Definition Campylobacter jejuni RM1221, complete genome.
Accession NC_003912
Length 1,777,831

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The map label for this gene is ywbL [H]

Identifier: 57238669

GI number: 57238669

Start: 1722176

End: 1724266

Strand: Direct

Name: ywbL [H]

Synonym: CJE1830

Alternate gene names: 57238669

Gene position: 1722176-1724266 (Clockwise)

Preceding gene: 57238668

Following gene: 57238670

Centisome position: 96.87

GC content: 32.66

Gene sequence:

>2091_bases
ATGAAAATTTTTAAAATTATATTTTTAATTATAAGTATTTTTTTATCAAGCTCAGCTTTTGCTAGGGTAGATGATTATAT
TAATGAAGCAAATCTTATCAAAGATATGCTAAAACAAAGCATAGAAACTTACAAAAAGGGTGATAATCTAGGTGCTAAAA
AGCTTAGCGAAGATGCGTATTTTCAACATTTTGAAAATATGGAAGGCCCCATAGGAAGAAACATAGGAAGAAAAGCCATC
ACCATGGAGCGTAAATTTGTAAATTTGCGTCGTATGTATAAAGATAAAGCTCCTTTGACACAAATTAATGCTTTAATTGA
TAGTCTTTATTATGATCTTGATGAAGTAGCCCCAATCTTACAAAATGGATATCGTTTAAAAGCAGAAGCAAGCGATACAA
ACTACGATAAGGCCAAAGCTGAAAAATCAAGCCTAGAAGCCAATGCCAAACGCGAAGCTGATGCAGAAGCTTTAATCGCG
CAAATGATGGGCGTGGATAAAAAAGATTTAGCACAAAGTTCTTTAACCACCCAAGCTCCTATACCTGCAAACGACGACAC
AAGCAAACTTACAGATGATAATGCAAGTGCTGATTTACAAGCTGCTGCTGCAATGGACACAAGATTGCAATTTATACTAG
ATAATATCTCTACCAAATTTTCACAGGCTGCTAATGCTTTTAAAGAAAAAAACTACCAAGCTAGTAAAGATTTTTTAAAT
GATGCCTTATTTAGTGATTATCGCAATACCAAAGTAGAAATTTTAGTAAATAAATTTACCAAAGCAGGAAACGATCAAAA
AATTCAACAAGCCATACGCACCCTTATACGCCAAATCAACGATGCAAAAATAGATGAAAAAGGCTTAAGAGATGGCTTAG
ATAATATAGAAGAACAAATTTTTGATGTTTTCTTACAAATTCCAAATTCAGAACTTTCAAGTTTGCAAATTTCAGGCTTT
AATGATGAAACAAAAGGCAAAGATTATGCCAAAGTTTCTAATGATATCAAACTTGCTTTAGATGGAATTTTAAAAAATTA
TGATGGCTTTAGTGCTTCTATAGTAGATGATTTACAAGGAATTTATCTAGATATTTTTGAAGCAAGCGGTATGGAAAATA
AAATCGGTGCTGTAGATAGCGGCTTAAAACTTAAAATAGAAAGTTTATTTTCCAAAGGTGTGGCACTGATTAAAGCAAGT
GCAGATAAAAAAGAGCTTGAAGCTACTTTTAATGACTTAGAACAACTCATAGCAAGCAGTGTGGATAAAATTCAAGATTC
TACTCCTTATTCGCTGTTTATATGGGCTTTAAGTATTATTTTACGTGAAGGCTTGGAAGCTTTGATTATCGTTGTAGCCA
TTGTTTCTTATCTTGTACAAAGTGGCAACAAAAATCGTTTAAATATCGCCTATAGTGCTCTTTTTACAGGAGTGATTTTA
AGTTTTGTTACCGCTTTTGGAGTTTCTTGGCTATTCAAAGAAAATGCAGGACAAAGTAGAGAGCTTATAGAGGGTATTAC
CATGCTTATAGCCGTATTACTACTCTTTTATGTGGGCTTTTGGCTACTTTCAAACGCACAAAATAAAAAATGGACAAGCT
TTATCAAACAAGGTGCTATAGATGCTATATCAAACAATAGTGCAAAAACCCTTTGGATCACCGTATTTTTAGCTGTTTAT
AGAGAAGGTGCAGAAACTGTGCTTTTTTATCAAGCCTTGCTTTTTGATGCTAAAACAAGCACTGATTTTGGTGCTGTTTT
TGGCGGGCTTGGACTTGGAATTTTAATACTTATTGTTTTATATTTTCTTTTAAAAGCAGGAGCCATTCGCATACCTGTAA
AACAATTTTTCTATATCACTTCTTACATTATTTTTTACATGGTTTTTGTTTTTACAGGCAAAGGCATAGCTGAACTCATA
GAAGGAAAAGTCATTATTCCTAGTCTTATACCTATGAATTTTGAACCGATTTTATGGCTTGGAGTTTATCCTTACTATGA
AACTTTAATCCCTCAATTTATAGTTTTGACAATGTTAATTATTGGCATTTTGATAACAAAACAAATTTCAAAAAAAGGAG
TAAAATCATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGCTTATTTTTTAGTTCTATTTAAGATTTTTAGTATTATACTAGCCATTATTTATTTTGATAATAAATATTATTTTTATC
AAAAATCAAGGATAATGATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAAAAAAGTTTTATCAGTAGTTGCTGCAGCTGCGGTTATTAGTACAAATTTATTTGCAGGCGAAGTGCCAATCGGCGAT
CCAAAAGAACTTAATGGTAT

Product: FTR1 family iron permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 696; Mature: 696

Protein sequence:

>696_residues
MKIFKIIFLIISIFLSSSAFARVDDYINEANLIKDMLKQSIETYKKGDNLGAKKLSEDAYFQHFENMEGPIGRNIGRKAI
TMERKFVNLRRMYKDKAPLTQINALIDSLYYDLDEVAPILQNGYRLKAEASDTNYDKAKAEKSSLEANAKREADAEALIA
QMMGVDKKDLAQSSLTTQAPIPANDDTSKLTDDNASADLQAAAAMDTRLQFILDNISTKFSQAANAFKEKNYQASKDFLN
DALFSDYRNTKVEILVNKFTKAGNDQKIQQAIRTLIRQINDAKIDEKGLRDGLDNIEEQIFDVFLQIPNSELSSLQISGF
NDETKGKDYAKVSNDIKLALDGILKNYDGFSASIVDDLQGIYLDIFEASGMENKIGAVDSGLKLKIESLFSKGVALIKAS
ADKKELEATFNDLEQLIASSVDKIQDSTPYSLFIWALSIILREGLEALIIVVAIVSYLVQSGNKNRLNIAYSALFTGVIL
SFVTAFGVSWLFKENAGQSRELIEGITMLIAVLLLFYVGFWLLSNAQNKKWTSFIKQGAIDAISNNSAKTLWITVFLAVY
REGAETVLFYQALLFDAKTSTDFGAVFGGLGLGILILIVLYFLLKAGAIRIPVKQFFYITSYIIFYMVFVFTGKGIAELI
EGKVIIPSLIPMNFEPILWLGVYPYYETLIPQFIVLTMLIIGILITKQISKKGVKS

Sequences:

>Translated_696_residues
MKIFKIIFLIISIFLSSSAFARVDDYINEANLIKDMLKQSIETYKKGDNLGAKKLSEDAYFQHFENMEGPIGRNIGRKAI
TMERKFVNLRRMYKDKAPLTQINALIDSLYYDLDEVAPILQNGYRLKAEASDTNYDKAKAEKSSLEANAKREADAEALIA
QMMGVDKKDLAQSSLTTQAPIPANDDTSKLTDDNASADLQAAAAMDTRLQFILDNISTKFSQAANAFKEKNYQASKDFLN
DALFSDYRNTKVEILVNKFTKAGNDQKIQQAIRTLIRQINDAKIDEKGLRDGLDNIEEQIFDVFLQIPNSELSSLQISGF
NDETKGKDYAKVSNDIKLALDGILKNYDGFSASIVDDLQGIYLDIFEASGMENKIGAVDSGLKLKIESLFSKGVALIKAS
ADKKELEATFNDLEQLIASSVDKIQDSTPYSLFIWALSIILREGLEALIIVVAIVSYLVQSGNKNRLNIAYSALFTGVIL
SFVTAFGVSWLFKENAGQSRELIEGITMLIAVLLLFYVGFWLLSNAQNKKWTSFIKQGAIDAISNNSAKTLWITVFLAVY
REGAETVLFYQALLFDAKTSTDFGAVFGGLGLGILILIVLYFLLKAGAIRIPVKQFFYITSYIIFYMVFVFTGKGIAELI
EGKVIIPSLIPMNFEPILWLGVYPYYETLIPQFIVLTMLIIGILITKQISKKGVKS
>Mature_696_residues
MKIFKIIFLIISIFLSSSAFARVDDYINEANLIKDMLKQSIETYKKGDNLGAKKLSEDAYFQHFENMEGPIGRNIGRKAI
TMERKFVNLRRMYKDKAPLTQINALIDSLYYDLDEVAPILQNGYRLKAEASDTNYDKAKAEKSSLEANAKREADAEALIA
QMMGVDKKDLAQSSLTTQAPIPANDDTSKLTDDNASADLQAAAAMDTRLQFILDNISTKFSQAANAFKEKNYQASKDFLN
DALFSDYRNTKVEILVNKFTKAGNDQKIQQAIRTLIRQINDAKIDEKGLRDGLDNIEEQIFDVFLQIPNSELSSLQISGF
NDETKGKDYAKVSNDIKLALDGILKNYDGFSASIVDDLQGIYLDIFEASGMENKIGAVDSGLKLKIESLFSKGVALIKAS
ADKKELEATFNDLEQLIASSVDKIQDSTPYSLFIWALSIILREGLEALIIVVAIVSYLVQSGNKNRLNIAYSALFTGVIL
SFVTAFGVSWLFKENAGQSRELIEGITMLIAVLLLFYVGFWLLSNAQNKKWTSFIKQGAIDAISNNSAKTLWITVFLAVY
REGAETVLFYQALLFDAKTSTDFGAVFGGLGLGILILIVLYFLLKAGAIRIPVKQFFYITSYIIFYMVFVFTGKGIAELI
EGKVIIPSLIPMNFEPILWLGVYPYYETLIPQFIVLTMLIIGILITKQISKKGVKS

Specific function: Unknown

COG id: COG0672

COG function: function code P; High-affinity Fe2+/Pb2+ permease

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the oxidase-dependent Fe transporter (OFeT) (TC 9.A.10.1) family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR005217
- InterPro:   IPR004923 [H]

Pfam domain/function: PF03239 FTR1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 77588; Mature: 77588

Theoretical pI: Translated: 5.18; Mature: 5.18

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKIFKIIFLIISIFLSSSAFARVDDYINEANLIKDMLKQSIETYKKGDNLGAKKLSEDAY
CHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
FQHFENMEGPIGRNIGRKAITMERKFVNLRRMYKDKAPLTQINALIDSLYYDLDEVAPIL
HHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHH
QNGYRLKAEASDTNYDKAKAEKSSLEANAKREADAEALIAQMMGVDKKDLAQSSLTTQAP
HCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCC
IPANDDTSKLTDDNASADLQAAAAMDTRLQFILDNISTKFSQAANAFKEKNYQASKDFLN
CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
DALFSDYRNTKVEILVNKFTKAGNDQKIQQAIRTLIRQINDAKIDEKGLRDGLDNIEEQI
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
FDVFLQIPNSELSSLQISGFNDETKGKDYAKVSNDIKLALDGILKNYDGFSASIVDDLQG
HHHHHHCCCCHHCEEEECCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
IYLDIFEASGMENKIGAVDSGLKLKIESLFSKGVALIKASADKKELEATFNDLEQLIASS
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VDKIQDSTPYSLFIWALSIILREGLEALIIVVAIVSYLVQSGNKNRLNIAYSALFTGVIL
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHH
SFVTAFGVSWLFKENAGQSRELIEGITMLIAVLLLFYVGFWLLSNAQNKKWTSFIKQGAI
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCH
DAISNNSAKTLWITVFLAVYREGAETVLFYQALLFDAKTSTDFGAVFGGLGLGILILIVL
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YFLLKAGAIRIPVKQFFYITSYIIFYMVFVFTGKGIAELIEGKVIIPSLIPMNFEPILWL
HHHHCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCEEEE
GVYPYYETLIPQFIVLTMLIIGILITKQISKKGVKS
ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKIFKIIFLIISIFLSSSAFARVDDYINEANLIKDMLKQSIETYKKGDNLGAKKLSEDAY
CHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
FQHFENMEGPIGRNIGRKAITMERKFVNLRRMYKDKAPLTQINALIDSLYYDLDEVAPIL
HHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHH
QNGYRLKAEASDTNYDKAKAEKSSLEANAKREADAEALIAQMMGVDKKDLAQSSLTTQAP
HCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCC
IPANDDTSKLTDDNASADLQAAAAMDTRLQFILDNISTKFSQAANAFKEKNYQASKDFLN
CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
DALFSDYRNTKVEILVNKFTKAGNDQKIQQAIRTLIRQINDAKIDEKGLRDGLDNIEEQI
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
FDVFLQIPNSELSSLQISGFNDETKGKDYAKVSNDIKLALDGILKNYDGFSASIVDDLQG
HHHHHHCCCCHHCEEEECCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
IYLDIFEASGMENKIGAVDSGLKLKIESLFSKGVALIKASADKKELEATFNDLEQLIASS
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VDKIQDSTPYSLFIWALSIILREGLEALIIVVAIVSYLVQSGNKNRLNIAYSALFTGVIL
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHH
SFVTAFGVSWLFKENAGQSRELIEGITMLIAVLLLFYVGFWLLSNAQNKKWTSFIKQGAI
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCH
DAISNNSAKTLWITVFLAVYREGAETVLFYQALLFDAKTSTDFGAVFGGLGLGILILIVL
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YFLLKAGAIRIPVKQFFYITSYIIFYMVFVFTGKGIAELIEGKVIIPSLIPMNFEPILWL
HHHHCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCEEEE
GVYPYYETLIPQFIVLTMLIIGILITKQISKKGVKS
ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7934828; 9384377 [H]