Definition Chlamydia muridarum Nigg, complete genome.
Accession NC_002620
Length 1,072,950

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Identifier: 15835525

GI number: 15835525

Start: 1057416

End: 1059911

Strand: Reverse

Name: Not Available

Synonym: TC0911

Alternate gene names: NA

Gene position: 1059911-1057416 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15835526

Following gene: 15835523

Centisome position: 98.78

GC content: 39.78

Gene sequence:

>2496_bases
ATGAACCGTATTAATTATACACAAGGATCATTAACAGATTATAATAGCGCTCTTGAGGCTATAGCGAAAAAGATTACGCA
ACCAAGTTCTTCAGAGAAGGTAATATCTCAGGTTACTCAATATGAACAGCTCAAAATTGAGCAAGAAGTGCTAAAAGCTC
TCCTAGTTTCTTTTGATCAAAAAGCAAACCAACAGTATCGAAGTCTTCTTCAACGATTAGAACAGTTTGACCTAGATAGA
CAGACAGAACGTTCTCCTCAAAATTCACATATTCAGGAACAACCGTTATCTTCCACACAAGCTGAGAATCAAGTTGTTGC
TGTAGTGAATGCAGATTCGAATACGCCTGCTTTCACAGGTATTAAGCAATCTTGGGCAGTACGATTAGTTCAAGGAATGC
GCGAGCTTTTGGAGCAGATTCTAGTAGAAGAATCGCTATTCACAGAGGAAGAAAAGGGAGATCTTCTTGCTGTCCGTATG
GATGCAGCTTCTCTACAGGATAAGAAAGAAAACTTATCATCCGAAGATATTCGATCTCTGTTCTTGCTTTCGAAAGATGT
GGTTAGTGTTTTACAAAGGGCTTCTGTGTCTAGTACACAGAAATTAACATGGATGCAATCTCTCTCTCAAGTTTTTGGAA
CAGAGGAGACTCTTGCTCAGTCTTTTGCTAGGATGCGTTTAGACAATTTTCAGGTAATTTTATCTGCGATTAAGGAGCGT
TTACCAGCAGACAAGTTTTTGGCATTTCAAGATATTGCTTCTGAAATTTCTTCGATTCAGCAGTCAGGTAAAGAGTTTCT
TAGTCAAGAACACATAGAAGCTATAGCTCGAGTTGGGGGGCATATTTCTTCTCAAATTATCGAGTCAGATCTGAAAGCAA
GCTATAAGGTGGATCTTTGTCAACGAATAGCTGCTATGTACCAGGAGCAGGTAGATGCAGTTCAAGCATATCATGGTCTT
GAGCAAGAAGCTTTATTAGTGAATTCTTGGCAAAGTAGTCACTTTGTACAGGTAATTGCTTTGGTTGCCTCTCTTATGCA
AATGTTGTCTCCAACTAGTGAAGAGGAGCGCATTTTACTGAATCCTGCCATGATGGTAAGTGTTCTTCCTACTGTGCAAG
CAATCGGCTTTCGTTTTGATTCCTTAACAGCAGAGCAGCAACAGATGGTAAATGATGCGCTTTCATCTCTGCATCATCAG
AAAATGGATGAATATTTAGGAGTTTTGTGGACACACCTACTTCTTGTAAATTGTCAGAACCAAGAAACTGGGGTATTGGA
AGGAGTAGAAGAAAGTTTGGAAGAAGCTTTGAATGGGCTTAGTCCAACTTTTATTCTAACTGCTAAAATGCGGGAAATTG
TGCAGGAATGTGCTCAAAATGGGCATGTAACATTAACAAATGGGGAGCGGTACGCGCTATTTTCTTACAATGAAGTAGGC
GCTACTATTTGTGATGAGTTGGCTTTAGGGGATAGTTTTCATCAAGTGTTAGGAACTATATTAGCAGTTGCGCTCTCTAA
AGCAGAAGTGTTTGAGCAGGAAAGAGAAAGATTTATTCTTGCGGCTGATATGGAGAAAAATGTTCTTCATCAACATATTG
CTCAGCGGGAGATGAAAAGTCAGTTTTTGTCCAAAATGCAGGCTGATTTAGATGCTGGTAAAACATTCGCACAAACCAAA
AGTGTAGAAGCTTCTCCGCTCCCATCTGCTGTGGCTTCGGTGTTGATAGATCACTATATGCCCAAAGAGGTTCGTTTCTT
AAAGGCTATATCGGATCGTTTATATTACGGAAATATGGGATCAACCATCGGGAATACAGTTTTAGAAACGATTAGTCCTT
ATGTCAATTCTGCCACTTATTTTGGTTTCGCTAACTATATTGGTCAGCCTCCTGCAACAGGTAAAACAGGGCCAAACATT
TTCGCGGGATCTGTGGATAGTGCTAAGGAGAAATTAGAAGAAGAAAAACAACAAGTAGACTCGTTTTTAGAAATTACAGC
TAATGCCAAAACAGTTGTCAATAATCAGAAAACCCTAGTTGCTGCGGATGCAGGTTTGTCGGCAGAGCAAAAGAAAAAAA
TTTCGGATGAGCTCACACAATATACTAGTATTCTAGATGCTATATCCAATGCTTTGTCATCTTTGAAAACGAATTTGGCT
CCACTTTCGATAGAAGCTGTTTCTGGTGTAGATGGAGTTTTTGAAGTGAGAAACGGTTTGAATGGAGCAGATGGGACTAA
TTGGCGGTTAGTTTTACAGACTTTAGAGGATACTGTCGTGTCTGGAGAAGTTGGAAGCCCTGTTAACATTGGAATGTTCC
AGATGCAAGCCTTGGTACATTCTAATCAACAAGCCTATGCAGATATGGGACAAAATTTTCAGTTGGAGTTGCAAATGCAC
CTCACTACCATGCAACAAGAATGGATGGTAGTAGCCACTTCTCTTCAGTTATTGAATCAAATTTACTTGGGATTAGCGCG
TAGTTTAATCCGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAAAAAAGTAGCTTTTTTGCCTTCTGGGAGAAAGTTGTAAAAAAAATATTGTTGGGATAGGTTCGCGAAAAATGAAGCTG
TAGAGTTTAGAGAGCTGGCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCGTCATTTGAAAGCAGCTTAAAAGTTTAGGCTTTTAAGCTGCTTTATCCTTTCTTATCCAGCAAATTTTCTGGACAATC
CGAGATAGATTTGATTAAGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 831; Mature: 831

Protein sequence:

>831_residues
MNRINYTQGSLTDYNSALEAIAKKITQPSSSEKVISQVTQYEQLKIEQEVLKALLVSFDQKANQQYRSLLQRLEQFDLDR
QTERSPQNSHIQEQPLSSTQAENQVVAVVNADSNTPAFTGIKQSWAVRLVQGMRELLEQILVEESLFTEEEKGDLLAVRM
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FAGSVDSAKEKLEEEKQQVDSFLEITANAKTVVNNQKTLVAADAGLSAEQKKKISDELTQYTSILDAISNALSSLKTNLA
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LTTMQQEWMVVATSLQLLNQIYLGLARSLIR

Sequences:

>Translated_831_residues
MNRINYTQGSLTDYNSALEAIAKKITQPSSSEKVISQVTQYEQLKIEQEVLKALLVSFDQKANQQYRSLLQRLEQFDLDR
QTERSPQNSHIQEQPLSSTQAENQVVAVVNADSNTPAFTGIKQSWAVRLVQGMRELLEQILVEESLFTEEEKGDLLAVRM
DAASLQDKKENLSSEDIRSLFLLSKDVVSVLQRASVSSTQKLTWMQSLSQVFGTEETLAQSFARMRLDNFQVILSAIKER
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PLSIEAVSGVDGVFEVRNGLNGADGTNWRLVLQTLEDTVVSGEVGSPVNIGMFQMQALVHSNQQAYADMGQNFQLELQMH
LTTMQQEWMVVATSLQLLNQIYLGLARSLIR
>Mature_831_residues
MNRINYTQGSLTDYNSALEAIAKKITQPSSSEKVISQVTQYEQLKIEQEVLKALLVSFDQKANQQYRSLLQRLEQFDLDR
QTERSPQNSHIQEQPLSSTQAENQVVAVVNADSNTPAFTGIKQSWAVRLVQGMRELLEQILVEESLFTEEEKGDLLAVRM
DAASLQDKKENLSSEDIRSLFLLSKDVVSVLQRASVSSTQKLTWMQSLSQVFGTEETLAQSFARMRLDNFQVILSAIKER
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EQEALLVNSWQSSHFVQVIALVASLMQMLSPTSEEERILLNPAMMVSVLPTVQAIGFRFDSLTAEQQQMVNDALSSLHHQ
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FAGSVDSAKEKLEEEKQQVDSFLEITANAKTVVNNQKTLVAADAGLSAEQKKKISDELTQYTSILDAISNALSSLKTNLA
PLSIEAVSGVDGVFEVRNGLNGADGTNWRLVLQTLEDTVVSGEVGSPVNIGMFQMQALVHSNQQAYADMGQNFQLELQMH
LTTMQQEWMVVATSLQLLNQIYLGLARSLIR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 92169; Mature: 92169

Theoretical pI: Translated: 4.60; Mature: 4.60

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.9 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNRINYTQGSLTDYNSALEAIAKKITQPSSSEKVISQVTQYEQLKIEQEVLKALLVSFDQ
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KANQQYRSLLQRLEQFDLDRQTERSPQNSHIQEQPLSSTQAENQVVAVVNADSNTPAFTG
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHC
IKQSWAVRLVQGMRELLEQILVEESLFTEEEKGDLLAVRMDAASLQDKKENLSSEDIRSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
FLLSKDVVSVLQRASVSSTQKLTWMQSLSQVFGTEETLAQSFARMRLDNFQVILSAIKER
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LPADKFLAFQDIASEISSIQQSGKEFLSQEHIEAIARVGGHISSQIIESDLKASYKVDLC
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QRIAAMYQEQVDAVQAYHGLEQEALLVNSWQSSHFVQVIALVASLMQMLSPTSEEERILL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEE
NPAMMVSVLPTVQAIGFRFDSLTAEQQQMVNDALSSLHHQKMDEYLGVLWTHLLLVNCQN
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QETGVLEGVEESLEEALNGLSPTFILTAKMREIVQECAQNGHVTLTNGERYALFSYNEVG
CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEEECHHHH
ATICDELALGDSFHQVLGTILAVALSKAEVFEQERERFILAADMEKNVLHQHIAQREMKS
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHH
QFLSKMQADLDAGKTFAQTKSVEASPLPSAVASVLIDHYMPKEVRFLKAISDRLYYGNMG
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SFLEITANAKTVVNNQKTLVAADAGLSAEQKKKISDELTQYTSILDAISNALSSLKTNLA
HHHHHHCCCHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
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CCEEHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
SNQQAYADMGQNFQLELQMHLTTMQQEWMVVATSLQLLNQIYLGLARSLIR
CCHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MNRINYTQGSLTDYNSALEAIAKKITQPSSSEKVISQVTQYEQLKIEQEVLKALLVSFDQ
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KANQQYRSLLQRLEQFDLDRQTERSPQNSHIQEQPLSSTQAENQVVAVVNADSNTPAFTG
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CCHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA