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The map label for this gene is ylbJ [H]

Identifier: 153935542

GI number: 153935542

Start: 2472439

End: 2473605

Strand: Direct

Name: ylbJ [H]

Synonym: CLC_2346

Alternate gene names: 153935542

Gene position: 2472439-2473605 (Clockwise)

Preceding gene: 153935754

Following gene: 153936315

Centisome position: 65.75

GC content: 23.48

Gene sequence:

>1167_bases
GTGCCTTTGTTTTTTTATATAATGTTATTTTTAATATTTATTTTACTTTATAAACTCTTTAAAAATGAAAATATAATAAT
AACCTTTTTATGTTCAATTTTAATCATATATATTATTATAGCACCTAGGTTTTGTATAGAAGCTACTTTATCTGGTGCTA
AGTTATTTTTTTATAAGGTTTTTCCTTCTTTATTTCCTTTTCTAATACTTACGAATATAATAATAAATTATGGTGGAGTA
CATGTATATTCTAAAATATTTGGAAAAATTCTATGTCCCCCCCTAAAGCTAAAAAAAGAATGTAGTTTTCCCCTAATAAT
AAGCGCCCTTTGTGGTTATCCCTTAGGAGCAAAATACTCCTGTGATCTTTACCAAAATGGTGATATTAATTTTCCTACTT
TGGAAAGACTTATAAATATAGCTTCTAATGCTGGTCCATTATTTATAATTGGATCTGTAGGTACTTCCATGTTAGGCAAT
CCTTATGCAGGATATGTATTACTCTTATCAAATTATATTTCCTGTATTATAGTAGGTCTTATTTTACCTAGCAGAAACAC
TAAAATGTATAGAAATTTTAAAGAAAATTTGAAAACATCAAATAAAAACATAGGTGAATCTTTAAAGAATAGCATTGAAG
GTGCCATAAAAACCTGTATAGGTGTAGCAGGATTTGTAATACTGTTTTCTTTATTGCTTAGTATAATAAAAAATAATTTC
CTTTTTAAATTTATATTAAATAAGTTATGTATTTTTTTTAATACAGATAAAAACCTAATAGAAGGATTTCTATTAGGCTT
AGTAGAAATGACCAATGGATGTTATTTAATTTCCACAAGTTCTATTGATATATCTAAAAAATTAATATCAATAAGCTTCT
TATTAGCTTTTAGTGGATTTTCTATAATATCTCAAGTTTATTCTTTTACTTATAAACATGGAATAAATATTAAGAGATAT
ATAAAAATAAAATTTATACAAGGACTTATAGCTTCTATAACCTGCATTGTTTTATACAGAATCCCCATATTTTCCATGTA
TTTAGATGCTTTTACAGATAAAAATACTTATCTAATTTTAAGTAACAACTTATTATTTATATTTATTTTATTTTTTTTAA
TTATACCCTTAATAATATACTATATAAAATCTTTAAATAAAATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTTTAGAAGTCCTACTATAATAAAAAATACTATTTATTAATGTAATAATATTTAATTTTAAAAATATAATTATAATAAA
TCAATTCTAGGAGTCTTATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTATTTTATATTTCTTAATTCCTTTATATTTTCTCTTATAGTATCTGTTTTTATCTCTACACTTTCTTCTAAAGAAGCCG
TAAAGGCTTCTAAATTTTTT

Product: nucleoside recognition domain-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 388; Mature: 387

Protein sequence:

>388_residues
MPLFFYIMLFLIFILLYKLFKNENIIITFLCSILIIYIIIAPRFCIEATLSGAKLFFYKVFPSLFPFLILTNIIINYGGV
HVYSKIFGKILCPPLKLKKECSFPLIISALCGYPLGAKYSCDLYQNGDINFPTLERLINIASNAGPLFIIGSVGTSMLGN
PYAGYVLLLSNYISCIIVGLILPSRNTKMYRNFKENLKTSNKNIGESLKNSIEGAIKTCIGVAGFVILFSLLLSIIKNNF
LFKFILNKLCIFFNTDKNLIEGFLLGLVEMTNGCYLISTSSIDISKKLISISFLLAFSGFSIISQVYSFTYKHGINIKRY
IKIKFIQGLIASITCIVLYRIPIFSMYLDAFTDKNTYLILSNNLLFIFILFFLIIPLIIYYIKSLNKI

Sequences:

>Translated_388_residues
MPLFFYIMLFLIFILLYKLFKNENIIITFLCSILIIYIIIAPRFCIEATLSGAKLFFYKVFPSLFPFLILTNIIINYGGV
HVYSKIFGKILCPPLKLKKECSFPLIISALCGYPLGAKYSCDLYQNGDINFPTLERLINIASNAGPLFIIGSVGTSMLGN
PYAGYVLLLSNYISCIIVGLILPSRNTKMYRNFKENLKTSNKNIGESLKNSIEGAIKTCIGVAGFVILFSLLLSIIKNNF
LFKFILNKLCIFFNTDKNLIEGFLLGLVEMTNGCYLISTSSIDISKKLISISFLLAFSGFSIISQVYSFTYKHGINIKRY
IKIKFIQGLIASITCIVLYRIPIFSMYLDAFTDKNTYLILSNNLLFIFILFFLIIPLIIYYIKSLNKI
>Mature_387_residues
PLFFYIMLFLIFILLYKLFKNENIIITFLCSILIIYIIIAPRFCIEATLSGAKLFFYKVFPSLFPFLILTNIIINYGGVH
VYSKIFGKILCPPLKLKKECSFPLIISALCGYPLGAKYSCDLYQNGDINFPTLERLINIASNAGPLFIIGSVGTSMLGNP
YAGYVLLLSNYISCIIVGLILPSRNTKMYRNFKENLKTSNKNIGESLKNSIEGAIKTCIGVAGFVILFSLLLSIIKNNFL
FKFILNKLCIFFNTDKNLIEGFLLGLVEMTNGCYLISTSSIDISKKLISISFLLAFSGFSIISQVYSFTYKHGINIKRYI
KIKFIQGLIASITCIVLYRIPIFSMYLDAFTDKNTYLILSNNLLFIFILFFLIIPLIIYYIKSLNKI

Specific function: Required for spore cortex formation [H]

COG id: COG3314

COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011642
- InterPro:   IPR014226 [H]

Pfam domain/function: PF07670 Gate [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 43983; Mature: 43852

Theoretical pI: Translated: 9.72; Mature: 9.72

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.8 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
4.4 %Cys+Met (Translated Protein)
2.8 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MPLFFYIMLFLIFILLYKLFKNENIIITFLCSILIIYIIIAPRFCIEATLSGAKLFFYKV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCHHHHHHHH
FPSLFPFLILTNIIINYGGVHVYSKIFGKILCPPLKLKKECSFPLIISALCGYPLGAKYS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCEE
CDLYQNGDINFPTLERLINIASNAGPLFIIGSVGTSMLGNPYAGYVLLLSNYISCIIVGL
ECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILPSRNTKMYRNFKENLKTSNKNIGESLKNSIEGAIKTCIGVAGFVILFSLLLSIIKNNF
HCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
LFKFILNKLCIFFNTDKNLIEGFLLGLVEMTNGCYLISTSSIDISKKLISISFLLAFSGF
HHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIISQVYSFTYKHGINIKRYIKIKFIQGLIASITCIVLYRIPIFSMYLDAFTDKNTYLIL
HHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE
SNNLLFIFILFFLIIPLIIYYIKSLNKI
ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
PLFFYIMLFLIFILLYKLFKNENIIITFLCSILIIYIIIAPRFCIEATLSGAKLFFYKV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCHHHHHHHH
FPSLFPFLILTNIIINYGGVHVYSKIFGKILCPPLKLKKECSFPLIISALCGYPLGAKYS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCEE
CDLYQNGDINFPTLERLINIASNAGPLFIIGSVGTSMLGNPYAGYVLLLSNYISCIIVGL
ECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILPSRNTKMYRNFKENLKTSNKNIGESLKNSIEGAIKTCIGVAGFVILFSLLLSIIKNNF
HCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
LFKFILNKLCIFFNTDKNLIEGFLLGLVEMTNGCYLISTSSIDISKKLISISFLLAFSGF
HHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIISQVYSFTYKHGINIKRYIKIKFIQGLIASITCIVLYRIPIFSMYLDAFTDKNTYLIL
HHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE
SNNLLFIFILFFLIIPLIIYYIKSLNKI
ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377; 12662922 [H]