| Definition | Clostridium botulinum A str. Hall, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009698 |
| Length | 3,760,560 |
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The map label for this gene is yueF [H]
Identifier: 153935595
GI number: 153935595
Start: 1905759
End: 1906853
Strand: Direct
Name: yueF [H]
Synonym: CLC_1795
Alternate gene names: 153935595
Gene position: 1905759-1906853 (Clockwise)
Preceding gene: 153936622
Following gene: 153935397
Centisome position: 50.68
GC content: 22.1
Gene sequence:
>1095_bases GTGACAAAAAATAAAAAAATACCATTCCTAGAATTCATACCTATAATAGTTATATCCTTTCTACTTTTAAAATTTATAAA CAACATAGAAAATATTTATTCTTTTATGAAATCTTTTTTATCAATATTAGTACCATTTATTTGGGCTTTTGGAATTGCCT ATATATTAAATCCATTAATGAAATATTTTCAAAATAAATTTAAATTAAAAAGGATATTTAGTATTATTATAACTTACATA ATTGTAATCGGACTTTTGATATTATTTATAAATACTTTTGTTCCTAAAATTATAAAAAATATTGGAGATCTTTTCGTCCA TAGTCCTGATTATATTAATCAAACAATTCAATGGTTTAATGATAATATAAAATATTCAAAGGTATATGATATGTTAATGG AAAATTATCAAATAAGCAATAATATACCTAATCTATTAAATAAAATTTCTAATTTGACTAATACATTTTTAAATACATTT TTAAATACTACAATAAAATTTACTTCATTTTTAGTTAGGTTTGTATTTGGATTGATTATTTCTATATACCTTTTACTAGA TAAGGAAAGTCTCATAGAAAACTTAAAAAAATTTATATTAGCACTATCCGGTGAAAAAAATTATTCAAAAATTTTGAGTT TCTTCAAAGAGGTAGACATAGTTTTTTCAAAATACATAATAGGCAAATCTATAGATTCTCTAATAATTGGATTGATGTGT TTTGCGGGATTAACAATAATGAAAGTTCCTTATGCTGCTTTAATATCTTTTATTGTAGGAATAACAAATATGATTCCTTA TTTTGGTCCTTTTATAGGAATGATACCTGCTTTTATAATAACATTATTTTTTAATTATATAAAAGCTATTTGGGTATTAA TTTTTATAATAATACTTCAACAATTTGATGGTTGGTATTTAGGTCCTAAGATTCTTGGCAATCAGGTTGGATTAAGTCCT ATATGGATAATATTTGCAATAACTATTGGTGGAGGAACTTTTGGTGTAATGGGTATGTTTTTATCTGTACCTATTGTAGC CATCATAAAAATTTATTTAGATAAATACATAGAAATGAAATTAAATAAAAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAATGTATTTATAATACCATATAGGTTGTAAAATCTATTACAATATAGTAAAATTTATAAAGCACAAGGCTATTATTATC TATAATTGGAGGTTAAAAAG
Downstream 100 bases:
>100_bases AATAGATTAAAACAACAATAAAGGGATATCTCAAAATTAAAATAGATTTAATTTTAAAGCTCGAAATATAAAAATTAAAT CTATTTTGAGACATCCCTCT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 364; Mature: 363
Protein sequence:
>364_residues MTKNKKIPFLEFIPIIVISFLLLKFINNIENIYSFMKSFLSILVPFIWAFGIAYILNPLMKYFQNKFKLKRIFSIIITYI IVIGLLILFINTFVPKIIKNIGDLFVHSPDYINQTIQWFNDNIKYSKVYDMLMENYQISNNIPNLLNKISNLTNTFLNTF LNTTIKFTSFLVRFVFGLIISIYLLLDKESLIENLKKFILALSGEKNYSKILSFFKEVDIVFSKYIIGKSIDSLIIGLMC FAGLTIMKVPYAALISFIVGITNMIPYFGPFIGMIPAFIITLFFNYIKAIWVLIFIIILQQFDGWYLGPKILGNQVGLSP IWIIFAITIGGGTFGVMGMFLSVPIVAIIKIYLDKYIEMKLNKK
Sequences:
>Translated_364_residues MTKNKKIPFLEFIPIIVISFLLLKFINNIENIYSFMKSFLSILVPFIWAFGIAYILNPLMKYFQNKFKLKRIFSIIITYI IVIGLLILFINTFVPKIIKNIGDLFVHSPDYINQTIQWFNDNIKYSKVYDMLMENYQISNNIPNLLNKISNLTNTFLNTF LNTTIKFTSFLVRFVFGLIISIYLLLDKESLIENLKKFILALSGEKNYSKILSFFKEVDIVFSKYIIGKSIDSLIIGLMC FAGLTIMKVPYAALISFIVGITNMIPYFGPFIGMIPAFIITLFFNYIKAIWVLIFIIILQQFDGWYLGPKILGNQVGLSP IWIIFAITIGGGTFGVMGMFLSVPIVAIIKIYLDKYIEMKLNKK >Mature_363_residues TKNKKIPFLEFIPIIVISFLLLKFINNIENIYSFMKSFLSILVPFIWAFGIAYILNPLMKYFQNKFKLKRIFSIIITYII VIGLLILFINTFVPKIIKNIGDLFVHSPDYINQTIQWFNDNIKYSKVYDMLMENYQISNNIPNLLNKISNLTNTFLNTFL NTTIKFTSFLVRFVFGLIISIYLLLDKESLIENLKKFILALSGEKNYSKILSFFKEVDIVFSKYIIGKSIDSLIIGLMCF AGLTIMKVPYAALISFIVGITNMIPYFGPFIGMIPAFIITLFFNYIKAIWVLIFIIILQQFDGWYLGPKILGNQVGLSPI WIIFAITIGGGTFGVMGMFLSVPIVAIIKIYLDKYIEMKLNKK
Specific function: Unknown
COG id: COG0628
COG function: function code R; Predicted permease
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the UPF0118 (perM) family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1788838, Length=330, Percent_Identity=22.7272727272727, Blast_Score=92, Evalue=4e-20, Organism=Escherichia coli, GI1787885, Length=317, Percent_Identity=23.6593059936909, Blast_Score=66, Evalue=3e-12, Organism=Escherichia coli, GI87082271, Length=133, Percent_Identity=29.3233082706767, Blast_Score=65, Evalue=7e-12,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR002549 [H]
Pfam domain/function: PF01594 UPF0118 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 42005; Mature: 41873
Theoretical pI: Translated: 10.12; Mature: 10.12
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 3.3 %Met (Translated Protein) 3.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 3.0 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTKNKKIPFLEFIPIIVISFLLLKFINNIENIYSFMKSFLSILVPFIWAFGIAYILNPLM CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KYFQNKFKLKRIFSIIITYIIVIGLLILFINTFVPKIIKNIGDLFVHSPDYINQTIQWFN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH DNIKYSKVYDMLMENYQISNNIPNLLNKISNLTNTFLNTFLNTTIKFTSFLVRFVFGLII CCCHHHHHHHHHHHCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SIYLLLDKESLIENLKKFILALSGEKNYSKILSFFKEVDIVFSKYIIGKSIDSLIIGLMC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FAGLTIMKVPYAALISFIVGITNMIPYFGPFIGMIPAFIITLFFNYIKAIWVLIFIIILQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QFDGWYLGPKILGNQVGLSPIWIIFAITIGGGTFGVMGMFLSVPIVAIIKIYLDKYIEMK HHCCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LNKK CCCC >Mature Secondary Structure TKNKKIPFLEFIPIIVISFLLLKFINNIENIYSFMKSFLSILVPFIWAFGIAYILNPLM CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KYFQNKFKLKRIFSIIITYIIVIGLLILFINTFVPKIIKNIGDLFVHSPDYINQTIQWFN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH DNIKYSKVYDMLMENYQISNNIPNLLNKISNLTNTFLNTFLNTTIKFTSFLVRFVFGLII CCCHHHHHHHHHHHCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SIYLLLDKESLIENLKKFILALSGEKNYSKILSFFKEVDIVFSKYIIGKSIDSLIIGLMC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FAGLTIMKVPYAALISFIVGITNMIPYFGPFIGMIPAFIITLFFNYIKAIWVLIFIIILQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QFDGWYLGPKILGNQVGLSPIWIIFAITIGGGTFGVMGMFLSVPIVAIIKIYLDKYIEMK HHCCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LNKK CCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9384377 [H]