAATGTACTGATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3829828-3828761 putative GTPase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGGTATGAAACAAATCAATTTACAAGACTATGGTCTAAATAGGAATTTTATTACTCAAAGTATGG
AATATCACGATTTATACCTTGCTCGAATTATCTCGCAGGAAAAGAACTTTTATCAAGCTGTATGTGTAAA
TGGTGTACTGTTTGCAGAGGTTTCAGGAAAACTGCGTTTTGAGGCTACTATACAATCTGATTTTCCCACA
GTTGGTGATTTCGTTATGTTGGATCGTTGCAATAATAAAAATGGTAATGCTATTATTCATCATGTGCTTC
ATAGAAAAAGCTTGTTTGTGCGTAAGGCTGCTGGAAAGGTAAATGAGGAACAGGTGGTTGCAGCTAATAT
TGACATTGTTTTTTTGTGCATGTCACTGAATAAGGATTTTAACATTCATAGATTGGAGAGGTATCTGTCT
TTAACATGGGAAAGTGGAGCTATCCCAGTAGTAGTACTTACTAAATCAGACTTATGTGACAATGTGCATC
GTAAATTACAAGTAGTTAATTCTATAGCCTTGGGTGTAGATGTAGTAGTTACCTCATCTATAGAGCCAGA
TGGTTATAAACAGATTTCTAAGTATATCAAATCAGGCTGTACTGTTGCATTACTTGGCTCTTCAGGAGTT
GGAAAATCTTCATTAATTAATTGTCTGCTAGGAGGAGAATTTTTAAATACAAAGGAAATTCGCATAGATG
ATGATAAAGGAAGACATGCCACGACTAGACGAGAGCTATTTTTAATTTCAGGTGGTGGTATTGTTATTGA
CACACCAGGTATGAGAGAGTTGGGAATGTGGGATGTTTCAGAAGGTTTAGATAAAAGTTTTGCAGATATA
GAAGCTTATTTCGGAAAATGTCATTTTCGTAATTGTACTCACACCTCAGAACCAGGCTGTGCTATCTGGG
AAGCTATTGCTCATCAAGAACTTTCGCCTAAAAGATGGGAATCCTATCGTAGGCTTAAAACTGAAGCAGT
ATTTGCAGACAATAAAAGCGAATACTTAGCAAAAAAAGAAAAGAAATTTAAAAATATCTCAAAAATAAAT
AAGACGATTAGAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3830226-3829825 hypothetical protein CDR20291_3213 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTATAAAAATAGAAAACGAGCTTATTATCAGGAAAATTCCTGTATGGATAACTTTATTTGCAAAA
ATTGTGGTTGCCTTGTAGTTCCTGAAGGAGCTGGTACACAACATAGAAATCATTGTCCACATTGTTTACA
TAGTCTTCATGTAGATATCATTCCTGGTGACCGTGCTGCAGATTGTGATGCTAATATGGAACCTATTGGA
GTGTGGGTGAGAAAAAATGGTGAGTGGGCAATTATTCATCGTTGTACACGCTGTGGACATCTTAGTTCTA
ATCGTATTGCAGCTGATGATAATTCAGTGAAATTAATGTCAATTGCATTAAAACCACTGGCACAGCCCCC
TTTCCCACTAGAAAGAATCATTGAAAAGTTGGAAAAGGAGGAAACAGAATGA
>ref|NC_013316.1|:3831797-3832396 hypothetical protein CDR20291_3214 [Clostridium difficile R20291]
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ATCATGTTTTTTCAAAAGGTTGTGAACGAAAAATGAAAAAGAGAAAAATTGTATTAATCACACTACTATT
AATAGGTGTTTTGTTATTAGGAAGTATCCTATATAATCTTTTTTTAGTAAAAGCAGCTAATATTTCAATG
CTAAAGGAATCTTGGAATTTTGATATACCAATACCTAACAAAGAAATTGAAGTATTTGATACTCAAGATA
GTATTAATGGAGATGGACAAAGTTATTTTATTCAAGGATTTTCTGAAAAGAATTTCAAAAAAGTTTTTAA
TTTAAAAGGTGGTATAGTTGTAAGCAAAGATAATATTAATGAAATAGAAAAATATATTGATAAATTTAAA
AGAGATTCTGTTAACATTAATAAAAGTAATAAAAATAAAATTGAAGAAGATTTTAAAAAATATAAGTTAG
AAGTTAAAAAAGATGATAAGTATATATATAAGAGAAATTATGAAAACTATGTAGTTTTAATTATAAAAAA
AGATGAACAAAAATTATACAGTTTAATATGGAATCAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3834232-3832874 putative RNA methyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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AGTACAATGGTATTACAGTTTTTGTAGAGGGCGGATTAATACATGATAAAGTTAAAGTTAGGATTAATAA
AGTAAAGAAAAATTATGCTGAGGGAGATATTGTTGAGATAATAGAAAAGTCTCCATTCAGGGTGAAAAGA
GTGTGTAGTGACAATCTTAGGGATTGTGGAGGGTGTCAGATACAAGATTTAGATTATAATAAACAACTTG
AAATGAAAACAAATGAAGTTAAACAAGTACTTTCGAGAATAGGTAAGTTAGAGGATGTAGAAGTTCATGA
CACTATAGGAATGGATAATCCATATAGATATAGAAATAAAGCACAATTTCCAATACAAAAGAATAATGGT
ATTCCAATTATTGGCTTCTATAAAAAGAAGACTCATGATGTAATATCGACAGAAAAATGCGTAATACAAC
ATGAGATAAATGATAAAATTGTTAAAATAATAAAAACATATATAAGGGCCTATAAGGTAAGTATATATGA
TGAAAAGACTCACACGGGGTTGATTAGGCATTTAGTAACAAAAATAGGTTTTACAACTAAAGAAGTAATG
GTTGTATTAGTAGCAAATGGAAACAAACTTCCATATCTTAAAGAATTAGCTTCAGTGCTTAAGGAAAATA
TACCTGGATTTAAGACTTTGGTTGTAAATGTAAATCAAAAAGATACGAATGCTATTCTAGGAAGAGAAAA
TATAGTTATATATGGAGATGGAAAAATAAACGATTATATAGGTGACTTAGTGTTTGAGATTTCACCATTA
TCATTTTTCCAAGTAAACCCTGTCCAAACTAAAGTATTGTATGATAAGGCTCTTGAATATGCAAATTTAA
ATGATACTGATACTGTTTTTGATATTTACTGTGGGATAGGTACAATATCTTTATTTTTGGCACAAAAGGC
TAAAAAGGTTTATGGAATAGAAATTATAGATGATGCCATAAAAGATGCTAAGATAAATGCTAAATTAAAC
AATATACATAATGCTGAATTTTATGTTGGAAAGGCAGAGGAAATTGTACCTAAGATGTATAGAGAGGGTA
AGACTGCCAATGTAGTAGTTGTAGACCCACCTAGAAAGGGATGTGACGAAAAGGTATTAGAGACTATTGT
TTCAATGAATCCGGAAAGAATTGTCTATGTTTCTTGTAATCCTTCTACTTTAGCAAGGGATTTAGACTAT
CTAAATGTTCACGGATTTAAATGTGTTGAGGCACAACCTGTAGATATGTTCCCTCATTCTACACATGTGG
AAACTGTAGCTAAGATAATCAAGCAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3836167-3834407 pyruvate kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAATAATGTAAAGAAGACAAAAATTGTTTGTACACTAGGTCCAGCATCACAAAGTGAGGAAATTT
TAACTCAACTTATGCAAAATGGTCTAAATGTGTGTAGATTTAACTTTTCTCACGGTTCGCATGAAGAACA
TAAAGAAAGAATTGATATGGCAAAGAAAGTTAGAGAAAAATTAAATAAGCCAGTTGCTATATTATTAGAT
ACTAAAGGTCCAGAAATTAGAACAGGTAACTTTGAAGACCCAGAGGTATTTTTAGAAGAAGGGCAAAAGT
TCACTATAACTATGAAAGATATTATGGGGACTAAAGAAATGTGTACAGTAAGCTATAAAGGTCTTGCTGA
AGACGTTAAATCAGGAGATTCTATACTAATAGATGATGGTTTAGTTGGCTTAAGAGTAAAAGAAATAAAT
GGAGAAGATATAGTTTGTGTTGTTGAAAATTCAGGAATAGTTAAAAATCATAAAGGAGTAAATGTACCTG
GTGTTAAGATAAATTTACCAGCAATAACTCCTAAAGATATAAGTGATATAGAGTTTGGAATAAGTCAAGG
AATAGATTATATAGCTGCTTCTTTTGTAAGAAAGGCATCTGATGTACTAGCAATAAGAGAAGTATTAGAG
AACAATAATGCAACTGATATACAAATAATATCTAAAATAGAAAACCAAGAAGGTGTAGAGAACCTAGATG
AAATATTAAAAGTTTCTGATGGTATAATGGTGGCTAGAGGTGACTTAGGTGTTGAGATACCAACTGAAGA
GATGCCAATAGTTCAAAAAATGATGATAAAAAAATGTAATGAATTAGCAAAGCCAGTTGTTACTGCCACT
CAAATGCTTGATTCTATGATAAGAAATCCAAGACCAACAAGAGCAGAAGTTACAGACGTTGCCAATGCTA
TATATGATGGAACAGATGCGATAATGTTATCTGGAGAAACTGCTGCTGGAAAATATCCTGTAGAGGCAGT
AAAAATGATGGCTACAATAGCAAAAAGAACAGAAGAGACTTTAGATTATGATAGATTACTAAAGGAAAAT
GGTACTAACAATGTTACTGTAACAGATGCAATAAGCCATGCAACTTGTACAACAGCAGTAGATTTAAATG
CATCAGCTATAATAACATCTACTTCTTCAGGATATACTGCTAGAATGGTATCTAAATTTAGACCAAAATC
TCCAATAATAGCTACTACAAATAATGAAAAGACTATGAATAAATTAGCTCTTACATGGGGAGTATATCCA
GTTAAGTCTTCTGTTGCAGGAAATACAGATGAAGTTATAGAAAAGGCAATTGAGGCAGCTAGACAAGCTG
ATTATATAGATAATGGGGAATTAGTAGTTATAACTGCTGGAGTACCAGTAGGAGTAAGTGGAACTACTAA
TTTAATAAAGGTTCATGTAATAAGCGAAGAAATCGTGCAAGGTATAGGTGTAGGTACTCAAACGGTAGAA
GGTAAAGTTCGTATAATAAAGAATGGAAATGCTTGTGTAGACTTTAATGAAGGCGACATACTTGTTTCTA
CTGCTACTGATGCTGAAATGAACAATTATATAGAAAAAGCAGGAGCTGTAGTAACTGAGAATGGTGGAAT
GACATCACATACAGCTATTGTAGGTATAAATTTAGATATACCAGTTATTGTGTCTGCAACTGATATAACA
AATCTAGTAAAAGATGGAGAAGTTGTAACTGTGGATGCATCAAGAGGCGTGGTATATAGAGGTTCAACTA
GAGTTTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3837178-3836219 6-phosphofructokinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAACTATAGGATTACTAACAAGTGGAGGAGATGCTCCAGGAATGAATGCTGCGATTAGAGCGGTTG
TAAGATCAGCAATATATTATGGATGCAAAGTATATGGAATCAATAGAGGATATAAGGGATTACTAGAAGA
AGATTTAACTGAAATGAACTTATCTTCTGTTGGAGATATTATACACAGGGGAGGAACTATATTAAAATCT
TCCAGATGTGAAGAATTTAAAACAGAAGAAGGTAGATTAAAAGCAGTAAAAATTCTTAAAAAGTATAAAA
TTGATTGCTTAGTTGTAATTGGTGGAGATGGTTCATTTGCAGGAGCCCAAAAACTTAGTGACTTAGGATT
CCCAGCTATAGGCATACCAGGAACTATAGATAACGATTTAGCATATACAGATTATACTATAGGATTTGAT
ACTGCAATGAATACTATTATAGATGCTATAGGTAAGATAAGAGATACATCATCATCTCATGAAAGAGTTA
ACATAGTAGAAGTTATGGGAAGACACTGTGGAGATTTAGCTTTATATGCAGGTCTTGCAGGAGGAGCGGA
AACTATAATAGTACCAGAAGTAGAAATTACAGTAGATGAAGTTGCTCTAAGATTAAAGACTACTCAAAAA
AGAGGTAAGAGACATAGTATAATCGTTTTAGCAGAAGGAGTCGGAAGTGCTAGTGATTTAGAAAAGGAAC
TTAAAAAAGAGTCAGGAGCAGATTTAAGAGTCACTGTATTGGGGCATGTCCAAAGAGGAGGAAGCCCAAC
TGTATCTGATAGAATACTAGCAAGTAGACTTGGAGTAAGAGCAGTAGAATTATTATTAGATGGAAAATCA
GCTAGAGTTGTAGGAATAAAAGAAAACAAAATAATTGATTTAGAAATAAGTGAAGCTTTAGCTCAAAAGA
AAGTATTTGATAAAGAAGCTTATGAGATGGCAAAAATATTATCTATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3840956-3837387 DNA polymerase III alpha subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGAACAAAGATTTTGCTCATCTTCATGTACATACTGAGTATAGTTTACTTGATGGGTTTTCGAGGGTGA
AAAAACTTATAAAAAGGGCTAAGGAACTAAACATGAGCTCAATAGCTATAACTGACCATGGTTGTATGTT
TGGTGTTATAGATTTCTACAAAACAGCTATAAAAGAAGGAATAAAGCCAATTATAGGGTGCGAAGTCTAT
ACAGCTGCACGTGGATTGAGAGATAAAGACCCAAACTATGACAAATATCAAGGACATTTAGTTCTGTTAG
CTAAGAATATGGAAGGATATAAAAATTTAATAAAAATAGTTTCAACTTCATACGTAGAAGGTTTTTACTA
TAAGCCTAGAGTTGACATGGAAGAACTTAAAAAACATAACAAAGGGATTATAGCACTTTCTGCATGCCTT
GCAGGAGATGTAGCACGTGCTTTAATGAATAGAAATTATGAAAAAGCAAAACAATTTGCTCTTGACTACA
GAGACATATTTGGAGAAGAAAATTTCTTTTTGGAGATTCAAGATCACAATTTACCTGAGCAAAAAGAAGT
AAACTCTGGTTTAGTAAAATTATCAAAAGAGACTGGTATACCACTAGTTGCTACTAATGATGTTCACTAT
GTAAATAAAGAAGATTCGAAAATACATGATGTTCTTATGTGTATTCAAATGGGAAAAACATTAAATGACC
CAAATAGAATGAGATTTGGTAGTGATGAGTTTTACTTAAAATCAAGAGAAGAAATGGAAGAATTATTTCC
ATACGCATTAGAGGCTATTGACAATACTGTGAAAATAGCTGATATGTGTAATGTGGAGTTTGATTTTAAT
ACTATACATCTTCCTAAGTATGATGTTCCAGAAGGATATACACCAGAAACTTATTTAAGGGAGTTGTGTT
TTAATGGATTAAAAGAGAGATATGATAATCCTAGCAATGAGATACTAGAGAGATTAAATTATGAATTAGA
TGTAATTGAAAAAATGGGTTATGTAGAGTATTTTTTAATTGTTTGGGATTTTATAAATTTTTCTAAAGAA
AATAATATTATAGTAGGACCAGGTAGAGGTAGTGCGGCTGGTTCGATAGTAGCATATACACTTAAGATAA
CTGATATAGACCCAATAAAGTACTCTCTATTATTTGAGCGTTTTTTAAATCCAGAACGTATATCCATGCC
AGATATAGATATAGATTTTTGTTATGAGAGAAGAGAAGAAGTTATAGATTATGTAAAGAGAAAATATGGT
GATGACCATGTAGCCCAGATAATAACTTTTGGAACAATGGGTGCAAAAGCTGCAATAAGAGATGTTGGAA
GGGTATTGGATATAGGCTACAATAAAGTTGACAAGGTAGCCAAGGAAATACCATTTGCTTTAGGAATGAC
AATAGATAAGGCCCTAGATACAAATCCTAATCTTAAAGAATTGTATGACCAAGACCCGGAAACAAAAGAA
ATAATAAATATATCAAAACAGATAGAGGGAATGCTAAGACATGCTTCTACTCATGCAGCAGGAGTTGTTA
TATCAAAAAATCCCGTAGATGAATATGTACCTTTGTACAAACATCAAGATGCAATCACAACACAGTTTAC
TATGACAACACTTGAAGAACTTGGGCTTTTAAAGATGGATTTTCTTGGGCTAAGAACTCTTACAGTTATA
AGAGATACTCTTGATTTAATAGAAAAAAATAGAGTTATAAAAAACTACACAGAAAAAATAGACTTTTCAA
AGATGGATTATGACGACCCGAAAGTATATGAAATGCTTTCATCAGGAAATACACTAGGGGTGTTTCAATT
GGAGAGTGCTGGCATGAGAAGTTTTATGAAACAGCTAAAACCAGACAATTTTGAAGATATTGTAGCGGGA
ATATCCCTATTTAGACCAGGTCCAATGGATTCTATACCTGCATATATAAAAAATAAAAGCAACCCAAAAG
ATGTAACATATCTACATGAAAAATTAAAGCCTATAATGGAAGTTACATATGGTTGTTTGGTATATCAAGA
GCAGGTTATGCAGGTCGTTAGAGATTTAGGTGGTTATAGTTACGGACGAAGTGACCTAGTTAGAAGAGCC
ATGAGTAAGAAAAAGATGGACGTGATGGAAGAAGAAAGACAATATTTTATTCATGGTAAATTTGATGAAG
ATGGTAATATAGAAATTGCAGGGTGTATCAGAAATGGTGTAGAAGAGGAAATAGCTAATAAAATATTTGA
TGATATGATAGACTTCGCTAGATATGCATTTAATAAATCACATGCAGCTGCATATGGGGTTTTAGCATAT
GAGACAGCTTATCTAAAAACATATTATCCAGTTGAATTTATGGCAGCATTGATAACCAGTGTAATGGGAA
ATACTGATAAGGTAGTTGAGTATATAAGAGAATGTAAAGCACTAGAAATAGATGTATTACCTCCAGATAT
AAACAAAAGTTTTTCAAAGTTTTCAGTTGAAGGCGACAATATAAGATTTGGTCTAGCAGCTGTAAAAAAT
GTTGGTGTAAATATAATAAACAATATAATCGCTGAAAGAGAATCTAATGGATTATTTGTAGATTTAGTAG
ATTTAGTCAAAAGATTAGACCAAAAAGATACAAATAAGAGAGTAATAGAAAGTCTAATAAAATGTGGAGC
TTTTGATAATATAAGTGAAAATAGAGCTAGTCTGATGGCTGGTTATGAAAGTTTATTAGAAAGTGTATCT
ATGGATAGAAAGAAAAATGTTCAAGGTCAAATTTCTTTATTTGATGCTTTTGGAGATAGTGAGGAAGATA
GTGATTTTCAACAAATATACAGTTTACCTAAAAGGCAAGAGTATGAAGAAAGAGAGAGACTTAACCTTGA
AAAAGAAGTCTTGGGAATGTATGTAAGTGGACATCCTTTATCACAATTTGAAAAAGAACTACAAGAAAAA
ACATCTATGGATAATGGAAAATTAAATTCATTAAAAGAGGAAGAAGAGTCATACCTACAAATGAATGAAA
CAGATGTTATAATGGGTGGAATGATTGTAACTAAAACTATTAAAACAACAAAACGAAATGAAATTATGGC
ATTTATTGAATTAGAAGATTTGTATGGTGCTATAGAAATAATAGTTTTTCCTCAATTATTACAAAAGTAT
AATGTCATTTTGAATGAAGATAATATAATATATGTAAAAGGAACATTAAGTATAAAAGAAGGCGAAAATG
CAAAACTTATAGCTAGAGAGATAAAAGATATAAATGATGATACTGACTTTGCAGATAGAAACTACAATTC
AGGAAGAACTAGAAATGTAGAAAATATTAAGCCAGAAAGTGGTAAAAAATTGTATTTGAAAATAGATAGT
ATGTCTGATACTGATACAACTAATAATATTGTAGAAATAGCCAAACAATATCCAGGTAATGACAGTATAT
ACTTGTACCCTATGGATGAAAATATAAATGGTAAACGTAAAGCATATAAAATGACCGGGGCATTGACTTG
TATATGTGATGAATTTATAAATAACTTAGAAGAGTTACTTCCTAAAGATAACATAAAAGTAAAAGCTTGA
>ref|NC_013316.1|:c3842060-3841113 hypothetical protein CDR20291_3219 [Clostridium difficile R20291]
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CTGAATTATCAGCTCTAGTTAAATCAGGGGGAAGTATACAAATCGTTGGATATAAGAAGCTAAATCTAAA
GATAACAACAGAGTTAAATTCAATAGCCCGTAAAGTATTTAAATTATTAAAAAAGAATTTTAATATCAAT
ACTACAATCTCAGTAAATAAGAATCAAATGCTAAAGAGAAATAACAGTTATGTATTAATGGTAACAAGCG
AAATGGGTTCAGAAATGTTATTAAAAAAGTTAGGTATACTTGAAGATAAAGAAGGCTTTTTTACTATAAA
CAAAATTTCAGAGAACTTAATTAAGCATGAAGGATGTAAGAGAGCTTTCATAAGAGGAGCTTTTCTTGGT
GGAGGTTCTATAAGCGACCCAGAAAAGAACTATCATATGGAATTTGTAACTAATAATGAGGAGTTTGCAG
ATTCTCTAAAAGAACTTATAAACTCTTTAGGTTTTAATAGTAAAATTGTGGCTAGAAAAAATAATCACGT
TGTTTATATCAAAGAGAGTGAACAAATATCAGATTTGTTGAGTATTATAGGAGGACACCACGCTCTTTTA
AGTCTTCAAAATACTAAAATAGTAAAAGAAATGAGAAATAATGTAAACAGGATAGTAAATTGTGAGACAG
CTAACCTTTCTAAAACAGTAAATGCAGCAGTAAGACAAGTAGAAAATATTAAGCTCATACAAGAGACTAT
AGGAATTAGCAGTTTGCCAGAAAATTTACAAGAGATAGCTAAGATTAGAATCGAGTATGAGGATATGACT
CTCAAAGAACTTGGAGAGATGTTAGAACCACCAATAGGAAAATCTGGAGTCAATCATAGACTTAGAAAAA
TAGAAGAAATTGCAACAGATTTGAAAAAAAAATCATAG
>ref|NC_013316.1|:c3842502-3842077 putative DNA repair protein (nucleotide pyrophosphatase) [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAGAAGAGGTTAGTGCTGGTGGTGTAGTCCTGTTTGGCAATACGATTCTTTTACTAAGGAAGTTCA
ATGGAGATTGGGTGTTACCCAAGGGAAAAGTAGAAGAAGGGGAAAATAACCAAGAGGCAGCATTACGTGA
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GAAAACTGGGATGAAAATAGAGCAGTTCATAAAACAGTTTTTTGGTATTTGATGCAAGCAAAGAATATGG
ATACTATTCCACAAAAAGAGGAAGGCTTTATTGATGCTAAATTTATCCATCTAGATAGAGTGGTAGACCT
AGCTAGGTATGATGATGAAAAGGAGATAATAAAGGTTGCCTTACAAGAAATAAAAAAAAGGTTAAAGAAA
AATTAG
>ref|NC_013316.1|:c3843689-3842571 hypothetical protein CDR20291_3221 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGCAAACATGGCTAAATTACTTATTATTGTAGGAATTTTAGGTTGGATTGCATTAATTGTATCGT
TATTTATATATAAAAAAGCAAAAAATGAAAAAGTAAAACTATTTCAAAGGTCTATTGTTGAAAATAGAGA
ACCAAATGTGGTTGTGATAGGTGGAGGTACTGGTCAATCAGTATTTTTAAGAGGTCTTAAACACACTACG
CAAAATATAACTGCAATTGTAACTGTTGCTGATGATGGTGGAGGTTCAGGTGTATTGAGAGAAGACTTAG
GAATGCTCCCACCAGGAGACATAAGAAACTGTCTATTAGCACTTGCAAATATAGAGCCAACAATGAATGA
AGTTATGCAATATAGGTTTACAGAAGGGCTTTTAAAAGGTCAGAGTTTTGGAAATTTGTTTTTGGCTGCT
ATGAATGGGTTGTATGGAAACTTTGAAAAAGCTGTATATAAATTAAGTGAAATTTTTGCTATAACAGGAA
GAGTTTTACCAGTAACTTTGGAAGATGTAAATTTAGTTGCCAAATTAGAAAATGGCAATATAATAAATGG
AGAATCTAGTATACCTGAAGAGTCAAAAATTCAAAAAAGCTCTATTGATAAAATTTTTTTAAATCCAAAA
GATGTCAAACCATTAAAGGATGTTATTGCATCTATTTACGATGCTGACATTATAATTATGGGCCCTGGAA
GCTTATATACGAGTATAATACCCAATTTACTTGTAGAGGGGATTGTAGACGCTATTAAATCGTCTGTAGC
TCCAAAAGTATATATAGCAAATATAATGACTCAACCAGGTGAGACAGAAGGGTACAATGTATTAGAGCAT
GTTAATGCTATAGTAAAGCACACTGATGAGAATTTAATAGATTATGTAATCGCAAATAATGAGATATTGC
CAGAAGAAATGCTTGACTTATATAAACAAGATGGAGCAGAGCAAGTCTTGTTAGATAAAAAGCAAAAAGA
TAAATTAAAAGAGATGGGTATAAAAACCGTAGAGAAGAATTTAATTGAAATAAAAAATAATTATATAAGA
CATGATGCAAAGTATATATCTAACATAGTTATTGAGTTAGCCCTAAATCATAATTACAACAAAAGTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3844546-3843689 putative ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTTGTTATAGTTACAGGTCTTTCAGGATCTGGAAAAAGTGAGACAATGAGAGCTTTAGAGGATA
TGGGATTTTATTGTGTAGATAATCTACCTCCTGCTTTGATAACTAAATTTGCAGAATTATGTTATCAACC
AAATTCAAGTATTGATAAAGTTGCTCTAGGGATAGATATAAGAGGGAGAAAGTTTTTTGAAGCGCTTCAT
GAAAGCTTAAATTATTTAGAAAAAGAAAATTATGAATATGAAATGGTATATTTGGACTGTAATGATGATG
TATTGTTAAAGAGATATAAAATGACAAGAAGAAATCATCCATTGGCAAAAGATATGCAGATTCCAGAAGG
TATAAAAATGGAAAGAAAGATAATGGAACCTTTAAAGGAGTTATCTACATGTATAATTGATACAACTAAC
ATGAAACCTAAAGACCTTAAGGAAGAAATAAAGAAAATATATTCTTCTGGTGAAGATAATCCAAACCTAA
CTATTTCTGTAGTATCTTTTGGATTTAAACATGGTATACTTGCTGATGCAGATTTAGTATTTGATGTAAG
ATTTCTTCCAAATCCCTATTATGTTGAAGAGTTAAGAGCTAAAACTGGTGATGATAAAGAAGTTAGAGAT
TATGTTATGAATTCTAAAATCAGTGAAGAATTTTATGTGAAACTTTTAGATATGATTCATTTTTTAGTAC
CTCAATATATAGATGAAGGAAAACAACATCTAGTAATTGGTGTTGGATGCACAGGTGGAAGACATAGGTC
AGTTACTATAACAAATCTTATAGCGGAGGATTTATCTAATAAGGGATATAGAGTTGTAAAGAAACATAGA
GACTCTATGTTGCGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3845290-3844577 putative phosphoesterase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATACTGGCTGATTATCATACACATACATTATATAGTCATGGCAAAGGGACTATTGAAGATAATG
TAAAGGTAGCCATTTCTAAAGGAATAAAAACAATAGGAATATCTGACCATAGCTATAAACATATTGCATA
TGGTGTAAAGAAAAAAGATATTCTCAAAATGAGAGAAGAAGTAGATTATTTAAATGATAAGTACAATGAT
ATAAATATACTTTTAGGTATGGAGTGTAACATATTAGATGATAAAGGCAATATAGATATGGATGATAAAT
TTATTAGAGATTTTGATTATATTATGGCTGGATATCATTTTGGTTCTACTCCAACATCATTAAGAAGCTT
ATTAAATCATTGTAATAACTATATTTTTAAAACTGAAAAAGCAAAAGAATACAATACAAAAGCTGTAATA
AATGCGATAAGTAATAATGATATTTTTATAATTACTCATCCAGGAGATAAAGGCGATGTGTATATAGAAG
AAGTAGCAAAGACAGCAAAAAAGACAAATACTAGACTTGAAATAAATAGTAGCCATTCTTTTTTGAATGT
AAATCAATTAAATAAAATAAAAGGGCTAGAAAATAAATTTATAATAGGCTCAGATGCACATTGTCCAGAA
AGAGTTGGTGATTTTAAACTAGCTATGAAGACTATATCTGACTCTAATCTGGATATATCGTTAGTAGAAA
ACATTATAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3846247-3845294 UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase [Clostridium difficile R20291]
ATGACAGCTAAAGTTCAGTATAATTTGGGAGGAAATACAATGAATAATCAAGATATATATATAAATTTAT
TAAATATATTAAGTAAAGAGGATATAAAAGTCGATGAACCTATGAAAAAACATATTTCATTTAGGGTAGG
AGGACCAGCAGATATATTAGTTAGACCTAGAACTGAAGAACAATTAAAAAATGTACTTAAGTTGGTAAAA
GAAGAATCTATTCCGTATTTAATAATTGGAAATGGTTCAAACATTTTAATTAAAGATGGTGGAATAAGAG
GAGTGGTAATAGAATTAGCTGATAATTTCAATTCTTATGAGATAAATGATACTAGGATGACTGCTCAGTC
AGGAGCTTTATTATCAGTTTTAGGTAAAGCTCTCCAAAAGCAAGAATTAAAAGGGTTTGAGTTTGCATCA
GGAATACCTGGTACATTGGGAGGAGCACTAGCCATGAATGCTGGAGCATATGGTGGTGAAATGAAGGACA
TAGTGAAGTCAGTAAGACTGATGGATATGGAAGGCAATATATTTGAATTATCAAATGAACAGATGGAATT
TGGGTATAGAAAAAGTATAATATCGAAAAACGGATATATAGCTTTATCAGCAGAACTAGAATTACAAGAA
GGAAATTATGATGAAATAAAAAGTTTAATGGATGATTTAGCGACAAGAAGAATAACTAAACAGCCATTAA
ATTTTGCGAGTGCAGGAAGTACATTTAAGAGACCAACAGGATATTTTGCAGGTAAATTAATAGAAGAAAC
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GGAGAAGCAAGTGCTAAAGATATTTTGGATTTAATATATGTTATAAAAAGTGCTGTATATGCCAAGTTTG
GGGTTATGTTGGAAGAAGAAGTCAAAATACTTGGAGAGGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3847317-3846481 putative formate/nitrite transporter [Clostridium difficile R20291]
TTGTTATTATATAATTATTGCCATAAAAAGACAAGGGAAAGTATAATTTTTAAGGGGGAAGGATTTATGA
GTAAAGGATTCTTGACACCTGGGGAAACTGCACAAGCAACTATAAGTGCAGGCATTAAAAAAGCAAACAT
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CAGTAGGTCTTATGCTTGTAGTGGTGGCAGGAGCAGAATTATTCACTGGAAACACCTTAATGGCTATTGC
ACTTATGGACAAAAAAATAACATTAGGAAAAATGTTAAGAAACTGGGGACTGGTTTATTTTGCAAATTTA
GTAGGTTCAATTCTGCTAGTTGCACTTGTGTTTTATTCTTCTACATTGACAGGAGATGCAGCTACAAAAG
CTATAGCTGTGGCAGAAGCTAAGGTTAATTCAACTATAGCATCAATGTTTTTAAAAGCAATACTTTGTAA
TATTTTAGTCGTTTTAGCTGTATGGATGGCTACAGCATCTCAAGATATAATGTCAAAATTGGCTTCATGT
TGGACAGTAATAATGTTATTTGTATTATGCGGATTCCAACATAGTGTTGCAAACATGTTTTTTATACCAA
TGGGAATGGCATTAGGAGCAAATATAACTATGGTTCAATTTATAACTAATTTGGTATTTGTAACGCTTGG
AAATATCGTTGGAGGTTCCATAGTAGTTGGAGGGATTTATTATCTTTGCTATGTCAAAAATAGTTAG
>ref|NC_013316.1|:3847569-3849050 putative cardiolipin synthetase [Clostridium difficile R20291]
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TCATGGTTATACTAAACCTTATCTTTAGAGAAAAAAGAAACATAAATACAACTTTAACATGGCTTCTTAT
ATTAGTATTGATTCCTGCTCTTGGATTCATACTTTATATAGCTTTTGGCAGAAATATTTCAAAAAACAAT
ATGTTTAGATTGAAAGAAAAGGATGATAAGATAATCAAAAGTAATATACTAGATACTCAGGTTAAACTCC
AATCTACATCTGAAATTGATTCAGATATACATCAACATAAGGATATGATTTATGCATTGGCTAATTCAAA
TAATGCTCATTATACCAATAATAACGATGTGTGGATTTATGCTGAATCTAGTCAATTTTTTAACAGTCTT
CTTGAAGAACTTAAAAAAGCTAAAAAATATATAAACATACAATTTTACATTTTCAAAGATGACAAAATCG
GAACTGAAATAATAGACATTCTTATAGACAAAGCTAAAGAAGGTGTTGAAGTAAGACTTTTATTTGATGC
AGTTGGTGGTAGAACACTAAAAAATAGTACACTTTCCAGACTTAAAGAAAGTGGTGTTAAAGTTGGAAGC
TTCTTCCCATCATTCTTGAAAATTGTAAACTTTAACTTAAACTATAGAAATCACCGAAAAATTGTTGTCA
TTGATGGTAAGGTAGGATTTGTAGGTGGATATAATGTTGGTGATGAATATTTAGGTAGAAATCCAAAATT
TGGTCTATGGAGAGATACACATACTAAGCTTACTGGTGATTGCGTAATTGACCTAAATATGAGATTCATC
CTTGATTGGAGATATACAACTAAAGAAGATTTAGATTTAGAAAAGTACTTTATAGAAGAAGATACAAATT
CTAATCATCCTTCTGAAAATATTGGGATTCAGATAGTATCAAGTGGTCCAGATATATCAGAACTTGATGA
GATTAAATATGGTTACCTTAAAATGATTCAGAAAGCTAGAAAGTATATATACATACAGAGTCCTTATTTA
ATACTTGACTCAACTTTTATAGATACTTTAAAAATAGCTTGTTTATCTGGTGTTGATGTGAGAGTTATGA
TTCCTTCTAAACCTGACCATCCCTTTGTATACTGGGCATCATATTCATATGCTGGAGAACTTTTAAAGTT
TGGAGCTAAAATCTACACTTATGGTCAAAATGCATTTTTACATGCTAAGACAATAGTTATAGATGACTCT
ATATGCTCTATAGGAACAGCTAATATGGATATCAGAAGTTTTGAGCTTAATTTCGAAGTTAATGCATTTA
TGTACTCTTCAAAAAAAGCATTGGAACAAAGAATTATATTTGAAAATGATATTTTAAATTCTAAGGAAAT
AACATTAGATATATATAATTCTAGGTCTACTTATATAAAAATCAAGGAATCAATTTCAAGACTATTATCA
GCAGTTTTATAA
>ref|NC_013316.1|:3849368-3849865 putative iron-only hydrogenase, electron-transferring subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGTGCGATTTTATTTCACACAACAAGCAATTATTTGACGAACTAGATATATTTATTGACTCTCTTACAA
CAAAGGAAGGTGCGTTAATACAAGTTCTACATGAAGCCCAAGGTATATTTGGATATCTTCCAAAAGAAGT
TCAACTTCATGTTGCTAGAAAACTTGGAGTAGCTCCTGCAAAGGTATATGGGGTTGTTACATTCTATTCT
TATTTTACTACAGAACCTGTAGGTAAGTATAAAATCAGTGTCTGTCTAGGAACTGTATGTTTTGTAAAAG
GTGCTGACAAAATCTTAAGTGCTTTTGAAAAACAGCTTGGCATAAAAGTTGGAGAAACTACTAGTGATTT
TAAATTTTCTTTAGAGGGTTTAAGATGTTTGGGGGCATGTGGTTTAGCTCCAGTTGTTACTGTAAATGGT
AAAGTTTATGGTAAAGTGAAACCTGACCAAGTAAGCGAAATATTAGATACTTATAGAGAATTAGAATTGA
ATTGTTAA
>ref|NC_013316.1|:3849882-3851768 putative iron-only hydrogenase, electron-transferring subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGCGTAAAGTAAATTCATTTGATGAATTAAAAGTTTTAGCTGATGAGCTGAAACCTAATCTTAGCTTAA
GAAAAAATTATTCTAAGGAAAATGTATTAAGAAGAGAATTACTTGTTTGTTGTGATACTGGATGTACCTC
TTCAAACAGTCTAGAAATAGTTAGTGAATTAGAAAATGAAATAAAGAAATCAGGAATCCAAGATAAAGTT
AGTGTTCGTTTGACAGGTTGTTTTGGTTTCTGTGCTCAAGGTCCTATTGTAAAAGTTTATCCTGATAACG
TTTTCTACGTAAAAGTTGAGCCATCTGATGCTGAAAAGATAGTTCAAAGCCACTTAATTAGAAATACAGT
TGTCGAGGAATTATTATATGAGGAAGAATCTTTAAGTAAAAAAGTTGAAGAACAAGAAGAAATGTCTTTC
TACAAAAAACAGTTACGTATAGCTTTAAAAAATTGTGGTCTTATAGACCCAGATAGTATAGAAGAATATA
TTGCCAATGATGGTTATTTAGCTCTAGGCAAATGTTTAACTTCTCTTACTCCTCAAGAAGTTATTGCAGA
GGTAAAAACTTCTGGCCTTCGTGGTAGAGGTGGTGCAGGTTTCCCTACTGGCTCTAAATGGGAAGCTGCT
TCAAAAAATCCAGCTGGTCCAACAGATAAAAAGTTTGTTGTATGTAATGCTGATGAAGGTGACCCAGGTG
CATTTATGGATCGATCTGTACTTGAAGGTGACCCTCATAGTGTACTAGAAGCTATGGCAATATGTGGATA
CGCTATAGGTTCTGATACAGGATACATATACATAAGAGCAGAATATCCAAAATCTATAGAAAGATTAAAA
GTAGCCATAGCTCAAGCTGAAAAATACGGTTTACTTGGCGAAAATATCTTAGGCACTGGATTTAACTTTA
AATTAGAATTAAAATATGGTGCAGGTGCTTTCGTTTGTGGTGAAGGTACAGCGCTAATGCATTCAATTGA
AGGTAGACGTGGTGAACCTAGAATGAAAACTTATAGTTCTTCTAAGAGTGGTCTATGGAAATCTCCTACT
TGCTTAAATAACGTTGAGACTTTTGCTAACATACCTGCAATTATACTTAAGGGTGGAGATTGGTTTGCCA
ACTTAGGTACTGAAGATTCTAGTGGTACTAAAGTCTTTGCTCTTGGTGGAAAAGTAGAAAATGTAGGACT
TGTTGAAGTTCCAATGGGTACTACTTTAAGAGATATTGTATTTGAAATTGGTGGGGGAATCCCTGAAGGT
AAGAAATTTAAGGCTGTTCAAACAGGTGGACCATCTGGTGGATGTATACCAACTGAACATTTAGACACTC
CTATAGACTTTGGTTCATTAAGTTCTATCGGTTCAATGATGGGCTCTGGTGGTATGCTTGTTCTTGATGA
ATCTGACTGTATGGTAGATATAGCCAAGTTCTTCCTTGAGTTTACTGTTGAAGAATCTTGTGGTAAATGT
ACACCTTGTCGTATAGGTACTACAAGATTATTAGAAATATTAACTAAAATTACAGAAGGTAATGGTACTC
TACAAGATTTAGATGACCTAGAAAACCTTGCTGAAACTATACAAACTGCTTCATTATGTGGTCTTGGTAA
AGCTGCTCCAAACCCTGTTTTAAGTACTCTTCAATATTTCAAAGATGAGTATATAGCTCATGTTGTAGAT
AAGAAATGTCCTGCTGGTAAATGTCAGAACTTACTTTCTTACTTTATAACAGATGACTGTAAGGGTTGTA
CAAAATGTTCTAGAGTGTGTCCTGCTGGTTGTATAACAGGTTCTGTTAAGGAACAACATACAATAGATAC
TTCTAAGTGTCTAAAATGTGGTGCTTGTATAGATAATTGTACATTTAACGCTATAATCAAGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:3851791-3853572 putative iron-only hydrogenase, catalytic subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTTAGTTAATTTAACTATTAATGGCAAACACGTTTCAGCACCTAGTGGAACTTCTATCTTAGATG
CTGCGAAATTAATAAATATAAAAATACACAACCTTTGTCATTTACATATGAACGAAATAGATAAGCTTGA
CACTTGTGCTTCTTGTCGTATTTGTATGGTTGAGACAGAGAGAGGCTTAGTTCCAGCTTGTGGAACAGTT
ATAAAGGAAGGTATGAAAGTTCAGACTAATAGTGCTAAAGCATTAAATGCTCGTAGAACTATTGTTGAAT
TATTGTTATCAGACCATCCACAAGATTGTTTTGTCTGTGAAAAAAATGGAGATTGTGAATTACAGACTAT
AGCTGCTGATTTAGGAGTAAGAAAAATAAGATATCAAGGTTCCAAATCTTTTGCAGGTAAAGATACTTCT
ACTAAATCTTTAGTTAAAGACCATTCTAAGTGTATATTATGTAGAAGATGTGAGACTGTATGTAATGACA
TACAAACAGTAGGAGCATTATCTGGAGTTAATCGTGGATTTAATACTTTAGTTAGTACATTCTTTAACTC
TGATATGGTTGAAACAGAGTGTACATTCTGTGGTCAATGTATATCTGTCTGTCCAACTGGAGCATTAACA
GAAGTAGATAATGTACCTAAACTTTGGGATGTTTTAAATAAAAAAGAAAAGACTATAGTAGTGCAAGTTG
CTCCTGCTGTAAGAGTTGCTATTGGTGAAGAGTTTGGATTAGAACCAGGGTCAATCTCTACAGGAAAAAT
GGTAGCTGCTTTAAAAGCACTTGGATTTGAACATGTATTTGATACAAACTTTGGTGCAGATTTTACTATA
ATGGAAGAAGCTACTGAATTTATAGAAAGAATCCAAAAAGGTGAAAATCTTCCTATATTAACAAGTTGTT
GTCCTGCATGGGTAAACTTCTTAGAACACAATTATCCAGACAAGTTAAACTTAGCATCTAGCTGTAAGTC
TCCTCAAGGTATGTTTGGTTCTATAGCTAAAAACTACTATGCACCTAAAATATTAGGAATCAATCCTGAA
GAACTTTATGTTGTATCTGTAATGCCTTGTGTGGCTAAAAAATATGAAGCTTCAAGAGAAGAATTAAGTG
AATCTGGAATACTAGATGTTGACCTTTCTATAACTACTAGAGAGTTAGCTAAAATGATAAAAGAAGCTGC
TATCGATTTACCTAATCTTCAAGACCAAGATTTTGATAATCCTCTAGGAAAATCTACAGGTGCTGCATCT
ATATTTGGAGCAAGTGGTGGAGTTTTAGAAGCTGCCCTACGTACTTCATATGAGAAGATAACTAATAAGA
CTTTAGATAATGTAAACTTCACTAATGTTAGAGGTCTTAAAGGAATTAGGGAAGCAAGTATAGATGTTGA
TGGAACTACAGTTAATGTGTGTATTGTAAATACACTTAAAAATGCTAGAAAGATTATGGATAAGGTCAGA
AGTGGAGAATGTAAATACCATATCATAGAAGTTATGGCATGTCCTGGTGGATGTGTTGGAGGTGCTGGTC
AACCTTATCACCATGGTAATACTGAAATAGTTGATAGACGTGCAAATGCGTTATATGAAATAGATAGAAA
TAAGGCTATTCGTAAATCTCATGAGAATCCTGATTTACAAGCTATTTATAAAGACTTCTTTGGAGAACCA
AATAGTGATGTAGCCCATAAATACCTTCATACTCATTACTTTGATAAGAGTTGTGTCTATGGAGAGTGTC
CACAAGAATGTGCTTGTGAAGAAGCTAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3855508-3853712 putative DNA mismatch repair protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAATAGAATATTTTAGTAAACTTTTAGAAAGTAGTACTGAAAAAGAATTGCTCTTAAGTAAAAAGT
CAAATAACATAAGTACAGCAAGATTAATATCTTTTTTGATAGTGATAGCAGGGTTTGCTATTGGATTTTA
CAATAAAAATATAGTAGGTATTTTTGTTGGAGTTTTATCAATAATAATATTTATAGCACTCTTAGTTATT
CATAGTAAAGTAAAAGAAGAAGAAACATATTTTAAAAGTAAGAGCGAAGTATTAAATAAGTATATTAAGA
GATTTGGAGATGGTTGGAAGGAATTTAAAATAGATGGTAAAGAATACTTAAAAGATGAAAATTCGCAAGC
AAAAGATTTAGACTTATTTGGAAGAGCATCATTGTATCAATATATCTGTGTAGCTAATACATCTTATGGG
AAAAATTTTTTAGCCAAATATTTGTGGAATGAAAATCCAGATGAGAATGTAATCTTAGAAAGACAGAGGG
CTATAAAAGAACTTTTATCAAAAGATGATTTTTCTATTCATATTCAAATACTCAGTAATATAATTGGTAA
AGAGCAAAAAAATAATTCAGATAGTAGTATAGAATCGTTTATAGAGTATGGAGAAAATAAGAATGTGTAT
ATACCAAAATGGATGCATATTTTTACTTGGGGTCTACCAACTGCAACAATCTTATCTTTTATATTTTGTA
TGTTAGGATTTTTACCTGTTTTACCTGTTTTTTTACTTTTTATAATCCAGTTAGGGTTTAGTGGTTTTGG
ATATCCAAGACTTATGCAAACTCTTTCTCCATTATTTTCATTTAGTAGAAGTATACAAGTATATGAAAAA
ATGTTTGAGGTTTTAGAAAAAGAGACGTTTGAGAGTGCATATTTGAAAGAATTACAAGATAAACTTTCTA
AGGGAAGTGGAGTTTCAAGAGGTGTTAAACAATTAAATTCAATAGGAAATGCTGTAAACCTAAGGTATAA
TCAGATACTATATATAATTGCCTGTGGTGTTTTGATGTGGAACTATCATTGTGCAGAAGCTTTGGAGCGA
TGGAAAGGTATATATGGAAATCAAATTAGAGATTGGTTTGAATCTATTGGAGAATTTGAAGCTCTAATAA
GTTTAACAGTTATTTCTCATGTAAAGGAAAATACATGTTTTCCAGTAATAAAATATGAAGATACTCCAAG
ATTGAAAGTTGAAGAGGTATACCACCCATTAATAGCAGAAAAAAGTGTCATAGCAAATTCGATACAATTA
AATTCTCAGACTTGTATTATCACAGGTTCAAATATGTCTGGAAAGACAACATTTTTAAGAAGTATCGGTG
TAAACTTAGTGCTGGCATATGCAGGTGCTCCAGTATGCGCTAAGAGTTTTGATGCGACCTGTATGGCTAT
ATTTACTTCTATGAGAATACAAGATGATGTAAGTCAAGGAATATCAACTTTCTATGCTGAGATTCTTAGA
ATAAAATCAATGATTCAATATAGTTTAAAAGAACTGCCAATGTTGGTTCTAGTAGATGAAATTTTTAAGG
GAACTAACTCTGCTGATAGAATTATTGGAGCAAGTGAGGCAGTAAAGAAATTATCAAAACCCTGGGTTAT
AAGTATGGTGACAACACATGACTTTGAGCTATGTGACCTTTCAGGTAGTGGAGATGTTGAAGTTGTAAAC
TATCATTTCTCAGAGTACTATGTAGACGATAAAATTCATTTTGACTATAAGATAAAAGATGGAAGATGTA
AAACTACAAATGCAAAACAACTTATGAGAATGGCAGGTATTCTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3856651-3855722 HPr(Ser) kinase/phosphorylase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAACTAGCAATAAAGTATCAATAAGAGAGATAATAAAAGAGTTGAAGTTAAAAGTAGTATACATGC
CTGATGATGTAGATTATTATGTCTACTCTCAAGATATAAATAGACCAGGATTACAGTTTGCAGGATATTT
TGATTATTTTGCATATGAAAGAATACAAATAGTTGGAAAGACAGAATATAATTTTTTTGGATTAATGGAT
AGTCATATTCGAGAAGAAGTACTAGATAGATTTTTCTCATATGAAATACCAGCGTTAATAATTTCTAGAG
ACTTGGAAATCAAGCCAGATGTAATTGAAAAGGCTAAAAAATATAAAAGAATACTTTTGAGCACAAATAG
AAATACCACTAGACTTATAAATAGACTGTCAAACTATTTGGATAATAAGTTAGCACCACACACAACAATT
CACGGGGTGCTAGTAGATATTTATGGTATAGGTGTACTGATAAAAGGTGAAAGTAGTATAGGAAAGTCGG
AAACAGCATTAGAACTGATTCAAAGGGGTAATAGATTAGTTGCAGATGATGCTGTAGAAATAAGAAAATT
AGATGAAAGTATGCTTGTGGGTCAGTCACCTGAACTAATAAGACATTTTCTTGAGATAAGAGGAATAGGA
ATAATAGATGTTAGAAGTTTATATGGAGTAGGGGCAATCAAAAATTCTAAAATGATAGATTTAGTAGTTC
ATTTAGAAGCTTGGGATGAAACTAAGTATTATGATAGACTAGGACTGGATAAAGAATACGAAGAAATACT
TGGTGTTAATGTAGAGAAATTAGTTGTACCTGTTAAACCTGGAAGAAATACTGCTATGATATTAGAAGTA
GCAGCAATGAATTTTAGACAAAGAGGAATGGGATACGATGCAGCTCAAGAATTTACTAAAAAATTATCAA
AATTAATCGATACTAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3858468-3856651 excinuclease ABC subunit C [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTGATATACAAGAGCATTTAAAAAAATTACCTTCTGAGCCCGGAGTATATTTAATGAAAGACAAAT
ACGACCATATAATATATGTGGGAAAAGCCATATCTCTAAAAAATAGGGTAAGGCAGTATTTTCAATCTTC
AAAAAACCATACATCTAAAGTAAAATCTATGGTTAAGAATATATATAAGTTTGAGTATATTATAACGGAT
TCAGAGTTAGAGGCATTAATACTTGAATGTAATTTAATAAAAAGATACAGACCAAAGTATAATGTAGTGC
TTAGAGATGATAAAACTTATCCATATATAAAAGTAACTACGAATGAAGATTATCCAAGAATCTTAAAAGT
TAGAAGAGTTCTTAAAGATAAGGCAAAGTATTTTGGACCCTATACCAATATAACTGCTGTGAATGATACC
TTGGAGCTTATAAGTAGTACGTATCCAATAAGAAGCTGTAAAATAGATATAGATAAAGCAATAAAGAATA
AGACAAGACCTTGTTTAAATCTACACATAAATAAATGTTTAGGACCTTGTACAGGAAATGTTTCTAAAGA
AGAGTATGGAAAAATGATAGAAGAGATTATAATGTGTTTATCTGGTAAAGAAGAAAAATTGATGGAACTT
TTAAAGGAAAAAATGAATGAGAGTTCTATGAACTTTAGATTTGAAGAGGCTGCTGTATATAGGGATAAGA
TAAAGAGCCTTGAAGAGATGATACAGAAACAAAAAATAGATGCTACTGTAAGTGACTTAAACCAAGATGT
GGTTGCAATGGCAAGAGCTCATAATGAAGCTTGTGTCCAGGTATTTTTTATAAGAAATGGTAAGATTGTA
GGTAGGGAACATTTTATATTAGAAGGTGTAATGGATAGTCCAAGAGCTTCTATATTAAGTTCATTTGTAA
AACAATTTTATAATGAACAAGAGTATATACCTAAAGAATTAATTATAGAAGATGAGATAGAAGATAGTTC
TATATTAGAAGAATGGCTGTCATCTAAAAAGGGGCAAAAAGTAACAATAAGAGTTCCTCAAAAGGGAGAG
AAGAAAAGCTTAGTTGAAATGGTTAGGAAAAATGCTGTAGAATATCTTGAAAAATTTTCTGATATGAATA
AAAGAAAATATGAAAAAAGTATTGGAGCATTGGAAGAATTAAAACAAATATTAAATCTAGAAAAGTTGCC
AATAAGAATAGAGGCTTATGATATATCAAATATACAAGGTGTAGATTCGATTGGTTCTATGGTAGTGTAT
ACGAATGCTAAAAAAGATAAGAAGGAATATAGGAGATATAAAATAAAGACAGTTATTGGACCTAATGATT
ATGATTCTATGGCTGAAATTGTAGATAGAAGATTAAAACATGGAAATTTACCTGACTTGATATTGTTGGA
TGGTGGAAAAGGACAAGTTAGTGCAGTAAAAAAAGTACTAGAACTCAATGATGTAGATATACCTCTTTGG
GGAATGTACAAAGATGATAAGCATAGAACTAAAGGATTGATATGCAAAGAAAAAGAAATAGAACTAGATA
AAACAACTAATTTATATAGATTTATTGCTAGTATACAAGAAGAAGTTCATAATTATGCAATAACATATCA
TAGAAGTCTAAGAAATAAAGCTTTGACAAAATCTATCTTAGATGATATACAAGGAATAGGTGAAAAAAGA
AAGAAATCATTATTAAATCACTTTAAAGATGTAGAGGCTATAAAAAAAGCTACTATGGAAGAACTTTTAG
AAGTAGATGGAATGAATAAAAGCATTGCAGATAATGTTTATAATTTTTTTAGAAAGGAAGAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3861552-3858727 excinuclease ABC subunit A [Clostridium difficile R20291]
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GAGATAAATTTATTGTTTTTACAGGTTTGTCAGGGTCTGGGAAGTCTTCTTTGGCATTTGATACAATATA
TGCAGAAGGGCAGAGAAGATATGTAGAAAGTCTATCTGCTTATGCAAGACAATTTTTAGGTCAGATGGAA
AAGCCAAATGTAGAATATATAGAGGGTTTATCACCAGCTATCTCAATTGACCAGAAGACTACCTCAAAAA
ACCCACGTTCTACGGTTGGAACAGTAACAGAAATATATGATTATTTGAGACTATTATTTGCAAGAGTAGG
AGATGTGTATTGCCCTACATGTGGTGAAAAAATAAGTCAGATGACTATTCAAGAAATAGTTGATAAAATG
CTAGATTTTCCAGATAGAACGAAATTACAAATTCTTTCACCAATTGTTAGAGGACAAAAAGGTACACATA
AAAAAGTCTTTGATAATATCAAAAAAGAAGGATTTGTAAGAGTTAGAGTTAATGGTGAGAACTATGAAGT
TAGTGATGATATAATCTTAAATAAAAATCAAAAACATAATATAGAAGTTGTAGTGGACAGAATAGTAATT
AAAGATGGAATAGAATCAAGACTAGCAGATTCAATTGAAACTGCAGTTAAGCTATCTGATGGTCTTGTAA
TAGCCCAAATAATAGATGGAGAAGAAATTCTTTTTTCAACTAAATTTGCATGCCCAGAACATGGAATTGG
CATAGAAGAATTATCTCCAAGGATGTTTTCATTTAATGCTCCCTTTGGTGCTTGTGATGTTTGTAATGGT
CTTGGGGAAAGTAAAGAAGTTGACCCAGAATTAGTAGTACCAAACAAAGATTTATCAATAAAACAAGGTG
CAGTGGCAGCATGGGGTTCAACAGGTGTTAATGATGACACTTATTACAGTAAAATGATAAAAAGTTTAGC
AGAGCATTTTAATGTATCTTTGACAACACCGTTTAAAGATTTACCAGATGATTTTGTGGAGGAATTACTT
TATGGTAAAGATAATATAATTGTAGAGTTTACTTATGAGTCAAAATTTGGAGGAACTAGAAATTATAAAT
CATACTTTGAAGGTGTAATAGTAAACTTAGAGAGAAGATATAGAGAAACTAATTCAGATTACATGAGAGA
TAAGATTGAAGAATACATGGCAGAGAGACCATGTCCAAAGTGTAAAGGGATGAGACTTAAAAAGGAAGTT
TTATCTGTTTTAGTTGATGGAAAAAATATAATGGAAGTTACAAACTTATCTGTAAATGAATTGATTGACT
TTATGGAAAATATAAATCTTACAGAAAAACAGAGATTTATAGCTCATGAGATTATAAAAGAGATAAAAGG
AAGAGCTATGTTCTTAAGAGATGTAGGTCTTGATTATTTAAATTTATCAAGAAAAGCTGGAACTTTATCA
GGAGGAGAAGCGCAACGTATAAGATTAGCTACTCAAATAGGTTCTGCATTGGTTGGAGTTTTATATGTAC
TTGATGAGCCAAGTATAGGGCTTCACCAAAGAGATAATGATAGGCTTATAACTACTCTTAGACATCTAAC
AGATTTAGGAAATACCTTAATCGTTGTAGAGCATGATGAAGACACAATGAGAGAAGCTGATTATGTTATA
GACATTGGTCCAGGTGCAGGTATACATGGTGGTGAAATAGTTGCACAGGGTACTTTAGATGAAATAATTG
AAAATGAGAACTCAATAACGGGTCAATATTTAAGTGGTAAAAAACAAATATTGCTTCCTGAGACTACTAG
AGAAGGAAATGGAAGTTTTATAGAAATAGTTAAAGCATCAGAAAATAATCTGAAAAATATTGATGTAAAG
TTCCCATTAGGTAAGTTTACATGCATAACAGGTGTTTCAGGTTCTGGAAAAAGTACATTAATAAACGATA
TACTTTACAAAGGTGTTGCAAGTAAAGTGAATAGACTTAAGCAAAGAGCTGGTAAGCATAAGGAGATAAA
AGGAATTGAAAGTATAGATAAAGTTATAAATATAGACCAAAGTCCTATTGGAAGAACACCTCGTTCAAAT
CCTGCTACTTATACAGGTGTATTTGATTTTATAAGAGATATTTTTGCATCTACTAATGAAGCTAAAGCAA
GAGGTTATAAAAAAGGTAGATTTAGTTTTAATGTAAAAGGTGGTAGATGTGAAGCTTGTAAGGGTGATGG
AATAATAAAAATAGAAATGCATTTCTTACCAGATGTATATGTTCCTTGTGAAATTTGTAAAGGTGAAAGA
TACAATAGAGAAACATTGCAAGTAAAATACAAAGATAAAACTATATCTGATATATTAGATATGAATGTGG
AAGAAGCTGTTGAGTTTTTCGAAAATATACCAAATATAAAAAGAAAATTAGAAACTTTAATGGATGTAGG
ACTTTCATATATTAAATTAGGACAGCCTTCAACTCAATTATCAGGAGGAGAAGCGCAACGTATAAAATTA
GCTGCTGAACTTAGTAAAAGACCAACAGGAAAGACTTTGTATATATTAGATGAACCTACTACTGGACTTC
ATATGGCAGATGTAGACAAGCTAATCCAAGTATTACAAAGACTAGCAGATACAGGAAATACAATTATAGT
CATAGAACATAATTTAGATGTTATAAAGACTTGTGATTATGTAATAGACTTAGGACCAGAAGGCGGAGAT
AAGGGTGGAACTATAGTTGCAACTGGAACACCAAAAGAAGTATCTAAAGTTGATGGTTCTTATACAGGTC
AATTCTTAAAGAAATATTTTTCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3863565-3861571 excinuclease ABC subunit B [Clostridium difficile R20291]
ATGTTCGAAAAAAGGAGTGATACTATGGATTTTAAAATAAAATCAGACTTCAAACCTACAGGTGACCAAC
CAGAAGCTATTAAATCAATAGTGGATTCTATAAATAGAAATGAGAAATTTTCGACATTATTAGGTGTAAC
GGGTTCAGGAAAAACATTCACAATGGCAAATATCATTCAACAAGTTAAGAAACCTACCCTAATAATGGCT
CATAATAAAACTCTAGCAGCACAACTTTACAGTGAGTTTAAAGAATTTTTCCCAGACAATGCAGTTGAAT
ACTTTGTAAGTTACTATGATTATTATCAACCAGAAGCATATGTAGCTCACAGTGACACTTATATAGAAAA
AGATGCAAGCATAAATGATGAAATAGATAAACTTCGACATTCTGCTACAGCATCTATTTTAGAGAGAAGA
GATACTATAATAATATCATCTGTATCTTGTATATATGGACTTGGTGACCCAAAAGACTATAAAGAACTTA
TGTTATCTATAAGACCAGGTATGCAAAGAGACAGAGATGATGTAATAAAAAGGTTAATAGAGATACAATA
CGAAAGAAATGACATAAACTTTACACGAGGTACCTTTAGAGTTAGAGGAGATATACTAGAAATATTCCCA
GCTAGTAATGATGAAAAAGCAATAAGAATAGAATTTTTTGGTGATGAGGTAGATAGAATAACAGAAATTG
ATTATGTAACAGGGAAGATTGTTGGTACTAGAAATCATGTTGTTATATTCCCAGCATCTCACTATGTAAC
AACGCCAGAAAGAATTGAAAAGGCAATTGTAGAAATAGAAAACGAGCTTCAAGAACAAATTAAATTTTTC
AAGGAAAATGATAGGCTATTAGAAGCACAAAGAATTGAACAAAGAACTAAGTATGATATAGAAATGTTAA
AGGAAATAGGATTTTGTCAGGGGATAGAGAACTATTCTAGACATATTACAGGAAGGTCAGAAGGAGAAAG
ACCATATACTTTAATGGATTTCTTCCCAGATGATTATTTGATAATTGTAGATGAGGCACATGTCACTATA
CCACAAGTAAGAGGTATGTATGCAGGAGACAGGTCTAGAAAAACATCACTTATAGAGAATGGTTTTAGAT
TACCTTCTGCACTTGACAATAGACCATTAAATTTTCAAGAATTTGAAGGAAATATAAATCAAATGTTGTT
TGTAAGTGCTACACCAGGACCTTATGAAATTCAACACTCAGAGACAATAGCAGAACAGATAATAAGACCA
ACTGGCCTTTTAGACCCAATTGTAGAAGTAAGACCTATAAATAATCAAATAGATGATTTGGTAGGAGAAA
TAACTAAAACTATAGAAAAAAATGAAAGAGTGCTTATAACCACTTTAACTAAAAAAATGAGTGAGGACTT
GACTAACTATCTTAAAGAAATAGGGATAAAAGTTAAATATTTACACTCAGATATAGTTACATTAGAAAGA
ACAGAAATAATAAGAGATTTAAGATTAGGGAAGTTTGATGTCCTTGTAGGAATAAACTTACTTAGAGAAG
GATTGGATATACCAGAAGTTTCACTTATAGCAATTTTAGATGCAGACAAAGAAGGTTTCTTACGTTCCGA
AACAGCTTTAATACAGACTATTGGACGTGCAGCTAGAAATGAAAATGGAAGAGTAATTATGTATGCAGAC
AGGATAACTGACTCAATGCAAAATGCTATTGATGAAACAAAGAGAAGAAGAGATATACAAAATTTATATA
ATGAAGAGCACAATATAATTCCTAAAACTATACAGAAAAATATAAGAGATAGTATAGAAGCTACTAAGGT
TGCAGAGGAAGAAGTTGTATATGGAATATCTGATACAGATGATAAAGACGAAATAAGAGCTAATATAGAT
AAATTAAAATCAGAGATGATGGAAGCTGCTCAAAACTTACAATTTGAAAGAGCAGCAGAACTTAGAGATA
AAGTGAAACAATTAGAAGAAAAATTGGAAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3864990-3863728 putative nucleotide pyrophosphatase [Clostridium difficile R20291]
ATGACAAAGGTTATAGTATTATCAGTAGATTCTTTATTTGAAAAAGACTTGGAATTTGTAAAAAATCTAC
CAAACTTTAAATCTATACTAGAAAATTGCTCCATAGTAAAAAATATAAATTGTGTTTATCCCACTCTGAC
ATATCCGTGTCATACTAGTATGGTTACAGGAGTATATCCTAAAAAACATGGTATATATCATAATGAAAAA
TTTGACCCAAATAAAGAAAATAAAGACTGGTACTGGTATTCAAAGGACATAAAAGTAAAAACTATTATAG
ATGTAGCAAAAGAAAATAATCTAACTACCTCTAGTGTATTATGGCCTGTAATGGGAGCAAATCCAAATAT
AGATTATAATATTGCAGAAATATGGGCTCCTAGTAGAGAAGATGACCCAAGAGAAACTTTTGAACGAAGC
TCCAGTAAGGTTATAATGGACGGTATTTACAATAGACATTGTCATTATATTGATTGGAAATTAGAACCCA
ACATGGATTTATTTGGAGTAAACTGTTCAGTAGATATAATAAAGGAATATAAACCAGATTTAATGCTAAT
ACATTTAGCTACATTGGACCATACACGACATAATTATGGCTTATTTAATGACGAAGTAGATAAAGCATTA
AAAATGAATGATAAATGGCTAGGAGATATTATTCAGGCTACAAAGGATGCAGGTACATACAAAGATACAA
ATTTTATAATACTTGGGGACCATGGTCATCTTAGAGTTGATAAAGTTATAAATCCAAATGTCTTGCTTAA
ATCAAATGGATTTATAAAAGTTGAAAATGGAGAAGTTAAGGATTTTGATGCCTATGTAAATTCTTCTGGA
ATATCAGCTCAAATAATAGTAAATAACTTAGATAGGTTAACAGAATTAAGAGAACTGCTTGAAGAATTTA
AAGAAGAATTATTCATAGAGAATATTTTTACCAAAGAGGAAGCATCTAACCTTGGTCTTGAAGGTGATTT
TGAAATGGTGATTGAAGGTCTTGAAGGAATTTCATTTGGAAATGATTTCGAAGGAAGTATTATAAAAGAT
TCAGATATAAAAGATTACAAGTTTGCTGTTGCGACACATGGTCATTTACCTACTAAAGGTAATAGACCTC
CATTTATAGCTTTTGGACCAAATATTAAAGGTGGTGTGGTTATAGAAGAAGGAGACCTGAGAGCACATGC
AGCAACTATATTAAAAATGTTTGATTTAAAATTAGATGGAGTTGAAAAAGAAGCATTTGATTTTATTATG
TAA
>ref|NC_013316.1|:c3866363-3865053 ABC transporter, solute-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATGAAGCTTAAAAGAAAATTAGCAACAGGATTAGCAATAACATTATTATTAGGTTCTTTAGTTG
GGTGTTCAAATTCTAATGATGCAAATGCATCTAAAGGAGAAAAGACTGATAGCAATATTACGAAGATAGA
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CATAAGGATGTACAAGTAAATATGTTAAAACAGAAAGATTACTATGAAAATGCAACAAAACTACAGGCAG
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AGGTGCTTTAGTAGATATGAGTAAATATTTTGATAAAACATATCAAGAAAGATTCTTTTCTGGTCTTTTA
ACAAATTCATATTATGAGGATAAGTTTGTTGGTATGCCATTTAATAGAAGTACACCAATATTATACATAA
ATAGAGATATGGCAACTAAAGCAGGTCTTGACCCTTCAGGTCCAAAATCATGGGAAGAGCTTAAGGATTA
CGCTAGTAAAATGACAAATAAATCAGAAGATACTTATGGTTTTGAAACACCAATAGATATTTGGTTCTAT
GAAGCTATGGTAATGCAAAGTGGAGGAGAAATAACTAATGGTAAAAAAGTAGCATTTAATAATGAGGCAG
GACAAGCACCAGTTAAATTCTGGCAAGATATGATGAAAGCTGGAATAATGAAAATGCCTCCTGGAGAAGA
TTATAATGCCTGGGACGTAGCAAAACAAGATTTTGTAAATGGTAAAGTAGGTATGATATTTACATCAACA
GCAGATTTAGCAGGACTTATGCAACAAACAGAAGGTAAGTTTGAAATATCAACAGCATTCCTACCAAAAA
ATCAAAAATACGCAACTCCTACAGGTGGAGCTAATCTAGTTATGCTTGAAGGTGGAACAGATAAAGAAAA
AGAAGCAAGTGCAGAATTTATAGAATGGATGACACAAACAGATAAAATCGTTCAGTTTAGTTCATCAACA
GGATACTTACCAACAACTGAAGATGCAACAAACTCAGAAAAGTTACAAACATTATATAAAGAAAAACCTC
AATATAAGGTTGCAACTGACCAATTACAATATGCTGTTGCACTTCCAATGTTAAATGGATACAAGGAAGC
AACTGATAAGCTAATGGATGAGATTAAAAAGGGGCTTACTGATTTAAATGCAAATCCAAAAGATGTAGTA
AGCAAAGGAACTTCTGCAATGCAAGCAGTAATAGATAAAACAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3867248-3866388 ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGATATTATACAACCTATCAAAAAAGACAAAGTTGATATAAAAAAAATAGCATCAAAATCAATGGAAA
TATTAATTCTATTACTTTTATCTGCAATATTTATATTCCCTTTTATATGGATGCTATCGACATCCTTTAA
AAATCCACAAGAAATGATGCAATTACCACCTACTATTATACCAAATGATATAGTGTTAGAAAATTATAGT
ACAGCATGGCATTCAGGTCCATTTTTTAGATATTTACTAAACAGTGTATTTGTAACAGGAAGTGTTTTAA
TTTTACAATTTTTAGTTATGGTTCCAGCAGCATATGCATTTTCTAAGATTAAATTTAAAGGTGAAAAAAT
GTTATTTGGGCTTTTGCTTGTAGGACTTATGATTCCACCACAAGTAACTTTTCTACCAGTCTATATGATG
ATGAGTAAGTTTGGATTTATAAATACTTATATTCCACTTATAATTCCATTTATGACATCTTCATTTGGGA
TATTTCTGCTTAGACAGAATTTTATGCAGATTTCAGATGAAACTATTGAAGCAGCTAAACTAGATAATGC
TTCTGACTTAAAAATAATGTTTAGAATAATGGTTCCTATGGCAAAACCAGCAGTAATAACATTTATATTA
TTTAATTTTATATACCATTGGAATAATTATTTCTGGCCCTTAGTAATGACAAATACAGATGCAATAAGAA
CTTTACCAATAGGAGTTGCGCTCCTTAAATCTTCAGAAGGAATTACTGCATGGAATGTAATAATGGCAGG
AAATATAATTCTAATTTTACCAATAATTCTTGTTTATATATTTGCGAATAAAAAAGTAAAAGAAGCTTTT
ATGTATTCAGGAATAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3868161-3867292 ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGCAATTTAATAAAGCATATTTATATATAACACCTGCTATTATAGGAACTTTATTGTTTATAG
TCTATCCAATAATTAAGACGATATCTCTAAGCTTCAAATCTGGTAGTCTTCTTAGTTCAACCTTTGAAAA
TGTAGGCTTAAACAATTATACAGAACTTTTAAAGAATCCAGAGTTTATACAAACTATAACGAACACTGCA
ATTTATACTTTTTTTATGGTGACTATATCTATATCACTAGCCATAGTACTTGCTGTTTGGCTAAATAAAA
ATTCTATAATACACAATTTAACGCAAAGTATAATCTTTACACCACATGTAATTTCACTAGTATCTGTAGC
TGTATTGTGGCTTTGGATTATGGAGCCACAATATGGCTTTTTAAACTGGATACTATCGACATTACATTTA
CCAACATCAAAGTGGCTTTCAAGTGAAAGTTCAGCTTTAATGTCACTAATTCTAATAGGAATATGGAAGA
CTCTTGGATACAATATCTTAATAGTATTATCAGGTCTTAAATCCATACCAAACTATATATATGAAGCATC
TAAATTAGATAATGCAAACAAAATAACGAATTTCTTTAAAGTGACATTGCCGCTATTATCACCAACAATA
TTTTTTCTTATGATAACAACAACAACTGCATCTTTTCAAGTATTTGATGAGATAAGTATAATGACACAAG
GTGGGCCAGTGGGTTCAACTAACATGTTATCTTATTATATATATGAGTCTGGATTTATATACTATGACAT
AGGGCAAGCGAGTGCAGCGAGTATGTTTTTGTTAGCTATAGTTATGATTGCTACATATGCTAACTTTAGA
CTCTTATCAAAGAAAGTTCATTATCAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3869215-3868145 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAGATATAAGACTAGAAAATGTAACAAAATCTTATAATAAAAAAAATACAGTTATAGAAAATTTAA
ATCTTACTATAGAAGATGGTTCTTTTACAGTATTGGTAGGTCCAAGTGGATGTGGTAAATCTACTACATT
AAGAATGATTGCAGGTCTTGAAGATATAACTTCAGGCAAGTTAAAAATTGAAGAAAATGACGTTACAAAA
ACGGATGCTAGTAAAAGGGATATAGCTATGGTATTTCAAAATTATGCATTATATCCACATATGACTGTTA
GAGAAAACATAGAATTTGGTCTTAAAAACAAAAAAGTAGAAAAAGAAAAAAGAGAAAAACTTATAACAGA
AGTTATTGATGTAGTAGGATTGAGAGAATATTTAAATGTGAAACCAGGCAACTTATCTGGAGGTCAAAGA
CAAAGAGTGGCACTTGCTAGAGCTATGGTTAAAAATCCAAAGGTATTTTTAATGGATGAACCATTGTCAA
ATTTAGATGCTAAATTAAGAAATCAAATGAGAACAGAATTAATACAATTACATCAAAAACTAAAATCTAC
ATTTGTTTATGTAACTCATGACCAGGTTGAGGCAATGTCAATGGCAGATAAGATAGTTATAATGAACAAA
GGAAAGATAATGCAAATAGGTTCTCCAAAGAAGATATATCAAAATCCTAAGAATTTATTTGTAGCTCAAT
TTATAGGGAGTCCTTGTATGAACATACTAGATATAAAAAATGATATTAAATTTGGATTCAGACCAGAAAA
AGCAACACTAGAGAGTATAAACATAGATGGAAAAAATGATGATGTATTTAGCCTATTTGGAAAAGTTGTG
ACTAAAGAAGTGTTGGGAAATGAAACTATATATTGTTTATCTGTTCTTAATAGAGAAATAAGAGTCAAAA
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TGATAAAAATGGAGAAAGAATAGAAGATGTAAAAGTATGTAAAAGTATGTATTCTAAAATTAAAGGAGAT
ATTTATGAAAAAGCAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3875371-3874793 putative siroheme synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGCTATATCCTATTAATTTAAAATTAGATGAGTTAGATGTAGTTATAATTGGTGGTGGAGAAGTTGCAT
ATAGGAAATGTAAAAATTTTTTAGAGTTTAACAAAAATGTTACTATAGTTTCTAAACAAATTTTAAATAA
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TCTGTAATAATTGCTGCCACAAATAATAGAGAGTTAAATATGGAAATAGGATTATATTGTAGAGCAAAAA
ATAAGCTAGTGAATGTAGTTGATAATATAGAAATATCGAACTTTACTGTTCCATCATATATAAAAAGAGG
AGATTTACTTATAAGTGTGTCTACTGGGGGCAAGAGTCCTTCATTATCATCAAAGATAAAAAAAGAAATT
GAAGAGAGATATACTGAAGATTATGAGGAGTATTTAAATGTATTAGGAGATATAAGAAAAAAGGTTATAA
AAAAATACGAAGATAAAAGTAAAAGAAAAGATGTGCTTAATATGTTGGTAACACTTGACCTAGAAGAACT
TAAGAAGTTTGATATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3876489-3875524 delta-aminolevulinic acid dehydratase [Clostridium difficile R20291]
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ATGTAGAAGATTTAATATATCCACTGTTTGTAGTAGAGGGGGAAAATATAAAAGAAGAAATCAATTCTTT
ACCAGATGTATATCATTTATCAATAGACATGCTAGAAGACGAAATAAAAGAAATAAGTGAGTTGGGAATT
GAACATATAATGTTATTTGGTGTTCCAGATGAAAAAGATGAGTGTGCTTCACAAGCTTTTAATGATAATG
GAATAGTTCAAAAGGCAATTAGAAAGGTAAAAGAAATAAATTCAGATATAAATGTAATAACAGATGTCTG
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TCATTGGAGTATTTGGCTAAAATATCTGTAAGCCATGCTAAAGCAGGAGCTGATATGGTTGCTCCATCTG
ATATGATGGATGGAAGAATACAAGCAATAAGAGAAGCTTTAGATGAAAATGGATTAGAAAATGTTGGAAT
CATGGCTTATAGTGTTAAGTATGCTTCAAATTATTATGGACCTTTTAGAGAGGCAGCTCATTCAGCACCA
TCTTTTGGAGATAGAAAAACATATCAAATGGACCCAGCAAATAGCAATGAAGCTATAATAGAGACTGAAC
TTGATATATTGGAAGGTGCAGATATACTTATGGTTAAACCTGCATTATCATATTTAGATATTATAAGAAG
AGTTAAAGATAATTTTGACTTACCTCTAGCAGCTTATAATGTAAGTGGAGAATACTCTATGCTTAAGTTT
GCTGTGAAGGAAGGTTTATTAAATGAAGATGTAATTCTTGAATCAATTACATCTATAAAAAGAGCAGGAG
CAGATATAATAATAACTTATTTTGCTAAAGACATTGCTAAACTGTTGAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3878005-3876506 porphyrin biosynthesis protein includes: uroporphyrinogen-III methyltransferase and uroporphyrinogen-III synthase] [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGGGTAAGGTTTACTTAGTAGGGGCAGGACCAGGTGATTATAAACTCATGACTTTAAAAGGTTTAG
AGTGTATAAGAAAATCGGATGTAATAGTATATGATAGATTAGCAAATAGTAGTTATTTAAGAGAAGCTAA
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AGAATTATAGCAGAAAAAGCTAAAGAAGGAAAAATTGTAACTCGTCTTAAAGGAGGAGACCCTTATGTAT
TTGGCAGAGGGGGAGAAGAAGCAGAGACTTTAGTAGATGAAGATATAGAATTTGAAGTAGTTCCAGGTAT
AACTTCTGCTATAGGAGGTTTATGTTATGCGGGTATTCCTATAACACATAGAGACCATGCTTCGTCATTT
CATGTAATAACAGGTCATTTGAAGGGTGATGATAGTGGAGAATTAAACTGGAATGCTCTTGCAAATAACA
AAGGTACTCTTGTGTTTTTGATGGGAATTTCAAACCTAGAGAAAATAAGTGAAAACTTAATGAAAGAAGG
AAAAGATAAGGATACACCTGTTGCTCTTATAAGTTGGGCAACTAGATATAATCAAAGAGTTGTTACATCT
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GTGTTGTAGGACTTAGAGAAAAGTTGAACTTCTTTGAAAGTAAGCCTTTATTTGGAAAAAGTATTGCTGT
AACTAGGTCTAGAAATCAAAATAGTGTATTGGTAGAAAAAATAATGGATTTAGGTGGAAATCCTATAGAA
ATACCTACTATTAAGGTAGAAAAAATACAAAATAATATTAACTTAGAAAATGAAATAAAAAATATAAATA
AGTATAATTATTTAATACTAACTAGTAAAAATGCCGTAGAAATCTTCTTTGAAAAGATATATGAAATGAA
TTTTGATTTAAGGATATTATCTAATTTAAAGGTATGTGCTATAGGTTCTGCTACATCAAATGAGTTGAAA
AAAAGAGGAATTATAGCGGATATAGTACCAAAAAAATTTGTAGCAGAGTCACTGTATGAAGAGTTAGCTC
CTATTTTAAATGATAACGATAATATACTTATACCTAGAGCAGAAAATGCTAGAGATTATCTGGTTGACAA
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GAGATATTAGATATTTTAAATTCTAATGATATAGATTATATAACATTTACTAGTTCCTCAACAGTAAATA
ATCTTGTTGAAATTATAGGAAAAGAAAATATTAAAATATTAGAAAAAATAAAAACACTATCTATAGGTCC
TATAACTACAGAGACAATAAATAGTTTGGGAATAAAATTGTACAAAGAATCTGCTACATCTACTATAGAT
TCGTTAGTAGATTTAATTATAAAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3878900-3877995 porphobilinogen deaminase [Clostridium difficile R20291]
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TAAAAAAGAAGTATCCAGAAATTAGTTTTGAGATTAAAATCATAAAGACAAAAGGAGATTTAATTCAAAA
TGTTTCACTGGATAAAATAGGTGATAAAGGATTGTTTGTCAAAGAAATAGAGCAACAATTATTAGATGGA
AAAATAGACATAGCAGTACATAGTATGAAAGATATGCCTTCTTATTTAGCAGATGGACTAAAATTTGCTC
ATACGCCTAAGAGAGAAGACCCAAGAGATGTTCTAATACTTAGAGAAGGATATAAAAATTTAGATGATTT
GCCTCATGGAGCAGTAATAGGAACAGGAAGTAAAAGAAGGAAGTTTCAATTATTGAAACAAAGACCTGAT
TTAAATATAGTACAAGTTAGAGGTAATGTGGAAACTAGGATACGAAAAATAAAAGATGAAAACATGCATG
GTATTGTGTTGGCAGCATCAGGAATAATTAGAGCTAATTTGCAAGATAAAATAAGTTCTTATTTACCTGT
TGATGTTGTTATTCCAGCACCTGCCCAAGGAGCTTTAGCTATAGAAATTAGAAGCAATGATAGTACGATA
GAGGGAATAGTAAATTCACTGAAGGATGAGAATACAGAAATCCAAATATTGGCTGAAAGAGGTTTTTTAG
ATGGTGTAAATGGAAGTTGTCATATTCCAATGGCAGCTTATTGTGAAATAATCCAAGATAAAATACATCT
TACTGGCTTATATGGAGATTCAGAAGGAAAAAAAGTAGTAATCAAGTCTATAGATGGAGATATTTCTTCT
CCTAGAGAGTTAGGTTTAAAGTTAGCTAAACTTGTATTGAAGGAGTATGAGAATTATGAAGGGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3880408-3878930 sirohydrochlorin cobaltochelatase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAAAGCCTTATTAGTAGTGAGTTTTGGTACAAGCTATCATGAAACGAGAGAAAAGACAATAGATA
TATGTGAAGATAAAATAAAAAATTCGTTAAAAAGCCATGATTTTTTTAGAGCTTATACATCAAATATGAT
AATAAATAAAATAAAAAAAAGGGATGGAATAGAAATAGATAATCCAATACAGGCTTTAGATAAAATATAT
GAACAAGGATATGATGAAGTAATAATCCAAACACTTCATATTATATGTGGCGAAGAATTTAACAAATTAA
AAGAACAAGTAGATGGATATTCTTCTAAATTCAAAAAGATTGTATTAGGAAGACCTTTGCTTACACATAT
TGAAGATTATCAGGAAGCTGTAGAGGCAATTAAGCATCAAATTCCTCATATGGAAAGTAATGAAGCAGTA
GTATTTATGGGACATGGAACACTTCATGAATCACATTCAGCGTATCCAGCATTGGAATACATGCTTAGGG
ATAATGGAATAAATGCTTATGTTGGTACAGTTGAAGGGTATCCAGAAATAGAACATGTAATAAGAAGATT
AAAAGAAGGAAATATAAAAACTGTAAATTTGATGCCATTTATGTTAGTTGCAGGAGACCATGCTATAAAT
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ATTTAAAAGGACTAGGAGAAAATTCTTATATACAAGATAAATTTGTTCGTCATGCTGTAAAATGTGCAGA
GAATGCTAAGTTCTATGGTATAGGAGCAGGGCCAGGAGATGGTTCTTTACTTACGATAAAAGCGGTTAAT
ACTTTAAAGAAACTGGATATTCTATACACTCCAGAATCAAAAAAGGGTGGAGATAGTCTAGCTTTATCAA
TAGTTAGTGAATATTTACCTGAATCAGTGGAAATAAAGTCTAGGCATTTCCCAATGAGTTTTGATGGGAA
TGAAAAAAGTTTAGCTTGGGACAATGTAGCACAAGAAATTATATCAGATGTTAATGATGGTAAAAATGTA
GGATTTGTTACATTAGGAGACCCTATGATTTATAGTACATATGTATATATAATGAAAAGAATATTAGGAG
AGGTAGAAGTCGAAACTATACCAGGAATTTCATCATTTTCCAATATAGCATCTAATCAGAATTTTCCATT
AGTCATGGATAAAGAAGCTTTAGTGGTAATTCCTTGTACTATGGAAGATGATAAGATAGAGTATGCTTTG
CAAAATTATAATTCAATAGTATTGATGAAGGTATATAAAAATTTTAAAGAAATAATAAAAAAATTAGAAA
AGTATGATTTAATAGAACATGCTATTTTAGTAAGTAATTCTTCCCAAGAAAGCGAAAATGTGTTTACAGA
TTTAAAAGAAGCGCACCTTGAAGATAAGATATCTTATTTTTCTACTATACTAGTAAATAAAGATAATAAA
ATAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3881179-3880427 cobalt-precorrin-6a reductase [Clostridium difficile R20291]
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AACCATATATCCTTTCAGTTACTACAGATTATGGAAGGGAACTTGCACAACAACATGCAGAGAATGTAAT
TTTAGGTAAGCTTGGAAAAGAAGATATGCTAAAATTTATAAAAGATAATAATATAGTAAAAATAATAGAT
GCCACTCATCCTTATGCAGTTGAAGTATCCAAAACTGCTATTACTTGTGCAAAATTATTGAATATAGATT
ATATAAGGTTTGAGAGAAAATCTTTAATTGAAGAAATAGATTATGATAATAAATTTATAGTAGATACAAT
TGAAGAAGCCTGTGAAATAGCAAATAAAATAGGGACAAATATATTCATAGGAACAGGAAGTAAAAATTTG
AACAGATTTATAGAGGAAATAAGTGATAAAAATTTAGTTGTTAGAGTTCTTCCAACGAGTGAAGTCATAT
TAAGTTGTGAAAAATTAGGTTTAAGTGCAGATAATATAGTAGCTATGAAAGGTCCATTTAGCCAGTATAT
AAATGAAGAAACATATAAACATTACAATATAGATTTAGTCATAACAAAAGAAAGTGGAATAGCTGGTGGG
TTCTTAGAGAAGGTAAATGCATGTAAAACTTTCAATATACCAGTAATAATTATAAAAAGAGAATCGATTA
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>ref|NC_013316.1|:c3881901-3881176 cobalt-precorrin-3b c(17)-methyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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AAGATTCTGAGGCTATTGTTGGATATAAGACTTATATAAAACTAATAGAAGAATTTATACAAGGTAAAGA
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AAAAAAGTAGCAGTTGTAAGCAGTGGTGATGCTGGAATATATGGGATGGCAGGTCTCATTTTAGAATTAA
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TATACTTGGAGCTCCTATTATGCATGATTTCTGTCATATAAGTTTGAGTGATTTAATGACTCCGTGGGAA
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AGGGAAGAAGTGAACATCTAAGCAAAGCATTTAAAATAATGGGTGAGTTTAAAGGTGGAGATACACCTGT
TGGAGTGGTAAAAGATGTAGGTAGAGAAAAAGAAGAAAAGTTTGTATGTACTTTTGAAAATATGGACTTT
GAAAAAGTCGATATGACTACAATGGTTATAATAGGAAATAAGTCTACCTATATTAATGGTGAATTGATGA
TAACTCCAAGAGGTTATACAGTATGA
>ref|NC_013316.1|:c3883019-3881898 putative cobalamin biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
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ATTCTCTAGTAAATAACTGTGTTATATATCAAGTAAAAAATAAAAAAAGTAATTTAGTTGTTGAAGAAAC
ATGTGTACATACAGTTCAAAAGAAGTTAAGTGATTTTGTAGGAGAAATATTTAGCAAATTTGATTACATA
ATATTTATAATGGCTACAGGTATAGTTGTACGAAGTATAGCACCATACATAATAAGTAAGTTTAGTGACC
CTGCAATTTTGGTAATGGATGAAAAAGGCAAAAACGTAATAAGTTTATTGAGTGGTCATATTGGAGGGGC
AAACAGCTTGACACAGTACATAAGTAGTCTTATTGATGCTAATCCAGTAATAACAACAGCTACTGATATA
AATCAAAAAGCTTCCTTAGATATGATAGCAAAAAAACTAAATGCACATATTGATAATTTTAGAGAAAGTG
TAAAAGAAGTAAATTCTATGCTAGTGAATAATAAATGTGTTGGATTATATGTTGATGAAGGATATCAAGT
TGATACTAGGGGATTTAAACTTATAGAAAGTAAGGATGAGTTAAGAGATAGCTTTTCAAACACATATATA
GAAAAATTAGTTGTAGTAAGCAATAAAATAAATTGTATTGAAGATATTGAGAATTTAAACTTAGATAATA
AATTTGAACATTGCTATAGTACTAAAAAAATAATAAAGGTAATTCCAAGAGATATAGTGATAGGAATTGG
CTGTAGAAGAAACACAGATAGTGAGCTGATGTATAATTCACTTGAAGAGTTTCTTAATAAACAAAATATA
GATATTAGAGCAATAAACACAGTTGGAAGTATAGAACTGAAAAAAGACGAAAAAGCAATAATTGAATTAT
CAAAAATACTAAAAGTGCCATTTAAAACATTTTCAATAGATGAAATATCTAAGGTTGATAATCTTTTTGA
TAAATCTGATTTTGTTAAAAAAAATGTGGGCGTGTATTCAGTAGCAGAACCTATAGCATATCTTTTGAGC
AAAGGTAATTTGTTAGTTGAAAAACATAAATATAAAGGAATAACTTTTTCAGTGGGGAGAATAAAAATAT
GA
>ref|NC_013316.1|:c3883755-3883003 precorrin-4 C(11)-methyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAAAGTACATTTTGTAGGAGCAGGACCTGGAGATAAAGAGCTGATAACATTAAAAGGATACAAAT
TATTAAGTAATGCAGATGTAGTGATATATGCAGGTTCACTTGTTAATCCTGAACTTTTGGAATACTGTAA
AGAAGATTGCCAAATACATAATAGTGCACATATGGATTTACAAGAGATAATAGATGTTATGAGAGAAGGT
ATAGAAAATAATAAATCTGTTGTAAGACTGCAAACAGGTGATTTTTCTATATATGGTTCAATTAGAGAAC
AAGTGGAAGATTTAAATAAATTGAATATAGATTATGACTGTACTCCTGGAGTAAGTTCTTTTTTAGGGGC
AGCATCATCTTTAGGGGTTGAATATACAGTTCCAGAAATTTCTCAAAGTGTAATTATAACAAGAATGGAA
GGCAGAACTCCGGTTCCAGAGAAAGAATCAATACAATCATATGCTAAGCATCAGACATCTATGGTAATAT
TTTTATCTGTTCAAGAAATTGAGAAAGTTGTGTCTAAATTACTGGAAGGTGGATATCCAAAAGATACTCC
TATAGCAGTTATATACAAAGCAACTTGGGCAGATGAAAAAATAGTTAAAGGAACTTTAAGTGATATAGCT
GTAAAAGTTAAAGAAAACAACATAAATAAGACTGCTTTAATAATGGTTGGGAGATTTTTAGGAGAAGAGT
ATAATAATTCAAAGTTATATGATAAGGATTTCAAACATGAATATAGAGGGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3884323-3883748 putative cobalt-precorrin-6y C(15)-methyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGGAATAGTGAATTTATAACAGGTAAAGTTCCAATTACTAAGGAAGAGGTTAGAGCAATATCAATAA
GTAAGTTAAATTTAGTAAATGCTAAAAACCTCATAGACATAGGGGCTGGTACAGGAAGTGTAAGTGTTGA
AGCTGCATATAATTATCCTAATTTAAAGGTTATATCTATAGAGAAAAATGATGACGCTATAGAGCTTATA
GAGAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAAAAAATATAGAAGTGATAAAAGGATATGCTCCAATTAATCTAG
GGTTAAATGTTAAAGTTGAGTCTATTTTTCTTGGGGGAACAGGAAATAATCTGGAAGAAATAATAGAATG
GTCTAAAAAAAATCTCGTTACAGGAGGAAGACTTGTAGCTAATTTTATAATAATAGATACATTTAATCAA
ACTTTAAAACTGCTTAAAAAGCATGGATTTAAAGAAATAGATGTATGTGTTTTGAATGTTTCTAAACTAG
AGAAACTAGGAAAAGGTGAATATTTTAAACCACTAAATCCTATATATATAATATCTTGTGAAAAAGGGGA
AAATGATGATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3884921-3884313 putative cobalt-precorrin-6y C(5)-methyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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CCACTTCTGATGTATTAATTGGTGGTAAAAGAAATCTAGAGTCTATAAAAAATTTTGAAGGAGAAAAAAT
AGTTCTGGATTCTAATTTAAGAGAAATTATAGAGTACATAAATAACAATAAAGAAAAGCAAATATCAATA
ATAGCATCTGGGGACCCATTAATATATGGGATAGGTAGATATCTATCTAAAAATATTGATAATAAGATGT
TAAACGTGGTTTCTGGGATTAGTTCATTACAGTACATATTTTCAAAAATATATGTAGATATGAATGATGT
ATATATTACAAGTAGTCATGGCAAAATACCAGATTTTGATTACATATTATCACATAAAAAAGTATGTATG
GTTACAGATTCAAAGATAGGACCAAAACAAATAAGTAGAGAAATAATAGATAGAAATCTAAATAAAATTA
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>ref|NC_013316.1|:c3886144-3884918 putative cobalt-precorrin-6a synthase [deacetylating] [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGAATATGTATATATAGATGGAAAAAAATATAGAAGAGGATATACTACAGGTTCATGTGCAACAG
GTGCATCTAAGGCTGCTGTATATATGTTGATTACAAAAAATAGAATCAATACTATAAATATAGATACTCC
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AAAAAAGATGGTGGAGATGATATAGATGCAACTCATACCATGGATATTTATGCAAGAGCTGAAATTGTAG
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TAAAAGTGAGCTCTATAAGTTTATTAGGGTTTATGGCGGAACTGGTATTGGTGTGGTTACGAAAAAAGGG
CTTAGTGTGGATGTTGGTAAACCTGCTATAAATCCGACTCCACTTAAAATGATAAACCATGAAATAAGAA
AGCTTATAGGAGATAATTTTGAATCTATACTTGGAAATGATAAAGTTTTAAAAATAACAATCTTTGCTCC
ACAAGGAGAAACTGTAGCAAAAAAAACATTTAATCCAAGATTAGGTATAGTTGGAGGAATATCTATAATA
GGTACAACTGGGATTGTTGAACCTATGAGTGATGAGGGTTGGAAGAAGTCTCTTTCTATAGAACTTCAGA
TGAAAAAAGAACAAGGCTTAGATAAAATAATATTGGTTCCAGGAAATCATGGAGAACAGTTTATAAGAGA
AAAATTAAACTTAGATATTAAGTATGTAGTTAGGGTAAGTAATTTTATAGGCTATATGATTAAAGAAGCT
CAAAGAATAGGATATAAAAAAATCTTAATGGCAGGTCATATAGGTAAATTTATAAAAGTATCTGCTGGTA
TTTTTAATACTCATAGTAAGGTAGCAGATGCTAGAAGTGAGATATTAGTGGCAAACTTAGCTTTAATGGG
AGCTAGATACGAATTTTTAAATAAAATAAATCAATGCGTAACTACTGAAGAAGCTGTAGAGCTAATAAAT
AATAGTGAATATAGAGAAGTATATAATATATTAAGTAATAAATGTAAGGAGAGAGTAAAGCAATACTTGA
ATGAAGATTCAGATGATATTGATGTGGAAGTAATCATATTTTCAATGGATAAGTCTTTATTAGGTAAATC
GGATAATACAGATGATTTAGTGGAGGTCTTTATATGA
>ref|NC_013316.1|:c3886785-3886153 cobalt-precorrin-8x methylmutase [Clostridium difficile R20291]
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AAATTAGACCAGATTATAAATTTAAGAATAATATTGAAGAAAAAATAATAAAAAGAGCTATACATACTAC
TGCTGATTTTGATTACTTAGATATATTAAAAATATCAGAAGAAGCAGTTGATAGTATAATAGATGCATTA
AAAAATAATGCAAGTATTTATACTGATACAAATATGGCTCTTAGTGGTATAAATAAAAGAAAGTTAGAAT
CATTAGGATGTAAGTATAAATGTTTAGTGGCAGATGATGAAACTGTAAAATTAGCTAAAGAAAAAGGAAT
TACTCGTTCTATGGCAGCAGTAGAAATTGCAGCTAAAGAAGAAGGAAGAAAAATATTCGTTTTAGGTAAT
GCTCCAACAGCTTTATATAAAGTTATGGAGATGAAATCAGAAGGTAGATTAGATTTAGATGCAGTTATAG
GAGTTCCTGTAGGTTTTGTAGGAGCACAAGAATCAAAAGATGAAGTTGAAAAAACAGATATACCATATAT
AATTTCTAAAGGTAGAAAAGGTGGCAGTAATTTAGCAGCAGCAATAGTAAATGCTATATTATATACTATG
TAG
>ref|NC_013316.1|:c3887660-3886773 putative cobalamin biosynthesis kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATCTTATGGAATATGCCCAGCATCTTGTGGAGAATTTGTACAAGGTATAATTGATGATGAAGAAT
ATTTATGTTCATATGCAATAGATATGTATTCTGAAGTGTATATTGAAGAAAAATTAGTAGATATAAATTT
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AAAAATATTTCTTTAAATATAAATAGTAAAATACCTGTTGGAAAAGGAATGGCAAGTTCAACTGCTGATA
TAGGAGCTACAATAAAGGCAACATTATCATTGATAGATAAAGATTTAAGTAGTGAGGAGATTTCTAAATT
AGCAGCAGAAATAGAACCAACAGATTCTATATTTATAGATAAAAATAGTATATTTAATCCTCTAAATGGA
ACTGTTATAAAATACCTAGGAAATCTGACCAATGCGAAAGTTATAATACTTGAACCAAACAAAGTACTAG
ATACTATGAAAATTAGATTGAGGCAAGATTATAATAAATTAAAAGTAGAAAATAAAGAAGTAATAAAAAA
ATCATTTGCTCTTTTAGAAGAAGGATTGAAAAAAAATAATTTATCTCTAGTTGGAGAGGCTTGTACTTTG
AGTAGCTTAGCAAATGAGAATATAGAAAAAAAAGAGTATTTAAATGAAATAATAAAAATATCAAAAAAAT
ATGGAGCATATGGAGTAAATATTGCTCACAGTGGAACTGTAGTAGGTATTTTAATTGATAAGTCTATGAA
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AACATAATTAATGGAGGAATTAAGGGGGAAATAGAATGGAATACATAA
>ref|NC_013316.1|:c3888732-3887662 pthreonine-phosphate decarboxylase [Clostridium difficile R20291]
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TAATTGATTTTAGTTCAAACATAAATCCAAATGTATTACCAAATTTAGAGAGATACATTTTAAAAGGATT
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ATAAATCCAGACTTTATAATACCTGGAAATGGTGCAACAGAAGTGATTTATTTGCTTATGAAGAGTGTTA
AAAAAAAATTGGCTATAATAAATCCGACTTTTTCAGAGTATAGAAGAAGTGCTGAGTTAAATAATTTAGA
TATTATAGATTTAGAGCTAGATTTAGAAAATAACTTTAAACTTAATATAGATATAATAAAAGAAAATATA
AAAAGATTTGATAGTTTATTTATATGTAATCCTAATAATCCTAGTGGTAATGTCCAAGATTTAAAGGAAC
TTGTTCATTTACTAGGTAAACATAATAAGGTACTAATAATTGATGAAACTTTCATGGAATTTGTTGAAGA
TGAAAGTAAATACAGTTTGGTTAAATATATAGAATCAAATAAAAATATATTTATAATTAAAGCTGTGACT
AAGTTTTTTGGTATGCCTGGTTTAAGGCTAGGATATGGTCTTACAAGCAACACTGAAATTATGAACAAAA
TTTATGAACACAAAGAGCCATGGACTATTAATTCTTTTGCAGATATACTATCCAATTTTATTTTTGAAGA
TAAAGAGTATATTAAAAATAGTAAAGAATATTACATAGAAGAAAGAAAATATATGTTACAAGAGTTGAGA
AACATAAGAAATATAAAGGTCTATGATACAGATGCTAATTTTATTTTGATAAGAGCATATAAAAAAACAA
CTAAAGAATTGAAAAAAGATTTGCTTAAGCAAGGAAACATATTAGTTAGAGATGCGTCTAATTTTATAGG
ATTAGATGATAGTTTTATAAGAGTGGCTATAAAATCTCATGAAGATAACAAAATTCTTATAGAAAATATG
AAAAATTTATTGGGTGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3889735-3888764 cobalamin biosynthesis protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTATTTTATCTATTTATATAGGATATGTGACAGACTTAATTGTAGGAGACCCATATTCTTTTCCTC
ATCCAGTGAGATTTATTGGTAAACTTATAAATTTTACTCAAGGTATAATAAGAAAGGTCTCTAAAAATGA
TAGGCAGTTAAAATTTGGGGGATTTATATTATGGTTTATAACCGTTGGAATAACATATTTAACAACTTAT
GCTATAGTGAAGCTATTTAGTTTTAATATATTATTGAGTATTGTAGTGAATAGTTTTATAATTTATACAA
CACTAGCCACAAAATGTTTAAAAGACGAAGCATTAAAAATTTATAATGTATTAAAAACCGAAGATATAGA
AAAATCTAGGATTCAGCTATCTTATATAGTAGGTAGGGATACTACTAATTTAAGTGAACCTGAAATAATA
AGAGCAACTGTAGAAACTGTTGCAGAAAATACTGTAGATGGTATAATTGCGCCTATGTTTTATGCATTTA
TTGGAGGAGCACCACTTGCTATGGCCTATAAAGCTATAAATACATTAGACTCAACAGTTGGATATAAAAA
TAAAAAGTATAAAGATATTGGTTTTGCATCTGCTAAGATTGATGATATAGCCAATTATATACCAGCTAGA
ATATCTGTTATTCTTATGACAATTGGAAGTTTCTTTTTAAATTATAACTATAGGAACTGTTTTAAAATCT
CTATTAGAGATAGAAAGAATCATAAAAGTCCAAATTGTGCTTTTTCAGAAGGCGCAGTATCTGGTGCTCT
AGGAATACAACTAGGAGGTACCAACGTTTATTTTGGGGAAAAAGTATATAAGCCAACAATAGGGGATAAG
CTTAGGGAGATAGATAAAGAAGATATAATTAAAACTAATAAAATTATGTATGTATCTTCATTTGTATCTA
TGTTGGTATTTACACTAATACATGTGTTATGTAGGATGATTTTAATTAACTTAATTATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3891151-3889736 cobyrinic acid A,C-diamide synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGATGACCTTTATTTATAATTTAGGTAGGAGGTGTATTATGAAAAAAATTTTAATTGCTGGTACTAATA
GTGGAGTAGGTAAAACAACAATATCATTAGGAATAATGCAAGCTTTGGTTAAGAGAAATATGAAAGTACA
GCCATATAAAGTAGGGCCAGACTATATAGACCCTTCATATCACACTTTTATAACTGGAAGACATTCTAGA
AATTTAGATTCTTATATGTTAGATGATGAAAAAATAAAGTATATAGTAAATAAGTCCTCAAAAGATGCAG
ATATTTCAGTAATAGAAGGTGTTATGGGCTTATATGATGGTTTTGGAATAGATTTAGATAATTGTACAAG
TTCACATACTTCAAAGGTATTAAAGTCACCTGTTATATTAGTTATAAATGGTAAATCTATGGCAGCATCT
AGTGCTGCTATGGTACTTGGATATAAGGAATTAGATAAAGATGTAAATATAAAGGGTGTTATAGTAAATA
ATGTAAAGACTAATAGCCATTATCAAATAATTAAGAGTTCTATAGAAAAATATTGTAATGTTGAAGTATT
GGGGTATTTTCCTCCAAATAACAAATTCTCTTTAGAATCTCGACATCTAGGATTAGTTCCTAGTGTAGAA
ATGAAATCACTAAGGGAAAAATTTTATACCTTAGCAGATGAAATTGAACACTATATAGATATTGACAGAA
TAATTGAAATATCAGAAAGCGATGAATTTGAGAGTGATTTTGATTTTCAAACTTTGATAGAAAATAATAA
AATAAAAGAACATGTTAATAATAAATCAATAGCTATAGCATATGATAAAGCATTCAATTTTTATTATAGA
GAAAATATAGAGCTTTTAGAGGAACTTGGTTTAGAAATAAACTATTTTAGCCCTCTTGAAGATGCATCAG
TGCCAAATGCAGATTATATTTATATTGGAGGAGGTTTTCCAGAAATATTTGGAAAAGAATTAGAAGCAAA
TGAGTCAATGAGAACTTCCATATTAGAAGCACATAACAATAATATACCTATTTATGCAGAATGTGGAGGA
CTGATGTACCTAGGTGAGAAACTATTGAATCAAGAAGAACAAGAATTTAATATGGTTGGAATATTTAGTG
GAATTAGTAAGATGACATCTTCTTTAAAGAGATTTGGGTACTGTATTGGTGTAGCCAAGGAAAATACTCT
TTTATCTAAAAAAGGGGAATCTATTAAAGGGCATGAGTTTCATCATTCAATATTTGAAAGTGATGAAAAA
TGTGTATATTCAATGAGAAAAGAAAGAGATGGAAATATAGTAGAAGAGTGGGATGGTGGTTATAGTAAAG
GAAACACTTTGGCTACATATCTTCATACTCATTTTTATAATAACTTAAATTGTATAGAAAATTTTTTGAA
AAAAGGAAATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3892650-3891151 cobyric acid synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGCTACAAGGAACAGCTTCAAATGTAGGTAAAAGTGTCTTAGTAGCAGGTTTGTGTAGAATATTTAAGC
AAGATGGTTATACTGTTGCTCCTTTTAAGTCACAAAATATGGCTTTAAATTCTTTTATAACTAAAGAAGG
ATTAGAAATGGGAAGAGCACAAGTATTTCAAGCAGAGGCTGCGAAAATAGAGCCAATAGCTGATATGAAT
CCAGTTTTATTAAAACCTTCTGGGAATAATAAAAGTCAAGTTATTGTAAGAGGTAAAGTTGTAGGAGAAA
TGCCTTCTTCTAAGTATCATGATTATAAATTGGAGTTAGTAGGTGTGTTGAAGGAAACATTTAATAGCTT
AAATTCAAGGTATGATATTGTAGTTATGGAAGGGGCAGGAAGTAATGCAGAGATAAACTTAAAAGATAGA
GATATCTCTAATATGGGTATGGCAGAAATAGCTGATGCACCTGTAATAATAGTCGGAGATATTGATAGAG
GAGGCGTATTTGCCTCATTAGCAGGAACAATGCTTTTATTAAATGAAGATGAGAAAAGAAGAGTAAAAGG
TGTAATAATCAATAAATTCAGAGGAAAAAAAGAGCTTTTACAAGATGGTGTAAAGATGCTAGAAGACATC
ATAAAAGTACCTGTTATAGGAGTAGTACCTTATACAGATATAAAAATAGAAGATGAAGACAGTGTAACTA
CGAGATTTAAGAAAAAAATGAATAAAAGTGATATACACATAGAAATAATTAGAACCCCACATATGTCAAA
TTTTACAGATTTTAATATATTTGAGACACAAGAAGATGTAAGTATTAGATATGTAGACTATGGAGAATCT
TTAGGAAATCCAGATATATTAATAATACCTGGAACTAAAAGTACTATAGACGATTTAACATATATAAGAA
AAAGTGGTCTTGAATCGCAAATCAAAAATTTACATAGTCAAGGTAAATTGATATTTGGGATATGTGGTGG
ATACCAAATGTTAGGTAAAAAATTAAAAGACCCTTATCATGTTGAAAGTGAAATTGAAGAAGTTGATGGA
ATAGGTCTTTTAGATACAGAAACAACGTTTGAGAAAGAAAAGACTACAACACAAGTAGAGGCTACTATTG
TTGAATGTATCAGTGAATACATGAATAACCTTAAGGGAAAAAAAGTAAAAGGTTATGAAATTCATATGGG
CATTACAAAGCGAGGTAATGATGTAAGAAGTTTAGATTTAATAACTAAAAAACTTGATAAAGAAGTGAAT
TATACTGAAGGAAGTGTAAATAAAGAGGGGAATGTAATTGGGACTTATCTTCATGGAATATTTGATGAAA
TAAGCTTTACAAGAGCAATTTTAAACAATATAAGAAAGAAAAAAGGTTTAGGAGAATTAGAAAGCAAAGT
AAACTCTTTTAATGAATTTAAGGATAAAGAGTATGATAAGTTGGCTGATTTTTTAAGAGAACATTTAGAT
ATAGAGAAAATATATGAGATTATGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3893640-3893026 putative cobalamin biosynthesis phosphoglycerate mutase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAGATTAATATTAATAAGACATGCACTGACAAATGATAATAAAAAAGGAAGATTATCAGGCCATA
TAAATAGTTGTATTAGTGAAGAGGGCAAACTACAAATAAATAAAATTACCAGATATCTGAGTAATGAAAA
CATAGATAAGGTTTATACAACACCATCTACACGTACTAAAGATACAGTAGAAAAAATATCAAAATTGAAA
TTATTAGAAATAGAAGAAAAAGAAGCTTTAAGAGAAATTAGTTTTGGAGACTTTGAAGGAAGAACTTTTG
AAGAAATTAAAATCAAATATCCAAATGAGTTTGAAAAAATGATAAAAGAAGGTAACAACTATAGATATCC
AAATGGAGAAAGTTTGATAGACTCTTATAAAAGAGTGGCAAAAGAAATTGATAATATAATTTTAGAAAAT
GATAGTAATTTAGATACAAAGACAATACTTATATGTTCTCATGCAGGAACAATAAGAAATATAATAACAC
ATTTGATTTCTGGTAGTTATAAGTATCACTGGAACTTTAAAATTGATAATGCATCTATTACAGTTTTAGA
AATTGATGGTGGATTTGCTGTAATAGATAAAATGAATTTTACAGACTTCATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3894433-3893660 cobalamin synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGATTTATTTTAATACTACAGTTTTTGACAAGGATACCTATAAAATTAAATGTAGGATTTGATG
ATGAATTTTATAAGTCAATAGTATATTTTCCACTTGTAGGTTTTGTCATAGGTATATTATCCTATTTAAT
AGGATGGATTTCTATGCTTTTATTTGAACCATTTATAGCTTCTATAATAATAACTCTAGCTGGTGTCTTA
ATTACTGGAGGACTTCATATAGATGGATTAGGAGATACATTTGATGCAATATATAGTTATAGGGATAAAG
AAAAAATGCTTGAAATAATGAAAGATTCAAGATTAGGTACAAATTCACTTCTAGCAATTATGTTTGTACT
TTTATTAAAGGTTGGATTCGTTTACGATATAATAAGTAATAATTCATTGTGGATTATAATTTTTATGCCA
ATGATTGCAAGGTTAGGAGTAATGTTATTGACATATAAAACCGTGACACCAAGAGAAAAAGGAATGGGAA
ATTTATTTATAGGAAAATTAACTACAAGTATGTTAATAACTGCTATAATATACACATTATTGATAGTTGC
TCTTATTACTAAATTTATATTTTTATTACCTAATATAGTGTTGATTAAAGTATTAGGTTCGATTATAGTG
GTTTTTGTATTTATAATATTATTCAAAAAACATATTTATAAAAAAATTGACGGAGTAACAGGAGATATAT
TAGGCTGTGGAATAGAACTTTCAGAGCTTGTATATTTAATTTACATATATTTGTTAATTTTTATGTTTTT
TTAA
>ref|NC_013316.1|:c3895057-3894443 bifunctional adenosylcobalamin biosynthesis protein [includes: adenosylcobinamide kinase and adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase] [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTGACATGGGAAGATAAATATAAAAATTTAATATGTAGGAGTGTTTTGATGAGTAAAATTATTC
TAGTAACAGGAGGAGCTAGGTCAGGGAAGAGTAACTTTGCAGAAAAACTATGTTTTGACAGAAATAATAA
TACAGCTTATATAGCAACCTCTATTCCATTTGATGATGAAATGAAAGATAGAGTAAAAAAACATCAAGAG
AATAGACCTAGAAACTGGAATACTTATGAAATATATGAAGATATATATTCCATAATTAAGGAGATATATA
AAGAACATGAAACTGTTATACTAGATTGTGTAACATTATTAGTAAATAATCTAATGTTTGAACACAATCT
AAATATAGAAGAGTCTAGTCAAGAAGAAATAAACAAATTAGAACAATACATAAAAGAACAAGTTGTCAAA
CTTATTGAAGAAATAGAAAAAACAAATCTATACTTTGTATTTGTAACGAATGAGTTAGGTATGGGAATTG
TTCCTGGGAATAAACTTAGTAGAATTTATGCTGATATTGTAGGTCGTATAAATCAATATATAGCTTCGAA
AAGTAATGAAGTTTATTTTGTAGTTAGTGGCATAGCTATGAAGATAAAGGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3896081-3895035 nicotinate-nucleotide--dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTTATTAGAAAGTATATCAAAAAACATATATTCCCTAGATAACTCTTCTATTGAAAAAACAAAGC
AGAGATTGGATAGGCTTATACATCCAACTGGAAGCTTAGGAAAGATAGAAGATATTTGCATGCAATTGGC
AGGAATATTTGGCAATGAAAATTTTGACACAAGTAAAAAGGTTATAATTGCTTTTGCGGGAGACCATGGT
GTATATGAAGAAGGCGTAGCACCTGACCCTCAAAATATAACAAAATTACAGTTTCCAAATTTTTCGAAAG
GTCTATGTGGAGTTGGAGTAATAAGTAAATTTGTAGGGGCAGATGTTGTAGCTGTAGATGTAGGAATAAA
CTGTGATGAAAAACTGGATGGGGTATTAGACTACAAGATAAGAAAAGGGACATCAAATATGGCAAAAGGT
CCAGCTATGAGTAAACAAGAAGCCATTAGATGTTTAGAGATAGGTATTGAAATAGCAGAGCAGTGTATAG
AAAAAGATTATAAGGTTATTGGTATTGGGGAGATGGGTATAGCAAATACTACTCCAAGTACAGCAATAAT
ATCTGTAATTTCAGGGTGTGACCCGTTAGAAGTTACTGGTATAGGTGCAGGTCTTAAGAAAGAAAGACTA
AAGCATAAGGCTGAAGTAATTAGAAAGGCTATTGAAATTAATAATCCAAATCCAACTGATGGAGTAGATA
TTTTATCTAAAGTAGGAGGATTTGAAATAGGCTCAATGGCAGGTGTTATATTAGGTTGTAGTGCTAATAG
GATTCCAGTAGTAATTGATGGGTTTATTTCTTATGCAGCAGCATTAATTGCATATAAGATAAATCCAAAA
ACTAGAGAATATATGATAGCATCTCATTTATCAGCAGAATCAGGAACTAAAAGAGCATTAGACATATTAA
AATTAGACCCTCTATTAAATATGGATATGAGATTAGGTGAGGGAAGTGGAGCTGCTTTAGCATTTGATAT
AATAGAAGCTTCAAACTATACTTACAAAAATATGGCAACTTTTGATGAAATTGACATGGGAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:3896886-3897758 putative aldose epimerase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATATTACAAAATGAAAATTTAATTATCGAATCAAGCAGTTTTGGTGCTGAACTAACTAAAATAT
TTTCTAAAAAATACGACAAAAACATTCTTTGGGATGGTAATAAAAAATATTGGGGTAGACAATCACCTAT
ATTGTTCCCTATAGTAGGTAAACTTTTTGATAATGAAACAATAATAGAAGAAAATTTATATAGCATGACT
CAACATGGGTTTGCTAGAGATATGGACTTTGAGATTGTAGATAAAGGAGATACATTTGTATCTTATAAAT
TAACAGATAATGAATCCACTTTAAAGAAGTATCCATATTCTTTTGAGCTAATCATAAACTATACATTAAA
TGATAATAGTATTGAGGTAGAATGGATTGTAAAAAATACTGACTCTAAAGATATATTCTTTTCTATAGGT
GGACATCCTGCATTCAACCTTCCTTTTTACAAACAAAATGATTTTTCTAAACACTACCTTGAGTTTAAAA
GTAAAAATGATGTAGAAAAAATCAATTTAAATGGTTCTTTTACAGATGATATAATACCTATTGGAAAATT
AAAAAACTTACATTTAAATCCAGAAGTATTCAAGAATGATGCTTTGATATACACCAACATAGATGAAGTG
TCTATATATAATAATGATGGTAGTAAATATGTAACTATATCTATGGAAGATTTCCCTCTAGTTGGTATTT
GGACTCCTTATTATAGTGAAACTAATTCTACTGCTCCTTTTTTATGTATAGAACCTTGGTATGGTCTTGC
TGATAGTATAAATTCTAACAAAATTTATAAAGATAAGAAGTTTATTAATAAACTTAGTAAGGGAAAAGTT
TTTACTGCTTCTTACAATATAAATATACACTAG
>ref|NC_013316.1|:c3899142-3897955 putative aminotransferas [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATATAATTTTAATAAAGTATTAAATCGTAAAGAAGGAAATTGTAGAAAATGGAGCAACCATGTGA
TTAAAGAAAAATTCGGCTTAAATGAAGATGCAATTCCTATGGATTTAGCTGATATCGATTTTGAGTGTGC
TCCTGCTATAAAAGAATCTATCTTAAAAAGAGCATCAGTAGGAGATTATAGTTATACTTTTATAGGAGAT
GACTTCTATGATGCTATTATAAATTGGAATAAAAGAAGATTTGATGTATATATAGAAAAGGATTGGATAA
AATTAACTTTTGGTACTGTTTCAACCCTTCATTATATAGTTCAAGCATATACTAAAGAAGGAGAGGGTGT
ATTGATAAATACACCTGCTTATGACCCTTTTGCAGAGGCTGTAGCAAATAATAATAGAAAGTTGTGTTGT
AGCTCATTAAAATTAGATAACAATAGATATTATTTAGATTTAGAGGATATGGAAAATCAAATGAAATACG
AGAATATAAGATTACTTATATTCTGTAGTCCACAAAATCCATCAGGTCGTATATGGACAAAAGAAGAACT
ATATCAAGTGTCAGAGTTATGTTTAAAGTATAATGTAATTTTGGTAAGTGATGAAATTCATAGAGATATA
ATATTTAAAGATTATAGATTTGTATCTTTGTGGAATGCTCATCCAGAAATTTATAAAAATAGTATAATCT
GCGTATCTCCTAATAAAGGCTTCAACTTAGGTGGATTAAAAACATCATATGTATTAATAAGAGATGTAAA
AATTAGGGAGACTTTATTAGAAAGGCTAAAAAGTAATTCAATAACTTCTCCAAATGTATTTGCAATACCA
GCAATAGTTGCAGCATACAATGAAAGCGAAGAATGGCTAGATGCTATGACTAGTTATGTAGAGGAGAATT
TTGAAATAGTTTATGATTTCTTTGAAACTAATATACCAAAAGCCAAAGTGATGAAGTCAGACTCTTCTTT
TTTAGCCTGGATAGATGTAAGAGAAGTATTTAGAAATGAAGAAGAATCTAAAGAATTTTTTAGACATGCA
AACTTAACTATGGTAGTTGGAAGTTATTTTGTGAAAGATGGAGATGGATTTATTCGTATTAATGTGGGGT
GTCCTAGAGAAACATTAAATGAGGCTCTAAATAGAATCAAAAAAACGTATATAAGTATGTATTGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3900217-3899147 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATACAATAGAGAGATTAGTATCCTTAATCTATAAAAGAGGTGTTGACGCTCTTTTGATTAAAG
CAAAAAATACTAAAAGATATATAGGAGCTTTATCAGGTAGTGGTGTATATGTGCTTGTTACTAAGGATAA
AAATTATCAAATTCTAGATGGCAGATATATTGATGAAGCAGATAAAAAAACGACTGGTTTCATAAAAAGG
ATTGTATCTCAAGGTTCTTATATACCAACTATAATTGAGTTATTAAAAGAATTAAATATAAAAAAGTTAG
CAATAGAAAACCAAGCTATGAGTATACAAGAGTATCTTTCACTAAAAAATGAAGGTTTTGAAATCAATTT
AATAACAAATGAATTATGGAAGCTAAGGGCTATAAAATCTAAAGAAGAAATTGAACTTATTAAAAAGGCT
TGTGAGATTACAGATGAAGTATTTGATGAGGTTATTTCTGAAATTAAAAAAGATATGACTGAGCTAGAAG
TATCAGCTCTAATTCAGTATCATGCATTAAAAAAAGGTGCAAGTGGAATGTCTTTTGAAACAATAGTGGT
ATCAGGAGAAAGAGGTGCAATGCCACATGGAAGACCTACAAACAAAAAATTGAAAGTGAATGAAGCTATA
ACAATAGATTTTGGTGTTGTTTATCAAGGGTATCAATCAGACATGACTCGTACAATATCTATAGGTAAAC
CTCCTAAAATTATTAAAGAGATATATGATGTAGTATTGGAAGCACAATTATCTGCAATAGAGTCAATAAA
GGAAGGAACTAGGGCAAGTGATGTTGACAAAGTGGCTAGAAAAATTATAGATAAACATGGATTTGGCGAA
TATTTTAATCATGGACTGGGTCATGGTATAGGTCTTGGAGATGGTGAAGTTCCCACTTTAAATCCAAATA
GTGAAGATATATTAGTGGAAGGAATGGTAATGTCTTGTGAGCCAGGTATTTATATTCCAAATGTAGGGGG
AGTTAGAATAGAAGATGATATTGTTATAATAGATGGAAAAGGTGTTCCACTCAATAAGACATCCAAAGAG
TTTATAATATTAGGAGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3901549-3900227 PTS system, IIc component [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTTCAAAATTTGAAGCATTTATGAATAGAGTATTTATGCCTTTAGCTCATAAGGTTGACAATCAAC
GTCACCTTGGTTCTATAAAGGCTGGTATGGTTGCTATGACACCATTCACAATATTAGGAAGTATATTTGC
AATACTTCCAGCACTTCCAAATATGCTTGGAGAAAATAATCCAATAAGCAAATTCATACTTAACAATTCA
GCAATATTGGATTTACCAGTAAGTCTTTCCATAGGTTTAATAGGATTATATGCTTGTATGTGTATTGCTT
TTAATCTGGGGAACTACTATAAATTATATATACCAGGTTGTGTTGCACTATCAACTTTTTCTTTTTTATT
CCTAGTAGCCTCATTTACACCAGATGGAGCTTTAGAAATAGGAAATTTAGGAGCTAAAGGGCTATTTACA
GGTATGATAGCAGGGCTTGGTTCTGTGGAGTTATATAATTTTTGTAATAAGAAGAATATCACAATAAAAA
TGCCAGAAAATGTACCTGATTTTGTATCTAGGTCTTTTGAATTAATACCTACTACTATAATAGTTTGTGG
AACTTTTATAGTTGCTCGTTTTATTTCATTAAAAGTATTTGGAGAATTACCTCCACAGATACTTACTCAA
TTTTTATCTCCATTAGTAGGAAGTATGGATAACCCATGGTCAGTTCTTGCACTTAACTTTGCTATATGTA
CTATATTCTTTTTTGGAATACATTCATCAGTATTTAGTCCTATAACTAGACCTATAATGATTACATTTAT
AGCTGAAAACATAGCAGCTATGCAAGCTGGAGAAACAATACCTCATTTCTTTACAGCAGGAGCTTCAAGT
GCATTCTTTGGATTTACAGGATGTGGAATTAGTATAGGTTGTGTAATTGCATGTATGTTATCAAAAAATG
CTTCCTATAAGAAGATTGGACGTGTATCATTATTCCCTGCATTATTTGGGATAAATGAACCAATATTATT
TGGAGCACCGATAATATTAAATCCAATAATGTTTATACCACATGTATTTGGTGGAGCTATAATAGGTACA
CTACCAATGTTTTTTATGCACTGGGGATGGTTAGCAAAGCCAGTATTTGACCCTCCATATGTAGGGGTAT
TCTTAGAAGGATTTTTAACTAATGGAGATTGGCATTCTATATTAGCAAATGCATTGCAATTAGTATTAGC
AGTTTTATTATATTGGCCATTCTTTAAAATAATGGAACGTCAACAAAATAATAAAAAACAAAAAGAAGAA
ACTAAGAATATATTCTCTAAAGAAGAAGAAGACTTATTGGATGATTTAGGATTGGATTTCTAA
>ref|NC_013316.1|:c3901916-3901581 PTS system, IIb component [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATATTATTATGTTGTGCAGGTGGATTTTCTACTAATATGTTAATGCAAAATATGAAAAAGGTGG
TAAAAGAGAGTGCTAAACTCAATGAAAAAGATTTTGAGTTTACAGCTATACCAGCAGATTCAATAGAAAG
TGAAGTTGATGATTGGGATATAGTACTTATAGGTCCTCAAATAGCTCATAAAATAGACTTCTTAAAAGGA
ATATTAGAGCCAAAAAATAAGCCTTTTGCAGTAATAGATAAAGATGTATATGGAAAAATGGATGGAGCTA
CAGTTATGAAGTTGGCATTAATAACTTATAAGAAACATCAATTAGCTCAAGGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3902318-3902013 PTS system, IIa component [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAACAGAAGTACAAATAATGGAGCTTATATCAACTGCAGGAGAGAGTAAATCGAAAGCTTTTGAGG
CTTTAAAAAAAGTAAAGTCAAAAGATTTTAAAGGAGCAAAATTGTTAATAGAGGAGGCTCGTAAAATAGA
TATTGAGGCTCACAGAATACAGACAGAATTAATAACTCAAGATTTAAATGAAGATGTTGAAAGCCCAACA
ATGAGTCTTTTAATGGTACATGCTCAAGACCACTATATGACTTCTCAGCTAGCAAAAGACTTGATAGAGG
CTTTGATATATTGTCTCGATAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3903376-3902333 endoglucanase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATAGAGTTTTTTAAGAGGTTGTCAGAAGCAGATGGTATAGCATCTAATGAAGAAGAGGTTAGAC
ATGTTTTATTGGAAGAACTAAAGGCTTATAGTGATAAAATTATCTGTGATGGGCTAGGGAGTATCATCTT
TTCTAAAATAAAAGATGAGAGTGCACCAAACGTAATGATTTGTGCTCATATGGATGAAGTTGGATTTATG
GTGAGAAGTATAGACAAACTTGGTATGATTCACTTAATAACAATAGGAGGAGTAAAACCTCTTGCACAGT
TTGTACAAAAAGTTAGAATTACAACAAAAGAAGGAAAGAAAATCCCTGCTGTCATAAATGCTACATATAA
TAATGGTAAGGCTGAAAATATATATGCAGATATTGGAGCATATACAGAAGAAGATGTATATAACCTAGGG
ATTAATGTTGGGGATATGGTAACATATACAACAAGTTTTGAGGAATTTACTTTACCAGACCGATTAGTGG
GAAAGGCTTTTGATGATAGGATAGGATGTTTTGTGATGGGAGAAGTTTTAAAAGAACTTAGGAAAGAAAA
TCTAAATTGTAATATTCACTTTGCGGCTACAAGTAGTGAAGAGGTTGGAATAAGGGGAGCAAAGACATCA
ACACAGTTAATAAATCCAGATATAGTATTTGTAATAGATGTAGCATGTGCTAAAAATGAGTTTGTGAGAG
ACTATACAAATCAGAAACAAATTGATAAAGGTGTAATGCTAATGCATAGAGATAGGACTCTAGTCCCTAG
TAGAAAAATGATAGATTATGTAATGGAAATTGCTGATAAAAATAATATACCACTTCAACATGATATGTTT
GAATCAGGTGGGACTGATGGAGGAGAAGCACATCTCGTAAATGAAGGGAAACCTTGTGTAGTAACTTGTG
TACCAGTTAGATATGGTCATTGTGCATTTTCAATAGTAAGTAATAAAGATTTAGAGAACATTATAAGATT
GTATACACAGTTAATTTTAAATTTTGATGAAGAACAATATAAACATATAAGAAATTTTATCTAA
>ref|NC_013316.1|:c3905280-3903379 putative transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAGAACGCATTATTCTTGAAACATTAAAAAATAGTAGTGGTTATCTAAACATAGATTATTTTGCAG
ATAAGTTGGGGGTATCTACTCGAACTATCAGAAATGAAATAAAAAAGATAGAAACTATAAAAGAATGTAA
TGGTTTTAAATTAGAATATAAGTCTAAATTAGGATATATTCTAAATATTAAAGACCAAGATAAATTCGAG
CATTATCTAAGAAACTTACCCTCAGATTTAGTTGAAAATCCAGAACAACGGTTGGAGTCTATAATAGTAG
AGCTTTTAGTAAATGAAGGTTATAAAACTATAGAACAGTTAAGTAAAAAATTTCTAGTAAGTTCATCCCA
AATAAAAAATGATTTAAAAAAGATAGATGAAAAGATAAAGGATACAGAATTAAAACTAGAGCGAAAGGCT
CATTATGGAATTAAAATAGAAGGTTCTATTAAAGAAATTCAAAGTATATTGGTGGATAGTTATTTTAGAG
GGAATAGAAATATAACAGAGTACAGGAATAAGTTTATAGATAATTTAAAATTAGCTAATATTAGAAGTAC
AATAAAAAATGTACTTAATGAACATGATTTAGAAGCAAATTTAACAGAACTTGAGGAAATATTAGCACAA
ATTATTATATTGTATATAAGAGTTAGTATGAGAGTAGTGGGAAATGCTAGCAATTTAAAATTATATACAG
AAGATTTAATTATAGATAAATTATTAGATAAAATTTTTAGAGATAAAAAATATAACCTTAATTATGATGA
AAAGTATTATTTAAAGGAGCTTATAAAACTAAAGACTAAAGATAAGAAAGCCACTATAAAGAATATTGAT
AAGAATAAACTTCAAGATATTATGTTCGAATTTTTTAGAGAGATAGATAAAAAATATAACTCTAATTTTT
TAGAAGATAAAGAGTTTTTTAACTTATTTTACTTACATATTGCATGTTTAATAGAACGTATAAAGAAGAA
CCACAAGATAATAAATCCTTTTTCAGTTAAAATAAGTCAACAGTATCCAACTGTTTTTAATTTATCTATT
CAATTTTCAAAAATCATAGAAAATGAGTATCATATAAAAATAAGTCAAGATGAAATAGGGTTTATAGCTA
CTCACATTGCTGTTCCTTTTGAAAAGAGAGAAGAAGCTAATTTTAATAAAAAATATAAAATAGCAATAAT
ATGCTCTTCTGGTGGAGGTAGTGCATTTTTGATAAATTTAAGACTTAAAGAAATTTTTCCAAATGCTGAG
ATAAGAAATTTTTCATTACTAGAAGAAAAAGCTGTAATAGAATTTGCACCAGATTTGATTTTTTCAATAA
CAAATCTTTTATTTGAAATAAATGCTCCAGTTATACTTATAAATGAAATTTTAGACGAATTGGATTATTT
AGATATTAAAGAAAGTGTTAGATTTGCAGACCATATAGGAAATATATCAAGCCCAAAACAATATATATTA
GGTCTATTTGATAAGAATCACTTTAGGTGTATAAAAGATAAAGCTAAGTATAAGGATATCCTTGATAGTA
TGTCAAAATGTATAGTTGACGAGGGAGCTTGTTCTCCAACCTATCCCAAAGATGTATGGGAAAGAGAAAG
CTATTTGAGTACTATTTATACAAATGGGGTGGCTATACCTCATCCAATCGAGATGACAGGAAACAAAAAT
ATAATATCAGTAGCTTTGATACAAACTGATATTATTTATGAAAATAGGGTGCCCAAAATTATTTTCATGA
TTTCATTAATAAAGGGAAATTTAGAACTTCATAAGCAAATATCTAAATATTTAAGTAAGATTATGGCAAA
TAAGGATATGGTAGACATGCTAAATAAGTCACAATCTTATGAAGAGTTTATGTATAAGTTAAAAATCTAT
CTGGGAGGTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3906457-3905606 putative tagatose-1,6-bisphosphate aldolase [Clostridium difficile R20291]
GTGGCATTAGTAACAACAACATCAATGCTTAAAAAGGCACAAGATGAGGGGTATGCAGTAGGAGCATTTA
ATGTAGAAAATATGGAAATGGTAATTGCTGTTATAGAAGCAGCTGAGGAGTTAAACTCTCCAGTAATATT
ACAAACTACTCCATCTACTGTAAAATATGCAGGTCTTGATTATTATCTAGCAAATGCAAAGGTTGCTGCA
GAAAGAGTAAAGATACCTGTAGCAATGCATCTGGACCATGGTTCAAGTTTTGACCTTGCAATGAAAGCTT
TAAGAAGTGGATATACATCAATAATGATAGATGGTTCTCATGAAAGCTTTGAAAATAATATATCTATATC
TAAATCAGTAGTAAAAGCATGTAGTCCTTCTCTTATACCAGTGGAAGCAGAACTTGGGAAAGTTGGTGGA
AAAGAAGATGATTTAGATGGCGGGAATAGTAATGATTATACAAATCCAAAAGAGGCAAAAGAGTTTGTCG
ATAGAACAGGAATATCTTCATTGGCTATTGCTATAGGTACTGCACATGGATTGTATAAGGGTGAACCTAA
AATAGATTTAGATAGGTTATCAGAAATTAAAAATGTAGTTTCAATACCTTTAGTATTGCATGGAGGTTCA
GGAATACATGATGATATTATAAAAGAAGCTATAAAAAGAGGTATTGCAAAAGTTAACTATGCAACTGAAT
TAAGAATTGCATATAGTAAAGGGGTTAAAAAAGTTTTAGATGAAGATTCTGAGGTTATAGACCCTAAAAA
GTATGGATTAGCAGGGCTTCAATCAGTGAAGGATTTTGTAAAAGAAAAGATTAAAGTGTGTGGGTCTGTA
AATAGAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3907675-3906506 putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATGTTTAAATTAGAAGAACAAAAACTAAAAGATTTAGGTGCAATAATAACAACTAATGAAATAA
AACAACAACCTGAGTTATGGTTAGAGACTTATGAAATATATAAATCTAACAAAGAAAAATTAAATAGATT
CATAGATACAATAAGTAATAATCATGGGCAGTTTAGAGTTATATTTACAGGTGCTGGAACTTCAGCTTAC
ATAGGAAATTCAATACTTCCTTACCTTAAGAATAAAAATGACATAAGAAAATACATATTTGAAGCAATAC
CTACTACGGATATAGTTTCAAACCCATATGATTACTTAAAAAAAGATATACCAACATTATTAATTTCATT
TGCAAGAAGTGGAAATAGTCCTGAAAGTTTGGCTGCTTTAAATTTAGGGAATAAGATTGTAGATAATTTT
TATCATTTAGCTATAACTTGTAATCCGCAAGGAGAACTAGCTAAAATGACTAAAAACGACGAAAATAATT
ACTTGTTATTAATGCCATCAAAATCAAATGATGAAGGCTTTGCTATGACAGGAAGTTTTTCGTGTATGAT
GTTATCTGCTATGTTAATATTCGATAGTTTAGAAGATGATGTAGAAAAGTCATATATAAATGCAATAATT
GAAATGGGAAGAAATGTTATAGATAGAAAAGATGAAATACATGAGTTAATAAATAAAGATTTCGATAGAG
TTGTATATTTAGGTTCAGGAGGATTAGGTGGTTTGACACAAGAAGCACAACTAAAACTTTTAGAACTTAC
AGCAGGAAAAATATCTACGGTGTATGATTCTCCTATGGGGTTTAGACACGGACCAAAATCATTTATTGAT
GAAAATACACTTGTATTTGAATTTGTATCTAACTGTTTATATACAAGAAAATATGATTTAGATGTTTTAG
AGGAGATAAAAAGGGATAAAATTGCTAAATTCACTTGTGCAGTGTCAGTAGAAAATGAAAATAACTTCTC
AGGAACAAAGTTTGAGTTTAAAGAAAAGTATAATAAATTACCAGATGTGTATCTTGCAATGCCATACATA
TTGTTTGCACAAACTATAGCATTGTTTGTATCGGTAAAGGTTGGAAATAAGCCAGATACGCCATCAGCTA
CAGGAACAGTAAATAGAGTAGTAAAAGGTGTAACAATATATGAATATTAA
>ref|NC_013316.1|:3908137-3909054 putative oxidoreductase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATATAAAAATGGGAATGATAGGTCTTGGCTCCATAGCTCAAAAGGCATATTTACCTATATTAA
CTAAGTCTGAGAGATTTGAGTTTGTAGGAGCTTTTACTCCAAATAAAGTTAAAAGGGAAAAAATCTGTAG
TGATTATAGAATTATGCCATTCGATTCTATTGAATCCCTAGCTAAAAAATGTGATTGTATTTTTCTACAT
AGCTCTACAGAAACACACTACGAAATTATAAAAATATTATTAAATTTAGGTGTTCATGTATATGTAGACA
AACCTCTTGCTTCAACAGTAAATCAAGGAGAAGAACTTATCGAGTTAAGTAAGAAAAAAAACTTAAATTT
AATGGTTGGATTCAACCGTAGATTCTGTCCTATGTACAAAGAAATTAAAAATAATGCTACAGAAATCGTA
TCTATCAATATATGTAAACATGGATTAAATTCCTTAAGAAATGTTAGATTCGACAGTACCCTTATAGATG
ACTATATACATGTTATTGACACTGCTTTATGGTTAGCAAATGAAGATGTTGAAATTAGCGGAGAAGATTT
ATTTTTAACAGACAATAAGAATCTTATATTTGTAAGTCATAAACTTAAAGGTAAACATTTCTCTGTAAAC
ACCTCTATGCATAGAGATTCTGGAACAAAGTTAGAACAAGTTGAAATTCTTTCAAAAGGTAAGATTCAAA
GAGTTAAGAATCTTAATGTACTGGAAATAGAAGAAGGTGGAAACCTAACTTTAAAACAAAGTGGTGCATG
GGTAAATATATTAAAACAAAAGGGTTTTGAGGATATATCAAATCATTTTATTGATTGTATAGAAAATAAT
ATAAAACCAGCTATTAATGGAGAAGAGTGTATCAAGGCTCAAAGATTACTAGAGAAAATTATAAATTCAG
TAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3910112-3909183 putative tagatose-6-phosphate kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTACAGTAATAACATTCAACCCATCTATAGATAGAATGTATAAAGTGAATAATATAAACATAGGTG
AGGTGCAAAGGGTAGTAAGTAAGAATGCAACTGCTGGAGGTAAAGGATTAAACGTAGCTAAGGTATGTAA
AATTTTAAAAGAAAATCCTTTAGCTATGGGATTTCTAGGTGGATTTAATGGAGAATTTATAAAAAATGAA
CTTAGAAAACTAGATATACAAAATAAATTTACAAAAATAGAGCAGGAAACTAGAAATTGCTTAAACATAA
TTGAGGACAATAAAGTTAGTACAGAATTTTTAGAAAAAGGACCAATAGTAGAAAAAAGCGATTTAGAGAG
ATTTGAAAATGATATAGAGGAAGTACTAAAAAATACTAAAATACTAGTAGCTTCTGGTAGTTATTGTGAG
AATATGCCGATAGATTATTATGAAAAGATAGGAAATATATGTAGAGCAAATAATATAAAATTTATATTAG
ATACATCAGGAGAAGCATTAAAAATAGCTTTAAAATCAAAACCATATTTAATAAAGCCAAATATAGATGA
AATAAGACATTTATTAGGAATAAATATAGAATCAAGAGAGGAAATTATCTTGTCAGGAAAAAAACTTATT
GAAATGGGTGCAGAGAATGTATGTATATCTTTAGGAAAAGATGGTATGGTGTATTTAAACGAATATAATG
TATATGATGTAAAAGTACCAGTTGTAAAGTGTATAAATACTGTAGGTAGTGGAGATAGCACAGTGGCTGG
ATTTAGTGTAGGTATTTTAAGGGGTTATAAAATAGAAAATTTACTTAAATTTGCAAATGCTTGCGGTATA
AGTAATGCTTTAAATATGGAAACTGGATTTGTAGATTTGGGAGAAATTGATAAATATCAAGATTTAGTTG
AAGTAAAAAAGTTAAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:3910381-3911106 GntR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
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ATGAGATGGAACCAAACGATAGAATGCTTTCTGAAAGAAAAATTTGTGATGAATATGGAGTAAGTAGAAC
CACAGTTAGACTAGCTATGGCTGAGTTGGAACATATGGGATATATATACAAAAGACATGGAAAAGGAACT
TTTGTTGCTGCACTAAGTCAAAATTCTCAAAACTTAATGGAAAGTTATAGCTTTACAGATTATATGAGAA
TACAAGGAAAAAAGCCAGGTACAAAGGTATTATCATTTGAGGTAGTAGAAAGTACAAAGTATTTCTCTGA
AAAATTAGGTATAACTCCTGGTGAAAAAATGATAAAAATAATGCGTTTAAGACTTGCTGATGACCTTCCT
ATGATGCTTGAAAGAACATATCTTCCTATGAAAGAATTTATAGGATTGACAAAAGAAAAAATCGAACAAA
AACCTTTATATGAAATATTTAGAGAAGATTATGGCGAGATTATTAAAGTTGCTGATGAAGAATTTTCAGC
TGGAATAATCTCTGATAAGGAAGCTAAGTTATTGGAAGTACCAGGAGATTCACCTTGTCTGAAATTACTT
CGTACCACATATAATGATGACAATATAGTTATTGAATTTACTTTGAGTGTTGCTAGAAGCGATAAATTTG
TATATAGAGTAAGACATGTAAGATAG
>ref|NC_013316.1|:3911222-3912343 N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACATGGAATCAAAGAAAAAGGTTACCTTAGTATAATTAATGGCAAATTCGGTGAATTTCAACAAG
AAAGACCTAATATTACTGATAATGTCATAGATTTTTCAGGTAAATATATTGCTCCTGGCTTAGTTGATAC
TCACATTCACGGTCTTTTAGGTGCAGATGTCATGGACAATACATTTGAAGCAATAAACACAATTTCAAAA
GGCTTATTAAAATATGGAGTAACATCTTTCCTACCTACAACTTTAACTGATTCTGTAGATACACTAAGTG
ATTCTGTAGAAAATATAAGCAATAGCTTCAATCGAGTTGAGGGTGCAAAAATACAAGGGATTTATTTAGA
AGGTCCATTTTTTACAGAAAAATATAAGGGCGCTCAAAATGAAAAATATTTTAAAGACCCTGACATCAAT
ATATTAAAATTATGGCAAAGAAAATCGAAAAATTTAATAAGAAAAATAGCAATTGCTCCAGAACGTAAAG
GTTCAATAGAATTAACAAGATATGCAACTAAAAATAATATCTCTGTTTCTCTTGGCCATAGTTCAGCTAC
ATTTGAACAAGTTAAACAAGTCGTTAATTCAGGTGCTAAAGTGTTTGTACATACATATAATGGGATGAGC
CCTTTAAATCATAGAGAACCTGGAATGGTTGGGGCTGCTATGGTACTAAAAGATACTTATGCTGAATTAA
TTTGTGATGGTCATCATGTAAGCCCAATAGCTGTTAAAATAATGATGGATGCGAAGTCTAGTAATAACAT
AGCTTTAATTACAGATTGTATGAGGGCTGGTGCTATGGAGGATGGAAAATATACTCTTGGTAAGTTTAGT
GTAAATGTAAAAAATAGTGTTGCAAGATTAAATAGTGGGAGTTTAGCTGGAAGTGTATTAACTATGGACA
AGGCTGTGAGAAATATAGTTGATTGGAACATAGCCACTTTAGAAGATGCAATAAAAATGGCTACATATGT
TCCTGCTTTAAGTTGTAATATTGATAATGTCTGTGGCTCCATACATCAAGGTATGGATGCAGACTTTATA
GTAACAGATAAGAACTTTAATATATACGAAACTTATATAAGTGGTATATGTATGTACAAAGTTAATAAAT
AG
>ref|NC_013316.1|:c3913917-3913081 transposase, mutator type; transposase, mutator type [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAACAAAAACGAAATATTAAAAAAACTTATTGAAGAATATGATGTTAAAACAACTACAGATATTC
AAGATATGCTAAAAGATTTATTTGCGAGTACAATTCATCAAATGTTAGAAGCGGAGCTTGACGACCATTT
AGGTTATGATAGATATGGCAATAAGAATAAAAATACTAAAAACTCTAGAAATGGATATAGAAATAAAAAT
GTTAAATCAGATTTTGGAGAAATAACTTTAAATATTCCAAGAGACCGAAATGGAGATTTTGAACCAAAGG
TAATTAGTAATTATAAAAATGATATATCAGGAATAGAGAACCAAGTGATTGGAATGTACTCAAAAGGCAT
GTCTACTCGAGATATATCAAGCCACCTTAAGAGTATTTACGGAATTGATATATCTCATTCTCTAGTAGCT
AAAATTACTGATAGAGTTCTACCTTTAGCTCATGAATGGCAAAACAGACCTCTTGATATGGTTTATCCAA
TTGTATTTATGGATGCTATACATTATAAAGTTAGAAGTGAAGGTAGAATAATAAACAAAGCTGCATATAT
AGCCATAGGTGTTAACTTAGAAGGTATAAAGGAGGTCTTAGGAATATGGATTGGAGAAAATGAAAGTTCA
AAGTATTGGCTAAAGGTGCTTACAGATGTCAAAAACAGAGGAGTTAAGGATATATTAATAACTTCTGTAG
ATGGATTAGTTGGATTTTCTGATGCAATTAAAGCAGTATTTCCTGATACTGAAATACAAAGATGTGTTGT
ACATCAAATTAGAAATACTTTAAATTATGTATCATATAAAAATAGAAAAGAATGTGCAAAAGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3914890-3914159 hypothetical protein CDR20291_3277 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAACAAAAAAAATGTAAGTTTAATTGTTTTAGTAATAGTTTTAAGTTTATTCACTGCTATATTTG
TTTTCAATAATAGAAATACAAATGATAAATCAAAAGAAATTGCTAAAAATAATGAAGAAATAGTGCCTAA
AAACTTAGAAGCTTTAAGTATAGAACAATTAACAAAAATTAGAGATAAGGCTATTGATAAAAATTTAGAA
GGTCTTAGAGAATTTGGAGAAGATTCAGTAAAACAGCGTAAAGATTCAATTTTAAATTTTGAATTTGGAT
TAGTTGCTTTTGTTAACAAAAATTATAGTAACTTAACAGAAAAAGAGAAATTAATAAGACAAATTAATAT
TGTTAACTATGAAAACTCTATAAATGACATAATGGATCCTTCAGGTTCATTCTTTGAATTAGCAAATCAA
AGTTATGAAATTAATGAGTTCATGTTAAAAAACAAAAAAAATTATAAAGAATGGTCATATGAATATATAG
AATTCTTAATTGATCATTTAGATGAATTATGCAAATTTGTTGATTTTGATATAAAAGATGTAATAGATAT
TATTGATCCTACAATAAAAACAGATCTTTCAGAAGAACAAAAGAAATCTTTGAATGATAAATTAAAGAAA
GTGTCTTCAAGTGATACTTTAAGTGAAGACATTAAGAAGGAGATAAAAAATTGGGAAAACAATTTGAATA
GTTTAAATATGAATAAAAATAATTCTAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3916477-3915224 putative exported protein precursor [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAATAAAAAAAATATAAGTTCAATTATTATGACAATGATTTTAAGCTTATCAACTACTGTATTTG
TTTTCGCTGATGAAAATACTAATGTGAAAGGACAAGATGTAACCAAATATAATGAAGAAATGGTCTCTAA
AAACTTAGAAGATTTAAGTATAGAACAATTAATAGATATTAGAGATAAAGCTATTGATAAAAATTTAGAA
GGTCTTAGAAAATTTGGAGAAGATTCAGTGAAAGAACGTAAAGATTCAATTTTAAACTTTGAATTTGGAT
TAGTAGCTTTTGTTAACAAAAATTATAGTAACTTAACAGAAAAAGAGAAATTAATAAGACAAATCAATAT
TGTTGAGTATGAAAATTCTATAAATGATATAATGGATCCTTCAGGCGATTTTTTCAAAGTAACAAACCAA
AGTTATCAGATTAATGAATTTGTATTAAAAAATGGAAAAAACTATAAAGAGTGGTCGTATGAATATGTAG
AGTTTTTGATTGAGCATTTAGAGGATTTATGTAATTTTGTAGATTTTGATGCAAAATATGTAATAGAAAT
GGTTGATCCTTCAATAAAACCAGATCTTTCAGATAATCAAAAGAAATCTCTAAATAATGAATTAATAAAA
ATGTATTCAAGTAATACTCTAAGTACAAATATAAAAGATGAAATAGAAAACTGGGAAAATAATTTAAATA
TTAATGAGAAAAATTCAAATGAACCTTTACCAAGAGTAAGCCCTTCTAGTTATAGACAACAAGCATTAGC
TTATGCTAAAAAACATGGCTATACTAATGGTTATTATGGTAGTACAAATAGAAAAAATAATGCACCTTCT
CCATATTATAATTTTCAAAAAGATGGATATGGAGATTGTGCTAACTTTGTTTCACAATGCTTACATGAAG
CTGGAGTAACATTCTGGACGAATAATAATCCATGGTATTATTATTCTACTAGTAATAGATCACCTTCTTG
GGCTGGAGCAAGAGAATTTAAAATACATTGGATGAATCGAATTGCATATCAAACACTTACTGTATCAAAC
TCTTTAAGTTTTTTAAGACCAGCAACACCTGTAAGTATATTAAATAGTAGTGGAGTAGCAACTCATACAC
TAATATCTACAGATAAGCATTCAAATGGATATAATTTTTCATATGCTGCACATTCAGATGAAGGTGCAAG
AACAAATTTGTTAAAAAAACTTGAAGGAAAGAAAATTTCTTATTACAAAGTTTATTGGGAATAA
>ref|NC_013316.1|:3916814-3917953 putative regulatory protein [Clostridium difficile R20291]
GTGGTGATTAAACTGACAATAGAAGAATACAAAAATAAATACTCTACTGGAGATAAAATTATACTTTCCT
TAAAGAGTTTTGATAATAAAGAACTATACTATCATGAAACTGATAACATATTAAATTCAAAAGATGAAAT
AGATAGATTAACATCAAGCAAGATATTTAAAATAATAGAAGATAAAAATGATTTAGCCTTAGAGTCTTAT
TATTCTAGTGTAATAGAAGGTGCCTTTTCAACTAGAAAGATTGCAAAATCTATAATTAGAGGAAAGATGA
AACCAAGTAATAAAAGTGAGTATATGATTTACAATAATCATAGAGCCTTAGAATATGGATTAGATAATTT
AGATAAATTATATAGTCACAAATTTATATATAATTTACATCATATATTGGGTGAAAACTGTTTAGATTCA
GAAGAATATGAATATAGAACTGAAAAAGTATATGTATGTGATTCAAAAGGTGAGATTATACATACAGGAC
TTGATCCTTTGAAAATATATAATTTTATGGATGAATTAATAATTTTTATGGAAAATAGTAAAGTAAATGA
TTTAGTAAAGAGTACAATAATTCATTTCTACTTTGTATATGTTCATCCTTTTAGTGATGGTAATGGAAGA
ACATCAAGAGCCTTATCATATCTATATTTAATTAATAAAGGATATGATACTTTTAAAGAGTTTTCAATAT
CATATATAATATCTAAAAACAGAACTAAGTATTATAAGGCTATACTAGATGTAGAGAATAAAGGATATAA
TTTAACTGTATTTATAGAGTTCATGCTAAAGTCTATAATACAATCTATCAATGAAATGCGTGATATGCAT
GATAGGAAGTCTTTAGAGAGTATATTAAAAGAGGAATTATTTGAAAATGATATAACTCTATCAGCAACAG
AAGAACATATATTAAAATATATCTGTAGTAAAGATAATTATTCTATGACATTAGAGAACTATATCAAAAA
GAATAAAGGTAGATACTTAAAGGCTGGAATAAAAGAAATCGAATTAGTTGACCAGTTGATGGAAGTGTTT
AATAATCTTGAAGAAATAGAGATTTTATCTAGAGAAAAGGATGTATATAAAGTTAATGAGAAGTACTTGA
ATATGCTTGAAATAAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:3918286-3918861 hypothetical protein CDR20291_3280 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAAGAAAAAAATAATAAGTTTTTTAATGGCAGGAATATTTGTTTTATCTAGTGGATATAATTTGG
TTTATGCATCTACTTTTGAAGAAAATGAATATAAACAAGAACTTGTTAATGAAAACGAATTTACTATTAT
TAATAGCAATGAAAATGAAATGATTGTGGATAAAAAAGGCAATAACACTTATGTTTCAACAAAAGTTACA
CCTGGTAGTTGGAAAAATGTTAAATATCTAGGTCAAAAATCACGCAAATTAAGTTCTCCTTATACAAGAG
AAAGAATTATACAAACTATTCAATGGGGATTAGGTTATCTTTCTGGAGGGTCATCTTTTTTATTAGGTTT
AGCTGAGAGTATTTATAGAGAAAAAGTATATGACATTACTAAATATGGAGGCGTATATACAAAAACATAC
TATAGGAGACAAATAACTGATATTAGAAACAGTCATGCTAATGTTCCTGTTCCATACAGATATGAATATG
TTACATATTTTTATAGCTCATCTAACTTTAAAAAAGTTGTATATACTGAAAGAGTAGGAGATGGTATAAA
ACTAGCAAATAACTAG
>ref|NC_013316.1|:3919255-3919812 transposon tn21 resolvase [Clostridium difficile R20291]
ATGGTAGTAGGTTATATGAGAGTTTCAACAGCAGAACAAAATGAAGATAGACAATTAGTTACAATGAAAA
AGCATAATGTAGAAAAAATGTATCAGGAGAAAATAAGTGCCAAAGATACTAAAAGATCAAAACTAAACGC
AATGTTAGATTTTGTAAGAGAAGGAGATACAATAATTGTACATGACTTTAGTAGACTTGCTAGAAGTACT
AAAGACTTATTAGAAATAGTTGAGCTCTTAGAAAAGAAACATGTAAAGTTAATTAGTGATAAAGAAAATT
TAGATACAAGTACACCTACAGGAAAACTTATGCTTACAATGCTTGGCGCAATATATGAATTTGAGAGAAC
AAACATGTTAGAAAGACAACGAGAAGGTATCTCTATAGCTAAAGAACAGGGTAAATATAAAGGACGTAAA
GAAGTTAAGATAGACAACTTTGGTAGTTATTATGATAGATATAAAACTAGAGAACTTAATAAGACTCAAT
TGGCTAAAGAATTGGGAGTAAGTAGACCAACATTAGATAGATTAATAAAGAGCCATGAGAGTAACTAA
>ref|NC_013316.1|:3920112-3920855 hypothetical protein; hypothetical protein [Clostridium difficile R20291]
GTGGATAATTTAGAAAGAAATATACAATTAATATTTAGTTATATGGCAAAGACCTTTATAAGAAATGGAG
CAACTATAAGAGAAGCTGAAAAAGAAGCAAATGAGATTATAAAAACTAATTCAAGCAATCTTTGGGGAGT
TAATGGCCTAGCTTATCAGCTTGGAAAAATAAATTTAGAATTTTTCTGTATGTATTTTATACAAGACACA
TATTTACCAAAAGAAGATAATGTTGCTGCTCCTATAGCTAAAGTTCATCATGAGTTATGGGAAGATATAC
AAGAGTCTATAATTGGAGATGGTTCACAGCAATTAGGAAGAATTTATCCAAGAGGAACAGGTAAAAGTGC
ATTTGGAGATTTAGCAACAACTGTATGGTCACATTGTTATAAACATAAGACATATACTTTAATTTGCTCT
GATATAGGCTCTACAGCAGAAAAATTCGTAAAAGATATAAAAAATGCATTACTTGAAAATGAGTATATTA
AAAAAGCATTTGGAGTTCTCTTAAATGATAATGATAGAAAATATATTTGCAATAGTACTCAATTAGAATT
AACTAATAAAACCTTTATTGAAGCAATATCATCTTCATCACCAATGAGAGGAAAAAAATACAATAATAAT
CGTCCAGATCTTATCATACTTGATGATTATCAGTCAGAAGAAAATGTTAGAACAGAAGATGCTAGAGAGA
AAAAATTTAAAAAATTTTCTGATGATGTAAAATATGCTGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:3921309-3921851 hypothetical protein CDR20291_3283 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTATTATGTGACCCAGCATCTGCAGGTGGTTCTAAACATGACTATAGTGCTTTTCTTGTTGGAAGTG
AATCAGAAAATGGTTTACTATGTGGCAGATTGGCAGAACTAGCCAAAATAAATGCTAGAACTGATTTTGA
TAAATATATATTGCATATGATTTATTTATTAAAAGTGTATCCAGATATAACACATGTTTATATAGAAAAA
AATACATTTAATGGTACAGCTGCTAATCAATTAGAACTTAAAATAAAAAATGATGATGTTCTTTACTACA
GAGATATAGAAATCATTAATGAGCACCAAAAGAAAAATAAAGATGATAAAATCTCTACTTTAATACCTGT
TTTAAATAAAGGTCAAATGATTTTTGCAGAAGAGGATAAGGCATTTATACAGCAAATCCTTAATTTTACA
GGACAAAAGTACTCTCTACATGATGATGCACCAGATATATCAGCAGAATTTATAAATAGGATTTTTAATA
TTAAAGTAAATGAAAGTATTACACTATTAGATAGAAGAAATTTAGGTCTTTGA
>ref|NC_013316.1|:3921946-3923151 phage portal protein; subname: full=phage portal protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAAGTATTATAAAGGTGAAACAGATGCTATTAGTAACTATAAAATGGTTACCAAGAGGTCTAATA
ATAAGATAAACACTAATTTCTTAAAAAAGTTTATTAATGAAGAGGTCGCTTATTCTCTTGCAAATAAAAT
CACCTATACAAGTAGATTAGGTGATGAGAAGATTATAAATGATTTAGAATACTATACTTGCCATTGGAGT
AAAAAGCACGATTCAGATTTATTGAGATATACACTATTATTTGGATTTTGCTATGAACTTTACTATGTAA
AAAACAATGAAATGAAAGTAAGAATAATAAAACCAACAGATGGCTGCCATTATGAAAATGAAGATGGAGA
GACCATCTATTTTTTTAGAGAATTTAAAAAAGATTTTAAAGATGATATTTATATAGATGTATATGATAAA
GAATACATATATCATTTTGATTCAAATTTTAAAGAGATAGAAAAACCTACAGTAAATAATATATTTAATG
GTAATGTTCCAATATCAATTTGTAAAAGAAGTGAAGAACTAGGAAAAAATACAATATTCAATGATATAAA
AGGATTACAAGATGCTTATGAAACTAATTTAAGTGATATAAGTAATGAAATTAGTGATTTTAGAAATGCT
TATTTAACCTTCTCTGAATGTAATATTAAAGAAGATGATTTGCCAAGGATGAAAGAACTTGGAATACTTC
AAGTTAATGGAGATGGAAAAATAGAATGGCTTATTAAAGACATGAATGATACATTTGTTCAAAATACACT
ATCTTCAATAAAAGAAAACATATATAAAATTACATCTCATATAAATCACAATGAAAAAATGCAAAGTAAT
ACATCAAGTTTAGCAGTTGTAGCAAGATTAATCAGTACAGAATGGATTTGTAGCCAGAATAATGATAGTA
TTGCAGATACTTTATTTAATAGGTACAAATTATTGTGCATTTGGCTTAATAAAAAATATGGTTTTGACTA
TGATTATAAAGATATTAAGGCTAAATTTACCCCTAAGATACCACATAATGATTTAGTTGTAGCAAATATA
TTAAGTCAACTTGGAGATAAATTATCTACTGAAACCGGATTATCTCAACCAAGTTTTATTGATAATCCTC
ATGCAGAAATGGAAAAGGCTAAAAAAGAACAGGAAATAGTTTCAGAGGGAGAGATTTTATTAGATGAATC
AAAAGATTATAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3924123-3923680 hypothetical protein; flags: precursor [Clostridium difficile R20291]
ATGAATCTTAGAAAAACAGTTATAAGTGGTATGTGTGCTTTAGTATGTTCATCAGCAGTTGCAATACCTG
CATTTGCTGATGAATATCAAGATAAGAATATTGAACAATATTCAGCAGTAAACTATATAGATGATACTAT
GGTGAAAATGTCTTATATTAAGTCTGGTACTTGCAATTTAAGTATTTCAGGAAGTACAGCTAAAGTAACA
TGCTTTGTTAGAGGAGCATCAAATGTTACAAGCACATCAATTATTGCTAGATTACAGAAAAGCAATGATA
ATGGGAAAACATGGTCAACAATCCAAACATGGAATGCTTCAGGAAATATTTCATGTTCTCTTTCTAAGTC
AAAAACTATAGGAAAAGGATATTACAGAGTTCATTCCACAATAAAAGCTAACTCTGAAAGTAAAAATATA
ATAAGTAGTACAAAGAAATATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3924784-3924341 hypothetical protein CDR20291_3286 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGATTATTTGCGTTATTACTTACTTTAAGTTTAGTTATATTACCATCAACTTTAGTATTTGCTA
ATGAAAAAGCTGAAAATGATTCAATTTATGCTGAGGCGCCATTAGTGTTTCAAAGTAATGAAAAAGCATA
TACACATGGTAGTGGAGGAACTGCATATATAGGTTATATGTCAAGTAAACATCTTAATTGGAGGATAACA
TCTTCAAAAGGAATAGTTATACTATTTTCAGGAACTGTTGAGATTAGAAATTCAAAAAATATGCTTGTAG
CATCATATCCAATAAGTGGTGGAGGATCTTCAACTATATCTGGACAAATAGATGTTAAATATCTTAAAAA
AGGGGATTATAAAGCTATATTGAAAGGTACAAGTACAACAGGAGGCGGAGTCTTAGTAGTAAAATCTGGT
CTAGTTCAGATGTTTACAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3925975-3925313 hypothetical protein CDR20291_3287 [Clostridium difficile R20291]
ATGCTTAGAGAAAGTATCCCAATAGCGACAAAAATTATTATTGATGACCTTCTTTCAGATGATGAATTAA
ATCATGTTTTTTCAAAAGGTTTTGAGCGAAAAATGAAAAAACTCATTAAGCAACAAAAAAGAAGTAGTCT
TACAAATAAAATCATTTTTTATTCAAAACAAACAGCTATTGTATTTTTAATAGTTTTAGCTAGTTTACTT
ACTATTACTATGAGTAGTGAGGCATTGCGTTCACGTTTCTTTAGATTAGTAATAAGAGTATATGAAGACT
TAACTTCATTTGTTTTTTCAACTAATGGAGAAGATAATCTTAGTTTAAAAAATAAAGAACCTGAGTATAT
ACCAAAAGGATTTAAAGAAGTTGATAGAGTTGATGATTTTGTTATTACATATAGAAATGATGAAAATATT
GAGATACAATATGTAACAGATAAAATTAGTTCAAATTCTATTATATTAGATACAGAAAATGCAAAAGTTA
AAGATATATTTGTAAATGGGCATAAAGCAAAATATATAGTAAAAGGAACTTTCTTACAGTTATTTTGGAA
TGACAACAACTTTATATATTTATTAAATGTAGATTATCAAAATAGTGGAGAATCTGAATTTTATGAAGAT
ATTTTGATAAAAATAGCGAAAAGTATAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3926549-3926007 hypothetical protein CDR20291_3288 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAATTTATCTAGCTATACTTGAACTCGAAGAAGATAAAATAAAGTTTGAAAAGGTATATGAAAAGT
ATAGACAAATAATGTTTTATGTAGCCAATAAAATATTAAAGGATGATCATTTATCAGAAGATGCAGTACA
TAATGCTTTTTTAAGAATAATTAAAAATATAGATAAAATTGATGAGGTAGACAGTCCAAGAACGAAGGCT
TTTATCGTTATAATAGTAGAAAGGATTGCTATAGACTTTTACAGAAAGAGAAAAAGAGAAAAGGTATCTG
ATATTGAAGAAGAGTATAAAAACAGGGAGATAAATTTTTCTATAGAAGATAAAGTATGTGAAAGTAATTT
AGCTATAGCACTTGCAAAACTTAATGAAAGTTACTTTCAAGTGCTTTCCTTAAAGTTCCAGTATGGTTTT
TCAAATAAAGAAATAGCAAATGCATTAAATTTAGGGGAGGAAAATGTATATAAGAGAATTCAGCGTGCTA
GAAAAAAATTAAAAGAAATATTAGAAGAAATGGAGGTTGGAAATATTGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3927610-3926999 leucine-rich repeat protein; flags: precursor [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATCAAAAGAATTAATCTCCTTTTATCAACAGTGATGGCAGCTGTGATAATATCTTTACCACTTG
CTGTTACAGCAAATGCAATGGAAAAAACAGAATCAGATAATAATGTGAAAATAGAGTTGTCTGACAAAGA
AGTAGAGGAATTACATAATTACTGGCCTGAGGATAAAATTTTTTCAGATGAAAAGATTGATGAGATCTTA
ATTAAAACAGGTCAATTTACTCAAAAGGAATTGGATAAAATCAATCAAGAAGTGGACGATTCTGCTAAGA
AAGTAAATCAAAATTCTCGTGTGAAATATATAAATGGGTATAACAAATACAGAACTTTTACTAAAAATGG
TAAAAACTATTTATATATTTATGTAAGTGGAAAGACATTAAAGAAAATAAAAGCTGGAACAGATCTTGCA
TCTACTTTTGGAGGTTTTTTACCAAAAATTTGGGTAGAGCTTGATGTAGTGGCAATTGGAAAGATAATAA
CAATTAACATGGATGGTATAAATACTAATTATGGGATTGTTTTATCATATATAGAGGATAAGTGGAATTT
TCAGGGTGCAACATATACTTATAGATATGATCATTGGTTCTATCAAACTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3929301-3928087 transposase mutator type [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTAACAAAAACGAAATATTAAAAAAACTTATTGAAGAATATGATGTTAAAACAACTACAGATATTC
AAGATATGCTAAAAGATTTATTTGCAAGTACAATTCATCAAATGTTAGAAGCGGAGCTTGACGACCATTT
AGGTTATGATAGATATGACAATAAGAATAAAAATACTAAAAACTCTAGAAATAGATATAGAAATAAAAAT
GTTAAATCAGATTTTGGAGAAATAACTTTAAATATTCCAAGAGATCGAAATGGAGATTTTGAACCAAAGG
TAATTAGAAATTATGAAAATGATATATCAGGAATAGAGAACCAAGTGATTGGAATGTACTCAAAAGGTAT
GTCTACTCGAGATATATCAAGCCACCTTAAGAGTATTTACGGAATTGATATATCTCATTCTCTAATAGCT
AAAATTACTGATAGAGTTCTACCTTTAGCTCATGAATGGCAAAGCAGAGCTCTTGATATGGTTTATCCAA
TTGTATTTATGGGTGCTATACATTATAAAGTTAGAAGTGAAGGTAGAATAATAAACAAAGCTGCATATAT
AGCCATAGGTGTTAACTTAGAAGGTATAACGGAGGTCTTAGGAATATGGATTGGAGAAAATGAAAGTTCA
AAGTATTGGCTAAAGGTGCTTACAGATGTCAAAAACAGAGGAGTTAAGGATATATTAATAACTTCTGTAG
ATGGATTAGTTGGATTTTCTGATGCAATTAAAGCAGTATTTCCTGATACTGAAATACAAAGATGTGTTGT
ACATCAAATTAGAAATACTTTAAATTATGTATCATATAAAAATAGAAAAGAATTTGCAAAAGATTTAAAG
AAAGTATATGCTGCAATTACAGAGGAAGTAGCATTAAGTGAGCTATCGCTCTTAGAGGAAAAATGGGGTA
ATCAATATGCGATAGCATTAAGAAGTTGGCGAAGTAATTGGAATGAGCTAGCAACATACTTTAAATATCC
TCAAGAGATAAGAACATTGATATATACTACAAATTCAATGGAAAGTTACAATAGATTATTAAGAAAAGTT
ACTAAATCGAAGTCTATTTTTCCTTCAGATGATTCTTTGCACAAATCATTATACTTAGCAACTATGGATA
TTTCTGAAAGATGGACTCAAAAGATTAGAAATTGGACTCAAATCTTAGCTCATTTAAGTATTTATTTTGA
AGAAAGAATTTTAACTCTAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3930645-3929488 putative exported carboxy-terminal processing protease [Clostridium difficile R20291]
ATGTATCTTGTGATTTCAAAGAAGAAAGCTATTTTTTTAGGGGTGATTTTAGTAATTATAACAGCTATGG
TTACATCAGCATTTCAGTTGACATTGGGGAATAAAGTTGTAATATCGAAAGAACTCTATGAAGACTATAA
AAAATATGATAAGTTGTTAGGACTAGAATCTATTATAAAACAAGATTTTTATAAAAAAGTATCAGATACT
GATTTGGTAAATGGAGCAGCAAAAGGTCTATTTCTAGGAACAAATGATAAGTATTCTGGTTATTATACTA
AAGATGAAATGGAGAATCTAATTAATGATAGTGAAGGTTCTTATGTTGGTGTAGGTATGTATATAGGGGC
ATCAAAAGATGGTGGCTTAGTAGTAGTTCCCATGAAAGATTCTCCAGCAGAGAAAGCAGGTGTAAAATCA
GGGGATAAATTAGTAAAAGTCAATGGAAAATCTGTCTCATATAAAAATTCAGATGAAGCTGTTCGTATGA
TGAAGGGTAAAAAAGGGAAAACAGTTGAACTGACTATATTAAGAGAAGATAAACAATTGAACTTTAAAGT
AAAAACAGACCAGATAATTGAGAAGAGTATAGAAAGTAAAGTAATTGATAATGATTTAGGATATATAGAA
ATTACCCAATTTATATCAAGTACATATACTGACTTTGATAAAGCTTTAAAAGAATTAAAAGCAAAAAATA
TCAAGGGATTAGTAATAGACCTTAGAAATAATCCTGGTGGAATGCTAGATATATGTAAAGAAGTTGCTGA
TGAGTTAATTGGTGAAGGAACTATAGTATATACAAAAGATAATAAGGGAAATACTGAGTACTTGAAATCT
GATAAAGAAAAATTGGGACTTCCAATAGTAGTGTTAACTAATGGAGAAAGTGCTTCTGCTGCTGAAATAT
TAACAGCTGCAATCGTTGATAATAAAGAAGGTATTTCTGTAGGGACTACAACTTTTGGTAAAGGGTTGGT
ACAATCAGTTGTAAGATTGAAGGATGGAACAGGATACAAGTTAACTACTGCTCAATATTTTACACCTAAT
GGAGATTATATCAATGAAAAAGGCATAAAGCCTACTATTGAAGAAAAAGATGAAAATAAACAGTTAGATG
TAGCGACTAAATGGCTTAGAGAACAGATTGATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:3930799-3931368 putative 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase [Clostridium difficile R20291]
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ATTCAAATTTAATAACTGAAAAATTACTTCAAATGGAAGATATAAGAAATGCAACTAATATAATGCTTTA
TCTAAATTTTAACAATGAAGTTCAAACAGATAATTTAATCAAAAAACTTTTGTCTCTAAAGAAAATAGTA
TCAAGTCCCATCACAATAAAAGAAAATCATACATTAATCCCTACTCAAATAACAGATTTAAAAGAGGGAT
TGAGAATTGGAGCATATGGAATAAGAGAACCTAACGAAAAATCACCTACAATTGATATTAAGGCCTTAGA
TGTTGTAATTGTACCAGCTGTAGCATATGATATACATTGCTATAGATTAGGATATGGTGGAGGATTTTAT
GATAGATTTTTAGAAAACTTAAGAAAAGATGCTATAACTATTGGCATAGCATTTGACTTCCAGATATTCG
ATTCTATTCCAAAAGAAACTCATGATGCACAATTAGACTACATAGTTACTGAAACTAGAATTATCACTCC
AAATAATTAG
>ref|NC_013316.1|:c3931984-3931550 hypothetical protein CDR20291_3293 [Clostridium difficile R20291]
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TATTCGTTATAGGGGGATTTATATTCATACCAAGTATGTTTGTAGAGAAATCTAAACCCATAGATTATAC
AGTATTACAAAGAAATTCAATACCAGAAAAGATATTAGATGTGATGGATAAGTATACAAATGAAGAAAGA
GCATTAGCGGCTAAAATCGATAACAAAATATACATTATAGTGACTAGAGGAAATAATAAATATGGTATAG
AAATGGACAAAATAGAAAGTGTGGTTGAGGAAGGAAAGGATGTTTTGAGAGTCAAGATAAAGTATAAAGA
TAAGGAAGATTCTTTTCCATACATAGTTGTTGAAACAAATATGAGTGAACTTCCAGATAGAATAGAATTA
AATGCGACGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3933286-3932192 hypothetical protein CDR20291_3294 [Clostridium difficile R20291]
ATGTCAGAAAAAGTAAATGTTAAAACAGTCATCAGTTTCGCAGGTGCGTATGTAGCAACAGTAATCGGTT
CTGGATTTGCAACAGGACAGGAAATAATGCAATTCTTCTCTTTTTATGGTTTTGCAGGTATTATTGGTGG
GATAATTTCAATGGTATTATTCTCATGGATGGGTGCTTCAGTTATGTCAAAAGGTAAAGAGCTTCAACTT
AAAGAACCTATCAAAATTTATCGTGTTTATTGTGGTAAGTATTTAGGGATATTCTTTGAATGGTTTGGAC
CTTTATTCTTATTTGGTGTTTTCGTAGTAATGATTTCAGGAGCAGGAGCAACTTTAACTGAATACTATGG
ATTAAATCCATTTGTAGGTAGAGTAGGTATGGCAGTAGTAGCATTATTAACTGTTTCACTAGGTCTTGAT
AAATTATCAAAGATACTAGGTGGAATAGGGCCTATAATAATAATCTTTACACTTTTAGTTGGTGGTATAA
GTTTAGCTAAAAACATAGGTAATATAGGAGAAGCTGCACAAGTTCTTAGCACTGTAAAGATAGCTAAACC
AGTTCCAAATGCCTATCTATCTGGTGTAATATATACTACTTATAACACAATTGTTGTTATGGCATTCTTA
ACTGGATTAGGAGCAAGTGCTGCTAACAAAAAAGAAGCTATTTGTGGTGGTATATTAGGTGGAGTAGCAC
TTATGGCTGCAGCTATAATGATGCACTTAGCTATTCTTTCTGATATAGGAAACTTATATTCAAAAGCAAT
ACCATCATTATTCTTAGCAGATAAGATTTCACCAGTAATTGGAGTTTTATTCTCAATAATTCTTATATTA
GGTATATATACAACAGCTGTACCTTTATTATGGTCAGTAACTAATAGATTTGTAGATGATAAACATCCTA
AGTTTAAATTAATAACTTTAATAGCAGCTATATTAGGTCTTATAGGTGGCTTCCTACCATTTGATAAGCT
GGTTGGTATTTTATATCCATATACTGGATATATGGGCGTCATAATACTGGTTTGTGTTCTTTATAGACAG
ATTACAAAAACATCTGGATATCAAGAAGGAATCAGTGACAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3934641-3933709 transketolase, pyridine binding subunit [Clostridium difficile R20291]
ATGGCGACGAGAGAAGCATATGGTAAAGCATTAGTAAAATTAGGTCAAATAAATGACAATGTTGTAGTAT
TAGATGCAGATTTATCAAAGTCTACAAAAACACATGATTTTTACAAGTCATTTCCAGATAGATTTTTTAA
TATGGGTATAGCTGAACAAAATTTAATAGGCGCTGCTTGTGGATTATCAACTGCTGGTAAAATACCTTTT
GCAAGTACTTTTGCTATGTTTGCTACGGGAAGGGCTTTTGAGATTATAAGAAATTCAGTTTGTTATCCAA
AGCTAAATGTAAAAATATGTGCTACTCATGCAGGTCTTACTGTTGGAGAGGATGGAGCATCTCATGAAAG
TGTGGAAGATATTGCTATAATGAGAGCTATACCAAATATGACAGTTCTTGTTCCAGCTGATGGAGTTGAA
ACAGAAAAAATTATTTTTGAAATAGCTAAGTATAATGGACCTGTTTATGTTAGATTAGGGAGAAGTTCAG
TACCAGTTTTATTTGATGAAGATTATAAATTTGAAATAGGAAAAGGTACAGTCTTAAGAGAAGGAAAGGA
TGTATCAATTATAGCTTGTGGAATTATGGTAAATGAAGCTCTATTAGCACAAGAAAAGTTGCAAGAAGAA
GGTATAAATGCTAGAGTTATAAACATGTCCTCGATAAAACCTATAGACAAAGATTTAATATTAGAATCAG
CAAAAGAAACGAATGCTATTGTAACTGTAGAAGAACATAGCATAATTGGGGGATTAGGTTCTGCTGTAAG
TGAGGTAGTAGGAGAGTCTTGTCCAACCATTGTAAAGAAAGTTGGAATTAAAGATACATTTGGAGAATCT
GGTACTCCAAATGAATTGTTAAAAAAATATGAATTAACTTGTGATGACATAATAAAGACTGTTAAAGAAG
CTATTATTGCAAAAAGAATGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3935470-3934643 transketolase, thiamine disphosphate-binding subunit [Clostridium difficile R20291]
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GAGCCAAATCTGGACATCCAGGAGGGTCATTATCAGTAGTTGAAATACTTACTGCGTTATACTTTGATGA
AATGAATGTGGATTCTTCAAATCCTAAAATGGAGGATAGAGATAGATTTGTATTATCAAAAGGACATGCT
GCACCAGCATTATATGCTACATTGGCTGAAAAAGGCTATTTTGATAAGGAAGAACTGAATGGATTAAGGA
AGATAGGAAGGATGTTACAAGGTCATCCAGACATGAAAGGCACGCCAGGTGTGGAAATATCTACTGGTTC
TTTAGGTCAAGGTTTTTCAGTAGCATGTGGTATGGCTATGGCATCAAAGTTGGATAATGCTCCGTGGAAT
GTGTATACTTTGCTTGGTGATGGTGAGGTTCAAGAAGGAATTGTTTGGGAAGCTGCTATGAGTGCTGCAC
ATTATAAACTTGATAATTTAATTGCTTTTTTAGATAATAATGGACTTCAAATAGATGGAGATATAGAAAG
CGTAATGAGTTTAGGTTCAATAGTTGATAAATTTAAAGCTTTTGGTTGGAATGTAATTGAGATAGATGGA
CATGATTTTGACCAAATATTTGCGGCTCTTGATATAGCTAAATCAACAGTTAAAAAACCTACAATGATAG
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AAGTGATGAGGAGCTAGAAAAAGCCTTGCTTGAATTAGGAGGTGCTGACAATGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3936003-3935641 putative regulator of cell growth [Clostridium difficile R20291]
GTGAGTACTAATTGTGAAATAAAGCGTGGTGATTTATATTACGCTGATTTAAGTCCAGTTGTTGGTTCAG
AGCAGGGAGGCGTTAGACCTGTTCTGATAATACAAAATGATGTAGGTAATAAATATAGTCCTACAGTTAT
AGTATCAGCTATAACATCTCAGATTAATAAAGCCAAATTACCTACTCATGTAGAGATAAGTTCCAATGAA
TATGGGCTTAATAAAGACTCAGTAATTCTTTTAGAGCAAATTAGAACTATCGATAAAAAGAGACTGAGGG
AAAAAATTGGTTGTCTAGATGAAAATATGATGATAAAAGTAGATGATGGACTTCAAATAAGTTTAGGATT
GTTTACTTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3936280-3935993 CopG-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
GTGTACGATAAGAGTAAAGAAAAAATAGAAGTTACTTTACCTGACTCTCTGATTTCTGAAGTTGATAGTA
TAGTTCAGATGGAGAACAGTAACAGAGAAGATTTTGCAAAAGCTGCTTTTCAGTTCTATATAACTCAGAA
AAAGAAAATTCATATTAAAGAATCTATGAAAACGGGTTATAGAGAAATGGGTCAAATTAATCTGTCACTA
GCTGAATTAGGTATGACAGTTGAAGAAGTATCTTCTGATGATAAAAATGAAGGGAAGATTGCCCAAGGTG
AGTACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3937470-3936313 alanine racemase [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAAAAATAACAGTGCCTACATGGGCAGAGATAAATCTAGATAACTTAAGATTTAACTTAAATAATA
TTAAAAATTTATTAGAAGAAGATATTAAGATTTGTGGAGTAATAAAAGCTGATGCATATGGACATGGTGC
AGTAGAAGTTGCAAAATTGCTAGAAAAAGAAAAAGTAGATTACTTAGCAGTAGCAAGAACTGCTGAAGGA
ATTGAACTTAGACAAAATGGCATAACACTTCCTATTTTGAACTTGGGATATACTCCAGACGAAGCTTTTG
AAGATTCTATAAAAAATAAAATAACTATGACAGTTTATTCTTTAGAAACAGCACAAAAGATAAATGAAAT
TGCAAAATCTTTAGGAGAAAAAGCCTGTGTTCATGTTAAAATAGACTCAGGGATGACTAGAATAGGTTTC
CAACCTAATGAGGAGTCAGTACAGGAAATAATAGAATTAAATAAATTAGAATATATCGATTTAGAAGGTA
TGTTTACTCATTTTGCTACAGCTGATGAAGTAAGTAAAGAGTACACTTATAAACAAGCTAATAATTATAA
ATTTATGTCTGATAAATTAGATGAGGCTGGTGTAAAAATAGCTATAAAACATGTATCAAACAGTGCAGCT
ATTATGGATTGCCCTGATTTAAGATTAAATATGGTAAGAGCAGGAATAATATTATATGGTCATTATCCAT
CTGATGATGTATTTAAAGATAGATTAGAATTAAGACCAGCCATGAAATTAAAATCAAAAATCGGACATAT
AAAACAAGTTGAACCAGGTGTAGGAATAAGTTATGGACTAAAATACACAACTACAGGTAAAGAAACAATA
GCTACAGTTCCAATAGGATACGCAGATGGATTTACTAGAATCCAAAAAAATCCAAAGGTTCTTATTAAGG
GAGAAGTGTTTGATGTAGTTGGTAGAATATGTATGGATCAAATAATGGTTAGAATTGACAAAGATATAGA
CATAAAAGTTGGAGATGAGGTTATACTATTTGGAGAAGGCGAAGTTACAGCTGAGCGTATAGCTAAAGAC
TTAGGAACTATAAACTATGAAGTGTTATGTATGATATCAAGAAGAGTTGACCGTGTTTATATGGAAAATA
ATGAGCTTGTACAAATAAACAGTTATTTGCTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3938075-3937485 putative lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
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AACGACAGTCCACAAAAGAAGAAGTATACAAAGATTTTCAAAAGCAGATTTCTGATATGAATTATTACAG
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AAAACCGATAACTATAAATTAGAAGTAATTTCCCCAAAACATTTAAAAGGGAAAAGTATAGAATATCAAG
GTGATAAAATATTAGTTAAAAATCCAAAGATTAGTGATGTAGTGGAGTTACCTAATACAGGAAAAAATAA
TCAATATCTTTTTGTAGGAGACTTTATAAAAAACTATCTTCAAAATGAGGAGATGAAAGTAAAGTTATCC
AAAGGACATTTGGTTTTAGAGACTTTTATTCCTGGGGATAATAAATATTTTAACAAGCAAGTATTATATG
TAAATGCTGACACAAAAAATCCTGAAAAAATGGAAGTGTTAGATAAAGAGGGAGTGCCAAGATTTACAGT
AAAATACAAAGATTTTGAATACAGAAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3938557-3938096 hypothetical protein CDR20291_3301 [Clostridium difficile R20291]
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CAGATGTAGCTAATATGCTAATTGCAGAAAAAATAGGAGGTCTGCCAGTTGTAGATTCAGAGAATAGAGT
TGTTGGAATAATTTCTGAAACAGATATTCTTAAAAAAGAAAAATATATAGAAGCACCTCTCTATATAAAT
CTATTACAAGGATTGATTTTCTTAGATGACTTAAAAAAAGTTGAAAAAGATATAAAACAAGTAGCTGCTT
ATAAGGTTGGAGAACTTATGTCTAAAGATATAATAAAGGTTCATGAAGATGATAAGTTTGATGATGTAGC
TAATGTAATGATTAAAAAATCAATAAACAGAGTTCCTGTAGTAGATGATGACAACAAACTTAAAGGTATA
ATTTGTAGATATGATATAATAAAAGCTTTATACAATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3938952-3938572 holo-[acyl-carrier protein] synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATATTTGATATTGGCGTAGATATAATTGAAATTGATAGAATAAGAAAGGCTGTAGACAAAAATA
ATAGGTTTTTGGAGAAGATATTTACAGATAGAGAAATAGAGTATTTTAATTCTAAGAATTTTAAAGCAGA
AAGTATAGCAGGTAATTTCGCAGCCAAGGAAGCTATAAGTAAATCTATAGGTACAGGAATTAGATTGTTT
AATTTTAAAGATATAGAAGTTCTCAGAAATGAAATGGGAAAACCAATAGTAAAAACTTATAATAATCTAG
CAAAAATGTGCATAGATTATAATGTTTTAGAAATAAAAGTTTCAATATCACATTCAAAAGATTATGCTAT
AGCAAATGCGATAACCATAATTAAGGACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3939674-3939414 ATP synthase epsilon chain () [Clostridium difficile R20291]
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TAGTAGTTAGAACTACAAAAGGAGACAAAGGGGTGTTGAAAGGTCATATACCATTTGTTTCAGGTATACC
TGTAGGAACTTTAAAGATAAAAAAAGAGGGAAGTTTTAAAGAGGCGAAAATAGCAGAAGGATTCATTAAT
GTAACTCAAGATAAAACTGTCATATTGACAGAATCTGCTGAGTGGATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3941071-3939677 ATP synthase beta chain [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAAATGTAGGTAAAGTAGTACAGATTGTAGGAGCTGTACTAGATGTTAAGTTTGATAGTGAACAAA
GCCTACCTAACTTATTAAATGCGTTAGTAATAAAGTTAGGAGATAAAGAAATAGTTGCAGAAGTTGCTCA
ACATATAGGTGATGATACTGTAAGATGTATAGCTATGAGTGCAACGGACGGACTTGTAAGAGGTATGGAA
GTTGTAGATACAGGAGGGCCAATAAGTGTCCCTGTTGGAGATGAGACTTTAGGTAGAATATTCAATGTTC
TTGGAAAACCAGTTGATGGGAAACCAGCTCCAAAATCTGCACCTAAATTACCTATACATAGACCAGCACC
GGCGTATGATGAACTAGAAACTACAGCAGAGATACTAGAAACTGGTATTAAGGTAGTTGACTTACTAGCT
CCATATCTAAAAGGTGGAAAAATAGGTCTATTTGGAGGAGCAGGAGTAGGAAAGACAGTTCTAATACAAG
AGCTTATAAACAATATTGCTAAGCAACATGGTGGTATTTCTGTATTTTCAGGAGTAGGAGAAAGAACAAG
AGAAGGTAACGACCTTTATGGCGAAATGAGTGAGTCTGGAGTTATAAATAAAACAGCTCTAGTATTTGGT
CAAATGAATGAACCACCTGGAGCGAGAATGAGAGTTGCTTTAACTGGACTTACAATGGCAGAACATTTTA
GAGATGAGCAAGGACAAGACGTTTTACTTTTCGTTGATAATATATTCCGTTTCACACAAGCTGGTTCAGA
AGTTTCAGCACTTCTAGGACGTATGCCATCAGCTGTTGGTTATCAGCCAACATTAGCTACTGAAATGGGT
GCACTTCAAGAGAGAATAACATCAACTAAGAAAGGTTCAATAACATCTGTTCAAGCAGTATATGTACCAG
CAGATGACTTAACTGACCCAGCACCAGCTACAACATTCTCTCACTTAGATGCAAAAACAGTTTTATCAAG
ACAAATATCATCACTGGGTATATATCCAGCAGTTGACCCTCTTGAATCTACATCAAGGATTCTTGACCCT
AGTATAGTAGGAAAAGAACATTATGAAGTAGCTAGAGGTGTACAATCAATACTTCAAAGATATAAAGAAC
TTCAAGATATAATTGCTATACTTGGTATGGATGAATTATCTGATGAAGATAAGTTAATAGTTGCACGTGC
TAGAAAGATACAAAGATTCTTATCTCAATCATTCACAGTTGCTGAGCAATTTACAGGAAATCCAGGTCAA
TATGTTCCTGTTAAAGAGACTGTAAGAGGATTTAAAGAAATTCTTGAAGGGAAACATGATGACTTACCAG
AGTCAGCATTCTTATTTGTAGGAACAATAGAAGACGCTGTTAGAAAAGCGAAGGGAAGTATGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3941926-3941084 ATP synthase subunit gamma [Clostridium difficile R20291]
ATGGGAACTGTTGAAAGTACAAAGCAAATAACTAAAGCAATGGAATTAGTTGCATCTTCTAAGCTTAGAA
AAGCAAAAGAAAAGGCTGAAGATTCAAGAGAATATTTTAATACTTTATACAATACAGTAAAAGATATTGC
CCAAACAACACGTGGAATTAGAAATGAATTTTTAAAAGAAAGAGAAGTAAAAAATAAATGTTATGTAGTA
GTAGCTGGAGACAGAGGACTTGCAGGTGGATACAATTCCAATGTATTAAAGGAATCTGTCTCTCATATGA
AAGGTAAAAAGGAAACAGTGATTACTGTTGGAAAGAAAGCACATGAATTTTTTTCTAAAAGAAACTACAA
TATAGCAAAAGATATAAATAGTGTTGAAGCTTGTGGATATGAAGATGCGACAGAAATTTCACAAACTATT
ATTGACCTGTATAAAAAAGGTGAAGTAGATGAAGTTTATATTGCTTATACAAAATTTAAATCTGCTTTAT
CACAAGAAGTTGAAATTTTGAAATTGCTTCCATTAGTCTTTGAAAAAGATACAGACGAACAAGGAATGGC
AGTAAAAGAAGAAAAACAAAATAGATCAAAAGTACAATATATACCATCAGCAGAAGCAGTTTTAAGTTAT
ATTGTACCTCAGTTTATATCAGGTACAGTATATGGTGGAATTTTGGAATCTTTTGCATCAGAGCAAGGTG
CTAGAAGAACTGCAATGGAATCAGCCACAGACAATGCGAATGAAATGCTATCTAATTTAGAGTTAAGTTA
TAACAGAGCAAGACAGTCAGCTGTAACTCAAGAAATAACAGAGATAGTTGGTGGAGTTGAAGCTCTAAAA
TAG
>ref|NC_013316.1|:c3943492-3941990 ATP synthase alpha chain [Clostridium difficile R20291]
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AGTTGACAGATACAGGTAGTGTTTTAACAGTTGGGGATGGTATAGCGAGTGTATATGGATTAGAAAAAGC
TATGTCTGGTGAGTTGCTAGAGTTCCCAGGTGAAATATATGGTATGGCACTTAACTTGGAAGAAGAAGTA
GTTGGAGCTGTTATCCTTGGAGATGACAGTGAAATAAAAGAAGGCGATATAGTTAAGAGAACTGGAAGAA
TAGTTGAAGTTCCAGTTGGAGAAGCTTTAATAGGTAGAGTTGTAAACTCACTAGGTCAGCCAATAGATGG
AAAAGGACCTATAGCGTACACAAAAACTAGACCAGTTGAATCTGAGGCACCTGGTATAATAGATAGAAGG
TCTGTTTATGAACCATTACAAACAGGAATCAAATCAATAGATTCAATGATACCAATTGGTAGAGGTCAAA
GAGAGTTAATAATAGGTGACAGACAAACTGGTAAAACATCTATAGTTATTGACACTATACTAAATCAAAA
AGGAAAAGATGTTATCTGTATATATGTAGCAATTGGACAAAAACGTTCTACTATAGCTCAATTAGTTAGC
TCTTTAGAAAAAGGTGGAGCTTTGGATTATACAATAGTAGTTTCAGCAACAGCATCTGAATCAGCACCAC
TTCAATATATAGCACCATATGCTGGAGCAGCTATGGGTGAAGAATTTATGTACAATGGGAAACATGTACT
TATAGTGTATGATGATTTAAGTAAACAAGCTGTTGCATATAGAGAAATGTCATTGTTACTTAGAAGACCA
CCAGGACGTGAGGCATATCCTGGAGATGTATTCTATTTACATTCAAGATTACTTGAAAGAGCAGCTAAGT
TATCTGATGAATTGGGTGGAGGTTCAATGACTGCCTTGCCTATAATAGAAACTCAAGCTGGTGACGTTTC
TGCATATATACCAACAAATGTTATATCTATAACAGATGGTCAAATATACTTACAACCAGAGTTATTCTAT
TCAGGTGTAAGACCAGCAGTTGACCCTGGTATATCAGTATCAAGGGTTGGTGGTTCTGCGCAAATTAAAG
CAATGAAAAAAGTTGCAGGAACATTAAAACTTGCATATTCACAATATAGAGAACTTGCAGCATTCTCACA
GTTTGGTTCTGACTTAGATGAAGATACTAAAAAGAGACTTGCTCAAGGTGAAAGAATCGTTGAGATATTA
AAACAAGGTGAGCATCAACCAATAAAAGTTGAAAATCAAGTTATGATAATATATGCTGTTATAAATAATC
ATTTAGAGGATATTCCGATAGATAATATAGCTAGATTTGAATCAGAATTGTATGCATTTGTAGATAATAA
TTATCCGGAAATATCAAGAAAAATATTAGGTGGAGAAGACTTCACTCATGATTTAACAGATGCAATAAAT
GAATTTAAAGAAAAGTTTGTTGTTGAAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c3944054-3943509 ATP synthase subunit delta [Clostridium difficile R20291]
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ATGTCTTATTCAAAGAACTAGAAAAAGTAGTAGATATGATGACTAAAGTTAGTAAAGATTTCTACAAAGT
TTTAAAATCACCATTAGTTTCAAAATCAGAAAAGAAAAACTTGGTAGAAATTATTTTTAGTAAGGAAGTA
AGTTCTAACATAAAAAACTTTTTAAAAGTTTTAGTAGATAAAGATAGAATATCATATTTAGAAGATATCG
AATTAGCTTATAAAGAATTATTAAATAAGAAAAACAATGTAATTGATGGAGTAGCAATAAGTGCTATTCC
AATGAGTGAAACAGATATTAAAGAACTTGAAGTCAAACTTTCAAATAAATACAACAAAAATGTTACTATA
GAAAATGTTGTTGACAAGACTATACTAGGGGGAGTTCTAGTTAGAATTGGAAATGAACAAATAGATGGCA
CTGTGAAAACTCGTCTTGATAAGATGAAAGAAAAGCTATCTGAAGTAATATCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3944566-3944051 ATP synthase B chain [Clostridium difficile R20291]
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ATACTTTTATAATATTTTTACTTCTGAGAAAGCTTTTATTCAAGCCAGTATTAAATATAATTGAATCAAG
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CAGAGCAGAAATCAGATGATATAGTAAATACTGCAAAGAAAGATGCTCTTGATATAAAAGAAAAAGCAAA
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TAAAAGAGGTAGGGGAAGCTAAATGA
>ref|NC_013316.1|:c3944931-3944671 ATP synthase C chain [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAACAGCAATAGTAGCGGCAGCATCAGCAATAGGAGCAGGGATAGCAGTTGCAACAGGTATAGGTG
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TGATATAACATCAACTTTATTACTAGGAGTTGCTATAGCAGAGTCTTCAGCAATATATGGTTTGGTTATA
TCAATAATACTTCTATTCGTAAATCCATTCTTTAAATACTTAGGAATGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3945704-3945000 ATP synthase A chain [Clostridium difficile R20291]
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TAATGGCCTTTTTAGCGATAGCATCTTATTTTTTGACTAGAAACTTAAAAAAAGTTCCAACTAGTAAAGT
TCAAATATTCTTAGAATTTGCAGTAGGTGGTCTTGCTAAAATGGTTACAGATGTTATGGGTAAAAATACA
GTAAAAAGAATGCCATATATGATACCATACATAGGAAGCTTGTTTTTATTTTTCGCATGTTCAAATTTAA
GCCCATTACTTGGATTAAGGTCACCAACAACCGACTTAGACACAACTGCTGCATGGGCAATGATTACATT
TTTTATGATTTATTTTGCAGGAGTTAAATTTAAGGGGTTATCATACTTTAAAGAATTGGCTCAACCACTT
GCCATAATGTTACCAATCAATATTATAGGTGAGTTAGCTAGACCAATATCATTAAGTTTCCGTCCATTTG
GGAATATTTTAGGTGGAACAATAATAATGGGTCTGTTTTATCAACTTTTAGGTTTTATATCTAGTTTAAT
ACCAGGATTATCAATACCAATTGGAGAAATATTAATACCAGTCCCATTACACTTGTACTTTGACTTATTT
GCAGGATTGTTACAAGCATATATATTTATAATGTTAACAATGGTATTTATATCAAGTGCAGGAGAGTTAG
ATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3946093-3945707 ATP synthase protein I [Clostridium difficile R20291]
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CAAGCTTATGCATCAGCACAATATGCTATTAGATTATTTATAATGGCAGTTGTTCTAATTGCATCAGCTA
CAGTACCACATTTAAATATAATCGGAACAGCATTGGGATTATTGAGCACAAAGTTTGTCATATTATCAAA
AAACTTTATAAATAAATTAAAGAGGAAGGAGGCATAA
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TTGTAATATCAATATTAGGATGTACTTTCTTAGGAAAATTTTTAGATAGTAAATTGAATACTACTCCAGT
TCTGACAATAATATTTTTATTGTTGGGTGTTGGAGGTGCTTTTAGTGGTGTTTATAAAACTCTAATAGTA
TATACACGAAGGAAGTGA
>ref|NC_013316.1|:c3946947-3946510 putative cytidine and deoxycytidylate deaminase [Clostridium difficile R20291]
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GAAGACAAGTAGGAGCTGTAATTGTAAGAGACAAACAAATATTAACAACTGGATATAATGGTTCTCCGAG
AAATCTTGAACACTGTGAAAATATTGGATGTAAGAGGCAGGAATTAAATATTCCCTCAGGAGAAAGGCAT
GAATTATGCAGAGCATTACATGCTGAACAAAATGCGATAATACAAGCTGCTCATAATGGTATTAGTGTAG
ATGGGGCAACTTTGTATGTTACTACAAGACCTTGTGTTTTGTGTGCAAAAATGTGCATAAATGCAGGTAT
ATTGAAAATTGTTTATGAAGGTGATTATCCAGATGATATGTCTACAGAATTATTAAAAGAAGCAGGAATA
GAACTCATAAAATTTTAG
>ref|NC_013316.1|:c3947988-3947173 hypothetical protein CDR20291_3314 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGAATTGTATAGCAGTAAGAGGGGCTGGAGATTTAGCAACAGCAGTTATTCATAAATTACACAACA
GTGGTTTTAAAGTAGTTGCGTTAGAAATAGAAGAGCCATTAGCTATAAGAAGGCAAATTTCTTTTTGTGA
GGCTGTTTATGAAAAAAAAGTAACTGTTGAAGGTGTAGAATGTATATTTTGCAATACTGAAAAAGAAATA
GAAGAAGTTTTATCTCAACATAAAGTAGCCTTGATTATAGACCCAAAAGGAGAAAAATTATCTAAGTTAA
ATCCAATCGTTTTGGTTGATGGAATACTCGCTAAGAAAAACTTAGGTACAACTAAAGATATGGCACCACT
TACAATAGCTTTAGGTCCTGGATTTTGTGCAGGAGAAGATGTAGATGTTGTTATAGAGACAATGAGAGGT
CATAATCTAGGAAGAATAATAACTAATGGTAGAGCAGAAAAAAATACAGGAGTACCAGGAGCAATAAAAG
GTTTTTCTAAAGAGAGAGTTATGCATTCACAGTATGATGGTATAATGGAAAATGTATGTAAGATAGGTGA
TATAGTTGAAAAGGGAGACCTACTTTGTTATATTAATAATTATGAAAAAAAACATGAAGTTAGAGCAACA
ATATCTGGAGTCCTTAGAGGTTTATTAAAGGATGGAGCAAAGGTGAACAAAAATTTAAAAATACTAGACA
TAGACCCTAGAAAAGAAGAAGTTAAGAATGCTTTTACAATATCAGATAAAGCTAGATGTATAGCTGGAGG
GGTTTTAGAAGCCATACTAAACAATGGGATTTATCCCCAAAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3948917-3948288 uracil phosphoribosyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCAAAGTGGTAGAGACAAACCATCCATTAATACAACATAAATTAACTTTAATGAGAGATAAAAATA
CTGGTTCTAAAGACTTTAGAGAGCTTTTAACTGAAATTGCAATGTTAATGGGGTATGAAATAACAAAAGA
TATACCATTAAAAGATGTAGAAATAGAAACTCCTATTCAAAAAACATCATCTAAAGTAGTTGCAGGTAAA
AAATTAGCAATAATTCCAATTTTAAGAGCAGGTCTTGGAATGGTAGATGGATTAGTAAGCTTAATGCCAG
CAGCAAAAGTTGGACATGTAGGACTATATAGAGACCCAGAAACATTAAAACCAGTTGAATATTATTGCAA
GCTTCCTCAAGACATAGGAGAAAGAGATATAATAGTAGTTGACCCTATGCTTGCAACAGGGGGTTCTGCT
GTAGCAGCTATAGATTTACTTAAGTCTAAAGGAGCTAAAAGTATAAAATTAGCTAATTTAGTAGCTGCAC
CAGAAGGTATAGCAGAAGTGCAAAAATATCATGATGATGTTGATATATATGTTGCATCAGTTGACGAAAG
ATTAAATGAACATGGATATATAATTCCTGGTCTTGGTGATGCTGGAGATAGATTGTTTGGAACTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3949405-3948953 ribose-5-phosphate isomerase 2 [Clostridium difficile R20291]
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GTAAAGGTATAGAATGTGTAGATTATGGAACTAATAATGCTACAGATTCTGTTGATTATCCTGTTTATGG
AGAAATAGTTGCAAATTCAGTTATAAATAAAGAAGTAGATTATGGAATATTATGTTGTGGTACAGGGATA
GGAATATCTTTAGCTGCTAATAAGGTTCCTGGGATAAGATGTGCAGTTGTATCAGATGTATTTTCTGCAA
AAATGTCAAAAGCACATAATGATGCAAATATGTTATCATTAGGCGAAAGAGTTTTAGGAAAAGGTCTAGC
ACTTGAGATAGTTGAAGCATGGATTAATACGGATTTTGAAGGTGATAGACATGCTAGAAGAGTAAACATG
ATTAAATCAATAGAAGAAAAACATAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3949871-3949422 low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase [Clostridium difficile R20291]
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CAATTAAAGAATCTGGAAGAAGTATTGAAGAATATTCGATATCATCAGCAGGTATATCTACAGCAAATGG
AATGGGTGCTTCTGAAAATTCTATAGAAGTACTAAAAGAAATCGGTATAGACTTATCAAATCATAGAAGT
AAAGTAATTACTAAAAAATTAATTGATGAATCAGATATAATACTAACAATGACTAAATCTCATAAAGAAA
TTTTAGTACAAGCAGTTCCAAAATGCAAAGAAAAAGTGTATACTTTTAAAGGGTTTGCAAATAAAAATGA
GGAAGATATATCTGACCCATTTGGTGGAAATTTGGATATTTATAGAAGCACTATGAGAGAAATAATGTAT
TCTGTCAACGAAATAGTAAAAAAAATATGA
>ref|NC_013316.1|:c3950949-3949888 hypothetical protein CDR20291_3318 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGCAGGCATACAAAAGATGAAAACTATTATAAGTAATATTGATATAAATAATATTGATTATGAGG
AAATAAAAATACAAGCAAAACTTCTTAGAGAAGGTAAAACAGTTATTTTTCCAACTGAGACAGTATATGG
GTTGGGTGCAAATGCATTAGATGAAAATGCAGTAAAGAAGATTTATGAAGCTAAAGGAAGACCTAGTGAC
AATCCATTGATAGTCCATATATATGAAAAAGAAGAAGTATATGACTTAGCCAAAGATATAAGTGATAAAG
CTAAACTTGTTATAGAAAAGCTTTGGCCAGGACCTATAACAATTATATTAAATAAAAAAGATATAATTCC
ATACAAAACTAGTGGAGGGCTTGATACAGTTGCAATAAGGATGCCTTCTAATGTTATTGCCAGGGCAATA
ATAAAAGAAGCTGGTATACCTATTGCAGCTCCTTCTGCAAATATCTCAGGTCGCCCATCTCCAACAAAAG
CAAAACATGTATATGAAGAGATGAATGGAAGAGTGGATGGAATAGTTTTAGGAGGAGACAGTAATTTTGG
ATTGGAGTCAACTGTATTGGATTTAACAGAAGAGACTCCTATGATACTGAGACCAGGAAGTATAACTAAA
GAAGTTTTAGAGGAACTTCTTGGAGAAGTAAAGCTTGACCCATCATTAAGTAAAAAAGAAGATAATCAAA
AAGCTAAAGCTCCTGGAATGAAATATAAACATTATTCTCCAAATGCAGATGTATATATAATATCTGGAAA
AAGAGAAAATGTAGCAACAAAGATTAATGATATGATAAAATCTAATAGAGACAAAGGTCTAAAGACAGGT
GTAATGTGTATCAGTAGAAACCGAGAGTTTTATGATGGAGAAGTAATCGATTTAGGAAACTCTCTTGAAG
AAGTTGCAAGTAATCTGTTTGATGCTCTTATAGAAATGGACAAAAAGGGCGTTGATGTCATATATTCAGA
AGAGTTCCCTAAGACTGGAGTTGGACAAGCAATTATGAATAGACTACTGAAGTCAGCAGGATACAAAGTG
ATAAAGGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3951637-3950957 putative zinc transporter precursor; putative zinc transporter precursor [Clostridium difficile R20291]
ATGATACTAAAAGTAACAATAATTGGGCTTTTGGCAGGTGTTATAGGGACAGGATTAGGAGGAGTAATAT
CAGCCATTTTTAAAAGAGAGGTCGATAAATATCTAAGTTTTTTTATGGGATTATCTGGTGGAATAATGTT
GGCTGTAGTGGTGTTTGATTTAATGAAAGAATCCATGGACAAAATGGGGATAATCAATACAGTTATATTT
ACGTTTGTTGGAGCTCTCATAACTATGTACATAAAAACAAAATTAGATGTGTCTGGAAATATGGCATCTG
GATATCTTATATTCATAAGTATATTACTACATAATTTACCAGAAGGACTAGCCATTGGTTCTTCTTTTAT
GTCAACTGAAAGTTTAGGTATTACACTTGCTATAGTTATAGGTCTACATAATATACCAGAAGGGTTAGCT
ATGGCATTAGGCTTAGTTTGCAATAAAATGAAACTAAGTAAAGTTATTTTGTTTACTGTAATAGCTGGAT
TACCTATGGGTCTAGGAAGTTTTTTAGGTGTTTATTTTGGAGGAGTATTTACTTCTCTTATAGGAGTATT
TCTTGCTACAGCAGGAGGTACTATGATGTATGTTGTATTGGAAGAAATTTTTCCACATTCAAAAAGTGTG
TATTGTATAATTGGTTTCTTGTTAGGTACAATGATTGTAAATTATATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3952830-3951766 peptide chain release factor 1 [Clostridium difficile R20291]
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TAATAAATGATCAAAAAGTTTGGCAGAAATATATAAAAGAACATGCTGACTTGGAACCTATTGTTATGAA
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GAAGAATTAAGAGAATTAGCTAAAATGGAGTTAGCTGAGATGGAAGAAAAAGTAGCACCTCTGGAGGAAG
AAATAAAAATACTATTATTGCCTAAAGACCCTAATGATGATAAGAACGTTATAGTTGAAATTAGAGGTGG
AGCTGGAGGAGATGAAGCAGCTCTATTTGCGGGTGATTTATTTAGAATGTACTCAAGGTATGCTGAAAGA
AGAAGATGGAAAATAGAATTATTGAGTGCAAGTGATACTGGAGTTGGTGGATATAAAGAAGTATCTTTTA
TGATAAAAGGTAAAGGTGCTTATTCAAGATTAAAGTATGAATCTGGAGTTCATAGAGTTCAAAGAATACC
ATCAACTGAATCTGGTGGAAGAATACACACATCAACTTCTACTGTTGCAGTATTACCAGAAGTTGAAGAT
GTAGAGGTTGAAATAAATCCAAATGATTTAAGAATAGATGTTTTCCGTTCTTCGGGTAATGGAGGACAAA
GTGTCAATACTACTGACTCTGCTGTTAGGGTAACACATATACCTACAGGTGAAGTAGTATCTTGTCAAGA
TGGAAAATCACAATTAAAAAATAAAGAGCAAGCTTTAAAAATATTAAAAGCTAGACTTTACGATAAAGCA
TTGGCAGAACAACACAAAGATATAGCAGCAGAAAGAAAAAGCCAAGTCGGAACAGGAGACAGGTCAGAAA
GAATAAGAACATATAATTTCCCTCAAGGTAGAATAAGTGACCATAGAATAAATTTAACTTTATATAAGTT
AGATGCATTTTTAGATGGAGATATAGATGAAATGATAGATGCTTTAATTACTGTTGACCAAACAGAAAAA
ATGACTGCAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3953722-3952874 protein methyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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ATACAGAGTTATTGTTACAAAAAACATTGGGTGTTGATAGATTATATATTCACTTAAATCTGAATAAAGA
GCTAACTGAAGAACAAAAAACAAAATTTATGGGTTTTGCAGAAGAAAGATTAAATGGAAGACCAATAGCA
TATATAGTTGAAAATAGGGAGTTTATGGGATTAGATTTTTTTGTTAAGGAAGGCGTATTGATTCCAAGAC
CAGATACAGAAACTTTAGTAGAAGAAATAATTGAAATATGTAGAGAAAAAAAAGATGTAAGTATATTAGA
TATAGGAACTGGTTCTGGAGCTATTACAATAAGTTTAGCAAAGTACATTGAAAATTCTAAAATCATGTCT
TTTGATATATCAGAGACAGCATTAGAAATAGCTAAAAAAAATGCTATTATAAATGAAGTTGGTGAAAAAA
TAAAGTATATTAATTCTGATTTATTTACAGCAATAAGTGATAGTAACATAAAATTCGATATCATAGTTTC
AAATCCACCATATATTAAAAAACAAGATATAGAAACTCTGCACAAACAAGTTAAAGATTATGAACCATAT
AATGCTCTTGAAGGTGGAGAAGATGGATTAGACTTTTATAGAAGAATAACAGAACAAGGTAAGAAATATT
TAAATAAGTGTGGAATATTAGCATATGAAGTTGGTCATAATCAAGCTGAAGATGTAATAAATATTATGAA
AAGTAATGGATATAAAAAAATATACACAAAGAAGGATATTCAAGGCATTGATAGAGTTGTTATAGGTTAC
AATATATGA
>ref|NC_013316.1|:c3954633-3953740 hypothetical protein CDR20291_3322 [Clostridium difficile R20291]
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CGGTAGCTGTTAGAAAAAGTGACGGAGAAATAGCACTAAAAGAAGATAGAATAAAAAGTTGGGTAAGAGA
TAAGAATATAGATAAGATACCTTTTGTTAGAGGTTCTTTTGTTATGATAGATACAATGATTCAAGGGATA
AAAAGTTTAAACTTTTCTTCAGAGTTTTTTATGGAAGAAGCTGAAGAGGATAAATTTGATTTATTTATAA
AGAAAATTTTTAAAGATAAGGCAAATGATATAATTATAATATTTTCATTGGTCATAGCAATGTTACTTTC
TGCTGGATTATTCATTTTTATACCTACATTGGTAGGAGGAGCTTTTTCTAAAGTAATGCCTAATGATTTT
ATGCTTAATTTAATAGAAGGAATCATAAGGATAGCTATATTATTTGCATATATAGTATTGATTTCACGAA
GTAAGGATATAGAAAGAGTCTTTCAATATCATGGAGCAGAACATAAATCTATATATTGCTATGAAAATGA
TTTAGAACTTACAGTAGAGAATGCTAGAAAATTTAAAAGATTACATCCTAGATGTGGTACAAATTTCCTA
TTTATAGTTATGGCTGTATCAATAATATTGTTTGCATTTTTTGGTTGGCCAAATCCAATTCTTAGAATAT
TTATGAGAATTATATGTGTGCCTATAGTAGCAGGTTTATCTTATGAGGTAATTAGAGTTCTTGGGAAATA
TGATAATGGATTTACTAAAATTATTGCATATCCAGGAATGATGTTGCAATATTTTACAACAAAAGAGCCT
GATGATGAGCAATTAGAGGTTGCTTTGGAAGCATTGAAAGCAGTAGTAGATTAG
>ref|NC_013316.1|:c3954978-3954778 50S ribosomal protein L31 [Clostridium difficile R20291]
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CTGGTTCAACTAAGGACGAAATAAAAGTTGAAATATGTTCAGAGTGCCATCCATTCTATACAGGAAAACA
AAAGAACATAGAAAAAGGTGGAAGAATCGACAAATTCAAGAAAAGATTCAAAATGGACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3956735-3955131 transcription termination factor Rho [Clostridium difficile R20291]
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TACGAGAGATAGCTAAAGAATTAAAAATAAAATCAATTACTACATATAAGAAAAATGAGTTAATTGAGAT
TATAAATTCCAAAAGTAAAAATGAGGAAAAAGTAAACGAAGAGACTAAAGAAAAAAATGAAGATATTAAA
GAAGACATAAAGAATAGAAAAGAAAATATAGAGCGTGAAAGTATAGAAAAAGAAGTTGAATATAAGAGCC
CTACCAAATCATACAACAAGAAAGAAATAGATACCCAAAATATTTCCCAAAACCAAGAAAATAGAAATCA
AAGAAATGACTATAATAAGACAACGAGTGTAAATGATAGTAATAAGTCATCAAATATATCTAATAGAATG
GTCAGAAATAATAATAAAAACTATTATATGCCTAAACAAGTTGATGAATCTAAGATAGTAGATGAATTTA
ACACATCAAAAGAGGATGAAGTAGTAGGTGTACTTGAAATTCTGCCAGATGGATTTGGTTTTTTAAGAGG
TTCAAATTATTTGTCTACTGAAGGAGATGTTTATGTTTCACCATCTCAAATAAGAAGATTTAATATGAAA
ACAGGAGACAAGATTAAGGGAATAACTAGACATCCAAAAAGTGGAGAGAAATTTAGAGCACTTTTATATG
TTCAAAAAATAAATGATGAAAACCCTGACACAGCTATACAAAGAAATGCGTTTGAGACATTAACACCAAT
ATTTCCAGAAGAACGACTTACACTGGAAACTAATAGAAATGAAATAGCTACAAGAATTATAGATTTAATT
TCACCTATAGGAAAGGGACAAAGAGGATTGATAGTAGCACCTCCAAAGGCTGGGAAAACAGTTCTTTTAA
AAAGCGTTGCAAATAGCATAGCTAAAAATCATCCAAATGTTGAACTTATAGTACTCCTTATAGATGAAAG
ACCAGAGGAAGTTACTGATATGAAAGAATCTATTGAAGGAGACGTTATATATTCAACTTTTGACCAAGTA
TCAAGTCATCATGTCAAGGTTGCAGAGATGGTGTTAAATAGAGCTCAAAGATTAGTTGAACATGGTAAAG
ATGTAGTAATTTTACTAGATAGTATAACTAGATTGGCAAGGGCATATAACCTTACAATATCTCCTACAGG
TAGAACTTTATCTGGAGGTATTGACCCTGGTGCACTTCATGGACCTAAAAAGTTCTTTGGTGCAGCAAGG
AATATTAGACAGGGTGGTTCTTTGACAATATTAGGAACAGCATTGGTTGAAACTGGTTCTAGGATGGATG
ATGTAATATTTGAGGAATTTAAAGGTACAGGAAATATGGAGCTACATTTAGATAGAAAATTAGCAGAAAA
AAGAATATTCCCTGCAATAGATATTTACAAGTCTGGTACAAGAAGAGATGATTTATTGCTTGATGATGAA
GAAAAGACTGCTCTTTGGAGATTAAGAAGAGAAATGAGTAATAATTCAGTAATGGAAATTACAGATAAAG
TCATTGAACTTATAAAGAGAACTAAGGACAATAAAGAGTTTGTAAAATCAATAAAGAATTTGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3958200-3957235 utp--glucose-1-phosphate uridylyltransferase (general stress protein 33) [Clostridium difficile R20291]
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AGGCACAACCAAAAGAGATGTTACCAATAGTTGATAAGCCAACTCTACAATACATAATAGAAGAAGCTGT
GGCCTCAGGAATAGAGGAAATACTAATAATAACAGGTAGAAATAAAAAATCTATTGAAGACCACTTTGAT
AAATCTGTAGAATTGGAACTTGATTTAGAGAAAAAAGGTAAGAAAGAATTGTTGGAGGTAGTACAAAACA
TATCTAACATGATTAACATACATTATATAAGACAAAAAGAGCCAAAAGGATTGGGAGATGCAATTTATTG
TGCGAGGCATTTTATAGGTGATGAGCCGTTTGCAGTAATGTTAGGGGATGATATTGTAGATAATGATGTA
CCTTGTCTAAAACAACTAACAGATGCATATGAGGAATATAGAACTACAATATTGGGTGTTCAAAAGGTAA
ATCAAGAAGATACTAATAAATATGGGATAATAGAAGCAAAAAATATAGAAGGTAGAGTTTACAAGGTAAA
AGACATGGTAGAAAAGCCAGAGTCAGGAAAAGCTCCTTCAAATATTGCTATTTTAGGTAGATATATAATA
ACTCCTGAAATCTTTGATATTCTTAAGGATTTACCACCAGGTAAAGGTGGAGAGGTACAACTTACAGATG
CTTTAAAAATATTATCTAAGAAAGAAGCTATGTATGCATACAATTTTGAAGGCAAGAGATATGATGTTGG
GGACAAGCTAGGATTTTTAGAAGCTACTGTTGACTTTGCTCTAAAGAAAGAAGACCTTAAGGAAGATTTT
ATAAAATATTTGAAACATGTATGTAGTGAATTTGATAAAAATAACAATGTGTTATACAATAATACAGATG
AAAAAATAGATTTAATTGAAGTCAATGAAGCTAGAGAACTTGAAATTCAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3960206-3958314 putative oligopeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAGAAAATTGTGCAAAGCAATAATACCTTTATTTATTTCTATTTTTTGCATGTTAATAATAAGTA
TAAAAGCTGACCAAGGATATCAAAAGAATAATGACAGAGCAATTGCTGTCATGAATAATAATGATACTGA
AGATGATGCTGAAAAAAAACAAGAAGTAGACTATGAAAAAACATGTTGGAATTTGCAATCTTTGTTCAAA
AGTGATGACCAATGGAAAAAAGAACTTAAGAGTTTTGATAAAGATACTAAAGAGTTGAAAAATTACATAG
GTAAAGTAACAAAATCGCCAACACATTTGTCTTTTGCCTTAAACATTAAGGAAAAACTTGATATAAGACT
AAATAAACTTTCTGCCTATGTAAAATTAAAACAAGATACTAATAAAAATTCATATAAGTACTTAGATATG
AGTGATAGTATGAGTAAATCATATGGGAATTATATGGGGATTTGTTCAGATTTAGAATTAGAAATACTAA
AATTATCAAACAAAGATTACAAGAAAATTATTTCAAATAAAAATATAAATAGGAAATATGGTGCATATTT
AAGAGATATAAGAAGGAATAAAGTACATTATTTGGATGATAAATCAGAAGATATTCTAAGCAAAGTATCT
TCAATAAGTAGTCTTCCAAGCCAAGTATATGAATTATTTAGAAATATGGATAGAAAAACTAATTTGACAC
CAGCGCAATATGCAAGTGAATTAGAGTCAGTAGATAGAGAAAATAGAAAAAAAGCTTATCAAGATGAACT
TATAACTTACAATGATAATATAAATACAATTGCAGGTTTAATTACTGGTCAAGTTAAAAAGAATATTTTT
TATTCTCAGGAAAGAGGTTATGAGTCTTCTTTAGAAATGTACTTGGAATCTGATAATGTAGATGAAAAAG
TATACAATAATTTGATAAGGACTGTAAATAGTAATATGGACAGTCTACACAAATATATAGATTTAAGAAA
AAAAGTATTAAAATTAGATAAGGTTCATTCATATGATATGTTTGTGCCTATGGTTAAGGCTGTTGATAAT
AATATTAATTATGAAAAGGCACAAAGTATAGTATATTCAGCGTTGTCACCTTTAGGAAAAGAATACAATG
ATGTAGTATATAAAGCTTTCAATGAAAAATGGATAGATGTTTATTCACATGAAAATAAAGTAAGTGGTGG
ATACTGCTTATCTGTTTATGAAAATCATCCATATATACTTTTAAATTATAATAATTCATTAGGTTCAGTT
TCGACTTTATCACATGAGCTTGGACATGCTGTATATGAATACTTAAGTTCTAAGAATCAGAATTATTTTA
ATTCAAATCCGTCTATATTTACTCACGAAGTTGCATCTACAACGAATGAAGCATTACTTTACGAGATGCT
TATAAAAGAAGCTAAAGGCAATGATGAAAAAGCTTATTATATAACACAGTATTTAGACTTGATAAAAGAT
ACTCTTTATACACAAACTATGTATGCTGAATTTGAAAAAACTATACACGAGTTAGTAGAAAAAGGAAAAA
GTGTAAACGCATTAGTATTAAATGATGTTTGGGGACAACTTCTTAAAAAATATTATGGACAAAGCTATGA
ATTAGACCAATTATCTAAGGTCGGATGGGCTAGAATCCCACATTTTTATAATAGTTTCTATGTCTATAAA
TATGCTACAGGTTGTAGTGCAGGAGTAAGTTTTGCCCAAGACATCCTAAAGAATGGTTCAGATAACTATA
TGAGCTTTCTTAAAAAGGGAAGTTCAGATTATCCAATAAACTTGTTAAAATCAAGTGGCATAAATTTAAC
TAATACAAAACCCATAGAAAATACAATCAAAAAATTTGATAGTTTAGTAGCAGAACTTGAAAAGCTATTA
TAA
>ref|NC_013316.1|:c3962929-3960557 stage II sporulation protein e [Clostridium difficile R20291]
ATGCAAAGAAGTGTAGCAGTTGTGAAGAATAAGACTGTAAAACCAAATGTCATAAAATTAATAAGCGGAT
ATATTGATTTTACTACGGCGGCATTCGCTGTGATGGGATTTTTACTTAGTAGGTCTATTATAGTAGACTC
TGTAGCTCCTTTAGGAATTGCCTTTTTTATATGTGCATCAAAGATTGATAAGTACAAGATACCTGTATTC
ATATCAACATTATTAGGAATATTGTTATCATCTAATGATTTTGGAAATGTAGCAAAATATGCTGTGTGCC
TTACAATATTTATGGCTATGAATAAAAAATTAAAATTATCAGATTCAATTGCTAAGGTTGCATTTATAGG
TGCAATAATACTACTTCCAATCTCCATGGGACAAGCTTTCTTTTCAAATAGGTATGTATATGGTCTTCTT
ATAGCAGGAGTAGAAGCAATAATAATGTTTATATCTATATATGTGTTTTCTTATGGGATAGGTTTAATGG
CCAATGTCAACAATAGGATGTCTGTACGGACAGAAGAAGCTATATCAATAAGTTTACTGCTAACCTTTAG
CATAATGGGAATAGGAGATATATCTCTGTTTGGAATATCAATAAGGACCATTTTATCGACCGTATTGATA
TTGCTGACCTCAATAGTAGGTGGAGCTACCATGGGAGCATCTAGTGGTGTAATTATTGGTGTAGCATCCA
TTTTAAATAATATGACATCAGCTGTTTATATGGGGATATATTCTTTTTCAGGATTAATAAGTGGAGCATT
TAATAAAATAAATAAATATTTCTGTATACTAGGATATATTCTAAGTTGGACAATAATATACCTATATACT
TCTGGTATTACTTCTAATATGATGCAATTAAGAGATATACTATTAGGTTGTTTGATAGTACTAGTATTGC
CAGAGAGATTATTTAATAAGATTGAAAAATTAATAAAAAGTAATGTGGCTTCAAATGAAATCGTATACGA
TTATATTATGAGAAGCAAAAACCTAACTAATAGCAGATTGAACAGTATTTATAAAACTTATGATGACCTT
GCAGATACATTTGATAAGATAAGAGAAAAAGACAAAGTGCTAGACCAAAGAGATATAGCTAATGTAATAG
ATATGATTCATAATGATGAATGTAAAAGTTGTAGTATGAGAAGAATGTGCTGGGAGTCAAGATTTAATCA
TACATACACTATGATATATAACATTCTTGAAAAAATTGAGGAGAAAGGGGAGTTAAGTCTAAACGATATA
CCTAAAAATTTTAGAAAGGAATGTATGAAACCAGAGTCGATAGTGAAAATATCAAATCACTATTACAAAA
TGTTTGTATTAGATTATGATTGGAGTGTGAAGTTTTCAGAAAGTAGAAAGTTAATAGCAAATCAGATAAG
AAGTATTTCAAAATCCATTAAATCCTTATCTCAAGATTTAGAAGGTGACATAATGCTAGATATAGAAAAG
GAAAAAAATATATATGAACAGTTAGAAAGATATGATATAACAGTTGATAAAGTAAGTTACTTAACAAAAA
GTAACAATGAGTTTGAAATATCAATAGAAAAGAAAACTTGTCATGATGGATGTATGTGTGAAGATAAAAT
TGTAAATATAATTTCAGACCTAGTAGGTGAAAATATGTCTGTTAGAAAAATAGGATGTCACTGTTTAGGA
GGTAAATGCAAGGCAACATTCGTTAAATCTCAAAAATATAAGGCTGTTACAGAAGTTTCAGCAATGTCAA
GGGATGGGCATATCCTTTGTGGAGACAATTACACATACATGGAGATAAATGATGGTAAATACATGATGGC
TATAAGTGATGGTATGGGAAAGGGTAAAAAAGCATATGAAGAATCTTCTGCCACTATTGATATACTGGAA
AAAATGATAGATGCAAAAATTAAAGATGAGATAGTCATTGATACTATAAATAATATGTTGTTGTTAAAAT
CTTCAGAAGAGATGTTTTCAACTCTGGATTTGGGAATTTTAGATTTAAAACGAGGTTGTTTAGAAACTAT
AAAGATGGGAGCGTGTTCTACTTATATAAAAAGAGAGGATGGAGAAGTTGACTTAATATCATCATCATCA
TTACCTGTGGGTATATTATCAGATGTAAAAATTGATAGAAAAAATGTAAAAGTTAAGGAAGGAGACTATG
TTATAATGGTTTCTGATGGAATTGTAGATGCAGGAAGAAATAACAATTTAGGAGACAATTGGTTAATATA
CTTCTTAAAGAATATAGAGACTACAAATCCAAAGGAAATTTCAAATTTAATATTGGATAGAGCATTAGAG
TTACAAGCGTTACAAATCGAAGATGACATGACTGTTTTAGTTACGAAAATATGTACAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3963939-3963019 putative exopolyphosphatase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTAGGAGCTATAGATATTGGGACAAACTCAATGAGATTACTGATAGCAGATTATAGAGATGGGA
ATTTTATAAACAGAAAAAAATTTGTTAATACAACTAGAATCGGTTATGGTGTGGATAGTAAAGGATATAT
AAAAGAAGATGCTATCAAAAGAAATATAAAAGCATTAAAAGAATTTTCTGATAAGTGTAATGATGAAAAG
TGTGAAAAAATTTATTGTATGGGGACATCTGCTCTTAGAGACAGTAAAAATGGAGATTACTTTGTTAAAT
TAGCTAAAGAAGAAACTGGAATAGATGTTGATATAGTTACGGGAATAGAAGAATCAAATTTGGGCTTTAA
GGGTGTTTTAGAAGGAATACAAGGTGATGATACTATTATTGTTATAGATATTGGAGGAGGTTCAACAGAA
TTTATTGTAGGTGATTCAGAAGGAATTAAATTTAATAAAAGTGAGAATGTAGGTGCTCTTAGGATGACAG
AGAGGTTTTTGAAGCACGATATTATTGAAGATGAAGAGTTTGAAGCTATGAGTTCATTTATATATGATGA
GATTGACAAAACGTTAAATCATATAAAAGACAGAGGATTAAAAACTCTTATAGGTATAGGAGGTACGATT
ACATCATTATCAGCAATGAATCAAGAATTAGAGATTTACTCTATGGAAAAAATACATAATAGTAAAATAC
ACAAAAAAGAAATAGAAGAAATTCTACAAAAATTAATAAAGATGACATTAAGTGATAAAAAGAACTTAAA
AGGGCTACAAGAAAAACGTGCGGATATTATAACTGCTGGTGTAAAAATATTGAATATAATAATGGAAAAA
TTAGAAATAGAAGAAATAACCGTAAGTGAATACGATAATTTGGAAGGCTTAATATGTCAAAAGTCAAAAA
AAATGTATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3964336-3964052 putative septum formation protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAACTTAAGAAAAAAATTTTCAGGACAGATTATTGTTATCAGTTTATTTTTAGGAATATCAATTTTTA
GTATGATGACAGGATTTGTATTTGAGTATACAAAAGCTAAGGAATATAAAAAAGAAATAGCAAGTCTAAA
TAAACAATTAAAAAAGACTGAAATACAAATAAACAGCTTAAAGAAAGATGAAAAATCATATGAAGGAGAC
TTAGAGGATATAGCAAGAAAAAGATTGAATATGGTAAAACCAAATGAAACAGTTTATGTAGACATAAATC
GTTGA
>ref|NC_013316.1|:c3964875-3964342 hypothetical protein CDR20291_3330 [Clostridium difficile R20291]
ATGATACCTTTTACTCAAGATGTAAGCATTTTTTATGCTACTATTTATGGTGGAATACTCATAGGGGTGT
TGTTTGATTTTTATAGAGGGCTAAGAGGGAATTTTAAATTCATCAATTATTTTGCTATAATCTTTGATGT
ATTGTTTTGGTTTCTAGCTACGGTTATAATATTCGTAACAATAAACCTTACAGAATTTTTTGATTTAAGA
TATTATCATTTTGTGGCTTTGTTTATTGGTTTTATTTTATACTATAACACCATAAGTAAAATTGTTTTAT
CAATTATCAATAAAATAATTCGTTTTGTGAGAAATTCTTTTAAAAAAGTTACACATTACATAGTCAGTTT
TTTAAATAATTTGTATTACGTTATAATCTATTCACTACACCTACTATTTGATATTATATTTTATATACCA
AACATATTTATAGCAACAAGAAAAAGTATAAAAAGAAAATCAAATAAAAAATTAAAGAACAAGAAAAAAT
CAAAACCTAAGAAGAAAAAAAATAAAACTAAAAAAAGGGTGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3965130-3964876 hypothetical protein CDR20291_3331 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAACAGAACATAACTTTGAAAGATAGATCAAAGCTGGTTATTTCGGGAGTCGAGCACATATACTCTT
TTAATGACAAAAGAGTAGAGCTCAAAACTTCTGTAGGCGAGATGGTAATTGAAGGCGAAAACCTAGATAT
GAGCAAGCTAAGTATAGACGAAAATATAATTAGCATAGATGGAACTATAAATTCTATGGTATATGCAAAG
CCTAAAAAGCCACAAGAGAGTTTCTTGAAAAAGGTATTTAGATAG
>ref|NC_013316.1|:c3965443-3965192 putative RNA-binding protein [Clostridium difficile R20291]
GTGATAATTATGAGATTAGATAAATTTTTAAAAGTATCTAGGATTATAAAAAGAAGAACTGTTGCTAAAG
ATGCATGTGATAAAGGGATTGTCACTATAAATGGAAAAGTTGCTAAATCTTCTTCAGAGGTGAATATTGG
AGATACATTAGAAATACAATTTGGAGAGAAGAAGATGAAGTTTAAGATAAATGAAGTAAAAGAGCATGTA
TTAAAAAATGATGCAAAAGAAATGTACGAAATTTTAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3965784-3965506 DNA-binding protein HU [Clostridium difficile R20291]
GTGAATAAAGCTGAATTAGTATCAAAGATGGCAGAAAAAAGTGGATTAACAAAGAAGGAAGCAGAAGCTG
CGTTAAACGCATTTATGAGTTCTGTTCAAGATGCACTAGTAAATAATGAAAAAGTTCAATTAGTTGGATT
TGGAACATTTGAGACAAGAGAAAGAGCTGCTAGACAAGGAAGAAATCCAAGAGATCCAGAGCAAGTTATA
GATATACCAGCTTCTAAAGCACCAGTTTTCAAAGCTGGAAAAGGATTAAAGGATATAATAAATGGATAA
>ref|NC_013316.1|:c3967348-3965873 putative bifunctional protein [include tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methylase and nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase] [Clostridium difficile R20291]
GTGAAATTTGCTAATAGGAGTGATGTTATGGGTAAGATAAGTATTGTAGGTCTTGGACCAGGAGACTATT
CTCTTATAAGCCAAGGTGTGTTAGAATCTTTAATAAATAGCCCTAAAGTTTTTTTTAGAACAGAGAAACA
TCCAATAATTGATAAACTTAAAGAAACTATACAATACACTTCTTTAGACTACTTTTATGAAAAAGAGGAA
AATTTTGATAATGTTTATTTGAAAATATCTGAATTTATCATAGAAGAATCAGCAAAGGGTGACCTAGTGT
ATGCTGTTCCTGGTCATCCAAGAGTTGCAGAGAAGACTGTAAGTATAATAGAGAGATTAGCCAATGAAAA
GCACATAGCAGTAGAAATATTGCCTTCTATGAGCTTTGTAGACGCTATGTTTAACTATTTGGCTATAGAC
CCATCTGAGGGATTTAAACTGGTAGATGCTTTTGAAATAGAAAATTCATATATAGACTTGGATACAAGCA
TGATAATAACTCAGGTATATGATAAATTTATAGCATCTAATGTAAAGTTAAAACTTATGGAACATTATGA
CTATAATCAAGAAGTATGTATAGTAAATGGAGCAGGTGTCAAAGATTTAGAAAGTAAAAAGTTTATAAAG
CTTTGTGAATTAGACAGAAATGAAAACTTTTTTGACTATTTAACTAGCTTATATATACCCAAAAGTTCTA
AAAAGATGTATAATACAGTACATGACTTAGAAATAATAGTTAATACACTTAGAAGTCCATCTGGATGTGA
ATGGGATAAAAAACAAACACATCAATCATTAAAAAATTCTGTTATAGAGGAAGCATATGAACTTTGTAAT
GCAATTGATAATAATGATATAGATGAAATGGTAGAAGAGTTAGGTGATGTTCTTTTACAGGTTATATTCC
ATTGTCAGATAGGAAATGAGGAGGGCTACTTTGATTTAAAAGAAGTAGTAAATGGCATATGTAAAAAATT
AATTCATAGACATCCTCATATATTTAGTGGTGCAAAATTAGATATGTCTAAGTTTGAGAAAACTTGGGAA
GAATTAAAGAAAGAAGAGAAAGGCGAAAGTACTATAACAGATGGCCTTAGAAGGATACCAAAACATTTAC
CAGCTCTTATGAAGGCTAGTAAAGTTCAACATAAAGCAGCACTTGTCGGCTTTGATTGGGACAATGTAGA
AGATGTATTTAAAAAAATTGAAGAAGAATATCAGGAATTACTTGACGAACACAGGGTCGGGAATATAAAA
TACATAAAGGAAGAGCTAGGCGATTTATTATTTTCGATAGTAAATCTAGCTAGATTTTTAGACATAGACT
CAGGAGAAGCCTTGAACTGTACTACAGAAAAATTCATAAATAGATTTGACTTTATAGAAAAAAGTGCAAT
GAACTTGAATAAAAAATTAGAAGACATGACACTTGAAGAGATGGATGAGTTTTGGAATCAGGCTAAAAAA
CAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3969041-3967428 stage V sporulation protein B [Clostridium difficile R20291]
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TAAAAATAATGGGTGGATTTTTTAGGATTCCCCTTGGAAACATGATTGGTTCAGAAGGAATGGGATACTA
TCAGGCTGCTTATCCTGTGTATACTCTATTTTTAACATTAGCTACTGCTGGATTTCCAACAGCTGTGGCA
AAATTGGTTTCGGAAAAAGTTGCAATTGGAAATTTTAAAGGTGCAAATAAGATATTTAAGGTATCACATA
CAGTTTTATTCATTACCGGTATAATATCATTTTGTATATTATTTTTTGGAGCCGACTACATAGTAACAAA
CGTAATGAAAAATCCAGGTGCGTTATACTCTATGAAAGCCATTGCTCCAGCATTACTATTTGTTCCTGCA
ATGTCTGCATATAGAGGATATTTTCAAGGGAGACAAGATATGACTAAGATTGCTGTGTCTCAAGTTGCAG
AGCAATTTTTTAGAGTTGTATTAGGTCTTACTTTGGCCTACTTGCTTATGAAGAGTCTAGGTCAGACTTT
TGGTGCAGCAGGTGCTATATCAGGGGCTACAATAGGTTCAATAGCATCTATGCTTTATTTGGTGTTTGCT
TATATGCTAGGGAGAAAAGAGCGTAGAGCAGAGATAGATGCAAGCCAAAGATTTAAAGATGAAAGAGTGT
CTTATATTTTTAAAAAGCTTTTAACTGTTGCCATTCCTATAACAATAGGAGCATCAGTAATGCCACTTGT
AAATATGATAGATAATGTTATTGTAATAAGAAGACTTATGGAAGCAGGATTTACATACAAAGTGGCAAAT
TCAATGTTTGGTCAATTAACAGGTATGGCAATGGCCACAATAAATTTACCAGCAGTCATAACAACTGCAA
TGAGTATGAGCTTAGTTCCAGCAATTTCTAAAGCATATGCATTAGGAAATAAGTCAAAAGCTAGAAAAGA
TACTAAGAGTGCAGTTAAGGTAACTTTACTTATAGTATTGCCTTGTGCGTTTGGTATGGCTTCTTTAGCA
ATACCAATAATGGGTCTTTTATTTCCACATGAACCATCTTCTGTAGGAACTATTTTGTTTACTCTTACTC
CATGTGTATTATTTTTAGGATTAATACAGACATTGACTGGTATAATTCAGGGAATGGGAAAACCAATAGT
ACCTGTAATTGCTTTATGTGTTGGTATGCTATGTAAAATTGTAATAAGTTATACTTTAACAGGTATACCA
GATATTAATGTACTGGGTTCAGCATTTGGTACAGTTACAGCATACTTTGTGGCAGCCATGATTAACTTAC
TATATGTTAAAAAACACATGAATGTAAACTTTTCTAAAAAAGAATTTATAATAAAGCCATTTATAACAGT
TATGACAATGTTTATAATGGTTAAGTTGAGTTATGGTGCTTTAGTTGGATTCTTAGGAAACAGCATATCT
ACAATAATTGCAATATGTGTTGGTGGAATTGTATATGTAGTAGTAATACTTGGAATAGGTGGAATTAAAA
AAGAAGAGATTCTAACTATGCCAAAAGGTGATAAATTATATAAATTGTTAAAAAAAGTTAAACTTATAAG
ATAA
>ref|NC_013316.1|:c3969718-3969161 stage V sporulation protein T [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGGATTAAAAAATATGAAAGCAACAGGTATAGTTAGAAGAATAGATGATCTTGGAAGGGTAGTTA
TCCCAAAAGAGATAAGAAAGACATTAAGAATTAGAGAAGGAGACCCTTTAGAGATATTCACAGCAAAAGA
TGGAGAAGTCATACTTAAAAAATACTCTCCAATAGGTGAATTAAATGAATTTTCGCAAGAATATGCTGAA
ACATTAGCTGAAGTACTAGGATATGGAGTGTTGATAACAGACTTAGATTCTATAATAGCTGTGTCTAAGC
TTCCTAAAAAAGATTATAAAGAAAAAAGTATAAGTGATGAGTTAGAAGCAATAATAAGTGAAAGAACAGT
AAAATATTCAAAAGATAAAAACATTTTACCATTATTCAAGGAAGACCAAAAAGAATATACTAGTCAAGTT
ATCATGCCTATAATTAGTGCATCTGGTGACTGTATAGGTTCAATTGTAGTTGTTTCAAAGGATAAAGATA
CAATTGCAGAAAGTGAAGAAAAATCTTTAAAAATTGCTGCTAACTTTTTAGGAAAACAAGTTCAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3970789-3969824 putative foldase lipoprotein (late stage protein export lipoprotein) [Clostridium difficile R20291]
ATGATTTTGGTAGTATCTGTGACTGCTTGCAGTTCTAGTAAAGGAGAAACTGTGGCAACAGTTGAAGGTA
CAAAGATATCATCAGATGAATTTAAAAAAACTATAGCTCTTTATAAAGATTCTATGGAACAAACTTATGG
AAAAGATATATGGGATAAGGAAGTTGAAAAGGGTGTAAAATACAAGGACAAGTTTAAAGATTTAATTCTT
GACCAACTTATAACTACAGAAGTAATATATTCTCAAGCTAAAAAAGATAACTTACTTCCTAAAAAAGAGG
ATGTTGAAAAAAGTTTTAAAGAATTAAAAGACGCTATGGGTAAAGATGAAAAATATAAAGAACAACTTAA
GAAATTAGGTATAGATGATGAGTTTTTAAGAGACCAACAAGAGAAAGATTTAGCAATGCAAAACTATCAA
AGTAACTTTGCTAAAAAGACTAAAATATCAGATGAAGAAATGAAAAAATACTATGATACACATAAAGATG
AATTTAAAAAAGATGAGGTAGAAGCTTCTCATATTTTATTGAAAACAGTAGATGATAATAACAAGCCACT
TTCAGATAAGGAAAAAGCTGAAGCTAAGAAAAAGGCTGAAGAGGCTCTTAAAGAAGTTAAATCAGGTGAG
GATTTTGCAAAAGTAGCAAAAAAATATTCACAAGATACTTCAGCAAGTGATGGTGGTAAATTAGGATTCT
TTTCAAGGGGGCAAATGGTTGCTGAATTTGAAGATGCTGCTTTTTCTATGAAAAAGGGTGAAGTATCTGA
TTTAGTTGAAACTCAATATGGATACCACATAATTAAAGTGACAGACAGAATAAATGAGCAAACATCATTT
GAAGATGCTAAAGAAACTATAAAAGACCAACTGTTGAAAAATAAATATCAAGAACAAATAGAAAAATTAA
CTAAAGAAGCTAAGGTAGAAAAAGATGAAAAAGTAATAAATAAAATCACAATCTAA
>ref|NC_013316.1|:c3974236-3970850 transcription-repair coupling factor [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGATGTTTTTTTATATCCTTTGCAAAATTCAAAAGAGTATAAAGATATAATAAACTGTATAAAAA
ATACAAAAGGCTCATTATTGGTTAATGGACTTTTACCAGTACAAAAACCTCATATATCGTATTCTATATT
TAATGATTTATCACGACAAATGATTTTTATAACGAGTAGTGATTTAGAAGCAAAGAAAGTATACGAAGAT
TTAAGTTTTTATATGGAAGATAAAGTTGAATATTTAGGTTTTCAAGATATTTATTTTTATCACTTGGATG
CAAAGGACAGAAACGAAGAAGCAAAGAAATTAAAAGTATTGTTAAAACTAGCAAATAAAGAAAAAATCAT
TTTAGTAACTTCTATTGAGGCAGTTTTAAGAAAATACATACCAAAACAAGTTTTGCTCGATAGTGTATCT
CATTATAAGGTGGGAGATAGCTTAGACTTAGAAAAGTTAACTGAGAAATTAGTTTCATTGGGATATGAAA
GAGTTTCAAAAATAGAGGGGTTTGGTCAATTTAGTATAAGAGGTGGAATTATTGATGTATTTTCACTTGA
ATATACAAATCCAATTCGTATGGAATTATTTGATGATGAGATAGATTCCATACGAACTTTTGACGTATAT
TCACAAAAATCAATTGATAAATTGCAACAATTCTCTATAACTCCATCTAGAGAATTTATTTATCCCGAAA
AAACTACAGATGCATTAGTTAAATTAAAAAAAGAAACAACTAAAAATACTGATGAAGGTACATTTCAAAA
TATAGATTATATATCAAGTAAGACTTATTTTGAAGGTGCAGAGAACTATATAGATTATATTTATCCAGAA
GAAAACAAAAGTATATTTACTTATTTAGCAGATGATGCAATAGTATTTATTAATGATATAACGAGACTTA
AAGAAAGATGCGAAAATTATATAAATGAGTTTAGAGAAAATTATAAATTAAATCTTGAAAGAGGTCTGGC
TATTAAAAACCAAGGTAAATTGTTATATCACTATACAGATTTAGAGTACTTAGTAAAAGACAAGTCTGTG
GTATTAAACTCGCTATTGCCAAAGTCTATAAATAACTTTTCTATAAAATCTATAATAAATTTTGAAAGTA
GAGAAGTTCCTACATTTAATGGAAAGGTAGATTTGCTTGTAGAAGAATTAAATCGGCTGAAATATAATGG
ATACAAAATAATTTTAGCAACAAATACCTTAGAAAGAGCAAATAAATTAGGAAAAGATTTATTGGACAAA
GGCTTAGAAACGACCATTTCTAAAGATAGAGATATTGAAATTAAATCTTCACAAGTTATAATTGTACCTG
CACACATAAACAGTGGTTTTCAGTATAAATCTATAAAGTTTGTTGTTATAACAGATAACGAAATGATAGG
TGTTTATAAAAGAGCGTCTAAGACTAGCAATAAAAAAGTTAAAAAAGGAAAGAAAATAGAATCCTTTTTA
GATTTAAGTGTTGGAGACTATGTAGTTCATGAAAATAGTGGTGTAGGTAGATACACAGGGATTGAACAAA
TTACAGTCAATGCTATTAAAAAAGATTATATGAAAATAGTATATCAAGGTGGAGATAATCTATATGTGCC
AATAGACCAGATGGACAAAGTACAAAAATATATTGGTGCAGAAGTAGAAAAAGTTAAGTTAAATAAGCTT
GGAACAAATGAGTGGACGAAAGCAAAAGCAAAAGTTAAAAAAGAAATTGAAGATATGACAAAAGACTTGA
TTGAGCTTTATGCAAAACGTGAAAAAATACAAGGGTATAAGTTTTCAAAAGATACACCTTGGCAGGCAGA
GTTTGAATCGTTGTTTCCATATCAAGAAACAGAAGACCAATTAAAGGCTATAGAAGAAACTAAAAAAGAT
ATGGAATCAAGTAAGGTAATGGATAGGCTAGTATGTGGAGATGTTGGTTATGGAAAAACAGAGGTAGCTA
TTAGAAGTATTTTTAAAGCTTGTATGGACCAAAAACAAGTTGCTGTATTGGTTCCAACAACAATATTGGC
CCAACAACATTATAATACATTCAAAGAGAGGTTTGAAAATTATCCTTTGAGAGTAGAAGTTTTAAGTAGG
TTTAAAACACCAAAACAACAAAAACAGATTATTGAAGATGCTAAAAAAGGATTAGTAGATATTTTAATTG
GAACACATAGAATAATATCCAAAGATATAAATTTACCAAACTTAGGTCTTGTAGTCATTGATGAAGAACA
AAGATTTGGAGTAAAACATAAAGAAGCTTTAAAGAAAATTAAATCTACAGTAGATGTACTTACACTTTCA
GCAACTCCTATACCAAGAACATTACATATGTCTTTAAGTGGAATAAGAGACATGAGTGTTATAGAAGAAC
CTCCACAAGAAAGACATCCTGTAATAACATATGTTACAGAGAGTAAGGAAAGCGTAATTCAAGATGAGAT
AGAGAGAGAATTAAGTAGAGGTGGACAGGTATTTTTTGTATACAATAGAGTTGAACACATTGAAGAAATG
GCAAGTATGATTCAAAAACTCGTACCAGATGCTAGAGTGGCTGTTGCACATGGAAGAATGACTTCTAAAT
CATTAGAAAATATAATCCTAGGATTTTTAAATAAAGATTATGATGTACTAGTCTGTACTACAATAATTGA
AACTGGTATGGACATATCAAATGCAAATACAATGATTATATATGATGCAGATAAAATGGGATTGGCTCAA
CTTTACCAATTGAGAGGTAGGGTTGGAAGAAGTTCAAGACAAGGATATGCATATCTTTTGTATGAAAAAG
ATAAAACTTTAAGTGAGATAGCGGAGAAGAGATTAAAAGCTATCAGAGAATTTACAGAGTTTGGTTCTGG
TTTTAAAATAGCAATGAGAGACCTCGAAATAAGAGGAGCAGGAAATATTTTAGGTTCTCAACAACATGGT
CATATGGCAGTTATAGGTTATGATTTGTACGTTAAAATGCTTAATGATGCAATTAAAAAAGTCAAAGGTG
AACCTATTGTGGAGGAAATTGATGTTGAAATAGATTTAAGTGTAAATGCATACATTCCAGATAATTATAT
CAAAGATGAGTTGATTAAAATTGAAATGTATAAGAAAATAGCTTCTATTGAAAACAAAGAAGACATGTTG
GATATACAAGAAGAACTTGAGGATAGATTCTCTGATATACCTAAACCAGTCCAGACACTTCTTACAATAG
CTTATATAAAATCGTTATGTAAGATATTAAAAATAGAAAAGATAAGACAATTAAAAGATGAAATATTATT
AGTTCCAATAACAAAGTATAGAACTAAACAGAAAATAGGTTATAATATAGTTACAGAATTAGAAGAATTA
TTAGAAAAGATGTGCAAGGTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3974813-3974253 peptidyl-tRNA hydrolase [Clostridium difficile R20291]
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ATGTTATAGATATTCTTGCTAAAGAATACAATATTAGTGTTACTAAAATAAAGCATAAAGCTTTGATTGG
TGAAGGGAGAGTAGGTACTGAAAAAGTATTATTAGTTAAACCACAAACTTATATGAATTTAAGTGGAGAA
ACATTAATAGATATATATAAATATTATAAGGTTGATTTAAGTAATATAGTAGTAGTATATGATGATATAG
ATTTAGAAGTTGGAAAGATACGTATAAGAAAAAAAGGAAGTGGAGGAACTCATAATGGCATGAAATCTAT
AACTAAGTGCCTAGGTTCAAATGACTTTCCAAGAGTGAGAGTAGGTGTATCTAAACCAGAAGCTGGTCAA
GACTTAGCAGACTTTGTACTTTCTAGATTTAGAAAAGAAGAATCTGATAACATAAATGAAGCATTAGAAA
AAGCGGCAGATGCTATTGACTCAATAATAAGAGAAAATATAGATATGTCTATGAACAAATATAATGGATA
G
>ref|NC_013316.1|:c3975477-3974827 putative type IV prepilin leader peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGTATATAATAATAATTTCCTTATTTTTTGCACATTTGATAAATAAATCTCTATGTGTTTTTTGTG
ATAGAGAAAAGAAAAATTTATATAATACGTTTTTTATTTACATAATAACTGTAGTTTTATCTGTATTAAT
ATATCTAAAATTTGGGATTAGTGTAGAATGTGTACAATATATGGTTTTAATTCCATTTTTAATAATTATA
TCCATTGTAGATTACTACACAATATATGTATATGATATAACAATAGTTAGTGGTATAATAGTTCAAGGTA
TAATTTTTTTGGCCTTTTTCAATATAGCTCAATTTGATTATATAAATCATATATTTGGACTATTGATAGG
CTTTATTATACCTTATATTATTGCTAAACTAACAAAAGGATTAGGCTATGGAGATGTAGGTCTCTATAGC
TTATGTTGCTTTGCATTGGGAAATAATTATGGGTTTTATGTGATAGTTTTATCATTTATTTTAGCGTTTT
TGTTTTTTATTATTTTATACATAACTAAAATATTTAAAGATGTAGATATAAGAAAGCAAATTCCTTTTAC
ACCTTTTATTTCCTTGTCAACAATTTTAATAATATTTACAGAGTATAATATATTTAATTTTTATTATAAT
TTGTTATACAAATTTATATAA
>ref|NC_013316.1|:c3976361-3975579 putative type IV prepilin leader peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATATTATAATCGTTAATCTATATGTATTTATAGTGGGTATAGTGTTTGGAAGTTTCTTTAACGTCT
GTATTTTTAGGATTCCAGAAGGTATATCTATTTCTAGACCTCCTTCCCATTGTATGAGTTGTAATACTAG
ACTAAAGCCAATAGACTTAATACCAGTGCTAAGCTATTTGATGAGTGGCAGAAAGTGTAGATATTGTTAT
GAGAAAATTTCTAGTAGATATGCTATAGTGGAATTAATTACAGGAATTTTATTTTTAACAGTATTTATGT
TATATGGAATATCTACATCAACTATTTATTATTTGGTTCTTGTGTCTTTACTGATTATAATTACATTTAT
AGATATTGACCACTTTATAATACCAGATAAAATATTGATTTTTGGAGCTATATTTTCTATGATTTTTAAC
CTTTTATTTAAAGAAATTCCAGTTAAGGATTCAATTCTAGGTGTTTTTATTTGTGGAGGAAGTGTCTGGA
TTATAGTTCTTTTGATTGAATTTGTAATAAAAAAAGAGTGTATGGGTGGAGGAGATATCAAACTATTTGC
AATGCTAGGCCTTTACATGGGTGTTAAAAATGGTCTTTTGACAGCCTTACTAAGCGTTTATGTAGGAGCA
GTCTATGGAATCTGTGTAATAATTATAAGTAGAATAAAAGGAAAGGAATATAATTCTGTTATACCATATG
GACCTTTTATATCTATTGGAGCATTAATAACAATCTTATGTGGAAAGCAATTACTTGAACTTTATTTTTC
TATGGTTATATAG
>ref|NC_013316.1|:c3977424-3976342 putative type IV pilus retraction protein (putative twitching mobility protein) [Clostridium difficile R20291]
ATGTATATTTATGATTTATTAGAGCAAGGTATAAGACTAAACGCATCAGATATACACATAACAGTTGGAA
CAAATCCTGTAGCTAGAGTAAAAGGTGGATTTGTAAAACTAAGTGAACAAATATTGACATCAGAAGTAAC
AATGCAAATGGCAAAAGACATAGCGGGGGAATCTATTTTTAAAGTAATAGAAGAACATGGAGAAGCTGAT
TTTTCAGCTTCTCTAAAAACAGGAGAAAGATTTAGGGTAAATGCATATAGGCAAAAAGGAAATTACGCAA
TAGCAATAAGGACTATAACAGCAGAAATTCCAACATTTGAAAAATTAGGCCTTCCAGAGAGTATAAAATC
TTTTACTGAAAAGCATAAAGGATTAGTTTTAGTTACAGGTCCAACAGGAAGTGGTAAAAGTACAACACTT
GCAAGTATGATAAATATAATAAATGAAAAACAACAAAAACATATAATTACACTTGAAGACCCGATAGAAT
ATGTACATCATCATAAACAAAGTTTAGTAAATCAAAGAGAAGTAGGAACTGATACAGAAAGTTTTCATTC
AGCCCTTAGAGCTATTTTGCGTCAGGACCCAGATGTAATACTAATAGGAGAGATGAGAGACCCTGAAACT
GTTTCAATAGCATTAACAGCAGCAGAAACAGGTCATTTAGTATTTTCAACACTACATACAGTAGGGGCAG
CTAAGACAATTGATAGAATAGTAGACATGTTTCAACCATCCCAACAGCAACAAATAAAAACACAGTTATC
TACAGTTTGTGAAGGTGTGGTATCACAGCAGTTACTTCCTACAGCAGATGGGAAAGGCAGAATAGCAGCA
ATTGAATTGATGTTTGCTACTCCAGCAATAAAAAACTTGATAAGGGAAGGCAAAACATATCAAATTCCAA
ACATGATACAAACTGGAGTTAAAGTAGGTATGAAAACTATGGACCAAGATTTAATGGAACTTTATAAAAA
TGGAAAGATTACAAAAGATATGGCACTTAGTAGGTGTACTGACCAAGAGTTTATGACAAGAATGATAGGT
GGAGTAAACTACAATGGATATTATAATCGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c3979062-3977524 hypothetical protein CDR20291_3343 [Clostridium difficile R20291]
TTGAGGAAGTGGAATAAATTTAAAAGTGAAAGAGGGGCAGCTTTAGTTTTAGTTTTGATTGTAGTAGCAT
TGCTTTCTATTGTTGGATTGATATTTTCAAATCAGATAGCTAATAGAATAAAATCTACAAAGACTACTAA
TGAAGGTATACAAGCAAAGTATTTAGCAGAGACATGTGTGGAAAATAGTATTGATAAAGCATATGAAAAA
TTGTATGATGAGCTTGAGAAAATGGATAATGAGTTTAAAAGTGAAAATCAAGAAAAATCCATATCTAGGT
CAAAATTAAGAAATATATCAGATGAAGATTTTAATAATCAAGATGAGAAAAATATTGAAGCAGAAAGACT
TGGATATATGAATAATATAAATTTCTATTTAAATAAAGCTTCTTCAGACTTGGAAAAAGCTAGTATGGAA
TTGAAAAAGCTATATGATTTAGATATGTTGGACTATAGAGACATTGAATATGTAGATGCAAATATTATTT
CACATAGAGATTCTATCTTAGAAATTTGCAAGAATTATACTTCTGGAGATATTAGTAAAATAAATGAATA
TATTCTGAAAGAAGATATAGACTCAACTACATTGATTGAGGCAAAGTTAGTGAATAATGATATTCTTTTG
AAAATGTTTTTAGAAGAAAATAAAATTGAAAATGAACATTTAAATTCAGCCTTTTCACATACTTATAAGG
CATTAGATAACATTTCTTTGGCGATGCAAAATATGATTGAGTATAGACATACGTTTCATATAGATGAGCC
AAAAGTAGAAGTATCTAATGGGATTCCAGATTCTCAACAATATTATGAACTAATACAAAATCCTATAATA
AATAGTATGGAGTATATCTGGAATAGTAAATGGGATACATTAGAAAACCTATTGGAAATTTTACCAAATC
AAACTCAAGGATTTAATTCTTTAAGAGTTCATTTGAGAAATAATGTAAGAAAATTTGAGAAGTTAAGCGA
TAATATATCTAGTGGTAAAAAAAATACAGCAAAAAATTTTTTAAAGTATAAAGAGTTATTGTATGAAATA
TCAGACCAATGTAATCAACTAAAAAGTATGTCTTATGAGAAAATACCTGTTAAATATGATAATATGGCTT
TGATAACAACTTTTGACTATATACAAAATGAGCTTTTAGCAGAGATAAAATGCAGATTAAAAGAATTAAA
ACCACAAGAAATTGATAAAACAGAAGGTATTACTATAAAAATACCTTTTTATAAGGCTGACTACGACATG
ACAAAAGAAGGATGGCCTAAATTAAAAGAAAATGGTTCAGGGGCGGAGTTAAGCTTAATGGTAACTGGTG
ATAAAGATGGAATAAAAGAAGTAGAAGTTACAGATGGTAAAAAAAATATTATTGGTTTAGGTGTTGAAGA
AAATTCAAATTCAAAGTATAAGGTTGACGCCATTGTAAACTTTAATCTAAATATAGATACAAATGTAGTT
GGAAATTATGATATAAAAGATAAAATTTTGATTAATCATGATATAAGTTCATACAAAAAAGTAAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c3979610-3979083 putative type IV pilin [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAAAAGAATAGTGAAAGAGGATTTTCCTTAATTGAAGTGTTAGTAGCTATGGCTATTATGGGAA
TTGTACTATTTGCATTTTTTAATATTATCAATACTAATAACAAAGCAAACACTAAAAATGACACAGATAT
AACTTCCTTAAACTATGTCCAAAGTGAAATAGAAAATCTAAGAGAAAAGATAAAAAGTGGAGAATTTGAT
TTTGATAGTTTAGATAAACTAGAAGATGGAACTGTCGTATATGAAAAATTAATAGATAAATCAAAAAAAG
TTGTATATGATAAAGTTCTTAGTGAAGGTGACGTGAGCTTATATGATACTCCATATGAAAAGATTACAAC
AATAAAAGATGAAGATGGTAATTTAATCGACAAAGGAAATATTACAAATAAGATAAAGACTATTGTAGAA
GATAAAAGTGGTCAGATATATAAAATAGCTGTAACTGGGAAAAGCATGAATGACTATTCAAGTAAAAAAG
AGGTTAAAATTGTAACTGAAATATTTAAAGATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3980213-3979647 putative type IV pilin [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTTGTACAAAAATAATGAAAAAGGTCTTACTTTATTAGAAGTAATAATAGCTGTTTTTATACTGA
CAATAGTTTTAAGTATTTCTTATAAAGTGTTCAATGGTATAACATCAGCAGTAAAAAAGCAACAGATTAT
TACAGATGCTCAAGTAAATATTAATCTAATTAATAAGTATCTAAATAGAGATTTGGAAAACTGTAAAGAG
CTAACTAAAACTGGTTCAGGTAATAATTATGAATACAATATAGAGATGCCAGATAATGTTGTAAAATATG
AAGTTTCTATAGAAACTAAAAAAAATACAGAGGTATATTCTGTAACGAGAATCCAAAACAATACAATTGA
TACAGAAAATGAAGTTAGAGAAGAGATAATCTATAATCAACCACTAGTTCAAAACAATAAAGAAATGAAG
GAAACACCATTTAAAATAGAAAAGCAAACTGGTAAATCTATTTATACTGTAAGTATATACTATAATGAAT
CAGTGCAAGAAAGTCATAAAAATAGCAATTTAAATAACAAAACTTATACATTTGATGTTATGTCAAGAAT
AGGGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3981148-3980240 putative type IV pilus assembly protein [Clostridium difficile R20291]
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TTATAAAGGTTATAATTTTATTAGCTATTTTATCATATGGTTATTTTGGACTTTACCCTCAATATCAGAA
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CTTATGCCAAAATATGAAAAACAACTTGAAGAAGTTGAAAGTGAATTAAAAGAAAAAAGCAAAAATCTTT
TATATGATATGCAAGATGGTCTTTTTTTAATAGGTTTAGATAAAAAAATGAAGGCTTATAATATTGACTT
AACTAGTTATGACGTTGGAAATGTTAAAGAATACGAACATTTTTATGGTATATCAACAACAATAAGTGTT
AGAGGTGATTATAGAAATGTCAAAAAATTAATGGCTTATTTAGAAGAACAAAAAAATGTTACTCAAATAC
TAGATTATACAATGACTTCATATATAGAACCAGAAAAAGAAGAGGAAGAAACAACAAACAATAAGGATTT
AATTAAAAATGTGAACATAAATAAAGATACAAAAATATACTGGGTGGAAGGCGAAAATAAGTGGCATTTA
TATAAGGATTGTCCATTGATAAAAGAAGGAGAGATTCTAAAAAATGACAAACTTTTAGATAGGTCTACTA
ATTATCTATGTAATACTTGTGTACTTAGAGCTGCAACAGAAAAAGAAGCAAAAAAAGAAGTCGTAGCTCC
AAAGGCAGAAGGTGTAGTAGATGCTACATTTAAATTTATAATGTACACTAAAGAGAATACTACAATGATA
CTTGATACAGATAATCCATCTTCATGGAGACCAGGAAAATATAATCCATTTAAGTCTAGTGCTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3982853-3981141 putaive membrane protein [Clostridium difficile R20291]
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AGGATAAGTTTTATGTAAAAAATTTTAATGTGTTTTCAATAGAGGATATTGCACAAGATTTTTCTAAGGA
AAAGTATGCTCTATTGAGATACGCATTAGAAAATGTTAAGTTAAAATCAAGACATGTAGTTTTTTGTTTA
AATACAAGAGATGTAATTTTAAAACCCCAAAAACTTCCTAATATGGACAAAAAGGATTTAGATGGATTTA
TGAAGCTAGAGATGGACGAAATGATGGCTTTGGAGTCAGATGAATATGTATTTTCGTATGAAGTATCTAG
TGAAACACATGATAATTCAGATGGCGATGAATCAAGCTTAAATCTTATCATTGGAGCTATACAAAAGGAA
GAGGTAAATGCAATTGTAGAGATAATGCATGAATTTGATTTAGTATTAGATAGAATAGATACATTATCAA
CAGCTTACTTAAGAATGCTTAAAAATTTAGACTACAATGATATAATGGTAACCAATATAAGTGACAATAG
TACAATTATAAATATATATAAGAAAGATACTTTATTTATTAGTGATAATATACCTATAAAGATAACTGCT
AAAGATATGGACATGCAATTATTAAATGTAGTAGAAGAATCAAAAGGTCTTATGAATTACTATTCGTCAA
GAAACTTTGGTAAGGTTACGGATACTATATTAATATTAGGAAAAAGATATTCCAATAAATTAATTTATGA
AACTTTTAGCTCTGCATTTTCAAGCTATGTTTCTCAAGGCCTTACTGAGATAATGGATATATCTGATATG
ATAACTGGAGATATAGATGAAGATGATATAAATTCAATTGTAGAGCTTTTAGGAAGTATGATAGAACCTA
AAGGGAAAAGAGATTTTGAAAATATAAACTTTTTACCAATGGATATACTTAGAAAACAGATAAAAGCTAA
ACAAATGAAAAACATACTGAAAATTGCTCCAATAGTTATTTTGATTCTTGCTATACCTTATTTATGTTTA
ATTTTTTCAAATAATTTAGCAAATAAGGAACTTGAAAATGTTAATGGTGAAATAAGAAATATTGAATCTG
CATATTATCAGATTGGAAATATAGAAAAAATGATACAGAGTAAAAGCGAAGAAATAAAGGTATATGATAT
GTTAATTGGGAAAAAGGTAAAGTGGGAAAATTTATTGGATGATATAGATAAAAATACTCCAAGTAAAGTT
GAACTAACAAGTTTATCAACAACTTATCAAAATCTTGGAACTAATAATAAAGCTGATAATTCAAAAAGTA
ATAAGACTACAACAGATAAATCAAGTAACAATGAAACAAAATCAAGTACGAAAAGTGATAGTAATGGAGA
TAAAACAGATAATGATTTAAATGAAGATAAGACTACAAATGTGTCAGAAGCATTAACTGGAAATAGTGAG
ACTAATAGTAATAACACGGATAAAGATGATAAAACTCCATTGTATGATAAGATACCAAATGTTATAAATA
TAGAAGGAAATGCTAAAGATTCCTCTTATGTAGGTCAATTTTTATATAAATTAAAGGGATTATACTATTT
CAAGGATGTTAAATTACATAGCATAAAAAGTAATGCAGAAGATTCTAACTATACATTTAGTATGACATTA
TACCTGAAAGAAGGTGTATTAACTAATGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3984076-3982868 type IV pilus assembly protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGTTTTAAATACACAGTAATAAAAGAGGACGGAAAAAAGCAAACTGATGTGATTGAAGCCAACG
ATTTTAATGAAGCTAGAAATCTTCTTAGAAAGAGAAATCTTAGAGTTATTGAAATCAAAGAAAGCAAAAA
TAAAAATATAAGATTATCTAGTAGAAAGAGAAAAAAAGACTTGGGAGCTGACCAGATAAGCCACTTTTGT
AGACAGTTTGCTATTATAGTATCTTCTGGTATAAATAGTATTTCAGGATTAGAAACATTAGCTAGAAGGT
CAACTAACATTACATTAAGAGAAGAAATTAATCGTATAGTGGCAGAAATAAAAGTAGGTTCTACTATTGC
AGATTCAATGCTTTCATCAAAATCAAAGTTTCCAAAGTTACTTGGTGCTATGGTAGCTACAGGTGAAGCT
ACAGGTAAATTAGATGAAGTATTAAAAAGTATGGCTTCATTTTATGCAAGTGAACACAGGGTTAAACAAA
AGCTTAGAAATGCTGCAACATATCCATTAATAGTTTTGATTTCTTCATTTATAATGATTTTTATATTTAC
AACATTTATGGTGCCTAAGATGATTAATTCAATTACAACAGTAGGAGCAACTCTTCCACTTATAACAAGA
ATTGTTATGGGGTTTGGTATGTTTATGAAGAAGTTTTGGATAATAGTACTTTTAGTTATTATATTATTTA
TCTATCAGTTTAAAAAATATTTAAAAACGTCAGTTGGAAGGGCTCATAAAGATAGAGTTATAAACAAGAT
ACCTGTTTTAGGAAAAGGAATAAATTGTATGGTAGCTACACGATTTTCAAGAGCATTGTATCTATTTGTA
TCAACAGGATACCCATTAGTTCAAGGGCTTGATTATATTATAGATAGTGTAAATAACACCATGGCAGAGA
AGATTTTAGCATCAGCTAAAGATGGAATAACAAGAGGAGAAGGCTTAGCAGAAAATTTAGAGAGATATAC
GTATTTTGACTCTGTGTTGGTACAGATGATAGCTATAGGGGAGCAGACAGGGGAATTAGAGAATATAAGT
AGACAGATGGCAGAATTTTATGAGTATGAATCCGAGATTTATTTAAATAGGATGGCCTCAATGATAGAGC
CTGTTTTAATAATTGCAGTTGGTATTATAGTTGCGATACTGGTTGTATCAATATTTATGCCAATGCTTAG
TATATATGATGCCATGTAG
>ref|NC_013316.1|:c3985773-3984088 type IV pilus assembly protein [Clostridium difficile R20291]
GTGAAACCTGTGGCTAAAAAAGTTAGAATAGGAGACAAACTGGTCGAAAAAGGATATATAACAGAAGACC
AGCTTAAATGGGCACTATCAGAACAAAAAAACAGTGGAAAAAGACTAGGAGAATTTCTAGTACAAGAAGG
GCTTATAGATAGTAACTTACTAATAAGTGTATTAAAAGAACTCTTGGATATAGAAAGTATATTTTTAGAA
GGGACAGAAATAGACACTTTAGCTACAAAGATGGTTCCAGAAAATATATGCAAAAGATATACTGTATTTC
CATTTAAAATTGATGGAAATAAAATATGTCTAGCCATGTCAGACCCACAAGACAGAGAAGCAGTTCAAGA
TGTAAGGCGTATGTCTGGTAAAGACGTAGAGATATTTATATCAAGTACAGAAGATATAAACAAAGCAATA
GGTCATGCTTATGCACATTCAGAAATAAATAAGGCAATGACTGAGTACAACAAAAATAGAACTGGTGGAG
TAAGAGAAACAGTAATACTTGAAGAAGATGTAAATGCTGCTCCAATAGTACGATTAGTAAATAACATACT
AGAAAATGCTGTTAGAATGGAAGCAAGTGATATACATATAGAACAAAGTGAAAATTACATGCGTGTTAGG
TTTAGGATAGATGGAATGTTAAGAGAATATATGAGGATGAACTCAGCACCATATAAGGCAGTAATCAGCC
GTATCAAGATAATGTCAGATATAAATATATCTGAAAAGAGAATACCACAGGATGGTAGAATCTATTTAAA
AGTAGATAATAAACCCATAGATTTTAGGGTTTCTACAATGCCAACTAACAGGGATGAAAAGATAGCTATG
AGGGTTCTTGATAAGAGTAATTTTATGGTTAGTAAAGAAGTACTAGGAATAGACGAACATGGCTCTAAGA
TATATGATGAATTGATAAACACTCCTTATGGTCTTATATTGGTTGTTGGTCCTACTGGAAGTGGGAAAAC
CACTACATTGTATTCAATGTTAAATCAACTAAATACAGAAAATAGAAATCTATTAACAATAGAAGACCCT
ATAGAGTATGAATTACCTGGTGTAAATCAATCTCAAATAAATGAAAAGGCAGGGCTTACTTTCGCCAGCG
GACTTAGAGCTTTTATGCGTCAAGACCCAGATATAATAATGGTTGGAGAGATAAGAGATACTGAGACAGC
AGAAATAGCAATTAGAGCTTCTCTTACAGGACATTTAGTTTTAAGTACATTACATGCAAATACAGCAGTT
GGAGCAATTTCACGTCTTTTAGATATGGATGTGGAAAGTTTTTTAATAACTTCATCTGTTTTAGGTGTAA
TATCTCAAAGACTTACACGAAAAATATGTGAGCATTGTAAGGTTTCATATGAAGCAGATATTGGAGAAAA
AAAGGCTCTTGGTATTGATGTAAATGAATCAGTAACTATTTATAGAGGAAAAGGTTGTGAAAGGTGTAAT
AATACTGGATATAAAGGACGTCTAGGTATATTTGAAATGCTTGAAATTACTCCAGAAATAAAAGAGTTAA
TAGATTCATCTGCAAATCAAAGAGAAATTTTAAAGATGGCTAGAAAACAAGGCATGGTTAGCTTAAAAGA
GGATATAGTTAAAAAGGTTTTAAATGGAAAGACAACAGTAGAAGAAATGATTAGAATAATTTTGATGACT
GATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3986436-3985915 pilin [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGTTAAAAAAGAATAAAAAAGGTTTCACTTTAGTGGAATTATTGGTAGTAATTGCAATTATAGGTA
TATTAGCAGTAGTGGCAGTTCCAGCTTTATTTAGTAATATAAACAAGGCTAAGGTAGCAAGTGTTGAGTC
TGATTATAGTTCAGTTAAGAGTGCAGCATTATCTTATTATTCAGATACTAATAAGATACCAGTTACACCA
GATGGTCAAACTGGTTTAAGTGTTTTAGAGACTTATATGGAGTCTCTGCCTGATAAAGCTGATATAGGTG
GAAAATATAAATTGATTAAAGTTGGTAATAAATTGGTATTACAGATAGGTACAAATGATGAAGGAGTTAC
ATTAACAGAAGCACAATCAGCAAAATTATTGAGTGATATAGGTGAAAATAAAATATATACAAGTGTTACA
GCAGATAATTTGGGAAATCCATTAACAAGTAATACAAAAGTAGATAATAAAGTTCTATATATAGTACTTA
TAGATAATACTGTGATGGACTCAACAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3988473-3987523 ribose-phosphate pyrophosphokinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATACTAGCGGAAGCGAGATTAAAATTATTGCAGGTAATTCATCGAAAGAGTTAGCACAAAAAATAG
CTGACTATATAGGTGTATCAGTACTAGATTGTGAAGTAGGTACATTTAGTGATGGTGAAATATGTGTAAA
CATGAATGAGACAGTAAGAGGTTGTGATGTGTTTGTAGTGCAATCTACTAACAGCCCAGTAAATGATAAC
TTAATGGAGTTATTAATCTTAATTGATGCGTTAAAGAGAGCATCAGCAGGTAGAATAACAGCAGTCATTC
CTTACTATGGATATGCAAGACAAGACAGAAAGGCTAAGGCAAGAGATCCAATCACTGCTAAATTAGTTGC
AAATTTAATAACTGCTGCTGGAGCAGACAGAGTATTAACAATGGATTTACATGCAGCTCAAATACAAGGA
TATTTTGATATACCATTAGACCACTTACTAGGTGGAACAATATTAGCAAATTATTTTAATGAAAAGAAAA
TAGAAGATTTGGTAGTAGTATCTCCTGACTTAGGAAGTGTTACTAGATCAAGAAAATTTGCTAATACTTT
AAATGGAGAAGTTCCAATAGCTATAATAGATAAAAGAAGACCGAAAGCTAATGTATGCGAAGTTATGAAC
TTAATAGGTGATGTTAAAGGTAAAAATGTTATACTATTAGACGATATGATAGATACAGCAGGAACAATAG
TTAATGCTGCAAATGCACTTAAAGAGTTTGGAGCAAAAGATGTTTATGCTTGTTGTACTCATGGTGTGTT
ATCAGGTCCAGCTATTGAAAGAATTGCTAATTCAGAAATAAGTGAGTTAATAGTTCTTGATACTATACAA
CTTCCTGAAGAGAAAAGAATAGATAAGATAAAGATAAAAACAGTAGCTCCTTTATTTGGAGATGCTATAA
GAATGATATTCTCTAATGAATCAGTAAGTAAATTATTCTAA
>ref|NC_013316.1|:c3989947-3988568 bifunctional protein [includes: UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase and glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase] [Clostridium difficile R20291]
ATGAACTTTAAAGCTATAATCCTTGCTGCTGGCAAAGGAACAAGAATGAAGTCTAAATACCCAAAAGTTA
TACATAAAGTATGTGGAAAAGAAATGGTTAACCATATTATAGATGTTTCAAAAAAATCAGGGGTAAAAGA
TACTGTCGTGATTTTAGGACATGAAGCTGAGGTAGTTAAAGAAAAGCTTGCAGAAGAAATTATAATAGCC
ATGCAAACAGAACAACTTGGGACAGGACATGCTGTAAAGATGGCTAAAGAATATATTAATGATGAAGATA
CAATAGTTGTACTTTGTGGAGATACTCCACTTATAAAAGAAGAGACACTGAAGAGATTATTTGAATATCA
TATAGAAAATAAATATCATGCTACAGTTCTTACAACAAGAGTTGGAAATCCAACAGGTTATGGTAGAATA
ATAAGAGATAAGAAGGGTGACCTTCTTAAAATAGTGGAACAAAAAGATGCAAATTCAGAAGAAAAGATGA
TAAGTGAGATAAACTCTGGAATTTATTGTTTTAATGGAAAGAGTCTTAGAGAAGCACTAGATTTGCTAAA
TAATAACAATTCACAAGGTGAATATTATTTAACTGATACTGCTAAAATAATGAGAGATAAAGGATTAAAA
GTTGGTGCATTTGCAGGTTCAACTATTGAAGAACTTATGGGCGTTAATTCAAGAGTAGAATTATCAAAGG
CAGAAGAAATTATGAGACGAAGAATAAATGAATCTCATATGGTAAATGGAGTAACTATAATAGACACTAA
CTCTACCTATATAGAATCTGATGTTATGATAGGCAATGATACTATAATATATCCAGGTGTTATGTTACAA
GGGAAAACAAGGATAGGTTCAGATTGTATAATTGGAATGAACTCATCTATAACAAATTCAGAAATAGGTG
ATGGTACAGAAATAAAAAATTCAACTATAATTGATAGTAAGGTTGGAGAAAATTCTAATGTTGGGCCATA
TGCATACTTAAGACCAAAGAGTGACTTAGGAAATAATGTAAAAATAGGCGATTTTGTAGAAGTAAAAAAT
GCTATTATAGAAGATGGATCAAAAGCATCTCACCTTTCTTATATAGGAGATGCACATGTCGGTAAAAATG
TAAATATTGGATGTGGAGTAGTATTTGTAAACTATGATGGTAAAAATAAATTTAAATCAGTAGTAAAAGA
CAATGCGTTTATAGGTTCAAATTCTAATTTAGTTGCACCAGTAGTTGTAGAAGAAAAAGGATATATAGCA
ACAGGTTCAACAATAACACATGATGTCCCAGATGGTGCTTTGGCAATAGCAAGAGAAAGACAAGTTATCA
AAGAAGGATGGGTAGAAAAAAAGAATCAAAAAGACGACCAAAGTAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3990435-3990157 stage V sporulation protein G [Clostridium difficile R20291]
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CTTTCGATAATTTGTTTGTAGTGCATGATATAAAAGTTATAGAAGGCCATAATGGGCTATTTATAGCAAT
GCCTAGCAGAAAAGTAGGCGAAGGAAATTTCAGAGATATAGCTCATCCAATAAATGCAGAAATGAGACAA
GTTTTAGAAGATGCAGTTTTACAAGCATATCATGAAGCATTAGTTCAATGGGAAGTAGCTGCTGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3991469-3990591 putative transcriptional repressor [Clostridium difficile R20291]
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ATACATTAAGTTATTTTACAAATCAATTTAATGCAGCAAAATCAACAATAAGTGAAGATTTATTAGTTGT
AAAAAATGTATTTGAGAAGCTACATTTAGGTAAAGTTATAACTATCTCAGGAGCAGCAGGAGGAGTAAAA
TATATACCTAAAACTTCTATAGCAGAAAATGCAGAGTTCTTAATGGAATTATGTGAGAGAATATGTGACA
AGTCTAGAATACTATCTGGTGGTTTTTTATACTTGATTGACCTAATTTATGACCCTACAATAGCTGCTAA
GATAGGAAAGATATTCGCATCAAATATTGAGTATGTAGATGCAGATTATGTTGTGACAATGGAAACAAAA
GGTATACCTATGGCACTTATGACTGCAAAAGCTATGAATTTACCTCTAGTTATAATAAGAAAAGATATAA
AGGTATCAGAAGGTCCTACACTTAGCATGACATATGTGAGTGGAAACAGCTCTAAAGTTGAAAGTATGAG
TTTGCCAAGAAAAGCTCTTAAACCAGATAGTAAAGTTATAATTATAGATGATTTCATGAGGGGTGGAGGT
ACTATAAAAGGAATGGTAGACCTTATGAATGAATTTGGTGCAGAGGTTATAGGTACTGGAGTATTCATAT
CTACAACGAATCCTTCAGAAAAAATGGTAAAAGATTATATTTCATTGATTCAATTGGATGTTAATGGAGA
TAAAATAGTAGTAGAACCAAACTTAAAGACTTTTAAAGATGAATATAGAAATGAAGATTTAGACGAAGAA
GAAGATTCAGAATTTGAATTTGAGATAGATGAAGATTAA
>ref|NC_013316.1|:3991688-3993040 UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATACACTTTATAGGAATTGGCGGTATCAGCATGAGTGCATTAGCTGAAATATGTATCAATAAAG
GTTATCAAGTTTCAGGTTCGGATTCAAACGAATCATACCTATTAGACAAACTTAGGGACCAAGGGGCAAC
TATTTATATTGGTCAGAAAAAAGATAATATATCAGATGATGTAAATATGGTTGTTTATACAGCAGCAGTT
CATCCAGACAATGAAGAACTTGTGGCTGCTAAAGAAAAAAATAAATTGGTAATGAACAGAGCGACTTTTT
TAGGCCAAATCATGAGGGAATATAAAAATTCTATAGCAGTTTCTGGAACACATGGAAAAACTTCTACAAC
ATCTATGTTATCTACAATCTTTGAATATGCAGACTTAGACCCAACTATACTAGTTGGTGGTAACTTAAGT
ATGATAGGTGGTAATGTTAAGATAGGTAATTCCAACCACTTTATAACTGAAGCATGTGAATATGTAGATA
GTTTCCTTAATTTTAACCCAAAGATATCTATAGTTTTAAATGTTGAAGAAGACCATCTTGATTATTTCTC
TGGAATAGATGAAATCAAGGCTTCTTTTAACAAATTTGGAAAATTATTACCCCCAGAAGGCTATTTCATA
ATAAATGGCGATGATGAAAATATTGATGACATATTGTATGATGTTAAAGCTACTATTATAAAATACGGTA
GAGATTCTGACAATGATGCTGTAATAAAAGATATTCACTTTGACAATAGTGGTCATGGAATATTTAGAAT
AGAATATGAAGGAAGAGATTTAGGAGAATTTGAACTTTCTGTATATGGTCTTCATAACATATACAATGCT
TCTTCTGCTATAATGGCAGCTCTTGTTTCTGGTATTGACTTAGAGACTATAAGAAAAAATATAAAAATTT
ATAAAGGTGTCGGAAGAAGATTTGAAACTAAAGGGTATTATAAGAATGCTTTAGTAGTAGATGATTATGC
ACATCATCCAACTGAGTTAAAAGCAACTTTAGCTGCTGCCAAAAAATTAAAAAAATCAACTTTATGGTGT
ATCTTCCAGCCACATACTTATACTAGAACAAAATCTCTTTTAGGTGAATTTTCAGAGGCATTCTATGCTG
CTGATAAAGTTATCATAACAGATATATATGCTGCTAGGGAAAAAGACCCTGGAGATATACATTCTAAGGA
CTTGGTTGAGAAATTATATCAAAACAATGTAGATGCCATCTATATAAAAGAATTTGAAGATATAGTAAAA
TACTTACGTGAAAATGTTAAGGATAATGATTTAGTAATAACTGCTGGTGCTGGTCCAATTTATAAGGTTG
CAGACTTGTTGGTTGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3993893-3993096 hypothetical protein CDR20291_3356 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCAAGAAAAGAAAACTAAAGAAAAAAGCTGCAATATTAATAGGAGTAGTTGTTTTCTTTATAATAT
ACTTTATATCCTTTAGAATAGGAATAAATATGGAAAAGGATAAAAGTGAAGTGCCAAAGAAGGTAGAAAA
AGAAGAAGAAGATAATAGGTCTTTAAGGACTCAAATAAAAGAAAAGAAAAAGGTTTATATATCAGACAAA
AATATAGAAAACATAAAAATTGAAGAAGATATGTGGGATGAAATAAAGTTATTTTTCTCAGATTTTAAGA
AAGTAAGAAATACTACTTCTTCTTACGAAGCAGTTTATGAAGGTTATTCTGATGATGGAGTTAAATTTTC
TACTGACCTTAACTTTTTTAGAGTATATACTGTAAATAAAGAAGAATATTATAAAGTACCAGTTAGTTCT
AAGGATGCTTTTAAGAAACTTTTAGATGAGAGTATATATACTTCATTTGACCTTTTAAGTCATTATAAAG
ATTGGAAAGAGGTTACTATAACTCATGGAAAAGAAATTAAAAAAGTTCATAGATGGAAATTTGATGATTT
AGCACATAAGATGATTTCAAAGAGGGTTGTAGGAAAAGTTCAACCTGAGAAAAGTAAGGAAAGAAGTGAC
TATAATTTTACTATAAATATAAAAGGTGATAATTTTGATGTAAAAGTTGATACAATGGGAAAAGATTATG
TAAAAGTTACTTCTAAGAAAAATGTATCTTACTATGAGGTTCATACAAGTTTATTTGATTACCTTAAAAA
TGAGATATTTGAAATTGGAAAGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c3994916-3993963 putative cation efflux protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTTCAGATGTAGGTTCTTAATAATATTTAGATTGTTTCATAAGGGAGGAATAAATATGGAAACAAGGT
ATGAAGAAGCAAATAAAATAACAATACAATCAATACTTTGGAATGTAGTATTAACAATAATTAAGGTTAT
AGCTGGTGTTATTGGTAATTCTAGCGCTATGATTGCAGATGGATTACATTCAGCATCAGATATTATAAGT
TCTATAGGAGTACTAATAGGCAATTATGTATCTTCTAGACCTGGAGATAGAGAGCACAATTATGGTCATG
AGAAAGCAGAGACATTAGTATCATTTGTGTTATCAATATTGCTTATTTTCGTTTCTATAACAATAGGTAT
AGAGGCAATTAAATCTTTATTTAACTTAGATGCATTAAGTGTTCCATCAATATTACCATTAGTAGTATCA
GTTATTTCAATCCTGATAAAAGAGTATCAATATAGAATAACAATAAAAGTTGCTAAAAAGATAAATTCAC
CAGCCTTAAAAGCTGATGCTTGGCATCATAGGTCAGATGCTTTATCTTCAGTAGCTGCTTTTATAGGTAT
AGGTGGTTCTATTTTAGGGTTTAAGCCACTAGACCCAATTGCGTCAATTGTAGTGGCTATATTTGTAGCT
AAAGTAGGAATTAGTATACTTATAAGTTCTGTTAATGAATTGATGGATGTTTCAGTTGACGAAGAAGAGA
TAAAAGAATTAAAATTTATTGTAGCAGATACAGAAGGTGTTAAAAATCTTGGTGATATAAAGACTAGAAA
ACATGGAGCTATGGCATATGTAGATTTGACTATATGTGTGGATGAAAATTTGACAGTTAAGCAAGGTCAT
GATATTGCTACCAAGCTTGAAAAACATATAATAAAACATATGGAATTTGTAAAAGGCATAACAGTTCACG
TTGAACCATGTACTAATTGCCAAGGAAATAAGTGTAATAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c3996226-3995045 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
TTGATAATATTTAAATATTACACTACAATATATCTTGAAATACCTATTATATTATGGAGGAAAATTATGA
TAAACGAGCAAAGAATTTTAAATGAGTTTCTTGAATTAGTACAGATAGATAGTTTATCTTTAAAAGAGGG
GAATGTTGCTAAAGTATTAGTTAAAAAATTAGAAGAAATAGGTTGTTCAGTAGTAATAGACAATGCTGGT
GAAAAAGCAAATGGAGAAACTGGTAATATAATAGCTACATTAAAAGGAAATAAAGAAGGAAAGAAAATAT
TATTTAGTTCACATATGGATACAGTAACTCCAGGTATAGGGGTAAAACCTATAGTGGATGAAGCAAATGG
AATAATAAAAAGTGATGGTACTACAATATTAGGTTCTGATGATAAAGCAGGTATAGCAGCTATATTAGAA
GGCTTAAGATATATAAATGAAAATAACATAGAACATACTGATATACAAGTTGTATTCTCTATATGTGAGG
AATGTGGATTAGTTGGAGCTAAAAATTTAGACTATGGAAAAATAGATTCTGAATATGCATTTATATTAGA
TAGTGGTGGTTCTCCAGGTGAAATAATAGTAAAAGCTCCTGCACAAGATGTAATAAATGTTAAGATATTA
GGAAAGACTGCTCATGCAGGTCTTGAACCTGAAGCTGGAATAAGTGCTATAATGGTAGCTGCCAGAGCAA
TAGAAAATATGAATTTACTTAGAATAGACGAAGAAACAACTGCTAACATAGGAATTATAAACGGTGGAAC
AGCTACAAATATAGTAACAGGAGAAGTTAATATAGTTGCAGAAGCCAGAAGTCTAAAAGAAAATAAATTA
GATGTTCAAACTAAACACATGGTAGAGACTTTTGAAAAAGCTGCAAAAGATTTTGGAGCTCAAATTGAGA
TAGATGTCAATAGAGCATATACACCAATAGATGTTAGTGAGGATTCTGAAATAATAAAACTTGCAAAGAA
GGCTTTTTCAAACTTAGGTATAGAAGGTCATACTGAATCTACAGGAGGAGGTAGCGATACAAATATATTA
AGTAAGAATGGTATCGAAGCTATAACTTTAGGAATTGGTATGAAAAATGCTCATACACTAAGTGAACATA
TAGCTATAAAAGACTTATATGACTCTGCTAAAATGGTAGTGGAGATAATAAAGGAAGCATAA
>ref|NC_013316.1|:c3997582-3996311 hypothetical protein CDR20291_3359 [Clostridium difficile R20291]
GTGGGTTCTAAAAGAAAGTTTAAAAGAGACTATATAATACTAGAAGCTAAAGACATAAACTTTAGATACA
AAGAACGAGTACTGCCAAAAGCTTTTGCAAAAGTTGAAGTAAATGATGAAAAAGCAATTATTGCATTATA
TGTAGAAAATCTAAAATATGTTAAAGATGGGTATAAAGCAGTAGCAATAAAAGATGACCATGGATTAATA
GACTTAGGAAATATAATTTTAAATGAACAAGGAAGAGGTGAATTTGTTTTAGATTTAGAAGATTCTGATG
ATGAGATAAAAGGTATTGCATTATTGTATGAAAGAAATATACCTTTAATTGGATTTAAGGGAAATAAGCT
TGAAAATTATGAGGACATATTATTTCAAGAGGTAGAGGAAGAAGAATATGAAGAATATGAAGAATATGAA
GAGTTGGAAGAAGACGAAGAGATAGAGGATAATGAGGAAAGTGATAGAGACGAAGATAGTGAAGAAGAAT
ATATTATAGAAGAATATGATGAAGATGAGTATGAAGACTATTGGGAAGATGATGAAGATATTGAAGAAGG
AGAGTTAAAAGCAAGAACGGAAGTAGAAGATTCTGGTGATGAGGAAATAGAAGAGTTCAATAATTATAAG
GAAATAGAAAATTATAATAGGGTTAAAGTACAGGAAGAATATATAGACATAGAATATGATGAGGAAGAAG
AGGAAGAAGAAGAAGTTTTTGAAGTAAATAGAGAAGAAGATAGGTTTGTTTCCTCAAAACCTACTAAATC
AAAGAAAGTTCAAAAAGATCAGAATAATATTGAAAAAATAAAAAGAGCTAATGGAGTAAGTCAAGGAGAG
AGTGGAAATAAACAAACCAGTACATTACTTATGCCAAGACAAATAAAAAAAGGTTTGAAATTATTTAAAG
AAGTAAAACCTTTTGTAACAGATTATATAGATAAGACAAGATGGTGGAAAATAGAGATAAATCCTACAAC
ACTGTGTGGATATACAATGCCTTATTTAGGATATTTAAACGTATTGAATTACACTATGTATAGTGATGCA
GTTTTACATTCATATAAATACAGACACTATTTATTTGGTGTTCAGTATGATGAATATAATAAGAGAAAAC
ATTATATTTATGCTATCCCAGGAAATAGAAATGAACAGCCAGACAATGGAAGCACAGGATTTTTAAGATA
TCAAGCTTGTGATAATAGAACAAATAGTTTAGGATATTGGCTATGTTTTATAGATTCTAGACAAAGAAAT
ATAGTTAGGTAA
>ref|NC_013316.1|:c3998517-3997648 dimethyladenosine transferase [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAGACTATCTTCACATAATGCAACAAAGGAAGTAGTACAAAAATATAATTTTAAATTTTCAAAGT
CTTTAGGTCAAAATTTCTTGATAGATAGTAATATAATTGATAAAATCTTATCTGGAGCTAGAATCACAAG
AGGAGATAATATCATAGAAGTAGGACCTGGTATAGGAACTCTTACTCGTGAGATGGGTAAAATAGCAGAA
AAAGTAGTGGCTATAGAAATCGATAGAAATTTAATTCCTATATTGAAAGATACCTTGTCAGATTTAGATA
ATACAGAGGTTGTAAATCAAGATATACTAAAAGTAGACATACAGGAATTAGTAAAAGATAAATTAAATGG
TGGACCAGTTAAGCTTGTAGCAAATCTTCCATATTATATAACTACTCCAATAGTTATGAAATTTTTAGAG
GAAGACATACCTGTAACAGACATAGTAGTCATGGTTCAAAAAGAAGTTGCAGATAGAATGAATGCTATTC
CGGGTACTAAAGATTATGGGGCATTATCTATAGCTGTTCAATACTATTGTGATACAGAGATTGTGGCAAA
AGCTCCAAGACATATGTTTATACCACAACCAAATGTAGATTCCACAGTTATAGGTTTACATGTAAGAGAT
AAAAGAAAATATGATGTTCATAATGAAGACATATTTTTTAAAACAGTAAAAGCATCCTTTGGACAAAGAA
GAAAAACTCTTCTTAATTCGTTGGGAGGTCTTGGTTTTCTTAATAAAGATGAAATAAGAGAAATATTAAA
AGAAGCTAATATAGACGAAAAAAGAAGGGGTGAAACTCTTAGTATAGAAGAGTTTTCAGTTCTTTCAAAT
ATAATAAATACAAAAGTATCTTCTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c3999218-3998688 putative DNA-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAAAGAAATAATAGTAGTAGAGGGTAGAGATGACGTTACAGCAGTTAAGAGAGCAATAGATGCAG
AACTTATAACTACAGGTGGATTTGGATTTCCAAAAGGTGTAATGCAGCGTATAAAAGCTGCTAATGAAAG
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GTTCCAGGATGTAAACATGCATTTCTACCAAGAGAGGAAGCTAAAAAGGATGGAGATATAGGTATTGAGA
ATGCTACTCCTCAAAGTATAATAGCAGCTCTGAATAAAGTTAGAACTGAAAATACAGAAAAAAGAGATGA
ATTTAAGCAAGTTGACTTAATTAGAAATGGTCTTATAGGTAATGAAGAAGCATCACTTAGAAGAGATGCA
CTTGGAAAAATACTTGGAATTGGATATGGAAATGCAAAACAATTTTTAAATAGATTGAATAATTATGGAG
TTGAAAGAGAAGAATTTATAGATGCATTAAAACAAATCTAA
>ref|NC_013316.1|:c4000477-3999410 putative iron ABC transporter, solute-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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GTAATGTTTCATCAGGTTCAAACTTAAAGTCTAATAATAAGACAAAAGGAGAGTTAACAGTTTATACAGC
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GTACTTAGATTATCAGTAGGAGGTATAACAGCAAGATTATTAGCAGAAAAAGATAATCCTAAAGCAGATG
TGTTATGGGGTGTTGCAGCTACAAGTTTGATAATTTTAGATGACAAAGAAATGCTAGAGCCATACGCTCC
GAAAGGCTTTGATAAGGTAAATCCTGCATTTAAAGATGATAAGAAAGTTCCTTCTTGGGTTGGAATAGAT
GCTTGGATGACTGGTATAACAGTAAATACTAAAGAATTAAAAGCTAAAAACATATCAGCTCCTAATTCTT
ATGAAGATTTAATAAAGCCAGAATATAAAGATCTTATATCTATGCCTAGTCCAGCTTCTTCAGGAACAGG
ATATTTAACAGTATCAGAACTCATACAAATTATGGGTGAAGAAAAAGCATGGCAGTATATGGATAAATTG
CATAAAAATATTGGTGTATACACTCAGTCTGGTTCAGCGCCAGCTATATTAGCAGCTTCAGGAGAATATC
CCATTGGTATATCTTTTGGAAATAGAGGTATAAAGTTAAAAGGTGAAGGTTATCCAGTAGAAGTAGTATT
TCCAAAAGAAGGTTCTGGATGGGAGATAGAATCAAATGCACTTGTGAAAAAAGATAATATAAAAGAAGCA
TCAAAAGTATTTTTAGATTGGGCTATAAGTAAAGATGCAATGAATGAGTATTCTAAGAATTTTGCAGTTA
CTACAATTGACACGGGAAATCCGGTGCCAGAAGGATTTCCAAAGAATCCATTAGAACAGATGATAGATAA
TGATTTAAAATCAGCAGCAAGAAATAGAGAGGCTATACTAAATAAATGGATAGAAAAATATGATGGAAAG
ACAGAAAAAGAGAGCTAA
>ref|NC_013316.1|:c4002346-4001243 putative iron ABC transporter, solute-binding lipoprotein [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAGCAAAAAGATGTTGCATAGGGGAGGAAAAAATGAAATTTAAAAAGCTAGTTTCTTTAGGAGTAT
TATCAACACTTTTATTAAGTGTAATAACAGGATGTAGTACTGATTCATCAGGTTCAGATTCAAAGTCTGA
TAGTAAGACAAAAGGGGATTTAACAGTTTACACAGCAATTGAAGAAGATAGTATAGAGCCATATTTAGCT
ACATTTAAAGAGAAATATCCAGATATTAAATTAAATATTGTTAGGGCATCAACAGGAGATATAACAGCAA
GATTATTAGCAGAAAAGGATAATCCTCAAGCAGATGTTGTATGGGGAGTTGCAGCCACAAGCTTATTGGT
TGCAGATGACCAGGGGATGTTAGAACCATATGCTCCAAAAGGTTCTGAAGAAATAGAGTCTGCATTTAAA
GATGATAAAGAAGTTCCTTCTTGGGTTGGGATAGATGCTTGGATGACAGGTATAACAGTAAACACTAAAG
AATTAAGTGATAAGAACATCCCAGTTCCTAGTTCTTACGAAGATTTAATAAAGCCAGAATATAAAGGTCT
TATATCTATGCCTAATCCATCTTCTTCTGGTACAGGGTACTTAACAGTATCAGCCCTTATACAAATTATG
GGGGAAGAAAAAGCATGGCAGTATATGGATAAGTTGCATGAGAATATTGGTGTATACACTCAATCTGGTT
CAGCTCCAGCTACATCAGCAGCTTCAGGAGAATATCCTATTGGTATATCTTTTGGATATAGAGGTATAAA
ATTAAAAGAGGAAGGCTATCCAGTAGAAGTAGTATTTCCAAAAGAAGGTTCTGGATGGGATATAGAAGCA
AATGCTCTTGTGAAAAAAGATAATATAAAAGAAGCATCAAAAGTATTTTTAGATTGGGCTATAAGTAAAG
ATGCAATGAATGAATACTCTAAGAACTATGCAGTTACTACTATTTCTACAGGAAATCCAATACCAGAAGG
ATTCCCTAAAAAGCCATTAGAGCAAATGATAGATAATGATTTAAAATCAGCAGCAAAAAATAGAGAAGAT
ATACTAAATAAATGGATATCAAAATATGATGGTAAGACAGAAAAAGAGAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c4004010-4002322 putative iron ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGATAACATCAAAAAATAAAAGAAGAATAAGTGATAGCACAATACAAAAATATTTCTTGATTTTTTCGG
TAATTGTACTAATAGTATTTATATTATTTCCATTAGTATCATTATTAAAAAATGCATTTATGGATACAAG
TGGAAATTTTATAGGAATTTCAAACTTTAGTAAATATGTTGAAAATCCAAGTCTTATAGCATCATTTAAA
AATTCAATTTTTGTATCTACAGTCTCATCTTTAATATCACTATGTTTAGCATTTATATATTCATACGCAA
TAACAAGAACAAATATAAAGTTTAAAGATTTTTTTAAAACTATGGGAATGTTTCCACTTTTTGCACCAAC
TATGTTATATGGTATTTCACTTATATACCTTTTTGGAAATAAGGGAATCTTTACAACCATGGGTCTGGAA
GTACCACTATATGGTCCATTAGGAATAATTATTTCTCAGATTCTATTTACATTTCCACAAGCTTTTTTAA
TATTATCTGTAGCACTTTCGATGGCTGATTATAGACTTTATGAAGCAGCAGATAGCTTGGGTGCTAGTGA
ATTTAAGAAATTTTGCAAAATAACAATTCCTGGTATAAAGTACTCATTACTTAGTTCATTCTTTGTATCC
TTTATACTTGCATTTACAGATTTTGGAGCAGCTAAGGTAGTCGGAGGAAACTACAATGTACTGGCTACTG
ACATATATAAACAAGTAGTTGGACAATTTAACATACCAATGGGAGCTACTGTTTCTATGGTAATGTTAAT
TCCTGTACTAATAGCATTTACATTAGATAAGATGGCAAGTAAGAAACAAGGTATGACCATAACTGCAAAG
TCTATGCCATATAAGATTAAGGAAAATAAGTTTAGAGATAGAGTATTTTTAATAGTATGTAGTTTTATAA
CATTGCTAATTTTTATTTTAATATTCGTTTCAGTTATAGGTTCAGTTATAAAGTTATGGCCATATAATTT
AAGCTTTACAATGGAACACTATACATTTAAAGGTATTTTGGGAAGTGGAATAAAAACATACTTAAGCAGT
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AGGTGGATAAGTTTCCTAAATTAAGACAAACAGCTTACCTTTTATCAATGATACCAATGGCCTTACCTGG
CTTAGTTTTAGGTATATCATATATAACTTTTTTTAACTCAGCAAGTAATCCATTAAATTTTTTATATGGA
AGTACAGCAATATTAGTTATAGTAAATGTAGTTCATTTTTATTCAGTTTGTTTTATAACCTCAAATTCAT
CTTTAAAAATGTTGGATAAAGAGTATGAATTAGTTGCAAAATCTATAAATATTCCATTCTATAAAGTATT
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ATGGTTACTGTTTCAGCATTAATATTTTTATATATACCTCAAACTCAGACTGCATCAATATCAATACTAA
AGTTAGATGAGATAGGATATATAGGACCATCAGCTGCTATGGCAGTATTAGTGCTATTAACAAATATAAT
AGTAAGACTTTTGTACGAATTTGTAACAAAGAAATTAAAAAATAACACACAAAAATGGCAGCAAAAAGAT
GTTGCATAG
>ref|NC_013316.1|:c4005023-4004028 putative iron ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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TTGATATTGAAAAAGGAGAGTTTATTTGTTTACTAGGTCCAAGTGGTTGTGGAAAAAGTACACTGCTTAG
AATAATTGCAGGGCTTGAGGATAAACATGGTGGAAAAATAATAATAAATGATAAGGATATGACTAATTCA
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TCTAGACGTTGTAGAATTAAGTGGATATGAGAAAAAATATCCATCACAATTATCAGGTGGACAACAACAA
AGGGTTGCATTAGCTCGTGCGATTGCTTTAGAGCCAGACTTTTTACTTCTTGATGAACCTTTATCTGCAT
TAGATGCAAAAGTAAGACTTAAACTTAGGGAGCAGATTAGAAGTTTACATAGAAAACTAGGCATTACAAC
TATAATGGTAACGCATGACCAAGAAGAAGCTCTTTGTTTAGCTGATAAGATGGTTGTTATGAATAGAGGA
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TAGGAACAATAAATTTTATAGATGATGGTATTAATAAGATAGCTATTAGACCAGAAGATATAAAAGTAGA
GTCTAATAGAGATTCTAAAGATAAGGATATAAAAGTGGGAGAAATTTTAGATATCGAATTTAGAGGATTT
AACTATAGAATTACAGTTGAGTATCGTTCTAAGCAAATGAAATTAGATGTAGTTTCCAAAGTTGCAGAAC
AAATGAAACTGTGCATAGGTTCTAAAATAAACTTTAAGATACCTAAAGAAGGAATTGTACAATATAAATC
AGAGGGATGTGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c4005860-4005024 putative phophoesterase [Clostridium difficile R20291]
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AAGCAGCAGAAAAGAATATAAATATCTTAGCAATAACAAATCATGACACATTATCTGGATTGGATGAAGC
TCTTGTGCTTGGAGAGCATTATGGAATAACAATAATACCAGGTATAGAAATTTCAGCCTATGATTATAAA
AATAGAAAAAGAGTTCATATTCTTGGATATAACATAGATTTAAACAGTCAAGAAATAAAAAATTTGTGCA
ATCCAATGGTATGTGACAGACATAAAGCATCTGTTAAGATGGTAAATAAAATTATAGATTTAGGATACAA
AATATCTTTGGAAGATGTAAAGAAATATTCATCAAAGACTGGAATATTTAAACAACATATAATGAAAGCT
CTTATAGATAAAGGATATACAGATAATATATATTCAAGTCTATATAAAGAATTGTTTCATAGAGGAAACG
GCAAGGTATATGTATCTTTAAAATATGTGGATTACAGAGATGCAATAAAAGCTATAAAAAATTCTGGTGG
AATTTGTGTGTTAGCTCACCCGGGTCAAATGGATAATTTTAGCGCTATTGAAGAGATGGTAAAAGTAGGA
TTAGATGGAATAGAAGTATATCATCCATCTCACAACAAAGAACTAGAAAAAGAGTCGCTTTCTTATGCTA
AGAAGTATAATCTAGTGGTCACAGGAGGCTCAGATTACCACGGATTTTATTCTCAACATAATTATGAACT
TGGAAGCAAGAGCTTAAATAAAGAAGATTTATTTAAGTTTAGGTTAGCTTTAGGAGGGGTATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c4007033-4005864 putative amidohydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAAACTAATTCATAATGCAAATATTGTATTAGAAGATATGATTTTAGAAAATGGTCATTTAATCA
TAGAGGGAGATACAATAAAAAAAGTATCAAATGATAGGATTGATTACGCATTTGACTTTAATGAGATAGA
TGAAATAATAGATGCAAAAAACTTATATGTAATACCTGGTATTATAGATATTCACAGTGATGCCATTGAA
AAGGAAATAGAGCCAAGACCAAGTACATTATTACCATTTAATATGGCATTTTATGAACTAGATAAAAAAC
TACCTGCAAATGGAATAACTACAGTTTATCATTCTATATCTTTAGGGGATGGAGTAGGAGTTAGAAGTAT
TGATAACTCTTTAAAGATGATTAAAAATATTGATTCATATAAAAATATAGATAGTAAGAGTATAAATCAT
AAAGTTCATTTAAGATATGAAGTGTTGTATTATGAAGGTTTAGAAAAGGTTTTAGAACTATTAGATGAAA
ATAAAATAGACTACTTATCAATAATGGACCATTCTCCAGGACAAGGTCAGTATACAAATCCAACATTTTA
TAAAGAGTATGCTACTAAAGTGTGGGGAGTTACAGAAAATTATGTAGATACATGGTTAGATGATTTAGTA
AATCTGCATGATAATTTAGATTGGAATAAAATAGCTAATATTATAGGTATAGCCAAAACTAAAAATATAA
ATGTTGCATCACATGATGATGATACATTAGAAAAAATGGATTTCATAAAAAATATAGGCATAAATGTATC
TGAATTTCCTATAACTCTTGAAGTTGCAAAACATTCAAAAAAATTGGGTGTTCTAACTTGTTTAGGTGCA
CCGAATATTGTAAGAGGTAAATCTCATAATAACAATTTAAAAGCAATGGATGCTATATTGGAAGATTGTT
GTGACATTGTGTGTTCGGATTATCTTCCATCAGCTATGATAAAGTCTATGTGTATAGTTGCAGAAAGAAT
AAATAATTTAAATAAAGCAGTCAGTTTATTTACCTCAAATCCTGCTAAAGCAGTTGGTATATATGATGAA
AGAGGTAGTATAAAAGAAAATAAAAAAGCAGATTTAGTTTTAGTAGATATTGATAGTGAATATCCAAAGG
TTTTAAATACTATTGTAAATGGAAAAACAGTTTATAAAAGGGAGGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c4007765-4007034 phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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ATGCATTGAACAAGACTATAACGGCATGTAGTAATATAAGTTTTGAAGTTTCAAAAGGTGAGTTTTTAGG
AATAATAGGTAAATCTGGAGCAGGTAAGTCTACCATATTAAAAAGTATCTATAAAACATATATACCAACA
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TGATAAATCTTAGAAAGAAAGAAATAGGATATGTATCACAGTTTTTAAAGACACTTCCACGAATAACTGC
AATTGAACTGGTAGTACATTCTTTAATTGAGAGTGGGTTTGAAAAAGATTGTTCGTATGATATGGCAAAA
GATATACTTAACCAATTTGAAATAAAGGAAAATTTATGGGATGCGTATCCAAATAATTTTTCTGGTGGAG
AAAAATTAAGATTAAATTTAGCTCAAGCTATGGTTAAAAAGCCTAGACTTTTGTTACTTGATGAACCAAC
TGCATCACTTGATAATCAATCTAAAATATATGTAAAAGAAAAAATGTTGGAACTTAAAAGTCAAGGAACT
ACAATGATAGGAATTTTTCATGATATAGAGTTTATGGAAACTGTTATAGATAAGACCTTTACTATGGCAA
AAGGGACTATAAGTGAAAGTGGGGTAGCCTAG
>ref|NC_013316.1|:c4008654-4007788 phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAAATAAATGTCTCTAAAAGATTAGAAAATATAGACAAGCAAGTATTAATAGGAAGAAATATCA
ATCTTATTTATGGAGATGGGTGTGAAAAGTGTTTTGAAAGCACAGGATATGAAAGCAATAATATATGTAA
GTATTGTGGTTCTATAGTTGCATGTAATAATGTAAATTTAGAACTTTATGAAGGAGAAGTCCTTGGAATT
GTAGGTGAATCTGGTTCAGGAAAAAGCACTTTATTAAAAATACTGTTTTTCCAAGAACATGCAAATAGTG
GAGAAGTATATATATCCCATTACAATAAAGACACAAATATACTAGAGCTTTCAGACCAAAAAAAGAGATA
CATAAAGAATCATTTTATGGGTATTGTGTATCAAAATCCCCACCTTGGTTTAAATTTAGACTTTAGTAGT
GGTGGTAATATAGCAGAAAAATTATTGATGGCAAATTTATATAATGTTGAAAAAATAAGAGATAGAGGCA
AAGAACTTTTAATAAAAACTAATATACCTGTAGAAAGAATAGATCATAAACCAAAATACTTTAGTGGGGG
AATGCAACAACGAGTTCAAATAGCAAAAGCTCTTTCAAATAACCCTCCAATATTGCTATTAGATGAGGTT
ACAACAGGTTTAGATGTTTCTGTGCAAGCGGAAGTATTGGATTTAATAAGAGAAATCCAAAGAGAACTTA
AGATTTCTATGATAGTTGTATCCCATGACTTTGATGTTATAAAGATGCTTGCTGATAGGACAATTGTAAT
GAAAAATGGAAGTGTGATTGAGTCTGGTCTTACAGACCAAATAATGGAGGACCCACAACACCCATATACT
CAGCAACTTATAAATTCATTGCTATAA
>ref|NC_013316.1|:c4009516-4008647 putative phosphonate metabolism protein [Clostridium difficile R20291]
GTGATATATAACTATGGTTTTTTAGACGAAAACACAAAAAAAGAAATAAGAAGAAAGATATTAAAAGCAA
TATCAATACCTGGTTATCAAGTTCCCTTTGGTTCAAGAGAGTTGCCTATAGCTAAGGGATGGGGTACTGG
AGGTTTACAATTAACACTATCATTAATTGGTAAAAATGATGTAGTAAAAGTAATTGACCAAGGAAGTGAT
GATTCTACAAATGCTTGTAATATAAGGAGCTTTATTGCAAGTGTAAGTAATGTAGAAACCACAAAAGATA
CATTAGAAGCTACATTGATTCAAACGAGACATAGAATACCAGAAGAAAAACTTAAATCTAATCAAATACT
AATATTTCAAGTACCAATACCAGAAACCCTTAGAATAGTAGAACCTAGTGAAGTAGAAACAAGAAGAATG
CATTCAGAAGAAGATTATAGTAGGATGTGGGTATATCTTTATGAAGATATAGTTAGATTTAATGATATAT
CTATAGCAGTTGAATATCCATGTAAAGTAAATGATAGATATTTAATGAATCCATCACCTATACCTAGATT
TGATATAAAAAAATTAAATATGTCAGACAATTTATTCTTGTTTGGTGCAGGTAGAGAAAAAAGAATTTAT
GCTATTCCTCCATATACAAAGGTAGAACCTTTAGAGTTTGAGGATTATAAGTTTGAAGAGGAAAAGTTTG
AAGGAAAATACTGTAGTTTATGTAACAGTACAAATACATTTTTAGATGAAGTATATGACAGTGACACTAA
TGAAAAGTACTATAGTTGCTCAGATACAAGTTATTGTGAAAAAGTTAGATTAAAAAATAACAGTATAGAT
GTGACAATAGGAGGTACTTGGAATGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c4010621-4009536 putative phosphonate metabolism protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTTATGTAGCAGTTAAAGGTGGAGAAGAAGCCATATTACAGGCTAAAAATATACTTGAGTTTTATA
GGGTAAAAGGAGATAGCTTGCCTATAGATGTAAAGCAGATTGAGGAACAAATGTCTTATGCTGTAGACAA
AGTAATGTCTGAAGGAAGTTTATACAACAAGGAACTATCAGCATTGGCTATAAAACAAGCTCAAGGTGAT
ATATTAGAAGCCTCTTTCTATGTAAGAGCTTTAAGGTCAACAATGCCTAGAATTACATATTCAGAACCCA
TAAATACAGAAGAAATGAGAATAAAAAGAAGAATATCAGCTACTTTTAAAGATATACCAGGAGGTCAGTA
TCTTGGGGCAACTAGAGACTATGAAAATAGAATATTAAATGTAGAATTATTAGAAGAAGATGAAAAAAAG
AATAGAGATTTTAGAGATAGTTTTATAAATGAATTAGAAACAGTAGATGAAATCCCTGAATTTACAAAAA
TATCTAATATATTTAGAAAAGAAAATTTATTACAAGAAGAAGTTTGTGAAAACAAATTGGAAGAAGTTAT
TGATGATATTACAAGAAATAGTTTAAGATTTCCAGTTTCTAGGTCAGCAAAGTTACAGGCATTGACTAGA
GGTGAAAGTGGAGTAGTGTCAGGTTTTGCTTATGCTATTGTAAGAGGTTTTGGTGATGAACATCCATATA
TAAGTGAACTTAGAACTGGTAATGTATTTATAAAAGTAAAACATCCCATCTATGAAGATGAAGAAATAAT
AATAGGTGATATGCTGGTTACTGAATGTGAAATAGTTTCAAAAGCATCACAAAATAAGACTGAAAATTCT
AAAACTAATTCGGAAGATAAAAATAAGATGTCTTTAGGATATGGTCTTTGTATGGGGAATAATGAGAATA
AGGCTATATCTATGGCCATACTAGACAAATCTTTGGAGCCAAATAGTGAAAAACTAGCACAAGATGAAGA
ATTTGTATTGCTTCATATAGATGGAATAGATTCATTAGGATTTATATCTCACTTTAAGCTTCCTCACTAT
GTAGATTTTAAAGCGGATGTAGAAAGAATAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c4011199-4010624 putative phosphonate metabolism protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGTAAATTATACACAAGAAATATATAGAAAGATGCTAGATAGTGCTTCGTTTCCTGGGAAATTAAATA
ATATAGATAATATAAATATAGAAAATAATACAAAACTATTGAATGGAGCAATTGGTATAGCAATCACTTT
ATTAGACCAAGAAGTTACCTTCTATATAGAAAATTATACTCAAAAAGATATAAAAAATATAAGAGCGCTT
ACAGTGTCAAATCAAATAGATTATAGAAAATCAGATTATATATTTTTAGATATTAATTCAGAAGTGGATA
TATTACAGATTAAAATAGGTTCTTTTGAATATCCTGATGAAAGTGCAACTATAGTACATCAAGTAAATGA
TTTATCAACGTACTCTCAAACTAAGTATATAAAGCTTGATTTGAGTGGTCCTGGTATAAAATCTAAAAAT
AGTATATATATAAATGGAATTAGAGAAGAATTTATAGAAAGATTATCTACCATAAATAAAGATTATCCAA
TAGGAATAGATTTGATTTTAGTAGATAAAAAAGGAGAAATTGCATTTATACCAAGGTCATCAAAATTAAG
TTGGGAGGTATTGTAG
>ref|NC_013316.1|:c4011645-4011214 putative phosphonate metabolism protein [Clostridium difficile R20291]
TTGTATACAGTTGATAGTACTAAGATATTGATAAATATGAACTTAGAGAAACTAGAAAAGATATACTCAA
TGATAAAAGATACATCAAGTATTTCTATAATTAAAGAACCTAACTTGGCTACAGTAATGGTAAGAGCTAA
TGAAAGTGTAAAAAATACAACATTTAATTTAGGAGAGATATTAGTTACTGAATGTAGTGTAAAGGTAGAT
GAAAGCTTGGGTTACGGAATAGTTTCAGAAAACAATAATAAGAAAGCCATTTACTTAGCAGTTATAGATG
CAGTTTTACATAGCAATAACAGTAAATTTGATGAGTTAAAGAATTACATAAATAAAAGTGTATATGAAGA
GAACTTAAGGTATGAACAAGAGATTATTGATGAATTTAGCTTGATTAATAAAACGAAAGTTCAATTCAAT
GCTATGGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c4012752-4011982 putative deoxyribonuclease [Clostridium difficile R20291]
ATGTTATTTGACTCACATGCACATTTAAATGATGAAAGTTTTGATGAAGATAGAGATGAACTTATTGGTT
CATTAAAAGATAAAGGTGTAGATTTGGTTGTAAATCCAGGAGCAGATATAGAGACGTCGATAACAGCAAT
TGAACTTGCGAAAAAATACGACTTTATATATTCAGCAGTTGGGGTACATCCACATGATGTATCAAAACTA
GATGATACAGCAATAGAAACTCTAAGAAAACTTGCAACTGAGAATGAAAAAGTTGTAGCTATTGGAGAGA
TTGGATTAGATTATTATTATGATTATTCTCCAAGAGAAGAACAAAAAGAGTGGTTTAAGAAGCAAATTGA
ATTAGCTAATGAGCTAAAACTTCCAATAATAATACATGATAGAGATGCACATGGAGATACTTTTGAGATA
ATAAAGAATACTAAAAATCCTGAAATAGGATGTGTACTTCATTGTTATAGTGGAAATGTAGAGTTAGCTA
GAGAATATGTTAAGATGGGTTGTTATATATCAATTCCAGGCACGGTTACTTTTAAGAATAATAAAAAAAC
TAGAGAAGTAGTAAGAGAAATACCTCTAGAAAGATTATTCATAGAGACTGATTCACCATATATGTCACCA
GAGCCACATAGAGGAAAGAGAAACAATCCTTCTCAAGTATCTTTTGTTGCTGATAAGATAGCCCAGGAAA
AAGGGATATGTTATGAAGAAGTATGTAGAGTTACAAAAGAAAATGCAAAGAAATTTTTTAATATAAAATA
G
>ref|NC_013316.1|:c4014719-4012782 methionyl-tRNA synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCAAACCGAGTTTTTATGTAACAACACCAATATACTATCCAAGTGGAGGATTACACATAGGACATA
CTTATTCAACAGTAGCTGCAGATACAATAGCTAGATTCAAGCGTTTCTGTGGATATGATGTAAAGTTCTT
AACAGGAACAGATGAGCATGGTGAAAAAATTCAAAAGAAAGCCATAGAACAAGGAATGTCAGAGATAGAG
TATCTTGATGGAATGATAAAAGATATAAAGGCCTTATGGAATACTATGGATATATCTTATGATGATTTTA
TAAGAACTACAGAAAAAAGACATACAGACATAATACAAAAGATATTTACTAAACTATATGAGCAAGGTGA
TATATATAAAGGTGAATATGAAGGTAGATACTGTACTCCTTGTGAGAGTTTCTGGACAGAATCTCAATTA
CTAGAAGGAAATAAATGCCCTGACTGTGGAAGAGAAACATATTTAGTAAAAGAAGAATCTTATTTCTTTA
GATTATCTAAATATGAAGACAGATTAAAAGAGTTATTTAAAGATGATAGTTTCTGTTTTCCTGCTGCTAG
AAAAAATGAAATGGTGGCAAACTTTTTAGACAAAGGATTAGAAGATTTAAGCGTAACTAGAACGACTTTT
GACTGGGGTATAAAAGTTCCTTTTGATGAAAAACATGTAATTTATGTGTGGGTAGATGCTTTATGTAACT
ATATAACAGCATTAGGTTATATGACTGATAATGATGAAGAATTTAAAAAATATTGGCCTGCCAATGTTCA
AATAGTAGGTAAAGAAATAGTGAGATTCCATACAATAATATGGCCAGCGCTTTTAATGGCTTTAGGTCTA
GAAGTTCCAAAACAAGTATTTGGACATGGATGGATACTATTTGCTGATGATAAAATGAGTAAATCAAAAG
GTAATGTGGTTTATCCAGAACCTATAATAGAAAGATATGGAATAGACACACTTAAGTACTTCTTATTAAG
AGAGTTTGCATTTGGGCAAGATGGAAGTTATACTCATAGAAATTTTGTAACGAGAATAAATTATGATTTA
GCAAATGATTTAGGAAACTTAATAAGTAGAACTGTAGCTATGGTTGAAAAATACAATAATGGTATAATAC
CAACAGCAAAAGTTTCAACTGATTTTGATGCTGACTTAAAAGAACAAGCTGTTTCAACTAGAGAAAACTT
TGAAGCTGAAATGGATAAAATGCAATTCCATGAAGCATTAGAGAGTGTATGGAAATTAGTTAGAAGAACT
AACAAATATATAGATGAAACTATGCCTTGGGCACTAGCTAAAGATGAAACGAAGAAAGATGAATTAGACA
CAGTTTTATATAATTTATGTGAATCTATAAGAATAATCGCAACACTAATAAATCCTATAATGAATGAGAC
TGCTAATAAAATATATGAACATATAGGAATAAAAGGTCAAGATGATATAACTACATGGGAAAGTACAAAA
ACATTTGGTCTTATTGGAGAAAATGTAAAAGTATTTAAAGGTGAACCTTTATTCCCAAGATTAGATGTAG
AAAAAGAGATAGAAGAATTAACTAAAATGTTCTCTGGGAAACCTCCAGTAGAAGAAAAACCTTTAGAGCA
TAAAGAAGAAATTACTATTGATGATTTAGACAAAATAGAGCTTAGAGTAGGGAAAATAATAAGCTGTGAA
AAACATCCAAAAGCAAATAAATTATTAGTATCACAAGTTAAGATTGGACCAGAAACAAGACAAATAGTAT
CAGGAATAGCTGAATACTATAAGCCAGAGGATTTAGTAGGAAAAGAGGTTACAGTGGTATGTAACTTAAA
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GTTTTACCATTTACACAAGGGGCTAAAGATGGATGCGAGGTTCGTTAG
>ref|NC_013316.1|:c4015636-4015115 spore maturation protein B [Clostridium difficile R20291]
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AAATAGATGTGTATGATAGTTTTGTAAAAGGAGCAATTGATGGATTAAAAGCAGCATGGGATATCCTACC
ATATATAATAGGTATATTTTTGGCAATAGGAATATTCAAAACTGGTAAAGGTCTTGATATGTTAGAATGG
CTATTTACACCAATAGCAAATATGATGAGTATACCAAAAGAATTAATAGGTCTAATAAGTGTAAAACCTT
TATCTGGAAGTGGTGCTTTAGGGATGTACAGTGAACTTGCAAATAGAGTTGGAATAGGAAGTTTAGTAGA
AAAAATGGGTGCTACGATTGTAGGTTCTTCTGAGACTATTTTTTACACAATGGCAATATACTATGGAAGT
CTGAAGATAAAAAATACTAGACATACATTATCATGTGCTATGATTAGCCATGTTGCAGGTGTCATAGCAG
CTGTTTTTATTTGCTATGTAATATTTGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c4016236-4015652 spore maturation protein A [Clostridium difficile R20291]
ATGATTATAATAGGAAAAATATGGTTTTATATGGTATCGATAGGAATAATAGGAAGCTTGATTTCTAAAA
ATATGGGTGAATTAAATAAAGTTATATTAAGTGAAACATCAAAAGGTATAGAGTTTGCAATAAGTCTAGC
TGGTATCATGGCACTCTGGATGGGGATAATGAATATCGCAAAAGAATCAGGTTTAATTGAAAAGATAGGT
CAAAAACTAAATCCTATAATGAGAAGATTATTTCCTTCTATTCCAAAGGGTCATAAAGCAATGTCTTATA
TAGTTATGAATATTGCTTTAAATATGTTGGGTGCTGGAAATGGTGCAACAGCATTTGGTTTAAAAGCAAT
GAGTGAGCTTCAAACTTTGAATAACAAGAAAGATACAGCCACTAATGATATGATTATGTTTATGGTAATC
AATATATCATCTATACAAATAATTCCATTTACTATAATCAAATTAAGGATGGATATGGGGGCTCAAAATC
CAAGTGAAATAATTTTTACGACTTTATTTGCAACCATAATATCTACAGCAGTAGCAATAATAACATGTAA
ATTTTTTCAAAGAAGATATAGATAA
>ref|NC_013316.1|:4016368-4017798 putative nicotinate phosphribosyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAATCTAACACTTCTTACTGATTTATATCAGCTTACTATGTTAAATGGCTATTTTGAAAAGAATA
TTCATGAAGACATTGTTGTATTTGATATGTTTTTTAGAAAAAACGCTTGTGATGGAGGGTATACTATAGT
TTGTGGTATTGATCAGGTTGTTGAATACATAGATAATCTTCATTTTTCAGATGAAGATTTAGAGTACTTA
AAAAACTTAAATTTATTTTCTGACAAGTTTTTAAAATTTTTAAAAGAATTTAAATTCACAGGAGATATAT
ATGCTGTTGAGGAAGGAACTATCATGTTCCCTAATGAGCCATTAATTACTGTTAAGGCACCTTTATATCA
AGCTCAACTTATTGAAACAGCATTGTTAACAATAGTTAATTTTCAGTCTCTTATTGCTACTAAAGCCTCT
AGAGTTTGCTTTGCAGCTCAAGGAGACCCTGTATTTGAATTTGGATTACGTCGTGCACAAGGTCCAGATG
CAGGGATATATGGAGCTAGGGCTGCTGTAGTTGGTGGTTGTGCTGGAACTGCAAACGTACTAGCAGGGAA
AATGTTTGATATACCTATAATTGGTACACAAGCTCACAGTTGGGTACAAAAATTTGATAATGAACTTGAA
GCATTCCAAGCATATGCTGATGTTTATCCAGATAAATGCCTACTACTTGTAGATACTTATGATGTATTAA
ACAGTGGAGTTCCTAATGCAATAAAAGTATTCAAAAATATTTCTGAAAAAGGATACAAACCTATGGGTAT
AAGACTTGACTCTGGAGATTTAGCTTATTTATCTAAAGAAGCTAAAAAACAATTAGATAACGCTGGCTTT
TCAGATATCAGCATCACTGCATCTAATGACCTAGACGAATATACCATAACATCACTTAAAGCAGAAGGAG
CTACTATAAATTCATGGGGAGTAGGTACAAAGCTCATTACATCTTTCGATTCACCTTCTCTTGGAGGAGT
TTATAAATTAGCTGCATCTTGTGAAAAAGGAGTTCTTGAACCTAAGATAAAGATTTCTGAGAATCCAGAA
AAAATAAATAATCCTGGTTACAAGAAAGTTATAAGAATATATAACGAAGACAATAAGGCAGAGGCAGATT
TGATTATGTTACATGATGAAGTTATAGATGAGTCTAAACCTTTAGAAATCTTCCATCCTACTTATACATG
GAAAACAAAGGTATTTACAAATTACAAAGTTAAAGAGCTTCTTAAACCATTGTATATAAAAGGCAGATGC
AAATATAATAAAAAAGCTGTTCTTGAAATAAAAAATCATGTACAATATGAATTAAGTACTATCTGGGAAC
AATACAAAAGACTTTCAAAACCACACATTTATAAGGTTGATTTATCTAGAAATCTTTGGTATTTAAAAAC
ACAAATGATAGATTCTAAAAAAGTTTTATAG
>ref|NC_013316.1|:4017835-4018263 AsnC-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGGATGTTACAGATTACAGAATCATAGAAATTTTACAGGATGATGGGAGAATTTCTATGAAGGACTTAG
GAAAAATAGTTGGTTTAACTTCTCCTGCAGTTTCAGAAAGAGTCAAAAGATTAGAAGAGTCTGGTGTTAT
AGAAGGATATAAAGCTATTGTCAACCCAGATTCATTAGGCAGAGTTATAAAGGCATTTATTCATATTTCT
CTTCCAAGCAATGGATATACAGAATTTATTGAGTCAGCTGCAAAGGACCCTAGGATTGTAGAATGTCACC
ATATAACAGGTGATGATTGCTTACTTTTAAAAGTAATTGTAAAAGATATGTACGAGCTAGAAAATGTGAT
TGATACTATAAAGAAAATTGGTTCTACTAAGACCTCTGTTATACTATCAACGCCAATACAAGCAAAATCA
ATATTGTAA
>ref|NC_013316.1|:c4019155-4018451 hypothetical protein CDR20291_3380 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAATAGGGAAAATTATAATAGAGAGTTTAAAGAGGGAAGATACACATAAAATATTTATAGAATTAG
ATAATAAGCATGAATTAGAAAAAATAATTCCTAAAATAAGCTGTATGAAGTCTGTAGGTGAATGTAAATA
TCATGTAGTAAATTGTTTTGAACATTCTATAAATGCATTAAAAGAATTAGAAATAGTATTAAATGATAAG
GATTTTTTTCCAATACATCTAAGAAAACATGTGTCAAACTATTTAAACACATATATTGAAGAAGGAATAA
ATAAGTTACATGTATTAAAGTTGGGAACATTTTTACATGATATAGGTAAGCCTGATAGTATGACCTTAGA
TGAAACCGGAAGAGTTCATTTCACAAATCATGAAAAAATAGGTGCTCAAATAATTGACAATATGGGAATA
AAGTTAGAGTTATCAACAGAGACATATAGACTTATAAGTAAATATGTAAGATATCATATGATACTTTTGT
CTCTATATAAGAAAAATGATTTGAGTAGGAAAGAATTAATTAATGTATTTAACTTAGTAGATGAGGACAC
TATAGGTGTAATAATGCTTGGGTATGCAGATATAGTGTCTACAGTAAAATTATTGGGCAAGAGTGGAGAA
GTCAGTGTGTTAAAGACATATATGGAATATATTTTAACAAATTACTTGTATAAGAGTAATTATACACATG
TATAA
>ref|NC_013316.1|:c4020011-4019178 putative corrin/porphyrin methyltransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTGGGAAATTGTACATATGTCCAACACCAATAGGAAACCTAGAAGATATAACATATAGAACTTTAA
GAACATTAAAAGAAGTAGACTTGATTGCAGCAGAAGATACAAGACATAGTATAAAACTTTTAAATCATTT
TGAAATCTCAAAACCACTAACTAGTTATCATGAACATAATAAGGATTCAAAGGGAGATTATTTGATAAAT
AAACTAATTGATGGTGAAAATATAGCTCTGATAAGTGATGCAGGTATGCCTGGTATATCTGACCCAGGAG
AAGAGATAATAAAACAAGCTATACAAAATAACATAGAGATAGAAGTATTGCCAGGTGCAACAGCCTTTGT
AACGGCTTTAGTTGGCTCTGGTATGGACACACATAGATTTGTTTTTGAGGGCTTTTTAGATAGAGATAAA
AAAGTTAGGAAAGCACAATTGGAAGAATTAAAGGAAGAAAGTAGAACTATAATTTTCTATGAATCACCAC
ATAGATTGAAGGATACACTAAAAGATATGCTTAAAATTCTTGGTAATAGGAATATTTCTATAAATAGAGA
ACTTACAAAAAAATATCAAGAAATAATAAGAGAAAATATAGAAACTACCATAAAAATATTTGAGGAAAAA
GAAGTAAGAGGAGAGTTTGTATTAATAGTAGAGGGTTTTCATGGTGAGAAGTCAAAGAAAGAAAATTATG
ATGGGCTTACAGATAGGGAATATGTTTTAAAACTAATTGAAAGTGGTATGAACAAAAAAGATGCAATAAA
AATAGTTTGTAAAGATAGAAAGTTAAAGAAAGATGTGGTTTATAAACAAGTTTTAGATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c4020758-4020012 hypothetical protein CDR20291_3382 [Clostridium difficile R20291]
ATGCAATTAAAAGATTCAGAAAGAATAGATGATTTACAATTAAAAGGCCTTAAAATTATACAAGATACTA
ATGGTTTTTGTTTTGGTATAGATGCAGTTTTATTAGCCAATTTTACTAAAATAAAAAAAGATGCCAAAGT
AGTAGATTTGGGTACTGGAACTGGAATTATACCTATTTTGATAGCTGGAAAAAGTGAAGCTAAAAAAATT
ATTGGCGTGGAAATACAAGAAGATGTATATGAAATGGCAACTCGTTCTATAAAATTAAATGGATTAGAAG
AAAGAGTTGAGATTATAAATGAAGATATAAAATACATAGACAAAGTCTTAGACATAAATGGTTACCATGT
AGTCACATCAAATCCTCCATATATGCATATTGATGGAATAAAAAATCCAAATGATAAAAAAGCAATATCA
AGACATGAAGTAAGGTGCAATTTGGAAGATGTAATTAGAGCTTCATCCAGATTGGTTATGCCTAGAGGAA
AATTCTTCATGATACATAGACCAACAAGATTGGTTGATATAATAACTTTAGGGAGAAAATATAAATTAGA
ACCAAAGGTTATTCAATTTGTGCATCCAAGACCTCAAAAAGCACCGAACTTAGTTTTGGTTCAATTTGTA
AAAGATGGAAGACCAGAGCTTAAAATATTGGACCCATTGTATGTTTATGGAGAAGATGGGAATTATACAA
AAGAATTAAAAGCAATATATAATAATAAAGATATAGGAGAGTTGTAA
>ref|NC_013316.1|:c4021729-4020836 putative signal peptidase II [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAAGATAGTAGGTATAAGGTTTAAAAGTGCTGGGAAAATATATTATTTTGACCCTGTTGATTTTA
ATATAGAGCAAGATATGGATGTAGTTGTAGAAACTGCAAGAGGCTTGGAGTATGGGAAAGTAGTCGTTGG
TCCAAAAGATATGGATGAAAGCGAATTAGTTTCTCCTTTGAAGCCAATTATAAGAATAGCTACAGAAGAA
GATAAAAAAGTATATCTAGAAAATAAGGAAAAGGCAAAAGAAACTTTTGAGTTGTGCCAACAAAAAATAA
AAGAACATGAGTTAACAATGTTTTTAATAGATTGTGAGTATACGTTTGATAGGAATAAGTTGATTTTTTA
CTTTACAGCAGAAGGAAGAATAGATTTTAGAGAATTGGTAAAAGACTTAGCTGCTATATTTAAAACTAGA
ATAGAACTTAGACAAATAGGTGTCAGAGATGAAGCTAAATCTATAGGAGGTCTAGGGCCTTGTGGTAGAA
AACTTTGTTGTTCATCTTGGTTAGGTGATTTTCAACCAGTTTCAATAAAAATGGCAAAAGACCAAAGTCT
ATCTCTAAATCCAACAAAAATATCTGGAATATGTGGGAGATTATTCTGTTGCTTAAAATATGAGCATGAT
GTATATAGTGAAGCAATAGAAAAAATGCCTGTTGTAGGTGCATTGGTGCAATCAGATGATGGAAAAGGAA
AAGTTGTAGAAGTGAATCCTTTATTAGAACAAATTAAAGTGGAATTTCAAGACAAGACAGTAAAGATATA
CACAAGAGAAGATATAAAAATACTTAGAGAGCCTAAAAAATGTGATGGCTGTGGTGGTAAATGTAAGGAT
AATGATGGATTAGATGAAGCCACACTAAGAGAGCTAAAGAAATTAGAAGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c4022661-4021726 putative DNA polymerase III, delta' subunit [Clostridium difficile R20291]
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AACTTAATAATGCGTATATGTTTGAAGGAATGGATGGAATAGGAAAAAAGAAATTTGCAGATGAATTATC
AAAACTATTACTTGATTATGAAAATCTCGAAAATAGTCCAGACTATGTACTCATAAAACCAGATGGAAAT
AGTATAAAAATAGCTCAAATCAGAAATTTACAATCAGATATAGTAATAAGACCTCATAAAGACTATAAAA
TATATATAATCAATAATGCTGAAAAAATGACTGTGGAAGCTCAAAATGCACTTTTAAAGACGCTAGAGGA
ACCTCCAAACTATGCTATAATAATCTTAGTCACAAACAACAAGGAATCTTTATTAGAAACTATAAAATCT
AGATGTGATATAATAAAGTTCTCACCTATACCAATTGAAGACTTAAAACGTTATTTGATAAATACAGGTA
TAGAAGAAGAAAGAGCTCAATTATTGGCTATTTTTTCGAGAGGAAGTATTGAGAATGCTCTAAATCTATC
TCAGTCTTCTGAGTTTTCAATGATGAGAGAAGATATACAACAGTATATTCAGATAATGTTAGATAAAAAC
ATAGTGGAGATTTTAAATATACCAAACAATATGGAAAAATATAGAGGTAAGATTATAGCTTTATTAGATA
TGATGATAAACTATTTTCGAGATATCATCCTATTAAAAGAAAATGTAAACAAGAACATGTTAATAAATGT
AGATAAGCTAGTTTTCATTCAAAATATGAGTGGAAAAATTAGTTATTCTCAATTGTCCAAGATTATTGAT
ATAATAGAAGATGCAAAGAGTAAAATAAAAAGCAATTGCAATTTCAATATAAGCATACAAGTTATGTCTT
TAAATATATACGAGGTGATTAAATGA
>ref|NC_013316.1|:c4023368-4022664 putative thymidylate kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGATATGAAAATGAAAGGTAAGTTAATAATTATAGAGAGTGGTTCAGATGCAAGTGGAAAGGCTA
CTCAGACAGAAATATTATATGAAAGATTAAAAAAAGAAGGCTATATGATTAAAAAGGTAGAATATCCAAA
TTATGAATCTCCATCATCTGCCTTAGTGAAAATGTACCTAAAAGGAGACTTTGGTAAAAATGCATCAGAT
GTAGACCCATATATAGCATCAACTTTTTTTACAGCTGATAGGTATGCATCATTTAAAACCGATTGGGAGG
AGTTTTACAATGAAGGTGGAATAATTATCGCAGATAGATATACAACCTCTAATATGGTACATCAGGCCTC
TAAAATGGATATTTGTGATAGAGAAGAGTATTTAAATTGGTTAGCTGATTATGAATTTAATTTATTTAAG
ATACCACAACCTGATTGTGTTATATTTTTAGATGTGCCTATTGAATTTAGTAAAAAGCTTATGGAGAATA
GAAAAAATAAAATTACAGGGGAAGAAAAAAAGGATATTCATGAAAGTGACATAGAGTATTTAGAGAAATC
TTACAACAATGCTTTATATATAGCAGATAAATATGATTGGAAAAAAATAAATTGTGTTTTAGATAACAAA
TTAAGAAGTATTGAAAGTATACATAATGAAATTTATAAAATAGTTCTTGATTCAATAAAACCTATGGAGA
GATAA
>ref|NC_013316.1|:c4024893-4023484 putative arginine decarboxylase [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTATTATTAATGAATTAAATAAGATTGTAAATGAAGAAGTAATATCTTTTCATATGCCTGGTCATA
AAAAGGGACAGGTTTATAAAAAGTTAGGATATAAAGATATACTAAAAAATTTGTATAAAATGGATACAAC
TGAGATATTAGGAACAGATAATTTACACTTTCCGGAAGGAATTATAAAAAATTCACAAAAAAAAGCATCA
AGAGTATTTAAAAGTGATTATACTTGCTATTTAGTAAATGGTAGTAGCTGTGGAATACAATCTGCAATAA
TGTCAGTATGTAGTCCTAAAAGTAAAATAATAACAAATAGAGACTGTCATCAGTCTGTTATAAATGGATG
TATTTTAGGAGATATAGATATAGAGTATGTGCCTTGTGAGATAAGTGAAGAGACAAATGTCTTAAAAGGG
ATATCTATAAGTAATGTGATTGATATAATAGATAAAAACTTGGATGCAAAAGCAGTACTGCTTACTTATC
CTACATATTATGGAATGACATATGATTTAGAATACATATGTAATTATGCACATAGCAAAAAGATGGTAGT
GATAGTAGATGAAGCACATGGTGCGCATTTAGGGCTTAGTGAGAGGCTTCCTAAAACAGCTCTTGAGCAA
GGTGCAGATATAGTTGTACAGAGTACACATAAAACTCTTCCAGCATTTACACAATCGTCAATGATACATA
TACAGGGAGACCGAGTTGATATAGATAAAATATTGAACATGTTAAGAATTACAGAATCTTCAAGCCCTTC
ATATTTATTATTATCTTCTCTGGAATTAGCAGTAGATATATATGAAAATAAAGGAAAAGAATTAATGGAA
GAGCTTTTAAATAATATTAGAATTTTCAAAGATAAAGTTGATTCAAATATTAATATATATGACACAAATG
ATAAAACAAAAATATTTATATCATCTAAAAACATGGGTTTAACAGGTTATGAACTAGAAAATATTTTGAG
AAACAAATATAACATACAAGTGGAGTTATCTAATTATTATGGAGTTCTTTTAATATGTACAATAGGAAAT
ACTGCTGAGGATTTCTCTAGTTTAGAAACAGCATTAAACAATGTTGTAAAGGAAGACTTTAAATTTGAAA
AGTTAGAAAATAAAAAATACCCTGTTGTTATTCCAAAGAAAATATTAACACCTAGAGAAGCATTTTATAA
AACTAAAAAAAGTGTTAAAATATATGACAGCATAGGTAAAATTTGTGGTGAATGTATAGTTCCATACCCA
CCTGGAATAAGTGTAATATCTCCTGGTGAAGTAATAAGTAAAGAAATAATAGACTATCTAATGTTTTGTC
ATTCTAAAGGCATGATTGTGAGTGGATTGAAAGATGTAGATTTAAATTTTATACAAGTAATAGATTTAGA
AGACATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c4025239-4025048 hypothetical protein CDR20291_3387 [Clostridium difficile R20291]
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CAGACTTAATAGGTAGTATCTTTGGTGGAACATATGAAATGGTAAGTAGAATAATATACTTCATTGTAGG
TTTAGCTGGATTATACTTAATACCAAGTTTAATGTCTGATGATAGAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c4030790-4030509 hypothetical protein CDR20291_3388 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATATTTAGAATAATTTATGAGAAGGTAAAAAGAATAATTTATGAGAATACTATATATAAAAAAT
TATTGGGGGAATGTCTGATGTTTCAAGTAATTAATTTTTTATGTTTATTTTGTGTTGGATTTTTGGTTCT
TGATGTTATGATATATTTTTGTAAGGATGCAATGGATATTTTTGAGGGTACAACTAATGTTAATAAAGTT
AAGAGTATAAATATTTGGGCAGATAGAGTGAGAGCTAATTCATATTCTTATGAAAATAAAATTGCAAAAT
AG
>ref|NC_013316.1|:c4032541-4031012 lysyl-tRNA synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATAATCAACAAAGCAATGAAGAAGCGCAAATTCAAGAAGACCTTAGTGAAGTACTTCAAGTAA
GAAGAGATAAACTAAAAAAATTACAAGAGTCAGGTAGAGATCCTTTTAAAGAAAGTAGATATGATAGAAC
TCATTATTCTATGGATATAAAAGATAACTTTGATTCTCTTGAAGGTAAAACTACAAAAATAGCAGGACGT
ATAATGAGCAAGAGAATACAAGGGAAAGCTGGCTTTATAGATATTCAAGACCAAGAGGGAAGAATCCAAT
CTTATGTAAGACTAGATGCTATAGGAGAGGAAGAATATAGTGTATTTTCAACATATGATATTGGAGATAT
AGTTGGAATTGAAGGAGAAATCTTTAAAACTAAAAAAGGTGAAATATCTGTAAAGGCTAAATCTGTAGTA
TTACTATGTAAATCTTTACAAGTTTTACCAGAAAAATATCATGGATTAAAAGACCAAGAACTAAGATATA
GACAAAGATATGTTGACTTAATAGTAAATCCAGAAGTAAAAAATGCTTTTTTAATTAGAACAAAAGCATT
AAAAGCATTAAGAGCATACTTAGATGATAGAGGATTTTTAGAAGTTGAGACTCCAATATTAAATACTATA
GCAGGTGGGGCAAATGCTAGACCATTTATAACTAATCATAATACTTTACATATACCAATGTATTTAAGAA
TAGCAAATGAATTGTATTTAAAAAGACTTATTGTTGGTGGATTTGATAAAGTTTATGAAATGGGAAGAAT
GTTTAGAAATGAAGGTATGGATTTAAAACATAATCCTGAATATACTGCAATAGAATTATATCAAGCATAT
GCAGACTATACTGATATGATGGAAATAACAGAAAATGTTATTGCACATATGGCTGAAGTTGCTACAGGAA
GTATGATAGTTAACTATCAAGGAACAGAAATAAACTTTACACCACCTTGGAAAAGAATGAGTATGGAAGA
TTGTGTTAAAGAATATTCTGGTGTAGATTTTTCTACTATAAATACAGATGAAGAGGCACTAGAAGTTGCT
AGAGAAAAAGGTATAGAGATAAAACCTGGAATGAGAAGAGGAGAAGTAATAAATGCTTTCTTTGAAGAAT
TTGGAGAAGATAAATTAATCCAACCAACATTTATAACTCATCATCCAGTTGAAGTATCTCCATTATCTAA
GAGAAATGTTGAAGACCCAAGAAGAACTGATAGATTTGAGGCATTTGCTAATAAGTGGGAGTTAGCTAAT
GCATTTTCTGAACTTAATGACCCTATTGACCAAAAAGGAAGATTTATAGACCAATTGAGAAAAAGAGAAT
TAGGTGATGATGAAGCTTTTGAAATGGATGAAGATTTCTTAAAAGCATTAGAGGTAGGTCTACCTCCTAC
AGGAGGACTAGGAATAGGTATAGATAGAGTAATTATGTTATTAACTAACTCTCCATCTATAAGAGATGTA
TTATTATTCCCGACTATGAAACCTATTGATAACAATCCAAATAAAGAAGAAGAAAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c4033035-4032556 transcription elongation factor grea [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGAAAATAAAGAGTTTTTATTGACACAAGAGGGATATGATAAATTAGAAGAAGAATTAGAAAACT
TAAAGGTTGTAAAGAGAAAAGAAGTTGCAGAGAGAATAAAAGTTGCTATATCTTTTGGTGATTTATCTGA
AAATGCTGAGTATGATGAAGCTAAAAAGGAACAAGCACAAGTTGAAGAAAGAATTTTAAAATTAGAAAAT
ATGGTTAGAAAAGCTGTTATCATAGATGAAAGCAAAATAGACCTTAATGTTGTTACAATAGGATCAATAG
TTAAAGTTAAGGATTTAGAATTTGATGAAGAGGTTGAATATACTATAGTTGGTTCGACAGAAGCAGACCC
ATATGATGGTAAAATATCAAACGAATCTCCTGTAGGGAAAGCACTTTTAGGTAGAGCTGCGAAAGAAGTT
GTGGAAGTGCAAGTTCCTGATGGAGTTGCTAAGTTTGAAATATTAGAAATAAGAAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c4034112-4033144 tRNA-dihydrouridine synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATAGGAAATTTAGAATTGAAAAATAAAGTTTTTCTATCACCTATGGCAGGTGTAACAGACCTTC
CATTTAGATTAATTTGTAAAGAACAGGGATGTGGGCTTTTATATACAGAAATGATAAATGGTAAGGCACT
TTGCTATGATGATGAAAATACTAAAAAAATGCTTAAGATAGAAGAGGAAGAACATCCTGTAGCAGTTCAG
ATATTCGGTTCAGAACCAGAGTTTATGGGAAGAGCAGCAGAGATAATGAATGATTATTCAAATGAGATTC
TCGATATAAATATGGGGTGTCCAGCTCCAAAAGTAGTTAAAAATGGAGATGGTTCAGCACTTATGAAAAA
TCCTAAGCTTGCAGAAGAGGTATTGAGGGCAGTAGTGAAGAACTCAAAAAAGCCAGTGACTTTAAAGATT
CGAAAAGGCTGGGATGATAATAGTGTAAATGCTGTTGAAATAGCAAAGATAGCAGAGGATTGTGGAATAA
GCGCTTTAGCAATACATGGAAGAACTAGAGAACAGTTTTATACAGGCAAAGCAGACTGGGATATAATTGC
AGAGATTAAGAAAAATTTGAGTATACCTGTTATAGGAAATGGTGATGTATTTACAATAGAAGATTCAATA
AATATGTTAGACAAAACTGGTTGTGATGCTATAATGATAGGTAGGGGTGCTCAAGGTAACCCTTGGATAT
TTAAAAGAATAAACCATTATATGAATACAGGCGAGATTTTGCCAGAGCCAACTCTTAACGAAAAAATAAG
TACTGCCATTAAGCATTTAAAACTTGCAGTAGAAGAACATGGAGAGTATGTAGCTGTAAGGGAAATGAGA
AAACACATCGCTTGGTATTTAAAAGGACTTAGAAACTCTGCAAAATTAAGGGATGAAATTAACAAAATAG
AAGACTATCAAGAAGTTGTGTCGAAATTGGAGTACTATATGGAAGACTCCTTGACATAA
>ref|NC_013316.1|:c4035019-4034249 hypothetical protein CDR20291_3392 [Clostridium difficile R20291]
ATGCTTCTAGTATTTGATGTTGGAAATACTAATATGGTTTTAGGTATATATAAAGGTGACAAATTAGTTA
ATTACTGGAGAATTAAAACAGATAGGGAAAAAACGTCTGATGAATATGGAATCCTGATAAGTAACCTATT
TGATTATGATAATGTGAATATAAGTGATATTGATGATGTTATAATATCATCTGTAGTTCCAAATGTCATG
CATTCTCTTGAAAACTTTTGTATAAAGTACTGTAAAAAACAGCCATTAATAGTAGGTCCAGGCATAAAAA
CAGGTCTAAATATAAAATATGATAATCCAAAACAAGTTGGGGCAGATAGAATAGTTAATGCTGTAGCAGG
GATAGAAAAGTATGGAGCACCAAGTATACTTGTTGATTTTGGAACAGCAACTACATTTTGTGCTATCTCT
GAAAAAGGTGAATATTTGGGTGGAACAATAGCACCAGGAATAAAAATATCTAGTGAGGCGTTATTTCAAA
GTGCGTCTAAATTACCTAGAGTAGAATTAGCTAAGCCAGGTATGACTATTTGTAAGAGTACTGTATCAGC
CATGCAATCTGGAATAATTTATGGATATGTTGGTTTAGTTGACAAAATAATAAGTATGATGAAGAAAGAA
TTGAATTGTGATGATGTTAAGGTTATAGCTACAGGTGGATTAGCTAAACTGATTGCTTCAGAGACGAAAA
GTATAGATTATGTAGATGGTTTTTTAACACTAGAAGGATTGAGAATAATATATGAAAAAAACCAAGAATA
A
>ref|NC_013316.1|:c4035655-4035038 hypothetical protein CDR20291_3393 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGCTGGAACGGAGGTGTATTTTTTATGATGAACACAAGTGCATCAGTAAGAAAAGTAAATGTAAGAA
AGATGACTATAATAGGAGTACTATCAGCTATTTCTATTATGCTATCTATGACTCCATTGGGATTTATTCC
AGTTGGACCTACAAAAGCAACTATAATGCACATACCAGTTATTATTGGAGCTATTATGGAAGGACCAATA
GTTGGGGCAGCAATAGGATTTATATTTGGGATATCAAGTCTCTTAAATGCTATAACAAACCCAACAGTAA
CATCTTTTGTTTTTATAAATCCATTAGTTTCAATATTACCAAGAGTTATGATAGGTGTATTAGCTTATTA
TGTATATCAGTTAATAATTAAGGCTACAAATAAGGTATACATATCAGGTTTAATTACAGGGGCAATAGGT
TCTCTGTTAAATACAGCTGGAGTTTTAGGAATGATATATGTCTTATATGCTGACAAGTATCTTCATGCAA
TGGGTAAAAGTGGTTCAGCAGGAAAAGTAATAATGGCTCTTGCCGCAGCAAATGGGGTGCCAGAAGCAAT
AGTAGGGGCTTTAGTAGTAGCTGCTGTTGCCACTGTACTTAAGAAAAGCAAAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c4036780-4035812 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAATAATATTTTGGATATAGAAGGCTTAAAGGTTGGGCAGGTTGAGGATAGAAATGGTCTTACTG
GGTGCACAGTAGTAATATGTGAAGAAGGAGCTACTTGCGGTGTTGATGTAAGGGGTTCTGCTCCAGGGAC
TAGAGAAACCGATTTATTAGACCCTGTAAATATGGTTCAAAAAGTTCATGCAGTAGTTTTGGCTGGAGGT
TCTGCATATGGTCTTGAATCCACTTGTGGTGTAAGTAGATACTTAGAAGAAAAAGGAATTGGCTTTGATG
TAGGTGTAGGTAAAGTGCCTATAGTTGTAGGAGCAGTTTTATTTGATTTAGGAGTAGGGAGCTTTAAATG
TAGACCAGATTTAAAGATGGGTTATAGAGCTTGTGAAGTTGCAAATACTGATATTTTAAATCAAGGAAAT
TATGGAGCAGGTTGTGGAGCCACTGTTGGAAAAATAAGAGGTCAGGAATATGCTATGAAAGGCGGAATAG
GTAGCTATTCTATAAAATTAGATAATGGTCTAATTGTATCTGCATTAATTGCTGTAAATGCTCTTGGAGA
TGTTTATGAAAATGGTAAGGTTATAGCTGGTGCTTTAAATGATAAAAAGACAGAAACAATTGATACATAT
AAATTAATGAAACAAGGTGAAAGTAAAGGTGGATTTAGTGTAGATAATACTACAATTGGGATAATTGCAA
CAAATGCTAAGTTAACCAAAGCTGGATGTAAAAAGATATCTCAAATGGGACATGATGGATATGCTAAGTC
TATTTTTCCTATCCATACACCTCATGATGGAGATACAATATTCACAATATCAACAGGAGAAATAGAAGCA
GATATAACATTAGTAGGTTCATTGGCTGTAGAGGTTGTGGAAAAAAGTATAATAAATGCAGTAAAAAAAG
CGGATAGTGTAGAAAATATAATGGCATATAAAGATATAGTAAAAAAACGAGAAATATGA
>ref|NC_013316.1|:c4037750-4036773 BirA bifunctional protein [includes: biotin operon repressor and biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGCGAGATAAAATAATAGAGATTATATTAAATAATAAATCTGAATTTATTTCAGGAGAAGAATTATCAA
AACAATTAGGGGTGTCACGTGCAGCTATATGGAAACATATGAAAGCCTTAAAAGAAGAGGGATATAATAT
AGAATCTGTAAATAAAAAAGGGTATCGATTAGCGGAAAATCCAACTGATTTATTAAGCCCACAGAATATT
TACTATAAATTAGATACAGAGTTTATTGGAAAAAATATTGAACATCTTGACACTATAGATTCAACAAATG
AACATGCTAAAAGGATAGCTATAAATAGTGTAGATGGGACTGTGATTTTAAGTGAACATCAAGATATGGG
GAAAGGACGATTGGGAAGAAGATGGGATTCAAAAACTCATGAAGGAATCTGGATGAGTATTATATTAAAA
CCAGATATGGAACCATTCAAAGCTCCATTTATAACTTTAATAGCAGGAGCAAGTGTAACGAAAGCTTTAA
ACAATCTAGGAGCAAATACATTAATAAAATGGCCAAATGATGTTATTTTAAATGGAAAAAAAATATGTGG
TATATTAACAGAGTTATCTGCTGAAATTGAAAGAACAAATTATGTTGTTCTTGGAATTGGAATAAATGTT
AAAATAATGGATTTTGAACAAGAAATAGCTGACAAAGCCACATCATTGTATAAAGAAGGGTATATGTTAT
CCAGAGTAGATATTGTTAGGAATGTATTGACTGAATTTGAAAAATTATATTTAGATTATACTGTAAATAA
TTCCAAAGAAAAAACCTTAAAAATATGTAGAGATTATTCTGCAATTATAGATAAAAATATATATGTATTA
AAAGGAGATAATAGAGAACTAGTGAAATGTTTAGACATAAATGAAGAGGGAAATTTATTAGTTCAAAGAA
GTGATGGAAGTATAAAAGAAATTATTTCAGGTGAAGTTTCTATAAGAGGAGAAAAAGGATATGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c4040058-4038064 cell division protein [Clostridium difficile R20291]
ATGTATGAAAGGAGGGCTTCTATATTGAATAAGTTGCTAAAAGGGGCAGGTTTTTATCTACTTGTTTTTA
TAATTATAGTAGGTATAGTTCAATTCTCAGGTAAGCCTACAGAAAAAATAAAAGATTTAAAATTCTCTGA
AGTATATAGAGAATTAACAGATGAGAATATATCAAGATTATACTTTGTAAATCAAACTTCTGTAGAAGGT
ACTATAAAAGATACAAATACAAAGTTTAAGTCATATGTTCCAACAGAAGTGATGGGAAATAAACTTGCAG
ATGAGGTGTTAGACCAAGCTAAGGCTGGGAAACTAACTTTTGGTGGTGAAGCTAAGCCATCTACACCTTG
GTTTGTCGAAATGTTGCCTACATTACTGTTAATATTCTTCATGGTGATTATTTGGTTCGTGTTTATGAAT
CAGTCTCAAGGTGGAGGCGGAAAGGTTATGAGTTTTGGCAAATCAAAAGCTAAGGTTCATAAAGATGATG
AAAAAACTAGAGTTACATTTAAAGATGTAGCTGGACTAGATGAGGAAAAAGAAGATTTGCAGGAGGTAGT
AGATTTCTTAAAGAATCCTAAGAAATATATTGAATTGGGTGCAAGAATACCAAAAGGAATGCTTATGGTA
GGACCTCCTGGAACTGGTAAAACATATCTATCAAGAGCAGTTGCAGGAGAAGCAGGAGTTCCCTTTTTCA
GTATAAGTGGTTCTGATTTCGTTGAGATGTTTGTTGGGGTTGGTGCTTCAAGAGTAAGAGATTTATTTGA
ACAGGCTAAGAAAAGTGCTCCAGCTATCATATTCATAGATGAAATTGATGCAGTTGGTAGAAAAAGAGGT
GCAGGTCTTGGTGGAGGTCATGATGAAAGAGAGCAAACTCTTAATCAACTTCTAGTTGAAATGGATGGAT
TTGGGGTAAATCAAGGTATAATAATCATGGCAGCTACAAATAGACCAGATATACTTGACCCAGCTTTACT
TAGACCAGGAAGATTTGACAGACAAGTTGTTGTTGGTACACCAGATGTAAAAGGTAGAGAGGCTATATTT
AAAGTTCACTCAAGAAATAAACCATTAAGTGATGATGTAAAAATGGATGTCTTGGCTAGAAGAACACCAG
GATTTACTCCTGCTGATATAGAGAACTTAATGAATGAGGCTGCAATATTAACAGCTAGAAAAAGAGAAAA
GAAAATTAAGATGGAAACTATAGAAGAAGCTATAACAAAGGTTATAGCAGGTGTGGCTAAAAAATCGAAA
GTAATAAGTGAGAAAGAAAGAAGACTTACAGCATACCATGAAGGAGGGCATGCAGTTTGTGCCCATGTAC
TTGAAGAAGTAAGTCCTGTTCATCAAGTTACAATAGTTCCAAGAGGAAGAGCTGGAGGGTTTACAATGCA
ACTTCCTGTTGAAGATAAGTTCTATGCTACAAAAAATGAAATGAAAGAAAATATTGTAGTTTTACTTGGT
GGTAGAGTAGCAGAAGAGCTAGTACTTAAGGATGTATCTACAGGTGCTTCAAATGACTTAGAAAGAGTTA
CAGCTACTGCAAGAAGTATGGTAACAAAGTATGGAATGAGTTCTAAACTTGGTCCAATGTCATTTGACAG
TGATGATGAAGTATTCCTAGGTAATAGTTTTTCAAGTAAGAGAAATTACTCTGAAGAAGTTGCTTTTGAG
ATAGACCAAGAAACAAAGCGTATAGTTGATGGTGCATATGATAAGACAAGAAGTATATTACAAGAAAATA
TGGATAGATTAGAGTATGTAGCACAAGCTTTACTTATATATGAAACTTTAGATGCAGAACAATTTGTAAA
AGCATTTAATAAAGAGTTACCTCTGAATGAAATTGAAAATGCAGTTACAGAGGAAAATTCTTCTAAAGAA
GTTGAAGAACAATTAACTATAAAATTAGAAAAAGATGAAGAAGAAAGAAACAATGTTATTGATATAAATA
AAAATTTAGAAGATAAATCTGATAAAGATAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c4041456-4040068 putative ATPase [Clostridium difficile R20291]
ATGATATTTGATAAGGTACTAAGTACTATAAATAAACATAATTTAATACAAAAAGGCGATAAAATAGTTT
TAGGTCTTTCTGGAGGACCTGATTCAGTTTGTTTATTGCATGTACTAAATAGATTAAAAAAAGATTTTAA
TATAGAAATATATGCAGCACATTTAAACCATCAAATAAGAGGGATAGAAGCTCAAAAAGATGCATTATAT
GTATCTAAACTTTGTGAGGATATGGGAATTATATTCTTTGTAAAGTCTATTAATGTACCAAAATATTGTG
AAAATGAGGGATTATCATTAGAAGAAGGAGCAAGGAAGCTAAGATATGAAATGTTTTATGAAATTAAGGA
TAAGATTAAAGCCAATAAAATAGCAATAGGTCATAATCTCAATGACCAAGCCGAAACTGTTATGATGCGT
ATCATGAGAGGAACAGGCTTAAAAGGCTTAAAGGGAATTGATTATATTAGAGATAATTGCATAATTAGAC
CCATATTAGACGTGGAAAGAAATGAGATAGAGGAGTATTGTGAAGCTTATAATTTAAATCCGAGGATAGA
TAAAACAAATTTAGAAAATATATACACTAGAAATAAGATAAGGTTAGACCTTTTACCATATATGAAGGAT
AATTTTAATTCAAATGTAATAGAATCTATAGTGAGGATGAGCAATAGTTTAAAAAGTGATAACGATTATA
TTGAGAAAGAGGCAGAAGCTAAATTTAGAGAAGTTTCAAATATAAAAGAAAAAGGCTTTGTAGAGATAAA
TTTAGACGATTTTGTTTGCTTACATGATGCTATCAAAGTTAGAGTTCTTAGAAATTCCATAAAACATATA
CTAGGAGATACTAATTTTGTTGACCAAAGACATATAGAAGATATAATGTCTTTAGAAGATAATTCAAAAG
TAAATAAAATGTTAACTCTTCCAAGAAATATATTTGTTTATAGAAAAAAAGACAGTATAATATTAACGAA
TGAGGAAATTGTTAATGAGGAAATTGAATTTTATTACAATGTACCTAGTAATGGGTTTATTAAAATAAAA
GAATTAAAACAAATTATTGAGACCCAAGTAATGAGCATAGATAGGTATAAGAGTATGAAATTAGACAATT
CATCTAAAGGGTTTGATTTTAATAAGGTAAAAGGGGGTATAGTAATAAGAAGCAGAAGGCAAGGTGATAA
GATAAAGCTTGCTATGGGAAGTAAAAAAGTGAAAGATTTATTCATAGATTTAAAAATCCCAAGAGAAGAA
AGATGTAAAATTCCTATAATCACAGATAGTGAAGGAATAATATGTGTTGGAGATTATAAAATCAGTGAAA
ATTATAAAATTGATGAAAACACAAAAGAAGTATTAAAAATTAATTTTAACAAATTATAG
>ref|NC_013316.1|:c4042067-4041639 hypothetical protein CDR20291_3398 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGAAAAATCGTTGAGTGTAAAAATAAGTATAAATACTAGACAATATGATGAAAAAGGAAATATGG
ACACCATAGAGATGACTGCCTTTGGTAAAATTTTTTATAAAAATGATGGAATATATGTTATTTACAAGGA
AAAAGAAGAAAATATAGAAATAACTAATACTATAAAGATACTTAAAAATCAAGTTAGTATCAAAAAGTTT
GGTGCTATTAACTCAACAATGCTGTTTAAATGTGGAGAAAGTAGTACTACAAAGTATGTGACCCCACAAG
GTACTTTATTAATTGATATTGATACAAGAGAATTAGATATAAATATACAAGAAGGGGAACACATAAAATT
GAAAATAGACTATAATATAAAGGTACAAGATTTATTTTTAGGTAGGAATAAAATAGATATATACATAGGT
ACTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c4042890-4042084 glutamate racemase [Clostridium difficile R20291]
ATGAACAATAAACCAATAGGAGTTTTTGATTCGGGATTAGGTGGATTAACAGTTCTAAAAGAGATAATGA
AGATATTACCAAATGAGGATATAATATACTTTGGAGATACTGCCAGAATACCATATGGTTCAAGATCCAA
AGAAACTATAATTAAATATACTTTTCAAGCTATAAACTTTTTAAAAACAAAAGGTGTAAAAGCTATAGTT
ATAGCATGTAACACTGCTACTGCAAGAAGCTTAAAAGAAGCTCAAGAAAAATATGATATACCGATAATTG
GAGTTATAGAAGCAGGAGCTAGAACAGCTGTAAGTTCTACAAAAAACAAAATTGTAGGAATAATAGGAAC
TGAAGGAACTATAAGTTCAAAAGCATACAACTTGGAAATATCTAAAATAGATGAGAGTATAGAAATTGTT
AATAAAGCATGTCCTTTATTTGTACCTATTGTTGAAGAAGGATGGGCAAATACAGAAGTGGCTAAATTGA
CAGCAAAGATATATTTACAAGAATTGAAAGAAAAAAATATAGATTCTTTAGTGTTAGGATGTACTCATTA
TCCTATTTTAAAGAGAACAATAGGTGAAGAAGTTGGAGAGCATATAAAACTTGTTAATCCAGCTAAAGAG
ACTGCAAAGGATTTAAAAAAGATTTTAGAGGTGCAAAATATTATAAACAATACAGAAATTCATGGGACTT
ATCAATATTATGTATCAGATATACCTGAAAAATTTTCAGATATAGCAAGAGAGTTCTTAAAGAAAAAAAT
TGATAAGATTCAAAAAGTAGAAATACAAAAATACTAG
>ref|NC_013316.1|:c4043598-4043092 putative spore cortex-lytic enzyme [Clostridium difficile R20291]
ATGGACAGGTGGAGTAAACTGATGGCTACACTATTAGCTTTGACTTTTATATTTATGCCTATTAAAGAGG
TATTTGCATATGAACCAACAGAAAATATTAAGAAAGTAAACAAACAAGAAAAAAATATAGCAAAGAAAGA
AGTAATAAATTTATCTGATAATGACTTGATGTTATTATCTAAGTTGGTTGCAGGAGAAGCTAGAGGAGAA
AGCTATGAGGGACAGGTTGCTGTAGCAGCTGTAGTAATAAATAGAGTATTGGACCCTAGATTTCCAGACA
CAATAGAAGAAGTCATATATCAAAAAAATGCTTTCTCAGTTGTGCTTGATGGTTCAATAAAGATGGCACC
AACAGACTCAGCACGTAAAGCAGCTCAGGAAGCTCTTTATGGAACTGACCCAACTAATAAAGCAGTATAT
TTTTGGAATCCAGAAATAGCCACTTGCAAATGGATAAATAGATTGAATCCTTATATGAGAATAGGAAATC
ATGTGTTTGCAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c4044287-4043628 stage II sporulation protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGAAAAATTAAGATTAGATTGGGACTATTAATATTAAGTCTTATATCAGTCATATCAATAATGACAA
TAGTAATAAATGGTGAGGTAAAAAAAGTAGACAATATATCAAAAGATTATAAAGATAAATTAATAAGATT
TCATGTTATAGCAAACAGCAATACAGATGAAGATCAAGAACTTAAACTAAAAGTTAGAGATGAAGTAATA
AAATATTTACAGCCAAAGCTTCAAAATTCAAAAAGTATAAAAGAAAGTGAAGCTATTATAAAAAAGGAAT
ATAGTAGTCTGGAAGAAATAAGTAAAAATATTATTCTTAAAAATGGATATAATTACAGTGTAAAGGTAGG
TATACAATATAGCAATTTCCCTACTAAACAATATTCTAATATAGTTCTTCCAGCTGGTGAATATAAAGCA
TTAAAGATTATCATTGGGAAAGGTGAAGGAAAAAACTGGTGGTGTGTTATGTTCCCTCCACTATGTTTTG
TTGATGAATCTAATGGAGTGATAGATAAATCTACAGATGATAAGTTGAAGGAAGTTTTAACTGATAAAGA
ATATAAGTTAATAAAACAAGATACACCAAAAAAAACAAGTAGAGTAAAAATTAAGTTTAAAGTACTTGAA
GTAGTCAAGGATTTAGAGAAAAAATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c4045112-4044432 GntR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
GTGGAGAATTTAACTAAACTGAACTTGGATAATTACAAGCCATTAAGAGATGTAGTCTTTGAGAATTTAA
GAGAAGCAATCTTAGAAGGAAAATTAAAGCCTGGTCAAAGGCTAATGGAAGTGCAACTAGCAGAACAATT
AGGAGTAAGTAGGACTCCAGTGAGAGAGGCAATAAGAAAGCTTGAATTAGAAGGTTTAGTCGTTATGTTG
CCTAGAAAAGGTGCGTATGTGGCAAATATGTCATTAAAGGATATTATGGATGTATTAGAAGTAAGAGCAA
GCCTAGAAGGCTTAGCAGCATATCTTGCCGCTGAAAGAATTAGTGATGAAGATATTAAAAAGCTTAAAGA
TATATCAGAAGAATTTAAAAAAAGCACTTTGGAATCCGATGTAGATGCGTTATTAAAACTTGATGTAGAA
TTTCATGAATGTATATTTAAAGCAACTAATAATAAAAAATTAATCCAACTAATAAACTCATTATGGGAAC
AAGTATATAGATTTAGAGTTACCTATATGTCTGCTTATGATACATCACATAATATTGTTGAAGAGCATAA
ATACTTACTTGATGCTATAATTAAAGGTGATAGTGAGCTATCCAAGAAGTATGCTACAGAGCATATAGAA
AAAGCAGAGCAGTTTATGATAGATAAGGCTATGATTAGTAAAGACTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c4046016-4045096 4-diphosphocytidyl-2-c-methyl-D-erythritol kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGCATTATTCTTTAAACAAGGAGGATAGAATGGATTTTATAAGACTAAAGAGTAGAGCAAAAATAAATT
TATCCATTGATGTCTTGGGAAAAAGGCAAGACGGTTATCATTTTGTTGAAATGATAATGCAAACGATAGA
TTTATACGATATAGTAAAGATAAAAGAATTAGACGAAGATGAAATAAAGGTAAAAAGCACTAGTTTAGAT
ATTCCTTTAGATGAAGATAATATTGTTTATAAAGCTGCCAAAATACTTAAAAATAAATTTTATATAAAAA
AAGGTGTAGAAATATTCATAGAAAAAAATATTCCTGTAGCAGCAGGGATGGCTGGAGGAAGTTCTAATGC
AGCCGCAGTATTAGTAGGTTTAAATCACCTATGGGAACTTAGATTATCTGAAGATGAATTAAAAGAAATA
GGACTTAATTTGGGCGCAGATGTTCCTTTTTGTATATCAGGAAGACCTGCCTTAGCTCAAGGTATTGGAG
AAAAGCTAACAAACATCAAAGGTTTACCATGTGATACAAATATATTGATATGCAAACCAGACTTATTCGT
TTCTACTAAAGAAGTTTATCAAGGATTAGATTTGAATAATATTAAAAAAAGACCAAATAATAAATATTTG
ATAGAGTGTTTAAAATCTGAAGATATAAAAGCTGTATCAGAAAGCATGGTAAATATTCTTGAAAATGTTA
CTATAGGTAAACACAAAGAAATAAGTGATATAAAACAAGTAATGATGAAAAATAATGCTTTAGGTTCTAT
GATGAGTGGAAGTGGTCCTACAGTTTTTGGACTATTTAAAAATAAAGAAGATGCTCTAATTGGAAAAAAA
GAATTATTAAAAAAATATAAACAGGTGTATGTTGTTAATAGCAGTCAAAAAGGGGTTGAAATTTGTGGAG
AATTTAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c4047654-4046104 putative cell wall hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAATTAATTAAAGATGTAATTAAAGTTGACAATAGAATAGACTTTGGAAAATTTCAAACATTCATTG
AAGCGGAGGCAGTTGTACCAGACAAAAAATTAGATGTATATGAAATTGTAAAAACAGAAGGATACATATC
ACTTAAAAAAATTGAAATGGCAGATGGGAAGATACTTTGCAGAGGTAGTTTTAATTATAATGTAATCTAT
ATTGCAGATGATAAAAATACTATTTCTAATGTAGACGGAAAAGTAGATATAAACGAAGTAATAGAAAAAG
ACAATGTTGTTCAAGATATGGAATACATGTTATTTTCAGAAGTAGAGCATATGGATTGTACTATAATGAA
TGAGAGAAAGATTAAAGTAGGAGCTCTTATGAATATAAGGGGAAGTTTGTTTGAAAAGCAAAGGTTAGAC
ATTGTAAAAGATGTGGCGCAAGTGGAAGGCATACAAAAGCACAGAAAGGAAATTTGTTTTCAAGATATAG
TTGGAATAGAAAAAGCAGAAAGTTCTATAAGAGATACTATAACAATAAACACAGAGGAAATTCAATCTAT
AATAAGTTTAAATCCATGTGTTAAAGTAAAAGAAAGTAGAGTGACTGACAATAAAGTTATTATTGGTGGA
GTATTAGAAATAAATCCGTTAGCTTGTACATATGAGGGTGAACTTGTAGAGTTGGATAGAGTAGGTATTG
AGTTTACTCAATTTGTAGAAGTCCCTGGAGTTAGTGATGGTATGACTGAAGAAGTATTGTTGTCTATGTC
AGATTTTAATCATATTTTCAAGCAAAATAGTGAAAGCAACACAGGTCTTTTAGAAATAGATTGTATGGCT
TGTTGTAAGGTAAAAGTTACAGATGAAGTTACAAGAGAAGTATTACAAGATGCATATTCGCCTCAAAAGA
TAATAAAATTTGACCACAAACCTATTCAATTAAATAAGACTTTAAGACGTAGTGAAGAAACATTTATGGT
TAGAGAAGGCATAAGAAATGATAATGATGATATACAAATAAAAGATATTGTAAGCGTTTGTCCAACCATG
TCTATAGAAAATAGTTATATTGAAGGAAATAAAAGCATTATACAAGGAATCATAAAAGTTGAAATTTTAT
TTGTCCCAGTTGAAGGTTTAAAATTGGTTTATAAAATTAGTGAGGAAATTCCATTTGAACATGATATAGA
AATGGATAATCTAACTGATACAGCATCTGTGTTTAATACAGCATGTATTGATAAAGTCGAAGTTGATTTG
AATAGGGACCAGATAGACTTGATTATCAAAATTAAGAGATTTACTGAAGCATTAGATAAGAAAGCAGAAA
ATTTTATTATCAAAGGAGAAGACCAAGGTGTATATGATTTATCTAAAGCTCCTAGCATAATCGTATATAT
ATGCAAAGAAGGAGATACTTTCTGGAATATAGCAAAAAAATACAATACAACAGAAAATGAAATTGCAGAA
CTTAATGATATAAAACTTGATGAACCAATTAAGCCTGGTAAGTGTCTTATTTTAGAAAAAAAAGTCGTAT
TAGTAGATTAA
>ref|NC_013316.1|:c4048014-4047748 hypothetical protein CDR20291_3405 [Clostridium difficile R20291]
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TGAAAGCTAATAAAGGAAGAAAGCAGATTATTACAAAAGAGGGTATACTAGAAAAAGTTTATCCAAGCGT
GTTTGTTATAAAGTTAGATGATGAAAGTAATGGATATCCTAGAGTATCTTATAGTTACTCAGATTTATTA
ACATCTAATGTAAAGTTGCAAGTTTTTAGAGATCAAGATAAATTACAAATAAGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c4049022-4048162 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAGGTAGGAGACATTGTAGCTAGAAAGTCACATAACAAAGATATAGTATTTAAAATAGTCTCTTTTG
GTGTAGATGAAAATAATGAGAAAATAGCTATACTAAAGGGAATTGCATTTAGAGTAATAGCAGATGCTTA
TATTGATGACCTAGAATTAGTAAAAGCACCTGATATAAAAGATATATTAATAGATAAAAATGTAGAAAAT
TTATTATATAAGTCAGTAAGAAAAGCTAAAGAAAGACAAAAAAGAATGACTAGAGCAGTTCCAAAACTTC
AATTAAATCCTAACACATATGGAATGCCTGGAAAAGTACTACAGATAGATGGAGATAAAGAATATTTAAA
AATTTGCTTGGATGTATATGCTCAACTTGGAATACCTGCAGTAGGTGTAGCTGTTTCAGAGCAAAATCAG
TATAAAGAAGTAAGAGCACTACTAGAAAAATATAATCCGGATATACTAGTAATAACAGGTCATGATGCAA
TGACAATAAAAAGAGGAGATATAGAAGATATGAGTAACTATAGAAACTCTTCAAATTTTGTTAAAACAGT
AAAAGAAGCACGTAAATGGCAACCAAATTTGGATAATCTTGTCATATTCGCAGGAGCATGCCAATCAAAT
TATGAAAAAATAATAAGTGCAGGAGCAAATTATGCAAGTTCGCCTGGAAGAATAATGATACATGCATTAG
ACCCTGTTTTTATAGTGGAGAAAATTGCTTGTTCAAGAATTGATGTAGTAGTTCCTATTGATGAGGTTAT
AGAGCAGACTATTACAGGTGTTAAGGGAATTGGTGGTTCTGAAACAAGAGGAAAATTTAGATGGGCAATG
CCAAAAACAATATTACATTAG
>ref|NC_013316.1|:c4050044-4049106 putative dipeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATTTATTGATTTACATTGTGATACTATAGCAAAATTAATGGAAAATGTAGAAACAAGTGAACTTA
AGTCTAATAAATATTCTGTTGATATAGACAGATTGAAAAAGGGGGATTCATTAGCTCAAACATTTGCTCT
TTTTGTTGATACTGAAGAAGTAAAACATCCTTTTGATTATTGCATGAGTATGGCAAATAAATTTCATGAG
GAAATGAAAAAAAATAGTGATGAAATAGCTTTAGCTACTAACTATGAAGAAATTATGAAAAACCAATCAG
AAGGTAAACTTACAGCTCTTTTATCTATTGAAGAAGGTGCAGTACTTGAAGGTAAATTAGAAAATTTAAA
GAAATTTTACGACTTAGGGGTTAGAATGATGACAATAAGTTGGAATCATGTGAATGAATTGAGCTTTCCT
CATAATAAAGTAGAATATAGAGAAAAAGGGCTTACTGATTTTGGAAGAGAAGTGGTACATAAGATGAATG
AATTGGGAATGTTGGTTGATGTTTCTCATATTTCAGATGGTGGATTTTATGAAATTGCAAAGATTTCTTC
TAAACCAATAATTGCTACACATTCTAATTCAAGAGCAATGATGAATCATTCTAGAAATTTAACTGATGAT
ATGATTAAAGTATTAGCAAATAAAGGTGGAGTTACAGGTATAAACTTCTTCCACTTATTTTTAAGTGATA
AAAGTGAAAGTAAACTTGAAGATATGGTTAGACACATAAAACATATTGTAAATGTTGGAGGAATAGATGT
TGTATCCCTAGGGTCAGATTTTGATGGAATAGATTCAAAAGTTGAGATTGAAGATATATCTCAGATGGGT
AAACTGTATGAACCTCTAAAAAAAGAAGGGTTTAGTGAAGATGATATAGAAAAGATATACTATAAAAATG
CTTTAAGAGTGATAAAAGAAGTATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c4050315-4050154 hypothetical protein CDR20291_3408 [Clostridium difficile R20291]
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TAAAAAAATATATTAGTGAAAATAATATAGATAAAACATGGCATCAAATTGAAGAAGTTAAAAAAGTAAT
ACCTAACTTAAAAGAAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c4050822-4050325 putative preprotein translocase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTTATATACTGAATGGAGAAATTTAAGTGATAATCATGAAAGTCAAGAAGCAGAAGTAAAATTCT
GGGAAGAATATTTGAAAGTTGAAGCTGGAATATACAATGAAATATTAAATAATAAAATGGATGTTGTTGA
AGGTAAAGTAAGTGAATTGGCTGAAAAATTTGGAACTACTAATGAATTTTTCATGGGATTCATAGATGGA
ATAAGTGAAAGCTTAAAAGAAGATATAGTTTTAGAAGAAGTAGAAGCTGATAAAGAAGTTTCTATAAAAA
TAGATTGGGAAAAATTATATAACAATATGGTAACTGTTGAGGCTCATTGGCTATATAATTTACAAGGTTG
GGAAGATATACTACCAGCAGACCAAAGAAAAGAAATAATAAAGGCTTATAAGAAGTCTAAAACAATAGTT
AAAGAAGCAAAAATAGGAAGAAATGATTCATGCCCATGTGGAAGCGGAAAAAAATATAAGAAATGTTGTG
GAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c4051647-4050937 hypothetical protein CDR20291_3410 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATTATGAATATAGTGGATTTTATATAGAAAAACCAGTAGGAAATAATGTATTTTCATATGATA
AAAGAGAAAATAAGAGCATATACGTTCCAAAACTTATAAATGGTACATTAAATGATGTAAGGTTAGGCAA
TGAGGTGGTATTTAATGAAGTAGATGAAAATAAGGAAATAAAAGCAAAAGGATTGGAGAATATGGTCGAA
TATGTCCTGGGAAATAAAAAGATATATGTGTTTGACAATCATAACCATGCATTTTATTTTTGGGCAAAAT
CTTTGTTAAAGGGTGAATTTACAAAAGGATGCAAGTTAGTGCATGTAGACCAACATAAGGATACTAGAGA
GCCTGAGAACTATGATGTAGATGTAAATAATCTAAAAGATGTATTTAGGTATACAAATGAAGTTTTAAAT
GTGGGAAGTTTTATAAAACCTGCTTTAAAATATAACATATTTTCAGAATTAATAATAATAGATAGTCTGT
ATGGATTTGATTTAGAAGTAGAATCAGAGTTTGTTCTTGATATAGATTTGGATATATTTTCAAGTGATAT
GGACTATATACCATTTGAACTCAAATTTTACAAGATAAAAAACTTAATTAAAAAAGCCAAAGTAATAACA
ATTGCGACAAGCCCTTATTTTATAAACCAAGAGTATGCTATAAAAGTATTAAAAGAATTGTTTAATTATG
ATATAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c4052353-4051823 hypothetical protein CDR20291_3411 [Clostridium difficile R20291]
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ATTCTTTATTTAGTAAGCTAATATTAAAGAACAAATATGCTCATGAAGTTAGACTTCATTATATAGAGTT
TAAAATTATCACACTTAAAATTCACAAAACGAAATCCATTTTCAAGAATAGGAGATATTCTAATGATATA
AATGAATTAAAAATTTTAGTGAATGGTTCTACAGGTTCTGGTAGTATAGTACAAGATTTTCCTACATATG
AAATTGTAAAAAATGTGGATTGTAATATTGTGCAGTATAGTAATAAGGACGAACGAAGAGTAAAAGCAAA
GGCAAATAAAATGGCTATGAGATTAATTCATAGGTTTATGGGAGGAATCCCAGAGATTGAAATAGTTAAA
ATTGAAAGTATTTTTAGACCATATTGGGTAGTATTTTTTGGAAAGGTGGAGTTGAATAGAAGAGTTAGTT
ACCTTCCAATTGAAGCTGATGGTTTTGTTATAGGAATGTAG
>ref|NC_013316.1|:c4052600-4052370 hypothetical protein CDR20291_3412 [Clostridium difficile R20291]
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TATTATTGTACTTTTTAATAACAGGATTTATATTTTATGGTATATTGACTAGAAATGATATTATAGTTGG
AAAAATAATTCCATATGGAGTTATGGCAGTTGTAATTGTAATATTTTTTGATTATATATATAGAGTTTTA
AAAATGACAAGAAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c4054024-4052615 putative sodium:solute symporter [Clostridium difficile R20291]
ATGTGGAGATTAGATATGTTAACATTTTGGGAAAATGGGATTATAGTTATATTTGCATTTATATTATTAG
GAATAGGTTATTATTTTTCTAGAAATGTAAAAGATATGGAAAGTTATTACCTAGGAAATCGAAGTTTACC
ATGGTCCTTAATAGTAGGAACTTTGGTTGCATCATGGTATGGAGGAGTTGGTACAGTAGGTAGTGTAGAG
TATGCGGCTATATATGGAATATCTGCATGGGCAGTTTGGTCAATAGCTGCACATATTGGGAGAATGCCTT
TAGCATTGTGGGTTGGTCCAAGGATTCATATAAGAACCAATATAACAGTTCCTGATTTACTGGAAAGTTT
TTATGGTAAGCATGTTGCTATAATTGGGGCAATTTTGATGTTTATATATTGTGCACAACTTGGAGAAATA
ACTGCTATGGGAACTATAGGTAACGTAGCATGGAAAATAGATAAAGAATTAATAGGATTAATAATGGTAG
GAGTAGTCGTTGTACTTACAGTACTTGGTGGGCTTATGGGAGTTGCCATTACAGATATGGTATTGTTTTT
TTGTATGGTATTTGGTTTAACTATGGTTATGCCAGGTCAATTTGAACAAATAGGAGGATTTCAAGGTCTC
ACAGAAGCACTCAAAGATGCACCACAGCTTATGCACCCTACAAAAGGTATGTCAGCTATGAAAGCATTGA
TGTTAATTGTATATTCTTTTGGAGCTTATTCAGACCCAACTTTTTATCAAAGATTTTCAGCAGCAGATTC
TCCTAAGGTTGGAAGAAGAGCCTTATTAACTTGTTTTTCACTATGGATATGTTTTGACATGGTGTTAACT
ATAACAGGACTTATAGTAAGAGCTACTTATCCAGAGATGGCTCCAGCCGCTGGATATATAACTTTAGTTT
TAGATACATTACCACAAGGAATAAGAGTAATATTTATAATAGGAATTTTAGGTTCTATAATATCAACATT
GGATAGCTATTATCTAGCAGCTGGAGCTACATTAGCAAATGATATATATGGAAGAATTACAAAAAAAGAG
TTATCTCAGAAACAATTAGTAAAGTTTACTAGAATAGGTGTATGTTTAGCAGCAGTTATGGGGCTTAGCG
TAGCATTTAGATTTGAAAATGTATATGATGCATGTATATTTGTAGGAAGTATTTGGATGGGTTCGGCATT
TGTACCTATAGTAGGTGGGCTTCTTGGAAATGGAAGAAGAACATCTATGGGTGGTATTTTAGGAATGATT
GTAGGTGGAGTGACTTTTGGTTATTTTAAAATATTTCCAGTTCAGAGCTTTGAGTTAGAGCCTCTTGTGA
TAGCTATACCTTTTTCATTTATTGCATGGATGATTGGTAATAGAATAGGTGAAAATTTAAATACACAAAA
TAATCTATAA
>ref|NC_013316.1|:c4055388-4054135 putative transporter [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGAACAAAAGTAATTTTAAAAGATTCTTGATAATATTCATATTGGCATTTGGAACAACGGCTATGT
ATAGTTTACCATATATGAAATCATCATTTTATGACCCAATGCAACAAGCTTTATCATTGAGCCATACACA
AATAGGGAACTTATTGAGTTTATATGGATTAGTAGGAATGGTATCTTATTTTATAGGAGGATGGTTTGCA
GATAGATTCTCGGTTAGAAAGCTGATAACTTTTTCTTTAATTGCTTCAGGAGTACTTGGTTTTTATTTCT
CTACATTCCCATCATATAGTATGATACTCTTAATATTTGTATTATGGGGATTTACAACAATATTAACTTT
CTTCTCAGCATCTGTTAAGGTTGTTAGAATGCAAGGAAGTGAGTCAGAACAAGGAAGAATATTTGGTTTT
TATGAAGGGTTATCAGGTGTATCAGGTACGTTAATTTCTTTTATAGGTCTTTACTTCTTTGGTAAATTTG
CTGAAATAACAGTAGGATTCAAATATGTAGTATGGTTATATTCTGCAGCATCTATAATATGTGGTATACT
TCTATTTTTCTTAGTGGAAGAGAAAAAAGATAGTGGAGCATCAGATGAAGGATTAAGTATTAAGTCATTG
TTAAAAGTAGTTACAATGCCAAAGGCTTGGTTAATTGGTCTTATAATATTTTCAACTTATTTAGTATTCT
CAAGTTTAACTTATTTAAGTCCATACTTATCAGAAGTTTATGTAATGCCAATGACTCTAGTTTCTGCTTT
ATCAATAATAAGAACTTATGTTATAAAAATGGGAGCATCTCCAGTTGCTGGTGTTATAACAGATAAAGTT
GGTTCATCTATAAGAGTAATGTTTGTAGGATTTATATTAATGACAGTAAGTACAGCTGCTTACTTGGTTA
TTCCTAAGAGTACAGGATTTATATGGATAGCTGTAATAAACATGATAATACTAAGTGTAATTTTATTTGG
ATTTAGAGGTATATACTTTGCATCTGTTTCAGAGTCTAATATATCTTTAGAAACTACAGGAGCAGTAGTT
GGATTTGCTTCATTTATAGGATTTTCTCCAGATGCGTTTTATTACACTATTGCAGGTAATTGGTTAGATA
AATATGGACAAACAGGATATACATATATATTTATTTTATCTGTAGTATGTGCAGTTATAGGGATATTTGC
TACTTATGCTTTAAATAAAATAAATAAAAGAGAAAATAAAGGTTTAAACAATAAAATTGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c4056593-4055439 methionine gamma-lyase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAACAATATTAATCAAGATTTAGAGACAAAAATAATACATTGGGGACATAGTGCAGACCCAACAA
CAGGTGCATTGGCTACACCAATATGTCAAACAGCAACATTTGCTGCAAAGACAGTAGAGCATTTTGAAGA
GTTGTGTATGACATGGGGATATGTGTATACAAGAGAGTGTAATCCTACTCTTACAGAGTTAGAAGCTAAG
TTGGCTATGCTTGAAAATGCAGAAAGTGCCATATCTAGTACATCAGGGATGGGGGCAATAACATCTACTA
TATTAGCATTGGTAAAAAGTGGTGACCATATAGTTAGTTCAGATGGAATATTTTCACACACTAAATTATT
CATGTCTGAGTTGTTATCTAAATTTGGAGTTGAAGTTACATTTGTAGATGCAGTAAATCCACAAAATGTA
AAAGAAGCAATGAGACCAAATACTAAAATAGTTTATATAGAAAGTCCTTTAAATCCATCATTAGACTTAG
TAGATATAAAAACAATAGCAGAAATTGCTCATGAAAATAAAAGCTTAGCTATAGTTGATAGTACTTTTGG
GACACCAATTGTACAAAGACCAATAGATTTAGGTGCAGATTTAGTAATACATAGTCTTACTAAGTTTATA
AATGGACATGGGGATACTTTAGGGGGAGCAGTAGCAGGTTCAAAAGAATTAATAGATTTAGTTAGATGGC
CAAGTTTATGTTGTTTTACAGGAGCATCTTTACCACCAATGAGTGCATGGATGATTTTAAGAGGTATGAA
AACGTTAGATATGAGGATGAAAAAGCATTGTGAAAATGGATTAGCAGTAGCAGAGTTTTTAGAGGAAGAA
GAGAATGTGGAATTGGTAAAGTATCCAGCATTAAAATCTCATCCTCAATATGAGCTTTGTAAAACTCAAA
TGAATGGTTTAGGTGGAGGTGTAGTTTCATTTAAACTTAAGGATGGTATCAATGGATTGACAAGAGACCA
AGCTAGTAGAAAATTAATGAACTCTTTAGAGCTTGCAACAATAGCAACAAGCTTAGGGGAAGAGCATACA
TTAGTTCAAATGAATGGAGAAAATCTAATAAGAATAGCTGTAGGATTAGAATCTTCAAATGATATAATAA
ATGACTTTAAACAAGCAATAAAAAAATTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c4057721-4057152 putative resolvase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTATTATATATGGATATTGCCGTGTAAGTACAAAAAATCAAACAGACAACAACAGTTTGTATCAGC
AACAGCAAGAAATTTTGAATAAATATAATGATGCTAAAATAATAAAGGAAACTTATACAGGCACTACTAC
AAACAGGCCTAAATTTGAAAAAATTATATCATCTCTAAAAAAGGGAGACTTACTTGTTGCAACTAAGCTG
GATAGACTAGCTAGAAGTACATCAGAAGGGATACAACTAATAGAAGGTTTATTTGCTAAAGAAGTAAGTG
TTCATATTTTAAATATAGGTCTTTTAGAAAATACTTCAATGGGTAAATTCTTTTTGACTACATTACTTGC
AGTTGCAGAGCTTGAGAGAAATATGATAATAGAACGTACTCAATTAGGAAAAGAATTTGCTAAAAAGAAA
AAGGACTTTAAAGATGGTAGGCCAAAGAAATACAGCAATCAACAGATACAATATGCATTGGGGTTATTAA
ATTCTAAGCCATATAGAGAGGTTGTGAAGATGACTGGTATCTCCAAGAGCACACTTATTCGTGCTAAAAA
ATCAATTTAG
>ref|NC_013316.1|:4057924-4058151 hypothetical protein CDR20291_3417 [Clostridium difficile R20291]
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AAGAATTGTTCAAAGGCTATGAATGGAACAGGTTGGAGATGAATATTAGATTGAAATTAGGAAAACTTTT
TTTGTATGAAGTGGTAACTAATCCCAATTTAAATGTAGAGGTCATCAATAAAAATTCTGCTTATCAGCAA
ATGTATAAAAAAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c4059113-4058370 hypothetical protein CDR20291_3418 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATTATCAATCTACAAATACCTGTACATATAATATATTATATGTACAATTTAATGAAGATTTTG
AAAGAAGTAAGTATTTTTCATATGATGTAAAGTATCCTGTTATATACAATATTAGAAATCAATCCACGTA
TGTAAACCCAGTTATTTTAAATAACATAAACAATGCTGTAAGAATGACTGTAAATAATTTTAAAAATGGC
TTACAGGAAGAAGAACGAGAATATAATAACGCAGCTTCTCAAAATTCACTTCCAAAACAAAGCTATTGGG
TATCTACCAGTTACGCAGTTACTTTTAATAAAAATTATGTACTGAGTATGATATTAAACCTTATGGGGTT
TGCTAATAACTATGGGCCTAAATACAATACATTGAATAATTACAATATAGATTTGACAACTGGAAAAGAA
CTTTTACTTAATGACATTTTTAGAGATGGAGTTGATTATATTAATATAATTACTGATTACATTAAATCTC
AAATAAATGAAAATAGAGAAATGTATTATTCTAATGTTGAGTTAGTTATACCTGAAGACCAAGCATTTTA
TATTACAGATAATGGAATTATCATCTATTTTGGCGTTGATGAAATAGCACCTGAAAGTTTTGGTATACCT
AAGTTTGAACTGAAGTTTTCTGACTTTGGAAATTTTATAAATTTACGCTTCTATTGTATTTCCCCAGATA
TATATGTTCAATCAAGAGGAAGAGCTAAGCATTTTATGGGATAA
>ref|NC_013316.1|:4059281-4060153 hypothetical protein CDR20291_3419 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTATTATTAGCAGATAAATGGAAAGATTATGAACTTATAGATATGGGAAATGGAGAAAAATTAGAAC
GTTGGGGAAGTTATGTACTTAGAAGACCAGACCCACAGGTTGTATGGCCAATGGAATCTGAATGGGCTTT
ATGGAAAAACCCTCATGGACATTATCACAGAAGCAATAAAGGTGGAGGTCAATGGGAACACAAAAAAAGA
TATCCAGAACAATGGACTATAAATTATAAAAACTTAAAGTTTCACATTAAACCAACTGGCTTTAAACATA
CTGGATTATTCCCAGAGCAAGCAGCTAACTGGGATTGGATGATAGAGAAAATAAAGAAAGCTAACAGACC
TATAAAAGTGTTGAATCTTTTTGCATATACAGGTGGAGCTACTGTAGCATGTGCATCTGCTGGTGCAGAA
GTATGTCATGTTGATGCTGCAAAAGGTATGGTTAATTGGGCAAAAGAAAATATAGAATTATCAGGTCTTA
AAAATCAAACAGTAAGATTTATAGTGGATGATGTTGTAAAGTTTGTTGAAAGAGAAATAAGAAGAGGTAA
AAAATATGATGCAATAATAATGGACCCTCCTTCTTATGGAAGAGGTCCTAAAGGAGAAGTATGGCAAATA
GAAGAAAAGTTATACAGTTTTGTAGATTTATGTATGGGAGTTTTATCAGATAACCCTTTATTTTTCTTAA
TTAATTCTTATACAACAGGATTTTCTCCAATAGTTCTTGAAAATGTATTGTCTACAACAATAGGTAAAAA
GACAAATACAGGAGATATATACGGTGGGGAATTAGGAATACCAGCTTCCAGAGATGGTAAGATACTTCCT
TGTGGTATATTTGGAAGATGGGAGAAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:4060153-4060818 putative pseudouridylate synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAAAGTCATATATGAAGATAACCATTTATTAGTTGTAGAAAAACCAGTTAACATATTGTCTCAAG
GAGATAATACTAATGATAAAGATATGGTAAATCTTTTAAAAGACTATATTAAAAAAAAGTATAACAAACC
TGGAAATGTATATATTGGTTTAATACATAGATTGGATAGACCAGTAGGTGGAGTTATGGTGTTTGCAAAA
ACATCAAAAGCAGCATCTAGATTGTCTGAGCAGGTAAGAAGTAAGACTTTCAAAAAAACTTATCTAGCTG
TTGTTCATGGCAAGATAAAATCTAACTCAGATATACTAAAAGATTTTTTATATAAAAATAAAAAAACTAA
TATGGTAACTGTAGTGAAAAAAAGCCATAAAGATGCCAAAGAAGCTGAACTTAACTATAATGTATTAGAT
TTTAAAGAAAATCTAAGTTTAGTTCAAGTTAATTTAAAGACTGGTCGTTCTCATCAAATAAGAGTTCAAT
TTGCAAGCAGAAAACATCCATTATACGGAGACCAAAGATATGGCAAAGAAATAAATAAGATTGGACAACA
AATATCTCTTTGGTCCAATAAGATAGAAATTTGCCATCCTACTACAAAAGAAAAAATGGAATTTACATGT
CATCCACCTGACAAATATCCATGGAATATATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:4060839-4061696 MerR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAAAAATTTTCAATAGGAGAAATGTCTAAACTTCATAAAATAAGCATACAGACACTAAGGTACT
ATGACCAAATAGATTTATTTAAACCTGTTCATGTTGACCAAGAAAGCAATTACAGATATTACTCAATTGA
CCAATTTTCACAATTAGATATTATAAAATATTTAAAATATTTAGGTATGCCTTTAAAAGAAATTAAGTCA
AAGCTTGATGAAAATAATGAAGAAATTCTAAAATTACTAACAAATAAAATTAATATAGTGGATGAAAAAA
TTAAAGAATTAGAGCTTATAAAGAAGGTACTAAGCACAAAGAAAGAAACTATGGAAAAAGGTATGAAAGT
AGATGAAGTTGGTAAAATAGTGAGAAAACATATTCCACGAAGAAGTATCTTATCTATAGAGTATGAAGAA
GGATTAAGTAGTGAAGAAACTATGGAACTTTCCAGAAGACAAATAGCAAATATATTAGAAGATAATATAT
CTGTGTTCTATGGTGGAGTAAGTGGACTTGTATCTATAGATAAATTTTTAAAAGAAGATAAAGTTATTTA
TGACAATAGTTTTGTTACTGTTGAAAGAGACTTATTTGATATAAAATCACAAAAACATATAACAGAAATT
TCATCTGGTGATTTTATTTGTATGACATATAAAGGGTCTTACAAAGAAAATTATACCGCTTTTAAGAAAC
TGGTTGATTATGTTGAATATAAAAGAATACCTATTGAAAATTATATATATGAAATACCTATAATAGACCC
TCTGTCTACAAACAACGAAGAGGAACTTCTAACAGAAATTCAAATACAAGTTAAAAAGAGAGAAATTGAC
TTAAGATGTCTAGTGTAG
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TAGGAGTTGTTCTGTCAGCTGCTATGATTACAGCAGTTACTACCTTTGGAGTTTCTTTGATGAACTATAT
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CAGGAACAAAGAGTCAATGATGAAGTTGCAAATACTGCAACATTTGAAAATATTGGCTATGCAACACTTG
AAGGTAACAGAAATCCAGATAAACCATATCTTTTTATTGCTGGATTTAGCAAAGAAGCTTTTGATACTTT
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TTATACAGTTGTGGGTATCTGTAGAAAGCCCGTATTTGAAGAATCTTCTGCACCAGGATATACCTTGATA
ACCAAAGAAGATAAACAAGTCAAGACTGACAGTCTTAGCCTTTTTGTCACATTGAAAAATCCACATCAGA
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TGTTTCTGATAACAATTTGTTCAATATGTTTTTGTACTCGGTTGGTGGCATTGTGCTTGCCATAATCATG
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AAAAACTTTGCAAATATTCTCTATGTAAACGTTCCGTTGACATTAACATTGTCTATCCCTGCAATCATCG
TTGCAGCAGTGGTAAGTATGGTTACAATCTTAATTTCTGCTTACATACCAGCAAGAAAGGCTGCCAACAC
ACCAGTGATGGAGTGTATTCGTCAGACAAATGAGGTAAAAATTGAATCTAAATCTGTGAAGACATCAAAA
CTAACACAGCGAGTTTATGGTCTTGAGGGAGTTCTTGCTATGAAAAACTTTAAAAGAAACAAGAAACGTT
ATCGAAGTATTGTATTGTCGCTTGTTTTAAGCATAGTTTTATTTATATCTACAAGTGCTTTAGTAGCAGA
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TTCACATTCTATGAGTGAAATGCTTGAATTACCAGTAGATATGCAATTTCTTGATGATAGAACTTATCTG
AATATTATTAAAAGTCTTGGATTACCAGCAGAAGAATATACTGGACAAAATGCAAAACTGATTGCTGTTT
CTATGGTAACAAAGGATAATAATATTATTGATATTTTCAACAGTTCTTCTATGAATGTTAGTCTCACTCC
TGAAACTAATGGCAAGTTGGAGATACCTGAGAGACAAAATGTGAATATTTCATTTGTCAAAGTAGTGCCA
CCTGATTCTCCTCCAGGAATCAGAAGTTCAGATGTGAAGAAAGCAAGCTTCAGAGTATTGGCTCCTTATT
CAGCCAAAGATAAGTTTGAGATTCCTGGTGTTTCTACAGGAATTGAAAGTTTAAGCTTTCAATCGAAAAA
TCCTACTCAGTCAGTTGCAGAAATGGAGCAAATTATTGAGAGTGAGGGAGTTACTAATGAGTACAATCTG
TACAATATGTATGGAATGATGGATGAGAACCGTAATTACATTTTTATTGCCAATGTTTTTGCCTATACTT
TCATAATTATGATTTCTCTGATTTCGATTGCCAATGTGTTTAATACAATTTCAACTAATATTAAGTTACG
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GAGTGTGCTTTTTATGGCATGAGAGCATTGTTCTTTGGACTTCCTATAGCAGTAATTTCTTCATGGCTAA
TTCATAAAGTAATGGTTACAGATGATATTGATTTTGTGATTCCATGGTTTAGTATTGGAATTAGTATATT
TAGTGTTTTATTTATAGTATTTATTACAATGTTGTATACTATTAATAAGATAAAAAAAGAAAATATTATT
GATGCACTTCGTGATGACATGGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c4065084-4064398 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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ACCATGTCTCACTTACTATTGAAAAAGGGGAGTTTACTGCAATCATTGGTTCTTCTGGTTCTGGTAAATC
TACACTACTACATTCCATTGCAGGAGTAGACGTACCAACAAGTGGAAAGATATATCTGGAGGGGCAAGAT
GTATATGGCCAAAGCAATGAAAAACTTGCTATTTTTCGTAGGCGACAAGTTGGATTGATTTATCAGTTTC
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CAATCAAGAACGGTTAAATGACTTGTTAGAATTACTTGGTTTAAAAGAACGAAAAACACATTTACCAAAT
CAACTTTCTGGGGGCCAACAGCAACGTGTTGCCATTGGTCGTGCATTGATGAATGCACCAGCAGTTATGC
TTGCTGATGAGCCTACAGGTAGCTTAGACAGTAAAAATGGACAAGAGATTATCCAGTTACTGAAAGAGAG
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TGGGATTTGCAATCAGTATTATGACTGGAATACTTTCTATTGTTTCTGCCACTACCTTTGGAATAGCATT
TTTTGTGTTTACTAAAAATCGATACAAAAGTATTGCACAGATTTCAGAACAAATTAATCTTGTGCTTCAT
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AAATGACGTTACGTATTAGAGAGCAAAATTACGCACTGAAAAAAGAAAAAGAACACCTTGCTGACTCACT
AGCTGACATAGCCCACCAGCTTCGCACTCCTCTTACATCAGTAACTCTTATTTTGTCACTGTTAGAGAAT
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TGATTACTTCCCTTTTAAAATTATCACGTTTAGATGCAGGTATTGTAGTCTTTCAAAAAGAACAAATTGA
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CATATTGATATACCAAAAGGAGTAAGGATTTTGGGTGATTTAAATTGGCTTTCAGAAGCAATTCAAAATA
TATTTAAAAACTGCATGGAGAGTGTGGGTGATAATGGAAAAATTGATATCGTTTGTGAGGACAACTTTTT
GTTTACTCAACTTACTATTCATGACAACGGAGCAGGCTTTAAAAAAGAAGACTTACCATGTCTATTTAAC
AGATTTTATCGTGGGAAAAATTCAAGCACAGCTGGTTATGGAATAGGATTGGCACTTTGTAAGACGATTA
TTATGAGACAAGGAGGAACAATTACTGCACAAAATCACCCACAAGGTGGTGCAATATTTGTTATTCGTTT
TCCAAAGTGA
>ref|NC_013316.1|:c4066829-4066143 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
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AAGGATTTATAGTAACCCATGTATCCACAAGAAGTGAAGCACTTGTAGAGATTGCTAAGAATAAATTTGA
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CAAGACATTCCTGTTATCTTTTTGACGGCTTCTGGTGATGAATCAAGTGTTGTTACTGGACTGAATATGG
GTGCAGATGACTATATTACTAAACCTTTTCGTCCACGTGAACTGATTGCGCGAATTAGAACAGCACTACG
AAAAAGTGGGCGTTTTGGGTCAACTTTTGAAATTTGTGGGCTTTATGTAGATACGGCAACCGGTGTTGTG
AAAAAGAATGGCAATGAGGTTTTTCTTTCAGCTTTAGAATACCGTTTGTTATTGGTGTTTATTAGCAATC
CTAAAAGTATTATTACGAGGGTAAGATTACTTGATGAATTGTGGGATGCGGCAGGTGAGTTTGTTAATGA
CAACACATTGACTGTGTACATCAAACGCTTGCGAGAGAAGATAGAAGATGACCCTTCAAGTCCACAAATA
ATTTTGACTGTTCGTGGGACAGGGTATAGATTGGGGGGAAGTTATGTTTCGAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c4070535-4067329 carbamoyl-phosphate synthase, pyrimidine-specific, large chain [Clostridium difficile R20291]
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CAGAGTTTGACTATTCAGGAACACAGGCCTGCCAAGCATTAAAAGAAGAGGGAATTGAAGTTGTATTAGT
AAATAGTAACCCAGCTACTATAATGACTGATAAAGAAATTGCAGATAAAATATATATAGAACCATTAACA
ATAGAATTTATAGAAAAAATAATAGAAAAAGAAAGACCAGACAGTTTACTTGCAGGTATGGGTGGTCAGA
CAGGATTAAACTTAGCTGTAGAATTACATGATGCTGGTATATTAGATAAATATAATGTAAAAGTTATAGG
AACATCTATAGAATCTATAAAAAAGGGCGAAGATAGAGATTTATTTAGAGAAGTAATGAAAGAAATAAAT
CAACCAGTAATAGTTAGTGATATAGTTACAAATTTAGAAGCAGGTCTTGAGTTTGCCAATAAGATAGGAT
ATCCAGTAGTTGTAAGACCAGCATATACGCTAGGTGGAACTGGTGGAGGTATAGCTGATACTGAGGAAGA
ATTAAGAGAAATACTTTCACATGGACTACAGCTAAGTCCTGTTGGACAAGTTCTTCTTGAAAAGAGTATA
AAAGGTTGGAAAGAAATAGAATATGAAGTAATGAGAGATGGAAATGGAAACTGTATAACTGTATGTAATA
TGGAAAATGTAGACCCAGTTGGAGTTCATACAGGAGACAGTATAGTTGTTGCTCCAAGTCAAACTCTAAG
TGATGAAGAGTATCAACTACTTAGAAAGGCATCAATAGACATAATAAATGCAATAGAGGTTCAAGGTGGA
TGTAACGTTCAAATAGCTTTAAACCCACATAGTTTAGAATATGCGATAATAGAAATAAACCCAAGAGTTA
GTAGGTCATCAGCCCTAGCATCAAAAGCTACAGGATACCCAATAGCAAAAGTAGCAGCTAAGATAGCTTT
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AAGATCACTTGAAACAGGAAAATATTCATTGGTTCATGCTCCATCAGAAGGTAGAACATTAGAAGAATTA
AAGGCTAGAGTAGTAGTACCTGATGATGAGAGACTATTTGACTTAGCTGAAATGATAAGAAGAGGCTATA
AAGTAGAAATGATATCAGAAATAACTGGTGTTGATAAGTGGTTTATAAATAAATTTAAATGGATAGTAGA
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AAGGGATTTTCTGATAAAGGTATATCTGACTTAATGAAGATAAGCCCAGAAAAATTATATGAATTGAGAA
GTTTATATAATATACAACCAGTTTATAAAATGGTTGATACATGTGGAGGAGAATTTGAAGCTCTATCACC
TTATTACTATTCAACTTATGAACAATATGATGAGGTAGTAGTTAGTGATAAGAGAAAAGTTGTAGTATTG
GGTTCTGGTCCAATAAGAATAGGTCAAGGTATAGAATTTGACTATTGTTCAGTTCACTGTGTAAAATCTT
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ATCTGATAAGTTGTATTTTGAACCATTAACAGAAGAAGAAGTTTTAAATATAATAGAAAAAGAAAAACCA
GAAGGTGTAATACTACAGTTTGGTGGACAAACAGCTATAAAATTGGCTAAGTTTTTACATGAAAAAAATA
TACCTATACTGGGAACAGACTTTAGAGATATAGATGCAGCAGAAGATAGAGAAAAATTTGATGATTTACT
AGAGAGACTAGATATAAATAGACCAAAAGGAAAAGGTGTATGGACAACTAATGAAGGTGTTGAAATTGCT
AAGGAGTTAGGTTATCCAGTATTAGTTAGACCATCTTATGTACTTGGTGGTCAAGGTATGGAAATAACTT
ATAACGAAGAAAAACTAATTCAGTATTTGGATGATGCATTTGATAGAGACCATAAAAATCCAGTACTTAT
AGATAAATATCTAACTGGTAGAGAAATAGAAGTAGATGCTATATGTGATAAGGAAGATATATTGATACCT
GGTATAATGGAACATTTAGAAAGAGCTGGAGTTCACTCTGGAGATAGTACAACAATGTATCCAAGTCAAA
ATATATCTGATGAAATAAAAGAAAAGATAGTAGAATACACTAAAAAAATAGCTTTAGACCTTAATGTGCT
TGGTATGGTTAATATACAATTTATAGAATTTCAAAATGAATTATATATAATTGAGGTTAACCCTAGAGCT
AGTAGAACAGTTCCATATATAAGTAAAGTAAGTGGAGTACCAATAGTTGACTTGGCTACTAAGTGTATGT
TAGGAGCTAAATTAAAGGATTTAGGATATGGTACAGGAGTTTACAAAGAGCCAAAATTAGTATCAGTAAA
AGTACCAGTATTCTCAATGTCTAAATTATCTAAAGTTGAAGTAAGTCTAGGACCTGAAATGAAGTCTACA
GGAGAAGTCCTAGGTGTAGGAGAAAATTTAGAAGAAGCCTTATATAAAGGGTTCTTGGCAGCAGGTAGAC
ATATGTCTGATGAAAGAGGAGTAGTACTTGCTACTGTAAATAATCATGATAAAGATGAGTTTATAGAGAT
AGCAAAAGATATGAAAGAATTAGGATATACTTTTGTTGCTACAGAAGGAACAGCGAAGAGTTTAAGAGAA
AATGGAATAGAGGCTGATATAGTAAATCGAATTGAAGAGCCTAGACCAAACATATTAGATGCTATAAGAA
ATAAACAAGTTGATATAGTAATAAATACACCAACTAAAGGAAATGACTCTACAAGAGATGGATTTAAGAT
GAGAAGAACAGCCATTGAATTTTCTACTGAAATAATGACATCTTTGGATACGCTAAAAGCTTTAGTAGAA
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>ref|NC_013316.1|:c4071822-4070728 carbamoyl-phosphate synthase, pyrimidine-specific, small chain [Clostridium difficile R20291]
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ATGGAACAGTTTTTATAGGAAAGGCATTTGGATATTTAGAAGAAAGTGTAGGAGAAGTAGTATTTAATAC
TTCGATGATAGGATATGGTGAAGTTTTAACAGACCCTTCTTACTATGGTCAAATAGTTACTATGACTTAT
CCTCTTGTAGGAAATTATGGTATAAATTTATCATCAGCAGAGTCTGAAAAAGTTCAAGTAAAGGGATTCA
TAGTAAGGGAGAAAAGTGATTCTCCAAGTAATTTTAGATGTGAAATTGATATAGACCAATATTTAAAGCA
AAATAAAGTTATCGGACTTGAAGGAATAGATACAAGAGCTTTGACTAAGATACTTAGAAATAATGGAACA
ATGAAAGGTATAATTACATTAGAAGACAGTAAATTAGAAGATGTTAAACATAAATTGGATAAGTTTTCAA
ATACAGAAGCAGTTAGAACTGTTACAAGAAAAGAAGTAGAGCATATAAAAGGAAATGGTCCAAAAGTGGC
TGTTATGGATTTTGGAGTAAAAAGAAATATATTAAGATCATTTATAGCTCGTGGATGTGATATAACAATA
TTTCCAGCTACAACATCTCCAGAAGATGTATTGAGTATAAACCCTGACTTAATATTCTTGTCAAATGGAC
CTGGAGACCCAGAAGACCTAGAAGATGTTATAGAAAATATAAAAGCTCTTATTGGTAAAAAACCTATAGT
TGGAATATGCTTAGGACATCAACTTTTAGCTTTAGCTCTTGGAGGAAAAACTGCTAAACTTAAATTTGGG
CATAGAGGTGGAAATCATCCAGTTAAAGATTTAGAAGAAGGAAAAGTATTTATAACTTCTCAAAATCATG
GTTATTATGTTTCAGAAGTTCCTGAACAAATGAAAGTGACACATATAAATTTAAATGATAATACTGTTGA
AGGAATGAGACATGAGAAGCTAGATGTATACAGTGTTCAATACCATCCTGAAGCTTGCCCAGGACCAAAA
GATAATGACTATATTTTTGATAAATTTTTAGAATTAGTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c4075241-4072035 carbamoyl-phosphate synthase, pyrimidine-specific, large chain [Clostridium difficile R20291]
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CAGAGTTTGACTATTCAGGAACACAAGCTTGCCAGTCTTTGAAAGAGGAAGGGATTGAAGTTGTATTAAT
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ATAGAATTTATAGAAAAAATAATAGAAAAAGAAAGACCAGACAGTTTACTTGCAGGTATGGGTGGACAAA
CAGGGCTAAACCTAGCAGTTGAACTTTATGAAAAAGGCATACTAGATAAATATGGAGTAAAGATAATAGG
TACTTCAGTAGAATCTATCAAAAAAGGTGAAGATAGAGATATATTTAGAGAAGTAATGAAAGAAATAAAT
CAGCCTGTAATAGTTAGTGATATAGTTACAGATTTACAAGCAGGTCTTGATTATGCACTTACAATTGGTT
ATCCAGTAGTTGTAAGACCAGCATACACACTAGGTGGAACTGGTGGTGGTATAGCTGATAATGAGGAAGA
ATTAAGAGAAATACTTTCACATGGTCTACAATTAAGTCCTGTTGGACAAGTATTAATTGAAAAGAGTATA
AAAGGTTGGAAAGAAATAGAATATGAGGTAATAAGAGATTCAAAGGGAAATTGTATAGTTGTATGTAACA
TGGAAAATATAGACCCAGTCGGAGTTCATACAGGAGACAGTATAGTTGTTGCTCCAACTCAAACTTTAAG
TAACAAAGAATGTGCAATGCTTAAAAAAGCATCTTTAGATATATTAAATGCAGTAGAAGTTCAAGGTGGT
TGTAACGTTCAATTTGCACTTAATCCACATAGTTTTGAATATGCAGTTATAGAGATAAATCCAAGAGTTA
GTAGATCATCAGCTTTAGCATCAAAAGCTACAGGATATCCAATAGCTAAAGTTTCATCAAAAATAGCTTT
AGGTTATACTTTAGATGAGATAGAAAATGCAGTAACTAAAAAAACTTATGCTTGTTTTGAACCAACTATA
GATTATGTGGTGGCAAAAATACCAAAATGGCCTTTTGATAAATTTAAAAAAGCAAATAGAAAATTAGGAA
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AAGATCACTTGAAACAGGAAAATATTCATTAGTTCACACACCATCTGAGGAGAGAAGCATTGAGGAATTA
AAGAAAAGAGTTGTAGTACCTGATGATGAGAGACTATTTGACTTAGCTGAAATGATAAGAAGAGGCTATA
AAGTAGAGATGATAGAACAAATTACAGGTATAGATAAATGGTTTATAAATAAATTTAAATGGATAGTAGA
GCAAGAAGAAAAATTAAAAGTTATGAAAATTGAAGATTTAACTAAAGACTATCTTCTTGAATTAAAGAAA
AAGGGATTCTCTGATAAAGGTATATCTGACTTAATGAAGATAAGTCCAGAAAAATTATATGAATTGAGAA
GTCTATACAATATCAAACCAGCATATAAAATGGTTGATACTTGTGCAGGTGAGATAGATGCTATATCTCC
TTACTATTATTCAACTTATGAGCAATATGATGAGGTAGTTGTTAGTGATAAGAAAAAGGTGATAGTATTA
GGTTCTGGTCCAATAAGAATAGGTCAAGGTATAGAATTTGACTATTGTTCAGTTCATTGTGTAAAATCTT
TAAGAAAAATGGACATAGAAACTATAATCATAAACAATAACCCTGAAACTGTAAGTACAGACTTTGATAC
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GAAGGTGTAATACTACAGTTTGGTGGGCAAACAGCTATAAAATTGGCTAAGTTTTTACATGAAAAAAATA
TACCTATACTGGGAACAGATTTTGATGATATAGATGCAGCAGAAGATAGAGAAAAATTTGATGATTTACT
AGAGAGACTAGATATAAATAGACCAAAAGGAAAGGGTGTATGGTCACTTAACGAAGGTATTGAAGTTGCT
AATGAATTAGGTTATCCAGTATTAGTTAGACCATCTTATGTACTTGGTGGTCAAGGTATGGAAATAACTT
ATAACGAAGAAAAATTATCTCAATATCTACAAGATGCATTTGATAGAGACCATAAAAATCCAGTACTTAT
AGATAAATATCTAACTGGTAGAGAAATAGAAGTAGATGCTATATGTGATAAGGAAGATATATTGATACCT
GGTATAATGGAACATTTAGAAAGAGCTGGAGTTCACTCTGGAGATAGTACAACAATGTATCCAAGTCAAA
ATATATCTGATGAAATAAAAGAAAAGATAGTAGAATACACTAAAAAAATAGCTTTAGACCTTAATGTGCT
TGGTATGGTTAATATACAATTTATAGAATTTCAAAATGAATTATATATAATTGAGGTTAACCCTAGAGCT
AGTAGAACAGTTCCATATATAAGTAAAGTAAGTGGAGTACCAATAGTTGACTTGGCTACTAAGTGTATGT
TAGGAGCTAAATTAAAGGATTTAGGATATGGTACAGGAGTTTACAAAGAGCCAAAATTAGTATCAGTAAA
AGTACCAGTATTCTCAATGTCTAAATTATCTAAAGTTGAAGTAAGTCTAGGACCTGAAATGAAGTCTACA
GGAGAAGTCCTAGGTGTAGGAGAAAATTTAGAAGAAGCCTTATATAAAGGGTTCTTGGCAGCAGGTAGAC
ATATGTCTGATGAAAGAGGAGTAGTACTTGCTACTGTAAATAATCATGATAAAGATGAGTTTATAGAGAT
AGCAAAAGATATGAAAGAATTAGGATATACTTTTGTTGCTACAGAAGGAACAGCGAAGAGTTTAAGAGAA
AATGGAATAGAGGCTGATATAGTAAATAGAGTAGAAGAATCTAGACCAAACATATTAGATGCTATAAGAA
ATAAACAAGTTGATATAGTAATAAATACACCAACTAAAGGAAATGACTCTACAAGAGATGGATTTAAGAT
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>ref|NC_013316.1|:c4076337-4075294 carbamoyl-phosphate synthase, pyrimidine-specific, small chain [Clostridium difficile R20291]
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CTATTGGAGAAGTTGTATTTAATACTTCAATGGCTGGGTATGGAGAAATATTGACAGACGCAACTTATTA
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AATAAGGTGCAAGTAAAAGGACTTATTGTAAGAGAAAAAAGTGATAACCCAAATAATTTTAGATGTGAAA
TGGATATAGACACATATCTAAAGCAAAATAAGGTAATAGGACTTGAAGGAATAGATACAAGAGCATTAAC
TAAAATTATTAGAAACAATGGAACTAAGAGAGGAATTATAACTTTAGAAAATGTATCATTACAAGATGTT
CAGTCTAAATTAGAAGAGCATTGTAACAAAGATTCAGTAAAAAATGTTACAAGAAAAGAAATTGAAAATA
TAAAAGGTACTGGAGCTAAAGTTGTAGTTATAGACTTTGGTGTTAAAAATAGTGTACTAGAGTCTCTTAA
AGCTTGTAACTGTGATATAACTATAGCACCAGCAATGACTACAGTAGAAGAAATTTTAAATATAAATCCT
GACTTAATCTTATTATCTAATGGACCAGGAAATCCAGAGGATATAAATGATATAGTTGAAAATATAAAAA
AATTAATAGGCAAAAAGCCATTGACAGGAATAGGTTTAGGACATCAAATTTTAGCATTGGCATTAGGAGG
AAAGACTTCAAAGCTTGTATTTGGACATAGAGGAGGTAATCACCCAGTTAAATGTTTAGAAACTGGAAAG
GTATTTATAACTTCTCAAAATCATGGATATAATGTTTCAGAAATGCCAGAAAATACAGAGGTAACTCACA
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>ref|NC_013316.1|:c4077079-4076363 orotidine 5'-phosphate decarboxylase [Clostridium difficile R20291]
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AGTAGTTGGAGTAACAGTTTTAACTTCATTAAGTAACCAAGATTTACAGGACATAGGATGTAATATGACA
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AAATAGAAAATGCTTAG
>ref|NC_013316.1|:c4078090-4077455 hypothetical protein CDR20291_3431 [Clostridium difficile R20291]
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AGCTTATAATGCTGGATTAGTTGAAGCAGAGGGGTATTGTCAATATACTAGACTAAAAGAGATTATAGAG
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GAATAA
>ref|NC_013316.1|:c4079028-4078114 hypothetical protein CDR20291_3432 [Clostridium difficile R20291]
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CATTGATGGAAGAAATAAAAAGAAGTTGTAAAAATTTAGAATACTTAAATGAAGATTTAAATATTAAAGC
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TTTTGCGCCTTACAACATTGGGAATAGCTACTTGCTGGTTGGAAGGAAACTTAAAGAGAGAAGATATCTT
GGAATTTGTAGATATTGGGAATAAGAATTTTGAAGAAGATGAGGAAGATGATTTAGATTATCTAGCTGGA
GTAAAAACAGAAGAAGATGATGAAAACAAAATAGAAAATCCTTATATAATAATAGCATTTGGATATCCAG
CAAAAAATGAAGAGTTGTTTAGGACGAGATATGCTAGACCTGATAGAAAGCCAGTAAAAGATATGATAAA
TAAGATAAATAGGAATAGAAAGTGGAAAGATATCTTAGAATTGACAAGAAGAGCTCCATCTGTAAAAAAT
TCTCAACCGTGGTATTTCCATAAGGATGAACGAGGTCTTCATTTATTTGAAAAGAGACCTAAGAAACACT
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AATAGATGTTTCATATGAAAAACTTCCTATAAGGAATAAAATAGGAAAATCATATTTTATAACTGTAGTC
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AATAA
>ref|NC_013316.1|:4079628-4080857 aminopeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATTTAAATAGAAATTTAGAAAAATACGCTGAATTAGCAATAAAAGTTGGAGTTAACATACAGCCAG
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TTAACATTTAAAGATGGTAAAATAATAGATTTCTCTGCTGAAAAGGGATTAGATACACTAGAAAAACTTA
TTGAAACGGATGAAGGCTCTCATTATTTAGGAGAAGTTGCTCTTGTTCCATACAACTCACCAATATCCAA
TACGGATATAATTTTTTATAATACTCTATATGATGAAAATGCTTCTTGCCACTTTGCAATTGGTTCTGCT
TATAAGACTTGTCTGGAAGGTGGAAACAATTTAAAAGATGAAGAATTAGATGAACATGGTGTAAATGACA
GTTTAACACATGTAGATTTTATGATTGGTTCTGCTGATATGGATATTATTGGTGAGACTTATGATGGAAA
ACAAATACAGATTTTTAAAAATGGTAATTGGGCTTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c4083443-4081062 putative homocysteine S-methyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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AAAAAGGGTTAAAGTTAGGTGAAAATCCAGAAGTATTTGGTCTTCAAAATCCAGATAAACTTATAGAAAT
ACATACAGCATACTTAGAGGCAGGTTCGAATGTAATTCTTACAAATACTTTTGGATGTAATGAACTAAAA
TTAGATAGTAAGTATACTGTAGAAGAGGTGATTGACAATGCTGTTTTGGTGGCTAGAAAAGCTATAGAAA
ATGTAGATAATACTAAACCAAGATATGTAGCTTTAGATATTGGTCCTATAGGAGAAATGCTAGAGCCTAT
GGGTACTTTAAGTTTTGATAATGCATATGAGATATTTAAAAGACAAGTACTACAAGGCGTTAAATCTGGA
GTTGATGTAATAGTAATAGAGACTATGATGGATTTATATGAAGCTAAAGTAGCTGTATTAGCAGCAAAAG
AAAACTCTGATTTACCTATTTTCTGTACTATGACATTTGATGAAGGTGGAAGAAGTTTTACTGGATGTAT
GCCAGAATGTATGGTGGCTACTATAGAAGGTCTAGGTGTAGATGCAATAGGAGTTAATTGTTCATTAGGA
CCTAAACAACTTTTACCAATAGTTGAAAAAATAGCATCAAGAGCTACAGTCCCTGTTATGGTTCAAGCAA
ATGCAGGTCTTCCAAATATAGTTGATGGAGAGGCTATATATGATGTTGATGCAAAAGAATTTTTTGAAGG
GGTTAAAAAGTTCGTTGAAGTTGGTGCTACTATAATAGGTGGATGTTGTGGTACGAATCCAAGTTTTATA
AAAGAAATATCTGAGAATATAAATTCTGTTACAAAGGGATGTATCGAGAAAATTGATAAATGTGTAGTCT
GTTCACCATCAAAATTTGTGGAAGTACAATCGCCTACAGTTGTTGGAGAAAGATTGAATCCCACAGGTAG
AAAATCTCTACAAGAAGCATTAAAAAATGAAAATGTTGATTATGCTATAAATTTAGGCTTAGAACAAGTA
AATGCTGGAGCACAAATACTTGGAGTAAATGTTGGTCTTCCAGAGATTGATGAAAAAAAACTAATGCCAA
AATTAATAAGAGAGATTCAAGCAGTAGTAGATACACCTTTACAAGTTGATTCTTCCAATGTAGAGGCCTT
AGAGCAAGGACTTAGATATTATAATGGTAGAACAATAGTAAACTCTGTAAATGGCAAAGAGGAGTCTTTA
GAAAGTATATTACCAATAGTTAAAAAGTATGGTTCATGTGTGGTTGGACTTACACTTGATGAAAAGGGGA
TACCTAAAAAGGCTGAAGAAAGATTTGAAATAGCAAAAAGGATAGTCAATAGAGCAGTTTCTTGTGGGAT
AAAACCAAAAGATATATTTATAGACTGTTTATCATTAACTGTTTCAGCACAACAAGAAGAAGCAATAGAA
ACTATAAAAGCTATAACAATGGTAAAGACACTAGGAGTAAAAACTATATTAGGTGTTTCAAATATTTCAT
TTGGTCTTCCAAATAGGAAAGCACTTAATGCTTCTTTTCTAACATTAGCTTTAGGGGCAGGGCTTGATTT
AGCAATTATAAATCCAAATGAATATAGTATGATGGAAGCTATCAATTCTTTTAAAATATTAAATAACACA
GATAAAGGATGTATAAACTATATAAATCAATATAGTAATATAAATAATTCAAAAAAATCGGATTCATCTA
CAAAGATTGACAAAGATTTGCCATTGGATATTTTAGTTGAAAGAGGATTAAAAGATGAAGCAAAAAATGT
AACACTGAATCTTTTAAAAGAGAAGGATGAAAATTACATATTAGATGAGATTTTAATTCCTGCTCTTGAT
AAAGTAGGAAAAAGATATGATAGCGGAGATATATTTTTACCACAATTGATTCAATCAGCAGAAACGGTAA
AAGTTTCATTAAATACAATAAAGGAAACTTTATTAAGTAAAAGTAGCAATAATGTATCCAAAGGAAAAAT
AATAGTTGCTACAGTAAAAGGTGATATCCATGATATTGGGAAAAATATAGTAAAAATAATGCTAGAAAAT
TATGGATATGAGGTTATAGATTTAGGTAAAGATGTCCCTATTGAAGAAGTAGTGGAAGTTGCTAAAAAGA
GAAATATAAAATTAGTAGGATTAAGTGCACTTATGACTACGACTGTTCAAAGTATGAAAGATACAATTCA
GGCACTGAGAGATAATGAGATAAATGCAAAGGTATTTGTAGGAGGTGCAGTTTTGACAGAAGAATACGCT
GAAGAAATGGGCGCTGATTATTATTCAAAGGATGCAAAGTCTGCTGTTGAAATAGCAAAGTTAAATTTTT
AG
>ref|NC_013316.1|:c4084140-4083415 hypothetical protein CDR20291_3435 [Clostridium difficile R20291]
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ACAGAGGTCAAGAGATAGATAAAGACCTTAAATATACTATTGATGAATGTGTAGCTATAACTAAAAATAA
AATAAATCCTAGATATTTATCTAGGATTTATCCTATTAGAATAAATAAAGATAATGTTGTAGAATTAGAG
GGAACAAATTTAACATTAGAGAGTAAAGATGTATATGAACTTTTAAAAGAATGTAATGAGTGTGTAATTA
TGGCAGCTACTATAGGGATAGATATAGAAAAAGAAATAAGACGACACTCTTATTCAAATTTAACAAAAGG
ACTAATAATTGATTCATGTGGAACAACAGCAATAGAAGAAGTGTGTGACATTGTTCAAAATAATTTAGAA
AAGGTTTTTTTAAACCAAGATAAATTTATAACTATGCGATATAGCCCAGGATATGGAGATTTACCAATAG
AAAAAAATATAGATATATTAAACGTTTTGAATGCTCAAAAACAAATAGGTCTAACAATTACTTCTAATGG
AATTATGATACCGAGAAAGTCAGTAGTGGCTATTATAGGTATTTCTAATACAAGAATAAATAAATCTAAG
AAAGAAAAGTCGTGTGAAAATTGTAAAAACTATAGAAACTGTACATATAGAAAAGGAGCGAACTCTTGTG
GAAATAAGACAATATCTGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c4084585-4084130 S-ribosylhomocysteinase [Clostridium difficile R20291]
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TACTTGATGGAGTAAAGGGAGATAAAGTAACTAAATTTGACTTGAGATTTTTACAGCCAAATGTAGAAAG
TTTTGGAACTGCTGCTATGCACGGTTTAGAGCATCTTTTAGCTACTTATTTAAGAGATACATTAGATGGT
GTAATAGACTTATCTCCAATGGGATGTAGAACAGGATTTTATTTAATACTATGGGGAGATGTAGATGCCA
AAACAGTTAAGATTGGTTTAGAAGAAGCATTAAAAAAAGTTCTTGAATCAGATAAAATGCCAGCAGCTAC
AGCCATAGAATGTGGAAACTACAGAGACTTATCTTTATTTGGGGCAAAGGAATATGCAAAAGATGTTTTA
GATAAAGGATTTTCTTTAAATATATATGGAGAATAA
>ref|NC_013316.1|:c4086021-4084867 two-component sensor histidine kinase [Clostridium difficile R20291]
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ATATAATAAAATTATTATATTTCAATAGTGAGATATCTGTAATTAATCAACTTGTATATCAGTTAAGAGA
TTTCAGAAGTCTTATAGGAGAGAGTTTATTTTATCCATTTTTATTTACAATCACATCATTAGCAATTTAT
TCCATGATATCGTACAAGAGAAATAAGCAAATTGTAGATTTTATAAGAAAGACTAATAGAAAAAATCAAA
AATTAGAAATCATTAAAAGTGCTGTAAATTTAATGGATGAAGGTAACTTAGAAAAAAGTATAGATATTGA
GTATGATTTAGATATATTAAAGGATAAAGAAAAGGATGATATTGATGAACTAGCACATAAAATCAATAAT
ATAGTCCATCAACTTAGAAATATAACTATTGAAGAGAGACAAGCTCAGCAGACAAAAACAGATTTAATAA
CAAATGTGTCACATGACTTAAGAACACCTTTGACATCCATAATGGGTTATTTAGGAGTGATAGAAGAAGG
TAAGTATAAAGATGAAGTTCAGATGATGTATTATGTTGATATTGCATATGAAAAATCGAAAAATTTAAAT
GTTCTTATAAATGATTTGTTCGAATTGACTAAAATGCAAAATAATACAATAAAACTAAACAAAATAGAAA
TAAATTTAGTAGAGTTATTAAGTCAAGTAGTATCTCAATTTGAAATTTATTTTAAACAAGAATTTATGGT
TAGTAGAATTAATTTTAATGAAGAAAAATTAATTGTGAAAGCTGATCCAAATAAATTGGTAAGAGCATTT
GAAAATCTTATAACTAATGCTGTGAAATATGGAAAAGATGGGCATTATGTAGATATAGTCACAGAGAAAA
TGGAAGATATGGCGGTTGTAAAAGTGATAAATTATGGAGAACCAATTCCAGTGTTAGATTTACCAAATAT
ATTTGATAGATTTTATAGAGTTGAAAAATCGAGAAATAGAAATGTTGGAGGTTCTGGATTGGGTCTTGCG
ATTACAAAAAATATTGTAAATTTACATGATGGAGAAATTACTGTTTCAAGCGATAAATATCAAACTGTGT
TTGAGGTACAACTGCCAATAATACAATCAGCTTAG
>ref|NC_013316.1|:c4086730-4086038 two-component response regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGAATAATACAGTTCTTGTTGTGGATGATGAAAAGGAAATAAGAGACCTTATAGAGATATATCTTTTAA
ATAGTGGATATAATGTAATTAAAGCTGAAGATGGAAAAGAGGCTCTAGATATTTTAAAAAAGGAAAATAT
TCATTTAATGATATTGGATATAATGATGCCTAAAATGGATGGGATAGAAGTTTGTAGAAAAGTTAGAGAA
AGTTTGAATATACCAATACTTATGTTAAGTGCAAAATCAGAAGATATGGATAAAATACAAGGGATAATGA
CTGGTGCAGATGATTATTTGACAAAACCATTTAACCCACTTGAACTTACTGTGAGAGTGAAATCACTGAT
TAGAAGAGCATATTATTTTAGTGGTGCTAATAATGAAGATAAAGATGTCATAAAGGTTGGAGTAGTAATT
ATAGATAAGGAAAAACATAGTGTAACAGTGGCTGGAAATGAAATAATTTTGACATCAAGAGAATTTGATA
TATTATATTTACTAGCAAATAATAAAGGCAGAGTATATAGTACAGAAGAAATATTTGAAAAGGTATGGAA
AGAGAAATATTACCAATCTAATAATACTGTAATGGTTCATATGAGCAGAATAAGGGATAAAATTGAAAAA
TATACAGATGGAGAAAAAATAATTCATACTGTATGGGGAGTAGGATATAAAATTGAAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c4087580-4086864 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAATTTAAATTAATAGGAGCCATTATTTTAGTAGTATTTATAAGTGTATTTATATCTAAAGATA
GATTACTTAAGAAAGATAAAGATCCAATAGTAGCTGCTCAACATGATTCAGAACAAGATGTTGAGGCAAA
TTCTCAAAATAAAAATCACTCAAATAGTATATCAAATATATTATTGGTAAACAAGACAAATGGAATTAGC
AAAAACTATACTCCTGAAAATATTACTAAGGTAAACATACCTTTTGTTGAAGAAGCAACAGAGGAAGAAA
AACAAATGGCAGGAGAACCTGCAAAGGCAGTTGAAGATTTAGTTAAGCAAGCTAATTCAGAAGGAATACA
GTTTTTAGGGTCTTCAGCATACAGATCTTATGATACTCAACTGGATACTTATACAAGAAGGGTAAAATCT
CAGGGACGAGAAAAGGCAGATGCATATGTAGCAAAGCCTGGTTACAGTGAGCACCAAACTGGACTTTGTA
TTGATTTAACAAATCCAGAAAGATGGTTTGTTGGAAGTACAAAAGAAGCTAAATGGTTGGCAGAAAATGC
TCACAAGTTTGGATTTATAATAAGATATCCTGAAGGTAAAGAAGATATAACAGGTACAGCATATGAACCA
TGGCATATTAGATATGTTGGTAAGGATGCTGCCGAGGAAATTTATTCAAAAGGATTAACTTTAGAAGAAT
ATTTACAAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:4087706-4088440 putative ATPase [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTATACAAAAACTTCTAAGTAAAGCTCGTAAGGCTATACAAGATTTTGATATGATACAAGAAAATG
ATAAAATTGCGGTTGGACTTTCTGGTGGAAAAGATAGTTTAACTCTACTTCATATACTTAAAAGTTATCA
AAGATTTTCTCCACAAAACTTTGAATTGATAGCCATAACATTAAATACTGGAGGTGTTGATAATTCTCCA
CTAGATAAATTGTGTAAAGAAATAAATGTTCCTTTTTATGAATTTCAAACTGACATAAAAGAAATTGTAT
TTGATATAAGACAAGAAAAAAATCCTTGTGCATTATGTGCTAATTTAAGAAGAGGTGCTTTGAACGATAA
TGCTAAAAAACTTGGATGTAATAAAGTAGCTCTTGGTCATCATAAAGATGATGCAATTGAGACATTTTTA
ATGTCTATGTTTTATGAGGGTAGAGTAAATTGTTTTTCCCCAAAGACATACCTAGATAGACAGGATTTAA
CAGTTATAAGACCTATGATTTACATAGAAGAGTATATGACTAAGAAAATTTCAAAAGATTCTAACTATCC
TATTATCACAAATCCCTGCCCTGCAAATGGTCATACTAGGAGAGAGTACATAAAAAATCTTATTGCTAAT
TTAAATAAAGAGATGCCTGATTTTAAAAGAAATGTATTTGGCGCTTTAAATAATTCTGAGAAATTGTTTA
TATGGGATAAAGAGAAGATAAAAAATTTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c4089576-4088725 putative exported phosphoesterase [Clostridium difficile R20291]
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TTGCGATAGAGCCGAGTCTATTAATTGTGAAAAAATATAATATAAGTGAAAATGGAGCATTGATAAAAAA
TGATACAATTGAGAGTAAATCTGAAAGTGTAAAAGTAGTTCAAATTTCAGATACTCAAATAGGTAGTTTT
TATTCAACTAAGAATCTCAAAAAAGTAGCTAATAAGATTAACACTTTGAATCCAGATATAATAGTATTTA
CTGGTGATTTAATTGATTACTCCAATAAAAATCCAAGTGTAGATGAAATTACAACTATTTTATCAAGTAT
GAATGCTAGGTTGGGAAAATTTTCAGTATTTGGCAATCATGATTATATGTATAAACTTCCTAGGTATTAT
AGGCAGATTATGAAAAATTCCAACTTCAATCTTTTAGTAAATGAAAATAAAAAAATAAAATTAAAAGATG
ATAAATATATTAATATATTAGGTGTTGATGAAATATTAAATGGAAATCCTAATATAAAATATCTGGAGAG
TCAGATAGATAATAAAAATTTTAATTTATTGTTAGCACATGAACCAGATTTAGTAGATATGCTTAGTAAA
GATACAATGAATTTAGTTCTATCTGGGCATAGTCATGGTGGTCAAATAAGATTACCTATTAAGGGAGCAT
TAGTTACTCCTCCATATGGGAGGAAATATACTAAAGGGTTTTATGATATAAATGGAAATCATTTATATGT
GAGTTCGGGTCTTGGAAGTACAAAGTTACCATTTAGATTTTTTAATATACCAGAGATAATAGAATTTAAT
ATTATAATCTAA
>ref|NC_013316.1|:c4090540-4089602 hypothetical protein CDR20291_3442 [Clostridium difficile R20291]
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GTGGGTATCAAATTGATATACTTACAAATGGTAAAAAGGAAATAGATTATAATGGTTTTAAAGAACATCT
AATTTGTGATAGAAAAGTTCGAAAAGATATGGAAAACATTATCACAGGAAGAAAATATGATTACATATAT
GATATGACAGCATATACAAAAGAAGATGTAAGTAATCTGATTGATTTTATAAGCATGGATAACTTAAAAA
AGTATATAGTATTGTCAGCAGGAGCAGTATATAAAGATAGTGGAAGAAATATAAAAGAAGAAAATGAGAA
AGGTGAAAATGAAAACTGGGGAAAATATGGGTTAAATAAAAAAGAGGCTGAAGATTTTATTATAAATAGC
CCTATACCATATATAATTATTAGACCAACTTACATATATGGTGAAAATAATAATTTATATAGAGAGTATT
ATTTCTTTGAAAAAATAGAAAAAAATGAAAAGATACCAGTACCAAAAGGAAAACAAGTTAGTAATCAATT
TATATATATTGGGGATTTGGTAAAGGTATTGGAAAGCATAATGAAAAATCCTCATGTAAGAGAGGCCTAT
AATGTGACAAATCCACAGTTAATTTCTTGGGATGACCTTATATATACATGTGGAGAAATTATTGGCAAAG
AACCTATAATAAAATATGTAGATATGGAAAAAGTAGAGTTTAGAGAAAGAACGTATTTCCCATTTAGAAA
TATAGACTTTAATCTTGATATAAATAAGCTTATTGAACATGGGCTTTATATACCAAATGTGTTACTAAAA
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AAGTTGAGTCTGTAATGCAAATAGTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c4091293-4090643 putative phosphatase [Clostridium difficile R20291]
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GAAAAGTATAGAGAATATTTTGCTGATAAAGGGATATTTGAAAATAAAATTTATGAGAATATGAAAGAGA
TATTAGAAATGCTCTATAAAAATGGTAAAATATTATTAGTAGCAACTTCTAAGCCAACAGTTTTTGCAGA
AACTATACTTAGATATTTTGATATAGATAGATATTTTAAATATATAGCAGGTAGCAATCTTGATGGTACA
AGAGTGAATAAAAATGAAGTTATACAATATGTACTAGACCTATGTAATGTAAAAGATAAAGATAAAGTTA
TTATGGTTGGAGATAGAAAGTATGACATAATTGGAGCTAAAAAAATAGGTATAGATTCTATTGGAGTATT
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ATAAAAGATATTTTGTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c4091631-4091443 ferredoxin [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGCATTTGTTGATAAGGATGTATGTGTAGCTTGTGGAGCATGTATAGGAACATGTCCAGACGTTT
TTAGTATGAGCGATGAAGGGCATTCAGTAGCAATTGAAGGAGAAATACCAGCAGATTTACAAGATTTATG
TAAAGAAGCCGAAGAAGGATGTCCAGTTTCAGCTATAACAGTTAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c4092922-4091738 putative amidohydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATTTACTTATAAGAAATGGGACAATAATATCTCCAACAGATGGTATCAAATTTGAAAAAAGAG
ATATCTTGGTTTTACATGGGAAAATATATGCTATTGGATTGAACCTTAAAGAGAAAATAAGAAAAGAAAA
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GTTCACACCCATTGTTATAAGAGAAAATTACCTACAGGTATGGATTCTGATTCAATTGGAATTGAAAAAG
GTTCTACAGTTATATTTGATGCAGGTACAGCTGGTCCCTCAAACTACTATGATTTTAAAAAAAAGTATAT
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AGGGTATAAAAGTAAAAGCGAGTAAATTTCAATCTAATGAAAGTGGTATAGATATAATTAAGAAATCAAA
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AAGAATCTGGCACATTAAGAAAATCAGTAATAAATGCAAAGAATAGAGGAGTATTGTTCGATGTATGTCA
TGGAGTGGACCAATTTGATTTTAAAGTTTTTAAAAAAGCAATAAAGCAAGGTTTAGAGCCTGACCTAATA
AGTACTGATATGCATATAAAAAACATGAAAGACGTAAACTATTCTCTTTTAAATGTTATAAATAAAATTA
TGGAACTTGGGATATCCCTAGAAAAGTGTATAGAAAAAGTAACTGAATACCCAACAAAGATTTTCGATTT
ACATGGAAATAAAGGCAGAATAAAGATTGGAGGAGAAGGTGATTTTACAATATTCACAATGGAGGAGTGT
AATGATATTATAAAAGACTACAATAATAATGAACTTGTTTTAAATAAAAAATTAAGATTGCAATATACTG
TAAAATCATGGATGAAAAGCAGTGAAGTTTATAGACATGGATACGAAAATACTATAATAAACTAA
>ref|NC_013316.1|:c4093981-4093064 hypothetical protein CDR20291_3446 [Clostridium difficile R20291]
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ATATACGTAAAAATGGGCAAGGAGTAGAGAGACATTCAACTGAAAATGTAACTATAATTCCTAAAACTGA
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ACAGAGGCTGGTGTACAGGATATGGTATATAATGATTTTGAAATTGGAGAAAATGCAGATGTTGTTATAA
TTGCTGGGTGTGGTATACATAACTGTGGTTGTGATGATAGTGAACATAATGGTATACATAGATTTTTCTT
ACGTAAAGGAGCTCGCCTAAAATATGTAGAAAAACATTATGGTGAAGGTGATGGAGAAGGAAAGAGAATT
TTAAATCCAGTTACTATTGTCAATATGGATGAGGATTCATATTGTGAAATGGAAACAATTCAAATTAAGG
GTGTAGATTCAACTAAAAGAGAAATGGATGCAAACCTAGGTAAAGGAGCTAAAATAGTTGTATTTGAGAA
ATTATTAACTCATGGTAATCAAGTTGCAGAATCTAATATGAAGGTTATCTTAGAGGGTGAAAACTCTTCT
GCTCAAGTAGTTTCTCGTACAGTTGGGCAAGATAATTCTAAGCAAAAGTTTAATCCTTGTGTTATTGGGG
ATTCCCTTTGTTCTGCACATGTTCAATGTGATTCAATAATTATGGGAAATTCTCAAATTAGTGCTATACC
TGAAATTGCTGCAAATCATCCAGATGCTCTTTTAGTACATGAAGCAGCTATTGGAAAGATTGCAGGAGAC
CAAATACTAAAGATGATGACATTAGGTCTTACTGAAGAAGAAGCCGAGCAACAAATACTTAATTGCTTCT
TAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c4094731-4094003 ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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TTAGCCTTTCATTTGAGAGGGGAAAACTTATTGTTATCACAGGTCCAAATGGTGGAGGAAAATCTACAAT
TGCTAAGCTTATTATGGGAATTGAAAAAGCTACGAGTGGTCAGATAATTTTAGATGGAGAAGATATAACA
AATCTTAGTATTACAGAAAGAGCAAAAAAAGGAATAGGATACGCATTTCAACAACCACCAAGAATAAAAG
GTATGACAGTTGAAAATTTACTTACACTTGCTCATGGAAAACCATTGTCTACTGATGTATGTTGCCAATA
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GAAATGAAAAGAATTGAGATAGCAACTCTTTTTGCTAGAGATTTAAAGGTTTCTATATTTGATGAACCTG
AAGCAGGGATAGACCTTTGGAGCTTTGGAAAACTCAATGAAAGTTTTAAGAAAATACATGAAGAGTCTAA
TCAGACTATAATCATAATTTCTCACCAAGAAAGAATATTAGAGTTAGCTGATGAAATAATTGTTCTACAA
GATGGTTCAGTAAAAAGCCATGGAACAAAAGAGGCTATATTACCTGAAATCATGTGTCAAGTTAATTCAA
GTTGTGAATTAATGAAAGACATGAATTAA
>ref|NC_013316.1|:c4095127-4094927 hypothetical protein CDR20291_3448 [Clostridium difficile R20291]
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AAAAGAAGAAATTATGTTAAAAGATAATCAAAAAATAATATTAGAGTATATAGAAGGTTAA
>ref|NC_013316.1|:c4095632-4095252 putative glyoxalase [Clostridium difficile R20291]
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AAAAATTGAACTTTGTAGTAACTTATGAAAAGGAAATGGGTCCAAATATGAAATGGGTGGAAGTAGCACC
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AATGTATCTCATCCATCAATAATTTTAAGTACAAGAGATATTAATGGAACTTATGAACAAATGGCAAATA
ACGAGGTTGAAGTTGGGGAATTAATGGAGATGCCATATGGAAGGATGTTTTCTTTTAAAGACCAAGATGG
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>ref|NC_013316.1|:c4097263-4095905 putative multidrug resistance protein [Clostridium difficile R20291]
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TAGGAGTATTTAATACAATAATGGCAGGTCATATTGGGGAAGAAGCTGTATCTGCAGTTGGAATGGTTGA
TTCAATAAACAATATATTTATATCTGTATTTGCTGCATTATCTGTTGGAGCTACTGTCGTTGTAGCTCAA
CAAATAGGAAAAAAAGATAGTGAAAAGGTGAATGAAACTATTAAGCAGGCTCTAGTGTCTGGAGTAATAT
TATCCTTTACAATAACAATATTGATGTGGGTTTTTAGAACTGGTGTAATTAATTTATTTTATGGTTCAGC
AGAAGAATTGGTAAAATCAAATGCAAAATTATACATAGAGTTTACATTATTTACGTATCCATTTATTGCG
ACACAACAAATAGCAAATGGTATTTTAAGAGGGTGTGGAGATGTAAAGAAACCTATGTATGTGACTATGT
TTATGAATATAGTAAATGTAACATTAGGATATATACTTATATATGGTATTGATTTAAATCCTCTAGGAAT
AAATTTGCAAACACCATCCTATGGCATAACAGGTGCAGCTATATCTATTGCTATAGCTAGAATAATTGGA
TGTATAGTAATTATAAGAGCTTTATTTAAAGGAAATGAATTTATATCTATGGGTAAAATATTTCCATTTA
AGATTGATGTTGAAACTCAAAAGTCTATATTTAATATAGGGATACCAGCTGGAGTTGAACAACTACTTTT
TAATGCAGGTAAATTGATTGTTCAAGTATTTATAGTTACTATGGGAACATCAGCAATTGCATCCAATGCA
ATAGGAATGTCAATTGCATCCATAATAAATGTAATTGGGAATGCTTTAGCTTTGTCTGCTACAACTTTGG
TGGGACAGTATATAGGACGTGGAGATATTAAAGGAGCTAAGAGTACTTTATTATATTTAACTAAATTTGC
AACAATTTGTTTATTTATAGTAGGAGCTATATTTATACCAATTGCACCCTGGATTTCAAGTATGTATACT
CAAAATGCTAGTGTAATTGACATCTCAACACAATTAATTCGAAGTGATTGTTTAGCTATGGTAATATGGC
CTATATCCTTTGTATTATCAGCAGGGCTAAAGGGAGCCGGTGATACTAGATATACAATGATGACTGCAGT
AATAGGTATGTGGATTTTTAGAATTTTTACAGGTTACGTATTGGGGGTTGTATTAGAATTTGGAGTGTTA
GGAATTTGGATAGGTATGTATACTGATTGGCTTGTTAGAGGGACTTTATATTGTTTAAGATTAAGAGGAA
CAAAGTGGCTAAAACACAAAGTTGCATAG
>ref|NC_013316.1|:4097747-4098163 hypothetical protein CDR20291_3451 [Clostridium difficile R20291]
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TGGAAAATATTTATTTAACTATAGCAACATACTTTGATACACTTGGTTTAGGCACAATGAATATCGACAA
AGTTTATGGTCAATGGGCTTGGTTTACTGATAATATATATGATTTAAATCTATTTGTTTTTGTAGGAAAT
TATCCTTATCAAATTGCTAAAAACAGATATGATACATTTGTAGATATTTTGCCAGTAGCTATTACTTCTA
TTGTCAATGGAGATAGAGTATTTTTAATTTCAAATCCTTGTTTGTTAAATTCAAAAATTACAGTTAGATT
TATATCTAGTCATCCTACTCTTAATAGAACAGTTGATTATGGCAATATTAGAGATTTTATTTTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c4098937-4098320 hypothetical protein CDR20291_3452 [Clostridium difficile R20291]
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ACATAAATTGTGTAGTTGACATTAGAGAAACTCCATATTCTAAATATAATATTCAATACAATAAAGAGGC
ATTTAACGAATCTCTTAGAAATTCCGGATTTATATATATATACATGGGAAAAGAATTTGGAGCTAAAAGA
AATAATAAAGATGTATATACGCAAGAAGGTTATGCAGATTTTGAGAAAGTAGCAAAAGAAGATATTTTTT
TAAACGGAATAGAAAGATTAAAAAAGGGTTGTCAAATGGGTTATAGGATAGTTTTATTAGGAGCTATGCA
AGAACCTATAAGATGTCATAGAAGTATTTTGGTGGGAAAAGTATTAAATAAAGAAGGTTTCGATGTAAAA
TATATAATGCATGAAGGAAATTTGGCATATCAGGAAGATATAGAGGAATCATTATTGGATAAGTATTTTA
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>ref|NC_013316.1|:4099441-4102146 putative collagen-binding surface protein [Clostridium difficile R20291]
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GTACAGGCTTTCTTGCCTTTGCAACTGTCGTTACCGCTTTACCGAGTTCAACGGTTCATGCGTCTAATAC
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TCTACCTTTAATGAGGGACATTTAACCGTTGAGGGTGAGGACGCTTATTGTATCGACATCAACACAGCCT
TTAAAAACGGCTATAAGACCAAAGCTGACGCAAGTACCCGTATGAGTGCCGACCAGATAGCTGACGTCGC
CTTATCTATTGAGTATGTGAAACAGTACACAGACATCCACAGCGGAATAAGCAGTAAACACGCCTACCTA
TTAAGACAGCTTGTTGTCTGGCAGAGATTAAGTGTTCAGCCTGACTGGCAATGGGATAATGTGCGAGCTT
CCTATGATGAAATCCCAAAAGCCGTACAAGATGAAGTATTCGCAGGAGCAAAAGCCTTTGTGAAAGAAAA
CAAAGGACGTTATGACTGTGGCGGATATATCTACTCTGGCGAGGGTCAAGAGTTAGGGCAATTCTGGGCG
AAGTTAGCTGTCGGAAATACCAAACTTCAAAAGACTTCCACCAATGCCAATATTACAGACGGCAACGGGA
TTTATTCAATCGCTGGTGCAACATACGGTGTGTATTCTGATAAAGACTGCACGAAACAGCTTACCACCCT
TACGACTGATACTAGCGGAAATACAGAAGCCGTTGAAGTAAGAGCCACTATAGTATATATCAAGGAACTT
TCTGCACCAGCAGGATTTAAAATTGATAAAACAGTTTACTCTTTATCTGTGGAAGTTGGAAAAACAGCGA
CTTTAAAAGTATCTGATACACCAAAAGTAACAGATACCTTGATTGAGCTATTCAAGATTGACATGGAAAC
ACAGAAATCCAATCCGCAGGGAAACGCTTCTTTAGAGGGAGCAGAGTTTACATGGAACTTCTACGCTGGA
TATTACAACAAAAACAATCTTCCAGCACAGCCTACAAGAACATGGGTAACAAAGACTATCGCTGAAAAAG
ACAGCGACGGTGCTATCCATTACATTACTCGTTTAGCTGACAAATATAAAGTATCTTGGGACAGCTTCTA
TACGCAGGACGGTAAAAACGTACTTCCATTAGGAACACTAACTGTTGAGGAAACAAAAAGTCCGTCGGGT
TACTTGTTAGAGGGTACATATATGCAGGCTGACGGTAGCGAAGAACAGATAAAAGGAATGTATCTGACAC
AGATTACAGAGGACGGCGACCTTGCCGTATTATCTGGAAGCAATCAATACCATGTTTCTGATAAAGTCAT
TCGTGGCGGTGTGAAAATCCAGAAACGAGATTTAGAAACCAAAGACACGAAAGCTCAAGGCGGTGCGACT
TTGAAAGATACCGCCTTTGAAATCATTTCCTTAAATGAGAATGCCGTCTTAGTTGAGGGCAAGTTATACA
AGAAAAATGAAGTGTTAAAGACAATCCATACCGACATTGAGGGTATCGCTTCTACTTCTGCTGACCTATT
ACCTTACGGAAAATACAGATTGTCTGAACAAAAACCGCCAGAGGGATATTTGACTGACGGTGCAAAGCCG
ATTGATTTTGAAATCACAGAAAATGGAAAAATCGTTGATTTGACTGACGAAGCCCACTCTATCTATAACC
AGATTAAACGTGGCGATATTGAGGGCGTAAAAATTGGTGCAGGTTCGCACAAGCGTCTTGCAGATGTTCC
GTTTAGGATCACAAGCAAGACGACGGGCGAAAGTCATGTTGTTGTAACTGATGATAACGGACAATTCTCT
ACTGCTTCTGATTGGGCTTCCCACAAGCACAATACCAATGCAGGAAAAACAAGCGAGGACGGTGTGTGGT
TTGGTACTTCTGAACCAGACGACAGCAAAGGTGCGTTGCTTTATGATACTTACATCATTGAAGAATTACG
TTGTGAAAGCAACAAAGGTTTCAAACTTATTCCACCGTTTGAGATTGTCATTTCCAGAAATAAGGTTGTG
GTTGATTTAGGTACGCTGACTGATGAATACGAAAAAGAAATCACTATCCATACTACTGCTACCAGCAAGG
ACGGCGAAAAGACTATTCTTGCTGGGAAAGACGTAACTATCACTGATACAGTTAAATTAGACGGTCTTAC
CAAAGGGACAAAATATCAGTTGAAAGGCTGGCAGATGTTAAAAGAAGAAAATGCAGAGCTTATCATCAAT
GACAAGCGTATTGAGAATGACTACATCTTTACGGCTGACAGCGAAACTATGGAAGTTAAAATCGAGTTTA
CCTTTGACGCTTCCAATCTTGGCGGTAAACAGCTTGTAACTTTTGAGGAATTATACGATTTAAGCAATCC
AGACGAACCTATCAAAGTTGCGGAACACAAGGACATTGAGGACGACGGACAGACAGTTACTATCAAGGAA
GTACCAGAAACACCTACCCCAGAAGAACCAGAGAAGCCAACCACACCAGATACACCTACGAAAACAGACA
GTCCCAAAACGGGCGACAATACAAATATCCTTGCCTTTGCAATTATGATGTTTGTTTCTGCTGGTGGGCT
GGCTGGTACATACTTTTTCAAACACCGTAAGATGAAGAAATCATAA
>ref|NC_013316.1|:4102371-4102694 conjugative transposon protein [Clostridium difficile R20291]
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AAGTAGACCAGCAACGTATCAATGGGCGTTACACTCTCGTATCAAGAAGTTACAACTTGTATTCGGATAT
TCAGAGAGCCGACGACATTATCGTTGTATTGCCTGCAAAAGCTGGCGAGAAGCATTTTAAGCCAGAGCAG
AAAGTAAAACTGATTAACCCACGCATTACCGCAGAGGGTTACAACGTCAAAGGACGTGGATTTACAAACT
ACATTTTAATGGCTGATGATATGTTACCAGCAGAAAGCAAATAA
>ref|NC_013316.1|:4103708-4104166 hypothetical protein CDR20291_3455 [Clostridium difficile R20291]
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TTGGACTTTATGTCATTATGGATTTTGGGGCAAATAAAACTTTAACAGGTGGATTAGCCTTACAGACAAG
TGAAACATACAAAGAGTTTATCGGTACAAGTGATATTTCTTTTGGTGGTAACAATTTTGAAGTCTATTTT
GAAGAAGAAGATTTTGATAAATTTGCTGATAGGCTGAAAGAATATGATATTGAATATGTCCACCCTATTA
TAGAACATTCATGGGGACAGCGTGTAGTCCGCTTTTATGACCCAGATAAACATATTATCGAAGTTGGAGA
AAACATGAAGATAGTGTGCAAGCGTTTCTTAAATAGTGGAATGACACCAGAACAAGTTGCAGAACGTATG
GATGTACCTATGAAATTTATAAATGCTTGTATGCGATAA
>ref|NC_013316.1|:4104191-4104733 hypothetical protein CDR20291_3456 [Clostridium difficile R20291]
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TTTTGGGAAATTACTGTGGCGGTTGTGGCAATGGTAATCAATCATGCAGAATTGCAAAATGTAGTCTTGA
ACATGGACAGATTGAATATTGCTATGAATGCAAACAATATCCATGCGAAAAATATCAACACATTGATGAT
TATGATTCTTTCATCACGCATAAACGGCGAAAAGCAGATTTAGAAAGAGCAAAAAACATAGGCATTGAGC
AATATAATCTTGAACAGCAGGAAAAAACACAAATTCTTTCTTACTTACTTTCTAACTATAATGACGGGCG
TAGAAAGACTTTCTTTTGTGTGGCAGTCAATTTATTAGAACTTTCAGAATTACAAGAAGCAATGAAACAA
ATACAATCCAATGACGAATTGACCTTACTACCATTTAAGGCACAATGCTTGTATGTGGTGGAGGTGTTTC
AGAAGATTGCTGAAAGGAGAAATATAAAACTGAAACTTTTCAAGAAAAAGTGA
>ref|NC_013316.1|:4104769-4105296 hypothetical protein CDR20291_3457 [Clostridium difficile R20291]
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AAGCAGAAAGGCAATATTTAATTTCTAGTAAAACTATACATAAATATGATATTGCTTTAGTCGCTGTATT
TTTGTTGCTGTCAGTCGTTTATATGCTGTTCTCCTCTTTTAGCGTATTTAGTATTTTAATATTTGGATTG
ATAATTGTTGTAACTGCATTGGGAAGCTATTTATATATCCTAATGCCTATACTGAAATTCAAACAAACTG
CAAAATATCATGAGGAATATACGCTGGTATTTTCTAAGGAAAACATTAAATTTAAAACACAAAGCATTGA
CTCAGAAGTGAAGTGGGACATTTACTCTGCACTATGGGAAAGCCATGATTTTTATTACTTAATTCAAGCA
CCACGATTATATACGTTAATTCCCAAAAGAATTTTTAAAGACCTAAACGAAAAACAGCTATTTGAAGAAA
TTGCACAATCAAGAGTTAAAACAACAAAGCATATATAA
>ref|NC_013316.1|:4105406-4106800 putative conjugative transposon FtsK_SpoIIIE-related protein [Clostridium difficile R20291]
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TAGGGACGCTTCTGTTTGTATTTGTGGCGGTTCTCCTGCTACTGAATATCAAACAGCTCATGCGTACCGA
CTGGGAACATTTCAGCTTATTGGACAATGGCTTGACGCTTTCCCCCTACAACTTCATAACCATATTGATA
GCGACTGGTATTTGTGCATTGGTCGCTTTTCTGTATTACCGCTTCTGTTATGACAGTTTCAAAAAGCTCC
TGCACCGTCAAAAGCTGGCACGAATGATACTGGAAAACAAGTGGTATGAAGCAGATACCGTACAAGACAG
CGGTTTTTTTACTGACCTGCAAAGCAGATCAAGGGAAAAAATCGTCTGGTTTCCAAAGATTTATTATCAA
ATGGAAAACGGATTGCTTCATATTCACTGTGAAATCACATTAGGAAAATATCAAGACCAGCTTTTGCGAT
TAGAGGATAAGCTGGAAAGCGGTTTGTACTGTGAGCTGACCGACAAGACCTTGCATGACGGCTATATTGA
GTACACGCTTTTATATGACATGATAGCGAACCGTATTTCCATTGACGAAGTGAAAGCAGAAAACGGCTGT
CTTAGGCTGATGAAAAATCTTGTCTGGGAATATGACGTACTCCCTCACGCTCTGATAGCTGGTGGGACTG
GTGGCGGTAAGACCTACTTTCTGCTGACGCTTATTGAAGCTCTGCTACATACGAATGCTGTCCTTTACAT
CTTAGACCCAAAGAACGCTGACCTTGCAGACTTAGGTACAGTTATGGGAAATGTGTATCATACCAAAGAA
GATATGATTGATTGTGTCAATGCCTTTTATGAGGGCATGGTACAAAGAAGCGAAGAAATGAAGCAACACC
CAGACTATAAAACGGGCGAAAACTACGCCTATCTTGGTTTACCGCCCTGCTTTCTTATCTTTGATGAATA
TGTGGCGTTTTTTGAAATGCTGGGGACAAAGGAAAGCGTAAGTTTACTTAGCCAGTTAAAGAAAATCGTT
ATGTTGGGACGACAAGCTGGATATTTCCTTATTGTTGCCTGCCAGCGTCCAGACGCAAAATATTTCTCGG
ACGGTATCAGAGATAATTTCAATTTCCGTGTTGGATTGGGGCGTATCAGCGAATTGGGTTACGGTATGCT
CTTTGGTTCTGATGTGAAAAAACAGTTTTTCCAGAAGCGTATCAAGGGGCGTGGCTATTGTGATGTGGGA
ACAAGTGTCATAAGTGAGTTTTACACGCCTTTAGTCCCGAAAGGACATGATTTTTTGCAGACCATAGGCT
CTCTTGCATTCGTAAGGCAGGACGGGACGGCGACGTGCGAAGCGAAAGGCGACGGCACGGACTAG
>ref|NC_013316.1|:4107080-4108201 putative conjugative transposon replication initiation factor [Clostridium difficile R20291]
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AGCACAAACTACTGGAAGCGGTGGAAAAATTCAATCCCGACGCTCCCATGTTCCTGCTCTTTGATTATGT
GCGTATCCGATTTCCCACGCTGGATATACAGCACGTTATCAAGGACATTCTAAAGCTGAATATAGATTAT
ATGCTTCACGAAGATTTCGGGCATTACAAGTACACCGAGCATTACTATATCGGGGACGTGTTCGTTTACA
CTTCACAAGACAAGGAAAAAGGTGTCCTGCTGGAACTGAAAGGAAAAGGCTGTCGTCAGTTTGAAAGCTA
TCTGCTGGCACAGGAAAGAAGCTGGTATGACTTCCTCATGGACGCATTAGTTGATGGCGGTGTGATGAAG
CGTATCGACCTAGCTATCAACGACAGAACGGGCTTACTGGATATTCCAGAACTGATAGAGAAATGCAAGA
ACGAGGAATGTATTTCTAAATTCCGTAGCTTCAAGAACTATGGTTCTGGGGAGCTGGTAAAGCACAACGA
AGCCAACAAGGACGGCATGGGACATACGCTTTACATTGGTTCATTTACCAGTGAAGTGTACTTCTGTGTC
TATGAAAAGAATTATGAACAATCCTCAAAATTAGGGATACCGATTGAGGAAGTCCCCATTAAAAACCGAT
TTGAGATACGTTTGAAAAATGAGCACGCCTACTATGCCATTAGAGAGCTGCTGACCCACTACGACGCAGA
GCTGACGGCATTTTCTATTATCAACCAGTATATCCGCTTTGCCGATAAGGAAGCCAACAAGCGAAAAAGC
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AGCCAGAGCCTTACACTCTGCAAAGGACGCTGAACTGGTTACAAAGACAGGTTGCACCGACCTTGAAAAT
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GA
>ref|NC_013316.1|:4108343-4108564 conjugative transposon protein [Clostridium difficile R20291]
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TGGTTATTGGTATCTACTTAGGGTTTAAACGTGAGTTTTCAAAACTTATCGGCTTCTTGGTGGTTGCCTT
AGTTGCTGTTGGATTGGTATTCAATGCAGGCGGTGTCAAAGACGTACTCTTAGAACTATTCAATAAGATT
ATCGGCGCATAG
>ref|NC_013316.1|:4108878-4109522 chloramphenicol o-acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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ACATTGATAATATGCGTATTGTTATGAGCTTAACCGTAGATATTGATGTAACAAAGTTTATTGAATTTTC
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GAGTTCAAATATAGTTGGGATAATAATGGGAATTTAATTAAGTGGGATTATATTTCTCCGTCCTATACTG
AATTTCATAAAGAAGATGAAAATTTCACAAAGATAGTTACAGATTTTTCTGATAGCATATTTGAATTTCA
TAAACGTTTTATATTAGATAGGGAGAAGTATAAAACAGAACGTGCATTTGTGGAAAATCAATCTTTGAAC
TTTTTTGATGTATCTTGTTTACCGTGGGTAAAATATAATCATTTTGATGTTCATGTTTTTGACGAGGGAA
AATTTCTTGCACCAGTTATTACTTGGGGCAAATATGAATTAGAGCAAGAAAGATATATAATGCCTCTTAC
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>ref|NC_013316.1|:4109808-4110305 conjugative transposon protein [Clostridium difficile R20291]
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CACTTCCCATTGACGAGGAAGAACTGGAAGAACAGATAGGCGTTCCTATCGACAGTGAAGATTACCATAT
CGTTGAAAAGGAACTGCCCTTTGCTGATGAAGTCGGCGAAGATGCGACCATTGAAAAACTGAATGACCTT
TACCATACCTTTGAAAGTCTGCCTGCCGATTTACAAGAGGACTACGGGGAGCTGATGTGTTACTTTACCA
GCCTTGACGAACTGCACCAGCACCGCCATGATGTGATACATTATTCATGGTGTAAAAACATGGCTGATGT
GGCAAGGCATTTGTTGGACAATGACCCTGCTTTTTCTGCCATCGAGGAACGCCTGACCCGTTACTTTGAT
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GGTTCTCTTTTCCGATTGACGAAGAAGATGTTGCCGAGCGTATCGGCTTGAATGAACGGTACGAAGAATA
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ATGTATGAAATGATATGTGAGCTTCCCGACTACATCACGGACAGTTTGGACGAATTTGTATCAAATTATG
GAAGTTTGGAGGAACTGTACGACCATAGGGACGATATGATTTTATACGCTGGCTGTGAGGATATGACCGA
CGTTGCCTATTACTTCATTGATGAATTGCAGGCACTTGGCGATATTCCCCCTAGTTTGCAGAACTATATT
GACTATGAAGCATACGGCAGGGATTTATCCTTTGAGGGAACTTTTATTGAAACAAGATACGGTATGTGTG
AGATACCGTGGTAA
>ref|NC_013316.1|:4111313-4113745 conjugative transposon protein [Clostridium difficile R20291]
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GCTAATCGCACAATCCCGTGAGGGCAAGATACACGCTTTGCAGATTGCCACAGAAAGCTCAAGCCGAAGC
ATACAAGAACAGTCAAAGAAGCTGGTTACGGGACGACTAAAAGACGTTGCCTATCAGAAGATAGACGAAC
AGACCGAAGCGTTAGTATCTATGATTGGGGACAATCAAGTGGACTACCGCTTTTTTCTTGGCTTCAAGCT
CATGGTAACAGACCAGAGCATGAACCTAAAGAGCGTGAAGCAATCGGCGTTTCTCACATTCAAGGAGTTT
ATCCATGAAGTGAACCACACGCTGATGAATGACTTTGTTTCCATGCCAAATGATGAAATCAACCGCTACA
TGAAAATGGAAAAGCTGTTGGAAAATAAAATAAGCCGACGCTTCAAAGTAAGACGCTTAGATAAAAATGA
CTTCGGCTATCTGATTGAACACATCTACGGCAGGGACGGTGTCGCCTATGAAGATTATGAGTATAGCTTA
CCGAAGAAGAAACTGAAAAAGGAAACGCTGATAACGCATTATGACTTGATACGTCCGACCCGTTGCCTTG
TGGAAGAAAGCCAGCGACATTTACGCTTGGAACATGAGGACAGCGAAAGCTACGTTTCCTACTTTACTGT
CAATGCGATTGTCGGCGAGCTTGATTTTCCGTCCAGTGAAATCTTCTATTTCCAGCAACAGCAGTTTACT
TTTCCCGTTGATACCAGCATGAATGTAGAAATCGTGGAAAACCGAAAAGCGTTATCGACGGTTCGCAACA
AGAAAAAAGAGCTGAAAGATTTAGACAATCATGCATACCAGTCTGGCAGTGAAACCAGCTCAAATGTGGT
AGACGCATTAGACAGTGTGGACGAGCTGGAAACGGATTTAGACCAGTCCAGAGAAAGTATGTATAAGCTC
TCTTATGTTATCCGTGTATCTGCTCCAGACCTTGACGAGTTGAAAAGACGCTGTGATGAAGTCAAAGACT
TCTACGACGATTTGAACGTCAAGCTGGTACGCCCTGCTGGCGATATGCTGGGGCTTCACTCTGAATTTCT
TCCTGCCAGCAAGCGATACATCAACGATTATGTGCAGTATGTCAAAAGTGATTTTCTAGCTGGGCTGGGC
TTTGGTGCGACACAGCAGTTAGGGGAAAACACGGGTATCTATATCGGCTATTCTGTCGATACGGGACGCA
ATGTTTATCTACAACCGTCCCTTGCCAGTCAAGGCGTAAAAGATACGGTTACTAATGCTCTTGCTTCTGC
CTTTGTAGAAAGTCTTGGCGGTGGAAAATCATTCTGTAACAACCTGCTTGTCTACTACTCTGTGCTGTTT
GGCGGTCAAGCGGTAATCTTAGACCCAAAATCCGAGCGTGGCAACTGGAAAGAAACGCTCCCAGAAATCG
CCCATGAAATCAATATCGTGAACCTTACCAGCGACAGAGAAAATGCAGGGCTTCTTGACCCGTTCGTGAT
TATGCAGAATGTGAAAGACGCTGAAAGTCTGGCAATCGACATACTCACATTCCTTACGGGCATTTCTTCA
AGGGACGGCGAGAAGTTCCCCGTACTTAGAAAGGCAGTGCGTGCCGTTACCCAGAGCGACCAGCGAGGAT
TGCTCCATGTGATTGAGGAATTAAGAAAAGAAGATACACCTATCTCTTGCAATATTGCCGACCATATCGA
CAGCTTCACGGACTACGACTTTGCACATCTGCTGTTCTCGGACGGTACGGTGCAAAATGCAATCAGCTTA
GACAACCAGCTCAATATCATTCAAGTAGCCGACTTAGTGCTACCCGATAAGGACACGACCTTTGAATTAC
TGTCCGTTTCCATGCTGATTGTGATTAGTACCTTTGCGTTAGATTTTATCCACTCGGATAGAAGTGTTTT
CAAGATTGTAGACCTTGACGAAGCATGGGCGTTCTTAAATGTGGCACAAGGCGAAACGCTCTCTAACAAG
CTGGTTCGTGCTGGACGTGCCATGAACGCAGGCGTTTATTTTGTTACACAGTCCTCTGGCGACGTGTCAA
AGGAAAGTCTGAAAAACAATATCGGTTTGAAATTTGCCTTTAGAAGCACCGATATTAACGAAATAAAACA
GACCCTTGAATTTTTCAGCATTGACAAAGAGGACGAGAACAACCAGAAGCGATTGCGTGATTTGGAAAAC
GGGCAATGCTTGCTTCAAGATTTATACGGACGTGTGGGCGTGGTGCAGATACACCCAGTCTTTGAAGAAT
TACTGCACGCCTTTGATACCAGACCGCCGATACAGCGAAATGAGGTGGAGTGA
>ref|NC_013316.1|:4113745-4115880 conjugative transposon protein [Clostridium difficile R20291]
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TCGTGGCACTTTCCCTTATCCTGCTTTCACTTTTGGGAACGGTGGCACACGCAACGGGACTTGTGGACGA
CACTATCAACACCGAGAACCTTTATTCCAAATATCCGCTGTCGAATTATCAGCTTGATTTCTATGCAGAT
AATAACTGGGCGTGGTTGCCGTGGAACTGGCTGGACGGGATTGGAAAAAGTGTGCAATATGGGCTTTACT
GTATTACCAACTTTGTCTGGACGATAAGACTATATCTAAGCAATGCAACGGGCTATGTAGTGCAGGAAGC
CTACAAGCTGGACTTTATCAACGATATGGCAGACAGTATCGGAAGAAGCATACAGACCCTTGCAGGCGTA
ACTCAAAATGGTTTTTCTACTTCGGGCTTTTATGTGGGATTTCTTCTGCTGATTATCTTAGTCGTAGGTA
TCTATGTTGCCTATACGGGACTGATAAAACGGGAAACCAGTAAGGCACTACACGCCGTTATCAACTTTGT
TGTGGTGTTCGTATTATCGGCTTCTTTTATCGCCTATGCTCCTGACTACATCAAGAAAGTGAATGACTTT
TCATCAGACATCAGTACCGCTTCACTGGACTTGGGAACAAAAATCATGCTTCCCGACAGCGACAGCAAGG
GCAAGGACAGCGTGGACTTGATAAGGGATAGCCTATTTTCCATACAAGTACAACAGCCGTGGCTACTGCT
TCAATTTGGTAATTCGGGTATAGAGGAAATCGGGGCAGACCGTGTCGAAGCTCTCGTATCGGCAAGCCCA
GAGGACGAGGACGGCAAGACCAGAGAGGAAGTCGTGAAAACAGAAATCGAGGACAACGACAACAACAATC
TGACGATACTGCAGGTGGTAAACCGTTTAGGTATGGTGTTCTTCCTCTTGTTCTTCAACTTGGGTATCAC
GATATTTGTATTCTTGCTTACGGGTATGATGTTGTTCAGCCAGATACTTTTTATCATTTTCGCTATGTTT
CTGCCTATCAGCTTTCTATTAAGTATGATACCGAGCTATGAGAGCATGGCAAAACAAGCCATAGTCCGTG
TGTTTAATACGATTATGACAAGGGCAGGTATTACACTGATTGTCACGGTAGCCTTTAGTATTTCCAGTAT
GTTCTACAACATATCGACGGACTACCCGTTCTTTATGGTGGCGTTCTTGCAGATAGTGTATTTTGCAGGT
ATCTACATGAAGCTGGGCGATTTAATGAGCATGTTCTCTTTAAACGCTGGCGACAGTCAAAGCATGGGAC
GGCGAATATTCCGCAGACCGTATCTGTTCATGCGACATAGGGCTAGACGTATGGAACATAGGCTTGCAAG
AGCTGTTAGTGCTGGTGGTGTCGCTGGTGCGGTGGCTGGTGGTGTCGTTGCCAGTTCAAAATCTACACGC
CAGAATGGAACAAAGAACAATCGTGGAAATACAAGCTCCAGCATGGGGCAGAAAGCAGGTTCAGCCGTGG
GAGCTGTCCTTGATACAAAGAATAAGGTCAAGGACAAGGCAACTGCTGTCAAAGAAAATATCAAAGATAT
GCCGACACAGACTGCCTATGCGGTTCACTCTGCTAAGGAAAAGGCGAAGTCCAGTGTGTCTGATTTCAAG
CGTGGCGTGGTGCAGGAAAAGGAAAACCGCCAGTCTGGACGCTTAAAGAAGCAACAGCTACATAGACAGA
ATATCGCTGACAAGCGTATGGAACTTCAAAAGGCACAAGAATCAAGGCAGGCAGGTAAGAAAACGGACGG
ATCAGCGACAAGCGGAGCTACCCGTCCCCATGAAAGACCAGCTACCACTTCTAAGGTTAATGTAGAAAAA
CAGCAGGAAGTCAAACGCCCTGCCATAGCTTCAACCGTGAAGAATGATGAACCTATCAAGAAAAATGTTG
TCAAGGAACGTCCACTATCTTCTGGCGATACATCAGCAAAGACCGTCAATCAAGAAACCACAAGACAGAA
TTACAAGACTGACCGTGTTACGAAAACAACCGTTCAGAAGCATACACAGCAGAATACCGAGAAGAACAAA
CGAACCGTATTCAAGAAAGGACAAAAGAAGAAATGA
>ref|NC_013316.1|:4115877-4116884 putative cell wall hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAACTAAGACATATCGCTATTGTTGGCAGTCTGTTTTCTATCCTCTTTTCTCTCGTATTATTCTTTG
GGGTTCTGATTAGTGCCGAGGACGACGACGGGGGCAATGGTTATTCCTCTAATTATGTAGGTATGAACCT
ATCTGCCGAAGTCTTGAAACATCAGCCTATGGTAGAAAAGTATGCCAAAGAAAACGGTATTTCCGAGTAT
GTCAATGTGTTGCTGGTAATCATACAAGTGGAAAGTGGCGGTACAGCCGAGGACGTTATGCAAAGCTCTG
AAAGTCTGGGACTACCACCCAACTCACTAGATACGGAAAGCTCAATCAAGCAGGGGTGTAAATATTTTGC
GTCCCTGCTTTCTTCCTGCAAAAATCAAGGTATCAGTGATATAAATGTTGTGATACAGTCCTATAACTAT
GGCGGTGGCTATGTTGGCTATGTGGCAGGAAACGGAAAAAAGCATATGTTCAACCTTGCGGAAAACTTCG
CAAGGGATAAGTCGGGCGGTCAAAAAGTAACCTATACGAACCCTATCGCCGTGGCAAAAAATGGTGGCTG
GCGTTATGGCTATGGAAATATGTTCTATGTGGAGCTTGTGAACCAGTACCTTGTTGTCAATCAAGTATCG
GGCGAGCTGGCACAAAAGGTTATGAATGAAGCCTTAAAATATCAAGGTTGGAAGTATGTATATGGTGGCA
GTAACCCGAACACTTCTTTTGATTGTTCGGGACTGGTACAGTGGTGCTACAACAAAGCTGGCGTATCTTT
ACCGAGAACCGCACAAAATCAGTATGACGCAACCCAGCATATCCCACTATCGCAGGCAAAGGCAGGCGAT
TTGGTCTTTTTCCACAGTACCTACAATGCAGGAAGCTATGTAACCCACGTCGGTATCTATGTAGGAAACA
CTCAGATGTATCATGCAGGCGACCCTATCGGATATGCCGATTTAAACAATGCTTATTGGCAACAGTACTT
GATTTGTGCTGGAAGAATAAAACAGTAG
>ref|NC_013316.1|:4116900-4117793 conjugative transposon protein [Clostridium difficile R20291]
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AATTTTGTGAAGAACTTCTGTAAGTCCTACTACACATGGGACAACAGCAAGGAAGCTATCGAAGCAAGGA
CGCAGGCAATCAGCAACTATCTGACAAAGGAGTTGCAGGACTTGAACCTTGATACCATTAGGACGGATAT
ACCGACAAGCTCCACTGTTACAAATGTACTGATTTGGGATATAAAACAGTCTGGAACGAACGATTTTATC
GCTACCTACGAAGTAGATCAGCAGATAAAAGAGGGAGAACAGACAAGCAATGTCAAAGCAACCTATACCG
TCAAAGTCCATGTGGATAAAGACGGCGATATGGTTATCGTACAGAACCCAACCATTGCACCAGCGATTGA
AAAATCAGACTATGAGCCAAAGGCACAAGAAGCCGACGCAAGCGTGGACGCAGATACCGTCAATGACGCT
ACCGCATTTTTGGAAACTTTCTTTAAGCTGTATCCGACAGCAACAGAAAAAGAACTTGCCTACTATGTGG
CTGGCAATGTGCTTGAACCTATCGGCAGGGACTACCTCTATTCCGAATTAGTCAATCCTATGTTTACGGA
TGACAGGGATAATGTGAAAGTCAGGGTTGCGGTGAAATTCATTGATAATCAGACAAAGGCAATGCAGGTA
TCACAGTTTGAGCTTGTGTTACATAAGGATAGCAACTGGAAAATTATTATGTAA
>ref|NC_013316.1|:4118006-4118863 hypothetical protein CDR20291_3468 [Clostridium difficile R20291]
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ATAGTCCTACCATTGTTTTTTTGCCGGGTACTATGTCACACCCTCTCATGTATGAGAATTTTCTATGTGG
TTTGAGTGAAAGAGGATTTAATATAATAGGCATTCACTATCTTTCACACGGAAAAAGCCCTAAAATCAAA
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GTGAAAACATAGCTGTCATGGGTTCCAGTCAAGGTGGGATTTTAGCTGCAATGGCGGCGGGTAGGGACAC
AAGGTTAAAAGCCGTTTTTCCACATAATATCATGCTGACTACATTAAAAGAAACTATGAGCTTAACAAAA
TACCCCGCATGGTCACACCGTTTTATGGGGCTGATACAGTTGGGCTTTCGTGTAGGTGGAAAATTGCTGC
CTAACTATAAGGTTCCAGGAGACGCTTATTTAGACTATGACAGAGTATTTTATAGTGAACAGGCAAAACA
AGATTGCTTAAATGACCCTATGCTTTTACCCTATTATCCTTTAAGATTTGTCGCCAGCTTATTTAATGCT
GACTTATCGTGCTTGGAGAATGGGGCTATACAATGTCCTGTTATTTTAATTACTGCCAAAGGCGATCCGC
TTTTTAGATTTGATTATACCAACAAAGTATTTGATTTAATTCATGTACCGAAAAAGGAATTACTTACTTT
AGAGCTTAATCGTCACATGATTTTTAATGAGGACACGGACACTACAATAAACGCATTGGAAGCTACCTTG
CATAAATATCTTGGATAG
>ref|NC_013316.1|:4118935-4119522 transcriptional regulator, tetr family [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTTTGCCACGATTTACGGAACAAGAAAAAGAAATCATAAACAGTAAACTTTTGATAGAGGGAGAAA
AGCTGTTTTCATTATACGGCTTAAAAAAAGTAACAGTTGATGATTTAGCAGCTGCTGTAAACATATCAAA
AGGTTCATTCTATGCTTTTTATCCCAGTAAAGAACATCTATATGTGGAAATCAATTTTCGCTTACAAAAA
GAGTTATTTACAAGTATAGAAACAACTGTTAAAAAGAAAAAGTATAAGAACCATAGAGATTTAGCAAAGG
ACGTTATTATGCTAAGTTTAACGGGGGTGATTACTTCGCCTATTCTTTCACAGATTGATTTATCTTTAAT
GGACTATCTGCAAAGAAAAATATCGTCAGATATTTTTGAAAATCATATGTACAGTGATATTCGTATATTG
GAGATACTGGAAGGTTTAGGGGTTGTATTTTTGGTTCCGCATACGGTTATCATAAAATCCCTGTATTCTG
TTTTATCCTGTTTGGAACAATTCAAAGAGGACGAAGAATTGAATATGGTACAAAATCTTTTAGTGAATGG
TATTATTCAGCAAGTAGTAGCAGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:4119551-4120471 abc transporter, atp-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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GAATAATGATTGATGTAAAAAAACTGTATTTTAGTTATACTGACAAACCGTTTGTTGAGAATGTAAGTTT
CCATGTTGGGAGAGGAGAAATTTTCGGTTTTTTAGGACCCTCTGGTGCTGGAAAATCAACTATTCAAAAA
ATTTTAACTGGGCTTAATACAAGTTATAAAGGCAGCGTAAAAGTTGCAGGTACAGAAATAAGGGAGCATA
CAAACCGGTTTTATGAAAATATTGGAGTAGACTTTGAATTTTCAACCTGCTACGAGAAATTCACAGCACG
ACAAAATCTCGCCTATTTTGCTTCTCTATATGACAAGCAACCTCGGTCTATTGATGAATTATTGCATATG
GTAGGCTTAGAAAATGATGGGGACAAAAAAGTTGCTGACTTTTCCAAAGGTATGCGTTCTCGCTTGAATT
TCATTAAAGCGTTAGTACATGACCCTGATATATTATTCCTTGATGAACCTACAAGCGGTCTTGACCCTAC
AAATAATCGTTTAATGAAAGATATTATTCTTGCGGAAAAGAAACGCGGAAAAACGATTATCATTACTACT
CACAATATGTATGACGCAACAGAGCTATGTGACCAAGTAGCCTTTATTGTTGCCGGAAAAGTCAGTGCAT
TGGATAGTCCACATAATTTGATTATGTCAAGGGGAGCTGCCAAAATACACTATACCTACTATGATAAAGG
CGAGAAAACCGGAGAATGTCTGCTTGATAGAACCACAGAAGATAAGTTGTTAAAAAGTTTAATTTCCGAA
AACCGTCTGCTTTCTATTCATAGTAGTGAGCCTACATTAAATGATATTTTTGTTGATATTACAGGGAGGA
CACTTCAATGA
>ref|NC_013316.1|:4120468-4121151 putative abc transporter, permease protein; putative abc transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAGATTGGGACGTTTAATTTGTGGTGATATACATTTCCAATGGAAATATGGTTTCTATTTTATCTACT
TTATATTAACAGTTTTATATGTGTGTGGGATTGCCGCTTTGACGGGACATTGGAAAACGGATATTGCTTC
TATCATGATATACTCTGACCCGGCAGCTATGGGATTGTTTTTTATGGGGGCGATTGTCCTTTTAGAAAAA
AGCCAAAAGGTATTAAATGCTATGGTAGTATCGCCTGTAAAAGTATCGGAGTATATACTTTCAAAAACCA
TCGCATTGATTGCTATTTCTACAATCATTGCGGTGATATTGGGATTTGTTTCCGGCAGCAATCATTTACT
TGGTATCGCAGTTGGTACAGCTTTGACATCAGCAATCTTTACTATGCTTGGCATTATCGCGGCTACAAAA
ATTTCAAACTTGAACCAATTTCTCATTGTGATTATGCCGATAGAAATTGTTTGCTTTGTTCCACCTATCG
TTGGTCTGTTTGTAAAGTTACCAGATATATTCCGCTTTTTTCCGTTCACAGCTTGCATGAACCTCATAAC
TGGAAAAAGCATTTTACTATCGTTTGATATGGTACTTGTAATTGCTACGTTGATTATCCTCTACATAGTT
GCGCGACATACAGTTAAGCATATGTGGAGAAGTTTGGGAGGTGTAAAGCTATGA
>ref|NC_013316.1|:4121148-4121846 putative abc transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGGATATTATCCAGTACCATACAGGTATTTAAGCAAATCAAGAGCGACCCTATGATGTTTGCAG
CTTGTTTTACGCCTTTTGTCATGGGAGCTTTGATTAAATTCGGTATTCCCTTTCTTGATGGAATAACAGA
TTTTTCTTTGCAAACATACTATCCGATCTTTGATTTATTACTTTCTATCATGGCTCCTGTATTGCTCTGC
TTTGCATTTGCAATGATTACATTAGAGGAAATCGACGATAAAGTGTCACGGTACTTTTCGATTACCCCTC
TTGGTAAGTCGGGGTATCTCTTTACAAGGTTGGGAGTACCCTCAATTATTTCGGCGGTCATCGCTTTTAT
TGTACTGTTGCTTTTTTCATTAGAAAAGTTGTCCATTGGAATGACAATATGTTTGGCGCTTCTCGGCTCA
GTACAGGCAATTATTGTTTCGCTTATGATTATAACATTATCAAGCAATAAATTAGAGGGTATGGCAGTTA
CAAAACTAGCTGCACTTACATTACTCGGAATACCAGCTCCCTTTTTTATTGATAGTTACTACCAGTTCGC
GGTTGGCTTCCTTCCATCATTTTGGGTAGCGAAAGCCATGCAGAATGAAGCGGTTCTTTATTTCTCCATA
GGATTGATGGTAGCTTTGGTCTGGTACTACTTCCTTATAAAACGTCTGTTTAGGAAGCTGGCAGGATAA
>ref|NC_013316.1|:4121858-4122769 hypothetical protein CDR20291_3473 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAAGGTAGACTTCTGCAAAACGAAAATATAAATAAGGCTATTCAGGTTTCCAAAATCACACTAA
TCATCAACCTGGGTTTATCGCTACTTAAATTTGCTGCCGGATATATAGGAAAGTCAAGTGCCATGCTGTC
GGACGCTGTACACTCGGCTTCTGATGTATTAAGCACAATCGTTGTGATGGTTGGAATTAAAATATCAGAA
AAACAGCCTGATAAAGAACATCCTTATGGGCATGAACGTATGGAATGTGTGGCTTCCATTATTCTCTCTG
TTGCATTGGCTATAACGGGTGCTGGAATAGGATATTCAGGTATCAAGAAAATCTTTTCAGGACAGTACAA
TACGCTTTCTGTCTCTAGTGGAATCGCACTTACGGCGGCAGTCTTATCCATTGTTATAAAAGAGTGGATG
TACTGGTATACAAGAAGTGCTGCAAAGCATACAAATTCTGACGCACTTATGGCTGACGCATGGCATCACC
GCTCTGATGCACTCTCGTCGGTTGGTTCCTTAATTGGCATTTTAGGAGCACGTTTAGGCTATGCTATTCT
CGACCCTATTGCAAGCATTGTGATTTGCGGTTGTATCTTAAAAGCTGCTTTGGACATTTTCAAAGAAAGC
ATTAACAAAATGGTAGACCATAGTTGTGACAATGCTACTGAAACGAAGATTAGGGAAGTTGTGCTTCAGC
AGCAAGGGGTTGATGGTATTGATGAATTAAAAACCCGCATGTTTGGAGCGAAAATGTATGTAGATATTGA
AATATTAGCTGATGGTAATTTAGCTCTTTATGACGCTCATAGAATTGCTGAGGGAGTCCATCAAACGATT
GAAAACAACTTTCCACAATGTAAACATTGTATGGTACATGTTAATACGAATGAACTTCCCTATTCTCCAT
AG
>ref|NC_013316.1|:4123650-4124078 hypothetical protein CDR20291_3474 [Clostridium difficile R20291]
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CTGTACAGATATGGTGCGGAAAGAGGGATAAACACTTTTCAATTCATAGCTGGAAAGGAGGTGAGATTAT
GAAACCGTCTGACTTCCAAAAAACAATTCAGTGTCAGTTTGAATGTAAGCTGAAAAAAGTTGTCAAAGGT
ATTATCTGGAACTACCGCAAAGAATTAAGACGAAGAAAAAACAAGGAAATATCTTTTAGCGAATTACCAG
ACATTACGGTAGAAAGTCTGGCAACATGGGACGACTACGAAACAAACTACACAATTTTTAATGTGTGTGG
CATAGATATTAAAGTCCTTGATGATGAACTTGCAGAAGCTCTCAAACAGCTACCCGAAAAAAACGTAACA
ATGTATTGA
>ref|NC_013316.1|:4124193-4125374 integrase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAGACAAGACAGTAAAGGACGCAATTTGCGTCTTGGAGAGAGCCAGAGAAAAGACGGAAGATACG
TTTATAAATATACCGATATATTCGGGAAGCCACAGTTTGTATATTCTTGGAAGCTTGTACCCACAGACAA
GACACCTGCTGGAAAACGTGATGATATATCGTTGAGGGAAAAAGAAAAGCAGATAAAAAAAGACCTTGAC
GACGGTATCGACACGGTGGGCGGTAAAATGACAGTCTGCCAGCTTTACGAAAAAAAGAACAATCAAAGAA
AGAACATCAAGAGAAACACGGAATTAGGACGACAGTATCTTGTGAACGCACTGGAAAATGACCCATTGGG
TATGAGGGCGATTGATACGGTCAAGCAGTCCGACGCTAAAGAATGGGCTATCAGAATGAATGGCAAAGGT
TATTCTTACAAGACGATAGATAACTATAAGCGTTCCCTAAAGGCTTCATTCTATATGGCGATACAAGACG
ACTGTATCAGAAAAAATCCTTTTAATTCCAAGTTGAGTGATGTTCTGGAAGATGATACGGAAGCAAAGGT
TATCCTGACACCAGAGCAGGAAGAAAAACTCCTTGCCTTTATGGAAACAGATAATGTTTACAGCAAGTAT
CGTGATGAAGTTATTCTTCTGCTGGAAACGGGACTTCGTATCTCTGAATTATGCGGACTGACAACACACA
TTGATATGCTTAACCGTGTGATTAACATAGACCACCAGCTATTGCGTGATACAGAGGTGGGCTACTATAT
TTCCAAAGCTAAGACAAAAAACGGTAAGCGAGAGCTTCCATTAACAGAAAGAGCATATCAAGCACTCAAG
CGAATTTTAAAGAACCGAGGAAAAGCACAACCGCTTGTTGTTGGTGGTTATAGCAATTTCTTATTCTTGA
ACCGTGAGGGATTGCCAAAGGTAGCAGGAAATTATGAAAGTATGGTGCGTGGGTTGATTAAGAAGTACAA
CAAGACCCATAAGGACAAGTTACCAAACATCACGCCCCATTCATTCAGACATACTTACTGTACGAACATG
GCAAATAAGGGAATGAACCCAAACACCCTGCAATACATCATGGGACACGCAAACATAACCATGACATTAG
GGTATTATGCTCACGGTACTTTCCAGTCTGCAAAGGCAGAGTTAGAAAGGCTGGCTTCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c4126526-4125714 MerR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTTCTATAGGAATGTTTTCTAAAATAAATAAAATAACTACAAAGACATTAAGGTATTATGAAGATA
TAGGGTTGTTAAAACCAGAATATGTAGATGAATTTACAAAATATAGGTATTATACAACAGAGCAATTACC
TAAATTACATCAGATAATAACTTTAAAACAAATGGGTTTATCATTAGCTGAGATAAAAAAAGCTGTAGAA
AATCCTGAAGAAGTTGAAAATATTTTAATGAATAAAGAAAAAGAAATGTTGGATGTAATTAAAAGTGAAG
AATATAAAATAATTAAACTACGTAATTACCTTATGAATTTGAAAGGAGAAGTCAATATGAATGATGTAAT
TATTAAGTCTTTACCAAAAGTTAAAGTTGCTTCTATGAGAAAAGTGTTAAAGGGATATGATGAACTTTTT
AATCTATTTCCAAATGTAATGGCTGAAGAAATGATGAAAACAGGGTGTACATGTGCAGTTCCTGATTATT
GTTTTAATATATATCATGATGGTGAATATAGAGAGACTGATATGGATGTTGAAATGTGTCAAGCTATAAA
TGATTTAAAGGAAGATACGGATATATTAAAATTTAAAGAATTAGATGCAGTTGAAAATGCAGTTTGTATA
TTACACAATGGTCCATATTCAACATTAGGAAAAACTTATGCAGATGCATTTAAATGGATAGAGGACAATA
AATATAAAGTGGTTGGAAATCCTAGAGAATCTTATATAGATGGTATATGGAATAAAGAGAGTGAAGAAGA
CTGGTTGACAGAAGTTCAGATACCAGTGAAACGCATATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c4129996-4126602 putative na+/h+ exchanger [Clostridium difficile R20291]
ATGACAGAATTAATGATTATAAGTGGGTTAGTACTATTGATTTGTATAACTTCTAGCAAGGTATTGTATA
AATTTGGAGTACCAATATTATTGATTTTTATCTTACTAGGGATGTTATTTGGGTCTGATGGAATGGTAGG
AATCTATTTTGATATGTTTTTTGGAGGGTTTGGAACAAACTGGAATATGGCTAAACCTGTTGCTATACCT
TCTATATTAATGTCTTCACTGGGTGTAATAATTACGTCTGGGGTTACAGGTATGTTTTGCCACATGGTAA
TAGGAACTAGTTTACTTGAAGGTTTATTAATTGGGGCAATTGCAGCTTCAACAGATGCTGCATCTGTGTT
TGCTGTGTTGCGTTCACAAAAACTAAACTTAAGGGGTTCACTTGCATCATTATTAGAAGTTGAAAGTGGA
AGTAATGACCCAATAGCGTATATGTTGACACTAATTCTTTTGACATTGATGAATAATTCTGGGGTAGAAC
TTATTGCACCAATGGTAATAAAACAAATAGCTTTTGGGTTAGCTATAGGATTTATACTAGCAAAATTATC
TGTTTATATTTTAAGGCATTCAAACTTCGAGATAGAAGGATTTTATACTATATTTATAACAGCTATTGCA
ATACTTTCTTATGCATTTAGCGAGTATCTTGGAGGAAATGGATATTTAAGTGTTTACATTTCAGGTATTA
TTATAGGAAATAGTAGGATACCTCTTAAAAAAAGTTTGGTTCATTTCTTTGATGGAATTTCATGGATTAT
GCAAATAATGTTATTCTTTATGTTAGGATTGTTATCTTTCCCTTCTAAGTTACCAAATGTATTTGGTATA
GCAATGGCCATATCTATATTCATGATAGTTATTGCAAGACCATTAGCAACATTTATAGTTCTAGCAAAAT
TTAAATTCTCAAATAAAGAAAAATTATTCATATCGTGGGTAGGTCTTAGAGGTGCGGCTTCAGTAGTTTT
TGCAATTTATGCTGTTACTCAAGGAGTAGCCATAGAGAATGACATATTCCATATAATATTTTTTATAGCG
TTGCTTTCAGTAGGAATACAAGGTTCATTGATACCAACTGTAGCCAGAAAGTTGGATTTAGTTGATGATA
ATACACCTGTATTAAAAACATTTAATGATTATGATGGGGAAATTAGCTCTAAACTTATCGAAGTAAATGT
TGATGAGGGTAATAAATGGGCTAATAAGAGTATAATAGATTCTAATATACCAGACGATATATTAATAGTT
ATGATAAAAAGAAAGGAACAGGTTTTAATACCTAAAGGTTCAACCATTATAAAAACAGGGGATATTTTGG
TATTGAGTGGAGATAGAATTGAAGAATTAATACAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c4129103-4127985 transposase-like protein b [Clostridium difficile R20291]
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AAACTTTTGGATGTTGTAGATTTGTATATAATAAGTATCTTGCTAAAAGAATAGAAGTTTATAAAAACGA
TAAAGAAACTTTTGCTTATAAACAGTGTAGTTCTGATTTGACTAACTTAAAAAAAGAATTAAAGTGGCTT
AAAGAACCTGACAAATTTTCACTACAAAACGCCTTAAAAGATTTAGATAATGCATATGAAAAATTCTTTA
AAAAAAAGGCAGGATTTCCTAAATTTAAATCAAAGAAAATTAATAGATTTTCATATAAAACTAACTTTAC
AAATGGAAACATTATGTATTGTGGTCAACATATAAAACTACCTAAACTTGGTATGGTTAAGATAAGGGAT
AAACAAGTACCTAAAGGTAGAATACCTAATGCTACTATATCTAAAGAACCAAGTGGTAGATATTATGTAT
CATTATGCTGTACTGATGTAGACATTGAAGCATTTGAAAATACTAATAATCAGATAGGTTTAGATTTAGG
AATTAAAGAATTTTGTATCTCAAGTTGTGGAGAATTTATAGAAAATCCTAAGTATCTTAAGAAGTCATTA
AACAAACTTGCTAAATTACAAAGAGAATTATCGAGAAAGACAATCGGTAGTTTAAATAGAAATAAAGCAA
GATTAAAAGTTGCAAGACTTCAAGAACATATAGCTAATCAAAGAAATGATTTTCTACAAAAACTATCTAC
TAAATTAATAAAAGAGAATGATATTATTTGCATAGAAGATTTACAAGTAAAGAATATGATTAGGAATTGT
AAACTATCTCGCTTAATTTCTGATGTGTCATGGTCAGAGTTTATTCGCCAATTAGAATACAAGGCTAATT
GGCATGGTAGACAAATTGTAAAGGTAGGTAAATTCTTTGCAAGTTCACAAATATGCAATAAATGTGGGTA
TAAAAACGAGGAAGTGAAGAACTTAAATATAAGAGAATGGATTTGTCCTAGTTGTAATGAAACTCACGAT
AGAGATATAAATGCAAGTATAAATATATTAAAAGAAGGATTAAGACTAATAACAATTCAAAATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c4131396-4130479 hypothetical protein CDR20291_3479 [Clostridium difficile R20291]
ATGGTAAATATGAATATTATAGAAATTCGCTCAGATAAAATATACAAGAAGATAATGGATGCACCAATAA
ACAAAAAAGAAGATATATACAGATATGAATTGATGAAGCCTTTTGAATTTAAGTGGAAGTGTATGAATGT
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CCTAAGGATATTGATGAAAAGCAAAAAAAGAATATAAATGTGTTATCTGCTGATAAAATTTGGGGCACTT
GCAAAGAAACCATAGAAAACTCTATAAATGCTTTTATAAAAGAAGGGTATGATTTAAACATTAAGGACTA
TAAATATTCAATATTATTGGCGAATCCAAATAGTCCTTATACAATATTAAGTGATGGATACTGGGGTGAT
GGTGGGATTCCTGGATATATATTTCTATCATTGGTTCCTAATGAATATACTATCAATAGATTACCAGTAT
TAATAGCACATGAATGTAATCACAATATTAGATTTCAGTTTATAGAGTGGAATAATAATATAACATTAGA
AGAAATGATGATAAATGAAGGTCTTGCAGAAAATTTTGCAACATGGATGTTTGGAGAGGAAATGTTAGGA
CCTTGGGTCAGTAGAACAGATATCGAAACATTAAATACTTATATAAAGCCAATAATAAAAAGTGCTTTAA
AAGAAACTGGATTTCAAAATATAACATCTTATCTTTATGGTGATGATATAGCTAAAATGCAAGGATATTT
TCCAGTAGGGTTGCCTTATTGTGCAGGATATGCTTGTGGATATTATATGATTAAGTATTATTTAGAAAAG
ACAAATAAATCAATAATCGAAGCGACTTTATTGCCTTATAGTGAGATAATCGAAACAGTAAAAGAGTTTT
GGGAATAA
>ref|NC_013316.1|:4131652-4132035 hypothetical protein CDR20291_3480 [Clostridium difficile R20291]
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CTTTCGGAGGAGGAAAAACTATATTTGCGCGATTAGACAGCAATCCAAACAATCCTATTATGCACGCAAG
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ATGGCGATTTGTGTTGTTCTACCATCTCGAGAAGCGATAGAAGAAATATCTGTAAAACTTGCCGAGGGTG
GTACACTTGTACAAGAATTTTTACCACACCCACCACCACATCAAAATGATGGCGCTGCTGAAGTACTTGA
TAGGTATGGGTATACTTGGTATTTAAGTACATAG
>ref|NC_013316.1|:c4132640-4132191 putative acetyltransferase [Clostridium difficile R20291]
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GGGAATCATCAGTAAGAGCAACGCATGATTTTTTAACAGAAAAAGATATTGAATCTTTGATACCATTAGT
TGAAATTGGACTTAAAGAAGTAGAAAATATAGTTTGTATAAAAGATAATGATATAATAAAGGGCTTTATA
GGAATAGATAAAGATAAAATTGAGATGCTCTTTATAGAAGATAAATATAGAGGAAATGGTATTGGTAAAA
AATTAATAAAATATGCTATAGATAAATACAATGTAAAATATGTTGATGTAAATGAGCAGAATAAAAAAGC
TGTAGGATTTTATATTCACTTAGGATTTAAAGTGTTTGATAGGTCTGAAATAGATGGACAAGGTAACCCA
TTTCCAATACTACATATGAAATTAATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c4133186-4132818 hypothetical protein CDR20291_3482 [Clostridium difficile R20291]
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CTTGACCATTTCCATAAGATATGTGTTACAACAGGGCCAGCAATTAGAATACCTGGAACTGATAAACACA
TTCACTTAATATGTGGAGAAACTACTGTTAATGATGGTCATTGTCATAAATTCCTTTTTACTACTCAAAT
AGAAGCACCTTTAGTATAA
>ref|NC_013316.1|:c4134201-4133335 hypothetical protein CDR20291_3483 [Clostridium difficile R20291]
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GTTTTGGACTTTGTTGTGTAGCTCTTTATTTTTCTGCTTCAGATGGATTTCCTATCGATAAGGAATCAGG
AAAACCCTGTATTAATTTACAACCAGATTTTAAATGTTCTGTACATAATAGTCTTATGAAGCGAGGTTTT
AAAGGGTGTACTGCATATGATTGTTTTGGTTCAGGTCAAAAAGTAGCACAAGTAACATATAAGGGGATAG
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AATGTTATGGTATCTTAAAGAAGCATCTGTATTAAATATATCAGATACAATCAAATCAAAAATTGATTTG
ATAATTGAAGAAACTGAAAAGATAACTAATATGAGCCCAGAACAGATAATTAATTTGGATATCATATCAC
ATAGAACAAAGGTTAATTTATTATTATCACAAGCGAGTGAGTCTGTGATGGGAAAGGTTAAATCATTTAT
CAAGACTTCTACTCTTAAAAATATGAAAAAATTAAGTAAAAATATAGATTTAATAGGAGCAGACCTTAGA
AAAATAAATCTAATAGGAGCAGATTTAAGAGGTAGATTTCTAATAGCAGCAAATTTAAGAAGTACAGATT
TGAGTGGGGCAAATTTAATAGGAGCAGACTTAAGAGATTGTGATATTAGAGGTGCTAATCTTGAAAATAG
TATATTTTTAACACAATTGCAAGTAAATACTGCAAAAGGAGATTCTAGTACGAAGTTACCAGCTTCACTA
ATACGCCCTAAATACTGGGAGAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c4135115-4134771 putative phosphonoacetate hydrolase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAATTTACCAAATTGCCCGAAATGTAATTCAGAATATACTTATGAAGATGGAACTCTTTTAGTTT
GTCCAGAATGCTCTCATGAGTGGGCATTAGGATTGGGAGCTGAAGAAGATTCAAATATTATCAAAGATGT
AAATGGAAATGTATTAAATGATGGAGATTCTGTTACAGTAATTAGAGACCTTAAAGTAAAAGGAAGTTCA
TCATCTATAAAGATTGGAACAAAAGTGAAAAATATCCGTTTAATCCATGACTCATCAGATGGACATGATA
TAGAATGTAAGATAGATGGTTTTGGAGCTATGAAGCTAAAGTCTTCTGTTGTTAAAAAAGCGTAA
>ref|NC_013316.1|:c4135921-4135304 putative ABC transporter, ATP-binding protein [Clostridium difficile R20291]
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TTTCTAAGGGCGAGTTTGTAGCGATAACAGGAAATAGTGGTTCAGGTAAGACAACTTTACTTAATATAAT
GGGATTATTAGAAAAACCTAATTCTGGTGATATTATAATAAATAATATAAAAAATCCAAATAGTAAACAG
ATAAGAATTTTACAAAGGGATTTTTATGGCTATCTATTTCAAAATTATGCTTTAATTGAGAATGAAAATG
TTGAAAATAACTTGAAAATTGCTTTAAAGTATCAAAAAAATATCAACCATAATGAAAAAATAAATTACGC
ACTTGAGTCTGTAGGTCTTAGAAAATACAATAAAAAAAAGATATACGAATTGAGTGGAGGAGAACAACAA
AGGGTAGCATTAGCAAGAGTAATATTAAAAGAATGTGAAGTAATATTTGCAGATGAACCTACAGGTAATT
TAGATAAAAAAAATAGAGACATAGTATTTGATATACTTAAAAATCTAAATAAGAATGGTAAAACTATCGT
ATTTGTAACTCATGATTTAGAGTTATCGGAGCAGGCAGATAGAGTTATAAAATTGTAA
>ref|NC_013316.1|:c4138097-4135926 putative ABC transporter, permease protein [Clostridium difficile R20291]
TTGAAAAAGATAATATATGTATTATTTACAATTGAACTATTAATAGTATCTTTATTAGGTCTAAATATAG
TTAAAGATAATGAAATTAATAATATTTTATATAACGATACAACAAGTATATCTGTAATGTTTAAAGATTA
TAAAAAGTTAAATAAAAATTATAGTAAGTGGATTAAAGATATTGCAGATGAAAATAATGTGGCTATATCA
AAGTATGTTTTTAATAATAATGAAAAATTATCTATATATACGACTGATACAAGTTTGAATAACAATATAA
AGTTAAAATCAGGAAAATTTCCTAATACTAATTCAAATGAATTTATTAGTAATATAAACACTAATAATAG
TAATAATAGTAATCAAGTAGGTAAATTCTCAACTATGAGTAAAGACATATCAATTTTAATTAGGGATTTT
GGTAAAATAAGTGAAGTTGGAGAATCAGGAATCTTATATATTTCAACTCAAAATGAAGATACAATAAATA
AAATATTAAGAGAACTAAATGTAGACAGAAGTATTTTTGTAGCAAGATTACATGATAGATATGTTAACTC
AAATTTATACTTAAATCCTTCAATAATTAGAGATTTAATACTAATTATCCTTTGTTTCTTGGCTACAATA
ATACATTATTCAATTAGTGTGAGTAGAGAGGCTTCTATTTTAAGATTAAATGGATACTCTAAGCTAGATA
TAATTGCTAGGGTTATAAAAAATATATTTAGAATTATGATTTTATCATCTGTCACAGCATTATTAATATA
TATAATCTATATTTTAAAATTAAATATAGGTGTTAGAGCATGCTTATACTTTGCTATGTTTTCGATTATA
TGTATTTTGATAAATATTTTGATATCTATATTAATAGTTGGTTTTAATAGTAGAAGTTCTAAATATGTGC
TATCTCTAAATGGAAAAAAATCTTATGGTTTTGTAAATATAATGCATTTCACATTGAAAATTGTATTTGT
ATCATTTCTTATATTATCCATAAATAACTGTATTTTAAATTATAATATGCTACAAACTCAGTTAGGAAAT
CTATCTGAGTGGGATAAAGCAAAAAATGTTTATAATCTTACTCTTAAAGATACAGGCGAACAATCTTTAG
GAAAGGAAGAAGTAATTAAAAATGCCAAGATTAAAGGTTTCTATAAAAATTTGGTAGAAGAAAAAGATGC
TTTCTTAATAGATTCAACTAATTTTGAAAAACTTGAAGATGGAAGTTACATGTATGAAATAAATTCAAAG
GGTAAAAACCCAGAAGTAAGTCAATATGGTAAAAATATAAAAATAAATAAAAACTATCTTAAAGTTAACC
CTATTTACTCAAATGGCAAAGAAATATTTAATCTAATCGATTATGACGATAAGACTATAAATTTATTAGT
TCCTAAAAAGTTACAAGTACATGAAAATGAGATTAAAAAAGAGTTTAGAGAATTATTTTATTTTGAAAAA
ATAGAAGTAGAAAATATGTACAATAAAGAGTTAAATAGAGAGTTAAATAAAACAAAGAAGTCAGATTTAA
ATGTTAATATAATATATGTAGATAATAATCAAAGCTATTTTACTTATAACTCCCTTGTTATGGATGACAA
TAGGAATCTCATTGATGACCCAATAGCAATAATTGACATAGATAATATTGATGATTCTTTTTATCTTTCT
TATATATCTAGATGTGTATATTTTAATTCTAAGAAATTAGATGCCCTTGCAGATATAAGTAACATTATTG
AAGCTCAAGGTGTAGAAGCGCATATCCAAAGTTTACATGCTGTTTATAATGAGTATGGTTTAGAAATAAA
TAAACTAGAAAAATATTTGAATAGTGAAATTTTTACTATAATAATAATAGCAATATCAAACTTAATGATT
ACCTACAATATAGTAGCTAGCTACTATGAAAGAAATAAATATAAGTTATATATTAAAAAAATATTTGGTT
ATTCAACTACAGCTAGAAGTATGTTGTTAATAGTCTCATTAATATTAACAAACATTATTCCAATAGGCAT
TATATCAACAAGAGTAGATTTAAGTAATAATATTATCTTATTTGGACTTCTGATATTAGTTATAGAAGTA
ATTGTATCTATTGTATTAGACAAGATTATCTCAAATAGTTCATTTAATAAAATTATAAAAGGAGAACATT
AA
>ref|NC_013316.1|:c4139144-4138512 2-keto-3-deoxy-6-phospho-gluconate aldolase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAAGATGAATATAACCAAAAGAATGTCAGAATGTGGGGCTCTTGCAATTGTAAGAGAAGAAAATC
TTAACCGTGCATGTGAAATTGCTGAAGGATGTATAAAAGGTGGTATAACAGTTATAGAAATGAGTTATAC
CCTAAATAATGCTGGAGAAATAATTCAAGGGCTTAATAAAAAGTATGGTGAAATACTTTGTGTGGGAGCA
GGAACAGTTTTGGATAGTGAAACAGCTCGTCATGCTATATTACATGGAGCTCAATTTATTATTGCACCAA
ATTACAATGAAGGTGTAGCGAAGATTTGCAATAGATATCAGATTCCTTATGCTCCAGGATGTACATCATT
GACTGAGGCAGTAGATGCACTAAGTTTAGGAGCGACTTTTATAAAAGCTTTCCCAATATCAGATTTCTAT
GGACCTAAACTAGTAAAGGTATTTAAGACACCAATACCTGATATGCCAGTTTTAGCAAGTGGAGGAATTA
ATCTTGAAAACCTACATATATGGTTAGAAAATGGAGTTGATGTATGTGGATTTGGTGGTTTATTAACTAA
AGGAACTATTGAGGATATTACTGAAAATGCCAAAAAGATTCGTGAAATCATTAAAAATATAAGAGAAATT
TAA
>ref|NC_013316.1|:c4140155-4139250 putative dihydrodipicolinate synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAATATAAAGGGATTATATGTGCAATGATAACACCATTTGATGAAAAGCAAAATATTAATTCACAAG
CAACATGTAAATTAATTGATTATTTGATTGAAAAGGGGATTTATGGATTATTTATTTTGGGTACTAATGG
TGAATGTCATGTGTTAACAGATGATGAAAAAGTTGAATTTGCAAAGATTGTTATTAATCATACAAATAAT
CGTGTACCTGTTTTTGTTGGAACAGGTGGTAATTCAACTCGTGAAGTTATAGATTTATCCAAGAGAATGG
AAGCGATTGGAGCAAGTGCATTATCTATTATTACACCATACTTTGTTACACCAACACAACAGGAATTAAT
CTTACATTACAAAACTATTGCTAATTCAGTTAATTTACCTATTATAATGTATAATATGCCAGGTAAGACT
GGAATTAATATTGAACCAGAGTCAGTACGTGAATTATCAAAGATAAAGAATATTGTTGGAATTAAGGATA
GTAGTGGTAAACTTGACAACATGAAAGCTTATATTGAAGTAACGCAGAATGAGAATTTTAGTGTGTTTTC
AGGCTCAGATTCACTTATTCTGGATAGTCTAAAAGCTGGTAGTCAAGGAGCTGTTGCAGCAACAACAAAC
TTCCTCACAGAGATTGGTATTTCTATCTATGAAAACTTTATGAAAGGGGATTTGGAAGAAGCTCAAAAAG
CTCAAAGTAGTATAGAAGAACTTCGACGTATACTAAAACTTGGAACAATTCCATCTGTTATGAAGAAAAC
TATTGTCTTGAATGGAATTAATGTTGGAACTGCACGACTTCCTGTAACTGAACCAACTGGGGAAGTACTT
GAAGAAATTAAACGAGTAGTTGAAAATTATAGGACAATACTTAATAAAAGTAGTGAGAATAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c4140783-4140160 putative sugar-phosphate isomerase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTTCAAGGAGGATACATCTTATGGAAAATACATTATCTGAATTTTTAGATAATATATCTAATGAAT
TGTCAGAATTTATTGCCTCAATAGATGAGACATCTATAAATAAAGCATGCGAATTAATTCTTGAAGCTGA
AAAAAATCACGGACGTGTACATGTGACTGGTATTGGTAAACCAGGACATGTATCAGGATATATTTCATCA
TTGCTTTCATCTACTGGAACATCAGCATATATATTGCATGGTACAGAAGCAGTACATGGGTCAAGTGGTC
AAGTAGTTGAAGGAGATGTTGTTATTGCAATATCAAATAGTGGTGAAACTCAAGAGTTAAAAGCAACTCT
TAAGACTCTAAAAGTAAATGGAGCAAAAATAATTGGTGTAAGTGGTAATGAGAGTTCATTTTTAAAAAAT
ATTTCTGATATATTCCTGTTCGCAGGCGTTAAACAGGAAGGAGATTGTCTTAATAAAGCTCCTCGTGCTT
CAATTTTAGCTGAAACAATAGTATTACAATCATTAAGTGTTGTATTACAATATGCTAAAGGTCTTAATAC
ACAGCAGTATTTGAAATGGCATCCAGCAGGAAGTCTTGGAAAGTCTATTAGAGAGGGAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c4142088-4140817 putative PTS system, IIc component [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGTTTATTATTAGTTTGCTGAGTACACCTGCTGTTTTGCTTGGCGTAGTTGCATGTATAGGATTGA
TTCTTCAAAAGAAATCAGCCGTTGAAGTATTTACAGGGTCTTCAAAAACACTTATCGGTTTTTTGATATT
TGGTATTGGTGCCTCTGCTATGACAGGAGCACTTCAAAATTTCAATAAACTGTTCCAACATGGCTTTGGA
ATTACTGGTGTTATAGCTTCACCAGAAGCAGCTACAGCACTTGCACAAGGTACATATGGTTTTGCAGTTT
CATGTACATTAATTCTTGGATTCATATTAAATTTAGTATTTGCACGTATTACAAAGTTTAAGAATATTTT
CTTTACAACAGGTCATAGTTTATTCTTTTCTTGTGTATTAGTTTTAATCATGAAAGCACATGGATTTGAT
AATACAATCACTATTTTAATAGGTGGAACTATCTTAGGGTTTATGTCTGCTGCACTACCTCAATTCTGTC
AACCATTTATGCGTGAATTAACAGGTGGCGACGAACAAGCTATTGGTCACTTTAACATGATTGGTTATGG
TTTATCAGGTTATATTGGGCGTTTATTTTCAAAACATAAAGATGATACAACAGAGACTATAGAATTTCCT
AAGTGGTTATCAATATTCAGAGACTTCTTAATGGGTCTATCCATAGTTATGTTAATCTTATTCTATATTG
CAACATTAAAAGCTGGTCAAGCATTTACTCAAGAAATTGCTGGTTCAACACATTGGTTGGTTTTTCCGCT
TATAGAGGCATTTACATTTGTGGCAGGTATGTCAATATTGATGTCAGGTGTTCGTATGTTCTTAGCTGAA
ATAACTGCAGCATTTGTAATCATTTCAGAAAAGTATATTCCAGGTTCACGTCCTGCGCTAGATGTTCCAA
CAGTATTTCCATATGCACCAAATGCAGTTATTATTGGGTTTATATCAGCATATGCTGCTGGTCTATTAGC
AATTGCTATTATGGCATCATTTCCTAGTATATTTCCTGTAGTAATTATTCCAGCTGCTCACATATGTTTC
TTCTCAGGAGGTACAGCTGCAATATTTGGCAATACTTCAGGAGGATGGAGAGGGGCTATTGCTGGGTCAT
TTGTTGTTGGGTTATTACTTGCATTTTTACCAGTTATACTATATCCAGTTTATGGGACTCTTGGTATAGA
AGGAGCAACTTTCCCTAATATTGATTACAACGTAGTTGGTTCGATATTACATAATATTTTACAATTTATA
AAACCTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c4142402-4142115 putative PTS system, IIb component [Clostridium difficile R20291]
ATGTATAAAATTTTAATCGCATGTAGAGCAGGAGTTGGCTCAAGTTTAATGTTAAAAATAAAGACTCAAC
AAATTATTAAGGAAAATAACTTTCCAATTGAAGTAGAACATGGTTCATTGGATTCACTAAATGGATTCAA
TGGAGATGCTGTAGAAACATTAATTGATGTTGCTGAAGAATTAAAAAATAAAAATTTGAAGTTTGATATA
ATTGGGATTCACAATATTGTTGACCGTAATGAAATAAAGACAGCACTAGAAAAATTCCTTGCTTCAAAAG
AGGGATAA
>ref|NC_013316.1|:c4144504-4142417 putative transcription antiterminator [Clostridium difficile R20291]
ATGGTAGTGGACAAAGAAATTGTATCAATTCTCCAGATTTTATTAAATAGCACATTGATTACAACTAATG
GATTACAAGAGGAGTCTAATTCATCAAAGAGACAAATTACTTATAGAATAAATAAAATCAATGACATGCT
TAAAGTAAAAAATGTACCACTTATATGTTTAAGAGCTGATAAAGATATTATCGTTAGAAAAGAAACAAAA
AAAGCAATTAAAGAAATTTTAGAAAAAAACTATTCTAAGAATACTTATTATTTTAGTAAGACAGAAAGAC
TTTTATATATGTATTTAATGCTTTTTATTAACATGGAGGATATTTCAATTAATCATTTTATAAATTCTAT
AAAAGTAAGTAGGTCTACTGTAAATCTTGATTTCAAGGATTTGATACCAGAGCTTGAAAAGAAGAACATT
AAAGTTAAGAACAATCGTATAAATGGATATTACATAGTTGGCAATGAGATGGAAATTAGGAGAGTGCTTA
TTAAAAACATTATAGAAACTTTGTCTAATGAGAAAAGTTCAAGAGTATTTGATATTTTTATTAAAGAATA
TAATTTAGATAGTTTTGAAGAGGCTAAAAAAATTATATTAAAGCTAATAAAAAAATATGAAATTACTTTT
GTTGAAGATAGATTAATAGAATTTATATATATATTTATCTTTCTAAAAGCAAGGATGTATTCAACTAGAA
TAGTTACTCAGGAAAATGTAGATATTCCTAATATTTCAGTTATGAGTTCAATGAAGGAGTATAAATTTGC
TAAGGAATTATTAGAAGTATATGGGAGTGAGGATAAGATAAAGCCTTATAATATAATGTATATTAGTGCT
TGGATTTTAGGTATATCGGTAGGAAATTATGAAGAAGATACAGAAGATAAGGATGTAATTTCAAAAATTG
TAAATAAAATGATGACAAAGTTTGGATATTTAAGCGGAGTTTACTATATAAGCCAAGAAAAAATATTTAA
ACAATTATATTCTCATTTTAGACCTGCCTACTATAGACTTTTATTTAAATTACCTATCTATAATCCGATT
TGTGAAAAAGTAAAAGAAGAATATAAATTAGTTTATAGAATTGTAAGTAATGCAATGAAAGAGTTTTGCG
GATTATTTGGAGAAGAAATTCAGGAAGAAGAGTTAGCATATCTTACAATGCACTTTGCAACACTTTTTTC
AAATAAAAAAGAATTTGATGGTTTTAGAAAAAGAATAGCATTAATAGTTTGTTCAAATGGCGTTGGTAGT
TCAGCTATTTTACATGCAGAACTTACAAACTTATTTCCTGACTTACACTTTATACCAATGTCGGAATCAG
TTGGATTAGAAAATATAAGTGAACCTGTAGATATCGTATTTACTACTAATTATAACGCAGAGGGTTTAAA
AACAGATGTACCAGTAATTAAAGTAAGCCCTGTTATGACCACAAAAGAAAAATATAAGATTACACGTGAA
GTGTATATTCAATTAGGTGATATTTATTTAAGACAACCTAAAATAGATGAGGTTATGGATATAATAAAAA
AATATGCAAATGTAACCTCTGAAAGTATTCTTTCAAGTGAGCTATTAGCTTATTTTACACAGATAGAGAA
TTTTACATCTAAGGAAGGAGAGGGGCCTATGCTAAGTGAGATTACTAATGAAACACTAGTAAAAATAAAG
GTAAAAGCTAAGAATTGGGAGGAAGCTATTAGACAGTCAGCTTCTGTATTAGTTGAAAATAACAAAGTAA
CTGAAGGGTATGTAGATGCTATGATTAACTCAGCAAAAGCATCTGGACCATACATAGTAATTACAAAACA
TGTTGCACTTCCACATGCTAGACCAGAAGCTGGGTCAAAAGAGATTGCAATAGGCATTGCTACTTTAGAT
AGTCCTATTGAGTTTGGGAATAACGAAAACGACCCTGTAAAATATGTATTTTGTCTAAGTGCAATAGACA
ATAATAGCCATTTACGTGCTATGTCTGAGCTAGTTGAACTATTGGAAGAAGATGAGTTTTTTAAGGTTTT
AGATAGTGCTAAAGAGGCTAAAGAAATTATTGATTTTATAAAAACACACGAATTATAA
>ref|NC_013316.1|:c4145925-4145071 hypothetical protein CDR20291_3493 [Clostridium difficile R20291]
ATGGCTATGGGTTTTGAATTTAAAATAATGAGAAGTTTAATATATGTAGGACTTGCCAAGGAAGAATATA
GACCTAAGTTAATGGACTGGTTATATCGTCACCATATTCCAGATAGTATTAGCACTTTTGGACCATATTG
TACTAAATATGCCTTTTATCAAGCATATCCTACACCAAATGAAGGTGAGCGTTTTGGTGCACGTAAGATG
CAACTAACAGAACATTATTGGCTTGTAGATGAACATATGCCTGAGATGGCAAATAGAATTATGACAGAAT
ATATGCCTATGGATGTTCTACGTTGGCAAGGGTGTATACCAGATGTAGAAAATAAAAGGGTTCATGAAAA
TGCAGAAAGTGGAGATGCAGGACGTGCAGTAGGTGGAGATAATGGATGCCCACCATTTATATTTGCTTTT
GTTCCAATAAACTGGGAAGAAGACTTTAGAGGAAAAGGACGTACTGTACAAGATGGACCAAACTATCGTT
GGCAATTTATGATTAAGTATCCAGATGGTATCTCTAAAGAAGAAGGAGAAAAATGGTTCTATGATGAGGT
AGTGCCATACTTTACAAACTGTTGCTATGTTAATCGTTTTGTCAGTAGTAAAATAATGATTAATTATGGA
GCAACTGCTTTTGACCGTGTATCAGAACTATGGTTTGAAGGGGAAGAGGAATGGTATAAAGCTGTGGTTG
AAGAGACAAAGTCGTTTATTAAAAAACCAGAATGGGCACAAGAAGAGGAGTTCCCATATTTAAAACCACA
ATTCAATATCGCATCAGTATTCTTAGGTGATATAGCAACTATGGATGCATACTCACAGTATCGTGGATAT
ATACCAATGAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c4146469-4145957 hypothetical protein CDR20291_3494 [Clostridium difficile R20291]
ATGGATAGAAAGAAAAAAGAAATATTAACACTGTCTATGGGGATTGCTTTACTACCTCCTTTATGGGCAG
TATTAGCACCTTATATAGGAATAAAAACTGGAGCTGTAGCACTAATCTGTGCAGGATTATATGTAACTAA
TGGTAATAAACAAAAAGATGGATTAAAAATAATGTTTGGTTTTTGGTGTGGAGATTTATGGGCAGTGTTA
GCCATTTTAATTATGGGATATATGAATTTCAATCAAAACCTAGAATTATTTTTAACACTTAGTATATTAG
GTTTTTTTGCAGTTGTAATTGCATCCTTATTTGAAAAAATAATTTTCCTACCATCATGGCTTTGTGGTTG
GGCTATAGGTCTAACTATTATGACAGGTGAAAATATTATTAATTTACAAGATATTTGTATTCAAATTGCT
GTAGCTATGGCAGTAGGAGTATGGTACGTGGGTGCAGGTGTAGATTTGTTTACAATATATATTTTGAGTA
AAGATAAGAAAAAGGGAAATTGA
>ref|NC_013316.1|:c4146686-4146462 putative phage-related protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGAAAAGCCAAGTTTTAAACAAATTGAAATTATTTTAGCAGTTATTTTTTTGGTACTTACATATT
ACAAGATTGGATTAACTCCAGCATTTATTGTTATATTTATACCATTATACTTAAGTTATTTTGCAGTATC
TATGATTGTAAATCAAATAGCAATTAAGCTATTGGAGATAAGGCAAGCTAGGGAAGCTACTAATTACAAT
ATAGGAAATGGATAG
>ref|NC_013316.1|:c4147699-4146746 hypothetical protein CDR20291_3496 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAATACTAGGTATTTCTTTTGGAACAAAAAATGGAAATAATGACACAATGTGTAAAGTTGCACTTA
AAGGTGCCAAAGAAGCAGGGGCTGAAGTAGAATTTATTCAAATGTCATCTATTAACATTAAACATTGTAC
TGGATGTTGTGCGTGCGTTAAAACTTTATTATCCGGGAAAGGTAGTATGTGTGTATTAAAAGATGATTTT
GAATGGTTGCTTGACAAAATGAAAGATGCAGATGGTATAGTAGTTTCAGACCCTATTTTTGAAGAAGGGG
CATCAGGATTATTCCATACTATAATGGACCGTTTTGGACCCAGAGCAGATAGAGGAAATAACATTATAGG
AACAAAAGTTGCAGAAGCTATAGGAGGAAAAATTCCAGACTCAAGAATGCTTAATGATAAAGTAATATCA
TTTATGGGAATAGGAGGTTCTGACTGGGGTACAAGAGTTCAATGTGAACATGCTATGCTAGCTCTCATAC
CAATGTGGAAAGTTATAGATAATGCTTGGTTCCCATGGGCAAAGGAATTAGTAATGGATGATACAAGGCT
TGTTCAAGTTCATCAAATTGGTTTAAATATAGTTGAAGCAGCAAAAGATTTTGAAAAAGCTTCATATCAA
GGAGAAGAAGGTGTATGTCCACATTGCCACAATAGATTATTCTACCTTGAGTCAGGTACTAAAAAGGCAA
TTTGTGCTCTATGTGGTATAGTTGGAGAGTTAGATACTATAAGTGGAAAAACTATATTTAGTTTTCCAGA
AGAGCAATTAGGTCATGCTCATGATACTTTACCAGGTAAGTTTATACATGGTGATGATATTAAGAAAATG
GAAGGTCATTATGCAGAAGTTCGTAAAACACAAGAATTTAAAGAAAGAAAAACATCTTATAATTTTATAG
AGCCATTAACTAAAGAAAAGCAAGCTGGAGTTTCATTAGGATAA
>ref|NC_013316.1|:c4149115-4147727 hypothetical protein CDR20291_3497 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGATAAATTTTATGCAAAAGGCAACGGAAATAACGGATATATTAAAAATCTTGAAGTTTGTTCCT
TTAATAACTTAGATGGAACTTGTGGAATGTTTCAAATGGCTCTGTACAAAAGAGATGAAAAATACTATTT
ATATGGATGCTGTTTTGGAGGAAATAAAAAAAATGGAGTAATGATTAGCGATATTACAGACCCTTATAAT
CCACAATTTATAAAACATTTTCAAATGTTAGACCCTAAAGAGTATCCTACAACAACAACTCCAAAAATTC
AAATAGCAGATGATTTAATGATAGTAGCAATGAGTTGTGGAAGTGGACCAGGAGCACTTGTTGACCAAGC
TAAATTAGCAAATATTAAGTGTGAAGCAGGAATTAGAATATACAGTTTAAAAGAAGACCCTTTAAATCCT
AAGTTTTTAGGATATTGGGATTGTGGCTTAAAGCATGTAATGGGTGTTCATAGATTCATGTACAATGGTG
GAAGATATGTACATTTATCAAGTGATTGTGTTGGCTTTGAAGGTCTGATTTATAGGGTCATAGATATAAT
AAATCCTAATAATCCAGTGGAAATAGGTAAATGGTGGAGACCAGACCAATATGCAGATGGATATCCAAAT
AGAACTTTTGATGCAGGAGCACCTCATTGCCCAGAATTTATGGATAAAGGATGGCTTCATGGACCTCCAT
TTGTAAGAGACGGAAAAGCATATTGTGGTTATGGAGGAGCTGGTTTAGTTGTATTAGATGTTGAAGATTT
AACAAGACCAAGATGCTTAGGTGAATTGCCATTTATGCCTGCATTTTCTAGTAGACTTGCAGGTGCAAGA
ACTCATACAGCATTACCATTGCCAGGAAGAGATTTAGTCGTTGTTCAAAATGAGGGAGAAAGATTCCAGT
TCTTTAAACCAGATAACATTACAGATGTTCAAGCTATGAATAATATACATATGGTTGATGTTAGTGACCC
AACAAAACCAACATTAATTGCTCAATTCCCATATCCTGAAGTTCCAAAAGATTTCCCTTATCCTAACTTT
AATGTTGCAGGATTAGGAAAAGCAGGGCCATTTGGTCCACATAATCTTCATGAACCAATGGATAATAAGC
CATGGTTAGAGCAAAGAGGAGATAGAGTATATTGCTGTTATTTCCATGCAGGGCTAAGGGTTTATGATGT
ATCAGACCCATATTATATCAAAGAGTTAGCATATTTTATACCACCAAATCCAAATAAAACACCAGAAGAA
TCTTATTTCCCAGGATTCCCAGGACCACGCTTGGCAGTAACAGAAGATCTTATCGTTGATGATAGAGGCT
ACATCATCATAGATGCTTTAGATGATGGATTCTATATATTAAAAATGAAAGAAGATTAA
>ref|NC_013316.1|:4149388-4150269 LysR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
TTGAATACTAAACAATTAGAATATTTTATATCTGTAGCAGAAAATCTAAGTTTTACCAAAACAGCAGAAA
AATTTTATATTTCTCAAACTGCTGTTACACAGCAAATAAAAGCTTTAGAAGAACAAATAAATGTAACTCT
ATTTACAAGAAGTAAACGTCATGTTGAACTAACACCAGCCGGAAAAGTTTTTTTATCTGAGGCACGTACT
ATAATAAAAAATATCAATGATGCTATTGCAAAAACACAACAATTTGCACATGGTTTTTTTGGAACTTTGA
GCATTGGAACCTTAATAGGATATGAAAAAAACAAACTTCAACAATACTTAAAAGAATTTTCTAATACATA
CCCTAATATATCTATGGATATTTGTACTAATGAAATAACCGAACTTTTAAACTTAGTAAAAAATAATTCT
ATGGACCTCGCTTTTGTTATTAATCCAGAAAATCAACCATTAAAAGATTTTGAATATAAAACTGTAGAAA
GATATTCTTTGGTAGCTCTTTTACCTCCTGGTCATCCACTTTACAATGAGGATTCTATCGATTTAATTGA
ATTACAACATGATAAATTTATTTTTGTAAAAGAAACAGGGGATGAGTATGGACAAAAGTCAATGATACAA
AATAGATATCGTGAAGCGGGGTTTGTACCTAATGTGGTACAACGTTCAAATAATCTTAATACTATTGAAT
CATTGGTATCTTCTAACATGGGAATATCCATTTTACCTTCATTTTGTGTTACAGATACAATGATAGAACG
TGATATTGCAATAGTACCTATAAAAGAAGTAGAAAATAGAATTGAAGTTGTGGTTGTATGGAATAAAAAA
AATACAAATCCAGCATTAGAAAAGTTCATTTCTATAATATAA
>ref|NC_013316.1|:c4151448-4150456 putative carbohydrate kinase [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATATTAGCTTTTGGTGAAATAATGATGAGACTTTCAGTACCTGACTACAAGTTCTTAACACAAA
CCAATGAACTAAATTATATAATTACAGGCACGGGATTAAATATATTATCTGGACTTAAAAACTTTGGATA
CAATACCTATATGTTGACAAAGTTGCCTAATAATAATGTAGGTAAAGCATCAAGTGCAAATATAAGAAAG
CTTGGAGTAAAAGATGACTTTATCACATATGGAGGGAATCATATAGGAGTGTATTTTCTTGAAAATGGGT
ATGGAGAAAGACCTTCTGAAGTGACTTATTTGAATAGGTTAAATAGTTCATTTTGTGAGAGTAAATTACA
AGATTATGATATTGATAAATGTTTAGAAGAAATGGATATAGTCCATATTTGTGGTATTGCTATGCAACTT
ACAGATTCAGTTAAAAAGATTGCTTTAGAACTAGCTAGAAAATCTTATGAAAAGGGGATAAAAGTATTCT
TTGATTTTAATTTTAGACAATCATTAAATCCAGAAAGGACTTATGATGATTTAGTAAATGATTATAAGAA
AATACTACCATATTGTCATGGGCTGTTTGCTAGTTATAGAGATATAAATAAGATACTTAATATAGATAGT
CTAAATATAAAATCTAGTTCAGAATTGATTAAAAAAGAGTATGATATAGATATTGTAGCTGGAACTATGA
GAAGATTTGATGATATGAATAATAGATTTATAAAGGGATATATATCAAATGATGATGGTTATTTTGAAAG
TAGGGAGTATAAGTTAGAAATATATGACAGAGTTGGTGCTGGGGATGGATATGTGGCAGGAATTATATAT
TCATATTTGGAAAATATGAAGAGTGAAGATATAGTTGAGTTTGGGGTTGCTAGTTCGGTGTTAGCTCATA
CAACTTATGGGGATAATTCTTTAGTAAGCACAGGTCATGTACTTAGACTGATGAACAATGAAAAAATAGA
TATATTGAGATAA
>ref|NC_013316.1|:c4152208-4151453 hypothetical protein CDR20291_3500 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGGGGATAAATATGAATTGTATACCACAATATTATAAAAATAGAGTTTGTTTAAATGTTCTTGCAG
GAAGCATAAAAAATGCTAAAGAAGTATATGATGCCTGTGATGGACATGTACTAGTAGGAGTACTATCAAA
GAATTATAGCACTGTAGAAGCAGCTATTGAAGATATGAAAAAATACTCAAAGGAAATAGATAATGCAATA
TCTGTGGGTCTTGGAGCTGGAGACCCAAATCAGTCAAATATGGTATCTCAGATTTCTAAAGAACTTCAGC
CACAACATATAAATCAAGTGTTTACAGGTGTCGCTACATCTAGAGCATTGCTTGGTCAAAATGATAGTAT
AATAAATGGATTAGTTTCTCCAACTGGTAAACCAGGATTTGTAAAAATATCCACAGGTCCATTAAGTTCA
AAAGAAAAAGATGGTATAGTTCCTATAGAAACAGCAATAGCTATGATGAAAGATATGGGAGGAAGCTCAA
TTAAGTTTTTTCCAATGGGAGGGCTTAAAACAAAGGATGAATATATAGAAGTTGCAAAAGCTTGTGCAAA
GCATAATTTTTATTTAGAACCAACAGGGGGTATAGACTTAGATAACTTCAAAGAGATAGTTCAAATTGCA
CTTGATGCTGGTGTAGAAAAAGTTATACCTCATGTTTATACATCAATAATTGATAAAGAAACAGGTGATA
CGAAAGTGGAAGATATAGGAGTACTTTATAAAATAATGAAAGAATTATTGGGATAG
>ref|NC_013316.1|:c4153367-4152258 putative selenocysteine synthase [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAGTATATTTGAAAAATACTCTGTAAGACGTGTTATAAATGCTTCAGGCAAAATGACTATACTAG
GAGTATCAACAGTAGATAAGGAAGTTATTGAAGCAATAGGTGAAGGGTGTAAAAATTTCCTTATAATAGA
AGAACTTGTAAATAAAACAGGTGAATATATAGCAAATTTATTAGGGTGTGAAAGTGCACTAATAGTTTCT
AGTGCATCTGCTGGGATTGCACAGAGTGTGGGAGCAATGATAGCAAAAGATGATATGAGTCTAGTTTACA
ATGTAAATAATCCTAAGAAACAAGTTAAAAGGGAAATAATAATTCCAAAGGGGCATAATGTTGATTATGG
AGTTCCAGTAGAAGTAATGATAAGACTTGGAGGAGGAGAAGTTGTTGAGGCCGGCTATGCTAATATGTGT
AACAAGGAACATATAATAAGAGAGATAAATGAAAATACAGCAGCAATTATGTATATTAAATCTCATCATT
GTGTTCAAAAGAGTATGCTAAGTGTATTAGATGCAGTACAAGTTGCTAAAGAATATAATTTACCTTTGAT
AGTAGATGCAGCAGCAGAAGAAGATTTAAATGTATATTATGAATTGGGAGCAGACCTAGTGATATACAGT
GGTGCTAAGGCTATAGAAGGTCCTAGCTCGGGGTTAGTAATAGGTAAGAAAAAATACATAGATAATGTAA
AGCTTCAATCAAAGGGTATAGGAAGAGCTATGAAAATAGGAAAAGAAAATATTGTAGGTCTAACATGTGC
AATTGAGAGATATATAAGTAATGATAAAGTAACTTTAAAAGAAATGGAGGACAAGCTAAATCCATTTATA
GACAAGATAAATACTATAAAGGGAGTGAGTGCTAGTATAACTAGAGATTCAGCAGGTAGAGAAATACTTC
GTGGAGAAATTAACTTTAATGAAGATATAATAAATAAGTCAACACAACAAATTATAAATGAACTTAGAAG
TGGAGAGATAGCTATATACACTAGAGACTATAAGGCTAATGAAGGCAAGATTGAGATTGATATAAGAAGT
GTAACTGGAAGTGATTTAGATAATATTTATAATAGGATAAAAAATATAGTAGAAAGTTAG
>ref|NC_013316.1|:c4154518-4153385 putative amidohydrolase [Clostridium difficile R20291]
GTGAAGATAGACATATTAATAAAATGTGGAAAAACAGTAGATAAAAGTATAATTGATATAGCTATATTAG
ACGATAAAATAATAGAAGTAAAAAATCATATAGATGATTCTAAGTATCAGGCAAAACAAATTATAAACTT
AGATGGAGAGAAATTTATTAGTGCGGGTTGGATAGATATACATACACACTGCTACGAAAGACTAGACCTT
TATAAGGATTATCCAGATGAGGTTGGAATAAAAAGTGGAGTTACTACTGTAGTAGATGCAGGAACAACAG
GAGCTTTAGATATAGGTGAATTTTATGAAGATACTAAAAAGTATAAGACCAATGTATATGCTTTAATAAA
TATTGCTAAGCAGGGAATAACATCTCAAGATGAACTTTCAAATATGATGAATATTGATGAATATGAACTT
AAAAATGCAGTTAGAAAATACAAAGATTTTGTTGTTGGAATCAAAGCTAGAATGAGTAAAAGTGTTGTAA
TTTCAAATGATGTTGAACCTTTAAAAGTAGCTAAAAGAATAAAAAATGAACTTAATCTACCTATGATGGT
TCACTTTGGGAGTTCTCCTCCAACGATAGAGGATATATTTGATTATATGGAAAAAGGAGATATATTAACC
CATATATATAATGGAAAGCCAAATGGAATACTTAGAGGCAATGAGGTTAAAAAGGAAATCATAGAAGCTA
AAGAAAGAGGTATAATTCTTGATGTAGGTCATGGAACCGAAAGTTTTAGTATGGATATTGCAATGAAATC
TAAGGATGCAGGAATTTTTCCAGACACTATAAGTACAGATATATATATTAAAAATAGAATAAATGGTCCA
GTGTATAATCTATCTACAACAATGGAAAAGTTTATATATATGGGCTATTCACTTGAAGATATAATAGATA
AAGTTACTAAAAATGCAGCAGATGCAATAAGTTTAAAAAATAAAGGTTTAATAAAAGAAGGATATGATGC
TGATTTAACTATATTTGATGTGGTTAATGAAGAAAAAGAACTTCAAGATTCTTTGAATAAGTCAGTAATC
ACAAGTACGTCTATAAAGCCAAGAGCAGTAGTAGTCAATGGAGAATATTTAAATATAGGCAACTCTATAG
AAGAGAATGAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c4155614-4154520 hypothetical protein CDR20291_3503 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAGAAGATTAGGAATATCAGTATATCCAGAGCATAGTAACATGGAAGATGATAAGGCATATATAA
AAATGGTTTCAAAATACGGATTTAAAAGAATATTTATGTGCATGCTTTCAATTACAAGACCTAAGGAAGA
AGTTAAAAAACATTTTAAAGAGATTATAACCTATGCAAGAGAATTAGGATTTGAAGTAATCCTTGATATA
GCTCCAAACATATTTGATATATTACAAATATCTTATGATGATTTAACATTCTTTAGTGAGTTAAATGCTA
GTGGAATAAGGCTTGACTATGGATATGATGGAAGTAAAGAAGCTATGATTTCTTTCAATCCATATGATTT
AAAAGTGGAACTAAATATGAGTAATGATGTAGCATACTTGGATAATATAATTACTTACAAGCCAAATGTA
AATAATATATATGGTTGTCACAATTTTTATCCTCAAAGGGGTACAGGCTTGCCATATGATTTTTTTGTAA
GATGCTCAAATAGATTTAAAAAGTATGGAATAAGAACTGCTGCTTTTGTCAATTCAAAATACGCAACAAT
CGGACCTTGGAATATAAATGATGGACTGTGTACGCTTGAAATGCATAGAAACTTAGATATTGCTACAGCA
ACTAAGCACTTATTCGCAACAGGATTGATTGATGATGTAATTGTAGGAAATGCATATGCAAGTGAAGATG
AATTAAAAAGAATGTCTGAAGTAAATGAATACCAAGTTGTATTTAATGTAGTAGCTAAAGAAAAAACTTC
TGAAGTAGAAAAGATAATAATGGTAAATGAGCAACACTTTAGAAGAGGAGATATAACTAATCAGGTAGCA
AGATCTACAGAAGTAAGAAAAAAATATGCTAAAGAAAATTTCCCTAAACATGATAATAAGAACATCTTTA
AAAGAGGAGATGTAGTGATTGGTAATGATGACTTTGGAAAGTATAAAGGGGAATTACAGTTGATACTTCA
AGATTGTACAGATGAAAGAAAAAATAAGGTGGGTAGAATAAAGGAAGACGAAATAATACTTTTAGACTTT
ATTGAACCTTGGAGTAAATTTAAGATTATTTTAGAGGGAGAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c4157052-4155751 PTS system, IIc component [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAATTCGCAAGTTTTTTAGAGCGCAAGATTATGCCTGTAGCAGCGAAGATAAGTAATCAGAGAC
ATATGAGAGCTGTAAGAGCAGGTATAATAGCAACATTACCACTAACAATAGTGGGGTCATTTTTCACAAT
ATTATTAAACATACCTATTGATGCTTATATGGATTTTATAGCTCCATTTAAAGCAACATTAGATATACCA
TTTAGATATACTGTAGGATTTTTATCTCTATATGCTACTTTTGGGATAGCATCATCACTTGCTAAAAGCT
ACGATTTAGATACAACAGGTGTTGGTATGCTTGCAGTTATGGCATTTTTAGTTTCTACAATAGTTCCAAC
TCAAGTAGTTGAACCAGTAGGTGGAGTTATAGAAGCTGGTAGATGGATGGATATGGCAAAACTTAATTCG
CCATCATTATTTGGAGCTATCGTAACATCATTAATTACAGTTGAAATATATCGTTTTATGAAGGAAAAGA
ATATTACAATTAAGATGCCAGCAGGAGTTCCAGTAGAGGTTTCAAATTCATTTACTGCATTATTACCGAC
AGCAGTAATTTTAATGTTATTCTGGGTAATAAGACATATTTTAGGATTTGATATAAGTGTTGCACTAAGC
GCTATGTTATCACCTTTAAAAGGATTCTTATCAGGAAATAGTTTAGGTGGTGGGCTACTGACAGTATTCC
TAATAACTTTATTCTGGGTACTTGGGATACATGGTCCAGCTATAATGGGGCCAGTAATAAGACCTATATG
GGACATGTCTATAGCAGAAAATATAACTGCATTCACAGAAGGAGTATCAGCTCATGCAATGCCAAACATA
TTTACAGAACAATTTTTACAGTGGTATGTATGGATAGGGGGAGCAGGGGCTACTCTTGCATTAGTTGTAA
TGTTTATGTTTTCTAAGTCACAATATCTAAAAAGTTTAGGTAGATTAGGATTTTTACCAGGGTTATTCAA
CATAAATGAACCTATAATATTTGGAGCACCAATAGTTATGAATCCAATACTAGGGATACCATTTATAATT
GGACCTATAATAATGACAATTCTATCATATGTTCTTACTATTACAGGGGTTATACCTATGATGGTAGCAA
GATTACCATTTGCAATGCCAGCACCAATAGCAGCAGTAATGAGTACTAACTGGAGTATACTAGCAGGTAT
CTTAGTATTAATCAACTTTGTGATATCATTTGCTGTTTATTATCCATTCTTCAAAGTTTTTGAAAAACAA
CAATTACAAAGAGAACAAGAAGAAATGAGTGAAAATTTATAA
>ref|NC_013316.1|:c4157977-4157276 GntR-family transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGTTAAGAAATCAACCATTATATATACAAGTTGTAGATATATTAAAGCAAAAAATATTAAATAACGAAT
ATAAAATTGATGAAAATATTCCAACAGAAAGAGAATTAGAGCAAGAATTTGGAGTCAGTAAAATTACTAT
TAGAAAAGCTATTGAGATATTAGAATCAGAAGGGTATGTAGAGAAAAAAAGTGGAAAAGGGACAAAAGTA
ATAAGTAATAGTCTTTTTAATAAGCTATCAAAAGCAGAGTCTTTTTCAAGTATACTTTTATCTAAAGGTC
ATAAGTTATCTAAAAAGACTATTTCAATTGAAAAAATAATAAATGATACAAATTCACAAGTATTTAGTAT
ATTTGGAGAAAAATGTAGCAAGATTACTAGAATGTATTACTTAGATAGTAAGCCATATATATTTTTTACT
CATTATATTCCTTTTGATGAAAATCTAACTGTTGAAAGTTTTAATAATGAAAGTTCTTTATATATGTACT
TATATAGGAGAAATATAAATATAACTAGATTTGAAGATGAATTTTTTATAGAAGAATCAGAACTAGAGGT
ATCAAAGGCTCTAAATCTAGCTAAAGACATATTATTAGGAAGAAAAAGAAAGACCTATGATGAGAATGAT
AATATAGTTGAGCTATCATTTGCAAGATATAATACAGAAGTACAAAACTACGTAATTAAATACGAAATAT
AA
>ref|NC_013316.1|:c4158507-4158190 PTS system, IIa component [Clostridium difficile R20291]
ATGGATGAAAAGATTATAGAAATATCTTTTAATATAATAGGTTATGCAGGTGAAGGTAAAGGGTTAGCTT
TTGAAGCAATAAAAGAGGCTAAGAATGGAAATATAGAAAAAGCAAAAGAATTATTAAAAGAGTCTAAGGA
AGTTATAAATAAAGCACATAGATATCAAACAGAATTAATACAAAACGAAGCTAGTGGAAACAGGACTGAA
ATAAGTGTCATACTTATACATGCACAGGACCACCTAATGAATGGTATGAATTTTCAACAGTTAGCTGAAG
AAATCGTTGATTTACATTTGAAATTACAAGATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c4158866-4158555 PTS system, IIb component [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAAAATAATGTTGGCCTGTTCAGCAGGAATGTCTACAAGTTTATTAGTTACTAAAATGGAAAGTG
CAGCTAAAGAAAATGGTATAGAGTCGCAAATTTGGGCAATACCAGAATCAACTATACAAAATGAAATAGA
AAAATGTGATGTATTATTACTAGGACCACAAGTTAGATATGTATTACCTAAGGCTCAAGAAATTGCTAAG
CCATATAATATACCAGTAGAGGTTATAAATATGATGCACTATGGAACAGTTAATGGAGAAGCTGTTTTAA
ATAGAGCGATAGAACTTAACAACACTAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c4159494-4159015 hypothetical protein CDR20291_3508 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATAAGTATAGTAGTAGTAGGTAAAATTAAAGAAAAATATTTAAAATTAGGTATTGATGAGTTCA
AAAAAAGGCTTTCTAAGTATTGTAAGTTAGAAATTATAGAGTTGGATGATGAAAAAGCTCCAGAGAATTT
GAGTGTTAAGGAAATGGAAATTATAAAAGACAAAGAAGGAAAGAAAATTTTAGGGAAGATAAAGCATAAT
AGTTATGTTATAGTCTTGGCTATTGATGGTAAGGGTTTATCCTCTGAAGAACTTGCTAAGACTATGAGTG
ATTTAGCAGTTAGAGGTAATAGTAGTCTCTGTTTTATAATAGGAGGTTCTTTAGGGCTTTCTGATGAGGT
TTTAGGAAGGGCTGATTATAGGTTATCCTTTTCTAAGATGACTTTTCCTCATCAGATGATGAGATTGATA
TTGTTAGAACAGATTTATAGGGCTTATAGGATAAATAATGGAGAACCGTATCATAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c4161664-4159562 putative signaling protein [Clostridium difficile R20291]
TTGCTAAAGAGAAATTTTGAAAATGTTGAGGATAATAAAATTTTATACTCTATAAAGCAGGGTATGATTT
TAGCAATACCTGCTATTATGACTGGTTCAACGGCTCTTGTAATTTTGAATCTTCCAATAAAGGCTTATCA
AGAATATTTATCAGGCTTGTTTAATGGAGAGGTTACAAATATTCTTAACTTTATAAATGATTCTACTTTA
GGAATTATTTCATTAATAATATTATTAACAATAAGCTATAGTTATGGAAAAATATATGGGAGCAAGTATA
CAGTACTTGTTCCTATAGTTGCAATGTGCTCTTTTTTAGTATTTTCACATGGTAATGAGCTTAATTCTTA
TATAGAAATATTTAAGACAAAGTGGTTATTTACATCTATAATTGTTTCTATGACATCTTCTGTATTGTTT
GTAAAACTTACAGAATCTTTTGTTACAAGTGTAAAGTTTCATACAGAAGGGGCTGATGCAGACTTTAATA
TGGTAGTTTCGGCTATAGTTCCTTTCATAATAGTAGTATTTTTGTTTTCTATTTTTAGAGTGATAATGAT
AAGTCTAATTGGCAGTTCAAACTTTCAAGATATATTTTATAATTTATTTTCAAATGTTTTTAATAAAATG
GGAACAAACCTTATGAGTGCTCTGTTGTTTATTTTTTTAATGCACTTTATGTGGTTTTTTGGGATTCATG
GTAGTAATGTATTAGATACCGTCGCAAAAAATTTATTTGAAAATAGTATGGCAATTAACATAAATTTAGT
TAATAATAATCAATTACCAACAGAAATTTTTACTAAGACCTTTTTTGATACAATGGTTTTATTGGGAGGA
TGTGGCTCTTTACTATGTTTAGTAATTGCAATTTTTCTTAGTGAAAAACGTATAAATGTAAGAAAGCTAG
CTAAAATTGCTTCAATACCAGCTCTTTTTAATATCAATGAGATGCTAGTTTTCGGGATACCAATTGTTTT
TAACTATATTATGTTTGTACCTTTTGTAATTACTCCTATAATCTTAACCATTACAAGTTATGTGGCTATG
TCTACAGGTATTGTACCATGTACAGTTTCAGCTGTAGAATGGACCTCACCTATATTTTTAAGTGGATATA
TGTCTACAGGTTCAATAAGAGGTAGTTTGTTGCAAGTATTTAATTTATGTGTTGGTGTTATGATTTATAT
TCCGTTTATAAAAATGTCGCAAAATAGATATACATATATGTTTAAGAATAATATAGAAAATTTAACAAAC
TTATTAAAAAGGTATGAATTAACAGGTGAACAGCCTAATCTTCTAAACCATAATGGTAAAATAGGTTCAA
TTTCAAAAATGTTGGCATCAGACTTGAAGTTTGCTATGAAAAGAGGAGAAATAGAACTTTTTTATCAACC
ACAAGTCAATTATAATGGAAATGTTGTGGGAGCAGAGGGATTACTTAGATGGAAACATTCAATAGGAGGG
TTCATTTATCCACCACTAGTTATAATTTTGGCTAAAGAAGAAGGGTTCTTAGATGAGCTTGGAGAGTATA
TTATTAATAAAGCATGTATTGATTTAAAGAAGAGTGAAAAGCTATTGAGAAATCCTGTTAAGTTCTCTGT
AAATATATCTCCAGACCAACTTGATGACCCTAAGTTACCGGAGCAAATAAAAAATATCATTAGTAGTAAT
GATATAAATCCTAATATGTTAGGTATAGAAATAACAGAGCAAATTGCATTATCAGGTTCACAAATAATTA
TTGAACGTATCAATGCGATACATAACTTGGGAATAAAGTTAATTATGGATGATTTTGGGATGGGGCATAG
CTCTCTTATATATCTTCAAAATAATAACTTTGATATAGTTAAATTGGATGGTTCATTAGTTAAAGAGATA
CTTACAAATAAAAGAAGTAGTGAAATTATAATGACTATTGTAAATCTTTCAAAAAATTTAGATTTTGATA
TAGTTGTTGAGTATGTTGAAAATATAGACCAAAGGGATAAGTTATATGGTTTAGGATGTGAAATATATCA
AGGATATTATTATAGCAAAGCAATACCTTTTGAAGAGTTTGTAGAATATGCAAATCAAGAAAAAGAGATA
TAA
>ref|NC_013316.1|:c4162474-4161677 putative metallo-beta-lactamase superfamily protein [Clostridium difficile R20291]
ATGCTAAAGTATTGTTCAGTAGGGAGTGGTAGTAGTGGGAATTGCCACTATATAGGGTATAAAAATACTA
ATATACTAGTAGATGCAGGATTAAGTGGCAAGAGAATAACTACAGGTCTTAAAGACATTGGTGTAGATGC
AGATAAATTAAAAGGAATATTTATAACACATGAGCATGTTGACCATATAAAAGGAGCAGGTATATTATCC
AGAAAGTTCGATATACCAGTATTTGCTAATATAAAAACATGGTGTTCTATGAAGGACAAATTAGGTGACA
TCAAAGATAAAAATATGAAAGTATTTGAAAATGATAAAACCTACTCATTAGGTGATATCATAGTGAGACC
TTTTTCAATAGAACATGATGCGTCTGATCCAGTTGGATATAATTTTTATACAGAGAGTGATGAAAAAATG
TCTATAGCTACTGATATAGGATGTATAACTCAAAATATAAAAAAACATCTATATAAATCTAAATTAGTAG
TATTGGAATCAAATTATGACCCTAATATGCTTATGATGGGTTCATATACATATGCTTTAAAGAAAAGAGT
AATGTCAAGTACTGGTCATTTATCCAATGAAGATGCAGCTAATTTCTGCGTTGAACTTATTAATGAAGGT
ACAGAATCTATATTATTAGCACATTTAAGTAAAGAAAATAATTTTCCTGAGTTAGCATATGAGACTTCAA
AAGGAGTATTAGCATCAAATGATATAGTAGTTGGACAAGATGTAAAACTAGATGTACTATCACGAAATGA
TGTTTCTAATGTTTATGAGATGAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:c4163982-4162576 putative peptidase [Clostridium difficile R20291]
ATGGTATTAATAATAGGTTGCTTTATAGAAAAGGATGACAGTTTAGAAACATACAAAGAAAAAACTAATT
CAAAAATAAATCAGTATAATATGGATGTTATATTTGATGATGAGACTAAGAGGTTAATGTGCAATCAGAA
TGTTGACTACATAAATAATACAAAATCAAACATAGATAAAATATATTTCCATATATATCCGAATGCTTTT
TCCAAGAAAGATTTTGCTCCTTTTGAAAAAAGTGAAATGACAAGGGCTTATCCTAATGGATTTAACGAAG
GATATATAGATATAAAGAATATATTAAATAATAATAGTAAAATGGAGTATAAAATTAAAGGAGACAAAAA
TGACATATTAGAAATAGAATTAGGGAAAGAGTTAAAACCAAATGAAAGAATGTCATTAGATATAAAATAT
AACGTAAAAATACCAAATTCAATTGGAAGATTTGGATATGGAGAAAATACTATAAATGTTACTAATTGGT
TTCCTATAGCTTGTGTAAATGATGAAAGGGGATGGAATTTAAAGAGTTATGAAACTATTGGCGACCCATT
TTATAGTGAGACTAGCGATTTTCATGTGAAACTATTGATTCCAAATAAATATAAAATTGCTCATACAGGA
AAACTTATTGATGATAAACATGATAATAAGAAAATGCTATATGAAATAGAAGCTGAAAACGTTAGAGATT
TTGCATTTATACTAAGTAGTAAATTTGATGTAAACAAAGTAGATTCAAAGGGAGTAGCTATCAATACATA
TAATTTAAATAAAAAGCTTTCTAAAAAAGCAACTGAAGTGGCAAAAGATTCAATAAATATATTTAGTGAA
TTATTTGGAAAGTATCCTTACAAAGAATTTTCTGTTGTAGCAAGTGACTTTTTTATAGGGGGGATGGAAT
ACCCTATGCTTGTTATGATAGACCAAAGTTTATATAATGAAAAAAATGAATTTTTACTAGAATATGTTAT
TGCCCATGAGACAGCACATCAATGGTGGTATTCTGCTGTTGGAAATGATGAAATAAGTGAACCCTGGTTA
GATGAAGCACTTACTGAATATTCTACAATAGTTTATTTTGAACAAAAGTATGGTAAAGATATGGCAAACA
AGCTTATAAAAACTATGGAGATACAGACAAAAAGTTATTTGAGTGAAAATATATTTAAGCCAGCAAATGA
GTATAAAAATTCTACTGAATACAGCTTGAATGTTTATACAAAAGGCGCAATAGCATTTAATGAAATAAGA
AAAGAAGTTGGAGATAAAGTATTCTTTGAGACTTTAAATGAATACTATAATAAATATAAGCATAAAAATG
CTAATGGAAGAGCTTTTGTGGAACTATGGAATAGTAAAGGTGTAGATATAAATAAGATTATAAGTGAATG
TAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:4164164-4165222 hypothetical protein CDR20291_3512 [Clostridium difficile R20291]
ATGTTTTTTAAAGAAAGCAATGAAATAGATTTAGGTGAAATCACTATTCCCAATATCTTTATAGATATAT
TTATGCCAATGGCGGACGGGTTATACGTAAAAGTTTATCTTTTAGGATATAGACAAGCATGTGATATTAC
TTCTAATCCTAAGTTCGACAATAATTCAATAGCCAAAAACCTAAATATACCATTGTCTGATGTGTTATCT
GCTTGGAAATTCTGGGAAGAAAAGAAGATTATAAAAATACATGACAATGGAGAATATGATAATTTTAATT
ATTCAATAGAATTTTTAGATTTAAAAAATTTCTATATTGAGAATATATTAAGCAATAATTCATCTATAAA
ATCTAATACAGATAAGGTTGTATCTACTTCTGAAAATCCAAGTATTAGAAAAATGTTTAATTCTATAAAT
AAAATAGTTGGGCGATATCTCGACCCAAGTGAAAAGATGAGTATTATGGATATAATGAATAAATACAATA
TGAGCCCCGATATGATACTTTGCGCATATGAATACGTCAAAGATAAAACTGGTACATCAAAGCCAGTTAA
ATACATTGAAGGCATTATTAGAAATTGGTATGATTCAAATTTATATACGCCAAAAGATGTTGAAGAAAGC
TTTTTGGTAAGAAGTGAACGATATATTTTATATAAAACGATTTTCAATGAATTGGGATTTTCAAGACAAC
CATCAAAATCAGAAAAAGAACTTATGGACACCTGGTTTGATAAATTTAATATGGATATAGATTTGATAAT
AAATGCATGTTCTAAGTCTAAGAATATTTCAAACCCAAGTATATCTTATATAAATGGTATAATTAAAAAT
TGGAATGAAAAAAATATAAAAAATTTAAATGATTTAAAGCAAAAAGAGGAAGAACGTATAGTTAAGGAGA
ATATTAATAAGAAGCAGATTAATACTACTCAAAACAACAATACTTACAAAAAAACTAAGTTTCATAATTT
CAACGAAACATTCACTCAGTATACCTCTGATGAGCTCGATGAGATTATTAAAAAAAGTCAAAAAGAAAAG
TTTAAGTAG
>ref|NC_013316.1|:4165231-4166223 putative DNA replication protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATGAGGATAAAATAAGAAAAATACTTGCTAAATATGCTAAGAGAAGAGATGATAATGAACTCTTAT
TAGAACATAGAAAAAATGAGGTATATAATAGAATCCCTGAGATAAAATCTATAGATGATGAAATTTCTAA
AATAGGTCTCAGTTTAGCTAAGATAGTACTTTTAAATCCCAAATCTAAAGATGAAATTGTAAAGAAGACT
AAAGAGAATATAGAGTCTTTAAAAGTAAAGAAAGAAAAACTTTTATCTGAAAGTAACATACCTCTTGATT
ACTTGGAAATAAAGTTTCAATGTATTTCTTGTAAAGATAAAGGATTTTTACCTAATGGAGAAAAATGTTC
TTGCCTCAAACAAGAAATTGTAAATGAAGCTTATAAAATGTCTAATTTAGATAGGATTTTAAGTCAGGAA
AATTTTTCGAATTTTAACTTGAATATATTTTCTCCTAAGAAAGGCTCTGATGGGGAAATATCTCCTAGAG
AAAATATGCTAAATAATTTAAGTATCTGCGAAAATTTTGTTCATGATTTTAAGAAGGATAATAGTGAAAA
TCTACTGTTTTATGGTTCTACTGGACTAGGAAAGACCTATATGTGCAATTGTATTGCAAAGGAATTGTTA
GATAAAGGAAATGTTGTAATCTATCAAACTTCTTTTAGAATTTTAGATATTCTTGAAGATTATAAATTTA
GAAGAGACACAAATAACCAAATAAGTGAAGATAATTATAAAAACTTGTTTGATTGTGATTTATTAATAAT
AGATGACCTTGGAACTGAACTTAATAATTCTTTTACTAGTGGGGAAATCTTCAATATTGTAAATACAAGA
CTTGTTGCTGGTAAAAAAATCATTATTTCAACCAACTTAACACCATCTCAAATAGGAAATACTTACACTC
AAAGAACTCTCTCTAGAATCTTAGATAAGTTTAGGATTTTAGAATTTACTGGAGATGATTTGAGATGGGA
AAGATTTAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c4168565-4167276 adenylosuccinate synthetase [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAACAGTTGCAATTGTTGGTTCTCAATGGGGAGATGAAGGTAAAGGTAAAGTTATAGATTATCTTG
CTACTCAAGCAGATGTAGTAGTAAGAGGGCAAGGTGGAAATAATGCAGGACATACATTAGTTGTAGAAGG
TAAAAAATACGCATTACATCTAATTCCATCTGGAGTTTTAAATCCAAATACAGTGAATATAATCGGAAAT
GGAATAGTGTTTGACCCTAAAGGATTTTTAGAAGAATTGGAAATGTTTAAAACGGATAATATAAGTACAG
AAAATATAAAAATAAGTGATAGAGCACATGTCATATTCCCATATCATAAAGAACTAGATGCATTGTCAGA
AGAAGCCAGAGGCGATTTAAAGATAGGTACAACAAAAAAAGGTATTGGACCTTGTTATATGGATAAAACA
GAGAGATCTGGTATTAGAATATGTGACTTAATGGATAAAGATAAATTTGCTATAAAATTAAAAGCTCAAA
TAGATGCTAAAAATAAAATAGTTAAAAATATATATGGAAAAGAAGAATTATTTGATTTTGAAACTATATA
TAACGAATATCTAGGATATGCAGAACAAATAAGAAAATATGTGGCAGATACGTCTGTTATTGTATATGAT
GCAGTAAGAGCAGGTAAAAAAGTATTGTTTGAAGGAGCACAAGGGACTTTATTAGATTTAGATTTAGGAA
CTTATCCATTTGTTACATCTTCTCATCCAACATCTGGTGGATTTGCAATTGGTGCAGGTATAGGACCAAA
TATGATAAAAGACGTTGTTGGTATAGTAAAAGCATATACTACAAGAGTTGGAGAAGGACCGTTTGTTACA
GAGCAAATAAATGAAACTGGAGATAAGATAAGAGAACAAGGACATGAATTTGGGGTAACTACTGGTAGAC
CAAGAAGATGTGGGTGGTTTGATGCAGTTATAGTTAAGTATGCAGCTAGAGTTAATGGATTGACTAGTAT
TTCATTTATGTTACTTGATGTATTAACTGGATTTGATAAGATAAAAGTTTGTACGTCTTATAAAATGGGC
GATAAGATAATAACGGATTTCCCAGCTTCATTAGATGATTTAGCAAAATGTGAACCTGTATATGAAGAAT
TAGATGGATGGAATGAAGATATAACTCAAATAGATAACTTTGATGACCTTCCAGAAAATGCAAAGAAATA
TGTAGCAAAAATAGAAGAACTAGTTGGAGTAAGTGTAGATATGGTTTCTGTTGGTCCAAATAGAGCTCAA
ACTATAATAAGAAGAAATATATTTGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c4168955-4168647 hypothetical protein CDR20291_3515 [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAAAAATAAGCTTAAAATATATATATCCCAATATAATTAAAGTACTTGATGAAATAAACTTATTTA
GAGTAATTGACAATAATTTAAGAGAGTCTATTGTTGTTTATGCTAATAATGTGGATAATCAGTATCATAT
AAACATGACTAATACAAACTTTGGAAACATAATTAACATATGTAAATTAGAAAAACTTTTAGATGTGGAT
AAATTTATGGAAAAAGTTATAAAATATGAAAAAGAAATAATAGAGAAAGAAGAGTTTTCAAAAATAGAAG
AATATATGTTAAATATTGGAGAATACTAA
>ref|NC_013316.1|:c4170488-4169160 replicative DNA helicase [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGATATGACGAGAATTCCTCCTCATAGTGTAGAATCAGAACAATCAATATTGGGTTCTATACTTC
TAGATAAAGATGCTATAATAACGGTTACAGAAACTATAAAGCCTGATGATTTCTATAAAGAGGCTCACAA
AATAATATATGAATGTATGATAACTTTAAGTAATAAAGGTGAGCCTATAGACTTGATAACATTAACAGAA
GAACTAAGAAAACAAGGGCATCTTAATGATATTGGAGGAATCAGTTATATTACAAGTCTTTCTACTATAG
TACCGACGACTTCAAATGTAAAATACTATGCTGATATAGTAAAAGAAAAGTCTGTACTTAGAAAGCTTAT
AAAAGCTTCTAATGAAATAATAAATCTAGGATATAGTGGAGCAACTAAGATTGAAGATGTTTTAGAACAA
GCTGAAAAGAGTATATTTGATATATCACAGGAGAAAACTAGTGATGATTTTAAATCTATAAACTTAGTTT
TGATGGATGCCTATGATATGATAGAAAAATTATATACTAACAAGAGTGATGTCACTGGTATAACTACTGG
TTTTAAAGATTTAAACAAAAAAATAAATGGTCTTCAAAGGACTGATTTAATATTAATTGCAGCTAGACCA
GCAATGGGTAAAACTGCCTTTTCTTTAAACTTGGTTCAAAATGCAGCCTTAAAAGGTGATGCCTCTGTAG
CTGTATTTAGCTTAGAGATGTCTAAGGAACAATTAGTACAACGTATGTTATCTTCACAATCTAGTGTAGA
ATTAAAAAAAATAAAGACTGGAACACTTAATGATAATGATTGGCCTAGAATTATAGATGCTATGGCAGTA
TTATCAGATGCCAAAATACACATAGATGATACTCCTGGTATAAAAATATCAGAACTAAGGTCAAAGTGTA
GAAAGTTAAAAATAGAAAAAGGACTAGATTTAGTGCTTATTGATTATCTTCAACTTATGGAAGGTGAAGG
TAATAATGAAAGCAGACAACAAGAGATATCTAAGATATCAAGGTCACTAAAAATATTAGCAAAAGAATTA
AACTGTCCTGTAGTTGCACTATCTCAGTTATCACGTGCACCAGAACAAAGAGCAGACCATAGACCTATGT
TATCTGATTTAAGAGAGTCTGGAGCAATAGAACAGGATGCAGATATAGTTATGTTCTTATACAGGGACGA
ATATTATCATGCTGATTCTGAGAGTAAAAATATAGGAGAAGTAATAATAGCAAAAAATAGACACGGTGAA
ACTGGTTCTGTGGAACTTGTTTGGCTTGGTGAAGTTCAAAGATTTGGGGATAAGTTGAGAGACCTATAA
>ref|NC_013316.1|:c4170956-4170507 50S ribosomal protein L9 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAGTTATATTATTAAAAGACGTAAAAGGAACTGGTAAAAAGGGAGAAATGAAAGAAGTAAGTGATG
GATATGCAAGAAATTTCTTATTTCCTAAAAAGATGGCTGTGCAAGCAGATAGTGTAGCAATAAAAGAATT
AAATGAAAAGAATAAATCTAAAGAAATAAAAGCACAAAAAGAGTATGAAGAAGCAGTTTTATTAGGTAAG
CAAATGGAAGAAATTAATATAGAAATATATTCAAAAGCAGGAGAAGGTGGAAGATTATTTGGTTCAATAA
CTTCTAAAGAAATTGCTGAGCAATTAAAGAAACAAAAAGACATAGACGTAGATAAAAGAAAAATATTATT
AGATGAACCAATAAGATCTTTAGGTTCAACTTTCGTAGAAATAAAAATACATCAAAAAGTAACTACTAAA
ATAAGAGTGGATGTAAAAGAAAAACAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c4172951-4170957 putative RNA/single-stranded DNA exonuclease [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAACAAACAAACCTTTAAATTAAATATGCCAGAAATAAATTTATATATAATTGTTATTGGTATTT
CTAGTATAATTTTGCTTTATTACAACTTGTATGTAGGGTGTTTATTTTTCTGTATTTTTGTATATATGGT
TTTTCACAATTGGAGAACTACTAATATTAGACGTCATGAATGGACAGAGTATATTCAAAATTTATCTTTA
GATATAGATGAAACAACTAAAAAAGCCATAATAAATCTTCCAATACCATTATGTATTTTAGAATTTGATG
GAAATATATCCTGGTATAATGGAAAGTTTTATGATATGATTGGTCAAAAAGATTTACTTGATAAAAATAT
AGAGGATATAGTTAAAAATCTTAATTTAAGAAAAGTATTAAATGAAAATAAAGAGATGTACACAGAAATA
AACTATAAAGAAAAAGAATATACAATAATTTATAATGTTATAAAAAATGATCAAGAAAAAAATCCTAAAT
ATTTGATGATATTATACTGGATAGACAAGACTGAATATTTAAAAGTAAAACAAAATTATGATGATGAAAA
AAATGCAATGATGCTAATACAAGTAGATGGATATGATGAAGTATTAAAAAGTGCAGCAGAAGATAAGAGA
GCTTTAATTAATGTTGAAGTAGAGAAAATACTTTCTGCTTTAGAATTAAATTCAAATGGTGCATTGAGAA
GAACTTCAAAAGACAAATTCTTCTTGGTAATGCATAAAAAAGAGCTAAAAAAATTGGAAGCTGAGAAGTT
TTCTATTTTAGATACAATAAGACATATTGATTATGGAAATAATCTTCCTGTTACTATAAGTATAGGAATT
GGTATAGATGGAGATACATTAAATGAGAACCTAAAACTTGCTACGGGTGCTCTCGATTTAGCACTTGGTA
GAGGTGGTGATCAGGCTGTTGTAAAAACAAAAGATAAATTTGTGTTTTATGGAGGAAAATCTAAAGCTGT
AGAAAAGAAAACCAAAGTAAAATCCAGATTAATAGGTCATGCTTTAAGAGAGGTTATACAACAAAGTGAC
CAAGTTTATATAATGGGGCATAAATATCCTGATATGGATGCTATGGGAGCAGCAGTTGGTGTTTATGATA
TATGTAAATCCTGTAACAAAACTGCAAACATAGTTTTACAATCTGTAAATGAATCTATAGAAATATTTAT
AAATAAAATAAATGAAAATAATTACTATAAAAAGCTGTTTATTGGAAAAGAGGAAGCTATTGACAACTGT
ACTAAAAATACATTAGTTGTAGTAGTTGATACTCATAGACCAAATTATACTGAATGTGAAGAACTGTTAA
AGCTATCAGAGAAGGTAGTAGTTATAGACCATCATAGAAGAGGTGTGGAGTTTATAAATGATGCAGTGCT
TTTATTCCATGAGATATATGTATCCTCAACGTGTGAAATGGTTACAGAGTTAGTTCAGTATATGGATGAA
GATGTAACAATAAATAAACTTACAGCTGAAGGGCTTTTAGCAGGTATAAGTCTAGATACTAAAAACTTTG
CATTCAAAACAGGTGTTAGGACTTTTGAAGCTGCTTCTTACCTTAGAAAAGTTGGAGCAGATACTATAGA
GGTAAAGAAATTCTTCAATTCTGATGTAAAAGATTTCATAATAAAAGCTGAAATAATTCAAAGTACTAAA
ATAATTAATAATAGAATATGTTTAGCATATTCAAGTACTGAGATAGATAGTATAAATGTTATAATAGCTC
AAACTGCTGATGAGTTATTAAATATCAAAGAAGTAGAAGCTTCCTTTGTATTAGGTGAAAAAGATGATAC
TATATTTATAAGTGCGAGGTCTTTAGGGCAAATAAATGTACATGTACTTATGGAAAAATTAGGAGGCGGG
GGACACATAGATATAGCTGGAGCACAGTTAAAAAATGTTTCTCTAAAAGAAGCTTATAAGATGGTAAATA
AAATAATAGAGGAGTATTTGGAGGAGGAAGAATAG
>ref|NC_013316.1|:c4173888-4172962 hypothetical protein CDR20291_3519 [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTATAATAGTTTTAGCTATAATAATCGCTTTAGTAATAGCCTATATTCCAATGCTAGGAATATTTA
GTATGTTAGCAGCTGTTCCATATGTAATTATAGGTGCTATTACTGATAGAAAGTATTCTCTTATATCTAT
TTTGGTTACATTTTGTGTACTGATTCTATTTGCAGACATTTCTTATGCATTAAATATATGTATAATGTAT
TCTTTACCAGGTATAGTAATAGGAAAGATGCTAAAGAGAAGCTTTGAACAAGAGGACAGTAATAAATTCG
AACCGATATATGGTGGAACCATAATATTTGTACTTTCAATGCTTGTATATTTTTTTGTATTAAAGACATT
TTTAAATGTGAATCTATTAGATGAAGTTTCTAAGATGATATCAGAAATTGTAAATATTCAAAAAAATAGT
TTTTCTGCAACTGAACTTAAAGTGTTTGATAAAATGAAGCCAGATGAGATTGTAAGTTATTTTACAAATA
TGCTACCAATGATGTTATTTTTACAAGGGTTGTTATCAGCGTTTGTCACATATTATTTGAGTGTATTTTT
TATAAAAAGGATTACAAAGATGAATATAAGATTTCCTAAATTTGCTGATTTTTATTTACCAGGAAATGCT
ATACTCACAACTTTCTTACTTTATTTATTAGTCTTATTTATTCAAATTATTGGTTCAAAATTATATACAG
AATTAATAATGACTAATTTACAGCTAGTTTTTAATTTAATGTTTGTAATTCAAGGTATAGCAGTTTGCAT
TTATTTCTTAAAGAAATGGATAAGACAGGGACCAAATAAAATTATGTTTTTTTCAGGGATAATTTTATGT
TTATTTGGATTTATGGGAATATCTTTTGTTGGTATGGTAGATAGTATAATTGACTTTAGAAAGGTAAGAA
GCTATAAATCCACTTAG
>ref|NC_013316.1|:c4174246-4173926 hypothetical protein CDR20291_3520 [Clostridium difficile R20291]
GTGAAAATAGATAAAGGTTCTGAGATAACGAGAAACATAAAGATAATAGAATGGATGAAAACAGAAATAT
TAATGAGTGTAAGTGATTTGTTTAATTTATTGTTTAAAGGGGTAAAACCATTAGATGAAGCAATTCAAGA
TACTTTAGCAAATATAATAATGATAACATATCTCTTAGCAAAGAGATTAGGAATTAGTTTTAGAGATGTG
GATTATAAAGTCAAGGAAAAAATAAAAATTGGTATAGATGAGGACCATAGCGTTGAAAGATGGTATGGAG
ATTTATCTAATTTAAAAAAACATATGGATAATAGGGAGTGA
>ref|NC_013316.1|:c4174616-4174389 30S ribosomal protein S18 [Clostridium difficile R20291]
ATGATGAATAAGAAAAGACGTAAGAAAAAAAGAGTTTGTCAATTTTGTGCTGACAAAAACGCTAAAATAG
ATTACAAAAGTACTCAAAGATTACAAAAGTATATAACTGAAAGAGGAAAGATATTACCAAGAAGAATATC
TGGAACTTGTGCTAAGCATCAAAGAGAATTAACAGTTGCTATAAAAAGAGCGAGAAATATAGCACTTTTA
CCATATACATTAGACTAA
>ref|NC_013316.1|:c4175069-4174635 single-strand binding protein [Clostridium difficile R20291]
ATGAATCAAGTTGTATTAGTGGGAAGGTTGACTAGAGACCCTGAATTAAGATACATCCCAGGTACAGGAA
CACCAGTGGCATCCTTTACAATAGCCATTGATAGAGACTATGTAAAAAAAGATGGATCTAAAGAAACTGA
TTTTATACCTGTTGAAGTAATGGGGAAATCTGCTGAATTTTGTGCTAACTACATAACTAAAGGTAGATTA
GTAGCACTTCAAGGATCTATAAGAGTAGACAATTATCAGACACAATCAGGTGAAAAGAGAACTTTTACAA
AAGTAAGTACTAGATCAGTACAAGCTTTGGATAGTAAAAATAAATCGGAAAATTCATATAGAGAGAGTGC
TCCAGCTTTTGAGCCAAGCTTTGAACCTCAAGGTTTAGACCCACAAGGTTTTCAAGCTATAGATGATGAC
GATATACCATTTTAA
>ref|NC_013316.1|:c4175384-4175106 30S ribosomal protein S6 [Clostridium difficile R20291]
GTGAGAAATTATGAATTAGTTTATGTGGTAAAGCCAAATTCTGATGAAGAAGTAAGAGAGGCTATACTAA
ACAAAGTTAAGGAAGTTGTTGCAACTGACGGAGAAATAGTTAAAGTTGATACTTGGGGAACTAAAAAATT
AGCTTATCCAATAGCTAAGTTTACAGAAGGTTTCTATGTATTAGTTAACTTCAAATCAGCAGTAGACGTT
CCTAAAGAGATAGACAGAAACTTAAAGATAAATGAAAACGTAATAAGACACATGATAGTTGTTGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c4176794-4175598 putative amino acid aminotransferase [Clostridium difficile R20291]
ATGGCAGTTAAATATGCAAAAAGAATGCAAGGATTACAAGGATCAGAAATACGTGAGCTTTTAAAACTTA
CTCAACAACCACAAATAATATCTTTTGCTGGTGGAATGCCGGCTCCAGAGTTATTTCCAGTTGAGGAAAT
GAAAAAAGTATCAGTTGCAGTGCTTGAAGAAAATGGAAGATCAGCTATGCAATATACTACAACAGAAGGA
TATGAACCATTAAGAGAAAAAATAGCAGCTAGAATGAATGATAAAAACAAAACTAATGTAAACAAAGATG
ATATATTAGTTACAAGTGGTTCTCAACAAGGTCTAGATTTTGCAGGAAAAGTATTTATTGATGAGGGTGA
TGTAATTTTATGTGAAAGTCCATCTTACATAGGAGCTATAAACGCATTTAAATCTTATCAACCTAAATTC
ATAGATGTTCCAACAGATTCTGATGGAATGATAATGGAAGAATTAGAAAAGATACTAGAAACAACTGATA
GAATAAAAATGATTTACGTAATACCTGACTTCCAAAATCCAACAGGAAGAACTTGGCCACTTGAAAGACG
TAAAAAATTCATGGAAATAGTAAATAAATTTGAAATACCAGTAATAGAAGATAATCCATATGGAGATTTA
AGATTTGAAGGAGAGACTTTACCATCTTTAAAATCAATGGATACAAAAGGATTAGTAATATTCTTAGGAA
CTTTCTCTAAAATATTCTGCCCAGGATACAGATTAGGATGGACTTGTGCTTCTCCAGAAATTTTATCTAA
ATTTAACTTTGCAAAACAAGGTGCAGACTTACAAGCATCAACTATATCTCAAATGGAAGTAAGCAAATTT
ATGGATATGTATGACCTAGATGCACATGTTGACAAAATAAAAGCAGTTTATGTTAAACGTAGAGATGTAA
TGCTTAAGACTATGGAAGAAGAGTTCCCAGAAGGATTAGTATTTACTCATCCAGAAGGTGGATTATTTAC
ATGGGTAGAGCTTCCAAGTAATTTAAATGCTAAAGAATTAATGCCAAAATGTTTAGAGAAGAATGTTGCT
TATGTTGCTGGAGGAGGATTCTTCCCTAATGGTGGTAGAGAAAATACTTTCAGACTTAACTATTCAAATA
TGCCAGAAGAAAAAATAATAGAAGGTATAAAAAATATAGCAGCTGTATTAAAAGAAGCTATGGGTGTAGA
AGCTTAA
>ref|NC_013316.1|:c4177082-4176897 hypothetical protein CDR20291_3525 [Clostridium difficile R20291]
ATGCCAATGGATTTAAAAATAGGTGATATTGTTGAATTAAAAAAGCAACATGCATGTGGGTGTAAAGAGT
TTGAAATCATAAGAACGGGAATGGATATAAAGATAAAATGTACTAAATGTTCAAGGCTAATAATGCTTGA
TAGAGAGACCTTAGAAAAGAGAGTAAAAAAGCTAATAAAAAAGTGA
>ref|NC_013316.1|:c4177360-4177097 hypothetical protein CDR20291_3526 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATCAAATGTATATAGTGTCATTTAATTCGACACATCATGCGATAAGATCAGAAAAGTTATTTGGTG
AAAATAGTCTAAAAGTAATGGCTCTTCCAACACCAAGAGAAATAACAGCAAGTTGTGGAATATCAATTAA
ATTTTCTTTTGAAGATATGGAAAAGATAAAAACTATTTTGGTTGAAAATAATGTAGATATAAAAGGAATT
TATTGTATAAGTAAATTAGAAAATGGTTCAAAAGAAGTAGAGAAGTTAGATTAG
>ref|NC_013316.1|:c4178065-4177433 hypothetical protein CDR20291_3527 [Clostridium difficile R20291]
ATGAATATTTTTAAGGAGATGAATCAGACAATGAGTATAAAAATAGATGCGAGAGGGCTTGCTTGTCCTA
AACCAGTTATAAATACAAAAAGAGAATTGGATAACCTAGAAGAAGGTGTTGTAGTTACAATAGTTGATAA
TGAAACAGCTAAGGAGAATATATTAAAACTTGCTAAATCTTTAAGTTGTGAAGCAAATATTGTTGACGAA
AAAGAGAATTTTATATCTATAGAAATTAGAAAAGGTAAAAATATACTAGATAAACAAAATGTTGTAGATA
ATAAAGAAAGTGAATTAGACAATACATGTATATTTATATCTTCAGATAAGATGGGACTTGGAAATGACGA
ATTAGGAAAAGTGTTAATAAAAGGATTTATATATACATTAACAGAATCTAAACCTTATCCTAAGTATGTA
CTTTTAGTTAATGGAGGAGTAAAATTAAGTGCTGAAAATGAAGAAACCATAGAAAATCTAAAAATACTTG
AGAATATGGGTGTAGAAGTTTTATCTTGTGGTACTTGTTTAGATTATTATAATTTAAAAGACAAATTACA
AGTAGGTACAGTTACAAATATGTATACTATAGTTGAGACATTAAAGAATGCATCAAATACCATTTCTATA
TAA
>ref|NC_013316.1|:c4179456-4178140 putative transcriptional regulator [Clostridium difficile R20291]
ATGTCTTCAAAAGGTGGGAATAGTATGGAAATTTTGAGCTTAGGAGAAAAGATTAAAAAATTAAGAAAAG
AAAAAAACATGACATTAAAAGAATTAGCTGGAGATAGGATAACAGCAGCACAAATAAGCCATATAGAGAG
GGATAAATCTCATACTAGTTATGAACTGTTGGAATATCTAGGCGATAAGCTAGATGTAAGTGTAGAATAC
TTATTAGAGACCAAGGAAATGCAATCAAAAAAGATAACTGATAATTTAATACTACAGAGCGAAATTTATA
TAAAAGAAAATGAATTAAACAAGGCTGAGGATCAAATAAAAGAAGTTTTAGATATATGTAAGAGATACGA
TTTAATGGAGAACTATGGCAGATGTAATTTTTTAATGGCTAATATTAATTTGAAAAAATCTAATTATAAT
GATGCTATAGAAAACTTTGAAAAGGCATTGTACTTCTTTATAAAAAATAGTGATAGTGAAAATATACTTA
AGTGTTATTTAAACATAGGGAAAATATATATGCAGGAAGACTTTTATAAAGGTGCTATAAGCCACTTTAA
TTTTGCAGAGGAAATTTTGTCAGAGAATAAATTTGAGGATGTTAACATACACAAGGAACTATATAGTAAG
ATGGCATATTGTTACATAAAACTAGATAATCCAAATATGTCATTGAAGTACATAGAAAAGATAAATGAAA
TAGATAATAGAAATGATAGAAAAGAAGATGTCGATATTTTGGTGTTAAAAGCAAATAATATGCTTGAGAT
TGGAAAATATGAAGAATCAAGAGATTACTTTAAAAAAGCACTAAAAATACTTGAGAGTGAGGATAATAAA
ACTGGATTAGCAAATGTGTATTTAACAATTTGTGATGTTTACAGAAAAATAGGTGAAACAGATAGAGTAC
TTGAATATTCACAAAAGGTATATGACATAAAGAAAAATGATGAAGATGAATACATGATGTCAGGATTATT
TAAGATAATAGAAGCATATATAGATAAAGAAGATTATGATTTAGCTAGAAAATATTGTAAGATAGCCTTA
GCTTCATCAATAAAAAATAAAAATAAATTCAATGAATATAAAGCATTGAGATTCTATGCTAATATGTATA
AAAATCAGAATGAAGTAACTCTTGCAATTGAATATCTGATTAAATGCATAAAAATAGTATCAGATTTAGG
CAACAATAGAATATTGGCCAATTTATATATAGACTTAGGTCAATTATATTCAAATATATCAAAAGAAAAA
GAGTTAGAATATTATCAAAAAGGTGTATTTATGTACAAAAATTTAGAAATAATGTAG
>ref|NC_013316.1|:4179692-4180267 hypothetical protein CDR20291_3529 [Clostridium difficile R20291]
ATGAAAAATAAGAAAATAATGTTAGTGTTAAGTATATTATCTATATCTATATTCGCAGTTGGTTGTACTA
ATGCTCAAAATGGAAGTGATACATCTAAAAAAGAAACTAAGAGCAATACAAATGTTGAACAACCAAAAGA
AGAAAACAATACTGAAAAAGAGGTTCCTAATAACAAAGCTAAACCTACTCCAAAAGAAGAAACTAAAACT
CAATCAGCTACTATTTACTCTTTTGATGTAGATAAGACAGATTTAATTGAAAATAAAGTTGATTTAAATA
AAATTGATGAGAACACTTTATTTGAAGAACTTCAAAAACTTAAAGTTGTTCCAGAATCTGCAAAATTAAA
TTCATTTACTACAAAAGACATTGATGGTGTAAAAACTGGTATATTAGATGTTAGCTCTGACTTTACAAAG
TCAAACTTAGGTAGTGATGCAGAAACTTTAATGCTTGATTCAGTTGCTCGTACTTACATAAAAAATATGA
ATGTTGAACAAATAAAAATTACTGTTGATGGTTCTAATTACGAAAGTGGTCATATAGTTCTTGAAGAAGG
AGATTACTTAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c4181543-4180401 putative selenocysteine lyase [Clostridium difficile R20291]
ATGATTTATTTAGATAATGCTGCAACTACATATCCAAAACCAGAAAGAGTGTATAATGCTGTTTTAGATT
GTATGAAAAATTATTGTGCAAATCCAGGTAGAGCAGGCCATAAACTTGCTATGAGAGCTGCTAGGGAGAT
ATATGATACAAGAGAGAATATAGCTAAGTTGTTCAATGTAAGTAATCCTATGAATATAGTATTTACATCT
AATGCAACAGATTCTTTAAATTTAGCGATAAAAGGTGTATTACAAGAAGGAGACCATGTAATAACAACGT
CTATGGAGCATAATTCAGTAATAAGACCTATAAAAGCATTGGAAAAAAGGGGTATTGAAAATACTGTAGT
AAAATGCGATTATGAGGGATTTTTAGATTATGAAGATTTAGAAAAATCAATAAAGAGTAATACTAAACTG
ATTGTAACAACACACGCATCTAATGTATGTGGAACTTTAATAGATATAAAAAAAGTTGGAGAAATAGCTA
AAAAACATAATATACTATTTTTAGTAGATGCATCACAAACAGCAGGTGTTTATGATATAGACGTAAATGA
ATGTAATATAGATATGTTGGCAATGCCAGGTCATAAATGCTTATTTGGGCCTCAAGGAACAGGTATATTA
TATGTAAGAGAAGGGTTGAACTTAAATATATTAAAAGAAGGTGGAACAGGTAGTAAATCAGAAGAAATAG
TTCAACCAGAGTTATTCCCAGATAAGTATGAATCAGGAACTCATAATACTCCAGGTATAGCAGGTCTTAA
CCAAGGTATACTATTTATATTTGAAAGAGGAATCAACAATATAAGACAACATGAAGAAGAATTATGTCAA
TATATGATAGACAAACTAGAGGAAGTATCAGATATAAAGATATATGGACCAAAGGATAGTAAAAAAAGAG
CATCAGTAATCGCTCTAAATATAGGAGATATGGATTCTGGAGAGGTTACTTTCTTATTAGATAGTGATTA
TAATATAGCAACTAGATCAGGAATACATTGTTCACCACTAGCACATACCACTTTAGGTACTTTAAAACAA
GGTGCAGTAAGGTTCAGTATAGGATATTTCAACACAAAAGATGAGATAGATAAAGCAGTGGAAGCTTTGA
AAAAAATTTCAAAAAATAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c4182439-4181576 stage 0 sporulation protein J [Clostridium difficile R20291]
ATGGAGAATAAGTCTAAAAGAAGTAATAGATTAGGTAGAGGTCTTAGTGCATTGATACCAGAAATTAAAG
GAGAAACTTCAGAAAAAGAAATAGTCAACATAGATATAGACAAAATATATCCAAACGAAGTTCAACCTAG
AAAGCAATTTGATGAAGAAAAGATAAAAGTATTGTCGGACTCTATAAAAAATTATGGTGTTTTACAGCCA
ATAGTGGTTAAAATGGATGAAAATAATAAATATATGATAATAGCTGGAGAAAGAAGATTTAGAGCATCAA
AACTTGCAAATAAAAATCAAATACCTGCTATAATTAAAGATATAGATATGAAAGATATAATGGAGATAGC
CTTAATTGAAAACTTACAGAGGGAAGATTTAAATTCAATAGAAGAGGCTCTAGCATATAAGAGTTTAATA
GAGCATTACAATGTAACTCAGGAAGAAATATCAGAAGCTGTTGGGAAGAGTAGACCTCATATAACTAATA
CACTAAGACTTTTAAATCTTGGACAAGATGTTATAGAAATGATAGACAGTGGTAGAATTACAGCAGGCCA
TGGTAAGGCTTTATTGAGAATTGCAGATAAAGATTTGCAACTTCAAATAGCGAAAAAGATAGAAGAAGAA
GAACTTTCTGTAAGAGAAGTCGAAAATATAGCTAAAAAAATATCTGAAAATAAACAAGAAGAACCTAAAA
AATCTAAACCTAAGGATGTATTTATTTTAGATGTTGAAGATAAACTTAGAAATATATTTGGAACAAAGGT
GAATATTTCTAAAGGAAAGAAGAAAGGTAAAATAGAGATAGAATACTATAATGATGATGATTTAAATAGT
ATTGTATCAATGCTTCTTGAATAG
>ref|NC_013316.1|:c4183295-4182441 sporulation initiation inhibitor [Clostridium difficile R20291]
TTGATTTATAGACATTATTTATACTTAAAAAACACCTATTCAACATTTAAAATTAATTTAATTCTTAAAG
GGGGGAACATCATGGGCAAAGTTATAGCTGTATTCAATCAAAAGGGTGGAGTCGGGAAAACTACAACAAA
TGTAAATTTAAGTGCTAGCTTAGGAACTTTGGGAAAGAAAATATTAGTATTAGATTTAGACCCACAAGGA
AATACAACTAGTGGATATGGTATTAATAAAAACGAAGTAGAAAATACAATCTATGAAATTATGTTAGATG
GGTTACATATTAAAGAAGCAATAATAAGTACTGAATTTGAGAATGTAGATGTAGTTCCATCAGCTACTGA
ACTATCAGGTGCAGAGATAGAGCTTACATCTAAAACTAATAGAGAGTATATTTTAAAAAATTCCATAAAA
GCGGTAATAGATGAATATGATTATATATTTTTAGATTGTCCACCCTCACTGGGGATGCTTACAATAAATT
GTTTAACTGCTGTAGATAGTGTTTTAATTCCAATACAATGTGAATATTATGCTTTAGAAGGTGTTAGTCA
ATTAATGGAGACTATAAAATTAGTAAAATCAAGATTAAATGCTGATATAGAAATTCAAGGTGTTGTTTTA
AGTATGTTTGATGGAAGAGCTAATTTATCAATACAAGTAGTTGAAGAAGTTAAGAAATACTTTAAAGGTA
GTGTATATACAACTTTAATTCCAAGAAATGTAAGACTTGCAGAAGCTCCAAGTCATGGAAAACCTGTAAT
TTATTATGATAAAAGATGTAGAGGGTCTGTAGCTTATTTGGAGCTAGCAGAAGAATTTATAGATTTAGAA
GAGGAGGAATGGTAG
>ref|NC_013316.1|:c4184134-4183349 putative stage 0 sporulation protein [Clostridium difficile R20291]
ATGGAAGATAAAAGAGTTATGGAGATACCTATAGAAGATGTAGTTCCAAATCCATATCAACCAAGAAAAA
TATTTTCACAAGTTTCATTGGAGGAATTGAGCAATTCTATAAAGGTATATGGTATAATTCAACCTATAAC
AGTTAGAGCAAAAGATGGCAAATATGAACTAATTGCAGGAGAAAGAAGATTAAGAGCAGCTAAATTAGCA
GAGCTTAAAACCATACCAGCAATTATAAATAATATGAATGATGAATCTTCTGCTGTTCTAGCGTTATTAG
AAAATTTGCAACGAGAAGACTTAAATTTCATTGAAGAAGCAATTGGTTATGAAAACTTAATAAAAGAACA
TGCTTTTACTCAACAGCAATTAGCAGAAAAATTGGGCAAAAATCAATCTACTGTAGCAAATAAGCTTAGA
ATATTAAAGCTTCCAAACGATATAAAAATGAAGCTAATAGAGAATAATTTAACAGAAAGACATGCTAGAG
CATTTCTTAAACTACCAAGTGAAGATTTAATGCAAAGTGTGTTAGACAAAGTCATAAAAAATGAATTGAC
TGTTAAAAAAACAGAAAAATTGATACAAGATGTATTAGAAGAAACTAAAGTTCAAGAAGAGCCTGATAAA
AAACAGAATATAAAGGGTGCTATGAGTATAAGAATTTACATAAATACTATAAAGCAGGCCTTTGATGCTA
TATCAAATACAGGAATTGATGCTAAGTATAATGAAATAGATAAGGGAGATTATATGGAAGTTGTTGTGAA
AATCCCTAAAAAATAG
>ref|NC_013316.1|:c4185037-4184309 methyltransferase (putative glucose inhibited division protein B) [Clostridium difficile R20291]
GTGGCAAAGGTGAATAATATAGAACTTCTGAAAAACGGGATTGAAGGTTTTAATATAGATACGAATGACA
GTATGTTAGAAAAATTTAAAATCTATAGAGAGATATTAGTTGAATGGAATAAAAAGATGAATCTTACTGG
AATAGAAGATGAAAAAGAAGTGTATATAAAACATTTTTTAGACTCTATTTCAGCTGTAAAGAATGGATAT
ATAAAAAATGGGATGTCTATAATAGATGTTGGTACAGGTGCTGGTTTTCCTGGAATACCATTGAAAATAT
GTTTAGATAGCTTAGAACTTACTTTGTTAGATTCGTTAAATAAAAGAATAAACTTTTTAGAGGAAGTTAG
TAGAGTACTAGAGTTAGATAATATTACATTTATACATGGAAGAGCTGAAGATTTTGGTAAAAATGAAGAC
TATAGAGAAAAATATGATGTTGCTACGGCAAGAGCTGTTGCTGGATTACCGATTCTTATGGAATTTTGTG
TACCATTTGTAAAAGTTGGAGGGTATTTTATTTGCTTAAAAGGTCCGAATGCTAATTTAGAGCTAGAAGA
ATCACAAAAGGCTATTGATGTTTTAGGATTGGAGTATATTGAAAAAATAGATGTAGAGTTACCAGAGGTA
GATTTAAATCATAATATATTAGTTTTTAAAAAGGTGATGGAAACACCAGTTAAGTACCCTAGAAAAGCTG
GTAGACCAGCTAAAAATCCTATTAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c4186916-4185021 glucose inhibited division protein A [Clostridium difficile R20291]
ATGATAAAGTTTGAAGCAGGAAAATATGATGTTATAGTAGTCGGAGCAGGACATGCTGGATGTGAAGCTG
CTTTGGCTACTGCAAGAATGGGATATAAAACTTTGATAATAACAATGTCTTTGGATTCCATAGCATTAAT
GCCTTGTAATCCATCAATTGGAGGGACTGGTAAAGGTCAATTAGTTAAAGAAATAGATGCCTTAGGTGGT
CAGATGGGATTAAATATAGACAAGACATATATACAAAGTAGAATGTTAAATACTGCCAAAGGTCCAGCGG
TACACTCTTTAAGAGCACAAGCAGATAAATTTAAATATCATGAAGAAATGAAAAAGACATTAGAAGATGA
ACCAAATCTTGATATAGCTATGGATGAAGTTGTAGAAATACTTCATGAAGGAAATGTTGTAATAGGAGTT
GGAACTAAACTAGGATGTTCATTTAAATCTAAAGCTGTAATATTGGCCACTGGAGTTTATCTGAACTCAA
AGATATATATGGGTGAAGTTGCATTTTATGAAGGTCCTAATGCATTGGGGTATGCAAAATATCTTACAGA
TAGCTTAGTTGAGCTTGGTCTTAGAATGAGAAGATTTAAGACGGGAACTCCAGCAAGAGTTCATAGAGAT
AGTATAGACTTCTCTGTAATGTCTTTACAAGAGGGCGATGAAAAAGTAACTCCATTCTCATTTATGAATG
AAAATATAGAAAAAAAACAAGAACCTTGTTATTTAACAAGAACTACAGAAGAAACTCAAAAAGTTATACT
GGATAATTTAAAAAGGTCTGCTATGTATAGTGGAGTAATAGAAAGTACTGGTCCAAGATACTGTCCTTCT
ATAGAAGATAAAGTAGTAAGATTTAGTGATAAAACCTCACATCAATTATTTATAGAACCAGAAGGGTTAA
ATACTAAAGAAATGTATATACAAGGAATTTCAACTAGTTTACCTTTTGAAGTTCAATTAGATATGTACAA
AACTATAAAGGGACTTGAAAATTGTAAGATAATGAGACCTGCATATGCTATTGAATATGATTGTGTTGAC
CCAACTCAACTAAAAATAAGTTTGGAAATAAAGGGTGTCGAGAACTTATTTAGTGCAGGGCAATTTAATG
GAACTTCTGGATATGAGGAAGCAGCAGCTCAAGGGCTTATGGCTGGTATAAATGCAGTTAGAAAGATAGA
AGGAAAAGAGCCGTTTGTATTAGACCGTTCAGAAGCTTATATAGGTGTCTTATTAGATGACCTTGTTACT
AAAGGAACTAACGAGCCTTACAGAATGATGACATCAAGAGCAGAATATCGACTATATTTAAGACAAGATA
ATGCAGATATGAGATTAACTCAAAAAGGTTATGATATAGGATTAGTTAAAAAAGATAGATATGAAAGGTT
CCTAAATAAAAAGGCTGCTGTAGATAAAGAATTTGAAAGATTAAAAAATGAAAGAGTTACACCAAAAGAA
GTAAATAGTTTGTTAGAAGAAAAAGGAGCAACACCAATAAAGGTTGGAATATCTCTATATGAATTTTTAA
AGAGACCAGAGGTTACTTACGAATTGCTTGAAGAATTAGGGAAGGGCGCTGGAGAAGATGTTTCAAGAGA
AGTTAAAGAACAGTGTGTAATAATAACTAAATATGAAGGTTATATAGAGAAACAATTGAAACAAATAGAC
CAATTTAAAAAACTTGAGAATAAAAAGCTGGATGAGAAAATAAATTATTCATCTATAGAAGGTCTTAGAT
TAGAGGCTAGACAGAAATTAGATGATATAAAACCTATTTCAATAGGGCAAGCATCTCGTATATCGGGTGT
TTCTCCAGCTGATATATCAGTTTTACTTATATACCTAGAACAAGTCAGAAGAACTAGAGGTGGCAAAGGT
GAATAA
>ref|NC_013316.1|:c4188399-4187011 putative tRNA modification GTPase [Clostridium difficile R20291]
GTGATAAATTTGTTTATAGATGATACAATTGCAGCAATAGCTACAGCACCTGGAGAAGGTGGTATAGGTA
TACTTAGAATAAGTGGAGAAAGAGCTTTGAAGGTTGCAGAAGAAATCTTTAAATCTATGTCGGGAAAGAG
TATTGAAGAATACAATAAGAGAACATTAATATATGGAAATATATTGGATAATGAAAATATAATTGATGAA
GTTTTATTGGCATATATGAAAGGACCAAACTCCTATACAGGAGAAGATGTTATAGAAATTAATTGTCATG
GTGGATTTATTTCGGTAAAGAAGATATTAGAATTAATACTATCAAAAGATGTTAGATTAGCAGAGGCTGG
TGAGTTTACTAAAAGAGCATTCTTAAATGGAAGAATAGATTTATCTCAAGCAGAGGCTGTAATTGATGTT
ATAAAAGCCAAAACTGATATAGCTCATGAAGTTGCTCAAAATCAATTAGAGGGTTCTTTATCAAAGAAGA
TAAGAGAATTGAGAGATAAAGTCACTGAGATATTAGCTCATGTAGAAGTTGCTATAGATTATCCTGAGGA
AGATATTGAGCATATAACATATCAAACTCTTAAAGAAAAAACTGATGAACTTAAAAAAGAGATTAAAAAA
TTATATGATACAGCTGAAAGTGGAAAAATACTTAGAGAAGGCTTAAAGACGGTAATTGTTGGGAAACCAA
ATGTAGGTAAATCTTCACTACTTAATTCTATTTTAGGAGAGAATAGAGCAATAGTTACTGATATACCAGG
AACTACTAGAGATGTTATAGAAGAGTTTGTAAACATAAAAGGTATACCTTTAAAAATTGTTGACACAGCA
GGTATAAGGGATACTGATGATATCGTTGAAAAAATAGGTGTTGAAAAGTCTAAAGAATCATTTACTAGTG
CAGATTTGATAGTAATGGTTTTAGATGCATCTAGAAAGTTGTCAGAGGAAGATATAGAGATATTAGAAAA
ACTTAAGGATAAACAAACAATAGTGCTGTTAAATAAGAATGATTTGAAACAAGAGATTGAAGAAGAAAAA
ATACTTAAATATGTAGAAAATAATAGTATAATAAAAATATCAGCTTTACAACAAGAAGGAATAGAAGAAT
TGCAAGATAAAATAGAGTCTATGGTATATAAAGGTAGTATCAAAAATAATTCTAGTTTAGTAGTAACAAA
TTCAAGACATAAAGATGCACTTAGTAAAGCATATAAATCTGCAACAGATGCTTTAATTGCTTTGGAACAA
AGTATGCCATTTGACTTTGTAGAAGTCGATTTAAAAAATATATGGGACTATCTTGGATATATTAATGGTG
ATACAGTAACAGAGGATTTACTAGATAATATATTCCATAATTTCTGTATTGGTAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c4189062-4188502 SpoIIIJ-associated protein [Clostridium difficile R20291]
TTGAATTTAAAAGCAGAGGATATAGAAGTAGAAATACTTGAAAATCCAAGTAAAGGGTTTTTAGGTTTTA
TAGGTGCTAAAGATGGTACTTATGAAATTTTTGTTATCGAGAGGGAAGTAGATGTAGCTAAAAATTTTAT
AGAGGTAATGTTGAAAAATGCAAATGTTGATGCCAAAGTCAATGTATCTCAAAAAGATAATTTAATCATG
GTTGATATTGAAGGCAAAGAAGCTGCAAGTTTAATTGGTAGAAGAGGGGAAACTTTAGATTCTATTCAAT
TTTTGACTGGATTAGCTCTTAATAAAATAAATAAAGATTCTCATACAAGAGTACTTGTAGATATAGAAAA
TTATAGATCAAAACGAGAAGAATCTTTAATAAGATATGCTAATAAAGTTGCTAGAGAAGTAGCGAAAACA
AGAAAAACTAAAAAATTAGATTATATGAATCCATATGAGAGAAGAATAATACATTCAGCTCTTCAAAATG
ACAAATATGTAATTACATATAGTGAAGGAACCGATCCATATAGAAGATTAGTAATTGAGTGTAAAAGATA
A
>ref|NC_013316.1|:c4189807-4189100 putative sporulation membrane protein [Clostridium difficile R20291]
TTGAATATAATAGGAAATTTCTTAGGATTGATTCTTAAGGTAATATTTGAATTTGTTAATCATTATGGTA
TTTCTATAATACTTTTTACGATACTTGTAAAGATTATTTTATTACCATTAACAATTAAGCAGACTAAGTC
AACAAAGGCAATGCAAGATATACAACCTCGTATAAAAGAGATACAAGAAAAATATAAAAATAAGCCAGAA
AAACAAAATGAAGAAATTGTTAAGTTATATGGAGAAGCTAAAATTAATCCACTATCTGGTTGTTTACCTT
TATTAATACAGTTTCCTATATTAATAGGATTATTTAGCGTTTTGAGAGAACCAGTTGCTCATGGCGTTTT
TGCAAACAAAGCTGCATTTTTAGCAGCTGACAATGGGTTTTTATGGATAAAAAGCTTAACATCACCAGAT
TATGTATTAGCAGTATTTTCAGGAGCAAGTGCATATGTCATGCAAAAAGTAATGACACCCAAAGATCAGT
TACAAGGCTCTATGAAAGTAATGACATATGTAATGGCAGGTATGTCTTTCTATTGGGGATTTATATTCCC
AGCAGGACTTACATTGTACTGGACAGTAAGTAACTTATTCTCAATAGCTCAATATTACTTAATAATGAAT
CCTTTAAAAGCTAAACTGGCTGCTAACTCTAAGGAGGAAAAAGTTAATGAGAAAAAGCCTAAAATTAATA
AAAAGTAA
>ref|NC_013316.1|:c4190024-4189839 hypothetical protein CDR20291_3539 [Clostridium difficile R20291]
GTGAGATTTTATCAAAAGTATATATCTCCCTTAAAGGGACCTACCTGTAGATTTTATCCAACTTGCTCAC
AATATTCAATAGAGGCGTTTAAAAAATATGGATTTGTAAAAGGTATGTATTTAACGATAAGAAGACTTTT
AAAATGTCATCCTTTTCATCCAGGAGGTTACGACCCTCTAAAATAA
>ref|NC_013316.1|:c4190466-4190122 ribonuclease P protein component [Clostridium difficile R20291]
ATGGACTTTAATAGGACTAAAGGGTTGAAAAAAGACTCTGATTTTAGAAAAGTATATAAACACGGCAAAT
CTTTTGCAAACAAATATTTAGTAATATATATACTTAAAAATAAATCAGATTATAGTAGAGTAGGTATTTC
TGTTTCAAAAAAAGTAGGAAAAGCTATTACTAGGAATAGAGTAAGAAGATTAATAAAAGAAGCCTACAGA
TTAAATATTGATGAAAAAATTAAGCCTGGATATGATATAGTATTTATAGCAAGGGTATCTAGTAAGGATG
CTACTTTTAAAGACATAGACAAGTCTATAAAAAATTTAGTTAAAAGAACGGATATTTCTATTTAA
>ref|NC_013316.1|:c4190681-4190544 50S ribosomal protein L34 [Clostridium difficile R20291]
ATGAGTAAAAGAACTTATCAACCAAAAAAGAGACAAAGAAGTAAAGAACATGGTTTCAGAAAAAGAATGA
AGACGTCTAACGGAAGAAACGTGTTAAAGAGAAGAAGAGCTAAAGGAAGAAATAGATTAACTCATTAA