| Definition | Campylobacter jejuni RM1221, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003912 |
| Length | 1,777,831 |
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The map label for this gene is ywbL [H]
Identifier: 57238669
GI number: 57238669
Start: 1722176
End: 1724266
Strand: Direct
Name: ywbL [H]
Synonym: CJE1830
Alternate gene names: 57238669
Gene position: 1722176-1724266 (Clockwise)
Preceding gene: 57238668
Following gene: 57238670
Centisome position: 96.87
GC content: 32.66
Gene sequence:
>2091_bases ATGAAAATTTTTAAAATTATATTTTTAATTATAAGTATTTTTTTATCAAGCTCAGCTTTTGCTAGGGTAGATGATTATAT TAATGAAGCAAATCTTATCAAAGATATGCTAAAACAAAGCATAGAAACTTACAAAAAGGGTGATAATCTAGGTGCTAAAA AGCTTAGCGAAGATGCGTATTTTCAACATTTTGAAAATATGGAAGGCCCCATAGGAAGAAACATAGGAAGAAAAGCCATC ACCATGGAGCGTAAATTTGTAAATTTGCGTCGTATGTATAAAGATAAAGCTCCTTTGACACAAATTAATGCTTTAATTGA TAGTCTTTATTATGATCTTGATGAAGTAGCCCCAATCTTACAAAATGGATATCGTTTAAAAGCAGAAGCAAGCGATACAA ACTACGATAAGGCCAAAGCTGAAAAATCAAGCCTAGAAGCCAATGCCAAACGCGAAGCTGATGCAGAAGCTTTAATCGCG CAAATGATGGGCGTGGATAAAAAAGATTTAGCACAAAGTTCTTTAACCACCCAAGCTCCTATACCTGCAAACGACGACAC AAGCAAACTTACAGATGATAATGCAAGTGCTGATTTACAAGCTGCTGCTGCAATGGACACAAGATTGCAATTTATACTAG ATAATATCTCTACCAAATTTTCACAGGCTGCTAATGCTTTTAAAGAAAAAAACTACCAAGCTAGTAAAGATTTTTTAAAT GATGCCTTATTTAGTGATTATCGCAATACCAAAGTAGAAATTTTAGTAAATAAATTTACCAAAGCAGGAAACGATCAAAA AATTCAACAAGCCATACGCACCCTTATACGCCAAATCAACGATGCAAAAATAGATGAAAAAGGCTTAAGAGATGGCTTAG ATAATATAGAAGAACAAATTTTTGATGTTTTCTTACAAATTCCAAATTCAGAACTTTCAAGTTTGCAAATTTCAGGCTTT AATGATGAAACAAAAGGCAAAGATTATGCCAAAGTTTCTAATGATATCAAACTTGCTTTAGATGGAATTTTAAAAAATTA TGATGGCTTTAGTGCTTCTATAGTAGATGATTTACAAGGAATTTATCTAGATATTTTTGAAGCAAGCGGTATGGAAAATA AAATCGGTGCTGTAGATAGCGGCTTAAAACTTAAAATAGAAAGTTTATTTTCCAAAGGTGTGGCACTGATTAAAGCAAGT GCAGATAAAAAAGAGCTTGAAGCTACTTTTAATGACTTAGAACAACTCATAGCAAGCAGTGTGGATAAAATTCAAGATTC TACTCCTTATTCGCTGTTTATATGGGCTTTAAGTATTATTTTACGTGAAGGCTTGGAAGCTTTGATTATCGTTGTAGCCA TTGTTTCTTATCTTGTACAAAGTGGCAACAAAAATCGTTTAAATATCGCCTATAGTGCTCTTTTTACAGGAGTGATTTTA AGTTTTGTTACCGCTTTTGGAGTTTCTTGGCTATTCAAAGAAAATGCAGGACAAAGTAGAGAGCTTATAGAGGGTATTAC CATGCTTATAGCCGTATTACTACTCTTTTATGTGGGCTTTTGGCTACTTTCAAACGCACAAAATAAAAAATGGACAAGCT TTATCAAACAAGGTGCTATAGATGCTATATCAAACAATAGTGCAAAAACCCTTTGGATCACCGTATTTTTAGCTGTTTAT AGAGAAGGTGCAGAAACTGTGCTTTTTTATCAAGCCTTGCTTTTTGATGCTAAAACAAGCACTGATTTTGGTGCTGTTTT TGGCGGGCTTGGACTTGGAATTTTAATACTTATTGTTTTATATTTTCTTTTAAAAGCAGGAGCCATTCGCATACCTGTAA AACAATTTTTCTATATCACTTCTTACATTATTTTTTACATGGTTTTTGTTTTTACAGGCAAAGGCATAGCTGAACTCATA GAAGGAAAAGTCATTATTCCTAGTCTTATACCTATGAATTTTGAACCGATTTTATGGCTTGGAGTTTATCCTTACTATGA AACTTTAATCCCTCAATTTATAGTTTTGACAATGTTAATTATTGGCATTTTGATAACAAAACAAATTTCAAAAAAAGGAG TAAAATCATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGCTTATTTTTTAGTTCTATTTAAGATTTTTAGTATTATACTAGCCATTATTTATTTTGATAATAAATATTATTTTTATC AAAAATCAAGGATAATGATA
Downstream 100 bases:
>100_bases TAAAAAAAGTTTTATCAGTAGTTGCTGCAGCTGCGGTTATTAGTACAAATTTATTTGCAGGCGAAGTGCCAATCGGCGAT CCAAAAGAACTTAATGGTAT
Product: FTR1 family iron permease
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 696; Mature: 696
Protein sequence:
>696_residues MKIFKIIFLIISIFLSSSAFARVDDYINEANLIKDMLKQSIETYKKGDNLGAKKLSEDAYFQHFENMEGPIGRNIGRKAI TMERKFVNLRRMYKDKAPLTQINALIDSLYYDLDEVAPILQNGYRLKAEASDTNYDKAKAEKSSLEANAKREADAEALIA QMMGVDKKDLAQSSLTTQAPIPANDDTSKLTDDNASADLQAAAAMDTRLQFILDNISTKFSQAANAFKEKNYQASKDFLN DALFSDYRNTKVEILVNKFTKAGNDQKIQQAIRTLIRQINDAKIDEKGLRDGLDNIEEQIFDVFLQIPNSELSSLQISGF NDETKGKDYAKVSNDIKLALDGILKNYDGFSASIVDDLQGIYLDIFEASGMENKIGAVDSGLKLKIESLFSKGVALIKAS ADKKELEATFNDLEQLIASSVDKIQDSTPYSLFIWALSIILREGLEALIIVVAIVSYLVQSGNKNRLNIAYSALFTGVIL SFVTAFGVSWLFKENAGQSRELIEGITMLIAVLLLFYVGFWLLSNAQNKKWTSFIKQGAIDAISNNSAKTLWITVFLAVY REGAETVLFYQALLFDAKTSTDFGAVFGGLGLGILILIVLYFLLKAGAIRIPVKQFFYITSYIIFYMVFVFTGKGIAELI EGKVIIPSLIPMNFEPILWLGVYPYYETLIPQFIVLTMLIIGILITKQISKKGVKS
Sequences:
>Translated_696_residues MKIFKIIFLIISIFLSSSAFARVDDYINEANLIKDMLKQSIETYKKGDNLGAKKLSEDAYFQHFENMEGPIGRNIGRKAI TMERKFVNLRRMYKDKAPLTQINALIDSLYYDLDEVAPILQNGYRLKAEASDTNYDKAKAEKSSLEANAKREADAEALIA QMMGVDKKDLAQSSLTTQAPIPANDDTSKLTDDNASADLQAAAAMDTRLQFILDNISTKFSQAANAFKEKNYQASKDFLN DALFSDYRNTKVEILVNKFTKAGNDQKIQQAIRTLIRQINDAKIDEKGLRDGLDNIEEQIFDVFLQIPNSELSSLQISGF NDETKGKDYAKVSNDIKLALDGILKNYDGFSASIVDDLQGIYLDIFEASGMENKIGAVDSGLKLKIESLFSKGVALIKAS ADKKELEATFNDLEQLIASSVDKIQDSTPYSLFIWALSIILREGLEALIIVVAIVSYLVQSGNKNRLNIAYSALFTGVIL SFVTAFGVSWLFKENAGQSRELIEGITMLIAVLLLFYVGFWLLSNAQNKKWTSFIKQGAIDAISNNSAKTLWITVFLAVY REGAETVLFYQALLFDAKTSTDFGAVFGGLGLGILILIVLYFLLKAGAIRIPVKQFFYITSYIIFYMVFVFTGKGIAELI EGKVIIPSLIPMNFEPILWLGVYPYYETLIPQFIVLTMLIIGILITKQISKKGVKS >Mature_696_residues MKIFKIIFLIISIFLSSSAFARVDDYINEANLIKDMLKQSIETYKKGDNLGAKKLSEDAYFQHFENMEGPIGRNIGRKAI TMERKFVNLRRMYKDKAPLTQINALIDSLYYDLDEVAPILQNGYRLKAEASDTNYDKAKAEKSSLEANAKREADAEALIA QMMGVDKKDLAQSSLTTQAPIPANDDTSKLTDDNASADLQAAAAMDTRLQFILDNISTKFSQAANAFKEKNYQASKDFLN DALFSDYRNTKVEILVNKFTKAGNDQKIQQAIRTLIRQINDAKIDEKGLRDGLDNIEEQIFDVFLQIPNSELSSLQISGF NDETKGKDYAKVSNDIKLALDGILKNYDGFSASIVDDLQGIYLDIFEASGMENKIGAVDSGLKLKIESLFSKGVALIKAS ADKKELEATFNDLEQLIASSVDKIQDSTPYSLFIWALSIILREGLEALIIVVAIVSYLVQSGNKNRLNIAYSALFTGVIL SFVTAFGVSWLFKENAGQSRELIEGITMLIAVLLLFYVGFWLLSNAQNKKWTSFIKQGAIDAISNNSAKTLWITVFLAVY REGAETVLFYQALLFDAKTSTDFGAVFGGLGLGILILIVLYFLLKAGAIRIPVKQFFYITSYIIFYMVFVFTGKGIAELI EGKVIIPSLIPMNFEPILWLGVYPYYETLIPQFIVLTMLIIGILITKQISKKGVKS
Specific function: Unknown
COG id: COG0672
COG function: function code P; High-affinity Fe2+/Pb2+ permease
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the oxidase-dependent Fe transporter (OFeT) (TC 9.A.10.1) family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR005217 - InterPro: IPR004923 [H]
Pfam domain/function: PF03239 FTR1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 77588; Mature: 77588
Theoretical pI: Translated: 5.18; Mature: 5.18
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKIFKIIFLIISIFLSSSAFARVDDYINEANLIKDMLKQSIETYKKGDNLGAKKLSEDAY CHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH FQHFENMEGPIGRNIGRKAITMERKFVNLRRMYKDKAPLTQINALIDSLYYDLDEVAPIL HHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHH QNGYRLKAEASDTNYDKAKAEKSSLEANAKREADAEALIAQMMGVDKKDLAQSSLTTQAP HCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCC IPANDDTSKLTDDNASADLQAAAAMDTRLQFILDNISTKFSQAANAFKEKNYQASKDFLN CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH DALFSDYRNTKVEILVNKFTKAGNDQKIQQAIRTLIRQINDAKIDEKGLRDGLDNIEEQI HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH FDVFLQIPNSELSSLQISGFNDETKGKDYAKVSNDIKLALDGILKNYDGFSASIVDDLQG HHHHHHCCCCHHCEEEECCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH IYLDIFEASGMENKIGAVDSGLKLKIESLFSKGVALIKASADKKELEATFNDLEQLIASS HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH VDKIQDSTPYSLFIWALSIILREGLEALIIVVAIVSYLVQSGNKNRLNIAYSALFTGVIL HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHH SFVTAFGVSWLFKENAGQSRELIEGITMLIAVLLLFYVGFWLLSNAQNKKWTSFIKQGAI HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCH DAISNNSAKTLWITVFLAVYREGAETVLFYQALLFDAKTSTDFGAVFGGLGLGILILIVL HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YFLLKAGAIRIPVKQFFYITSYIIFYMVFVFTGKGIAELIEGKVIIPSLIPMNFEPILWL HHHHCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCEEEE GVYPYYETLIPQFIVLTMLIIGILITKQISKKGVKS ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MKIFKIIFLIISIFLSSSAFARVDDYINEANLIKDMLKQSIETYKKGDNLGAKKLSEDAY CHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH FQHFENMEGPIGRNIGRKAITMERKFVNLRRMYKDKAPLTQINALIDSLYYDLDEVAPIL HHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHH QNGYRLKAEASDTNYDKAKAEKSSLEANAKREADAEALIAQMMGVDKKDLAQSSLTTQAP HCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCC IPANDDTSKLTDDNASADLQAAAAMDTRLQFILDNISTKFSQAANAFKEKNYQASKDFLN CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH DALFSDYRNTKVEILVNKFTKAGNDQKIQQAIRTLIRQINDAKIDEKGLRDGLDNIEEQI HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH FDVFLQIPNSELSSLQISGFNDETKGKDYAKVSNDIKLALDGILKNYDGFSASIVDDLQG HHHHHHCCCCHHCEEEECCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH IYLDIFEASGMENKIGAVDSGLKLKIESLFSKGVALIKASADKKELEATFNDLEQLIASS HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH VDKIQDSTPYSLFIWALSIILREGLEALIIVVAIVSYLVQSGNKNRLNIAYSALFTGVIL HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHH SFVTAFGVSWLFKENAGQSRELIEGITMLIAVLLLFYVGFWLLSNAQNKKWTSFIKQGAI HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCH DAISNNSAKTLWITVFLAVYREGAETVLFYQALLFDAKTSTDFGAVFGGLGLGILILIVL HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YFLLKAGAIRIPVKQFFYITSYIIFYMVFVFTGKGIAELIEGKVIIPSLIPMNFEPILWL HHHHCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCEEEE GVYPYYETLIPQFIVLTMLIIGILITKQISKKGVKS ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7934828; 9384377 [H]