| Definition | Chlamydia muridarum Nigg, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002620 |
| Length | 1,072,950 |
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Identifier: 15835525
GI number: 15835525
Start: 1057416
End: 1059911
Strand: Reverse
Name: Not Available
Synonym: TC0911
Alternate gene names: NA
Gene position: 1059911-1057416 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15835526
Following gene: 15835523
Centisome position: 98.78
GC content: 39.78
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases GAAAAAAGTAGCTTTTTTGCCTTCTGGGAGAAAGTTGTAAAAAAAATATTGTTGGGATAGGTTCGCGAAAAATGAAGCTG TAGAGTTTAGAGAGCTGGCC
Downstream 100 bases:
>100_bases TCGTCATTTGAAAGCAGCTTAAAAGTTTAGGCTTTTAAGCTGCTTTATCCTTTCTTATCCAGCAAATTTTCTGGACAATC CGAGATAGATTTGATTAAGA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 831; Mature: 831
Protein sequence:
>831_residues MNRINYTQGSLTDYNSALEAIAKKITQPSSSEKVISQVTQYEQLKIEQEVLKALLVSFDQKANQQYRSLLQRLEQFDLDR QTERSPQNSHIQEQPLSSTQAENQVVAVVNADSNTPAFTGIKQSWAVRLVQGMRELLEQILVEESLFTEEEKGDLLAVRM DAASLQDKKENLSSEDIRSLFLLSKDVVSVLQRASVSSTQKLTWMQSLSQVFGTEETLAQSFARMRLDNFQVILSAIKER LPADKFLAFQDIASEISSIQQSGKEFLSQEHIEAIARVGGHISSQIIESDLKASYKVDLCQRIAAMYQEQVDAVQAYHGL EQEALLVNSWQSSHFVQVIALVASLMQMLSPTSEEERILLNPAMMVSVLPTVQAIGFRFDSLTAEQQQMVNDALSSLHHQ KMDEYLGVLWTHLLLVNCQNQETGVLEGVEESLEEALNGLSPTFILTAKMREIVQECAQNGHVTLTNGERYALFSYNEVG ATICDELALGDSFHQVLGTILAVALSKAEVFEQERERFILAADMEKNVLHQHIAQREMKSQFLSKMQADLDAGKTFAQTK SVEASPLPSAVASVLIDHYMPKEVRFLKAISDRLYYGNMGSTIGNTVLETISPYVNSATYFGFANYIGQPPATGKTGPNI FAGSVDSAKEKLEEEKQQVDSFLEITANAKTVVNNQKTLVAADAGLSAEQKKKISDELTQYTSILDAISNALSSLKTNLA PLSIEAVSGVDGVFEVRNGLNGADGTNWRLVLQTLEDTVVSGEVGSPVNIGMFQMQALVHSNQQAYADMGQNFQLELQMH LTTMQQEWMVVATSLQLLNQIYLGLARSLIR
Sequences:
>Translated_831_residues MNRINYTQGSLTDYNSALEAIAKKITQPSSSEKVISQVTQYEQLKIEQEVLKALLVSFDQKANQQYRSLLQRLEQFDLDR QTERSPQNSHIQEQPLSSTQAENQVVAVVNADSNTPAFTGIKQSWAVRLVQGMRELLEQILVEESLFTEEEKGDLLAVRM DAASLQDKKENLSSEDIRSLFLLSKDVVSVLQRASVSSTQKLTWMQSLSQVFGTEETLAQSFARMRLDNFQVILSAIKER LPADKFLAFQDIASEISSIQQSGKEFLSQEHIEAIARVGGHISSQIIESDLKASYKVDLCQRIAAMYQEQVDAVQAYHGL EQEALLVNSWQSSHFVQVIALVASLMQMLSPTSEEERILLNPAMMVSVLPTVQAIGFRFDSLTAEQQQMVNDALSSLHHQ KMDEYLGVLWTHLLLVNCQNQETGVLEGVEESLEEALNGLSPTFILTAKMREIVQECAQNGHVTLTNGERYALFSYNEVG ATICDELALGDSFHQVLGTILAVALSKAEVFEQERERFILAADMEKNVLHQHIAQREMKSQFLSKMQADLDAGKTFAQTK SVEASPLPSAVASVLIDHYMPKEVRFLKAISDRLYYGNMGSTIGNTVLETISPYVNSATYFGFANYIGQPPATGKTGPNI FAGSVDSAKEKLEEEKQQVDSFLEITANAKTVVNNQKTLVAADAGLSAEQKKKISDELTQYTSILDAISNALSSLKTNLA PLSIEAVSGVDGVFEVRNGLNGADGTNWRLVLQTLEDTVVSGEVGSPVNIGMFQMQALVHSNQQAYADMGQNFQLELQMH LTTMQQEWMVVATSLQLLNQIYLGLARSLIR >Mature_831_residues MNRINYTQGSLTDYNSALEAIAKKITQPSSSEKVISQVTQYEQLKIEQEVLKALLVSFDQKANQQYRSLLQRLEQFDLDR QTERSPQNSHIQEQPLSSTQAENQVVAVVNADSNTPAFTGIKQSWAVRLVQGMRELLEQILVEESLFTEEEKGDLLAVRM DAASLQDKKENLSSEDIRSLFLLSKDVVSVLQRASVSSTQKLTWMQSLSQVFGTEETLAQSFARMRLDNFQVILSAIKER LPADKFLAFQDIASEISSIQQSGKEFLSQEHIEAIARVGGHISSQIIESDLKASYKVDLCQRIAAMYQEQVDAVQAYHGL EQEALLVNSWQSSHFVQVIALVASLMQMLSPTSEEERILLNPAMMVSVLPTVQAIGFRFDSLTAEQQQMVNDALSSLHHQ KMDEYLGVLWTHLLLVNCQNQETGVLEGVEESLEEALNGLSPTFILTAKMREIVQECAQNGHVTLTNGERYALFSYNEVG ATICDELALGDSFHQVLGTILAVALSKAEVFEQERERFILAADMEKNVLHQHIAQREMKSQFLSKMQADLDAGKTFAQTK SVEASPLPSAVASVLIDHYMPKEVRFLKAISDRLYYGNMGSTIGNTVLETISPYVNSATYFGFANYIGQPPATGKTGPNI FAGSVDSAKEKLEEEKQQVDSFLEITANAKTVVNNQKTLVAADAGLSAEQKKKISDELTQYTSILDAISNALSSLKTNLA PLSIEAVSGVDGVFEVRNGLNGADGTNWRLVLQTLEDTVVSGEVGSPVNIGMFQMQALVHSNQQAYADMGQNFQLELQMH LTTMQQEWMVVATSLQLLNQIYLGLARSLIR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 92169; Mature: 92169
Theoretical pI: Translated: 4.60; Mature: 4.60
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.9 %Met (Translated Protein) 3.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.9 %Met (Mature Protein) 3.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNRINYTQGSLTDYNSALEAIAKKITQPSSSEKVISQVTQYEQLKIEQEVLKALLVSFDQ CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KANQQYRSLLQRLEQFDLDRQTERSPQNSHIQEQPLSSTQAENQVVAVVNADSNTPAFTG HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHC IKQSWAVRLVQGMRELLEQILVEESLFTEEEKGDLLAVRMDAASLQDKKENLSSEDIRSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHCCCHHHHHHH FLLSKDVVSVLQRASVSSTQKLTWMQSLSQVFGTEETLAQSFARMRLDNFQVILSAIKER HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LPADKFLAFQDIASEISSIQQSGKEFLSQEHIEAIARVGGHISSQIIESDLKASYKVDLC CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QRIAAMYQEQVDAVQAYHGLEQEALLVNSWQSSHFVQVIALVASLMQMLSPTSEEERILL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEE NPAMMVSVLPTVQAIGFRFDSLTAEQQQMVNDALSSLHHQKMDEYLGVLWTHLLLVNCQN CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC QETGVLEGVEESLEEALNGLSPTFILTAKMREIVQECAQNGHVTLTNGERYALFSYNEVG CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEEECHHHH ATICDELALGDSFHQVLGTILAVALSKAEVFEQERERFILAADMEKNVLHQHIAQREMKS HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHH QFLSKMQADLDAGKTFAQTKSVEASPLPSAVASVLIDHYMPKEVRFLKAISDRLYYGNMG HHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHEECCCC STIGNTVLETISPYVNSATYFGFANYIGQPPATGKTGPNIFAGSVDSAKEKLEEEKQQVD HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHH SFLEITANAKTVVNNQKTLVAADAGLSAEQKKKISDELTQYTSILDAISNALSSLKTNLA HHHHHHCCCHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC PLSIEAVSGVDGVFEVRNGLNGADGTNWRLVLQTLEDTVVSGEVGSPVNIGMFQMQALVH CCEEHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH SNQQAYADMGQNFQLELQMHLTTMQQEWMVVATSLQLLNQIYLGLARSLIR CCHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MNRINYTQGSLTDYNSALEAIAKKITQPSSSEKVISQVTQYEQLKIEQEVLKALLVSFDQ CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KANQQYRSLLQRLEQFDLDRQTERSPQNSHIQEQPLSSTQAENQVVAVVNADSNTPAFTG HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHC IKQSWAVRLVQGMRELLEQILVEESLFTEEEKGDLLAVRMDAASLQDKKENLSSEDIRSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHCCCHHHHHHH FLLSKDVVSVLQRASVSSTQKLTWMQSLSQVFGTEETLAQSFARMRLDNFQVILSAIKER HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LPADKFLAFQDIASEISSIQQSGKEFLSQEHIEAIARVGGHISSQIIESDLKASYKVDLC CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QRIAAMYQEQVDAVQAYHGLEQEALLVNSWQSSHFVQVIALVASLMQMLSPTSEEERILL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEE NPAMMVSVLPTVQAIGFRFDSLTAEQQQMVNDALSSLHHQKMDEYLGVLWTHLLLVNCQN CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC QETGVLEGVEESLEEALNGLSPTFILTAKMREIVQECAQNGHVTLTNGERYALFSYNEVG CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEEECHHHH ATICDELALGDSFHQVLGTILAVALSKAEVFEQERERFILAADMEKNVLHQHIAQREMKS HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHH QFLSKMQADLDAGKTFAQTKSVEASPLPSAVASVLIDHYMPKEVRFLKAISDRLYYGNMG HHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHEECCCC STIGNTVLETISPYVNSATYFGFANYIGQPPATGKTGPNIFAGSVDSAKEKLEEEKQQVD HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHH SFLEITANAKTVVNNQKTLVAADAGLSAEQKKKISDELTQYTSILDAISNALSSLKTNLA HHHHHHCCCHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC PLSIEAVSGVDGVFEVRNGLNGADGTNWRLVLQTLEDTVVSGEVGSPVNIGMFQMQALVH CCEEHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH SNQQAYADMGQNFQLELQMHLTTMQQEWMVVATSLQLLNQIYLGLARSLIR CCHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA