Definition Francisella tularensis subsp. holarctica LVS chromosome, complete genome.
Accession NC_007880
Length 1,895,994

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is mdtL [H]

Identifier: 89256955

GI number: 89256955

Start: 1618452

End: 1619639

Strand: Direct

Name: mdtL [H]

Synonym: FTL_1685

Alternate gene names: 89256955

Gene position: 1618452-1619639 (Clockwise)

Preceding gene: 89256954

Following gene: 89256956

Centisome position: 85.36

GC content: 31.57

Gene sequence:

>1188_bases
ATGTCTAATGATCCTTTTAAGAGGATATCCTCTGATAAAACTGTTATCTTTATAATCTGTCTTTTTGGTTTGATGTCACA
ATTTGCTACGGATAGTTTTACACCATCATTGCCACATATTGCTGAATATTTTCATGCAGCAGCTAAAGATATTAAGCTAA
CAGTAGGCGTATATTTTTTTGGGATGACTTGCTCGATGTTGGGCTTTGGTTATTTATCAGATAAGTATGGGCGTAAACCA
GCACTACTAGCTGGGTACTTAATATTTTGTGTTGCAAGTATTCTATGTATGATAGCCGAGAGTGAAACACAGTTGCTGTT
TTTTAGATTTTTACAAGGTATCGGTATGGGAAGTTCTTTTGTATTTTTCCGTGCGATTATGAAAGATGTTTTTAGTGATA
GTCAATCACTTGCTAAAGCAAGCCTTGTAATTACAAGCATAGTTTCATTGACTCCTCCTTTAGCGCCAATTACGGGAGGT
ATCATTCAAGAAACCATTGGTTGGCGTGGTAATTTTACTTTACATTCAATAATGGCAATAATTATCACGGTTTTAATTAT
AAAATATTTACATCTTAAAGCTATTCCTAAAAGGAATTATAACGTCTTAGATTCATATAAAAGGATATTAACACATAAGG
TTTTTGTGCTAAATGCTATTTGTAGTGGTTTAGCATTGTCATTAGTTTTTGTTTTTGCGACACTTTCACCTTTTTTCTTT
CAGATTAAATTAGGTTTTTCTGCTGTTGAATATTCATTTATATCAGCTGGGGTAATTATACCTTCAGCAATATTTTTAAT
ATTATTTAAAAATATAATCAGTAGATTAGATATGAACAAAGTTATACTTTATTGCGGTTCCTTCTCTACATTAAGTGGTT
TACTACTTGCTTTTTCTTATTTTATTTTTGGTTTAGATGCTAAAGTGATTGTTATCTTATGTGCTTTGGCATTTTGTGGT
AATGTTTTTCAGTATACTGCTACATACGTGTGTGCGTATAGAGATATTCATACTGAAATAGGTGCATCGGCAATATTTGG
ATTTATACAGATAGCTGTTACAACTATTTCATCATCACTTGTTTCTAGCATCACTTTACACAATCAGTTGGTTTTTGGTT
TATTGATGGCAATACCACCATTTTTGATAGTGATACTAAAGATAATTGATATTAAAAAAGCCTTGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTAGTTAAATATAAAGATGCATTTAAAAAATATTTCCAAAAATAAAATTTAGATTATAATCTCTCCAACCCTTATTCATT
ATTAAATTTAGGATTAGTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGGATAGGGTTATATGATTAGGTTAGAAAGATTTACAGAAAGTAATATATCTGACCTTTTGTCTGAATTGAATCGCCATG
ATATTCGTTTTTTATATCAA

Product: major facilitator transporter

Products: Proton [Cytoplasm]; drug [Periplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 395; Mature: 394

Protein sequence:

>395_residues
MSNDPFKRISSDKTVIFIICLFGLMSQFATDSFTPSLPHIAEYFHAAAKDIKLTVGVYFFGMTCSMLGFGYLSDKYGRKP
ALLAGYLIFCVASILCMIAESETQLLFFRFLQGIGMGSSFVFFRAIMKDVFSDSQSLAKASLVITSIVSLTPPLAPITGG
IIQETIGWRGNFTLHSIMAIIITVLIIKYLHLKAIPKRNYNVLDSYKRILTHKVFVLNAICSGLALSLVFVFATLSPFFF
QIKLGFSAVEYSFISAGVIIPSAIFLILFKNIISRLDMNKVILYCGSFSTLSGLLLAFSYFIFGLDAKVIVILCALAFCG
NVFQYTATYVCAYRDIHTEIGASAIFGFIQIAVTTISSSLVSSITLHNQLVFGLLMAIPPFLIVILKIIDIKKAL

Sequences:

>Translated_395_residues
MSNDPFKRISSDKTVIFIICLFGLMSQFATDSFTPSLPHIAEYFHAAAKDIKLTVGVYFFGMTCSMLGFGYLSDKYGRKP
ALLAGYLIFCVASILCMIAESETQLLFFRFLQGIGMGSSFVFFRAIMKDVFSDSQSLAKASLVITSIVSLTPPLAPITGG
IIQETIGWRGNFTLHSIMAIIITVLIIKYLHLKAIPKRNYNVLDSYKRILTHKVFVLNAICSGLALSLVFVFATLSPFFF
QIKLGFSAVEYSFISAGVIIPSAIFLILFKNIISRLDMNKVILYCGSFSTLSGLLLAFSYFIFGLDAKVIVILCALAFCG
NVFQYTATYVCAYRDIHTEIGASAIFGFIQIAVTTISSSLVSSITLHNQLVFGLLMAIPPFLIVILKIIDIKKAL
>Mature_394_residues
SNDPFKRISSDKTVIFIICLFGLMSQFATDSFTPSLPHIAEYFHAAAKDIKLTVGVYFFGMTCSMLGFGYLSDKYGRKPA
LLAGYLIFCVASILCMIAESETQLLFFRFLQGIGMGSSFVFFRAIMKDVFSDSQSLAKASLVITSIVSLTPPLAPITGGI
IQETIGWRGNFTLHSIMAIIITVLIIKYLHLKAIPKRNYNVLDSYKRILTHKVFVLNAICSGLALSLVFVFATLSPFFFQ
IKLGFSAVEYSFISAGVIIPSAIFLILFKNIISRLDMNKVILYCGSFSTLSGLLLAFSYFIFGLDAKVIVILCALAFCGN
VFQYTATYVCAYRDIHTEIGASAIFGFIQIAVTTISSSLVSSITLHNQLVFGLLMAIPPFLIVILKIIDIKKAL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. DHA1 family. MdtL (TC 2.A.1.2.22) subfamily [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1790146, Length=245, Percent_Identity=30.6122448979592, Blast_Score=112, Evalue=3e-26,
Organism=Escherichia coli, GI48994889, Length=248, Percent_Identity=29.0322580645161, Blast_Score=95, Evalue=7e-21,
Organism=Escherichia coli, GI1788509, Length=244, Percent_Identity=26.2295081967213, Blast_Score=92, Evalue=5e-20,
Organism=Escherichia coli, GI1790794, Length=227, Percent_Identity=24.2290748898678, Blast_Score=72, Evalue=5e-14,
Organism=Escherichia coli, GI1787065, Length=309, Percent_Identity=23.6245954692557, Blast_Score=72, Evalue=7e-14,
Organism=Escherichia coli, GI87082312, Length=191, Percent_Identity=24.0837696335079, Blast_Score=65, Evalue=5e-12,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196
- InterPro:   IPR005829 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 43510; Mature: 43378

Theoretical pI: Translated: 9.28; Mature: 9.28

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.3 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
4.8 %Cys+Met (Translated Protein)
2.3 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
4.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
SNDPFKRISSDKTVIFIICLFGLMSQFATDSFTPSLPHIAEYFHAAAKDIKLTVGVYFF
CCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GMTCSMLGFGYLSDKYGRKPALLAGYLIFCVASILCMIAESETQLLFFRFLQGIGMGSSF
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHH
VFFRAIMKDVFSDSQSLAKASLVITSIVSLTPPLAPITGGIIQETIGWRGNFTLHSIMAI
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
IITVLIIKYLHLKAIPKRNYNVLDSYKRILTHKVFVLNAICSGLALSLVFVFATLSPFFF
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QIKLGFSAVEYSFISAGVIIPSAIFLILFKNIISRLDMNKVILYCGSFSTLSGLLLAFSY
HEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHH
FIFGLDAKVIVILCALAFCGNVFQYTATYVCAYRDIHTEIGASAIFGFIQIAVTTISSSL
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VSSITLHNQLVFGLLMAIPPFLIVILKIIDIKKAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Proton [Periplasm]; drug [Cytoplasm] [C]

Specific reaction: Proton [Periplasm] + drug [Cytoplasm] = Proton [Cytoplasm] + drug [Periplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 12620739 [H]