>ref|NC_003361.3|:57-1052 delta-aminolevulinic acid dehydratase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGCTCATTAGCCCTGCTTCGACGTCCTCGAAGGAATAGAAAAACCGCAGCTATCCGAGATTTGGTGG
CTGAAACAGCTTTATTACCCCAAGATTTTATCTGCCCATTTTTCGTTAAGGAAGGGAAGAATATTTGCGA
GGAAATAGAAAGTCTTCCGGGCGTCTATAGGTGGAGTATAGACCTTCTTTTAAAAGAGATTGAAAGGTTG
TGTTCTTTAGGATTGAAAGCTGTGATTCTTTTTCCTGTGATTCCTTCAGATCTTAAGGATGCTTATGGTT
CGTATTCTTCCAACCCTAAAAACATCCTTTGTAAGAGTATCTATGAGGTGAAAAAAGCTTTTCCTGATTT
GTGTGTGATTAGTGATATTGCTTTAGATCCTTACACCACTCACGGTCATGATGGTATTATGGATCAGGGT
GAAGTGTTAAATGATGAAAGTGTCCGTATATTTGGAAATATAGCGACATTGCATGCTGAGATGGGAGCTG
ATATTGTGGCTCCTAGTGATATGATGGATGGTAGAGTTGCTCATATTCGCGCAAAACTCGATCAATCCGG
ATGGACGAACACATTAATTCTTTCTTATAGTGTTAAGTATGCTTCTTCTCTCTATAATCCTTTTAGAGAT
GCTTTAGGATCACATTTACAATCCGGAGATAAACGAAATTATCAGATGAATCCAAAGAATGTTTTAGAAG
CTTTGTTAGAATGTTCTTTAGATGAGCAGGAAGGCGCAGATATGCTGATGATAAAACCTGCAGGATTGTA
TCTCGATGTTTTACATCGAGTAAGAAATTCTACAACTTTGCCTTTAGCAGCATATCAAGTTAGTGGTGAA
TATGCCCTAATTGCAGCGGCTGATAAGATGGGATGGTTAAACAAGGAAGCGATGTTTTATGAATCTTTAA
TAGCCATAAAACGAGCAGGAGCTGATATGATTATTTCCTATGCAACTCCATTAATTTTAGAGATGCTAGT
TTCTTCGAAATTCTAG
>ref|NC_003361.3|:c2480-1068 Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAATTGCGATTACTCGGGGTTTAGATCTATCTTTGCAAGGGTCTCCCAAAGAGTCTGGGTTTTTAA
AAAGAATAGATCCCGCTCTAGTTTCTGTAGACCTGCGCCCTTATTCTGCCTTAGCTTTAAAGCTTAAGGT
GGAGCAGGATGATGTTATCTCTTCCGGATCACCTATCGCGGAGTACAAAAACTTTCCAGGCGTTTTTATC
ACTAGTCCAGTTTCTGGAATCGTAAAGGAAATACGTAGAGGAGAAAAACGTTCTCTTTTGGACGTTGTGA
TCAAAAAAACTCCGGGACAAAATCTAACAGAATACTCTTACGACTTATCTAAATTATCACGAGCAGAGCT
GTTAGAGATCTTTAAGAAAGAAGGGCTTTTTGCTTTATTTAAGCAACGTCCTTTTGATATTCCCGCGCTT
CCAACTCAAACTCCTAGAGATGTTTTTATCAACCTTGCTGATAATCGTCCCTTTACTCCCTCTACAGAAA
AACAACTTGCTGTCTTTTCTTCGCGAGAAGAAGGATTTTACGTTTTTAACGTGGGTGTTCGTGCAGTAGC
GAAACTTTTCGGTTTATGTCCTCACATCGTTTCTACCGATAGACTCGCTCTTCCTGAAAAAGATTTAAAA
TCTATAGCGCATTTGCACAAGATTACAGGTCCTTATCCTTCAGGATCACCCTCTACACATATTCACTATA
TAGCACCTATTACCAACGAAAAAGACATAGTCTTTACGCTATCCTTCCAAGAAGTCCTGACCATAGGACA
CTTATTCTTAAAAGGAAGAATTCTAAATGAACAAGTTGTCGCTCTTGCAGGATCAGGTTTAAAATCATCT
TTAAGACGTTACGTTATCACCACCAAAGGTGCGAATTTTGAAAGTTTACTTCCTTTGCAAGATATCTCCT
CAGACGTATCTTTAATCTCCGGTGATCCTTTAACAGGAAGACTTTGCGATAGAGAAAGCCTTCCTTGTCT
TGGCATGAGAGATTCCACGATTTCCGTTCTCCCTAATCCTAAAACACGGCAAGCTTTCAATTTCTTAAGA
TTAGGAATTAACAAACCAACCCATACAAGAACCTACCTTTCTGGATTCTTAAAAAGAAAACACACTTATA
TGGATCCAGATACCAATCTCCACGGTGAAACCCGACCCATCATAGATACAGAAATTTATGATAAGGTTAT
GCCTCTAAAAATCCCCGTGGTCCCCCTAATCAAAGCTGTCATTACAAAAGATTTTGAATTAGCCTGTATG
TTGGGATTTTTAGAGGTTTGTCCTGAAGACTTTGCTCTTCCAACCTTCATAGATCCTTCAAAAACAGAAA
TGTTAACGATAATCAAAGACGCTCTGAAAGATTATGCGAAAGAAACAGGTATTTTAAATCTAGAATACGA
AGATAAAGAATAA
>ref|NC_003361.3|:c2936-2502 hypothetical protein CCA00003 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATAGTAATTCCGCACAAAAAATAATAGACTCTATAAAACAAATACTTACTCTTTATAATATAGACT
TCGATCCTTCATTTGGTTCTTCCTTATCTTCTGACTCTGAAGTAGATTACGAATATTTGATGGAAAAAAC
CCAAGAAAAAATCCAGGAATTGGATAAGCGTTCTCAAGACATCCTTCAACAAACAGGAATGACTAGAGAA
CAAATGGAAGTGTTTGCTAATAATCCTGATAACTTTTCTCCAGAAGAATGGTTAGCTTTAGAAAATATAC
GTTCTTCGTGTGACGCGTATAAAAAAGAGACTGAAGCTCTAATTAACGAAGTTACTAAGGACTTAGGAGG
AGAAACAAAAACCTCTAGTTCCAATAAGAAAACAAAAACCACTTCATCCAAAAAAAATAAGAAAAAAAAC
TGGATTCCCTTATAA
>ref|NC_003361.3|:3048-5201 fused transcript cleavage factor/uncharacterized domain-containing protein [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGGACTATCTAGAAAAGTTGCAAGTCTTAATAGACGAAGAGCAGCCTTCAAGTTTCTTTAATTTGTGGG
AAGAATATTGTTTTAACGATGTGGTGCGAGGGGCAGAGCTAGTTCAAATCTTAGAAAAAGTAAAGCATTC
ATCTTTAGCGCCTTTGTTTGGTAAAATAGCTGACACAGTTCTCCCTTTATGGGAAATGATTCCTGATGGA
AAAGAAAAAGATCGGGTTCTTCAATTAGTTTTGGATGTTCAAAATACTAATGCTAAACCGTTTTATGACG
CTGCCATCGACTATGTGAATAGAAAATATGCAGGTCGAGAAAATTTTAATGAGGCGTTAAGGGTTGTTGG
CCTGCGTGATGGTCGTGAATTTCAGTATAGTTTGAGTCGTTTTGATTTCCTAATGCATTTAAGCGAGGGG
AATTTTGTTTTCCATTCTGGAGGGTGGGGTGTTGGAGAGGTTATGAGCGTATCCTTTCTTCAACAAAAGG
TTCTCATAGAGTTTGAGGGAGTTATGATGGCTAAAGATATCTCCTTTGAAACCGCGTTTAAGAGTTTAAT
TCCTTTAGAGAAAGATCATTTTTTATCACGAAGATTTGGTGATCCCGATGGTTTCGAGTCTTATGCTAAG
GAACATCCCTCAGAAGTTATAGAAATGCTTCTTAAAGATTTAGGTCCAAAAACTGCTAAAGAAATCAAAG
ATGAACTTGTAGATTTGGTTATTCCTGAAGCTGAATGGAATCGTTGGTGGCAAGCAACAAAGACTAAAAT
TAAAAAAAATATCTGCATAACAACCCCAAAGACGATTAAGGATTATTATAGATATAATCCCGGAGGGGAC
TCTTTAATAACTCAATTAGAAACACGCCTCTCTCAAATCGAAGATACTTCTGCGAAGCTTGTTGAAATTT
ATCAGTTTATTCGTGATTTGCACAGTGAATTAAAGAAACCTGAAAATCGAGAAATTGTAATCAAGGCTTT
ACAAACCCTTTCTGTTGAGGGGAACCAATCTTTAGAAATTCAAAGAGATTTACTACTTTCTGATTTTTTA
GGTGAGAAATCGAGTGTTTTAGATAGTGAATTCTTATCCTCTCTTCCTGAAGAGGAGATAGTCTCTATAG
TGAACAATATTTCTATAGTGGTTTTGCAAAAAGCATTTTTAATGTTGATCAAGAAACATTCTCCAGTTTG
GGAGAATGTTTTTATGAAGATCTTTCTTTCAACCACATCGCCATCTCTTAGAGAGCTTACTTTTAAAGTG
TTTAGAGGTGAGGACTCTTATCGTAAAAAAATCGAGAAAAAACTTCTTGAATGTGCTGAACATCCGATGA
TGTATCCTGAAGTTTTTACTTGGTTTTTCTTAAAACTAGGATCTCACGATGATGGTATTTTTAAACCGAA
TGATAAAAAGATCGAGAGGCTGTTTTTAGAGGCAGCGCTGGTCTTTATGTATCATGTTGCGTCAACACCA
CAGAAAGAATTAGGGAAAAAGATTTACACCTTTCTTGTAAGCCAGCGTTATTTAGCTGTTCGTAATATGA
TAGAGGGGGCGCCTCTGTCTTATTTAAAAGAGATATTACTGCTGTCCACCAAGTGTAGTCAGTTTTCTTC
TAGTGATCTTAGTGTATTACAAAGCCTAGCTGAGGTTGTGCACCCTGATTTGAAGAAAAATACTGTTGTT
GTAGAGGAAGATATTCTTTGGACAACTCCTGAAAGCTTTACCAAAATGAAAAACAAGCTTCAGTCTCTTA
GCGGTAAGGAAATGGTTGATAATGCTAAAGAAATAGAGGATGCAAGAGTTTTAGGAGACCTTAGAGAAAA
TTCTGAGTATAAATTTGCTTTAGAAAAACGTGCGCGTTTACAAGAAGAAATTCGCGTGCTTTCTGAAGAG
GTAAATCGCGCTAGAATATTGACTAAGGATATTGTTTTTACTGATAAGGTTGGTGTTGGTTGTAAGGTTT
CTTTGGAAGATGAAAACGGAAATCTTATTACCTATTCCATTCTTGGTCCTTGGGACGCAGACCCTGATAA
CTATATTCTTTCTTTAAAATCCAAGCTGGCTCAAGAAATGCTTGATAAGAGCGTGGGAGCGGCTGTGCAA
TTTCAAGGAAAGAAATATAAGATAAGCCGAATACAATCTATTTGGGATGAATAA
>ref|NC_003361.3|:5353-6543 aromatic amino acid aminotransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGTTTTTTCAATCAATTACCCACGTTCTCACCTGATTCTATTTTAGGTTTGCAAAAACTATTTTTAG
AAGATGAGCGAGAGGAAAAGGTGAATCTTGTTATAGGTGTCTATGAAGATCCTAGCAAGGCATATGGTGG
TTTTTCTAGCGTCCGTAAGGCGCAATTTCTTTTTTTAGAAGATGAGATGAATAAGGGGTATTTACCCATC
AGTGGCTTATCTTCTTTTAATCAAGAAATGGAAAAGCTGGTTTTTGGTGATGTAAATTCTAGTTTTGTTG
TTGGTGCTCAGGCGCTAGGGGGAACTGGAGCTTTGCATTTAGGGGCTAAGATTTTTTCTATGGCCTATAC
CTCAGGCAAAGTATACATTCCCGAGCAAACTTGGGGAAACCACGTAAGAATATTTGCTCAACAAGGTTTA
GAGGTTCTTAAATACCCTTATTATAGCTCAGAAAGCAAAAGTTTGCTTTTTGATGAGATGCTTTCTGTAT
TGAAAGCCGCTCCAAAAAATTCTTTGGTGCTTTTGCAGTGTTGTTGTCATAATCCTACGGGAATGGATCT
TAATGAAGATATGTGGACACGTCTTGCTGAAGTTATGAAAGAACATCAGCTTCTTCCATTTTTTGATACC
GCTTATTTAGGTTTTGGGCGAGGCATCAAAGAAGATAGGCGTCCTATAGAGATTTTCATAGAAGTTGGTA
ATCCCGTATTTGTAGCAGCATGCGCAAGTAAAAATTTTTCTCTTTATGGAGAGAGGGTAGGCTACTTCGC
AGTTCATAGCAAAATTACTGAGGATTTAGATAAGATTTCTAGCTGTCTCGAAGAGAAAGCCCGTGGAGAA
TATTCTTCACCTCCTAGACATGGAGCTAAAATTGTTTCAACGATTTTATCCGACGCTTCTTTGAAGAAAG
AATGGTTGTCAGAATTAGATACGATTCGTAGTTCTTTAGGGAAAACTCGCGCAAGACTTGTTCAAGCTAT
GCGAAATCACGTCGGTCATTCGTTTGACTTTATCTTGTCTCAGAAGGGATTTTTTGGTTATCCCGGATTT
TCTGTAGAACAGGTGCTCTTTTTAAGATCAGAGAAGGGTATCTATACGACGAGTGGAGCAAGATTTAACT
TAAACGGAATTACTGATAAAAATATCGACCACGTCTCTCAGAGTTTTGCTGAGGCGTATCAGTTGTCTTA
G
>ref|NC_003361.3|:6839-7861 hypothetical protein CCA00006 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCAGGATCTGTTGCTTATCGTCGTCATAGAAAAAACAGGCTCTATGTCTATTTAGTGCTTGCTCTAA
GTGTTATTTTGTGTTGGTCTTTACCAAGACCTTTTTATGAAAATATCCAGAAGCATTTTGTATCTTTGTA
TACGCGTGTTTTTTTCAAACGTAGTGGGGTTCCTTCTATAGATTATACGATTCAAGATGTCGAAAATATC
ATCTTAAAAGACCGCATTGCTATTTTAGAAGAGCGTTTACAGGCTTATGAGATTGCTAATTATACACCGC
CTGTATTTTCTGAAATCTTATCACCATATTTTCGTAAGCTAATTACTAGTCGTGTTATTTACAGAGATCC
TGCTCATTGGGGAAGCTCTTGTTGGATAAATGTAGGAAAAAACCAAAAAATACAAAAAAATTCTCCGGTG
TTGTCGGGGAAGGTTCTTGTTGGTCTTGTAGATTATGTAGGAGAGCAACAATCACGAATACGTTTAATTA
CTGATGTAGGTATGCAACCTTCTGTGATAGCTGTTCGTGGGGGAATACAAGCTTGGTTAGTAAAAGATCA
GATACAGGGTCTTACTAAACACCTTGAACGCCTTTCTGATTCCTATATTCTTGAAAAAGACAAATATGAA
AAAGTTGATCAGTTAGAAGAGCTCAGCTCTTCTATACAGTGTAGTGATGATAACACTTTACTTTTACGAG
GGACGTTGTCGGGGAGTGGCGGTCCTTTGTGGAAAGATGAAACTTTGGTTTTACATGGTGAGGGCTTTTG
TTTCTCTGATGGAAAAGGTCTTCGGGTAGGAGATATTTTAATCACAACAGGATTAGATGGGGTGTTTCCC
CCAGGGCTGTTTGTTGCTGAGATTACTAAAGTTTGTCAGCCTAGGGAAGGCGCGTGTTCTTATAAAATAG
AAGCCAAGTCGTTGGCCGAAGACTTAACAAACCTCTCTTCCGTTTTAATTCTTCCTGCTATGGAGTTTAA
TCCTAATGATAGGCCGGACATTTTCGGGTTATTGTGGGATTAG
>ref|NC_003361.3|:c10958-7821 exodeoxyribonuclease V, beta subunit [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAACCGTTTGATATTTTTAATCCTCAAACATCTATTCGTGGGAAATATTTCTTAGAAGCTTCTGCAG
GCACGGGAAAGACATTTACTATCGAACAAATTGTTCTACGAGCCCTTTTAGAAGGTTCCGTTTCTCATGT
GGAAAACATTCTTGCGGTCACATTTACAAACGCTGCAACCAATGAATTGAAACTCAGAATTCAAGACAAT
CTTAAACAGGCATTATGCCAGATAAAATCAGTCCTTGAAGATCCCTCAAAATCTCTTCCTCCTTACTTAA
AGGACACGTCTAATGTAAAGCTGCTTTACATGCAGGTGCGTAATGCTTTAGCGACTATAGATCGTATGGC
GATCTTTACCATTCATGGCTTTTGCAATTACGTTTTACAGCAGCATTTTCCCAAAATGCAAATGACGCAG
AAAAATGCTGCTCTTACGCACTCACAGGCTGTTTTTCATCATATAAAAAAATATCTGTCTCAAGATCTTT
GGCGCTCTGTTTTATTTCCTGAGCAATTTTATTTACTTGCAGCTAAATATAATTCTAACTCCAAACACAC
AGCCTTTTTAACCGATAAGCTACTCTCTAGTTACACGCTGCAAACTTTTGAGCATTTGCCGCAAACAAGC
ACTACTTTAGACGCACTTCGCTCATGGCACAACTCTATCCGCTCTAAAATACAAGATATTCCAAAAGAAG
ACTTCCTAAGGCAAATACTTCAGCATAAAGATGGTTTTAAAAAACAACCTTTCCCTATAGATGAAGATCT
GCGGCTTTTTGTAGAGTGTTTATACGCTTCAGAAACATCTGTACAGTTATTTTCTTTTTCTAAAATTGCA
GAAACTTTCCATCCTAAAAACCGCTTAACACGCTACAAACCCTCTAAAGCTTTTAGCCATATAGAAGAGA
CTTTGTGGAGTCTCTATACGGAACAATTTTGTAATATAGAGCTGATTTTCAATACCTTACTCCAAGATGT
ACAACTGTATTTAAAAAATCATTACACACAATGGTTATCCCCTGATGAGAGTATCTTAGCTTTAGAAGAA
ATTTTGTTATCTTCAAGGTCTGAAGAAATCATAGAAACTCTAAGAAAACGCTTTCAGTTAGTATTAATTG
ATGAGTTCCAGGATACCGATCGGAAACAATGGAACATCTTTTCAAAGCTATTTGCCAATGATGCTTTTTC
AGGATCCCTATTTTTAATAGGTGATCCGAAACAATCTATTTATGAGTGGCGAAATGCCGATCTCGCGACA
TATCTAAAAGCTAAATCCTCATTTCCAAAATCCTCACAGTTGCATCTCATAAACAACTACCGCTCTACTG
CTCAACTGATGGAAGCGGTTAATATTCTCTTTTGTAAATGTTCACCCTTTCTACAAATTCCTAGTTATGA
ACCCATAGAATATCATCCCCTATGTCCTCAAAGTAGTGAGCATTTTGAGAATTCTCACCACGCTCCTATT
CATTTCTTTTCCTATGATGATATTTCTGATCAAGCTGCGTGGATTTCCCATACGGCTTCTTATTTACAGG
CTACTTACCATATTCCCCTAGGACGCATGGCAATTTTAGTGTCGGATTCTGCTCAAGCTTTCGATCTCAT
TACCCATTGCAGCATCCCTGTAGCATTTTCTAAGAACAAATCGATATTTCATCTTACAGAAACCTATTTG
TTAACCTTAGCGTGGTTAGAAGCTATTCTCCATCCGGAAAATTATGAAAAAATACAAAGGGTATTATTAA
GTAGCCTTTTTAGACATAATCTTAGCGATACTATAGAAAAGAAAGAGCTCTACTCGACCTATTTCTTTTC
ACTTCGCAGTTATGTCTTTGATTATGGGCTTTTAGCAACTTTCTATCATTTTATGACTCTTCAAGGAGAA
GCGTTGCTAAAAACCCCACAAGGAGATCTTTCTTTTCAAGAAATGGAAAGGCTTTGTGCTTATTTAGATA
CCGTTTCTTCTCATCCCCAACATCAATTACTCTATCTACAATACTTTTCTGAAACTGGACGCTGGGAAGA
GAGCCTCTCCTTCTCTTCGTATTCTGAAGATACGGAAATATTAAAAATCACCACGATTCACGCATCTAAA
GGATTAGAATATGATGTTGTTTTTTGCCCAGGGTTAGATAAGTCTAAGAAAAATAAAAGCGCATCAGAAT
GGATACGGGAGATGTATGTCGCTTGTACACGGGCAAAAAAACAACTGTTTATCCCTATACAAAACTCTTC
AAATTCACGATGCAATTCTGCACTAACCAACTATGTAAAACATGTAGGTTCTTACGAATCTATTCTAGAT
TTAGCGCAACAGCTAACCAAAGAACATCCCCGCCTTTTTTCTTTATCAATTACAGAAACTCGTTCTGAAA
CTACCGATCCCGTTTATAAAATTATTCCACCGTCGACCTTTACATTATCCATAGCTCCTGCTAAACAAAT
CTTCTCTTTCTCTTCTGTAAAGCTTGCATTTGATAATGAAGTTTCTTTAGATAATGTTCCTGCGGAACCT
GTAGCTTCTTTTGTTCTTCCTAGAGGAAGGAAAACGGGGATTATCATTCATAAAATCCTAGAAAATATCT
CTCCGAATTTTAAAATTTCTTTTTCTAAAATTGTGTCCATAGTTACGCATTTTGTTAAAAATACGCATTT
AGAAGGCTATGAGGAAATCATTTCTCAAAAGCTTGTAACAACATTCTCTTCTCCCCTATCTTTTGCCACA
GAATCTTTTTCCTTACAGGATATCTGCCCAAGTAAAATAGCCTGCGAAGAGTCTTTCTTATTTTCCAATC
AAGAACAGTTATGGCAAGGGGTTATCGATCTATTTTTCGAGTATAATGATAAGTACTACATTATCGATTG
GAAGACATCATTCTTAGGAGAAACAAGCTTAGAATACTCTAAAGAAAATCTTCTCAACTATATAAAAGAG
CAAAACCTTGATTATCAAGGTGCTATTTATACCCACGCAGCAAAACGATTTCTTCAGCAATTCGACATTG
TTAGCGATGTAGAAATGGGATTTATTTTTATCCGGGGTATGGATCCTGAGGGAAATGGATTCCTATGCCT
ACCAAATCAGAAAATATCTAATCCCACAATAACCCGAAAATGTCCGGCCTATCATTAG
>ref|NC_003361.3|:c14010-10945 exodeoxyribonuclease V, gamma subunit [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAACGCGACCAAACATAGTCAGGCATTTTTTAGCAATTCTCCCACGCATCTATTAGCTAAACTTGCAG
AAGATCTATTTTCTACCTATCAACAGCCCTTTACTAAAAGATGGATTCTTGTTGCCAATACAGAAATAGG
GCACTGGCTGCGTAGAGAACTTACTAATGCTACGAGTAACCACATTTTCATGGGGTCGACCATTTTCTCT
TCTTCTGACTCCCTTGTCAAACATTTATTCTCCGAAGTTTGTCATGAAAAAGCATTAATTCCTGACTATA
TAACACTTCCTCTATTTATACACGAGCTGCTAAATATTACCGATTCTCCCGTTGATGGCAGGCTTAGCAA
ACTTCCTTCAGAACCCTCTTACAGCTCAACAAAAAGCTTGGCAGCTATTTTTAAAAAATTTTATACATTC
TCGCAATCCCCTTCTGAAAATAATCGCTATCATAAAGACCTGTTTTCTCAATTAGATAAACATTTTATGC
CTATAGACAAGGTCTTCTCTTCGATACTCGGTTCTTTAGATTCTGAAAAACAAAATCGTTCTTTGCATGT
CTTTGGCTATTCTCATTTGCCTAAGCATTTTGCAACTTTTTTTACGGAATTAAGTAATTTTTTCCCTGTA
TACTTTTATTGTTTTTCACCAAGTCGAGAATATTTCGGAGATTTACTCTCTGACAAATCTATTGATTTCC
TATGGCGTCAGCTTGCAGATCAACCTAAAAGAGATGCTTGGGAACATTATGTTTTAGCTGATAGGCAAGC
CTTGCTTGCCAATCTCTCTCATAAATCCCAAGCATCTCAAAATTTCTTCTTAGATAAGGAAGTGGACTAC
TGTGAAGCTTTCGTAGCTCCTCAAGAATCAACATCTTTAGGAGTCTTACAAAGTAATTTATTTTACCTAC
GCCCCAATTCAACAGAGAACACTTTAGATAAAGATCAAACAGCAACTATTAGCAACGCTTTAAATCCTTC
TCGGGAAGTTCACGAAGTGTTTTTAAAGATTTCTTCACTATTACATAAAGGCGTGGCTCCTGAAGAAATC
TTTATTCTATCTTCCCAATTGGAAACCTATGAGGTGTATTTAAAAGCCGTATTCCAACCTCATCTACCTC
TATATTTTACGAATAGCACGTCAACACACGCCAAAGAGTTAAAAGAAAAGTTTTTACTTTTATCATCTAT
CATACAAACACAAGGCAATCTATACCGTCTGCTTCAATTGCTTATCCACCCACAGCTACAAAATTCTATA
GAGATAAGTAAAACTCCTCACCTTTTAAAAAGGCTTTCTAGCGAGTGGGAGAAACTTTATAAAGGAGATA
GCACTCATGTACAAAACTTGGGTGATAATATTCTGAACGAATACCCTTTTGTTGAGGAATGTGGGAAGGT
AAGCCAAATAGAACTTTGGGAGCGCATTCTTCCTTTGCTTTATGATTTACAAAATTTTATAAATGCTTAC
TCCACAAGTACTGTTCAAACATATGAACAACACTTTACCCAGAGTATATCTTCCTTAGAATCGATCTTCG
TCCTCTCTTCCGAAGAATTATCTTTGATCTCCTCTCTTAGAAACGCTCTTTTCCCTACGTTCGCATCTTC
AAAATGCTCTTTGGTATTTTTTACTGATTTCTGTCTGGATTTCTTTGACCGTTTCTGTGGCAACAGTCCT
ATTTATGATAAACCTGGTCCTTACGTAGGCTCCTTAGGAGACTTAAGCCTTCTTCCCAAAGGTTATACAT
TTATTCTCGGAGCAAACAAGCGCACACAGACTGTTGATTTTCTAGATCTTGTAGATACAACAACCCAAGA
AGAACTCGTATTTTCTTCTTCTGAAGATGAAGAAAACTTCCATTTCCTTCAGGCCATAGTCTCTACAAAG
CACGAACTCCATGTGAGCTATCAGTCTTCTGCTCATAATCCTGCTTTACCCTGTGCCTATGTGAATTATC
TTCAGGAAGCTTTAAATCTATCTGTCACTCATTTTCCTTCTAAAGCCTATACCCCTTCTTTATTTTCTAA
GGAAACCCTGGTACATACTTCGCAAGAGTATCATCACAAACTCGCACGAGCATTTTGCTCTATAAAAGAG
CCCCTGCCTTCTTTATTTCAACCCTCTAAGAACACCCCGACTCTTCCTTGTCATGTATCTGTATCACAAA
TTATTAAGGCAATCTCCTCTCCCTTAGATTTCTTTTTAAAAGCTAATTATCATGTATCTCTACGATCTCC
TGCAACATTAGAAACTAGAGAAAAGCTTTTCCCAACAAAAAAGCAGGTTCTGCTTTTTTGGGAAAAACAG
CTTTCAAACACGTCAGAGAATATTTCAAATAATTATCTATCTTCATCTTCTAAAGCTATGTTCGCCGCTT
ACGATGAACTTATAGAAAAGTGGCTAGAAAAGGCACGTCAATACCCCTCTACCTCACCCTATACGGTAAT
TTTTTCTTCTCTGTTATTCCACGATTACCTTAACGATCAGGATAAGATTCTCCTTCCTGTTTGCCTGAAT
ATGAACGGTAAAGAGGTGTCTCTGCATGGAAGATTCTCTGGAGTATTCTCTAAAGGCATATATTTATGTT
CTATTGATCCATTAGCTAAAACAAGAAAAACGCTTAAGAAAACTAGAGCTGTTCCAGAAAACTCTTTTGA
AATGCAGAACTATTTGAAAGCTTACATTGCTATAGCAATGTTACAACAATCCAATGCTATTACAAAACAT
GCAATCATAAGAAACATAACCTCTCATGATAACTTCGAGGATCTTTCTCTGCCTTTTTCTAGTCCTGAAA
AATACCTAAATCAGGTATTACAGGTATATCAAATGATGAAAGAGCATCCGATTCCTTTAATTTCTTCTGA
ATGTTGGAAATTTCTAGACAATCCTGAAAAGTTTCATGAAGCGGTTTCTGCTACGATAGAAACAGATGCT
AACAATCCCACCCTATCGCTTTTCTGGAAATTTCATAACCGTGATTATCAAGATCAATTCACGATAAGTG
AAGAGCAACGTTTGTTACTTCTTTCTTTGTTTAAGGATGTGCATGAAACCGTTTGA
>ref|NC_003361.3|:14009-15721 efflux protein, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGATATATCAATACAGAAAAAATCTTTTCGTGCTTTAGTAATAACGCATTTTCTTACGATATTAAATG
ATAATCTCTACAAGTTTCTTTTAGTATTTTTCCTTCTTGAAGGAAAAGGTTTAACAGAGAATGCGAAGAT
ATTATCCTACGTAAGCTTGTTCTTTGCTTTACCGTTTCTATTACTAGCACCTTTAGCAGGAAGTTTATCA
GATAGGTACCAGAAACGAAACATTATCTTAGTCACGCGTTTGATAGAAATTCTCTGCATGTCGTTAGGGC
TATATTTCTTCTACATACAATCTGCCCTTGGAGGGTATGTAGTTTTGATCCTCATGGCAAGTCATACAGC
CGTTTTTGGTCCTGCAAAAATGGGGATTCTCCCCGAGATGTTGCCTTTAGATTACTTATCTAAAGCCAAC
GGGATAATGACTGCCGCGACCTATACAGGGAGTATTTTAGGATCGTGTTTTGCCCCCCTGCTCGTCGATC
TTACCAAAAGTCTCGCAATTAATTGTTATGTGCTTTCAACATCATTTTGTGTTGCCTCCTCAATTATCAG
CACATTCGTTTCTTTAAGAATACGATCTAGTAATATTAAAAACCGTAGTCAAAAAATTACTTACGTAAGC
TTTAAAGATCTTTGGGAGATCTTTAAAGATACGCGTTACGTACACTACTTAACTCTATCGATTTTCCTTG
TTGCTCTCTTCCTATTGGTAGGGGCCTACACACAAGTAGAGATTATTCCTTTTGTAGAATTTACTTTGGG
TTACCCTAAGCACTACGGAGGGTATTTATTCCCTCTTGTAGCTTTAGGGGTTGGGGTCGGATCCTATATT
GCAGGATGGCTTTCAGGGAAAGATATTAAATTAGGTTACGTGCCTATCATGACTTTATGCTTGGGCATTA
CTTTTATGGGCCTTTACGCTTTCTCGTGCTCTTTAGCTGGAGTGATGTTCTTTCTTCTTCTTTTAGGATT
TTTAGGCGGGGTATATCAAGTACCTTTGCATGCGTATATACAATACGCTAGCCCCGAACATAAGCGGGGA
CAAATTCTAGCTGTAAACAACTTTTTGGATTTTGTCGGTGTATTGATTGCGGCAGGAATTGTAAGGGCTT
TAGGTTCAGGCTTAAGTTTGTCACCAGAGACAAGCTTCTTGTATATGGGTGTAATCATTTTCTGTATAGG
CTTATGGATTTTATGGATTTGGAAAGAGCTGGTGTATCGTTTGGTGCTCAGCGCTGTATTACTAAGGCAG
CTAGGAAGCTATCTTAGACTCCCTAAATCGATAGCTCCTGTTTGTTATATGATGCGGGCCTGCTCTTATC
AAGAAGTGCGCCGTGTGTTAGCTATGCTACCAAAAACCATACGCAGCACTGTAGTCATACTAGATCAGAA
ATTGCAACCAGGCTGGACAACCAGGATAATTTCTTATTGCGTGCCTACAGTTATTTCGGATCTTGATGAA
ACCAGCGATCATAGCATGAAAGAAGCTTGGGCTGTTTTACAAGCTAAGCGTTTGCAAGTACTACTGAAAA
AACAACCAGATTTATGCGTGATTTGCTTAGGAAAAGAAGAGAATGTTGAAATATTTTCTAAGGTGTTGCT
AGAGCAGGGAATCGATATTAAGAGTATTTATCTTTCCTGCAAAAAAGTTTCTTACCGGAGAAAAATATAT
GATTTATCCCTGAGCCAAGCAGAAGAGGCTTAG
>ref|NC_003361.3|:c16738-15743 hypothetical protein CCA00010 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAAAGAATTATTACGCTTTAGCTTATTATTATTTGACTCGTGTAGATAATCCTCAACTAGAAATCG
CGTTGCACAAGGAACTATTTAAAGATTTGGATGTTTCTTGTCGTATCTACATATCTGAACAGGGAATTAA
TGGCCAGTTTAGTGGTTATCAACCCGACGCAGAACACTACATGAACTGGCTAAGACAGCGTCCTGGATTT
TCAAATGTAAAATTTAAAATTCATCATATTGAAGAAAATATTTTTCCTCGTGTGACTGTGAAGTATCGTA
AAGAGCTTGTAGCTCTTGGTTGCGACGTAGATCTTACCACCCAAGGCAAACATATTTCTCCAAAAGAATG
GCATGAGAAGCTGAAAGAAAATCGCTGTCTAGTTCTGGACGTAAGGAATAATTACGAATGGAAAATCGGA
CATTTTGAAAATGCTGTTCTCCCAGATATTCAAACTTTCCGTGAATTTCCTGAGTATGCCGAGCGGTTAT
CCAAGGAACACGACCCAGCAACGACTCCTGTGATGATGTATTGTACCGGAGGTATACGCTGTGAGCTGTA
CTCTTCTCTCCTTTTAGAAAAAGGTTTTAAAGAAGTTTATCAGCTTGATGGCGGTGTTATAGCTTATGGT
CAAGCTGTGGGAACGGGTAAGTGGCGAGGAAAGTTATTTGTATTTGACGATCGTTTAGCAGTGCCTATTG
ATGAAACAGACACTGATGTAGCTCCTATTGCCCAATGTTCTCATTGTGGGGTTGGCTGCGATACTTATTA
CAACTGCGCCAATACGGATTGCAACAATTTATTTATCTGTTGTGAAGACTGTATTGATTCAACAAAAGGA
TGTTGTTCTCAAGAGTGCTCTCAAGCACCAAGAATTCGCGCCTTTTCACCATCTAGAGGGAATAAACCTT
TCCGCCGTATGCATCTATGTGAACAAGTAGAATGCGAACAGGTAGAAAAGAAAGCCTCTAGTTGCTGTTG
TTCCTGCTCTCATTAA
>ref|NC_003361.3|:16965-17594 30S ribosomal protein S4 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCTCGATATTGTGGCCCTAAAAATAGAATAGCAAGGCGTTTTGGAGCGAATATTTTTGGAAGAAGCC
GAAACCCTCTGCTCAAAAAGCCCCATCCTCCAGGTCAGCACGGTATGCAGAGAAAGAAAAAGTCTGACTA
CGGCCTTCAGCTTGAGGAAAAGCAAAAATTAAAAGCTTGCTACGGCATGATTTTAGAGAAACAGCTTGTC
AAGGCTTTCAAAGAAGTTATTAATAAGCAGGGCAGCGTCACCAAGATGTTCTTAGAAAGATTTGAATGTC
GTCTGGACAACATGGTTTACCGCATGGGATTTGCTAAGACTATTTTTGCAGCGCAGCAATTGGTTTCTCA
CGGTCACGTATTAGTTAATGGGAAAAAAGTAGATAGAAGATCCTTTTTCCTACGTCCTGGCATGCAGGTT
TCTTTAAAAGAGAAATCTAGAAAATTACAGTCAGTTCAAGAGTCTTTGGAAAATAGAGACGAAGGTTCTT
TGCCATCCTACATTTCTGTAGATAAGGGCAATTTTAAAGGAGAGCTGTTGGTATCTCCAGAACAGGATCA
AATAGAGGCTCAGCTTCCTCTGCCTGTTGATGTTTCTGTTGTATGTGAGTTCTTATCTCACAGAACATAA
>ref|NC_003361.3|:c18528-17659 endonuclease IV [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCAGGTATTTCCGCCTCCCCAAGTTCCTTTATTAGGTGCCCATACATCGACCGCTGGGGGTCTTCACA
ACGCCATTTATGAAGGCCAAGAAATTGGGGCTTCTACTATTCAAATGTTTACTGCGAATCAGAGACAGTG
GCGTAGACGCCCCCTCACTGATTCTCTAATAAATTCTTTTAAAACCGCTCTTAAAGAGACCTCTTTATCC
TATATTATGAGCCATGCCGGCTACTTAATTAATCCTGGCTCCCCCAATCCAGAAATCTTAGAAAAAAGTC
GTATTTGTATACAGCAAGAGATCCAGGATTGCATATCTTTAGGAATAAATTTTGTTAATTTCCATCCTGG
AGCCGCTGTCAACGACACTAAAGAAACCTGCTTAGATAGAATTATTTCAAGTTTTTCTTTAATGGAGCCC
TTATTTGAAAACTCCCCTCCTCTCGTTGTCCTTTTTGAAACTACAGCGGGTCAAGGCACTCTTGTTGGCA
GTAATTTCGAAGAACTTAGTTATCTAATAGACAATCTCAACCACAAAATCCCCGTAGGAGTTTGCATAGA
TACTTGTCATATCTTTGCTGCTGGCTACGATATTACTTCTCCAGAGTCCTGGAAGCGGGTGCTCAAAAAT
TTTGATGATGTCATAGGATTGTCATATTTAAGAGCTTTTCATCTTAACGACTCTATGTTTCCTCTAGGGC
AACATAAGGATCGCCACGCGCCTTTAGGGGAAGGAGATATTGGCATCGAAAGTTTCAAATTTCTTATGAC
TAACGAAGACACGCGAATGATCCCCAAATATCTAGAAACTCCTGGAGGTCCAGACTTATGGGCTAAGGAA
ATTCGTCAATTACAGAGTTTTCAAAAATAG
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GTCGTGTGACAGGAATGTTACGCGAAATTGTTATGGCAGCCTATTTTGGAGCCGATTCTTTAGTAGCGGC
TTTTTGGTTAGCTTTCAGGACGATTTTCTTTTTAAGAAAAATCCTTGGAGGGCCTATTTTAGGCCTGGCT
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CTAGATTTTTCTGTCTTAATGCCTGTGCATTCACGTTAATTATCGAAATATGCCTAGGCATATGGCTGCA
TTATGCCCAGGGGAATACAGCAAATGCCTTGCAGCTAACCATGATTCTCCTGCCATCAGGCATATTTCTT
ATGATGTATACTGTGAACTCCGCCCTGCTACATTGTGAGAAAAGATTTCTTAGTGTGGGTTTAGCTCCTG
CTGTTGTCAATGTGCTGTGGATTCTTACCGTATTTCTCGCAAGACATAGTGATCCACGACAACGGATCAT
TGGATTGTCAGTGATTCTTGTCATAGGGTTTATTTTAGAATGGTTTGTTACCGTTCCTGGGGTAAGGAAA
TTTTTAGGTTCAGCAACAACCCCACCTAAGGAGCGTGATAGCATAAAAGCTTTGATAGCCCCGCTATCTT
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GGAGTCTTTACCGTTCTTTTACCTTCTATTTCTCGATGCATTCAGCAAGATGATAATGACGAAGGTTACA
AGCTTATGAAATTCGCTTTGAATCTTACTGTTTCTGTAATGGTAATTATGACCGCAGGATTGCTACTTCT
AGCTCTTCCTGGGGTACGTGTACTTTATGAGCACGGTTTATTCCCAACAAGCGCTGTACATGCTATTGTA
GAGGTTTTACGCGGCTATAGCGGGAGCATCATCCCTATGGCGCTTATTCCTTTGATTTCTGTGCTTTTTT
ACGCACAACGGCACTACACCATACCTTTAGTCATAGGCATCATAGCCGCTATCGCCAATATGATCCTCAA
TGTTGTGTTTGGTTGCTGGTTGATAAAACACGTTTCGGGATTAGCCTACGCCACTTCTCTTGTTTCTTGG
TTACAACTCTATTTTCTTTGGCAATATGCATCAAAAAAACATCCCGCATATTCTGGATTAATGTGGATAA
CATTTAAGCGTTCTATCAAGGTTGTGGGAGTTACCTGTTTAGCCTTTGCAGTTACTCTAGGGGTTAATAT
TCTAACACATACTACATATGTGATTTTCCTTAATCCTATGACGCCGTTAGCGTGGTCTCTAGCGTCTTTT
GTAGCGCAAAGCGCCGCTTTTTTCTCAGAAAGCGTCATTTTCTTGGCTTTTTTGTTTGGTTTTGCAAAAC
TGCTTCGGGTAGAAGATCTTGTAAACTTAACATCTTTTCAATATTGGAAAGGACGCCAAAGCTCTTTGCA
TAGTTCATCAGTTATGCAAGATAGTCAGAATTAG
>ref|NC_003361.3|:20346-21614 hypothetical protein CCA00014 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAAAATATATTTATCAGTGGCTAGTATGCATGTCCCTATCGACAGCGATGTTTCAAGGGCTTGCAG
ATGCTCCTTCTGGAAAGCAGAGAATAAGCGATTCTCAAACATTTATGAACTTAGATGATATGAAGGCGTA
TCTAGATTCTCGTGGCTTCGTAGAAACGAGAAAACGCGGAGGAGTTTTAAAATTAGCGGGTGATGTACGT
GTGAAGTGGATCCATGCTAGAGAAGACATAAAAACACCACCAGCCCAGCCAGATAAATATAAGCCGTTAC
CAGTAAACCGTTACCGCAGTGAATTCAATCTTTATGTAGATTATAACGCGGATAAAACCTGGTTGACATC
AGAAATGAGTTGGGCGGCAATTGCTGGAGGTGAATCCTCAGCTGCTGGTATGGATATTGACAGAGCGTTC
TTAGGATATCGTTTCTATGAAGATTCAGAAACGCATACGGATATCTTTGCAGAAATTGGCCGTTCTTCTT
TAGGCAGTATTTTTGAATCAGAAGTACAGTTTAATAGTAACTTTGATGGTATTCATCTTTATGCAACGCG
CCGTCTCTCTGAGGCTTTCCCTTATAATGTAATCATTCATGGTGGTCCTTTCGTAGTAAATATGGCGAAA
AAACATTATGCATGGGTTGTTGAAGGTATTCTTAACAGATTACCAGGGAACTTCTCTGTAAAATGTAGTG
TTGTTGATTGGAATTCCTTCTCTCCTACAGAGGTTCCTGCAAATCCTGCTACTGCTAATTTGAAGTATAA
GTATTGTGTATGGCAATGGTTAGTTAGTAAGCACTCTCAAGTACCTTGGTTTTATGGAAAGAAAAAACCT
TTGTATGTCTACGGTGCTTATTTGATGAATACCTTAGCAAAAGCAACAACAACAACCTTAAATGAAAAGC
AAAACAAAGCTTGGTTCATTGGAGGAACTTTAGGTAGACTACGAAAAGCTGGAGATTGGTCAGCAACAGT
ACGTTACGAATACGTAGAAGCTTTAGCTGTTCCTGAAATTGATGTTTCTGGTATTGGCCGTGGAAATCAA
CTTAAGTACTGGTTCGCTCAAGCGATTGCTGAGAATTACGATCCTAAAGAAGCTAATGGATTTACGAACT
ATAAAGGCGCTTCTTGTCTCCTTATGTATGGAATCACAGACACCTTATCTTTCAGAGCTTACGGAGCTTA
CTCCAGACCTGCAGATGATCGCTTAGGTAGTGATTTTACTTACAGGAAGTTCGATCTCGGGTTAATTTCC
GCATTTTAA
>ref|NC_003361.3|:21725-23635 hypothetical protein CCA00015 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGCAGGCGAGCGCAGCAAATCGTAGCTCAGAAGCTCAATCGATAACCGGAATTGCAGGCAAGTCCGGGTC
ATCGCAGCCTTCTGTGGAAACTGTAGGACGATTGAGCTTTTTGAGCTCTGCTCGGAAAAGTTTAGCAAGT
CTTTTCGATAAGATTTCCTCGTTCTTTTCAGGGAAAACGACTCCTCAAACTTTTGATGAAGCTAAGACGC
AAGCAGAGAGTGCGAAAACTGCGCTGCAGAGTGCGACTACTTATGATCAGTTCAAGACCGCTTTACAGCA
GCTGCAAGATGCTGTGAAACAGATGGAGCAATTAGCTACTACTGATGCAGAAAAAGCTACAGTTGCTACA
TGGAAAACGGCTCTTGAGGCGCAGAAGAGTACGCTGGATACACTTAACCAGTTGGGTGCTATTCTTACAG
AGAACCAGAAGCTTCTTGAGGCAATAAAGACGACCTCGTCTATGGATCAGATTATGGGAGCTGCCGGACA
AGTAGAAACCAATAAAACAACTGCTGAGGAGTTAATTAAACAGTTGAAGGAAGCTGGGGTTAGCTATCCT
GTGATAGATGACCTTGAGAAGCAAATTACAACCTCAGGAACTCAGGTTACTGAATTAGCAGATGCTATAT
CGGAAGCTTATGCTGCGGGGAAAAACAGTACCGCGGCTGTGGGGCAAGCACAGGCAAATAACAGCCCCGC
AAATATAGAAGCTTCCAAACAAACTATTGCAAATGCACAAAAAGTCATAGAAGACGCTCTTAAACTTGCT
CCAGATTCTCCGATACTCAAAGCTGCTTTGAAAGAACAACAACAGGCAGCAAAAGATATCCTCAATGTGA
AACCTAGTGGTGGTAGTGATGTGCCTATCGGTGGTCCTGGAGCTCCTGGTAGTGTGGGGACTTCTCAAAA
TCGCGGTGCTACCTTAGGGGAAGTTCGCGTATCGATGTTATTGACTGATGTTGATAATGAAACCGCAGCG
ATCATTATGCAAGGTTTCAGAAATATGATCGATAACTTCCATGATCAAAACTCTGATTTTACAGCGCCTT
TAGAAGAGATTATGAATCAAGTAACCGACTTATCAACGCAGATCAATCCTGCAGATGCGGAAGCTACAGC
ACAACTACAAGAAATACAACAAACCATACAAGATGCCCTTCAAGGGACTGCCGGTCAAGACGGCATGATC
AATGCTTTAGGAGCTATAACAACAGCAGCTTCAATTTCTACAGGAGCTCCTATCGCTTCTGCAAATCAAG
GTGGATCAGCTGTAAAGCAGCTTTACAAAACAGGATCTACTGCTGCGAGTTCTAAATCTTACGCGGATTC
CTTATCTGCAGGGTATGGGGCATATCAATCTTTAAATGATGTGTACTCACGTAGTAGTGCATCTAACCGT
GAGGTTTTAGATCGTACATCGACTCCAGCATTAACGCAGACAGTTTCTAGAACAGAAACTCGGCCTCGTG
ATAATGATAACGCAGCTCAGCGTTTTGCAAGAACTATAGCTGCTAATAGTAATACTCTTGGGGATGTTTA
TGCATCCGTAGGTGTATTGCAAACATTGCTAGGTGTATTACAAAATAATCCCCAAGCGAATGAAGAAGAA
ATCAAACAGAAGCTCACTTCTGAGGTTACGAAAGCTCCGCAGTCAGGTTATCCTCATGTACAGCTTTCTA
ACGACTCTACGAAGAAGTTCATTGCTCAACTCGAGAATGAATTTGTTCAGGGATCGAAAAGACTTGCCGA
AGCAAAAGAAGCTGCGTTTGAGAAACAGCCTTTGTTCATCCAGCAGGTATTAGTGAACGTAGCATCTCTG
TTCTCGGGATACCTACAGTAA
>ref|NC_003361.3|:c26432-23820 hypothetical protein CCA00016 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCTTCTTTTTATATACAGAACAGGCCTAAAACAGTTTCCGGTGAAGGTTTATTTAACATTAAGTTAA
ACCATAAGTTTTCTAATTTTGATGCTAAAGCTCAGCCAGCGATAGACATAGAAGCATTGAATTCCGGGTT
ATACTTTTTAAAACGTTTAGCATCTGCAATAGAATCTGGTAATGTCCAAGCTTCTATGTTGTTAAATCCC
AACAACACGATATTCCCCTCCCCACCTGTAGCACCTAAGCGTCATACAGGAAGCAGTCCAAATACTGCTT
CTGGGAAAGCAGGAACAATTGCTGGTTTTCAAGGAGAAGCAGCTGTTGCTTTGGTACCTCTTATTCTTGA
TGGCTTAGAAGCTTTTATAGCTACAACCCCTGAAGTTAATTTGGCTCAGATAGCTTCTATAATTCTTGCT
ACTGCCTTAATTACTCCACTTAAAAATAAACCTTCTCTTTCTGCCGATGAGCAGAAAAAAGTATTCAACA
ACTGCTATCAACCTAGTAAGGAAGAGATTCTTACACAGATCAAAAAAGAGCAAGCTGCCGAAATTAAAAA
AGGTCAAGACAAGCTAACAGAAAAGCTCACAGCTGTAGGAGCCTCGGAAGAGGAAATTAAGAAAGCAAGT
GAAGAACACGCTGATCAATTCGCATCAGATTTCTTCGATACTCATGTTAAAGAACAGTTCATGACTTATC
GATCCTCTATTGGGGGAGAAACCCTAAAAATGATGGAAAACATGAAAGCTCTTGAAGCAAAAATCCCTGA
TCCCACCAAAGATAATGTGGAAAGTGTCAATGGGATGGTAATGCTTCAGGCTACCTTTAACGGCCTTACA
GAGGCCGTTAATAAAGAGCACGCATTAGGAGGGGAAGAAGACGTTATTAAAACACAGCTAGCCTTGAGCG
GTCTTCTAACTAAAAGTCCTCTGGATAATACCGATCTAAAAACGATTTACGATGCTACAGATCTCCCTAG
CAAAGCTTCTTTAGATTTGTATCTAAAGTCTAGAGATGCTGCTATATACCGAGAGGGAGTTACAGGAGCC
TATCAAATTGCTGTGCAGAATCTCACTACAGTACGTTCTTCAATAGAAAACGAAAAACAAACTCTAGAAA
ATCAATTAGCAGCATTTCAACAAGGTGTTAGTTCTTATACTTCCTGGGTAGGTGAATCTAAAAATATTGT
AGCAGGAAAAGACTATACTTCTGTTCTAGTAACCGCCGCTATGGAAGCAAATGCAGCTTTGACAAGCTTA
TCCCAAATGCGTGGAAATCTTACAACAGAAGAACAGCAAATCTTTGATAAACATGTTCCTAAGTATTTAG
AGCTTACTATAGACAATACAACCGGTTTCGCTACTACTGTAACTCAATTCATTGCCAAGATGAACGCATT
TCAAGAGATTTCTGAATACACTCTAAATAATGCCATAACCTCTAACGATCAAGTAAAAACGTTCTTAAAA
AACAAAGGCGCCGCCATTCAAAATTATCCGTTCTTTTCTGAGGTTGGGAAAGAAATGGTAGCAATAACTA
ATTCTAGTGGCTTTGTTAATTATGCTAAAGATGAAAGTGGTTATCAAATCCCCGCTTTTGAAAATTTTGT
CCAAGTAGAGTTAAAAATTAGAGCGATAACTTCGGATTTCGCTAATCAAGCTAAAACTGTCTTACAAAAT
TTTAAAACAGAAGCAGATGCGCACGTCTTAAAACTCCAACAACAAATAGAGGAGTTAGATAAAAAGTATA
AGGAATTTAATCCTGCAGATGCAAGTTTCACTGCTGATCGCAGGAAAGCCGTAGAAAGCTGGCTAAATTC
AGAGAGCCTGGGTTCTGCGTTTATCTACTTAATCTTAAACTCCCAGTTACCTAAACAATCGGCCTTCTTA
AATCCTCTGATAGAAGAGATTAACTTCAATAACCTTGCTGCGAACGCTATTAATGATCTCTTAAAAATCA
CCAACCACTTTTCTACAACTTCGGTGTATTACAACCTCTCCTCCTATCTTATCCAAAGTAAAGAAGGTGT
TGACTTATTCTGTGGGGATTATTTTGAAACGTGCCTTGCCCTATCGAAGGAAAAAGAATACATAACTCGT
GATACAGATCGTTGCCGACGTGCTCAAAATTTGGTAGAGGAGTTACTAAATAAAATTAATAAATTACCCA
ATATCTCCTCGTCTCAAAAATCTGAAATGCTTAATGCGACTGCGAATTATAAATATGCTCTCACGATTAC
ATTTAACCAGCTCAACTTGTTAAACTCTCTACTTGCCAACCTGAAAATCCAAGAACAAAAGAATAGTGAT
GATTCATATAAAAGTACCGTTTTCAAAATGACTGGTCCCACAGACTGGATCCCTACATTAGCTTCGTTAG
AAGGTTTTATTTCCAATGGATTTCCCAATATCACCCCTACAGGTGGTTTAGGACCTCTATTCACTCAAAT
CCAAGCTGACCAACAAGACTACACAACTCAAGGACAAACCCAGCAGTTAAACTTGCAGAATCAGATGACC
AACGTACAACAAGAGTGGACGTTAGTCTCAACATCTATGCAAGTGCTAAATCAGATCCTTTCCAAACTCG
TAGGCGAAATTTACCCTAATTAA
>ref|NC_003361.3|:26634-29150 hypothetical protein CCA00017 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CGATACAAAAAAGACATCAGTTATTGGAGAGTATTTTTCATTATGAAAGAACTGAATTTGAGCGTCATAT
TGTGCAACATCTGTTGTGTATTTTAGATCAAAAATCCGATGAAAAATACCGACAATTAATAGAGAAGCTT
CGCAAATCCGAAATAGAAGATCGCGTGGTGAGCAAGAAGAGCCGTACGGCTGCTGTGCATCATAAACCTT
TATCTGACCTACACGCACCGATTGCTGTAGTGGCTCAAACCTCTACTTTAGGAGTCAGTGATAATCCGCG
CGCAGAAGACCCTTTCTATAATGCTACTAAGCAACAGTGGGCGCAAAACCTGTTGAAGGGGATAAAAGAG
GTTGTTGATGAGATTGTAACAGCTATCACAACAACCACACCACCATCTCCTTCTGCAGATGCTCTTAAAA
AGATCCAAGCAGAGGTTAATCGTTTAATCTCTGTAGGTACAAATTTAACGAATAAGGATTTCGAAAGTTT
ATACGCTCTTCCTAAGTTAATTTTTACTACTGTGCAACGAGCTGATATTTTTACAGGCGGTCAGAAAACA
GATTTTATAAATAAGTTAGCAGAGAAATATGGTAATTCCACTCAATTATCTCAGGTTTTTGCTGATGGTC
GTATTGAGGGGTTAAAAGATGTTCTTAATGTAGTTAAAACTAAATTAACGGATGAAGAATTTGCTATTTT
CTTAGAGATTGAAAAAGAGCTGAACGACTTACAATCTGCAGTAAGGACCTATGATCAAGAGAAATTTGAT
AGTATTGATTTGGTAGGAGATCAATTAGCAGATACAATCAATATATCTGCCTTATCAAGAAATGATAAAA
TCGATTTATGTGCTCAGATCTCTTATTTATATAAAGACCAAGTAGATGCTGTAGAGTCATTTAACGTTAT
TGTCGAAGCAACAATCTTTGTGAACCGTCACCAAGAAGCTATTTTTTCTCAAATATCCAGTTTAGTAGCT
TCTTTTGTAGGAGTATTTGCTCCTATTGATTTAGGAAAAGTGACTTCTGAGATCAGTAGCGCCGCTATTG
CCGGAGCTTTACAAGCCTTACGTGCGATTAATTCAAGATTTAATGATTTAACTGCGGAGCAAAAAAAACT
AGTTAATGATGCTATAAAGAATATAGCAGTTTTTAAAGGCGAGGAATATATAGGGGCCGTTTGGGCTTAT
TTTGTTGCATCCACTGTTCTTGCTAATAAAACTACAGCAACTATGGCAGAGGTTGGTAATGCAATTAAAG
AAGCAGCTAAAGAGATGGAAAATTCCTCATTGCAATTAGCTCCAAAGATTAAAACAACGATGGAGACCAT
TACAACTACTGGGAGTTTTCAGCCTAGTGGTACTAGTGAAAATTATACAATTTATTCTCAAAGTGGCTCT
ACAGTATCTATTAACCACAGTCTTTTAAATCGTGGTGATGTAGGATTTTTACCCAATATAACATCAAAAG
CGACAGCTCAAGCTGAGACTACAGCCAGAGATTATTTTGCATTTAAAGGTCTTGCTCAAGTAGAAATAGC
AAAACTTTTATCTAAAGTTGAAACGACTCAGACGCAGCATAAGGATTTTCAAAATCTAAAAGCAGAACTT
TATAAAGATCAGTTATTTGCTCAGGCTAATGAGCTACAAGCCATGGCTTTACCTTCAGCTGTAGCTTCTG
TGTTAATTGATCGCTATATGCCTAAGGAGGTGGATTTCTTAAATGATATTTACGCTCAGCTTTACTATAG
CAATCTAGGCTCATCTGTTGGCAATGCTATGATCGATGCCATTTCAGAATATGTTAACGGCGCTACCTAT
TTCAATTTCGCCAGTTATGTTGGTCAACAGCCTGCTGTAGGGCAGAAAGGTAAAGATGAATTTCCTGGAA
CAGCAGATAGTGCGAGAAATAAATTAGAAACAGAGCGTCAGAAAGCAGCTGCATATCTTAAAAGCACACA
GCATGCCGAAGAAGTTTTAGAAGAACAGGTCAAAAAAGTTACTGAAGATTCGAAAATTACTAACGAACAG
CGCACACGTATCATCGATTCCTTAAATAACTACCGAGATAATTTAAATGCGATATCCGGATCTATAGTGT
TACTGCAAAACTATTTGGCACCTTTAAGTATAGACAATGGTTCTGTGGATGGAACCTTTACTGTTAGGGG
TGGGCAAGATCAGTGGCAAGAACGCTTAGAGATCTTAGAGGATGCTTTAGTTTCAGGTCTGTCAGGAAAT
GCCATCAACGGAGGGATGTTCCCACTACAGGCAACGATACAGTCTGACCAGCAATCTTTTGCTGATATGG
GACAAAACTATCAGTTGGAATTGCAAATGCACTTAACATCCATGCAACAAGAATGGACAGTTGTTGCGAC
TTCTTTACAAGTTTTAAACCAGATGTATCTGAGTTTAGCTAGAAGCTTAATGGGGAATATTTCTTAA
>ref|NC_003361.3|:29189-29419 hypothetical protein CCA00018 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CGCAACAAGAATTAGCACGTTTAGAATTCATTAACGATCAGCTACGTGCGGAACTAGAATATGTAAATAC
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GAAGATGATTTCTTAGATTAA
>ref|NC_003361.3|:c30138-29416 ABC transporter, ATP-binding protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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TCGAGGTAAATGCTGGAGAGGTTGTTGGGCTTTTAGGGCCTAATGGTGCGGGGAAAACAACAGCCTTTTA
TCTTACAGTAGGGTTAATTCGTCCCGATTCAGGAAAGATCATTTTTAAAAACACTGATGTTACTAAAAAA
ACGATGGACCACCGAGCGCGATTAGGTATTGGCTATCTCGCTCAAGAACCTACGGTATTTAAAGATCTTA
CAGTAAGAGAAAATCTTATCTGCATTTTGGAAATTATCTACAAAGCTAGAAAACAACAATCCCACCTTTT
AGATACTCTGATCGACGATCTGCAACTCGCCTCATGCATAAATAAAAAAGCAGGAACATTATCTGGAGGA
GAACGACGGAGATTAGAAATCGCTTGTGTATTAGCTTTAAACCCTAGTGTTCTCCTACTTGATGAGCCTT
TTGCAAACGTCGATCCTCTCGTTATTCAAAACGTAAAATACCTGATTAAAATTCTTTCTGGTCGTGGTAT
TGGTATTCTCATTACGGATCATAACGCTAAAGAACTACTTTCTATAGCAGATCGTTGCTATCTCATTATT
GATGGAAAGATCTTCTTCGAAGGATCTTCTTCTCAAATGATAGCCAATCCTATGGTCAAGCAGCACTATC
TTGGAGATTCTTTCTCTTATTAA
>ref|NC_003361.3|:c30629-30144 hypothetical protein CCA00020 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACCAAATTCTTATTCTACGGCTTGATATGTTCTTTAGGGATATTCGGAGTTGCTTGCTCAACAATCG
TTGCTATAATCAAAGTAGATAGCATTTGTGATGTCTCTTGTATGAACAAGCATTTTGAAAAGGCTCCGCC
TTTTTTAAAAATTAAGAAACTCGGCATACACAAGCAAATTGTCTCTCCGGAACAGCAGTTTTTCAACTGC
CATGTAGAGAAATCCTGTATGGAGCTGCACTTCTCTGATGCAAACTATGCTTGTAAGGAGATTTTGTCTA
AGTTATCAGGGCATATCCACACACAAGATTTAGACAAGCTTATGACATTTCAGGGCAACGGGGGATTGTT
AAACTACCATGATTGCTCTTTAAATATTTACGACTGTCGCTTTCATGTAGATCCTATTCATCCTAATCCT
GATGCTCCTGCAGAACGTGCTGTAGGAGGCATGAAAACCTTATCCCTATCTTTATTGAGAAAGTGA
>ref|NC_003361.3|:c31435-30626 2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTGCCTCGAGAATTCAAGAATTAGTTACTCCGTATGCCGATCGTATACATTGGATTTTCAAAAGTAGCTA
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TCTAAAGTTAAGGATACTTTAGGTGTAGAAATCCTTACAGATGTGCATTCTCCTGAAGAAGCCCGTGCAG
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AGCAGAGACAAATGCCGTTATCAACATTAAAAAGGGTCAATTTCTTTCTCCTTGGGATATGCAAGGCCCT
GTAGATAAAGTTCTCTCTACCGGAAATAATAAAATTATTTTAACAGAAAGAGGCTGCTCTTTCGGTTACA
ATAATCTTGTTTCAGATATGCGCTCTATCCCTGTACTTTCGGGTATGGGTTTTCCCGTTGTTTTTGATGG
TACACATTCTGTACAGCTTCCTGGAGGACTCAAAACACATAGTGGGGGGCAAACAGAGTTTATTCCCACA
TTAACACGAGCTGCCCTAGCTGCAGGAGCGCATGGTTTATTCATAGAAACCCATGCGAATCCAGCCATAG
CAAAAAGCGATGCGGCTTCCATGTTATCATTAAAGACTTTTGAAGCTCTTCTTCCCCTATGGGATCAGCT
CTATACTTGTGTACGTTCATTTGAGATGGCCTCAGTATGA
>ref|NC_003361.3|:c32111-31875 hypothetical protein CCA00022 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTCAAGGCACCCACACGATTATCTATGAATTAACAGTTGCGAAGCCCGATATCGGCAAAATCATCGGAAA
AGAGGGTCGCACAATCAAAGCTATCCGCACTCTACTTGTCTCTGTAGCCAGCAGAAACAACGTAAAAGTC
AGCTTAGAAATTATGGAAGACAAGTAG
>ref|NC_003361.3|:c33753-33445 hypothetical protein CCA00024 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGGGATTACCTACTTTCTAGCTTTACCTCTCACTGAAGAAGATTCTTCGCGTTTTCTAAACTCTGCAA
AACGCTGGGCTCCATTTTTAAATCAGAAGCTCTATCTTTCTCTTATCTTCCACAATGATACTTACTACCT
TGCTAAAGAAATGTCTTCTTTCCCTTGCTCAGCTGAAGAATGGCAAAAATCCCTAAACCACGTATCTAGC
CTTCTTACCCATACATTTCTATGCACATCTACCGATGCTCTTACCTTTTTAGCCTGCATGCAATTTCAAC
AAATTGATTTGGCAGCACCTACAAACTAA
>ref|NC_003361.3|:c34048-33755 hypothetical protein CCA00025 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGAACCGCGTTACATCAATATCAAAAAAGCTGAGACTCAAGAAACTTCACCAGCAAAAGAGATCAATA
CTCCCGAATATTTATCTCCAACAAACATGACATTTGAAGGTCCTGTACGTACTTTAGATCAGCTAAGACT
AGCTCTCATTCAAAAAATGGGCGAAGAAAAAGGAAAAGAGATGTATGACAAGTTCATCCAATCTATCCTT
ATTTCTTCTTTCGGCAATATCCATAAAGAAATGGATCGCGCTCAGAAAGCATCTAAGAAAATGCGCTCTA
TCTATAAAGAATAG
>ref|NC_003361.3|:c35600-34161 DNA topoisomerase IV subunit A [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCATAATGTTTCTGATCTTTTTAAAACGCATTTCATGCACTACGCATCTTATGTGATTCTAGAAAGAG
CTATTCCTCATATTCTTGATGGCCTCAAACCTGTACAACGACGTCTTCTTTGGACATTGTTTCGCATGGA
TGATGGTAAAATGCACAAGGTTGCCAATATTGCTGGGCGCACGATGGCATTGCATCCCCATGGAGATGCT
CCGATCGTTGAAGCCCTTGTTGTTTTGGCAAATAAGGGTTATCTGATCGATATGCAGGGAAATTTCGGGA
ATCCCCTAACGGGAGATCCCCATGCCGCAGCCCGCTATATTGAAGCACGCCTTAGCCCTCTTGCTAAAGA
GATTCTATTTAACACAGATTTAATGTCTTTCCATGATTCCTATGATGGACGAGAAAAGGAACCTGATATT
CTTCCTGCAAAACTCCCTTTACTTCTACTCCACGGTGTTGAGGGCATTGCTGTAGGCATGACTACAAAAA
TTTTCCCCCATAACCTTTGTGAGCTTATAGCAGCGCAAATTGCTGTTTTAAATAATCGTGCCTTTACCCT
TCTTCCTGATTTCTATTCTGGAGGCGTTATGGATGCCTCAGAATATCAAGATGGCTTAGGATCGATAACG
ATGCGAGCTTCTATTCAAATTGCGGATCAAAAAACCTTAATCATAAAAGAAATCTGCCCTTCAACAACAA
CAGAAACGCTAATTCGTTCTATAGAAAATGCTGCAAAACGCGGTGTGATTAAAATCGATTCCATTCAAGA
TTTCTCAACAGATCAACCTCATATAGAAATCAAACTCCCCAAAGGAGTTTATGCTAAAGACATTCTTGAG
ACGCTATTTCAACATACCGAATGTCAGGTCGTTCTCACATCAAAACCTACAGCTATCTATAATAATAAAC
CCGTAGAAACAACGATTTCTGAAATTCTAAGGCTCCATACAGAAGTTCTCGAAGGCTACTTACAAAAAGA
GCTCCAAATACTTCATGATGAACTCTCTCAAGAACATTACTATAAATCTTTAGAATACATTTTCATTAAG
CATCGTTTGTATGATACTGTCAGAGAAAACCTCTCGAAATTAGGCAATAAAGTTTCTCAAGAAGATCTTC
ATGAAGCTGTTTTATCTTCTTTATCCCCTTTCCTTGCCAGCTTACCTGAAACTCCAAATAAGGAAGCAAC
GGGACAGCTTGCTAGCTTGGCTATTAAGAAAATCCTCTGCTTTAACGAAAGTCACTATACTAAAGATCTT
GCAAAGATAGAGAAAAAGCAAGCAGCTGTAGAAAAAGATCTGAATAACATGAAGAAATTCACGATCAAAT
ATCTTAAAGGCCTTTTAGCAAAATACGGCGAGCTTGGAAAAAGAAAAACACAAGTTCTATCGTTTTCTAA
ACAAAAGAAATCAGTTCTTAAACAACAAGCTTTAGTATAA
>ref|NC_003361.3|:c37412-35604 DNA topoisomerase IV subunit B [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCAACATATACTGAAGCTAGTGTTGTTTCTCTAGCCTCTTTAGAACATATCCGCTTACGTGCGGGTA
TGTATATAGGGAGATTAGGAGACGGCTCTCAAGTTGAAGATGGGATCTACACATTATTTAAAGAAGTTGT
GGATAACGCGATTGATGAATTTATCATGGGACATGGGAAACGCATTTCCATTTCTACGCAGGCCACTAGT
GTAACTGTGCGTGATTATGGTCGAGGCATTCCTTTAGGGAAAATGATCGAATGTGTCTCTAAAATCAACA
CAGGAGCAAAGTACACTCAAGATGTTTTTCATTTTTCTGTAGGATTAAATGGTGTAGGGTTAAAAGCTGT
AAATGCCCTTTCAGAGACATTTACAGTGCGTTCTGTACGCAAGAAAAAATACCATGCTGCCACATTTTGC
AAAGGTATTTTGCAAAATTCCCGTCAAGGGTCTACGAAAGACCCTGATGGAACAGAAATCACCTTTTCTC
CGGATCCAACGATCTTTACCGATTTCTCTTTCAATGATGAGTTTTTAAGAAAAAAAATCCGTCGTTATAC
CTATCTGCATCCTGGGCTCGAAATACTATGTAACGATGAAGTTTTCGTATCACAACAAGGCCTTCAAGAC
TTATTTAAAGAAGAAATTACAGAGGAAACTCTTTATCCTCCTATAGCATTCCAAAATTCTGAATTATCTT
TTCTATTTACCCATCTAGAAACACATAATGAACGGTATTTCTCCTTTGTTAATGGTCAGGAAACCGTAGA
TGGCGGCACACACCTAGCAGCGTTTAAAGAAGCTATTGTTAAAGGAATCAATGAGTATTTCGGAAAAACA
TTTACAAGTAATGACATCCGTGATGGCCTTGTAGGCTGCATTGCAATAAAAATTGCCTCGCCCATTTTTG
AATCACAGACAAAAAATAAGCTTGGAAATACACAAATTCGCTCGGGAATAATCAAAGATGTTAAAAGTGC
GATTATTCAAGAGCTCAAAAAAAATAAATCCTATGCTGACCTTCTTCTCGATAAAATTAAACTCAATGAG
AAGACGCGAAAAAATATTCAATTTATCAAGCAAGATCTTAAAGATAAGCAAAAGAAACTCCATTATAAGA
TTCCAAAACTTCGTGATTGTAAGTTTCACTATAACGAGCGCTCTCTTTATGGTGAGGCTTCGTCTATTTT
TGTCACCGAAGGAGAATCCGCTTCGGCTTCTATTTTATCTTCAAGAAATCCTCTCACCCAAGCTGTCTTT
TCCCTTCGAGGGAAGCCTATGAATGTTTTTTCTTTGGAAGAAGAAAAAATGTATAAAAATGATGAGCTAT
TTTATTTAGCCTCAGCTTTGGGAATTACAAAAAACAATACGCAACACTTGCGTTATAATAAAATTATCCT
TGCCACCGATGCTGATGTCGATGGTATGCATATCCGAAATTTATTAATTACATTCTTTTTAAAAACCTTC
TTGCCCATTGTTGAAAATCATCATCTATTTATCTTAGAAACCCCTTTGTTCAAGGTGCGTTATAAAGACA
CAACTCTATATTGCTATTCAGATCAGGAAAAAGTGCAAGCAATACAGAAATTAGGAAAAAAAGAAGCGAA
TTTAGAAATAACAAGATTTAAAGGTTTAGGAGAGATATCTCCTAAAGAGTTTAAAACCTTTATTGGTGCA
GATATGCGCCTAACTCCTGTAACCATTGGTTCATTAGAATCTTTAGAGACTCTTTTGCAATTTTACATGG
GGAAAAACACTAAAGAACGAAAACAATTTATTATGGATAACCTTATTACCAACTTGTAG
>ref|NC_003361.3|:37967-38983 glutamyl-tRNA reductase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTCCTAGGGGTTGTTGGAATTAGCTATCGGGAGGCTGCTTTAAAAGAAAGAGAAGCGGCGATTAATA
TCCTAAAGGATTTTGAAGCTAATACATTATTTTCTCAGCGTTTTTTTGGTGGTGAGGGGTCTTTCGTTTT
ACTGCTTACATGTCATAGAGCTGAAATTTATTATTTTTCTAAAAGCAATCATAATGTCCAATCGGAATTG
CTTTCGCGGATTTCTGCTTTAGGAGCGCGTCCTTACTGTTATCAAGGATTAGCATGTTTCACACATTTAT
TTACTGTTACTAGTGGTATGGACAGTTTAATTTCTGGTGAGACAGAAATTCAGGGACAGGTGAAACGCGC
CTATATTAAAGCAAAAACCGATCGAGAATTGCCTTTCGCGCTACATTTCCTATTTCAGAAGGCTTTAAAA
GAAGGAAAGGATTTTCGTTCTCAAGTCTCTTTATCTCATCCTGTTGTGACTATAGAGTCTGTGGTTGAAC
AAACTCTAGACTTGCATGGTAAATCAACAAAAGACAAACTTTTATTTATCGGTTACTCCGATATTAATCG
GAAAGTCGCAAACGGGTTGAGTGCGAAAGGTTACCGCAATCTAATTTTTTGCTCTCGAAAAAACATTTCC
ATACCCTACGCTACAGTAGCTCGTAGCCAACTTTCTTTTAGGGAACCCTATGATGTCATTTTCTTTGGAT
CTTCGGAATCGGCTAAAGATTTTCCCGGACTGTCTTTAGAAAATTTGGCAAGCATTTCAAATCGCGTGAT
CTTTGATTTTAATGTTCCGCGTACCTTTACCTTAATGGAGCGTCCCAAAGATATCGTATGTTTGGATATG
GATTTTATTAGCGAGCAAGTGCAGAAGAAGCTTCAAATTAGTAAGCAATGTACAAATAAAGAAAAACCAT
TTTTAGCTCTAGCAGCAAGAAAACAATGGGAAGTTTATGAAAAAAAGTGCTCACATATATCTTCGAGCCA
ACTTCAAACTTCTCGTCCTAAACTGTTGATTCTTTAG
>ref|NC_003361.3|:39330-39734 hypothetical protein CCA00029 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATGGAGCATATGTCTTGCCTATAAGCGATCTTGTCAAGATACGTGTACTACAAAATGCAGATAATGAAAT
TGTATTTAAAGCTTTCTTAGGGGAATTGGCTCCTTCTGCGGACATAAACAAAGTATACTTACAGATGATG
ACGGCGAACTTGTTTGGTAGAGAAACAGGAGGTAGTGCTTTAGGATTGGATTCTGAAGGCCATGTCGTCA
TGACGCGTAGAATTCCCGAAGAAGTTTCATATGAAGATTTTGCACGTTACATAGAGAGTTTTATGAATTT
TTCTGAAACCTGGCTAGAAGATTTGGGACTAAATAAAGCACAACAAGGACAATAG
>ref|NC_003361.3|:39754-42231 FHA domain-containing protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGGTGCACGTTTAATTATTGATAAAGGCCCGTTGTCAGGATTTGTTCTAGTCCTTGAAGAAGGGACAA
GCTGGTCGATAGGAAGAGATGACGCGACTAGCGATATTCAGTTAGAAGATCCTAAGATTGGCGATACCCA
AGTTGTTATAAGTTTAGAAGCAGGTGTGTACTCTGTCACAAATTTAGACACTGCGTACCCTGTTATTGTA
AATGGCAAAGAAATACAAGAGATAACAACTCTGCAAAACGGTGACATCTTAACGTTTGGAAGCAATCAAT
ATTCTTTCTTCACGAATGAGTTTGATCCTGAGGACGTTGTTTACGATTTTGACCTTTCTTCGAAAAATAC
TACTAATGTCACGCCCGAACCTGCCGATAGTAAAAAGAAGACGAAGAAAGAGAAAAAGTCTTCACAAGAC
AGTGGAAAAAAATCTTCTTCGAAACAGCAAGATTCTTCCAATACTTCTCCTACCGATAAAGACAAAGAAC
TTGCTGAAGCTTTCTTAGCTTCTGCAAAGACAGGAAAGAAAGCTCTCGATCAAAAGGTAGATATAGATAC
GCTACCCGATTCTGGAATAAAAAAGAAAAAATCTCCATTAGGAGATATAAAAAATACTGAAACCCAGCAT
ACTACTATGGAAGAAAACGGAGCTTTGCCTAATCAAAATCAGCAGCCGTTGCCAGATTCTGATCCTGTTA
AACAGGAGCAATCGCAAGAAGGTGGTGACCGGCCTAAAGAAGGTGAACCTGTTAAAGAATCTCCTGCTTC
TAAAGAAGAAGTATCTCCCCAAGGAACTGCACCTGATGAGAAGCGGGATGTAGAAGATGCCCTTGATGAC
AAAGAAGCTTCTGAAGATGTAGAGGATAAAAAAGAAACTTCCGAGGAAGTAGCGGATGATAAAGAAGCTG
CTGAAGAAACTCCGGAGAACAAAGAAGAAACCGAAGAAAAGTCTGAAGAGGCTGACGAGAAAGCTGAAGA
GGAAAACGAACAGGAAGATAAAAAGGCTGAAAAAGCTGAAATCTTGTCCCCGTTTAATGTGCAAGATCTC
TTTAGATTTGATCAGGGTATTTTCCCTGCAGAAATAGATGATATCGTTCAGAAGAATGTTTCCGTAGATC
TTTCTCAGCCCTCCCGCTTTTTACTAAAAGTATTAGCCGGAGCGAATATCGGTGCAGAGTTCCATCTAGA
TACAGGAAAATCCTATGTTTTAGGCAGTGATCCTGCTTCTGCGGATATTGTCTTTAACGATCTTAGCGTC
TCAGGTCGCCATGCAAAGATCATCGTAAGTAACGATGGATCTATCATGGTAGAAGATTTAGGAAGTAAAA
ATGGCGTAATCATTGAAGGAAAGAAGATAGAGAACAGCTCTACTTTAAGTTCCAATCAAGTTGTTGCTCT
AGGAACAACGCTATTCTTATTGATAGACCATTTGGCTCCTGCCGATACGATTGTAGCCTCATTTGCTCCA
GAAGATTATGGTTTATTTGGTCGTCCTCAAGATGCTGAAGAAATAGCTCAGCAGGCAGCTCAGGAAGAAG
AAGAAAAGCGTAAGCGAGCTACTCTGCCTACGGGATCTTTCATTCTCACATTGTTCATTGGTGGACTTGC
TATCCTTTTCGGTATAGGTACAGCTTCTTTATTCCATACAAAAGAAGTTATCCCTATTGAAAATATGGAC
TTCCAAGAAGACATCGAGCGTGTAGTAAATGCCTTCCCAACAGTTCGTTACACATTTAATAAAAATAACG
GTCAGCTCTTTTTAATCGGGCACGTAAAAAACAGTATTGATAAAAGCGAGCTTCTCTATAAAATGGACGC
TTTGTCTTTCATCAAATCTATCGATGACAATGTGATTGATGACGAAGCCGTCTGGCAAGAAATGAACATC
TTGTTATCAAAAAGAACAGAGTTCAAAGGTGTCAGTATGCACTCTCCAGAACCTGGACAGTTTGTGATCA
CAGGATACCTAAAAACAGAAGAACAGTCTGTATGTCTCTCAGATTACCTGAATGTGCATTTCAACTATCT
TTCCCTGCTTGAAAACAAGGTAATCATAGAATCACAAATGTTGAAAGCAATTGCTGGTCAACTTTTGCAA
TCAGGATTTGCAAACATTCACGTAGCCTTTGTTAATGGCGAAGTTGTTCTTACCGGTTATGTAAACAATG
CCGATGGTGAGAAATTCCGTTCTGTTGTTCAGGAAATTTCTAGTATACCTGGCGTACGTCTTGTAAAAAA
CTTTGTTGTTTTGCTTCCTGTTGAAGAAGGCATCATAGATTTAAATTTACGGTATCCTAGCCGTTATCGT
GTAACCGGATATTCAAAATACGGTGACGTGAGCATTAATGTTGTAGTCAATGGTAGGATTTTGACCCGTG
GTGATGTTATCGATGGAATGACGGTAACAAGCATCCAACCAAACTGTATCTTTTTAGAGAAGGAAGGGTT
GAAATATAAAATCGAGTACAATAAATAG
>ref|NC_003361.3|:42278-42529 hypothetical protein CCA00031 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTAATATGGAAAATACAGCTGCTAAAGAAGATAAATCTTCTCGTCAGCTGTTTGATTTAGAGAAAG
ATATGCAGGATCTGAGTAAAGCTCAGGAGATCAAAGCTAACGTGCAGGATAAAGTGCAGAAATTAAATGC
TTCTCTTCGAGAAGGTTCTGATAAAGTATTTTTCGAGAAGCAACAAACATTGTTAGCAGGATATCTAGCC
CTTCAGAAAGTTCTCGGGCGGATCAACCGCAAAATGGTTTAA
>ref|NC_003361.3|:42553-42813 hypothetical protein CCA00032 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGTAGTGGTAGCGGGAGCAGTTGCTCAGCATTTAATTTTAATGACATGCTCAATGGCGTATGTAAGT
ACGTCCAAGGTGTGCAACAATATTTAACAGAATTAGAAACCTCAACGCAAGGTACTGTTGACTTAGGTAC
GATGTTTAATTTGCAGTTTCGTATGCAAATTTTATCACAGTACATGGAAGCAGTATCCAACATCTTGACA
GCAGTGAACACAGAGATGATTACTATGGCAAGAGCTGTTAAAGGAAGTTAA
>ref|NC_003361.3|:42832-43281 hypothetical protein CCA00033 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCAGATTTGGAATTATTTAAAGCAGATTTTGCGTTGTTGTTTGAAGCTGGCATGTTGGCCATCAAAC
AAGGTGATGAAGAAAGCGCAAGAAAGCTTTTTCAATCTCTAGAAATTTTAAATCCTGACCACTACGGTCA
TGAATTGGGATTAGCATTGATTGACCTGCATAAGATGGAAATTTTTGCTGCAGAAGAGCGCTTAAGTGCT
TTAGCACAAAAAGAAGTAGATAATTGGAGCATTAAGTCTTTCCTTTCTCTAACACATATGATGATTGTGT
TACATCAAGGAAGCTCTTTTGAAGTGCGTCGTGAAAGCTTGGAAAACTGCTTAAAATTAGCAGATCAAGT
GTTAGAAAATTGTGAAGTAGAATCAACAAGAATTCTTGCTCAATCCGTTTTAGACTGGCATGATACTCTA
GTAGCTAAAAGTAGTGGACCTTTAGGTTAA
>ref|NC_003361.3|:43325-43993 hypothetical protein CCA00034 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATAGATCCTTTACAGCTTTTTCCGAAGCTTGACTCCGATAAAGAAACAGCTTCTATACAAAAGCCCT
CAGGAACTCCTTTAGCTAGCGAGCTGAATAAGGAAGTTCCTGCATTTTCTTTAGGAATGTCCGCGGATAC
TCTGAATAAAAATGTAGAGGATGTAAAGCCTAATCCTATGGCGATGATGCAAGATAGAAACTCTAATATC
ATCGATCCTGAATTGGAAGAAGCCTTAGATTCTGAAGAGCTCAAAGAGCAAATAAACAACCTAAAAGAGC
GTTTGTGGGACGCACAAACAACTCTAAACCAAGATCAAAATAAACTATCTCCTGAACATTTTGAAGCTGT
CAGTGTGATTATTGATTTAATCAATGGAGATCTTAGTGATATAGCTGAACATACACAGCAGAGCTTACAG
AAAAAGACAGATGAGGAAAGCGATTCTGTTACACGTAAGATGATCAACTGGGTATCCTCAGGAGAGGAAG
TTTTAAACAGAGCTCTTCTATATTTCTCTGATAGAAATGGAGAGCGAGAAAACTTAGCTGACTTTTTAAA
AGTACAATACGCTGTGCAACGAGCAACACAAAGAGCAGAGCTCTTTGCTAGTATCGTAGGAACTACGGTA
AGTAGTATAAAGACGATAATGACCACGCAATTAGGTTAA
>ref|NC_003361.3|:43995-45323 type III secretion system ATPase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGACGAATTGACGACAGATTTTGACACTCTGATGTCGCAATTAAACGACGTGCATTTGACTACCGTTG
TAGGTCGTATCACTGAAGTTGTCGGTATGTTAATCAAAGCCGTTGTTCCCAATGTTCGTGTTGGGGAAGT
GTGCTTGGTTAAACGTCAGGGTATGGAGCCTCTTGTTACCGAAGTTGTTGGCTTCACACAAAGTTTTGCT
TTTCTATCACCATTGGGAGAACTTTCTGGGGTTAGCCCTTCTTCAGAAGTGATCCCAACTGGTCTCCCTT
TGTACATCCGTGCAGGGAATGGTCTTTTAGGGCGTGTGTTGAATGGTTTGGGAGAACCTATTGATACCGA
ACTGAAAGGACCCTTAGTCGATGTTAATGAAACCTATCCTGTTTTCCGTGCTCCACCAGATCCGTTGCAT
AGGGAAAAGTTAAGAACGATCTTGTCCACAGGCGTGCGCTGCATCGATGGTATGCTCACAGTAGCTAGAG
GTCAGCGTATCGGGATTTTCGCTGGAGCCGGTGTGGGTAAATCCTCCCTTCTAGGGATGATTGCTAGAAA
TGCTGAAGAAGCCGATGTTAACGTGATTGCTCTCATAGGAGAGCGGGGACGTGAGGTTCGCGAGTTTATT
GAGGGGGACCTTGGAGAAGAAGGAATGAAACGATCGGTGATCGTCGTTTCTACATCCGATCAATCATCAC
AATTACGATTAAATGCTGCTTATGTGGGTACTGCTATAGCAGAATATTTTCGTGATCAGGGAAAAACTGT
CGTTTTAATGATGGATTCTGTAACCCGATTTGCCCGAGCCTTAAGGGAAGTAGGATTAGCTGCTGGAGAG
CCTCCAGCTAGAGCAGGATACACACCTTCAGTATTTTCAACGTTACCTAGACTTCTAGAACGTTCGGGAG
CATCAGATAAAGGAACAATCACAGCATTTTACACTGTGCTTGTCGCTGGAGATGATATGAACGAACCTGT
TGCCGACGAAGTTAAATCGATTCTTGATGGACATATTGTCTTATCAAATGCTTTAGCACAGGCATATCAC
TATCCTGCTATTGATGTTTTGGCATCAATTAGCCGATTGCTAACAGCAATTGTTCCTGAGGAACAAAGAC
GCATCATAGGAAAAGCTCGTGAGGTATTAGCAAAGTATAAAGCAAACGAAATGCTTATACGTATTGGAGA
ATACCGCCGAGGTTCTGATCGCGAAGTGGATTTTGCTATAGATCACATAGACAAACTGAATAGATTCTTA
AAGCAAGATATCCATGAAAAAACTAATTACGAGGAAGCTGCGCAACAACTTCGGGCTATTTTCCGATAA
>ref|NC_003361.3|:45344-45862 hypothetical protein CCA00036 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGTAAAAAATCACTATATGCAAAAGATTCAGCAATTACGAGAATTGTTGGATGAGGGCACAACGAGTGAT
GCTGTTTTGCAGAGAAAAGCTTACATTAAAGTTGTTGCTGTGCAACTTGCTGAAGAAGAAGAAAAAGTTA
ACAAACAAAAAGAAAGCGTTTTAGCAGCTTCTAAAGAGCTGGAAAAAGCAGAAGTTAATTTAGCCAAACG
GCGAAAAGAGGAAGAAAAGACGCGTTTGCATAAAGAAGAGTGGATGAAAGAAGCTCTCAAAGAAGAAGCG
CGAGAAGTAGAAAAAGAGCAAGATGAAATGGGACAACTGCTTCATCAGTTACGCAAGAATAAACAACGTG
AATCGGGGGAATCTAGTTCATGGAATTAA
>ref|NC_003361.3|:45853-46701 hypothetical protein CCA00037 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGAATTAAATAAAACATCCGAGTCTTTGTACAATTGCAAGACAGATCGCCATTCAGTACAACAAGAAG
TAGGTCCAGAGCCTAAAGATAACCGTGACGTTAAAGTGTTTTCTTTAGAAGGCCGTCAACAATCAAAACA
AGATCGTCAGGATAAAGTTTCCAGTAAAGATTCTCGTCAAGAATCTCGAGGAGCTGATGATAAGCATGTA
GAAGAGAAAACATCAGCAGTATCTTCTAAAGAAGAAGATAAAGAAGAGAGTGATGGTTTCATGGCTTATG
ACAATCCTACAGCAGGCATGGCATTTGTAGATGTTGCTGCTTCTGTATCTAGTGAAGCCGTTGTAGAAAG
TACTACAGTAGCTATCGGCAGTGCAGATTTACAGTGGGTGCAAGATGTTATTGCTAGTACTGTAGAATCT
ATGATGGTTGCTGATGTTAACGGTCAGCAATTAATCGAGTTAGTTTTAGATGCTGAAGGTAATGTTCCTG
ACATTTTTGCAGGTGCGAATTTAACATTAGTACAAACAGGAACAGACCTATCTGTAAAATTCTCTAATTT
TGTAGATAATGCTCAGATGGCAGAAGCAATGAGTCTCATTGTGAATAACCCTTCTCAGCTTGCTGGTTTA
GTAGAGGCATTAAAAAATCGTCATTTGAATTTGACAGAATTGGCTGTTGGATCAAGTATTGTACAATTGC
CAACTATTGAAGAGGTGCAAACACCTCTACATATGATTGCTGCTACAATTCATCAAAGAGATGAAGAGAG
AGATCAAGAAGGACAAGATCAGCAGCAACAGCAAGATCAAGAACAAAACCAATATAAAGTTGAAGAAGCA
CGTTTGTAA
>ref|NC_003361.3|:46714-47829 type III secretion system protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCAGTAGCAGCGGAGCCTAGCACTAGTTGGTTAAAATCCAGAAATGATTTTCTAAGTTCTTTAGTAA
AAACGGAAGAAGGGGTTTCCCTTCCTCCGTTTCCTGAAGATCTATGCCAACAAAAGTTGAAAGAAAAATT
TCGTTTAGAAGACACGAGCCTTACGATTCAACCTCGAGGCTCCCTCTCTGCTGCTCAGGCTGTTAAAGAT
TTTGGAACACATCTTTTAGTGCAGTCATTTTTAGCGCAGCCCTTAGATTCTGGAACCTTTTTCTTTGTTA
CTTCAGAAGCAGATCTTCAATCTTTCATGGTTGCTGTATTCAATGACTCCAGTTTAGCCTCCTATTTTTA
TGAAAAGGATAAGCTGTTAGGATTCCATTACTACTTTTGTGCAGAGCTATGTAAGTTACTCCAAGAATTA
GCTTGGATACCTTCGTTATCTGCTAGGGTCGTAGGAGATGCACGGTTTTCTAGTAAGAATCTGCAAGAAT
CATATCAAGCTGTAGATATCACTTTTGGGTTAGATGGAAACTCTATGCGTTTCCGTTTACTTTTCCCAGA
AGCTCTATGCGACAGTTGCCAAAAGTTTCTCTCAGCATCGAATCAAAACTTTGATGTGCATCAACTAGAT
CCTACGCCTTTGACAATGTCCGTAGAAGTGGGCTATTGCCAACTCACACAAGATGAGTGGCAGCAAGTTG
TCCATGGTAGTTTTATCTTGTTGGATAGTTGTTTATATGATCCCGATACAGAAGAAAGCGGTGGTTTACT
TACTGTTCAAGGACATCAATTTTTCGGTGGTCGTTTTCTCGATCCAGCCTCCGGTGAATTTAAAATTACT
AGCTATCCGAATTTACAACAGGAAGAACCTACTAAAGAAACTCCAGAAGTTCTCCCCGCAGCACCTTTAC
CAGGAAATTGTAAATTAGTAGCGGAAGCTTCTAGATACTCATTAACGGTGGAAGAGTTTTTAAAACTTAC
TCAAGGTAGTGTTTTAAATTTCAATGGTGTCCATCCTTCGCGAGGTGTGGATCTCATTCTCAATGGAGCA
AAAGTAGGAAGAGGAGAGATAGTATCTTTAGGAGATGTTTTAGGAATTCGAGTCCTAGAAGTATAA
>ref|NC_003361.3|:47847-49352 serine/threonine-protein kinase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGATTGTCAATCCGAAATGCTTTCTCACAATCAGGTAATTGGTGCATACCACATCAAGAAGCTCTTGA
GTAAGAAAGAGGGAAGCACAGTATATCAGGGTGTCCATCCCGATACTCTACAGCCTGCAGCTATTAAAGT
TCTTGCAACGCCTTTGGTTACTGATACACCACGAGTTCATAATTTCTTAAAAGAAGCACGGATTATTGAG
CAGATCTCACATCCTAATATTGTTAAGCTATATCAATATGGACAATGTCGAGAAGGTCTATATATAGCTA
TGGAATATATTCAGGGAGTTTCTCTTCGACACTACATCCTCTCTCAGCTCATTCCCTTATCACGTGCTAT
CGATATTATCCTACACATCGCACAAGCTATTGAATATTTACATAGCCGAGGCATACTCCATAGGGATATA
AAACCAGAAAATATCCTTATAACATCTCAAGGAAACATCAAACTTATAGATTTTGGCCTTGCGATAAGTT
CTATAGATAAGGACGCTCGTCCTTTATATTTAGGAACACCATCGTATATGAGCCCTGAACAACGTCAGGG
AGATAAGATTTCTGAACTTTCAGAAATCTATTCCTTAGGCTTAATAGCCTATGAATTGATCTTAGGGAAT
TTAGCTTTAGGTAAAGTCGTTTTGTCCTTAATTCCAGATAGAGTGAGTAAGATCTTAGCGAAGGCTTTAC
AGCCTTCTCCTACAGATCGTTACGCATCTATGAAGGAGTTCATTATTGACTTACATAGATACCGTCATGG
CGAAGATCTGCAAAAAGATCTGCGGAATAAAGATCATACAGCCATGGTGAATGATCAGCTATATCATCAG
AGATTCTGGTTATCTCCCTTAGAGATTGTGGTTCCTGAATACCTAGCAGTTTCTATACATGAACACGGTT
ATCCTACGCATCCCCACGTATACTACGAAGCTTATATGAGTGGAGATACTTTTAGATTATGGTTTTGTTA
TAGTCTTTCGGGAAATCCAACTTTAGTATTAACTGTTATGAAAAGCTTCGTAAGTCAATGGGGTCATGAA
GAGAACATTCGAAGCACAATTCGTAAAATGCATAGCGAATTAATGCGTATCAATGTTCCTATCAATGGAA
AAGGAATCTCCTTATTTTGTGTAACGATCCCTAAAGAAAAAAAGGAACTTTCTTGGATTGCTTGTGGGAA
AACTAGTTTCCGGTTAAAAAAACAAGGAAAGGTTCCTGAGATTTTTACTACTTCGTCCGCGGGTTTAGGG
AAAATTAGTTCTTTACAAATTCAGGAAACCAAGGTTGCATGGGAAATAGGTGATGGAGCAGTATTACATA
CCTTACAGGCAGACGATTCCATGTCATCTTTACATAGTCCTTTATTCACAGAGTTGAAAGATAGAGGACA
AACAGCTATATTCTGCCCAATAGAGAGCGTACGGTACGGGATAGAAGAAAATCATGACGGAAATCTTTGT
CCCTCAACACTTATCAGCTTAAAAAGAATCCGGTGA
>ref|NC_003361.3|:49349-52078 type III secretion protein SctC [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGAAAATAGTGACGTCGAACATTGGAAGAAAGATCTTACAGGTCATAAATAAGAAAAAAGGGAAAATAG
GTGTACTTTCTGTTCTGTTTTTCTTGGACCTGGTTTTACTTGGTGTAAATTCTCAAAAACCACCAATTAG
TGAACCAAGATCTCGAGCTAAAAACTCCCAGGCTGACGAGAAAAGCCAAATTGCCGCTTGTCCTAAGAAC
ATAGTGAATAAGACCTCGGCAAGAAAATCTGAGAAGCAATCTATTGCTAAAAACGTAACACAGAATCAGC
CGCGTCATTTTAAAAAGTCTACGCAGACATTCTCCCCAGGGTTTTCTGAGGGATCTCCGTTTGCTAAACC
TGAAGTTAAAAAACGCCCTCTCGATAACCGTTACACACAAACCGCTGCAAAAAAAAACCCACGCTTCCTT
CCTAAACAAGAAGAAAAAACCGAAGTTGTCGAAGAGAAGAGTGAAGATGCACAAATTTGGGAAGATAAGC
GTGCTTATGCTAAACGTGCTGTAAATGCTATAAACTTTAGCGTAAAAAAGCTTGTTGAAGAAAGCGAAAA
AAAGAGTGCAAATGAAGAAGGCTTTAAAATTGATAACAAAGCATCTTCGCAATCTATAAAAACACAATCT
CCAGATAAGCAGCCTTCTGTTGATACAGTAGCAGTACACGCCGATCCCGAAAAAGATGATAAGCAGCTTC
CCCCAACATTATTGAAAGGGAAGCAAATTACTTGCGCCGATCTTAAAGATAACGGCTATACTGTAAACTT
TGAAGACATCTCTGTTCTTGAATTATTACAATTTGTCAGTAAGATTTCTGGAACAAATTTCGTTTTCGAC
AGTAATGACTTAAACTTTAATGTCACCATTGTTTCTCATGATCCTACATCTGTAGACGATCTTTCTACAA
TCCTTTTACAAGTCTTAAAAATGCATGACTTGAAAGTGGTAGAACAGGGAAATAACGTTCTTATTTATCG
TAACCCTCGCATTTCTAAATTATCTACCGTGGTTACCGACGGTTCTGCAAAGGATAATTGTGAAGCTGTT
GTGGTTACTCGTGTATTCCGTTTATACAGCGTACATCCGACATCTGCTGTAAATATTATTCAGCCTCTAC
TTTCGCACGATGCTATAGTCAGTGCTTCAGAAGCTACACGACATGTCATTGTTTCTGATATCGCAGGAAA
TGTTGAGAAAGTCGGAGAGCTGTTAGCAGCTTTGGACAGTCCAGGGACATCCGTGGATATGTCAGAGTAT
GAAGTGCGTTATGCAAATCCTGCTTCACTAGTGAGCTACTGCCAGGATGTCCTCGGTGCTATGGCTGAAG
AAGAAGCTTTTCAGATCTTCATACAGCCAGGAACAAATAAGATTTTCGTAGTGTCTTCGCCGCGCTTAAC
TAGCAAGGCAATACAACTACTAAAATCTCTGGATATTCCAGAAATGGCACATACATTAGATGATGTCACA
AGCCCCGCCTCAGCTTTAGGAACATCAGGAGCTGCAAATCCTAAAAGCTTGCGTTTTTTCATGTACAAGC
TGAAGTATCAAAACGGCGCAGCTATTGCTCAGGCAATTCAAGATATTGGTTACAATCTCTATGTGACAAC
AGCGATGGATGAAGATTTCATCAATACGCTAAACAGTATCCAATGGCTAGATGTTAACAACTCTATCGTT
GTTATCGGAAACCAGACAAATGTAGATAAAGTTGTTAGCTTACTGAATGGTTTAGATCTACCTCCAAAGC
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AGCACTTGGAGATGAACAAGGTAAGGTTGCCTATGCTTCAGGATTATTAAGCAATACAGGTCTTGCTAAT
CCTGCAAAAGCTACAGCACCTCCTCTAAAACCTTCTCCAGGAGATATTCCGTTACCGACACCTGGTCAGT
TAGCAGGCATTAGCGATATGATGTATGCATCCTCAGCTTTTGGATTGGGGATCATAGGAAACGTTCTTAG
CCATAAAGGGAAATCTTTCTTAACCTTAGGGGGACTACTCAGCGCTTTAGATCAAGATGGCGATACTGTC
ATTGTTCTTAACCCAAGAATTATGGCTCAGGATACACAACAGGCATCTTTCTTCGTTGGGCAGACGATTC
CTTTCCAAACGACAAGTACGATCATTCAGGAGACAGGAACTGTCACACAAAATATCGAATATGAAGATAT
CGGTGTTAACCTTGTTGTCGCTTCAACGATTGCTCCAAATAACGTCGTCACTTTACAAATAGAACAAACT
ATTTCTGAACTACATTCTGCTCAGGGAACTCTTACACCTGTAACTGATAAAACATACGCAGCCACACGTT
TACAAGTTCCAGATGGATGTTTCTTAGTAATGAGTGGTCATATCAGAGATAAAACTACAAAAATTGTTAC
GGGAGTGCCTCTGCTAAACTCTATACCTTTAATTCGAGGTTTGTTCAGCAGAACAATAGATCAAAGGCAA
AAACGTAACATTATGATGTTCATTAAGCCTAAGGTTATTAGTAGTTTCGAAGAGGGCACAACATTAACGA
ATAAAGAGGGTTATAGATATAACTGGGAAGCTGATGAAGGATCTATGCAAGTAGCACCACGACATGCTCC
TGAATGTCAGCGCCCTCCTGCATTACAAGCAGAAAGTGATTTTAAAATGCTAGAAATAGAAGCCCAATAA
>ref|NC_003361.3|:c53783-52707 ATP:guanido phosphotransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATTCTTCCCAATGACTTACTTCTTAATTTTGCTAGTAAGAAAGACGCCCCTCCTACAAATAAAACCT
GGCCGATAACAACGTTCTCACTATCTAGGAATCTTTCCATAGCGAAGTTTCTTCCTTGTTTATCTAGGGA
GAAAAAGCAGGAAATTTTAGAGGCTATTTCTTCGCATTTCAATGCTATTGAAGGTTTTGATGAGTTTCTA
GTTTTACCTCTTAAAGAGGCTCCTGCTTGGCAAAAAGAATTTCTTATGGAGCATTTTCTATTTCCCTATG
ACCTAACAGGGAACCCTGAAGGCGAAGCTCTTATTGTAAATCGTTCTGGAACTATCCTAGCAGCTATAAA
TTTCCGAGATCATCTGATTCTCCATACTATAGATTTTACCTGTGAGCCTGAAAAAGCTTTAGATCAGCTT
GTACGATTAGATGCTTATCTTAATGAGAAGTTAGAGTTTGCTTTTTCTTCAGATTTTGGTTTTCTAACTA
CAAATCCTCGAGAATGCGGTACAGGACTAAAAAGTCAGTGTTTCTTGCATGCTCCGGCATTAGTATATTC
TAAGGAATTAAACGATATTATTGATGAGGATACAGAAGTTGCTTGTTCAGGAATACTGCCAGCAACGCCA
GGGTACATTGGAAATATGCTAGTATTATCCAATAAATACTCTTTAGGGCTTACTGAAGAGCAGATCTTAT
CATCATTAAGAATATGGTCATCGAAAATATCTGTTGCAGAAGCCTCTGCTAAAAAGAAGGCTGCTGAACA
AAATTCTGGAGAGTTAAAAAATCATATTCTACGCGCGTTAGGCCTGCTTACGCATGCGTATCATTTAGAC
CTTCAGGAAACATTAGACGCGTTAAGCTGGATTCAATTAGGGATCAGTCTAGGATGGATCCAAGGAGCTG
ACAATAGCCCTATGTGGAATCCTGTATTCTGGCAAGCACGTCGTGGACATTTAGCGCTCTCACAACAACC
TGCAGATAATAAAAATCTGCAAAAAGAAGTCATCACGCAATTACGCGCGGATGTGTTAAAGAAACTTGCG
AGCAACTTATCCCCTACCGGCTTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c54285-53767 hypothetical protein CCA00042 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCGACTTCTAAACCTCATCAGTGTTATCACTGTCAAAAGCCAGCAATGATTTGCTATACTGAAGTAG
ATAAGGATAAGATTTTACGTTCTTATGTATGTGAGTCTTGTCCTTGTCCCAGTCACTACTACAGTCGTGA
CAACACTGCTGTGGGGATTTCGGGATCTTTAGTAACTTTAGAGTGTGGTAATTGCAAAACTGTATGGCAA
CCGACTGCTGATGAAGATCAGTTATTTGGTTGTCATTTATGTTATGCTAATTTCAAAACACAGCTTATTG
CCAAGCTAATGCATACTAAAGCGATTTTCTCTTCGGCAACTTCTGACACTAGTCGCGGTTGCTTGCATAT
TGGTCGCGCTCCTGGAGAAGCGGCGAGTATGAACCCTCTTCTTAAACTCATAGCTTTAAATGAGGCTCTT
CAGGATACGTTAGCTCGTGAAGATTACGAGCAAGCTGCTGTAATACGAGACCAGATTAATCATTTAAAAA
ATCAGAATTCGCATGATTCTTCCCAATGA
>ref|NC_003361.3|:c55233-54691 ribosome recycling factor [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCCAGTCTAACTGATACCGAAAAGAAAATGGCTGCTGCTTTAGAATTCTTCCATAAAGAAGTTAGAT
CATTTAGAACAGGAAAGGCTAATCCTGCTTTAGTAGAAACCGTAACTGTGGATGTGTATGGAACCACAAT
GAGGCTATCTGATTTAGCCTCTATTTCTGTAGCGGATACACGTCAGTTAGTTATTTCTCCTTATGATGCG
AATAACGTTTCTGCGATATCTAAGGGTATCATTGCTGCAAATTTAAATTTGCAACCCGATGTAGAAGGAA
CCATAGTACGTATTAAGGTTCCAGAGCCTACTGCAGAATACAGAAATGAAGTTATCAAGCAGTTACGTCG
TAAATCTGAGGAAGCGAAAGTAGCTATTCGCAATATCCGTAGGGAATCTAACGACAAGTTAAAAAAAGAT
TCTGACTTAACAGAAGATGCTGTTAAAGGAATGGAAAAGAAAGTCCAGGAATTAACAGATAAGTTCTGTA
AGCAAATCGACGAAATCACAAAGCAAAAAGAAGCTGAACTTTCGTCGATATGA
>ref|NC_003361.3|:c55957-55235 uridylate kinase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCTAAGCGAATAACACGAGTCTTATTTAAGATTTCTGGAGAATCTCTCTCAACAGATAGTGGAAACC
GAATTGATGAAGTTCGTTTATCCAGATTAGTATCAGAATTACGTGCTGTACGTAACAGCGATATCGAAAC
AGCTCTTGTTATAGGCGGTGGAAATATCTTAAGAGGTCTTGCTCAGCAAAAAGAACTACAAATCAATCGC
GTATCTGCAGACCAAATGGGTATGCTAGCTACTTTGATTAATGGCATGGCAGTAGCAGATGCATTAAAAG
CTGATGACATTCCTTGTTTATTAACTTCTACCCTTTCCTGCCCTCAATTAGCAGATTTATACACTCCTCA
AAAGTCTGAGGAGGCATTAAGCCAAGGCAAAGTTTTAATTTGCACAACAGGAGCAGGATCTCCTTACTTA
ACTACAGATACAGGAGCAGCTTTGCGCGCCTGTGAGTTAAAAGCGGATATCCTACTTAAAGCAACTATGC
ATGTTGACGGAGTTTACGATAAAGATCCTCTGATGTTTACCGACGCTGTAAAATACGATCGCATTAGCTA
TAAGGATTTCGTAGCTCAAGGATTAGGTGTCATGGACGTTTCTGCCGTATCTTTATGTATGGATTCTAAT
ATTCCTATTCGTGTCTTTAGCTTTGTTAAGCATTCTTTAGAACAAGCAATTTTCGATGAGAATATTGGAA
CATTAATTTGTGGAGACGCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c56821-55973 elongation factor Ts [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGCAACTTTTCTATGGAAACCCTCAAACTCTTAAGACAACAAACCGGTGTAGGGTTAACCAAATGTA
AGGAAGCTTTAGCTGAATGCAATGGCAATCTTGAAGAAGCTGTTGTTCACTTACGTAAGTTAGGCCTTGC
CTCTGCTAGTAAAAAAGAACACCGAGAAACAAAAGAAGGCGTTATTGCAGCGAAGAGCGATGCTCGAGGC
ACTGCTGTTGTCGAAGTTAACGTAGAAACAGATTTCGTAGCTAATAATGCTGTATTCCGCACCTTTGTCG
ATGGTCTTGTTGAGGATGTCTTAAATCACAAAGTAAATAGTGTAGATGCATTATTACCTCTAACTTCATC
TCAAGATGCTTCTCTTACCATTGATGAGTTACGTGCTGTAACCATGCAAACTGTCGGAGAAAACATTCGC
ATTAGCAGAATCAAGTATTTACCAAAAACAACAGAAGAAAGTGTGGGAATTTACTCTCACGGCAACGGGA
AAGCTGTTTCCGTGACTGTTCTTTCTGGAGTCGCTGATAAAGAAAGCTTGGCTAAAGATATTTCTATGCA
CATCGTTGCGGCTCAACCTCTGTTCTTAAATAAAGAAAGTGTGCCTGCAGATGCTTTAGAAAGAGAAAAA
GAAGTAATTTCTTCTCAAGTACAAGGAAAACCTCAAGCTGTTATTGATAAGATCATCAGTGGCAAATTGG
GAACATTCTTCCAAGATGTTTGTCTACTAGAACAAGCTTTCATTAAAAATCCTGATATAACCATTCAAGG
TTTGGTTGACGACGCTAGTAAAACTAGTGGCAATTCCGTCGAAGTGAAGGAATTCATTTTATGGAAAATA
GGAGCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c57651-56821 30S ribosomal protein S2 [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGGAAGAACAACCACTATGCACTCTTTCAGTTAAAGACTTAATGGAAGCGGGGGCTCATTTTGGGCACC
AAACGCGAAGATGGAACCCAAAGATGAAACTTTACATCTTTGAGGAGAAAAACGGTCTTTACATTATCAA
TTTAGCAAAAACTCTTTACCAATTACGTAACGCCCTTCCACATGTGTGTAAGGTCATTAAAGAGAATAAG
CCTATTCTCTTCGTAGGAACCAAAAAACAAGCCAAATGCGTCATCAAAGAAGCGGCTATAGAAGCTGGCG
AGTACTTTGTTGCTGAGAGATGGTTAGGCGGTATGTTAACCAACATGGCGACTATCCGAAACTCCATTAA
AACTTTGGATAAAATCGAAAAAGATCTTACTCAAAATAGTTCCTGCCTAACAAAAAAAGAAATTGCCTTA
CTTGCTAAGCGTCATCAGAAATTATTGAAAAACTTGGAAGGTATCCGTTACCTAAGAAAGATTCCAGGTT
TGGTTATCGTTGTTGACCCTAGCTATGAAAAAATCGCTGTTGCGGAAGCTAAAAAGCTCGGCATTCCTGT
ATTAGCCTTGGTTGATACAAACTGTGACCCAACACCGATTGATTATGTTGTTCCATGTAACGACGACTCT
TTAAAAAGCATTCGCTTAATCATTAGCGCTATTAAGGATAACATCATCAACACCAAGAAAAAACTTGGCG
TTGAAATTGTTTCCCCAATTAAAACTTTAAGCACCGAAGATGGATCTGAAGAGATCGATATCGCAGCAGG
TGATGACAATCGTAAAGAAGATCTATTAGCAAAAAAATATGACAGTAATGAGGCTAACTAA
>ref|NC_003361.3|:c59197-58028 major outer membrane protein, porin [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAAAACTCTTGAAATCGGCATTATTGTTTGCCACTACGGGTTCCGCTCTCTCCTTACAAGCCTTGC
CTGTAGGGAATCCAGCTGAACCAAGTTTATTAATTGATGGCACTATGTGGGAAGGCGCTTCAGGCGATCC
TTGTGATCCTTGCTCTACTTGGTGTGATGCTATCAGCATCCGCGCAGGGTACTACGGAGATTATGTTTTC
GATCGCATCTTAAAAGTTGATGTTAATAAAACTATCAGCATGGGGACAGCTCCAACTGGTAATGCAGCTG
CTGACTTTAAAACCGTTGCAGACAGGAATAACATAGCCTACGGCAAACATATGCAAGATGCAGAATGGTC
CACAAACGCGGCTTTCTTAGCATTAAACATTTGGGATCGTTTTGATGTCTTCTGCACATTAGGGGCATCT
AACGGCTATCTCAAAGCAAATGCTGCAGCTTTCAATCTAGTCGGCTTACTTGGGGTAACAGGAACAGATC
TTCAAGGCCAATATCCAAACGTAGCCATCTCTCAAGGCCTTGTAGAGCTTTATACTGACACAACCTTCTC
TTGGAGCGTTGGTGCGCGTGGAGCTTTATGGGAATGTGGTTGCGCAACTTTAGGAGCAGAGTTCCAATAT
GCGCAGTCTAATCCTAAGATCGAAATGCTTAATGTAATTTCTAGCCCAACACAATTTGTGATTCATAAGC
CTAGAGGATATAAAGGGACAGCGGCCAACTTCCCTCTGCCTTTAACCGCTGGAACAGAGAGCGCTACTGA
TACTAAATCAGCTACAATTAAGTATCATGAATGGCAAATTGGTTTAGCTCTTTCTTATAGATTGAACATG
CTTGTTCCATATATTGGAGTAAACTGGTCCAGAGCTACATTTGATGCTGACTCTATCCGCATTGCTCAGC
CTAAATTACCTACGGCCATTTTAAACCTAACTACATGGAACCCTACTTTATTAGGGGAGGCTACTACTAT
AAACACTGGAGCAAAATATGCTGACCAGTTACAAATTGCTTCGCTTCAAATCAACAAAATGAAGTCTAGA
AAAGCTTGTGGTATTGCTGTTGGTGCAACCTTAATTGATGCTGACAAATGGTCGATCACTGGTGAAGCTC
GCTTAATCAACGAAAGAGCTGCTCACGTAAACGCTCAATTCAGATTCTAA
>ref|NC_003361.3|:59801-63076 PBP2-transglycolase/transpeptidase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAACCCTCTAAGAAACGTCGTTCTTATCTTACAGTTCCAGAAAAGACAAATAGGCTATTGTCGGGAA
TTATCGTAGCGTTAGCAATCATTGCTGTGCGTTTATGGCATCTCGCTGTTGTTGAGCATGATCAGAAGCT
GGAGGAGGCTTATAAGCCGCAGGTAAGGGTGATTCCAGAGCTTGTTGAGCGTGCGACAATTTGTGATCGT
TTTGGCAAAGTATTAGCAAAAAATACGATGCAATATGATGTGAGCGTAGCTTACGGAGCTATTCGGGACT
TGCCATCTAGGGCTTGGCATGTTCATGCAGATGGCACGCGAGAGCTGATTCCTGTTAGGAAAAATTATAT
CACACGTTTATCAGAACTCCTTGCTCAAGAGTTGCATCTAGATAAAGATGCAATAGAAGACAGTATTCAT
GCAAAAGCTTCTGTATTAGGCTCTGTGCCCTATTTAGTTCAGGCTAATGTTCCTGAGCGTACGTATTTAA
GACTAAAGATGATGTCGAAACATTGGCCTGGTTTGCATGTAGAGCCTAGTGTACGACGTTATTATCCCAT
GCGCAAGATGGCTTCTGATATTTTAGGTTATGTAGGACCTATTAGTGCTCAAGAATATAAGCAAGTTACG
CATGAGCTAAGTAAGTTGCGAGAATGTGTTCGAGCGTATGAGGAAGGTGAAGATCCGAAATTTCCTGAAG
GTTTAGCAAGCATAGATCAAGTGCGTTCTTTATTAAGTTCTTTAGAGAACAATGCGTATAGTTTGAATGC
TTTAGTTGGAAAGTTGGGTATAGAGGCGTGTTGGGATGGGAAATTACGGGGTCAATTAGGTAAAAAAACC
GTTCTTGTAGATCGTCGTGGTAACTTCATTCAAGGTATTAGTGCAATTGCTGCAACTTCTGGAAAGAAGT
TGCAGCTTACATTATCTACAGAGCTACAAGAATTTGCAGATGCTTTGCTTTTAGATCATGAAAGAACGGA
GCATTTCCGTTCGGCACAATCATTAAAGAAGCAAAAACTTTTACCTCCTTTATTCCCTTGGATTAAAGGC
GGGGCAATTATTGCTTTAGATCCTAACAATGGCCAAATATTGGCGATGGCATCATCTCCGCGTTATCACA
ATAATGACTTTATTGATATGCGGATAGGGTCAGATTTAGAAGCAAGATCTGAAGTATATCGTTGGCTGGA
AAATGTTGAACATATTGCAGAAGTCTATGATAGGAAGGTTCCTTTGCGTCGTGAAAAGAGAAATCCTTTG
ACGGGTTTATGCTATGATGAGGAGCTTTCTCTTACTTTTGATTATTTCCTAGATTTCATTCTTCCAAATA
CATCAGAGCTTAAGTCAGTTGTTAAGCGTTATGGGACTGTAGAGAACGCTATTAAGCTACAACAGGTTGT
GGAGCGTTTATTAGATATATTTTCTTATTCTGAAGGGCATTGCTCGTGCTCTTCTATATTTGATGCTGTG
TTTCCTTCAGAGCACGAGCACGTGACTATAGGCAGGGTGATTTCTAAAAAGCAGCAGCAGTGGATAGCGC
GCTGTTGTAAAGACTATGAGCAAGAAATCGAGGAGGTTAAGCTTGAGCTTGAACCATTTTTTGCTGAGCT
CCCAGCAAATTACGATAAGCTGTTGCTTATAGATCTATTTCAGATGGTTATCGATCCTTCGAGATTTCAT
CCTGAGCTACTTTCGTCAGTAGGCTCTCTTTCTTTATCGGAATTTTTCGAATGTCAGGGCCATTACGTAG
CTTTGCGTAGTGCATTTTCTAAGATTGTGGAAGATATTTTTACTGAGATAGATTTTAAAGAGTGGAGAAA
GCTTTATTTTGCAAAGTTTCTAGAGCTTAAGCGTAAAGAGGAAAACGAGAGGAAGCAACGTTATCCTACA
CCCTATGTAGACTATTTGTTAGAGCAAAAACGTGCGCAATATCAAGATTTTCGTCGTTGTTACCTTGATA
CGTTTTTAACGTATTTACTTTCTGGACAAGGGGAAACAGAGCATCTAAAGGCTTATTATGAAGCCCTTTC
CATATGGAAAAGAGAATTAGAGAGTGGAGCACATAAAGCACTACCTTGGTATGAGCATTATGAGTTTTTA
AAACAGAAGTTTTCTGATTCTTCAATTGATCTACTACAATTGTTCTTATCCTTCAGGGAGTTTTCTGAGC
TACAGCGCCCTCTCTATGGTAATTATGCTCCCATGCTTACAAGAAATATTCCTCAAAAAGAACAAGATTT
AGCTGCAGCATTTTATCCTACTTATGGTTATGGATATCTACGCCCACATGCTTTTGGTCAGGCAGCAACT
TTAGGGTCTATTTTTAAACTTGTCTCTGCCTATTCTGTATTATCTCAAGAGGTGATGCGAGGGAATGTTG
ATGTAGACTATCTATCTCGTTTGCTGGTTATTATTGATAGGCAGTCTTTTGGTTATGTAAGTGCTAAGCC
GCATGTGGGCTTTTTTAAAGATGGCTCCCCCATTCCTTCCTTTTATCATGGGGGAATTTTACCGAAGAAT
GATTATGCGGGACGCGGACGCATTGATTTGATTGCTGCTTTGGAAATGTCTAGCAACCCCTATTTTTCTT
TGCTTGTTGGTGAGCATCTCTCTGATCCTGAAGATCTATGTCACGCAGCATCTTTATTTGGTTTTGGAGA
AAAAACAGGCGTGGGATTGCCAGGAGAGTATGCTGGTGTCATTCCTCATGATGTGGCTTACAATCGTTCA
GGATTGTACGCAACCGCAATAGGACAGCATACTCTTGTTGTTACTCCTTTGCAAACGGCTGTTATGATGG
CAGCATTGGTTAATGGTGGGGCTCTTTATGTCCCTAGTTTAGTTTTGGGAGAATGGGATGGGGAGGAGTT
TTATAAAGTATCTCCTGTGAAAAAACGGGATGTATTTATGCCTGAGTGCATAACGGAATTATTTAAGTCT
GGGATGCACAATGTAATTTGGGGAAAGTATGGAACGACACGAAGTATTCGCGAGCAGTTTAGCCCAGAAT
TATTAAGCCGTATTGTCGGAAAAACAAGCACGGCTGAATCTATAGTACGTGTAGGTTTAGATCGACAATA
TGGAAATATGAAGATGAAGCATGTATGGTTTGCTGCTGTAGGGTTTCCTGATGCCGAACTTGCTCATCCT
GATATTGTTGTCATTGTTTATTTGCGTCTTGGAGAGTTTGGAAGGGACGCAGCTCCTATTGCTGTGAAAA
TGATAGAAAAGTGGGAGAAAATAAGGAAAAAAGAAGGTTTTTCTTCTAATTTGTAA
>ref|NC_003361.3|:63144-64151 type III secretion chaperone, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGAAGAAGCTGCGAAACATCTAGCCAAAGAATTTCTCTGCTCAGGAATTAACTTCTTTTTGAGTGGGG
AATATGAACAGGCAGAACGAAGGCTAAAAGAAACTTTAGAGCTAGATCCTAAAGCAGCGCTAGCCTACTG
CTATTTAGGAATTATTGCTTTAGAATTAGGAAGAATTCCTGAAGCGCTAACTTGGTGCACAAAAGGATTA
GAATCCGAGCCTGGGGATAGCTATTTACGTTATTGTTATGGAGTAGCTTTAGATCGGGATAATCGTTGTG
AAGAAGCTATAGAGCAATACCGTGCTTATATCATTTTGCATCCAGATGACGCTGAATGTTGGTTTAGCCT
AGGAGGGGTCTATCATCGTTTGGGTAGATATATAGAAGCAATAGAATGCTTTGATAGGATCTTAGAGCTG
GATCCTTGGAACCCACAGAGCATGTACAATAAAGCTGTTGTTTTAACAGATATGGACAATGAGCTAGAGG
CTATTGCTCTATTAGAGACTACGGTAAGTAAAAATCCTTTATATTGGAAAGCGTGGATAAAGTTGGGCTA
CTTACTTTCACGCCATAAGCAATGGGACAAAGCCACAGAAGCTTATGAAAGGGTTGTGCAGTTACGTCCC
GATCTATCCGATGGTCATTATAATCTAGGTTTATGTTACCTCACCTTAGATAAAACACGTTTAGCTTTAA
AAGCTTTCCAGGAAGCTCTCTTTTTAAATGAAGAAGATGCGGATGCGCATTTTTATGTTGGGCTAGCTCA
TATGGATCTTAAGCAAAACCAACAAGCGTCCGATGCTTTCCATCGTGCGCTTGGAATTAATTTAGAACAC
GAGCTGTCTCATTATCTTCTCGGCTATCTTTATCATATGGAAGGGCAGTCAGAAAAAGCAGAGAAAGAGC
TGTCGTTTTTAACTGTGAAAGACTCCATGTTCGCTCCTTTGCTACAAAAGACGGTGTCTTCGGGGCAATT
TGAACGTAGATTGGATGTGCTGCCATAA
>ref|NC_003361.3|:64506-65960 cysteine desulfurase activator complex subunit SufB [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGCCAGTCTATAGAAGATTTTTTACAGAATCATCAAGATTATCCTTATGGTTTCGTCACACCTATAG
AGTCGGAGGGATTAACTAGAGGTCTTAGCAAAGAGACTATCGAAGAAATTTCCCAATTGCGCAAAGAACC
TTCTTTCATTTTAGATTTCCGCTTAAAAGCTTATCAGCATTGGAAAAAATTGCAGGAGCCTGGCTGGGCT
AGGCTAAATTATAATCCTATGGATTATGAGGAGATCGTCTATTTTTCTGCTCCGAAGCAAAAAAATCCTT
TAGGGCGTTTAGAGGAGGCTGATCCTGAAATTTTAGAGACTTTTAAAAAGCTGGGCATCCCTTTAGATGA
GCAGAAACGTCTATTAAATGTTCAGAATGTCGCTGTAGATTTAGTTTTTGATTCTGTATCGATAGGGACG
ACCTTCAAAGAAGCTTTGGATAAAGCTGGGGTGATTTTTTGCTCAATGAGTGAAGCCATTCGTGAACATC
CTGAACTAATAAAAAAATATTTAGGCACAGTTGTCTCTCATAGGGACAACTATTTTGCAGCTTTAAATGC
TGCTGTTTTTAGTGATGGTTCTTTTGTCTATATTCCGAAGGGTGTGCGTTGCCCTATGGAGATTTCTACC
TATTTTAGGATTAATGATAAGGAGTCAGGGCAATTTGAACGCACGTTAATTATTGCAGAAGATGATGCTT
TTGTGAGCTATCTTGAAGGGTGTACGGCTCCATCATTTTCTTCAAATCAGCTGCATGCAGCTGTTGTAGA
GCTCGTAGCGCATGAACGGGCTGTTATTCGTTATTCTACCGTGCAAAATTGGTTTTCTGGAGATAAGAAA
ACGGGCAAGGGTGGAATTTATAATTTTGTAACCAAGCGTGGCTTGTGCGCGGGTTATAAATCAAAGATCT
CTTGGTCTCAGGTTGAAGTTGGCGCAGCAATTACGTGGAAATATCCAAGCTGCATTTTGAGGGGGAAAGA
AAGCGTGGGAGAATTTTATTCCATAGCTTTGACAAATGGCAAAATGCAAGCCGACACCGGGACTAAGATG
ATTCATGTGGGGGAAAAAACAACTTCAACAATAGTTTCTAAGGGAATTTCTTCTGAGGACTCTCATAATA
CTTTCAGGAGTCTTGTTTCTATTTCGGAAGGAGCTGTAGGAAGTCGTAATTACACACAATGTGATTCGAT
GTTGATAGGCCAGTCATGTGGAGCTTATACCGATCCTAAAATTACGGTAGAAAACTCCAAATCATCAGTT
GAACATGAGGCCACAACATCGAAATTACGCGCAGATCAGTTAATGTATTTGCGTAGTCGCGGATTGAGTG
CGGAAGAGGCTGTAAGCTTGGTGGTGCATGGGTTTTGCCGTGAGATTATCGAACAGTTGCCTTTAGAGTT
TGCTCGAGAAGCTTCGAAATTATTGTTTGTTAAGTTGGAAAATAGCGTGGGGTAG
>ref|NC_003361.3|:65964-66731 ABC transporter, ATP-binding protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCTACATATACAAAACTTACATGTATGTTGTGAGGATGTTAAAATCCTGGATGATTTAAACTTACACA
TCTCTCCAGGAGAATTACATATTATTATGGGCCCTAATGGAGCAGGAAAATCTACCTTTGCTAAAGTGTT
ATCAGGAGATGATAGCGTGTCTATTATTTCTGGAGATATTCGCTTGTTGGATCAGGATCTATTAGACAAA
GCTCCTGAAGAACGAGCGCAGATGGGATTATTTATGGGATTCCAACAGCCTCCGGAAATTCCTGGTGTAA
ACAACAGGCTTTTCTTGAAAGATGCTTATAACGCCTGTAGGCGGTCTCGTCAGGAAGAAGAAATAGCAGA
AGCTGAATTTGATATGCTTCTGTCTTCTGTTTCTGAAACTTATGAATTTGAATCATTTAATCACTTCTTA
GAAAGAAATATCAATGAAGGATTTTCTGGCGGGGAGAGAAAGAAAAACGAAATCTGGCAAATGCTTGTTT
TAGAGCCAGAGATGATACTATTAGATGAGCCCGATTCAGGATTAGATGTGGATGCTTTAAGGTTTATCTG
CAAAACGATTGAGAAGTATCGAGAGATTCATCCTAAGAGTGCTGTGTGTATAGTTACGCATAACCCTAAA
TTAGGTAATCTTCTTCAACCCGATCACGTTCATATCTTATTAGAAGGAAGGATAGCGTGTTCAGGGGGAG
TTTCTTTGATGCGTGAGCTAGAAGAAAAGAGTTATCACGAAGTATTGTCCTGCTCTTCTCGGGGGTAA
>ref|NC_003361.3|:66733-68007 hypothetical protein CCA00052 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTGAATTTTTTAGAACATAGCCGCTCTATAGCTAAAGGTTCTCCTATACATCAAGCGACGCAAATAT
GCTATGAGAAACACTTTCAGTCTGAATCTTTTAAAGAGATTTTTCGGGCTTTCTCTTGGCTTAAGGATCT
TACGCAATTTCCAGAGAAATACTATATTTCCCATGGAGGATCGGAGACTGCGAAGCAACATTGGTTACAT
CATGAAAATTCTCTGTCTTGCGAGTGCATTTTAATTAACGGTAAATACGAACCTTCACTTTCTCAATTAC
CAGAGGGAGTGTTGTCGATGTCGTTAAAAGATGCGCAATCTGTTTTCTCTACTTTTATTCAAAGATATGA
TGTAGATGCACAACCTCTAGCATTTCTGAATGCTGTGTGTTCTCAAGAAGAAGGAGTCGTTATTTATGTT
CCTGAAGAATTTCAGGTGCGTGAACCTTTAAGCATTCGTCATATTTGCTTCCCAATGGCTCAAGATGAGC
GGGTGATTTATTCTCCAAAGATTGTCGTCATCTTAGGAAAGCAATCCAGCTGTTCTGTCCAAATTTCTCA
TCATACTGCGCGAGAAAGCGGTGTTACTGAAAGCTTTGCTATTATTAATGGTGTTACAGAAGTTTTTGTA
TCAGAGGGTGCGGAGTTGTCTTTAACTATGCTACCTAAATACATCCACGAGGAAAGAATAAGTTGGTCGC
ATATAGCAACTATTGAAGAACAGGGGGCCTGTTCTATAACCCAATATCTTCAAGAAGATGTTGGAGGTTA
TGGTTGGTTTGACAATACCTTTTCTATGATAGGAAATAACGCTCATGGAGAGTCTTTGGTTTCTACCCTA
TCTCCGAAAAAGACGTGGGTAAGGAACCTTATGTATCATGATGCAGAGTCTACAACATCACGACAGAATA
TCAAATCCATCCTGTATTCTGGGCATTTCCTTTTTGAAGGAGGTATCCATATAACGTCTCGTGGGATGTT
TGCTGATGCTTATCAAAAGCACGACACGTTATTGCTTAGTGATCACGCCCATGTTACAACTTTCCCAAGA
TTAGAGATTCTTACCGATGATGTTAAAGCCTCTCACGGAGCTACGGTAGGACCGTTAGATGCTCAACAGA
TGTTTTATATGCAATCTCGGGGAATGACACGCGAGGAAGCTCAGAAGAAGCTTGTTCGGGGATTTTTATC
TGTAGAGACTTCTCAAGAGCATTTTCCAAAGTTGACCAGACTATCTCAAGAAATTATTAAGGAGCGCTCT
ATAGATGGTATGTAG
>ref|NC_003361.3|:67997-69217 aminotransferase, class V [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTATGTAGGATAAAAGAAGACTTTCCTATTTTTGCTAATAAAGAGCTTCAAGGGGAACCCTACATTT
ATCTAGACTCTGCTGCTACCACGCACAAACCTAAAAAGGTAATAGAGGCGATTAGTGATTTTTATAGCAG
TACATATGCTACTGTAAATCGTAATGTCTATAGTTCTTCGAAAAACATCACCGAAGATTATACTGCTGTT
CGTGGAAAGATACGCGAGTGGATACACGCTGCGTATAATGAAGAAATTATTTTTACTCGAGGCACGACAG
CAGCTTTAAATTTATTGGCAATATCTGCCAATGATACCTTCATTCCTGAAGGTGGTGTTGTATTAGTTTC
TGAAGCAGAACATCACGCAAATGTTTTATCTTGGGAATTAGCTTGTCGTAGACGCGGATCTTGCGTGAAG
AAAATAGCTGTTGATGATTCTGGTTATATAGATCTAGAGCATTTAGAGGCCTTGCTTAAGGCTGGGGCTT
CTTTTGTCAGTATAGCACATGTAAGTAATGTTACAGGATGTATCCAACCTTTAAAGCATATAGCCCATCT
TGTTCATCAATACGGAGCCTATATTTCTGTAGATGGTGCTCAGGGAGTTGCTCATACCTTTGTGGATGTT
GTGGATTGGGATGTTGATTTCTATGCTTTTTCAGCTCATAAGATGTATGCGCCTACAGGGTTAGGCGTGC
TATATGGTAAGAAAGAGCTTTTAGAAAAACTATCTCCTGTAGAGGGAGGTGGGGATATGGTCTCTATTTA
TGATAGTGAAAATCCAGAATATCTTTCTGCGCCATTAAAATTTGAAGCAGGAACCCCCCCTATAGCTTCT
ATTTTAGGATTAGGAGCTGCTATAGACTATCTACAATCTCTACCTGATACTGTATATCGGCAAGAGGAAG
AGCTAACGCAGTATCTTTATAATGAGCTCATGACGATTCCTGGTATGCAGATACTAGGTCCGGGGATAAA
TCAGCTGCGCGGAGCTTTGGTGAGTTTGAAAGTTCAAGGCGCGCATCCTTTTGATATCGGTTGTCTTTTA
GATCTTCAGGGAATAGCCGTGCGTACAGGGCATCAATGCGCACAACCTGCCATGAACCGATGGAATCTAG
GCCATGTTCTTAGAGTATCCTTGGGGATATACAACGATAAGAAAGACATTGATACTTTCATGTCTGCTTT
ACGAGCTATACTAGCTAGAGTGCGGGTGTAG
>ref|NC_003361.3|:c69999-69220 hypothetical protein CCA00054 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCTGATTGTTTTAGCCTTTCGCCAAGTCTTTTTCTCTAAACAGCCAGGTCTTTTAGAAAAATTGCAAA
GGTATTTGTTACTGCTTAAACAAGCTTATCCCTTAGTGCTCCCCGGAGAACCTATAAAAAAGTTATCCCT
GATGTTAACTTTTGATCATGCCTCCGTAGATTTTTACTCTCATATTTTTCCGTTTCTACAAAAGCATCAC
ATCCCTGCTGTTGTTGGAATTGCTTGGAGATATGTCGCTAAAGATTCTGCTTCTTCTCTTCCTCTCAGCC
ATCGTTTATCTCCTAGCGAAACTCTCGCGTTTCAAGATGAAGTTTTTGCAGCTCATCAACCATTTTGTAC
AAAACAAGAATTGCAAATACTTGCAGATTCTCCCTATATACAATTAGCCTCATCAGGATTTGCTATTCGC
AATTTACAACACTCTCCTCCCTACCTTGCTACAGAGATTTTCTTATCTAAATATTCTATAGAACAAGCTC
TTGGGAAAACTCCCTTAGGATTTTTCTATCCTTTTGGGAAATATGACGATGCATGTGCAGAAGTAGTTAA
GAAACACTACCCTTTTTCTTTTGTTTTAGGAAATACACTAAACAGAAAAACAAAGTATCACGGGATCTAT
CGTATAGATATGACACATGCAGCATATACGTTGCCCAATATCCACAGACCACAATACATCAAAAATTGGC
TAATGGATAAATGTAGACAGACGTATTTGCGCTGGAGCCCTAACAAAGAACGCATTGCGTTTCAAGAAAG
CTCTCGCTAA
>ref|NC_003361.3|:c70846-70193 hypothetical protein CCA00055 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAGAACTTACTATCCTCTATATGGAAAAGGGTTTATTCCTATTCGTTTGCTTTAACAGTCCTAGTGA
CCTCGTCCCTATTCCTGACAGGAAAGATCATTTATAATTTCCAAAAGAGCGATCGCGAGAAGCATGAAAG
TATTCTTCTTCTTACAAAAACTGCAGAAGCTGCAGTTTTTCAAGGGTTCATACCTCCTAAAACTGCCTTA
CCTATGTTAGAACGTGCCTATCGCATGGGTGGGAACTCGTTAAAACCTTATGCAGGTTTCCTTTCTTCAT
GTTTTTACATTCATAATGAGCCCCTACGTGGTGCTTATTATGCAGGACTTGCCTACGGTAGCGGAGCAAA
TTTCCATATGCCCTCTCCAGCTCAGGTTTTATTAAAAGAAATCGTAGATGCTCAAGCTAATCAAGATTAT
CACGTAGCTTTAGAAAAATCTTCCCAGCTTCTTCAATTGGCGGCATCTTCCGAAGATTATCCTACATTAC
GCTTTCTCACACTTCTAAGAATCCTAGAAATCAAAGAAATCTTAAACCAAGATACCGAAGCGGATTTTGA
AGAACTCAAAACCCTGCCATTGTTCAAAGAGTTTGAACAATTCTATAAGGATGGAGAGTGGACATTAACT
AAACGTTTTGGCAAAAAGCGCTAA
>ref|NC_003361.3|:71087-71920 ParB family chromosome partioning protein [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGAGCGGAGTTATCAATAAAGATACGATAATAGAAGTGGCTGTTGATAGTATTCGGGTGAGTCCCTTTC
AACCTCGCCGGGTGTTTTCTGAGGCAGAGCTTCAGGAGTTAGTGGCGTCTCTACAATCCGTAGGGTTAAT
ACACCCTCCTGTAGTTCGTGAAATTCGTAGTGGTGATAAAGTTTTATACTATGAATTAATTGCTGGGGAA
CGTCGTTGGAGGGCTTTACAGCTTGCAGGATATACTACGATCCCTGTTGTCCTTAAGCAAGTGATTGCTG
ATGATATTGCCGCAGAAGCAACGCTTATAGAGAATATCCAACGTGTAAACCTCAGCCCTATGGAAATGGC
AGAGGCTTTTAAAAAGCTCATTAATGTTTTTGGTTTAACTCAGGATAAAGTCGCTCTGCGCGTAGGGAAA
AAACGTTCTACAGTTGCAAATTACCTACGTCTTTTCTCTTTATCGGAAACTATTCAAAAAAGTCTTTATT
TAGGAGAGATTACCTTAGGACATGCTAAAGTTATCCTGACTCTTGAAGATCCTAAATTGCGAGAAATTCT
CGCTGAGAGGATTATCTCGAAGCGTCTTGCTGTTCGTGAAGCAGAGCAAGAAGCAAAGAAATTATTGTCA
GGGGAGTCTATATCTTTATCTTCTAAAGAACATGTAAAAACACCCTCAACTGTATCTTATCAAGATATGC
AAGAGCGTCTTAGCCAATCTTTAGGCTATAAGGTAACAGTAAAATCACAAGGTTCTCACCATAGCGTCTC
TCTACATGTTCACGATGAAGAGCAGCTAAAGCAGTTAGAGGAGTGGCTTTTGAAGAAAGCCTAG
>ref|NC_003361.3|:c72927-71959 peptide ABC transporter, ATP-binding protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATGATCCTTTAGTACAAGCTAATCAGTTAAAAAAATATTACTACAAGCGTTCGAGCTGGTTTTGGA
AAAAAACAATAGCAACAAGAGCTATTGATAATGTTTCTTTTTCTATACCTTCAGGGAAGATCGTAGGTCT
AATTGGAGAATCGGGATCGGGGAAAACAACACTAGCCCTAGCGCTTTCTGGACTATTATCGCTAACCTCT
GGCTATTTATCTTTTAATAACACCCCTATCAAACTACACTCTAAGCATGATTTAAAAAAGCTTCGTTCTT
TCGTGCGTATGGTTTTTCAAAATCCCAAAGCTTCTTTAAATCCTAGAAAAACGATTTTTGACAGTTTGGG
CCACGCTCTTATTCATCACCGTATAATTACAAAAGAGAAGCTCCACTCTGTTATTGGGGATACTTTAGAA
CTTGTAGGGTTATCTGCTGATTATTTTTACCGTTATCCTCATCAACTTTCAGGTGGTCAACAACAGCGCG
TCTCCATAGCTAGAGCTTTATTAGGAGCTCCTAAGCTTATTATATGTGATGAGGTAGTTTCTGCTTTGGA
TCTTTCGATGCAAGCGCAGATCTTAAATATGCTCTCAAATTTACAAAAAGAGCTGAAGATGAGCTATCTT
TTTATCTCTCATGATTTAGCTGTTGTGCGCTCTTTTTGTTCGGAAGTAATGATTATGTATAAAGGGAAAA
TTGTTGAATCAGGAACAACAGAAGAGATCTTCTTAAATCCTAAACATCCTTATACGCAAATGCTTCTCAA
CTCGCAACTTCCTGACCTTCCAGAAAATCGCAGTATAGAGCACAAATTAAAAGCATATCAGACAAACTCT
TCCGAGATCCCCTCACCTACGGGATGTGTTTTTTATAATCGCTGTCCTAAGCGACAAAAAACCTGCCTTC
AAGGACCTATTCCAGAACGAACCGATGGGGATAAGCACTCATATCAGTGCATTCTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c73882-72920 peptide ABC transporter, ATP-binding protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACTCATCTACCTATCTTACAGGTTAAAGATCTATCGGTCAGCCTGAATAAACGTCGCGAACGCTACT
CCATTATCGAGTCATTGTCCTTTGATTTACATAAGGGGAAAACATTAGCGATTATCGGAGAATCAGGATC
GGGGAAATCGGTAACTGCTCAGGCTCTTATGCAGCTATTACCTTCTCCGCTATTTTCTACGTCAGGAAAA
ATCCTTTTCCATGGAAAAGATTTGTTAGAAGCACCGCGGGGAATCCTAAGATCGATTTTCGGAACGAAAA
TTTCTATGATTTTCCAAAATCCCCAATCCTCTTTAAATCCTGTTTTCACAATAGAGCAACAATTCCAAGA
GTTTATCCGCACGCATCTCCATCTTCCCCATAAAGAAGGACGAGAGAAAATCATCCAAGCTCTTATAGAT
ACAGGATTCCATAATCCTGAACTCTGTTTAAAACTCTATCCTCACCAGCTTTCCGGAGGCATGTTACAAA
GAGTCTCTATTGCTATGGCTCTGCTTGCTTCTCCAGAAATTTTAATTGCTGACGAGCCAACAACAGCTCT
CGATGTTTCTGTTCAATATCAGATTTTACAACTATTAAAAGGCTTACAAGAGAAATTCGGGATGAGCTTG
CTCATCATCACCCATAATATGGGTGTTGTTGCTGAAACCTCTGATGAGGTCCTCGTCCTCTATGCAGGAA
GAAAGGCAGAATATGCTTCTGCAAAGGAAATTTTCCATAACCCTTGCCATCCCTATACCCAAGATCTTTT
AGCGTCACGCCCTTCGCTGCAAAATGAAACGTTTAGGGCAATTCCTGGACAACCTCCTCACTATAGCTCT
CTTCCTTCTGGATGCTGCTATTACCCGAGATGTTCAAAAGCTTATGGGAAATGTAAAAACGAGTCTCCAG
AAGTTCACAATGCAAGCGAGGGGCATAAAGTAAGGTGCTGGCTATATGAATGA
>ref|NC_003361.3|:73936-74610 hypothetical protein CCA00059 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCAAACCCTTGCTCGTCTGTTCGGACAGTCTCCTTTTGCCCCGCTACAAGCGCACTTGGAAGTCGTAG
CATTTTGCGTTCAGCAAATGGTGCCAATCTTCACAGCCTTGCGTGATGGGGATTACAAACAGGTACAAAC
AATAGCGAAAAATATTTCTGATAAGGAATACCAAGCAGATTGTATAAAAAATGATATGCGCAATCACCTT
CCTGTAGGCTTATTTATGCCGATATCGCGGGCAGGATTGCTAGAAATTATTTCTATACAAGATAGCATCG
CTGATGTTTCCGAAGATGTAGCCATCTTACTTACCGTTAGAAAGCTGCATTTTTATCCAGAATTTGAGAA
GATCTTTTTCCAATTCCTACATAAAAGTGTTGAAACTTTTGATCTTACTATGACGGTCATACAAGAATTC
AATAAATTACTAGAAAGCTCTTTTGGAGGGCGTAAAGCTGACAAAGTACGGTTTCTAGTAAGTCGCGTAG
CGAAAGCTGAGCACGAGTGTGATGTTATTCAACGAGAGATCATGCAAATATTCTTTTCTGATGAATTTAT
GATCTCTGAAAAAGAATTTTATTTATGGCTGCAGGTAATTAAGCGCGCTGCGGGGATTTCCGATAGTTCG
GAAAAACTTGCTCATCGAGTTAACATGACGTTAGAAGAAAAGTAA
>ref|NC_003361.3|:74617-75897 phosphate permease family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCTTGTTCTACTCATTTTTGTTCTCTTATGTGGTTTTTATACCTCTTGGAATATAGGAGCTAACGACG
TGGCTAATGCCGTTGGTCCTAGTGTGGGATCCGGGGTATTAACATTACGTCAGGCAGTAATCATCGCTGC
TATTTTTGAATTTTTAGGAGCTTTGTTCCTCGGAGATCGTGTTGCAGGAACTATAGAAAGTCGTATAGTC
TCTGTTTCCGATCCGTTGATCGCCTCTGGCGATTATATTTATGGTATGACGGGGGCCTTATTGGCCACAG
GAGTCTGGCTACAACTTGCATCATATTTCGGATGGCCGGTTTCTACAACCCATTCTATAGTAGGAGCTGT
AATCGGTTTTGGTCTTGTTCTTGGTAAGGGAACAGTCATTTATTGGGGATCTGTAGGGACAATTTTAGTG
AGTTGGGTAATCTCTCCGCTCATGGGAGGTTGTATTGCTTACCTCATCTTTTCTTTTATACGTAGAAATA
TCCTTTATAAGAATGATCCCGTAGGTGCAATGATTCGCATAGCACCATTTCTTGCTGCTTTTGTCATCAT
TACCTTAGGAATCATTATTGTTTGTGGCGGCGTGGTTACACGCTTGGTCCCTCTTCCCTTGGCTTTACTG
TTAGTGTTTCTTGTCGGCAGTCTTGCCTATGCCCTCATGTTTAAGTATGTGCATACATCACATTGCTCCT
TTATTTGTGAATCTCCGAAACCCGGAAGTTTGCTTTGTCGTTTAAAAACATGTGGGGGAAACTACGGTAG
GAAATACCTTATCGTAGAGAGAATCTTTGCTTATTTGCAAATTATCATTGCTTGTTTCATGGCTTTTGCC
CACGGATCTAACGATGTGGCTAACGCCATTGCTCCTGTAGCTGGAGTTTTGCGCCAAGCATATCCCCAAG
TGTATTCTTCCTATACATTAATAGGGCTTATGGCTTTCGGCGGCGTCGGATTAATTATTGGATTATCCGT
TTGGGGATGGCGCGTGATTGAAACTGTAGGGTGTAAGATTACCGAACTTACCCCCTCAAGGGGATTTTCT
GTAGGCCTAAGTGCTGCTGTTACAATTGCTTTGGCATCAGCTATGGGCTTGCCTATATCAACAACTCACG
TGGTTGTGGGAGCTGTGTTAGGCATAGGTCTTGCTCGTGGGATTCATGCGATTAATTTAAATATTATCAA
AGATATTATCATGTCGTGGTTTATTACTCTTCCTGCAGGAGCGATACTCTCTATTCTATTTTTCTTTGCT
TTAAGAGCGCTCTTCCATTAA
>ref|NC_003361.3|:75935-77146 phosphoglycerate kinase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGATAGATTGACAGTCAGGGAACTTTCCCCAGAAGAAAACAAGGTTTTAGTTCGTGTAGATTTTAATG
TTCCTATAAAAGATGGGAAGATTCTTGATGATATTCGCATTCGTAGTGCTATGCCAACAATTAACTATCT
GTTGCAAAAACGCGCTGCTGTAATTTTAATGAGTCATTTAGGCCGCCCTAAGGGAACGGGGTTTGAAGAG
AAGTATTCCCTCCAGCCTGTTGTTGAAGTTTTAGAAGGCTACTTAGGCCATCACGTTCCTTTAGCTCCCG
ATTGTATTGGGGAGGTTGCTCGTCAGGCAGTAGCGCAGCTATCTCCAGGGCGCGTATTGCTATTAGAAAA
TCTCCGTTTCCATAGGGGTGAAGAACATCCCGAAGAAGATCCTACATTTGCTGCTGAACTTTCTTCTTAT
GGAGATTTTTATGTGAATGATGCTTTTGGGACTTCTCATAGAAAACATGCTTCTGTTTATCATGTGCCCC
AAGCTTTCCCTGGAAGATCTGCAGCAGGCCTTCTTATGGAGAAAGAACTCGAGTTTTTAGGGCAGCACCT
TCTGCATTCTCCTAAACGTCCTTTTACTGCTATCCTTGGTGGGGCTAAAGTATCTTCAAAAATCGGGGTA
ATAGAAGCCTTACTATCGCAAGTGAACAACTTACTCTTAGCAGGAGGCATGGGATTCACCTTCTTAAAGG
CACTAGGTAAGTCCGTAGGGAATTCCCTAGTTGAAGAATCGGGAATAGAGCTTGCTCGTCGTGTTTTGAA
ACTTGCAGAGCAGCGTAATGTGCGTATCGTTCTCCCTATAGATGTAAAAGTTGCCAAGGCGTGCGAGCCT
GGAGTCAGCTGGTCAGAAACACTTATAGATCAGGGGATTCCTGCAGATCTTGAAGGTTTAGATATCGGAA
CCAAAACGATTCAAGAGTTTTGTAAGATCATTGATGCTTCAGCAACAGTATTTTGGAACGGCCCCGTCGG
TGTTTATGAAGTTCCTCCTTTTGATCAAGGTTCTATGGCTATCGCCAACTGTCTAGCACGACATTCTTCT
GCAACTACCGTCGTGGGTGGTGGTGACGCCGCTGCTGTTGTTGCTTTAGCCGGATGTACCTCTCAAGTCT
CACACGTATCGACAGGCGGGGGAGCTTCTTTAGAGTTTTTAGAAAACGGCTTTTTACCAGGCACAGAAGT
TCTCTCTCCAGCGCAAGATTAA
>ref|NC_003361.3|:77599-78990 hypothetical protein CCA00062 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGGAATTAATCCAAGCGGTCGAAACAATAACAATGATCTATGGATTTCAGGAGCTCATGAGCAACATC
CAGATGTCCAGGAAACTAGAGGATCTTCTGAAGCAGCGGGACCCAGTAGAGTTTCTTCACAAAATAATAC
ACCAGAGACTCAGGGTTTCTTATCAAGAATCAGTTCCGCTGTAAATAGTTTCTTCTCCGGAATATTTGGT
AAGAGCTCTTCACAAACAAGTTCTCAGGATTCTTCGCAGCTAGCTACTCCGTCTAGTAGTCGTAGATCTT
CGACTGCATCAGATTCAGATATGGATGTAGAGGGAGAGGGATCAGATACAGGTAGTGTAGCATCAACAGA
AAGTACGAGCTCTAGCGATAGTGCAAGATCAACAGAGGGTGCTGCTAGAGGATTACAGAAGAAAGGCTAT
ACTCCAGGAGTTAAAGCGGACTCTCCAAGAGTTCCTCGTAGAGGAATTCAACGTCCGAATACCCCACCTC
CACCACCTCCAACTGCAGCAGGGACATCACAATCTCCATCAACAAGTGGAACTGGGGTGACAAAACGTAA
GGCTCCTCAACCTCCAGCAGGAGATCCTAAAAGAACACGTCATGAAAGTGGATCCTCTATTTCTAGTACA
GATTCTACAGTGAGTACAGATTCCGGTGTTGATGAGTCACAATCCATAGCAGCTAAATTAAAAGCAGAAT
TAGAAGCTAATAGCGCATCGAGACAAGAGCGGTTAGAGGCGTTATCTGGTCAGATTAAAGACCGTTGGAC
AAGTCAAGAAACTCAAGAGCCGGTGGCTTACAAGGTTTCTTGTATGCAGACATTAACAGCACGATTAGGG
CAAGCACGTGCGGATGCTCAGAAAGAAGTAGAAGTAGCGCGTCCTGGAATTAATGAACGTCCATTAAAGG
CAGCGTCTTCTCTAGCTCGATCTATATGGGATCTTGGAGAGAAAGAGCAGAGACAAGATGGGGATTCCGT
CCTTCTTCAAGTGCTGATACGCATGGGATTAGAGGGAGGCTTATTAAGCCCTGAAGTTGACTACGTGGAT
TATGTAAATCAGCTTGTTAGTGAATATGGAGATTCTGAGGAAGATTACGATTGGCAACCTACAATGCAAA
CTCTTGCTCAAGATTTAAATGAGATAAGAAATACTAACCCCAATGGTATGCATAAATTCTGGTCTTCATT
TTCTGGAAAAGGTGAGGTCGTTGTAAGGAGCTTAGCCAATAAGTATATGGCTACAAATGCAGGAAACTAT
GAGCCTTCTTCGGTTAAAACTGCTAATCGTTGGAATGCCGGTGCTTTGGATTTAATGAAGTCTTTAAATC
CCGGAGTCTATGTAACAACAGTATCTGTCTTAGGCTTGGATGCTTTTAGTTCAGAAGAATAG
>ref|NC_003361.3|:79009-80226 hypothetical protein CCA00063 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGGATCACCAATTTCAGGTGGTGGAGGCGTTGAACCCCCATGGAAAGATCTATTTACAGAGCAGGGTT
CTTCGCCAGAGGGTGAGGCTGACGATATTGATTTAAACGATCGTATTTCCGATCATGTGGAATCTATCTT
CGAAGATCAACAGGCTGAACGTGGTATTCCTGAAGCACATGCTTCTGAAGGAATGAATAGCGATCTGCAA
GGCAGAGTACAGTCAGAACCTCAGGAAGGCTTCTTAAGAAGCATACTCAATAGAATCCGTAGCGCAGTTT
ATAGATTATGGCATCATAGATCGGGGTCTCGTTCAAGAAACGCGAGCTGTTCTAAAGGTTATGCCGATCT
TTTTGCAGAAACAGAGCTGCCCGCATCAGCTATTGCTGAAGCTCAAGCAGCTACAAAAGAAACCGCGGGG
TGCTGCGCATCTATAAGAAAGTTCTTCACGAAAGCATTTAGAAAAATGTGCAACTGCATCACTAAAAGAC
AAGCAGAGTCGTCTATAGATTTTTGCGGTGGAGATCCTGAAGGGCCTGAGGGAACCATGGCGCTTGCATT
AATGTTGCGTATGGCGTGCAAGTGGGCCTCACAACAAGAATTTTTCTGCAAATTGCAAAAGAAGGGGTTG
GACGCCTTTATATCCATGGGAACAGCTCCTATTGCAAGTATTGTAGAAGCCACAGCTATTTTAACACAGC
TGGAGGACATAGTAGAAGGAGAGAAACCAGAGTCTATAGCCACAGTTCGGGGGATTACAAAACTTTGCGC
TCTTTCTTATAACGCAAGAATTTGTTGCAGGGAAGCTATAGAGTCTCTCCAGGAAGGCGATCCTGACTAC
GACTATACAGCGATGCTGAAGTTGGCTACGCGTCTTGATAATCTTGCAAGTAAGGGCTCTCAAGAATCTA
CTACAGTGAGACAAATTCTCTCATCTTTGCGCTGCACGCATACAAATTTAATGGCAGAATATCTCAGTGT
ATGGGCAGATGATTCTTCACAAACCAGTCAGCCAGTTCCCATAAATTATGATTTAGTTGTTGCTATTGTT
GGTAGCAACTTACCTTCTTTAGAAGAGGCATACCGAGATGATCGTGAGGAATACGAGAAAAAACTGAACG
ATATCATACGAAACTTTTTCTTTTCCTATGAACCAAGATCATCTAAATTGAGAAGGTTGTATCAAGGCAA
TACAGAAAATTTTCAAGATCTGGGGTAA
>ref|NC_003361.3|:80322-81476 hypothetical protein CCA00064 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATGTTGGATTTGCGATTTTCTACAGACTATTATTTACGTGTTGTCGAATTAGCGATCCGTGATGGAT
CGCGCGCTCTTGTCTATAATAAGAAACAATCTCTTTTAGAAACTTGGCCTATAAATGCACCTCTTTCTTC
TGATCACGATGACAGGAAAGAAACCATCCAACAAGGCATTCAGGAGATTTTTTCACGTTCCGTGATTTCC
TATTCCTTATCAGGAAGGCTCCTTTCTATTATTGATACGCGTCTACGTCAAGAAACACCCTACACAGGTA
TTTTATATAGAGTGTTTCGCAAAGACACATTCTTGAGAAAAAAGGCCGTTGTTAAGAAGCTCCTATTATT
AAAGAATATCATTTTCCTAGAGCATCAACGCCCCTTAAATAAAATCTCTACTGTGGCGCATTCTGTATTT
GGAAAGGAAAAGACAAATTTTTCTTCATGGGAAGACTTTACCCATGATGTAGAAATCCATGCAGAAAATA
CTGATATGAGCTCTTCGGTAAAAGAAAGCATGGCTGCAGAGGCTTCTTCCCAAGTCATAATGGAAGCTTT
GATGACTTTTTTAGAAAGCCAAAATACCTACCTACCTTTGAGTTTAGAGCTTTTAGATCAATTTCTTTCG
GAAAAGGTAGTGCCTTTACATACACTGTCAGAAAGAAATTTCCACCTACTCACAGAACTAAAAAATCTCT
ACACATTCAGTCGTGAAGACTTCCAAGCGATTCTTGGAGGGATTATTACCAACTCTCTTTCCGATGTTCT
TGCAAATTCTTTAGTAGGCTCTCAGCTGCTCTCCCCCCAAGGGAAAGCTATGGTAAGTACTTGGAAAGAA
ATTGTTGAATTTTCTTCAGAAGAGGCTATTGTTGCTCAAGGATTTCTAGCCGAAATCCTTCGGCGTATCG
TTTCTGAAGATTTAACAACTGCTATTTCAATAACTAACGATGCCGCTCCAGAACAGATCGGCAGGATGTA
CAGTATCCGTGATTGCAGTCCAGGATTATGGTTGAAAATGATGCGCATACTTTTAATGCGCTGGCTTTTG
GACTTCGATAATAGGGTGTACTCTTTATTGAAAAAAGGGATCAACTATTACACGCCACAACCGACCCTCT
GGCAGCAAATATTGAGCCTATTTAAAAAATTTTAA
>ref|NC_003361.3|:81600-82715 Nol1/Nop2/Sun family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTAATCGTGTAGCTTTATATTTTAAACAACATCGTTCTTTAGGTTCTAAAGATCGTCAATGGATAAGCGC
GCGTATTTTTGCTATTCTTCGTCATCGACGGTTATTAGAAGCTCTTATCCAACAAGATAATCAAGAGGTG
ACTCCTGAGACTTTAGTGGCTAAGGTTGAAGAAGGCGTTTTGGATGATATTGAAAAATATCAAGATCTCC
CTTGGCCTGTGCGCTATTCTGTATCCGATGATCTTGCTGAATGCTTAATCGAAGATTATGGCCAAGAACG
AGCCAAGGAGCTCTGTGAGATTTTTCTTCATGAAGCCCCTTGCGCTATTCGTGTAAATACACGACGGACT
TCTGTAGAAGATCTCCAAAAGCGTTTAGAATACCCCTGTACACCAGGATCTGTTCCAGGTTCTCTATGTT
TTGATAAGCGCTACCCTTTACAACATAGTGCAGCTTTTCATCGCGGTTTATTTGAAGTTCAAGATGAATC
GTCTCAGAAAATCGCTTTAGGCATTCCTATAAGTAAAAAAGATCGTGTTTTAGATTTTTGTGCAGGGGCT
GGAGGGAAAAGTCTGATTCTTGCTGAGAGAGCGCATCACGTTGTATTACATGATAGCCGTAAGGATATTT
TGGAAGAGGCAAAACAACGTTTGCGTAGAGCGGGAGCAAGGAACTTTTCTATAGGAGAGCAACATCTAAG
AAGAAATAGCTTTTCTATTGTTGTTGTTGATGCTCCTTGTACAGGATCAGGAGTATTCAGACGGCATCCT
GAAAAGAAAAGCCAGTTTTCTAAGAAACTTCTTACTACATTTTCACAAGTGCAGAGAAAGATTCTCAGAG
AAGCTATGCATTATGTAAAACCTGGTGGAAGGCTGATCTACATTACCTGTTCTCTACTTTCTCAAGAAAA
TGAAAAGCAAGTTGCGTTCATGAAATCTTTGGGGTGGGAAGAAGAACGTCATGTACACACTGCGTTATCA
GCAGAAAGCGGGGACGGCTTTTTTGCTGCCCACTTTGTTCATAAAAGTAGCAAGGCACCTATATAG
>ref|NC_003361.3|:c83110-82721 hypothetical protein CCA00066 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TACCTATAGCGGGAATTGGAGGCGAAACTTCTGAGAGTTTAGTATTTGCTACATTGTGTATTTCTAAAAA
TGATGCTCCAACAACATCATCTTGGCACTTTTGGAAAGACCCACAAGTTATCAGAGACGAGCAACATGCC
TACTTTCTCAAACAGGTAATTTCTGCATTAAAACGTCCTGAAATATGGAACGACCCTATAAATCTTCTGC
ATATCTTGTTACAATTTGATAAATTCTCAGAAAAATCCGGAGAATGTCACGATTTATTGTTGGTCATTAT
CCGACATAGAATAATGACCCTTACCATGAACATGGCATAG
>ref|NC_003361.3|:c84462-83161 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACAAGAGTTTTTTTTAGATCTGGCCTGATTGGTTTTTTTGCAGGTATCTTTACGATTCCTTCGTATG
CGAATTCACCTTTCCCCGAAACACGAGGAAATGCCGTAGCCGTCATTCAATCGGAAACTGGCAAGGTGCT
TTATGCTAAGGACATAGACAAAAGAATCTATCCTGCAAGCATGACAAAAATAGCCACAGCGCTATTTATC
TTAAGAAAACATCCCGATCTTTTGAATCGCTTCATTACTGTAAAACAAGATGCTATCGCTTCAATCACCC
CTCAGGCTAAAAAACAATCGGGCTATCGCAGCCCTCCACATTGGCTAGAAACCGATGGTGTGACAATACA
ACTGCAAAATAAAGAAGAGGTGTCGGGATGGGACCTATTTCATGCGTTATTGATCTGCTCAGCTAACGAT
GCTGCTAATACCCTCGCTATGGCCTGCTCGGGATCTGTAAGCGAGTTTATGAAGCAATTAAATAGCTTCC
TGAAAGAGATAGGTTGCGCTGACACCCATTTTAATAACCCTCATGGCTTGCACCACCCTAACCACTACAC
AACAGCTCGAGATTTAACCTCTATTATGCGTGAAGGTCTAAAAGAGCCTTTATTTCGTCAGGTTATTCGC
ACTACCAATTATAAAATGGCCGCGACAAATCTCAGCCAAGAGAGAGTTTTAAATCTTACAAATAAACTCA
TCCTTCCTGGATCTACCTATTACTATCCTCCCGCATTAGGAGGGAAAACAGGAACAACAAAAGATGCTGG
AAAAAATCTTGTCTTCGCGGCGAAAAAACATGGTCGCTCTATTATCACTATAGCTGCGGGCTATCCTACT
ATGGGGGAGCTTTATGAAGATGTTATCGCTTTATGTGAGGGAGTATTTAACGAGCCTGTTTTACGGAGGT
ATCTCATTCCTCCTACGGAAAAATATACCTTACGCTTGGGGCTTTTAGGGAAAGTTTCTATTCCTTTACC
TAATGGCGTCTACTACGATTTCTATGCTTCTGAAGGAGAAGAGCTTCGAACTATCTGTTTTGTTCCTCAT
GCAACAAAGTTTCCTATTCAAAAGGGTGATCTTCTGGGTCATTGGGTATTTCGCAATCTCTCTGGGGAGA
AGGTCCGTGCTGAACCTCTATATGCACCAGATACTATCCGCCTGCTCGCGATCCAAAAAATCTGTTTGTA
TGGCAAGCGTGTAATCACCTCATATAGAACGTATATTATTTTGACGTTAATCGTTCTGTATTATAGGAAA
ACGCGTGCACATCGCAGGAAATCCTCTCGGTATTACCTATGA
>ref|NC_003361.3|:84573-84995 hypothetical protein CCA00068 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGTTTGGATTTTTTAGAAGAATTTTACCGTCGTTCTATTTGTAACAAAGGAACGGCATTTCCTGAGG
GCTTCATGGATATTGCCGATGTCCTATCCCATTCTGCGTCTGAACTTAAAATCGAGTCTATGAGCGATCT
TCCTGTTAACAATTTCATCATTGCAGAATCGGCAGATAAACTCACTTTATTTAATGCAGATTTTGCTGTT
TGGTTAGTGCCTGAGCTTGTCCAAGGAGAAGCTGTGACTCGAGGATACATCGCTTTATACCATTCTGGAG
GGGATTATACTCCAGAAATGGCATTTCAAGCCTCTGGGGAGTACAATCAATCAGCATTAATTCTTGAAGC
ACTTCAGATATATCTACAAGACATAAAAGATACCGAAAGCACGCTACGCTCTTTCCGCTTTAATCAAGAC
TAG
>ref|NC_003361.3|:c85440-84982 rsbW protein, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGTTCAACAGGTATATTATGACCTCTTCTGATGGAGAAGCAGTCTTTCCAGCACTCCTTAGTGAACTTC
ACAATATGCTCGACTTCGTAAAAGAGACAGGACAACTCAATACATTCCCAAAAGAAAAGCTATTAAAGCT
TGAACTTGCCTGCGAAGAACTTCTTGTTAATATCATCTCCTATGCATACCAAGAAGCCCCCTCTCCTGGA
AAAATCATCATTTGTTGTGATGGAGATAAAGAGGCTTTAAAGGTAACTATCAAAGATAATGGGCCTTCTT
TTAATCCTCTAACGGCATCTATTGATATTCAAGATCAACTTCCTTTAGATGAGAGAAAACTGGGTGGGCT
AGGGATCTTCTTAGCAAAAAACTCTGTGGATGAATTTCAGTATGAAAGACATGGAGACTCCAATATCGTT
CATCTAAAAATCCATAATAGCGGCACTAGTCTTGATTAA
>ref|NC_003361.3|:c86008-85409 hypothetical protein CCA00070 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCGTATATTAGTTTTTGCCCTGTTTTCTTGTTTATCCGGTTTAGGACTATCTTCTTGCAGTGGATATA
CTCTCCTAAATTCTTCAGCGGCCTTATCGGATTTAGGACGCTCTATACGTTCTGAGGGCATCTACATTTC
TCCTATTGAAAAAGATTCTTTAGGACAATTGACATCAGCTCTCATTTATGAATTAGGGAAACGTTCTCTT
CCTATACGCAACGGAGAAAGTAACGCTCGCTATCTTCTCAAGGTACAGCTCCTGAATGAAGTTGACGAGA
ATACGGGTTTTACGTATGCCCCAAATAAAATTGATGATAAGACCCCAAGACATTTTATTGTCTCTAGTGA
GGGGCGTTTATCTATATCTGCGAAAGTACAACTTATTGACAAGCATTCGGGGAAAGTCATTGTCGATGAC
TGTTTATCAAGAAGATCGGTCTCCTTTGATTTTGAACCTGATTTAGGCACGGCGAATGCTCATCAATTTG
CCTTAGGCCAATTTGAAATGCACAATGAAGCTATTAAGAGCGCTTGGCGTGTGTTATACGCTCATTTAGC
TGAGACTATTGTTCAACAGGTATATTATGACCTCTTCTGA
>ref|NC_003361.3|:c86981-86025 TPR domain-containing protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAATCTGTTTTACAGTTCGTTGTTTTATTACTACTTTTGTGTTCTGGATGCTACGCCAGGCCAATTT
CTTTTGAGCCTTTTTCTGGTAAATTATCTCCTCAAAAGTTTGTACCTAAATACTCTCCGGAGCAATATCT
TTCAGAAGGAAAGAACTATTTAGAACAACAAAGTTACCGTAAAGCATTGCTTTGTTTTGGTATGATTACT
CATCATTTTCCAAAAGATCCTTTGTACACTGAAGCTGTATACTTAACTGGAGTATGTTACTTTAAAAATG
GTCAACCAGATTTAGCTGAAAAAGCTTTTGCTGCTTACATGCAACTTCCTGATGCTGACTATTCTGAAGA
GTTATTTCTAATGAAGTATTCTATAGCGCAGAGCTTTGCTCAAGGAAAACGCAAGCGCTTATTCCTTTTG
GAAGGATTCCCTAAACTCGTTAATGCTGATGCTGATGCCTTACGTATTTACGATGAGATCCTCACAGCTT
TCCCAGATAAAGATTTAGGAGCTCAAGCTTTGTATCTAAAAGGTGACTTGCTTGTTATTACAAAAGATTT
TTCCGAAGCTATTAAGATTTTCAAAAAGCTCACGTTACAATTTTCTGCGCATGCATTATCTCCAAAAGCC
TTTGTGCGTCTTTCAGAAATTTATCTTATGCAAGCACAAAAAGAGCCTCATAATGTGCAGTATTTAAATT
TAGCAAAGATCAATGAAGAAGCTATTAAAAAACAACATCCTAACCATCCTTTAACAGAGGTTGTCTCTGC
TAATGTTCGCTCTATGCATGAGCGTTATGCTTCAGGGTTATACGCTACTGGACGTTTTTATGAGAAAAAG
AAGAAGCATCATGCAGCGAGCATCTATTATACTGCAGCGATTGACAATTACCCTGAATCATCTTTAGTAG
CTAAGTGTCATAAACGACTAAATAGAATAGCAAAACATTCTTCTTAG
>ref|NC_003361.3|:87134-88018 hypothetical protein CCA00072 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAAAGTTAGTTTTGTACTTTGTTACTTTTGTTGGTTCTCTTTTTTGCGGAGTTTTTTTATGGGATA
ATGTGCCGTGTGCACATAAAGCCATGCAAGTTACCGCAAGCTATAGCGTGAATGTTTTTGAAAAGAGTTG
CCGATTTGTGCGCAAAGTTTCTGGATTTGAGAGGCTGCGAGTTTTTGAGAGGAAATTCTCTCCGGAGCAA
GTATTGGCTTTCTTCCCAGAGCATATAGAGGGAAATGCTTCTATAGAGCTAACTTTTGTTCCTCATACAC
TGATGCATGTGCGTTTTTCTAAAGAAGATGCTGCTAAGAAAACGATGGTAAGTCAAGAAGGAGACATCCT
TTGGAACTTAGCAAACGGTGAGATGGTTCTGAATACAGGAGCATGGTCCTATTCTAAAGGATTTAGAGAG
TGCTTGATGTTGAAAGCAGGAAAGCAAGATGTCAGTGTTATGCAAACTCTAGCAAATCTTGGAGGAGCTG
CTACTAAAGACTCCTTAGCGCAAGCTCTATCTATGAAAAATATCAGAGCTGATAAGGTAATTCGTGCTTG
TCAGAAAAAGAAATTGATTTTCTCTACGGGCAGTCAAATAGGAAGTCATTTCCAACAGCTGCAGCCGATT
AAAGGTTGTACAACAATCATCCACTCTTCTCCTGTATGGTTGCGAAGACCTCGAGGCTCCTCTATGGTAT
CGCCACAATTTTCTGAAGATCGCGTAAGCAATCTTGCAGGAATGATTTTTGGAAATAACTTCCTTATTTT
AAACAAAGCTGTTGTTTATGTTCCTGTATATCAGGTGTCTTTAATGGCTGCGGATAATAGTGTGCGCATA
GAATACATTAACGCGGTAACAGGAAAGCCGTTTTTAGATATTTAA
>ref|NC_003361.3|:c91743-88015 DNA polymerase III subunit alpha [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGACTTGGATACCTCTTCACTGTCATTCTCAATATTCCATTTTAGATGCTACAAGCTCTATTAAGAGCT
TTGTAGCAAAGGCAAAGGAATATCAAATTCCTTCGTTAGCATTAACAGATCACGGGAACTTATACGGTGC
GATTGAGTTTTATAAAGAGTGTCGACAAAATGACATTAAGCCGATCATTGGTTGTGAAATTTATGTAGCT
CCCACCTCACGTTTTGATAAGAAGAAAGAGAGAAAAAGCCGCGTAGCAAATCATCTTATTCTTTTATGTA
AAAATGAACAAGGATACCGCAATCTCTGCTTATTATCCTCATTAGCATTCACTGAAGGGTTTTATTATTT
CCCTAGAATAGATAGAGAACTTCTCAGCCAACATTCTGAGGGCTTGGTTTGTCTATCAGCCTGTCTTTCT
GGCTCTGTAGCTCAGGCAGCTTTAGAATCCGAGGAAGCCCTGGAAAAAGACCTTCTCTGGTATCAAAATC
TATTTGGTGATGATTTTTATAGTGAAATCCAGCTCCACAAAATGTCAGAGGAGAAAATAGCTTCTCTGGG
AGAAGAATGGTTAAAGCACGAGTATCATCAATTTATTGAAGCTCAGATAAAAGTTAATCAGGCTGTATTA
GCAACTAGTCGACGTTTAGGAATTCGTTCGGTAGCTACTAATGATATCCATTATATCCATCCTAATGATT
GGTTAGCGCATGAGATTCTTCTTAATGTGCAAATAGGCGAAACAATAAGAATCGCAAAACAAAATACGTA
TATCCCTAATCCTAAAAGAAAAGCTTTCCGCAGTAGGGAATACTATTTTAAGTCTCCTGAAGAAATGGCG
CTTCTATTCGCCGATCATCCAGAAACAATCTCCAATACTTTAGAAGTTGCTGATAAATGTAACCTTAGCC
TGAATCTTTCGTCTAAGCATTATCCTATTTATGTTCCTGAGTTTCTTAAAGAAAAGCAGACATATACCGA
AGAAGAGCGCTATGCAGCGTCTTCTACCTTTCTTCGTGAGCTTTGCGAACAGGGCTTGTTTACGAAATAT
ACTGCAGAACAACTTGCGCATATCTCTAAAAAATTTCCCGATCGCGATCCTCTAGAATTAGTTAAAGAAC
GGTTAGAGATGGAAATGTCGATTATCATTCCTAAAGGGATGTGTGACTACCTTCTTATCGTTTGGGATAT
TATCCGTTGGGCAAAAGATAACGGAATCCCTGTAGGTCCTGGCCGTGGTTCTGGAGCTGGATCTGTCATG
TTATTCTTATTGGGAATTACAGAAATAGAACCTATCCGCTTCGATTTGTTCTTTGAAAGATTCATCAATC
CCGAGCGTTTATCCTATCCCGATATCGATATCGATATTTGTATGGCGGGGCGTGAACGTGTTATCAACTA
TGCAATAGAGCGGCATGGAAAAGATAACGTGGCTCAGATTATTACTTTCGGAACGATGAAAGCCAAAATG
GCTGTAAAAGATGTGGGAAGAACTTTGGATGTCCCTCTTTCTAAAGTTAACCATATCGCCAAGCATATTC
CAGAGATGAATACCACATTGGCAAAAGCTTTAGAAACAGATCCTCATCTAAATGAGTTATATACCAATGA
CTCTGAGGCGGCTCAAGTTCTTGATATGGCGATGCATCTAGAAGGCTCGATCCGCAATACAGGAGTCCAC
GCTGCTGGCGTTATTATTTGTGGAGATCATTTAACCAATCATATCCCTATCTGTATTTCTAAAGATTCTA
CAATGATTACCACACAATTTTCCATGAAGCCTGTGGAAAGTGTGGGAATGCTTAAGGTTGATTTCTTAGG
ATTAAAAACTTTAACGAGTATCCATATTGCTATTCAGGCAATCCAAAAGAAGACTGGGAAGCTATTAGAG
ATGGCATCTCTTCCCTTAGATGATAAAACGACCTTTGCTCTTTTGCATCAAGGAAAGACCATGGGGATAT
TCCAAATGGAATCTAAAGGGATGCAAGAGTTAGCAAAAAATCTCTGTCCTGATTCCTTTGAAGAAATCAT
TGCTATAGGCGCTTTATATCGTCCTGGTCCTATGGATATGATCCCCTCCTTCATTAGCCGAAAGCATGGT
AAAGAGATCATAGAATACGATCATCCTCTCATGGAATCGATTCTCAAAGAAACCTATGGCATTATGGTGT
ATCAAGAGCAAGTGATGCAAATTGCTGGCTCTCTAGCAAGCTATTCCCTTGGGGAAGGTGATGTCTTACG
TCGTGCCATGGGGAAAAAAGATATCCAGCAAATGCTTCAAGAGCGTACAAAGTTTTGTGAACGCGCCTGC
AAAAATGGTATCGATGCAGATTTGGCAACAACCATTTTTGATAAAATGGAGAAGTTTGCTTCCTATGGCT
TTAATAAGTCCCACGCGGCTGCTTATGGATTAATTACTTATACAACTGCTTACCTTAAAGCAAACTATCC
TAAAGAATGGCTAGCAGCCCTTCTTACCTGTGACTCTGATGATATTGAGAAGGTCGGGAAACTCATTCAC
GAAGCCCATAGCATGGATATCTGTATCCTCCCTCCTGATATTAATGAGTCAGGAACAAATTTTGTCGCTA
CAGATAAAGGGATTCGTTTTGCTATGGGAGCTATCCGCGGTATAGGAAAAGGTCTTGTAGAAAGTATTGT
CGAAGAAAGAGAAAAACACGGTCCCTATCAAAGCATTCAAGACTTCATCCAACGTTCTGATTTAAAAAAG
GTTACTAAGAAGCATACGGAAAACCTAATTGACGCAGGATGTTTTGATGTTTTTGAATCTGACAGAGATG
TTGCTCAAGCGACTTTAGAAACTCTCTATGATACGATATCTAAAGAAAAGAAAGAGGCTGCAACTGGAGT
CATGACATTCTTTTCTTTGAATACTATGCATCAAGAACATCGTGTAGCGTTGCCTCCAGCGACCAATGTT
GTTCGTAGATCAAAAAAAGAAATACTCAAGAAAGAGAAAGAATTATTAGGCATTTATCTTACTGAGCATC
CGATGGATGCCGTTAAAGATATTTTACCTCAACTTTCTGTTGTCAACTCAGGAGAGTTTGAAAATCTCCC
TCACGGCTCGGTAATTCGAACCATATTTATTATTGATAAAGTCACCACGCGGATCTCTTCAAAAGGGCAA
AGGAAATTTGCTTTGTTACGTGTTAATGACGGTGTGGATTCTTATGAATTACCGATATGGCCAGAAATGT
ATACTGAGCAACAAGACCTTTTAGAAGAAGATCGTTTAATTTATGCTATTTTATCTATCGATAAACGTAG
CGAATCTTTACGCTTATCCTGCCGCTGGATGAGAGACTTATCTCTTATTAACCAAGAGCTCATTCAAGAA
TGCGATGATATGTTTGATAAGATCAAAGGTCAGATGCAGAAAATGTCGTATTTAAACTTAGAAACTAATA
AAGATACGAATCAGAGGAAAACATCTACTATGTCAAAAGCTACTGATAATCGATCTCAAGCTTCTATAGT
TAAGCTATCTCTTGATCTTGGGCAATTACGCCATAGTCATTTGTGTGTATTAAAACAAATCATACGCAAA
TATCCTGGACCGCGTACCCTCTCTCTAGTTTTCACAAAGGACAATGAGCGTATAGCTTCTATTTCTCCTG
ATACCGACTATTTCGTCTCCAACGATACTAGCGACCTTCAAAAAGACTTAGAAAATTCTCAACTTCCCGT
TCGATTTATCGCTGTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c93136-91769 sugar phosphate sensor protein UhpC [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATATTTGGACCAGATTCTTTCAGCCTCCCAAGCACATTAAAGAACTTGATGATCCAGAATTAGTCA
AAAAACAGTACAAGTATTGGAGAATTCGCATCTTCTACAGCATGTTTATAGGGTATGTCTTCTATTATTT
CACAAGGAAGAGTTTTACCTTTGCCATGCCTACGCTGATGACAGACCTTGGTTTTGATAAAGCACAACTA
GGGATCATTGGTAGTACTTTGTACATCAGTTATGGCATCAGTAAGTTTGTTAGCGGCGTTATATCTGATC
AGTCCAACCCTCGTTACTTCATGGCGTTGGGTTTAATTATCACAGGGCTCACTAACATCTTTTTCGGAAT
GTCCTCCTCTATTCTTTTATTCGCTTTATGGTGGGGACTTAATGGTTGGTTTCAAGGATGGGGATGGCCT
CCTTGCGCTCGTTTATTAACTCACTGGTACTCAAAATCCGAAAGAGGGACTTGGTGGAGTGTATGGAGCA
CATCACATAATATTGGTGGTGCTTTAATTCCTATTCTTACAGGGTTTGCTATTGATTGCTGTGGTTGGCG
TGGGGCGATGTTTATTCCAGGTGCCCTATGTATTATGATGGGATTTGTTTTAATCAACCGTCTTCGTGAT
ACGCCACAATCTTTAGGCCTTCCAGCTATTGAAAAATATAGAAAAGCACAAAAGGCTAAAAAACACGAAA
AGACAACAGCAGATATCCTAGAAGAAGAAGCTGAAAAAGAATTATCCACTAGAGAAATCCTCTTCACCTA
TGTCTTGAAGAACAAATGGATCTGGTTATTATCTTTTGCTTCATTTTTCATTTATGTTGTCCGTATGGCT
GTAAATGATTGGAGCGCGTTATTCTTAATCGAAACAAAACGTTATGTTGCTGTAAAGGCCAACTTCTGCG
TTTCTCTATTTGAGATCGGCGGGCTTTTCGGTATGTTAATTGCTGGATGGTTATCTGATAAGATTTCCAA
GGGCAAGCGCGGTCCGATGAATGTTGTATTTTCTTTAGGACTCTTATTTGCAATTTTAGGCATGTGGTAT
GGCCGAGATCAAGATATGTGGTGGTTAGACGGCACCCTGCTCTTTGTTATCGGTTTCTTCTTATTTGGTC
CCCAAATGATGATTGGTTTAGCAGCTGCTGAATTATCCCATAAAAAAGCTGCGGGTACCGCTAGCGGTTT
CGCAGGTTGGTTTGCTTATTTCGGAGCAGCATTTGCAGGTTATCCATTAGGAAAAATAGCTCAGGATTGG
GGATGGAAAGGATTTTTCATTGCTCTTCTAAGCTGTGCTTTAATTGCTTTGGTTTTATTCCTACCTACAT
GGAATGCCTCCGAGAGAAGTTTACAGACTAAAAAATAA
>ref|NC_003361.3|:93368-93586 hypothetical protein CCA00075 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GAGATAATAATAGAGAGGCGTCACCTTCTGAGCCTAAGACTTGGGAGAAAATATTACGTGTATGTGTTCA
AGAATACGAGTTTCCTCATCGAGAGATTATAGAACCTATCTTTTACAAGCCCCTTGATGCTCATATAGGA
AGGGTTTAA
>ref|NC_003361.3|:93655-94947 histidyl-tRNA synthetase [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGAAAGTAGCCTTACCCAAAGGGGTTTTCGATATATTCCCTTATATTACTGATGCGAAACATATGTGGA
GACACACTTCCTTGTGGCATCGGGTGGAAGATGTTATTCATGAAGTATGTGATTTATACGGATTCTCAGA
AATCCGCACACCTGTTTTTGAAAAGTCAGAAGTGTTCTTACATGTTGGAGAGCAAAGCGACATCGTAAAA
AAAGAAATGTACACTTTTCTAGATAAGAAAGGACGGTCGTTGACTCTACGCCCTGAAGGAACAGCTCCAA
TAGTGCGTTCGTTCATAGATAATCCTATGAGTCAACGTGAAGATAATAAATTCTATTACATCCTTCCTAT
GTTCCGCTACGAGCGTCAACAATCTGGAAGGTACCGTCAGCACCATCAATTTGGTGTAGAAGCTATAGGA
GTGCGCCATCCTCTTCGTGATGCAGAAGTTCTCAGCTTACTCTGGAATTTTTATTCCGCAATAGGTTTGC
AGTATATGCAAATTCAATTGAATTTTTTAGGGGGAAGTGCCACACGTAAGCGCTACGATCAAGTTTTGCG
TGGATACTTTCTCCAACATTTAGATTCCCTGTCTTCTTTAAGTAAAGAAAGATTTAATACAAATCTATTG
AGAATATTAGACTCTAAAGAGCCAGAGGACCAAGAGATTATTAAGTCTGCGCCTCCTATTCTTGAATATG
TGTCTGATGAAGATCGAAAATATTTTGATGAGATTCTTTCTGCTTTAAGTGCTTTAAATATTCCTTACTC
TATTAATTCGAGATTAGTTCGAGGTTTAGACTACTATACCGATGTGGTTTTCGAAGCGATCACAACATTC
GGAGGGCATTCTTATGCCTTGGGAGGGGGAGGCCGTTACGACGGACTTATTGCTGCATCTGGAGGCGTCG
CAACTCCTGCATGTGGTTTTGGAGTCGGTTTAGAGAGAGTTATTCAAACTCTATTAGCTCAGGGGAATCT
AACACTTCCATCTTCTCATAAATTACGTTTGATCCCTGTTGAGCCGGAAGCGGATTCTTTCTGTTTTGTT
TGGGCGCAACATTTACGTAGTTTAGGCATCCCTACAGAAGTAGATTGGACACATAAGAAATTGAAAGCTG
CTTTAAAAACAGCAGATACAGAGAAAGTAACTTTTGTTTGTCCAATAGGAGAGAGAGAGTTACTTTCCGA
GCAATTAACCATTAAAAACATGTCTTTACGCCAAGAGTTCTCTGGTTCGAAGCAAGAGGTAGAGCAAAGG
TTGCTATATGAAATACAGAACACATCGTTGTAA
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GATGGGTGCATCGTTATCGTAATCATGGGGGCGTCGTTTTTATAGATTTACGAGACCGTTTTGGGATTAC
GCAGATAGTATGTCGTGAAGATGAGAAACCAGAATTACATCAGTTAGTTGACTCTGTGCGTTCGGAGTGG
GTGCTCTCTGTAGAAGGAACTGTATGCCGACGTTTAGAGGGTATGGAAAACGCTAATTTAGCTACCGGGG
ATATAGAAGTAGAGATTGAAAAAGTAGACATCTTGTCGAAAGCTAAAAATCTTCCTTTTTCTATTTCTGA
TGACCATATTCATGTGAATGAAGAGTTGCGATTAGAATATCGCTATTTGGATATGCGTAGAGGGCAAATT
TTAGACCGCTTAATTTATCGTCATAAAGTGATGTTGGCCTGTCGTCAATATATGGACAAGCAGGGTTTTA
CTGAGGTTGTGACTCCAGTTTTAGGTAAATCCACTCCTGAAGGAGCTAGAGATTACCTTGTTCCTTCTAG
GATATATCCTGGAAGTTTTTATGCTTTACCTCAGTCTCCACAATTGTTTAAACAAATTCTGATGGTGGGT
GGTTTAGATCGTTATTTTCAAATAGCCACTTGTTTTAGAGATGAAGATCTTCGCGCAGATCGTCAGCCAG
AATTTGCTCAGATTGATATTGAGATGAGTTTTGCTACACCTGATGATCTCTTCCCTATTATTGAACAATT
AGTGGTCGAGATGTTTTCTGTTCAGGGAATTAAAATAGATCTGCCCTTGCCTAGAATGACGTATCAAGAA
GCAAAAGATTTGTATGGAACGGATAAGCCAGATCTTCGATTTGGTTTGCAATTACGCGATTGTCGAGAGC
ATGCAAAACAGTTTTCTTTCTCTATCTTTTTAGATCAGCTGGCGCAGGGAGGCACAATAAAAGGTTTCTG
TGTTCCTGGTGGTGCAGACATGTCCCGTAAACAGCTTGATGTTTACACAGAGTTTGTAAAGCGTTACGGC
GCTATGGGCCTTGTTTGGATTAAAAAACAAGAAAATGGCTTAGCTTCTAATGTTGCTAAATTTGCGTCAG
AAGAGGTGTTTGACGCCATGTTTGCTGATTTTAGTGCTAAAGATAATGATATCTTACTTTTGATAGCAGC
TCCGGAATCTATAGCCAACCAATCTTTAGATCATCTACGTAGATTGATTGGTAAAGAGCGCAACCTATAT
AACGAATCGCAATACAATTTCGTTTGGATTACAGATTTCCCTCTATTTGCTAAAGAAGAAGGAAAGATAT
GCTCAGAGCATCATCCATTTACTTCACCTTTAGATGAGGATATTTCTTTATTGGATACAGATCCTTTATC
CGTACGCTCTTCAAGTTATGATTTAGTTCTTAACGGATACGAAATAGCTTCGGGATCACAACGTATTCAT
AACGCAGATTTGCAAAATAAAATCTTTTCTATTTTAGAGCTGTCGCCCGAGAGTATAAAAGAAAAATTCG
GTTTCTTTATAGATGCTTTAAGTTTTGGTACACCACCACATTTAGGAATTGCTTTAGGTTTGGATCGTAT
TATGATGGTGTTAACAGGGGCTGAAGGTATTCGAGAAGTAATAGCTTTCCCGAAAACTCAAAAGGCTGCA
GATTTGATGATGAATGCGCCTGCGGAAATTATGACTTCCCAATTAAAAGAACTAAATATTAAGGTAACTT
CTTAA
>ref|NC_003361.3|:96752-97519 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase Mip [Chlamydophila caviae GPIC]
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GTTCTCAAAGAGGGAACCAAATAGCACAAGTTGAGGAGAAAAGCGCTGCCAACGATTCGCAACTTTCTGT
AAATCAACAGATATCGCGTACTTTCGGTCATTTGCTCGCAAGACAGTTACGCAAATCAGAAGATATCATG
ATGGATATCGCTGAGGTTGCTAAAGGATTGCAAGGTGAGCTAGAATGCAAAAGCGCACCTTTAACTGAAT
CAGAATATGAGGAAAAAATGGCAGAAATACAGAAATTAGTTTTCGAGAAAAAAGCGAAGGAAAATCTCTC
CTTGGCAGAAAGATTCCTACAAGAAAATAAGAAAAATTCAGGTGTTGTCGAAGTACAAGCTGATAAACTG
CAATACCGCATTGTCAAAGAAGGTACAGGGAGAGCTATTTCAGGTAAGCCTTCAGCGCTTCTTCACTACA
AGGGGACTTTTATCGATGGTCAGGTATTTAGTAGCTCAGAAGCTAATAAAGAGCCTATTCTTCTTCCTCT
AGCACAAACAATACCTGGATTTGCTTTAGGTATGCAGGGAATGAAAGAAGGTGAAACTCGTATCCTTTAC
ATCCATCCTGATCTTGCTTATGGAACTTCTGGCCAACTGCCTCCGAACTCTTTATTGATTTTTGAAATCA
ATTTAATCGAAACTACAGATGATTCTGTAGCAGCACAAAACACAGAGAATGAAAACACTGCCTCATGA
>ref|NC_003361.3|:97516-97986 RNA methyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
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GATGGATTACTGGGATAAGGTTAATCTATCTGTTGTAGACTCTTTAGACGAAGCTTTATCCGGAGTAGAT
CAAAACAAGGTTTTTTGTCTTTCAACCAAAGGATCACAATACTATGGGGATGTTTCTCTCCCTATGGATG
GTGTGTATGTTTTTGGTTCTGAATCAAAAGGATTGCCAGAAGACGTATTAAAGAAATACTACAACCACTG
TTATTACCTACCAATGCGGCCTGGTATCAGATCTTTGAATTTGGCAACAACTGTGGGCGTAGTACTTTTT
GAAGCAGTTCGACAAAATAATCAAAGTGCTTGTATCCGCAATGGGGATTAA
>ref|NC_003361.3|:c98291-97983 thioredoxin [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTGCTGAATGGTGTGGCCCTTGCAAAATGCTCACCCCTGTATTAGAAAGTCTTGAAGCAGAAGTCTCCTC
AGTGCTTATTGGAAAAGTCAATATAGATGACCATCCTGCACCAGCAGAGCAGTACGGTGTTTCTTCAATT
CCTACTCTAATTCTATTTAAGGATGGGAAAGAGGTTGATCGTGTAGTCGGACTAAAAGATAAGGATTCTT
TGATTAGGTTAATTAATCAGCACTCTTAA
>ref|NC_003361.3|:98417-98515 hypothetical protein CCA00081 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AATCCCTATCTATTTCCACTGTTCTTTAA
>ref|NC_003361.3|:98701-98856 hypothetical protein CCA00082 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTTTCTTACAGGAACATGCGAACGAACATCCAAAACTTCAAGAAGCTTTTGATATGTTCGATAAAACATT
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>ref|NC_003361.3|:99311-100027 hypothetical protein CCA00083 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGGCTACGTATTTATTTTATCTAGAACAAGCTCTAAATATAAATCCTGTGGTTTTTGCTCGCGACAAAAT
AATTTTTAAAACTCCAGAAGATGCTATTCGAATTCTTGAGGAAGATAAAAAGATTTGGCGCGAAACAGAG
ATACAAATTCGCTCTGGGAAGCCAGAAGTTAACGAACACACAAAAAGAATCTATATTTGTCCTTTCACTG
GGAAAGTATTTGCTGACAACGTGTACGCTGATCCTCAAGACGCTATTTATGATTGGCTATCCTCTTGCCC
TCAAAATACAGAGCGCCAAAGTGGTGTCCGTGTAAAACGTTTCCTTGTATCCGATGATCCAAATATGATC
AAAGAGTACATAGTCCCTCCTAAAGAGCCAATTGTTAAAACTGTTTTTGCCTCCGCTATTACGGGGAAAT
TGTTCCATAGTTTGCCAGCGCTTATAGAAGACTTCACTTCTACATATTTACGTCCTATGACTTTGGAAGA
AGTGCAAAATCAAAATAAGTTCCAATTGGAAGGCACTTTCTTATCTTTGCTACAAGATGCTCTCGAGGAA
GACAAAATTGCTGAGTTTGTAGAAAGCTTAGCGGACGATACGGCCTTTCATGTATATATTAGTCAATGGG
TAGATACAGAAGAGTAA
>ref|NC_003361.3|:100006-100467 hypothetical protein CCA00084 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TATTGTACAAGGGTATTTAGGGGACACTCTAGCTCAAGAAGTTGCTAGTCCCTCGTTTTCTCTTTTACAT
GTGTATGGTAGTGAACCGCGAAGAATCTGCCACTATGATCTTTATCGGATAGATGCTATTGGAGAGGATC
AGCAAGGCCTTTTTCAAGATGCTGAAGAAGACGATATTTTATGTGTGGAATGGCCGGACAAAATAACATT
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GATGCCTCACCATCGATAATGTTAAAATTGCTGAAGGAATAA
>ref|NC_003361.3|:100477-101226 DNA polymerase III subunit epsilon [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATCGTATTATTGAATTTGCTGCAATGCGTTTCACTTTTGATAAGGTGATAGATTCCATGGAGACTCTGAT
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CAGCCTAGGATTGCGGAGGTGTTTCCGAAAATTAAGTCCTTTCTGAAAGAAGGAGACTACATAGTTGGAC
ATAGCGTAGGGTTTGATTTGCAGGTCTTAACTCAAGAAGCTGAGAGAATAGGGGAGAGTTTCTTATCTAA
GTACTACATTATCGATACTTTAAGATTGGCGAAAGAGTACGGAGATAGCCCGAATAATTCACTAGAAGCT
TTAGCTGTACATTTCAATGTTCCTTATGATGGTAATCATCGCGCTATGAAAGACGTAGAGATTAACATCA
ATATTTTCAAACATTTCTGTAAGCGTTTCCGCACCATAGAACAACTTAAGCAAATGTTGTCAAAACCAAT
AAAGATGAAGTATATGCCTTTAGGTAAACATAAAGGGCGCTGCTTCTCAGAAATTCCTTTATCTTACCTA
CAGTGGGCATCTAAAATGGATTTTGACGCCGACCTACTCTTTTCTATAAGACACGAAATTAAGCATCGGC
AAAAAGGCACAGGATTTACTCAAGTTAATAACCCATTTATAGGATTATAG
>ref|NC_003361.3|:101387-101857 cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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TAAATACCAATAACACCGTATTCGGTGGTCTATTAATGAGTTTACTAGATCGTTTAGCTCTTGTAGTTGC
AGAAAGACATACAGAAGGAATTTGCGTAACAGCTTTTGTGGACGCTCTACGTTTTTATGCTCCTGCCTAT
ATGGGAGAAAATCTAATTTGTAAAGCTGCTGTTAATCGTACGTGGAAAACTTCGTTAGAAGTTGGAGTGA
AAGTATGGGCAGAGAACATCTATAAGCAGGAAAGACGTCATATTACCTCTGCCTATTTTACATTTGTTTC
GGTAGATGAGAATAATGCTCCTACTCCTGTGCATCAGGTTGTTCCAGAAACCCCTGAAGAAAAACGCCGC
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>ref|NC_003361.3|:101865-103490 apolipoprotein N-acyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTTTTTCTCTATTGGGGAGTGCCGTGGGTTACGGACTTTTGTGGTATAGTTTAGAACCTCAAAAGAGCCC
CAAGCTATCTTGGAGGCAACTGACATCACTATTATTCTTGTGGTCTGTTACGGTATATGGAGTGCATTTT
TCTTGGATGCTCTCAGATTTATATGTCGGGAAATTTATCTACGTAGTTTGGGGCGTGCTCATTAGTTTGT
TAGCACTGCTATTTACAGCTTTCTCTTGTCTGTTGTTTTTTATCGTGCGCAAAAAACACACGAAAATTCT
TTGGTGTTTACCTGGTCTATGGGTAGCCGTGGAGATGGTGAGATTTTATTTTCTTTGTTCAGGAATGTCC
TTGGACTATTTAGGTTGGCCTATTACCGCAAATGCTTATGGACGCCAATTTGGAGGTTTTTTTGGCTGGG
CTGGAGAAAGTTTTATCCTAGTCGCTACAGGAATTAGCTTTTACCAGGTATTGTTGAGAAAGTGTTTTTC
ACGATACGTATGGTTGGGATGTTTGCTTTTCCCTTATATTTTAGGAGGAGTGCATTATGAATATCTCAAA
AATACTTTTTCAAAAGAAGAAAACCTACGCGTTGCTGTTATACAGCCTGCATCTTCAATGCTTCTAGAAG
GGCCCTGGTCAGGATCCCCAGCAATGGCTTGGCAAAGGCTGGTTAGTCTTTCTTCTATTGTAAGAAAACC
TGTAGATCTTCTTATTTTCCCTGAAGTTTCTGTTCCCTTTGGAAGAGATAGAAAAGTCTATCCTTACGAT
GATAGTCAGGTAATACTTTCCCCCCTGACACATTTTAAACATCAAGATGAGCTATTAGCCAATGTAGATT
GGATGCAAGCCCTTTCCAACCATTTTAATTGTCCTATTCTTATGGGTTTAGAGAGATGGGAAGAGCTAGA
TTCTAAATTGCATCTGTACAACTCCGCAGAGTGTATTTCTCAACATGGCGAGCTAATTGGATACGATAAA
CGTATTTTAGTTCCTGGAGGAGAATATATCCCCGGAGGAAAAATTGGCTGGTCAGTTTGTAAGAAATATT
TTCCAGAATATGCATTGTCATGTCAACGGATCCCTGGAGCGCGTTCCGGAGTTATAGAGGTAGAAAATTT
ACCAAAAATGGGAGTTTCTATTTGTTATGAAGAGACTTTCGGAATGCTATTGCGTAATTATAAGCGAGAA
GGAGCAAAGCTCCTTGTCAACCTAACCAATGATGGATGGTATCCCTCATCAAGGTTGCCACAAGTGCATT
TTTATCATGGGATTTTACGAAATCAGGAATTGGGAATGCCCTGTGTTCGTTCTTGCCATACGGGAATTAC
TGTAGCTGCAGACGCATTGGGGAGAGTAATAAAAATGCTTCCTTATGAGACGCGTTATAGAAAAGCCTCC
CCAGGAGTTTTACAAGTATCTCTTCCTATGCAAAATTATCCAACTTTGTATGCATTTTGGGGAGATTTTC
CAATGATTTTCTTGTCTTTGTTATCTATTGGATGCATTGGTTGTTATTTTGGATATCGCTTGCTTGCTAA
AAAAGAAAAAGCATAA
>ref|NC_003361.3|:103505-104362 UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase [Chlamydophila caviae GPIC]
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GAATTCACTTCGGAAAGTCAGCGACTTTAACTTTAGAACCTGCCAAAGAAAATACTGGAATAGTCTTTTG
CCGCTCCGATCTTTTAGGAGAACGTATCCCCGCTTTACTCCCACATGTATACAATACAGGGCGCAGCACT
ACCTTATCAGCAGGAGATTCGGTTATTGCTACCGTTGAGCACCTTATGGCTGCTTTACGTTCAAGTAATA
TTGACAATGTCATTGTTCGCTGTAGTGAAGAGGAAATCCCCATAGGGGACGGAAGCTCTCACGTTTTTAT
GCAGCTCATAGATGATGCTGGTATTTGTACGCAGAATGATAAAGTTCCCATTGCGAGACTATCTCAGCCT
GTGTACTATCAGTCCCAGGATACTTTTCTCGCTGCATTTCCTTGTGACGAGTTAAAGATTTCTTACACCT
TACACTATCCTCAAAGTCCGACTATAGGGACCCAATACCGTTCTTTCGTTATTACGGAAGAATCTTTCCG
TAAGGAGATCGCTCCTTGCAGAACGTTTGCTCTGTATAATGAGCTGTGTTTCTTAATGGATAGAGGTTTG
ATTAGAGGAGGGTGTTTGGAAAATGCCGTGGTTTTTAAAGATGATGGTGTCATTAGTCTTGGGCAATTGC
GGTTTTCAGACGAGCCTGTAAGGCATAAAATTTTGGATTTGATAGGGGATCTATCTTTGGTAGGCAGACC
TTTTGTTGCTCATATTGTCGCAGTAGGGTCAGGACATTCTTCAAACATTGCCTTGGGTAGAAAAATTTTA
GAAGTGCTACAACCCTAA
>ref|NC_003361.3|:104377-104841 (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTGTGGATAAGGTGTTGTCTTATGATTTAGAGAAGCGATCCATTGTTGCACAAAAAAATGTAACAATAAA
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GCGCAAGCAGCCGGAGTTTTGCTAGGCTTGGTTTTAGAAAACGACAGAAATAAAAGGTTGGCTTTGTTTT
TGGGAATACAAAAAGCGAAGTTTCGTCAGGCTGTGAGACCTGGTGACATTCTTACATTGAGCGCTGAATT
TTCATTGATTTCGTCGAAGGGAGGAAAAGCTTCGGCACGAGCTTGTGTGGGTTCTCAGGTTGCTGCTGAG
GGAGAACTGAGCTTTGCTCTTGTAGATAAGCAATCTTTAGATTAA
>ref|NC_003361.3|:104851-105690 UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
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CGTATGTTGTTATTAAATCTACGGTGACCCTTTGCGATGATGTAGTTGTTAAATCTTATGCGTATATTGA
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CGTAGCCCATAACTGCACAATTGGGAATTATGTGATTTTAAGTAATCATGCACAGTTAGCTGGGCATGTT
GTCGTCGAGGATTACGCAATTATTGGCGGCATGGTAGGCGTTCATCAATTTGTTCGTATTGGTGCGCACG
CTATGGTTGGAGCTTTAAGTGGTATCCGGCGTGACGTTCCTCCGTACACTATAGGTACTGGAAATCCATA
CCAACTCGGCGGTATCAATAAGGTTGGTCTGCAAAGACGGCAAGTTCCTTTTGAGACGCGTTTAGCTTTG
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>ref|NC_003361.3|:105677-106642 methionyl-tRNA formyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATCATGATGTTAATGTTATAGGGGTTGTTACTCGCGTAGATAAACCTCAAAAACGTTCGTCTCAGCCGAT
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CCACAATTTATTGAACAACTCAAGGCTTTTGAAGCCGATGTGTTTATTGTGGTCGCTTATGGAGCTATCT
TGCGTCAGGTAGTTTTAAATATCCCAAAATACGGTTGTTATAATTTACATGCGGGCTTATTGCCTGCGTA
CCGCGGGGCCGCTCCCATACAACGCTGTATCATGGATGGTGTTACACAGTCTGGAAATACTGTAATTCGT
ATGGACGCAGGCATGGATACTGGAGATATCGCTGGCGTATCCTATGTCCCTGTAGGCCCTGACATGACAG
CAGGAGAACTGGCAGAAGCTCTATCTGCTCAGGGCGGAGAAATTCTAATAAAAACTTTACAGCAAATCTC
TGACGGAACAATCTCTCATACGCCTCAGGATTCGTCCAAAGCATCGATAGCTCCTAAGTTATCGAAGGAA
GAGGGGTTTGTTCTCTGGAATCATCCTGCTGAAAAGGTATATGCTCAAATACGGGGTGTTACACCGGCTC
CTGGAGCCTGGACGCTCTATTCTTATCAAGATAAACCAGCAAAACGTTTGGTTATTCGCAAAGCCTCCTT
AGCTTCTAACAAGGGCATTTATGGCAACCCCGGTGATGTTATCGTATCAGATCAGCAAGAGCTTCTTATT
GCCTGTGCTGAAGGGGCTATTTGTCTAAAAGAAATCCAGCCCGAAGGTAAGGGAGCAATGGATTCAAAAA
CTTTTTTGAATGGACATTCTAATCATAAATTGAAATTATCTTTTCAAAACAACTAA
>ref|NC_003361.3|:106758-107732 hypothetical protein CCA00092 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTTTAAGCACGGCTAGAAATGTTGTCGCCTTGTCTAATGTGTTCACTGGTGCGATTCCTGGATTCGTCCT
TTCCTCAAAGAATTGCTATAATCATATTAAGAAATGTTTTGCTCCAGAAACTGAGTACGATTGCGGTAGT
ATTGAGAAAGGCTTGCCTTATAACAAGCTTTATCTCACTAAGGGTGATCATGTGTTGGGTGCGATTAAAG
AAGGTTGCTCTGCAGTTGGCGCGGGAACTTACGTTGCAACGTTTGGTGTCAGCCGTCCGGTGCTCTTGGC
AAACAAGCTTGCTCACAAGCCTTTCCTCTCTTCAGGAGTGAAGGCAGCATTTTGTAACAGCGTAACCTAT
ATGATGACAGCAAACCACGCTGCAGGGGTTATCGGCGGAGCAGCAGCCTTGCTCTATGAAAACCGTGTAT
ATAAACGCGCTTCTGAGGGATTGTTAGCTTCTAAAATGACAGAGAGTCTGGATTCTGAAGTTTACGATCA
AGTGTCTAAAGGCTTGAAAGAGTCGCACTACCAAGCTGTTAAAAAAACAATACTTGGAATTTTAGAAAAA
GCATTTGAATTGATCGCTGATATATTCGATTTCATTGCTTTACCAATTACTGCTTCAGTTCGCTTGGCAA
TAAAAGCGGGATTAGTCACAGTATCCAGTGGTTTCGGTCTTTACAGCGTCTGGGTCAATTCTTAA
>ref|NC_003361.3|:108028-108693 50S ribosomal protein L3 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCGATCTCAGCTTAGCTTAATGGGAAAAAAGGAAGGCATGATTCATGTCTTTGACAAAGATGGAAATC
TGGTTGCGTGTTCGGTAATTAGCGTGGGTTCCAATGTTGTTACTCAAATAAAAGTTGATTCAACTGATGG
TTACAATGCTATTCAGATGGGCGCAAATGAAATCAATGTCCCAGAAAAAACATTAGAAAAACGTATGAAC
AAGCCTGAACTCGGCCATCTTAAGAAATCGGGGTCGCGTGTTTTTGGTTTGTTAAAAGAAGTTCGCCTTT
CCGAAGATGCTATTAATGAAGTTTCTTTAGGAAACGAATTTGGTTTAGAAGTCCTTGAAGATATCTCTTC
TGTAGATATTAGCGGTGTTTCTAAGGGTAAAGGGTTCCAAGGGGTCATGAAGAGATTTGGATTCCGTGGA
GGTCCTAAAACTCATGGTTCCGGATTCCATCGTCATGCCGGTTCTATAGGAATGCGATCAACTCCTGGAC
GATGCTTCCCTGGAAGTAAACGTCCTAGTCATATGGGTACTGTCAACGTAACCGTTAAGAATTTAGAAGT
GGTAAAAATAGATTTAGAGAAAAAAGTATTACTAGTGAAGGGGGCAATCCCTGGTCCTAGAGGCTCTGTT
GTTGTCATCAGACGTTCTTCTAGAGCAAAAGGGTAA
>ref|NC_003361.3|:108710-109384 50S ribosomal protein L4 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTTTTATTGTCAAAGTTTGATTTTTCTGGGAATAAGGCAGGAGAGGTTGAATTGCCAGATGCCTTTT
TTGTTCAAGAAGGAAATGGGCTTCAATTAGTGAAGGACTATCTTGTGGCTATTCGGGCCAACAAGAGACA
GTGGTCTGCGTGTACGAGAAATCGTTCAGAAGTCAGCCATTCTACTAAAAAGCCTTTTAAACAGAAGGGG
ACAGGAAATGCCCGTCAGGGGTGTTTAGCTTCTCCTCAGTTTCGTGGAGGGGGCGTTGTTTTCGGCCCCA
AGCCTAAATTTGATCAACATGTTCGCATTAATAGAAAAGAAAAAAGAGCGGCGATTCGTTTGTTGTTATC
TCAAAAGATTCAAACAAATCGATTAATTGTGGCTGATGACAGCGTATTCACAAGTAGTTTAGCTTCTCCA
AAGACAAAAGAAGCATTGAGATTTTTAAAATCTTGTAATGTGGAATGTCGTGGGATCCTCTTCATTGATG
ATTTAGATCATGCTCAAAACAATGAAGGTTTAAGATTAAGTTTGCGTAATTTGTCGGCTGTACGCGGGTT
TACGTACGGAATGAATATCAATGGATATGATCTAGCTTCCGCCCGCAATGTAGTGATTTCCGAAAAAGCC
CTGAAAGGACTCGCTGGGCATCTTATTTCTGGAACGAAAGATTAA
>ref|NC_003361.3|:109401-109736 50S ribosomal protein L23 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAGATCCTTACGATGTAATCAAACGGCATTATGTAACCGAGAAGGCTAAAACTTTAGAAGGTTTGA
GTCTAGGGAATGGTGAGGGTAAAAAGAAAGGCAGTTTCTGCAAGCATCCAAAGTATACATTTGTTGTATC
TTGTGATGCTACTAAGCCTTTAATTGCTCAAGCTTTGGAATCTATTTATGCAGATAAAAAAGTAAAAGTT
AAAAGTGTAAACACGATATGTGTGAAGCCTCAGCCAGCCCGAATGTTTCGTGGAAAACGAAAAGGAAAGA
CTGCAGGATTTAAGAAGGCAGTTGTGACCTTCTATGAAGGCCATTCTATCGGGTAA
>ref|NC_003361.3|:109758-110612 50S ribosomal protein L2 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTAAAAAGTTTAAGCCAGTAACTCCAGGGACTAGACAGTTGGTTCTTCCGGCTTTCGATGAGTTGA
CCAGACAAGGCGAGTTATCGGGGAAAAAAACTAGAAAAAGTGTACGTCCAAATAAAAAGCTGTCATTTTT
CAAAAAAAGTTCAGGTGGCCGTGATAATTTAGGTCACATTTCCTGTCGTCACCGAGGTGGAGGGGTTAAA
CGCCTGTACCGAGTTATCGATTTTAAACGCAATAAAGATGGTATTGAAGCGAAGGTGGTTTCTGTTGAGT
ACGATCCAAATCGCTCCGCCTATATTGCTTTATTAAATTATGCTGATGGAGAAAAGCGTTACATCCTTGC
TCCAAAAGGCATAAAAAGAGGAGATGAAGTCATCTCCGGAGAAGGTAGCCCGCTCAAATTGGGTTGCTGT
ATGACTTTAAAAAGCATGCCTTTAGGGTCAACCGTTCATAATATTGAAATGAGACCCAACTCTGGAGGAA
AATTAGTAAGATCCGCAGGTTTGGCTGCGCAGGTTATTGCTAAGACTCCAGGATATGTTACATTAAAAAT
GCCTTCAGGCGAATTTCGCATGTTAAATGAAGGCTGCAAAGCTACTATCGGCGAAGTTTCTAATTCTGAT
CACAATTTATGTGTTGATGGTAAAGCAGGAAGAAAACGATGGAAAGGCGTTCGCCCAACCGTTCGTGGTA
CTGCTATGAACCCTGTCGATCACCCTCACGGAGGTGGTGAAGGCCGTCATAATGGTTATATCCCACGCAC
TCCTTGGGGTAAAGTCACGAAAGGACTAAAAACTCGTGATAAGCGCAAAAGCAATAAGTGGATAGTTAAA
GATCGTAGGAAATAG
>ref|NC_003361.3|:110618-110884 30S ribosomal protein S19 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGTAGATCGTTAAGAAAGGGTCCTTTTGTTGATCACCATCTAATAAAAAAAGTACGTGCTATGAACT
TGTTGGAGAAAAAGTCTCCAATTAAAACCTGGTCTCGTCGTTCTATGATTACCCCTGAAATGATTGGACA
TACATTCGAAGTTCATAACGGGAAGAAGTTTCTAACAGTTTTTGTTTCGGAAACTATGGTAGGACACAAG
CTGGGAGAATTTTCTCCAACGAGAATATTTAAAAGTCATCCCGTGAAGAAAGGGTAA
>ref|NC_003361.3|:110903-111238 50S ribosomal protein L22 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTAAAGCGACCGCCCGCTACATACGGGTTCAGCCTCGCAAAGCTCGACTAGCTGCCGGGCTTATGA
GAAATTTAAGTGTTATGGAAGCTCAGCAGCAGCTGAATTTTTCTCAGCTAAAAGCTGGAAGATGTTTGAA
GAAAGTTTTAGACAGCGCTGTAGCTAATGCTGTGCTCAATGAGAATGTAAAACGTGAGCAATTGAGCGTT
ATCGAAGTCAGAGTGGATGCAGGTCCTGTATATAAGCGAGCTAAATCTAAAAGTCGGGGAGGACGATCCC
CAATTTTAAAACGCACCAGTCACTTAACTGTTATTGTTGGTGAGAAGGAGCGGTAG
>ref|NC_003361.3|:111247-111918 30S ribosomal protein S3 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGGTCAGAAAGGATGTCCAATCGGTTTTCGTACAGCTGTTACTAAAAAATGGCGTTCCCTGTGGTACG
GAAACAAACAAGAGTTTGGTAAATTTCTTATCGAAGATGTGAAAATTCGAGAACATTTAAGAAAAAAACC
TTCTTGTCAAGGGGCTGCGGGCTTTATTGTAAGACGTATGAGCGGTAAAATTGAAGTTACAATTCAAACA
GCTCGCCCAGGACTAGTTATCGGGAAAAAAGGGGCAGAGGTAGATCTTTTAAAAGAAGAGCTAAGAAAGC
TTACTGGTAAAGAAGTTTGGGTAGAAATCGCAGAAATTAAACGCCCTGAATTGAATGCAAAACTAGTTGC
AGACAATATCGCCAGACAAATCGAGCGTCGAGTTTCCTTTAGACGCGCTATGAAAAAGGCTATGCAGTCC
GTTATGGATGCCGGCGCTATTGGTGTTAAGATACAGGTTTCTGGAAGATTGGCAGGCGCTGAGATTGCCC
GTTCTGAATGGTATAAAAATGGCCGCGTTCCTCTGCATACATTGAGAGCTGATATTGATTACGCCACAGC
ATCTGCAGAGACTACTTACGGAATTATCGGTGTAAAAGTTTGGATTAATCTTGGTGAAAAAACCTCTACA
GCTAATGCTAATACTGGCGCTACGGCACCAGCTGCACAATAG
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CTACTTTTGTTGACTTTGGCGAGTTTGGAATGCAGACCTTGGAAAGAGGTTGGGTAACTAGCCGGCAAAT
AGAAGCTTGCAGGGTTGCTATCAATAGATATTTAAAACGTAAGGGAAAAGTTTGGATCCGTGTTTTCCCA
GATAAAAGTGTGACTAAGAAACCTGCTGAAACTCGTATGGGTAAAGGTAAAGGAGCTCCAGATCATTGGG
TGGCGGTAGTTCGTCCAGGAAGAATTCTTTTTGAAGTGGCTAACGTTTCCAGAGAAGATGCTCAGGATGC
CTTGAGAAGAGCAGCGGCAAAATTAGGAATAAGAACACGTTTTGTAAAGCGGGTTGAAAGGGTATAA
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ATGAAAATAAGAAAGCTCTCTTTTCTTTAAGAGCCGAGGCTGCTTTACAAAATAAAGTAGTCAAGAAGCA
CTTGTTCTCTATGTACAAGAAAAACATAGCTCGATCTATGACGGTCATGCAAGAAAAAGAGGGAAAAATC
GATGGCTAG
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ATGGCTAGTGAAGAAAGAGGCCTTAGAAAAACCAAAGTTGGTGTTGTTGTCTCGTCAAAAATGGATAAAA
CCGTAGTTGTTCGAGTAGAAAGAATATACTCCCATCCTCAGTACGCTAAAGTTGTTAGAGACTCTAAAAA
ATACTACGCGCATAATGGTTTAGATGTTTCTGAAGGCGATAAAGTTAAAATTCAAGAAACACGACCAATC
TCTAAATTGAAAAGATGGCGTGTTGTTGAGCGTGTAAGTTAG
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TTTTAGGCGGATCTCGAAGACGTTACGCTACAGTGGGTGATATCATTGTATGCTCGGTTAGAGATGTAGA
ACCCGATAGCTCTATCAAAAAGGGTGATGTGGTTAAAGCTGTAATTGTTAGAACACGACGCGATATTCTT
AGAAAAGATGGTTCTTCTTTGAGATTCGATACTAATAGCTGTGTAATTATCGATGAGAAAGGAAATCCCA
AAGGAACACGAATTTTTGGTCCGATCGCTCGAGAGATTCGGGATCGTGGCTTTGTGAAAATTAGTTCTTT
GGCTCCTGAGGTGATTTAA
>ref|NC_003361.3|:113247-113588 50S ribosomal protein L24 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAAGATATAGTGTTTGTGTTGGCGACACGGTTTATGTGTTGGCCGGGAACGACAAGGGAAAGCAAG
GTAAAGTTTTATCTTGTCTTAGAGAAAAAAACAAAGTGGTCGTTGAAGGAGTCAACGTTCGTACGAAAAA
TATCAAGCGTAGTCAAGAAAATCCTAAAGGTAAAAGGATTAGTATTGAAGCTCCGATACATGTTTCTAAC
GTACGTTTAAGTATAGACGGTGCTCCAGCAAAACTTTCTGTCAAGGTTACTGAAAACGGACGAGAGTTGT
GGAACAAGTCTCCTGATGGCACTTCTAAACTATATCGTTCTGTGAAAGAGAGAAAAGGTTAA
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ATGAGCAGGTTAAAAAAACTATATACTGAAGAGATCCGAAAGTCCCTCCAAGAAAAGTTTGGGTATGGAA
ATACCATGCAAATCCCTGTTCTTAGAAAAATTGTCATAAGCATGGGTCTTGCTGAGGCAGCTAAAGATAA
GAACCTTTTCCAGGCTCATTTAGAAGAACTTTCCATGATTTCCGGACAAAAACCTTTGGTAACAAAGGCT
AGAAATTCTATCGCCGGTTTTAAACTTCGTGAAGGACAAGGCATTGGAGCTAAGGTAACTTTACGAGGCC
AGCGCATGTACGATTTTATGGATCGTTTTTGCAATATAGTCTCTCCTAGAATTCGCGACTTCCGCGGTTT
TTCAATGAAAGGAGATGGACGCGGATGTTATTCATTGGGATTAGATGATCAGCAGATTTTCCCTGAAATA
GATTTAGATCGCGTTAAGAGAACTCAAGGAATGAACATTACTTGGGTAACTACAGCACAAACAGATGTTG
AATGCACTACTCTTTTAGAGTTGATGGGTTTGCGCTTTAAGAAGGCTCAATAG
>ref|NC_003361.3|:114151-114552 30S ribosomal protein S8 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGGCATGACAAGTGATACTATAGCCGATTTATTAACACGAATCCGAAATGCTTTGAAAGCAGAGCATT
TGTATGTGGATTTGGAGCATAGCAAGATGCGTGAAGCGATTGTGAGAATCCTGAAGCAACATGGGTTTTT
AGCTCATTATTTAGTGAAGGAAGAGAATCGTAAACGCACAATGCGTATCTTTTTACAATATAGCAATGAC
CGCAGGCCTGTGATACGCCAATTAAAGCGAGTTTCTAAACCTTCTAGAAGGGTTTATGTTCCTGCAGCAA
AAATCCCTTATGTTTTCGGAAATATGGGTATTTCCGTTCTCTCTACATCTCAAGGGGTGTTAGATGGAGC
AACAGCTAGGGCTAAAAATATTGGCGGCGAACTACTCTGTTTAGTTTGGTAA
>ref|NC_003361.3|:114584-115135 50S ribosomal protein L6 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCTCGTAAAGCTCGAGACCCTATTGTGCTCCCTCAAGGAGTAGAGGTCTCCATTCAAAATAATGAAA
TCTTAGTAAAAGGTCCTAAGGGCTCTTTAAAACAAGTATTGGCTCCAGAAGTGGTTGTCGACATCAAAGA
TAGGGAAGTTTTTGTTCATGCTGCTCCCCATGTTGTTGATAGACCAAGTCGTATGCAAGGTTTGTTTTGG
GCATTGATTTCTAATATGGTTCAAGGAGTCAATACAGGATTTGAAAAGCGATTAGAAATGATTGGGGTCG
GTTTTAGAGCTGCTGTTCAAGGCTCCGTTTTAGATTTATCGATTGGAGTATCTCATCCTACGAAAATGCC
TATTCCCGCAGAGCTTCAAGTTAGTGTTGAAAAGAACACTTTGATTTCAGTGAAGGGAATCAATAAGCAG
CTAGTCGGAGAATTTGCTGCTAGTATCCGTGCTAAACGTCGTCCTGAACCTTATAAAGGTAAAGGTATCC
GCTATGAAAATGAGTATGTCCGTCGTAAGGCAGGAAAAGCGGCAAAAACAGGTAAGAAATAG
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GAGGCTCTTCTTTAAAGCCTCGTTTGTGTGTTGTGAAGACCAACAAACATATCTATGTGCAATTAATTGA
TGATTCTATTGGCAAGACTTTGGCTTCTGTCTCAACTATGGCGAAATCAAATAAAGCTTCCGGATTAATT
AAAAAAAATCAAGACGTTGCTAAAACGTTGGGAACCCAAATTGCCGAGATAGGGAAAAGTCTTCAAGTAG
ATCGAGTTGTTTTCGATCGTGGCCCTTTCAAATATCATGGAATTATTGCCATGGTTGCTGATGGAGCTAG
AGAAGGCGGATTACAGTTTTAA
>ref|NC_003361.3|:115545-116042 30S ribosomal protein S5 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACGTTATCAAAGAATTCTCACAAAGAAGATCAGCTAGAGGAGAAAGTTCTTGTTGTCAATCGTTGTT
CGAAAGTAGTCAAGGGCGGTCGTAAATTTAGTTTTTCCGCGCTTATTTTAGTGGGTGACGGTAAGGGACG
CTTGGGCTACGGTTTTGCCAAAGCAAACGAATTAACAGATGCTATTCGCAAAGGCGGAGAAGCTGCCAGA
AAGAATCTAATTACTATTGAATCTTTGGAAAGTGGTTCTATTCCTCATGAAGTTTTAGTTGATCAGGATG
GAGCTCAGTTGCTTTTGAAGCCTGCTAAGTCAGGAACTGGAATTGTGGCAGGTTCTCGTATTCGTTTGAT
TTTAGAAATGGCTGGAGTCAAAAATATTGTTGCCAAAAGTTTAGGCTCAAATAACCCAATGAACCAAGTA
AAAGCTGCTTTTAAAGCTCTCTTGAGTCTTTCTAGCAGGAAAGACGTTTTGCAAAGGAGAAGAGTGACAC
ATGATTAA
>ref|NC_003361.3|:116035-116469 50S ribosomal protein L15 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTAGTTCTGGTCATGGCAAAACAAGTTGCCGAGGCCATAAAGGAGATGGAAGCCGTTCTGGTTATAAGCG
TAGATTTGGTTATGAAGGGGGCGGAGTGCCTCTTTATAGAAGAGTCCCTACGAGAGGATTTTCTCATAAG
CGTTTCGATAAATGCGTAGAAGAAATTACTACTCAACGTTTGAATGTTTTATTCAATGAAGGGGAAGAAA
TTACTTTGGATGCTTTGAAGGAAAAAAGAGCTATAGATAAGCATGCGATTAGAGTAAAAGTAATTGTTAA
AGGCGAATTAGAGAAAACGTTTATCTGGAAGGACGCTAATGTAGTATTGTCTCAAGGAGTACGAAACCTT
ATTGGTGTTGCTTAA
>ref|NC_003361.3|:116494-117867 preprotein translocase subunit SecY [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTGCGGCCTGCCGAGTTGGTGTGTTCATTCCTGTTCCAGGAATTAACGGGGAACGCGCCGTAGCTTATTT
CAAACAATTACTAGGTTCTAGTCAGAACTTATTTCAGTTAGCTGATATATTTTCTGGAGGAGCCTTTGCG
CAAATGACAGTGATTGCGTTAGGCGTGGTGCCGTATATTTCGGCATCCATCATAGTGCAACTTCTTTTAG
TGTTTATGCCCTCAATACAGAGGGAGATGCGCGAAAGTCCTGACCAAGGGAAAAGAAAGATTGGTAGGAT
GACTCGTCTATTTACAGTTGGCTTAGCATTTATTCAGTCTCTGCTCTTTGCTAAGTTTGCTTTAAAGATG
AATATGTCTATTCCTGGTATTGTTCTTCCAACCCTATTGTCCTCCAAATTATTTGGAGCTCCTTGGATCT
TTTACATGACAACAGTTGTTGTTATGACAACAGGAACATTGTTGCTAATGTGGATAGGCGAACAAATTTC
TGATAAGGGGATTGGTAATGGCGTTAGCTTAATTATCAGTCTTGGGATTTTAGCTTCCTTCCCATCTGTT
TTGGGATCCATAGTGAATAAGCTAAATCTTGGTTCTCAAGACCCTTCACAACTAGGTTTGTTCTCGCTCC
TCTTGTTGTGCTTTATTTTTGTATTTGTTCTCGTCACAACAATATTAATTATTGAAGGTGTGAGAAAAAT
TCCTGTGCAATATGCACGTAGAGTAATTGGTAGGAGAGAAATCCCCGGAGGAGGATCCTATTTGCCGCTG
AAGGTAAACTATGCGGGCGTTATACCTGTTATTTTTGCTTCGTCCTTGCTGATGTTTCCTGCGACTATAG
GGCAGTTCATGTCCTCGGATTCTTCATGGCTTAAGCGCATTGCTATGATGTTATCCCCAGGTAGCTGGGT
ATATTCCTCATGTTATGTTCTGCTTATAATATTTTTTACTTATTTCTGGACTGCAACCCAGTTCCACCCG
GAACAAATTGCTTCTGAAATGAAAAAGAATAACGCCTTTATTCCTGGAATTCGACAAGGGAAGCCTACAC
AAACATATTTAGAATACACCATGAACCGCGTCACTTTATTAGGGGCGGTCTTCTTAGCTGTTATTGCTAT
TTTACCATCTATTTTAGGACGCGTTCTTCATGTAGATGCTAATGTAAGTTATTTTTTAGGCGGCACAGCA
ATGTTGATCGTAGTTGGTGTGGTTTTAGATACGATGAAACAAGTGGATGCCTTTTTGCTTATGCGTCGGT
ACGATAGTTTTTTGAAAAAAGATCGTTCCAAAGGAAGGCATTGA
>ref|NC_003361.3|:117923-118291 30S ribosomal protein S13 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GAATAGGGCCAGCTCTTTCTGAAGAGATTATTGCGAAATTGCAATTGAATCCTGAAGCTAGGGCTGTTGA
ATTGACGGAGGAAGAAATAGGCCGCCTCAATTCCCTCCTACAATCAGAATATGTAGTTGAAGGGGACTTG
CGACGTCGTGTGCAGTCGGATATTAAAAGATTGATCTCTATACACGCCTATCGTGGACAAAGACATCGTC
TTTCATTGCCTGTTAGAGGACAGAGAACAAAAACAAATTCTCGAACACGTAAAGGCAAGCGTAAAACAGT
CGCAGGTAAGAAGAAATAA
>ref|NC_003361.3|:118312-118710 30S ribosomal protein S11 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTCATGTTAAGGCTACCTTCAACAATACGATTGTATCCATAACAGATCCTGCAGGAAATACTATCTCTTG
GGCTTCAGCTGGAAAAGTTGGATATTCTGGATCTCGTAAGTCATCTGCTTTTGCTGCAACGATGGCTGCA
CAAGACGCTGCAAAAAATGCTATGAATTCTGGCCTTAAAGAAGTCGAAGTATGTTTAAAAGGTACTGGAG
CTGGCAGAGAATCTGCGGTTCGCGCTCTCATAGCCTCTGGTTTAGTTGTTTCTGTCATCCGTGACGAAAC
TCCTGTTCCTCATAATGGTTGTCGACCAAGAAAAAGGCGCAGAGTGTAG
>ref|NC_003361.3|:118680-119861 DNA-directed RNA polymerase subunit alpha [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATTTACTTTACGATAAATTTGAATTGCCAGAATCAGTCAAAATGATGGCTGTAGAAGGTAGCGGGGGATC
GGTTGATAAGCAGGCGAGTTTTGTCGCAGAGCCTCTAGAGAGAGGTATGGGTCATACCTTAGGTAATGCT
TTGAGAAGAGCATTATTGATTGGTTTAGAAGCCCCTGCAATTATTTCTTTCTCTATGACTGGTGTGCTTC
ATGAGTACATGGCGATAGAGGGAATCGTAGAAGATGTAACAAACATTGTCTTAAACTTGAAAGGAGCTTT
GCTCAAGAAATATCCTTTCCAAGATAGTGAAGACGGTCGTTGTACTCAATTATTAAAGTCTACTATTTCT
GTAGATGCCTCTGATCTTGCTGCTTGTGGTGGTCAAAAGTCCATAACATTGGCTGATTTATTGCAAGAAG
GTGGGTTTGAATCTGTTAACCCTGATCATGTGATTTTCACTGTCACACAACCTATGCAGCTTGAAATTGC
CCTAAGAGTGGCATTTGGAAGAGGATATTCTACATCTGAGAGAATCGTTCTTGAGGATAAAGGTGTGAAT
GAGATCGTCTTAGATGCGGCCTTTTCACCTGTAGTTTTAGTTAATTACTTTGTAGAAGATACTCGTGTTG
GTCAAGATACAGATTTCGATCGCTTGATTTTGCATGTGGAAACAGATGGTAGGGTATCTCCTAAAGAAGC
TTTAGCTTTCTCTACACAAATTTTAACTAAGCACTTCTCTATTTTTGAAAAAATGGATGAGAAGAAGATA
GTCTTTGAAGAAGCTATTTCTATCGAGAAAGAGAACAAAGACGATATTCTTCATAAGTTAGTCTTAGGTA
TTAACGAGATCGAGTTATCTGTAAGATCTACAAATTGTTTGTCTAACGCAAATATTGAAACTATTGGTGA
GTTGGTGATTATGCCGGAACCTCGCCTGTTGCAATTCAGAAACTTTGGTAAGAAGTCTCTTTGTGAGATT
AAGAACAAGTTGAAAGAAATGAAACTTGAATTGGGAATGGATCTCAGTCAGTTTGGTGTTGGTTTAGACA
ACGTAAAAGAAAAAATGAAGAGTTACGCCGAAAAGATTCGGTCTAAAAACGTCAAGGGATAA
>ref|NC_003361.3|:119870-120298 50S ribosomal protein L17 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCAACACGCAAGAAAGAAATTTAGAGTTGGTCGTACTTCTGCGCATAATCGTTGTATGTTAGCTAACA
TGTTAAAATCTCTAATTCACCAAGAAAGAATAGAAACTACTTTGCCTAAGGCAAAAGAGTTGCGTCGTTG
TGCTGATAAGATGATTACACTAGCTAAGAAAAATACATTAGCTGCAAGACGTTTAGCTGTTGCTAGGCTA
ATGGTTAGATACAATAAGTTGACAAGCAAGGAAGCTCGTCAAGCTAAAGCAGGCGATTTATCAGCTTATA
ACGTAGACCGTACCGTTATAAACAAACTATTCGATCAATTAGGCACTCGTTTTGTCTCTAGAAATGGCGG
TTATACACGCATTTTAAAGTTGCAAAATAGAGTTGGTGATAATGCACGAAAGTGTATTATAGAATTTTTA
GCCGACTAG
>ref|NC_003361.3|:120337-121344 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTTCTGTCGATGTCGTGGCTGTTAATGATCTTGTCCCTGGAGAGGCTTTAACGTATTTATTCAAATACGA
TTCTACTCATGGACGTTTCCCAGCAGACGTGTCTTATGATAACGGCTATCTCGTTGTTGATGGCCGTAGA
ATTCAATTGCTAGATCAACGTGATGTTCAAAAGCTTCCCTGGAAAGATCTGGGTGTAGATGTTGTCATTG
AAAGTACAGGTTTATTTACCAAAAAAGAGGATGCTGCAAAGCATCTTGATTCTGGAGCTAAACGTGTACT
TATTACTGCTCCTGCAAAAGGAGATGTCCCGACGTTTGTAATGGGAGTAAATGAGAATGCATTTGATCCT
GAGAAGGATACAATTATTTCTAATGCTTCCTGTACTACAAACTGTCTTGCTCCTTTGGCTAAAGTGTTAC
TAGATAATTTTGGTATCGAAGAAGGTTTGATGACCACAGTGCATGCCGCTACAGCTACCCAAAGTGTTGT
AGATGGTCCATCCAAGAAAGATTGGAGAGGTGGTAGAGGAGCTTTTCAAAATATCGTTCCTGCTTCTACA
GGAGCTGCTAAAGCTGTTGCCTTATGTCTCCCAGAATTAAAGAATAAATTAACCGGAATGGCTTTTAGAG
TTCCTGTTGCCGATGTTTCTGTCGTTGACCTTACTGTAAGATTACAGAAGTCAACAACATATGAAGAGAT
ATGTAAAGCGATTAAAAATGCTTCAGAAACTAATCTGCGTGGGATTCTAGGTTATACGGATCAAGAAGTA
GTATCTTCTGATTTTATAGGATGCGAATATTCTTCTATATTTGATGCTGGTGCAGGAATAGCGTTAACCG
ATCGCTTTTTCAAACTAGTTGCCTGGTATGATAATGAGATAGGATATGCAACCCGCATAGTTGATTTGTT
AGAGTATGTAGCAAAGAACTCTAAATAA
>ref|NC_003361.3|:121357-122199 hypothetical protein CCA00117 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GCAATACCAAGCATTTTTCTCAGGATCCCTTTGTTGTTGAAGCGGTTGAAGTGATTTCTTTGGGGAACAC
CTGTTTCTTCCGTAACTGCGATCATAGTAAGCCATTCATTGTCCCTGCTGGTGATTACGAAGTAATGGAA
ATTCGAGATACTAAGATCAACCTAAAAGCTGTAGGTTTGGATCGTGGTATTAAGATTGCCGGAGGTAGAG
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TACAGCTGAATCTTCATCTTCAGAATCTTCCACAACACCATCTTCTCATTCTACAACTAGAAAAGAGAAG
AAAGAACGTAAGGGAGATAAGTGGAAAGAGAAGAAAAAACAGGGCCGTAAAAAAGCCAATAAAGAAGTAT
CCGAAGTTGCGGGATCTTCACAAGAGATCATTGATACCGTTACTGAAGAACTTTGGGAAGAGTCACAGGA
AAATAAATTAGGGGAGCAGAAGAAGTTTTCTCTACTACCTCCTCCAGCAAAATTAATTTCTGAGATTATT
TCTCAAACTATTTCGGATCCTGAAATAACTTCAGCTGATTTAGATGAATCTCTACAGGCTTTAGTAACCG
AAAGTTCTGAAGTGATCAATGCTTTACTATCAGGTGATCAGACAATTATTTTCCCTGAAGAAGAAATGGA
AGCTTCTCCAGTTTGTGAACAGCCTGTCTGTGAACAGCCTCTACCTTCTTCTTTCCCAATGGAAGACGAG
TAA
>ref|NC_003361.3|:122709-123674 hypothetical protein CCA00118 [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGCGGCGGCTCTTATCGGCAATTAAGCTGCATCTAACTTCTATATGGTCTAGCAACTCCACCTATTCTT
CTTCAAATCACTACGACATATACTCGAGATCTATGCTTCTGTTGCTCTGTCGATGGAAAGATGCAGACAT
TATGGAATGGCAATACACATGTAATGCTTTAGCAGATGTTTGTAGCAAAATGAGTGGGCAATTAGTTTGT
AGTAAATCTGAAGTATTACAAGTAGATCTTTCTCATGAGCAAGATATCCATTTAGAATGGAAACATCGGT
TATTGGCTTTGGAAAAAGAGTTTTCATCTCGTGATGAGGTTAAAAATTCTGAAATTGAGAAATTAAAGAA
TGAGAATAGCTGGTTACAACATCGTCTTTCTGAGAAGTTACAGCAAACACGTCATCAAAATGACATCATC
GAGGAATTAAAACGAGATTTGATAGAAAGTGTTCAGCAAACAGAAATTAGTGAGGGAAGACGTCTCTGTT
ATGAGCATAAGATTAAGGTCCTCGAGGAACAGTTAGATAAGTTAACGCTATCGCGTATTCCTGAAACTGA
TATGTTTGAACAAGGACCGAAAGAAAGCGTATTGCAACAAGAGATAGTCGATTTAAATGAAGCTATGACG
GCTTTGCATCAGAAAAAAGCTGATCAGGATAAGAAGTATCAAGAAGAAATCGCAAGATTAAGTCTAGAGT
TACAGAATTATAGACAGTCCGAACGCACAAATACAGAAACAGAGAAACTCCTACAGATTCAGGATGAGCT
AGTTCAGAAGAAGAAAGAGGTTGCTTTACTACAAGATCTTGTTGAAGAACAGTATTGTCGTATACTGACG
CTTAATAAGAAACTAGGATGTGAAGATGTTTTGAGTGTATCCCATTTAAAACGGCTTTTAGGTAGAGATT
TAGACTGTGATACCGAATGTATTGGAGAATCACAATGTAGTGGGCTTGTAGAGTAG
>ref|NC_003361.3|:123780-124286 Holliday junction resolvase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACGCAATTGATTATGGGGATTGATCCTGGGACACTAGTTTCTGGATACGCTATTATCCATATTGAAC
AGCGTTATAAGATACGAGCTCATAGCTATGGGGCTATCCGTTTATCTTCAAAAGATTCATTAACACAGCG
TTATAAACAGCTTTTTCAAACATTGTCTGGGGTATTGGATGATATTACTCCTGATGCTGTGGTTCTTGAA
ACGCAATATGTGCATAAGAACCCTCAAAGTACTATAAAATTAGGCATGGCGCGGGGAGTGCTCATACTTG
CTGCTGCTTTACGAGACATTCCTGTTTTTGAATATGCTCCAAACGTAGCTAAGAGAGCTGTTGTCGGTAA
AGGAAATGCCAGTAAACAGCAGGTGCAACTTATGGTTAGCAAGATTTTAAATATTCCTGATGTCTTAAAT
TCCAATTGTGAAGATATTGCAGATGCATTTGCATTAGCAATATGCCATGCACATACTTCTGCTTATACTT
GTTTAGGAGTTCGATAA
>ref|NC_003361.3|:124286-124909 Holliday junction DNA helicase motor protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTACGACTATATTCGTGGAATTCTTACTTATATGAGTTCTGGAACTCTTGTGATCGAATGTCAGGGAT
TAGGATTCAATATTTTTGCTCCCGATCGATGGTTGATTGAGCTGTCAGGTCAATTACATCGTGAAGTTGT
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GAATGTTTCCGTATGTTAATTTCATTTTCTGGAGTAGGCCCTAAGACAGGCCTAGCAATATTAAATACAT
TTTCTCTTAGCAAATTATGTTCTATAGCACGTGCTGAGGATGTCAGAGCTATAGCTTCTGTTCCTGGTAT
AGGGAAAAAAACAGCAGAAAAGCTTATGGTAGACCTCAAGCAAAAGCTTCCAGATTTACTTCCTTTAGAT
TCTAAAGCAATTGCTTCTTGGGAATCCGTAAAACCTTCGTGTATGGATGAGGGTATACAAGCATTAGCTG
CATTAGGATATTCTAAACCTTCAGCAGAGAGAATGATTGCTGAAGCTATGAGTGAACTTCCAGAGAATGC
ATCGTTAGCAGAAATTCTTCCTATTGCTTTAAAAAAGAACTTACAAGGTTTGAACAAGAGCTAG
>ref|NC_003361.3|:124974-125399 nucleoside diphosphate kinase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGAACAAACGCTATCCATTATCAAACCTGATTCTGTTGGCAAGGCTCATATTGGTGAGATTGTTGCGA
TTTTTGAAAAATCAGGATTTCGCATAGCTGCTATGAAAATGGTGCATTTATCAGTGAAAGAAGCTGAAGG
CTTCTACGCTGTTCATAAATCTCGTCCATTTTTCCAAGAGCTCGTAGATTTTATGATTTCAGGCCCAGTT
GTTGTTATGGTTCTTGAAGGTGATAATGCTGTAGTTCGCAACCGAGAAATTATGGGCGCTACAAATCCTC
AGGAAGCTGCTCAAGGGACGATTCGTGCTCAATTTGGCGAGTCTATCGGCATCAATGCGGTACATGGATC
CGATAGCTTGGAAAATGCAGCTATAGAAATTAACTATTTCTTCAGCAAAATCGAAATAGTTAACTCTGCT
AAGTAA
>ref|NC_003361.3|:c126117-125413 lipoate-protein ligase A-related protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCTCACCAATAAGTGTATTTTCTTAAATTTATCTGGAAAGACTATCTTCGAGCAGTTGCAAATAGAAG
AAGCTCTTCTTCGCAACTATAAGGAAAATATTTGCATTATTAATTCGAATGCTCCGGAAGCCGTTGTCCT
TGGTATTTCAAGACGTCCAAACGAAGATATCCATATCCCTAAATTACGATCTGATAACGTTCCTATAATT
AAACGTTACAGTGGGGGTGGAACGGTATTTATTGATGAAAATAGTTTATTCGTAACATGGATTATGAATT
CTTCCGAACCCATGGCCAATTCTCAAGATTTGATGCAATGGTCTTATGGTATCTATGCACCCATCTTCCC
TGAAGAATTTTCTGTTAATGAAAATGATTATACTTTAGGAGAGAAGAAATTCGCAGGAAATGCTCAATAT
ATCCAAAAATCTCGTTGGGTACATCACACAACATTCCTATGGGATATGGATATAGACAAGCTTACACGTT
ATCTACCAATACCCCAAAAACAACCGTCATATAGAAAACAACGTCTACATCAAGATTTCCTAACAACTAT
TCGCCCATGGTTCCCCACAAAAGAAAGCTTTTTTGATAAATTAAAAGCATCTGCGAGTAGTATTTTTCAT
TGGGGAACTCTTTCAGAACAAGAGCTGAAAGATATTCAGGAAAAACCCCACAGGAAATCTACCACTTTAT
TATAA
>ref|NC_003361.3|:c127939-126104 tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTTGCTCTGCAAAAATGGGCGCCTCTGTACTAATCTTAACTTCAAACTTAGACACTATTGCTAAGTTGAG
TTGTAATCCTGCCGTTGGAGGTATCGGCAAGGGGCATATTGTTCGAGAGATCGATGCCCTAGGCGGTATC
ATGGCTGAGGTTACTGATCAGTCTGGGATACAATTTCGCATCTTAAATCAGACCAAAGGCCCTGCTGTCC
GTGCTCCAAGAGCTCAAGTTGATAAGCAAATGTATCATATTCATATGAAACGCTTATTAGAGAGCACTCC
CGGCTTGCATATCATGCAGGGTACGGTTGAGTCCTTGCTAGACAATGAAAATGTCATTCAAGGTGTTACA
ACAAAAGAAGGTATCACCTATCTAGGTAAGACAGTCATTTTGTCTTCTGGGACATTTATGCGTGGCCTAA
TTCACATTGGCGACCTTAACTTTCCTGGCGGACGTCTTGGCGATCCTGCGGCTACAGGATTATCGGCAGC
TCTCAAGGAGCGTGGTTTTCCAATCAGCAGACTAAAAACAGGCACGCCTCCACGATTACTTGCTTCCTCC
ATAGACTTTTCCGTAGCAGAAGAACAGCCTGGAGATCCTGGTGTAGGCTTTGTTCATAGAGATGAACCCT
TTGTTCCTCCTCTACCTCAAGTATCGTGTTATATTACTCATACTACTCAAAAAACTAAGGATATCATTGC
TGCTAATATTAGCCGTTCCGCTTTGTATGGAGGTCGTATTGAAGGTATAGGCCCTCGATACTGTCCATCT
ATTGAAGATAAAATCGTTAAATTTGCAGATAAAGAGCGTCATCATATCTTCATAGAACCTGAAGGAATTT
ATACTCAGGAAGTCTATGTAAATGGCCTATCCACATCTATGCCTTTTGATGTGCAATATAACATGATCCG
TTCAGTTCACGGGCTAGAAAATGCGATTATTACGCGTCCTGCCTATGCTATTGAATATGATTACGTTCAT
GGAAATGTGATCTACCCTACTTTAGAAAGTAAGATCGTAGAAGGTCTATTTCTATGCGGCCAGATCAATG
GAACAACTGGATATGAAGAAGCAGCTGCTCAAGGTCTTATAGCAGGGATTAACGCAGTAAATAAAGTCCT
TAAAAAACCGGCATTCATCCCCTCACGACAAGAGTCCTATATTGGCGTGATGTTGGATGATCTTACAACT
CAAGTATTAGATGAACCTTACCGTATGTTCACAGGCAGAGCAGAACATCGCCTACTTTTAAGACAGGATA
ATGCTTGCTTACGTTTGTCTCACTACGGTCGGGATTTAGGCCTCTTAAGTCAAGAGCGTTATGAAATCTT
TGAAAATCAAAAACAAATTATAGAAGACGAAAAAGCCCGTCTCAATAAAACTTTCAAAAAGTATGGAAAT
TCTGTAGTCTCGCTAGCAAAAGCTTTATGCCGTCCAGAAGTCTCTTACGATATTCTCAGGGAAACCTTCC
CTGACGATGTCCGTGACCTTGGCTCAACGCTTAATGCTTCGTTAGAGATGGAAATCAAGTATGCGGGATA
TATAGATCGTCAGAAATCGTTGATTCATAGTTTATCGAAATCAGAGAATATGGTTATTCCTGAAGATATA
GACTATCAAAGTATTTCCTCTTTAAGTTTAGAAGCTAGAGAAAAACTAGCTAAATTCACCCCAAGAACTA
TAGGGTCAGCTTCAAGAATATCGGGTATTGCCTGCGCTGATATTCAGGTATTGATGGTTGCTGTAAAAAA
ACATGCTCACCAATAA
>ref|NC_003361.3|:c129752-128334 replicative DNA helicase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCGACTCAAACAGAAAAAGCCTCTGCCCCTACACTGCCCAGTCCTCCCAGCTCTAAAGAATCAGAAA
TGATTGTTCTGGGCTGTATGTTAACAGGGGTTAATTATCTTAATCTAGCGGCCAACCAACTTAATGAAGA
TGATTTTTACTACCTTGAACATAAAATCATTTTCCGAGTTCTACAAGACGCTTTTAAACATGATAAACCC
ATAGATGTGCATCTTGCAGGAGAAGAACTAAAGAGAAGAAATCACCTTACGGTGATTGGGGGCCCTGGCT
ACTTAATTACTTTAGCAGATTTTGCAGGAACTGCAGCGTATATTGAAGAATACATTCAGATCATTCTTTC
TAAATCCATTTTAAGAAAGATGATCCAAACAGCTAAGGAAATAGAGAAGAAAGCAACTGAAGAACCTAAA
GATGTTGCTGTTGCTCTAGATGAAGCTCAAAACGCTTTATTTAAAATTAGCCAAACAACAGCCCTCACAC
AATACGTTCTTGTTGCCGATAAACTTCAGGGCTTAACTTCCGCTCAAGAAAAGCCCTTTTTAATACAATT
ACAAGAAAAACAAGAGTTCTTCCATCAGCACGCTCAAAGTGGTGATGCTTTACCCATTTCGGGCATTCCT
ACGCATTTCATTGATTTAGATAAGATGATCAACGGGTTTTCCCCATCCAACTTAATGATTCTTGCCGCCC
GACCTGCCATGGGGAAAACTGCTCTCGCTTTAAATATTGCAGAAAACATGTGTTTTCAAAGTCGGCTTCC
TATAGGAATTTTTTCTCTAGAGATGACCGTAGATCAACTTATTCATAGAATCATATGTTCTCGATCCGAA
GTGGAATCTAGAAAAATTAATGTAGGAGATTTATCCGGGCAAGACTTCCAACGAATTGTTGCTGTCGTAA
ATGAAATGCAGCAGCACACCCTACTTATAGATGATCAGCCCGGATTAAAAGTAACAGATCTTAGAGCTCG
CGCTCGAAGAATGAAAGAAAGCTATGATATTCAATTTTTGATTATCGATTACCTACAACTTCTTTCTGGT
TCGGGGACCCTACGTTCTGCAGAAAGTCGCCAAACAGAAATTTCAGAAATCTCAAGAATGCTGAAAACTT
TGGCTAGAGAATTAAATATCCCAATTCTCTGTTTATCACAGCTGTCTAGAAAGGTGGAAGACAGAGCCAA
TCACCGACCTATGATGAGTGATCTTAGAGAAAGTGGAAGCATAGAACAAGACTCCGACTTAGTGATGTTT
TTACTACGTCGAGAGTATTATGATCCAAACGATAAGCCCGGAACAGCGGAACTTATAGTCGCGAAAAACC
GTCATGGTTCCATAGGCTCTGTTCCTTTGGTTTTTGAAAAGGAACTCGCGAGATTTAGAAATTATGCAGC
CTTTGAGCTCAACGGTTAA
>ref|NC_003361.3|:130414-130920 CDP-alcohol phosphatidyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TCCATCTACGCCTACTGGTCATTTTAGGTGCCATGGCTAGTGATGTTTTGGACGGCTATCTTGCCCGTCG
CTATAAGGCGACCAGTCGTTTTGGTTCTATGCTGGATCCTCTGACCGATAAGTTCTTTGTTTTTGTCTGT
GTTGCCATCCTTTATTGGGAAAGGTCTTTGTCCCCTGAGCACCTCCTTCTTATTTTTGCTAGAGATATTT
TCCTCGTTCTTTTTGCTATCTACCTCTCTGTTGTTAGGGGGTGGAGAGGATATGATTACCGAGCTCTTTT
CTTTGGAAAGATTTTTACAGTGGTTCAATTTATTATTTTGCTAGGAGTCACCGCGGGCGTGCGCATCCCT
GTAATGGGGTTAATGCCATTAATTATTCTCGGATTTCTCTACTTCCTGGAGAGAGTATTCGATTATAAAA
AGCAGTGTCTCGACTAA
>ref|NC_003361.3|:131156-132796 ADP, ATP carrier protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCAGTCATCAGAGATGAAACCCTTTTCAAGACTGCGGGCTTACTTCTGCCCCATATATCGATCAGAAT
TCCCTAAATTTATTCCTCTTTTCTGGCTAGCCTTTTTCGTAGGATTTAATTACTGCCTATTAAAAAGTAT
GAAAGATACTTTAGTGGTTGTGGGGTCTGACGCGGGTGCGGAAGTTATACCGTTCTTGAAAGTCTGGGGG
ATAGTCCCCGGGGCCGTTATTGTTACTATGATCTACGGTTGGCTAAGTAGTCGGTGTCCTAGAGACACCG
TTTTTTATTCCTTTATAGGTACTTTTCTCGGCTTCTTTTTCTTGTTTGCCGTAGTAATTTACCCCATGGG
GGATGCTCTACATTTGCATTCTCTCGCAGATAGGCTACAAGAGTTGCTGCCGAAGGGATTGCGTGGTTTC
ATTGTAATGATTCGCTACTGGAGCTACAGTCTATACTATGTGATGTCAGAGCTGTGGAGTTCAGTAGTTC
TTTCAACGCTCTTTTGGGGCTTGGCTAATGAAGTGACCAGTGTAAGGGAAGCTGGAAGGTTTTATGCCCT
TATTAATACGGGGTTGAATCTTTCTTCCGTGTTTGCCGGGGAAATCTCCTATTGGATGGGGAAACACTCG
TTCTTCATCTATCCTTTTGTGAAGGACAAGTGGCATGAGGTTATGATGAACCTCACCATTTTAATCGTTT
TAGCTGGATTATGCATGATTTGGCTATATAGAAAAGTTCACTTCCTCACACAACACACCTATAATTTCTC
CACAGCCTTTGCTCCTTCTGAAGCGCCTCCTCAAGTTGAGGAAAGCGTGGCCAGTGTAAAAGCTAAGAAA
AAGACGAAAACAAAGGCAAAAAGCCTCTTCCTCTATCTTATTCGCTCCCGGTACCTACTAGGTCTTGCCA
TTATAGTTTTATCCTATAACCTTGTTATTCACTTGTTTGAAGTGGTTTGGAAAGATCAAGTCAGTCAGAT
TTACAGCTCCCATGTTGAATTCAATAGTTACATGAGTAGGATTACAACCCTAATAGGAATTGTGTCTGTC
TGTGCGGCTATTTTCCTTACTGGACAGAGCATACGAAAGTGGGGCTGGACGGTAGGAGCATTGACTACTC
CAATTGTTATGTTGGTAACAGGCGTTCTATTTTTCGCTGCTGTATTTGCTGTAAAGAGAGACGTTATGAT
CTTTGGCGGCTTTTTCAATATGGCTCCTTTAGCCATAGCAGCTTGGATAGGTGGGATGCAAAACGTGTTC
TCGCGTGCTGCTAAATTCACGTTCTTTGATCAGACTAAAGAAATGGCGTTCATTCCTTTGCCTAATGATC
AGAAAAACTATGGTAAGGCCGCTATTGACGGCGTTGTATCTCGGATAGGGAAATCAGGTGGTTCGTTGAT
TTATCAAGGGCTATTGATAATCTTTTCATCCGTTGCAGCAAGTCTTAATGTGATTGCTGTAGTGCTTCTT
TTAATTATGGTTGTTTGGATCGCTGTTGTCGCTTTCATAGGAAGAGAGTACAACATCAAAGAAGCTAGTG
CTGTTGCGGAAAGTTCGAAAGCAGATGCAATCGCATCGAATGCCACTATCAGCAGGACTACAGTAGAAAA
TTCCAACAAAGAAGAAGTTGCTACGCTATAG
>ref|NC_003361.3|:132894-133892 protease IV, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAACGTTTTGGCATTTTTTGTCTAAAGGCTTCCTATCAATTCTAGGTTTATCTTTTGGAGTGGTTC
TTGCCTTCTCTATTATCTTGGGATTTGTTGCTCTCTCCTCTGGGGGTGGCATTCAATTTGTGAATATGCC
TAATGCTAAAGGGGAGATAAAAGATCTAGGCAAAGAGGCGCCAATTATTGCTGTATTAGAAATGAAGGAT
GTTATTGCCTCGAGTAGACATACGGAAAAAGTCATACAAGAAGCTATTATAGCACTAGATTCAGCACCTT
ATAAAGGTAGAGTGAAGGGCTTAATCATTGATATGGATTGTCCTGGAGGAGAAGTATTTGAAATCGCCCG
TGTATACTCAACAATCAAATTTTGGAAACAATGTACGAAGTGCCCTGTTTATGTTTTTGTAAATGGTCTT
TGTGCCTCTGGCGGATATTATGTTGCTTGCGCTGCGGATAAAATTTACTCGACATCCTCATCTTTAATAG
GTTCTGTAGGAGTGCTTTCTGGACCTTATTTCAATGTAAAAGAAGGTTTATCTCGTCATGGTGTGCAAAG
TGATTTGCTTATATCCGGAAAAGATAAAGCTCCTATGAATCCTTATACGGAATGGACAGCTAAAGATCGT
GAAATTAGACAAGAGATCATAGACTATCTTTACGGTCAATTTGTTGATATCGTTGTAACGAATCGCCCGT
TATTGACTAAAGAAAAATTAGTTGGTGTTTTAGGTGCACGTTTATATTCTCCTGAAAAAGCTTTAGAAAC
AGGCTATATTGATGTTGTAAACGCAACTAAACAACAGGTTCTTGAGGATTTAGTTGCTGCTTGTGACATT
GAAAATAACTACCGTGTGATCGGTTTAGGAAGCGATGGCTGGTTGAAAAAATTCATGTCATCAGCTGCTA
ACAGCCCATTAATCACAGGAAAGATTCAACATGAATTGCTCCCTAATCTAGATAATTCTACCAGTACATT
TTACTATTTGGAGCCATGA
>ref|NC_003361.3|:133923-136532 DNA polymerase I [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGAGAAAGATCTTTATTTTAGATGCTTCAGGATTTGTTTTCAGGGCATATTTTGCTCTCCCAGATATGA
AAAATTCTTCTGGAGAAGGAACCCAGGCTGTTTTCGGCTTTATTCGTTCTATTAATAAATTAATTAAAGA
GTTCTCTCCGAGTCATATGGTGGCCGTATTTGACGGCCCAAATAATAAACAAAGTCGTAGAGAGATTTAT
GCCGATTATAAAAGTAATCGAGAACAGAAAGAAGAGAATCTCTACCAACAAATTCCTGTAGTTAAAGAAT
ACTGCAGTTTGCTTGGTTTGTCCTATCTAGAAGTAGAAGGAGTAGAGGCTGATGATGTTATAGCTAGCGC
TACAAGGCAAGCTGTGTCAGAAGGCTATCAAGTCTGTATATGTACCGCAGATAAAGATCTACTTCAACTG
GTGGGGCCTAATGTTGTTGCTCTAAATCCATGGAAAGATCAACCAGAAATTGATGAAAACCGTGTCATAG
ATATCTATGGCATCCCTCCAACAGGAATATCAGATTATCTAGCCTTAGTTGGTGATACTTCTGATAATAT
TCCTGGAGTTTCTGGATGTGGGCCTAAGAAAGCAACGGCCCTGTTACAAAAATATCATTCCGTAGAAGGT
ATTTTAGAAAATCTTGATGAGTTGACAGGATCTACTCACAAGATGCTTTCGGAGCAAAAAGATGTTTTAT
TATTAAGTAAAAGTCTTGCGGTATTAAACGACGCTATACCTCTTCCTAAGAGGATAGATGAATTAAAGTT
CCCACTTTATGAAGCGCATCAGGAAGAGTTGAATGCTTTCTATATGCGGCAAGGCTTTAAAACTTTAGTA
CAGCAGGTTGAGGAAGCATCTAGCGTAGATGTTGAGATAATCAATAATAATAAACAGTTGGCTCACGTAC
TTTCTACTTTGCATGGGAAAAGCGTGGCTTTTTCTGTTGGTTATAAGGGGAGCTTTCTTCCCTCTTTAAC
TTTAATGGGAGTGGCTTTAGCTAGCGATGATGATGTTTATTATGTTGATATAGAACATGCTTTAGACGAT
GTTCTCACGCCGCTACAATATTTCTTCAGAAGAGAAGATACTACATTCTATGGTTACAACATAAAGAGAG
ATAATCATGCACTAAAGAATGCGGGTATTCATGTGCATAATATAGCTCTAGATTTAGCTTTGGCTGAACA
TTTGATTAATGGAGGAGCTAAGATTTCATACCAAACGCTTCTTATGGATCACGGATTAGTTAGTTCTGCA
GGCAGATATGGAAAGGAATGGGGGCAATTAAGCTTGCCTATAGCAAAGTCTCCAGCAAATCCTGCGCAAT
ATTTTGGGGGATTTGTTTCTCATTTGCCCAAGATAAAAAAATCGTTGCTAGAAGAATTGAAGATAAAAGG
AGTAGAAGATCTTTTTTTCAATATGGAAATGCCCTTAGAGAAAGTTCTTTTTACTATCGAAAGAAACGGC
ATGCCTTTGGATGTTGAAGATCTTCAGGAGTTAGAAAGAATTCTATCAGAAGAATTAGCAATGCTTACTG
ATGATATTTATACGTTAGCCGGAGCCCCTTTTAATATTAAATCTCCTAAGCAGTTGTCAGAGGTTTTATA
CAATAAACTTGGTCTGAAACCTATAGATAAGGCTCGATCTACTAAGGCAGAAGTTTTAGAAGCTTTATCG
GGTGAACATGAAATTATTGAGAAGATTTTAGCCTTCAGAGCTGTTGAGAAGTTGTTGTCTACTTATGTTA
AGGCCTTGCCTAGACAAGTGGATCCTAGCACCTCTAGAATTCATCCTACATTTAATCAAATGGGTACGGT
GACGGGAAGACTGGCTTGTCAAGATCCCAATCTACAAAACATTCCCATACGCTCTGAGCGGGGAAGATTA
TTAAGAAAGGCGTTCTGTAATACTCATCAGAATAATTATTTTTTATCTGCAGATTATTCTCAAATTGAGT
TAAGATTCCTGGCGCATTTGAGCCAAGATGAGTCGTTGAAATTGGCCTTTGAGTCGCGAGAAGACATACA
TACGTTTACTGCCTCGCAGGTATTTCATGTCCCATTGGAAGAAGTCACCAAACAACAGCGCATGCAGGCA
AAGACTGTGAATTTCGGTATTATCTATGGGCAACAAGCTTATGGATTGTCAAAAATTTTAAAGATCAGTG
TTTCAGAAGCTCAAAAGTTAATAGACGCATACTTTGATCGTTACCCTGAAGTAGCTCGTTTTATTAATGA
AACGGTGAGTCAAGCTTGTGAAAATTTACGAGTGAAGACTCTGCTAGGAAGAGAAAGGATCATAGATAAT
TGGACAGAATTTTCAAATTCTCGTGCTGCTTCAGGCCGTCTTGCTGTTAATACCCGTATACAAGGTAGCG
CTGCTGAATTGATAAAGCTGGCAATGTTACAACTTTCTGATGCGTTGGAAAAACGCAAATTGAAAAGTCG
TATGTTGTTACAGATACATGACGAGCTGATTTTCGAAGTTCCTGAGGAAGAGAAAGAAGAAATGCAAACT
TTAGTGCGCGATATAATGGAATCTGCAATGATTTTATCTGTCCCGCTAGTTGTGAATATCTTAATTGGAA
AAAATTGGGCAGAATGTTAG
>ref|NC_003361.3|:136526-137134 dephospho-CoA kinase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTAGAATTATTAAAAGTTTCTATTACAGGGGATCTCTCTTCAGGAAAAACTGAAGCAAGTAGAGTTT
TTCAAGATTTAGGTGCCTATGTAATTAGTGCTGATAAAGTTTCGCACAGTTTCCTTGTTCCTCACTCGCA
TATAGGTCGTCGCGTTATAGATCTTCTGGGACCAGAAGTTGTTGTTGATAATGCATTCGATAGGAAAGTC
ATAGCAGAGAAAGTTTTTGATAATTTAGTTCTTCTTCAGGCTTTAGAAGCTATTTTGCATCCTGAAGTGC
GTCGGATTATTGAAGAACAATATTATCAAGTCGCTAAAGAGCGAAAGCATCCTCTGTTCATTGCTGAGGT
GCCTTTATTGTACGAAATACATTATGCGAAATGGTTTGATCGCGTCATTCTTATTACAGCAGATGAGAAT
ATTCGTAGGGAAAGGTTTACCAAAAAAACTAATTGTTCTGATTTAAATTTTTATCAGAGATGTGCTCGGT
TTTCTTCTAATGAAGAGAAAAAGATGCACGCCGATATTGTTATAGAAAATAACGGCACTAAAGAAGAATT
ACGTCATAAAGTCGAAGAATATTTTTACGCTTTAAAGGGAGCATTATGA
>ref|NC_003361.3|:137131-138525 transcription termination factor Rho [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGCAAGAGAAGTCTTTTGCAGGAGAGTGTGCGGTAGTTACGGATACGGTTGATGAAAATCAGAACGTGAC
TATTACAAAAATTGCTAAATTGCAAAGGATGGGAATTGAAGAGCTTAATGTATTAGCTCGTCAATACGGA
GTGAAGAACATCGGGTCTCTCACCAAATCTCAAGTAGTATTTGAGATTGTGAAAGCAAAATCTGAGCGTT
CAGACGAGCTTTTGATTGGGGAAGGAGTTTTAGAAGTGCTTCCCGATGGATTCGGCTTTTTAAGATCTCC
TACTTATAACTACCTCCCTTCGGCTGAAGACATTTATGTTTCCCCTGCTCAGATCCGTAGATTTGACTTA
AAGAAGGGAGACACCATCATAGGTACGATACGTTCTCCAAAAGAGAAGGAAAAGTATTTTGCCTTATTAA
AGGTAGATAAAATCAATGGATCTACCCCAGACAAAGCTAAGGAACGGGTTTTATTTGAAAACCTCACCCC
TCTATATCCTAATGAAAGAATTGTTATGGAGATGGGGAAAGAGCATCTTGCTGAAAGGGTATTAGATCTT
ACAGCTCCCATTGGGAAAGGTCAAAGGGGACTTATTGTTGCTCCTCCACGTTCTGGAAAGACCGTCATTT
TACAAAGCATAGCCCACGCTATTGCTGTTAATAATCCGGATATTGTTTTAATTGTTTTACTCATCGATGA
GCGTCCTGAAGAAGTCACTGATATGATTCGTCAAGTGCGGGGTGAAGTTGTTGCTTCTACATTTGATGAG
CAGCCAGAGAGACATATTCAGGTTGCGGAGATGGTTATAGAAAAGGCTCGACGTCTAGTTGAACACGGAA
AGGATGTTGTTATTCTTCTCGATTCTATTACACGTTTAGCTCGAGCTTACAACACTGTTCAACCGCATTC
TGGAAAAATTTTGACGGGTGGTGTGGATGCTAGTGCTCTGCATAAACCAAAGAAATTCTTTGGCGCCGCT
AGAAATATTGAAGGCGGGGGATCATTAACCATTCTAGCTACAGCATTGATCGATACAGGATCTCGAATGG
ATGAAGTGATTTTTGAAGAGTTCAAAGGCACAGGAAATATGGAGCTTGTGCTTGATCGTCGTCTTTCTGA
TAGAAGGACCTATCCTGCAATCGATCTCATTAAGAGTGGTACCAGGAAAGAAGAACTCCTTTATCATCCT
AGTGAGTTGGAAAAAGTTTACCTCTTCCGTCAGGCAATTGCTGATCTTACCGCTATTGATGCGATGCATT
TGCTGTTGGGTAGATTAAAGAAAACGAATAGTAACGCAGAATTTCTTCTTTCTTTAAAAGAATAG
>ref|NC_003361.3|:c139045-138785 hypothetical protein CCA00131 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCTTATTCGTTTATTTTTTGGTATTCCCCTAACTAAGGGACTGCAAGTAATCAATTACCCTCCCCTAA
CTGTGGCAATCTTTCAAAAAAAAGAATACTTAGGAATTTATAGTCTTGCGGAAACCGAGTTACAGGTTGC
AAAACTCAATGAGTATTACCATCAAGCCCAAGAAATCTTACAAAAAGTCACTCAGGGAAAATATCTCACC
GACAAAGAGACTTCTTTGGTTATCTTCCCTGAGATTCTTATCGGGAAATAG
>ref|NC_003361.3|:139107-139727 orotate phosphoribosyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATGAGCTTTGAAGAAGAGCAGCTTCGTGATCATGCTGTGGTTAACCTATACCGCATAGGGGCAATAA
GATTCGGTGATTTTATTTTATCAGACGGGAAAAAAACTCCTATTTATGTTGATATGCGCCTGGTTATCTC
CTGTCCTGATGTTTTACAAACTATTGCTTCGTTGATTTGGCGTTTGCGTCCTTCTTTTAATAGCAGCCTG
TTATGCGGAGTTCCTTATACAGCTCTTACTCTGGCTACATGCATATCTCTGAAGTATAACATCTCTATGG
TGTTGAGAAGAAAAGAATTAAAACACCCAAATCAAGAAGATAAAATAAAAGTCGAAGGCTTATTTTCTCC
AGGACAGACATGCTTAGTAATCAATGATGTTATTGCTTCGGGACGTTCGATTTTAGATACCGCTAAGGCT
TTAGAAGATGAGGGTTTAAATATTCGAGAATCCTTGGTTTTTTTAGACAGACAAGTCGGTGGTGCAGACG
CATTAAAAGAGGCAGGTATTAAATTAAGATCCGTATTTACTCTAGAAGAACTCGTTAAGGCTCTACTTTC
CAAATGTCAATTAAGCGAGACAGACGCAGCGATTGCCCGTACGCTTTTAGAAACTTTTTAA
>ref|NC_003361.3|:139864-141192 glucose-1-phosphate adenylyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATAGAAAATGATTTTCAGGGCTACTCCCCAAGTTATCAGGCTTCTCATTTTTATAGAGATAAGGTTG
GCGTTATTGTTTTATGTGGCGGTGAAGGGAAAAGATTGTCCCCTTTAACCTACTGGCGCTGTAAACCAAC
CGTATCATTTGGAGGAAGATATAAGCTCATTGATGTACCCATTTCCCATGCAATAGCTTCAGGATTTTCT
AAGATTTTCGTAATAGGTCAATACCTTACCTACACACTACAACAGCATCTTGTGAAGACGTATTTTTATC
ATGGAGTACTTCAAGATCGGATACATCTCCTTGCTCCTGAGGGGAGGGAGGGAAGTCAGGTATGGTATCA
AGGAACCGCCGATGCTATTCGGCAGAACCTCTTGTATTTAGAAGATACAGAGATAGAGTATTTTCTAGTT
TTATCTGGCGATCAGTTATACAACATGGATTTTCGTAAGGTTGTAGACTACGCTATAGCTATGCAATCTG
ATATGGTAATAGTCGCACAGCCCATTCAGGAAAAAGATGCTTCAAGAATGGGAGTGTTGCAAATAGATAA
AGATGCAAATCTTGTAGACTTTTACGAAAAACCTCAGGAAGAAGAGATTTTAAATCGTTTTCGGCTATCT
TCTGAGGATTGTCGTAAACATAAGCTGGATCCTCAATATGGAAATTTCTTAGGGAATATGGGGATTTATC
TCTTTCGAAGGGAAAGCCTATTTCAACTGCTACTAGAAGAACAAGGGGATGATTTTGGAAAGCATCTTAT
CCAAGCCCAAAAGCAACGCGGGTCGATAAAGACTTTCCTTTACGATGGCTACTGGACAGATATCGGAACA
ATCGAATCTTATTATGAAGCGAATATTGCTTTAACACAAAGGCCTAAACCTCAGGTTCGTGGATTGAATT
GCTACGATGATGCAGGAATGATCTATAGTAAGAATCATCATCTTCCTGGGACTATAGTTACAGATTCTAT
GATCTCCAGCTCTTTGCTTTGTGAAGGTGCTGTTATTGATTCTAGTAATGTATCCCACAGCGTTGTGGGG
ATCCGTGGTGTGATAGGGAAAAATTCTATAATAGATCACTCTATTGTTATGGGAAATGACCGTTATGGCA
ATCCCCAACAAAACGCTTTAGGGATCGGGGATAATTGTGAAATTTATAAAACAATTATCGATGAGAACTG
TAGAATCGGTAACGGGGTAAAACTCACGAATATCCAAGGGCATAAGGATTATAATTCTCCTGATGGGAAG
CTTGTCGTTAGGGATGGGATTATTATCATTCCTCGAGGAACTAGAATTCCTGATAATTATACCTTCTAA
>ref|NC_003361.3|:141307-142050 hypothetical protein CCA00134 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCAGATATATGCAATAGCGGATTTACACCTGGCTATCGGAGTTCCTGAAAAGACCATGGAAATTTTTG
GCGAGCCATGGATTTCCTATCACGAGAAAATCCGTGAACGGTGGGAAAAGATAGTCAATCCTGAAGATAT
CGTTTTGCTTCCCGGAGATATCTCTTGGGCTATGCATATCGAAGAAGCGAAAAAAGATTTCGCTTTCCTA
GGTTCTCTCCCTGGAACTAAGTATATGATTCGTGGGAATCATGATTATTGGAGTTCCGCATCAACGACTA
AAATAACACAAGTTCTTCCTGAAAATGTGCATTATCTAGCTCAAGGCTTTTCTCTACTACATCCGGAAAT
AGCTATTGTGGGAGTAAGGCTATGGGATAGCCCAACAATACGTGTAGCCCCTGAGTGTTTCCAATCTCCT
CTTCCAGAGAAAGAGCGCCATTATAGTGAGAAAGATGAGAAAATTTTTTCAAGAGAGCTTGGAAGATTGC
AAAGGGCTTTAGAAGCCGTTCCTCAGAATATCGAGCAAATTATTGTTATGACCCATTACCCACCTATCAG
TAGTGATGGCACGCCAGGACCGGTATCGCAAATGCTTGAAGCTGATGGGAGAATATCACATTGCTTATTC
GGTCATATGCATAAAGTATCCTCTCCTTTGAAAGGATTCGGAATGATCGGTACTATAGACTACAGGTTAG
TTGCTGCTGATTATATAGATTTTATTCCCCAGGTTATACAGTGA
>ref|NC_003361.3|:142047-142616 hypothetical protein CCA00135 [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGAAAATTCTTGCAGGCAAATATAAAGGGAAGTCTTTAAAAATTTTTTCTAACCCTTCAGTGCGTCCTA
CGTGTGGGGTAGTCAAAGAGGCTGTTTTTAATATTTGCGCGGCTTATATTGAGGATGCCACATTTTTAGA
TCTCTTTTCTGGAGTAGGATCCGTAGGTTTTGAAGCTTTAAGCCGAGGAGCTTCTTCAGTGACTTTCGTA
GATTCCTCTGCACAATCTGTACGTTTAATTCGGGCAAATAGCCAATTATTGCATCCAGATTTGCCAGTTA
CCATTATGAAACAAGAAGCAAGATCCGCGATTCAGAGACTGACTAAAAAAGGTATGTCCTTCGATCTTAT
TTACATAGATCCTCCCTATAATCTTGAAAATCGCTATCTTGCAGCAGTATTAAGCGATATCGTTTTCGGC
AAGATTTTGGATAAGGAAGGCTTACTATTTTTAGAAAATGCTTCAGTAGAACCTATTCTTGTTGAAGGCT
TAGTCTTGAAGCGTAGAAGAAAATTAGGGGGAACATTTTTATCGGAATATATCCTTGACGATAGTTCGTG
TTCGCTTTAA
>ref|NC_003361.3|:142809-143561 periplasmic amino acid-binding protein, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGAAAATCAAGAATTCCTCAAAGCTATATTTTCTAGCTCTTTTGTGTTTCCTTCCTTTGGTTTTTCTAG
GATGTTCTAGAGAAAAGAAAGAGTTGTTAGTAGGAAGAGATACTACTTGGTTCCCAAAACAATTTGGAAT
TTATACAGCGAATATCAATGGGTTTCTTAATGATCTTGTATCAGAGATTAACTACCGCGAGAACCTGAAT
ATCAATATTGTAAATCAAGATTGGATCCATCTTTTTGAAAATCTTGATGATCAAAAGACTGCAGGAGCTT
TGACATCGATAGCGCCAACAGCAGAGATGTTAGATCATTATCAATTTTCTGAGCCTATATTGCTGACAGG
TCCTGTGCTTGTTGTTTCCGAGAATTCTCCGTACAAGTCTATACAAGATCTTCGCGGGAAGCTTATCGGA
GTGTATAAATTCGATTCTTCAGTGCTAGTAGGTCAAGATATCCCCGACGCTGTTTTAAGCCCTTATCAAC
ATGTCCCCATAGCTTTAGAAGCTTTATCTTCTGGTTGTTATGACGCCTTATTAGCTCCTGTTATAGAAGT
CACAGCTTTGATAGATACAGCATATAAAGGGCGCTTAAAAATTATTTCACAGCCTTTGAATCAAGATGGC
TTAAGATTGGTAGTTCTTCGTGGTGAGAAGAATAGCTTGCTAGAAGGGTTTAACATGGGATTGGTAAAAA
GCATGCGTTCTGGAAAGTATCAGACCATCAAACAGCAATACCGCCTGCCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c144522-143566 ferrochelatase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTTTCTGCTTACCTATTAGCAAATTTTGGCGGTCCGCGTCATTCTAATGACATTGAGGTTTTTTTAA
CTTCATTACTTACAGATCGTGATGTTACCGGAGGATTTCTTCCTTCTTTCATTCACAAACGTTTATTTTC
ATTTATCGCTAAAAAACGCGCTCTTAAGGTTCTTCCTCAATACAATTGTATCGGCGGATTCTCCCCGATA
TATCAAGATACAGAATTGCTAGCAGAAACTCTATCTTCGCATTTAGATGCTCCTGTAATTACCTTTCACC
GCTATTTACCTGATACACATCCGCACACAATTCAACAGTTAAAAACTCTTGGGGATTTTCCGATTGTTGG
AGTCCCTCTATTCCCACATTTTACTTATGCCGTTACAGGAAGTATTGTAAGATTTATCCACAACCAACTC
CCCTTGCTAAATATCTCTTGGGTATCTCACTTCGGAAATCACCCAGAGTTTATTTCATGTATGATGGATC
ATATCCTAAAATTTTTACAATCTCACGATATCTCTACTCATGACTGCTGCCTATTATTTTCTGCCCATGG
GCTTCCTATGAGACACGTGAATAAAGGCGATCCTTACAACATGCAATGTGAAAAATCCTTCAGAGCGATT
TCTGAACGATTACCAAACATAGAAACCCATCTTTGTTATCAGTCGAAATTTGGTCCTGGGAAATGGTTAT
CACCATCAACAAAAGATCTATGCGCAACATTAAAGACAGACAAAAAACATGTGCTAATTGTCCCTTTTGG
ATTTACCTCAGATCATATAGAAACTCTTTATGAAATAGAAAAAGAGTATATAGCCGTACTTATAGATAAG
GGGTATCAAGCTCTACGCGTACCTGCTATTTATCAATCCTCTCAATGGGTTGAATCCTTAGCAACAATTA
TTCAAAGTACGCCACACGTGGAGAAAAAAAGCTTAATAAAATCGTAG
>ref|NC_003361.3|:144619-145626 hypothetical protein CCA00138 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ACCTCATGCGGCATAGCTTATTGTTGTTTGGATGTTTATTATTAATGGCTGCCGAACTTGGTGTTTTTAT
TTATTTTTTCCTGTTTTCTGGAAAAACTATCGTTCCAGCATTTTGTCTAGCCTGCTTTTTTCTTACATTA
TTCGTCTGTCTTGTTGCGCGTTTATACATATTGTCGAGAAAGCCTGATTTCTTTGAAAACCTAGCAAGCG
GCTATTTAAGAAACGCTCAATCCTTGTTTAAAGGGAAACAAAACGTTGTGGAAGAGCAAACACATCTAGC
CTCATCTGCAACAAAGCTTGCTATAGATTTACAAAATCAAGAATACACTCTCTTATCGAGCATGTTAAAT
TTCCTCCCTCAGCACGACTTCATTAGGAAATTTAGCTGTTTTTGCTTCTGGAAAGATTACTTTCTGTTCA
GAGAATGCTTACTACAGAAATCTATAGACGCCTACATTAAAGTAGTACAATCTATCCCCGTAGATCTCGG
AGCTCATGTATCGCTAGCAGATGCTTACGTAGCTCTTTCTGGACTCTATGCCGATCCCAGGAAATATCCT
GAATTCGATACGAACTATTGGGTCCCTCCAGGAAGATATGGAGAAGAAGTTCAAGAAAAATTTTTCATAA
CGGCTCAGCGTGCAATAGAAGAATTTAAAATTTTAAATGAATATGCACCGGGAAATGCTTGGGTCCATGC
GCAATTGGCTTATAGTTATCATGATTTACAGATGCCTCTCGAAGAGATCCAAGAATATGAGATGATCCTC
AAGTTAAAACCTGCTGATGTGGAGACCATGACCAAGCTAGGCATTCTATATTTTCAACAAGGAATGAATG
CTAAGGGCTTGCGTATCTATGAAGAATTAAAAAAAAGAGATTACAAAAAATCAAGAAAATTAATTAAATT
CTATGGAATGGAATACAATAATTATTAG
>ref|NC_003361.3|:145681-146022 hypothetical protein CCA00139 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GGCGAGCGCGTTTTTCAGTTCGTACGCGTTATGAAATAGCCAGTGCCGTGGCTATTTTTGGTTTAGTCCT
AGCTTTATGTGGGTCTGGAGCCGTTTACGCTGTTTTTACATCGTGTGCAATCTCTGAGATATTTATTCAG
GGATGCATGTCTTTAGGATTAATGCCCATTCCTGTGGCAATACTTTCATTACTTTTGGGTATTTTGATTC
TTCTCTATGGGATCTACCTATTGCCACAGCAAAAAGAAGAAAAAATAGTGCGTATTTCTTAA
>ref|NC_003361.3|:146094-146300 hypothetical protein CCA00140 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TAGAAGCATCTTTGGATAAAGTGGTTTGTTTATCAGAAGATGATGGTGATGATCAAGAAAACTGTTCTGA
GTGCTGCGGCGACGGAAGCTGTGGGTACTGCCCAGGATGCCAGGACATCCACTGGGTGATCTCTTAG
>ref|NC_003361.3|:146811-146975 hypothetical protein CCA00141 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAAAATTAATCTTAGCGCTTCTTCTAGCTTCTTCGTGTGCTTGTACAACAGCTGTTTTCGCTGATG
ATAGTGAAGATGTGAAAGTATTGGCTGATGGCGGGGATTCTGAAAATGGATCTGAAAACGACGACGGAAA
CGAAAGTTCCGAAACTCACGAATAA
>ref|NC_003361.3|:147733-149850 peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATAAACGGTGCATAATAGACAAAATTTTAAAGTGTGTAGTTGTTGCCTCTTTGGTTTTGTTATACT
GGTCATCTGATTTGCTTGAAAAAGATATCAAGTTAATCAAAACGAATGTTCGAGATGTGCAACAAGACAT
CCAAGAATTACTGAGTATTGTAAAGCAAAATAACGCTTCACGGTCTTCCAGCGCGTCCTATCCCTCTTCA
CTACCGATAACCACATGCTGCAACTTTATAGAAGTTGGAGATCCTCGGTACCCCAATCTACTTTCTCCAG
ATCCTTATAAGGAAAAAACCCTAGGGAATCTTGTAGGGGATGGATTTGTTCCTAAAGGTATTTTACGTAC
AGCTCATGTAGGTAAGCCAGATAATTTAAGTCCTTTTAATGGCTATGACTATGTCGTAAAATTATACGAT
TTATGTGTCCCTGGGTTGGCAAACGCCCATGTGGGAAAATACGAAGAATTTTCTCCGGGATTAGCTTTGA
AAATAGAAGAGCATGACGTTGCCGATGGCTCTGGAGATCGCGAATTTCATATTTATTTACGTCCTAACGT
ATCTTGGGTGCCTATTGACCCAAGACGCTTTCCGAAACATGTGCAGCTAGCGGATGACTTTATACAGCCG
CACCCCGTGACAGCACATGATTTTAAATTCTACTATGATGCGGTAATGAATCCCTACATTGCAGATATGC
GTGCTGTAGCCTTACGCTCATATTTTGAAGATATTGTCTCTCTCACCGTAGAGAATGATTTAAAATTTAT
AGTGCGATGGAGAGCGCACACTCTTGTAAACGAAGCAGGGAAAGAGGAGAAAAAAGTTCTATATTCTGCT
TTTTTGAATACTCTATGTCTACAACCTCTACCCCGATTTGTGTATCAGTATTTTGCTAATGGTGAGAAGA
TCATCAAAGATGATTCCGATCCCGATATCTATCGTAAAGACTCTGTATGGGCTCAGAATTTCTCCTCGCA
CTGGTCAAAGAATTATCTTGTTAGCTGCGGAGCGTTTTACTTTTCTGGTATGGATGACGAAAAGCTTATT
TTCACGAGAAATCCAAACCACTATGACCCTAGGGAAGCTCTAGTGGAGAAGCGCTACGTCTATATTAAGG
ATAACTCAGATTCTCTATTTCAAGCTTTTAAAGCAGGGAACCTTGATATAGCCTATCTGCCTCCGAATCA
TGTGGATAATCTCGCAAGCTTTATGAAGACTCCTGCCTATAAAAACCAAGCTTCTAAAGGAGAAGCTATT
CGTGAAATGGTCTATCCAGACCGTTCTTACGCTTACATTGGTTGGAATTGTTATTCATTGTTTTTTGAGA
ATCGTCAAGTGCGACGTGCTATGAATATGCTCATAGACCGTAATAGGATTATAGAAGAATGCTTGGATGG
TCGTGCTCATGTGATCAGCGGGCCTTTCTCTCCTTTTTCTCCTTCCTATAATCAAAAAGTGGAGGGGTGG
CATTATTCTCCTGAAGAAGCTGCGCGTATATTAGAAGAAGAGGGTTGGATCGATATTGACGGGGATGGCA
TTCGAGAGAAAGTCATAGACGGCGCTATTATTCCTTTCCGTTTCCGTTTATGTTATTATGTCAAAAGTAT
TACAGGCCGCACTATTGCAGAATACGTAGCAACTGTCTGTAAAGAGGTAGGCATTGAGTGTAGTTTATTA
GGATTAGATACTGCCGACCTTTCTCAAGCATTTGAAGAAAAGAATTTTGACGCTTTGCTTACCGGCTGGT
GTCTAGGATCTCCTCCTGAGGATCCCCGAGCTCTTTGGCATTCGGAAGGCGCAATGGAAAAAGGATCCGC
CAATGTTGTTGGTTTCCATAATTCCGAAGCTGATAAAATTATAGATCAACTGAGCTATGAATACGATACG
AGTAAACGTATGGACTTGTATCATCGTTTCCACGAAGTTATTCACGAAGAATCTCCCTATGCTTTTCTAT
TCTCTCGTACCTATTCTTTACTTTATAAAGATTATGTAAAAAACGTCTTTGTCCCTAAACAGAGGACTGA
TTTGATCCCTGATGCTCAAGACGAAATGGTTAATCTTCATATGGTTTGGCTAGACAGGAAGGAGGAAGAG
TGCTCAAATATATCTTAA
>ref|NC_003361.3|:149832-151313 peptide ABC transporter, permease protein, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGCTCAAATATATCTTAAAACGTCTGATATTGATTCCTCTGACGCTTTTTGCCATTATTTCGGTTAATT
TTATCATATTAAATGCAGCTCCAGGGGACGTTGTTGAAGATCAATCTATTGATGCTCACGGAGATGCATC
AAAATCAGATAAGATTCGTACATATAAAGGCCCGGATCGCTATTTACAGTTTCGAGAATATTACGGTTTG
ACTCTACCTGTTTTCTTTAATACCCGCCCTGGCATACCACATGCTAAGGTAAAAAAGGGAATTCAAGAAA
TCGTAGATAACTTTCACAATAAAAAAGCTAACAAGGAATCTAGTTCTAAGCTAAAGGTTTATTGGGGTGA
TCGGGCAAAATTTATTATGCCGGTACTATTGTTTGAGGCTAGTGATAGTACAAAAAGTTCTTCTTACCGT
CATGTTGCTGCAGATTTGTTCATTCGTGGAGCCATCCGTCAGGGATTTGTAGGCTCAGGCTTATCCGTGC
AACAGTATGCGTATAACGAGAAAGTTTCTAAAAACAATGCTTTACTTGTGAAATTGCTCTCCGAAGAAGA
TATAGGGACCAAAGTTGAAGATTTAAAAGAATGGTTTCGTAAAGAGGGCGGGATGGAAACTTTTTCCTAC
AAACGCTTTTCTTGGAAGACATTCCTTTTTGAGACGCGCTTTTCTCGTTATATGTCACGAGTTTTGCGTT
TAGACTTTGGAACTTTACGTAATGACTCTCATAAGACAGTAGTTTCCGAGGTGATCAAACGGTTGCGTTC
ATCATTAACTCTCTCGGTCCTTCCTATGATCTTGGTATTTATCTTATGCCAGGTATTTGGGATGGTTATG
GCTTTAAATAGGAATCGCTGGTTGGATCATACTCTGAATTTTATCTTCTTATTTTTATTTTCGGTTCCTG
TTTTTGTCGCCGTTCCTTGGATTATTGATAATTTCGTCATTAATAAAACGATACCGTTTACCTCTATCCC
GATGCCCTACAGTGGCCTCCAGTCTTCTCCGGAAGTTTTTAATCAGCTGAGTTCTTTTGGGAAGCTTATA
GATACCATAACGCATAGCTTTCTTCCTTTCTGTGCTGTAAGCTATGGGGCTTTCGCTTCTCAATCAAGAT
TAAGCAGATCGATATTTTTAGAAATTCTAGGGGAAGATTATATTTGTGCGGCACGAGCTCGTGGAGTATC
TCGCTATGATATTCTTGTAAAGCACGTAGGGAAGAACGCAGCATCCTCATTGATTACCTCTCTTACGGCA
TCTTTAGGAGCAATATTAGGAGGAGCTTTAGTTGTAGAGACTTTGTTTGATATCGATGGATTTGGGAAAT
TTTTCTATCAGGCGATTTTAAATCGAGATCATAACGTAGTATTATTTTCTGTTATTGTTGGATCGGTTTT
ATCTTTATTAGGCTACTTAATTGGAGATATTTGCTACGTGCTATTAGATCCTAGAGTACAACTAGGAAAG
AAGAGGATTTAA
>ref|NC_003361.3|:151318-153051 peptide ABC transporter, permease protein, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCAATCCCAGACTTCTTTTTCCCGTAGATTTTTTCAGGCATACCATAAGAATCTCTTGGCATCACTGT
CATGGAAATTTGTCATCGTGTTATCACTTATAGGTGTTTACGCTCCTTTATTTGCTAGCAGTAAGCCTAT
TTTAGTGAAGTGGGAAGGCTCTTTCTTTTTCCCTTTATTTAGGTATTTATGGTTCCCAGGTTTTTATACT
AAACCGGTCGATCTTTTCTTTAATGTATTCATGGTGACGCTACCCCTGTTCTTTATAGGGTGTAGGTTTT
TCAAGAGGAGTCTTCGTAAGGGGATTATAGGCTGTTTAGCTATTGTTCAAATCCTAGGATTTGTCTTTGT
ATATCGTGGGAATATTCAGGATCCTTCGGGAGATGAAAATCTTAAAAAAATGCGCGCTGAGAAAATCCTT
TCACAAGTTGCCGATAGCAGAGCCGAATCTGTAGTTTTACTCCCTAAAGATATGCGTACTTGGGAATTAG
AAAAGACGTATATGAGTAAGTACGAGCAGTTGGGGATTTTGATAAAATCAAAATACCGTCGAGCGCAACA
TGAGAAATTACAAAAATATTGTGTGGATTATGAGGGACATAAGGGCTCGCAAATGCCGACATTACACCAC
TTGCAGATGAAAAATGAGCAGGTGTGTCTGGAGCGTCTGCAGCGAAGATTACAGAAAATCAGTACTTCTT
ATGAGTCTTCTTTGCAAACTTGGCATAGGGCAATTGATGAGTATCGTCCTTTTCTTATGGCACTTACCCG
TATAGAGCATGATTTAAACTTAGCTTTATATAATAAAGATCAGCATGAAAGTTTACTCATGAGACATTCT
TCAATAGAAGAAGAGGCTGAACCTTTCCGCAAGCATGTATTAAGTACACGTCAAGTTCTTGAAGAATATA
GTAAAATCCAAAGTACAATTAACTTTATTCAGGACAAACGTGCGTGGATTAATGAGGAATCTGAGAAATT
GCAGATTCTTATCAGCCCACTCCTCTCTAAATTTCATTGGGAAGATGATGCAGGAGGATCTCGTGAGATG
AATAAGTATGTGCGTTGGTGGCAGCTTACGCGTATTAACCGTAAAGATCTTTTAGCCTCTTTAATTTTCG
GTATTCGTATCGCTTTAATTGTCGGAGGCATTTCCGTTGCTATTGCGCTATTTATTGGTACGGTTATTGG
CTTATTTTCCGGATATTTCGGAGGAACTACAGATATGGTTCTTTCTAGATTTACCGAGATTTGGGAAACC
ATGCCTATGCTATTTATTTTGATGCTTGTTGTTTTAATAACGCAGCAAAAATCTCTAATCCTAGATACAA
TACTCCTCGGTTGTTTTGGTTGGACAGGATTTAGCAGATACATCAGGATAGAAACTCTGAAACAACGCAA
TATGTCCTACGTATTAGCTGCAACGAATATGTGCTATAGTCATTACCATATTATGGTGCATCAGATACTT
CCTAATGCAATTGTGCCTATCATTTCCCTATTACCCTTTTCTATGATGGCAATGATCAGCTGTGAAGCAG
GGTTAACATTTTTAGGCCTTGGAGAGGAAAGTTCTGCATCTTGGGGAAATCTTATGAAAGAAGGTGTCAC
AGCTTTTCCTTCAGAAAGCGCTATTCTTTGGCCCCCAGCTATCATGCTTACAGCATTGCTGATTGCCATA
GCATTGATAGGAGATGGTATTCGCGATGCTATGGATCCTAAGTTACAAGACTAG
>ref|NC_003361.3|:c153575-153048 DNA methyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGCAGATAGCTAAGCATCCCCCTCTACAAGTCATTGTTCATTTTCAAAACAACACTGTTGTAAAAACTCA
ACTTTCTGTAGCTCCTGTATTTTGCTGTTTATTTCTCGGCCCAGCATCACATAAAGCTATGGAAGAAATT
GTTTTATTATGCGCTAAGTACTCACAAAAACTCGATATCCCACGTTCTTCTTACATCAATACATCTATTT
TATCTGAACAACAAAAAACGATACTTGATTGTGTTGCGAAAATCCCTTTTGGGCAGACGCGCACATACGG
AGAGATTGCTAGAGAAACGGATACACATCCACGCACTGTAGGATCAGCGTGTAAAAACAACCCTTTTCTT
CTATTTTTCCCTTGCCATAGGGTAATTGGGAGTAATGGCGAACGCCATTACTGCGCAGGAGAACAGATCC
AAAACATCCTTCTGAATTTCGAAGGATCTTTAAGCTAG
>ref|NC_003361.3|:c154561-153590 hypothetical protein CCA00146 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAACGGCTGCTTTTTTGCGTTTGCGCACTCTCTTTCTCATGCTTTACCTACGGTTCAGCTCTAAAAC
AAGATTCTTCTGTTATGAAGGAAACCTTCCGTAACAACTACGGAATTATTGTATCAGGAAAAGATTGGGT
AAAACGAGGCTGTGATGGGACAATCACCAAAGTTTTAAAGGATGGGTCTACTCTTTATGAAATTTACGTT
CAGGGTCTTCTTCATGGCGAGATAACGTTAACATTCCCCCATTCTACGACTCTTGCTGTAATAAAAACTT
ACGATCAGGGAAGGCTTGTTTCATATAAAACATTCTTTTCTAATGGTTTACCTTCTCAAGAAGAATTATA
CCAAGAAGATGGCTCTCTTGTTGTGACTCGCTGGCCTGACAACAAAAATAGCGATACCATCACCGATCCT
TATTTTACTGAGACTACCTACCAGGGTCGTGTACTTGAAGGGAGCTACTCCTCATTTAATGGGAAATATA
CATCAACAATTCGCAATGGAGAAGGCATACGCTCGAACTTTTCTCCAAGTAACGTCCTTCTTTCTGAAGA
AACCTTTAACGATGGCGTTATGGTAAAAAGAACTACCTTCTATGCTACTAGAGATCCTGAAACTATAACG
CATTATATTAATGGCCAACCTCATGGATTGCGTTTAACCTATCTCCCTGGAGGGATTCCTAACACTATTG
AAGAATGGCGTTATGGTTACCAAGATGGAACTACAACAGTATTTAAAAACGGTTGCAAAGCTGCTGAGAT
TCCTTTTGTAAAAGGATCTAAGGAAGGATGTGAATTACGCTATAATGAAGACGAAGTTATTGCCGAAGAA
GTGTCTTGGAGAAATAACTTCCCTCATGGTATGAGAAAGATCTATGCTGCCGGTGTTTATAAATGCGAGT
GGTACCACCGCGGACGCCTAGTCTCAAAAGCTAAGTTCGAGAGACTCAATAATGCAGGATAA
>ref|NC_003361.3|:c156942-154561 phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTTGTGATCATATAGGTATAGAAACTGAAGTAGAAACTCTTCTTACTTGTTCTTTCTCTTCTATCATCAC
AGCAAAAGTACTAAAAACAGTTCCCCATCCTAATGCTGATAAACTCGTAGTCGCTACTCTTTTTGATGGA
CAACAAGAATACCAAATAGTTTGCGGGGCTCCTAATTGCCGCCCTGGCATCATAATTCCTCTAGCTCTCC
CAGGAGCAAAACTCCATGATCACGAAGGCAATGCCTACACAATAAAAAAATCTAAACTACGTGGCGTGGA
ATCCCAAGGTATGTGCTGCGGCGCAGATGAATTAGGATTTGCTCATCTACAAACAACAGAAAGAGGCCTT
TTTGAATTCCCTGAAAATACACCTTTAGGAGAAAGTGCATGCGCTCTTCTTGCCGACACATTTATCGAAT
GTTCCTTAACTCCTAATTTAGGCCACTGCGCCTCGCTTTTAGGCCTTGCTAGAGAAATTACCTATGTAAC
AAACGTAGATCTTGTTCTCCCCCCAGAATTTGTATGTACTCCTCTAGAAACAATTACAAAAGAAACTTCA
GGACAAGATCAACATCTTTGCCCTATCTTTTGCTGTGTAAAAATTTCTGGAGTCTCTGCTCAAGCTTCTC
CTCAAGAGCTACAAAATGCTCTCGGAGGACTCAAGCAAAAATCTATTAATTCCATTGTAGACATCACCAA
TTACATTATGTTGTCTTTAGGACAACCTCTACATGTCTACGATGCTAACGCTGTGGATATCGATTCTCTA
CATGCTCAAAAAGCACAAAAAGATGAACCTTTAAAGCTGTTAAATAACGAAGAAGTGCTTGTCCCTCAGG
GAACAGCAATCATCTGCGATAAAGATCATACTGTAGGTTTGGCAGGTGTCATGGGAAGTTTAGATTCTTC
TTTCAATGACGCAACAACAGAGATTATTTTAGAAGCTGCATATTTCCTCCCGAGCGCAATACGTGCTTCA
CAAACACACGTCCCCATACACTCTGAAGCTGCCTACCGTTTTACAAGAGGCATTGATCCCAACAATGTTT
TACCAGCTCTCTACGCAGCTATTCATTACATACAAAAACTTTTCCCTAATGCTAAAGTATCTCCTATCCA
AGTTTTAGGTTCTACACCACAAGCCTCTACTTTATCGTTCCGTACAGAACTAGTAGGGAAGATTCTTGGA
ATGCCCTTACATGCTTCTCAAGTAAGAGATCAACTTCATTCGTTAGGATTTAACATTTCTTCCGAAGAAA
ACTCTATTCTATCTGTAAATATCCCTTCGTATCGTCATGATATCCAAGAAGAAATCGATCTTGTTGAAGA
AGTTTGCAGAACACAACCTTGGAAAGTTGAGAATAAGAAAGCTCCTGCTATTTACAGCCCTATGTACTCT
CTTAAACGAAGGGTCGTAGACTTTTTAGCAAATTCAGGACTACAACAGTTTTTCACTTGTGATCTTCTAG
ATACAGAAACAGCAGCATTAAATAGAGAAGAGGCTGATTGTATCTCTTTACAAGGCTCTAAGCAGGCTAC
TGTATTGCGAGACTCTTTGCTCCCTGGATTATTAAAAAGCACGGCAACAAATCTCAATCGACAAGCTCCC
TATGTGCATGCTTTTGAGGTAGGAACGACGTACACAAAGAAAAGTTCAAAGTATCAAGAAACACAAAGTT
TAGGGATCATCCTATCAGGACAGGCAGAAGAAATATCTTGGATATCTCACGAACGTCCCCTATCGTTTTA
TTCAATAAAAGGATGGATTGAGAGACTATTTCAATATCTACATGTTTCTTCACAAGCATATGCAATTCAA
CCCTATGAGCATGCAAATTTCCATCCCTACCAACAGGCCGAAATTCATCTTCATAAGCATGTGCTAGGAC
GATTTGGAACCTTGCATCCGCAATTATGTAAAAAAGCCCAGATAAAACATTCTGTATTTTTTGCTGAACT
TTCTTTAGATTCTCTTCTACATACCCAGAAGAAAGCCTTGCATCTATACAAACCCTACCCTATTTATCCC
TCTTCATTCAGGGATATAACACTGACTGTTCATGAGTCTGTACCCGCAGATTCCTTAAGGAAAAAACTTT
TAAGTTTCCATTCTAAATGGCTTGAAAGTGTTTCTATTATCAGTATATATCAAAATAAGAACCCTACTAC
TCAGAATAAAAATGTTTCTTTACGTCTTGTATTTCAAGACAAGGAAAGAACATTATCTAATCAAGAAATA
GAAGAAGAACATGAGCGTTTACTTGCCATGCTTAACGCGCAAATAAACGATACAAAAGGAACTATCGATT
AA
>ref|NC_003361.3|:157050-158141 LysM domain-containing protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCCCTGCAAAAAGCGACCCGGTGGCTGTGGCAAGCTTTAGTTTTAAGTGCGGTGTTAAATATTGTTT
TCTTGCTTTTGTTTTATTCAACTATCTTTCGAAAGGATATTTATAAACTACGTTTATTTTCTGGTCCTTT
AGTGGCGAAAAGTTGTCAGGTGAAATCTATCCCTGAGGATTTTTTAGAGAATTTGGCAGAAGCTTCTCTT
GAAGAGCTTTACCGTTTGTTAGATGAAGATCATTTGCTTTATGGCCGCCCACTAAAGTTATGGGCGTTGA
GTGTGGCCATCCACACTTATGATGTGGATGTGGGCAGTGCACTCTCTCATCCTCTGACATTCACGCAATT
GCGTAGCAAAGGGAAAACCTGGTTACTCCCCAATATTGATGAGAGAGAATACAGTTTAATACGGCGTTAT
TTATCTCGCGAACGTTATCCTTTTACTTCTCGAGGTTTGTTTGTTTCTATTTCTAAAAATTTAGAGCAGG
GTGTTGTTGACGAGGATTGTCTATACCATTTTTGTCATACTCCGGAATTTCTTTATTTACGTACCTTACT
TTGTGGTGCTGACGAGCGTGTTGCTTCTGTGGCTTCTTTAGCCAGGATGGTAATACGTAATGGGGAACAA
ATCTTTTTTTCACTATGCAACGAACATAACCGCACTACGGCAATTTCTGATCGACAACGTCAGAAAGTTT
TATCTGCCTATGTGAGCTTAGGAGAACCTTTAGCGGCTTTGTTATTACTCGTTCATGATGAAGATTGGGT
GATTCATGAGTTCACAGATGAAGCTCTGAAGGCTTTTATCAATCTTCTTCCTGAGGAATCTTCTTATAGT
CAAAATTTTATTTCCCGTGTGCTCTCAACGCCACGCTCTTTTGTTGCTCATGACGTGAGTGTTGTAGAAA
CTCCTGTTGCTGATGCTAAAGAGGCTGTTTTTGAAGATTATATTGTAAAAGACGGCGATTCATTATGGTT
GATAGCGCGTCGTTATGGAGTGACTATTGAGGAGATCATGCGTGTAAATCACATGACTCATCATCGTCTA
CTGCCGGGGAAATGTCTAAAGCTTCCTCTAAAGTCGTCATAG
>ref|NC_003361.3|:c158376-158065 hypothetical protein CCA00149 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GGACAATCTCTCCTTTGCTAGGAAGCCCCTGTAGATTTTTCCCCACATGTTCACAGTATGCCCTGCAAGC
TCTAAAACATCATGGATGCATTAAAGGACTGGGGTTAACAATAAAAAGAATAGGAAAATGTGGGCCTTGG
CATCCAGGAGGGGTAGATCTCGTTCCTATGACGACTTTAGAGGAAGCTTTAGACATTTCCCCGGCAGTAG
ACGATGATGAGTCATGTGATTTACACGCATGA
>ref|NC_003361.3|:c159160-158366 hypothetical protein CCA00150 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GTTTCCCCACCGTCTTATCCAGGGAATATGTTTTAGTATCCTCGGAAGATCCCCAGGAATGTGATAAAAT
TGCCGTGTTCTTTCCTTTCGGAGTGGCTGTATTTTGGGGGTGGGAAGAATTCGAAGAAATCAAAATCCTA
CAATCTATCGTCTCAGCATCTCCAGAAATTCTTCCTCAACCAGAAATCGATTGCTATAACTTCCATTACG
GGGAAAAGCTCCAAATACGTAGAGATAGGCTCATCCTAGCCGATTCGCAACTCAATACAAAGCTAGCTAT
ATCTTTCGGCCTTGCCCAGTCAGTCAAGCTCACCATATTCGAAGCGACTATTTATAAAACTATTGAAGAT
TCTAAACGCCTCCCCCAAGATCTCGCCACGAAAGGAAAGATCTCTATGCCTAGGAAGGCAATTGCAAAAA
AGATTGGCAAGTTATTTTTAGACAAAGCCTCTGTAAATCTCCATTCTGATATTCTGGATGAACCTGATTT
TTTCTGGGAACATCCAGAAACACAACCCATTTACATTGATGTTCTTAACTGCTTAGATATTAACGCTAGA
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ATCAGCATTCCTCGTCACTAGAATGGACTATCATTTGGTTGATTATGTTAGAAGTTTCTGTCGCTCTCCT
GAAAGACGTATTCAATGTCATTTAA
>ref|NC_003361.3|:159440-160030 hypothetical protein CCA00151 [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGTGGTTTCTTTCGTTTATTTTCTTTATACTTTCTTCTTTAACCCTACCCAGTCTCCCGGTATTTGCTG
AGCATTACATTTCTGAAGACGAAAAATTTTATATAGATCGGTTTAATTTTTCTGGAGAGTTTCCTGACAT
GGAAACTATGGAAATTCATGCACAGAGAAAAAAACGAGTACATTTGGATGCTTCTGGAGATTTCCCTAAA
CTAGAATCTATTGTTTACAACGGATCATTTGGATCCTTACGAGCTAAGCTCACTGGGAATTATCCCGAGC
TTACTTCTTTGGTGTTTGTTTGTTCATCTTGTAAGATGGATTTAGATTTCCGTGGACAGTGGCAGAAAAA
TACGACGATTTCTGTAAGTAATGAGTCGGAACCTCTTACATTAACTCTTCCGAAGGACGTGGGTGTGATT
GTTCATACAAAAGTATCTACAAAAGGAAAGGTAGTTTTAGAGGGAGATTTTGAAAAACGCGGGCGTGGGA
TTTGGAATAAAACGTACCACAATTCTTTAGTGGGTGTGGTGCCTATTACTTTAGTTTTTGAAGTCTATAG
TGGCTCTGGCGGCGTGATTACTTTACGGTAA
>ref|NC_003361.3|:c160729-160022 DNA repair protein RecO [Chlamydophila caviae GPIC]
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TATTTTCTCCTCTGGGACTTCTTACGTTTTTTGCAAAGCAAGGTCAGTCTATTTATTGTGATTTTAGAGA
AGCTCTTATCCCCCTATCCCTGGGAATCTATAGCCTAGATTATTCCCCGCCAAAAATGCGTAAGCTAATT
TGCGCAGAGGTAAAAAATCCCTTTTCAGAGATAAAATCCTCTCTTTCCCTACTGCAAGCAGCGGGGAAAA
TGGCCCAAAGTATTTTAGAATCACAATGGCAAGAAAAGCCCTCTCAAGAGCTCTTTTCCTTATTTTTAAA
TTTCCTACACCGCTTACCAGAAAGTAAAAATCCTGAAATGTTTGCAGCAGCGTTCCTGCTCAAACTTCTA
CAATATGAAGGAATCCTAGACCTATCCTCAACATGCGCACATTGTAAAAAAACGATTAGTTCTCCAAATT
TCTATCGTTATCAAGGGCGAAAATTCTGCCTAGAACATCGTCCAGAAAATGCCGTGATGATAGAAAATGA
AGAAGAACAAATTCTCTGTGCACTGATTCATGCTAAGAGATTTCAAGATCTCCTACATCTATCAAATTTT
CACTTAGAGTTTTCAGAAAAGATTACCCTCATATTTGAAAGTACCATTCATGAAGGAAAGAACAAGAAAT
TACCGTAA
>ref|NC_003361.3|:c161309-160734 hypothetical protein CCA00153 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCCTCATCGAACCTACCATCGCCCCTGGATTCCATATCTTCTAATGAGCAGACATCTACAAATGAAA
ATTCTTTAACTATCTTTGATCCCATACGGCATAAGATCTTGGCGTCAACACCCGAAGAAAAGGTTCGCCA
AGAACTTATTGCCTTTCTGATCGAAGAATTACTTTATCCTCCGGCCCTCATTATCGTGGAAAAGGGGCTT
AAAACCTTATTCCCGCTTCTTGCTCGTAAGACTATACGCCTTCCACGACGACGTCCTGATCTTCTTGTCA
TCACACCAGCAACATATACGAATTCCGAAGGCAAAACCTATAATCTAGGGCATCCCAAGCCCCTTCTGCT
TATCGAGTGCAAAGCTCGAGTAATTAACCAGCAAACGGTGAATCAGCTGTTAAGCTACAACTATATTATT
GGGGCCCCGTGTCTCTCTCTTGTATGTTATAAAAAACAACAAACAGGATTTTTAAATCCCAAAACACAAA
CCCTGGATTTTTATCCAGGGCTGCCCAGCTACTCTCAGCTACTTTCTTATTATCTTACATTAAACTCTGC
ACAACCTATAAACTGA
>ref|NC_003361.3|:c161946-161263 hypothetical protein CCA00154 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCACAGTCCTCAACGTCGATTAGCAAAGCAAAAGAAAACCCCAAGACGCGAGGTCGCCAATCTAGAAA
TCACAGGGAAGTCTTTTCATATTTCCCAGCCTCTACGTCAATTAATCATTGAAAAAAGCGGTCAATTACT
TGCAGTAGACTCTATTCATGTAGTCTTAACTTCGCATAAGGAGAAGCAGGGAACCGGAGTGCATCTGACT
GCCTCTATTGGGAAAGAGACCTTCCAAGTAAAAACCCAACACAGCAATGCTTATAGCGCGGTAATTTCCG
CCTTTAAAAAAATCCGCACCTTAGCGAATAAACATCAGAAAATACGCCAAGATAAGAAGAAACACGATAT
AGGCCTATCGAAAAAAGAAGAGCACATCGTTGAGATTCAAGAATCTGTGCATCTTTATGATGATATGTTG
CCTATAGAAGCTATGGACGCCTGGGATTCTTTAAAACAGTATGGTTATATCCCCGGATCTATGAAAAAGA
CTCTCTCTAAGAAAAAAACAGATCTCCCCGTTCTTTCTGAGGATGAGGCCATTAAGAAATTCGAAGCTTC
CCGAGATAAAGTGCTGGTCTTCCTAAATGAAAAAGAGCATAAGATTCAGCTAATCTATAAACAAAACGAC
GACAATTATGTCCTCATCGAACCTACCATCGCCCCTGGATTCCATATCTTCTAA
>ref|NC_003361.3|:c163408-162248 sigma-54 dependent response regulator [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATATAGAAAGAGTGCTAATAATAGACGATGAACCCTTGCTCAGAGACTTTCTTTCTGAACTTCTTT
TATCGCGAGGATTCTCCCCATGTACTGCGGATAATGTGAAGCAGGGTTGTCAAAAGATTCGGTCTGAGAA
ATATGACCTGATCATCTCCGACATGAATATGCCCGACGGTAGTGGCTTGGATATTATTAAAGTAGCTAAA
GCATATGCTCCGCAAACCCCCGTCTTGGTGATCACAGCTTATGGCACTATAGAGAATGCTGTAAAGGCTA
TGCATCAAGGCGCTTTCAACTATCTCACCAAGCCTTTCTCCTCCGAGGCACTGTTTGCATTCATAGCAAA
AGCTGAAGAACTACAAAATCTTGTAAACGAGCATCTTTTGCTAAAGTCGCAAATTTCATCGGAATCGCAC
CCTCTAATCGCAGAAAGCCCTTCAATGAAGGATTTATTGTCTAAAGCAAGAAAAGCCGCCGATAGCTCCG
CAAACATCTTTATTCATGGGGAATCTGGATGTGGGAAAGAAGTCCTTTCCTTTTTCATTCATAAAAACTC
TCCTAGAGCTTGCCAACCCTACATAAAGGTGAATTGTGCAGCTATTCCCGAAACTCTGTTAGAGTCAGAG
TTTTTTGGTCATGAAAAGGGTGCGTTTACAGGAGCTACGGCAAAAAAAGCCGGGCGTTTTGAACTTGCAC
ATACAGGGACTCTCTTATTAGATGAAATTACAGAAGTCCCCATTAATCTTCAAGCAAAGCTCCTTAGAGC
TATTCAAGAGAAAGAATTCGAACATCTCGGCGGGACCAAAACCCTATCGGTAGATGTGCGCATCCTCGCG
ACATCCAACCGCAACCTTAAGGAAGCTGTAGATCAAAAGATCTTCAGACAAGACCTGTTTTACCGTCTTA
ACGTCATTCCCCTCTACCTTCCTCCTTTAAGGGAGAGAAAAGAAGATATCCTCCCCCTGGCGCAGTACTT
CTTAGAAAAATTTTGTAGATTGAACAATAAGCCTATAAAAACTCTCTCAGAAAGCGCACGTTCTGCTCTT
CTTGACTACTCATGGCCGGGAAATATCCGAGAGCTCTCTAATGTATTGGAAAGGGTGGTTATCCTAGAAA
GCCCCACCTACCTCACCGATACTATGCTCGCTCTCTGCTAA
>ref|NC_003361.3|:163591-166611 hypothetical protein CCA00156 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCCTCTTCTTCAACACCAAATTCCTTGGCTTCTTCGTTGAACCCAGAAAGTACACAGTCTCGTTTAT
CCTTATTTTCGGATTTAACTCCTTTAGAGAGAGGGGAAGTTTCTTCCGTTTGGAAAACGCGGTGTCAGCT
TGCCTCCTGTATAGGGCTATTTTGTTTATCTTTGCTTACTATTTGTGCTGGAGCTTTAGTTTTAACTTTA
CTGCCGGCAACTCCTGTAATTATTGGGGTGGCGTTTATAGCCCTTGGTAGCGTTTTGTTGGTTACAAGTT
TGTTATTACACTTTGCAACACGGCCGAACAAGAAAACGGCGATGCAAAAGGTAAATATTCAAGATTTGCA
GGCGCAACTTCAGGCTCTGCTCGCGACTACAGATGCGCGTGGTTTAGCTATAAACGGTTTTGATCCTAAT
GGCGATCCGCAATTAATAATTCAAGGGCGAGAGAATCTCTTAGCAAGATTTGATAGAGATTTGCGTAAAA
AAGAAGTGGATTTATACCGTCTTATATCTTCTGAAGCGGAAAATAGACATTGTGCTTTGTCTGATTTATC
AGAGTTTCGTGAGATGCAAGAGCGGGTTAGCGAGGAGTTAGAACTTTTATACCGTTCTTATAATCAGCAT
ATAGCAGGAACGAGAGATACAGGAGATGATGAGCGTTTGACAAGGCTTTATCATGAGAGAGATTTGCTGA
TTCAAGAGCTTGTTGGTGTGGGGATTGAAAAATCCAATCAAACCGAAGCGGTTAGGAATTTACAAACTAC
ATTAAATACTCTGGTTCAACGTATCAGATTATTAGAGAACCAAATTGCTAATGAGGCGGGTACTAGACAG
CGACATGAGGGATTGGTAGCGGGCCTACAACCTCTATTACAAGAGCAAAATAGTTTATTATCCCGGCTCT
CTCAATCATACGAAGCGCTCATTGCCTTATCTATACGTGATGAGAGCCTGACAAATCAACGTATTGATTT
AGAAAAGGAGATTCAATCTCTTATGGAATCTACATCTGAGCGGCTCTTGCTTAATCGTGAATATAGAGAT
AAGTACCTACGTTCTGCGGGGGCGATAAATCAATTAACTAATAGCTTACGTGAAAAAGAAGCGAGGCTTT
TAGGGCTTACTCAGGAATTAGAAGGCTTAACTGATGAGGTGGAAAGACTCCGCAATCGTCAGCCGGTTGG
AGAATATTCTCAAGAGGATATCGATTTCCAACGCAATGCCATAGAAGTTAAAGATGCAGCTATTGAGCAG
TTGCGAGAACAGCTTGCAAGTTATAGACGCCTGATTGATGAGGCGGTTGCTGTCAATAGTCAGATTGCTA
AAAGGACTGAGGAGAGTGAAATACGTGCTCTGCATATTGCAGCTTTAGAGCAAAGAGAGAAAGTCTTAGG
GACGAAGATTCATGCGCTACAAGGGGATATTGATAGATACGCAGCAGAGCAACAACGTTTACGTCTGGAA
AATGAAGAGTTGCGGGAGCTAGTATTAACCGCAGAGAGCAATCCAGGCTCTAATGCACAAATAGAGGCTC
TTCAAAGAGAGATTCAAAGAATAACAGCAGATTTAAACGTTGTGGTTAGAGAACGAATAGATATTTCTGA
CTCACTTTCTCTTGCACGAACACAATTGACAGAGTCGCAATTGCGCTATGCGAGTCTTAGAGAAGAGGTT
TTAGCTAAGGATGAGGAAATTGCTGGTCTTGAAATAGAAATGAGTAGGCTACGCGCTGATATCCGTATTT
ATGATAGTGATATTGCTCACTTGCAAAACTCTTTACAAGGTGGCTCAGAACTACGTGGCACTATAAATGC
CTTAAGAGATGAGATTAAGAGATTAGAGAAAGAGAAACTTGATCTTAATACACGTATGTTGGCGGCGGTT
GAGCAAAACCGTGTGAATGTAGACCTACTGCAACAAAGTGAGAAGGAAAAAGAAAGACTTCTTCAAGAGG
TTCAAGCTTTACGCATGCGCTATGATCAAGAGAAAGCTGCTTTGCAAGATCAGGTAGCTCAGTTGCAGCA
GACAATGCACGACCGTTATCTAGAGCACATAGAAACGACCTCGCGATTAAAATTAGAAAACGAGCAGTTA
GAAAAACTTCTCAAAGACGCCAATAGAATGGCAAGGTATAGCGAAGAAGGTGCTATGCAGATGTTGGCGG
CACAGCTAATTACTTTATCCTCTAACATAAAGCAAAGGAAAAAAACTGAAGTACAACGCCTAGAATTTTC
AGAGATGCTTGCTTTTACTGCTCCGAGATTCTTCGGTAATGTAGGCATGAATATATCTTGTAGATGGTTA
CGCCCCGGAATATATTTAGAAGCAGAACTCCCTGCAAGTGCTACAGATGCGCAAAAGCGTGGGGTTATTG
AACAACGTTGCTTGCGTGAATGGTTCCTTGCATTGCTAGGGTCCTTCACCATACAACAGGTAGAGGCGAT
AGCGCAAAGAGCGAATGCTTTAGTTGCAGAATCTGGGGAACAACAACCCGCTCTTGATGAGTTGTTTAAT
GATTTGGCTGAAGAATTCCCTGAAATCCGCGCTTCTTCTGGAACACTTACCGAATGGCTGTCAACTTGCT
ATAGCTATGTGACAGACCTGCCGATGTTCAATGACTATGCACATTGGACAAGCTTCTTATTCTCGATGTT
GAGGAAAATGCATAGAGATGCCGGGGGACTACTAGAGAACCTCTCTGAGGAAGAAAATAAATTCTTAAGC
ATGGTGTCATGCTTCTATGGGAAGATTCCTTTAGTATTAGGAAGTATTGGTCATGGTCTAGGAACAACAC
CGGGAGCAGCAAATCCTTTAGGTGATTGCAACTATGAGAATCTAGGAAATGTGTCCTGGAATCGCTTAAT
AAGAGTTGTCGAACAAGTTTTAGCTGTCAGAAGTGGTCTTAATGGTCCGCAACTCTTAGAGATGCGTGAT
ATTTCTGAGGGCATGCAAAGAAGCGATGCATTAGCTCAAAGGTATTCACGAACCACTTGGACTCCCCCAA
GAGATCTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c167679-166621 sensor histidine kinase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGCAACAACAACTGTAAATCATGTTCTTCAACTCAAGAGCTGATAGAGATAAAATCTCGCATCACCC
AATCTTATAAAGAAGCGGATACTATCCTTACATCGATTCCTGATGGGATTATTCTACTTTCAGAAATTGG
CAATGTTCTCATTTGCAATTCACAAGCTCGTGAAATTTTAGGTATTCCTGAAGAATTAGAAATGTTGCAA
AAACCATTTACAGATTTTTTCCCAGAGACCTTCTTTGGATTTTCTATAAACGAGGCTTTGCAATCTTTAT
CCTCCCCAAAAACGTTACGACTAACGTTATCGAAAAATGATCAAGATCGTGATGCGGAGATCTTCATAAG
AAGAAACTCTGTAAATGGTTACCTCTTTTTACTCATTCGAGATCGCTCAGAGTATAAGCAGCTAGAAAAT
GCTATTGAAAGATATAAAAATATCGCTGAGTTGGGGAAAATGACCGCGACTCTAGCTCATGAGATTCGCA
ATCCCCTAAGCGGCATTGCAGGATTTGCCTCTTTGTTAAAAGAGGAGCTCTCCTCCCCACGCCACCAGCG
CATGCTTTCCTCTATCATTGATGGGACACGATCTTTAAATTCTCTAGTTTCCTCAATGTTAGAATACACA
AAGTCCCAACCATTGGATCTAAAAACCATAGATCTACAAGAGTTTTTCTCATCGCTCATTCCCCTACTAT
CGATTACGTTTCCTTTTTGCAAATTCGAACGTGAAACCGCAACCCCCATAGTCCGTGCTATAGATCCCGA
TAGAATGAATAGTGTTGTATGGAATCTTGTAAAAAATGCTGCAGAAGCGACGGAATCCCCTATGACAGTA
ACTCTGCATGCATCGGGAGATATTTCCGTAACCAATCCTGGACAGCTCTCTCAAGAGATTTTTGATAAGC
TGTTTATTCCGTTCTTTACAACAAAAGCCCAGGGAAATGGTTTAGGGCTAGCAGAAGCTTTAAAGATCAT
GCGTTTGCACGGAGGTGATGTTCACGTGGAAAATGCTAACGCTCGCATCACCTTTACTCTAAAAATTCCC
CAGCCCTAA
>ref|NC_003361.3|:c167986-167660 hypothetical protein CCA00158 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CGGAAACAGAGCCTTCGTTAACTTCCATAGAACTTGAAAAAGTATTACAACAGAAAAAAACCCTTCTATC
TTGTATAGACAAAGTGGATAACCAAATTAAAGAATTTCGGCATTGTTTTACTTTAGCGCTACCTCAAGAT
ATCCAAGATGAACTCTCCGATATCCGAGAAATCATTACGAAAATTCTTGATACAGACAAGCTCAACTATC
TGCAGAGAAAAAAAGAGTTAGGGATTTATGAGCAACAACAACTGTAA
>ref|NC_003361.3|:c168922-168215 hypothetical protein CCA00159 [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGCATAGGATTCTTATTAAGGTAAGTTTTGGATTATGTGTATTTCCGTTGCTCTGTAGTTGTGCAGATA
CTACAAAAACACCACGTAGGCATATACACGCAGGAAGAATCACTTCTCAGCAAGGACATTCTGTCGTTAT
TTATCCCGAAAGACAGGAAAATCCCCTACCGAAATATTCCTGGCCAACCCCACAACGCCCCGTAATCACC
AAGTATTCTTTTCATTGTCACGGATCCTTAACCTCTATAGAAACCGAGAAAGGCACTATCTATGACTGTG
ACGGATTAAACCATAGTCTGTATAAAACCTTCCCGATACATTCAAGAATTATTGCCATAACGCGCTTAAT
CCATGCCCACAGTACCCTCTCTATAATTGAAGGATTCTGTTGTCATAAGCATGTCCGTTTTCTAAAAGCC
TCTGGGAAAAATCTCTCTAATAAGCATCTTGAGGGAAATGCCGCTCTTTTATTCTCTGATAAAGAGCTTT
CTGTAGAGACTCTGCGCTCTATTTTACATCCTCTGTATAAAAAGAAGTGTCTCTATCCGTGTTCTATAGA
GTTTATAACCACAGAAACCACTCTAAGTAATGAAGAATTTATTATCACGCTGATACGAGAAAATAAAGGA
ACCTACTTAGCTATAGAGATGCTTTACGATCTAGAAAATGCCCAGCCTGTGAGGGTGCCCCCATCTCCCC
TATCTTAA
>ref|NC_003361.3|:169049-169741 HAD family hydrolase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATATCAATGATTATCAGGTTTTCTTTTTTGATTTAGATGGTTTGGTTATCGATACTGAACCCTTGT
ACTACAGAGCCTTTTTAGAGGGATGTAGAGAACGCGGATTAGATGTCTCTATGGATTTCTCTACATATTA
TTTATTATCGATGTTGGGAAGAGAAGTTTTTAAACAAAAATTCTTGGATATGTACCCTAATACAGAGGCT
TTTTTCCCACAATGTTTCCATGATCGAGAGCGTATCTATAGAGAGTTAATACAAACCGAGGTGCCTGCGT
TACTTCCTGGTGTTGAAGATTTTCTAGGACTGCTATTATCTGAAAATAAAACTGTAGGCGTAGTGACAAA
TTCTTCAGAGGTTCTTACGCAACGTTACCGCAAGGTTCTTCCTATTCTTAATCAGTTCCATTTTTGGGTA
ACGCGTGAAGATTATGAACGCCCTAAACCCTATCCCGATAGTTACCAACATGCCTACCAAGCGTTTGTTC
AAGAGGGGGAGAAGGTTGTGGGTTTTGAAGATAGCGTGAAGGGGTTACGCGCCCTTGCAGGGATCTCAGC
AACATTAGTTGCTGTAAATGCAATTATACCCATATCTCATGCTAGTCACGAAGACTTCTGTGAGAAGGAA
TTCCATTACTTCTCTTCTTTCAATGAATTGATTGGGCATTGCGGAATGCAAAACCAATTATAA
>ref|NC_003361.3|:c171131-170487 2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
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AACCTAAACAATATCTACCTTTTCAAGGGGAACCCCTTATCCTACACGCGTTAAAAACCGCTCTCCATAT
TCCTGAAATCACTGAAGTTATTGTTGTTTGTGATGTAAGCTATCGCCATATTTTTGAAGGCTTTCCTGTA
AAATTTGCAGAGTCTGGGAAACGTCGTCAAGATTCTGTTTTTTCAGGGCTACAACACGTGAGCAACCCCT
GGGTATTGATTCATGACGGCGTACGTCCTTTTATCTATCCTGACGAAGTTACTGAGCTTATTGCTGTAGC
GCAACAAACAGGAGCTGCAACATTAGTATCTAACGTTCCCTATACGATCAAACAACGTCATCCTGTAAAA
ACTTTAGATCGTGATGCTCTTTCTATTGTTCATACACCTCAATGTGTAAAGACCGAGATACTCTCTGCAG
GTCTTGAGTTTGCTAGTAGGGAGGGAATCACCCTGGTTGATGATACACAAGCTGCAGAGCTATTAGACAT
TCCTGTATCTTTAGTCTCCAGTAAACATCCCCAAATAAAAATTACTTATCCCGAAGATTTAACCATTGCT
CATGCCTTGCTATGA
>ref|NC_003361.3|:c172089-171115 hypothetical protein CCA00163 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGCCAAACTGGTTACAAACATCTTTGTTAACATGGAAGCTGCCTAAAAAACACGCCCACTTGCATGGGTT
GCGCATTGTTCAAATCTCTGACCTACACTTTCATAAATTTGTTCCTAAAAAATTCCTTAAAAAAGTTTCT
TTAAAGATAGCGAAGCTCGCTCCGGATATTCTTCTATTTTCTGGGGATTTCCTTTGCCGAGCACAAATAG
AAGAGCGTTCGCGACTAGAAGCTTTTTTAAATACTTTGCATGCTCCTTTAGGGACATTTGCTATTCTTGG
GAATCATGATTACCAATCTTATATTTCCCGCAATAGTCAGGGAAAGATTGATATTATTTCCTTGAAAAGC
AGCCAGCCATTAAAGCGGGCTTTTGTTTCGATAACCCAAGGACTATTTGGCTCTCGAGATTATACATACG
CTGAGGGTCTTGAAAAACAAGAACCTAATAAAGAACTTTTACAATTATTAAAAAATACCCCTATCCGCCT
ATTGCATAATGAAAGTCACCTTATTCCCGATGTAATCAATATTGTTGGTTTGGGAGATCTTTTTGCTAAA
CAATTTAATCCCGAAAAAGCGTTTATTAATTATAATCCTTCTTTGCCTGGTATTATCCTTTCTCATAATC
CTGATACTGTGCGTCAACTAGAGCCTTATCCTGGAGATATTATATTTTCTGGCCATACACATGGACCTCA
AATTTCTATCCCTTGGCCGAAGTTTGCCAATAAGATTATGAACAAAATCTCTGGATTAGAAAATCCAGAT
TTAGCGCGAGGTCATTTCCTCTTTGAAGAAGGGAAAAGGCAATTATATGTAAATCGCGGTCTTGGAGGAT
TTAAAAGATTACGCTTCTGTTCCCCTCCAGAAATTTGTTGCGTACGGTGTGTATATGGATCCTAA
>ref|NC_003361.3|:c172424-172161 BAF60b domain-containing protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGTCAAAAAAACAAAAACTCTGCTTTTATGAACCCCGTCAATATTACCCCCGATTTAGCAGCTATCG
TTGGCGAGGGACCAATGCCCCGCACTGAAATTGTCAAAAAAGTATGGGAGCACATTAAAAAAAATAACCT
TCAAGACCCTAAGAATAAAAGAAATATCCTTCCCGATGACGCCCTAGCTAAAGTCTTTGGTTCTAAAAAT
CCAATCGATATGTTTCAAATGACGAAAGCCCTTTCCGCTCATATCGTAAAATAA
>ref|NC_003361.3|:172424-172555 hypothetical protein CCA00165 [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGGTTACTCCTAGTAAAGGTGGTATGAAGAGACGGAGCTCTTCATCGCAACTTTTTTATCTTTCAAGAA
GGTTTCTCGTCAAAACAAAAAAACAGAACTCGCTCCTCAATCACTCTTTATTAGTGTTTTAA
>ref|NC_003361.3|:172781-173794 peptide chain release factor 2 [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGACTGAATTAGAAGATCAGACCTTGAAAGAGGACTTCTGGCAAGACGTTGCTCATGCTGGAAAAGTTT
CTGAACGCGTCGCATCATTAAAACGACAAATTTCTGATTATGAAGAATTCAAAAGTAAGGTAGATAACCT
GACTTTTTTCTTAAATGATAGTGAAGCTTCTTCAGATCCCGAACTTCGTGAAGATTTAGAAAAAGAATTT
TCTGTTTGTGAAACTATCCTTGCCGAATGGGAAACGCAACGCTTACTTTCTGGCGAGGTGGATAAAAATC
CCTGCTTTTTAACGATCAATGCTGGTGCGGGGGGGACCGAGTCTTGTGATTGGGTGGAAATGCTTTTCAG
GATGTATTCTCGCTGGGCATCCCACCATCAATGGAAAGCCGAGGTTATAGATCGTCAAGAAGGGGATGTC
GCAGGGATTAAGCATATTACCGTAAAGTTTTCAGGAGAGTATGCTTATGGTTATGCTAAAGCAGAGCGTG
GTGTGCATAGACTTGTGCGCATTTCCCCTTTCGATAGTAATGCGAAACGTCATACAAGCTTTGCTTCCGT
GGATGTCTATCCTGAAATTGATGATGAGATAGAAATTGATATCCGCCCAAATGATTTGCGTATTGATACG
TACCGATCTTCAGGAGCTGGAGGACAGCACGTCAATGTTACCGATTCTGCTGTGAGAATTACCCATATTC
CCACAGGAATTATTGTTTCTTGCCAAAGTGAGCGCAGCCAAATCCAGAATCGTGAAAGCTGCATGAAAAT
GTTGCGCGCAAGAATGTATCAGCAGGTTCTTCAGGAACGGTTAGAAAAGCAACTTCTTGATAGAAAAAAT
AAAAAAGAAATTGCTTGGGGTTCACAAATTCGTAATTATGTTTTTCAGCCTTATACTTTGGTCAAAGATA
TGCGTACGGGGCATGAGACTGGCAATGTGCAGGCTATGATGGACGGAGAATTGCTAGATGATTTCGTCAA
AGCGTATTTAGCAGAGTATGGAGAAGCCTCATGA
>ref|NC_003361.3|:173791-174303 acetyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATATGCAGCAATGGTTAAATGATCCTAAGATCCTTCGAGGGTTTCCGTTAAAGACTGAAGCAGAAATTCG
TGACAGCGTAAATTTTTGGGTAGGATTTTATCGGTACCATAGTAGTTTAACAGCTGTATATGAAGGGGAA
GTCGCTGGAGTGGCTACTCTTATTTTAAATCCCTATATTAAGGTGTCCCACCATTCGTTAATTTCGATTA
TTGTTGGTGAGCCTTACCGAAATAAGGGGATTGGAACAGCATTATTAAATAATTTGTGCCATTTGGCTAA
AAGTCGTTTTCATTTAGAGATCCTCTATTTAGAAGTCTATGAGGAAAATCCTGCTATAGAGTTATATAAA
CGTTTTGGTTTTATTGAAGTGGGAAGACAACGGCGTTTTTATAAAGATGAGATAGGGTATCTTGCCAAAA
TTACTATGGAAAAAGATCTTTAG
>ref|NC_003361.3|:174344-174898 hypothetical protein CCA00168 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCATTTCAGAAAATCCGTAAAATCCTTAAAAAATTTTCTCGAACACTTCTCGTCACTAAGTCTTCTT
CTATGAATCTATCAGGGATCTATAGTCCTACGCGCATAAGATCTTCTATTCCTGTCGATTATACTTCTGG
AAAAGTGTATGATCTAGAGAAGATATATCAAGATCTCAATTTGAGATTGTTTGATGGTTCTTTGAATTTA
AAAATCGGATGGTTTGGTCGGGAACGCTCGGGGAAAGCACGCCGCGTTGTTTTAGGGTCTTACCATGAAG
AAGAACAACTCATACGCATACACCGTTCATTAGATCGTGAAGATATTCCGTTATTTTTTATGGAGTATAT
TATTTATCATGAAATGGTTCATAGCATAGTTCCTCGTGAATATTCTTCATCAGGAAGAACGATTTTTCAT
GGGAAAAAATTTAAAGAATGCGAGAAACGTTTTCCGCTATATGAAAGTGCTGTAGCTTGGGAAAAGGCAA
ATATTTACGTATTGTTGCAAGGATATAAAACAAGATTGGGTAGGAAACATGGCAGGACACAGTAA
>ref|NC_003361.3|:174882-175598 hypothetical protein CCA00169 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCAGGACACAGTAAGTGGGCGAATACAAAATACCGCAAAGAACGCGCAGACCATAAAAGGGGAAAGA
TCTTTTCTCGAACGATTAAAGAATTAATGGCTGCTGTGAAGATGGGAGGTCCTGATCCTAAAACAAATGC
ACGTTTACGCGTAGTCATACAAAAAGCTAAAGATCAAAATATTCCTAATGAAAATATCGAAAGGAATCTG
AAAAAAGCGACCTCAGCAGATCAGAAAAATTTCGAAGATGTTACCTATGAGCTTTATGGTTTTGGGGGAG
TCGGGATCATTGTCGAAGCAATGACGGATAATAAAAATCGTACCGCCTCTGATATGCGCATTGCTGTGAA
TAAACGCGGAGGGTCTCTCGTAGAGCCAGGTAGTGTTCTGTATAACTTCGCTCGTAAGGGAGCTTGCTAT
ATTTCTAAGAGCTCTATAGATGAAGCGACTCTATTATCACATGTCATTGATGTGGGAGCTGAAGATCTTG
ATAATGATGATGAAGAGAATTTCATCGTACTTTGTGATCCCGTAGAGCTAGCTTCTGTGAAGGAAAAGTT
AGTTGCCTTAGGCGTGACGTGTTCTGAAGAAAAGCTTATCTATGTCCCTTTACGTCTCGTAGATTGTGAT
GAAAAAGACGGAGAGGCAAATCTTGCTTTAATCGAATGGCTAGAGCAAATCGATGATGTCGATGAGGTAT
ATCACAATATGGCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c178278-175636 hypothetical protein CCA00170 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACTAGTCCTATTAATAATCCATCTACAACGAATGTTACGACTACGACGACATCAACTCCTGTAGTAA
CGACATCTACATCCTTTGGGGGTCACGTTGTATCTACTACAGGGACTGGAGCTTTAGAAACAACCGCGCA
AACTGTTAACACAACAGCAGAGCAAGCGGTAGCTCAGGCAGAATCTGATTCGGGAGCCGTGATTTTTACA
ACGCAAAGAGATGTATCTACAACAGCGCCGACTACAGGCGGCAGCGCATCAACAGCTACAGCAGCCAGTC
TATTAGGAACTCATATTCTTGGAACAGGAAGAGCAAGAACTGACAGCACATCGAGTAGCGACAGCAGCAT
TTCCGACACTTCAACGACATCTTCAACTCAAGATACTGGGGCTACGGGAGAAACTCAAGATGCTGGGGCT
ACGGGAGAAACTCAAGATGCTGGGGCTACAGGTGAAGCTGGAGGCACTCAAGAAGCTTCTGGTGATGTAG
ATTTAGGAGATCTTGCAGGTCTACGAGGTTCAGAAGCTGCCGATGGTGCTGAAAGAGCTGAGGGTCCTGG
TGGCCTACCCAGTATGGCCCTTCCTAAATATGATCCCACAGATAAAGCTTCGATTATCAAATTCCTATCC
ACCCCCTCTGTACAAGCAAAATTACAGACTAAGGCCGGTCATATTGTTTTTATGGATGAGGCTAGGGGAA
GCTTTATTTTCGTAAGAAATGGTGATTGGAGCACAGCAGAGTCCATAGCTGTAACTAACGGAAAAACAAA
AGAGCCTATCACTGATGTTAAAGATTTAGAAATGTGCATTGCGAAATTCTGCGTAGGCTATGAATCTATG
CAAGCTGACTGGTCCAATAATATTCAACCACGCGTCGCAGGACAGACTGGAGAGACAGGACATTACGATC
ACCTACTTATGAGCATGAAGTTTAAAACTACTGTGCTCTATGGTCCATGGAACTCTAAAGAATCTAGCAG
CGGCTATACCCCTTCGGTATGGCGTCGCGGAACCAAATGTGATTCAGGACCTATCTGGGGTGATGTCGGT
GGTTTGAAAGGAATTAATTGGAATAATGTTGCTAAACCAGACGCAACAGCATTCTCAAGAGAAACAGCGG
CTCCTGCTCAACCACAACCCGGTCCTTACACTCCACCTGTTATCAATGTTAACTTAGGTGGTATTAGCAC
TAACGTCAATGTTACTGGAGGGACAACGACGACTACTGTCACTACCTCCCCTACACCCGATATGTCCGAA
GTTGATAGTACCGCAGGCTTTGATGAAATTGACGGCCTCTCCACTCAAGATGAAAGTACAGAAACAGATA
TTGATGATGTAGAAACACAAAGTACCAGCACACAATACGAAGATACTTTACATTACGAAAGTGGTGGGGA
AGAAGTAGACAACTTAGCCCCAGCCCCACTACCTCCTGGGCCACCTCCTCCAGCTAAAGGGGGCGTCAAT
ATCACAGGAATGCCGGCTGCTAATTTACAACAAATATTGAACAACGTCCGCGAGCATTTAGATACTGTCT
ATGATCAAAATGGCGTACATCATGAAGGAAACCAAGATTTAGGCACCGTTGTCAGAACATCAGAAAATGG
GACTTATAAGCCTACAGTATTGTTAAAGAATGATCAAGGTGATGGTGGACGTGGAGTACAAAGAAGTAAT
GACGATGATGGCGGTGAACTAGGAAATATCTTAAACCGTGTCCGAGAACATTTAGATGTTGTTTATCCTG
AAAGCAATGAAGGAGAGCCTATTCCTGTAAATCAGAATCTCGGCGATGTAATTCAAGCTGTTGAATCAGG
GAACACACCGAAGCCTACCCAACCTGAAGGAGTATTCGTTGCAAAAAAAGTTAACCTTGATGGGGACGGC
AATATCGTCGGAGGAAATGCAAGAACCTCTTCTGAATCACGAGCCAGCAATTTAATGAGTGCTGCAGGTG
GTGAGGGCGCAGAAGGATTGGAGCATCTTTTACCACAGTTACGCTCCCACCTTGACGACGCGTTTGATCA
ACAAGGGAACCTTGTTGGTGCCCCAGGGACAAACGTAGGAAGTCTCATCAAAGCTTTCCAAGAGCGCACG
GGATCAGGCGGTATCGTTGCACCTTTACCTGCTTCAGTAGTTACTAGCAGTTCTGCACCTCAACAATCTG
CGACTGTCTCCGATCTTCCTAAAGCACAGACGGCAGAAACAACGACTCCTGGAGGTTCCCCTGACCTTCA
TGGAGCTGCTAAAGGTGTAGCTGATAGCTTATCGAATTTATTACAAGCTGCGACACCTTCTACGACAAGC
ACTACGGTAAGCTCGCCAGCTCCTCGGCAAGAGACAGCAACCTCTACATCTGTAGCAGGAACTAGAGGAA
CAGCGACTCCTACAACGGGAGGGTCTCCTTCAGGAATTCCTGGAGCAGCAGCCAATGTAACAGCAACATT
AAGCAGCGTTGCTAATAAAATCGCACTATTTGAAAAAGGCGCAAGATTGCAAGAAGCCTTGGATAGTGCA
GATACAGAATCCACACAAGGTAAACAGTTACTTGAAGCTGCAAGAAATACAACAACAATGCTGTCAAAAA
CCTTATCTAAGGTGACGGGGTCTCCTCCTTCTCCACCTCAAAGACACTCCTAA
>ref|NC_003361.3|:178511-179845 UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCAGCAGCAGAAGTTTTTGGTGGTTGTGTGTTACAAGGTTCAGTACGTGTATCTGGAGCTAAAAACT
CTACAACTAAGTTACTTGTTGCTTCGCTATTGTCTGATCGCAAATGTATTTTGCGTAATGTTCCTGACAT
TGGTGATGTACGTTTGACAGTTGAGTTATGTGAATCTTTAGGTTCAATCGTTCATTGGGATAAGCAGGCG
GAAGTCATAGAAATTCATACACCTGAGATTCGTATGACTGAGGTGTTGGCACAATTTTCTCGGGTAAATC
GTATTCCGATTTTATTGTTAGGAGCTTTACTTGCGCGTTGTCCTGAAGGTGTTGTTGTTCCCTGTGTTGG
GGGAGATGCTATTGGAGAGAGAACTCTGAATTTTCATTTTGAGGGTTTAGAGCAGCTTGGAGCACAAGTG
GCTTGCGATGGGCAAGGATATCAAGCGGCTGCTCCTAAAGGTCTTGTAGGGGCTTATATCACTCTTCCTT
ATCCTTCTGTAGGAGCTACAGAGAATTTAATCTTAGCGTCTGTACGTGCGCGGGGAAGAACGATCATTAA
GAATGCTGCTTTAGAAGTGGAAATCCTTGATCTTATTTTGTTTTTACAAAAAGCCGGCGTAGAGATCACT
ACAGATAATGATAGAACTATAGAAATTTTCGGATGTGATGATTTCTATGAGGTAGATCATTGGGTAATTC
CTGATAAGATAGAAGCGGCTTCATTTGGTATGGCGGCGGTACTTACCGGCGGGCGTGTTTTTGTAGAAAA
TGCTGAGCAGGATCTGATGATTCCTTTCCTGAAGACTTTACGCTCTATAGGAGGAGGATTTTCAGTTACA
GAAACTGGAATCGAGTTTTTCTATAATGAGCCTTTAAAAGGAGGCGTTGTCTTAGAAACAGATGTGCATC
CTGGATTCCTTACGGATTGGCAACAACCGTTTTCCGTTCTCCTTTCTCAGGCAGAAGGGTCGTCGGTAAT
TCATGAAACCGTTCATGAGAATCGCCTAGGGTATTTGCGAGGGTTACAGCAGATGGGAGCCAGTTGCGAG
CTGTTTTATCAATGTTTAAGCTCAAAGGCTTGTCGCTATGCTACAGGAAATTTCCCTCATAGCGCGGTGA
TTCATGGCGTGACACCTTTAAGATCCTCACACCTTGTTATTCCTGATTTACGTGCAGGATTTGCCTATAT
CATGGCAGCGCTTATCGCTGAGGGGGGACCGTCGCTAATAGAGAATACTCAGCTATTAGATCGGGGGTAT
TATAATTGGGTGGAAAAACTCAATTCGCTAGGGGCAAAGATCCATTTACTATCTTTAGATCCCGTCGCTC
CCTAA
>ref|NC_003361.3|:c181542-179848 arginyl-tRNA synthetase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACGATGACTCTGCTTTCTTATTTATCTTCTCTATGTCGAGAAGCCACTCTATCAGCGTTTCCTCAAA
TCGACACTTTTTCTCCTGACATTACCCAATCTACAAAAGAGCATTTTGGTCATTATCAATGTAATGATGC
GATGAAACTTGCTCGAACATTAAAGATGGCGCCTAGAGCGATTGCTGAAGCCATTGTCAATCACATTCCT
AAAGAGATTTTTACTTCTATAGAAATTGCTGGCGCAGGTTTTATCAATTTTACATTTTCAAAAGAATTTC
TAAACAACAGTCTAAAAACATTTTCTGAGGAGTTATCTTCAGGATTTCGTGTTAAGGATCCTAAAAAAGT
TGTTATTGATTTTTCTTCTCCAAATATTGCTAAAGATATGCATGTAGGGCACCTACGGTCTACAATTATA
GGAGATTGTTTAGCACGTGTTTTTGCTTTTGTAGGCAATGACGTTTCACGCTTGAATCATATTGGTGATT
GGGGAACAGCTTTTGGCATGTTAATCACCTACCTTCAAGAAGAACCTTCCGAAGATATCGAGAACCTTGA
AGATCTCACAGTATTATATAAAAAAGCGCATGCACGCTTTGCTGAGGATGCAGAATTTAAAAAACGTTCA
CAAACGAACGTCGTTGCTTTACAAGCTGGAGATCCTTCTGCTTTAAAGTTATGGAAGCAAATTTGTGCTA
TTTCTGAGCGTGCTTTTCAAAAAATCTACAATATTTTAGATATTGCTATCGAAAAGCGTGGGGAATCTTT
CTACAATCCTTTCCTTCCTGAAATTATTCAAGATTTAGAAAACAAGAATCTCATTACGATTTCTGATAAC
GCAAAATGCGTTTTTCATGAGGGCTTTTCCATCCCTTTAATGGTGCAAAAAAGCGATGGGGGCTATAACT
ATGCAACTACAGATTTAGCTGCTATGCGCTATCGCGTAAACAACGATGGTGCTGATAAAATTATCATTGT
CACCGATATGGGACAATCTCTACATTTCCAACTTCTTGAAGCTACGGCATTAGCTGCAGGCTACCTGCCT
AATAAAGAAACCTTCTCTCATGTGGGTTTCGGTCTTGTTCTTGATTCTGAAGGAAAAAAATTTAAAACCC
GTTCCGGAGAGAATATAAAACTCAAAGAGCTGTTAGATACTGCTATAGATCAAGCAAAAGCCACCTTAAA
AGAACACCGTCCGGAAATCTCTGATGAAGAAATTTCCTCACGAGCTCCTATTTTAGGGATTAATGCTATT
AAATATGCGGATCTATCTTCTCATCGCGTCAGTGATTATATCTTTTCTTTTGAGAAGATGTTGCGTTTTG
AAGGGAACACTGCGATGTTTCTTCTTTATGCTTATGTACGCATTCAAGGAATAAAGCGGCGTTTGGGAAT
TGAAACATTAGACCTAGAAGCGACGCCAAATATTCAAGAACCTTCCGAAGAAGCTTTAGCTTTAGCGCTC
TTGCGCTTCCCAGAAGCCATTGATCTGACTCTGAAAGATCTCTGCCCGCATTTCCTAACCGACTATTTAT
ATATGCTTACAAACAAGTTTAATGCCTTCTTTAGAGATTGTCATATTGAAGGGTCCTCCCATCAAAAAGA
ACGTTTGTATCTTTGCGCTCTTGTTGAAAAGACCCTAGCTGCAGGCATGCATTTATTAGGGTTACAAACT
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>ref|NC_003361.3|:c182189-181542 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
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GAGTGAAAAAGAATCTTGTCAAAGGCGCAGCGATTATTGCTTCGAATCATAATTCATATTTAGATCCTAT
AGCGCTAAACTTATCTGTTCGTGGTTGTCTACATCACCTGGCACGTTCTACATTATTCAGCAACCGATTT
ACAGGATGGCTACATAAAGAATGGGGATCTTATCCTGTTAAAAGAGGTGGGGGAAATTCTGCAGCATTTA
AGGCTGCTTTTGAACTCTTTAAAAAGAAAAAAAAGCTGATTATTTATCCCGAAGGAGAGCGTAGCCCAAC
TGGGGATCTGCTTCCCGGAAAGGTTGGTGTTGGTTTAATTGCTATTAAAGCTCGCGTTCCTGTGGTTCCT
GTCTATATTGGAGGGACTTATGATATTTTCAATCGCCATCAAAAATTCCCTAAAATTTGGAAAACAGTCA
CTTGTGTTTTTGGTACGCCGCTAACTTTTGATGATTTGATTGATAATGACACTCTAAGTGCTAAGGAAAC
TTATCAAATAGCTACTGATAGAATTATGAGCAAAATCGCCGAGCTAAAAACTTGGTATGAAAATGGCTGT
ATAGGAGAGGTCCCCTAA
>ref|NC_003361.3|:c182836-182186 cytidylate kinase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TAAACTTTAACTATTGCAATACAGGTGCGATGTATCGCACCTTAGCCTACACACACCTGCAAGAACCTTG
GCAAGCCCTGCCAATCAAAGAGCTTATTGACAATCCTCCTTTCTCCTTTTCATTTATTTCGGGGCAGCCT
TTGGAAGCTTTTCTAGAGGGGCAGCTCTTATCTGCAGAACTAGGAACTCAAGAAGTCGCCAATGCAGCTT
CAAAACTTTCTCAGCTTCCCGAAGTACGTTCTTTTATGCATAAGCTCCAAAGAAAATATGCAGAATTGGG
CAACTGTGTTTTTGAAGGAAGGGATATGGGTTCCAAGGTCTTTCCTGATGCTGATGTAAAAATCTTTCTT
ACAGCAAGTGCCGAGGTCAGAGCTTCCCGAAGATTAAAAGATCTCCCAGAGAATTCTCTTTCGAAAGAAG
CTTTACATGCTGAGCTTGTGAAGCGTGATGAAGCCGATAGCCAACGTCTCCATGATCCTTTGATCATCCC
TGAAGGTGCCATCATATTAGATTCTTCAGATTTGACAATAAGCCAGGTTCTAGAGAAAATTTTAGCTTTA
GTTTCCCCGAATTTGCCATGA
>ref|NC_003361.3|:c183753-182833 phosphatidate cytidylyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGGTTCTCACTTTCTTAGTACTTCTTCTTTACAGTTCTTTATTTCCTGTCACATCTTTTGCTTTAGGATT
TATCACAGCGCTTTGTAGTGCTGTAGGAACCTATGAATATGGAACGATGGCCAGAGTGAAGATGCACTAT
GCTTTCCGTTTATATAGTGCTATGGGATCCTTTATCTTTGTTTTAACCAGTTTCATTGCGATTCGATGGC
GTCATGTCCTTCCGGAATTTATTTCTACCCTCCCCTGGAGCTTCTTATTTATTTGGGTAACGATCAATGT
TTTTAGATCTAGGAAAAATAAATGTGGTCCTTTGGAAAGCTCAGGAATTACCTTATTTTCCATGCTTTAT
GTGGGCATTCCTGTGCGGTTATTTCTACACATTCTTTATGGATTTATCCACACGGATGAACCCTTTTTAG
GTGTGTGGTGGGCATGTTTTCTCATTGCCACAACAAAAGGAGCAGATATCTTCGGATATTTCTTTGGGAA
AGCACTGGGACAAAAGAAAATCACTCCTGAAATCAGTCCACATAAAACGATTGTTGGTTTTGTTGCAGGA
TGTTTAGGAGCTACATTAATCAGTGTCGCCTTCTTTTTACAAATTCCCGCAAGATTCGCTAACTATATCA
CTATGCCAAGTATTTTAATTGCCTTAGGAGTGATTCTGGGAATTAGTGGATTTTTTGGAGATATTATCGA
ATCTATTTTCAAACGGGATGCAAAAATTAAAAATAGTAACCAACTCAAGGCTGTAGGCGGTACCTTAGAT
ACCTTAGATTCTCTGTTACTTTCTACTCCTATTGTGTATATTCTCCTTTTGATTACCCAAAAATCTATAT
TTCTCAGATGA
>ref|NC_003361.3|:c184508-183756 undecaprenyl diphosphate synthase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TCATTATGGATGGCAATCGCCGTTGGCATCAGCAACATCAAACACAATGTACGCTCAAACAAACCTCAGG
GCATTACTACGGAGCTAAAGCTCTTCCTAGTATTATTGAATCTGCTTTTTCTTTAGGTATTGAGGTTCTT
ACACTCTTTGCCTTCTCTACAGAGAATTTTCTAAGATCAACCGAAGAAGTCGAGGAACTTTTTTCTCTTT
TCCACTCGCAACTGGACGAACAGTTTCCTTATCTTATTGAAAATAAGATTCGCCTACGTTGTATAGGGAA
CTTATCGGCTCTCCCTTTACAGTTACAACAAAAAATTTCTGAAATCTCCTTAAAAACCCACCAAAACTCG
CATAGAGATCTTGTGTTAGCAATTAATTATGGAGGAAAGGATGAACTGGTACGTGCATTTAAAAAACTCC
ATCAAGATTTGGTAGAGCAAAAAATATCTTCTGACTCTATTTCTGAAGAGTTAATCCGCTTGTATTTAGA
TACTTCGGAGATGCCGGATCCTGATTTATTAATCCGCACTGGCGGTGAAATGCGTGTCAGTAATTTCCTC
TTATGGCAAATAGCGTATACAGAGCTATACGTAACTGATATTTTATGGCCAGATTTTAAACCCAATCATT
TTCTAGATGCCATTAAAGCTTACCAACACAGATCACGACGAGGAGGCAGATAG
>ref|NC_003361.3|:185126-186229 hypothetical protein CCA00177 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GTGTTCATTATATCCCTACTGCTCGGCATGCGGCTAGAAAGATAGGTTCAGGGCTCTTCTCACTGCTAGG
TATGGGAGCTCTTTCCTGCAGTATACTTGCCGCCAGTATGTGTCAGACGTTTCTCCCTTGTATTGGATTG
TTAATTCTTGGGATCCTTCTATGTGTCGTTGCCTATCGCCAATACACAAGCGCATGGACACGTATAGAAA
TCCCAAAATTATGTTATCGGCAACATGTAGTCTCTTCGGTAACCGACCAAGAATACCTCTCTTTGTTGCG
GACATGGCGTTTGCTCTCCCCAGGGATGTACTGTCATCAAGAAAATAGAAATATTCAAATTTGCGAAGGG
ACTAGGGAGAATTTAAAGAAAATTTTAGAAAAAAGATCAGTTAAGAAGAATGGAACGATTTTAATTCAAG
AATTGGATTTAGAGGCCATTCGAAATGGTCGGTTAGCAACGGAAACATTGTATCAAGAAGTGTTTCAGCT
TCCCCCTATTATGCAAGAGTGTGTTGAAAATTCATTAAGAACCAGCCATTCTAAAGACAGAATAGTCGCC
ATTCCTTGGAGCGATCTCTCTCCAGGACCATCCCCCCAAGAAGTCCTTTATACACATATTCCTGGATTGC
GTCAGGAAGGAGCAGAGTCCTCCCCGCTTTCCGTATATACAGTAGCCTATGTTGAGGCTTTTAAAGCAGC
TATAGAAAGAGTCTCTGTTTCACGTCTTGTAAATAAGGCAGGGATATGTCTTTTAGTTTCTCCTTTAGGT
GTTGTAAAGGGATTGGATCCAGAGGCGCTACATTCTACAAAACTTCTTTCTAAAATGGCTTTTCTTCAAG
CTGCGGAGTTTTTGGCAAGAGAAGCAGTACTTCCCGAGAGTAAATCGAAATTGCCAATAACCATAGCTCT
TGTTGATCCCGAAAGTGTTGCTCCGTTGAGATCTATAGATACTAACGTGATGTTTCCAAGTAGAGAATGT
TTGTCTTTCTCCGATTTCACCCCATCAAGTTTTTCTTGGTGTCATGTAATTTAA
>ref|NC_003361.3|:186476-190690 bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGCCCACATGTCTGTACTACTCGCGACCATTAAGTAAAAAAATCGATGAGAAGGAAGCGCAACAAATTGT
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GCGTTGAAATTACGCGGTCATATTGCACAACATCCCAGTATTCCAGGAGTGGTGAATATCCATTTCAAAG
ATCATGCGGATGCCTACACTTTTCTTGAAAATATGATTTATGGCGAACCCACAGTCCCTATAAAATCTTC
ACGTCTTTACGTATTAGGCTATGAAAGGAAGGAAGGCAGTGTTGTCCAGGTGACTGGATCTTTGACTACC
GCTTTAACAGAAAAAGACTTTTCTTTTGTTTCTTATAATAGAGAGGATGCTGAATCAGGAACAGAAATCT
TAAATATTGCCGCATCTTCAATTACTCCAAATCCTTCAGGTGCATGCTCTTGTGGCTATCCCTCGTTTTG
GGCTACAGCATCGATAGATAGAGTCGTTCAGTTGGCTAAGAACCTTTCGTTAGGTTTGGACATTCTTCCT
AATTTCAGAACAGCATCTCTACTGAATTATTTCTTTTCTTCAGAAAGAGATTATTCCGCATTTTTAGCAC
GCTTAGAAAGTTTATCGATGGACTCAAATATTTCTGAGCAACATCAATCTATTTTTCGTGACTTATGTCA
TGATCTGAAGACCAGAGCGCAAAGATGGAAAAAAACAACCACGCGCATTGTAGATAATTCTTTAGAGTGT
AGCGCAGTATCTCCCTTCTTCTCTTCAGTAGAATTTCTTTCTAAGGAAAGAAAATTAGTATTTTGTCTCG
ATCCTCATGTGCTTGCTAAACGTGAAGAGTTGCCCATAGAACAGCGTTTGGATTTTGATGCTTGGTTGGC
TAAAGAGAAACACAGACTAGCGCATAAATTTCAACGACCTTTGCAGGAGACCTCTCAGGGATTTTCATTG
AATCTAAGTGATAAAGATGCGAGTGGAAAAATCGTTTTGCATGGCCAGCGTATCTATCAGGGAATGGTCG
AGCATCTAGCTACATTGGCATTGAATAGACCTCCAGCAGAATCCTGTGATCTTGTACGAGAAAATTTTCC
TATACACTGTCGTTTGCCTAGAGAAAGCGATACCTTCGGTTGTTTCATTTTCTCTCCAGAAAAAAGTTGC
TCTCATTTCTCTAAAGGATCTGTTTACATAGTTTTGAAAGGGCTCCGCTCTGTAGCCGCGAAATATGAGA
AGGGAAACGCAGAAGAGGCTAAGGTCTTCGATAAGGATCTACAAAATTTATATAATTGTTTTGCTTATAC
GGATGCTGCTCCATGGAGTATCGGAGAAGATGAGGTTTTAGAAGTTAAGGAGCCTCTACAAAGATTTTTC
GATGTGTGGGGCGAGAACTTTGTTGTTTCTAACGAAGGTGAAATTGCTAGTCTTGAAGTTCGCGATATAC
GAGATCGTTTAGAAACGTTGAATCGCATTGAAAAGCACCGTCAAGAAGAATGGGTGCGTTGGCATGAACA
GTACCAACAGGCCAGCTGTTCTATGGATGATCAGCAGCGTGTACGCGCTGCTGTGCCTCACCGAAGTGCT
TTTGTTGAAAATCTCAAACTCAATCTACGAAAATACTCTCGTGGCGATAACGTTTTGCGCTTCGGGATTG
ATTTTATTGGTGGAAAACAGATCCGCTTAGCTTTTAAAGATCATCAAGGAAAGCAATTAACTGATAAGGA
AGGGATCCTTAAAGTTTCTGATGAACTCTACGCTCGTTTAAATAAATTGGGCGTTGCAGAAGTCGAGATA
CGTAGGGAAGGAGATAACGTACATCTCAGTGTTCCTGGATCTACTAAAATTTCTTCCGAAGAAATTTTAG
GTACCTCTCAGATGACGTTCCATGTCGTGAATGAGAAATTTTCTCACTATTCTGCGCTTCGCTATGAAGT
GCAAAGATTTTTAGATTACCTGTGGTTCACAGCACGAAGTCAAGAAACGACATCTCCGGAAGCTATTAAT
AAGTTGGCAAGTCGTATCTTTAATGATCAGAGCTTCCCTTTGCCCACTAGCGTTAAAGAAGCAGTTGCAA
AATTACAGCAAGAAGGTCTGGCTTTCCCTGAAGTTGGTGGTGAGGCAGCCTCTTCTCATTTGGATACGAC
GTATTCAATGATTGCTATAGAAAAGAATATTGAAGGTAGAGCAAATCCTTTGATGATTGTTTTCCGCAAC
TATGCTTTAGACGGTGCTTCTTTAAAAAACATCCGCCCAGAATTTGCTGTAGGGGAAGGCTATATCTTAA
ATTTCTCAGTAAAAGATACTGCAATAGCTCAACGAGCTCACAATATTTCTCCAACAGAGAGTTTCCACGC
TTGGACCGCTGCTTATTGTCAGGAAGGCGTCAGTGGAACAACCAATAGCCAACACTCTTCTGGAAGAGGC
TGGAGAATGGCTGTTGTTCTTGATGGTTATGTGGTCAGCGATCCTGTATTAAATGCTCCTTTAAAAGATC
ACGCTAGTGTTTCTGGAAAATTTTCACATCGTGAAGTAAACCGCTTAGCTACGGATTTAAAATCAGGATC
TATGTCCTTTGTTCCTGAGGTTTTAAGTGAAGAAGTTATCTCTCCTGAATTAGGCAAGCAACAACGTACA
CAAGGGATTATCTCTATATGTTTAGGTCTTGCTGTTTTGATCATTTTGATGAGCGTTTATTACAAATTCG
GAGGAGTTATTGCCTCGGGAGCTGTTATCTTAAATCTTCTATTGATTTGGGCAGCCCTACAGTATCTTGA
TGCCCCTCTAACTCTCACGGGATTAGCGGGAATTGTATTGGCCATGGGAATGGCTGTAGATGCTAACGTG
CTTGTATTCGAAAGAATTCGCGAAGAGTATTTATTATCGCGAAGTCTTACCCAGTCTGTAGAAGCAGGGT
ATAAAAAAGCTTTCAGCGCTATCTTTGATTCGAATTTGACCACAATATTAGCTTCGCTACTTCTTTTGGT
TTTAGATACGGGACCAATTAAGGGATTCGCTCTGACTTTAATCCTAGGGATTTTCTCTTCAATGTTTACT
GCATTATTCATGACGAAGTTTTTCTTCATGGTATGGATGAATAAAACGCAAGAAACTCAGCTGCATATGA
TGAATAAGTTCATCGGCATCAAGCATGATTTCTTAAAAGAGTGCAAAAGACTTTGGATGGTATCCGGGAG
CGTTATTGTTTTGGGATGCGTTGCGTTAGGTTTCGGGGCATGGAATTCCGTTTTGGGAATGGATTTTAAA
GGTGGTTACGCTTTCACTTTAGACATGTCTGATCAGAAAGCTGTAGATGTTGTACAGTTTCGTAATAAGT
TAGGGGATAAATTTAAGCAGGTAGGCTTATCTTCTAGAGACTTCAAAATTAAGACGTTAGACTCTTCTGA
GAAGATAAAAATATACTTCAGTCAAAACGCATTAACTCGAGTACAAGCTTCTGAGAAACAGGTATTCGAA
ACCCCTGATCCTAATTTATCTTTAGTGATGGGCATACTTTCTGATACAGGAATAGACACTTCTTCAGAGA
GCTTTAAAGATACCCAGAATTTCTGGCTTAAAGTTAGCGGACAGTTCTCTAATAAGATGCGTCAACAAGC
TTGTATAGCGTTGGCGGGAGCCTTAGCGATCATTTTGCTTTATGTGAGCTTGCGTTTTGAATGGCGTTAT
GCATTTAGTGCTGTTTGCGCATTGATTCATGATCTTGTCGCTACCTGCGCCGTATTAGTAGCCACACATT
TCTTTTTGCAAAAGATACAAATTGATTTACAAGCAGTCGGAGCTTTGATGACGGTTTTAGGGTATTCGTT
AAATAATACCTTAATCATTTTCGATCGTATTCGAGAAGATCGTCAGGAAAAATTATTTACACCTATGCCG
ATTTTAATAAACGACGCACTGCAAAAAACCTTAGGAAGAACAGTAATGACCACAGCGACAACACTGTCGG
TATTATTAATTTTACTGTTTGTTGGAGGCGGTTCAATCTTTAACTTTGCTTTCATCATGACAATAGGTAT
TCTTTTGGGCACACTATCATCTCTATACATAGCACCGCCTCTTCTTTTATTCATGGTTCGTAAAGAGGAA
AGAAACAGGCAATAA
>ref|NC_003361.3|:190778-192550 single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATAGTGACGTTGACGGCATGACGGGGGTGGCTCTTCTTGTAGAGTTCCTAAGATCTATAGATATGAAAGT
TAGCTACTGCTTTTTGGGAGCTTTGCTAAAACATTACGGAGAACCGTCCTCATTAATTGCTAAAATGAAA
GAGGAGAAGGTTACTTTACTGATTACAGTAGATTGTGGGATTACCGCAGGAAAAGAAGTCAGCGATATCA
ATAAGCAGGGAATTGATGTGATTATTACAGATCATCATATGCCTACGGGTAAAATTCCCCATTGTATAGC
TACTTTAAATCCTAAATTAAGAGATCGTGCTTATCCGAATAAGGAATTAACCGGCGTAGGTGTGGCGTTT
AAGCTCGCGCGTGGTGTTCTCAATGCGCTAAGGAAAGAGAACCCAAAACTAAAAGTAGATACTAAACATT
TATTAGATTTAGTGACTTTAGGGACAGTGACTGACGTGGGGACCCTTTTGGGAGAAAACCGCACTATGGT
CAGGCATGGTATAAAAGAGATTGCTAAGGGCTCGCGGTTAGGCCTGCATAAACTCTGTATTTTTGCTGGG
GTAAAACCTTCCGAAGTGACCTCTACGGATATCGTTTTGAAAATATCTCCTAAGCTGAATAGCTTGGGAA
GGCTTGCCGATGCTGCTAAAGGGGTGGAGTTATTACTCACCCAAGATCCAGAAACTGCAGATGAGATAAT
TCAATATCTCGATAAGATAAACAGAGAACGGCAAAAAATAGAAGCTGATGTTTTTCATGATGTACAAAAA
ATCCTGAAAAACAAACCCGAAATCGTTAAGCAAGCCGCTATCGTATTATCGTCGAATGATTGGCATGCAA
GAGTCATTCCGATTATTTCTGCGCGCCTTGCCAAGGCCTACAATAAGCCCGTAGCTATTATTTCGAATCA
AGGAGGCGTAGGGAAGGGGTCATTAAGAACTATAGGCTCTTTCCCACTCCTTGGGATATTACAGAAGTGC
TCATCTTTGTTTATATCCTACGGAGGGCATGATTTTGCTGCGGGGATTATCATCAACGAAGACCAAGTAG
AAGCATTCAGGAAGAAATTTATCCATCTTGTGAACTCATCATTAAAAAAGGATAAAGCAGTTCTTACCCT
GCCCTTAGATGCTCAAGCTGATTTCGACGAGATAGATCACGATTTATTGTCCTCTATAGATCTTTTTGAA
CCTTTTGGGAAAGGAAACCCTATGCCGGTATTCTACACCATAGTCCATCAGGTGCGTTATCCTAAATTAT
TACCAGGAAATCATCTCAAGCTTTATCTTAACCACGGGGAAAGGAATCTGGAAGGCATTGCTTTTGGACT
GGGAGATAGAATAGAGGCGCTTAAAGCAAACTGGAATAAGCCCTTGGAACTTGCCTATACGCCACGTTTA
TCCCAATCTTCTAACGGAGGAGTGATTCATTTACTCGTTCGAGATTTCCATATTCTTCCGCTAAATTATA
AAGATAGCCAGCCAAAGTTTTAA
>ref|NC_003361.3|:192991-194145 hypothetical protein CCA00180 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TAATATTTTCCTCAGAAGCGGCTCGTCAGGCGCATAGGAGGCGAACTCTTTACCCCGTAATTTACAAGAT
ACTTGATGTCATTTGTGAAATTATTAAGTGCATTTTCCGCATTATTTTGTTTATTCCGTTCGGATTACTT
TGGGTATTGGGGAAGATTTGTCAGAATTGTTTGCTTCCGGCTGCTGGAGGGCTATTCACAGAGCAGCTAT
GCTTTGCGAAAAAAATATTGCAAGAGAGTTTTCGTTGTTATGTGGACGATTGGCTAGAGAGTGGTTATGC
AAGTTCTGTAAAGCGTATTCCTATTCAATGTGATGATTTACTCATTGACGCCATTAGTATTCAATTCCCT
GATGCTGAAAAAGATAGATGGATGCTGGTTTCCTTAGGGAATAGCGAATGTTTTGAAACTAGAGCTATGG
TTTACTCTCGTAATGATTGGATATTGAATGTGGCGAAACAAGCGCGGGCTAATGTTGTAGTATTTAACTA
TCCAGGGGTGATGCATAGCAAGGGCCCCATTACACGGGAGTCTTTAGGAAAGGCTTATCAGGCATGTGTT
CATTATCTTCGAGATCACCCTGACGGACCGAAGGCAAAACAAATTATAGCTTACGGCTATTCTTTAGGAA
CCCTAGTACAAGCGTTAGGATTGAGCAAGGAAGTCGTCGATGGAAGTGACGGGGTCGATTGGTTTGTCAT
TAAAGACCGTGGACCGAGGTCAGTTGCGGCGATAGCATCTCAATGGCTCGGGAAAGTTGCTGGATGGACA
GCAACACAGTTAGGTTGGGAAATCAATTCGGCAAAATACAGTGAATCTCTTGTTTGCCCAGAATTATTCA
TACACGGAGAGGATTACCAAGCTCAACTCATAGGAGATGGTATGTTCAATAGGGATAATTGTTTTGCAGC
ACCATTTTTAGATCCTAATGCTCCTAAATTCCCTGGAAAGAAAATTCCTGTAGGGGAGTTCCTACTACAG
CATAAGGGAGAGCTTGATGAGACGACCATACAGAATGTAGTTAAACACATCATAGATCACTATAGTCCGG
AAGACCCCAGTGAAACACCAGATGATGGGGAATAA
>ref|NC_003361.3|:194760-195305 DNA binding domain-containing protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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TACCCGCACGGGAACCATGCGAGGAGAACGCAAAGGCGCAGCTTGGGTTATCTCTCAATCAGAGATCGAT
AGATATAAGAGCGAGTATTTAAATAAGCAAACAGTGAAGAAAATGAAAGAAGTTGCGGTTGAACACCCTA
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>ref|NC_003361.3|:195577-197094 glutamyl-tRNA synthetase [Chlamydophila caviae GPIC]
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ACTCATGTTCTTCGTGGAGAAGAATGGCTGAGTTCTACTCCTAAACACCTGCTTCTTTACGAAGCTTTTG
GTTGGGAACCGCCTATATTCTTGCATATGCCCTTACTCCTTAATCCCGATGGTACAAAACTATCGAAAAG
AAAGAATCCTACTTCGATCTTCTATTATCGTGATGCTGGGTACATAAAAGAAGCCTTTATGAATTTCCTG
ACTCTCATGGGTTATAGCATGGAGGGGGATGAAGAGGTATATTCTTTAGAGAAGCTTATTGCAAACTTTG
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TCTAAATCATGAGGGATCACCAGAAAATCTATTAGCTAGACTGAAGGATTGGTTGGTCAATGATGAGTTT
TTATTGAAAATTCTTCCCCTCTGCCAATCTCGGATGGCGACACTTGCAGAATTTGTCGGGTTATCAGAAT
TTTTCTTTTCAGTTCTTCCTGAGTATTCCAAGGAAGAGCTTTTACCAGCCGCAATCTCTCAGGAGAAGGC
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TGGCTATTACTGGAAAGAAACAGGGATTACCCCTGTTTGACTCTATGGAGTTATTAGGGAAACCTCGTAC
GCGTATGCGTATGGTTCATGCTCAAAATCTACTTGGGGGAGTTCCTAAGAAGATCCAAACGGCTATCGAT
AAGGTTCTTAAAGAAGAAAATTTCGAGAATAAAATCTTAGAATTTTAG
>ref|NC_003361.3|:c197325-197137 hypothetical protein CCA00183 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAAGATTTTCTTTTTTACATATGGCTATCTTTACATCTCTGTTTGTCTCCAGCTGTTCCTACGCTC
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TTCCATCGCCAAGTCGATATTTCAAGCATCCTTCCCACAAAATATATAG
>ref|NC_003361.3|:197747-198013 OmcA [Chlamydophila caviae GPIC]
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TAGATTGCTGTTTCGAGGATCCTTGTGCACCTAAGTCTTGCAATCCTTGCAACGTTTTCAAGAAAGACGG
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GTTCAAGGACCTCAAGCTAAAGGTTGTACATCTCCAGACGGTAGATGTAAACAATAA
>ref|NC_003361.3|:198178-199854 60 kDa outer membrane protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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AATAATGGCCCTTACTGTGATAAAGAATTTTATCCGTGTCAAGATGGCTCATGCCAATCATCAGTAGATA
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CCAAGCTGTACCTGAATATGCAACAGTAGGATCTCCTTATCCTATTGAAATTCTTGCTGTAGGTAAAAGA
GATTGCGTTAATGTTGTTATCACTCAACAGCTTCCTTGCGAAGTTGAATTCATAAGCAGCGATCCTGCGA
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TACTGTTTGGGTAAAACCTCTTAAAGAAGGTTGCTGCTTCACAGCTGCTACCGTATGTGCTTGCCCAGAA
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TACGTTGCCCAGTTTGTTACAAAATCGAAGTTACCAACACAGGTTCTGCTATAGCCCGTGGTGTTGTGGT
TGATAACCCAGTACCCGATGGGTATTCTCACCCTTCAGGACAACGCGTTCTTTCCTTTAACTTAGGAGAT
ATGCGTCCTGGTGATACAAAATGCTTCACTGTAGAGTTTTGCCCTCAAAAAAGAGGAAAAATTACCAACG
TTGCTACTGTATCTTACTGCGGTGGACATAAGTGTTCCGCTAACGTAACTACTGTAATCAACGAGCCTTG
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TCTAACCCAGGGGATCTTAAACTTTACGATGTTGTTATAGAAGATTTAATCCCATCAGGAATTACAATTT
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AACTCTTCAATTTAAAGTTGTTGCTAAAGCTCAAACCCCAGGCAAATTTACAAATCAAGTTTCCGTAAAA
ACAAACTCTGATTGTGGATCTTGCACTTCTTGCGCAGAAGTTACAACTCATTGGAAAGGTCTCGCAGCTA
CCCATATGTGCGTAATTGATACCAATGATCCTATTTGCGTAGGTGAAAATACTGTATACCGTATTTGCGT
AACCAACCGTGGTTCTGCAGAAGATACTAACGTTTCGTTAATCCTTAAGTTTTCTAAGGAATTACAACCC
GTTTCTTCTTCGGGTCCAACAAAAGGAACCATTACAGGTAATACAGTAGTATTCGATGCTTTACCTAAAC
TAGGTTCTAAGGAATCTGTAGAGTTTTCCGTAACATTGAAAGGAGTTGCTCCTGGAGATGCCCGCGGAGA
AGCTATTCTTTCTTCAGATACTTTAACAGTACCTGTAGCAGATACGGAAAACACACACGTTTATTAA
>ref|NC_003361.3|:200065-200547 hypothetical protein CCA00186 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTAACAGGTGTAGAAAATAGCGAAAGCGGCGTTATCGATCTAATTAAACCAGGATTGGATGATGTAA
TGAAAAACGAAACAGTACAAGTGACTTTGGTGAATTCTGTATTAGGATGGTGTAAAGCGCATATCGTTGA
TCCGATAAAGACATCCAAAATTGTACAATCAAGAGCCTTCCAAATTACCATGGTTGTACTTGGAGTTATC
CTACTTATTGCTGGTTTGGCTTTAACTTTTGTATTGCAAGGGCAGCTTGGCAAAAATGCCTTCTTATTCT
TAATCCCTGCGGTTATTGGTTTGGTTAAACTTCTAACCACCTCAGTGTTTATGGAAAAACCTTGCACTCC
AGAAAAATGGCGTTTATGCAAACGTCTTTTAGCAACAACTGAAGATATTCTAGATGATGGGCAAATTAAC
CAATCAAATACGATTTTCACTACAGAAAGTTCCGACGTAACGAATACAGCAACGCAATCGTAG
>ref|NC_003361.3|:c202555-200600 tail-specific protease precursor, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATAAAAATACTACGTCTTTGCGCTCTTGTTCTAACCTGCCTTCCCAGTTTCTCTTTTGCTTCTGAAT
TACTTCATGAAGCAGACATCCGAAAAACTGTGGATCGATTGATTGAATATCATGTGGATGTTCAAGATAT
CTCCCCCGATATTCTTATGCGTTCATTAAGAGGATATTCGCAATCTTTTGATTCTCACAAAGCTTATCTT
ACAGAACAAGAGGTAGGTAATTTTATCCAATCTACAGATATCAAGAAACGTCTGTTGAAAAATTATAAGA
CGAATAATTTTGCGATTTATCAGAATTTAAATCGTGTAATTAAAGATAGCATTATTCGAGCACGCGAGTG
GCGAACTGAATGGTTATCTGATCCTGAGGCTTTGGTTAAAGAAGCTGCTACCCATGCACTGATTAAGAAA
CCTAAGCAGTGGGCGCGCTCTATCCAAGAGGTTAAAGAAAGACAGCGTTCTTTACTTCTCTCTTATATTT
CTGTGTACCTATCAGATAGTTCTAAAAACCGCTATCAGGGCAAGGAAGCTTCTTTAACTCAACTTTGTGT
ACGACAACTCGAAGCGCATGAAAACCCCTACTTAGGGATTAATGACTATGGGAAACCTATGTCTCCTCAA
GAGGAGTCGCACCACTTCCATGTTCGTGTAGTTAAGGCTATGGCTCATAGCTTAGATGCGCATACCACCT
ACTTTAGTAAGGATGAAGCCCTTGCTATGCGTATTCAATTAGAAAAAGGCATGTGTGGGATTGGTGTAAT
CTTAAAAGAAGATATTGATGGGGTTAGTGTAAAGGAGATCATTCCTGGAGGGCCTGCCCACAAAACTGGA
GACTTACATGTTGATGACATCATTTATCGTGTTGATGGCAAAAATATAGAGAATCTTCCCTTTAGAGCGG
TATTAGACTGTCTTAGAGGTTCTCAAGGTTCTGAAGTTACCTTAGATGTCCATAGTCAAGATCAAAACCG
TACAGTAAAATTAAGACGTGAGAAGATCAGCTTGGACGATCGTCGTGTGGATGTCTCCTATGAGTCCTAT
GGCAATGGGGTTATAGGAAAGATCACGCTGCATTCTTTTTATGAAGGAGAAAATCAAATCTCTAGCGAAC
AAGATTTAAAACGTGCGATTCAAAGTCTACAAGATAAGAATCTCCTAGGGCTAGTTTTAGATATTCGAGA
AAATACTGGGGGATTTCTCTCACAAGCTATCAAGGTGTCGGGATTATTTATGACTAACGGTGTCGTTGTT
GTCTCTCGCTACGCAGACGGCAGCATCAAGCGTTACCGCACAGTATCTCCTAAAAAGTTCTACGATGGTC
CTTTAACTATTCTTGTTTCGAAAAGCTCTGCATCTGCGGCGGAAATTGTTGCTCAAACGCTTCAAGATTA
TGGCGTAGCTATAATCGTTGGTGATGAACAAACTTATGGGAAAGGGACAATCCAACATCAAACAATTACG
GCAGATTCTGATAAAGAGGGCTTCTTCAAGGTTACTGTAGGGAAATACTACTCTCCTTCTGGAAAATCTA
CACAACTTCAAGGTGTACGCTCTGATATCCATATCGCCTCGCGTTATTTTGCAGAACCTTTAGGAGAGCG
TTATCTAGAACATCCCCTCCCTGCGGATAGTTGTGATAATGTGATGGATGATAATTTAAAAGACCTAGAT
GCCCAAATGCGTCCTTGGTTTCAAAAATACTACACTCCCAATCTACAGAAAGAAGAGACTGTTTGGAAAG
AGATGCTTCCTCAGCTAACCGCAAATAGTAAACAACGTCTAAGTGAAAATAAGAACTATAAGATCTTCTT
AGATGAGTTAAAAGATCCCTCAGAGGCAATACGACCTTTTGGAAGCAATGATTTACAAATGGAAGAATCT
GTGAATATTTTAAAGGACATGATTCTTTTAAGAGAGCGCAAGGCGGCTATTTCTTTAGGAGGCTAA
>ref|NC_003361.3|:c202961-202683 hypothetical protein CCA00188 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATTACGGAAATTCCAGCTAATTCTTTACACGCAAGTTGTCAGCAGCGAGTATATGCTTCCTCTCGCA
ATATTGTGATGACTGCGGCGGCGGCTGTATTTTTGATTCTTGCTTTGATTTTATCTGGATTAAGTTTCCT
TCCTCAAGCAACACTACCTTTTTCAGGAGCCTACTTTATTATAGGTTCTTTCTTGGTTTTCATTGCAGCC
GGAATATTATTGATCAATACACTTTGCGATGCGTGCGACGTATTACGTCCCTTCGCTCCGCTATCTTAA
>ref|NC_003361.3|:203065-204015 hypothetical protein CCA00189 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTGAAGATTTTCCTTGGGTAGCACCCAAATCTCTTACCATACTCGGTAGCCCCTTTATCGATGTTGTTCT
CGATGTTGATGAAGAATTTATCGAAAATTGTAATTTGAAAATCGGAGAGATACAGACTTTAAGTAGCTTC
GATATTAAAAAATTTTTTTTTATGTATAAAGAGGCTTTCCCTGAGAATCCTATTCAGGTGACGAGGAAAG
AGCCTCTCAGTCTTACTGAAGATCAGCTAGCTAACTTAGGGATTGCAAGTTTACGCAATGGTAATGCCTA
TTTCAATTCTCCAAAACATGCGGAGCATGGCCCCGCATTTAATGAGTTGGATCAACTGCGACTGATTTTA
TGCTGCCCAAATCAAGAAGACACTTTATGTTACTTCTCCCAGGAAGCTCCTGAGTCTTCAACGGAATTGT
GTCTATCTCCTGATGGGCGATATACTCTGATTGATAGTGAATTATTTCTTTGCGGCTTTTGTATAGAAAG
TTTTTTAAAAAGAACAGAGAGCCAGACACAAAAGGTCTTGCTTGATCTGAATAATTCACGTGTTGCTTCT
CGATTTAGAGATCGGATTTGGTCGTTATTGCCGTATATAGACGTTCTTTTTTTATCCGAGGGGTCAATAG
AAGCGATCACAGGGATTTCCAATCCAACTACGGCAAGACGCCTGCTTTCTCGCATTGTTCCTACGGTATT
TGTTCAAAATGCATCTGAAGACAAAGCACATATCTACTTTATGCAACACGGAAAAGAAACAGCTTATAGT
TTAAAACAAGACACACAACAAATCGTTCTAGGGTTTCTTTTCGGCTATATTAACGATAATGTAGTCGATA
ATTATTTCCACTCTAGTGATCTTTTATTTGAAAATGCCTAA
>ref|NC_003361.3|:204212-204583 30S ribosomal protein S12 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGCAGAAATGTCCACAAAGACGTGGTGTATGTCTACAAGTGAAGACAAAGACTCCTAAAAAGCCGAACTC
AGCTTTACGTAAGGTTGCTTGGGTGCGCTTGTCTAATGGCCAAGAAGTTATCGCTTACATTGGTGGTGAA
GGTCATAATTTACAAGAGCACAGCATCGTTTTGGTTCAAGGTGGTAGGGTTAAAGATTTGCCTGGTGTCC
GTTATCACATCGTTCGCGGAGCTCTAGACTGTGCTGCTGTCAAAAATAGAAAACAAAGCCGCTCTCGATA
CGGAGCAAAGCGTCCTAAGTAG
>ref|NC_003361.3|:204627-205100 30S ribosomal protein S7 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCAAGACGACATGCCGCTGAGAAGAAAGTAATTCCAGCAGATCCTATCTACGGAAGTGTAACCTTAG
AAAGGTTCATTAATAAAGTTATGATGCACGGAAAAAAAAGCATCGCTAGAAAGATAGTCTATTCTGCTTT
AGAGAGATTCTCTAAAAAAATCGGTGCGGAGAATGTTCTAGAAGCTTTTAAAGAAGCCTTGGAAAATGCA
AAGCCTTTGCTCGAAGTTCGCTCCCGTCGTGTTGGAGGAGCAACTTATCAGGTTCCTGTAGAAGTTGCTG
CAGGAAGAAGAGATTGCTTGGCTATGAAATGGATTATCAATAATGCCAGAAACAAGCCTGGAAAGTGCAT
GGAAGTAGGACTAGCAACCGAGCTTATTGATTGTTTCAATAAACAGGGAGCTACCATCAAGAAACGTGAA
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>ref|NC_003361.3|:205142-207226 elongation factor G [Chlamydophila caviae GPIC]
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AAACGACAACTACAGAAAGAATTCTTTATTACGCTGGAAGGACTCATAAAATTGGTGAGGTTCATGAAGG
CGGAGCTACCATGGACTGGATGGAGCAGGAGCAAGAAAGAGGAATCACCATTACCTCTGCTGCAACAACT
GTTTTCTGGTTGGATTGTAAAATCAACATTATTGACACTCCTGGTCACGTAGACTTCACTATTGAAGTTG
AAAGATCTCTCCGTGTTTTAGATGGTGCCGTAGCTGTATTTGACGCGGTATCTGGAGTCGAACCTCAGTC
AGAAACTGTATGGAGACAGGCGAATAAGTACGGTGTTCCCCGGATTGCTTTCGTAAACAAAATGGACCGT
ATGGGTGCGAATTATTTCGCAGCTGTAGAGTCTATGAAAGAAAAGCTTGGTGCTAACGCTATTCCTGTAC
ACTGTCCTATTGGCGCTGAAAGCCAATTTGTTGGGATGGTCGATCTTATTTCTCAGAAAGCTCTATATTT
CTTAGATGAAACTCTAGGGGCTAAATGGGAAGAACGTGAAATTCCTGAAGATCTGAAAGAGAAATGTGCA
GAACTTCGCTATGCTCTTCTTGAAGAGCTAGCTACAGTAGATGAGGGCAACGAAGCTTTCATGATGAAAG
TACTTGAAGATCCCGATTCCATTACTGAAGAAGAAATTCACCAAGTCATGCGCAAAGGTGTTATTGAAAA
TAAGATTAACCCTGTGTTGTGCGGAACCGCTTTTAAAAACAAAGGTGTGCAGCAACTTCTTAATGTTATC
GTAAAATGGTTGCCTTCCCCTAAAGATCGTGGCATCATTCACGGAATTAATTTAAAAAATAACGAAGAAG
TTCATTTAGAGCCTAGAAAAGATGGGCCTTTAGCTGCTCTTGCGTTCAAAATTATGACAGACCCTTACGT
TGGTCGTATTACCTTTATCCGTATCTATTCCGGAACGCTTAAAAAAGGTTCAGCTATCCTTAACTCTACT
AAGGATAAGAAAGAACGTATCTCACGTTTATTAGAAATGCACGCCAATGAGAGAACCGATAGAGATGAGT
TTACTGTTGGTGATATTGGTGCTTGCGTTGGTTTGAAATATTCAGTTACAGGGGATACCCTCTGTGATGA
TAATCAGGAAATTGTTCTTGAGCGTATTGAAATCCCTGAACCTGTGATCGACATGGCTATTGAGCCAAAG
TCTAAGGGCGATAGAGAGAAATTAGCTCAAGCGTTGAATGCTCTTTCTGAAGAAGATCCTACGTTCCGCG
TGACCTCAAACGAAGAAACCGGACAAACAATTATTTCCGGAATGGGTGAGCTACATTTAGATATTCTTCG
CGATCGTATGATCCGCGAATTTAAAGTGGAAGCTAATGTCGGTAAACCTCAAGTTTCTTATAAAGAAACA
ATTACCAAAAACGGCAGTAGCGAAACTAAATATGTAAAACAGTCTGGTGGTCGTGGACAATATGCTCACG
TTTGCCTCGAGATCGAGCCAAATGAACCAGGGAAAGGGAATGAAGTTGTCAGCAAAATTGTTGGAGGTGT
CATTCCTAGAGAATATATTCCCGCGGTTATGAAAGGTGTGGAAGAAGGCTTAAATACAGGAGTTCTTGCA
GGCTATGGTTTGGTCGATGTTAAAGTAAGCATCGTATTTGGATCATATCACGAAGTGGATTCCAGTGAGA
TGGCATTTAAAATATGCGGTTCGATGGCTGTGAAAGAAGCTTGTAGAAAAGCTGCTCCAGTAATTTTAGA
ACCTATTATGAAAGTTGCAGTAACCACTCCTGAGGATCATTTAGGAGATGTTATTGGTGATTTAAATCGT
CGTCGTGGCAAGATCTTGGGCCAAGAATCTTCACGAAGTATGGCGCAAGTGAATGCGGAGGTTCCTTTAA
GTGAGATGTTTGGATATACAACATCTTTAAGATCTTTGACTTCCGGAAGAGCAACATCAACAATGGAACC
CGCCTTCTTTGCTAAGGTTCCTCAAAAAATTCAAGAAGAGATTGTTAAGAAGTAA
>ref|NC_003361.3|:207234-207551 30S ribosomal protein S10 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTGCAGATATTGTTGAGACTGCTAAAAGAACAGGCGCTCGTGTAGCAGGCCCTATTCCTTTGCCTACAAA
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ACCCATAAGCGTTTAATAGATATCCTGGATCCTACAGGAAAAACTATAGATGCCTTAAAAATGTTAGCTC
TTCCAGCAGGGGTTGATATTAAGATTAAGGCTGCTTAA
>ref|NC_003361.3|:207563-208618 oxidoreductase [Chlamydophila caviae GPIC]
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GTTGCGATTCTAGCATTGCTTCTTCCGATGCAGGCCATGTCTATCAGCTGTTTTTCAATACAACAAATTC
TAATCTATCTTATAAGGTAGGGGATTCTTTAGGTATATTCCCTAAGAATTCTTTAAGTGTTGTTGGGAAG
ATTCTCGAGTGTCTAGGTTATTCTCCAAAACAACTAGTGCAAACTCGAGAATCCTCTCACATTACATTCT
ATGACTTCCTAAGATGTCATGCAAACATAGATAAAATACCTGCAAAACTTAAGTCTTTTTTCCCTGATGT
AGAGGATTCCACCTCCCTCTATGATGCTATCCAAAAATATCAACCCACGATCTCTTTAGAGCTATTTACA
CAAAGTGTATTACCTTTGTTACCCCGATTTTATTCCATAGCTTCTGCTCCACATCCTACTGAGGGCAAGA
TAGAACTTCTAGTACGGCTTGTGAGCTATTCTGGAGAGTATGAACAACGTCATGGAGTATGTTCCTTCTT
TTTATGTAAGGAATTAGAAATAGGCGAGGAATGTTACGCGTTTGTACAGCCTACCAAGCATTTTACTATT
GGAGATCATGTTCAGAATAAGCCTATTGTTATGATTGGTTCAGGAACAGGAATTGCTCCATATAAAGGTT
TTGTACAACAGCGCATTTATAATAATGATCCTGGAATGAACCTTCTCTTTTTCGGAGAGCGATTCGAAAA
GGCCAATTTCTACTATCAAAATTTTTGGAAGAAAGCGATTAAAAACGAGTTGTTGAAGCTTTTCTTGGCA
TTTTCTCGTGACGGGGATCAAAAGATCTACGTACAAGATCTGCTCAGAAAAGAAAGAGAACTCGTTTTAC
GAGCATGCGAAGAGGGAGCTCACTTTTTTGTCTGTGGTAGTAAAACATTGGGAAGTGAAGTTAAAAAGAC
TCTGGAAGATATCCTAGGCAAAGATAAGCTCTCCCAATTAAAGGAAGAGCGTCGTTATGTTATCGATGTT
TATTAA
>ref|NC_003361.3|:c209145-208615 2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase [Chlamydophila caviae GPIC]
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GCCATCGTTTTCTCTCAGAAAGTTCTGCAAAGCCCTGCATTTTAGCTGGGGTAATCTTTGAAAACAGTCC
TGGTTTCCAAGCCAATTCTGATGGTGATATCGTCTTCCATGCTATTTGCAATGCCATTTCTTCTGTAACT
CATAGAATCATATTAGGAGAAGTCGCCGATGAGCTTTTCCACACTCGCGGCATTACCGACAGTAGTGTGT
ATTTATCCGAAGCTATAAAATCTTTAAAATCGAACCAAATGATTTCCCACGTAGCGATTACTATTGAAGG
AAATCGCCCTAAATTTCTGCCAAAACTCTCTGCCATGAGACAAAGTATTGCCTCAGCTTTAAATATTCCT
TTAGGCTCTGTAGGTATTACTGCGACTTCTGGAGAAGGATTGAGTGATTTTGGCTGTGGCGACGGTGTAC
AATGCTTTTGCGTACTCACAGTTGCAGAGTATTGCAATTAA
>ref|NC_003361.3|:209465-209917 hypothetical protein CCA00196 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATATGGTGTTTCCTAGAGATGATGATGGCCTTTGGGATACCTCTTATGATTGGGATCTAACACATCCTTT
TGCTTTGAAAAATTCTGTTTTAGCAGCCATTCCATTGATTGGATCAATTATGGGATTGATCAAATTATTC
ACTGTTTGGTCTGTGAGCCCATATGGTGAAAGTAAAGTAAAGATAGCTACCTACACCATCACAGGACTCA
TGGAATTGTGTGGTCTAGGGATTGTTCTCCTAGCATTAAAAATTCTCTATTTATTTTTTAAAACTATTTG
CGCTCTATTTAAAAACATTTCTTTTAGGAATGGAGGGGAGCAAATTTCTTCTGCAAACTTGCAAAATCGA
AGTTTTCAATCCGCAGGTCTAATTTTTTCGTAA
>ref|NC_003361.3|:210216-210536 50S ribosomal protein L21 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TCGAATTATTAGACGGCATTTCCGAAGGGCAAGAAATTGTTTTCGATCAAGTGTTGTTTACTTTTGATGG
ATCTAAAGTTTCTTTAGGGACTCCCATTGTAAAGGATGCTGTGGTGAAAGGTCAGCTACTCTCTCAAGTT
CGTGGAGAAAAAGTAACGGCCTATAAATACAAAAGACGTAAAAATTATCATCGTAAGACTGGTCACCGTC
AGAACTATCTTAGAGTGAAAATTAGCAATCTAGTGATTTAA
>ref|NC_003361.3|:210564-210812 50S ribosomal protein L27 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCACATAAGAAAGGTCAGGGAGCAAGCCGTAACGGTCGCGATTCAGAGTCAAAGCGTCTCGGTATGA
AAGTGGGCGCAGGGCAAAGAGTTTCCACAGGAAGTATTCTTGTAAGACAAAGAGGTACTAAGTGGCATCC
TTCACAAAACGTAGGTAGAGGTCGTGACGACACTTTATTTGCTTTGGTGGACGGTATTGTGGTCACTAAG
AAGACAGATCGTACATACATTTCTGTTCTTCCAGAATAA
>ref|NC_003361.3|:210929-211936 GTPase ObgE [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGGAGAAATACCTACCAAAAGGTGGTCCTTACGGTGGTAATGGCGGCGTCGGTGGATCCATTATTATTGA
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TCTGGAGCTACGAATAATCGTTCCGGAAGAAATGGGAAAGATTTAGTCTTAGTCGTCCCTGAAGGAACAT
TATTACGGGATGTAGAGACTCGGGAGATTATTTATGATTTTGCTAAAGACGGAGAACGTTTAGTCATTTG
CCGCGGAGGCAAAGGTGGTAAGGGAAATACTTTTTTCAAGACATCTACCAACCGTGCTCCTACAAAAGCT
ACTCCAGGGAAACCTGGGGAAGTGCGCCAAGTCGAGCTAGAGTTAAAACTCATTGCAGACATCGGTCTTG
TGGGCTTTCCAAATGCTGGGAAATCTACGTTGTTTAATACTCTTGCTAAAACAGAAGTTAAGGTAGGGGC
TTATCCATTTACTACACTGCAACCTGTATTAGGTTTAGTTCCTTGTCGAGAGAAGTTGTATCAAAAACCG
TGGATTATTGCAGATATTCCCGGAATCATAGAGGGCGCACATCAAAATCGTGGTCTAGGATTAGACTTTT
TAAGACACATTGAACGCACGAGATTGTTATTATTTGTCGTTGATATTTGTGGATGTGAGAGATCATCTCC
GGAAGAAGACTTACGTATTCTTATGGATGAGCTTTTGCATTATAAAGAAGATCTTGCTGATAAAGGTAGG
ATCATTGCTTTAAATAAGATCGATGATCTTCTTCCTGATGAGAGACAGGAACGTCTGGAGAATTTTCAAA
GGCTCTTTCCGTCTGAGCAGTTCGTGATGTTATCTGGACTTACTGGAGAAGGAGTAGATTTGCTCAACAG
CCTTTTCACAAATAGACTGAGTGTATAA
>ref|NC_003361.3|:c212727-211834 metal ABC transporter, permease protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTATCGCTGGGGGCGTTGTAGGAACATATATCGTAGTCAAACGCATCGTTTCTATTAGTGGGAGTATCTC
CCACTCTATTTTAGGAGGGATTGGTCTCACCTTATGGATCCAATACCGGCTAAATCTTGAGTTTTCTCCC
ATGTACGGAGCGGTAATCGGAGCAATAATCCTCGCAATCTGCATTGGGAAAATTCATCTCAAGTATCAAG
AAAGAGAGGATGCCCTCATTGCTATGATTTGGTCTGTAGGGATGGCGATTGGGATTATCTTTATCTCTCA
ATTACCGGCTTTTAATTCAGAGTTAGTGAATTTCCTTTTTGGGAATATTCTTTGGGTAACCACCGGAGAT
CTCTATAGTTTGGGGATATTAGACGTTATTGTTCTGGCAACTGTAGCGCTCTGCCATACACGATTTCTCG
CCTTATGTTTCGATGAGAAATACATGATGCTCAGTCGCTACTCTGTACAAACGTGGTACTTTCTTTTGCT
AATCTTAACAGCAATTACCATCGTTATGCTAATTTACATCATGGGCGTTATCTTAATGCTAAGCATGCTT
GTTTTGCCTATATCGATTGCTTGTAGGTTTTCCCATAGAATGATTCATATTATGATCATTTCCGTTCTCT
TAAACATTTTATGCTCATTTTCCGGAATCGTTCTTGCCTACGCCTTGGATTTCCCTGCAGGACCAACAAT
CGCTATTTTGATGGGTATTGTTTATACACTCAGTCTATTTGTGAAAAGGCTGTTGAGCAAATCTACTCCT
TCTCCAGTAAGTCCAGATAACATCACGAACTGCTCAGACGGAAAGAGCCTTTGA
>ref|NC_003361.3|:c213443-212724 ABC transporter, ATP-binding protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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AAGTCTCCTTCATGATTCATGAAGGAGACTTTGTCGGTATTATAGGCCCCAATGGTGGAGGGAAAACAAC
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AAAGAATCCGAGTTAACCATTGGTTGGGTCCCCCAGCACTTCTCCTACGACTTTTCCTTCCCCATTTCTG
TAAAAGAGGTTGTGCTATCAGGAAGACTTTCTTTTCTTCGCTGGCATGGGAAATATGCTAAATGCGATCA
TGAATTTGCTGAGCAAGCCCTAGAAACAGTAGGTCTTTTACACCATAAGGATAGGTGCTTTTCTCACCTA
TCTGGAGGACAGATACAAAGAGTACTCCTGGCTAGAGCTCTGGCATCTCATCCTAAATTACTCATTCTTG
ATGAACCTACAGCAAATATCGATCCTGAAAATCAACAACGCATTCTACAGATTCTCTCAGAACTTAATGA
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ATGAGTAGAACTCTAACAACACTCACAAATACCCCAACGATACCTCAAGAGTTTTGCTGTGATTCTTTCG
ACAAAAAGGTTGATCTATGA
>ref|NC_003361.3|:c214276-213440 ABC transporter, periplasmic solute-binding protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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AACACAAACATGTTCTCGTTAGTATAGTTCCTTATAAGTTCCTTGTTGAACAGATAGCGGGGGATACTTG
TGAGGTATGCTCTATAGTTACTAATAACTATGATCCTCATACCTATGAATTATCTCCCCGTCATATGGAA
AAACTTCTTCGTGCGCAACTTTGGTTTCGTATGGGAGAGAATTTCGAGAAGGCCTGTGAAAAAAATGTTT
CTTGTCCTCAAGTAGATCTCAATAAAAATGTTCAAGTCATTCCTGGGTATACGGGATGCGCACAGCACTT
TCACAGCTTTGATACCCACACCTGGCTAAGTCCGAAAAATTTAAAAATACAAGTCGCCTCTATTGTAGAA
GCTCTATGTTTGCATTTTCCAGAACATACCGCGCTATATCAAAATAACGGAGAAAAGCTACTTAAAACTC
TAGAAGCTTTAGATATAGAGATTCAGGAAATCACCTCTGCTGCTAAGCAGCGTCATATTTTAGTCGCACA
TGGAGCCTTTGGTTATTTCTGCAGAGATTACAATTTTTTCCAACATGTTGTTGAAAAGAGCAATCATGCT
GACCCCTCTCCAAAAGATGTTATCCGCACGGCTCAAAGTATTCGAGAGCATGGGATTTCTTCTATGATTT
TACTTCGTCATGCCGGTAAGCGTAGTAGCGCTATGCTTGCTGAACGCTTCCACATGGATACAGTAAACTT
AGATCCCTATGAAGAACACGTTATAAATAACCTGAAAACCATAGCAACAACCCTTGCTAATTTATGA
>ref|NC_003361.3|:214863-215501 thiamine-phosphate pyrophosphorylase [Chlamydophila caviae GPIC]
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ACTTTGTATCCGCTTGCGTGCAATCGGGAGTGACTGCAGTTCAACTTCGTGAAAAGGGACTTTCGCATAG
GGAGCTTCTAAGTTTTGGAGGAGCATTAAAATCCATTTTAGACCCTTTGGATATCCCTTTAATTGTTAGC
GATAGCGTATCTGTATGTTTAGATTTGGATGCTTCAGGTGTCCATTTAGGACAAACAGATGGGGATGTTA
TAGAAGCTAGAGAGCTTCTAGGCCCTGATAAAATTATAGGATGGAATGTCCATACTCTTGATCAGCTGCT
CAACGCTAATACTTTACCCATTGATTATTTAGGATTAAGTGCGTTGTTTGCGACTGAGAATAAGCCTGAA
GCTACTGATCTTTGGGGTTTTTCTGGTTTAGAGCAAGCCGTTTCTCTATGTGAACACCCTATAGTTGCCG
TTGGCGGTATTGATGAAAGTAATGCCGGAAATGTTGTAGAAGCTGGTGCTGCGGGGATTGCCGCTATAGG
CGCATTCCATTCTGCGCACAATCCAGGTTTAGCAACAAAAGCACTAAGAGAAATTGTTGATAGGGGACTT
AGATGCTAG
>ref|NC_003361.3|:215495-216283 hydroxyethylthiazole kinase [Chlamydophila caviae GPIC]
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ACTACGTTTCTATGGATTTCCTCGCCAATTGCTTTCTAGCTATTGGAGCATCACCTATTATGAGTGTCTC
TGATTTAGAGTTGGAAGAGTTAATAGGACTGAGTTCTGCGGTTTATCTGAACATTGGGACTTTAGATCAT
CTATTTATCCAAAGATCTTACAGAGCAGTAGATATTGCTATCAGGCAAAACAAGCCGATAATTTTTGATC
CGGTAGGTTCAGGGACGACAAAAATTAGAACAGAGGTTTCCCATCATCTTCTTGCCCACTCTACGATTGT
TCGAGGAAATGCTAGTAAGATTCTTTCTTTCGGAGATCTTTCTATAAAAACACGTGGTGTAGATTCTGCT
AACACCACGCATGATGCTAAAGAAACAGCAATTGCTTTAGCTAATGAATGTTTATGTGGTTGTGCTATTG
CTGTTACCGGCGCTGTAGATTTTATTACTGATGGGAAGCGTAGTGCAACTATAGAGCTGGGAGATCCGTT
AATGTCTCATGTTACGGGCATGGGGTGTTCTTTAACAGGAGTCCTTGCTGCGTTTAGATCAGTAATTGAC
GATTCTTTTGAAGCTGCACGATTAGGTGTAGAATACTTCTCTCTTTGTGGCATGTTGGCTCGTGAGCGTT
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TCGTTATTACGAGCAATAG
>ref|NC_003361.3|:c221796-216409 polymorphic outer membrane protein B/C family protein/autotransporter, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTTCGAAAGAATTAAACTCCAGTTATAGAGGATCTGGGTTCTCTTTGTCAGATTCTCAGTCGAATAACTT
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CAGATGGTTCCGACAGTTCAGCCAGTACTAAACAACAGCAGGCAACGGCACAAATTAGCTTTCTTCAACC
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CATCAAGGAAATATTGATCTTAGCAACCTAACATCTGCACGACCTTATGCACTAAGCTTTCCCATTGCAA
CTACGACAACGACTGCTGACAGCGTGACTTCCACTCCTACCCCTAAAGGTGGAGGAGCTTTCTACAATGA
CCAAGGCGGCCCCTTATCATTTATTACCCACGCGGGAAATCCAGGATCTATCTCCTGCTCTCTAATCAAA
ATGACAGGAAAAGGAGGAGCAGTATACTCCAAAGGTCCTATATCTTTTGATGGATTAGAAAATGTTACCT
TTAAAGATAACCTATCTCAAGAAGCTGGGGGCGCTCTATTTACAGATTCTACACTGACAATTCAACATAT
CCTGAATTCTATTGAATTTACAAATAACGCTGCGCGCGTTCCTGTTCCTCTAATCCCTATTCAACCAGCA
ACTCCAGATGGAACCTCTCCCTCTAGTTTACGAAGCATCTCTCCTGGATATATCGCACAAACAAACAAGG
CGGATGCAGGATCTCAAACTCCTACGCTCCCTACATATACAACAGAAACTGCAGGAAACGGCGGTGCCAT
CTTCGCTCAAGGCGCCATTGTCATCTCTACTTACAAAGATATGACTTTCAGGAAAAACTCTGCAGAATTC
CCTCATATTATTGACACCATCAAAGAGCAAATCGAAACAACGAAAAAAGCAAAAGCTGCTGCAACGCCAG
CGGCTCCTAAAGTTTCCAGTATTCTTGCTTCTTCCAGTGCACCAGCTGCCGCTCCAGATGTAAAAGACAC
TACTATCAAAGGATGTGGGGGCGCCATTTTCGGTTTAGATACCATTACGATTCATGATGGTTCTGAAGAT
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ACAAAGTGGCTAATTTAAAATTCCAAAGCAACTCCGCGGATGCACAAGGAGGTGCCATTTATGCAAAAGA
GAATCTTACAATAAGCGATTCCTCTACCCTCACTCAGTTTAACGGTAATAACGGGAAAACCGGTGGTGGA
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GCAACTACGACATTACCCTCACTATACCCTCCAAAGAAAAAGCTGTTGTTGCTTCTGCTGCTACTGGCGC
GGCTTCCTCTCAGTCAGCAGCCCAGCAATCTGCACCTGCTGATACGCCTCCTTTGGGAAAAGGTGGAGGT
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CAGATCATGGTGGGGGCGCCTATGTTAAAGGCACTCTCACATGTGAAAATTCTCATAGAATACAATTCAC
CACAAACACCTCAAAAAAATCCGGTGGTGGACTCTACTGTGAAAGCGATGTGACATTCTCCAACCTTACA
GGGAAAACACTCTTTAAGGGTAACGTTGCCGAAGAAAATGGTGGGGGTCTCTGCCTCGCTGCGGAGAAAT
CTCTAAACTTATCAAATTTAGAGAGCTTTTGTTTGATAAACAACACCTCCAGCAAAAGTGGTGGCGGAGC
CCACATTCCCAAAGAGCTTACTTTTACCGTCCCTAATCCAGACTCTTCCTCTACGACAACTACAGGTCCT
GTATTTGGAAGTGCTGTGATTACTGGAAATACAGCTACGGAACATGGCGGGGGTGTTTACACTAAGAAAG
CCTCCTTCACCAATCTTGAGTTAATTGATATTGATCAAAACCAAGCTAAAAATGGTGCTGGTCTTTGTAC
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GTTGACTTCATCGTTACAACAAACGTTACGAAAAACGCTGCCTCAGAAAATGGTGGGGGTGTTTACGGTA
AAAAAGGAAAAATCTCCCGTCTTGATCATTTAAATATCTCAGGAAATTCCGCAGGAAAATTTGGTGGAGG
TCTCTACTTTACAGAAGAATTGACTCTTGATGGTGTTGAAGTTTCAAATATCTCAGGAAATACGGCAAAA
GAAGCTGGCGGCGCTATCTATGCGAAAAAACTTACCTGCACAAATCTTCCTGAAGAATTCACTGTAAGCA
ATAACAAAGCAGAGACTACCTCAGCTGTAAAAACAGAGTCTGGTAACAATACTACTGTTCCTACAGACAT
TATTGGCGGTGCTATCTATGCTGAAGAACTTATCTTAAAAGAATTAGTCGGGGATTGTACATTCTCTGGG
AACCAAGCCATTGATAAAAATGCGACTCTCTCAACTAATAATTCTCCTACAGATCCTAATGTTCAAGGTG
GGGCTATCTATGCTAAGACCTCCTTTAAACTACAAAATAGCAAAGGGAAGCTAACCTTCTCAGAAAACTC
TGCAACTACAAAACGATGTGCAACAACAGGCCAGGTAGCAGGTGGGGCTATCTATGCTCCTGCTGTGACG
ATTGAAAATTGTTCTCAATCGATCTACTTTGTTAATAACTCAGCCTTATGCACTCCATCAGAGTCTTCTG
GGTCAGCTCTACAAATCACTCCAAAGGGAACCTTTGGTGGGGCTATTGCAGGAACAACTAGCGTTACATT
CACAGGAAACCAAGCACTATTTTTCCAAGGCAACTCGGCAGAAAATGGCTCGGCAATCGGCTGTAAAAAT
AGCACAAACGGTTCAGACGGCAAGGTAGAATTTACCGATTCCTCCTACTGTTACTTTGAAGAAAACATAG
CTAAAAATCGTGGAACTATCTACGCAGCTACCCTATCCATTCCAAAAGGATACATGAACTTCTCCAACAA
TAGTTCTGCAAACGATGGTAGTGCGATTTATTTCACAAAACAGGCAGACATTACAGCTTCTGCGTCTGTG
TCGTTCCTGAATAACAAGGTCACCTTAGCACAAACTCCAGCAACAAACACTCAAGGATCAAATCAAACAG
CTTCTGTTAAAAACTTAGGCGCTGCAATTTATGGAGAACCTGCTAGCGGCAGTGATGATGCTGTGCTTAA
TCTTACAGCTTTAAGTGGTAACATCACATTTAAAAACAACCAATGCCTACCTACAGCACAGCAAGACGCC
ACGTCTTTTTGTAGTATAGCAGGGAAAGTTAAGCTCACTCTTAATGCTGCTGAAAATCAATCCATCAATT
TCTATGATGCTGTAAACATCACAACATCTAAAACTAGTGGTTACAATACTCTAGACATCAACAAAGCCCC
CTCTTCATCTCCAGGGACTCCATCAAGCTACACGGGAACCATACTATTCTCCGGAGAGCTTCATGAGCAT
AAGTCCTTCATTCCTCAAAAGGCTGTTTTACACAGCGGGACATTAGTATTAGGAAAAAATGCAGAGTTGA
ATGTTATTTCCTTTGATCAGAAAGCTGGATCTTCTCTCGTTATGGGACCAGGATCCATATTATCCACACG
AAAACCTACAGGTGGTAGCGGCGGAACGACCGGAGGTATAGCAATTAATAACCTTACTATTGATTTTAGT
GAGGTTCTTGCCCAAGACGGCAACGCTGCTTCCCCTCCTGCTTTGAAATTAGGCGTGGAGCCTACGCGAG
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CCTGACTTAGGTCAAGATCGTCAAATTGAGTTATTGAAACTCCCAGACTCTAGCAAGGTAGAGATTTCTG
ATCTAACTTTAGCTGGGGATACCAAACCTAAAAAAGGTTATATTGGTACCTGGACACTAGATACAACAAA
TACAAATGGCAAGCTACAAGCTAACTGGAAGTTTGAAGAATACCGTCGCTGGGTCTATATTCCTCGTGAC
AATTACTTCTATGTGAACTCTATTCTCGGTTCTCAAAACTCCCTGATTGCCGTAAAACAGGGTATCGTCA
ACAACATGCTTAATAACGCACGGTTTGACGACGCTGCTTACAATAACCTTTGGTTATGCGGTATCGGATC
CTTCTTACAAAAAGATGAAGGAGAAGAGGCAAGATCCTTCTCTTACCATAGCCGTGGCTACTCACTCGCT
ATAGATGCTAAACCACGCCCTGAGTTTATTCTAGGAGCTTCATTTAGCCAAGTCTTCGGACATGCTAAAT
CTGAAAAGACTGCTGGGCAATACAAGCATAAAGGTTCCGATCACTCTTTCCAAGGAACGTTATATGCGGG
TAGATCCTTCTATTTACCTCATAGACAAACAAAAGCTCCTCGCCCCATACTTTTCCAAGGGTTGGTGACT
TATGGCTATATGAAGCACGATACAACCACCTACTACCCAACCATTCAAGAGCGCAATCTTGGAAATTGGG
AAGATCTCGGCTGGTTATTTGATATTCGTATCGTTCTTGATTTAAAAGAGCCTTCTCATAACTCGACGAC
AAGATTCTCCTTCTACTCAGAAGCAGAATATACAGGAGTACGTCAAAAGCAATTTACAGAAGTTGACTAC
GATCCTAGAACATTCAACTCTTTCGCTTATAGAAACCTAGCTACACCTTTAGGTTTCGTCTTTGAAGGAG
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TCATCCTGAATGTACTTACAGAATTAATTCCACAGGACAAACTGGTGAAGTTTCTAGTGTAATTCCTGCA
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ATACTGTAGATGCTGGAATGTCTTCGTTAACACAAATAGCCAACTGCGGCGCACGTATGATCTTCTAG
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TATCAGCGGAGGTCACTCTTCCTCTATCGGGAACCCATGCGGGTGAAGATCTTGAATTATTCACCATGTT
AACTACGTCCCCTCAGGGAACAAATTACACGTTGAGAGGTGAATTCACCCTTAAGGATTTCCTTGGAAAC
AATATCCATAAATCCGGGGGAGCGTTTTGCAACTCAGAGGGCAATCTCACATTTACAGGGAGCTCTCCTC
TAGCGATCTTAAATTTCACGAATTTACAATTAGGTGGTCAGGGAGCTGGTGTATTTTCTAAGACTCTTCT
TACTTTTGAAAATTTAAAAGCGATCAACGTAGAAAATAACCAGAGTTCTGGAGGAGTGTTTACCTCTAAA
CAGGATATGCTCTTCACTAGAAACACTAGTCTGCTTTTCCAAAATAACATAAGTCATGGAGCTGGAGGCG
CGATTCTCCTTACAGGAGTGCAACCAAATCACATGAGATTTAGTGAGCAGCGTGGCGCTATTTCTTTTAT
TAAGAACCGTGCACAAGTTACAAAAAACATCACAAATTCAGGTAATGGCGGAGCTATCAATAGCGAAGTT
GCTGGATCTTCTATCCTCTTTGATGGGAATCAGGAAATTCTCTTCCAAGAAAATTACGCTAATTTTGGTG
GAGGCATCTGTAATGCACAAGGAACTGTAGAATTTAATGGAAACAAAAATACCATTACCTTCACACAAAA
CAGAGCGGTATCTTCTGGAGGAGCAATTTTTACAAAATGCTGCAATATACATAAGCAAACTGCTCCTGTA
GTTTTCTGCAAAAATAGTGCTGACATTCTCGGCGGTGCTATTTTTTCTTCGCAGGTAATTATCAAAAACA
ATGACGCGCCTATTCTCTTTAGTGAAAACCACGCTAAAGGTGGCGGAGCTATAGCCGCGGTAAGCTGTAA
TATTACAGCTTCTCAACCCATTATCTTCTCTGACAATTCCTCTAGGGATTTTGAAGGGGGTGCAATTTAC
TTAAGTGGACAACCAAAACTACATTTGCACGCACAAAGTGCTGACATTATCTTTAGCAATAACACGGCTA
GGATCACCACCAAGCATTCTTCCACCATAAAGAATAATGCCATTATAATTAACGGTGCTCCTGAATCTAT
CCGCCTCATTGCTAATGAAAATCAATCCATTATTTTTTATGATCCGGTTCTTGCAGCATCACAGGGTGCA
GATCCTATACACATTAACTCTGTTGATCATACTCTGCATTGCGGTTCCGTTATCTTTTCTGGAGAGAAAC
TTGCTATAGATCGCCAAGATAACAATAATAAAACTTCTATCTTCAACCAACCTGTATATCTACATAACGG
AACTCTTTCTATTATAAGTGGTGCTATTCTTGCTGTTCAAGAATTTAAACAGTTAGGCGGTACATTACAT
CTTAGCCCCGGGTCGATGTTAACAACCTACAATAGCTCAGGAAAAGATCTGGTTATTTCTAATATTAGCT
TTGGTTTAGATACTACTCACTCTCATCTTCCCGCTGAAATACGATCAGGAAATTCAGTAATCAAACTGTC
GGGATCTCCACAAATTCATGATCCCGATAATATCTTCTATAATAATCATGATTTGGCATCTCAGCCATAT
CATATGGAAATCGTTTTCAAATCCGAAAAAAGTGTTAATATTGACAACTTTATTCCTGAAGAGATTGCTG
TGCAGCAAAATGCCTATGGCTATCAAGGTGTATGGAAATTTAATTGGTCCAAGGAAAATTCAAAGCGACA
TAAAACATTAAAAGCCTCATGGATCCCAACAGGAACATTCATTTTAAATCCTGAGAAAGAGGGATATCTC
ATCCCATCTTCTGTATGGGCAACATTTACAGGGATGCGCTCTTCTAATGACGCTATTCTTGATAACTACT
TAAATAACAACACGATCATGCCTATAAAGTATGCGTGTATTTTTGGTGGCCCCATCTCCAGTGTTATGGA
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TTTTCACCCAATACTGTTGTTTGTGCGACATTCACACAACTTCATGGATCTATCTCTCAGGATAATATTC
CAGGGAAAAGCAATTCGCATATGCTATTAGGAACAGTAGCCGCTTTTAAAAATTGGCGCGCTTTATCATT
CAGATCTTCTATAAGCTATGCTGAAGAATCCCATGTTGCAAAACATCAATTTTCGAAAAAGGACATCACC
CGAGGAGCTTGGAAAAACCAGGGATTTCGCGGAAGTGTAGGCCTATCTTATGCCTATCCTAAGGGAATCC
GTTGTCTGAAAATTACTCCATTTGTTGATCTTGAGTATACCGTAATCAACCAAAATCCTTTCATAGAAAC
AGGATACGATCCTCGGTATTTCGCTTCTTCACATTTGAGTAATCTTGCTCTCCCTACAGGGGTTTCTTTA
GAATTACGCCTTTTCGGAGCAAAATACTCGCTATTCACACAATTGAGCATGGCCTATATCAAAGACTTGC
TTAGAGAAAATCCTACAACAACGGCTGCCTTAATCCTAAATCAACATTCTTGGAAAGTTGCAGGAGCCTT
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CTGCGTGCATCGGTGGTCCCGGAGCCCTATTTTGGGTTTGGATTGCGGGAATTTTTGGTTCCATAGTGAA
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ATGTACTTCCTAGATAAAGCTTATGGGACCAAACTCATCCCTATTATTGTAGCCGTATTGCTCTGTATTT
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ATTCACTATTTTTGGTTTGCTATTTTTAATTCTCTATGCAGTTCAAGGGGGATTGCAGCGTATTGGGAAA
ATCTGTGCTGTCGTACTTCCATTTTTCCTCACCTTATACTGTGTACTATCTCTATACATACTTATAAAAG
AGTTCCACCAGCTTCCGGCTCTGTTTTCAGCCGTATTTTCATCAGCATTTACAGGGCATGGTGCTATTGG
AGGCTTTGCTGGTTGTACTGTAGCAACGACAATCCACCAAGGGATCTCCAGAGCCGCTTATTCCGGAGAT
ATTGGTATTGGATTTGATTCCATTATTCAAAGTGAGAGTTCCGCAAAACGTCCAGAAACACAGGCTCAGC
TAAGTATCATAGGACTTCTTATCGATAACCTTATCTGTACACTAAGCTTACTGATGGTACTTGCATCCGG
ATCTTGGTCTCTAGGCCTTGACAACGCTTCTCAAGCTGTTGAACATGCCTTAGCCACCTATTTCCCTCTT
GTGAAGATCCTCCTCCCCACATTCTTCTTCGCCACGGGCTATACAACGATTATTTCGTATTTCCTTGTCG
GGAAAAAATGTGCAAAGTTTCTTTACGGAAATATGGGATCGAAAATCTATACCCTATACGGAGCTGCTAT
ATTACCTATGTTTTGCTTCTTATCGCAAAACACAGCCCTATTGATCATGTCTGTATCTGGAGCTCTTCTC
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TTCTTATTTGCCATACGTATAGCAATTATTTTAGGTATTCTTGCCTTTCTTTTTCTAAGAAAGAAAAGAA
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ATTCTACAGGCATGTTGTCGATTTTATTTCTATCGGTTTTAAACGGTGGTATTTCCCAACTTTTAATTTT
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TAAAATAG
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AAAAGGTCTACTTTACGGAAACTAA
>ref|NC_003361.3|:c228695-228237 transcriptional regulator NrdR [Chlamydophila caviae GPIC]
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GAGGTTTTGCTATCTGCAACTCCGGATATGGAAAAATAG
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GTATTATTTTCGTGTACCAAGTTCCTTATCTCTATATCTTTTTGAAAAGGGATTTGTTTCAGTAGATGGA
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GGCCCGAATTAAAACAGAGCATAGAAAAGCATTCTGAATGTCGGGTTTTAAATTTATTTGCTTATACAGG
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AAATGGGCGCAAAAAAATGTTGCGAACAACGCTTTGTCTGAAAAAAGGATCTTTTGGGTTATTGAAGATG
TATTTTCTTTTTTACAAAAAGAAATACGGCGAGGGAAGAAATACGAAGTGATTTTATTAGATCCTCCAAC
CTATGGTCGCGGACCTGATGGCGAGGTTTTTAAAATAGATAGAGATTTCTTCTCTCTGCTGCTTTTATGT
TCCAAATTGCTTTCTGATTCTTCTTCCTATATTTTGATCACTTCGCATACGCCAGGGCATACGCCAGCTT
TTTTACACAGTTTAGCTACGCGGGCTCTACCTTTGGATAGACAGTATTGGTCTTCTGGAGAAAGTTTTTG
TGGTATTGGGGATCAAGCCTTACCTTCTGGAGTGTTCGTTAAATGGAGTTCATAG
>ref|NC_003361.3|:230334-231131 spoU rRNA methylase family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGGGGCCGCTATTTCTTTTAGAAGGATTTCGAGAAATTCAAAAAGCTCTGAACTCAGGATACGAGTGTGA
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TTGGAAAAGATTTATTGTTCAGAAGAAATCCTTTCAAAACTTTCTTATAAAGAGCATCACGATAATTTTA
TCGCTGTGATGAAGAAACGTTGGTGGTCCCGAGAGGAATTTCTAGGCCAGAAAAAAAATCCTCTGCCTTT
CTATTTAATCATAGAACAGGTTGAAAAACCTGGAAATGTGGGTGCTATACTTAGAATTGCTGATGGGGTA
GGTGCTGATGGGGTGATTTTATGCGATCCCATAGTTGACCTCTACAATCCTAATGTGATTCGCTCTTCAT
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AAAATGGCAAGTTTTTGCAACTTCTCCTAGAGCAAGTACTATGTATTTTTGCGAGAATTACAACCAGCCG
CTGGCTCTAGTTTTTGGGTCAGAAAAAGACGGACTAACTTCTCACTGGCTTAAAGGGAATTTTGCAAAAA
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AGTCATTCGCCAACGCTGGCTAGCCTAA
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CAGCGCCGCTTATGTAGGAGATGAACCCTTGCTGATGGCAGGGAAACTCCAGGATGGGGCTGTTTTTGTG
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TCCAAAATACCAAACTACACAAAGACGTGGAAATTGTCGTAGTTAATGGTCAAGATCCCTTAGGGGGAGC
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AATGGTTCCTGTTGTTTAGAGAATCAGAAACTTTTAAATACATGGAGCTCGTCGCCAAAAATTTTTGTTG
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AGCTGCCGGTGTTTTCTGTGGTCTCGGATTTCCACAGGGATTTCTTGATATGTTGAAACGTGCCGGAGTG
AAGATATTAGGGACGTATTTATTACCTGACCACGCGGGAATAACGAAAAAAGAATTGCACTACTTTAGCT
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TCTGGCGTTTCCTTACTAAATAGAATAGATCAAATACATAATGGTAAGAGGTAA
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ATTTTACAAATCATTGTCTTCGCTATTTTCTTGGGAATCGCTATGCGTCTTTCCGGAGAAAAGGGGCTTC
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GGAAAATTCGTTCTCGCGTACTATCTAGCGTGTGTATTTCACGCTGTGATTGTCTTTGGCGGTATTATCC
GCATGGGCTGCAAGATGTCCTTCTCTAAATTCCTTTCTGCTATGATGGATGCAATATCTTGTGCGATATC
TACCTCTAGTAGTTCGGCGACACTACCTGTAACGATGCGTTGCGTATCTAAAAATCTTGGGGTTTCTTCG
GAAGTTTCTGGTTTTGTTTTGCCTTTAGGTGCTACTGTCAATATGAACGGTACCGCAATATTTCAAGGTA
TGGCCGCAGTATTTATTGCTCAAGCTTATAACTGCCCTCTATCTTTCAGTAGTTTGCTATTGCTTGTTAT
TGCAGCTACTTTTTCTGCAGTAGGCAGTGCGGGTGTCCCTGGAGGAGGAATGATCACTTTAGGATCTGTA
TTAGCCTCCGTAGGCTTGCCTATACAAGGAATCGCTGTTTTAGCAGGAATTGATAGGTTGCGAGACATCA
TAGGAACCCCGATGAATATCCTCGGAGATGCTGTGGTAGCTGTTTATGTAGCTTCTGGAGAAGGCGAGCT
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AAGTAGGTGAGAATGTTGCAAAAGACGAACCTATAATTGAAGTGTCAACAGACAAGATTGCTACTGAATT
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CTTGTTCTCATTCTCAAGATTGTGGAAATTCCCCAGGATGGTTTTCACCAGCAGTTCTTAGTTTAGCGCA
TCGCGAAGGTGTTAGCATCCAACAGCTCCAACAAATTTCTGGAACAGGAAATGAGGGGCGTGTGACGCGT
AAAGATTTAGAAAATTATATTTCTGAAATGCGTGCGCCTTCGTCTCCAAAAACAACAAATGCGAATGAAA
ATCGCATTCCTATGTCTCCACTACGTAGAGCTATAGCTTCTTCATTATCTAAATCTTCAGATGAAGTGCC
TCACGCGTCTCTTATTGTAGATATTGATGTCACAGATTTGATGAACTTAATCTCTGAGGAGAAAGACAGA
TTCTTTGCAACACATGGTGTGAAACTGACGATTACGAGTTTCATTATTCAATGTTTAGCAAAGGCCTTGG
AGCAATTCCCGTTATTAAATGGATCTTTAGACGGGGATACAATCGTTGTGAAGAAATCCATAAATGTGGG
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TTATCCCGAAGTGGCTATTTTAGGAATAGGAACAATACAAAAACGTGTTGTTGTTCGTGATGATGATTCT
CTAGCTATCCGAAAAATGGTCTATGTTACGCTAACATTTGACCATAGAGTGCTTGACGGCATTTACGGTA
GTGAATTTTTAACCTCATTGAAAAATCGGTTAGAGTCTGTTACGATGAGCTAA
>ref|NC_003361.3|:234953-235942 carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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GCTTTTTTGCTACTTTCCAATGTGAGGGGACGTGGTTGTTAGCTGAGAAAATATTGAATCATCAAGGTTC
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GGAGAACGTGCTTTTTTTCTTTGTTCTGGAGATCTTCTCCACGGGGATTTTGGTGTTGTCCGTCCAGGAG
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ACGTGGTGTATTTATCGCAGGGATTACTTCCTCTGCATATTCTAGTTTAGCTATTCTTTGCGATCATGTG
GTTATTTTACCTATGATAGAAGAATTAGATCCTTTTAATCTTGTTCCTACAACATCAACAACATGCCAGC
TGTTATTTGGAGATCTTCTCTCTATTACACTATTGCGTAGTCGAGGAATATCTCTGGCAGACTACGGGAA
GAATCATCCGGGTGGGCAAATTGGTTTGAAGGTTGTTGGGAAAATCCGAGATTATATGTTCCCAAAAACA
GAAGTGCCTTTTTGCTCTCCTGACAATACAGTTGCAGACTCCTTGGATATTTTTTCTTCCTATGGTTGTG
GCTGCGTGTGCGTAGTGAATGAGCTATTCGAAATATTGGGAATATTTACAGACGGGGACTTACGCAGGGC
TTTATCTCGTCATGGAGGGGATATTTTATTGCAGAAGCTTAAAGATATCATGACTCCAAGTCCTAGAGTG
ATCAGCGAAGATGCTGATGTGCTTCTTGGCTTACAAATGATGGAAACAGGAAACCCTGTTAGCATCCTAC
CTGTTGTCGATGCTAAAGATCAGAAGTATGTTGTGGGATTGCTTCAGATGCATACACTGGCAAAAGCAGG
ACTCATCTAA
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TCAAAAAAGAGCATCAGAAAGAGCTCGCTAAAGTCCAATCTCTTAAATCTGACATTCGTCGTAAAGTTCA
GGAGAAAGAGTTGGAGATGGAAAACTTAAAGAATCAGATTAAAGAAGGTGAGAATCGGATTCAAGAGATT
TCTGATCAAATCAATAAATTAGAAAGTCAACAAGCAGCTGTGAAAAAGATGGATGAGTTTAATGCCCTCA
CCCAAGAAATGACAGCAGCAAACAAAGAGCGTCGTGCGTTAGAACATCAACTTAGTGATCTCATGGACAA
GCAAGCAGGAAGTGAAGATCTGATTGTTTCTTTAAAAGAAAGTCTAACATCTACAGAAAATAGCAGCTTT
GCTATTGAAAAAGAAATCTGCGAAAGCATTAAAAACATCAATCAAGAGGGCCAAGCCCTACTACAACAGC
GTAGCGAGTTAAAAGAAGCTACGGATCCTGAAATGTTTCTTATTTACGAACGTTTGTTAAATAATAAAAA
AGATCGCGTTGTTGTTCCTATAGAGAATCGTGTCTGTAGTGGATGTCATATCGTTTTAACTCCACAGCAT
GAAAATTTAGTCCGTAAAAAAGACCGATTAATTTTCTGCGAACATTGTTCTAGAATTTTATATTGGCGAG
AACCAGATGCTCTCACTGCTGACAGCTCTGCAGCAAAACGTCGTCGTCGTCGCGCTGCTATATAA
>ref|NC_003361.3|:c238695-237601 hypothetical protein CCA00221 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CCCTATCTTCAAGAGAAATTGCTACTCAAAGACGTAACAAGATACTAAAAATTGCCTCCGTATCTATTCT
CAGTGCCTTAGCAATTGGAACTGCCGCTGCCGGTATTACCCTTGCTATTGTTTTAGGGTCTCCTGTATTC
GCAGCATTGGCTATAGCCTCTGTGCTATTTGCCGGAGTGGCCATACTTGTCTATAAACAGCTAACACAAA
AAGCTGATGGGGACTGGATTCAAGCACTAGATCAAGATTTTAGAGCTCTCCCAGCTACAGTTGCAGATGC
AAATTTTGTAATCGAACCGGGAGCCCAACTATCGTTTTACCAAAACAAGAAAAATCCTGGTGTTAAACTT
GGTATGCGAGAAGAGGTCTCGGGCTTCTCTATAAAGTTCTCCGCTCTTCCCAGGTCAAATACAGCAAGAA
CGGTAACAAGCCAACGCGGAATCACATTCAATGCAGTACCTCCTGCACCGCAAACGCAGATTGCAATAAC
TACAAATCAAGCGCGCGCTTTAGTCAAAGAGCTTACCAAACTTGGAGAGCATTCAAATTGGGGTGCAGCT
CAGTATCAGGGACAAACCTCCATTATCTCACCGTTCGCCCCCACAGAGGCTCGTTCCACACCATTAAATA
TAAAAAACAGCAAGTCCATACCTCTCTTAGAAAAAGAAAAATATCCGGAACGTATAGGGCATATCCGAGG
TCCCAAACTCGACGAATTCTCAGGAAGCGATCAAGACGTAATCAATGGTTATTATAACCGCGCACTTTAT
GCCTACGAAAGCTGCATAAAAGAAGCTATTGAAAAAGAATGTTCTATCATTTCCGTCCCACTATTCTCTT
CTGTCTACGAATTGGATGCAAAAAACGATGTTCCCAAAAAAAATAAAAATTATGAGTGGATGTTAGGCTG
CAATAATCTATGCAAGAAGGCTTTGGTTGAAGCTGTCAATAACGCAGCCCTAAGCAATCCAAATTCTTTA
AAACTCCTTATTCTTTTACAAGATCCGTTTGCACCTCTTCCCTAG
>ref|NC_003361.3|:c239138-238767 hypothetical protein CCA00222 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GACATAAAGAGCCTTTGAGCCTATTCCCAAAGGGAAGTAAAGCCAGAGCTAAACTCATTCGTTTTATTGC
ACATTGCGTCATTCAAACACTAGTCTTAACGACGCTAACCGCAGGAATCATTGCTTTAGGCTGCTGCGTA
CACCCCGTATTCTTTACATTTCTGCTTGCTGTTATCCCCGTGTATCTATCTCTTAGACACTTAACTACAA
ATAAACTCCGAGACATCTACATCTCATTTAAAGTTTATCCTTCTAAAGATAAAATCCATGCTATTTCTTC
TTCTAAAATCAAGAAGCTGTAA
>ref|NC_003361.3|:c239834-239193 uroporphyrinogen-III synthase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGATCGTTCCATTTGCAAGAAGTTCCCCGCAACAACGCCGCGCTTTTCGGTACCTTGAGAAAACTTCGCA
TATTTTACTCACTAGCCCTTCGTCAACATCGCTATTTATCTCAAGAATGCGTAGGAAAGTGCCGAAAAAA
ACTTTGGAAAATAAGCATTACCTATGTTTAGGGAAAATCACAGCACATCGGCTTAAATGTCTTCTCCCAA
AGGCACACTACGCACTAGCTACAGTTGAAACAGGAGAAGGTGTTTTGCCAATGATTTCCTCACTACCTAA
AGACGCTCGGATCCTCTACCCGCACTCTGCTTTATCTCGCCCTGTTATTAAAAATTTTCTAGAGAAAGAA
AATAGATCTTTTTTTGCCTACCCTCACTACGGCATTCGAGAACAACGATTGAAGTCAAAAATATTTGATC
GATGTCATCGGATAATTTTAACCAGCCCCTCGGGAGTTAGAGCTTACGCCAAACTCTTTTCTAAGCTCCC
AAACAAAAAACATTTATGCCAAGGGCCCATTACATTAAAGGAGTTTCAAAAAATTTATAATCAACCAGGA
GAACTCCTTTAA
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CATATTTAGCTGCATTAGACCATCTTTTGCACTCCTTTCCTTCGATTGGGAAGAGCGTTATTGATGAGCT
CAAGGGGCAACGCTCTCGTTTAAAGATGATAGCTTCTGAAAATTACGCCTCTATTTCAGTTCAGCTTGCT
ATGGGAAACTTACTTACAGATAAGTATTGTGAGGGAAGTCCATTTAAGCGATTTTATTCTTGCTGCGAGA
ATGTTGATGCTATTGAGTGGGAGTGTGCTGAAACAGCTAAAGAACTCTTTGGCGCAGAAAGTGCTTTCGT
GCAGCCCCATTCCGGAGCCGATGCGAATTTATTGGCGATGATGGCAATTATTACTCAGAAAATCCAAGGT
CCTGCTGTTAAACGTTTGGGATACAAAACGATTAACGATCTTACAGATAAAGAGTATGCTGAATTAAAGG
CTGAGATAGGTTCTCACGTCTGTCTAGGTCCTTCATTAAATTCAGGAGGGCATTTGACACATGGAACAGT
ACGTATGAATGTGATGTCAAAATTGATGCGTTGTTTGCCTTATGAAGTGAATAAGAAGACAGAACGTTTT
GATTATGCTGAAATTGCACGTTTAGTGCGTACACATAAGCCTACAGTGTTAGTTGCTGGATATTCTTCTT
ATTCGCGTAGATTAAATTTTTCCACCCTAAAACAGATTGCTGATGATTGCGGAGCTGTTTTATGGGTAGA
CATGGCACATTTTGCAGGACTTGTTGCTGGGGGTGTTTTTGTCGAAGAAGAAAATCCTATTCCTTTTGCT
GATATTGTCACTACGACAACGCATAAAACTCTACGAGGACCTCGTGGAGGTTTGGTTTTAGCTTCTAAAG
AATATGATGGGATAATCAATAGAGCTTGTCCTTTAATGATGGGTGGTCCCTTGCCTCATGTTATTGCTGC
GAAAGCCGTAGCATTAAAAGAAGCTCTCACTGTGGATTTTAAAAAGTACGCTCATCAGGTTGTGGATAAT
GCGAGAACTTTAGCAGAGCATTTCCAAAAGCAAGGATTACGTTTGCTTACAGGCGGTACGGATAATCATA
TGTTGATTATTGATCTGACTTCTCTAGGTATTTCTGGACGCATAGCCGAAGATATTTTAAGTTCTATCGG
TATTGCAGTAAACCGCAATACGATACCATCGGATGCAGTGGGTAAATGGGATACTTCAGGAATACGTTTG
GGAACACCTGCTTTAACCACTCTCGGTATGGGCAGTGATGAAATGGAAGAAGTTGCGAATATTATTGTGA
AAGTATTGCGAAATATTACTTTGAGACGTAATGCTGATGATAGTTTTAGTAAAAGTGAAGGAGAGCTTCC
AGAAAACATTGCTCAAGAAGCTAGAGCACGAGTCGCAGACTTATTATCGCGGTTCCCGCTTTATCCTGAA
ATCGATCTGGAAACTTTAGTTTAG
>ref|NC_003361.3|:241676-242251 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit [Chlamydophila caviae GPIC]
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TCTTTTCAGAACCTGTAACAGATAAGAGCGCAGCAGATGCTATTAAGAAGCTATGGTATTTAGAACTTAG
CCATCCTGGTCAGCCTATAGTATTCGTAATTAATAGTCCTGGGGGATCTGTAGACGCAGGGTTTGCAGTT
TGGGATCAGATAAAAATGATGACTTCACCAGTGACTACTGTGGTTACAGGACTAGCCGCTTCCATGGGAT
CAGTATTAAGTTTGTGTGCTGCTCCTGGCCGTCGTTTTGCAACTCCTCATTCACGTATTATGATTCACCA
GCCATCTATAGGAGGTCCAATTACAGGACAAGCTACAGATTTAGACATTCATGCTCGTGAAATCTTAAAA
ACAAAAAAACGCATTGTTGATGTGTATCTAGAAGCCACAGGACAACCTCGCGAAGTCATTGAAAAGGCTA
TTGATCGGGATATGTGGATGACAGCAGATGAAGCCAAGGATTTTGGTTTATTAGATGGCATCCTTTTCTC
ATTCGACGATTTATAA
>ref|NC_003361.3|:242220-243002 diaminopimelate epimerase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCATCCTTTTCTCATTCGACGATTTATAAGCCTTACGTGTACTCTGGGGCGGGAAATTGCTTTATTC
TTAGCGAAACTTGTCCTGAGATTACAACAATCTCAGCTCTGTGTAAGGAAGAACAAGTAGATGGATTTTT
ACTTGTTCTTCCTTCATCTGTTGCCGATGCCAAGCTCATTATTTTTAATGACGACGGTTCTCGCCCTAAG
ATGTGTGGGAACGGTCTTCGTTGTGTTATAGCACACCTTTCTTCGGTATTGAAAAAAGAAGACATTTCTG
TAGAAACCGATTCAGGGATTTATTTTGGAAAGTTTTATTCTTGGAATCGTGTTGTTGTAGATATGACTCT
TCCAGATTGGAAATACCGTTGTCATAACCTCACATACACTATTGCGCAGCTGCCTCAAGAAATCTTCAGT
ATCAATACCGGAGTTCCGCATCTTGTTGTTTTTGTCGATGATGTATCTTGTATTCCTATAGATCTTTGGG
GAAGTTTTCTACGTTATCATGCAGATTTTTCCCCTGAAGGAGCTAATGTAAATTTTATTGAAGCAATGAG
TTCTAGGGAATTTCGGATACGCACTTATGAACGAGGGTTAGAAAGAGAATCTTTGGCTTGCGGTACTGGA
GCTACAGCCGCAGCCCTTGTCGTAGCGAAACGCTACGGCTTATCAAATATTCAAATCCCTATCCGGACGT
GGAGTAATATTGTAATCAACATCTCTTTAGATCGTGACCGAGTGTATCTTGAAGGGCCCGTAAATAAAGA
AGTACTTCACTAG
>ref|NC_003361.3|:243153-244142 hypothetical protein CCA00227 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGTCTGATGACGAGAGAGATTTTTATTTAGACCGTGTTGAAGGGTTTATCCTCTACATTGATTTAGATAA
GGATCAAGAAGACTTAGATAAGATATATGAAGAATTAGAGATAAATGCAGAACGCTATTGTCTAATTCCT
AAGCTCACGTTCTATGAAGTTAAAAAAATCATGGAAACGTTTATCAATGAAAAAATTTATGACATTGATA
CCAAAGAAAAATTTCTTGAGATCTTACAGTCTAAAAATGCTCGCGAGCAATTTTTAGAATTTATCTATGA
TCATGAGTCTGAATTAGAGAAGTGGCAGCAATTTTATGTAGAACGTTCTCGTATACGTATTATTGAGTGG
TTACGTAATAATAAGTTTCATTTTGTCTTTGAAGAAGACTTAGATTTTTCAAAACATATTTTAGAGCAAT
TTAAAATTCATCTTTTCGATACTAAAGTATCGAAAGAGTTATCGCAAGCACGTCAGCTTCTTGTGAATAA
GGCTAAAGTTTATTATTCTAATGAGGCTTTAAATCCTCGTCCTAAACGAGGACGCCCTCCGAAGCAAACA
GCAAAAGTAGAATCTGAGACTACAATATCTAGTGATATTTATACTAAGGTGCCTGCAGTTGCTCGACGTT
TTCTTTTCCTTCCGGAAATTACCTCAGCATCTTCGATTACATTTTCTGAGAAATTTGATACTGAAGAAGA
ATTTCTTGCGCATCTTCGTGGATCAGGTCGTGTTGAAGATCAATTAAACCTTGCTAATCTTTCTGAAAGA
TTCGCTTCGTTAAAAGAGCTTTCTGCGAAATTAGGTTATGATTCGCTATCTACCGGAGATTTCTTTGGTG
ATGATGACGACAAAGACGATGATGAGAAGCCTGCACCTAAGAGCAAGGCTCCTGCTAAGCGTGGTCGTAA
GAAATCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c244840-244148 ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TCAATTCTATCTTATCTTTAGGGATGCATCATTTATGGAATCGTAAGTTTTCAAAAATGTTAGGGAAGTC
AGAATGTCTCCTAGATCTTTGCTCAGGAACAGGGAAAGTTGCCTATAGATATATTCACGATTATCCGAAA
TCGCAAGCCATACTCGTTGATTTCTCCTCAAATATGCTCGCGATAGCAAAACAACGTTATCCTAAGGCTC
CTTTCACCTTTATAGAAGGAGATATTGCCCAACTCCCTATCGATCAAGAGTCACATACATTAGCAGCAAT
AAGCTACGGATTACGAAATCTTCCCGATCGTAAAAACGCCCTTAATGAAATCCATCGTATTTTAAAACCA
AATGGATGCTTAGGAATTTTAGAGCTCACCTCGCCTTCTGATAACCACCCTATGTATCTAGCACATAGAT
TATATCTAAAATTCTTAGTGCCTTTGATAGGAAGGTTATGCTCTAAAAATAAACAGGCCTATCACTATCT
AGCTGAAAGCATTAAGAATCTGCCTAAAGATGACTACTTAGAACAACTCTTCAAAGACGCACAATTCCAG
ATAAGCAAAAAAAGAAAATTTGCCTTTGGAGCTGCAACTATTTGGATATTGCAAAAGATCTAA
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TAGAGCTTGCAAAACACAAGGAGATTCTTCTTCATACGGCACCTCCTGCAGATCTCCTTGGGAAACTCCT
CGATGGTAGTTTACAATTCGCTCTTACCTCTGCAGTAGGGCTGTTGACCCATCCTTTAGGAACACTTCCA
GGATTTGGCATAGCGGCTTATAAAAAAATTCTTAGTGTGAATCTTTATGCTGCATCGACGTTTTTCACAT
CAGAAAAACTTCGCATTGCAGCAACAAAAGAAAGCCGCTCTTCGGTAATGTTACTAAATATCCTCTGCCA
ACATTTATGGAAGACACCCATCCCAGAAATTATCCAACTCACCTCTGATAAGGTTATCGAAAAGAGCGAA
GAGTATGACGGTTTATTATTAATTGGCGATAAAGCTCTACGCCATCCTCATGTTCCAGGATTTACAACTT
ATGATCTTGCTCAAGGATGGTATGAACTTACCCAATTACCTTTTGTCTTTGCTGTTGTTCTTTCTAATAA
CCCTCAGGGAAGTGCTATTGTACAAGCAGCATTAGAGAGTTCATTAAGCCATTTCGAAGTTCATCCCGAA
GCAGCTATAGCACAAGCTATCGAGCGCTCTCAGCTGCCAGAAGCTCTTATTAAGGAGTACTACTCTCTTT
GCCGTTATCGTCTAAGAGAAGAAGATTATGAAGGTTTAGAAAGATTCCGAGAATATTATGCAACTATCCA
CCAACAAGCCTGA
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TGGGAGGGGCGCGTCTCTCTAAAGAGGATGCCTTACGCTTGCTTCTCATTGAAGATGAAGACGACCAACG
TGCTTTATGGGCATTTGCAAATACGATACGTCACAAATATGTCGGTGATATTGTCTACTACTCCTCTACG
TTTTATCTATATCCCACAAATTTCTGTGAGTTTAACTGTACGTTCTGTGCTTTTTATGCAAAACCTGGAG
ATGCTAAAGGCTGGTTTTATACGCCAAATCAGTTAATAGAAAAGATCCGCGCTTTAGATGTTCCCATTAC
AGAGACACATATTGTTGCCGGATGCTCCCCAGAGTGTAATTTAGACTATTATACCGAGCTATTCAGTAAG
ATTAAGGAAAACTTCCCTCATATCCATATCAAAGCATTGACAGGCATCGAGTATGCATATCTTGCTAATC
TACACAATATTCCTGTTGTCGAGGTTTTGAAAACATTAAAAAATGCGGGATTAGACTCTATTCCTGGGGG
AGGATTTGATATCCTTGTTGATGAAATACGGCAGATACTCGCTCCCGGACGTTTATCCTCTCAAGATTTC
TTAGAAATTCATAAAACAGCGCATAATCTTGGAATTCCTAGCAATAGCACGATGTTGTGTTATCATAGGG
AACGTCCTGAAGATATTGTTACACATATGGATAAATTGCGCAGTCTGCAAGACGATACTTTAGGATTTAA
GAACTTCGTATTGTTAAAGTTCGCAACAGAAAATAACCCCCTAGGGAAAAGACTACGCAAATTAGGCGGT
TCCCATAACATCCCTCCAGCATCTATCATTGCTGTTGCAAGGTTATTCTTAGACAATTTTAGAAATATAA
AAGCCTTGTGGAATTACTTAGGAATCGAGCAAGCTCTACATCTATTATCTTGTGGAGCCAATGATTTTTC
CTCCACTCATATCGGAGAAAAAGTTTTTCAAATGGCCTCTTCAAATCAAAATATAAAAATGGACATCGAG
GGAATGGCAAACCTCATTAAAGAACAAGGACGCATACCATGTCTGACGAACTCGAAAGACGTATAA
>ref|NC_003361.3|:c246872-246651 hypothetical protein CCA00231 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TAGGCTCTTATCTCTTAGGTAGACCTTTATCTAAAGGGTGTGGAAAATCGGACTGTTGCCATAAGAAAGC
ATGCGATAAACAAACTCGATCTGATTCTACAACCAAGGCACCACCCTATGACGACAGCACACATCCCCCG
CATTCTTCCTAA
>ref|NC_003361.3|:c248765-246903 hypothetical protein CCA00232 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCGCAGATCTGTTTGTTATGTTAATCCTTCCGTAGCTAGAGCTGGGCAAATATCTACATGGAAGTTTC
TTTATTCCCTAGTTGACTACCTCCCTGAGGGAACAAAACTTAAATTTGACTTGGGATGTCAAGGGAGACC
CATAGATTGGGAGATCCCTTCTACAGATCTAAAACAACCGCGTAATACTATCTATTTAGAAACGCCTAAA
GGGGATATTCTTACTGCTGTAACGATCCCCATTGCAAATAGTCCCGTCCCTCAATATGAATTCACCCTTC
CTTATGAACTAGATGCTGGTGAAACTCTTACAATTGTTCTTGGACCTTCTCCAGAACATCCACAAACAGA
TGAAGCAGGAAACGGTGCTCAGCTATTTACCCAACGTAGAAAACCTTTCTATCTTTATGTGGACCCCGAA
GGCAAGGGAGATTATGATGAACCGGATATCTTTACTATGGATATCCGTGGAAATGTTCTCAAACAGATCC
AAATTTTCACACCCTCCTATGTTGTCAAGAACAAGCGTTTCGATATCACTGTACGATTTGAAGATGAGTT
CAATAACCTGACAAACTTCTCACCAGAGAATACACGTATTGAGCTCTCCTATGAACACCTAAGAGAAAAT
CTTAATTGGCAATTATTCATTCCTGAAACAGGATTCGTGATTCTCCCCAATCTCTATTTCAACGAACCTG
GTATCTATAGGATCCAATTAAAAAATCTCCTCACAAATGAAATCTTTGTGTCTGCACCTATAAAATGTTT
CTCAGAGTCATCTCCTAATCTTATGTGGGGTCTACTACACGGAGAATCAGAACGTGTAGATTCTGAAGAA
AATATAGAAGCCTGCCTACGACATTTCAGAGATGATTGTGCATTAAACTTTTATGCTTCATCATCTTTTG
ATAACCAGGAAGGTTTAACTCCTGATCTTTGGAAAATGATCAACCAGACTATAAGCGATTTTAATGAAGA
AGATCGTTTTGTCTCTCTATCTGGTTTGCAGTATTTTGGAGAACCTGGCGAAGAGGGACTCCGACAGATT
CTCTATATAAAAGAGAATAAATCTTGTTCAAAGCATAAAGATTGCAAGATTGCCTCTTTATCCAAGCTGT
ATAAAAGCTCTTCGGGTCACGATATTATTTCGATCCCCTGTTTTACAGCATCAAAACAATATGGATTTAA
CTTCGATAATTTCCATCCAGAATTTGAGCGTGTTGTAGAAATCTATAATTCTTGGGGATGTTCAGAAAGA
ACAGAAAAAGAAGGAAATATCTTCCCTATCAAGGGAGCAGACTCCGAAGTCGCCTCAGGAACATTAATAG
AAGCGTTAAAACGTAACCTACGTTTTGGCTTTGTTGCTGGAGGCCTTGACGATCGTGGTATCTATGGTAA
ATTCTTCGATGCCAACCAACAGCAATATACTCCAGGGCTCACAGCCATTGTGTGTAACAAATACAATCGA
GATTCCCTGGTAGAAGCTTTATATCAGCGTCATTGTTATGCAACTACGGGGCCAAGAATTATTGTTAGCT
TTAACATTACCTCAGCTCCTATGGGTTCTGAGTTATCAACAACCACAAAACCTGGCCTTGCTGTAAATCG
TCATATCTCAGGATATGTTGCAGGAACAGATCAACTAAAAACCGTTGAGATTATCCGCAACGGGGAAGTG
ATCAAAACATTCCATCCCGATAGCAACAATCTAGATTATGAATATGATGATATGGAGCCTCTATCTAAAG
TAACTCTTAAGGATCCTAAAGGAAAAATTCCTTTTGCATTCTACTATCTCAGAGTAACGCAAGCGGACCA
ATCTATGGCATGGAGTTCCCCTATTTGGGTAGATCTTCATTAA
>ref|NC_003361.3|:c249176-248826 anti-anti-sigma factor [Chlamydophila caviae GPIC]
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TCTCTTCTCCGGAAGTACAAGAAAACATCTCACAATCCCTATCTTCAGGAATCAAAAATATCGTTCTTGA
TTGCACAAATTTAGACTATATGTCCAGTGCGGGCATTCGTGTCCTCTTACAAAGCTACCACCAAGTAGGA
AAACATTCCGGAAAAATCGTTCTTACCTGCGTTCCTAAAACAGTAGAACAAACTCTTTACGTTACCGGAT
TCCTCTCATATTTTAAAATGTTCAATAGCGTGCAGGAAGCATTACAAGCATTAAGCAAAGACGAAGATTG
A
>ref|NC_003361.3|:c250404-249292 CBS domain-containing protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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TCAAAACACACGATGAGAATGATGAACAGCGCTGTTCAAATACTCCGGCTCTTTTAGCCTCCGTATTACT
AAGTTTATACGGAATTTTAGGAACCACGATCTATTCTCAATATACATTCAAAACTAAAAGCGCATCCCTC
ACTTTTTGGGGAATGTATATACTCGCAGCCCCATTAGCTTATGGATTCCTTCCCTTCTGTATAAAACTCC
GTAAAGGGATTGTTTCCGCACTATGCTCTATTTCTTCTCTACTTCAAGCTTTCTTTTTCCCCTTCCAACG
TTCCATCAATAACAATGAAGACGATCCTAAAATTCATAGTTCAGAAATGGAAAATCAACTGTCAGAAGCC
GTATCGTCTTTTGATAAATTGATCGTTCGGGAAATTATGATTCCTAAAGTAGATATCTTTGCCATTCAAG
AAGACACGCCTATCTGCAATGCATTTCCAGCTATCGTAGAAGAAGGCTATAGCCGAATTCCTCTATATAA
GAAAAATATCGATAACATTACTGGAGTCCTTTTAGTAAAAGACTTGTTGGCAATGTACCCAAAATCTGTA
GATGCCTCCCAACCTGTCTCTTCAGTAGCTAAACCCCCGCTATACGCTCCAGAAATTAAGAAAGTCTCCT
CACTACTTCAAGAGTTTCGTCAGAAACATCGCCACTTGGCGATTATCGTCAATGAGTACGGAGTTACCGA
AGGCATCGTAAGTATGGAGGACATTATCGAAGAAATCTTCGGAGAGATTGCCGATGAGTATGATGTTCAA
GAAGATATTCCTTATAAAAAAGTTGGCAATGCTTGGATCGTAGATGGGCGTATGAATATCTCTGATGCAG
AGGAATACTTTAATCTAAAAATCCATCACGAAAATAGCTATGACACCTTAGGAGGCCACGTTTTTCATAA
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TCAGAACGTAGTGTAGGCAAACTCAAAATTACCCCACGAAAAAAGAAAATATCTCCTTCGTAA
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CGAAAAAATTAGTCCTTTATTGCTTACAACATTGGGAAGTTCATACGGATCAAGTATATATTTACTTTTT
AGATGATGAATCTTTAGCTCAACTTCATGACGAAGTATTTTCAGATCCTTCTCTAACAGATACCATTACT
TTACCTATAGATTCTCCAGGAACGTCTTCTCAACCTCACATTCTTGGTGAAGCTTTCATTAGCCCAAAAG
CTGCTATACGTTTTTTGAAAGATCGTGCAGAAGATTCTGATCTTCTATACGAAGAGATCTCTCGTTATGT
TATTCACTCTCTCCTGCATATGCTTGGATATGATGATCAAACTCCTGAAGAAAGAAAAAAAATGAGAGTT
AAAGAAAATCAAGCGCTATGTATGTTAAGAGAAAAACACGCGCTTTTATCAGATTAA
>ref|NC_003361.3|:c251063-250902 hypothetical protein CCA00236 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AACGGATAGACGTTTTACGTAAACTAGGCCGTTGGAATGATGTTACAGCAAAAAAAGCTACAGGCCTTCC
TAAAACTCCTGTAATGAAATAA
>ref|NC_003361.3|:c251242-251081 hypothetical protein CCA00237 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTACTCATCCAAAACCCGCTCCAAGAATCGCTTATAAGGCACATAAAAATGCTGTAAGCAATGAAAGTGT
TTTTATTCCGCAAATTAGTTAG
>ref|NC_003361.3|:c252025-251363 hypothetical protein CCA00238 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAAAACACTTTATTACAGGTCTGGTTATCCTCCTCCCTCTAGCAATCACCCTTGCTATTGTTGGAA
TGATCATAAATTTCCTTACGCAACCTTTTGTTGGCCTAGTTTCAGGATTTTTCGAACGCATTAGCTTTTA
TGCTAAACACAAAGCTCTATTAAAATTTGTTTTGCAAATCATCCTTTTGTTCGGATTATTCTTCGCTACC
GTCCTTTTGGGATTCCTTGCTCGTTTAATGATTTTTAAATCCCTGCTCTCTATTTATGATAAAATTCTTC
ATAAAATCCCTATTATAAAAACTGTTTATAAGGCTGCTCAACAAGTCATGACCACCATCTTCGGATCACA
ATCCGGATCGTTCAAACAAGTTGTTATGGTTCCCTTCCCTAATGCACAAACACGCTGCATCGGCCTCGTT
GCAGGAGACGCACCACACATTTGCTCAGATGATCCCGAAGATCCTATGATTACAGTGTTTATCCCCACAA
CACCTAACCCCACTTCAGGTTTTCTCACCCTTTTTAAAAAATCTGATATTACTTTCTTGGATATGAAAAT
CGAAGATGCATTCAAATATATTATCTCCTGTGGAGTGCTTACTTCAGGATCAAATACCTCCTGTTCTCCA
ATTACTGAAGCTCTAAGCAAAAATCCTCTGTAA
>ref|NC_003361.3|:c252783-252211 DNA-3-methyladenine glycosylase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCTTCCTGAAAGTTTCTTCCTACACGATGATGTTCTTCATCTAGCAAAAGAGTTACTAGGACACATTC
TCATAACGAAAATCTCAGGAAAAATAACTTCAGGATTTATTGTAGAAACAGAAGCGTATCGCGGACCGGA
TGATAAAGCCTGTCACGCCTATAACTATAGGAAAACAAAAAGAAATAGCCCTATGTATAGTCGTGGGGGT
ATTGCCTATATCTACCGTTGCTACGGTATGCATTCCTTATTCAACGTAGTAACCGCAAAGCAAGATCTCC
CCCACGCAGTATTGATTCGTGCTATCCTTCCTTATGAAGGAGAAGATATTATGATCCAAAGACGCCAATG
GCAAAATAAACCCAAACATCTACTCACCAACGGACCGGGGAAAGTATGCCAAGCTCTCAATCTTACCCTG
GAACACAATACCCATGCGCTTACCTCTCCCCATCTGCATATAAGCAAAGAGAAAGCCTCGGGGAGAATCA
CACAAACACCTCGAATAGGGATTGACTATGCTGAAGAATGCAAAGATCTTCCATGGAGATTCCTATTAAA
TATAAAAGATTGA
>ref|NC_003361.3|:c254819-252783 VacB/Rnb family exoribonuclease [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGGTGAAAAAAATAAGAAAAAGAAAACCCCAAGGCTTTAGAAGAAGCTCTAAGCAAATCTTAATTTCCG
GCGTCTTATTTGTTCACGCTAAGAAAGGCTTTGGATTTGTCACACCTGACCATCCTGAGGAGTACCCCTT
TGATATTTTTATTCCCGCAAGAGACCTTAAAGGTGCTCTAGATGGAGATCATGTTATCGTCTCTCTTTTC
CCAAATTCTAAAGAAGGAGAAAAAAGAAAAGGCATGATCCACCAAGTTGTTTCAAGAGGGAAGACAGTTC
TTGTAGGAACTATAACCTCAATAATTGATGGAACAACCGCTCTCGTTTGTGTTAATGCCTTAGGCCCAGA
TATTCCTGTAAAAGCAAAACTTCTCCCTAAACGTTCTTATAAACTTGGGGATCGTTTATTACTTAGCACC
CCCGCATGGAAGGAAAAACCCGAATCTAAAGAACCTCCTCCATTGGAAATGCTCGAATTTATCGGCAATA
TCTCCAATGCTAAAGCGGACTTCCCCTGCATAAAAGCTGAATACGCTATTGAAGAGGAATTTCCGGAAGC
TGTTATCGAAGAAACTAGCCATTTCTCACAAAAACATATCAACCAAGCTCTACGATCACGAAAAGACCTT
CGCGATCTCCTTTGCTTTACTATCGATTCGATAACTGCAAAAGATTTCGATGATGCCGTATCGCTAACTT
ATGACAATAATGACAACTATATTCTTGGCGTCCATATTGCAGACGTCTCTCACTACGTAACGCCACATTC
TGCTCTAGATCAAGAAGCAAGTAAAAGATGCAACTCTATCTACTTTCCTGGGAAAGTAATCCCCATGTTG
CCTTCAGCTCTTTCTGATAACCTTTGCAGCTTAAAACCCAACGTAGATAGGCTTGCTGTTTCTGTATTCA
TGACTTTCACTAAGGAAGGCCATTTATCCGATTACGAGGTATTTCGTAGCGTAATTCGCAGTAAATACCG
GATGACCTATGATGAAGTAGATGAGATTGTAGAAAATAAACAACCCCATCCTATATCAAAAACTCTCCTT
GCTATGGCAGAGTTAAGCGAAAAATTCGCAGATATTAGAGAAAAACGTGGGTGCATACGCCTTGTCCTAC
CCTCATTTACTATGGCTCTCGACAACCTACAAGAGCCTGTAGCTCTTATAGAAACACGACAAACGCTATC
GCATAAACTTATTGAAGAGTTTATGCTTAAAGCTAACGAAGTCATCGCCTACCATATTTCCCACCAGGGA
GTCACTCTACCATTTAGAATTCACGAATCTCCAAACGATGAAAGCCTACTTTCCTTCCAGGAAATGGCAA
AAGGTATGGGGTTTGATATTATTATGACCCCAGCTCAAGAACCCGATTACCAATATCTACTACAAGAAAG
CTCTGCAGGGCACCCTCTAGAAGCCATTCTACATTCACAGTTTGTCCGCAGCATGAAAACTGCCTCATAT
TCAACAGAAAATAAAGGCCATTACGGATTAAAACTCGACTTTTATACACACTTTACAAGCCCAATCCGTC
GTTATATCGATCTTGTTGTGCATAGACTGCTATTTCACCCCATGTCGATAGAAGAAACTCGCCTAGAACA
CATCGTACGAGCCTGTTCAACACAAGAACGCATAGCCGCAAAAGCTGAATTTGCTTTCGAAAATCTTAAA
AAGACCCGCTTCTTAGATAAGTTCTTAAAAGAACAACCTGAAACAATTTATAAAGGCTTCATTATCACAA
CAACTCCTGAAGGGATTTCCTTCACAGTTCCAGAGTTTTGCCAAGAAGGTTTCATCCCAGCAGCGCAATT
ACCTAAAGAATACTCCTTAAAAAAGAAAACCTCTCCCGATGATCTTCCAAGTAAAATGCGCCCCGGAGCA
ACTATAGAGGTCAAACTCTCGGAAGTAAATCTCCTCAATCAGGCAATTACTTGGTCGTTGGTTACAAAAA
CGCCAAAGAAAAGCGAGAAAAAATCATCCAATCCAGAAAAGAAACCCAGAACTAGAAGAAAAAGGAAAAC
AGAGTAA
>ref|NC_003361.3|:c256967-254973 molecular chaperone DnaK [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGTGAACAAAAAAAATCTAGTAAAATTATAGGGATAGACTTAGGAACAACAAACTCCTGCGTATCTG
TAATGGAAGGCGGGCAAGCTAAAGTCATTACCTCTTCAGAAGGAACACGTACAACACCTTCTATCGTAGC
ATTCAAAGGAAACGAAACCTTAGTAGGGATTCCTGCAAAAAGACAGGCTGTTACAAATCCTGAAAAAACC
TTAGCTTCTACAAAACGTTTCATTGGAAGAAAGCATTCCGAAGTAGAATCTGAAATTAAAACTGTACCCT
ACAAGGTGGCTTCAGGATCTAACGGTGATGTTGTCTTCCTAGTAGATGGGAAACAATACACTCCTGAAGA
AATTGGTGCTCAAGTTCTAATAAAGATGAAAGAAACTGCAGAAGCATATCTCGGAGAACCTGTTACAGAA
GCTGTCATTACCGTTCCTGCTTATTTCAATGATTCTCAAAGAGCTTCTACAAAAGACGCTGGACGCATCG
CCGGCTTAGACGTTAAACGTATTATTCCTGAACCAACAGCTGCGGCTCTTGCTTATGGAATTGATAAAGC
TGGTGATAAAAAAATTGCTGTTTTTGACCTTGGTGGAGGAACTTTCGATATCTCCATCTTAGAAATCGGT
GATGGCGTATTTGAAGTTCTCTCTACAAATGGGGACACCCATTTAGGAGGCGATGATTTCGATGAAGTTA
TCATTAAATGGATGATCGAAGAATTCAAAAAACAAGAAGGCATCGATCTCAGCAAAGATAATATGGCTCT
TCAAAGACTAAAAGATGCTGCTGAAAAGGCAAAAATAGAACTTTCGGGAGTATCTTCCACAGAGATTAAT
CAGCCATTTATCACTATGGATGCTAGTGGGCCTAAACACTTAACACTAACATTAACACGTGCACATTTTG
AAAAGCTGGCTTCTACTTTACTCGAGCGTACAAAAGCCCCATGTCAAAAGGCCTTAGCTGATGCAAAACT
CTCTGCAAGCGATATTGATGATGTCTTGCTTGTTGGAGGTATGTCAAGAATGCCTGCAGTTCAGGAAGTA
GTAAAATCTATCTTCGGTAAAGAGCCAAATAAAGGCGTAAACCCTGATGAAGTTGTTGCTATTGGAGCTG
CTATTCAAGGGGGCGTTCTTGGTGGCGAAGTAAAAGATGTTCTATTGCTTGACGTGATTCCTCTTTCCTT
AGGTATCGAAACTCTCGGAGGAGTGATGACCCCCCTCGTAGAGAGAAACACTACGATCCCTACGCAGAAA
AAACAAATTTTCTCAACAGCTGCAGATAACCAACCCGCAGTAACTATTGTTGTTTTACAAGGGGAACGCC
CCATGGCAAAAGACAATAAGGAAATTGGAAGATTTGACCTTACAGATATCCCTCCAGCACCTCGAGGACA
TCCTCAAATCGAAGTAACTTTCGATATCGATGCTAACGGGATTCTTCACGTATCTGCAAAAGATGCTGCT
AGCGGTCGTGAGCAAAAAATCCGCATCGAAGCAAGTTCAGGATTAAAAGAAGATGAAATCCAAAGAATGA
TCAACGATGCTGAGAAACACAAAGAAGAAGATAAAAAACGCCGCGAAGCTTCTGACGCAAGAAACGAAGC
TGACAGTATGATCTTCAGAGCTGAAAAAGCAATCAGTGATTATAAAGACAATATCCCTGAATCTTTAGTA
AAAGAAATTGAAGAGCGTATAGAAAAAGTTCGCACAGTTCTTAAAGAAGAGGCTCCTGTAGAGAAAATCA
AAGATGCTTCCGAAGAGCTTAGCCGTCATATGCAAAAGATAGGAGAAGCTATGCAATCGCAATCTGCATC
AGCTGCTGCATCTTCAGCTGCTAACGCTCAGGGTGGTCCCAATATCAATACAGAAGATTTGAAAAAACAT
AGCTTCAGCACAAAGCCACCTGCAGGAAATTCAGCTTCTTCAAACTCGAACAATGAGAACATCGAGGAAG
CGGATGTTGAAATCGTAGATAAACCTAACGATTAA
>ref|NC_003361.3|:c257561-256998 heat shock protein GrpE [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACAGATTCCTCTAATGAACATGAGACAGAAAATCCTTCTCTTCCTATCCCAGATAATGAGATTCAGG
ATCTCCAACAAGAAATAGCCACGCTAAAAGCAGAGCTAAAAGAAAAAAATGATAAATACTTAATGGTCCT
TGCGGAATCAGAAAATGCCCGCAAGCGTATGCAAAAAGAACGTCAAGAAATGATGCAGTATGCAGTCGAA
AATGCCCTTATAGACTTTTTAGTACCTATCGAAAGTATGGAGAAAGCTTTAGGATTTGCATCACAAATGT
CAGACGAAGTGAAAAATTGGGCATTAGGATTCAATATGATCCTACAACAATTTAAACAAGTTTTTGAAGA
GAAAGGCATTGTTGAATACTCCTCAGTAGGACAAAAATTTAATCCATTTTTACATGAAGCGGTGGAAACA
GAAGAAACAACAAAAGTCCCCGAAGGGACTATCGTGGAAGAATTTTCTAAAGGCTATAAAATCGGTGAGC
GTCCCATACGCGTTGCAAAAGTCAAGGTAGCAAAAGCTCCAGCGCCTCAAGAAAAAGAAGAAGTAGAAAA
ATAA
>ref|NC_003361.3|:c258718-257558 heat-inducible transcription repressor [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCCAGATCATGGATCTCGAAACGAGAGTCTAAGATTCTTTACATACTCTTAACGACGACAGAGCTGT
ATTTAAAAACAGGTCATCCGGTCGGATCAAAAACTTTGAAGGAATATGAAGGCTCCAATCTGAGTACAGC
AACTATTCGCAATTATTTTTCAGAGTTAGAGGCGGAAGGATTTTTAAAGAAAAATCACATCTCCGGAGGA
AGAATCCCTACGGATTTAGCTTTTCGTTATTATGTGGACCATTGTGCAGATTGTTCTCAGGATGAGCTTC
CTGAATCTACAATCAATCTGTTAAACCAGCTACCTGAAGAGAGCCAAAATATTGTTAAGGATTTACAAAA
GGCATCGGAACTCTTAGGAGAAGCCCTCCAACTTCCGACATGTTTCTCTTCACCGCGATTTGACAATGAC
TCTGTAACCAATATCCAGCTTTCTCTTGTAGATGAACAACGGGCTGTTGTGATTTTATCTACAGAATTTG
GTCAGATATTTACAGATACCCTATGGCTATCCGAAGCGTCAAATCCTGCTTCTTTAAAACGCATTGAAAT
ATTTCTTCAAAGTTATGTTCGTAAGCAATCTCCCATGGAGATTCTTTCACAAAAAGAAGAAGATATAGGA
ATGACCTTATACAACGAAGTCGTGGTACGGTATCTTACCCGCTACTGTAATTTCAGTGAGGAAGATCTAT
ATCAAACAGGATTATCAAAACTCCTAAGATATGAGTCTTTCAAAGATCCCGACATGCTAGCTTTAGGGTT
ATCATTTTTCGAAAACCGCCGCCATATGTGCAAGCTTTTAGATATTGGGATGCATAGAGACCGCCCTACA
GCATTTATAGGTAATGAGCTTTCTGATATTTTTAGAACCCCAAATCCACAATGTGCTGTGATTACGATTC
CTTATTACATGAACCGCACTCCATTAGGAGCCTTTGGCGTGCTAGGCCCTGTAAATCTTCCTTATAAGGA
GATTTTTAAAACCCTCACAATATTTGCAGATAAAATTAAAGCAAGCCTGACACAAAGTTTTTATAAGTTT
AAATTATCCTTCAGAAGACCTTGTCCTTCCGATCCTACACTCTCTAAAGAACCTACATTACTGGCAAGAT
ACTCTTCTATAAAACTGTTACCCCCTAAGGAGACATCATGA
>ref|NC_003361.3|:c260560-258827 prolyl-tRNA synthetase [Chlamydophila caviae GPIC]
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AACTTCTAGAAAAGGCTGGATACATTTTCAAGACAGCAAAAGGAATCTACACCTACACCCCGCTATTCTG
GCGTGTAGCTCTGAAAATGATGGATATCGTTCGCGAAGAGCTGAATGCTATTGGAGGTCAAGAACTTGTA
CTTCCTATTCTTCATCCCGCAGAGCTTTGGCAAAAGACAGGCCGTTGGGAAGCCTTTCGTTCCGAAGGCC
TACTCTATACCTTAACGGATAGAGAAGATAAGGAACTCTGTCTTGCCCCTACGCATGAAGAAGTCGTTTC
TATGTTTGTTTCTCAATGGCTATCAGGCAGGAAACAACTCCCCATCCATCTGTATCAAATTGCAACAAAA
TTCCGAGATGAAATCCGACCAAGATTCGGCTTGATGCGTGCTAGAGAATTCCTCATGGAGGATAGCTATA
CCTTCTCAGATTCTCCAGAACAGATGAATGAACAATACGCCAAGCTAAGACAAGCCTACCAAAACATCTT
CGATAGACTAGAAATTAAGTACGTTATCGTAGAAGCTGACGGAGGGAAAATCGGCAAGGGAAAATCGGAA
GAATTCCATGTTCTTTGCTCCCTAGGCGAAGACACTATTTGTGTGAGCGGCGCTTACGGCGCGAATATTG
AAGCTGCAGTTTCACAACCTCCACAATACACGTACGATAAAGAACATCTCCCTATAGAAGAAGTCGCCAC
ACCTGACGTACGCACCATGGAACATCTCCAAGATTTTTTCTCTCTTCCTTCCCACAAAATCATTAAGACT
CTTGTGGTAAAGCTCTCCTATGGAGAAAAAGACAAGTTTGTAGCTATAAGCATCCGAGGAGATCGTCAGA
TCAATCTGACTAAAATACGCTCTAAACTCAATGCCGATGAGTGCATTCTTGCTTCAGATGAAGAACTACA
ACAACATCTAGGAACTGAAAAAGGCTTTATTGGTCCTTTAAACTGTCCTATTGAACTCTATGCTGATGAA
ACTACACGCTGTATGACCAACTTCATCTGCGCAGGAAATACCAAAGACAAACACTATAAAAACGTCAACT
GGGATAGGGACATTCCACGACCTGAATATGGAGATTTTCTCCTTGCTGAAGCCGGAGACCTTTGTCCAGC
AAACGGCAATGCTCCTTATGAAGTCTTTGAAGGTGTAGAAGTTGCCCATATTTTCAATCTAGGCACACGC
TACACGGAATGTTTTGAAGTGGGCTTCCAAAACGAACAGGAAGAGCAACAAACCTGTTGGATGGGGACCT
ATGGCATTGGCATCGGCAGAACCCTAGCTGCCTGTATAGAACAACTTGCCGACGATCGTGGTATCGTCTG
GCCTAAAGCAATCGCTCCTTTTGATATCGCCATTCTCTATAACGGTGGTGATGCCGCATCTCAAGAAGCT
GCTGAAAAAATCTATAAAGATCTCCAAAATTACGGCTACGCTCCTCTATTAGATGATCGCAATGAAAGAC
TTGGATTTAAATTAAAGGATAGCGATCTTATTGGCATTCCGTATAAACTCATTCTCGGCAAGACTTTCCA
AAACTCCGGAGTCCTTGAAATAGAATCTCGGTCCAGAGAAAAGTTTTTCGTAGAACCAAAAGATTTTTTC
AATTGGTGTAAGAATTATTTCCCAAAACCTCGCGGTTTCTCTCCTATTTCTTAG
>ref|NC_003361.3|:260829-262043 hypothetical protein CCA00245 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATAATGCGGAGGCTTCTTCTAGGGATCAAGGAGAGGGTGCAGCCAGTGGGGTTACTGAGACGGGATTAAG
TGTGGATGTTGTGTCTACTGGACAGGTGTCGACCATAAGTCCTGCGATTAGTGGGATACAAAACATTGCC
AGTGAGATTATGGCTGTAGGTGTACCTACAGCTTTACCTCCAACATTACCCGAAGCTGCGGGTTTTGTTG
AAGAAGTCGCTACTGATTTCTTTGACGACGACGGTCTCAGTAGGGAAGATTCAGAGAATTTAGAGGAAGC
AGCTGCAGATTTATTTGCTGGTGTTAGTGAATCTAAAGAGCTAGTTGATGGTTTGAGAGGAAGACTAGCA
AACTTCCAGAAGACGCAACCGGGAACCACAAAGCAAACATCTAGAAAATCTCGACTTGAAGAAGGTGAAG
ATGTCCCAGATCTTGAAGAGCAGTTTCTTGACCTGCGTCGCAATTATGCTGTATTAAATGGTCGTGCGAA
CCAATTAGAAAGTAATACGTCTAGGTTCATGGCTGATTTAGCCAATATGCACCGTACATTAATGAATGTA
TCTTTGGAAGAATTTTACGGTATTTTCGGAGGTGAGTCTGATCGCTTCCGCGCAGACTTGCAAAGTCTGG
GGATAATTTATGACAACGGTGGTTGGAGAATTTATTCTCAAGGAGTGATTCCTAGATTAACTTTAGAGGC
TCAAAATCTGCGTACTGCTTTGGAAAATCTCTATATCCCAACAGAGGAAGAGTTCATAAAAGCAGCGACA
GAAGATATCTCTTGTTGTCGAGCTCTTATCAATAGATTAAAGGCACTATGGAATACGTTGGTGCAGATGT
TTCACGCTCTGTACGATAAGGCGCTATTTTACCTATTTTGGCTTGCGAAAAAGATTCGTAGGCAGCAGCC
TTTGACGAGTCAGGGTGAAAAAAATCCTAAATTTGAAAATCCTTTCGCATCTACTTCGGGGTCTACTGGG
GAGAGTGAAAGTACAGCTTCTGTAAGATCTTCAGTTTCTGGAAGAGGCGATATATCCGATGAGGAGATGA
TACGTCGTCCCGAAGATAACACTGTAGAAACTCAAGATGTTGATAATCAAGATGAGGAAAGCAGAGAAGA
CACCGAGGGCAATTCTCAAGATTAA
>ref|NC_003361.3|:262152-263093 hypothetical protein CCA00246 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GCCCTTTTGCGGATAAAAACACTACCTGCTCTCCTAAAAAGTATCTTCCTGTTGTAAGTCATCTTTTAGA
ACTTTGTGATTTGCCAGAGGTAGAAACCCCAGAGGAATTAGTAAAGGTAACTCAGCCTTTATTATTAACT
CGAGAGCAGCGTATGGCTGTGAATTTCGATTCTGTACCCTTAAAGGATGATCATGCTTTTTATAATGATC
TTTCTTTATTAAGAATGACGCAGGTAGTTCCTGCTTACGCAGCTACCTATGGTAGTGCGGTAATCTTTGG
CGGTACACTTATAAGTATTCGTCAGCGTTTAGATTTCCTTGTTCGTGAATGGCATCGCGGTGTACGTTTC
AAAAAGATCATTTTCCTCTCTGGAAAACGCGGGCGCTACGCTAAGGTTGAAAACCCTGATCAATTTTATG
ACAGCCGTCATAATCCCTTTCCTATAGAAGAGAATTGGAATCCTAGGGAACATAAGCTTCCTTCTTCAGA
AGATGAAATCGCTAGATTTGTTTGGTCGCAGATGGTCGTTCCTGCTTCTTGGAGAGATCCTTCAGGGAGT
GTTGAAGTAGAGTTTCTAGTTGCCGAGCCTGCAGAGGGGCAAGAATACGGAACACGTCATGATACATTAA
AAATTTTTCGTGCGTATCATGGAGATTGTTCCGAGCGTATTTTATTCGTCAGTAGCCAGCCTTTCATTCA
TTTAGACCGTTCCCGTGTTGTCAAGCACTTTGATAAGGAAAAGTATGACATTGCTGGTCCTGGATTTGCG
CAGGCGGTTTTAAAACATAACTGGGCTCCTAGAGTATGTCTACATTCTTTAGCTGCGTGGGTAGGTGAAA
CTAACGGCTATCTTGTACTATCTCAGGAGTAG
>ref|NC_003361.3|:263097-263375 hypothetical protein CCA00247 [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGAACGAGGAGTATTGGATTTTAGAGGTGAAGGTCACCCCAAAATCTAGGGAAAATAAAATCGTTGGAT
TTGAAGGTGAGGTATTAAAAATACGTGTCACCGAAGCTCCCGAAAAAGGAAAGGCTAACGAAGCAGTGAT
TGCTTTGTTAGCCAAAACTTTATCTCTTCCTAAACGTGATGTCACTTTGATTTCGGGAGAGACTTCTAGG
AAAAAAAGGCTCTTATTACCGAAGTCTACGGAATCGATAATTTCTCATTGGCGAGAACATGGACTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c264415-263372 hypothetical protein CCA00248 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATTCTTCGTAAAATTGCTCAATATGCTTTTTTCCTTTCCATTATCTGCTCCTTTATTTCTGTAGTTA
TCTCCTCGCCAAATCCAGAACAAGGATCTCCGAAAGTCGCTGTATTCTTATCTTTTCCCCATTCGATACT
CGAAGATTGCAGCCAAAGCTGTATAGATGTTTTAAAAACCTTAGACAACTGTCCAGAAGTTCTTGTTGTG
AACGCTGAAGACAGTGTTGTTAAGGCAAGAAAAATCGCACGCTCGTTGCATAGCAATCAAGATATTGTCG
CTATTGTTACCTTAGGCTCTATAGCGACAAAAATTATGAGCCAAATCGAAACAAAAAAGCCCATTATCTA
TGCTGCTGTTCCTGAAGGAGAAACATTAGCTTTCTCGAAAAAACAAACAAATATCTATGGTGTTAACGAT
ACCCTAGATATCAACCAATGTTGTTTTGCTATACAAGCTGTAAGAACAAATGCAGAATCTTTGATCTATA
TAAAGCCTTCAGAGCCCTTCCCCTCAGCACTACAAAAAGAAATTGAGAAGAAACTCCATGCTTCAGGAAT
CACTGTTACGGAAATTCCTGTAACGGCGACAAATTTCAAAACACGTATCCAACAAGCTATTGACAAACGT
CCCTCAGCAATTTTTATTCCCTTTTCCTCATTGGCTCATAAACAAAGAACAACATTTATCGAAGATATCC
TTAAAGAAAAAATTCCTGTAATTACTGATGATTTCTCTTTAGTAGCCGAAGGGGCTTGCGTTGCCTGTGG
TGTAGATTTTAAAAAATCTGGGAAACAAGCAGCTCAAATGGTCTATCATTTACTCAATCGCCATCAAGAT
ACCGAGGGATTACGAAAAATCATTGCTGAGCCCCTACCACAAACAACAACATTTAACGAAGATGTTATCC
GTCGTTTAGGCTTGAAAATCAACAGAACAGAACGTAAACAATTCCGCTCTATTATTTTTAAAGAAAATAA
AGATAAGAAAGCTGCTGTGAAAAGCGACAAACCTGAAGCTGAAAAAAACTGCGGCCCTGTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c265608-264421 L,L-diaminopimelate aminotransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
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GCGCTTTTCGTGAAGCACACCCTGACGTCTCTATTATAGACCTGTCTATAGGAGATACGACCCAACCGCT
GCACACAGCGGTCATGGACACCTTTACAAAATCTGTACAGAAGTTAGGGAATCCTGAAACCTACCGCGGC
TATGGTCCTGAGCTAGGCTTATCAACTTTAAGAGAAAAACTCTCTGAGGTGTTCTATCAGGGGAAAGTAT
CTCCTGAAGAGATTTTCATCTCAGACGGAGCAAAAATGGATATTTTCCGTCTGCTATCTCTATTTGGTCC
GGGGAAAACGATAGCGGTTCAAGATCCTTCCTACCCTGTGTATATCGATACAGCCCTCCTTGCAGGAGCA
AAAAAGGTTATTAAACTTCCCTGTAGAAAAGAAACTGATTTCTTTCCTGTGATTCCTCAAGGAGAGGAGA
TTGATATTTTCTGTTTATGCTCTCCTAACAATCCCACGGGAACTGTATTGACTAAAGAGCAGCTCGAAGA
ACTTATCACCTATGCAAACTCTCACGGAAGTATCATTCTCTTTGATGCTGCCTATAGCGCATTCATCTCT
GATCCTTCCTTACCAAAAAGTATCTTTGAGATTCCTGAAGCACGTTCTTGCGCTATAGAAATTAACTCTT
TCTCTAAGTCTTTAGGGTTTTCAGGAGTGCGTTTGGGATGGAATGTTGTTCCCAAAGACCTGCGCTATAG
CAATGGTCTTCCTATAATTGACGATTGGAAACGTTTCCTGCATACGACGTTTAATGGGGCTTCTTTACCC
GTTCAAGAAGCCGCAATTACTGGGGCTTCTTTATTTCCAAATTTAGAGGCTATTGCCCATTATCGCCACA
ACAGTTCACTATTGCGTGAGGCTTTACAAAAAGCTGAGTTTTCTGTGTACGGAGGTGAACACGCTCCCTA
TCTTTGGGTTGAAGTCCCTAAAATCCTCCCCGATGAAGATTTTTTTGACTTTTTCTTAACTCAGTATCAT
ATTGCCATCACTCCTGGTAAAGGATTTGGCGCGTGTGGAAAAGGCTATGTTCGTTTTTCTTCTTTAGGGA
AAATTGAAGACATTATGGCAGCTTGCCAACGGTTAACTCTAACATCTGTATATGATAGAATGGTGTAG
>ref|NC_003361.3|:265877-266767 hypothetical protein CCA00250 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATCCTCTTCGCGGCGTAGGGGAAGGCTCAAAGTTTACAAGAAGGGGTGCTGTTCGGAAAAAGGGTGTGCG
CGGTGCTTCGGGATATCTTGAGTCTAGGGTAGGCAAAGCAGGAGATAAAAAAGCTCAGGCAGCTGCTGCT
AAGATGTCAGGATTTGGGAAGGCGATTAAGGAAACTGGGGAAAAGGCTGCTGCGGCTGTGAGGGGCGCCG
TGGGTGGAGTGAAGGAAAAAATTATTAAAACAGCAAAGGATTTGAAGGGGAAATTTCAAGAAAAGGTTGA
CGGGAAGAAAGAGAAGTCGGCTCCTGAACAAATGAAAGCCCTTGCTAAAGAGGCAAAGGAGAAGGTGGAG
AAATTGGTTTCTCTAGGGAAGAGAGGGAGTACAGGGGAGTCCTCAGAGGGCCCTGTTTTCAAAATCCCTA
GACCTGAAATTAACCTAGAAGGGGCGTCTACCTTTAGCCCAGATTTAGGTGCTATAGTCGGGCGGAAGCC
GGTAAAAATTCCTAGAGCGAAAGTGCCAACGGGCAAAGGGGGTTCTAAAGTAGGGAAGCTTGCGGCAGGT
TTGAAACGAAGTGCAAGGTCGGGTGGTATAAGAAGGAAGGGACCTAAGTTTGGTCCGGATTTAACCAAAG
TCAGTCCTGAAAAGTTCATATTCCCCAGAGCTAAGGTCGGTGGTGATGGGACCACGAAAACCGAGGCACC
AAGAAAATCTGAGCGTTTAGAGGGGAAGAAAAATAAGGGAATTCTTAAACAACCTGGAAAACCTAAAACA
GGGGATAAGGGAGTGCGTTGGGCCGATCAGGAGAACAAGCCTCTTGAATAA
>ref|NC_003361.3|:266873-266971 hypothetical protein CCA00251 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TAGAGGGTTCTCAGGCGGGCTTTTCCTGA
>ref|NC_003361.3|:267287-268528 hypothetical protein CCA00252 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTTGTTTAACTGCTGGAGCTCAAGAAACCGCGCGTTGTCCTGATTGTGAGAATTTTAGAAAGTCCGTTAC
GCGCTCGGATCAATTACCAGAAAATATTCAAGAATCTGAAAATGGTTGTTATCTTACGGGATATGTACAA
GCTCTCGTGGATATGCATTTTTTAGATAGCTGTACTCAGGTAGTTGTTGAAGATCATGTTGCCTATGTAT
TTTCCCTTCCTGTAGATACTGTCCTTTCCAGTGCGATTATAGATTTTATTAAAGATCTACCTTGCATTAC
GGCTGTAGAAATTTGCGATAGCTCATATCAAGAGTGTCGCAATCGCTATAGAGAGGGTTGTCCCTTATTG
CCAAAGCAGAGAGCTTTAGGAACGGAGATTGTCTGTGGTAAGGAGGGGGTATGGCTGCCTCAAAATACTA
TACTTTTTGCTCCGTTAATTGCCGATCCTCGTCAGGTAACAAATAGTGCGGGAATTCGTTTTAATGAGAA
GGTTATAGGGAATCGCGTAGGTTCTGCTATTTTTGGTGGAGATTTCATTCTCCTCCGTCTTTTTGATATT
TCTCGATTTCATGGAGATTTGGACGTTGGTATTCAAGGTGGAGTCTTTTCTGTTTTTGATTTAGATCACC
CTGAATCCTGTATGGTCAACTCGGACTTTTTCGTTGCAGGTTTGTTAGGATTTGCCGTGGATAGATGGAG
TTTCCGTTTGCGTCTTTGGCATCTTTCCTCACATTTAGGAGATGAGTTTCTTCTGAGCCATCCGAACTTC
CCAAGGTTTAACCTTAGTGATGAGGGAATCGATTTCTTTGCTTCTTTACGCTATAATGCCCAGATCCGTG
TTTATGGAGGTTTAGGCTATATCATTAGTCGAGATCTCTCCTTTCCTGAACGTCCGTTATATATAGAGGC
GGGAGCAGAATTACGTCCTTTCGGATTGCGAGAGGGAAATTTGCATGCTCAACCTATTTTCGCTATGCAT
TTTCGCTTCTGGGAAGAGCAACATTTTGGCATAGATCAAACCTATATCTTAGGTATGGAATGGTCAAAAT
TCCGCGATGTGGGAAGAAAAATCCGTGCGTTCGTTGAATATCACCAAGGCTTCTCTAAAGAAGGTCAGTT
TGTGCGAGAGCCGTGTAATTACTACGGCTTTCGCTTAACCTACGGTTTCTAA
>ref|NC_003361.3|:c270614-268530 hypothetical protein CCA00253 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTATAGTTTATTCCACAGGAACCATGATGCAACTTCTCCTGATGGGTATCTAACCTCTCCCCTACGCA
TGCTTTCGCCTAATACCTATGAAGGAGAAATAGAAATACTAAATATCCCCGAGTACTTCTTGGGTTTTCA
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TAGCCTCTGTTATGCTTACCTTGTTAGAACCTGGAGACTATATTGCCAAGTTATTTGCTTCTGATGATCG
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TTCCTACACTTCCTGGCGTGATTCACTACGATCATAAAATTTATGGTTTATTGCCTCTAATAGGAAAAGC
ATTAGGCCAACCCAACATGAGAGTAAGAAATTTCCTTTCTCTATATCAGCATAAAGTAGAACGTGAAAAA
CTCCCCTTACGCGATCGTATTTTACTTATAAAAACCGAGCCCTTACATATCCGCACGGTATTCGCTCGCG
TTGTAGATTCCCTCCTTCCTGAAGGAGTACGACATACTGCGGCAAATATTTTAGAGCCCACAACACAAGA
ATCTGGGGATATCTACGAATTTTATGGAACAAGCTCAGTCCCTGTAGAAACCATTCCTCTAGAATTCTTC
ACTATAGAGCCATATAAAGAACATTCTTTCTTCTGTTATCGTGATTTACTCAAATCTTCTTTAGAATCTG
AACAATGTATTTTTGATATTTTCAAAACGACACCAGGAGACCAAGAAAAAGCAGCAACATTTATTTCTAA
GGGCAGTGAAATCTCCGAACTATCACAAGATTCCTGGTTAGTAGGATCGGCAAAATCTCTATACGATAAA
AAAGAATCCCAGCCTGAGAATCTTCAAGAATACATAGAGGAACAACCCTGCTTCCCCTTCCTGCAAGCTA
TGGAAACAGGACATATCACAAGTCAGGGAGTGCTTTTCTCTAGATATTTCCCTTCTGCCTGTCTTAAAGG
CATGTTGCTTTCTTATCATGTAAACTATTATCTCAAGCAAATCTATTTCCAAATACCCTCTTACACCTAT
GGAGAGTACTTCTCTGAACATGACCGCTCCTTGCTTATGGATTTATACTTTGCAGGCATTCCTACATTTT
GGGTGGATAGAGTCTCTAAACGCGTTTTACAATATGTAAAACGTCGTGGGGAAAATACAGGGATGTTTGT
CCCCACCCAACGTGTTCAACAATTTCGCTCTGCCTATTTTATTGGGATTCACGGCTCGTGTATTGTTTCA
GAAGGGTATAAAGAAGACCTCCGAGCATTTTTAAAAGGGATTAACGATCTTACCCAATCCATGCCTATTC
CTGGATTTCCCCCCAATACTCCTTTAGCGATTATGACAGGAGGCGGTCCGGGAGCCATGGCTGTAGGGAA
TGAAGTTGCCATGGAACTCAATCTTCTCTCATGCGGCAACATTATAGATTTTGAGGAATCTCCGGGAGCC
CCTCAAGCTGCAAATCCCTATATACAAGCAAAAATGACCTACCGCCTCTCTTCTTTAATTCAACGTCAAG
AACACTTCCATGTTGATCTTGCTTTATTTGTTACCGGAGGAATGGGGACAGATTTTGAATTTGCTCTTGA
GCTTGTCAGTATAAAAACAGGGAAGAAACCCCCAGTTCCTATATTCCTAATCGGGCCAGCATCCTATTGG
AAAGAAAAAGTGACTCCTGTATATCAAAGCAATTGCAAATCAGGAACCAATCGCGGTTCGGAATGGGTAA
GCAATTGCGTATTTTGTATTTCCACTCCCCAAGCAGGAATCGAAATTTTCAGAAGATATCTCAATAATAG
ACTACCCATAGGACCGGAACATCCTCCTTATCCTGATGGATTCATAGAGGTATAA
>ref|NC_003361.3|:270755-271633 hypothetical protein CCA00254 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGGAAATATGCGAATTCCAAGAAGCGTTGGTACCCACGACGGTTCTTTTCATGCTGATGAGGTTACAG
CGTGTGCCTTGCTTATTTTGTTTGATCTTGTTGATGAAGGGAAGATCATCCGTACACGAAATCCTGAGAA
ACTCGCAGAATGCGAGTATGTATGCGATGTCGGGGGTATCTATTCTTTAGAGGAGAAAAGATTTGACCAT
CACCAAGTTTCCTACGAGGGACCTTGGAGTAGTGCAGGCATGATATTAAATTATCTGAAAGAACAAAGAC
TGATGAGTTTGGAAGAGTATCATTTTCTAAATCAGACGTTAATTCATGGTGTTGATGAACAAGACAATGG
AAGGTTTTTTTCAAAAGAAGGCTTCTGTTCTTTTTCCGATATCATTAAAATATACAATCCTGAAGAAGGC
AAGAATTCTTCGGATGCAGACTTCTTTTTCGCCCTAAAATTTACTATGGATTTACTGAAGCGTTTGAGAA
GTAAGTTCCGCTATGATCGCATGTGTAGAGATGTTGTCAGATCTGCCATGGAAAAAGATGAGTTCTGTTT
GTTTTTCGACCGTCCTTTAGCATGGCAAGAGAATTTCTTTTTTTTAGGAGGAGAGCAGCATACCGCAGCG
TTTGTCTGTTTCCCAGCCTGTGATCAATGGATTCTTAGAGGCATTCCGCCTACCTTGGATAGACGCATGG
AAGTGCGTGTTCCCTTCCCAGAAAGTTGGGCAGGACTTCTTGGTAAAGATCTCGAAGAGGTCAGTGGGAT
TCCTGGAGCTATTTTTTGCCATAAGGGGCTCTTTCTATCCGTTTGGGATAGCAAAGAACATTGTCGACGT
GCCTTGCAATTGGTATTAGAAAATCGAGGATTAGTGTGA
>ref|NC_003361.3|:271630-271962 HIT family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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TAGCTATTAAAGATCGCTTTCCCCAGGCTGCTGTTCATTTATTAATTATTCCTAAGAAGCACATCGAAAG
AGTGCAAGATATGCAAGAAGAGGATTTACCTTTACTTGCTGAAGCAGGAAAAATTATTCAGCAATTGGCA
GAAACTTTTGGTATTGCTGATGGATATCGTGTCGTGATCAATAACGGTATTGAAGGGGGACAGAGCGTAT
TCCATTTACATATTCATCTTTTAGGCGGAAGTGCCTTAGGGGCTATTGCTTAG
>ref|NC_003361.3|:271986-273623 hypothetical protein CCA00256 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTAAGACGCTATTGTCTTCTTCCGAGTGTTCACTTTCTGAAACGCGTCTTGCCTTGCGGGCATTAGCACA
GGGAAAGGATTATACAGCCTGGAATCAGGAATTTAATAAATCTCGGCAACGCTATCCACAACTTGCTAAA
GATCGTGATACTTTAGAAGATTTTTCCCAACAAATTCTCCGCGATGGGATCTCGCATCCTTCCATGACAG
TCCGTGCTGTGAGTATTCTTGCTGTAGGCCTCGCTAGAGATTTCCGTTTAGTTCCCTTAGTGTTAACGAG
TCTTTCTGATGATAGTGTCGTCGTGCGTACATTAGCTTTGCAAGTAGTTTTGCACTATGGAACGCAAAGT
TTAAAAGATGCTGTTTGTGCCATTGCTCGTCATGATGAATCTATGCAAGTGCGGATAACGGCATACCAAA
TTGCTGCGATGTTAGCGATTGAAGAACTCCTTCCTTGTCTTAAAGAACGGGCAAATAACAAGCTTATTGA
TGGGGAGGAGCGTAGGGAAGCGTGGAAAGCCTCTTTGATGCTTACCCCGCAACTGCTCACAGGATCTAAA
GTAAAAGAAGATATGGACCAGGCACTATTTGCCTGCGAGCTTTTAAGCCACGAAGGAGACGGAAAAGATG
AAGAGGTCCTCTTAGATTTGCTATCTATTCAGTATCCTGAAGTGCAAGAGACGGCGTTGCGTGCTGCTTT
GGCTTGCGGACGCGAGGTGAGCTGTGAATCTAAGAAAGTGGCGGATCAGGTGCGCCACATCGCACAAACA
TCACCATTTCCTAAAGTGCGTTTGCAAGCAGCAGCCGTACTCTATCTTCAAGGAAACTCTTTAGGAGAGG
AGCTTTTGGTTCAAGGTTTACAATCTTCTTTTGCTTCTATTTGTGAAGCGGCTTCTGCTGCGGTGTGTTC
TTTAGGGATACGCGGCAAAGATCTTGCCGATAGGTATCTGCATGTTGTGACATCTAGAAAGGCTGCAGCA
GATCTTGCAATTTTACTTCTCGTGAGTCGTACAAATGTAGAAAAAGCAGGAGATGTCCTTGCTGAGTTTA
TCAGCGATCCTGAAATGTGCTGGGCTATAGAACAGTTTCTTTGGGATTCACAATGGAATCCTAAAAGCAC
AGCTCTTCCTCTCTACTTTGATATGGTGAAAAGGGAAATTGGTAGGAAGCTTATCTGCCTACTTGCCGTA
GCAAAATACAGTAAGGTAAAGAAAGTCACGGAAGACTTTCTTGCTAACCGTCAGCAGCAAGGATGGAGTT
TTTTTGCAGGTGTGTTTTGGGAAGAAGGAGATGAACAAGCAGCTCAGGAATGGACAACAGATAAGAGCTT
TGCCTCTAAATTAGAATCTACATTAGCTACGCTATGTCAGAAAAAAAATAGCGAGTCCTTACATACAGCT
ATAGATCTCTATCCTAAAAGTCGTTGGCAAGACAAACTCGCTATCTTAGAAGGCATAGCATTTTCCGAGA
ATACAGAGGCTATAGATTTTCTTCTTGAGTGCTGCTATCACGAAACCCCTTCGCTACGTTGCGCAGCCGC
AGGGGTTTTATTCGCTTTATTTAAGTAA
>ref|NC_003361.3|:c273875-273612 hypothetical protein CCA00257 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTGTTGATAGTTTTTTAGAAGTTTTAGAAAATCAGTGTAAATCTTTCTTTTCTAAGGAAGAGTGTGATCG
TGCCCTATCTTCATTAATTGAAGATTTACAGAGGTATAAAGACAATCTCGATACTGTAGCTAATGATCCC
TCGAATCCTTTAGATAATCTCGTCAAGCTGACGGAAGCGGATTTACTTAAATAA
>ref|NC_003361.3|:274233-275567 sodium/pantothenate symporter, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATTTTGGGTTATTTTTAGGTTGTTTGCTTGGCGTTCAGGCCTTTTGTTTATTTGTAGGTCGTCAGG
GCGGTTCTGCAATTCAAGATCGCGATAAGTACTTTCTTGCGGGAAGAAGTTTAAAAACGTTTTCATTAAC
GATGACGTTTATTGCTACGCAAATTGGTGGTGGGGTCTTACTTGGTGCTGCTGAGGAAGCAGCACGTTAT
GGTTATGCGGTAATCTTATATCCTTTAGGTGTGGCTTTAGGGTTGATATTCCTTGGTGTAGGTCCGGGAA
AGAAACTAGCCTCTGGATCTATAGTGACTGTGGTGACACTTTTCGAAAGTGTTTACAAGTCGAAAAAGCT
ACGTAAAATGGCCTTTCTTCTTTCAGCACTATCGTTATTTTTTATTCTGGTAGCCCAGATTATTGCTTTA
GATAAATTGTTCAACGTTTTGCCCTATGGTAAGTACCTTACCGCTATTTTTTGGATAACGTTGGTATTTT
ACACATCTACAGGGGGCTTTCGTGGTGTCGTAAGAACAGATATTATTCAGGCAATTTTTCTTCTTATTGC
TGTGATTACTTGTGCAATTTCTGTTTGGTACCGTTCTTCTGAGTTTACCCCTATACTTTCCAATGCGGTA
TTCGAGCCTTTGCCAACAAGTAAACTCCCGGGGTGGATTTTCATGCCTATGGTGTTTATGATTGTTGAGC
AAGACATGGCACAACGTTGCGTAGCGGCATCATCACCGCGACGTTTGCAAATTGCTGCGATACTTGCGGG
CAGTGTAATTTTGCTATTTAATTTCATCCCGCTATTTTTAGGCTCTCTAGGAGCAAAACTTGGCATTGCT
CAAGGTTGCGTGCTTATTGATACTGTAGCTTATATTAGCGGTCCATCACTAGCAGCTGTTATGGCAGCAG
CTATTGGTATCGCGATACTTTCTACTGCAGATTCCTTGATTAGCGCTGTTGCTCAGCTTGTCAGCGAGGA
AGTCCCTCAGATATCTTCGATAAACTATCGTTATTTGATTTGTATTATTGCGGTGTTGGCGCCTCTTACT
GCTATGGGCTTTAGCAATATCGTAGATTTGCTGATGTTAAGCTATAGCCTGTCCGTATGCTGTCTTTCCG
TCCCCATAGGTGCTGCTCTTCTTACGCGTTATCAAGCTAGCACAGCGGCAGCTTGGGCAGCAGTACTTAT
AGGTGCAGGTGTCTATAGCTGTGGGTATGTTATCACAATTCCTTTCTCCAGGGATTTGATTTCTTGGTTA
TGTTCATTGCTCGCGTTTGTCTTTGTTGAAATTCTCTACGTATACAGCAGGAAGCCTTCAGAAAGGGAAG
CGTAA
>ref|NC_003361.3|:c275862-275668 hypothetical protein CCA00259 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTAACACAAACATGCAAGCTCTATCTTCTACAATGTCTATTTTACGCCTTATATTGGCTAATTTACT
ATTGTAGAAAATTACTCAGAGGCATCTCCGATCATTCCGATGAACCTTTGTTCCAAGCCTTCCTATCCTC
TCTTATAGATCTTCTTTCTAGCTTAAAACAACTTCCGAACCTTGACGTAAGATAA
>ref|NC_003361.3|:c276925-276074 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTTTCCTATCTTCAGAAATATCCGTAGGAGGAGGCTCTCCGCTTCTCATTGCGGGTCCTTGCACTCTAGA
AAGCTACCAGCATACGGTAGCTATAGGTCTTGCAGCTAAAGCAGCAGGAGCTACGGTACTGCGAGGCTCA
GTAAGAAAGCCTAGAACCAGCCCCTACTCTTTTCAGGGATGGGAAAAAGAACGGGTGATCTGGCATAAAG
AAGCGCAACGTATTCACGGATTACTTACAGAAACAGAAGTTTTAGACGTCAGGGATGTGGAAATCACAGC
AGAAAATGTCGATATCCTTCGTATAGGGGCAAGAAATATGCAAAACTTTGTTTTGCTTCAGGAAGCTAGT
CGCAGTCACCGTCCCATTATTCTTAAACGTCATCCATCAGCAACTATAGAAGAATGGCTATCCTCAGCTG
AATATATTCTTAATTCTCCGACATGTCCTGGAGTCATTCTCTGTGAGCGCGGCATACGCACTTTTGAAAT
GTCTACACGCTACACACTAGATCTCAATACGGTTGCCCTACTGAAAGAGATCTGCCCTCTTCCTGTAATT
GTGGATCCCTCCCACGCTGCTGGAAAACGCTCGTTAGTCGTTCCCCTTGCAAAAGCTGCTATGGCGGCAG
GAGCCGATGGATTGATCATAGAAATGCACGAGTGTCCAGAAAAAGCTCTTTGTGATGGGAAACAGCACGT
CACTCCCGAAGAACTTACAGATTTATTCTCCTCTATCAGAAAAGAAGACGCGGCCCCTATGTATCAAGAA
ATAGGGGGATAA
>ref|NC_003361.3|:c280075-276941 hypothetical protein CCA00261 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CCAATCCGCAAGACCCTTTGTCTATTAGAGTCTTAAGGTTGGTTGCTTATGTGCTACTGCATATCATTAC
ACTGGGTCTCCTTCTGCTTCTCCATTATTGCACGCATCATGCAAGAGATAAGACCGCTAGACCCATTATC
CCTGTACAACCCCAGTCACCTTCACCGACGACATCCCCAACATCATCTCCAAGAGTTTCCCCACTATCTT
CACCTGCACCCTCTCCGCTCTTACCAAGAAGCCCAACCCAGCAACCTCCTCAAGAGCCAGCGACGCAACA
ACGGGCTGATACACGACAGGTGCCACCACCAGCAGATACCACCCCTCCTCCCGCACAACAACCCGCGGCT
CCGGCTCCACAGCCTCAACACCCTCCCGTTACCAAGGCCTCATTAGATCTCCCCCCAGCGGCGCCGGCCC
CTAGCCCAGTGCCGGGATTACCTTCGCTAACTGAAATCATAGACAGCATGCAGGGATTAGGCGTTGTGCC
TGCGGGTGTGGATAGAAAATCCTTAGAAGCTATGGTAAACTTTAACGAACAGGGACTATCTCCAAATAGT
GCACGTTTAACTATCACTGCGGCACAAATCCTGAATCCCCTATTCGTGGCTACCTATCCTAAACGTATCC
AATCGCATTTCCAAATGATAATGAGGGATCTGGAACATAGCATCCAAACAGGAAATCCTCAGAATGAAGA
CGTCCAAGTTGCCAAGCTACAGTTAAGTCAGTTAAAACACTTGAATGAACATTATTATCTCGTTGATGTT
CCTGGAGATGGGAACTGTTTTTACCGTTCTTTCCACATAGGTTGGATGTCTTCTTTGATGCGCTCCAGAG
ATCCTCAAGCATTCGAAAATGAAGCTCAGCGTATTTTAGGACTCCCTTTTGCACGATCATCAGCAAGAAA
CCGCTTATTGTCTCAGCAAATGGCTACGGTTATCCGCTCTTGCCAACACTATCAAAATATCAAGGACCTA
TACGATAACGTTCTTCTTTCTCCACTGCATACCCCTATAGCGATTTCTTACTTAAAGAATCTCGCTCTTT
TCACTATGGATGAAAACCGTATAACTAGTCTGGGGGGAGAAGATAACGTCAGGGCTTTAATCTTGGGTCA
GATGACGGAAGCTCCGGAGATGTTGGCGGACTCGCTGAAAAAAATCATCCAAACACAACCATCTAGCCCA
ATTTTAAATCATATCTTCCGTGGCAATGTATTGCCAATAACAGGAGCTGCTGATCAGTGTTCTCTCGCTT
TGGAATTCCTATCCCAGCTCCTCCTCAATGATCAAGATGTTCAACAATTACCCCAGGAACAACAGCAAGC
AGCTGCGCAGCTTCAAGCATCATTAAATGAGCTTATCGACGTTGCATCAACGGTTTTAGTTTCTGGAGAT
TTAACTGAAACAAATGTTGCTCCTATTATACGAAATCTTCCCCGAGAAATTCGAGGCCACTACAGAAAAT
TCTCCCAGGCAATTACTGAGAAAAGGCCTAACCCTCCTTTAGCTACATCATTAATCCTTCTTTCTTTCCT
TCTTTCTCATCCCTCATGTGTAGCGAATAATGCCGTGTGCTCTGACTTCTTAACACAAGCACAAGCTCTC
CTCAAAAATACTTTAGGGGATGAACAATCCCTAGTAGGATTTTTAGGATGGCGTGGGGAAAAAGCCTCGG
CACTTGATGCGAAGCTAAAAAGCTCCTGGAAGCAAAAACAGGCTGGCAGCCTGATTGAGGTTGCCCTAGG
TCTTTGTGACGGATTTAAATCTTCAAGTACTATTACACAATTAGGTCTTACCTATAGAATTATTGCTAAG
TTAATGCAAATCACGCCACAGACTCTTTCTGAGGCACAGTTGCGCACCTCCTTAGATGCTATTTTAGCGC
ATATCTATCAAAATACAAACTTAGCTATGTCGTATCTTGAAATGACCGAATCTCAGATATTTAAAGGATT
ACCTTTAGAGGCCTCGGCGAATTCTCAAGATAAGGTGTATGCGGAAGGAATAAAGATGTTCTTCTTCCTA
TTGCAATACCCCTCTTTACTTCAAAATTTGGTTACTGCAAAGGATGCAAAACAGATTATGCTGCTTTTTC
AACCGCATCTGCAACAAGCCTTGAGAAAGAATATCAATACGCATCGCGTGCTGTCTACAGGAAGCAGTAT
TTTCGGAACCTTCTGTTGGTCCGGTCCGACATTTGGAGATGACGTTACCCCTCAAACTATTGAAGCTATA
CTAGCCTTCTTAGCTAAGGATCCTGCAGCGCTTTCTCTTTGCCCGACCATGAGAAACGACTTCTTCCAAA
TTATGAACTCAGGGAATCCGGAAAAAACTTCTGCGTTAGTCCAAGAAGTACGGACAAACTATCCTGAGCT
ATGGGCAGATTTTATTCAGCATTTGGATATCGTAGGTCACAGAGCTACGCCTCAAAATGCGAGTAGACCA
TTTAGCCAAACGCTCACTTTGGACATCTTACTCTATAGTTTCTTAAGTACTTATCCTCAGATATTAGAAG
ACAATACAGAGGTCACGACCAGGTTAACCACCTACATCTCTGAGCAAACGACACGCATTAAAACGAGCAT
TGTAGAGGACTTTCACCGCTGGAATCTATTATTCTGGGCAAACCTTGAAAAAATCATTACCTATAACAAT
TTACAAAAAGTCTTCCTATTTTCCTTAGTGCGTAGAGGAAATGCCTATCCAGAAGCCTCGCAATCCTTCA
TCCATGATCTCAATACTATGGACATTCACGAGCTGATGCGGATGTTTAACTCTGTAAATACGCAAGCGGA
AGACGAGCATATTAGCGCCATTTCTTCTGCTTTAGGTTCTTTAGCGCTTTGTCAATACCTAGCAGATGGA
AGTTTAACACAAACGGTACGCCAATTAACACCGTTGGCAAATAACCATGGTTTCTTCCAGACGGACTATG
CCTCAGAACAACAAGCAGGAATTTTTGTTCTACATGCTAATAACCACTACAACTGTTTATTACCAAAAGA
TGCTAGCGACACTACGAGAACGACGCATCCTGGAACCCCACCGAATCAACCATAA
>ref|NC_003361.3|:280211-280990 amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTTCCTCTAATAATAGGGATAAACTTTGGATAGTGGGAACGAACGCCACTTACCCTCCTTTTGAGTTTAT
CGATGAGAATGGGAAAGTCGTGGGTTTCGACATAGACCTTGCTGAAGCTATCAGCAAAAAACTAGATAAA
CAGTTAAAAGTTACAGAGTTCTCTTTTGACGCTTTAATTTTAAATCTAAAAAAACACCGTATAGACGCTA
TTTTGGCAGGAATGTCGATTACTAGATCGCGTCAAAAAGAAATCGCTATGATTCCTTATCATGGAGAAGG
TGTTTGTCAGTTGACTGTCATATCTAAACAACCCTTAAGTAAAGAAGATATTCTTCCTTTATCTAAACAC
TCCTCAGTTGCTGTGCAAACAGGAACCTTCCATGAAGATTACCTACTATCTTTGTCAGGAGTGAAAGTAC
GTTCTTTCGATAGCACTTTAGAGGTGTTGATGGAGGTTGGTTCTAAAAAATCTCCTGTGGCAGTTCTTGA
GCCTTCCGTTGCTCGTGTAGTATTGAAAGAGTTCCCTGATTTATATACGACAACTATAGACCTTCCTGAA
GATTGGTGGGTTTTAGGTTGTGGTTTGGGAATAGCAAAAGATCGCCCCGAACATTTAGAAGAAGTTCAAA
AGGCTTTGGATGAGCTGCAAGCAGAGGGAGTAGTCCGAGAATTAGAAAAGAAATGGGGCTTAGATCAAAA
GAAGTTTTAA
>ref|NC_003361.3|:281198-281902 hypothetical protein CCA00263 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTGGTTCCTTCCCGTGCTATCCTGGTTTTAAGGATAGTGCCCAGTATGCCAACACGCATTTTTATT
GTTCTTCTTGCAAGAGTGTTGCCCAACCCACCGAGGTTTCTGTTCTTGTTGTGGGTAGTGATGGGCATCC
TAGTGGTGTGGCTCCCGTTTTGCGATGTAAGAATCATCCGATTAAGGGGACATATTCTTCTGGGCCTATG
ACAACACTGTGGGGGTTACATCCTAAGGATGCCGAGGCTATTGCTATTCGTGAACAAATGCGTAACGTAT
GTTTTCGAGTACGTAATTTAGATATTTGTACTTTGTTAAGTTGTTTGGCAGGCGGCGTTCTACTTCTTTC
AGGAATTATTCTTGGTATGATTGTTGCTGCTCCTGTATTTCCTGGATTACATCACTGGTGTTTCCCTGCG
ATTTTATTAGGTATTGGTTTAATCTTGTGTTTGATGGGAGCAATTCTTAATTATTTTTCCAGGGCACGTG
TGTGGGAATGGCTAAGTCTTTCAAAGGATTATACAGAACGTTGTGATCTTGTGCATATTCAAGACGGAAC
GGAAAAGTATGTCGTGCTTACGGATTTTCCTCCTTCATGCCATTTGTTAGATCCTATATTAGCTAACAAT
GGTCTTGCCCAACCTACAATCCCTTTATCTTCTGCGGAACTTCCAGTTGCCGAACCCGCTTCCTCTTTCC
CTTAA
>ref|NC_003361.3|:281935-282768 metal-dependent hydrolase, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTGCCGGGGATTGTCTGTGAAAAACAAGATTCAGGGAGATTTTTCATCAGGGAAATTAATCTTTTTAG
GATCAGGAAATCCCGAGGGGATTCCTGCGGCCTTTTGTTCCTGTGCGATTTGCACAGGAAAACAGATCCG
GCGTTTGCGTTCTTCCGTGCTTATTGCATGGGCAGGAAAGAATTTTCTTATTGATGCGGGGCCAGATTTC
CGACAGCAGATGTTGGAAAATCATATTCAGCAACTCGACGGAGTATTTCTTACTCATCCCCACTACGATC
ACATCGGTGGGATCGATGATTTGCGCGCTTGGTATGTGATGCATCAACGTTCTCTTCCCGTTGTTGTTTC
CGCATTTACCTATAAATATCTTTCTAAAACTCGTGAGCATATTGTTTTCCCTCAAAGTAGTGCCACAGCA
CTCCCCGCTTCTTTAAATTTTACTATTTTAAACGAAGCCTATGGAGAGAGTACATTTTTAGATCTTCCTT
ATACTTACGTCACCTATTATCAAAAATCTTGTGAAGTTATGGGATACCGTTTTGGAAATCTTGCCTATCT
TACGGATATGAATAGATATGATCATGAGATTTTTAGTTATCTTTCTGGAGTGGAAACATTGATTTTATCA
GCTTCTCCTAATCAGCCCCCTCCGGCTTTTCACGGATACGGACACGCGCATTTTACTTTGAGTCAGGCAG
AAGATTTTGCTTCTCATGTAGGAGCAAAGAAATTAATCATCACACATATCAGCCATAACTTACAAAAAGA
GCTCGCAGATTATTCTGATAAGGTGTGTGCTTATGATGGTATGGAAGTTTCCTGGTCTTTGTAA
>ref|NC_003361.3|:282778-284154 GTP-binding protein HflX, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
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GAGAAGAGCAAGATCCTTCTCAAGCTTTAGCCGTTGCCTGTTATACAGGCAAAGCTGATCAAAAGAACAT
AGAAGAACATAAAGAAGAGCTCGTTTCTCTTGCTGAATCCTGTGATATCACAGTGTTAGAAACACGTTCA
TGGATTTTACGCATGCCGTCATCTTCAACGTATTTAAATGAGGGGAAACTATTAGAAATCGAGGAGATTT
TACAGGCGTTTCCTACTATTGGTACATTGATAGTTGATGAGGAAATTACTGCTTCACAACAGAGAAACCT
GGAAAAACGTTTAGGCCTTGTTGTTTTAGATCGTACAGAGTTGATATTAGAGATCTTTGCTAGTCGTGCC
TTCACTGCAGAAGCTGGACTTCAGGTAGAATTAGCCCGCGCACGTTATCTTCTTCCTCGGTTAAAGAGAA
TGTGGGGGCACCTATCACGTCAAAAATCTGGAGGTGGTAGCGGCGGAGGTTTCGTTAAAGGAGAGGGAGA
GAAACAAATCGAACTCGATAGAAGGATGATTCGTGAAAGGATTCACAAATTAACTTCTGATCTTAAATCT
GTAGAAAAGCAAAGGAAAGAGCGTCGTAAGGCTAAGGAAAGACGGGGCATCCCTTCATTTGCTTTGATTG
GATATACTAACTCTGGAAAGAGCACATTATTGAATTTTTTAACCTCTGCAGAAACTTATGCTGAGGATAA
GCTGTTTGCTACTTTAGATCCTAAAACGCGCAGGTGCATTCTTCCTTGTGGTCAGCGTGTTCTCGTTACC
GATACAGTAGGATTTATCCGCAAATTACCCCACACCCTTGTTGCAGCATTTAAAAGTACTTTAGAAGCCG
CTTTACATGAAGACGTTTTACTTCATGTTGTGGATGCTTCGCATCCCTTAGCTTTTGAGCATATAGAGAC
AACGAAAGCGATATTACAAGAATTGGGAATTGAGCATCCTAAAATCGTTACAGTGTTAAATAAGATCGAC
GCACTTCCTGATAGTAAAGCCTCTGTGAAACTTCGTTTGTTATCCCCCCGTGCTGTACCCGTCTCTGCAA
AAACTGGAGAGGGGATACAAAATCTTCTTGAAGCGATGACAGAGATGGTTACCGAAGGATGTCCCGAGGT
AACATTAAAATTTTCTTATAAAGACTATGGGAAATTTACTGAGCTTTATGATGCTGGATTAGTACGTTCA
CATCGCCGTAAAGATGATATTTTAATCGTAGAGAGCTACTTACCCAAAGAGTTGGAGAAAAAGTACCAAC
CGTTTATTTCCCGCCCGCGTTCTTCTCAAAAGAAAAAAGAAGATTAG
>ref|NC_003361.3|:284277-285542 MiaB-like tRNA modifying enzyme [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACAGTTGTAGAAGTAAAGGGAACGTTTAAGCTTGTTTGTTTAGGGTGTCGTGTAAATCAATATGAAA
TTCAGAGTTACCGAGATCAGCTGAATTTTTTAGGCTATCGCGAAATTACTGATCCCGAGGAGCCTTGTGA
CCTGTGTATTGTCAATACCTGTGCTGTTACAGGGTCTGCAGAAAGCTCTGGACGTCATGCTGTACGTCAA
GTTTGTAGACAGAATCCCGATGCTTTTTTAGTGATTACTGGCTGTTTAGGAGAGGCTGATAAAGAATTTT
TTAATTCTTTAGAAAGGCAATGCCTTCTTGTGTCTAACAAGGAAAAGCATCAGTTAATGGAGAAGATTTT
TCCTTCCATTCAAGATCTTCCTGAGTTTCGTATCCGTAGTTTTGAGGGGAAGTCTCGAGCTTTTATTAAA
GTTCAGGATGGGTGCAATTCCTTTTGTTCGTATTGTATTATTCCTTATTTGCGTGGTCGGTCACGTTCAC
GTCCTATTCAGGAAATTCTTGATGAGATTTCTGGACTGGTTTCTCAGGGATACCAAGAGGTTGTTATTGC
GGGGATTAATGTTGGTGATTATCAAGATGAGGGGAAGTCTCTAGCGCATCTTATCCGTCAGGTGGATGAG
ATCAAAGGTATAGAAAGAATACGGATTTCTTCGATAGATCCTGAAGATGTTCAGGAAGATCTTAGGGATG
TATTGCTTTCAGGAAGACATACCTGCCATTCTTCGCATCTTGTTTTGCAATCGGGGTCAAATGCCATTTT
AAAACGGATGAATCGTAAGTATTCAAGAAGTGACTTTTTAGATTGTGTAGATGCTTTGCGTTCTGTGGAT
CCTCGATATGCTTTTACAACAGATGTGATTGTTGGCTTTCCTGGTGAGACAGATCAGGATTTTGAAGATA
CCCTACGGATTATTGAAGATGTAGGTTTTATCAAGGTGCATATTTTTCCTTTCAGTCCTAGAGAACGAAC
AAAAGCCTATACGTTTGCTTCTCAACTTCCCCAGTCTGTGATTAATGAAAGGAAAAAGCACCTGGCCCAT
GTTGCCAAAGAAATCGCCCGTAGGGAGATGGCACAGCGTATAGGGGAGACGGTTTCCGTCCTTGTTGAAA
GAATTGATCAAGGTATAGCTTATGGGCATTCTCCATATTTTGATATGGTAGGCTTTCCAGCAGATTCTAC
TGTTGCTGTGAATACGTTAGTCAATGTGTATATAGACGCTGTTGAAGAAGATACTCTTAAAGGAAAACGT
ATATGA
>ref|NC_003361.3|:285539-286537 hypothetical protein CCA00267 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATTAAAATAACCCAGAGTTTTAAACCTTATACGTTGATTCCTGGAACATTTATGCCTATTCCAGGAT
CTGAGCTTTATGCTCAGATCTTTCCTACATTATGGCGTATATTTTCTGCTTCTCATGAACTTCTTAATGA
GGGTTATGTAGAAGCTCAGGGACCTTTAAAACGCTTTGCTGTTTTCCAAGATTTGCACCGTGGGGGCTTA
TCTGTTGTTTGTGAGCAGTATAAATACTACATTCTTCCTTCTGGGAAAAAGGTAGATTCTTTGAAAGGGC
ATTTACCCCACGCAGATTCTGCACAACCCCTGCTTTCTTTAGGTGTGCATAAACACGCAGATTTGCATAA
GATTCGCTATCGTAGAGATTTAAAAGAGGTTCTTCCTTTATTGCTACGCTTGGGTTCTCTTACTCCTGAG
TCTTCAAGAGATGAGGAGGTTTTAAAGAAGGGAAGTGGGACATTATTCGTTGATGCTTATCAAAAGATTC
AAGAAAGAAGGAAGACGGAGATCTACGCAGCCTTATCTTCTTTATATCTTGCGGGCTTTTCTGAGAATCT
TTTGCCTAGGATTTACGATACTGAATATCAAGGCATTCTTCATGAGCTTCCTAAAAAGAATCTACGGGAA
AATATTCCTTTCCCTCTGCTTTTTTATACCCTGGGCATGCTGCGGGATCTCTTTATTTTACGTGATAAGG
AGATTGTGGAAATCCTTCCTTCCCTACCCCCAGAGTTTCCTTGTGGAAGATTTATCGATGTCCATCTGCA
AGGAATAGGGAAATTATCTTTAGAATGGAGTAAAAAGACCATCCGTCGTGTTTGTTTGCATGCTGAGGAA
ACTGGACCCGTATTGTTAGCTTTCTCTTCAGAATTATCTCATTGCCGTTTACGCCAATGGGAGAAGAAAC
AGTTAGTAAATTCTTCTAAGGTTTCTTTAGGAGAAAGTATGGAGATAAAAGCAGGAACTACGTATTTATG
GGATTGTTTCCATAAATAA
>ref|NC_003361.3|:286550-288709 glycogen branching enzyme [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTCGAGAGGATTATAAACTCTGAAGATATTTCCTTGCTGATTTCCGGAAGGCAGAGTAATCCTCATA
AGTTTTTAGGGATTATTTCTGAAAGTTCTTCACAAGATAGAATTATTCTTTTTCGGCCCGGGGCTCATTT
TGTAGCTATAGAACTTCAGGGAAACATCGCGCAGGCGACACACCATCATTCAGGAATATTTTCTCTAGTC
ACCCCTAAGGGGACTCTCCCTCATGATTACCGCATTTATCACCAAAACGGCTTATTAGCTCACGATCCCT
ATGCTTTTTCTCCTTTGTGGGGAGAGATGGACTCTTTTTTATTTCATCAGGGGACACACTATAAAATTTA
TGAGCGTATGGGAGCCATTCCCTGTGATGTTGGGGGCATTTTAGGAGTCCTTTTTGTTGTTTGGGCTCCC
CACGCGCAACGTGTTTCTGTAGTTGGAGATTTTAACTATTGGAATGGTTTAGTTAATCCTTTGCGTAAGG
TTTCTGATTCTGGAGTGTGGGAGTTGTTTATTCCTGGTCTTGATGAGGGAACGCTATACAAGTGGGAACT
CGTTACGGCTTCAGGAGAGGTCCTTATCAAAACCGACCCTTACGGGAAAGGTTTTGATATTCCTCCTCAA
GTGACATCGCGAGTTATAAATAGCGATCGCTATACATGGCATGATCAAAAATGGATGGAAAATCGTAAGA
ATACAAAAGATCAACCCTTAGCTATTTATGAGGTGCATGTTGGCTCTTGGCAATGGGATAATGGTCGCCC
TTTAGGTTATCGAGAACTAGCGAAGAGACTAGCGCAATATTGTAAGGAACTCCACTATACGCATGTAGAA
CTTTTACCGATCACAGAGCATCCTTTAAATGAATCTTGGGGGTATCAGGTAACAGGATATTACGCACCTA
CATGGCGGTATGGGTCTTTCCAAGATTTTCAGTTTTTTGTAGATCATCTCCACTGTGAAGGCATTGGAGT
GATTTTAGATTGGGTGCCGGGTCATTTCCCTACAGATTCTTTTGCTTTAGCATCTTTTGATGGAGAGGCT
CTTTATGAGTCTGTAGACCATAAAGACCCTTTACATCCCCATTGGCATACCTATACTTTTGATTATCGCT
GTAGTGAGGTTGTCAATTTTCTTATAGGAAGCGCTCTATTTTGGCTAGATAAAATGCATATTGATGGTTT
GCGTGTGGATGCTGTGACCTCAATGCTATATTTAGACTATGGGAGAAAAGCAGGTGAGTGGTCCCCAAAT
ATTTACGGGGGAAATGAAAATCTCGATGCTATTGAATTTATCAAACATTTTAACTCTGTAGTACATAGAG
AATTTCCCGCAGTATTGACATTCGCAGAAGAGTCTACAGATTTCCCAAAGGTTACAGAGTCTGTAGATTC
TGGAGGGTTGGGGTTTGATTATAAATGGAACTTAGGATGGATGCACGATACCTTTCGTTATATCAAAGTC
GATCCTATATTCCGTTCTTATCATCATAATGATCTCACGTTCAGCCTGTGGTACGCTTTCAATGAAAGGT
ACCTGCTCCCTCTTTCTCATGATGAGGTTGTTCATGGTAAAGGCAGCCTATTACAAAAAATTCCCGGAGA
TACCTGGACGAAATTTGCCCATATGCGTCTGTTACTGAGCTATCAGATATGTCAGCCTGGGAAAAAACTC
GTATTTATGGGAGGGGAATTTGCTCAATGGAAAGAGTGGTCTCCAGACAACTCTTTAGATTGGCATTTAC
TAGACAATCCTTATCACGCTTCTTTGCACAAATGCGTTGCGAAGATGAACGCTTTATATTGCGAGCTACC
CTATTTTTGGAAAGGAGATCATAAACAAGAGTCTTTCCTTTGGGTAGATTTTAAAGATACCAAAAATAAT
GTCATTTCCTATTACAGATTTTCAGGAGAAGATCGTAGTAGCGCCTTACTCTGTATTCATCATTTTAGTT
CGGAATATTTTCCTTCTTATGTTCTACATTGCCAAGGCATTAAAACATGTGAGCTGCTCTTTAACAGCGA
TGATATCTCCTTTGGCGGCTCAGGAAAAGGGAACCGCTTACCCATACTCTGTGTAGATCATAACATCCCC
TGGGGAATCGCTATCGAGCTTCCCCCTCTAGCAACTCTAATTTTTCAAGTTAGCTTCTAA
>ref|NC_003361.3|:288857-290617 hypothetical protein CCA00269 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCAGTTTCTAAAATTCCAGGCGATGGTCATAAGCCTTCGGGGGTTGTAAGAGCGGAAGTTCCCTCTC
AAGTCTCTCAGGGCAATACTATAGGGGCGCATGTACAACGTCCTGTGTGTATTGAAGATGCGGCTATGGA
TAAGAGAAGGTTTTCTCATTCTGTAGGGTTGCTTGCGGGATTGATTGTGTTTGCTTTAGCTATGATTATC
GTTGTTGTGGCTTTGACGTGTATAGCTCCTGGAGTGCCTCAAAGTATTGTATTGGCGTTAGCTTTATCTG
GGATATCTCTCGGTGGCTTTGCCGTGATGAAAAATCTTGTCAATAAGTGTAGGGATCTTTTTGCTCCTAA
GATGTCGGAAAAGCAGAGGTTAAAAAGTGCTGCAGGTATAGGACTGGGATTTACAGGATTAGGATTGGCT
ATGAAGGTGGGGGCAAGTTTTGTTCCCGGAGGGTATGGAGGTGTTGTTGGGAACTTAGGGGGAGTTACGT
ATTCTAAGGGTAGCCAATCAGGCTTTGCAAGCCTCACGCACTATATATATGTAAAGTTCGCCCGTTCTGA
AAAAGCTGCTTCTGGAGAACCTCTATCGCGTATAGAGATTATGCAAGAGGCTGCAAAGCTAGAGCGTATT
AGCTTAAGTCTTTTAGCTGTAGGGGGAGGTTTTGTAATTTTAGGAGTTACCCTTGCGATTGTCGGTACTG
TTGTTTTAGGAGGAGCGCCTGCTGCGGTTATGATAGTTCTTGCTCCTCCTTTTGTTTCTATAGGGGTGGG
ATTAATTCTTCAGACGCTATTGCATAGCAGTATTGGCAAGTGGAAGGGCTTTTTAGAAGCGCAAAAAGGT
CAGATGCTTTTTGCTGATCCGGGGTTAAAAAACATTCGTAATGAAGATATTGCAGCAAAAGAGCTTGTTG
AAGAGCCGTTAACAGTGATCTCTAAGAAAGAAGAAGAGGGACTCTCTAACTCGGGGAATTCTGAAGAGAT
TTTCGAATATAAAAGAATCTCTTCTGAGGAAATTGATACACGTTTATCTTTAACCCCTAAGCAGAAGGTG
ATTTTTGCTTTATCTGTCTTACTTGTACTTGCAGGAGTGGCTGCTGTCGTTGCCGCAGGGTTTGCAGGAT
TGCCGGCATTGCACGTGCTTCTTATTGCTGCTGTAGGCTCTTCGGTTTCTTCTACAGTTTTGCCTATGGC
CTCTTCAGGTTTGGTTTATAATGTATTTCAGTGTAAGTCCCGATTAAGCATTGCCAAAATGCGTTGGAAA
GAGGCCAGGGCAAAAGCAGAATTTACAAAACATATTATCAATGCTTCTGATCTTTCTAAGGCAGCTATTG
ATAAAGCCTGGTTGTGTGTTGGTAAAGATACGATTCTTGAAACCGATCGTGCTATTCGTGAAGAAATCGC
AGATTTTGAAAAAGGCCGTGGTGTTAACAGCGTGATCACTGCAGGAATTTTTATCGCTGCAGGCGTCAGT
GTGATGCTCCTTACCCTCGTTCCTGTTTTAGCTCCGATCATGGCTGGAGTTTTGGCAATAGGCTCCACGT
TGTTCACTATCGGCGCTGCTATGTATTTACAAAAGCTCACCGCTTGGCTCTACAATCAGCTGGTTATGCT
AAGGGAGCGTTTGCGTTCACGAAGATCCTATTTAAACGATATCTCTGAAAAATTACAAATCCCCACGGAA
GATCTCATTGTGGATGCGAGTTTCGATGTTTGGGATGTTGAAGAAGATGATGGCATCTTCGCTGACGCCT
TTGAAGACTAA
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ATAAACAATCTAAATCAGCCAGTTTCGGAGGCCATGATATAGTTTTTGGAGATGGGGAGCGCTCTAGATC
CGGTAGTGTGAGTAGTGAACACTCAATAGAGGAGAGAACCCGGACGTTAATGGAGGAGGGTTTTCAAGTA
CGCACTCCTGAAGAGGTAGAGGAAACTCGAAGAGCGTCTATTTCCCCAGAGGAAGCATCTAACCCAGGAT
TCTTTTCTCGTATATGGTCATCTGTTAAGGGAATATTCACAGGTGGGAAAAAGAGTGATAGAGCTCAAGG
ACCAGAAATTTCCTCTCCTATCATTGCGGGATATAAACGTCATGGCGTGCGTCTTCCTGATGCGCGCGCT
ATGCAGGCACATTTGCAAAGTCAAAGTCTCCAAGAGATTTCTGCATCAGACGTTTCAGAAATAGGAGATT
TAGATTCTGGGGATACAGATATCACGGATATTTCTGATGAAAGTTCGCTACAGTCGATAGATTTGGATAC
AGACGATAGAGCCGAAGCTTCTACATCTTCAGGGAGAGGTGTTGGTGGATTGGCGGCTCGTGTTCGTGGT
TTGTGGGATTTTGCTACTAGGCAGCAAGAAACTCCTGTTGATGGATTTACGGGGATGACTTTTTCTGAGT
TGGTCGATACGGTCCAATTGTATGATCAGATGATTTTAGATGCGGACAATGAGACTGAGCGGCAGGAACT
CTTAAAGTATCGCGATATGTATCAAAGCTATGTTAATACGATGTTAGGTGAGGGCAATACCTCACCTACA
GATCAGTTCGATGTGAGTGCTTCTGCTGGTATCCCAGGGGCTTCTTCTAGAAGATATAGCGATGGCGTTG
GAGAAGCGAGATTTTTAGACATAGATGACGATTTATCCAGTGTGTCGGAAAGTGAGCTTTTAGATGCTAT
AGAAAGTGGAGAGTATGCCGATCATGTCTTAGAAGAGATCAGCCCTGAAGTAAGAAGAGTTTTAGATGAA
GCTAATAACTTGCGTTTACAGTTTGATATGGAAGTTTCTGCAAGTGTAACACCTTCATTAAGAGAGCGTA
TTCAATTTGCTCTTGTGAGGTTGGAAAGAGGGATTATCCGTATACTTACTTTGATTAGACGTAACCTAGT
CGCTCTAGCACGTTTAGTAAGAAGAGGTCTTCGATCCCTTGGGGAGCTTGTAAGACGTTGTTGCGTGCGT
GAGAGAGGTGTTTACAGATTTCTTGGTAGAGATCGGGCTTATGCTAGGGAGGCCGAAAGATTTATTCAAA
GGCATACCAACTCAGAGAATTTTTACAGTCCAGGAACTCTTACGGTTCCCTATGAGGTTGTAAACGCTTG
GGTAAATGGAAGACCTGATGTTGTCTATGTTTCTGATGTTAGAGGTATGTTTGGTCATGAAGTTGTGAGA
CTTCACGTTGATGATCGTGAGGGTACATATGAGATAATTGGCTCTAGCTGGATTCCTTATGAAAGTGATG
GTGGGGATACACCCCCACCTTTACCGGGAAATCATCCTAGTTTAGATTACGCAGATATTAACGATGACTC
TGAAGATCTTCCCACAACAGGGGATAGGGATGCTGAGCCGCTATATGCTCAGATGAGACCCCGCCCTCGT
GGAAGAGATGAGGGACCGATTTACGATGTCCCAAGTCCTCAAAGTAGAAGGCCCAGAGCAGGTGATGATA
GGGATACACCTCCGCCTTTACCGGGAAATCATCCCGGTTTAGATTCTACAGATCTTCCCACAACAGGGGG
TAGAGATCCTGAGCTACTATATGCTCAGATGAGACGTCGCCCTCGTGGAAGAGATGAGGGAACGATTTAC
GATGTTCCAAGTTCTCAAAATAGAAGGCCCGGAACAGGTGATGCTAGGGATTCTATTTACGACACGCCAA
GACCTGTCTCTGATGGTATTTACGACGTCCCCAGATCTCCTTCCGAAGATATTTATAATGTGCCAAGATC
TGGCCCTCAACTATTTACTGTGCTTCCTGAGGATGGGTATAGGCTTCCAAATCTATCAGGATCTGCTCTT
GGAGTGACTCCAGGATTTGGAAATGGTGTTGGGGCAGCTTCTATGGCAGAAGAAATTGATAGGTTTATTG
AAGAAACCCATGAAAGAAGAGAGTCGGCAGCGGCAGCGCGTCGTCCTTTACCCCCTCTTCCTCCGTTGCA
AACTCCTCCGGAAAGTCCTTATGGAAGTAATCGGATGATGCGGTTGTTGAGACTCATGAACGATAGGGTA
CAGGAGTACAAAGAGCGTCGTAAGGATAAGCAATAA
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CCCTGCATGCCTCCGAAAAAGAAGCTCCATACTCATGGAAAACTTTTGGATACGAACAACTTCTTAAGCC
GGAATTCTTCTTTGATATTCTTGAAGAACAAAACACCCTTGAAGGGCTTACACGTTCAACAGGGGGGATT
ACTGTTGAAAACTATAAGAATATTATCTGCTCTCAGCAAATCTCTATTACACCTGGTGGGGTTTTCGATG
CTGCTTCGGTAACAATACAAAACATTCAAAATGACATAAAGTTCATCTCAAACATAACAACGCAAAAAGG
CGGTGTCATCCATACTCCAGGCAACTGTACCATTACTCAAAACCTAGGAAAACAATACTACATTAGCAAC
GAGTCTAATGCTTCTGCATCTACGGCAAACTCCTCATACTATGGCGGAGTTGTCTATTGCAGAGGAGATT
TTGAATTATCTAAGAATCGTGCGACTATTTGTTTTGCTTATAATGTGGCAAGACAGCGCGGTGGCGCTAT
CGCATCAGAGACCTATTGTAAGATCAGAGAGAATACGCATCCTATTTTGTTCACGAACAATTTAGCCTTA
AAAGAACAAGGTGGGGCTATTTATTGTCGAGATTGTGAGATTGCAAACAATTCTGGACCTATATGCATCA
CTTCTAACTGTTCTCCTATTGGAGGGGGTTGCCTCGCTACTTCCAGCGTCGCAATTAAAAATAATTCCAA
TTTGATTTTATTTTCGAATAACTCCGGTGTATGCGATCAACCCGTTGGAGCGACAAGCTCCGGAGGGGCG
ATCTCCGCACCAATGATAAACATAGAGAACAATTCTGGGCCCATTTGCTTCGATAATAATATTGTGGATC
GCAATGGCGGCGCCCTATGGTTCTCAACATTAACTATTAAAAATAATGGGCTCGTCCAATTTATCAATAA
CCGAAGTAAATGGGGAGGCGCCCTCCTCATTAAAAATAATGGCTCCTGTGAGCTATCCGCAGATAATGGG
GACATTATTTTTGATAGTAATTGTGGAATAAAGAGTGACCAATTGTATAGAAATGCTATGCATTGCACAG
CAGGAACAACTTTAAAAATTGGTGCCAAGAAAAATCGCTGTGTGAAATTCTATGATCCTATCCAATGCAC
TTACTCATCTCCATTAATAGCATTTAATCATGAAGATTATCACCAAGGAACAATTTTATTTTCCTCGGTG
TTCGTGCCTCCCTCATTCAAACTAAACGATAACTTCATGAGCTATATAAGAAATCCTCTAACTATCCATA
ACGGCGTTCTTGCTATTGAGGATCGCGCAGCATTAGCTGCTTATCAAATTACACAAACTGAAGGAACTCT
ACGCCTAGGAAATGGCGCCGTCATTACTACTATACAAAATGCTTCCCCACAGACAACAGATGGCTGCACG
CTGGCACTCTCTAAACTCGCTTTAAATCTTCCTTCTATTTTAGCTAAAGGTGCTGAAGCTCCTAAAATCT
GGGTCTATCCCGCAGGAAGTAACAATAACTACACTGAAGATCCCAACCCGACCATCACTATTTCCGGACC
CCTAAAACTACTTGATAATTACAATGACGATCCCTACGACTCTTTAAATCTCTCTCATGGGATTACACGT
GTGCCTTTCTTATATCTTTGTGATAACGCCACAAAGAAAATTAACATCGATGCTCTAAATGTTGAAGCCA
TTAATGATCATCTCCATTATGGCTATCAAGGGGTTTGGTCTCCCTATTGGGAAGAATACACGACCATAAC
CAACCCAACTTCAGTGCTAACAGCAAATACTTCCCATCGCCTGCTCTATGCAGATTGGACCCCAACAGGT
TATATTCCTAATCCCAAGTACAAAACTCCTCTCATCGCCAATGCTCTATGGGGATCCGTCTACACTACAC
TATCAGGAATGCGCACGCTACCTTCTCCAGTAGCTAATCCCGATCATTTCGAACTCAGCAGTCAGGGAGT
CCTCCTAGGTGTTCGTCAGCACAATCGCTCTGGAATTCGTGGATTTCGCATGGAATCCTCAGGTTATGCA
CTCACCTCATCGGCTGCAACAAAGATAGATCGTAAGATCTCCTTTGCATTTTCTCAGCAAATGTCTCACA
TAAAAGAACATACGACATCGAACAAAGTCTCTTCGAAAAACTTCTTCGGAAGTGTACAACTACGCCTGCC
TTGGTTAACAGCATCACTAGCCTATAATTATGGAGACCACACAGCGAAGCATTTCTATACAGAAGATAAC
AAGGATTCTGAAGGGAATTTCCATAGCCATACATTCGGAGCCTGTCTGAATTTCACGCTAAATCGCAGCC
CAATAAACAATGCGTTTATAGCACCATTTATAGAGGCTGTAGCCTTTAGAGCAATGCTCTCCGGTTTTAC
AGAACAAGGAGATTTTGCACGGAAATTCACAATGCATAAGCACTTACAAAACCTCGCATTACCCGTGGGA
ATGATCGTACAATGGGCATATGATGGGCACTTGCCAACAACCTGGCAAATACAACTTGCCTACCACCCCG
TTATCTATAGACACTACCCTAAGGTAGCGACAACACTACTGGCAAGTAGTGGAACTTGGCACTCATCAGG
AACGCCAATCGCACGCAATGCTTTTTCCTTTAAAATAGGAAATGAAACGCAAATCTTATCTTACGTGAAT
ATCTTCTTAAACTATCAAGGAGAAGGCTCTTCTTCCTTCTTCTCTCATTACCTAAAAGCAGGAAGTACAC
TCACCTTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c298869-296044 polymorphic outer membrane protein E/F family protein/autotransporter, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
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GTATTTGCGCACAGCCACTCGACTGTTTCGCCAAAGAAAAGAAACCCTATTCTTTCCATAAAATTCCTGA
AAGTGGTTCTGCTTGCACAGAGTCAAACTTCTATACTGGAGAGCTTCATAATCAAAATGCCGATGTAGAC
ATTACCGGAAGAAAGTATCTTTGCATTAACAATCAATATTATAGAGAGAACGGAGGAGCCTTTACTGTTA
GATCTCTGAACATCACGAAGAACCTTGGACCTATAGTGTTTAGAGAAAATGTCTCTAATGACAACGGTGG
AGCTATTTTCTCAACAAATTGCAACATCACATACAATAAACAAGACTGCTGTTTCGTTAACAACATGGCC
AATGTCATTATCGATTTGCTCGCATCTCGCTCTGGTGGCGCCATTAAAAGTGCCAACCTTGTAATTTCTA
ATAATGTCGGACGTTGTCAATTTTTAAACAATACAGCTTCTCTATCGGGAGGAGCTATTTTAGCTGACAA
TGACATCAATATTACTCATAACTACGGCGACATAATTTTAAGGAATAACAAATGTTTAAAAGATCGGAGC
CTAGGAGGAGCTCTACATAGTACGAACTGCTCTATTACCTCCAATCACGCTCCCATAAACTTTATAAGTA
ATCAATCCGGTGGTGGTGGTGCTATCTATGCAACAAGAACGTGCACGATCTCTTATAATTCCGAAACTAT
AACATTCTTAAATAACTGTAGTTTAGATCAATTATATGACTCTTCAAGTAACTGGAGAGCTGGAGGAGGA
GTTATTTACTGCTCTTCTTGCTCGATTACGAATAATCCTAAAGGCTTGATTTTTCAGAATAATTCGGCAA
AACGTGATGCAGGCGTAATCTTTGCTCAAAATCTCACTATCAAAGATAATGGACCCATTTTATTTATAAA
CAACTCTGCGACATGGGGAGGAGCTCTTCAAAATCATGATAGGGGACAATTTTATCTATCCGCTGACTAT
GGAGACATCGTATTTAAAAGGAACTTTTGTATTAAATCTTGGGGATATACTAGAAATGCGCTCCACTCGA
CGCCTAACTTAAATCTACAAATAGGAGCACGGCAAGGCTATAGTATTAAATTTTATGACCCTATTGAAAA
TGAACATCCATTATCCTCTGTTCTTACATTTAATCCAGAAAGCTATCATCTAGGAACTGTATTATTTTCT
GGTGCTGATGTATCTACAAATAATACTGATATTAATAATCTCCGGAGCAAAATGAGAAACGTATCAAAAA
TTGCTCATGGTGTACTCGCTGTTGAAGATAGAGCCGTATTAGCTATATATAAAATCACACAAGATGAAGG
AACTCTACGCCTAGGAAATGGCGCCGTCATTACTACTATACAAAATGCTTCTAGCCCACAGACAACAGCT
GGCTGTACGCTAGCACTCTCTAAACTCGCTTTAAATCTTCCTTCTATTTTAGCTAAAGGTGCTGAAGCTC
CTAAAATCTGGGTCTATCCCACAGAAAGTGGCAATAACTACACCGAAGATCCCAACCCAACCATCACTCT
TTCTGGAAATTTATCTCTATTAAACGATGATAACGAAGATCCCTACGACTCTTTAAATCTCTCTAGAGGG
ATTACACGTGTGCCTTTCCTATATCTTTGTGATAACGCCACAAAGAAAATTAACATTGATGCTCTAAATA
TCGAGGCAATCAACCAAAACGCTCATTATGGCTATCAAGGGATTTGGTCTCCCTATTGGGAAGAATACAC
GACCATAACCAACCCAACTTCAGTGCTAACAGCAAATACTTCCCATCGCCTGCTCTATGCAGATTGGACC
CCAACAGGTTATATTCCTAATCCAGAGTATCGTGGCGATCTCGTCGCTAATGCCCTCTGGCAAGCCGCAT
ATAACACAATCACAGGTTTACATAGCACCCCCCCCCCCCGAACTTCTTTAGGAGTGGCTGGAAGAGGGTC
AGTAGCCTATGTTTTACAGAAGACTCGCAATGCCAAACCAGGGTTTGAACTATTCTCTAGAGGCTACTCT
ACGCAAGCCTCGCGTTCCACAGAGACAAATCATCATTTTGCATTAAGCTTCTCTCAATTCTACAGCGAAA
TCAAAGAGGCGAAGTCGCAAGACAAAGTTTCTGCCAATACTTACTTTGCAGGCGCACAAATACACATTCC
TTGGTTTGATGAAAATCTCCTCACATCAGCATCTTTGGGTTATGCCTATTCTCATAACCATGTAAAAACA
AAACATCACACTACAAACGCCTTATCCGAAGGAGACTTCCACAGCCATACGTTAGGAAGTGAGCTTTTCT
GTAGGTTCCCCGAAGGTACTGTCTCGAATGTACAATTCCGTCCTTTCATTAAAGCTTTGGGTATTCATGC
GATTCAAGAAAGCTTCACAGAAACCGGAAAAAACAGCCGCTATTTTCAAGCAAAAGATCCCTTCATTAAT
GTCACTTTACCTGTAGGAGTCTATGGCTATACAGAACACGAAATGCATCTAAAGACCTGCTGGGAAATGC
AGCTTGCCTATACGCCGACTATCTACAGAAAAAAACCTAAGATCATCACGACAAGACTTGTAAGTAAAGG
TAGGTGGATCACATCAGGAACACCTGTGGATCATCATGCCGTCTCCATCTCGGCAAAAAATACCACAACT
TTAAATAGGATGAGCCTGAGCATTAACTACCGTGGAGATTTCTCAAAATCTACACTGTGTAACTTTCTAA
ACATCACGAGTGAAATCAATTTTTAG
>ref|NC_003361.3|:c301825-299033 polymorphic outer membrane protein E/F family protein/autotransporter, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAACATAAGTTTATTTACAATCTTATTTTCTCAATATCCTTAGCCTATTTTTATAATATAGATGCTA
GAGAAGTAGTTCTTCTGGCTCCCCTACCTTCTGAGAATTCCCTCTACATCCCTCAATCTCTAGAGTTTCT
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ATATTTGCTATTTCCCAAATGACTACTGATTCAGAAGGAGCAAGTGTAAAATGTAGTAACTTATACATTC
AAGATACGCAAGGTCACATTATCCTGATAGGCAATATATCACCACGTTCAGGAACGGGAATCTACACTAA
TCGTGATTTAGAGATTTCCAATAGCAATCAAGTGATTGTTTTCTCAAATAATCTCGCGCGCAGCACAGCA
CTTGACCAAAATCGTTCACTTGATGGCGGCACTATAAACTCCCGATTTCTCGATATCAAAAATAATAACG
CTCCGATATATTTCCTTAGAAACGCCGCCTATTCAAAAGGTGGCGCGATCATGTCAGGAGAGAGATTTGA
TTTATCCGGCAATAAGTCCTCTTGTATTTTTTGCGACAACGCAACCTTAGCTGTTGATAGTCAAGGAGGA
GCCTTACGAGCCCAAGACTTCAACTGCATCAACAACTTAGGAGATATCGTATTCAACAACAATCAATCCA
AAAGTGGCGGGGCTCTCTCTGTAAATACTACATGTCTATTCTCAGAGAATCAGGGAAACCTCATCTTTAA
AAATAATAGAACCATGTCTATGCACGATGGTAATGGTGGAGCTATCGATGCAAAAAATACCGCTATAGCA
AATAATAAAGGAATCATATCGTTCCACAATAACTCTTCCTCATATCGAGGAGGAGCTATTAAAGGCGCGG
TATGCACGATTTACAATAATAACGATATTTTCTTCACAAATAACTCTGCTCAGGAGGGAGGCGCTATACT
GATAGCAGGCGGGGGTTGTAGCCTCACACTATCTGCAGATAAGGGAAATATTGTTTTCAATAACAACCTA
TCCATATCCCCAAATAAAATCTACAGGAATGCTGTCTGCATAGCAAGCGACGCTGATTTTGTTGTCGGAG
CTAAATTAGGACAACATATCCTTTTTTATGATCCTATTGAACATGATCACAACGCAACAAATCCTATGCT
CATCAATCCCGATGTTGAGGATCACGGTTGTGTGATCTTTTCAGGAGCTACTGTCGATAGCCACTTAAAG
ACAGAGAATAACCTATTCTCAAAATGCAAAAACACCATCGAACTTAAAAACGGTGTATTAGCCATTGAAA
ATGATGCGGGGCTTGCCACTTATAAATTTATACAAACTGGAGGCCTGGTTTGTTTAGGATCGGGAGGGAC
ACTAACAACAAGAGAAAAGGACAATAATAAAAATTCCACTCTTCAATTAACTAATCTTGGATTAATTCTC
CCTCAATTAATTACAAGTAAAGCAGAAACAGCAAAATTGTGGATCTACCCATCCGCAACAGGAAATACTT
TTCAAGAAAATACCCTCGCATCCATCACTGTTTCTGGCGACCTGATACTCACAAACGAAGAAGGCCATAG
TCCCTATGATGATGTAAATCTCTCTCGTGGGATTACACGTGTACCTTTCCTATATCTTTGCGATAACGCT
ACAAAAGTCATTGATGTTGCTTCTTTAAATATTGAAGCCATCAATGATCATCTCCATTATGGCTATCAAG
GGGTTTGGTCTCCTTATTGGGAAGAATATACAACCACACCCGATACGACTTCAGCACTCACAGCAAATAC
TTCCCATCGCGTACTCTATGCAGACTGGACCCCAACAGGTTATATTCCTAATCCAGAGTATCGTGGCGAT
CTCGTCGCTAATGCCCTCTGGCAAGCCGCATATAACACAATCACGGGTTTACATGGCTTCACCCCCCCCC
CCAACAGAAGCTCTCTAGAAGTGGCTGGTGGTGGGTCAGGAGCCTATGTCTCGCAGAAAACTCGCAATGC
AAAACCTGGATTTGAGCTATTTTCTAAAGGCTATGCTACTCAAGCTTCACGTTCTACAGAAACAAACCGT
AGCTTCGCATTAAGCTTCTCTCAGTTCTATAGTGAAATCAAAGAGTCAGAGTCAAAAGACAAAGTCTCTG
CAAATTGTTACTTTGCTGGAGCACAGCTGCAAATCCCTTGGTTTTATGAAAATCTCCTTACGTCAGCATC
TTTGGGTTATGCGTATTCTCAAAACCATGTAAAAACAAAAAATCAAACAACAAACGCCTTATCCGAAGGA
GATTTCCACAGCCATACTCTAGGAAGTGAGCTTCGCTGTATGTTCCGTGAACGAGCTATTTTGAATTTAC
AATTCCGTCCTTTCATCAAAACTTTGTGGGTACGGTCTACTCAAGGAAGCTTCACAGAAACAGGAAAAAA
CAGCCGCAATTTTAAAACAAAAGATCCTCTCATCAATATGACTTTGCCCTTGGGAATCTATGGCTACGCG
GAACACGAGGTATATTTAAAAACGAGTTGGGAAATGCAACTTGCCTATACGCCGACTATCTACAGACAAA
AACCTAAGATCAACACAACACGCATTGTAAGCAACGGCTCGTGGATCACATCAGGGACTCCTGTTAATCG
TCATGCTTTCTCTATCTCGATAAAAAATACGACAAGTTTAAATAGGATGAGCCTAAGTATCAACTACCAC
GGAGACTTTTCAAAATCTACACTGTGTAACTTTCTAAATATCACAGGTGAAATCAAATTTTAG
>ref|NC_003361.3|:c304635-301852 polymorphic outer membrane protein E/F family protein/autotransporter, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
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ACATTAAAATCCCTGAAGAGATCTCTAAGCTACTTTCTGCTCTTGATTTTCCATTAACACGCGTAAATCA
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CAACCTAAAATGTTTATATGCAAATTGAATACAACCGATGGCGGTGTGATCAATTGTCGCTCTTGTAGTC
TTATAAACAATACCCAACCTATTTTCTTTGGAGATAACAAATCAACCTTGTGTGGTGGAGCAATCTATTC
TGCTGAAAGCGTAATCCTATCAAAAAACTCTCGTATCATTTTTTATCAAAACACCACTCTCAATCAAACA
AATAGCTCTAGTGGTACTGGCGGTGCTATACAAGCGAAAAATTTTGAAGCTTCCCTTAACAAAGAGACAC
TTTTTTCCTCCAATTTAACTAAAGTAAAAGGAGGAGCCATTGCCTCTACGGAAATGTGCAGGTTCTTTAA
TAATTCTGCATCCATACACTTCGATAATAATAGAACTACCAATGCAGACAGCTTTGGAGGAGCGATTTCT
GCAGTCTCTTGTGAATTTGCCCGCAATCGTGGAAAAATTACATTTAGTGAGAATAAATCTGGAAAAGGCG
GGGCGATTTGTTCTACAACCTCGACAAGAATTGTTGATAATCAGGCGCCTATCACCTTTTCTCATAATGT
TGCTTCTAACACCAGTAACCAAGGAAATGGGGGAGCAATTAATAGCCCAACTATTGTCATCGAAAACAAT
AAACAACCTGTGCTATTTTCTGGAAACTCCTCGGCTCATGCTGGAGGCGCTCTCTCCTATCAACACCTCA
CTATCCAAAATAACGGGCCTGTCTACTTTCTAAATAATACTTCTTGCTGGGGAGCTGCATGTTATGGACA
AACAAATAACGGAACTACCACCATATCTGCAGATTATGGCGATGTAATTTTTGATAACAATATTGCGATA
GATAGAATGGGGGTTTGGAGATCCGCTATGCATTTCAGCTCGAACCACTCCCTATCTTTAGGGGCTTCCA
GCAACCAACATATCTATCTCTTTGATAGAATGAACACTGGCGGTCTATCCTCTTTTATCATTAATCCTGA
AGATAAACATACAGGAGCGGTAGTATTCTCAGCAGCGAGCACTCAATTAAAGCTAGCTAATCAGAGCATC
AAAAATCTTCAAATTAGCTATAAGGGTGAACTCACAATTAAACACGGCATTGTCTCTGTAGAAGATGGCG
CTATACTATGGCTATATAAATTCACTCCCGAAGATAATACGCATCTCTGTTTAGGAAGTCGTGCGATCAT
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ACAGACATTTTAAAACCTGATAGTAGCCCACCTACTGTTTGGATTTACCCAGGAGGCTCCGGAGGCAACT
ATACTGAAAATACTGACGCAAGGATTTCGATATCGGGATCCCTATCTTTATGGAATAAAAATTATAGCGA
TCCCTATGATAGTGTAGACCTTTCCCAACCCATAGATAGAATTCCCCTCTTACACCTCTCTGAACCAGCA
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GCATTTGGACTCCTTATTGGGAAGAGGTCTCCTCACCTTCGATAACCTCATCGTTAGAGACAACAAACTC
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CTTGTTGCCAATACCCTCAGACAAACTGCTCGCAATGCCATGGCTTTTTACCCAGCATTGATAAACGACT
CTACGTCTTTTTACCTAGAGGGTAACGGATTAGCATCACATACCCGTCAAAGAAATCAAAATGAAATTTT
AGGATTTTCTTCACGATCTTTAGGCTATGGCGGAGAATGTCTTTTCTCCTCAAAAACTCAGCACAAGTTC
TTACTCACATTCTCACAACTCATTGGGAAAATAAAAGAACATACATCTAACAATAAAGTTAGCTCACATA
GCTACCTGTTAGGTGCAACTTTGCAAACACCCCAGTTTAACGACTATCTTATAACTACAGCCTCCTTAGG
CTATGGTTATGGGGACCATCATATGCAAAGTTTTTATGCACAAAATAAAACATCAGAAACACAATTTAGC
GACCATGTCCTAAGCGCACGTATAGGCTGTTATACAAAACTTCCTCTTTTGAATCACCACGTTACACCCT
TCATTCAATTGGCTGGGGTACGGGCAAAACAAACGCAAATCAATGAAACTGGAGATTTTTCTAGAAAATT
CTCTAACCAACATCCGTTGGTTTCTCTCACCTTGCCCGTAGGAATTCTGGCTTCTTGGCATGCAGACTCC
TACGTACCCAGTGTCTGGGAATTCGAACTTGCCTACCAACCTTTAGTGTATGAACAAAAACCCAAAGTCC
TAATAACACTGCTGGCAAGCAATGGATCTTGGATATCTTCGGGAACTGCTGTAGCACGACATAATTTACA
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>ref|NC_003361.3|:c305981-304845 polymorphic outer membrane protein E/F family protein, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
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TAAATAATAACTCTTTCTATTTTGATATTGAAGGTGGTGCTTTAGGCCTCTGCCTTTATCAAAAAAATAT
GGCCGAGAAAGCAGGCTTCCATATGGATGGTGCGGGATACTACACAGAGCTCTCTGTCGGGTCGCCTTCC
TTTTATAAACTTGGTTTTAAGTTTGCTTCGCAAAAAACCAATGCTAAGGCCAATATCGGTCATGACGAAG
TAGCATCAGATTACCTATCCTTCGGAAGTTACTGGGAAGTCCATCTCTTTAAAGGGAAATTTATCCTAGC
AGGAAACGGTCTCTATTCTCGTGGTTTGCATTATTTAAACCATACGCACCGCAAACTTTTAGGAGCTTGC
TGTGCTTCATTCGAAAGTCAAACAATAGGAAGTGCTCTTTCCTTTTACTTCCCCTTAAAAGCTATTAAAA
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ACAAGGCGCTCGTGTACGCACTTTCTCAGGCTCTCCAAAATTCGATGAGTTTCTTGATACTAGCCTGCCT
TTCGGATTGCATAGTCAGTTAGCTTTTCACGGACGTTTCCCATCAATTTGGGAATTAGAAGTTGCCTATA
AGCCTTCAACTCAACGTCAACTCCCTGTAGTAAGTTCCAAATTAGTTGCAGATGATGGAACTTGGGTTTC
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>ref|NC_003361.3|:c309324-306379 polymorphic outer membrane protein H family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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GTATTTGGAAGAAATCGCTCGTTAATCTTTGTGCAAAGTCATGCTCCTGTAAAAGAAGGGGCAGCGTTAA
TCTCTGCTGTAGATAGTCTGAAATTAACAGATCTTTCTAAGCTTGTTCTTAATGAAAACATCTCTACAGG
AAAGAATGGTCTTATCTCAGGGAAAAATATCGCAATTACTTCCTCAAAATCCCTGGTAATTACAAATAAC
AGAGCTCCCTATACTCCTGTAGTCACTAGCGTGACTACACCTACTGCCTCAACTACAGTAAACTGTTTTT
GCGGTTCTGCTATTCATACAGAAACTAACTTAAACATTACGAAAATTCGAGATAACATCTCCTTCAATAG
CAACTCGGCAAACTTCGGAGCTGCCCTCCTCAATAAAACAGATGCTACATGTACTATTGAAAACAACGCT
GCAGCGATCTCTTTCTGTCAAAACTTTGCTGCTTGCGGTGGAGGCGCTATTTATGACGGAACGATCAGCA
TTAAGAATAACTCAGGGCGCATTACCCTAGAAGGAAACACCGCAGCAAATGGATTGCTAACAACTACTCC
CAATCCTAATGTAGTTATCGCTGCAGGTTGTGGAGGCGCAATTTGCGCACCCACAAAGTCGGTAACCTTC
GCTAATAATTCTGGCATTTGCAATATAAGTTATAACCTTGCTGAACAAGACGGCGGGGCAATTTATACAA
CAACATGCGATCTTGCAACGCATGCTCCTACATATTTCAATAAAAATGCTGCCACAAGATATGGCGGAGC
AATTTGCGCAAAAGCTCTCACAATAAATGCTCATGGCCCTACCATATTCGTCAGCAACAGAGCTGAAAAA
GGTGGAGCGATTTACGTTGCCTCTACTGTTGGAGATACTACAGCAGGCCCAGATTCAACGTTAAGCTTAT
CCACAAGTTCTGGAGATATGGTGTTTGTCGGCAATATGCTCGATAGCCGCCCAGGAACACGTAATGCTAT
CCAAATTGAAGGCGATGGTAAAATCACTTCCCTAAACGCTACGGGATTATCGAGCATTATCTTCCATGAT
CCTATTGCAAACCCAGGTCCTACAACTGTTACAACTTTAGATACCATCACGATCAATTCTTCGGGATGTT
CTGGATCAGTAAAATTCACATCAGAGACGCTATCCATATCAGAACAGTTAAATCCTGATAACTCCACAAC
TTCCCTATTTGGAAAAGTTGTTATTGAAGATGGTCAGCTTGTTGTCACCAATAAAGCCAAAGTCAATGTT
CTTGGCTTGACTGCAGAGACCGGAAGGCTAACTTTAGGTTCCGGAGCCGCTATTGGGATGCTAACAACTA
CAAACAATCAGCCTCCTTCAGAAAACTTCGTCATTAAAAAATTAGGTTTTGATGTTAAGTCTTACCTAAA
TCCCAATTACGCTACAGCTACTGTCACAACGACTAATACTAAGACGATTACATTAGAAGGTCCTTTAGAT
CTTGTTTCTGAGGATAATGAAGAGCTCTATGATAATCCCCTATTGGTGAATGCACTATCTATTCCTATAG
CGACTTTCACCAGTAATAATGGTAATCCAACGACAACTAGCTTTACTACTGGTGATCTTGCTGTCTCCAA
ACATTACGGCTATCAAGGCGTATGGTCTTCCACATGGACAATACCCCTATTAGCTCCTACACCTAACGGA
GGGATCCCTTCAGGAACAAATAACCGTACTCTCTATGTTGCATGGAGACCAGATCCTGCGTATCGTGCTC
CCTATGTTTTAGCTCCTGAACGTCGCGGAGAACTCGTATCCAACACCCTATGGACCTCCTTCTTAGCAAC
GCAGACTTTTGCAGAAGCGTTAGAAGAAACTTTCCTTTCTGAACAAGAAGGAGTTCTTATTTCTGCAAAA
GCTCTCGGCAGTTATGTCCGTCATCCTATGAAAAAGACTCATGAAGGATTTAAAGGGCAATTCGGAGGTT
ATCAAGCCTCTCTTGGTATCCATTATCCTGATGATGCTTCTGTAGGCTTAGCTTTCGGTCAGCTATACGG
ACAAGTAGAGAGCAAACCTTACGATGCACAAAGCACAGAGCAAATCAGCTTAGTTGCTTTCTTCGGGAAA
TTCCCTATTGCTACAGAAAATACTGTAACGAACATCTCCTGGGAAGCCTCCTACGGTTATGCAGTAAACC
GTATGAAAACAAATTACCTAAACGCTATCACGCAAAAAACGCGACAGTCGAAAGGACGTTGGCATAACAA
TACCTACTATGCTTCCGTATCTGTAGAACATCCGTTCTTAACATGGTGCATGCTTACACGTAACATTGCC
CATGATCTTGAGCTGTCAGGATTTATATCTGCAGAGTTTATGGGTGGATGGCAAAATGCCTTTTCTGAAC
AAGGTGCGCTACCACGTGGTTTTTCTAGAGGCCGAGGACATAACATTACTCTACCTATAGGATTTACTTC
TGAATGGGGCACACCATTTAAAAAGGCACCTTCAATGCTTACATTGAAACTTGCCTATAAACCTGATGTT
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AAATCCCTCGTCATGGATTCTACCTACAAGTGCATGACAGTGTAGAACTCTCACGACATGCTACAGGGTT
CGTTGATTATGTATTTGATTCAAAAAGATCCTACGCAAGCCATCGCATAACGACAGGATTGCAAGGGAGA
TTTTAA
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CTTTGGAAGTCGTAGTCCCTAATGGAACTTATGATGGGAACCTTAGAGAAACGTTCCCCTATACGATTAC
ATCCAATCCTGAAGGAACAACGGCAATACTGTCAGGAAATTTAAATCTTTTAAATCTTGATAACTCCATG
GTAGCAACGCCTTCAAGTTGCTTTTTCAACTCTGCAGGATCCATGACAATTGTGGGGAGAAACCACAATC
TAACCTTTACAAACCTTCGCACGTCGGCAAACGGTGCTGCCCTAAGCTCTATTCCTACAACAACTCCTGA
ATCGTTCCCTTATACGATTAAAGGAGTGAACACCCTCTCCTTTTCTAACTGCCTAGCCCTAATGGCCCGC
ACAACAACGGCGCCAAATACGACAACTCCTGTAAATCCAAACGGAGGGGCGTTCTACTCCAAAGCTCCTG
TATTTCTAGAGAATATTCAGAATGTGCTATTTAAAAATAACAGGGCTGCTGATAGCGGCGGTGGCCTATG
GGTAGAAACAGCTGGGATTAGCAATATCAAAAAATCCATGCAGTTCCTTAGCAACGTCGGAGCCAACGGT
GGCGCTATCAACGCGTCTAAAAGCCTAGATGTTACGCAATGTCCTTCGATTCTCTTCAGATCTAACTCTG
CTGAGAAACTCGGAGGAGCTATCCAAGCTGTTGATCCTGCAACAACAAATCAAGTAAATACTGCCGTCAG
ATTCTCCGAAAATGGCTCAGTACAATTTGATGCCAATAATGCGAAATCTGGCGGAGCGATTTATTCGAAA
GGGAACGTCGATTTCTCAAATAATGCGCAATTGCTGATACAGAATAACTCCGCATCTCCTGAAGTCGCTA
ATACTAATGAAGTATTAGGACAAGGTGGGGCGATTTTCTGTGTACAACAGACTCCTACTCAACCGCCGCC
GCCACCACCACCTACAACGAATCCTGTCTTCTCAGGATTAACTATAACCAATCAAAAAGATATCCTCTTT
GCAAATAACTTTGCCGCAACTGCAGGCGGAGCGATTTATGGAGAAAAGGTCAGCATTACCTCCTCAGGGA
AAACGATGTTTACAAACAACATCGCTAAAGATGGCGGAGCTATCTACATTCCTGAAAATGGAGAGCTCAC
CTTATCTGCTGACTACGGCGATATGATTTTCTATGAAAATCTAAAAAAAGATGACGCTACTGTCACAAGA
AACGCTGTTACCTTAGCAAAAGGAGCAACGATTAAGTTACTAGCAGCTTCTGGGGATCATAAACTCTGTT
TCTACGATCCTATTGTGACTACACTTCCAGAAACAGCTCCTACTAATGACAAGACTCTAACGATCAACCA
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AGCCAAAGCGCTAGCACTACAGCGAATTTTGAATCCACTATCTATCAAAAAGTCATCTTAGGTGGCGGGA
AGCTTGTTCTAGCAGATAAAGCCAGCCTATCTGTAGCTTCCTTTACTCAGGAAACAGATTCTATTCTTTT
AATGGATAATGGAACTACTCTAGCAATTACAGAGCATTCCCATCAAACACCAGCAGCTGGTGGGGGTGGC
GGAGGCGGAGGAACCCCCACTCAGGAAGCCAATACTGATGGAGTTATTTCCTTAACAAATCTTCATGTCA
ATATCAGCTCGCTTACGGAACAAGGTGAGGGGGCGAAACTTGAAACAAAAAATACAGATGGGACGATAAC
TTTAACTGGGCATGTATCCTTAGACGATGTTTCAGGAACTGCTTACGAGAATCACGATCTTTTCAATAAA
GATACCGTCACGATAAATCTGCTTTCTCTTTCTACAGCAGGAGATAGTAAAACGACGATCAATGGTTTGG
ACCTCACTCTTAGAGGAGACGCAGAACCTCAATACGGTTACCAAGGATCATGGCAACTGGCTTGGGAAAA
TGGAGCTGATGCCAATAAACAGAAAATCCTAAAAGCTACATGGACAAAAACAGGATTCACTCCTAATCCT
GAGCGTCAAGCATCTTTAGTTCCTAATAGCTTATGGGGAGCATTCATCGACCTACGTTCTATGAATGCCT
TAGCGACAGCAAGCTGTGACGGCTTCGGTTATGGTAAGGGATTGTGGGTAGCTGGGATTTCCAATATCTT
CCACCATGATCGCAATAGCGTATCCCATGGTTTCCGTCGTATTAGCGGTGGTTATGTTATTGGAGCCAAT
TCACAAACAGTAACGGATTCTGTATTTGGAGTGGCCTTCTCCCAGATATTTGCTAAGTCTAAAGACTATG
TTGTCTCCTCAGCAAAATCACAAGCTATAGCAGGTAGCGCTTACCTATCGGTAAAACGTCAGTTAAGCAA
CACGATATTCTCATCCTTCGCTGCAAGAATTAACTACAGCCATACTAACGAGGATATGAAAACACGCTAT
ACCTTCATTCCTGAAAAAGATGGCAATTGGGATAATAACTGCTGGTTAGGAGAAATAGGCGGAAGCTTAC
CTATTGTTTTACAAATTACTAAATTACATCTAAATCAAATCATTCCTTTTATGAATGTTCAGCTTGGCTA
TGCTGAGCATGGATCGTTTAAAGAAAAACTTGCAGAAGCACGCTCCTTCTGTTCTTCTCGTTTGATTAAC
TTAGCGGTTCCTGTTGGATTTAAAATTGATAGGCGTTCCCACTCCCATCCGGATTTTTACAGCCTAGCTA
TATCCTACATTCCCGATGTATGGCGAAGGAATCCAGGATGTAACACTTTATTGCTCGCAAATGGAGTCCG
TTGGAAAACGCCAGCAACTAATCTAAATAGACATGGTTTATTGATGCAAGGATCCACACATACAGCTGTG
CTCAGTAATATTGAGATCTTTAGCCATGGTAGTTGCGAATTACGTAGCTCCTCACGCAACTACAATATAA
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ATGCTGCTGTGTTAAAAACACTCACCGCAACCGATAATTTTGACGGCATAAATAACGCAGCTTTCCCTAC
GAAAACTTCTGATAGTGATGAAGGAACGAACTACATTCTCTCCAACGATATTGTAATACAAAATGTCGCG
GCTACAAATCCTAGAAACAGTAGCTGTTTTAAAAATACAAAAGGGAATCTTATATTTAACGGAAACAATC
GTAGCTTGACCTTCAATAACATCACTACAGCCGTTGAAGGAAAAGCCATTTTAAATTCCTCGGAAACTTT
CCTTTCTATGTCCTGCTTTTCCAAACTACAGTTCTTAGAGCCTGTAAGCTCAAGAAAAGGGAAAAGTATC
GTAGTCTCTAAAGGCACCTTAATGTTTCGAACAAATAAGGAGTTGCTCTTTGATGGATGTTACTCTTCAG
ATAAAGGTGGCGCTATATGCTGTATGCCATCTCCTGGATCAGCACGCAACTCCTCACTAACATTTTCACG
CAACAGAAAAGTAACATTCTCTAATAATACATCCGTAAATGGTGGGGGAGCGATCTATACACAACACCTG
CGTATAATAGCCGCGGGTCCTACCCTCTTTACTAATAACATGTCTTCAGGAGATGTAAATTCTCGACCTG
GGGGCGGAGCTATCGCCATCGCTAAAGATGGAGAGTTATCTCTATTTGCAGAAGATGGGGATATTACCTT
TTCAGGAAATCTCACATCTAGAGGGAGACATTTCGAGAAAAATGCCATCCATTTAGAAAATGATGCTTAT
ATCAGCTACATAACAGCAAAAGAAGGGAGGTCTGTCACCTTCTACGATGCGATTACCTCTACAAATGCCT
CTACAGTTCCCCTACTTATTAACCAACTTACCGATGGGACAACGCATAAAGGCAGCGTTGTCCTTTCTGC
GAAAGACTGTGTAGCGTCATGCTCGTCCTTAATTTCTACGAATATGTCTAGGATTGCTCAAGATATTATA
TTAGCAGGAGGCTCTCTAAATTTAAATTCAGGTGTGATTCTCACAACAAACAGTATTACGCAACATCCTA
ATACTACGTTTGTTATAGATCAAAGCACCATGCTGAGATTGCAAGAAAATGCGCACATATTAAATATGAC
CATTCCTGTAAAACTCCAAACTTTAGTTTTGCGTCCCAAGGAATCTAAACGGAAATATAATTCGTTGTCC
TCTCGTCAGCCTGGGCAAATTATCCTCCTCTCACAAGATAAAATATTTTCCCTATCAGGATCTATAAATA
TCGATTTTGAAGATGAAGATTTTTATGAAAATCTAGAGCTAGCTAATCCTGTAAAAGTTCCCTTAATTCA
TATTGAAGCTCGAGAATTAGAAGATATACGTATTAAAATTGATCATCTACATGTTCCCACGAATCCTTAT
GGCTATCAAGGATCCTGGGATCTTCAATGGCTAGACACCCCCTCGCAACAGATAAGCACGCGCTTAGCAA
ATAATGCTGAGAAAACGGCCCAGCTGATATGGACGCCTAAACACTACCGCCCCCGTCTTATTGACACTCA
AGGGAATTCTTTAGTTCCCAATAGCTTATGGAATGCTTTTGTAGATATTCGTGGTATCCACAACCTTATG
GATACTGTCTCTGACGGCAGCTTATACCACAATGGCCTATGGGCTGCAGAAGTCTCTAACTATTTCCATA
AAGACCACCATAAAGATAACCGCGGATTCCGTCATACTAGTGGCGGCTATGCTTTAGGACTCTCACAACA
AACTCCCTCTAAAGATATTTTTAGCCTAGGCTTTTTCCAAATGTTCGGGGTTTCTAAAGATGCCTCCCTA
GCAAAAAATCATGAACATATCCTGGCAGGATCCGTATATGCCCAACATAGCATCCCTGTTCAACCCATTT
TAAATTGGTCTCTAGGGAACCTATGGGTTCGTCCTGAATTTTTATCAAAGATTTCCTCAGATATCCCTCT
AATTTTAAATATTCAAGCCACCTACAGCCATAGTAAAAACAAACTCACAATATCACGAAAATCTTCAGAA
ATTACCCATGGATATTGGAATACCCATTGTATAGGTGCTGAATTAGGATCTTCTTTATCCTTTGATTTCT
ATGAAGAACATAATATCTTTCATCATATCCTCCCCTTTATGAATCTCCAAGGAGTCTATGCTTATCAAAG
GAAATTTAAAGAAGAAGGAGAGAAAAAACATGAAATTACCAGCAGTAAATTAGGAAATATCTCCCTCCCT
GTGGGCATACGTTTGGAAGGACATACCTCACAATGGCCGATTTTCTATGCAACCTCTGTAGCGTTCATTG
CAGATCTATACCGTCAAAATCCCTGTTCTACAATTACTGCTACTTATGAACCTTTCGCTATATGGGAAAC
CTCAGGAACAAACCTAGAAAGACAAGCACTAGCAGCACAACTATCGATGCATTGTGCTATTTTAGAGAAC
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>ref|NC_003361.3|:c318056-315525 polymorphic outer membrane protein G family protein/autotransporter, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
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ACATCGCCTGCCAATACAAGCTGTTTTAAAAATAGCGGGGGGAATCTCACCTTTACAGGAGCGAACCACT
CCTTAATATTTGAAGATATTATCTCTACAGCTCAAGGAGCTGCGATCAGTGCAAATACTGATGCTAAAAC
CCTGAAAATGTCAGGATTCAATACCCTAGCTTTTGTTGCTGCGCCACAGGCAACCACGGGAAATGCTGCT
GTCTATGCTATAGGGACAACAACAATCAAAGAAAATAAGAAATTAATCTTTGGTAAGAACCACTCTACAG
CAGCAGGAGGCGCTATCCATTGCGCAAAAACAGGAGCAACCGAAGCCGTGCTAACGTTGCAACAAAATGC
ATCTATGCTCTTTAGAAATAACTCCTCAGCAACTACAGGAGGAGCGATTCATGCAGAGAAATTCATTCTT
AAAGCCGGAGGCACCACCCTATTTGAAAATAACCACGCTACGCAAAAAGGAGGAGCTATTTCCATTGCAG
GATCTGGGGAAATTAGTCTATCTGCAGATGACGGAAGTATTATCTTTAAAGGCAATACTATTACCGACGC
TGGAAATAAAGTAAGCAATGGAATTCATGTAGGGACAAATGGAAAATTTGCAAAGCTAGAAGCTAAAGAA
TCGCAGTCTATCCTATTTTATGATCCCGTAGTTGCTGAAGGTACAGCGGATAGTAATTTAGAAATTAACA
AAGCTGATGGTGGAACCTCCTATACGGGATCTATAATCTTTTCAGGAAGATACATAGAAAGTCCTCATAA
AAGGATGAAACACGTTTCTACATTCACACAACCCCTCACGCTATCCTCAGGATCTTTGGTATTAGAGAAA
GGGGCACATTTAAAAGCTAAATCTCTAACACAGACTGCAGGATCTAAAGTTATTCTAGATCAAACATCCA
GTATAGAAACAAAAGAAAATATAGATATAAAAGAGCTGTGGCTACGGCTTGATGATTTTAACACACCTAC
AGCAACTTGTATCTCTACATCAGGGAATGCCCATACCATTACTATTAAAGGACCTTTAGGGGTTTTTACA
GATCAAGAAACTTTCTATGACAATCATGCTCTTGCCTACAGCATAGATCAAGAATTCCTACAACTTGCTG
ATAAAGACATCACAAAAATCTCCTTAGTAGATATCCCCCAAGCGGTTAGGAAAAATCTTGATTCCCATAG
TGGGTACCAAGGGAAATGGTCCATAGATTGGAAAACGGTTCCAGGATCTACAAATGCAGGAGTGACAACT
CTCGGAACGAAAACAGCAACTGTACATTGGAGACCTACAGGATACATTCCTTTTGGAGGTTCTCAAGAAA
TTACCACGCCTTTAGTAGTCAACACTCTATGGGGAAATTTCTCAGATATCCGTAATTTAGAAAGAACTGT
AGAATCCCTAGCTGTCAATTCTCTATGCTCTGAAGGCTTCTGGGCTGCGGGAATTAAAAATTACCTCTAT
TCCAATAGCCCTGCTGAAAACTATGTTTTCCAACATCATAATGCCGGCTATGCCATTGGTATGAATAAAC
ATACGTTGTCAGAAAATGTATTTTCTGCGGCTTTTTCCCAACTCTTTGGTAAGGATAGAGACCATGCTAA
TGGTCATGTAGACCATCAAACACTTTCAGGATCTTTTTATGCTCATCACGTAGGCTCATTACCTATGCTG
CGCTTCCTTTGTGGGGGATCTAAAAATTGCCCTCCTGAACTTCAAGCATCGCCATCTATCCCCGTTATTG
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AACAGGAATGTGGTCTAACTACTCCTTAGCTGCAGAATTAGGATCCACATTTGTCTACACATTAAGCAAA
TGCCCCTCCATACTGAAAAACGTCTCTCCATTTGTTAAACTCCAAGGGGTATATTCTGAACAAAGGAAAT
TCTCTGAAGAAGGACTTCGTCGTTGCTTATTCTCAAGTACCTATCTAGCGAATCTTGCTCTCCCCTTAGG
GATTAAAATCCATGGTGTATGTCCTAGAGAACTATTTGCCTATGATCTATCTGCTATGTATGTTCATGAT
GTATTTCGTATCGATCCTGAAACTATGACACTATTTCTCATTGGAGGCTTAGCCCCTTGGACTACACACG
CCAATAACCTAGCCACCAAAGCTATAGTTGTTCAAGGTTCTGGAAGATTTGCCGTTAGATCGAATATTGA
AGTTTTCGCAGAAGGTAACTGTGAACTACGCTCCTCATCTCATAGCTATAACTATGATTTTGGTGCGAAA
ATACATTTCTAG
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GATCAGGCAGACACCAGCTGTTTTGCCAATTCCGCGGGAGATCTTACCTTCACGGGAAGCCGACGCCTTC
TCTATTTTAATAACATCACATCCTCAGCAAAAGGCGCGGCTATCAGCACCACAGCAGATGCTAAGACCCT
GACATTATCGGGATGTCTGAGTCTGATTTTTTATATGTCTCCTAAAGAAGACATAGGAAATGGAGCTATT
TATTCAAATAGCTCCATGCTGATTCAGCAAAATAGCGATGTTAGTTTCGGCTATAATAAATCTGCAGGGA
AAGGAAGTGTTATTCTTTGTGAGAAAAGTACAAGTGCCGGAGCGACATCTCCCACACTGACAATACAAAA
TAACGGCGAGTTTAAGGTATTAGCAAATTTATCAGCATCCTCAGGAGGAGCTATCTATGCTGAAAAAATG
CTCTTATCTGCAGGAGGAAATACAGTATTTCAAGCTAACGTCACTCAAGAAAAAGGTGGGGCTATTGCCA
TTGCTGCTAATGGAGAAATTAGCCTATCTGCAGATGGCGGAGATCTGACTTTTGAAAGAAATATCATCAT
CGAAAATAATGAAACTATCCGCAATGCTATTCATTTAGAAGATGGTGCTAAATTTCTACAGTTGCGTGCT
GCTAAAGACAGATCTATCTACTTCCATGATCCGATTACAACCACAGGAAATGTCGCCGATCGTTTGACTC
TCAATGCTGCTAACGGAGCGACTCCCTATGAAGGGACAATTGTCTTTGCCAGCGGAGTATCTTATGTAAA
CTCGCCTCTTTCTAAACTCTACTCATTTTCTCAAGATCTCACACTAGCCGCGGGATCTTTAATCTTAAAA
GACGACGTATTGATAAAAGCGAAATCTTTCGAGCAAAATCAAAAATCCCTATTATTCATGCATCCGGGAA
CAAGGCTACAAACAACCAATAATCTATCTATAAAAAATCTTCATCTAGACCTGAGTAAGATAGCAGCAAC
TGCCGTAGAGATAGCAGCAACTGCCGATGCTGCTGCTATAGAGATTTGCGGTCCTATGGTTATGCATGTT
GATGATGAGATATTTTATAATCAGGAAGCATTAGCAGATTCGTTATCTTTCGAATGCTTGCATGTTCGCG
CGCCACATTTAGACAACATCACTGTCGATGATGTTCCTCTAATCCCGATAACCACGATGGAAACCCATCG
CGGTTATCAAGGTAAATGGACAGTCTCTTGGGAAGAAGAGCATGAGATGATCTTTGGTAATGTCTCTACA
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AGTTTACCACATCTTTAGTTCCTAATAGCCTATGGAATCTCTTTTTAGACACACGCTTTGCTCAACAAGC
TATAGAAACAAATGCGCAATCACCAGGGAATGGGATTTGGATTTCATCTCTCACGAATTCCTTCCGCAAA
GGCTCTACTGAGAATAACCACGGCTTCCGTCATAAAAGTTCAGGATATGTCGCTGGAGGGAAATTTCAAA
CCCTTCAAGATGATATCTTTAGTGTAGGCATATGCCAGTTATTTGGAAGATCCAAAGATTTTGGATCTGC
AAAATCTAAAGATAAAGCCTTCTCGGGCTCTCTCTATGCTCACCATTCACGCTACCTCCTGCCTATTACG
CGTTTCCTAGCAGGGACATCAAGATCCCAACCTAGGTTCTTATCCAGAATCCCTAAAGACTTCCCTATTA
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AACAACTAGCTCATGGAATACCTACGGCTATAGCGCACAGATCGGAAGTTCCTTACCGTGTGCTTTGGAT
GTTTCCCATACATTTTTCCAGTATGTATCTCCATTTGTCAAATTGCATTGGATTTATGCTCATCAAGTAC
AATTTCAAGAACAAGGAATAAAACGGCGCTCTTTTAATAATAGCAATTTAAAAAATCTCTCGTTGCCCAT
AGGCCTTAAAATCCAAGGTCAATCACTACATCATCTTTCTTATGAACTCACTGGGATGTATATTGCCGAT
CTCTATCGTTGCAATCCTGAGAGTGTGACTTCATTAATCTCCGGAGGCCTACTTCCCTGGACAACAACAG
CGGCAAATCTTGGTAAGCAAGCAGCTCTGTTGCAAGGCTCGGGAAACCTCTCTCTCACATCACACATCAA
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TAAAGAAACACAAGCAGGCGCTGAATATACTTGCGAAGGGAACGTCTGTATTACTTATGCAGGGAAAGGG
ACTGCATTAACAAAGAGTTGTTTCACGGAGACTACAGAAAATCTTACCTTTCTAGGAAGGGGCTATTCTC
TTTGCTTCGATAACATTAATACAACAGCTAAACCAGCTGCTATTGAAGTAAGCGCTGCTGATAAGACATT
ATCAATCTCTGGATTTTCTTTGTTTTCATGTTCCGACTGTCCTCCAGGAACTACTGGACAAGGGGCTATT
AAGTCTGGAGGCACAGCCACTTTTGAAAATGATTTTAGCGTCCTATTTAAAAAAAATTGCTCTACAGCAG
CTGGTGGAGCGATCAATTGTAAGGGGCTCACATTAAAAGGGACTTCTGGGATTGCTAATTTTATAGAAAA
TAAATCTACAGATAATGGTGGCGCAATAGAAGCCTCTGGGGCTAGTTCTATTGAAAATAACTCAGGAGTT
ATCAGCTTTTCAGGAAATACTTCTGCAAAACATGGCGGAGCAATCCATTCAAATTCAGCGGTCACCATTG
CCAATAACCACAGGGTAGAATTTTCAAAAAACACAACTACGGGAACTGCGGATTCTTCAGGAGGAGCTAT
CTGCTGCAAGGACAATGCAGCACCTGAATTAAAATTCGAAGGAAACGCACAATTACTCTTCCTAGAAAAC
TCATCTCAAGTGAGTGGTGGAGCTCTTTATAGCAATAAGCTCACAATTTCCTCAGGTGGAACTACTGTAT
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GCCAGAAAATGCGACAACCTACAATGGAAGAGTTGTCTTCTCAGGAGAAACCCTATCTGCAACAGAGAAA
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AAGATGGCGTAACAGTAGAAGCGAAAAAAATCACGCAAACAGCTGGCTCTGCTGTGGTTATGGACGCAGG
CACGACATTACAAACTCCTTCTACTGATGGAGAGACCATCACCTTACCAGATCTCACCATCAACGTCGCC
TCGTTTGGGGGGGAGGGGGGTACCTCTTCGCCTGCTAAAGTCCACTCTCAAACAGCCAATCAAGCCCTCA
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AAAAACCGTACACATGTGTATGCAGGTTCTTTGTTCTTTGAACATTTCCATATGCTGCATCCTCAAAATT
ACTTGAAAGTAGGATCGAAATTCCCTCCTGCGTTCTTAGCTAACCTTCCTGAAAATGTTCCTATGATTCT
CAACATACTGTTTAGCTACAGCCATGCTGAAAATGATATGAAAACACGCTATACCAAGCGTTATTCTCCT
AAACCGGTCACCTATCCAGAAGTCACAGGTAGCTGGGGAACAAATTGCTTCGGTGGGGAGATTAGCACAA
GTTTCCCTATAGAACTTTCTGATTCCTACATGTTTGAGAGATTTGTTCCTTTCATGAAGGTACAGATGAT
CTACGGTGAACAGGAGAGCTTCCAAGAACCTACAAGTGAAGGACGTTCTTTTGAAAATAGCCATCTTGTG
AATTTAGCTTTACCTATCGGAGTGAAGTTTGAAAATATCTCCTCAAATAACAAAGATACTTTCGATCTTA
CACTTGTCTATTCTCCAGATGTCTATAGAAGTAATCCCCACTGTGCGACTTCTTTAGTTGTTACAGGAGC
TGCTTGGGAAACAAAGGCTACCAACCTAGCTCGTCATGCATTTGTAGTTCGTGCTGCAAATAACTTTACC
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>ref|NC_003361.3|:c326420-323820 polymorphic outer membrane protein G family protein/autotransporter [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAACATCCAGTTTACTGGTTCTTAGTGTCTTCGGGGCTGCTCGCTTCAACCTCCTTGAGCTTTGCAG
CAGCAGTTCAAGAGACTCTAAATTCCTCTGATAGTTATAATGGAAATGCAACAACAGATGCGTTCCAAAC
TAAAGAAACAACAACAGGTGCTGAATATACTTGCGAAGGTAACGTCTGCATTACTTATGCAGGGAAAACA
ACACCTTTAACAAAGAGCTGTTTCACAGAGACTACAGAAAATCTTACTTTTATAGGACAGGGCTATTCTC
TTTGCTTTGATAATATTACTGCTACAGCTAAGCCAGCAGCTATTGAAGTAAGCGCCGCTGATAAGACATT
ATCAATCTCTGGATTTTCTTTGTTTTCATGTTCTTATTGTCCTCCAGGAACTACCGGACAAGGGGCTATT
AAGTCTGGAGGAACTGCTACCTTCGACAACAACTCTAAACTACTTTTCAAGAGCAATTGCTCATCAGAAG
AAGGCGGCGCAATTAACTGCAAAAGTCTAACACTTAAAAATTCCTCCGTATGCGCAAATTTTATAAAGAA
TTCATCCGATAAAAAGGGTGGAGCTATTTACTGTAGTGACGAGAATCTCCAATTAGAAAATAATGATCAG
ATGCTTTTCTCTGAAAACACTTCCAAAGAAGAAGGTGGGGCTATTTATGCGAAAAAACTCTCCATCATCT
CTGGAGGGCCAACCCTATTCTCTAATAATTCAACCTCTAAAGCTGCTGACCCTAAAGGCGGGGCTATTTG
CATAGCTGATGCAGACAGCGAATGTAGCTTAACTGCCGAAAATGGGGATATTATTTTTGATGGAAATAAA
ATAATAACCACGGGCACTCCTTCAACGAAAAGAAACTCTATCGATTTAGGCTCTGGAGGGAAGTTCTCTC
AGTTAAGAGCTAGAGATGGTTTTGGCGTTTTCTTTTACGATCCAATCGCCAATAATGGCAGCGACACTGA
TACATTAGAAATCAATAAAGCTGACGGAGCTGCAACCTATTCCGGTCGTATTGTCTTTTCTGGAGAAAAG
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CTGGATCTTTTGTACTTAAAAATGGCGTAACAGTGTCAGCAAAGCAAATCACCCAATCCGGCGGCGCTAT
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CTAACTGACCATGCTCCAGCCGCTCATTATGGCTATCAAGGTCTCTGGACAACATCCTGGGCACAAGGCA
CAGCCACAACCTCACAACTAGCTACTTTAGCTTGGCAACAAACTGGCTATAACCCTAACCCTGAACGTCA
AGGACCTCTAGTCCCTAATACCTTATGGGGATCGTTCTCAGATGTACGCGCCATTCAAAACCTCATGGAT
ATTAGTGTCAATGGTGCTGACTATCAAAGAGGCCTCTGGGCATCGGGATTAGCTAACTTCTTACAGAAAA
GCGGAACGGAGACAAAACGCAAGTTTCGTCACCATAGTGCTGGATATGTATTGGGAGCGTATGCCAAAAC
ACTTTCCGATGATGTCTTCAGCGCCGCTTTCTGCCAACTCTTTGGAAGGGATAAAGATTACTTAGTCTCT
AAGAATAATTCTAATATCTACGCAGGATCTATTTATTATCAGCATACCTCCTTCTGGGATGCTTGGGATA
ACCTGCTACAATCTACTCTCGGCGCGCAAGCTCCGTTAGTACTCAATGCACAGTTAACGTATAGTCACAC
GTCTAACGACATGAAGACAAATATGACGACTAAATACGCTCCACAAGGCGTCGTCTACCCAGAGATCAAG
GGTGATTGGGGTAACGACTGCTTCGGAGTGGAACTCGGTGCTACTGTGCCTATTGAATCTCCCTATTCTT
CCTTATTTGATATGTACTCTCCTTTCTTAAGATTCCAATTGGTTTATGCTCACCAAGAGGACTTTAAAGA
AAATAACAGCACTGAAGGAAGATACTTTGAAAGCAGCGATCTCACAAACCTCTCCATGCCTATCGGCGTG
AAGTTTGAGAGATTCTCTGACAATGACATAGCTTCCTACAATGTAACTTTGGCTTATGCTCCGGATCTTG
TAAGAAGCAACCCTGATTGTAAAACGTCTCTGCTCGTTAGCCCAACCACAGCTGTTTGGTTAACTAAAGC
AACAAACCTAGCTAGACATGCTTTCATTGTAAAAGCAGGAAATTATCTTTCCTTATCTTCTAACTTTGAA
ATCTTTAGCCAGTTTGGTTTCGAGCTCAGAGGCTCTTCTAGAACCTATAACGTAGACCTCGGATCTAAGA
TCCAGTTCTAA
>ref|NC_003361.3|:c329323-326543 polymorphic outer membrane protein G family protein/autotransporter [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGGTGCATGCGGAAGTGGCTTTAACTCAAGAATCTGTTCTCGATGCAAATGGAGCATTCAGTCCGCAATC
TACAAGCACTGCGGGAGGAACTACCTACAACGTTGAGAGTGATATTTCTATTGTAGATGCAGGGCAAGCA
GCGGCGATGGTTTCTGCAGCCTTTGTTCAAACTGCAGACGATCTAACGTTCAAAGGCAATGGTCGTAGCC
TAGCGATAGAAAACGTAAACTCTGGAGCTAATCCCGGAGCTATTTATGTTTCTGCTGCGGATAAGACTCT
TACTCTGACAGACTTTTCTACATTGAGCTTCAAGAAATGTCCTAAGCATACCGTGAATACGGGTAAAGGA
GCAGTGAAATCTGGAGGAGCATTAAACTTAGCGAATAATGCTAGCATTCTTTTTAATCAGAACCATTCCG
CTGAAGATGGTGGCGCCATTTCTTGCAAAGCTTTTTCTCTAACCGGCTCGAGCAAGGAAATTAGCTTCAC
CACCAACACAAGCACGAAAAAAGGTGGAGCGATTGCTGCTACAGGAGTTGCTAACCTTTCAGACAACCAA
GGAAAAGTCATATTTTCTGGAAATACTGCCGTGAATTCTGGAGGAGCAGTATATGCAGAAGCGAATACGA
CTATTGCAGGAAACAGCGCTGTTGTTTTTAACAACAATGCTGTTACTGGAACAACAGATGGTTGCGGTGG
TGCTATCCATTGTAGCAAAACAGGTGCGACACCGGTCCTTACTATAAGAGATAACAAAGTCTTGCTTTTT
AAGGAAAATACTTCTGCAGCAAAAGGCGGGGCTATTTATGCGGATAAACTCTATCTAACTTCTGGTGGAC
CTACGGTATTCGTAGGGAACAAAGCGACCAACGCCGCTCCTAAAGGTGGGGCAATCGGTATTGCTGCCAA
TGGAGAATGTAGCATAACAGCGGAACACGGGGATATCACTTTTGAAAACAACCTCATAGCTACAGCAAAT
AACGCTACAGTAAAGAGAAATGCGATTAACATTGAAGGCAATGGGAAATTCGTAAATTTACGCGCGGCTT
CTGGAAACACTCTTACCTTTTACGATCCTATAGTTGTTGGGGGTACTGCTGCAGATCTTCTCACTTTAAA
CCAAGCTGAAGGGACTAAAGTCTACAATGGGAGAATTATCTTTTCTGGAGAAAAGCTCACAGAAGACCAA
ACTGCCGATGCCGACAACTTAAAGACAGTATTCACGCAGCCTATCGCATTAGCAGCTGGAGAGCTTATCT
TAAGAAACGGTGTGGAAGTAGAGGCAAAAGCTGTTTCGCAAACAGCGGGCTCTCTAATTTTGATTGATGC
AGGAACAAAGCTGTCTGCGAAAACAGAAGATGTCACGCTAACCAACCTGGCGATCAATCCTAATTCTTTA
GATGGAACAAAAATCGCTGTTATTGCCGCCGTAGCGAATGCCAAGAATGTCACTGTAACAGGAGCTATTG
GTATTATCGACCCTACAGGAAAATTTTATGAAGACCATAAGCTAAATGAAACATTAGCTTTAGGAGGAAT
TCAATTTTCTGCAAAAGGAAGCATAACAACGACAGATGTGCCTAGCACAACGACACGTTCTCCTGCACAA
CATTATGGGTATCAAGGAAACTGGTCGCTCTCTTGGATTACAGATAACGGCTCAGATCCTAAAACACAAA
CAGCTGTCTTTAACTGGAATAAAACGGGATACAATCCTAATCCTGAACGTCGTGCTCCCCTAGTATTAAA
TAGTCTTTGGGGATCCTTTATGGATATACGTTCTATTCAGGATGTCATGGAACGTAGCGTAGATACACTA
TTAGAGACACGTCGTGGCCTTTGGGTTTCTGGAGTGGGGAATTTCTTGCATAAAGATCCCAGCGCAGAAA
ATCGCAAATTCCGTCATATCAGTTCGGGATATGTATTAGGAGCAACAACAAATACCTCTCAAGAAGATAC
GCTTAGCGTAGCTTTCTGTCAGCTATTTGGGAAAGACAAGGACTACCTTGTAGCGAAAAATGCTGCAAAT
GTCTATGCAGGATCTATCTATTATCAACACGTAAGTAAGTTTGATGATCTCACACGATTATTTAACGGAC
CAAACACCTGTTGTTCAGGATTCTCCAAAGAGATTCCTATTTTCTTAGATGCGCAAGTTACCTATTGCCA
TACCAACAACAACATGACAACGACCTATACAGATTATCCTGAAGTTAAAGGCTCTTGGGGTAATGATACT
GTGGGTGTCGCATTATCTACTAGCGTGCCTATTCCTATATTTACCCATGCTTTCTTTGATAGCTACGCTC
CATTTGCAAAGTTGCAAGTTGTCTATGCTCATCAAGAGGATTTTAAAGAACCTACAAGAGAAGGCCGTAC
CTTTGAAAGTAGCGATCTTCTCAATGTTTCCGTCCCTATAGGCGTGAAGTTTGAGAAACTCGTCTACGGA
GAAAAAACTGCTTATGATCTTACATTGATGTATGTTCCTGATGTGTACCGTCATAATCCAAACTGCATAA
CAGGATTCGCTATTAATGATGTTACTTGGTTAACAACAGCAACGAATCTTGCTAGACAAGCTTTCATAAT
TCGTGCTGGCAACCATATTGCCGTAACATCTGGATTTGAGATGTTCAGTCAATTTGGTTTCGAATTACGA
AGCTCTTCAAGAAATTACAACGTAGATCTTGGAGCTAAGGTCTCTTTCTAA
>ref|NC_003361.3|:c334233-333958 hypothetical protein CCA00286 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCTAGGCAAACTCGTTCGGGGATTATCCTCTCTTATTGTTGTTCTTTCTGCATTGAACGTAGGAATTA
TAGGATTAACTCATCATAAAGTAAACCTTATTGCTCGACTGTGCGGGGGCGCAAGCGCAACAGCAACACA
AATTACCTATATTATTATTGGAATCGCTGGAATGATTTCTTTAGTAAGCTTTTGTAATTGTTGCTGCAAA
AAGCGTCGAGGGGGAGATTGCTGTTCAAAAGGTCATGCATCTCATCACTGTGATCCTAAAAATTAG
>ref|NC_003361.3|:334432-334734 aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACACAACCCTACATAACTAGAGAAGAAATTTTACTTTTAGCGAAGAGCTCAGCTTTGGAATTAAGCG
AAGAGCTGATTCAAGAATACGAATCTTCGTTAAACGATGTCATCGGCATCATGAAAGCATCTATTGCCTT
GGATGTGGCCGATGTAATTGTTGAGGTTGGTCTATCCCACACTGTTGGACCTGAAGATTTGCGAGAAGAT
GTCGTCGCCTCAAGTTTCTCTCGTGAGGAGTTTCTTACCAATGTCCCCGAGTCTTTAGGGGGATTAGTGA
AAGTACCCACAGTAATTAAGTAG
>ref|NC_003361.3|:336230-337693 aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGCGATGTTTATGCTGATTGGGAATCCGTCATAGGTCTTGAGGTCCACGTAGAATTAAATACCAAAT
CAAAGTTATTTAGTTGTGCACGAAATCGTTTTGGTGATGAGCCTAATACCAATATCTCTCCTGTATGTAC
AGGAATGCCAGGATCTTTGCCTGTATTAAATAAAGAAGCTGTAAGAAAAGCGATTTTATTTGGTTGTGCG
GTTCAAGGAGAGGTTGCTTTATTAAGCCGTTTCGATAGAAAGTCCTACTTTTATCCCGATAGCCCTAGGA
ATTTTCAAATTACACAGTTTGAACATCCTATAGTGCGTGGGGGACGTGTAAAAGCTATTGTCCAAGGCGA
AGAGCGTTATTTTGAACTTGCCCAAGCGCATATTGAAGATGATGCAGGAATGTTAAAACATTTTGGGGAG
TTTGCCGGGGTTGACTACAACCGGGCCGGTGTACCTTTAATAGAGATTGTCTCTAAGCCTTGTATGTTTT
GTGCAGATGATGCTGTTGCTTACGCCACAGCTCTTGTCTCCTTATTAGATTACATTGGAATTTCTGATTG
TAATATGGAAGAAGGGTCCGTACGTTTCGATGTAAACGTTTCTGTACGTCCTCGCGGTAGTGACGAACTA
CGCAATAAGGTAGAGATTAAAAACATGAACTCATTTGCTTTTATGGCGCAAGCTTTAGAAGCAGAACGCT
GCCGACAGATAGAGGCTTATTTAGAAAATCCTAATAAAGATCCAAAGACTGTCATTCCTGGAGCCACATA
CCGTTGGGATCCTGAAAAGAAAAAAACGGTATTGATGCGTCTTAAAGAACGAGCTGAAGATTACAAATAT
TTTATAGAGCCTGATCTTCCTGTATTGCAATTAACGGAAGCGTATATCAATGAAATCCGTGATACGCTTC
CTGAGCTTCCTTATGACAAATACCAAAGGTATTTGCATGATTATGCGCTTGCTGAGGATATCGCTGCTAT
TTTAATCAGCGATAAGCATATTGCGCACTTCTTTGAGCTAGCTGCTGCAGAATGTAAAAACTACAGAGCT
CTTTCTAATTGGGTGACTGTAGAGTTTGCAGGACGTTGTAAAACGCAAGGTAAGAACCTTGCCTTTTCAG
GGATTCTTCCTAGCAGCGTAGCTCAGCTTGTCAATTTTATTGATAAGGGAGTGATTACTGGAAAGATCGC
TAAAGATCTTGCCGATATGATGATGGAATCTCCAGAAAAGAGCCCCGAAGCTATTCTTAATGAACATCCT
GAGATGTTGCCAATGACAGACGAAAGTGCTTTAGTGGCGATTATTTCTGAAGTGCTAGCTGCTAACGCAC
AATCTGTCATCGATTATAAGAATGGCAAGACCAAAGCTTTAGGATTTTTAGTTGGTCAAATTATGAAGCG
CACTCAAGGAAAAGCACCTCCAAACAGAGTGAATGAGCTTTTACTTGCTGAATTAGATAAATAG
>ref|NC_003361.3|:c338965-337820 hypothetical protein CCA00290 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGTAATCCTATAGATCCTTTAGATCAATCACATCGACCAGTTCCTCGTAATCAGCTACCTGCGCCTC
AGATGGGTATCGGGCATCGTATGCGCACTTCTTCCACAGGATTTTTCGGGAGACTTCTCTCCCTTCCCGA
TCGCAATCCTAAGATGCGCTATATCTTTGATATCGCGATTATTGCCATCGCTGTGATTTCTATTGTTGGT
ATTCTTGTTGCCTCTCAGGGATCTGGATTGCTGCTATTTGGATTAATCCCTGGATTCATTGTTGGTGCGT
TGGGAGTGACTCTTCTTATTTCTGATATTGCAGATACACCAAAAGCTCAAAAAATCGCCGACACCGTCAC
TGCTGTTCTTTTACCACTTATTATTTTAGGAATAGCCTCAGCATTAATTGCATCAGCATATTTTACCGCT
GGGGGAAGCACTCTTATTTTTGCGAATCCGCAATTCCTTATGGGCTTTATGACCATAGGTGTGGCTTTAA
TCTCTTTGAGTAAGGTCACGTTCCAGCATTTTAAAACTGAAGCTTTGATAAAAGCTCAGCAAAAAGTGAT
TAAAGCTTCTGAGGAATCAATACCTCCGGATACTCTTCATGAAAAAGACGCAAAGCGTGTTTCTCAAGAG
AGAAAGAGAGATCTTGCTTCGGAGGCGAGACGTGAGCATGAAGATCGAGAAGCACGTACGCATACACGTC
ATCAACGTATTTCTAGAAGCTCTCAGGGAGTCCTTCAGCATAGAGCGCAAAACCAAGTAGACGTTGAACA
AGCTGATCTTGATCATTCGCAAGAGGGATCTAACCCCTTTGTACAATACGACTTCTCTTCTTTACATGAG
GCTTATAATCCCTTTACGCACGGCTATCTACCGCCTAAATCTCCAGAAGAATCATCGTCTTCTGCGCAAA
ATATCCCCTTAGGTTCACCTATTCTCGGAGACACTATAAGAACAGGTCCTGTTACATCAACACCACGCAG
AGTATCTCGCGTAGGAGCTATAGGATCCTCGCGATCTAAAAATAGAGAGGAGGATGAAGAAAGACGAGAA
AGAGATCGAAATCAAGCTGATGATGAATCTTCAAATTTAGAATCTCCAGACTTACAACGTAAGCCAAACA
GAAGAAGGAAAAGAAAGAAAAGCTAG
>ref|NC_003361.3|:c339764-339246 hypothetical protein CCA00291 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCATTGTTGTGAAGTTTATAGAAAAAGCTCCGAGATTTATTTAGATAGCACTTTTCCTGAGAGGGTTA
TAGCGCGGCGCTGCCAAGGTAAAGCGAAACTCTATCCCAAAACAGCGATGGCTATTGAGGTACTTGCTGC
TGTTATTCTCGGCACCCTCAAAATTATTACCTTCCCCTTAGCGACATTTTCATCTATAGGGTTGCTCCCC
ATTGCCTGCGCATTAAAAGGTATTTCTTCAAGAAGCTGCTCCCATTTCCTTGCGTATTTAGGCGCTTGGT
TCATCAGCTTATTAGTTTCTGCTCTTATTATTGCTGCGATTTTCGGCTTAGTTATGATTGCTCCGGAAGC
TGTCTTCTTTATGATTGGTGTCTGCGGAGCCTTGGGAGCTAGTGCAACACTATTGCACATCCATAGGGAA
TTATTTTCTTTAAGATCTTTACAAACTCAAGAGATCAAAGAAGTTTCTGACGAAACTCGATCTTCCCCTT
CTCCCAGCCCTAGTGCTCGCCTCCCTTAG
>ref|NC_003361.3|:c340842-339892 hypothetical protein CCA00292 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTGAAGTTGTTATTTCACGTGATGACTCTTGCTGGTCATCTGCTCTCCACTCCCATCTATATTGTTT
ATGATGCTTGTGACATCGATAAAGAAACGTTGGACACTCGCCCTAAACAACTCCCCTTTTCTCTACAAAC
GCAGTATTTGCAAGTAGAAAACGCCGACTTTAAGAAATTACCGAACCAATCTATTGGTTACCGTCAATTC
GATACGACTTGCCTTTGTACGCTTCCTATAACCCCACAATCAGGAATGCTCTTCTCCACAGGTTATGTGG
GAGCAAATATCCTTTGGAATAATACACAGCCCGTTGTTGGAGACCAAAATTCCCTAGGATACTATACATT
CGATGATAAGTCCTACTATAGCTATGTACTGTTATCCACGGGTTTTTACACCTTGTCGTTAAAAAATTGG
CAATGGTCTGTGGTGTTCTCTGCTCTCCTTGATCCAGAAAACGTAGAAGCAGGTTATGGGCTATATCAAG
CTATACTTTCTGGAAAATACCAAGCGACCCCGCAGTTATCCGTAATTTTTGGAATGATTAATGAAACGGG
ATTGCATCAAGAAAAAGCCTGGCCTTTATTAGGTGCTACCTATAAGCCTAATGACAAGCTCACCATCAAC
TGTATTTATCCTATAAACTTCTCTGTAGAGTATAGTTGCACTTCTGTGTGTGATTTTGGAGCTGCCTACC
GCCTAACCCGATTCAGAAAGAAACTCCACGCCAATAACCTTTCCTCCTCCAAAGGGATTTTTGAATATCA
AGGCCGAGAAATTGAAGGCAGTGTTAAACTCATCCCCTGGCCAGGCAGTTTTATCAAGCTATTTTACGGA
TGGTCTATAGGCAGCGATATCTCACTAGCAGATAGCCATAACAATAACCTGACAAATTATCCTTTCAAAT
CTTCGACATTCTTTGGTGGATCTGCTGCGCTTTCCTTCTAA
>ref|NC_003361.3|:c341969-341067 ribonuclease HIII [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCTACACCGTTTGTAACCACGCTCTCACCTTCTTTACATGGGCTGCTTAAAGACCGCCTTGAGGAAA
AAGGCTTTATTTTAACACAACCGCAATACACGATTTTCCAAGCGCGCTCTCCCTCGGTAACGTGCGTTCT
CTATTCCTCAGGAAAGCTTGTTGTTCAAGGGAAGGGATCTAAAGAGTTTATCAAATTTTTCTTAGAGCCT
GAGATTCTGCTCACATTTACCCATAACCGTGTAGAAGAAGATCTTCGTCCTCGCCTAGGTGTGGATGAAT
CTGGAAAGGGAGATTTTTTCGGTCCTTTATGTATTGCTGGAGTCTATGCTAAAGATGAAGAGACTCTGAA
AAATCTCTACAAAACAAAAATTCAAGATTCAAAGCTACTCAATGATGCGCAGATTCTCTCCTTAGCAAAA
ACCATCCGTGCTTCCTGTAGCTGCGATGTTATGATTCTTTATCCAGAAAAATATAATGAGCTTTATGGGA
AATTTCATAATCTCAATATTCTTCTAGCGTGGGCACACGCAACAATCATTGATCAACTCGCTCCACGTCC
TTCTGGAGAGGTTTTTGCTATTTCCGATCAATTCGCTTCCTCAGAAAGCGTTTTACTCAACGCTTTAAGG
AAGAAAAATACCGATATTTCGGTCATTCAAAAAGTACGTGCAGAACAAGATATCGTTGTCGCTGCAGCAT
CTATATTAGCTAGAGAAGCCTTTATCACAGCAATGACAAAATTAGAACAACGCTTCTCCTTAAAGCTACC
TAAAGGAGCCTCTGCGCAGGTAAAATCTGTAGGGAAATCTATTTTAAATAGCCGGGGAAAAGAGGTTTTA
TCTCTTATTTGCAAAACACACTTTAAAACATTCAATGAAATTTGCGACTCTGCTTCTGCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c342249-342124 hypothetical protein CCA00294 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATTTGTTCTGCCATAGAGATCCCTTTTACAAGGTCACTGAAATAAAAAATTCTGGATTTTCTAAAG
ACTTCCCAACCTCAACCTGGGAGAAAAATTTCTCCTTATGTTCAGGTCTTGCCTAA
>ref|NC_003361.3|:342232-342663 hypothetical protein CCA00295 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTCTATCATTAAAAGATGTAGAAGCCGCAACATCGATACGCTATTCCTGCCTAGAAGCTATAGAAAACGG
CTGTTTGGGAAAGCTAATTTCTCCAATTTACGCTCAGGGATTTATAAAAAAGTACGCCGCATATTTGGGA
ATGGACGGTGAGCGTATTCTGCAAGAATATCCTTATGTAATGAGAATCTTTAAAGAGTTTTCAGAACAGA
ATATGGAAATGCTACTCGATTTAGAGTCAATGGGAGGAAGAAACTCTCCAGAAAAAGCTATCCGTACTTG
GTCCAATCTTTGGTGGGTAGCTCTTATCACCATTAGCGGTATGGCGATTTGGTGGCTGGGATCTTTGCTT
TCTATTTTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c344079-342733 hypothetical protein CCA00296 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTGTGGACCCATAGGCTCTTGTAGTTGCAAGTGCTATACAGAAGAAAATAGTCGAGGTGGTCACGAAG
GTCGTGACAATCATGAGGCCTCGCGACCCATAATGACACAACCAGGGAGACAAACTACCTTAGAACTTAA
GATAGGGGATGAAGATCTCCTTGATACCGTCGCAAAAGCTGGTCATCTTGTAGAAACTATGTTAAGCAGC
CCAAGAACACAACGTGGGGCCACGTATTGTCAGGAACATTGCGGTCCATGGTGCGACTCCCACTGTCCTA
ATTGGCTCTCGCATTGTTTCCAATGTCTTTGTGCTTGCGTGATAGATGAACCAGGTCCTTCAAGAGAAAG
TCGAGATCTTACAGCTTTTTTACAATCCATGAGAACAAAGTACGGCCCTGTTGTTTTAGGACTAGTTTTA
CAGCAAGGAGGTCATGATTGCGGCTTGCGCATGGCTGAAGGGAAAACCTTGAATGAAAATGAGAAAACAG
ATTTTGAAAGTCTCTGCTCTAGCTTTGGCAAACTCTTTGTAGAGAAGCTCATGGGAGGAATCCAAACGGC
TTTGTTTAACATAGCTGATGACCCTGAGAAGATTCCCAGTAAAGAGAGTTTCAATGCCCTAATGGCCCAA
CGTGGGTTTACGGACTTTAAACATGGACACAAACATAATCCCCCTACATGTTGGATTAGTCACTCCGCTA
GAACTGAAGAAACAAAGCAGAAAGGGGCTGGAGGAAAAATTCATCAAGCTAAGCTCTTAGATTTTGACAA
GCTCATGACCCAACTGGCACATCTAGAGGTTATCCCTATTGCAAATGGTGGAGTCTATCCTCTAGGAAGA
GAAGCGGAAACAGTATGTTCTCTACTAAAAAACGCCATATATTGTCTCTCTTCTGGAGCAGCATGTTTCG
AATCTCCAGACAAAACGTATGGTTTAACCTTCAATCATGACAATCTGCTACAGTTGATTCTTCTGTCTCT
TTTAGCTGCAGGTTATGTCCCTACAGACAAGGAATTTGACCCTCCAACACCCTGGGCACAGTTAGCCGAA
TTATCGCAATTTTTAAGACGCGATGGGCTAAAACCTCTTGGACCAAAGAAAAGAGGTCCTCGCCCTCTAG
ACCCTGATATTCAAATAGACGGCATGCATGTAACAGATGGCCCTTCTTCAGATCTTGAGTCAGAAGATGA
TTCTGCTTCAGGGTCACGTCCGGCTCCAGAGGCCTGCCCACTTTCAGACTCGAGACCACCAGTGAATACT
CGCTCCTGGTTCTCACCTGAGCAGCAAGAAAGATTACTATCCCTATCGGGGAAAACAGAGAATATTTTCT
CTATAATACTAGGATAA
>ref|NC_003361.3|:c345705-344368 hypothetical protein CCA00297 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTGCTGCCCTGGAATTAGCGCGGGCTGGCGTTCATCTCAAAATGCCTGCTCAGAAGAAAGCCTTGCTT
TAAACGGAATTTCAAAACAACCTGGATCCTCTTCAGAATTTCATCTGAAAATTGGAGATCCTTCATTACT
AGATACAATTCGAGCTGCTGGAGATCTTGTTTCAGATGCCTTGAATTCTGAAAGAGTACAAAGAACAAGC
CAATTTTGCCAAGATTCTTGCAGACCTTGGTGTGCAGACTCTTGTTGGAGCCCCTGCCTATGTTTCTTTG
ATTGTCTTTGTGCATGTATGATCACCCCAGGAGAAGCTGGCTCTCAAGAAAAACAAGATGAGTTGTCTGA
ATTCATCCAAAGTCAAAGAGATTTGTTTGGGCCTATTTGCGTGGGTATCGCCATGAAAAATGGTCCCTGG
GATGTCTCTAAGTTACTCGCTGAAGGTCAAACTCTATCCGAAGATCAGAAAAGCCTATTTTCTGAGAAAT
GTATAGAAGCAAAAGAGCAGCTCGGAAGATGCTTAAAAGGAGGATCGCAACATGAGCTCTTTAAAGTTGC
CAATGCGGCTCAGCATCTCCCTTCAAAAGGTTCTACAGAGATGGAAAATGTGAAGAAGTCCCGAGAAGAA
TTTATTAGCTCTAAAACACCTCCCTCTCTTCCCACATGTTTGATTCTTTACCCCAATGAGAATGCCGAAG
GCGCTTCTAACGAACAAAGGTCAGGGTATACTTTGAACCTTCAAAGACTGCAGCAGCAACTCAGCCAATT
GGAAGTATTAGATTTGAACTCTAATGAAATGGGTTACTTAGGCTTTCAATCTCGAGATGCTGTGGGTGTT
TTGATTTTCACTTTAAGCAAATACGTTGATGAAGCGAAAAATACCTTTGATTCTCCAGGGTTTGGATTAA
CTCTTGAAGAATCAAAATACCGTACTTTACTTCTTCTTTCTTTGCTATCTTTAGGATTTACCCCAGTAGG
TGCTGATCAAGAACTCCCCATATGCTTAGAGCAATTACAAAACACAAGCAAAGAACTCTATAAAGAAGAG
AAAAACGCTCCTAAACCCGCTCTTGATACACGTTCCTTAATGGGGACAGAAGTCAAAGTACGTTCGGGAG
GCCTTCCTCTACCCAAGTATGGACAGAAATCATTTATTGGCGGACGCCTACCAGCGGCTATGCGTAGTGA
TGCTGGGGAATCGCGGGTTGATGGAACTCTACCTGAAACCACAAATAATGCTGACCTTTGGGATCCTACA
AATCCCAAATCTCAAGAAGCCCTTCTCAAAATGGCTAAAAACATTACAGCAATGACTTCGAGTCTATTTT
TAAGATAA
>ref|NC_003361.3|:c347629-346028 hypothetical protein CCA00298 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CAAATCAGACAGAAAACGATCAAGACGATGGTAGCATAGCATCTGCACCGGTAGTTACAAGCCAACCCCA
GCCATCATCAACAACAACAGAAATGAAATTGCTATTAAGCCCAAACAACGAGGATGGTCTTTTACAAACT
GTTGAACGTGTTCAACAACTGGTAGAGGATTCTCAACGGATAATTAAGAATCCTCATATACAACAAGGCT
GTTTGGTCTGTTACGATCAGTGCGCGCCGCGCTGCTCCTATCGTTGTGGATGCTTTGGAAGTTGGCTCTG
TGCCTGCTTTAAAGCCTGTTGTATTGTAGAAACCCCAATAACGACGAACATCCCTAAGGTTATGCAACAA
ATGGATAAGAAGTATGGGCCTTTAAGTCTAGCTTTAGCGCTGCAAGAACTGCGCTGGGAGATTACTAAGA
TGGCTATTAATAACCGCCACATAACAGAAGAAGAACAAGAAGATCTTGAGAAAGCATGTAAAAAAGCTAA
AAAGAAACTTACCGGATCTTTCGTTCATTTATCCCAACAATATTTCTATGACCTTACTAAAGATCTCCCG
GGAAGTCCACTCGCAAAATCTGTTCTCCCTCTCTTATTTAAAATTATGAAAGAGAAATCTTGGACACAGC
CTATCTACCAGCATACGCCTCTGAAATGTTGGATCTTAGAACCTACCACTGAAGATGAATTGCCTCTATC
TCGGTTAAGTCTAGATAGATCATCTCTATCGCCTGCAACCGATAAAAACATGTATCCGGATCCTACGCGG
GCAATTGGGATAAAATACGACAAAAAGAAAATGACAAGATTCCTCTCAGACTTAGAGGTTTATTCTCTAG
AAAGCGGAACTACAGGAAAATTAGGGGTTAAAGAAGCACATTTAGTAACTACAGTATTTGATATTCTACG
CCTCATGAGTGCGGGAGAAGATTCCCCCCTAACACTCTCTGACGGATGTTTAGGTTACGAGATGGAAAAG
TTCGTCAAACTCTTTATGTTAATTTTAACTACCTGCGGTTATGTTCCCCTGGATGACAACAAAACGACTG
ACATTAAGTATGATGATCCGAACGATGAGCATGCACAGATATACAAACAAGCCATGTTAAATTATAACAA
CCCCAAAGATGCAGCCGCCCCACTATCGCGACCGTTAGAAAGGAGGAGACAAAGCCTGGGAGATGAACTC
CTTGGAGCACGTCCTAAAACGAAAAAAACCGTAGGATTTTCCCAAACGGTACTCATAGAATCTTCTACTT
CCATAATACCCTCTCCATTATCAAGCTCAACCCCCTCGTCTCCTTTATCAAGAAGACCTCTTGTACGTCA
AGATAGTGTACGCACGTACTCCACGCCTTCGGATGATTACCAACCTCAAGTTGATCAAGAATGGTTGCAA
TTACAGCTGGATGGAATCAGCGAGAGTAGTGATGATGATGATGAAGGCATTGAACGTCAACGACAACTCG
TCAATAGCTCTCTCCGTTTAGAAAAATTATTTGCTGCTATGCGACAAGAGTATGGGGAATAA
>ref|NC_003361.3|:348049-348915 hypothetical protein CCA00299 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTAAACGTGACCCATTGGCTGAAATATTTTCCTAAGATATTGGTACTTGCTTTTGCAATCTTAGGAG
TATTATCTCCAGCTGAAGCAGCGAAGAAACACTCTGTGCCCATGACCATGGCCTATTCTTTTGGTGATGT
TTTTGCTCATTTAGAAAAAAATGAGGAGGAAACGTTATTTTGCATCAATGTGGATACCGTCATTCAGCAT
AAGTATATAGGTTCTCCGGGTTGGCATCAAAGTAGGTTATCGAAGCTTTCTACGCGTTTAGGAGATTTTT
ATAACGCTAAGAGACGTGTGGAAGAAGAACAGGTTATTGTAGATACATTGCTAAGCAAAAGGTGTTTGGA
GCCAGACTTTGCCGAGCAGTTTGCTCGCCTACTTTCTGATTATTCGTGTTCCTTGTTGGGGATTTCTTTA
TCAGGTAGTGAATCTGTTTCTTCAACATTAAAGAGTCTGAAAGAATTGGGGATAGCCTTGCGCTCACAGG
CGTTTTCCCAACAAGATTTTTGCCTGGATACTCATGCCAAATGTAGTGCATCCGCATTGGTGCAAGAGGG
GATTTTATTTTGTGGGGCTTCAGAAATCTCAGAAGCTATGAAGTTGCTATTTACCTATGAAAATAAAACT
CCAAAGAACATCATATTTTTAACTGATAACCCCGAGGAAGCTAAAGCTTTAGGGCGCGAGTGCTTGGGGT
GGGGAATCGCATTTTTAGCTTTCATATACTATCCTGCTGCGGAAAGCTTATTTTTTTATGCAGACCCTTT
TTCCACAGCAGTAGGGATTCAAGAGGAACAGGCATTGAAGGTTATCTCCGATGCTGCAGCGCAATTATCG
CTAGATTCTCTTAATCAAAAGAGTTAA
>ref|NC_003361.3|:349093-349911 hypothetical protein CCA00300 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAGGTTCTATTTTTTATCCTAGCGATCTTTTCTGTATTTTCCTTAGAAGCGAGTATTATCCAAGTTT
CTAATGCGCAGGCTGTCAATAAGTATGCAAAGCAAGAAACGCTAGTTTTACTAGCCTTAGAGGAAACAAT
GATTTTCCCTAAGCAGATGGTAGGAAACTCTTCCTGGTTTCACCAGCGTTTAGAAAGTGTGAAAAACGAA
GAGTCTATTGCAGATCCCTTTGAAAAGGCCTTTGCTGAAAAAATCGCCGTATCTTTTGCTGTAGACTATG
AGCTGATCCATTCAGATATCCCTAAAGTTATAAAAGCTTTATCTTTATCGCAAGCCTGGGTCTTGGGGGT
TTCTCAACTTCCCATTCCTATGGCAAAACATTTTCTGCAAACTGCTCAAGATCTGGGAGTCGGATTTTCT
TCATGTCTACCTATACGTGAGGATGGATGGATGCAACATCCCAAAACGCTTGCTAAACCGCAACACGCGA
TTTTTATAGAAGATCAAGTGCTCTTTACTGGAAGACTCGTTAATGAAATTCCCCTGGAAGAAGTGCTGGC
TGTCTTATTTGCAACGATAGAAACACTTCCGAAACAAGTAGTTTACTTAGACGCAAATAAAGATAACCTC
ATTGCTGCAGAAGCTGCCTGCAAACGAGCGAATATCTTCTTTATCGGTATGCACTACAGTCCTGCAGAGC
AACGCCTACAAGGATACAAATCTGACATTGCTGAGATGCAGTGGTTACAATTGTGTACACATCTTTCTGA
TGAGTACTTTCAGTCTCTGCTTACCTATGTCATTGGACCGGAAGGTTAA
>ref|NC_003361.3|:350419-352521 hypothetical protein CCA00301 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCGCAGCCGTTATATACGAATAGACTTATTAGTGAGAAATCTCCGTATTTGCTTCTTTATGCCCATA
CTCCGGTAAATTGGTATCCTTGGTGTAGTGAGGCTTTTGATCTTGCTGTGGAAAAAGATAAGCCAATTTT
CCTTTCTATAGGGTGTGCACATTCTCGATGGTGCCAGGTGATGCTTCGCGAAAGCTTTGAAAATCCTGAG
GTTGCTGCGATACTCAATGAGAATTTTATTAACATCAAAGTAGATAAAGAAGAGTTGCCTCATGTGGCGA
ATCTCTATTTTGATCTTGTGCAAATGCTTTCGATCTCGGGGGAACATGAAAGTTCTCCCTCATGGCCACT
AAATGTATTTTTAACTCCGGATCTTCTTCCTTTTTTCTCCGCAAATTATTTAGGAGCAGAGGGGAAATTA
GGGATCCCTTCATTCTCACAGACAATAGAAAGACTCCACATGATGTGGGAAGATCCTGAAGAAAGAGAGA
CGCTTGTTCATCAGGGGCATAAAGTTCTTGAAATAGCTTCATTTATAGAAAAATGCGCAAGGAAAGAGAT
GCTCGAAGAGGGCTCTCTTCGAAAAACAGTGGAAGCCCTATACCTTGGTGTAGATCCGCATTATGGAGGG
GTGAAAGCTTTTCCTAAAACCCCACCAGCCTTGCTTAGTCAATTTCTCCTGCGCTATGGAGTGGAGTATC
AAGATAACAGGAGTTTGTTCTTTGTAGATCGTTCTTTGCAAATGATGGCTCACGGGGGAATTTTCGATCA
TTTGGCAGGAGGGTTTTACTGTTATGCCATAGATGATAGATGGTTAATTCCCTGTTTTGAGAAGCGTCTC
GTGGATAATGCTTTCTTGGTATTAGACTATCTCGACGCTTGGGTTTGTATGAAAAGACCCGAGTATGGCT
CTGTAGCTAAGCAAACTCTCCATTATATCCTTTCTGAGCTCTACAATCCTGAAGTGGGAGCTTTCTATAC
CTCAGAACATGGAGAACATTGGGGAGATTTTGATGGGGGGTATGCAACATGGTCAGGAGAAGAAATCCGC
GAAGTTCTGGGAGAGAATGCCGCGATTTTTTGCGAGTATTATGGGATTTCTCGAGAAGGATTTTGTAACG
GAAGGAATATCCTACATATTCCTTCAAATATTGATGTCGAAGAGATCGCAGATAAGCATGGCTGTAGCGT
TGAAGAATTTTATGAGATTATCGACAGGCTTAAGGAAAAGTTACGTATGTACAGGGCGACTAAGGTGCGC
CCATTTAAAGATGACCAGTCTCTGACATTCCAAAATGGCTGGATGGTCTACACACTAGCATATGCAGGAA
GAGTCCTTGGTAATTCCTACTACATTGATGTAGCAAAGAAATGTGGGGAGTTTATCTGCGAAAATTTATG
CAGACACTCTAAGGTGCTACGTAGATGGCGTGATGGAGAAGCAAAATATTCCGGAGGTCTTGAAGATTAT
GCAGGAGTTATTTTAGGAGCCCTAGCTCTTTATGAAACAGGGTGTGGAGCTAAATGGTTGCTTTTGGCAG
AAGATCTCATGAAAGAGGTGATCTTATCCTTTCGTTCCGAAAGTGGGGGATTTTACACTACAGACGGTAA
AGATGCCGCATTGCTTTTAAAACAGGAGAATCTTTCTGATGGGGAGACAATATCTGGAAATGCTCTTGTC
TGTCAGGCTTTGATAAAATTACATATGCTTACCGAAAAAAAACACTACCTGACTTATGCGGAAGATATTT
TGCAGATAGCCCAAGCTCGATGGCATACCCATAAGTTTTCTTCTTTAGGGAGTCTCATAGCCGCGCAATC
TTATTTTTCACGTAAACATCAAAAAATTCTTATTTCTTTAGCTAACGATCAAGATCGCGAAGCGATCCTA
TCCTGCTTCGCGGGATTATTTCTTCCTCAAGTTTCCCTTGTTTGGATGAGCGCGAAAGATAGTGAATTGT
TAGAAGCTATTCTTCCTGAATACGAACATAGCTTAATCCCTAAGGAAGGCCAAAAGTCTTCGGTGATTTG
TCTTTTAGAATCGGGAGTGGGAAGGAAATTTTCTAATATTGAAGCATTTCGCGCCTACCTACATTCAAAT
TAA
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ATGAAAGTTCTCTCCCTGTACAACGGGAGTATCCAAGTCGTACAGAAAGAATCCCTGAAGATCCTGCCGG
AATTGCTATTCATGATCGTGTGTTATTTAAAATCGATGAAGATAACGTTGTTACGACTTTAGATGTTATA
CAGAAGCTTAACCTTCTTTTTGCTTCTTCATACCCTCAGCTTATGGATTCTTATCCTGCGCGTTCGCAAT
ACTATACAGCCATGTGGCCAGTAGTTTTAGAATCTGTAATAGACGAGTTTCTTATGGTTGCCGATGCTAA
GACTAAAAAAATCCAGGTGGACTCTACTACAGTGAATGAAGAAATTGAAGCAATGTTTGGTAGAGATCTA
TCTCCTTTGTATGTACATTTTGACATGACCCCCGAAGATGTTTTCAACGTGGTAAATCGTACCCTAATTG
CTCAGAGAGTCATGGGTATGATGGTGCGCTCTAAGGTAATGTTGAAAGTTACCCCAGGGAAAATTCGCGA
ACATTATAATCAGCTGGCTGAAGATGCAGCAAACACTACTGTATGGAAATACAGAGTTGTTACGATTAAA
GCAGCTACAGAGTCATTATCGAGCCAAATTGCCGATAAAGTCTGCGCTAGGTTAAATGAAACGCAAAGCT
GGAATAAAGAGCGTTTATCTGCTCTTACTCTTTCTCAAGGAGGGCAGTTTGTCTGTTCTGAAGAGTTTAC
ACGCAATGATAAAGAATTATCAGAAGCTCATAAAATGGAATTGTCCTCGGTAAACTACCCACAAACTATT
TGCAGCCTACCTAAAGCCCATAAGTCAGGACATAAGCTTTATGTGCTTCTTGATAAATCTGCAATGGCAA
TGCAGCCCCTAGAAGAAATGGAAACGCAGATAAAGCAGACGCTATTTATGAATTATGCTGGGACTATAGA
AAGTCAGTATAAAATGAAATTGCGTACACGCTATGGATTTGACTCTTCAACGATTGCTAAATTGCTTTCT
GAAGAAGCTCCGCCTCTATTTTCATTGCTTTAG
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TATCACAGAACTTTTTGATAGATGGGAATATTCTAAGAAAAATTCTTGCTGTCTCTTGCGTAGAAGCTGG
GGATTGGGTTTTGGAAATCGGTCCTGGATTTGGCGCTCTTACCGAAGTCCTCGTGAATCAAGGGGCGCAT
GTCGTTGCTTTAGAAAAAGATCCCATGTTTGAGGAAACACTAAAGCAACTTCCTATAGATCTAGAAATCA
CAGATGCATGTAAGTATCCGTTATCCCAGTTGGAAGAGAAAGGCTGGCAAGGGAAGGGAAGGGTCGTTGC
GAACCTGCCTTATCATATTACCACACCCTTATTAACGAAATTATTTTTAGAAGTGCCTAACCAATGGAAA
ACGGTTACGGTAATGATGCAAGATGAGGTTGCACGACGTATTACCGCACAACCTGGAGGGAAGGAATACG
GATCTCTAACTATATTTTTACAATTTTTTGCCGACGTACGCTACGCCTTTAAAGTGAGTCCTGGATGCTT
TTTCCCCAAACCTCAAGTGTCCTCAGCTGTCGTACATATGACAGTGAAAGAGACCTTTCCGCTTGAAACC
TCCCTCCATCAGAAATTCTTTTCTTTAACTCGAGCTGCTTTTGGACAAAGACGCAAATTATTAGCTAATG
CTCTTAAAGATCTTTATCCTAAAGAATTAGTTTTCTCCGCTCTAAACCAATTAAACTTTTCTGAAAAAAC
CCGTCCAGAGACCCTCTCTCTCAACGAATATCTTCAACTTTTCCATCTCCTTTCCTCGAACGCCTAA
>ref|NC_003361.3|:c356939-355005 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase [Chlamydophila caviae GPIC]
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CGGAGCTTTCTCTTCTTGCTGAGCAGATGCGTCATAAAATTATTTCTGTTCTTACCAACACGGGAGGGCA
TTTAGCTTCTAATTTAGGGATCATTGAATTAACTATAGCTTTGCATTATGTTTTTTCCTCTACTGAGGAT
AAGTTTATTTTTGATGTCGGTCATCAAGCCTATCCGCACAAATTACTCACAGGACGCAATACTGAGGAAT
TTGATCGGATTCGCCATGATGGGGGTTTGAGTGGATTCACCTCCCCTTCGGAAAGCATTCACGATCTCTT
CTTTTCTGGTCATGCGGGGAATGCCTTATCTTTAGCTTTGGGGATGGCTAAAGCTACTGAGGACTCTAGA
ACGCACATTCTTCCCATCCTTGGTGATGCGGCTTTTTCTTGTGGGTTAACTTTAGAAGCTTTGAATAATA
TTAGCTCAAACCTATCTAAGTTTATTGTCGTTTTAAACGATAATAACATGTCGATTTCGCAAAACGTGGG
TGTTATGTCTAAGAATTTGTCGCGATGGATTCACCATCCCAAATTCAATTTATTTTCTAGAAAGATAGAA
AAATGGCTAACAAAGATCCCTCGTTATGGCAACAGCATATCCAGGCGTTCTCACAAACTATCCATCTGTT
TAAAATCTTTATTTTGTCCGATTCCTATTTTTGAGCAGTTTAATTTGGCCTATATGGGTCCTGTAGATGG
TCACGACATAAAAAGGCTGATCTCTGTATTCCAAACTGCGCGGGATTTACCCTTTCCTGTTCTTATTCAT
GTGTACACAACCAAGGGTAAGGGTTTAGAAATCGCTCAAGAAAACCCAGAGAAGTATCATGGTGTGACAG
CGAATTTTAACTCTTCTAAGGAAAATAAATTCCTGCCAACTATTAAGCCTCAGCTCACTTATCCGGATAT
TTTTGGACAAACAGTGTGCACACTCGGAGAAGCATTTCCGAATTTACATATTGTGACTCCTGCGATGTCG
TTAGGCTCCCGCTTGGAAGCATTTAAAGAAAAATTTCCCAACCGTTTTATAGATGTGGGGATTGCAGAAG
GACATGCGGTGACTTTTTCAGCAGGCATTGCCAAAGCTAAATCTCCTGTTATTTGTTCTATCTATTCGAC
ATTCTTACATCGTGCTTTAGACAATGTTTTCCATGATGTATGTTTACAAGGTCTCCCTGTAATCTTAGCG
ATAGATCGTGCAGGTTTAGCCTATGGGGACGGCTGCAGCCATCATGGCATTTATGATTTAAGTTTTCTTC
GTGCCATGCCAAATATGGTTATTTGTCAGCCAAGAAGTGCGGTTGTTTTCCAGCAGTTACTGCAATCGTC
TCTACAATGGAACATGCCTGTAGCGATTCGTTATCCTAATATTGCGGCGACTCAAAGAGATCCCATTGCT
ACGGATGTGCATATGCACCGCGATCCGGGAGTAGGAGAAATCCTCAGTCAAGGAGAGGATGTTTTGATCC
TAGGTTTAGGTCATATGTGCAATACGGCGCTGTCTATAAAACTACAGTTGCTCACCCATGGGATTTCTGC
AACTGTAGTAGATCCTGTATTTGTCAAACCTTTTGATAATAACCTATTTAGCATTCTATTAATGCATCAT
TCTAAGGTCATTATTATAGAAGAGCATTCGATTCGGGGTGGGTTAGCTTCAGAATTCAATGATTTTCTAG
CTACCTACAGCTTTAAAGTCGATGTCTTGCACTTTGGTATTCCTGATGCGTTCTTTGCTCATGGAGATAA
GGAAAGCTTATTAAAAAGAGTAGGCTTGGATACTGAAAGCATGGTTAAGCGGATTCTCACACACTTTAAC
TTTCGGACAAAAACCTCTCCCTCTAATAAGTTGAGTATTGTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c357187-356936 hypothetical protein CCA00305 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GATCCGCCTATTTTACAAACGTTTGCCATGACAAGACCATGA
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GAATCTTGTACGCATTAA
>ref|NC_003361.3|:c359100-357433 exodeoxyribonuclease VII large subunit [Chlamydophila caviae GPIC]
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ACTTTTGTCATATTGTGGTCAAAGGAGAGTTAAGCAATGTCTCACTACAACCTAGCGGACATTTATATTT
TGGAATTAAAGATAACCGATCTTTCTTAAATGGGGCGTTTTTCCATTTTAAAAGTAAGTATTTCGATCGT
CGTCCCAAAGATGGCGATTCTGTAGTCATTCATGGAAAGCTGACGGTTTATGCTCCACGGGGTCAATATC
AAATTATCGCCCATGCTTTAGTCTATGCTGGAGAGGGAGACCTACTACAAAAATTTGAAGAGACGAAAAA
ACGCCTCGCTGCTGAGGGGTATTTTGCTATAGAGAAGAAGCAAGCGCTGCCCACGATTCCTAAAAGCATT
GGGGTGATTACCAGCCCTACAGGGGCAGTAATTCAAGATATTCTGCGCGTTCTTTCCCGTCGGTGTTATC
AATACAAACTCCTCATTTATCCTGTAACGGTTCAGGGAGCTACAGCTGCAAAAGAAATCTCCCGAGCTAT
TGAAGAAATGAATAAAGAGAATCTTGCAGATGTTCTTATTCTAGCTCGTGGTGGTGGAAGCATCGAAGAT
CTTTGGGCTTTCAATGAAGAGATCATTGTCAAAGCCATAGCTGCCAGCTCCATCCCCATTATTTCTGCTG
TTGGTCATGAAACGGACTATACGTTATGTGATTTTGCTGCTGACGTACGTGCTCCCACACCTTCTGCTGC
TGCAGAAATTGTCTGCCAAAGTAGCGAACAGCAAATTCAAGTATTGAAGAGTTATTTACGCTACCTGAAT
GCGCATGCGCAGCAGCTGCTTTCAGGGAAAACAAAACAAATTCAACAATGGAAGCGTTATTTAGATCACG
TAGATTTTTTCCGTCCAGCACATCAGTCCCTAGATTACCTTTGCTTATCTATAGAACGGTCAATTAAAAT
AAAACTTTCACAATACAAACAGCGTTATATGCAATATGCACGCTGGTTACAAAGTGATGTTTTACAGAGA
ATGACCTACCGCCTTTATGATCTTTGGAAAATGATCGTGCAGGCCTTTCACAATCGTTTGATTGCTGCAA
AACATCTCTGTATACATCAGAAAAAAAATCTAACATTTCTTAATACACAGCAGTTTATCCAGAAATTGGA
TCTTTGGAAGCAACAAACCCGTAGAGCTCTGAGACAACGCTTAGGATACTGCAGCCAATCTCTAACGCAC
CAACAAACATCACTAAAACATTTTATAACTAAATTAAATCAGCAGTTTACCAAGGAAAACCATGCCTTGA
GTCTTTTACAGAAACGGCTGACGAGAACTTTTGCCAATAGAGTAGACGAGCATCGAGAGAGCTATATGCG
TTCTAGGGAAAACTTAATATTTTCCTTACACCACCTTGTAAAAAGAAACCGCGAAAAATATTCTCAGGTT
TCTAAGCAACTTACCCTATTAAACCCTAAAAATGTTTTCAAACGTGGGTACGCTATGCTCTTTGACTTTA
ATGAAAATTTCGCTATTATTTCTGCAAAAAGCTTACATAAACACAGTTGTGTAAGGGTACGACTGCAGGA
CGGGGAAGCCACTCTTACTGTAACGGATATTCAGAATTTTGAAACTCAAGAGTCCTAA
>ref|NC_003361.3|:359233-359997 triosephosphate isomerase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TATCGATTTTTTGCCCTTTCGTTAAAGAAATTTCTCCTGCATCCCTAGTGGGTATAGCTCCAGCATTTAC
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CATCAGGACTCTTCTGGAGCCTTCACAGGGGAAGTGTCCTTGCCCATGCTTCAAGAATTTCATGTAAATT
TTGTTCTTCTAGGGCATTCAGAATGTCGGCATATCTTTCATGAAGAAGACGCTACCATAGCTCTTAAAGT
GGGGGCTGCAGCTCGTTCGGGAGTGGTTCCAGTTTTATGTATTGGCGAGACTTTAGAAGCCAGAGAAAAT
GGTACGACTAAGGAGGTTTTGTCTAACCAATTGATGTTGGGACTGGCTCAGCTTCCCGAAACAGCCCCCG
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AGTTCACGCTTTTTGTCGCGAGGTTCTCTCTCGTATATTCTCTAAAGAAAAATCTGAGATAATTTCTATT
CTCTACGGCGGATCTGTAAAAGCTGACAACGCAGAAGGATTTGCTCGCTGCCCCGATGTGGATGGTTTAT
TGGTAGGAGGAGCCTCTTTAGATCCTCAAGGTTTTGCCAATGTTTTAAGAAATTTTAATCTTTAA
>ref|NC_003361.3|:360287-360601 preprotein translocase subunit SecG [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGTATCGACACCAGATATTTTAAAGAGAGTCACAGCTTGGCTTGCTGTCGCTTTTTGTTGTAGTTGTCTG
CTTCTTTCCTTTGCAACAACACATTTAGGGAAAAAAGCTCAAGAGCTGCCTACGAAAGCTCTAGAACAAG
TTGCTCCGGATGGAGAAGAAATTCTCGTGGAATAG
>ref|NC_003361.3|:360659-360805 hypothetical protein CCA00310 [Chlamydophila caviae GPIC]
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>ref|NC_003361.3|:360830-361390 peptide deformylase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTGATCTTTTGTGATTTCCCAAAGGTCTATATCAATCCTGTTCTTTCTAATCCTTCTGAGGATCTCGTTA
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AACGGCGGTGAATCTTGATGGTCAGGAATTCACAGAACATTTGGAAGGGTTTCCTGCACGAATCATTATG
CATGAAAATGACCATCTTCATGGAGTGTTGTATATCGATAAGATGGAAGAGCCTAAAGACATTAAGAAGT
TTAAGGCTTCTTTAGAAAAGATACGCCGTCGTTATCATGCTCATGTAAAGCCAGAAGATAGAGCTTCCTA
A
>ref|NC_003361.3|:c363548-361452 hypothetical protein CCA00312 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTCATAAGGAAGCCGCTAAGAAAAAAGTCTCCTACCTAAGCCATTTTAAAGGGGTATCGGGATCGTTAGA
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GTTCCTGATCGTGGTATGAAGTTAATTGCCCATGGAAATGTCATGGTCAATTACCGAGGAAAGACTTTAG
TTTGTGATTACCTAGAGTACTACGAAGACACTGATTCTTGTCTTTTGACTAATGGTAGATTTGCCATGTA
TCCGTGGTTTTTAGGAGGATCAATGATGACATTGACTCCAGAAACCTTAATTATCCATAAGGGATACATA
TCCACATCTGAAGGGCCTAAAAAACATATTTGCCTCTCCGGAGATTACTTAGAATACTCTTCCGATAGTG
TGCTTTCTATAGGAAAGACAACATTTAGCATTTGCAATATTCCAGTGTTATTCTTTCCGCAATTTTCCAT
TATGCCTATGGAAATTCCCAAACCTCCTATTAATTTCCGTGGAGGTACGGGAGGATTTTTAGGGTCTTAT
TTAGGAATTAGCTACTCGCCAATTTCCAAAAAGCACTTCCAATCTACATTTTTCCTAGATAGCTTTTTCA
AACATGGCATTGGGGTGGGCTATAATATGCACTTCTCCCTAAAAGATAATCCTAAAAATGTCTTCAACAT
GAAAAGCTACTATGCCCATCGCTTAGCGATTGACATGGCAGAACCTCGAGACCGCTATCGTTTCCATGGG
GATTTTTCTCTTTCGCATAAACAGGCAAAGTTATTTGGGGAATATCATGTTAGTGATAGCTGGGAAACCG
TTGCGGATATTTTCCCCAACAATTTCTCTTTAAAAAATACCGGTCCTACGCAAGTTCGCCTGACTTGGAC
AGATGCGTTATTTGATGGCAGTCTATCCTCTTCTGTGAGAGTAAATCCTTTCCAGAATGTAAATCAGGAG
CTTCCCTATCTATCTTTGAAACAACGTCCTCTGAATATTAAAAATACGGGGATTTTTATTGAGAACCTGC
TTGAGTGCGGGTACTTGAACTTTGCCTTTAGCAATAACATTGCTGATTCTAACTTCTCATCATTACGCGC
ATCTGTCTCTCCTAAGGTATACCGTCCGATTCCCTTATTTATAGGAACTCTGACTCCATCGGCATTGGCA
TCGGCAATTTACTATAGTAATGTTCCGAAAACATTCTCACGTCATTGCCAAGCTTCTGCGAAAATCAATT
TAGATTATCGTTTCTCTTTATATAAGAATTACCTACAGACGAGACATATTGTAGAACCGTTTGTGTCTTT
TACTTCGACAACACATCCTTTAACAAAGAATCATGAGCACTTTATCTTTTCTATAAACGATGCCTTTGCT
TCCCTACATTTAGGCAAAGTTGGTATAGAATCTTTCATATACAATAGAGTGTCTCCGAGCACGCCTCCGA
TTTCGGCAAAACTTTGGACAACGCAAATTTTTAAAAATACCTTTGCCAACTCGACCTTTCCCAAAACGGC
ATGTACGATTTCCCTACCTTTAGACCGTAAGAACACCCTATCTTTAGATGCTGAATGGATATGGAAGAAA
CATTGCTGGGATCATATGAATCTCCTTTGGCAATGGGTAGGAAGTGAAAATGTGGGCTTAACTTTAGAGT
TCTTACATCGAAGTAAATACAGTCTTCTTAAATGCGATAAAGAAAATTACGTTTTAGATGTAAGTCGCTC
TCCTGACGAGCTTTTCAATTCTCCCCTATCGGATCGTCGCAACCTTATTTTAGGAAAGGTGTTTGTTCGT
CCTCATCCTTGCTGGAATTACCATTTAACATTGAGATATGGCTGGCATAGATTGGATACGCCTAGCTATC
TCGAATATCAGATGATTTTAGGAACAAAAATCTTTGAGCATTGGCAGTTATATTCTGTGTATGAGAAAAG
AGAAGCAGACAACCGCTTTTTCTTCTATCTCAAGCTCGACAAACCTAAACGCCTGAAAAATAAATAA
>ref|NC_003361.3|:c365265-363559 hypothetical protein CCA00313 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TCCCCGATCCAGTAAGCCATAAGATTCTTTATACTAGCCAAAAATCTGTAGACAAGGCTCTCACGGCCTA
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AGGCAGGGGTTACATTCTAACGACCCCTATATTCGGAAAAGTACTATTATCGGAGCAGGGATTGTAGGTT
CTTCGGAAGCTTTGGAGATTCTTTCTCAAGCTATGGAAACGGAAGATCCTTTTCAGCAACTGTTAGTATT
GTCTGCTTTATCTTCCAACCTAGGAAAAACGTCGGACGAGCTTTTATTTAAAGCATTAGCTTCTGCCTAT
CCTGTGATCCGTTTAGAAGCCGCCTACCGTCTAGCAGGACTAAAAAACATTAAAGTTATCGATCATCTTC
ACTCTTTTATTCATAAGCTTCCTGAAGAAATACAATGTCTTGCTACAGCAATTTTTTTAAGATTAGAGAC
TGAAGAGTCGGATACGTATATCCGCCAGATGCTTTCATCAACAAGTAACACGACAAGAAATTATACAGCT
TTGCTCATTGGTGAATACCAACAAAAACGGTTCTTGCCTACACTAAGGAGTTTATTAACAAGCGCCTCCC
CTTTAGATCGTGAAGCAGCAGTTTATGCCTTAGGGATGTTAAAAGACGGTCAGAGCTATACCACGATAAA
AAATCTCTCAAAGAGAAATGATCCTGATCTATCGTTAGCTTCTGCTCAAGCATTAATTGCGATTGGGAAG
GAAGAAGATGCTCTTCCGGTTTTTGAAAAGCAGATTGTGGAAGAACGCTCAACAGCTCTATATACAGCAC
GATTACTATCTAAAGAGACAGGGATTCCCCTACTACTTCCTGTATTTTTAAATACGAAAAACAGCGAAGC
AAAATTAAATGCTGCGCTAGCTTTGATACATTTAGGGTGTGACCATCCCCTTCTTCTTGAATACATTACA
GAGTGGTTGGTTCAACAACATTATAGCCAAGCCTTAGTTCCTACATTTTCCAAAGGGCGAGCCACACAAG
CATGGAAATGCAGGGGGATTATCCTTCCCCAAAATCCTACAGAACGTATTAAGGCGTTATCGATCATTCA
AAATGCTGAAGAGCAGATTCTTGTTTCTCTATTGCGGTTACCTAAAGAAGCCTATCTTCCCTATATCGAG
AAGATCTTATTAAGTCAGAAAACAGCTCTAGCTTCTAAAGCGATTACCTTTTTGGCGCATTCTTCACATC
AACAAGCTTTAGAAATCCTTTCACGAGCCTCACAGCTTCCTGGAGAGCCTATAATCCGAGCTTATGCTGA
TTTAGCTTTATATAATCTTACCAAAGATCCTGAAAAAAAATTATCCCTACACCGTTACGCTCAAAATCTC
ATTCAAGAAACACTATTGTTCATTGATACCGAAGACAAACAGCCACATCCAGATTCTCCCTATCTTCGTT
ATCAGGTGACTCCAGCAACACGAGCAAAGCTCATGTTAGATATCCTAGAAACTCTCGTGGTATCGAAGAC
ACATGAAGACATTCGCTTTCTTATTCAGCTAATGACACAAGCAAAGGCAAAAAACTGTCATATTTTAGCT
GGGTTATTGATGAAAATTGTAGAATAA
>ref|NC_003361.3|:c365837-365247 Maf-like protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTTTTACCTGTATCTCACCAAGTTTCGAAGAACGTTCTGTTCCTTATCAAGGTGATCCTGCTGCGTATTC
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GCAGATACGGTTGTTATCTATAAGGGAAAAGTTTTCAATAAGCCGAGTTCGCGTGATGAGGCTATTGAAA
TGCTAAAAACGTTAAGTGGTCAAACGCATTCTATAATTACAAGTGTTGCTCTTCTTCAACAAAAGAAATT
GATGGTTGGCCAAGAAACAACGCAAGTGACCTTTAATCAGCTTCCTGAAAAGTATTTAGGAAGGTATGTC
GAGGCATTTTCCACGTTAGATAAGTGTGGAGGCTATAGCACTCAAGAAGGCGGAGGATTGATTATTCATA
ATATCCAGGGCTGTGCATACAACGTCCAGGGTCTTCCGATTAGAACATTGTATCATCTCTTGCTGGAGTT
CGACATTAACTTATGGGATTATCTCGTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c367507-365882 ABC transporter, ATP-binding protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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TAGGCACACGCGTACTGTTCGACGACGTTTCCGTCGTCTTCAATCCAGGAAATCGCTACGGATTAACGGG
GCCTAACGGCGCAGGAAAATCTACATTATTAAAAATTATCACAGGTTTTGTAGAGCCTACTCGTGGGTCA
ATTTCTTTACCTAAAAAAGTTGGAATCTTACGCCAAAATATTGATAGCTTTGGTGATGTTTCCGTTATAG
ACTGCGTGATTATGGGCAATGCCCGCCTATGGGATGCTCTCCAAAAAAGAGATGCTTTATACTTAGAAGA
ATTCACCGATGCTATAGGTATCAAGCTCGGCGAGATGGAAGAAATCGTCGGCGAGGAAAATGGTTACCGA
GCAGAATCTGAAGCTGAAGAGCTTCTCACAGGCATTGGCATTCCTGAAGAATTATTTAACAATAAAATGT
CCACGATTCCCATAGATTTGCAGTTTCGTGTTCTTCTATGCCAGTCCTTATTTGGTCATCCAGAAGCTCT
TCTTCTTGATGAGCCTACAAACCACTTAGATATTCATTCTATTAACTGGTTAGGAAGCTTTTTAAAAGAT
TACGATGGTACCGTGATTGTTGTTAGCCACGATAGGCACTTTTTAAATACCATCACTACCCATATTGCTG
ATATCGATTATGACACAGTCATTATCTATCCTGGAAATTACGATGCCATGGTAGAAATGAAAACAGCTTC
TAGAGATCAAGAAAAGGCCGATATCAAATCTAAAGAAAAGAAAATTGCCCAACTTAAAGAGTTCGTAGCT
AAATTTGGGGCAGGTTCTCGAGCTAGTCAGGTACAATCTCGTTTAAGAGAAATTAAAAAGCTCCAACCTC
AGGAATTAAAGAAGTCGAATATTCAGCGCCCTTACATACGCTTTCCTTTGTCAGAAAAAGCTTCTGGGAA
GGTCGTCTTTTCTATAGAAAGCATTACGAAAGGTTACAATAACGAAGAGCCTATATTCCAGCCTTTCTCT
TTGGAGATATATCAAGGAGACAAATTAGGAGTTATCGGAAATAACGGTCTTGGGAAAACAACCTTAATGA
AGCTTTTAGCCGGCGTAGAGACTCCTACTCAAGGGACTATAAAAACCGGTCATCAGGTTGCTTATTCCTA
TTTTCCTCAAAATCACTCTGATGTTTTAAAGGATTGTGGAGACGAGACACTGTTTGAATGGTTACGCAAT
CGTAAAACAGGGATCAATGATCAGGAAATACGCAGTGTTTTAGGAAAGATGTTGTTTGGAGGCGATGATG
CTTTCAAACAAATTAAAGCATTATCCGGGGGAGAAACAGCACGATTGCTTATGGCAGGAATGATGTTGGA
AAATCACAACGTATTGATTCTTGACGAAGCAAATAACCACTTGGATCTAGAGTCTGTTTCTGCATTAGCT
TGGGCGATTAATGATTATAAAGGCACCTCTATCTTTGTTTCTCACGACAGAACGTTAATTGAAGAGTGTG
CCACGAAATTGCTTATCTTTGATAAAGGCAAAATTACTTTCTTTGATGGGACTATGGCTGACTATACAAG
CAGCAGCAAGTTATAG
>ref|NC_003361.3|:c368462-367524 site-specific tyrosine recombinase XerC [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATCTCAGCTTTTTATGCTTTTCTTGATTACCTAAAAAACATAAAAACAGCCTCACCTCATACCCTAA
GGAACTATTGCATAGACCTTAATAGCTTTAAAAGCTTCTTAGAAAAACAGGGAGAGCTCTCTCCATCTTC
CCCTATCTGCTTACTTACAAAAGAGAGAAAAGAAACAGAGCTTCCTTTCTCTTTATTTACGAAAGATAGC
GTACGCCTCTATGTTCTAGAACTCATGCAGGAAAATAAAGCGAAACGCACGATAAAACGCCGTCTTTCAG
CAATTAAAAGCTTCTCACAATATTGCATAAAAAACCGCATCATTTTTGAAGATCCTACAGAAACAATTCA
TGGACCTAGATTACCTAAGGAACTGCCTTCACCCATTACCTATGAGCAAGTAGAAATCCTCATGGCCACT
CCTGATCTATCAAAATATACAGGATTTCGTGATCGGTGCTTATTAGAATTATTCTATAGCTCAGGATTGC
GTATTAGTGAAATTGTCGCTATCAATCATTGGGATATCGATTTCAATTCTAACCTTATCCGCATCCGAGG
AAAAGGGAAAAAAGAACGTCTTGTTCCTATGACTCCTCATGCTGCTCAGTGGCTGCAACAATATCTACAT
CATCCAGAAAGAGCCCATGTCGAACAAGATCCTCAAGCATTTTTTTTAAATCGTTTTGGGAAAAGATTGA
CTACACGCTCTATTGATAGGAAATTTCAAAAATATCTTCGTCAATCGGGCCTGTCAGGAAGTATTACTCC
TCATACGATTCGTCATACAATTGCCACACACTGGTTAGAGAACGGTATGGACTTAAAAACGATTCAAGCA
CTTCTTGGACATAGTTCTTTAGAAACTACAACCATCTATACTCATGTATCTATGAAGCTTAAAAAGCAAA
CGCATGAGGAGTCGCATCCTCATAGCTAA
>ref|NC_003361.3|:c369425-368505 ribonuclease Z [Chlamydophila caviae GPIC]
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CCTATCTATTCCGTTGGAATAATGAGGGCTTGCTTTTTGATCCCGGCGAGGGAACACAAAGACAATTCAT
TTTTGCTAACATTGCTCCTACTGTAGTCTCCAGAATCTTTATCAGCCATTTCCATGGGGATCACTGTTTA
GGTTTAGGTTCCATGCTTATGAGACTAAACTTAGACAAAGTTACCCACCCTATACACTGTTACTACCCAG
CCTCGGGGAAAAAGTACTTTGATCGGTTACGCTACGGTACTATCTATCACGAGACTATCCATGTTGTAGA
GCATCCTGTAGATAAGGAGGGGATTGTTGAAGATTTTGGAAATTTTCGTATTGAAGCACGTAAACTCGAT
CATCTTGTAGATACTTTAGGATGGAGAATCACCGAGCCTGATACGATAAAATTCATTCCCGAAAAAATCA
AAGCTGCAGGGTTGCGTGGACCTATCATGCAAGATCTTCTCCGTGATGATCACGTAACGGTAAACGGAAA
TACTATATACCTTAAAGATGTCAGCTATGTACGAAAAGGCGATAGCATTGCCGTTATTGCTGATACTCTT
CCCTGTCAATCTGTTGTAGACTTAGCCAAAGATGCAAGAATCATGTTATGTGAAAGCACATATCTTGAAG
AGCATCTTCATTTAGCAAAAAGTCATTACCACATGACAGCGAAACAAGCAGCCACTCAAGCATTGGCTGC
TGGAGCCCAGCAGCTCGTGCTCACACACTTTTCTGCACGTTATTTAAATTCTAAAGAGTTTGAATTAGAA
GCTGGGAAAATTTTCCCCAATGTTGCTGCTGCTGAAGAATTCCGTAGTTATCCCTTTCCTAAAAACCCTT
CTTCTAAATAA
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AACCATCGAAAGAAGTAGAAAGCAAGAAAAGAAATAGCCTTATCGCTTTGATTTGCCTGCTCGTCTTAGC
CTTATTAGCAGTGGTTATGTTAGGAGGATTTCTTGTTACACCATTTTTCCCTGGAGGGGTCTATATCGGT
ATTGCTGCTTTAAGCTCACTTCTCGTAGGTATGGTCTTGTTCCCCATCATCATGAGCTGTTTATCAAAAT
CTCCCGCTAACATTCCTGTACGCCCTAAAGATTTAGATCTGTCCAAACTAGATACACGGCACAACCGCCT
ACTTCATGAAATCATCAAAAAAGATGAGAAAAAATATGCCCAAGAACAGGAAGAAAAAATCCAAAAAAAA
CAACGAAGGCCTTTAAGAACTCGTCCTCAACAAAAACAAGCTCAAGAAACATCTTCGGATGAATCACCAA
AACCACGAAGAAGAACTTCACCGATACTAGACTTAATTCGGCCTAAAAGCCCCTCATCTAATACATCTTC
TAGTCCTTCCTCTTCTGATTCAGATACGGATGCAGATGCAAAAGTAGGCCCAAGGTTACTTTCTACAACC
AAGATGATAGCAAAAGCCGTAACCACCCCTCCGCTCTACCAGCTTTATAAGCACCTCAACCCTAAAGATT
AA
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ATGAATCTGAGGAAGTCGAAGAAAAATCAGACGATCGCTCCCTACCTTCCGATTTATTTATTCTTCCTCT
TAATAAGCGCCCCTTTTTCCCAGGAATGGCAGCGCCAATCCTTATAGAATCAGGACCTTATTATGAAGTG
TTAAAGCTCCTAGCAAAATCCTCACAAAAATACATAGGTTTAGTTCTTACCAAAAAGGAAGATGCTGACA
TTTTAAAAGTTGGTTTTAACCAACTCTATCGCGTAGGTGTAGTAGCACGTATCTTACGTATTATGCCTAT
AGAAGGAGGCAGTGCGCAAATACTCCTTAGTATAGAAGAACGTATCCGCATTGTAGAGCCTCTCAAAGAT
AAATATCTCAAAGCTCGCGTCTCCTACCATAGAGACAATAAAGAGCTAACAGAAGAGCTAAAAGCGTATT
CTATTAGCATTGTTTCTGTAATTAAGGACCTCTTAAAACTTAATCCCCTGTTTAAAGAAGAACTGCAAAT
CTTTCTCGGCCACTCAGACTTTACTGAACCTGGGAAGCTTGCTGATTTCTCTGTAGCACTAACAACAGCT
ACCAGGGAAGAACTTCAAGAAGTTCTTGAAACAACAAACATGCACGATCGTATTGATAAAGCTTTGATCC
TACTTAAAAAAGAGCTGGATCTTAGCCGCCTACAAAGTAGTATCAATCAAAAAATCGAAGCAACAATTAC
CAAAAGCCAAAAAGAATTCTTTTTAAAAGAACAGCTAAAAACGATCAAAAAAGAGCTGGGATTAGAAAAA
GAAGATCGAGCTATTGACTTAGAAAAATTCATGGACCGGTTAAAAAAACGTCAGGTCCCTGATTACGCTA
TGGAAGTGATCCAAGATGAAATGGAAAAACTTCAAACTCTAGAAACATCGTCTGCAGAATACACTGTATG
CCGTAACTATCTAGATTGGTTAACGATTATTCCTTGGGGCATTCAGAGTAAAGAATACCACGATCTCAAG
AAAGCTGAAGTGATTCTCAATAAAGATCACTATGGTTTAGAAGATATTAAACAACGCATTCTGGAACTTA
TTAGCGTTGGAAAGTTATCTAAAGGTCTTAAAGGAAGTATTATTTGCCTAGTGGGCCCTCCAGGAGTAGG
TAAGACAAGCATTGGCCGTAGCATAGCAAAAGTTTTACATCGTAAATTCTTCCGTTTTTCAGTAGGAGGA
ATGCGTGATGAAGCTGAAATCAAAGGACACCGACGCACCTATATTGGTGCGATGCCTGGAAAAATGGTCC
AAGCATTAAAACAAAGTCAAGCTATGAACCCTGTCATTATGATTGACGAGGTTGATAAAATTGGCGCGAG
CTATCACGGCGATCCCGCATCTGCTTTATTAGAAGTTTTAGACCCAGAACAAAACAAAGACTTTTTAGAT
CATTACCTAGATGTGCGTGTGGATCTATCTAATGTTCTATTCATTCTAACAGCAAACGTGTTGGACACTA
TTCCTGATCCCCTATTAGATCGTATGGAAATCCTACGCCTTTCGGGTTATATTCTTGAGGAGAAGCTTCA
GATAGCAACAAAATATCTTGTTCCTCGAGCACGTAAAGAAATGGGGTTAACAGCTCGTGAAATCGTATTC
CAACCCGAAGCTTTAAAGCATATGATTAATAACTATGCCCGAGAAGCCGGTGTGCGTACATTAAACGGGA
ATATTAAAAAGGTTCTGAGAAAAGTCGCGCTTAAAATAGTTAAAAATCAGGAAAAGGCGCATCCAAAACA
TACACAATACAAGATTAATGTAGGCAATCTTCAGGACTATTTGGGCAAGCCTATATTTTCTAGCGATCGT
TTCTACGATCATACGCCTATAGGTGTTGCTACTGGTTTAGCTTGGACATCTCTAGGGGGTGCTACGTTGT
ACATTGAAAGCGTTCAGGTCCCTTCAATGAAAACAGATATGCATCTTACAGGACAGGCTGGAGATGTTAT
GAAGGAGTCCTCTCAAATTGCTTGGACATATTTGCATAGCGCATTAGAACGTTATGCTCCTGGCCATAGC
TTTTTCTCCAAATCTCAGGTACATATTCATATTCCTGAAGGGGCAACACCTAAAGATGGTCCTTCAGCGG
GTGTAACGATGGTCACCTCCTTATTATCCTTGCTTTTGGACACACCTATTTTAGAAAATTTAGGTATGAC
GGGAGAGATCACGCTAACAGGTCGTGTACTAGGAGTGGGAGGCATTCGCGAAAAACTCATCGCTGCACGT
CGATCACGATTAAACATCCTAATCTTCCCTGAAGATAACCGTCGTGATTATGAAGAACTTCCTGCCTACC
TAAAAAAGGGACTGAAGATTCATTTTGTTGCACATTATGATGATGTTTTCAAAGTTGCTTTTCCGAACAT
TAATTAA
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CTACGTATATGTTTTATATTAAACAATTTCTCATGTTTTTTTTATCGGATCTTGATTTAGAATGA
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AGAGGGTACTGAAACGTTGGAGCCTTCCCGTGGGTCCAGATCAAGGATTGGTTTTAGAATTTATTTTTAA
AAACAGTGGGCTATGCTTTCAAGGAATCGGAGTTGCCGCGGGACCTGGGAATTTTTCTGCAACTCGTGTG
GGGTTGTCCTTTGCTCAAGGGTTGGCTTTATCCCGGAAAGTCCCCATGATAGGTTATAGTTCCTTAGAGG
GGTATTTGACTCCTAAGGATAAGGGCAAGGCTCTTATGCTTCCCCTAGGGAAAAAGGGCGGGGTAGTCAC
TCTTAGCTCAGATCTCACGGAAGAAGGGTTTATCTATGAAAAAAACGGGGTTGGTCCTGGAATTTTATTA
CCCTATGAAGAAGCTTCCGAATATTGTTTGGCAAATCATTGCTATCACGTCGTCTCTCCCAATCCGCAAC
TTTTCACTGATAGATTTTCAAATAAAATTTATATAGAAGAGACGGCGCCTTCAATTGACCATATTAGGAG
AAATGTAGTTTCTCAACTTATGCTTTTAGAGTGTAGTCAGCAGCTCACTCCAGACTACCGTAGTTGTTCC
TGTTTTTTTTAA
>ref|NC_003361.3|:374317-374493 30S ribosomal protein S21 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGTTGGCTGTTAAGTATCACCCTGACAAGAATCCAGGGGATGCTGAGGCAGAGAAACGTTTTAAAGAAGT
TTCAGAAGCTTACGAGGTTTTGAGCGATCCTCAAAAGCGCGAATCTTATGACCGCTATGGTAAGAATGGA
CCTTTCGCCGGAGCCGGTGGTTTCGGTGGTATGGGCGGCATGGGCAACATGGAAGACGCTCTGCGTACTT
TTATGGGAGCTTTTGGCGGAGAATTTGGCGGTGGCGGAAGCTTTTTCGAAGGCCTGTTTGGTGGTCTTGG
AGAAGCTTTTGGAATGCGTGGAGACCCTGCGGGAGCCCGTCAGGGAGCGAGTAAGAAAGTTCATATCACC
TTAACATTCGAAGAAGCTGCTCGTGGTGTAGAAAAGGAACTCCTTGTTTCTGGATATAAAACTTGTGAAA
CTTGTTTAGGCAGCGGTGCTGCTAGTGAGCAAGGAATCAAGTGTTGTGATCGGTGCAAAGGTTCTGGACA
AATCGTTCAGAGTCGTGGATTCTTTTCTATGGCGTCAACTTGTCCTGAGTGTGGCGGAGAGGGGCGTGTC
ATTACTGACCCTTGTTCTAATTGCCGGGGACAGGGAAGAATTAAAGATAAACGAAACGTCCATGTACAAA
TTCCTGCCGGAGTCGATTCAGGAATGCGTCTAAAGATGGAAGGTTATGGAGATGCCGGACAAAACGGTGC
TCCTTCCGGAGACCTTTATGTATTTATTGATGTAGAAGCGCATCCTGTTTTTGAGCGCCGCGGGGACGAC
TTGATTTTAGAGTTGCCTATTGGTTTTGTGGATGCAGCTTTAGGAATGAAGAAAGAAATTCCTACACTCT
TAAAGGAAGGTATGTGCCGTCTTACTGTTCCTGAAGGAATCCAAAGTGGCACGATTCTTAAGGTTAAGAA
TCAAGGGTTTCCCAATGTTCATGGTAGAGGGCGCGGAGATTTGCTAGTTCGAGTTTCTGTAGAGACTCCA
CAAAATCTATCAGAAGAACAGAAGGAATTACTTCGTAAGTTCGCAACTACGGAAAAAGCAGAAAATTTCC
CCAAGAAACGTGGTTTTTTGGATAAAATAAAGGGTTTTTTTTCCGACTTCGCCGTATAG
>ref|NC_003361.3|:375736-377772 2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTGCTGAAAACAAGATGCTCCTTCTTTCCCGACAGAGTGATTCTGGAGGAACCTTCCAGTTGTCTTGTGC
TGGTCACGAGCTTGCAGGAGTTATCGCAGGAAAGAGTCTCATCCCAGGTAAAGACTGGTCTTTCCCTTAT
TATAGAGATCAAGGATTCCCTATAGGATTGGGATGTGATCTTTCGGAGATCTTAGCCTCTTTCCTTGCTA
GGTTAACTCCTAACCACTCTTCCGGTAGGATGATGCCCTACCACTATTCCCACAAAAAGTTACGTATTTG
CTGCCAATCTAGTGTTGTGGGTACGCAATTTCTTCAAGCTGCAGGACGCGCTTGGGCTACCAAACATGCA
AAGTCTAACGAAGTAGTTTATGTTTCTGGAGGAGATGGATCCACGTCTCAAGGAGAATTCCATGAGATGT
TAAACTATGTTGCTCTACACAAGCTGCCATTAGTTACCGTGGTCCAGAATAACTCCTGGGCAATCTCTGT
TCCTTTTAAGGATCAATGTTCTGCAGATCTAGCTCGTTTAGGGGAAAGTTATCGCGGTCTTTCAGTATAT
GAAGTGGATGGTGGTGATTATTTTGGTCTTGTAGATGTATTTTCTAAAGCTGTGGATCAGGCTAGACATG
CTTCTGTTCCTGCTTTAATTCTTATCAATGTTATGCGTTTAGAGCCGCATAGTAACTCTGATAATCATGA
GAAATATCGTAGTCGTGATGACTTAGATTATTGCATGAATAATGATCCTCTAATTCGTTTAGAGCGCCAG
ATGGTCGAAGAGTGCGGTATTTCCCCTGCTGAAATTTTAGAAATAAAAGCTGAGGCTGAGGCCGAGGTGG
CTCGTGCTTGTGAGCTAGCTGAGGGAGTGCCTTTCCCTAGTAAAGGTTCTACAAGCCATGATGTATTTTC
TCCACATACGATTTCTCTGATTGATTACGAAGGTTCTTTGGAAGCTCAGCGTTTACGTGATACACAGCCA
AAAGTCATGCGTGATGCTATTACGGAAGCTTTAGTTGAAGAAATGAATAGAGATTCTGGAGTGGTTGTTT
TTGGTGAGGATGTTGCCGGAGATAAGGGTGGGGTTTTTGGTGTTACAAGAAATCTTACTGATAAATTCGG
TGTGGAACGTTGTTTTAATACACCTTTAGCAGAAGCTACAATTATTGGAACAGCTATCGGTATGGCTATG
GATGGTATCCATAAGCCTGTTGCAGAAATCCAGTTTGCCGACTATATCTGGCCAGGAATTAACCAGTTAT
TTTCTGAAGCTTCGAGTATTTATTATCGTTCTGCAGGAGAGTGGGAAGTCCCCTTAGTTATTCGTGCTCC
TTGTGGGGGATATATACAAGGTGGCCCCTACCACTCTCAAAGTATAGAAGCTTTCCTAGCCCATTGTCCG
GGAATTAAAGTTGCGTATCCCTCTAACGCTGCAGATGCGAAAGCTTTATTAAAAGCTGCTATTCGCGATC
CTAATCCTGTGGTCTTTTTAGAGCATAAGGCTTTGTATCAACGGCGTATTTTTAGTGCCTGTCCCGTATT
TTCTTCTGATTATGTTTTGCCTTTTGGTAAAGCAGCGATTACCCATCCAGGTTCCGATCTCACGATTGTT
TCTTGGGGAATGTCCTTAGTTATGAGTATGGATGTAGCTAAGGAGTTAGCAGCTTTAGATATTTCTGTAG
AGGTTATAGATTTAAGGACAATAGTTCCTTGTGATTTTTCTACAGTTTTAGAATCTGTGAAGAAAACTGG
GAAGCTTCTTATTGCTCATGAGGCTTCGGAGTTTTGTGGATTCGGTAGTGAGCTCGCTGCGACTGTAGCC
GAGCAGGCATATTCGTATCTTGACGCTCCTATTCGCCGTGTTGCGGGATTGCACGCTCCTGTCCCCTATT
CAAAAATCCTAGAAAATGAAGTTCTTCCTCAAAAAGAGAAAATTCTTCAAGCAGCAAAAAGCTTGGCAGA
ATTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c378806-377769 hypothetical protein CCA00325 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GCCCATACAATTTAAAGATAAAAACCTTGCACGTCATACAGGCGATAGCTACTTTAGGATTAGCATTTTT
ACTAGGAGGGATACTCGCATTATCTTCAGGGCAATCTTTTGCCCTTGCCTCCCCCCTACTTGCTTTAGGA
GCGGTTTTCCTTATCCTTAGCTCTCTGATTTTGATAAAGCTAAGAAAACCTCTTACGCCTATTTCCACGC
CTTCTTTCTTAGAGCTTACGCTATCAGGTGTTGCAAAACGGTTAAAAAACACCTACTCCTTAAACCTGAT
ACTTCCCCATTCAAATAGAATAAGTAAGAATACGGAATATATTTTTGTAAGCAATCCGAAGACCGGTTTA
CAACTCGCCTTTTATAAAGGACATCCTATCAATGATCCTGTATTAAAAAATAAAGATTCTGCGGTTATGC
TCTGCACGAACTCTGATAGAGATTCCAGTTACGTAATTCATCGAACATTAGCATTAATTGGACGCATAGA
AAAAGAGTGTTGGAATGCTATTACACAACCTAATGCCTCAAAATTCCCTCCAGGTGCTATAGCTTACGGA
CCTTGGATAAATAAGTCTCAAGAAATAGCCCCTGCTTCTCATTTGATCTTTATCAACCCACCGACTATCG
AAGTTCTTCTCCATACTAAGCAATTACAAAGAGCTGTTACCTTCCAAGATTTTAATCATGAGAAAGCCTT
TAAAAACCTTGTAGACGCTTATCTAAAATGTTTTAACATCTGCAGGGAACATAAAATTACTTCATTGCAA
CTGGAACTTTTAGGTGTAAACGATATGCATTCGCATCAAGAAGAATACGAGATGTGGTGCTCTCTATGTG
CCTTAGCCTTGCTAGAAGCTATACGTATAGAAGAACAACGCAACGGAAGAACAGTAAAACAAATTACCGT
AAATCATCAAAAAGAACTTCCCCTGCTGTCTATATTACAAAAAGCTTACAACAATTAA
>ref|NC_003361.3|:380447-381238 hypothetical protein CCA00327 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGTTACGTGAAGAGATGTCTTGGGAAGAGATTTCCAAGAAAGCTCCGCGCTTGCCCCGAGGCTGGTACGA
GCTAATGGGATTATCAAAAAAGGACAGATTAGATTTTTGCCAAGAGTATTGGCTTACTGTTTTGGGAATT
GATGGTAATCAATTTCCGGGTATTTGTCGTTTTTTCTCGTTATTAGATAGTCTAGATGTTTATATTTATC
GTTCTGCTAATGAACCCTATGAGGCGAAAATGCTCTATACCTTCGGTGATGGGCGTTGTGGATTTCAAGG
AGGACCTCCTTTATTGGAAACAGAGGGGCATTGTTTTCCTGCTCTAGGGGATAATGATTACCAGAAATTT
TTCACGATTCATAATGGATTTGGGAAATGGGAAGATGAGGGAATTTTCCCTTACCGTTCTTTAGCTAAAG
TTCAACATAAGCTGCGGGAGCTGCTGCTGCGTTTAAAAAAGATTTCTCCTGAAGACAATTGTACCTTTTT
AGGAATTTATCCTTTCTATGGTTATGAAGAGCCTTTGACTTACCAGTGTTTTCTTTTTGATCCGGAAGTG
CGTAGGGATTTTCCCTCACCAAACATAGTATTGAGTGAGGAAAGCCTAGAGCATAGAACTTTAGAAAGTA
TTGAGCGTTTACATTTAACTACAAGTCATTATCCTTCTTTCCTTTCTTGGTTGGAAAACTACTTGCATAG
TGAAGAGGTGTATGGTGAATGA
>ref|NC_003361.3|:381228-381566 phosphocarrier protein HPr [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATGAACTGACATGCCTATGCATTGTAAAAAATACTTCTGGGATACATGTCCGCCCTGCAGGTGCTATTGT
GAAGTTGTTTGATGGTGAAGATTGCGAAGTCAGCTTTACCTACGCGGGGAAGACGGTAAATGCTAAAAGT
ATAATGAGCATACTCATATTAGGAGCACCACAAAACGGTGAGATTTTTGTGCGTATTAAGGGAAAAGATG
CGAGTCGAGTCATGCAGAAAGTGCAAGATGCTTTTGATTCAGGTTTTGGAGAGTTGTAG
>ref|NC_003361.3|:381567-383267 phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATACGCCTGCGCCTTCTGTAGAGCAAAATGAAGAATGGAAAGTTCCTGGAATGACCTTGGTTTCTG
GAGTGGCCATAGGGAAAGCTTTTTTCCTAGGGACTTCTCCTTTGCAGGTTCATGAACTTACTTTGCCTCA
AGAGGAAGTAGAGCACGAGATCCATCGTTACTATAAAGCATTGAATCGTTCTAAATCTGATATTGTTGCC
TTAGAGCAAGAAGTTCAAGGGAAACAGGGACAACAAGAGATCTCTTCGATACTACAAGCACATTTAGAGA
TAATTAAAGACCCTATTTTGACTGAAGAGGTGGTGAATACCATCAGAAAAGATCGTAAGAATGCTGAATA
TGTCTTTTCTTCAGTCATGGGGAAAATAGAAGAATCTTTAACAGCAGTTCAGGAGGGTTCTTTAGCTGTA
GATCGTGTTCAAGATATTCATGATATTTCCAATCGTGTGATTGGTCATTTATGCTGTCAGCATAAGAGTT
CTTTAGGAGATGCTGATCAAAATCTCATTGTCTTTTCTAAAGAGCTTACTCCTTCAGAAGTTGCTAGCGC
GAATCCCTCCTATATTCGAGGATTTGTTTCTTTAGTTGGCGCTCCGACATCGCACACAGCAATTGTTTCT
AGAGCAAAAAATATTCCCTATTTAGCGAATTTTTCTCAGGAAAATTGGGAACGTATTCAAGAGTATTCTG
GGAAGCTCGTCCTTGTTGACGGTATTCGTGGTGAGATTATCTTTAATCCTAAATCAAAGACTCTTGAAAA
CTGTTATAAGCAAAAAAACATAACTTACAGTGTGAAATCTTATCCTCAGGCATCGCCACATGCTCTAGTG
TCTTCTCATGCTACAAGTCTTGAAGAAGTGCGTATGCTTTCAGAATTCTTCCCACAAACGTCTATCGGGC
TATTTCGTTCAGAATTCCTTGCGATTGCTGAGGATAGGCTACCTACGGAAGAAGAACAAGCTGCGGTATA
TAAGTCCTTAGCTTTATTTCCAGAGCGTGTCTCTGTATTGCGTTTATTTGATTTTGGTGAGGATAAGCTT
TGCCCAGGTCGAGATCCTATTCAAGAACGTTCTGTACGCTATTTATTAAAAAATCCTCAAATACTCGATG
ATCAGCTTCGCGCTATTTTAACAGCTTCGGCATCAGGTCCTTTAAAAGTATTAATTCCAGGAACCGCGGA
TGTTATAGAAATTATAGAAGTGAAACGTCGATTAGAAAATATACGACGTGCGTTTAATAAAGATCATTAC
ATAGAAAACATCGCCTGGGGAAGTATGATAGAAATTCCTTCAGCTGTATTGATGATTGATGAGATTCTTC
AAGAGTGTGATTTCATTTCCATAGGGACTAATGATCTTATGCAATATGCCCTAGGAAACAATCGAGAAAC
GGTTCTTCCTGATTATCTTGATAATCCGCTTCATCCTTCAGTAATGCGTATGATTCGTCATGTAGTATCT
AATGCTAAGCAGCGTGATGTCTATACATCTATTTGTGGGGAGGCAGCAGCAAATCTATCTTTAACTCCCT
TTTTCTTAGGATTGGGAGTGCAGGAATTATCGGTTGCTATGCCAGCTATTGTAGAATTAAGAGAGAGAAT
AGCCTCTTTGAATTTAAGTAGTTGCGTAGAGCATACGGAGAAATTGTTAAGAGCAAGGACCTGTGAAGAA
GTTCAGGCCCTATTAGCTTAG
>ref|NC_003361.3|:c383554-383264 hypothetical protein CCA00330 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTTCTCTAGAGCAAAAACGCTACGAAGGACAAGCAGGTAATGGACTTGTTTCTGTAGTGATCAATGGCAA
ATGTGATATTGTTTCCATAAAAGTACAGCCCACATGTCTTGATCCCGAAGAACCTGAAGTTGTTGAGGAT
CTCTTTCGTTCAGCATTCAAAGAAGCCAAAGAAGCTATGGACAAAGAGATGTCTGTTATGCGAGCTGGAA
TGCCTTTCTAA
>ref|NC_003361.3|:c384897-383557 DNA polymerase III subunits gamma and tau [Chlamydophila caviae GPIC]
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AAGATGCTGTAGTTACTGTTTTAAAAAATGCCCTTCAATTTCAACGTGTAGCGCATGCGTATTTATTTTC
AGGAATTCGTGGAACTGGGAAAACAACCCTGGCAAGAATTTTTGCTAAAGCCTTGAATTGTCCAGAACGC
ACCTCTGATCACGAGCCTTGCAATCACTGTTGCATTTGCAAAGAAATTTCTTCAGGAACTTCCCTAGATG
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CACTCCAGCAAAATCGCAATATAAGATCTACATTATCGATGAAGTGCACATGCTAACAAAAGAGGCTTTC
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ATAAAATTCCGGGCACTATTTTGAGTCGTTGTCAAAAAATGTACTTAAAAAGAATCCCCGAAACAATGAT
TGTGGAGAAGTTAGCTTCCATATCTAAAGAAAACTCTATAGAGACTTCTTCTGAAGCTCTTCTCCCTATT
GCGAGGGCAGCACAGGGAAGTCTACGCGATGCAGAATCCCTTTATGATTATGTCACGGGGTTATTCCCTA
AATCTTTATCTCCAGAATCTGTAGCAGATGCCTTAGGTTTACTCTCTCAAGATACCCTTTATACGTTAGC
CGAGTGTATCCGCACACAAAAATATGCTGAGGCTTTACTCCCCGTAACCACGGCAATCAATTCTGGAGTC
GCCCCTATAACTTTCCTTCATGATCTCACTGTTTTCTATCGCGATTTACTTCTCAATAAAGATCAGGGAC
ATTCCCCTTTATCCGCAACAGCCGTGCACTACTCTAGTGAGTGTTTATTAGAAATCATTGATTTTCTCGG
TGAGGCTGCGAAACATCTACAGCAAACTATCTTTGAAAAAACATTTTTAGAAACAGTAATTATTCATCTG
ATTCGGATCTGCCAACGTCCTTCTTTAGAAACTCTATTTTCTCAACTTAAAACATCAACTTTTGATACCC
CAAGAAGTATCCCCCAACAGCAAGAACCTCCTAAGCCTATTATACAGCCCGAAAAGCACTACGAAGAACA
AAGTTTCCTATCGTTATCTGCAAAATCTCCCACCGTTAAAGAAGCTCTCCACCAAAAAGAGACTTCCCCT
TCTTTAGTGGGATCAGCTACTATAGATACGCTTTTACAATTTGCTGTTGTTGAGTTTTCAGGAATTTTAA
CTAAGGAGTAA
>ref|NC_003361.3|:385236-385361 hypothetical protein CCA00332 [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGATGTCATTTGCTGTGAAATTTTTAGAGTTTTCTTGTTTGCAAGTGACAGAGTTTATTTGTGAAAAGA
ATAAAGAGCTAGTTTTGAATAAAAAATGGCCTTTTGTTCTTGGGTGTGATAGCTAA
>ref|NC_003361.3|:385392-387488 hypothetical protein CCA00333 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GGTCAAGGTATTTTTTGTATTTTGCTATTACGGGAGTTTTTGGGTTAACGTTATTCTCTTTTGTCTATCT
TAGAGTGCTTCATATTCCCATATATAAGGAGGGGGATATTGCTCAAGTATCTCTAAGTTCTCCTATTGAT
TTTTCTATAAGTTGGAATGTACATGCATTTTACAGTAAGACTGCTGAAGTTCCTGAAGTTTTTGGAAAAG
TTTATCGGATTTCTGAAAGTCCTTGTTTTGACGAGCCTGAAGAGGAAGAAACACGACGCTGGTTGAAAAA
AACTCAAGATTTTCTTGGGGCTGTAGGGTTTATAGATAACTCTACAGAAGCCTGCCTTCAAGATCTTCAT
CTACGTCCCTCTGCTTTGAAAGAAAGAGACCGTTTGTTAGGAATTCATGTAAGTTCTGATTCAAGAGCGG
TTATACATCAGTGCGTTGCTCATGTGGATAACTTTCTAAAATCTGAAAATTGTCCACCATCTTGCAGATT
ACATATTATAGATAATTTAAAAGAGAAGCCTTTAGACATTGCCGTAGATAAGGAAAAATCAGGCTATGTT
AAAGGAGATTTGCTCGGAACGCGACGTATAGAACATTTCCCAAAGGGAAGAGCTATTATAAGGCAGTATC
AAAGAATTAGCGGTAGAGATGCTAAAATTCTTCGTTGCTTACGCCACCAACTCGTTTCTTCAACAACGTT
ATTTTCTTGTCGTGGAGCTTTCGGAGTTCTTTTTTTAGTCGCCGTTATTTTAATTTGGGGTTACCGCTCT
TTAGTAACGTTTTGCCCTGAGTTATTAATGTCTCCAAAACGTTTCATGCTCTACATTGCTATCTTTTCCC
TATCCTTGATTGGTGTGAAGATTACGGAGACTCTATGTGTGTTAGGTCCACAAAGTTGGGAGGTTTATCT
CTCTTGCCCATTGATTCTTCCTTTTACAGCAATTCTCCTTGGTCACCTTGTGGGAATTCCTCTTGCAGGT
GCTTCCTGCACATTTTTAGGAGTCCTCTATACTTTTGAGTCAGATATCTGGAATAACAGTTGGTTCCTTG
CTATGAACTTATTGAGTTCCTGGAGGATTTTATTCACGGTAAGTCGAGTTACCCGCTTAACTTCTCTATT
TTGGTGTTGTATGCGGTTGTGGTGGGTATCCACGGCTATTTTAACAGGATTCCGTTTGTTCTTTGGCGAA
GCATCTATAACAGCTTTCCGTGCCGATTGTTTAGGAAGCTTTGTTTATAGTTTAATTACTGCTTTAGGAG
TCGGCGCTTTAATTCCGGTATTGGAGTCTTCTTTTGGTGCGTGTACGCATAACCATTTATTAGCGTATTT
AGATTCCGACTATCCTCTACTAAAACGGCTCTTTGAACAGGCTCCGGGAACTTACCAGCATTCAGTTTTA
GTGGGTATTCTTGCAGAAGCTGCAGCGAATGCTATTCATGCTGACGGTCTTTTTTGTCGTGTTGTGGCGC
AATATCATGATATTGGTAAGTTAATTAATCCAGGGTTTTTCATGGAGAATCATCAGATGCTTGGCACATC
AAAAAATAACCTCTCTCCAATAGAAAGTGCAAAAATGATTATGCGGCATATTCCTGAGGGGGTAGAGTTA
GCAAGAAAAGCAGGCCTCCCGGATTCTTTTATTCGTATTATAGAAGAGCATCATGGTACATCTGTTATTC
TTTCCCCATACCATCGTCATTTGCAAAATAATCCTGATACAGGCGCTTTAGATGAAGAACTGTTCCGTTA
TCCAGGAAGAAAACCCTCCTCTAAAGAATCTACAATTATTATGATTGCAGATTCATTTGAGGCGGCGGCA
CGTTCCTTAGAAGGAACGAGCATGGTAGCTTTACGGGAGCTTGTAGACAAGATTGTATCAGGGAAAATGC
ATGATGGGCAATTTGCAGATTCCCCAATAACTTTGGACGAGCTTACTACTATCTGTGAGACTATGGTCAA
AACACTCTATAGTGCTCTACATTCTCGCGCAAAGTATCCTGAAATGGTTTTAAAGCCTTGTGTATAG
>ref|NC_003361.3|:c387971-387507 hypothetical protein CCA00334 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGGAGTCGTTCAAATTCCTCAACACACACACGTAAATGAAAACAATAGCGTCTGTCTCGCACCTCATG
TCATATTGCCAGAGGTCATTCACGGCTGTCCAATGGCCCCAGAGGCTATGATAACCAAGCTTCAGCATCT
TCCCTTGCTCTTAATTCCTATTGTAGGTTTGGTTTATGCTGGAATATTCTATCGCAGATACACGCGTGCT
TGCACCTCTTTCCAAGCGATAAATGGCTTTACTCCAAATACAAAGTGCCCTCAATGTCGAGAAACCTCAA
TGATCATGGTTCTACCCATAGTCGTTAGCGTCTTGGGTGGTTTAGGATTTATGCTGCCTCTACTTATTCT
TCTTCTCCCGATCCTTTTAATTACAGGATTGGTGAAGGCTATCTTGGGTATTGGTAGGTGCGTAGCAGCA
GGCGTAAAATGTTGCGGAAACAAGCCAAGGTCCGTAGATATTTAA
>ref|NC_003361.3|:c388655-388218 hypothetical protein CCA00335 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCCTCTTGTCTCCACAATCATTCCCGCGCATACACATAAGCGCGAAAACGGTTCTACCCTAGATGTAG
AAGCCTCCACCACGATACATGTTCCCAAACACCTAGTTTATCCAAATTCAGGATCCAGCTGGTGTCAAAA
GATTGCTTCCTGCATTCCTGTTGTAGGTTTATTTGTCGCAGCCCATCTTTTTCATCAGAAAAGAGCCTTG
GATAAAGAATATTTAAAACTAGAGTATGCCCCTAATGAAGAATGCTCAAATAGAACCTGTTCGTTGGTAG
ATGCAGGGCACCTAAGTTTTGCCCTAACCACTGCTGTTCTCGGTGGACTAGGTCTTTTACTCCCAGTCAT
AATACTTCTAGTATCTGTCCTATTGATCTTTGCTCTTGTTTCAAAAATCCGCTCCTGCTGCTGCCCCACT
TCCAAAACACTCCAGTGA
>ref|NC_003361.3|:c389488-389048 hypothetical protein CCA00336 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTCTTGCCTCAATAATCATTCCTGCACACACACACCTTCCCCCCCCCCCCCCCGGGAAAGATGTAG
AAGCATCCCCTACGTTATATGTTCCTAAACACCTCGTTAATCCCAACTCAAGATTAAGCAAGTTTCAAAA
GGTTGTTTCTTGCATTCCCGGTATAGGTTTATTAGTCGCGGCCCATCTTTTTCATCAGAAAAGAGCCTTG
AGTCAAGAGTATTCAAAACTAGAGTATTCCCCTAATGAAGAATGCACTAATAAAACCTGTGCGTCACTAG
ATCCTAAGCACTTAAATGCTCCTCTAAGCATTGCTGTCCAAGGCGGATTGGGTCTTTTATTCCCATTCAT
GTTGCTTGTAATCGTTGCCGCAGCACTCATTGCTCTTGTTACAAGCATCCAATCTCTCTTCTGCTGCACT
TCTCCCAACCAAAGAGCATAA
>ref|NC_003361.3|:c390294-389842 hypothetical protein CCA00337 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTGTTTGGCTTAACAATCATTCCCCCACATACACATACGAACAAAAATAATGCTACCCAGGATGTAA
AATCCTCTATTATTCAGGCTCCTAAAGTCCTAGCTACTCCAAACTCAAAAGCAAGCATTCTTCAAAAGAT
CGCTTCTTGCACTCCTATTATAGGTTTATTGGTTGTGCCCCTTGTTCTTTATCAGAAAAGAGCAGTGGCG
AAGAAATATAAAGAACTAGAGTATATTCCCTGTAACAAATGCCCCCATACACGCTGTTCATTATTAGATC
CATCTAACTTAAATATTGTTCTAAGTGCGTCTTTACTGGGTGGATTAGGTCTTTTATTCCCATTCATAAT
ACTTCTATTAGCTATGGTAGCGATTATTGCTCTTGTTGAGAAAATCCGTTCTTGCTGCCAACGCCCTCCC
CAACAATTATTACAAAATCCTCTTCAAAAATAA
>ref|NC_003361.3|:c391092-390676 hypothetical protein CCA00338 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTGTTTGCCTCACTAACTATTCACGCGCATGAACATACAAATGCAAACTGTTCTAGCCAGAATGTCG
AAACCGCTACTACACAGGTTTCTAAACTCCTTAATCCAAACTCAAAAGCAAGCATCCTTCGACGGATCGC
TGTCTACACTCCCATTATAGGTTTGTTTGTTCTGTCCCTTGCTTGTTATCAGAGAAGAGCAATGAGTAAA
CTAGGCTATACTCCTAGTAGCCTATGCCACCATCCAATCTGTGCGTCACTAGATCCTAAGCACTTAAATG
CTACTATACGCGCGTCTTTACTAGGTGGATTAGGTCTTTTACTCCCATTCATGATACTGCTATACTCTGC
CTTAGCGATCATCTTTCTTGTTGACAAACTCTTAGATTTCTCCTGCTGCTGCTCTTCTTCCGACTAA
>ref|NC_003361.3|:c391631-391167 hypothetical protein CCA00339 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACGTTTACTTCATACGTTACCCTACCAGCTCATACACACACGATAAGTAAGAATAGCTCAATACCTG
TTTCTGAAATACAAATCCTAGTCTGCAAAACAGCGTATTTTCCTGAAATTAGTAGACGTTTCCTAGTTTT
CCCCGTTTTAGGGCTCATTTTTACAATTTTCTTAATCTATCGTAGATGTACAGTAATGCGCGATGCTTAT
TCAAAATTAGAGTATACGCCCAACAAAAATTGCATGGATAAACTGTGCTCTCGGCTACACCCTAAATACC
ATTTCCCTTTAATTGCCTTCGGGATTTTAGGAGGCATAGGAGCTTTAACTCCCCTCCTTATTCTAGGAAT
CGTTATGCACCTGATTCTAAAAATTTTAAAAAAATTTGCGTTTTTATGTGAGCATACGCAAAAATGCACC
TACTCACTTTTTCCCAGCAAATTACGGAAACAAAATCTATCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c392488-391760 porphobilinogen deaminase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCTATCCGATTGCTACACTGATCCTTTTCTTTCTGATTTTTGTTCAGGAAGGCGTCCCTTACGCATAG
CTTCTCGCCGCTCTACCTTAGCACAAGCTCAGGCACATGAGTGCGTTTGTCTTCTTCGTTCCTGGTTCCC
TAAACTTTGGGTTCAAATACACACAGTGCATACCCTTGGGGATAAAGATAAAAAGACTCCCTTGCATCTT
GTAGAAAATTCACAATTTTTCACAGATGCTGTGGATAAACTTGTTCTTCGCGGCAACTGCCATCTTGCTG
TGCATTCTGCTAAAGATCTCCCCAATCCATCAAAAACCTCCATCGTAGCAATAACTAACGGGTTAGACCC
TTCAGATCTTTTAGTTTATGGCGAACGCTACCTTTGGAAACGGTTTCCTAAAAACCCTAGACTAGGAAGT
TCTTCTTTACGTCGAGGAGAAATGTTAAAAAACCTATTTCCTAAAGGACAGATTCTCGATATTCGAGGTA
CAATAGAGGAAAGGCTGAAACAACTAGAAAGCGGAAAATACGACGCTATTGTTGTTGCAAAAGCTGCTGT
CATTAGACTCCACCTACGCCTGCCGTACACCAAAACTCTTCCTCCTCCTTACCACCCTCTTCAGGGACGT
TTAAGCATTACAGCAGCAAAAAATATCGAAGCATGGAAAAAGCTTTTACTTCCGTTAAACGCCTCTGACC
TCACTCAAGACAAGCACGGCCTTGTTTGA
>ref|NC_003361.3|:c393827-392466 DNA repair protein RadA [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACTACGAAAATAAAAACACAATGGACTTGTAATGAATGCGGAACCAACACACCAAAATGGTTAGGTC
AATGTCCCGGATGTTTACAATGGAACACGTTCATTGAAGAACATATTTCCCCCTCTCAAAGTGGAAGACG
TTCTCGAACGCAAGCGACTGCAGTATCTTTGAATACTGTAGAACTTTGCGAAGAAGAACGTCTGTGTATA
GGAGAGCCGGGATGGGACCGCATTTTAGGTGGAGGTGCTGTTCGTGGCAGCCTTACTCTATTAGGAGGCG
ATCCAGGGATTGGCAAGTCTACGTTGCTTTTACAAACAGCTGCGAAATTTGCCCATCGGGGCCTTAAAGT
CCTTTATGTCTGCGGGGAAGAATCTGTAACGCAGACCTCTCTAAGAGCACGGCGTTTACATATTTCCAAT
GCAAATATTTACCTATTCCCCGAGACGAATCTCGATGATATCAAGCAGCAGATAGCAACGTTACATCCTG
ACATTTTAATTATTGATTCTATCCAAATTGTATTCAATCCTGCCCTACATTCCTCTCCAGGATCTGTGGC
TCAAGTACGGGAAGTGACCTCCGAACTGATGCATATTGCTAAACAATCACAAATCACAACTTTTGTTATC
GGGCACGTAACAAAATCTGGAGAAATTGCTGGTCCTAGAGTCTTAGAACACCTCGTAGATACTGTCTTGT
ATTTTGAGGGAAATTCCCATGCTAATTATCGCATGATACGTTCCGTAAAAAACCGTTTCGGTCCTACGAA
TGAATTGCTTATTTTATCCATGCACGCGGATGGATTAAAAGAAGTTACCAATCCTTCTGGCCTCTTCCTA
CAAGAAAAAATTACAGAAACCACAGGTTCTGTAATTATTCCTATTATTGAAGGATCTGAAACTCTACTTA
TTGAGATGCAGGCTTTAGCTTCATCTTCTCCATTTGCCAATCCTATTAGAAAAACGTCAGGATTTGACCA
GAATCGCTTTTTATTACTCTTAGCTGTTCTAGAAAAGCGTGCTCAAATAAAATTCCATACTGCGGATGTT
TTTCTTTCCATAGCTGGAGGATTAAAAGTTACAGAGCCTGCTGCAGATTTAGGAGCAGGTCTTTCGGTAG
TATCCTCATTGTACAATCGCCTTTCTCCTCAAAACTATACGTTTACTGGAGAAATAGGCTTGGGAGGCGA
AATTCGTCATGTGACCCATTTAGAAAGGCGTCTTAAAGAAAGTAAACTTATGGGTTTCGAGGGTGCAGTG
ATTCCCGAAGGACAGATTTCAGGGCTATCTTCTGAAATTAAAAACCAATTAGATATTCGAGGGGTGAAAA
CTATAAAAGATGCTATCCGATTGCTACACTGA
>ref|NC_003361.3|:c394506-393793 ribonuclease III [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATAATCTGATCAACATTAAAGAAGTTGAAGCTAAATTAAATTTTACATTTACTCAACCGAAACTCT
TAGTGACTGCTCTCACACACCCTTCTTATAGGAATGAGACTGTGACTATTACCGAAGATAGCGAGCGTTT
AGAATTCTTGGGAGACGCCGTGTTATGTTTAATCGTAACTGAACACTTATTCCTGTTATTTCCTTCCATG
GATGAAGGGACACTGTCCACAGCACGCGCAGCTTTAATTAATGCAGTTTCTTGCTGCCAATATACCGACG
CATTAGGATTAGGAGAACATCTACTTATAGGAAAGGGAGAAAGAATTCAAAATGAGCGTGGCAGAACTTC
AGCCTATGCTAATTTATTCGAAGCTGTTTTAGGAGCTGTTTATCTAGATGGAGGTTTAGCCCCAGCACGA
CAAATCACCGTGCCGTTATTACCTTCAAAAAAAGATATCCTTCCTCTTATGCTTGGAAATCCCAAAAACC
GCCTTCAGCAGCTCACACAAAAACAACTGAGGACATTACCTGTATACCAATGTACGCCATGGACATCACA
ACAAGGTGTTCCGGGCTACCATATTCGTGTAATAGTGAACGATGAAGTTTGGGGAGAGGGATGTGCCTTA
TCAAAAAAAGAAGCCGAAAAACTTGCAGCTCAAAAAGCTTTAGATGCCCATGACTACGAAAATAAAAACA
CAATGGACTTGTAA
>ref|NC_003361.3|:394626-395090 hypothetical protein CCA00343 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGGATCGTTCTACATTTAGAACACCTGCGCCATTTTCAAAATCAAGGTAGTATATTATTCGAAGATT
TGGTCTCTGCAGACGATTGTTTTGCTTTAGAAACAAAACTCAGACACTTCGTAGAATCCCTATCCAAAAA
TACACTAGATGCGCGCTGGAGAGACAATATCTTTCGTTCCCTTCCTGAAGTGGCAGCTTTAGTTAAAAAG
CGGCGTTTGGATACTTTTGCCGCGAATCTCGTGCATCGACCTCGATTATCGTTAGTTGGTGATTTTTGGG
TTTTGCCCGGCGATAAGCTTATCGAAAGAGAAGAAGATTGTCAGCTACTCTTATCTTTATCGGGAGATAG
GGTAGGGCAGGGAGTATTTTTCGTTGGACCTTATCCTACGGATCTTTATTTCCCAGAATCAGGGGAAACA
GCTCTTCTGCTTGTCTTCTCTTCTGCGGGGATCCCTATTTCTTAA
>ref|NC_003361.3|:395188-396990 phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAGCATCTTCAACAGAAAATAGAAACTCTTTGTAACCCTATAACAGCGAAGAATATCTTAACCTGGT
TGTCTAGTGATTTTGGTCAGAATGATCGGGAAACGATAGCCGAGCTTCTAGAAAACAATCCGCAGCATCT
CGAAGAGCTATTTGGAAAAACTCTTGCATTTGGTACCGGAGGATTGCGTAGTCCTATGGGATTAGGTACC
AATAGAATCAATGTTTTCACAGTGCGACGTGCTACGCAGGGCTTGGCTCAAGTATTAAAAAAACACAATC
CGCATCCCGGAGATCCTATTCGGGTGGTCATTGGTTATGATACTCGACACTGTTCTTTTGATTTTGCTCA
GGAAACTGCCAAAGTTTTCGCGGGGAATAAAATCCATGCACTTATATTTAAGGATCCCGAACCTTTAGCC
CTCGTTTCTTTTACTTTACGATCTCAAGAGGCTTTAGCCGGGGTGATGATTACGGCTTCCCATAATCCTC
CAGAGTATAATGGATATAAAGTCTATATGGCCTCAGGAGGGCAAGTGCTACCTCCTTTAGATCAGGAAAT
TATTCAAGCCTCAGCAAATGTCGAAGAAATTTTAGTCGTTGATTCTTTAAAAGATCCCTATATCCATCTC
ATAGGGGAGGAATACGAGGCTTTATACACAGAAACCGTGCGGCAACTACAGCTCTATCCTGAAGATAATC
GTATTTCCGGACAGGCAATTCACGTAAGCTATTCTCCACTCCATGGAACTGGGGTCACCATGATCCCTCG
AGTTTTAAGAGATTGGAATTTCCCCATGGTGAAGCTTGTTGAAAAACAAGCACTTCCCGATGGGAATTTC
CCCACAGTGCATTTGCCTAATCCTGAAGATCCGGAAGCCCTGACTTTGGGAATTGAGCAAATGATAAAGA
ATCAAGACGATATTTTTATAGCTACAGACCCTGATGCTGATCGTTTGGGTGTGGTTTGTTTGGATGAGAA
TCAACCTTATATATTTAACGGAAATCAAATCGCTTGTTTGCTTGCAGATCATATTTTACGTGCATGGTCG
GCTCAAGCCCCTTTAGGGAAGGAAGACAAGGTGGTTAAAAGTTTGGTAACTACAGAAATGCTCTCGGCAA
TCACAGAGTCTTATGGTGGTGATATCATAAATGTAGGGACGGGATTTAAGTACATTGGCGAGAAAATAGA
AGCTTGGAGAGGCCAATTAGAAAGGTATGTATTTGGTGCAGAAGAGTCCTACGGTTATCTCTACGGTACA
CATGTAGAAGATAAAGATGCGATTAGCACATCAGCATTAATTACAGAGGCTGCTTTAAAGCAAAAACTCC
AAGGGAAAACTCTTCGAGAGGCTATTTTAGATTTATATGAGACTCATGGATATTTCATGAATAAAACGCT
TTCCCTATCCTTTGAGCCTGGTCAGGAAAGTTTCATGAAATCACAAATAGAGAAGTTGGCAGTTCTTGAT
CCCTCGACCATGTCCTTAACAGGGTATCCTGTGGCAGCATTTGAAAATTATCGCCAGGGGATAGGCATCA
ATATTGCTTCGGGAACTACATATAAACTGCATCTTCCGAAGATGTTCATGTTGTGCTACTACTATCAAAA
TGGAGGAAAGATCATCGTGCGTCCTTCAGGAACAGAACCTAAAATAAAATTGTATTTTGAGCTTGTGAAT
CATTACGATGTGGTAGCAAAAAAGAAAGAAGAGCGTATCCAAAGAGAACAAGAAAGTCAGAAAAAATTAG
AGGATTTTATTTCTGAATTTAAAGAGAAGTTCTCTTCTTTAAAGCCTGAATAA
>ref|NC_003361.3|:397180-397797 superoxide dismutase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACCTTTGTTCCCTATACTTTGCCCGAATTGCCCTACGATTACGATGCTTTAGAACCAGTGATTAGCG
CAGAAATTATGCTTTTACATCATCAAAAGCACCACCAAAGTTATATAAATAATTTGAATGAAGCCTTGAA
GAAATTAGACGTTGCTGGTGTTCAGCAAGATCTTACACGCCTGATTGCCTTAGAGCCTGCCTTACGTTTT
AATGGCGGGGGACATATTAACCACTCTCTATTTTGGGAAATGCTCGCTCCAGTAGATCGTGGCGGCGGCG
TACCCCCAAAACATGGGTTGCTCAAGCTGATTGAGAAATTCTGGGGAACTTTCGATAATTTTTTAAAAGA
ATTTATTGAATTTGCAGCTCCTATTCAAGGATCGGGATGGGCGTGGCTAGCTTTTTGTCCAAAAAAACAG
GAGCTTATGCTATGTGCAACAGCAAATCAGGATCCTCTAGAGGCGACCACTGGTAAGGTGCCCCTTCTCG
GAGTGGATGTCTGGGAACATGCTTACTATCTCCAGTATAAAAATGTTAGATTAGATTATTTAAAAGCTAT
TCCTCGAGTAATTAATTGGGGATATATTGAAAAAAGATTCTCTGAGACAACTAATTAA
>ref|NC_003361.3|:397874-398800 acetyl-CoA carboxylase subunit beta [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGCGTTTATTTTCTTACGACAAACCTAAGATTAAAGTGCAAAAGATAAAAGCTGATGGTTTTAGCGGTT
GGTTAAAGTGCACGCATTGTCACGAGATGATTCATGCGAATGAATTGGGGCAGAATTTTAATTGTTGTCC
CAAGTGCTCTTACCACTACCGTATTACCGCTGCAGAGAGGATAAAGCTTCTGGCGGATAAAGATTCCTGG
CGTCCTCTCTATACAAATCTTAAATCGCAAGATCCGTTAAAATTTGTTGATACAGATACCTATCCAAATC
GTTTAGCTAAAGCTAGAAAAGACAACACAAAAAGTGAGGGTGTTCTTGTTGGTGTTTGCACCATAGGTGA
GCATCCTGTGGCTTTAGCTGTTATGGATTTCAATTTCATGGCGGGATCTATGGGGTCTGTGGTCGGTGAA
AAACTTACCCTCCTTATAGAGAAAGCTATAGAATCAAAACTTCCTGTAATTATTGTCTGTGCTTCGGGAG
GAGCAAGGATGCAAGAGTCTGTACTCTCTTTGATGCAGATGGCGAAAACATCCGCTGCTTTAGCCAAATT
ACACGAAGCAGGTCTACCATACATTTCTGTATTGACCAACCCTACATCCGGAGGGGTTACCGCTTCTTTC
GCTTCTTTAGGTGATGTGATTATTGCGGAACCTAAAGCCCTTATTTGTTTTGCGGGTCCTCGAGTCGTTG
CCCAAGTTATAGGTGAAGATCTTCCCGAGGGGGCGCAAAAATCTGAATTTCTTCTCGAACATGGAATGAT
TGATAAAGTGGTTGAGAGGAAACAATTAAAGACTACTTTGCAGAGTTTACTTGATTACTTTTGTGCTCAA
GAATACACTGGCGGCCAGGATAAAGCACCTAGGGATCTGTCTAAGACTCTTAAAGAGATTTTTTTATTGA
CAGATGACGGTGAATAA
>ref|NC_003361.3|:398843-399286 deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACTATAGTTTGTGAATTAGAATCTGGAGCAGATCTTCCAGAATATGCCACAGAAGGCGCTTCAGGCG
CAGATCTTCGAGCCCATATTGAAGAACCTATTGCCGTATTGCCAGGGCAACGCGTGTTAATTCCTACGGG
AATAAAAATGCAGATTCCCCAAGGCTATGAAGTTCAAGTGCGTCCACGTAGTGGGCTAGCTTTGAAACAT
GGGATTATGGTTGTTAATTCTCCAGGAACAATAGATGCCGATTATCGCGGAGAAGTTTGTATCATACTTG
CAAATTTTGGAGAGAGTACTTTTATTATCGAACCTAAGATGCGCATTGCTCAAGCTGTAGTTGCTCCTGT
AGTTCAAGCAAAGTTTATAGTCGTGGATCAAGAAGAAGGATTAACGGCAACATCTCGGGGAAGTAGAGGT
TTTGGGCATACCGGAGAGAAGTGA
>ref|NC_003361.3|:399288-399764 PTS system,IIA component [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCCTTTCTATTGTGAGAGTCAACCTGATTTTTCCTTGTTTTCTCTTTTATCTCCCAATCTTATTATGT
TTTTGAATAAAAACTCTCGGGAGGAGATTCTCCAAGATCTTACAGATCTTGCGAGTGCCGCCGGCCTACT
TGAGAATAAAGAAGAGTTTTTTCAAGCTTTAGTGACTCGTGAAAACATTATGTCCACGGGTATTGGCATG
GGGGTAGCCATCCCCCATGGTAAATTACGTAGTTGTTCTGACTTTTTTATCGCCATAGGTATTCATTCTC
AGGGGATTCTCTGGGATGCGATAGACGGAGCTTTAGTCCGTCTAGTATTTTTGATAGGAGGTCCTGATAA
CGCTCAAGCTGAGTATCTCAAGCTGTTATCTACATTAACTCTTTCACTTAGAGATGAATCTCGACGACAG
AAGTTGCTACAAGTAACAACGATTGAAGAAGTTATGAATGTGTTTTTAGGAATGTAG
>ref|NC_003361.3|:399770-400450 DNA binding protein/PTS system, IIA component [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGATTTAAAATTAGACGAGTTAGCTTCTCTATTGGATGTTTCTGAAAATACTGTCCGTCGTTGGCTGG
ATGAGGGAGCTATTCCTAGTTATAGCATGAATAATGAACACAGATTCAATCGAGAAGAAATAGAAGATTG
GATTTTACATAATCAAGCGCTAATCGGATTGGAACAAGACGAGAAGCAGGATTCAGAGTTTCGCGACCTT
TCCTTAAAATATAGCTTGTATAAGGCGATTTATCGTGGAGGGATTATCCGCGATGTTACTGTAAACAATA
AAGCAGAAGCTTTGCAATATGCCTCTTCTTATATAGCAGAAAAGTTTAATCTCGACGCCAGCGTTCTTTT
TGAAATGCTTTCACATCGAGAAAGTCTCATGTCTACAGGTATAGGAGAGGGCATTGCTCTTCCCCATGCC
AAAGATTTTCTAATCAACGCCTATTACGACGTTGTCGTTCCTATGTTTTTATCAACAAGTATTGACTTCG
GTGCTCTTGATGGAAAACCTGTGAGCGTATTGTTCTTCCTTTTTGCATCCCAAGATAAAAGTCATTTAAA
TTTAATAAATAAAATCGTCCATCTTGGAATGTCTTTAGAAGCTCGAAGTTTTCTGACAAGCTATCCAGAA
AAAGAGCAGCTTCTTGCCTACATTAAGAATTGGGAATCACAAATCCATTAA
>ref|NC_003361.3|:400549-401805 hypothetical protein CCA00350 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATGAGTTCTAAGCGTACTTCGCAACTTGCAATGCTTTCCATTTTGTTAACTTTTACTCACTCTGTCG
GTTACGCAAGTGCTGCAGTTCCTCCTTTTGAAGTTAGCTCTGTATATTCCGAGGATTCTTTAATTGCTTT
GGAAAGCGAACAAAGCAATCAAAGCAGCCTCAGCCGTAAAGAGAAAAAACTCAATAGGATTCAAGAAGGC
AGAGCTGCAAGAAAAGAAGCAAGAAAAGCTGCCGAAGCTAAAAAAAATGCTAGAGATGCAGCAAGAAAAG
CTAAACAGAGTAAAAAACTGTCCTTTTCATTCAATAAGTTGAATCGAAAGCCCAATGTTCAAGCTCAAGC
TAAAGAGCAGAAGGAACAACAAAAAGTCTTTGCCCAACAAGTTAAAGACGGCGTGAATTATTGCCGAGAA
AAGCTTGTTGAATATGGAACCGAAAATCTTTTAACTCGCGGTGGAAGATTTTTTAAAAGACAACACAAAG
TTAATAACCCTGATCAAAATACAGTAGCAGCTCCCGAGGCTGCAACTCCAGGGACTTTATTAAAAGCTAA
AGTTGATAGCGAAACAAAAGCTTCTTCAGAAAATAAAGAAGCCATTCAAGTTGTTCATGATATCAAAGAC
GGTCCAGTACTCCCTATTTTTGTTCGTCCTGATGTAAAAGTAGTTCATGAAGAGAGAAGTAAACTTATTC
AGGATTTAGCTAGAGAACAGAGAATCACTAAGAGGAAATCTTCTAGAGAAGCTCTCCAGGCTCGTGCAAA
GGAAAATAAAATTCTTAGAGATGGGAAGATTACTTCAACACTACGTTATGATGTTGAAAAAGCTGCAGCT
GTTAAAGTTAAACGCAATGGTTCTGTAAATCCTCAGGTTCGCGCTCAGAAAGCATCCAATACTCGAAGAA
GCGCACGTAGTGAACAAAATCAGCAAGAATCAGCACAAAATTCTGCAGATCAAAAAGAGCAAACTGCTAG
CAACACATCTAAGGATGATTTCTACAGAACATCTTCTGCTGCAGGAAATACCAACATAGATAGCTACCTT
AATGCTAAGCAGTACCGTTGTGATTCTTCTGAGTCAGACTGGCCTTGTTCTTCATGCGTTGCTAAACGTC
GTACACATACAAGCATTTCTGTATGTACCATGGTCGTTACAGTTATAGCTATGATCGTTGGAGCTATTAT
TATTGCCAATGCATCTGATTCTACCCCAGCTAATGGTGGAACAAATCCTACCCCACCGACTCCTTAG
>ref|NC_003361.3|:401993-403744 hypothetical protein CCA00351 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCTGAGCCTAAGCCAATATATCAAAGCCCTGCTTTACATCAGGTAGAGATCGGAAAATCATTCTTAG
ATAGGAATCCGAAAATTGCTAGAACTATGCAAGTTACCGGAATAGTGCTAGCTGTCTTAGCTATAGTCGC
TTCTGTATTTTTGATTACCGTCATGCCTTTAGGTTTACCGATTTCTGTGGCACTGGGTGGAGTCTTGCTT
GGAATTGGTGGAAGTGTATTGTTTACCTCTGTGAGCCATTTAGCTCAAAATATAAAGAGGGCAGTTGTAG
AGAATAAACGTCGGAAGCTTTTACTTCAGGAAAAACGCGAAGGGATAAAGCCAAGAGATGACAACTTAGA
AATATTGTGGTCTAAATACCATCATATGGTGGATAAGTTTGCTCATTTAAACATGAGCATAGGCAAACAT
GAAAGAAGTATTCTAAGTCATATGGGTAGGGGAGAGGGAGCCTGGTTTGTAGAGAACCTCAATCAAATTA
CTAGCGATTACTTAACTTGTATGAGTTTACTTGAGGGTCGTCGGGCTGTTTATGATCAGGAAGATTATGC
GCAGCGCGATGAGAGTTATCCCAGTGTTGCTAGGAAAAATGAACTACTTATTAGATTAGGAAATAACATC
GTTTCTAAATTGTCTAAGGGTGGTGGGGCCTTTTCTTTAAAGATGCAGAGATTAAGCAGCACCATGTCAA
AAGTTCATACGGGAATAACTTTAGGTTTGGTCGTTGGAGGCATTGCTGCTGTAGGGGTTATTGCTGCAGT
TATCCCCGGAGGGATCTTCGCTCTACCTATGATTATAGCAGCGGCTATAGGAATCGGTCTTGCTGTTTTA
GGTTTGTCCTATGCAATCGAAGCCATATTAGAGCGATCTAAGACAAATAAAAAACAATTACTTAAAGATC
TAAAGTCCACGATTGATATTCAAGATTTGAAAGATATGACACTAGATCAAACTGTTCTTATGAATATGTT
GAAAGTCTCTTTACAAGCCGATCAACAAATGACTTTGGATCACAAAGACTTTTACGAGGAGTATAATAGG
ATACGCGATAATTTGCAGTCCTTAAACGAACACCTCGAAGAACTAGAGTTTAAATACAAGCATATAAATA
ATGAGCACAAGCGACGTGCTAAAAGATTAGAAAAAAGGCTTGTGACTCTTTCCGATAAGCAGAATGCCCA
AGAGGGTAGCAGTGCCCCTCAGGGACCTGCTGCTGGTCAATCAGATCTATGGGGTGATACTGCAGGATTT
GATGAATTAGTCACTAAAGGTGCAAATGCTGCGCAACGCAGACGAGAAAATGATCGCCAAGGCAGATCAT
TTTTAGGCGATTATGGACAGCATTTAGATGCAGATCAGCTAGAATTTGCCTCTGGATGGAGCCCATCAGG
AAAACGTGCTCTTGAAAAAATGTGGTCTGCAAAGCCTGGAATGACTGAAGAAGATTACTTCATTTTATAT
GAGGATGTAAATAAAGAGCTGACTGCATGTCGCAACGATATACAAACTCTGAAAGCATATATTATTTATA
TGCAGGCGCTCTTTGCTGAAATAAATGCAGGAAGAAGCAGGCTTGAAGTTTACTCAGAAGAGATTATAGG
GATTTGGACGGATGCAAGTAACTATTGCCACAGGATTCTTAATCATCTAGTGGGAATGCAAATGCGGCTG
ATAGATTGTATAGAATCTAGAGAGATTCGCCCTGATGTCGGGAATATCTCTCCAGGGCAATTCCCTTACT
AA
>ref|NC_003361.3|:c404357-403764 hypothetical protein CCA00352 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACATTAACGCCTATTCCCCCAGATCAAAAAGTAGTTTTCCTCCTTCCCTGGGATAGTTATCGTGCTA
ATTTAATACTACGTACTACGGTTTGTTTTGCTATCTCAGTACTTACGTGTTTAGGAATGATCGCTTTAAT
GAGCTATGCTATACTCTATGGTAATTGGCTAATTTTTGGTATTAGCTTAGGGATGATCCTTTTACTAATT
TCCGTGGCACTTATTCTAGACTTGCCTATCAAAAATAATTTTTTTGGCACTTCATTGACCCAAGAAATTT
CTCAAGACATCTCGAATTTAGGTGTAGAATCTATCGAGAAGTTCCGCGTAGCATTTGGAAATATACGGAA
TACGTTTATTCCGCATATGCGGGACTTAAACAATAAACTACAAAATGACTATGATACGGCAATATCTACA
AAAGAAACGCAGATTCATAATCTGTCCAAAAATTTAGATTCTATGGTGAATGATAAGCGTCAGGAATACG
CCCTATGGCAAGAAAATAGTCCCCTCTCTTCTCAAGCTCTTACACTAAAAGAGCAGTTAAATCATTGGGA
TAAAATTGAACAAAAAAGCTCTCCCAAGAAATAG
>ref|NC_003361.3|:c404929-404369 hypothetical protein CCA00353 [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGGTATTAAGTCTTTCTAATTCTATTTCACCAGATCTTCTATCCTTGCCTAGCCAATGCTCCTTGCTTT
TCAACGTAGAAAAGGACGCTACGGTATTACAAAAAAAAGTTGCTATTTTTATTAAGCAAAGCTCTTTCTC
TTATATTTTAGCTATTATACTTTTGATGGGAACAATGACTGGGGGTGCTGTAGTGGTAGCTTTTGGCTGT
ATTTCTTCTAGTCTTCCAGAAATTATTGGTGGGGTGACTTTGATGGTCGCTTCATTAGTTTGTATTCTCC
TACTTATTAGCATGATTTATCTAGTTAAGTGCCTACCATCTAAGATCCAACAAACGATAACCCTCGTAAA
AAATAAAACCTCATCATTATCTTCTTTCCAACTACTTCAAAATGCCTATTCAAAATTGATTTACTCGATC
ATCGGGAAAGAACAGCGGCTAGAACAATTAAAACAAGAGGAACATCATCTACTGGTCAAACTACGTGCCT
GGCAGGAAATATCAAATGCGTCTCAGGAAATGTATGTGCCAGATGCAACCACTCCTAATTTAACAAACTA
A
>ref|NC_003361.3|:405034-406116 tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATAAAACTGTTGTTGTTGCTATGTCTGGAGGCGTAGATTCCTCCGTAGTTGCCTATTTATTAAAAA
CGACCACTCCTTACAAAGTTATCGGTCTCTTTATGAAGAATTGGGAAGAGGAGGATAGCGATGGTCTTTG
CTCTACAGCTAAAGATTACGAAGACGTGGAAAGAGTCGCGGGTCAGTTAGACATTCCCTACTACACAGTA
TCTTTTGCTAAGGAATACCGTGAGAGGGTTTTCTCTCGTTTCCTTAGAGAATATTCTAAAGGTTATACGC
CTAATCCTGATGTTCTTTGTAATCGTGAAATAAAGTTTGATCTACTTCAAAGAAAAGTCCGTGAATTAGG
GGGAGATTTCCTAGCGACAGGTCATTACTGTCGCTTATCTTCAGCTGCCGAGGGGAGGCATTTACTTCGG
GGGCTAGATCCCCAAAAAGATCAAAGCTATTTCCTATGTGGCACACGAAGGGAATCTCTCGATAATGTAC
TTTTCCCTTTAGGGGGTATGACAAAAACAAAAGTACGTGCCATTGCTGAACAAGCTAGATTGGCTACAGC
GCAAAAAAGAGATAGTACGGGGATCTGTTTTATTGGGAAACGTCCATTTAAAAGTTTTCTTGAAAAGTTC
GTGCCTAATGTAGAAGGGGATATCGTAGATTACGATTCTCAGAAAGTTGTAGGCCGACATGAAGGCGCAC
ACTATTACACGATAGGACAACGCCGTGGGTTAGATCTTGGGGGTTCAGAAAAACCTTGTTATGTTGTTGG
CAAAGATATGGAAAAGAACATCGTATATATCGTGCGTGGGGAAGATCATCCTTTGCTATACCAGACCGAA
CTTACAGCTAAAGAATTGAACTGGTTTGTATCTCCAGAATCTATAACAAGATGTAGTGCAAAAGTACGCT
ATCGCTCTGAAGATGAAGAATGTGAAATTCTTCATTCAGATGAGGATAGTGAAGTGCGTGTACGATTTTC
TTCCCCCGTTAAGGCAATTACCCCAGGGCAAACAATTGCCTTTTATGATGGGGAGAAGTGCCTAGGGGGA
GGGGTCATAGAAGTTTCTATGACTCCCCATTAG
>ref|NC_003361.3|:c408640-406100 ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTGAGAAGTTTACTAACAGAGCCAAACAGGTCATTAAATTGGCTAAAAAAGAAGCTCAGAGGTTAA
ATCATAACTATCTAGGCACAGAGCATATACTCTTAGGCCTACTCAAATTAGGCCAAGGAGTAGCTGTAAA
TGTATTGCGTAATTTAGGGGTAGACTTCGATACGGCAAAGCAAGAAGTCGAGAGACTAATTGGCTACGGC
CCAGAAATTCAAGTCTATGGCGACCCTGCCCTTACTGGGAGGGTGAAAAAATCTTTTGAATCTGCAAATG
AAGAAGCCGGGGTTTTAGAACACAATTATGTAGGTACCGAGCATCTTCTTTTAGGGATTTTAAATCAGGC
TGACGGTGTTGCTTTACAAGTTCTAGAAAATTTACATATTGATCCTAGAGAAGTTCGCAAAGAAATTCTT
AAAGAGCTCGAAACATTCAATCTTCAACTTCCTCCTTCATCTTCTTCTAATCCTCGAGGAAGTTCCTCTT
CTTCTTCTAAATCTTCCTCTTTAGGTCATGCCTTAGGTGGAGAAAAAAGTGATAAGTTATCGGCATTAAA
AGCCTATGGCTATGACTTAACAGAGATGTTTCGCGAGTCTAAGCTTGATCCTGTTATTGGTCGATCTGCA
GAAGTTGAACGTTTAATTTTAATCCTTTGCCGTAGAAGAAAAAACAATCCCGTGCTTATCGGTGAAGCCG
GTGTAGGGAAAACGGCTATTGTTGAAGGATTAGCACAGAAAATTATTTCTAATGAAGTGCCCGATACTTT
ACGTAAGAAGCGTTTGATTACTTTAGATCTTGCTTTAATGATTGCCGGAACGAAATACCGTGGGCAATTT
GAAGAACGTATCAAAGCTGTTATGGACGAAGTCCGCAAACATGGAAACATCCTTTTATTTATCGATGAGC
TGCATACTATTGTAGGTGCTGGAGCTGCTGAAGGCGCTATTGATGCTTCAAATATTTTAAAACCTGCATT
AGCGCGTGGAGAAATCCAGTGTATCGGAGCAACAACGATTGATGAATATCGCAAGCACATTGAAAAAGAT
GCTGCTTTAGAACGTAGATTCCAAAAAATTATCGTCCAGCCACCTAGTGTAGATGAAACTATAGAAATCC
TACGTGGATTGAAGAAGAAATACGAAGAACATCACAACGTGGCGATTACTGAAGAAGCTTTGAAAGCAGC
AGCAACGTTATCCGATCAATATGTTCATGGGCGTTTCCTTCCAGATAAGGCTATTGACCTACTTGATGAA
GCTGGAGCACGCGTACGAGTGAATACCATGGATCAGCCTACAGAGTTAATGAAACTCGAAGCTGAGATCG
AAACTACGAAACTAGCTAAAGAGCAAGCTATCGGCACTCAAGAATACGAGAAAGCTGCAGGATTGCGTGA
TGAGGAGAAAAAGCTTCGTGAACGTCTTTCCAATATGAAGCAAGAATGGGAAAATCATAAAGAAGAGCAT
CAGATTCCTGTAGATGAAGAAGCTGTTGCTCAAGTGGTCTCCTTACAAACAGGAATTCCTTCAGCAAGAC
TTACTGAAGCAGAAAGTGAGAAACTACTTAAATTAGAAGATACCCTACGTAAAAAAGTCATTGGCCAGGA
TCAAGCTGTAAAAAGTATTTGCCGTGCTATCCGTCGTTCAAGAACAGGCATTAAAGATCCTAATCGTCCT
ACAGGTTCCTTCTTATTCTTAGGTCCTACAGGGGTCGGGAAAACATTACTCGCTCAACAAATTGCTATCG
AGATGTTTGGCGGTGAGGATGCCTTAATTCAAGTAGACATGTCTGAATACATGGAAAAATTTGCAGCTAC
GAAAATGATGGGGTCACCTCCAGGATATGTTGGACATGAGGAAGGTGGTCATCTTACTGAGCAAGTGCGT
CGTCGGCCTTATTGCGTTGTTCTATTCGATGAGATTGAGAAAGCGCACCCCGATATTATGGACTTGATGT
TGCAGATTCTTGAACAAGGACGTCTCACAGATTCCTTCGGTCGTAAGATTGATTTCCGTCATGCAATTAT
TATCATGACGTCTAACTTAGGTGCAGACTTAATTAAGAAAAGCGGAGAAATCGGTTTTGGGTCTCGATCG
AATTTTGACTATAAAGTGATTCAAGAAAAAATCGAGAATGCTGTTAAGAAGCATTTAAAACCGGAGTTTA
TCAACCGTTTAGATGAAAGTGTTATCTTCCGTCCTTTAGAGAAAGATGCTCTATCTGAAATTATCCATTT
AGAAATTAACAAACTGGATTCCCGTTTGAAAAATTACCAAATGGCGTTAAGTATTCCCGACTCAGTGATT
TCTTTCTTGGTTACAAAAGGACATTCTCCAGAAATGGGGGCACGACCTCTACGTCGTGTTATTGAGCAGT
ATCTTGAAGATCCTCTTGCAGAACTTTTGCTTAAGGAGTCTTGTCGTCAAGAAGCACGAAAACTTCGTGC
TCGTCTTTCTGAAGATCGCGTTACTTTTGAACGCGATGAAGCGCAAGAAACTGAAAGCGTCGCAGCGGCT
ATACCTAATGGGGAGTCATAG
>ref|NC_003361.3|:408844-409560 hypothetical protein CCA00356 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCTATGCGCATAGTAGATTCCGGAAAAGGAAGTTCTGAGGCCCATATGGCCCGAGACAAGTATTTGC
TAGAACACCTCAAAAAAGGGGAGGTAATCCTTCATCTCTATGAGTGGGATAGTCAATACCCGCTCACTTA
CGGCTATTTTATGCGCCCAGAAAAATTTTTAGTTGACAATAGGGCTGCGCTAGGCATGGACGCTGCTGCC
CGACCTACGGGAGGGGGGTTTGTTTTTCATCACGGGGATTATGCATTTTCGTTATTAATGTCATCGGAAC
ATCCTAGGTATGCGCCAACTGTTTTGGAGAATTACTATACTGTGAATCAGATGGTGTTACAGGTTTTGAA
TAAGGTTTTCCGTATTAAGGGCTCGCTTTCTTTTGACGAGGATGTGCACCACCCCCAGACGTCTAATTTT
TGTATGGCTAAAGCGTCAAAATACGATGTTTTAATGGGAGATAAGAAAATCGGTGGTGCTGCTCAGCGTA
CTGTAAAACAAGGATTCTTACACCAAGGGTCGGTATTCTTGTCGGGAAGTTCCTTAGAGTTTTATCAAAA
GTTTCTTTTGCCTGAGGTTATGGATGTTATCGCCTCTGCGATTGAGAAACGAGCATTTTTCCCTCTGGGT
CTGTCAGCACCTTCTTCAGATCTTTCAGAGGCAAGAAAGGAAATAAAAGAGGGGTTAATTCAAATGTTTT
CAAGTGGCCATCTATGA
>ref|NC_003361.3|:409557-410981 phospholipase D family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATACAATGCGATGGGGTTTGGTTATTGCGCTCTTTTGTTCATTTATAACAAAAGATGCTTTTGCCT
TTACAGTGCATTTCCCTACTTCTAAAGAACACGCGAGTGTTATTGTTCATGATAATAGTGTTGAGGTTTA
CGAAAAGCTTCTATCAGCTATAGACGTTGCTGAGCATTATGTCGAATTATGTCCTTGCATGACGGGCGGG
AATTTATTAAAAGAGATCGTTGAGCATTTACATGTACGCATGTCTCAGGCCCCGCAACTGTGTGCTTATA
TCCTTATTCAACCTACATTTATTGATAGTAAGGACAAGCAGGTCCTTGAAGATGCAAAAGCCAATTGGCC
TGATAGATTTTTTTATCTATTTACCGGATGCCCCCCGGGATCAAGTATTCTAGCCCCTAATGTTATAGAG
AGTCATATCAAGATCTCCATGGTAGATGGAAAGTACATTTTTATGGGAGGGACCAATTTTGAAGATTTTA
TGTGTACTAAAGGGGACACCATTCCTGAACCTGTAGAATCTCCGCGTTTAATTATCGCCGGCACCCGAAG
ACCTCGAGCTTTTCGTGATCAAGATGTCACTATCAGTTCTGCGCAACTTGGCACAGAGTTAAGAAAGGAA
TTTCATGCGCACTACGCTCTTTGGCATGCTTATGCTCAAAAACCTTGGTTTAATAAAAATCTCAATGATT
TTCGTGCGCTCCCTTATCCAAAATTAACTGTTGAAGAAGCTGCAGCTACATATTGTAGCGCTATTGAAGA
AAGTCCTGATCTTGTAACAACAGATCTTAAAAATATTCGTGTGATTTTTTCTGGGCCTGATGAAAGTAAA
AATGCAATTACTCAAGAATATGTAGATTTAATCAATAGAGCAGAGAAATCTATCAAAATTGCGAATATGT
ATTTCATCCCTAAAGATGAGATTATTGAGAGTTTAAAATCTGCATGTTTCTCTCGTGGTGTGCTCTCAGA
AATTATTACTAATGGATGTACGGAAAATAGTCCTGATCTTACCGCAGTGTATGCTTGGGGAAATCGCATG
AACTATTTCTTTTTATCTTATGGAGAGCGTCCTTCTCTATGGAAGAAGTTCATATTTTCTAACAAAACAC
CTTGCAATTCTCTGTTTATCAATGAATATTTTGTTCCGGATACGCAACTACATAAAAAATGTATGATCGT
AGACGGACGTTACTTTGTTATAGGGAGCTATAACTTCGGGAAGAAAAGCGATCTTTTTGATTACGAAAGT
ATTGTGGTCATTGACTCTCCAGAAGTTGCTGAAAAAGCTAATACCGTCTTTATAAAAGATTTGAGCTTAT
CCAAACCCGTCGATGATTCTGAGATTTTTGATTGGTACTTCAATCCTGTGTATAATCTCATAGGTCACTT
ACAAATTAATTTTATGCCTGCTTAA
>ref|NC_003361.3|:411111-413180 hypothetical protein CCA00358 [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGCTAGCATTCTTTTATAAGCATCAGAAAAAATTCATTGGTTTAGTTATTGTCGGTGTATGTGTATCTG
GAATAGGCATAGGCTGGGGACGCTATCCAGGGGAATCTGCAAGTAATGGATCTAGGAAGGTTGTTTTCTC
TGTACCGGGGAAAAAATATTCTGAGAGAGAATTCCTAGCGATTAAGAGATTCTTTATGAATGAGGCGTAT
CCCTTTACAGGAAATCCTCAGGAATGGAATTTTTTAAATGAAGGGTTACTTACTGAGCGCTTTTTAACAA
ATAAAATTGGGGAAAAGCTCTTTTTAAAAATCTATTCTCAAGACTATCCAGCTTTTAATAAAGAGAAACG
TTATCAAGCTTATCGAAGATTTGATACTCCATTTATTTCTTCTGAGGAAGTTTGGAAGTCTTCTGCTCCC
CGTTTATATCAAGCTTTGACTACTTTGCAGGAAATAGATAATCCCGTGTCTCCTGAAGGATTTGTTGCTA
GGGTTCAGCTCTTTTTAGAAGAGAAAAAATTCCCACATTATATTCTCAAACAGATGCTTGAATATCGTAG
ACAAATGTTCAATCTTCCCCAAGATGCTGCTTTGGCTCAGGGAAAAGATCTACGTTTATTCGGTTATAAG
AATATTTCTGATTGGTTTGGAGATGCGTATGTTTCTGCTGCTGTTGAAGCCTTGTTACGCTTTGTCAATG
AGCAGAAAAAGAATATCGCTATGCCTTCTTTAAAAGAAGCGCGGCAAGATTTCGAAGATAAAGCTCAACA
AGCGTTTACTAAATTGACTAAACACGCGGGACTTACCTTGAGTTTTGATCAATTTGTGGCTTCTTATTTC
GATTTTCTTGGAGTAAGCAAGTCAGAATTTTTCAATATGTATCGTGAGATACTTCTATGCAAAAGAGCCT
TTTTACAATTAGAAGGTAGCGTGACCTTTGATTACCGTCCTTTGCAAGAGTTTTTCTCTATGGGGAAAGA
TTCTACATCTGTAGAAATGGTTAAGCTCCCTCGTGAATATCAATTTAAGAATAGAGAAGATCTAGAAGCT
TTCGAGACTTATATCAGCCTTGTAGGCGTTCCAGTTAAGGATTGTCTCGATGTTCCACGGTTTACCTTGC
CTATTAAAACTATTAAGGCGAAAGAGCCAAGATTGGTAGGGCGAAGATTTTTAGTTTCCTATAAAAGTAT
CCATCTTCAGGATCTCGAGACTAAAGTTCCCATGGTTGAGGTGCACCAGTGGCAACAAAATCCTGAAAAT
TTCCAAATTCTGCTTCAGCAGTTTCCTAAGATTGAAACATGCAACTCAAGCAAGGATTTCCAAGCTCTTA
AACCCTCTCTTTTAGAAAAAATCTATTCTTTCACAAGAAAGGAGATTTTAAGAGCACATCCAAAAAGAAT
TCTCGAGAGCTTAGCTCAATGTAAACATGAGAGCCACGAAATTTTCCTTTCTTCAGGAAAAGATAGTATC
TTAGAAGGCATTTTAGATGGTGATAAGCTAGCTGCATTATTATTGGATAATGAGCTCTTAGAGGCCTACA
GTCAGGATGGAGAACACTATTACACATTTGTCGTAAATACGTGTTTTGAGGGAGAGGAGGTCATTCCTTA
TCGTGAAGTATTACGTAAGGATCTAGCGAAAGCCTTAGTTTCCTCACATAAAAATTCCTCACATATTGAT
AAGGTGATTTCTGCTTTAAAATCTCATTATCAAGAAGAGGAGAACGAGCATCTCTGGCAAAAACGCCTAT
GGTCTTTGGTCAAAGAACATAAAGAGGGAACATATCAAGCAGGGACTCTGTCCTGGAATCTTGAAAAATC
TATAAAAATATTTACTCGTGGGGATCAAAGTATTCCTCGGCCTTATTCCGAACTAGCTTCTATGGAAGAG
GGAGCGTTGTCAAATATTGAATTTAATCCTGAAGAAGGCCCATTTTTCTATAAATGTTTATCACATCAAA
CATGTGTTGATCCCGCTAGTGTGGAGAAGTTATTCCTCGCTAAGGGGCATTTAAATGAAGAAATCCTAGG
GAGCTATATAGAACGTTTTATTGATGAAAGAGTCAGATAA
>ref|NC_003361.3|:413180-413521 glycine cleavage system protein H [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTGGGATTCTGATTATCATGTGTGGATTTTACCGATTCATAGTGACGTTGTCCGTTTAGGATTGACAG
CTAGAATGGGGGAGAACTTAGGTCAAATGCTTCATATTGATTTGCCCACAGTAGGTAGTTTCTGTAAGGA
AGGTGAGGTTCTAGTCATCTTAGAGTCTTCGAAATCGGCTATCGAGGTTTTAAGTCCCGTTTCTGGAGAG
ATTATAGAGGTTAATGAGGCTCTTAAAGAGGACATTCAGCTTCTTAATAATTCTCCTGAAGAATCTGGTT
GGTTCATGGTTGTTAAACTCGATGAAAAATTAAATACAGAAAATCTTTCTCCTAGAAAATAG
>ref|NC_003361.3|:413645-413938 hypothetical protein CCA00360 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCCTCGTTAATAGTTGGCAATGTCTCTACTCCTGTAAAGATGAAGAGCGCCCAGTTGGAGCTTTCAA
CGCAGCTTAAGGTAATAACAGCTATTACGGTATTATTAGCTTTAGCGGTGATAGGTCTTGCCTGCTATGG
ACTGTTTGGAACTCCACTGATAGCCACGCAATTAATGATATGGATTATGAGTGCTTCTATGACCTTAGAG
GCGTTGATATGTTCTTGTGCGAAATATCATCTTCTTCGTCGTTATGAGAAAAACCTACTTAGCGGTGGAG
AACCGATACAGTAA
>ref|NC_003361.3|:413960-414292 hypothetical protein CCA00361 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATGATTCACGTGCAAAGATTTCAACGACCTTCTCCTGAAGCTCCGAATACAGCAACTCTATTGTATC
AACTACATAAAGGCCCTTTAAAGGAGCCTGAGGGATTGCGCACTTTCCGTAGAGTACTATCAACTCTTAT
GACTTCTTTAGCGATACTCGTCATGATAGTATTCACTATTCAATCTTCAACGATTACTCCAGCAGCGTTG
TACACAGCAATTTTCTTTGCCTGCTGTACTCTTGTATGCATAGCAATGTTTATGGTAAAACACGTATTGT
GTCACTTTCCAGAACTCGCTAGAGGGACTATCGAAATTACCTCGAATAGTTAA
>ref|NC_003361.3|:c415088-414294 Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit E [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTGGTTAGGCGAATATACATGGCTAAATGTCTTTGGTATCTTTTTACAAGCAACCTTCATCCAAAACA
TCCTTCTATCGAATTTCCTTGGGATGTGTAGCTATCTTGCCTGTTCCGCGCGAGTTTCTACTGCTAATGG
CTTAGGAATGTCTGTAGCCTTAGTACTGACAGTTACTGGAAGCATTAACTGGGTCGTGCATACATTTATT
ACCGGGCCTAAAGCTTTAACTTGGATATCCCCCTCATTAGCCAATGTAAATCTAAATTTCCTTGAGCTGA
TTATCTTCATTGTAGTTATTGCTGCCTTCACACAGATCTTGGAACTACTTTTAGAAAAGGTATCCAGAAA
TCTCTATCTTTCCTTAGGGATCTTCCTACCGTTAATTGCTGTAAATTGTGCAATTTTAGGAGGCGTGCTC
TTTGGGATTACACGGAATTATCCATTTATCCCTATGATGATATTCTCTTTAGGAGCAGGATGCGGTTGGT
GGTTAGCTATTGTCTTATTTGCAACTATTAAAGAAAAACTTGCCTATTCTGATATTCCTAAAAACCTTCA
AGGCATGGGGATCTCCTTCATTACCACAGGACTTATAGCTATGGCCTTTATGAGTCTTACAGGTATTGAT
ATCTCTAAGCCATCAGCAGCAGCACCAACATCGGATATTCTAGAAACACCAAATGCTTCTTCGATAACAA
CAACAAATCTAAAACCTGTGAAAAAAGTACGAATAGCACAACAACGTGCTGCTAAGGAAAAAGCAATAAA
TATAAAAAGAGGAAAAACTCAGTAA
>ref|NC_003361.3|:c415734-415093 Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCAGCAAATAAATCATATAAGAGTTATTTCCTTGATCCTCTTTGGGGTAACAACCAACCGCTTATTG
CTATTTTAGGGATTTGTTCTGCACTTGCTGTAACAACAACAGTAAACACGGCGATTACTATGGGTCTTGC
TGTAAGCTTTGTTACAGGATGCTCCTCATTCTTTGTATCTTTATTACGCAAAGCGACTCCTGATAGCGTC
CGTATGATCACACAGCTCATTATTATTAGCTTATTTGTGATTGTTATTGATCAGTTTTTAAAAGCCTTTT
TCTTTACTATCTCAAAAACGCTTTCCGTTTTTGTTGGATTGATTATCACCAACTGTATCGTTATGGGAAG
AGCTGAAAGCCTAGCAAGAAATGTTCCCCCTATTCCAGCATTTTTAGATGGTCTTGCATCGGGATTAGGT
TACGGTTGGGTATTAGTTACTGTGAGTATAGTCAGAGAGTTCTTCGGCTTTGGTACTATTCTTGGATTAC
AACTTATCCCAAAATGTTTCTACGCGTCCGAAACCCATCCTGATGGATATGAAAACTTTGGTTTGATGGT
TTTAGCGCCCTCAGCATTTTTCCTTTTAGGCATTATGATTTGGGGAGTGAATATTCTTAGATCTAAGAAA
GCAAAAAGGTAA
>ref|NC_003361.3|:c416680-415721 Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCTTCAGAGAAACCAAAACCGCATCTGAATAAAACATGGTATGTTATCCTTTTCATTTTTGCGTTAA
GTTTATTCTCCAGCGTTTTTCTCTCTACCGTGTATTATATCTTAGCTCCTTTCGAAGAAAGAGCAGCTAT
TTTTGATCGCGATCAGCAAATGCTAACCGCAGCACATGTTTTAGACTTCTCAGGAAAATTTCAAATCTAT
GAGGAAGGATCTTGGCAGCCTGCTGTATATGATAAGAAATCCCACCTACTCAAAGTTGCAGATCAACATG
CCCCTGTTGTTACAAGCTCGGTTTTGGACGCCTATACACAAGGATTTGTTCGTCCTTTACTCGCTGATAA
ACTTGGACAGATGTTTTCTTTCGAAGAAAAAAACATTAACGTGACAGAGTTTATAGAAAAACATCAAAAT
GGCCATTTCTACCAACAGCCCTTGTTATTGTTTTATGTAATCTTAGCAAATACCGAACAAGCTAGGGCCA
TGAGCGCTGCCGATGTTATTAAAAATCCTTCAGTAGTTCGTGCTATTATTATTCCCATTTCTGGATTTGG
TTTGTGGGGACCTATTTACGGTTATCTCGCTGTAGAAAATAACGGTGATACTGTTTTGGGAACAGCGTGG
TATCAACAAGCGGAGACTCCAGGATTAGGAGCAAATATTGCCAATCCTCAATGGCAAAAGCAATTCTATG
GAAAGAAAATCTTCTTACAGGCTGCGGCAGGAAATACGGATTTTGCTACAACACCTTTAGGTCTTGAAGT
AATTAAAGGATCGGTACAATCAGCATTTGGGACAACTCCGAAAGCATTATCATCAATCGATGGTATTTCT
GGAGCCACATTAACATGTAACGGTGTTACTGAAGCTTACGCACAATCTTTAGCTCCCTATCGGAATTTGT
TGATATCTTTTGCAAAGCTTAACCAGAGAGATCACAATGGCAGCAAATAA
>ref|NC_003361.3|:c418196-416685 Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCTTAAACGATTTGTTAATTCCATCTGGGAAATTTGTCAAAAGGACAAGTTTCAACGCTTTACTCCAG
TTGCAGACGCTATTGATACGTTTTGCTACGAGCCTATCCATCAACCTTCATCTCCTCCATTCATTCGCGA
TGCTGTAGATGTTAAACGTTGGATGATGCTTGTTGTTATTGCCCTATTTCCGGCAACGTTTTTAGCCATA
TGGAATTCAGGAGTTCAAGCTTTAGTCTATGGTTCGGGTAATGCCCAACTCATGGAGTCATTTTTACATA
TCTCAGGATTTCGTAGTTATCTCTCATTTATCTTCAACGACATCGGCGTATTTTCCATTCTTTGGACAGG
ATGTAAAATTTTTCTTCCCCTACTAATAATTAGTTATTCGGTAGGCGGTGTTTGTGAAGTGCTCTTCGCT
ATCGTTAGAAAGCATAAAATTGCCGAAGGATTACTCGTTACAGGGATTCTCTATCCTCTAACATTACCGC
CAACAATTCCCTATTGGATGGCTGCCTTAGGAATTGCTTTTGGTGTTGTCGTTAGTAAGGAATTGTTTGG
TGGCACAGGGATGAATATTCTCAATCCTGCACTATCCGGAAGAGCTTTCCTATTTTTCACATTTCCAGCA
AAGATGAGTGGTGATGTTTGGGTAGGCAGTAATCCAACAAAAATTAAAGAAAGTCTTCTTGCTATGAATT
CTACAGCAGGAAAATCGATTATCGATGGCTTCTCACAATCTACCTGCCTACAAACATTAAACTCTACAGC
ACCTGCTGTAAAAAGAGTTCACGTAGATGCTATAGCTTCTAACATATTGCAGATGCCGCATGTTCCTACA
GAAAGTGTTATCCACTCCCAATTTTCTATCTGGGCGGAGTCTCATCCAGGATTAATGTTAGATAAGCTCA
CTTTAGAACAATTGCAAAACTTTGTAACCTCTCCTCTTAGTGAAGGAGGCCTTGGCTTATTACCAACCCA
GTTTGATTCAGCCTACTCAATTACTGATGTGATCTATGGTATTGGGAAATTTTCTTCAGGAAATTTATTC
TGGGGAAATATTATCGGTTCCTTAGGAGAAACATCGACATTTGCTTGCTTACTCGGTGCTATATTTCTTG
TTGTGACAGGCATTGCGTCGTGGAGAACGATGGTATCCTTCGGTATAGGTGCTTTCATCACTGCCTGGCT
ATTTAAAATTTTCAGTATTCTTATCGTTGGAAAACATGGAGCTTGGGCTCCTGCAAGATTTTTTATTCCT
GCCTACCGACAGTTATTCCTTGGAGGTTTAGGCTTCGGTCTTGTATTCATGGCTACAGACCCAGTATCGT
CGCCAACCATGAAATTAGCAAAATGGATTTACGGATTATTTATTGGTTTTATGACCATTGTTATCCGCTT
AATTAATCCAGCATATCCCGAAGGAGTTATGCTCGCCATTCTTCTTGGAAATGTGTTTGCTCCTCTTCTT
GATTACTTTGCTGTAAGAAAGTACAGACGAAGGAGAATATAA
>ref|NC_003361.3|:c419433-418843 hypothetical protein CCA00367 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTCGGAGAACTGGAAAAAGTCCCTTTGAAGATGTTCAGACATTATACGAAGAAGAAACTCCCTCGC
ATGCTAACTATGCCTCTTATCCTAGATCTGAGCGTTTAGATTCTCCTCCAAATCTTTTTGATTCTCCAAA
ATCTCCAGAAACGCGGCCGTTACCTCTTTCTTACCCTATAAGTGAAGAATCACAAAAATGGGCCTCTGCA
TCTTCTGAAATTGACTCTTTACCTTCATTTTCCGAAGAACCAGAAACTACACTTGGAGAAGGTGTAACAT
TTAAAGGCGAGTTAGCTTTTGATCGTTTATTACGTATTGACGGTACTTTTGAAGGGATCTTAGTTTCTAA
TGGGAAAATCATCATAGGCCCTAAAGGTAGTGTGAAAGCTGATATACAACTTCAAGAAGCAATTATTGAA
GGTGCTGTTGAAGGCAACATCACAGTCAGTGGGAAATTAGAACTCCGTGGTGAAGCGATAGTGAAAGGCG
ATATCCAAGCAGGCACTCTCTGCGTTGATGAAGGTGTGCGGCTTTTAGGCTACGTAGCTATTGTTGGAAT
CAACGAAGAGTCTCAGAAAGAAAAAGACTGA
>ref|NC_003361.3|:c420802-419450 chromosomal replication initiation protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTAACCTGTAGCGATTGTAGTACTTGGGAACAGTTTGTGAATTATGTTAAGACACGTTGCTCAAAAA
CGGCTTTTGAGAATTGGATTTCTCCTATTCAAATTATAGAAGAAACACAAGAAAAGATCCGTTTAGAAGT
TCCGAATATCTTTGTTCAAAATTACCTTCTTGATAATTATAAACAAGATCTGTGTTCTTTTGTTCCCCTT
GATGCCCAAGGAGAGCCCGCTTTAGAATTTGTTGTTGCAGAAATCAAAAAAGCTCCTGCGCAACCCATTG
CGCCTAGAGAGCCCCAAGAGAGCCCTGCTGAAACTTTTGAAGAATCTAAAGACTTTGAACTGAAATTAAA
CGCAGCGTACCGTTTTGATAATTTCATAGAAGGCCCTTCAAACCAATTCGTCAAATCTGCAGCTGTAGGT
ATAGCAGGTCGTCCCGGACGTTCTTACAATCCTCTATTTATCCACGGGGGTGTGGGACTAGGGAAAACAC
ATTTACTCCATGCTGTAGGTCACTACGTCAGAGAACATCATAAAAATCTTCGCGTTCACTGCATAACTAC
AGAAGCTTTTATCAATGATTTAGTCCAACATCTTAGATTAAAATCTATCGATAAAATGAAGAATTTTTAT
CGTTCTTTAGATCTACTTCTCGTCGACGATATCCAATTTCTGCAAAACAGACAAAATTTCGAAGAGGAAT
TTTGTAATACTTTTGAGACGTTGATTAATTTAAATAAACAAATTGTCATTACGAGTGACAAACCCCCAGG
ACAACTAAAATTATCAGAGCGCATTATTGCTAGAATGGAATGGGGATTAGTTGCTCATGTAGGAATTCCT
GATCTAGAGACTCGCGTAGCCATTTTACAACATAAAGCAGAGCAGAAAGGCTTACATATTCCTAATGAAA
TCGCATTTTATATTGCAGATCATATTTACGGAAATGTCAGACAACTTGAAGGAGCTATTAATAAACTCAC
TGCTTATTGTCGTTTATTTGGAAAAACACTTACAGAAAGTATTGTTCGAGATACCTTAAGAGAACTGTTC
CGTTCTCCTTCCAAACAAAAAGTCTCTGTAGAAAGTATATTGAAAAGTGTTGCTACGGTCTTTCAAGTAA
AACTACAGGATCTTAAAGGAACTTCACGGTCTAAAGAACTTGTTTTAGCACGTCAAGTGGCTATGTATCT
TGCAAAAACTCTAATTACAGATTCTTTAGTTGCTATAGGTTCTGCTTTTGGGAAAACCCATTCGACAGTG
CTTTATGCTTGTAAAACTATAGAACAAAAAATAGAAAAAGATGAGACTCTAACACGTCAAATTAGTTTAT
GTAAAAACCACATTGTTGGGTAA
>ref|NC_003361.3|:420818-420982 hypothetical protein CCA00369 [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGTCGAGGATTTCCTTAATGGACGAGCAAACTTATGCTCGTTTAGGAAGAAATTGCCAATGTAGCATTG
CTATTGATAAGCAATCAACAGTTTTTCTGCAAAAAACAGCAGGGGATTTCAAACGTATAAAGAATTATTA
TAAATTAGGGACAAAACGATCCTGA
>ref|NC_003361.3|:c421430-420999 type III secretion chaperone, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTGGATAATGAATGGAAAGCCATCTTAGGATGGGGGGATGAAGAACTCGAAGAACTCCGCATTTCTG
GGTACACATTTCTTCGTCAAGGACATTATCAAAAAGCTATCCTCTTTTTCGAGGCCCTAGTGATTTTAGA
TCCATTAAGCATTTATGATTTCCAAACTCTTGGAGGATTATATTTGCAAATTGGAGAAAACGCCAAAGCT
TTAGGAGTCTTAGATCAAGCTTTGCGTATGCAAGGAGATCACCTCCCTACATTACTAAATAAAACCAAAG
CTCTCTTTTGTTTGAATCGTATTGATGAAGCCTCCGCTATAGCAACCTACCTTACGTCTTGCGAGGATTC
TATGATTGCTAATGATGCCGAAGCTTTGCTTATGAGCTACGCTAAAAAAACGATTAAAAAACCTGCTGCT
GTTTCTCATTAA
>ref|NC_003361.3|:c421982-421434 hypothetical protein CCA00371 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTAGAAATTTTTAATTACAGTACCTCTGTTTACGAAAAACACGCGTCTAACAGTAAAGTAGTGAATG
ACTTCCGCAAGGAAGTGCACATGGAAAGTTTGACGATCCGTGATGTGGCCAAGCATGCCCAAATTATGGA
CATGACCCCAAAACCCTCGGCTTTATCTTCCCTAATGCAGACGAATAAGAAAACCCATTGGGCTTTCTTT
TCACCTCCTAATAATTTCCATAAACAACGATTCTCTACTCCCTATTTAGCTCCTTCACTAGGATCTCCTG
ATCAGCAAGATGATGATTTAGAGAAAATTTCTTCCTATTTAAAAGTACTGACTCGAGGAAAATTCTCTTA
TCAAAGTCGTGTAACACCTTTTCTATCTCACCAAGATCAAGAAGAAAGTGAAGAGGAAGAAGAAGCTTCT
GACTCTGAAGAAGACGTCATCGTTCAAGAAGGAAAAATCCTACTCAAAGCTATTGATATAGGGTTGAAAT
CTTCTAACATTATGATTGATTACGTTATTTCTCGTATTTTTCAATTTGTTCAAGGCTAA
>ref|NC_003361.3|:422155-423048 S-adenosyl-methyltransferase MraW [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGGCTGAGACTCCTTTCCATATTCCGGTATTAGTAAATGAGTGTTTGTCTTGGTTTTCTGATCGAAATC
CAAGATCTTTCTGTGATGTTACTGTGGGAGCTGGAGGTCATGCCGAGGCTTTCCTCTCTACCTATCCTTC
TATAATTTCTTATGATGGCTCCGACCGAGATGCTACAGCTTTATCTTTGGCAAGGGAACGTTTAGAAAAA
TTTGGAGATCGTGTGCATCTTCATCATGCTTCATTCGAGGATCTTGCTCAAGATCCTAAAGAAAATGTGT
ATGATGGGATACTTGCAGATCTTGGGGTTTCTTCTATGCAATTAGATACGTTATCTCGAGGTTTTAGTTT
TCAGGGGGAAGATCACGATTTAGATATGCGTATGGATACCTCTCAAGGAATCACAGCAAGTGAAGTATTG
AACACACTTCGAGAAGAGGAGTTAGGAAAGATTTTTCGTGAGTATGGAGAGGAACCCCATTGGAAAAACG
TAGCTAATGCTATAGTGCATTTTAGAAGACGTAAGAAAATCATTACTGTCAAAGATTTAAAAGAAGCGAC
TGCAAGGGTTTTCCCTTCCTATCGTTTACGTAAAAAAATTCATCCACTAACTTTAATTTTCCAAGCTTTA
CGCGTGTATGTAAATCAAGAGGACGTGCAATTGAAAGTATTGCTAGAGTCTGCTATGCGTTGGCTTGCTC
CTAAGGGACGTTTAGTAATTATTTCATTTTGTAGTTCTGAAGATCGTCCTGTAAAATGGTTTTTTAGGGA
GGCAGAGAAGTCTGGTTTAGGGAAAATTCTTACTAAGAAGGTTGTTATGCCTACCTATGAAGAAATTAGG
AGAAATCCTCGTTGTAGATCGGCAAAACTCCGTTGTTTTGAAAAGACATCCTGA
>ref|NC_003361.3|:423048-423335 hypothetical protein CCA00373 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATAAGTATCGTTTTTTACGCCTATCCTTTTGTTGTTGTTTTTTAGGAGGGTTACTTTATTCCTATA
TTAACAAACAAAATGATTTGACTAAATTACGGTTAGAAATTCCTTCTTTATGGTCAAAGTTGCGCCAAAG
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GCAACCCTTCCCGAATATCAATATCTCCAATATCCTACAGAAGATAGTGTTTGTGTTGTAACTGATGAAT
CATCGTAA
>ref|NC_003361.3|:423322-425271 penicillin-binding protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATCATCGTAAATACTTAACAATAATCACTTGTGGGATGCTGCTTGCTTACTCTTTCTTGATTATGC
GTTATTACAAAATTCAGATTTGTGAAGGCAAACGTTGGGCTGCGGAAGCATTAGGGCAACATGAATTTCG
GGTCAAAGATCCTTTCCGTAGGGGAACATTCTTTTCTTTGATGAATGTACGTAAGGGAGATCCTGAACAA
CGACAACCTCTCGCCGTTGATATTACAAAGTTCCATCTTTGTTTAGACGCAGTAGCGATTCCAGAAGAAC
ATCGCGATACGATTGCTGAGAAAATATATCATCTTATTGGTGATGGGGATTATGAGAAGTTGCGTGCAGA
ATTTGATAAGAAATCCCGACATAGGAAGTTATGTCTTTGGTTAGATCGTGCTGAGCATGACCGAATTCTT
TCTTGGTGGCGAGGGTATGCATCTAAATCTAAAATACCTTCTAATGCTTTATTTTTCATGACGGACTATC
AAAGATCCTACCCTTTTGGAAAGCTTCTAGGTCAAGTGCTTCATACTCTTAGAGAGGTGAAGGATGAAAA
AACGGGGAAGGCTTTTCCTACTGGAGGATTAGAAGCATATTTTAACCATATCCTTGAAGGGGAACCTGGG
GAAAGAAAATTTCTTCGTTCTCCTTTAAATCGTTTAGATCTTGATAAAGTTACAAAAATTCCTAGGGATG
GATCGGATATCTATCTTACTATTAATCCATGCATACAGACGATTGCGGAAGAGGAATTAGAAAAAGGTGT
GAAAGAGGCTCGCGCTAAGGGCGGGCGTTTGATTTTAATGAACGCCTATACCGGAGATATTTTAGCTTTA
GCGCAATATCCTTTTTTTAATCCCGCAGAGTATAAGGACTTTTTCAATGATAAAGAAAAGATAGAACATA
CAAAAGTGACGTCAATAAGTGACGTTTTTGAACCAGGTTCTATTATGAAACCTCTTACTATTGCTATAGC
ATTGCTCGCGAATGAAGAGATGATAAAAAGATCTGGGAAACCTCTATTTGAGCCTTCGGAGCCTATCGAT
GTTACTCGCACTATTTTTCCTGGAAGAAAGCAATTTCCTCTTAAGGACATTTCATTAAATCGTCGTTTAA
ATATGTATATGGCGATTCAAAAATCTTCCAATGTGTATGTCGCACAGCTTGCCGATCGTATAGTCCAGAA
TTTAGGAAGCCATTGGTATGAAGAGAAGCTTTTGCTATTTGGCTTTGGAAAGAAAACGGGAATAGAATTA
CCCGGAGAAGCTGCGGGATTGGTCCCTTCTCCAAAGCGTTTTCATATTAATGGTGTTCCCGAGTGGTCTC
TGTCTACACCGTATTCTCTTGCTATGGGCTATAATATTCTTGCTACAGGAATACAGATGGTGCGAGCTTA
TGCGATTCTTGCCAATGGTGGGTATAATGTGCGTCCTACTTTGATAAAGAAGGTTGTGGCTACTTCTGGA
CAAGAGTATGTATTACGTTCTCAAGTTCGGGGAGAAAGGATTCTATCTCAGAATATTGTTGATGAAGTGT
TAAAAGCTACCCGGTTTACTACATATCCTGGGGGTACAGGGTTTCGAGGTTCTCCTAAAAACCATTCTAG
TGCTGGGAAAACAGGAACAACAGAAAAACTTGTTAATGGGAAGTATGATAAACATCGCCATATTTCTTCA
TTTATCGGAATTACTCCTATATATCCTGCTGAAGAAACTTGCGTTCCTCTTGTTATGCTTGTTTCTATAG
ATGATCCTGAGCACTGTGTTCGAGAAGATGGTTCTAAAAATTATATGGGAGGGAGATGCGCTGCTCCTGT
ATTTGCTCGTGTGGCAGATCGTGCGCTCTCTTATCTGGGTGTTCCTGAAGATAAACAGAAATACAATTAT
AATCAGGAAGTTGCTTCTATGAAATCTTTGTATGAGGAATGGAATCGTTCGGGAAAATAA
>ref|NC_003361.3|:c425717-425274 hypothetical protein CCA00375 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TCGTTGCGCATGCAAAACATTTTCCACAAATCATTCAACGGGGATGCATACGCAACCGTCAGGGCATTGT
GCACAACGATTGGCTTTTGAATAATAGAAAATCTATTTCAGAATCTGTTGTTCGCGCACTTCCTATATTA
GGAAATATCTTAGGAGCCGCTAAGCTATTTAGCATTTTTGCAGCGCCTACTAAAGCAGATAGCAAAGTAG
ACATTGCCTTTCACACTTTTGCAGGAATCTTAGAAACACTTGGTCTCGGTTTAGTCGTATTGGCGCTGAA
AATTATGTTTACAGTTATATCCTTATTAACGCGTCTCTCCAGGAAACAACCCGAATTTGTTCAAGCACGC
ATCTACCACAACTTGGTAGTGTAA
>ref|NC_003361.3|:426032-427483 UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2,6-diaminopimelate ligase [Chlamydophila caviae GPIC]
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GAAATCTTACCAAAGATTCCCGTAATGTTGGATTTGGAGATATTTTTATAGCTAACAAGGGGAAACAGTT
TGATGGAAACGATTTCTCGCCCCTTGCTATTGAAAACGGCGCTATTGCTATAGCGTCTTCTATTTACAAT
CCTTTCCTATCTGTTGTTCAAATCGTTTCGTCGAATCTTCCTCAGCTTGAAGCAGAGCTTTCTGCGAAAT
ATTATAACTACCCTTCTAAAAAACTTTGCATTGTTGGTGTTACCGGCACCAATGGCAAGACTACAGTTTC
TCATTTAATAAAAACCCTGTTTGATGGTTGCAATAAGCCTTCGGGCTTGATAGGAACTATCGAGCATGTT
TTAGGGAACAACCGCATTCAAGATGGTTATACCACTCCCGAATCTTGTCTATTGCAAAAGTATTTAGCTG
AGATGGTAAAGAACCGTTTAACATCTGCGGTTATGGAAGTTTCTTCCGTAGGTCTTGTTTTAGAGCGGTT
GGCAGAGGTCGATTTTGATGTTGGAGTTTTAACAAACATTACTCTCGATCATTTAGATTTCCATGGTTCA
TTTGAAGAGTATATAAACGCTAAGCTAAAATTATTCTCGAAGCTTCCTGCTACGGGTCTTGCTGTCGTGA
ATGGTGATTTATCCTATGCTTCGCGATTTTTGGAAATGACTCAAGCGCAACCCATTACTTATGGTATAGA
GTGTCCAGCAGATTATCGAGCCATGCATCTGCGCTCTTCTCCTTTTGGAACTGATTTTGATTTAGTCTAT
AGGGGAGAGTCTTTGCCGTGCCGCCTACCTTTAATAGGGAAACATAACGTTTACAATATTCTTGCTGCTA
TCGCTGTTGCGCATCAACACTGCAATGGCGATTTGCAACAGCTAATTTCCTTAGCGGCAAATGTAGAATC
GCCTAGAGGGCGATTAGAACCTGTTTTTTCAGGGCCTTGTCCTATTTATATTGATTATGCACATACCCCA
GATGCCTTAGAAAATGTATGCAAAACACTACATGCTTTACTTCCTGAACAAGGAAAACTCATTGTTGTTT
TCGGATGTGGAGGAGATAGAGATCAAAGCAAGCGACAAATCATGGCTGAAGTAGTCGAAAGATACGGATT
TGCTGTTGTGACTTCAGATAATCCCCGAGGGGAAGATCCAGAAGAGATCATCAAGGCTATCTGTTCAGGG
TTTGTAAAAAGAAATTTTTCTATCGAAATCGACAGAAAACAAGCAATTACATATGCTTTGTCCATTGCCT
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CGCTTTTGATGATAAGGAAATTGTGCGCGAGGTATTGTCATCTCATGTCTAA
>ref|NC_003361.3|:427398-428195 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase [Chlamydophila caviae GPIC]
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GTCATCTCATGTCTAATCGTTATATCTTGCTTACTCTTTGTATCTTTGGAATGGCTTTAGGAGGGGTTGC
TGCTGAAAGTGCGCCTCCACAACGCGTGCGTCGCAATGAAGTGATCTTTATTGATCCCGGACACGGGGGT
AAGGATCAGGGAACAGCGAGTAAAGAATTTCATTATGAGGAAAAGTCTTTAACCTTATCTCTTGCGTTTT
CAGTGCAGAGTTATCTCAAGAGAATGGGGTATAAGCCAGTTCTTACCCGAACGTCAGATGTTTATGTAGA
CTTAGGGAAAAGAGCCGCTTTAGCAAATCAAAACAAAGCTGATATTTTTGTCAGCATCCACTGTAATTAT
TCTTCTAACGCGTCAGCCTTTGGTACTGAAGTATATTTTTATAATGGTAAAAATAATGTTGCTTCGAGAA
GTCGTGCTTCAGAAGCTCTAGCTAAGGAAGTCCTAAACACAATGCAAAAAAACGGAGCGTTGAAAAATCG
AGGAGTGAAGAACGGGAACTTCGCTGTTATTCGAGAAACAACAATGCCCGCAATTTTAATTGAAACGGGA
TTCCTCTCCAATCCTAGAGAACGAGCCGCACTTTTAGATGCGCGTTACCGAATGCATATAGCCAAAGGCA
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CAGAAAACTTTCTGCAAAAGCGAGTTAG
>ref|NC_003361.3|:428599-428901 integration host factor beta-subunit, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGCGTACTGTAATCCAAAATTTTTTGGATAAAATGACAGATGCTCTAGTCAAAGGTGATAGGTTAGAGTT
TAGAGATTTCGGCGTTTTACAGGTTGTAGAAAGAAAACCTAAAGTAGGGCGCAACCCTAAAAACGCAACT
GTTCCCATTCACATTCCTGCAAGACGTGCCGTGAAATTTACTCCAGGAAAAAGAATGAAACGCTTGATCG
AAACTCCTTCGAAGCATTCCTAA
>ref|NC_003361.3|:429029-430210 hypothetical protein CCA00379 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TAAAGCAATTAATTTATGCCTGTCAGGATAAGAAACTTCGCGATTTCGTCTTTAAAGTTTTCCGACATCA
TCCTCTCTTAAAAGTTCATGACATCGCAAGGGCAATTTATTTGCTTATGGCTTTGGAAGAAGGACATGAC
TTGGGATTGGATTTCTTGAAATTAGAACAAGAAAGTTCTGGAGCAGCACGTCTATTTTGTCGAGGGGGAT
TTCCTTGGAAAGGTCTTCCTTATCCCGCGGAACATGCGGAACTCGGACTTTTACTTTTACAAATCTCTAG
ATTCTACGATGAAAGCGTGAAGCATGCTGAAATGATGAACTCCTTCCAGCAGGCATTATTTACGCATGAA
GCGACTATATTTCCAGCTTTATGGAGCCAGGAATATACCCGATCTATAAAGGAAAAGACCTCGGTGAGTA
AGTCTTTTCTATACCAGTTAGATCAGCAGGTAACCAGCGAGTATAGCTTTACAGATCCTAATCTAGGTTT
CTGGATGCAACGAACACGTTCGGCATCCACTTTTATTGCTGGATCAGGGTGTAAAAGTGGTGTGGGAGCT
TATTACTCCGGAGATGTTGGTATAGTAAACTACGGTCCGTGTTGTGGAGACATTAGCGATTGTCAGGGAT
TTGGTCTTTGTGGAATGGTTAAAGATTTCTCTATTATAGAAAATCAGGGTATTACGGAAATCTCTTTCCT
TTCCGCTACCGCGGTGCCTTGTCCAAGAATTACAGGCTTTTCTTATTTACAAGATGCTTATTTAGGATCA
AAAATTCGCCATTATATCACTATCTCAGAAAGGCAATGTCAGGTACGCTCTTCGTTAGAAGAAGATCCTT
GCCAATCCTCATTCTCGATTTTCTGTAAGGGGAAAAGCTGCCAAGTGGTTGAAGGTCCTAGATTGCGGTC
AAGCTCACTAGATTCTTATAAAGGACCGGCGAATGATGTAATAATTCATGGAGAACGGGATTCCTTGCGA
ATCCTATGCTCTAACCCTCATATGAAAATTTTTTCTTTACAGGGAAAAGAAAGGTTTTGGGGAAGTAATT
TTTTGATTAATATTCCCTACCAAGACGCTAACGTCTCTGTTATTTTTGAAAAATGCAATTAA
>ref|NC_003361.3|:430316-431290 acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATAAAAAAAATTCTTTACTCTCATCCTCAGAGATACAGAAATTGGAAAGGCGTTTAGATAAGTTAAAAGA
GAAGATTTACTCCGATTTGACACCATGGGAACGTGTGCAGATTTGTCGGCATCCCTCGCGTCCTCGATCT
GTGAACTACATTGAGGGGATGTGTGAGGAATTTGTCGAGCTTTGTGGAGATCGTACGTTCCGTGATGATC
CTGCCGTTGTTGGGGGATTGGCTAAGATCCAAGGCCAACGTTTCATGCTTATTGGTCAGGAAAAGGGATG
TGATACTGCTTCTCGTGTGCATAGAAACTTTGGGATGCTTTGTCCCGAGGGTTTCCGCAAGGCATTACGT
CTAGCAAAAATGGCTGAGAAGTTTGGTCTGCCGATTGTTTTCTTAGTAGACACCCCAGGAGCTTTTCCTG
GACTTACGGCTGAGGAACGTGGCCAGGGATGGGCCATTGCTAATAATCTTTTCCAATTAGCTAGATTAAA
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GTGATTGCGATGTTAGAGCACTCTTACTATTCTGTAATTTCTCCTGAAGGTTGTGCTTCTATTCTTTGGA
AAGACCCAAAAAAGAATAGTGAAGCGGCTGCTATGTTAAAAATGCATGGTGAGGATCTCAAGCAATTTGC
TATTGTGGATGTTGTAATTAAGGAGCCGGTAGGTGGTGCACACCACGATCCAGCTGCTGTATATCGCAAT
GTTCAAAATTTCATACTTCAGGAGTGGTTACGATTAAAAGACCTATCGATAGAAGATTTATTAGAAAAGC
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>ref|NC_003361.3|:431256-433217 ABC transporter, ATP-binding protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATATTTCTCGTTATGGTAGGGGAACCACATCCATAACCAGTAAGTTATCACGTCTTATTTCTCAGTACAT
AGATCTCTCGCGTTTCGGCTCTTTAGCTTTATTTTTAGTAATTGTAGCCATTTTCAAAGCTGTGACTTTG
TTCTTTCAGAGATTCCTTTCTCAAGTGGTTTCTATTCGTGTAAGCTGTGATCTTCGTAGAGACTATTTCA
AAGCTCTACAAAAGCTTCCCATGACATTTTTCCATGCTCACGATATGGGAAATCTTAGTAGCCGTGTGGT
TACCGATTCCACATGTATTGCTCAAGCAGTAAATTCGTTAATGGTGAACTATGTTCAAGCTCCGATAACC
CTCACACTAGCTTTAGCAGTATGTTTATCGATATCCTGGAAGTTTTCTCTTTTAGTATGCATTGCTTTTC
CTATATTGATTCTTCCTATTGTGATCATTGCTAGAAAAATCAAAGCTTTAGCAAAGAGAATACAGAAAAA
TCAGGATAAGTTTTCTTCGGTACTTTTAGATTTCCTCGCAGGAATTGTCACTGTAAAGGTCTTTCGTACG
GAGTCTTTTGCTTTTAAGAAGTATTGTGATCAAAATAGTCAAATTGCCGCTTTGGAAGAAAAAAGTGCAG
CCTACGGTTTACTTCCTCGGCCACTATTGCATACGATAGCCTCGCTATTTTTCGCTTTCGTGGTGATTAT
TGGTCTTTATAAGTTCAATATTCCTCCTGAAGAGCTTATTGTATTCTGTGGATTGTTATACCTTATCTAC
GATCCTGTGAAGAAATTTGGAGATGAAAACACAACTATTATGAAAGGTTGTGCTGCTGCAGAAAGATTTT
ATGAGGTGCTTTCTCATCCCGATCTTCATAATGAATCTGAAGATAGTAAGGAATTCTTGGGTTTAGTAAA
AAATATAGAATTTCGTGATGTTTCGTTTTCTTATACTAATCAGAAAACGGTGCTTAAAGAGCTGAACTTT
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TGCTTCCAAGGCTATATGAAGTAACACAGGGAGAGATTCTTTTAGATGGAGTTTCTATTAAAGACTATAG
CAAATCTTCTCTTAGGAATCATATCGGCTGTGTTTTACAAAATCCGTTTCTCTTTTACGATACTATTTGG
AATAACCTTACCTGCGGTAAGGATATTCCTGAAGACGATGTCATCCATGCGTTAAAGCAAGCGTACGCTT
ACGAATTCGTTCAAAAAATGCCTCAAGGGGTGCATAGCCTTCTTGAAGAATCTGGAAAAAATCTTTCCGG
AGGACAACAGCAAAGGTTAACTATAGCGCGCGCCTTGTTGAAAAATGCTTCCATCTTGATTTTAGATGAA
GCTACATCTTCTCTAGATGCTATTAGCGAAAACTATATCAAAGAGATCATCGGCCAGCTAAAAGGTCAGT
GTACGCAGATAATCATTGCTCATAAGCTCTCCACTCTTGAATACGTAGATAGGGTAATTTATCTAGAACA
TGGTGAGAAAGTAGCAGAGGGAGTGAAAGATGAGCTTTTGTCCTCATGTCCCGCCTTTTTGAAAATGTGG
GAATTATCGGGAACTAAAGACTGGGAATCCTCTGCAAGTGCTGAGTTGATAACACCGCTATCTCTTAGCT
AA
>ref|NC_003361.3|:c433879-433226 hypothetical protein CCA00382 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AAACTAGAAGATTATGATTCCTGTGTGAATCTTGGCTTTGCTGGAAGCTGCTCCCCCGACCTTCCTTTAC
AAAGCTTCTATACCGTTGATAAGGTAGCGCAGCTTAGCAAAACACATCCCAAACAACTGGATTCGGCAAT
CGCGCTAGAAATCACAACGCTTCCTAATCTTCCCAAAGCCTCTTTGGTTTCTGCTCATGCTCCTTATAGA
TATGGATTTCATGAGACATTCCAACTTGTGGATATGGAGGGATATACTATCGCTAGGTTATGCAAAAATC
ATCACCTACACTGTATGATGATAAAAATAACTTCAGATTATGCTACGCAAGAAGGTGGGGTGTACCTTAA
AAAACACAAAAACGTATTAGCTGAAAAGCTTTCCTACGCTTTCTCCTCATCTATTTATGACATCGTAGCA
ACTTCTACCCCAAGCCAAATCTAA
>ref|NC_003361.3|:c434633-433860 hypothetical protein CCA00383 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATGAAGGTTTTTCCTTATTAGATCAAATTACCATAGCAGATATTGCAACATTAAACGAATTAGCTTTGCA
ACATCGCTATTCCCTAATAAAAATATCCGCAGCGTTATTGCCAAAAGTCGCTGATCACTACACCCTTATG
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GATCCATAGCCACGCCTGGGGAAACAACAACAGCTCACCTTCTCTGTAGGATATTCTACCCTGAAGCAAA
GCTTGTTCCTATGAAATACAGTGAGATTATCGCTGCCATTTTACGTGGTGACGTAAATGCAGGAGCAGTC
ATTCATGAAGAAAGATTTAGCTATGGCGCGCAACTATTTTTAAAAGCCGATCTTGGTGCGTTATGGGAAA
AGAAAACACAACTTCCTCTCCCTTTAGGGTGTCTTGTTGTATCAAAAACACTTCCACAAACTGTTGTTGA
TATTTTAACCCTAGCGTTAAGAAAATCTCTATTTCTAGCATTAAAAGATCCTAAAGGTTCTGAAAATAAA
GCTTTGGAATACTCTAGAAATAAAGATACCTCAGTTATTAACAAGTTCATCGCCACCTATGTAAACGATG
ATACTCTTGTCTTATCGAATTCAGGGGAACAATCTCTCTACACATTATCAAATTATGTCAGCTGCTTTAT
CTAA
>ref|NC_003361.3|:c435316-434630 DNA polymerase III subunit epsilon [Chlamydophila caviae GPIC]
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AAGCAATTCTGTGATTTTTGTGGTAATGAAGCCATTCTTGTTGCACATAACAACGATAGTTTTGACTTCC
CACTACTTGAAAAGGAATGCCGTAGGCATTCCTTGGAACCTTTATCCCTACGGACAATAGACTCATTAAA
ATGGGCACAAAAATATCGCCCCGACTTACCAAAACATAATTTACAATACCTACGTCAAGTATATGGTTTT
GCAGAAAATCAAGCCCACCGTGCTTTAGACGATGTCATTACCCTATACAATGTATTTTCTGCGCTTATTG
GCGATCTCTCTGCAGAGCAGGTGCTGGCTCTAATGGAAGAGAGCCAGCATCCTAAAGCTTTTAAAATGCC
TTTTGGCAAATACAGAGGGAAACCTCTCACTGAGGTTCCCGCATCTTATATCCAATGGTTGGAAAACCAA
GGCAACCTAGATAAAGATATGAAAGCTGCTATCGATTTAATGAAACAAATGACATGA
>ref|NC_003361.3|:c435804-435331 hypothetical protein CCA00385 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TAGAAAGAGAAAGCGGGTTAACTTATATCAATATCCAAGCTGGAGATCATGAGCTACCTTTGTTTTTTGT
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GAAGCTACAGCACGTCTTCTACACTTGCTCAATAGAGATGTGGATATTCCTGGATTTGGAATGGATGAAG
AACAAGGATTAATTTTTTACCGTTTGGTAATTCCTTGTCTCAATGGGGAAATTAATGAAACCCTATTGCG
TGTATATATCGACACTATTAGGCTGGTTTGTGATAGTTTTTCTCATGCTATAGGTTTGATCTCTTCAGGG
AACATGAATCTTGATGAATTGAAAAAACAAGCAGCTAAAGACAGAAAGGAATAA
>ref|NC_003361.3|:c436342-435836 hypothetical protein CCA00386 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGCACATGGGTTTTCAAGGAATGTTTCCAGAAAATATGAAGCTGGAAATGTTTAAGATGTTAGGATCGTT
AATACTACTTCTTACGCTATTTGGCATTGGCGTTTGGGCATTTAAAAAGTTCTTAAAATCGAAAGGTCCC
GGCTTTGGAAACTCTTCAACAATTAAAATTCTTGATAGACGCTCCTTAAATCCAAAAACTTGTATCTACA
TCATTCGCGTTGTAAATAAAATTCTCGTCATTGCAGAATCAGGAGAAAAAATTACACTACTGTCAGAATT
TCCTCCCGACACAGATATCAATGAACTCCTACAAAAAAATGAGAAAAAAGAACACGCATCTACTTCTGAT
TTTCTTAGCAAAAGCATACGGAAATTTCATAAGAATAAAAAAGTAGATAGTCCTCAGATCTCTAATCCTA
CTGACAAAGAATTTTAA
>ref|NC_003361.3|:436707-437594 HAD family phosphatase , putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGATAAATTACTGATTACGGATATCGACGGTACGATTACACATCTTCCGCATCATTTAGATCCTGAAA
TTATTAAGAGCTTGCATCAGCTGTATTATTCTGGATGGCAGATATTCTTCCTTACAGGAAGGTATTTTTC
TTACGCGCGTCAGTTATTTCGAGATTTTTCAGTTCCCTATTTATTAGGGTGCCAAAACGGTGCTTGTGTT
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GTTTACATCTTATCCTAGTGAGGAAGATTTATTGCGTCATTTAGATCCTGTATATTTCCCCAACGCAGAA
GATAGAGCACGATTAATAGAAACAAAAAAGCTTTCCGAAGACTATCCCTATGAGATGTTTGCCGTGGCAA
AAATTTTTGGTAAAAAAAGCGAAGTAGAGAAAATACAAGCGAGAATGCATCAATCTAAAGAGTTAACTGC
TAGTCTAAGGATGACCTTCATGCGTTGGCCTTTTGATTTTGATTATGCGATCTTATTTATGACGGATAAA
GCAGTATCTAAGGGATATGCTGTTGATCGTGTTGTAGATTTGGTCTATGAAGGTCAAAAGCCTTTTATCA
TGGCTTCTGGAGATGATGCTAATGATATTGATTTGATAGAGCGTGGGGATTTTAAGATCGTGATGAATAC
AGCTCCAAAACATATGCACGCTGCAGCAGATTGCCTTGCCTCCCCAGCGAAAGATTTAGGGATTCTTCCC
GCTTGGGAGGCAGGTGTAGAAATGTATCAAAGAATTAGGAATTCTTAG
>ref|NC_003361.3|:c438480-437581 enoyl-(acyl carrier protein) reductase [Chlamydophila caviae GPIC]
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GGGGAATCGCTAAAGTACTAGCAGAAGCAGGAGCTACTATTATTGTAGGCACCTGGGTACCTATTTATAA
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GAAATCAAAAAAGTCTATCCTATGGATGCAAGCTTTGATAAACCTGAAGATGTTCCTCAAGATATTACGG
AAAACAAACGTTACAAAGGGATCTCAGGATATACTATTTCTGAGGTTGTTGAGCAAGTAACAAAGGATTT
CGGTCATATTGATATTTTAATCCATTCCCTAGCGAATAGTCCGGAAATTTCTAAACCACTTTTAGAAACA
TCACGCAAAGGTTATCTAGCAGCATTAAGCACTTCGAGTTATTCTCTAGTGAGTTTATTAGCCCACTTCG
GCCCCATTATGCATCCCGGAGGCAGCAGCATTTCCTTAACTTATTTAGCTTCTTCACGTGCCGTACCTGG
CTATGGAGGCGGCATGAGCGCTGCAAAAGCTGCATTAGAAAGTGATACGAAAATGCTTGCTTGGGAAGCA
GGAAGAAAATGGGGCATTCGTGTAAATACCATTTCTGCAGGGCCTCTAGCGAGCCGTGCAGGGAAAGCCA
TCGGGTTTATTGAACAAATGGTAGATTACTACTTAGATTGGACTCCAATCCCCAACCCTATGACAACAGA
ACAGGTCGGGGCTGCTGCTGCATTTTTAGTTTCCCCTCTTGCCAGTGCAATTACCGGAGAAACTCTCTAT
GTAGATCATGGAGCAAATATTATGGGAATTGGCCCTGAAATGCTTCCTAAGAATTCCTAA
>ref|NC_003361.3|:438745-440925 hypothetical protein CCA00389 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ACAAACAGCATCAAGTGCTTCTACGTTGATTTCTTCAGCTTTTGTTTCTGAAGCGGGGGATGCAGCGGTA
ACTGCAGCTGCGGTAGCTTTATCCACTTTGGATGCGAGCTTGGAAGATATCTATGTAGATATGGAGCCAA
TTAGGAGCGATAGCGCATCGCAAACGGAAAAGGTGAGTTATTTAGAATATCTAATAGAAAGAGAGACTCA
AGGAGTGGTTTTACGTGACCATGTAAGAGAAGTTATGTCATATCGATCATCTTCCTCTGGCGCAGATCTT
TTTGCGAGATCGTCGATACTCACACAACCTATTCGTGCAAGTATGGAGTGTTTAGATGATATTTCCATTT
GCGAGAATACTGAAGAGACACCTTTAACAGCTGAAGAAAATGCCGTAGAGGATAAATCTCCGATACGTGC
TCAGCTATTCAGTTTCTTTGTAGATCTTTTAAAACAAGATTTGCAGCACGGGAATATTAGTGGAGGTAGA
GTTAAGGCGCTTTTAGATCACATATCTGGAGGTATGACTGCGCAAGAATATAAAGAGCTATTGGACTTGA
TTAAGGAGGGGGATTTCTCTTCGATAAGAGATATTAGCAAGTTGTGCAATATATTTATGTCCACACCTGT
ATTTCAATCTTCTCATCAGTTGCAGGCGCTATTTGCCTTTTTTAAAGGAGAAGGTGGAGCTGTTACCTTA
GTCATGTTACATGAATTGATGGGTGTATTAACCGAAACGTTTGGTTTACCTCTTCCTGAGGGACTAGGTA
CATTCTTACTTGCTCTTAAAAATTTATATGAGACTACACATCCTGAAGGAGGCTCGGGAGTTGCTGCGGC
AGTGTCTATAGTTTCATTAGTTTCTGGAATGTTGCAAAGTGAAACAACACGACGTGTTATGCAATCCTGT
TATGATGGCTGTGCAGATTCTTGTACAGGAAATTGTGGTTGCACAGGTTGTGGATGTGCTGAAGGAGCTG
CAGGTTGCGGTGGGTTTGGTTCATTGTTATGCGGACTTTTTGCAGGATGCTTCAATTTAAATACCGGCCG
TAGTGGTGTTACAGAAGAAGATTTTAAAAAATTAGAAGACAAATACAGCTCTGCTGTTGTTTTAATTGCT
TTAAATAATTTGGGAGTCAATACCGTAGATCTTCTTGCAGGGAGGTCAAAGGTTTTGATTACTTTAGATG
CGCTTAAAGCTGAGTGCGACTCTTCTTCTAAAGATCTTAACAAAATTATCAAGAGTAAGAGTAGGGAGAT
GTGGGGAGAGGCTGCGTGCAACTACTCTCAGATTCTATCCCATCCAGTTCTTAAAGAAGGCATTGTCGTA
GGTTTATCCAATCGAAATATTGTAATTAATGAAAAACGATTACAAGGGAAAGTGCTTATCGATTGTTCTT
GGGGATCTCAAGGGTTTATTTCTACTAATGAGCCTTTTGATTCTCAGAGATTGGTAGGTTCTCTTGTCTC
TCTTGTAGTGATGAAGAAAGAGGATAAAGTACACCGTAGATTGGGTGCTAATGATGCTGCTGCTGTAATG
ACGAGTGTATCTAGAATTCTTTCTGCTGCAATAGCTGAGGGAGAGAATATTTGGTTATCTACTGAAGATC
TCATGACGTTGGTTTGCATTGTTTTAGCACATAGGAATTTTTCTGTGGTTGATGGAGAAGGTTCTGAGAA
TACAAGAATCTTTAAGACTCAGGAAATCAAAGATCTGTTTGCCACTGTTGAAGAGAATCGTATTCGATTA
GAAAGGACGCAACAAGGTGATATTAGGGCTGGCTTGAACGCCACTGTTTTATACGCCAATATTGCTAGAA
ATGAATCTAAGAAAGAAACAGGTTACAGAGTATTTAAAGACAAGGCTAGAACTGAGGTTAGAAATAATCT
TGTTACTCGTATGTCTATGCCGTGGATGAGAGCTTCCGGTTTAGTGTTAAAGAGCGCTTCAAAAGCAGAT
CTCGATGAAGTTCGCCATCCTATCGCAGAATCTTCTCTAGGTGTCTATATGCCTCAGGAGTATAGAGAAA
CTGCCGTGTAA
>ref|NC_003361.3|:441052-443748 hypothetical protein CCA00390 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTGGTTATTATACGCTCACTTTTTTATATTTTTAAAATTTTTACTATACATTTTATTTCGTGTTCCCC
AATCTGTTGCGCCTAATTTATTGAAAATCAACAACTTTGAGCTCAATTGCCTTTGTTTGTTGCTTTATTT
AAGGAGAATAGAAATGACATCGCCTACAGGTAGGGGGAATGCGAATCCCGGTTTTATTTTTGATGAGGAT
TCAAATATTGGAGGAAATTCTACTGACGAAGAAAGAAGAGGAACACCGCGTCCAGGAGGAGCTAGGAGGA
TATCTGCTCGTGTTGAGGATGTGTTGCAACAAACGAATGTTTCTGGAGTCAATGCTGCATCACAAACCGA
TGACCCGCCTCCCATGCAAGTAACTGCGCAACCTGGTTCTGATGATCATAGGCGTCTCTCTGCGAGAGTT
CAGTCGCTTTTAGGATCTCTCAGACAAGGTGGTGTGGCTCCTGCTCCCACACCTACGTCTATTCCAGCGC
CATCTGCGGCTCCTACAGCTGAGTCTAGTGGGGATGCTGGCATGGAATCACTTCTATCTTTATTTTCGCA
TTTTGGTGGACGCGGTTTACCCCCCATGTCTACTGCAGATGCGATGCAGCCTATTGATTCTGTTGTTACT
ACGCAACCTGCTCCTCGGCGATTAGATATGCTGGCTGCTGGTATAACTCCCGGAGCCTTCGCGCTTTCAG
CTATGACGTTGCCTACTCCTCCCGTGACTACACAACCCGTGACCACACAGCCTGTGACTACACAACCTGC
TCCTGGATATGTCTTGCAGCAACCTAGTTCTGGTCTTGCTCCCGAGGCAAGAGCGCTTTTATCTTTACTT
ACACAAGCTAATGGAGGAGGGATTCATGCCCCCGCTCCAGCTGCGATGCCTTTGCCTGTGACTACACAAC
CTGCTGCTGCACCTGTTAGTCCTGCACAAGCTGCTGGCTATTTGACGGCATCAAATATGGTGAATCCTGG
TACTAATCCCGCGTTGAATTCGCTTCTGGGTTTATTGAACCAAGCCGGAGGAGGAGTCGCTATACCCAAT
CTAGGGGGGATACCTTCCATTCCTTGGTCTACACAGCCTGTGTCTGGAGGTGCGTCGCAACAAACACTTA
TGGGGCTTTTAGGTTTATTTGGACAAGGTACTGGCGGTCTTTCTGGTTTAAATCCACAAATGTTTCTCAG
TATGCTTCAAGGAATTGCAGCTACTCCTGGCCCTTACCAGAACGGTGCGAAAGCTATTTTGGATTTACTT
CAGGGACATACTGGAACATCTATTCAGCATGGGCTTGGAGCTATAGCAAACTTAGTCAGTGGCCAGGGGT
CTACGGCATCTAATGTGGGAGCGGCTGTACAAGCGTTAAGTGGGTTAGCGGGTTTGGCAGGTCCTGCGGG
TGTTGCTGTTGGAGGTGTAGCCTCCCTTCTTGCAGCAGCAGTAACGAGTGAACCTGTACGTCGAGGAGGA
CGGTTCTGCTATGATAACTGGCATACAGGTTGTGAGGGAAATTGTTGCTGTCCTCAATGTGGCTGTGAAG
AGGGAGAATGTGGCTGTGGAAGCTTAGGAAGATGTTTATGCGGTCTATTCGGAAATTGTTGCGGAGTGGG
AGTCGATGCGCGAAGAGAGTTAGAGCAACAGCTAAGAGAAATAGAGGCTGAGTATGGTGACAGTATCTTT
CTCATTGCTTTGAGTAATTTAGGTATAGATACCGTGGCTCTCTTATCTGGAAGCACGGCATTAATACTTC
CTTCTTTGGATAGGATTCGTGAGGAATGTGGTCACTGTTCTAGAGATCTTCCAGGGATTTTGAAACGGAA
AACAAATGCTATGTGGGCAGCTGCTGCTCAATGCTATGATAATGTATTGCGCAATCCATCTTTAAGAGCA
TCTTTTGTCGCTGGTATGGCAGGTAGATGTGATATCAATGCCGCTCAGTTAGCAGATGATATACGTATAC
TTCATCTTTGGGGAGGAGATGGCAGCCTTGTTGTAGCATCACCTTTTGATATGGAAAAGTTAGCACTTAC
TCTTCCAGAACTTAACGTGACCTCGCGTCGTAGTCCAGTAGCAGGGCCGCTAGGTGCAATTACAGCTGCA
GTTGTCATGCAGGATTTAGCTAGGGTTTTAATGAAAGCTTCTCACGGAAGACGACAAATTTGGCTCAGTG
TAAATGATTTGATGACTCTTACATGTATGATTCTTGCTTATCGAGGTATTAGTATTGTCTCTGATGACGT
ATTTACTGAGGGATCAAAGATACATAGGAGAGCTGATATGCGTCGGCTATTTACGGACATAGATAATCGT
CGCTTCTTAAACGAGCGTACTCGAGGACCGGCTCCTTATGAAACTCTAGTAAATCCTTATGTGGAACTAG
CTACAAGATGTTTTGCTGAAAGTGCTGCTCGCGCAGAGAGAATGAGACGTCCCGGAGATGCCTCTAGGGA
AGAACTGTTAACAAGCCTCTCGAGTAGATGGATGTTAGCAGCAGGCATTACTCCCGCCAATCCTGTTGTA
GCACAACCTTTAGGATTAAGGGCTCCTACACATATGCCAATTAGTGATTTAGGAGAGGCTGCATCTAGAG
GAGATCAGGGTCGTGATTACGAACGGGAAGGTGCGCGACCTCGAGGAGACCATGGAAACAACAATGCAGG
AGGCAGTACCGAAGAGGAAGAAGAAACTATAGTTTAA
>ref|NC_003361.3|:444619-445728 adenine glycosylase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTAAAGATAGCTTTTTCTGAAAGAGCGAAAAAATTTCCTGTAGAAAAGTTAAAACAATGGTTTACAG
ACAATAAACGTAGCTTCCCATGGAGAGACAATCCTTCTCCCTATAATGTCTGGGTTTCCGAAGTGATGCT
CCAGCAAACACGAGCAGAAGTTGTAGTAAAGTATTTTATTGAATGGATGGAGAGATTTCCGACTATAGAA
TCTTTAGCCACAGCTAAAGAAGAAGATGTCATTAAGGCTTGGGAGGGTTTGGGGTATTATACCCGCGTGC
GCAACCTTTTGCATGGAGCGCGCATGGTGATGAAGGATTTTGGGGGAGAGCTTCCTGATGATCCTTTAGA
TTTAATGCAGATCAAGGGGCTAGGTCCGTATACGGTACATGCGATTTTAGCTTTTGCTTTTAAAAGAAGA
ACGGCCGCGGTAGATGGCAATGTTTTGCGGGTAATCAGTAGGGTATTTTTGATAGATGCTTCTATAGATT
TAGAATCTACTAAAACTTGGGTATTTAGGATTACCTTATCTCTTTTACCTGCTAAAGATCCACAGATAAT
TACGGAAGCTTTAATAGAGCTTGGAGCGTGTATTTGTAAACGTGTGCCCAAGTGTGAAATTTGTCCTTTA
AACGCTATGTGTGGAGCTTATAAAGAAGGGAGACAAAAATCTCTTCCTATACGTCATGCTAGGAAAAAAA
CAGTGACACTATTTCGTTGGGTAGCGATTGTTCTTTATGAAGATTCTATTGTTCTTGAACAGAGAAAACC
TGAAGAGATGATGGCTGGTTTATATGAATTTCCTTATATAGAGGTTGAGTCTTTTGATGATTTTTCGGAT
ATAGAGGGGCTTATCCAAGAAATGGGGGAACGTGTGGGAACTCCTCTGGTATTTCATGGGGAAATAGAGG
AACAGCGTCACGCATTTACACATTATAAGGTACGCCTTATTCCAAGAATCTTCCGTGCAAAATTTAAACC
CAAGCCTGAGCTTCTTTATCCTTTAAAAGGATTAGACTCGTTGCCTTTTTCTTCTGGACATAGGAAAATC
AAGGCTTGGTTATTAGAGAATGCTTACATTGTTTCTAATCCTGAACTTGTGAAGGTTTAA
>ref|NC_003361.3|:445733-446119 mazG protein, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAAATATCGACTTTTCTCAATTAATAGAGCTTGTTAGAAAAATGGTCTCGGATGGTGTTTGTCCTT
GGACAGATCATCAGAATTTTGATTCTATAATCGGCCATATTCTTCAGGAGTGTCAGGAATTATCCGAAGC
TGTTCATGAGGGACATCCCATGGAGGAGGTCACTTCAGAAGCTGGAGACGTTCTTACTCTTGTATTGTTG
TTGTGCTTTAAGATGGAGTTTCTAGGAATGTCTTCGGTAGATGCAATCATTACCGAAGCTCTTGCTAAGA
TTCGCCGTCGTGCTCCTCATGTTTTCGATTCAAGTAAAACAATTTCTTATGAGGAGGCAAGAAAGGCTTG
GGCTCTTGCCAAACTCGAAGAGAAGAGTAGAAAATAG
>ref|NC_003361.3|:c447079-446303 hypothetical protein CCA00394 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATGCATTCTTGGTTAGTCCTTCTTGCACTTCTAGCTTTAGCAGCTGTTGTATCAAGAAATTTTTTTA
GTTGGCCAAAACCCTCAGAAAAAACTCCATTACAGCTACGACATATTCTTGCTGGAGTTGTTCTTTTGTT
TCTTCCTGGTCTGCTTCCTTTTATTACAGGATCGCATTCTCATACCACTGCACGATCATTGCATGGGGTT
TTTCTAACCTGTGCTTATATTTTCTATCTTCTAGGGCTACCTATTGAAGTTACACGTAGTGTAATTTACT
CAGGGAATAAGCCTGGAGCGACATTTTTACATGCGGTATCTTCTGCTATACGGATGTGGATTATTGTCAT
TCCCATTACCCAGATCATTGGTTTGGTGCTGAATAAAGGGCTAGCACTCATTTTGCCTATAGAGGCGTTA
CAAGAACAAACGTTGACTCAGGAAGTTCAAGATACCTTAACCTCTACCGCGCATGATCGGGGATTTATTC
TAAGTTTAGGCATGTTGGTTCCTTTTGCTGAGGAGATATTCTTCAGAGGGTTTTTACAAACCTTTTTAAA
AAATAAAATGAATAGAGTTTATGCTCTCTTATACTCTTCGGTCATCTTTGCTCTTACTCATGTAGAGCAT
TCTTGGGGAAGTTTGGTATTTGTTCCTGTTCTTTTCATTTTTTCTCTATTTACGGGATTTCTTTATGAAA
AAGAACGTCATATTGCTGCACCTATAGTATTGCATATGCTATTCAATGCGACGAATATCGGAATGTTATC
GGTGTAA
>ref|NC_003361.3|:c447727-447083 hypothetical protein CCA00395 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCGAAAACTCCTCTTATTAGTTTCTTGTGGACTTTTGTCTATCAACCTATCTAGCTGTTCTCTACCAG
CATCGGGGAGCTATCATCCTAAGCTATACAAATCAGGAAGTAAGGCTAAGGGTGTTGTTGCCATGTTACC
AGTATTTTACCGTTCTGGAAAGGTCTCTGAAGTACTTCCATGGAGTTTACAAGCAGAATTCACTCAAGAA
ATTAGCAAAAGATTCCACTCTTCTGAAAAATTATTTCTTATTAAACATTCTGCATCTCCACAGGTCATCT
CACAATTTTATGCTCCTGTAGTTCATGATTTTTCTCCACAAGCCATCGTCGAATTCCTCCCTGCAGAATT
TGTCGTAGCTACAGAACTTTTAGAACAGAAAACATCACAAGATATGTTTGGTCACGACTCTGTAACAGCT
TCTGTTCGTGTTCGTGTTTTCGATATTCGTCATAATAAAGTTACAATGATCTATCAAGAAATCATTGAAT
CTAGCCAGCCTCTTGCTACAACAGCGAGCGATTATCATCGCTACGGATGGCACACGAAACACTTCGATTC
CACACCTATGGGGCTTATGCATCAGCGTCTATTTCGAGAAGTCGTTGCCAGAGTTGAAGGCTATGTCTGT
GCAAATTATTCGTAA
>ref|NC_003361.3|:c448063-447932 hypothetical protein CCA00396 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAATGGTTTCTTTCTATTCTTGTATTCTCATCCCCTGCACTATTAATTCCAGGATGCACACTAATTC
CTAAAGAATGGGATTGCCCCTGCTCATACCATCAGCAAGAGTCTAGCTCTCAGGTAAAATAA
>ref|NC_003361.3|:c448833-448468 hypothetical protein CCA00397 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTAATATATCCAGCATCTCCACAACCTGGAGAGGTAAAGGTAAAACCGCAGAGCTTTACCACTCCAG
AGTCCTATCATAAAGGCGTAAGAAAAGCGAAAGTCCTTTCCATCATTGCGATTGTAGCTGCAGTATTAAT
AGCTGCTGGGGGTATAGCGGCCACTGTTCTTACTGGGATTTCGGCTCTATGGGCGATTCCTGTGCTAGCT
CTTGTTCTTTCCGTTGTTTTGGTTCTAGTAATTTATAATGTACGGCCTAAACTCTCCTTTACTCCTTTTG
TTCCCAAGACCCCCGTATTAGGATTTGCTAATACTGAGCCGGATTTTGCCGAGGGATTAGGAGCAGAGCT
GCTTAACCAACAATAA
>ref|NC_003361.3|:c450029-448899 hypothetical protein CCA00398 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCAATACAACCAGTATCTTTAAAACCAGAAGCTTCGCTATTCCAAATTGATTCATCAAGAAGCTGTT
CTCAATTCGTAGAAAAACATGAGAAAAAGCTCTTAGGATGCATTCTAGGACTTGCTGGGGTGTTGACTTT
ATTGGGAATTAGTTTGGCTATGGCATTCCCTTCGGCAGCGTTTATTATCACCCTCTCCTTAGTGCCTATT
TTAATGATTCTTTGCTGTCTTTTAGATTTGATAAATACAAAATCAGATCCCAATAGCACGGTCCAACCCA
CCTCTTTTCCCTGTCGAGAACTCCTCTGCAGGAAAAATAGTTCCCTTGATGGCAAATCTGCTGCAGATCT
ACCTACTGTTCCTAAATATGATGATCTATTGACAACTTTATGGACGGCATCTTGGTGGTGTCATCTCCCC
TATAAAATACGCCCGCTTCCAGATAGCGTGCAACAATCTGTATGGCGGTTAAATAGCAACCCAGGAATTA
TTCTGATTTCCACTGTGGGTGATGTCACTGTGCCTAGAACAACCTCTGAGTGCACGTTAATGATGGTAAA
TCCTACGGATGCACAAATGAACAAAGAAGATCTCTTTGGGGGACGCTACCCTTTCTATAAAACTATAAGT
TCTCACTGTTGGAATAGAGCGAAACAAACCCCGAATCATAGCCCTATACTAACGCCTGGGACCTGCTCAA
AAAAATGTATCTGGGAAACTAATAAAGGATTGAAAAATCCTCCAAATACTGGACTACCTTTCTACTTCTC
TCACGTCTACAACCCCATAACCCTAGAATGCTACGACCCTAGAGCAGCTTTCTATTTGTGTAAAGAAACC
TATATAAAATGTTTTGAAGAAGCGATTTCTGGGGAGAGCCCAGCAACCATGGTGCAAATGCCTTTACTAT
TCTCTGAGGCAAACAGAGGAAGTTCCCTTGATCCCGAAGAGCTTCCCTTCGATAACCCCCATCTAAAAGC
AGCAAAAGCGGCTCTTGTGGTCGCTCTTCAAGAATTTTCTGAACGTCATCCTAACACATCCTTAACAATT
GTGGTGGTTAGAGAGCGGGGCATGCCTATAGAATTCCATCCCCCAAGAAGGAACCAGCTGCAATTAAATA
CACATAATTAA
>ref|NC_003361.3|:450320-451069 serine/threonine protein phosphatase, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCAAAGTACTGTAGATTTCGATTATTTTGGTCTAAGTGACATAGGGATGGTTCGTTCCAAGAATGAAG
ATTTTTGGCAGGTAAATCTTTCCTCCAGAGCTGTGGCTATTGCAGATGGCATGGGAGGATGTTTAGGTGG
TGACGTGGCTTCTCACGAGGCTATTTTTAGCTTAATGGAACTCATCGATGCTAGACAGTCCCAGTTAGAA
GAGTTTCAGGATGATCAATATCGAGAGATGTTAACTATTATCCTTTCTGAAGTTAATGGTTTGATTTATG
AGCATGGCCTCATGGAGTCTCGTCTTCAAGGTATGGGAACCACATTGAGCTTCATGCAATTTCTTAGAGA
CAAGGCCTGGCTACTTCATGTGGGTGATAGTAGAATTTACCGTTTGCGCGGTGAAGAGCTTTCCTGTTTG
ACGGAGGACCACTCCCTAGCAAATCAATTGAAAAATCGTTATGGGCTTTCTAAACAATCAGATAAGGTGT
ATCCTTATCGTCATATTCTGACTAATGTATTGGGAAGTCGTCCCCACGTTACCCCCGATATTCGGGATAT
TTCTTACGAGAAAGAAGATCTGTTTGTTTTTTGCTCCGATGGCTTAACAAACATGGTTTCTGATGTAGAT
ATTCGGGATACTCTACTTCAAACTGCGACCTTAGAAGAAAGTGGGAATCTTTTAATTTCCCTAGCAAATA
GTCGCGGGGGATCCGATAATGTTACCGTGGTGTTAGTCCGAATACAATAG
>ref|NC_003361.3|:451093-452208 nifS protein, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATCTACTTGGATAACAATGCTATGGCTTCTTTAGAGCCAGGTCTTTTGCAATTTTTACAACAACTCT
TTTGTGAGGGGATTTACGCCAATCCTTCTAGTGTACACAGTGCTGGGAAAAAATCCCGTAAGATAATTCA
CGACACTACAGCGTTAATTCAGAAGGTCCTCTCTTTTTCTGGGCAGGTAATTTATACCGCAAATGCTACG
GAAAGTTTAAATCTGGCTATTGCTAGCCTTCCTAAGGGAAGTCATGTGATTACCTGCAGCTGCGAACATC
CTGCGATCATAGAGCCTTTAAAAAATGCCAATCTTTCCGTGTCCTATTTGGATCCTGATTTGGGAAGTTG
TACGCTCAGCCCAGAAAAAGTAGAAGCTGCGATTACACCAGCAACTTCAGCTCTCGTCTTTGGCTGGGTA
AATAGTGAAATTGGTGCAAAAATAGATATAGAGGCGATGGCCAATATTGCCAGAGAGCATAATTTACAAT
TTATTGTAGATGCTACAGCAATTATCGGTAGGGAAAAGGTGGCCATCCCTCAAGGCGTCACTATGGTTGC
CTTTAGTGGACATAAATTCCATGCTTTATCAGGAATAGGCGCTCTTCTTATCTCTCCAAGAGTGAAGGTA
TCCCCTTTATTTTTTGGAGGTGGTCAGCAAGGAGGCCTACGTTCAGGAACAGAGAATCTTTGGGGAATTG
CTTCGCTATATTACATCTTCAACATACTTAATGAAAAACAAGAAGAGATAGCCTCAACGCTAGCGCAATA
CCGTAATGACTTCGAAGCCTGCTTAAAGAAGCGTATTCCTGATATTAAAATTCATTGTGAGCACCAACCT
CGTGTAAATAATGTTTCGGCTATCGCTTTCCCGCCATTAGAAGGTGAAGTGATGCAGATAGCTTTAGATG
TTGAAGGTGTTGCCTGTGGTTACGGATCGGCATGTTCTTCAGGAGCGACTACAGCTTTTAAATCTTTGGT
CGCGATGAAAATAGATCAGGATATAGCACTAGCTACACTTCGGTTTTCTTTCTCTCATTTGCTAACACAA
GAAGATCTTAATTTAGCCATAGAGAAGATCGTCAAGGTAACCACGCATTTAAAAAATGCTTGGTAG
>ref|NC_003361.3|:c453425-452211 CBS domain-containing protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACTGATTCTCCTTTCTTTTGGCTTGGGATCAATTTTCTATGTATTGTTCTTCAGGGGTTCTATTCTA
TGATGGAAATGGCTTGCGTTTCCTTCAATCGTGTACGTCTGCAATACTACCTAACTAAGGATCATAAAAA
AGCGCGCTATATTAACTTTCTTATTCGCCGTCCTTATCGTCTATTTGGAACGGTAATGCTTGGGGTGAAT
ATAGCGCTTCAAGTGGGTTCTGAATCAGCTAGAAACTGTTATAAGGCTCTAGGTTTTTCTCCAGATTATG
CTCCCTTTACTCAGATTTTTCTTGTTGTGATTTTTGCTGAGCTTTTCCCTTTAACCATATCACGTAAAAT
CCCCGAGAGATTAGCGCTTTGGGGCGCTCCTATATTGTATTATTCTCACTATCTATTTTATCCATTAATT
CAGTTCATAGGGAGCCTTACAGAAGGGATTTACTATCTTCTAAAGATAAAGAAAGAGAAGCTGAACTCAA
CATTAAGTCGTGATGAATTTCAAAAAGCTTTAGAAACGCATCATGAAGAACAGGACTTTAATGTTATTGC
TACAAATATTTTCTCTTTAAGTGCGACGTCTGCGGAGCAGGTATGCCAACCCTTAGATCAGGTAACGATG
TTACCCTCTACAGCAAATGTTAAGGATTTATGTCGTAAGATAAAAAATACGGACATGGAGTTCATTCCTG
TATACCACAAAGCACGTAAGAATGTGATAGGGATAGCGCTGCCTAAAGATTTTGTGAATAAAAATCCTAA
CGATGCGTTAATTCACAACCTACATTCACCCTGGTTTATCACAGCAAAATCTAAGCTGATACGTATCCTA
AAAGAATTTAGAGATAACCGCTCCAGCGTAGCTGTTGTCTTGAATTCTTCTGGAGAACCTATGGGAATTC
TTAGTTTAAATGCGATTTTTAAAATCCTATTTAATACGTCAAATATTGCTCAATTAAAGCCGAAAACCGT
CTCTTTGATAGAAAGAACATTTCCTGGAAATACGCAACTCAAAGATCTACAGAAGGAGTTAGGAATTGAG
CTTACGCGTTATGGCGTAGAAACTCTAGCGCAGCTAGTTCTACAATTACTCGATACCCCTGCAGAAATAG
GAACCTCGGTGATTACCGATAATCTTCTTCTAGAGGTCAAAGAAGTATCATTGTACGGAATTAAAAGCGT
CTCTATTAAAAATCTACTCTCATAG
>ref|NC_003361.3|:c454653-453418 CBS domain-containing protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATTTCTATTGTTCTGATTTTTTTAATCATATGTTTCACCCTATGTTCTGGATTTATTTCGTTATCGC
AGATAGCGCTTTTCTCTCTTCCAACTTCTTTAATTTCTCATTACAAGCGCTCTAGATATAAAAAGCAGCA
GTTAGTCGCGTCTCTTCTTTCGCATCCCCACCATTTACTCATTACTCTGATCTTTCTTGATATTGGATTA
AATATTGGGATTCAAAACTGCGTAGCTATACTTGTTGGTGATCAGGCTTCTTGGCTACTCATTGTAGGTT
TCCCTTTAGCGTTAACTTTAATTCTATGTGAAATTCTACCCAAAGCTGTTGCCCTTCCCTTTAACACGCA
GATCGCCACTTTTGTTGCTCCTCTTATCTTAGTATTTACAAAAATTCTTCGGCCTTTACTCTACTGGGCA
ATCAGTGGCATTAATTATATTGTGCAATGGATTCTTTCCTCTCAGAAGATGGATATTATCCAACCTCAGG
AATTGAAAGAGGTCTTACAAAGTTGCAAAGACTTTGGAGTTGTTAATCAAGATGAAAGTCGCCTACTATA
CGGTTATCTATCTCTTAGTGATTGTAGTGTTAAAGAGCGTATGAAACCCCGTCAGGATGTTTTGTACTAT
GACATTCAAACACCTTTGGATAATCTCTATGATCTATTTTCTCAGCAGCATTGCTCACGAGTTCCCGTAT
GTAACGACAATTTGCAAAACCTATTAGGAATTTGCACCGCGAAAGCTTTGCTACTTCATGGCAAACCCTT
ACAATCGTCTGAAGACCTCTTACCCTTGTTGAAAAAACCTTATTATATGCCTGAGACAATATCAGCGAAA
ACAGCTTTATGTCACCTTGCTGCTGAAGATGAAACGTTAGGGATGATCATTGATGAATACGGTTCCATCG
AAGGGTTAATCACTCAAGAAGATCTCTTTGAGATCGTTTCTGGAGAAATTATAGATCAACGCAGTGAGAA
AGTCCTTTATACAATGTCTGGGAAAGATGTTATTATCGCAGCAGGAACTTTAGAGCTAAGTGACCTTAGC
GAGATTTTTAATATTAATCTCCCTACAAATAACAATAGCGCAACTTTAGGAGGATGGTTCACTGAGCAGA
TGGAATCTATTCCGATTACAGGAACAAAGCTCACTTGGAATAATCTTATGTTTCAAGTTTTGGATGCCGC
TCCCAATCGTATACGCCGAGTATATATAAGGAAAATACATGACTGA
>ref|NC_003361.3|:c454992-454663 hypothetical protein CCA00403 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGCTTATTAGTGGGTTTATGTATGACCGTGCTATTCATGAACTAAAACAAGAGGAAATGCGTTTACAAAA
GCGTGTAGCAGAACTTCGAGAAAAAATCCTTTATGCTGAAGAAGAGCAAAAAGAACTTCGACTGCATATT
CAACATTGGGATAATCCTGCGGTGATTGAATCTGCTTTGATTCGTAGACTAGGCCTAATTCCTAAGGGCT
ACACTAAAGTATGTTTCTCTCCGATTATAGAATCGAAGAGCATGGATTGA
>ref|NC_003361.3|:c455574-455002 deoxycytidine triphosphate deaminase [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATGGTCAAGTCAATGTAGACGCGGAAACTGGGGAAAAATTAATCAGCTACGGTTTATCTAGCTATGGTTA
TGATCTTCGTTTGTCTAGAGAGTTTAAAGTATTCACTAATGTGTACAATTCTCTTGTCGATCCAAAGCAT
TTTACAGAAGATACATTTATTTCTATTACTGATGATGTTTGTATTATTCCTCCGAATTCATTTGCTCTTG
CTCATAGCGTAGAGTATTTTCGTATTCCAAGAAACATCTTAACAATGTGCATAGGAAAATCCACATATGC
ACGTTGCGGACTCATTGTTAATGTAACCCCTTTTGAACCTGAATGGGAAGGATACGTTACCATAGAAATT
TCCAATACTACTCCCTTACCTGCAAAAATTTATGCTAACGAGGGAATAGCTCAAGTCTTGTTCTTTGAAG
CAGATGAGATGTGTGAAGTTTCTTATGCAGAAAGAAAAGGTAAGTATCAAAAACAGCAAGGAATTACCGT
TCCTTTTGTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c455826-455671 hypothetical protein CCA00405 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTATTATCTAACATCCCCGTAGGATTGCATCTGGTCAACGTTCTTCTCTTTTTAGGAGAGCGCAAGA
GCGTTCTATTTCAAATAGTTAAAAGACCTTTGAATTTTTTAGGTATTTGCATATACGGACAAAAGATGTA
TTCTATTATCCTATAG
>ref|NC_003361.3|:456177-457190 Holliday junction DNA helicase B [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACACATCAGGTATCTGTCTTACATCAAGATAAAAAGTTTGATATTTCTTTGCGGCCCAAGGGATTAA
GGGAGTTTTGCGGTCAAAAGCAGCTTACAGAACGCTTGGAATTATTTCTTCATGCTGCTGTACAACGGGG
AGAAGTTCCTGGTCACTGTCTTTTTTTTGGCCCCCCAGGATTGGGTAAAACCTCGCTAGCCCATATCGTT
GCTCATACCGTTGGTAAAGGACTAGTTGTCGCTTCAGGACCTCAACTTGTTAAGCCGTCCGATTTATTGG
GATTGTTAACAAGCTTGCAAGAAGGTGACGTTTTCTTCATCGATGAAATCCATCGTATGGGAAAAGTCGC
TGAGGAATATTTATATTCCGCGATGGAAGATTATAAGATTGATATCACCATTGACTCGGGGCCAGGTGCG
CGATCAGTTTCTGTAGATCTTGCTCCTTTTAGTTTGGTAGGAGCAACAACACGTTCCGGAATGTTAAGTG
AGCCCTTACGCGCGCGCTTTTCTTTTACAGGGCGGATGTCTTATTACTCCGATGAAGATCTAACAACAAT
TCTTAAGCGATCTTCTAATTTATTAGGTATTGATGCCGATACTGCGGCATTATATGAAATTGCCCGAAGA
TCTAGAGGGACACCTAGATTAGCCAATAATCTCTTGCGTTGGGTTCGAGATTTTGCTCAAATGCGTGAAG
GTAATTGCATTAATAGTGACGTAGCCGAAAAAGCTTTGGCTATGCTATTAATAGATGATTGGGGATTAAA
TGAGATTGATATTAAACTCCTCACCACAATAATAGATTATTATCAGGGGGGCCCTGTGGGAATTAAAACT
TTATCAGTGGCCGTAGGAGAAGATATCAAGACCTTAGAAGATGTATATGAACCTTTTTTGATTTTAAAAG
GTCTATTAAAGAAAACATCTCGAGGAAGAATGGTTACCCAAATTGCCTATAATCATTTGAAAAGGTGTTC
AGATAACTTGCAGAGTTTAGGAGAAGAAAAGTGA
>ref|NC_003361.3|:457187-458002 hypothetical protein CCA00407 [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGAAGATATTGAAGTGCATCCTTTTAGGACTTTCCTTCAGTATGGGCGTCGCCGGGTACGCAGAAGTTA
AAGTTTCTGATACGTTTACGGTGCAGTCTGTTGTTTCCGAACCTAAAATTCGTGTTCTTCTTCTGAATGA
AAGTACGACAGCTTTAATAGAAGCTAAAGGTCCTTACCGTCTCTATGGTGACAATGCGTTGTTGCAAACC
TCACCTCAAGGTTTGCGTTGTGCAGCTCATGCACTTTATGGTGGCATTCGCTGGGGAGAAAATTTTCCTG
GGGTCCAATGTTTAAAAATAGAGCCTACCGATGATTCCGCATCTCTATTTGTAAATGGGCTACAATACAA
AGGCGCTCTCTATATTCATAAGACGGATAAACATTGTATCGTTGTAACTAACGAGCTCACTGTTGAAGAG
TACCTTAAATCAATTCTTTCTACAAAATATCTCAAAGAATTAGATAAAGAAGCTTTATCAGCCTGTGTAA
TTTTAGAAAGAACAGCTTTATATGAAAGGCTTCTTGCTAAAAATCCTCAGAATTTCTGGCATGTCACAGG
AGCTGAAGATAATTATGCTGGTTATGGAGCCACAAGACAGTTTTACGGCGTTGAAGATGCTGTAGATTGG
ACATCACGATTAATTGTTGATAATCCTGAAGGATTAATTATTGATGCGGATGGCTTGCTCCAAGCTAATG
TAGATCGTCTTGCTGTGGAAGGCTACAATGCACGTCAAATTCTTGAAAAATTCTATAAAGATGCAGATTT
CGTAGTTATCGAATCCTGGGATGATGAAGCTAATGAAATTAGCTAG
>ref|NC_003361.3|:c459983-457995 glycosyl hydrolase family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGACAAAATTAGTTTTTATCCAGGCTCTCCACTACCTCTGGGAGCAACTCAACTTTCTTCTCATCGTT
ATCGTTTTGCATTATTTTCCTCACAAGCTACTCAAGTGGTTCTTGCTCTTTCTGATAAGAATTCCCACAT
TCAGGAAATTGTTTTATCGCATGAAAAAAACCGCACAGGAGCCGTCTGGCATATAGAAGTCGAAGGGATT
TCAGATCAGTGGTCTTACGCTTTTCGTGTAGATGGTCCTACAAATACAACAGCTAAGTTCGATTTTAAAA
AATACCTTGCTGATCCTTATGCAAAAAACCTTCATTCTCCACAAATTTTCGGTTCTATAAAAACTTCTGG
AGACTATGCCTTTAGTTATTTAAAAAATGAAGAGTTTTCTTGGGAAGGCGATCACTGTCTCAATTTACCT
AAAGAAGAATCAATCATTTATGAAATGCATGTGCGTTCTTTTACTTGGAATAATTCTTCGAAAGTATGTT
ATCCAGGGACTTTTTTAGGTATTATCGAGAAGATCGACTATCTCAAAAAACTTGGAATCAATGCTATTGA
ACTCCTCCCTATTTTTGAATTCGATGAAACCCATCATCCTTTCCGAACAGCTGATTCCTCGCATCTTTGC
AACTATTGGGGATATGCTTCAGTAAACTTCTTCTCTCCTTGCCGACGTTACGCTTATGGTTCGGATCCCT
GCGCACCGATCAGAGAATTTAAGACTCTAGTAAAAGCTTTGCATAAAGCAGGCATTGAGTTGATCCTTGA
CGTTGTTTTCAATCATACAGGATTAGACAACACCACTTGCCCTTTGCCTTGGATAGACCTTTCTTCGTAT
TATATGGTGAATTCTCAAGGAGAATTTGCGAATTATTCAGGATGTGGAAACACAGTAAATACTAACTACA
CGCCTACAACGCAATGGATTTTAGACTCTTTACGCTATTGGGTTCAGGAAATGCACGTAGATGGATTTCG
TTTTGATCTTGCTTCTGTGTTCTCACGAGATCCTCTAGGAAATCCCGTCCCCTTCTCACCTATTCTACAG
GCTATCAGCTATGATCCCGTGCTTTCTGAAACCAAAATTATTGCTGAACCTTGGGACGCTGCCGGTTTAT
ATCAAGTAGGTTATTTCCCTACTTTAAGTCCTCGATGGAGCGAATGGAATGGACAATATCGCGATACGAT
AAAGTCCTTTTTAAATGGGGATGGCCATCTTATTGGCACTTTCGCCTCAAGAATTTCCGGGTCTCAAGAT
CTCTATCCTCAAGGTTCTCCATGTAATTCCATTAACTATATTTGTAGTCACGATGGATTTACTTTACATG
ATACAGTTTCCTACAACTCCAAACATAATGAAGAAAACGGAGAAGAGAATCGGGACGGAAGCAACGCAAA
CTACAGTTATAATTTTGGAGAAGAAGGCGAAACTAACAATCCAACAATTCTTGCGCTACGTGAACGTCAG
ATGCGCAATTTTCTATTAACCCTATTCCTTTCTCAAGGTATTCCTATGCTACAGTCTGGAGATGAATATG
GGCATAGCGCAAAAGGCAATAATAACCGCTGGGCACTAGATACTGATACCAACCATTTCCTTTGGGACGA
GCTATCTAAGAACAATGCTCTTTTTGATTTTGTCTGTAATGCCATTCGTTTTAGAAAACAGCATAAGGAA
ATCTTTAATCAGGGATTCCTCACTGAAGAAAATATTTCCTGGCTTGATGCACAGGGCAATCCTATGCAAT
GGAACCCTAGCAAATTTTTAGCTTACGAGCTGAAATCTCCGAAATATAGCCTATTCACAGCATTTTATAC
AGGTGAAGAAAAAATCGAAATCCATCTACCAAAATTGAGAGAGAACTTCCTTCCTTATCAGAAAGTAGCA
GATAGCTTTGGATTTGCATCAGAGAGCTTATCAAAGCAAGTATCTTTAGATGCACATATGATGCTAGTTG
CTATAAGTTATGCAAACCAAGCTAGCTAA
>ref|NC_003361.3|:460116-460622 hypothetical protein CCA00409 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTGATCAGAACAACACGTGCATTTTGTTTGTTGATGGCGAATTTTCCCTTCACCTTACTTATGAAGAGCA
TTCTGATCGTTTGTATGTCTACGCTCCCTTGTTAGATGGTTTGCCAGATAATACTCAAAGAAAATTAGCT
TTATATGAAAAGCTTTTAGAGGGATCTATGCTTGGCGGGCAAATGGCTGGCGGCGGCGTTGGAGTTGCTA
CTAAAGAACAGCTCATTTTGATGCATTGCGTTTTAGACATGAAATATGCTGAAACAAATCTCTTAAAAGC
ATTTGCTCAGTTATTTATTGAAACTGTGGTAAAATGGCGAACCGTTTGTGCCGATATTTGCGCTGGTAGG
GAGCCTTCTGTAGATACCATGCCTCAAATGCCACAATCCGGTGGTCCTGGTGGAATGCAACCTCCTCCTG
CAGGCATTCGTGCGTAA
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GCGTGGTTGTATTGCGTCTAGGCGTAAAATCTCGCATAGGAACTAAAGATGAAACCGTATGGTGCAAATG
TAATGTTTGGCATAACCGTTATGATAAAATGCTTCCTTATTTGAAAAAAGGGTCAGGGGTTATTGTCGCT
GGAGATATCTCTGTAGAAAGTTACATGAGCAAAGATGGAACTCCACAGTCGTCTTTAGTCATTAGTGTTG
ATACCATTAAATTTAGTCCTTTTGGAAGAAACGAGTCGCGTTCTCTATCACTACTTGAAGAGAGCTCAGC
CCAAACAACATCGTATGATAACGTTTCCTTAGGATTTGAAGGGGAAAGTTTGGATGCTGAAGCAATAGCG
GATAAAGATATGTATGCCGGCTATGGTCAAGGTCAGCAATATGTATCAGAAGATGTGCCTTTTTAA
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GGAAGCTGAAAGACAAGGTTAAGTGTGCAGCTTCAATCGCAAAAGAATACGAATCACTTTATCAAGTTGC
TTTAGATAACTTTTCAGCGAAGAGCAGGGAAGTTGAGCTGATTTATAGCTGTGGACAGGGGAAGGAAAAA
CGTATCGTTCTCTTAGGATTAGGAAAGAACGAAGAGCTCTCTTCTCAAGAGGTTTTAGAAGCTTATGCTA
AAGCAACCCGTCTGTTACGTAAGGCAAAATGTACGACGGTGAATGTGGTCCTCCCTACAATCTCCGAATT
ACGTATCTCTATAGAGGATTTCCTCACCAATCTAACTTCAGGAATTCTATCATTAAACTATAACTATCCT
AAGTATACTAAGGAATCATCGAATGATCCCTTATTGACTAAAGTTAATGTATTGGGAATTGTTCCTAAGA
TTGCTGATAGAATCTTTAGGAAAGAAGAGAATATCTTTGAAGGTGTTTACCTGACTCGAGATCTTGTAAA
TGGTAATGCTGACGAGGTAACTCCTCAGAAATTAGCGAATATTGCTAAGGGAATGGCTAAAGAGTTCCCT
AGTATGGATGTGAAGATTTTAAATAAGGATGCTATCCTTAAAGAAAAAATGGGTCTTTTAGCTGCAGTGG
CTAAAGGATCTGCTGTAGATCCTTGTTTTATTGTTTTGACTTATCAAGGAAAGCCAAAATCCAAGGACCA
TACCGTACTTATTGGGAAGGGTGTAACTTTTGATTCAGGGGGCTTAGATCTTAAGCCGGGCAAAGCTATG
TTAACCATGAAGGAAGATATGGCAGGAGCAGCTACAGTATTAGGTATTCTGTCAGGAATAGCTGCTTTAG
AGCTTCCCGTAAATGTTACTGCTATTGTTCCTGCTACAGAAAATGCTATAGACGCTGCTGCTTATAAGAT
GGGCGATGTCTATACAGGGATGTCAGGCTTATCCGTAGAGATTGGCAGTACGGATGCTGAAGGGCGTCTA
ATCCTCGCAGATGCAATCACTTATGCTTTAAAATATTGTAATCCTACACGCATTATTGATTTCGCTACAT
TAACAGGAGCGATGGTTGTCTCTTTAGGAGAGGATGTGGCTGGTTTCTTCTCTAATAACGATGTATTAGC
TCAAGATCTTTCCGAAGCTTCTGCAGAAACTAGCGAAGCGCTATGGCGACTTCCTCTTGTTGAAAAATAT
AACAAAGCTTTGCATTCCGATATTGCTGATATGAAAAATATTGGTAGTAACCGTGCAGGGGCTATTACTG
CAGCACTTTTCTTAAAACGTTTTCTTGAAGATCAACCGGTAGCTTGGGCACATTTAGACATTGCTGGTAC
TGCATATCGTGAAAAAGATGAAGATCTCTATCCAAAATATGCTTCTGGTTTTGGTGTTCGTTGTCTTATT
TATTACATAGAAAAGTTTTTATCTAAGTAA
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AAGCTGCTACTAGAAAGCCTGTTGCTAGAAAGACAGTTGCTAAGAAAACTACAGCTCGCAAAACAGTTAG
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ACAGCTCGTAAGACTGTAGCTAAGAAAACTGTAGCTAAGAAGCCTGCTGTTAGAAAAACTACAGCTCGCA
AGCCAGCTGCTAGAAAAGCAATAGCAAAACCTGCTATCTCATGCCACAAGAATCATAGACACTCAGCTGC
TTGCAAGCGTGTATGTTCTTCTTCAGCTAAAAGAAGATGTGGTTCTAAAAGTCGTGTTCGTACAGCTCAT
GGCTGGCGTCAACAATTAATGAAACTCGTTTCTCGTTAG
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TCGGCTCAAATTCTGAAGAAGATAAGAGTGTCTGCATGGAGCTTCTTGTTTCTGGGAAAACTCAGGAATT
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GAAATCCCCGCCCCCACCTTATTGTATTTTTATTCACTACGAAACAATCGTGTTTTCAATCTTTACGTAA
AGAACTCTCTTCCGCAGCTTTTTTATCGTTATTTGGTGAGTGGCAGTCGGATAGAGAGAAGCGCATGACC
GTTCTTCTCTCTCAAAGAGCTGCACTTTTAGGGGTGACATGTTCTTTAGCTTTAGCCTCGGCATTTATTA
AGAAATTTCCTCTAGGGGAGATGCATAACCTTATAGGAGAATTTCATAAGTTGTTGTGTTGCATAGGGAA
AAAGCAAGCGCTAGAGTATAGCGATATTGAAAGCTTTGTAGTGAAAAAGGAACAAGTATCCTTATGGAAA
TTACGCGATGCTATTTTACAGAGGAATACTGCAGAAAGTCAGGCATTACTACGGGCTTTGCTTCTCGAAC
ATGGAGAAGATCCTCTAGGATTGATAGCTTTTCTTCGAGGTCAGTGCTTATATGGTCTACGTAGTTTAGA
AAAAGAAACAGCAGATAGGAAACATCGGTTTTTCATTGCCTATGGAAAAGAACGCCTCCATCAAGCGTTG
AGTCATTTATTTTATGCCGAGAGTATTATAAAGAATAATGTCCAAGACTCTATAATAGCTGTTGAAACTT
TGCTGATTAGGATGACAAATTCATGA
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AGATTATCCCTAAACTCCAAGGTTTAATAGCGGAGAGTGATCGCGGGGGACGTGCTTTTCTTAGTCTCTG
GAAAGTTCAAGAAACACATAAATTTCCCATTGCGGTGTTAAATAAAAATGATCGTTCTATAAAAGCTTGG
GATTTTTACCTTGAGCCTATTATAAAAAAGCAGGAGAACTGGGGACTAGTCTCTGATTCTGGACTTCCTT
GTATTGCAGATCCTGGAGCAGGACTCGTGCGTCGTGCTCGTGCTCTTAACCTTCCCATTCAGGCATTTTC
AGGTCCATGTTCTATAACATTAGCGTTAATGCTGTCGGGATTGCCTGGACAGAATTTTACTTTTTTAGGG
TACCTTCCGCAAAATCCCAAGGATAGGGAACGTTGTATAAAGAGTAGCTCAGGGAAACAACATACACAAA
TATGTATTGAAACGCCGTACCGTAATGTACATACATTTCAAGCGTTATTGGAAACTCTACCGGGATATGC
TGAGCTATGTGTAGGTGTAGACATTACCGGAGATCAAGAGTTTGTTTCTACAAGATCTGTAGATGCTTGG
TTGCGATCTGCAGATCTTGATAAGGTAACGAAACAAATCACAAAGATACCGGCAATTTTTTTATTTCACA
CTCCAAGATAA
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TTTGTCATAAAATGCGCAAATTAAAAGACCATTACGCACAACTTGCTAAAGAAGCTGAAAATACTTCTGT
GAAACAACCTGTTGTTGTTGAACGCTGCTGCTCAAAAGGCTCTTGCTGCAGCAATAGGGACTCCCGGGAT
ATTCATGAGAAACCTTTAACATAA
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TCTCCTGTGATGATGGTGTTGGGAATGCTATGCGTAAACCTTGGAACGTTTCTAATCAAAAAGTTACAAA
TATAGCTCGTGGATCTGGAACTCCTCCTACTGGCAGTATCGCTGTAAAAAGTGATCTTAGTGATTATCTT
GAAAAGGGAGGTGTTACTACAAGAGGGGTCTTTCTAAGGACGACAGGGGGATTGATGATTGGGGACATTG
ACATGACATCCTCTTGTACTGTCGTGGGTCTACCTACATCATATAAAACTGCTACTGTGAATGAGAATGA
CATGGCTTCAGTAGGTATGGTCTCGGAAGATATAGGTTCTCTTGCTAATAAGGTAACCGAGCTTATTGAT
CGTATCAACCAGCTTTCATCAACAAATGGCTTGGATAAAATTATAAAAGATTTAGGAACGCCATCTAACA
ACAATGTTACAAAACCCACCGAATCCAAATGGTTAGTGCGTGCTGGAGGAAGCCCTATGCAGGGAGATCT
TGGATTTAAAAAAAACAGCCAAAGTTCTCCTACGGATTCAGATCCTACCATTACAAATCTTGCAATCACA
GGTTCTGTAGCCTCGCCAATAACTAAAACAGCACCCAAACCTAAACCAAAAAAAACAGCTCCTAAAAAAA
GTTCTACAACAACAGGTTCCACAGCAGGTTCTACAACCAAGGCGCTTACGGCATTGGGGGCTATTTCTAC
AGCAACTACACAAGAAAACCTTCACAGAATTGTTGCTGTAAATGACCTTAAAGAAACTTTAGAGGCAATA
AAAACGAAAAATACTACCTATCCAAATTGGACAGGAATGGATGTGCCGTTTGTTTGTTTAAAGCAAGGTA
CGAGCACGACATCTTCTATAGATTATGAAAAATCTGACAATGCGGATAAATATATAAAAACAGTAAGTGA
AACCAGCGTTACATTATTGCGTAGAGGTATTTATTGCGTATCTTGTATCTATGATTTCACTCAACCAACG
CCTCCCACTCCACCATCCGGATCTTCTACATCGGCTACAGAGGTTAGCTGTGCATTATCTCTTACTCCTA
AAAATGGCACGAAAACAGAGCGTTATAAAATAACAGGTAAGTCGGACACGACATTGATAGGAAGGGCTTA
TATTTTTGTTGAGGGGGATCAAGCATCGATAGAAACAATACTAAGTTTTGATGTCACACCTACTCCAACA
ATTGAGAAACGAACATGGACAGTATCTTTTGTAGGTGCTGCTTATTAA
>ref|NC_003361.3|:c469258-467723 hypothetical protein CCA00417 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGGCTGGTCCTGATCCAGCTTTATTTACCGTGACAACGACATCGATCACATCAACAAAAGCCATTAATAT
GAATAACCAAAATATTACTGGTTTACCCGAGCCTAGAAACGACTCAGATGCGGTATCTTTGGATTATTTA
AAGTCCAATTACGTATCCAAAAGCGATCCCCTATCTGGATATCTTGCCACAACAGGTGGTTCTATGACGG
GGAATATTGATATGAGTGGTCACTCTATCATTAATATATCTATGCCTACAACTCAGGGGTCAACAGATTT
AAATCCATCAGCTGCTGCAACTGTAAAATATGTTATGGATACAGCTAATACAGTAACGAATAACTCTCAA
ATTAATGATGCTGTACAAAAAATTACTGAGGTATCCGCAAAGGTCACCACTATAGAAGAAGCCTTAGGGA
TGAAATCAGATGATGATGATGCCGATGATCCAGATGCTCCACCACCACCCGACACATCACTATTTGTGAA
AATTGAAGGGAGCACTATGTCGGGTAATTTAGATATGTCTCTACATACTGTCACAGGTTTAAAGACACCA
TCTGATAGCGATACTAAAGACGCAGCAAATGTTGAGTATGTACAATCTAAAATTACCACACCGCAAATTG
GGTTATTAGGGAATACAATCTCTACGCAAACTACAGTTACAGGTGAGTTTGATTGGAAAACAGCTCCAAC
TCCTCCAACACCAGTACCGCCAGCTCCTCCCGCTCCAGCACCACAGCCATCACCAACCCCTGCTGTGCCT
ACGCCGTCTCTGCCACAACCCTCACTTCCAAAACGTATAAAAATGGGGTCGGATATCACGGCTGCATCTC
CTACAACAACCACAACGCCTAAAACAACGCCGACACCGACGACGACACCCCCAACAACAACTCCAACAAC
AACCGATGTGATAGTCACTACTCCAGTAACAGATCAATATTTAAAGATTGAAGATAGTGATACAAAAACT
ATCAAAGTTCTTGCTCCAGGAATTCTTACATTATCTGTAACAGCTAACTGGTCTGGTGGCACTAATGCAA
ATATTAGTGTGATATTGAATCCGTCTACACCGGCAGGCGGCGGTAGTGGCAGCGCAGGAGGAGGTTCTTC
TAGCGGCGGTGGCAGCGGAGGAACTCCAAGCAATGGCAGCGGAGGAGGAACATCTCCAAGTGCACCTACA
TCTGTAAGATCATCTTCAAACTCAAGTTCGTCTTCATCTGGGAATACATCTACAACTACGGATACTACCG
TCTACACTGTTTCTGCTTTAAGTTCGGGACAAAATTTATTCTGTCAGATCCCTGTTGAAAAACCTTCTGA
TCTTAAACTGAAATTTAATCCACCGACAACCGGAAGCAGTAACACAGGAAATGATCTGACTGTGACATCT
TGGTCATGGCAGGTAACCCTTCTTCCATCAACATTCGCAACAACTACAACTCCACCTTCACCATAG
>ref|NC_003361.3|:c470447-469320 coproporphyrinogen III oxidase [Chlamydophila caviae GPIC]
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GCTTTTATACTATTCCCTACAATCCGGAATCTGTAAGTTTGTACTGCAATGCGGTTCTTCAAGAAGGATT
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TTAATTCCTCCCCATCATCTGCATAATATAATTACACTCCTAGCTCCCCACGCTCAAGAAATCACTTTAG
AAGCCAATCCTGAGGACTTATCTGAATCCTATTTGAGAGATCTTACTCTTACACCGATTAATAGGATAAG
TATTGGGGTACAAACGTTTCATGATCCCATTCTTAAAGCTTTAGGAAGGATCCACTCAGCATCTACATCT
ATGGATGCTGTCCACCGTTGCTACGAACATGAATTTCATAACATCTCTATAGATCTTATTTACGGTCTCC
CTACACAATCTTTGGCAGATTTTCTTGCAGATCTTCATCAAGCTCTTACTCTCCCTATTGCGCATATTTC
TCTTTATAATCTGACCTTAGATCCTCATACCTCGTTTTATAAGCATCGGCGTATTCTAACCCCCTCTATT
GCTAACGATGATATATTAGCAGCTATGAGCCTCTCCGCTGAAGAACTTCTCTCCTCTCGGGGATTTTCTC
GCTATGAACTTGCCTCATATGCAAAATCTCAAGCGCAGTCTAAACATAATCTCTACTACTGGACAGATAA
ACCCTTTTTAGGATTGGGGGTTTCTGCATCACAATACATAGATAAAGTACGCTCGAAAAATCTCTCAAGA
ATCTCACAATATCTACGTGCTGTACGCAAAAATCTCCCTACTCATGAATCTACAGAATGCCTGCCTGAAA
AAGAACGTATCAAAGAAGCCCTAGCTTTAAGATTACGCCTTACCAAAGGAGCAAAAATCAAAGATTTCCC
ACCTTCATTAATACAATCTCTTACATCCCTTCCTCTAATTAAAGAACTATTCGATCATAACGACGAGTTT
CTATTCTTAAATAAACAAGGTCGATTATTTCACGATACTATCGCTGAAGAAATAATGAATCTTTCTTTTT
TAATTTAA
>ref|NC_003361.3|:c470883-470437 hypothetical protein CCA00419 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TAGTTCCAAAAAAAGAAATCGATAGACATAAGGAAGAAATACGTTCTTTAGAAAACAAAATCCATGAAGA
GAAGGAACGCCTGCAACTTCTAAAAGAAAGTGGCGAAGTTGAAGAGTTTGTTACTCCAAGACGTAGCCCT
GCAAAAACGGTATATCCTGACGGTCCAAGCATGTCAGATATGGAATTTGTTGAAGCTACAGAGACAGAAA
TTGATATTGATCCAGGTGAAACCGTAGAGCTCGAACTTCCTGATGAAGAACGTGAAGAAGGCGCTGTAGA
AATCGATTATTCCAGTGATGACGATGAAGATCCTTTCAGTGATCGCAATCGTTGGAGACGTGGGGGCATT
GTTGACCCCGATGCTAATGAATGGTAA
>ref|NC_003361.3|:471038-473764 alpha-ketoglutarate decarboxylase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTCTAAATCACGAAACCTTGGATCCTTCATGGAAATATTTTTTTGAAGGGTACCAATTAGGCCAAGAGGG
CGCTGTTTCAGCATCTTCTGGAAATGAAGAGGCGTATGCTGCTTTGCAAGAAAAGAAAGCCCGATTTCTT
TGTATGATATACCGCTACTACGGGTATCTACAAAGCGAGATTTCTCCTTTGTCTCCTGTTACTCCTTCAC
CTTTAATTCAAGAAAAGATCAAGAATATAGATCTTAATGAAATTGTCCCATCTTTAGGTCTTCTTCCTCA
GCCTAAAGTTCCTGTCCGCGATTTAATTCAGGCTTTAAAAAATTTTTATTGTCGAAGTATTTCTGTAGAA
ACTCTGACATGTTCTCCTCAATTACAGGAATATGTATGGAGGCTCATGGAGAGTAAGCCTCCTCAAAAAT
CACTCGAAGATCTTATGCGTTCATATCAAGATATGTGTAAGGCAACATTTTTCGAGGAATTCCTCCAGAT
AAAATTTACGGGGCAGAAGAGATTCTCTTTAGAAGGTGCTGAAAGCTTAATTCCTATGCTTGAGCATCTC
ATTTATTATGGTGTTACTCAAGGTATCACTAACTACATTCTTGGTATGGCTCATCGCGGACGATTGAATG
TCTTAACGAATGTGTTGCGTAAGCCCTACTCTCAAGTGTTTATGGAATTTGAGGACAACCCTAAATCTCG
AGGTTTAGATGTTGTCGGAGATGTGAAGTATCACAAAGGTCATGTTTCTAGATCTCTTTGTAAAAGTGGT
GATGAGGTAACCGTAGTGATGTTGCCAAATCCTAGCCATCTAGAAGCTGTAGATCCTGTTGTTGAAGGTG
TTGTCGCGGCTTTGCAACATCAGATGGATTCCGAAAAGGAGTATTCTTGTTTAGCAATTCTTATCCATGG
GGATGCGGCATTTTCAGGGCAGGGGATTGTTTATGAGACTTTACAATTAAGTCAGGTTCCTGGGTATTCT
ACAGGGGGAACTCTCCATATTGTTGTGAACAACCATATAGGCTTTACAGCGCAGCCTAGGGAATCACGAT
CCACACCTTACTGTACAGACATTGCCAAGATGTTGGGGATTCCTGTATTTCGTGTGAATGCTGAAGATGT
TTCCGCTTGTATGCAGGCTATCGAATATTCCCTAAAAGTACGTGAAGAATTTAATTGCGACGTTATCATC
GATTTTTGTTGTTATCGGAAATATGGACATAACGAAAGTGATGATCCTTCAATAACGGCTCCTTTGCTTT
ATGATGAGATTAAGAAAAAATCGACAATTCGTGAGATCTATAGAAAGTATCTACTAGATAATTATCCTTC
AGAAATCTCCGAAGATAGCCTAGAGAAAATTGAAAAAGGCGTTCAAGATATCCTCAATAAGGAATTCCAA
GTATTAAAACAGGAAGAAAATCAAACTTTACCGAAAAGAAACTGTCGTCATTGCGATCGGATGGATCTCG
GAGAGTTATTGGTAAACGATCTTGATGTGTCTTTAAGTAGAGATACGGTATTTCATATAAGTTCGAAATT
ATGTGGTCTTCCTGAGAATTTCACACCCCATCCTAAGGTGAAAGCTCTTCTTGATAAGAGAATGAAAATG
GCTAATGGCGAAATTGGCTATGATTGGGGGATGGCTGAAGAGCTCGCCTTTGCTTCTTTGTTAATAGAGA
AGTTTTCCTTACGTCTTTCGGGACAAGATGCTATTCGTGGTACCTTTAGCCAGCGCCATTTGTTATGGAG
TGATATAACATCTGGAGATACCTACTCACCCTTATACCACCTCTCTCCTGATCAAGGATCCGTGGATATC
TATAATTCTCCATTATCAGAATATGCTGTTTTAGGCTTTGAGTATGGTTATGCTCAACAAGCAGACCGTA
CCCTTGTTTTATGGGAAGCGCAATTTGGAGATTTTTCTAATGGAGCGCAGATTATTTTTGATCAGTATAT
TTCTTCTGCGATTCAGAAATGGGATCTACATTCTGACCTTGTTGTTCTTTTACCTCACGGTTATGAAGGT
CAGGGCCCGGAGCATTCCTCAGCACGTATAGAAAGGTATTTACAGCTAGCTGCAAATTGGAATTTCCAAG
TTGTTATTCCCTCTACTCCTGTACAGTATTTCCGTATCCTTCGTGAGCATACAAAGCGGGATTTATCCTT
GCCTTTGGTGATCTTTACTCCAAAAATGCTTTTGCGTCATCCTGAATGCACAAGCTTTATAGACGAGTTT
ACCACCCCGGGAGGGTTCCGCCCTATACTTGAAGATATAGAGCCAAATTACCAAGCTAAGATTTTAGTTT
TATGCTCCGGAAAGGTGTATTACGATTTTAAAGGAGCTTTACCTCAAGAACGTCAAAAAGACTTTGCTTG
TTTACGTATTGAGAGTTTATATCCCTTGTATCTTGAAGATCTCCTTTCTCTTCTTGGGAAATATTCTCAA
GCTGAGCATTACGTATGGCTTCAAGAAGAGCCTCAGAATATGGGTGCCTTTGATTATATATTCATGGCAA
CTAAAGAAATTTTCTCCAAAAAACTTACATGTATAAGCAGACCAAGAAGTAGCTCGACAGCTACAGGATC
TGCACGTCTTAGCCAACAAGAATTTTTAACATTAATGGAAACATTGTTTTCTCTAGGTAATGTATGA
>ref|NC_003361.3|:473761-474858 dihydrolipoamide acetyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATTACAGAAGTACGCATTCCAAATGTCGCTGAATCCATAAGTGAAGTGACCATAGCTTCCCTTTTGG
TAACTTCAGAAAGTCTGGTTCAGGAGAATCAAGGCATTATGGAGATCGAAAGTGACAAAGTAAATCAGCT
TATCTATGCTCCTACATCTGGAAGGATTGTCTGGTCAGTTTCTGAAGGCGATGTTGTTGCTGTTGGAGGG
GGTGTTGCTAAAATTTATGATGCTAATGAAGCTGTCCCTGAAAGCGCTATAGAGAACACTTCTTCTAGCG
AATCTGTAGATGCTGAGATTATCTGCTTCCCAAGATCTAAAGCTCACGAACCTCCTGCGGAGGGGAAAAC
TTTTGTTCCCTTACGTGATAAAATTCAAAATGCCCCACAGCCTGCAGGATCTAAAAATGAGGTTCGTGAG
CATATGTCTTCTATACGCAAAACGATTTCTCGACGTTTAGTTTCTGCTCTTCATGAATCGGCAATGTTAA
CCACATTCAACGAGATTCATATGACGCCTCTTATGAAACTCCGCAAGGAGAAACAAGAGAGCTTTTCTTC
TCGTTATAATGTGAAATTAGGCTTGATGTCTTTCTTCATAAAAGCAGTGATTGAAGGGTTAAAAGCTTAT
CCTCGTGTGAATGCCTATATTGAAGGGGATGAAATCGTCTACCGTCAATATTATGATATTTCTATTGCTG
TAGGCACAGAGCGCGGTCTTGTTGTTCCCGTGATTCGTGATTGTGATAAACTCTCTAGTGGGGACATTGA
AGTAAAACTTGCAGATTTGGCAGGCAGAGCTCGCGATGGCCAGATTTCTATTCCTGAGTTAGAAGGAGGA
AGCTTCACCATTACTAATGGTGGTGTTTACGGCTCTTTACTTTCTACGCCTATTATTAATCCTCCTCAAG
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>ref|NC_003361.3|:c475603-474863 hypothetical protein CCA00422 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TATACAACCCCTGCAGGATGCCCTGCAGATGGATTGTATACCGAGGATCCTCTAATTTCCCTACATATCC
GCCATTCTGATTGCCAACCGGCCATCTTTTATGATCCCGAAAAACATGTTGTTGCTAATGTACATTGTGG
GTGGCGAGGACTGGTCGGGAATATCTATGCTGTGACAGTAGCGACGTTAAAACGAATCTACAACTCCCGC
CCTCAAGATTTAATTGTTGTTGTCGGACCTTCTTTAGGACCTGATTACGCTATTTATCCTGATTATAGGG
AGCTTTTTCCCCCTAGCTTCTTTGCTTTTATGCCGCAAGAAAATCACATGGACTTTCCCTCTATAGCGAG
AAAGCAACTATTAGATTTAGGGATCTCTAGTTCTAAAATAACTATTTCTGAAAGGTGTACGTATACCGAA
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AAAAGAACAACGTTACCGCTGTTCTTCTTCTTCCTAGATAA
>ref|NC_003361.3|:c477439-475619 4-hydroxy-3-methylbut-2-en-1-yl diphosphate synthase [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATATTCATTTCTTTCCTCAAGCAGCGATGCACGTTGCTGATTTTGTAGATAAGGTACGTATCAATCCAGG
GAACTTTGTTGATAAGCGCAATATGTTCACCGGGAAAACATACACAGATAAAAATTATGCCGATAGTCTT
CTTCGATTAGAGGAAAAATTTACTCCCCTTGTAGAAAAGTGTAAGCGCTTAGGGAAAGCCATGAGAATAG
GTGTGAATCATGGTTCTCTTTCGGAACGTGTTATGCAACGTTACGGCGACACTATAGAGGGGATGGTAGT
TTCTGCTCTTGAATATATTGAAGTATGTGAAAAACTTGGCTATCGCGATGTTGTTTTCTCTATGAAGTCT
AGCAATCCGAAAGTTATGGTTGCTGCCTACCGTCAGCTGGCAAAAGATCTCGATGCTCGTGGTTGGCATT
ATCCTCTGCATCTAGGAGTTACGGAAGCAGGGATAGGTTTGGATGGAATTATTAAGTCTGCAGTAGGGAT
TGGCACGCTCCTTACAGAAGGGTTGGGAGATACGATTCGTTGTTCATTAACAGGATGTCCTACTACAGAA
ATTCCTGTTTGTGAAAGTTTATTAAAACATACCACAACATATCTTGATCTTCCGAAAAAAGAGAATCCAT
TCGCTTTAGAAAATTCTGAAACCTTCGTTAATGCCTCAAAGAAAATCACTAAAGCCACCCCTTGGGGCTC
TGTTTACGGTGTATTTATTAAGCTTATGAAAGAGCATCTTTTAAACAATACCGTGGAGAAGTTGCTCGAA
CAGTTGGGTATTAACCCTACAAATGGGAAAAAAGACTTCACAGCTCCCGATGGGATCATTGTTCCAAAAA
GCTTTATAGGAACTTCTGTTATTGAAAAATTAAAAGAGCATTTATTGGTTTTCCATCATCATGAAGTCCC
CTGTCTTTACAATCATAATGAAGAAATTTGGAATAGTGAGCAGGTCTTAAGCGCGCCTTTTGTTCACTGT
CATGCTACACCTCCGTTTATTCATAGCACAAGAGAGTTTTTCGAGAAGAAACAGAGTAACGAGCAACCTG
TGAAGTTAGTATTTTCAAAAGATCTTGATGATGAATTTGAAGCAGCTGTATCTATAGCTACGGAATTTGG
TGCTTTACTTCTCGATGGTTTAGGTGAAGCTGTGATTTTAGACCTTCCCAATGTTTCTTTACCTACTGTT
CGAGAAATCGCCTTTAGTACTTTACAAAGTGCTGGGGTACGTTTAGTGAAAACAGAATACATTTCCTGTC
CTGGATGTGGGAGAACGCTTTTCGATCTCCCCGAAGTAACAACACGCATTCGCGAAAAAACAAAACATCT
TGTAGGATTAAAAATCGCTGTTATGGGATGTATTGTTAATGGCCCTGGAGAAATGGCTGATTCTGATTTC
GGATTTGTAGGGTCGAAAACTGGGATGATCGATCTCTATGTAAAACACACATGCGTGAAAGCGCATATTC
CCATGGAAGATGCCGAAGAAGAACTCGTTCGTCTTTTGCAAGAACATGGTGTATGGAAAGATCCCGAATA
A
>ref|NC_003361.3|:c478974-477772 hypothetical protein CCA00424 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCGCCCAAAAAAATTTCATCGGATAATAATCCGCTACCACCACATCAAATATTTAATCTAACTCCTA
AGCAGCGTTTTTCTATAAAGGGATGTTTTCATAGGGTTTTATATAATCCAAACACCCGAGAGACTACTCA
GAAGGTTCTTGCGATCTTAGGAGGACTTGCTTTAGTTGCAGGAGTGGCCTGTGGTATCACTTTAGGAGCA
CTTGGAGCCCCTGGCCTAGCAATTGCTACGGCTATAGGGATTACTCTGGGAACAATTTTATTAGGAACAT
CGTTAGCGCTTATCCCTAGCAACACCAAGAGCAGCATGAAGAAAAGACTTCATAGCGCTTTTGAAAAAAG
CAGGGGTTATGACTTCCTTTCTCAAGATCTTGCCCAGACGTTAAAGGCAAACTTTAAGGAAAGCTCTTCT
CTACCTAAAGATATGGAAGCTCCTGGTGCAGAAAATATCAATATCTTCACTGCGAAAGGCAACCCTAACG
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AGTGTGTTTCGTCCCTCCCGAAGCTGATCTTGCAAATCCGAATACTATTCACAATAGTGCTGTAGATCTA
TTTAGGTTCGAAATGGGAGATTATAATTGGAATATAGGGCTCACAGAGTTTTCCCAAACGCCTAAAACTC
CTGGGGGATGGAAATGTACAGAATGGAGCGATGTTACACAATCCCCCAAAGATAGTCCAAAACAGCTCAT
TAATGTATGGAATCCCTTTGGGCATTACCCCACAACAGCAAATGAACAACCTGGGGATAAACCTCATCCC
CTGTACGGACAAAGAAGCTTGGAAAATCAGCAAAAGATGTTTACCAGCTTCTTTAAATCCTTAATTGCTA
ACGGAATTCACCATATTGGAATTTATGGACATGATCTTATGTTCCCAAAAGATCATAAGAACGAATTCTA
TATCAACACATTTGCACCACTCGATGCAAAATTCGAAAGTAGGGTGTTAACAGCGTTATCCTTAGCTTTA
TCTGAAATAGCTAATGATCAAGATAGTCGTCTAACTGTCTGTCTTTACGGTTTGCTGGAGAATCCTCTAC
GCCAAGCGAAACCTATAGTTTACGGAACAATCGATGACTTTGACGATAGCGATTTTAATGAGTTTGACGA
TTTTGATGCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c480048-479074 hypothetical protein CCA00425 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATAGCGTTACCTCAAAAGCTTTCCGTATTGCCATGGTCGTCATTGCAGGTTTAGCGGTACTTGGAACTAT
TATTCCCTCTGTAATCACGGGAATTTTATCTCTTCTTTCTCTATGTGCTCTAACCGTTCCCCTACTCCTT
ATATCCCTATTCCTTCTTAGAAGATCCTGTCTAAAGCCTAAAATAGCAGAAAGAATAGATATGAAATCTA
TTCCTAGGGGGGCGTCCTTCCTTTTTGAAGTGGATGAAAACATCAAGCATACGCAAATCTTAGAAGAGTA
CGGCGAGGTAGTTACTGATTGGAGTAGCCTACCACGTATCTTTGGAGAAACTACACCCTCTTTACTGAAT
AAAACCTGGAAAATCAATAACTCACAAACAACTCTATTTACCACTACAGGAGTGATTTATTCTCCACGAG
TTCATTGCTGCTGTAATCTCATGATTGTAGTAGAACATAATACAATCCTGTCAAACTTAGATGCATTGAA
CATCTCTTGTGTAATCCCTGATATGCAAGAGGGGGAATGCATTTCTATGCGTTGGAAAAACTCTGACGGA
TCTAGCAATAAGAAAAAACTCGGCTTACCAAATTTCCTAGGTTTTATCCAAGGCCCCGATCCTGAATCCC
ATAACCATCATCCCGCTGCTGCCTTTACCCTGGCAAAAACTGCCTATGCAAATTGTCTAAATGAGGCGAT
TAATCAAGGTGCTGATATGATTCAACTTCCACTCATATCTACAGCGCCCGCACAACTCTCATCAGACCCT
CAAGAAGCTGCTATATGGAAATCGGCTATACAAACAGGTTTAGTTGCAGCACTAACGCAATTCGCAAGCT
CAAATCCTAAAACGATCATGAACGTTGTTGTCGTGAGTCCTCCTGGATTAGGACTTTCATTATAA
>ref|NC_003361.3|:c481561-480422 hypothetical protein CCA00426 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CCAGTCAAGATAGACAAAGAATCGCTAAGCGGGTAGCGCTGGCTAGTGCCGCTGCTTTGTCCCTTGTCTG
GGTTGTGACAACCCTAGCTTTAGCCATCACGCTAGCAATGCCTGCTCTTGCTGTTGCTACGGTGATATTT
TCTATAATTGCTGTGGCCTGCTGCGTTCTGCTAAACAAGAAACCTCAAAGAGACGCTACTCCTTACCCGC
CTTTGGAAGAAGGAATGCCCGAGAATCCAAGACTGACGATTCCTGAAACTCGACGTGCCCAACCGCGATC
TCCAGAAAGTCAATCGGCTCTTGTTGACACACCAGCTCCTGCGCAACCTCAGGATGCCCCTGCGTCTTCA
CATCTTGTTCCGAGTGCTTACGAATTACTTAGTGGGTGGATACCACTACCTTTCTCAGCGGCTATCAATA
TACCGGTATTCGATGCTGTCGATATTACAGCTCCCATGAAAATCTGGAAAGCACTAAACACCAAAACCGT
CTTAGTATCTACCGCTGGAGACATTACTAAACCTAGATTTACCACTCAGGACCTGTCTCCGATGTTGGTA
AACGCTGCTAATAGCACTATGTTCCGAGGAGGTAGTGGAACAAATTACCACTTTACACAAGCAGTAAGTA
AACGAGGATGGGAAAATTCCAAAGAAAATAAGACTACATTACAAGTTGGTGAGTGTAGCGCTGGAAAATG
GATAAATGCTGATGGCACGAATAATGATCTTAAACCTGAAGGCCCAGCATTTCTTGCACAACTTTTAGGA
CCCACAGCTGCTCAGCTAAACAACGATGCAAAACAATGTTACCAAGTTGTTACTCAAGCATATGAGAACT
GCTTTGCTAAAGCTCTGGAAAAAGGGGCTAAGTATGTTCAAGTCCCTCTTATCTCATCCAGTGCTTTTGC
TCCGAGCAAAGACCTTATAGTAGATGGACGTAGTGTTCGCGATCAATGGATAGATAGTGTAAAAGCTGCT
TTGGTAACAGCTGCTCAACACTTTGCAGAAGCAAATCCTGATGCAGAGATGGTTATTGTCGTTACCGATA
TCAATACCTTACCTCTTTAG
>ref|NC_003361.3|:c482060-481785 ferredoxin [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTGAGCCTTGTGAATCTTCAGGCGTTCCTTTTGCATGTACTGAGGGTGTTTGCGGCACCTGTGTTATTGA
GGTCTTAGAAGGAAAAGAAAACCTCTCCGACTTCACCGATGAGGAAAAAGATTTTCTTGGTGAACCTGAG
GATTCCAACGAACGTTTAGCCTGCCAATGCAAAATTAAGGGTGGCTGCGTTAAGGTGACCTTTTAA
>ref|NC_003361.3|:482340-484097 type III secretion system protein [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGGTGACAAGCAAACAAGAGAAACTATGGCGAATGGCTCTTATTCCCTTAGGTATTCTGCTTTCTTTTT
TAATTCCCTTACCTCAAGTGCTTTTGGATATAGGATTGTGTATCAATTTTATCCTATCTTTAACCGTTGT
CTTTTGGGTATTTTCCTTAAAATCAAGTCGTGACGCTAAGCTCTTCCCACCGTTATTTTTGTATCTCTGC
TTATTTCGTTTGGGGTTAAACCTTGCGTCAACTCGATTGATTTTATCTTCGGGTTGGGCATCTTCTATGA
TCTTTTCTTTAGGCAATTTCTTTTCCTCAGGAAGTCTAGGAGCCGGAACTGTTGCCTGCTGTCTATTCTT
TCTAGTAAACTTTCTTGTCATTGCTAAGGGATCAGAAAGAATTGCTGAAGTTCGCGCTCGATTTATTTTA
GAAGCGCTTCCTGGAAAGCAAATGTCTCTAGATGCTGATCTTTTGTCTGGAAGAGCGTCCGGTATGGATG
TAGAAAAGCAAAAACAGGACCTTTTTGAAGAGAGTGATTTTTTTTCCTCTATGGAAGGGGTATTTCGCTT
TGTAAAAGGAGATGCCATTGTCAGCTGTATTTTGCTTATCGTTAACTCTATAGCCGCCACCTATTTCTCT
TATTCTTTGGACGGCACTACGGATAGTTTGTGGCTCACGGTTGTTGGAGATGCTTTAGTAAGCCAAGTTC
CTGCGCTATTGACATCGTGTGCTGCGGCTACATTGATATCAAAGGTGGGGCAAAAGGACTCTCTCATCGA
GCATATGATGAATTACTATGAGCAAGCTCGAATCCATTTTCGAACAATTGCTCTTTTGCTCTCCTCGTTA
CTCTTTATTCCCGGAACCCCTAAGGGATCTGTGGCTCTTTTTGTCATTGCACTATTTATTGCATATAAAG
AACCAAAAGGCATTCAGGATCTAGCGCTTATACCCGAAGAATTTCAACAAATACATCTGTCTCTTCCAAC
GAATTACACAGGAGAAGATCCAAGAGAGATCTATGCGCAAGTTCGTGAAGATATCTTCAATGAAACCGGA
GTGCTGTTTCCTCAGGAAATACAGATAATTCATACTGAGAAAAAAGCTTCATTAAGTTGTGGCGGGCAGC
ATTTTTGTCTTAAAGAAGTATCGCAGTTACATCTCTTGCTAATATTAAGAAATTTAGCTCCAGACGCTAT
TCATGGAAGATATATCAAAGCTCTTATAAGAGATGCTCAAAATATTTTAGGGATCTCTATTGAGGAGATT
ATTCCAAAAAAAATCTCTGAAAACTCCCTGCTCTTTTTAATAAAAGCTCTAGTTAAGGAACGCATTTCTT
TAAGGTTGTTCCCTAAGATATTGGAAGCGATAGCGTTATATGGCTCTCATGACGAAAGTCTAGAAACTCT
TTCCGAGAAGATCAGAAAATATCTAGGGAAACATATAGGAAGAGCTCTTTGGAACAAGGAAAACACTTTA
GAAGTTATTACCGTAGATTCACATGTAGAACGAATGATTGGTGACCTATACTCACAATCGCATCCCCTAA
TGTGTGATAAAGTTGTTCATCAAGTGCAAAATCTCCTGGGACAATCGGGAAATGAAGGTTTTCGAGCGAT
CATTACCGGATGCGAATCACGTTTTGAATTAAGAAAAATGATCGAACCACATTTTCCAGATCTTCTTGTT
TTATCGCATAATGAACTCCCTGAAGAAATCCCTATTTCCCTTTTAGGATCTGTCTCAGATGAGGTTTTGA
CACTTTAA
>ref|NC_003361.3|:484199-484972 RNA polymerase sigma factor sigma-28 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATCGAGATACTTTGATCGATTTTTACCTACATCTAGTCAAATGTGTAGTTCACCGTTTGATTTCAGGTAT
GCCTTCCCATGTAAAGACCGAAGACCTGTATGCTTCCGGAGTAGAGGGATTAGTGCGCGCCGTAGAGCGC
TTTGATCCAGAGAAAAGTCGTCGTTTCGAAGGTTACGCCCTGTTTTTAATTAAGGCTGCTATTATCGATG
ATTTAAGGAAGCAGGATTGGGTTCCTAGAAGCGTTCATCAAAAGGCAAATAAGCTTTCAGAGGCTATGGA
TACCTTAAGGCAGTCTCTAGGAAGGGAGCCTACAGATGGAGATCTTTGCGAGTATTTTCAAATTTCCCAA
CAAGAGCTTTCCGGATGGTTTATTTCAGCGCGTCCGGCTTTGATCATTTCCTTAAATGAGGAAAGACCTT
CACTATCCGACGGAGAGTCGGGTGTAGCTTTAGAAGAGCGCATTCCTGACGAACGGGCGGAAACAGGGTA
CGATATCGTCGATAAAAAAGAATTCTCCTCATTTTTAGCCAACGCTATAGAGGGCTTAGAGGAGAAAGAA
CGAAAGGTGATGGCTCTATATTATTATGAAGAGCTAGTTCTTAAGGAAATTGGCAAAATTCTTGGAGTTA
GCGAATCTCGCGTCTCTCAGATTCATTCCAAAGCTTTGATTAAACTTCGAGCAGCTTTATCCGCCTTTAT
TTAA
>ref|NC_003361.3|:c485247-484969 hypothetical protein CCA00430 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTATTCCATCTACCACGCTTATCCGTATCACTTCGGCGGTACTTCTTACTCTCGCAATTTTAGCTGTAGT
GGGAAGCTGCGCAGCTTTAATACTTACTACAAATCTCTGGTTCTTATTATTAAGCGCGGCTGGAGGACTC
TGTTTAAGTCTTGGAATTATTGTAAACTTTACATTTCCTACTAAAAAAGAAGGAAAACAGATTTGTTAA
>ref|NC_003361.3|:485409-486647 tyrosyl-tRNA synthetase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TAGAATCTCCCATTTCCGCATATCTCGGATTTGATCCTACAGCCGCTTCTCTCCATATTGGACATTGGAT
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GGGATGATAGGGGACCCATCAGGGAAAAGTATAGAGCGTACTTTGCTGGAGAGTAATGAGGTAGCGCACA
ATAGCAAGAAGCTTTCCGAGTGTCTTTCTCACTATTTGCCTGGAGTGCAAATAGTGAACAACATGGAGTG
GTTTCAAGGCACCACCGTGATTGATTTTCTTCGAGATGTAGGGAAGCACTTTAGATTAGGAACAATGCTA
GGCAAGGATACAATTAAACAGCGTATTCAGTCCGAAGAGGGCATTAGTTATACTGAATTTAGCTACATCC
TCTTGCAATCATATGATTTTGCCCATCTATTTGAAAAGCATGGGATAGCTTTGCAGTGCGGAGGAAGTGA
TCAGTGGGGGAACATTACCTCAGGAATTGATTATATCCGTCGTAAGGGATTAGGACAGGCCTATGGGCTA
ACGTACCCATTATTAACAAATAGCCAAGGGAAGAAGATCGGGAAGACCGAATCGGGAACTATTTGGCTGG
ATCCTACTTTAACTTCTCCTTATGAGCTATACCAGTACTTTTTAAGATTGCCCGATGCAGAGGTTCCTAA
AATAGCACGCACGCTAACTTTATTGAGCAATGAAGAAATCTTTGATTTAGATAAGAAGTTCCTTTCAGAT
CCCATAGCTGTGAAGAAGTTTGTTACTGAAACTATAGTTACTTCCATACACGGTGAAGATGGGCTTAAGA
AAGCTCAAATGGTTACTCAAAGTATGCATCCTGGTAAAGTATCTTCCATTTCTGAGAAAGATTTCCAAGA
TCTTATTTCTATGGGCCAAGGAATCTCTTTAGATCGCGTACAGACCCTTGGCAAACGATGGATAGATCTC
TTTGTTGGGGTGGGATTCTGTAACTCTAAAGGAGAGGCTAGAAGATTGATCGAACAGAAAGGTCTCTATG
TAAATAGTGAACCTATAGCTGATGAGCACAGTGTGTTTGAAGAACGTCAAGTTTGTTACGATCAATATGT
TTTACTAGCACAAGGAAAAAAGAAAAAATTAGTTTTGCATCTAATTTAA
>ref|NC_003361.3|:486664-488109 6-phosphogluconate dehydrogenase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TAGATCACGGTTTTTCTATTTCTGTTTATAACCGTAGTCCAGAGAAAACCCGAGAGTTTCTACAAGAACA
TTCTCAAAATACCCTCCTTCAGGGACACGAAAATTTAGAAGACTTTGTGCGTTCTTTAAAACGTCCTAGA
AAAGTGATGCTGATGATCAAAGCAGGAGCTCCTGTAGATCAAAGTATCGAATCATTGCTACCTTATCTTG
AACCTGGAGATATTATTATCGACGGGGGAAACAGCTATTATAAAGATTCAGAAAGGCGATGCCGAGACCT
CAAAGAAAAGGGCATACTTTTTGTAGGGATGGGGATTTCTGGAGGCGAGGAAGGTGCTCGCAAGGGACCT
TCTATTATGCCCGGAGGTAATAGTGAGGCGTGGCCAGCTATAGCCCCTATCTTTCAAGGTATTTCTGCTA
AGGTTCATGGTAACCCCTGCTGTTGTTGGGTTGGCTCTGGAGGGGCAGGGCATTATGTAAAGACTGTACA
TAATGGTATTGAATACGGAGATATACAATTAATCTGCGAAGCTTACGGATTATTAAGGACACGTTTAGGC
ATCTCTCCAGAGGGTATATCGGAAATTTTTGCCGAATGGAATAGCCGAGAGTTAGAAAGCTACCTTATGA
GAATTTCTGTAGAGGTGCTTTCTTTAAAAGGTCCTGACGGATCTCCTGTTATTGATACAATTTTAGATGT
CGCAGGACAAAAGGGGACAGGCCGCTGGACAGCCATAGATGCTATCGACTCTGGAGTCCCTCTTTCTTTA
ATTATTGAATCTGTATTAGCGCGCTTTCTCTCTTCATGGAAAACGGTACGAGAACAGGCTGCTAGCGAAC
TTCCTGGTATTCCTATAGTCTTTGAAAAACCCAGAGACCCGCATCTTTTTATCGAAGATGTATTCCAGGC
ATTATATGCTTCGAAAATTATTAGCTATGCTCAAGGATTCATGCTGTTAAAACAAGCATCAGAAGAGCAT
CAATGGAATCTAAATTTCGGAGAGCTCGCTCTATTGTGGAGAGGAGGCTGTATCATCCAAAGCGCATTTT
TAGATGCTATCCATAAAGGCTTTGAAAATGAACCCGAGGCTCCTTCGCTAATTTTACAAACCTATTTCAA
ATCCACATTACAAAACTCAGAATCTGGCTGGCGTAGAACTGTTGCTTACGCAGTTGGTTCAGGATATCCT
GTGCCTTGTTTAGCAGCTGCTTTGACCTTCTATGATGGTTACCGAACAAAAGACTCTTCAATAGCTTTAG
CTCAAGGACTACGAGATTATTTTGGAGCGCATTCTTACGAACGTAAGGATAGACCTCGAGGAGAATTCTA
CCATACAGACTGGATAGGGACTAAAACTACAACAGCAGTAAAATAA
>ref|NC_003361.3|:c490139-488331 GTP-binding protein LepA [Chlamydophila caviae GPIC]
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CAATTGCTGATCGCCTGCTTGAAAGTACAAGTACTGTTGAGCAAAGAGAAATGCGTGAACAGCTCCTGGA
TTCTATGGATCTTGAGCGAGAACGTGGGATCACCATTAAAGCGCATCCCGTGACTATGTATTATGAATAC
AATGGTGAAGTTTATCAGCTTAATCTCATAGACACTCCCGGCCACGTAGATTTTTCTTATGAAGTTTCGC
GTTCTCTAGCAGCTTGTGAAGGTGCTTTGCTTATTGTTGACGCTGCTCAAGGTGTGCAAGCGCAGAGTTT
AGCTAACGTGTATCTAGCATTAGAGCGTGATTTAGAGATTATTCCTATTTTAAATAAGATTGATCTGCCT
GCTGCCAATCCAGAGAGAATCCGCAAACAAATCGAAGATTACATAGGGTTAGATACCACCCACGCAATCG
CCTGTTCGGCAAAAACAGGAGAAGGAATCTCTGAGATTCTTGAGGCAATAATAGAACTTATTCCTCCACC
AAAGCTCCCTGAAGAAACTGAATTAAAAGCTTTAATTTTTGACTCTCACTACGATCCTTATGTGGGAATT
ATGGTCTATGTCCGTGTGATCAGCGGAGAGATCAAAAAAGGTGATCGCATTACTTTTATGGCGACAAAAG
GTTCTGCTTTTGAAGTCTTAGGTGTTGGTGCTTTCCTTCCTGAGGCTACGTTAATTGAAGGATCGCTACG
TGCGGGTCAGGTAGGCTATTTCATTGCCAACCTAAAAAAAGTAAAAGATGTGAAAATTGGGGATACCGTA
ACTACGGTAAAACATCCGGCAAAAGTACCTCTGGATGGATTTAAGGAAATTAATCCCGTGGTTTTTGCAG
GTATCTACCCTATTGATTCCTCAGATTTCGATACTTTGAAAGATGCTTTAGGACGTTTACAGCTTAATGA
TTCAGCTTTAACTATAGAGCAAGAGAGTAGCCATTCTTTAGGTTTTGGCTTCCGTTGTGGATTTTTAGGG
CTACTACATTTAGAGATTGTCTTTGAAAGAATTATCAGAGAGTTTGACCTTGATATTATCGCTACAGCAC
CTAGCGTAATCTATAAAATTGTCTTAAAAAATGGAAAAACCCTGTTTATAGACAATCCTACGGCCTACCC
TGATCCTTCTATTATTGAGCATTTAGAAGAGCCTTGGGTGCATGTGAATATCATTACACCTCAAGAATAC
CTAAGCAGTATTATGAACTTATGTTTAGATAAACGTGGAGTGTGTCTAAAAACAGAAATGTTAGATCAGC
ATAGATTAGTTCTTTCTTATGATCTTCCTTTAAATGAAATCGTCTCAGATTTTAATGACAAATTAAAATC
TGTAACCAAAGGCTATGGATCCTTTGATTACCGTTTAGGAGATTACCGTAAAGGCTCGATCATAAAGCTT
GAAATTCTAATCAATGATGAGCCTGTTGATGCCTTTTCATGTCTTGTACATAGGGACAAGGCAGAAGCTC
GTGGACGAAGTATCTGTGAAAAGCTTGTTGATGTAATTCCTCAGCAACTTTTTAAAATTCCTATTCAAGC
TGCTATCAATAAAAAAGTAATCGCTCGCGAAACGATTCGTGCTCTTTCCAAAAACGTTACTGCAAAGTGT
TATGGTGGCGATATCACGAGAAAACGCAAACTCTGGGAAAAGCAGAAAAAAGGTAAAAAGCGTATGAAGG
AATTCGGAAAAGTTTCTATTCCAAATACTGCTTTTATTGAAGTTCTCAAAATCGACTAA
>ref|NC_003361.3|:490384-491739 hypothetical protein CCA00434 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AATTTCTTTATTAATTTTACCCTTATCTATAAATCTTACTATTTCCTTATTACTTGGTGGCTTAGGTTGG
TGTATTTTATCTTTTGTTACCGCACAGCTTATTATCAAGTATTCACAACCAAAAAATACGCATATTCCTT
TGGGATTTCGCCAGGTGATTAAATCAAAATTCTCTAAGGTGTTTTTTGATTTAGTAACTACTCAGGACTT
AAACATTATAACATTTAGAGAATTAGTAACCTCTGTTTGTAATTTTAGAGAATTTGAAAACTCTTCTATT
AGGAATAATTTAGATAAGCTTTCTTCACAACTAAGGGAAGCTATCATAGCTTTTGGTGTTGATAACTTAG
ATAGAGAAATTAATAATCAGGACATTTTTAACTTGGATAAATTACTTATAGAAAATTGCCCTCTATATTG
GATGCAACGGTTTATAGAATTGGGTAGTAGTGAGGTTTTAGAGGGAAATGAAATAAGACAAGATTGGCAA
TATTCAGGAGATTATTGGTTTTCTGAACTAGGTTTGATCCACCAGTCTTCAGATAATAGTTTGAAACCAC
AAACGATTTTTAACCTACATTTATATGGAATAGTTCAAGAAGTAAGTGAGTCAGAATACTCTTGTTTGAT
GAATCATGCTAGAAATGGTCACTGGAATCATCAAGCTATAGAAGCTATAGTGGATAGATTATTGATTGTT
TGTCAGGGAGACTATAGCAGATATATCAATGAGAAAGATCAGGATAAAATATCTAACGAGCTGCGTATAG
AATTTACCGAAGAGGGAGTAAGAAACCTTCTTTTATGTATGTGTTTGCATGGATTGTCGTGGGAACAATT
ACAACTCATTCGCTCAACGCCTATTTCTTCTTGGCAATTTCTGTTTTGGATAGATAGGTCTACCCCTGAG
GGAGGGATGCGAAGTCTTGCAAGAGGCTTTCTAGGAGATTTTATTGACGAATCTCATCCTAATTATGAGC
CTGGAATAGCTCTATCAACGTATTCAGAATACAAGAACATTACTCAATATAGAAAGTGTATAAACCAAAA
TGAGAATAACGCCTTTAGGCATATCTGTTGCTATTTTAATCATCGTATGAGGTTTCATGAGAAAATAGTA
AATATAGATGCCCTCCTAAACAATGTCATAAATGCTAGAAGATACACTGTTGATTTAGAAACGGGGAGTA
GAGCCGAAATCCCGGCAGATATTTAA
>ref|NC_003361.3|:c493404-491803 ADP, ATP carrier protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACACAAACAGCGGAAAAACCTTTTGGAAAATTGCGCTCCTTTCTTTGGCCAATACATATGCATGAGC
TGAAAAAGGTGCTGCCAATGTTCCTAATGTTCTTCTGTATTGCGTTTAACTACACCGTATTGCGTGATAC
AAAAGACACTCTTATCGTAACGGCTCCCGGCTCCGGTGCAGAGGCTATACCCTTCATCAAATTATGGCTT
GTCGTTCCCTGTGCTGTTGTCTTCATGCTTATCTATGCCAAGCTAAGCAATATTTTAAGCAAGCCAGCCC
TCTTCTACACAGTCATCACCCCATTTCTTTTATTCTTCGCTTTATTCCCTACAGTGATTTATCCATTCCG
TCACATCCTACACCCAACGGATTTTGCCGATAAATTACAGACCATCCTTCCTCAGGGGTTGATGGGTTGT
GTAGCTATGCTAAGAAACTGGACCTTTGCAGCGTTTTACGTGCTTTCTGAGCTATGGGGAAGCGTTATGC
TCTCCTTAATGTTCTGGGGTTTTGCTAATGAAATTACCAAAATTAGCGAAGCTAAACGTTTCTACGCTTT
ATTCGGAGTTGGTGCTAACATCGCTTTACTAGCTTCCGGACGTTCTATTATCTGGGCTTCTAAGCTACGT
GCTAGCGCTACAGGAAATACAGATCCTTGGGGACTTTCCCTTTACCTCTTAATGAGTATGGTTATTCTTT
CCGGCGGCGTAATTATTCTATGCTACTGGTGGATGAATAAGTGCGTTCTTACAGATCCTAGATTCTATGA
TCCTAAAGAATTGAACAAATCCAAGAAATCCAAGCCAAAAATGAGCATGAAGGAAAGCTTTGCTTATTTA
GCAAGATCTCCTTACATGTTATTACTAGCCCTTCTTGTTATTTGCTACGGCGTTTGTATTAACCTCGTAG
AAGTTACCTGGAAGAGCCAATTGAAAATGCAATACCCAAATGCTAACGAATATAGCCAGTTTATGGGTAA
CTTCTCATTCTGGACCGGGGTTGTATCCGTTATCGTGATGTTATTTGTCGGTGGTAACGTTATCCGTAAA
TTCGGTTGGTTAACAGGAGCTCTCGTAACTCCAGTTATGGTATTGTTAACAGGCGTTCTTTTCTTCGCTC
TAGTTATCTTCAGAGATCAGGCTTCTGGAATCGTAGCTACGTTAGGAACCACACCATTAATGCTTGCTGT
TATGGTTGGGGCTATCCAAAACATTCTATCTAAATCCACGAAATACGCCCTCTTCGATGCAACAAAAGAA
ATGGCCTACATTCCATTGGATCAAGAACAAAAAGTTAAAGGAAAAGCTGCTATTGACGTAGTTGCTGCTC
GTTTCGGAAAATCCGGCGGTTCTTTAATCCAACAAAGTCTTCTAGTGGTTTGTGGAAGTATTGGAGCGAT
GACTCCTTACCTAGCAATAGCTCTCTTCTTGATTATTGCTGTATGGTTAGTCTCAGCTACAAAACTTAAT
AAGCTATTCTTAATTCAATCTGCGATCAAAGAACAAGAACTTGCAGGAGAAGAAGCCGCTGCTGCTTCTG
AAGTTGCTAGTTCTTCCACAACAATTCAGGGTACACCTGCTGTTGAGAACGCTTCTTCGTAA
>ref|NC_003361.3|:c494131-493628 hypothetical protein CCA00436 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCCGTAGAACAGTCGAATATAAATGAAGAAATAGAAAAACTGATCTCAAAAGCTATTAGAAAGGTCT
GCGGGGATAAGGAAAACGATCTATGTCGCTATCTTCCAGGACCCAGTGGTGGTTACATGCACCATTTTAC
ATTAAAGAAAATGAAAAGTGCCGCCCCAGAACAATTTCTAAAAATGCTAAAAACATTTATCTTAGAATCT
GATTCACCAAGAGCCATTAATCCAAAGCCTCGAGCACCTAGAGGGTCTAAAAAACGTAGAGACTTTATTA
ACTTTACGAAAACTGATATAGAACGTGTTCTAGAATTAGCCAGACAAGTAGGAGACAAAGATCTCTTAGC
ACGGTTTAGCCCCAAAAAACCCCTGCCTTCTTTAAAAAGAGAGCTTATTCGTTCCATCCGTAACGGAATA
GTTAGTGTTGAGTTATGGAATGCGTACGTAGAAGCTGTAAGAACTAATTCTTCAAACTTGGATTCTCCTC
AGTCTTTCGTTTAA
>ref|NC_003361.3|:494620-495585 ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCGTCAGCACGTCTATTCAAAAGAGTAAAACTTTCAATCTGCTTATTTTTAGTTTTTCTTGTTTCCG
GATGTTCTTCTTCTAAGGTGCACAATAGTGATAATAAAGCCTGTGTATTATCTATGAATCGGATGATACA
CGATTGTGTGTCTAGAATTATAGGAGATACACTGTGTTCAATAGTTCTTATTGATGGCGCTATAGATCCC
CATGCTTATGAGATGGTCAAAGGTGATGAGGATAAAATGGCAATGAGTAGGCTCATCTTCTGTAATGGTC
TTGGTTTGGAGCACACAGCAAGCTTACGTAAGCATTTAGAGGGAAATTCTAAGACTGTGAGTATCGGAGA
ACGATTAATAGCTCGTAAAGTGTTTTCCCCTATAGAAGAAGATGGATTCTATGACCCGCATATTTGGACA
GATATGAGTATCTGGACAGAAGCGGCTAAAGAGATAACTACAGCTTTAATTGCTGAATTTCCAGAATATG
AAGAACAATTTGCCGCTAATTCCAAGGAATTAATAGAAGAAATGCATGTGTTGGATAGCTGGGCACAAAG
ATGTCTATCTACAATCCCTAAAGAATCTAGATATTTAGTTTCTGGTCACAATGCTTTTAGTTATTTTACA
AGACGGTATTTAGCAACTCCAGAAGAGGTGCAGGCGAATGTTTGGAATAAGAGGTGTATGTCTCCTGAAG
GGATATCTCCTGAAGCTCAGATTAGCATTCGCGATATCATGCTTGTCGTAGACTATATCCACGAACATAA
TGTTCATGTTATATTCCCTGAAGATACCCTAAATCAAGATGCTCTTAAAAAAATTGCTTCGTGTTTGAAA
AAGGAGCATAATATCCGATTGTCAGCTCGTCCTTTATATAGTGATAATGTTAAACATGATTACTTTAATA
CATTTAAGCATAATGTGAGCACAATCACTGAAGAGCTCGGAGGAACTGTTTCTTGA
>ref|NC_003361.3|:495582-496361 ABC transporter, ATP-binding protein [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGAATAGACAAAATGAAATTGCTTGGTCAGTACATGATTTATGCGTGAACTATGATCATTCCGATGTTT
TATGCCATGTTTCCTTTTCTTTAAGAAAAGGATCTTTAACAGCAGTTTTAGGGCCGAATGGTGCAGGGAA
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AAGTTTAAAAAAGTGCATCAACGTGTTGCTTATATGCCACAAAGAGCTAGTGTGGATTGGGATTTTCCCA
TGACAGTTTTAGATCTTGTTCTCATGGGGTGCTACGGCTACAAAGGAATGTGGGGAAGAATAACGGCTGA
TGATCGCGAGGAAGCCTTCAATATTTTAGAGCGCGTAGGTCTATCTGATTTGGCAAATAGACAAATAGGA
AAGCTCTCTGGAGGACAACAACAGAGAGCTTTCCTTGCTCGAGCTCTTATGCAAAAAGCTGATCTATATC
TTATGGATGAATTGTTTTCTGCTATAGATATGGCTTCATATCAGACTGTTGTAGAGGTATTGCGGGATTT
GCAGGAGCAAGGAAGGACTATTGTTGTTGTGCATCATGATCTGAGTCATGTGCGCCAACTATTTGATCAC
ATTATTTTATTGAATAAGCATCTCATTTGTTCTGGACCGGTTGATGAATGTTTAACAAGCAAAAACATTT
TCCAAGCCTATGGTTGTGAGTTGGAGCTCTTAGACCGCACTCTTAAATTATCCCGAGGGAAGCAACAAGG
AGCGTATTAA
>ref|NC_003361.3|:496362-497711 ABC transporter, permease protein, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCTCGATTGTGCTTTTATTGGTTCTGTTTTTTTATCAAGCTTTCTAGCTGTTACTTTAATTTGTATGA
CAACGGCTTTATGGGGGACTTTGCTTCTCGTAGGCCGACAGCCTCTTTTGAGCGAGAGTCTTTCTCACGC
TTCTTATCCAGGATTGCTTCTGGGAGCTTTGTTAACCTACAAAGTCTCTTTCTTCACAGATTCTATTATT
TTGATTATTGTTTTTGGCTGTCTTGCAGCAATTTCTGGCTACGGAATTATAGTATTTTTAGAAAGAGTGT
TAAGGGTTCATAAGGACGCTTCTTTGTGTTTCGTTCTTGTTGTTTTTTTTGGTGTAGGGGTTATTTTAGC
AAGCTATGTGAAAGATTGCTGTCCTTTACTATATAATCGCATCAATGCGTATTTATACGGCCAAGCAGCT
ACTTTAGGTTATGCAGAGGCGAAACTTGCAGTCTTTGTTTTCCTTATCTCTTTAGCAACTTTGTGGTGGT
GGTATCGTCAAATTGTCATAACAATCTTTGATAAAGATTACGCGTCAACTTGTGGATTGAGTACGCGTAT
CTCTGGAAGTATTGTTCTTATATTTATTTCCTTAGTGATTGTAAGTGGAGTGCGTTCGGTAGGTGTCGTA
TTGATATCTTCAATGTTTGTTGCGCCTTCTTTAGCAGCCCGTCAGTTGTCTGATAAGTTAAATGTTATTT
TCCTTCTTTCATGTTTGTTTGGAGGGATTTGCGGAGCTCTCGGCAGCTATATTTCAGTAGCTTTTAGTTG
TTCTGTTTCTGGACATGGAGGGGTAATTACTTTGCCTACAGGTCCTCTCGTTGTTGTTATATCTGGTTGT
TTAGCTTTCCTTTGCTTAATGTTTTCGCCAAAATCGGGATGGGTAATACGCTATATACGTAAAAAACATT
TTTCATTTTCCAAGAATCAAGAACATTTACTGAAGGTGTTCTGGTATTTACTAGAGGATCAATTACCCGA
AGTAGGGGCACGAGATTTTGTTTGCTCTCGTAAGTATCAGGAATATTTTGGCCCCAAGCCCTTCCCTAGG
TTTAGAATCCGTCTTCTCGAATTACAGGGGTTTTTAAAGCATAGAGATTGTCGCTGGAGTCTTAGTGAGA
AAGGAAAAATCGAAGCGAAAAGGTTAGTTCGAGCTCACAGATTATGGGAATGTTATCTCGTCCATTCTTT
AGAATTTAAAGAAGAAAATGTTCATGTTTTTGCAGAAGAGATGGAGCATGTTCTAACGGATGAGTTGGAT
TACGCAATTACGGAAATGTTAGATAATCCGCATTATGATCCACATGATAAATTAATCCCAGAAAAGCCAA
ATAAGAAGGAGGAACTATGA
>ref|NC_003361.3|:497708-498691 ABC transporter, permease protein, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATAGGAGCCTTTTCCCCGTATCATGGGGTATCCTTTATCCAATTTTTCATCGTCTTTTTCTCGAGAG
TTTTTTCTGGAGAGCTTTTTCGAGGACACTTGTTTATCGATGATATTCAAGTTATCGTATTCTTAGCTAT
TGCTCTTACTGGAGCTTTTGTGGGGAGCTTCTTAGTTTTGAAAAAGATGGCTATGTATGCCAATGCAGTT
TCTCATACGGTATTATTTGGCTTAGTGAGTATTTGTTTATTTACCCATCAGTTAACATCATTATCTTTAG
GAGCCCTTACCCTGGCCTCCATATCAACCGCTTTACTTACAGGTTTTCTTATTCATTTTATAAGAAATAT
CTTTCGTGTTCCTGAAGAAGCTAGCACAGCTTTGGTGTTCTCTTTATTATTTTCTATGAGTTTACTTTTT
CTAGTATTTCTCACGCGCAATGCTCACATAGGAACTGAACTTATCTTAGGTAATGCAGATTCATTAACTC
GTGGCGATATTTTGCCCGTGTATACCATCCTTTTGCTTAATCTATTCGTTTCTTTAATTGGTTTTCGTAG
TTTTGTTTGTGTTTCTTTTGATTCAGTATTCTCTTTTTCTTTAGGGATCCCTGTAAAAATCATCGATTAC
TTAATTATTTTGCAATTGTCAGCAAGCTTAGTAGGAGCATTCAGGGCTGTTGGAGTTTTAATGGCCTTAG
CTTTCTTATTAATTCCTGGGCTTATTGCTAAAGTGTTTGTTGTTTCTGTAAGGGGAATGCTTTTTTGGTC
TTTGATTTTCGGGTCTCTTACTGCATTAATCGCTCCTGCATGTTCTAGAGCAATTTTAACATCGTATGAT
GTGGGGTTATCAACTTCTGGTATTTCAGTTTTTATATTAATGTTTTTTTATATTTTCGTTTCTTTATTCC
ATTATGGTAAGAAATTAGCCTATAGAAGACTTTATTCAAAAAATAGCCCAAATACAGAATTGACAACTCT
CTAA
>ref|NC_003361.3|:498732-499871 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGAAACATTTAGCCATTTTAGGATCTACTGGAAGTATAGGGCAGCAGACTTTAAAAATTATCCGGTCTT
TGCCTCATTTATTCAAGGTTGTCGCTCTTGCTTCATACGGTAATAATAAGGATGTATTTTTCGAACAAAT
TCGAGAGTTTTCTCCTTCTATAGTTTCCGTATACGATGAACAATCTTATTTTGAGATTTCTAAAGAGTTT
CCTAATATCGAGGTATTCCTAGGTGAAGAAGGCTTGTTAGCAGCTGCTACGGCTGGGGAAGTCGATACTA
TTGTTGCTGCATCTTCAGGCGTTGTCGCTCTGCCAGCAATTATAGAAGCAATGAAATTAGGGAAAACCCT
AGCACTAGCAAATAAAGAAGTCTTAGTTTCTGCAGGTGAGATTATCAAAGAGATTGCTAAGCAATACCAA
ACGAGAATTTTGCCCATAGATAGTGAACATAATGCCTTGTATCAATGTTTAGAGGGAAAGAATACTTCTG
AAGTAAAAAAGTTAGTATTAACTGCTTCTGGAGGTCCTTTATTATACAAGTCTAAAGAAGATTTGAGCCG
TGTGACTATTCGAGATGTCTTGAAGCATCCTATATGGAATATGGGTGCCAAAATTACCGTGGACTCTTCG
ACATTGGTAAACAAAGGCTTAGAGATAATAGAAGCTTACTGGTTATTCGGATTGGAGAACGCAGAGATAG
ATGCTGTAGTTCATCCTCAAAGTTTAATCCATGGTATGGTAGAATTTCAGGACGGAACGGTGCTTTCTGT
AATGAATCCTCCCAGCATGCTCTTTCCTATACAACATGCATTAACCGCTCCGAAACGGTATCCAGCGCCT
CATAAAGGGATAGATTTTTCTGTAAAACAAACATTAGAATTTTTTCCTGTAGATGAAGAACGTTTCCCAA
GTATTGGTTTGGCTAGACAGGTATTAAGAGAGAAAGGATCCTCAGGACCATTTCTTAATGCCGCTAACGA
AGTCTTAGTTCAAAGATTTTTAACAGAAGAAATTGCTTGGTGCGATATTCTAGATAAGTTAACAAGACTT
ATGGAAAATTATAGAGTTTCTTCATGCTCTTCATTAGACGATGTCTTTGCAGTTGATAAAGAAGCTCGAG
CCCTTGCTCAAGAGATATAA
>ref|NC_003361.3|:499884-501752 zinc protease [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACAATAATATATTTTATTCTTGCAGCCCTTGCTTTGGGGGTTTTGGTATTGATCCATGAATTGGGTC
ATTTACTAGCAGCCAAGTCTGTAGGTATGACTGTTGAGAGTTTTAGTATTGGTTTTGGTCCGGCTTTATA
TAAAAAGAAGATTAGAAATATAGAATATCGTGTGGGTGTTTTCCCTTTTGGGGGTTATGTTCGTATCAAG
GGTATGGACAAAAGAGAAAAGGGTATGGCTGCTGACCCAGACTCTGTTTATGATATACCTCAAGGTTTTT
TCAGCAAATCCCCATGGAAAAGAATTATTGTTCTTGCTGCAGGTCCTGTGGCTAACATCTTATTAGCTTT
TGTAGCTTTTGGTGCCTTACATATCTCTGGAGGAAGAAGTAAAGCTTATTCTGAGTATTCCCGTATTGTT
GGATGGGCAAATCCTATTTTAAAAGAGAAAGGTTTAAACCTTGGAGATGAGATTATCACTTGCAACGGCA
AGCCTTATTATTCGGATAAAGATGCTATTACCTCGGCTTTATTAGATAAGCATCTATCATTGAATGGAGT
ACATCCTGCGTATCTTTCAAAAACTTCTAGTGAATTTTCTTTGGATGCAGAATTCAATGTGAATAAAAAT
GGTATCCCTCTTGCTGGAGCCAGCTATCTTTTATATCGTTCTCAAGAGCCTATTTCCAAAGAATCTCCTA
TGTATTCAGCGGATATATTACCAGGTGATCGGCTAGTATGGATGGATGGGCAAATCCTATTTTCTCCGAT
GCAAGTTTCACAGATGCTTAATGAAGCCTATGCTTTTGTTAAGGTTGCTCGTTATGATCAGGAACTATCA
TTACGCATTCCTAGAATGTTAGCGAGTACGTTGTATCTATCTCCTTACGTAAGGAATGAACTTATTGACA
ACCAATATGAAGCTGGCATTAAAGGTAAGTGGTCTTCTTTATATACTCTACCTTATGTGATCAATAGTTA
TGGTTACGTAGAAGGTGAGCTACAGCCTATAGATCCAGAATCTCCGTTTCCTCCTATGGAAGAGAAGTTG
GAGTTGGGAGATCGTATTATAGCTATAGATGGTACTCCTGTTAGTGGAAGTACGGACATCTTGCGTTTGG
TTCAGGACCATAAGGTATCTATAATTGTTCAAAAAATGGCTTCAGAGCAGTTAGAAGAGGTCGATTCTTC
ACTTGCTGATGAGAGGTTTATCCGTTCTTATAATGCTAAGGATCTATTAGCGATTATTAATTCCATAGGA
AGTACTCAAGGAGTACGAGAGTCAGGTCAGTATCGCTTGCTGCCTCCTGTTCAGCCTAAACCTTGGATAA
GTATTTATTCTGATGATCTTTTAAATAAACGTCGTGAAATGGCGAAAAAAATTAAGAATCAGGACCAACA
GCGTTATTATCTAGATAGAATAGAAGTAGAAAAACAAAAGCTATCTTTAGGGATCCCTTTGAAGGATATG
ACTGTAAAGTATAATCCTAGTCCAGATACTTTAATCATCAATATTTCTAAAGATAGTCTACGTACTATGA
AAGCTCTAGTCGTAGGGCGACTGAATCCTCAGTGGTTATCAGGACCCGTAGGGATTGTCCATATGCTACA
TAAAGGATGGTCATTAGGAATTTCAGAAGCGCTATTTTGGATTGGGTTGGTAAGTATCAATTTAGCTGTT
TTAAATCTTCTTCCTATTCCTGTATTGGACGGAGGCTATATTGTACTGTGCCTTTGGGAAATGATTTCAA
GGCGTCGTTTGAATATGAAGCTTGTTGAGAAGATGTTGATACCATTTTCTCTGTTATTGATAGCCTTCTT
TATTTTCCTAACGTTTCAGGATTTGTTCCGCTTTTTTGTTGCGAGTTAG
>ref|NC_003361.3|:c502683-501703 hypothetical protein CCA00443 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTCAAACTCTTCCTTCCGGAATTGATGGGATTAAGGAAACATCGCAGCAAAAAGAATCTGTAATCTGCGT
TCACGCATTTTTAAGATCTTACAGGTCATTAAAACCTATCGGTAATGTCTTAGAGAAAGAAAATTACGAC
GTATTTATCTGGAACTATGAAACTCGCAAATTTACATTAGAGAGACATGCGGATCATCTTGTTAAACTCA
TCAAAAAGATCGCGGAGTTAAAGCCTGGTGTCCCCATCAATTTCGTAACACATTCTATAGGAGGTGTTAT
TGTTCGTGTGGCCTTGGCAAAACCTGACTGCCCTCAAGAAGCAAAATGTGGTAAAGCTATACTTATGGCT
CCTCCAAATGCAGGATCTACATTAGCAAGACGTTATAGATCTTTAGCGCTTGTACAATTCGTTTTCGGAG
GTAAATTAGGCAGACAATTGCTCACCTATTGCCCAAGAAAAATGCTAGATGTTGGCAAACTGCCTTCTAC
AGTAGATGTTCTTATACTCAGTGGAAATAAACGCAGTAAGTTTCTCCCCTTCCGTTTAGAAAGCGAAAAT
GACGGAAAGGTATGCACATTTGAGACTCGCCTAGACACTCCTCACAAAGGGTACGTGATCAATACCAATC
ACACCTATATCATTGCAAACAAGAAATCTATTTTCCTTATGAGGGAGTTTTTAAAACACGGAAATAAAAC
CGCAGCTATAGAACAAGTCCCTGAAGAAATAGAGCAAAAAGTAAAGGAAAATAAACAAAAGAGCTCTAGA
CTAAATACGAGCAAAAACAAGGATATCTATGTTATCCATTGTTTTGGCTCTCATCCTTACAATCTCTATG
GTTTTCCAAAAACCTGGAAACCTAACTCGCAACAAAAAAGCGGAACAAATCCTGAAACGTTAGGAAAATA
A
>ref|NC_003361.3|:c503895-502792 recombination protein F [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAGATTCTTTCCCTGCGTCTTAAAAATTTTAGAAATTATAAAGAAGCTGAAGTTTCTTTATCTCCGG
ATATGAACTACATTTTTGGAGAAAATGCCCAGGGAAAAACAAATCTTCTTGAGGCCCTCTATGTTCTATC
TTTAGGTAGGTCTTTTCGTACTACACATCTCACAGAGGCTATTTTTTTTGGGTCTTCTCATTTCTTTTTG
GAGATGACCTTTGAAAAAGACGGGTTTTGTCATACACTATCTACCTACGTAGATAAGCAGGGGAAAAAAA
TTCTTTGTGATCACTCCCCTATAAAAACCCTATCGCAATTGATAGGTATGGTGCCTATCGTTCTATTTTC
TTCCAAAGATCGTTCTTTAATTTCTGGAGCTCCTGCAGATCGCAGGCTATTTCTTAATCTACTTCTATCT
CAATGCGATCCTCAATATAAACACACATTGTCTTATTATCACCGAGCGTTATTACAAAGAAATACCCTAC
TTAAAACTAAACAGACGTCTACGTTATCGGTTTGGGATGAACAACTTGCCACTCTAGGTGCTTATCTCAC
AGTAAGCCGGTATTTTTGCTGCGAACAATTAAATCAATTAGTTCAAGAATTATGGAGTAATTCTTTATCA
GAACAACTACGCATTAAATTTAAAAGCTCACTAATTAAACAAGGGAATCTTTCCCAAGAAGCTATTATTG
AAGAACTTCGTAAACAGCTAACAACAGCACTACATCGTGATTTAGAATTAGGGACAACATCCGTAGGCCC
CCATCGTGAGGACTTTACTTTAATGATTAATGACCTTTCTGTAGCACAATTTTCTAGTGAAGGTCAAAAA
CACAGTTTGCTTGCCATCCTTAGACTCGCAGAATGTCTTTATATAAAAAACATCTATAACGCATGTCCCT
TATTCTGTATGGATGACATTCATGCGGGATTGGACAATCATAGAATCTCACAACTACTCGACCTTGCTCC
TACTCTAGGGCAAACTTTAATGACCTCTACAAACATCCCTCATCAATCATTATCTGAAACTAGTAAGATC
TTTTCAGTTAATCAAGCTCAAATATCAATTCATTCACATTTAATTGTTAATTAG
>ref|NC_003361.3|:c504995-503895 DNA polymerase III subunit beta [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATACTCCTATCCCTGTGCTCACTCATGTCCTTATCGAAACATGTAATGATGAGCTCGTCTTTACAGCTAC
CGACCTCACTGTAAGCACCCGATGCGTAGCTCAGGCAAAAGTATATGAATCTGGAGCCATTTCCATCCCT
TCAAAAAGATTTTTTCAACTCGTGAAGGAATTAACAGAGGCGAATCTTGAAATCTCCGCAACTACTGGAG
AAATGGCGAAGATCACCTCAGGATCTTCTTGTTTCCGTCTACTTAGCATGGGAAAAGAAGACTTTCCTAT
GCTCCCTGACATCCAAAACGCTATAAGATTTACTCTCCCTGCTGAGCAACTCAGAGAGATGTTGCAGCGC
ACATCATTTGCTGTTTCTCGAGAAGAAAGTCGCTATGTTCTTACAGGAGTTTTATTAACAATTGCCAATG
GTATTGTTACTGTAGTAGGTACAGATGGGAAACGCTTAGCAAAGACGGATACAGAAATCTCCTTAGATAA
AAGCTTTATCGGCGATTATATTGTTCCTATTAAAGCTGTTGAAGAAATTATTAAGCTATGTTCCGAAGAT
TCTGAAGCTACAATCTTCTTAGATCAGGCAAAAATTGCTGTAGAATGTGGCAATACATTATTAATTACTA
AATTACTTTCTGGGGAATTCCCCGACTTTTCTCCAGTAATCTCTACAGAAAGTAGTGTGCAATTAGATCT
TCACAGAGAAGAGTTAATTACCTTGTTAAAACAGGTAGCATTATTCACTAATGAATCTTCGCATTCCGTG
AAGTTTACCTTTACTCCCGGAGAGCTCACCCTAACAGCAAACTGTACAAAAGTTGGTGAAGGGAAGGTCA
GTATGGCAGTAAACTACTCTGGAGAATTATTAGAAATTGCCTTCAATCCTTTCTTCTTCCTTGATATCTT
AAAGCATAGTAAAGACGAGTTAGTTCGCTTAGGCATTTCAGATTCCTATAATCCTGGAATCATTACCGAT
TCTACTCGTAGCCTATTCGTTATTATGCCAATGAGATTGCATGATGATTAA
>ref|NC_003361.3|:505234-505686 SsrA-binding protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCCAGTAAGGAAATTGTTTCTAACCGCAAAGCCTTACGCAATTACGAGGTTTTGGATACTTTAGAAG
CCGGAGTCGTGCTTACCGGGACCGAGATAAAATCGCTACGTGATCATGGAGGGAACCTTGGTGATGCTTA
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TATAATCATGAAGAACGAAGAAAGCGCAAGCTTCTTCTTCATAGATATGAGATTCGAAAATTAGAGGGGA
GAGTAGCTCAAAAGGGTATAACAATTATTCCTCTAGGGATGTTCCTTTCTCGCGGCTATGTAAAAATTCG
TCTTGGCTGCTGTCGTGGAAAGAAAGCTCATGATAAGCGACAAACGATCATAGCAAGAGAGAAGCAACGG
GAAGTGGAATCTGCTATGAAGCGTTATCGTTGA
>ref|NC_003361.3|:c506614-505667 thiamine biosynthesis lipoprotein [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGCTCACGACTTTGGAGGGAGAAAAAATGACAATGCCTTACCGCATTGTCATAGGGAAATATCTGTCACA
CGAAGAAAGCGAACAGCTAAAAAAAGAAATCGAAGCAGTATTTCATGTCATTGACACGGTCTATAATAAT
TGGAATAGAGAATCAGAAATCTCAAAAATCAATCACGCAGCTGCAGGGGTAGCTATTCCTCTATCTAAAG
AATTATGTGATTTCTTAAAGCAAGTAGACAGTTTTTATCGTATATCTAAGGGAAGATTCGATCCTACTTT
AGGACCGTTAAAAACTCTTTGGTTATTACATCTTAAACAACATTCGCTTCCTAATGAACACGTATGGAAA
TCTTATTACGAAAATTCAGGATGGAAACATATTGATCTTGATGTAACAAATCAAACACTTACCAAAAAAC
ATTCTGATGTACAACTCGACCTTTGTGGTGCGGTAAAAGGATTCGCTGTTGATTGCTTACTAGAAACTTG
TCAGCACTTTTGTGTTGATAGCTATGCAGAATGGGGAGGAGAAATTAAAATCTCAGGACGTCATCCCTCA
GGAAGGCCATGGCGTATTGCTTCCTCAGCGACCCCCGAAATTATAGAACTCAAAAATACTGCGGTTGCTA
CAAGTGGAAACTACTACCAACAATGGTCTGTAAATGGGAAAATCTATACCCATATCTTAGATCCTCATAC
AGGAAAGCCCTTAGAACAGCACGAGTACCCGATTATATCGGCAATGGTTATTCACCCGAGTTGCGCTTTT
GCTGATGCGATGGCTACGGTACTCATGACCTTTTCAACAAAAACAGAGGCTTTGGCCTGGGCAAAAGAAA
ATCACATTGAAGCTTTTATCAACGATAACGCTTCATAG
>ref|NC_003361.3|:c507447-506584 methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase [Chlamydophila caviae GPIC]
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CAACACGTCCAGGTCTTGCAGTAGTGCTCATCGGTAATGATCCGGCATCTGAAGTTTACGTCGGTATGAA
GGTAAAAAAAGCTACAGATCTCGGCATGGTCTCCAAAGCTCATAGGTTATCTTCTGACGCTACGCTTACT
GATATCCTTAAACTTATTGACAGACTCAATAATGATCCGATGATCCATGGGATTTTAGTACAAATCCCCC
TACCAAAGCATTTAGATGCCAATGCTGTAATTCAAGCGATCTCTCCAGAAAAAGATGTCGATGGTCTTCA
CCCCATTAATATGGGAAAGCTTCTCTTAGGACAGCTGGGAGGTTTTGCTCCCTGCACACCTGCAGGGATT
ATAGAGTTATTGCATTACTATGAAATTCCTCTTCATGGACGTCATGTTGCAGTTGTGGGAAGAAGCAATA
TTGTCGGCAAGCCTTTGGCGGCTATGTTGATGCAAAAACATCCTTCAACGAATGCTACAGTCACCCTACT
TCATAGCCAATCAGAAAACCTTACGGAGATTTTAAAAACAGCGGATATTATCATTGCTGCTGTTGGCGTT
CCTTTATTTATTAAAGAAACTATGATCTCTTCTCACGCTATTGTTGTTGATGTCGGGACATCACGAGTCG
CTGCAAATAATGACAAAGGGTATACGTTAGTTGGCGATGTAGATTTCAATAATGTCGTTGCCAAATGCAA
AGCCGTTTCCCCAGTCCCTGGAGGCGTAGGGCCTATGACTGTGGCCATGCTGATGAAAAATACATGGGAA
AGTTACAAAAAATCCTCATCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c507953-507438 hypothetical protein CCA00449 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGACCGGTTAGTATCTTTTCAGTGCCTTGTTCTCTCTGTATTGAGTTTCTTTATCCTCCCTCAATACT
CCCCTAATCTCTGTCCTATTTTCTTTTCCCCTTATCTCGTCGCTAACTTTTATAGATTACAAAAACGAGA
GCTGTTGGTTCATGCGCTCATCATAGGTCTGTTTTGCGATATAGGCTCTTCGTATCTCTTTGGAATTCAT
TCGTTTCTGTATATCGCAACGTCGGCGCTTCTCTATAAAATGCATAAAATTTTTCTTAAGGATAAGTGGT
TATCGCTCCCCCTCATTAATTCTATATTTGCCCTAGTATTTTCTTATTTTTCCTATCCAACGCTAGCCTT
CTTTAACCATAAAATTAATTGGAGCCTACATTCCCTATTCCTGGATGCAAAACATGCTTTTACTATCGAC
TTCATCTATAGCGGAATAATTTACCTACTCCCTTGTACAATAACTCAAGGAATCCGTAAGATGAGAGGCT
TCTTAAGGAGTCGTTCATGTTATTAA
>ref|NC_003361.3|:508155-508445 LtuB protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGCGGGACAAAGAAGAAAAGAAGTAAACGGGATTTGTCTCGGGTGATTCAGAAGAAGACAGAACAGC
TTCTGAACAAGCCTAAAAAATTACAAGGAAAGAAGTCTAAGTTATTTATTTCTAAAGATCAAAAGCAGCT
TCGCCATCGTGCCGAGGAGTATGATAATTTAGTACGTTCCCTATTAGCTAGGAAAGATCAGGATACGAAT
CGTGTTTTAATTTTTAATTATCAGGACGGTTTTGTTTTCACTGATATGAATAATTTCGGAAAGTATTCCA
TAAAGCTATAG
>ref|NC_003361.3|:508818-510557 hypothetical protein CCA00451 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGCAGCCTGAGTCATTATCAGGACCTAAAGAATCTATATTTTCTGAGACACAAGAGGCTTCTTCTAGAAA
ACAGGAGGCTATGATCCAGTCTGGAGCCACTGCAAATTATGAAACGGATCTGCAGATTAATGAGGGAAAA
TACCGAAAGACTCAGGAAAAAGCCTCATCATCTCCTAAATCAAAGTTGCGTGGAAGCTTTTCCAAGGTGC
GTGCGAGTATTCAGGGATTTCTCTCGGGGTTTGGTACGCGAGCCTCTAGAGTTTCTGCCCGTAAGGCAGA
AGCTGGTGGAGAGGGGAGATCCATGTTGCCTAGCGATATGGAAATGGTCGGTAAGAAGGGAAACCGCATT
TCCCCGGAAATGCAAGGATTTTATCTAGATGCATCGGGAATTAGCGATACCTCATCTGATGTTTCTAAGC
TTTCTCTAGAGTCGTTACGTTCCACATCCTTAGGCTCACTCTCTGGATTAAGGGAAGATATCAGTGCCGC
AGAAACTTCTTCTATAGCTTCATTTGGTTCATTTCAGACGGCTAGAACACCCATAACGGAATCTACAGTG
ACTGCTTGGACAGTAAATCGTCTAGGTGGGGAAATGATTAGCACAATCTTAGATCCCAATATAGAGACTT
CTTCTTTATTACGCAGAGCATCTCTTGTAGGCAACGAGGGTATGGTAGATCTATCGGATTTAGAGAATCG
TAGTCTTAGCACAGATACTCGGGCAGAAAATACTTCAAAAAATACAAAAATTATTGATTCGGGTCGCGAT
GCTGGAAAGCTAGAAGAGGTGGACCTAGAGGGATCGGGGATTTTAGAGACCGCGACTAAAGAAGCTGAAA
AGAAAGAAAGTCGGGAAGATCTTATAAAAGATCAACTTGCCTTAGCAAAAATGATGGAGAGTTTGCTTGC
TTCTGGAGCTCCTTCATCTGTTTATGTGCCTTTAGGGGCTACGTGGTCAGGAGGGAGTACAAACTTCCCA
GCTCCAAAATTTTCTGGAACAGTGATACACAGTTATAATGATAAACCGCAGCATTCTCCTATAGGAATCT
CTAGTAATCAAGGGCATACCAATTTTTCTTCTCCGCATATATCCGGAAATATGGTAAAAGTTTCTCCAAC
ATTTACGGAACACAGTGAAAAACCCTACCGTTTTCCTCTGCATCCCTCTTCCGATGATCGTGTGCCAGAT
CTCACTGATGAGGGAGCTGTAAGCTTTTCTGCTTTGTCCGATGTGGACCCGGTATTTTCACCAGTTTCTG
AAGAAAACCCAGTGCCGAGATACAATCCCTCCGCAGGGGCTATGGGATTTGATACGGTAAGTTCGGCCTA
TTTATTTTCTTCTCATCAGGGGATGTCTTTACTAGCCCCGCTACCTCGTTCTTTATCTGAGTATAAACAC
GAAGTTGAGAAGAGAAAGGGGCCTGGAGCACCTCCAGATCCCTTAATTTATCAATACCGTAACGTGGCTA
TAGATCCACCTTTGATTTTTAGATCCCCACAACCATTCGCTTCTTCATCGCGTCTAGGGGTTCAAGGAAA
ACCTGAGGCTGCTTCCGTGCACGATGATGGGGGAGGATCCGGTGGAGGATTTTCAGGACAAAATCGGGAT
CAAGATAACAGGCGTTTTTCTGGTGGAGATGAAAAAAGCAAATCTAAGGAGTTAGGTTAG
>ref|NC_003361.3|:510568-511053 hypothetical protein CCA00452 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATATACCTTTAAATCAGAAGATTTCTGATGAAATAGCTAAAAATGAAGCTATGCGTTTGGCTTTGCTTGC
TATTACTGATCAAGAAAAAGACAAAAGAAAGAGAAAACATCGGTTTAAAATTCTTAACCGCAAACAAGCA
AAAGTGCTCCTATCTCAATTGCGAAATGTAGATTTAGACTTTCAAAGTTTGAAAAATGCTGGTTTAAAAG
AAGAAGAAGATAACGAAGAAGATAATGAAGAATCTTCAAAACAAGGGAAAACTTTCCATATTGCTAGTAG
TAAGAAGCCTGTGAAGATAGGGGCATCTGCAGCTCAGGCTATTGCTGATGCTGCAGAGGCTTGGGTTATT
GCTCGCAATAGAGGAGTCTTGGATATGGCCTCCCTATTATTCTGGCATAAAGATGATGAGTGTTAA
>ref|NC_003361.3|:c512105-511050 phospholipase D family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTACAAAATCGCAAGCTCCCGATACATTTCAAACCTTTACTGCTTCGCAAGAGCCTGTAATTTATTCCAA
GCAGTGTGGGGATGACACTCTTAAGGTGCTTTGCGATGCTATAGACTCTGCCCAGACAAGCATATTTCTT
CGTATTTATCGTCTGAGCGCTCCTGAGATTTTTACAAGCCTCGCCAATCAAGCTAGGGCAAAACGTAATG
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GCATCCTGCAGAGGGAAGAAAGCTAATGCATCAAAAAGCACTAGCAATAGATGACAAACATGCTTGGCTA
GGATCAGCAAACTATACACATACTTCCTTTCTTCAAGATAGCAACTTGATCATTGGTTTAAAAAGTAAGG
AACTTTGTCGCTACATTAAGGATGAATCTTGTGGGCAATGTGTGATTCATGGCCAAAATGCACAATATTT
TTCTCTACCTGGGGACCAAGGAAAGGCTTTATCAGCGGTATTGCGGACATTGAGAACAGCGCAAAAAACC
ATCCGTTTGGCTATGTTTGCCTTAACCTATCCTCCAGTATTTCGTGAGCTTAATGAAGCAAAAAAACGTG
GTGTAGATGTAAAAATCCTGATTGATAAAGATTTTAAGAAATTATCGATAAAGCAGATTCAAGCTTTAAA
AGATTCTAATCTCTCACTACACACAAAAACAACACGTTATCGTCTACATCATAAATTTGCTGTTGTAGAT
CAAAAAATTCTCATTGCGGGGTCTGTAAACTGGTCAGAAGCTGGTTTTTGCATAAATTCAGAAGACATGC
TTATCCTAGATAATCTTACAGACAAGCAGCTAAAGAAATTGGACAAAATCTGGAAAGATTTAGAGAAACA
AAGTTCCCTAACCTATCCAGTTAGTGATGGAGATGAAAAGGTCATTCAGCTGCCTGAAGAAAAATGCGCT
GCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c513956-512211 hypothetical protein CCA00454 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCTATGTCTTCCTTAAGACGTCTTGTTTCCCTTTTGCGTTCCCAAAACGACCTTATCGATATCTTTG
CTCCTGTAGATCCTTATTTGGAGCTCCCTGAGATTCATCGTAGGGTCATTGAAAATCAGGGTCCCGCTCT
TTTATTTCATAATGTTCAAGGGGCTTCTTTCCCTGTTCTTACCAATCTCTTTGGCACGCAAAAGCGTGTA
GATCAGATCTTTTCTAAGGTCCCTAAAGGTTTAATTCCTCAAGTCATTCATTTACTATCTTCTCCTCCTA
AGCTATCGCAGTTATGGAAACATCGCAATTTGTTACTTCGAGGGCTATCTCTAGGGTTACGCAAAGCGCG
TTTCCTAAAATTTCCTCATAAGAAGATGGCTTCTGTAGATTTACATCAGTTGCCTATGCTGACAAGCTGG
CCTGAAGATGGGGGTGCTTTTCTTACACTTCCTTTGGTCTATACGGAATCTCCTAGTTCTAAAATTCCTA
ACTTAGGAATGTATCGCATGCAAAGGTTTGATCGCGATACTTTAGGCTTGCATTTCCAAATCCAAAAAGG
TGGTGGGATGCATTTTTATGAAGCAGAACAAAAGAATGAAAACCTTCCGGTTACTGTATTTTTATCAGGG
AATCCCTTCTTGATACTTTCTGCAATAGCTCCTTTACCTGAAAACATCTCAGAACTTCTCCTTTGTACAT
TTTTACAAGGATCAAAATTGCATTATAAAAATGATCCTGATACCCCTCATCCCCTACTTTATGATTCTGA
ATTTATCCTGATAGGAGAGGGTATTTGCAATGAACGTAGGCCTGAAGGCCCTTTCGGAGATCATTTTGGT
TATTATAGCCTTCAACATGACTTCCCAGCATTTAAATGTAGGAAGATCTATCATCGAAAAGACGCTATTT
ATCCTGCGACAATCGTAGGCAAACCTTATCAAGAAGATTTCTATTTAGGAAATAAGCTTCAGGAATACCT
CTCGCCTTTATTCCCTATGGTCATGCCAGGAGTCAGACAGTTAAAAAGTTACGGAGAAGCAGGATTTCAT
GCATTAACAGGAGCTGTTGTTAAAGAGCGTTATTGGAAAGAATCCCTAGCAACCTCTTTAAGGATTCTTG
GAGAAGGACAATTATCGCTAACAAAATTCCTGATGATTACAGATCACCACGTGGATCTCGATAACTTCCC
TAAACTTCTAGAAACCATACTATCACGCATTGTTCCCGAGCGTGATTTGATTATCTTTTCGGAAACATCA
AATGACACCCTAGATTATACAGGACCTAAATTAAATAAAGGCTCTAAAGCTATTTTCATGGGCATAGGCC
CCGCAATTCGTGATCTTCCACATAAATATCGGGGAAAATCTCTCCCTAATATCACTAATATGGGAACTTT
TTGTCCTGGTTGTCTCGTTTTAGAAACTACACTACAACAAGTAAATATTGATGCGTTATTAAATCACCCC
GACCTCAGCTCGTGGCCTCTCGTTGTTCTTACAGAAAATCTAAACGAGACACTAGCCAGCTCGAAAGATT
TTCTTTGGAAAACATTTACACGTCTCGCACCAGCGACAGATCTACATGTTCGTTTTAGTAATGTCGCCCA
TCATAGACCAAACTATACCTTCCCGATCTTACTTAATTCACTCATGAAGCCTCACTATCCCAAAGAAGTC
GAAGCCGATGAAACAACTATTCAAAAAGTTTCTCATCGATGGAATGAGTATTTCCCTAAATACTAA
>ref|NC_003361.3|:c514244-513975 50S ribosomal protein L28 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCAAGAAAGTGTCCACTTACTGGAAAAAGACCTCGCCGTGGCAATAGCTACACCATCCGAGGTATTG
CGAAAAAGAAAAAAGGAATTGGTTTAAAAGTTACAGGGAAAACCCCACGCCGTTTCTTCCCTAATATGAT
CACCAAGAGACTTTGGTCTACAGAAGAGAACAAGTTCCTTAAACTTAAAATCTCCACCTCTGCCCTACGT
CTTATCGACAAGCTTGGCTTAGAGAAAGTAATCGCAAGAGCTAAAAGCAAAGGCTTATAG
>ref|NC_003361.3|:c516006-514414 4-alpha-glucanotransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACTCCATTTTCTAAAGCTCTACGTTGTATCCAGAATTCTCCAGCAAAGCAAAGCTGGAAAACTCTAG
GAATCATGCCCAAACATGGGATTTGCCTTCCTCTATTTTCCCTACATACAAGAAATAGCTGTGGTATCGG
AGAGTTTTTAGATCTCATTCCTATGATCTCCTGGTGCCGAAAACACGGATTTCAAATCATACAAATTCTT
CCTATTAACGATAGCGGTGAAGATAGCAGCCCGTACAATAGCATATCTTCAGTAGCACTCAACCCCCTGT
ATCTTTCCTTAGCAAGCCTTCCCCATGCCCAATCAGTTGCCTATGCGAATGCTAAGCTAAGAACTATGCA
GCAGCTCTCTAAACTGCCCTACGTACATTATCCACAAGTCAAAGCTGCTAAATGGGAGTTCCTCCGTGAC
TATTACCAATATGTCGTCAAAATCGGAGCTTTAAAAGACGAAGATTTCGAAATTTTTTGTGAAAAGGAAA
AGTATTGGCTACGCCCCTACACAGTATTTCGCTCTATTAAATACCACCTAAAAGGAGCCCCAGTAAACAA
CTGGCCCAAAGCCTACACAGACATTAAGAACTTCACGGAATTTGAAAAACAATTTCAAGATGAGTGCAGC
TTTTTTTCCTATCTGCAATATCTCTGCTTTCAGCAAATGTCCCAGGTAAAAGCTTTTGCAGATGATAACC
ACGTTTTCCTTAAAGGAGATCTTCCCATCCTTATCAGTAAGGATAGTTGTGATGTTTGGTATTATAGACA
GTTCTTTTCCTCTTCAGGATCTGCTGGAGCCCCTCCAGATATTTACAATACAGAAGGGCAAAACTGGCAT
CTTCCTATCTATAATATGCATAACCTTGTTCAAGATAACTACACTTGGTGGAAAGCTCGTCTACGTTATG
CAGAAAATTTTTATTCTCTATACAGGCTGGATCATATCGTAGGGCTCTTTCGCTTGTGGGTGTGGGATAC
TTCAGGAAATGGAAAATTTCAACCTGACGACCCTAAAGAATATCTCCCCCAGGGAACGGATATACTGACG
CAGATTCTACGTGCATCTCGTATGCTTCCCATAGGAGAAGACCTTGGAAGCGTACCTACTGATGTCAAAG
AAACATTAGTAAAACTAGGGATATGTGGAACGAGAATTCCTCGATGGGAGCGTAATTGGGAAGGAGATGG
AAACTTTATTCCTCTAGGGGAATATTCCCCACTTTCAGTAACCTCATTATCTACGCATGATTCCGACACG
CTGGCTCTTTGGTGGCGGCACGCTCCGAAAGAAGCTCAAAAATTTGCACAATTTCTAGGAATGTTTTTCA
CCCCGGTCCTAGCTGAGGAAGATCAAAAACATATTCTCACGTTGTCTCATAAGACTTCGTCTATTTTTCA
CATTAATTTAATTAATGACTACCTTGCTCTCTGTCCCGATTTAGTATCCAATAATCTAAAGTATGAACGC
ATAAATATGCCAGGGACCGTATCAAAAAATAATTGGGTTTACAGGATCAAACCTTCCGTGGAAGAAATCC
TGACTCATGATGCATTCAACGCAAATATAGCGGATATCTTTTCCAAGATTTAG
>ref|NC_003361.3|:c516503-516063 type III secretion chaperone [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCAAAATCAATTCGAACAACTTCTCGAGTCTTTAGGAACAAAACTGAATACCTCTTTGGTTCCTGATA
AAAACCAAGCATGTCTGATTCGTTTTAGCGCTACTCAGGTTCCCGTACAACTTGAAGAAGATGGTAATTC
TGGTGATATTGCTGTAGGTACAATCCTTGGACCGCTTCCTGAAAATGTATTCCGTGAACGCATTTTCAAA
GCTGCTCTTTCTGTAAACGCCTCTCCTCAATCAAACATTAAAGGGATTCTTGGCTATGGAGAAATTTCTC
AACAGCTATATCTATCTGATGTTTTAAATATGAGCTATCTGAATGGGGATAAGCTTTTCCACTACTTAAA
TCTTTTTTCGATGCATGCAAAAATTTGGATTGCTGCTTTAGAAACTGGCAATCTTCCTGATCTACATGTC
TTAGGTATGTACCATCTATAA
>ref|NC_003361.3|:c517712-516519 copN protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCTGCATCTGGAGGAGCTGGTGGCTTAGGCGGTTCACAAGCTGTTGACGTTGCGCAAGTGCAAGCTG
CAGCTGCGAAAGCTGATGCCCAAGAAGTTATCGCTAGCCAAGAGCAATCCGACATCAGTATGATTAAGGA
TTCTCAGGATTTATCAAATCCTCAGGCTGCGACACGTACAAAGAAAAAAGAAGAAAAATTCCAAACTCTA
GAATCTAGAAGGAAAGGCGCGACTCAAGCAGAGAAAAAGTCTGAAAGCACGGGAGATAAATCCGACGCGG
ATCTTGCGGATAAGTATACAGAAAATAATGCTGAAATCTCAGGTCAAGATTTACGCAGTATCCGAGATTC
TTTGCATGATGGTTCTTCCGAAGAAGATGTTTTAGATCTTGTAAAATCTAAGTTCTCTGATCCTGCGCTT
CAAAGTGTTGCCCTAGATTATTTAGTCCAGACAACACCAGCTTCTAAAGGAGCTTTAAAAGACACCTTAA
TCAGGGCACAACAAAACCACATGCAACAAAATCGACAAGCTGTTGTTGGTGGTAAAAATATTCTATTTGC
CTCTCAAGAGTATGCATCTTTATTAAATACCTCTGCTCCAGGATTACGTGCTCTTTATCTTGAGGTAACG
TCTGATTTCCATTCTTGTGAGCAATTACTAACATCTCTCCAGTCACGTTATAGTTACGAAGAAATGGGCA
CTGTTTCCTCTTTCATACTTAAGGGGATGGCTGCTGATTTAAAATCTGAAGGATCTTCAATTCCAGCTCC
GAAACTACAGGTGATGATGACAGAAACTCGTAACCTTCAAGCTGTGCTTACTGGTTATCATTTCTTTGAG
ACAAAGCTACCAACACTTACCGCATCTTTAAAAGCCGATGGGGTAACAGTTCCGGATCTTAAATTTGATA
AAGTAGCCGATACTTTCTTTAAGTTAATCAATGATAAATTCCCTACGGCTTCAAAAATGGAGCGCGGTGT
CCGTGACCTTATTGGCGACGATACAGAAGCTGTTACAGGGATGCTCAACCTCTTCTTTGTTGCTTTAAGG
GGGACATCCCCAAGATTATTTGCTTCAGCAGAAAAGCGTCAGCAATTAGGCACAATGATGGCTAATGCTT
TAGATGCTGTGAATATTAACAACGAAGATTACCCAAAATCTACAGACTTCCCCAAACCTTATCCCTGGTC
TTAA
>ref|NC_003361.3|:c519872-517743 type III secretion inner membrane protein SctV [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAACAAGTTACTCAATTTTGTCAGTAGAACCTTTGGGGGAGAAGCAGCCCTAAACATGATCAATAAAT
CGAGTGACCTCATCCTGGCTCTATGGATGATAGGCGTCGTTTTAATGATCATCTTGCCCCTGCCTCCGAC
TATTGTCGACTTGATGATCACTATCAACTTGGCGGTGTCTGTCTTCCTATTGATGGTGGCTTTGTATATC
CCTAGCGCTCTACAATTATCGGTTTTCCCCTCTCTACTTCTAATTACAACAATGTTTCGTTTGGGAATTA
ACATTTCCTCATCGAGACAGATTCTCCTTAAAGCATATGCTGGACACGTCATTCAAGCCTTCGGAGACTT
TGTTGTTGGAGGGAACTACGTTGTTGGATTTATTATCTTCTTAATCATTACGATTATTCAGTTTATCGTT
GTTACCAAAGGTGCTGAGCGTGTTGCCGAGGTTGCTGCGAGATTCCGATTAGATGCTATGCCTGGTAAGC
AGATGGCTATTGACGCCGATTTGCGCGCAGGAATGATTGATGCTCAACAAGCTCGTGATAAACGAGGAAT
GATTCAGAAGGAAAGTGAGCTTTATGGAGCCATGGACGGTGCTATGAAGTTCATTAAAGGGGACGTTATC
GCTGGTATCGTTATCTCTTTAATTAACATCGTTGGTGGTTTGACCATTGGTGTCGCCATGCACGGTATGG
ACCTTGCTCAAGCTGCACACGTCTACACTCTTTTATCTATCGGTGATGGATTAGTCTCTCAGATTCCTTC
ACTACTTATCTCTTTAACTGCTGGTATCGTGACTACTCGAGTTTCTAGTGACAAAAACACGAACTTGGGT
AAAGAGATTTCTTCTCAATTAGTTAAAGAACCTAGAGCGTTGCTCCTCGCTGGCGCAGCAACTTTAGGTG
TGGGCTTCTTTAAAGGCTTCCCACTTTGGTCATTCTCCATTCTCGCTTTCATCTTCGGCCTGCTTGGAGT
TATCCTTCTTGCTAAGAAAAATAACGCCTCTAAAAAAGGTGCATCGGGAGCAACAACAACGGTGGGGGCT
GCTGCCGATGGAGCAGCAACAGCTGGCGACAATCCAGACGATTATGCGCTAACCCTCCCTGTCATTTTAG
AGTTAGGAAAAGATCTATCTAAGTTAATTCAACAGAGAACAAAATCTGGTCAAAGCTTCATTGATGATAT
GATCCCTAAAATGCGTCAGGCTTTGTATCAAGATATCGGTATCCGTTATCCAGGAATTCACGTACGTACT
GATTCTCCTTCATTAGAAGGGTACGACTACATGATCCTTCTTAATGAAGTTCCTTATGTTCGAGGTAAGG
TACCTCCAAATCACGTATTGACTAATGAAGTAGAAGAGAATCTTAAAAGATATAACCTCCCCTTCATTAC
CTATAAAAATGCTGCGGGACTACCTTCAGCTTGGGTTAGTGAAGATGCTAAAACCATTCTCGAAAAAGCA
GCTATTAAATACTGGACACCTTTAGAAGTAATTATTCTTCATCTTTCGTACTTCTTCCATAGAAGCTCTC
AAGAGTTCTTGGGAATTCAAGAAGTGCGCTCTATGATTGAATTTATGGAACGTTCCTTCCCTGATCTCGT
TAAGGAAGTTACCCGCCTTATTCCTCTACAAAAACTTACAGAGATTTTCAAACGTCTAGTCCAAGAGCAA
ATCTCTATTAAGGATTTGCGCACGATTTTAGAATCATTAAGTGAATGGGCTCAGACAGAAAAAGATACCG
TATTACTTACTGAATACGTACGTTCTTCTCTTAAACTCTATATTAGCTTTAAATTTTCTCAGGGCCAATC
TGCAATTTCTGTCTATTTATTAGATCCAGAAATTGAAGAAATGATCCGTGGAGCAATTAAGCAAACTTCT
GCGGGATCTTATCTTGCCTTGGATCCTGATTCTGTAAATCTCATCTTAAAATCTATGAGAAATACAATTA
CGCCAACACCTCCTGGAGGTCAGCCTCCTGTGCTGTTGACAGCAATTGACGTAAGACGATATGTAAGGAA
ATTAATAGAGACAGAATTCCCTGATATCGCTGTGATTTCTTATCAAGAGATTCTCCCAGAGATTCGCATC
CAGCCATTAGGAAGAATTCAGATTTTCTAA
>ref|NC_003361.3|:c520954-519872 type III secretion system protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGGTGAAAAAACAGAAAAGGCGACCCCGAAGCGTCTTAGAGACGCCAGGAAAAAAGGCCAGGTAGCAA
AATCTCAAGATTTTCCTTCCGCGGTTACCTTTATCGTTTCGATGTTCACGACATTTTCTCTAGCATCGTT
TTTCGCAAAACATCTTGGTAGTTTTCTAGTTTCTATTTTTAAGCAAGCCCCTATAAATCATGACCCTAAA
GTCACGCTATACTATTTACAAAATTGCTTAGTTTTAATTCTAACCACTTCCCTTCCCCTACTTGGTGCTG
TGGGATTTGTCGGTATTATTGTCGGATTTCTTGTTGTAGGCCCAACTTTTTCTACAGAGGTTTTTAAGCC
TGACTTAAAAAAGTTCAATCCTATTGACAACTTGAAACAAAAATTCAAGGTGAAGACTTTAATCGAGTTA
CTGAAGTCCATTTTGAAAATTTTTGGCGCTGCGTTAATCTTATACGTTACGTTAAAAAATCGCGTGCCTT
TGATCATAGAAACTGCAGGAGTCTCTCCAATTGTTATTGCTGTGATCTTTAAACAGATACTTTATAAGGC
AGTCACCTCAATTGGCATTTTTTTCTTAGTCGTTGCTGTTCTTGACTTAGTGTATCAAAGAAAGAACTTC
GCTAAAGAACTAAAAATGGAAAAGTTTGAGGTTAAACAGGAATTTAAGGATACAGAAGGTAATCCAGAGA
TTAAAGGACGCCGTCGTCAGATTGCTCAAGAAATCGCTTATGAAGACACCTCTTCTCAAATCAAACACGC
GAGTGCGGTGGTCTCTAATCCCAAGGATATAGCTGTAGCTATCGGTTACATGCCGGAAAAATATAAAGCT
CCGTGGATTATTGCCATGGGAATTAATTTACGTGCAAAAAGAATTATCGTAGAAGCTGAGAAATATGGTG
TTCCTATTATGAGGAACGTACCTTTGGCGCATCAGCTTTGGGATGAAGGAAAAGAGTTGAAGTTTATTCC
AGAGTCGACGTATGAAGCTATTGGAGAAATCCTTCTCTACATCACTTCTCTTAATGCACAAAATCCTAAC
AATAAAAATATTAACCAACCCGATAATCTATAA
>ref|NC_003361.3|:521317-522411 translation-associated GTPase [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTGGAGCGCAAGTAGCTTCTTGTAACTATCCCTTTTGTACAATTGATCCGAATGTTGGCATTGTTCCGGT
TATTGATAACCGTTTAGACGTTTTGGCTAAGATGAGTCAAAGTCAGAAGGTTATTTATGCCGATATGAAG
TTTGTCGACATAGCAGGTTTGGTCAAAGGGGCCGCTGACGGCGCAGGATTAGGCAATAGGTTTCTCTCTC
ATATTCGAGAAACGCATGCTATAGCGCACGTTGTTCGCTGCTTTGACAACGATGACGTTACCCATGTCTC
TGGAAAGATAGATCCTGCTGATGATATTTCTGTGATAAATCTTGAGTTAATCTTCGCTGATTTTTCCTCA
GCAACAAGTATTCATAGCAAATTAGAAAAGCAAGCTAAGGGTAAAAAAGACCTTGGGGTTGTCCTGCCAT
TGCTAGATAGAGTGATTAAGCATTTAGAAAGTGGTCAGCCTGTACGTACATTAGACTTATCTCCTGAAGA
ACAGATACAGTTAAAGCCCTATCCTTTTTTAACAGCAAAGCCGATGTTATATATAGCCAATATCGGAGAG
GACTCTATAGCAACTATGCATAATGATTACGTTGCTATTGTTCAAGAGGTGGCTAAGAAGGAAAACGCTC
AAGTAGTTCCTATTTGTGTTCAGCTGGAAGAAGAGGTGATTTCTCTTCCTGTAGAAGAACGTCAGGATTT
TTTAAATAGTCTGGGGCTTCAAGAATCGGGATTGAATCGATTAGTCCGCGCTGCGTACCATACGCTTGGA
TTGATTTCCTACTTTACGACTGGACCTCAAGAAACACGAGCTTGGACGATTCCTATAGGATCAACGGCTG
CAGAAGCTGCAGGTCAGATTCACACTGACATCCAAAAAGGATTTATTCGTGCAGAAGTTGTCACTCTTGA
AGATATGATAGCTTATGAAGGGCGCTCCGGAGTCCGTGAGGCGGGTAGATTACGCGCCGAAGGTAGAGAC
TATATTGTTCAAGACGGCGATATTATGCTTTTCTTGCATAATTAG
>ref|NC_003361.3|:c523303-522389 bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGAAATACTCTATAGTTTAGCAACGGTCCCTTCTTCTGTGGATTCTATAACTATAGGTTTTTTTGATG
GTTGTCATTTAGGTCATAAGCAGTTGCTTACTGTCTTGTCTTCTTATTCAGGGACATCTGGAATCATTAC
CTTTGATTTACACCCTCGATCGATTTTACAACCATCCCTCCCCAAGCTAATTACAAGCACAAGGGAAAGG
TTCCTGCTTCTACAGGATTTTCAGATAGATTATTTATATATCCTTCCCTTTTCGAAAAGTTTTGCTGATC
AATCTGCTGAGAGCTTCATACTTTCCTTACATCAAATTTTAAAATGCAAACGTTTAATATTAGGGTACGA
CTCTAAATTGGGTAAGGACGGGCAAGGAGACGCTGTAACATTGAAACCTCTGGCTGATTCTTTAGGAATA
GAAATCATCGAGGTTCCTCCGTATAAAATTGATAATGAGATTGTATCCAGTAAAAGAATTCGGCAATTCT
TAATCCAAGGTGATTTAGATAGTGCGAATCGTCATTTAGGACATTCCTATAAATATGTAGGGAAAATCGA
AACAGGTTATGGATTAGGAATACAATTAGGGGTGGCTACCATTAACCTGCCTCAAGAGCAGTGTTTGCTT
CCCTATGGAGTGTATGCATGCGAAATAGAACACAATTCTATAACATACCAAGGGATTATGAATCTCGGAG
AAGCCCCTACAGTAGGGAGAAATTCCTTATGTCTAGAAGCACATCTCTTTGATTTTTCGGGAAACTTATA
TGGTGAGACAGTTTCTGTGATTCCTAGAAAATTCCTTCGTGAAGAAAAAAAATTCCCTTCCAGAGAAGAT
TTATCAAAAGCTATACGTAAAGATATCGCTGAAGCTAAGGCGTTTTTTACTACTAATTATGCAAGAAAAG
CATAA
>ref|NC_003361.3|:c524397-524035 ribosome-binding factor A [Chlamydophila caviae GPIC]
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AAGATGTAAAGCACCCGAAAATCTCTAATCAATGGATTACGGTTACTAGGGTCTGTTTGTCTAAAGATTT
ACATTCGGCTCGTGTCTATGTTTCTATTATGCCTCATGAAAATACATCAGCAGAAACTTTGGACGCACTA
AAGGCATCGGCAGGATTCATTGCTTATAAGGCTTCTAAAGGTGTTGTGCTCAAGTATTTTCCTGAGATAC
ATTTTTATATCGAAGATATTTTTTCTCCTCAGGATCATATAGAAAACTTGCTCTGGAAAATACGAGAACA
AGATAAGAATTAA
>ref|NC_003361.3|:c527067-524404 translation initiation factor IF-2 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGAGAAGGCAAAGTTGACGAAAAACCTAAAATTGAAGATTAAAAACGCTCAATTAACGAAAGCTGCTG
GATTAGACAAGTTAAAGCAAAAATTAGCTCAGGCAGGATCTTCAGAAACGAAAAGCTCTTCAGAAAAGCC
TTCAACTAAGGTTCCTGAAAAAATTGCAAAAGAAAAAGTCGTGAAGAAAAAGAGTGTTGTAGATCCGGGT
GTGCCTACGATGACTGAACCTGTCTCTGCTGAAAATTCTCCACGTAGAATTCGAGCTAAAAATCATTCAT
CGTTTGTATCTGAAGATCTAAACTCTCCACAGCCTCCTGTTCCCGTGGATTCTGATGCGTCTGCATTTTC
AGATTCTGCGGTAGTGGAAGAAGTAGATTCTTTCGTAGAAACAGAGCAAGAAATCTCAGTGTCAACACCT
CCTCCTCCAGTAACTGAAGAAACTGAAGTAGTTGCTAAGGAACCCCCAGCTCCGAAAAAAGAGCCTGAAG
TTGTAGTTAAAAAAGAACCTCCCAAGAGCGTGGTTTCTATAAAATCTAACTTTGGACCTACTGGGAAGCA
TATTAATCATCTGCTTGCCAAAACATTTAAAGCTCCGAAAAAAGAAGATAAACCTGCTCCGAAAGAAAAA
ACAAAAACAACTCAGACAAAGCCTCAGCAATCTTCTGATGCTTCAAATGATAAACATCATTCTCCAACCA
ATCGAACATCTCAACCATTTTATCGTAGGGATGTGTCTAAAAAATCAGGATCTGATTTCAGAGATCGTGC
GAAAAAGGATGACAATCCTAAAGCATTTACTGGTAGAGATCGCTACGGCTTAAATGATAGTAGTGATGAT
GATAAGTGGAGAAAAAAACGTGTTCAAAAAACGAAAAAACACTACGAAGAACACGCTATACAACGCCCTA
CACATATTAAAGTACCTCTGCCTATCACGATCAAGGATCTTGCAGCAGAAATGAAGCTAAAAGCTTCTGA
GCTTATTCAGAAGATGTTCATTCACGGCATGACCTATGTTGTGAACGATGTTTTAGATAATGAAACAACG
GTACAGTTTATTGGTTTAGAGTTTGGTTGTACAATTGATATCGATTCATCTGAACAAGATAAACTTTGCA
TCGAGAGCAACACTGTTAAAGAGGAAATCCAAGAAACTGATCCAAGTAAACTGATCACTCGCCCACCTAT
CGTAGCCTTTATGGGTCACGTCGATCATGGGAAAACCACTTTGATTGACTCATTGAGAAAAACCAATGTA
GCAGCGGTAGAAGCAGGAGCTATTACCCAACATATGGGAGCCTTCTGTTGTTCCACACCAGTGGGTAATC
TCACTATCTTAGATACCCCTGGCCACGAAGCCTTTTCTGCCATGAGAGCTCGTGGAGCTGAAGTTTGTGA
TATCGTTGTTCTTGTGGTTGCCGGTGATGAGGGAATCAAAGAACAAACCTTAGAAGCTGTTAAACATGCT
CGAGCTGCAAATATTACTATTGTTGTGGCTATTAACAAGTGCGACAAACCCAACTTCAACGCAGATACCA
TTTACAGACAACTCGCTGAGATCGAGCTATTGCCCGAAGCTTGGGGCGGTACAACTGTAACAATTAATAC
CTCTGCAAAAACTGGAGAAGGTTTATCTGAACTACTAGAAATGCTTGCCCTACAAGCAGAAGTTTTAGAA
CTTAAAGCCAACCCATCCGCCCGCGCTCGTGGACTTGTCATTGAATCTGAGCTACATAAAGGCTTGGGTG
CAGTTGCAACTATTTTAGTGCAAAACGGAACTCTACATCTTGGAGAAGCTTTAGTCTTCAATGATTGTTA
TGGCAAAGTCAAAACAATGCATAACGAACACAATCAGTTAATGAAATCAGCCAGTCCTTCTATTCCTGCT
TTAATTACTGGATTGTCTAGTATGCCAAAAGCCGGAGATCCTTTCGTAGTTGTTAAGAATGAAAAAACAG
CTAAAGAAATTGTCGGAGCTAGACTTGCTGGCCAACAGAAATTTGCTTTGCAGAAGAAACGTCCTAATTT
CGACGCTATGCTGCAAAATAAGAAAATCCTGAAGCTTATTATCAAAGCTGACGTTCAAGGATCTATCGAA
GCTTTAGCTAACTCTATATTAAAGATTACCTCCGATAAAGTAAGTGCGGAAATTCTTGCTAATAGCGTTG
GAGAAATTTCTGAATCCGATATCCGTTTAGCTGCAGCATCTAAGGCTGTTATTATTGGCTTCCATACTGG
AATAGAAAGTCATGCCGAATCTCTTATTAAAAACTTAGGAGTGAAGGTTCAATTGTTTAACATCATTTAC
CACGCTGTAGATGCTGTTAAAGAAATGATGACAGCGTTACTCGATCCTATTGCTGAAGAGAAAAATCTCG
GTTCTGCAGAGATTAAAGAAACCTTCAAGTCCTCACAATTAGGTACAATTTACGGTTGCTTGGTTTCTGA
AGGCACCATGACTAGAAATCAAAAAGTTCGTGTTGTACGTGGCAACGAGATTGTCTGGAAAGGCAACTTA
TCTTCACTAAAACGTATTAAAGAAGACGTTAAAGAAGTTAAGAAAGGCTTTGAGTGCGGTATTTTATTAG
AAGGATGTCAACATGCTCAGGTAGGTGATATTCTACAATGTTACGAAGTGATCTATCATCCACAAAAGCT
TTAA
>ref|NC_003361.3|:c528328-527024 transcription elongation factor NusA [Chlamydophila caviae GPIC]
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AAATATTAATCCTCGCACTGGTGATATAGAGGTCTTCTGTGAGAAAGAAATCGTAGAAGTATGTGAAAAT
CCCAGTAAAGAGATTCCTCTAGACAAGGCTAGAGAATACGATCCTGAATGCCAAATTGGGCAATACATGG
ACGTTCCCTTTGTTTCTGAGCATTTCGGAAGAATTGCTGCGCATGCAGCCCGACAAATTATCGGCCAAAA
ACTACGTCATGCTGAAAGAGATGTTATCTATGAAGAATATCGACATAGGGTCAATGAAATTCTTTCTGGC
GTCGTCAAACGATTCGCCAAAGGATCAAATTTAATCATAGATTTAGGAAAAGTTGAAGGTCTTCTACCCG
CACGTTGTTATCCTAAAACAGAGAAACACAAAGTTGGCGATAAGATTTATGCTTTATTACAAGAAGTTCA
AGAATCCGAAAATGGTGGAGCTGAAGTCATTCTTAGCCGCAGCCATCCCGAATTCGTTAAACAACTTTTC
TTACAAGAAGTTCCAGAATTGGAAGAAGGTTTTGTAGAAATTGTTAAAATTGCTCGTGAAGCAGGCTACA
GAACTAAATTAGCTGTAAGTTCATCTGATCCAAAAACAGATCCTGTAGGAGCTTTTGTTGGAATGAGAGG
TTCTCGAGTGAAGAATATCATTCGAGAGTTAAACGATGAGAAAATAGATATTGTAAACTATTCTCCCGTA
ACCACAGAATTATTACAAAATTTGCTTTGCCCCATAGAAATTCAAAAGATTGCAATCTTAGAAGATGACA
AGGTTATTGCTATAGTCGTTCATGATGCTGATTACGCAACAGTAATCGGTAAGCGAGGAATTAACGCTCG
ATTAATTAGTCAAATTTTAGACTACGAGCTCGAAGTTCAACGCATGAGCGAATACAATAAACTATTAGAA
ATTCAACGCCTACAGTTAGCGGAATTTGATAACCCTCAGTTAGATGAGCCGCTAGATATGGAAGGCATTA
GTAAGTTGGTTGTCCAGAATCTTGTACATGCAGGATACGACACGATCAGAAAGGTATTATTAGCCAGTGC
TAATGATCTTGCTTCTGTTCCTGGAATCAGTTTAGAACTTGCTTATAAGATCCTTGAGCAAGTCAGCAAA
TATGGAGAAGGCAAAGTTGACGAAAAACCTAAAATTGAAGATTAA
>ref|NC_003361.3|:c530166-528421 30S ribosomal protein S1 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCCAAAACAATCCGAATACACTTGGGGATCCAAAAAAATTCTTGATACTATAGATTGCCTCGCGGAAG
ACGTTGTTGAATTCAAAGATCTTCTATGCTCGACACACGGAATTACTTCAAGCGACGAGGAAACTACCAG
TGAGATACAACCTGGCGCCATCCTAAAAGGTACTGTAGTTGATATCAATAAGGACTTCGTAGTCGTTGAC
GTTGGCTTAAAATCCGAGGGAGTCATTCCAATGTCAGAATTCATAGATTCTTCTGAAGGCTTAGTTCTCG
GTGCTGAAGTAGAGGTATACTTAGACCAAACTGAAGACGAAGAAGGAAAGGTTGTTTTATCCAGAGAAAA
AGCTACTCGCCAAAGACAGTGGGAACATATCCTAGCTCACTGTGAAGAAGGCTCTATCGTCAAAGGACAA
ATTATACGCAAAGTCAAAGGTGGTCTTATTGTTGATATTGGGATGGAAGCTTTTCTCCCCGGGTCACAAA
TCGACAATAAGAAAATTAAAAACTTAGACGATTATGTAGGAAAAGTTTGCGAATTTAAAATTCTTAAAAT
CAACATTGACAGAAGAAATGTTGTTGTTTCAAGAAGGGAACTCCTAGAAGCAGAACGAATTTCCAAAAAA
GCGGAACTCATTGAGCAAATTAATATCGGTGAACGTCGTCGCGGTATTGTTAAAAATATTACAGATTTCG
GTGTATTCCTAGATCTAGACGGTATTGATGGTCTCCTACACATTACAGACATGACATGGAAACGTATCCG
TCATCCATCTGAGATGGTAGAACTCAATCAAGAGCTCGAAGTTATTATTCTAAGCGTTGACAAAGAAAAA
GGACGTGTTGCTTTAGGTCTTAAGCAAAAAGAACACAATCCTTGGGAAGATATTGAGAAAAAATATCCTC
CAGGAAAACGTATTGTTGGAAAAATTGTTAAACTTCTCCCCTACGGAGCCTTTATTGAAATTGAAGAAGG
CATTGAAGGGTTAATCCACGTTTCCGAAATGTCTTGGGTGAAAAATGTTGTTGATCCTAGCGAAGTGGTA
AACAAGGGCGATGAAGTTGAAGCTATTGTTCTATCTATTCAAAAAGACGAGGGTAAGATTTCCTTAGGTC
TAAAACAGACAGAACATAATCCATGGGATAACATCGAAGAGAAATATCCTATCGGCCTACATGTTCATGC
AGAAATCAAAAATCTAACAAATTACGGAGCTTTTGTTGAACTAGAGCCTGGTATTGAAGGCTTAATTCAC
ATCTCTGATATGAGCTGGATAAAAAAAGTATCTCATCCTTCAGAACTATTCAAAAAAGGTAGCACTGTTG
AAGCTGTTATTCTCTCTGTAGATAAGGAAAGTAAAAAAATAACTCTTGGAGTCAAACAATTAAGTTCGAA
TCCTTGGAACGAAATTGAAGAAATGTTCCCTACAGGAAGCAATATTTCTGGCGTAGTAACTAAAATCACC
GCATTCGGTGCATTTGTAGAACTACAAAACGGTATTGAAGGTCTGATTCACGTTTCAGAACTTTCTGAAA
AACCTTTCTCAAAAATTGAAGATATTATCTCAATTGGTGATTCTGTATCTGCAAAAGTCATCAAACTTGA
TCCAGATCACAAGAAAGTATCTCTTTCTGTAAAAGAGTACTTAGCTGACAAACAACACGATCACATGGAT
ACAGATTTGAATAATTTGGACCTAGATGATTTAGTTGGTTCAGACAAAAAGAAAAAAGGGAAATAA
>ref|NC_003361.3|:530335-531270 thioredoxin reductase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACTCACACTAAAGTAATTATTATTGGCTCCGGTCCCGCAGGTTATACTGCAGCGATTTATGCTTCAA
GAGCGCTTTTAAGTCCTATTTTATTCGAGGGCTTTTTTTCCGGTATTGCTGGTGGTCAATTAATGACTAC
TACTGAAGTGGAAAATTTCCCTGGATTCCCTGAGGGCATACTAGGCCAAAAGTTGATGGACAATATGAAA
TCTCAGGCGGCACATTTTGGAACTCAAATTCTTCCAAAAGATGTCACTTCGGTGAATTTCACCAAACGTC
CTTTTGTGATCATGTCCAATGAGGAAAAATATACCTGTGATACATGTATTATAGCAACGGGAGCTTCTGC
AAAACGTTTAGAAATTCCCGGAGCATCGGACAATGAGTTTTGGCAAAAAGGGGTTACAGCCTGCGCTGTG
TGTGACGGAGCTTCTCCTATTTTTAAAAATAAAGATTTATACGTGATTGGTGGGGGAGACTCTGCTTTAG
AGGAAGCGATGTTTTTAACTCGTTATGGAAAACGTGTGTACATTGTTCATAGAAGGGATACTTTAAGAGC
TTCTAAGGTTATGATAAAAAAAGCAGAGGCTAATGAAAAAATTACTTTCCTATGGAATAGTGAAATAGTA
AAAATTTCTGGAGATACTGTTGTTCGTTCAGTTGATATTTTAAATAACGTTTCTAAAGAAATCTCTTCGC
GTGATGCGGCGGGGGTATTTTTTGCTATCGGACATAAACCGAATACGGATTTCTTGGCTGGTCAATTAGC
ATTAGACGAGCACGGGTATATTATTACTGATAAAGGAACGTCGAAGACTTCTGTCCCTGGAGTGTTTGCG
GCTGGGGATGTTCAGGATAAATATTATAGACAGGCTATTACGGCTGCAGGAAGTGGCTGTATGGCTGCTT
TAGAAGCTGAACGCTTTTTAGATTAA
>ref|NC_003361.3|:c531630-531262 4'-phosphopantetheinyl transferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCAAACTGCACATATAGGAACAGATATCATTGAAATTTCTAGGATCCGCAAAGCAATAAAAGCTCACA
GTCAAAGAATATTAAATAAAATTTTTACTAAGAGAGAGCAAGAGTACTGTCTAAGTCTAACCAACCCCTA
TCCTTCTTTTGCTGCGAGATTTGCTGCAAAAGAGGCCGTAGCTAAAGCCTTAGGGACAGGAATAGGAAAA
GTCGTTAGGTGGAAAGACATAGAGATTCTTAAATCATCAAAACATCCCGAAGTCTATTTACCTGAAAGGG
TGTATAAAGAATTAGGAATCTCCAAAGTTTTACTATCTATCAGCCATAGCCGTGAATATGCTACAGCTGT
AGCTGTAACTTTAATCTAA
>ref|NC_003361.3|:c532092-531646 hypothetical protein CCA00470 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACTAATAATAAAAATCATTTACTTATTTGTCTCCCAGGCATTCTTTGGTTGTCAGCAGGAGTTAAAC
TACTTTTAAAAGCTTCCGCGGCTGTCTATCAACCGGAGTTTTCCTTCAAAATTTTTGCTCCCCTAGCTAT
GGGAGCATGGGTTATTGCATCTTTGAAGTATCGTTTTTTATTATTAAAATCCGTATCTTCTCAAAATGAA
TTATCCCGCCAACTACTCTTGGAAACTATATCAAAACAAAATTACATAAAAAAATCTTTTGTTTCCAAAC
GCTTCTTAATCATGGCAGCAATGATTGCTATCTCTCTACTACTACGTAGATACATTCATAATGAGACCAC
TCTCTTTTTTATCCGCTCCACTATTGGCTACGCTCTTATTAAAACGGCTTTGACTTACTTTGCTAAATCT
CACAAAACACTCTTAGAAAGCATTTAA
>ref|NC_003361.3|:532162-533052 prolipoprotein diacylglyceryl transferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCGCATCTTTTTATCAGCAATATATTGGAATCATTCAAAATTTTTATGGAATTCGGAAAATTGGCCTA
TCAAAGTTCCTTGGTACGGTCTATGTTTTTCTTTAGGTATTTTGTTCGCTTCTTTGCTTGGTATTTATCT
CGCAAAGTCTTCCTATAATTCAGAAGATGAAAAAAACTTTTCTAAAGAACAGCTTAGTGGAGCTCTGGAA
AATTTTGCTCTCTATTCTCTTTTATTTATCATTCCGGGATCGCGCATAGCCTATATTTTATTTTATGGTG
GCGACTTTTATTTCAAACATCCTAGGGAGATTCTAAAAGTTTGGAATGGGGGATTAGCAAGCCATGGAGG
TATGTTAGGACTGATTCTTTGGGCGTTGATTTTTTCTTGGAGATACAGAAAAAAAATCTCCGTGCTAACC
TTTTTATTTCTTTGTGATCTTTGTGCTTCTGTATTTGGATGCGCAGCTTTTATGATTCGTATTGGAAATT
TTATGAATCAAGAAATCGTAGGAAAACCTACAAGCTTGCCCTGGGGAATCATTTTTTCATCTCCCGCACA
AGGAGTTTTAGGCGTGCCTGTGCATCCTGTGCAGCTTTATGAGGGGATGAGTTATCTGTTGCTTTCTATA
ATTTTGTTTTTTTTAAGTTATAAACGTTATTTTCGTTTAGGTTCCGGATGGGTGACATCTTTAGGATTAG
TAGGCATATCTTTAATACGCTTCTTTGCTGAATTTTTTAAAAGCCATCAAGGCAAAGTTATAGGTCCAAA
TAGCCCATTAACAATGGGACAAATCCTGTCTTTCCCTTTATTTGTATTTGGTTTGTGTTTAGGGATAGCT
TGTTTTCTTAAAAATAAGAAGAAGAGATCCCCCACTTCATCTGTAAAATAG
>ref|NC_003361.3|:533148-535532 putative inner membrane protein translocase component YidC [Chlamydophila caviae GPIC]
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GTTATAATGATTTTCGCTCTTGCAGGACTCTCACCGAGAAACAAAAAACAATTACCGAACAAGTGCTTGC
TGCAACAAAATCCATGGGGTTAAGTGTTTCTCCTTGGACTACATCTCTTGAAGAAGAGACAAATAAAAAT
CACTATGCTGTACGCGTTGGAGATAAATTACTCCTTTTAAATCAAGGGGGATCAGCAAGTTCAGTTTATT
CTTCTGGAGTGCGTTGGAATTTTATCGAAGAGACAACTGCTTGTGATAATATTCATGTTGCTTTGTATGG
CGAAGCAAACGAGACCACAACTCCTTCAAACATGGGAAAAGTATTTCTTCCTGTAACCAACGAAGATCTT
CCTGTTTTAGTTGTTGAGTTTCGTAATAATCAAGAACCTGTGGTGTTCTTAGGTCAATACAAGCAAGAGC
AAGGTAAGGTTTATAATAAGGATAGTGCCGTTTACGGGACTTCTTTAGTATTCTGGAGATCTGGAAATGA
ATACCTTCCTTTAGGTATTTATAATTCTAAGGAAGAAAGGTTAGAATCTTTAGATCTTCCGATTACCAAG
GCTGCTGTTTTTAGCGACTCTAAATCAGCAAATGCTGGTGCAAATTCTGCACAATATTTTGTTCTCTCTA
ATGAGTATATGCAGTTGATTGTTTCTCAAGAGAGCGGTTCTATAGAAGGAATCAACCTTCCATTTTCTTC
CGAGGATAATAAGAGTATAGTTAATGAAATCGGCTTTGATAGAGAGTTAAAAGCTCAGGTTCCTAGTGAA
GCTTCTTTCCCTGGCCTTCCTTCCGTAGGAGCAAATAATCAACCGGTTTCCGATACTGTCGGGGGATACT
ATCCTTTATTGCGCAGAGGGATTCTTTCCGATGCTAAAAAACGCACTCCTTCCAGTTATCATGCTTTAAA
TATTGTTTCCGGTAGAGAGCTTACAAATTCTGTAGCTTCTGGATACCGTGTTTCTACTTTCAACAGCACT
ATGTTGGAATTGGAAAGCAATGACGGTTCTATTAAAAAAACCTACAAGTTGCCTCAACAGCAGCCTTATG
CTTTTGAAGTTGAAGTTGGCGTAAATCGTGCCAGTGATGACCTATGGATAACTTCAGGGATTCCTGAAGT
TGAAATAATGTCTAATGCGTTTACTCCAGCTATTAAATATCATGTGATTAAAAAGAATAAGGGACAATTA
GATAAGGTGAAATTACCTAAGGCTAAAGATCCTTTAGCTTTGCGTAGCGGAGTCTATCCTCAGTGGATAC
TAAATTCCAACGGATACTTCGGTATTATCTTATCGCCTCTTACAGATATTCCTGCAGGATACGCTGCTTC
GTATGTTCCTGGTAGTTCTGTTCCTACACGCTTATCTTTATTATCTCCTAAAAATCAGGCTTATCCAGCT
TCTAAATATCCTGGATACGAAACATTACTTCCTTTGCCTCAGAAAGAAGGAACACACCGTTTCCTTGTTT
ATGCAGGACCTCTAGCTGACCCTACTTTACGCGTTTTAGATAAAGCCTACACAAATTCTAAAGGTGAAAG
CCCTCAATATCTTGATTGTATAACTTTCCGAGGATTCTTCGCGTTTATTACCGAGCCTTTTGCAGCTTTA
CTTTTCATCATTATGAAATTTTTCAGAATGATAACAGGCTCGTGGGGAATTTCTATTATCCTACTTACAG
TATTCTTAAAATTATTGCTGTACCCATTGAATGCTTGGTCAATACGCTCTATGAGACGCATGCAGAAGTT
GTCTCCTTATATTCAAGAAATACAGCAGAAATATAAGAAAGAGCCTAAACGTGCTCAAATGGAAGTCATG
GCTTTATATAAAACTAATAAAGTGAATCCTATTACAGGCTGTTTGCCTTTATTGATTCAGCTACCGTTTC
TTATAGTTATGTTTGATTTGTTGAAATCTTCATTCTTACTACGAGGAGCTTCTTTCATCCCAGGATGGAT
TGACAATTTAACAGCTCCAGACGTTTTATTTTCTTGGACTACACCAGTTTGGTTTCTTGGAAACGAATTC
CACCTTCTTCCTATTTTATTAGGGATTGTAATGTTTGCTCAGCAAAAGATCTCTGCTTCGAAGAAGAAGG
GGCCTGCTACGGATCAACAAAGACAACAGGAAACAATGGGGACAATGATGGCTCTGTTGTTCACCTTTAT
GTTTTATAATTTTCCTTCAGGTTTAAATATTTATTGGTTTTCTTCCATGCTTCTTGGTTTAATCCAACAA
TGGTTTACTAATAAGATTTTAGATAGCAAACATCTTAAAAATGAAATCTCTGTTAATAAGAAAAAACAAA
GATAA
>ref|NC_003361.3|:535600-536982 chromosomal replication initiation protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGAGGTCGTTAAAAGTCCTGTGTTTTGACGCGTGTAATTTATATCTTGAAGCCAAGGACTCTTTTCAAGT
GACCTGGTTTGAAGAGCATATACGTCATAAAGTTAAAACTAGTTTAGTGAATAATAACGGGAAGTTAATC
CGTGTTCACATAACTTCTTTGGATAAAACTGCGCCTTTTTATAAAGAAAAGCAGATTCAGCAGGAAAAAA
CAGCCTACTTCACTATGCAGTATGGTAATGTAAATCCTGAAATGACCTTTGGTAATTTTCTTGTAACTCC
TGAAAATGATTTGCCATTTCGTATTTTGCAGGAATTTACCAAGCCCGCGGAAGATACCGCAGGCTTTCCA
TTTAATCCCATTTATCTTTTTGGTCCTGAAGGTTCCGGAAAAACACATTTAATGCAGGCAGCAGTAAATG
CTCTTAGAGAATTCGGAGGAAAAATTCTTTATGTAGCTTCAGACTTATTTACCGAGCATTTAGTGTCAGC
TATCCGTTCTGGAGAAATGCAGAGATTTCGTTCTTTTTATCGTAATGTCGATGCTTTATTTATAGAGGAT
ATCGAGGTCTTTTCGGGGAAAGGAGCTACTCAGGAAGAGTTTTTTCATACTTTTAACTCCTTACAGACAG
AAGGTAAGCTCATTGTGATTTCTTCGGCGTATGCCCCCGCGGATTTGAAGGCTATGGAAGAACGACTCAT
CAGTCGTTTTGAATGGGGAGTTGCTGTTCCTATTCATCCTTTAACAAAAGAGGGGTTAAGAAGTTTTCTA
ATGCATCAAGCTGAACAGCTATCTGTCCGTATAGAAGATACAGCCTTAGACTTCTTAATTCATGCCTTGT
CTTCGAATGTGAAAACATTAATAGACGCTCTCAAATTGCTTTCGAAACGTGTTGCCTATAAGAAATTAGC
GCAGCAATTACTTTATGAAGATGATATACAAACTCTATTGCATGATGTATTAGAGGTTGCAGAAAGCGTG
CGGTTAACTCCTTCTGGAATCGTTCGTGCCGTTGCTAAATACTACGGAGTATCTCCAGAGAGTATTTTGG
GACGTTCGCAATCTCGAGAATATGTGTTACCTAGACAGGTGTCTATGTATCTATGCCGTCAAAAACTATC
TTTATCTTACGTGCGTATAGGAGATGTATTCTCCAGAGACCATTCAACCGTAATTTCGTCAATACGTGCT
ATTTCTCAGAAAGTGGAAGAAGGAGGAGATGACATTAGCATTGCTACGCAAGAACTAATGAAATCTCTTA
CTTCAGCGTATAAGAGCCTAGAATTCTTCCCAGAAGAAGAAATCTCTTGCTAG
>ref|NC_003361.3|:c537374-536979 hypothetical protein CCA00474 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACTTCAGCCCATGAATACGGAGCATTTGCCTGGCGTCCAAGTAGGAATGTTTTTACACTAAGTGATC
TTGACCGCCGCAGCTCTACTCATTCTCAGGATTCTAGAACTTCCAAACGCGACTCTAGCCGCACAGTAAG
CATAGCTAAGCCTTGTATCGAGAGACATCCTAAATGCCCAATGGTTGAACACACCGCCTTGTGGGTCTGT
TTAGGAGTGGCTGCTGCTCTATCAGCTTGTTTATTATTAGCAAGCGGGTGCTATTCCATGCCTACAATTA
TTGCAGCCTTAATTATCCAAAGCATCTTAATAGTGGCGTCTATTACTTGCTTAATTATTAACTATAGAAA
AGAGATCGCCTCTTTATTCTGTGGAAAAAATGAGCAATTATGCTAG
>ref|NC_003361.3|:537530-539980 glycogen phosphorylase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGTTTTGATAAGAATTTGGTAAATATTGAAACGATGAAGCAGGCGATTTTAAATCGTCTATATTTTG
GCGTAGTACAATCTCCAGAATCTGCTTCAGCCAGAGATATATTTACAGCAGTTTCAAAAACTGTCATGGA
ATGGCTGGCTAAGGGTTGGTTAAAGACTCAAAGTAGTTATTACGAACAAGATGTTAAACGTGTCTATTAT
ATTTCTATGGAGTTTCTACTCGGTAGAAGCTTAAAGAGTAATCTTTTAAATTTAGGAATACTCGATCTTG
TTCGAGATGCATTGGCAGAGCTAAATTATGATTTCGATAGTTTAGTACAAATGGAAGCAGATGCAGGATT
AGGGAATGGCGGTTTAGGACGGCTTGCAGCGTGTTATTTAGATTCCATGGCGACATTAGGGATTCCTGCT
TATGGTTACGGAATCCGCTATGATTACGGAATTTTTGATCAGAAAGTCGTCAATGGATATCAAGTAGAGG
CTCCTGATGAGTGGTTGCGCTATGGAAACCCTTGGGAGATATGCCGAGGGGAATACCTCTATCCTGTTCA
TTTCTATGGTAGAGTAATTCACTATACAGATGCTAGAGGCAAGGAAGTTGCAGATCTTGTAAATACACAA
GAAGTATTAGCCATGGCTTACGATGTGCCTATTCCTGGATACGGAATAGACACTGTGAATACTTTGCGCT
TATGGCAAGCGCAATCTCCACATGGATTTGAATTTAACTATTTTAATCATGGGGATTATATTCGTGCTAT
AGAGGACATCGCGTTAGTAGAAAATATCTCGAGAGTACTCTACCCTAACGATTCTATTTCTGAGGGGCAG
GAGCTCAGATTAAAACAGGAGTACTTTTTAGTTTCTGCAACAATTCAAGATATCCTTCGTAGATATACGA
AAATGCATATTTCTCTAGACGATCTTCCTAATAAGGTGTCTGTTCAGCTAAATGATACCCATCCCGCTTT
AGGAATAGCAGAAATGATGCATATTCTTATCGATAGAGAAGAGCTCCCTTGGGATAAGGCTTGGGATATG
ACGACGCGTATATTTAATTACACGAATCATACGATATTACCTGAAGCTTTAGAGCGTTGGTCAATAGATC
TGTTTTCACGATTATTGCCTCGACATTTAGAGATTATCTATGAAATTAATGCACGATGGTTGGAGAAAGT
TTCCCAGAGATTTCCTGGAAATGATGATAAGCGAAAAGCCTTATCCATTATTGAAGAGGGAAGTGATAAG
CATGTAAATATGGCAAATCTCGCTGTTATAGGTTCTGCTAAGGTTAATGGTGTATCTGCTTTCCATTCCC
AACTTATAAAAACAACCTTATTTAAAGATTTTGTAGAGTTTTTCCCAGATAAATTTATTAACGTGACTAA
TGGTATTACTCCCAGACGTTGGTTAGCTTTATGTAATCCTCGTTTAAATACACTATTAGATCAGACAATT
GGAGATGGTTATCTCGTAGATCTTTCTCAAGTTCATAAGGTGATCCCTTTTGCTGACGATGCCAATTTTA
GAGAACAGTGGCATCAGATTAAGCTAAAAAATAAGGAAGACTTTGCATTAAAATTAAAAAAAGAAATCGG
AGAAAAAATAGATCCGACATCTCTCTTTGATTTTCATGTAAAGCGTATTCACGAGTATAAACGCCAGTTA
ATGAATATCCTCAGAGTGATCTACCTTTATAATGATCTTAAGGAAAATTCTGCTTCTAGCATTGTTCCTA
CAACAGTGATTTTTGCTGGGAAAGCAGCTCCGGGATATGCCTTTGCTAAGCTCGTCATTAAACTTATTAA
TAGCATTGCAGATTGTGTAAATAATGATCCTCAAGTGAATGAGGTGTTAAAGGTTCTCTTCCTTCCGAAT
TATTGTGTGACTATGTCTGAAATGATCATGCCTGCTTCTGATCTCTCTGAGCAGATCTCCACAGCAGGAA
TGGAAGCTTCCGGAACAGGAAATATGAAATTTGCTTTAAACGGCGCTTTAACAATAGGCACTATGGATGG
AGCTAATATAGAAATGTCAGAACATATTGGGAGAGACAATATGTTCATTTTCGGTTTATTAGAAGAAGAA
ATAGCAAAAATGCGTCGGGAGTATTATCCACAAGGGATATGCAATAACAATCCTAAGATCGCTCATGTAT
TAAAGTTACTAGATCAAGGATTTTTCAATACTTCAGATAAAGATCTCTTCAAGCCTATAGTACACAGGCT
GCTTCATGAAGGAGACCCATTCTTCGTTTTGGCAGATTTAGAATCTTATATCTGTGCTCATGAATCTGCA
GCGACCTTATTCACTCAAACTGATGAATGGGTGAAAAAATCTATATATAATGTTGGTGGTATCGGCTTTT
TCTCCAGCGATAGAGCAATTGCTGACTACGCTAAAGATATATGGAATGTTCCTACGAATTGTAAGTCTTA
A
>ref|NC_003361.3|:c541340-540054 branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AAAGCAATGGTGATAAGATAGAGTTTGGGGATGTCCTCATTGAAATATCAACCGACAAGGCTGTGTTAGA
GCATACAGCATCTGAAGAAGGTTGGTTTCGAGAATGTCTTATTAAAGAAGGGACAAAAGTACAAATAGGC
ACGCCTATAGCTGTTATATCTTCTGAAAAAGATGAGTCTTTCAACTTAGAAGAGTTACTTCCAAAATCCC
CAATTTCACAACCTTCTATAGAAAACGTAGAGCAGGGAGACGTAGCAGCATCTGATGTATCACATCAAAA
TGCCTCAATGATGGTAGCTTTTGGCTTTAGGCCTGAGCCTCCCCTTTCTGAACCTCTATCTTTAAAACAA
GATTCTTCAAAAGTTCCAGTCTCTCCTCTAGCTAAACGTTTAGCTAAGGAAAAGAATTTGGATATTTCTG
GAATTAAAGGTAGCGGCCCTGGAGGACGTATAGTTGAAAAGGACCTTGAGAAAGCCCCTGCCAAAGGCAT
TGCAGGCTTTGGGTATCCTGAGGCTCCTGAAGTTCACCCAGGAGCTTATCATGAGGAAGCTCTTTCTCCT
GTTCGTGAAATCATTGCACAGAGATTACAAGCTGCCAAAACTTTTGTTCCCCATTTTTATGTACGGCAAA
AAGTTTATACCTCACCGTTACTAGCCTTGCTTAAAGAGCTACAGGCTCAAGGAATTAAACTTTCCATTAA
TGATTGTATCGTTCGTGCTTGTGCGTTAGCTTTAAAAGAGTTTCCTGAAGTAAATTCAGGATTTAATAGC
ATCGACAATAAGATTGTACGTTTTGAAACTATTGATATTTCCATAGCTGTGGCTATTCCCGATGGTGTAA
TTACTCCGATTGTACGTTGTGCTGATCGTAAAAACGTTGGAATGATCTCTGCAGAAATTAAAAGTTTAGC
TTCTAAAGCCAGATCTCAATCTTTGAAAGAGGAAGAGTATAAGGGCGGATCTTTCTGCGTCTCTAATTTA
GGCATGACGGGAATTACTGAATTCACAGCAATCATTAATCCTCCTCAAGCTGCCATTCTTGCTGTAGGCA
GTGTTCAAGAAGAACCTGTAGTGATGAATGGAGAAATCGTAGCGGGTTCTACATGCATATTAACATTATC
CATAGATCACCGTGTGATCGATGGATATCCTGCAGCGATGTTTATGAAACGCTTACAGAAGATTTTAGAA
GCCCCTTCAGTACTTTTATTAAACTAA
>ref|NC_003361.3|:c542331-541345 pyruvate dehydrogenase, E1 component, beta subunit [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCCTAAGCACGTTACATTAGAAATCCGAGAAGCTATTAGAGAAGCTATTGATGAAGAAATGGCCAGGG
ATCCTAATGTATGTATACTAGGAGAAGAAGTTGCCGAATATAACGGTGCTTATAAAGTTACAAAAGGCCT
TTTAGACAAATGGTCATCATCAAGAGTTATTGACACACCGATCAGCGAAGCAGCATTTGCAGGAATTGGT
GTCGGAGCCGCGTTAACTGGGCTACGTCCAATTATAGAATTTATGAGTTGGAACTTCTCTTTAGTTGCTG
CGGATCAAATTATCTCTCATGCTGCAAAAATGCATTATATGACTGGTGGGAAATTTTCAGTTCCTATTGT
ATTTCGTGGACCTAATGGAGCTGCAGCACAAGTATCGTGTCAGCACTCTCATTGCGTAGAAGCTTTATAC
GCGAATATCCCTGGTTTGATTGTTATCTCCCCATCAAATCCTTATGATGCTAAGGGATTATTAAAATCTG
CAATTAGGAATGATAATCCTGTTCTCTTCCTAGAAAATGAATTAGAGTACAGTTTAAAAGGTGAAGTTCC
TGTTGAAGAATACTTAGTTCCTATTGGGAAATCTCGCGTTATTGAGGAAGGAAAAGACCTAACGATTATT
ACTTATGGACGTATGGTTTCTGTAGTAAAAGAAGCTGTGAAGATAGCTAAACAACGTTATGGTCTTTCTA
TAGAAATTCTAGATCTTCGAACAATCAAGCCCCTAGACATCTCTGGAATATTTTCTTCAGTAAAGAAAAC
AGGAAATTGTATAGTTGTAGAAGAGGGCCACTACTTCGCGGGAATCTCTGCGGAAATCATTACTAGAATT
ACAGAACATGTTTTTGATTACCTGGATAGTCCTCCTTTGAGGGTATGCCAAAAAGAAACCCCTATGCCCT
ATAACAAGACCTTAGAGCAGGCAACGCTCCCAAATGTAAATCGTATTTTAGATACTATCGAAAAAATCAT
GAGGTAA
>ref|NC_003361.3|:c543349-542324 pyruvate dehydrogenase, E1 component, alpha subunit [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCCCAACTCCTCTCATTACAATATCGCCTCTAAGGAATCTGACGAGGCTACTATAAAAAATATTGTTG
ATATATACGGCGTGAGCCGCTGTCTAGAATTCATAAAAAATATGTTGTTGATTCGTGAGTTTGAAACTCG
TGGCGAAGAAGCATATCTAGAAGGATTAGTCGGTGGTTTTTACCACTCCTACAGTGGTCAAGAAGCCGTT
GCTACTGCAACACTAGCTAACACAGGATTGGATCAATGGTTTTTCTCGTCCTACCGCTGTCATGCTTTAG
CCATATTACTAAATATTCCTCTACGCTCACTTGCAGCAGAACTGTTGGGTAGGGAAACTGGCTGTGCATT
GGGTCGAGGCGGGTCTATGCATATGTGTGGTCCAAATTTCCCCGGAGGGTTTGGTATTGTAGGTGGACAA
ATTCCTTTAGCTGCTGGAGCCGCATTCGCTATGAAATACCGTGGTGAGGATAAAATTGCTCTAGGATTTA
TTGGAGATGGCGCTGTTGCTCAAGGGGTATTTCACGAAACATTGAATTTTGCTTCTTTGCATAGCCTTCC
TCTTATGCTTGTTATAGAAAATAATGGTTGGGGAATGGGAACCGCTCTTAATCGTGCTATTGCGAAGCAA
CCCATAGGAGAATCTCAGGGATCTTCTTATAACATACGTTCTTTTACTTTGAATGGTTTTGACTTATTTA
ACTGTCTTTTAGGCTTTAAGGAAGCTTACGAGTATATGCAAAAGACGCGCCTTCCTGTGATTGTTGAATG
TCTATGTTCACGGTTTAGAGGGCATTCTATTTCCGATCCTAATCTTTATAGAAGTAAAGAAGAGATGCAA
TGTCTTATAAAAAAAGATCCGATTATTTTTGCTAAAAATTGGCTAATACAATTGGGAGTACTTTCAGAAG
AGAAGTTTCAAGAACTACGCCAGGAATGTAGGAGTGAGGTCTTAAAAGCTTTCACTGAAGCAAAATCAGA
TCCAGAACCAGCGATTGCCACATTAGAAGAAGGTGTTTATGCCTAA
>ref|NC_003361.3|:c545628-544549 UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCCTCAGAAACTGGTCTATACTCTTCAAGAGTTAGCAGACTTATTAAAAGTTGAAGTTCAAGGAAATA
CAGAAACTCCTATTTCTGGTGTTGAGGAAATAAGTGAAGCTCAAGCTCATCACATTACCTTCTTAGACAA
TGAAAAGTATTCGCGTTTTATAAAAATCACCGAAGCTGGAGCTATCATTCTATCAAAAGCTCAAGCCCAA
AAATATGGTCATTTAAATAAGAACTTTCTTGTAGTCTCTGAATTTCCATCAATAGCTTTCCAGAAATGTA
TAGAGTTATTCATTCCTCCCGTTGAGTCAGGATTTCCTGGCATTCACCCTACAGCTGTTATTCATCCTAC
AGCACATATTGGTAAAGATGTTTGCATAGAACCGTATGCTGTTATAGGCCAACACGCCCATATTGGAGAT
TCTTCATATATTGGAGCAGGAAGTATTGTAGGGGCGTATTCAATTCTTGGAGAAAATTGCCTTATTCATC
CTAAAGTAGTTATTCGTGAACGTGTCGAGATAGGAAAACGTGTTATTGTTCAGCCCGGAGCTGTCATTGG
CTCTTGTGGTTTCGGCTACATAACTAACGCTTTTGGTCGTCACAAACACCTAAAGCACCTTGGCAAGGTA
ATCATCGAAGATGATGTCGAAATAGGAGCGAATACTACAATAGATAGAGGCCGTTTCAAAAACAGCGTCA
TATGTGAAGGCACAAAAATCGACAATCAAGTTCAAATAGCCCATCACGTAGAGATTGGGAAACACAGTAT
GATTGTTGCTCAGGCAGGAATCGCTGGTTCTACAAAAATTGGTAACCACGTTATCATTGGAGGGCAAACA
GGAATTACAGGTCATATTTCAATAACAGATCATGTAATTATGATGGCGCAAACAGGGGTAACGAAATCTA
TTTCTTCCCCAGGAATCTATGGAGGAGCTCCAGCACGTCCTTATCAAGAGATTCACCGTCAGGTTGCAAA
AATCCGTGGTCTACCTAAATTAGAAGAACGTTTAGGAATGTTGGAAGAAAAAATCAAAGGGTTATCTGTA
AGATCCGAAGAAGCACAAGTAACCCCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c546195-545656 cationic outer membrane protein OmpH, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATGAAAGCTCTCTTGAGGGAGGCTTAGGCGTTGTTAGCTTGAAACGTTGTTTAGAAGAATCTGCTTTTGG
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GAGCTGACAGCACTTTATAATAAATTACAAGACGAAGACTACATGGAGAGTCTTTCAACTTCTGCTTCTG
ATGAATTGAGAAAAAAGTTTGAAAGCCTTTCTGGAGAGTATAACGCTTTACAGTCTCAATATTACCAAAC
ATTGAACCAAAGCAATATGAAAAGGGTTCAGAAACTCATACAAGAAGTAAAAAAAGCTTCTGAAGTATTG
CGCGTGAAGGAAGGTTTATCAGCTATTTTAAATGATGAAATAGTTCTATCGATCGCTTCTAGTGCTGATA
AAACTAATGAAATTATCAAAATTCTTGATGAATCTTTCGAAAATAATTAA
>ref|NC_003361.3|:c548676-546304 outer membrane protein, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTCATGATACGAAATAAAGTTATTCTGCGGTTTACTGTTTTGGCGCTAATCCAAGTCCCATTGGCCC
TATCAGCTTCAGAAACAGTTAAGGAAGGATATACACTAGTTGAATCCATTACGATTACAACTGAAGGTGA
AAATTCTTTAAACAAGCATCCACTACCGAAATTAAAGACAAAAAGTGGTGCTTTGTTTTCTCAAGCAGAC
TTTGACGAAGATCTACGAAATCTATCTAAAGAATATGATAAAGTAGAGCCGAAAGTTGATTTTTCCAACG
GCAAGACTACAATCTCTTTGGTTCTTGTTGCCAAGCCTTGCATTAGAAAAGTTTGCATTACAGGGAACGA
AGTTGTCCCCAATCATAAGATTCTTAAAACTCTGCAAGTCTACGAAAATGATGTATTCGATAGAGAAAAG
TTTTTAAAAAACTTTGATGAACTCAGAGTCTACTATCTTAAGCGCGGTTATTTTGACTCTAATTTATCCT
ATGACTTAGATCATAATGAACACCTAGGTTACATTGACATAACTGTTCGGATTCAAGAAGGTCCTTGTGG
TAAAATCAAAAAGCTAGAGATCTGCGGCCTTAACAGATGTGAAAAGTCTGATGTCAAAGAACTCATCCTT
ACTAAACAACATTCCAAAACCACTAGCTGGTTTACAGGAAGTGGTCTGTATCATCCAGATATTGTTGAAC
AAGACTCGTTTGCCATTACTAATTACCTACACAATTTGGGTTATGCAGACGCAACAGTTACTCCAAGACG
TGAAATTGATGAGTGTGGGAATATCATACTCTATATGGATGTAGACAAAGGTCCTCTTTATACCTTAGGA
CACGTTCATATTGAAGGATTTAATGTATTGCCTAGACGGCTTATAGAAAAACAATTGGCTGCGGGTCCTA
ACGATATTTATTGTCCTGAAAACATATGGAGCGGTGCCCAGAAAATTAAGAATACCTACGCTAAGTACGG
GTACATCAATACGAATGTTGACGTAACATTTTCTCCTCATGCATCGCGTTCTGTTTATGATGTAACTTAC
AAAGTAAGTGAAGGCTCTCCTTATAAGGTTGGTTTAATCAAAATCACAGGAAACACTCATACAAAACATG
ATGTTATCCTACACGAAACTAGTCTATTCCCCGGAGATACTTTTAATAGATTAAAACTGGAGGATACAGA
ACACCGTTTAAGAAATACGGGTTATTTCCAAAGTGTCAGTGTTTATACAGTACGTTCTCAATTAGATCCC
CTGGATAATTCCGAAGAATATCGTGATATCTTCATAGATGTTAAAGAAACTACAACAGGTAATCTAGGAC
TATTCCTAGGATTTAGCTCCCTAGACAATTTGTTTGGAGGAGTCGAACTTTCTGAAAGTAATTTCGATCT
TCTAGGCGTTAGACACTTATTCTCTAAAGGATTTAAATGCTTGAGAGGTGGTGGAGAATACCTATTCCTA
AAAGCTAATTTTGGGGATAAGGTTACTGATTATACTATTAAATGGACTAAACCCCACTTTTTAAACACAC
CATGGATCCTAGGTGTAGAACTGGACAAATCTATCAACAAAGCCCTTTCTAAGGACTATTCTGTTGAGAC
TTATGGCGGAAATGTCAGCACTACATACATCTTAAATCAACAATTAAAGTACGGAATCTATTACCGCGGC
ACTCAAACAAGTTTGCACAAAAAGAAAAGAAACCTATCAGGACCAGATCTTGCTGCTAATAAAGGTTTCG
TGTCTGCCGCTGGTGTGAACTTAAATTACGATTCTGTAAACAATCCTAGAAATCCTACGACAGGAATACG
TAGTGGTGTAAACTTTGAAGTTTCCGGTCTCGGTGGTACATATCATTTTACAAAACTCTCTATAAACAGT
TCGATATACCGAAAACTGACAAGAAAAGGAGTTTTGAAAATTAAAGGAGAAGCCCAGTTTCTTAAACCCT
TTGGGAATACAACTATAGAAGGTATTCCTATTAGCGAACGCTTCTTCTTGGGTGGAGAAACTACTGTACG
TGGATACAAGCCATTTATCATTGGTCCCAAGTTCTCCCCCACAGAACCTCAAGGGGGTCTATCTTCTCTC
TTGCTTTCTGAAGAGTTTCAATATCCTCTGATTAATCAGCCTAACGTTAGCGCTTTTGTCTTCCTAGACT
CAGGATTTATTGGGCTTAAGGAATACACTATCCGATTGAAAGATCTTTGTGGTAGTGCAGGATTTGGTCT
ACGCTTCGACGTAATGAACAACGTTCCTGTTATGTTAGGGTTTGGCTGGCCATTCCGTCCCACAGAAATG
TTTGAAGGAGAAAAGATCGACGTTTCACAACGATTCTTCTTTGCTTTAGGAGGCGTCTTCTAA
>ref|NC_003361.3|:c549450-548848 recombination protein RecR [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTAAAATATCCAGATTATTTATCTAAATTAATCTCTCTTCTTAGAAAACTTCCAGGAATAGGATTTA
AAACAGCAGAAAAGTTAGCCTTTGAGCTGTTGGATTGGGATCAAGATCAGTTAGAAGCTATGGGACAAGC
TTTTTCGGAAGTATCTGCCGCGCGTAGTCATTGTTCGACCTGTTTTTGTTTAAAAAATCTTCCCGAAAGC
AATTGTGAATTTTGTCAAAACAATCGCGACACCTCCACACTATGCATCGTAGCCACCCCTAAAGATATTT
TTTCTTTAGAACGCTCTCAAATTTTCAAAGGTCATTATTATGTCTTAGGAACACTGTTATCCCCGATAAC
AGGAAAACATATTGATGTGGAAAGAATAGGGTTATTGAAACAACGTATAGAATTTTTAAAACCACAAGAA
ATTATTCTAGCCTTAGATGCCACTCTGGAAGGAGATGCTACTGCTCTTTTTTTGAAACAAGAATTAGCAT
TTTCTTCAGCCTCTATTTCTCGTTTAGCCCTAGGTTTGCCCATAGGATTATCTTTTGATTACGTAGACTC
GGGAACCCTGGCCAGAGCGTTTTCTGGGAGGAATCCATATTAA
>ref|NC_003361.3|:549571-550578 3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGTGTGTGAAAAAAATAAGAAAGGCATCTATTTGGGCTACGGGTTCTTATCTACCCGAAAAAATCCTAT
CTAATTCTGATCTTGAACAGATGGTAGACACTTCTGATGAATGGATAGTAACAAGAACCGGAATCAAGGA
AAGGCGTATTGCGGCACCAGGTGAATATGCCTCTATTATGGGTGCTAAAGCAGCGGAGAAGGCGATTGAA
AAAGCTGGTCTTACTAAAGATCAAATAGAATGTATTATTTTTTCCACCTCAGCTCCTGATTATATTTTCC
CTTCCAGTGCAGCCTTAGCCCAAGCTTATTTGGGAATAAAGGAAGTTCCAGCATTTGACTGTATGGCTGC
GTGTACTGGCTATTTATACGGTCTGTCAGTAGCTAAAGCTCTTGTTGAATCGGGAGCTTATAATAATGTT
TTGCTTATTGCAGCAGACAAACTCTCTTCCTTCGTAAATTATGAAGATAGAAATACTTGCGTGCTTTTTG
GTGATGGAGGTTCTGCCTGTGTTGTAGGAGAGAGTCGTCCCGGAGCTTTAGAAATCACTAATGTGAATTT
AGGGGCTGATGGAAGTGTCGCTGATCTCCTTAGTCTTCCCGCTGGAGGAAGCAGGCTTCCAGCTTCCCCA
GAGACTGTAGCAGAAGGTAAACACTTTATTTACATGGAAGGTAAAGAAGTGTTTAAACACGCGGTAAGAC
GTATGGAATCGGCTGCTAAAATATGTATAGCTGAGGCGGGTCTTGCGGAGGGTGATATAGATTGGCTGGT
CCCACATCAAGCTAATGAAAGAATCATTGATGCTATAGCTAAACGTTTTGAAATAGATGAATCTAAAGTG
TTTAAAACTTTATCGAAGTATGGAAATACAGCAGCTTCTTCTGTGTGCATAGCTCTAGATGAATTATTGC
AATTACATGTGATTAATTCTGGAGAGTATTTACTCCTAGTTGCTTTTGGAGGCGGATTATCTTGGGGAGC
AGTTGTTTTACGACAGGTGGAAGGTTAA
>ref|NC_003361.3|:550582-551508 acyl-carrier-protein S-malonyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACGAAAAAAATAGGATTCTTATTTCCAGGCCAAGGTAGCCAATATGTTGGCATGGGTAAAGATTTAG
TAGAAAATTATCCAGAAGCTGCTGAAGTGTTTTCTTTGGCTGATGAAACATTGGGATTTTCTTTGTCTTC
AATCATGTTCGACGGTCCCGAAGAAAAACTTCTTGAAACAGCATACAGCCAATTAGCTATATATCTACAT
AGTTTGGCTGTAGTAAAAATTCTAGCTTCACGGACTTCTATAACACCCGCTGCAGTTTCTGGACTAAGTT
TAGGGGAATATACTGCTTTAGTTGCTTCTGGGCGTATTTCTCCGATCGATGGTTTTAATATCATTAGCAA
ACGTGCGCAGTTTATGAATCAAGCTTGCCAACAAAGTCCTGGAGCTATGGCTGCGATTCTTGGATTGACT
GCAGATGTTGTTGAACAAAATCTGGAAAGTTTAGGAGAGGGTATTTGGGTTGCTAACTACAATGCTCCTA
AACAACTTGTGATTGCAGGTTTGCGAGAAAAAATAGAAGAAGCTGTAGCTTTGTTTACAGATTTAGGAGC
AAAACGAGCGATTTTATTAAAAGTATTTGGTGCTTTTCATACGCCATTGATGCAAACAGCAGAAGATGAA
CTATCTCCTTATTTACATAATTTAGATATGAATAGTTCTGAAGTGCCATTTGTATCGAATGTCGTGGCAG
ATTTTTTAACAAACAATGATGAAATTCGTCAGTGTTTAGTAAAACAGATGACTTCTCCTACATTATGGTA
TCAAAGTTGTTCTAAGATAGATTTAGAAGTTGATGAATTTTTAGAAATAGGCCCAGGCAAGGTTCTTGCA
GGCTTGAATCGTTCCATAGGGTTAAAAAAACCCATTAAAAGTTTAGGTACAGTAGAAAGCATCAATAATT
TTTTAGCGGAGCTATAG
>ref|NC_003361.3|:551513-552259 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATAATGTATTGTTGGGGAAAAAAGCGATCGTTACAGGAGGATCTAGGGGTATAGGATTTGCCATAG
CTAAGCTTTTTATTGAGCAAGGTGCTGATATTGAAATATGGGGAATAAATGATGAGGGTGGCAAAAAAGC
CGCTGAAGAGTTATCCAGAATAGGACGGCCAGCGACTTTTGCTAAGGTTGATGTTAGTAATAACGAATCT
GTAAAAGATGCTGCTCAGAATTTTATTTCAGCACATGGTAGTGTTGATATTTTAGTGAATAACGCAGGAA
TTACTCGAGATAATCTTTTGATGCGTATGTCTGAAGAAGAATGGTCTTCTGTTATTAATACGAATTTAAA
TTCTTTGTATTACGTGTGTTCGGCCGTAATTCGTTCTATGATTAAAGCTCGTTCTGGTTCCATAATCAAC
ATTAGTTCTATTGTTGGTTTAATGGGTAGTCCAGGACAAACTAACTATGCCGCTGCAAAAGCTGGTATTA
TAGGGTTTAGTAGAGCTTTAGCTAAGGAAGTTGCCGCAAGAAATGTTCGAGTGAACTGTATAGCTCCAGG
ATGTATCGATACCGATATGACTAAGGTGTTAAATGATAATTTAAAAACAGAATGGTTAAAAAATGTTCCT
ATGGGAAGAATGGGTTCCCCAGAAGAAATTGCCAATGCGGCGCTATTTCTTGCCTCCCCCCTATCTTCTT
ATGTAACATCTCAGGTTCTGAGTGTTGATGGAGGCATGGCGTACTAA
>ref|NC_003361.3|:552371-552604 acyl carrier protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGTTTAGAAGATGATGTAAAGTCAATTATTGTTGAGCAGCTTGGCGTAGATGCGAGTGAAGTAAATG
AAAATTCTTCATTTATCGAAGATCTTAACGCTGATAGTTTAGACTTGACAGAGTTGATCATGACTTTGGA
GGAAAAGTTCAACTTTGAAATTTCAGAGCAAGATGCAGAGCAATTACGTACTGTAGGCGACGTTATCACA
TATATTAAGACTCGTCAGGGTTAG
>ref|NC_003361.3|:c553142-552723 cyclic nucleotide-binding protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATCTAATTGACCGCGCCTTTCTTCTAAAAAAAAATCCTATTTTTAGTTCTTTAGATATGGATGTTC
TCCTAGCTATTTCAGATAAAACTGAAATTATGATTTTTAAGCCGGGAGTAAAGATATTTTCTAAAGAAGA
GCCCAGCTTCAGTCTGTATATTATAATAGAAGGCTATGTCAAAATTACTGATAACAATTCTTCGTTATCA
ATTACAATTTCATCACAAGATTGTTTCGGAGAGGAAAGCTTATTCAGCAATAAGCTTCGAGAATATAACG
CCGAAGCTATAACTCAAGTACGAACTTTGATCTTAAGCAAAGGACAATTTCTTAGTATTGTTGAAGAATG
TCCCTCTGTTGCACTCTCACTTTTAGAACTCTACGCCAAGCAAATCACCTTTAGACACCCCTCATCATAG
>ref|NC_003361.3|:c555934-553157 hypothetical protein CCA00489 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCAAAAAGCCCTTCGTTTGCTACTCAATTTGCATCATGGAGAAGAGAGACGAGCACTTCTATTCCTGG
TTTTAGGCTTAATCTGGGGAGTAGGCTGTTATGGATCTCTAGCTTTAAGTGAAGGGCTTTTTCTCGAGAA
TGTAGGAACTGAGGGCTTACCATCCATCTATCTTGGCTCCTCTTCTATTCTCTGCCTTTTATCTTCACTT
ATTCTTTACAATTTATTCAAAAAAAGAGTTTCACCCAAAACACTATTTTTAATCCCAATAACTAGTGTAA
TTGTGTGTAATCTTTATCTTCTCTGTTACGCAGCAACGTGTAGTGAAATCCCTCCAACTCCCCTGCTTAT
CTATCGTATGCTCTCTTGGAGCTTAATCATCTTAGCATATACAAATTTTTGGGGATTTGTGGACCAATTC
TTCAATCTTCAGGATGCTAAAAGACACTTCAGCGTATTCAATGCTATTATATTTTTAGGAGATGCCATTG
GTTCAGGGATAGTGAACCGCATCCAATACATAGGCGTAGAGAGAATTTTAATACTTTTTATAGTGATTCT
ATTCATTTGCTATCCTCTAGTCCATTATGTATCTAAATCGCTAAAAGAGCTATCAGAAGATCATGACCAC
TTTTTAGATACCGGCCACCCACCCTCTGTATCCAAAGCTTTTAAACTCTGTCTGAAAGATAGCTATACTT
TCTATCTTCTCTGTTTTTATTTCTTAATGCAGTTGCTCGCTATCGCAACAGAATTCAATTACCTAAAAAT
CTTTGAAACACACTTTACTGACGGGAATACCTACGAACTTACAGCACATATCACTAAGTGGTCCTCCTGG
ATTTCCTTAACTAACATGTGTTTTGCTCTGTTTGCCTATAGTAGAATAGTTAAAAACATAGGCGTAAACA
ATATCATCCTATTTGCCCCCCTATGCTTCACTAACCTATTTCTCTGCTGGTCCTTCAAAACCTCAGTGGG
AATTGCTACGATCGGGATGGTAGCTCGAGAAGGGCTTACTTATGCATTAGATGATAACAATCTACAGTTA
TTGATTTATGGTGTTCCAAATAGCATACGAAATCAAATTAGAATCACGATAGAGTGTTTTATCGAACCCA
TAGGAATGTTTGTATGGGCTCTAATGTGTTTTGCTATTTCCTACCAATACACCGTCTGTCTCATTATATC
CGTGATTACAGTCGTCCTCGCCTGTTTACTACGTTCGTATTATGCACGGGCTATCCTAAGAAACTTATCT
TCTCAAGCTATCCATTTAAAAAAGACTATGCTCGAATGGATAAAAGCTATGACTTCAAAAGAGAAGAGGC
AAATTGAACTTTTACTACTTACACACCTGAAGCACCAGCAGGAACGCCATCAAATATTTGCCTTCCAATA
TCTATTAAATTTAGGAAGTCGTAGTGTACTTCCCAGCTTATTAGCTCATATGAATAAGCTAAGCTTGCCT
AGCAAGCTAAAAACTATGGAGATGTTAAAGAATAGCCTTTGGGCTCGCGACTTCCTTACTTTAGAGCTTC
TAAAGCGTTGGTCATCAACAACACCACATCCTTCAATAGCCATAGGCATTCATCTCTATTTTGCAGAACA
CGATTTGTTGCGCATATCTGATATTGCTGAAGATCTTTATGATGAGCCAGGTGACAGACTTTTAGCAGCG
ATTCTTACAGTGCGCCGTCAGGAAATGAGTGGGCAATATCGTGATGTTGCAGATTCACGACTCAAAGAAC
TTCTGAGCTCTAAAGATCATCGCGTGGTAGCTATCGGTCTTACTATTTTAACTTTAGAAAGAAATCCTGA
TAATTTCCCTATTTTAGTTGAGTTTCTGGATAACACTAATAACGAGATTTTTGTTCAAGCATGCAAAGCA
CTACAAGCATCTGTAAAGGCTATTCACAGGCCCTACTGCAAAAAACTCATACAAATCCTAAAACAAAATG
TTCATAACGATCAGGCTTGCTACTATCTACTGAAAATAATCGGAGTCATCTTAGACGCTTCATTAGTAAA
AGACTTTGTTACCACTACAGCATTATTAAAAAGCGCTTCGAGAAAATATGCTGAGTCTATAATTGTAGAG
CTTCCTAAAGAAACCGCGAATTCACTCCTACAGATTCTTTCCGACAACAGCATCCATAACCGCTGTCGCA
TTCTTGCTGCAAAAGCCCTATGTAAAATTGATAATAAATTATTCAAAAAGAATGCATATAAAATCGTAAA
ATCTAAGGCCCTGAAAGCAATTTTTTATGATTATCATAAAAATTATATTCAAAAATCCTATCCTAAATAC
AATCTCAGCCTATTAGTTAATACTTTGGAATCTAACTACCAATCGGAAGTTAACTTCATGTTTGAGTTTT
TAGGGATCTTAGGATCTGTGGAACATTCGGATATTCTAATAAGAGCTTTAACGGGGAAAAATAAAAAAGC
AAAAGCTCAAGCTTTAGAATCTCTAGAGAAAAACTGCGAAGATTACCTATTTTCTCTGCTTGATCCATTC
ATTAACAATACAGAAAGACGCAGTGAAAAATACTACCTCAAATGCGGTGTTATTCCTTTAACTTTAAAAG
AGTTATTAAATATGATGGAAAATTCTCCTTCGTATTTAAGTAAACTCACATCGAGACAGTTAAAGGAAGA
ATTAGCAAGCTGTGACGCTGATTTTCAACCAGCACCGCCGTATTCGACTTTAGATGAAGAGTATGACCAT
TATAATAAAGACGACTCTGACAGTCTAGTTCCCTTCTTTACTATTTAG
>ref|NC_003361.3|:c556596-556036 inclusion membrane protein C [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACCTCTGTAAGAACCGATTTAACTCCAGGCGACACCTCACTCCAATCTTCTTTATTAAATCCGAGTG
ATCTCACAACACAACTATCCAACCTCCAGACTGTTCTCGCAGGGATACAACAACAACATCCTTTAAACGG
TGGTTGGCCTCAGCATCATCCTACTGGCGCTGCAGATCAAAATTATCTCATGCGTCTGATGCAATCTCAT
ATGGCAAGTACCGTATCAGCAGTATCTGAATTAAGAACCGAAGTCACTGCAATCAAGACAAAATTGCACG
GGCTATCTACTCCAGCTAATGTTTGCAGCGGTCCTATGGCTCTAGCCGCTTTTCTTCTAGCTATATCTTT
AGTTGCGATTATCATCATTGTTTTAGCCTCCTTAGGCCTTGCAGGCATACTACCTCAAGCTGCCGCTATC
TTAGTGAATACAGCAAACTCTATATGGGCTATTGTTAGCGCTTCGATAGTCACTGTTATCTGCTTAATTA
GCGTGCTATGCATAACGCTAATTCGACACCATAAACCCTTACCTATTGAAACTAGGCCTACCGGACATTA
A
>ref|NC_003361.3|:c557229-556633 inclusion membrane protein B [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCAACAACACCAGCATCTTCAGCAAGTCGAGACGTATTATTAGATGACGTTTTAATAGCTTTTAATA
GAAAGCTAAATCTCGTAGAACAACAAGCGAAAGAACTTGAAACGAAAGTCAGTTTGGTAGACAGAACAGC
TACTTTATCACTTACCACTGGCAATAATGTAGCCACGGATGTACTCCTTTTAAAAGATGAGGTTGCAGAA
CTAAAAGGATGTTTGTCTGCAGTTACGGATCTATTAATCCGCTCAGGCTCATCAAGAACACCTGGGGGTG
CTCCTAATCCAGAAGGCACTAATTACCTAATAGGATGCACACCTCCTTCTCTTTGCGCTAAACTTACAGC
GTTAGCGTTAACAATTATAGCCCTCATTGCTATCACAGTACTTGTTATCTGTATTGTTACTGTTTGCGGC
GGTTTCCCCCTATTTATTTCCCTACTCAACATGTACACAGTTGGTGCTTGTATATCCTTACCGATCATTT
CGTGTGCCGCAGTTTCAATGATGATTCTATGCTCACATTCTATTAACTCTTTATTAAGAAACAGGCCTGC
GATCTATATGACTAACAATTTTCAAACAGAATCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c558796-557315 sodium-dependent transporter, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGCAAAAATCAGACTCACTTTTCTTCTAGACTAGGCTTTATTTTCTCTATGATGGGGATAGCCGTTG
GCGCAGGGAATATTTGGCGCTTCCCTAGAATCGCAGCGCAAAACGGTAATGGGGCCTTTATTTTAATTTG
GCTCCTATTCCTATTTATATGGTCAATTCCTCTGATTATCATAGAACTTTCTCTAGGAAAACTAACTAAA
AACGCCCCTATAGGCACGTTAATCAAAACGGCAGGACCAAAACGCGCGTGGTTAGGAGGCTTTGTCACTT
TAGTAACAACATGTATTCTAGCTTACTACTCTAATATTGTTGGATGGGGTTTGAGTTATTTTTACTACTC
AATCTCTGGTAAAATCTATGCTGGCAATAACTTTTGTCAGCTATGGGAAGCGCATTATCAAAGCTCCTTC
CCTCTGTTATTTCACTTCCTGTCTCTATTTTTAGCCTATATGATCATCCGCAAAGGTATTGTACAAGGGA
TTGAAAAGTGTAATAAAATTCTTATCCCTTCGTTTTGCGTGTGTACCCTAGTACTACTTGTTAGAGCAGT
TACACTTCCTAATGCAATGCAAGGAATCAAACAACTGTTTACTTTTGATTTTGCCTCGCTATCTAGTTAC
AAACTATGGATAGAAGCTCTAACACAAAATGCTTGGGATACAGGAGCTGGTTGGGGATTACTCCTAGTAT
ATTCCGGATTTGCTTCAAAAAAAACCGGCGTAGTGAGTAACGGAGCCCTTACAGCGATATCAAATAATCT
CGTCTCCTTAATCATGGGCATTATTGTATTTGCTACATGCGCTTCCCTAGATGTTCTAGGAACAACACAG
TTACAACAAGGTGTTGGCTCCTCAAGCATAGGCATAGCTTTTATCTACCTGCCAGAACTGTTCACTAGAG
TTCCTGGATCTGCCTACTTACCAGCTATTTTTAGTTCTATATTCTTCTTAGCCTTTGCTATGGCAGCTCT
CTCGTCAATGATTTCAATGCTATTTTTGTTATCACAAACCCTTTCAGAATTTGGAATAAAAAAGCATGTA
GCAGAGTACTCAGCCACCATTATAGCTTTTATTCTTGGTGTCCCCTCATCCTTAAGTCTTTCAGTATTCG
CAAACCAAGACACTGTTTGGGGCATTGGATTAATTATTAACGGGCTTATTTTTATCTACGCCGCAACTAA
GTACGGGCTGACACCTCTAAAAAAGAAAGTAATTAACGCTGTTCCCGGAGACATCCATCTCAATAAATCT
TTTGATTCTATGGTAAAATATCTGCTTCCTATTGAAGGAATAATTTTACTTTGCTGGTATTTTTATGAAG
GGCTTTTCCCTGAAGACGGGCATTGGTGGAATCCTATATCTGTATATAGTCTTTCTAGTTTGCTTTTGCA
ATGGTCTGCGGGATTAATTATTTTTAGATCATTAAATAAAAAACTATCTAAACGCTTTTCTTTATATAAC
TTAAAAAATTAA
>ref|NC_003361.3|:c560022-558802 sodium:dicarboxylate symporter family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGAAAGAAAATCGCAAAATCGCATTACAATCTCCTATTGCTGGGAAGCATGTTCATAGGGTTGGCTC
TAGCCTCCTTTAATTCCCCCTTAATATTTCAAAGCGCAGAGATCATATCAGGAATTTTTTTAAAACTGCT
AAGGTTTTTAAGTCTTCCCCTAGTATTTTTTGCTATCGGGTCAACGATCACGTCTATCAAGAATTTTCAG
ACAATGTTGTCTCTAGGGAGAAAAATACTCTATTATACGCTACTCACTACAGTGATATCCGCTACAGTGG
GTTTGGGATTATTTATTATTATTTACCCTGCCATGCCCTTAGAAGGGAGTTTAGAAACACCAGCAACGAC
ATGCTCAACTGGCTACCTTAAGGTGTTGTCGGATACCATTCCTGGAAACATTCTAGAGCCGTTTATAGAT
AATAATGTTATTTCAGCTACATTTTTAGCGGTTATATTAGGAATCGCTTCCCTGTTCCTTCCTGAAAAAG
AAAAGAATCTTACTCACAATCTGTTTTCAACATTCTTTTCTATACTTTTGAATATCGCTAAAGGCGTTCT
TAAATTACTAGTTCCAGCTACACTAGCCTTCTCGATTCTCTTCTATAAAGAGGCTACACAAAATCAAGGG
AACCTGGTTATCTTTAGTAAGTATCTGCTTTGCGTAGTAGGAGCTAACTTGATTCAAGGGCTTATTGTGT
TACCATGGCTTTTGAAAGCAAATAAACTTTCCCCCTTAAACATTGCGAAAAGGATGTCTCCAGCATTAAT
CACAGCATTTTTTTCAAAATCCTCGGCCTCTACCCTTCCACTAACAATGGAATTAGCTGAAGAGGAACTC
AAAATCAAACCCTCATTATCAAGGCTAGCTTTCCCCTTATGCTCCGTTATCAATATGAATGGCTGTGCCG
CTTTTATTTTGATTACAGTGCTTTTTTTGGGAATATCCAACGGCATTAGCTTTTCTCTATTTTCAATGAT
TGGCTGGGTATTCATTGCGACTTTATGTGCAGTTGGAAATGCTGGCGTGCCTATGGGATGTTTTTTTCTT
GCATCCTCATTAATTACTTCAATGCACATTCCTTTGCATTTGTTGGGCCTTATTCTGCCTTTCTACACTA
TATTAGATATGATCGAGACCTCATTAAATGTTTGGTCTGATTGCTGTGTGGTTAGTTTGACAGATAAACA
CTTTGCAAACAAATCTATTAAACTCGAGTAA
>ref|NC_003361.3|:560127-561293 hypothetical protein CCA00494 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCTTGTTTTAATTTGCCTGCGGTTAACGCAAAATTAACCCCTGTTAAGTCTAGTAATTTTCCTAATC
AAGAGGATTGGAAGAATACTTTCCAAACTAAGGTTACGAAGAATTCCCGTACTCATTTGAATTTACAAAA
GTATCAAGCAAATCGTCAAACGCGTGTTGTTATATTAGCACTATCTGTATTGATAACTCTAGTTTTATTG
GCAATGCTGCTTAGTACTTTACAGTTACAAGCATTTGTTATGACATGGGTGTCGATTATAGTGGCTGTGG
CTATTCCGACCATTTTGTTAACGGGCGGAATGTATATTCTACATAGAATTAGCAAGAAAGTAGATGTCTT
GTCAGGTACAGTAATCAAGCCTTTTGGCAATAGGATCTGGGCCCCTATGCCGGTATGTTATTATTCCAAA
CCTAAGGAAGGGCAAAAAGAGGGTGCCCAGGAGATGGTTCAAGAGGGCCATATCGATTTATCAACTTTAG
ATGAAACTCAGTCTGGTGTAGCACTGGTATATTATTATCCTGAAGGCGTTGATTATAGAATCCCGACTTG
TGTTTTCCCCTTAATTGCCACTCCTTTTCTTGTTCTTGTTAAGATGGTCTACAACTTAATTAGATTTATT
GTGGTTCCTTTTTATATACTTTTGCAAATGGTCATTCAGTGCTTTTCTAAGAAGGATATATCTATAGAAG
ACCGTTTTGTTTTCAAAGATATTGTTAGGGAAATGGGGCGTTCTTTGGTTAATATGCTCAGGGCTCCTTT
TTACGGCACGGCATCGATGATGACGGTTTTTTATGGGTTGCTTAATCCTTTAGGCGGTCGTGTTGCTTAT
GCTTGCGTAGAAAGGGATTGGAATGACGAAGTTATTCGTTCCCGTGGAATATGGTTGGCAGTTCCTCAGC
ATAATTTCCAGTTCGAAGGTGGAGGGTCGCGCCAAGGCTTGGGACAGTTTAGTTACTATCTCATTGGATG
TTTCCAACCAATTTCTATGTTCCTATTTAAAGATGGTCATATTGTTTCTGGAGCTCATACTTCTGTTCAA
TACTATCCCGATGCGCACCTCCCCGTTTATCCTGGAATAGCCGTTGTTACTGCTTCAACTCCAGAGGGTG
ATGAGAACGATAAAGTGGAAGCTAGTGATAAAAGTGCAGCGTCTTAA
>ref|NC_003361.3|:561576-563708 hypothetical protein CCA00495 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGGATCATCCTTACCTTTCATTTCTTCTGAAAATTTCCATGAGGAATCGGATCTATTCGATGAATTCG
GTTGCTCTGAAGCACGCTTAGATTTTCTCATGTCTGAGTTAATAAACCTGGAGGGGAGTTCTGATATTAG
CGAGGGATATCTATCTTTGTCTGAGAGTTTATTAATGCTTACTCGTGATCACGTTGTGATAGTGAAGCGA
GTCATTTTCTATGGAATGAAGTATGGTATTGATAAGAAAAACTCTCAAATTTTGATTGATACTTTATCTT
ACATAGATGTCTTATTCAAAAAGTTGGGGATAAGTTCTTCCGACAGATTGTCTTTATGTTCTGCTAAAAT
ATGTGCAAATTTCGAATTATTTTCTTTAACTAAAGATGTGGCTTTTCTCGAGCGTATTGTTAAAGATTTT
GATGTGATGGAGCAGTTGCTTAAGCTTCATCCTCATTTGGATAATAAATTAGGCTGGGAACATTTTTGTC
ATGGTGGAAAACATGAGGAGGTTTCTCATTCAGCTACCGCCTATGTATATGAAGCTATAGGGAAGACGTT
TCTAACACTATACTATAAGAATAGGGAGAAAGAAGCTCTTGTACGTAGTTGTCAGTCTTTTTCTAAAGTG
TTAAGTTTACTTCCCAATCGAGCAGGCGCTCATGCAGATTATGCCGAATGTCTACAAATCCTTGGATTGG
AGTTAGGGAAGTCTTCTTATTTACAGCAAGCAATAGACCATTTATCTAAGGCTATTTTCTTGAGTTTCAA
TCGTCATATTGATAACTTTGCTTATGAAAATTATCGCTATAGCTATGCTCTGGCTGTCGTAAGATTATTT
AATGTTACTTATGAGAAAGAGCATTTCTATGATGCAACTAGGGTACTGTATGAAACGATTCAGGCATTTC
CTCATATTGCGGAGTTGTGGGTTTTATGGGGGGAATTATTAATTCGTTCCGGTTGGCTTAATAGCAACAT
GAAGCATATAGAAATGGGTTTGGATAAGCTGACTTCAGCTCAGAAGAAAGGCGCGGACCCAGTTATTCTT
TCCGCATTATTAGCTAATGGTATAGCTGTATTAGGGTTATATTTAGATGAGCCAAATTTATTTAGAGAAA
GCCGAACGAGACTAATTGCTGCTATGAGGGCTTTCCCAGGAAACTCTCATTTGATTCAAGCTTTAGGCGA
GGTGCAGCTTTGCTCTGCTTTATATTTTAGTGATGATGCTAATTTCGCTGCTTCAGCTTCATGTTTCAAA
TCTTGCATTGAATGGGACGCAGAAAATGTCAATAGTTGGCAGAAATTATTCGATGTGTATTTTGCCTGGG
GAGTGAGGAAAAGAAATGTAAGGTTGCTTCAGAAAGCTGTGGATGTAGTGAAAAGATTGTGTTCTTTACG
TCCTGAGGTATTTTTATTTTGGAGTGATCGAGGTCTTGCCTTAAAGTGTTTGGCTGAGGCGACGACAGAT
CTTGCTTATAAGGAAATTTATTTAGAAGAATCTTTATTATATTATCGTAAAGCCTGGAATCTTTCCCATC
GAATAGAGATCTTGGAATTGTGGGGACATTCGTGCTATTTATTGGCAGATCTTCAAGAATCTCAAGATTA
TTATGATGAGGCCTATGCCTTAATATCCAATATAGATGAGGAGAGACAGTCTTTTAGAGCTAAGATTATT
CTTGCTTCTACTCTTTTAGGAAAAGGGAAACTATTGCAAGATGAGGCTCTAGTTGAAGAAGCTCTGGTTA
TTTTAAATTCATTAATAGATGAATATCCTGATCAAGAGGATTTATTACTTTTGTTAGGAGAGGCCTGGTT
ATTTCTATTTTGGAAACGGCGTTGTTCGGAATCCGAGGAATTAGTTAGGGTATACTTAGAACGGGCAATT
GCTTTAGGATGTAGTGAGGCTTACTATACTTTAGGTAAGTTCTATGCTGTGAAAAAAGAAATTGGTCAAG
CTTGGGCTATGGTAATGCGTTCTGTAGATTTTGGTTTTAAAATTACAGAATCGCGATGGCTGAATGATCC
CTGTTTAGCAAATTTACGAGCTGGACATGCGTTTCATGAAGTTGTAGCTAATCAAAGAGGTAAACTATGG
TGGGCGAACAAAACAGAGGCGAAGAGAAACTAG
>ref|NC_003361.3|:563735-565147 magnesium transporter [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGATTCAAAAACTAGCCATTTGGATGATGAGCTAAGTTTTAAGTTGGAGAAAGCGTTTACCTGTTTGT
CTGCGGATATACATTCCCACGATCTCTCCAAAATTGTTAGTGAGTATAATCCTATAGATTTAGCTTATGC
GGTTTCTTGTCTTCCCCCAGATTCTCGTGCGATTCTTTATAAAAATCTTTCATGTATTGCATCTCGAGTA
GCTTTTATTATTAATACGGATTCAGCTTCTCGCTGGGCTATTTTCCGTAAATTAACTGATATAGAAGTCT
GTGCGCTCATTGATCAGATGCCTCCTGACGAAGCTGTATGGGTATTAGATGATATTCCTGATCGGCGTTA
TCGTAGAATCTTAGAATTGATAGATTCTAAGAAGTCATTAAAAATTCGCGATTTACAGAAACATGGCCGC
AATACTGCAGGAAGACTTATGACTAATGAGTTTTTCGCATTTTTGATGGAAACTACCGTAAAGGATGTTT
CTGCGTGTATTAGGAATAATCCTGGAATAGATTTAACCCGTCTTGTTTTCGTTTTAGATTTTAAAGGGGA
GCTTCAAGGTGTTGTTACTGATAGAAGTTTAATAATTAATCCTCCTGAGATGTCTCTAAAGCAGATTATG
CATCAGGTAGAGCATAAAGTATTGCCCGATGCTACTCGAGAAGAGGTTGTTGACTTAGTAGAACGCTATA
AGATAGCTGCTTTACCTGTTGTTGACGAAGAGAATTTCTTAATAGGTGCTATTACTTACGAAGATGTTGT
AGAGGCTATTGAAGATATTGCTGATGAAACAATAGCGCGTATGGCTGGAACTACAGAAGATGTGGGATAT
CATAGCTGTCATGTTGTTCAAAGATTTTTACTCAGAGCCCCTTGGCTATTAGTTACTCTTTGTGCTGGAT
TGGTTAGTGCTTCGGTCATGGCATATTTTCAGAAAATTGCCCCGTCATTACTAGCTCTTGTTATTTTCTT
CATTCCTTTAATTAATGGGATGTCTGGAAATGTCGGTGTTCAATGTAGCACGATTTTAGTCAGAAGTATG
GCTACCGGGACCCTTTCTTTCGGGCGCCGTAGGGAAACCATCTTTAAAGAGATGAGCATCGGTTTATTAA
CAGGTGTTGCTTTGGGTATTCTTTGCGGTATCGTCGTTTACCTTATGGGATTCATAGGGATAAACCTTTT
CGCTGGAGGAGGACTACAGTTAGGAGTTACTGTAGCAGCTGGGGTGTTAGGAGCATCATTAACGGCTACA
ACTTTAGGAGTTCTTTCACCATTTTTCTTTGTGAAATTGGGCGTGGACCCTGCTTTAGCTTCAGGACCTA
TAGTTACTGCTCTAAATGATATTATGTCGATGGTGATATTCTTTTTAATTACAGGATTTTTGAACTTTTT
CTTTTTCAGTTAA
>ref|NC_003361.3|:565287-566702 hypothetical protein CCA00497 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATTATGGTCATCTTTTTTTCCATCATTGTTGTTATTGGCATTATAGGAGCAGTACTTGTTGGAGCAA
ATGTTCTCACATCTTTAATGGCGTTACTTTGCTTTTCTGCCATTGCTACGTCAGTATGTTTGATAGGTTT
AGTTCTCATTTTCATTTTAAATGCTGAAAAGAGGATTTTTCCAAAAATTACTCTTCCTGACGAGATGGAA
TTTTCGACAGAGGAACAAACTTTTCTACAAACATTGCTAGAGTTATCGGTTTCTGACCAGATTATAGAGA
CGGAAATCCCTAGCTTATCTGAGGGAACTCTTGAGCATGTATTTATTTCTGGAACATTTTATCGTGAGAA
TCCTGCCTATAGGGAAAATATTTCTACACGAGTAGAAAGTTTGGAAACGTCTCTGATGAATTTCGCTAAT
ACCTTTACGAAAGCTGTAGTGCATTGTGGTCAGGAATCAGGAAACTTAATTCAGGGGGTCCTTAAGGAGA
TAAAAGACTTATTTATTCCTTCATTAAGTTCTAGGGAAAAAGAGACATCGCTTTGTCATTGTTTACAAAC
ATGGAGTGAGCTGTTGATGCAGCACTCTTTTGTAGACTTTATTGTTCTTATTCTTGAAAAACCTAATATC
AATCGCTTCTTACTTGAGAACTTTATAGAAATTGCTGAATCTTGGCGTGCCCGCCCAGGAGGCCTCGCCT
ATATTCGTAAAGCTTTACAGTCGTTTAATCTTTGGCTTTATGGTTTGTATGTGGGTGAGCCTTGTATCAA
TATTCTAGAATCTTACAATTCAGATCTTCTTAATGAAGAGGTGCGATCTTATTTAGAAAGTGGGAATTTC
GTTCACTTAATGTTTTCTAGAGCAGACCCAGAGTTGCGTGATAGATTTTCTGATTTTCTAGAAGAATCTC
TTCGTGGATTAGCTGCAACAGAATGCCATAAAATTCATCGCGGTATGAACTCCGATGGGTATATACAAAA
TGATCCTTTGTTACGTTCCGTTATAGATAATCTAAATTTAAGAATGACTTTTTGCTTAAATTTACCCGCA
TGTTCTTCTTGGAAATTTAGATTTGCTCTAGCGAGAAATTTAAATGGAATTTTTAATTTAAGTGAGTTTG
TTCGTGATAATTATTACGGCCTAGTTGCTAATCCTTTTTTACTTATAGAGCTTCTTCATAGCCATTCTAA
GTACCAAAGTTTTATCCAGGGATTGCTCACGAAAGCCATGTCTATGGCTCATTGGAAAGCTTTATTTAAA
CCGATGATTACCGGCTTATTTAGTGCGGGGATGGCGAATAGAAGAGAGCTCGAAGTCATGGCAAATCACC
TGGGAGTAAGTATAGAAGAGGTAACCAGCGTTATTTCTTCTAACTCTTTCTTAGAAGTTTTATTTCCCAA
CTTATTCGAAGAATAG
>ref|NC_003361.3|:c568216-566816 amino acid antiporter [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCATACCCATTCAAAATCTTCAAAACCCCTGGGCACGTTTACTGTTGGGATGTTATCTCTAGCAGTAG
TGATTAGTTTAAGGAACTTGCCCTTAACAGCCAAGCACGGCTTATCGACGCTTTTCTTTTATGCTCTTGC
CGTGGGCTGTTTTATGATCCCCTACGCGCTTATTTCAGCCGAACTAGCATCTTTTAAACCTCAAGGAATC
TATATCTGGACTCGCGATGCCTTGGGAAAATGGTGGGGATTCTTCTCTATATGGATGCAATGGTTCCATA
ATATGACTTGGTATCCAGCTATGCTGGCATTTATTGCAAGCACACTCGTGTATAAAATTAATCCAGAACT
GGCCCATAACAAAGTCTATTTAGCAACTGTTATCCTTGCTGGCTTTTGGGGTTTGACCTTTTTTAATTTC
TTTGGGATTAGTACATCAGCCCTTTTCAGTTCGGTCTGTGTTATCATAGGAACTTTAATTCCAGGAGCAA
TCTTAGTTACTCTAGCGATTTCCTGGATTGTCTCTGGAAATCCTATAGCCATTTCTCTTTCTTGGGGTGA
TCTACTCCCTGAATTTCATGGCATGTCCTCTTTTGTGTTGCTTTCAGGTATGCTTTTAGCCCTTTGTGGA
TTAGAAGCTAATGCCAATCTAGCCTCAGATATGGTCAACCCTAGAAAGAATTACCCTAAAGCTGTATTCA
TTGGAGCTGTTGCTACTTTAGCTATTTTGGTTTTAGGATCACTTTCTATAGCTATTGTTATTCCTAAAGA
AGAAATCAGCCTGGTTTCCGGTCTTGTTAAAGCGTTTTCTCTATTTTTTGATAAGTACAATCTTTCTTGG
ATGACAAGCATTGTTGTTGTTATGACAATTGCTGGGTCTTTGGGAGAGCTTAATGCTTGGATGTTCGCAG
GAACTAAGGGATTATTCGTATCTACACAAAACGATTGTCTTCCTAAAATGTTTAAAAAAGTAAACTCAAG
GAACGTTCCTACGAACCTTATGCTATTTCAAGCAATTGTAGTTACTTTGTTTACTTTGCTATTCTTATGT
TTGGATTCAGCAGATTTGGCCTATTGGATTCTTAGTGCTTTAAGCGTACAAATGTACTTAGCTATGTATA
TTTGTCTATTCATTGCTGGGCCTGTTCTTCGTATTAAAGAACCAAAAGCTCAACGTTTATACTCAGTTCC
TGGGAAGTTTTTTGGTATCTGCGTACTTTCATTCTTAGGAATACTTTCCTGTATATTTGCCTTATGGATT
AGCTTTTTACCTCCTCAAGAGGTCACACAGTTATCGGCAGCAGGTAAAATAGGTTATTCAACCTTCTTAC
TACTTGCTTTCTCTGTAAACTGTATGATACCTTTTGGCATCTACTATGCTCATAAGAAACTAATGAAATA
A
>ref|NC_003361.3|:c569283-568234 fructose-bisphosphate aldolase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCAAAGATACATGATTTGCTTGGCAATGACGCGGAAAATTTGTTGAAATATGAATGCAAATATATCC
CTAAAGAAAGTCTTACCCTTCCCTCCCCTGACTTTGTTGATAAAGTTTTCTCTTATTCTGATAGAAACAA
TCTGGTATTAAAATCTTTGCAAGCTATGTTTGCTCATGGAAGGCTAGGAAATACCGGTTATCTTTCCATT
CTCCCAGTAGATCAGGGCGTAGAACATACGGCAGGAGCCTCCTTTTCCCCAAATCCTATTTATTTTGATC
CGGAAAACATTATCCGATTAGCTATAGAAGGTGGTTGCTCTGCCGTAGCTTCCTCTTATGGAGTTTTGAG
CCTACTTTCACGAAAATATGCTCATAAAATTCCCTTTATGTTGAAGCTTAACCATAATGAGCTTCTATCT
TACCCAACAACATATAATCAAATTTTCTTTAGCCAGGTAGAAAGTGCTTATAATATGGGTGCTGTTGCTG
TAGGAGCAACTATTTATTTTGGTTCTGAAACATCTTCTCAAGAGATTGTCGCAGTCTCTCAAGCTTTTGC
AAGAGCTAGGGAATTAGGCTTAGCCACAGTATTATGGTGTTATTTACGAAACTCGCATTTCGTGACCAAT
GGCGTAGATTATCATACAGCTGCAGATCTAACCGGTCAGGCAAACCATTTAGGAGCAACCTTGGGTGCTG
ATATCGTGAAACAGAAACTGCCCACATGTCAAGGAGGTTTTAAAGCTATCAAATTTAGTAAAACAGATGA
TAGAGTATACTCCGAACTCTCTTCAGATCATCCAATTGACCTCTGCCGTTACCAGGTACTAAACAGTTAC
TGCGGTAAGGTAGGTCTTATTAATTCGGGAGGCCCCTCGGGAAAAGATGATTTTGCAGAGGCAGCAAAAA
CCGCTGTGATTAACAAGCGAGCTGGAGGTATGGGATTAATTTTGGGAAGAAAAGCTTTTCAAAGACCTCT
TACCGAAGGCATACAATTATTAAATTTGATTCAAGATATTTACTTAGACCCAAGTATTACAATAGCGTAA
>ref|NC_003361.3|:569450-571327 hypothetical protein CCA00500 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCTCAGCCTACAATCAATCTGAATCCCCGTTTAAATGATCTTACTGAATCGCTATCTATTACCTCTA
AGCAGAAAGATATCGCGTGTAAGATAAGGCAGTGTCAAATTGTCAGCTTAATCTCGGCAGTAGTCGCAGC
CGTTTTATTATTGACAATCTTGATTCTTCAATTGATTCCTGGGGTTCCTATTGCCTTTAGCATAGTATTG
GGGTTGACACTTGTGGTTGCTACGGCGGTGTCTTTAATATTTTTTGCTTCTTATTTTCTCAAAATCAGAA
AAGTACTTTTTGATCTTTCCGAAGCTTCCGCAGAACTTCGCGAAGCATTTGCTAACTTCTCTTTAGATTT
AATACGAAATATAGAGCCTCAAAAAATCACACAACCTCCAAGATATGGTTTGAGAACCCGCACTAGAGCT
CCGAGGGTCTCAACTCAAGAATCTTCAATACGCCCCCCTTCGCTAGCTCCTACACCGACTCTGCCGCCAG
TTTCTACACCTACACCTCCAGTCGCCCCTACAGAAGAGCGGTTGGCAGAAATTTTCGAGCCCTCTCCTGG
AGAGGCGCCTGCAGAGGCTCCCGATGTTCTTCCCCATGTTCAGGAGGAGGTGCCTCCAGGTGGTGTTGCT
GAAGAACCTGCGGCTGCGGCAGGACCATCCGTAGAAATGGACGTGGATTCCCTATTTCAAAGCAGTCTAT
TGCACTTTCTCGATATTGCTGATAGAGGTGTTCATCCCGGTATAGATAAACATCCGAGATATAAAAAAGA
TCACAACACTGCTTGTAAAACATTTTCTAACTTCTGCGGGAGCATTGCGAGATTTTGGGATAAAGTAAAA
AAAGGAGAGATACCTATAACTACTGGGGAAATAGTATCGATGTTTACTCCGCCAATTTTCGGTAGAGATA
ATCACCCGGTGCTATCTATTACCTATAGTGGGAAAGATGCATTTTCAAGCGAGATTTACGGTGCCTTTTG
GTTGCATGATGCTTTAAAAGATCCTGAAAAATTGGAGAAATTATTGGATGTTATTCGAGTGTTGAAGATG
TCGAATCTGTCATTACGGACGCAAGAAGAGCAGTTGGTTGCCTACACAGCATCTCTAGTCACTTTCAACG
TATTGCTTTCAGGATGGTGTCTATGTAATCAGAACCTCGCCTCGAATATCGTGGGGTCAGTACAGGCATT
AAGGATATCTGAAGAAGACAAAATGATGGTTCTTGAAATGTTGAACTCTGGGAACGTTCTCGGAGCCCTA
GTGTTTGTGCATGGTGATAGAAATCCAGAAGTAAAAGCACTTATGCGCATCAATGATTTAGACCCGGAAG
GAAACCCTCTGCCAGATCCTCAAAATGCTATCAATATACTATATGAGCATATCGATCCTTATAGCGCGCG
TGCAATTACAATAATGGGAGACTTAGCTGAAACAAGTGACGAACAAGATGAAACTCTTGTTAAGGAAGCT
CAACGTATTTTTGAGAAGCTGGGCGCAAGTCTACCAATGACTGCAGCAGGATTGGGATATGACATATGGA
ATAGAGGCAATACAAATCTAAACGCAGCATCTTTAGAAGCCAGCCAATTCTTAATGAATAATCCTCCTGC
ATCAACATCTAAGATGTTCTCATTCTTAAGAGCCGTTCGTGGTGCACCAAAACTTCAGTCTCGTCTGAAA
AATTATCTTCCTTATGCAGGGAAGGAAGCTATTGGGGCTCTTCTCTCAACATTAATATTAGGCGGGTACT
CTCTAGGACTGTTTACCTACCGACAAATTGATGGGCTATGCAGTGCCTTAGGAATTTCTGAGCGAGAATT
AATAAGATTCATTCTGTCTAAAAAAATAGCAGGAGAGATTCTCCCAAAACTTTTATAA
>ref|NC_003361.3|:571514-572539 ABC transporter, ATP-binding protein [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGTTTGAGAAAAACTTTCCTATCATTTCTGTACAAAAAGTAAATAAAGAAATAGGAAATCATCGTATTT
TAAACGATATCTCCTTTTCAGTTTTCCCCGGGGAAATTTTTGGAATTATTGGCCATAGCGGTTCCGGCAA
AAGCACCTTATTGCGTTGTTTAGATTTTCTTGTTTCACCAACTTCAGGATCTATCTCCGTCGCGGGGTTT
CACAACCTTCACTCAGACAAAACCAATTCTCGCTTAGCCTTTGCTAAGCGTGTTGCTTATATTTCTCAAA
GTTGTGGACTGTTTTCAGCAAAAACTGTGTTTGAAAATATAGTATATCCTTTGAAACTTCATTACCCCGA
TATGACAAAATCTTTGATTGAAGAGAAAGTGGACAATGCGTTGGATTTCTTAAATCTATATGAACGGAAG
CACGCATATCCTAGTAGATTAAGCGGGGGGCAGAAACAAAAGGTAGCTATTGCAATAGCTATTGTATCCG
ACCCTGTTGTTTTGCTTTGTGATGAAATCACTTCCGCTTTAGATCCTAGATCAACAGAAGATGTCACTGA
TAAATTACTAAAGTTAAATGAAGAGCGAGGCATTACTCAAGTTTTTGTTTCACATGAAATTGAAGTAGTT
AAAAAACTCTGTTGTCAAACTCTAGTTATGCATCAAGGTGCTATTGAAGAATTAGGTCCTACAGAAAAAC
TGTTTTTAAATCCTCGCAGCTCGATTACCGAGGAGCTCTTTCATATGAATTCGATCGCTAAGGGGATTTA
CAATCATGGTGAGAATGAAGAAATTCTAAGATTAGGTTTCTCACAAGGTTTAGCGGTTCAAGGAATGATA
AGTAAGTTGATTCAAGATGGACAAATCTCTATCAATATTCTTTCTGGAGACATCAATCTCTTTCGTAAGG
TTCCTTTAGGCTTTCTTATCATCGCTTTATCTGGAGATAAGGAGGAAAGAGAAAAGGCAAAAGATATTCT
TATCAAGAAGGGAGTTATCATACAACAACTCCAGAAGACAAAATAG
>ref|NC_003361.3|:572552-573217 ABC transporter, permease protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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TCTTTTTCTCATCCATTTTAGGTGGTCTTTTAGGATTAGGACTTTTCGTAACAGCTCCCTATGGATTGAA
ACCAATGAAAAGTATCCATTCAACAACTTCCATTGTGTTGAGTTTCCTTACCGCTATTCCGTTCGCTATT
TTAATAGTTATTTTATTCCCAGTAACGCGGTGGATAGTAGGTACCTCTTTAGGGGCAACAGCCTCCATAG
TGCCTTTAACTTTGGGAGCTTTACCTTTAGTCGCTTCTTTTGTGTCTGATGCGTTGCGTGTGGGGGCGTT
AACATGTGTTGAACCCTCTATAGCTTTAGGGATCCCTAAAGTAAAAATTGTAAAAGATATTCTTTTCCCA
GAAATTTTCCCCCAGCTAATTTTTTCATTAAAGTCGTTAGTTGTACACCTGATTGCTTGCTCTACCTTTG
CAGGGTTTGTTGGGGGTGGAGGATTGGGGCAGATTTTATTGCAATATGGTTACTATCGTTTTGATTTTTC
CATAACGCTATCTGTATTGGTTACTACTTTGTTTTTTATTGAAGGTATCCGGATTTTGGGGGATACTTGG
GGACGGCGTATACTAAGACGTCGGGGGATTCTATGA
>ref|NC_003361.3|:573214-574017 YaeC family lipoprotein [Chlamydophila caviae GPIC]
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AAGAAGTTTTGCGTATCGCTGCCAGTCCAACGCCACACGCTGAACTTCTCTATAGCTTGCAAAAAGAAGC
AAAATCCTTAGGATTACGTCTCCAAATACTTCCTGTAGACGATTATCGTGTGCCTAACCGTTTACTTTTA
GATAAACAAATAGAGGCAAATTATTTCCAACACGAAGACTTCTTAAAAGATGAATGCTCGCATTATCAGT
GTGAAGGAAAGCTGACTGTCTTAGCTAAAGTGCACTTAGAGCCCATGGGGTTATATTCTAATAAGATTCA
ATCTCTTGATGAGCTTAAAAGCAGAAAACAATTACGTATTGCTGTTCCTGTAGACAGGACAAATGAGCAA
CGCGCTCTCGATCTATTGAAAGATTGTGGTTTGATTGCTTATAAAAAATCTTCTCATCTAGATATGACAG
CGAAAGATGTTTGTGGTTGTGGGGATAGAAAAGTTATTGTTATAGAGATTGCAGCACCTTTATTAGCATC
TTCGTTACCCGATGTAGATGCCGCTGTTATTCCTGGAAATTTTGCTATTGCTGCAGGATTTTATCCCTAT
AAAAATAGCCTTTGCTTAGAGGATGTTCACACATCTAAGTATACTAATGTTGTTGTTGTACGCTCTGAAG
ATGTAGATAGTCCGCAAATACAGAAATTACGTCAGTTATTTGAGAGTGCTTCTGTGAAAGACTTCTTTGA
TGCGAAATACAAAGAAAGCTTTTCACTTCATTAA
>ref|NC_003361.3|:574069-574161 hypothetical protein CCA00504 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTTGTTATTCCAATGGCTTTTGA
>ref|NC_003361.3|:574511-574861 hypothetical protein CCA00505 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTCCCTTCCTTAAAAATCGAGAGTTACACAAAACGAAAACTTCTAAAAAAACAGCTTCTACAATTA
AACATGCAAAGCATTACTTAAATGGATATTTAAAGAAAATAGAGCACATTGTCGCTGCCAATCCTAAAGA
AGTAATAGAAGCATGGAATGAAATGTTAGGAACCAAGTATAATGGAATGTTCCAAGCTTTAGGGTTTAAG
GATCATATTCTATTGGTAAAGATTTACAGTTCTTCTTTGTATGCTTCGCTAAAGCAAACGAATCAAAGTA
GTTTAATCGCTCGGTTGCACCAAGTAGTTCCTCACGCTAAGATCAAGGAAATACAGTTTTTGTTAGGATA
A
>ref|NC_003361.3|:574865-577285 DNA gyrase subunit B [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGCGTCCTGGGATGTATATTGGAGATACTGGAATTACAGGACTTCATCACTTAGTGTATGAAGTTGTAGA
TAACAGTATCGACGAAGCTATGGCGGGCTATTGTTCTGAAATCTATGTTAGGATTTTAGAGGATGGTGGT
ATTACTATATCCGACAATGGTCGAGGGATTCCAATACAGATTCATGAAAAGGAATCTAAGAAACAAGGTA
GAGATGTTTCTGCTTTAGAAGTTGTTCTCACGGTGCTTCATGCTGGGGGAAAGTTCGATAAAGATAGTTA
TAAGGTGTCTGGAGGATTGCACGGGGTTGGTGTCTCCTGCGTTAACGCCTTGGCTGAGAAATTAGTCGCA
ACGGTTTATAAAGATAAGCAAGCTTATCAAATGGAATTCTCCAGAGGAGTTCCTGTAACAGCCTTGCAAC
CTTTAGGGGTTACAGATAAGCAGGGAACAGAAATCACTTTCTATCCCGATAACAAAATCTTTTCCTCATG
TGTTTTCGATCGTTCTATTCTCATTAAAAGACTAAGAGAGCTTGCTTTCTTAAATCGAGGTATCACTATC
GTTTTTGAAGATGATCGTGATGTCAGTTTCGATAAGGTTGTCTTTTTCTACGAAGGCGGAATTCAGTCTT
TTGTTAGCTACTTAAACCAAAATAAAGAAAGTCTTTTCCCAGAACCTATTTATATTTCTGGGATCCGCAC
AGGGGATGATGGGGATATTGAATTCGAAGCAGCTCTCCAATGGAACTCTGGATATTCTGAACTCATTTAT
TCCTATGCTAATAATATTCCTACTCGTCAGGGAGGAACGCATCTTACAGGATTCTCTACTGCACTAACTC
GCGTGCTTAATGCCTATATTAAAGCACATAATCTAGCTAAAAATGACAAGTTATCCTTAACCGGTGAAGA
CATCCGTGAAGGGCTCACTGCTGTGGTTTCTGTTAAAGTTCCTAACCCTCAATTTGAAGGTCAGACCAAG
CAGAAATTAGGAAATAGTGATGTAGGATCTGTGTCACAACAGATTACCGGAGAAGCTCTAACGACATTTT
TTGAGGAGAATCCTCAAATTGCCAAAATGATCGTTGAGAAAGTCTTTATTGCAGCTCAAGCTAGAGAAGC
TGCGAAAAAAGCTAGAGAGTTAACCTTAAGGAAAAGTGCTTTAGATAGCGCACGACTTCCAGGGAAGCTT
ATCGATTGCTTAGAAAAGGATCCTGAAAAATGTGAGATGTACATTGTAGAGGGAGACTCCGCTGGAGGTT
CTGCTAAGCAGGGGAGAGATCGTCGCTTCCAAGCTATCCTTCCTATCAGAGGTAAGATCTTAAACGTAGA
GAAAGCTCGTTTACAAAAGATTTTTCAAAACCAAGAGATTGGAACAATTATTGCAGCTTTGGGTTGTGGT
ATCGGATCGGACAACTTCAACTTAAGCAAATTGCGTTATCGACGTATCATTATCATGACAGATGCTGACG
TTGACGGCTCTCACATTCGTACACTGCTATTGACATTCTTCTATCGTCATATGACCGCATTGATTGAAAA
TGAATGCGTGTATATAGCCCAACCTCCTTTATATAAAGTTAGCAAGAAGAAAGACTTCCGCTATATCCTT
TCTGAAAAAGAGATGGATGATTATCTTTTAACATTAGGCGTGGGGGATAGTAAGCTTGTTTTCAAAAATG
GAGGTCGTGAGATAAGCGGAGAAGCTTTGGATAGCTTTGTAAAGCTTATCTTAAACGTAGAAAGTTTTAT
AGTTGCTCTAGAGAAGAAAGCTATACCTTTTTCTGAATTTTTAGAGATGCGCAGTGAAACTTCTGGGTAC
CCTCTATATTATTGTCCTCCAAAAAGTGGAAAACAAGGAGGACGTTACTTCCATTCTACAGAAGAGAAAG
ACAAAGAAGTTTTGTCATCTGAAGATCCAGATTCTGTAAAAGTTGTTGAATTGTATAAAACGGCTGTTTT
TGCGGAGATCCAAGAAGAACTCCGTGATTATGGTTTAGATATTCGTCATTATCTCAATCCAAAAGATTCT
GAGATGGTGATTACAAATGAAGATTCAAAAACGCTTCCATACACTTGCTATACTTTGAAAGAAGTCATTG
ATCATCTTAAAGCCCTTGGAAGAAAGGGAATAGAAATCCAACGCTATAAAGGTCTTGGAGAGATGAACGC
AGATCAGCTTTGGGATACGACTATGAATCCTGAGCAAAGAACTTTAGTACGTGTATCATTGAAAGATGCT
GTAGAGGCAGATCATATTTTTACCATGCTTATGGGAGAAGAAGTCCCGCCAAGAAGGGAATTTATTGAAA
ATCACGCTCTATCAGTTAAGATGAATAATTTAGATATTTAG
>ref|NC_003361.3|:577301-579793 DNA gyrase subunit A [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTAACAAAGAAGAAATCATTGTCCCTAAAAATCTAGAAGAAGAAATGAAGGAAAGTTACCTTCGTT
ATTCTATGTCTGTGATTATTTCCCGGGCACTTCCTGATGTTCGTGATGGTTTGAAGCCTTCACAGAGACG
CATTCTTTATGCGATGAAACAATTAAATCTTACCCCTGGAGCCAAGCATCGTAAATGTGCGAAAATTTGC
GGTGACACCTCTGGAGACTACCATCCTCACGGCGAAAGTGTTATTTACCCTACATTGGTGCGTATGGCTC
AAAATTGGGCTATGCGTTATCCACTGGTAGATGGACAAGGAAACTTTGGTTCTATTGACGGTGATCCTGC
AGCTGCTATGCGTTATACGGAAGCCCGTCTAACTCATAGTGCGATCTTCCTAATGGAAGATTTAGATAAA
GATACCGTAGACATGGTATCCAACTATGATGAGACAAAACACGAACCTGTTGTTTTCCCTTCGAAATTCC
CTAACCTTCTTTGTAATGGTTCCTCGGGTATTGCTGTGGGTATGGCGACAAATATCCCTCCACATAATCT
TGGGGAATTAATTGAAGCTACGCTACTTGTATTAAGCAATCCTAATGCTTCTATTGAAGAAATCTTAGAA
GTCATGCCTGGTCCTGATTTCCCCACAGGGGGGATCATTTGTGGCGGTGAAGGCATTCGCTCTACATACC
ATACAGGAAGAGGTAAAATAAAAGTCCGCGCACGTCTTCATGTAGAAGAGAATGCGGATAAGCATCGTGA
GAATATTATTCTCACCGAGATGCCTTACAATGTAAATAAATCCAGATTAATCGAGCAAATTGCCGATCTA
GTTAATGATAAGACCTTAGCAGGAATTTCAGACGTTCGAGATGAATCGGATAAAGATGGTATCAGAGTCG
TTCTTGAGCTGAAGAAAGGAGAATCATCGGAAATTGTTATTAACCGTCTCTATAAGTTTACTGATATTCA
AGTGACTTTCGGAGCTAACATGCTTGCCTTGGATAAAAATCTCCCAAGGACCATGAATATTCATAGAATG
ATTTCTGCTTGGATACGTCACCGTACAGAAGTTATCCGTAGAAGAACCCGCTACGAATTGAATAAAGCTG
AAGCACGCGCGCATATTCTTGAAGGTTTCTTAAAAGCTCTTTCTTGTTTAGATGAGGTTGTTCGTACAAT
TCGCAATAGTGATAGTAAAGAGCACGCTAAACACCAACTAGTTGAGAATTTTGGATTTACCGAACAGCAA
TCTGTAGCTATTCTTGAATTACGCTTGTACCAATTGACAGGGTTAGAAGCTGAGAAAATTCAAAAAGAAT
ACGATGAATTGCTAAATAAAATTGCTTACTACAAACGTGTTCTTGCTGACGAAGGTCTCGTCAAAGATAT
CATTAGAAATGAACTGCAGGACATTCAAAGAGTTCATAAAACTCCTCGTAGAACTAGGATAGAATTTGAT
GCTGATGATATCCGCGATATTGAAGATATCATCACTAATGAACCTGTAATTATTACCATATCAGGTGATG
ATTATGTAAAAAGAATGCCTATAAAAGTCTTTAGAGAGCAGAAACGTGGTGGTCACGGAGTTTCTGGATT
CGATATGAAGAAAGGCTCTGATTTCTTAAAAGCAGTATATTCAGCATCCACAAAAGACTACCTATTAATC
TTCACTAATTTTGGTCAATGTTACTGGCTGAAAGTATGGCAATTGCCTGAAGGTGAAAGACGCGCCAAAG
GTAAGCCGATTATTAATTTCCTTGAAGGCATCCGTCCTGGAGAACAACTTGCAGCAGTTCTTAACGTTAA
GAACTTTGAAAATGCTGGATTCTTGTTCTTGGCAACGAAACATGGTGTTGTTAAGAAGGTCGCTCTTGAA
GCTTTCAGCAATCCTAGAAAGAAAGGTATTCGTGCTTTAGAAATAGATGACGGCGATGAGCTCATTGCAG
CTGCTCATATTACTAGTGAGGAAGAAAAAGTCATGCTCTTTACAAGATTAGGCATGGCTGTACGTTTCCC
TCATGACAAGGTACGTCCTATGGGAAGAACAGCACGTGGTGTACGCGGTGTTTCATTAAAGAATGAAAAT
GATCGTGTAGTGGCTTGCCAAATTGTTAAAGATGATCAATCTGTTCTTGTTGTTTGTGATAATGGTTTCG
GAAAACGTTCTCAAGTGGGAGACTTCAGAGAAACCAATCGTGGTGGAGTAGGAGTACGCTCTATCCTTAT
CAATGAGAGAAACGGGGATGTTCTTGGAGCTATTTCCGTTACAGATAATGACAGTATTTTACTGATGTCA
GCACAAGGGCAAGCTATCCGTATTAATATGCAAGATGTACGCGTTATGGGAAGATCTACTCAAGGTGTGC
GTTTAGTCCATGTTAAAGACGGTGATATCCTAGTTGCTATGGAGAAACTCTCTTTAAATGAAGATGAAAC
TCTAGCAGATATCGAACAAGAGAGTCCCTCACCACAAGTATAG
>ref|NC_003361.3|:579805-580428 thymidylate kinase [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGTTTATAGTCATTGAAGGATGTGAAGGTTCTGGGAAAAGTTCCTTAACAGAACTCCTAAAAGACAGGC
TAATAGCTGAGGGGAAAGCGGTTGTTGCCACTAGAGAGCCTGGGGGGTCTCCTCTAGGAGAGCGAGTGCG
GGATTTGATTTTAGAACCATCTACACCATCAATTTCCCCTTATACAGAGCTGTTTCTATTTCTTGCTGCA
CGTGCGGAACACATAACTAAAAAAATATTTCCAGCATTAGAATCAGGAAATATTGTCATTTGTGATAGAT
TTCACGATTCTACAATTGTCTACCAGGGAATAGCTGAAGGATTAGGCAAAGAGTATGTGACAAGCCTATG
TCATCATGTCGTAGGAGAGAAAAAGTTTCTTCCAGATTTAACTTGTCTTTTAGATATTCCAGCTGATGAA
GGCTTAAGAAGAAAACAACAGCAAAAATCTTTAGATAAATTCGAAGATAAACCTTTAGCCTATCATACAA
AAATCCGTGAAGGGTTTTTATCTCTTGCTGAAGCACATCCTAATAGTTATCTTATTTTAGATGGGAGACA
ACCTCTCGAAGAGTCTCTTAATAAAGTAATGACAGCCTATACAGAACTCGCGTTATGCAAATAG
>ref|NC_003361.3|:580419-581285 DNA polymerase III subunit delta' [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCAAATAGAAGAAAAGGTTGATAATGACCCCTGGGAAGCCTTACTTGATAATATTAATCAAGGGAAGG
TCTCTCATGCAATTTTATTGCATGGGAATGCATTATCCTTACTTTCACAATATGCGTATGATTTAGCAGC
GCATATCCTTATTAAAGATACTCCTGAAGCACAATATAAAATTACCCAAAGAGTTCATCCTGATATTCAC
GAGTTTTTCCCTTCAGGGAAAGGAAGATTGCATCCTATAGAGATTCCTAGAGACATTAAAAAACAGATAG
GCGTGCTGCCTTATGAAGGGTGTTATAAGATCTATATCATTCATGAAGTAGATCGCATGACTCTTCCAGC
AATCTCTGTGTTTTTAAAAGTTCTTGAAGATGCTCCCGCGCATAGTGTGATTCTACTGACATCGGCAAAA
CTTCAGCGTATCCCGGCAACGATTCTTTCCCGTAGTTTATCTATCTATATTCAAGGCAAGGAAAACGTAG
CCCCAAATGAAGAAGATATAGAATATCTTTTAAACTATGCCTCTGGGAAAATGAAAATTACAGAAGTAGG
ACAAATAGTTAAAGGCAACGCCGATACAGATAAGCAGGTGCTTAGAGATAAAGCTAAGGTCCTTTTGGAA
ATTCTTCTTAAATTATTTAGAGATCGCTTTATGCTTTCTTTAAATATCCCTGCAAGCGCGCTGGCATATC
CTAAATACGCCAAAGACATCCTGAATCTACCTATACTACCTTTAGAAAAGGTATTGATTATTATAGAGAA
AGCTCATCAAGCTTTGGATAACTCTTCATCAGCAACAAGTTGTATGGAATGGGTAGCCTTACAACTTGTA
TCACTGAATAATCGTTTAGCGCGTTAA
>ref|NC_003361.3|:c582004-581282 serine esterase, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGATTATTCATTTTTTCGTCGTAAGTTTGCTGGATTAGACGCCATAGTATGTCCTGGAGATCCTGATG
ATCCCGTTATTATCTTTTGTCATGGCTATGGAGCAGATGCTGATAACTTAGCATTCTTTCCTTCAGCATG
TCCTTTCAAAGGTATACGTCCTACATGGATATTTCCCCATGGGGTAGAAGATCTTTCTTATGAATTTGGA
GAAGGCAAGGCGTGGTTTCCTTTAGATATTCCTTTATTTCAAAGTTTGATTTCGAATCCTGATATTACTC
CTGAGACAGAACAGCAATATCAAACGTTATTTAATATCGACTTTGAAAAGCCAAAAACAGCTTTAGAGAA
TCTTATTGAGGAGTTAGGTCGTCCTCGACAAGATGTTATTCTTGGAGGGTTTAGTCAGGGTGCTATGATG
ACAACGCATCTTGTGCTATCTTCTAAAATTCCTTACCGAGGAGCTTTGATTTGTTCTGGAGCTTTACTAT
TAGATAAAGGGTGGGAAAACAATGTGAATCTTTGTGCGAAAGTTCCCTTTATTCAAAGTCATGGATATCA
GGATGCGATTTTACCTTATTATCATGGGGAAAGGCTAAACAAGCTCCTCTCTTCACGACTCGAGGGAGAT
TTTATTTCTTTTAAGGGAGGGCATGAAATTCCAGCGCTCGTTTTACAGAAAATGCAGGAAACGATTCCTC
TATGGACAAACACTTTAAGTTAA
>ref|NC_003361.3|:582317-583174 Sua5/YciO/YrdC family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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CCTTTCCAACAGATACCGTCTATGGTTTAGCTGTGGCATTAAATTCTCCAAATGCTCAAGAGAAGATCTA
TTCTCTAAAACATAGAGAGCGGGGGAAGCCTTTAGTTATTTATGTAAACACACTTGAAGATATTGAAAAG
TTCTCAGGCTGTCCTTTGTCTTCACAAGCGATGAAACTAGCTCAAGAGTTTCTTCCAGGGCCTTTAACTT
TACTTGTAGATCATAGGAATTCTAGATTTTCTCAAGAAAAGTTAGGCTTTAGGATTCCTTCCCTTCCTGT
AGTAGAAAGGTTAATTGATCTATCAGGCCCTTTATTAGGAACCTCTGCGAATATTTCAAATTTCCCTCCT
GCAGTAGTTTCTGAAGAAGTTGTTGAAGATTTTCCGAATGAGGATATTTTTATTATTCCTGGTCAATGTT
CCTTTGGATTAGAATCTACAGTAATATCTACAGATCCATTAAAGATATATCGTGAGGGGATAATCTCACG
ACAAGCGATTGAAGAGATTATGGGGGAGACAATAGAGCCGTGTGTAACGCAGCATGCATTTTCTCAGCAT
GTTAAAATTTACACGCTAAGAGATAGTGCTGCTTTGAATGAGTTTCTTAAACTCCATGAGGGGTTTCAGG
GTAGTGTTTGTGAAGATCCTCAGCCATGGAATTTCTATCCTACATTACGAAAAGCATTACGATCTTCGGA
TCCCACAGTTATATTTGTTTATAATCAGCAGACATCTTCATATCCGGAGCTTATGTCTTATCTAGCGCCT
TATACCCACACTAGGTGA
>ref|NC_003361.3|:583179-584153 dipeptidase, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATCATAGATATGCACTGTGACCTTCTTTCTCACAAAACTTTTTCTGATCATGATCCTTTTGTCCGTT
GTTCCCCTAACCAACTACTCTCTGGGGGAGTCAATAAACAAGTGTGCGCTATATTTACTGAACATAGCGA
AAGTTCCCCAAAAGCTGACAAACAAAATCAACTATTTTTCAGCCTTCCAGAATCGGATACACGCATCCAA
CTGATCTCTTTTGATTCTGATATTGTAGATCAAGACAACAGTAAAAACTCTCTTTCGATTATTCGTAGTA
TAGAAAATGCCTCAGCATTAGGTTCTGACTACCAACATCTCAGTGAACTTTTGCGTAAGCTTATTCAGCT
ATTTTCCATGGGGCCTATTGCTTATTTAGGTATTGTCTGGAATGGGAGAAATCGTTTTGGAGGAGGGGTT
TTTGATCCCCATAAACTGACTCCTGATGGTAAGCGTTTATTAGAGGTTATGGAGCAATTGGCTATTCCTA
TAGATCTTAGCCATTGTTGTGATAGGCTCGCGGATGATATTCTAGATTATACCCTGGATAAGCTGCCTAC
CATGCAAGTTCTTGCTAGCCATTCTAACTTCCGAGAAGTTCAAAATATCCCCAGGAACCTTACCAATGCT
CATGCAAAAGAAATAGCATCTAGAGGCGGCGTGATCGGTTTAAATATTGTGAACTACTTTGTAGGAGCAT
CTTTAAAAGATTTGCAACAGCATGTCTATCATGCTGAAAAATTGGGGATCTTGGATAAACTCGTCCTAGG
AACAGACTTTTTCTATTCTGATGAACACGAGAAGTTCTTCCCAGAATGCTCTACAGCTAAAGATCACCCA
AATATTCATAGTATTCTCAAAGATAGATTACACGCAAAGGACGCAGAAAAGATACTTTGGCAATCTGCCC
AGACATTTTTAAATGAAACACTGCGTCTTCAAAAAGAAAGAAGAGCCATCCGTTTAGATATATAA
>ref|NC_003361.3|:c585340-584219 hypothetical protein CCA00513 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TATGTCAGGATGCTCATATTAGCCGCAAGGTTGTTAGCATTACCCTTATTGCTGTAGGTATTATTTTAGT
TATATCCGGGATTTTGCTTCTAACTCTTACGATTGCTAGTTTGCCTTCAGCATTCTCTATTGCTTTAGGG
GCTACCGTTCTTGCCTTAGGTGCAGGACTGATCGCCTTTGGGATAGCTATGCGCATTCTTAAAAAGCCGG
CTCCTTCTCATCAAGAAGAAGACGTATTGGCTAGTGAAATCATAAGAATTAGCAGTTTGGTCGAACAGAA
AACAGGTGAGGCTACCCGCCTACAAGAAGAGCTTGGTGAATCTCAAAGACAGATTTTAGCAATTTCCAAA
GAACTTGAAACAGAGAAACGCGGTGCTGCAGATCTACAATTACGTTTACAGGAAGCTGAACAAGGATTAA
CGCAAGCTAGAGAAGAAAATCGTGCACTTCAGGCACGTCCTCAAGAGTCTGAAGCAGCCATTCAGAGAAA
AGAAGAACGTATTCAAGAGCTTCAGGCTGCATTGACTTCGGAAAAAGAAAAGGCTCAGCAACTTGATGAT
AAAGTTAAAGATCTAGTTTCAGACGCTCAAAAAACATCTGTTCAGATAGCCACCCTTAGCGATGATCTTG
CTAGAGCTGTTGCTAACCAAGAAGGTTTAATCAGTAGATTAACTGATGATTTTGAGAAGGAAGTTGGTAG
ATTAAATGGTCAATTAGCTGCAAAAACAAAAGAATTAGATGCAGCTGAATTAGTAATTCAGCACATACAG
AAAAAAATAAGTGAAGGCGAGCAGGCAACGCCTGCTATACCAATGAGAAGAAGTAGCTCGACGCTTTCAT
TAAATGCTGGTATTGATGGCCTTTCAAGTCCACGCTCTCGTTTAAGCGCTTGGTGGGAAAATAGGAAAAG
CTCAAGAAGCTCAAGAAGTGACTCATCATCAGGAGCAATCCCTACTTCTGAAAGTTCATCTTCACGTGAG
CAATCTGCTGATGAAAGAAGCTCACAAAATGATACTGCAGAAGAAGCTGAAGAGGCTAAGGAAGACGTAT
AA
>ref|NC_003361.3|:c586735-585596 hypothetical protein CCA00514 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCTATTCCCGTTGATATTCAAGTCAGAAATTCAGAGAATCAAGTAAGAACGATTTCTGTTTTGGCGA
ATAACCGAAACTTTATTAAAAACGAAAGACAGACTTTCCTAGCTGTTATTGGAGCTTTTGTTCTAGGTAT
TATCCTACTTCTTGTTGGAGTGAGCGTATTAATCCTTCCTTTAGGACTCACCTCAGCCTTAAGTATTTCC
TTGGGGGTAGCAGGACTCGTTATAGGTTCTGTGGTCATTGCCCATTGTCTTAAGGTTGTCTATTCTCAAA
ATGCTGTTTGGAGAAGAAATTATCTAGATATAAAAACTGCTATTAGAGGCCGAGGGCTAATTATTCCAAA
CGAAAAAAATACAGAGACTATTCTTTCCGTACTTTTCCCCTCTTCATTAGATGTTTTGACCTATGGTCGG
GTGCATTGTATGGGGAAAACAAGAACAGTAATCGCAATGACTGAAATTGTTCTCGGTATAGGTTGTATCG
TTGGCGCTCTTATTTCTGAGCTTCTGATCACTACTTGGTTCCGTCCTGGAATCAGTTTAGGGTTAGGCAT
CGCAGGAGCAGCCCTATTTGTTGGCGGTCTTCAAGATATCCGTGCCTTCAGTTTAAGCGCTCAAGGAGTT
GCCCATTTATATTTGATGCAACACGAACAAGATTTAAGAAGAACTGAAAGGATCTTGTTTGAAAAAAGTT
TAGAGAGCGCGGTATCACGCTCAAATCTATTGGAGAGGAATCTTCAGGAAGCTAATACTAAAAACTTTGA
CCTAACAACAGAGCTCATTGCACATAGTGCTCAAATAACGCATTACAAAAATCAAATTTCGAGTTTAAAA
CTAAATCAGCCTATTATCCCCCCACCTCCTACAATCTCCTCCTGGCTAGGCACAATTTCCTCATCTATTT
CGTCTACATCGCAATTTTTAGGTTCCTTCTTACCTAGTGGGCGACAAACTGTTTCTTCCGCTATGGGAGG
GGCAGCAGGCACACCTCCCCTACTTGCTATTACCGCGCCACCTGTCATTGAGAATACAGAACAGGACGAG
GAAACTATAGAAAGCTTATCTATTAGCAACGATAATAACGAATCTGATGAAGAGTTTGAAGACGCTAATG
AAAATATCAATCCTACATAG
>ref|NC_003361.3|:587725-588615 prenyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCGAATAAAGTATTTCAACCAATTGTTAAGCATGAAATATGCTCTATTTTCGGCCATATTTCTATCTG
CGACCACAGTATTTGCTTGTACATTCCCTGAAATTTCCCCAGACTTTTCTAAGAAAGGGTGGGTGACATT
ACTGATAGGAGGGTTTGCTTTTTTCTGTGCGAGAACAGTGGGAATTTTGGTAAATCAGATCATTGATCAC
GCTATAGATAAGAAAAACCCAAGAACCTCTTTTAGGGTATTACCTTCAAAAAAGCTCTCATTCAACTTCG
TTTCATTTGTTGCAGCCCTAGCTTCGCTCTTCTTTGTCATTCTATGTATGTTTTTAAATAAGGAATGTAC
CTGGCTAGCTTTAGTCTCTACTATTCTTATGGTTGTTTATGCTTATGCAAAACGCGTGACTTACTTATGT
CATTGGATACTGGGGTTAATTTATTATCTGGCAATTCTTATGAATTTTTATGCCTTATCCTCAGGCCCTC
TTTCTTTGAAGATGTTTACCATAGTTTCTTTATGGGGGATAACAGCAGCAATGATCATCGCTGCGAACGA
TATTATCTACGCTATTCAGGATTTAGATTTCGATAGAGAAGAAAAGCTCTACAGCATTCCTGCATGTTTT
GGAAAAGAAAAGGCTATCCGCATTGCTTCGGGATGCTTAATCATTAGTTTAATATCTTATATAGTGATGT
CTTTGCTTGCATCTTTCACTAAATTAGGTTGTGTATTATCTTTTTTCCCAGCCTTAGTCATTTGCAAGAC
TATGAAAAACTATCATGGGATGCATAAGAACAAAGCTAATTTTGAAAGATGTTTCTTTAGGGGAAATATT
TACCTTGCTTTATCCTTTTTCGTCGTCATGGTAAGTTTATTACTTTCATAA
>ref|NC_003361.3|:588631-589209 aromatic acid decarboxylase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGACACCTATTCTTTGCTGTCTTTAATTCCTGAAGAGAACCATCCCTATATTCATCAACACAACATCAAA
TCTATAGAGAGTAAATTAGCCTCAGGATCCTATCGCGTAGATGGTACTGTCATTGTTCCTTGTAGCATGG
CAACATTAGCAGCTCTTTCGGTGGGATTGGGGGACAACCTATTAAGAAGAGTCGCTGATGTTGCTCTAAA
AGAACGTAGGAAATTGATTTTAGTTCCTAGAGAAAGCCCCTTACATGCGATTCATTTGGAGAACTTACTC
AAACTATCTCAAAATGGAGCTATTATTCTTCCTCCTATGCCCATGTGGTACTTCAAACCACAAACAGTCG
AGGATATTACTAAGGATATTGTTGGTAAAATTCTATCTTTACTAGACGTAGAAAGTGACTTAGAAAAAGT
TTGGGTAAACCCAGCCTAG
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TTCTTGGAGGGTTTCTTGCTGCTTGCGGCGTTCAAATGGTTTTAGTACCTAATGAGCTTATTGACGGCGG
CATCGTAGGACTATCTCTTATTGCCTCCCATTTCTTTGGTCATAAGTACCTTCCTTTTTGTTTGATATTA
TTTAACCTACCTTTCGTTATCTTGGCTTTCAAACAGATTGGCAAGTATTTCGTTATTCAGATGATGACTG
CCGTTATTGTCTTTTCTTGCGCCTTATGGCTCATTGATTCTCTACCTGTATGGTTTGGATTCCACCCTAT
CGTTTTTAAGGGATCCGAACTGGAAACCGTGGTTTTCGGCGGTGCCATTATCGGGGTGGGGTGCGGTTTG
ATTATCCGTCATGGAGGATCTACGGATGGTACGGAGATTTTAGGAATCATTATCAATAAAAAAAGAGGAT
ATACTGTTGGTCAAGTTATCCTTTTTGCCAACTTTTTCATTTTTGCATTAGCAGGGATCGTTTATCAAAA
TTGGCACACAGCGTTTGTCTCGTTCTTAACCTATGGTATTGCTACAAAGGTTATGGATATGGTGATTTTG
GGCCTTGAAGATACAAAATCCGTCACGATCATCACCTCTTCTCCAAGAAAACTCGGCCATATCCTTATGG
AGAATTTGGGAGTTGGTCTTACGTATATCCATGCTGAAGGTGGCTATTCTGGAGAACAAAGGCATATTCT
TTATATTGTTGTCGAGCGTTTGCAGCTTTCACAACTTAAAGAAATCGTCCACAGAGAAGATCCTTACGCA
TTTATTGCGATTGAAAATCTTCATGAAGTAATCAACGGTAAACGCGCCAACTAG
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CTTTCTCTAAAGAAAAAGCAGCTAGTGTTTCAGAGCTGTCTGAGCAGTGCGAAAAAAGACTAAAGATTTT
ATTAACCAATGATGACGGTATTTTCGCTCCAGGAATGACGCTATTAGTATCTAATTTATTAAAAGCTGAT
TTTGCTGATCTGTATATAGTCGCCCCTAAAACAGAACAATCTGCGAAAAGCATGGCAATGACTTTTCATG
AACCCGTGATTTTACAACCATACGATTATCCTCTGCCTGTTGCAGGCGCCTGGTCTGTTTCTGGAACTCC
TGTAGATTGTGTGAGAATCGCTTTAGCGTATCTGTTTAAAGATGAATTGCCTGACCTCGTATTGTCCGGA
ATTAATCGCGGATCTAATGCAGGACGGCATGTTTTTTATTCCGGGACCCTTGGAGCTGCTATAGAATCTA
CTCTATGTGGAGTTCCTGCGGTAGCACTTTCTCAAGAGGGGAACTTTAGTTTTTTCCAGGAGAAGAATTT
TGATATCCCAGAAATGCTAAAATCCCTATCTCTATATGCTCTATCCTTACCTTTCGCGCCACATCCTGTG
GCTCTAAATGTCAATTTTCCAGCAAGCAACGAGCGTTGGAAAGGTATGCGATTTGTCACTACTGGACCAG
AATATTCCTGCGGAGTTCCCCACTTTCTATTTTGTGATGGGGATTCTAAAATCTTTAAACTCAGTGGTGG
TCCTAAGATAGTAGAGGAGATTCCTTCTGAGGAATGGCAAACTCTGAGAGCTAGCTATATTGCTGTATCT
CCTGTAATGGCAACAACTTCTCCTTTAGCAACTTTTTCTTTGGAAGAATTCGAGCAGTTGCAAGTAGGGT
TTTATGATTTTGCAAATAGTTTAGGTATGGAAAATTAA
>ref|NC_003361.3|:c592530-591691 stationary phase survival protein SurE [Chlamydophila caviae GPIC]
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TCTCTAACTTGCTAAAGGCTGATTTTGCTGATCTGTATGTAGTGGCTCCCAGCACAGAACAGTCAGGGAA
AAGCATGTCCTTTTCCTATACCCAACCTGTATCTATCGAAAGCGTTGATTATCCACAGGAGGTTGCAGGT
GCTTGGGCAGTCTCCGGGAGCCCTGTAGATTGTGTTAAACTTGCCCTAGGGGATTTGTTTTATGATTCCT
TCCCTGATCTTGTATTGTCAGGAATCAATCATGGATCTAATGCGGGAAGAAATATCTTTTACTCTGGAAC
CGCCGGTGCCGCTATGGAAGCCATTTTATCTGGCGTCCCTTCTATAGCTTTTTCTCAGGAGCAACACATT
TCTTTCTTTCAAACAGATTCTGCTCCTGAGCTGCTTAGAAAGCTATCCTTCTATGCTTTATCAAATCCTT
TCCCTGTTGTCACGGGTTTTAACGTGAATTTCCCTGCTAGCGAACGCAATGAACCATGGAAAGGTATGCG
GCTTGTTGCTACAGGAAAAGAGTTTGCTTGTGGTTTGCCTAAACTTTTAAGTAGTGATGGGAAACGCAAA
AGTTTTTCCTTAAGTGATTGTCAGGTCGTCATGGATGAAGATATTTCTGAGGAATGCCGTTGTCTTTTAG
ACAACTATATTACCGTTGTTCCTTTGTTAGTAAGAAACTCCCCATTAGCTTTAACTAGCGAATCAGAATT
TCAACAACTACAAGAAACTTTCCAAGAATTTATGTGCTCTGAAGCTGATACCAGGTTGTTTGACGTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c593337-592594 hypothetical protein CCA00521 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTTTGTACACCTATTCTATGTTAGAAAATCACACTAAGATCGTTGTGGCTCTTAGCGGTGGTAAAGACAG
CCTTTCTTTACTTTTAATGCTTAAGGCGATTTCAGGAAGGGGGTTCCCCGAGCTCGATCTTTATGCTGTC
AATATCGGCGGGAAATATTCCTGTGGTGCAGAAGTTAGCCAACAATACCTAGCTAATATCTGTGATAAAA
TTCAGGTCCCTTTTACGTCGATAGCCTCTCCTTATGATCCTGAAGTTCCAGAATGCTATTCATGCTCGCA
AGTTAGAAGACGCCTACTTTTCCAAGCGGCAAAAGAGCTTGGTGCTACTGCGGTAGCTTTTGGACACCAT
CGAGACGATGTAGTGCAGACGGCTTTAATGAACCTTTTACATAAAGCAGAGTTTGCAGGTATGCTGCCTG
TTTTAGATATGGTACATTTTGATATTACAATCTTACGCCCCTTGATTCTTACTCCTGAATCATGGATACG
TAAGTTTGCTAAAGAAAGTGGGTTCGCTCGTGTTACCTGCCGCTGCCCCGTTGTCTCCTTAAGAACAAAA
ACGGAATCCGCTTTAAAGTTGCTGGAAGATGTTTTCCCTCAAGCGCGACATAATATTGCTTTAGCAATTG
AGCAACACGGTTTATCAAAAGCCCAAAAAATTAAAACCAATTAA
>ref|NC_003361.3|:593465-593950 protein translocase subunit, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCAAAAAAAATTAATAGAAATGATCCATGCCCATGCGGCTCTAATAAGAAATATAAGCAATGCTGTC
TTGCTAAAGAAAGTCAATCCGCACGTTATACTTCTGAAGGCAAGTTTAAGTTTTCTGCACAAGTGCTTCC
TTCGGGACAAGAAGGCAGTAGCTGCACACAATTATTTCAGCGTCTTTCTGAAAGCTTAACATCTGAGCAA
AAGCAAGCGGTTAATAAGTACCACGAAATTACTAAGAACAAAACGACGCCTGGGAAGAAAACTATAAAAA
AAGCGCAGGCTGAAGAAGAGCGTTTAGTTTCTGAGCAACTTAAGAAGCATAATTTTCAAGTTATGGAAAC
AAATCTCTCTGCAGATGCTCTAGCTGGACAGATGAATCAAGACACGTCTTTTGTTTCTGAAGACTTCATT
CCTACACAAGAAGACTATCGTATAGCAGAAAATACCGATTCTGACTTGGAAGAAAATAACCAATAG
>ref|NC_003361.3|:594340-595182 hypothetical protein CCA00523 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATGTTGTTGCTGGAAATGTACAAACCAACGACACCAAAGCCAATTCGATAGTTTCTACAAATAGCTTTTC
TGTAACTACGCCGGGGAATGCTTCTTTTAAAGGAGCTATAAATGCTTCCGGTCTTACATCAGCTAACGCA
CTTAAAATAGAGAACACACAAAGCACTGCTTCCATAGATTTGCATGGCAATAGACTCAGTAATGTCGCTC
GCCCTACTCATGATTCTTCACCGGTTCCTGCAAACTATGTGCGTTCTCCAGAATATTTTTTCTGCTCACT
CAACCAATACGGAAGAATCTACATCAATTCATCAACACCTATCCCAATTATAGGACCAGATAGGATCGTA
TACCAATCTCACAGCATTTTTTCTCATATACGATTCGTTGACTACGTAAAACACTCTGTTAAGTCGGTTA
CATATCCAGGAACTCAATGGGTGCAATTGCTAAGCAAAGGGATCTATATGATAGATTTCGGAATTAATAA
GCGTTGGGGTTGGGATAATGGTTGGGGATCGGATGTTGCCCTAGAAGATGCCGATGGTACGATTTATAGC
AACAATACTATCTATAGTGGCGGGGGCTATGCAGACCAAGCTGCTTTAAGCACAGCAGTAAATATTAAAA
ATCCTCCCGCCGATCCGAACTCTGCAATACTTAATCAGAGCAACTTATCAAAATCTCTATTTTCTGCACG
TCTCGCAGGAAATGGTGCAGCATTAAGCGGATTTTATTTCGGTATCATTTTTTACCCCGAGGATAATGGA
TAA
>ref|NC_003361.3|:595185-596048 hypothetical protein CCA00524 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGGCTACTGGGGTAAAAGATCAAAACCTCTACCTACAAAATGCCACATTAAATATTGATGGGAATTTAAA
CATAGAAGATGAATTTAACGCGGATTCTCTGACTGTAAAACAAGATGTAAATTCAGATTGTGATTTCTTT
ATCGGAGGAAATCTTTCAGGAGAAAATGGTTTTTCATTACAAGAAACTATTTTGAACGGAGATATTACCG
TTACATCCTCCGTCACATCTAATTCTCAGACACAGCCGTTGTTTAGTAATGTCTCTGACCCTCTTTCTCA
ACGTGATGCGCTCACATTTAATTACTATAAAAAGCATTGCGTACAAGCCTACACTTGTTTCATAGACTAC
CGTGGTAGAGCTAGTCTTGATGCTAATTCTTTAGTATATCTGAAAACGAATACTTCAAAAGATTTCGAAA
ATTATACCCCTATGTATCGGAATTATTTTAATGTTGATACTCGATATATTCAAATTCGAACTCCAGGTAT
TTATCAGGTATCTTTTGAACTCACAAGAATAGGTGGGCAGCATTCTGGAAATGATGAAGTAAATTTATTC
TTAAGATTAAATTCGGGACCACAATATCAAAATTTATGCATAGCAGACACTCGTGGACATTATAATACCG
ATAGAACGTCTACCTCTCTATATGCCATTTTCTCTGTTACAGATGTAAAAAGTTCTGATTTACCTACAGT
CTCCGTCTATACAGGAGCTCACATACTGTGCATGTTCTCCTCTGTAAGCGTGATTTGGTTCCCATTCCCA
ACAAGATTTTCTGAGGAGGATTAA
>ref|NC_003361.3|:596055-596858 hypothetical protein CCA00525 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTACTGAGAAAAAAAAACAAGCTCTTACTGTAAAAGACCACATAACCTCAAAGAACACTACCGTTACTAA
TCTGACCTGCACAGAAGGAAAACTCAACTGCAATCAAGACTTGTTTGTGGGCCGAGAAATGAATGTGAAA
ATAGGTCCCGATAAGCGTGCAGATTTCTACGGAAGGGTAAATCTAACGAATCACACTGTGATCTATCCTA
ATGGGCTCACCAACACTCAAGAACATGCTCAGCACTATGTTTCCTATGGACGCTTTAAACAAACGAAAAC
CTCAGTTTCTATGCGTTCATCAACTTCGGGAGGACACGTAGGAACAGGAGATGTAAAAAGAAGCTGGGAT
ATTCCTTGGGATCGATTCGGACAGAAAGTTGGTGAAATGGGAATTCCTGATTTAAAAATCAACGGGGGGA
AACTAGAATTTAAAGCTACTCCAGCTCAACCTAAACTTTTCCGAATTAGTGTCGTAATGGCAAAACACGG
GGGGTGGTTAGATAATGGAACAGGAGGGGAGTGTCTTTTAATGGCTGTAGTGGGTGGAAGAAATATATTT
TTACAAGGATCCACGTGCTCAGGCACAAGCTACTACAGACCTAAACCGATGAAATGGATTGCGACCACAT
ATTTTGCCACACAAGACGGATACTTTGTATTAAGGAACGTGAGCTATTCGTGGCGCGCTGCTTCGTTTTC
TTGGAACGTAGTTCAACTACCTTTTTTGAAATAA
>ref|NC_003361.3|:c598272-596890 MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG [Chlamydophila caviae GPIC]
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GTTGCTCTCGAAACCTTGTGGATAGTGAGGTCATGCTAGGTATCTTATTGAAAGCTGGTTATGAAGCTAC
GGAAACCCTTGAAGAAGCTGACTATTTGATTTTAAATACCTGTGCTTTTTTAAAAGCAGCTCGAGATGAA
TCCAAGGATTATCTCCAGCGTATAATTAAGGCAAAAAAGGAAAGTGCCAAGATTATATTAACCGGTTGTA
TGGTGTCTAAGCATAAAGAGGAGTTAAAACCTTGGCTCCCCTACATACATTATGTTTTAGGTTCTGGGGA
TGTCGAGCATATTTTATCTGCAATTGAATCTAAGGAAGCAGGAGAAAAGCTAACTTCTAAAAGTTATTTA
GAAATGGGAGAGATCCCAAGAAAGCTATCAACTCCTAAGCACTATGCCTATTTAAAAATAGCTGAGGGAT
GTCGTAAACGCTGTGCTTTTTGTATTATTCCAACGATTAAGGGTGGTTTAAGAAGTAAATCTCTAGATCA
AATTATTAAAGAATTCCGCCTATTATTGAAAATGGGAGTGAAGGAGATTATTTTAATTGCTCAGGATTTA
GGTGATTACGGTAAAGATCTCTCTGCAGACCGGAAATCTTGTTTAGATAGTGTATTAAAAGAGATGCTCA
AAGAGCCCGGGGATTATTGGATTCGTATGCTTTATCTATACCCCGATGAAGTTGATGATACGATTATTGA
TCTTATGGAAAGTGATCCGCGTCTACTCCCCTATGTGGATATTCCTCTACAGCATATTAATAATCGTGTC
TTAAAAAGCATGTTAAGAACAACGTCTAAAGAGCAAATTTTAGATTTGTTAACTAAGCTCCGTACACGGA
TTCCCCATATTTATATCCGTTCTTCTTTCATTGTTGGTTTCCCTGGAGAGACCGATGAAGAGTTTCAGGA
TCTTGTAGATTTCGTTAGCGAGGGGTGGATTGACAACTTGGGAATCTTTTCCTATTCCCAAGAAGAAGGT
TCTGTCGCAGCAAACATGGCGGATCAAATATCGCAGAGTGTCAAATCGAAAAGACTGAAGATTCTCTCTC
AAACACAAAAGAAAAATGTTGAGAAGCATAATAAGCAACTTGTTGGACAGATTGTTGAAGCTGTTATTGA
TGGCTACCACCCCGATAGTGAACTTTTACTAACCGCTCGTTTTTATGGACAAGCTCCAGAAGTGGACCCC
TGTATTATTGTTAATGAAGCGCGTTTGGTTTCAGGATTTGGAGAGCGTTATTTAATCGAAATTACCGGTT
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>ref|NC_003361.3|:598372-598530 50S ribosomal protein L33 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTTCAAAGAAGCTAAGTAA
>ref|NC_003361.3|:598579-600090 permease, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
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TCTCTCTATTTTCAATAGGCATCATTTCTTTAGTCACTTGGTTGTCCATTGTTTTTATTTCCGTAATTTA
CGGTTTAGAGCAACGTTGGATTCATGATCTTTCCCAGCTTCATTCTCCAGTAAAGATTTTGCCTTCATCC
GCATATTATGACTCTTATTACTACCAAATAGATAGGCATGCGGATCTCTCTCAATATACAACAAAGACTA
TAGGAGAAAAACTCGCTTCGTCTTTTGCCGATCCTTATGATGCAAATTCAGATTACTCTCTGCCAGAGAA
CTTTCCACTACCGGACACAACCCTAAATGGAGAGCTAAAGGATCCTGTAAAAGTCGCCTTTGAATCTCTT
ACTCCCTATCTAAATCAAAACCAGGCTCAGCTTTTGGAATTTGAAGAGGGGATTGGCTATGTACAGATGG
ATAGAGTTCCTCATCCTAATAAGTCAGAATCTCGAACATTTTCCCAATTTGTTGCCTATCCGTCAGACGA
AGTTTATAAAAGCAGAGTACTTCCCTATGAACATACGGACTACGGTTCTAGCATTTTAAATCCTTTTAAT
AGTTCTAATGAAGGCTGGGAAAAAGATTTTGCCTATTTGCAAAATACTTACCGGGGTGCTTCCATTATTC
TTCCTATTAACTATCGTGATATGGGTTATAAAGTAGGGGATAAAGGAGATCTTAGTATTTTCTCTCCAGA
AACTCAGAAGGAAATCAAACACCCCGTATACGTTATTGGATTCTATAATCCCGGTTTATCTCCCATGGGG
AGTAAGATCGTATTTATTGATATGGATCTGGCTTCTCTAATACGTTCGGAATCTACAGGATTAGGGATGC
ATAACGGCCTACATGTTTTCTTCCCCAATACTAAGCAGATAACTCCCATGAAAAATGAGATCGAAGCTAT
CCTGCGTCAAGCAGGTGTGGATCAATACTGGGAAGTGTCATCTCTTTATGATTATCAGTATTTCAAGCCT
ATTTTAGATCAGCTTCGCAGCGATCAGGTACTATTTTTGCTTGTCTCTATTATTATCCTCATCGTTGCTT
GCTCAAATGTAGTGACCATGTCCATTCTTCTAGTAAACAATAAGAAGAAAGAAATAGGGATACTTAAAGC
TATGGGGACGCCTTCACGCAGCTTAAAAATTATTTTCAGCTTTTGTGGGGCACTTTCTGGAGCTATTGGT
GTAATTTTTGGAACAGCTTTTGCTATTATCACGATGAAAAACCTCTCACTAATTACCCGAGGATTAAGTT
ATCTACAAGGCAGAGAAGCTTTTAACTCTACATTCTTCGGTCAAGGATTGCCTCAAGAAATCCATATGCC
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GTTGCTAAAATGCACGTATCGGATATCTTAAAAGCGGAATAA
>ref|NC_003361.3|:600093-600764 ABC transporter, ATP-binding protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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TCTTAGAAGACGACACTGTAGTTAAAAATATCTTAATGCCTGCAAGCATTGCTCGACAAAACATTGCCAA
GGGCTCTTCAGCATATGAAAAAGCCTTGGCGTTAATAGAATCCGTAGGTCTATCCCATCGAATACATTCA
CGCTGTTGCAATCTATCCGGGGGAGAAAAACAACGTGTCGCTATCGCTAGAGCCTTAATAAATGATCCAT
CAATTTTATTGGCAGATGAACCCTCTGGAAATTTAGATGATCAAACTTCAGAATGCATTCACGATCTTCT
TCTATCTCAATCACATCATTCACGTGGAGTGCTTATCGTAACACATAATAAGCAACTCGCACGTCAATGC
CATCGTGAGGGAGTTTTACAAAACGGGGAACTTGTTTTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c602041-600767 hypothetical protein CCA00530 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AACGAATTCAGGATCGTTTGACTATAGCCATAGTTATGGCTGTTATCTCCGCTATTAGTTTGATTATAGC
TATTATTCCAGCAATTATTATGGCGACTCCTATAGGATTTGTTTGGGCTGGAACTTTTGGTACTATAGCT
CTTGCATTATTTGTTTTTGCGATGATCACGAACTATTTAAGAAAGAATATGCCTGAGGGATTTAAGGAGG
TTCTTAAGGAGAACTATCCTGATGCTTTTTGTAAGTTTATTCAGAAGAAGCAGCTCACTATTCAAGAAAT
ACGTCTATTGCTTCATCGATTGGAAGAGGTTGGTGAGGATAGGGGGATTGCTTTCCATAAGTATTTAGGA
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AGGTAGATCTTGCTTCTTTGAATTCTGTATTAACTAGTAACTGCCCTATATACTGGTTGAGAAAATTTAT
AAAAATAGCTCCAGAATCCCCCACTAGAGATTTTGTTAATGCATCCCATCTAGAAATAGCCTCCTATTGG
TTAGGAAAATCAGGAGGCTGTAGGAATGCAGGGACTATTTTTTCGAAAAACACTCATCTTATTGCTCAAA
GGATCTCTAGAGAGGATTTTGAGGCATGTGGTTTGTATGCACGTAATGCAGATTGGGGAAACGAACAAGT
AGAGGAAATAAAACATAAAATATCAGATGCGTGTTTACAGATAGGAAGGCAGGGAGATGAGGATTCAGGT
ATTGATGTTACACAGTTTTTCACGGGGATTCAACATTCCCTTTTAGAGCTATGTACACATGGCATTTCTT
GGGATCAGCTTTCTTTAATTAAATCATTGGATGTTGAGAACTGGGATTTTCTATGTGCTCTTGACGGTAG
TAAACAAGGCGTGCGTAGATTTGCTGTCCCTTGCCTTGGAGAGGTTTCTGATGAGCAGAATCATTTGTAC
GAACCTTTAATTTCTCTTCTAACGTGGAGAGATTTCGATAATTTAGGTCTGAAAAAAGAATCCATTTTCA
CGGGAGAAGTAAGAAACCCTGAGAGTAGACTTCTTAAATACTTTAACAGACAATCACGCTATCATAAATC
TATAGACTTCCTAAATCAAGAGCAGGTTTTAGATAGTCTTCCTAGATACTCTTTAAATTTATCTACAGGG
GAAAAAAGAGAATAA
>ref|NC_003361.3|:c602387-602238 hypothetical protein CCA00531 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTTTATTTTTTTTATTTTACAAAATTAGAAAACAGCTACTCTTTTCTTTCTTTTTAAGAATCTTATTTAC
AAAGCTATAA
>ref|NC_003361.3|:602542-602994 50S ribosomal protein L13 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTATCGATGCTACAGGCAAAACCTTGGGGAGGCTTTCTTCAGAGGTGGCAAAAATCTTGCGAGGCAAGCA
TAAAGTAACTTATACGCCTCACATAGCTATGGGTGATGGTGTTATCGTTATCAATGCAGAGAAAGTGCAT
TTGACAGGTGCTAAGAAAGGTCAAAAAATATACCGATACTATACAGGGTATATTTCAGGAATGCGCGAGA
TTCCTTTCGAAAATATGTTAGCTAAAAAACCATCTTATATTATCGAGCACGCAATTAAAGGTATGATGCC
CAAAACTCGCTTGGGTAAACGTCAGTTGAAATCCTTAAGAATATTAAAAGGGGATTGCTACAAAACGTTC
GAAGCTCAGAAGCCGATTTTATTAGATGTTTAA
>ref|NC_003361.3|:603008-603412 30S ribosomal protein S9 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTCGTCCAGGAACTGGTAAAATTGATGTAAACGGAAAAGCCTTTGAAGAATATTTTCCTTTAGAAATTCA
AAGAGTTACCATTCTTTCCCCATTAATGAAAGTTCTCGGAACCACCAATGAATGTGATCTGATTATCCGC
ATTAATGGCGGTGGAATTCAAGGACAAGTAATTGCGACTCGCTTAGGGTTGGCAAGAGCTTTGTTAAAAA
AGAATGTTGATTCAAAACAAGAATTAAAAAGTCACGGTTTTCTTACTAGAGATCCTAGGAAGAAAGAACG
TAAAAAATACGGACACAAGAAAGCACGTAAGAGCTTCCAATTCTCCAAACGTTAA
>ref|NC_003361.3|:c604366-603515 NLP/P60 family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGCTTTTTGGAGAGCGCTTGCTTGTTGGTAAGGATACGTATTATGCCTATTCTCAGTTGGTTCGTGATCA
GGATATTTGGCGACCGTATCCTGTTAAACACATGTCTTCCAAAACCTCTTTTTCTCCCCTGTCTCAATAC
ATCCTACCCAATGCTGTTGTTAGGTCTTTTGAGGCTTTTTTAGAGCCGTGGCATATACCTCTGCCCTATG
GCGCGCCATTATCGATAGATTCTCGAGGGAGGGTAACCCTCCCCGAAGAAGTTAAAAAAGGAATGAAATT
CCCTTTTGATAAGGAAGTTCCTTTTTGTGATGTCAACCATGTGCGTTTTTGTGATGCTCACCCCTCCATA
GATCTTTTGCTTAGGGAAGCTGAAAGCTTTTTAGATATTCCCTATGTGTGGGGAGGACGTTGTGTTCACC
ACTCCCTCATAGATTATGGATTAGATTGTTCAGGGTTTGTGAATATTCTATTTCAAGCCCATGGATTGAG
TATCCCTAGGAACGCTAGAGACCAATACAAGGATTGCGAGATAGTCGAGTGTTTTGAAGATCTCCCCCCA
GGAGGGCTGGTCTTTCTTAGAAATGATCAGAACTCACAAATTTCCCACGTTATGCTGAAGAAAGACCCCA
CCTCTTTAATTCACGCAACCCAAACCTTAGGGAAAATTGTTCGGGCTTCTTTAGGGGTGGATATAGAGTT
TAGCAAAGAGAGATTCCAGACTCTAAATAATCAAGGCTACACATGCTTTGGAATCCCAAAGAAAAGAAAG
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>ref|NC_003361.3|:c605044-604400 adenylate kinase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTAAATAGTATTTTTTACATTATTATGGGGCCTCCGGGCTCTGGTAAGGGCACGCAATCGCAACGTC
TTGCTAATCACTTAGGGCTTCCTCATATTAGCTCGGGAGACCTTTTCAGATCTGCTATAAAGTCAGCTAC
CCCCCTAGGAAGTAAAGCTGCAGAATACATAAATAAAGGACTTCTTGTTCCCGATAATCTTGTCTGGGAG
ATAGTACAAGAAACTTTAAATAAACCAGGTTGTAAGTCTGGATGTATTATCGATGGATTTCCTAGAACTT
TAGATCAAGCAGTCCTTTTGAATGATTTTTTAGTTAAATCCAATGCAGCAGATTATCGTGTAATACAATT
AGATGTTTCTGCTGAGGAAATTATTTCCAGGATTCATTCTCGATTTATTTGCCCTGCATGTAATTATGTA
TATAACCAGAGTCAAGGTTTTAAGGAGTGCCCAACATGTCATGTTGCCTTGATTCGTCGTTCTGATGATA
GTTTAGAGGTTATTCATCAGAGACTAGAAAGTTATGAAAAAGCTACAGTTCCTGTAATTAACTATTATGA
AGATCTGGGAAAACTCATCCATATCCCTTCTGAGACATCTCCCGATGAAGTTTTTCAAAGTATTTTAGCT
TGTACGGAAGCCTAA
>ref|NC_003361.3|:605339-606463 hypothetical protein CCA00536 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CGATAACCTAGACATTAATAATCTAGCGATTATAAGCCACGTTTTCACGTTAGAAACGGCTCCTCTATTT
CAGCAAGACACCTCTCCTGTTGTACAACATGGGGCAGAATATTCGGTATGTTCTCTGAGGGGAAGTCTGT
GTTTAAGCTTATCAGAAAGTTCCAGTCTTTTTCTGACGCTAATTCACGAAATTTGCACACTAATTAATGT
TATCTTTCAAAATACGTTCGGCAGTGTAATAAGAAGTACTATTAGTGTCTGCTCGCTTATTCAAAAAAGC
TTTCTTTTCTATCGAAATGAGAAAAAAATCTTAAGAATTATCAAGCAAGACAACACAATATCCGCATTTA
AAAAAGGCGGTTATCTAGCAGCGGCATCAGCATTAAATCATGCTAGAAAAACCGCATCATCCTTACTTGC
CTGGAAGGTATCTGCTCTAGCCACAGCGATACTCTCCGTACTCGCTATCATAGTATTCATTATAGGGTGT
ATATTTGCATTTAACGCTGGGGGCATTTTCTCAGATACCTCCTTTATGTCTCAAGCAGCATGGACGTTAG
GCGCTGGGGGACTTGCTTTTCTTCTTTTAGGCCTACTTTCCATCCCACAATCTCATTGTAGTTATTACCG
CCGACAAGCGGCTATAGACTCTATTCATCGTTCGCTGCTGTGTCTCCACATTAGCGAACAAATTCGTGTA
TCATCTCAAGATTCTGATAACCTCTCCTCTGTAGTAGCCAGAAACTGTCTGAGTCCCTATAGCGATCTTT
TAGATCCTCAAGTTTTCCCTCCTTTCATTCCCTCTGAAGAATCCACGAGAAATCACCCTATAGAAAGACA
GTATCTACACACAAATAGCCTGTCAGATCTAATCGCTTCTCTTGCTATTGATTCTAGAGAAAGCTCCATA
CCTCTACCGCCTTCTTTGCCTCCTCCTTATGCAGAACTTCCACCAGCCTATGAAGAAGGTTTTAGAAGAA
GATAG
>ref|NC_003361.3|:606518-606940 hypothetical protein CCA00537 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCGTGTTATTTAACTTTTGGCAATGAAGATATTAGCGGTTTTTCAACATCGCAAAAAACTTCGTGTG
CAGTTTTCGATCTTATTACATTTCCTGTAGTTTCTATAGTTATAAGCATCTTAGCCTGGGCAATTTTACT
TATAAAAATAGTAGCTAAAACATTGAAATTCCTATTCCAGCTCATTACGGCTCCATGTAGAGGGGATGAT
GAAGTATCTTTACGACGAGCTTTCGGTAGATTAAGAACAGAAATGATCACAGAACATCTCATCCTACTAC
CTTTGATAGGCTCCATTCTTCAAGGATTAATCCTCGTTTATAGGGCAGATCAAAATGGCTATGCAGAGCT
AGGATCTTTAGATTCAGCTGTTTGCTTCATGGAGAGCAGTCCAGCATATTTAGCCAATCTAGTTAAATGG
TAA
>ref|NC_003361.3|:607059-608180 hypothetical protein CCA00538 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCGTCTACTTCCTTAAACAATAAGCTCTTAGCCTCTAACGAGAGTGCTCGTTCGACGATTTTAGATC
TTACGGACCATGGACCTCACAGTTTTACAGAATTACCTATGAGCTCCCCTGCTCATACTTTTCTAATTTA
TCGATCTAGCGCAACATCTGCAGCAATAAATAATTTAGCAACGACGTGTCCTGCTTTGCATCCTACAGGC
ACCTCTTCAGAAATGGAAACGGCTTTCGCGATGATGTCGGCTTCAAGTGCTGTATGCCATTGTGTTGAGC
ACATTCTTTGTGCACATGCTCTATGTCATATATTGAATGGGGCGGGATCCGGGAACTCTGGCGACTCTGT
TATCGTTGCTGTTATTTTTGGTATCTTTGCCACTTTAATTTTAGCAATTTTCGGTTCTTCTTTAGGCTCT
GCTATTTTAAGCGCCGTGAAAATCCATAGTGTCTCTAAAACGATCTCTAAGTTACAAGAGTCTAATAATG
AGATTATTCAAGATTTAGCAGACTCTCGCGTCAATGATCAGGCAGGCGCCAGATCAAAAGCTGCTGCGCT
ATTAACTGTAGAGGGGAATAAGGAGTTAGTTTCCGCCTACAAGCACTACAGAGCTTCCAAAATAGCCTTC
TTAGTGTGCGCTATTATTTGCACCCTGGCTATAGCGGCATTAGCTGCTGCTGCTGTATTAGGTGTTTTCT
TCTCTGGTCCTTTAGCTGCTGCTGCTATTTCCGCTGCTATTCTTGGTTGTTGCGCTGCAGGAGGAAGCTT
AATAGTTGTTGCCTTCATAGGCTTTATGATTGCTTCGGTATATATGGCCAAAAGACAACAAACTGCTGTC
GCACATTTAAATACTGCCACTCTCTATGCTATGGTCGCAGACCAAATCCTGAATAATCCTGAGGACTACG
ACGGAAATGCGATGAGCCGGAGGGTTACGCGCCAGGTTCTAGCAAAATCTCCTCAAAGGTTATTTAATCA
AATGGAGCGTGCGTATCTAGATATAGAAAACCTTCTACATTACTCCAGACAGACATCTCCAACTCCAAGT
GCCCCTCCGCCTAGTTATGCAGATCTGTATGGAAGCGGCCTACCTCCAAGTTATGAAGAAGCTACGCGAT
GA
>ref|NC_003361.3|:c609020-608244 6-phosphogluconolactonase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCAACATTAGTGAATTTTAACGATACGAATAAACTCCTCCTCACGAAGAAACCCGAGTTGTTTATTG
ATCTGGCTAGTAAGGATTGGATAGCAAGTGCTAATAAATCCATTAAACAGCGCGGAGCTTTTTATGTTGC
TCTTTCTGGAGGGAGAACTCCTTTAGAAATCTTTAAGGAAATTGTAAAAAACAAAGATAAGATCTCCGAT
CCTACTAAGATCTTTCTATTTTGGGGAGATGAAAGAAATGTCCCCCACACATCTTATGAAAGTAACTATG
GTCAGGCCATGAGTATTCTTCGGGATTTGTATATTCCTGAAGAGCAGATTTTTCGCATGGAAACTGAAAA
TCCTGACGGAGCAAGAAAATATCAAAACCTTATAGAATCCGTAGTTCCTGAAGTAAGTTTTGATATGGTT
ATGCTCGGGATTGGTGAAGACGGTCATACCCTATCCCTATTCCCAAATACACAAGCTCTAAAAGAACAAG
AGCGTCTAGTCGTATTTAATGAAGTTCCTCAATTAGAAACTGAGAGAATGACTCTTACCCTTCCCACTGT
GCACAAAGCAAAACACATAGTTGTCTATGTTCAAGGAGAGAATAAAAAAGCTATCGTAAGTAGCGTATTT
TTCCCTAAAGATAAGCAACCGCAACCCTACCCTATAGAGCTGGTCGGACAAGCAAAAACGCCTCTATTTT
GGATTCTTGCTGCAGATGCTTATGATTCGAAAGATTTCGACTCGATTTCCCCACTGTATAAATTAGATAT
TATCTAA
>ref|NC_003361.3|:c610579-609044 glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACAAGTAATGAAAATAAAGATGGCGGGAAAACCTTGCTCCCATGTCCTCCCTGTGTGATGGTAATCT
TCGGAGCTACCGGAGATCTTACAGCGCGCAAGTTATTCCCAGCATTGTATCATCTTATTAAAGAGGGTAG
GCTGTCTGAAAACTTTGTCTGCGTAGGTTTTGCTAGAAGAAAGAAAAGCCATGAGGAATTTCGTGAAGAA
ATGAAACAGGCAATACAAAACTTTTCACGTGCTCAAGAGCTTGATATCCGCATTTGGGAAGAGTTTGAAT
CACGTATATTTTATCACGAATCCAACTTCTCTTCTCCCGAGGGCTACGCCTCATTAAAAGAGAGACTTGA
GGATATTGATAAGAAATATAAGACACAAGGGAATCGGCTATTTTACTTATCAACGCCTCCAGAGTATTTC
CCCGAGATTATCGAAAATATTAATAAGCATAAGCTTTTTTATCATGATCAAAGCGAAGGCAAGCCATGGT
CTCGAGTGATTATAGAAAAACCCTTTGGTGTGGATCTACAAAGCGCTAAAGAACTACAAAAGTACATAGA
TGATAATCTAGATGAAGATTCTGTCTATCGTATCGATCATTATCTGGGGAAAGAAACTGTACAGAATATT
CTTACGATACGTTTTGCAAATACTCTATTTGAGTCTTGTTGGAATTCTCAATACATTGATCATGTGCAAA
TTAGCGTGAGTGAATCTATAGGCATAGGCACACGAGGGAACTTCTTTGAAAAATCTGGAATGCTTCGTGA
TATGGTGCAAAACCATATGATGCAGCTTTTATGTCTATTAACTATGGAACCTCCTTCAGTATTCAATTCT
GAAGAAATTAAAAAAGAAAAGATCAATATTCTTAAGAAAATCCGTCCATTTGCTAAAGAAGATATTATTC
GTGGACAATATGGTCCGGGAGAAGTACAAGATGTGTCTGTTCTTGGCTATCGTGAAGAAGACAATGTAGC
TCCAGATTCTAATGTGGAGACTTATGTAGCGTTAAAGATGTTTATTGATAACCCACGTTGGTTGGGAGTG
CCTTTTTATCTTCGAGCCGGTAAACGTCTTTCTAAACGCTCTACAGATATCTCTATCATTTTCAAAAAGT
CTTTGCCCAGCTTATTTACAGCGGAATCTTGTCCCGTATGTCCTTTAGAAAATGATCTGCTAATTATCCG
TATACAACCGGATGAAGGCGTGGCCTTGAAATTTAACTGTAAAGTTCCTGGAATGAATAATATCGTACGT
CCTGTGAAAATGGATTTTCGCTACGATACGTATTTCAAGACAACGGCGCCGGAAGCTTACGAGAGATTGC
TTTGTGACTGTATTCTAGGCGATAGGATTCTATTTACCTGTAGTGATGAAGTTATGGATTCTTGGGAGCT
CTTTACACCGATTTTAAAGCGATGGGAGCAAGATTCCTCAGATGCGCATTTCCCTAATTATGTTGCTGGA
TCTTCAGGTCCTAAGGAAGCAGAGGAATTACTACAAGCTGATGGAAGAAGTTGGCGTCCCCTGTAA
>ref|NC_003361.3|:c612464-610878 peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCGCAAGATATCATTGGGAATCTATCTCAGCTTCCTTGTCTCCTCTTCCTTAGTGCTTTATGGATGTA
ATAATTTTCGAAAATCACAAGATCACCTCTCTATAAATATGAAAGACGACCCGAGGTCTTTAGATCCTCG
CCAAGTTCGTTTGCTCTCTGATATTAATCTAATTAAGCATATTTATGAGGGACTGGTTCAAGAAAATACT
CAGACGGGAAATTTAGAACCGGCACTCGCAGAAAACTATTCTCTCTCTGAGGATGGAAAGACCTACACCT
TTCATCTAAGGCAAGCTTATTGGAGTAATGGCGATCCCCTAACTGCTGAAGATTTTATTGCTTCTTGGAA
ACAAGTGGTAAGTCAAGAAGTCTCTGGAGTGTATAACTTTGCTTTCGATCCGATTAAAAACATTAAGAAA
ATTCAGCAAGGAATGCTTCCTGAGGAGAATGTAGGCTTTTACGCTAAAGATGATAAGACGTTAGTCATCG
AACTAGAATCTCCAACCTCGCATTTTTTAAAACTTTTAGCCTTACCTATTTTTTTCCCTGTTCATAAAGA
ACAACGTGAGTCACAACTAGCTCTCCCTATCGCCAGTAGCGCCTTTTATCCTAAACAAATTAAACAAAAG
CAGTGGCTGCGTCTTGAGAAAAATCCTCATTATTACAACCAAGAGGCAGTAAAAACTCAAACGATCACAG
TGCACTTTATCCCAGATGCAAATACCGCAGCTCTGTTGTTTAATCAAGGGAAGTTGCATTGGCAAGGGCC
TCCTTGGGGAGAACGTATCCCAACTGAGACGCTATCTCATCTGCAATCCAAAGGAAGTCTCCGCTCTTTT
GACGTTGCAGGGACCTCTTGGTTAACTTTCAACGTAAATAAGTTCCCTCTTAATCATGCGAAGTTAAGAC
AAGCACTCTCTTTGGCTTTAGATAAGGAATCCTTGGTTTCTACAATATTTTTAGATAGAGCAAAGCCCGC
GCTACATTTGCTGCCAAATAACTTGCATACCTACCCGAATTTAGAGCTTCCTTCTAAAGAACAGCGTAAG
CATCTAGCGAAAAAGCTCTTTCAAGAATCTTTAGAAGAGCTGAATATCACATCAAAAGATTTGGAGAGCC
ACTCCTTAGTCTTTCCTTCAGGTTCCTCTGCAAGTGCTTTACTTGTTCAGATGATTCGTGAGCAATGGAA
AGATACCTTAGGATTTTCTATTCCGATAGCAGGAAAAGAGTTTGCTCTTTTACAAGCAGAATTAGCTTCG
GGACATTTTTCATTAGCTACGGGAGGATGGTTCGCAGATTTTTCTGATCCTATGGCATTTCTAACAATTT
TTGCTCACCCTTCCGGAGTGCCTCCCTATGCGTTAGATCATAAGGACTTCATAGAGCTCCTAACCACTAT
TCAAGAAGAAAGGGATCTAGAAAAGCGTAATGAACTCATTTCACAAGCCGCTTTATATTTGGAAACTTTC
CATATCATCGAACCGATTTATCATGACGCTTTTCATTTCGCATTAAATAAAAAGTTATCGAATTTTAACT
TTTCCCCTACAGGAGTCGTGGATTTCCGTTTCGTTAAAGCACCCTAA
>ref|NC_003361.3|:c613444-612410 O-sialoglycoprotein endopeptidase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTATGGCTAATGTCGTCTTCTCTCAACAAGATCATGTTGCCTACGGGGGCATTGTTCCTGAACTGGCCTC
CAGAGCTCATCTAAGGGTTTTCCCCTCTGTTGTGGATTCTGCTTTAAAAGAGTCGGGAGTTTCCCTAGAG
GACATTGATCTTATTGCAGTAACACATACCCCAGGGCTAATAGGTTCGTTAGCTATAGGCGTGAATTTTG
CCAAAGGTTTGGCGATAGGATGTCAAAAGCCCATCATTGGTGTAAATCATGTCGAAGCTCATCTTTATGC
AGCTTATATGGAAGCAGAAAATGTGGAGTTTCCTGCTTTAGGCTTAGCGGTTTCCGGAGCGCATACGGCG
ATGTTTTTGATGGAAGATCCTTTAACATATAAGTTAATAGGAAAAAGCCGAGATGATGCTATAGGAGAGA
CTTTTGATAAGGTGGCAAGATTCCTGGGGCTTCCTTATCCCGGAGGCTCTTTAATAGAAAAGCTTGCCTC
CTGTGGATGCGAGGAATCCTATTCTTTTTCACCCTCTAAAGTTCCCGGTTGTGATTTATCCTTTAGTGGA
TTGAAAACCGCTGTTCTTTACGCAATTAAGGGAAATAACAGCAATAGTCGTACCCCCCTTCCAGAGCTTT
CTGAAGCGGAAAAAAGTGATATCGCAGCATCTTTTCAAAGAGCTGCTTTCACGAGCATTGCACAAAAACT
TCCTAATATTGTAAAAAAAATTTCGTGCAGATCGATCCTGGTCGGAGGGGGAGTAGCAAGTAATAAGTAT
TTCCAAAATTTATTAAAAAATACTCTAAATTTGCCTTTATACTTTCCCTCTTCTAAGTTATGTACCGATA
ATGCTGCGATGATCGCAGGATTAGGACGAGAGCTGTTTCTTTCAGATAAATCTACTATAGGAATTCATCC
ATGCGCAAGATATCATTGGGAATCTATCTCAGCTTCCTTGTCTCCTCTTCCTTAG
>ref|NC_003361.3|:613527-613970 arginine repressor [Chlamydophila caviae GPIC]
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AAGAAATTTGCGAAAAACTCTCTTCCTTAGGAATTGCAACGACACAATCTTCTGTGTCTCGCTGGCTAAA
AAAGGTTCACGCTATAAAAATCCCTGGGGACAAAGGTGCCCGCTACTCTCTTCCTCCCTCAATAGACGAC
TCTAGCATCAAACATTTGGTCTTTTCTATCCGTCATAATTCTTCTTTAATTGTCATACGCACAGCTCCTG
GTTCAGCTTCCTGGATAGCTAGCTTAATTGATAACAAGTTTGCAGAAAGCATCTTAGGGACTTTAGCCGG
TGATGACACCATTTTCATCACACCCATCACAGAATCAACAATTTCCTTAACAGCCAAAGATATAGAAAAC
TTCTTGCTAGTTTTTTCGGAATAA
>ref|NC_003361.3|:614016-614669 amino acid ABC transporter, permease protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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TCTCTATATTGTTTGGCTCCTTATTAGGTTTAATTATCGGAACGATGACATCGCGTTATTTTCCTTGTCG
TATTACGCGCTGGCTAGGAAATCTCTACGTTACGGTAATTCGGGGCACACCACTATTCATTCAGATTCTT
ATATTCTACTTTGGTCTTCCTTCCATCATTAGGTTGGATCCTACACCATTAATGGCGGGGTTAATTGCTT
TAAGCATTAATTCCTCAGCTTATCTCGCTGAGAGTATCCGTGGGGGAATTAATGCTCTATCTGTAGGACA
GTGGGAATCTGCCAAAGTTTTAGGTTATAAAAAGTCGCAAATTTTTGCGTATATCATCTATCCGCAAGTG
TTTAAAAATATCCTACCTTCTTTAACTAACGAGTTTGTTGCCTTGATTAAAGAAAGTAGCATTTTAATGG
TTGTAGGCGTTCCTGAGCTTACTAAAGTGAGTAAGGATATTGTTTCTAGGGAGCTTAATCCTATGGAGAT
GTATAGCATCTGTGCAGCTTTGTATCTGCTTATGACATCATTATTTTCTTATGTCGCTAGATTACTAGAA
AGAAGGAGGGGTTATGACTGTTAA
>ref|NC_003361.3|:614659-615339 amino acid ABC transporter, ATP-binding protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACTGTTAAGGTTAGAAATCTTGCTTATTCGATAAATGATAAACTCATTTTATCCAACGTATCGTTTT
CCTTAGAAGAAGGGCATATCACACTCTTTGTTGGTAAGAGCGGTTCTGGGAAAACTACAATATTACGTGC
TCTTGTTGGCTTAGTCGAGCCCTCAAGTGGGGACATCTTGATAGAAGGCGAGACTCCCGCGCTAGTCTTT
CAGCAGCCGGAGCTTTTCCCTCATATGACAGTTTTAGATAACTGTATGCATCCGCAAATGAAGGTGAAGC
ATAGAAGTAAAGAAGAAGCCAAAGACAAGGCTTGTAATCTTTTAAAACTTTTAGACATTGAAAACATTTC
CACAAGTTATCCACACCATCTTTCTGGAGGACAAAAACAACGTGTAGCTATAGTCCGTTCTCTATGCATG
GACAAGCACACGCTGCTTTTTGATGAGCCGACATCTGCATTAGATCCTTTTTCAACATCTACATTTAGAC
GTCTTCTTGAGTCTTTAAGAGATCAAAATCTTACACTAGGAGTATCTACTCATGACATGCACTTTGTTCA
GGGATGTTTAGATCGCGTCTATCTTGTAGATCAGGGAGAAATTGTTAGCACGTATGATAAGCGCGACGGC
GCTTTAGATGATGATCACCCTTTAAATCTTTATCTAAATTCCGCGCGATAG
>ref|NC_003361.3|:c616752-615379 hypothetical protein CCA00546 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGAAAGCGAAATTCTTTCCTTAACCCTACGGCTAACAATAAGAGTAATAGGAACGAGCCTCTGGCTT
CTATGATTCAAAAGACCATAACTATGGTAGAGAGGATAAAGGGAAATTCACAGGATCTTGTGGATTTAGA
TATCCATAAGATTCACGCAGACATTCAAGGGATCAAGACCGTTTTAATGAAACATGCTGAGGACATTGAT
AGCTTAAATACAAAAACAACGGAGGAGAAAGTTCAAGCTTTAGAAGCGGATACGCGTCTTATGAAACTCT
CTCTTCAAAGTCTTTTAGAAGAATTGAGGGAGTTAAAGACTCTTATAGGAGAAGGTATTGATGAGTCCAT
CAATGATCAAAGCTACCTTGTTCGAGATGTTTTGATAGAGATCTATGAGAAATTCTTACCTCTATCTGGA
GGTAGGCTCTTGGGAGATATTGATATGAATAATCATACGATTTCAGGATTAGAGACTCCTAAAAATCCTA
GAGATTCTCATGCAGCATCCGTAGGGTATGTAGGGAAACAGTTATCTCCTATCCTGGATAAGCTTAACGA
AACATACGAAAAAACTAAAAGGCATGACAAAGCGATAACAGGTTTTAATTTTCAAGTGATGCCGGTATCC
GGGGGGAAATTTCGTGGTATTGTAGATATGGATGGTTATAGAATTACAGGATTAGCAAACCCTGAAGAGC
GCTCCGATGCCATATCTTTAGGTTATCTCGAGCGTTATTTAGAACACCGAGCTCTTCCCGAGGAAGCTAA
AGAAACTCTACTCTCACCTCAAATTACACGTATGGAAACCAATCTTCTTTATTCAACAGGATTGAGTCAT
AAGGTGGACTACCCTCTTCCTCTAGAGATTCTTTCCCAAGGAATACTAGGCTTTACTTGGGAAACAAAAA
GCTCAACACTCTCAGGGAAATTTCCTCTAAATTCTTTAAAGCATACCTTCTCTAATGAGGAGCGCCGTTG
CTTTGTATTAGATGATAACGTTTTATACGGGAAATATTCGGGAATCTATACTTGGGAGCTCACTCTTAAA
GCTTTAATTCCCTCAGTGTTAGAATGTAGAGCGCCTAGCGTCAAATTGAGAGCCTGTTATGACTATCCTT
CTTGGAATCATAAGGAAGAGCTCCAAAGTAGTACAAGCTATATAGAGATTCCCCTATATTCTGTAGGCAC
TATGATGGTAGGAGGACATAGTTACGATATAGTCGAGCTGTCTCCTGGAAATTCTCAAGTATTTACCGTT
CCGAAAAACTGCGGTGGTGTAGCGCTGTATTTAGAAAATCATAAAGAAGGCGCCTGTCCTCAAGATCTTT
ATGTCGTGCAAGCTGCCTACTCCTGTAGTTGGCGACAGTACTAA
>ref|NC_003361.3|:c620286-616837 hypothetical protein CCA00547 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATTTCCTGCCCCCGCTGCTTTCTAAAGGATCCGGAAAATATCTCTTTCTATCTTTGGTTCATAAGGAAAC
AGGGCTTTCCTGTGATGTTGAAGATTTGCAGTTATCATGGTTAGGACCTCAATATGCAAAAAAAGTCAAA
GTTGTTGGGAAAAATAAAGAGGGGGAGCTGTTCTCTGCGGAGAAGATAGAAGTTAATGGGTCTTTATTGA
GATTACTTCTTTATAAACGCCCTAAAGGCATAGCCTTATCAGGATGGTCATTACAAGTTGATGAGTCCTC
AACTATAGAAAAACCCTCGGTAGGGCATCTCGATCCAGGAGTGTTTCTTTCTTATTTAGCACATAGCTCC
ATACTTTCCGAACATGGCTCTATAAGCATGAAGACGATTAAAGGGGCTACATTAGTGCTTTCGGGATTTT
ATGTTGAAAAGACTCCAGAAAAGCTCATAGTTAAAGGGATTGTTACCGAAGATAATGTTAGCGGAAGAGT
ATTCATAGAGAGTATAGTGACTCCTAAGGTTAATATTGTCGCAGAATTCAACTCCGTCCCTGCATCCTTT
TTTAAGTTATTCCTAGCCTCCCCTGTTATGGATCGTATGCTTTCTGAAGAGGATGTTATAGATCTTCATG
CTGCTGCTAATCATAGTAACGGTAAAATCCTTATGACAGCAACAGCCCAGGGAAGCCAAATTCAAGCAAA
GCTTCAGGGATATATTCACCAATCTATATTTTACATAGTTGAGGGCAGCCCCTCATTTATAGAACTACAA
CCGAAAATTGCTTCCTTACTATGCTCGGAGTTATTTTCTTGTCCCACGCGAATTTCTAGCCAGCAGATCC
GCGCTCATGTCGCTAATGCAAAGATTCCTTTAGACTTCACCCAATGGAGAGCTATAGAAGCGAACTTACA
GGCTAATCTTCCCCTGGTTTCACTATCCCCGAAAGACCCGAATCTTTCCATACAGATGAGAAATGTCAGT
GTGGGAATTAAGAAAAGCGCACGCTATACACATATCCGTGGATCTTCGGTAGCTGTATTTGGAGGCGCTG
CACAATCCTATATCAATGGGATGATGACCATTGATAGTAAAAAACATCGTACGGAATTTCTTCTACAACA
ATCGATGCTACCGCATACGTATTTGCGTGCGTTATTCCCACGACCTTTTATCATTAATATCCCCCTAGAA
GTTCCCTACTATTCTCTAGAGATTCGAGGGGAATATAAGAATTCACAGTTAAAAGCTGAGGCAGATCTCG
ATAACTCCCTATTAAAGATGAATTGCACATCCTCAGGAACCCTACAAGCTTTGCTATTTCAAGGTAGTGC
TACTTACCATCTCGAAGACAACTTAAAGAAAAAATTTTCTCAACAATTCTCTTATGCTGAAGCTACGTTT
TCAGGAAAAGTACAAATAGCGAAAAAACATATCTACTTCCCCAAATTTTCCGGAAAAATTACTGCCGGAG
AAAATGAAGTTTTCATTCATGGGAAATTTGGAAGACCTAACGAACCTATACGTCCCGATACTTGCTCTAC
TTTAGTTCATGGCAAGCTTCGTGACTTGCCTTTAAGCATGGTTTCCTCAAAGTTAATTCCCCTACAACTG
ACTAAAGCGAGCTTTTCTTTTCATACAGACGGTGCACGCTATCTTACTAAGGGAAATACACAACTTGTTA
TTGAAGATCCTGAAGATCCTATACTTCCTCCTTCTAGGATCATTATTCCCGATGTTTTGGTCTCTGTTGT
AGATCCTCAAAAGTCTATAGATATCAACAACATAAAAATTCAAAGTTCTGGAGAAATCATAGATTTTCCT
ATCGATAGGCTTCTTAGGATCCAACAAAAAGAAGCCAATTTGTCGACCTATATCGGCCCTACAGGAAATA
TGACATTTTCTGTTCTCTACAATCCAAAAGAAGAAGACAGGCTTGTTCTTCATTCTGCTGTGACAACAGA
AGCTCTTAAGGGTGATATAAATTTGGTTATGGATGATTCCCTAATGCTATCTTCAAAAACACAAGGGACT
TTACAATGGGAGATCACTTCAGAACGCTACGCAAGTTTTTTTGAGAAAGCTTCGTGTGCTCCTTCATGTA
CATTGCATAGAACAGCTATTGCTAGATTGGATATCTACAAACTCTCCTGTGCTGAGCAAAAATCAGGACT
TTCTTGTCTTTCCTTGCTTACAGAAGGTGGTTTTGAAGGCTCCTTATCAACAAACCCTCTGATTTTCTAC
GATTATGTATCTAAAGAAACCTTCATCATTAACAACCTATCAGGATCGTTATATTCAAGTAATCTAGATA
CCAAGGTAGAGTATGATCTTCAGGGAAGCTGTCTTGTGCCCAATCAAGATAGTAAAATTTCCGCAGAATT
TTTTATTCAAGGTTCTGTAGAGCACCTGCTAAACCCCTCAGAAAGGGAATTTAAACAAACTGCAGAATGG
AAGCATATTCCCTCCCCATTCATTACAGGAATTTTCCCCATCTCTCCGAATGTAAAAGTCAAAATTTCTT
CATTGGCGGGGCAAAGAATTCATGTAGGCATGACACATCATTTTCTCAGAGGAGAAGGGCCTATAACGGT
AAAGGTAGATTCCGCGAACCTCCAAGCGTACATCCCACTCATCTTAAAAGAAAACGCGATCCTTTTAGAA
GATGACCTTATCGCTACCCTATACATCAATGAAGAGATTAATAACGCCTTCTTTAAAGAATTTAACCCGC
TAATTTCAGGAAATGCCTATTCACAACACCCCGTATTGTTACAGGTAAGCAAAGAGAACTTTTATCTGCC
GATTTCCCCTTACTCATTTGAAGAATTCCGTATTCAAGCAGCAAGTTTAGACTTCGGTAAGGTTGCCATC
GCTAATACAGGAACTATGTACGATCTCTTCAAATTCCTGGATATTGAAGAGAGTAAACAATTCGTAGAAT
CCTGGTTCACACCGATATTTTTCTCAGTGCAAAAAGGATCCATTATCTGTAAGCGCTTTGATGCTCTCAT
TGATAATAGAATACGCCTAGCCCTTTGGGGAAAAACTAATATTCTCAAAGATAGAATCTCCATGACCCTA
GGAATTGATCCCGAAGTCATTAAGAAATACTTCCATAACACTTCGTTAAAAACAAAGAACTTCTTTCTTA
TCAAAATCCGAGGGGCTATCTCCTCTCCAGAAGTGGATTGGTCCTCAGCTTACGCACGTATCGCTCTATT
AAAAAGCTACACAATCGCTAGCCCATTCAGCACCTTAGCGGATAAACTCTTCTCCTCCTTAGGGGATTCG
ACGCCTCCGCAAACCGTATCTCCCCTACCTTGGGAAAAACCTCAAGAGGCACCCGAAGATAATAGTGCCA
ATAAGGGTAGGCGGTTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c621575-620283 ribonuclease BN family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTCGAAAGCTCTCGATATTTTCTAGAAAGAAAAAGAATCCAAAATCGGGATTTCGAAATAACCGAA
TCATTAGGTCGTTCTTATTGGCTCCCCAAGTTTTAGTGAAAAATGAGGTGTCTAAGGAAGCGTGTGTTTT
AAGTTACTATGGTTTGTTCAGCTGCATTCCGATACTGGTCTTTTTCCTAAGGTTGTCTCAGCATCTTTTT
GCAAATCTTGATTGGAAAGAATGGCTTCTAGTTAGGTTTCCTGATTATAAAGAGCCCATTTTAGCAATTG
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TTGGGCAGGGATTCTTATGCTTTTATCTTTAGAAGATGGTTTGAATAAGATCTTTAGAACAGGTTGGACT
CCGATATCTGTGCAGAGATTAATCGCGTATTTCATCATTACGCTTGTCAGCCCAATGATCTTTATTATTG
TTTGCGGCTCGTGGATTTACATTACGCAAATCATGCCTGTAGCCTATGCAAAGCTCTTTTCTTTAAGCCA
CTCTATTACCATTTTATATGTCTTTTCACGGTTGACTCCCTATTTATTCATTTATCTAGCGTTATTTTGC
TGTTATGCTTTTCTGCCTAGAGTTTCTGTGCAAAAGACAGCCGCGTTAATCGCGGCGCTCACAGCAGGAA
CTCTCTGGATCTTTTTTCAGAAGGTTTTCTTCTGTTTGCAATTTTACTTATTTAACTACAGTTTTACTTA
TGGAGCTTTAGTCGCGCTACCTTCATTTCTACTTCTTCTTTATCTCTACGCGATGCTGTATCTTTTTGGA
GGAGCGTTTACTTTTCTTATTCAAAATCAAGGATGCAATTTCATTCTTCCTACGGAAAAATACTTGCCGA
ATTGCTATGTAAAACTTGTGGTGTGTACCTATATTCTTTCTGTGATCTCGAGAGATTTTGATGAGGCTTT
TACGTCTCCCACAGCAAGGAGCATAGCCAAAAATTCTAAGATTCCTATCGGAGAGATATTCCAATCTTTG
GATATCTTGGAAAATGAAGGCTTAATTCTTTCTTATAAGAAAGCGTATAAGCCTACGCATAATATTTCAG
GGCTTACTATTAAAGATGTTGTTGAGAAGCTTCTACACCTGAAAACCTTTAATCAAATCCATCCAGACAC
AGCGTTAAGTTTAATACAAAGTAGTCTGAGAGATATGTTTGATCAAGCAACGAAAAGTCCTTACAACCTC
ACTCTCTCGGATATCGCTGGAAAGATAAAATGA
>ref|NC_003361.3|:c622467-621655 methyltransferase, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCTCGTTATTCATCCAATAAAAAGCACCACTCTTCTAGGAAAACAGAAAGAAATTCTACTTCCTGGG
AGCCCATCGCTGAAGATTATCATAAGATCGTTCAGGGAGAGGGGCATTATTATCATAAAGAGGTCATTCT
TCCTAAGCTACTTCCCCTAATGAATCTACAATCTGAAGATTCTTTGGTGGATATCGGTTGTGGCCAGGGA
ATTTTAGAAAGAGCCATTCCTAAGGAGTGCGGATATTTAGGGTTAGATATCTCTCCGAGCTTGATCTCTA
TAGCAAGGAAATTGAGAAAGTCACGAGACCATGAGTTTAAAATCCAAGATCTTACAAAAAGGTTAGTCCT
AGAGACTCCCCAGTCTTTTTCCCATGCTGTAGCTATTTTGTCGCTACAAAATATGGAAACCCCAGAGCGA
GCGATTAAAAACACTTCGAAGCTTCTTAACGATGGAGGCCGGTTCTTTATGGTGTTAAATCATCCTTGTT
TTCGTATTCCTAGAGTGTCTTCGTGGCATTACGACGAAGATAAAAAGCTTCTTTCAAGAAAGATCGATCG
CTATCTTTCTAAAATAACCGTTTCGATTGTTGCACACCCTGGGAAAAAACAGTCAGAATCTTCTATTTCT
TTTCACTTTCCTCTAAGTTATTGGACCCAAGCATTATCAAAATATGGGTTCGTTATTGAGAATATGGAAG
AGTGGATATCACCGAAAAAATCCATAGGAGCACACGCAAAAGCAGAAAACCTTTGTCGCGAAGAGTTTCC
ATTATTCTTAATGATCTCATGTATTAAAACTCATAAGAACTAA
>ref|NC_003361.3|:c623688-622621 inclusion membrane protein A [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACAGTATCCACAGACAACACAAGTCCTGTAATATCGAGAGCGTCCTCACCTACTTTTGGAGATCATG
GTAAGGATTTCGACAACAATAAAATTATACCCATTTCAATAGAAGCTCCAACTTCTTCAGCTGCTGCTGT
AGGGGCTAAAACGGCTATCGAGCCTGAAGGAAGAAGCCCACTACTTCAAAGGATTTGCTATCTTGTTAAA
ATTATCGCTGCCATCGCCCTCTTTGTTGTTGGTATCGCAGCCTTAGTTTGCTTATATCTCGGTAGCGTTA
TCTCAACGCCTTCTCTTATTCTTATGCTTGCGATCATGCTTGTATCCTTTGTGATCGTTATTACGGCAAT
TCGAGATGGCACACCGTCTCAAGTGGTCCGTCACATGAAACAGCAAATTCAGCAATTTGGCGAAGAAAAC
ACGCGTTTACATACCGCAGTAGAAAATCTAAAAGCTGTTAACGTTGAGCTCTCAGAGCAAATTAACCAAC
TTAAACAACTACATACTAGATTATCGGATTTTGGTGATAGGCTTGAAGCGAATACCGGTGATTTTACTGC
ACTTATTGCGGATTTCCAACTCAGTCTGGAAGAGTTTAAGTCTGTTGGTACTAAAGTTGAAACCATGCTC
TCTCCATTTGAGAAATTAGCTCAGTCTTTGAAAGAGACCTTTTCTCAAGAAGCTGTTCAGGCAATGATGT
CCTCTGTAACTGAGTTAAGAACCAATTTGAATGCATTGAAAGAGCTTATAACAGAGAATAAAACCGTAAT
AGAGCAACTAAAAGCTGATGCTCAACTTAGAGAAGAGCAAGTGCGGTTTTTAGAAAAGCGTAAACAAGAG
TTAGAAGAGGCTTGTTCAACATTGTCCCATTCAATTGCGACTCTACAGGAATCCACAACCCTTCTAAAGG
ACTCTACAACTAACTTACATGCAGTTGAAAGTCGTCTTATCGGTGTTATGGTTCAGGATGGTGCAGAGTC
CTCCACCGTAGAGGAAGCTTCACAAGATGATAGCGCGCAACCCCAAGATGAAAATCAATCTGATGCTGGA
GAGCATAAAGATAGTTAA
>ref|NC_003361.3|:624086-624781 ribulose-phosphate 3-epimerase [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGAATAAAAAACAACGTCAGAAAACATTAATCGCCCCCTCAATTATGGGAGGAGACCTTGCATGTATAG
GTGCAGAGGCAAAAAAAATAGAAGAATCTGGAGCGGATCTCATTCATATTGATGTTATGGATGGGCACTT
CGTTCCCAATCTGACTTTTGGCCCAGGAGTCATCGCAGCAATCAATAGATCCACAGACCTCTTCTTAGAA
GTTCATGCGATGATTTATACGCCTTTTGATTTTATAGAAGCCTTTGTAAAGGCTGGGGCTGATCGTGTCA
TCGTGCATTTTGAAGCCTCCGAAGATCTCAAAGAATTATTAGCTTATATTAAAAAATGTGGAATACAAGC
AGGGCTAGCTTTTTCTCCAGAAACCTCTATAGAATTCATTCCTCCATTTTTACCTTTCTGCGATGTTCTA
TTATTAATGTCGGTACATCCTGGATTTTGCGGTCAGGGATTCATTCCTGATGTTCCTGATAAAATTCGTT
TTACAAGACAAGCACTTAAAACTATGGGTCTGGAAGATTCCTGTTTGATTGAAGTGGATGGAGGAATAAA
CGAGGCTTCTGCAAAAGAATGTCGCGAAGCAGGTGCGGATATTTTAGTCGCTGCATCCTACATGTTCCAA
AAAGATGCGCTGACTATGGAAGAAAAAGTTTTGCTACTTCGAGGAGAAAATCATGGTATTAAGTAG
>ref|NC_003361.3|:624768-625325 elongation factor P [Chlamydophila caviae GPIC]
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CGGTTTCTAAAGTTACAGGGAATAAAGGGGAGTCTTTTATCAAGGCTTCGTTAAAAGCTGCTGATTCCGA
CGTCATTGTTGAAAGAAATTTTAAAATTGGCCAAGAAATAAAAGAAGCCCAGTTTGAATCTAGAAATCTA
GAGTATCTCTATATTGAGGATGAAAACTTTCTTTTCTTAGATTTGGGAAATTATGAAAAAATTTATATTT
CTAAAGAAATCATGAAGGATAATTTTTTATTCTTAAAAGCAGGGGTTACTGTTTCTGCTATGGTTTATGA
TGATGTTGTTTTTTCTATAGAGTTGCCCCACTTTTTAGAGTTGATGGTATCTAAAACAGATTTCCCTGGA
GACTCGCTTTTAATTACCGGGGGGACAAAAAAAGCTTTATTAGAAACCGGGGTCGAAATTACAGTACCTC
CTTTTGTAGAAATTGGAGATATCATAAAAATTGATACGCGTACGTGTGAATATATTCAACGCGTATAA
>ref|NC_003361.3|:625356-625856 acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit [Chlamydophila caviae GPIC]
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AACGTGAAGGGCTAGAGCTTGAACTGGAAAGAGACACAGGAGACAAACCTAATCAAGAACCTGTATTTTA
CGATAGTAGGTTATTTGCTGGTTTTTCTCAGGAACGTCCTATTCCCACTGATCCTAATAAAACAGTAGCA
AAAGATGTGGCTTCAGAAAAAACAGAAGCCGACTCCCAACAATCTCCGGGAGATTTTATTAGCTCTCCTC
TCGTAGGAACATTTTACAGCTCTCCTTCTCCTGACTCTCCCTCTTTCGTTAAGCCCGGGGATATGGTTTC
TGAAGATACGATTGTTTGTATTGTAGAAGCTATGAAAGTTATGAATGAAGTTAAGGCCGGAATGTCTGGT
CGCGTTGTCGAAGTCTTAATCACCAATGGTGATGCAGTACAATTTGGATCTAAGTTATTTCGTATAGTTA
AAGCTGAATAA
>ref|NC_003361.3|:625856-627211 acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAAAAGTCTTAATAGCTAATCGTGGGGAAATTGCGGTACGTATTATACGTGCGTGTCATGATCTTG
GCTTATCCACAGTCGCAGTATATTCCCTAGCAGATCAAGAAGCTTTGCACGTGCTATTAGCAGACGAAGC
TGTTTGTATAGGAGAACCTCAAGCTGGGAAATCCTATTTAAAAATATCTAATATTTTAGCTGCTTGTGAG
ATTACAGGTGCAGATGCTGTTCATCCCGGTTATGGTTTTTTAAGTGAGAATCCGAATTTTGCTTCTATTT
GTGAAAGTTGTGGATTGACTTTCATTGGCCCTAGCTCAGAGTCTATAGCGACAATGGGAGATAAAATAGC
GGCAAAACAGCTGGCTAAAAAGATTAAATGTCCTGTGATTCCAGGTTCTGAGGGCATTATCAAAGACGAA
GCTGAGGGATTAAAAATCGCTGAAAAAATAGGCTTCCCTATAGTGATTAAGGCTGTTGCTGGTGGTGGTG
GCCGGGGTATCCGCATCGTTAGAGAGAAAGATGAATTTTTCCGTGCTTTCTCAGCGGCGAAAGCAGAAGC
AGAAGCAGGATTTAATAATCCTGATGTTTATATTGAAAAGTTCATTGAAAACCCAAGGCACTTAGAAGTC
CAGGTCCTTGGAGATAAGCATGGCAATTATGTCCATCTTGGAGAAAGAGACTGTACGGTACAAAGACGTC
GGCAAAAACTGATTGAAGAGACTCCTAGTCCTATACTCACTCCAGAATTACGTACCAAGGTAGGGAAGGT
TGCTGTAGATCTAGCGAGAAGTGCCAACTACCACTCTGTAGGGACTGTAGAGTTCTTGTTAGATAAAGAT
AAGAAGTTCTACTTCATGGAAATGAACACGCGTATTCAGGTAGAGCATACGATTACGGAAGAAGTTACAG
GGATTGATCTTCTTAAAGAGCAGATTTATGTAGCGATGGGGAAAAAGCTTGCTTGGAAACAGAAAAACAT
TGTTTTCACGGGGCATGTTATCCAGTGTCGTATTAATGCTGAGGATCCGAGCAATAACTTTGCCCCATCT
CCGGGTCGTTTAGATTACTATCTTCCTCCTGCGGGGCCTTCAATACGTGTGGATGGAGCTTGCTATAGCG
GCTACGCTATTCCTCCTTACTATGATTCTATGATTGCTAAGGTGATTTCTAAGGGAAAGAACCGTGAAGA
GGCTATAGCCATTATGAAGCGTGCTTTAAAAGAGTTTCATATTGGAGGGGTGCATTCTACTATACCTTTC
CATCAATTCATGTTGGACAATCCACAATTCATCAATTCAGACTATGATATCAACTACGTTGATCATCTTC
TCTCTCAGGGGAATACCCTATTTTAA
>ref|NC_003361.3|:627383-628837 hypothetical protein CCA00555 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGAATACACGAAAGTTTTTGTTTAAGTTCTTTTAATAAAGAACCGAGTTGCTTTGATAAGGTTTTAT
CTACGGTAGATCGTTATTTCTATTTCGGCGGGAAACAGATAGAGATTGTTGCTAGAAATGAAAAAACACG
AGAACTTTTCTGTCTTACTAGTCCTGGGCGAAATGTCTCTATTGTAGAAAAGGTTTTGAAAATCCTTTCT
TATTTCATATTCCCAATTGTGCTTACTGCTCTGCTTGTACGCTTCTTACTGTATAAAATATTACATAAAA
ATCATAGGGTGGTCTTGATCAATAGCCAAGAGCCCTGCACACCGATTGGTCTCTATTTAAAAGAGGCTAT
AGCCATCCGTGATAAGTTCATGGATTTACGTGGTAAACTACGTAATAACAATGAACTTAGAAGAGCTCTT
ATAGGTGAGGGACTGTGGGTAGAGCATTTTTATCTAGATGAAACCTCGACTCAACTCTTGCTTACGATGA
CCTCACAGCGTTTCTCGGATATAGCCTTTACCTTTGTAGTTCCTGCTACAGCTAACGTAATGCCGAAACC
TGAGGATCTGCAGTGCTCTATAATGGAGCATTTATGGAACTGTACAAAAGCGATAAACGTTGCTCAACGA
AAGAAATTAGACAATTTAATCCTTAGCAAACCTGTGGGTATCAGTGTACGCGATGGCGTGCTGATTCATC
ATATTCATAGTATCCATCTACACGAGAGATCTTTGAATAAAAAGAACGTTTCCACAAGTGTTGAAGAGCA
TAATAACCTACAGAATTGCTTAAATGATCTTGTGAACTTTACTGTAGCAACAGGTTATCATGGGAAGGCA
TTTGCAAAATCGCACAGGAAATTTGTCTGCATGGATAATGCAGAAAATCTCTATATGACTCTGGTCATTG
ACCCTGGCCACGTATGTCAAAGATGCCCAAATAAAAATGCGGAGATAGAAAATCGCGCTTCCTGCCTAAT
GCCGATACTTAAGAGTGTGCCTCCAGAGTATCTTAAAGGGATGTTAGGACAGATCCCTAGCTCGATAAAA
TCTAAGATAGAAAATTTACACTCCTTATTGTCTAAACAATTCTTAAACAACACTTTGGACATCCAAGCGC
CTTTATTTTCTCCTGATGCTCTACAGGGGCAAATATCAGATGAAGAAAAGAAAGAATTAGTGAAAAACTT
CCTAGGGTTTATCTCGAAAAGAGCTGTTGTTCAAAATGACCAAGGGCGTCCTAGGGTGCTCTTCTACAAG
CATGGGCAAAGTTATCCTGGAGGAGGCGACGGAGTATTGATTAATCAGCTGAATAATTATGGCTCTATGT
TCTTCAAGACTACCGGCACTCAGGAAAAATGTTTAGGGGAGAGTATTATGGATCAGCTGGTGCATATGGG
GATCTTCTCTGAATATGAAAATACCGACACGATAGTTTGCGCCTATTTTGACTAG
>ref|NC_003361.3|:629042-630688 hypothetical protein CCA00556 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATTCCTATTTTTATCTAGGAGGGAAGCGAACAAAGGTTATAGATAAATCAACAGAGCTCGGCCTTAGATT
TGCTATACAAGATCAGGGACGGGAAGTATCTACTGCTGAAAAAGTCTTAAAAATACTCTCTTGGATCTTT
ATTCCTATTGTTATTGTAGCTTGGCTGCTAAGGCAAGCTTTGCATTTATACTTACATCTTACCTATCCGT
GTGTATATCTTGATGCACCGTTATCGGAAGCTCTTCAAAAAGACATCATCACCACGTGTCAAAAAATAGC
CTACGCTACCAAATTTAGAACTATTTTAACGACAGAAGAAGAGGCTTGTCAGGAGCTCATAGCTGAAGGT
ATTACCCTAATAAAGCCCGAAGAAGAATTTGCAAATGTTCTTCCTGAAAGGTTTTACCTAGATTCTCGGA
CATCTCAAACGTTTTATATTCTAGGGAGTCAGCAACAATTAAGCGCTCTTTATCTGAACCTTTACGACCT
CATCCTGTCAGGAAGAAACCTTATTTCTGAATCCGAGTTAACAGGGAAGAAAGATAAGAAATCTATAGAG
AAAAACTTAAAGGATAATTTCGGAATTACAGCAAAGATTTCCCGACTTCCCAATCAGAAACAGGGGATAC
ATCACGGGCTAAAAGCAGAGTTTTCTTTCGAGTACTATCCTGAGTATACCTGTACCTTGAACGATGATTC
CATAAGCATTCATAAAGCAGCCCCCTCACCTCAGATCGATTTAGAAGAAGCGACTGTTGCGAGATTTGTA
AGAAATGTCTTGGAAGCACGTCATAAAGAAAGTAGCACGTTTATATCTTGGCCGAAATACGTTGGCTGCG
ACATGAGCTCAGGAATCGTTGTTTTAGATGATGAGGAAGAATATAAACAATTAGTTGTTAGTAGTCCCCA
AGGAGAAACTGCGGCGAATCTTTCGCTTTTTTCAGTGCAATCTTTTATAGATTGCTATCGAAGCATGAAA
AACCGCCATGTAGTTCCCTATATCTTAGGGCAGCAGGCGGCTTTCAAACACCGTCAAAACAAATACCAAC
TGATTATGAATGAGTCGGGGAGCCGCCTACCCATGGATTCGTATGAAAGTAGAAAAAACGTGATGTCTGC
ATTTTTACGACAGGTCCCTAGTACCTTCTTAAAAGAAGTATTAGAAGAGGCGACTTTTGAGGAGGTTGCG
GCAGCGTTAGACTCTTTAGATCATCAAAAGATAGCCCGCGCTTTAAATCTAGATGAAGTTAGAATTCCAA
AAGCATTCATTTTACAAAGAAGACCAGATTTAAGAGGCTGTTCTGATAAACAGATCAAATTAAAATTAGC
TATCCAGTTGATTGGGGGAATTTTATCAGATCTAACTGCTCCAGAAATCTTCATACATTATAAAGAAAAA
GATGATTCCCCTCAGAGATTCAAAACAACTTTCTGGGGACATCTTGCTGATCCATCGGGACCGGGTTTGC
CGGACTCTATACTTGCACAATTAGAACGCATGCACGTTATTGATGGATATTCAGAAGTCAATCGTGGGAT
GTACGTCCGTTTGAATCTTGTAAATACGGACCTCTAA
>ref|NC_003361.3|:c631788-630802 hypothetical protein CCA00557 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCTTTTATAAATAGCATCTTGGGCAGACAGGTTTCATTAGAAAATATTGAGCCGAAGAAAAGTTTAT
GCCAATCCAAACCTCTTGTGGTTTGTGGCAGTATCATCGGATGTGCAATCCCAATAATTTTCGTAATTCT
TGGTGCTTTAGGACTCGCTAGTTGTGCTAGCCTTCCTTTATTGATTTTAGGAGGCCTTGGCCTGAGTTTT
ATCGTTCTTGGAGCCATTGCATTCAGTGCATTTTTGATTGCAGTGAAGGTTTGTTTAAAGACTCCAAGAG
AACCCGAAGATGCCTCAGTAGGTGCGTCAGTAGGTGCGCGAGTGGACATAGATCCTATAGGGGCAGAGGC
TTTGAAATTTGCAGCTGAGACGCTTGATGCGGAGAGATCAAGAATAGAGCCTATTACATGTGGATATTTA
CGTCCCCCTATAGATGATGATATTCGCTATTTATGTGCTTTAAGAGGAGAAAGGCACAATCAATTCTTAA
ATTTATTGCGTATAGATGATTCTAGAGAACTCTCTTTCCCCGATGATCAGCTTTGGACTGATCCAGAATT
TACACGCGTTTCTACAGAATTTCTACAACTATCCTATGCGATTAGTGTGCGTTCTTTGCTAGATTTAGAA
AATTACCGAGCAGCACATCAGGATGCGACTTCAAATTTAGAAGCTCTAGCAAGACAGAATTCAATATACT
ATAAGACATTTTATATGATGTCTACTGCCTACTCCTTATTAAGACATACGTATATGTATTGTAGAGATAG
CGCTTCTCAGGAACATATTGAAGCTAGAAGGGCGAGGTTCTACCAACCAGGCTCTATAGAGAATCAGTGG
AGATTACTGTACAATGATTTCTGTCGGCAGGCACGTAGTTATCTTGGTGATCCAGAAGAAGCTGATATAA
GAGAGTGCCGTCTGATTAAACATTCTACTTGCGATCTCGATCCCAGCTTCCATCAACAAGGGACAACCCC
GACTTAA
>ref|NC_003361.3|:632204-642244 putative cytotoxin [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACTCTTCCAGAAAAAACAACTTCTGTCGCCTCTTCGGCTCAGACTCACTCCAATTACACAGCAGCTT
CTAATTCTTCTTCTTTGCGTCAAAATAATACTACTCGCGCGGCTTCTTTAGATGAAAGGCTTGCCCTTTA
TGACGAAGCTGTAAATCAAAATAACTCTACTGAAACGGTTGTGGAGATAGGGAAGAAGCTACAGGAAGAA
TTTTATAATCTAACGACTTCGCAGCCTACAAGAACAACAGCGTCGCCCTCCAATCATACGGGAAACTGGA
AAACATCTTTCTTATATAATTTAGCGCAACTTATTGCCCATATTGTCCCTCCGCAGATATTACCGGCTAA
AATCGCCAAGCCGACGATTATTCCACCAGCTGCAAATGCTACAGGAAATTCTACGACAGAGATTTCTCAA
CGTGCTTCTAACGCCTCTATATCTCAGAACACCACTTCTTTATCTCAGCCCGTGATTGGGGGGGGGGGTA
GACCTACTGCCAAGAAAAAAGTACTGGGGACATTAGTAAAAAAATCAGCTTCTTATCGATATAAGAAGAC
CTTAAAAACAACTGCAAAACGTGCTCCTAGGCACATCTCTAAATCTTCTTCTGTCATTGCAAGCTCTGCT
GCTTTAGAGCCATCTTTCATTGAAAAAACTGAAAATCAACTTATCGAAAAGACGGTGTCCGCGGATTCTG
TTCAGAATGTAGAAGATTCACCTTCTTTTTCTAGAAGGAAACGTGCTTTAGAAGAAGAAGCTCAAGAAGC
AGGTGCGGAGAAATACGATCTTACCCCAGAGAACATCGTAGATAAGTTAGGATTAACTGAAGCACAGAAG
AAAACATGCCGTGCGTCCATCAATAACATTAAGAAGGCTATAGGATACTACAACAATTTAGCAGAGAAAA
ATTCTCGGAAAGGGCAAGACCTCTTAGTTAAACAGTCTGTTTTTTTAGAAACGATACAAAAAAAGGCTGG
GTTACCTGAGACACATGCAAGTGCCAAGGTGATGACGACGATTAAAACAGAGTTTTTATCCCATCGGGTT
GCTGTGAATAAGCATTTACACGGTATCTGGATTGCTGGATCTCCTCCGGATGATGTTAGTCCCTACATCA
AAGTATTTTTACAGACATATGAGGATTTTGATTTCTTTTTCTGGGTAGATGAGAGTGCTTACGGCGCTGC
TAAATTTTCATCTACTCTGAAAAGAATAGCTTTTGACGCATCTATCACGGAAATAAAGGAAAAAACACCG
GAAGCTGCAAAAGACTTTATTCAAAATTATGAAGAATTAAAGAAGAAATACGATTCCGCTGAAGATGCTG
AGCAAAAAGAACAGTATCAGAAGGATTTACACGACTTTTCTGAGAAGTACGACAAATTAAATAAAGAGGT
GAAGGAAAATTTCAACGCTCTATTTTTAAAAAACATGATCACTTCTCAGGATGGGTTTTTTAATTTCTGC
ATGCTTAAAGGTACGAGTACCGTTACGGATGCTTTGCGCATAGAATATCTCGAACAAAACCTGAAACTTC
CTCAAGAGGAGATCGAGCAATATAAGAAAACGATAGAGGATAATAAAAAGAAAATTCAGGATATCGTTGC
TAAAGCCAACAAGGGTTTAGGGTCTGAAAGAGTTAAAATCAAAGATATTAAAGAACTGACTTCCATGAAA
GACAAAACCAATCTCTATAATTATGAGATGGAGATGTTTTTACGATGGAATTATGCCGCAGCATCGGATC
AGATCAGAATGTATATGCTCAAAGAATACGGGGGCATTTATACCGATTTGGATATCATGCCCTCATATTC
TCAGGAAGCTACTGATGCCATTTTTAGCAAGGGCGGGAATAGGTTTTTTGAAAACTTACAGATTAGGCGG
GTGATCTCTACTGCAGCTTTGAAAATAGCGACTGAAGAAACCCCTGTTACATTGGAAGAAATCAGTAAGG
AAATCAAAACATCACAACTTACACGCGAGGACAAAAAAAAGCTCAAAGAGTTAATCCCTGAACTTGAGAA
GCTACATAAAGACGAAGGAGGGGGTGGTAAAGGAAAGTCTAAGAAAGGTCTCTTTCAGACGATGGCTCCT
GACACGGTTCGAGATACGATGCCAGTATTGCGAAGGTACCATAAGTGGAGTACGGGTTGGAATGTTCGTA
TATTGAATGGTTTGATGATGGCTCATAAAGACAGCGCTGCGGTTGACGCTGTCATTAAAGGGCAACAGCG
CGCGTATGCTGAATTAAAAGACTTAAGGGAAAACGTTCTTAGCGGGACTTTCTTTAATACTCTTGATGAT
CTCACACATTTGGATCAAAAAGATAGGGTGGGACATTATTTAGTCAAAGATTATCTCGGAAAGAGTCTAT
TTTACAATTTTAGACAAGATTCGATTATTCCTGGTGCGGTAAGTACATTAGGAATTACAGGTCCTGATTT
AATTAAGAAAGAACTGGTCAAGTATTTCAAAGATTTTGGCCCGATGGGAAAAGAATTTCTTAATGAAAAT
GGGAGGAACTTAGGAGATTCTGCGTATTTAGGCTCCTATAAACAAATTAAAGATGAGCATGGTGAAACTA
CCTATGACTGGAAGAATCCGCTATCTGTAGGAGCTAATGACGTCACTCCTGGAGATGAGAGTTCGTGGTG
TAATGTCAGACAAAAATGCGCTGGGGAATTACTTTTTTCTGATTCATCAAAGTTACGTGTAGAGACGCCT
AAGGGAATAGAGCGTACAAAAGTTAATGAGGCAGACTTCACTAAGTTATGGAAGGAGGAGTCGAGAAAAA
AACTGCCTAACCGTTTGTTAGCAAGGTTTAATGAACTTATTGACAACCCTAATATAGATGTCGCGAAATT
ATCTGATTTAGATTATGACATCCTTAAAGCCAAACTAGCAATCACTAACGATCCTGCGGCAACGACATCT
TTATTTTCCCTGCAGCTACAGCTTGCAAACCTTATTCGTGGTGTGCAACTTCCTGTTGGCAATCAGATGA
ACTTTTTCCCAGATTTGTATAAAAATGTCGAGGATGACCTAGAAAAAGCCATTAAGCTGTATCTCAAAAG
CCATTCTCAGACGACCATTACCTTATGGTATAGCTCGTCAGGGAACCTCTCCTTGTTTTTAAGAGATATG
CTCTCTGTAGCTGAGAGACAACTTGCCGTTGGTAATCTCATTGACTCTGTAGGGCAAGCTCCTCTTTCTG
AAAAACAGATTAATCTCTTAACAACCTATGTGGAACTGAAGTCTAAAGAGATTTTAAGTAGTTTCTCCTC
TGATGAAGATTTGACGAACTTTCTAGAGACTTTGAATAGCATCACAGAGGATGCTCAACTTCGACCTCAA
ATCGAGAAGATTGAAGAGAAGATTTCATCAGGGCACTTCTATCAAGATCTGGAAGAGCTCATAAATAAGT
GTCTGGGTCTACCTGAGCACAAAAGAAGAAAGCTGATTCTTGACACGATGAAGGATATAACCCGATTTAG
TGGTCTGGATAAGCAGGAACAGCAAAGCGCACAAAAATGGTATGAAAAAATCTATGATACTACGTTAGAA
AAACGCGTCTTAAATCCCCAAAAAAAATTAGAGGCCCTTCTCAAAAAATTTGAGAGTAGCGAACGTGTTC
GTCTAGAGAACTTGGATCTATTCTTACGTGATAGATCCTTATTTTCACGTATGCATCGGGATGGGTATGC
CTTTGCTGATTCCAATGATCTCTATCGGTTCATGGTAGCTGAAGCAGGAATTTCAGGAATCTTTTCTGTA
GATAGTGTCTTGCCTCCCCCCTCAAAGCATCTCGTCAATATGATGAAAACAACGCTAAACGCTGATTATG
AGGATATGCATGACACTCTTGGCGCCGTATATAATTATCTAGCTCTAGATCCTGAGACTGAAGAGGCAAA
AGCTGCTTTAGATAAGATCCCTGAAGGATTAAGGGAGAAACTTCAAAACTCTCATATTCCTGATTTACTC
ATCCCTCCAATTGATAGCCATGTCTCTGCTTTAGGAATGCAATATGGAGTAGAAGAAGGAGGGGAATCTG
AGCGTATAATGGCAAGCATTATGCCGGGGGAATTCAATCCAACCAGCTACATCATGTCAAGCTATTTAGA
TACTCTTTATCAGCTACATCAACGCATTCATGATGGTTCCTTAACTCTAGAATCCGCTAAAAAATTATTA
AATGAAAATCACATCTATTGTTTTGTTGAAGACACTCGTCTTCAAGAGCTTGTAAACCTTGCGCAAGAGA
AGAAATACCTCTCCCTAACTGAAATTAATAAACTTCTCTCTAAGAAAAAGAATTTCGCACAAGCAGCATC
AGCCTTGTTGGATGGTGTTTTACCCGGAGCGAATCAGATCTTACAACGTGATGCGGATTTCGGCCGTCCC
TTAGCGACGACAATGCTAGAGCCGACAGCAATGAATCCGTATGATTATCGCGGTGCAGGGTTAAGTAAAG
ATCTTTTCTCGACTCCTCCTGATGTGCCTACACTCCCAAATGTTGTAGAACGAGCGAAGTATTCTCTAAT
GGCATGGCCTGATTTTTCTAGAGAGCATATACATCCATGGAGTGTTTTAGCACGCACATTTGGCTCCAAT
ATTGTTCACGTACACCCGCAAACATTCCTATATGATTTAGAAGGACGTTGTATGGGCTTGGCTATGCTCT
ACATGTCAGCGAAAACCCCAGTAGAGTATGCCTTCCTCACGCAAAATCTTATGACAGTAAGTTCTCTATT
TCAAACAAAAGAGCGTGATCATCTCCCCCTATCAGAGGCAGATAACAAATTCTTACTCAAAAGCCAGAGC
TACATTGATTGGTTACAGTATCGTGGAAACAAAGAGATAAAAACGCAGGGGATACTCACTCCCCATACAT
GGGATATTGCAGCGTTATCTGAGAAATTCTCGAAAAGCACAGGATCAAAAAGCCTATTAGTGACCACGCC
TACGCATTCCTTAGTTGTTCAACACTTGGATTGGGGTTACAGATTTACAGACCCGAACTTTGGACATTGT
GACTTTGCAACATTACAACAGGCTCTCTCTTTCTTAGAATCTTCAGTACAGTTATCTGAAGAAGTAAAAC
TTCGCTATGGAATCTCCGAACACAAAGATATAAAAGAGCAGCTAAAAGTTTATACCTTAGATTCTCAAAA
AGCAGAGAACTCCTGGTTCCCATCGACCAACTTGAAATTCCTCTCATATGATCAACATATGATTACTTTA
GATAAGATGATTCTAAGGGGAGATGTCTATGTAGGTCGTAAAAAAATATCCTGGAGGCACTTATATGCCG
CAGGAGCTACGATTGATCATAAAAGGATCGATGAAAAAACTCGTGAAACAGATCTAGACAAATTACAGAT
AAACGGGGAGATTTTAAGTGATTTTCTTTCTAGAAATACCTTAGACGCTCCTCTTGCTAGCACCATTCAA
TACCTCTTAGACACTTACGGCACAGAACCTGGGACAAAAGAGGTCAGCAGAAGCTTAATTGTTGAAACTC
CAAGAGATTTTGCTTCCATAATAGGTGGGTTCAAAACTAAAGCGCACCAAATGAGCGCCATGTTGCGCAA
TGTAATGGATTCTATAAGATCATCCATCAAAGATATTCCCCCCGGCAATCAAGATAGAGTGTCTGTCACA
GACATAGAAGTCGATGGGGAAGATAGGATTTCCTTCAAATTCAAATGTGGCAGCTCTCCGGAAAAAAAAA
TACAAATCCCAAGTCATGGACTAGTCAAAGTATTTAGACAGCTAGGGGGCATGTTAAATGACCTTGCTGG
CACAGGCGTTATGGATATGGAGCTCGGTATGTCCGCAGTCTCTATTATACAATATGCACGCTTGGTGGAA
GCAGGAAAGGGGGGAAGTGCCCTAGCTATTTTCAATTTGTCTTTAGACGTCAAAGAAATGGCTGAAATGA
CCTTGGGAGCTATTGTCCAAGGTGTAGGAAAGAAATTCATTACCGAAAAAGGGATAGACGGCCTTCGACT
GGAATCTGTCTTGTCCAAACAACTTATAAAAGTTTCTAATAAAGTTGGAGGGACTGTAGGGAAAGCGCTG
TTTAGAGTAGGACAAATGTTAGAGCTCCCCATCCTAGAAACTGTTGCAGGTGTTTGGGGTCTCTACAATA
GCGTGGAAGAACTCATGCAAGCCTCTTCACATAGCGATATGATGGGAGCTCGTGTGCAAGTTGCCTTTGA
TGTGATTTCCTTAGCGTTAACACTATCAGCTGTTGTGGCTCCTGCAGCGATGTTGGCAGCCGGGCCTATT
GCTGCTATCGGGATGGGAGCCTCATCCATTGCCCGCAATGTAGCAAAAACAGAAGGACGCCACAAGGAAT
GGGGGAAATATAAGAAATTTCTAGAAGATGGATCGGAGCATGTTGTCACCGCGTTCCCAGAAAGAGGTCT
TATAGATTTATCTGGCAACCAAATTTTAGGGAATATCTATCTAGATCTAACGCACAATCCTCCGATTTTT
AAAGGAGAGCGCTCCTACAATGCTAACAGATGGATTGGCCATAAGCCACATTTATCGGACCATCAGATCC
GAGAAAAACTCGGTTATGCATTTAGGATTACTCCAACTTACGCTTTAGCGCTGGGGCATGCCAATAGCTA
CTGGCCTCCTGAAGTTCCTCATATCCCTGCAGGAACCTATAACACTGTGATTCTAGGATACGGAATTACC
TACAAAGGCACTACTGAGGTTGTTTACCTGTCAAATAAAATCGTTTGGCGGGAAGCAATTATGGATCCAG
AATCTCGTTACTTTGTCTCTCCTTTAACAGCTCAAAATCATAGAAGTACGGTAATTACTGGGAAGACGCA
CACAACTATTGTTCCTGTTCGTCTTTTAGATGACGATTCAAAAGAAAGGCTAGATCAAGCCTTAGAATAT
AAAAATTATGAAATCCGGATTCAAGGGGGCTCAGGAGGAGTCTCGGTTCAAATCGGAGGTGCTGGGTACT
ATAACCTCACCGGAGCTCCAGGAGCTGAAAATGTGATTTCATTCCGAGCTATTCCCCCCCCATTGGCAGT
GCAATTCAATCTGTCCCAAGGGCTGCAAGATGTGCCTCTGATAAGACCTAATGGCACAAAAATAAATATG
TTGAAAATCAAACAAAAAGGGTTTTCTACAATCATTGGTTCTTCTGGAGGGCAGGATACTTTAACAGGAC
ATCGTGATACCAAATTCTACGTCAGCCCAGGAGGAGGGAAGGTATATTCTGGAGCGGGGACAAACTGGTA
TTACATCCCTAAATTAAATGAGAACCTGACTATTGTACTCGCTACGAATTCTACGGATCATAGTCTTCAT
CTCAACATGCATTCCTATGAGCTGCATTCAGTCGAGAACAACTTAAACTTATTAGGTCTCAACGGAGATA
AGCACAAAGGCATATACATTGAAAATGCAGATAAGAGTAGTTTGTTTGATCGTTGGATAGGGCACTTTAT
AGTCAAATTCTCTGATGGCATTACAGTTGAAGCTGTAGAAAGACCTATCCCTGGGAATCATACAAATGCC
ACCACTTTAGGTTTTACAAAATGTGACCAATCTACATGGGCGTTAAAACATCCTGAAGAGCCCGGATTCG
TGGATAATATTGTGAAATGGATGAAAAAATACCTCTGGTGGTTTGCTCCCGAGGTATCCATCACTCAACA
ACACGGTCATGTATCCTATTTCGATCAGGAAAAGCTTTTTGTTTATAAACCTGACAAGCATAGCGAATTA
GAAATTCGCGCTCAGGAAGAATTCTTAACAACAGTTCAGGGTTCTGTAGGTTCTTCCTATATCTTGTCTT
CTGCACCAAATAAGCAAGCTAAACGTATTGATATTGTACTAGCAAAAGATGAAGACGCTCCTCAATATCT
TGATCTCAGCAGTCTTATTCCAAGTTTAGTAAAAGGCAGAATAACCAACGGCAGTAATTCAAGTATAGAT
TTAGAAATTTCTTCCCCAAGATACACGATCCCTCTATCTCTACAATGGGATCCGGAAGCATTGCCTGAAA
AAACAGTAATAGAAGTACATCCTCAGAATCGTCCTACACTAGGGGAATGGTACAAGATTCTGAAAAAAGA
CCCTACACAATGGCATACTCTTTACCGCTACTCCGTCCTAATTCCTGAAAGACTTGAAGGCATCCTTAGC
ATGAACAATACGGCAACCTTGATGCTAAGTGAGTCGCGAAAAAACGAAGAGCATATCCTTGGCGTGGAAA
ATAAAGGGGATGTGAATCTAAAAATCTGGGGAACACTCTGGGCGGGACATATCAAAGGCGCTATGCGCCA
TCTACATTGGAAAACGTTTAACAATTACCGAGCTCTAGAGAAATTTGGCATTACAATAGATGCGCATGGT
TTCCAATATCTTGCTTTCGAAGGCACTGAAAAGAGTGGGGATAACATCCTCTTCCATAGTGTGCTAGAGT
CCTACCCATTCAAAGCTAAGCAGACGCCACAAACAGAGCTCTCTCACCATAAATGGAAGTTCTATGATGA
AATTCAAGTCTTCGCAACCACATTACACCTTCAGGATTTCAATCGCTATCACATAGCCTCAGAAAATAAG
GCGTTATCACGACAGTTACTGTATGCTAAAAATTTAGTCAGCATATCAAACAGAGATTTCATCGTAAAAC
TCTTCTATGTCAGAGAGGGATTCGGGATAGGCGCCATGCGTTTGGTATTTAAAAACTTCTTTAATGAACA
TATGGAGGATATTACCGAAAAAACATTAGAGAGGGAAGCAAAACCCTGGATGGCTTCCAATCCACACGCA
TTCATTGATCCAAGTTATCAGAATCACTTAGAGCTCATATTAGGGAAGGAGAGGTTGAACCTCGCCACAT
TAGTCAGAGAATTCTGTGCTTCTTCCCATATTCTTCCTCTAAGTGAAGATGAAGATCATCGCTTGATTCT
TCCTGAGCGTTATCAGCCAGCAAACTTAGCTGTATTAACCTACACTATAGATTCTAACAAGATTCACAAT
GGGCCAGCAAATACGTTGCGCTTCTTTGACAACACCATGAAGGAGTATAGGCTACCTTTAACAACAATCT
TGAAAAGCTCGTATTACTTAGATCCGGTAACTGGAGATCTTTATATAACGCGGCTAGTGGCAGAACAGAC
CGATATACAGCATCAAGCATTCGTTATTAAGTTGAAGGGTTTTAAACGGCATTGGGAAAGCTATAAACAT
ATTTTCATCTCAGGAGCTCATGTAGGACTTACCAGATCTAAAGGCACAGCTCTGACATTTATCGGTCCAG
AGCTACGTCATCTAGAAATTGATTTTCCAAGAAATACGACCCACCACGTATTCCCAGAAAGGCTGGTTTC
TCGATCAGGCTTAGTATTCCCAACTAACGACCAGGTTGTAAATTATGATCCTCGAATTGATAAACAGTTC
CATACCATACTAGATTACATGTTATGGAATCTTCGTGACAGAGCATGGGGATCTAAGAGAGCTAAAGCAT
ACGATAGCTATTTATTAGAATCTGCCATGCATATATACGATAAAAATCCTCAATGGAAAATCCCTGAAAG
CATGCTGCATTACGCTATTGGCTACTACAAAGTGCAAGTTCCTCGATGGGTACGTTCTCATATGCGCCCC
TACACACTTGTAAAAATGCTAAAAGGAAGTATTACACTCTCGTTAATCACTACACAAAATGAGATTTTTG
CTCACAAACGTGGATCCGGTTTCAATATCTACTTTGCCCTGCTTGGATTGAATAAACACGTAGAACCTCA
TAGTAACAAGCCTGGGGACATGACGTTGCGTCTAAAACAAGATGTCATTCTGAAAGTGAGGAAAGTCGAT
GAAAGTGAATACCAGAAAAAAAGAGTCTATGTGGTTGCAGAAATTGCTACGGAAGAAGACCGTAGTCTAC
GGCCTAACTCACAAGTACTCATCTTTCCCGGGGGGGAGAAGATCAGATATAGAAGAAGTCTGAAAAATCC
AAAAGAAAGCAATTCTACAATCACCGATTAA
>ref|NC_003361.3|:642703-643941 tryptophan synthase subunit beta [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTATACTTGTGATACTTGTGAGGAAGATTTAGACCTTTCATTAGATTTAGGTGAAACTTATGAAGAAC
TCGAGACCTATGGGGGACAATATGTTCCACTAGAACTCGTTAAGCCCTTGGAAGATCTGGACCGGAGCTA
TGAACAATTAAAAAAAGATCCTCAATTTCGAGAAACCTTCCACCATATTTTAAAAAATTACGCAGGGAGA
CCAACGCCTTTAACAGAGGTCAAAAATTTTTCTAGAGCCATCAATGGCCCACGGATCTTTTTAAAAAGAG
AGGATCTTCTACATACAGGAGCTCATAAAATCAATAACGTCTTAGGCCAATGTCTTATAGCCAAGTTTCA
AGGGAAAACCCGTGTTGTGGCAGAGACTGGCGCCGGACAACACGGAGTTGCTCTTGCAGCAGCAGCAGCA
TATTTAGGCATGGAATGTGTGATTTTCATGGGGGAAACGGATATCAATAGACAAAAGCCCAATGTAGACA
GAATACGTGTCTTGGGAGCAGAGGTTGTTTCCGTGAAAAGAGGAAATTCCGGCCTTAAAGAAGCTGTAGA
TGCCGCTATCGAAGATTTTATTTTTAAACATGACCACACGCATTTTTGCATAGGATCTGCGTTAGGCCCC
TATCCCTACCCGAAGATTGTGCGGGATTTTCAATCTGTGATTAGCTTGGAGGTCAAAAGCCAAATCAAAG
AGTATACGGATCGAGATCCTGATATTCTGATTGCCTGTGTAGGAGGAGGATCCAATGCTATAGGTTTTTT
TCATCATTTTATTCCAAATACAAAGGTGAAACTTGTAGGCGTAGAGGGAGGTGGTCTTGGAGTCGAATCT
GGGAAACATGCGGCAAGATTTGCCACAGGGAAGCCTGGCGTGGTTCATGGTTTTCATTCGTATGTACTCC
AAGACGAGGACGGGAATTGTGCAGACACTTACTCTATCTCTGCAGGATTAGATTACGTAAGTGTTGGCCC
AACACATGCAGAAATGCATGAATCTGGACGTGCTCAATATACCTATGCAACGGATGATGAGGCTTTAGAA
GCTTTCCGTCTTCTATCAAAGACAGAAGGTATCATTCCAGCTTTAGAATCTTCTCATGCCTTGGCTCATA
TGATAAAAATAGCTCCTTCTCTAGATAAGGATACGATTGCCATTGTTAACCTTTCAGGAAGAGGAGATAA
AGACCTATCACAAATTATAGACCTCGACAAAAGAAAAAAACATTCTTAG
>ref|NC_003361.3|:645812-647533 hypothetical protein CCA00561 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTAGCACCTGTTCGAATTCCTATAGAGGATTTAACTAGCGAGAACCAAGAAAACACTCCTTCGCAAG
AAGGAAGAGCCAGTTTAGAGGCTGTCGCTAGCCAATTGAATGAAGTTATTATCAATATGTCTGAAATAGA
TCTGACAAATAATGATGATAGCGATGTAGGAGGGAGTAGAGCGGTTTCTGAGTCTTTATGTATAGCTAAT
ACAGAGACCCCAGAGCCTGCAGACTACGATATTGGAACAACATACGTTAATGGCAGTTGGCAGACAGAGA
CGGAAGCTCAGCTAGAAGGCATGCATATCAGCGGACTTCGAGGAGAACCCGTACGAGTTCTATATAATTC
CGGAAGAGGTCTCACATCTTCAGGATTTTTAAATCGACGTAGTTCCGTTAGCCCTATGAATTCTCTATGC
GTTACTATATTAGAGATTTTACAAGCATTCTTTTCTCATCCAGAAAACGCTGGAAGAAGACACACTCTTA
TATTTTATGGCGATGCAGGAGCCTATGTTCAGCAAGTCCTAGATCATTCCCCATATGCTAGTCGTGTAGA
TTGTATAGGGATTGCTCCAACAACATATGTCACTGGACATTCAAACGTTCACCATTTTCGCGTTTCTGGA
GATCTAGCCACTTTACGAGATCGCGATGGTTATAATAACTCTAGTGTTAGCACCTTAGGATATTCAGCCG
GAACTGAAGGCCTTCTTTTACCTGGATTGCGAGATCCTTCCTATCAATATGTTCTAGGGATACAGGATCC
TTCTCAATTAAATGAAGGTCCAGTTACAGATCCTGCAGTTGCCATATCCCTAATACAAATGGGCTCGGAC
ATGCGAGCTTTTGCTCAAGCAGAACGCGCATTCAACGATGTAGATAATCCCAACGAAGCCTTAGTTAACC
CTTATCCTTCTACCTGGCCCGATACTATACTCACCGGAATCTTCCTTGTTCCCAGCATACTTGCAATAAT
GCAAGACGTTTTCGTGCGTAGTCTTTTACCAGAGGAAGACCAGCCTTTCTACTGGGTCTCACATGTGGGA
TACTCTGCAGGGCTACTTCAAAGACTCGTGTTAATGTTCACAAACCATAGGGACCTAAGATTCAATCATA
GGGGAGCACGCTTACTAGTTAGGTCTTTTGCAGCTCCTATGCTGTTAATTTCTGCCGCAGAATCTGTAAA
CTATCTACAAAGAATGCGAAGACCCATCCCGATTCTACAAGCAATTTACTTTGGCGGATCGGTAATGAGT
GGAACTTGGGTAGTTTTGGCTATTGGAAACACGTTCTTAACCCGTATGCGCGCAAGCGTACAAAGACTTG
GACTAAGACTCATGAGAGATCCTGAACAAGAACGAGGGGGTAATGAGAGAAGAGCTATTCGCGTTGCTGA
TGCTGCGAGGCGCGGAATTGCTACAGCTCTGCCCACCATGTGTGCAGGGGTTGTCGCGGGACTAGGCGCT
GGACTACTCAATGGGTGTTCTATACCAAGCGCCTTGAATAGGCCTATCAATGCAACAGCCCATAATCTCC
CTGAGAATAGAACCTGGGTATTTGACGGAGATATATTAAGGGATCCTTCTAGATCATGGGTATCAGGAGA
TTGGTTCGGCTTATCTGCAACTATTTCTTTCTTACTAGGGCTCATCGTGATTTGTACTTCTATTGGAGTC
ATAGTAGCCTCCGTAAGAAGAAATCGTCACCGCAGAACATAA
>ref|NC_003361.3|:647589-647894 Trp operon repressor [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCGCAGGAAAGTAATGAAAATGGTTGGGGAGACTTTTTAGAGCTGTGCTCTAAAATTAAGACTCCTG
AAGCATTTCATGATTTCTTTGCGTTATTTCTTACTTTTGGAGAGCGAGAATCTATGGCTTCTCGTTTTTT
AATTGTCCAAGCGTTACTCGCGGAGCAGCTCACACAACGTGAAATTGCCCAAAAATATGGCGTGAGTATC
GCACAAATTACAAGAGGATCAAACGCTTTGAAAGCGATTGATCCTAAATTTAAAGAATTTTTAAAAAATT
TAAATAGAAAATATGGAAACCAGTAG
>ref|NC_003361.3|:648125-649156 anthranilate phosphoribosyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCTACAGACCTATTTGCAATCAATTATGAATCAATCACATTTAACATATGATGAGGTGGAATCCGTTA
CTAATCTCATGTTAAATGGAGCTGATCCGCATCAAATAGCAGCCTTTTTGGCTGTGTTAAAATATCGAGG
AGAAACACCCACAGAAGTTGCTGGAATGATCTCTGCGTTACAAAAACAAGCGACACCTGTAAACCTTCCT
TTTCCAGCTTTAGACATCGTAGGGACAGGAGGAGATTTAGCAAATACAGTTAATATTTCCACAGGATCAG
CCATATTAGCAGCAGCTTGCGGGATCCCTATTGCAAAACATGGAAATCGTTCTGTTTCTAGTCAAAGTGG
GTCTGCAGATGTTTTAGAAGCACTCGGAATAGAAATAGAAATGTCTCCAGAAGAATTGCTCTCTTGCGTT
CAAGAAGTAGGTATTGGATTTATGTTTGCTCCTATCTACCATCCCTCATTAAAGAAATTAGCTCCTATAC
GAAAAGGAATGAAATTCCCTTCCGTATTTAACATTTTAGGCCCACTGCTCAATCCTGCAAATACTGAGTA
CGCTTTAATAGGGGTTTCTAATGAGCCTATTTTAGAACTTATGAGCGAAGTTTGTCTCAAGTTTAAGAAC
ACAAAGAGAACCTTTCTTTTTCATGGAAGTGGTCTTGATGAGTTAACCACACTAGGAAAAGTCGTGGGTT
ATGATATTCAACAAGGCAAAAAAACTCGCCTTGAAATAGATCCCACATCGTTAGGGTTTAATTCTTGTAA
AATCGAAGACCTAAAAGGCGGTAATTCTAAGTTAAATGCTTGCATTCTGAAAAAAGCTTTCATGGGTCAA
CAAAGCGCTATTGCTGACGCTCTTATTTTCAATGCTGGAGCAGCCATGTGGGTTTTTGGCAATGCTGCAA
CTTTAGAAGAAGGGATACATAGTGCCCGAAAAACACTAATGGAAGGAGAAGCACTAAGAGTACTAGCACA
GTGGGCAGCATTTTCACAACAACTAAAGTTGAAGAGGGGATCATGCAATTAG
>ref|NC_003361.3|:649147-649968 indole-3-glycerol phosphate synthase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCAATTAGCTCATCATTTAACAAACATTATTGCTTATAAAAAACAAGAAGTAGAACGGCTCAAAGAAG
AAGTTAGCTCACAGAAAAATCATTATCTGAGTCAAATTCTAAAGCAAAATCACTTACAAAAAGAGCAGTT
TGCCACAGCTCTAAAGGAACCGGGTTTATCCATTATTGGTGAAATAAAAAGACAGTCTCCAACACGTGGA
AAAATTAGAAGTATAGATAGTCCAGCAGATCTTGCATTAAAATATTGTTGTGGAGGGGCCTCTGCTATTT
CAGTTCTTACTGATACTCAAGGCTTTGGCGGATCTTTTTTAGATATGCAACAGGTAAATCAAAAACTCCA
ATCACAATACTCTCATGTTTCTGTATTGAGAAAAGATTTCATCCTACATCCTTTACAACTAGCCGAAGCT
ATTTTCTTCGGAGCACATGCTGTTCTTTTAATCGTGAGCGTTGTTGGAGAAAATTTAAAATTTCTCATAC
AAGAAGCCCAGAGATTAGGTTTAGAAGTTTTAACCGAAATTCATGATTTGTCAGAACTTGAGTTAGCTTT
AGAAGCAGAAGCTCCCATTATTGGGGTTAACCACCGCAATCTTCAAACTTTTGAAATCGATCTCAATCTA
TCCGAGATTCTAAAACCCTTTATCCCTCCTCAGATCATTACTGTAGCTGAATCAGGAATCCATCACCCTA
CACAAGCCAAACGGATGCGCGAGCTTGGATTTGACGCTATTTTGGTCGGAGAAGCCCTTGTGAGCTCTAA
AGATCCTTCTTTGTTAATTAAACAAATGAAAGGAGAAGAAAATGAAAGTTAA
>ref|NC_003361.3|:649958-650578 N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAGTTAAAATTTGTGGAGTTACACATCCAGAAGACGCAGAATATGCCGCTCTTTTAGGAGCAGATT
ATATTGGAGTGATCTTTGCCGAGAAATCAAAACGAAAAACCTCATTATCCATGGCCAAAAGCATTGCTGA
TACAACAAAACGCCTGGGTGCCGAGCCTGTAGGCGTGTTTGTGGAACAAACTACAGACCAGATTATTGCT
ATCTGCGAGCAAACAGGAATTAAGACTATTCAACTACACAGTACTTTCCCTTTAGGAGCTCTTGAAAACC
TCTTGAGAGATTATTCCATCATTTATGCAATTTCTGTCCGAGAAAATGGAGATGTTTGTCACCCACAATC
TTTGCCCCCCAAAGTCATTCCTTTATACGACACTGAGAAGGGGGGGACGGGCAAACAGTTTAACTGGAAA
GCATTTTCGTTGCCAAAAGATACCTTTTGGATGCTAGCCGGGGGATTAAACCCTAAAAATATAGAAGAAG
CTGTTGCTACTTTGCATCCCAATGGAGTTGACGTTGCTACCGGTGTAGAATTCCCAAATAAGACAAGAAA
AGATCCAGATTTACTTAAGGCTTTCATCCTGTCTGCAAAAAAATCCGGGGAGAAAATATGA
>ref|NC_003361.3|:650575-651750 tryptophan synthase subunit beta [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAACATCCTTATCCATTTGGCGGGCAATTTATGCCAGAAATATTGATGGCTCCTGTTCAAGATTTAA
GCAATAGCTGGAAGTCCCTGCAAAATCACAGTGACTTTAAAAATGAGTTAGATTCGGTTTTAAAAAATTA
TGCAGGAAGACCAACACCTCTGACTGAAATTAAGAACTTTGCCAAAGCAATACATGGACCACGAATTTTT
CTAAAAAGAGAGGATCTTCTACACACTGGAGCTCATAAAATTAATAATGCTCTAGGCCAATGTTTGCTCG
CAAAACATCTAGGAAAAACACGAATTATTGCAGAGACGGGAGCTGGACAACATGGAGTTGCAACAGCAAC
TGCTTGTGGCTGCTTGGGTCTTGAATGCGTCATTTACATGGGTGCTAAAGATATCGAAAGACAGAAGCCC
AATGTAGACAAAATGAACTTATTAGGCGCAGAAGTCATTTCTGTTAACCAGGGAGCCCAAACCTTAAAAG
ATGCTGTTAACGAAGCCCTTAGAGATTGGTCTAAAAATTATGAATCTACGCATTATTGCTTAGGATCAGC
TCTCGGGCCAAGCCCTTACCCTGAGATGGTGCGTAACTTCCAATCGGTAATAAGTTTAGAGGTGAAATCT
CAGCTTCAGGAGATAGGTTTCTCTCCTGATCTTCTTATTGCTTGTGTTGGAGGTGGATCAAACGCTATTG
GGTTCTTCCATCATTTTATTCCCGATACACGCGTTAAACTGGTTGGAGTTGAAGCAGGAGGATTAGGAAT
TGAGTCGGGTCATCATGCTGCTCGATTTGCTACAGGTCGTCCTGGAGTCTTGCACGGATTTTACTCCTAT
CTTTTACAAGATAACGAAGGACAGGTGTTGCCCACACACTCTATTTCTGCTGGTTTAGATTATCCCGCAG
TAGGCCCCGATCACGCAGTATTATACGAGTCAGGAAGGGCTTCTTATACTGTAGCAACAGACAAGGCTGC
TTTAGAAGCTTTCTTTCTGCTTTCACGACTCGAAGGCATTATTCCCGCTCTAGAATCATCTCATGCTCTT
GCAGAATTGATTAACATAGCTCCTACTCTTCCAAAAGAGAGTGTTGTTGTCGTTAATCTATCCGGAAGAG
GGGACAAAGATTTAGAGCAAATAACCAATCTAATAAAGGCTGGCAACAATGAATAG
>ref|NC_003361.3|:651743-652516 tryptophan synthase subunit alpha [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATAGAATTGAAACAGCATTTAAAAACACAAAACCCTTTATTGGATATTTGACAGGAGGGGATGGTG
GATTTGACTATAGTGTTGCATGCGCTCACGCTTTAATTCGGGGAGGTGTTGATATCTTAGAAATAGGGTT
CCCTTTTTCAGATCCCGTTGCAGATGGTCCTATAATCCAAAAGGCTCACACAAGAGCATTAGAAGAAAAG
ACCGACTCTACAACCATTTTAGAAATCGCAAAAGCTCTACGTGAAACCTCTAATATTCCTTTGGTGTTAT
TTAGCTATTATAACCCGCTTTTGCAAAAAGGTCCCCAGTATTTGCATCAGTTAAAAGCAGCAGGATTTGA
TGCTGTTTTAATTGTAGATCTACCCATTCCTCAGCATGCAAATGAATCTGAGCCCTTCTTTCAAGCTTTA
ATCGAAGCTAAGCTGTTCCCCATAGTATTAGCTACACCTTCCACACGTGAAGAACGGTTATTACAAATCA
GAAAGTTAGCAAAAGGTTTTCTCTATTACGTTTCTCAGAAAGGAACTACAGGAATAAGAAGCAAGCTTTC
TGATGATTTTTCTACACAAATAGCGAGATTACGCTGCTATTTTCAAATTCCTATTGTTGCTGGATTTGGC
ATAGCCAACCGAGCTAGTGCAGCAGCAGCTTTAAAACATGCTGATGGCATTGTTGTAGGTTCTGCTTTTG
TGGAGAAATTAGAAAAGAAAATATCTCCTGAAGAACTTACAACATTTGCTCAATCTATAGATCCCCGTCA
GTAA
>ref|NC_003361.3|:652528-653805 kynureninase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATGAAATTTTAAAACATTATCAGAAAAAAGCCGCCCAATTAGATGAACAGGATTCTCTGAAACATT
TGAGAGCTCGTTTTGCCTTACCGAAAGATCCTAATGCTATTTATTTCTGTAATAATTCTTTGGGCCTTCC
TGCAGTAGGTGCTTTTACGAAAATAGAAGAACTACTGCAACGCTGGTCAGATGTAGGAGTGAACGGATGG
TTTGAGGGAGTTGGAAACTGGTATCGTTCATTTGACAATCCTTTAAGACAACCTCTTTCCAAGATTTTAG
GTGCGGAATATGAGGAAGTCGTTGTCATGAATAGCCTCACCATGAACTTACATTTGTTATTGGTTTCGTT
TTACCGACCAACCGATACAAGATATAAAATATTAATCGAAGGTCCTACATTTCCTTCGGACTTATATGCG
ATAAAAAGCCAGCTGAGTTTTCATGGGAAAAATCCTGACGACGCTTTAATTATTTTAGAGCCACGTGCAG
GTGAGGATTTACTTCGTTATGAGGATTTTCAACAGACTTTGGAAGAACAAGGTGAATCTATAGCCCTTGT
ATTTATGAACTGTGTCAATTTTTTAACGGGACAGGTTCTTGAAGTAGAAGCCATCACAAACTTAGCAAAA
GAAAAAGGCTGTGTAGTTGGTTGCGACTTAGCGCATGCTGCAGGGAATATTCCCCTTAAACTCCATGAAT
GGGGAGTGGATTTTGCCTTGGGATGTTCCTACAAATACCTTTGTGGAGGACCAGGTGGGCCAGGTATTGC
TTTTGTTCACAAATCCCATCATAATGAACAACTTCCGCGTTTCAGCGGATGGTGGGGAAATGATCCTGAA
ACACGTTTCCAAATGCAACTACAGCCAGAGTTTATTCCTTACAGCGGCGCTTATAGCTGGCAGGTGAGTA
CACCGTCTATAGTATCTCTAATGCCTCTTCTTGCGACTCTGGAGGTTTTTGAAGAAGCTGGTATGGAGAG
GGTAAGACACAAATCAAAACAAATGACAGCTTTCCTATTAGAATTACTAGAGTTAGCTCCTCCTTCATGT
TTTGAAATTATCACTCCAAGAGATCCAGAGTTGCGGGGAAGCCAGCTCTCCATTCGTATTCAACAACATA
GCGAAGAGGTTTTACAAAAGCTGGAAGCCCAAAGGATAACTTGTGATTCGCGACCACCAGATATTATTAG
AGTAACGGCAACACCTCTTTATAATACTTTCAGCGAAATCTACAAATTTACCTGTAAGTTATTTGAAGTG
TTAGAGATCAAATCATGA
>ref|NC_003361.3|:653802-654707 ribose-phosphate pyrophosphokinase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATAAACAACCAATTTTATTATCAGGTTCTTCTAACTTAATATTGGCTCAAAATGTTTGTGCTGAGC
TGAAAATAAAACTTGGGCGTATGGAGTTGAATCAGTTTCCTGATGGAGAAACTCACGTTAAGGTTTTAGA
AGATGTTCGAGGTCGTGATGTTTTTATAATGCAATCGATTGTAGGTCAACCAAACCACTACTTATTCGAA
TTGCTTATTATTGCTGATGCCCTGAAGAGATCTTCCGCAAAGAGTATCACAGCAATTATTCCTTATCTCG
GCTATTGCCGCCAGGATCGAAGAAATAAAACAGGGGAACCCATTACAGCCAAGCTTGTAGCGGATGTTCT
TACTACAGCAGGTATTACCAACCTTATCACATGTGATTTACATGCTGATCAAATAGAAGGCTTCTATAAA
ACACATGTAGATCACTTACACTGCCAACAGCTTTTTGTAGACACTATAAAAAGCTGTATAAGCCAAGACT
GTATTGCAATAGCTCCCGATATAGGGAGCATTAAAATTGCAGAAAGGATAGCAAGGATGTTAGATACTGG
ACTGGCTGTGATTAAAAAAGAACGTCTAAATTCGTTCGAAGTGAGCATGCAATTAATAGGAGAAGTACAG
GATAAAAATGTCGTAATTATTGATGATTTGTGCTCAACAGCCAATACGCTGGTTGAAGCTGCAAATTTAT
GTAAGCAAAAAGGAGCAAAAAAAATCATTGCTACGGTGACTCATGGTCTTTTTGTTGGTGATGCTATACA
AAAAATTGAGACAAGCGCTTTAGAGAGTCTTTTTGTTACAGATACAATACACTTACAAAGCACCTCAACA
TGCATAAAGACTTTATCAACAGCTCCAATGATCGCTTCAGCAATCAAAGCAGCATTATCTTTCTGA
>ref|NC_003361.3|:c655821-654997 hypothetical protein CCA00570 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATTTCGTGTTTTTTTTCATCAGCGATTTTTTCACATAGGTTTTTGAAAGATCTTCCTAAAATTGGTA
GGGGAAGTGGCTATCTAGAATCTTTAGCAGAAAGGGTGGATAGGTTACTTCAATTACGAGATAGATCTCG
TGTTTTGTATATTGATAAAATCAATATACGGGGACAACTTGTTTATGTGGACATACGGATTCCATTACTC
TTTCAAGAGAGAGTAAGAACACTGTTTCTATATCTGCTTATCATTCCTGCAATTATAGCCTTTATTATTA
AGGTCGTGGTGAGAATAACTCTGTATTGCAAATATGGAGGATGGGAGAGATGGTCTGAAAGGACGGCTAG
CTTAATTGATCCTTCACTGGGATTCAATGAACATCCTCCTTATATATTCAGCAAAGAGCAACTCAAATCT
ATGAATTTTTACCTTCCATCCTTGGGAGAAAAGAACATGGAAAGCATACTAAATGAACATCAACGTCTCA
GAGATATAGGAAGCAAATCAGTTCTAAATAGGATGGGTGTGGGGATTAAATCTAAGACACGGGGTAGCGA
TATCTTAGGGGATGATGATGATATTTTTTTCATACATCCAGAGTTCCCAAGGCTAGAATTTGAATCTATA
GGACAAATGAGAATCAATAACCAGGTGGGGTATTCTGCTCAAGAATGGGCAGATATGCATGTATTGGAAT
ATCTAGCTTTACAAAGAGAACAGCTATCCAAACTACGTGGATTTATTAACTCGCGTATTATCAGTATCCG
AAGAATACGTACAGATCCTGCGGGAAACCATGTTTTGATTATTCGAGAATGTTGA
>ref|NC_003361.3|:655845-655997 hypothetical protein CCA00571 [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGAAATTCAAAATAGAAAGATCTGATCTAATCACCGATGTAAAAGATCTTTCTATGCGTAATGAATTGC
CGTTATTGACTTCTGATCAAGTGAAAACGCTGCTGTTTTTAGAGCCATTCTACGACAGTCTTTTACAGAG
CATGGAAGAATAA
>ref|NC_003361.3|:c657451-656084 adenosine/AMP deaminase, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTCGATAAGAGGTTTTTTTTAATTATCCAACAGTTGTCACAGTTGACATCTGAGTTGTACGATGACA
CTCCTTGTACGAGTCAGTTTATTAAAGATCTCCCTAAAGCGGATATTCACGTGCACCTTCCAGGGACTAT
TTCGCCAGAAACAGCTTGGGAGTTGGGAGTCAGAAATGGTCTGATAAAGTGGGAGAATAATCAATGGAAA
TCTCCAGCCTTCTCTAATGGGAACCCTCACAAGAGTTATGCTGAAATATTCAGAAACTTTGAGAGTATTC
GCTATGAGCGGGACCCTAATGTTTCTTTATTAAAATATGCTATTATCACCCGTGATTTTGCTAGCTTTGA
TCGGATTATGGCTACCGTACAGGGGCATAGATATCCTCCGGGAGGAATCCAGAACGAAAATGATCTGTGG
CTTGTTCTGCAAAATTACTTAAAACAATGTAGACAAGATAATATCATTTACACCGAAGTCCAACAAAATA
TCCGCATAGCTTATGTAATTTATCCTTCGCTTAAACCTCTAGAAGCTCGCTTACGATTGTATGATCTATT
TTCTAGAGCTTCTCAACTTTTCCAGAGTCAAGGAATTACCCTTCGCTTTCTCAATTGTTTTAATAAAACA
GGCTCTTCTAATCTCCAGCAATCTACACAACAACGCTCAGAAGAGGCTGCGAGTTGGCTTGATGAAGCCG
AGTCGTTCTTCCCTAACCTCTTTGTTGGCTTGCAATCTGCCGGAGCAGAAATTTGTCCTGAGGCAGCACC
AACAAAATTAACTTCGGGTTATCGTCATGCTTATGAGAAAGGATTTGGTTGTGAAGCTCACGCAGGAGAG
GGGACGGGATTTTTATATTTAAACCAAACGATACAAGCTTTACCTATACAAAGAATAGCCCATGGGTTTC
AGGCAATTGAACATGTGCCAACGATTCATGAAATTCAAGAGAAAAACATCACACTTGTTATGGCTCCGGC
TATTAACCTGGTACTTGGAGCTTCGTTGCATCAATATTCTGGATTGAACAAGAGCGGTAAAACGATCATT
AATAATCTTGATGAGCATCCTTTCTTTGCATTATTCAGAGACCATAAGCTTAGCGTAACATTGAGTTCTG
ATAATCCCCAAATGGGAGGGACTTCTTTGCAAAATACGATGTTGCTTTTATCTGGATTCCCTGCCGATGA
AGATTCTCATTTAACTCATGTGAAATCTTCACCTCTAACTTTTAAAGAAATCATACAACTCAATGTGGAG
GCTATAGTCTCTTCGTTTGTGGATGTTGATACAAAAATAATGCTTTTAAATAGGATTCACGAATACTTAT
TCGAAGATCAAAAAAGACTACGATCTACTTGTGGATAA
>ref|NC_003361.3|:c659019-657481 bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGAGTAATATTCTCATTCTTGATTTTGGTTCCCAATATACGAACGTTCTAGCAAAAAAAATACGTTTGC
TTTCCGTTTTTTGTGAGGTCCTCACTTGGAATACACCTTTAGAAAAGATTCTTCAAATATCTCCCTCAGG
TCTAATTTTTTCAGGAGGACCACATTCGGTTTATCAGGAGAATAGCCCTAAAGTTGATAAGGAAATCTAT
AACAGCAACATCCCTATACTTGGAGTGTGCTATGGCATGCAGCTGATTGCTAGAGATTTTGGAAGTGAAG
TTCAGGGAGGAAAAAGCGAATTTGGTTATACACCTATAGTGTTTTATCCAAGCGAACTTTTTAAAGGTCT
TGTTGATCAGGATGCTTTCCATACAGAAATTCGAATGAGTCATTGTGATTCTGTTGTTATTCCTCCTAAA
GATTTCTTTGTTATAGCGAGTTCTCAGCACTGTCCTATTGCTGCTATAGAATGCCCAGAGAAAAAACTTT
TTGGTCTTCAATTCCATCCTGAAGTTTCAGATTCTCAAGCCGTAGGGGATAAAATTTTATCAAATTTTGT
GAAGCATATTTGTCAGGCCTCAGAAACTTGGAAAATTGAAACAATAGAAAAACAACTTATTCAAAGCATT
AAAGAAAAGGTGGGAGAAACAGAACGTGTCCTTCTCGGCCTATCTGGAGGCGTAGATTCTTCTGTTTTAG
CTGTTTTGCTTCATAATGCTCTAGGTGATCGCTTGTCTTGTGTCTTCGTTGATACTGGACTATTAAGAAA
GAATGAAGTGGAAGAAGTTAAACAACAATTCTCTTCTCTAGGGTTAGAGATCCTTGTGGTAGATGCTTCT
GAAAAATTTTTCCATGACCTATCCGGAATAGAAGATCCTGAGCAAAAACGTAAAGTCATAGGAGCCGCCT
TTATCGAAGTTTTCGATGAAGTATCTAGAAATCTCGATGTTCAATGGTTAGCTCAGGGGACTATTTACTC
TGATGTAATTGAATCTGCAAAATCTTGTGACGCAACACAAGTAATCAAGTCTCACCATAATGTAGGTGGA
CTTCCAGAAAAGTTGAATTTGAAGCTTTTAGAACCTCTACGTTTTCTTTTTAAAGATGAAGTTAGAGCTT
TAGGTAAAGTTTTGGGTTTGCCGGACGTCCTAATATCCCGACATCCTTTTCCTGGTCCTGGTTTAGGAGT
CCGAGTTCTTGGGGAAGTTCGTCGGGAATATGTAGAAATAGTGAAAAATGCTGACAGCATTTTTATTGAA
GAACTAAAAAAAGCGAATTTATACCACAAGGTTAGCCAAGCTTTTGCTGTTTTCTTGCCATGTAAATCTG
TTGCTGTAAAAGGTGACTGCCGTCATTACGGTTATACGATAGCTTTACGTGCAATAGAATCTACTGATTT
TATGACAGCATGCTGGCCATCTTTATCTAGAGAATTTCTTAACCGTTGTTCCTCGCGTATCATTAATGAA
ATCCCTGAAGTTTGCAGGGTGGTTTACGATATTTCCGATAAACCGCCGGCAACTATTGAGTGGGAGTAA
>ref|NC_003361.3|:c660108-659035 inosine-5'-monophosphate dehydrogenase, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCGCGAAGCCCTGACTTTTGATGATGTTTTATTAGTTCCTCAGTATTCTGAAGTTCTTCCTCAAGATA
CTTGTTTAGCTTCTTCTGTTTCAGAATCTTTATCTTTAACTATCCCTATCTTGTCTGCAGCAATGGATTC
AGTCACAGAGTTGTCTATGGCTACAGCCATGAGTGTGGCAGGAGGACTTGGGATTGTTCATAAAAATATG
GATGTGAATGCACAGGTTGCTGTCGTAAAACAGATAAAATCGCAAAGCGCCTCTTCAGTAGTTGGCGGTG
CCGTAGGTATCGGTCAACAAGGTTTAGAAAGAGCAGAAGCTTTAGTTGAGGCAGGTATAGATGCTTTAGT
AGTCGACACTGCTCATGGGCATTCTAAATTGGTGCTTGATACAGCCTTTACCCTTAAAAAGAATTATCCT
GTAACTCTCATTGTGGGGAATATTGTTTCAAAGGCAGCTGCTCTTTGTTTGGCTGAAATTGGTGTAGACG
CTGTTAAAGTGGGGATTGGTCCCGGATCTATATGTACAACGCGGATTATCTCGGGTGTAGGATTGCCTCA
GTTGACAGCAATTATGGATGTTTCTGAAGCATTGCGTGATTCTTCTGTACGTGTCATTGCCGATGGGGGG
ATGCGCTATTCTGGAGACATTGTTAAAGCTCTAGCTGCTGGAGCGCATTGTGTTATGCTCGGTAGCATGC
TAGCAGGAACTGATGAGGCTCCAGGAGAAATCGTTCAGATTAATGAACGTGCTTACAAGATGTATCGAGG
TATGGGTTCTCTCGGTGCTATGAAGAAAGGTAGTGCCGAGCGCTATTTTCAAGAAAGTAATGCTAAAAAA
TTTGTTCCAGAGGGTGTTGAAGGGCTTGTGCCTTACAAAGGCTCTCTTCACGACGTTCTCTATCAAATTC
TAGGAGGGATTCGATCGGGGATGGGCTATTTAGGAGCTCGCAATTTAGAAGAATTGCGCCAGAACGCTGT
ATTTTCCCGAATCACTCATTCTGGAAGATCTGAAAGCCACATCCATAACTTGCAACACATTCAGCATGCT
CCGAATTATCTAATCTCTAAATAA
>ref|NC_003361.3|:c661319-660435 hypothetical protein CCA00575 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATTGGGGAGTACTCATGCGTAATTATCTTTTTCTCATGTATAGGGGAGGATCTTTAATGTATAAAT
CAATAACATATCTATGCGGATGTTTATTAGTTCTTAGTGGTTGTTCTCAACCCACTTTTACAAAGGATGC
TAGTGTTGATCAGGTATTTTGTATTAACTTACCTATTTCTGATTTTTCTTCCTATCCTGCCGCTTATACA
CCAGCACAATGCTTGGCAAAGGAAAATAAAGATCCTAAAGTTATTGCGAGAGTGGACGAAGAATCTCGTA
GGATCTGGAGAGAAATACATGCAAAAATGAATCTAACCACTCCTTATATTCCTATGTTTGTTTATGGGAG
TTTAATGAATCCAGCTTCAGCGAGAAATACTCTTGAGGAATACCATCCCTATGCTGTTTGGTTACGTGAT
TATGTAAGAATATTCAATTTAGATGTTGATTGTGTAGGGGGGACTACTAGATTAACCGAAGCAGATGGTC
CTAAAAATCGCGGTTTTTTAAATTTAAAACGTATGCCAGGAAAATCTTGCAACGGTATTGTTTTGGGTAT
TGGAGAAGATGATTTTGTGTCTTGTCGTCGTCGTGAAGGAGTTTATGAATTTGTTCCTGTTGTAGTGTCT
GATTATAGACCTACGGGGAAGTGTAACCGTAGTATAGCTTTTGCCTGGATTGCTGGACCTCAAGTGTGTT
CCAGTGATGTTTTACCAGTAAAAGGTTATTATTCTATGATCTGGGCTGCAGTCGAATCTGATAATGTAAA
AAAGAATTTCGGAGAAAATTTTGCTCAGGATTATCTAGACACGACATTTTTATCTAATGAGCAGTCAATA
AAGACTATTCATGAAGAATACAAAGACGCTCCATTGCGTTATTAA
>ref|NC_003361.3|:661718-662230 hypothetical protein CCA00576 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCAAATCCAATACCTACACAACGCCTAAATATTTCTTCTTTTCACTCAATTACGAGTCATACTTTAA
TGGAGGGAAATTTTTCCCCTCGCAGAGCATCTCTACGACTATTTTTAGATACAATGTTGATTGTTCTAGG
TTTCTCTACTGTAGTTTCAATCTTTGTAGCAATATTTTTTCTCAATGGACTCAGCATGCTAAACACAACA
ACAATTGTCTTATCTGTATCGTTGATTCTGATGGGCATTATATTTATCAGCATCGGAGTGCTTTTCTTTG
TCAATAACATAGAACAAGGACTTTCAGGCATTTTGAAAAAACGTTTAAGTGAAGCAGAGTCGGAAATCAA
AGATCTTAGAGATCAGCTACAAAATTATGAGCTTAATCTTGCATTTGCTCCATCGGAAGATCGTATAGAA
AATTCTGAAAATATAGAACCCCCTGCATCTACAGAGGTCCCTGTAGAGACCATTGTGGAGATAGATGAAC
ATATGAGTTCTACAACGTCTTGA
>ref|NC_003361.3|:662231-662323 hypothetical protein CCA00577 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAATTTTAGATCAGACTTTAGCTAAAACGTTACCAAAAACAAACAGCCAAAAAATCAATCATTTAG
GAAAGCTTGGGTGGATTTTCTAA
>ref|NC_003361.3|:662455-663297 hypothetical protein CCA00578 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGAACACAAAACTTCTTTCTATCGAAAATCAGATTATTGGGTGCTTTATGCCTAGCTTCCCTTGCTG
TTTTAATTACTGGATGTGATGCTGATGATGCATTTACTAGCGATAAACAATTAGTTGAAGAAGCTAAAAC
TTCAGCTCCAATTTTCACCAAAACCAACGGCGCTGATGACATCTGGGATACAATAAAAGCAGCCTGGGGA
TTATCTAAGCAGATGAATTGTGTTCCCGTAGTGATTTACGACGACCTTATGAATCCTTCCAAATTCCAAG
CTAAAGGGGGAAGTATTTGGAACACTGTTGTAGAAGTTTCTAACAGCAAACGTATTTTCAACTACGATAC
ACGTGCCGATAAAAATGATGCACGTAATGATAAAAAAGAGAATTCTGCAAAAAATTACGCTGATATTAAC
GCTCTTGCTTTAGATTTACAAAACAGTAAAGAAGAATCTCATTTCACCGCTGTTTTACATGGCGTTGAAA
AAGAAACATTTATCGCTTTATGCGATTATTATCCACAACACAGTTTAGTACCTGTAATCGTAACTAAAAC
ATCTGATGACCGTACTACTTATGGCCTCGGATTTATGTTCTCAGTAACAAACCCTGCTTTACAAACTCGT
CAAGACGTGCTTCCTAACCACGCACGTTTCTCAGAAATCTGGGATAGCATCAATTGTAAAGATGTTACTG
ACTTGTACGGAGAGGATTTCCCTGCAACCTATATCAATACAACAGTCCTTGCTAACGGAGAGGATTTCCC
TGCAACCTATATCAATACAACAGTCCTTGCTAACGGAGAGTCTATCACCTCTTTAATCCCAGCAAACAAG
TAA
>ref|NC_003361.3|:663541-663987 hypothetical protein CCA00579 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTATTAACTTACGAAACTGGTTTAGATTTTCTTCACCAAACACGAAAATATCCCTGCTTCGTAAGAA
GCGCTTTCGCCCGTGAAGCCCAAATGGGTCAAGAACCGTACTTACGTTTAGGTATAGTGGATTTAACGTT
AATTTCTTCTAACGATCTAAAATTGTCTTTATTAAACTCTATTCCTATTTTAGGAACTATTCGTGGTTTA
GCACGTCTTTATAGCGTGTGGTCTGTTAAAGATAGAAGTAAAGACCGCGTCAAAGATTTAGTAACACACA
CCTTTTTAGGGATTTTCGAAACCCTAGGGTTAGGCGTAGGCCTTCTAGTTATGAAAATCGTTATTACAGC
TTTGATACGCATTGCCTTTCTTATCCTTGTATTATTTGCTGCGCTCTACCAATTCACAAGAACAAAAGTC
CAACAGCTATCATGTTTTTCTGAATAA
>ref|NC_003361.3|:664251-664922 hypothetical protein CCA00580 [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGCATAATGAAATGATTTTTATAGCACAAACCGTGTTGATTGTACTGGCAGGGATATTCTTTGCTTCTA
AAAGCACAGGATGGCTAACGGGATGGTTGGCTACTCTATCAGTAATTATGAATGTATTTGTGCTAAAGCA
GATTGTTCTATGCGGTTTAGAGGTGACCTCTGCTGATGTCTATATGATCGGGATCCTCTCCTGCTTAAAC
TTCTCTAGAGAGCTCTATGGGCAAAATAAGGTAAATGAGGCGATGATCGGCTCGTGGATTATCACAATAG
CATTTCTTCTTCTAACGCAATTGCATCTCGCCCTTGTTCCTTCACCAAATGACACAACCCAAAACCATTT
TATAGCGTTATTCTCACCAACACTAAGACTCACTTTAGCCTCTTTGATCACTGTGATTTTCGTGCAGATT
GTGGATCTTAAGCTCTTCTCATATCTCAAAAACTTATTTCAAGATAAGGCTTTTGGAACCCGCTCAGCTA
TCTCTTTAATCTCCTCGCAAGTCTTAGACACCCTTCTCTTTTCTTTCCTAGGTCTCTATGGCATTGTATC
CAACCTCTTTCATGTCATCCTATTTTCTCTCATTACAAAAGCGTGTGTGATTGCCCTATCAGTTCCTATC
GTAGTTCTTGGCAAACATTTTAGAAAAAGAAATGCAGTGTAA
>ref|NC_003361.3|:665038-666156 queuine tRNA-ribosyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGGCATTAAAATTTCACGTTCTTCATCAATCTAAAAAATCGCGAGCCCGTGTCGGCAAAATAGAAACTG
CCCATGGAATCATAGACACCCCTGCTTTTGTGCCCGTGGCAACCAATGGCGCGTTAAAAGGCGTCATAGA
CCATAGCAATATCCCACTCATGTTTTGCAATACCTACCACCTCCTGGTGCACCCAGGAACAGAGGCTATT
GCCGCTATGGGAGGACTTCATAAATTTATGAATAGAAATGCTCCTATAATCACAGATTCTGGAGGATTTC
AAATCTTCAGTCTTGCCTATGGCTCAGTAGCAGAAGAAATCAAAAGTCGCGGGAAAAAGAAAGGCTCTTC
ATCAATCTTAGAGGTTAATGACGAAGGCGTATGGTTTAAATCTTATAGAGATGGGCACAAACTCTTTCTA
TCCCCAGAAGTTTCTGTACAAGCTCAAAAAGACTTGGGTGCTGATATCATTATCCCCCTTGATGAGCTCC
TACCCTTTCATTCCGATGAAAAGTATTTCCTATCCTCATGTTCACGAACGTATGTCTGGGAAAAACGCTC
TTTAGATTACCATAAAAAAGACCCTAGACATCAGTCTATGTATGGGGTAATTCATGGGGGTATAGATCCT
GAACAAAGAAAAATAGGTTGTCAGTTTGTTGAAGACCATCCTTTCGATGGTTTTGCTATTGGAGGCAGCT
TAGGAAGAAATCTGCAAGAAATGCTCCCTGTTGTTGACGTCACCACTTCATATTTATCTAAGGATCGCCC
TGTGCATCTTTTAGGGATAGGAGATCTCCCCTCAATACATGCTACTGTCGGCTTGGGCATAGATTCTTTC
GATAGCTCCTACCCAACCAAAGCAGCGCGCCACGGTTTGATCCTATCCTCTCAAGGGCCTATCAAAATTG
CCAATCAGGCTTATGCTAATGATCTTTCTTCCCTAGATCCTGAATGCACATGCGCTACATGCACTTCAAA
CATCTCTAGAGCTTATCTACGGCATCTTTTCAAGGTTCATGAACCTAATGCAGCTATTTGGGCCTCTATC
CATAATTTGCACTATATGCAAGAAGTAATGAAAAATATCCGAGAACAGATCTTAAATGACGAGATCTGA
>ref|NC_003361.3|:666407-666853 hypothetical protein CCA00582 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCTTGTTTCATCTATAAATATAAAAATAATACAGAGTTTTTTTGTGATAATCAGAACGCCTGCTGGT
TATTTAAACAAGGCTTTATCAGGTCAGACACTCAATTGCTGCCCTACACACTGGATTGGGAAATCGACAT
AACTCATACCGATGAAATCAAAGAACTTATTATTCGTTGTGTTCCTATAGTGGGGAGCATTCTCGGTTTC
GGAAAAATCTATAGTTTGTGGTCCACAAGGGATCCTACAGACCGATATAAAGATATCTTATTTCATACTC
TCTCTGGAGTGTTAGAAACTTTAGGGTTAGGTATCGTAGCCTTAAGTTTAAAAATCATCAAAACAACAAT
CTTTTACTTCTTTGAATTCCTTGAATGCTTAATGTATGCGATTATCTCTATAATTCTCCCTGACTCTCCA
GCTGCAGAAAGATTCGTGCTTATCTAA
>ref|NC_003361.3|:667360-667827 hypothetical protein CCA00583 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTATAAATACCTATAGAGATAATTCAGAATTTAATCATACAACACAAAACTATCCCACATTATTTA
AACTGGGATTTGTTCGTGATGAATTCGGACTTAAAAGGTGGAATTATGAATGGATACTGTCCATTGATAT
CGACGATTTAGATGCGGATGGTATCGCTGTACAAATTTTACGCGCTCTCCCTCTTATAGGAACCGTCATG
GGATTAAGTAGAATCTATAGCGTATGGTCTACAGATACATTCGATGACAACCTAAAAGATAAAATCATCC
ATACACTAGCAGGCCTTATCGAAACCTGCGGATTAGGACTCATCACTTTAATCATGAAAGTTTTTTATAA
TATTTTCGCACACATCATTTTCGCAATTACCGCTTCATGTGTGCGGCTATGCAAAGGCATAGAAAAAGAA
GAAGAAGTCAGAGAACTCTTAGGCAATATATTCGCTTGTGGAAATTGA
>ref|NC_003361.3|:668009-668836 hypothetical protein CCA00584 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTATTGAAAGATATCAAAACAATCGGGATTTTGTTAATGCAACAAGAGACGTTTCTCCCCTATTGA
AATCAAGCTTTGTTCGTAAATCTCATTATGTGCGATCTATTAGCGAGGAATGGAATCTCACAACAAGAAA
TGGCGTTTTCTCCAAAACAAATCTTCAGGAAATTAAAAAAGCCACGCCTCTCTTAGGAACTATCCTAGGT
CTAGGCAGGTTGTATAGCGTATGGTCTACAAAAGACAATATAACAAGTAAAAAAGAGCTCGTCCTGCATA
CCCTAACCGGCGTTGTGGAAACTTTAGGATTAGGGATCATTCTCCTAATCGCAAAAATTATGCTTACTGT
AATCAAAACGTTATGGGAGAAAGTCGCTATGCGCTATTCCTTTTGTACTTGTTACAGAAATTTAGAAACT
AGCTCCACATCTTCAGGACGTTCTAGGAATCGTGACAATTCTCAAGAGATTCGAGATTTCAAACCGAAGC
CATTTGAAAATCCACCCGCAAATCCTTTCGACTTACCTAACTTCACTCCAGAGCAACTCTCTAATCTAGT
CTCTACTATGGTGCAAGGCGATCCTTCTAAGGGAGAGAATATAACAATATCGCTCACAATAAATCCTGAA
GCTATGGAACATATGGTAAATGCAACAACACAGCTCTTAGCTAATACCATAAATATGAATGAGATTAGTG
AGGAAGAATTGACAAGAAATATGTCTCAATTTCAAAATCTTCTAGATCCAAATCTGATGCAGGGCTCAAT
GCCCGCGGTGGCAGCTTCTTTAAGAGAGTTACCCTCTAGTGAAGAAGAAGAATCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c669071-668961 hypothetical protein CCA00585 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTGCTGTTTCCCCTATTTCTTGCTTATTGATTTTGTCTTGA
>ref|NC_003361.3|:669190-669741 hypothetical protein CCA00586 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTATTGAAAGATATCAAAACAATCGGGATTTCATTAATGCGACAAAATATGTTTGTCCTTTATTGA
AATCCAGTTTTGTTCGCGGATCTCGCGGTGTTCAACCTATTTGCGTGGAATGGACTCTCACAACAAGAAA
TGGCATTTTCTCCAAAACAAATCTTCAGGAAATTAAAAAAGCCGCGCCTCTCTTAGGAACTATCCTGGGT
CTAGGTAGGTTGTACAGTGTATGGTCTACAAAAGATAGAACAACAAGTAAAAAAGAGCTACTCCTACACA
CTCTAACCGGTATTGTGGAAACTTTAGGGCTGGGGATCATTCTCCTAATCGCAAAAATTACGCTTACTGC
AATCAAAACAATCAGGAAAAAAATTAACCTATACTATTACGGTTCGAGACGCCTACCCTCCAATGTATTT
GCTCGCTCTGACAGTGCTTCTGATGATGAGAGTTCCTCTGATTCTGATTCAGAGATAGTAACATCAGCAG
TACCTCTAGAGTTCTATAATAGGCTAGAACAATTTGCTGCTATGGTTACTACACAGGAATAA
>ref|NC_003361.3|:c670334-669924 putative disulfide oxidoreductase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATTAGATTCCTTCGTAATAACGCTTTATATTTTGCTTGGTTGATTTGTTCTACAGGGACAGTGATGA
GTATTTATTACAGCTACCTGTTAAACATAGAGCCTTGTGTTTTATGTTATTATCAAAGAATTTGCTTATT
CCCTTTATCTATTATTTTAGGAATCGCTACATACCGTGAGGATAATTTAGTAAAGATCTATGCTTTACCT
TTATCAATTACAGGCATGGTGATTGCCGTGTATCAAATTTGTCTTCAAGAGATTTCTGGAATGACGATAG
ATATTTGCGGTAGGGTGTCTTGCTCCACAAAACTATTCGTTTTTGGATTTATTACTGTTCCCATGGCATC
AGCCTTAGCATTTTGCGCTATTTCGTGTTTATTGATTTTATCAGGAAGTAAAAAGAAGTAG
>ref|NC_003361.3|:c671025-670327 hypothetical protein CCA00588 [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGAATAAAAAGATATTAGTCATAGTTACAAGTGCTTTTTTCCTACTATGCTTTGGATTAATGCTTTATA
AAAAGCAGCAGATATTGCCTCCCAAAGCGCATATCCCTACCAATGCCAAGCATTTCCCGACTCTTGGGAA
TCCTTATGCGCCGATTAACATTACGGTGTTTGAGGAACCCTCATGTGCTGCATGTGCGGAGTTTAGCACA
GAGGTTTTCCCTCTATTAAGAAAGAAATACATTGATACAGGAGAGGTATCATTTACGTTAATTCCTGTAT
GTTTTATTCGGGGATCGATGCCGGCGGCTCAAGCATTACTTTGTATATACCATCATGATCCACGTCAGGT
GGATATAGAAGCTTATATAGAATATTTCCATAGGTTGCTTACTTATCCTAAGGAAGAGGGGAAACGCTGG
GCCACTCCGGAAGTATTAACTAAGCTTTCTGAGAATTTGAAAACGCATTCAGGGCGTAGCATTAATCCTA
AGGGATTAATGCAATGTGTTGATTCTCAGCAGTATGAAGAGCAAATTAAGAAGAATAATATTTATGGTTC
TCAGGTTCTTGGCGGGCAGTTAGCAACACCAACAGCTGTTGTTGGAGATTATCTCATCGAGGATCCTACG
TTTGATGAGTTAGAACGTGTGATTCGACAAATCCGCCATTTACAAGCTACAGAGGAAAATGATGATTAG
>ref|NC_003361.3|:671130-671252 hypothetical protein CCA00589 [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGGCGTCTCGTACATATCAAGATAAGTTGAGATTAATAAAAAACCTTTTAGTTTTATTATTCTCATTCT
ATTTAGAAAGAAACATCCCAAAGTTTTTCTTTTCATGGATAAAGAAACCCTAG
>ref|NC_003361.3|:671234-672460 hypothetical protein CCA00590 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGATAAAGAAACCCTAGAAAATATTTATAAGCACTTCCGTTATCGATTTTTCAAACTCAGTATTCTCC
CTGCATTTTTAGGACTGTTGCTTATATGCACGCCATACACTCTGAACTATCAAGCGCCTAGCGTCATCCT
GTCTGATAGGATCTGCGGAAGCCTGTTAATCATCTTAGCCTTGATATCTTTTTTTAGACGTTCAGTACTT
TGGTTTGGGGTATTTATAGGTATTTGGGTAACTCTTTTCCCTTGTTTCCCAGAACGCTCTTCTATCGTTT
TTGCAAATGATACACTGATAGGCTTTGCTATCTTTGCTGTTGTTTGCATCTCCCCTACACGACCAGAAGC
TTTGGAAGTCGGCCCTACTCTTCCTGAAGGCATGTCCTATAATCCATCTTCAGGAGGACGGCGTGCTGCT
GTCTTAATCTTAAGCTTATTAGCTTGGCTGCAATCACGCTTTTTAACAGCATCCGCTTTAGGGATTTCCT
CATCTGCTTTTGAGAGCGAATTCTTTGCCTATGCAGCGATGATGACTGCCTATTCCCTACTTGTTGTATT
ATCTCTATCCGGAGGAGAGCGTCGCTGGCATACACGACCAAAAATAGTGTTGGCAACAGCAATCACGTTA
CTATCTGCTATTATCCTCACCCTCATCCCTATCATATCGAAACAGATATCTTTAGATTGCTGGCTATGCC
TTGCTCTTACGATACAGCCTGCTCTAGCATTCGTTTTTGCCTATGATGAATTCAGAGCAACATTCACATA
TCTAGGACAATTTCTTCGAAAAAAACGTGAACTTATTCGTATAGCACTATTCGGATCCGAATACTACAGA
GATTCATTGTTTTGGGAAGAACGTACCGTCCTTCCTTTTACAAAAGCATGTAAACAAGCTTTTCTAGGCA
TTTCCTTCCCAATTAACCTTTTGATTGCTGTTTGGATAGCTATAGGCTTCATCAAAGTCAGCGATAGATT
CGCCGTTACAGATGCACTGAGAAATTATATCGATATTTGCTGCTGGTTCATCATCGTACTCGCCACGCTA
TCTTTTGCCGATAGCCTGCGCCACCTTAGATGGCTATGTGTGATTTTTGCAGCTGCAATCCTACTTTCTC
CTGTTGTCTTCCATATTCCCCTGCACGCTCCTATATTGATTCCAACCGTAATCGTCGGGATTGTTCTGAT
TGTTCTATCCATAGGGAAAATAACACAGAAAAAATAA
>ref|NC_003361.3|:c673176-672469 hypothetical protein CCA00591 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTGAGGACAAACTTTCTCTTTATCGTGGTATTCACTCCCATCGTTGTAAGGGCGCTCCTCTTGTATTTAT
CGCTGGGATTGTTTTAGTCTGTTCTTTAGTGCTGATCTTGATAGGATCTATGTTAGTTGGGTACCCTCTA
GAGGGATTTTCTTTTGCTTTAGATGTGTTTTTGCCTTTCCTTTTTCCTGGGATTTTTTCTTTGGTATTGA
TTGTGGCGCCTTTATTTATGTATGCCTTTCAGCATCATAAAGGAGCTTTAAGTAAGCATAAAAAATTAGC
AGAGAGCAATTACGTACAGATTTTAAATCATTGCAATAGTCAAAAAGGGAAGTTTACGAAGAAAGAGGTC
GCAGCGTTTGTAGAATCTCAAGTTCTCCTTCCTGAATATCCGCAGACATTTTCTTGTGTTACGTTATTGC
AAACGATAGAGGTTATTCCTCATAAGGATTCCCCGCATGCTTCTATGCATGATGGTGTTATTTCTGAGGG
TATAGATCGTGCTCGAGAAGATATTTATGCGAGTGCAGACGACAAGGAAAAACGAGATCGCCTTGAAGCC
GAAGAAGAGGAAGATAGGGCTGCTGAGGTACCGCAGCAAGATACCTCATTAGGCATTAGCTCAATGCTCA
CGCAGTAA
>ref|NC_003361.3|:c673868-673161 ABC transporter, ATP-binding protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTGGAAGTCAAAAATCTCAGCTATTCCTACTCAGATAAGTTAATATTTAAAAACGCTTCTTTTACTT
CTCATCCAGGCAAGATTTCTATTATTTTGGGTGTTTCCGGAATAGGGAAGACGACATTGTTTCGTTTGAT
TGCTAATTTCTTATCTCCTTCTGAAGGGGAAATCTTATGGTTAGGCGAGCCTATTCAGCAAACAGACGTT
GCCTATATGCAGCAAAAGCACACACTACTTCCTTGGAGAACAGTACTGAAAAATATTTATCTCGCTTCTG
AATTGGGAGTGAGGAGCAAGCGTTTTTCTATATTTCCTGAGAAGTTGGCCGAGGTTATTGAAAGCTTTAA
CATAGGCGATTTATTAGATTGTTATCCCGACGAGTTATCTGAAGGACAAAAGCAAAGAGTCTCTTTGGCT
TGTCAGTGTTTATCTCCTAAGCCTATATTACTTTTAGATGAGCCGTTTTCTTCTTTGGACATTACAACTA
AGGAGCAGTTGTATAAGTACATTTTGCTGGTAGCAAAAAAAGACTATAAAACTGTAGTGCTTGTTACCCA
TGATTTTCGTGATGTTGCCTTCCTTGGAGATGCATTTTACGTCCTTAAAAATTGTGGACTTGTTCCTGTA
TTTTTCAATGATTCAACTCGCTCTGCTGGTAATGTTCATCTGCTTATAGAGAACATTCGGGAGTGTCTTG
CAACATGA
>ref|NC_003361.3|:c675039-674146 5'-methylthioadenosine nucleosidase-related protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTTCTTCGCGTTGTTTTTTTCACCATTCTTTGTTGTTCCGTTATCTCTTTAAAAGCCGATGCCATTG
AAATTTTTGGCGAAAAAAGTGCGCCTCTATCTCGTATAGGAATCATTTTTGCTCTTCCTGAAATTTCTGA
ATCTTCTGATGCAGAATGTCCTATACCTTGGTTTGCTAATAGTAAGAAAACTATAGAAGGAAGAAGGACA
TACTATTCTGGAGATTATTTCGGGAAGTATCTAGTTATGTCTTCTTTTTGGCCTAACAAGGTATCTGCCG
CTGTAATTAGCTGTAATATGATTTTAAAGCATCGTGTAGAGCTTATTTTAATTATTGGTACCTGTTATTC
ACGTTCAGAAACGGGCCGTTTTGGAAATGTTTTAATTTCGAATGGCTATGTGAATTATGATTCCGATGTG
CGTCCGTTTTTTAAAAGATTCGAAATTCCCGATATCAAGCAGTGCATTTTTGCAACAAGCGATGCCTATA
GAGAGGCTGCAAAGAGCGGAGGAAGACAGTTTATAGCCACTCATAAAAAAGCTATTGAGGATCTATTAAA
AACGCACGGTTATTTGAAGCCTACGACATCTACAGAGCATGGACTTGCGGAGGGCATCATCGCTACAGGA
GAGGCGTTTACCATGTCTAAAAATTATTTCCTTTCACTGCAAAAAGTCTATTCTGACATTCAAGGTTTTG
ATAGTGCTGGGGGAGCCGTTTCTCAAGTGTGTTATGAATTTGATATTCCTTGTTTAGGAGTTAATATTCT
TATTCCTCATCCTTTAGAGTCTTCAAGTAATGCCGATTGGCTGCAGCTTCAGAGTGAAACAAGTAAATTT
TATATGGACTCTCTTTTGAAAAGTGTCCTTAAAGAAATCTGTTTGGCTCACTAA
>ref|NC_003361.3|:675011-675235 hypothetical protein CCA00594 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTGAAAAAAACAACGCGAAGAACCATAAAAATTCCCTCTATCGGATTCTGGTTCCTTATAGAAAAAC
ACACTGTTAAAAAGAATGAAAAAGCTGGAGGTGAAGATAGCCCTTTCGACTCTAGAGGTAGCGAAAAACT
AGACTCGAAAAGGCAAACCTTCTATGAATCTTTATTCATAACAAAGAGAAAAACACGTCTTTTAAAGTCT
GACTTTCTTTTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c675901-675212 hypothetical protein CCA00595 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCTTTCAAGATTAAGTAAGTTCCTATTAACCGTATTAATATCTCTTCAAACCCTATGTCCAGCTTCAT
TAGTTGCCGGGGAGTCGAAAACAGGTTTTCTTTCTAAAATGAAGGGATGGTTCTCTAGTAGAGAGACCAA
AGACGGTGTATCCATATCTCAAATCAAAGATAGTCTAAAGTGGAAACGCTATGACTATACGAAAAGTTGT
GGGTTTTCTGCAGAGTTTCCTGGAGATCCGGACCATTCGGGTCAGATTATAGAGGTTCCTCAATCAGAAC
TTACTATACGCTATGATACATACGTTACAGAAACACAATCAGATAATACTGTATATGTTGTGTCTGTATG
GGAATATCCTGAGAAAGTTGATGTCAGCCGTCCTGAGTTAAATCTTCAAGAAGGATTTTCGGGAATGCTG
CAGGCCCTTCCAGAGTCTCAGGTTTTATTTATGCAGGCAAAAGAGGTGCAAGGACATAAAGCTTTAGAAT
TTTGGATATCTTGTGAAGATATCTATTTTAGAGGGATGTTGGTTTCAGTAAACCATACTCTTTATCAAGT
TTTCATGGTTTATAAAAATAAAAATGCTAAGGCTTTGGACAAAGAATACGAAACGTTCACGAAATCATTT
AAGATTACCAAAGTGCGTGAAGCGAGAGTTATAGATTTAAAAAAGAAAGTCAGACTTTAA
>ref|NC_003361.3|:676068-676832 3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAAAGCAAGTATTTGCTAGTAAAAAGGTTGGAGTTCTACCAGCACGATGGGGCAGCGCAAGATTTA
CTGGGAAGCCCTTAGCAAGCATTCTCGGAAAATCTTTAATACGAAGGACTTATGAGAATATCAATCAAAG
CATCGCATTAGATAAAGTCATTGTAGCTACTGATGATCAACGTATTATGGATCATGTTCTAGACTTCGGC
GGCGATTGCGTGCTGACAAGTCCTGAATGCGCTAATGGAACAGAGCGCACAGCAGAAACCATATCTCGTT
ACTTCCCTGAAGCTGAGATTATAGTAAATATTCAGGGAGATGAGCCCTGCTTACAGCACACCGTTGTTGA
TGCCCTTGTGAGAAAACTAGAAGAATTTCCTGAAATTCAAATAGTTACTCCAGTGGCTAAAACTACAGAT
TCTCATGAGATCTTAACAAATCAAAAAGTGAAATGTGTTTTCGATAAAAACGGAAAGGCTTTATATTTTA
GCAGGAGCCCTATTCCACACATCTTAAAAAAAGAGACACCGATTTATCTTCATATTGGCGTATATGCATT
TAGAAGGAATGCCCTATTCAATTACATTGAATCTTCCCCTACACCATTAAGCCAAGCTGAAGATCTGGAG
CAACTGCGTATACTAGAACACGGTGGATCTATTCATGTGTGTGTCGTGGAAGCTAAGAGCCCCTCAGTTG
ATTATCCTGAAGATATAAACAAGGTGGAAAAATACTTAACATGCCATTCAAGTGCATCTTTTTAA
>ref|NC_003361.3|:676808-678421 CTP synthetase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCCATTCAAGTGCATCTTTTTAACAGGAGGAGTTGTTTCTTCCCTAGGCAAGGGATTAACCGCAGCCT
CATTAGCTCTATTATTAGAGCGTCAAAATCTTAAAGTTGCCATGTTAAAACTGGATCCCTATCTTAACGT
TGATCCGGGAACTATGAATCCTTACGAACACGGTGAGGTCTACGTTACCAACGACGGAATAGAGACGGAT
CTAGATCTTGGTCACTATCATCGATTCTCTTCAGTAAACCTATCGAAATATTCTACAGCAACCTCAGGAC
AAATCTACGCTCGAGTGATTAAAAGAGAACGCGAAGGAGTTTATCTAGGAAGCACTGTTCAAGTTATCCC
TCATATTACTAACGAGATCATCGAAGTGATCCTAGAATGTGCTAAGGAAAATCAACCTGATGTATTAATC
GTAGAAATTGGTGGCACTGTTGGTGATATAGAATCCCTACCTTTTCTCGAAGCTATTCGCCAATTCCGTT
GCGAGCATGCGGCAAACTGCTTCAGCATTCATATGACTTATGTGCCTTATTTAAAAGCTGCTGGAGAGGT
AAAAACAAAGCCTACGCAACATTCTGTTCAAAGCTTAAGAGGAATTGGAATTATTCCTGATGCCATTCTT
TGCAGATCTGAAACGCCTCTAAGTAACGAGGTGAAAAAGAAAATCAGTCTATTTTGTAACGTCCCCGATA
GCGCCGTTTTCAATGTTGTAGACGTCGAGCATTCCATTTATGAAATGCCCTTAATGCTCTCTCGAGAAAA
GATTTCTACATTTATTACGGAAAAGTTAGGGCTATTTACAAAGCAAGAAGACTTAAGCGATTGGAAAATT
CTCATAGAACGTCTACGCAATCCTCTTCCAAATAAAGTGCGTATTGGTTTGGTAGGTAAATACGTACAAC
ATAAAGATGCGTATAAATCTGTCTTTGAGTCGATTACTCATGCCGCATTAAGTTTAAATTGCGCGGTAGA
CATTCTTCCTTTAGATTCTGAAGATCCTCATTTCCTTGAAGCCCTAGAAGAGTGTGATGGCTGTTTAGTT
CCCGGAGGTTTTGGAATTCGTGGATGGGAAGGAAAAATTACTGCAGCAAAGCTCTGCCGAGAAAGAGGCA
TCCCTTACTTTGGTATTTGCCTAGGAATGCAAGTTCTTGTTGTTGAGTATGCTCGCAATGTCATGGACTT
AGAAAAAGCCAATTCAACAGAAATGGATCAAGATACACCACATCCTGTTATCTGTATGATGGATGGACAA
GCCGCTCTAGTCGCTACCGGGGGAACCATGCGTCTTGGCGCCTACCCTTGCACACTATCTCCAGGAACCA
AGGTGTATGAAGCCTACGGACAATCCGAAATTATGGAACGCCATCGCCACCGCTATGAAGTAAATTTTGA
CTATATACAGCAATTAAAAGATCACGGTCTGAATATCGTGGGGAGATGTCCGCAACAAGGACTTTGTGAA
ATCGTAGAAACCGAAAATCATCCCTGGATGGTCGGTGTGCAATTCCATCCTGAGTTCCTGTCAAAATTGA
TAACACCTCATCCTCTATTTGTAGGCTTTATTCAGGCAGCACTTCTATACTCGAAGAATAAAAGCCATGT
CTAA
>ref|NC_003361.3|:678414-678905 Holliday junction resolvase-like protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCTAATCCTAAGAATAAGAAAGAAAAAACTTTCCTAGGTATAGACTATGGACAGAGGCGCATAGGCC
TTGCCTATGCCGCCTCGCCTCTGTTCATCAGTCTACCTATAGGATGTATAGAAGCAGGAAATACAGTAGA
GGCTACCGCTAAAATTCTTTTCAATATTATTCAAGAACGCAGCGTATCTTGTGTTGTGTTAGGGAATCCT
ATTCCTATGCAAAAAGGACAAAAATCCGCCCTACAAGAAGAAATCACCAAACTTTCTTCCTTAATTCAGG
AATCTTGTGGCGTTGAAGTTATCCTTTGGGATGAAAGACTTTCTTCTGCACAAGCAGAGCGCATGCTAAA
AGGTGATTGCGGATTAAGTAGAAAAAAAAGAAAAGGGAAAACCGATACTATTGCCGCAACGCTAATTCTC
ACCAGCTTTTTAGAAAGCTCCCCCCCAAAGATATTCCTAAAAAAAACATGCCCGAAGCCTCCTGTCAGAT
AG
>ref|NC_003361.3|:679139-680476 peptide ABC transporter, periplasmic binding protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATAATGAAGGTGTTCTCCTTTTTTATGATGTTCACACGGTGGCTGTTTGCAATTGTTCTCGCGTCTT
CAATTCTAGCAGGCTGTTCCCCAGCAGCTTTGAGATCATCAAAAACTCTTACGATTGCCATTCATGACGA
TCCTGTATCTCTATCTCCTGAGCAAGCAAAGCGCGCGTTAGATCTTTCTATTTCCAAGCTTATTTTTGAA
GGACTTACAAGAGAAAATCCTTATAAAAATGATGTGGAATTTGCCTTGGCAAGTCACTACACCGTATCTG
CTGACGAAAAAATCTATACATTTTTCATAAAACATGATGCCTGCTGGAGTAATGGCTCTCCCATTAGGTC
TCAAGACATTGCTAAAGCTTGGGAATACGCGAAAACCTTCTCTCCTCACCATAAAGCTTTCGAAGGCATC
CATTTCAAAGCCTGCTCACCATCGAGTATTACTTTAACCTTAGACACGCCAAATCCTAAGCTATTACAAT
TGCTAGCCTTCCCCGCATTTGCCGTTTTCAATCCTGAAAATACGACTATGTTTAGCGGACCTTTTCATCT
AGTGACCCACAATCCTGGCCATAGCCTTCTATTTGAGAAAAATCCTCACTACTATGACAGGGACAAGGTC
AGCATAGCCTATGTGAGCCTACTGGTGATCCCAGATTTGTATACTGGAGCCCTTTTACTCAATCGCGGGA
AAATTCACTGGCTAGGGCAACCTTGGCATCAAGGCTTAACTAAAGAATTAAAGGAAACGACTCCATACCA
TTATAAGAGCTATCCTGTAGAAGGAACGTTCTGGCTGATACTCAATACAAAAGATCCTATACTATCGCAA
TTTCATAACCGTTATAGATTAGCAGCAGCTATTAATAGAGAAGAAATCATCGAGCATGCTCTACAAGGAA
ATCAAGAACCTGCTCATACACTATCGAGAAACTCCTCTCCCTATTATCAATACAACAAGCCAAAACCCAT
TACCCCTACAGAAAAACTCACCCTCACCTACCCTTCTAATATTTTAAGATGCCAACGCATTGCAGAAATC
CTTAAAGAACAATGTAAATCCGTAGGCCTCGATCTATTTCTTGAAGGGTTAGAATACCATGTATTTCTAA
GCAAAAGACAAATGGGAGATTTTACGATAGCTACAGGCACAGGAGTAGCCTACTACCCCAACGCTCCTCT
TCTTCCCGAAGCAGAGAAGCTTATGAAAAAATTGGAAGTTATTCCTATCTACCATATGAGCTACGATTAT
ATTACACTATCTCCGATAGAAAAAATCCTCCACAACGCTTCCGGAGCTGTAGATCTTAAATACGCACGTT
TGCCTTAA
>ref|NC_003361.3|:680595-682202 peptide ABC transporter, periplasmic binding protein, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACGAATAGATTCAGAAAATACTACGCTGCTTGTTTCTTATCTCTTGCTAGTGTGTTTCTAATCAGCT
GTCATCAACAATCTTCTCAAGATATAGGGAAATCCTTAAGAATCGGCATGTCATACGATCCTATTTCTTT
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CCATACATCCTTGAGGGAATATTATAAAAATCCACAAATTAAGCCCGTTTATATCTCTAACGGACCTTTT
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ATAAGTTGGGAATTCGCGCCATAGACAAATCAACATTAGAAATCACCCTGGAAAAGCCCATCCCCTACTT
TCTCGAGCTGCTTGCCTATCCTATTTTCTTTCCAGCACACAAATCCTTAAGAGATTTCTATTCTTCAGGA
AAGACGAACCTTCCTAATATTTCTAACGGCCCTTTTATCATCGAAACCTACCAGCCGCAACACCAACTAA
CTATTAAAAAAAATGCGCTGTATCACGACAAATCTTCGGTACATCTTGATACAATTGTATTCCAAATTGT
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TCCCCTATTTCTAAAGAAGACCAATACCATATCCCTAAAGACAAACTTCATAATTATCCCGTGCTGGGAA
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TGCCATTGATAAAGCAACCTTACTGCAATTTATTAGCCAAGGAAAAGTCGCTGACCATTTCCTACCCCCA
GAATTATCAAAAATCCATAAACGATCTTATGTATCTCAGGAAGAACTTCAGGAACGCGCTCGGTTGTGTT
TTAAAGAAGCCCTAAAAGAACTCTCCCCAAAAGATATCTCAGAATTATCCATTATTTATCCTTTAGAGTC
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GAAAATATTCAAAATCAAATCTTAGCTGAAGAACTTATCGAAGACGAACTCCCCATTATTCCTCTATACC
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TCTTTGGTAACCTTAGATTTTGGAAACTCCCTTGTTTATAAAGACCGCAGTGTAACAAGTATTATCACTA
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AGGAACACTAGCAGCATTAAGAAAGAAGAAGCAGGGACGCTATATCCTTCTTTCTTCTATTTTACAAATT
TCCATTCCTGCCTTTGTCCTTGCAACTATGCTGCAATACGTTTTTGCAGTGAAGATACCGATTTTCCCGA
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ATGCTGCCTTTCTTGTAACTACAGTCATGACAGGAACTTTTGCGATAGAAAATATTTTCTGCATTCCTGG
TTTAGGGAAATGGTTCGTCTGCAGTATTAAACAGAGGGATTATCCAGTAACACTAGGATTATCCGTATTT
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ATAG
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AATCTTCTCACCCCACTCTATGGCAACGTATGAAAGGAAATACCATGTTTATGGTAGGCATCTCCATACT
AGGAACCTTAATCCTAAGTGCTGTTCTCCTTCCATGGATTTACCCTAATTACGAACAGACATCTTTAGAA
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ATCCTATTTTCTATTCCTAGAATCCCTGTAATCATTCTTCTTCTTGTTATCTTTGATCATGGGATTCTTC
CCTTGATTCTTGCGATGACGCTTACAGGATGGATCCCCATAGCACGCATTATCTACGGGCAATTCTTATT
ATTAGAAAATAAAGAGTTTGTACTTTCTGCAAAGACTATGAACGCATCTACTTTTCATATTCTTAGAAAG
CATCTTCTTCCCAATACACTTACACCGATTATCTCTACGCTCATTTTTACTATTCCCGGAGCGATATATA
CAGAAGCCTTTATTAGCTTTTTAGGCTTAGGGATTCAGCCTCCACAAGCCAGTCTAGGAACATTAGTAAA
AGAAGGGATTAACGCTATTGACTACTATCCTTGGTTGTTTTTCATTCCATCATTTTTCATGATTACACTC
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AACAATTACTAAGGCGATTCTTGGTTTCCTTCCAGATAATTGTGAAATTATAGAAGGAAATATCTTCTTT
GAAGATCAGGACTTAAAGACCATGTCTTATAAAAATTTCCAAAAGATCCGCGGAAGAAAAATCGCTACGG
TATTGCAAAATGCTATGGGATCCCTCACCCCATCTATGCGTATAGGGGCGCAAATTGTAGAAACCTTACG
ACAACATACTCCCCTAACAAAAAAAGAAGCTTATACAAAAGCTATAGAACTATTAACAAGCGTACGTATA
CCGAATCCAGAACGCTGTTTTCATCTCTATCCTTTTGAATTAAGTGGGGGCATGCGTCAACGTACGGTAA
TCGCGATATCTTTAGCAAGCTCTCCAGAACTTATTCTTGCTGATGAACCTACAACAGCTCTAGATTCCGT
ATCACAAGCTCAAGTATTGCGCATACTTCGTAAGGTCCATAAGGAAAATAATACAGCAATGTTGTTAGTT
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AAACAGGAAGCGTAAAAGAAATTTTTTCTTCTCCACAGCATCCTTATACCAAGCGTCTTTTAAAGGCTGT
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AAAGCAAAAACAGTACAGATTGTCTGGCAAGACGTGCACTCAAGTTTAAATCCTACTATGAGTATCGAAG
ATCTCATTTCAGAGCCCCTGCATATCATAGGCACCTACTCTAAAGAAAAACAAAAAGAAAAAATCCAACG
TGTTTTACAACTCGTTAATCTACCGCTATCCGTACTACGCTTAAAACCTCATAAGCTTAGCGGGGGACAA
AAACAACGTGTAGCCATTGCAAAAGCTTTAGTATGTGAACCTGATCTCCTTATTTGCGACGAACCTATAT
CAGCCCTTGACACTCTTAATCAATCACTCATCCTAGAGCTTTTCCAAACAATAAAACAGGAATGTGAAAG
CACTCTACTCTTCATTACACATGACATGTCAGCAGCTTATTATATTGCCGATACGATTGCTGTCCTGGAC
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ATTCTACCCGATTAGCAAAGCTTTTAATGCTGGCCTCGTAGATGTAACTTTCATTAGCATGGAAGATGTA
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>ref|NC_003361.3|:688829-690241 sodium:sulfate symporter family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGGACATTTGGAGACCTTTTAAGAATCTCAGCGACAACAGCAGCATTAATTGGCTTATCCCTACTCATTC
TTACAAATATTTTAGATTGGCATAAAGATGTTATGGCCAATACCACCGCCTGGGAAACTTTTATTTGGTT
TGGTGCTCTTATCATGATGGCATCATTCCTAAACCAGTTTGGCTTTATTCCTCTAATTGGTAATTCCGTA
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>ref|NC_003361.3|:690350-692005 diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
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GCTTTTCCCAAATACCTATGACAGCCCTTATCTAAAATTCACCTCAGGAACTCTACCAACTCTACAACCA
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TAATAATACGGTAGAAATTACCGAAGAGTTTATGGAATGCTTTAGAAATTCTGGAGGGTTCAATTGTATA
GGGACAGGGAGAACAAATATCATTACCGAAGAAAATAAAGCTGCATGCTTAAAAACAGTGAAAGCTTTAA
ATCTTGATGGCTTAGTCATCATTGGCGGAGATGGTTCAAATACAGCAACTGCCATCCTCGCGGAATATTT
TTCTCAACACCATCCTAAAACATGCGTTGTTGGCGTCCCTAAAACTATTGATGGAGATCTCCAACACTTA
TTTTTAGACCTGACTTTTGGATTTGATTCAGCGACAAAGTTCTACTCTTCAATTATTAGCAATATCTCAA
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AAAAAGATGCTCAATTTGTATGGAAATTCCTGATTGCGATTACTAA
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ATCAGAACTTGTACAATGGTTAAAACATCAACTCATTCCCTAG
>ref|NC_003361.3|:692950-694569 diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TCAAGAACATATTCCTAATTTATGCTCTATTCCTGAAGTAACTATTGAAAAAGGAGAAGCCACACCTTCA
CAACCTTTGAAAATTGGCGTTTTACTTTCTGGAGGGCAAGCTCCTGGAGGCCATAATGTAGTTATAGGAC
TCTTTGAAGGCCTACGCGCTTTTAATCCTAAAACAAAGCTCTATGGATTTATCCAAGGTCCTTTAGGGCT
AACACGTGGATTGTATAAAGATCTAGATATTTCTGTAATTTATGATTATTACAATGTCGGTGGTTTTGAC
ATGCTCTCTTCAAGTAAGGAGAAAATAAAAACCAAAGAACAAAAAAGTACGATTCTCACTACTGTGAAAA
AGCTTAAGCTTGACGGCTTACTCATCATAGGAGGGAATAATTCTAATACGGATACAGCAATGCTTGCGGA
ATATTTCCTTAAGCATAACTGCACTATCCCGATTGTAGGTGTCCCTAAAACCATTGATGGTGATCTCAAA
AACTTCTGGATTGAAACGCCCCTAGGCTTCCATACTTCCTGCCGCATCTACTCAGAAATGATCGGGAATT
TAGAAAAAGATACTTTATCCATAAAGAAGTACCACCATTTTGTCCGTCTTATGGGACAAAAAGCTTCATA
TACAACTTTAGAATGTGGTTTGCAGACCCTACCTAACGTTACTCTCATTAGCGAACATATCGCCATGAGG
AAGATTTCTCTACAAAAGCTTAGCGAACATATCGCTATGGGTTTAGTAAACCGCTACAGGTCTGGGAAAA
ATTATAGCACGATACTCATTCCTGAAGGCTTAATTGAACATGTATTCGATACAAGAAAGCTCGTCAATGA
GCTGAATGTCTTATTATTAGACAACAATCTGAATTTAGATAATGTACAGAGCAAACTCTCTCCAGAATCT
CTGAAGACATTGTCTTCTCTACCTATAGAAATTGCTCATCAACTACTGATTGCTCGAGATTCTTATGGAA
ATGTGCGTGTATCTAAAATTGCTACCGAAGAACTCCTAGCTGCATTGATAAAAAAAGAAATCCAAAAAAT
AGAACCAAAAATGGAATTCCAACCCGTGAATCACTTTTTTGGTTACGAATCTCGTGCAGGATTTCCTTCA
AATTTCGATGCCAATTATGGTTTAGCCCTGGGTATCGTTTCCGCTCTTTTCCTCGTCAGACAACGTACCG
GCTATATGGTAACCATCAATAACCTTGCTCGTTCCTATAGTGAATGGATTGGCGGAGCTACACCTCTATA
TAAAATGATGCAACTAGAACATCGTTTAGGAGAAGATACACCGGTCATTAAAACTGACTCTGTTAACCCT
CATGCTCCCGAAGTCCAGTATCTATTAAATCAAAGCGATGCATGCTTAATGAAAGATCTTTATTGTTTCC
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TAGAGAGTAG
>ref|NC_003361.3|:c696143-694839 3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TAGCGCTTCCTAAGATTCTTTATAAAAGATTCGTTCATGGGAAGTATAAAAAGTCATTGAAAATTCGCTT
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GCCTTTAGATTTAAGTTTGATTATTAAACCTGTTGTTAGAGCTATCTCACCCTCTTTACTTGTATTTTCC
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GGAAGCTTTCTGTAAACTCTTGCAAATGGTTCACAGTTTTAAAGCGTTTTGGCAGGAACTATTTTTCTCC
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AAGATAGAGGTCACAGGAAATATCAAAACCTATACGGAAATCTCTTCTGAAAATAACCAGCGCAATTACT
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TGATGCTTGGATTCCTTTAATGCGTCAACTTCGTCATAGAAATATTAAAGTGCTTTGGGTTCCTCGTCAT
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TTTCTTTATGAGAAGGGCCTTGCCTATATGGCGGACATGGCGGTCAATTATTGCCCAGAGCTTGGGACGG
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ATCCGTGCTGCTCAAAGTAAAAGTGAAAGGGATCGCATAAGTGAGACTAAGGTAAAAACCGGAGTATTTA
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AGGTTATGGCTCTGGAGTTGTTATGGGTGTTCCTGCTCATGATGAAAGAGATAGAGAATTTGCAGAAGCT
TTCTCTTTACCTATTTATGAAGTTCTCGATAAAGATGAGTGCTGTATTCATAGTAACCACGGAGATTTTC
TTTTAGACGGTCTTGCAGGCCAAGAAGCTCGTGACTATGTGATTGCTTATTTACAAAAGAAAAATTTAGG
AGAGGCTAAGGTTGCGTATAAACTACGTGACTGGCTGTTTTCTCGCCAAAGATATTGGGGAGAGCCGATT
CCTATTATTCACTTTGAAGATGGCACCTGCCGTCCTTTGGAAGACGATGAACTTCCTTTACTGCCTCCTG
AAATTCAGGACTACCGTCCAGAAGGTTTCGGTCAAGGACCTTTGGCAAAGGTAAAAGAGTGGGTGGATAT
TCATGATACAAAGACCAACCGTCGAGGAAGACGGGAAACGCATACGATGCCGCAATGGGCAGGATCCTGT
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TAGCTCCTATAGCACCGCACATTAGTGAGGAGCTATGGACAGTCTTGGGTTATGCTCCTGGTATAGATGC
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TTTCGTTCTATGA
>ref|NC_003361.3|:698658-698783 hypothetical protein CCA00613 [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGATGAAAAAACAAGAATCTTCTATTCGTCGAGCGCAAAAGATTAAAAAATTTTATAAAAACACAACTT
GTGCTATAATCTTGCCCCGCTTTTCCTTCCCCGCCCCATTGACAAAAAAAATATAA
>ref|NC_003361.3|:698834-699781 hypothetical protein CCA00614 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCGCAAATTATCCGCATTTATTTCTTTATTTTTCATAATAGCAAATGCACCGCAAGCGGAAGCCATTA
AAATCCCCGGATTCCCAGAAATCCCCGACTCCTTACTTGTCATCAATAAAACAAAGACTCCGAAAAATGA
AATTTGTCGAGCGGTCAACATACAAAGTGGAGAACACAATCTTGTAGGCACTTTACACTTACCAACAACT
CCTATGCCGGAAGATGGTTATCCCATGGTTATCCTATTGCATGGATTCAGGGGTAGTGCCGTTGGCGGCT
TAACAGGATCTTATAGGAAAATTGCACGCACTTTAGCTCAAGTAGGCATTGCTAGTGTACGCTTTGATAT
GGCTGGGTGCGGCAATAGCGAAGGCATTACTACCGAAGTGCCTATTGGCACCTATTTAAAGAATGGCGAA
GACATTCTTAATTACGTATTGCAATATCCTGAAATCGATCAGAATCGCTTAGGTCTTGCAGGTTTCTCTT
TAGGATGCCATACAGCATTTCATTTAGCACGCTTCTATCATCCAAAAGAATTTCAGATTAAAGCTATAAG
TATTTGGGCACCGGTTGCTGATGGCGCGATTCTATTTAAAGAGATGTACGAAGCTGTGAAGAACAACTCT
TCTATTGTGGGGAATCTTGGAAAAGATTTTGGATTTGGCCCTGCTCCCCTAGTGGTATGTGAAGAGGATG
TTGGAGATTTTCTCTCCCTTCAGGATCATATTGTTTTAAACTCTCTGCCTACGAAAATTCCTGTTTTACA
TCTACAAGGTCTCGAGGATAATTTGGTTTCACTAACCCAGAGAGATTTATTTAAAAATACGGCCCCAGGA
AATACAGAATTCAAAACCTATGAAGATACTGACCATAATCTTGGATCCTCACCGCACCTAACCGTGATCA
TTGACGACATTGTTGAGCATTTTCTATCTAATTTATAA
>ref|NC_003361.3|:699929-701449 hypothetical protein CCA00615 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACAGATGTATTAGTCATAGGTGCAAACCCCACGGGTCTCATTTTAGCAAACATGCTAATTCAGCATG
GCATCCTTGCAAAAGTTATAGACCATCGAGATTCTCCAGACGATCCTGGTTTTATAGACTGTAGGGAGCT
GCCTGTTGTTTTGTCTTGTTCTTCTTTAGAATTACTAGATAACGCAGGCTTATTGGATAATTTCATAGAG
AAATGTCATAAGCTCTTTGGTGCTCGTTATCACTGGAAGAAACGCACAGTCTTATTTAAATTCAATCAAG
CGTCAGAGTCTCGTTTCCCTTTTTCTTTATCCACCTCCTATCAAGAGCTAACCAAACACCTTATTCATAA
GTTTGAAGAACAAGGGGGAACCATTGATTGGGGTACGCGTCCCATTACTTTGGTAGACAATAGCATCTTT
ATTGAGAGTACTAAGACATCACAAAATTTCGAAAATCGAGAAATTTATAATCCTAAGTGGGTAATTGCTG
CTGAAGCTGATGCCGATCCTGATATTCGTGACCTCTTTAAAACCCAACTAAAACCACGCAAACAGGCAAA
AGAAGTTCTATTTGTTGACTGTGATGAAGGTGAGCCTTTTGAAGAAAGTCACATCCATCTTGTTCCTAGC
TCAAAAAGCTTCTTAAATTTTGTATTTTACAACCATGAGAAAGGGTCCAAGCAGCTTTGTTTAACTAATA
CCTCCTATCCACTATCAATCAAGCATAAGCAAAAGCTTCTCTATAATTATAATCTTGCTGTTGCTGATGA
GCATTATCATATAAAATCCGTGTTTCATCAGTATCCTACGGACCATAACAACTTCCTATTTGTTGGTAGC
CTAGCCAACAACTTGGCTTTCTCTTACCTTACGGGAATAAATTCGAATATCCATGCGGCCTTCAACTTAA
CATGGAAGCTTATCCCTGTTTTAAAAAAGGCTGCGTCAAAACACCTCATAACCGCTAAAGAACATGAAAG
TGGGAATATTCTTCCCCATTTTAGCGAGAACAGGCAAAGACGCGCTAAAAATCTATTATTCTCCAATCCT
TATGCCCCCGCCCTTATGTATTATTTCTTAAAGGGCTGCCGTCAACTGGATGTTTTTGGAGGAGAGTATT
ATTATCCCCCTCACAAGGCATTGAAATATCAAAATAGTGATATTATTAAGATGTCTTCTCAAGATAAAGA
AATTCTTGGTCCTGACCCTGGAATGCGTGCTATTAATGCGCAGCTGGATAATGGGAGTTATTTATTAGAT
GGTTTGAAGAGCACCAAGCACCTTCTGATCTTCTTTAAGGAACGTAACGACCTAGAACAGGCTCTCAAAG
AAGAATACGGGGAATGGTTAGAGGTCATTGTTACTAAAGAACAAAAGATTGCTAATCTTTATCATGCAAA
TCCGGACTCGTTATTTATTATCCGTCCTGATTGCTACATCGGTTATAGAACTCATAAGTTCAAATTACAT
GAACTTATTTCGTATCTCTTGCGGATCTTTGCCGCTGAGAAAGTAGATTAA
>ref|NC_003361.3|:c705884-701508 hypothetical protein CCA00616 [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGTCTATTTTCCTAGCCAACGGAGATACTAATCAAAATCCTCAAGGGGCATCGTTTCTTCAAGCTTCCT
CAGCATCTCCTTTGAGTCCGGAAGCTACGGGAATCCGCGCTTCATTAACTACCCAGGAAACTCTTTTACA
TACCGTGGAGAGAGAGATTGCTGCTATGGAAAAGACGGATCTTAAGAAGATGCGTTTATATAAGGTAGCT
CTGGTTATTTTGACAGTGATTGGAATGGCGATTCTCTTTGTCCTTCCTGTGGCTATGGTCTTCAATGTAG
CTATATGGATACCTATCGTGATTACCATAGGAGTATCTTTAGTTTGTGGAGCCGTCAGTAACAAGCTAAG
AGCGCGTTGTCAGGAAATAAGATTAAAATATCGTTCTCTACAGGTATATCGTAGACATTTATTTAATAAA
CACCCAGATCTGAAACGTTCGACCTTATCTAAGTATCATATAGAGCTTCCTAAAGGGGGATCATTAAAAG
AGAAGCTACTGGCGCAATTGCGTCCAGATAAGCATCAAAACTCCTTTGATGGGGGAGCTTCTTTAGATCA
AAGTTTAGGTTTAGCTGGGGAAATAAATTCACGTTATCAATGTGAAGCGCTTCTTGGTGTGGATAGGGTT
GATAATACGGTTTGGGAAAAACGCCTTACCGATGTGTTGAACGCTAAAGTAGAGTTGTTAAAAAATAATT
CTGCCTATGCAGCATTGCGAGGTCTTTCTAACTCAGCCCTGAAAGAATCCGGATTGGATCTACCTTCACT
ACTTCCCGGGATGAATTTCATAGATCTCGGTAAATCTTTAATGAGCATTTGTGGATTTGGGAATAAAGTT
GGTTTGGAGATTCGCCAATCTATCGATCAATATGAGCGTATGTATTCACACAGTAAGACGCTTTCCTCTT
GGTTATATGAGGTATCTCCAGCAACACGAGTTTACCTATCTCAGGAACGGCAAACTGTCGATGTTACCTT
GGATATGTTCACAAAGCTACAGACGCATATCAATAAAATGCAGTTTGCTGATTGGGTAGTGCATTTTGAT
AGTTGGCAAAAGGATGTCTGCGCATTCGCTGCGGATCCTACAAATCTTGATGTACATAAAAAAATTGTAT
CGGCTGCTAACAAGCTCTGCATACATGAGGGTGTGAACCAGGATCGCCAGGTTGTGGTGAGAAATATTCT
TATGCAGATTGAGGATGTGATCGCGCAACATCAATCTGGGAATATAGAAAATCTCAATAGAATAAAAACA
TCTCTTGAGGAATCTATACAGGCAGAATTCAAGGAGATGCGTAAATCTCTCGGAAACAAACATGCAGACT
CAGCGAATTTATTGCATGGTGTGGAGAAAGAATTTATTGGTTATCTTGCAAGTCTAGGGGATGTCAAACT
TCTATTCGATAAGATCTATAAGTGTATCCAGCTTGGAAAGTTTGTCCGTATGGATATGGAGAAGGCTGTC
CAAAGACATCCCGATAATCAACGTATTAGGATTTTAAGTTCTATCGATCAGTTATTAGAATTAGTGAACA
GAGATACTTGGGGATCTATATCTGCAAAATCCGTAGAAGAAATTCTCGAAGAAAAAAATGAGATTATACG
GGGATTAGAAAGGTCACGCCAGAAGGTCGAACAGTGGAGTGAGAAATACAATCTCTTTAAATCTCAGAAG
ATGACGCGAATCTTCATGAGTGATTTTTCTGAGGGCTATTCTACAATAGAGTCTGAAATTGATAAATTAC
AGAAAACACATCATAAAGCCTCTGATGTTAGCGATTTTATAGACGGCTGTCGTAGCTTTTTAGATACTAT
CTATGGGGCTCTTGGAGGTTCTCAAAATCTTCCTACTAAAGAAGAGATCACGGCATGGTCTGAAGAGTTT
AAAGCTCTAATTAGTGAATTAGATAGTGTGCTTCCTGATATTCAGTCTGCGGGGCAAAGAATACAAGCTG
AGGGGACTTCAGGGAAGTCCATGTTATTACAGGCGATTACTAGCAGAGAGTCGTCTTTAAAGGCTGCTTC
TAAGAAAAAAGAAGCAGAACTTGTAGCTGCGATTAAAGGGAGACGTCCTGGACCTAGGGAAAGTATCGCT
ACTTTACTCGATGATAGCATTGCGCAGATGCAGGCGCTTCTTGGAGGGATGGCAGATTTAGAGCAGTCCT
TAAAAGACCCCAATAACATCGCTGTTGAAGAGGTAGTTCGCTCTTCTGATCATCTATTTTCGATTATGCA
TGACTCTAAATCTTCTAAACTGGGAGATTTAGAAACGCTATTATCAGCGCGTAGCGAAGGTGTAGCTTCT
ACAGCGGCTACGGAGTTGGGAGAGGCTGCAGAAAGTGCTGCACAGACAGTGAGTGATACCCAAAAGGTCG
GAAAGAATTTCTGGGAAACACGAAATAAAGATTTAGATAGCCTCTTAAAGCAGGTACAGAAAATCGCCAA
TAAGTGGAATATGGGACAGTCTATTGTGATGTTCATCGCGGGTCTGCTTCTTCTTGTTGTCAGTTTATCC
CTACTGTCATTGCAGATGGTATGGTTGCCTGTAGGTCTTAGCGCTCTTGCTCTTATTTTACAGATCCTTC
CGATGTTCTTTAATCATGTGATTGAGAAAAAGGTTTTTGATGTACGCGCGGCTTCTCTAGCGAAAGATAT
GCTTCCTTCAACAAAGATCCTCCCTTCAGAATTGGATAATTCGGATGTTGAGCGTCTTTCTCGGATTCAA
GATATCTTGCAGTTGGAGGGTTATGAACAAGCTTGGGCCAGGGGAGTGATTAAGGATATAGATGGTCCCC
TTGCGAATAAGAAAGATGATTTCAAAAAAACGATCAAAGATCTTAAAAGCGCATCGAAATCTTTAGATAA
GGGTATTAAGAAACGTTTTGGAACTAAGAATCTTCAAAATGTTGTAGAGGGTGAGAAGTCTGCTGAAGTG
CTGCAGCCAGCAGCGTCCATTCAACAAGTGGTGCAACCTTCTGATCCTGCTAGAGCTATTGCTATAGCTG
CACGTCAACATCATCTGGACCAGCTTATCATAGAGATTGATCGCATAGAGAAAGAGGAGAATAAGATAGT
AGACTACCGTCTCCGTTATGGTGTTGAGAAGGCGCGTTATGAGCAGCAATCTGCTTATCGTCATCTGTTG
CGAAGGCAATTTGAAGAGGGTAAAGAACAATTTCCAGCTTTAGAGAAGAAGCTCGTTGAGAGCCGGGGAA
TGGTAGATATATGTGCCCAAGCGCTATCGCAATCTCCTGTTTCAGAAACGGATCCTCAAGAAATCAACAG
CAAGCTTGACCTCCTGACTCTGCTGATATTTAAGATCTACAATTCTCAGGATGATGCTGCTGTGCGGGAT
GCCAAAAATAGCTTTGATGCTTTAGTTAAAGAAGCTGCGAATAGAGGGTATCTCCAAGAACTCCAAGATG
CGTTAGAGTTATCCGCCTGTTTAGGAAATAACGATATGAGGTTTGATCAAACCCGTAGGGAGCAGCTTGC
TCGTTTACAACCTGCTAGAGCAGCTTCTGTTGGGAGAGTGGAAAGATCTGCAGTTGGTGAGCAAGAGCTT
GAGGTACGTAAGAAAGTATTGGACGTCTTAGGTATAGGTTACATTTCCCCATTCCTAGAGTTCTCTTCAT
CCACTATTTATGGTAAGGGAAGTTCGGCGGTTCAAGAAGCCCTAAAAGAACTGCAACTTCTCAAAGTGAA
AATAGATTCTGGAGATGAGATTTCTCCTGAGGAATATAAGAAGGCAAAAAGATCTCTTTCCTCTTACTTA
GGTTTAGAAAGAAAGCTATCCCCATTAGCTTACGGAAGGGTATTGGGAGATGAAAACTTTGTTAAAAGCG
CACAAATGATGAGAGAAAAACACTCTCTTCAAGAGATTGTTGGTCTCAATACTGCTATCGGTCGCCACGA
GTTATGTTCCCTAGCAATAAAACGTATTGATAAATGGATAACGCAGAGAGTAAATAGGGGAGAAAATCGC
AATCTGGTTGCTAATGTATTAGAGAGTCTCCGTGCCTGTGATAGTTCTGGCTCCTCCGCTAACCAAGAGA
AGATCCGCGAGTTTTATGGCAAACTCGTCAAGCTTCCTAAGTATGTTTTAATACGTATCATAAAGGATTT
CAGAGTTCAATCCCTATTGGTTACTCAAAAGATACAAGACATTAAAGAACTACAGAAGCAATTTATCAAA
GCCTCCTGCGTAGTTGAAAATAGAGAGAGGATACTCGCTGAAACTCGTGCAGGTTGTGAAGAAGAGCTCA
GAAATCTATCTGAGCTACTTGCAAGGCTACAGTTAAGTAAACAGGAGTTAATTGCAGAAAGGGACGCCAT
TCGTAATAAGTTATTCTCTGATGAGATTGACGATTAG
>ref|NC_003361.3|:c708033-706045 NAD-dependent DNA ligase LigA [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGAAAGTATGTATTCCAGGGAACAGTATCTATCTCTGTGTAAGGAGCTCGAAAAAGATGATTATTGTT
ATTATGTTCTTCATAATGCCGTAATTTCAGATTATGACTACGATATGAAGATGCAAAAGCTTCTTGCTAT
AGAAGCTCAGCATCCCGAATGGAAGGTATTGTGGTCACCATCTATGCGTCTTGGAGATCGCGTCTCAGGG
AATTTCCCAGTAGTTGCGCATTCTCATCCCATGCTCTCTATTGCGAATGCGTATACTTTAGAAGAGCTTA
ATGATTTCTTTTCTCGTGTAGAGAAAACCTTAGGCTATGCCCCTATATATACCTTAGAGCTGAAAATTGA
CGGTATTGCCGTAGCTATCCGTTATGAGCAGGGAATCCTTGTTCAAGCGTTAAGTCGTGGCAATGGCCAG
AAGGGCGAAGATATTACAGCAAATATTCGTACTATACGTTCTCTTCCTCTCCGTTTGCCAAAAGATGCTC
CAGAATTTCTTGAAGTTCGTGGTGAGGTATTTTTCAAACGAGAAACTTTTGAGCAGATAAACGCTGCACA
AAGACAAGCCGAAAAGCCAGAATTTGCTAATCCCAGAAACGCGGCTGGAGGTACATTAAAGCTGTTATCT
GCTAAAGAGGCGGCACAAAGGAATCTAGAACTCTCTGTTTATGGGTCTCTTTCAGATGAGAATACAGAAT
CGCATTACGATAACCTGATGCTATGTAAGAGATGGGGATTCCCTATATTCGGTCAACCGCGGCAATGTCA
AACTATAGCCGAGGTGGTGAAGAGTCTTGATGAGATAGAAGGTCTTCGTGATCAGCTCCCTATGGAAATC
GATGGTGTTGTCATCAAAGTAGATGATGTAGAAGCTCAGAAAGCCTTAGGAATGACTGCGAAGCATTACC
GCTGGGCATTGGCTTATAAGTATGCTCCGGAGAGAGCCGAAACCATTTTAGAGAATATCCTAATTCAAGT
AGGTAGAACAGGGGTACTAACTCCTGTGGCTAAGCTAAGCCCGGTATTTTTATCGGGATCGAGAGTTTCA
CGAGCTTCTCTATATAATGAAGAAGAAATCGAACGGAAAGATATTCGTATCGGCGATACTGTATATGTAG
AAAAGGGAGGAGAAATTATCCCTAAGGTTGTCGGTGTGTGTTTAGAAAAACGTCCTGAGGGTACGCAACC
TTGGGTGATGCCGGAATTTTGCCCCGTATGTCATGGCAAGGTGACCCGTGAATCTGATAAAGTTTCTGTA
CGTTGTACTAATCCGTTATGTTCTGCAGGAGCTATCGAGAAAATCCGTTTTTTTGTGGGAAGAGGAGCTT
TAGATATCGATCATCTCGGAGAAAAGGTAATCACAAAGCTTTTTGATCTCGGAGTGATTCACCGATGCTG
TGATATTTTTAAAATTACCGAAGAAGATCTTCTTCAAGTGCCGGGATTCAAAGATAAATCTGTAAAGAAC
GTCCTTAAGAGCATAGAGAAAGCAAAACAAGCACCTTTAGATCGTTTTATCGCAGCTCTAGGGATTCCTT
ATGTAGGTGTTAGGGTAGCCTCGGCTCTTGCTCAGCATTTCCTTAATTTAGAAGCTGTAATGGGAGCTTC
TTTAGAAGAGTTAAAGAGTATTGAGGGAATCGGAGATAAAGTTGCCGAGTCTATAGAGGCATACTTTAAT
CAACAAGATACTATCGAAGAGATCCAGAAAATGCTTTCCTTAGGGGTAAATGTCTTGCCGTATCATAGGG
AAAGTTCATCGTGTTTAGGGAAAACCTTTGTCATCACAGGAACTCTTAAAAAAATGACAAGATCTGAAGC
TGAGGCTTCTATTCGCAATTGTGGGGGGAAAGTAGGCTCCTCAGTCTCTAAAAGCACAGATTATCTCGTT
GTTGGGGAAGATCCGGGGTCTAAATTTAAAAAAGCCCAGGAACTAGAAATCCCTATTTTAAATGAAAATG
ATCTGTTAAAAATCCTTTACCCTAACTAG
>ref|NC_003361.3|:c709897-708041 protein kinase, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGAAGGTGAGCAAGATATAGGAGTTGAGTTTTTAGGTGACTATAAGATCCTCTGTTATTTGCGAAAGG
GTTTGTGGTGCCAAGATATTCTTGCCGAGCATCGTTTTATAAAAAAACGGTATATTTTAAAATTACTCTG
TTCTGAGCTTTCTTCATCCGAAGCCTTTATGACTGCTTTTCATGAAGCTATTATCAAATTGGCAACAATA
AGACATCCCGGGATTATCTCTATAGAAAATGTTTCACAAGCAGAAGGGCAGTATTTTTTAGTAACCGAAG
AAAAAGAAGTCCCCACGCTCTCTTTAGCTCAATATCTTTCCAGTTGTTCTCAAGGATTATCAGAATTAGA
AGCTAAAGATCTTATCTGTCAGCTTGCTGAGATTTTAGACTATGCCCACGCGAATAGATTAATTCACGGT
GGTTTAAGTTTGGATTCTGTACATATCGATCTTACCGGACAATCCCCAAAAGTATTTCTTCCAGAGTTGG
GGTTTTCTTTTTTACTTAAGGATCAATATACCCAGAGCCTTTTAAGAGATTCTTCTGAGAAATCTTCTTT
TGATAAGTTAAAGCAGATACTTTTATTCCAAGCTCCAGAAACTGCTTTAGGAACAGTTGCTGAAGATGTC
TATGCATTTGGAGTGATTGTATATTTTCTTTTATTTAGACAGTTGCCTCAGGGTGCGTTTCCTTTACCCT
CAGAAGCTTTCCCTGAGTATGTTTATGATTGGGATCGATTAATTCAATCCTGTTTAAGTTATGCCGTAGA
GAAAAGGCCTAAGAAGTTGGCTCCTTTACTTGTGAAAAAAACCTTAGGAGAGCAGTTCCTCGCAGCTAAA
ATACAATGCAGCGAAGAAGATTTAAGAGAGATAGAGGAAGAACCTCAAGTTCCTAGTGTAGCGAATATTC
TTCAGAAAGTTGAGGACAAAATAATAGAGGAAACCTCGGATCATTTAGAATTTGTCCTCGTGGAAGCCAA
ATCTATAGACGAAGCGATGAATACCTCTGTAGATTCTAAGGAAGAAGTTGTTGCTGAAGATGAAAGTTAC
TCTAACGCTTTACAATCATTATTAATACGAGAGCCGGTTGTTAGCCGTTATGTAGAAGAAGAAAAAGAAG
AGGTGAAGCCACAGCCCTTATTCACCGAAATGGTATTTATTGAAGGGGGAAAGTTTCTCCGAGGAAGTCG
GGAGGGACAACGTGATGAACATCCTGTACATGAGATTTTTTTACATAGCTTTTTCTTAGATATTCATCCC
GTGACGAATGAGCAGTTTGTTCGTTATTTAGAATGTTCGGGAAGTGAACAAGATAAGTATTATAATGAGC
TTATTCGTCTTAAGGATTCACGAATACAACGCCGTTCTGGCAAGCTTGTTATTGAACCTGGTTATGCTAA
GCATCCTGTTGTTGGTGTTACGTGGTACGGAGCTTCTGGCTATGCCTCTTGGGTGGGGAAACGGCTCCCC
ACGGAAGCTGAATGGGAAATTGCTTCTTGTGGAGGCGTGACTCAGCTGCGGTATCCTTGCGGTGAAGAAA
TAGATAAAAGCCAGGCAAACTTCTTTAGCTCAGATACAACGCCAGTAATGAGCTATCCCGCCAATCCTTA
TGGATTGTATGATATGGCAGGGAATGTATACGAGTGGTGTGAAGATTGGTATGGCTATGATTTCTATGAA
ATCTCGGCTCAAGAATCCCATGCGCCTCAAGGTCCTGCTCAAGGTGTTTATCGTGTGCTAAGAGGAGGGT
GTTGGAAGAGCTTAAAAGATGATCTTCGTTGTGCTCACCGTCATCGTAATAATCCTGGTGCGGTAAATAG
TACCTACGGCTTCCGCTGCGCAAAAGGAGTTAAGTAA
>ref|NC_003361.3|:c710515-710150 hypothetical protein CCA00619 [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGATGCCTTTTATTCAGAATGCGAAAGATGTTATTGGTGGTTTAGGGAGTTGTGATCTATCCGTAGAAA
AAATCCCTGCTTTTCGAGCAGAACGTAAATGTGTAGATATTAGCAGAGTTGTGATTACTGTTATTGGCGC
TATATTTGCTATTGCTATTTTAGTCCTTGGAGTTACAGCTTTGAATTTATATTGTCCAACTTCAGTGTTG
GCAGGTGGATGCGCAATTGTTTTGGGTATCCTCTTTTTATCTTGGGTTGTAGTAATGACTCTGCGTTTAT
GTGGTGTTGGGAAAATAACTAAAGAACCTCTGGCAAGAAATCTTGTTGCAGAAGAGCCCGCCAGTCAATC
TGTGATTAGTGAATAG
>ref|NC_003361.3|:c711157-710789 hypothetical protein CCA00620 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGCTGCATGACAAATGTTAAAGAGGTTTGTGGTGGATTAGGAAAAATTGACTTGTCTCGAGAAGCTG
TTCCTGCTTTTGATAAAAGTCGCCCATGTTCAAGCATATCTAGAGCTGCTATTTGTGCTTTAGTAGCTAT
TATGGCAATTGCATCTATAATCGTCGGTTGTATTTGCTGCGCTAGTGGTGGAACAGCTCTTGCTTGCGGC
GTGCTTTCTATTGCTTTGGCATTACTTGGTCTTTCTTGGGCTGCTATTGTCTTAAAACATATGTTTTGTA
AGCAGGTTGTTAATGAGAATACTCCCATAGAGCTCCATGCTGAAGAACTCCATGCTGAGAATGCTCCCGT
AGAGCTCCGTGCTGAGTAA
>ref|NC_003361.3|:c711835-711509 hypothetical protein CCA00621 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCTTGTAAACAAGTGATGTCAGACATACGCGAGGGTTTAGGTTGTAGTGGTTTTAGCTCGAAGTATC
TTGTAAAACCGCAACTTTCTGTGAATATTGTTCGTGTTATTATGACGCTTGTGACCTTGCTGCTTGGCTT
TGGTGCTTTAATTTGTGGTATTGGGACATGTACCGCAGCATCTTTCACCGCTATGTCATTGGCTGGTGGC
GCTGCTATAGTTTTAGGATTTGTTATGCTAATGTTGGCACTTTACTGGAGCTATGGTGTATTTTCTAGCT
TCCAAGCTAGAAAATCTGATCTGATCAGAAATAGTCAGGATGTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c712356-711925 hypothetical protein CCA00622 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGAGTTAATATAGAAAAAACTGTAACTTCTGTTCAGATGTCTTCTCAACAGATCCGCAGTAAATGTG
ATAATCTCACAGCAGAGATAAGTAAGATGCGGGTCGTTCCTACATATAGAGTAGGTATTGAGATCGCTGC
CGCTATTTTAGGAGCTGTGTGCTTAATTTTAGCTGCTATCGTTGCTGCTGGGGTTTTGGCTGTTGGCTGT
ATATGCCTGATGCCTTTGGCATTTTCTCTGGGATCAGCTTTATTGACCTTTGCTGTTACATCCGTGGTTT
TGAGGCAGGGTGAGTTGCGACGTGAGAGATGCTGGAGAAGTCATGCGCTGCGTTGGAATTCCTTCGCAAA
TGATTTGTATACTGCTCTTGAAACGGCGAGGCAAAAAAGAAGTCCGCGATTACCTTCTTCTGTAAGTGCG
CAATCTTGTTAA
>ref|NC_003361.3|:c713944-712436 hypothetical protein CCA00623 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTATGATGCCAAGGCTACTTTGTGTTTTTCTTATGCTTGTTATTGCTGTAGAAGGTATTGGATCAA
AGGCATTTTGTGAAGATAGAGCTATTGCACAAAATACACATGATGCTTTCTGGAATCTCGATCCCTATTG
TTTGGAGAGCTTATGTGCATATTTTGTAACACATGGCGATAAGCAAAGTAGACAAAAACTGGCAAATTTT
TTCCCTCAGCTAACAACTGGTGAGTTAGCAACCCTATCGAATTGCGTTTTATTATCTAAAAATCCTAACT
ATATTTTTTCACCTGAAGATATTGCAGTTATGAAAAAACTATCTCTTCCCGGGGTCGTCTTTTTATGTAA
TTCTGAAGGTAACCATCTTCCTGAAAAAGATCTTGCCCGTGCTTTAGTACTTGCTGAATTTCCTGGAGAA
GAGGGGATGCGTAAGGCAGAGCATTATACTCGTTATCTAGATATTCTGGCGTTGCGTGCCTATATTGAAC
GTCAAAGGTATTTAGATAGAGAACATTATGTTTTAGGTTCAGAAGGTTTTCATAAGGCAACGATAGAAGC
TCTGAATACGATTCTTTTTTATGAAGAGGGGATTCGTTACCCATCAAAAAATGAAATGTTTTCCGATGAG
TTTTCTTTTTTATCTTCTGTTGCGGATAGAAAATTCGGGGTTTGCTTGGGTGTTTCTTCCCTATACCTCT
CCCTAGCGCAACGCTTGGAGCTTCCTTTAGAATCTGTCACACCTCCAGGGCATATCTACTTAAGATATGG
TGGGGGAAAAATCAATATTGAAACTACCGCAGGAGGAAGACATCTTCCTACGGAACAATATTGTGAGTGT
TTGAATGTTGATGAGTTGCGCGTACGTTGTGAAAAAGATCTTATAGGCTTAACATTTATCAACCAAGGAT
CTTTTGCTTTGCAAAAGCAACAATATCATGAAGCTGATCTCGCTTATGAAAAAGCTAAAGAGTATGTAGA
TGACGATGACCTCCAGGAGCTTATGGGCGTTGTGAAAATTCTCAAAGGTCAGAAGAAAGCAGGCGAAGCT
CTTCTTAAGAGTTCTTCTCAAGCGCAATCTGTAGGATCCGTAGCGTATGATTATTTACAGGGGAATATTG
ATAAAGCAACTCTAAAGCTATTGTTTACTCATCCAGGATCTACCTATGACGAGGTCCTCTCCTATCAAGA
GGCATTAAAAAAGGCTATACGGCGTTCTCCAAAATGTAGCGAATCTCGCCGTAGACTGGCTTCTGTTCTC
TTGCATCTTGGAAAAACCGCAGAAGGTGTGGCTCTTTTAGAGCAGTGTGCTAAAGAGTCTGTAGATGATA
TCGCACTCCATCTGAAGCTATCTAGGATACTTTGTGATCGTCATGATTATGAGAAAGCTCAAAACTATTT
TTTAATAGCGGAAAAGCTCCTTGTCGCTAAAGGCTTGCAGAGTGGGGATAAGAAATCCTTCACTTTGTAT
CATGACATTCGTCAAAAAATATTTTTAATAGCGCCTTAA
>ref|NC_003361.3|:714234-716759 polymorphic outer membrane protein G family protein/autotransporter [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAACATCCAGTTTACTGGTTCTTAGTGTCTTCGGGGCTGCTCGCTTCAACCTCCTCGAGCTTTGCAG
CAGCAGTTCAAGAGACTCTAAATTCCTCTGATAGTTATAATGGAAACACAACAACGACTCCATTCGTACC
CAAAGAAACATCAACAGGTGCTGAATATACTTGTAACGGCAATGTATGTATTACTTATGCAGGGAAAACA
ACACCTTTAACAAAGAGCTGTTTCACAGAGACTACAGAAAATCTTACTTTTCTAGGACAGGGCTATTCTC
TTTGCTTTGATAATATTACTGCTACAGCTAAGCCAGCAGCTATTGAAGTAAGTGCCAATGATAAGACGTT
ATCAATCTCTGGATTTTCTTTATTTTCATGTTCTTATTGTCCTCCAGGAACTACTGAACAAGGGGCTATT
CAATCCAAAGGGGTAACTACTTTCAGCAATAACGACAAAATTATTTTCGAAAAAAACTGTTCAACCGAGA
AAGGTGGGGCTATCAAATGTGATACAGGCACCAATGCCGAGCTAAAATTCGAAGGAAATAAATATCTGTT
GTTCTCTGGAAATTCTTCTCAGCAAGAAGGTGGGGCTATTTATGCGAAAAAACTCTCCATCATCTCTGGA
GGGCCAACCCTATTCTCTAATAATTCAACCTCTAAAGCTGCTGACCCTAAAGGCGGGGCTATTTGCATAG
CTGATGCAGACAGCGAATGTAGCTTAACTGCCGAAAATGGGGATATTATTTTTGATGGAAATAAAATAAT
AACCACGGGCACTCCTTCAACGAAAAGAAACTCTATCGATTTAGGCTCTGGAGGGAAGTTCTCTCAGTTA
AGAGCTAGAGATGGTTTTGGCGTTTTCTTTTACGATCCAATCGCCAATAATGGCAGCGACACTGATACAT
TAGAAATCAATAAAGCTGACGGAGCTGCAACCTATTCCGGTCGTATTGTCTTTTCTGGAGAAAAGCTCAC
AGAAGATGAAAAACAAGTTACAGACAATTTGAAATCCTTTTTCAAACAACCCCTCACAGTAGGATCTGGA
TCTTTTGTACTTAAAAATGGCGTAACAGTGTCAGCAAAGCAAATCACCCAATCCGGCGGCGCTATTGAGA
TGGATGCGGGGACCAATCTAACCTCAACCACAGAAGATATTTCCCTAAGCAATCTGGTTATCAATACCGC
CTCATTGGGGGGGGGGGGGGTACCTCTGGCAGCACAAATCTCAGCTGAAGGAACCAACAAAAGTGTTACA
ATCTCCTCTCTTAATTTAGTCGATGCCGACGGAAACGGCTACGAATATCCAGTCTTCTCCACAACACGAG
AATTTCCTTCTATTATAGAAGCTAAAGCTAATGGTACAGGAACACCTACAATCCCAACAACTCATCTAAC
TGACCATGCTCCAGCCGCTCATTATGGCTATCAAGGTCTCTGGACAACATCCTGGGCACAAGGCACAGCC
ACAACCTCACAACTAGCTACTTTAGCTTGGCAACAAACTGGCTATAACCCTAACCCTGAACGTCAAGGAC
CTCTAGTCCCTAATACCTTATGGGGATCGTTCTCAGATGTACGCGCCATTCAAAACCTCATGGATATTAG
TGTCAATGGTGCTGACTATCAAAGAGGCCTCTGGGCATCGGGATTAGCTAACTTCTTACAGAAAAGCGGA
ACGGAGACAAAACGCAAGTTTCGTCACCATAGTGCTGGATATGTATTGGGAGCGTATGCCAAAACACTTT
CCGATGATGTCTTCAGCGCCGCTTTCTGCCAACTCTTTGGAAGGGATAAAGATTACTTAGTCTCTAAGAA
TAATTCTAATATCTACGCAGGATCTATTTATTATCAGCATACCTCCTTCTGGGATGCTTGGGATAACCTG
CTACAATCTACTCTCGGCGCGCAAGCTCCGTTAGTACTCAATGCACAGTTAACGTATAGTCACACGTCTA
ACGACATGAAGACAAATATGACGACTAAATACGCTCCACAAGGCGTCGTCTACCCAGAGATCAAGGGTGA
TTGGGGTAACGACTGCTTCGGAGTGGAACTCGGTGCTACTGTGCCTATTGAATCTCCCTATTCTTCCTTA
TTTGATATGTACTCTCCTTTCTTAAGATTCCAATTGGTTTATGCTCACCAAGAGGACTTTAAAGAAAATA
ACAGCACTGAAGGAAGATACTTTGAAAGCAGCGATCTCACAAACCTCTCCATGCCTATCGGCGTGAAGTT
TGAGAGATTCTCTGACAATGACATAGCTTCCTACAATGTAACTTTGGCTTATGCTCCGGATCTTGTAAGA
AGCAACCCTGATTGTAAAACGTCTCTGCTCGTTAGCCCAACCACAGCTGTTTGGTTAACTAAAGCAACAA
ACCTAGCTAGACATGCTTTCATTGTAAAAGCAGGAAATTATCTTTCCTTATCTTCTAACTTTGAAATCTT
TAGCCAGTTTGGTTTCGAGCTCAGAGGCTCTTCTAGAACCTATAACGTAGACCTCGGATCTAAGATCCAG
TTCTAA
>ref|NC_003361.3|:c719489-716895 ATP-dependent Clp protease, subunit B [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGATAAGATATCAGATGCGGTTAGCGAAGCTCTAGAAAAAGCTTTTGAGCTCGCTCAATCAGCAAAAA
ATCCTTACGTAAGTGAAAACCATTTTCTCAAATGTCTTTTAGAGAATACGGAATCACTATTTTATTTGAT
AATTAAGGATATTCACAATAATCCTAAATTACTCACTTCTGCGGTAGATGAAGCGCTTTCTTTAGAACCT
TCAGTTATTGAAGGCAGCGCTATGCCTAAGCCTTCGCCAGGACTGCAAAGTTTACTATTAGATGCGAAAC
AGGAGGCGAAAGATCTCGGAGATGAATACCTTTCTGGAGATCATGTACTGTTAGCTTTTTGGAAATCCAA
CAAGGAGCCTTTTGCTTCTTGGAAAAAAACGGTAAAAATATCCTTAGACGATCTTAAAAAACTCATTATT
AATATAAGGCGTGGCAATCGTATGGACTCTCCTAGCGCTGAAAACAACCTTCGGGGCCTAGAAAAGTATT
GTAAGAACCTAACTTTGTTAGCAAAGGAAGGCAAGTTAGATCCTGTGATTGGTAGGGATGAAGAAATTCG
TCGTACTGTTCAAGTCTTATCACGTAGAACTAAGAATAATCCTATGCTTATAGGGGAACCAGGCGTGGGA
AAAACAGCAATTGCTGAGGGATTAGCTCTGCGTATTGTTCAAGGTGATATTCCAGAAAGCTTAAAAGGGA
AGCAGCTCTATGTTTTAGATATGGGAGCGTTAATAGCTGGAGCAAAGTATCGCGGGGAATTTGAAGAGCG
CTTAAAAAGCGTTCTTAAAGATGTGGAGTCTGTCGATGGCGAGAGCATTTTATTTATCGATGAAGTGCAT
ACTCTTGTAGGTGCTGGTGCTACCGACGGAGCCATGGATGCTGCGAATTTATTAAAGCCTGCTTTAGCGC
GTGGTACTCTACATTGTATTGGTGCTACAACCCTGAATGAATACCAAAAGTATATTGAAAAAGACGCTGC
TTTAGAAAGGCGTTTCCAACCTATTTTTGTCACAGAGCCTTCTTTAGAAGATGCAGTATTTATCCTTCGA
GGTCTTCGTGAGAAGTATGAAATTTTCCATGGCGTACGTATTACTGAGGGAGCATTAAATGCTGCTGTTC
TTCTTTCCTATAGGTATATTCCAGATCGTTTTCTTCCCGATAAGGCGATCGACTTAATAGATGAAGCTGC
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TTGATTGTTAAGCAAGAAGCTATTAAGCGTGAAAAGGCTCCTTCATATCAAGAAGAGGCTGCGGCTATGC
AACAGTCTATAGAGCAACTTAAAGAAGAGCTTGCTGCTTTACGCTTGCGTTGGGATGAGGAAAAGAAACT
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GTTGCCGATTACAACCGTGTTGCAGAGCTACGCTATAGCTTAATCCCTGCTCTTGAAGAAGAAATCCGCG
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TCAGGTAGTGGCAAATTGGACAGGAATTCCTATTCAAAAGATGTTGGAAGGAGAAGCTGAAAAGCTTCTT
GTTTTAGAAGAGTCTTTAGAAGAGCGTGTTGTAGGTCAGCCATTTGCCATTTCTGCTGTTAGTGATTCTA
TACGTGCTGCGCGTGTAGGACTGAGCGATCCACAACGTCCTTTAGGGGTGTTCCTGTTTTTAGGTCCTAC
CGGAGTCGGGAAAACAGAACTTGCTAAAGCTTTAGCTGATCTTTTGTTTAACAAAGAAGAGGCTATGGTG
CGTTTTGATATGACTGAATATATGGAAAAACATTCCGTATCTAAGTTGATAGGATCACCTCCAGGTTATG
TAGGCTATGAAGAAGGAGGAAGTCTTTCTGAGGCTTTACGTCGCCGTCCTTATTCTGTAGTGCTTTTCGA
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AACTTGCTGATTACTGCGCGAAGAAAGGTAGTCGGGTAAGTAAAGAGACCGTATTATCCGTAGTGGCTCC
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AATACTGAAGATATTGTTAAGATAGTCGGTATTCAAATGCGTAGGGTTGCGCAACGTTTGTTAGAAAGAC
GTGTAACGTTAACTTGGGATGATTCTGTGATTCTTTATTTAAGTGAACAGGGTTATGACAGTTCTTTTGG
AGCACGACCTTTAAAACGGCTCATTCAACAAAAAGTAGTTACGCTATTATCAAAAGCGCTACTTAAAGGT
GATATCAAATCTGATACTTCTATAGAGCTTACGATGTCTAAAGATGTCTTGCTATTCAAAAAAATAGAAG
GCTAG
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CTGTAATGCTATTCACTCCTAAAAGTCGCGGAGATGGCAAACAAGAAATTCATGTAGCTTTTACCCATCT
TAGTGGTGTAAGCAAGGGAATGAATGTCTGTCTTGCAGGGAAGATCGTAGGTTCTGTAGCTTCTGTACAA
AATATTATGGATAGGGGAATCTGCGGGAAGTCCGGAGAGCTGTATTGTTATGAATTAGTATTGAAAATCG
ATTCGGGGATTTCTCTATATAAAGAGGATACTTTCGCTATGTATTCTCCTAAAATTATAGGAGAATCTAT
TGTGAATATTATTCCTGGAAAGATAAGAGATGAGAGCCATCGTCTTTATGCTCAGGATTTAGTTTGCGGA
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AAGCTGAAACTACCCATCTCTATGCTAAAATAGCCACTTTACTTGATGAAGAAAAAGATACTTCATTAGT
AAAGCAGGCACGATTAGCCACAGAGTCTATACATAAGAGCGCTGATAGATTGGCGGATTGTTTGGATAGT
GTGCGTGTTGAGCGTATCGATGGGTTGATGGAAGATTGTAAAGATATTACTTCTGCTGTTAAAGATTACG
GATTGTTGTATCAGTACAGCTCGCGATGGAAAAAACAGCGCAGAGCAAAAGACAAGAAGCAAAGTCTTGA
GCAACAAGGGATTGCCTTGGAAAATAAGTAG
>ref|NC_003361.3|:c721117-720371 ABC transporter, ATP-binding protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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CGGTATTGCAGGGGATTTCTTTAGAGGTATTTCCTGATGAGCTTTTGGTGATTTTAGGTAAATCTGGGAC
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GAGGAACTTACCCATAAAGGACGTTTAAAAGATCTCACCATTGGTATGGTATTTCAAGGTGGCGCCCTTT
TTGATTTTCTTTCTGTTCGAGAAAATATTGCCTTTGGGCTTCATGCGTATAATGAACGTTATAGGGTGTT
TTCTAAAGGCGAGATAAATGCTAAGGTAGATCAAGCTTTAGCGAATGTAGGATTAAGTTATGCTGCAGAG
TTTATGCCGAATAAGTTGTCGGGGGGTATGGTTAAGCGTGTCGCTTTAGCACGTTCCTTAGTTTATTCTC
CCAAACTTGTTCTTTATGATGAGCCTACAGCGGGATTAGATCCTATGACGAGTCGAGAAATGACCCATCT
GATTTTCCGTTTGCGTAAGGAACAGGGGATCGGAGGTATTGTGATTACCCATGATATTACATTAGCATTA
ACTCTTGCAGATCGTATTGCTATTCATCATGAAGGAACAATCCCCCTTATCTATACAAAGGAAGAATTTA
TACAAACGAATGATGTATTAGCGAGACAATTTTTCGCCAGTGAGTAA
>ref|NC_003361.3|:c721917-721126 ABC transporter, permease protein, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
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GATGGATGGGATTTACCTGTGCAGTAATCAAAAGTTGTTCATGGAAGAAAAGTTTATTTCGGTCTGTAAG
CCTACAAGGCTATGATATTGGCGTTGCTTCTTTGCCTGTAGTTATGCTTACGGGAGCTGTCACAGGAATC
GTTTTAGCTCTACAGTCCTATTATCAATTAGGCATTCATGGCTTGTCCTGCGCTATAGGATTTTTCGTTG
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GATTTCTGCATTTTTAGGAACTATGCGCATGACAGAACAAGTTAGCGCTATGGAGACTTTAGGAGTGAAT
CCTTTAGAATACTTTGCTCTACCCAGGATCATTGCAGGGATTATTGCTATGCCTGCTTTGGTAATTGCTG
CAGTATGGTCGGGGATCTTTTGTGGGTATTTGCTATGTCGTTATGCTTTTCAACTCCCTGCTCAGGTTTA
TTTACATATGGTATCGGGAAATGTATTGCTATCCGATATTGTGATGGTCATTGTTAAATCTTTAGTATTT
GGATTTATCATTACCTCTTTAGCGTGTTATCAGGGCTTAGGGAAGCATTGTCGTATTACAGATGTGGCTA
AGGTCACCACTGCGGGAGTGGTTACCTCCTACATCTCTATCTTATTCGCTAATTGTGTCATTACGTCATT
TTTTCATGTTTTAGGTTGCTAG
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CTCCAATACGAGCCTGTATTCCTGTGGGGATTGTTCCTCCTATTGTCTCTAGTGCTTCTAGAGATGTTTT
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ATGAAATTTCTCTAGCCACCACTCTATTTTCTTGTTTGGGATTGCAAGATCATAAACTACGTTTTGTCTC
TTCAGGAACGGAAGCTGCCATGACTTCTGTGCGTCTTGCCTGTGGAGTTACGCAACGCTCAGTGATGATT
AAATTTTTAGGATGTTATCACGGACATGCTGATGTTTTGCTAAAGGGAATGACTATAGATGAGAATAATC
TTATGGAAGTTCCCCATCTTGTAGATAGATATTTTTCTTCAGATCCTTGCTTACCCCTAACTTTAATCTT
GCCCTACAATGATCTGAAGACTTTTGAAGAGGTAATGGAGAAGATAGGGGAACGCGTTGCTTGTGTGATC
TTTGAACCTATAGCTATCAATATGGGTGTTGTTCTTCCTGAAGCCGGGTGGATTGAGAGCATTATAACCA
CATGCCGACGGTATGGAGCTTTATCGATTATGGATGAGGTTGTTACAGGATTTCGTATGGGGAGTCGAGG
GATGCGCTCTATCCTCGATGTTACTCCCGATATTACTGTATACGGGAAGATTTTAGGCGGAGGGATGCCT
GTTGCTGCCGTTCTAGCTCATCAAAGTATTATGGAGCATTTGATGCCTGTGGGAACAGTATTTCAGGCGG
GAACTCTTTCAGGGAATCCTATTGCTATGGCTGCAGGGCAAGCTTCTATAGAGCTTTGTCAGGAGAGAGA
TTTTTATCCTAAGTTAGAAAATCTCACAGAAGGGTTCTTATCTCCTATAGAAGACTTCATTCGCTGTAAA
GGATTTCCTATAGCATTGGTAAGAGCGGGTTCTATGTTTTCTTTCTTTTTTAGAGAAACCCCTCCTAGAA
ATCTCCGTGATGTGCAGGAATGTGATCAGAAGACCTTTGGGATATTTTATCGGCATGCCTTTTCTCGAGG
GGTGTATTTGTCTCCAGCTTCTATGGAAGCGAGTTTTATTTCTTCTGTCCATAGTAGAGAAAATCTAGCC
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TTTTGCATGGGAGGCCCTCTGCAGGCCAATCAAATGATGCTTTTGCATTCCTGTTCTGAAATTTCTGAAC
AGACGTTAGAAATCTGTCCTTCTGTATATTTAGGGGGAGATTTGTCTTTCCTACAAGAGATCGCTGCTAG
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ACTGAATTAG
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GGGCCAGGCATTTCATCACTCTGATTCCTCACACTTTTCTTTATCACGACCACTAACTCATGATCTCCTC
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TTTATACACGCATGTTTTTAGAGCAAAAACAAGGAGATTTTCTCTATGTCACCGATGTTGATGCTCGCCC
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GCCATAGCTTACGAAGAATAA
>ref|NC_003361.3|:c725077-724376 ribose-5-phosphate isomerase A [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATCCCCTTGATTGATGATGAAGAATTCATCAACACGGATCTTGCTGTTGATGGTGCTGATGAGATAGATC
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ACGACGTTTGATACTTGCTGATGAGAGTAAAAGCGTTAAGGTTTTAGGGAAGTTTGGTCTTCCTGTGGAG
ATTAGTCCTTTTGGAAGATCTTCTATTATTGCTACCTTGGAGAATTTTGGATATCTGGGAAATTTAAGAA
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ATAGAGAATGTTGAGGTATGGTTGGGTTATACCAACGGTCAGATTGGCAAAAAGAACACCGGTGGATTAT
GA
>ref|NC_003361.3|:c726362-725268 hypothetical protein CCA00633 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGCTTTCCTATCTCATATACATAAAGAAGACAGTTCTATAGCTACAGTTTGTGTGTTAGATAAATACAAT
TTATCATTTGCTCAGCTTTATAGATTAGGAGTTTTAGCTTCTGGAGCGGATATAGATCCTTTTACAGATT
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TAATGGCGAATTGGATTTAGATTCTATCATTGAAGAGAATTGCCCATGCTATTGGTTGGAAACTTTTTCT
TCTAAGGTTCTTCAGGATTATAACAGCGATGTCTTAAATAGTTTAATCATTGGGCAAATGGCGTTTTTGG
GAATTTTTCATCCTCAATATTTACCAGTTTTCTCTTCAATAAGTATGCAAGACTATCGAACATTATCCGC
AGCTATGAACCAATCCATGTATACTATCTGGAAAGAAGATGCTAATGTAAAAGCTATAGTAGATACAGCT
TTAGCCACACAATCTTCTTTATCCAGAGAAGATAGAGAAGAGTTCCTGATTTGGTTATATTCAGGATTAG
GGATTTGTACATTAAATACAGAAGCAAAAGCTTTGCTAAAAGATCTTAGCAATCATAAAGGTCAGTACTT
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>ref|NC_003361.3|:c727776-726526 hypothetical protein CCA00634 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GCTCTCTCTTTAGTTATTGTTGGGGTAACGGCCGCTTTGGCATTGTGTCATGCAATCCGTGAGTTAAAGC
ATCCTCTTCCTTCAGGGTTTCGTTCTCTTATAGAAGAATCTTATCCTAAAATTATTCATGATCTTGTCTT
TAGTAAGACTCTTAATTTTCAAGAATTCCGCGCTGTTTTATTAGGATTGTCTTCGGGGAATTTTAATTTT
CCTTCTGAGGATTGTAAAAATAGAGTGGAATCATTTGGTCTTGAGCGTTTGCAACAGGCCTGTGAGGGCA
TTCAATTGCCTGAGTTAGAGAACATTCTTTTAAAGAATTGTCCTTTGTGCCTGATAAATAAGTTCATTCA
CCTTGGCCCTAGGGAATATCCCGATGCTGAGCGTATGGAACCTACTGTGTATTGGGTGAATCGAGCAGGT
TTATCGGATATAAATCAAACAGCGTTTCATCCTTTTGTTTGGCTGCTAGCACGTCTTATTTCTGAAGAAG
AGTACGGTATGCTATCCCAACATGCAAGAAATAATACTTGGGGAGAGGTACGTAATTTTGTTGAAGAGCT
AGATGTGCGATTTAGAACGTATTTAGAAAATAAAACTATAGAAGGGTTTGAACGAAGAGGATCATGGTTA
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AACTACAGTTATTTAAAGATATAGAATGCCGCCAGCTAGGTTTTCTCCATGCATTCGATACATCTCGTGT
TGGGGGTATTCTAATGGAATTATTACTGATTACTTCTCCATACCTCGATGAAGAGAATCCAGAAAATTTT
GATCCTAAAATAGCTTTACTTACATTGAAAGAGTGGATGCATTTCTATCATTATGACTCTCATCGTGTTT
ATGGTTTTCATAAAGGGACTTTGGAATTTTTTAACAAACACAGCAAACATAACTTGCAGAAGCAAAAACT
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>ref|NC_003361.3|:727793-727885 hypothetical protein CCA00635 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TCTCAGAACTTTTTATTTCTTAG
>ref|NC_003361.3|:c729226-727991 hypothetical protein CCA00636 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ACCTTAGTTCTCTTGGCAATATCCTTACGTCGTTATATACGACGTGAATTCGGGCCCTCCCTTCCTGAAG
GTTTCCTATCAATAATAAAAAAAGAGTTTCCCGTATCTATTTACGAGCTAGTAGTTCAAGAGAGATTGAC
CCTTCAAGAACTACGTGTTGTTATTTCAGGTTTATCTTCTGGGGTGTTTACTTTTCCCTCGAAAAAATGC
CGGGAGAAGTTAGAGAGATTTGGTCTTGAGCGTTTACAAAGCGCTTGTGAGGGTATTCAACTGCCCGATC
TAGAGAAGATTCTTTTGAAAAATTGTCCTCTATATCTTTTAAGTAAGTTTATCCAACTAGGTCCTAAAGA
GTTCCCTGAATCTGTCAATTTACCTCCGGAAGTATATTGGTTAAGTCGTTTAGGATTGTCAAGTAGCTAC
GTTGTATTTTTTAATTTTCATAATTGGGTTTTATCTCAAGTAGTGACTAAGGAAGAATATGAAATACTTT
TGAAGCATGCGAAAGATTCTACTTGGGATCAGATTAAAGATTTAACTGAGAACTTAAGACTTCGTGTAAG
AGAGGGTGTAGACAACTATTTTGTCGAACAGGATGGTTTGACTAAAGGTATGCTGAGATCTCTCATTGGT
GGCTCCTGGTTATTGTATCTATGTAAACACGGTGTCTGTTGGGAACAATTGCAATTACTTAAAGAATTAG
ACTGTTCAAGTGTTGGCCTAATGGATGAATTCGAAATGTCTAGGAGAAGAGCTTGTTTGATGAAATCATA
CTTTTCTATTTCACCCTATGCTAATGAAAGTGATGTCGAGGCTTTTGACCCACACTTAATCTTATTTACT
TTTAGAGAATGGAAGAAAGGTCTTGATTCCCATAAGTATAAAAAGGATTTTTATATTTATGATTGCACTA
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GCCTGAGCGCAATATAAATAGAGAGACGGGTGCGATCGTAGAGTAA
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TGGCTCAACCGTCTATGTTTATCAGATGGTTTGGATACAGTATTCCATCCCTACGTGTGGATGTTTGCGT
AA
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GGCCTCTGTTATTTTCAGCGGCATTTCTGGACCAGTAATGATATTAGGTTTGGTAATCTCTTTAGTGCTT
TGTGGAGCTTTACTAATCTCTGCTTTATATTATTCTAGACACCCTTATGTTATTATAACGCCTATCGTTG
ATTCTGGGACAAATGGTTCTATCTCCTCCTCTACTGAAGAGAGTTCTTCTTTAGATGAGTCTATAGAGGT
TAGTGCTACATCTGTATCTGTATTGGATTCTACAATTGATGACAGAGAATCTTCTGATGACGATTTTGTT
TTAGCTGAAACTCCAGAATCATATTCTGAGACTATTGCTGCATCTATGCTAGATTCCAGTACTGTTGGAG
AGGAATTTTTTGATGAAGAATCGACTTCTATTTTAAATGCTGCATTTAATTTATCTTCCTCAATTGTTAG
TGATGACTCTATTAAAGAAGAAGATAGTTTAGAAATAGATCTTGATTTAAGTTGGTTATATGATAGTCAA
TTAGTAATCGATGCAGAGGCTACAGTTGATGCTACAAGTTATGTAGGTGAAATGACGTCTCTTCCAAAAG
GATTTCTTTCTATAGTAGCAAAAAATTATCCTAGAATCATCTATCAGATATGTATTCAGGAGTTCTTAAC
GATTCAAGAGCTACGCCTTCTTATAGACGGATTGATTGAGAGTAGAAAGCTTGAAAATTATCCCGAAAAT
CTCAGGATGAAATTACAAAGTTCCCGTTTATCTATTATGGAATTTGATTGTCGTGATATTGAGTTACAAC
CTCTGGATGAAATTTTACTAAAAGAATGCCCTTTCTATTTTCTCGATAAGTTGATTGCATTAGGGGATAG
GGAATTGCCTATAGCAGAGAGAATATCTCCCGCTGTTTATTGGACCAGTCGTTTAGGATTTGTGAGTCAA
ATAAATACCATTGTCATTCCATCTGTTTGGATTTTATCTCGAGTGACAACCCGAGAAGAATACAAGATGA
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AAAGGTTTATTTAGATAACGAATATCAGCCAAGTTTTTCTTGTACAAAGAGTAGTGTGGGGTGGGATTTA
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AAACATAGTCTCTGTTTTTGCATATATCAATGAGAAGAAAGAAAACTTTGATCCAAATATTGCGTTATTT
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>ref|NC_003361.3|:732383-733138 hypothetical protein CCA00640 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAACATTACCGATCTTCTTATCTACTTAAATGATCTATTGTCTTCGGAATCATTTCCCGATTACGGCC
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>ref|NC_003361.3|:733232-735061 oligoendopeptidase F [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTAGCTTCATTATACATGCAATCTACAGATAGGGAATTAAGAAAGACAGCTTACCTAGCACAATGTGAAA
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CTCTGAATATAAAAGACTTTCACTTCTATGATGTCTATGCACCCCTAAGCCAATCCGAAGAGAAGAAATA
CTCTTATGAAGAAGCTGTAGACCTGATTTACGATAGTCTTTCTCCTCTGGGAACTGAATACGTTGATATT
TTAAAACAGGGATTAACCACAGAAGGTTGGGTAGACAAATACGAGAACCTGAATAAACGCTCTGGAGCCT
ACTCTTCGGGATGCTATGACAGCTACCCTTATATTTTATTGAATTACACAGGAACATTATACGATGTATC
TGTAATCGCTCATGAAGGTGGTCATAGCATGCATTCGTATTTCAGCAGGAAAAACCAGTCTTTCCATGAC
GCTCAATACCCTATTTTCCTCGCTGAAATTGCCTCAACTCTCAATGAAATGCTTCTTATGGATTCAATGC
TGAAAAAGAGCAATTCTAAGGAAGAAAAGATCACTATTCTTACAAGATGTTTAGATACGATCTTTTCTAC
GCTATTTCGCCAGGTTTTATTTGCTTCTTTTGAATACGAAGTCCACTCTGCAGCAGAACAAGGTATTCCT
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TCGATACTCTTTCCAACATAGAATGGGCAAGAATTCCCCATTTCTATTACAATTTCTACGTATACCAGTA
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ATATGGCAACCAGCGAGCCCATATACAAGGCCTTTTCCTTCATAGAGAGAAAAATTCAAGAGTTATCATC
TTTAATTTAA
>ref|NC_003361.3|:735193-735501 co-chaperonin GroES [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCAGATCAAGCAACGACCCTTAGGATTAAGCCCCTGGGCGATAGAATTTTAGTGAAAAGAGAAGAAG
AAGATTCTACAGCGCGCGGCGGCATCATTTTACCTGATACAGCAAAGAAAAAACAGGATCGAGCAGAGGT
ATTAGTCCTAGGCACTGGAAAACGAGATAAAGATGGCAACGTCCTACCTTTTGAAGTTACCGTGGGTGAT
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AAAGCGAAGTTATGGCAGTTCTCAAGTAA
>ref|NC_003361.3|:735552-737186 chaperonin GroEL [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCAGCAAAAAATATTAAATATAACGAAGACGCCAGAAAAAAAATCCATAAAGGAGTTAAAACCCTTG
CAGAAGCTGTAAAAGTAACCTTAGGTCCTAAAGGCCGTCATGTGGTTATCGATAAAAGCTTTGGTTCTCC
TCAAGTTACCAAAGATGGCGTAACTGTCGCTAAAGAAATTGAGCTCGAAGACAAGCATGAGAACATGGGA
GCTCAAATGGTAAAAGAAGTCGCTAGCAAAACTGCAGATAAAGCTGGTGATGGAACTACAACAGCTACTG
TTCTTGCAGAAGCTATCTACAGTGAAGGATTGAGAAACGTAACTGCAGGCGCCAATCCTATGGACCTCAA
AAGAGGCATTGATAAGGCAGTAAAAGTCGTTGTCGATGAAATCAAAAAAATTAGTAAACCCGTACAACAT
CACAAAGAAATAGCTCAAGTAGCGACTATTTCTGCAAATAATGATGCTGAAATCGGTAATCTTATCGCCG
AAGCCATGGAAAAAGTTGGCAAAAACGGCTCTATTACTGTTGAAGAAGCTAAAGGTTTCGAAACTGTCCT
CGACGTTGTCGAAGGTATGAATTTCAACCGCGGATACCTATCCAGCTACTTCTCTACAAATCCTGAAACA
CAAGAATGTGTTTTAGAAGAAGCTCTCGTGCTTATCTATGATAAAAAAATTTCCGGAATCAAAGATTTTC
TACCAGTTTTACAACAAGTAGCAGAATCAGGACGTCCCCTACTTATCATTGCTGAAGATATCGAAGGAGA
AGCTTTAGCTACTTTAGTAGTAAACAGACTACGTGCTGGATTCAGAGTGTGTGCAGTAAAAGCTCCTGGA
TTTGGTGATAGAAGAAAAGCTATGTTAGAAGACATCGCTATTTTAACTGGTGGTCAACTCATCAGCGAAG
AGCTTGGCATGAAGCTTGAGAACACAACTCTAGCTATGTTAGGAAAAGCTAAAAAAGTCATCGTTTCCAA
AGAAGATACAACAATTGTTGAAGGTCTTGGCAGCAAAGAAGATATTGAATCTCGCTGCGAAAGTATCAAA
AAACAAATCGAAGACAGTACTTCTGATTACGACAAAGAAAAACTCCAAGAACGTTTAGCTAAACTTTCCG
GAGGCGTAGCTGTAATCCGTGTAGGAGCTGCTACAGAAATCGAAATGAAAGAGAAAAAAGACAGAGTAGA
TGATGCTCAGCATGCAACTCTTGCTGCAGTTGAAGAAGGTATTCTACCTGGCGGTGGTACAGCTTTAGTT
CGCTGCATCCCTACTTTAGAAGCTTTCATTCCTATTCTTACAAATGAAGATGAGCAAATCGGAGCACGTA
TTGTTCTCAAAGCATTATCCGCTCCATTAAAGCAAATTGCAGCCAATGCTGGTAAAGAAGGCGCTATCAT
CTGTCAACAAGTGCTTTCTCGCTCCTCTAGCGAAGGCTATGATGCTTTACGCGATGCTTACACCGACATG
ATTGAGGCAGGAATTCTCGATCCAACTAAAGTTACACGTTGTGCTTTAGAAAGCGCAGCTTCTGTAGCTG
GGCTTCTATTAACAACAGAAGCTTTAATTGCCGATATTCCTGAAGAGAAATCCTCTTCTGCTCCCGCAAT
GCCAGGCGCAGGAATGGATTATTAA
>ref|NC_003361.3|:737328-738131 hypothetical protein CCA00644 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTAAACTTTTAAAGAATTTATTTTTATTAGCATTTTGCGTTATCGCTTATTTTTGGATTCGCAAAG
AAAGTATTGTTGAGCATTGGTTATCTGCAAAATTACACACTCAAGTAACTGTAGGCAGGGTCTCTCCTAG
AACCTCAGGGATGAAAATCCGTTACCTATGTATTCATAATCCCATGCCATCGGAGCGTTTCCCCTATGCC
ATGGAAATTGAATACGTGAACTTGCGTTTTTCTCTTATTTCTATGCTTCTATCTAAGAAAATAGAGATCT
CAGATCTTCTTATTCATGGAGCCAACTTCACTATACTTCCCTACGACAATCAGTCGTCAAAAACGAACTG
GTCGTTATTATGGAAAAATTTCACTCCACAAAATCAAGAAGTGCTCGGGACATCTCCAGCACAATCTTTT
TCATCAAGACTCGATGACGTTCCCGTATTGATTAAACGTTGCCTATTTGTAAATACGCGTATTCATGGAG
TAAAAGCAAATAATAAAGAAATTCCATATCTTGCTGTACCCTCTTTGGAATACCACAGCAATATAAACAA
ACAAGGTTCTCTACCAAACCTTGCAACAGCGCTAACCTCTATTCTTTACCTCGCCGTAGAAGAAAGTCTA
TATCATGTAAATATTCCCGGAGATATCGTTAAAGCACTGTCTAAGCAATCCCATACCTACTTTAGCTCCG
CCTACCCTATCCTAATAGAAAATGAAGAGCCAGAAACTACAGTAACTCAAAAAAAGTCCACTAATGAAAT
CGTAGGATTTGTTAGAGAGCTATTTTTTCATTAA
>ref|NC_003361.3|:738381-738779 hypothetical protein CCA00645 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACCAAACCCACCTCACAAGAAATCACCACAATAAACCCAGTTCAGACTAGTTTTCCTTTATTTTGCA
GACAGTCTATTTCTTCATCTGCTCTAGGGGTGTGTATCAGCGTGTCTGCTATTTTAGCTACAGCAGCTGT
TATCGCCTGTTTATGTTTAGCTCGTTCATCAGAAATACTGATTATCATAATGGCATTAATTACAGGGGTT
CTTGTTATTCTCTGTTTCCTACAAATTGTTTTTCATATTCACGGAAAAAAACAAAGGGCAATACAACATC
CATCTCCCCTACAACCCCAGCCACTAGCACCCACACAAACTCTGGTTCTTCCACAACTTCCTGAAGCTAC
CCTTACAGAGCTACAGCAAAAGATGTCTACAGATCCGAAACCACAATAG
>ref|NC_003361.3|:c738714-738595 hypothetical protein CCA00646 [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGGAAGAACCAGAGTTTGTGTGGGTGCTAGTGGCTGGGGTTGTAGGGGAGATGGATGTTGTATTGCCCT
TTGTTTTTTTCCGTGAATATGAAAAACAATTTGTAGGAAACAGAGAATAA
>ref|NC_003361.3|:738878-739687 hypothetical protein CCA00647 [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGGCTTCGTGGAAAACCTGCCAAGAAGATGGCGATGAGGTAACTCTCTCTAGAGATTATATAGGGTTTG
ATATTGTCCTCACAACTCACGATTTTGCAGGACTAGAAGCAGAGGCTGTTATCAATGAAGAACCCCAACG
GTGCTACATACATCAGGAGCTTCAAAGAAATCTACCCCGAGATACAGGTAGCCAGGTCATAAGAACGAAA
TTAGGAAATCTAACTTATGTACTTCCTATTCTTCGAGATTCTTTAACACCTAATGAAAATGCTGATACAA
CAAGTCAGGAAGAGATCAATGAAGCCTTCTATAAAATCTTCAAAAGTTTCTTCACGAAGTACTACATAGC
ATTAAACGCTAGCGTTGCTAGAGAAAAAATTATCACTCTACAACTCCTTAGATCTGGTTGTCCTGATCTC
AGAGTACGTCAGATGGAAATTTTCGCGCTATTTTGCGCTATTGAACAAATGCACTTCACGCAAACACCAG
AAACTCCAAGTCTATTTAGCAATACAGTCGCTTCTCAACAATTGCCGGTATCGCCACTAACGTCTCCAAC
AGCAACTGCTTATGGTCAGCTACGAACATCTCCTACAAGTCCTCCAATGCTCACACCTCAATTTGATAGC
ATGCAAAGATTCTTAGCTCAGGAGAGACATCATCAAAACATTCCAACAGATGCAAGTCAAACGTCAGTCC
ATTCTATCTCCGGAAGATTACTGGAAAATATTTGTAGAAAAAGATATAGCGTCATTCCCAAGAGAATGCT
CTCCATACGGACTTGTTTCTCATCCTTGCGGAAATCATGA
>ref|NC_003361.3|:c740615-739842 biotin apo-protein ligase-related protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGAACAAAAATACTCATTTATTCTGACGCGGGTGTCTCCCCCTATTATTTACGCCATCTGATGCGCT
GGTTAAGAAGTAGTCTTCCTTCTGAGGAAAACCTAGAAATTTGCCGGGTAGATGGGAAGTTCCTTCTTTA
TGATCCCCTATGGGAGTGTACGGCTAGGTTGCTGATTATTCCTGGGGGTGCTGACCGCCCCTATCATGAA
ACTTTACATGGTTTAGGAACAGCAAGAATAGATAACTATGTTCGTGAGGGGGGGAGTTATCTAGGTATCT
GTGCAGGCGCTTACTTTGCATGTAAGAGTTTGAGTTTTGATGAGCCTGATGGCTTTCTTTATACTGCCGA
TCGGGGATTAGGGTTTTTCCCTGGTCGTGCTGTAGGCCCTGCCTATGGTAGCGTATTTTCTTATACCACT
CCGGTAGGGGTTCGCGCCGCGCCGCTGGTTTTTTCTAACTTAAATACGTATGGTTGGGCTTTATTTAATG
GTGGGCCCTATTTTGAGCACGCAGATGCTTATACAGAAATTTGTGTAGAAGCTCGGTATGAAGATCTTCC
TGAACAACCTGCTGCGATTATTTCCCGACGGTTAGACAAAGGCTTAGTTGTCCTTTCAGGATTACATATA
GAATATCTTCCTGAGCATTGCCAGATGCCCGAGGATAATGTTGTTAAGGCTCGTGAGATTCTAACAAACG
CTACAGTGTTGAATCAGTACCGTGCGTCTCTTTTATCACGACTCCTGCGTACAACGACACCTGTAGCTGT
CTGA
>ref|NC_003361.3|:740749-741765 hypothetical protein CCA00649 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTGTTAACGATTCTCAAATACAACAAGCTCGTAATGTTCCCCTAGGACTGTTTCATAGCCTCCTCG
CTTGTCTCTATTGGGGAATCGTCTTCGTAATCCCTGATTTGTTAGAATCTTTTCACGAACTTGATATCGT
CTTAACCCGTTATACCATTTTTGGTATTTTTTCTCTTTTCCCTATCCTATGGAAAAGACAAAATATCTTT
AAAAATGTCTCTTTGCGTATTTGGGGTCAAAGCTTCCTCTGGGCCTTTCTTGTAGATATTGTCTACTATC
TCGGCATTACCCTAGCCATTCGTTACATAGGCGCCGCTATAACCATTATTATCGCGGGATTAGCTCCCAT
AGCCGTCCTATTTCATTCGAATATAAAGAAAAAAGAGATTTCCTATGCCCTACTCTCTGCGATTAGCAGT
GTGATCTTCCTAGGGGTCGTGCTAACAAACCTTTCGGAGTTTCATTCAACAACAGCAGATCCTTTGCAGT
ATTTCATGGGACTTTCCCTTGTGACCATCTCCACAGGAATTTGGGTTGCCTATATCGTCTGCAACCACGA
CTTTTTGTTAAAAAATCCTAACATTTCCCCTGATTTATGGTGTGGACTGTTAGGGGTAGCTTCGTTAATT
TTATGTCTACCCTTGATTATTCTTTTTGATTGTCTTGGCATCACGTATGTTGCTCATAACTTCATAGCAC
ATACGCCGACATCAGAACGGTTCCTCTTTATTGTTCTATGCTCAGCTATGGGGATACTCTCTTCGTCTCG
AGCCATCACGTCCTGGAATAAAGCTAGCCTACACCTCCCCCCTGCTTTTTTAGGGGCCATGTTAATCTTT
GAGCCTATTTTTGGTTTGATTTTATCCTATCTTTATCAAAGGATCTTACCCAGCTTACAAGAAGGGATAG
GGATTTTCTTAATGTTAGGAGGTAGCCTCACCTGCTTAATTCTTTTTGGAAGAAGGGCGGGTCAAAAGGA
ACCGGAAGAATCCGAGATTCTTCCTTCGGCAGATTAG
>ref|NC_003361.3|:742283-744490 RecD/TraA family helicase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGAGAAAATTTCCGGAAAATTAGAAGGCATACTTTTTGAAGATCAAGATTCAAAGGAAACTGCTGCGC
GCATAAGAATACCCTATAAGGGTACGGTCATCGTTATCAAAGGGCAGTTCCCTAACTCTTTTCTACAAAT
TGGGATGCAACTGCATCTATATGGAAAATGGTCAGAAAATCCTAATTTAGGAAAATACTTCCAAGTCTAC
AGTTGTGATTCTCTAGAAGGGAGAGATAATCGTGGGGTAGTCAATTATCTTACCTCTAAACTTATCAAGG
GTATCGGTCCAAAAATCACTGAGAAGATTATTGAAACATTCCAAGGTGAAACTACTGATATCCTGGACAA
TCAACCAGAAAAATTAATTGAAGTTCCAGGAATTAGCCAAACGCGTTGTGACAGCCTCTGCGAGCAACTT
CGCGAACAAAAAGATCTTAGAACCACCCTGCTCTTCCTACAGCAATATAATATTGCTATTCACTATGGCG
TAAGAATTTATAAAAAATATAAAGAGCACTCCATAGAGAAAATCTGTGAAGATCCCTTCCTTCTCGCTAG
AGAGATGGAAGGAATAGGATTTAAAACTGCGGATCTTATTGCCACGCGCTTAGGAGTGCCATTAAATTCA
CAAAGCCGATTATTTGCAGGAATCCAACATTCCCTGGAAGAACTCCAAGAAGATGGTCATACCTGTTATC
CCCTACAAAGGCTTGCGCAGGCTGTAGAGAAACTCCTAAATCAAGATATCCCTGACAAACTGATACAAAC
TGAAGAGATCATCTCTCAAATATATAACATGCAAGAAAAAAACCTTTTGCATATTCAAGAATTAGAAACC
GTACCGCACGTCTGGGTAAAGCATGTTTACCTGGCAGAAAAGACTGTAGTTTCTGATTTAAAACGGATCT
TATTTTCCTCGAGGAGAATTCGTCCTATAGATGGCAACAAAGCTATTCAATGGGTTGAGGAGAATCTCAA
CCTTCACCTAGAGCAAAAGCAAAGAGAAGCTGTTCATGCATGTTTTTTAGAAAAGATTCACATTATCACT
GGAGGACCAGGAACAGGGAAAAGTACCATCACCAAGGCTATCCTTAAAATATTTGAACAGGTTACCTATA
AAATCATTCTCGCTGCTCCTACAGGGAAAGCAGCAAAACGTATGACAGAGATCACGGGAAAGCACTCCGT
GACTATTCATGCTCTGTTACAGTATGATTTTAAAACACGTTCTTTTCGTAAGAATTATGAAAATCCCATA
GACTGTGATCTCATCATAGTCGATGAATCGGGAATGATGGATACCTATCTCCTACATCATTTTCTAAAAG
CACTTCCCGATCATGTGATTGTTATCCTCATTGGAGATGTGCATCAGCTACCTAGTATTGGCCCTGGAAA
TATCTTAAAAGATATTATCAATTCTAAAAAAATCACCGTAACCAAGCTAAATAAGATTTTCCGTCAGGTA
CATGACTCAAACATCATTATCAATGCCCATAAAGTAAATGAAGGAGAATTCCCCATACTCTATTCTGAAT
CTGGGCGTAAGGATTTCTTATTTTTCCAAAAAGAAGATCCTCAGGAAGCTGTGGATCACATTGTCCAACT
AGTTACACAATTCATTCCTAAGAAATACCATATCTATCCTAAAGATATTCAGATTCTTGCCCCTATGAAA
AAAGGCATCTTAGGAATCCATAATCTCAATAAAGTATTAAAGTCTGCTCTAAACCCTAAACAAGCAACTC
TCCATGGTAAATTTCATTCCTATGCTATTGGAGATAAAGTTATGCAAATCCGCAATAACTATAATAAAGA
AGTGTTCAACGGAGATATTGGCTATATCTCCATGATCAACTTTGAAAATAAGCGTGTTGTAGTCAACATG
GAAGGAAAGTATGTTGTCTATTCCTTCTCGGAACTTGATGATCTTGTTTTAGCCTACGCCACTTCAGTGC
ATAAATATCAAGGAAGTGAAAGTCCCTGTATTGTCCTTCCTATACATACATCCCACTTTATGATGCTCTA
TAGAAATCTTCTTTACACAGCAATTACAAGGGGGAAACAGCTTGTTATTCTAGTGGGAACAAAAAAAGCA
ATCGCCATAGCCACAAGAAATGATAAGGTACAACATCGCTGTACAGGACTCGAGCAAGCTCTTGAGCAGC
TTACACAACCTGGACAAGAAACTATCTCATTTTCATAA
>ref|NC_003361.3|:c746156-744504 methionyl-tRNA synthetase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCCCTCGCGCGTTTTAATTACCTCGGCATTGCCTTATGCGAACGGACCTCTACATTTTGGACATATAG
CTGGAGCCTACTTGCCTGCAGATGTCTATGCTAGATTTCGTAGATTATTGGGGGATGATGTTCTTTATAT
TTGTGGTTCTGATGAGTATGGAATCGCAATCACATTAAATGCCGAACGCGTAGGTTTAGGCTATCAAGAG
TATGTGAGTATGTATCATAAGGTGCATAAGGATACTTTTGATAAATTGGGAATTTCCTTGGATTTCTTCT
CACGTACTACAAATCCTTTTCACAAGGCTATTGTTGAAGATTTTTATCTAGAGCTAAAATCTAAAGGCTT
AGTAGAAAATCAGATTTCGTTTCAGCTATATTCTGAAGATGAAAAGCGTTTTCTTGCCGATCGTTATGTA
GAAGGTACCTGTCCGAAATGTGGTTTTGATGGTGCTCGTGGTGATGAATGTCAAAAGTGTGGCGCTGACT
ACGAAGCTACGGATTTAATCAATCCACGATCTAAATTATCGGGATCACAACTCGTTCTTAAAGAGACAGA
GCATGCGTATTTTCATTTAGAACGTATGGTCGAGCCTTTATTAGCATTTATAGAAAAAGCATATTTACCT
GAGCATATTCGTAAGTTCGTTGTAGATTATATTAAGAATTTGCGTCCACGTGCCATTACTAGAGATTTAT
CTTGGGGAATCCCCGTTCCTGATTTCCCAAATAAGGTATTTTATGTATGGTTTGACGCTCCTATTGGCTA
TATCAGCGCCACTATGGATTGGGCAGCGTCTGTGAACACTCCCGATCTTTGGAAAGACTTTTGGTTAGAA
GAGTCGACAGAGTATGTACAGTTTATAGGTAAGGATAATATTCCTTTTCATGCGGCGATATTTCCTGCTA
TGGAATTGGGGCAAAGCATCCCTTATAAGAAAATGAACGCTTTAATATCCTCGGAGTTTTATCTTCTTGA
GGGGGCCCAATTCAGTAAATCTGAGGGGAATTTCGTAGATATGGATGCCTTCTTGGATACCTATTCTCTT
GATAAATTACGTTATGTATTAGCCGCAACGGCTCCAGAAACTTCTGATAGTGAATTTACTTTCCTAGATT
TTAAGACACGGTGTAATTCAGAGCTTGTTGGTAAGTTTGGGAATTTTATTAACCGTGTGCTTGCTTTTGC
AGAGAAAAATGGGTTTAGAGAATTAACGTGTCCAGAAGCTTTAGAAGATAAAGACAGACAGTTTCTGGAT
GACTGCCAAAGAATTGTTCAGGAAGCCCAAGCGTATTATAGTAAGTATAGCTTGCGTAAGGCGTGCTCTG
CAATTATGGAGCTAGCTGCATTAGGAAATGTGTACTTTAACGATCAGGCACCATGGAAGCTTCTTAAAGA
AGGATTCGCGCATCGTGTAGAGGCTATACTTTTTTGTGCGTGTTATTGTCAGAAGTTGCTCGCGCTGATT
GCGTATCCTATTTTGCCAGGGACAGCTTGGGAGATATGGAATATGCTGGCTCCCAAATCTTTAGATCTTG
AAAATCAGGATAAAGATCGTGTGAAAAACCTTTGGAATACAGAATTTATAGATTTCTCGGATGAGGTTTT
CTCTCTAACAACACCGCAGTTGTTGTTCACAATTGTAGATTAG
>ref|NC_003361.3|:c746452-746156 hypothetical protein CCA00652 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGCAACAAAGATCGTTTAACAAATGAAAAGTTAAACCAATTATTTGAAAGCCCGTTTAGTTTAGTAA
ATTATGCGATTAAGCAGGCAAAAATTAGAATAGCAAAAGGCGACGTACGTTCTTCTAATGCAGCCATTGA
GGCTTTAGTTTTATTAGAAAGGGACGGAGTTCAGGCAGATTTTACAGAAGAAGATGTAGAGAATGCTACC
GCTCCCGTTACTGAAAGAAGAAGAGAAGGATCCGTGTCGGGAAGAAGAAAAGACCCTTCAGCTTACACAT
GGAGTGATGTAAAATAA
>ref|NC_003361.3|:c747063-746449 guanylate kinase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAGATAAAGTTCGTGTTCCTTTTTCCCCTGATCACCCCTCGTGTGCACCGAAATTATTTACTATTA
GTGCTCCTGCAGGAGCTGGGAAAACTACACTAGTGCGTATGTTAGCACAAGAATTTCCCGATTCTTTTCA
AAAAACCTTATCCTTAACAACGCGAGCTCCTCGTCCCGAAGAAGTTTCTGGTATAGATTACTGGTTTGTT
TCCCAAGAAGAGTTTAAACAACGATTGGATAGTAATAATTTTCTAGAGTGGGTCTTGCTTTTTGGAGAGT
ATTACGGAACTAGTCGTTTAGAAATTGATGAAATTTGGAAATCAGGGAAACATGCGGTTGCAGTGATTGA
TGTAGAAGGAGCTTTGTCTTTAAAAAGTAAGATCCCTACAGTCACGATTTTTATTTCCGCACCTTCGCAA
GAAGAATTAGAGAGGCGTTTAAAATATAGAGGGTCTGAGCAAGATTCTCAAAGACAAGAACGATTGCAGC
ATAGTCTTATTGAACAAGCAGCATCGAACCAATTTGAATACGTCATTATCAATGATGATTTGCAAAAATC
TTACGAGATTTTGAAGAGTATTTTTATAGCAGAAGAACATAGGAACGTATTATGA
>ref|NC_003361.3|:c747708-747070 ribonuclease HII [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAGACACTAGCTATTGATGAGGAACAATTATTTTTATCTAAAACTATCTTTGAAGAAGAAGTTTATG
GTGAGGGTTTTTCTATCATAGCTGGAGTAGATGAGGTCGGAAGAGGCCCCTTAGCGGGGCCTGTTGTTGC
AGGAGCTTGTATCCTTCCTCGAGGTAAGATATTTGCCGGAGTGAATGATAGTAAAAAATTGACTCCCAAA
GAAAGAGGCAAAATTCGCGATATTCTATTGAATGATCCAGATGTATGTTATGGAATCGGAGTTGTCTCTG
TAGAAAGAATAGATGAGATCAATATTCTTGAAGCAACCAAGGAAGCTATGGCGAAAGCAATAGCCAACTT
ATCTGTTCATCCTGATTTTCTTCTAATAGATGGTCTACATTTACCCCATAAGATTCCTTGTAAGAAGATT
ATCAAAGGAGATTCAAAATCCGCATCCATAGCCGCAGCATCGATAATAGCTAAAGAATATAGAGATGACT
TAATGCGAGAGCTTCATCAACGCTATCCCAATTATGGCTTTGACAAGCATAAAGGTTATGGAACAGCCGC
GCATTTAGCAGCATTAAGGGCTTTTGGCCCTTGTGATTGTCATAGAAAGAGTTTTGCTCCCATAAGGCAG
GTAGTCTAA
>ref|NC_003361.3|:c748131-747766 50S ribosomal protein L19 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGGGAACTTAATTAAGGAATTGCAAGACGAACAGCTTCGAAAAGAAGCTCTTACAGATTTTCGTGTTG
GAGATACAATTCGTGTAGCTACAAAAATTGTGGACGGTGGTAAAGAACGTACACAGGTATTTCAAGGGAC
AGTTATGGCCCGTAGAGGTGGAGGAGCAGGGGAAACTGTTGCTTTACACCGCGTAGCTTACGGCGAAGGC
ATGGAAAAGAGTTTCTTACTTCATAGTCCTAAGATCGTAGGTATTGAGGTTGTGAAACGAGGTAAAGTTT
CTCGAGCTCGTCTATACTACTTGAAAGGTAAGACCGGTAAGGCTGCTAAAGTTAAGGAATATATTGGTCC
TAGAGCTCCTAAGTAG
>ref|NC_003361.3|:c749222-748155 fused tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase/uncharacterized domain-containing protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGAGATCGAGATACTTTCTTTATTCCCAGACTATTTTGATAGTCCTTTACGTTCTAGTATTTTAGGTA
AGGCTATTAAGAACGGGCTGTTAAAAATCCAATCCAGAGATATCCGAGATTTCGGATTAGGAAAGTGGAA
GCAAGTAGACGACGCCCCATTTAACAATGATGGGATGCTTCTTATGGCAGAGCCTGTAGTACAGGCAATA
CGGCATATTAAAAGAAGCGATAGCAGGGTAATACATCTTTCTCCTCAAGGAAAGCCTTTAACAGCACAGA
AGAGCCGAGAATTGGCAAAGTGTTCTCATTTGATATTCTTATGTGGGCACTATGAAGGCATTGACGAAAG
AGCTTTAGAAAGTGAAGTAGATGAGGAGATAAGTATCGGAGATTATGTTTTAACTAATGGCGGAATTGCA
GCCTTAGTCGTAATCGATGCTTTATCTCGATTTATTCCTGGAGTTTTGGGAAATCAGGAGAGTGCAGAAA
AGGATTCTCTAGAAAATGGGTTGTTAGAGGGACCTCAATACACACGTCCTCGAGTATTTGAAGGTAAAGA
GGTTCCCGAAGTGCTTCTTCAAGGAGATCATCAAGCGGTTGCGCGGTGGAGAAAGCAGGTAAGTTTAGAT
AGAACCCGAGAAAGGCGTCCTGATTTATATATTCGCTATCTTTACGATCGAGAGAATGAAGAAGTTTTCC
CACGGGAAGAAGATACGAAACAGTCTACATTAGAAGGTGAGAGTGCTGTAGTTTTAGAGGTTGAAGATCT
ACAACGATCGCGAAAGTTTTATTCTAAGATGTTTAGATTAAATCAACCTAGTAAGGATAAACTACAGATC
CCTGGAAGAACGCAAATGGTTCTCCATTTGCAAGAAGTAGGGTTAAAAAATAAAAATACAGCCATTTTGT
CGCTTCGATTGGATTGTGAAGACGATTTTTTTAGTTTTTTAGGACGATGGAAAATGCTTGGAGGGACTCT
AGAACAAGCTGACGATCATGGAACGGTGAGATTAGTTCGTGATTTTGACGGACATCAATGGACGATCTCT
TACAAAAAGGTAAAATAG
>ref|NC_003361.3|:c749596-749237 30S ribosomal protein S16 [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGGCGTTAAAAATTCGTTTACGACAACAAGGGCGAAGAAATCACGTAGTCTATAGATTAGTACTTGCTG
ATGTTGAGTCTCCTCGTGATGGTAGATATATAGAATTATTAGGTTGGTACGATCCTCATAGCGCAGTTAA
CTATCAATTGAAAGGTGATAGAATTTTCCACTGGTTAAGCCAAGGTGCTGAACTTACAGAAAAAGCTGCT
GTTTTGATTAAACAAGGCGCTCCTGGAGTTTACAGTGAATTGATGGCTAAACAAGCTGCTCGCAAAGCTG
CTGTATGTCAAAAACGTCGCGCTTATCGCCAACGTCGTTCTTTAAAAAGAGCTGAAGCTGCAAAAGCTGC
TGCGAAGTAA
>ref|NC_003361.3|:c750930-749587 signal recognition particle [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATCAGTTCTTTGTCGCAAAAACTATCCTCAATTTTTTCTTCGTTAGTTTCCTCTCGTAGAATTACTG
AAGAAAATATCTCCGAAGCGATCCGGGAAGTCCGCTTAGCCTTACTAGACGCCGATGTGAACTATCATGT
CGTGAAAAGTTTTATTGCTAAGGTAAAGGAAAAAATTCTCGGAGAGGAAGTATGGAAGCACGTTTCTCCC
GGACAGCAGTTTATACGCTATTTACATGAAGAATTGACAGAATTGCTTAGCGGTAAGGCCGATTTAATTA
CTTCAGGGAATCCTGGAGTCATTTTACTTTGCGGCTTACAAGGAACGGGAAAAACGACGACCTGCGCTAA
GCTCGCCGCTTATGCTCTAGAGGAAGGTAAGGCAAAGAAGGTGCTCGTTGTCCCCTGCGATTTAAAACGC
TTTGCGGCAGTAGATCAATTAAGAAACTTGATTTCAAAAACCCGCGCTGAGCTGTATAATCCGGAAGGTC
AGGATCCTGTAAAAGTAGCTTCCCAGGCTTTAGACTATGCGAAGCAGCATGGCCATGATCTTGTTTTAAT
TGATACAGCAGGCCGATTGCATGTGGATGAAGTGTTGATGGAAGAATTGGCTTCCATACAAAAAATCTCC
AAATCATGTGAGCGGCTATTTGTTATGAATTTAGCTATGGGACAGGACGCTGTTACCACGGCTAAAGCGT
TTGATGATTATCTAGATCTCACGGGAGTGATTATCTCCATGACAGATGGAGATGCTCGAGCCGGAGCTGT
ATTGTCCATGAAAAGTTTATTGGGAAAACCAATAAAATTTGAGGGCTGCGGAGAGAAAATACAAGATCTT
CGACCTTTTAATGCTGAATCTATGGCAGATCGTATTTTAGGTATGGGAGATACCGTGCATTTTGTCCAAA
AAATGCGCGAATGTATTTCTGAAGAAGAAGACGAAGAACTTGGGAAAAAATTAATAGAGTCGACCTTCAC
TTATGAAGATTATTATAAGCAGATGAAGGCATTTCGACGTATGGGTCCACTTAAAAAGCTTATGGGGATG
ATGCCGAGTTTTGGCGGTGCTAAACCTAGCGATAAAGATATAGCGGATTCCGAAGAGCATATGAAAAAAA
CAGAAGCGATTATTCTTTCTATGACTCCTGAAGAAAGAAAAGAGGAAGTTGAGCTAGACATGAGTCGCAT
GAAAAGAATTGCTGCCGGTTGCGGGTTAACTGTAGGTGATGTAAACCAGTTTCGCAAGCGTATGGCACAA
TCTAAAAAGTTTTTTAAAAATATGAGTAAAGAGAGAATAGAACAAATGAAAAAGAAAATGTCTGGAGGAA
ACCTGTGGCGTTAA
>ref|NC_003361.3|:c751808-750957 N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGAAACGAAGAGAATTCTTAGAGAAGCTGCTGCATATTTAAAGTGTTGTGGTGTAGCTTTCCCTGATA
GAGAAGCCGCAGATGTTTTAATGGATTTTCTGGAAATCAGGTCCAGAGCGCAACTGGCATCTATTACATT
AGATGAACATCTTATTCCGGCCTATTGGGAGCGTATTCAAAAAAGAGCTCAGCGTTATCCAACAGCCTAT
ATTCACGGCAGTGTACATTTTTTAGGCCTGCATCTGGAAGTGGATTCTCGCGTCCTTATCCCTAGAATGG
AAACAGAATTATTAGCCGAACAGATCGTAAAATATTTAAGCGATCATCCTCATATTCAAACATTTTATGA
TGTTTGTTGCGGAAGTGGTTGTTTGGGATTATCTATAAAAAAATATTGCCCTAATATTCAAGTTATTCTT
TCAGATATTTGCTCAAAAGCGGTGGCTGTAGCTAAGACAAATGCATTTAAAAATAATTTAAATGTTGAAA
TTCTTAACGGGGACTTGTTTGCTCCATATTCTTGCCCTGGGGATGCTTTTGTCTGCAATCCTCCCTACCT
TTCTTTCGATGAGATCCTGCATGTAGATCCTGAGGTTCGTTGTCACGAGCCGTGGAAAGCATTAGTTGGA
GGCAGTTCTGGATTGGAATTTTATGAACGCATTGCTAATGAGCTGAATACTATTTTGCTCCCCAGAGGTG
TCGGTTGGCTGGAAATTGGCTATAAGCAGGGGAGTTCAGTAAAAAGAATTTTTGCAAATCGTGGCATCTC
AGGGAACATATACCAAGATCTCTCGGGATGCGATAGGATTTTTTTTCTTGAAAATCATGCAAGTGATGCT
GTATCCTCATGA
>ref|NC_003361.3|:c752871-751786 peptide chain release factor 1 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGAAAAAAAGATTCTAGAATATTTGAAGCGCTTAGAGGAAGTGGAAGTTAAAATCTCTAATCCAGAAA
TTTTTGAGAATCCTAAAGAGTATAGTAGCTTAAGTAAGGAACATGCGCGTCTTTCTGAATTAAAGAACGT
ATATGATAAAGTTTTAGGACAAGAAAAAATTCTCAATGATGATAAAGAAGCGCTAGCTCAAGAAAAAGAT
CCTGAAATGATTGCTATGCTAGAAGAAGGCATTCAATTGGGAAAAGCTGAGGTTGATAAGCTTTATAAAG
TTTTAGAGAATCTATTAGTTCCTCCGGATCCAGATGATGATTTAAATGTGATCATGGAGTTGCGTGCGGG
TACGGGTGGGGATGAAGCAGCTCTTTTCGTGGGAGACTGTGTTCGCATGTATCATTTGTATGCCTCTACT
AAGGGATGGAAGTACGAAGTGCTTTCTGCTTCTGAATCTGATATCGGGGGATATAAAGAATATGTCATGG
GGATATCTGGAGCAGCTGTAAAACGTTTGCTTCAGTATGAAGCTGGAACGCACCGCGTGCAAAGAGTTCC
TGAAACTGAAACGCAAGGTCGTGTGCATACTTCCGCAATTACTGTTGCTGTGTTGCCAGAACCCGCAGAA
GATGATGAAGAAGTCTTTATCGATGAGAAAGATTTAAAAATAGATACCTTTAGGGCTTCTGGAGCAGGAG
GTCAGCACGTCAATGTTACTGACTCTGCGGTTCGGATTACCCACTTGCCTACAGGCGTTGTTGTTACTTG
CCAAGATGAACGTAGCCAGCATAAAAATAAAGCTAAGGCTATGCGTATTTTAAAAGCGCGTATACGTGAT
GCAGAAATGCAGCGACGTCAGAAAGAAGCTTCTGCTATGCGCTCAGCTCAGGTGGGTAGTGGGGATCGTT
CGGAAAGAATTCGTACATACAATTTCTCACAAAATCGCGTGACTGATCATAGGATAGGGCTCACCCTTTA
TAATCTAGATAAGGTTATGGAAGGGGATTTAGACGCTATCACTTCAGCTTTAGTTAGCCATGCGTATCAC
CAGCTCTTGCAACATGGAAACGAAGAGAATTCTTAG
>ref|NC_003361.3|:c753619-753293 50S ribosomal protein L31 type B [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAAAGAACACTCATCCCGAATATAACAAAGTTTTATTCGTAGATTCTTCTACAGGATATAAATTTG
TTTGCGGATCTACATACCAAAGCGATAAGACGGAAGTTTATGAAGGACAAGAGTATCCTGTATGCTACGT
CAGCGTATCCTCTTCCTCACATCCTTTCTTCACTGGAAGTAAGAGATTAGTCGATGCCGAAGGTCGGGTA
GATAAGTTCTTAAAACGTTACAGCAATGCAAAGCCTGCGCAACCTGTTCAAGCTCCTGCAGAAGAAGGAC
CTGTGGTTAAAGGTAAGAAAAAAGCTCCTGCAAAGAAAAAGAAATAG
>ref|NC_003361.3|:753703-754452 hypothetical protein CCA00662 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAAAGCAAGAAAAAATACGTTTATCATCTCTGTTTCAAAGACTTTTTATTTTAGTACTTTTCCTTT
CTCCATTCCCCGCTTTTACTGAAGCCCCCCTTTCTCTAAAACAAAATATTTTTCGTGCTCGAACTGGTGA
CTATGCCGTTTTCAGCAAGGGAGTTCAAAAGTTTTTTTTATTTGTAAAATCTGTATCTTCCGACACAGTG
TGGATAGAGATGACAGAATTCCCACACCTATCTCAGCAAGATCGAGCTTTAGTACAAAATAAACCGTGGA
AGAGCTTAATTCATGAGCTACATTCCCCCAGAAGAGTTTTTTTAATTTCTCTATCAAAAAAAGATATTGA
TATCTTTTGTTTGAACCCAAAAACTCATCAACTGCGTCGTTTACAACCAGAAGATCTTCCTATCTTCTCC
ACGCTCTTACAACTCTCTTTAAATGAAGCTCCTAATCATTTAATAAAAAGACAGGGGAAAAACCAAGATC
CGTGGTCACCTAGAATTACTATAGAGGGAAATTGCTCTCTTAAAACACCTGCCCAAGCTTGGCATGCAAA
TTGGCCTAAAGATTCTTCCGTGCTATCAGGGAAAAATGTACTCATGTATTTCACAGCTTGTGAAATCTCT
GCGTTCCCCTTATGGACTAGCATAGAGACTCCAAAAGGAACTGTTGTTTTAAGAACTATTGATGTAGGTC
ATGACGCTTCATCTTCCTATTCCTACATTCTTCCTGACATTAACGAGTAA
>ref|NC_003361.3|:754762-756651 signal peptidase I, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGACATCGGTATTCCTTAAATAAAAGTCGTCAAATACTTCATACGACTTATAAATTACTTAAAAGCA
AAAAACTTTCTCAACATCCCGACTCTCAAAAAGAATTGCAAACATTACTAGAACAACTTGAAGAGGCTAT
CTTCCAACAAGATCAGGAAACAGCCAGCCAACTTGCGGAGCAAGCTCAACAGTTCAGTAAACGTTATCCT
GCTTCTTTTGCTAAGAAATCTTGGGAACTCACCAAAGCAATTCTATTCGCTGGTTTGGTCGCTTTCCTTA
TTCGGCAATTTTGGTTTGAACTTTATGAAGTTCCTACTGGGTCTATGCGTCCAACGATTTTAGAACAAGA
TCGCATGATTGTTTCTAAAACAACTTTTGGGCTGCATTTCCCTTTTAAGAAAAAACCTTGGGGATTTCGT
CCTGAATCCATTACTCGTGGCGGGCTTGTAGTCTTTACTGTTGGGGATCTCCCCATCCCAAATTCTGACA
CCAAGTACTTCGGATTCATCCCTGGGAAAAAACGTTATATTAAACGTTGTATGGGAAAACCTGGAGACAC
TCTTTATTTTTATGGAGGGAAAATTTATGGGATTGATAAAGACGGGGCCGTAATTCATTTTCCTCATACT
TTTGGTCTTGAGAATCTCTATCACGTCCCTTACATATCTTTTGATGGCTCTGTAGAAATCGTAAATAACG
ATAAAACTACCGTCCTCTTTAAACAAATGAATCAATCGTGTGGAAAAATTTCGCTACCCCAGGAAGGGCC
CTACGGCAAGTTCTTCTATAACGATTCTTGGCATAATGACGTCCCTAATGCGTTAAAAACTCCTCATACA
TCTCCAGTTAGCTATGCTGATCTTTTTGGCATGGGAAACTACGCTATGGTACGCATCCTTAACCATAAAC
AAGCGAGCTTATGCCATGCAATCTCAAGTCCAGCAGCTCACTATTTAGAGATTTGTCATACTCCCAATGT
TTCTTATCCTGCACCGCATCTTCAGCACTATAATAATCAGATCATTCCTACCATACAACCGATGAAAACG
CTTCTTCCCCTACGTCAGGAGCATATTCATCTTATTAGGAATAACCTCACTACATCACGGTTCATTATTT
CTGATGGTGTTGCTTATAAATACCAACCATTTGCGACTGGAGCAGAGAGTTCAGCAAAACTTTTTGCCCT
CCCGTTCCCAGGTTTAGATAACGGTTGCTATGAGTATTCTAAAGGGGAAGCATACAAAATAGGTTTCGGA
GGGACGCGTTATAAGCTCAAGTCAACACATCCATTAATGCAGCTAAACGATAGCCAGGTAATTGACCTAT
TTAATTGTGGCATCAATTTCAGCTCATTCTTTATTCCAAAAAATCCCAAATACAATCCTTTGCCAAGTCG
CTATGCATTTTATAATCAAGGAAATCTCTATGTTATGGATTCTCCTATTTTCATTAAAAATGACCCTGCT
TTGCAAAAGTTCGTAGAGTCAGAAAAAGCAAAACAAGAAGCCTCTTCAGAAGACCGGCCTTATGTAGGTT
TTATTGATCGAGGTCCTCCTCCCCAAAATCTAGAACAGTTCTCAGAATTCATTCATAATTTTGGAATACA
AATTCCTGAAGGTCATGTGTTAGTTTTAGGAGATAATTATCCTATGAGCGCAGATAGCCGTGAATTCGGT
TTTGTTCCCATAGAAAATCTTTTAGGATCCCCCTTGTGGATTTTCTGGCCTTTGGGACATTTTGGACATT
TAAAAAATGTTCCTGCCCCAACCACACTACCTGGGTATTTAGTCAATAGTCTAGCTTTAGGATTCTTTGT
TGTTATCTTCGGACATATGTATTACCAAAGACGCCGCCGTCTATTTCCGAAAAATGACAAAAAGAAATAA
>ref|NC_003361.3|:c759838-756707 isoleucyl-tRNA synthetase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATACAGAAGGCGAAAGTAGCAAGGAAAGTCTTGCTAACAGAGAAGAGAGGATATTAGATTTTTGGA
AAACACACGATATTTTTCAAAAATCGTTAAAAAATAGAGAAGGCAAGACTCTGTATTCTTTTTATGATGG
GCCACCGTTTGCTACAGGCTTGCCTCATTATGGTCATCTTCTTGCCGGGACAATTAAGGATGTTGTCGGA
CGTTTCGCCACTATGGATGGATATTATGTTCCTAGACGTTTTGGATGGGACTGTCACGGTGTTCCTGTAG
AATATGAAGTGGAAAAATCTTTAGATCTTACCACGCCAGGAGCTATTGAGGATTTTGGTGTTGCTAAGTT
TAATGAGGAATGTCGAAAGATTGTTTTTCGTTATGTCGATGAGTGGGAACGCTATGTGCATCGCCTGGGG
CGTTGGGTAGACTTTTCTGTAACATGGAAGACCATGGATGCTTCATTTATGGAAAGCGTTTGGTGGGTAT
TCCGTTCTCTTTATGATCAAGGTTTAGTTTATGAAGGTGTGAAAGTTGTTCCTTTTTCCACAAAATTAGG
CACACCTTTATCCAATTTTGAAGCAGGGCAGAATTATAAAGAAGTAGACGATCCTTCCGTAGTGATTAAG
TTTGCTTTGCACGGAGACCCTGCATCTTTATTAGTATGGACGACAACGCCATGGACATTGGTGTCCAACA
TGGCAGCTGCTGTAGGTCCAGAAATTACTTATGTACGTGTTGCAGATAAGGTTTCTGGAGAACAATGGAT
CTTAGGCCAGGGATGTCTATCTCGATGGTTTTCAGATCCAGATTCATATGAAATTTTAGAAAGTTTTTTA
GGGACAGCTTTAGTAGGGAAGAGCTATGAACCTCCCTTTAGCTTTTTTGAACATAAACGTGCAGAAGGAG
CTTACAAAATTCTTTCTGGCTCATTTGTAGAAGAGAGCGAAGGTACAGGGGTTGTCCACATGGCTCCTGC
ATTTGGTGAAGCGGACTTTTTTGTATGTAAAGAACATCACGTGCCTATAGTGTGTCCTGTGGATAATCAC
GGCTGCTTTACCGAAGAGATTCCTGAATATCAAGGCCAATACATTAAGAGTTGTGATAAAGGAATTATCA
AATCTTTAAAAAACCTAGGAAAGGTTTTTTATCACGGGACTGTAATGCACCGTTATCCTTTCTGTTGGAG
AACAGACACCCCATTAATTTACAAAACAGTGAACTCTTGGTTTGTTTCTGTTGAGAAGATCAAGGATAAA
ATGTTGCGAGCTAACCAGAAGATACACTGGGTGCCTGAGCATATTAAGGAAGGGCGTTTTGGTAAGTGGT
TAGATGGTGCTAGAGATTGGGCTATTAGTAGGAACCGTTATTGGGGAACCCCGATTCCTATTTGGAAAAG
TAAAGAGGGAGAAATCTTAGTTATAGGCTCTGTAAAAGAGCTTGAAGAGCTTACTGGAGAGAAGATCTCT
GATTTACATTGTCATTTTATTGATCAATTAAAAGTTGAAAAAGAAGGAAAGACTTTCCAACGAGTTCCCT
ATGTATTTGACTGTTGGTTTGATTCAGGCGCTATGCCTTATGCGCAAAATCATTATCCTTTTGAAAATCA
GAAGGAGACGGAAGCTGGGTTTCCTGCGGACTTTATTGCTGAAGGTCTAGATCAGACAAGAGGATGGTTT
TATACCCTCACGGTGATTTCTTCAGCCCTATTTGATCAGACAGCATTTAAAAATGCGATAGTGAACGGTA
TTGTTTTAGCTGAAGATGGCAATAAGATGTCCAAAAGGCTAAATAACTATCCTAGTCCTATGGGAATCAT
GAATACCTATGGAGCTGATGCCCTACGATTATATTTGTTGGATAGTGTTGTTGTTAAAGCTGAGGATTTG
CGGTTTTCTGATAAGGGCGTTGAATCTATTCTTAAACAAATTCTTTTACCTTTAACAAACGTATTATCAT
TTTTCAAAACCTATACGGATCTATACGGTTTTGATGCGGATAATTATGATAAAGAAGAGATAACCTATAG
TGAGATCGATAGGTGGATCCTCTCTAATCTTTATACTGTTGTTGGTAAAGTTCGTGAGAGCATGAGCTCT
TACAATTTAAATACTGCTGTAAATCCTTTTGTCACCTTTATTGATGATTTAACAAATTGGTATATCCGTC
GTTGTCGTAGACGTTTTTGGGAATCTGAAGATACTCCAGATAGAAGAGCAGCTTTTGCTACACTATATGA
AGTGCTTACTGTTTTTTGTAGAGTTATTGCTCCTTTTATCCCATTTATCTCTGAAGATATTTACCAACAG
ATTAAAACTGAACATTCTGCAGAGTCTGTGCATCTCTGTGATTTCCCTCATATAGATCTTGCTAAAGTGT
TCCCGGATTTAGAACAACGCATGAGCGATGCTCGTGAGATTGTAGGTTTAGGCCATTCTCTACGTAAGGA
ACATAAGTTAAAAGTACGTCAACCTTTAGCGAATTTCTATATTGTAGGTCCTAAAGATCGTTTGGATGAA
TTAACTTCGTTTGAGCAACTCATTGCAGAAGAACTCAATGTAAAAAATATTGTATTTTATAAAGAGACTC
CAAGCTTCGTAAAAACAACTGTGAAGCCTAATTTCCGCTCATTAGGTAGAAAGGTTGGTGAGAAAATAAA
GGATGTGCAAAGAGCTTTAAGCAATCTTTCTCAAGATCAGATACAGCAGTTGCTAAAACAACAATATCTC
CTTCTCAACTTAGGTTTTGAAGAGATCACTTTGGGTATAGATGATGTGGTAATTTCTTGGGAAACAGATC
CTGGATATGTTGCTCGAAGTTCTTCATTATTTACGGTAGTTCTTGATTGTCAGTTAACTGAAGATCTTAT
TGTTGAGGCAATCTCTCGAGAATTAGTGAATAAAATTAATACAATGCGTCGCAACCATAAATTGCATGTT
TCTGATCGCATTCTTTTGCAGATACACTCATCAGAAGATGTTGAGAAGGCGTTTTTACATTACGAAGATT
ATATCTGCGAAGAGACATTAACTGTTCAATTTGAGTTTAAAGATAGTGTTGAGGGTGAGGAGTGGGATAT
CAATGGTCATCCCACAGTTATTGCTCTTACAGTAGCTTCTAAAGCAAACTAA
>ref|NC_003361.3|:760599-761096 hypothetical protein CCA00665 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAATCACAAAAGATGCGGTTTTAATCATCAATCACCAACACTCTCCAACCGGTGGATTAGATCATT
ATTTTGAAAAAAATAAGCAACATGTTGTTCAGAATCCATTGCATCGTTCGTGTTTGGAATCTTTGGTGAG
CTATTTACCAATTTTCAGTACTTTTACAGGATTACGGGCGTTATTAGGGATTTCCCGTGTTGAGGCAGCT
GTGCTTCTTCCAACAGGAGGCTATAGCGAAGTATGCACAATTTCCCCTTGCTGGGACATCAACGAAGCTT
TACCTACGATTCGCAAGAATGCTTGGTTAGAAATCTTCGGAATAAAAGGTCTTTTAACCATTTGCAAAGT
AGTTTTCAAAGTTCTTCGAGTAGCGGTTAATTACTTTAAAAAAGTCTGCGGTTATGTAGAACCCACATTT
GTTGATATTAACCCTAAGCAACAACTTATGCTCCCTTTAAAGTCTGCTGAGGAAGAAATCAAAGATTTCC
TAGGCTAA
>ref|NC_003361.3|:c762392-761100 phoH family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAGAAAACAATGGTCATTGATACGAGTGTGTTTATTTATGATCCTGAGGCTCTATCATCTTTTGAGG
ATAAACGAATTATTATTCCTTTTACTGTAATTGAGGAGTTGGAAGCATTTGCTAAAGATCGCGATGAGTC
AGCGAAAAATGCTTCTCGAGCTTTGAGTAATATCCGTTTATTACTTGAACGCTCTACGAATCCTTCTGAG
GGAATATTTCTTCCGAATGGGAGTGAGTTGCGTATAGAAGTATCTTCAATTGCTAATTTAACTAATGATG
AAAAACGTCGAAAACTTCTTACATTAGAGCTGCTTCAAGTAATAGCACAACGCGAGCCGATGATTTTTGT
GACCAAGAGTTTAGGGCGTAGGGTGCGTGCTGAGGCTTTAGGAATAGAAGCTAGAGATTATGAAAATAAA
CGATTCTCTTTTAGATCGCTATACCGGGGTTATCGTGAATTAAGTGTGTCGGCATCTGATGTGGAGAGCT
TTTATACCAACGGATATTTAGATATCCCTTTGGATATAGCTCCATCGCCTAATGAATATTTTTTTATTTC
AGGAGGAGAGAACTATTTTGCTCTTGGTCGTTATCATGAACGAGAGAGAAGAATTGTTTCTTTAAAACCT
CTTCCAGATAAAATTTGGGGAATAAAACCTTTAAATACCGAACAAAAGTGTGCGTTAGATCTACTTTTGT
TAGACGATATAAAATTAGTTACTCTTATGGGACAGGCTGGGTCTGGGAAAACGATTTTAGCATTAGCTGC
AGCTATGCATCAGGTGTTTGATAAAGGGAATTACAATAAGTTGCTGGTAAGTCGTCCTATCATTCCTATG
GGGAAAGATATTGGATTCCTCCCAGGAGTTAAGGAGGAAAAGCTTTTACATTGGATGCAACCTATTTATG
ATAATATGGAATTCCTTTTTAACATTAGTGGTATGGGGGATTTTTCAGAGGTCCTACAATCTTTAATGGA
TGCTAAGAAATTAGAGATGGAGGCTTTGACCTATATTCGTGGACGCTCTTTGCCAAAAGTCTTTATGATT
ATTGATGAAGCGCAAAATCTCACACCTCATGAGATTAAAACGATTATTTCTCGTGCGGGAAAAGGAACGA
AAATCGTCCTGACAGGGGATCCTACACAGATCGATAGTCCCTATTTCGATGAGAATTCTAATGGCCTTAC
TTACTTAGTGGGTAAGTTTCATCATGTATCTCTTTATGGTCATATGTTCATGACGCGTACAGAACGCTCT
GAACTTGCTGCTGCCGCTGCAACTATTTTATAG
>ref|NC_003361.3|:762619-763440 hypothetical protein CCA00667 [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGCTAATTCAATTGTCAAAAAAACAGAGCTGCTCTACAATGACGTTAAGCAATGACAGTAGAGTTTACC
CACTGGAGGTCGCCATGAAAGTGAAAATTAATGACCAATTGATTTGCATCCCTCCCTATATTTCTGCACG
ATGGAATCAAATAGCCTTTATCGAATCTCAAGAAGGAGAAGTTAAGGGTCAGGCCACTCTCAAACTACAT
TTAATTGACGGCAAGCTCATTTCCATCCCTAATCTTGATCAATCCATTATTGATATTGCTTTTCAAGAAC
ACCTTCTCCATCTAGAAGCTTCTCAAATGATTCGAGATGAATCTGGTCGTGAAGATGATAAACTAGGCAT
GTTGATCAATGTACTTCAGCAATTATCTAAAGATACTGACGTGCAAATATTTTCACATAAAGGTCTGATG
TCTCCGCTATTTTCTGGAGCCAGCCCTATGGAAATGATCCTACAGCATACTCCAGAACATAAAGACCATC
CTGATGCGCCGGCGGATATCTTAGAAAAAATGGTGATGGTGATTCGCACTTTAGCAGGAAACAATCCCAA
TGTTCTCCCTAAAGCTGAGCCTCATTGCAACTGTATGCATTGTCAAATTGGCAGAGTAATTAGTGAAGAA
GAGGACGCTACTGTTTCTGAACAAGATTTATCTTTCCGCACATGGGACATTAGTCCAAGCGGGAACAAAT
TGTATCTTGTTACTGATCCACTAAACCCAAATGAGCAGTTTAGCGTATATTTAGGAACGCCTATCGGATG
TACATGTGGACAGTTAAATTGCGAACATGTAAAAGCAGTTCTCTATACCTAA
>ref|NC_003361.3|:763587-764816 hypothetical protein CCA00668 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCGAACGCTATCGATTTCTATGCTTTTATTTACCATCGGGTCTGGAATAAGTTCAGCAAGTTTACTTG
CCGCTCCTTCCACATCAACGACATCTGTTGCGCAAATGGACAAGTCTTCCTTTGCTCCATTTACGGGAGA
GATTAAAGGGAATCGTGTGCGTTTACGTCTAGCTCCTCATGTAGATAGCTCCATTATCAAAGAACTGTCT
AAAGGCGATTACATTGCTGTTATAGGAGAAAGCAAGGATTACTATATCGTTGCTGCTCCTGAGGGACTCA
AAGGTTATGTATTCCGCACCTTTGTCTTGGACAACGTTATTGAAGGCGAGCAAGTGAACGTACGTCTAGA
GCCCTCTACATCAGCTCCCGTGCTTGCACGTTTGTCCCGAGGCACACAAATTGAAGCAACACCGATTCAG
CAACAAGGAAAATGGTTGGAGATTGTTCTACCTAGCCAATGTGCTTTCTATGTTGCAAAAAACTTTGTTT
CTCAAAAGGGATCTATAGATCTTTATAAACAGAGAGAAGGTCAGAAAAAAATTGCTTTAGATTTACTCGA
TTCTGCTGTGCAGTTTGCTCAAGATGAGCTGAAAAAAGGTTTGGATTTAGTCGATTTAGAAGCAATTTAT
AAGAAGATTAATCTTGTACAATCTGAAGAATTCAATGATGTTCCTGGCTTGCAGCCATTAATACAAAAAG
CTTTGGAAGAGATCCAGGATACCTACCTAGCAAAATCCTTAGCAAATCAAGATAAGGCTATTGGGAAGCA
ACAGGCATCTAGTTCGTCTGATACTCTCTCTACCCCAGAAAGACCTGCTACTACCGGATCCTTATTATCT
CGACATATTCGCAAACAAACGGTAATAAAAACTTCTCCAAAAACTCAAGGCAGAGAAAGTCTTGAGTATT
CTTTGTTTAAGATTTGGGCAAGCATGCAGCCTCAGGAACATGCTAAAAAGCTGACTCAAGATGCCTTCTA
TGAAGAAGAGAAGAAGAAAAAGAAGACTTTCGTTGGAGAGCTCGAGCTTTATCCCCATGTCGTAAAGAAT
AATCCTGGCGACTATTTGCTGAAAGATAAGGAAAATACTCTAGCCTTTGTCTACGCGACAAAAATAGACT
TAGAAAAGTGGGTAGGAAAGAGAGTATCTGTAGAGTGTTTACCTCGTCCAAATAACCATTTTGCTTTTCC
AGCTTATTATATTATCGACATCAAAGAAGTTGTTTCGTAA
>ref|NC_003361.3|:c766191-765130 cytochrome d oxidase, subunit II [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGATTTTTCGTTAGCTTCACTGTTGCCGATAGCTTGGTATGCTATACTAGTAGTTGCAGTCTTTGCTT
ATTCGTTAGGGGATGGTTTTGATTTAGGTTTAAGTACGATCTATTTCATATCTCGCGTTGATGAAGAACG
CCGTACGCTACTGAATTCCATAGGGCCTGTTTGGGATGGTAATGAAGTATGGCTCATTATTATTTTTGGT
GGACTTATGGCAGGGTTTCCGCCGGCCTACGGTGCATTATTATCTATTTTCTACATGCCAATATGGACAT
TAGTTTTACTTTATATCTTTCGAGGATGCTCTTTAGAATTTCGTAGTAAGGCAGAATCTGCGAAATGGAA
AGCTTTCTGGGATGTTGTTTTCTGTGTATCGGGGATCGCTATTAGCTTCTTTCTCGGAGTTTTAGTGGGG
AATATGATCCTAGGATTACCTATATCTCCTACGACTCCGTATTCTTCCTTATCTTGGATATTGTTTTTCC
GTCCTTACGCTCTATTGTGTGGTGCTCTTGTCGTTAGTGCTTTTGCAATCCATGGAGCAACTTTCGTGTT
AATGAAGACCGCAGGGGAGTTACAACAACGGATTATTAAGCGTTTCTCTTATATTATATCAGCATTTTTG
GTCGTTTATTTTCTTCTAATTGGCGCTACGCTAGCTATGATACCGCAAATAAATGGATATTCTTTCCAAG
TGGGAAGTTTTGCCGGAGTCCCTACATACCCTGTATTGATATTGTTATTTTCTATGACTTTGGGGAGTTG
CTTAGCAGCTAGAAGTTGCGTATTTAAAAAGCGTTATGGTTCTGCTTTTCTCTATTCTTCGTTGCATTTA
CTTCTGTTGATATTATCAACAGTGACTTTGATTTTCCCAAATATCTTATTTTCTACAGTAAGCCCTGAGA
ATAGCTACACTATTTACAATACGGCGGCCAGCACGAAAACATTGCAAAGTCTTTTGGTAATCGTACTGGT
AGGTTTACCGTTGATTATAGCTTATGGTGTCTACGTCTATCGTGTTTTCAGAGGGAAAACAGATTTCCCT
TCGGTGTATTAA
>ref|NC_003361.3|:c767534-766194 cytochrome d oxidase, subunit I [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGACACGGAGATTTTATCTAGAATACAGTTCGGTTTATTTATTGCATTTCACTACTTGTTTGTTCCTT
TGAGTATGGGCCTCAGTATGATGCTTGTTTTAATGGAGGGCTTGTATCTAGTTACGAAGAAGAATATTTA
TAAACAGATGACCTGGTTTTGGATTGGTGTCTTTGCTTTAACATTTGTTGTTGGAGTAGTCACTGGCATC
ATGCAGATTTTTTCTTTCGGATCAAATTGGTCGAGATTTTCTGAGTACAATGGCAATGTTTTTGGAACCC
TTTTAGGGAGCGAAGGTATCTTCGCCTTTTTCTTGGAATCGGGATTTTTAGGCGTTTTGTTATTTGGACG
TCATAAAGTTTCTAAAAAAATGCATTTTTTCTCTACTTGTATGGTGGCTTTAGGAGCTCATATGAGTGCT
TTCTGGATCGTATGTGCCAATTCTTGGATGCAAACGCCTTCGGGTTATGAAATGGCCATGCATAATGGAC
AGCTTGTCCCTATGCTGACTTCATTTTGGCAAGTAGTTTTCTCTCCTTCAAGTATAGAGCGTTTTATTCA
CGTTGTATTGGGAACTTGGTTATCAGGTGTTTTCCTTGTGATTAGTGTGAGCGCGTATTATTTGCGTAAA
CAACGCCATGTAGAATTTGCTCGTCAGGGGTTAAAATTAGGCGCGATTACTGGGATTGTCTTACTTATTT
TACAATTATGGTCCGCAGATGTTAGCGCTCGTGGTGTTGCTAAAAATCAACCTACGAAATTAGCAGCTTT
TGAAGGGTTATTTAAAACAGAAGAATATAGTCCCATTTATTTATTCGGTTATGTTGATGTAAAGAATCAG
AGAGTTATAGGCCTGCCTATTCCTGGAGCTCTTTCGTTCTTAGTGCATAGGAATACTAAAACTCCAGTTG
CTGGTTTAGATCAAACACCACAAGATGAATGGCCTAATGTGCAGATGGTTTTCCAATTCTACCATTTAAT
GGTTATGCTTTGGGGATTGATGGTTCTTTTGGCAGTCATTACCTGGTGTGTTTATAAGAAAAGGCGTTGG
GCATTAAAATCTTTCGTTTTATCTGTACTCTCATTATCCGTTCTCTGTCCTACGGTATGTAATGAAGTGG
GTTGGTTTGCTACAGAAATGGGAAGACAACCGTGGATAGTTTACGGTTTATTAAAAACTAGCGATGCTGT
TTCTCCTATAATACGGGGAGGCCAGGTTGTTCAGACTCTTATTTTATTTAGTATAGTGTTTGTTTGTCTC
TTATCTTTATTCCTCTTTCTTCTATGGAAGAAAATACAACGAGGACCCGATCAAAACGATCTTAATGAGG
TGGAAGTATAG
>ref|NC_003361.3|:767734-768528 hypothetical protein CCA00671 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCCCATAGATATTACTTACTATACGACACCCTTGTTAGAAATTATTCTGATTTGGGTAGTATTAAATT
ATCTTCTGAAGTTCTTTTGGGGAACTCGAGCCATGGACGTTGTCTTTGGTTTGCTTGCCTTTCTTTTTCT
ATTTGTCTTAGCAGATAAGTTACATTTTCCTATTATCCGACGATTGATGTTACATGTTGTCAATGTCGCT
GCCATCGTCGTTTTTATTATTTTCCAACCAGAAATACGCTTAGCCTTATCACGTGTACGGTTTCATGGGA
GGAAGTTTGTTATTGATCTACAAGATCAATTTATTGAACACCTCACCTCATGCATCTATCAGATGTCCGA
TAGGCAAGTTGGTGCTCTTGTCGTTCTTGAAAATAAAGATTCTTTCGATGAGTTTTTAAGTTTTTCTTCA
GTAAAAATTAATGCGGACTTCTCAGAAGAACTCTTGGAGACGATTTTTGAACCCTCATCTCCCCTCCATG
ATGGAGCAGTAATTCTCAGAGCAGAAACTATAGCCTATGCGCGTGTTGTTCTTCCTCTAGCACACGATAC
AACACAGTTATCACGTTCTATGGGAACGCGTCACCGAGCGGCTCTAGGAGCAAGTCAACGTACCGATGCG
TTGATTATTACTGTATCTGAAGAAAATGGCTACGTATCGTTATCTCGTGATGGGATTTTGACACGTGGAG
TGAAAATGGACAGATTCAAAGCTGTATTGAGAAGTATTCTTGCTCTTAAAGAACAAAAACGTAAACCCTT
TAGCTCGTGGATTTGGAAAAAATGA
>ref|NC_003361.3|:768510-769793 hypothetical protein CCA00672 [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGGATTTGGAAAAAATGATCGATTTTCTTTCTCGTTTTTTCATGCGCAACTGGCTGAGAAAAGTGGTGT
CTTTAGGGTTTGCTATCATCATTTGGATTCTCGTCGGACAAACAGTAACCATTACCCGCACATTGAATAA
CATCCCTGTGCGTATTGTTGATCTTGATCCTGATCAAACGGTGTTGGGATTGCAAAGCAATGGTCTATTG
GACAAGAAGGTTTCATTAACCATCGTAGGAAATAAAAGTACTGTTCATGATCTTCGTCCTACAAACTTGG
AAGTAGTGATTAGCGCTACGGGACATACGGAAAGCTGGATAGCTGCCATTGATAAGTATAATCTTGTTAG
CCTTGATGGTGAGATGAATATCCGTAGAGATATTCAAAGTGTCTCTGCTGATGATATTTTTATTTGCCTG
ACACAATATGTTACTGAAGACGTTACGGTGACGATTACAACTCCTGTAGGAAGTCCACCTAAGGGTTATG
AATATTTAGACGTTTGGCCAAAATATCTTATCCAAAAAGTCAGCGGTCCTAAAGAATATGTAAATGCTCT
TAAGGAACAGGGATTAGAGCTCACCTTTAATCTCAATAAGGTATCTTTTGAAGAATTGGAGAGAAATCGG
ATAGCCCAAGGGAATCACGATGAGATTATCTTTCCTATTCCTGAAGAATGGAAAAAAATTCTTATTCCTT
TTGGCAATACCAATACCTATGAAAATCTTAATGATCCTCAAGCAGATTTCTTACGCTTACTCTTTTTAAA
ACAAGAACTCATTCCTCTAAATCTTAACCTCCCTGTTTTACTTTTCTTCCCTGTAAAATACAGCAACACC
TTCAATCCTCTAGCTTATACTTTAGAAGCTTCTCACCCTATTATTCTTAACCAAGGCATCTATCAAATCA
ATATTCCCCTCTATGCAAAAGATGTCAGTAAGCTTTTCTTAGATGTTGTGAAGAATAACATTGCCTTAGC
TGTGGTTATGGCGCCACCACATGGGAATAACTCTGTAAACTGGGCTGTAGAATTTATAGACGAAAAGACT
CTTGAAGACACCTTTGTTCAAGCTATCATGGCTCAAGAACATGGGATTCTCCATGATTTCGCTTTGATTG
ACGAAACAGGGATTCGCCATCGCTTCCGTGAATATTTAAGAAAGCTTTCTTTATTCGGGAAAGATGGATC
TCCACTGCACCTTTCTGCGGAGATTTCCCATAACAAAGTGATTATCCATTCAAAATCTAGGGAAACCTCA
AAGCTAATTCAAAAAGAGTGGTAA
>ref|NC_003361.3|:769998-771344 lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTAAAGAGCATACGTCGCGCGAAACAAACTATCCTTGATTCGTTCGTTTACTATTTAGGAATATCGT
TCATCAGTATTTTTAAACATATTCCCCGCTCTCTTCTATGTTGTTTTGGAAGAGTTTTAGGCACTATCGT
TTTCTATACCATCTCTGACTACAGGAAAACAGCACTTACAAATTTAGCCCTTGCTTTTCCCTATAAGTCT
TTTAAAGAGAGAAAGCACATTGCTAAACACTCTATACAACATGTGATGATTACTGTTTTAGAGTTATTAG
CTGTGGAGGGATTAATAGGGAATATAGATAGTTTAATTTCAATAGCAACTGAGGAAACCCATCCGGAAGG
ATTCTGCGGTGGCGACGTCCTGACACAAAAAGAATTGGCAGATACATTTTCCAAGCTGAATGAAAACGAA
GGGATTATTTTATTTTGTGGTCATCAAGCAAATTGGGAACTTCCTTTTCTTTTTATCACTCGAGATTATC
CTGGTTTAGCATTTGCAAAACCGATAAAAAATGCCCGATTAAACAAAAAAATTTTTTCTCTACGGGAAAC
CTTTAAAGGGAAAATTATTAGCCCAAAACAAGGCATACATTCTGCCCTTCAAGCTCTACAACAAGGACAC
ATTATTGGTATAGTTGGTGATCAAGCATTACTCATATCCTCTTATGCATATCCCTTATTTGGGCATGAAG
CTTTCACAACAACATCTCCAGCACTACTCGCCTATAAAACAGGAAAACCGGTAATAGCCATAGCAGTGTT
TCGTCATGAAAACGGGTATAGAATTGTTCCTAGTAAGAAGTTTTATGCTGATAAATCTTTACCCATCAAA
GAAGCCACCTCTTCACTGATGGACAATCTCATGGGATTCTTAGAAAAAGGTATAGCGCATAAGCCTGAAC
AGTGGATGTGGATGCATAAACGATGGAAACGAAAGCTCTTCAGCCATCTGAAAAAGAGACATGCCTATAG
CCATATTCTCGTTATTGCCAATTACGCTACTCTGGGAAATTTTCAGGGATTCCTTACGGATCTTGCCGAT
CTGTATTCAGGGGCTTCACTAACATTAGCTTTAGAAATCCCAACGAATGAGAAGATCCCTACCGACGATT
TCCCTCAATACACTATAAAAGAATTCTCATCTCTTGAAGCTCTACACACCCTTCCTAATAGCTTCCCCGC
TGTTTTTGATCTTGTAGGGCTCCCCAAAAACCTACACAAACATTTTAAAACAACAGGTTCCAAGACTCTT
TATACACAAAAAACACTAGAAAGAAAGCTTCTCCATCCACAAGCATCTTTAATTACCGCATTAAAGAATT
TCTCAAAAAAATCTTAA
>ref|NC_003361.3|:771398-771727 hypothetical protein CCA00674 [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGTTATTTTTAAATCAGAAGAATTTTATGTGCTTAACAGGATGTTTAGGGTCTACATTTGAATGTACTC
TTAACTGTATTTGCTTTTGTAAAGACTCTCAGAAAAACAAACGTGCTCTTGCGTTGATTTCAGCATTAGC
ATTAGCAGTATTAGCAATAGCTGCCGTTGTTGTTTTCTCATTAATCTGCGCTGGAACTATCCATGTTCCC
GATACCCTATGGGGAATCAGTAAGTACATTCTAACACCGATACTCCTGGTCATAGCGCTTATCACAGCTT
CACTATCTGCAGGATGTTTTAAAGCTAGAAATCGCTTTATACCTATTTAA
>ref|NC_003361.3|:c773189-771744 pyruvate kinase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATCGCAAGAACGAAAATCATTTGTACTATAGGTCCAGCAACAAACACTCCAGAAATGCTTGAGAAGC
TTTTAGATGCGGGTATGAATGTTGCTAGGTTGAATTTTAGTCATGGTACTCATGAAAGTCATGGTGAGAC
AATTCGTCTTCTTAAGGAATTGCGAGAAAAGAAAGGGGCTCCTTTAGCGATTATGTTGGATACCAAGGGT
CCAGAAATTCGTTTAGGGAATATTCCCACACCAATTCAGGTATCTCGAGGTCAGAAAATTACCTTAGTAG
GAAAAGAGGTAGAGGGATCTGCCGAAGGTGGCGTTACCTTACATCCTCAATGTGTTTTCCCTTATGTGCG
TGAGGGTGTTGATGTCTTGATAGACGATGGTTATATTCAAGCTGTTGTGACCTCTGTTGGTGAGGATCAT
CTAGAATTAGAGTTTATTAACTCTGGAGAATTAAAGTCGCACAAGTCTTTAAGCATAAGAGAAATTGATT
TAGCTCTTCCTTTTATGACGGATAAGGATATCAATGATCTTCAGTTTGGCGTTGCGCAGGGCGTTGATGT
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GAATCTATGATTCGCAATGTTTTACCGACACGAGCAGAAGTTTCTGATGTTGCTAATGCTATTTATGATG
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TTTTCCAATTATTGCTGTTACACCAAATCTATCTGTGTATTACAGGCTTGCTTTAGAGTGGGGAGTCTAT
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GAATTTTATCAAATTATGATAAGATTTTAGTTTTGAGTCGTGGCGCTCAAATGAAAGATACTAATAATCT
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ATCATGCGCACTCTACTGTTGGAAGTGCCGCAGAACTCTCCCAACATCTTGCTTTATTATTCTCGCTAGA
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CCTGTACGCCTTTTTGATCCTACATTAGGAAAGAAACCCCTATCTCACAAAGTTTGGAGAGGGATTCTTA
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GTCCTGTCCTACATGTCAAGGAACCGGAATTGGAGAATACGCTTGTGCAGCTACATGGCAAGGAAAAACT
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CCTCACCCCAGAAAGAACACTCGCAACATTATCAGGAGGAGAACAAGAACGCACAGCTTTGGCTAAACAT
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CAGAATGTCAAGGTATAGGGTCTATAACTCTTGATAACCATACCCCCATTCCCTGTCCTCTCTGTCATGG
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CCTTAGGTCTTGATCATCTCCCTTTAGGAAGACCTTTATCCAGCCTATCAGGAGGAGAAATCCAAAGATT
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GGATTGCATACTCACGATATCCATGCTCTTATCCATGTTCTTCAATCTCTTACTCAACAAGGACATACTG
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AGGAAATCTCGGAGGATATCTCTTAGCCTCATGCACTCCTGAAGAACTAATTTCCCTCAATACACCTACA
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GGCATCTTCTCAAAGATATTTCTATTCAAAATGCCTATCATCACAACCTTAAACATATTGATATTACTCT
TCCTCGCAATGCTCTAACAGCAATTTCAGGACCTTCGGCATCAGGGAAACATTCTTTAGTCTTTGATATT
CTTTATGCTGCAGGAAATATTGCTTATGCTGAGCTATTTCCCTATTACGTGCGCCAAGCTCTTATTAAGC
AAACCCCTCTGCCACAAGTAGAAAGTGTCCGAGGATTATCTCCAGTCGTTGCAATAAAAAAAACAGGAAT
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CTGCTAGGAAAACCTCATTGCCCCTTAACAGGAAAACCTCTAAAAAAAATCACTCCGCAGACAATTATCG
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GTCTATTGCTCTAGAAATGAAGAAAAAAGAGGGATATTTAAAGCTATTTGCTAATAATGAGATTTATGAT
CTTGGAGAACATCTTCCTGAAATTCTAGAAGATCCTGCCATCATTATCCAACATACAAAAATCTCCAAAA
GTCATGAATCTTCTTTGCTATCCTCATTAACGTTAGCTTTTTCCTTATCACGAACAATACGCTTACATAT
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CTTTAAGCTATTTTTCCCCGATATTTCTCCAAAACGTGTGGTTGATCTTATTAGAGAACTGAAGATTTCC
TCATCTACGCAAATTCAAGATCTCGATCCCCCTACTCAAGAAAAATTATTTCAAGGAACTCAAAAACATG
CAGGACTAGAAAGAATTCTCATGGAACAATGCAATCTTGTTCCCTTCTGTCCTCTTCTCCATCCTCTAAT
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GAAACATCTCTCATAGATATCTACCAAGAAGATACCGAATTCCTCAAAAATCTGTTAATGACCCTCCATG
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CTACATCACTCTAGGGCAACAACAAGACACTTTAAGTGATGGCGAGCACTACCGCCTCCACCTAGCAAAG
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ATATTCCAACATTAACCAAATTACTTAAAGAACTCGTTACCAACAATAACACTGTTATTGCTACAGACCG
GAATCATCTATTAGAACTCTGTGCGGATCACACGATAAATTTAGGACCAGGATCAGGACCTCAAGGAGGA
TATCTCACCAATCCACTCCCATCATCTATAGAGGATGATGATCATAAAAAAGTTTTCTCTAAAGACACTT
TAGAGGTTCGTCTCTCGATTCATAATATCTCTAATCTTCATGTACAAGCTCCTTTGTATAGTCTCGTTGC
CATCGCTGGAGTGTCGGGATCTGGGAAAACCTCATTACTCACCGAAGGGTTTTATAAGCAGGCTCAAAAG
CTTATCGATACTGGAAATGCGCATTTCTCAAATGTAGTGTTCCTAGATTCTCATCCGCTATCTTCTTCAC
AACGATCTGACATCAGCACATATTTTGATATTGCTCCATATTTGAGGAACTTCTACGCATCGCTCACACA
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TTAGGCTTAGGATACCACCTAATAGATAGAGCTTTTTATGCTTTAGAAAAGCGCACGTGCCCGACATGTT
CAGGATACCGTATTCAACCCCTATCTCAGGAGGTTGTCTATGAAGGGAAACACTTCGGGAAACTCTTGAA
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ATAGACTCAGGGCTTGGCTATCTTCCTTTAGGCCAAAATCTCTCTTCCCTATCTCTAAGTGAAAAAATCT
CTGTAAAAATTGCTCGATTCCTTCACTTGGCTCCTCAAGAGCCCTCGCTATTTCTTCTAGATGAAATAGC
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TATATTTCATAAGATTTGTTCCACTGTAGAATATGTACATTCTCGGGGAATTCTTCATCGAGATCTTAAG
CCTGATAATATTTTGCTCGGACTTTTTAGTGAGGTCGTTATCTTAGATTGGGGAGCAGCATTATCTAAAG
AAATGGAGGAAGATTTTCTTTCGGATATTGATGTCCGTATCCCGGGATCATTGTTTTCTAACATGACGAT
TCCTGGTAAGATCGTAGGCACTCCAGATTATATGGCTCCCGAACGTTTACGAGGGACTCCAGCTTCAGAA
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AAAAGGGTCAGAAAATCAGTCTTCGTCATCAAATTAGTTTCCCTGAAGAAATTGCTCCTCATAGAGAAAT
TCCTCCGTTTCTCTCTCAAGTGGTCATGAGGGCTTTAGCGGCAGACCCCAGGGAACGTTATCGTTCTGTA
AGTGCTTTGAAAGCAGATATAGAACAACATTTACAGGGAAGTCCCGAATGGACTCCTAAGATTGTTTTAC
ATACTCAAGATAGAGAATGTTGGAAGTTCCATGAACCTATTTTATTATCTAAGTATTTCCCAATGCTGGA
AGTGTCACCAGCTTTATGGTACAGCCTAGCCATTTCTAAGATAGAAAGTTTTTCAGAAGTGCGTTTGGAA
TATACGCTATTGCGTAAGGGACTAGAAGAAGGCTTTGGAATTTTGCTTCCTCCTTCCGAAGGCGTAGATC
ATGGGGATTTTTACCATGGTTATGGTTTTTGGCTGCACATTAAGGAAAATATCCTATCGGTATCTTTAGT
AAAAAATGGCTTAGAGATACAAAAGACTTCCCGGCACATCGATGGAAATAAGGAGAAGTTTTTCATAGCT
TTTGAAAAGCAAAATCACCGTTTATCTTTGATTATCGATAATATTGTCTGGACGATTCATATGGATTATC
TCCCTGCTCGGGGAGGACGTATTGGGGTGATCATTCAGGATGTTGCTGATGTTTGCGGAAACATTGTTGT
TTTAGAAAGTAGTGGATCTTTACAAGTCAGTTGTTTAGCGGTTCCCGATGCCTTTCTTAATGAAAAGTTA
TACGAGCGTGCCATTACGTTTTATCGTAGGATTGTTGAGTCTTTTCCTGGACGTAAGGAGGGATATGAAG
CACAATTTCGTATAGGCATTGCTTTATTAGAAAAAGCTTCTGAGAATAGTGACTCTGAAGGATTTATCCA
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AACGTCCTGAAATCTCTCGTGTTCGTGATCATGTTGTTTATCGTTTGCATGAAGCTTTATATAGCAATCA
CCGCATTTCTTTAGTCTTTATGCTTCTTGCTCTTCATGTTGCTCCCGAATCTATAAATGCTTCTGAAGAA
GAGCATTTCCTTCAGAATTTACATGGAAAAATTCAAGATACTTTATTTTGCAATCTAGATATTTCCCCTG
TGGATTTTCGTTCTTCTAAAATGGAATTGCTGTTGAGCTATTGGTCAGGATTTACACCGTTTCTTCTCGG
GTTGTTTCAAAGATCTTGGGATTTAAAGGATTATCGTGCTCTTGCGGATATTTTTTACACTGCTGCAGAT
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GATTTATTTGCTAAAGACGCTTTGATTCACGGTAGAGGTGAAGAGATTCTGAAGGCCATTGCTCTAGTAG
AAAAGTATATTTCTCCTCAGCAGCGTTATAGGTATCTTTTGCCCTATGAGGTGCTCTCTTATTTATGGAT
GAAAGATGCGAATAAAGTTTACGATCTTTTGTCTAGTTATGACGAATCTTCGTGGATAGACGATAGCAGT
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AAGCGGATGTCTGGATTTGAGGTGTGCTGGGTCCCTGGTACAGATCACGCAGGTATTGCTACACAAACCG
TAGTAGAAAGACATTTATATGCTTCCTTGGGTAAACGCCGTATAGATTTTTCTCGAGAAGAATTCATCAA
GCATGTTTGGGAATGGAAAGAGAAGAGTGAAGGAGTCATTCTTTCTCAATTGCGTCAGCTAGGATGCTCT
TGCGATTGGTCTCGCTTACGTTTCACTATGGAACCGTTAGCGAACCGTGCTGTAAAAAAAGCTTTCAAGG
CTCTTTTTGATAAAGGACATATTTACAGGGGATACTATCTTGTTAACTGGGATCCTGTTTTACAAACAGC
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GATAGCTCTGAAGAAATCATCGTGGCGACTACACGTCCAGAAACATTACTTGGGGATACTGCCATTGCTA
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GATCCCTATAATTGGGGATATGTCTGTAGATCCTTTATTTGGTACTGGAGCTGTAAAAATTACCCCCGCC
CATGATCGAGATGATTACCGCACAGGAATCAATCATAATTTACCTATGGTAAATATTCTGGCTCCTACCG
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TACGTGAGTTTGTTGCTAATGATTCTATAAAGATTTTCCCTCCAGAATTTACTCGAAATTACCTCTCTTG
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CATAAGAGTGATGAAGATCGTATCCTCTGTTATGATGGTGAAGGGATTCCCGAAGAGGTCGCTCAAGATC
CTGATTCTTGGTATCAAGATCCTGATGTATTAGATACTTGGTTTTCTTCTGGGTTATGGCCATTAACATG
TTTAGGTTGGCCTGATGTAGAATCTGGAGATTTAGAGAAATTTTATCCCACAGCAGTTCTCATTACAGGA
CATGACATTCTATTTTTCTGGGTAACACGCATGGTATTGCTTTGCAGTGCTATGGTTGAAGAGAAGCCTT
TTAGCGATGTCTTCTTACACGGATTAATTTTTGGTAAATCTTATAAGCGCTATAACGATCTTGGAGAATG
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GTTTGAGGAATACAAAAATTTTGCGAATAAGATTTGGAATGGGGCGAGGTTTATCTTTGGTCATATTTCC
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AACCATGGCGTATGAGTTCTTTAGGAATGATTTCTGTTCTACATATATAGAAATTATCAAACCTACGCTC
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TTTTAGGTGTTTTACATCCTATAACGCCTTTTGTTACGGAAACGCTATTTTTAAAGCTAAAGGCAACACT
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AATCCAGATCTTGTACGTTCTAAAGAAGAAACTTTAAAAAATAATCGTATGGAATTACAAAGTATTCTTG
ATAAGCTAGCGTCCTTTTCTTAG
>ref|NC_003361.3|:c785123-784635 hypothetical protein CCA00679 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTGCTATAATGCAGGGGAAATGTTGTGTAAGTGCTATCCAAGCATACGCTCGATCTTCGGCTATTTATGG
TAAATCTTTTGCATCTATTGGGATAGTTGAATCGTTTGCACTCTTTGCTTTTGTTTTTGCGTTATTATTA
TTCTAA
>ref|NC_003361.3|:c787585-785630 V-type ATP synthase subunit I [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATAAAGATCCCTCATTATGGGTATTTATTTCGTTTTTCTTCTTCTTTTCTATGATCGTCAATGACGGTGG
TTACGGGCTTGTTTTTTTAGCAACTTCGCTTTTTATAACGTTTAAAGCTCGACGGGTCCTGAAGCGATCT
AAATCATTGGCACGTTTCTTGAAGATGTTCTCAATTTTAGGGTTGGGATGTATTTTCTGGGGATTTGCTA
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CGTCCATATGGCTTTGGGAATGTTGCGTTATATGCGGCAGCGTTATTCTGGCCTAGGATGGATTGTTTTT
ATGTGTGGGGCCTATCTATATCTTCCCTTATATTTGCAATCCGTATCTTTGATTCATTACCTATTTCACG
TTCCCTACGATCTTGGGGGAATCATTGGTTATTACGGAGTGTTTGTTGGTATAGGCCTTGCTGTTGCCGG
TGCAGTTTTGCAACGTGGTGTTGGGGGTATTGATGAGATTACAGCAATTATACAAGTATTCTCAGATGTT
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GCAACCGTTTCTCTCCTGCTATAGCCTTCGTTATTATTTTGTTCGGTCATTCAGTGAATATCCTTCTCTC
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>ref|NC_003361.3|:c788202-787576 V-type ATP synthase subunit D [Chlamydophila caviae GPIC]
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TAGTGAGAGCATACAAGCGTATGAAGCAGCCAGGGAAAGTATTTATGCTTTCGCAGAGCTTTATAGTGTT
CCTCTTTATGTTGATGCGATTGCAAATAGTTTTAAGATAGAGAAAGTTGAAAAAGACTATGAAAATATTA
CGGGGATAGAAGTCCCTGTGATAAGGAATATTATCCTAGCTGAATCTTCTTATTCTGTTTTAGATACTCC
TATTTGGATCGATACGCTTGTAGCTTACTCTCGAGAGTTTGTAATTAATAAAGTGCGTTCTGAAGTAGCT
GCGGAAAAGCAAAGAATTCTTGAGGAAGAATTAAGAAATGTATCCATTCGTGTAAATCTCTTTGAGAAGA
AGCTAATTCCAGAGACTACGCGAATGATTAAGAAAATCGCGATTTTCTTAAGTGATCGTAGTATTACAGA
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>ref|NC_003361.3|:c789503-788187 V-type ATP synthase subunit B [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCAGACAATATATACAAAAATTACCGACATCAAAGGAAACTTAATAACTGTAGAAGCTGAGGGAGCGC
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TTAGGTCGTTCTATGGAGGTTACTTACGGGGAATCTCTAATAGGTAGACGTTTAAATGGTGTGGGTAAAC
CTATTGATGGCGAGGGAGAGTGTTTCGGTGATCCGATTGCAATCTCAACACCTACGTTTAATCCTGTTTG
TCGTGTTGTTCCTAGGGATATGGTGAAAACCAATATTCCTATGATTGACGTATTCAATTGTTTAGTGAAG
TCTCAAAAGATTCCTATCTTCTCTTCTTCTGGAGAGAGTCATAACGCCTTATTGATGCGTATAGCTGCAC
AAACAGATGCCGACATTGTCATTATCGGTGGTATGGGATTGACATTCGTTGACTATAGCTTTTTCGTTGA
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GAGTGTGTTTTAATTCCTGATATGGCCTTAGCATGTGCTGAGAAATTTGCTGTAGATCACAATAAGAATG
TGTTGGTCTTACTTACGGATATGACAGCGTTTGCAGATGCTTTAAAGGAAATCGCCATTACTATGGACCA
GATCCCTGCGAACCGTGGATATCCGGGATCTTTGTATTCGGATCTTGCATTGCGTTATGAAAAAGCTGTG
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TGGTTCTCTATCTCGTTTGAAGCAATTGGTTATTGGTAAAGTAACTAGAGAAGATCATGGAGATCTTGCA
AACTCTTTAATACGGCTATATGCCGATTCTAGAAAAGCTGCGGAAAGAATGTCCATGGGCTTTAAGTTGT
CAAATTGGGATAAAAAGTTATTGGCATTTGCTGAGCTTTTCGAAACCCGATTAATGAGTTTAGAAGTAAA
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GGTATAAAGGAACAGTTGATCAATAAGTATTGGCCGAAGTCATGTCTTCACAGATAA
>ref|NC_003361.3|:c791283-789508 V-type ATP synthase subunit A [Chlamydophila caviae GPIC]
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GTTTTGATGGGCATGTACGTCAAGGGGAAGTTGCTTATGTTAACGTTAACGACACATGGCTGAAAGCAGA
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GCTTTAGTCACTTTCTCAGGACATTTGTTAGAAGCAGAACTAGGTCCAGGGTTATTACAGGGGATCTTTG
ACGGATTGCAAAATCGTCTGCAGGTGTTGGCAGAAAGTAGCTTCTTCTTAAAGAGAGGAGAGTATGTTAA
TGCTCTTTGTAAGAATACATTGTGGGAATATACCCCAAAAGCGGTTGTAGGAGATGTTCTTGTTCGTGGA
GATGCTCTAGGTTTTGTAAAAGAAGGGTACTTTAACCACAAGATTATGGTGCCGTTTTCCTGTTTTAAAG
AGGTGACGATTACCTGGGTAATTTCGGAAGGTAGCTATAGTGTTGATACAGTAGTTGCTAAAGCTCGGGA
TGCGGAAGGGAAAGAATACAGCTTTACTATGGTTCAGAAATGGCCAATTAAGCAGGCATTTATCCAAGGG
GATAAAGTGCCCTGTCATGAGATTATGGACGTGGGCATACGTATTTTAGATACACAAATTCCAGTGTTAA
AGGGTGGAACGTTTTGTACTCCTGGCCCATTTGGTGCGGGAAAGACAGTTTTGCAACACCATTTATCGAA
GTATGCTGCTGTAGATATTGTGATTCTCTGTGCATGTGGAGAGCGTGCGGGTGAAGTGGTAGAGGTATTA
CAAGAATTTCCTCACCTTACAGACCCTCATACAGGGGAGTCTTTAATGCATAGAACATGCATTATTTGTA
ATACCTCTTCTATGCCAGTAGCAGCTAGAGAATCTTCCATTTATCTAGGCATTACTGTTGCAGAGTACTA
TAGACAGATGGGTCTGCATGTACTTTTGCTTGCTGATTCCACATCACGTTGGGCTCAAGCATTAAGAGAA
ATTTCAGGAAGATTAGAAGAGATTCCTGGAGAAGAAGCTTTTCCAGCTTATCTAGCATCAAGAATAGCTG
CTTTTTATGAGCGTGGTGGTGCTGTACGTATGAAAGACGGTTCAGAAGGTTCTTTGACAATATGTGGTGC
TGTATCCCCTGCGGGAGGGAACTTTGAAGAGCCTGTAACACAAGCTACGTTATCTGTAGTAGGAGCTTTC
TGTGGTCTTTCTAAAGCTCGTGCGGATGCTCGCCGTTACCCTTCTATTGATCCTATGATTTCGTGGTCAA
AATACCTAGATCAAGTTGGAGATATATTAGAGAATAAGATTCAGGGTTGGGGCAAAGCAGTCAAAAAAGC
AAATTACTTCCTTCGTGAAGGATCTGAAATTGGCAAACGTATGGAGGTTGTTGGAGAAGAGGGTATCCCC
ATGGAGGATATGGAGATCTACCTAAAAGCAGAATTATATGATTTTTGTTATCTCCAACAGAATGCTTTTG
ATGCTGTGGATTGTTATTGTCCTTTTGATCGGCAAATTGAGTTATTTTCATTAATGAGTCGTATTTTTGA
TGCGAAATTTAGCTTTGATTGTCCCGATAATGCGAGGAGTTTTTTCCTTGAATTGCAAAGTAAAATCAAA
ACCTTAAATGGACAGAAGTTCCTTTCCGAGGAATACAAGGAAGGAATGGAAGTAGTTCTTAGGTTATTAG
AGACGAAGATGGTACAAACAGCGTAA
>ref|NC_003361.3|:c792077-791277 hypothetical protein CCA00685 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTGATGATCTCGATGATTTACTTCATTTAAACTTATCTAATGAAGATCTAGGCCATTACGTTATCTTAAA
GCGTTTTTTTGATTTTGAAAATTTTGCATTTTTCTGGTCTGGAAAACCTCTACCGCATGCTTATGGTATA
GTGACACAAGAGAATGTTGAAAGTATGGTGAATCTTCAACAATGGTCGGATGACTGTGAGTTCGAGGATT
TCTTTAAGGATTTCTTATTGCAATATAAGACTTCTCAAGAGCGTCTAGATAACTTCTCCTCGTTAGTTAG
AGAATTTCTATCACATTACCAACGTAGCTCTTCTGAGTTCCTGCGTACGTATTTTACATTTAAGCAAAAC
CTACGCGTTATTTTGGCAGGTTTTCGCTCCCGAATTATGAAGCTTGATGTTTCTTATGTATTAAGAGATG
AAGATAGTTCTGATCCTGTGGTGCTTCAAGTGTTGATGCAAAAAGATGCTCCTAATTATGAGCTTCCAGG
AGAATTTTCAGATTTGAGTGATGTATTACAGGATTACGGTCGCTTACCTCATACATTGAACCGTACACTA
TCTTTGTACGAGTTTCATAAAATTGAAGAGATGTATCGTGATAAATATTTTGATGCGAATGCAGTTTTAG
CAAGGGTTGCAGCGTATTTATTTGCCATTCGCAATAGTATGGTAAATTTAGAGCAAGGCAAAAACATTAT
TAATTCTATGGAAAAGGCAATCACATGGTAG
>ref|NC_003361.3|:c792751-792125 V-type ATP synthase subunit E [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCAGATCTCGGTGCAGAAGATAAGTTAAAGCAAATCTGCGATGCTCTACGAATAGAAACTTTAAAAC
CTGCTGAAGATGAAGCAGAAGCCATTGTGCGTAATGCGAAAGAGCAGGCAAAAAGGATAATTGACGAAGC
TCAAGAACGGGCGAGTCAGATTATTACTTCAGCTCAACAAGATGCTGACCATAAGCTAAAACAGGGGGAG
TCCGCTTTAGCTCAAGCAGGAAAGCGTTCCTTAGAAAGTTTAAAACAAGCTGTAGAAAATAAAGTCTTTA
AAGAATCCTTGGCGGAATGGCTAGACAATGCTTTAGCTGATCCTGAGGTATCTGCTAAACTTGTTGCAGC
GTTGATACAGGCTATAGAAGACCAAGGCATTTCCGGGGATCTTACAGCTTGTATTGGCAAACACGTGGCG
ACAAGAGCCGTTAATGAATTCCTAGGAAAATCCGTATTAGCAAAACTTAAAGGTAAGGGAGTAGCTGTCG
GTAATTTTGTTGGTGGGGTTCAATTAAAAGTTGAAGACAAGAATTGGGTTTTAGATCTTAGTTCGGATAC
CTTGCTTGATCTTTTAATGCGTTATTTGCAAAAAGATTTTCGTGAAATGATATTTCAGGGCTCATAG
>ref|NC_003361.3|:792868-793626 hypothetical protein CCA00687 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATTAAAAAGATCACAAATCATTGTTTCTAACAAAACTGCTTCTCGCTATGTGCCTCACAAAACAAATAAA
AATAGAAGAACAAGACAAGAGGAAAAAGCAAAACATTTAATTTCATGGGTTTCCTATTCTGGAGATGAAT
ATTCGATTCGCATTCCAAGTAATTGGCAATGCATAAATGATAAAACTCAACTCCCTGAAAAACTCGATGT
GGTATTTATTGGCCAAGGGACAGGATCGTTGACCCCTACAATCAATATTGCTCAAGAAATCACATCTAAC
AATCAATCTGCATACATTGAAGAGATTCTTACCTATCATAAATCTAATGAAATGACCTTAGAATCTTCTG
TATTTACGCACCTACAAGCTGCCAACGGGGAATTTACTATTATTAAAACAGAAAAGAATTCTTCTTGGGG
AAAGGTTTTTTGCCTTCAAGGCGTTGCCGTGATCAATCACAAAGCCTATATCTTTACAAGCACGGCTACC
TTAGATGATTATCCCAATGTATCTTTGATTTTCTTAAAAACAGTCTCTTCATTTAAGCTTTCAGCAAAAG
AAGCTGCTTCCGGAGACGCTATCCTTGAAGAAGCATTAAAATCACTTCAAGGGGAATAA
>ref|NC_003361.3|:c794049-793639 hypothetical protein CCA00688 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCTTGAAAGGCAAATTAAAGAAGATAAGATGAACCATAACTCGTTACTTGTTTTTTCCTGTCCGTGCT
GCTGCGAAGGAGAAGTTTCTTTTTCTGTATTTAGCTTGGAGGAAGTCCTAGCTTGTAGTTGTTGTTCTTC
TACATATGTCTTCGACTCATCAATGCGAAACTCTATTCGTCAGTTTGCTGCGTTATGTCTGAGGATTCAT
GAAGCCTCTTCTATATTAGGAAATGCTGCGGTTTCTGTATCTGTTCAAGACAGTGCTGTAGAGATTCCTT
TCCAATTGCTCTTTTCTAGATTTCCTGTGGTTTTCAACTTAACTGTTGAAGGCAAGAAGATAGCAATTCG
CTTTATCTTCGACGCTCTTAAAAGAGAAGTCTTATACAAAGAGAATGAGTCTTTAGTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c795054-794071 transaldolase B [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTAAAACTTCAGGATCTCAAGATGCAACGACGAATCCATCTCTCATTCTCAAAGTTGCGCAAGAGCCGAA
ATATCAAGAATTGCTAACGGAAGCAATTGCTTGGGGCATTCGACAAAATGGCGATGATATTCAAACTCTG
ACTTTTGTTTTAGACAAGATACAGGTAAATTTTGGTTTAGAGATTCTAAAATGTATTCCTGGTAGAGTTT
CTTTAGAGATAGACGCTCGTCTTTCGTTTAATACAGAAGCGATGATTCAAAGGGCTATTTTTCTAAGTGA
ATTATTTGCTGCTACTGGTGGCGATAAGAAACGTCTTTTAGTTAAAATCCCTGGTACTTGGGAAGGCATT
CGAGCTGTAGAAGTTTTAGAAAAGCAAGGTATTGCTTGTAATGTCACTCTCATTTTTAATTTGATTCAGG
CTATTGCTGCTGCGAAAGCAAACGCAACGTTAATTTCACCGTTTGTTGGTCGTATTTATGATTGGTGGAT
AGCAGCTTATGGAGATGAAGGTTACTCTATAGATGCTGATCCTGGTGTAGCGTCTGTATCGAATATCTAT
ACTTATTATAAGAAGTTTGATATCCCTACACAAATCATGGCTGCTTCTTTCCGTTCTAAGGAGCAGGTAT
TAGCCTTAGCAGGATGTGATTTGCTAACAGTTTCTCCAAAGTTGTTAGATGAATTGAAAAAGGATCAATC
ACCGGTTGCGAAAAAATTAGACGTGGCTGCTGCTAAGAAACTTGATGTACAACCTGTTGAATTGACAGAA
AGTGTATTTCGTTTCTTAATGAATGAAGATGCCATGGCTACAGAGAAACTTGCTGAGGGTATTCGTATAT
TTTCTGGCGATACTCAAATTCTTGAAGCAGCGGTTACAGAATTTATTAAGCAAATAGCCGCCCAAGATGC
GTAA
>ref|NC_003361.3|:c799355-795174 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [Chlamydophila caviae GPIC]
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GAATTGCCTCAGATATTACTATTCGCGATAAGTGGTCTTGTGGGGAAATCAAGAAGCCTGAAACAATCAA
TTACCGTACGTTTAAACCTGAAAAAGGTGGATTGTTTTGCGAAAAGATTTTCGGGCCTACGAAGGATTGG
GAATGTTGTTGTGGTAAATATAAGAAGATTAAACACAAGGGCATTGTCTGCGATCGCTGTGGAGTAGAGG
TCACCCTTTCTAAGGTACGTCGTGAACGTATGGCTCATATAGAGCTTGCAGTGCCTATTGTGCACATATG
GTTTTTTAAGACTACACCTTCAAGAATCGGTAACGTCTTAGGAATGACTGCATCTGATCTTGAAAGGATT
ATCTACTATGAAGAATATGTAGTTATCGATCCAGGTAAGACAGATTTAAATAAGAAACAGCTTTTAAATG
ACGCTCAATATCGAGAAGTAGTTGAGAAGTGGGGTAAAGACGCTTTTGTTGCTAAAATGGGCGGAGAAGC
TATTTACGATTTATTAAAATCAGAAGATCTTCAAAGTTTATTGAAAGAGCTTAAGGATCGTTTGCGAAAA
ACAAAATCTCAGCAAGCTAGAATGAAGCTCGCTAAACGATTAAAGATCATTGAAGGTTTTGTTTCCTCTT
CTAATCATCCTGAGTGGATGGTTTTAAAAAGCGTTCCTGTTGTTCCACCCGATCTTCGTCCATTAGTTCC
TTTAGATGGCGGAAGATTTGCAACTTCTGATTTAAATGATTTATATCGTCGTGTAATTAACCGTAACAAT
CGTCTAAAAGCTATTTTAAGATTAAAAACTCCTGAAGTGATCGTTCGCAACGAAAAACGTATGTTACAGG
AAGCTGTGGATGCGTTATTTGATAACGGTCGTCATGGACATCCTGTAATGGGAGCGGGTAATCGTCCTTT
AAAATCTCTTTCTGAAATGTTGAAAGGGAAAAATGGACGTTTCCGACAAAACCTTTTAGGTAAGCGTGTC
GACTATTCTGGACGTTCTGTTATTATCGTCGGCCCCGAATTGAAATTTAATCAATGCGGTTTACCTAAAG
AAATGGCTCTTGAGTTATTCGAACCATTCATTATTAAAAGACTTAAAGATCAAGGAAGCGTCTACACTAT
TCGCTCTGCTAAGAAAATGATTCAACGCGGGGCCCCTGAAGTTTGGGACGTTTTAGAAGAAATTATTAAA
GGTCATCCCGTATTACTTAACCGAGCTCCTACGCTTCACCGTTTAGGGATACAGGCTTTTGAGCCCGTAT
TGATTGAAGGTAAAGCTATTCGTGTTCACCCGTTAGTGTGTGCAGCGTTCAACGCCGACTTCGACGGAGA
CCAAATGGCTGTTCACGTGCCACTGTCTATTGAAGCACAGCTAGAAGCTAAAGTTTTGATGATGGCTCCT
GACAACATCTTCTTACCATCTTCCGGAAAGCCTGTTGCAACACCTTCTAAAGATATGACGTTGGGTATTT
ACTATCTAATGGCTGATCCTACTTACTTCCCTGAAGATCACGGTGGAAAAATTAAGATCTTTAGAGATGT
TACTGAGGTATTGCGCGCATTATATACAGGTGGATTCCTTGATGAGCGTATAAATAACCGTTGTGATGAG
ACTGGACGTGGTATCCACATCCATGAAAAAATTAAAGTGCGTATTGATGGTCAGATTATTGAGACCACTC
CTGGACGCGTTCTGTTTAATAGAATTGTTCCTAAGGAATTAGGGTTTCAAAATTACAGCATGCCAAGTAA
GCGTATCAGTGAATTGATTTTACAATGCTATAAGAAAGTTGGTCTTGAAGCGACTGTGCGTTTCTTAGAT
GACCTTAAAGATCTAGGGTTTATCCAAGCGACAAAAGCTGCGATCTCCATGGGATTGAAAGACGTTAGAA
TTCCTGAGATTAAGAGTGAGATTCTTAAAGAAGCTTACGATAAAGTTGCTGTTGTTAAGAAGCAATACGA
TGACGGTATTATCACAGACGGGGAGCGTCATTCTAAGACTATTAGTATTTGGACGGAAGTTTCTGAATTG
TTATCAGATGCTCTTTATGTTGAGATTAGTAAGCAAGCTAAGAGCAAACACAATCCTTTATTCTTAATGA
TTGATTCTGGAGCTCGAGGTAATAAATCTCAGTTGAAACAGTTAGGAGCCTTGCGAGGTTTGATGGCGAA
GCCAAACGGAGCGATTATTGAATCTCCGATTACTTCAAATTTCCGCGAAGGGTTAACAGTTCTTGAATAC
TCGATTTCTTCTCACGGTGCTAGAAAAGGTTTAGCCGATACTGCCTTAAAAACAGCGGACTCTGGATACC
TAACGCGAAGACTCGTTGACGTAGCTCAGGATGTAATTATTACAGAGAAAGATTGCGGAACATTGAATCA
TATTGAGATTTCTGCAATTCGCCAAGGTTCTGAAGAACTTTTACCTTTGAAGGATCGTATTTACGGTCGT
ACGGTGTCTGAAGACATTTATCAGCCAGGGGATAAGAGCAAGCTTCTTGCTAAGAATGGAGATGTTGTTA
CATCTGCTCAGGCAGAACTCATTGACGATGCTGGTATCGAAAGCATTAAAATTCGTTCTACACTTACTTG
TGAAAGCCGTCGCGGTGTTTGTGCTAAGTGTTATGGATTGAATCTTGCTAATGGTCGCCTCATTGGTTTA
GGGGAAGCTGTAGGTATTATTGCTGCTCAGTCTATTGGGGAACCAGGAACACAGTTGACAATGAGAACGT
TCCACCTTGGAGGTATCGCTGCGACATCTTCAACTCCAGAAATCGTTACAGATAATGACGGTATTTTGGT
GTATATGGATCTTCGGGTTGTTGTAGGTCAAGATGGCAACCATCTGGTATTGAACAAGAAGGGAGCGATT
CACGTTGTTCGTGATGAAGGCCGTAGTCTAGAAGAATACAAGAAGCTCTTAAGTACCAAATCTATCGAAA
GTTTAGAGACTTATCCAGTAGAGCTTGGTGTAAAGATTTTGGTTGGCGATGGGGAAAAAGTATCCTCAGG
TCAAAGAATTGCTGAAGTTGAGCTGCATAATATTCCAATTATCTGTGATAAACCTGGTTTTGTGAAATAT
GAAGACTTAGTGGAAGGTATTTCTACAGAGAAAGTTGTCAATAAAAACACAGGATTAGTCGAGCTTATTG
TTAAACAGCATCGCGGGGAATTACATCCTCAAATTGCTATTTACTCTGATGCCGGTTTAACAGAATTAGT
TGGAACATACGCAATTCCTTCTGGAGCTATTATTTCTGTTGAAGAAAACCAAAAAGTTGATCCAGGTATG
TTGTTAGCGAGATTACCTCGTGGAGCAATCAAGACTAAGGATATTACTGGTGGTTTACCGCGGGTTGCTG
AATTGGTTGAAGCTAGAAAACCTGAAGATGCTGCAGACATTGCGAAGATCGATGGTGTTGTAGATTTTAA
AGGAATTCAGAAAAACAAACGTATTCTTGTTGTTCGTGATGAAATCACTGGAATGGAAGAAGAACACTTA
ATTCCATTGACCAAACACTTGATTGTTCAGCGTGGAGATAACGTGATGAAAGGGCAGCAGCTAACAGATG
GTTTAGTTGTTCCTCATGAAATCTTGGAAATCTGCGGTGTTCGCGAATTACAGAAATATTTAGTAAATGA
AGTTCAAGAAGTTTATCGTCTGCAAGGTGTGGATATTAACGATAAGCACATTGAAATCATTGTTCGTCAG
ATGTTGCAGAAAGTTCGTATTACCGATCCAGGTGATACCACTTTACTTTTTGGTGAAGAAGTTAATAAGA
AAGAGTTTTACGAAGAAAATAGACGTACAGAAGAAGATGGTGGTAAACCAGCTCAAGCTGTTCCTGTGTT
ATTGGGAATTACTAAAGCTTCGTTGGGTACAGAATCATTTATTTCTGCAGCGTCCTTCCAAGATACGACT
CGTGTATTGACTGATGCGGCTTGCAGTAGCAAAACTGACTATCTCTTAGGATTCAAAGAAAATGTCATTA
TGGGACATATGATTCCAGGAGGTACAGGGTTTGATACACATAAGCGGATTAAGCAATACTTAGAAAAAGA
ACAAGAGGATCTTGTTTTCGACTTTGAAAGCGAATCTGAATGCGCTTGTTAA
>ref|NC_003361.3|:c803141-799383 DNA-directed RNA polymerase subunit beta [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTCAAATGCCCGGAGCGGGTTAGCGTCAAAAAAAAGGAAGACATCTTAGATCTTCCAAATCTTATTG
AAATTCAAATTAAATCTTATAAGCAATTTCTTCAGATTGGGAAGCTTGCGGAAGAGCGCGATAATGTCGG
CTTGGAAGAAGTTTTTAGAGAGATCTTTCCAATTAAATCTTACAATGAAGCTACTATCTTAGAGTATCTG
TCTTATAACTTAGGTGTGCCGAAATACTCTCCCGAAGAGTGTATCCGTAGAGGGATCACCTACAGTGTAA
CTCTAAAAGTTCGCTTCCGTTTGACTGATGAAACAGGTATCAAAGAAGAAGAAGTCTATATGGGAACTAT
ACCCATTATGACAGATAAAGGTACCTTTATTATTAACGGTGCTGAAAGAGTTATTGTTTCTCAGGTACAC
AGGTCTCCAGGAATTAATTTTGAGCAAGAAAAGCACTCTAAAGGAAACATTTTGTTTTCCTTCAGAATTA
TTCCTTATCGAGGTAGCTGGTTAGAAGCTATTTTTGATATCAATGACTTAATTTATATCCATATTGATAG
AAAAAAACGTCGCCGCAAGATTTTAGCTATGACGTTTATTCGTGCTTTAGGGTATTCATCTGACGCTGAT
ATTATTGAAGAGTTTTTCCAAATAGAAGAGCGCTCTTTAAAGAGTGAAAAAGACTTCACCCTTTTAGTTG
GTAAAATCTTAGCGGATAATGTTCTCGACGAATCCTCCTCCTTGGTTTACGGAAAAGCTGGTGAAAAACT
TAGTACAGCAATGTTAAAACGTATGCTGGACGCGGATATTTCAACTTTAAAAATAGCGGTAGAGGCAGAT
GAGAATCACCCTATCATCAAAATGTTGGCGAAAGATCCAACAGACTCTTATGAAGCTGCTTTAAAAGATT
TCTATAGAAGATTACGTCCAGGAGAGCCTGCAACATTAGCTAATGCGCGTTCTACAATTATGCGTCTATT
CTTTGATTCTAAGCGTTATAACTTAGGAAGAGTAGGTCGTTATAAGTTGAATAGAAAGCTCGGCTTCCCA
ATGGACGAAGAGACTCTATCACAAGTTACTCTGAGAAAAGAAGATGTCATCGGTGCTTTAAAGTATCTTA
TCCGCTTAAAAATGGGTGATGAGAGAGCCTCGATTGATGATATTGATCACCTAGCAAACCGTCGTGTACG
TTCCGTAGGGGAATTAATTCAAAACCAATGCCGTTCTGGCTTGGCTAGAATGGAGAAAATCGTTCGTGAG
AGAATGAATCTATTTGATTTCTCTTCCGATACATTAATTCCTGGAAAAATTATTTCCGCGAAAGGTCTAG
CAAGTGTTTTGAAAGACTTTTTTGGTCGCTCCCAACTTTCTCAATTTATGGATCAAACCAACCCTGTAGC
GGAATTAACGCATAAGCGTCGTTTGTCAGCTTTAGGTCCTGGTGGTTTGAATAGAGAAAGAGCTGGGTTT
GAAGTTCGTGACGTACATGCGAGCCATTATGGACGTATTTGTCCGATTGAAACTCCAGAAGGACCAAACA
TTGGTTTGATTACTTCGCTCTCTTCTTTTGCGAAAATCAATGAATTTGGATTTATTGAAACTCCCTACCG
CATTGTTAGAGATGGTGTTGTCACTGATGAAATTGAATACATGACAGCCGATGTTGAAGAAGAATGCGTT
ATTGCTCAGGCTTCAGCAGCTCTAGATGAATATAATATGTTTGTGGATCCTGTATGCTGGGCAAGGTGTC
GTGGAGAGGCTTTTGAAGCTGATACGAGTACTGTTACACATATGGACGTTTCTCCAAAACAATTGGTCTC
GATTGTTACAGGTTTGATTCCATTTTTAGAACATGACGACGCTAACCGTGCTCTCATGGGATCAAACATG
CAACGTCAAGCTGTCCCTTTGTTGAAAACTGAAGCTCCTATAGTTGGAACAGGATTAGAAGCTCGCGCTG
CTAAAGATTCCGGAGCTATTGTTGTTGCTGAGGAAGATGGAGTTGTTGACTACGTGGACGGTTATAAGGT
CGTTATTGCACCTAAACATAACCCAACATTGAAACGTACTTACGATCTTAAAAAATTCTTAAGATCTAAT
TCAGGTACATGTATCAACCAACGACCTCTATGTAGTGTTGGAGATGTCATAGTTAAAGGTGATGTTATTG
CCGACGGTCCTGCTACAGATCAAGGAGAGCTTGCTTTAGGAAAAAACATCTTAGTTGCCTTCATGCCATG
GTATGGGTACAACTTTGAGGATGCGATTATTATTTCTGAAAAGCTCATCAAGCAAGATGCGTATACTTCA
ATTTATATTGAAGAATTCGAATTAACAGCTAGAGATACAAAATTAGGAAAAGAAGAGATTACTCGTGATA
TTCCTAATGTTTCTGAAGAAGTTTTAGCTAATTTAGGTGAGGACGGGATTATCCGTATTGGTGCTGAAGT
AAAGCCTGGTGATATTCTTGTTGGTAAAATTACACCAAAATCAGAAACAGAACTCGCTCCTGAAGAACGC
CTATTACGCGCTATCTTTGGTGAGAAAGCTGCTGATGTTAAAGATGCTTCTTTGACAGTACCTCCGGGAA
CAGAGGGCGTTGTCATGGATGTTAAGGTCTTTAGTAGAAAAGACAGACTATCCAAGAGTGATGATGAGCT
TGTAGAAGAAGCTGTTCATTTAAAAGATTTGCAGAAGGGTTATAAGAATCAGGTTTCGGTATTAAAGACT
GAATACCGTGAGAAACTTGGAGCCTTATTACTTAATGAGAAAGCTCCTGCTTCGATTATTCATCGCCGTA
CAGCAGATATTTTGGTTCAAGAAGGTACAGTATTTGATCAAGAAACTATAGAGCTTCTTGAACAAGAGTC
TTTAGTTGATTTGCTCATGCCTCCTTGTGAAATGTATGACGTCTTAAAAGGTCTACTTTCTGACTATGAG
ACTTCTTTACAACGCTTAGAAGTCAATTATAAAACAGAAGTTGAGCATATCCGTGAAGGAGATGCTGATC
TTGACCATGGTGTCATTCGTCAGGTTAAAGTTTATGTTGCTTCAAAAAGAAAGCTCCAAGTTGGAGATAA
AATGGCTGGACGCCATGGAAACAAAGGTGTTGTTTCTAAGATCGTTCCTGAAGCTGACATGCCTTATCTA
GCTAATGGTGAAACTGTACAGATGATCTTAAATCCTCTTGGGGTGCCTTCGAGGATGAACCTAGGCCAGG
TATTGGAAACGCATCTTGGTTATGCTGCAAAAACTGCCGGCATTCATGTAAAAACTCCAGTATTTGAAGG
ATTCCCAGAGTCTCGTATTTGGGACATGATGATCGAACAGGGATTACCTGCAGATGGTAAGTCTTACCTA
TACGATGGAAAGACTGGAGAGAGATTCGATAATACTGTAGTTATTGGCTACATTTATATGTTGAAACTCA
GCCACCTGATTGCGGATAAAATCCACGCTAGATCTATTGGACCTTACTCTCTAGTAACTCAGCAACCTCT
TGGAGGTAAAGCTCAGATGGGAGGTCAAAGATTTGGGGAGATGGAAGTGTGGGCTTTAGAAGCTTATGGT
GTAGCTCATATGCTTCAAGAGATTCTTACAGTAAAATCAGACGACGTTTCTGGACGAACAAGGATTTACG
AATCCATTGTTAAAGGAGAAAACCTCCTTAAATCAGGTACGCCTGAGTCGTTTAACGTTTTGATTAAAGA
AATGCAGGGTCTAGGACTTGATGTTCGTCCTATGGTAGTAGATGCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c803671-803279 50S ribosomal protein L7/L12 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TAAAAAAATTGTTGGAAGATAAATGGGATGTCACTGCTGCTGCTCCTATGATGGCTGTTGCTGCTGGCGC
TGCTGTTGGTGGTGATGCTGCTCCTGCTGAGTCAACAGAATTTGCAGTGATTTTGGAAGATGTTCCTGCA
GATAAAAAAATTGGCGTTTTAAAAGTTGTCCGAGAAGTTACAGGATTAGCTTTAAAAGAAGCTAAAGAAA
TGACAGAAGGTTTACCTAAAACTGTTAAAGAAAAGACTTCTAAGTCTGATGCTGAAGATACTGTTAAGAA
ATTACAAGATGCTGGAGCAAAAGCTTCCTTCAAAGGCTTGTAA
>ref|NC_003361.3|:c804225-803713 50S ribosomal protein L10 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGAATTTGAAGTATTGAAAAAAAGAATTTTCTTCAAAGCTATAGAAAATTCAGGTTTTGAGATAGACTCT
TCAGATACTGGAGGGCATTTAGGCGTAGTATTTGCTTATGACGATGCTGTTTCTGCGGCAAAACAAGTAT
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CTAGCTGCTCCTATGTCTCAGGTTGTTGGAATTATGGGATCAGCTCTTTCTGGTGTTATCTCTTGTATCG
ACCAGAAAACACAAAAAAACTAA
>ref|NC_003361.3|:c804937-804239 50S ribosomal protein L1 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AAGAAGCTATAGATATTTTAAAACAATGCCCCACAGTGCGCTTTGATCAAACTGTCGACGTGTCTATCAA
ATTGGGCATAGATCCAAAGAAAAGTGATCAACAAATTCGTGGATCCGTTTCCTTGCCTAACGGTACAGGA
AAAACTTTAAAAATTCTTGTGTTTGCTGCTGGAGAAAAAGCTAAGGAAGCGCTAGACGCTGGAGCTGATT
TCGTAGGTAGTGATGATCTTGTTGAAAGAATTAAAGGTGGTTGGGTTGACTTTGATGTCGCTGTTGCCAC
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AAAGCTGGCACAGTAACCATGGATGTTACTAAAGCTATTGCTGAGTTGCGTAAGGGAAAAATTGAATTTA
AAGCAGATCGCGCTGGAGTGTGTAACGCTGGTGTAGGTAAACTATCATTTGATCGAAACCTTCTTAAAGA
AAATATCGAAGCTTTATGCTCTGCTTTAATTAAAGCTAAGCCGCCAGCAGCTAAAGGTCAATATCTAGTA
TCATTTACCGTTTCTTCGACTATGGGGCCGGGTATTTCTGTCGATACTAGGGAATTAATGGCGTCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c805385-804960 50S ribosomal protein L11 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CAATAGGACCTGCTTTAGGTGCCGCAGGTGTGAATATTATGGGATTTTGCAAAGAGTTTAATGCTGCAAC
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GAGTAA
>ref|NC_003361.3|:c806040-805492 transcription antitermination protein NusG [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTAAGTGGTATGTCGTTCAAGTTTTTACGGCTCAAGAAAAAAAAGTTAAAAAAGCTTTAGAAGATT
TTAAAGAATCATCTGGAATGACCGATTTTATACAAGAGATTGTCTTGCCTATAGAAAACGTCATGGAAGT
GAAAAAAGGCGAACATAAAGTAGTCGAAAAATTCATTTGGCCAGGATACCTATTAATTAAAATGCATCTA
ACAGATGAATCCTGGTTATATGTGAAAAATAATCCTGGCGTTGTTGAATTTTTAGGCGGGGGAGTTCCTC
TAGCTCTATCTGAAGATGAAGTAAGAAATATTTTAAAGGATATCGAAGAGAAAAAAGCTGGCGTTGTACA
AAAACATAAATTTGATGTTGGTTCAAGAGTCAAAATTAATGACGGTGTTTTCGTAAACTTCATCGGTGTC
GTTTCTGAAGTTTTCCATGACAAAGGACGTCTCAGCGTCATGGTGTCCATCTTTGGAAGAGAAACTCGTG
TTGATGATTTAGAGTTTTGGCAAGTGGAAGAGGTTGCTCCGGAACAAGAAAGTGAATAA
>ref|NC_003361.3|:c806290-806045 preprotein translocase subunit SecE [Chlamydophila caviae GPIC]
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GCTTTCTAGATGAAATTAAAAAAATTGAATGGGTCAGCAAGCATGATCTGAAAAGATACGTTAAAATCGT
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TTGTTAAGTAGTATAACAAGCTTTTTGTTTGGTTAG
>ref|NC_003361.3|:c807635-806451 elongation factor Tu [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCAAAAGAAACTTTTCAACGTAATAAACCCCATATCAATATAGGGACCATTGGACACGTTGACCACG
GTAAAACGACGCTAACAGCTGCAATTACACGTGCACTGTCAGCAGAGGGGTTAGCTAATTTTTGCGATTA
CAGTTCTATTGACAATACTCCTGAAGAAAAAGCTAGAGGAATTACTATCAACGCGTCTCACGTTGAATAT
GAAACCCCTAACCGTCACTACGCTCACGTAGACTGCCCTGGACACGCTGACTATGTTAAAAACATGATTA
CAGGTGCTGCTCAGATGGATGGAGCGATTCTCGTTGTTTCCGCTACTGACGGTGCGATGCCTCAGACCAA
AGAACATATTCTTTTGGCGAGACAGGTTGGTGTTCCTTACATCGTTGTTTTCCTTAACAAAATCGATATG
ATTTCTCAAGAAGATGCTGAGCTCGTAGACTTAGTTGAAATGGAATTGTCCGAACTTCTAGAAGAAAAAG
GTTATAAAGGTTGCCCAATTATCCGTGGTTCTGCTTTGAAAGCCTTAGAAGGTGATGCAAGCTACGTTGA
AAAAATTCGCGAGTTAATGCAAGCAGTGGATGATAACATCCCTACTCCAGAGCGTGAAGTTGATAAGCCT
TTCTTAATGCCTATCGAAGACGTATTCTCTATTTCTGGTCGTGGTACTGTGGTCACAGGACGTATCGAGC
GTGGAATCGTTAAAGTGGGTGATAAAGTACAGATTGTTGGTTTAAGAGATACTAGAGAGACAATTGTTAC
CGGTGTGGAAATGTTCAGAAAAGAACTTCCAGAAGGTCAAGCAGGGGAAAACGTTGGTTTGCTCCTCAGA
GGTATCGGTAAGAATGACGTTGAACGTGGTATGGTTATCTGCCAACCTAATAGCGTGAAATCTCACACAC
AATTTAAAGGTGCTGTCTACATTCTACAAAAAGAAGAGGGTGGACGTCATAAACCTTTCTTTACCGGATA
CAGACCTCAGTTCTTCTTCCGTACAACAGATGTTACAGGTGTTGTAACTCTCCCAGAAGGTACAGAGATG
GTTATGCCAGGCGATAACGTTGAATTCGAAGTTCAATTAATTAGCCCAGTAGCTCTAGAAGAAGGTATGA
GATTTGCTATTCGTGAAGGTGGTCGTACAATCGGCGCTGGAACAATCTCAAAAATCATTGCCTAA
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AAATATTATTAGAGAATGGCATGCCGGTCACAGCTCATTTGTGTGGTAAAATGCGTATGAGCAATATTCG
TTTGCTTGTTGGAGATCGCGTCACCGTTGAAATGTCAGCTTATGATCTAACAAAAGCTAGAGTTGTATAC
AGGCATCGTTAA
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GATTACAGTATCCTCTTCTATTCCTCCATTATCTTCTTTAAAAATTTTACCCCACATCTCCTCTCCCAAA
ACATGTATGGATCATGTACGTTCTGTAGGAGAAAAAATTAGTTCCTTCTTAAGGGATAATTGGAAGTATA
TTCTACTTTATATCCTTGCTTGGGCTTTAATATTAGCCTGTCACCATACTATGGCTGTAACTTTGACTAT
ATGGCTTGGTATCGGTTTAGGCATTGGGGTGGTTTTTGGTATTTTTACTGCCAATGTTTTAGATAGAAAA
AATAAATATAAGAATACGAATAGTCTTTGGAATTTGATGAATTATGGGTTACAGCAACTTGATCCGAATG
GAACGCGTCAAATTCTTTTAGCTACAATTATCGCCTCTATTTCTGCTTTAATTTATGCCATTCCACAAGC
TGTTGGAATCACTATTGGGGCCTGCATAGGAAACCAAATTAGTATTCTCACCTGCTATGGTCTACGTTTA
GGAGATGATGACAACTATGTTGCCGACAGAGAGGCTTTTAATAAAAAAGTAGCAGATATTCAAAAGGCAA
TTAATCAATACCAACTTATTAAAAATCAAATGATTATGCAGAAGCAAATTTCTGCAATTGCGCAGCAACA
GAATAATCCTCAAATGATCAATGCGCTGCATACATTGCAATTAAAGATGAATGCGCCTTTGCCTTATGTA
TTCGATATGCCTACAACACAGTATCGAGATCACTTACATTTTAGTGATCCTGATCTTGTTATTGCTTCAG
CAAATCAAAGAATCCTTGCATTATCACAAACTTTAACTTACCTAAGACAAGAGCCTAATCGTGTTGTTGA
GGAATAG
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TGTTTCCTGAAAAATTTCATAAAGATGTCTTATACAACACGCTTTTAGATATTGGATCAAAATCTAAGGC
ATTCGATAAAAGTAGAATCACAAGAGAAAACCTTGTGTTAGGCTGTCAGAGCGATTTATATCTCTATGAG
GTATATCAAGAAGGTCGGTTATTCTTTTTTACCTACACGGAAGCTTTGATCTCTTCTGGGATCGCTGCTT
TATTTGCTGAAGTATATTCCGGAGAAACTCCTGTCACCATATTAACGTGCAAACCTGTATTTTTTGATCA
ACTTAGTCACTACCTGTCTATTGGAAGGGTAAATGGCGGGGAATCTCTCTACATGCGCATGAAGCAAATC
TCCGTGCGTTATTTGAAATCTTCGGAATAG
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CTAGCATGGAATCCTCCGAAGTGCATTCTGAGCAGGTACTTCCTCCCTCATCATCGCCATCAAGAATTTC
TAAAATTTTATCTTCTAAAGTCACTTACGTTGCAGCTGTAATCTTGGCTCTATTAGGAATAATCGCATGT
GCCATAGGAACCATATTCTTTCCTGCATACGCCAATTTCATTGTTATTGGCGGTGCTATACTTTCGGTAA
TTGCTATTGCTCTGGTATCTGCATTACTTGCCCATGGGAAAAAAGAAGTTGGAGCCCTTCATGCAGAGTT
GCAGACATCAGATGCTAAAATAGATCAGTTATTAGATCAATATAACGAGCTTGTCGATGAGTACAACCAA
GATAGCGTCGATGATGAGCAGAGTATTGAAAAACTCACAGCTGATTATAATACATTAGCTCAACAGTATA
ACGATCTCCTTCAACAATATAGTGATTTGCAAGAAGATAAAAGTTGGAGCGAGAGTGAAATAGCTGATGC
TGATGCCCAAAAAATTAGTCAGCTAGAACAACAAAATGCGGATCTAGTAATCCAAAACAACCTTTTGCAA
GAAGAAAATACCTCTCTACAAAACAACTGTGGAACACTATTTCATGAAAAAACTGAAGAAGAGTCACGCA
ATCTAGAGCTTTCTGACAACTGTAAAAAGTTGCAAAAGGAGCTAGCTGAATTAAGAGCTGCATTAGAGAA
GAAAAAATCTGAGATCTCTGATCACAAGCTCCAATGTGATATGCAGACTTCAGAAATAAGTCATTTAAAA
ACCGACCTTACGCATCTTCAGCAAAAGATGGCAGACCATCAGAGAGCTTCACAAAAAACACAGGAACAGC
TTGAACAACAATTAGCAAGCCAACAAGAATTAGTTGTAAAAACTGAAGAGGCACTCAGAACATCAACAGA
AGAACAACTAAAACTTGAAGCTCTATTAAAAGAGGCTGCAGGCTCATCTCAGGACATTACAGCAGAACAA
CTCTTAGCAGTAACATCCGAAGCTGAGGGCTACAAACAACAACTAGAGCAACTCCAGTTGAAAATAACAG
CTCTTCAACAACAATTAGAGCATCAAAGACAACAATATCAAGAGATGCAGGAACTCGATATCAAACAAGA
AGGAGCCTTAAAACAGAAACTCTCTAATTTAGAAAAAGATAAGGAAGATCTTCATGCTGCATTAGAGACA
TCTTTAAAGAAGGAGAAATATTTACAAGGACAACTCGTCGATGTAGAAGGGCAAGTGGAACAGCTAAAAC
AAGTTTTAGAGACTGAAGGGAAAAAACTCCTAAAAGATATACAAATTTTAGACCAACGTCTTGATGTATA
TCGACTCAACCAGGGCCTAATTCTTGAGAAATCAGTAAAGACTGTCAAAGTACAACATGTAGTAACCTCT
AAGAGCAAGGGCCAAAAAGTTATAAGGACGACTGAACATCCTGTAACTAGTTGGGAAGATAAAACAGTAG
TGGTCACCATGCAAGCGTTTGATAAAAAAGCTCTCAAGAAAACTTCTGGAGCCGACGTAGACGCAGTAAG
CTCATCTACGCCTGAAACCGAGCCTACAGGGCCTTCTGAAGACAAAACAACGTCTAAAGATGCAAAGACT
CCTGCAATGAAAAAACCAAAATTGTTCAGCAAAATTTTCCGCTCTCATAAAAAATAA
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CAGTATAGTTAAAGCAAGGATTATCCCGGATTTTAGGGTTTTATGGCTTCCTGTTGGAGGGGAGGGTCGT
TCCTTCACGTGA
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CGTCATGCTCATCAATGAAGTTCCTATAGTGTTGAGATAA
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TTAAAAGAGGTTCCTATCATGTTTTTATAGCAACCTCTTTCGGCAAAAGAACTTTTACCAAGAAACTAAC
GATACCTTAG
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AGGGGTCAATTTTCCTTACTTTGTTAGCAAAAATTTCCTTTCCTCTTCCATTTACTCCCACCCCAATTAC
TTTCCAAACTTTAGGGGTGTACTGTATTGGGGTGGCGTACTCTCCTCTGGTTGCTTTTAGCAGTGTGGTT
GCCTATCTATTAGAAGGGTTGTTTTTCCCTGTATTTTATGGTGCAGAGTATGGCGTAAATGCCTTTTTCC
GACCAACAGCAGGCTATCTCTATGCGTTTCCTCTAACTGCAGCGTTCATATCACAACTGTATCGTCTATA
CAAGAATCCCAGCAATTGTATTTTGGTGTCTATTCTTACGGGAGCAGCGTCTATCATACTCGTGTTCGGG
TCAATATGGCTCGCTATCTTCTGTTATCTGTTGTCAACAACAGAGTTTCTAGATCTTGTTTTGGGTTTAC
AACTAGGTGCTTTACCGTTTATTCCTGGAGAGGTGGTAAAGATAGCTCTGGTTGTTCAAGGAAGAATGGC
TGTGCAGTTCTTTCAAAAGCAGTATCTAAGGTATCGTTAG
>ref|NC_003361.3|:813864-815729 hypothetical protein CCA00707 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTCCTCCTCGTCCAAATCCTCAGCCAGCTGAGATTACGAATCTATCCCAGCGCATCAGTGGTTTTGTGAC
AAAATTTATTCCTCTAACCGACGACGGTTGTACAAAACGTTCTCCTAAGTGTCCCTCATGTCCTCGCGAA
GCTTGCGTCCACTCAGGGAACGGAGAACCCATGATGAATTTATGCAATTGTTGGACATGTTGTTTCGGCA
AACCCACTATAAATGACACGAGGGGTTTTTATAATTTTATTAAAGAATACGCTAGAATCCACGGGAATGC
ATGTGCAGCCCACTCTATGTTACAAGCTGGCATTAATATCGCAACGGCATCAAAACAGCGCGGAGAGATA
TCCGAAGAAGAAAAAAGAAAAATGGCTAAATGCTGCCCCACTGTAGTCAGAACCAAGATTGAGCGAGGTT
ATTATGATGTTACTCGTATCTCGGTAACAATGATGGACCTCGTGAGCGACTTACAAGAAGAAGGCGTGAT
AACAGGTTTGAGCGGACAGTTACTCAACCTATGGCATACGGCTCCAAGAGATGTAAACCCTGATGATGCC
CAAAAAATTTGGATACGGGATGCTGATGGGCGCCTATCCCCATTCTGCTACTTAAGATGTCTACATTATA
TCAGGGCAATTCGTTGTTTTAGAACAGATAGTGCAAATCCGCTGCAAGGAAACTTTTTACTTCTCGAAAG
TCCTGCAAGTATTATCGCTGCAAGTGTAATGTACTCTCTTGCGGCGTTACTCAATAGCGATAGATTCAGA
GATCTCCTACTCGAGGAAGAATCTGATGGAGAAGGCGGAACAATCTATACCTGCCCTTATAGAGTAGTTC
AAATGCTTATTCTACTTTCCATGCTCGCTCGAGGTAAACAGCCTTTCACAGGCAGGCCGCGACATCGCGA
ACAACTCAAAGACGAGGAAAAATGTACAATTATTCTGGCCTCGAATGAATTTAGAGAACGCGTCTTAGGG
AAGTTCATACAGCGTAGACCTGGCGTACAAACTGTAAGCGTACTACTCAGAGAGTTCCCTTCAACGGGAA
TGAACTTAGGTCTAAAGCCTTGGAGTAGAGTGAGCTCAACCTCTGATTCAACTGACAGTTATGAACCAAC
AGGCTCCGGAGAATTAGAGGCAGAGCCAGGACCTTCTCGAAGAAGACGTAGACGTCAGACTCCTCCCCAA
GCACCATCCTCTTCAACAGAGTCTGCAACGTCTCCTGAAACTAGTGAGAGATGTTCTCCACCTAACTCGC
CTGCATCCAGCGGCTCATCTCCTAGACGCCTTGTTACTGTGGAAGAGGCTCCTAGTGACGATGATTCCGA
TTTAAAGCAACTCGCCTCCTTCTTACAAGAACCAATTGTCTCCCCACTACCTAGCTCGCCTGCATCCAGC
TGCTCATCTCCCGACCGCCTTGTTATTGTGGAAGAGGCTCCTAGTGACGATGATTCCGATTTAGAGCAAC
TCGCTGCCTCTTTGCAAATACAAATTGTCTCACCACCGCCACCTAGATCTCTTGGAGATGGGGGCGAGCA
AGCAGAATCTCTTCGTTCTTTGTCAGTTCAGACTATGGGGGCTTACTATACAGAAACGGGGGAAGGAACA
TCTGCTCAGCCAGCAGAGGAGCCCACAACAAGCTCAGCTACACCTCCGGTAGATAGTAGCCTTCCTCCTA
AAAAACGCGGGAGAAACTGGCAACCTACCGATGGGGGACCCACGACAAGCTCGATAACACCTTCGGAAGA
CAGCCACCCTCCTAAAAAACGGTGGAGAAACTGGCAACCCACCTAA
>ref|NC_003361.3|:c816233-815883 hypothetical protein CCA00708 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGTTTTCTTTAGCAGAGCGTATCAATATCATATTCTCTATCGTTTTTGTGGTGTTTGGTGTGATTTGTAG
TATTGTGGGTATGGGACTTGGTTCAATAACAACAGGTGCCGTAGGTTTTGGTATTTATATTATAAGTATC
CTTTGCTTACTTCGCGGCGTTGTTGTCTATAATCATATCGCTTCCAACTACCTAGTGTATGGTTCATTAG
ATAAGAACTATCCAAGAAGAGAGTTTTGGGGGAGTATTTGTGAATGTCCCGATCGTCTTCTTCCTAGTTA
A
>ref|NC_003361.3|:c817976-816306 hypothetical protein CCA00709 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AACATATAGATTCTAGGGATACCGAGACCCACTTTCCTGAACAGACTACAGAACAAGTAAATTTATTTAT
TCATGGCGGTCTTAGGCCGTTTGTCACAGAATCCTCAGAGATATTTGAAGCCGTAAGTATTTTTGATAAC
AATAGAGAAATCCCTGCGGCATATGATGTCGATGTTACCTATATTAATGGTAGTGGTCAAACTCTAGCAG
AAGCACAGCTAGAATCTCTATATATTAGTGAAGTGCGTAACGTCCCCGTACGCATGTTGTATAATTTAGG
ATCAGGAGATTGGTATTCGCGATTGTCTCGAAGACCTAGCTTTTCTCGATCTAGTCCCTTATGCCAAGCA
TTATTAGATTCTTTGCATCATTTCTTCTCTCGTCCTGGGAATCAACATAGAAACCATGTAATTATATTTT
ATGGAGATGGGGGAGCCGTAGTTCAGCAGGTGTTAGATCGTACTCCCTATGTAGATAGAATTCGTGTGAT
TGGTATTGCTCCGACGGTATACGTCATAGGAAATAACGTACATCATTTTAGAGTGGCTGGAGATATCACC
ACTCTTTTAGACCATGATGGATTTACGCAAGCTAATGTAACGACGGTTTCCTACGCCTCGGGAGCAGAGG
GGGTGTTTTTCCCAAGTGTACGTTGCCCGAGCTATCTTTGGGCTTTGCGTTTAATAGGACCTCCTCCCTT
CGAAATAGAAGCTGAAAGAACCGCGAATCAGATTGCTTTGGTAGAGATCGGTCATGGAAGTGGAGCATTT
GAGAGATTATCAGAATTATTAAGATTGGGAGATACTTCTGCAGAGGCAGAATTTAACTTCGCGCCAACAG
CAGCAACCGATGTGGTTTTATCGAGTATATTCAGCATATTTAGAATTAGCGGTCTATTGCAAGAGTACAT
TATTCTTTCCGTTACTTACCATCCTGATGTTGAAGTTTCTTATGTCATTGTTTGTGGCTACAGTTTGAAT
TTACTTCGTTATTTCCTTCTATTGTTTACAAATCGCCGGTCTATTCGCGATTCGTATAGATCAATAAGAC
TAGCTGCTCACGGGATAGCTCCGTTAATTTTCTTAGTGACTCTACTTGATAATATCAATTGCGTAAGAAG
ATACGGACGCTCTCCTGCAATTTTACAAGCTGTATTTGTTGTAGCATCGACATTAAGCGGTAGTGTCGTG
TTCATGGAGATATTTCGACATTGTTTGAGGGGATTGCGTGGGCGTATCCAAAGCTCAATTTTACAAAGAT
TAACAGGATCATCTGAAGAATCTAGGGGAGTTGTGCGTTCTACAGAAGGAGGGAGGATAGGCTCTGTTCA
GATGATGATAGGCTCAGCTCATGGAATATTCTTAGCTGTTACTATCGGCATTTTAAACAGTATAATTATT
AACTTGCCTAGCGTATTAGGTAGGAGCTCTATTACAGATACAGGTGTGTATTCTAATCAGCTACACAATG
CTTCCTTAGCTTGGCAAACTGGAGATGTTTTAGTGGTATCGCAGACGGTAAGCCTGTTTATATGTATGAT
CGTATTAGTGGCAAATATTATGATTCTGGTGGGTTTGGTAAGTAGAAATCGTCGTCAGTAA
>ref|NC_003361.3|:c818848-818318 hypothetical protein CCA00710 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GGGAAGCCTTAGCAGATCAGCTGGATTCTTTATTTCAAGTTTTAGTCGAAGAGGGGCAGGAGTTGTACCG
TGATCTTGCTCTTATATGTAAAAATGAGAATATAGAGTTAGAAAGCGATGAGCAAGCTATAGAGCTAATG
AAAGAGTCGCCCTCAGGGCAGAGAATTCTAGAGGCATGTAGAGATATTCTCTCGTGTCTTCGTATGCCCT
CTGAAGATTTAAATAACGAAAATCTTTCTTTTGATGTTTTGTTGCAAAAGCTCGATGAGATCGCCAATGT
TTGGCGTCAATATCGTCATTCTAAAGATATGGAATATGTCCGTAAAGACCTCGATATGCGAGAAAGAGAG
TTGGAATTTAAAAAAGACCTTCTTGCTTGGCAAAAAGAGAAAACAGATAAGGAACTTACGTGGAAGCGCG
AGAGGTATGTTAGGGATATCGTGGCTCAACAAAGATATTAA
>ref|NC_003361.3|:c819466-819152 hypothetical protein CCA00711 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGCAAAGTCAGGTAGTGTGCAAATCGAATTTTCTGAATTTTATTTTAGAAATGCTCAGGTTAGATAGGGT
TTATAAGTTTTTGTCAAGAATCGGGCTAACACGACTCTCTGCCTTTGTTTATCATGCTATGCTGATGTTT
ATCACAGTAGTTTATATATCGATTTCTTGTGTTTTATATATTTTATGCATGCACAATCCTTTAGAAGATA
AAAGAAAAGAACACAGGAAATCTTCCTCATATTGA
>ref|NC_003361.3|:c820467-819598 dihydrodipicolinate synthase [Chlamydophila caviae GPIC]
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GAATTTTATATTCTCAAAAAAAAGAAGGAAATGGCGTTGTGCTTCTTGGAAGTACTGGCGAAAGTCTAGC
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GTGGGAGTGTCTGGCACTTCATTAAACGATGCTTTAGAGTGGATGAAGATATGCCATGCGTATCCTATTG
ACGGATTTTTAATCCCTAGTCCTATTTATACAAAACCTGGGGTCTATGGTCAGACCTTATGGTTCGAATC
CCTCTTAAATACTACGGACAAGCCTGTAATTTTATACAACATTCCCTCTAGAGCAGGAACACCTTTGTAT
TTAGAGACTGTAGGTGCATTAGCCAGCCATCCCTCCTGCTACGGAGTGAAAGATTCTGGAGGATCTATAG
AACGATGCCGCGAATATGCACAAATAGCTCCTCATCTTGTTGTGTATTGCGGAGATGATAGCTTGTGGCC
CCAAATGCACTCATATGGAGCTCAAGGACTCATTTCTGTTTTGTCCAATAGCTGGCCGAGAGAAGCGCGT
AGCTACGTAGATAATCCTTACCAAGAAAGCAACACGCTGTTGTGGCAAGAGCTATCTTTATGGCTTAGCC
TTACGACAAACCCTATAGCGATAAAGGCTGTGCTTGCCTACAAGCAAGATATTGCTCACAGCGTTTTGCG
TTTACCCTTATCTATTGCGGATTTGCAAAATGCAGAAGCCTTGCCAAATGTTGTGGAAAAAATGTTGAAG
TGGTCGCAAATCTATCCAGTCCATACATAG
>ref|NC_003361.3|:c821800-820478 aspartate kinase [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTATTGTTTGTAAGAATACACCACGTTTTATTGTTGTTAGCGCTGTAGCGGGAATTACAGATCTATTAGA
TATGTTTTGTTGTGTCTCTAGTGAATATCGTGAACAGATTGTTCTTGATATTGCCAAGAAGCATGATGAA
ATTATTCATGAACTCCAGCTTGCCTTTTCCCTATCTCCTTGGATAGAGAAGTTAAACAAGTGGGTGGATA
AAAAAGAAATTTCTCTAGGTGATCGCGCAGAGATTCTTGCGTTAGGTGAGGATATATCCGCTTCTTTGTT
TCAAGCTTTCTGTCATAGCAATAATTTTCCTATAGAATTTTTGGAAGCAAGAACGGTCATATTGACAGAT
GATGAATATCATCGGGCAACCCCTGATATTTCACGTATGCGAGAAAATTGGCATACACTTAATCTGAAAG
GTGATGCTTGCTATATCACTCAAGGATTTATAGGAGCGAGTACTTCTGGTAAGACCACGGTATTGGGTAG
AGGAGGAAGTGATTATTCCGGAGCGTTAATTGCTGAGATGAGTTGCGCTGAAGAAGTGCGTATTTATACC
GATGTGAACGGCATTTATACGATGGATCCAAGAATTATTGAAGATGCGCAGCTCATACCAGAATTAAGTT
TTGAAGAAATGCAAAATCTCGCTACTTTCGGAGCTAAAATTCTTTATCCTCCTATGCTTTCTCCGTGTGT
GCGTGCTGGGATTCCTATTTTTGTAACCTCCACTTTTGATGTTTCTAAAGGAGGTACGTGGATCTATGCT
ATGGATAAAACCGTGAGCTATGAACCTCGTGTAAAGGCGCTTTCCTTACGTCAGCATCAGAGATTATGGT
CTGTAGACTGTGGTATTTTAGGTGCTGTGAGCTTAGATAAGATATTGCCCATACTCGATACCTACCGTAT
TCTTCCTGGACTGATAACTTCTCAAGATGCCAAGGTATCTTTTACCACCGATGATGATGATATTTCTGAA
GAGATTATCCAAGATCTCTATAGCCAGCTGTCTAACATAGGCACCGTGCATATGCTTTATGATCTAGCTT
TGATTACGATGATTGGTTCTGGATTAGCTTCAACAAAGGTTGTCACTACAGTTACAGATAAATTACGTAA
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GCGGGAAGTATTGTAGAACAACTCCATAATGATTATGTTAAGCAGAAGTTTTCTGTAGTATAA
>ref|NC_003361.3|:c822792-821788 aspartate-semialdehyde dehydrogenase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTCCTTGGCATATTTGTGAAGTGGTTGCCTCCGAGACAAAATATAGTCAAACTTATGGTTCTGCGTGTGT
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GAATCAGATATTATCGTATCTTTTTTGCCGGAAGGCATAGCAGAATCCTTGGAGACATATTGTTTGTCTA
AGGGAAAGTTGGTTTTCTCTAATGCCTCTGCCTATAGAATGCATCCTGCGGTTCCTATTCTTATCCCTGA
AGTCAATCAAGATCATATGAGTCTTGTGGTTAAGCAGCCTTTTTCAGGAAGGATCATTACGAATTCTAAT
TGCTGTGTTTCTGGTATTGCCTTAGCTTTATCTCCTTTACAGGAATTTGGTATTGATCGCGTAAATATTG
TCACATTACAATCGGCAAGTGGAGCCGGTCATCCTGGGGTTTCTTCTATGGATGTTTTGGGAAATACGAT
TCCTCATATAGTAGGGGAAGAAGAAAAAATTCATAGAGAGACGCTAAAGATTTTAGGCAAGTGTGATGAA
CCTGCGCATTTTCCTATAGCAGTTTCTGTGCATCGTGTTCCTGTAGTGTATGGGCATACATTAACTTTAC
ATGTGACTTTTCTCAATTCTATGGATATTGAAGAAATTCTTCATTCCTACCATCGTAGGAATGAAGAATT
TCCAGGGACATATAAGCTTTATGATACTCTTTGGCATCCACAAGCAAGAAAAGATCTTACGGATGATGAT
ATGCGTGTTCATATAGGCCCCATTACTTATGGTGGAGGAGATTTTCGAACAATAAAAATGAATATATTGA
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TGGAGAATATGCATGTCTCCAGTAG
>ref|NC_003361.3|:c823718-822978 dihydrodipicolinate reductase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCGCGTTGGTATTATCGGATGTTCTGGAAGAATGGGGACGTTACTCAGTAATTTATTGAGGGCAACAG
CACGTTTTACTTTGGGCCCTGGATTTTCCAGAACAAGTACGCATTCTTTAGCCTCTGTTATAGACAATAA
TGATGTTCTTGTAGATTTTTCTTCTTCATCTTTGTCTGAAGAACTTTTCCGGGCTTTGCTCTCTAATCCA
AAACCTTTGATTTTTGCTACGACTAAACCTGCACCGTCTTCATCTATAGACGAAAAAATAGAGGATTTAG
CAGCTTATGTTCCTGTTGTTGTTTGTCCAAATACGAGCTTAGGAGCGTATGTGCAGAAGCGTTTAGCAGC
TCTACTTGCCGCTGTTTTTGATGATGCCTATGATATTCGCATTACTGAGGTGCATCATCGAGGGAAGAAG
GATGCGATTTCAGGAACAGCGAACGAATTAGTTTCTATTCTTTGTGATGCTAAGAAGAAGGAATGGCAGC
AGGAGTATCGTGTTGGGGCTGATAGCGACAGTGTGAAGAATATTGAATTGCACGCATCGCGTGTGGGCAA
CATTTCTGGGGAGCATGAAATCGCTTTTATCAGTGATAAGGAGCAAATTACCTTGCGGCATACTGTCTTT
TCTCGCGAAGTCTTTGCTGAGGGGGTTTTGAGAATTTTAGACTGGTTGCTAAACGAATCTCCACCTCCTG
GATGTTATGGACCTGAAGTGGGGCTAAAGGTTTCTGTGTAA
>ref|NC_003361.3|:823928-824761 phenylalanine 4-monooxygenase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCTCATCATATTGCCACACCACCTTCTAATTCTGAAAATTATTCGGGTGCACTTCTAAATTCTCGAC
TTCCTTTGTGGAAAGCTTACTGCCCTCAAGTTTTTTTTGAATATTTAGAAGCGCTACACTTAGTTAAAGG
ATCGGCTATAGATTTCGACCTTATCAATAACATCTTATTGTCAAAATCAGGATTTACACTATCACCAACG
CAAGAATATCTCCCTCCCCACAATTACTTATTTGAGTTAAGTCAAAAGCGTTTTCCTATAGCTACACAAA
TGCGCGCCGTAGATGACGACGGCTTTTCTATTTTTCCCGATCTGATTCACGATGTATTTTGCCACGTTCC
CTGGCTACTACATCCCGAGTTTATGAAGTTTTTCTTTACTATGGGACAGCTGTTTATAAAAGCTATACGT
AGAGCAAAGGAGATCTACCCTATCGAAGATCAACCGCGCATCCTCAATAGTAACGCTCTCGCCATCTCAA
GATGTTTTTGGTTTACCGTAGAAAATGGCCTTATCGAAGAACAGGGAAAAAGAAAAGCTTATGGAGCTGC
TATATTGAGCTCCACGGAACAATTAACCTATACTTTTAATAATAACGTGTTCGTCTCCCCATTTAAAACG
GAGCACATTATACAACGTCCTTGCAATCCAAATTCCATACAAACAACATTCTTTATTATCCGCGATTTCG
ACGAATTAAATGCTATCTCGGAACAAATGCACCAGTTTCTAAATCAGGGACAACTTGATTTTATTGTCTT
TGGTCCCCACGACATATATTATCCAGACATCGTCTACTTTTTAAATGAGCATGTCCTTGCATAA
>ref|NC_003361.3|:824742-825413 integral membrane protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGCATGTCCTTGCATAAAGATAGGGTATTTTTTAACCTAGCCCTCACCTTTTCATTGATTCTGATCC
TATCGAATCTGGTAGCAGCTTCTAGGCTCATCGTCACCCCCTACTTCACTATTCCCGGAGGACTACTTTT
CTATCCCATGACCTTTATGATTTCTAACATCGTTAATGAAATCTTTGGTCCGGAAAAAACCCGACACATG
GTATTTACAGCATTTGCCGGAAATATTCTTTCCTTAATACTTCTCCAAATCGTCTCTTTTCTTCCAGCTT
CTTCCTCAGAAATAGCAAATGCCTGGCATACGCTATTTGATATTAGTCCCGTCGCCTTTATCGCCTCCTT
TACCGCTTTTTCTACTTCACAACATCTAGACATCGTTTCCTTCCACTTTTTTAAACAGCGCTTTCCTAAA
TCCCCCCTTTGGATACGTAATAACGCATCCTCCATGCTCTCACAAATGGTCGATACCCTCATTGTTGATC
TCGGCGTAATCTACCTAGGAATGCATCTACCCCTTACAAAAACTTTACAAATCATGACATGCTCATACCT
ATATAAAATTTTCTTTAGCATAGCTACTACGCCAGTTTTTTATATGGGAATAAGAAAGATATCCAGCGTT
TATAAAGATAATATAAAAACAAAACACGAGACATTAGTATAG
>ref|NC_003361.3|:825501-826580 hypothetical protein CCA00718 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCTAATTTCCTTCTTTCTTCGCCAAGTATCCCACCAGGGTCAACCTATACCCTATACAATCCTCTTC
CTGGGCAAGGGAACGCTGCGCCTGCGAGGAAAAAAACACCTGTTACTGGTCCAGGATCGTTTGATAACGC
CTCATTTTTAAGTAAACTAGCCCGAGCAATCCTAGCTGCTATACTGATTATTGTTACTCTAGGGTTAATT
CTGTGCATCATGTCCTCACAAAATCTCTTGGACTTGAATACCCATGAAATCTGCTTAGATTACTCAGACT
ACGACTATCCTTCTTATCTCCCTTATGGGTATGATCCAACGTTCTTCCCAGCAACCCCAACAGTTACATT
TGAAAGCTGGGATAGCTCCGAGATTTTAGACCAATTCCTACGGTTATTCAAAACCCGTACCGATTTGTTC
GTTCCAGAAAGAACTGTAGAAATCGCTACCTATTTTTCTATAGAACGCATAATACTTCAGGATATGCATA
TGTATGACCTGAATACTCAGCAACTCCTAGACCAACCCGATCCTAGCCAATGTCGCCACAATGAAATAAC
CGAGTACCCTCACCTACAAGGCAGAAACTGTAATAATTTCCGCATATTTGCCTATCCTATGTGGCACCAT
CCCATGGCAAATAATCAAGAGGAAATGACAGCGAGAATGGATGCAACAATACAAGCAGGGTATGCAGGAA
TATCTCATTGGACCTCGGTAATTGTAAACCTAGATAGAAGAGAAGTACTTTTCTTCGACAGTCTCGCGCA
TTTTGTAGAGAACAATAAGATCGATCCCGTTTTGAAATCGCTAGCGACCAGATTAGGAAACTGTCATTTG
GATGCTAACGGAGCACGCTCTCCATTTACTGTAAAAAAAGTTGTCAAAACTCCTGTGCAAAAAGATGGTT
CATCTTGTGGGATGTGGGTAGCATTATTCCTTGAGAAATATTTAGAAAACCCCAACTATGTCCCCCCTAC
CATGGGATATACTGAAACCCAAAACTTTATACAAAATTATCTAGACAATCTTCCTGGAGCCGACGGAAAT
CACGATATGCAGCCAGCACCTATAAATTAA
>ref|NC_003361.3|:826588-827436 short chain dehydrogenase, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTATCACTGTAGCAATCTCAAAAAACAGATAGGGTATTTTCTAACCGGATTAACCTTATTGTCCTCTA
CTTACGCATTAGCAACAACTGAGGAAAATCATCCCTGTGTTGTGCTCACAGGAGCTTCAGGTCAATTAGG
ATCAGGAATCGCACGCTATCTTCATGATAAAGATTACCACCTACTGCTTGTCGGAAGACAAAATAGCAAG
CTATGCGCTCTGCACCAGCAAAACCCCAATTCCTCAACCCTAGCTATCGACTATTCCCTTCCAGGATATC
TTGCTGATTATAAAAATGCGCTTAAAGAGCTCAATCGCCCCATTCACGGACTTATTATTTCTACCCCACG
GCCTATTTGGAGTGGCATATTACAATCTCCAGAGTCTTGGGAAACTACATTACAGACAACCTTCATAGCA
CAGACCGCTTTGATTCAAGCGACTCTTCCCTATATGAGTCCACAAAGCTCTATTGTGATTATCGGAGGAA
CCGCATCGGTACAGTTACTCTCCTCCTACGGACTTTCCTGTGTGATTCGTCGTATGTGGACAACATACGC
GAAAGCCTTAGCCCATGAATTAGGTCCTAAAGGGATTCGCGTAAATGTTGTCTCTCCAGGAATTGTGTGC
ACTTCATTTCACAAAGAAAGAATTCGAGAAAGAGCAAGAGTAAATCACTCTAGTTATGCAGAAGAATACA
CTAAAGAAACCGACGCCATACCCTTACGACGTTTTTGCGAAACCGAAGAGCTAGCACAAACTATCGAGTT
TCTTCTCTCGTCATCATCATCTTTCATTTCAGGAATTAATTTAGTTCTCGATGGAGGGTTTACAAGCTCT
CTGAACTAA
>ref|NC_003361.3|:c828081-827692 hypothetical protein CCA00721 [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGAGGATCATTATTGCTGCAAAGGTTAATGCTGTAAGCGTTTTAAGGCGTTTAGAGCAACGATCTCTGT
GTCATGTGGTTTGTTGCCCTATTGACTGTTTCGAGGCTCTAAACGCAATTATAGAGGTTTGGGAGCTGTT
TGACGCTTTGCCTGCTAAAGTTCGTGAGTGTTTTGGAAATGATCCGGAAGAGATGTTGGAATGTTTAAAC
TATGAAGATAAATATTTTAACAACCTTGAAAATCCTTCTAAAAGCGTTAGTCTAGCTAGTCAAATTTTGA
AAACGGAGACCAAAATTAGGGCCATAATGATGCGCATTTTTGTGCAAAGAAAGAGGTTGAAATTGGCCTC
TAAAAAAACGGAGGATTTTAGGAAAGAAGAGCTAGCGTAA
>ref|NC_003361.3|:c828549-828196 hypothetical protein CCA00722 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTATTTCCTAAGCAGAACTAAACCGTACAGCGGGTTCTCAGTTTCTCTGAATAATTTGGCAGCTGCAC
GCATAACATACTTTCGCACTCCCATGCATAAGAACGAAGTGCTTGTGCATGGGAGTGCGAAGGTGTGGTC
GTATCGTTGCATTCATGAAGCGTCTCTTTATGGGCAGAATAGTTTTCTTACGTTGACGTATGAGGATAGG
AATTTGCCTGAGAAGGGTTCTTTAGTGAGGCGGGATGTGCGGTTGTTTCTGATGCGTTTCTGCTCCTCAA
GAGCCAGATTTTCTTTGCGTTGTGCACGACCTATGCCTGTCTATTCTGTTTCTGGTCTTATTGATCATTT
CTAA
>ref|NC_003361.3|:828613-829953 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCTTACTTATAAGATCTCTCCCTCATCTATCTCTGGAAGTGTTGACGTTCCTCCGTCGAAGTCTCATA
CTTTACGAGCGATTTTCTGGGCTTCGCTATCTCGAGGCACATCAACAATAAACAATCCTCTCGAGTCTCC
TGATTCAGAAGCAATGATTCAAGCTTGCAAGCAATTAGGAGCCAAGATTTATAAAAAATCTTCGTCTCTT
GAAATTACAGGCACACCTCATCTTAGATTGCCAAAAGATATCGCTATTGATGCGGGAAGTTCTGGGATTG
TTTTTCGTTTCTTTACTGCACTTGCAGCAATATTTTCTGAAAAAGTAACGATTACAGGATCTTCCCAATT
ACAAAGGCGCCCTATAGCTCCTTTAATCCGAGCTTTAGAAAATTTCGGAGCTACATTTTCCTATCAAAGA
GACCCTTACACGCTACCTTTTTCTGTTTTAGGTCCTATTTCTTCAGGGTATACTGAAGTGTTAGGAGAAG
ATTCGCAATATGCTTCAGCACTTGCTATGGCGTGCTCGTTAGCAGAGGGGCCTTTCTCCTTCACTATAAT
CAATCCTAAGGAACGCCCTTGGTTTAAACTGACATTGTGGTGGCTAGAACAATTAGCCATTCCCTATTCA
CAATCAGAAGAGAATACATATTCATTTGTAGGAAAATCTCGACCTGAAGGATTTTCCTATACAGTTGGAG
GCGATTTTAGTAGTGCAGCCTTTCTTGCTGTTGCTGCACTACTTTCTCAATCCCCACATCCTACGTACTT
AAGGAATCTTAATATGCAAGATGTTCAGGGAGATAAAGAATTGTTTGTTCTCCTAAAAAAGCTAGGAGCA
AATATTGTTTTTGAAAACGACATAGTGATTATTTTCCCCTCAACCATCTCTGGTGGGAACATAGATATGG
ATCCTTTTATTGATGCTCTTCCTATTCTTGCTGTTCTCTGTTGTTTTGCTACCTCGCCCTCACATTTATA
TAATGCACGAGGAGCAAAAGACAAAGAAAGCGATCGTATTGTCGCTATTACGGAAGAACTGCAAAAGATG
GGTGCATGCATCCAACCCTGTCATGATGGCTTACTTATTAACCCTAGTCCTCTATATGGGGCTTCTATGT
TTTCCCATAATGATCATAGAATAGCTATGGCCTTATCTATAGCAGCAATGCATGCTTCTGGAGATAGTAG
TATCTCTGATACTGAGTGTGTGAAAAAAACTTTTCCAAATTTCATACAGATTCTGAATTCCTTACATGCA
AATATTCAGGAGTACCATGAACCTATTTCTATGTGGACTACCGGCAGTGGGCAAGACCTTATTGGGTCGT
GCCCTTGCTAA
>ref|NC_003361.3|:829889-830410 shikimate kinase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAACCTATTTCTATGTGGACTACCGGCAGTGGGCAAGACCTTATTGGGTCGTGCCCTTGCTAACTATC
TATCAATTTCTTTCTTTGATACTGATGATTTAATTGTAAGTAACTACGACAACGGGCTATATTCCTCAGC
AGGTGAGATATTTCAAGCTGTTGGAGAAGAGGCGTTTGCAACTTTAGAGGTAGAGGCTTTACGCTCCTTA
CCCCGAGATAATAGCGTTACTGCTTTAGGTGGGGGTACCATTATGCATCAAGAAGCATATGATATAATTA
AGCACAGGGGAACATTGATCTATCTTTCTCTTCCTGTTACTGAAATTTATCAACGGCTCTTGAAACGCGG
CCTTCCCGAAAGATTAAAACACACGCCAAATGTAGAAGAGATTTTAAAACAACGTATAAATCGTATGCAG
CGTGTAGCAAATTACAATTTTTCTCTGAATCATATAGACCTCTTTGATGAACGCTCTTTATTATCGGCAT
GTGAATCTCTTAATATTTTACTAAATCCATGA
>ref|NC_003361.3|:830407-831486 chorismate synthase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGAAATCGATTCGGTTCTTTATTTTCTCTGACCACGTGGGGAGAATCTCACGGCCCATCTATTGGAG
TTGTTATCGACGGTTGTCCTGCAGGGCTCCTTCTCGATCCCGAAGATTTTATTCCTGCAATGTCGCGTAG
ATCTCCGGGAAGACCTGGAACTTCCCCTCGTAAAGAAGCAGATATCGTTCACATTCTTTCTGGAGTATAT
CAAGGGAAGACAACTGGAACACCGATCTCTCTTCAAATTTTCAATACTGATGTGAAGAGTGCTACATATC
ATCAGCAAGAGGATCGTTACCGGCCCGGTCATGGGCAGCTTGCTTATGAAAAAAAATATGGTCTTGTAGA
TCCTCTAGGAGGAGGAAGATCGTCTGCTAGGGAAACAGCATGCCGCGTAGCTGCAGGGGTTATCGCAGCG
AAGATTCTTGCTCACTACGATATTTATTGTTTAGCTTTCCTATCCAAACTAGGAAAGGAATCTATCGAAA
CCTATCCAAAATTATCTAAAGAATTTGCCCAAAACATTTATAACTCGCCTTTCCTTTCGCCTCTCGACAA
CGACTCTATCCTCCAAACACTAACTCATCTACAAAACGAACAAGATTCTTTAGGTGGGGTAGTATCTTTC
ATTACTTCCCCTATTCATGAAAGTCTTGGTGAGCCGGTATTTAATAAAGTGCAGGCAGTTTTAGCTTCTG
GGCTGATGAGCATTCCTGCTGCTAAGGGGTTTGAAATCGGGTTGGGATTTGCCTCTACAGATAGTTATGG
GTCGGAATATATTGATCCATTTATCATTGAGAACGAAAACATCTCCATGGGATCGAATAACTGTGGAGGC
TCTTTAGGAGGCATTACTGTGGGAATGCCTCTCAATGGCCGCGTAGCCTTCAAACCCACATCTTCGATTA
GGAAGCCCTTTCTCACAGTAACAAAAACTGGAGAGCCGTCTATTTACGCTACGCAAAAAGAAGGTCGTCA
TGACCCTTGTGTAGCTATAAGAGCTGTGGCTGTTGTAGAAGCCATGGTCAATCTTGTTCTTGCTGATTTA
TTACTACAACAACGGTGTGCAAGGCTATGA
>ref|NC_003361.3|:831483-832622 3-dehydroquinate synthase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATAGAGAATTTCATTTCTGATCCTCATAATGTTAAGTTCGTGGAAAATTTCTTCAATAGCGAGTTAT
TTTCTTCCCTATCTACCGACTATCCGATTGTAATGATTAGCGATCACTATGTTGCTGAGGAACTTCTCCC
TCCTATCCTAGATTTTATGGATAATTTGGGTTATAGGGTGATCCTGCTCACATTCCCTCCTGGAGAAAAA
AATAAAACATGGGAAACTTTTATTTCCCTACAAAATCAGCTTATTGACCAAGGTGTTTCTTTAGGATCTA
CGATCATCGGTATCGGCGGGGGTATAATATTAGACATGGCGGGATTCTTAGCCTCTACATATTGTCGAGG
AGTTCCGCTATTTTTAATCCCCACGACGCTAACAGCAATGATTGATGCAAGTATTGGAGGGAAAAACGGG
ATTAATCTACGAGGGTTTAAAAACCGTTTAGGGACTTTCTATCCTCCAAAAGATGTATGGATATGTCCTG
AGTTTTTAGCAACATTACCTAAAAAAGAATGGCTCCATGGAATTCCTGAGGCTATAAAGCATGGATGCAT
TGCTGATGCCTATATATGGGAGTTTCTAGACAATTGTAGGGATAGGCTCTTTTCTTCTCAGGAAATTCTC
CATGAGTTTATCAAAAGAAACTGCATGGTCAAGGCTGCTATTGTCGCTAAAGATCCTAAAGATCAGAATC
TGAGAAAAACCCTCAATTTCGGTCATACGATTGCCCATGCAATAGAAACACTATCCAAAGGGCACATCTC
TCATGGATTAGCGGTAAGTGTGGGAATGATGATAGAAATGAGAATTTCTCTAGAATCGGGAATTATGAAA
AATCCCTATCTTATTGAACAATTAGACAACTTATTAAAATATTTCTGCTTACCTACGGCTCTTCAAGAAC
TAGGATCTTTGATTCCACAACACCTTCATAATGAATTTTATCATCCAGAAAATATCCTCCATACCTTAGG
CTATGATAAGAAAAATCTATCCAAAAAAGCTGTAAGAATGGTCATGGTAGAACATTTAGGAAGAGCTGCT
TCGTGTAATGGAGCTTATTGTGCAACACCACATACGGATATTCTTTATGAAGTTCTAAAAAGTGAATGTC
ATGTTGTGTGCAACAATTAG
>ref|NC_003361.3|:832603-834036 bifunctional 3-dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTGTGTGCAACAATTAGTGGTCCCTCTTTTTTTGAAGCAAAACAACAGCTTCTGCACTCATTGCCTT
TCGTAGATAGTATAGAATTACGTATCGACTGTCTTTTATCTTTATCATCAGACCAGCTGAAACATTTGGT
TTGCTTAGCTAAGAAACCTATCCTCACGTTGAGAAGACACGCGAGTCTATCTGAAATCGCCTGGGTAGAA
CGTACTATGGAATTAGCAAAATTGCAGCCTGATTATCTGGATATTGATAAGGATTTTCCTAAAGAAGCTT
TAAGAAAGATCCGAAACCAATATCCTAATATCAAGATCATTTTGTCATATCATAGCCAAACTTCAGAACA
CGTCCCCACCCTCTATAATGAAATGCTAAAACAACAAGCGCATCATTATAAAATTGCTATTACTTCTACA
AAATCTGTAGATGCGCTACGTCTTATACAGATAAAAAAACATCTTCCTGAAAATACTACAGTACTGTGCA
TGGGAAATGAAGGCATCGCTTCGCGTATCCTTTCACCACTAATGAAGAATGCTATCAATTATGCTTCAGG
AATCCACGCTCCTAAAGTCGCTCCGGGGCAGCTTTCTATAGAAGATCTATTAGCTTATAACTATGCGAAT
CTCTCTTCAGAAGCACGTATCTATGGCCTCATCGGCAATCCCATAGATCGTAGTATCAGTCATCTTTCCC
ACAATAAGCTGTTTTCAGAACTTCATATGAAGACGAGCTACATAAAAATCCTTTTATCCTCTGCAGATCT
TAAAGAATTTTTCTCTCTAACACGTGATCTTCCTTTTGGAGGACTTAGCGTAACTATGCCTTTCAAAACT
GACGTTCTTGATTATATCGATGTTTTTGATCCCTCTGTAAAACATTGTCAATCTTGCAACACTCTTGTTT
TCAATAAGAATAAGATCACAGGACACAATACGGATGGTTTAGGATTACTGAATCTTTTAAAACGCAAAAA
CATTGCCGTTCACAATACCCATGTGGGTATTGTAGGCTCCGGAGGAGCCGCAAAGGCTATAGCAACAACA
TTTGCTTATTCGGGAGCTTGTATTAGCATTTTTAACCGCACGGAAGAAAATGGTAAAAAACTTGCTGAGC
TATGTAATGGCAATGCGTTCCCCCTAAGCTCTTTATCAGAAAAGCATGCTATAGATATTCTAATTTTATG
CCTTCCTCCGCATGTAAAAATCCCTGAAATCTTCCCTCCTGTAGTTATCGATATCAATACATTGCCTAAA
GAATCTCCCTATACTAGGAAAGCTAAAGCCCAAGGATGTCATGTTCTTTACGGATATGAAATGTTTGCTG
AGCAAGCTCTCCTACAATTTTCCCTTTGGTTCCCTAGAAGTCTCTCCCAAGACGATAGCGAGAGATTCCG
TATTAACGTAGAAAATATTGTTAACACCATGTAA
>ref|NC_003361.3|:834088-834879 hypothetical protein CCA00728 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCAAAAGTACTGGTTATTTTTCTTTTTTCTCTTTCCTCTAGCTCTGTATAGCGAAACTACGCGTTATG
TAGAGGTAAAATCTATTCATGAAATTGCGGGTGATATTCTTTATGATAGTAGTGACTTTTGGTTAATATT
TGATCTTGATGATACTTTATTGGAAGGTGCTGAAGCATTATCACAATCGCTATGGCTACAAAAAACAATG
GAAGGATTTCAACAACTGGGACTTTCTGAAAGTGAAGCTTGGGAAGCTATCTACCCTTACTGGGAAGGCT
TTCAGGAAAAAGGATCTGTAAAAACTATAGAAAATGCCATGCAGCTCCTCATCACAAAAATACAAGAACA
AAAGAAAACTCTCTTTGCTTATACAGAACGTAAGCTCTCTTCAAAGGACATCACCTTACAACAACTAAAA
AGCTTAGAGCTAAAATTAGACAGCACGGCTCCTGCTGTTCCTAATCATCTACCCAAAGGGATTCTCTTTA
CTTCAGGGGTGTTATTCGGAGACGAACTTCATAAAGGGCCAGGATTACAACTGTTTCTAGATGCTATAGG
CACTCTTCCTGAAAAGATCATTTATATTGATAATCGTAACGAAAATGTTTTGCGGATTGGCGAGTTATGT
AAAAGCAAAAAAATTTCTTATCTAGGCGTTACCTATACAGCTCAGAAGTTTTTGCCCCCTATATATATTC
CTGAAATCTCTAAGGTTCAATATACCTACTCTCAAAAACTCCTTAGCAATGAAGCTGCTGCTTTACTCCT
AAGGCACCAAATGACAGAGTAG
>ref|NC_003361.3|:834984-836339 hypothetical protein CCA00729 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCGTCTTTTCATTCTTCCCTATTAACCGCTCTATGTACTTTATGTACTTACGGTATATTGACGATGC
CTGCTTATGGACTCGATCCTAACCACCCTAAGCATCACTATCATAAATATTCCGAACGATTGAAAAGAAG
TAATGCTGAAGATTCTGCCTTTTATTTATCTTCGGCATCAGAATCCTCTGAAGACTTACGCCAAGAACCT
CGTCGTCACATACTTACCCCAGTTCGCAATGTTCTAAAAGATGACCCCTGCGACGAGGGACTGTCGATCT
CAAAATTGTTGCACTCGATTGAAAAAGAGACTAATTCTCAAATATCTGTGGATTTTACCATTCTCCCTCA
ATGGTTTTATCCTAAGAAAAGTGCCCTTGCAACAAGTGAAGAAAAGCAGCCTACTTGGCAATTTTATGTG
AGTCCTAACATCTCCTGGCAACTATACAATAGTCCAACAGCAGGTGTAGGAAGTATCGATTTTTCCTATA
CATTAATACGTTATTGGAACAACTCTGCACAAAATGCCAACAATGCTATAGGCATTGCCGGCGAGATCAA
CGATTACAGCTCTCGAACCAATACGCTATCTCTGCTCACATTTTCCCAAACATTCCCTGGGGAGATGCTT
ACCGTTTCGTTTGGCCAATACAGCCTATATTCTATAGACGGAACTTTATACGATAACGATCAGCAATGTG
GTTTCTTAAGTTACGCCCTATCGCAAAATGCTAGCGCGACATATTCCTCAGGAAGCGTGGGAGCTTATGT
ACAATTTACGCCTATCCCTTCTATAAATATCCAAGCTGGTTTTCAAGATGCCTATAGTATTGTAGGCTCT
TCTTTTGATGTCTATAACCTCACGAAAAATCGATACAATTTCTATGGTTATTTCTCTTGGGCGCCACAAA
GTTGTCTAGGTGCTGGGCAATATTCTGCATTAATCTATTCTACAAGAAATGTTCCTCAACAGCCTGTCCA
AACGACAGGATGGTCGCTGAACTTCGGTCAATACCTTGGGGAAAAACTGTATGTCTTTGGAAGATGGAAC
GGGTCTACAGGAACAGCAGTAAACCTTAACCGTTCTCATGTTCTTGGATTAGCGTCAGCAAATCCTATTA
ACCGCAACCCTAAAGATCTGTTGGGAGCGGCTTGCTCAATGAGTAAAGTTAACCCTAAAGTCGTTACAGA
TAAAAAAATTCGCAAATATGAAACTGTAATAGAAACATTCGCAACTGTAGGATTTGGTCCTCATCTTTCC
CTATCTCCAGATCTGCAAGTCTACATCCATCCAGCACGAAGACCAGATAGACGTTCTGCAACTGTTTACA
GTATTCGAGCCAACTTCTTTGTCTAA
>ref|NC_003361.3|:836367-836954 hypothetical protein CCA00730 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCCTTACGGAACACGCTACCCAACACTAGCCTTCCACACAGGAGGAATAGGAGAATCCGATGACGGGA
TGCCTCCACAACCTTTTGAAACTTTTTGCTACGACTCTGCTCTTTTACAAGCGAAAATCGAAAATTTTAA
TATTGTTCCTTACACATCTGTATTACCTAAAGAACTCTTTGGGAATATTGTTCCTGTAGATCAGTGCATA
AAGTTCTTCAAACATGGAGCTGTTCTCGAAGTCATCATGGCTGGTCGTGGCGCTTCTACATCAGACGGAA
CTCATGCGATTGCTACAGGTGTAGGGATCTGCTGGGGACAGGATAAAAATGGAGAGCTTATCGGTGGATG
GGCTGCAGAATACGTAGAATTTTTCCCCACTTGGATCAACGATGAAATCGCAGAATCCCATGCGAAGATG
TGGTTGAAAAAGTCTCTCCAACACGAACTAGATCTTCGCTCCGTTGTTAAACACAGCGAATTTCAATATT
TCCATAATTACATCAACATTAAGCAAAAATACGGGTTCTCATTAACTGCACTAGGATTTCTCAATTTTGA
GAATGCCGATCCAGCAACAATTAAGTAA
>ref|NC_003361.3|:836964-838424 amino acid permease [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTTTAAATAGGGGTAAATCTAAGAAAAATCTTGGAGCCATAGCTTTAGCAGGCATGGTAATTAGCT
CTATGATTGGGGGAGGAATTTTCAGTCTTCCCCAAAATATGGCAGCATCTGCAGGAGCAGGAGCTATTAT
CTTAGCATGGCTCCTAACAGGCATAGGCATGTTTTTCATTGCCAATACTTTTAAAATTCTCTCCTTAGTA
CGCCCTGACTTAACAACAGGGATTTATATGTACAGCCGAGAAGGATTTGGCCCTTATGTAGGGTTTACTA
TCGGTTGGGGATACTGGTTATGCCAAATCTTTGGTAATGTCGGTTATGCCGTAATGACCATGGATGCGTT
AAACTATTTCTTCCCTCCCTATTTTAAAGGTGGGAATACTATCCCTGCGATTATTGGAGGCTCTATCCTT
ATATGGGTCTTTAATTTTATAGTCCTTAAAGGAATCCGCCAGGCATCTTTTATCAATATTATCGGAACAG
TATGTAAACTTGTTCCTCTTATTGTATTTATTATCATCACAGCATTCGCATTCAAACTTGCTATTTTCAA
AACGGATTTTTGGGGAGATGCGGTTACAAAAACACAACCGGCACTAGGATCCGTAACTAGCCAGTTAAAA
AGTACAATGTTAGTCACTCTATGGGCTTTCATCGGAATCGAAGGTGCTGTTGTTATGTCAGCACGTGCTA
AAAGCCCTAGCGCTGTCGGGAAAGCTACTCTCCTAGGTTTCGTAGGATGCTTAACCGTGTATATCCTTTT
ATCTATTCTACCTTTTGGATCCCTATTCCAATATCAACTTGCTGGTATTCCCAATCCTTCAACAGCTGGG
GTGTTAGGCATGCTTGTAGGAAGATGGGGAGAAATTTTAATGAACGTAGGTCTCCTTATAGCCATACTCT
CTAGTTGGTTATCTTGGACTATAATTGTTGCTGAAATCCCTTATACTGCAGCAACAAATGGTACATTTCC
CGAGATCTTTGCTATAGAAAATGCGCAACATTCCCCTAAACTCTCGTTATATATCACCAGCGCTCTTATG
CAAATCACCATGCTTTTTGTATATTTTTCAACAAACGCATGGAATACGATGTTGAGCATTACAGGAGTGA
TGGTTTTACCTGCCTATTTAGCAAGTGCCGCTTTCCTTTTTCAGTTTAGCAAAAACAAAAAGTATCCAAA
TAAAGGCCCCGTCAAATCTTACATCGCAAAATATACAGGATTTTTTGCTGTTATTTATTCCCTTTGGTTG
ATCTATGCTGGAGGCTTAAATTACCTGCTTATGTCTGTCATTCTCTTGGCTTTAGGCATTCCCTTTTACA
TAGATGCCGGCAAGAAAAGTAAAAGAGAGAAGACATTTTTTGCAAAAAAAGAGGTTACAAAAATTATAAT
AATTGCTTTGTTGGCGTTATTAGCGATTTTTCTTTTTTCTACGGAGAAAATTCGTCTATAA
>ref|NC_003361.3|:838589-839629 DadA family oxidoreductase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCGTATAGCAGTTTTAGGAGCAGGATATGCAGGTCTTTCCGTAACTTGGCATTTGCTACTACATTCTC
AGGGAACAGCAACGATAGATCTTTTTGATCCCGTTCCTTTAGGTCATGGCGCATCGGGATTATCTTCAGG
TCTCCTTCATGGTTTTACTGGAAAAAAGGCGAGTAAACCTCCCCTTGCGGACTTAGGAATTACCTCTACC
CACGGCTTAATCACAGAAGCCAGCAAAGCATTAAACATCCCTATTGTTCTTTCCCGAGGGATTATCCGTC
CTGCGGTAGATGACGAGCAGGCGGAAATCTTTATGAAACGCGTGGAAGAATTCCCTAATGAAGTAGAATG
GTGGGAAAAGGCGCGGTGTGAAACGACAGTTCCAGGTATTGTTGCTAATTTCGGTGCCCTATTCATAAAG
AACGGCGTCACCATTAATAACATTGCCTATATTAACGGTCTTTGGGATGCCTGTGCTAATCTCGGCACGC
AATTTTACGATGAGCTTATAGAAAATATTCAAGATATCGAAGAGTTTTACGATCATATTATTGTCACTCC
AGGAGCTAATGCTCATGCCCTCCCTGAATTGCAAAATCTTCCCATATCTAATGTAAAGGGTCAGCTTATA
GAAATTTCCTGGCCTGAAGATTTAGCCATGCCGCAATTTAGCATCAATGCGCATAAATACATGGTAGCAA
ACACTGAGAAAAACACGTGTATCTTAGGAGCAACTTTCGAACATAACCAGCCTGAACCTGTTACTGACGA
AACTATTGCTTATAATGAGATCATGCCTCCTGTTCTTTCGCTATTTCCAGCTCTTAAAGATGCCAAGATT
CTCAACTATTATGCAGGAATGCGTTCATCAAGCTCTACCCGCTTACCTTTGCTTAGCAGAATAAAAGAAA
ACCTTTGGTTCCTAGGAGCTCTAGGATCCAAAGGTCTACTGTATCACGGCATTACCGGAGATATGCTTGC
TCAAGCTGTATTAAAACAATCTACAGCTTATATAGCTAAAGAGTTCCTATTCACTCCCTAA
>ref|NC_003361.3|:c840443-839619 hypothetical protein CCA00733 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACTCGATCTTTTGACGTATTAAGTCAAAATGCTTTTAAAAAGATCTTTAATAAGCAGCGATTTCTTT
TTGTTTTTTCTAGTTTGTGCTGTTTTGGTTTTGTTTTTGCCATATTTTTAAAACTATGCTCACAGTTTGT
TCTTAGCTTTTCGCTATCAACATTAGGATTGGGAGCTTTTTTCTCTTCTTTTAGCATTATTTGTGCTTCT
GGAGTGATTGTACAGGCACTGTTGAAACAGGAGTCTGCAGGGAGTGCATGTAAGGTAACCTCAGCATTTC
ATAAGAATTGGAAATCCCTATGGCTATCACTACTTGTTTCCATGCCATTTTTTATAGCCATGATTGTGGT
AAGCACGGTAATTTTACTCTCAGTATTTTTGGGTTCTTTGCCGTGGGTGGGTAAGTTCTTCCATACCTTG
TTAATTTTTATTCCTTACCTTTCGGCAACAACTTTGATTTTGCTATTTCTAGGTGCTTTTGTATCTCTAT
TTTTCTGCATACCAGCTTTAAGCGATCGCGATAGTATCGACTTCATGCAGCTATTGCGTTGTTTTCAGGG
AAATATCTTGAATCAGTCTATTGGATTTGTCATAGCAGCAACACCTTTAGCGTTGTGTAGCTGGTTAGCT
TTAGACTCGTTTTATTTGATGTCGCATTTAGTCTGTTTATCAGATATGAATACAGGCTCGTTTTTGATGG
AAGTCTTGGTATTGGTCATGCCAATAGCTCTAATTCTTACACCCGCCGTTTCCTTCTTCTTTAATTTTTC
TTTTGATTTTTACTTAGAGAAGCAAACCTCAAAAGAAAATCTGATTAGGGAGTGA
>ref|NC_003361.3|:c841458-840466 malate dehydrogenase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATTATGAAACTAATGCGTACGGTTAGCGTTGCTGTGACGGGTGGAACAGGGCAAATCGCCTATAGCT
TTTTGTTCGCTCTAGCTCATGGCGATGTTTTTGGTAGTGATTGCAGCATTGATCTTCGTGTGTATGATCT
TCCAGGTTTAGAAAGAGCGCTCTCCGGTGTCCGTATGGAACTCGATGATTGTGCTTATCCTCTTTTACAA
TCGCTACGTGTTACAACGTCTTTAGAAGATGCTTGTGATGGTATTGACGCAGCTTTTCTCATAGGAGCGG
CACCACGAGGCCCTGGAATGGAACGTTCGGATCTTCTAAAACGTAACGGAGAGATTTTTTCTCTTCAAGG
TTCTGTGCTCAACGTGTGTGCAAAGCGTGATGCGAAGATTTTTGTCGTTGGCAATCCTGTAAATACCAAT
TGTTGGATTGCTATGAATAAAGCTCCAAAATTGAATAGAAGAAATTTCCATTCTATGCTGCGTTTAGATC
AAAATCGTATGCATACGATGTTAGCACATCGTGCAGAAGTGCCTTTGGATGAAGTTACCAATGTTGTTGT
TTGGGGGAATCATTCTGCAAAACAAGTTCCTGATTTTACTCAGGCATTAATTTCAGGAAAACCCGCTGTA
GAAGTTATTAGCGACCGTGATTGGCTTGAAAATATTATGTTCCCCTCTATCCAAAATCGAGGAAGCGCTG
TAATTGAAGCTCGTGGAAAATCTTCTGCAGGGTCTGCTGCTCGTGCTTTAGCAGAGGCTGCACGCTCTAT
TTTTCTTCCGAAGGATGGAGAGTGGTTCTCTAGTGGAGTATGTTCCGATTATAATCCTTACGGTATTCCT
GATGATTTGATTTTTGGTTTCCCATGTCGTATGTTGCCCTCTGGGGATTACGAGATTGTTCCTGGATTGC
CTTGGGATGCCTTCATAAAAAATAAGATTCAAATATCCTTGGATGAAATTTCTCAGGAAAAAGCCAGTGT
CTCTTTGTTATAA
>ref|NC_003361.3|:c841953-841810 hypothetical protein CCA00735 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTTTTATTCGTGTGCGTTCTGTAGGATTTTTAGATATTCATGGTGTTTTATCTACTCGTAAGGGAG
AGCAGGTAATCAAATCTGGTACCGGAGTTTGGGTAGGAGCTCGAGGAGCTATTTTCTACCGCATAGCTTC
CTAG
>ref|NC_003361.3|:c843642-842059 glucose-6-phosphate isomerase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATAAAAAAGGCTTTTTAGATAGCTCCTCAACAAAGATATTACAAGATTTGGCTGTGGCACCTATAG
ATTTAACAGCCCCAGGAGTAATTTCTAAAGAGCGTATAGAAAGGTTTTCCTTGTCTGTAGAGGGCTTTAC
ATTAAGTTACGCTACGGAGCGTGTCGATGAGGGAATTTTATCTGCATTAGAGGATTTAGCTTCTGAACGT
GGCCTTATAGAATCTATGCAGGCAATGCAAAACGGAGAAGTTGTCAACTATATCGAGAATTTTCCTAGTG
AATCGCGACCTGCTTTGCATACGGCGACACGTGCATGGGTTAAGGAAAGCCCTTTACAAGGTAATGCTGA
AGACATTTCTTTAAGATCAAAAATCGAAGCTCAACGTTTAAAGGACTTTCTCAATCGCTATAGGGATGTT
TTTACAACGATTGTACAAATTGGGATTGGGGGGTCAGAACTCGGTCCTAAAGCTTTGCACTGGGCTTTAA
AAGGCTGTTGCCCTTCAGATAAAAAAGTATATTTTGTCTCCAATGTGGATCCTGATAATGCTGCAGAGGT
TTTACAAGAAATCGATTGCGCAAAAACTTTGGTTGTTACGGTATCAAAATCAGGTACTACATTAGAGACT
GCTGTTAATGAAGAATTATTAGCAGATCATTTCTTAAAACAAGGATTGCATTTTCAAGATCATTTTATTG
CTGTTACCTGCGAGGGTAGCCCTATGGATGATACAAGTAAATATCTTGAAGTTTTCCATATTTGGGATAG
TATCGGAGGCCGCTATTCCTCAACATCTATGGTTGGCGGGGTTGTTTTAGGCTTTGCCTATGGATTTGAT
GTGTTTTTACAGCTCCTTGAAGGCGCAGCATCTATGGATCTCGCTGCTTTAGAACCTCGTATGAGCGAAA
ATCTTCCTTTATTATCGGCAATGTTAGGGATTTGGAATCGTAATTTCTTACGTTATCCCACCTCTGCTGT
GGTTCCCTATGCTACAGGATTAGAGTATTTCCCTGCGCATTTACAGCAGTGTGGTATGGAATCTAATGGA
AAGAGTGTTGCCCAAACCGGAGAGGTGATAGGCTTTGCCACAAGCCCTATTCTTTGGGGTGAGGTGGGAA
CAAATAGCCAGCACTCCTTTTTCCAGTGCCTTCATCAAGGTAGCGATATTGTGCCTATAGAATTCATTGG
TTTTCAAGAAAACCAAAGAGGGAAAGATATCGTTATCGCCGGATCGAGTTCTTCTCAAAAGCTCTTTGCT
AATATGGTAGCGCAGTCCATAGCCTTAGCAAAAGGACGGGAAAATACTAATCCGAATAAAAATTTTAGAG
GAAATCGCCCTTCCTCTCTTCTTGTATCTGAAAGACTCACTCCCTACACTATGGGAGCTCTTTTAGCCTT
CTATGAACATAAAATCGTCTTTCAGGGCTTTTGCTGGGGAATTAACTCCTTCGATCAGGAAGGAGTTACC
CTGGGAAAAGATTTAGCAAACCAGGTTTTGCAAGTTATGCAAGGTCAGGAGAAAGAGGGAGCTCTTCTTG
AAGCAGAAGCCTTGTTAAGGCTTTTTAACAATATTAAAAAATAA
>ref|NC_003361.3|:843715-844611 site-specific tyrosine recombinase XerD [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACCTCAGCCCAGTTTTGCGATGTTATTCTCGAACAATTTATTCTTTTTCTCTCTGTAGATCGCGGTC
TTTGCCGCAACTCTATTTCTGCGTATTGTCAGGACATTACCCTATTCCTAAAAATAAACGCCATTACATC
AACCGAAGAAATTTCCCAAGATAGCGTGTATCTGTTTGTTCAGCAGCTACATAAACGCAAAGAAGCTGAA
TCTACTTTAGCGCGTCGCCTGATTGCCTTAAAAGTATTTTTCCGATTTCTTAAAGAAGCAAAGCTTCTTG
ATCATCCTCCTCTTATTGAACATCCGAAAATTTGGAAACGCCTTCCTTCTGTTTTAACTCCGAAAGAAGT
CGATGCCCTTTTATCTGCTGCCCAACAATCTAAAACCTCTCCTATAATCTCTGCTCGAGATACTGCTATT
CTCCTTACCCTCTATTCCACAGGGATTCGCGTATCCGAACTTTGCGACTTATGTATTAGTGACGTTAGTG
ATGATTTTCTACGAGTTACAGGGAAGGGCTCCAAAACACGCCTTGTTCCCCTAGGAAAAGTCGCCTGCAA
GGCTATTGACGCCTATCTATGCCCATTTCGAGAAACCTTCCAAAAGCTCCACCCGGAAGAACATCATCTA
TTTCTTTCCGTACGCGGCCATAGATTAGAACGCTCTTGTGTATGGAGAAGAATCCACTACTACGCAAAGC
AGGTAACCCATAAACGCGTCTCCCCGCATTCTCTAAGGCATGCCTTTGCTACGCATCTATTAGATAACAA
GGCTGACCTCAGGATCATTCAAGAGATGCTCGGGCATGCCCGCATTGCCTCTACAGAAATCTATACACAC
GTAGCTGCAGATACGTTAATGGAAAACTTCCTCTCCTACCACCCGAGAAATCCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c844895-844608 hypothetical protein CCA00738 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAGAAAATGCTTCTAGTTCTCACTTATTCTCTAAGTTGTTGTTTTTCTGTGGCTTTTGCGGAAAGTT
TCCTTGCTTCGGGATGTACATCCTTAGTCAAGGCCGTACCTGTATCGGAATTACACTTCCAAGAGTCAAC
TGGTCACGTCCCCTATAGCTTCTATTATCCTTATGAGTATGAATACTATTACCCACAGACTTACGGGGAG
TACACTGGAGCATCCCGGGGTAACGAAGATTGCTATTCTCGCTTTGAAGACGGTACTTTTTTCTATCATT
GCGATTAA
>ref|NC_003361.3|:845259-846701 hypothetical protein CCA00739 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAACACTCCCCTGCCTTCAGCAGTTCCCTCTACCAACATGACGTTAAAGGAAGATGCCTCCTCTTCAT
CCTCAGCATCAACATCTTCCAGTATTTTAAAGACTGCAGCAGGAGATGTTGCGCTTTCCGTATTCACTTC
CGAAGGAACCACACCAGCTTCCTTAAACTCTCTAGTTGCTCTTGCCCTTGCGCAAATTTCTGCAGCTTCT
GGAGAAAATGCCAATCCTTTACAAGATTGTGCTCATAATCTTGTCTTCCTTTCTCCAGAAACTATTGAAG
TTGAAATACTCATCTCTGATCTTCTTCAAACTTTAGAGACTACAGATCTTATAAACACACAGGAAGAGTC
CTCAAGTTTAGGAAAACAAGAACAGCGCCTTCCTCAAGAAGGATGCAAACCACAGGATTTAGCACCAAGA
TCTACAATAGATTCGTACGGCACACCGAAAGCATTACAACAACCTGCCGTGAAACTCGCTGTCCGCTATT
CTTCTGCAAAGGCTCCTGATTCTCGGCCTTATACAAGTTCCTCCTCACCGCAGCATACTTCGGGACAATT
TGCCCAACGTGCTGCCCAGGCGCCAGGAATACTGCAACACTCCCAAACAAAAAAAGATGGAGAGCAAATT
TCTTCTCAATCTCACAATTCCTTTATTGCGGAGAAAAAAGAACAGCAGATTTTCACCACAAAGTCTCAAG
AATCTCAGCAGGATCGTGAAAACCGAGATCAAAAACAAGATCGCCAACATGATGGCCAACATCAAGATGA
TGATGATGATCAGCAAAAAGGTAGGGGGAAAAAATATAAATCAAAGACTTCTGCCGAAGCAGTTCCTGCT
GATCTCTCCGTAGCGCATCTACGCTATCTTAATGAGGTACGCCAATCTCGAGAAATTCATGTTGAGGAAG
AAAAAACATTTAAGAAGAAAGCGCAATCTCCGATGGCACTTTTTTCTGCTCCAACTCCTCCAGCAGGATT
TACCCCAATTCCTACTCCAAAGATTGAAAACGTATTCATACGTTTTATGAAACTTATGGAAAGGATTCTG
GGACAGGCCGAAGCCGAAGCCCAAGAATTATATCTTCGCGTTAAAGAGCGTACCGATAATGTAGACACAT
TAATGCTGCTCATTTCTAAAATTAACTCTGAAAAAGGTGCTATTGACTGGCGAGATGATTCAGAAATGAA
AGCTCTCGTGGATCAAGCAAAAAAACTGGGTGTAACGATAACAGATACTCTGCAATGGTCTGAAGAAGAG
AAAAAACTTCTAAAAGAAAATATTCAGATGCGTAAAGAAAACCTGGAAAAAATCACCCAGCTTGAACGAA
CAGACATGCAAAGGCATCTTCAAGAAGTCTCACAATGTCACCAAGCACGCTCCAACGCCTTGAAACTTCT
CAAAGAACTCATGGATACCTTTATTTACAATTTGCGTCCGTAA
>ref|NC_003361.3|:846701-847219 type III secretion chaperone [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCATACTTAGCTTATTTATTAGAAAAAATAGCCTCCTCAAGTAAAGAAGATTACCCCTTTCCAGATG
ATTTGGAGAGTTATCTATCAGGATATTTCCCAAGCAAAGAATTCCCATTAGATACATACCAGAAAATCTT
CAAAATCTCTGCAGAAGAATTAGAACGTGTTTATAAAGAAGGTTACAACGCTTACCTAAATCGAGAATAT
CAAGAAAGTAGTAAAACTTTTCGTTGGTTAGTCTTCTTTAATCCTTTTGTTTCTAAATTCTGGTTTTCTT
TAGGAGCCTCTCTCCATATGAGCCAGCTTTATCCTCAAGCTTTACATGCTTATGCGGTAACGGCAATATT
ACGAGATAAAGACCCCTATCCTCACTATTATGCCTATATCTGTTACACTCTCATGGACCAACAAGAAGAG
GCAAGCAAGGCTTTAGAAGCTGCGTGGGAACGAGCAAAACATCATAGCGCTTACCAAGAACTAAAAGCTG
AAATCTTGGATATAAAAAACCACGCATAA
>ref|NC_003361.3|:847244-848758 hypothetical protein CCA00741 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCTTCTTGGCTCGCACAATCTACCGAGATTCTCTTAAATCAACAGCCTTACATTCCCGATAGTCCTA
AGCAATCTGAAGCGCTATCAGATATAAAATATTCAATCACACTAGCTCCAGAATCTTTAGGAAAATCTCT
AAAACTCTTTTCCGAGACACTGACGAAAACAGTATTCACAAAAAATGAAGGGAAGACTGTTTTGAATAAA
CAGCTGACTCTCGCGAGCGCTAGAGAGAAAATCTTACACTTTGGAAGTTCTTTAGCATCGCAATTACCAA
AGAAAGCACAGTCGTCATCATCTTCTTCACCATGGAATCTTTTTTCGCAAAAAAATTCCAAAGAATCGAT
GCAAGCTCTTCTTAAAGATTTAATCATGCCGAAGACTCAGGAAAAGGCACCTGAAAAGAGCTCTCGCGCC
GATGCATCTCTATTCATGCCTAAACCTAAACAATCTGAAGAACAACCAAAAACCCAACGTAATTTAGAAA
GAACTGAGATCTTCCGTGAATCTACAGAAGATTTGGGACATAAAATGCTGCCTGAGGAGGAATCTCTTTC
TTCTCGGAATGCTGATCTGCGCAGCAAAGAAGAAGAACGTCCTACTCTAAAATCGCCCCTAGGAAAATAC
AGTAAAGGATTATCACAAGATGAGCATCCAGGAAAACAGCAGCATCAAGAATGTTTCTTTAAAAAATTCA
AAAAAAACCACAAAACGCGAGCAGCTTCTGTTGTTCCTGTTATTAGCCCTCCTTCTCTTGGTGTATTTAC
CTTAAGTTACCTTTTGACAAAACAAGGAATACTTTCAGATTTTTCTGCCTACGCATCCTATAAAGATTGT
GTAGAAACGACCCAGAAGGAATTAGAAGCAACACATGCAGAACGCATAACACAACTCCAAAAATACATAG
AAAAGGAGGCACAAGCAAAGCGTTGGGGCTCAATAATGACCGTTATAGAATGGATCCTCCCATGGATTTC
TGTAGGGACATCTGCCACTCTCGTCATTATGGGTGGAGGTCTTTTCTGCTGGTTAGGTTTAATCGGTGCT
CTCATTATGCTAGTACTGACTTTACTAGATACTTTAAATGGCTGGGAAAAAATTGAAAAACTTCTTCCAG
GAAAGAACAAACAGAAAAAACAACAGATATTGAAAACAATACAAATCTCTCTTTATATCATAGCCACATT
ACTCTTGCTTGTCTCTTTAAAGACGGAAGGCCTCGGATTTTCTAAACTCACAGAAGGCATCATGAGTGGA
ATCGGCCCCGCTGTAGAAGGAGCTTTAGGTCTTATACGTGGATGTATGCTTTGGATACAATCACGGCTAT
CGAAAATCAAAGCCAGGTATTTAACTCTTGAAGCAAAAATAGAGTTATTAAATTTTGAGAGGGATGATCA
CGTCGCTCGCACTCAAGAACTCATAGAAAGCATTCATGATTCTTTAGAAAATCTCGGACGCGTGTTACAG
TTGTGTAGAGAAATAGATAGAACGTTTCTGGAAGCCCTAAGGTAA
>ref|NC_003361.3|:848778-850262 hypothetical protein CCA00742 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACAGCATCTTGTTCAACAACAACGATTACAACTTCGGAGAATGCCGAACTTGATTTGATAATGACCG
AATCAGGATCCGAAGCATCTTCAACAACAGATGCTAAGGTAACCGTTCCTGATTGTTGCCAAATGGCTAT
TTTACGTTCCATGTCCGATGCTTGTTTAAACTTATTAAATCAATCAGGTTCGGTATTTTCACAACTTCCT
TCACAAAATAAACCTGCGCCCTCAGAAACCTTAATGGCAAAAAATGGTATGCTGATGAAATCTTCATCTC
TACCGAATCTGTCATCACAAAAATCTCTGGATACATTTTCCTCAGCTGATAAGAATCCAGCTTTACGACA
AACTAACCAACTCTCCTCGTCTTTTTCTTCTGTAAAAGAACAAAAAGCACAAGCAAGTATGGGATTTTCC
TCTTGCTTAGCTCCTAAAGACGAAAGTGCCGTAACAAAAACAACAACAGTGATCTTAAACCTACCAGAAT
CTAAAGATGATGGTTATGGGGAAAAACCATCCCTTACCTTATGCAAAACGCAAGTTGAAGTGCAAACTTA
TGACAAGCAAACCATAAAAGAGCACAGCTCGAAAGATACTGGGAGAACTTCTGAAGACGCTGAAAAATCT
GCACCATCTTTACCAAAACCTTCCACATCTTCTCTCAGTCCTATGGCGCTATTCAGCCATGTACAAAAAG
AGATTGCAGAACCACGTTTCAATGCAAAATCTCAAGAAAAAGAAGAAGGAAAAGGAGAGCACGGAGAACA
GGGACAACAAGACCAAGAGCAACAACATCATAAACAGAAAAAAGATTTCGCTATTGAAAAACTTTCTAAT
CAGATGGCTGCTCACTATACGCAATCTCCTAGCTTGCCTGATGAAATTATTGAATTTGCTCTTACGGAAG
CACAGCTAAGCTCTTTACTGCACATGCGTGTATCCAATCTAGATGTCCTTAGAATCTGCGCAGAAATTAT
GAAGCTGATGTTAAATAGCAGAGAACAAGAGAATCTTGCTCGTTTAGAAGCTAGGAAGCATCTTTTGGAA
AAAGCTAGGGAGCTGATTGAAAGTTACGAAAGTCAAGCTAAGATGGCGCAGTGGTTGGGAATTGCCACAG
CAACTTTAGGAATCATAGGAGCGGCTTCTCCACTCCTTGGAGAGATCTCTGGAAAACGTATTTTAGGATT
CGTTCAAAAACATACAGGATTATGGAAAGAAGCAACAGCACGAACATTCTTTAAAAGTGCTGGTAAAATT
TGTACTTCCCTATCGCAGCTTACAGAGACCTCATCAAAAATTTATGAGCTGAAAGAAACTGCGTCACGAA
CATTTGCAGAAAACTATAAAGAAATATTCCGTATAGAACATGACGAAATCACCCGTTCTATCGAAGAGGT
AAAGGACCACTGGAAAAATATGGATAATTTCTTACTACAAATACTACAAACAGAACACGATGCTGTTCGC
AGCCTTTATCAATAG
>ref|NC_003361.3|:c850992-850270 hypothetical protein CCA00743 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCGTATTTCAACCGCCTAAAGAGCTCCGTAATTAAAAAGTCTTCATTCTTACATATATTGCGAGTAG
GAATGCATAGAATAATATTCTCTATTAGAGAATATATCTATTTATCCTTCTCACTCTATATGAAATATCC
AAAACTCATCGTATATGATTTAGCGAAGTTTTTTTATTCCTTATTCAGAAATCCCTACAGGAAGTTACGC
CGTTCTCCACAATCTTCATTGCTAAAGGAAGGAAATGTTTATGGAGAGACCCCTTGGTCAGCATTAAACA
AAGTCAGTAGGGAATTCGGAGTTACTTCTCAAGATGTTGTTTATGATTTAGGCTGTGGACTAGGGAAAGT
ATGTTTTTGGTTTTCCCATATTCTGAGATGCCAGGTTGTGGGTATAGATAACCAATCTACGTTTATTAAC
TTTGCCTCTCGTATGCATAGGCTGTTGTCTGCACAGCCTACAGTGTTTTTTCAGGAAAATTTTCATGAAA
CAGAATTGTCACAAGCTTCTTGCGTCTATTTTTACGGCTCGTCGTATTCTTTAAAAGTGTTGAAAGGTGT
CCTCATAGCTTTAGAAAAGCTAAAGTCAGGAAATATGGTCATTAGCATTTCCTTTCCTCTAGACTCTTTA
CCCGATGGAGATATGCTGTTTTACACAGAGAAAAGTTGTGATGTTACTTTTCCTTGGGGTAAGACAAAAG
CATATAAAAATATACGAAAGTAA
>ref|NC_003361.3|:c851884-850955 4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGACTGCTTTAGAGAAATGGGGAGCCCCGATTTATGTGAAACATGAAATTGTTCATAACCGACATGTAGT
AGATGATCTCAAGAGGAGAGGGGCGATCTTTATCGAAGATCTTAGCGATGTTCCTTCTGGAGAAAAGGTT
GTTTATTCTGCTCATGGGATTCCTCCAGAGGTGCGCGAAGAGGCAAGAACTCGGAATCTTTTTGATATTG
ATGCGACTTGTGTTTTGGTAACTAAGATTCATTCTGCGGTGAAGCTTTATGCAAGCAAAGGTTATCAAAT
TATTTTAATAGGGAAGAAAAAGCATGTGGAAGTTATTGGGATTCGCGGAGAAGCTCCTGAAAGTGTTACC
GTGGTAGAAAAGGTAGAGGATGTAGCTAATCTTCCTTTTGAAGAGAGTGTCCCTTTGTTTTTTGTAACTC
AAACGACGTTAAGCTTAGATGATGTTGCTGAAATCACCCAGGCGTTAAAGGTGCGTTATCCGCATATCAT
CACTTTGCCGAGTTCTTCTGTATGTTATGCTACACAAAATCGTCAAGAAGCTCTACGTTCGGTATTGCCT
AAGGTGAATTTCGTTTATGTTATTGGAGATGTGCAAAGCTCTAACTCCAATCGTTTACGAGAAGTTGCTG
AAAAAAGGAATATTCCTGCTAGATTAGTGAATAGCCCGGATCATATTTCTGATGAGATTTTAAATTATTC
TGGTGATATTGCAATAACAGCAGGAGCGTCAACTCCCGAGCATATTGTTCAATCTTGTATTTCTAGGTTA
AAAGAGTTAATACCCGATTTACAAGTTGAAGAAGATATATTTGCTATAGAAGATGTCGTATTTCAACCGC
CTAAAGAGCTCCGTAATTAA
>ref|NC_003361.3|:c853775-851994 hypothetical protein CCA00745 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGACTTTAGTTCAAAAAAATGCATGTTCTGACTTGGATTTTTTGGAACACTTACTTGATGTTAAATATGC
TCCTAAAGAGTGGAAACATAAGCTTTTTCATTGGGATTTGAAAGATGCAACGGATCAAGCACGTTTAAAA
TTGTGTATTGAGGAAAATCCTTCAACAAGCTACTGCCAAGGAGTTCTTGCAGAATATATCTCTGATTTAA
AAGATTTTCATGCCGGGATTACTTTCTTCCGCACAGAGAATTCTCATCTACCTTATACGGTTAAGTTAAG
CAATTCTCGCAGATGCTTTATTGTTGATGTGCATACGTATAACTCTGAAATTTCTGTAGGTGATGAAATT
TTAGAGATGGACGGTATGCCGATTATGGAGGTAATCGAGAGTATACGTACTGGTAGAGGAGCTCTTTCTG
ATTACGCTGCAGCTGCACGAACACTCTTTTCTCGTTCTGCTGCCTTAGGCCATCAAATTCCTATGGGAGT
GGCAACATTAAAAATTCGTCGTCCTAGCGGTTTAACGCGTACGGTAAAAGCTAAATGGCGCCATACGCCT
GAATATATTCAAGATCTATCTTTAATATCTCCTTTAGTAAAAGATCCTATCATCCAGATGAGATCTAGCC
GTGCTTGCCCTTTATTATCTAGTGCTTCTGAAAATTGTTTATTCACAAACGAAATGGTTCCTTATTTCTG
GAAGGAATTACGTCAGCAATATAAACGTGGTTTAAGTAGTGATTACAATATCGGAAGTAAAAGAGGTTTC
TTACCTGATTTTGGACATGTGACATGGAAAGCTAAAAGTGGTCCTTACCATGCTTATGTGTTCACCTGCA
CCGATAATCATGGACAGTCTCACAGTATTGGATTCCTTAGGATTTCTACATATTCTTGGACAGATATGGA
AGATCGTACTGCTATGAATATGGAATCCCCATGGGATGACTTCAGCGAGATCATTAGTGTTTTACAAGAG
AAAACCGAAGCTTTGATTATCGATCAGACAAACAATCCTGGTGGTAGTGTCTTCTATCTTTATGCATTGA
TTTCTAGATTAACAGACAGACCTTTAGAAACACCTAAACATAGAATGATTCTCACTCAAAGTGAAGTACA
ATCTGCAGTACAATGGTTGAACCTTCTTGAAGGAGTTGAAACCGATGAGCAAGCAAGAAATGCTCTCGGT
GAGGATATGGAAGGTTATCCTATCGATATGAATGCGGCAGGATATCTACAGACATTTTCTAATACTGTTT
TAAAATGTTGGGCAAATGGGGATATTAATCTCTCTACACCTATGCCTTTGTTAGGATTTGCTAAAGTACA
TCCACATCCTGAACATCGTTATACACGTCCTATCTGCGTCTTAATCAATCAGGAAGATTTCTCCTGCGGA
GATTTATTCCCTGCGATTATGAAGGATAGCGGTCGAGCTCTTATTGTAGGAACGGCCACAGCAGGAGCCG
GAGGTTTTGTCTTTAACGTAGAGTTCCCTAATAGAACAGGCATTAAAAGTTGTTCTTTAACAGGATCTCT
AGCAGTAAGACCTGACGGTTCTTACATAGAGAATTTAGGGGTCTCTCCTCATATATTCTTAGATTTTACA
GATACGGATGTACAAACAGGAAAATATTCTGATTACATTAGCACTGTGAAAAGTTTAGTTCTTGATCTTA
TTGAAAGAGAAGCTGATAACAAAGCTTCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c855152-853890 Na+/H+ antiporter, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTGAAATTCCAATTGTGTGCTCTGTTTTTATTTGGATACATCGCGATTGTTTTCGAGCATATTGTGC
GAGTGAATAAATCTGCCGTGGCTCTTGCTATGGGAGGTTTAATGTGGCTAGTTTGTTTTTCTCATATACA
ACATGCGGATCACATGATTCTAGCTGAAGAAATTGCTGATATGGCTCAGGTAATCTTTTTTTTATTCGCA
GCGATGGCTATTGTTGAACTTATAGATGCACATAAGGGATTTTCGATAATCGTACGGTGTTGTTATATAC
AGTCTAGGACCTTACTCCTTTGGGTGCTTATAGCACTTTCTTTCTTCTTATCAGCAGCCTTAGATAACTT
AACATCTATCATCATCATTATTTCCATTTTGAAGCGGTTGGTGAAATCTCGAGAAGATCGTCTGCTTTTA
GGGGCTATTTGTGTTATTAGTGTGAATGCTGGAGGTGCTTGGACACCTTTAGGAGATGTAACAACAACAA
TGCTATGGATCAATGATAAAGTCACTTCTTGGGGAATTATTCGCGCTTTATTTGTTCCTAGTTTGGTTTG
CGTTCTTATTGCCGGGGTTTGTGCGCAATTTATGCTTAAAAAGCGCACTACAGGAATGATCTCTAAGGAT
GTTGAGATAGAAGGTTCTCCTAAAAAAAGTGGTTTGATCATTTGTATTGGTCTAGGATCCTTATTGATGG
TTCCTGTCTGGAAAGCTTGTTTAGGAGTTCCTCCATTTATCGGAGCTTTACTAGGACTCGGTCTTGTTTG
GTTGGCTAGTGATTGGATTCACTCCCCCCATGGTGAAGATCGCTATCATTTGCGTATCCCTCACATTTTA
ACGAAGATCGATATCTCCTCAATTACCTTTTTCATAGGTATCTTGCTTGCTGTCAATGCTTTGACTTTTT
CCAATGTTCTTTCCGAACTTTCAATGAGTATGGACAGGATATTTTCTAGAAATGTTGTCGCTATTTTTAT
TGGTCTTATTTCAAGCGTATTGGATAATGTTCCCCTTGTTGCTGCGACTATGGGTATGTATCAAGTCCCG
ATGGACGATACTTTATGGAAGTTGATTGCTTATGCGGCAGGTACTGGGGGAAGTATTTTAATCATAGGAT
CGGCTGCTGGAGTTGCCTTCATGGGTATCGAGAAAGTTGATTTTCTATGGTATTTTAAGAAGATCTCTTG
GATTGCATTGGCTAGTTATTTTGGCGGTCTTATTTCATACTTTATGCTCGAGCGCATTGCTATGTTGTTT
TGA
>ref|NC_003361.3|:855428-857128 sulfate transporter family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGAAAGTCGCCTTATCGTTTAAACATCTTGTTCCTAAGCTCTACACATGTATTAAGGATGGTTATACCT
TTAATACATTTAAAAAAGATTTCTTAGCTGGACTTACTGTAGGCGTTCTAGCTTTTCCTTTCGCTATTGC
TATTGCAATCGGTGTGGGCGTATCCCCTATTCAAGGTTTATTAGCTTCGATCATCGGAGGGTTTATAGCC
TCTGCTTTAGGCGGTAGCCGTGTTCTTATATCGGGCCCGACAAGCGCTTTCATCTCTATACTTTATTGTA
TTTCGGCAAAATATGGAGTCGAGGGGTTATTCACAATCACCCTAATGGGAGGGGTATTCCTGGTAGCCTT
TGGGCTTACAGGACTGGGAACTTTCATTAAATATATGCCCTACCCCGTGGTTACAGGATTGACAACGGGA
TTAGCTGTTATCATTTTCTCCTCTCAAATTAAAGACTTTTTCGGTCTGCAAATGGGAGATAGCGTTCCTA
CAGACTTCATTGCTAAATGGATAGCTTACTGGGATTATCTATGGACCTGGGATAGTAAAGCTTTTGCCGT
AGGGTTATTCACCCTACTCATCATGATTTACTTCCGCAATTATAAGCCGCGATATCCAGGAGTCATGATC
GCTATTATCGTAGCTTCAACACTAGTGTGGTTACTAAACATCGATATTCCTACGATTGGCAGTCGTTACG
GAGCTCTTCCAAAATCGATACCTATGCCTTCGTTCCCACATCTTAGCCTGACAAAAATTTTACAGCTTAT
GCCGGAAGCTTTAACTATTGCCGTTCTTTCCGGTATTGAAACTCTACTTGCAGCTGTAGTTGCTGATGGT
ATGACAGGATGGAGACATCAATCCAATTGCCAGCTTGTTGCACAAGGTATCGCAAATATTGGTACATCAT
TCTTTGCCGGTATGCCTATAACAGGTTCCTTATCAAGAACTGCAGCAAGCATTAAATCTGGAGCTACAAC
TCCTATAGCAGGATTGGTTCACTCAGCCTTTATCTGTGTTATTCTTTTAGCTTTAGCACCACTAACAGTA
AAAATTCCTCTTACCTGTTTGGCCGCTGTTCTTATTCTGATTGCTTGGAATATGAGTGAGATACATCACT
TTATTCATTTATTCACTGCTCCTAAAAAAGACGTTGTTGTTCTTCTAACCGTCTTTATCCTTACGGTTAT
GACGAATATCACTTCTGCAGTGCAAGTGGGTATGATGCTTGCCGCGTTTCTATTCATGAAACAGATGAGT
GATCTGTCTGACGTGATATCTACAGCAAAATATTTTGATGAGAATAAGCAGGCAAAAGATGATAATTTCT
TTTCTAAATCTGAAGTTCCTGCACATACAGAAATTTATGAAATTAACGGGCCTTTCTTCTTTGGAATTGC
TGATAGATTGAAAAATCTTCTCAATGAAATAGAAATGCCGCCAAAGATTTTCATATTATGTATGAGTCGC
GTGCCTACAATTGACGCCTCCGCTATGCATGCTCTAGAAGAATTCTTTTTAGAATGCGATCGCCAAGGGA
CGCTCTTGCTTTTAGCAGGAGTGAAAAAAACACCGCTAAGCGATCTCAAACGCTATCATTTGGATGAGCT
TATCGGTGTTGATCATATCTTCTCGAATACGAAGAGCGCTCTCTTATTTGCTCAAGCTTTGATCAATTTA
GAAAGCAAAGCCTCTCATTAA
>ref|NC_003361.3|:c858507-857125 fumarate hydratase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCGGCAAGAAAATGATAGTTTAGGAATTGTAGAAGTCCCTGAAGATAAGTTGTATGGTGCGCAGACAG
CGCGCTCTCAAAAATATTTTTCTTGGGCTCCTGAGGTTATGCCTAAAGAAGTTATTCGAGCTTTAGTTTT
GATCAAACAATGTGCTGCTAAAGCCAACCATGATCTAGGGTTTTTAGATTCAAAATATTGTGACATGATT
GTTTCTGCTGCTTCTGAGATTCTTGAAGGCGGATTTGAGGAGCATTTTCCTTTAAAGGTATGGCAAACGG
GCAGCGGCACGCAATCCAACATGAATGTAAATGAGGTTATTGCTAATTTAGCTATTCAACGTCATGGAGG
GGTTGTAGGTAGTAAAACACCGATACATCCTAATGATCATGTCAATAAATCCCAATCTTCGAATGATGTT
TTCCCTACAGCTATGCATATTGCTGCGGTGATTAATCTGAAGAAAAAGCTCATTCCCGCTATGGATCATT
TGCAAAGGGCATTAGATGCTAAGGTAGCTGAATTTCGTGACTGCGTAAAGATAGGAAGAACACATTTAAT
GGATGCTGTTCCTATGACATTAGGACAGGAGTTTTCTGGTTATAGTAATCAGATACGTCAATCCTTAGAG
AGGGTAGCGTTTTCCCTTACGCATATGTATGAGTTAGCTATAGGGGGAACTGCAGTAGGTACGGGATTGA
ATGTTCCTAATGGATTTATAGATAAAGTGATCCACTATTTGCGTCAGGAAACCGGAGAGCCTTTCGTTGC
TGCATCGAATTATTTCTCAGCATTATCTAACCACGATACGTTAGTAAATGCTCATGGTGTTTTAGCTACT
TTAGCTTGTGCTTTAACAAAGATAGCTACGGATCTAAGCTTTTTAGGATCTGGTCCTCGGTGTGGTTTAG
GAGAGTTGCTATTTCCTGAGAATGAGCCGGGATCTTCAATAATGCCGGGGAAGATCAATCCTACACAGTG
CGAAGCTTTGCAAATGGTTTGTGCTCAGGTTATAGGGAATAACCAAGCAGTAATCATGGGGGGAAGTCGA
GGAAATTTTGAACTCAATGTGATGAAACCTGTAATAATTTATAACTTTTTACAATCTGTGGATATTCTTG
CGGGAGGTATGCAGGCTTTTGCAGATTACTTTGTTTCAGGTTTGCGTGTGAATAAACCTCGTCTTAAAGA
GTATTTGGATAACTCTTTAATGCTTGTTACAGCTTTAACTCCAGTTTTAGGATATGATAAATGCTCGAAA
ATGGCTTTAAAAGCTTTCCATGACAATATTAATTTAAAAGAAGCCTGTATACAAATGGGTTATCTATCTG
CAGAAGAGTTTGACCGCCTTGTTGTTCCCGAATCTATGGTGGGAAAATTTTAA
>ref|NC_003361.3|:858560-860392 ABC transporter, permease protein, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAACAAAGTTTTTGTGTTACTTTCTAACTATTTCTCTTTTCATTTTGTTTTGGGAATTTTTTGCTA
GAAATAACGCATCATTTTCCTTTCTCTGTCCGCCTCCATCAAAAATAGCAGCGAATTTTTCAGATTCTAT
GAATCTTATCCTTTCTTCTTCCTGGTATACTCTGCGAGGTATTTTAGGAGGATTCTTTTTAGCGCTATTC
TTGTCGATAGGCTTGGTTATCCTTATGCTAACCTGCAAGCTAGCAAAAGATCTCTTAAATCCATTTTTCA
TACTGGTACAATGCACTCCCATGTTCACCCTAGCACCGTTAATTGTGCTGTGGTTTGGCTGGGGATTAAA
TGCTGTCATTGTTCCTACGGCTCTTACTGTCTTTTTCCCTCTAACAATAACGATCTATCAGGGGATCACA
TCCACCCCCCCAGAGCTTTTAGAGCAGTTTACGCTACATCAGGCAACAAAACGACAAGCCTTCATTAAAC
TACGCCTCCCCCATGCTCTTCCTCATATATTTTCAGGGTTAAAAATTGCTATGGGATCTGCAGGATTTGC
CGCTATAGCTGGAGAATGGGTAGCTTCACAATCAGGTCTCGGCATTCTTATTTTAGAAAGCCGAAGAAAT
TATGATATGGAAATGACCTTTTCAGGATTGTTTGCTCTAACAACGGTAACTTTCATCCTATTTCAAGGAA
TTTTACTAAGCGAGAAACTGATCTTTGCTCTATTTCGCATAGAGATAACAATAAAAAAACTTCGCCTGCC
AAGTAGAAAATTGGCTATGTTACTTATTCCCTTACTTATTCTTCCTATATGGAAAATCAAAACTAAACAC
ACACAACCCAGTAATCTAACTCCTATAACTTTGCTTTTAGATTGGACTCCCAATCCTAACCACATTCCCT
TGTATGTAGGGGTTTCTAAAGGCTTTTTCCAGAATCAAGGTATAGATTTACATATTCAAAAAAGTACTGA
TACCGGAGCTGTTATTCCCCATGTTCTATTCGAACAGGTAGATCTGACTCTCTATCATGCTCTTGGAGCA
ATAAAAACCTCTCTTCAAGGAGCTCCTGTACAAATAGTCGGATCGCTAATCGGTTCTACTTTGCAAGGAT
TTATCTATAGGAAAGAAGATAACATCTCAAAATTCAAAGACCTAAACAATAAAGTTTTAGGGTTTTGCCT
AAACAACTCGCGAGATCTTTCTTGTTTATTAGAGACGTTACGCCTACATGGGGTTGTTCCCTCAGAGGTA
CGCAATGTTAGCTCTGATTTAATCTCCCCCATGTTACTGAAGAAAATCGATTTTCTCTATGGAGCTTTTT
ATAATATTGAAGGTGTTAAGCTAGATACTTTAGGCATGCCTGTAGGCTGTTTCCTATCCGATTCCTACGG
TCTTCCTACTGGCCCTCAACTTCTCTTATGTGGAAAAAAAGATACGAAAGCCACATCTCCAGAAATTGTC
GAGGCAATACAAAGAGCTCTTCAACAAAGTATTCATTACTGTCAACAACACCCTAAGAAAGCCTTTCAAG
CATATCTTAAAGCGACACCGGACACACCTAAAATTGTTAAAGATGAACTTCTTCAATGGGAAGCAACTCT
CCCTTTACTTGCAAAATCTCAAGAACCACTGAGCAAAGAACTCACAAATGCTTTATTACAAGCTATAGTT
CACCGTTACCCGAACTTGGCAGATAAGATTACAAGCTTCTCTCTAGATCACATATACCCGTCTAATTCAC
AGGTTTGCCAGGATGAGAAAATACATGAGCAAGCCGAAATAGGACATCTCGAAGCACTTCCATCGGTTTC
TGGTCAGCACTAA
>ref|NC_003361.3|:861051-861659 hypothetical protein CCA00750 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGACACTATTTATTTTCTATTATCCCAAGCTTGCATATTATTATTTGCAACAGATGCTTTAACTAATG
TTTTAGTATTAAACCATGTACTTGCTCCTTATTCCAGAAAGGCGCGTTTATCTCTATTAGTCAGAGAAAG
TGTATTTGCTCTCTTTAGTATGTTCGCTCTTTACCAGGCCGCTTTGGGTACTCTCTATGTGCTAAAAACA
CCTCTATGTGCCATAAAAGTTGTAGGGGGAATCGCCGTCACTCTAACAGGAATCCGGGCTATTTTAAATT
TAAGTAGAGAAAATAGCTGGAAAGGGTTTACCTCTCCCTCTTCCTTATCCATGGTAACACCTATTGCTCT
GCCCCTGATGATCGGACCTTCTTGGCTAGCTGCCTGCTGTACTTTAATAGGCAAGCGCTATAGCTTTGCT
TCTGTTTCTCTTATTCTCATTCTTTCTTGGTTCCTTATTTCCCTAACAACGATCATCCTACAAGTTTTTA
TTGGTGGGGGAAAAGAAAAGACCAAGCCACTTCTTGCTATACAAACAGTACTTGGTCTTTTTGCGACAAT
TGTAGGTACACAGTTACTTATGTCCGGATTACAACTAGCCTTCTTATAA
>ref|NC_003361.3|:861672-862280 hypothetical protein CCA00751 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTAACTCTTATCAATCTTAGCTTGTTATTCTACGTACTCTTTGACGCTCCGGGATCTGTTCCCGTTT
TTGTGTCCTTGTTGAAGCGCTACTCTGCGAAAAGACAACAGCATATCATTCTTAGAGAATGTGTCTTTGC
TCTTGCTACCCTATTACTTTTTGTTACCTTTGGAAGAAAATTCTTCCAATTTCTTGACATCTCCTTATAT
GCATTTCAATTCATCGGTGGTGTTTTGTTATTTTCAGTATCATTGAAAATGATGCTGGTCCCCCCACCTG
TAGAATCTGATTCATCTGAACCTCAATCAGAACCTATCTTCTTTCCTCTAGCCTTCCCTGTAATCACCGG
GCCTGCGGTAATTACTGCTTTGCTTAGCTATATGGAAGAAAATCTGTTTTCTAAAGAACTTATTCTTGGT
GCTATGATTATAGCTTGGGTACTATCTGTATTTACTTTATTGAGCTCGAGTTTTTTCAATCGTATCCTCG
GATCTTCCGGTTTAGTTGCCTTAGAAAGATTGTTCAGTGTTGCCTTATTATTAATGTCTGCAAACCTCAT
GCTTAAAGGTATTTCCATCGCGTTTAACATAGGTTTTTATATTAAGTAG
>ref|NC_003361.3|:862290-863165 methionine aminopeptidase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAAGAAATGATCCCTGCTGGTGTGGAAGCAAACGCAAGTGGAAACATTGCCACTATCCTCAGGCTC
CTCAAGTGTCCTGGGAACAACAAAAACAATATTACGCGTCGCAATACGATATTATTTTAAAGACTCCTGA
GCAAATCGAAAAAATCCGTTATGCGTGCCAAATCACTGCTCGCATCCTCGATGCTCTCTGTGAAGCATCT
AAAGAAGGTGTAACTACAGAAGAGTTAGATCAACTCTCTCGCAAATTACATAAAGAGTATCATGCGATCC
CCGCACCTTTAAACTATGGAACCCCACCTTTTCCAAAAACAATCTGTACATCACTTAATGAAGTGATCTG
TCACGGGATTCCTAATAACAATCCTTTGAAGAACGGCGATATTATGAATATCGACGTTTCTTGCATTGTT
GATGGATATTATGGCGATTGCAGCCGCATGGTAATGATTGGAGAGGTCTCAGACATAAAAAAACGTGTAT
GTCAAGCATCTTTAGATTGTCTAAACGCAGCTATAGCTGTGTTAAAACCTAACCTACCCCTATATGAAAT
TGGCGAAGCTATAGAAGCTTGCGCCGATACTTACGGATTTTCTATTGTCGATCAGTTCGTAGGGCACGGA
GTAGGAATAAAATTCCATGAAAACCCTTACGTCCCTCATTACAGGAACCGTAGTAATATACTATTAGCTC
CTGGAATGACATTCACCATAGAACCTATGATCAATGTTGGGAAAAAAGAAGGAATTATCGATCCTAGAAA
TCACTGGGAAGCAAGAACTTGTGATAACCAGCCCAGCGCACAATGGGAGCACACCCTGCTTATTACTGAG
ACAGGTTATGAGATACTAACTCTTCTAGAGAAGTAA
>ref|NC_003361.3|:c864399-863122 hypothetical protein CCA00753 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGGATTTGAGGCCATGCACGTTTTTAATAAACATCTTTATCGAAAAGTCTATCAAGGATTTAGATGGG
AAACTTTGTTGGGTAGATGTAGGTCTTTTTCAATAGAGTGGGTATTTCTATCATCTATAGTTTTGATTTT
CTGTGGATTAGGTTGTGCTTCTATCGTGGATGCAACGTTACTTCTGTTAACGATGTGTTTCTCTGCTTTA
GCTTTAGTTGCTTCTGTTTATTTCCGGTTTTGGGGATATGGTGTAGTTTCTTGTTTATTTCTATCTGTAT
ACTATTATAAGTACATCGCTACTTATTCTTCATTATTGTGGGCTTTAGGGCTATCTACAGCCTTTTTATT
ATCTTGGGGAATTTTTGTTTTTGGCATATCCCTTATCGATGAAGAAAATGATGAACAAAAACAAAAATAT
GATCAGCTATCAAACGAGTATACGGAGATTCAAGTAGCTTACGATAAAGTAGTTCATGATAAAGCTATGG
CGTGTGAATTTTTAGAAAAACGTGCGCAAGCTTTAGAATCTGAGCTTCAAGAATACCGGGCTTTGCTGCA
AGCTTCTTGTAAGAAGCAGGAGCATATGGCTTTAGACTTGCAGATTCTTGCTGATCAGAAAAATAGCTGG
TTGGAAGATTATGCTGTTTTACATAATGAATATGTTCGTCTTGTAGCTGGAGATGAAACAACTTCTGTAT
TTTCTTGGGTATCTGGGAAAGAAACTTTTTCCAGTAACGAAAGTAAGGATGCTGAGCTATGGCTCCGCAC
TTTGCGAGAAAAAGATGAGAAGGTGTCGTCCTTAGAAAATAAGCTTATTGAAGAAAAATTACTGAGAACA
ACCCTAGAAGAGGAATGTCATAGTCTTAAGTCTCATGTTCAAGAAGTCGATCAACTGCGTGTACGATTAG
AAGAGTGTCAGAATTTTTTACATCAAAAAGATGAGGAAATTGCACAATTAAATGCTCTTGTGAACGAACA
AAAAGCTATCGTTATTGAAACGCCGGCTATTGATGTTGAGCTTAAGTCTTATAAAGATAAATATTTGCAG
CTAAGAGAACAGTTTGCTGAAAAAACAGAGACGCTAGCAGAAGTTCGTAAGGAGCTTTTCTTAGTTCGTG
AAGAGTATCTTGCTTTACAAAAGCAAGAGGAAATCACCTCGAGCTTTGCAGATATGAAAGACATCGAGAT
GATTCAAAATCTTCTAGCACATATAGAAGGGTTAGAAGAAGAGATTACTTCTCTAGAAGAGTTAGTATCT
CATAACCTGTCTCAGTAA
>ref|NC_003361.3|:c864597-864412 hypothetical protein CCA00754 [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGTCTGGAAACGAATGTGACGACGGGACAGGAACTTTCGATGAGGATGTGAGTGCTTATGTATTGGTGA
CTTGCGGGCATGCGTCTTCAGATGGTAAGATGAAAGTAGAGATGACCTACGAGGGAGATCCTGCTGTGAT
TAGCTATTTATTAACTAAGGCTCAAGATTCTCTGGAAGAATCTTAG
>ref|NC_003361.3|:864851-865354 hypothetical protein CCA00755 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACAATACAACCTATCAGCACCGCATCTACAGCTTCGATAGCATCTAAAGAAACGGCGCAGGCTGCTC
AACTTCCTCCTTTAGATCCATTAAACACACCTCCTATTGGGGCATTGCTTTTTAGTATTTACGAGCTTCT
CCTACAAGCGATTGAAATTCGACAACAAACAGTTCTGACTCAATCACAACAATTAAATGATAATACTAAT
ATCCAACAACAATTAAACCAAGCAACTAATCAAATCAAATTTGCTGTTGTAAGTGCTGGAGGCAAGGAAG
ACGAAATTACTCGAGTACAAAACCAAAACCAGAACTACTCCGCTCAAAGATCAAATATTCAAGATGAATT
AGTCACTGCTCGACAAAATGGACAAATTATCCTCTCACACGCATCTACGAACATTAACATTATCCAACAA
CTAGCCTCTCAAGACTCCTCGTTCTTAAAAACGACAAGCGCCATTGGAAGTACAGTAAACCAACTCAACA
AACCTCCTTCATAA
>ref|NC_003361.3|:865405-865923 hypothetical protein CCA00756 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTGGTTCTCTTCTCCAGCACTTCAAACTAGCCCTAGAGCCGCTATTGACGTTCCCGGGACATCTATCA
CAGGTGGACCAAATACAGCAACAGCCGATGAAATTATTGCAAAATTTGCGAAAGATTCCAATCCTCTGAT
TATCACCGTGTACTATGTATACCAGTCTGTATTGGTAGCGCAGGACAACTTATCTATTATCGCTCAAGAA
CTTCAGTCTAATGCTTCTGCCCAGACTTTTTTAAACAACCAAGAAGCTTTATACCAATACGTAACCATAC
CTAAGAACAAATTAAACGATAACTCGTCGGCGTTCTTACAAGATGTTCAATCAACAAACCAAGCTGTTGG
AGCTTCTCGACAAGCACTACAAAACCAAATTTCAGGTTTAGGAAATGGTGCTCAGGTTATCTCAAGTAAC
TTGAACACGAACAATAACATTATCCAACAGTCTCTACAAGTAGGCCAGGCGTTAATTCAAACGTTCTCAC
AAATTGTAAGTTTGATAGCAAACATTTAA
>ref|NC_003361.3|:865943-866473 hypothetical protein CCA00757 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACCACCCAACCTATAATACCAGGCGTTGATAAAGTCCCAACAGTTGTTCCAGCAAGTACAAAAGTTG
TGTCTGATAGTATTGTGATTAATAAACCTTCCGCTATCTATTTCTGCATCTCTGTAATGTTGCAGTTATC
GACATCTACTACAGAATTCGGAAAGGCCATTATGTCCGTACTTCAAGACAATACGGTAATACAACAAAAG
AAAACAAAAGAGCTTATTAACCTACCTTTATTGAAAGTCCCCGACCTTCAAAAAGTTGATAATTTTAACG
CAGATAAACCTGAATATAAAAACCAGACAGAAATCCAAGCCTATCAAACCTCGAACCAACAAATTACTGC
TAACCGACAGTTAATCCAGCAGGAACTGGCTGCTGCACAACAAAGAGCACAAGCAAACCAAAAAGCGGTA
AATGCTACGTCTACGGAATCTATGAAGTTATTGCAAGCAACTAATGCTCTCCTATCTTCATTAAAAGACT
ATAATATTAAAGCAAATCTAACGACATCTCCGTCTGATTAA
>ref|NC_003361.3|:866557-867264 hypothetical protein CCA00758 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGGGTTATCTTCCCAGATAAACATAACAGATACCCGTTTCTCACTCAGATACTTAAACGGCTTCCCT
CGTTTATCTTAATAACCTCATGTGTTTCCCCTATTCTTTCTTATTTGATGAAAAAACTCTTTGGCATCCC
AGGGATCATTGAAACCCTGGCGCTATCCACAGAAGGAATTCATAAATATAAATTCTGGCAGTTTATCACC
TACCCCCTCATTACCGCAGATTCTCTATGCATCCATAAAGAAGGGTGTATGGACATTACTCAACGGTTAC
TTATTAGAAATATGCTTGGCTTCACTTTCTTTTATAAAGCCACTAACCACGTCATTCGAAAACTAGGGTC
AATAACCTTCCTAGTCCTTATTGTCAGCCAGACTCTTATTATAGGAGTTGTCATTTGGGGATGCTTGAAA
CTATTTCACAGCTCACAGGCCCTATTTGGTCCAGAATGTTTAATTAGCACGCTGATGTTAATTTGGGTTT
TCCTTGATCCAGAAAAACGCCTAGGACTCACCCCACTCCCTATTACCCTATCGCGTAAATGGGGATTTGT
CGTCCTAGCAACCTTTTACTTCTTTATTCTACTCTTCTCAGGAGCCTTCGCTTTATTCTTCGGATCGATA
TTATCCCTAATGTTAGGGGTTCTTTTTTGCTATAAAGAAAAAATCCCTAATCCCTACAGAATATCTCGGA
TGTTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c867491-867261 hypothetical protein CCA00759 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAAATAAACTACATGATTTGTTGAATCAGCTTTATGAAAATCAAAAATCTCGTTTACAAAGCATGG
GGGAGCAGATCGTCCCGAATTTAACTTCTGATGATGTATTACAGCCCATGGATTTTTCTATGCTGGAAGA
AAATCCTTTCTTTCGGTTTGAGGAAGGTGTTCTTTCTGGTCTTGGAGAGGCTCGGGCGGCGATTTTGGCA
TTATTTGCCGAAGAAGGTTAA
>ref|NC_003361.3|:c867954-867481 cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGATATAGAAAAAGATATATTTTTTATGAATCAAGCACTAAAGGAAGCTCGCCAAGCATATGATCAGG
ATGAGGTTCCCGTAGGCTGTGTTATAGTTAAAGATAATAAAATAATTGCTCGTGGTCACAACACTACGGA
GAAGTTTCAGGACCCAACTGCTCATGCTGAAATTTTATGTATAGGAGCCGCAGCACAATATTTAGAGAAT
TGGCGTTTGGTAGATACCGTGCTCTACTGTACTCTTGAGCCTTGTTTGATGTGTGCTGGGGCTATTCAAT
TAGCCCGTATTCGTAGAATTGTCTGGGCAGCTCCGGATTTGCGTTTAGGTGCAGGAGGAAGTTGGATAAA
TGTTTTTACAGCAAAACACCCATTTCATCAGGTAGAGTGTTTCTCGGGGATCTGCCGTGAGGAGTCTGAA
CAATTGATGAAACAATTCTTTATAGAGAAGCGAAAAGAGAAAAATGAAAAATAA
>ref|NC_003361.3|:868198-868467 30S ribosomal protein S15 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCTTTGGATAAGGGAACTAAAGAAGAAATTACAAAAAAGTTTCAACTTCATGAAAAAGATACCGGTT
CAGCAGATGTGCAGATCGCTATATTAACGGAACACATCACAGAACTAAAAGAACATCTCAAGAGATCTCC
TAAAGACCAAAACTCTCGATTAGCCCTACTAAAATTGGTAGGACAAAGAAGAAAGCTCTTAGAGTATCTT
AACTCTACAGACACCGAAAGATATAAAAATTTAATTACAAGATTAAATTTAAGAAAGTAA
>ref|NC_003361.3|:868515-870599 polynucleotide phosphorylase/polyadenylase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACATTTGAAACTATTTTCGTTACCCTCGAAGAAGGCAAAACATTAGTATTTGAAACGGGGAAAATTG
CTCGCCAAGCTAACGGAGCTGTTCTTGCTCGCATGCAAGAAACTTGGGTCTTTTCATCTGTTTGTGCGGC
CAATCTCGAAGAACCTGTAGACTTTCTCCCTTTAAGAGTCGATTATCAAGAAAAGTTTTCCTCTATAGGA
AAAACTTTAGGCGGGTTCATTAAAAGAGAAGGTCGCCCAACTGAAAGAGAAATTTTAACTTCTCGTTTGA
TAGATCGTTCTATGCGTCCTTCTTTACCGAACCGGTTAATGCAGGATGTTCAAGTCTTATCTTATGTATG
GTCTTATGATGGGGTGACTCTCCCCGATCCTATAGCTATTTGTGGTGTTTCTGCAGCACTAGCAATTTCT
GACATTCCTCAAATTAGTGTTGTAGCTGGTGTTCGTGTTGGCTTTGTCAACAATAGTTGGGTAGTTAACC
CAACAAAAGCCGAAATGGATGTTTCTAGAATGGAGCTCGTTTTAGCAGGAACCGAAAATGCTATTCTAAT
GATAGAGGGTCATTGCGACTTCTTAACGGAAGAGCAGGTTATCGAGGCTATTGAATTTGGTCATAAACAC
ATAGCAACCATTTGTAGAGCAATCAAAGACTTGCAGCAAAAGGTAGGCAAGAAAAAGAATTCCGATGCTA
TTGTTCCCCTTCCTGAAGAAGTTCAATCTTCTGTAAATACGTTTGTTGAAGGCAAATTTGCTGATCTTTT
AAAAATTAAAGAGAAAAAAGCTTTTGAGGCTGCTTCGAAGCAATTAGAAAAAGAAATTGTAGAGAAGTTC
CTAGAAGAAAATGAGATCTTCACAGCATTGAATATTAAGACAGCTTTCAAACAAGCTAAGTCGGATTATA
TGCGTGCTTTGATACGCGAACAAAGTGTTCGTTCTGATGGACGGGCAATAACAACAATCCGTCCTATTTC
TATTGACACATCTTTCTTACCAAGAACCCACGGAAGTTGTTTATTCACTCGTGGAGAAACACAAACTGTG
GCCGTTTGTACTTTAGGTAGCGAGGCTATGGCGCAGCGTTACGAAGACTTGAACGGTGAAGGGTTGGCTA
AATTTTATTTACAATACTTCTTCCCTCCTTTCTCTGTTGGCGAAGTAGGAAGAATAGGTTCTCCAGGAAG
AAGAGAAATTGGTCATGGTAAGCTTGCTGAGAAAGCTTTAAGCCACACTCTTCCTGATCCTGCAAAGTTT
CCTTATACTATCCGTATAGAATCCAACATTACTGAATCTAATGGTTCTTCATCCATGGCTTCTGTTTGCG
GAGGTTGTTTAGCTTTAATGGATGCTGGGGTCCCTATTAAAACTCCTATAGCAGGTATTGCTATGGGGTT
AATCTTAGATAATGATCACGTCACTATTCTTTCAGATATTTCTGGATTAGAAGATTATTTAGGAGATATG
GACTTTAAGGTTGCTGGGAATACCGAAGGGATCACAGCATTCCAAATGGATATCAAGGTAGAGGGCATCA
CCCCTACAATTATGCAAGCAGCCCTAGCTCAAGCTAAAGCTGGCCGTCAACATATCCTGGATATTATGAA
AGAGGCTCTTGCAGCTCCAAAAACAGACTTATCACAATATGCTCCTCGTATTGAAACGATGCAGATTAAG
CCAAATAAAATTGCTACTGTTATTGGACCTGGAGGAAAACAGATTCGTCAAATTATTGAAGAAGCTGGAG
TGCAAATTGATATTAATGACTCAGGTCTTGTCAGCATTTCAGCATCTTCTCCACAAGCGATAGAAAAAGC
TAAGTCTATGATTGAAGGTTTAGTTGGAGAAGTTGAAGTTGGTAAAATCTACGAAGGTCGAGTGACATCT
ATTGTTCCTTTCGGGGCTTTCGTTGAAATTCTTCCTGGTAAGGAAGGTCTTTGCCACATTTCTGAATTCT
CTAAACAACGTATAGAAAACGTTGGTGATTTCGTTAAGCAAGGAGACATCCTGGCTGTTAAATTGCTAAG
CATTAATGAAAAAGGCCAATATAAACTCAGCCATAAAGCTACTCTCAGCGAGTAG
>ref|NC_003361.3|:c873429-870688 cell division protein FtsH, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCTAAAGATAAAAAAATGAAGCCCGAATCGAAAAAAAGTTTCCCTACATTGTTTTTTTTCCTTTTAT
TTGGTGTGATCTTCGCCGTAATAGCCGTTCAAAATTTTCTAGTTACCAAGAAGGCACGGGTCAGTTTTAG
CCATCAGCTAGAGCATTTAGTAAACTTAAAATTGATTTATCCTGAAGATAGCCGAAAGATTGCTCTGAAT
GATAACTTAGTTTCATTTAGTGGACGTTTCCGAGACTCTTCAACAGATGAAAGCCAACTACGCTATCATT
ACTTAGAATTGATAGATCAAAGACATCAATTAGAATTTGATCTTCAAGAAATAAATAAGAGTTTAGACAA
CCTTTCGAAAGAGGTTGAGAGCTCTGTTTTATGGTTTTCCGCGATTTCAGGATGGTCTATCCCTGAAACA
GGTTATTTGATTTCTCCTAGTGTAGAGTTAGGGAAATCTTCTTTAGGAGCTCTTGTTATTCAAGCTCCAA
ATAATTTTCAAATTATCAACTTGCGTTCTTTAGAGCAGCGTTATCAAACTCTTCCTAGATCTAGTGAAGG
TTTACGTACTTTTGGTTCGGATTTATATGAACTTATTGGAAAATATCTTTCTCCAGCTTTAGGCATAGGT
TCTGAGAGTGTAAAACGCGAATTAAAAGATCTCTATCAACAGGTAGAAGTTTCTTTAACTCAGTCGATGG
ATGCTGAGCATCTCAGTGCTCTTTATCAGAGAGTTTTAGATTCTCTACAGAGAATTTCTTCATCATTAGC
TTTATCTGATAACGGAGAGCGTTTTGGTCAGTTGCGTTCGGTACGCCTATACCGTGAAGAACGTAGTAAA
TATGAGAAGCTTATTGAAGATAGTCAGATTAACCAAGTGCAGTTGGATAAACTCCGAAGTGATCTTAGCC
AGGTAGTTTGGTATTTCAACAATCAAGAATTATCTTCTCGTGCTTTAGAAAAACAAGATCCTGAGGTATT
CGCTCATTGGTTTTCTGGAGCGAAACAAGAGTGGGAAGATTTCTCTCATAACCGCAGCTTAACTTTTAAA
GCTCCAGATCAGCCACGTAATTTGGTTTTAGAGAAAACATTTAAGAGTGAGGAGCCTGCTCCGCATTATA
TAGGGTATTTATTTACATTCTTGCCGATTATCCTGGTGCTTGTCTTTGTTTATTTCGTCTTTGCGAAACA
AGTACGTGGTATGAATGGTTCTGCGATGTCATTCGGCAAATCTCCGGCACGTTTATTAACGAATGGGCAG
AATAAGGTTACTTTTGCTGATGTTGCTGGCATTGAAGAAGCTAAGGAAGAACTCATAGAAATTGTAGATT
TTCTAAAAAATCCCACAAAGTTCACGAGCTTAGGGGGAAGAATCCCTAAAGGCGTATTATTAATAGGACC
TCCTGGAACAGGAAAAACTTTAATAGCGAAAGCTGTTTCTGGAGAAGCTGACCGACCTTTCTTCTCAATA
GCAGGTTCTGATTTTGTGGAGATGTTTGTTGGGGTTGGTGCTAGCCGTATCCGTGATATGTTCGAGCAAG
CTAAGAGAAACGCTCCTTGTATTATTTTCATTGATGAGATTGATGCTGTAGGACGTCATCGAGGTGCGGG
TATAGGTGGTGGTCATGATGAACGTGAGCAAACATTAAACCAATTACTTGTTGAGATGGATGGCTTTGGC
ACGAATGAAGGTGTTATCCTTATGGCTGCGACTAACCGTCCTGACGTATTAGATAAGGCGTTATTGCGTC
CCGGTCGTTTTGACCGTCGTGTGGTTATGAATTTACCCGATATTAAAGGTAGATTTGAAATCTTATCTGT
ACACGCTAAGAGAATCAAATTAGATCCTACTGTAGATCTCATGGCGGTAGCGCGAAGCACCCCAGGAGCT
TCTGGAGCGGATTTAGAGAACTTATTGAATGAAGCAGCTCTTCTTGCTGCGCGTAAGGATCGTACTGCGG
TGACTGCTGTAGAGGTTGCTGAGGCTCGTGATAAGGTTCTCTATGGTAAAGAACGTCGTAGTTTAGAAAT
GGATGCTGAAGAAAGAAAAACTACAGCATATCATGAATCAGGACATGCTGTTGTAGGTCTTTGCGTGCAA
CATGCCGATCCTGTGGATAAAGTAACGATTATTCCTAGAGGCTTATCTTTAGGAGCCACGCATTTTCTTC
CTGAGAAGAATAAGCTTAGCTATTGGAAAAAAGAACTTTTCGATCAGTTAGCTGTTCTTATGGGAGGCCG
TGCTGCAGAAGATATCTTTTTAGGAGATATTTCTAGTGGTGCTCAGCAAGATATTTCTCAGGCTACAAAA
TTAGTCCGCAGTATGGTCTGCGAATGGGGAATGAGTGAACAGTTAGGAACTGTAACTTATGACGAGCGTT
CGGATAGCTCTACTGGTTATGGATCGTATCATGAGAAAAGTTACTCAGAAGAAACAGCTAAAGCTATTGA
TGGTGAGTTAAGAGCATTATTAGATGCTGCTTATCAGCGTGCTTTAACAATTATCAGAGAGCATCGAGAT
GAAGTAGAGCTTATGACTCAGATGTTAATTGAGTTTGAAACTTTAGATGCTAAGGATGTTAAAGAAATTA
TGGATCATACTTGGGATCCTGAAAGGAAAAGAGCACGTTTAAAAGAAGAAGGCATATTGTTCAAGAAGGT
GTCTGATGATTTGCCTCCTCCTCCACCTCAGGAAAATGCTATGAAAGATGGTACGTTAAAATTAAACAAT
ACTACAACTTAA
>ref|NC_003361.3|:c874556-873603 MesJ/Ycf62 family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTATCCCGTCTACTCAGAGATGATAAGCTATTAGAAGTTTTTTTTTCTTCTTTAGATATGAAAAAAA
GCTACTTACTTGCTTTATCAGGAGGAAGTGATTCATTATTTCTTCTATATCTTCTTAAGTCGCGAGGAGT
TGCTTTTACCGCAGTCCATGTAGATCATGGATGGAGGGAATCTTCCTATCGTGAGGCTGAAGAACTTAAA
ATCAGATGTGAAGAAGAAGGGATTCCCATTCTTATAGATCATGTTCCTCCCGAATATAGAACTTCGAGAG
ATCCAGAAAACGCTGCGCGGCGCTATCGTTATACACTGTTTCACAAAGTGTGTAAGGAGCAGAATCTTGC
GGGAATCTTTCTAGCTCATCACGCTAATGATCAAGCAGAGACCGTATTAAAACGTCTATTGGAAGGAGCA
TCCTTAAGTAATTTAAAAGGGATGAGTCCAAAAACATCTTACGAAGATATCCCACTTTTTCGACCTTTAT
TGCACATTCCTAAGCAGATAATAATAAATGTTTTAGATGCGGAAAACGTTCCCTGTGTTCAAGATATAAC
CAACACTGACGAACGGTATCTTCGCGCTAGAATGCGTAAGAAGATATTCCCTTGGTTGGAAGAAATTTTT
GGCAAGAATATCACGCAGCCTTTATTGACATTAGCCCAAGATTCTGAAGAACTTTCTTGTTATATGAAAC
AGCAAGCAGAGCCTTTTCTTGAGAATATGCGAAAAGAAAATACAACTTGGTCTATTGAAATTCCTCAAGT
GTTAATAGAACAAGTCTTTTTGACTAAATGGGTTTGCAAAGAGTTCTTTTTTAGGGCTGGAGTAGTTGCC
TCAAGACATTTTTTGCAAACGGTTTATGATCATTTACAGCGCAAATTACCAGCACAAATGCGACTTCGAG
ATAAAAGAGTGATCATAAAAGCTGGAGTAGTAATGATAGAGTAG
>ref|NC_003361.3|:874671-875744 YjgP/YjgQ family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCCTATTTTATGGAAAGTCTTAATTTTCCGTTATTTAAAAACCGTTACCTTTTGTACGCTAAGTCTTA
TCTGTATTTCTATCATTAGTTCTCTTCAAGAAATCGTCAGTTACATAGCAAAAGACGTTCCCTATCTGAC
AGTTTTGCGCTTAACAGCTTACCAGATCCCGTACTTATTGCCTTTCATTCTTCCGGTTTCTTGCTTTATC
TCTGCATTTGCACTTTTCCGAGGTCTTTCTGATAATAATCAAATTACTTTCCTTAAAGCCTCTGGGGCTT
CTCAAGGGATTATTACTTTCCCTATCCTTATGGTCTCTTGTGCTATCTGCTGTATAAATTTTTACACATG
TTCTGAACTTGCTTCTATTTGCCGATTTCAAACCTGTAAAGAAATTGCCAACATGGCAATGACCTCGCCA
ACACTTCTGCTGCAAACGTTACAGAAAAAAGAAAATAACCGCATTTTCATCACTGTGGATCATTGTGCAA
AAAGCAAATTTGACAATGTGATTATTGCTTTAAAAAGAGATAAGGAAATTGCCAATGTCGGGATTATCAA
AACTATCATCCCTGACGTAGCAAACGACACTGTCGAGGCGAGGGATGTTGTGATGATTTCAAAACTTCCT
TCTACACTGACAGAGCAACATTCTTCAAATTCTAAGGAATACTACATAGAAACTTTGGACGAGATGCTAA
TCCCTAAAATTACTTCAACGTTATTTGCGGGAAAATCTTATATGAAAACGCGAACGGATTATCTCCCTTG
GAAACAGCTTGTTAAACAGTCATTTAGTCATGCGCACCTACCTGAAACCTTAAGAAGGATCAGCATAGGT
TTGCTCTGTATTACTTTGACCTATTCAGGAATGGTTTTAGGAACCTATAAACCCAGATTTCGTAAATCCA
TAACTCTATATTGTATTTTTCCCGTAATGGATTTGATTTTATTAATAGTTGGCAAAAATACTACTACACT
ACTTCCTGCGTTTATGATGTTTATCATTCCGCAGGTAATCACTTGGATAGTTTTTTCTATCCGTGCGTAT
CGAGAAAGCAGAGGCTATGCATAG
>ref|NC_003361.3|:875748-876851 YjgP/YjgQ family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTACATTTGGAAACGTTACGTATTAACTAAATTTTGGTTATCTTTAGTATCTTTAATAGTACTTGCCT
TTGTTTTTTATGCCTCTATCCATCATTCCCTCCACGCGATCAAAGGAAATTCAACCGCGTTAGCCTCAGG
TGCCTCTTTAAAGCTTTCCGTTCTATATTATCTATCTCAGATAGCTCTTAAAGCAGAATTTTTGATTCCC
CAATTAGTTGCAGTAGCCACAACGATTACGCTATTTTCGATGCAGAACAAACGTGAAGTTCTTCTTCTTC
AGGCATCGGGACTCTCATTAAAATCTCTAACAGCTCCTTTAATCCGTTCAAGCTTCATTATCACCTTACT
GCTATATGCAAATTTTCAATGGCTGCATCCTATATGTGAGAAAATATCTACAACTAAAGAACATATGGAT
CGTGGAACCTTAGACAAAGCACAAGATAAAGTTCCTGCTCTTTATCTCAAAGATCAGACAGTATTACTGT
ACTCTTCTATTGAGCAAAAAGCCTTAACTCTTAACAAGGTATTTTGGATTAAAAATCCCAAAACTATCTA
TACGATGGAAAAGTTGGCGTTTACAACACCATCGCTTCCTATTGGTCTGGATGTGATACGTTTTTCAGAA
ACAGAATCTGGCACTATGGAGCTCAGTGAATTCTCAGATATGAAAGAGTTTCCTGAGATTGAATTTGGGT
TCTATGATAATCCTTTTTCTAAGATCTTCACAGCAGGAGGAAAAAACCGTCTTTCGGAATCTTTCCGGGC
TATTCCTTGGAACGCTACAGGTTTGGGATTATCAACGACTATTCCTCAGCGCATTTCCTCGTTATTATCG
ACATTTTATTATATGCTGATTTCACCCTTAGCTTGTATATCAGCAATGATTCTCTCTGCTTATCTTTGTT
TAAGATTCAGTCGTGTCCCTACGGTGACTCTTGCCTATTTGGTTCCCTTAGGTACGATAAACACCTTTTT
CGTCTTTTTAAAAGCAGGGATGGTGCTATCCAATAGCAGTGTTTTACCCATATTGCCCGTAATGTTATTT
CCTCTCGTCGTCTTAGCAATATTTACAAACTATGCTTACGCTAAGCTTCAGTAA
>ref|NC_003361.3|:c878865-876838 hypothetical protein CCA00767 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGAAGATCTTGTTATAATTTTGAAAAAGTATTGGAACATTTAGAGAAATTAAAAAAGATTTCTTACA
GTTCCTCTTCCTCTTTTATAGAGAACGTTAAGCTTGATGACATGCTTTCTGCTGACCAACATGTTGGCGA
AATGAAACACGCTTTGAAAAATATAGAAGACTATCTTAAGAAGGCGGGAGCTTTGCCCAAGAGTGAGGCA
AATAAAGCGTTACAAGAATCTAATTTCCTTATTGCTGGGGTGCAGAATGTATTTTCGTTTTTGGAAAGTA
GAGAGCGAGAATTGTATCAAAACTTGGTTCAAGACTATTCTGAGTTAAGTAAGGTCTATAATAAGACTCA
GGCAAATCTTAGTCGAAAAATTATTAAGGAAGAAGAGGATGAGGATCTAGTAGAGCGAGAGCTAGAAGAA
ATGCATCAAGAAGAGCGTTTCTTAAATAACCTAGTAGAGGTTAAACGCGATCGTTCCTACGAGCTTTTTT
ATATGTCTGATGAGGAGAATAAGCGCTTTTATACCGATGCTTTGACTCAGATTATTTGTAAGCAGGGAAA
GATCCACGAAACAGCTCATGAGGGAGATCCTTTAACAAAAACGCTTGTGTGGAATAGCGAAGAGCTCCAT
AACCTAGCCTCTTCGTTAGTATTTACTAACGACATGCCTGTACGGTTATTTTATCAAAAAGCTCTCAGTG
ATTTAGAAACGCCATCTACAGAAAAGATTCATAATGCTGTTATGGGCTTGTTCTTTTCTAGATACGAAGC
CACTATAGTTTCTAATAATCCAAAAAAAAATAATCTCCATTATTTTAATGATTTTCTCTATTTCCTCAGA
GATGCGTGGAAAGCTTTGAGTAATCATACTCAGGACCAGATGCATTATCGACATTCGTATACGCTAATGT
CTACGTTAAGTAGTGGCATTTTTGAAGGTAAACTCGCATTTACAGAGGCTGCTCGGTACTTATATTTCCA
TATACATACGAAATTGCAATCTGAAGGGGATAAGAAACCTCTTTCTTCCGGGCAATATGTTTCTGAGGTT
TATGAGGGGTTATATCGGTTGCTTTCTAAGTACCCAAATGGACCGCTATTTAAAGCTATAGATAGAATAC
TCGATCCACATGCTTCGGTGTTTGATCCTATTATTTTAGGTATGTTCCCTGGAATAGAAGGAATTTTGAA
ATTAGGAGATAAATCTATCACCGTCATACGCTCTCCGAGCCCTATAACTCAAAGTTCCATACTGTATGCT
AATTGTAATGCGGAATTTATAGGATTTCTTAATGCTAAGGCAGATCTAGGAGATACTACCTTCATTTTAA
ATATACAGAATCGTTTATCTAGAAAAGATCGTGCCCGAAGTCGTGTTATAGAAGAAAGCTTGGATAGCAT
TGATAGGGCGCATATATTTTCATTCCCAGAACCTGAAGATCTGCTAAAAAGTATAGAAAGAACACATGGT
GAACAAGAAACATTTGTTGGTTTCTTTTCTGTATTGAAAGAAGAATTCAGTAAATCAGGATCTCTATCTC
TTTTTTCTGTTCCTAATATATCCAAGGGACAAATCCATGAATTTCTTGACAATAGCTTATCTGTTTTGAA
AGATACTTTTTTCTCTAAGAAAAAAATCTTATTTAAAAATGACAAGTTATTGCTCTTGCATATTATTTCT
TACCTGCTTGTCTTTAAGCTTATAGAAATTATAGACCCGAATAACCTCATAGTTATGTCTAAAGATGGAT
TAGATTATGCATCGATATTCATTTCAGGGTTTACTTTCTTTGCTGGTGAAGCATCGTGGGATGAGCATAA
ATTGAAATTGCTCATGGTGAAAGTTCTTGCACCTACTTTAGTCGCCAGAGATCGCTTGGTGTTTTCAAGT
CATATAGAATTGATGAGTAAGTTTCTTAATTGCCTGAGAAAAAATAGACAAAACTTATCTAATCTCAAAC
CTTTCTTTAATTATGATTTGGAAAAATGGCATTTCTCAGGCTATTTAAACGAAATTACTGAAGCTTAG
>ref|NC_003361.3|:c880210-879185 phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATGATTCAAGAGGAGCTTGAAGCTACAAAGCAACAATTTTGTATTGAGTTAGATCAAGTTCACTCTT
CAAAAGATCTTTTCGATCTAAAGGTTCGCTATTTAGGAAAGAAAGGTCTTTTTCGTTGTTTTGCAGATAA
GTTAAGGGAGTGTCCTTCGGACCAAAAGGCTCTAATGGGTGCTTCCATAAATGCTTGTAAAACCTATATC
GAGGATTTAATCCGAGATAAAAATAACGCTATTCTTCTAGCAGAAGAATCCGCAGAATTTCTCAAAGAAA
AAATCGATATCACACTACCAGGAGAACCTCAATGTCCTGGAGGGAAGCATATTGTCAAAAAAGTTTTAGA
CGATGTTGTGGATATCTTTGTTCATTTAGGATTTTGTGTTCGCGAAGCTCCAAATATTGAAAGTGAAGAA
AACAACTTTTCCTTACTCAATTTTGAAGAGAACCACCCTGCTAGACAAATGCATGATACTTTTTATCTAG
ATGCTAAAACAGTATTACGCACACACACATCTAATGTTCAGGTTAGAGAACTAAGTAGAGGGGAACCTCC
TATTAAAGTTGTCGCTCCAGGCTTGTGTTTTCGTAATGAAGATATCTCAGCCCGTTCACATGTTATTTTT
CATCAGGTAGAGGCATTCTATGTTGATCGTAATGTAACACTTTCTGACTTGACAGAGATGTTGACGGAGT
TTTACCATACATTTTTCGAAAGGAAAATAGAGTTGCGTTTAAGACACAGCTACTTTCCTTTTGTTGAGCC
GGGAATAGAAGTTGATGTCTCTTGTGAGTGTCAGGCTGCAGGATGTTCCCTTTGTAAACATACTGGTTGG
CTGGAAGTGGCTGGAGCTGGTATGATACACCCTCAAGTTTTGCGCAACAGCGGTGTTGATCCTGAAACCT
ATACAGGGTATGCTGTTGGCATGGGTATCGAAAGGTTAGCCATGTTAAAACATGGAATCTCGGATATCCG
TCTTTTCTGTGAAAACGACCTAAGGTTTTTACAGCAATTTTCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c880588-880223 50S ribosomal protein L20 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTGAGAGCAACAGGTTCAGTAGCTTCCAGACGCCGTCGTAAGCGTGTATTGAAACAAGCTAAAGGTT
TTTGGGGAGATAGAAAAGGGCACTTTCGTCAAAGCCGATCCTCTGTAATGAGAGCTATGGCATTCAATTA
TATGCATAGAAAAGATCGCAAAGGCGATTTTCGTAGTCTTTGGATAGCTCGTCTTAACGTAGCTTCTAGA
ATAAACGGTCTATCCTATAGCCGTTTAATTAACGGCTTAAAATGTGCCGGAATCGATTTAAATAGAAAAA
TGCTATCGGAAATGGCTATTCATAACCCTATGGGTTTTGCAGAAGTAGCTAATCAAGCTAAAAAAGCTTT
AGAGGCAACTATTTAA
>ref|NC_003361.3|:c880801-880607 50S ribosomal protein L35 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCCCAAGATGAAAAGCAATAAATCCGTTGCGGCGCGTTTTAAGTTGACAGGTTCTGGTCAGTTAAAAA
GAACCCGCCCAGGGAAGAGGCATAAGTTATCAAAAAAATCTTCGCAAGAAAAACGCAACCTATCCAAGCA
ACCTTTAGTAGATAAGGGTCAGGTAGGGATGTATAAGCGAATGATGCTTGTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c881339-880779 translation initiation factor IF-3 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AACAACTAGGCATATTGAATACCAAAGATGCTTTAGATTTAGCTAGAGAAGCTGATTTAGACCTTGTGGA
AGTTGCTTCAAATAGTGAGCCTCCCGTGTGTAAGATCATGGATTATGGCAAGTATCGCTATGACCTGACG
AAGAAAGAAAAAGATTCTAAGAAAGCCCAGCACCAAGTGCGCATTAAAGAAGTCAAATTAAAGCCAAATA
TTGACGAAGGCGACTTTTCTACAAAGCTAAAACAAGCAAGGGCTTTTATTGAAAAAGGAAATAAAGTAAA
AATTACGTGTATGTTCCGAGGTCGTGAGCTTGCTTACCCAGAACATGGGCACAGAGTTGTGCAAAAGATG
AGCCAAGGTCTCGAAGACATCGGATTCATGGAATCCGAACCAAAATTAAATGGCCGTTCGTTAATTTGCG
TAATGGCTCCAGGAACGGTTAAAACTAAGAAAAAGCAGGACAAAATCAATGCCCAAGATGAAAAGCAATA
A
>ref|NC_003361.3|:881761-882258 transcription antitermination protein NusB [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCTACGCTGACCCCTGAAAGCTCCTTAGGGTCTTACGTCAAGATTTCTCGTCCCCTCCCCAAACAAA
AAATGCGGGAGATTGTGCTACAGATGCTTTACGCTCTGGGTATGGATCCTTCATGCGAAGAGAGTCTTGT
TCCTCTTTTAATGTCTGAGACTGCTGTGACTCAAAGACACGCTTTTACTGCTTTAAGTTTTTCAAAAGAA
ATCCTTGCAAAGTCTTCCGAATTGGATTTATTAATTGCTCAAACAGTGAAAAACACCTCCCTTGAGAAAT
TGACTTTGATGGAGAAAAATGTTTTGCGTTTAACGCTTTTTGAACATTTCCATGGTCAGCCTATAAATAC
TGCTATTTTAATTGCTGAAGCTACAAGACTGGTAAAAAAATTTAGCTATATTGAGGCGTGCACATTTGTT
CATGCAGTTTTAAATGATATTTTTCGTTTAGCTATGCCCGTAGCACATCAAGAAATTCCGTTATGTTGTC
AGGCTTAA
>ref|NC_003361.3|:882290-883180 UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGAAAGAATCTACCGTTATTCATTTTCCTTTCTCAGTTCGTCGAGGTGTTTGGTTAAGTAAGTACTCCA
CATTTCGTATTGGAGGTCCTGCCAATTACTTTAAAGAGGTTCACTCAACGAGTGAAGCTCAGCGGGTCAT
TCAATTTTTATATAGTCACAATTATCCTTTCATTATTGTAGGTAAAGGTTCTAACTGCCTATTTGATGAT
CAAGGATTTGACGGTTTTGTTTTATATAACAGCATCCAAGGAAAAGAATTTCTTTCAGATACCACTATCA
AAGCGTATTCAGGAATGTCTTTTTCTTTTTTAGGTAAAACCCTTGCCTCATCAGGATATTCAGGTTTAGA
ATTTGCCGTAGGCATTCCTGGATCTGTTGGGGGTGCGATATTTATGAATGCTGGTACTGGCAAACAAGAC
ACTGCCTCAGTAGTGGAAAGTGTCGAGGTGATTAATTCTAAGGGAGAAATTCTTTCATATCGGAATGAAG
AATTAGAATTCGGTTATCGAAAATCACGTTTTCAGAATCACAACGAATTTATCTTATCAGCAACCTTCCG
CATATCTAAAAATTCTTCCTCTTTACAAATTGCCAAAGATCTACTTGAAAGTAGGCTACTCTCTCAACCT
TATCAACAACCTTCTGTCGGATGTATTTTCCGTAATCCCCCAGGAAACTGTGCGGGCAAGCTGATAGACG
AGGCAGGTTTAAAAGGCGTCTCTTTAGGAGGGGCTCAAATATCTCTGAAGCATGCCAATTTCATTGTGAA
TACGGGAAGAGCCACTTCTCACGAAGTGAAAGAGCTTATCCGCATGGTTCAAGACAAGCTAAGATCTCAG
GGAATTAGCTTAGAAGAAGAAATTCGTATCATCCCTTATCGCCTACCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c883754-883158 hypothetical protein CCA00774 [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGATGTTTAAAGGAATAGAGTTGCTTCAAGGAAATGTTGTTCAATTATCTCATGAAATTTTTCAAAAAG
TTCTTACTCCTGGTGACACCGTTGTTGATGCTACTTGTGGTAATGGTAAAGACTGCTTGATTTTAGCCCG
ACTATTGAAAGGAAAAGGGAAGCTGATAGCTTATGATGTGCAAAAGGAAGCTTTAAACAGAACGGCTCTT
TTATGTTCAAAATCTCTATCTCCTGAAGAGAGGTCTGTTATAGAATTTAAAGAAATGTCTCACGAACATA
TCAACGAGGCAGGAGCTAAGTTATTTCACTATAATTTAGGCTACCTCCCAAACGGGGATAAACGTATTAC
GACTTTAGAAACTACAACGATGCTTAGTATTCAGAAAGCACTCGATTTAGTTGCTCCTCAAGGTGTGATT
ACTGTTGTATGTTATCCAGGTCATGAAGAGGGATCGCATGAGATGGTATCTATTGAGAAACTTGCGATTG
GATTAGATTCTAGGTTATGGGAAGTGGGATCTTTCTATATTATGAATAGGAACAAGGCTCCAAGGCTCTT
AATTTTCCGCTCTCTTAAGGTAGGCGATAAGGGATGA
>ref|NC_003361.3|:c884543-883869 tRNA (guanine-N(7))-methyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAACCGCAAAATTTAAAAGTTCCTTTTTTTTGGGAAGAACGTAGTACTGAAATAAAGGATAATGTTC
TCTATATTCCCAATCACTATTTCAAACACGATCAATTCATCATGCCCTCTTGGGAAGAATTTTTTGGAAA
TAACAACCCCATTTCTTGTGAGCTTTGCTCAGGAAATGGCGATTGGGTAGTCTCCCAAGCGCAAAATATG
CCCCAGATGAATTGGATAGCTGTTGAAAAGCGCTTTGATAGGGTGAGGAAAATCTGGTCGAAAATGCATA
ATTTTCAGGTCAGTAATTTGCGGATTGTTTGTGGGGAAGCACAGACATTTTTTCGTCACTATCTTAAAAA
TGAAATCTTACAACGTATAGTTGTTAACTTCCCTGATCCATGGCCAAAGTCTCGTCATCGTAAACACCGT
TTATTTCAAGATGAGTTCATGAACGATGTTGTTAGGGTGTTGGTAGAGTCTGGAATTTTAGTTCTTGCTA
CAGACGATAAGAACTATCTTGTTGAAGCTATCAAGATGATGAGACAATGTTTACTGCCTACAATCGAAGA
TCCTTATTATTGTAAAGTGTTGGATAACTACGGAGATTCTTGGTTTGAAAGGTTGTGGAGATCTAAGGGA
CAGGAGATTTTTTATACAGAATTTGTAAAGAAAGTTGGGATATAG
>ref|NC_003361.3|:c885761-884721 ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGAAGCAGATATTTTAGGCGGCAAATCAAAGCGAGTCCAATTAAATAGTAAACGCTTGGTGAATTGTA
ATCAGGTAGACGTGAACCAGTTGGTCCCGATTAAGTATAAATGGGCGTGGGAACATTACTTAAATGGGTG
CGCAAATAACTGGCTGCCGACAGAAGTTCCGATGGCTCGTGATATTGAATTATGGAAATCTAACGATCTT
TCGGAAGACGAACGTCGAGTCATTCTCTTAAACCTAGGGTTTTTCAGCACTGCGGAAAGCTTGGTAGGTA
ATAACATTGTCCTAGCTATTTTCAAACACATTACCAATCCTGAAGCACGTCAATATTTATTGAGACAAGC
TTTTGAAGAAGCCGTGCATACCCATACTTTTCTTTATATCTGTGAGTCCTTGGGGCTAGATGAGGGAGAA
GTTTTCAACGCCTATAATGAACGTGCAACTATTAAGGCTAAGGATGATTTCCAAATGACCTTGACTGTAG
ATGTTCTGAATCCTAATTTTTCCACAGATTCTGTAGAGGGCTTACGTCAGTTTATTAAGAATTTAGTAGG
CTACTACATCATTATGGAAGGGATTTTCTTCTATAGTGGTTTTGTAATGATTCTTTCTTTCCATCGTCAA
AACAAGATGACTGGGATAGGAGAACAGTACCAGTATATCTTACGAGATGAAACTATTCATTTGAATTTCG
GTATTGATCTTATCAATGGTATTAAAGAAGAGAATCCCGAAGTGTGGTCTCAAGAACTTCAAGATGAAAT
CATAGCCCTCATTCAAAAAGCAGTAGATCTAGAAATCGAATATGCTAAAGACTGCTTGCCACGGGGTATT
TTAGGACTAAAATCTTCAATGTTCATTGACTATGTTCGTCATATTGCCGATCGTCGTTTAGAAAGAATTG
GTTTGAAGCCTATTTATTATTCTAAAAATCCTTTCCCATGGATGAGTGAAACTATCGATCTTAATAAAGA
GAAGAACTTTTTTGAGACTCGCGTAACGGAATACCAAACTTCTGGGAACTTAAGCTGGTAG
>ref|NC_003361.3|:c888919-885785 ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTCGAGGTAAAAGAGAAGAATTATACTATTGTGAAACGTAATGGCATGTTCGTCCCCTTCAATCAAG
ATCGGATATCTCAAGCTTTAGAAGCTGCTTTTCGTGATACACGTAGTTTAGAAAATAACTCTCCTTTGCC
TGAGGATTTAGAAAATTCTATTTCCGACATTACGCATCGAGTTGTTAACGAGGTAATGCAAAAGATTAGA
GAAGGGCAAGTTGTTACCGTCGAGCGTATTCAGGATATGGTAGAAAACCAGTTATATGTAAATGGTTTGC
AAGACGTTGCTAGAGATTATATTGTTTATAGAGATCAGCATAAAGAGCAGCGCGAAGGATCTTGGCATTG
CGTTTTGGTAAGACGTAGGGATGGAAATGCTGTAAAATTCAATCCTATGAAAATTTCTGCAGCCTTAGAA
AAAGCTTTTAGGGCTACGCAAAAAAATACGGATACTCCTTTTCAAGAAACTCTTGCTGAGATCAATGATT
TGACTAATAAAATTGTTGAAGAAATCTTAGTGGTTTGTTCTCAAGAAAAAACTGTCGATATAGAAGTCAT
ACAAGATATTGTTGAAAAACAACTCATGGTAGTTGGTCATTATGATGTTGCGAAAAACTATATTTTATAT
CGAGAAGCACGTTCTAGAATCCGTGAAAGTAAAGAAAACGTTGCTACACAAGAAAGTATTGAAGAAGTTT
ATGATGTTGTTAGGGAGGATGGTAGTACTTACCAAATAAACAAAGCTCAACTAACTGATAAATTTATTTG
GGCGTGCCAGCGATTCCCTGAAACCACAAATCCCCAGACGCTAGCTTCTATGGCATTTGCAAATTTCTAT
TCTGGAATCAAAGAAGCAGAAATTGTTAAGGCCTGTATTATGGCAGCTCGAGCAAATATCGAAAAAGAAC
CTGATTATGCTTATGTAGCGGCAGAGTTGCTTACCGATGTTGTCTATCAAGAAACTATGGGCAAAAGCGC
AACAGATTCTGATCTTGCTGAAGCACAAAAGCAATGTTTTAAAAACTATATTCTTAATGGGGAAGAATAT
CGATTAAATCCTCGTTTAAAAGAGTATGATCTTGATGCCCTTGCTGAAGCTTTAGATATATCTAGAGATC
GTCAGTTCTCTTATATGGGAGTACAAAATCTTTATGATCGTTATTTCAACCAGCATGAAGGACGTAGATT
AGAAACCGCGCAGATTTTTTGGATGCGTATTTCCATGGGGCTTGCATTAAACGAAGGTGAAGATAAGACT
TCGTGGGCCATCACTTTCTACAACCTACTATCTACATTCCGCTATACTCCAGCAACACCTACGCTATTTA
ATTCTGGAATGCGCCATTCACAATTAAGCTCTTGTTATTTATCCACTGTACAAGATGATCTTGCGCATAT
TTATAAAGTCATATCAGATAACGCTATGCTTTCTAAATGGGCTGGAGGTATCGGTAATGACTGGACAGGG
GTACGAGCTATAGGTTCTTTAATAAAAGGAACCAATGGTAAAAGCCAAGGCGTGATTCCTTTCATTAAAG
TCGCCAATGATACAGCGATTGCTGTGAATCAGGGGGGTAAGCGTAAAGGCGCTATGTGTGTATATCTAGA
GATATGGCATCTAGATTACGAAGATTTTCTAGAACTAAGAAAAAATACTGGTGATGAGCGCCGACGTACT
CACGATATCAATACAGCAAGTTGGATTCCTGATTTATTTTTCAAACGTTTAGATCAAAAAGGGACGTGGA
CCTTGTTTAGTCCCGATGATGTTCCTGGTTTACATGAGGCTTATGGTTTTGAATTTGATAAGCTTTATGA
AGAATACGAAAGAAAAATCGATAACGGAGAAATTAAGTTATACAAAAAGATTCCTGCTGAAGATTTATGG
CGTAAGATGCTGAGCATGCTTTATGAAACTGGGCATCCTTGGTTAACATTTAAAGATCCTTCAAATATCC
GTGGTGCGCAAGATCATGCTGGGGTTGTGCGTTGTTCAAACTTATGTACGGAGATTTTGTTAAATTGCTC
AGAAAATGAAACAGCAGTTTGTAATCTAGGTTCTGTAAACTTAGTAGAGCATATTGAAAATGGCGATATC
AATGAAAAGAAACTCGCAGAAACCATCTCAATAGCTATTCGCATTTTAGATAACATTATTGATCTTAACT
TTTATCCAACTCCAGAAGCAGCTAATGCAAACTTGTCTCATAGAGCGGTGGGCTTAGGGCAGATGGGCTT
CCAGGATGCTCTTTATAAACTCAATATTAGCTATGCTTCTCAAGAAGCTGTAGAGTTTGCTGATAAAAGT
GCTGAATTGATTGCATATTATGCAATACTATCTTCTAGTTTATTAGCTAAAGAACGGGGGACATATAGCT
CTTATAAAGGATCTAAATGGGATCGCGGTTATCTACCTCTAGATACTGTAGAGCTATTAAAAGAATACCG
CGGTGAAGAAAATGTTCTTATGGACACCTCGTGTCGTAAGGATTGGACACCTGTTCGTGAAGCTATCAAA
GCTTATGGGATGAGAAATAGCCATACTATGGCGATTGCCCCAACAGCAACGATTTCTAATATTATTGGAG
TTACCCAATCCATAGAGCCTACGTATAAGCATTTGTTTGTGAAATCCAACCTTTCCGGAGAATTTACAAT
TCCTAATGTGTATTTGATAGAACAGCTCAAGAAATTAGGCATATGGGATGCCGATATGTTAGATGATTTG
AAATATTTCGATGGGTCTCTATTAGAGATTGAACGCATTCCCGATGATTTGAAAAAAATCTTCCTTACAG
CGTTTGAGATTGAACCCGAATGGCTTATCGAATGTGCTTCTAGAAGGCAGAAATGGATAGACATGGGACA
GTCTCTCAATTTATACTTGTCGGAACCTAATGGTAAAAAACTTTCTGCCATGTATCTCACAGCATGGAAA
AAGGGACTGAAAACTACGTATTACTTAAGGTCCTTGGCAGCTACTTCTGTAGAGAAATCATTTACTGATG
TTAACAAACGAGGCATCCAACCTCGATGGATGAAGAATAAGTCCGCTTCTACGAGTATTGTCGTAGAAAG
AACTAAGAGCACTCCTGTCTGTTCTCTCGAAGAAGGTTGCGAATCTTGCCAGTAA
>ref|NC_003361.3|:889295-890101 glycerol-serine phosphatidyltransferase, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCAGAATTGGAACCAGAAATCCGAGGCAAGCGTCGTGTAGTGACTCCCAATGCCATTACAGCTTTCG
GCCTCTGTTGTGGACTTTTTATTATTTTTAAGAGTGTTTTAAAAACGTCATCGTCTGTAGAACTCTTGCA
CCGTCTACAGGGACTTTCGCTTTTATTAATCAGTGCGATGATTGCAGATTTTTCTGATGGCGCTATTGCA
CGCATTATGAAAGCAGAAAGTGCTTTCGGCGCACAATTTGACTCTCTTTCTGATGCTGTGACATTTGGTA
TAGCACCGCCACTCATTGCAATTAAAAGCCTTGATGGTGTGTATGCTGGAGGGTTCTTTTCCTCGCTTCT
TCTTGTAACTTCTATTATTTACTCTCTATGTGGAGTCTTAAGATTAGTTCGTTATAATTTATTTTCTAAA
AACCCTGGAGATGCGACACGGCATTCGTGTTTTATTGGCTTGCCTATTCCTGCGGCGGCGGCGTGCGTTG
TATCTTTAGCTTTATTTGTAGCTTCTGATTTCTCAACGGTATTACCTGTACAAGTACGTGCTGTTTTGAT
TTCTTTAGGGCTACTTTTTATTGGAAGTTTAATGATCTCTCCGTGGAAGTTCCCTGGAATCAAAAACTTA
CGTTTTAAAGTATCTTCTTTTTTACTTGTCGTCGCTACAGGATTAGTAGCATGCTTATTTTTCCTAGGTC
TTGTTGATCACTTTACCGAAGTATTTTTCTTAGTCTCTTGGCTATATGTTTTGGTAGTTTTCCCTATTTT
TGCGATCACATATCAAAGAAAAAAGAAACGTCAATGA
>ref|NC_003361.3|:890098-891336 RmuC domain-containing protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATAGATTTCTCCACAACACAGATTACTATTGCCCTTGCTGCCTTTGGCTTGGGGTTGTCTTTATCGT
CTCTTTACTATCGGAAAAGAGAATCTTCTCAGATGAAGTTGCAGAGAAATTTAGAACACGAAAATGAGCT
TCTTAAAAATTCTTTAGATTTATCGCGTCGCCAAGAACAACTCATGGAAGATTTCAGTAATAAGCTTGCG
GTATCTTCACAATCTCTTATCAAAGAGATGAAAGAAGAAACACAGAGTTACTTTTCTGAAAAATCCAAAA
CTATTGAGTCTATATTGACTCCTGTTCAAGCTACTCTGACAGCTTTTAAGCAAAACTTAGAAACTTTTGA
GTCTAAGCATGCTGAAGATCGCGGTTCATTAAAGGAGCAAATCACCCATCTTCTTGCCGCTGAGAAAAAG
CTAGAGAAAGAAACACAAGCTCTTACGGACATTTTAAAGCATCCAGGATCACGAGGTCGCTGGGGAGAAA
TCCAATTAGAAAGAATTTTGGAACTTTCCGGCATGCTGAAGTATTGCGATTATGAAACTCAGGTTACCGA
TGCTCAAGGGTCAGCACGTGCTGATATGATCATCCGTCTTCCTAACGAGCGCTGTTTGATTATTGATTCG
AAAGCTCCATTTTCAGAAACCTATTTTTCTCAAAATACTTCTAACAAGTCTGATCTTGTAGGAAAGATAA
AAGATCATATCAAAACTCTAAAATCAAAAAGCTACTGGGAAAAATTTCATTCTTCCCCAGAATTTGTGAT
TCTTTTTCTTCCTGGGGAGAGTATTTTTAATGATGCTCTGCGTATTGCTCCCGAGCTTATCGATGTTGCA
GCAACCTCTAATGTCATTTTATCAGGACCTTTAACCTTGCTGGCTTTACTAAAAACTGTTGCTCATATGT
GGAAACAGGAAAATCTACAAAAACAAATTCAAGAGATAGGTCAGTTAGGAAAAGAGCTACATCATCGCTT
GCATGTAGTCTTTAATCATTTTCATAAGGTTGGGAAAAACCTTAATAATGCTGTGCAAAGCTACAACGAT
ATGTCCTCTAGTCTACAACGCAGGATATTGCCAACTCTAAGAAAATTCGAAGATTTAGAAGTAGCTTCTT
CCGTGCATAAGATAGAAGATCCTTCTTCTATTGATAATCCTGCTGCTTCTTTATTACCTAGTTATGAAGA
AGAAGATATCCCTGTAGAAAATTCCCTATTGCAAGAAGATACGCTCTAA
>ref|NC_003361.3|:c894265-891341 insulinase family metalloprotease [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAGCTGGAGATACATATAGGAATTTCGTTGTTAAATTGAGTCAGGATCTCCCTGAAATAGAAAGTA
AATTGCTCGAGGTAGAACATAAACCCTCAGGCGTTTCTATTATGATGATCATCAATAATGACGATGAAAA
TGTTTTTAACATTTGCTTCAGAACTTGTCCGCAAACTTCTAATGGTGTAGCTCATGTTTTAGAGCACATG
GTCCTCTGCGGCTCCGATAATTATCCCGTCCGTGATCCTTTCTTTTCCATGACACGACGTAGTTTAAATA
CGTTTATGAACGCTTTTACAGGAGCGGATTTTACCTGTTATCCTGCGGCATCGCAAATTCCTGAAGATTT
CTATAATTTACTCAGTGTGTACATAGACGCTGTTTTTCATCCCCTCCTTACAGAAAATAGTTTTTTGCAG
GAGGGATGGCGATATGAACTGAATCCGGAAAATGCCTTAACCTATACCGGCGTAGTTTTTAATGAGATGA
AAGGCGCAATGATGTCGGGAGAATCCCGATTATCAGAAGCTTTAAATGCAGCCCTATTCCCTTCGGTCAC
TTATGGGGTGAACTCAGGAGGAGAGCCTAAGGATATCCTTACGCTCTCTCATGACAGTATAGTAGCATTT
CATCAAAGTCAATATACCCTCGGGCGTTGCCTATTTTATTTTTATGGAAATATTAAGCCTTCTAGGCATT
TAGATTTTCTCGAAGAGAAACTCTTACGTCATGTAGGTAAATTAGAAAAACAGACGGTTGCCGTTCCTCT
TCAAAAGAGATTTAAAGAGCCCGTTAGAAATATCCTTAAATATCCTTCGGATAGTCAAAATGAAGATAAG
GTGCTTTTTGGCTTGTCTTGGTTGACATGTTCCATATTAGATCAGCAAGAACTGCTAGCCTTGCACGTTC
TTGATGTTGTTCTTATGGGCACAGATGCTGCTCCTTTAAAATCTCGATTGTTAAAATCAGGATTTTGTAA
ACAAGCAGATATGGGAATCGATAGCGAGATTCGTGAAATCCCTATTACTATTGTTTGTAAGGGATGTTCC
CATGGAGGGGCTCAGAAATTAGAATCTTGGATTTTTGCTTGCTTAGAAGAGATCATAAGAGAGGGAATTC
CTAATAATCTTGTTGAAGCTGCTGTACATCAATTAGAGTTAGCTAGGAAGGAAATTGCTGGTTACTCTTT
ACCCTATGGATTATCACTATTTTTCCGTTCAGGGCTATTACGACAGCATGGGGGTCGTGCTGAAGATGGA
TTAAGAATACATAGTCTATTTGCAGATCTTCGAGAAAAATTAAAACAACCAGATTACCTTCCTAAGCTTA
TCAGGAAGTATTTCTTAGATAATCCGCATTTTGCTCGTGTGATCTTGCTCCCTGATGCTGATTTGATTTC
TATTGAAAATCAAGAAGAGCAGTCTCTTCTTAAAGAAGTACAAGAGAAGCTTTCTCCAGAAGATGTGGAA
AAAATACGCCTGACTTCTAAGGTTTTAGAAGAGTATCAAGCGCAGAACGAAGATTTAGATAAGATTCTTC
CGAATTTTTCTTTGGATAAAGTTCCTAACTCAGGAAAAGAATACAATCTTACAAAGGAGAACCTCTCTTG
TGGTGAGGTTCTTCATCACGATTGTTTTACCAACGATTTAATTTTTGCAGAATTAGTTATGGATCTTCCT
CCATTATCTGCTGAAGAACTTCCTTGGTTGCGTTTACTTGTCTTCCTTATGTTGCAGTTGGGATGTGCGG
GTAGATCTTATAGGGAACAGCTTGAGTTTCTCCTAGAGCATACGGGAGGGGTGGATGTTTCTTATGAATT
TTCTCCACATGCAAATCAAAATGCCTTGTTATCACCTTCGCTAGGTATTCGTGGAAAAGCTTTAGCATCT
AAAGCTGATAAGTTATTCCAAGTTATGGGAGAGACACTAACAAGTGTTGATTTTACAGACGTAGCAAGAA
TTAAAGAGCTGCTTATGCAGCATAATGAAGCACTGACAAATAGCGTGCGTAATAGTCCTATGGGTTATGC
TGTGAGCATGGCTTGTATGGATAAATCTATATCAGCAACTTTGTCTTATTTAGCTTCGGGATTGCCTTAT
GTTGATAAAATTTGTAGTTTAACGAGCAATTTTGATAAGGAAGTTGATAGCGTTATTGGTATTTTACAAT
CCTTATATAAAAAATGTTTCTTTGGTAAACGTCAGTTGATTCTTAGCGGTAGCAGTGCAAATTATCAATA
TTTACGTGAGAATAATTTCTACGGCATTTTAGATGTAGAAGGTCAGCCGCATAAACCCTGGATAAATCCT
TCTATAGATATCTCCCAAGCATCTCAAGGGCTATATATTCCTGCTCGTGCAGCCTTCAATACTTTAGCTT
TCCCTATCGGAGATTTACCGTATGATCATCCTGATGCTGCAGCTCTCACTGTAGCTGCAGAAATCCTTGA
TAATACTGTTTTACATACAAAGATCCGCGAACAAGGTGGAGCGTATGGATCGGGAGCTGCTGTAAACCTC
GGTAGAGGAGCATTTTATTGTTATAGTTATCGTGATCCGGCAATTTTTGATACTCATCAGGCATTTCTTC
ATGGTATTGATGAAATTTCTAAAGGAAATTTCTCAAGTGAAGATATTCATGAAGGAGTTCTCGGAGTGAT
CCAAAATTTAGATTCTCCAATAGCTCCTGGAAGTCGTGCATCTACAGGGTATTATAGATTGCGCTGCGGA
AGAGTTCCTGCTTTACGTCAGGCGTTTCGTAGAGCCGTTCTTAATATAACGAAAGAGCATATCTGCTCTG
TTATGGAGAAGTATTTAAAAAATCCTAAGGGGAAAACAACATTCATTTCCTTCGCTGGAAAAGAAATGCT
TGAGGATAATGCGAAAAACTTCGATCAAGAGTTGCCAATAAAGTCTGCTTTATAA
>ref|NC_003361.3|:894414-895778 M20/M25/M40 family peptidase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAACGATGATCTCAATTATTTTGAAAGTCATTATGAAAAATTTCTCAAGGAATTTTCAGATCTTCTTC
ACTTCCGTTCTATATCTGCAGATCCCGATTGTCTGACTAATTGCAAAAAGTGTGCAGATTTCCTAGTTGA
CAATCTTCAAGATATATTCTCAATAGAATTATGGGAAAAACCTGGCCATCCTCCTATAATCTATGCCACT
TACCGTGAAGCAGGTCCCGCAGCTCCTACCCTACTTCTCTATAATCACTATGACGTACAGCCTGCAGATC
TTGCTGATGGCTGGTTAGCAGATCCTTTTACTATGAGAAGAGAAGGAGAACGCCTTATAGCGCGCGGTGC
TTCTGATAATAAAGGACAATGTTTTTACACCTGGAAAGCTCTTGAGCATTATTACAAATCACGAAAAGGT
TTTCCCGTCAATATCACCTGGATTATTGAAGGTGAAGAAGAAAGCGACAGCCCCGCTTTAACGAGTTTTG
TTAAAGAGAAACAAGAAGCTCTGCAAGCAGATTATTTCTTAATTGTTGATGGAGGGTTCTCCTCCGCAGA
ATCTCCCTCTGTTAGCATTGGAGCGCGAGGTTTAGTGACTATGAAAGTTACCCTAGAAGAAGGCAGCAAA
GATATGCATTCAGGGATCTTCGGAGGTGCTGCCTACAATGTAAATAGAGCCTTAGCAGAAATGCTTACTA
CGTTGCACGCTAGTGATAATTCTATCGCCGTAGAAGGGTTTTACAATGACGTTTCTCTCCCCAAAGAAAA
TGAATCCTGTGATATTCCCAAAGGAAATCTTTTAAAAGATGGTGAGAAAACTTTCGGTTTTTGCCCTACG
TTATATGCTCCTGCAGGAAGTGTTGAAGAAGCCTTAAGTTTATACCCCACTTTAGAGATCAATGGGATCT
CTGGCGGCTATACAGGACCAGGATTTAAAACTGTAATTCCTTATAAAGCTACTGCGTATCTTTCTTGCAG
GCTAGTCCCTAATCAAAATCCAGAAAAAACAGCACAACAAGTTATTCAGCATTTAGAAAAACGCGTTCCC
TCTACATTAAAATTTTCCTATGAGATTTTTGAAGGTTCCCCAGGATGGAGAAGTTCTCCGAACCTCCCGC
TTGTTCTCATGTTGCAAGAGATTTATTCAGAGCTCTACCACGAACCTTGTCTCAAATTATTTATGAAAGC
CACTATTCCCATTGCCTCATTGCTCGGGGAAATTTTGAAAACAGAACCTATCGTTTGTGGTACATCATAT
TTAAGTGATGCTATTCATGCTGCTGAAGAAAACTTCTCCTTAGAACAAATAAAAAATGGTTTTCTCTCTA
TTTGTCTTCTTCTTGATAAGTTAGGAAAAGCATAA
>ref|NC_003361.3|:c897300-895834 serine protease [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACGAAGAAGCCATTATATTTATTATTAGCCACAGCGATGTTTTTAAGTGTTCCTACGCTTTCTCCTT
CAGGATTTGCTGCTGTGAAAAAAGATGCACGGATAGCAGAGGTGCCTCAAGAGGTGCTTTTAAAGGAGAT
TTCCGGAGGATTTTCTAAGGTTGCTGAACTGGCAACCCCAGGAGTTGTTTATATCGAGAGCTTTCCTAAA
TGTAATCGTCCAGTAGCTCCTGCTCCAGGACGTCGCGGACCTTATGATAACCCTTTTGACTATTTCAACG
ATGAGTTCTTTAATCGTTTCTTTGGTTTGCCTACGCAAAAAGAACGTCCGGTCTCTAAAGAAGCTGTTCG
TGGTACAGGGTTCATAGTTTCTTCAGATGGTTATGTAGTTACCAATAATCATGTGGTTGAAGACGCAGGG
AAAATTCATGTTACCTTACATGACGGTCAAAAATATCCTGCTAAGGTTATAGGCTTAGATCCTAAAACAG
ATTTAGCAGTTATTAAAATTAATGCTGATAAGCTGCCTCATCTTACTTTTGGAAATTCTGATCATTTGAA
AGTAGGGGATTGGGCCATAGCTATTGGGAATCCTTTTGGTTTGCAAGCTACGGTTACTGTAGGGGTAATT
AGCGCAAAAGGTAGAAATCAGCTGCACATTGCAGATTTTGAAGATTTTATACAGACGGATGCTGCTATCA
ATCCAGGAAACTCCGGAGGCCCCCTTCTTGACATCGATGGAAAGGTTATAGGGGTAAACACTGCTATTGT
CAGTGGTAGCGGAGGCTACATTGGTATTGGTTTTGCTATTCCTAGTTTGATGGCTAAGAGAATCATCGAT
CAGCTAATTAGTGATGGCCAGGTAATTCGTGGATTTTTAGGAGTTACTTTACAACCTATAGATGCTGAGC
TAGCAGCCTGTTATAAACTAGATAAAGTTTACGGAGCTTTAGTTACAGATGTTGTCAAGGGATCTCCAGC
ACATAAAGCAGGATTAAAGCAAGAAGATGTTATCATTGCCTACAACGGTAGGGAAGTAGAGTCTCTCAGC
GGATTCCGTAATGCGATTTCTTTAATGAATCCTGATACGCGTGTATTACTTAAAGTGGTTCGTGAAGGTC
AGGTTATAGAAATTCCTGTCATTGTTTCTCAGGCTCCTCAAGATGATGGTGTCTCCGCTTTAAATCGTGT
AGGCATACGCGTGCAAAATCTTAATCCAGAAACTGCTAAGAAATTAGGCATGGCTCCCGATAGTAAAGGG
GTGCTTATTGTTGCTGTTGAAGCAGGTTCTGTAGCAGGATCTTCGGGAGTCGCCCCAGGACAACTTATCT
TAGCTGTAAATAGACAGAAAGTATCTACAGTAGAAGAGCTGAATTCTGTTTTAAAAGATGGAAATAACGA
AAATATCCTCCTTATGGTTTCACAAGGAGAGGTGATTCGCTTTATTGTATTAAAACCAGAAGAATAA
>ref|NC_003361.3|:c898511-897636 succinyl-CoA synthetase subunit alpha [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTTGCTCATTAAGTAAAAAAACACCAATAATCACTCAAGGAATCACAGGTAAAGCGGGGTCATTTC
ATACTGAGCAATGCCTAGCTTATGGATCCAATTTCATTGGGGGAGTTACTCCAGGAAAAGGAGGCACTAC
CCACCTCAATCTCCCTGTGTATGATTCTGTATTAGAAGCAAAACAGGCTACTCGTTGTCAAGCGACAATG
ATTTTTGTTCCCCCTGCTTATGCTGCGGAAGCGATTTTAGAAGCTGAAGATGCTGGAATTGATCTGATTG
TCTGCATTACAGAAGGGATTCCAATAAAAGATATGCTTGAAGTGAGCCATGTGATGGAACATAGTGCTTC
TCGGCTTATAGGCCCTAATTGCCCAGGAATTATTAAACCCGGAGCATGTAAAATTGGTATTATGCCGGGA
TATATCCATCTTCCAGGAAATGTAGGTTTGGTCTCTAGATCAGGGACTTTAACTTATGAAGCCGTTTGGC
AGCTTACACAACGGAGCATAGGCCAAAGTGTATGCATTGGTATAGGGGGAGATCCCTTAAATGGAACTTC
ATTTATTGATGTCCTTGAAGAATTTCAAAATGATCCTCAAACAGAACTTATCTTAATGATTGGAGAAATC
GGAGGTAGTGCTGAGGAAGAAGCCGCTGAATGGATTCAAACTTACTGTACGAAACCCGTTGTAGCTTTTA
TCGCAGGGGAAACGGCTCCTAAAGGGAAACGTATGGGCCATGCAGGAGCTATTATCTCTGGGAATTCTGG
AGATGCAAAGAGTAAGAAAGAAGCTTTGAGAAAAGCAGGAGTCTTTGTTGTTGAATCCCCTGCTCTCATC
GGAGAAACTGTAGAAGCTGTATTTCGCTCACGATAG
>ref|NC_003361.3|:c899686-898520 succinyl-CoA synthetase subunit beta [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGGCCTCTTCTGTCGAAGAGGGGCAACAGGCACTCAAGGAGTTGGCTATAGACGCTGGTGTTGTCAAAGT
ACAGGTACATGCGGGAGGCCGGGGGAAAAATGGCGGTGTAGTTGTTGCTAAATCTCCTTCTGATATTTTG
GCAGCTGTTGACAAATTGTTGCGCATGCGTTTCGTAAGCAACCAAACTTCAGGAGAAGCTCTTCCCGTAG
AGAAAGTTCTTATTACCCCTTTAGTAAATATTGCTGCTGAGTATTATCTTGCAGTGATCATGGATAGGAA
AAACCGCTGTCCAGCAATTATGCTGTCAAAAGCAGGTGGTGTGGATATTGAAGAGGTCGCTCAGAAATAT
CCAGATCAGTTGCTCACAGTGCCTCTAACGCCTTTTGCACGCCTATATAATTATCAGATTAGACAGATCA
TTAAATTTATGAACTGGGAAGGGGATATAAGGAAACAAGGCGCACAGTTAATTAAAAAGCTAGTCCAATG
TTTCTACGATAATGATGCCTCTCTTCTTGAAATCAATCCTTTAGTACTTACTCAAGAGGGAGATCTTCTC
GTTTTAGATGCTAAAATCACTATTGATGATAATGCTCTATACCGTCATCCGAAACTTGAAGTGCTTTACG
ATCCCTCTCAAGAAAATGTCCGTGATGTGCTTGCTAAGCAGATAGGGCTTTCCTACATCGCTCTAGATGG
AAATATCGGCTGTTTAGTAAACGGTGCAGGATTAGCTATGAGTACATTAGATATTCTTAAAATTCACGGT
GGATCTGCAGCGAATTTTCTTGATGTAGGAGGAAGCGCTACAGAACAGCAGGTTCAAGAGGCGGTTTCTT
TAGTCCTCTCAGATGAAAATGTAGAAGTTCTGTTTATCAATATCTTTGGAGGCATTATGGATTGTTCTGC
AGTTGCCTCAGGATTGGTTGCTGTTATGCAAACAAGGGAAAATCTCATTCCTACAGTAGTCCGTTTGGAA
GGAACTAATGTAGATCTAGGGAAAGATATTGTACAACGTTCAGGAATCCCTTGCCAATTTACAGACTCTT
TAAATGAAGCCGCACAGCTTGCAGTAGCGTTAAGTAAGCAGGGTTAA
>ref|NC_003361.3|:899757-900614 signal recognition particle-docking protein FtsY [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTACAGAAAGTTTATTTTATGAAGCTGATTTCGGTTCAGATCTTACCGAAGAGTTGTGTTCTCGGTTGCG
CAAGTGTCGCAAGCCCGATGAGTCTACTGTTAAAGATCTTGTCTTATCGTTACTTCGTGAAACAATAGCG
AATCTTCCTCATACGGAATTACCTCAAACAGAGGGCCCAATCGTCTCCTTAATGTTAGGAACAAATGGAT
CTGGGAAAACAACGACAGTAGCTAAGCTAGCGCATCATTACCAGTCGCAATCAAAGAAAGTCATGATAGT
CGCTACCGATACTTTTCGTAGTGCTGGTATGGATCAGATGCGCTGTTGGGCAGAGAAATTAGGTTGTGGA
TTTGTCGCTGGCAAACCTGGAGGTGACCCTGCAGCTATTGCTTATGATGGCATTGCTTCTGCTATATCTC
GAGGTTATGATCGTGTGCTTATAGACACTTCAGGTCGTTTGCATACCCATACCAATTTACTCAATGAACT
ATCAAAAATTGTTTCCGTTTGTAATAAGGTGCATCCAGGGTCTCCGCATGAAAGGCTGATGACTATAGAC
GCCACTTTAGGAAGCAATGTTATTGAGCAGGTTCGTGTATTCCATGATACCATTCCCCTGTCTGGGTTAA
TTCTTACTAAAGTGGATGGTTCTGCTAAAGGTGGAACTTTGTTTCGCGTAGCAAAACAATTGAAAATCCC
CACAAAATTCGTCGGTTACGGCGAACTTATTGGGGATCTTGAAGAATTTCAGATAGATAGGTTCTTAGAA
AAGCTTTTCCCTTCCTAA
>ref|NC_003361.3|:c901342-900626 hypothetical protein CCA00786 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GCTGGATGACCGCTGGTCTTGCTGTAACGACTTGTGTATCCTTAGGGTTATACTTTTCTGGGATGTATAA
GACTTTATTTTCATTCTGGTGGGTTTGGTGTATCGCTACTCTAGGAATATCTTTTTGCATCAGTGCTATG
ATTCATAAGCTTTCTGTTTCTGCAGTTATGGGATTATTTTTAGTCTATTCTGCTTTAGAAGGGTTATTCT
TTGGAACATTAGTTCCCGTTTATGCTGCCCAGTACGGTGGAGGAGTCGTTTGGGCCGCTTTTGGCTCTGC
AGGGTTGATTTTTGGCCTAGCAGCTGCTTACGGAGCTTTTACCAAAAGTGATCTTACACAGATGCGTGTC
ATTTTGATGTTTGCTCTGATTGGTTTAATGGCGGTAACACTGATATTCGCCTTGGTATCTCTATTTGTTT
ATTTGCCAATGGTCTACTTGTTAATTTGCTATATAGGATTAGCAATTTTTGTGGGATTGACTGTTCTGGA
TGCTCAAGCAGTCCGTAAGGCAGCTCAGAGTGTAGGCGACGACGGTGATTTAAGCTATAAGCTATCTTTA
ATCATGGCATTCAAGATGTATTGCAACGTGATTATGATATTTTGGTATCTTCTACAGATTTTTGCTGCTT
CAGGGAAAAGACGCTAA
>ref|NC_003361.3|:c902585-901398 aromatic amino acid transport protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGTGGCATCCGGACTTTGTTACCTCGAAATTATGACTTGGTTTAAGGAAAAGCAACAAGTTAACTTGTTG
TCGATGGCGCAATATACCTTAGGGGATATTGGTAAGATCTTCATGTGGCTCCTTTACCTGTTCCTATTTT
ACTCTTTGCTTATTGCTTACTTTTGTGAGGGAGGGAATATCCTATTTCGTATTTTTGGTTGTCAGGGATT
AGACATTCCTTGGATACGTCACATGGCCCCTTTGGCATTTGCAGTTTTGATTTGCCCTGCATTGATGATG
GGAGCAAAAGTTGTAGATTACTGTAATCGCTTTTTTGTTTTAGGATTAGCTATTGCTTTCGCGGTATTTT
GTATCTTAGGAGTTTTTTCTTTACAACCCCAGCTACTTTTACGTGCTTCGTGGGCGCGCTCTACAGAAGG
TTTATCTGTTCTGTTTCTCTCCTTTGGTTTCCACAATGTAGTGCCCTCACTGTATTACTACATGGATAAG
AACGTTAAAGATGTTAAAAAAGCTATCTTTATTGGTAGTTTGATTCCTTTGATTTTATACGTGATTTGGG
AGGCTCTTGTTTTGGGAGTTGTTCCTTTAGACTTTCTTATGAAAGCTAAGGAACATGGCTATACAGCAGT
AGAGGCTATGAAAACTTCATTGCAGTGTTCAATGTTTTATCTTGCTGGGGAGTTTTTTGGTTTCTTTGCT
TTAGTTTCTTCATTTTTAGGCGTGGCTCTGGGGGTTATGGACTTCCTCGCGGATGCTCTTCAATGGAATA
AAAAGAAACGTAGTTTTTCTATTTTCTTTTTAACTGTTATTATCCCTTTAGCTTGGTCAATGTGCTATCC
CGAGATCGTGCTTAAATGTCTCAGTTATGCTGGAGGTTTCGGCGCTGCTTTAATTATCGGAGTTTGCCCA
GTGTTAATGATCTGGAAAGGGCGTTATGGGAAAAAACATTATCAAGCAAAACATTTAGTCCCAGGTGGAA
AAATTGTCTTGGTATTAATGCTTGTAGTAATAGTAATTAATTTAGCTAGCTTTTATTACAAATTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c904483-902654 D-fructose-6-phosphate amidotransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TAGAATACCGAGGTTATGATTCCGCAGGGCTTGCAGCTGTTATTCCCGAGCGGTTGTTCGTAAGAAAAAC
CGTAGGCCGTGTCGATGAGCTTAGAAGCTCTTTAGAGAAGGAAAATGTGCCTTCTTCATTAGCTATAGGT
CATACCCGTTGGGCAACGCATGGCGTGCCTACAGTGAAGAATGCGCACCCTCATGTTGATGAGAATTCTG
CCTGTGCGATCGTTCATAATGGCATTATCGATAATTTTAAAGAATTAAGGTCCCTACTAATTTCTGAAGG
CATTTCTTTTTCTTCAGATACCGATTCTGAAGTTATTGCTCAGCTATTTGCTTTCCGTTATCAAGCTACA
GGAGATCTGGTTCATAGTTTCTCATGGACTCTATCGCAACTTCAGGGAAGTTTTTCCTGTGGTCTTATTC
ATAAAGATCATCCTAATGTTTTGCTTTGTGCAGCACAGGAGAGCCCATTAATCATTGGGTTAGGGGAGAA
GGAAAGCTTTATTGCTTCAGATGCGCGTGCCTTTTTAAAACATACAAAGAGTATTCAAGCATTAGCTTCC
GGAGAATTGGCTGTTGTAGGTCTTGGAAGTGAAGTTGAGACATATAATTTCGCTTTAAAGCGCATTCATA
AAGAAGTGCGTCAAGTTGTTTATACCGATGCGGATTCCGATAAGCAGGGCTATAGTTATTATATGCTTAA
GGAAATTTATGAGCAGCCAGAAGTTTTAGAACGTCTCATTCATAAATATTTAGATCAGCAGGGATGTATT
AGTGAGAAATTCTTAAATGGTTTCTCAATAGAAGATTTTGATGAGATTTCTATTGTCGCTTGCGGTTCTT
CCTATCATGCAGGCTTTTTAGCAAAGTATATTATAGAGTCTTTAGTTTCTATTCCTGTCCATGTAGAAGT
TGCTTCGGAATTTCGCTATCGGCAGGCATATATTGGGAAAAAGACCCTAGCGATTTTAATCAGTCAATCT
GGAGAGACTGCGGATACATTAGCTGCTTTAAAAGAATTCCGTCGTAGACAGGTTGCCTGTGTTTTAGGGA
TTTGCAATGTTGAAGAGTCTGCATTAGCTACAGGAGTCGATCATTGTTTATTTTTAGAAGCCGGGATTGA
AATTGGTGTTGCTTCTACAAAAGCTTTTACAGCACAACTGCTTTTGCTGATTTTACTAGGATTAAAATTA
GCTACTTTAAAACAAACGCTAAGTTTAGAAGAGCATCGTGCTTGTGGAAAAGGTTTATTTGAACTTCCAG
AATTATGCAATCGCTTATTAGCAAATGAAAATTTGCATTCATGGGCAAATGATTATTGCGACGAAGATAG
GTTCATATTTTTAGGGCGTCGTTTGATGTATCCTATTTGTATGGAAGCTGCTTTAAAGTTGAAAGAAATT
GCATATGTTGAAGCAAACTGTTATCCTGCTGGTGAAATGAAACACGGGCCTATTGCTTTAATTAGTCAAG
GGTCTCCAGTGATTACTTTTTGCGGCGATCCTGTCGTCTATGAAAAGATGGTAGGTTGTATCATGGAAGT
GAAAGCTCGGCAAGCGCATGTGATTGCTGTAGCTTCAGAATCACAAGAAGATATTGCCGCCGTTTCGGAT
GCTCAGATCTATGTGCCTAATAGTCATCCTTTAGTGTCTCCGATTCTTTATACAATAGTCGGGCAAATTA
TGGCCTATACTATGGCTTTGAAGAAAGGCTATGAGATAGACCGTCCTAGGAATTTAGCAAAGTCTGTAAC
AGTTGAATAA
>ref|NC_003361.3|:c905867-904491 phosphoglucosamine mutase [Chlamydophila caviae GPIC]
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CCGTGTTGTTGTAGGTAAGGACACACGTTTGTCAGGATATATGTTTGAGAATGCACTTGTTGCAGGTTTA
ACTTCTATGGGGATAGAAACCCTAGTATTAGGTCCCATACCTACTCCAGGAGTTGCTTTTATTACCCGAG
CTTATCGTGCAGATGCGGGAATTATGATTTCTGCATCCCATAATCCTTATTGGGATAATGGGATAAAGAT
TTTCTCTTCTGAGGGGTTTAAAATTAGCGATGTTATAGAGCGCCGTATTGAGCAAATGGTCGCTTGTAGA
GATTTTGGAAATTTCCCTGAAGACTATGCTGTGGGGAAGAATAAGCGTGTCGTAGATGCTATGGGCCGTT
ACATAGAATTTGCCAAAGCTACTTTCCCTAAAGGAAGAACATTAAAGGGGTTGAAGATAGTTTTAGATTG
TGCTCACGGTGCTGCTTATAAAGTGGCCCCTTCTGTATTTGAAGAGTTGGATGCTGAAGTGATTTGTTAT
GGTTGTGAGCCTACAGGCAGTAATATCAACGATAACTGTGGAGCTCTTTTTCCTTCGGTAATTCAGAAAG
CGGTAATAGAGCACAAGGCAGATGTGGGAATTGCTTTAGACGGTGATGGTGACCGTATTATCATGGTAAA
TGAAAAAGGTCATATTGTTGATGGTGATATGATTTTGAGTATTTGCGCTAGTGATCTAAAGAAAAAGGCT
CTTTTAAACGGGAATCGTGTTGTTGCTACTGTGATGACTAACTTCGGAGTATTAAAATATCTCGAAAGTT
TAGGAATAGAGACATTGATTTCTTCTGTAGGAGATCGTCATGTTCTTCAGAATATGTTAGAGCATGAGGC
AAATCTCGGTGGTGAGCAAAGCGGCCATATGATCTTTTTAGATTATAACACTACTGGAGATGGTATTGTT
TCTGCTTTACAAGTGCTTCGCATTATGATTGAAAGTGAATCTACGCTTTCAGACTTAACTTCTCTAATTG
TAAAAAGCCCTCAAGCACTTATCAACGTATCTGTTAAGGAGAAAATTCCCTTAGATACTTTGCCTATAGT
TCAAGAGGCTCTTAGAGATGTAAGATCGTCTTTAGGTGATTCTGGACGTGTTTTATTAAGATATTCTGGA
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TAGCTGATATTGTTGATTCTGAGTTGGGGGCCGGCATTATAGAGTAG
>ref|NC_003361.3|:c906477-906307 hypothetical protein CCA00790 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTTGCAAGAACAAAATGTTTAGCCGAAAGACATTCCTTTATACTCTATGCAAGGATTTTTTTATTATTTA
TCTATGTTTTTTCAGAGAATCTTTATTTTGA
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CCACTCCAATTATCTATTCAGCTGCCGACCACAACATAAAACTTAAAGACTTTTCTCCACACGCACTCTC
CGTAGTAAAAACCTTAAGAAAAGCCGGCCACAAAGCTTATATTGTTGGCGGGTGCATCCGTGACTTATTA
CTCAATACAACTCCTAAAGACTTTGACATCTCAACGTCTGCTAAACCTGAAGAAATCAAAGCTGTTTTCA
AAAATTGTATACTTGTAGGGAAACGTTTTCGATTAGCCCACATCCGCTTTTCGAATCAAATTATCGAAGT
CTCCACCTTCCGCTCAGGAAGTGCTGATGAAGACTACCTCATTACCAAAGATAACCTTTGGGGAACAGCT
GAAGAAGATGTTTTAAGAAGAGACTTCACAATTAACGGTCTTTTCTATGATCCTGCAGAAGAAACAATCA
TAGATTATACTGGTGGGGTGAGCGATTTACAGAATCGGTACTTACGTACTATAGGAGATCCTTTCGTACG
TTTTAAACAAGACCCCGTACGTATGTTGCGCCTGTTAAAGATTCTCGCAAGAGCCTCTTTCACTGTAGAC
CCCAAAACTTTAGAAGCACTTCAAGAATGTCGTTATGAGCTCGTTAAGAGTGCTCCGGCACGCGTTTTTG
AAGAGCTCATTAAAATGTTAGGCTCTGGAGCTTCTTCTGAATTTTTCAAATTAACAGTTAAATATCAGAT
GTTAGAAATTCTGTTTCCTTACATGGATAAGGCCTTTCGTTTAAATAAAACTTTAGAAGAGCAAACCTTT
TCCTGTTTAGATGTTTTAGATAAAAACGTTTCAAGCAAAAAATATAACTACGATCGCCATCAACTTATGG
CAGCATTTTTATTCCCGATTGTGAATTTTAATGTACGTTATAAGCATAGGCAGCACCCGAGTTTATCTTT
AACTGCTATATTTGATTATATTAAAAACTTTTTAGGACAATTTTTTGCAGATTCCTTTACTAGCTGTTCT
AAAAAGAATTTCATTTTAATAGCTCTTGTTTTGCAGATGCAGTATCGTCTGACTCCCTTAGTGCCGACGA
AAAAAATTCATTTCTTTAATCGGAAGTTTTTAAACCACATACGTTTTTCAGAGGCTCTTTCTCTATTAGA
AATTCGTAGCTTAGTTTATCCTAAACTAGATAAAATACTTGCTGCTTGGGTTCGTCACTACCAAGCTTTA
CAATGTAAAAAGGAACTTCCTTCTTGA
>ref|NC_003361.3|:907807-909687 lipid-A-disaccharide synthase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCTTCCTCTTTATCTGGTTCATGTACTGTATCCTATAGGATTGATTGCCAATTTATTTTTCGGTAGTG
CGTTTACCATCCAATGGTTGTTGAGTGAAAAACGAAAAACCGCTTATGTTCCTAAGGCTTTTTGGGTTTT
GTCTTCTATAGGAGCGGTTATGATGATCGCTCATGGCTTTATCCAAAGCCAGTTCCCTATGGCACTCCTT
CATGGAGCCAATCTTGTTATCTATTTTAGAAATCTCAATATTGCCTCCTCTTATAAGCTTTCATTAACAA
CAACACTGGTAATTCTTGTTCTAACCTTACTTGTTACAACATTACCCTTTGCCTTAGCGGCCTACTACTA
TCCCTATATGGAATGGATGGCCTCTCCCAACTTTTTTCATCTTCCTCTACCTCCACCAAATATTTACTGG
CATATTGTTGGCTGTTTAGGTTTATTTACCTTTTCCTCAAGGTTTTTTATCCAGTGGTGCTATTTGGAGA
TGAACAACCACTCGACCCTACCAGCATTATTTTGGCAGGCAGGTTTCGTCGGTGGTTTCTTAGCATTCAT
ATATTTCATACGTACCGGAGATCCTGTAAATATCCTTAGCTATGGCTGTGGGCTCCTGCCTTCACTGGCG
AATTTGCGTATCATATATAAGAAATCACGCTTACCTAAATTTCATAGCCCGAGCTGTTTCTTATCTGCAG
GAGAGCCAAGCGGGGATACCTTAGGAAGTGATCTTCTTCGCAATATTAAGGAGCTAAATCCTAATATACA
TTGTTTCGGTGTTGGAGGACCTTTAATGCGGAAAGAAGGTCTTGAGCCCCTCATTCGTATGGAAGAATTT
CAGGTGTCAGGATTTCTAGAAGTTTTTTGTGCTGTTTTCAGTTTATATAAGAAGTACCGAAAACTCTATA
AAGCCATTCTTAAAGAAAATCCTGAAACTGTATTTTGTATAGATTTCCCCGACTTTCATTTTTTCCTAAT
TAGAAAGTTAAGAAAATGCGGGTATAGAGGAAAAATTATTCATTACGTCTGTCCAAGCATTTGGGCATGG
AGACCTAATAGGAAAAAGATCTTAGAAAAGCATCTTGATACTCTTTTGCTTATACTTCCCTTTGAAAAGG
AGATTTTTAAAGACTCCCCTTTAAAAACTATCTATCTAGGGCACCCTTTAGTAAAAACAATTGCTAATTT
CCAAGATTGCAACGCGTGGAAACAACAATTAGAAATTTCTGACCAGCCTAGTGTTGCGTTATTTCCAGGT
AGCCGCCCTGGCGATATCTTTAGAAATTTACAAGTACAAGCTCGTGCATTCCGATCTTCATCATTAGCAA
AATCACATCAACTGCTTGTATCTTCTTGTAATCCTAAATACGACAAGAAAATCCTAGAGCTCCTAGACAA
AGAAGGTTGTCATAATAATAAAATTGTTCCCTCAAAATTCCGTTATCAGCTGATGAGAGATTGTGATTGT
GCTTTAGCAAAGTGTGGGACTATTGTTCTTGAAGCTGCTTTAAATCAAACCCCAACGATTGTTACTTGTT
TGCTAAGACCTTTTGATACCTTCTTAGCAAAGTATATCTTTAAGATTTTTATTCCTGCGTATTCCCTACC
GAATATCATTACAGGATCTGTTATCTTTCCAGAATTTATAGGGGGCAAACACGACTTTTCTCCAGAAGAA
GTGGCTGCAGCGATTGATATCCTTGCCAACCCTATAGGTAAAGAGAAACAAAAATATGCCTGTCAGCAGC
TTCTCAAGACTATGACAGAAAATGTAATCACTCCTAAAGAGTGTCTGCAAGCTATATACGCACAAAAAAA
TCGTTTTTACTTAAAGAATGACTTTATCAAGGAATTTCATCCTAAAAGCTCTAGAGCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c910756-909998 hypothetical protein CCA00793 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTATGCATCGTTTTAAGAAGTGTTTGCTATCGCACACTGCTGCTGTTGCTGTTGGTATTGTTCTCATTCT
TGCAAGTGTCGCTGCGTTGATTGCTTATGCTTCTTCCTTACCTATACTGTGTTCTATTCTTTTGTTTACT
TCTGCTCTCATAGGGGTAGCTTTAATTAGTTTAGGAGTGAAGTATGTCCGTACGTATCTTTCTAAAATAG
ATTTTGTAGATAGCCATGAAAGAGCAGGATACGGCGCCATGATATGGAAGTCGCTTTTAGAAATTCAGGA
CCTACAAGATAGAGTTAATGAGCAGGCGGGCGACATTGAAAAAGTCGAACAATTACAAGAGTATGTCAAA
ACCCTCCACTCTCATATAACTGCTTTAGAACAATTCAAAGAGTGGAAAGACAATCAACAAAAAGAAATGG
TATGTGCTCATTTTGAAGATTCCCGAGCTTATGAAAGAGAACTTAAAAAAGTAGCCAGAAAGCTTTACGA
GGCTAATAAGAAGATAGAGCAGCAACGATTACAAATTCCCGAAGAACTGAAAGTTGCCAGAGAGCGAGTT
CAAATCTTGGAGTGGGTCCAACTACGTCTTTCTCGAGATCTCCAATATGCAGCAAATATGATACAGTTCC
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TTCATACGCAGCAATTAGCTTCTAATCGTTATAATATCAATAAACCACACAGCGTTCTCATCTCTTCTGT
CGTTGCCACAATTTTAGGACTAGCTGTGCTAGCAGCTAGCATAGCTTTGCTTGTTTTATTTGGTGCTCAG
GGATCAGCAGTGTTTCATGGGATTATTGTTGGGGTGATTCTCGCAGCTTTACTGCTCTTTTTTATAGGAG
GAATACATTCTGCTATCGTCTTTAAATTAGTGCGATCCCGTCAAGTAGAGAGTTCTATATTTGAGAATAC
GGAGTTAAATTTGCAAAGGCAATTACAGGATCTTCAAAGTCGTTTATCTAAAAAAGAAAGCGATATTTGT
AATTTACGGGCGCAACTAGATAAAGAAACTGTTAAAGTTCAAAAAGTGTTAAAACTCAAACAGGAGGAGT
TAGACAGCCTGATACGTAGGTATGCTGCCATGGCTCAGGAAAGCTCAGATTTAGCAGCGTTAGTTTTGCA
TTTACGTACTGAGTCAGCAGATTTAAAAAGAGTCTTAGAAAAGAACACAATAACTTCGAATGCTATTATA
GAAAAGTTGCGCAGCAATAGTGAGTTGCTCCATTCCGAAACTATAATTGCACGACAGTCTCAGGAGGCAG
AAAAAGTTGTTGTAGAGAGTCTGAGAAACTATTCTGAACAACTATCAAAACAGCTTTGTGAAAAAGCACA
AGACCTCCGTGATAAAGATCAAACAATTGCGAAGTTAACGCAACAAGTGGCTGAGTTAAAACAGGAGATT
GCCACACTTCAGATATTTATTACTGATAATGTAGCAAATAGAGAACAAAAACGTGATGTTGTTGAGGAGT
TGAATAAGAAGCTCGCAGCATTGAAATCTCAGATAGAAAGTCTTCAGGCATATATTACGGAGAGTACAAA
GGGAGACGAAATAGCCATCCCAACGGGGAATATCTTGGCCCAAAAAGTAAATGCTTTGCTTAAAGATGTT
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AG
>ref|NC_003361.3|:c912816-912085 hypothetical protein CCA00795 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGTACGTGTCGCCTCACATGCAAAACTAGGGTCGCTTCATGTTGTTTTCGTGACTCTGACTATAATCGTA
TCTATTTTACTTGTCTGTGTAGCTGTTTATAACCTTTTTCATCTTTGTACTTCCGTACGTGAGCATCAAG
ATGAAAAAGAATCGCTAGATCGAAGAGTGCGTAATTTAGAAATGGTAGAACAAGAGCTAAATAGACAATT
GCAAGCACAAAGACTCGAACTAGATTGTCTTGGAGAAGAGATTATTTTGCAAATTAACAGAGCAGAGCAT
AGTGAGAGCAAGTTTGGTGAGAATTTGCATCGCTTTGCAGCGGATAAAGCAGATCTAGAACAACAATTAC
AATTAGCAAGAGAAGAAATTACGAACCTATCTCAGGAATTAGAATCTCGATTGGAAGCAGCGAGCATGGA
GATAGAACCGCCCTATAGTGATGAGGAGATGGACGAAGATGCAGATTGGTTTGAAGCTAATAACATTTTA
GGATCTCCCACAGATCAACAAAATGTCGCGTATATGGTTATGGACGAAGGCAATGCAGATGATGAAGCAA
GTACTTCTTCAGAACGCGAATCTCCTAGATAA
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TTGTTTTTCGCTTTAACACGTCATGCTACGAGTTTGACATTACGCCATCATCAAGAGGAAACTCTTAATG
AAGCAACAAAAAAGTGGAAGAATTAG
>ref|NC_003361.3|:c914112-913288 hypothetical protein CCA00797 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACAACTAACCCAGTGAACACTACTACTACGATAACTCCACCTATCACACAAAAACAACCACTCTGTA
GCGTACAAGAGAGTAAATATCGACGAATTGCTGCTGCTACTACCTTATTAGAAGGCTTAGTACTTATCGC
ACCTTTAGTAGGAGCTTTGGTCTTCTTTGCCTTACCTACAGCGACAACTATTACTGTTCTTACTGTTCTT
ATTGGAATTGCTCTAGGTGCTAGCGTTATTCTTCTATCTATGGCTATGTATAAACTGTTAAGATGTCGAC
AGGTTCCTAGCGATCCAAAAGGTATTGAGGACAGCGTAACCTTAAAAGAAGAAATTATAGAGATAAAAGC
TCAGCTTACACAGAAGGCCATTCAATTAATCGAAGAGGAAGAGCGCAGCGCTTCCTTATTAGGACAGTTG
TTAGCTATAACAGGTGATTTAGAGGCCACACAACACCAGAAATCCGCTTTAGAAGCTGAAGTTAAATTAT
TGCAAGAACAGTATACTTCTACTCTCAAATTAGCGGAAAAAGATCATTCAGAATTAACAGAAGTTCAACA
AGAACTAGATGAAAAGACAGCACGACTTGAAGACTTCGTAAAAACAACGGTTTTATTAGAGAAGCAAATA
GCTGAGAAAGAACAAGAGATAGGTCAATTAAACGCTCGTGTTGCAGAACTTGAAGCTGCTGCAGTAGTTA
AAGCTCCTGAATCCGCTGAGGCTTCTGAAACTGTTGAAGCTACAGAAGAAGTAGAAGCTTCTGAAGAAGG
AGATTCTGTACATGCAGGGAACCTAGACAGTGAAAGTGGTCCAGACCTTGATTAA
>ref|NC_003361.3|:c914302-914207 hypothetical protein CCA00798 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTATTTCCGTTCAAAATTTTGTCTAA
>ref|NC_003361.3|:c917077-914459 hypothetical protein CCA00799 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CATCAAAGGTTTGCCTGGTGATCAATGTATTTTCTATAGTTTTATCTTTGTTGATTCTTGTTACTGGTAT
AACCACGCTAATTTTTTTTAGTGTTGGACTGGGGATGATGCATAGCGCAATTTTAGGCATGTGCGTTTTA
GCTGCAGTATTTTTCCTAGTGATGAATGCTTATTACCTAGCAAATAGAAAACATACTGTAGGCATGTCTG
CTTTACAGAATCAACGAATTTCTCAAGATAGTACGCGATCTTCTCTCCAGGGAGCTCCAACAAGTTTGGG
AACCTCTCAGGTGTTTAGTGAAATTCAAGGAGAGCTCAGTTCCAAGAATCAGCAGATCCAGGAAATGCAA
GCAGAGCGTGAACGCATGTCCGCAAGAATCTTAGAATTAGAAGCTAGGGCTTTAAGATGCCAGGAAGATC
AGGGAAGGATTTGTGGATTTGAAGAGCAGGAGAACTCTTCACTAATAACTTTAAATAATGAACGACGTAC
TTTTGAATCGAGAATTCATGATTTAGAGCAAGCGCTCTCTGATGCCGAATCTCAATCTCAAAGCCATACC
TCTGTTTTAGAAAGTACTTTGAAAACTCTACAAGAAGAACGTCTGCAACTGCAAAATCGCATCGCAGAGT
TAGAAACCACGGTAGCAACTCATGCTGAGCGAACATCTGCAACATTGACTACAGAATTAGAAAGACAGTT
AGCAGAGAAAGATGAGGAAATACAACAGCTACAAGCACTGAAATTACAAGTCTATAATGAGCTTACATTA
GTGCAACAATCTTTAGATAACGAAGCGGAGAATAACGGTAAAATTGCTAAAAGATTTGAAAAGCTTCGCG
TTGCCCTAGAAACGGAAAGAGATGAATTTCGCGCTAGATGTTTAGAACTAGAAGCTGCAAAGGTGCAGCT
AGGGGTATTGTTATCGAATGCTTCGCGATCTTCTTCTAGCAATATCGTCGAGTATGAGTCCGAAATAAAC
AGGCTTAATGTAGCACGTAGAAATGCTGAAGAGAAGATCGTTATATTACAAAAAAAACTTAATTTTAAAA
AAGAGGAGATTTCCGCTATCGACGCGGGCCTTCGGGAGAAGGAACATTGCCACAAGGAGGAGATTTCACA
GTTAAAACAGAATCAGCTTGAGATGTCTTCACGGATCCAAGGATTGGAACAAGAACTCATAGACGCTGCT
AGTGAACAAGAGCGCAGTGCTCAAGCTTTCGTAGATGGACGTAGTGAATACGAAAGAGAAATAGCTGAAC
TTAAGAACACCTGTTCTACTCTTGAAAAGACTATGCAGGATTTGCGAAAAGAGCATGTGTCTTCTTCAAA
TGAAGTTGGGAATCAAGTCGAGGCCCACCAAGCTCTAAGAAGGGAATTAAGGGAATTAGAGGATAACATT
ACGCGTCTACAAAGAGAAAATGAGGCAAAACAGAGAAAAGTCTCTCAGCTAGATGAGGAAATAGTTCGCA
TTTCGAATGCAAAAATGCAGACTCAGAGAGTGGCTAGAGAACAGATAGCTAATCAGGTAAGTAAAAGAAA
AGAAGTAGAGTTGGAATTAAAAGAAAGTCAATCTAAAACTCGAGAATTGGAAGCTACTATCGGGAAATTA
AAAAGAGAACCTGGCCGTACTGTTGTAGGTTTACAAAGACAGATAGCAGAACTGAGTTTGCAAATAGGAG
AAAATACTACTACGATTTCAAGACTAGAGAATCGAAATAGAGAATTAGAAAGAACCGTTCAACAGCATAC
AAACAAGAAATCTATGAAACTTACGTCGGATCCTGAGAGACAAAGCAGTATAGCTAAGTTAGAAGTGGCA
AGACAAAGAATAAGAACAAATATGAGTAAAGACAATAAGGATCGCGTGCGTATGGCACAGAAAAGAATCG
AAAGATTGGAAAGACTCAGTCAAGGTTCTACATTAGCGCGTCAAGCTTTCCTATTTGCTGAGGATGCAGA
AAAAAGGATCGATTATCAAGGGCTTTTTGAATTAGAAAGTTCTCTATACGATCTTTTCCGTTCCAAGAAG
CCTGCCACAAGAAAAAATAGAATCGATGGTCTGAGAGCACTAAGATTGCAGCAATATTGTGATGGTGATG
CAGAACTTGAAGCAAGAGTGCGCGAGTTTAATTTTCCTCCAAATGCCCCGATTGATTCCACAGCGCTTTA
TGAACTAGAGCAAGAAATTCTTGATGCTAGAGAGGGTAAACTGTTTTCACTACGCGAATCTCTGGAAGAC
TCCAATGAACGTATACTTGACCTAGAAGCCAAAATTAAAGAACTCACAGAAGCGCTTAGAGCTAGTACAG
AGGCTTTAAGCCCTAATGCTATTGAAAGAAAATCACTAGCAGAGCAACAGGAAGCACAACAAGATATTCA
AAATCTCCGCAGTCAACTACATGAAGCTCATTCGCAATTGGAAGATTATAAAACCAGATTCCTTGGTGCT
CAAAATGAACTTTTGAAGGCATCCCTAGAGATACAATCGAGAGATTTAGCTTTTAAAGTTGCTGAAGATA
AATTAAAGAGCTTCGAAGATAAACAATAA
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GTGCAAGTTATCTATTTTATTATGGGTTTCTTTATGAAATGTATGCAGACGAACTTGTCTTCTGGATTAG
AAGGGCAGGTTGCATCTACAAATGTAGACAGAACATATTCTTACAGTGCTATCAATGCTCTTGCGATAGT
CTCGGGAATTTTAATCATTACTGCTAGTGTCGCGGGATGTATTTTTATAGGTGCAGATTTAGGATTGTTA
AGTGCTATTCTTCTAGGTTTCACTATTATTTCTGGGCTAATACTTATTGCTCTTGGGACATACTTTTGTT
GTCAGGGAAATGCTTTCGAAGCAGTTGTCTCCCAAAGAGTTTTAGTAGAACAGGCAAGGAGTGCTGAGCT
AACAACACAGCTAGCTGTTGCACAGCAAGAACTCGTTGATCTACGTGCTCAACAGCTAGAGGATCAAGAG
CATAGAGTGCCAGACCGAGAAGGTCTCGTATCTGAAGAACAGGCAACGCTTCTACAAGCAAGAAATCAGC
GTATAATTGACTTAGAAAGCATAATAAAGCTTCTAAGAAAAGAGCATGCAGAACTTTTGGAGGAGCAAGA
CAGAAAATGTTATGCAGAGATTATCAGGCAAACATCCCTACGTAACCAGCTTCAAAATAATCATCAAAAA
GAAATGGAGTCAAAGGAGAAATCCGTTAGAGAGCGAATGGAATTTTTACAAAATGAGATGTCGCAACACG
TGACATCACACGCCGATGAATTGACAACAATCCGACAAACTCTATTGCAAAACCAAGAAATATTTAATCA
AAATATACGAGAACAAGAACAACAGATTTCTGTTCTACGAGATTCTGTGAGTCAGCAACATGCTGTAGAT
CTTGATCGTATTCATGAGCTAGAAACTTTATTAGAAGATAAGGAAGAAGTTATATCAGCCTTACAACGCG
ATGTAGAATCTTATGAGAATGTAGAACTACATCATAGCATAGACTCTCTTCCTCATGCTTTAGCGCGTAT
CCGACAGCAAGAAGCACGCATTACTTTGTTAGAGGTTATAAATTTACAACTGACTCCAAGAACACGTAAT
CGATCATCGAGTATATAG
>ref|NC_003361.3|:c919587-918601 hypothetical protein CCA00801 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAGTGTGCTTCTCCTTGTTTCTATTTGAAATCGGAGAACTCTGATGAGCGTTGTTATAATTTTCTTG
ATTCTCGAGTTCGTGTAGTTGCGACTATTTTATCAATAGTAGCAAGTTTATTAATTATTATCGGAGCTAT
AGCTGCGGTGGTTCTTTTTGGATCGCAGTTAGGTTTGCTATACTCAACAATAATCATTGGTTTATCTGTA
GCGATTGGGGTATTGCTTTTTAGCGCAAGTTTCAGATGTTTTACTTGTTGCGCTTTAGTATCTCGGTTTC
AACATAGCTCTTCGCGACTTCGTATCGATGATCCAGCAGCTTCTCAGCTAACTACACTATCTGATGAAAC
TACAGAGAATATAGAACATCATCTACGTGATGTTATTTCAGAATATGCTGAAAGTCGGGATGCCTATCAA
GATCTTATGAACCAAAAAGAGCAGTCAGCGATAGGTTTACATGCTGCTAGAGCGGCATATGAAAGCGCGG
ATGCAGAGTATCAAAGACTAGCTGAGCAGCCTGCAGTTGATGGAAATATAAGTCTGGAATGCCAAGCAGG
TTTGATGACATCAAGAGAAAAATGTTTGGAATACATTCAGACTGTACATGCTTATGAAGGGATTCTTGAG
CAAATTAGTTCTATGAACAATCTGTTAGAGTTTCAAAAGGTAACATCTGCTTATGAGCAGGTAGGTGTTG
TATTAAGACAAAAAGCAGAGGATGCTCAAGCACGTGAGCGTGTTTTAGAAAGTCAATTAGATTTACGCAC
TAAAGACTTCGAGCGATTATCTCAACTCGAGAGGGATTTACGAAGTTCTATAGGAGAACTAGAGAATGCG
CGTGGGGCAGAAAGACACCGAGACCTCAATGTCACGAGCTTAGATGTTGTTGATATGACATTAGAGGAAA
ATACGCTTAACCTAGTCGTGAGTGACGATGATTTTCAAGATGCGGGAGACAGTTTTTTAGATCCTCAAAA
TGAATAG
>ref|NC_003361.3|:919810-919920 hypothetical protein CCA00802 [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGGAATATATTCTCGAATTAACTATCTTTTTAATATTTAAGGGTGTTCTTTCTTTATCTTCGGGCTTTC
CTATTTTTCATCATTTGTCATTAAGACTCTCTTTTGTTTAG
>ref|NC_003361.3|:920130-921410 hypothetical protein CCA00803 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTCTCTATGGCAAATACTATTCCCACTAATTTTCCTATCTATTCCGCAGACGTTGTCTCTCAGAAAT
CTTTAAAACAAACTCTGCGAATATACGCTGAAAGGGTCCACTGTTATGTTTTCCATACTTTTGTAAAAAC
GGCTCTATTAAGACCCTTTCAGCCTGCCAGCAGTCAAAAGTATTGCCATTCTCTTCTTATTTCTATCCTG
GCAGTCATTGTTAGCGCTATTCTCTTCTTACTTCTCTATCCTGTAAAACTCACCTTCCTAGCGATCAGCC
TGTGTTTAAAAGATCCAAAAACAACCACAGTATCTCTTAGAAAAAGTTTCGTTCGTAATCTTCAAGACAT
GGTGAACCGACAGCTCTTTATAAATTCCGATTATCTTAGTGTTACCCCCGAATCATCTCCTTTTCTAACA
TCTTTCTTAATCCCAGAAACGCAATCCTGGGAATCGTATCATTTAGAAGATGAAATACTCGAACTCTACT
CTACCCTCCCTGAAGGATGGGAAAAGATACTGAATTATGCCGACACTAGAAATCAAGACTACCCCTCAAA
AGAGATGGCGTACGAGGGATCATTATACCTTACAGTATTGCACAAACTAACGACAGTATTACAAGACCCC
TTGATCCCTAAAAAGAAAAAACAAGAGCTCCTAAACTATATTGGGACCTACGCAGATGCTTGTCCCCCCA
CATGGATCGAGGTTATATTCAAGGAATTAACGGCGATCTATAACAAACGAGACACAAGCATCAATTACAT
CATACTTTGCGTACAGACATTCAAAGAAAACCTTTTGCAATCCATGGTTAATCGATCTTCAGAAGAATGG
CATCATATATCCGGTTTCAAACATTATCATGGAGGCTCTCTAGGATTGAATATGAATTCTCTAGCGCGTA
TTCAATTTACCGGCCATCTGATCTTGAAAAAGCAAGCTCTCTATAATCGTGTCTTCAAACGATTTCTTTC
TAACTACAGAGCTTCTGTAGCAAATCTCATCGAATATACCCGCTGTCAAATCATAGAATCTTCTCAAGAG
CTGAAGAATTCTCTATCAAGATATTTATGCGAAACTATGACGCAATTGGAGGTTCCAGAAAATGAAATCT
CCTCCGTTTTATCCTCTTTATTTTACGATGAGCACTTTGAATTAAATAATACCGGAATTGCCTTTATTCT
TATCATGCAAGGAATTCTAACTACAGAAGCACAGACAACTATCGGAAAAATAGCACAAAGGCTCCCCAAT
CTGTTTCGATGTCTTCGATAG
>ref|NC_003361.3|:921608-924373 hypothetical protein CCA00804 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCGCTAGAACACAATAATTTCCATGCTGCTTTTGCACCACCACCAGCTTCTGCATTGCACGGAACTT
CTTTTATAAAAACTGCGAATCAAAAGACTTCTTTTAGATCTATATTCAATGCATTAAGCACTAGACTCGG
ATCTTGTCTTTGTTTAAATCCAGAATTTCGCTCTGGAGCGGGATGGGGCTTTACCTTCGTTTTATCCGCC
ATTATCACAGTTCTTCTTTGTATTTTGCTTCTTCCTATAAAATTAATCCTCTTAGGATTAAGCTGTTGCC
CCTGCGCTTCTAGACCTCCCGTAAGAGGAGAGGAAATTCAGGTAATTCCTCAACTACCTCCTCAACCTCC
ACAACGACCTCTATCAAGTAGACAAAGCTCCGATTCCGGAATTTCTGGAGGGTTGGATTCGGGTAGATTT
TCTCCGAGCTCCTTTATACCTATCCATCCAGAACCTTTAACACCTCCGCCCTCTACGCAATCATTAGGAG
TAGTTCCTGAAGAAGTTTGCCTAAGAGAATATCTAGGAGAACACTATCCCCAAAGAAACTTATCAAATAT
CAATCTAACAGACTTAGGAATCTCTATTTTACAACCTGAAGATTTTCCTGAAGGAACAAATATTCTTGAT
CTTCCCGCCTCCTTATTCTTCCCAGAAGGAGCTCCACCACCTCTTTTCTTAAATCAACAAGATATTACTG
CGGCAACACCTACATCCCCTCAACCCTCCATCGCATCTCAAACGACGATTGCCCCACAAGCAGCAGATCA
GACAGCCCCTCAACAAGATGATACAATAAGCCTACCAGAATCCCTGGCCGCTATTCCACCTCTCGAAACG
GCTCATATCATACGGGAAGTTGATCAAACACTCACAGCTCAAGAATTTTTAAATAGCGCTTATCCAAATA
TGGATCATAGTGCACTTATTCATGGCGCTCTTATAAATGTACAACTTCAAGGCATTCCTCTTGAAAATAG
TGAAGATATTCTTGGTCTTCCAGCTCTTATTGCTTTCCCAGATCTAGTTGCTGGACAACCCGTACGACCG
ACATTCTTAGATCTCGACAATATGCCAAGATCTCTTTCCGCTGATCAAGAGATAGCTCCTCCTCCCCCTA
CTGCAGCAGATCCCATCTCTCCAAATGATCCTAGATACATCTTTCTACAGAATCACTTCCCCGAGTTATC
TCCCGAATACTATAGCCAACATATCAATCTGCTTGCTTCTTTAGCTGGAGTAGACTCTGACAACTTTGAC
CTTCTTCAATTACCTCTTGAAGTATTCGTTGAAGCACCAGCACCTCAACCTGACTACAGTCCTATTTCTC
CAGAAGAAGCCCAACAAAGATACAATGATGTTTCTGCAGAAGAGCACGCAAGAAGAAGTAACGATTTTAT
CCGTTATCTTATAGAAAATTCACCACAACGTTGGACCTTCTTAAACAGACTGAAAAATAACATCTCTGCA
TCAACTTCAAGCTTAACCCTGCGTAGAGAATGGTTTAAAATGTTGGATGTAATATCTAACAAGACGAGCC
CTGAAATCACGGATCGCGAAGTACAGGATGTTGCCCGTGCATGTCTCTTCAAAATTAATTCCATCTTAAA
GGATCCTACCGTTGCTCCTGAGAGAAAAGAAGAGCTCTTAAAATACGTAGCTTCTTATTACGATAGCTCT
CCAGATGTGTGGGTAGAGGCAATACAACAAGAAGTATTCCTACAAAATACGCTTAATCCACAGATAATTT
CTATGGAGGAAGCAGGAGCAGCTGCAGCTGCGGCTAGCGTACCAATTAACCAAATTCTACCTCCATTTAA
CACTCAAGCAACAGATCAAGAAGTACAGGGTTATACACAATTATTAAGAACTACTCTATCTCGCCCAGTG
TTGACAAATATGGATAACATCCATCTCGCCCCGACAAATGATGAATATTTAGAATCATTAACGAGAGGTG
TTCCTAGTAGCTGGGTAGACATCCACGAACCACTACAAACTCGTATCGAGCAAATCGCCCAAAACCAAAA
CACACGCAATAATTGGAGAGCTATTTTAAACTGTTTAGCATCGGGCACTGTGGGGTCTATAAGCTCAAGA
GAAGCTCAAGCGCTTTCCCGCTCAACCATGTACCAACTTCTTAAACTCCTAAACAATCCAAATATACCAA
ACGAAAGAAAATTATTGATCATCAACCACGTAGCTTTCTACAGAGATAGATGTCCTCCTACATGGGTAAG
AGTTGCCGGGCAAGAATTGCAAACCATTTTCAATTCTAATGACACCTCAACAAACATTGTATTTTCTTGG
GTACAAGCCTTTAAAGAAGGTCTGGTATCAGAGATCTTTAGAAATGAAGGTGAATGGCATATGATGACGG
CCTTTAAGCATAATCACGGCGGCGAACTAGGTCTAGATAATACGGGAATCATTTTAGATCAATTCACCTT
GGCCATAGCAGGTAGACGCTACACGCAACAACATGACAACTATCTTAGCTTATTCCGAAATGCGTATCAA
AACAGTGGTAGCGGTCTAGTTGACTCTGCTTTACAACAAGTTCTCACAGGATCTGAAGATCAGATCCGAG
CTATAAGAAATGGTATCCTTGCTGATTTAGAAGCCGCAGGCATTCCTGAAATACATCGCGCAGGGATTAT
GATGGAAGTCTTCTTCCCAGAAGAAAATGACTACAAACCATCTAGAGAAGCAATTGTCTACCTACTACTA
AAAGAAGGAGTTATCACCACACAAAATAACAACTAA
>ref|NC_003361.3|:924751-926055 hypothetical protein CCA00805 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGCGTGTCCCTGAATCCAAATAATTCTAATCTACCGGTATCCTCCCCTCTAACTCCTTCATGTTACA
AACGCGTAACTACTTTCATGAAACAACTCACCTGCTCTTATCTATTCTCTAAACTCTTTCAAGAAATAAC
CGATATTGTAAGGCTACATCCGAAACAATCCTGTCTAAATCAACTACTCGTTGTGCTAGTATGCGTGATT
TGCCTTCTACTTTCTCTTGTGATTTACGTTCTGCTTCTCCCCATAAAATTGCTCACCCTAGCAGCCACGT
GTGCCTGTGGAAGGAAAACAGAAGCTATTCCCCTTCTTCCGGAAAAGCCAAAAATCTTCAAACCATTAAC
AGAAACCCAAGAGGCCTTTGTTGAAGAGGTAAAAAGAGAAATACTCCAGAAAATATCTGAAGAATTTGAA
ATCAACATGTCACCAGATATCTTACGCCTAATTCCCCTTCCCTCGCCATTCTTAAACTCACTAGCCACAA
CGTCCTACTCAAAGAAATTATGCGATTACAACAAGCTTACAAGCCTAATTCATCGTCTAAATTGTTGGGA
TGCCGGTTGGGGAATTATTATGAAGTACCTCACCTCCACACTAAAAGAAGATGGATCCCATCCAGACACA
CATACATTTCCCATTATGATGCATCATCTTATCTTAGCTCTAGAGGACCCTAATATTCCTGAGAAAAGTA
AACGCGCCGCCCTTCAAGAAATCTCTTCCTACGCAAATACATGCAAACCCACTTGGGGCGAGACAATTTT
TAGATCTATCAACAATCTCTATAACACACGAAATTCAGGAAGAGATCAGATCCTACTGTGGGTACAAATG
TTTAAAGAACATTTGCTTTCTCAACAACAACTGGTCACTCATAAAGAAGAATGGCATGAAATCAACGGTG
TAAAAAATCTATACGGCGAACAACTTGGTTTAATCACCGATCATTTAAATAAGAATCTCTCAGGCCTAAC
CTTACGTCAGACATCAACAGTTCCTTACAATCGAGCAAGATACACAGACCTTAAAAATAACTTTGTGCAA
ACTTATAAAACGTCTCACTGTGAATTAGTACAGCATATCCATAACGCGTTCTTATCATCAGAACCAGGAG
TACAAGCACGTGTTTATAATTTCCTACTCGATCAAGTAGCTGATGTTATCAATCTTCCTGAAACTACAGC
ACATATCGATTTAGTCGTGGATTGCTTCTATGACGACACTTACGAACTCAAGCCAGAAGGAATCCTCTAC
CTACTCTATATTATGGATATCATAATTCCTAAAACGACTACCTAA
>ref|NC_003361.3|:c930747-926134 polymorphic outer membrane protein D family protein/autotransporter [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTCGCAAAAAAGGTATCAAGATTTCCAAAATCTACATTTTCCCATTCCGTAGTTTTAGCAATATTAG
TTTCTACTGGGATGACTGCTAATAATCATAGATTATATGGTTATGAGACAGTTTCAGAGGCGTTTTTGAG
TGATTCTTCTTTGAAAACCCAATTAGAAACGACTTCTGCGGGTGTTTTTAGAAAAGTAAAATCTACTGAT
ACACAAGAGGTTCAGAAAGAAAATAAAGAAGAAAATACGCCTGTAGAGACTTCTTTTATAGAGAATGCTT
CTTCATGTTCTGTTGCTATTTTAGGCTCAGAATGCGGTCAAAGACAGCATTTAGTCAATGCCAGTACTTT
GTTTGAGATATCGGATTCTTTATCATGGAAGAGTATAGATGGCGAGTTGTCTAAAAGCTCCAAGAAGTCT
GCTACAGCCGAAGATGCAGAGAGAAAATATCTTGTGGATGATTCCAGTCAAGGTTTAGCTTTTTGTTATA
AAAACCCATCAGATTGTGTTGTGGATGAAACTACGCCTGGATTCTTAGGTGTTGCTCTTGTAGGAGTGGG
ATCTACATCAGGACTATCTTTTTCTAATTTAAAGTCGCTCTCAGCAGGATCTGCGGTCTATTCTGATGAA
GATGTTGTTTTTGAACACCTTAAAGAAAAACTGTTTTTTGAAGGTTGTGAGTCTCAAGCAGGTGGTGGAG
CTGTTTCAGGACGTAGTATTGCTATAAATGGTTGCCATGACGTTTCTGCAGTGTCTTGTAAGACCGATTT
AGATCTTGCATCTTCTGAAGTCGTAGATTTTTCCAAAGGTGGAGGTGCTTTTAACGCGCATAAGGTGCAT
GGTGAAGCACATAAATCCAGATTTTTTACTGGAGAAATCATCTTTACAGCCAATTCTGGGAATGTTTTGC
TAGATGGTAATCATGCAGACAAGGCGAACGGTGGAGTTGTAGCCTGTGGAGCATTTGTTTGTTCTGTAAA
TCGTGGAGATATCCGCTACACAAGTAACCGCGCTCTATCTGGAGGCGCTGTATCTGCTTTTAAGTCTATT
GATTTTGTTGGAAACGTAGGATTGATAGAGTTTGTAGATAACCAGGCTTTAATTTCTCCTGAAAGTTCTT
TATTTTTAGGTGGTGGGGCCTTAGCTTCTGGAGAGAGAATTAGTTTCTTAAACAATGGAGGCATCCATTG
TTGCAAAAACACCTCTAAATCCTCTGGAGGAGCTCTTTTATCTAGGGATGTAAGAATTGTAGAGAACATC
GGAAATTCTTTGTTTAAGGAAAACTCTGCTCAAGTCGTAGGTGGAGCCATTAGTTCTCAAAATCAAGTAG
AGGTTGGTCAGAATTTTGGAAATATCACTTTTGAAGGTAATACTTCCAAGATGGGTGGTGGAGCTATTCA
CTGTTTATCTGCTCAGCAACCTTATACGAGTTCTGAAGAAGCTCTGGAAGGATCTGGGGATATCAAGATT
GTTGATAATTCGGGGGCTGTAAATTTTGCATCTAATGAGAACCTATTGGAATCTCAAGAGACACATAGTC
ATATTGGTGGTGGTGCTCTATACGGATCAAATGTTTTAGTTTCAGGCAATATTGGAGAGGTTACTTTTTC
TAAGAATACCGCTGGTCAATGTGAATCCGACAGTACCTGTATAGGTGGTGGAGCGGTTTTTGCTAATGAG
GCTGTTAGAATAGTAGATAACTCAGGAGCGATTACTTTCTCTTATAATAAAGGGACAATTCTTCCATTTC
CTAAAGTTGCTGCAAGTTCTGAAGGGGAAAGTGCTCCAGAAGCTCCTAAAGAGTCATCTCCTGTAGATTT
AGGGGTTCGCGGCGGTGGAGCAATTTTTGCCAAGCGTATAGAGATAGCAGATAACTCTGGTGTACTATCT
TTCTCAGATAATTTCATGAAAATTAGAGATAATAAGGCACAAAAAGAGAATCCTCTAGGCGGTGGTGCTT
TATTTGGGATAGATGAAGTCGGTTTGAAAAATAATAAAGAACTTGCATTCACTAATAACCATGTCTCTGG
TGAGAATAGTAGCGGTGGTGCTGTCCTATCTAAAGTTGTCACTATTGCTGATAATGGAAAAGTACAATTT
TTCCGCAATTATTCGAATTTCCTTGGTGGTGCCGTTTGTTCTCTAGGAGATGCTCTAAACATTAAAAATA
ATGAATCTTCAGTATCTTTTATTGGCAACAGAACTGTGACTGCTGGTGGAGCGCTTGCTAGTGCTGCAGG
TGATGTTTCTATTTCTAAAAACCTTGGGAAAGTAGAATTTAAGGATAATTTAGTTTTTGGCGATTCTCGT
GTAGATAATCTTGAAGAAGGTCAACTCAACACTACAGGACATCATAGTGGCGGCGGTGCCATTTTTGCTA
AAGCTTCAGTGGTTATTCGTGAAAATAAAGATCAGGTGCTTTTCTCAGGGAATTCTTCAGGATGTTTCGG
TGGTGCGATTTTAACAGGTTCTTTAACCCCAGAAGATCAAGAGCGTTTTGCTTCTAAGGTAGTGAATGAT
AATACTAAAGTCGTTATTACAGAGAACATTGGAGACGTAGTATTTTCAGGAAATAGCACTACGGCTTCAA
AACATCCTGAGCATAATTTGTTCGGTGGTGGTGCTATCTATACCCAAGACTTAATTATCAATAAAAATGC
AGGTTCTGTAGCTTTTTATAATAACTACGCTCCTACAGGTGGTGCTGTCCGTATTAGTGAAAAGGGAACT
GTGATTTTAGAGGCTCTAGGAGGAGATATTGTTTTCCAAGGAAATAGAAATTCTGAAGATATCTCTAATG
GATTATATTTTGCCGGAAAAGAGTCGAAATTAGTTGAGGTATCTGCTTCTGGGGAAAAAACGGTTAATTT
TTCAGATGCCATTATCTTTGAAGATTTAACCTTAAGACAAGGCCTAGAAGGTCGTGAGGATATTTTAAAT
GATCCTACATTAGTATTGAATTCTAAGGCTAAAGATGATTCTGAAGTTTCTCATTCTGGAAACATTCGCT
TTGCCTATGCGACATCTAAGATTCCTCAAGTCGCTGTATTAGAATCAGGAACTCTTATTTTATCTGATAA
TGCTGAGTTGTGGTTGTGTGGCTTAAAACAAGAGAAAGGTAGTGAGATCTTGCTCTCAGCAGGAACTGTA
TTACGTATTTTCGATCCTAATGCTAAGCCTGAAGAAAAGCCTGAAAGTCCTTCTGCAAGATCTTACTATA
GTGCTTATGATTCTGCTAGAAATCCTGAAGAGAAGACTTTGGCAGACATCAGTGTTATTGGTGTAGATCT
AGCTTCTTTTGTTGCTAGTGAGGATGAAGCTGCTCCTTTACCTCCACAGATTATCGTTCCTAAGGGCACA
ACAATCGGTTCGGGATCTTTAGACTTGAATCTTGTGGATTCTGCAGGTGTTGGTTATGAAAACCATGCCT
TATTAAATAAAGAGACTGATATCACATTGCTTTCATTTAGGAGTGCCTCAGCAGTCTCGGATGTTCCTGA
TTTAGACCATGCTTTGGAAGAGTTACGTATTAACGTTTCTGTTCCTAAAATTACGGACGACACTTATGGG
CATATGGGAAAATGGTCAGATCCTCAGGTTGTTAACGGTAAATTAACGATCAACTGGAAGCCTACCAGCT
ATAAGTTAAATCCTGAAAAAGGAGGCTCTATCGTATTGAACACTTTATGGGGACAATGCGGAGATTTGCG
CGCCTTAAAACAACAGCATTTATCTCATAATATTACTGCACAAAGAATGGAATTAGATTTCTCAACAAAC
ATTTGGGGATCTGGAATGGGAACATTCTCCAATTGTGCAACGATTGCTGGAGTGGACGGCTTTACTCATC
GTGCTGGCGGCTATGCTTTAGGTTTAGATACACAGTTGATAGAAGATTTCTTGATAGGAGGAAGCTTTGC
GCAGTTCTTTGGTTACACTGATAGTCAGTCATTTTCATCACGTAGTGACCAAAGTGGTTACTTAGGTACG
GGATATGTCGGTATCTTTGCGGGTTCTTGGTTATTCAAGGGGATGTTTATCTATAGTGATATTCAAAACG
ACTTGAATACAACATATCCTACACCAAACATTGGTAGATCTAAAGGATCGTGGAATAGCCGCGGTATCTT
AGCAGATGCTCATGTGGATTATCGCTATATTGTGAATTCACGTAGGTTTATCTCATCGATTGTTTCGGCT
GTGGTACCTTTCGTAGAAGCTGAATATGTTTACATTGATCTTCCTACATTTGCGGAAGTAGGTAGTGAAG
TGAGAACATTTGCTGAAGGGCATTTACAAAATATAGCGATTCCTTTTGGGATTACTTTGGAGCATAACTA
TTCTCGAGGGCAGCGTTCAGAAGTGAATAGCTTAAGTTTCTCCTATGCTTTAGATGTCTATCGTAAAGCA
CCTACAGTGCTTATCAATTTGCCTGCAGCTTCTTATTCTTGGGAGGGGGTAGGTTCTGATCTTTCTAGAA
AGTTTATGAAAGCACAGTTTAGTAATGATACGGAGTGGAGTTCCTACTTCTCTACTTTCTTAGGGTTTAC
CTATGAATGGAGAGAACACACGGTATCTTATGATGTGAATGGAGGTATACGTTTGATATTCTAG
>ref|NC_003361.3|:c931803-930853 putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsX [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAACGTGCAAATTGGCATAGATCTGATGGGAGGGGATCATTCTCCTCTTGTTATTTGGGAAGTGCTAA
TCGATGTACTCAATTCTAGAGCTTCGAACTCGCACATTTCTTTTATTGCCTTCGCTTCTCGTGAGGTGAA
GGAACAAATCCTCAGTAGCTATACACATAAAGAATATCCTGAAATCATTGCTTCAGAAAGCTTTGTTGCC
ATGGATGATTCTCCATTGGCTGCTATTCGAAAAAAGTCTTCATCCATGGCTCTAGGTTTAGACTATCTTA
AAGAAGATAAGATAGACGCATTTATTTCCACGGGAAATACTGCTGCGTTGATTACCTTATCTCGAGCTAA
AATTCCTGTATTTCCTACTGTTCGTCGTCCCGCTTTGCTTGTCCGTGTGCCCACTATGCGTGGTTGTGCG
GTTATATTGGATGTTGGTGCCAATGTTTCTGTAAATCCTGAAGAGATGTTAGGTTTTGCGCGTATGGGTT
TAGCCTATCGACAGTGTCTTGGGAAGGCAGAATGTCCTACTATAGGTTTGCTAAATATTGGTTCTGAAGA
GCGTAAGGGAACAGAAGCACACCGACAAACATACCGCATTCTTAAAGAAACCTTTCAGGATGCCTTTCTG
GGGAATATTGAAAGTGGTGATGTCTTCGGTGGTAGTGTGGATATTGTGGTTGCTGACGGCTTCACAGGGA
ATATTTTCTTAAAAACAGCAGAAGGCGTTTTTGATTTTCTGCGTCATATTTTAGGGGATAAATTAGAATC
TGATGTCACACGTCATCTAGATTATACAATTTATCCCGGCTCAATGGTCTGTGGGCTGTCTAAGCTTGTA
ATAAAGTGTCATGGGAAAGCTTGCGGAAAATCTTTATTTAATGGCATTTCCGGATCTATAGATTTAGCGC
GTGCACGTGTTTGTGAGCGCATTTTATCTAGTTTATCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c932001-931819 50S ribosomal protein L32 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCAGTACCACGCAATCGACATAGCAATGCGCGAAAAAATATCCGAAGAAGTCATCATGCGAAAAAAG
CACGTCATGCGGCTGTCTGCAACAACTGCAAGCAAGCTTTTATTCCTCATACAATCTGTACTTCTTGTGG
TTTTTATAACGGGAAAGCCGTTATGACTGTAGAAAAGAAATAA
>ref|NC_003361.3|:c932475-932014 hypothetical protein CCA00809 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGGAAACGTTGACGATTTAAAGTTATATATTTGCAGACTAAAGTTTCCTGGAGAAAAAGAGGTAATAA
AATATTCTTTAAGCCCTGAAAAGATTTGTGAGCTAGGAGAGGAGGAGCTTTTCTCCAATCCGATCGAAGT
CTCAGGAAGTTTAGAGAAAATAGATAATGAACAGTGGATTTTATCTTTAAGTATATCGACGCAATTAGGA
TTGCGTTGTTGTATTTGTGATAAAAAATTCTTATACTCTGTGAATTCAATAGAAATTTCACATTTGATTT
GTCACGAAGATGCGAAATCGGGTGTGTTTGATTGTAAAGATTTAATTAGACAGGAACTCCTCTTGGAGAG
CGATCATTTTCAAGAATGTGAGAAAGAAAGCTGCCCTGAAAGAGGAAATATCGTACAATTTTTAGAAGAT
AGAAAAAGAATCAAAAGGGAAACCCCTTTTGATAATTTATAA
>ref|NC_003361.3|:932779-934311 ribonuclease G [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGAAAACGACATCTTGTTAAATATAGAGTCTAAAGAAATTCGCTACGCTCATTTAAAAAACGGTCAGC
TTTTTGATCTCATTATTGAAAGAAAAAAAATTCGCCAGCTCAAGGGCAACATCTATCGAGGTCGCGTAAC
TAATATCTTAAGAAACATTCAATCTGCTTTCATTAACATTGATGAAAGAGAAAATGGTTTCATTCACATT
TCAGACGTATTAGAAAATTCTAAGAAGTTTGAACAAATGTTCGATATGGATTTCGATGTTCTCCCCAAGG
AAGACAGTGAAAAACCAGAAGCACCAATAGAGGAATTATTAAAGTTAGACAGCCCTGTGTTAGTTCAGGT
AGTTAAGGAACCCATAGGGACCAAAGGTGCACGTCTAACCTCAAATATTTCCATTCCCGGACGTTATTTA
GTTTTACTCCCCAACTCTCCGCACCGCGGTGTGTCTAGAAAAATTGAAGACCCCCACATGAGAGATCAGC
TAAAGCAGCTTATTCGCTCTTTTGAAATGCCTCAAGATATGGGTCTGATTTGTCGCACAGCCAGCGTGCT
TGCTTCTACTGATGCATTGATAAATGAAGCTCATGACTTACTAGCAACTTGGAAAGGTATTTTAGAAAAA
TTCCACTCCACAGATCAGCCTTGTCTACTTTATGAAGAGACCGATATCCTGAAAAAGGCTGTAATCACCT
GTATTGATAAGAATTATAAACGTTTACTCATTGATGATTATTCTACCTATCAAAAATGTAAGCGTATGCT
CAAAAAATATTCCCCTGATTCTTCTGTAAAGATTGAATACTATCGTGATTCAATCCCTATGTTTGAACGA
TTCAACATTGAAAAAGAAATTGACAAGGCAACAAAGAGAAAAATCTGGCTTTCTAGTGGCGGTTATCTAT
TTTTCGATAAAACAGAAGCGATGCACACAATTGATGTGAACTCAGGGAGAAGTACACAATTAGAAAGTGG
TGTTGAAGAGACTTTGGTTCAAATCAACCTAGAAGCAGCAGAAGAAATCGCTAGACAACTACGTCTACGC
AATGTTGGAGGCTTGGTAATCATTGATTTCATAGATATGAAATCGCGTAAAAACCAACGTCGTGTTTTAG
AACGTCTAAAAGAACATATGAAATACGATGCTGCACGCTGTACTATTTTAAGCATGAGTGAATTCGGTCT
TGTAGAAATGACTCGTCAGAGAAATCGTGAATCTTTAATGCAGACACTATTTACAACGTGCCCCTATTGT
AGCGGTAACGCAATTATCAAAACTCCAGAAAGTGTGGTTATTGAGATTGAAAGAGATCTCAAAAAAGTGA
TCAATCATAAAGAACACACGCATCTATGTTTAGTTGTTCATCCGGAAATTGCTGGTTATATGAAACAGGA
AAAAGACGATGATGAACTCATCCGTTTGGCTAAACATTTAAAAGCTAAATTACAAATTAACACTTCAGAC
TCGCTTCATCTCAACCATTACCAATTCTTCTCATTAGTTACAGGAGAGAGTATTGAGTTATAG
>ref|NC_003361.3|:934320-935315 glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCATTTTTCTAGATATTTACTACAATCCTTCGGCAATCAATCCCTGCCCGAACCTTTGTATCAGAAGT
TTCAGATATATCATCAAAACTATCTTGATGCAGCGACAAAGAAATGTTCTTTGGAAAAAGCTGAGGAGTT
ATGTCTACAATGGCTGAAGATTGTCATTGAGGATCTGAAAGATCCTTTCATCTTTCCTCCTTACCATAAG
AAAATTCGCTCGCCGATAGATTTATTTGATTTCGGCAAGCAATTTTTCTCAGTTCTTGTAGATGATGAGA
ATTCTAAAGTTCATAATCTTCATCATCTAGATCAAATTCAAGAATTTATAGATCGCAAAGACAACGTGAT
TTTACTTGCAAATCACCAAACAGAATGTGATCCCCAGCTGATGTACTATGCTTTAGGGAAGACTCATCCC
GAACTAGTTGAGAATATGATTTTCGTAGCAGGAGACCGCGTAACTTCCGATCCCCTAGCCCGTCCATTCA
GTATGGGCTGTGATTTATTATGCATCTATTCAAGACGTCATATTAATAATCCCCCTGAACAAAAAGAAGA
GAAGCTACACCACAATCAAAAGAGTATGAAAACGCTGAGAACTCTACTTAATGAAGGAGGCAAGTTCATT
TATGTAGCTCCTGCAGGAGGTAGAGATAGGAAAACCCCAGAAAATCTTCTTTATCCCTCAGAATTTCAAC
CAGAAAGTGTGGAAATGTTTCGTTTATTAACGAAGGCATCGGGAAGACCCGCTCATTTTTATCCATTCGC
ATTAAAAACTTACGACATTCTCCCACCACCACCAACGATAGAAGATGCTATTGGAGAATATCGAGCAATT
TTCTTTGCTCCTCTTTCTTTTAGTTTTGGAGAAGAGATTTTATTAGATCACCTATGTTCTGAAGAGGAAC
TTTCACAATGTGACAAGCGCAGACAACGAGCATTAAGATCAAAAAAAGCATTTTCCATTTTAACGCAGCT
ATATGAGGAATTATAA
>ref|NC_003361.3|:935318-938131 insulinase family metalloprotease [Chlamydophila caviae GPIC]
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GAACCATCCCCGATCAGTGCCCACTAAAAATCCTTACCCCATCAATAGCAGATCAAAAAACCGCCAAGGT
TGTTTGTGCGAATGGTCTTCAGCTTCTCATAGTTTCTAATCCCAGTATTTCTAATTCAGGAGCGGCTCTA
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TCTTCTTAGGAAATGAGAAATACCCAAATAATGAAGGTTTTTCTCATTTCCTAAGTAATAATAACGGCAT
TCACAACGCCTATACTAGTTCCTACACAACAAGTTATCTATTCTCTATAAAGAACTCAGCATTCCCTGAA
GCTATCAATCAATTCGTACATTTATTTATCCAACCTATTTTCGATCAGGAAGACATTGATAGGGAGAAAA
ATGCTGTACATCAAGAATTCGTGATGCATCCAAATAATGATCTTCGTCGTGTACATCGCATTCAACAACT
TATTGCTCCTCAAGGGCATCCCATCCAAAGATTTGGATGTGGGAATGCCTTTACCTTAGCAAAAGTAAAA
TCTCAGGATATGCATGCGTGGTTTCAGCAGCATTACCATCCTGAAAATATGATTGCTGTTATCCATACAG
TGGAGCCAATAGAAAAAGCTGTAAAAATCTTTCCGAAAATCTTCTCTAAAATTCCCTCTAAGAAAAATAG
TCTTAGCAAAAAAACGTTCTCCCTCCCTGAAACAGACCTCTCAGCAGGGAAGCTTTATATTAATTCTGCT
GTCGAACCTACAGCAAGTATAAAGATTTACTGGCATTTATATAATACGTCCCAAGCTCCTTTTGGTTGTT
ATGCTGCCCTTGCCTACGTATTAAATCATGAAGCCACGGGTAGTTTAGTTTCTTTATTAAAAAAAGAAAA
ACTCATTACTGGATTTGATTCTGGATTTTATAAAACATCGGACAGCACAGGGAATTTTACCATATACTAT
CAGCTCACTGAAAAAGGCGAGAGAGAGTACTCAAAGGTATTACTTCATACTTTTAAATATCTACATCAGA
TCCAAGAAGAAGGAATCCCTGCATATTGTTTGAAAGACATTTCGACAATTAATACTTTAGAATATTGCTA
CAGTTCAAAAACAGATCTCTTTAGAACTCTTCAGGAACAAATTGCAGATCTTATAGATGAGGATTTATCA
ACCTTTCCGTATCAGTCACTTGTCTATCCAAAATACTCTCCTGAGGAAGAACAGAATATTCTGAAAATTC
TTTCAGATCCCTATCAAGCACATTATGTATTATCAACAAAAAATCCTGAAAATTGGCAAAAGGCAATAAA
GCATCACGACACCATTTTCAAAATGGACTATTATGAAGCATCTCTGCCAGATTTAGAATCTTACAAACAG
GCTTTTGCTCAAGAGCGCATGGCTCTACCTCAACCGAACATCTATATTCCGAAAAATATTGAGGTTACAG
GTATATCTAGAACAGAAAATAACGAATTCCCGTTCAAACCTCAATTAGCGTATAAGGATAGCGGTCTTAC
CCTCTACTATTGCGAAGACTATTTCTATACGATGCCCAAGCTCACTATAAACTTGCGCATGCGCTCTCCT
AATATCTCTAGAAAGAATATTCGTTCCTTAATCGCTACAGATCTATGTTCTCTAGCCATTAATGAAAATC
TCCTTAAGGAATACTATCTAGCAGCTCAGGCTGGTCTTTTCTTCTCTACCTCCTTACGTGGAGATGGATT
GAACTTAGAAGTTTCAGGATACAACGCTACAGCGCCAATCTTATTGAAATCTATTTTATCCTCGTTAAAA
CCTTCTATAGAGAAAGAGAGATTCGATATACATAAGCAGCGGCTTATAGAAACGTATCAAAGAAAGATCT
CAGAATGCCCTATACGCGCAGGTATGGATAGACTTTGGTCTTATACCCTAAATGATGTTTACTCTTACCA
AGATAAATTAAGCGCACTTCAAACAATGGATTTTGAAGAAGTAGAAAACTTCTCAAAAATCCTATTTGAA
CAGCTCCATGTTGAGGCTATGGTTCTTGGCCCACCTTCAAAGAAGCAGGAACAAGAATTAGTGACTATCG
TTAAAGACTTTGTCTCTGCATATCCTACATATGAAGCAGATGCTTTCTACTATCAAAGACAGGACAAAAA
AATTTCGAATATAAAAATCGACTATCCTCTATCAGGGAATGCCATGCTGCTAGTTTTACAAGATACGCAT
TCCTCTTCTATTGAGCATATTGTCGCTACAGAAATGATGTTTAAATGGCTGCATCACATAGCTTTTTCTC
ATTTGCGAACAGAACAACAATTAGGCTATGTCATAGGAGCATGTTATCACGAACCTTTATTGTGTCCTTC
AGGTCTATTCTATATCCGTTCTAATGCCTACACACCTCAAGAGCTTGTAGCAAAAACAAAAACATTCATT
GAAGAAGTTGCTCTATCTCCAGAAAAATTTGGTATGTCTGAACAATATTTTTCTGATTTAAAAGATGCTT
ACATAAAAAATATTACAGACCCCACACATTCATTAGAATCCATGGGATTAGCATTATTTTCGTTAGCCTT
TGAAAAAGCTTCTGTGCAGTTTTCACAGCCTAATCAAAAGATTACTGCTGCCAAAACTATGAGTTATACG
ACCTTCAAAACCTACTGCCAGGAATTTCTAAATCAAAAATTAGGATCAGAAATTCCTGTATACATTCATG
GGAAAGACCTTTAG
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ATACCTTTCTTACTCCTTGGTTATTCGGCAGGTGTCAACTGTATCAACATAAGAAAATGGTATTTCCTGA
AAGATGGAAGAAATACCTTTGGTTAAGTGAATTCTATCGATTGATAAGTAGGGTAGAGCTAGTTTTCGTT
CTTTGGGCAGCCCCCTTATTTCTATGGTTTCTCTATTCTGAGGGGTATAGAGTGACCATGAGCTATTTCA
ATAGCAGGAATTATGTATTTTCTCTTTTTATTGTTATCATGCTCATTCTGCTTGAATCGCGCCCTATTGT
TTATTTCTCAGAATGTATTTTTTCAAATATTGCAAAAATAGGTCGGCAGTCTCCGCGATGTTGGTGGTGG
ACGTTGATGATAGCCGCACCATTATCCGGAGCGCTTCTTAAAGAAACAGGAGCTATGATTATTGCTGCAA
CGTTACTGGTTAGAAATTTTTATAAGTTTTCCCCATCCCCGCGTTTTGCTTATGCAACGATGGGATTGTT
ATTTTCTAATATATCTATTGGAGGATTAACCTCAGCACTATCTTCTAGAGCTCTATTTATTATTTTACCC
TCAGTAAAATGGAACAATAGCTTTATTTTAAAATATTTTTGCTGGAAATCTATAATTGCCATCTTACTAT
CGACAACTATTTACTATCTTATTTTTAGAAAGGAATTTAATAATTTCCCCAAAGTAGTAATCAATCCTTC
TATGATGAATGAACGCGTCCCTAAATGGATTATTTTCGTTCATATTATTCTTGTTGGCTCTGTAATCCTA
GCACGATCAGTCCCATTATTAATGGCTGCCATCTTTCTGTTTTATTTAGGATTTCAGAAGTTTACGATTT
TCTATCAGCACTCAATTAATATTTCGAAAGTATGCTTTGTAGGACTTTTTTATGCTGGGCTTGTGATTTT
CGGAGAACTTCAAGAATGGTGGGTTTTAGAGCTCATGCATAGAATGTCAGATTTTGGTTATATTATTACC
TCATATACCCTATCTATATTCTTAGATAATGCCTTGGTAAACTATCTTGTTCATAATCTTCCCGTAGCTA
CCGACTGTTTCCTGTACCTCGTTATTGCTGGATGCATGTCTGCAGGGGGACTTACAATTGTTTCGAATAT
GCCGAACATTGTGGGATATCTCATCTTAAGGCCTTCATTTCCATCCTCGTCACTATCTTTAGGATGGCTA
TTCTTATTTGCCTTAGGGCCATCAATCATATCATTGATGACCTTTTGGTTTCTCAGAGATATTCCTGAAT
TCATTTACTGCTTTTTCAGATAG
>ref|NC_003361.3|:939687-939914 hypothetical protein CCA00814 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTACTGCTGCTTCTTCATGTGTTCTTGGATCTTCACGTGAGCAGGAAAATGCTGATCAGCCTTATGACGT
TTGCCAAGCTGAGAGCACTCTTTCTGTAGAAGCAAGTAAGATCGCTTCGGTTGCTGAAGGCACCTTACTA
TCTTGCTGCTGTAAATAA
>ref|NC_003361.3|:c940769-939894 4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGATTTTTTTTCTCCGGCAAAGCTCAATCTTTTTTTAAAGCTTCATGGTAAGACGTCACGTGGTTTCC
ATGAGATGACTACCCAATATCAGGTTATTGATTTCGGAGATACTCTGTGCTTAGAGAGGAGTAATGAAGA
CACTCTTATTTGTAATCTCCCAGAATTAAGTACTCCACAGAATCTCGTATGGAAAAGTCTTCAGATTTTT
AGAGACTACACCCAGGTAAATGATCCTGTAGCCTGGAGATTGCATAAACGCATTCCTATAGGAGCTGGTG
TAGGCGGAGGTAGTAGCAATGCTGCAACAGCACTCTATGCTTTAAATGAGCATTTCCAAACACAATTATC
CAATGATGAGCTTCAAGAATTAGGGAAAAAGATCGGTATGGATGTACCTTTATTCTTTTCTTCAGGTTCT
GCCATAGGTGTAGGCTGTGGTGAAGAGATTCTTCCTTATGAAGATTACAATTGTGAAGAGAGATATGTCC
TGTATTTTTCTGATCAAGGAGTACTAACTAAAGATGCTTTTTCTTATGTGCATCCTGAAGACTTCTCTCA
TCGGAAAGATGCCATAGCCTTGTACGAGAGAGATAATGATTTAGAGAAGTCCGTATTTCGTTTCCGCAAG
GACCTTGAAGAGAAAAAACAAATGCTAAAAAGGATGTGGAGTCCTTTTCATGCTCATGTCGGGATGTCTG
GAGCTGGGGCAACTTTATTTGTAAGCTATCCCAGAGAAATGGAAACAGATCCTTCGGTAGCAAAAGCTAT
TCATACTACTATCCAAGATAGTCACGGTTTGCTTGTAAATAGCCTACGCAAGCAAAGCAGTGGATGGTTT
CTGAATTCCGATAATTTATTTACAGCAGCAAGATAG
>ref|NC_003361.3|:c941336-940818 50S ribosomal protein L9 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GTCCTGGATATGTCCGAAACTATCTTATGCCTCAAAAGAAAGCCGTTATAGCGGGAGCTGGAACTTTACG
TTTACAAGCGAAGCTGAAAGAAGAACGGTTATTACGCGCCGCAGAAGATAGAGCGGAATCTGAAAAATTA
GCAGAAGCCCTCAGAGATGTTATTCTTGAGTTTCAGGTTCGTGTAGACCCAGATAACAATATGTACGGTT
CTGTCACGATTAGTGATATTATCGATGAGGCAGCTAAGAAAAACATTATTCTTACACGTAAGAATTTCCC
ACATTCCCACTATGCGATTAAAAATCTTGGGAAGAAAAGCGTGCCTTTAAAACTGAAAGAAGATGTTACT
GCAACTTTATTTGTTGAAGTGTCTTCTGAAAGTTCTTATGTCGCCGTTCTTAATCAACAGCCCACTCAAG
AAGAGCCTGCTGCTGAAGAATCAAACTAG
>ref|NC_003361.3|:c941605-941357 30S ribosomal protein S18 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATAAGCCTGTTCATAATAATGAACACAGAAGGAAGCGTTTTAATAAGAAATGCCCTTTTGTTTCCG
CAGGTTGGAAAACAATCGATTATAAAGACACGGAAACTTTAAAAAAATTCATTACAGAAAGAGGTAAGAT
CTTACCTAGAAGAATTACAGGTGTCTCTTCCCGCTTCCAAGGTACACTTACCCTAGCTATTAAGAGAGCA
CGTCATATAGGGTTACTACCTTTTGTAGCAGAAGATTAA
>ref|NC_003361.3|:c941961-941623 30S ribosomal protein S6 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAGAAAAAAAAGCCCAACTTTACGAAGGGGCGTATGTATTTAGCGTTACTCTGAGTGAGGAAGCTA
GACGCAAAGCTTTGGAGAAGGTAACTTCAGGCATCACAAACTATGGTGGTGAAATTCTAAAGATTCATGA
TCAGGGACGCAAAAAATTAGCGTATACTATTCGTGGAGCTAGAGAAGGTTACTACTATCTTATCTACTTC
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TAACCCTTAAAGCTGATGCGGTCAAAGAAGTTTTAGAGTTCGCATCATTGCCAGAATAA
>ref|NC_003361.3|:c942591-942040 peptidyl-tRNA hydrolase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACGATGCTGATTGTTGCCATAGGGAATCCAGGGCGTCAATATACATGGACGCGGCATAATATAGGAT
TCCTCTGTGCGGACAAACTGCTTCAAGGGTTTCCTGAAGCTCAATTTAAAGAAGCTCGCAAATTATTTTC
TGATATTGCCAAAGTAGAATCGCCTCAAGGATCTATGGTTTTTATTAAACCTAGAACTTACGTCAATCTA
AGTGGTAAGGCTGTCTCAGCAGTTAAGGAATATTATGGTATTCCCATAGACCGTATTTTAGTTCTCGCTG
ATGACGTAAACCATCCTTTCGGTAATGTGCGTCTTCGCCAGAATGCTGGCGGTGGCGGGCATAAAGGCAT
AAAAAGTATCACGCAAAGCCTAGGTTCGAATGATTATTGGCAATTGCGTTTGGGTATAGGTCGACCTCAA
AGAGAAGATATAGAGTTGTCGGACTTCGTTCTTGGACAGTTTACTGAAGAAGAACAGATTGGAATACAAT
CTTTATTTATCGAGGCCAGTGCGTTGTTTTCTCAATGGTGTTCTGGGACTCAAACGGCCTAG
>ref|NC_003361.3|:c943157-942600 50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc [Chlamydophila caviae GPIC]
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GGATCCCCGCTGTTATTTATTCCGGTGGGAAGAGCTTGGCTAATATCGTTGTTGACGCTCACGTATTTGG
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ACAATTAAGGCTCTTGTTAAAGATATTCAATATCAAGTTACCTCATACAGAGTAATTCACTTAGATTTTG
AAGAACTTATAGAAGATCGTGATGTGAAGTTAAATATTCCAATTCGCTGCATTAATGCTGTGGATTGTGT
CGGCGTAAAATTAGGTGGATCTTTAAGACAAGTTATCCGTGCTATGCGCGTCGTATGTAAACCTAAAGAT
ATTGTGCCTTGCCTAGAGTTGGATGTTCGGTCGTTGGGATTATCTCAGACAAGAAAATTAGCTGATATTA
ACATCCCTGCGGGACTTCGTCCTATTACTCCTTTAAAGGAAGTTGTTGTAACAGTATCTAGAAGATAA
>ref|NC_003361.3|:943644-945071 glycogen synthase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAATCATACAAACTGCTGTAGAATTTGCTCCTTTTATTAAAGCTGGCGGATTAGGTGATGCCGTCT
ATGGCTTATCAAAAGCATTGTCTGAAAGCCATGATGTTGAGGTATTACTTCCTTTCTTTCCTCTAATCAC
CCCCTCTTTTTCTTCTCAAGTAATTGACGAGAAGGTTTTTTCTTACGAATTCCTAGGGAGACAGCATGCG
CATTCCATTTCCTATTCCTATGAAGGAATGATTCTCACAATAATTAAATTGGATTCACAATTAGATCTGT
TCTCAACATCAACAATCTATACTGAAGATGATACATTACGCTTCAGCGCTTTCTCTGCTGCCGCTGCCGC
CTACATTGGGGAATTAGATCATGTGGACATTGTACACATGCATGATTGGCATATGGGGCTTCTAAGCGGC
CTTTTAAAAGAACCTAACCGCCCGCATTATCCAAAAAGAATTTTTACAATTCATAATTTTAGTTATCGAG
GCTATTGCAGCACACAATTACTTGGGACATCAGGGATCAGCGATTTCGGGTTAAGTAATTATCAATTATA
TAGAGATCCTCAGATGAGTGTATTACTGAAAGGAGCTCTATATTGTTCTGATTATATTACCACTGTCTCC
CCTACATATGCTCAAGAGATTCTTAATGATTATTCTGATTATGAAATGCACGATGCGATCATGGCTAGAC
GCCATGTTTTCTGTGGGATCTTAAATGGTATAGATGAACAGATCTGGAATCCTGAAACGGATGCTTCTTT
GGCTGTCAATTACAGCAAAGATTTACTTGATGCTCCTGATGTTTTATTCACAAAGAAAGAGGAAAATAAA
AATGCTCTATATGAGAAATTAGGGCTGTCCTATGAATACTCTCCTTTAATGTGCATCATTTCTCGCATTG
TAGAACAAAAAGGGCCTGAATTTATGAAAGCAGCCATTCTCCATGCTATGGAAAATGGCTATGCTTTAGT
CATAGTAGGCACGTGTTACGATCCAGAAATTCAAAGAAAATTTACAAATTTACAAGAGTCGTTAACGACT
TCTCCGAATATCCGCATTATCTTAGATTATAACGATCCTCTAGCCCGGTTAGTGTATGGGGCTGCGGACA
TGATCTGTATTCCTTCTCATTTTGAGCCCTGTGGGCTCACACAACTCATTGGAATGCGTTATGGAACGGT
TCCCTTAGTTAGATCTACCGGAGGCCTTGCCGATACGGTTGTAACGGGAATCAATGGGTTCACATTCTCT
CAGACGGATAATTTCAATGATTTCCTTCACATGCTAACGCTAGCAATTACCACTTACAGACAAGAGCCGG
ACATATGGTTCCAACTTGTAGAAGAAGGTATGCTGCGATCTTCGGGTCTAACAACAATGGCGATACATTA
TTTAGGAGTCTATAATTCCTTATTATGA
>ref|NC_003361.3|:c945661-945053 CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGGGACTACCTAATTATCTAACTTTTTCCCGGCTATTTATAACGCCAATTTTCATGCTACTCTATCTTA
AAGGAAAGTGGCTTGGAATTACTCCTGTAGTTCTTCCATATGTTCTACTTGCTCTTTTAGGCCTTTCAGA
GCTCACAGATGCTATTGACGGCTATATAGCTAGGAAATTTTCTCAAGTTACAGATTTAGGGAAGCTTCTT
GATCCCATGGCAGACAGTATTTATAGAATTTCCCTCTATTTAACATTCACACAGCCTCCGGTAAATTTCC
CTTTAATTCTTGTATTCATATTTTTAGCTAGAGATTCGGTAATCAGTACGCTACGTACGGTATGCGCTTT
CCGAGGCGTTGTCCTTGCAGCTAGGGCAAGTGGGAAGTTAAAAGCTATTTTACAAGGCGTAAGCTTTTTA
TTGATTTTACTTGCTATGATTCCTCATTCCTTAGGAATGATCTCTGAGGGGGATTTGGAACTTTTTGCTT
CTGTAGTAGGGTGTATTGTTGCAATCTACTCTGTATGTTCAGGAGTTGAATACTTCTGGGTGAATAAAAA
TCACGTATTACAGAGAGCAAAATCCAAAGATCATAATAAGGAATTATAG
>ref|NC_003361.3|:945963-948983 glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, alpha/beta subunits [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGATTCATCAGGGGTATGATCTAGAAGTCGGAGCGGGGACATTTAATCCAGCAACATTTTTACGTGCCTT
GGGTCCTGAACCCTATAAAACTGCATATGTAGAGCCTTCAAGACGTCCTCAAGATGGTCGTTATGGCATG
CATCCTAACCGTTTGCAAAACTACCACCAGCTTCAAGTCATTCTTAAGCCTGTCCCTTCAAATTTTCTTT
CTCTGTATAAAGAGTCTTTGCAGATTATTGGTTTGGATCTTCGTGAACACGATATTCGTTTTGTTCATGA
TGACTGGGAAAATCCTACGATTGGCGCGTGGGGTTTAGGTTGGGAAGTATGGTTAAATGGGATGGAAATT
ACCCAGCTGACTTATTTCCAAGCTATCGGAAGTAAACCTCTGGATACAATTAGTGGGGAAATTACCTATG
GCATCGAAAGAATTGCCATGTACCTACAAAAGAAAAGCTCTATTTTTGATGTCTTATGGAATGATGAGCT
TACCTATGGGGACATTACCCAAGCTTCTGAAAAATCTTGGAGTGAATATAACTTTGATGTCGCCAATACG
CAAATGTGGTTAAAACATTTTGAAGATTTTGCTCAAGAAGCGCTCGCCACCTTAGATAAAGGACTACCAG
CTCCTGCTTACGACTTTGTTATCAAAGCGTCTCACGCTTTTAATATTCTTGATGCTCGGGGAGTGATTTC
TGTTACAGAACGTACGCGTTACATCACTAGAATTCGTCAATTAGCCCGTGCCGTTGCTGATGGTTATGTA
GAGTGGCGAGCTTCTTTAAATTACCCCTTATTGCACAAACAAGGCGTGCATAAGGACGAAACTTCCCCGT
CTCTGCCCTGTCCTAAAATTACAACAACGGAAAATTACTTATTAGAAATTGGCTCTGAAGAGCTCCCTGC
GACCTTTGTTCCTATTGGCATTCAACAATTAGAGTCTTTAGCGAAAAAGCTTTTAGCTGATTACAATATT
GGTTACGAAAGTTTAGAGGTTTTAGGATCTCCACGAAGACTCGCTCTATTAGTTTATAAATTGGAGCCTA
CAGCCATTCAAAAAGCTGTTGAGAAGAAAGGTCCTATGCTCTCCTCATTATTTAGTGATTCTGGAGATAT
CACTGCACAAGGAGAACAATTTTTTGCTTCTCACAACATTTCTATTCGTCATTATGACGAGCTGTCCCAG
CACTCTCTATTTGAGATCCGTGAGATTGGCTCTGTAAACTATCTCTTCATTCTACATCCTGAAGTATGTA
GAGATACAGTAACGATCTTAGCCAATGAATTACCTAAATTAATTCAGTCTATGAAATTCCCCAAGAAGAT
GGTCTATGACGATAGTGGTGTAGAATACGCACGACCTATCCGTTGGATAGTATCCTTATACGGAACATCT
ATTCTTCCTTTTTCTTTTGGAAAAGTCGTAGCTGGGAATACCTCTATGGGTCACCGACAGTTGGATCCTA
GGGAAGTTCCTATTCCTTCTTGTGAACATTATATCGATACCCTACGTAATGCCTGTGTAGTCGTTTCGCA
TAAAGAACGTCGAGAAATCATTGAACAGGGATTGAAATTGCATAGTTCCGACAATGTTTCTCCCGTGGCA
AATCCTCGTTTACTTGAAGAGACAGTTTTCCTTACTGAGCATCCTTTTGTTACCTGCGCGCAGTTTGATA
AAAAATTCTGTGCTTTGCCTAAAGAGTTGCTGATTGCTGAAATGGTAAATCATCAAAAATACTTCCCTAC
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ATTGAGGGAAATGAAAAAGCCTTAACACCTCGCCTTACTGATGGAGATTTCCTTTTCGCTCAGGATCTGA
AAACATCGTTAGCTATCTTTGTCGATAAGCTAAAGGCTGTCACTTACTTTGAAGCTCTTGGTTCTCTTTA
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GACATAACAACAGCAATAGAGTTTTGTAAAGCGGACTTAGTCTCTGCTGTTGTTAATGAATTTGCAGAAC
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AGAACACCTCCGGCATATTACCGATGGTCAAACCATCTCGACTACGGGAACACTATTAAGCCTAATAGAT
CGTTTTGATAATTTACTTTCTTGTTTCATCTTAGATCTTCGACCTACTTCATCTCACGATCCTTATGCCT
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ATTACATCATTTAGCTGATAATTTCCCAGCTACTGTTCAAGGAGCTACTTGGGATAAACCTGCGGTTATC
CGTGATATCTTAACCTTCATCTGGGGAAGATTAAAGACCTTCATGGCTTCATTAGGATTTAGCAAGGATG
AAATCGCTACTGTACTTTCTGACACCTCTGAAAAGAATCCTGTAGAGATGTTAAAATCAGCAACAGCACT
TCAGGCTATGAAAAATAGTCACAGAGCTATTCTTGAAAAAATCACAACGACGCACAATCGTTTGAAAAAG
ATCTTAGCCTCATTAAAACTCTCTACAAACACACTGACTCCAATTGAACTTGATCTACAAGAATCGCAAC
TTAAAGCAGCTCTAGATCACTTTGATGCGTCTGTACAAACAAAGGATAGTAAAAAAGACTACTTCCTCAG
TCTTGGAGACCTTACTGATAGCATCAATACATTCTTAAATGAGGTACATGTCACTAGTGGAAGCGAAGAG
TTGCAAAACTTACGCATTTACCTATTGCTAACAGCTCTGGAAAAGTTTTCTTCGTATCATTGGGAAGCAC
TAAAAGTATAG
>ref|NC_003361.3|:c949516-949070 hypothetical protein CCA00824 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCGTATCTTATTAGCTTTATTATCATGTTTATTATTGCCATGTCAGTTTGTTCACGCCGATGAAGAAA
CAACTGCTCCTGTAGTTTCAGAAAGTTGTGTCGCTCATGTTTTCCAAGACTATGAAGAAGCTCTGCTATA
TGCTAGAGAAGAAAGCATTCCTTTAATTATTGTTTTGATGAGCGGCACCCACCAACAAGTATTGGCAGAT
CTTGTTGATGAAGGATTAGATCTCAGCGATTTCTTTGGATTTTCATTAAGAAATACAGCAGCTATAGCTG
TTTTACATCCCGATGATAGCAATGTAGCAGAATATTCTAAACTTGAAGATTTTAAGAATAGATTCCCTGG
TTCAGCGTTCCCTGAAGAGCCCGGTGTTTTCATGGTAACTATCGTACTCGATGGAGAAGATGAAACCCTT
CTAGATACCACCCCACTTTATCTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c950143-949628 hypothetical protein CCA00825 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCACATCTTGTTATCTATACTCTCACTGTTGTTAGCCCTGCCAGCTATTGCAGGAGAAACCTCTACAT
TGAAAGAAGACGACAGCGGCCAGCAGATCGAAGATATTTCAGAGAAGCATCCTTTTATATTTCATTCTTA
TGACGATTGTCTAACTGCGGTAAGACAAGAAGGTAGAAATACTATGATCGTTCTATACAGTGATGAGAAC
ACTATAGCGTTTCAACCGTTATATACCATGGCGATAGATATGGAAGGATCGGTTCTTAGTAAATACGCAA
AGTTTGCTGTGTTGAGCCCCACGGGGATTAACTTATTAATCTATCCTCCGGTTCCTGATCCTATGCTTGC
CGAAATAGCAGCATTTAAAGCGCTATTTCCAGAGGTTAAAGATCTTAAGGGAGCCTATTTGATTACTATT
TGCGTTACTGATAGTGATGAAAAAATCATGGATATGGCTCCGATTGATCTGCCTTTAGACAATGCTATAA
AGCCCATCATCTCCCCACGTTCATAA
>ref|NC_003361.3|:c950849-950340 hypothetical protein CCA00826 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GAGGTTGTGAAGATCCTGTTTATAATAAATTTTCTCCTCCACAGCATGTGGAACTTCTTAATGGGGAAAG
AGTATATTATTCCTACCATAGTGCTTTAGAAAACGCTAAGGATAGCGGGAAGTGTTGTATATTTGTGTAC
TTTAATTCGACTTCTAAAAAAGTATGGGGAGACATCACTAAAAAAGATTTTTGTTTCCCCACTGAGCTGG
CCGGTCTATTTAATATTGTCGTTATGCAGCCAGGTCTGATTAGCCCTACGGATTTCTATCCTAAAATGGA
TCCTATGATTTTATACATGGCGGATTTTCAGGATCGTTTTTGGGAGTTAGATCTTCAAAACCCCTGTGTG
ATTCTTATTACTGTAGATTCTAAGGGCCGTGATAAGGTGCAAAGAGTTCTTCCTGTCTCTACCTTTATTT
CTATGTATTCAAGATCATAA
>ref|NC_003361.3|:c951272-951006 hypothetical protein CCA00827 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAACTTTAAAGTTTCTTTTACCAATACTTGCCTGGGCTCTATGTTGCGGAGGGATGGTAACGGAGT
CGAACCATAGCCGTGGCATCATCGTTTCGGAAGCCATGGGATTGGCAGCTGCCCGTTGTAGTTCTTTATC
TAGTCAAGCTGGTGAGCTTGCTAAGGCTGCAGGCCTTGGCTATGGAGCTTCTGCTTTACTTCAAGAATGG
CAGAATCAACAAGCTATAGAATTAGAGACATTGATAGCAAGAAACAACGAAATCTAG
>ref|NC_003361.3|:c953155-951380 DNA primase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTATACAGAAGAAAGTTTAGATAATCTTAGACACAGCATTGATATTATCGAAGTGCTTTCGGAACACC
TCCATTTAAAAAGAAGTGGAGCTACCTATAAAGCGTGTTGTCCCTTTCATGTAGAAAAAACGCCTTCTTT
TATTATCAATCCGACAGGGGCTTACTACCATTGTTTTGGTTGTGGAGCTCACGGGGATGCTATTAGTTTT
TTAATGAACCATCTCGGGTATTCATTTAGTGAGGCTGTTCTCACTTTATCGAAGAAATTTCATGTAGATT
TAATTGTTAAAATTAAGGATACACAATCTCCTTTCTCAACAGGCGCTAAGGATGAATTACGTCAAATTAA
CAGTGAGGCAGAAAAACTTTTCCGTTTCTGTTTGTATCAGCTTGCTGAGGGGAGGGAAGCTTTACAATAT
TTGTATCGTCGGGGATTCTCTCCAGATACTATAGACCGTTTTCATTTAGGCTATGCTCCCGAACAAACCT
TGTTTATCCAAGCAATGCGGGAAAAAGATATTTCTGAAAAACAGCTTGAAGATGCAGGTTTCATAGGAAA
TAAATGGTTTTTATTTTCCCGTAGAATCATTTTCCCTGTCCATGATGCCTTAGGGCATACCATAGGGTTT
TCATCGAGAAAATTTTTGGAAAATACACGGGGGAGTAAGTATGTCAACACTCCTGAAACTATTATTTTTA
AAAAGTCTCGAGCTCTTTTTGGACTCCATCTATCTCGGAGAAGAATAGCGAAAGAAAAACGTGTGATTCT
AGTTGAAGGTCAGGCGGATTGCTTGCAGATGATAGACTCAGGGTTTAACTGTACTCTTGCTGCTCAAGGA
ACCTCTTTCACTGAAGATCACGTAAAAGAATTAAGTAAACTAGGTGTTCTTAAAGCTTATCTACTTTTCG
ATGGTGATGATGCTGGAGTGAAAGCTGCCATTCGTGTTGGAGATATGTGCCAGACGGCAGGGATCGCTGT
TATGGTCTGTCGTCTTCCCAAAGGAGAAGACCCTGATTCCTTTTTAATGCATAAAGGAGCTCGACTTCTT
GGAGAGCTACTAGATCAAAGTGAGGATTACCTCACTTTTCTTGTTAGTGAAAAAATTCGTGTGTATCCGA
ATTTTTCTCCAAGAGAGAAGGCTCTGGTAATTGAAGAGACGATTACACAGATTAAAAAGTGGGGGAACCT
TATTGTTGTCTACGAGCATCTCAAGCAGTTAGCTTCTTTGATGATGATCCCTGAAAGTATGGTATTTTCC
TTAGCGAAATTAGAATCAGGAATCACACCGAGCAAGGCCCCTGTAGCTAATAAAGAGAAGTTACCAAAAA
TTCATTCCGATGTGATTATTGAAACCGATATTTTGCGCTGCATGCTATTTTGCAAACCCCATAACATCAG
TATTCCTCATACAGCAAAAAATTACTTCACAGCTATGGATTTCAAACATCCTGAGTGTAGAAAGCTATTT
TCCCATCTGATTGAATATTACGAAAAACATCACAGTAATCTTCCTTTTGACAAAGCGCTATCCTTGTTGG
AAGATAAGATCATCATAGAGCTTTTAATAAAACGACGTATAAATACCGACTGTCTTGAGAACGTATTTGT
ACAATCTTTACAGAAGCTCGCAGATCGTCAGTGGAGGGAACACCGTCATCCACTCGCAAGTCAATCAAAA
AGCCCCCAGGGACAGAAACTCTCCATTCTCGAAGATTATGTCCGTTTACGTAAAGATAGGGTTATAGTTA
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TCCTTCTCTTCCGCATGGGGGATTTTTACGAGGCTTTCTATGACGATGCTGTTTTGCTCTCTCAGAATTT
AGATATTAATCTCACGCAAAGACAAGGGATTCCTATGAGTGGAATTCCTGTATCTACAGTAAACGGGTAT
ATAGACCGTTTGGTGAGTAAAGGATTCAAAGTTGCTATTGCCGAACAGATCGAAGAAGCACAAAACAATA
AAGGAAAATCCGAACCTTTAGCTAGAGAACTGCAGAGATTTGTCACTCCAGGAACATTACTTTCTTCCTC
ACTACTTCCTGAAAAAGCGAATAATTATATTGTCTCTATCTATCGTGTTGGCTCTTTATTTGGATTTTCA
TGTTTAGATTTCTCCACAGGAGCATTTCTGTTAAACGAATACGACAATATGAAAGATCTTATTGATGAAA
TCTGTCGTTTAGCCCCTACAGAAATCTTAAGCTGTGACAAATTCTATAAAAAACACTTTGAGATCGTAGA
ACAAATCCAACAGCATTTAAAACTTACTTTATCTACCTACTCTGACTGGGCATTCGAGCATCAGTTTGCT
ACGCAGAAGTTATCCTCCCATTTCAATGTATCGTCCTTGGATGGTTTCGGCCTCAAAGGTCTCGTTCCTG
CTATTAACGCAGCAGGGGCTCTACTTTCCTATCTTCAAGATAAACTTCTTTTACCTGTTGAGCACATTTC
CGTACCCAAAACACACGGAAATCAAAAACACTTGCTCATAGATACTGCGTCTCAAGTAAACCTTGAGCTT
TTAACCCCTATACATGATCCTCAAGGGAAGAGTTCTCTTTTACATGTTATGGAACGCACCTGCACTCCTA
TGGGGGGCAGACTACTACGTAATACTTTAGTCAATCCTTTTTACGATCAAAAAGAAATCTTGCTACGTCA
AGATGCTGTGGAGTTTCTTTTGAATCGTTCGGAATTAAGAAAAAATCTACGATCTTTCCTGTCCCAAGTA
CGCGATCTAGAACGTTTAACTACGAAGATTACCACGGCATTAGCAGGTCCTAAAGATATAGGGATGCTTC
GTGATTCATTAAATGCTAGTATGCATATTTGTGAGATTCTTTCTCCCCTACCTCTACCAGAATTTTTCCA
TGGAAAATTCACCCTAGGTCTTGGCCTAGCTTCTCTTTTAGAACTACTTTCTAAAGCTCTTTTTGGAGAA
CTACCTTTAAGAATCTCCGATGGAAATATTTTCTCTGATGATCACCATCCCGACCTTAAGCGCCTACGCT
ATACTCGTGAAAATTCCAAAGAGTGGTTGTGGCAATATCAAGATGCTATCCGCACACAAACGGGAGTTAA
AAAACTTAAAGTCTGCTATTCCCAAGTTTTAGGCTATTATATAGAAGTGAGTAGCGATCTTGCTCCTCTA
TTACCTAAAGATTTTATCCGCAGGCAATCACGTCTACATGCTGAGCGTTTTACAACAGAGAAGCTGCAAG
AATTCCAAGATGACATGCTTAATGTTTCCGATAAATTGCAGACGTTAGAGACGCAATTATTTAAGGATTT
ATGTGCGCAAATTCTTGAACAACGTGATGCAATTCTTTCTCTATCTCAAGTCATCGCGGATACAGACTAT
ATTCTTTCTCTTGCTGACCTTGCTGCAGAATATGGTTATTGTCGTCCTATTGTAGATACTAGCGACTCTC
TGTCTATAACGGGAGGGATGCATCCTGTCGCACAAACATTATTAGATCGGGGAACTTTTATCCCCAATGA
TATAAAAATGCATAGTGCACGGACACGAATGATTTTAATCACGGGTCCAAATATGGCGGGGAAATCCACC
TATATCCGACAAATTGCTCTGCTTATCATTATGGCACAAATGGGTTCGTTTATCCCTGCAAGATCTGCGC
ATATCGGCATGATTGATAAAATCTTCACGCGTATAGGTGCTGGAGATAATCTATCTAAAGGGATGTCTAC
ATTCATGGTGGAAATGGCAGAAACAGCTAATATTTTACATAATGCTACGGACCGCTCTTTAATCGTTCTT
GATGAGGTCGGTCGAGGAACAAGTACTTATGATGGCTTAGCAATTGCACAATCCGTTGTAGAGTATCTGC
TATTTACCGAAGGGAAAAAAGCTAAAACTCTATTCGCCACGCATTATAAAGAACTTACAGATCTAGAGAA
TCACTGTCCGCATGTAGAAAATTTCCATGCGGGGGTGAGAGAAAATGGCGGCCATCCTGTATTCTTATAT
GAGATTCTTAAAGGACATTCTCAGAAAAGTTTTGGAATACACGTTGCGAAACTTGCTGGCTTTCCTCTTT
GTGTGATATCGAGGGCTCAACAGATCTTACGTCAATTAGAAGGCCCGGAAACGACTTCTAAGCAAACCCA
AGAAAAAGTTCAGCAACTTACGTTGTTTTAA
>ref|NC_003361.3|:955942-957759 excinuclease ABC subunit C [Chlamydophila caviae GPIC]
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CAGGAGAGGTACTCTATATCGGAAAAGCAAAAAACTTACGCAATCGCATAACAACGTACTTTCAAAAACA
AGGGGACTCTCGAGAAAGAATTCCCTTCCTAATGAAGAAAACGACTACTATAGAAACGATTTTAGTTTCT
AATGAAACTGAAGCTCTTCTTTTAGAAAATAACTTAATAAAAAAGCACCATCCGAAATACAACGTACTTT
TAAAAGATGATAAAACTTTCTTTTGTCTAGCGATATCTCTGACACACCCTTGGCCGAAAATAGACGCTAT
CCGCACGAAAGCGATTACATCTTCAAAAAGGCAGATCATTTTTGGCCCTTACGTAAGTGCCGAAGCCTGC
AGAACTCTTTTAGAAGTTATTAGCCAATGGTTCCCACTACGCACGTGTTCCAATCGTGAATTCGCTTCGA
GAAGACGTCCTTGCATCCTTTATGAGATGAAACGGTGCTTAGCACCTTGTGTGCATCTATGTACGCATGA
GGAATACGAAGAGACTTTAGAAAAAGCTGTATTATTTTTAAAAGGTAAGGTCTCTGAAATCATTCAAGAT
TTAGAAAAATCGATCGAGAAGGCCTCTCAAGAACAAAAGTTTGAACAAGCAGGAATTTACTACCGCACAT
TAAAACTTATTCAACAAGCTATGGAAAAACAGCATGTAGAAAAATTCCACTTTCAAAATATTGATGCTAT
TGGTCTATATAGAAAATACCAAGAAACGGTCATTACTGTATTAACGGTACGTTCAGGGAAATTACTTGGA
GCCCGCCATTTCCCATTTTCAGAAAATGCTCAGGAAGATACGGATTTGCTCTCTTCCTTTATTTTACAAT
ACTACGCCAATCAACCTCAGACTCCCAAAGAAATTCTTACTCCTATTCCTCTAAACATCCCTGAACTTCC
ATATTTGTTAAATAAAGATACGCCACCTCAGCTGCGCTCTCCGAAAACAGGTTATGGGAAAGAACTACTT
ACCTTAGCTAAAAATAACGCTAAGGTACATGCGGAAACGACTACACAATCTTCATCTCTACCTTATGAAG
AGATGAAGAAAATTCTGAAATCTCCGGACTATCCTTACCGCATAGAATGTTATGACAATGCTCATTTACA
AGGTTCTCACGGAGTTGGTGTGTACATTGTCTATGAAAATGATGCGTTCTCTCCAAAAAGTTACAGGACA
TTTTCTATCTCTTCTTTAGCACATAATGATCTGGCAACATTCCATGAAGTTCTATCACGTAGATTTAGTT
CTCTTACCTCTTCTCTTCCTGATATGATTGTTATAGATGGAGGGCGCGCCCAATACTCTCAGGCAAAAAA
AACATTAAAAGAACTTAATCTCACGGGAATTCAGGTTGTCTCCTTAGCTAAAGAAGCAAGCAACCATAGC
AGCTCATTAAGAAACGAAAAATTATTCTGTGATACCTTCCCTCAGGGGATTCAACTAGCACCAACATCAA
AACTTCTACAATTTTTCCAAAAGCTTCGTGACGAAGCGCATAGATTCGCCATCAGCAAACATCGTAGAAA
ACGTTATAAAGATCTCTTATTCCCTCAGGAGAAAATTCCCGGAATTGGTGAGGTAAAAAGAAAACGCTTA
TTACAGAAATTTAAAAGTTGGAAACAAGTTATGAAAGCCTCCCAGGGAGAGCTTGAGGCTATCCCTGGGC
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>ref|NC_003361.3|:c958250-957768 hypothetical protein CCA00831 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TAGAGACTCGTGTAATTCAAGTAATTATTTTACATTGTTTAGCTAAAATCAACGGGGTTTCTCTTTTAGG
GGGAAATTTAATTGATACTTTATTCGGTAGAGATATCGAGAGAATGAAGGGAATCTATGTAGAACAAGAT
TCTAAAAATCATCTAGTTAAGGTTCGTGTCGAAGTAAACGTTGATTACGGTGTTTCTATACCAGAAAAAA
CCGAAGAAATTCAGGGATGTATAGTTTCTGAAGTATCCGAATATACAGGTCTTCATGTAGCTTCCGTTCA
TGTGATCATTAAGGGGTTAACTCAGCCTAAGGATCGCTCTGAATCAGAAGATGAGCCAGAAGAATTATGT
GTTGCAGACCTACCCTCAGCAGAGGACTTTTTAGAGGAGATCAAAGAAGAAGTAGAAGAATAA
>ref|NC_003361.3|:958341-958844 hypothetical protein CCA00832 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGGCTGTTAAAAAAAATCGTAACCCAATCGGTTGGTTTCTTGCAGGGATGTGCTTTGGATTCTTCGGAAT
CATTATTCTCCTCATCCTCCCGGACCTTTCCCCAAGGGATGGTGATTCTAATTCATCCGATGATAACGAA
CCATCCAATAATATTTTGCACTCTATTTTAGAAGATTCTTCTGTGATTTCCTCCCCATCTCCTGTGGATC
AAGTCCTCAGAAATACAGAAAAATGGTTTTACTTAAACAAAGAAAAACAGAATATCGGACCAATGTCCTT
AGAAGATCTTCTTGTATTTCTCAGAGATAAAGAAAAACATACCACAGAAAACATAAACCCCGAGGATGTT
TGGGTATGGAAAAAAGGAATGGAAAATTGGGAAAGGGTCAGAAATATTCCGGAACTTAACGAGGCGTTAA
AAATTCTTAAGTAA
>ref|NC_003361.3|:c959208-958903 30S ribosomal protein S14 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GAAGCGAGCTTCGCAATATTGCAAAAAGCTTAACTGCTAGCGAAGAAGAGAAAGAAAATGCACGTGTGGC
ATTGAATAAGATGAGAAGAGACACGGCTCATATTCGTTTACACAACAGATGCTTATTGACAGGCCGTCCT
CGCGGTTATCTAAGAAAGTTCGCTATTTCTAGAATTTGTTTCAGAGAAATGGCTTCCATGGGAGAGATTC
CTGGAGTTATCAAAGCTAGCTGGTAG
>ref|NC_003361.3|:c959371-959234 50S ribosomal protein L36 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAGTGAGTTCATCTATCAAAGCAGATCCTTCTAAAGGAGATAAGCTTGTTCGTCGTAAGGGGCGTC
TTTATGTTATTAACAAAAAGGACCCTAATCGTAAACAACGTCAAGCGGGCCCTGCACGTAAGAAATAA
>ref|NC_003361.3|:959785-960204 ribonuclease P [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGCATCGATCAACCTTACCCAAATATGCTCGTGTGTTAAAGAGAAAGCAGTTTCTCTACATCTCGCGAG
CGGGATCTCACTGTCAAGGCAGTCAGGTTATTTTTCATGTTGCTCCATCTAGATATTCTGGATGTTGCAA
GCTTGGGATAACTGTCTCAAAAAAATTTGGGAAAGCGCATAAAAGAAATTATTTTAAACGTATTGTGCGC
GAGGCTTTTCGTAAAAAGCGTCACTCTCTTCCTGCTTGTCAAATTGTTGTTATGCCTAAAAACAAGCAGC
AACCTAAATTTGAAGATCTGCTTCAAGACTTTGCTCAGCAAATTCCAGAAGCACTCAGTAGCAAATTAGC
AAAAAATAAGCCTACGACTGGTGTCGAATATAGTCCAAAGAATGAGAAATGTGAGTCTGTACTTCCTTAG
>ref|NC_003361.3|:c961192-960146 hypothetical protein CCA00836 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GTGCAGGTTCTTTAAGTTTGCATGGCGTTGTTCATGAGAATTCTTCTAAGCTTGTTTGGCATGTAGATTA
TAATGAGGCTGTAAAAAAAAGCCGCGATTCTGAATTGCCAATGTTAATCTTTTTTTCAGGTTCCGATTGG
AGCGGCTCATGCATGAAAATTCGTAAAGAGGTGCTTACTTCTTTAGAATTTTCCAAAAAGGTCAATGGAA
ATTTCATATGCTTAGAAGTAGATTTTCCTAAGCATTCTTCACAAAGTGAAACACTACGCTCACAAAATGC
TAATCTAAAAACTCAGTTCAAAATTGAAGAGTTTCCCTGTCTTCTCTTACTCTCTCATGACGGAAGAGAG
ATTTATAAAATCGGTTCTTTTGGTAATGAGACTGGAGAAAACTTAGGCGAGAGTCTATGTCATATTATTG
AGAGTGATTTCTTAATAAGTAACGCCTATCCCATCATGCATACATTATCTATGGAAGAACTCCAGAAGTA
TTACCGACTTTCTGAAGAGCTTTCGCAAAAAGATTTCATGGCAAAAGCCTTGGAGTTGGGTGTGCGTAAT
GACGATTACTTCTTCTTATCAGAAAAATATCGTCTTCTTGTTGAAGGCGGGAAAATGGATTCTGAAGAAT
GTCAAAGAGTAAAACGTAAATTACTCAATAAAGATCCTAAAAATGAACAACATACCCACTTTACTGTTGC
TCTGATCGAGTTTCAGGAATTGGCCAAGAGATCTCAAGAAGGCGTGCGCCAGGATCCTAGTCAAGTCATC
GCTCCTCTAGAATCTTATTTAACAGAGTTCGGTCAGCAAGATCAGGAAAATGTTTGGAGAATTGAGATGA
TGATAGCTCAATTTTACTTAGATTCTGATCAGTGGAAAAGTGCTTTACAGCATGCCGAAGTTGCTTTTGA
AACAGCACCTAAGGAAGTACAGACTCACATTTCTCATTCTTTGGACTATATTCGACACCAGTCGTAG
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TTTGTTCTTCAAATGATCCTGTGAAATTGTATACATGCGGTCCTACGGTATATGACTACGCACATATTGG
AAATTTCCGTACGTACGTATTTGAAGACCTACTAAAACGGACTCTTTTGTTTTTCGGCTATTCTGTAAGA
CACATTATGAACATTACAGATGTGGATGATAAGACTTTAGCAGGAGCTTGTAAGAAAAATATATCCCTGG
ATGCTTATACTGCTCCGTATATACAAGCATTTTTTGAAGATGTTGCTTCATTAAATATTCTCCCTGCGGA
TGTCTATCCCCATGCTACGCATTACATCCCTCAAATGATTGAAGCTATCGCAAAGCTTTTAGATGAAGGC
ATTGCTTATGTTGGTCAGGATAGTTCGGTATATTTTTCTATAGAGAAATTTCCCACATATGGAAAGTTAT
CTCAATTGAAATTACAAGATTTGCAATGTTGCTCTAGAGTATCCTCTGATGAATATGACAAAGAAAACCT
TTCTGATTTCGTATTATGGAAAGCGTATGAAGAGAAGAGAGATGGTCATATTTACTGGGAAAGTCCTTTT
GGTAAAGGTCGTCCAGGATGGCATCTAGAATGTTCCATTATGGCTATGGAACTTCTTGGCGCTTCTATTG
ATATTCATGCAGGTGGTGTGGATAATATCTTCCCCCATCATGAAAATGAAATTGCCCAATCAGAATCTCT
ATCGCACCAACCTTTTTCTCGTTACTGGCTCCATTCGGAACATCTTCTCGTTGATGGGAAAAAAATGTCG
AAAAGCTTAGGGAATTTTTTCACACTGAGAAATTTATTAGATCGTGGGTTTTCTGGAGAAGAAATCCGCT
ACATGCTCTTACAGAGTCATTATAGAATGCAGTTAAACTTCACAGAAGAAGGATTACTTGCTTGCCGTCA
GGCATTAAAACGTCTTCGTGATTTTATTTCCAGAATAGAAAGTGTTTATCCCGAAAGCTCGCACATTTCA
GAAGATATGCAGCAGCACGGGGAAGGGTTTTTACAAGCCTTTTCAGAGGCGATTGCTAATGATTTAAACA
TAGCAGCAGCTCTTGCAGCTTTATTTGATTTTATCCATCAAACAAACTCAACCATCGATCAAGCTAATTT
TACACAAGCTGATGCTAACTATGTTTTAGACATTATGAAGAGAATCAATACCGTACTTGGTGTGATCCCC
TTCTCCGCTGACTTGGAAATTCCCGATCACGTGAAGCAACTTGTAGAAGAACGAGAAGTTGCTCGTAGTG
AGAAAAATTGGAAACAAGCGGATGCTCTTCGAGATCAGGTTGCTTCTTTAGGCTATAGTATCGAGGATGC
TAAATCAGGGCCTAAAGTAAAAAAACTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c964629-963052 lysyl-tRNA synthetase [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATCTAGGTATTAATCCTTATCCTTATGAATTCCCAGGAACAAGTAGTGTTGAGGAAATCAAACAAGAATA
TGCTTCACAGACTCTTGGTAATAGCGAAGACGCCACGAATAAGAAAACTCCTAAGGTAAAAATCTCAGGA
CGTATGGTGCTTTTCCGTTCTATGGGAAAGAACGCTTTTGCTCAAATCTTGGATAATGATCAAAAAATCC
AAGTCATGTTTAACAGGGATTTTTCTTCAGTGGCAGGTCTTCCTGAAGATGCAGAAATTTCTCCGATAAA
ATTTATAGAGAAGAAGCTTGATCTTGGAGATATTTTAGGAATAGAAGGGTACCTATTTTTCACACATTCA
GGAGAACTAACTATCCTTGTAGAGACCGTTACCCTGCTATGTAAAGCTTTGATCTCCCTCCCCGATAAAC
ATGCAGGATTAAGTGATAAAGAAATCCGTTATAGAAAACGTTGGCTAGACCTGATTTCTTCGGATGAAGT
GCGTCAGACTTTTTTTAAAAGAAGTCGTATTATCAAATTAATCCGTCAGTATATGGATGCTCAGGGATTT
ATGGAGGTAGAAACTCCTATATTACAAAATATATATGGTGGTGCTGAAGCAACACCCTTTGTCACTACTT
TGAATGCTTTGCACTCAGAAGTGTTCTTAAGGATTTCTCTAGAGATTGCTTTAAAGAAAATTCTTGTTGG
CGGAACCTCACGTGTCTATGAAATCGGAAAAGTATTCAGGAATGAGGGGATCGATAGGACGCATAATCCT
GAATTTACCATGATTGAAGCCTACGCTGCTAACGTGGATTATCATAGTGTTATGACTTATGTGGAAAACC
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GCCGCAAACTGTTGATTTTAAAGCTCCTTGGATTCGCATGACGATGAAAGATAGTATTAAGACATACGGA
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AGGAATCTTACGCAACGGCACCCAGAGGTTTATTAATCACAGCGCTGTTTGATGAGTTAGTCTGTGATAA
GCTAATCGCCCCTCACCATATTACAGATCATCCTATAGAGACGACACCTTTATGTAAGTCTTTACGTTCT
GGAGATGCAGATTTTGTAGAACGTTTTGAAAGTTTTTGCTTAGGAAAAGAACTCTGCAATGCTTATTCAG
AGTTGAATGATCCACTACATCAAAGAATGCTTTTAGAAAAGCAAATGGAGAAAAAAGCTTTAGACCCCGA
TAGTGAATACCACCCTATTGATGAGGAGTTTTTAGAAGCCCTATGTCAAGGAATGCCTCCTGCAGGAGGG
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TTCCAGCTATGCGTCGTTTAGAATCAGAAAATAATTAA
>ref|NC_003361.3|:964605-964751 hypothetical protein CCA00840 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GAATGTTTAA
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GGTTCTGATTGGTGTATCTGGTGTATGAAAATGAAAGATCAGATTTTAAATACTGTTGAGTTTGCAGATT
ATGCTAATGAACATTTGCATATGGTGGAATTGGATTTCCCACAGGTGAATAACCAACCTGAAGATGTGCA
ACAGCAAAACCGAGCATTAAAATCCAAATATGGTGTCAATGGGCTCCCAACGTTAGTTTTCATTGATGCT
AATGGAGCTGAGAAAGCCAGAATGGGATTTGAGTATGGTGGTGGCGCAAATTATGTTAAGAAAATCCAAG
CTGCTTTGAAGCAAAAATAG
>ref|NC_003361.3|:c965562-965455 hypothetical protein CCA00843 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGGGTTTATTCATCCACGCTCTTTATTTCCAGATGTGA
>ref|NC_003361.3|:965541-966263 hypothetical protein CCA00844 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATCCACCATTAGCAAAACTTATCCCTTTAAGCCTCAAAGAAGAAATAAGCAAGCTCCCCCCTGCAAAACC
TTCCCCGATTTCCAAACCAATAAGTATTCCTCAACCTGCCACTATAGATAAAAAATTAACAAATTCTTCT
CCCCCTCCAACCCAGGATAATGAAGAACCTCCCTTACCTACTATTCATGAGCGTGTAAAAAAATCTTCGT
GGGAATGTATTCCTCCTCCTCCCGATCTTTCCAGAGAAGAAATCCTAAGATTCCGTTATCCTGCTTTAGA
AGCACACTGTGTGAAAACATCTTTGAATATCCCCTGTGGGATTTTTGTAGATGAGGAAAAAGACGAAGAA
GTCTTGTTCTTCAATAGACTAGCAAAAATTCTCACCCAACAAATTTTCCCTTCACGGCTCGTCTTATCCA
CCGGTCATAAAAATATTTTTTATAAGAATAAGGGCTTCTCTTTATGTCTAGCGCCTTTAACGATGATGCG
TTATAAAATGTCTAACATACGTTATCATCAATCGTTCGCTAAAGATGGGTGCACTTGGATTCCTATTTAT
TCTTCAGTATACTATGAAAATGATCCGCAATTGAAACGAGATCTATGGGTAATATTGAATCAACTACCTT
TCGCCTATACGCAGAAGTCATAG
>ref|NC_003361.3|:966215-968464 primosome assembly protein PriA [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGGTAATATTGAATCAACTACCTTTCGCCTATACGCAGAAGTCATAGTAAACTCCAATATCAATAAGG
TGTTAGACTACGGGCTTCCTAAAAACCTTGAACACATTACTAAGGGTACTGGTGTTAGCGTTTCCTTACG
GGGGGCAAAAAAGTACGGAATTGTCCATCAGATTAAAGCAACAACAGAATGTCGGCGTGTTCTCCCAGTC
TTAGGTGTTATTGATTCTGGAATCGTCTTGCCTCAAGATCTTTTAGAACTTATGTTCTGGATGAGTCAAT
ACTACTTCGCTCCTTTAGGAAAGACATTACGTTTAGTGCTCCCAGGAATATCCTCAAGTATCATACAACC
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AAAGAATCCCCTTCGCAAGCAGCAACTTTAAAAACATTACTGTCTTGTAGTTCTCCTCCGGGTTTTTCTG
AACTTATGGAGAAGGCTAAGGTCTCCCAATCCCCTATCCATTCTTTAGAGAAACTCGGCGCTATTGAAAT
TGCCAACGCTGCCGATCTTGAAATTCAAGAAGACAGTTTAACATTTTTCCTCCCCGATGCGCATCCTTTA
CATCCTCAGCAACAATCTGCTGTAGATAAGATTTCTTCTTCTTTATCTTTGGGGAAATTTCAAACACACC
TTCTTTTTGGTATAACAGGAAGTGGGAAGACAGAGGTATATTTCCAAGCTATTCGTGAGGCAAGAAAATT
AGGGAAAAGCGCTATCCTTTTAGTTCCTGAAATTGCTCTTACGATACAAACAGTCACCTTATTTAAAGCC
CATTTTGGAAAAGAAGTTGGTATTCTCCATCACAAACTCAGCGATAGTGATAGGAATAAAACCTGGCGAG
AAGCCTCTAAGGGAAATATTAGTATCATTATAGGACCAAGATCTGCCTTATTTTGCCCTGTGCAGAATTT
AGGATTGATCATCGTTGATGAAGAACATGATCCTGCATATAAACAAAGTGAAAGCCACCCCTGCTATCAC
GCCCGTGATGTTGCTGTCATGCGAGGGAAACTTGCTCATGCTACTGTAATCTTAGGAAGTGCCACGCCTA
GTCTAGAAAGCTATTCCAATGCTCTATCGGGGAAATATATCCTTTCGGAATTATCGACACGAGCGGCGGC
TGCCTCTCCAGCAAAAGTCTCCCTCATTGATATGAATATGGAGAGAGAAAAAACAAAGACAAAAACATTA
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CCTCAAACATCCTGTCCAAAATGTCATGGAGCCATGACTTTACAGTATCGTGGATCAGGAACTGAAAAAA
TAGAAAAGGTGCTTCATAGTATCTTCCCGGAAGTTCGCACTATACGTATTGATTCTGATACTACGAAATT
TAAAGGAAGCCACGAATCTTTACTAAAACAGTTTGCCACAGGAAAAGCTGATATCTTGATAGGCACTCAA
ATGATTGCTAAAGGCATGCATTTCCCTGCTGTCACTCTAGCAGTAGTTTTAAATGGAGACTCGGGACTTT
ATATTCCTGATTTCAGAGCCTCTGAACAGGTATTTCAACTCATTACTCAAGTAACAGGAAGGTCAGGAAG
AAGCCATCTTCCTGGTGAGGTCCTCATCCAATCTTTTCTTCCCGATCACAGCACGATCCGTTGTGCTATG
CAACAAGACTATTCTGCTTTCTATAATCAAGAGGTTACTGGAAGGGAATTATGCAGTTACCCTCCGTTTA
TTCGTCTTGTGCGCTGTATATTCATAGGGAAATGTCCCAGGCTGACTTGGAAAGAAGCCCACCGCATTCA
TACAGCACTTGAGAAAAAATTAGACGCCCATACCCAGCTCATGCAAATCACTCCCTGTGGGCATTTTAAA
ATTAAAGATCTGTTTCGGTACCAATTCCTGATAAAGAGCAAACAAGTTCTACCTGTAAATAAAAAGCTTC
ATGAAGCCTTACTATCAGCAAAACTATCTCCTAAAGTAAAGTTCATGATCGATGTCGATCCCACAACAAC
ATTTTTCTAA
>ref|NC_003361.3|:c969502-968408 8-amino-7-oxononanoate synthase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGTGAATACCCAATAGATTTTGTAACTAATGATTTCTTAGGTTTTTCTCGTTCTACAACATTAGTCA
AAGAGGTCGAGAAACGCTATCGTGCGTATTGCGAAGAATTTTCTCATGCACAACTAGGAGCACGAGGTTC
TCGCGCTATTGCAGGCCCTTCTCAAATTCTACAGAATTTAGAAAAGAAAATAGTAGATTTTCATAATGCC
GAAGCTGCTTTTGTGGTTCATAACGGCTATATGGCGAATTTAGGGTTTTGCTATCACATCTCTAAAGATA
CTGATAAGGTATTTTGGGATGAATCTGTGCACGTGTCTGTTGTGCAAAGTTTAAAAATGATTTCCGGAAA
ACAGCAATCATTTCCACATAATGATTTGGATGCTTTAGAGTCTTTATTGATAGCACATAGGGCAGTTTCC
TCAGGAAGAATCTTTATTTTCGTTTGTTCGGTATATTCGTTTTCAGGAACATCAGCTCCACTTGAAGAGC
TTATAGATCTTTCAAGAAAATATCATGCTCATATCATTGTAGATGAGGCTCATGCTATGGGCATTTTTGG
TGAGGACGGTCGTGGTCTATGTCATCAATGGGGATATGAAAATTTCTATTCTGTTCTTGTAACCTATAGC
AAGGCTATGGGAGCTATGGGAGCAGCGATTCTTTGTTCTTCGGAAGTGAAAACAGAGTTGATGTTAAACT
CCCCACCTTTACGTTATACTACCGCACTAGCCCCTCATGCGTTGATCACAATAGACTCTGCTTACGATCA
TCTATTGTTGGAGGGAGAGCACTCTAGAAAACAGATGTTCAGCTTGAAGGCTTATTTCCAAGAGCATTTT
GGACTGCATTCGCAATGTTGCGGGCAACCTATATGGCTAAAAGATTTTAATATCGATCTTTTTACTTCCA
TGTTAGATGAGGCTAACCTACGTGTTGGATTAATGACTTTTGTCAATAAACCTTTCATACGAGTAAATTT
CCACACGTATAATACGCGTGATGAAGTCGATGTTTTAGTGGCTATGCTACACAGCTATTTAGAAAAATGT
TGTTGTGGGATCGACATCGATCATGAACTTTACTTTAGGAGATAG
>ref|NC_003361.3|:c971172-969553 long chain fatty acid--[acyl-carrier-protein] ligase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCATAAGCGTTGGCATCATTCTAATAAACGTCGTGTAGGTTTACGTGACGGTCGGACTGTTTTACAGA
AATTCTTAAAACTGTGTTCAGAAATGGGATCGGATGCCAGCTGTTGGGATGAACAGCTCGGGGTTTTATC
TTATGATGATCTACGTAAGGCTGTTATAGCTTTAGCTTTAAAAATATCCAAATATCCCGATGAGCATATT
GGAGTCATGATGCCCGCTTCTGCGGGAGCCTATATTGCTTATTTCGCTATACTCTTATCTGGTAAAATTC
CCGTTATGATTAACTGGAGTCAGGGATTTCGTGAAATGGTAGCTTGTATGGAGCTCGCTCATGTAAATCA
TATCCTAACTTCTAAACAACTTGTTGATCATTTACGCCAGGTTCACAGTGATATTGAGTATCCAGCACAG
TTAATTTACATGGAAACTATACGTAAACATCTCTCTCTTTGGGATAAGATGCGTATAGCGTTTTATCTAT
CTCTACCTTATCGCTGGTTGATACGCCTGTTCAATATTTCAAGTCAGGATGAAGAGGACACCGCTGTTAT
TCTATTTACCTCAGGGACGGAAAAACTTCCGAAAGGGGTCCCATTAACACATGCAAATCTCATAGAGAAT
CAGAAAGCCTGTTTAAAATTTTTCAACCCTACAGAAAACGACATTATGATGTCGTTTCTTCCTCCGTTTC
ATGCTTATGGGTTTAATTGCTGTGCGCTTTTCCCCATGCTAGCGGGTTTATGTGTAGTTTTCTCCTACAA
TCCTTTGCAACCTAAAAAGATTGTAGAACTTATAGATAAAACTCATGCGACTTTTTTAGGCAGCACGCCT
ATCTTTCTCGACTACATTTTGAAAACAGCTAAAAAACAAGAATCTTCTTTAAGTTCTTTGAGTTTTGCAG
TTATTGGTGGTGACGCGTTAAAAAACTCTTTAAGAGCAAAATCTGAAAAAGATTACCCACACATTACTCT
GCGTCAAGGTTATGGAACTACCGAGTGTTCTCCGGTTATTGCAATTAATAATGAGGATAGCCCGAAGGAT
GAATGTTGCGTGGGGACTCCTATTGCAGGCATGGATGTCATGATTGTTTCTGAGGAAACTCATGTCCCTG
TATCATCGGGAGAGGTCGGTTTAGTTGTTATTCGTGGGACATCACTCTTTTCTGGTTATTTAGGGGCTGA
TCCTAGTCAAGGATTCGTTTGTCTTGGGGGAGATAATTGGTATGTGACGGGAGATTTGGGATACCTGGAT
AGAAATAATCAGCTATTTTTAAAAGGTAGGCTGAGTCGTTTCGTAAAAATCGGTAGTGAGATGGTAAGCT
TACAAGCTTTAGAGAGCCTACTTACTGAAGGTTTCGGGTTGCCTGATGAGCAAGAGGGGATTTCATTAGT
CGTTTGTGGTCTTCCTGGAGAGAAGATAAAACTGTGTTTATTTACAACGTTTTCTACAGATCTCAATGAA
GTAAATGATATCCTAAAAAACTTAAAAACAAGTAGCATAATGAAGATATCCTATCAGCATCAGCTGGAAT
CTATTCCGATGCTGGGCACAGGAAAGCCTGATTACCGAGCTTTAAATTCTCTAGCTCTTTCTCTGTTTCA
TGGGGACTAA
>ref|NC_003361.3|:c971951-971190 hypothetical protein CCA00848 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGCGCTACAAGATAAAACTAGAGGGTTTAAAGTCTCTCAAACCCAATCCCAATCAAGGCAGCCTGTTTTT
ATCAAATCATGTAGCTGAAATTGATCCGGTAATTCTTGAATACTTATTTTGGCCACGTTTTCATGTGCGT
CCTCTTGCTGTGAGTTATTTATTTAAGAATACCGTAGTTCGCTGGTTCTTAAATTCTGTCAGGGCTATAC
CTGTACCCAATATTGTTCCTGGAAGAGAGTGTAAAAAGACTATCGAACAGATGGAAGAGTTTTACAATCA
GACAATTAGCGTCTTGGATAATCGGGGCAGCGTCTTACTGTATCCTTCGGGTAGATTGTCAAAGAATGGT
AAAGAAGAAATAGTTAATCAGTATTCCGCACACGTGTTATTGCATAAATCCAAGGCGTGTAACGTATTTT
TGATACGTATTAGCGGATTATGGGGCAGCGCTTTTTCGCGTTATAAAACTCAATCTACACCTAAGTTGGG
GATAGTATTTAAGGAAGCTGTGCGAGCCCTATTGCGTCGGGGATTATTTTTTATGCCGAAACGCTTTGTG
AAAGTAACGATACAGCAAATAGACAACGACTTCTTAAAACAATTCCCTACAAAACAGGATTTAAATGCTT
TTCTTGCTTCGTGGTTCAATGAGGAAGAAGAGAGTTTTCCTATAGAAATTCCTTATGCCTAA
>ref|NC_003361.3|:972059-973039 3'(2'),5'-biphosphate phosphatase nucleotidase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCCGTCTCATTTGCTAGACTATCAAAGAGTTGCAGAAAGTATAGTTGAGAAAACAATCGCCGAGTTAA
TCCGTTACCGACAGCGCCTCCCTCTGGTTCATTTCTGGACAAAACCCGATGGATCTTTTGTCACTCCTGC
AGACTACGCGGTCCAATATTGTCTGCAAAAAAAACTCTCAACAACCTTTCCACACATTCCGTTTATAGGA
GAGGAAGTCCTAGACCCTGTAAATGATAATCATAAAATTAACAAAATTTTAGAATTTGTTCATAAACTAG
ATCCTCAAGTAACGCCTGAAGATCTTCTAGAGACATTAACGCCCTATCAAGAAACCTCCTCGTTATATTG
GCTTGTTGATCCTATCGATGGTACGTCCGGATTTATCAAAAATAGGTTTTTTGCCACGGCAGTATCTCTC
ATTTATGAAGATAAGCCTATACTTGCGGTGATGGCTTGCCCATCGACGGACCCTCATACCTATAAAATCT
ATTCTGCTGCAAAAAACCACGGCGTCTCCTTATTCGGCACCGCAATTGAATCCAGACGTTATTTAAGATC
TGGAACCACATTAACAGGGAGGTTTTGCGAAGCTTCTTTAGCAGCACGAAACCAACAACACCACACCACA
CGTTTATTAAGCTTATCCCTACCTGGGCAACCTCAGGCTTGCCGTGTTGATAGCCAATACAAATATGCTA
TGGTTGCTGAAGGCGCTGTAGACTTTTTTATCCGTTATCCTTTCGCTATTTCCCAAGCAAAAACTTGGGA
TCATGCTCCCGGAGCATTTTTAGTCGAGGAATCTGGTGGTAGTGTTTCTGATATTTTTGGAAATCCACTA
AATTATCGTAGGGAGGGTTTCATTTTAGAAAACCACCCCATCATTTTAGCTTCTGGAAATGAAGAGATTC
ATAGAATTACTTTAGAAGCTCTACAAGAACGTTGCAACGTTGTTCCTGAGGAAAACTTACTCGCTTATTA
A
>ref|NC_003361.3|:c974085-973036 Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAATATCCCCTAGTGTTCAAAGATATAAATATAGAAGATTACGAACGTGTGATAGAAGTAACGTGTG
AAAGCGTACAGCTACACGCTTTGATCGCTATTCATCAAACGCTAGTGGGCCCTGCATTAGGTGGGGTTCG
TGCTTTTGCTTATAATTCTTTTGATGATGCCTTAACAGACGTTTTACGTTTGTCTAAAGGGATGACATAT
AAAGCAGTTCTCAGTGAGACAGAAACAGGCGGAGGAAAAAGTGTTATCATTCTTCCAAAAGGTATGACAC
GTCCTACTGAGGCTATGCTCCGTGCTTTTGGTCAGGCGGTAGATTCGCTTGGTGGTCGCTATATAGCCGC
TGAAGATATGGGAGTATCTGTTCATGATATCAACATCATTAATCAGGAGACTCCTTGGGTATGCGGTATA
GAAAGCGTAAGTGGTGATCCTTCAATTTACACAGCTCACGGAGTCTTTTTATGTATAAAGGAAACAGCAG
AGCAGTTGTGGGGTGACTCTTCTTTAAAGGGGAAAAAGATCGGTATTCAAGGTCTTGGTGCTGTGGGTAG
AAAATTACTCCACTCTCTATTTTTCGAAGGTGCGGAACTTTATGTTTCCGAGACGAATCAAGAGGTCCTT
CAAGAAATTACCAAATTCTATAGCGTCACTGTTGTTTCTAAAGACGCTTTCCCAACATTAGAATGTGACA
TTTTTGTTCCATGTGCATTTGGTGGGGTGATTAATAACAGTAATGTCGACAATTTGCGCTGTCGTGCAAT
TGTTGGAGCTGCAAATAATCAACTAGAAAACGCTTCTTTAGGCGCTGCTCTTCATGCTAGGGGGATCTTA
TATGCTCCAGACTATCTAGCGAATGCTGGAGGCTTATTGAATGTGGCACTTGCAGTCGGCAAGCCTTATT
GTCCGAAAGCCGTCTTACAAAAGGTTAGTAGACTTCCTCTGATTCTTAGAGAAATTTATGAACAGAGTAA
AGCCTCTAATAAAGATACCGTAATTCTATCTGATAGTATAGTAGAAGAAAAACTTACCGCTTATATTTAA
>ref|NC_003361.3|:974252-974902 inorganic pyrophosphatase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCTGAAAAACCATCTTTATCGATCATGCATCCTTGGCACGGTCCTATACTAACTCAAGATAACTACG
AATCTCTATGTTGTTATATAGAAATTACCCCACAGGACTCTGTAAAGTTTGAATTAGACAAAGCTACCGG
TTTATTGAAAGTAGACCGTCCTCAAAAATTTTCTAACTTCTGTCCTTGTTTATACGGATTGTTACCTAGA
ACATATTGTGGGGAACTCTCTGGGAAGTATAGTGGAGAACAGAGCTTGAAAGAGAATATACAAGGAGATG
ATGATCCCTTGGATATCTGTGTGCTGACGGAAAAGAATATTACCCACGGCAATATCTTGCTTCAAGCACG
TCCTATTGGAGGATTACGTATTATTGATTCTGGAGAGGCTGACGATAAGATTATCGCTGTTCTTGAAGAT
GATTTAGTATTTTCAGAAATTCAAGACATTTCGGACTGCCCTTGCACAGTTCTCGATATGATCCAACACT
ATTTTCTGACTTATAAAGCATCCCCAGAGCATTTGATCCACGGCAAACCTGCAAAAATTGAAATCGTAGG
TATCTATGGAAAGAAAGAAGCTCAAAAAGTAATCGAGCTTGCTCATCAAGATTATCTAAATAAATTTTGT
AGAGAAAAAACAACGATATAA
>ref|NC_003361.3|:c975392-974943 mutT/Nudix family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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GTACGCTGAAAGCTTGTTTTATCTGCCATACCCAAGGTAAGCATTGGGGATTTCCTAAAGGTCATTCTGA
AGATAAAGAAGGTCCTCAGGAGGCTGCAGAAAGAGAGCTGGTTGAAGAAACAGGCTTAAGTGTAGTCGAT
TTTTTCCCAAAAGTTCTTGTAGAACACTACTCTTTTAATGATAACGAGGTGTTTGTTCGCAAAGAAGTTA
CTTACTTTTTAGCAGAAGTTCAAGGGGATGTACACGCGGATCCAGAGGAAATTTGTGACACTCAATGGTT
AAGCATTCAAGAAGGAATGCGTTTATTGAATTTCCCAGAGCTTAAGGAGATTGCTGGAGAAGCTGATAAA
TTTATCAACAGCTACCTCTTCTCATCCTAA
>ref|NC_003361.3|:c976645-975395 3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATAAAAAACGTGTAGTAGTCACGGGATTGGGCGTTGTTTCTTGTTTGGGCAATGAAATAGACACCT
TTTATGATAACCTGCTTGCTGGTATCAGTGGCGTTCGTACAATCACTTCTTTTCCATGCGAAGATTATGC
TACCCGTTTTGCTGCTTGGATTCCTGAATTTAATCCCGAGCCTTATTTAGATAAAAAACAAGCACGTAGA
GTTGATCCTTTTATTACTTACGCAGTAGTTGCAGCTAAAAAAGCTATTGCGATGTCTCGATGGGATAAAG
ACAATCTTCCTGCTGATCCTCTCCGTTGCGGTGTTATCATCGGCTCTGGTATGGGAGGTCTACAGACTTT
AGATGAAGGTATGGAACGTCTTATTTTAGGCAATAAGAAGCTTTCTCCTTTCTTTATCCCTTATATTATT
ACTAATATGGCTCCTGCGCTTATTGCTATGGACTTTGGACTTATGGGTCCAAATTATTCGATCTCCACAG
CTTGCGCAACTTCGAATTATTGTATTGATGCAGCTTACCAGCATCTTGTTTCCGGACGTTCTGACATGAT
AGTTTGTGGTGGAACTGAGGCTGCAGTGAACCGTGTCGGATTGACCGGTTTTATTGCTAACCGTGCTTTA
TCGGAGAGGAATGACGCTCCTCAAGAAGCGTCTCGTCCTTGGGATAGAGATAGAGATGGTTTTGTTATTG
GAGAGGGAGCTGGAGTTTTAGTTTTAGAAACTTTAGAGAACGCTTTGAAGCGAGGAGCTCCGATATATGC
GGAGATACTTGGTTCATATACCACCTGTGATGCTTTCCATATTACAGCTCCTAGAGATGATGGAGAGGGC
ATTACTTCATGTATTCTTGGAGCTCTAGAGAGTTCTGGCATTCCTAAAGAACGCGTAAATTATATTAATG
CTCATGGGACATCAACTCCTCTAGGAGACATATCGGAAGTTTTGGCATTGAAAAAAGCTTTTGGTAGTCA
TGTGAAAAATTTACGAATGAATTCCACAAAGTCTCTTATAGGTCATTGCCTGGGAGCGGCTGGGGGAGTC
GAAGCTGTTGCAACAATTCAAGCAATTCAAACGGGCAAATTACATCCTACGATTAATTTAGAGAACCCGA
TTGCAGAAATTGATGATTTTGACGTGGTTGCAAATAAGGCCCAAGATTGGGATATTGACGTTGCTATGTC
GAATTCTTTTGGTTTTGGTGGACATAATTCAACGATATTATTCTCGAGGTATATACCCTAA
>ref|NC_003361.3|:c977022-976663 iojap-related protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTGTTGTCTTAGATGTCCGTGCCATTTCTCAGCTCACAGATTACTTTATTTTTGCTGAAGGAAATGTTGG
TGTACATGTAAAAGCTTTGGCAGACACCATTGTAGAGGAATTGAAACAGTATAATGTTTCTCCTTTACAT
GTAGAGGGGTTAAGCCATGGTGACTGGGTAGTTATAGATTACGGATTTATCGTCATCCATTTGTTTATCT
CATCCATCAGAGATCATTATCGTCTGGAGGAGTTATGGAAGGACGGTTCCATTATTACATCCAAGCTTCT
AGCTTCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c977722-977081 hypothetical protein CCA00855 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTTATAAATACGCTTTAGGACACCGCTTATTCTCTTATAAAACCCTCCCTTCTTGCTGTTTGTTTTTTCT
TCGTTTTCGATTTTTTTTTTTAGATTTGCCTTCATTTTATTCGCGAATCGCCTCTTCTTTGCTCTCGACA
GTCTCATTTGATAATCTTTCTTCCATGGCTCTAGAGTTTGCCGAAACATTAAAAGAAAAAGATTTTTACC
CTCCTGCTTTAGAAAAATTTCATGAAGCTTTGGAGGATTCTTCAGGGGAAGTCATGATTTTTTCCTCGTC
TCCAGATTTTATTGTTCGGCCCATAGCCGAGAGACTTGGAGCGGATATGTGTTATGCCTCAGGGTTTCAA
GAATTTTCTAGAGGGCAAATGCTTGCAAATCAATGTCTAACTGGGGATAATAAAGCGAAAATACTTAGCC
ATCTTAAAAAAATAGGGCGTGCAAGAAGCCATACTTTCTCAGATCATATTTTAGATCTGCCCTTTCTTTT
GCTAGGTGAGGAAAAAACCGTAGTACGACCTAAAGGAAGACTTAGAAAAATGGCTAGAAAGTATTACTGG
AATATTATTTAA
>ref|NC_003361.3|:c979383-977719 hypothetical protein CCA00856 [Chlamydophila caviae GPIC]
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AAATGAAATCTAAAAGTGATGACATTTCTAACGCCGCAGTAACTAATGAATCCTTTACCATATTTACTCA
AGAGTTATCTGGATTTTCATTAATCGAAGAACAGGTCGCTTTTAGTTTAGAGAAAATGGAACAAGCCTTA
AGAAACAACCAAGGAGCAAATTTAAAGCTGTTTTGGGCGATACGAAAGCACTGTCTTCCATTATTCCATC
AAGTAGAAAACGTTGGTAAGCGGGCTGAATTTTGGCGTCGCTACATTGATTTAACGAAGGAAGGACGGCA
TATTAAATCCTTACAAGATGAAGAAGGGACTTTTGTTGTTGGACAGATTGAGTTAGCCATATCTTGCCTT
GAGCAAGATGTAACTAGTTTCTTAGAGGGAACCAATCCTCTGACAGTACAAGAAGAACAATCCGTATTTT
TAGAAACGCAGACCTTGGAAAAACGCAAGACTTTCTATAAAGACTTGCACGCTTCTTTAGTCTGGTTAAG
TAGTTTCTCCGCAAGAATCATTGATTTGCGAAAGGAATTAATGAATGTTGGCATGCGTATGCGCATGAAA
AGTAAGTTTTTCCAACGTTTATCTTCTTTAGGAAATCAAGTATTTCCGAAAAGAAAAGAACTTATTGAGA
AGGTCAGTGAAGCTTTTGCAGAAGATGTCGAGTCTTTTGTTTCCAAGTATTTTTCTCGTGCAGATAAAGA
TGCATTAAAGCGTTCCGTTTTTTTTTTACGGAAGGAAATCAAAAATCTACAGCAAGCTGCTAAGTGTTTA
GCTGTTTCCTCCGCTGTATTCTCTGACACTCGTTTGAAACTAAGTAAGTGTTGGGATCAGCTCAAAGGTT
TAGAAAAAGAAATTCGTCAGGAGCAAAGTCGGTTACGGGTTACATCTGCAGAAAATTCTAAAGATGTTCG
TGACCACTTAACAAATATAGCTCAAGTATTGGAAGAGGGCGGTGATCTTTTTAAAATTCGCAAAGATTTA
GATGCAGCTACAAAACGTATACGCGCTCTAGACTTAGTGCATGATGATGTTGTTGCTTTAAAAGCAGAGT
TGCAAGCTCTGTTTGAAAAGCTTCGCGAAAAACAAGAGGCCGCAGAACAAGCGTATCAAGAGCAATTAGC
TCGAGATAGACAGATTAGACAGGAAGCGATTAAAGAGCTGACTGATAAGATCCAGTTGTTTTCTGAAAAG
TGTATTTCTGGGGATATCCATCTGCAGGCGCGTTCAGAATGGCAAGAATTGAAAGAATCTTTAACCAAAG
CGGCTTTCTTGTCCGCTTCGGAAAGAATTGCCTTAGACAATCGATTAAATCTAACCTCGCAGCATATAGC
AGCGTTTTTTGAAGAACAGCTACTGTCTTCTCCCGATTCTCGTGAAAAACTCACAAATATGCGGCAGGTT
TTGTCTCAAAGACTGGAACGTCGTAAAGAATTGAAGGACAAACTAGAACAAGATAAGAAACTTCTTGGAT
CTTCGGGCCTGGATTTTGATCGTGCTATGCAATATAGTGCTCTAGTTGAAGAAGACAAACGTGCTTTAGA
TGAATTGGATCAAGGGATCCTAGATCTGAAGCGACAAATCCAGCAGTTAACATGA
>ref|NC_003361.3|:979473-980534 hypothetical protein CCA00857 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TACAGGAAGTTGCGAATATTTTACGTGAGCAACGTTATCCTGACAATAAAGTCACTTATGTTCTAGATGC
CAATCCCAACTACACCAACATTTGTAAAATTGATTGCACCTTTTGCGCGTTTTACAGAAAGCCTCGCTCT
GCTGACGCATTTCTTCTTTCTTTTGACGAATTTCGTTCTTTAATGCAACGATATATATCTATGGGGGTTA
AAACCGTTCTTCTTCAAGGAGGCGTTCATCCAAGATTAGGCGTGGATTATCTCGAAGAGTTCGTACGCAT
CACTGTTAAGGAGTTTCCCTCTCTTCATCCTCATTTTTTTTCTGCTGTCGAAATTGCACATGCAGCTACT
GTCTCTGGGGTCAGCACTGAAGAAGCTCTAGGAAGACTTTGGGATGCAGGGCAAAGAACCATTCCTGGAG
GGGGCGCTGAGATTCTCTCTGAACGGGTACGTAAAATCGTATCGCCCAAAAAAATGGGCCCCGACGGATG
GATTAATTTTCATAAGCTCGCCCATCGTTTAGGCTTCAGGACAACAGCCACAATGATGTTTGGGCATATA
GAAACCGCTCATGACATTCTCCTACATTTAGAAACTCTAAGAAATGCCCAGGATGAAACCCCAGGATTTT
ACAGTTTTATTCCTTGGAGTTATAAGTCTGGAAATACAGCTTTAGGGCGTAAAGTCCCTAATCAAGCAGC
TCCTGAAATGTATTATCGCATCCTTGCTCTCTCTCGCATCTTTTTAGACAACTTTGAGCATATAGCTGCT
TCTTGGTTTGGAGAAGGGAAAGAATATGGAGCTCGTGGTCTCCATTATGGGGCTGATGATTTCGGAGGGA
TTATTATTGATGAGAGCGTGCATAAATGCACAGGGTGGACGTTAAAAAGTTCTGAAGAGGAAGCCCGCGC
AATGATTGCTTCTGAGGGTTTCATCCCTGTAGAGAGAAACACCTTCTATGAACACATAGAAATCCCTGCA
CATCAACCGTGA
>ref|NC_003361.3|:c981553-980525 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCGTGCTCCCGAATTTCAATCTAATACTACAACATCTACAGGATGCGATGTCTGCTTAGATCCACAAA
AGTCATTTGCAAACTTGTTTAAACGTACTGTGATTTTACTTTCAGGACCCACAGGATCAGGGAAAACAGA
TGTGTCCTTAAGGTTGGCTTCTATGGTTGACGGAGAAATTATTTCTGTGGATTCCATGCAGGTTTATCGC
GGTATGGATATCGGCACGGCGAAGGTCTCTTTAGAAGATAGACAGCGGATTCCTCATTATTTGATAGATA
TCTGCCACGTTCAGGAACTCTTTAATGCTGTGGATTTTTACTATCAGGCTATGCACGCATGCCAAAACAT
CCTCTCTAGGAATAAAGTTCCTATTCTTGTTGGCGGGTCCGGGTTTTACTTCCATACTTTTCTTTCTGGA
CCTCCCGGAGGCCCGCCTGCAGATCGTGAATTTCGTGATCAGCTTGCTCTTTATATTCAGGATCACGGCT
TATCCTTTTTATACGAGAATCTTTGTCAGAAAGATCCTGAATACGCACGTACCATTACAAAGAATGATAA
GAATAAAATTGTTCGCGCTTTAGAAATTATCCATCTCACAGGGAGGAAAGTTTCAGAGCATAGCTGGAGC
ATGGAGCCTCAAGAATCAAGGGAGTATAACTGCCGAGGTTGGTTTCTATCGCCTCCAAAAGAGCTTTTGC
TAGATAACATCCAGTTGCGTTGTCAGAAGATGCTGGAAGATAACTTAATTGGTGAGGTCCGTGGATTGCT
TGAGCAGGGGATAAGAGAAAATTCCTCAGCATCGAAAGCGATAGGCTATAGAGAGTGGATCGAATTTATC
GATCAAGGATCTCCAGAAGAGGCCTATGAGGCTGTGAAACAAAAATTTATTACAAATACCTGTCAATATA
CCAAAAAGCAAAGAACGTGGTTTAAACGTTATCCTGTGTTTCGAGAGTTGCCTACCCTAGGATTGACAGC
AGAAACTCTAGCAGGAAAGATAGCAGAAGATTATTTTCTTCACGGTTGA
>ref|NC_003361.3|:c981897-981565 anti-anti-sigma factor [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTGTGCCGAGATCGGAAACATTTCTAAATAAGAAAGTAGAAGAGGGGAAGCATAAAATCGTGCTCAACTT
TCAACACGTTACTTATATGAGTAGCGCAGGAATTCGCTTGTTATTTTCATTGTCTAAGTCATTACAATCT
CGCCAAGGTCTTCTTTGTATTTGTTGTGTTCAGGATTTAGTAGCAGATGTTATTCGCATGGCAGGCGCCG
ATCAACTTTTCCCTGTATGCCAATCAGAACAAGAATGTTTTACTAAATTTTAA
>ref|NC_003361.3|:981973-982761 hypothetical protein CCA00860 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GCATTTTTCTTAGCACCTTAATTTTTATCCCTACCATTCATTGGCTTTTGTTTCCCGAGACTTTTTCACT
CCCTACAACAAAAGCTCTGCCAATTAAAAATATTTTCCTGGTCTCCTCATCTTCTTCTAGAATTCCTGAA
GTAATTTTTTCAGAAACGCTACAACTCTCCGCAGATCATCCAACGTACCTACATCAATTTACGACTAAGA
AGGCAGAAGCCACTTTAAAAGAATTGGGGATATTCTCTTCAGTATCTATAGAAAAGATTCCTGATAATAA
AGGTATCATTATCTTTTACTCTTTACACTCCCCCATGGGTTATTTAGGTAACCAAGAAAACACTTTCATT
AATTACTCTGGCGAGAAATTCCCTTGCCTGCCTTTTTTTAAATCTCAAAAACTTCCCAAAATTTTTTTCT
CTACAAAAGACTTAGAGGCTTCTATTTTACCTTCATGGAAAATAGATATTGCATCTCTCTTCATTGAAGA
GCTCAAAGAAGATCCTCCTAAAATTATAGATTTGTCTCTTACGGAAATATATCCTATGGAGATCACAGTA
ACTTTATCTTCAGGGAGCCTTTTAAGATTTCAATACCAAACATTGTATAATGGTCTAAAGAATTATCATC
TCGCTCAAAATAGCACTGTAATAGACTCTCAGCAATCTTATATCTATGATTTAAGATTCCCTAACCATTT
ATTATTCAGCAAGATATGA
>ref|NC_003361.3|:982758-983090 periplasmic divalent cation tolerance protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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TCACGCAAAAACTTGCCGCGTGTGTTCATGTTTTCCCAAAGGGAAATTCGACATACATGTGGGAAGGCAA
ACTCTATATTTCCGAAGAATATCACATGCACATCAAAACAATATCTTCTAGATTCTCAGAAGTTTCCGCA
ATAATTCAGTCCTTATGTTCTTATGATGTTCCAGAAATCCTTTTGGTTAAAGTTGATGATGGAAATCCGC
AGTATTTACAGTGGTTATCTCTAGAAACGGCCCCACAAATACCTCAGGAATGA
>ref|NC_003361.3|:983198-983626 KH domain-containing protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGAAGAGTTTGTAGCATATATCGTAAAGAATTTAGTTGCTGATCCTGAAGCTGTGGAAATTCGTTCTA
TTCAGGATGAGTCAGGTGAATCTATAAAGATAGAGATACGTGTGGCTCCCGATGATATAGGGAAGATCAT
AGGTAGACGAGGAAATACAATACACGCGTTAAGGACTATTCTTAGACGTGTGTGCGCAAGATTAAAAAAG
AAGATACAAATCGACTTGATTCAACCCGAAGGCAGCAGAGAATCTGTTAGCGAGGATGAGGATGCTTCCG
GTAGTTTTTGTTTCGATTCAAACAACTCTAATGATTCAGAAATGGCCTCTCAATGTTGTGGTCGTGCTAC
CTGCTGTTCAGAGGATAAGGAAGATTCAGAAGAATCTTCAGCACATCACCAATGCAGCCACAATCACCAT
TCTGAATAA
>ref|NC_003361.3|:c986130-983695 UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase/D-alanine--D-alanine ligase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TATTGGACCGGGGATATTCCGTATCGGGGAGTGATTTAAATCAAGGCATTACCATAGATAAGCTTATCGC
TAAAGGCGCCGCATATTTACCAGGACATAAAGAAAGTTATGTTCCTGAAGAGGGTACGATTATCTATGGA
TCGGGAATTGCTAAGGATAACGTAGAGTATAAAGAAGCTCTGCGAAAACAGCTCCCCCTAGTACATCGCG
CTGAGCTTCTTGCCTTGTTAATGCAAGAGCAGACAAGTATTTTAGTTTCAGGAAGTCATGGGAAAACCAC
GGTATCCTCATTAATTACAGCCATCTTTCAAACGGCGAAAAAAGATCCTTCTTATGCTATTGGCGGATTG
AATTCTCAATATTTAAATGGGTATTCAGGAAGTTCAGAATATTTTATTGCCGAAGCTGATGAAAGTGACG
GCTCTTTAAAGCATTATTTTCCTAAAGTAGCTGTAGTTACAAATTTAGATAATGAACACCTGAGTAACTT
CGAAGGAAGTAAAGAAAAACTTGCGCAAACGATCGAAGAGTTCACCCGCAAGGTTGATGATCCGAATTTA
TGTTTTTATAACGGCGATTGCCAGGAACTTAAAGGGAGAATCTCTGGAATATCTTATGGGTTTTCTCAAG
AGTGCGCTCTATATATTTATTCGCATCGTCAGGAAGGCTGGCGTTCTGTATTTTCCCTATCTTTCTTAGG
AAAAGACTACCTAGATATAGATCTTAACTTGATTGGCAAGCATAACGTGGCAAATGCTGCTGCAGCTATA
GGTGTTGCGTTAACTTTTGGCATCGATGAGGAAAGTATTCGAGAAGCTCTTAAAAGTTTCTCCGGAGTGC
AAAGACGTATGGAAAGAAAGAATACCTCTGAGAAATTCCTATTCCTTGAAGACTATGCCCACCATCCTTC
TGAGATTTCTTGTACTTTAAGGGCGCTACGCGATGCTGTAGGCTTACGGCGTATCATTGCCATATGCCAA
CCGCATAGATTTTCTCGATTGCTCTATTGCTTAGAAGAATTTTTCAATGCTTTCCAAGATGCCGATGAAG
TCATCCTTACGGATGTCTACAGCGCTGGAGAAATGCCATTAGATCTACCTTCTCCTGAGAAACTAGCAGA
AACTATTTCTTTATCTTCTCATGTTTGCTGTACCTATGTTCCCTACGACAATGTCATAGAGCATCTAAAA
CAAAATATTCGTGTTCATGATGTCTGCATATCTTTAGGAGCAGGAAATATCCATACCGTAGGCAATGCTT
TAAAAGATTTTGAACCTAAGAAATTATCAGTCGGAGTAGTTTGTGGAGGCCAGTCTTGTGAACATGATGT
CTCTTTATTGTCCGCACGTAATGTCGTTCAATATCTTTCCCCGCAACATTATGATGTGCAGTATTTCGTT
ATCAATCGTCAGGGATTGTGGTCGCAAGTTGCGAACCTAGATGCGGGAAGCGATTATAATAGTAAAAACT
ATCACGTGTTATCTTCAAAGATCGCAGAAGCTTTAGCTAATTTAGATTTCGTTCTTCCCATCCTACACGG
TCCTTTCGGTGAAGATGGTACGCTTCAAGGATTCTTGGAAATAGCTAATAAGCCCTATGGAGGGCCTTCG
TTGCTCTTTTCAGCAATCAGTATGGATAAGATTATGACAAAACGCCTTGCTGCTTCTGTAGGGGTTCCTG
TAGTTCCTTATCAGCCATTAACCTTACCCACCTGGAAGCGAACTCCAGAATTATGTATGCGCAGAATTTT
AGAAACATTTACTTTTCCAATGTTTGTAAAAACAGCACATTTAGGATCAAGTATCGGTGTATTTGAAGTT
CATAATGAAACGGAACTTAAAGCAAAAATATCCGAAGCATTTCTATACGATACCGATGTCTTTATCGAAG
AGAGCCGTTTAGGATCTAGAGAAATCGAAGTGTCTTGTCTTGGGGATGCATGTAGCTGTTATTATATTTC
TGAACCACATGAGCGCCGTGGGTCAAAAGGATTTATTGGTTATGAAGAGAAATACGGATTCAATGGTAAA
TCTAGCGCTACAATACAATACGATCTGAATCTTTCCGAAGAATCTAAAACACGCGTGAAAGAACTTACAG
AGCGTGTGTATCGTGTTATTCAAGGTAAAGGATCTTGTAGAATCGATTTCTTTTTAGATCGTGAAGGAAA
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CGCTTAGGATGGACCTTCGAACAAATTGTGCATCAGTTGATCATAGCAGGATTACATAAGTTCGATCAGA
AGAAGAAAGTCAGCAGCACTTTTAATAAGCAGTGCTTATTAACCGCGAAGAGCTAA
>ref|NC_003361.3|:c987214-986138 N-acetylglucosaminyl transferase [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGGTGAAGAAAATCAACAAAATAGCTCTAGCTGTCGGAGGATCGGGAGGGCACATAGTTCCCGCTCTAG
CAACAAGAGAAGCATTTTGTAAAGAGGGTGTAGACGTTCTTCTTTTGGGAAAGGGGTTGGATAATCATCC
AAATCTTTGTGATCTAGATGTGCATTATAAAGAGATTCCCTCAGGATTGCCGACAGTCGCTAGTCCCGTA
ACAGCTATTCGTAGAATGTCTTCCCTATACAATGGGTATAGGAAAGCTAAAAAAGAGCTATGTATTTTCG
ATCCCGATGTTGTTATTGGATTTGGGAGCTACCACTCTCTTCCTGTATTAATGGCAGCATTAAAGAAGAA
AATCCCTATATTTTTACATGAGCAAAATCTTATTCCAGGCAGGGTAAATAAGCTATTTTCACGTTTTGCT
AAAGGTGTAGGGGTATCTTTCCATCCAGTAACTAAGAATTTCCGATGTCCTTCTCAGGAGGTCTCTTTGC
CAAAAAGAGCCTTCTCTGCTTGCAGCCCTATTGCCGAACGTCTTGCATCACATTCCCCAACAATTTGTGT
TGTGGGAGGCTCTCAGGGGGCGAAAACATTGAATGATCATGTCCCTCTTGCTCTTGTAGAAGTTGCGAAG
GATTATCCAAATATGTATGTTCATCATATTGCAGGGCCTAAAGGTGATGTGATTTCTATACAACATATCT
ATAGCCGCGGTGGAGTATCTTTTTGTGTGAAACATTTCGAGCAGGATATGCTGAATGTTTTGCTTTCATC
AGATCTTGTCATTAGTCGTGCGGGGGCAACAATTCTAGATGAGTTATTGTGGGCACAAAGTCCTGCGATA
CTTATTCCCTATCCGGGAGCTTATGGACACCAGGAAGAAAACGCAAAATTCCTTGTCTATACTATAGGAG
GGGGATCAATGATTTTGGAAAAACAGCTGTCCCAAGAGGTTTTGACTAAAAATATTTTGCTTGCTCTCGA
TCCTGAAACTATTAAAAATAGGCGAGCAGCACTGCGAGATTATTATCAGAACAAATCCTCTAAGTCTTTT
TATCAATTTATTTGCGAATGTTTATAG
>ref|NC_003361.3|:c988277-987123 cell division protein FtsW [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAGTGGTTTATTGTTTCATGTTTATTAGGGATTTTTTCTCTGGGCCTAGTTATGGTTTTTGATACCT
CCTCAGCAGAAATTCTTGATCGTTCTCTTGCTTGCAGTACACATAAGGCTTTAATGCGCCAGATTACCTA
TTTATTATTAGGGTTAGGTCTTTCTTCTTTAGTTTATATGACAGGATGGAAGGATTTTCTAAAAATTAGC
CCTACGCTATTACTGATCGCCGGAGTCGCTCTTATCGCTGTTTTGATTCCAGGGGTAGGGGTATGTAGGA
ATGGTGCGAAACGTTGGTTGGGTATAGGGCAGCTTACTTTACAGCCTTCAGAATTCGTGAAATATCTTGT
TCCCTGTGTTGCCATAGAATACCTGGTTTCTCGTCCGCAGTATCGAGAAAACTTTAAATTATTTCTTAAG
CTGACCATAACGTTATTCATTCCCATTTTATTAATTGCCATAGAGCCTGACAATGGTTCTGCAGCTGTAA
TTGCGTTTTCTTTGATTCCCGTATTTATTATGACAGCTGTGCGATTACGTTATTGGTTACTTCCCCTGTT
GTGTATTCTTGTTATTGGCGGTGCTCTTGCTTATAGAATGCCTTATGTGCGTCATCGATTAAATGTCTAT
CTCCATCCAGAGTTGGATATTAAGGGACGAGGACATCAGCCATATCAGGCAAAAATTGCAGCAGGATCAG
GAGGGTTACTAGGTAAGGGGCCAGGAGCGAGTCTGCAAAAGCTTACCTATTTACCGGAAGCACAAAATGA
TTATATTGCAGCTATATATGCTGAGGAATTTGGTTTCATTGGTATGTTGCTTTTGATCTTGCTATATATG
TATTTTGTTTATGCTGGTTATGTCGTTGCTATTCGAGCTTCTTCTTTGGAAGGGTCTTCATTAGCGATAG
CTATTACAGTGATTATTGGGATACAAGCTTTTATGAATTTAGGCGTTGTATCTGGCTTGTTGCCGAGTAA
GGGAGTGAATCTTCCTTTTTTCAGTCAGGGAGGGTCCTCTTTGATTGCTAATATGTGTGGTGTTACATTG
CTGTTAAAGGTGTGTGGTGAAGAAAATCAACAAAATAGCTCTAGCTGTCGGAGGATCGGGAGGGCACATA
GTTCCCGCTCTAGCAACAAGAGAAGCATTTTGTAA
>ref|NC_003361.3|:c989024-988296 LysM domain-containing protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAACCGTAGAGATACGATTATAATTGCAACTTTAGTGAATGCAGTTTTGGTGCTAGTGTTATTCACTA
CAGCGAAACATGTTGATAAGAAAAATACCGATGTATTTCTTCCTCCTCTACCAGCAAAACTTGTTGAAGT
TGCCCCCACAAGTGTGGAAAAAGTACAAGAGAAAGTTGAAAAGGTTGAGAAGCCTATTGTAGAAACCCCA
GCTCAACGTGTTTCTAAAGAAGAATTAGCAGCACAATTTGCAGAAAATAAGCCTGTGGTTGTCAAACCTT
CTCCAGCGCCTAGTGTTCCTCAAACAACTCCTTCTGTTCCAGTTGCGCAACCTATATCTCCTGAACCCAA
AACCCAAGTTACTAAAGAAGCTGCTAAGAAAGAAGCTTATGCAACCGTTATTGTGAAAAAAGGAGATTTC
CTAGAGCGCATTGCTAAGGCAAATCATACGACAGTAGCCGTTCTTATGCAGATCAATGACTTGTCTTCTA
CGCAATTGAAGATAGGTCAGGTATTGAAGGTTCCTGTATCTAATAAACAAGAGGAAATTAAGAATCCTCA
GGTAAAAGTCTCCAATGCTGAAGATTTCTATACCGTGCAAGAAGGTGATAGCCCTTGGACTATAGCTTTG
CGTAATCATATCCGTCTTGAAGACCTATTAAAAATGAATGATCTTGATGAGAATAAGGCGCGCAAACTTA
GACCTGGAGATCAGTTGCGTATACGGTAG
>ref|NC_003361.3|:c990280-989021 UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGAAACACCAAAGAGTCATAGTTTTAGGGGCAGGGGTGACTGGAAAGTCTGTAGCAGAGTTTCTTCATT
CTCGGGGAAGTTATGTGATTGGAATCGATGGATCTTTAGATGCTCTAAACTCTTGTAGTTTCTTCCATGA
GCGTTATCTAGATACCATCGAAGAATTTCCTGAAGATATGGATTTATTTGTACGTTCTCCGGGAGTCAAG
CCCTCGCATAGTTTGGTGGTTGAAGCAAAACGTAGGGGGATTCCTATAGTTACCGATGTCCAGCTAGCTT
TTCAAGATCCAGAGTTTCATCGGTATCCTTCTATTGGAATTACAGGATCGGCAGGGAAAACAACAACAGT
GTTGTTTTTAGTCCATCTACTGCGCTCTATGGGGATGGGAGCTTTTGCTATGGGGAATATAGGCGTGCCT
ATCCTTCAGGCAATGCGTGAAAAAGGTATCCGTGTTGTTGAGATCAGCTCTTTTCAACTAACCGAACAAG
AAATAGAGACTCCTGTGCTATCAGGAGCTGCTATTTTAAATATTTCTGAGAATCATTTAGATTATCATCA
AAGTCTGCAAAACTATAGCGAAGCAAAAAGGAACATTACTAAATGTTTACAATCGGTTGAATCTTTATGG
GTTGGAGAGTGGCTTTCCCCTGGAAAATCCTATCTGGATTATACTAAAGAAATAGCTTCGGTTTTAGACA
AAGGGAGTGCATTAAAACCATTATACTTGCATGATAGGAGTAATTATTGTGCAGCTTACGCTTTAGCCAA
TGAGATATCTAACGTTCCTTTGGAAGCGTTTTTACAGGCACTTCAAACCTTTGAAAAACCTCCCCATAGG
ATAGAATATCTGGGAGAAAAAGATGGCGTAAGTTATATCAATGATAGTAAGGCTACAACTATGAGCTCTG
TAGAAAAAGCTCTAATAGCTGTGAAAGAAAACGTCATTGTTATTTTGGGCGGAAGGAACAAAGGTAGTGA
TTTTACCTCTTTGATTCCAATCCTTACTCAAACGGTAAAACATATTGTGGCTATGGGGGAATGTCGGAAC
GAAATTGCCCAAGCTTTATCTGGTAGTCTTCCTTTAACTCAAGCCCGAGATCTACAAGAAGCGGTAAGCA
TGGCCCAGAGTATCGCACAGCCTGGTGATGTCATTTTATTATCTCCGGGATGTGCCAGTTTTGATCAATT
TCGAAGCTTTGAGGAACGAGGGGATTGCTTTAGGCAATTGGTTGGTGACATGGAGGCATTAAGAGTATGA
>ref|NC_003361.3|:c991330-990284 phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide-transferase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGTTCTGTATTTTCTTATTTTAACGAATCCTGGATGCTTCTTTTGGCAACAGTGTTTGGTCTAGCAT
TTTTCCTGGGGATTTTCTTAGGGAGACCCGTGATTTCCTGGTTGAAAAAGCAAAATCACTATGATCAGGT
GCATAAAGAACACTGTGAAAAGCTAGAAGCTCTGCATCAGGATAAAAAAAATACACCTACAGCTGGAGGC
ATACTTTTCTGTATTGTTTTGTTAACGACTGTTTTCCTTTGGCTTCCCTTAGGGAAGCTTTCAACGTGGT
TATTTGTATTTTTGATAATCAGTTGGGGAACCTTAGGTTGGTATGATGACATTATAAAAAAGGAAAGGAA
AAAAGGGCACGGAATCACAGCAAAACAGAAATTCGTTATTCAGCTAATCATCTCCGCTATCACCATTGTA
ACGATATTCTCCATATACAAAGGAAGCGCGCTATTCTGTACATTACAGGTTCCTTTTTTCGGAACGGTTT
CTGTCGGACATTCTATTTTAGGTAAGTTTTTCTATTTTGTTTTAGCAATGCTAACAATTGTAGGGACGAG
CAATGCTGTAAATCTTACGGATGGTCTCGATGGCTTGGCCGCAGGAACTACATGCATGAGTGCCTTGGGT
TTGTTGGTTGTTGCTCTTTCTAACCCTACCATGCCTTTAGCTCAAGATGTCTCTATAGTATTATCTGCAT
TGATAGGCATAAGCTTTGCTTTCCTAAAATACAATCGTGCTCCTGCACAGGTATTTATGGGCGATACAGG
ATCCTTGCTGATCGGAGGAGTGTTGGGGAGCTGCGCTGTGATGCTTCGTGCAGAATTACTTTTAATTTTG
TTGGGGGGAGTTTTTGTTGCAGAAGCAGGATCTGTAATTTTACAAGTTGGGAGTTGTCGCTTAAGGAAAA
AGCGTATTTTTCTATGTTCTCCCCTACATCATCATTATGAGTATAAAGGAATTTCCGAAACAAAAGTTGT
CGCGCGTTTTTATATAGCAGGACTACTTTGTATGATTTTAGGGATCATTGCAGCATTGTGGAGATAG
>ref|NC_003361.3|:c992694-991348 UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2,6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCAGTCTATCTTATTAGAAGATTGGGTATCGTTAATGTTATCTGATGTGAAATACCCAAGGTCTGGGA
AAAAGATTTCTGGGGTTGCTATTGATAGCCGTCAGGTGCGTCCAGGAGATTTATTTTTTGCTCTTTCTGG
GCAATGTACAGACGGACACCGTTTCCTTAAACATGCCGCGCAGGCGGGAGCCGTGGCAGCAGTAGTTTCT
AAAGACTATTGTGGAGATTCTTTCGGGTTAGAGTTAATTATTGTTAATGATCCTACAGAAGCATTGAAAG
AAGCCGGAGAAAACCAAAGTCATCTATTTCAAGGAACAATCGTTGGGATTACCGGGTCTATCGGAAAGAC
AACAACAAAAGTATTTGCAAATACTTTTCTTTCCTCAGTGTATAAGGTATACGCGAGCCCTAAAAGCTAC
AACTCTCAACTTACTGTTCCCTTAAGCTTATTAATGGCAGACGGCAATGAAGATTTTATCATTTTAGAAA
TGGGCGTCTCTGAACCAGGGAATATGAAGGATTTACTTTCTATAGTAGAGCCCGAGGTTGCTGTAATCAC
GAATGTGGTAGATCAACATGCTATGAATTTCTCCGATAAAGGCATTCAAGGCATTGCTGAAGAAAAGGGA
CGTATCTTACAAAATAGTCGTGTACAGCTTCTTCCTAAAGATTCTCCATGGTACCCGCACTTTATAAAAC
AGGCTTCGTCTTCTGAAAAGTTTTCCTTTGCTTTTCATAATGAGACCGCCGATTTTTACTATAAGGCTAT
TCGTAAGGACAGCGTGATTATAAGCACCCCTGAAGGCGATATAGATTTTGCAATTTCTTTTCCTTATCAG
CCAGCCTACAGCAATTTATTAATTTCTCTATCTTTGGCTTGGCTTCTTGAAGTCCCTGTCGATAGGATAG
TTCACTCTTGTTGTGATTTGCAACTCCCTCCTATGCGTTTTGAGCAAAGCATGCGAAATGGCATTCAAGT
AATCAACGATGCTTATAATGCCTGTCCAGAAGCAATGATTGCTGCTTTAGACGCTATTCCTCATCCTTCA
GAAAGCGGAAAAATCATATTGATTTTAGGTCATATGGCAGAATTAGGAAATTATTCCGAGGAAGGACATA
CTATTGTTGCTAAAAAAGCTTTATCAAAGGCTAGTATTATTTTCTTCATTGGAGAAAAATGGTTGCCGAT
ACAACATGTATTAAACTACGGTTCTTGTGAAGTTTCCTTTCACCCATCTGCTCAGGGTATTGAAGAGATC
TTAAAGAAAGTCGTCCAGCAAGGAGATATTGTCTTGCTAAAAGGATCACGATCTTTAGCTTTAGAATCTC
TGCTGAGCTGTTTTTAA
>ref|NC_003361.3|:993075-994595 60 kDa chaperonin, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTAGACAAGGAAAACTCTCTGTATGATACAGATAAAAAACTTTTCCTTGGAATAGACAAGGTCTTTC
ACTCCATCAAGGACCACTACGGCCCGGTGAGCTCATCTCTATCTTTTTTTGAGCATCAAGGTTATCTATC
TTTATCTCGTATCACGTTAACAGATCCTCATGAAAATATCGGTGTGGATTTTGCTAAAGCCATGGCAAAG
AAAATCCATAAAAAATATCTTGACGGCGTCACTACAGGGGTCATTCTACTCTATACTCTTCTTAAAGAAA
GTTACCTTTTTTTAGATCAAGGTTTGTCTCCTTATAAACTTTGTTTTGCTTTAAGAAAAATGAAAGAGAA
ACTTTTAACATCTTTAACGAAACATTCTTGGCCTTTAAAAGATAGTAATAAAGCTAGAGGAATTATTTTT
TCTTCTCTTCCAGATCCTAAAATTGCTACAGAATTGACAGAAGCTTTTTCCTCTGTAGGTTCTGAGGGAT
TCATTTCGTTGTCACTCGGCATTCCCCATATACAGGTAACTCGCGGATTAAAAATTCCCTGTGGGTATAT
CTCTCCTTATTTCATTTCTCAACCTACGCAGCGAACGATTATACTTTCTCATCCCCGTATCTTTGTTACT
GATAAAAAGATTACCTCAGTTCTTAGCTTCTTCCCTCTACTTCAAGAATTACAAGAGAATGGAGAACGCT
TGCTGATTTTCTGTAAGGGCATAGATCAAGATGCTCTTGCTACATTTACAGTAAATAAACTTGAGGATCT
TTTACAAATTGTTGTCGTCGATTTAAACAACCCCTCCTTGGATTCAACTTTTGCTGAAGATATTACCCTA
TTCACAGGAACTACAGTTTTCTCCCAGAGCTTTTCTCCAGCTACCCAACTCCCTGAACGCGCATCTTTAG
GTTCTTGTGCTTCTGTAGAAATCTCTGAAGAAGAAACGGTCATCATTCATGGAAATAGCGTCTCTGAAGT
TCTAGCATTAAAAATACATCAAATAGAAGAAGAAATACGCACCAGCTCTTCTCAAGAGAAAAAAACGGCA
TTGACAAAGAGAAAACACCGCTTACAAGGTTCTGTTGCCATCGTTCCTGTCTGCGAAGAAACCAAGTTTT
TCTATTCCTCCGCTCTCTCCGCATTAACATCTGCCTTAGACAAAGGTTATATTCCTGGAGGTGGCGCAAG
TCTATTCTATGCTTCTTTGAATCTATATGATGAGGAGAACCTCTCTGAAGAAGAACAAGCTGCTATGCAT
GTGACACAGATGTGTTGTCGCGCTCCTTTAGAGCAATTAATCAGCAACCTAAAGTTAGACAGTAAAATGG
TTATCGATAAACTCCTATCGTTATCCACCCCCAGTTTAGGTATGAATGTTCTTTCTCAGCAGATAGAAGA
TTTTATTGCTTCAGGAATTTTAGATCCCCTAGCTAAAATCACCGATATTTTTTCCCTGGCGCTAGAAACA
GGATTAAATATACTTTCATCAAAAGTAATCATTAACGATGTAAATAAATAA
>ref|NC_003361.3|:994981-995862 hypothetical protein CCA00871 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCATAACAAATCTTCAGAAGCTCATCGTATTATTCATATCTCTGATGTGCATTTTTGTGTCTTTCCTA
AGAATCCTTTAACCTGTCTAAATAAAAGATTTAAAGGAGCGTTGCGCCAAGTATTCGGTGGTGTGACATT
CCAATCATCCACAATAGCTGAACGTTTCCCAGACCTAGCTGTAAAATTACAAGCGGATAGCATTTGCATT
ACGGGTGACTTTTCTCTAACAGCTTTGGACGCAGAATTCTTACTTGCTCAAGATTTTGTGAACAACCTAG
CACGAAATGCTTCTGTCTATGTGCTTCCTGGAAATCATGATGTGTATACTCAAAAAGCACTGAATCATCA
GACGTTCTATCAATATTTTCCTAATACACAATTACAAAATGAGCAAATTTCCTTTAACAAACTTGTAGAT
CATTGGTGGTTAGTCTTACTAGACTGTTCGTGTTTGAATGGTTGGTTCTCAGCAAATGGCATGATAAAAT
CCTCGCAAATTTCTATTTTAGAAAACTTTATTCTCAGTCTGCCCCCACAAGAAAATATTATTATTGCCAA
CCACTACCCTCTTTTACCTACAAAAGACCCCTCTCATGATTTAATTAACTACTTACTTTTACAACACGTC
CTGAAAAAGTATTCTAACGTACGTTTATATCTTCATGGACATCATCATCAGGCTGCGGTTTATAACTGTA
AAGATCACGCACCGAATATGATTTTAAATAGTGGGTCTATTTCATTACCCTCTAACGCACGCTTTCATAT
TATAGATCTATACCCTCAAGGGTACCACGTCTATACCACAGCAATAACAAATCTCCTAGACACTAAAGAA
CCTTTAGAGATTTCTATAGAAGCAAGTTTGGAGTCTTGGTAA
>ref|NC_003361.3|:c996133-995912 hypothetical protein CCA00872 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGAAACGAAAAAAACAAAAGAGCTATCTGCAGAGGCAGAGCTACTTAAAAAATTGCGAGACAAGGCTT
TAGTTCTTGAAGAACAAAAGAAGCGGAAAGTTTGGGTTGAAAAACTCATCGCTATGCCGGAATCTACTCG
TGACATTTCTCATTGCGACGTTCCTGATACCCCAGAGGTATTTCGAGCTATTGCAGAAAAAATTTGCGAA
GAAGGTGTGTAG
>ref|NC_003361.3|:c996764-996192 elongation factor P [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTTCGTGTAAGCACTAGTGAATTTCGTGTAGGATTAAGAATAGAAATAGATGGTCAACCTTACTTGA
TTTTACAAAATGACTTTGTAAAACCAGGAAAAGGCCAAGCTTTCAATAGGATTAAGGTAAAAAATTTCCT
AACGGGAAGAGTTATTGAAAGGACGTTTAAATCCGGAGAATCTGTAGAAACCGCGGATGTACGAGAACAA
CAGATGCGTTTCCTTTATTCAGATCAAGAAGGTGCTACCTTCATGGATGATGAGACATTTGAACAGGAGA
TGATCTTCTGGGACAAAATAGAAAACATCCGTCAGTGGTTATTAGAAGATACGATCTATACATTAGTTTT
GTATAACGGTAACGTTATTGGCGTAGAGCCTCCAATTTTTATGGAGCTTACCATTGCTGAAACAGCGCCA
GGTGTACGTGGAGACACAGCCTCAGGAAGAGTATTAAAACCTGCAGTGACAAATACAGGAGCAAAAATTA
TGGTTCCTATTTTCATTGAAGAAGGTGAGGTTGTTAAAATAGATACACGTACAGGTAGTTACGAATCTCG
AGTTTCTAAGTAG
>ref|NC_003361.3|:996964-997839 AMP nucleosidase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTAAGAAAAAAGACACCCATATCAATGAATCAAAAATAGCCCAGGACATGTTAGAGCGTTATTCTG
GATCGACTGTTGAAGAATTTTGCCCTTACTTGCTCTTAACAAATTTTGCTTACTATACTCATGTATTCGC
AGAGGCATATCAAGTCCCCATTTCAAAAGGATCGATGTTTTCTGCAGCACACGCTCCTCAAGTGAATACT
TCTATTCTTGATTTTAAGCTGGGATCTCCTGGAGCGGCTTTAACTGTGGACTTATGTTCTTTTCTCCCCC
ATGTAAAAGCTGCTGTGATGCTAGGTATGTGTGGAGGATTACGTTCGCACTATCAAGTTGGAGATTATTT
TGTTCCCATAGCTAGTATTCGAGGAGAAGGAACTTCTGACGTGTATTTCCCTCCTGAAGTTCCTGCTTTA
GCGAACTTCATGGTTCAAAAGACCATCACAGAGATATTAGAAGAGAAAAAATCGAGTTATCATATCGGAA
TTACCCACACGACAAATATCCGTTTTTGGGAATTCAATAAAGAATTTCGAAAGAAACTCTATGAAAACAA
AGCACAAACTATAGAAATGGAATGTGCTACGTTATTTTCCGCAGGTTATAGAAGAAATCTTCCCATAGGA
GCTTTGCTGGTCATTTCCGACTTACCATTAAGGAAAGAGGGAATAAAGACTAAGGAAAGCGGAAATTTGG
TGTTGAAAACATACACGGAAGACCACATCACCACAGGAATTGATGTCGTTACAAAATTAAACATAGTATT
GAAAAACCGTCCTACAAAAGCCAATAAAGGCCTACCTCACATGGAGCTGGGAGAAGCTGACGATACTATG
CCTAAAAATTCCGGGATTTCAGATAGTGATTATTGA
>ref|NC_003361.3|:c999830-997833 transketolase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTAAACAGGGAAGTAGACGTAGATATCTTGGAAAAGATCTCAGGAACTCTTAAACAGTTAAGTATAG
AGATCATTCAGAAAGCGGGTTCTGGTCATCCGGGATTGCCTTTGGGTTGTGCGGAACTTGCCGCGTACCT
GTATAGTTATGTTTTGAGACATAACCCAAAAGATCCTTTATGGATTGATAGGGACAGGTTTGTTTTGTCA
GCAGGGCATGGTTCAGCGTTACTATATGCCTGCCTTCACCTTGCTGGATATGATGTTTCTTTAGAGGATC
TTCAGCAGTTTCGTCAGTTGCATTCACGAACTCCTGGTCATCCAGAATTTGGAGAAACTGAGGGCGTTGA
AGCTACTACAGGACCTTTAGGTCAGGGTGTAGGTAATGCTGTAGGTATGGCTTTATCTATGAAGATGCTT
CAAGTGCGCTTTAATCGCCCTGAACATGAAATTTTTAACGGTAAGGTGTATTGCCTAGCCGGTGACGGAT
GCATGATGGAAGGTGTTAGCCATGAAGTCTGTAGCTTGGCAGGGACATTAGGCTTAGATAATCTTGTCGT
TATATATGACTACAATAACATTGTTTTAGACGGCTTCTTAGGAGAAGTAAGTTCTGAAGATGTTAAAAAG
CGTTTTGAATCTTACGGCTGGGAAGTTTATGAAATCGATGGCTATGATTTTTCCTCGATTCATGAAACGT
TTGTAAAAATTAAACAGTCGCAACAGCGTCCTGTATTAATAGTAGCCCATACGATTATAGGGCACGGCTC
TCCTAAGGAAGGAAGTCATAAGGCTCACGGATCGCCTTTAGGTGAAGATGGCGTAGAACAGACAAAACGT
TTCTGGCATCTTCCTGAGGAAAAATTCTTCATTTCTCCTGCAGTGAAATCCTTCTTTTCCCATAAATTAC
AAGAAGATCGTAAAGTGCAAGAGGAATGGCAGAATGATTTCCGTGTTTGGTCACGTCAATTCCCCGATTT
ACATCAAGAATTTCTTTCTCTAAAAGCGCCGATATCCTCTGAAACATTAGAGACAATACTTGAAAGTGTG
GAAATGCCAGAAGTCATAGCTGGTCGTGCCGCATCTAACAAGATAATTCAAAATTTAGCTAAGAATATCC
CTTCACTTATTGGGGGATCAGCAGATTTATCAAGTTCAGATGGAACCTGGATAGCAGAGGCTAAAGAAAT
TAATAGCCAAGACTTCTCCGGCAGGAATATTAAGTATGGTGTTCGAGAATTTGGTATGGGAGCCATTATG
AATGGTTTAGCCTATTCTCAAGTATTTCGACCTTTTGGAGGAACATTCTTAGTATTCTCTGATTATTTAA
GAAATGCTATTCGTTTAGCAGCATTGGCTAAGCTCCCTGTTATTTATCAATTTACTCATGACTCTATTTT
TGTTGGTGAGGATGGTCCTACACATCAACCTATCGAACAGATCATGTCATTAAGAGCTATCCCAGGTCTG
CAAGTTATCCGCCCTGGAGATGCCAATGAAGTGAAGGGGGCTTGGCATGCAGCATTGCGTCATCTTGGCC
CTACAGCATTGATTCTTTCTCGACAAAACTTGCCTACATTAGCACAGACAGACAGACCATTTAAAGAGGG
TGTGGGACGTGGTGCTTATATTGTTTTAAAAGAGACCGAAGGTAAGCCCGACTATACTTTATTTGCTACG
GGATCAGAATTGCATTTAGCATTAGCTGTAGCTCAGGAGCTGATTTACTTAGATAAGAAAGTTCGAGTCA
TTTCCTTCCCATGTTGGGAATTATTTGAACAACAAGATTTTGAATATCGAGAAAGTGTGGTCGGTGGTGA
TTTAGGTTTGCGAGTCTCCATAGAAGCGGGATCTGCATTGGGTTGGTATAAGTATATCGGTCTCGATGGT
TTGGCTATTGCTATGGATAGATTTGGCTATTCGGGAGCTCCCGCTGATGTAGCGGAAGCTTGTGGATTTA
CTGCGGACTGTATTTTACAGAGAATACTTTCTCAATAA
>ref|NC_003361.3|:1000094-1002721 alanyl-tRNA synthetase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTAAGTAACACTCTTCGATCTAATTTTTTAAAATTTTACGCCAATCGTCATCACACTATTGTTCCTT
CCTCTCCTGTTTTTCCTCACAACGACCCTTCGATTCTCTTTACCAATGCAGGGATGAATCAATTTAAGGA
TATTTTTCTAAACAAAGAAACTGTGAGCTATTCGCGCGCCACGACTTCTCAAAAATGTATCCGTGCTGGA
GGCAAACATAATGACCTCGACAATGTTGGACATACGTCGCGACACCTTACTTTCTTTGAAATGCTAGGGA
ACTTTTCTTTTGGCGATTACTTTAAGGAGCAAGCGATTGCTTTTGCCTGGGAAGTTTCTTTATCTGTCTT
TAACCTAGACCCTGATCGTATCTACGCAACTGTTCACGAAAAAGATGATGAAGCTTTCGCTCTTTGGGAA
AAGCATCTTCCCTCCGAACGCATTTTCAGACTGACTGATAAGGACAACTTCTGGAGTATGGCAGAAACAG
GCCCTTGTGGATACTGTTCCGAGCTTCTTTTCGATCGTGGAGAAAAATTTGGCACAGCAGCTTCTCCTTT
GGAAGATACTGAAGGGGAACGCTTTTTAGAATATTGGAATCTTGTCTTCATGGAATTCAATCGCACAGCA
GAAGGTTCCTTATTAGCTTTACCAAACAAACATGTGGATACAGGTGCGGGATTAGAACGTCTAGTTTCTA
TCCTTTCTGGAACAAATACGGTGTTTGAAGCCGATGTTTTACGTCTCCTTATTTCAAAAACAGAACAACT
ATCAGGAAAAACTTATCACGCAGATGAGGCTTTAGGGGCTGCTTTTAGAGTGATTGCTGATCATACACGC
TCTCTATCTTTTGCTATTGCTGATGGTTTGCTTCCAGGAAATACAGAACGTGGTTACGTATTAAGAAAAA
TTTTACGAAGAGCTGTAAACTATGGGAAGCGTTTAGGATTTACCCAACCTTTCTTAGCAGACATCGTCCC
TTCTTTAGTGGATACTATGGGAGAGGCTTATCCTGAATTACGTTTATCTCTATCTCAAATTCAAGAAGTT
ATGACCATGGAAGAAGAGAACTACTTTAAATCTCTTCATCGTGGTGGGAACTTACTCCAACAGGTACTTA
AATCTTCGTCATCATCCTCGATCATTTCTGGAGAGGATGCTTTCAAATTAAAAGACACGTATGGATTACC
TCTTGATGAAATCGCTTTATTAGCTAAAGACTATGATTTCACCGTAGATATGGAAACCTTCTACCAATTA
GAAGAAGAAGCCAAAGAGCGTTCTCGAAAAAACATTGCTAAATCCCACAGCTCTACAGATACGGTTTACG
ATTCTCTATCTTTAGGAGAGAACTCAGAATTTGTTGGTTATAACGATTTATCGTGTGACACATTTATTGA
AGCCTTGGTTAGTAATGGCAAACAAGTTTCCTCACTTAAGGAGAAAGAGAAAGGTGCTTTAATTTTAAAA
GTTACTCCTTTCTATGCAGAAAAAGGTGGGCAAATTGGGGATTCTGGAGAAATATTCTGTTCTGATGGGA
CCTTTATTGTTAGCCATACGACATCTCCAAAAGCAGGAATAGTCATTCATCATGGAGAGGTCTCCCAAGG
GCAACTTTCTCAAGATCAAGCAGTCACTGCGCAAGTGAATTGCATCCGCAGAAAGAAAATTGGCAACAAT
CATACCGGATGCCATCTTCTACATAAAGCTTTAGAGGTGACCCTTGGCGATCATATTCGCCAAGCAGGAT
CTTATGTCGACGATACAAAAATTCGTTTAGACTTCACTCACCCCAAAGCTATTGCTCCAGAAGACTTAGC
TTCTATTGAACTTTTAGTTAACGAGAAAATCCGAGAAAACCACCGTGTGGAAACTCGTGAGGCTATGTAT
TCTGACGTGATGAACTCCAAAGAAATTAAACAGTTTTTTGGAGATAAATATAGTGATGTTGTTCGCGTAG
TCTCAGCAGGCTTCTCCCACGAACTCTGTGGAGGAACTCACGCAGAATTTACGGGAGATCTCGGGTATTT
CCGCATCCTTAAGGAACATGCTGTAGCCACAGGAATTCGCCGTATAGAAGCTGTGACGGGAAGAGAAGCC
GAAGCTCTAGCACATCAAGACAATGAAAATCTCAATGAAATTGCTCTTGTTTTACAATCTCCTCGAGATC
AAATTCTGAATAAATTACAAAACGTTCTAGAAGAAAGAAAAGAACAAGCAAAACAAATCTCTGAATTAGA
GAATAAGCTGATTCATTCCTTATTGGATAAGCTTATTGACGGTTGTCAGCAGGTTGACGATGTTTCCTAT
TTGATTCATCATTTACCCGAATCAGAAAGTCATCGTCTACAACAATATGCTAACTGCTTACATCAAAAAA
TACCCTTACGTTTAATTTCCTTATGGACGACTCAGAAAAATGGGAAATATATCATCTTTTCTCGAATTTC
TGATGACCTTGTTAAACAGGGGTTGCAGGCTAAAGACCTCTTAAAAATAGTACTTACACCTTGTGGTGGT
CGTTGGGGAGGAAAAGATATATTTGCACAAGGTAGTGCAGATAATCTCCCACAAGCAGACGCATTAAATA
ACACTTTATGGCAATGGATTTCGACCCAGTTAATTTAA
>ref|NC_003361.3|:1002691-1005948 transcription-repair coupling factor [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCAATGGATTTCGACCCAGTTAATTTAAACCTACCCATCTTATCTGAAATAACTAACGCCTCTATTC
CATTACTAATAGAAAATATCCGTCCTGGAGCTCGCGGATTCTTAGCCGCTAAGTTTTTCCGCGAGAGGGA
CGAGTCTGTGGTAATGATTACCACACGCGCTCGTATTGATGATCTTTTCGAAGATCTCTCCTCATTTTTA
GGATGTGCCCCTGTTGAGTTTCCCTCATCCGAAATTGATCTATCTCCTAAGCTTGTCAATATTGATGCTG
TGGGTAAACGTGATAAAGTTCTTTATGAATTATATGAAAAGAAAGCTCCGTTATTTTGCATAACCACGTT
AAAAGCTTTACTAGAGAAAACTCGTTCACCTAAAGATACTGGTCATCAACATTTAGATCTCCAAGTTGGT
GATGTGCTAGATCCTGAAATGATGATCGATCTATGCAAAAATTTAGGCTATCGCCATGAAACTCTTGCGA
GTGATAAAGGAGAGTTTGCTTATAGAGGGGGGATTATTGATATCTTTCCGTTATCTTCTCAAGAACCTTT
TCGCATAGAATTTTGGGGAGAAAAGATCATCTCCATACGTCCTTTCAACCCTTCTGACCAACTCTCAACA
GGAAAAGTTTCCAAAATTTCGATTTCTCCGGCTACAAAAGATTCAGGGAAAGAAGCGTTATCACATTGCC
TATTGGATTATTTTAAAACACCCCCTGTCTTTATCTTTGACAATCTCTCGATGTTAGAAGATGATTTTTC
TGAGATTTCGGGAACATTGTCTTCGTTGCCTAACCGCTTTCTATCGATTACAGATCTCTGTGAACGCGCT
TTGCAATCCCCTACTATTTTCTTTGAAGAGAAAAGCTTCCCTAATGTTCGCAATCTTAAAAACAATGAAG
TAAATATCGAAGTCTTTCATCGTGATGTAAAAGCTTCTCGCCTAGTTGTTCCTTTTGTTTATCCTAATGA
GACTATCGATGATCAAGAAAATCCCCTTCTGGGTTTTCTACAAAAACTTCAAGAATATGTTCCTCATAAA
GGCCAACCCTTTAATGTAGCTCTCTACAATACAAAAGCAAAATCTTTAAAAGAAGCTCGTGCTTTAGTAG
AAACTCTATCGGGAAATTCTATACATATTTACGAAAAGCCAGGAAATCTCTCTACAAGCTTTGCTCTAGT
TGAAGAAAGATTTGCAGCAATTTCCCTTGCAGAATTCTCTGCTACAAAAGTGTTGAGGAGACAAAAACAG
AGAAATTATTTTTCTGTAACTACCGAAGAAGTTTTTGTTCCTATTCCTGGCGAGACCGTTGTGCATCTTC
ACAATGGTATCGGCAAATTTATCGGAATAGAAAAGAAGCCAAATCACTTAAATATTGAAACAGACTATCT
CGTTCTTGAATATGCTGATAAAGCTAGGCTGTACGTCCCTTCTGACCAAGCTTATTTAATTTCACGCTAT
GTAGGGGCCTCTGATAAAGCTCCTGATCTTCATAATCTTAATGGCTCTAAATGGAGAAGATCTCGAGATC
TCTCTGAAAAATCCCTTGTGCTCTATGCTGAAAAGCTTCTTCAACTAGAAGCACAGCGGTCTACTATCCC
TTCATTTATTTATCCTCCCCACGGTGAGGAGGTGATTAAATTCGCGGAAAACTTTCCCTATGAGGAAACT
CCTGATCAATTAAAAGCTATCGAGCAAATTTATTCTGATATGATGTCCGATAAGCTAATGGATCGATTAA
TTTGTGGTGATGCGGGATTTGGAAAGACGGAAGTCATCATGCGCGCTGCTGTAAAAGCTGTCTGTGATGG
CCATCGACAAGTTATTGTCATGGTACCTACAACAATTTTAGCGAATCAGCATTATGAAACTTTCTCACAA
CGCATGGCAGGATTACCAATAAATATTGCTGTTCTTTCACGATTTTCAGAAAGAAAATCTATGAAAAAGA
TCTTCGAGGACACTGCTAAAGGCGATATTGACATCCTAATTGGAACACACAAGCTGATAAACAAAAACCT
TGAATTTAAAAATCCTGGGTTATTGATTATTGATGAAGAACAGCGTTTCGGCGTTAAAGTTAAAGACTTC
CTTAAGGAACGTTATCCTAAAGTAGACTGCCTGACAGTATCCGCCACACCGATTCCTAGAACATTGTATA
TGTCTTTATCGGGTGCTCGTGATCTCTCTTTAATTACTATGCCTCCATTAGACAGGCTCCCCGTCTCTAC
TTTTGTTTTAGAACATAATGAAGAGACTTTATCCGCAGCCTTACGTCATGAATTACTTCGTGGTGGTCAA
GCTTATGTTATTCATAACCGTATTGAAAGTATTTTTAGATTAGGAAATACCATACGAACATTGATCCCCG
AAGCACGTATTGCTGTTGCTCACGGACAAATGTCCCCAGATGAACTAGCTTCTATATTCCAAAAATTTAA
AGACCAAGAAATCAACATTCTTGTAGCAACAGCATTGATAGAAAACGGTATCGATATTCCTAATGCCAAT
ACCATTTTAGTAGATCAAGCCGATAAGTTTGGTATGGCAGATCTTTACCAAATGAAAGGTCGGGTAGGAA
GATGGAATAGAAAAGCTTACTGCTATTTCCTAGTGTCTCATTTAGATAGATTATCAGGTCCCGCTGCAAA
ACGTTTAGAAGCTTTGAATAAACAAGAATATGGCGGGGGGATGAAAATCGCCCTCCATGACTTAGAAATT
CGTGGAGCTGGGAATATCTTAGGAACCGATCAATCAGGGCACATAAGTGCCATAGGGTTCAATCTCTACT
GCAAGCTATTGAAAAAGACTGTGGCAGCATTGAAAAACAATACTACTCCTTTGCTGTTTAACGATGACGT
CAAGATAGAGTTCCCTTACAAATCACGTATTCCCGATACCTATATCGATCTGGCATCTATACGTATAGAA
TTCTATCAGAAAATAGGCGGTGCTGAAGATGCTGAACAACTCGAGCTCATAAAAGAAGAGATGCGTGATC
GCTTTGGTCCTCTTCCAGAAGAGGTACTATGGTTATTTGCTTTGGCTCAAGTACGCCTATTCGCTCTACA
CCACAACATTTCTAGTATTAAAGGTACGGGAAATGCATTGTATATTCAACAATGTCATGGAAAAACAGAG
CAAATAAAGAAAACATTACCCTATTCTTTATCTCCAACTCCAGAATTGTTAATATCTGAAGTTTTAGCAT
CTATAGAGAAAGCTTTTCCTCTAAAAACCCCTCGTTAA
>ref|NC_003361.3|:1005958-1006959 uroporphyrinogen decarboxylase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCGGGATTTTACGACGTTATAAAGCCGAAAACCGCACGTCCACCTGTATGGTTTTTACGCCAAGTAG
GCAGATACATGCCTCAATATAAAGAGCTCAAAGGCTCCCAAACATTGAAAGCTTTTTTCCACAATACAGA
AGCCATTACCGAAGCGACTCTTTTAGGACCAAGCTTATTAAAAGTCGATGCTGCGATCCTCTTTGCCGAT
ATTCTTTCTCTATTAGACGGTTTCAATATCTCTTATGATTTCTCTCCAGGACCACAAATTTCTTTTTCTC
CTTATGAAGAATTAATTTTCACAAAAGATCCTCAAGAAACCTTTTCTTATCTTCTCCAAGCAATTAAAAA
TCTTGTGAAAGCTTTGGATGTTCCTTTAATTGCCTTTGCAGCGTCTCCTTTCACGATGGCTAGCTACCTT
TTAGATGGCGGGGCTTCTAAAGATTTCCCAAAAACAATGGCGTTTCTTTATCAATATCCTGACAAATTCG
ACGCCCTGCTTAAGAAATTAACAGAGGGGACTGTCATTTATCTTAAAGAACAAATCCATGCAGGAGCAGC
AGCTATTCAGTTATTTGAATCTTCAAGTTTACGCTTACCCTCAGAGCTATTTTCCCGCTATGTGACAGCA
CCAAATACACAACTCATTTCTCAATTAAAACAATGCATTGCTTCCCCTATAAGTTTATTTTGCCGCTGTT
TCGATGAAAACTTTTTAGATCTCTATTCTATAGGTGCGGACACACTACATCCTGACTATCACGTAAATCT
TAATAAGATCTACAAAACAGTCCCACAGCCGGGATCCTTACAAGGAAATATCGATCCTACACTATTTCTA
CTTCCCCAAGATCAGCTTCTCGCTCATCTTGAGAAGTACCTGACCACTTTGAAAGATCAACCCAACTATA
TTTTCAATTCAGGGCACGGGATTCTTCCTGAAACTCCTTTAGAAAACGTCCAAGCTGCGGTATTATGTTT
AACGTCAATTTCAACTTCTTAG
>ref|NC_003361.3|:1006932-1008308 coproporphyrinogen III oxidase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTAACGTCAATTTCAACTTCTTAGAAGGTCTTCACCAACCTGCACCGAGATATACAAGCTACCCAA
CAGCTCTAGAATGGGAATCATCTGATGCGCATCCTGCTTACCTAGCTTTTGAACGGCTTCGAGAAGATGA
CCGTCCCCTATCGCTATATTTCCATATCCCTTTCTGCCAGTCTATGTGTCTGTATTGCGGATGTTCTGTA
GTTATCAACCGTCGCGAAGATATCGTAGAAGAGTACATCGCTACTCTTATTAAAGAAATGGAGCTTGTGC
ATACCCTTTTAGGAGGGAAACGGAAAACTTCACGCATTCATTTTGGAGGAGGAACTCCAAGCCGATTATC
TCGAGCGCTATTTGAAAAGTTATTCTTCCATATCCATCGTTTATTTGATCTTTCTGAAGTTGAAGAGATT
GCTATTGAATTTGATCCGCGTTCTTTAAGGAACGATAGTGAAAAAGCGGAATTTATCCAGTCCTTAGGAT
TTAATCGTGTGAGCTTAGGGGTTCAAGATACGCAAGCTGCTGTTCAAGAAGCTGTACGGCGACGACAAAG
TCATGAAGAATCTCTGCATGCTTATGAGAAGTTTCGTGCTCTAGGTTTTGAGAGTATAAACATTGATTTG
ATTTATGGTCTCCCCAAGCAAACAAAAGCAACATTTACCCAAACAATCGCTGATATTTTACAGATGCGTC
CTGACCGCCTAGCGTTGTTTTCATTTGCTTCTGTGCCTTGGATAAAGCCTCATCAAAAAGCTATGAAAGA
AAGTGACATGCCCTCCATGGAGGAGAAATTCGCTATATACTCTTATGCACGGCATAAATTAACAAAGTCG
GGATATCAGGCAATTGGTTTAGATCATTTTTCACTACCGGAAGATCCTTTAAGCATAGCCTTTAAAAATA
AAACTCTGATTCGTAATTTCCAAGGTTACTCTCTCCCCCCTGAAGAAGATCTTATAGGGTTAGGAATGAC
ATCAACGAGTTTTATCCGTGGTGTATATTTACAAAATGCAAAAACTTTAGAATCCTACCATAACCACATC
CTTGCAGGATCCCCAGCAACGATTAAAAGTAAGATCCTCTCAGAAGATGATAGAATACGAAAATGGGTAA
TCCATAAGCTTATGTGTACATTTGTCGTATCTAAAGAAGAATTCTCAGATCTTTTTGGCTACCGTTTTGA
TGAGTATTTTTGCGAAAGTCAAGAACGGATTGATAGCATGGCAACAACAGGGCTGATTCAAAATAGCTCT
TCTTTTCTTACTGTAACCCCATTAGGAGAGCTGTTTGTCCGTGTAATCGCTACAGCTTTTGATGCTTATT
TCTTAAAAACGGTTTCTTCAAGCCCTAGGTTTTCAAGATCTATATGA
>ref|NC_003361.3|:1008305-1009573 protoporphyrinogen oxidase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAAAAATCATTGTGATAGGAGCAGGGATTTCAGGATTAGCAACAGCGTGGTGGTTGCATAGGAAAT
TTCCCCATAGCGAACTTACAATTATAGATAAGGCGGAGCGTCCTGGAGGTCTTATCTATACAGATCATCA
AAAAGATTTTTCCTTAGATCTCGGGCCTAAAGGTTTTTTAGTACGTGGTGAGGGAGAATATACTCTTGGA
TTAATTCACGATTTAGAGCTGCAAGATTTCCTCATTGCTAGTGACAAAACAGCGAAAAAACGTTTTATCC
ACTACAAAGGGAAAACCCGTAAAGTCTCCCCATGGACATTGATAAAAGAGGGTTTGCCCTTTGCTATGAT
CAAAGACTTCTTTGCCCCTCGATACACAAAAGATAGTTCTGTTTATGATTTTCTATGTCGTCATAGCACA
ACAAATCTTATTCATAATGTGTTAAATCCTGTTGTTACAGCAATTCGTGCAGGACATAGTAATGTACTTT
CTGCCCATATGGCTTTTCCTACTCTTTCTCAGCGCGAAGCAAAAACAGGATCTATATTACGTAGTTATCT
AAAAGAACCTTCGAAGAAAAAAAATAAGGGAGCTCCTTATCTTGCCTCGCTACGCCCGAGTCTAGGAATT
CTCATTGATACTTTAGTAAGGAAAATCCCTGCTAATTGGAGGTTTTCTTCACCTATCAGTAAGATCGACT
GTTTCCCTTCTGAAGTTGTAGTATCAACAGCAAATGAAATATTCTCAGCAGATTTAGCAATTTATACAGC
TCCGACACCATTACTCCCCTCTCTTATTGATATTCCTGGTATGAAACAGCTCGCTAAGAAAACACCTCAT
TGGGATCTTTCCTGTATAACCCTAGGATGGGATAAGAATCCCCCTGCGATTCCGAAAGGCTATGGGATGC
TCTTTGCTGATGAGCCTCCTTTACTTGGCATTGTCTATAATAGTGAAGTCTTTCCCCAGCAAATGCCAGG
GAAAACTGTGATTTCATTATTATTAGAAAATCGCTGGCATAACGAAGAAGCTTATGCTTTTTCTTTAGCA
GCAATTTCTGAATATTTAGGAATTACTACAAAGCCTGATGTCTTCTCATTATTCTCTCCAGAAGAAGGAC
TCCCCCAGCATAGCGTAGGATTTTTAGCAATGAAAAATCAGTTGCTTCCCTCTATTCCTCATAATTTAAA
AATCGTAGGGCAGAATTTTTCAGGACCAGGATTAAACAGATGTGTCGCTTCAGCCTATCGTACCGTCGCT
GCTATCTAA
>ref|NC_003361.3|:c1012045-1009544 hypothetical protein CCA00881 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAGTATGTCGATACGCATGTAAATGCGTTTTCCAATTTTATTTAATTATGAGCGTGGGAGTTGTCT
GTGCGGCTCAAACGCACCAGGTATCTTTCGGTCATTATTGTGCAGATGTGCATACGGTATTGAAGTCAGG
GACTAGTTGTGATGAAGCTTTTTCAGAATTTGTAGAGCGGATAATTTCTGAAAAAACAAGTTTATCCCCT
AGAGATTGGGAAACGGTAGCGTCGTTAACCCGTCAGTACGTACAGGTAAAGATAAAACAAAATGATAGGT
CTATAAGTAAAGATATAGTCAGAAAGTTATTATCTGTAGTTACGATTCCTCCTCATATTAGATCTGAAAT
ACGTCTTGCTTGGCAGAGATTAAATCCCGATAGTGTTTCTCTCAGGGATTTGATAACGCAATTTCATAAT
ATTGGTAATGGTAGAGAAACTTTAGAAGATAATCTTCTTCTTCAGCTCTACAGCATGACCTTACATAGTA
GTTATGAGGATCGCAAACAAGAGATTCTCATAATGAAAGAACGAGGAGACTACGACGAAGCTTTAAGGTT
ATGTGAGAGACTTTCTCATAGTGTTGAAGAAGGTGTGTGCAGTCCACATCCTGATGTTCTTGATATAGAG
AAAATTTTTTTAAGAAAAATAGTCTTGGGGTTGAAAATTGAGAAGTCTCGAGAGACAAAAGCATCTTGTG
AATCTTTACTATTACCTTACTGTCAGGCTGAAAAAGCCTATGCACAATCTATTGATAACTTAGTATTGAG
GATCGCACGGGGAGAAATACAACGTGCTCACGAAGTAGATGTATTGCTTCTTGCTCATGCTTTATATACG
CTTCCATGGAATCAAGAAAAGGGAATTCGGGAGTTAGAAGTTCTAATAGATCATGGAAACTATTTACAAT
CGACACTGCTTTATTACGGCTACTTTTCCTTATTAGAGATCTACCATCAGAGCAGAAATTTCCCTGCTAT
GCAAAGGCTATTAGTTTCTGGAGAATCTGTATTTGTTTCAGAACATCCCTATTTCCCAGAATATAGTTTT
TTCCTAGGTTGTTATAGCTATGAGAAACAAGATTTCATAAAATCTCGAGAAATTTTCTTATCTACCTTAG
ATCATGCTTCTAGATTAGGAGTGACTTTAGCTCGAGTATATGAATATTTAGGATGTATTTTTTGCCGGGA
ACACCAGTATAGTGACGCTGAGGATTTTTTCCTTAGGGCATATAAGAGTTGGAGTCGTGAAGAGGCAGGT
TTAGGGTTATTTCTTACCTACGCTCTTCAAAAAAAGATCGATGCTTGTGAAGAGTTCATTTCTAAATCTC
ATTTTTCATTTCTATATCGTAAGATTTTAAAATCTATAGATGCGTTGTTTGTAAAGAAAGATCATGGATC
TTTTTCTCATGTTATCAAGGTGTGTGAGTCGCTAAATAGCAATAAGGCATCTCTTGAGGATCTCTATCAT
TATTTTATTTATGACATGATAAAGCATTGTAGGGTTCATAACGATAGCCCGATACTCTCACTCATTGATT
TGCAAATAGATCTAGAGGAACAAAACTATTTAGAAAAAGCTAAAGATAGAGCAGTAGATCCTGAATACAA
GAAAGCTTTAACTTTATGGTTGGCATTCCGTCGTCAGGAACTGTCTAAAGAAGTCCCTTCTACTATGCAG
ATTGGCTCAGTTACATCGTTAGAAGATCTTGCGAAATGTTGTTTTGCTTCTCTATATTATAAAAATGCAC
AATCTAGTGCGTCGCTAACAAAAGTCTTTTCTCAAGAGCGCTCTTCGCTACAGTCTACTGTTAGATTGGT
TTGGGCATTAACACGAAAGTCTAGTGGGGAGAATTTGGATCTTTATTGTGATAATTTGGATCTGCGTTTG
TACGGAGATCGTTTATATCTCCTTGCTTACGATATAGGAGATTACCTTTCTGGGAAAGATGCCGCTCTTC
TTCACCTATCATGTTTTTCAGAACTTTTCCCGCATTCTTCGTTATTGTCTTTGGCATATTATCTTCAAGG
GCATGCAGAATCTTCAATGATCAGGAAGATTAGCTGGTATATAAAAGCTTTAGATGAATTTTCAGAAATC
ACTTTGTCAGGAGACAATGCTAAAGCTTGGACATATGTATACTATACTTTGAAGTTAGATCTTGCTGATG
CTTATCTTGCATTTGGAAATACTGCACGGGCTATTGAGGTTTTTGAAGAGATAAAAGGAGATTGGCAAAC
ACCTAATCATCCGCAGGTGATCTTGATTGAAGAGATTGCCCATCGTGTAGCTATGGAAATGCGTTGGGTA
TCAGGACTCGCTTGCGCTTATGAGAGACTGAATGAAAAAGAAAAGCTAGCTCAGCATCTTCTCGATCATA
TTGAAAAAAGATTACTTGAAATGTCTTCACGAAGGGAATATTTCGGAGAGATGCTCACCATAACGTTAGC
TCTTTGTGAGCGTTTCCTCCCTTTAGATAGCAGCGACGGTACGATAGGCTGA
>ref|NC_003361.3|:1012462-1012839 histone H1-like protein HC1 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CCGAAAGAGGAAATAAAGCAGCAGCTCAGCGAGTACGCACTGACTCCATCAAATTAGAGAAAATTGCTAA
GCTGTATAGAAAAGAATCAATCAAAGCTGAAAAGTCTGGCTTAATGAAGCGCAAGCCTGCAACAAAAGCT
AAAAAAGCTGCTGTTGCTAAAAAACCTGCAAAAGCTGCGCCTAAGCCTAAGGCTAAAGTTAAAGCTAAAC
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AAATTCTTCTCGCTCCCTAAGAAAATAA
>ref|NC_003361.3|:1013066-1014271 RNA methyltransferase [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTGATTCTTTAAAAGCTAAAGAACAGATCCTGCACGAACTCTTTGCACCTATATTTCCTCCTTCAGAGAT
TCTTCCTGTGATTCCTTGTGATCCCGTACTACGAGGAAGAAACAAGATGGAGTTCTCCTTCTTTCAGACA
AAAGAAGGGAAGAAGAGTCTAGGGTTTATTACGCCCACAAAACCTAAACAAGGTGTTCCTATTACAGAAT
GTCTCATGATTCATGAAGATACTATGGATATTCTAAACCTTACACGTGCTTGGTGGGATAATCACCCTGA
ACTTACAGCTTATTATCCTCCTTTTAATAAGGGGTCTCTTTGTACTCTTACTGTACGTATTGGAAGTCCT
GAACGAAAACTCATGGTCATTCTGACAACATCTGCAAGAGAAGAGTATGCTGTTGAAAAAGGGATTATTG
AAGAATGGAAAAACGCTCTTATTAATTCTTCTCTCCCCATTGTTTCTATCATCTGGGAAGAAAAAGTTAG
TGCAAAAAACGCTCCAACGTATTTCCGTTCTCACTTAATCCATGGGGAACCATTTATTAAACAAACATTA
ACACTGCCTAAGGATGGAAATTCTGGGGTGTTTCATGTACGGCCTAGAAGCTTCTTTCAACCCCAAAGTC
TTCAAGGAGCAAAAATTATAGAAATTGCTAAAGAGTTTATGAATCCTCAAGGATCCGAAACTCTATTGGA
TCTCTATTGTGGTGCGGGAACTATCGGGATCATGCTCTCCGCCTATGTAAAAAAGGTTATAGGAGTAGAA
ATTGTCCCTGATGCTATAGATTCTGCAAAAGAAAATATCTTAATAAATAAAAAAGAAAATCTCATTGAAG
TGTATCTAGAAGATGCGAAAACATTTTGTAGAAGACATCAAGACTGCCCTCCGCCAGATGTCGTTGTTAT
TGACCCACCACGTTGTGGAATACAAAATAAAGTTCTGAAATACCTTCTGAGAATTTTTCCAAAAAAAATT
ATTTACATCTCCTGTAATCCTAAAATACAGTTTGAAGAGTGTTGTAGTTTAATTTCTGCAGGTTATCACA
TCAAAAAAGTACAACCTTTGGATCAATTCCCTCATTCTCCACACTTAGAAAATATTATTTTGTTAGAAAG
AGAAGATAGCCTCTAG
>ref|NC_003361.3|:1014342-1014695 preprotein translocase subunit YajC [Chlamydophila caviae GPIC]
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GCACTCAAGTAAAAAGTACTTTTGCTCAACCCGCTGTCATGCTAGGCATTGCCATTTTGTTCTTTTACTT
CATTTTATGGCGTCCTGAACAAAAACGCAGAAAAGCTATGGAAAAACGCAAAAACGAACTTGCGAAGGGC
GATAAAGTTACCGCTATGGGGATCTTAGGAACTATTGATGAGATCCGCGAACATACTGTAATTCTTAATA
TTACCTCTGGGAAAATCGAAATGCTAAAAGCAGCAATTTCTGAAATTTTGAAACCCGACGGAACTAAAGC
ATAA
>ref|NC_003361.3|:1014815-1016110 Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACTTGGCTTTCAGGCCTATATTTTATCAGCATTGCTAGTTTAGTATTTTGTGTTATAGGTTTGATAC
TTTCTGGGATCATTCTTATTTCCCGCAAATTTCTAGTTAAAACCCACGCTTGCAAGCTTAAGATTAACGA
CGACGACTCTCTCACAAAAACAGTGGATAGTGGTCGCACTCTGTTGTCTTCTCTTTTAGATTCGGGGATT
CCCATACCTTCTCCGTGTGGAGGTAAGGCTACTTGCAAACAGTGTAAAGTAAAAATTGTAAAAAATGCTG
ACCAGCCTTTGGAAACAGATCGTGCTACTTTTTCAAAGCAGCAGCTAGAGCAAGGCTGGCGTCTTTCCTG
CCAAACGAAAGTGCAACATGACATGTGTTTGGAAATAGAAGAACGTTATTTAAATGCTTCTTCTTGGGAA
GGTACAGTGGTTTCTAATGATAACGTCGCTACATTCATAAAAGAGCTTGTTGTATCGGTTAGTCCTGAAC
ATCCTATCCCCTATAAGCCTGGGGGATATTTACAAATCCGCGTTCCTCCATATAAAACGAATACTTCCGA
TTGGAAGCAAACCATGGCTCCTGAATACTATAGTGATTGGGAACATTTTAATTTATTTGATCGGACTATC
GACAATAGCCTCCTAGAGTTGGATTCTGCAAACAAAGCATATTCTCTAGCTTCATACCCAGCAGAACTTC
CGGTTATTAAATTTAACATCCGTATTGCAACACCACCTTTTATTAACAACGCTCCCAATCCAGAGATTCC
TTGGGGAATATGCTCATCGTATATTTTTTCATTGAAACCTGGAGATAAGATTACTGTCTCTGGTCCTTAC
GGAGAATCTTTCATGAAGGAAAATAACCGTCCGCTGATTTTTTTAATCGGTGGTGCGGGTTCTTCATTTG
GAAGAAGTCATATTTTGGATCTCCTATTAAACAAGCACTCCACAAGAGATATCACCTTATGGTACGGAGC
ACGTTCTCTAAAAGAGAACATCTACCAAGAAGAGTATGAAAAGTTAGAAAAGGACTTCTCTAATTTCCAT
TACCATTTAGTATTGTCAGAACCTCTTCCTGAAGATATCGACTCAGGTTGGGATAAGAATGACCCTGAGA
AAACGAATTTTCTATTTCGGGCTTTTGAGCTTGGTCAGCTCAGTAAACTAAGCAATCCTGAAGACTATTT
ATATTATGTATGCGGTCCACCTCTACACAACAGTAGCATCTTAAAATTACTCGACAATTATGGTGTAGAG
CGATCTTCTATAATTCTCGATGATTTCGGAAGCTAG
>ref|NC_003361.3|:1026516-1028933 cell division protein FtsK, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTAAGAGAGCGACAAAAATCTAAGTCTGCACTATTCCCTTCGGTACCCTTTGCGGTTAGAGCAAGCA
TTTATTTATTTTTGGCTTGTTTTTCAGGCCTGAGTCTATGGAGCTTTCATAATACGCAACCATGCACTCA
AAATTGGATAGGATTATTGGGATGGTCTTTGAGTTCCTTTCTTGTCTATTGCTTTGGAGCTGCGTCTTTT
CTTATCCCTCCGTATTTTTTATGGTTATCCTTTCTAAATATAAGAAAAACACCCCCAAAGATCTTACATC
GTAAGGCTCTTGCATTTGCATCTATTCCTATCTGCTGCGCGGTATTGTTATCCATGCTTTCCCCTGTGCA
AGCATTACCTCACGCTTTAGATGTACGTCTTCCTAAATTTATTTTAGATGTTAATCCTCCTGTTTCTTAT
TTAGGGGGTATTCCTTTTTATATTCTTTATGCTGGGCAATCTTTCTGTTTGAAACATTTGGTTGGCTCGG
TAGGTACAGGTCTTATCTTTTCTTTCATCCTGTGCTTTTCTATTTTTTATCTCTGTGGAGGCGTAGTCTT
AATTAAAAAAAAAATCCTGCAAAAATTCCTCAAAAACAGATTTCAAGCCTGTTGGCGTATTTGCAAAAGT
ATTTTAAAAAGACTAACTAATAAGCAGAACTATCTCCCTAAACCTTCGATTAAGGTTCCTTCTGCTCCCA
TAGCAAGGAATGATCCTAGGAAACTCCCCACCCCGATTGTTTCCCTTCCGATAGAAAAGGGAGATTTATT
CGATGATCCTCGTCATCATTCCCAAGATGCTTCAGAAAAAGCGACTCTTTTTTTAGCTCCTCATCCTCAA
AAACGTATTCTATCTTCATTCGCTAAGCCACAGAATACAGCTGAAAAAAAGTCTAAAATTACCGTATTGC
CTCAACCCTCACTTCCACCAAGGAAGAGAGTTGAGACATCGCCTCCTATGGATCTATCAACCTTCCCAGG
GGGGAATTCTGAGCTACCTCAGTATCATCTGTTAAGTAAAAGTGATAATTCAAAACCAGAGTCTCTTCGT
GAAGAGCTTCAGAAAAAGGGTATCCTTTTACAGCAAACTTTAGAAAGTTTTGGAATAGATGCTGATATTG
GAAATATTTGTTTTGGACCTACGTTAGCAGCATTTGAAGTACAACCACATACAGGTGTAAAAGTTCAAAA
AATTAAAGCTTTAGAAAATGACATAGCTTTAAATTTACAAGCTTCCAGCATCCGTATTATTGCCCCTATT
CCAGGGAAAGCTGCTGTGGGTATTGAAATTCCCAATCCCTATCCCCAACCAGTAAATTTCCGTGATTTAT
TAGAAGATTATCAAAAACAAAACCATAAACTGCAGGTTCCTCTTTTACTTGGGAAAAAGGCTAATGGTGA
TAATTTCTGGGCAGACTTAGCAACAATGCCCCATTTAATCATTGCAGGAACGACAGGGTCGGGGAAATCG
GTGTGCATCAATACGATTGTCATGTCGTTGATCATGACAACACTCCCCTCTGATATTAAACTTGTCATTG
TCGATCCGAAGAAAGTGGAGCTTACTGGCTACTCTCAACTTCCGCATATGTTAACTCCGGTAATTACAGA
ATCTCGTGATGCTCATAGCGCCTTAGTCTGGCTCGTTAAAGAAATGGAACTTCGTTATGAAATTCTAAGA
TTTCTAGGTCTGCGAAATATTCAGGCATTCAATTCTCGTGAACGCAATATTGAAATAGAAGCTTCTTTTG
ACAAAGAGATCCCTGAAAAAATGCCTTTCCTTGTGGGTATTATTGATGAACTAGCTGATCTCTTACTTTC
TTCTTCTCAGGATATAGAAACGCCTATCATTCGCTTAGCGCAAATGGCAAGAGCTGTTGGTATTCATTTA
ATCCTAGCGACACAAAGGCCTTCTCGCGATGTGATTACTGGCTTAATTAAAGCAAACTTTCCTTCTCGCA
TTGCGTTCAAAGTGGCCAATAAAGTGAATAGCCAAATCATTATAGATGAGCCTGGGGCTGAAAATCTCAT
GGGGAATGGAGACATGTTAGTCGTTTCCCCTTCTTCTTTTGGTGCGGTTCGTGCTCAAGGAGCTTATATT
TGTGATGAGGACATCAACAAGGTCATAAAAGATCTATGCTCTCGTTTCCCTACAAAATATGTTATTCCTT
CATTTGACACTTATGAAGATTTTTCAGGAGATGATTCTGCGGATAGAGATCCCTTGTATAACCAAGCGAA
AACTCTTGTTTTACAAACGGGAAATGCTTCTACAACTTTCTTACAAAGAAAACTTAAGATTGGCTATGCT
AGGGCTGCTAGTTTGATAGATCAACTTGAAGAAGCGAGAATCATCGGCCCATCAGAAGGTGCAAAACCTC
GTCAAATCTTAATACAAATGCCCCCACAAGAAGGATGA
>ref|NC_003361.3|:1028938-1029726 metal dependent hydrolase, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGAAGGTTTTTTCCCTTTAGCCTCGGGTTCGAAGGGGAACTGTACCTATTTAGGAACGGACTCCTGTA
AAATTTTGATAGATTTGGGTATTAGCAAGCAGTGTGTGACTCATGGGCTATTGTCTATGAATGTCCATCC
TGAAGATATTCAGGGCATTTTTATTTCTCATGAGCATTCCGATCATATTTCCGGAATTAAAAGTTTTGTA
AAAACGTACAACACGCCAATTATCTGTAACCTTGAGACTGCGCGTAGTATATGCCAATTCTTGGATGTTC
GTCCTAATTTTAAAATTTTTTCTACAGGAACAACATTTTCCTTTTACGATTTAAAAATTCAAACTTTCAA
TGTTCCTCATGATGCTATAGATCCTGTAGGGTTTGTTTTTCATTACCGCGATGAAAAGTTAGGCTTTTGT
ACTGACTTAGGTTGGGTAACCTCGTGGGTAGTTCACGAACTTTATGATTGTGACTATTTGCTTATAGAGG
CAAACCATGATCCTGAACTTGTGCAGCAATCCTCACGTCCGGATATTTATAAAAAACGAGTTCTGAGTAA
ACTGGGGCATATATCCAATCATGAGTGTGGAGAATTATTACAGAAAATTCTTACTCCTAAGATTAAGAAA
ATCTATCTTGCGCATCTTTCCAGCGAGTGCAACACTCCTGAATTAGCTCTATCGACAGTATCTTCTGCTA
TAGAAAACATCACGTCAATTTTACCTGTGGCTGCTAAAAACCAAGAAATTTCTGACCCTATTTACTTCAG
GGATTTAGTAAACGCATGA
>ref|NC_003361.3|:1029723-1030385 SET domain-containing protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATTTAGAATCCTCTGCATCTGAGACGCTATATATATCTCTAGATCACAACTGGAAGGAGAGCACCC
CTTACAGTATGGAGAGAGCCTCGCAATTACTCAATTTCAAGTTCCTTCCTCATCTTACTTTTACAGATTG
GAAAGTCGAAGAAAAAGTCCGTGCATTGTGTGCTAAGGCTAAGAAAAAACGTCTTGTTTCTCCACTAGCC
AAATGGCTTGGAGAACTTCATAAACAAGATCTAATCACTCCTTCTATGCCTCCTGTGGCAGTATGTTGGG
TGAGTTCGTATATTGGTTATGGGGTTTTTGCTCGAGAGCGGATTCCTGCTTGGACCTATATTGGTGAATA
CACGGGAATACTGCGTCGCCGGCAAGCGATTTGGATGGATGAAAATGATTATTGTTTCCGTTATCCCTTA
TCTTCATGGCTATGGCGTTATTTCACTATCGATAGTGGTCGGCAGGGCAATTTTACCCGCTTTATTAATC
ATAGCGACAAACCTAATGTGGAAGCCATAGGCGTTTTCCAAAACGGATTGTTTCATGTGATTATTAGAAC
AATTCAAGCAATTGAAGCGGGCGAGGAATTATCCTATCATTATGGCCCGCTATACTGGAAGCATAGGAAA
AAACGAGAAGAGTTTATTCCTGAAGAAGAGTAG
>ref|NC_003361.3|:c1030842-1030390 hypothetical protein CCA00890 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCAGCTACTATCACCAGCATTTGATTATGGAAAACCGATTCCGAGAAAGTACACATGTCAAGGCGTGA
ATATTTCTCCACCCTTAATATTCAAAGATATTCCCGCAGAGGCAAAGAGCATAGCATTGATCGTTGAAGA
TCCTGATGTGCCCCAAAATTTACGAGCTGATGGTCTATGGATTCACTGGTTGGTATATAACTTGTCTCCA
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GTTATGAAGGGCCATGTCCACCTGATAGACAGCATCGATACTTCTTCTACTGCTACGCTTTAGATACCAT
CTTGCCATCAGAAGAAAATGTCACCAAGGATCAGCTTCTTGAAGTGATGGAAAGTCATGTTATCGATAAT
GCTGAATTAATGGGAACCTACGAGAAAAGCTAA
>ref|NC_003361.3|:c1032229-1030856 sodium/alanine symporter family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTACATTTTCTAGAACAATTAAATAACTTCTGTATTTCGTTTTGTGTGTTCCCCGCGATTTTATTTC
TTGGTGGACTATTAACATGGAAACTACGTGGTCTGCAATTTACAGGATTAAAGCTAGGCTTTAATTTTAT
GTTAAAAAATAAGGAGAGCCCGTCTTCTGCAGATGGTAAGGTCTCTCGTTACGAAGCCGTAGCAGGTATT
CTTGCTGGGAATTTTGGAACGGGAAATATCGCAGGTATGGCTATTGCTATTGCTTGCGGAGGCCCAGGAG
CTCTAGTCTGGATTTGGATAGCTGCCCTTTTAGGAGCTATTGTTCAATATTCGGGATCATTTTTAGGGGT
AAAATATCGTAAACTTCATGGAAAATCCGGAGAGTTTATCGGTGGACCAACAGCGTGCCTAGCCTACGGT
ATGGGAAGCAAGTTCCTTGCAGGTCTTTTCTGTATATTCACAATTATCACAGCATTTTCAGCAGGAAACT
TTGTACAAATTAATTGTATCGTTCCTCTTTGTGCTGAAAGTTTGCCCATAAAATTCTTAATAGGCTTGGT
TCTTGCATTAACAATTCTTCCCGTGCTCATTGGGGGAAATACGCGTATTCTTAGATTCTCGGCTAGGGTG
ATTCCTTTCATTGCCGGTTTCTATGCTATTTCTTGTCTTGTTATTCTTGTACAACATAGCTCTATGCTTC
TTCCTGCGTTGAAACTCATTGCTTCTTCTGCATTTGGAATAAAAGCAACGGTAGCAGGTCTTGGAGGCTA
TACAATAACTCAAGTGATCTCAACAGGAATGAGCCGTGCTATTATGGCAACTGACTGTGGTAGCGGTATG
GTGTCTATTCTACAATCTGATTCTCAAAGTAAGAACCCTGTGATTGATGGTTTGGTCACTCTCTTGCCTC
CTGTTATCGTCATGATAGTCTGTTCGATTACGACTCTAGTCCTTATTGTTTCCGGAGCCTATGTATCAGG
ACAAGAAGGAACGCTTATGGTGCTACACGCTTTTAAATCAAGTCTAGGATCTCTCGGAGGGCTTGTTGTT
ATTCTTGCAATGGCCTTATTCGGTTATACAACAGCTTTGACTTGGTTTGCTTGCGCAGAAAAAAGTTTAG
AATATATGATACCGGGGAAACGAGCTAACTCTTGGTTGAAGATGCTCTTCGTCGCAGTTATACCTTTCGG
AGGGATCATAGATATGCGATTGATCTGGAGTCTGTCTGATACAGGGTTTGCAGGTATGGTAATTCTAAAT
TCTATAGCTTTAGTAGCTTTATTTAAGGATGTGCTATCTACAAATCGGGAAGTTGCCCTACTTAAAATGG
AAGCAGGTGCTAAATCCAATGTTTTGCCAAATCTAGATATCTAA
>ref|NC_003361.3|:c1032986-1032342 hypothetical protein CCA00892 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGAACCCTTATGGATCCAAGCAGAGCTCAAAAAACTCGAAAGACATAAATAACAAATCTGTTATACTCAC
AGAAAGTGAAAAGAAACCTTCACGTCGTTCAAGAAGATTATTTGCTCGACGTAGTTCATCTAAGAAGGAA
ACACAGAAAGTGCAAGCTAACTTTAAGAATTATGAAGCTCAGATAACGGATCAAGACAAAAGAGACATCT
CTTTCGTCGTTGACGCTGCTTCTGAAAAATCTTCTATTTCTTTAGCTATGTCTCAGAGTGAGATTAAGAG
CGCTTTAAATCGTATTAGAGAACTTCACCCTTTAGCTTTATTAAAGCTTTTAGCTGAAGATTCCTCATTG
ATTGAAGGTATGAAGAAAATGCAAGGCCGTGATTGGATTTGGAATATGTTCATGTCCGAATTAAGCGAAG
TATTTTCTCAAGCTGCATCTCAGGGTGTTATCACTGAAGAAGATATTGCTGCTTTTGCCTCCACCTTAGG
ATTGGATTCCGAGACCGTTGCCTCAATTGTGCAAGGGGAAAGGTGGCCTGAGCTTTTAGATATTGTGATA
TCTCAACCTTCTTAA
>ref|NC_003361.3|:1033243-1034610 hypothetical protein CCA00893 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTTATGGGGCTCCGACTGCGTCGGCAATGCCCTCCATGAACACGCCCTCTAGCAAAGGAAAGATCGGTTC
TGATGCTTGGATTGAACAGAAGTTACGTCAGTATCCAGAGCTACTTTGGTTAACGGAGCCTTCGGCTGCT
GCAAGCCTTACCACAACATCCAAGGCAACGTATTCTTTATCCTTATTTGATAAAAAGATTCCTGCTTTTG
ATATAGCGATACGCAGTTTGATATACCTACATTTATTAATACAAGGTTCGCGTCAATCTTACGCTCAGCT
CTGTCAATTACAGCCTTCGGAAGATAGTATTACGTTTAAGCAATTCCAAACTATCCATAGGCAGTTGATT
CATTTCTTAAACTCTCCCAAGCATTTTGATAATACTTTAAAGATCTTGGAGACTGCTATTGTCTTAAAAC
ATATGGGATGCTCTGCAAAGGGTGCTGCGAACTTTAAACCTTACTTCACAGAATCTCGGGCTGATGCTTT
TTATGCGAAAGCTCTACATGTGCTTCAGGCATTTCCAGAATTGAGTCCCTCATATTCTCGACTCTCTCCA
GAGCAAAAAGAAGTCTTCATTGCCCTACGTCGTTTAACTGACTACGATGCGCTATTCAATCTTACAACTA
CGCCAAACGCCCAGCTTCTATCTATTGGTAGAGCAAAACGTCCTTTAGTAGTTTTAGATTTATATCTCTA
TTCTCTTGATATCTGTGGAGAAAATAACTGCTCTCAAGAATTTTACTATAACTTCGCTCCTTTATTATCC
ATGTTGCAGCAGCATGCTACTGTAGAAGAAGCTTTTTCCCGTTATTTCACATACAGAGCAAATCGCTTAG
GATTTGAAGGATCTTCTCGTAGTGATATGACCTTGGTACGCTTAGCAACTCTTATGGAGCTTTCTCCTAC
AGAGGCTAGTGCTCTTAATTGGAGTTTTAAAAATCTCCCTATTGACGAGTCGGAAAGTTTGGTAAATAGT
TTTTACACAGCACAGGGGGAACACCTTCCTTTAGACATCCGGGGTCTTCCTAATCTCCTTACTGGTTTGC
TACAGGCAAATCACGGAACAGCTTCAGCAAGTCCTGAAAGCCGTTTACGCCAGATTTACTCTACAGCATT
GTCTTTAGTAGTAAAAAGCTTGCGTGTGCATAAGGATATGTTAAAAAAGCAGCTGCTTGATCAAACAACT
GTTTTAGACTTTTCAGAAACGACAGTTTCTTGTGGAGGATTAGATATTTTCTCTGAAAATATTGCCGTGC
GAGTGCACTTAAACGGTTCTGTTAGCGTTGCACTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c1035092-1034628 riboflavin synthase subunit beta [Chlamydophila caviae GPIC]
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GACCCATAGCTGACGCCTTGGTTTCAGGAGCACAACAGACTTTTTTGGATCTAGGTGGAGCAGAAGATAT
GCTTACCGTAGTGCGTGTTCCCGGATCCTTTGAGATCCCTTGCACATTAAAGAAACTTCTTACTTCAGGT
GTGAAGTATGATGCTATAGTAGCGTGTGGTGTGCTTATTAAAGGAGAAACTACACATTACGATCACATTG
CAGATCAGGTTTCGGCAAGGATCAGTGAGTTGTCTCTAGAATTTAACCTCCCTATTACCTTTTCCGTCAT
CACAGCACCTTGCATAGATTCTGCCTGGCAACGTGCAGGTATTAAGGGATCAAATTTAGGAATTTCTGGG
ATGAAAACAGCTTTAGAAATGGCAGACCTTTTCAAAAAGCTGTAA
>ref|NC_003361.3|:c1036364-1035105 bifunctional 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase/GTP cyclohydrolase II protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTGAGGGGAAATTTGTTATTGTTGTTGACGAAGCTTCGCGAGAAGATGAAGGGGATCTTATCATCGCAGG
TGAGAAGATAACCGTAGAAAAGATGGCTTTTCTTCTTAAATATACGACAGGAATCGTTTGTGCTTCTTTA
GAACAGGAAAGAATAAGAGATTTAGAATTCCCCCCTATGGTTGAAGACAATCGCTGTCGTTATCGTACAG
CGTTTACCGTCTCAGTAGATGCTGCAAAAGGCATAACGACAGGGGTGTCAGCAGCAGATAGAACGAAAGT
CGTAGAATTATTATCCAATCCTAATAGCCGTCCCGAAGATTTTGTCCGTCCGGGACATTTCTTTCCCTTG
GCAGGTACGCCGGGGGGGGTATTGAAACGAGCTGGACATACCGAGGCTGCTTTAGATCTTATGCGTTTAG
CAAATATGCAGCCTTGTGGCGTCCTTTCAGAACTTGTTAATGAAGACCATACCATGATGCGTCTTGCTCA
AATTATAGAATTTGCTAAGGAACATGAAATCTCAGTAATCTCCATATCTGATTTGATAGCCTACCGGATG
CTCTCCGAAAGGTTAGTTATTCCTGTTTCCTCAGCGCGTCTTCCTACAGAATATGGAGATTTCAATATTC
ATGTTTACGAGTCTCTTCTCGATGGTATTCAACACATCGCTTTAGTGAAAGGTGATGTTAGCGGCAAAGA
GAACGTTCTTGTCCGAGTGCATTCCGAATGTCTTACAGGAGATATTATGGGGTCGATGCGCTGTGACTGT
GGGCATCAGCTGCGTTCTGCTATGGAATATATCGGATTAGAAGGGGAAGGTGTTATTGTTTATCTACGTG
GTCAGGAAGGACGTGGTATTGGATTAGGTCATAAGGTTCGTGCTTACGCCTTACAAGATCGCGGGTATGA
CACTGTCGATGCTAATTTAGAAATAGGCTTCCCTGTCGATTCTAGAGAGTATGGGATAGGGGCGCAGATT
TTGGTTGATCTAGGATTGACAAAGATAAAATTGATTACTCATAATCCTCACAAGTATTTCGGTCTGCAAG
GGTTTGGGTTGGAAATTGTTGATAGGATCGCGCTTCCAATTCATGTTTCTGAAGAGAACGAACATTATCT
GCGCACAAAAAAAGAGCGTATGGGGCACTGGATAGACCTCCCCTATGCTGAGGAAGTAAACATAAGATAA
>ref|NC_003361.3|:c1037556-1036450 riboflavin biosynthesis protein RibD [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTTCTGCTCCCCCTAACCCTTGGGTAGGTTGTGTAATTGTAAAAAATGGACAAATTATAGGAGAGGGGTA
TCACGAAAAAAGAGGTCAGCTACATGCCGAAGAAAATGCCATAAATTCTACATCTGTATCTGTAGAAGGT
AGTGAAGTTTATGTAACCTTAGAACCGTGTTGCCATTATGGCAATACGCCTCCCTGCGTCAATCTATTAA
TTAAACATAAGGTATCTACTGTCTACGTGGCTTTGTTAGATCCTGATAGTCGGGTTGCTGGTAAAGGGGT
AGCCTCTTTAAAAGAGGCTGGTATTCGTGTTTTTGAAGGTCTAGGGAAAAAAGAAGCTGAGGAATCTTTA
AAATCTTACATTCACCAACGGACTTATGGTACCCCTTGGGTGGTGATTAAGAGTGCGGCTACTGTAGATG
GACAAACTGCAGATAGTCATGGAAAATCTCAATGGATTACTTGTCCAGAAGCTCGTGCAGATGTAGGCAA
ATTGCGTGCGAGTTCCCAAGCTATTGTTGTGGGCTCTAAAACTGTTTTACAAGATAATCCCCTGCTAACG
GCAAGGGAACCTTCCGGAGAACTCTATTCTCATCAACCTTTGCGTGTTGTTGTTGATAGTTTGGGAAATG
TAGGCCCTCAGGCAAAAATTTTCCATAGTCATGGAAAATCTCTCTATGTGACCACAACACAATGTTCAAA
AGATCATATTAAAAGTATCGAGGATCTTGGTGTCGATATCTTAGTTACAGAACCTAGAGATTCTAGAGTG
AATTTACATAAATTAATGTCCTATCTAGCTACTAAACAGATTTTACAGGTTCTTGTTGAAGGTGGCCCGG
TTTTACATACGGCATTTTTGAAAGAACGCTTAGCAAACGCTCTCGTTATTTATCTGGGACCAAAAATTTT
TGGTGATCAAAGAAAGCCTCTTTTTGGAGATTTGGGATACCAGCTGCAATCCGCTCAAAAAATTCTTCCT
AAGTTTTTTGAGGTATTAGGAAATTCTTTAAAAACGGCTTGGGAAGTTGTTGGGTAG
>ref|NC_003361.3|:1037600-1038880 seryl-tRNA synthetase [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATATTTCCCTTCTCCCTATTCTTGATTTGGATAAAGAAGTCCGCAGATTAAAAACCGACTCGGAATCTCT
ACAATCTCAAAGAAAACTTTTATCTACACAAATCCATAAAGCTAAAGCTCAAGGTGAAGACGCCTCTAAT
ATGATTAGTGAAGTGGAGAGGATCTCCCAAGATCTAGAGAAATTAGAAGCTTCACTAGAGGAAAAGAACG
CAACTTTACAAGACCTTCTTGTACGCCTTCCTAATTACCCTGAAGAAGATGTGCCCGTATGTCCTGACAA
ATCAGGAAATCAGGTAATTAAAAGTGTAGGTGCTTTACCAACATTTTCTTTTACTCCTAAACATCACGTA
GAGCTTAATCAAAAATTACAAATTTTAGATTTTAAACTTCCTGCAAAAACTTCGGGATCTGGATGGCCTG
CCTATAAAAATCAGGGAGTGATGTTAGAATGGGCATTGCTCACTTATTTATTAAATAAGCAACGGGAGCA
TGGCTTTCAATTATGGTTACCCCCCCTTCTTGTAAAACGTGAAATTCTTTTCGGCTCTGGACAAATTCCT
AAATTTGACGGTCAATACTATTGCGTAGAAGATGGAGACCAATCTCTTTACCTGATTCCCACTGCTGAGG
TTGTTCTCAACGGATTCCATTCTCAAGAAATTTTTAACGAAAAAGATCTCCCTATATATTATGCAGCCTG
CACACCCTGTTTCCGCCGAGAAGCAGGCGCCGCGGGGGCTAACGAACGCGGTCTTGTTCGTGTACATCAG
TTCAATAAAGTGGAGATGTTTGCCTTCACCACGCCAGAACAAGCGGATCAGGCTTATGAAAAGATGCTCG
CTGTTGTTGAAGACATTCTTACGGAATTAAAACTCCCCTACCGTCTCTCTTTACTCTCTACAGGGGATAT
GTCCTTCACAGCATCAAAAACTATAGATGCTGAAGTGTGGCTGCCTGGGCAACAATCGTATTATGAAGTT
TCTTCTATTTCGCAGTGCACAGATTTCCAATCACGCCGTTCAGAAACTCGTTATAAAGATAGCCAAGGGA
AAATGCATTTTATTCATACCCTTAATGGTTCAGGTTTAGCAACACCACGTTTATTCGTTGCTATTTTAGA
AAATAATCAACAAAAAGACGGCTCTGTAGTTATTCCTGAAGTTCTACGCCCTTACTTAGGAAATCAGGAA
GTATTACTACCTCAAGAATGA
>ref|NC_003361.3|:1038945-1039688 hypothetical protein CCA00898 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATAGAGTGTGCGTTGGCGAACCTCATACAACAATACAAGGTTTTATCTATCATCTAGCCAGTGATGCCTT
ATCCACTGGAGTCTTCTTATTTTTCATTAGAACACTTGCTTTTCTTCTTCCTATTTCTCAAGGAACACAA
GCGGAGCTTCTATTTTCATTAGGATTAGGATGGATTTTTTATCGAGGCTGCTTGAAAGCAAAAAAAGCCT
GGTCTTACATGGAGCTCTCTCATCGTTTTATGCTCCAGGAAAAAGAAGAAATAGAACAACATCCCGAACA
AGAACGTCTGGAACTCCATGTGATCTTTAAAAATCACGGATTCAAATCTCCTCTTCTTGAAGAAATGGTA
GATTATATCAGTTCGGATTCTACCCTCCTTCTGGATACTATGATCCGTGAAGAACTGCATATTTCTAAAG
AGAGCTTCCCTCATCCTTTAAAACAAGGCGGGACACGTATGCTCGGAGGGCTTATCGGTTTAATTCTCTT
CTTACCACTAGTTCTCTGTTCTAGTTATACCGTAGCAGGCGTATTATCCGGAGTGCTTATCACCATACTC
TCAGCTACTAAAGCAAAAATATTAGGAAATGATGTTATTACAGAGGTTGTGTGGGTGTTAGGGATTTTCA
TCACCTCCATAAGCATCGTTTGCACTTGTGTAAAATTTTTATAA
>ref|NC_003361.3|:1039704-1041677 cadmium-translocating P-type ATPase [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTGAAGATAACAGTCCCATGTTATCTCAAAAGAATCGGTTATTAAGTCGTAACCTTTCTTTAAAGTCTGC
GTCGATTTCTTTAGCGACGTATCTCTGTGCCTTAGCTTTTTATTGGTTTCGCATTGTTGATATTTCTAAT
CTATTTGTTGTTTTTACATTCTTTCTTGCTGGAACCCCAGCGTTGATAAAGTCGTTGGATGATATTCGCA
ATAAGACTGTAAATATTGATATTTTAATGACCTCAGCAGCCTTCGGTTCTATTTTCATTGGTGGGGCCTT
AGAGGGTTCTTTACTCCTTGTTTTATTTGCTATTTCTGAAGCTCTGGGACAAATGGTATCTGGGAAAGCG
AAGAGTACGTTAGCTTCGCTCAAACATTTAGCGCCTACTATTGCCTGGATAGTCGGCACCGATGGCAACC
TAGAAAAAAAACCCGTGAGTCAAGTTCAAGTTGGAGATATTATCCGCGTAAAAAGTGGAGAAATCGTTCC
CTTGGATGGAGAAATTATTCATGGTTCCTCCTCTATAAATCTTATGCATCTTACTGGGGAAAAAATTCCT
AAGTCTTGTCAGATAGGCTCTATGGTTCCTGCAGGGGCTCATAATCTCGAAGGAAGTTTTGATCTGAAAG
TTTTAAAAACAGGTGCTGACTCAACAATTGCTCATATTATCAATCTCGTTATTCAAGCGCAGAAATCCAA
GCCTCGTTTACAACAACGTTTGGATAAATATTCTTCAGCCTATGCCTTAACGATCTTTGCTATTTCTACA
TCTATAGCCGTTTTGGTCCCTCTATTTACCTCTATTCCTTTCTTAGGACCTAATAGTGCTTTTTATCGTG
CATTAGCATTTCTCATTGCTGCCTCTCCCTGTGCATTGATTATTGCTATTCCTATTGCTTATCTCAGTGC
GGTAAATGCTTGTGCGAAACACGGTGTCTTGCTTAAAGGTGGTGTGGTTTTAGATCGCTTAGCTTCTTGT
AATTCTATTGTTATGGATAAAACAGGAACACTAACCACGGGAGAGCTTACCTGTATTGGCTGTGATAGTT
TTGGGCCTCAAAACCCTGATTTCTTCCCTTTTATTTTAGCTTTAGAACAATCTTCTATGCATCCTATTGC
ACAAGCCATTGTTGCCTATCTGATGAAGAATAATGTCACCTCGTTTCCTGCTGATGAATACTGTATGATT
CCTGGGAAAGGGGTCCGGGGGATGTTCCAAGGTCAAGAGGCATTTGTAGGAAGAGTCGATACTGCCTTAC
AAAATGTCCCTAAAGAGTATGTTCAGGAATTAGAAGAGCGTGTGCATACTGCCAGACAACGCGGGGAAAT
CTGTTCTCTGGCTTATTTACAAGGCAGTTGCGCATTATTTTATTTTAAAGATACCCCACGTCAGGATGCG
GGGAAAATCGTCAAAGAACTCAAGGATGAAGGTTATCCGATCACCATGTTGACTGGAGACCATCATATTA
GTGCAGAAAATACGGCTAAGCTCTTAGGAATTTCTGAAGTCTTTTCTGATCTATCTCCTGATGATAAATT
AGAAAAAGTCCGTGAACTTGCTAAACAACGTCATATCCTTATGGTCGGTGATGGGATTAACGATGCTCCT
GCTCTCGCTCAAGCGACGGTTGGTGTAGCTATGGGAGAGGCAGGAAGTGCTACAGCTATAGAAGCTGCAG
ATATTGTTCTCCTCCATGACGCGATTTCGCTATTGCCGTGGATCATAAGAAAAGCAAAGAAAACACGAAG
AATTGTTACACAAAACTTAGGTTTAGCCTTAGCTATTATCCTTCTTGTTTCCTGGCCTGCCTCATTAGGA
ATCATTCCTCTATGGCTTGCTGTAATTCTTCATGAGGGAAGTACTATTATCGTTGGGCTTAACGCTTTGC
GATTGCTAAAGTAA
>ref|NC_003361.3|:c1042819-1041680 cell shape-determining protein MrdB [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTAGCTTAGTTGTTATTTCTTCCATGGATCCCTCTACGATTTTAGTTACATCATCGAAGGGACTACTTAC
GAATAAAAGCATCATGCAAATTCGTCATTTTGCTTTAGGATGGCTGGCTTTCTCTTTGTGTATGTATCTG
GATTACCATAGATTAAGAAGCTGGGCGTGGGTTCTCTATATTCTTATGCTTTTGAGCCTTGCAGGTCTAT
TTTTTGTCCCTACCGTGCAAAATGTTCATAGATGGTACAAAATCCCTTTCATTGGTTTAAGCGTCCAACC
TTCTGAATATGCGAAGCTTATTGTTGTGATCATGCTGAGCTACACGCTAGATATACGCAAATCAGTAATT
TCTTCGAAGACCACTGCTTTACTTGCTTGTATTATTGTGGGAATCCCTTTTTTTCTTATTTTTAAAGAAC
CAGATTTAGGGACAGCTTTGGTGCTATGCCCCGTTGCTTTGACAATTTTTTACCTTGGGAATATCCATCC
TTTATTTGTGAAAATTTGCGCGACAATTGCAGGCTTGGGAATGCTCTGCTCTTTGCTAATTTTCTCAGGA
ATCATTTCCCATGAGAAAGTCAAACCTTACGCATTAAAGGTGATAAAAGAATACCAATACGAAAGGCTAA
GCCCTTCGAATCACCATCAGCGAGCATCTTTAATCTCTATTGGATTAGGCGGTGTTAAAGGCCGGGGATG
GAAATCTGGAGAATTTGCCGGTAGAGGATGGTTGCCCTACGGCTATACAGATTCAGTATTCTCTGCTTTA
GGAGAGGAATTCGGTTTGATAGGCCTATTTTTCGCCTTGTGGATGTTTTACTGTCTCATTTGTTTTGGCT
GCCGAACTGTAGCTGTCGCTGTTGATGATTTTGGTAGATTATTAGCTGCAGGAATCACCGTGCATATCTC
TATGCACGTGTTAATTAATATCAGCATGATGTGCGGATTGATGCCTATTACTGGAGTTCCCTTAGTTTTG
GTATCCTACGGGGGATCTTCTGTAATTTCTACAATGGCCTCTTTAGGAATTTTACAAAGTATCTATAGTC
GTAGGTTTGCAAAATACTAA
>ref|NC_003361.3|:1042855-1043445 biotin--protein ligase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGTGGAATCGCTCCGCGCTTACTGTTGTTTCCACCCAAAAGCAAACAACAGGGAAAGGGAAGTTTAACAA
AACTTGGATCTCTTCTCATAAAGATCTTACCGTATCTCTCTGCTTTTTCATTAATGAATTAGATATCGAC
GCGAGTCAGTTATTTCGTTTAGGGACAGAAGCCGTTCTTAATCTCATCCAAGATTTAGGCATCCCTAACG
GAATGATAAAATGGCCTAACGATGTTTTAGTAAATCAAGAAAAACTCTGTGGGGTTCTTAGTGAAACAAT
TCCCATGCAAGGCTATTTAGGCATCATTTTAGGCATAGGAATCAATGGCAACACTACGAAAGAAGAACTT
TTTTCTATAGATCAACCGGCAACATCACTAGCCATACTATTAAATCATACTGTAGATCTTAGAGAAATCC
GCGAAAAGCTTGTTGAATATGTAAGAAAGAGCATCTTGCAAAAATTTTCAAAAATTCTAGCGAGAGAAAC
AGATCATAGGGAGATCAAGAAAACGAAATAG
>ref|NC_003361.3|:c1043937-1043401 hypothetical protein CCA00902 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATTGTCAATTATACTATCTCGTAAAGAATATTATGCTTTCTTGGGAGAGTTTGCTTTCCCATGCAATAGC
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GAGTTTTTAACGCAGCATCATAAGATGTCCTGGAGAGGATTTTTAAAACACGGTTACGATATCCTTTTTG
CATTTCAGGAAATGGAGGAGACTCTTCCTCAGCTTGTTCATGAGATTGTAGAGTCTATAGGTGAACATCA
TGAACGCGAGGATATTGTTAGTCTTCTAGAGGATTTTTGGGCTAGGGATAATCTCTTTGCTTTTGAGACA
GCTGCTTATGAACAGGCTGTTGAGAAATATTTAAAGCAAAGATCAAGTCCGTCATTATGGATAGCCTCTA
GGCTATTTCGTTTTCTTGATCTCCCTATGATCTGTTTCTCTCGCTAG
>ref|NC_003361.3|:1044828-1045511 phosphoglyceromutase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TAGATATCCCTCTAAGTCAACAAGGAATTGATGAAGCTATTCATGCGGGTCAGGTGATAAAAGATCTCCC
GATAGACTGCATCTTTACCTCGTCTCTTGTTAGAAGTTTGATGACAGCGCTGCTTGCTATGACACATCAC
AGCTCTAAAAAAATTCCTTATATTATTCATGATGATGAGCAGCAGAAACTGATGAGTAGGATCTATAGTG
ATGAAGAAAAGAGTATGATCCCTCTTTATCGTTCTAGCGCACTAAACGAAAGAATGTATGGGGAGCTGCA
AGGGAAAAACAAAAAAGAGACTGCTGAGGAGTTTGGTGAAGAACAGGTAAAATTATGGAGACGAAGTTAT
AAAATCTCGCCTCCTGGAGGAGAAAGTCTCTATGATACGGGATTGCGTACGGTTCCCTATTTTCAAGAAA
CGATCTTCCCTTTATTGAAAAATTCAAAAAATGTGTTCATTTCTGCACACGGGAATTCTCTACGCTCACT
GATTATGGATATAGAAAAATTAAGTGAGGAAGAGGTACTCTCTTTAGAGTTACCTACAGGAAAACCCATA
GTATATTTATGGACCGGCCACACATTCGAACGACATCCAGAACCACTTGGTTAA
>ref|NC_003361.3|:1045466-1046623 nifS protein, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
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CAGTTTCAGTAAGAGAAAGTTTGGAGACCTATGCGGATCCTTTTTCTTTGATACCATCATCAGCAATGAA
ACTACTTAATGAAACTGAAGAGGCTGCTCGTAAGCTTGTCGGTTGCTCTGAAGAAACACATACGTTTCAT
TTTCTCCCCCACTTCCCCCATGCTCCAGCAATTATCGTAGCGGCTTTATTGGAAAATCTTACCTTTTTCC
AAGGGAGGAATCATCTTTTAGTCTCCTCTCATGAACAGCAATACATTATTGATGCTATTTGCCGACGGCA
AGGCCTCGGCACTACCTATGATTGGGTAACAATAAACTCTTCGGGACGACTGTCTCCTGAGCAACTTACA
GAAGCACTGACACCACGCACCCTGCTCTTTTCCTTATCTGCTGCCAATGGTATGACAGGGCTGATTGAGC
CTATAGGATCTCTACAACCCTTATGCAAAGATCGTGGCGTTGTTCTACATTTAGACCTTTGTGATATTTT
AGGACGCGCACCACTCACTCCAGAAATGCTCGATGCCGATATCCTTACATTTTCTTCTTTAGCTTTAGGA
GGGATTGGAAATATTGGAGGGATGTTTATTAAAAAATCCCTGAGCAAGTTTTTCAATTTATGGCTCTCTA
GACATTCTCCGGGAACTTTATGTTTAGGATCTGTAGCAGCCATGAAAACAGCTTGCCAAGAACGCCTATC
TTCTTTTGCTTCATTAATCTTATCTTCGATAAATCTAAGAAATAAACTTACTAAAGAGCTCCAAGCAGCT
TGCCCCGACGTGGAGTTTCTTTTTCCAGAACTAGAGAATAAGCTCCCTAATGTCATGATTGCCACTATAG
GAGATCTCCCTGCAGAAAGTTTAGCCTTTTTCCTACATCAACAAGGGATCTATCCAGGACTTGGCTACGA
GCGTTTCCAACCTCTGTCTCAAATACTACAAAATTGTGGGGTATCGCCTTTCCTCTGTCACAGTGCGCTA
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GCGCGCACCTACAATCTGCAATTGCGAGCTCCGTATGA
>ref|NC_003361.3|:1046620-1047441 nifU protein, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGTTTTATTGTGGGGGGACATTTTCAGCAGAAGATGCTGAAACAAAAGGCGCCTATCTGATTATCGGCAA
TCAGGGGCACAGACTTACCGGTAACTATGTGATATTTTATTGGCTGATAGATAAGATAAATGGAAAAATT
ATCGATGCGAAGTTCCAATATTTTGGACATCCTTTCCTACTTGTCCTTGCAGAAGTCACATGCAATTTAG
TTATCGGAAAAACCTATGCACAAGCCTACAACTTAACTGTAAATACTATCGATACTGAGCTGCGCTCACA
TCCCAATAAACCTGCGCTTCCAGAAAGTAGCTTACCCTTATACCACTGCATCATCGATGCTTTAGATATT
GCCGCTGAACAATGTATGGAAATTCCTCTTGAAGATGGTTCCCTACCTTTAAAAGAATCTTTTCTCCCCT
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GGTCCTACGTACAACCGCGGAAGATAAAATCTCCCCCTATGTAGCTATGGATGGCGGTAGTGTACTTATC
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>ref|NC_003361.3|:1047545-1048558 type III secretion system protein [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGAAAAAAAAACTCCAGGTTGGTTTAAGCTTAGCCAAGTAGGAAATCCGAAATTATTAGAGTCTTTAGCA
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TACCTACAGAAGATGATCCCGACATTATTCCTCAAGTTTCTGTTATTCTTTCATCGCATAAGGACGAAGT
CTTCTCTTCCTCTTTGCTACTTTCTATCGTTGACTATCTATCTAGCAGCATTCCTGGATTAGCTAAAGAG
CACATTACCTTATCGGATAACCTAGGGAATACGTATTCCCCAGGAGAGTTCTCAAACTCTCTATTATTAT
CTGCATGTGAAAGTTACTTAGGAAAAATTTTCCCTAAGGAACACTTCGCTCTTACCTGCCTAAATGCGAA
ACAAACGCCTACTATTCAGCTAACGGTTAATGAGAAATACCTAGCGAAATTCCCAAAAGACAAAAGAGAA
TCTTTCCTAAAGCATGCTGAAGATCAGCTAAAGAAAATCTCTGGGGATAACCATCCTATTGTTATCGAGA
AATTTCCTTTTTCACAAACGATACAGAAAGACCGTCTCTCTTATAAGCTTCTCGTTGGGGGAATCATTTT
ACTTTCTAGTTTAGGAATTATTGCCTTGGCAAGCTTTTACCTTGCTTTTTACGCTTACGAACGCATTCCC
TTAGAATCAAAAAAAATAAAACAAGGCATAAATATTACGAAGCTGGTAGAGATACTACAAAAAGAATCTC
CCGAAAAAATCAGGGTGATTCTCTCGTATTTGGATCCTAAAAAAGCCGATGAGATCTTCCAACATTTGCC
TGAAGATGTAAAACACCAAGTACTGAAATTATAA
>ref|NC_003361.3|:1048582-1049133 hypothetical protein CCA00908 [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGACACTGTCTCAATCTCCTGGTTCGCTTTCAGATGCTGAAGATTCCCCAGAAAGAAAAAAAGACTGGA
ATGAGGGATACTCCCAAGGGTTTTCAGAAGGAGAAACCTCGGGATATGATAAAGCCTTTCAAGAACTCCT
CTCTTTGATTCAGATATTTCGGAAATTATCGATTCGTATGCTTTCTGAAATAGAAAAGGTTCCCCAGCAA
CTCAAACCTGATCTTGTAGAACTCGCAATTTTAACATGCGAGAAATTCCTCTATAAGAAATTAGATAATA
TTGAAGAGCTCGCACTGTTAATTTCTTCTGCTCTACAACAGCACACATCCTTGCGATCTTTATCTCCCGT
AAAGATCTTTCTTCATCCTGAAGATCACAAGAAACTTAATGATTGGATAGCAACGCATGAAATCCCCATG
ATTAAACATGCAGAGTTTCTCCCTGACATATCTTGTAAAAAATCCAGCTATAAAATGGAGTCTCCCTCAG
GAATCCTACGACAAGAAATTGGAGAAGAACTAGATCATTTGCTTTCTGTTTTAACTACATGA
>ref|NC_003361.3|:1049130-1050434 type III secretion system ATPase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACGAACCTAAATTACGAAAAATCCCAACTGCAGTATTGGCAGCCTTACCGCACCTGTGGGCTTCTCT
CAAGAGTGTCTGGGAACCTCTTAGAAGTTCAAGGGCTATCGGCATGTCTTGGTGAGCTTTGTCGTATTTG
CACTCCAAAATATCCAGATCTCCTTGCAGAAGTGATTGGCTTTCACAATCAAACAACATTATTAATGTCC
CTATCTCCTATGCACTATGTTGCTTTAGGATCTGAAGTTCTTCCCCTACGACGTCCCCCATCACTACATC
TCTCTGATCACCTTCTTGGTCGTGTTATTGATGGTTTCGGAAATCCCTTAGACAATAAAAAAAGCCTGCC
AAAAACACATATAAAGCCATTGATTGCTCCCCCACCACCTCCGATGTCTCGACAACCTATCCAAGAGATT
TTCCCTACAGGGATTAAAGCTATCGATGCTTTTTTAACTTTAGGGAAAGGACAGCGTATCGGTGTATTTT
CAGAACCAGGGAGTGGGAAATCTTCACTACTATCCGCAATAGCTTCAGGCTCAAAATCTACAATTAATGT
TATTGCTCTTATTGGAGAAAGAGGCAGAGAAGTCCGCGAGTATATAGAACAGCACTCTTCAGGATTGAAA
CAACTTCGAACTATCATTGTTGCCTCTCCAGCGCATGAAACAGCACCAACAAAGGTAATTGCTGGACGTG
CTGCTATGACAATAGCAGAATATTTCCGAGATCAAGGTCACGACGTGCTATTTATTATGGATTCTTTATC
CCGATGGATAGCGGCTCTTCAAGAAGTTGCCCTAGCAACGGGAGAAACCCTAGCAGCGCACCAATACGCA
GCGTCTGTTTTCCATCATGTATCAGAGTTTACAGAACGTGCGGGGAATAATGATCGGGGTTCTATAACTG
CCTTATATGCTATTTTACATTACCCCAACCATCCGGATATCTTTACAGATTACCTAAAATCTCTCTTAGA
TGGGCATTTCTTCCTTACGAATCAGGGAAAAGCCTTAGCCTCACCTCCTATTGATATTCTTCTTAGCCTA
TCAAGGTCTGCGAAAAAACTTTCCCGTCCTCATCATTATGCTGCTGCGGAGAAACTTCGTGCCTTATTAA
AAACATACCAAGAGGCGTTAGATATCATTCAGTTAGGGGCCTACACTCCAGGACAAGACAAAGATCTCGA
TGATGCTGTAAAAATTCTTCCCAACATAAAAAAATTCCTCTCTCAGCCATTATCAAGTTACTGTCAGCTA
GAAAACACCTTGAAAGAGTTGGAGGCTTTGGTAAATCTTGAATAA
>ref|NC_003361.3|:1050427-1050786 hypothetical protein CCA00910 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GACACTTTAAAAGTGAAAAGTATTATCTATCTCAAGAGCTTGTCAGTATAAAAGAGCGCATGATGGTGGT
TTCTAAAATCAGGAAGGAGAGGTTTTTATACCGCGACAATATAGAACATTACAATTTGCTTTTAGAAAAC
TTGCAAACATTACAAGTATCTATTTATAAACAACACAATATCTCCTGTCAGCGGCTACAAGAGCATCAAA
ATAAATTACTAGAATTAATTAACCGTAGAAAAATTATCGAAAAGATCAAGAATAATAAGTATTCTAACAT
CAAGAGATAG
>ref|NC_003361.3|:1050806-1052188 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACTGACTCTGTAACCTTTCCTTCTGCTGTGGAAATGTCTTCACTAACAGAAAAACTCAAGTCTATTA
ATCAAGAGCATTTATTAGATTCGTGGTCGTCCCTTTCTCAAAAACAACAACAACGTCTCCATCATCAAAT
TTCTTCCATAGATATTGAGCTTTTCCATAAACAACGCCAGCTAATCACCTCCCCAAAATCTATTTTAAAA
GACTTCCAACCTTTAACTTCTTTCGCTTCTTCTGGAGAAGATCCTGAAAGAACAAAGATCGGGACAAATC
TTCTAAAAGAAAAGAAGGTTGCCTGTGTAGTTCTTGCAGGAGGACAAGGGTCTCGATTGAAATGCGACGG
TCCTAAAGGGCTTTTCCCGGTATCTCCTATCAAAAAAAAGCCTCTTTTTCAGCTTGTTGCTGAAAAGGTC
TGTGCAGCAAGTAAACTTGCGCATCAGCCTCTGCCGTTAGCCTTTATGACATCCCCGTTAAATAATCGCC
AGACACGCTCCTACTTCGAATCTAATGATTATTTTCATCTTGATCCCAACCAAGTAGACTTTTTCTGTCA
GCCTCTTTGGCCTTTATTATCTTTATCAGGAGATCTCTTCCTAGAAGATACCGACTCCCTATCCTTAGGA
CCTAATGGAAATGGTTGCTTAGCAACCCTTCTATATACCTCAGGAGTTTGGGAAAAATGGAAAAAAGCAG
GTATCGAAATGGTGAGTGTGATTCCTATCGATAATCCTTTAGCCCTACCTTTTGATGTAGAGCTTTGTGG
ATTCCACGGTATGGAAAATAACGAGGTGACTATTAAAGCTGCTTTACGACAGACAGCTATCGAAGATGTG
GGCATCTTAGCACAATCTCATGCTTCTGGGAAAACCTCGGTTATTGAATATTCTGAAATACCTCAAAACG
AACGTTTTGCTACAAATCCAGATGGAACGTTGAAGTATTGCTTAGCAAATATCGGTTTATATTGCCTGTC
TATGGACTTTATTGCCCACGCCGCTCTTCGCGAACTACCTCTTTACAAAGCCCATAAACACGCGAAACAA
TTAGGGCTCTATTCCTCAGAGAAAAATTCTTGGAAATTCGAAGAATTTATCTTTGATCTATTTTGCTATA
GCGAACGTTGCCAAACTCTTGTCTACCCACGTCAAGAATGCTTCGCACCATTAAAAAATCTTGAAGGCAA
CCACAGTCCCGCGACTGTTCGAGAAGCTCTTTCTGCTAGAGAACGTCAAATTTTCCATAAAGTGACTGGA
AAAAAACTTTCTCCAAACACAACATTTGAATTAGAAGCCGATTTCTATTATCCTTCAACCTCTACGTCCC
TACACTGGGAAAATAAAGCGTTTTTCGAGGAACCGTTTTTTGAGGCCTCATGA
>ref|NC_003361.3|:1052185-1053189 NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGGGGTATCACGTTGTTGGATGGGCCCGCAATGCTGAATTGATTGCTCAACTACAAACAGAGAAGCGTCA
TCCGCAAGTTCCTGATGTTCCCATTCATCCGAATCTATCCTTTACTACAGATATGGCAGAAGCTGTAGAA
AATGCTTCTATGATTGTTGAAGGTGTCTCCTCAGCAGGGATACGCCCTGTATCTGAACAGCTAAAAACAA
TTACGAATCTCAATGTTCCTTTTGTCATTACTTCAAAAGGTATCGAGCAGCATACAGGACTATTACTTAG
TGAAATTGTCGTAGAAATTTTCGGTAACGACGCTTCGCAATATCTTGGTTATCTTAGTGGCCCCTCCATA
GCTAGAGAGGTGCTTAAAGGCTGTCCATGTTCTGTAGTGATCAGCGCGTATAATCCAGATACCTTAAAGA
AAATACACAATGCCTTTCTCACGCCGACATTTCGTGTGTATCCTAATAGCGATCTTAAAGGTGTGGCTCT
CGGTGGAGCTTTAAAGAATATTATAGCTATCGCCTGTGGGATTTCTGATGGATTTCGTTTTGGAGATAAT
GCCAAATCAGGATTAGTCACTCGAGGACTTCATGAAATACGGAAATTTGCCACGATTATGAACTGCCGTC
CCGATACTCTCAACGGTTTGGCAGGTCTTGGAGACCTTTGTACCACGTGTTTTTCTTCGTTAAGTAGGAA
TACGAAATTTGGGAAATTAATCGCTCAAGGAATGACTGTTGCGCAAGCAAAAGCAGAAATCGGTATGGTT
GTGGAAGGGGTCTATACAGCTCTCTCAGCATACCAAATTGCCAAACATCATAAAATCGATATGCCGATAA
CTACAGGAATCTATCGCGTTTTATATGAAAATCTCGACATCCAAGAAGGTATCGCTGCACTTTTACAAAG
AAATACTAAGGAAGAATATCTTTAA
>ref|NC_003361.3|:1053322-1054356 major outer membrane protein, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATAGCAAGCTGAAAAAGCATCTACGTTTAGCATCTCTCTCTCTTCTAGCTTTATCAGGAATTTTTT
CTTCCTCGACTCTGAATGCTATGCCGTCGGGAAATCCTGCCTATCCTGTAATTCCTAGCATCAATCCAGA
ACAAAAAGGCATGTGTGCTTTTGACCTCTGCAACAGCTATGATCTCTTAGCAGCACTTACAGGAAGTTTA
AAATTAGGATTTTCTGGAGATTATATTTTTTCAGAAAGTGCAAGAGTGAAGAATGTTCCTGTGGTGACAT
CTGTCAATACGACAGGAACCGGGCCTACGCCTACAATTACCTCAACAGTAAAAGACTTTGACTTCGATCT
AAATGATTCTAAGGTTAGCGCTAGCTACATCTTTGCCTCAGTAACTCTCCAAGATACTTCACCAGCTGCT
ATTCCCCTTTTAGACATCAGCTTTGATGTGAAAATCGGAGGCTTAAAACAATACTACCGTCTTCCTCTAA
ACGCTTATAGAGACTATACTTCTTCCCCTCTTGCTTCTGAATCACAAGTTACCGACGGTCTGGTAGAAAT
CCAAAGTAACTACGGTTTCGTTTGGGATTTAAATTTGAAAAAGATCATTTGGAAAGATGGGATTTCTTTC
CTAGGCGTTGGTGTAGATTACCGCCATGCTGCCTGCCCTATTAACTACATCGTAGTCAATAGCCAGGCAA
ATCCTGAAGTATACTTCGAAGATTCTACCGGGAAAATCAGCTATAAAGAATGGTCGGCGAGTATAGGAAT
TACCACCTATGTCAATGACTACATCCTTCCTTATGTTTCTGCTTCTGTAGGGAGTTCTTCAAGAACAGTG
CCCGCAGATAGTTTTAAACGTTTAGAAAGCCAGTTTTCTAACCTTAAGTTCAAAGTACGTAAAATCACGA
ACTTTCATAGAGCGAACTTTTGCTGTGGTGTCACAAGCTGTGCATCAGATAACTTCTTCTATAGCGTTGA
AGGACGTTGGGGTTACCAACGTGCTCTAAACGTAACCGCAGGCTTCCAATTCTAA
>ref|NC_003361.3|:c1055519-1054353 hypothetical protein CCA00914 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GTCGTGTTTCTCCTGCTGAGGTAGCTGCAGATTATACAAAGATGAATGAGGTAGCCTCTCACCTAAAAAT
CATGCAAGACTTGCTTAAAGAGGCGAGTAATTTAGGATTGCGTAGGGAATTTATAGCTTCTTTAAATCAG
GACTTTTTAGACGCAGGATTTGAACTAGCTGTGATACAAACCGTACTTACGGAAAAGGAAAATAAAGAGC
TACGTAAGGAAGCAAATAAGGTTTTCCAGGAACATTTAGATAGGATATCTCCACAAGCGTTAACAACGGC
TCCCGAACTTGCTCCTGTCAAAGACTCTATAGTTAATAAAATGCCTTTCCAATCGGCATTCGCCTATATT
CTCTTGGATAAATACATTCCTGCGCAAGAAACAGCGTTATATGCTCTAGGAAGAGAGCTCAATCTTTCAG
GATATGCGCAGAACTTATTTAGTCCTCTTTTAGAGACGATAAAGAGCTTTAACTCTGCCCCTATCATTTA
CAATTTAGGGTCTTATATTTCTCAAACATCAGACACGGCGAATTTTAAATACGGTTATCAGATGATTGTA
GATCGCTATGAGGAAGAGTGTCTACATTTGAAAAATGATATAAAAAGCGCTGAAAACGCTCAGCTTTTGT
TAAAGCAAATTTCTAAGAATATTCAAGACAACGCCTCACTGTCTGATGAACAGAAAAAACAGCTTCAGGA
TATCGTCAAATCCTATGATAGTGAATTAGTCATTATGATAAAGCAGATGAAGAACCTGATGTTAAATCTG
AGTTCTCTTATTTTCATTCCTGGAAATAGTGAATACGAACCTTCATATAAGATCATGGGTTCTGACTTCT
CCATCATTACATTGCAGGATTTGGAGCATATAGTTGTTGATGGAGAGATTGATATCGATAAGGGAACGTC
AAAAGGCGGTTTGTTAAATTTCTTTAACAACTGTCTTGCTGACGTGCAAAATTATGGTGATTTAGCGCAG
ACGCACCAGCTAATGTTAGAACTTCAAATGCGTGCTATGCAGCAGGAGTGGAGCTTAATTGCAGCATCGT
TGAAACTCATGCATAACGTATACCGCACGCTAATCAGCTCGTATTAG
>ref|NC_003361.3|:c1057771-1055528 hypothetical protein CCA00915 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATATGACAATGCCGTTTTCTAGTTCTGTGTTTCTTTTTCAAGAATTAGATCAGAAGGCAAAAGGATTAAA
ATACGCGCTTGGTTTGTTGCAAGAAGCAGAGACTAAGTTGCCCGTAGCGCAAATTTCTTCGGAGTTTGTA
GATGCTGCCTTTAAAAATATCCCTGAAGAGAAAATTGCATTTCCGAATGTGGATTATGATTCTATGAAAG
TAGATGAGATCTTAGCCAATCCAAATCTTGCTGCTGCAAAACTTTATATAGAGGGACTTGAGAGGAGTTT
TGATGATTGGCTGAAGGATATTGATCAGGGGGGGATTTTTAATCCTACAGAAGCTGAAAAGACATTAGTT
CAAGAATATAGAATAAGATTAAGTACGTTAAAACAGGCCTTTACAGAAGGAAACCCTACAGATGCTCAAT
ACACATCTCTATATGGCTTAGCTAAGGAATTTGTAGGGACAATAGAAAAGCTAGAGGGAAAAGACGCACC
GCCAAAAAGTAAGGTTATCAATTTTTGGCAGAACATGATGGTGGTTTACAATGCCATGATCTCTTTGTCT
TATCCTGTTTCTGAACAATTAAATATTAAAATTGCTGAGTGCTCATTAAATATTGAAGAAGCGAATAAAG
TTATTGAGCTCATACGTCAGTTTTCAAGTTCCCTTAAAGATCTACTCAATCCTGTTTGGGATATCTCTTC
AACAGCAACTAATTTAACAGGTTCTGGTTATAACGCTATGCAAGGTGGTATGACGCGGACGTACATAGTG
CTTGCTGGAGTGTATCGTATGCTTATGGATAAATATTCAAGTAATGCAGCCGATACTATGCCTACAGAAG
TTAAAGCTGGGGTGACCACTTTTATAAATGCTATGGGTGGGCTGAAGATGGGAGAAAGAGCTACTTTACC
TAGTTTTCTAAGTTTACTGTATTCTTACTTAGTGTGTGCAGGACAGTATGGGGAAAAATCTTCTTCAGCC
CAGGCAGATTATAAAAAAGTCCTTCAGGAAGAGCTATCTTATTGGGATGAACGGGGCAATAGTAGTTTTA
ATGTTGCAGATGTCCCTTTAAAGACGTTTGCTAATAGCCCTACAACATCTTATGAAGGGATATCTTTATT
TTACAACGGAAGCCAAACTAATCTTAACCCCGAATTTTTTCAAAAATGCGTTGAGTTAATGACGAAGCAA
CCTAGTAAGGTGATGTCACGTTCTGATTATCAGAAAGTAATTGATGGGATGAATAACGGTATTAAGCAAA
TCCAAGCTCAAATTACTAAGTGGACAGAAGAATCGGCAAAGTTAATGGCTCAAAAGGATTCTATGGATCC
TACGACATTAAATTATTTCGAGAGCATGAAAGAGGGGAAAAAGACCTTTGTAGATACTTCTCCAATACAA
ATGGTTTACTCATCTTTATTATTAGATAAATATTTACCCAATCAGCAGCACGTTTTAGAGACGTTAGGGG
TACAGATGACATTCTCTAATAAAGCTGCTAAGTACATGAATCAAATTATTTCTCAAGTTACAAATTTCCA
AACTGCAGATGTCTATTATTCTTTAGCGATATACCTGCGTCAGATGAACCTTCAGGCTCTTACTGATGCG
TTAGGGAAAGCACAGAGTGTTTTAGATAAGGAAAAAGTACGTTGTAAAAGTGACATTGAGCGTTGTCTGA
GGACAAAAACTGAACTCAAGAAAATTTTAGACAACATCAAACGTGATGCCGAGTTGACCTCTTCTCAACA
ACGGGAGCTTCGTCAGACAATTTCTGGCTATGAGTTTCAGTTCGAGGCTTTATTGCGTAATCTTGGGAAT
CTTTATATCTTCCTAAACAGTATGGAGTTTACTCCTGTAGAAAAACCCGACGAAGTTGATGAGGCTTTTG
ATATTCAGGTTAACAAACAGAAGTCTGACAATTGGCCTCGTTTCTTATCAGCTTTTGAAAGCTTTGTTAT
TGAAGGTGGTGAAAACGGGATTATTCCTGGTGGTGAGCAGCAGATCTTACAGAGTTTAGAAGCTACCCAA
CAGAATTTTACAACCTTTAACCAAAACCAACAGCTCGCATTACAGTTAGAATCTTCCGCAATTCAGCAAG
AATGGACTATGGTCAGCGCTGCTTTAGCATTGATGAATCAGATATTTGCGAAGTTAACACGTAGATTTAA
ATAG
>ref|NC_003361.3|:c1059696-1057894 phosphoenolpyruvate carboxykinase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACCAGTGCATGGAGTAGTGAAATTCAGCATGAAGGTTTAAAACAATGGATCCAAGAAGTTGCTGAAT
TAGTAACTCCTGACGACATTCGTATATGTAATGGCTCCGATTCTGAATATGCTGAAGTTTATGGCATAAT
GGAAAAATCAGGAGTGGCTATTCCTTTAAATCCTGACGTACACCCCAACTGTTTTTTAGTACGTTCTTCT
CCTGAAGATGTTGCGCGTGTTGAGCAGTTTACTTTTATTTGCACTACAAAAAAAGAGGATGCAGGTCCTA
CAAATAATTGGCGGGATCCTCAAGAGATGCGTCAGGAATTACAAGGTCTTTTCCGTGGGTGTATGCGTGG
AAGAACCTTATATGTGATTCCTTTTTGCATGGGACCATTAAATTCTCCATTTTCTCTTATTGGTGTTGAA
CTTACTGATTCTCCATACGTTGTTTGTTCTATGAAGATCATGACGCGGATGGGAGCGGAGGTATTAAAAT
CTCTAGGAACAACAGGTTCTTTCCATAAGTGTCTACACAGTGTGGGTGCCCCCTTATCTCCAGGTGAAAA
AGATGTTGCCTGGCCTTGCAATCCTAAGAATATGCGTATCGTGCATTTCCAAGATGACAGTAGTGTCATG
TCTTTTGGTAGTGGTTATGGGGGTAATGCTTTACTTGGGAAGAAAAGCGTAGCATTACGTTTAGCTTCTT
ATATAGCTCGTTCGCAAGGTTGGCTTGCGGAGCATATGTTAATTATCGGTGTGACTAATCCTGAAGGGCA
GAAGAAGTATTTCGCAGCTTCTTTCCCTAGTGCTTGTGGTAAAACCAACTTGGCTATGCTCATGCCTAAA
ATTCCTGGTTGGGAAGTCGAATGTATTGGCGATGACATTGCTTGGATACGTCCTGGTCCTGATGGCAGGT
TATATGCTGTAAATCCCGAGTTTGGTTTCTTTGGTGTTGCTCCGGGAACATCGGAAACGACAAATCCTAA
TGCTTTAGCTACTTGCAAAACTAATTCGGTCTTTACTAACGTTGCTTTAACGCCAGATGGGAACGTTTGG
TGGGAAGGGTTAACGAGTCAGCCTCCTGAAGGCCTTATAGATTGGCGTGGGAATCCGTGGCAACCTGGAG
GGGCTCCTGCAGCACATCCGAATTCTAGATTTACGGCTCCTGTAAAACAGTGTCCTGTTTTAGATCCTCA
ATGGAATAGTCCAGAAGGTGTACCTATAGAGGCGATTATTTTTGGTGGTCGTCGTTCTGAGACTATACCT
TTAGTTTATGAGGCTTTAAGTTGGCAGCATGGGGTTACCATTGGTGCCAGCATGTCTTCGGCGACTACTG
CAGCTATTGTTGGCGAGCAGGGTAAGTTACGCCATGATCCTTTTGCTATGTTGCCTTTCTGTGGTTACAA
CATGGCACATTATTTTGATCATTGGCTATCCTTTGCTTCTAATACAAGTTTAAAACTACCAAAGATCTAT
GGTGTGAACTGGTTCCGTAAGGATAAAGATGGCAATTTCATCTGGCCAGGATTTAGTGACAATCTTCGTG
TTATAGAATGGATTTTCCGAAGGACAAACGGCGAAGAGTCCATCGCTAAGAAAACACCTATTGGTTATCT
ACCAGAGGAATCTTCTTTAAACTTAGAGGGCCTCAACTTATCTTCACAAGCTCTTCAGGATCTACTATCT
GTAGATGTTTCTGGATGGCTTAAAGAGGTTGCTAATGTTCGTGAGTACTGTAAGATCTTCGGGTCAGACC
TTCCTCAAACAATCACGGATGAGTTATTCAGAATAGAAAGAGAATTAAAATAA
>ref|NC_003361.3|:c1060793-1059693 cell shape-determining protein MreB [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGCCCACATCGAAGCTTATTTAAAATTAAAAATCTTTCCAATCGATTGTACAACAAGACTTTAGGCC
GTTTTGATAAAGTTTTCAACTTTTTTTCTGGCAACGTTGGTATCGATTTAGGAACTGCGAACACCTTAGT
ATATGTTCGTGGACGGGGTATTGTTCTTAGTGAACCTTCTGTAGTTGCTGTCGATGCTCAAACGCATACA
GTGCTTGCTGTTGGTCACAAAGCTAAGGCTATGTTGGGGAAAACCCCAAGGAAAATCATGGCGGTCCGGC
CTATGAAAGACGGTGTGATTGCAGATTTTGAAATAGCAGAGGGAATGTTAAAAGCGTTGATCAAACGTGT
AACGCCTTCTCGCAGTATGTTCCGACCAAGAATTCTCATTGCTGTACCTTCGGGGATTACTGGTGTGGAA
AAGCGTGCTGTTGAAGACTCTGCTTTACATGCTGGAGCTCAGGAGGTGATTTTAATAGAAGAGCCTATGG
CTGCTGCTATTGGTGTGGATCTTCCTGTTCACGAACCCGCTGCAAGTATGATTATTGATATTGGTGGTGG
AACTACGGAGATTGCTATTATTTCTCTAGGAGGAATTGTAGAATCTCGTTCTTTACGTATTGCTGGTGAT
GAATTCGATGAATGCATTATCAATTACATGCGTCGTACGTATAATCTTATGATTGGTCCCCGTACTGCTG
AAGAAATTAAGATCACCATTGGTTCTGCGTATCCTTTGGGAGATCATGAACTTGAAATGGAAGTTCGCGG
TCGTGATCAGGTGGCAGGACTGCCAATTACAAAAAGGATTAACTCTGTTGAAATTCGTGAATGTTTAGCA
GAGCCTATCCAACAAATTATCGAATGCGTCCGTTTAACTTTAGAGAAGTGTCCTCCCGAACTTTCTGCTG
ATTTAGTTGAGCGTGGTATGGTATTGGCTGGGGGTGGGGCCTTGATTAAAGGTCTCGATAAAGCTTTGAG
TAAAAATACAGGACTTTCTGTAATTACTGCACCTCATCCTTTACTTGCTGTTTGTCTAGGAACAGGAAAG
GCTTTAGAACACTTAGATCAATTCAAAAAACGCAAAGGGAATATGGTATGA
>ref|NC_003361.3|:c1064298-1060798 SNF2 family helicase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCTTAATTTTCGCAAATTACGAAGGGATTTTACAGCTAATATTTTGCAAGATGGCAAGGAACTTTTTG
ACCAGGGAGCTGTGATTAATGCGAAGATCCTGTCAATGAATGGAGAGTCGGTGTGTATAGGAGCACAGGT
TCGAGGTCTATACGACAACGTATATGAATGTGAAATAGAAGTTGATCGTTCGAAATCTGATACTATAGAT
TCTAACTGTGATTGCTCTTATAACTATGACTGTCAGCACATAGTAGCGCTACTGTTTTACTTAGAGAAAT
ATTTCAATGAAATGGTGGTGGCCTACTCTCAGGAGGCTGATTTAGAGACGAATCAAGAAATAAATGAAGA
AGTTAAGAAAGAGCTTCAAGAAACTTTTGTAGCTGCTGCAAGTAGGGAAGAAGAAAGAAAAGACCGTGCG
CATCAAAAAGAAATCTTAAGTGAATACGTTCATGCAGCCAATGCGTTGAGTGCAAATCCATTTTTCCTTC
CTCAGGAATATTTGGAAAAAAATTCTGCAGAACTTGCTGTTTTATTTGTTGCTTCTAATGACGAGGTATT
CCGTCCGAATCAGCATGTGGAATTCCAATTAGTTTTACGTCTTCCTGGCCGTTCTAAGCCATTTTATATT
TCAAATATTAAAACTTTCCTTGAAGGAGTTTTGTATCAAGAACCGATAATCCTTAATGGTCGTCGTTTCT
TCTTCACAATGCAATCTTTCAATGTTTCCGATCGCAAACTTATAGATTTATTGATCCGTTATGTTCGTTA
TGCGAATCAAGCCCCTGAAGAAAAGTTATTGAAATCAGCCTATCTGACGTTGACATCATTAGGTGTGATT
TTGGCAAAAATGTATGAACATCAGATGGCAGATCGTGGTGGGGGACAAGTCGGAGAGAAAGAAAGTTTTT
CAGGTATGTTTTGTGGGAACCTTGAAGAACCTTTATATTGGTCGGCTTCTGCCGCTAAGATGAAGTTTGA
TTTAGATTTTTTCGATACCCCCTACAAGGCACTATTAATGACGCCATTAATTCTTGTGGATGATGAAACT
CTTCAGCCTGAACAGGCGATTCTTTTAGAGTCTAATGTACCTGGAATTATCCACAATAATGTCTACCATC
ATTTTGCTCCTCAGATTCGACGAGCACATTTACGTTCTTTCTTAAGGCTGCGAGATATCACGATTCCGGA
AGCTTTGTTCGGATCTTTCCGGGAAAATGCGCTTCCTGTGTTTAAGGAATACGCTGAGGTTTCTAATGTT
GAAGTTTTAAATCCCTTTGTTACTCTTCCTTATGTTGAGGATATCCGTGGAGTCTGCAATATAAGTTATT
TAGATGGGGAGTTAGAAGCGAAGTTACATTTTATCTATGATTCGCTCACGATTCCTGCGGCTTCGTTTGC
TTTAAAATACCAAGATGTTCATGCGTTTATTCGTGATGATGGAATTTTAGCTAGGAATCTTGTTGAAGAA
CGTAAGATTACAGAAGAGGTTTTCTCAGGCTTTATTTATGACGAGCGCGACGGTGCTTTTCATGTAAAAA
GTGAAAAGAAGATCGTGGAGTTTATGACAGAAACGATCCCGAATAATCAGCATAGGATTACATTTAACTG
CCCTGAGACGCTCTCGGATCAATTTATTTATGATGAAACAGTCTTTGATCTTTCCTTTAAAGAGAGTTCA
GAAGTTAATACTTATGAAGCCGAGCTCAAAGTTAATGGCTTACTGAAGGGAATTAGCTTAGACTTACTTT
GGGATTGTATAAGTGCTAAAAAGCGTTTCCTAGAGTTGCCTAAGAAAGGCCGTAATGTAAAAACTCCTAG
AAGGGGTAGAGCTTCTAGCACTACGAAACTTCCATGTATTTTAGTTTTAGATTTAGAAAAGATCTCTCCA
GTTGTTCAGATTTTTAATGAAATAGGCTTTAAGGTTCTTGATAACTTTGTAGAAAAGTGTCCTTTATGGA
GTTTGACAGGCATTTCTCCTGAGATTTTCAAAGGTTTACCAGTCAATTTTACAATGACGGATAAACTTGC
TGAGATACAAAAGCAAATTCGTGGAGAAGTCGCTTTTGATTTCCAAGCTGTTCCTGAACAAATACAGGCG
ACATTGCGTAGTTACCAAACAGAAGGAATTCACTGGTTAGAGCGTCTTAGAAAAATGCATTTAAACGGTA
TTCTTGCTGATGATATGGGCCTTGGAAAGACCCTGCAAGCAATTATTGCCATTACACAAAGTAGATTAGA
GAAGGGAAAGGGATGTTCTCTCATCGTCTGTCCAACATCCTTAGTATATAACTGGAAAGAAGAATTTCGC
AAGTTCAATCCAGAATTTAAAACTATGATAGTGGATGGAATTCCTTCTCATAGACGTAGACAGTTGGCAG
CTTTGTCGGAATATGATGTTGCTATTACTTCTTATAATCTGTTGCAAAAGGACATCGACACCTATAAGGA
TTTTGTCTTTGACTATGTAGTTTTAGACGAAGCCCATCATATTAAGAACCGCACGACGCGTAATGCGAAA
TCTGTAAAAATGATTCGTTCGGGACATAGGTTAATCTTAACAGGTACTCCTATCGAAAATTCTCTCGAAG
AATTATGGAGCTTGTTCGACTTCTTGATGCCTGGTTTATTGAGTAGTTACGACCGCTTTGTTGGTAAGTA
TATCCGCACAGGCAATTACATGGGGAATAAGACCGACAATATGGTTGCTTTGAAGAAGAAGGTCGCGCCA
TTTATTCTTCGTCGCATGAAAGAAGATGTATTGGAAGATTTACCGCCTGTTTCAGAAATTCTGTACCATT
GTCATCTTACAGATTCTCAGAAAGAGTTGTACCATTCGTATGCTGCTTCAGCGAAGAAAGAGCTTTCTCG
TTTGGTTAAACAAGAAGGATTCGATCGTATACACATCCATGTTCTTGCAACGCTTACACGTTTAAAACAA
ATCTGCTGCCATCCAGCTATCTTTGCAAAAGATGTTCCTGAACCAGGCGATTCTGCAAAGTATGATTTGC
TGATGGATCTTCTTTCTTCTCTTGTTGAGACGGGGCATAAAACGGTTCTCTTTAGTCAATACACCAAGAT
GTTAAGCATCATCAAAAAAGACCTAGAGGCTCGTGGAGTGCGCTTTGTTTATTTAGATGGTTCCACCAAG
AACAGATTGGAGTTAGTCAATCAGTTTAACGAGGATCCGGGATTACTAGTTTTCCTGATTTCCTTAAAAG
CTGGAGGAACAGGATTGAACCTTGTTGGTGCGGATACGGTAATTCACTATGATATGTGGTGGAACCCTGC
TGTAGAAAATCAAGCTACCGATCGGGTGCATCGTATAGGGCAGAATCGCTCAGTGTCTTCATATAAGCTA
GTTACGTTAAATACCATTGAGGAAAAAATTCTATCTCTTCAAAACAGGAAAAAGAGCCTTGTAAAGAAAG
TGATCAACTCTGATGATGAAGTCGTTTCCAAGTTGACTTGGGAAGAAGTGCTAGAATTGCTACAGATATG
A
>ref|NC_003361.3|:1064594-1065919 trigger factor [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTACAGTAAAAACCACACCGCAACTCTTAGATAAACTTCATAAACAGGCTATAAAAAAAATAAAAAAAGA
TGTTGTTCTACCAGGATTCCGCAAAGGTAAAGCTCCTGATGGAATTATCGTTTCTCGTTATCCTAGCCAA
GTCACAAGAGAATTAAACCAATTATTGATTCAATCAGCTTACCAAGCCTTATCTACTGTAGGAGACCGAC
GACCTCTTTCTCCACAAGCCATCAAGTCTACATCTGTAGCAAAAGCAGATTTAAACGAAGGTGGACAAGT
AGATTTCACTTACGAAGCCTTTCCTGTAATTTCTGATATTTCTTGGGACAAACTATCTCTAACAGAAGAA
GCTCCTGTAAAAGATATCACTGATGAAGAAATAGAAAAGGGATTACTGAATATCTCTTATTTCTTCGCTA
CAAAAACTCCTGTAACTCGTCCTTCTCAAGAAGGAGATTTCATCTCCTTATCTCTTCATGTTTCCAAACA
AAATGAAGAAGGAACTCCTACAGCAATCTTTGAAAATAAATATTTCAAACTCTGTGAAGAGGAAATGACC
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ACATCCAATCATTTTTAAATGGGGATGTTCTAACCTTTACTGTTAATGCAGTCATTGAAGTTGTTGCTCC
AGAACTTGATGATGAGAAAGCTCGTCAATTACAAGCTGAATCTTTAGAAGATCTAAAGAAAAAGCTACGC
ATTCAATTAGAAAATCAAGCAAAAGACAAACAGCATCAACAACGCTTTACTGAAGCGGAAAATGCCCTAG
CAAACATTGTCGATTTTGATCTTCCAACATCTATGTTAGAAGATCGTTTAGCCATGCTAACGAGAGAAAA
ACTCCTCAACGCTCGTTTGATTCAATATTGTTCCGATGAAGAGTTGGAAGATAAAAAATCAGATTTATTA
AAAGAAGCAGAAGCAGACGCTAAAAAAACTTTAAAACTATTTTTCTTAGCAAACAAGATTTTCACAGATG
AAAAGCTTGTGATCAGCCGTGAAGAACTTCAATATATGATGGATGTATGCTCTAGAGAGCGTTACGGAGC
CCAGCCTCCTCGAGATATATCTAATGAAGCTTTGCAAGAACTCGTGATGACTGCTCGCGATCGCTTAACT
TACCATAAAGCTATGGAAAAAGTTCTACTCAAAGCGAAAGAATTAGCGACAGCACCCTCTGCGTAA
>ref|NC_003361.3|:1066098-1066709 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit [Chlamydophila caviae GPIC]
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GTTGCTTTTCCTCATGTCTGAAGATCCTAAAAAGGATATTAAAGTTTTCATTAACTCTCCTGGCGGATAT
ATCACAGCTGGATTAGCTATCTATGATACTATTCGTTTCTTAGGTTGCGATGTAAATACCTATTGCATAG
GTCAAGCAGCTTCTATGGGAGCTCTGCTACTTTCTGCAGGAACTAAAGGTAAGCGTTATGCTTTACCTCA
TAGTCGGATGATGATCCACCAACCTTCAGGAGGGATTATAGGAACCTCTGCAGATATTCAATTGCAAGCT
GCAGAAATTCTAACGTTAAAAAAACACCTAGCAAACATTCTTTCCGAGTGTACAGGACAATCTGTAGAAA
AAATCATAGAAGATTCTGAAAGAGACTTCTTTATGGGAGCTGAGGAAGCTATCTCCTATGGTCTAATTGA
TAAAGTGGTCTCTTCGGCAAAAGACACGAAAGATAAGGATACTATCTCCTAG
>ref|NC_003361.3|:1066719-1067984 ATP-dependent protease ATP-binding subunit [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAACAAAAAAAATCTCACTATTTGCTCTTTTTGCGGGCGTTCTGAAAAAGATGTGGAAAAACTTATCG
CAGGTCCTTCTGTTTATATCTGTGATTACTGCATCAAGTTATGCTCAGGGATTTTAGACAAGAAACCTAC
TTCTACTCCATCATCAGGAACGCCTACAGAAACTACGCCTCAGCATTCGGATCTTCAAGTTCTTACTCCA
AAAGAGATCAAAAAACATATCGATAAATATGTTGTAGGCCAGGAAAGAGCAAAAAAAACCATAGCTGTGG
CAGTATACAACCACTATAAGCGCATACGTGCGTTATTAAACAATAAACACGTAAGCTATGGGAAATCCAA
TGTTTTACTCCTAGGCCCTACAGGATCAGGGAAAACCCTTATTGCTAAAACCTTAGCAAAAATCTTAGAT
GTGCCTTTTACCATTGCTGATGCCACAACTCTTACAGAAGCTGGCTACGTCGGTGAAGATGTGGAAAACA
TTGTTTTAAGATTGCTACAAGCTGCTGATTATAATGTTGCCAGAGCAGAACGTGGGATTATCTACATCGA
TGAAATTGACAAGATTGGTAGAACTACTGCTAACGTTTCTATCACTCGCGACGTTTCCGGAGAGGGTGTT
CAGCAAGCGCTATTAAAAATTATAGAAGGAACTACTGCTAACGTTCCGCCTAAAGGAGGACGTAAGCATC
CTAATCAAGAATATATCCGTGTAAATACAGAGAATATTCTTTTCATTGTTGGTGGTGCTTTCGTCAATTT
AGATAAAATTATTGCCAAACGTTTAGGAAAAACTACAATCGGATTTTCTGACGATCTAGGAGATTTTTCA
CAAGAAGATCGTGATCATTTACTTACTAAAGTAGAAACAGAAGATCTTATTGCCTTTGGTATGATCCCTG
AATTTGTTGGTCGATTCAATTGCATCGTTAACTGCGAAGAGCTCTCTTTAGACGAGCTTGTCGCTATTCT
TACCGAACCTACAAATGCAATTGTAAAACAGTATATCGAGCTATTTTCAGAAGAAAATGTGAAGTTGATA
TTCGAAAAAGATGCCCTATATGCTATAGCGAAAAAAGCTAAGCTGGCAAAAACGGGAGCTCGTGCTTTAG
GTATGATCTTGGAAAACCTCCTCAGAGATCTGATGTTTGAGATTCCTTCCGATCCTACCGTAGAGGCAAT
AAGGATTCAAGAAGACACAATCTTAGAGAATAAAGCTCCGGTAATTATCAGAAGAACTCCTGAAGCTATA
GCTTAA
>ref|NC_003361.3|:1068014-1069246 poly(A) polymerase family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACAACGATCGCCCTAGAAGCTGCAAAAAAAATTCTCTTGAAATTGCGTAACTCTGGTTACCAAGCAT
ATTTTGTTGGTGGTTGCGTTCGCGATATGCTCATGGGGAAACCCATAGAGGATATCGATATTGCCACCAA
TGCTCCCCCCGTCATTGTTTCTACTATCTTTACCGACACTTTATCCTTAGGTGCTGCTTTCGGCATTATC
GTTGTTAAAGAAAATAACCGCTTATTTGAAGTAGCCACATTCCGTAGTGATGAAAATTATGAAGATGGAC
GCCATCCCGAACGCGTTGTATTTTCATCGATGAAAGAAGATGCCCTACGTCGAGATTTCACAATAAATGG
GATGTATTATGATCCCTTTGAAGAGAAACTCTTTGATCTTGTTGAAGGAAGAAGAGATCTTGAAAAACGC
GTTGTACGTGCCATTGGTCATCCTAAATTACGTTTTTCAGAAGATAAACTCCGTATACTACGTGCCGTAC
GCTTTAGCAGCTCATTAGGCTTTTCTCTAGACCCAGCTACAGAACGCGCGATTATTAAGGAAGCCCCCAC
CCTAGTAAATTCCGTATCTCCGGAAAGAATCTGGCAAGAACTAAGGAAAATGCTGAAAAAAAATCCTTAT
GAAGCCTTGTCCTTATTGATAAAACTGAAGATCATTACCGTGATTTTCCCAGAGCTTCGCGATGTTCCCC
CTAGCCTATTACGAGTCAATATCGAGTTTGCCAAAAAACTTAATCCCCTAGAATTTCCGGAAATTTGCTT
CCTACTCCCCCTATTTCAAGGAGTCAGCGAAGAAGCCGCTTGCGTAGCATTTACCCGCCTACGGGTATCA
AACAAAGATTTAAAACTAATACAACTATGGTATCAAGCACTTCCACAATTTCAAAATATTAGTAATAATC
GTGTTTTTTGGGCTCATTTTTTAGCCTCACCAACAGCACATCTATTTCTATCCCTATTTTCAGCAATCCA
AAAAGACCCTTCCAAACAGCAGCATTTTATTGCTCGCGTTCAAGAATTAGAAACACGCCTAGAACAATTC
ATTTTAAGAATCAAAACTTCTTCACCCCTGGTTTCTGCTCCAGACCTTATTTCTAGAGGGATTGCACCAG
GTCGACTACTCGGAGATCTTTTAAGGGAAGCTGAAACACTTTCTATAGAAAATGAGTGTCATGACAAAGA
AAAAATTTTATTGCTTCTAAAGGAAAAAGGCTTCTGGAAGTAA
>ref|NC_003361.3|:1069368-1070792 GTP-binding protein EngA [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCTACGGATCGCTATTTTAGGAAGACCTAACGTCGGGAAATCCTCTCTTTTCAACCGCATGTGCAAAC
GATCTTTGGCTATTGTCAACTCCCAAGAAGGGACAACACGAGATCGCCTATATGGAGAGATACGTGGATG
GAGTGTTCCTGTACAAGTAATTGATACTGGGGGCGTTGATAAGGATTCCGAAGATCACTTCCAAAAGCAC
ATCTACAAACAGGCTTTAGCGGGAGCTAACGAAGCAGATATTTTGCTGCTTGTTGTGGATATTCGCTGTG
GCATTACGGAGCAAGATGCCGAGCTAGCCAAAATGCTGCTTCCTTTAAACAAGCCTTTGATCCTCGTCGC
GAATAAAGCGGATACTTTCAAAGATGAACATCGTATTCATGAATTATATAAACTAGGAATCTCTGAGATT
CTTGCTGTATCAGCAAGTCATGACAAACATATTGATAAGCTTTTACAAAGAATTAAAACTCTCGGTAATG
TTCCTGAAGTTGTGGAAGAATTTTCAGAAGAAGAGGTCGAAGAAGAAGCCGTTCCTTCAATGGAACTACT
CTCCAAAGAGCCTTTATCAGATTATGAAGAAGAAGAAATCCCCTTCTCTACAACATCAGCACCAGATAAA
CCTCTAAAAATTGCTCTTATTGGTCGTCCTAATGTAGGAAAATCTTCCATTATTAACGGACTATTAAATG
AAGAGCGCTGCATCATCGACAATGTCCCAGGGACAACTCGCGATAACGTCGATATTCTATACTCTCATAA
CGACCGCTCGTATCTATTTATAGATACAGCCGGTCTAAGAAAAATGAAAAGTGTAAAAAATTCTATAGAG
TGGATCTCTTCATCTAGAACAGAAAAGGCTATAGCACGCGCAGATGTTTGCTTACTAGTCATTGATGCTC
AACATCATTTATCTTCTTACGATAAGCGCATCCTTTCTTTAATATCTAAACATAAGAAACCTCATATCAT
CCTCGTTAACAAATGGGATCTGATAGAAGGTGTACGTATGGAGCACTATATCCGCGATTTACGTGCTACT
GATGTTTATATCGGTCAATCTAGGATTCTCTGCATATCAGCAGCGACAAAACGTAATCTACGTCATATCT
TTTCATCAATTGACGAGCTCTATGAAACCGTATCCAGTAAAGTACCGACACCTGTTGTTAATAAAACACT
CGCCTCAACACTACAAAAACATCATCCTCAAGTAATTAATGGAAGAAGATTGCGTATTTACTACGCCATT
CATAAAACGGCAACACCCTTCCAGTTCTTATTATTTATTAATGCAAAATCATTACTAACTAAACATTACG
AGTGTTATTTAAGAAATACTTTAAAATCATCTTTTAATTTATACGGGATACCTTTTGATTTAGAATTCAA
AGAAAAAACGAAAAGAACAAATTAA
>ref|NC_003361.3|:1070867-1071397 hypothetical protein CCA00924 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CAGAAGAAGCTTTCTCCTTGGATAAATACCAAGAAACTGGAGTTTATGTTGAAGAAGACAAGGAAAACGG
CGATCTCCTTATCGTTCTTGGAGAATCTATCCTTAAAGGCGTTATACGTCAATTCTATATCAGTGATGAT
AACCACGCGTACACACGTAGCTGCCTGACAGGAGATTGGGAATTATGGTTTAATATTCCTCCAAAAACAA
TAGAAAGCAAAACTTACGACTTTAACTCTCTATTAGAATCCGATTTCCTTCTTACTACAAATGTAGAAGC
GTTTGCAAATGCTCCTAAAGATTTCCCTAAAGGTTCAGAATCCTTAAATAACATTATTATTTGCATGACG
ACTCGTAATCGCGATCATCATGTACAGTTTCTGATTGGGGATAATCATAGAACATTTTGGATACGCCACC
ATGATGGAGATGCATGGTCTGAGTGGTCCACATTCATTTAA
>ref|NC_003361.3|:c1074368-1071456 preprotein translocase subunit SecA [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGGATAAGGTAAATCTCTATGATGAGATGCTTGCTCCTTTGTCCGATGAGGAGTTGCGTAATAAAACAGT
AGAGTTAAAAAAACGCTATCAGGAAGGCGAATCCTTAGACGATATGCTTCCCGAAGCTTATGCCGTTGTT
AAAAACGTATGTAGGCGTTTAACAGGAACCCCTGTAGAAGTTTCTGGTTATCATCAGAATTGGGACATGG
TTCCCTATGATGTTCAGATTCTCGGTGCCATAGCTATGCATAAAGGCTTTATCACTGAGATGCAAACAGG
CGAGGGGAAAACTCTTACAGCAGTTATGCCTTTATATTTGAATGCTTTAACAGGCAAGCCTGTGCATTTG
GTCACAGTTAACGACTACCTTGCTCAAAGGGACTGTGAATGGGTTGGCTCTATATTGCGTTGGTTGGGTT
TAACTACCGGAGTATTGATCGCAGGTTCTCCTTTAGAAAAACGAAAAGAAATCTATCGTTGTGACGTCGT
TTACGGCACAGCATCGGAATTTGGATTCGATTATCTTAGAGATAATTCTATAGCAACTTCTGTTGATGAG
CAGGTAGGCCGTGGCTTCTATTTTGCTATTATTGATGAAGTAGATTCAATTTTAATTGATGAAGCAAGAA
CTCCTTTAATTATTTCCGGACCTGGAGAGAAACATAATCCTGTTTATTTTGAGCTTAAAGATAAGGTTGC
TGGATTAGTTCAATTGCAAAGGGAACTATGCAACCAATTAGCTCTTGAGGCTAGAAGGGGATTAGAACTT
TACTTAGACATGGATATCCTTCCTAAGGATAAAAAAGTTGTCGAAGGGATCTCTGAATTTTGCCGTAGTT
TATGGTTGGTTAGTAAGGGAATGCCTTTGAATCGTGTTTTACGTAGAGTACGTGAACACCCAGATTTGCG
CGCTATGATTGATAAGTGGGATATTTATTATCATGCTGAGCAAAATAAGGAAGAGAGTATAGAGCAGTTA
TCTCAACTTTATATCATTGTTGATGAGCACAATAATGATTTTGAATTGACAGACCGCGGTATGCAGCAGT
GGGTTGATAAGGCCGGAGGCTCTGCTGAAGATTTTGTCATGATGGATATGGGGCATGAATACTCTCTCAT
AGATAGTGACGAATCTCTCTCTCCAACAGATAAAATTAATAGAAAAATTGCCGTTTCTGAAGAAGATACT
CAAAGAAAAGCTCGTGCACATGGTTTGCGACAGCTCTTGAGAGCGCAACTTCTTATGGAACGTGATGTGG
ACTATATTGTCCGTGATGATCAAATTATCATTATTGATGAGCATACAGGTCGTCCACAACCTGGTCGTCG
TTTTTCTGAAGGCCTCCATCAAGCAATAGAAGCAAAAGAACATGTCACCATCCGTAAGGAATCACAAACT
TTTGCGACGGTAACTTTACAGAACTTCTTCCGTCTTTATGAAAAGCTTGCAGGTATGACCGGAACAGCGA
TTACCGAATCTAAAGAATTTAAAGAGATTTATAATCTATACGTTTTACAAGTACCTACATTTAAAACGTG
CTTACGTATAGATCATAATGATGAATTTTATATGACAGAGCGTGAGAAGTATCATGCGATCGTTAATGAA
ATTGCTCGTGTGCACAAAGAGGGTAATCCTATTCTTATAGGGACAGAGTCTGTTGAAGTCTCTGAAAAGC
TTTCTCGTATTTTGAAACAGAATCGCATAGATCATACGGTTTTAAATGCGAAAAATCATGCTCAAGAAGC
GGAGATTATTGCTGCAGCTGGGAAGCTAGGTGCTGTTACTGTTGCTACAAATATGGCGGGTCGTGGAACA
GATATTAAGTTAGATGAGGAAGCTGTAGTCGTTGGTGGTCTTCATGTTATTGGTACAAGCCGCCATCAGT
CTCGACGTATTGATCGGCAGTTACGTGGACGTTGTGCCCGTTTAGGAGATCCTGGTGCTGCGAAGTTCTT
CTTATCTTTTGAAGATCGTTTAATGCGTTTATTTGCTTCGCCGAAGTTAAATGCTTTGATTCGACATTTC
CGTCCTCCTGAAGGAGAGGCAATGTCAGATCCTATGTTTAACAAGCTGATTGAAACTGCTCAAAAGCGTG
TTGAAGCAAGGAATTACACGATTCGAAAACATACTCTAGAGTATGACGATGTTATGAATAAGCAAAGACA
AACCATCTATGCTTTTCGTAATGAGATTATACGTTCTGAGGATGTCTTCCCCTTAGCTAAGGAAGCGATC
TATCATGTGTCGTTAATGATAGCTTCATTGATTACAAGTCGTAACCACCCTACGGGCCACTCTCTTCCTA
ATTTAGAAGAGTGGATGAACTATTCCTTCCCTATAAAGTTAAATCTTGATGAGTTGCGTAAGTTAACAAC
TTTAGACGCTATTGCAGAACAAGTAGCGGAAGATTTGATAGAAGTTTTCCAAAATAAGTTTTCTTCTATG
GTGGAGGAAATCACTACAGCTGCTGGAGATGATGTTGATGCTAAAGGTATTTGTAGAGACATCATACGTT
CAGTAATGATTATGCATATCGATGAGCAATGGAAAATTCATCTTGTAGATATGGATTTACTGCGTAGTGA
AGTAGGTTTACGTACGGTGGGTCAGAAAGATCCTCTAATCGAATTTAAACACGAGTCATTCTTACTATTT
GAAAGTCTTGTTCGAGATATTCGTATTGCCATTGTAAAACATTTATTCCGTCTAGAGTTAACTATGACTA
GGGAACAAAGACCGCAAAACGTGATTCCTGTTGTTGCGACATCATTCCAAAATGATGAGAACTTTGGTCC
TATGGAATTAACTGTTATCAGTGATGCTGACGACGACGAATAA
>ref|NC_003361.3|:c1075881-1074556 hypothetical protein CCA00926 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATATTTCCCGTTTCCGTCGTTATGCGGCGCAGATTATTCGAGAAGTTCATCTGAGCATGGAATTGAAAGA
ATGGTCTGTTGCTGAACAAAAGCTCCTGCCCATTTTAAAAAAGCGTTCCTACCGTCGTCAGTGTTTATTT
GATTACATGCGTATTCTTCGCGGTATGAATCGCTTTGATGAGGTAGAAAAGCTATTAGCCGAAGCTCAAA
AGTTAAATTTGAGAGGCCCTCAATTTTTATTAGAGATTGCTTACAAGGCTTATCGTCATGGAGCATATAA
AGAGTCTTGCCAAGCCTTTTCTTTGATTGCGAAAGATCTATTCGAAGAACAAGATGCTGCAAAGTATGCA
TCTGCTTTGGTGCATGTAGGACATTTGGATGCTGCGTGTAGTATTATTGAGCCTTGGATTTCTCCTTTAT
CCCATCAAGAGACCTACATTACCGTTGGGGATATTTACTTCACGTCAAAGCGCTATCAAGATGCTATAGA
GTTTTATAATCGCGCTTATGCTTTAGGCCCCTGTCCTGTAGAAGTTACCTATAACTTAGCGCATTCTTCT
CGTATTTGTGGTAACTATATTGAAGCAGGGAAGCTATTTCGCAAGTTATTATCCGAGCCAAGCTATAGAG
AAGAGTCTTTATTTAACATTGGTTTGTGTGAACAAAGACAAGGTCGATCGAGAAAGGCATTACTTATCTA
TCAAAGTAGTGATTTATGGTCTCGAGGAGATGCCTTGTTAATGAAACATGCAGCTTTCGCTGCTATGGAT
CAAAATGATTACTCACTAGCTGAGTACTGTTGGAATTTGGCATTCCAATGCGCTGCATACGCTGAAGATT
GGCAATGTGGTTTAGGCTATGGATTTAGCTTATGTTGTTTAAAAAAATATTCTGATGCTGAAAAGATGTA
TCTTAAAGTCATTCAGAAAAATCCTTCCTGCCCTACAGCATGCAAAGCTTTAGCATGGCTTTCAGGAGTT
GGATACGCTTCAATAGTAACAGCAGAAGCTGGCTTAGAGTATGCAAAAAAGGCTCTCCAGTTAAATCATT
CCTTGGAGACTCTAGAACTATTAAGTGCCTGCGAAGCTCGTTCGGGAAATTTTGATGCTGCTTATGAAAT
ACAAGCGTTTTTATCGGCTCAAGATGTTTCTTTAGAGCAAAAGAAGCGCCGCTCGCAAATTATGCGTAAC
TTACGCCAGAAGTTACCTTTGAATCATCAGCATATTGTAGAAGTAGATACGCTACTTGCTGCTTAA
>ref|NC_003361.3|:c1076846-1075947 phosphatidylserine decarboxylase [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTATGATGTTTCTATACACCTCTAGATTAGGGAAAGGCGTGTCCACGCTATTATCGAGAACCCCATTTTT
ATCTCGTCTTTATGGCTGGATTCAAAAACGTTCTTGGACACGTAAAAAGATCCCAGGGTTTATCAAGAAA
AATCGCATCTGTACAAAAGAATTTAAAAAATCTATTTCCGAGTTTACCTCTTTCAATGATTTTTTTACCA
GAGAGCTGCGCCCGGAAGCACGGCCTATTGCTCGGGGGGACGATATCTGCGTCACGCCTGTCGATGGGGC
GTATTTGATTTATCCAAACATCGCCGAGTTCGGGGAGTTTGTTGTTAAATCTAAGCGATTCTCTCTTTCG
AAATTATTAGGCGATGCTAAGCTTGTTGAGAAATACGCCTCTGGCAGTGTAGTTTTTGCTCGGTTAGCTC
TTTTCGATTACCACCGTTTTCATTTCCCCGTAGACTGTTTGGCAGGACCGACGCGGAACATTAACGGTTA
TTTATTTTCTGTACACCCCATGGCGCTGAAAGATAATTTCAATATTTTTTGCGAGAACAAGCGTACGTTA
ACTGAACTGAAAACAGAGAAGTTCGGAGACGTGCTTTATTTGGAGGTGGGAGCATTAAATGTTGGTTCCA
TTGTTCAGACCTACACGGCAGAAAAAAAGTATTCTAAAGGCAATGAGAAGGGCTTTTTTGAAATCGGAGG
GTCTACTGTAATCGTGTTGTTTGAACCAGGAGTTATTCAGTTTGACGCAGACTTATTGAAGAACTCGCGG
ATGGGATTAGAAACACGTTGCCTTATGGGGCAGTCTTTAGGGCGTTCTTTGAGAGAATAA
>ref|NC_003361.3|:1077003-1078334 tRNA modification GTPase TrmE [Chlamydophila caviae GPIC]
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TATCGGGCCCGGAAGCTATTCAAATCACAGATAAAATATTCTCAGGATCCGTACCGTCTTTTGCCTCACA
CACCGCTCATCTGGGAATAGTAAATCATAAAGACCGTCAGATTGATCAGGTACTTTTGTTAATCATGCGC
GCCCCACGCTCATTTACTGGAGAAGACGTTATTGAGCTACAATGCCATGGCGGCTACTTCTCTTGTTCTC
AAATCCTAGAGGCTTTGGTATCCGAAGGGGCTCGGCCTGCTCTCCCTGGAGAATTTTCTCAACGAGCTTT
TTTAAACGGGAAAATAGATCTTATCCAAGCGGAAGCCATTCAAAACATTATTGCCGCTGACAACTTAGAT
GCATTTTTTATTGCTCAGAACCATTTCCAAGGGCATTTTTCTAAAAAAATTCAGCTGATTTCTTCATTGA
TTGTCGAATCCTTAGCTTTCATTGAAGTTCTTGCCGATTTTCCGGAGGAAGAACAGCCTGATATGGACGT
TCCTAAGCAAAGATTAAACGAAGCCATGCTCATTATTGAGGATCTTATATCGAGTTTCGATGAAGGGCAG
CGCCTCGCTCAAGGGACGAGTATTGTTCTTGCAGGCCACCCTAATGTAGGAAAATCTTCTCTTCTTAATG
CCCTAACGAATAAAAATCGCGCTATTGTTACCGATATTCCTGGAACTACAAGGGATATATTAGAAGAAAA
CTGGACGCTACAAGGAAAGCGTATCCGTCTTATAGATTCTGCAGGACAACGAGAAACTGATAATCTTGTC
GAACAAGAGGGCATCGAACGGGCAATTTCTGCCATGGAACAATCTGAAGGAATTCTTTGGGTTATGGATG
CTACGCAACCTCCGCCCTCTCTTCCAGAAATTTTATTTCAAAAACCTTCCCTCCTTCTTTGGAATAAATC
CGATCTTGCATCACCACCACAACTCGATACTTCGCTCCCCCAACTAGCTATCTCTGCAAAGACAGGGGAA
GGAATTTTTGAACTCAAACAATTTATCCAAAAATGGATGCAACAACAACAGCTAGGAAAGAACGCAAAAG
TCTTTCTTGTTTCTTCTCGACATCATACCATATTGCAACAGATGCGTTCGTATTTGCTCTCGGCTAAAGA
AGGCTTGCTAGCCCAACTCCCTCCCGAACTTATTGCTCTAGAGCTCCGACAAGCTCTACAAGCTACTGGG
AACCTTTCCGGATCTGAAGTTAATGAAACGATATTAGGAGAAATTTTTAGCAGGTTTTGCATTGGAAAAT
AA
>ref|NC_003361.3|:1078324-1078968 endonuclease III [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGGAAAATAAAACTCTTATTAAAAATTTTATCATTTCTACATTAAACGATCTCTTCCCAAATCCGAAGC
CATCTTTAACGGGGTGGGAAACTCCATTTCAGCTACTCGTTGCTATTTTGCTTTCAGGGAACTCTACCGA
TAAGGCTGTAAATTCTGTAACACCGGAATTATTTTCGGCAGCACCTGATGCGCAAGCATTAGCAAAACTT
CCCTTAGACAAGTTATACTTTATTATTTCTCCTTGTGGCCTTGGCAAGAGAAAGGCTGCATATCTTCACG
ATTTATCAAAAATCATTTCAGAAAAATATCGTGGCGAACCCCCAGCTTCTTTGGAATTGTTAACTAAATT
ACCTGGAGTGGGGAGAAAAACAGCATCCGTCTTTCTTGGAATTATTTACAATATGGCAACCTTCCCAGTA
GATACACATATCTTGAGACTAGCCCAACGTTGGGGCATCTCTAATAAGCGGAGCCCTTCAGCAGCAGAAA
AAGATCTTGTCAGGTTCTTTGGAGATATGAATTCTCCAAAACTTCATTTACAACTCATCTACTACGCCAG
AAACTACTGTCCGGCTCTCCATCATGATGTGAATACGTGCAGGATATGCTCGCACTTAAGAGATCTCTCT
AGAAAAACAAACTAA
>ref|NC_003361.3|:1079131-1080360 branched-chain amino acid transport system carrier protein BrnQ [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATAAAAACGCTTCTAATAGGGCCAGCTCTAAAAAAGAGCTCTCTGTTTGGTCGATTGGAGGGTCTA
TTTTTGCTATGTTCTTTGGAGCAGGCAATATAGTATTTCCTCTAGCCTTGGGTTATCACTACCATTCGCA
TCCTTGGTTCGCCTGTTTCGGAATGATACTTACTGCGGTTTGTGTTCCTCTATTAGGTTTGTTTAGTATG
CTATTGTATTCGGGAGACTACAAAAGTTTTTTTTCCTCTATTGGAAAGATTCCTGGGATGGTTTTCATTA
TAGCAATTTTATGTTTAATAGGTCCCTTTGGGGGGATACCTAGAGCTATTGCTGTATCACATGCAACTTT
AGCATCTCTATCTGATTCAAAAACAACATTACTCCCCAATCTACATATTTTCAGTTTGATTTGTTGTGTT
TTGATCTATCTATTCACATGTAAACTTAGTAAACTCATCCAATGGCTGGGGTCTGTATTTTTCCCCATTA
TGTTAGTCACATTGCTTTGGATAATTTTTAAAGGATTGACTATTCCTGCAAACCCCAGTTTCTTAGAATC
TGCAAATGCTCGACAAGCTTGGGTAGCTGGAATTGCAGAAGGCTTCAATACTATGGACCTTCTTGCAGCT
TTCTTCTTCTGCTCCATTGTATTAATTTCTATACGACAAATGATAGTAAATGGAGATGCTAGTGATGAAA
TACCTTTAAACTTTCAAAAAATCAGTAAAAAAGACAAACGCACTTTAGGTTTAGCTTTTGCTTTAGCTGC
GGCTCTTCTTGGAATCATTTATTTAGGGTTTTCCCTATGTGCTTCTCGGCATGCAGGTTTATTAACCCAT
GTAAATAAAGGACAAATTCTAGGAAAAATTTCTGCTATTGCTCTTGGACCCAATAGTTTATTGACTGGTG
TATGTGTGTTTGTTGCTTGCTTGACCACAGAGATTGCTTTAGTTGGGATTATTGCTGACTTCTTAGCCCG
CATTATCTCATCGAAAAGAATGACGTATTCTAATGCAGTAATTTTCACTCTGATACCCTCCTACCTAATT
TCTATTTTAAACTTTGAAAATATCAGTCTCCTTCTATTGCCCCTACTACAGCTAAGTTACCCTGCATTAA
TCGCTTTGACTTGCGGAAGTATTGCTTATAAGTTGTGGAATTTCCGACACGTCCAAGCTTTGTTTTATTT
AACCCTCTCTCTTACGATTATTTTACGATTAGTGAGTTGA
>ref|NC_003361.3|:1080395-1084012 Snf2/Rad54 family helicase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTTTTAAACGCTTTAGCTGGCTTTCGTCAAACAGCGATAGATTATCTCGCTACGAATCGCCAAGACA
TCGCTTTAGATTTTTCTGGAGATTGTTACAATATCCGCATCCCTGATGAAGATTCTCCTGATGGGAATTG
GCTCAGCACACTGAGATTTAGTGATATTGACAATCTAACTTTTGCCTCTTGTAGTTGCCCTGATGGGGAT
TGTTGCGTTCATTTAATGACCGCTTTTTTCTCTGCCTATGATGCTCACGGGTGGCTACCTCTACATCATA
AATTTGACATATCTTTTTGGCATGCATTGTTCTTGAAGTTATTTCTAGAAGAGGCGCAGTTGCATGCTGA
TGGTGACCGACAGTATTCTATAACATCTCCCCACATAACATTAGAGATTTCTGCGTTATCTTCGGAGGCT
TTTACAGAATGGTTGCCTATCATTCATCAAACTCCAGAACCTAAAACTTATACAAAGAAAACTTTCCCTC
AGTCTGTTTTATATCGCGTAGCAAAACAGTTTTTCTTCTTTTCTGAAGCAGGAGCACGTTTAGATCTTAT
TGAAAATAGTCAGGGTTTCCCTACGCAATTTGCAATGCAATGGGAAGGCATCTCTTTAAAAGGAGAGATT
TTAGATTTCTCTACTTTGGAAAATCTATTCCCAAAGATTAATTTCTCTCAAACATCTCTCCCCGGAAATT
ACAGTGATTTTTCTATAACGAAAGTACGCGTAGCTCCTGAAGAATCCAAAATATACTTCACCGTTGAACC
TATCGCGCACGATCATGCAAATCAACCTATAACCGAAATAGGCTCTATTGGCTATATAGCAGGGTCTCAA
CAGGTTATTCTTCCCTCAAAAGAAACCTTCGTTTCTATTTATCTGATCTCCCTCCTTCCTGAAACGCTGA
AAAAACAAATATTAGCACTGCTACATTACGATTCTGAAGAACGTCCTATTCGTTATTCTATTCATTTCTT
AAGAGACTCTTCTATTTCCTTTTCGGCATATTTAGACACTCCTGGAGATCTAGAGAATGGGAAATTAATC
TATCCTGATTTTTGTTATGTTCCTGAAAAAGGGTTATTCACAGTTGTAGGTTTACTCTCTCCCCAAATCT
CATTTGTTATTAAAGCAGATCAGGTTGAAGAGTTTTTAAATAATGAAGGTATGTTAATTCGCGAACCGGG
ATTTGAGGTATTTACCGATCGCATTCCTGAAGGCCAATTAACCTATAACATTACACAACAGGGTGTTTTG
TTATTCCATTACAACACAGGAAATCCCGCAGCTATAGACATTCATTATGGCCCGTGGACATACTATTCCG
GACAAGGATTCTTCTTACAAAGAAAAGCTGACTTAGAAATTCAGGATGGTTTGATTGTAGAAGCGGATCA
CATTCCTAACTTCATTATGAAGCATGAAGTTGTTTTACGAACGATCCCTAATTTCTTTGCTCCTACACCA
CCTTTGAAAAACCTTTTCTTTGAAGTGCACAAAGAAACAAAAGGTTCAGGGTTGTATTTAAAACCTGTAT
TTCAAGGTTTGGAAGAAGAAAATTGCCGCCTATTTGGCGTTTTCCTTTATCGGGAAAATCTCGGTTTTAA
CCTACTTCCTACTCCCTTACAACCCTTATGCTCACTCCCTAGAAAAATCCCCGCTGAACAAGTTCCGGAT
TTTATAAATCAAAATTCCCAGAATGATAAGCTTGTCTTCACAGATCCGCAGCTTTGTCCTCCGGTAACAT
TTGAACTGGTCATATTGTCCATAACACGACCGCATCCATCGTCACCTCTACATCTACATCTAGAACTCAA
GACAAATATTGGTTCTATACCGCTGGGCATCGTGCTGCAGGCGTTAAAAAACAAAAAGGCTTTTGTTTTC
ACTAAGGCGGGATTTTTAAGTTTCCAGCATTGCCTCTTTCAATTCTTAAAACAATTTATCTCGGCGCAAA
AATGTCTCATCCCTGAAAATACTGTAATCGCAACGGTTACAGATATCTTCAAATTAGATGCTTTAGCACC
TCTATCTACTCATGAACACATTAGCGCGAGCGCATCTGATTTAGCATTTTTCTCTCAGCTTAAAGCAGCA
TGTCTACCGCCTATTCCACAAAGTCTATTCTCTACAGATCACAAACTCCGCCCTTATCAAAATAGCGGCT
TATTGTGGTTATGGTTCTTATATAACCACCGTCTATCTGGATTACTTTGTGATGAAATGGGATTAGGGAA
AACTCACCAAGCCACAGCATTATTGGATATTGTCTTCCAATCGGCAGAGCCTACAGAACGACCAAAATTT
CTTATTGTCTGTCCAACAAGCGTGCTGCCTCATTGGGAACACACGTTAGCAACACACTTACCTACAGTAA
GTATTTTTGCTTTTCATGGTCCTAATAAACCTGAAAATCTTCCTCCTACTGATGTCATTATTACTTCATA
CGGCACTCTAAGGCAAAATTACGCCAAATTTTATAAGGTTTCATTTACGGTAACCGTGTTTGATGAAATC
CACATGGCAAAAAATAAAAATAGCCAAATTCATAAGATTCTCTGTCGCTTAGATTCTCAAATGAAATTAG
GCTTAACAGGAACCCCTATAGAAAATAACCTTCTTGAGTTCAAAGGTCTCTTGGATATCATTCTCCCCAA
CTACCTCCCGTCGGATGCTTTATTTAAGAAGCTATTTACAAAGAAAACACCTGCAGAAATAGATGATGAG
ATTATCCCTTCACAAGATCTATTACTCAAATTAACTCGGCCTTTCATTTTAAGAAGAACGAAAAAGCTTG
TCCTTCCTGAGCTTCCTGAAAAAGTAGAATCGATAATTCCTTGTACGTTATCTCCAGAGCAAAAAAAGCT
CTACCAGTCTACATTGAAGAGAGAAAAAGCGCAGATTCAACAGCTGGAATCTCCAGAAGAACAAACTGTC
AACTACCTCCACGTATTCGCCTTATTGAATCACTTAAAACAAATCTGCAATCATCCAGCAATCTTCTTCA
AAAATCCCGATAAATACCGAGAACACGAATCCGGAAAATGGAATGCTTTTGTACGCCTTCTCCATGAGTC
CTTATCCTCGGGATATAAAGTTGTTGTATTCTCACAATACATCCATATGATTCGTATTATCATGCTGTAT
CTTGAAGAGATCGGCGTGAAATATGCCTCTATTCAAGGAAAATCCTTAAATAGAAAAGAAGAGATCGAAT
ACTTCACCACAGATCCTGAATGTCGCGTATTCGTAGGTTCCCTACTCGCCGCAGGAACAGGCATTAACCT
TACCGCCGGTAACGTCGTCATTATGTACGATCGCTGGTGGAATCCTGCTAAAGAAAACCAAGCTTTAGAT
CGTGTTCATAGAATAGGACAGAAAAATACAGTATTTATCTACAAGCTCATGACTGAGGATACGTTAGAAG
AACGTATTCACTACCTCATTGAAAAGAAAATTCGCCTATTGGATAAGGTTATCTCTACCCAAAACTCTAA
TATCCTCCATATGTTAAATAGAGAAGATCTCATTACGATTCTATCTTATAAAGATGAACGCAATGGAGTC
GATGATACAGCGAATATTCCTAACGATGAAGAAAACTCTATCTTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c1084502-1084035 hypothetical protein CCA00932 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCCATTTGCTAAAGAAGCAGATATGCAGCGCACGTGTTGGAAGTGTGAGGGTAGCGTATCCATGCATA
TGCCCCAATGTCCTTACTGCAGTGCGTTTCTTCAAGATCCTCCGGTAGCTTCGGGAGGGTTTTCTTCATG
CCATATTTCTTTTCCAGAAGGTTCTACAAAGGGCGAGTCTGAAGATCTTTTTGCGGTTTCTTCAGAAGAT
TGGGAAGCTGTTCTCAGCGATCAAAATACTTTCCAAAAGCCTACGGAACAATCTGAAGCAGATTGGAACT
GGTTACAGCAGTGGCCACTTGTTGCCTTATTTTTAGGCGCAGGATTTTTAGCCTTTGCTTTGATTATTCT
TTTATTTGCTACAGATGCTGGGTTGACTTTGACATGGCCTAAAAACCGTGCCTATCTTTATGGAATTATA
GGCGCTGTATTTGCCTATCGTGGATATTTGAAGCTTTCTCAAGAATAA
>ref|NC_003361.3|:1084766-1086154 dihydrolipoamide dehydrogenase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGTACAGATTTTGACTGTGTTGTTATTGGTGCTGGACCTGGAGGTTATGTTGCAGCAATTACTGCAG
CACAACAAGGGTTAAAGACCGCACTTATCGAAGAACAACAAGCCGGAGGCACGTGTTTAAATCGTGGCTG
TATTCCATCGAAAGCGCTATTAGTAGGCGCTGGTATTGTTTCTCAAATTAAACATGCCAAACAATTCGGA
ATACATATTGATGGTTATTCCGTAGATTACCCCACAATGGTCCAAAGAAAAAACACTGTCATCAATGGCA
TACGTCAGGGATTAGAAGGGCTTATACGTAGCAATAAAATTACCGTATTGAACGGTCGAGGATCTTTAAT
TTCATCCACAGAGGTAAGAGTTAAAGGTCAAGATACTACAGTAATCAAAGCTAAACATATTATCATAGCT
ACTGGATCAGAATCGCGTCCTTTCCCAGGAGTTCCTTTTTCATCCCGCGTCTTATGCTCAACAGGCATTT
TAAACCTAACTGAGCTTCCTAAAAAACTAGCGATCATCGGCGGTGGTGTTATCGGTTGTGAATTTGCTTC
TCTTTTCAACACTTTAGGAGTGGAAGTCACCATAATAGAAGTTGCTGATCAAATTCTTTCCGTAAACAAC
GCTGACATTTCCAAAACTATGCTAGATAAGTTTTCACAGCGGGGAATTCAGGTAATCACTAGGGCATCTA
TTAACCAGCTGGAAGACCTTGGTGATAGAGTAAAAATCACGGTGAATGATCAGCCACAAGAATACGAATA
TGTTTTGGTTGCTATCGGACGTCAATTCAACACTACAGACATTGGTTTAGACAATGCTGGAGTGATTCGC
GATGAGCGCGGTGTCATTCCTGTAGATGAAATGATGAGAACCAATGTTGCCAATATCTTTGCTATTGGAG
ATATCACAGGAAAATGGTTACTCGCTCACGTTGCTTCTCATCAAGGAATTGTTGCGGGTAGAAATGCTGC
GGGCCATAATGAAATTATGGATTATTCAGCAGTTCCTGCGGTGATCTTTACCTTCCCAGAAGTCGCCATG
GTAGGCCTTTCTTTAGAGGCAGCTCAAAAACAAAATATCCCTGCAAAACTTACGAAGTTTCCGTTTAAAG
CTATTGGGAAGGCCGTTGCCATGGCAGAAGCTGACGGCTTTGCAGCTATTATTAGCCATGAAACTACACA
ACAGATTCTTGGTGCTTACGTTGTAGGTCCTCATGCAGCGTCATTAATTGCAGAAATGACCTTGGCAGTA
CGTAATGAACTGACCTTACCCTGTATCTATGAGACTATCCATGCCCACCCAACACTTGCCGAAATTTGGT
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>ref|NC_003361.3|:1086151-1087089 lipoyl synthase [Chlamydophila caviae GPIC]
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GGCTAAGGCAAGTTTTACCTACTGGTCCAGTCTTTGCCCAAACAGATACAACGATAAAGCGCACGGGAAT
GGCCACGGTATGCGAAGAAGCTCTATGTCCCAATCGGGCATGTTGCTGGTCAAGAAAGACAGCAACCTAT
CTAGCTTTAGGAGATGCGTGCACAAGACGTTGTGGTTTCTGTAACATTGACTTCACGAAAAAGCCTATCT
CCCCTGATCCTGAAGAACCTCAAAAAATTGCAGAATCAGCAAAAATTCTTCAGCTTAAGCATATTGTTTT
AACCATGGTAGCCCGTGATGATCTAGAAGATGGCGGTGCAAGTTTTCTCGTGCGTATTATTGATACTCTA
CATCAAGAGCTTCCAGAATCTACTGTCGAGGTATTAGCTTCAGACTTTCAAGGAAACATTGATGCTTTAC
ACACACTATTGGATTCAGGATTAACCATTTATAATCATAATGTGGAAACGGTTGAACGTCTCACACCTGT
AGTACGTCATAAAGCAACATATCGTCGTTCTTTATTTATGTTAGAGCAAGCGGCTATGTATCTCCCTGAT
CTTAAGATTAAATCAGGAATTATGGTGGGTCTTGGAGAGCAGGAAAGCGAGGTAAAACAAACGCTAAAAG
ATCTTGCAGATCACGGAGTGAAAATCGTCACCATAGGACAGTATTTACGTCCTTCCCGATCACATATACC
AGTAAAAAGCTACGTTACTCCCGAGACTTTTGATTACTACCGTACAATAGGAACGTCTTTAGGGCTTTTT
GTCTATGCAGGACCTTTTGTTCGTTCTAGTTTCAATGCAGATATCGTCTTGCATAATCTGGAGAACAAAC
AATCTGATGTAGCAAAAATGCAGAATTAG
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GCAGATCGTTAATCGTTCATGGCCTTCCAGGAAGGGAAGCTAATGAGATTGTCGTTCTTCTTGTTAGCAA
GGGCGTCGCAGCACAAAAACAACCACAAGCTGCAGCTTCTACAGGAGGCGCTGCTACTGAACAGCTATGG
GATATTTCCGTTCCCGCTCCACAAATTACCGAAGCTTTAGCAATTTTAAATCAGGCTGGTCTTCCTCGTA
TGAAGGGAACAAGCCTCTTAGACCTATTCGCCAAGCAAGGTCTTGTTCCATCAGAAATGCAAGAGAAGAT
CCGTTATCAAGAAGGTCTTTCCGAGCAAATGGCCTCTACTATTAGAAAGATGGATGGGATTGTAGATGCT
AGCGTACAGATCTCTTTCACAACAGACGCTGAAGATAACCTTCCTTTAACAGCCTCAGTGTATATCAAGC
ATCGTGGAGTTTTAGATAACCCTAATAGCATTATGGTTTCTAAGATCAAACGATTAGTTGCTAGTGCTGT
TCCAGGTCTTTCTACAGAAAATGTTTCAGTTATTAGTGACCGCGCTTCTTATAGTGATATTACTATTAAT
GGTCCTTGGGGATTATCCGATGAAATCGACTACGTTTCCGTATGGGGAATCATCTTGGCGAAATCTTCAT
TAGGTAAATTCCGTCTTATCTTTTACTTCTTGATACTTACCCTATTCGTGATCTCTTGCGGATTGCTTTG
GGTAATTTGGAAAACACATACATTGATTCTTTCCTTAGGTGGAGCTAAAGGTTTCTTCGATCCCTCTCCA
TATTCTAAAGTTGCCTTAGAAGCTAAGAAACCTGAAGAAGGTGCTGGAGAGAAAAAAGAAGGAGCTGCGC
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TGAGGAGGTCTAG
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TTTTGCCGGAAAATCTCCTAGTCGCGCCTACGCACCATGAGGATATTCCTCTAAATTCTTTATCTTTTAC
TATGTGCTGGTTAGCGACAATTCATCCTTCATGGATTAGCGTAGCTATTAAAGAATTCCCTGAGGTAATA
CAAAGCCAACTACTCTCTTGGCTACCAGACTCTTTAACTCAAGAATTAGCTCCTCTGCTTCCGAATATTT
CCATTGCGAAACAACGTTGCTCTAATTTCGGAGCTTTCTATCTATTAGATATGTTGAGCAAAAAAATCCG
TCCTCCAGGAATTACCGAAGAGATATTTCTTCCTCCTTCGCCGTTCAATGCTATGTTGTATTATTCAGGA
ACGACGAAAATGACCCTGATTAATTGCTTAGGACTATTTTCCGTAGCAAAAGAACTGAAAAACATTGTTG
ATAAGGTGATTATCGATCGTGTCCATAAGATCCTCTCTCCTACAGAACAACTGTTTCTCTCTTATTGCCA
ATCACATCCTATGAAACATCTTGAAACAACGGAATTTCTAGTTTCTTGGGAGAAGGATAATGATTTCCGC
AATTTTATTCACAAACAGGGATTGCAGTTTCTTGCTGTAGCATTGGCAAAAGAAGATGCCTCTTTCCTCT
GGTATTTTCTACGTAGGTTGGATATCGGTCGGGGTTATATTTTTGAACAAGCTCTACGAAAATCTTATGA
GCATCCTCACTGTGATTATTTTAAGAGCCAATTAGAATTATGCATAAAGATCTTAGTACAATAA
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CTTTTTCAGCTCTGCTTGACGCTAAAGAACTCTTAGACAAAATAAAAGAAGATAGTGAATCTTACACTAA
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CAATGGAGTTCCCAGCTTGCTTATTTAGAAAAAGAAACCCATGATCTTCGTAATAAGGTTAAGGAAGCTC
TTGTTCCTTTAGCGATTGCTAGTGTGAAAAAAATTCTCGGTAAAGAATTAGAAATCCATCCTGAAGCGAT
AGTCTCTATCATTGCCAAAGCACTAAAAGAGCTTACGCAACATAAAAAAATTATCATTCACGTAAATCCT
AAAGATCTTCCCATTGTTGAGCAAAACCGTCCCGAATTGAAAAAAATTGTCGAGTATGCTGACACTTTAA
TTATTGCCCCCAAAACTGATATTACCCAAGGGGGTTGTGTTATAGAGACAGAAGCTGGTATTGTAAATGC
TCAATTGGATGTACAATTAGCTGCTTTAGAAAAAGCGTTCTCTACTATACTAAAACAACAGAATCCTGTA
GATGAAGCTCAACCTAAGCAACAAGCACCTGCAGATGAAGCTCAGGGCAAGCAAGAATAA
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ACGATTCATCCTGTTCTTCTCGCTGTAACCCCCCTCAATCTACAGAACTGTCGGCAATTGCTCAACCACC
TGAGGTCAAGAAAACCTATCCTCAACCGGCTTTCCGAGAGAGGGTAACTGCTAATGATGTGCTTCCTCAA
GAGCATCTTTCCGCAGGAAGTTTTTCAGATACGTATCCGGATCTAACAACACAAGCAATTATCTTAATTT
TCCTAGCGTTATCGCCTTTCCTGGTGATGTTGCTAACATCGTACTTAAAAATTATCATTACTCTCGTTCT
GTTAAGGAACGCTCTGGGAGTTCAGCAGACACCTCCCAGCCAGGTCCTTAACGGCATAGCATTGATTCTT
TCTATTTATGTGATGTTCCCTACGGGAGTTGCTATGTACAACGACGCGAGGAAAGAGATACAAGGAAATG
CCATTCCTAGAGATTTATTCTCCGCAGAAGGAGCGGAAACTGTTTTCGTAGCATTGAATAAATCTAAAGA
ACCTTTGCGATCCTTCTTAATACGCAATACGCCAAAAGCTCAGATCCAAAGTTTCTATAAGATTTCTCAA
AAAACATTTCCCCAAGAGATCCGTGAGCATATGACAGCTTCGGATTTCGTGATTATTATTCCTGCTTTTA
TTATGGGGCAGATTAAAAATGCTTTTGAAATTGGCGTTCTAATTTATCTACCGTTTTTTGTGATCGACCT
AGTCACAGCAAACGTTTTAGTAGCTATGCAAATGATGATGCTTTCTCCATTATCTATTTCGCTACCCTTA
AAATTACTTCTTGTTGTGATGGTGGATGGTTGGACGTTATTACTTCAAGGTCTCATGATTAGCTTTAAAT
AG
>ref|NC_003361.3|:1090888-1091172 type III secretion inner membrane protein SctS [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGATTATCTCTGCGCCTCCTATTATCCTTGCTTCTATTGTGGGTATCATGGTTGCCATTTTCCAAGCCGC
AACGCAAATCCAGGAGCAAACGTTTGCCTTTGCTATTAAGCTTGTTGTGATTTTTGGGACCTTAATGATT
TCTGGAGGATGGTTAAGCAGTATGATTTTCCGTTTTGCCTCTCAAATCTTCCAAAACTTTTATAAATGGA
AATAA
>ref|NC_003361.3|:1091179-1092048 type III secretion inner membrane protein SctT [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTCCAGCCTATGTATGGAGTGTTTTTTTGCTTCTTTTAGCTCGATTACTTCCTGTATTTGCTATTGTTCC
TTTCCTTGGGGGAAAGCTATTTCCCGCGCCTATTAAAATAGGCATTGCCCTGTCTTGGGTGGCGATTATT
TTCCCTAAGGTGCTGATGAACACCCATATCGCAAATTATCTAGATGATGATATGTTCTACATCCTCATTG
TTAAAGAGCTTTGCATAGGCACGTTAATAGGTTTTATTCTTTCTTTTCCCTTCTATGCTGCGCAATCTGC
AGGATCCTTTATTACCAACCAACAAGGTATTCAGGGGTTAGAAGGAGCTACATCACTAATTTCTATTGAA
CAAACATCCCCTCATGGGATCTTCTATCACTACTTTGTTACTATAGTTTTCTGGCTTTCTGGAGGACATA
GGATCGTTTTAACGATCTTATTGCAATCTCTAGAGATCATTCCTATTCATAAGTTTCTCCCTATGGAGAT
GATGTCCTTAGACGCACCCATTTGGATAACACTAATCAAAATGTGTCAGCTTTGTCTTATTATGACTATT
CAGCTTAGCGCTCCCGCTGCGGTAGCGATGCTCATGTCCGACCTATTCTTAGGAATTATCAATAGGATGG
CACCACAGGTGCAGGTTATCTACCTGCTTTCTGCTTTGAAAGCCTTCATGGGTCTATTGTTCCTAACTCT
TTCCTGGTGGTTCATAGTCAAACAAATCGACTACTTCACATTAGCATGGTTTAAAGAGGCCCCCATCATC
CTTTTAGGATCGAACCCTAAAGTTCTATAA
>ref|NC_003361.3|:c1092597-1092148 hypothetical protein CCA00941 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GTAAGGTGAAGGGTTTGCACGCCAATCCTAAAGTAGGAAGAATCAAGAAGTTCCTTTCTCATCACGCTCG
CGAAGCTATTAGTGGAGCGTTAGTACTATTCGGTATTATTACTGATTTTGTATCGTGGGTTGGAGGCCTA
TTTGTCGCCTGTGGTGTGGTATTAAGTTTTTATCCTGAGATCCGCGCTGTTTTGAAAAATCTTCAAAGCT
ACTATGCGAAGAATGGTCCTGCGAAGAATGCTATCCTTTGCAGCTTACTGTTATTTTTCCTCTTAAATAT
CTTTCCCTTCACATTATCCTTTTTAGTCTTATGTTTGATTCTTGTTTTACTTGGAGATAACAAAGACGAT
AAGAGTAGCAACTCTCAAAGACCTCTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c1093695-1092691 hypothetical protein CCA00942 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATGCGAGAAAACGTTGTGTTTGCTCACGGATTATTGAAAATAGTGAGACTCTTTTTACTGCTCAACGTTC
TGCATGTGCTGAAGTGGAATATCAGGAAAAGTCTAAAAAGATCTCTGCCATAGAGAAGATTTCTAAAGAT
GAGGAGATTTCTTCTGCGAAAAAGACAGCAAAGGTAGCGACTAGGAAAAAACGTAAATACCGCCTTTTAA
AAGTGCCGTTTTCACGACCACCAAATAACTCTAGGTTTAACCTTTATGCTCTCATGCAAGAATCTCCGGA
AGAGTATGCTGATCCAGCATCTTGGCATGCGATATTTGTCCGTTTGTTAAGACGTGTTTACGTAGATACG
GGATCCGTACCCCCAGGATCCGAATATGCCATTACCGAAGCTTTGCTAAGTAAAAGAGCAGAAATCCTAG
AGGGGGGGAAAATGTTCGGCCCTGATGTTATTGAGACTCTGACTCTTCCCTCTCAAGAAGCGGATATTCT
CTACACAATGCTCCGTGGTTCTAAAACAACGCAATCTCTTCTAAACTTCCTTCATTATGAGGAAAAGGCA
CAAGGATTGATCAAGTTAAACCTGATATTTGCCGACCCATTACTTTTAGAAGCTGTTGTAGATCATTCCG
TTGCCTGCCAAGAGTTAGAAGCTCTTCGTGGGGGAATTTGGGAAAGTGTGAAACGTCAAGAACAGTCTAT
TCAAGAGCATGGGGAGGCCGCAGCTTTAGAATTATTTAAAACACGTACGGATTTTCGTATGGAATTGAGA
GATAAAACCCAGGTTCTTCTCTCTCAGTACGATCTACTCGCCCTACTAAATAAAAAGGTCTTTGACTTCA
CATTAGGAAGCGCCGGAGACTACATTTATCTCACGGATCCAGAAACAGGAGCTGTTTCTCGATGTCGTTG
TTCTTCAAAGAGTAATAAATTATAA
>ref|NC_003361.3|:c1094240-1093698 hypothetical protein CCA00943 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TAATGAACGTGTCTATAAAACCTTCTTACAGGAAAACTACGCCTATAAAAAATTGCGAACGGTATTTTGT
GCGACATCACGTATTGAAGATATTCCCGGAGCACTATGTTCGGTAGTTTTTGATCGTGGAGTATATCGAG
ATCCTGAGCTTGCCGGAGAAGTCGCCGGCTCTCTATACTATCATCAAAGTCAAGGTAGACTAGAACTACA
AATACGCAGTTTGCGCAATCATACTAAGATAGAAACCGCATTACTTTTAGATAACGTCTCGAAAGTCGAT
ATTGTTCCTCAAAGGAACACGGGAGATCAAGAGCTCCCTGAGAGAATATTGATGGTGATTCATCGGAGCT
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>ref|NC_003361.3|:c1094662-1094225 hypothetical protein CCA00944 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTTGTCTCGTGCTCATGCCCTGCATTCATTTTTACTCTGGCGTTCGTAGATCTATTGAAGACGATATTGT
TAATTTGCAGTTGCCCGCTGTAATTGATAATTGTTTTTTTGCTGTTGAAGATAACATGCGAGAGCAAATG
CTTAAGGGAAATTTTCCCACGTCGGGATCTGGAGAGCTCTCCTGTGTTGTTTATACGAGTCAGGGAAAAG
GGATACGTATCCCTTATGTATATTCTGTAGATATTCGTAAGGGAATGCGTATAGAGGCTAACATTGTCAA
AGCATGTTTCGCAGATGTTGTCATCGAGATTTTCCCTAATCAAAAATATACAACGTCCGTGCAAAGAAGC
GTATGCGTAGTAACATAA
>ref|NC_003361.3|:c1095048-1094671 hypothetical protein CCA00945 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTGTTGGAGGAGCTTTAGCTTTTAATATGCGCGGTAGCATTCAGAAAGGGAAAGTTTTCCAATCAGAGCA
AAATTGTGCCAAAGTTTACGACATCTTAATGATGGAGTACGCAACTGGAGGAAACTCTCTAAGAGAGATC
GTAGATCAGAAAGAATCTATTCTTGAAGGTGCTGCGTGGTGCAAAGACGGGAAGAAATTGCTGAAAGATG
CTTGGGGAGAAGACATTATAGTAAAGCTCAATGATAAGGGCGATGATTTGATAGTCTTTTCAGAGAAGGC
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ACGTCGCGTGCGAGTAAAAAATAGTGAACTGATCATCTTCTCAAAACAGATGCTTCTTCTTCTTCGTTCC
GGATTGCCTCTATATGAAAGTCTGTCCTCTCTTAGATATCAATATCAGGGACAGAGAATCTCGGGATTGC
TCACAGCATTCATGGAAAATTTACGTTCGGGAGGGTCATTGTCACAGGCAATGGCAGCCTATCCCGATGT
TTTTGATACTTTTTACCGTAGTGCTGTTCTTGCTGGAGAAAGTGTGGGGAATCTAGAAGGGTGTTTGCAA
AACATTATCGTTGTTTTAGAAGAACGCGAGCAAATGTCTAAAAAGCTGATGGCTGCCCTGAGCTACCCAA
TAGTGCTACTCGTATTTTCAGTAGCTGTAATTCTCTTTTTCTTGATGGGGGTAATTCCCTCTTTGAAAGA
GACATTCGAGAATATGGAACCTAACACACTGACTTCTATAGTGTTTAGCCTTAGCGATTTTGTGTGTAAC
TACAAATATTTCCTTCTTGGAACTCTGGGATTAGGAATCGCAGGATTGGCGGCTACACGACGTAAACCCT
TTTGGAAGAAATGGTTTGAGAAAACCCTATTTTCACTTCCTGGAGTGAAGAAGTTCTTCATCAAATTAGG
GTTTAGCAGATTTTGTTCCGTAGTTTCTGCGATTCTCCGCGGTGGAGGGACGCTAATAGAAGGATTAGAA
CTAGGTTGCGGAGCAGTTCCCTATGCCATGTTGCGTGAGGATATGAAACAGATGATACACGCTGTTATCG
AGGGAAGCTCATTAAGTAAAGAATTAGCAAAACGGCCCTGGGTGCCGAAATTAGCCTTAGGCATGGTCTC
ATTAGGAGAGGAATCTGGGGATCTTGCTGATGTATTAGGACATGTCGCGCATATTTATAATGAAGATACC
CAAAAAACACTAACCTGGATAACCTCGTGGTGCCAACCGATTATCCTTGTGTTTCTTGGAGGGATTATAG
GGATTATTATGTTGGCGATACTTATCCCGCTAACAAGCAATATTCAAATTTTATAG
>ref|NC_003361.3|:c1097751-1096258 general secretion pathway protein E [Chlamydophila caviae GPIC]
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GCCTTCTGCCGTTAAAAGAGCAGGAAGACAGTGTGACGATAGCTTATGCAAAGACCTCCTCACTCATGGC
AAAAGACGAAGTGCAGCTGCTTATAAAAAAGCCTGTGCTTTTTGTTCTTAAAGACGAAACAGAGATTATA
CAGAGTTTACAAAAGATTTACTCGAATTTAGAGGGGAGGGCCTCCGACATGCTGTTAAGCATGAAAGAAG
GCGATACCTCGCCAATAAATGAAGAGGAAGATCTTTTAGAAAGTACTGACCTTGTTCCCGTTGTACGCTT
TTTAAATCTGATTTTGAAAGAAGCAATTGAAGAACGTACCTCAGATATTCATTTTGAACCTTTAGAAGAC
TCTCTACGCATACGCTACCGTATAGACGGCGTTTTGCATGATCGTCATTCTCCACCAGCCCATCTGCATT
CAGCATTAATCACTCGGATTAAAGTATTGGCAAAAATGGATATAGCGGAACACCGCTTGCCTCAAGATGG
GAGAATAAAAATCCAAATAGGTGGTCAGGAAATCGATATGCGTGTGAGTACCGTTCCTGTAATCTATGGT
GAACGTGTTGTTCTTAGGATTTTAGATAAGCGTAATGTGATTTTAGATATCTCGGGATTGCACATGCCTA
AAGATATCGAAAGTTCTTTTAAAGAAGTGATTGCTGTTCCTGAAGGGATACTTTTAGTTACAGGCCCTAC
GGGGAGTGGGAAAACAACAACGCTCTATAGTGTGATCCAACATCTTTCAGGACCTTTTACCAATATCATG
ACAATAGAAGATCCCCCTGAATATAAGTTATCAGGAATAGCGCAAATTGCTGTGAAACCAAAGATAGGTC
TATCGTTTGCTTGTGGTTTAAGACATTTATTGCGTCAGGATCCCGATGTTTTAATGGTTGGAGAGATTCG
TGATCAAGAAACGGCGGAAATTGCTATACAAGCCGCGCTAACAGGGCACCTTGTTGTCAGCACATTGCAC
ACTAATGATGCGATTTCTGCAATTCCCCGTCTTTTAGATATGGGAGTAGAGCCTTATTTATTATCAGCAA
CAATCGTTGGTGTTGTTGCTCAGAGATTAGTGAGAAAAATCTGCCCTCATTGCAAGCAGCAATGCGCAGC
AGATGTCCAAGAACGGGCATTTCTACAGTCTATAGGACAAGATCCGGATATCCCCTTATATCGCGGAGAG
GGGTGTTCTCACTGTTTCCGATCAGGATATAAAGGACGTCAGGGAATTTATGAATTTCTACATCCCGATA
CAGCGTTGCGTTCTGAAATCGCTATGCATAAACCTTATCATGTATTGCGAGAGCATGCTGAGAAGAAGGG
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TAGCTTTGACTATTTCGGAAAAAGCTGCGTCCTTAGAAAAAACCGGAGATTTTATAGACAGTTCCCCTGG
GCTCGCTTCATTCAATGCGGATATGAAGGAGTACAATCTTCAGTTAAAAAATCTTTACGATGAGGCTGCA
GCTTTACGAGAGTCCGGATGTGAAGACGAAGCGCGCTGGAAAGAGCTTCTGCATAAGCTGGCAGAGGTTA
AAAAGCAAATTAAGCATATAGAGAATCTCTGGTCAGCAGAGATTCGCGAAAGGGGAGATAATCCTGATGA
TTATGCCTTATGGCATCATCCTGAAACGACAATTTACAATTTAGTTTCTGATTATGGTGAAGATAACGTC
ATTTACTTGGTCCCTCAGGATATCGGATCGATTAAAGTTTCCGCATTATCAAAATTTACTGTTCCTAAAG
AGGGTTTTGAAGAGTGTCTTACGCAGTTGCTAACACGTCTTGGTATAGGTGTGCGTCAGATAAGCCCATG
GATAAAAGAGCTCTATACAACGCATAAAGAGGGTTGTGGAGTTGCTGGAGTCTTTTCTTCTAGGAAGGAT
TTAGATTTACTCCCTGCAACTGCTTATATTGGCTATGTATTAAACTCGAAGAATATCGATATACGAGCTG
ATCAGCATATCTTAAGAAAGTTTGCTAACCTTGATACAACGCATATTGATCTTTTCGGAGGGAAGTTGTG
GGTATTCGGTTCTGTTGGTGAGATAGGTGAACTCCTTAAAATTTATGATTTCGTCCAAGAAGATAGTGTT
CGTCAGGAATATCGCGTTGTTCCTTTAACGAAGATAGAAGCTTCGGAGATGATTTCTATTCTTAAAGCCG
CTTTTCGAGAAGATATCACTAAAGAGGACAATGATGAGAATCTTGGTCTTAAAGTTGTTCCTCTACAATA
TCAAGGGCGCTCTTTATTTTTAAGTGGTACAGCGACTTTAGTTCATCAAGCGATGGATTTAATTAAAGAT
CTTGAAGAGGGGATTGAGAACCCTACAGACAAAACTGTCTTTTGGTATAGCGTGAAGCACTCCGACCCTC
AAGAGCTTGCAGTATTGCTATCTCAGGTACACGATGTCTTTGCAGGGAAGGAAGGGGGATCTCTTGCTTC
TCAGGAATCTATGCTAAAGGAAGCGACTTCTACGATACATATCGATACATCTTCCGCAGGAACTGCAAAA
GAGGGTTCTGTAAAGTATGGAAATTTCATTGCAGATTCTAAGACGGGCACCTTGATCATGGTCGTGGAGA
AAGAGGCTTTACCCAGAATCAAGATGTTATTGAAAAAGCTCGATGTGCCTAAAAAGATGGTGCGTATAGA
AGTTTTGCTTTTTGAGAGAAAGCTTTCTAACCAGCGTAAAGCAGGGTTAAATCTGTTAAGACTTGGCGAA
GAGGTTTGTAAAAAATCATCAATGGGGATTTCTTGGGCAAGCTCAGGGATTTTAGAGTTTTTATTTAAAG
GCAGTACGGGGGCGTCTTTAGTCCCGGGTTATGATCTTGCCTATCAATTTTTAATGGCTCAGGAAGATGT
ACGTATAAATGCGAGTCCTTCTGTTGTGACTATGAACCAAACTCCCGCAAGAATTGCCATTGTAGAAGAG
ATGTCGATAGCAGTCTCGGCAGATAAGGAGAAAGCTCAATATAACCGTGCTCAATACGGAATTATGATTA
AGATGCTTCCTGTTATTAACGTGGGTGAGGAAGATGGGAAAAGCTACATTACCCTAGAGACGGATATTAC
CTTTGATACTACAGGAAAAAATGCTAACGAGCGTCCTGATGTTACTCGACGTAATATCACCAATAAAGTG
CGTATTCCTGATGGTGAGACGGTAATCATTGGGGGGTTACGTTGTAAACACGTCTCGGATTCTCAAGATG
GCATTCCTTTTCTTGGGGAGATTCCCGGAGTAGGGAAGCTTTTTGGGATGAACTCGACCTCGGATAGTCA
AACAGAAATGTTCGTCTTTATCACTCCGAAAATCCTCGATAATCCTGCTGAGAAAAAAGAGCGCCACGAA
GAAGCTGTTCTTTCTTCGCGTCCTGGAGAGAATATTGAATTTCGTAAAGCCCTGTTTGCTGGAGAAGAAG
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GCTAGAGTACGATGGGCGATAA
>ref|NC_003361.3|:c1101316-1100003 hypothetical protein CCA00949 [Chlamydophila caviae GPIC]
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CTCCGAATCACCTGGAAAGCCTGTACAGTGTTTCTTTGAAATTTGATGGGTTGAAGGGGAAGCAAAAGAC
ATTACCTATGGCTCAGGATGTTTCTTCAGGGATTTGGGCTTTAGAGTCGCCGGAGCTTAGGGAAAGATTA
CCAGATCTTAGGCAGGAGCTTGTGTTTTTAGGGAGCAATAAGCGTCCTGACGCTTGTGGAGGCAAGTTTT
TTTTAGAGTTTGCTACCTCCAAGGATTCCTATGTGGCTAGTGTGAATGAAAAAGTCTATGTCAAGGTACT
TTCTTCTCCTGAGGGAGGGGTATTCACCTTTAGTCCTAAGGGGGAACCCACAGATTTATGGTTAGAGTGC
CGTCCTTTGAGCATGGATAACCGTATAGAAGTCAAAGTCCGTTTAAAGGGAGTCAATGGGGAGCTAGTTA
CCTCTCCTAGAGAGCGCGAGACCTTATTTTTAACGTCTCCTGCTAAGGGATTAGAGTCTTGGGAAATCGG
TGGTATTCGTGTAGATGCGAGTTTCCCTGTGAAGCAAAAGATTCGTCGTATAGGGAGTGACAAGTTTCTT
CTAATGCACGGGGGAGCGGATTATGCTGATAAAGCTGTTAAAGAGCGTGTAGATTTTGTTTCTTTATCTG
ATGAGAACTATAGCCGTTACCTTGCTGTTGGGGATGTTTTGCTTTGGGATGGCGATCGTTGGCAGACTTG
TGGGGAATTTAGAGGAGAGAGTTCTCAGGCGCCTCTATTAGAGGTTAAGAAAATAGATGAGAAAGTCATG
GTGATCGAGCTGTGGAATGTTGGGGGAACATCCCATCAGTCCATGAGTTTAGTAAAAGGCATGAGTTCCC
CAATAGAGATTGCAGAGATCGTTAAGGAATTTGAATTTGTGGGGATGCGTTCTTGGTCCCGTCCTATTAT
ACAAGCTGGGGGACAAAGGATGATTCTTTCTCCCGACGATTGGGTAGTATATACGGGAAAAACTTGGGAG
AAGATCTCTCGCAAAGAGCAGCTGGAAGACTATCTTTCAGGAAAGACTCAAGGGCCGTTACTGGTTTTTG
ATAAATTAGAAAAAGACTCTAGAGAGTTTGTTGTGCGTGCTCACGTATTTAACGCGCAAAGAACACTAGT
AGAGACTGTGACATTACCGCTAAAACAAGGTTTTGATTCTGGAGCCGCCTCTACGAAAGAAGAAGCACGT
CCCGGAAGGCAGCCTCTTATAGGTGGTGAAGGAACCAATCGTGGGGGATCATAA
>ref|NC_003361.3|:c1102507-1101437 proline dipeptidase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTCCAAGATCGCGTAGCTAGAGCGCAAGCAGCTCTTGCAGATTATGGTATAGAGGGGTTTATCGTAG
AAAGAGGAGAAGATCTTGCGTATTTTCTTGGAGATAAAGTAACCACAGGAACCCTTCTCATAGGCAAAGA
TGAGGTAGTGTTTTTTGTTTATCGTATGGACAAAGAGCTCTATGCTGATCTTCAGGGGCCCTCTCTTGTA
TTTTGTGATAGAAACATCGCAGAATTTCTTCTTCCCTATCTTAAAACAACTGCTTATCAAACTTTGGGCT
TTGATAGCCTCCATACTTCATATCAAAGATACCAAGAAAGAGAAAATGCTTCATGCTCTTGGGTGCCTAT
AACGTTATTCACGGAAAAATTACGCAGTATAAAGTCTGCAGATGAAATAGAAAAAATGCGTCAAGCAGCC
ACTTTGGGCTCTGAAGGGTATGACTATGTTCTCTCCGTATTGCAAGAGGGGATAACAGAACAAGAGGTTG
TGCGGCTCCTTCGTGTATTTTGGGCTAAAGCTGGTGCTGAAGGGCCTTCATTTTCTCCGATCGTGGCTTT
CGGCCATCACGCTGCCTTCCCTCATGCTGTTCCCACGGATAGGGAGTTGCGCAAGGGGGATATTGTGCTT
ATTGACATAGGCGTTCTGTATCAAGGATACTGCTCGGATATGTCGCGTACAGTAGCTTGGGGACGCCCAG
ATACACGTCTTATTGAAAGTTATCCTGCAGTCGTAAAAGCTCAACAAGCCGGGATGAAATTATGCCGTGC
CGGAGCTCTATGTCTAGACATTCATAACGAAGCTGCCCGCGTATTAAGAGAATACGGGCTCGAGGAATAT
TTTTGCCACGGCGTAGGTCACGGCGTAGGAAGGAATATTCACGAATACCCCCAGCTTTCTCCAAAATCGG
ACACAGCTACCCTAGAAACCGGAATGACAGTTACTGTGGAGCCCGGAGTCTATTTCCCAGGGATCGGAGG
CATACGTATCGAAGATACAGTCCTGATAGATGGTAATAAAAATTTTAGTTTAACCAGCCGTCCTGTGTCT
ACGGAGTTAGTTTTCTTATAA
>ref|NC_003361.3|:c1104253-1102511 DNA mismatch repair protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGTTCAAGAAACCCTATTCAATTACTCGATACGATCACTATCAATCAGATAGCTGCAGGAGAGGTTA
TTGAAAACTCTATATCTGTAGTTAAAGAGTTGGTAGAGAATGCCTTAGATGCTGGGGCGGATGAAATAGA
GGTTGAAACTCTAGGAGGAGGGCAGGGGCTAATTGTTGTAAAAGATAATGGCTGTGGAATGAGCTCAGAA
GATGTTGCTCTTGCTCTTAAGCGTCATGCCACGTCAAAAATCGGTGAGTTTTCCGATGTCTTTTCTTTGT
CGAGTTTCGGTTTCCGTGGGGAAGCTCTCCCCGCGATAGCTTCTATCTCTAAAATGGAAATTCTTTCTTG
TCCTAGAGCGGGAGAAGGCTCTAGGACAATTATCCATGGGGGAGAGATCGTTACATCAGAAGCTAAGCCA
CGTCAGGTAGGGACGACAATTTCTATAGATTCGCTATTTTACAACGTTCCTGTACGTCGGGGATTTCAAA
AGAGTCCTCAGACAGATCGGATGGCTATGAGAAAGCTTTTGGAGAATAGAATTCTATCTGTAGAGAATGT
GGGCTGGTCTTGGGTAAGTGAAAGGCAACAGGAATTTCATATTTTCAAGCATCAGGGATTTGCCGAGCGC
GTAGCTTTTGTCATGGGAGAGGGCTTTATGCAGGAAGCCTTACGTGTGGATAAGGGGGGCAATCTTGTAC
GTGTTGTCGGTTTTTTAGGTTCTCCGGGCTTTCACAGGCCTACACGTTTAGGACAGAGAGTTTTTATCAA
TGATCGTCCCGTGGACTCTACGTTTATATCAAAAAAAATAAGCGAGGCTTATTCCATGCTTTTGCCTCCA
CAAAGGTATCCTGTTTTTGTTTTAAAACTGTATCTTCCTCCCGAGTGGTGCGATTTCAATGTGCATCCTC
AGAAAACAGAAGTGAGGATTCTTAGAGAAGAATTTGTTGGGGAATTCCTTTCAGAGACAATAGGAGAGGT
TTTAGCGCGCCCTCAAGAGGTCTCTGTTTTTGAAACAGCTTCTACGTTGCCTGCGCTACGCTTTTTTGAT
GAACAGCTCCCTGAAAGTGCTTTAGAAGGGCTGCAGGGTTCTAATGTTTTGCCGGTAGTAAAATTGACGC
CATCTTCCTCTGGATCTCTTCCTTTCTTGGATAGGGAGCCAGATCCCTTGCCTGTAGATAGGCAAACACA
AATTTCTTGGGGAGCTTCTCAAGAAGTGCGTTTTTTAACTTCTCTAGGGAAAATAGTTCTTGCAGAGGAC
TCGGAAGGTGTTCATGCTATTTTTACAGAATCGGCTAGAAAACATTTGTTTTACCTATCTTTAGTAGAAA
ACCATCAACATAACTATAAAAGTCAGTCTTTTTTAGTCCCTTTATGTTTGGAGGTGACGCCTCAGGAGCG
TATTTTCCTCTCATCTCATATCGAGGAATTTAAGCTGTTAGGAATAGAGATTTCTCAAATGGGTCCTTGT
GTATTCTCCATTGAAAGTGCTCCAACATTTATAGGTGAGGAAGAGTTGAAATTGTGGATTCTCTCCTTGG
CAGCAGAGAGTGCCAAAGTGGATAAAAGAGCGATGACTCTTTTAATTAAAGAGGCTTTAACACAGACCAT
CTTTTGTAAAACACTGAGGGCATTCGATATTTCTTGGTTATCTTTGCTTTGGCAACTAGGTAAGCCGGAA
AAAGCATTTGACGGCTCACAAATACGCCGATTAGTTTTAGATGAGGATTTTATTAAGGAGTAA
>ref|NC_003361.3|:1104481-1105164 type III secretion chaperone SycD [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAGCAAGCCTACTTCTAATAATTCTAAAAAGCCATCAGCCTCGTTTAACAAAAAAACACGTAGCCGAC
TCGCTGAGCTTGCTGCACAAAAAAAAGCTAAGGCTAATGATTTAGAACAGCAATATCCAGTCCCTACAGA
AGAAGAAACAAAGAAAGCTTTGTCAGACATCTTACATGGTCTTGGTGAGGGATTAACTCTTCAGCAGATC
TTAGGTCTATCCGACGTTTTGTTAGAAGAGATTTACACAATTGCTTACACCTTCTATTCCCAAGGGAAAT
ACAACGAAGCCATAGGTCTTTTCCAAATTCTTACAGCTTCAAAACCTCAGTGCTACAAGTATATCCTAGG
CTTAAGCTCATGCTATCATCAGCTCAAAATGTACAATGAAGCAGCCTTCGGCTTCTTCCTTGCTTTTGAT
GCGGAGCCCCAAAACCCCATTCCTCCTTACTACATAGCAGATAGCTTGATGAAGATAGACCAAGCGGAGG
AATCTCGAGATTTCTTAGATATTACCATCGATATTTGCGCTAACAAACCTGAGTACAAAATTCTGAAAGA
ACGCTGCAATATTATGAAAGACTCTCTCAAAGATATGATTAAAGAAACAGCTCCAAAAAAGAAAAAAGCC
ACTGCTGCCAAATCAAAAACAGCAGACAAAAAGAAATCCGGTGGGAAACGTTAA
>ref|NC_003361.3|:1105188-1105586 hypothetical protein CCA00953 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATAAAAAAGTTAAAAAAACAAACAAAACTACTACTAAAAAAACAGCTACTAAGAAGACATCTGCAA
AACATACACATGTTGCTCCTGTCCTATTCACAAATGAAACAGACAAACAAGAAGTAGCAATTTCAAATTT
GGAGAACTTGGTTTCTTCTATTTATGAAGATTTGCCTCTAGCTCAAACATTTTCTGGGATTCAAGACGAA
AAGCAACTTGCAAAGATGATGGCTGCGTTAAACGGCACTTTAGACTCCCTCCCTATTGAGACTCTTACAG
AAGGCTTGTTTAACAATCCTAAAGAAGATGCAAAATTTGCTAAAGATTTAGCTTCGGTCCTTCATGGATT
GAAGAACCTATCTTCAACAGTAAATAAGCATATCTCTGACAAACACTAG
>ref|NC_003361.3|:1105624-1107108 hypothetical protein CCA00954 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTCTCTTTCTACCTCAGGTCCAGACAACGCCAACCAGAAAAATATCATGGCTCAGGTATTAGCTTCTA
CACCGCAAGCTGTACCCACTCCAGATAAACTTGCTGGCAATGAAACTAAGCAAATTCAGCAAACCCGACA
GGGGAAAAACGCTGAAATGCAAAGTGATGCTGGTATTGCTGGAACTCAAGGTAAAGAAAAAACCAGTGCT
GTTTCTGAAGCTCAAGGCGCAGATAACATCATGGCGGGTCAAGGAATTGCCGCAGGTCAAGAGACTGAAG
CTGCAGAAGCTGCCGCCGGCGCTAACCAAACAGCCGGCGCCGCTGCTTTCCGAGCAAATTTACAAGCTTC
ACTTGAAGAAACTAACAAAACATTGGAGACCACTCTCTCCTCTTTATCTTCCTTAGATTCTACTCAGCTA
CATGAAGTTCAAGAGTTGGTTGCCTCTGCTGTTAGCAGATCATCAAACTCTGCGATTCGAGGATTAGAGA
CTCCAGATCTTCCTAAACCTTCTATAAGCAAGCCTAGACAGGAAGTTATGGAAATTAGCATGTCCATAGC
AAAAGCTATCGCTGCTCTTGGAGAAGCTACCGCTTCGGCCCTTTCTGACTATCAAAGCACCCAGGCCCAA
GCTTCAACGATGAACCGCTTATCCTTAGAATCTCAAGGATTGAAAATCGATTCTGAACGTGAAGAATTCC
AAAAAATGAAAGAGATTCAAGCAAAAGCAGACGGGAATAAAACACTCGAAACTGTAAACACCGTGATGAT
TGCTGTTTCTGTAACTATTACCGTGGTCTCTGTTGTTGCTGCATTATTTACCTGCGGTCTAGGTCTTATA
GGTACTGCCGCTGCTGGAGCTACTGCCGCCGCTGCCGCTGCAACTGCAGGGGCTACTGCAGGAGTTACTG
CCGCAACATCCGTAGCCACAACTGTAGCTACACAGGTTACCGTTCAAGCTGTGATGCAAGCAGTCAAAAC
TGCCATTGTACAAGCAGTCAAAACTGCCGTTATGGAAGCTGTTAAATCCGCTATTAAACAGGGGGTCAAA
CAAGCTATTAAAGCTGCTGTTAAAGCCGCCGTTAAGACATTGATGAAGAACATGTCCAAGATCTTCAAAA
CAGGGCAAAAAGCCCTTTCCAAGAGCTTCCCAAAACTTTCTAAAGTAATCAATACTTTAGGGAATAAATG
GGTCACTGCTGGAATGGGAGTGGTTGTTGCCGTTCCTTCTTTAGTCAAAGGTATTGGAGATCTTAAATTA
TCCGAAATGCAAACCGAACTTGCCGATATTCAGAAAAAAACAGGGATGCTCACCGCTCAAGCCGAAATGA
TGAACATGTTTACCATGTTTTGGCAACAGGCAAGTAAAATCGCCGCGAAACAAACTGACAGTGCAAATGA
AATGCAGCAACAAGCAACTAAATTAGGTGCTCAGATTGCTAAAGCCTTCCAATCTATCAGCTCGGGCTTA
GCAGCAGCAGTATAA
>ref|NC_003361.3|:1107138-1108454 hypothetical protein CCA00955 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGACATCAGGAGTTAGTGGAAGTAATAATACTGATCCTTCATTAGCTGCTCAGCTTGCGCAAAATGCCA
GTCAAGCGGCTTCTAAATCTCAAGGACAACAAAAATCAGGTAATGCTCAAGAAACACAAGAAGCAGCTGC
AGGGTTTGAGGATCTAATCCAGGAGACACAAACTCAAGGAACTTCTAAAAAAGAAGCGACTTCGCAAACA
ACCAAAAGCTCTAAAACTGATAAATCTGCTAAATCTTCTTCCTCTACGTCAGTAGCTAGTGCCTCAAGTA
CTGTTACAGCTCAAGCTGTAAAAGGACCTAAAGGGCTGCAGCAAAATAACTATGAGCTCCCCCAACTTCC
GATGCCTGAGAATACGGAAGTTAACGGCGTAGTAATCAAAAAAGGCATGGGAACTCTTGCCTTATTGGGA
CTCATTATGACCTTACTTGCACAATCTAGTGCAAAATCTTGGTCCTCACAGTTCCAACAACAAAACCAGG
CAATTCAAAACCAAGTAGCTATGGCCCCAGAAATAGGGAATGCGATTAGAACTCAAGCAAATCACCAAGC
TTCTGCTACAGAAGCTCAAGCTAAACAAAGTATGATCTCCGGGATCGTTAACATCGTTGGTTTCGCAGTT
TCCGTCGGCGGGGGTCTTCTCTCTGCTGCAAAAAGCTTAGGAGGAATAAAATCTGCAGCTTTTGCAAAAG
AAACAGCGGGTGCTGCGGGATCCGCAGCGAGCTCAGCCGCCTCTCAAGCTTCAAAAATGGCCACAGATGC
TGCTACTACAGCCGCTAAAACAGCATCAACAGCTGCTTCTGGTGTTGCAGGTTCTGCAGCTCAAGGTGCT
GCAAAAGCTGCAGCAGGATTAACCGACGATATCGCTGCTGCAACTGCAAAAGCCACTGCAGGGACTGCAA
AAGGCGGGGGATTATTCGGCAAAGTATTAAACACCCCTGGCTGGAAAGATAAACTTACACGCGGAATGAA
CGTAGTGAAAACTCAAGGGGGACGCGCTGCTGCTTTTGCTGGTAGAGCCCTTTCTACATCCATGCAGATG
TCTCAGATGGTTCACGCTCTCACAGCAGGTATTGACGGGATCGTTGGTGGTGTTATGGGAGCTGAAATTG
CTCATCACCAAAGACAGGCTGGTATGGCTGAAGCTCACGCTGAAGAGTTGAAACAACTTTCCTCCATTCA
GGGTCAGTACGCAGGACAAGCGCAACAACTTCAAGAGCAGTCGCAACAAAGTTTCAACTCTGCTTTGCAG
ACTCTACAAAATATTGCCGACTCTCAAACCCAAACAACATCAGCAATCTTTAGTTAA
>ref|NC_003361.3|:c1109438-1108533 hypothetical protein CCA00956 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGGAGGTTTCAGCACCTTTATTTGTAACAGGAAGCCGTATGCTTGTTGCTGGTTTGGTTTTAGCAGCAAT
AGTGTTGTGGAAAAAAGGGTCTTTAAAATTACCAAAACAGGTTTATGTTCCTGTTTTGATTTTAGCTTTA
GTTGGATTCTACCTGACGAATGTCTGTGAGTTTGTAGGCTTACAAAACTTATCTTCTTCTAAAGCTTGTT
TTATCTACGGACTTTCTCCGTTTATTTCCGCTTTATTTTCCTATATCCAGTTACGGGAAACTGTAACGGT
GAAAAAAATAGCTGGATTAAGCCTTGGGTTGGTTGGCTACCTGTTTTATCTATTTTTTGGAGGTAGTAAC
TCTACGGAGACATGGAGCTGGCAATTGGGGGTTCCTGAGCTACTGTTATTGCTTGCGACCTGTTTGTCTG
CTTTTGGCTGGACATTATTAAGAAAGATAGAAAAGAACTCCTCTTTATCGGTAATGGCAATAAATGCCTA
CGCAATGCTTATTTCCGGGGTTTTATCTTTAGGACACTCTATGGTTGTCGAGACGTGGAATCCTATCCCC
GTGAGTAATGGGGTCGTGTTCGTTCAGGCAGTTTTTTGCCTTGTACTATTCTCCAATCTGATTAGCTACA
ATCTGTATGCAAAATTATTGAGAAAGTATTCTTCAACATTCCTTTCCTTTTGCAATCTTGTTATGCCTTT
ATTCTCGGCATTTTATGGCTGGTTGTTGTTAGGGGAGAGCTTATCAGGATCTTTGCTCATGGCTGTTGTA
TTTATGGTTGTAGGCTGCCGCCTGATCTACCATGAAGAATTTCGCCAAGGCTACATTGTTTCTTAA
>ref|NC_003361.3|:1109660-1111567 threonyl-tRNA synthetase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATCCGCGTGATTTGCAACAACGAAACTGTTGAGCTGCCTAAAGGCGCTACTGCTGCTGATTTCGCGA
GCAAAATAAAAAATTCTCATTACTTTGCTGGCGTTGTCATAAACGATCAAATTAAAGATCTATCTACAAC
CCTAAACGAAGGCGATACCTTAAGATTTGTCACCTTTGAAGATTCCGAAGGAAGAGAAATTTTTCTACAT
ACTTCTGCCCATATCCTAGCCCAGGCTGTATTACGTCTCTGGCCACAAGCAGTTCCAACAATCGGACCTG
TTATAAACCAGGGATTCTATTACGACTTCGCAAATCTTTCCGTGAGTGAAGAGGACTTGCTCGCGATTGA
AAATATGATGGAGCAAATAGTTCAAGAAAAACTTGAGGTGTCCAAAAAAACATTTAATGGCAAGGAAGAA
GCTCTAAAAGAATTCATGCATAATGCATTTAAAGCAGAGCTGATTCAGGAACTTCCAGAAGGAGAAAGCA
TCACAGCCTACTCCCAAGGGGAATTTATGGATCTTTGTCGAGGACCCCACCTGCCCTCCACGGCTCCTGT
AAAAGCTTTTAAACTTTTACGTACATCCGCAGCCTATTGGAGAGGGGATCCTAGTCGGGAATCTTTAGTA
AGAATTTATGGGATATCTTTTCCTACAACAAAGGAGTTAAAAGAACATCTCCATCAACTAGAAGAAGCGA
AAAAACGCGACCACCGCGTTTTAGGAGCAAAACTTGACCTATTTTCTCAACAAGAATGCTCTGCTGGGAT
GCCTTTCTTCCATCCTAGGGGAATGATTGTTTGGGATGCATTGATAGGTTATTGGCAACGCTTACATCAA
CTTGCGGGTTATAAGCAAATCTTAACCCCACAACTGATGAATCGTAGTCTTTGGGAAACTTCCGGACATT
GGAGCAACTATAAAGCGAACATGTACACTCTAAAGATAGATGAGGAAGACTACGCCATTAAGCCGATGAA
CTGCCCCGGATGCATGTTATATTATAAAACACGCCTGCATAGCTATAAGGAATTCCCTCTACGCATTGCG
GAAATAGGTCACGTGCATCGCTATGAGGTTTCTGGAGCTCTTTCGGGACTTATGCGTGTACGCGCATTCC
ATCAAGATGATGCGCACGTATTTCTAACTCCTGAGCAAGTGGAAGAAGAAACTCTAAATATTTTAAATTT
AGTTTCTGAACTCTATTCAACATTTGGTCTTGAGTATCACTTGGAGCTATCCACACGTCCGGAAAAAGAC
ACCATCGGTAGCGATGAGCTGTGGGAATTAGCAACGTCTGCTTTAGAGCGCGCTCTTATAAATTCCAACA
CGCCGTTCATCATTAATCCTGGTGATGGCGCCTTTTACGGACCAAAAATTGATATTCACGTAAAAGATGC
TATTCAACGTACGTGGCAATGTGGAACGATACAGTTAGACATGTTCTTACCTGAACGCTTCGAATTAGAA
TATACAAATGCACAGGGAGAAAAAAGCACGCCTATTATGCTGCACCGCGCTTTGTTTGGTTCGATTGAAA
GATTTTTAGGAATTCTCATAGAACATTTCAAAGGTAAGTTCCCCTTGTGGTTAAGCCCTGAGCATATTCG
CCTGATTACCGTAGCGGACCGCCATCAGCCGCATGCTAAAGAACTGGCCGCTGCATGGCAGAAATTAGGT
CTTGTTGTTACTGTGGACGACTCTAACGAGTCTGTAAGCAAAAAAATCCGTAATGCACAAAATATGCAGG
TAAACTACATGGTCACCTTGGGAGATCGGGAAATAGAGGAAAATACCTTAGCGATACGCACCCGTGATAA
CCGAGTTTTAAACGCTATGACAGTAGAGACATTTATAAATACTATACTTGAAGAAAAGAACTCTTTGAGT
TTAACTCCACTATTGTAG
>ref|NC_003361.3|:1111598-1112365 chromosome partitioning ATPase ParA, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAACCATCGCTGTCAATAGCTTTAAAGGTGGAACAGCAAAGACATCAACTACCTTGCATTTAGGAG
CCGCTTTAGCACAATATCATAACGCACGAGTACTACTCATTGATTTTGATGCTCAAGCAAATCTTACTTC
AGGACTAGGTCTTGATCCCGATTGTTACGACAGCCTTGCTGTCGTACTTCAGGGAGAAAAAAACATTCGC
GAGGTGATTCGTCCTATCGAAGATACGGGATTAGATCTAATTCCCGCAGACACCTGGTTAGAACGTGTCG
AAGTTTCTGGAAATTTAGCCGCGGATCGTTATTCTCATGAACGGTTAAAACATATCTTAACCTCCGTAGA
AAACGATTACGACTACGTAATTATCGACACTCCCCCATCTTTATGTTGGCTTACAGAATCTGCATTAATC
GCAGCACAGTACGCTTTAATTTGTGCTACCCCTGAATTTTATAGCGTTAAGGGGCTAGAAAGACTTTCAT
CATTTATTCAAGGCATCTCCTCAAGACATCCCTTAAATATCCTCGGTGTTACTCTTTCTTTTTGGAACTA
TCGTGGGAAAAATAACGCAGCGTTTGCTGAGTTGATTCACAAGACGTTTCCCGGCAGGCTATTAAATACT
AAGATTCGTAGAGATATTACGATTTCTGAAGCCGCGATTCATGGAAAACCTGTATTTGCCACAGCACCTT
CAGCACGAGCTTCTGAGGATTACCTAAATCTGACCAAAGAATTGTTAATTTTACTGAGAGACATGTAA
>ref|NC_003361.3|:1112370-1113122 pGP6-D chromosomal paralog [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGGAAATTTAAAAACGTTGTTAGAGAGTCGTTTCAGGAAAAATACTCAAGATAAAATGGAAACGCTAA
CACGCAAGCGCATGGAAGGAGAGCTCTCACCTTTCTTAAGCAGATTTTCCGATATAAAATTATCACCAAA
AGAAGAAGAGAAATTCCGTCAACTTCTAGAAAACTACACTTTTGAAGATCAGATTTCCGAAGAAGATTTG
AAAAATCTCTGTACTCTCTCTGCACAAATAAAACAAATCCATCATCAGGCTGTGCTCTTACACGGAGAAC
GTATTAAAAAAGTCCGTGATTTATTAAAAACGTATCGCGAAGGAGCCTTCTCGGCTTGGTTACTCATCAC
CTACGGGAACCGACAAACTCCTTACAACTTTCTCGTATATTACGAATTATTTTCTACTCTTCCCGAACCA
TTGAAAATAGAAGCTGAGAAAATGCCCAGACAGGCTATCTACACACTAGCTTCTCGACAAGGACCTCAAG
AAAAAAAAGAAGCCATTATTCGTAATTACCGTGGAGAAAGTAAAGGCGAGCTTTTAGATATTATTAGAAA
AGAATTTCCTTTAATTTCTACAGATCGTCGTCAAACATGTTTAGCAAAACAAGCGCTAGCTATACTTTCC
AAAGGTTCACAATTATTAAAAAAATGCTCGGAATTATCTCCTGAGGATTATTCTTCCCTGGAAAAATTGA
TAAAAAAGCTTCAAAAAGTTAAAAATAACTTCTTTCCCAATACAAAGGTCTAA
>ref|NC_003361.3|:1113126-1113680 hypothetical protein CCA00960 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCAGCTAAATCAAAAACACTAGAACTGGAAGATAATATTTTTCTTATTCTTGAAGGAAATTTAAAAA
GAATTTTTGCCACCCCTATTGGCTACACTACATTCCGAGAATTTCAAAATGTTGTTTTTAATTGCTCTCA
AGGCCAACAAGAAACAGCGAATTTCTTTTTTGAAATGCTCATCAACGGAAAACTCATTCATGAACTTTCT
GTCGATCAAAAACAAGCAGCTCAAAGTCTAATCACTGAATTTATGATGCCTATTCGTGTTGCTAAAGATA
TTCATGAGCGTGGTGAATTTATTAACTTCATTACATCAGATATGCTTTCTCAGCAAGAGCGCTGCGTATT
CTTGAATCGCTTATCTAGAGTAGACGGACAAGAGTTCCTATTAATGACCGATGTGCAAAATACCTGCCAT
TTAATTCGTCATCTATTAGCAAGACTTTTGGAAGCGCAAAAGAACCCTGTGGGAGAAAAAAATCTTCAAG
AAATTCAAGAAGATATCATATCCTTGAAGAATCATTTTGAAGAACTTGAAAAGTCTGTTCAATAA
>ref|NC_003361.3|:1113691-1114728 tryptophanyl-tRNA synthetase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATAAAAAAAAACGCGTACTCACTGGAGATCGGCCAACAGGAAAGCTGCATTTAGGTCATTGGGTCG
GATCCATCAAAAATCGTTTAGATTTACAGAATAACCCCGCTTATGATTGCTTTTTCATCATAGCAGATCT
CCACACTCTTACAACCAGGGTGCGTAAAGAACAGGTTGTAGATGTTGATAATCACATTTACGAAGTTCTT
GCAGACTGGTTGAGCGTGGGGATAGATCCGAACAAATCCTCTATTTACCTACAATCAGCAATTCCTGAGA
TTTATGAGCTCCATTTGCTATTTTCCATGCTAATTTCCGTAAACCGCATTATGGGAATTCCTAGTCTTAA
AGAAATGGCGAAAAACGCTTCCATTGAAGAAGGTGGGTTATCTTTGGGATTGATGGGTTATCCTGTATTA
CAAAGTGCTGATATTCTTCTTGCAAAAGCTCAGCTTGTTCCCGTAGGGAAAGATAATGAAGCACACATAG
AGTTAACACGTGATATTGCGCGCAATTTCAACCGTTTATACGGAGAGATTTTCCCCGAACCTGAAACCCT
ACAAGGAGAACTTACCTCTCTAGTAGGTATTGATGGTCAAGGGAAAATGAGTAAATCGGCAAACAATGCT
ATTTACCTTTCTGATGATGACGCTACTATCGAAGATAAGGTCAGAAGGATGTATACGGATCCAAATCGAA
TTCATGCATCAACTCCGGGCCGTGTTGAGGGAAATCCTCTATTTATCTATCACGATATTTTCAACCCTAA
TAAAGAAGAGGTTGAAGAGTTTAAAACACGTTACCGTCAAGGATGTATAAAAGATGTTGAAATAAAAACT
CGTCTTGCTGAGGAGTTAATCCGCTTCTTACAACCTTTTAGAGAGAAACGTGCTGAGCTACTAGCACATC
CTAAAATTCTTCAAGAAGCCTTGCAGAAAGGCACCGAAAACATGTGTGCTTTAGCAAAAGAAACTATGGA
AGAAGTCCATAATACCCTAGAGTTAAGTCGTAAATGGCGTTCGCGTCTATCGCTATAA
>ref|NC_003361.3|:1114741-1116711 excinuclease ABC subunit B [Chlamydophila caviae GPIC]
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AAGGCATACGTAATGATGTACAATCTCAAGTACTTTTAGGGACTACGGGCTCTGGGAAAACTTTCACCAT
TGCCAATGTTGTTGCTAATGTTAATCGTCCTACGCTCGTATTGGCACATAATAAAACATTAGCAGCACAA
TTATACCAAGAATTCAAAGAATTCTTTCCCAACAATGCTGTCGAGTATTTCATCTCCTATTACGATTACT
ATCAACCTGAAGCCTACATTGCGCGTAATGATACCTACATAGAAAAAAGCCTCTTAATCAATAGTGAAAT
CGATAAACTCCGTTTATCTGCAACACGATCTATTTTAGAGCGTAGAGATACCTTAATCGTCTCTTCTGTG
TCTTGTATTTATGGTATTGGTTCTCCCGAAAACTATGCTTCTATGGCTTTAGAGCTAAAGGTAGGAAAAG
AATACCCACGCACGTTACTTGCTGCTCAGCTTGTGAAAATGAACTATCAAGCTTCTCCTGTAGCACAACG
TTCAACATTTCGTGAACGCGGGAGCGTTATTGATATTTTCCCTGCTTATGAAAGTGATCAAGCTATCCGC
TTAGAATTTTTCAATGATACGCTATCCTCCATAGAATATAGCGACCCCCTGACTATGATCCCTACAGCGT
CGGTAGCCTCAACGATTATCTATCCAGGGTCGCATTACGTCACTCCTGAAGCTGTGCGTGAACAAGCTAT
CTGCTCTATACGGGAAGAATTAGAAGAGCGTATGCTATTCTTCCACGATCGCCCTGTAGAACAAGATAGA
TTATTTCATAGAACCACGCACGATATCGAAATGATAAAAGAAACAGGATTTTGTAAAGGAATAGAAAACT
ATTCTCGTCACTTTACAAAAATGCCTCCTGGAGCACCTCCTGCTTGCCTTTTAGATTATTTCCCCGAAGA
TTTCCTATTAGTCATAGATGAATCACATCAAACACTACCGCAGATACGAGCTATGTACCGCGGAGATCTA
TCTAGAAAGCAGTCTTTGGTAGAATATGGCTTTCGGCTTCCCTCTGCTTATGACAACCGTCCTTTGACCT
ATGAAGAAGCTCAGAAGTATTTCCATAATGTAATTTATGTATCTGCAACGCCCGGAGAAACAGAGCTAAA
CGAAAGTCAAGGACATATCGTAGAACAAATCATCCGCCCTACAGGAATTCCTGATCCTATTCCAGAAATT
CGTCCTGCAACAGGGCAAGTAGATGATCTACTTGAAGAGATCCGCAAACGCTTATCTAAATCTCAGGAAA
AGATTTTAGTCATTTCTATTACTAAAAAGCTCGCTGAAGATATCGCTGCTTTCCTTTCAGAATTAGATAT
TGCTGCAGCATATCTACATTCTGGAATAGAAACTGCAGAGCGTACTCGTATTCTTGCAGATTTACGTTTG
GGAAATATTGATGTACTTATAGGCGTAAACTTACTCCGCGAAGGATTAGATCTTCCTGAAGTCTCTTTAG
TCGCTATTCTTGATGCCGATAAAGAGGGTTTTTTACGTAGTACCTCTTCTTTAATACAGTTTTGTGGAAG
AGCGGCAAGAAATGTAGAAGGGAAGGTTATCTTCTACGCCGATCAAAAAACACGCTCTATAGAACAAACC
CTAAAAGAAACGGAACGCCGTCGGCAGATACAATTAGATTACAATAAGGCAAATAACATTACGCCTAAAC
CCATTATTAAAGCGATCTTTGCCAATCCTATCCCTCAGGGAGGGAAAAAAGAATCACAAGAGCCTGCTAA
AACCCCTCTATCGATAAAAGAATTAGAAAAGCTGATAAAAAAATTTGAAAATCTCATGCAAGAAGCAGCT
CATGAATTTCGATTTGATGAAGCTGCAAAATATCGAGATAAAATGAAAGCTGCTAAAGAACAACTTCTTT
ATCTTTCATAA
>ref|NC_003361.3|:1116890-1118164 phosphopyruvate hydratase [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTAGAAGTTGTCATTTCCGATATCCAAGCTAGAGAAATTTTAGACTCCAGAGGATATCCAACATTAT
ATGTTAAAGTAACTACAGACGCAGGCACTTTCGGAGAAGCTTGTGTGCCTTCGGGAGCTTCTACAGGAAT
AAAAGAAGCTTTAGAACTTCGTGATCAAGATAGTTCTCGATTCCAAGGGAAAGGTGTTTTACAAGCTGTA
AAAAATGTGAAAGAAGTACTTCTCCCTGTCTTACAAGGAATCAGTATATTCGATCAAATCCTTATCGATT
CTATCATGGTAGAGGCTGATGGCACACCAAATAAAGAGAAGCTAGGGGCGAATGCCATTTTAGGAGTTTC
TTTAGCATCTGCAAAAGCTGCTGCTGCTACATTAGGACGTTCTTTTTACCGTTATCTAGGAGGATGTTTC
GCTCATGTGCTTCCTTGCCCTATGATGAATCTTATTAACGGAGGGATGCACGCAAATAACGGTTTGCAAT
TCCAAGAGTTTATGATTCGTCCTATCGGAGCAACTTCTCTAAAAGAAGCTGTACGGATGGGCGCTGATGT
TTTTCATTCTTTGAAAAATATCCTCAATGAAAAAAACTTAGCTACAGGGGTTGGTGATGAAGGAGGCTTT
GCTCCACAACTAAAATCTAACTCTGAAGCATTAGATCTTCTTGTACTTGCTATCGAAAAAGCAGGTTTCC
AACCTGGAGAAGACATCTCCCTAGCTCTCGATTGCGCAGCTTCTTCCTTCTATGATACGAAAGCAGAAAC
CTATGATGGAAAGAGCTATGAAGAACAAGTGAACATACTTGCCGATCTCTGTGATCGCTATCCTATCGAT
TCTATAGAAGATGGCCTCGCTGAAGAAGATTTTGACGGTTGGGAATTGCTAACAGCAGAACTTGGCGAAA
GCATTCAAATCGTTGGAGATGATCTCTTTGTTACCAATCCTGAATTAATAGCTGATGGCATTAGTAGAGG
TCTTGCTAATGCTGTGTTAATCAAACCAAATCAAATTGGTACATTAACAGAAACTTCAGAAGCTATACAG
CTTGCCCATAGCCAAGGGTATACAACTATTCTTTCTCACAGATCTGGAGAAACCGAAGATACAACAATTG
CAGATCTTGCTGTAGCTTTCAATACAGGACAAATTAAAACAGGATCGCTATCACGTTCTGAGCGTATTGC
CAAGTACAACAGGCTTATGGCAATAGAAGAAGAACTCGGTCCTGAAGGACTATTTAAAGATTCTAATCCA
TTTTCTGGAGAATAG
>ref|NC_003361.3|:1118413-1120320 regulatory protein, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGATCCCTTTTACAAAAACGATAGGCTACCGTTTATGGTTAGCATGTGTAGCTGCGATATTAATTCCCC
TAGGAATTAATATCGTGCTACTCAACTTCCGACAATACCACACTACAGTTTCATCAGTTGCCGCAGCATT
TAAAGAAAATGCTTCTTTTAAGGCGGATACTCTCATGCAAATAGTTCCGCTAAATGCTGATGTTTTAGCA
TTATTTTCAGAAGTTTTAGATCTTGATGAGGGAGTTCCCTCGGTTCCTAATGTTGAACTTAGCAATGAAA
TGCAAAGGATCTTCAGCTCAACATATGACGAAATCTCTTTAATTAAACTGCAACCTAACGGAGAGAAAAT
CGTTGTAGCCTCTAGCCAGCCAGAACGTCTTGGGGAAAATTATAAAAATAAAATAGATATTCCTAGCCAC
TTGCCTTTAGCAGCAACTTTTAAACAATCTTCAGACAAGCATGAAGTTTTTTCAGTAATGCAGGTAAATA
TCTTTGATAATGATACCCACGAACTCCTAGGGATTCTCTATACAACTCATAATATTGAAAAATTCCTAAA
AGATATTCTTATAAATACTCAAGCTTACTTCACTGTAAAAACAGCTATTTTATCTAAAGACGGTGTTATA
TTAAAAGCCTCTGACCCAGATTTAGACCTTCGAGCTATTTATCCTCATGTTACTGAAAAACAATTCTGCG
ATACTTTCCTAGATATAGATTCCTGCCCAAAAGGAATTGCTCTAAATCCTCTTTCGCTAACGCCTTTACC
TATAGAGCCAAACTTTTTCTCCTTTAAAAACGGAAATCAGGAAATATGGAGTTATCTCGCTAACGTTCCT
CATATGGATTTGTCCGTTCTCTCTTATGGGACAAAGACTGAGCTCTTTTCTACCTTATGGAAACGTACGT
TAATTTATTTTGCTTACTTTTTATGCGTTGTTTTAGGGAGTATCATTGCCTATCTTGCTGCGAAGAGATT
ATCTTTGCCGATCCGCAAACTCGCCACTGTCATCATACAAACAAGAGACAACATCCGCGATCCTTATGTG
GATGATTCCCTAGGGTTTGAAGTTAACAGGTTGGGGCATATTTTTAACGCCATGGTACAAAGTTTAGACC
AACAACAAACCTTAGCTGAGAAAAATTACGCTATTAAAGAAAGTGCACAAAATGCCCTGCGTCTTGGTGA
ACAAGCCCAACAAAGACTCCTCCCCAATACTCTTCCTAACTATCCCCATGTTGAATTAGCAAAAGCCTAT
ATCCCCGCGATTACCGTAGGAGGAGATTTCTTCGATGCCTTTATCGTAGGTGAAGGAGATAAAGCTACAT
TATTTTTAATTGTTGCTGATGCTTCTGGGAAAGGTGTCCATGCTTGCGGATATTCTTTATTCCTTAAGAA
TATGTTGCGCACATTCCTATCGCAAACCCCTTCTATAAAAGAAGCTATAGAACAAACATCCTTGCTATTT
TATAAGAACACCGCGAATTCAGGGATGTTTGTCACCTTATGTGTCTACAGCTACAATTATAAAACAGGAA
GTGTAGAGTTTTACTCCTGCGGCCATAATCCCGCATGTTACCTATCTCCTAATGGAGAGGTTTCCCTTCT
TTATCATCAAGGAATGGCCCTGGGATTCCTTCCTAACATTCCTGATATCCCTACAACAAGTTTCCAACCA
GCTCCAGGATCTTTGATTATCTTATATTCAGATGGCATTACAGAAGCTCATAATAAAGCTTTTGAAATGT
TTGGTGAAGAACGGTTAAAAAGCGCTGTAAAAACCTTAGTAGGAAAAAGCGCAGAAGATGCTATGCATTC
TTTAATGCTATCTGTGAAAACTTTCGTAGGGAATAGCCATCAACATGATGACATTACCTTGCTGATTCTT
AAAATAGCGGACTCATGA
>ref|NC_003361.3|:1120317-1122140 hypothetical protein CCA00965 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATCTGGTAGTTCTATCGTTATTTTCTTTTTCAGCAGCGAAAAATAACCTGATGGAAAATCTCCATACCCA
TGTGACAAACTTCAGCTTAGAATTTGAAAAAAAACTCACCATTCACAAAATCTTTCTTAAACGTTTAGCA
AATACCTTAGCACTTAAAGCCTATGCATCATCAGCGGAAGATTTCTACTCTCAAGCGTATAATGAGATGT
TCGCCCTATCGGATACGGACTTCTCCCTTTGTTTAATCCCTCTTATCGATGGGAATATAAAAACAAAAAA
TCCCCACGATCCATTTATCCACTATTTAAAAAGTCATCCGGAAATAAAAAAGAAACTCAGCATGTCTTCA
GGGAAGGCCTGCATCATTACAATCTCTTCAGATACTTACCAAAATTATCCTAAAAATTATCTTGTGATTA
CCGAAGATATCGAAGTATGGAATGCACCAACAAGCGCGGGGTTACTTGTTAGCTTCTATCCTATGGACTT
CTTACAAAAGGATTTATTCAAATCTTTACATCTAAAAAATGAAGCTATCTGTCTATTAAACAAATATGGG
GAAGTCCTCTTCGCTTCAGATCCTAAATTCTCTTCAGAAGTCTTTTCCGTAGATATCCCTGATCTTCCTA
AAATCACGGCTAGGAAACAAGCTCTTGCTGTAACAACGGCTCCTAAAATTCTTCGAGAACACAATCTTAT
AAGCATAAAAATAAAAAATAAAAGCTATCTAGGGATTGTTTTAAATAAACTTCCTATTCAAGGAACCTAT
ACCTTATCTATCATTCCTCTTTCTTGGTTTATCAATAAGGCTATCCATCTGCCTTTGAATGTGATTTTCT
TTTATTCGTTAGCCTTTCTCTTCATGGGATGGGTACTCACGAAAATAAACAAACGGTTAAATCAGCCTAT
CCAAGAACTTACAACATGTATGGAAGCTGCATGGCGAGGAAATCATAACATCCGTTATGAACCTCAACCT
TACGGATATGAAATTAATGAATTAGGGAATATCTTCAACTGCACTCTATTGTTACTCCTCAATTCAAGAG
AAAAAGCAGAAATCGAATATGCCTCTGGAGATCAATTACAGAAAGAATTAGCTATTCTTGCTTCCCTTCA
ACAAACACTTCTCAGCCCTACCTTCCCCGAATTTCCTAATATCTCTTTCATTTCCAAACACCTTCAGGGA
ATTCAGCTATCAGGGCATTTTTATGGATGGAAAACTTCCTTCCCTGAACAGACTCTCATTGGCGTTATAG
GCCTCGCCGGAGATATAGGACTCCCATCCTATCTTTATGCTCTATCTGCACGAAGTTTATTCCTGGCTTA
TGCAAACCTCTCTTCTTCCTTAGAGAAAATAAGCTCAGATACTTTTGATGCCTTCGGGAAAACTACAGAA
GGTGATGAAGCTACCGTCTCCATGACTTTTATCCGCTACGATTCCATAGATTCCACATTATCTATTTTAT
CCGTAGGGGAAACCCCTCCCATAGCCTTTTTAAAAAGACAGGAAACCTTTTCCCGTCTTGCTTCACCCAC
TAAGCACAAGATAGAACCCGGTGATATTCTAGTATGTATCACAGGAAATTATGAACTTACTGAATATCTC
ATGCGTTTACCTATTGAAGAACTCATTAAAGATCCCCTAGCACCTTTAAATTCAGAAAATTTCATAGAGA
CTCTTACAGAAATGCTGAATAAAGAAACGCAGTCACAGATAGATGGAACGTTAAGTTTCCTGTCTTTCAG
TTGA
>ref|NC_003361.3|:1122718-1125609 hypothetical protein CCA00966 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TCTTTTGCTCAGAAAATGACGATCTATTTCGTGCTTATCAGACGACTTCCCTACAATCTCCCCTCGCAGC
GAAAAATCTCACCATAGCAAGAAACGCAGCTCGTTATATCCTCGCAGAAAATGGCGAAATCGATACAACT
AAAGTCGTAAAAGCTATAGAGCATCTAACAAAATGTCTCTATCCCCTAGGGCCTCATAGACATAATGAAG
CTAAGCCTAGAGAACATCTCCTGAAAATGCTTCAAACTATCAAACAAGAACCTGAGATTAAAGAAAGGAT
AAAAAAGTTTTTTGTTCCCTCTTATAAGAGTATCCAAGATCTCATTCGTAATACTATAGCCTTATCCCCA
GAGATTACCTTAACGCCTATTCACGCACGCCAGGCAGCGCTTACAGCGCTATTTTGCTACCTACGTCAAG
ATGTGGGATCTTGTTTTGCAACAGCCTTCGCCATTATTATCCATCAAGAATATCCCAAGTTATTCATAAA
AGATATTGGTGATCTACTGACTTCGGGAAAACTTACAAGAATCATCGGCACAAGAGAAATCTGCGTCCCT
ATAAACCTATCGGGATGCATCGGAGAATTATTTAAGCCGTTAAGAATATTAGACTTATATCCTGACCCTA
TTGCCAAACTTTCAGCATCTCCAGGTCTACAACGAGCATTCGCAGCTGCAGGTATCGTGGATACTTTAGA
CGATCCTCAAGTTCGTGTTCAGCAGATTCTGGCTCATGAATATCTTCTAAATAAACTGCAGCACGTCGAT
AATATCCTAACAGCGAATGAAGTAATCCAAAGTACGTTACTACATCATTATCAAATTACAGCGGATTCTG
TCTGCTCTATCTTATTTCAAGAGGGCTTCTACAACAAGGAGCAGGTCTTTTTCTCCATTGAACATTCTCA
TAAGCTCTCCCAAACTCAAAGGGTCTATAGCTATCTCACAGCATACGAGCAGGCTAAATCTGCTTTTATT
AGTGACACACAAAATCCCCTACTAAAATCCTGGGAATATACATTAGCGACTCTTGCGGATGCTAATGATT
CCTCAACGTTAAATCATATTCGCGTAGCCCTAGGATGGCGCCATGATGAGCCTGATAGCCTAGCACATAT
TATCCAAACGTTTGTAGAAGAAGCCGTTGATAATGCTCGTGAGCTTATACAACAATGCGAGCAGACATAT
AATGAAGCGCGTGCTCAGCTTGAATATATAGAAAGCCGCATGAGAAATCCGCTAAATGAACAAGATAATA
AAATCTTGCTCATGGATCACTTACGTTTTCGCCAAGAGCTCAATAAAGCTCTCTACGATTGGGATACTGC
TCAAGAAAAGGCAAAAAAACTCTTCGCTCTTCCTAATTTCTTACTCTCCTTTTACACGAAGATCATTCCA
CAATATTTCCGCAGTTCCTATGATGCTTTCATTCAAGAATTCTCCCATCTTTATGCGGATTCTCCTGCAG
GATTTCGTATACTCTTTACTCATGGAAGAAGCCACCCAAATACCTGGTCTTCCATCTATTCAATTAACGA
ATTTATCAGCTTTTTATCTGAATTCTTTTCCTCAACCGAAGGAGAACTCCTCGGAAAACACGGTGTTTTA
GGATTAGAAAAAGAAACTTCTGCTCTCATCCACCGTATTATTTCTTCTCTTCATAAGAACTCTTTCCAAG
AAGCTGCGATAACACGTATCCTTAAAGGATATAACCTTCCTGTTCCCGAACCTGTTCTTAACAATTTAGA
CAAGATTTCCCACACTCCCTGGGTATATGTTTCCGGAGGAACAGTAGAACATTTATTGAAAGACTACTTC
GAAAATTCCGAAGAGGTCTCATCTATGGAAAAACATCCTGAAACTGCCCATGAACTAGCAGCTTTTTTCT
CAGACGCTTTAAAAGATCAGCCATCAGCAGTAAAAAGCTATTTAGAAGATGGCTCTCATTCGCTACTAGC
TTCATCTCCCACACATGTTTTTTCTGTCACTGCAGGAGCTCCTTTATTTCGTGAAGCTTGGAATAACGAC
TGGTATAGCTATACCTGGTTACGTGATGTTTGGGTAAAAAACCACCAGGATTTCCTAGCAGATACTGTGC
TAAATCAACAAGGGATCTATACATTTATAGAAAGATTCTGCTCAAAATACAGCTTAGAAAATCTTACTTA
TGACTTTCACGATTTCTGCTCTGATCATTCTTTAACGCTTCCGGAACTCTATGAAAAAGCCTCGAGATTT
TTACAAGAAGCTCTACCAAGCTCAAAAAGCATCTTCCCCTTATACCAAAGACGCTTAGCACATCAGATTG
TCCAAGATATTCCCTATACCTCGGACCAACAGCTCCCTGAGGTTTTAGACAATGTCAGTTCTTATTTAGG
AATTTCCTCTAGAATTACCTATGAAAAGTTCAGCAAACTCATAGAACAATTCATCCCGAATTTCTCCTTA
TTATCCTCGGAAGAGATTCGTCATCTTTTTAAAGGATTGCTGATGGAAAGCTATCAGCAATTGTATTTTG
AAGAAGATCTCTTCTTCAGATTAGCAACAGCTATGCGCCATCATAACCTTGCTTATCCAGCTCCTCTACT
CTTTGGAGATAGCAATTGGGCTTACAGCTATTTCGGATTCATTCTTCATCCAGGAACTCAAGAAATTGAT
CTCTGGCAGTTTAATTATGCTGGATTACAAGGCTATCCGTTAGAAAATACTGACAAACTACTTTCCGTCT
CAAGACCTTGGACTCTCTACGCAAATCCTATAGACTATGGCATGCCGCCGCCTCCAGGATACCGCAGCCG
CATGCCTAAGGGATTTTTTTAA
>ref|NC_003361.3|:c1126397-1125606 succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTGAATTAGCGTTGCATCCAGGAGAGAATGTAATTAGCGCTCTTATGGAAATCGAAAAACGTCCTGTAAA
TACTTTAGGGGAAACTGTAGATCCTGTTGTATGGGAACAGGGGTGTTTAGAAGAGGTTTGCGGTTCTTGC
TCATTATTGGTCAATGGTACGCCTCGTCAGGCATGCACAGCGCTTATTGAAGAGTATATAAAAGAAACAG
GATCTCGAGAGATTGTTTTAGCTCCGCTAACGAAATTCCCATTAATTCGTGATCTTATTGTAGATCGTTC
CGTCATGTTTGATAACTTACAAAATATTCAAGGATGGGTAGCTGCGGATGCTGATGGAGAAAATAGTGGC
GTGAAAGTATCGCAAGAACAGCAAGAGCTGATGTATGCCTTATCTATGTGCATGACATGCGGGTGCTGTA
CGGAGGCTTGTCCTCAAATTAATGAGCATAACGATTTTATTGGGCCGGCAGCTATTGCTCAGGCGCGTTT
GTTTAATACCTATCCTGGAGATAAGCAGTCTAAAAAACGTTTGCGTGCGCTTATGGGCAAGAAAGGTATA
GAAGGTTGTGGGCAAGCGCATAACTGTGTGCGCGTGTGCCCTAAAAAACTCCCATTAACAGAAAGTATTT
CTGCAATGGGAAGAGATATTTCTAAATATTCTTTAAAATCCTTATTCCGAGCGATTTTCCAAAGAAAGAA
AAAAGATAGCGATACGGATTAA
>ref|NC_003361.3|:c1128295-1126412 succinate dehydrogenase flavoprotein subunit [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGAAGCACAGAGTTGTAGGGTTATAGTTGTCGGTGGTGGTTTAGCAGGGTTGTCGGCAGCCATGAAAT
TGGCAGATCATGGTATCGTTGTTGACCTCATATCACTGACAAAAGTGAAAAGATCTCATTCTGTATGTGC
TCAGGGAGGGATAAATGCTGCTCTTAATCTTAAACAAGAAGAAGCAGATTCTCCCTATATACATGCTTAC
GATACGATAAAAGGCGGGGATTTCCTAGCAGATCAGCCTCCTGTTTTAGAAATGTGTTTAGCAGCGCCTA
GGATTATCCGTATGTTAGATAATTTTGGATGCCCTTTTAACCGTACTCCTAATGGAGAATTAGACGTGCG
TAGATTTGGAGGGACGCTATACCACCGCACAGTATTTTGTGGGGCTTCTACTGGGCAGCAGCTTATGTAT
ACCCTAGATGAGCAAGTGCGCCGTCGTGAAAGCCAGGGAAGAGTTAACAAATTTGAGAATCATGAATTTG
TAAGATTGATTACGAACAGCGCGGGAAGAACCTGCGGGGTTGTATTGATGAATTTATTCAATAATCGCCT
AGAAGTTCTTAAAGGAGACGCTGTTATTGTTGCTACAGGAGGTCCTGGAGTCATTTTCAAAATGTCTACA
AACTCGACATTTTGTACGGGAGCTGCAAACGGTCGGTTATTCTTACAGGGAATGACATATGCAAATCCAG
AGTTTATACAAATTCACCCTACAGCCATTCCTGGCATTGATAAGCTGCGGTTAATATCCGAGTCCGTTCG
TGGTGAAGGTGGACGCGTTTGGGTTCCTGGAGATGCATCAAAGACAATTATTTTCCCTGATGGTTCACGA
CGCCCTTGTGGAGAAACGGGAAAACCTTGGTATTTCCTAGAAGAAATGTATCCTGCTTATGGGAACTTAG
TCAGCCGTGATGTAGGCGCTCGCGCTATCTTACAGGTATGTGAAGCAGGGTTAGGAATAGATGGTCGTAT
GGAAGTCTTTTTAGATGTCACTCATTTGCCAGCTTCTACACGACATAAGCTAGAAGTTGTTTTAGATATT
TATAGGAAGTTTACAGGTGAAGATCCTGATAAAGTTCCTATGAGAATTTTCCCGGCTGTGCATTATTCCA
TGGGAGGTGCTTGGGTAGATTGGCCCGCTGCAGATGATCCCGATCGCGATAGTCGTTATCGTCAGATGAC
AAATATCCCAGGATGTTTCAACTGTGGGGAATCGGACTTCCAATATCACGGAGCGAATCGTTTAGGAGCA
AATTCGCTGCTATCTTGTTTGTATGCAGGACTTGTCGCTGGAGAAGAAGCTGCTCGTTACATTACTGCTT
TTGGCTCTTGTCCAACAACCTCGACAGATTTTTCCGACGCTCTTCAACAAGAGAAAGAGATGAATGCTCT
TTTACTTTCAAGAAGAGGCGGAGAGAATATCTTCGTCTTACATGAAGATATCGCTAAGGTTATGGTTAAA
AACGTTACTGTGAAACGAAATAACAAAGATCTAAGAGATACTTTAGAACAGCTAAAAGAGTTTAGAGAGA
GGCTTCAGAGAGTTTCTGTGCATGATTCCTCACAGTTTGCCAATAAGACTTTCCATTTTGTACGACAGAT
GGGCCCTATGATAGAATTGGCATTAGCGATTACAAAGGGAGCACTATTGCGTGATGAATTCCGCGGTTCG
CATTATAAAGAAGAATTCCCTAAACGTGATGATGTTCATTGGCTAAAGACAACATTAGCGTCGTATTCTC
CTGAAGAACCTGAGATTACTTATAAGCCTGTAGATACACGTCACGTGCAACCTACATTACGAGATTATAC
AAAATCTTCGACAGGGAAAATCGAGCTTGCCAACGTTCCTGAAACCGTGCGTTTGCCCATATAA
>ref|NC_003361.3|:c1129193-1128300 succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAGAAAGGGGAACCTGTTCTGGGACAGCTCAGAAGCCATGGAAGTACTACACTAGCTTTGTTTTAC
GTTGTGTTCATTCTTTAGCGGGAGTTGCATTTACGTTGTTTCTTTGTGAGCATATGTTTATTAATATGCT
CGCCTCTTCTTATTTTAATGAGGGGAAGGGATTTGTTCAGTTAGTGAGCAAATTTCATCAGATTCCTGGT
CTTAAGATTATAGAAATCACCTTTTTAGCCCTGCCTTTTATCTGTCATGCTATCATAGGCATTGTCTATC
TTTTCCAAGGGAAAAGTAATTCTGGGGCTTCTGACGGCAGTAAGCCTGCATTAGTTTATGCAAGAAATAT
TGCCTATACCTGGCAGAGAAGAACAGCATGGATTTTACTTTTCGGGCTTATCTTTCACGTTGTTCAGTTT
CGTTTTCTTCGTTATCCTCTTCACGTAGAGTTGCATGGGCAGACATACTATGTTGTGGATATCAATTCCT
CCCGTTACCCAGCGATAGTGCGTGGTACTAAGGGATTCTTCACTATAAATTTCTCAGCTCCTCAAGGGGG
AACTATCCGTCTGGATAGGGAGGATCTTGAGGGTAGTGCTGTTTCTAAATTGTCAGAAAATAAGGCGTAT
GTTCTTACACCTAATGTTGGGGCAGCTTTTCTCTATATTGTTCGTGATTCTTTAGGATCCTTATGGATTG
CTATTTTCTATACTCTGCTTGTGATTGCTGCTGCATTTCATGGGTTTAATGGATTATGGACATTTTGTTC
TCGATGGGGAGTTGTTATATCTTTTCGGTCTCAGGCTCTTTTACGTAGTTTGTGTTATTTTGCCATGGTT
ATCGTTTCTACCATGGGCATTAGTGTGATTTGGAATTTGTATAGCGTGGCATAA
>ref|NC_003361.3|:c1130089-1129289 TatD family deoxyribonuclease [Chlamydophila caviae GPIC]
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GTCGTGCAAAAGACTCCGGAATTTCCCTCCTTGTTAATGTCACAACAACCATTGATGAGCTGAATAAATC
TTTTGATTATGCTGAACGTTTTCCAGAATTGCGTTTTTGTCATGTTGCTGGGACGCCTCCTCAAGATGCT
CATACAGATATAGATGAGCATTTCCAATATTTCCAAGGTTTTGCTCAAGCAGGAAAATTAGCTGCTGTTG
GTGAGGTAGGTTTAGATTATTGTTTTGGGGAAGACGATGCTGCTAAAGAACGTCAAAAAAAGGTGCTAAA
GAAGTATTTGTCCTTGGCTTTAGAATGTGAGCTTCCTCTTGTTGTGCATTGTCGTGGTGCTTTCGATGAT
TTTTTCCATATGCTAGATCAGTATTATCATCATGACGAACGCTCTTGTCCTGGCATGCTGCATTGTTTTA
CAGGATCTTTAGAAGAGGCGCAGGAGCTGATTTCTCGTGGATGGTATCTCTCTATTAGTGGGATTGTTAC
ATTTAAAAATGCTCAGGATTTGCGTTCAGTAGTTTCTCAAATCCCTCTGGATCACTTGTTAATAGAAACA
GACGCTCCTTTTCTTGCCCCTACGCCTTATCGGGGTAAAAAAAATGAGCCTGCGTACATAACCCATACGA
TACAAGCTATTGCAGCTATTCATGGTATTGATTCCCAAGAGCTTGCAGGTATAGCGCGAAGTAATGTTTT
ACGTTTCTTAGAGGGACGTAAAAAAGGGTAG
>ref|NC_003361.3|:c1132395-1130257 thiol:disulfide interchange protein DsbD [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGAATAAAATCAAAAAGCATTTTCAAACTATATTGGTAGCCTTTCTATTTTCCTTGCCTGCCTTTACTG
GGTATGGTCAGAAATTGCATGCTGCAGAGCCTGTAGTAGAGAAGGCCTTGCCAGGTGCTACTCTAGTTTC
TGAGGGGTCTCATATTCCCAAAGGTGGAATATTTAGATTGGGGATTAAGATAACCGCCCCTAAGGGAAGT
CATATTTATTGGAAAAACCCCGGAGAAGTGGGGAGCCCATTAAGAATTAACTGGAATTTACCCAAAGGAT
TTGTCGTCGAGGAGGAGCATTGGCCTGCGCCAAAGGTCTTCGAAGAGGATGGAATGACATTCTTTGGTTA
TGACGATAACGCGTTTATAGTTGCGGATATTCGTGCCCCCGAAGGAGGCGCTGATAAGGAAGCCGTAGAG
TTAAAAGCTCATGTCGAGTGGTTGGCCTGTGGGGAGAGTTGTGTCCCTGGAAACGTCGATTTGGTGCTAT
CGCTGCCGTATCGTGACGGCGTTGCCGCCTTACATCCTGAAAGATCTGTAGAGTTTGCTCAAACTCTACA
ATCTCAACCCCGTCTATTAAAAGATAATCAAGCGATTACTTTGGGACGTAGTCAGGAAGGCGAGATCATT
TTAAATATTACTGGAAGTCAACACCACGCTAAGAAGGCCTGGTTTATCTCAGAGAAGGCTGATAAGATTT
TTGCTTATTCCGAAGAGGCGATAAATGAGACTTCTGGAACAGCTTGGAAACTGAAGATCAAAACCCTATC
GGGAGTGGAAAAGAATCAGGAGCTGCAAGGAGTTTTACTGCTTACAGATAGTGCGGGTCAAGAGATTGAG
TCTTTTATAGTTCATGGTCAAATTAGTGATTCTGGACAAAGCTCTGAATTATGGAATTATATAACAATTA
TAGCAATGGCGTTCCTCGGGGGACTTCTTCTTAACATCATGCCCTGTGTTCTGCCATTAGTAACCCTTAA
GGTTTATGGATTGATTAAATCTGCGGGAGAGCATCGCTCCTCTGTGATTCTCAATGGCCTTTGCTTCACT
TTAGGAGTTGTGGGTTGTTTTTGGGGATTAGCAGGAGTTGCTTTTCTGTTAAAGATGTTAGGGCACAACA
TTGGTTGGGGTTTCCAACTTCAGGAGCCCATGTTTGTGGCAACCCTAATTATTGTATTCTTCCTATTTGC
TTTAAGCTCTTTAGGCTTATTTGAAATAGGCACCATGTTTGCTAACCTTGGAGGGAAACTCCAGTCTACG
GATGCGGGAGCCTCTAAGAGTAAAATTGTGGGAGCTGTCTTTAACGGGGTGCTGGCTACTTTAGTAACAA
CACCGTGTACAGGACCATTTTTAGGTTCTATACTTGGCTTAGTGATGTCTTTATCGTTTATCAAGCAGTT
GATGATATTTACATCTATTGGTTTGGGAATGGCCTTGCCTTATCTTGTCTTTTCTGTATTTCCTAAGATG
TTATCTGTTCTGCCTAAACCTGGAAATTGGATGAGTACGTTTAAGCAGCTTACTGGGTTTATGTTATTAG
GAACGGTAACTTGGTTAGCATGGATTTTCGGATCGGAAACGAGTACAACAGCGTTAATTCTCCTACTTGC
TGGATTGTGGCTTGCGGGGATAGGGGCCTGGATTTTAGGAAAATGGGGAACTCCTGTTTCTCCTAGGAAG
CAGAGGGTATTTGCATCGACTCTATTTTTTGGATTCCTTGCGGGAGCTTTATCTTTGAGCTTTATTGCTT
CTCGGTATTTTGCAGAAGAAGCAGAAACTGTGGTCGTTCAAGAAGGAAGTTCTTGGCAGCCATTTTCTGC
AACAAAACTCGCTCAGCTGCGCAAAGAAGGGCAAGCGGTATTTGTCAACTTTACAGCTAAGTGGTGTTTA
ACCTGTCAGATGAACAAGACTGTGTTACACGCAGCTGCTATAAAGGAAATGTTTAAAGAGCATGGGGTAG
TTACTCTAGAGGCTGACTGGACACGTAAGGATCCTGGTATTACCGAGGAGCTCGCGCGTTTAGGACGAGC
CAGTGTTCCTTCGTATGTCTATTATCCTGCTGATCAGTCGGAGCCTGTGGTGCTTCCTGAGAAGATTACA
CAGGCGGTTCTTGAGGACATGGTCTTTTCGAAAAGCTAG
>ref|NC_003361.3|:1132565-1133263 MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTACAATTCACCCATAATCCAATTATCCAGGCCTTCAGGGAAGCCGATCTCTTCGGTAAGGGGATAT
TCTTCAGCTTGCTCATACTTTCCTTATGCACTTGGACAGTACTACATCAAAAGCTTGCTATTCAAAAAAA
ATTTCTAAAATCAGGGAAATCTCTTAAAGATTTCTTGATAAAGAATCGTCATGCTCCGTTGTCTTTAGAA
ATTCATCCGGAGTTAAATCCCTTTGCGGATTTATATTTTACTATTAAGCGAGGAACTTTAGAGCTTCTTG
ATAAAAATCGCCAACAGGCTCCAGATCACGGTCCAGTATTGTCTATGGAGGACATCCAGTCTCTAGAGAC
TTTGCTGGGGGCTATTATGCCGAAATACCGTGCTATCATGCATGAGAACAACTTTATCCCCGCGACAACG
ATCAGTTTAGCCCCCTTTTTAGGCCTTTTGGGGACTGTTTGGGGCATTTTGGTAGCTTTTTCTCATATTA
GCTCGGGAGAAGCTGGGGGAACAGCGATGATGGAAGGTCTGGCAACAGCTTTAGGAACGACAATTGTAGG
GTTATTTGTTGCTATTCCCTCTTTGATAGGATTTAACTATCTTAAAGCCCATTCTTCTAGATTAATTCTA
GAAATAGAGCAGACAGCGTATTTGCTGTTAAATTCTATAGAAGTTAAGTATCGTCAGACAAATCTATGA
>ref|NC_003361.3|:1133260-1133667 ExbD/TolR family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAACGTATCATCATTGAAGATGCTGAAGAAGACCCTAATGTCAATCTCACTCCGTTAATTGACATTG
TCTTTGTTATTTTAATGGCATTTATGATTGCCATGCCTTTAATACGGCTTGATTCTATAGCCTTAGCACC
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AATACGATCCTATTAAATGATCAGGCTCTTTCCTTAGGAGAATTAAAAACACAACTTAGCCTGTTATATC
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AAAAACCATAATAGAATCTGCAGGATTTCACGAACTCCATATAGCTTTAAAAAGCTAA
>ref|NC_003361.3|:1133670-1134431 hypothetical protein CCA00974 [Chlamydophila caviae GPIC]
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ATTCCCCAACACAAAAAAAACAACCTAAGCTTCTCCCTTTCACAGAAAAACTCGTTACTTTAAGCGAACC
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GTTGAGAAACCCCCTCAACAACCTTCCCCTAAAACTCCTGCTGAGAAGAAGAAAACAGATAGTGTTAAAA
AAACGCCCTCCCCTAGCAAACCTGTAAAAAAAGAACAGTCTGTAGCGAAATCACAGGGAGAACAAAAAAT
TGCAGCAAAGACAAATCCTGCAAAAGAAGCAAAGCTCAAAGCTATAGCAGATCTTGCAAAAACACTTTCT
CAGCATCTCGAGGATAGTGATGCACGGCTTGCTGATATTTCCCTCCCTACATGTAGAGAACTAGCCATAA
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ACAAATACAAAGTCTCGAAAAATATCGCTTTTCATATTAAACTCCTGAGTAATGAGTCTTAA
>ref|NC_003361.3|:1134451-1135734 translocation protein TolB [Chlamydophila caviae GPIC]
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TCCCAATTGGATGAACATAGGGAATTGTAATCCCTACCTTTATGTTTCTTATAAATATGGCATTCCTAAA
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CGACATTTTCCCCAAGAAAAAAGCTTTTAGCTTTTATTTCCGATACTTATGGGAACCCCGACCTCTTTCT
TCAGAGCTTTTCTTTATCAAAAGGCGTTATGGGGAAACCTCGAAGAGTGTTGAACGAAACTTTCGGAACT
CAGGGGAATCCTTCTTTCAGTCCCGATGGTTCTAAGTTAGTTTTTGTTTCTAATAGAGATGGTCGACCGC
GTCTATACATTATCCAAATAGATCCAGAAATTCAGACACCACGGTTACTCACTAAAAAATATAGAAATAG
CAGTTGCCCTTCATGGTCTCCAGATGGTAAAAAAATAGCCTTTTGCTCTGTAATTAAGGGAGTTCGTCAA
ATCTGTCTGTATGACCTTTCTACTGGCAAAGATTATCAACTAACAACAACTCCTATAGACAAAGAAGGGC
CCTCATGGGCTATTGACAGTCAACATCTTGTTTATAGTGCAGGAAATTCAGGAGAGTCAGAACTTTATTT
ATTAAGTCTGATTACCCAAAAAACTAAGAAAATTGTTATAGGATTGGGGGAAAAACGTTTTCCTTCCTGG
GGAGGATTCCCTAATAACCAATAA
>ref|NC_003361.3|:1135745-1136320 peptidoglycan-associated lipoprotein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAAAGAAATATTTAGGCGTTATCAGTTGTTTATTACTTGCGCTTTTCGCCTTACCTTCATGCTCAT
ATCCTTATGGTGATTGGGATACCGTTTGCGAAGACTATCAGCATTCTAAAAAAAGAAAACAAAATTTTGC
TTTTGTTCCTCTCTATACCGATGATGAAATGAATCAAAACTTCGCAGATGCTTACGATTCTAAGGAGGAG
CAATTATACAAAACGAGTAGCCAATCAGTTTCTTTCAGAAATATTACTTTTGCAACCGACAGCTATACTA
TTAAGGGCGAAGAAAACTTAGCTATTTTGTCTAGTCTTGTTCGTCAAATGCAAAAATCTCCAAAGACAAC
TCTGTATATAGAAGGTCATACTGACGAGCGCGGTGCAGCGGCATACAATTTAGCTTTAGGAGCACGACGC
GCTAATGCTGTTAAACAGCACCTAATTAAGCAGGGAATTTCTGCAGATCGGTTATTTACTATATCTTACG
GAAAAGAGCAGCCGGTAAACTCTGGCCATAACGAACTTGCTTGGCAACAAAATCGTCGTACAGAATTTAA
AGTTCATGCACGTTAA
>ref|NC_003361.3|:1136310-1136927 LysM domain-containing protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGCACGTTAACTACAAATATTTGTTCTACTGTGGCTTATGGTTTTGTCTTGGGATAATGTCCCCTACGG
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ATGTCATGAATCTGAAATTCAGATGTTAGCAGATCGTATAGACGAACACGATGGTAAAATCCAAAGACTG
TCGTCAATAAAACCAGAATCTTTCACAAAACAAATTCAGCAATTAGAAATCGAACAAAAAACCCTAGCAA
AAACTGTTGCAGTCCTTACCTCTTCTGTAAAGGACATCCAAACTACTCTGAATAACAAGCTTCAAGAAAT
CCAAAAAGACCATAAGACTCTCTCTCAAGATATTCGTCTTTTACGACGTTCTCTTCTAGCTCTCATTGAT
GGCTCTTCCCCAGAAACCTATACAGATCTTTCCGATGAGATCCCCGCGCATATCCATGTTGTGAAACCTG
GAGAAACCTTAGGGAAAATTGCTGCAAAATATAAGATCTCCGTATCAGAATTAAAAAAACTTAATAAGTT
AAATTCTGATATTATTTACGCTAATCAAAAGCTTTGTTTACCAGAGAATAAGAAATAA
>ref|NC_003361.3|:1137026-1137424 hypothetical protein CCA00978 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAACTAACAATTGCGTTATTTGGTGAAGCAGAAAAAGGAAGCTATGACACTGCTTACCTATGCCGCA
GTGCTGCAGATCTTTATGACCATCTCGGCGGAGGATCTGCAACAACTAGGTCAGGAATAGCTTTAGCCAT
ACAAGCTCTGATGTACAATTACAATGTACTTTACTTCAGAGTAAAAGAAGAAGGATACTGCGTAGACAGT
TATTTTTTCGGGCTACACTTCTTAAATACTCAGACTACTTTAAAAAATATCATTGCCATGGGTCTTCCCG
GTGTTGGAGACCAACACATCATAGAAGCCTCTAAATCTCTCTGCAGAAAATACAAAAGTTTCCTTTTATT
CTTCGAACAAGATCTCTATGACTTATTAACTTTTAATAAAGTTTTCTAA
>ref|NC_003361.3|:c1138011-1137421 anti-oxidant AhpCTSA family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGAATCGCTATTTATTGGGAAAGCTGCCCCAGATTTTTCTGTACAAGCAGTCGTTAACGGCGAAGTAA
AGAATGTTTCTTTAAAAGATTATCGTGGTAAATACGTTATTCTTTTCTTTTATCCTAAAGATTTCACTTA
TGTTTGTCCTACAGAGCTTCACGCTTTTCAAGATTCTTTAGAAGAATTTGAAAATCGCGGTGCACAAATT
ATTGGTTGTTCCGTTGATGATCTCGATACGCACAAACGTTGGTTAAATACCGACAAAAAAGCTGGTGGCG
TTAAAGGCATTACCTATCCCCTAGTTTCTGATACAACTCATGAACTTTCTAAACTCTATGGTGTTTTAGA
TTCCCTGTCGGGATTATCATTCCGCGGATCTTTCTTGATCGATAAGGAAGGTATAATCAGACATCTGGTC
ATCAACGATCTTCCTTTGGGTCGTTCTATAGACGAAGAGCTTCGTGTGTTAGACGCTTTGATTTTCTATG
AAAATCACGGACTCGTATGTCCTGCAAATTGGCAGCAAGGGCAGAAGGCTATGGCCCCGAATGAAGAGGG
GTTGAAAGAATATTTCGGAACTATTGATTAG
>ref|NC_003361.3|:c1139883-1138273 chaperonin GroEL [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGTCTAAAATATTCAAGAATCGACTAGAAGGGCTTAGAGCGTTAAATCGAGGCGTGCGTGCTTTAGCTA
AGGCCGTCACCTCTACTTTAGGGCCTCAAGGTTCTCATGTCGTTATCAAAAAAGATCACTCCTCTCCTTA
TGTTACAAAACAAGGGGCTTCAATAGCTAAAGAGATCATTCTGCCTGATGCTTTCGAAAATACTGGTCTT
AAGCTAATTAAGGAAGCTGCATTACAAATGGAAGCTCAGGTAGGAGATGGATCTACAACGGCTATTGTAT
TAACAGATGCATTATTTGCCTCAGGGCTTAAAGGTGTTGCTGTAGGTTTAGACCCTTTAGAAATCAAACA
AGGCATCCAGCTTGCTGGAGCTATGTTAGATGAAGAGCTTGCGAAGCTCGTAGTTAAGATAAGTGAATCT
GAAGATATATTTCATATAGCCACAAGCTCAGCAAATCATGATGCCGCCATAGGGAAAATTTTAGCTGATG
CTATAGCGCAAATAGGTATCGAAGGAGTCCTTTCGATAAAAGAAGGACGGGGGACAGAGACGACGTTACA
AGCTACTAGACATGTGGGATTAAACTCGGGATATCTATCTTCATATTTTGTAACGCATCCAGAGACTATG
GAAGTTATCTATGAAGACGCTTCTATCTTATTGTGTAATCAGGCGTTATCTTGCTTAAATCAATCGTTTA
TTCACTTCTTAGAGCAGACCTTTCAGACAAATCGAAAACCTTTAATTATTATAGCTGAAGATTTTGATCC
TGAGCTTCTCTCTATTTTGATTGTTAATAAGCTCAAGGGAAACCTGCCTGTATGCGCCATAAAAGCTCCA
GGCTACGGGCAACAATGCAAGGAGACTTTAGAAGACATCGCGATTTTGACAGGAGCTACTCTTGTAGGAG
ATTTATTGGGAATTTCCTTAAGTGAGAGTAGTTTAGATGTTTTAGGTCGCGTGGAGAAAATCATTGTTAA
ACGAAATACAACGATTTTTTCTGGAGGCAAGGGAAATCAAGAAAGTCTAGAACAACGTATTGATTATTTA
CGCCAGGCTATTGTCCAAAGTAGTTCTGAAATGGACACTCAAGATTTAGAAAAGCGTTTAGCTAGGTTTG
TTGGCGGAGTCGCTCAAATCTATTTAGGCTCTGCAACAGAAAACGAATACAAAGAAAGGAAAATTCGATT
AGAGAGCGCTTTAAAAGCAGTAAAAGCTGCTTTTAAAGAAGGCTGTCTCCCTGGAGGCGGCGTGGCTTTG
GCTCGTGCAGCATCTATTATAAAGATCCCTAATGAATTGCCTATAGGTGTGATGTTTGGATGTAAGTGTA
TGCTGCAATCAGCAGAAGAGCCTCTTAGAGTCTTGGCAACGAACTGCGGGAAAGACCCTGAGTACGTAGT
AGATACTGTTTTAAAGCATGCGGACCCTTATTTCGGATATAATTGCATAAACGATTCTTTTGAAAATTTA
ATTACGTCGGGAGTGTTTGATCCTTTCTCGGTAACTAAATGTGCTTTGAAATATTCTATTTCAATCTCTT
GCTTACTTTTGACTAGCTCATTTTTTATTGTAGACTCCTCGGAAAAAATGCAAAATCCCCCTCTTTTTTA
A
>ref|NC_003361.3|:c1141226-1139994 hypothetical protein CCA00981 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TGGGGCTAGATCGTATTTTTACCGATGAAACCTACCTCTCTTGGATTCGTGGAAAGAAAGTGACATTAAT
TTCTCATAATGCGGCTATTAATCACGAGGGAAAGGACGCCCTATCTGTTTTTCGCGAACATAAAGATTTA
TGTTCTTTGAGTATCTTGTGCACATTAGAACATGGCTATTACGGTACTGCGCCTGCAGAAACTCCTGGAG
CAGTTCCTGAAATTCAAGGATTGCGTACGGTGTCTCTCTACGGTATTAAAGATATCCCTGAATGTGCTGT
GCAAGGTAGTGATGTCTTAATCTACGATGTACAAGATATTGGAGTGCGTTCTTATACTTTCGTTTCTTCA
TTACTCTATTTGGTGCGTGCTGCACAAAAGTATAAAAAGACGTTAATCATATTAGATCGCCCGAATCCTA
TGGGGGGGAGGTTAATCGATGGCCCCATCCCATCGCAATCAGATTATGCTCCAGAAATTCCTTATTGCTA
TGGAATGACCCCCGGAGAATTAGCACTTTTTTATAAAGCAAAGTACGCCCCCCAAGCTCAGGTATCTGTA
GTTCCCATGCAGGGCTGGAAACGATCTATGACATTTTCTCAAACAGGATTAAATTGGATCCCGACAAGCC
CACAAATTCCGAATGCACAAACGACATTTTTCTATGCTGCTACAGGAATTATAGGCGCTTTATCCATATC
GAGTATCGGTATAGGCTATACTCTTCCTTTTAGGGTGATCGGAGCACCTTGGATGGATGGAAATCTTGTT
GCAAAGAAGTTAAATGATGCGCGATTACCGGGAATCAAGTTCTACCCTTTTTGTTACGAACCTTTTTTTG
GTAAATATAAGATGGAATTTTGTTCAGGGGTTTTACTCATATTAGAACAGCCTGAAAAATTTCTTCCTAT
GGAAACGCAATGTACAATTTTAGGGACCCTAAAGACTCTTTATCCTAAACAAGTAGAGAATGCTTTTAAA
ACCTTGGAGAAAATTCCTTTACGAAGAACGTCGATACAGCGCTGTTTAGGAGAAGAAAAATTTTTACATG
TTTGTCAAAACGAGCGGTATATTATTTGGCCTTTAAAAAGATTGTGTATTGAAGGGAGAACAAAGTTTGA
AAATATACGTAAGCCGTTCTTAATAGCTGACTACGATGATTAG
>ref|NC_003361.3|:1141462-1142082 putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase [Chlamydophila caviae GPIC]
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GAAGTTTTGATATTTTCTCATTAACAGATTTCCCTAACTATTCTGCTCCTAAAGAAATAGGTTGCCTTCC
TGAAGAAAACGCCTTAGCAAAAGGCCTTCATGCAGCAAAAGAACTCAATTCTTGGGTGATTGCTGATGAT
ACCATGCTTATGGTGCCAGCATTGAATGGGCTTCCTGGCAAACTTTCAGCCACTTTTGCCGGAGAAGATG
CCTGCGATAAAGATCACAGAAAAAAACTTCTGCAAGAGATGCAGTCTTTAGAAAGTATTGTAGATCGCTC
TGCCTATTTTGAATGCTGTATTGTTCTTGCTTCTCCAGAAGGAAAATTTTTTAAAGCTCGAGGAATTTGT
GAAGGCTATATTAGCAATCAAGAAAAAGGTTCTTCAGGGTTTGGTTACGATTCATTATTTTTAAAATATG
ATTATAAACAAACGTTTGCTGAACTTTCTGAAGATGTGAAAAATCAGGTTTCGCACAGAGCCAAAGCTTT
ACAAAAGCTCGCTCCTTATTTGCAAAACCTGTTAGAGAAACAGCTAGTCTCTAGGAACTAG
>ref|NC_003361.3|:c1142298-1142065 hypothetical protein CCA00983 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAATGAAGGTATTCAAACCGTTTCTTTTAACAAGACACACCGACTCACCGCGAAATCTACAGTTAGTT
TAGAAATGCCCGTAGCGACACAGAAACTTCAAGGTAAAGAAGGCATGCCCGCAGCGGCAAGTTTAGAAGC
TGATTTCTTAAGAGCAGAAGCTATACTTGCAGAAATGCGTGAAATTCGCGGCTGTTTAGAACATTCATTG
GAAACGCTAGTTCCTAGAGACTAG
>ref|NC_003361.3|:c1142984-1142295 uracil-DNA glycosylase [Chlamydophila caviae GPIC]
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AGCCCTACATGCATAAGCTTAGGGAATTTTTACAATCTGAGTATTCCCAGACAACCGTCTTTCCTGCAAA
AGACAATATCTTTACCGCATTAAAAAGCACACCTTTTGATTCTGTGCGTGTTGTTATTCTTGGACAAGAT
CCTTATCCAGGAGAGGGCCAAGCTCATGGATTGAGCTTTAGCGTTCCGCAAGGGGTGCGTCTACCCCCAT
CCCTAATCAATATCTTTCGTGAATTACAGACCGATTTAGGAATAGAAAATACTACAGGATGTTTGCAATC
CTGGGCAGATCAAGGCGTCCTATTGTTAAATACTGTGTTGACTGTACGCGCAGGAACGCCTTTTTCCCAT
GCTGGTCAGGGATGGGAACAATTTACCGACGCTATTGTTACTAAGCTTATAGAAAATCGTTCCCATGTGA
TTTTTGTATTATGGGGAAATGCAGCAAGAAAGAAATGCGACTTACTTTTTCATTCCTCGCATAAACATGC
GATTTTAACAGCGCCACATCCCTCTCCTTTGGCGGCACATCGGGGCTTTTTTGGTTGTTCACACTTTTCA
AAAATTAACTACCTGCTTAAAAAGCTGAATAAGCCCATGATCAATTGGAAGCTCCCATGA
>ref|NC_003361.3|:1143095-1145008 ATP-dependent helicase PcrA [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTGCTGGAGCCGGAGCTGGAAAAACTCGCGTAGTAACATGCCGTATTCTCCACTTAATTAACGAAGGTAT
AGCTCCTAAAGAAATCCTAGCTGTTACTTTTACTAATAAAGCAGCAAAAGAACTTAAAGAACGCATTTTA
CATCAATGTCCCCAAGCTCACGGTTCTGACGTTCCTATGGTATGCACGTTCCATAGTTTAGGAGTATTTA
TCCTACGACGGTCCATACATGCTTTAAATAGAGAAAATAATTTTATTATCTATGATCAAAGTGACACGGA
CAAGCTTCTCAAGCAATGTTTACAAAAATTTAATCTCAAGAAAACTCTCAGTAGTTCGATACAATACCAC
ATATCTCAAGCAAAAAACCGTCTGCTCTATCCTGAGGATTTAGATCCCGAAGAGTATATTGATCCTGTAG
TGTCTATTTATAAAGAGTACCAGCAGCGCTTAAATGAAACTAATGCTTTAGATTTTGATGATCTTTTATT
TCTTACTGTGAAACTGTTTAAAGAATTTCCTGAGATCAGAAAAGAATATAGTGAGTTATGGAAAGCTCTT
CTTATTGACGAGTATCAAGATACCAACCACGCACAATATATGATGGCGCAGACCATCGCTGGAAAACACC
ACAATATATTTGCTGTAGGAGACCCTGATCAATCTATCTACTCGTGGCGCGGAGCCAATATCCATAATAT
TTTAAATTTTGAAAAAGACTATCCTAGAGCTCTTGTCCTACGTTTAGAAGACAATTACCGCAGTTATGGA
AACATTCTTAATGCTGCTAATGCTTTAATTCAAAACAACGTCTCAAGATTAAAAAAAGACCTACGCAGCG
TAAAAGGCCCGGGAGAAAAAATTCGTGTATTTCTAGGCAAAACAGATAAGGAAGAAGCGGAATTCGTAGC
TGAAGAAATCTATCGTCTTCATAAGAGAGCGAATATTTGTCTTCGTGATATTTGTATTTTTTATAGAACA
AACTTCCAATCTCGAACTTTCGAAGATGCTTTATTACGTAGACGCATTCCCTATGAAATTCTTGGGGGAT
TATCTTTCTACAAACGTAAAGAAATTCAAGATATTTTAGCTTTTCTAAGGATGTTCTCTGCCAAATGCGA
CGTTGTCGCATTTGATAGAACTGTAAATCTTCCCAAACGTGGTTTAGGGCCTACGGCGATTTCTTCTTTA
ATAGACTACGCTCTTACTAATAACCTCCCTATGTTAGAAGCATGTAAAAATGCTTTAGAAACTCAAGCTG
TGAAGTTATCTAAAAAGCAACAAGAAGGCTTAAGATGTTATCTGAGTATTTTCCAACAGCTCGAACATGC
CTATGAAACTCTTTCTCTTAACGAATTTGTTGTCGCGACGATAAGAATCACAGGATATCTCCAGGTTTTA
AAAGAAGATCCCGACACTTTCGAAGATAGAAAGAGCAACCTTGATGAACTCGCTTCAAAAACTTTTGAGT
GGGAACAGCAAAATACAGAAGGCTCTTTAGAAAGTTTCCTAGATGATTTAGCTTTAAAAAGTTCTACTGA
TGACTCGGAGCTCATTGCTGATCGTGTCAATCTTATGACAATTCATAACGGTAAGGGACTAGAATTTCGG
ATAGCCTTTCTTGTCGGTTTAGAGGAAAACCTCTTCCCTCATGCAAACTCTAAAGGAAATTATGAAAACC
TTGAAGAAGAACGACGGCTATGCTACGTAGGAATCACTAGAGCCCAAGATCTTCTTTATTTAACCGCAGC
GCAAACTCGCTTTCTTTGGGGCACAGTTCGTGTCATGAAGCCGAGTCGATTTCTTAAGGAAATCCCTAGA
GATTACTTGATTCAAGTACATTAG
>ref|NC_003361.3|:1145011-1146282 RNA polymerase factor sigma-54 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGTTTCAACAACATCAAAAACTTTCTCAAAACTACCTTCCCTCGCTGCGTATGCAGCAGGGATTGCAGA
TGTTGCAATCTCCAATTACTGAACTTGCCTCTTATGTACTCCAACAAATCATTCACAATCCCTTCTTTGA
TCTCTCTTCTTTAGAAGATGAAGAATGGTCCGTATGTTCTTCTCTTCCCTCTGTAGATGCTGCATATTCT
CGTCCGGAATCTTTATTTTCCCATCTTCTCACACAAGTGCAGCAAACATTTGATCGTTCTGAAGACCTGC
TCATTGCTCAGCACATTATAGGGAATCTATCAGATCAAGGTCTGTTTCTCTCTTCTACTGAAGAGCTCTC
CTTACAATTAGAAATGCCTTTAGAAACTATCCATACTGTTTGGGAAACTATTCAGCATTTTCACCCTTTA
GGGATAGCTTCTCCCTCTCTTCAAGATTATTGGCTATTACATTTAGAAGGCTCTGCACATGCTCTTGCTT
ATAAGATCATCAAAGAACACTACTCTCTTTTGATTAACTGTGATTTCTTACGTATAGCAAAAAAATGTCG
CTGTTCCCCTTCAGATATAAGAAAAGTTCTTAAGACAGCCTTAGCAAAAATTCCTTGGTGTCCTGCGGAA
GGTTATGCTTCTTTATCTCATGTACAACCTGCGCTTCCTGATGTTTACGTCACTAAAAAACATCAAATTT
GGGAAATCCAAATAAGCTCTCGAGGTTTACCTCCTATAAAACTTAACAGCGAAGTATTTCATATTTATGA
ACAGCTTCCTAAAGAAGAAAAAAAAAATCTCACACAGCAAATTCTCTCTGCTAAATGGCTTATCAAAAAT
CTAAGAAAACGAGAACAAACCTTATTTTCTATAGTAGAAACTATCCTCCCTCATCAAGAAAGCTTCCTTC
TTGGCAAGTCTTCTTCTCCCAAAGCATTATCTGTAAAAAGCTTATCTGAAGAGCTTTCCTTTCATGAATC
AACGATATTTCGTGCTATAGAAAATAAAACATTAGCCGCGCCTATCGGGATTATTCCTCTGAAACAGCTT
TTTCCACGCGCTGCTGGTGATAACGATTCTCAATCTAAAGAAACCATACTGCAGTGGATTCACGAATGGA
TAGCTTCAGAGACAACACCTTTATCTGATGCTGATATTAGCGAACGGATCTCTCAACAGGGAATTCAATG
TGCCCGTCGTACGGTAGCTAAATACCGCACACAGTTGAAAATTCTCCCCGCGAATAAAAGGAAAGCCTAT
TTTGAAATGTAA
>ref|NC_003361.3|:c1147101-1146304 hypothetical protein CCA00987 [Chlamydophila caviae GPIC]
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GAATTATAGCCGGGCCTGAAGAATTAAAACCCCCCTTTCTTTATCGCGCTCAAGATATTATCGATAATGC
TCCTGATTATCCCACAGCTTTCCCAAAAAGATTACAAGAGCTCTTTGATATCAATCCTACACACTTGGAA
GTCTTATATACTAATGAAGGTATGGACGTTTGGGAGGCGGGATGCACGTGGATAGCAAATAATCAGGTCA
CTATACAACTGCGCAAACCCCTACGCAAAGCTGCGCGTTGGTTGTATATGTATTCTAAAGAAGAGATTCT
TGCCCACGAAGCTGTTCATGCCGCACGTATGAAATTCTATGAGCCTATGTTTGAAGAAGTCTTGGCTTAT
CAGACTTCACCAAAGGTATGGAGACGATTTTTAGGGCCTTTGTTTCGTTCTCCTGGAGAGAGTTACTGTT
TATTCTTTTTCGTTCTTTCGGGTTTGGGATTAAGTTTATGGTCTCCCTTAGGAGGCCTTGCTTGTATTCT
CGCTACTCCGGCGTATTTTGGTACAAGATTGCTCATTGTACAGAGCTATTTCCGTCGTGCCATGAAAAAG
ATCCGCAAGATGCTCGGAATTCCTCCTTTATGGGTGATGTTAAGACTTACAGATGCTGAGATCCGGATGT
TCGCTACTCAGCCAATTCCAGTTCTTGAAAAGTATGCTAGAGAGCAAAAGTTAGAAAGCATTCGCTGGCA
GCAAATCTATGTTAGTTACTTCACCTAA
>ref|NC_003361.3|:1147744-1150329 fused DNA topoisomerase I/SWI domain-containing protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAAAATCCTTAATCGTAGTGGAATCCCCTGCTAAAATTAAAACCTTGCAAAAGCTCTTAGGAAAAG
GTTTTATTTTTGCTTCATCACTAGGACACGTTGTTGATCTTCCCGCCAAGGAATTCGGTATCGATATCGA
CCATGATTTCGAACCAGATTATCAAGTTCTTCCTGATAAACAAGAAGTTATCAGTCAAATTCGCAAATTA
GCCTCTAGCTGTGATGTTGTTTATCTGTCTCCCGACCCGGATAGAGAAGGAGAAGCGATAGCTTGGCATA
TTGCCAATCAGCTCCCTAAGAATACGCATATGCAGAGGATTTCTTTTAATGCGATTACCAAAGGCGCTGT
TAATGAAGCTTTAAAGCATCCTCGAGAAATCGACATGGCTTTAGTAAATGCTCAGCAAGCTCGCCGTCTA
TTGGATCGCATTGTAGGCTATAAGATTTCTCCTATTTTAAGCCGCAAGCTTCAACAGCGCTCAGGAATAT
CTGCGGGGCGTGTGCAATCTGTTGCGTTAAAGCTCGTTGTCGATCGTGAAAAAGCTATAGAAGCTTTTGT
TCCTACAGAATACTGGAATATTCGTGTTTTCCTTCAAGACCCTAAAACCTCAAAAACTTTTTGGGCGCAT
CTCTATTCTGCGGATGGGAAAAAATGGGAAAAGGAACTCCCTAAAGGAAAAACTGAAGATGAGATTCTAT
TAATTAATTCTGAAGCTAAGGCTCAACATTATGTAGAGCTTCTAGAAGACGCTTCCTATAGAGTGACTCG
CGTAGAAGCAAAAGAAAAACGCCGTAATGCAGCACCACCATTTATTACATCGACTTTACAGCAAGAAGCA
AGCCGGCATTTCAGATTCTCCTCTTCCAAGACGATGTCTGTAGCGCAAACACTTTATGAAGGTGTTGAGC
TAGATAATGAGGATGCCACAGGATTAATTACCTATATGCGTACAGATTCTGTACGTATAGATCCTGAAGC
ACTAAACAATGTCAGAGACTATATTCAAGATACATTCGGGCAAGACTATCTTCCAAAATCTCCCAATCTC
TATGCTACAAAGAAGATGACTCAAGATGCCCACGAAGCTATTCGCCCTACGGATATTCAGTTATCTCCAG
ACAAGCTTCAGGGAAAGCTTACGGATGATCAGTTCAAACTTTATTCTCTCATTTGGAAACGTTTCGTTGC
TTCACAAATGAATCCCGCGATTTACGATACGTTAGCAATGACTATCTCCACAAATGTGAAAATCGATTTA
CGTGCTTCTGGGTCCCTGCTGAAGTTTAAAGGGTTCTTAGCTGTATACGAAGAAAAAATCGATGATGATG
TAGCTGAAGAAGAGAACCTTTCTCTTCCTCAGCTACATGCTCAAGATGTTTTAGATAAAGAAAGGGTTTC
TGCAGAACAGGCATTTACAAAACCTCTTCCAAGATTTACAGAAGCTTCTTTAGTAAAAGAGTTAGAAAAA
TCTGGTATAGGCCGTCCATCTACATACGCAACGATTATGAATAAAATTCAAAGTCGTGAGTATACGATCA
AAGAAAATCAGCGTCTGCGTCCTACAGAATTAGGGAAAATTATTTCACAATTCCTAGAAACCAATTTCCC
TAGAATTATGGATATAGGTTTCACAGCTCTTATGGAAGATGAGCTAGAGCTTATCGCTGACAATAAAAAG
TCGTGGAAACTGCTTCTTAAAGAGTTTTGGGATCAATTTCTCCCTGTAGTCACCACAGCAGAAAAAGAAG
CTGTTATCCCACGTGTTGTAACTGATATCGAATGTTCGGCATGCCACAAAGGCAAACTTGTTAAAATCTG
GGCGAAAAATCGCTATTTTTACGGCTGCTCAGAATATCCTGAATGTGACTTTAAAACTTCAGAAGAAGAA
CTTGCCTTTAATAAAGATGATTATGCTGTTGACACACCTTGGGATAGCCCCTGCCCTGTTTGCGCAGGAA
AAATGAAAGTCCGCCATGGACGTTTCGGTACGTTCTTAGGATGTTTAAACTATCCTGAATGCCGTGGAAC
CATTTCCATTCATAAGAAAGGCGAGGAAGTAGAGAAAGAAGAATCGATTCCTTGCCCTGCTATAGGCTGC
TCGGGGAAAATCTTAAAGAAACGTTCTCGTTATAATAAAACATTCTATTCTTGCTCAGAATATCCCGACT
GCAGCGTGATCGGCAATACTATAGACGCTGTTGTTACTAAATATACAGGGACAACAAAAACTCCTTACGA
AAAGAAAACAACGGGAAAGAAAAAATCCGCCTCAAAAAGTAGAAAAACTACAAAAACCCCAGCTAAGAAA
AAGAAAAGCGAAGGGAAAACCACGAAAACCACTCGAGTAGGAGCTTTGCTTACACCTTCTCCTGAGCTTG
CTTTGATGATAGGCGATGAGCCTGTAGCACGTGGAGAGGCCACAAAGAAAGTCTGGAAATATATCAAGGA
TCACAATCTACAGTCCCCTGAAAACAAAAAGATGCTCGTCCCCGATGATAAGTTTCAGGCAATTATTGGC
CCTGAACCTGTCGATATGTTCCAATTACCAAAATTGCTAAATCAGCATTTATTTAAAGCTGGTTGA
>ref|NC_003361.3|:c1151324-1150305 nifR3 family TIM-barrel protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGCTTCTTCAATATATATAAGAAATATTTTACTAAGATCTCCTGTTGTTTACGCGCCTTTAGCGGGTT
TTTCGGATTATCCTTACCGGAGAATGTCTTCGCTTTACGGTCCTCCTGCTTTAATGTTTTGTGAGATGGT
GAAGATAGAGGGGTTGCACTATTCTCCTTCGCGCACATTGAAACTCTTAGAATATTCTGAATCCATGCGT
CCTATAGGGGGACAGCTTTGTGGGAGTAAGCCTGATATGGCTGGAGAAGCTGCTAAGGTATTAGAGGGTT
TAGGTTTTGATTTAATAGACTTAAACTGTGGTTGTCCTACGGATAGGATTACAAAAGATGGTAGTGGGTC
GGGGATGTTAAAATCTCCTGAGCTTATTGGAAAAGTTCTAGAAAAGATCATTGGGGCTGTCTCTATTCCT
GTTACTGTAAAAATACGCTCTGGATGGGATGGGAATAACATCAATGTTGAAGAAACTGTGCGTATTATCA
AAGATGCTGGAGCTAGTGCGATTTTTGTACATGGAAGAACGCGAGCACAGGGCTATGTCGGCCCTAGTAA
TCTTGAGTATATAACGCGAGCCAAGGCCGCCGCAGGTAAGGATTTTCCTGTATTTGGAAATGGTGATGTC
TTTTCTCCAGAAGCTGCCAAGGTAATGTTAGACACTACAGGATGTGACGGCGTGCTTGTTGCTCGTGGCA
CGATGGGAACCCCGTGGATAGTAAGACAGATAGAAGATTATCTTAATACAGGGACATATGAAAAAATGCC
TTTCTCAACGAGAAAACAAGCATTTATTCAACATTTACAGTGGGTAGAGGAATACTATCAAAGTGAAGCA
AAGTTTCTCTGTGAAACGCGAAAGCTTTGCGGACATTATTTAATATCCGCTTCTAAAGTGCGATTTTTGC
GATCAGCTTTATCTAAAGCTACATCTGTGCAAGAAGTGTATCAGCTAATTGATGATTATGAAGAAGCTGA
CGACGAGCATCGAGATCAACCAGCTTTAAATAAATGCTGA
>ref|NC_003361.3|:c1151599-1151303 YGGT family protein [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTATCTTATTTTTTGAAAACGGCTATTAATGTTTATAGTTTTTTAATCTTAGTATATATTCTTGCCT
CTTGGGTTCCCGAATGCCACAATGCAAAATGGTACCAGTACGTTTATAAGCTCGTAGATCCCTATTTGGC
GCTATTTAGAAAATTTATTCCTCGTATTGGCTTCATCGATATAAGTCCTTTGATTGCTCTACTTTGCTTA
GAGGCTGTTCCTTTTATTGTGATACGAACCCTGAGGTTTGTTATTCTTAATATTTTTCAGTCTCCATGGC
TTCTTCAATATATATAA
>ref|NC_003361.3|:1151696-1153096 hypothetical protein CCA00991 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTTTGCAAAAAACATGTAAAGGATGGATAGTTTCCCATTGCGAGCATATCTTTGAAAATCAAGAGTGGCA
GCTTCCAAAAAAATACTTAACATCCCCTATAACTTTTTCTTTAAAAGGAACCGATAGCTTAATTAGAAGC
TCGCTTTCTTCATTAAAAAACAAAAGAAATATTTTAAAGATAGCTTTGACTGATTTAGAGGCTAATGCGG
CATTCCCTTGGAATTCGTTAATGGTAGCACCTAGATTAGGAAAAAGAAATGAAAATGGGGAAACTCCGGT
AACTTTATGGGTAACGCAAAAAGCTACGGTCGAACGAGAGATAGCTCTTTTACATCAAGCTCGTGTTTTT
CCCGATTCTATATCTTGTCAACCTGCGGACATCTTTTCTCTTGCCCAGCAGACGCCTTTAAAAGCTCTCC
CTGCCTATTTCTTAATTTATGCAGGCTCTTCTGAGACCACGTGCCTTTTCGTTCAAAATGGAGCAGTTTT
AGTTTCTCGTTCATTTTGTAATTCTATCGAGAAAAATAGTGAGGATATCCTTACTACACTAGATTACGTA
AAAGAAACCTACCCTTCTGTAGAGCTGACAGCTCTACATACTGTGCAGCTTCCAGAATTATTAAAAAAAT
CTTTAGAGCAGAAACTCTCTTTATCTTTGATTCCCTGTCAAACGATGACATTTGGTCTAGAAGAAGAGGA
ATGGGCAAATTATGGTGATGCGATTACGACGGCGTATCATGGAGCTTCTCGAGGGACGCTGACTTTTCCC
TACAATCCGGTATTTAACTGTAAGGAGTCCCAGAAACACTGGTTAAAGCGCTCGGCATTTACAATAGGAA
AACTCGCGTTATTATCTACAGTACTTGTAGGTTTAGGCTCTACTTTAAAACTCGCCTCTATTTCTCATCA
TGTGCGGGAACATTTTTCTCTAGTGTGTCCTGAAACCCAAAAAGTTCCTAGATCGCTTCGTGGTGTAGAA
GAAGCGCTGCGTGCTGCTATAGCAGAAAAAACGCGCCCTGAATACCCCTATCTACCTACAATTCCAACAA
ACAAAGAAACCATGCTGTTTCTTTCCTCTGTAGCACAAAGTACGCCTTCCGTGAAACTTTCGTATTTCTG
CTACTCCCTAACCTCTTTCCCTTCACAACAGAATCCTAACCGACACTACAAAGCGCATGTTTCTGTTCGG
GGTGAAGGAGATCCCGAAGAAGTGTCAGAGTTCCTCCGTAAACTCTCTCTGCATCCCAAACTGTCCAATA
TTACCAAAACGTTGTGCAGCGGACACTCTTTTGAATTACAATTTACTCTAGTTGCTCAGGAAGTCCTATG
A
>ref|NC_003361.3|:1153093-1153677 hypothetical protein CCA00992 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGAAAAAATGGTCATTTATTTGCGCTCTTATCGCTTTAAGTTTGGTTAGCTGTCTTCCCGTTATAGGCA
TTGTTTATAAGCATGCCCAAACGGCAAAGCGCTGGGAAGCTCTAAATTCGCATATCCTTACTCTAAAGGG
TATGAAAGATCAATCTGAGCTAATTGCGAAGATGAACGCGCATCTTAAACAACAGCATAAAAACATTAAA
TCTCAAGAATTCCTACGGGCAAGCAAAAGCATTCGTCTATTAGGCAGGGAACAAGATCGCTTAGCGTCTC
TTCAAGAAAACTCCCTAATTTCGCAGAGTAAAGAGGTCTGGTCTAGGAAACAAATGTTTCTTTCATCTAA
CAACCAAGCGGTATGGTCCATCAGGAAAATTTCCAACGATCTCATATCCCTATGCTTGGAAAATCCCATA
GAAGCCGATAGCGATAACCTTGAAGAGCTCTTCTATTTATTTGATTCTACCAACCCTAACGCACCTTTAG
CTTTCTTCACACATTGGGAAATGACAAAACTGACCACACCATTAACCAATCAGGTATGGTCTATAAATGC
TGAGGCTATAAGTCGATGGTTATAA
>ref|NC_003361.3|:1153668-1154945 hypothetical protein CCA00993 [Chlamydophila caviae GPIC]
ATGGTTATAAGAAAATTTTTGCGTTTATGTCTTTTATGTTGCGCCTTCACTTCTTCAGGTTACGCTGCAG
GAACTTACGAAAAGCTGACATTAACAGGGATTAACATCATTGATAGAAATGGTTTGTCGGAGACAATCTG
CTCGAAAGAAAAGTTGAAAAAGTATTCTAAGGTAGATTTTCTATCCCCCCAGCCTTATCAAAAAGTTATG
CGTATGTATAAAAATACGCTGGGCGAAAACGTTTCGTGTTTAACAACATACCATGCAAACGGGCAATTAA
AGCAGTATCTTGAGTGTGTGAATAATCGTGCTTGCGGACGTTACCGAGAATGGCATAGCAATGGAAAAAT
CAAAATCCAGGCAGAAGTTATAGGAGGGATTGCTGATCTTCACCCCTCTGCAGAATCTGGATGGTTATTT
CACGGAACAACACTAGCTCACAGTGATGAGGGGATGTTAGAAGCTGCCATCAATTATGATAAAGGTCTGT
TACAAGGAACTTCATATTACTATCATTCCAATGGTCAGGTATGGAAAGAGTGTTCTTATCATAAAGGCCG
CGCTCATGGGGATTTTCTTACCTATACAACAGAGGGTTGCTTGCTGAAAAAACAGACCTATCAAAACGGG
GAAAAGCATAGCGTATCCATACGCTATGATGAGCGTTCTAACAGTGTACTTTCTGAAGAAGAATATGATA
ATGGTTTGTTGTTAAAAGGGTCTTATTTAGATCCTCAAACACATCAAATATTTTCTGAAGTCATTAATGG
CAACGGAACACAGGTAATTTATGGAAAACATGCCATTGTAGAAACTCGTGTATTTAAACGCGGTGAGGCC
TGCGGAAAAGTTACCGTATTCGATAGTCTCGGAGAGCAGGTTCTTCAAACCTATGCGCTATTTGAAGGTG
CAAAACATGGTGAAGAGCTGTTTTTCTACCCTGAATCTGGGAAAACCAAGCTTCTTTTAACTTGGAACTA
CGGTATTTTACAGGGACCAGTAAAGACCTGGTATCCAAACGGATCTTTGGAAAGTTGTAAGGAATTGGTA
AATAATAAAAAATCCGGATTACTAACTTTGTACTATCCTGAAGGCCAAATTATGGCTACCGAAGAATACG
ACAACGAACTCCTTCTCAAAGGAGAGTATTTCCGCCCTGGAGATCGTCATCCCTACTCTAAGGTAGATAA
AGGTTGCGGCACAGCTGTATTTTTCACATCTTCGGGCACGATTACTAAAAAGATTCCTTATCAAGACGGA
AAACCTTTGATTAATTAG
>ref|NC_003361.3|:1154948-1155490 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, putative [Chlamydophila caviae GPIC]
GTGAATACTTCTGTTATTACTGAAAAAAAGAAGCAACGGGAATTCTTTACTTCCCTAAGGCAATCTATAC
AGGAACCACGGTTATCACAAGCATCTCAAGCCGTTGCTGCTTTTATTCGCAAATTACCTAAGGGGAGCTT
CGTGCTTTCCTTTATTCCTTTCCGATCAGAAATCAATATACATTTAACCAATAGCATTCTTATCAACGAA
TTCTCCCTAGCCTTACCGCAAATGCACGGGGATCAACTTCATCCCGTTCATGTGCCCTCCCTAGAGGCGT
TATCAAAACTCACACACCCTTTACGGCTTTCCGAATTTAATTTAGAGCCCGTCCCGCCAAAACAAATCAC
CCATGTTCTTGTCCCCGCGTTAGCTTTTGATCACAATAACTATCGTCTTGGTTACGGAGGTGGTTGTTAC
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TCGGGGAAAACTACACTAGCTACCCATATTGTTGCCAACGCCCAAAAGATGGGCGGTGTCGCTGCATATA
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CTCCCAGCCCGACTGTGGTGAAGATGCTTTAAGCATTGCCGAACTATTAGCAAGATCAGGGGCTGTTGAT
GTTATCGTTATTGACTCTGTAGCTGCTTTGGTTCCTAAAAGCGAACTCGAAGGGGATATCGGTGATGTAC
ACGTAGGCCTACAAGCACGGATGATGTCTCAGGCATTACGCAAACTTACAGCAACATTAGCACGTAGCCA
AACCTGCGCGATATTCATCAACCAAATTCGTGAAAAGATAGGTGTTAGCTTCGGTAATCCTGAAACAACA
ACCGGTGGACGCGCGTTAAAATTCTACTCATCCATACGCATGGATATCCGTCGTATTGGAGCTATCAAAG
GGAATGAAAGTTTTGATCTTGGAAACCGCATCAAAGTAAAAGTTGCTAAAAACAAATTAGCACCTCCATT
CAGAACTGCAGAATTCGATATTCTCTTTAATGAGGGGATTTCTTCAGCAGGATGCATCTTAGACCTCGCT
GTAGAACATAATATCGTGGAAAAAAAAGGCTCTTGGTTCAACTACCAAGATCGTAAATTAGGCCAAGGAA
GAGAAGCTGTTCGTGAAGAACTTAAGAAAAATAAGAAATTATTTGATGAGTTAGAAAAACGTATCTATGA
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CTTGATAACCTTATGGATGAAGAAACAGGCCATCCTAATCACATAGATCTATGGAAAAATTTTGCCTATG
CGTTAGGTGTTACTGAGGAAGAATTAGAAAATCATGTTCCTAGTGCAGCAGCACAAAAGAAAGTGGATAC
ATTTTTACGTTGGTGTACTGGAGATTCCTTATCTGCTGGTGTAGCTGCTTTATATACCTATGAAAGCCAA
ATCCCTACAGTTGCAGAGACTAAAATCTCGGGATTAAAACAGTATTTCGGCTTTACGGCTCCTGAAGATT
ATGAGTACTTCACAGTACATCAAGATGTTGATGTAAGACATTCTCGTGAAGAAAAAGAATTAATAGAGTC
GTTGCTAAATAATGATAGCGATAAGGTTCTACAAGCTTCAAAAGAAGTTTGTGATGCTTTATACGGCTTT
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CCTCTTCATGATTTATATCTAACTAAGAAACAAGGGATTTTGATTCCCTCGGCAGGTATTGATGAGTCCA
ATGCTCAAGATTATTACGTTTTATATCCCCGGAATTTACTGGCCTCTACAAATGCTTTAGGGGCTTGGTT
AAAGAGTTTTTATCATTTAGAAAATCTCGGAGTGATTATTGTAGACAGTCATACTACCCCTATGCGTCGG
GGTGTTTTAGGGTTAGGATTATGTTGGTATGGGTTTTCTCCTCTATATAGTTATGTGGGGAAACCTGATT
GTTTTGGCCGGCCTTTACGTATGACACAGATTAATCTTTTAGATGCCTTGGCGGTTTCTGCTGTACTTTG
TATGGGAGAGGGGGATGAGCATACGCCATTAGCGCTTGTAGAAGATGCACCTAAAATAACTTTTCATTCT
TCCCCTACGTTGCAGTCGGATTTATCCTTACTAGGTATTGATGAAACTGAAGATCTGTACGGCCCTATCC
TCAGTTCTGTAGCTTGGGAATCTACACATTTTTAA
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GAAAACTCTGAGAATATTATTTGGGTGTCCTCATTAGAGCAATTTCATGATTTAGACCTTCCCTCTCCGA
TCTTTCTTCTCGGTGGTGGGGAGCTGTTTTCTTTATTTTTAGAACATCGTATGTTGCATGGGTGTTATGT
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ACGATATTAGATGAAAAAGAAGATTTAACGTTTTGCTATTATGAAAGTCTCTCCCATTGTTACGCGTAG
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CTTATTGTTGCCTGGTTCTCCAAAAGAATGGGATTTACCTTTTTTTAATTCTGTACTTATTGGAAAAACA
ACCTTATCTCCAAAACAGTTGTTATCGGGAGTAAAACAAATTGAGCGCAGGCTAGGTAGAGATGTTAATG
CATTACCTTGGTCTCCGAGAGTTTTGGATATCGATATTCTTTTGTATGGAGATGAAAATCACCAACAGGA
AGATGTCAAGATACCGCATGAGAGGATTACAGAAAGGCCTTTTTTACTTTCTCTTATTGCTTCGCTGTGT
CCTACGAGAATATTCCATAAACCGGGTTCAGAATATCATTTAAAGTCGTTTGGGGAAATAGCCCATCTTC
TTCCATGTCCTCAAGAGATGATTCTCAACAGTTTTTCTCCTAATACTTTATTAATGGGAGTAGTCAACGT
TACCGATAACTCTATTTCAGACGAAGGATTGTACCTTGAGGCTTCCAAAGCAGTTGCTCATGCTGAAAAA
TTATTTGCCCAGGGAGCTTCGGTTATAGATTTCGGAGGACAGGCGACTAATCCCAAGGTGCAACAGCTAC
TTAACGTAGAGCAAGAATGGTCGCGTTTAGAGCCTGTCTTAAAACTGCTTGCTGAAAAGTGGGCGGGGCG
TAGGCAATATCCTGATATCTCATTAGATACCTTTTATCCTGAAATCATTAAAAGAGCTTTGGAGATTTAT
CCTATCCGATGGATTAACGACGTTTCCGGTGGCTCTAAGGAAATGGCAGAGATTGCTAGAGATGCGAATT
TATTATTAGTGATTAATCATTCATGTTCTCTTCCTCCTCGTCCTGATAAGACGCTAGCATTTACTACGTG
TGCTTCTGATCAATTATTAAGCTGGGGAGAAAAGCAAATAGAAGCTTTTGTCGCTTTAGGATTACGCCAA
GATCAAATTATTTTTGATCCAGGCATTGGCTTTGGAACGACACAGATCCAAGCGTTGAATGTATTACATA
AAATGAAGAAATTTCGAAAGCTTGGCTGTGCTACGTTAGTAGGCCATTCAAGGAAATCATGTTTCTCTCT
TTTAGGAAAATACGATGCCAAGGATCGTGATTGGGAAACTGTCAGCTTGTCGGTGTTATTGCAACAGCAA
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>ref|NC_003361.3|:c1160616-1160275 dihydroneopterin aldolase [Chlamydophila caviae GPIC]
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TTTCTTTTTTTGAAGAGCCTCCTGTTTGTGTTTCAGACGATCTTAATGATGCGTGTTGTTATGTTGAAAC
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ATGGATGCTTTAGAATCAAAGTTAAGGGACAAGGTTTCTAAAATAGATTTAGAAGTACGTAAGGAGCGTC
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AAGAACTTGTTTCTCTTGCTAAAGATCAGGGCTTTATCACTTACGAGGAGATCAACGAGATCCTTCCTAT
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AACCAGGCAGATGTTGAAAGACAAAAAGAAAGAAAAAAAGAGGCCAAGGAGCTAGAAGGCTTAGCCAAAC
GTACTGAGGGAACTCCAGACGACCCTGTACGTATGTATTTGAAAGAAATGGGAACAGTTCCTCTTTTAAC
TAGAGAGGAAGAGGTTGAGATTTCTAAGAGAATAGAGAAAGCTCAAGTTCAAATAGAACGTATTATTTTG
CGTTTTCGTTATTCTTCAAAAGAAGCTATTTCCATTGCGCAGTATCTAATCAATGGGAAGGAGCGTTTTG
ATAAAATTATTTCAGAAAAAGAAGTAGAAGATAAGGCGCATTTCCTTAAGTTGCTTCCTAAGTTGGTTAC
CTTGCTTAAGGAGGAGGATTTATATTTAGAGTCTCTTCTCTTGGCGTTAAAACAGGGGAATTTATCGAAG
CAAGAAATTGCGAAGTTAAATGATAATTTAGAAAAGTGCCGTATCCGTACGCAAGCATACCTACGTTGTT
TCCATTGTCGTCACAATGTTACAGAAGACTTCGGTGAGGTTGTCTTTAAAGCGTACGATTCTTTCTTACA
ATTAGAACAACAAATCAATGATTTAAAAGTTCGCGCAGAAAGAAATAAATTCGCAGCAGCAAAATTAGAC
GCTGCTAAACGTAGATTACACAAAAGAGAAGTCGCTGCAGGACGAACTCTGGAAGAGTTCAAAAAAGACG
TGCGTATGTTGCAGCGTTGGATGGACAAAAGCCAGGAAGCCAAAAAAGAAATGGTCGAGTCCAATTTGCG
TTTAGTGATTTCCATAGCTAAAAAATATACAAACCGAGGCCTGTCCTTCTTAGATTTGATTCAAGAGGGC
AATATGGGCTTGATGAAGGCTGTAGAGAAGTTTGAATATCGTAGAGGATATAAATTTTCTACATATGCCA
CTTGGTGGATCCGTCAAGCCGTTACCCGCGCTATAGCTGATCAAGCGCGAACGATTCGTATTCCTGTGCA
CATGATTGAAACGATAAACAAAGTTCTTCGTGGTGCTAAGAAATTAATGATGGAGACTGGTAAGGAACCC
ACTCCGGAAGAATTGGCTGAGGAATTAGGATTAACTCCTGATCGGGTGCGGGAGATTTATAAAATTGCCC
AGCACCCTATTTCTTTACAGGCAGAAGTTGGTGAGGGAGGCGAAAGCTCCTTCGGTGATTTCTTAGAAGA
CACTGGCGTGGAGTCTCCTGCGGAGGCTACGGGTTATTCTATGCTTAAAGACAAGATGAAAGAGGTTTTA
AAAACTCTTACAGATCGTGAGCGATTTGTTTTGATTCATCGTTTTGGTCTTTTAGATGGGAAGCCTAAGA
CATTAGAAGAGGTGGGTTCAGCGTTTAACGTGACTCGAGAGCGCATTCGTCAGATTGAAGCTAAAGCTTT
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TTCTTCTTCCCCTAATTTGTCTCCCTTTTCTTTCAGCGTCTCAAAAAAATTATAGCTATTTCATTTTTTC
AATTATTTCTGCTGTGGGATGGTTTTTTTCTATTGGTCTTAGAGAAAAACAATTGAAAATGGCAGCTGGT
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TGTTCGCAGCGTATTTATGAAGACCAAGGCGGATACGCAACGGATGGAGGGGGCGATCGCTCATTTAAGA
GAAGAGAATCAATGCCTGCAATTGCAGTTAGACGCGCTATCTCAAGAATGTCGTGAAAAGGAAGAAGAGG
CTCAGCAGCTTAATCGTGAACTTGCTGATGCTTTGGCGTATCAGCAAGTTCTTAATGAAGAATATCAAGC
GACCTTTACGGAACAACATAACATGCTAGATGTTAGGCAAGTATATATTGGAAAGCTGGAGTCAAAAGTG
CAGGATTTGATGTGTGAAATCCGTAATTTGTTGCAGCTTGAATCTAATATGGTAGATAGTTTCCCTAGAC
AGGCTACGGTTAACTCTCAAGAACAACCTAAACAACTTCTTTCAGAATTAAAAAAAATAGCTTTTAAAGT
AGAAAACGCAGAAGCGGCTTCATCTTTGACGGCGTCTCGTTATATAAGATCAGAATCTTCGGTGCATAAC
TATTCTTTAGAATGTCGTCAGTTGTTCGATAATCTTAGAGAAGAGAGTCTGGGAATGCTTTTTGTGTACG
CTCCACAATCCCAGAGGGCAGTTTTTGCCAACTCTTTATTTAAGACCTGGACGGGGTATGGCGTAGAAGA
TTTTTTAAATGCAGGCGGGGATATTGTTATCTCTGGTTTGCCTCAGTGGGAAACAGATCTTCGTTTGCTT
GATCGAAAAGAACGCTCAGGAAAAATAATCATCAAAACAAAAAATCATGGTCAAATTCCTTTTTACTACT
GTTTAACTATTTTAAATAAAGGTCCTCTGCATAATCATGTTTTAGGAGTTCTTTATCCGGTACGTATAGA
TGCTTTTCGTGGATAG
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AAAGCTGTAAAAAGAGGTATTTTTAAAAACAATAAAGCAGCTCGAATCAAGTCTCGTGCCACTTTAAGAG
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TTAGGAGACACACTTGGAACTGTTGGTGCTGCTACAATGATTGCTAAAACAGCTACGGATGCTAACGCTT
TAAGCACACTTAACAAACTTTCCTCTTTAGAGACTGCTTGTGGGATAGCTATGGGAGCAAGCAGTTGCGT
GGATGTTGCTGCCCTAGGCGTCCAACTTTTCACGGGAGCTATGTTCTATGAAGTTGATGCACAAACTGGC
AATTTCGTACTCCAAACAAAAACCGTACAACTAGAAGACGGAACTCAGCGTGTTGTTCCTTCTCGCGTTC
TAAGATCTCCTCTTTGTATTGCAGGTAAAATTACTCGACTTGCTTCGAAAGCAATAGGTAGTGTCGTCTT
CGCTGACGAATTAAAATTGGTCAGCTTGGGCAAACGCGCCGCAACGTTGGGTGGAGTTGCTTCGTGCTTG
TCAGCAGTTAGCTCGGCTTGCTGTGCTGCTGATGATGCTGTAGATATCGTCAGCTTGGTCCGCTCACCAA
CCGGTGATCTTTCAACTGAAGAGCTCTCAGAGCGTCGTCAAACACTAAGAATGAAATTCTTCGCCTTACT
TTGCAACTTGGTTGATTTAGTTACCGAAGGTGTTTGCTTGTGCTTGAGTTTCGTTCCTGCTTTACTAGGG
TCTCACGCTCTTCTAATTGTCGGTATTTTCTTGTTACTATCTGCAGTATTCAACTTTGTTCGAGATTTTG
TCGGTTTCTAA
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TAGATCTAGCTTTTGCTAAGAAATACGCTTCCCCAGAGTCAAAAAAAGCCTTTGCCTTTCTTGCTCTTTC
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GGGGTTTCAGAAAAGCTTTTTTATGAGTATTTCAAGGCTCTTCCTGAAGATGTTTGTTCATCTTTATTTG
TTATAGAAAACAACAGGATTTACTTACGTTCTTTGTATGCAGTTCGAGAAAAGCTTTTTTCAAAGCTTTC
TTTGTTATCACAAGCCTCTCCAAGGTACAATGTAACAACAGAGTCTCTCCCTAAACTATCTTCAGAACAA
AATATTGTTTTTCAAAAAGCGATTAACAGCTGCTTTTCTTTAATTTGTGGAGGCCCTGGAACAGGGAAAA
CTTTTTTAGCTATTCAGATCATACTTATTTTAATTAAGCAGTATCCTAAAATTCGTATTGCTATAGTTTC
TCCTACAGGAAAAGCAACTTCACATATTCGCCAGATACTCTCTAAACATGATATTTCTGAGGATAATGTC
TCTATCCAAACTATCCATAGGTTTTTACAAGAGCATGTCTATCATCAGTGTAGTTCTGTAGATCTATTAC
TGGTTGATGAAGGTTCTATGGTAACGTTTAACCTTTTGCATAGCCTGGTAAATACATTATCAGGAGAGAA
CAAAGAAGGAAAAATTATCGCCGATAATTTAATTATACTAGGCGATGCGAATCAGCTTCCTCCTATAGGC
GTGGGGGCTGGTAACCCTCTCCAGGATTTAATATCACGTTTCCCTGATAGGGCCTTACATCTTCAAGTTT
CTCACAGGGCAAAAACAGATCGAGTTCAGAATTTTTCGAAAGCTATTTTAGAAAAACAATCGATTCCGTT
TACGCCATTACCCTCGATGCATTCCGCAATTGCTAAGATCAAAGAGGCGTTTATACAAACCCCCTCATCT
CAAACGCAATTATGTATTTTAACTCCTATGCGTCATGGTCCCTGGGGTTATTTGCGTCTAAACGAGTTGA
TTTTTAATGAAATACAAAAAACACATCCCAATCTGCCTATTCCTATTATGATTACAGAACGTTATGAAGC
TTGGGGATTATTTAATGGGGATACAGGATTTTTATGCCCGAAAACGCAACAGCTATTCTTCCCACACTGT
CGCTCTATAGATTCTAGGGAGTTTTCCTATTATACTTATAATTATGCGATGTCTGTGCATAAAAGTCAGG
GAAGCGAATACGATGATGTGATTGTCATTATTCCTAAAGGATGTGAAATTTTTGATGTATCCATTCTCTA
TACGGCTATTACACGCGCTAAGCATAGCATATCTGTGTGGGCGGACAGTGAGACATTGAATAAGATCATA
AAAAAACCCCACAAGTATACTTATGGGGTAGAATAA
>ref|NC_003361.3|:c1168629-1166785 hypothetical protein CCA01006 [Chlamydophila caviae GPIC]
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TCTGTTCTTCACACAATCCCTCTGTAGCGTCATCAGAAAGTACAAAAGCGGTAGCGTTATGGGATGAGGG
GCAAAAAGAACAAATGAAGTCTTTTTTCCATCATTTACTTCCGAGTCAACAACGACAATGCCTTCTTTGT
TTTCAAGGGTTTGTTCTGCAAAAGCAGAAAAACATGATTCAGTCTGAGAAAATTTTTTCTAAGGTTTATG
ATGAAGTAGAGAGCACGCAGTTTTTATTTAAGGAAGAGGTGCTAGGGGGGCGTATTCTCAATGCGTTTTT
CTTAGAGGATATAGAAAAGATGGAGATTTTAACAGTCGCTTTGCGTGAGCAATTTGCAAAATCTCCCTAT
CTTTCTTTGTTTGAATGTCTTTTGCATTATAAACAGAAAAGTTTCACTAAGGCTTTACAAGCTTTATCGG
TATGGAAAAATCAGTTAAGGGATTCCGAATCTTCTTTATTGGAGTTGAATATACAACTGCTGATTTCTGA
TTTTTTTTTAGAAAATATAGAAGCACATTGTTTGATAGAGTTAGGGGAGTTTTCAGAAGGACGAGCCATC
CTTAATCGTATTATTGAGAAGATGTTAAAGAAAGAGTGTGATTGGGATTCTGAAACTTACGATTATGCTG
TTTTGATGTTAAGCAGGAGCTATTTCTTAGAGTTAAAACAATCGCATTCTTTTAAGATTTATCCAGATTA
TTATGAAATGATTCTCTTTTATAAGAAGAAAGTTCATGCGATAGATCAAAGGGCCTATGAGAAATTTATT
CCTCAAGAGGAATTATTCTCCATGCTTATGGACCATCTTTTTGTTGTTCCTAAAGAGCGTCTAGCTCCCT
TAATGCAGATAATCAAAAATTGGGAACGTTTTTACTTTAACCCTAACTATAACTTGGTAATTCAACCTTT
AATCGATAGATTTGTTTCCTCCCCAGAACAGGTTGCGCATTTCTGTAATTCTATAACTTTTTTTGAAATA
GAACCTCTTAAGAAAAAGCTTATAGATGCTTTTGGGGTGATTTTATCTAAAAAAGTAAAAGAAGTAGAAA
CTACAAAAGCTCAACAAACCCTTTCAATATTAAAATCTTTAGATTCAAATTTGTGGGTGAGTGAGAAGTT
GATCATTTCTCCTGAGGCTCTTCAAGATATTATTTCTCAAGATGATGCCGACTACACTAATTTAAGAAAG
TATCTAAATCTTTGGGAGACGATACAGTCTTATGATATAGATAAACAGCAACTTGTTCATTATCTTATGA
AAGGAGCTAAGCAACTTTGGAATCAGGGAAGTTGTGATGATAAAGCTCTGAATTTACTCCGTCTTATTCT
TCAATTTACAAACCACGATATAGAAAGTGAAAACATTGTTTTTCTGTTTGTAAAGCAGGTGTACAGGCAA
ATGTTAACAAGACATTCTATAACACGTTTATTGAAATTAGAAGATTTTATTACAGAGGAGGGTTTAACTC
CTATAACGATAAGAGAAGAAGAAATCGCCAACTTTTTAGCAGACGCTGAGTTCTTGTATTCTCAAGGCGA
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AA
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TTGGAGATGATTCTATAGGGGAGTTGGGTGGAGCACACCTTGCTATGGAAAGCGTTTCTATGCTCGCTGC
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GGCAAACACTGTTACACAAAATTCAAGGACACAATCTTACAGAAATACGACAGATTGGTGAAAATTCTTT
GACAGAGTTGATGAAGATAATTCCTTCTTTTGTCAGCCGCGCTGAATCTCATCATCACCATCATCAAGCT
ATGTTGGGTTACCGGCAGACTCTAAAAGAGCAGCTCACAAGTTTGGCAGAGAAGTTTAGTGAAGGTTCTT
CACCATCTAAACAAACAGGAGTGCGTTTGGTTTATGGAGATCCTGAGGGAATTTATAAAGTAGCTGCGGG
ATTCCTTTTTCCTTATTCAGAGCATACCTTCGAAGAGCTTATTAATATTTGCAAGGCGATGCCTAAGGAA
GATCTTATTCGCGTTTTAGAAGCTGGATCTTCCTCAAGAGAAAATCGCCGTCACAAATCTCCTCGGGGAT
TAGAATGTTTGGAATTTGGATTTGATATTACTGCTGATTTTGGAGCTTATAGAGATCTCCAAAGACATAG
AATACTTACTCAAGAGCGCCAATTACTCACAACAAAGCTAGGATACCATATTCCCGAGCAATTACTCGAC
ACTCCTATGGAAAAAGATTTTAGAGAAGCTATGGAGAAGGCTGAAGAGGCCTACAATCAAATTTCCGTAG
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>ref|NC_003361.3|:1173237-1173386 hypothetical protein CCA01012 [Chlamydophila caviae GPIC]
TTGATCTTGTGTTCACAAACATGCAAAATCTTGATTTATTTACAAAGTGAACAATGTTTCAACAAAGTTT
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