| Definition | Pasteurella multocida subsp. multocida str. Pm70, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002663 |
| Length | 2,257,487 |
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The map label for this gene is pgtB [H]
Identifier: 15603324
GI number: 15603324
Start: 1649743
End: 1651725
Strand: Direct
Name: pgtB [H]
Synonym: PM1459
Alternate gene names: 15603324
Gene position: 1649743-1651725 (Clockwise)
Preceding gene: 15603323
Following gene: 15603325
Centisome position: 73.08
GC content: 38.12
Gene sequence:
>1983_bases ATGAAAAAATGGTTGAAACATTTAGATTTGAGCACTGGCTTACAACTGTCTTTTCTGATCAGTGGGCTACTTTGTCTGTT TGTCGGTGGCGTCGGGCTTTATACTTGGCAGCAACAACGCACGGAAATCAATTTCGCACTCGATAAAGATTTTCCTAAAG TGCAAGCTGCGTTTCAAACAGAAGAACAAATTAATATCCTCCATCATGCCTTTATCCATTTGGTCAATGTCAAAAACACC AATGAGAAAGTCGAACGTTACAACCATGCAAAGCAACAGCTTTCGACGTTAAAAGAACTGATCATTGAATTAGACGAAAA TTTAGATGAGGATTTGATGGCATTATTACAACAACAAGCCTCACTTTTAGAACAAATATCACAAAATATCACAGGTACGC TTACGTTAAACGATGAACTGAATAAAACCATTTCTCAAATCAACTGGTTACATAATGATTTTCACAATGAATTCACCGCA CTTTTGCAAGAAATGAGCTGGCAACAATCTACTCTGGCTAACAATATTGTTCAACAGCCACACAACAAACAAAAAATCGA ACAATTAAAAAAACTACAACAAGAATTATTGTTAGTTTACGATTTCACTACTTATGAAGAGCAAATTATCACGGAATTAC GCACCCAGATAACAGAGCCAACTGAAAGCAATGTCATTCGACTACACAATTATTTGAGCTATTTATCGTTATTAATTACT AACCGAATTCAGTTGCTTGGTCTTCATTCCTCCACGTCAACCATTAAACAAATTTTAGATGAACTGATTAACTTTGGCTT AAACCCACAAGCACTCCCCGCCCTATTTGCAATCCGTACCGAACTGAACCAACAACGAGAACAGCTGATTCAACAAAGTG ATAAGATATTCGAGGCATTTCGCGAGCAAATCAGTACTCAAATTGGTAACAGTAAACAACAATTACATTTACTGCATAAT ATTGTCGAAAAAAGTACTACATTCAACGGCGCATTAATTTTATTGGTGATGCTATTTGCGGGAATTTTTGTCATCGGTAT TAACTTCTTTTATATTCGTTTACGTCTCTTAAAACGTTTTCAACAACTTAACCACGCCGTAGTTCAATTAACCAATGGCG AGCCCAACGTCAAAATCGCCATTTATGGCAATGATGAATTAGGGCGGATTGCTAAATTATTGCGCTTATTTCTGTTCGAA ATGAATCACAAAACAGAAGAGTTAAAATCGCGTAATCAAGTTCTCTTAGAGGAAATCGAACACCGTATTGAAGTACAAAC CGCATTAGAAAATGCCCAAAATGAACTAACCCAAGCCGCAAAACTGGCTGCTGTCGGTAAAACCTTGACTTCGATTAGCC ATGAAATTACACAACCACTTAATGCCATGAACGCTTATTTGTTTAGTGCGAAAAAAGCCGTGAGTAAACAAAACAGTGAG GCAGCACTTGAATACTTAAATAAAATCAATCATTTAGTTGAACGCACGGCGCTGATTGTCAAACGCTTACGGCAATTCTC ACGCCAAGGGAGCGGCAAAATACAAGCTGTCAATTTAATGGATTGTATTCAAAGCGCGTGGGAATTATTGGAATCACAAC ATAAACCGCGTCAAAGTCAGCTCATCACGCCCACAGATTTACCACTCGTATTAGGTGAAGATGTCCTTATCGAACAAGTG TTTGTCAATCTCTTCCTCAATGCTTTAGAAGCCATTGAACACACACCGCCCCAAATTCATATTGACGTTGACAGCGATAA TGCGGAAGACCTCTGTTTATGGATCACCGACAATGGTCAAGGTTGGCCCTTAACTGACAAGTTATTGCAACCTTTTTCGA GCAGTAAATCGATCAATTTAGGTTTAGGACTGTCCATTAGTCAATCCATCATGGAGCAATGTCAAGGATCATTGACCATT GCCTCTACTCTCACCCATAATGCATTAGTGATATTAAAATTTAAGGTGGCTCAACATGTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATTACTTAACCCATTTTAATCGCAGCCAAGAATTACTTAATTGGCAACATTTTTTTATTGCCCAGCAACTTGCTTTCGTT AACGCATTGGAAAATCAAGA
Downstream 100 bases:
>100_bases TCCTGCCTATAACGTACTCTTAATTGATGACGACATGGATATTCTCGATTCTTATCAGGATTTATTACGACAAGAAGGCT ATCAAGTGATCACCTGTGCA
Product: PgtB
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 660; Mature: 660
Protein sequence:
>660_residues MKKWLKHLDLSTGLQLSFLISGLLCLFVGGVGLYTWQQQRTEINFALDKDFPKVQAAFQTEEQINILHHAFIHLVNVKNT NEKVERYNHAKQQLSTLKELIIELDENLDEDLMALLQQQASLLEQISQNITGTLTLNDELNKTISQINWLHNDFHNEFTA LLQEMSWQQSTLANNIVQQPHNKQKIEQLKKLQQELLLVYDFTTYEEQIITELRTQITEPTESNVIRLHNYLSYLSLLIT NRIQLLGLHSSTSTIKQILDELINFGLNPQALPALFAIRTELNQQREQLIQQSDKIFEAFREQISTQIGNSKQQLHLLHN IVEKSTTFNGALILLVMLFAGIFVIGINFFYIRLRLLKRFQQLNHAVVQLTNGEPNVKIAIYGNDELGRIAKLLRLFLFE MNHKTEELKSRNQVLLEEIEHRIEVQTALENAQNELTQAAKLAAVGKTLTSISHEITQPLNAMNAYLFSAKKAVSKQNSE AALEYLNKINHLVERTALIVKRLRQFSRQGSGKIQAVNLMDCIQSAWELLESQHKPRQSQLITPTDLPLVLGEDVLIEQV FVNLFLNALEAIEHTPPQIHIDVDSDNAEDLCLWITDNGQGWPLTDKLLQPFSSSKSINLGLGLSISQSIMEQCQGSLTI ASTLTHNALVILKFKVAQHV
Sequences:
>Translated_660_residues MKKWLKHLDLSTGLQLSFLISGLLCLFVGGVGLYTWQQQRTEINFALDKDFPKVQAAFQTEEQINILHHAFIHLVNVKNT NEKVERYNHAKQQLSTLKELIIELDENLDEDLMALLQQQASLLEQISQNITGTLTLNDELNKTISQINWLHNDFHNEFTA LLQEMSWQQSTLANNIVQQPHNKQKIEQLKKLQQELLLVYDFTTYEEQIITELRTQITEPTESNVIRLHNYLSYLSLLIT NRIQLLGLHSSTSTIKQILDELINFGLNPQALPALFAIRTELNQQREQLIQQSDKIFEAFREQISTQIGNSKQQLHLLHN IVEKSTTFNGALILLVMLFAGIFVIGINFFYIRLRLLKRFQQLNHAVVQLTNGEPNVKIAIYGNDELGRIAKLLRLFLFE MNHKTEELKSRNQVLLEEIEHRIEVQTALENAQNELTQAAKLAAVGKTLTSISHEITQPLNAMNAYLFSAKKAVSKQNSE AALEYLNKINHLVERTALIVKRLRQFSRQGSGKIQAVNLMDCIQSAWELLESQHKPRQSQLITPTDLPLVLGEDVLIEQV FVNLFLNALEAIEHTPPQIHIDVDSDNAEDLCLWITDNGQGWPLTDKLLQPFSSSKSINLGLGLSISQSIMEQCQGSLTI ASTLTHNALVILKFKVAQHV >Mature_660_residues MKKWLKHLDLSTGLQLSFLISGLLCLFVGGVGLYTWQQQRTEINFALDKDFPKVQAAFQTEEQINILHHAFIHLVNVKNT NEKVERYNHAKQQLSTLKELIIELDENLDEDLMALLQQQASLLEQISQNITGTLTLNDELNKTISQINWLHNDFHNEFTA LLQEMSWQQSTLANNIVQQPHNKQKIEQLKKLQQELLLVYDFTTYEEQIITELRTQITEPTESNVIRLHNYLSYLSLLIT NRIQLLGLHSSTSTIKQILDELINFGLNPQALPALFAIRTELNQQREQLIQQSDKIFEAFREQISTQIGNSKQQLHLLHN IVEKSTTFNGALILLVMLFAGIFVIGINFFYIRLRLLKRFQQLNHAVVQLTNGEPNVKIAIYGNDELGRIAKLLRLFLFE MNHKTEELKSRNQVLLEEIEHRIEVQTALENAQNELTQAAKLAAVGKTLTSISHEITQPLNAMNAYLFSAKKAVSKQNSE AALEYLNKINHLVERTALIVKRLRQFSRQGSGKIQAVNLMDCIQSAWELLESQHKPRQSQLITPTDLPLVLGEDVLIEQV FVNLFLNALEAIEHTPPQIHIDVDSDNAEDLCLWITDNGQGWPLTDKLLQPFSSSKSINLGLGLSISQSIMEQCQGSLTI ASTLTHNALVILKFKVAQHV
Specific function: Member of the two-component regulatory system pgtB/pgtA that regulates the inducible phosphoglycerate transport system. Activates pgtA by phosphorylation [H]
COG id: COG4192
COG function: function code T; Signal transduction histidine kinase regulating phosphoglycerate transport system
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 histidine kinase domain [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1788549, Length=235, Percent_Identity=26.8085106382979, Blast_Score=82, Evalue=8e-17, Organism=Escherichia coli, GI1790436, Length=216, Percent_Identity=26.8518518518519, Blast_Score=71, Evalue=2e-13,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003594 - InterPro: IPR003660 - InterPro: IPR003661 - InterPro: IPR005467 - InterPro: IPR009082 - InterPro: IPR017116 [H]
Pfam domain/function: PF00672 HAMP; PF02518 HATPase_c; PF00512 HisKA [H]
EC number: =2.7.13.3 [H]
Molecular weight: Translated: 75291; Mature: 75291
Theoretical pI: Translated: 6.29; Mature: 6.29
Prosite motif: PS50885 HAMP ; PS50109 HIS_KIN
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 1.2 %Met (Translated Protein) 1.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 1.2 %Met (Mature Protein) 1.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKWLKHLDLSTGLQLSFLISGLLCLFVGGVGLYTWQQQRTEINFALDKDFPKVQAAFQT CCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHCC EEQINILHHAFIHLVNVKNTNEKVERYNHAKQQLSTLKELIIELDENLDEDLMALLQQQA HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH SLLEQISQNITGTLTLNDELNKTISQINWLHNDFHNEFTALLQEMSWQQSTLANNIVQQP HHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC HNKQKIEQLKKLQQELLLVYDFTTYEEQIITELRTQITEPTESNVIRLHNYLSYLSLLIT CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH NRIQLLGLHSSTSTIKQILDELINFGLNPQALPALFAIRTELNQQREQLIQQSDKIFEAF CHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH REQISTQIGNSKQQLHLLHNIVEKSTTFNGALILLVMLFAGIFVIGINFFYIRLRLLKRF HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QQLNHAVVQLTNGEPNVKIAIYGNDELGRIAKLLRLFLFEMNHKTEELKSRNQVLLEEIE HHHHHHHEEEECCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH HRIEVQTALENAQNELTQAAKLAAVGKTLTSISHEITQPLNAMNAYLFSAKKAVSKQNSE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH AALEYLNKINHLVERTALIVKRLRQFSRQGSGKIQAVNLMDCIQSAWELLESQHKPRQSQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC LITPTDLPLVLGEDVLIEQVFVNLFLNALEAIEHTPPQIHIDVDSDNAEDLCLWITDNGQ CCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCC GWPLTDKLLQPFSSSKSINLGLGLSISQSIMEQCQGSLTIASTLTHNALVILKFKVAQHV CCCCHHHHHCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHCCCEEEEEEEHHHHCC >Mature Secondary Structure MKKWLKHLDLSTGLQLSFLISGLLCLFVGGVGLYTWQQQRTEINFALDKDFPKVQAAFQT CCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHCC EEQINILHHAFIHLVNVKNTNEKVERYNHAKQQLSTLKELIIELDENLDEDLMALLQQQA HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH SLLEQISQNITGTLTLNDELNKTISQINWLHNDFHNEFTALLQEMSWQQSTLANNIVQQP HHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC HNKQKIEQLKKLQQELLLVYDFTTYEEQIITELRTQITEPTESNVIRLHNYLSYLSLLIT CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH NRIQLLGLHSSTSTIKQILDELINFGLNPQALPALFAIRTELNQQREQLIQQSDKIFEAF CHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH REQISTQIGNSKQQLHLLHNIVEKSTTFNGALILLVMLFAGIFVIGINFFYIRLRLLKRF HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QQLNHAVVQLTNGEPNVKIAIYGNDELGRIAKLLRLFLFEMNHKTEELKSRNQVLLEEIE HHHHHHHEEEECCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH HRIEVQTALENAQNELTQAAKLAAVGKTLTSISHEITQPLNAMNAYLFSAKKAVSKQNSE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH AALEYLNKINHLVERTALIVKRLRQFSRQGSGKIQAVNLMDCIQSAWELLESQHKPRQSQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC LITPTDLPLVLGEDVLIEQVFVNLFLNALEAIEHTPPQIHIDVDSDNAEDLCLWITDNGQ CCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCC GWPLTDKLLQPFSSSKSINLGLGLSISQSIMEQCQGSLTIASTLTHNALVILKFKVAQHV CCCCHHHHHCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHCCCEEEEEEEHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 2842311; 11677609; 2842312 [H]